Scheikunde BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde

Scheikunde BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

I

De opleiding Scheikunde richt zich op de bestudering van moleculen, op het doen van wetenschappelijk onderzoek hiernaar en op de toepassing van de verworven kennis. Binnen de bacheloropleiding doe je kennis op van alle gebieden binnen de scheikunde: biochemie, fysische chemie, organische chemie, theoretische chemie en analytische chemie. Met de opleiding wordt beoogd zodanige kennis, vaardigheid en inzicht bij te brengen op het gebied van de scheikunde dat de afgestudeerde in aanmerking kan komen voor een masteropleiding in de scheikunde. Dit kan een onderzoeksrichting zijn, maar ook een opleiding op het gebied van Communicatie en Educatie of een meer maatschappijgerichte opleiding. Eveneens is het essentieel dat de afgestudeerde zich bekwaamd heeft in het verantwoord kiezen in wetenschappelijke problematieken. Om deze doelstellingen te bereiken is in de eerste plaats een brede scheikundige basisopleiding nodig met daarin ook aandacht voor algemene academische vorming. Daarnaast is het noodzakelijk dat de student gedurende enige tijd actief deelneemt aan het scheikundig onderzoek. Meer opleidingsinformatie is te vinden op de de FEW-website. Een complete beschrijving van deze opleiding is te vinden in de Onderwijs- en Examenregeling op de FEW-website.


II

Inhoudsopgave

Eerste jaar bachelor Scheikunde

1

Verplichte vakken

1

Verplichte algemene onderdelen

2

Tweede jaar bachelor Scheikunde

2

Verplichte keuze 1 uit 2

3

Verplichte vakken

3

Derde jaar bachelor Scheikunde

4

Individuele vakken

4

Bachelorprojecten

5

Keuze ruimte

7

Verdiepingsvakken Analytische Chemie en Toegepaste Spectroscopie

7

Verdiepingsvakken Organische en Anorganische Chemie

7

Verdiepingsvakken Theoretische Chemie

8

Verdiepingsvakken Fysische Chemie

8

Verdiepingsvakken Farmacochemie

8

Keuze vakken Oriëntatie op de C/E/M variant

9

Derde jaar bachelor Schei keuzevakken

9

Minor Energie en duurzame chemie

9

Verplichte vakken

9

Vak: Analytische chemie

10

Vak: Anorganische chemie 2

10

Vak: Anorganische chemie I

11

Vak: Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken

11


12


13

Vak: Bachelorproject Farmacochemie BMA

14


14


14

Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie

15


16


16

Vak: Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.

17


17


18

Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.

18


19


19

Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.

19


20


20

Vak: Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken

21


21


22


III

Vak: Bachelorproject Organometaal synthese

23


23


24

Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectieen identificatietechnieken

25


25


26

Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse

27


27


28

Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry

29


30


31

Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie

32


33


34

Vak: Basischemie

35

Vak: Basispracticum Scheikunde

35

Vak: Basiswiskunde

36

Vak: Basiswiskunde

37

Vak: Bioanalyse eiwitten

37

Vak: Biochemie

38

Vak: Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW.

39

Vak: Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1

39

Vak: BP Farmacochemie MC, DD&S

39

Vak: BP Farmacochemie MC, DD&S

39

Vak: BP Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S

40

Vak: Calculus 1

40

Vak: Calculus 2

40

Vak: Cellulaire biochemie, modelling en structuur

40

Vak: Chemie / farmacochemie en samenleving

42

Vak: Chemische binding

43

Vak: Computational (Pharmaco)Chemistry

43

Vak: Computationele organische chemie Computational Organic Chemistry

44

Vak: Experiments in Green and Sustainable Chemistry

44

Vak: FEW individueel vak intern

45

Vak: Fysica en medische fysica 2

45

Vak: Fysische chemie 2: Moleculaire interactie en dynamica

46

Vak: Geschiedenis van de natuurwetenschappen

47

Vak: Green Chemistry

47

Vak: Heterologe expressie van biotransformatie enzymen

47

Vak: Inleiding bioinformatica 1

48

Vak: Inleiding computergebruik

49

Vak: Integrated Practical Course

49

Vak: Kernspinresonantie (NMR)

50

Vak: Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie

50


IV

Vak: Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken

51

Vak: Keuzevak Fysische Chemie

52

Vak: Keuzevak Fysische Chemie

52

Vak: Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction

52

Vak: Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction

53

Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth.

53

Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth.

54

Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.

54

Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.

54

Vak: Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.

55

Vak: Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.

55

Vak: Keuzevak Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.

56

Vak: Keuzevak Multidimensionale scheidingstechnieken

57

Vak: Keuzevak Spectroscopische detectieen identificatietechniek

57

Vak: Keuzevak Spectroscopische detectieen identificatietechniek

58

Vak: Keuzevak Theoretische Chemie

58

Vak: Keuzevak Theoretische Chemie

58

Vak: Levende chemie

59

Vak: Lineaire algebra

60

Vak: Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen

60

Vak: Macromoleculen

61

Vak: Macromoleculen en katalyse

62

Vak: Mentoraat / Tutoraat

63

Vak: Moleculaire quantummechanica

63

Vak: Natuurkunde en Wiskunde voor chemici 1

64

Vak: Natuurkunde en wiskunde voor chemici 2

65

Vak: Natuurstoffen

65

Vak: Nuclear Chemistry

66

Vak: Open House Analytical Chemistry and applied Spectroscopy

66

Vak: Open house Chemical Biology

67

Vak: Open House Comp. Med. Chem. & Tox.

67

Vak: Open House DDS

67

Vak: Open House Organic and Anorganic Chemistry

67

Vak: Open House Physical Chemistry

68

Vak: Open House Theoretical Chemistry

68

Vak: Organische chemie 1

68

Vak: Organische chemie 2

68

Vak: Organische chemie 3: moderne organische synthese

69

Vak: Organische en anorganische chemie

70

Vak: Organometaalchemie

71

Vak: Oriëntatie op de M-variant

71

Vak: Oriëntatie science educatie

73

Vak: Practicum Analytische chemie

74

Vak: Practicum Anorganische chemie

75

Vak: Practicum energie en duurzaamheid

75


V

Vak: Practicum Moderne synthetische methoden

76

Vak: Practicum van Atoom tot (Bio)molecuul

76

Vak: Principes van chemische reactiviteit

77

Vak: Programmeren

78

Vak: Project Katalyse

79

Vak: Spectroscopie

79

Vak: Structuurbiologie

80

Vak: Studie en loopbaan

81

Vak: Synthese practicum

81

Vak: Theoretische chemie I

82

Vak: Theoretische chemie II

82

Vak: Theoretische chemie III

83

Vak: Thermodynamica

84

Vak: Van atoom tot (bio)molecuul

84

Vak: Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min

85

Vak: Voorlichting door studentendecanen en CSL

85

Vak: Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers

86

Vak: Why Chemical Reactions Happen

87

Vak: Wijsgerige vorming: natuurwetenschappen, filosofie en ethiek

87


VI

Eerste jaar bachelor Scheikunde Eerste jaar voor studenten gestart in 2010/2011 In het eerste jaar zijn alle vakken verplicht, er zijn geen keuzevakken. Het programma in het eerste jaar vormt een basis; het geeft een eerste overzicht van de Scheikunde en is bedoeld als een verbreding van de kennis op diverse terreinen. Het eerste jaar van de bachelor heeft een oriënterende en selecterende functie. De student kan zich tijdens het eerste studiejaar oriënteren op de gekozen opleiding, dat wil zeggen: voldoet de opleiding aan de verwachting en is men er geschikt voor. Het programma van het eerste jaar geeft een eerste overzicht van de opleiding en geeft een verbreding van de kennis. De selecterende functie komt vooral tot uiting in de studieresultaten. De studieresultaten worden gevolgd door de studieadviseur. Als het nodig is worden studenten opgeroepen voor een gesprek. Op grond van de cijfers wordt aan het eind van het eerste jaar aan elke eerstejaars een (nietbindend) schriftelijk studieadvies gestuurd. Opleidingsdelen: - Verplichte vakken - Verplichte algemene onderdelen

Verplichte vakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Analytische chemie

Periode 3

3.0

X_435087

Anorganische chemie I

Periode 3

3.0

X_435141

Basischemie

Periode 1

3.0

X_435077

Basispracticum Scheikunde Periode 1

4.0

X_435092

Basiswiskunde

3.0

X_401069

Basiswiskunde

Periode 1

2.0

X_400288

Biochemie

Periode 2

6.0

X_435051

Calculus 1

Periode 2

3.0

X_400300

Cellulaire biochemie, modelling en structuur

6.0

X_430563

Chemie / farmacochemie en Periode 4 samenleving

3.0

X_435080

Chemische binding

Periode 2

3.0

X_435079

Fysica en medische fysica 2 Periode 5

3.0

X_430061

Levende chemie

3.0

X_430569

Lineaire algebra

Periode 4

3.0

X_400302

Macromoleculen

Periode 6

3.0

X_435094


8-6-2012 - Pagina 1 van 88

Natuurkunde en Wiskunde voor chemici 1

6.0

X_430572

Natuurkunde en wiskunde voor chemici 2

6.0

X_428005

3.0

X_435091

6.0

X_430573

Organische chemie 1

Periode 5

Organische en anorganische chemie Practicum Analytische chemie

Periode 6

3.0

X_435083

Practicum Anorganische chemie

Periode 4

3.0

X_435089

Practicum energie en duurzaamheid

3.0

X_430574

Practicum van Atoom tot (Bio)molecuul

6.0

X_430575

Principes van chemische reactiviteit

3.0

X_430576

Van atoom tot (bio)molecuul

6.0

X_430580

3.0

X_435088

Why Chemical Reactions Happen

Periode 4

Verplichte algemene onderdelen Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW.

Periode 1

0.0

X_000002

Blusinstructie: Theorie: Periode 1 S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1

0.0

X_000003

Inleiding computergebruik

0.0

X_000004

Mentoraat / Tutoraat

Periode 1

0.0

X_000008

Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min

Periode 1

0.0

X_000019

0.0

X_000007

Voorlichting door studentendecanen en CSL

Tweede jaar bachelor Scheikunde Tweede jaar voor studenten gestart in 2009/2010 In het tweede studiejaar wordt beoogd een verdieping van kennis, inzicht en vaardigheden op deelgebieden van de scheikunde tot stand te brengen. Dit vormt de basis voor de differentiatie in het derde jaar. In periode 4 is er een verplichte keuze tussen de vakken Maatschappelijke aspecten van natuurwetenschappen en Geschiedenis van de natuurwetenschappen. Daarnaast volg je het verplichte onderdeel Studie en Loopbaan in periode 5. Tijdens deze cursus wordt er expliciet aandacht besteed aan jouw Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 2 van 88

competenties en vaardigheden, zodat jij je bewust wordt van jouw sterke punten. Daarnaast krijg je meer inzicht in keuzemogelijkheden binnen de opleiding en mogelijkheden na de bacheloropleiding. Opleidingsdelen: - Verplichte keuze 1 uit 2 - Verplichte vakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Studie en loopbaan

Periode 1, Periode 5

0.0

X_000018

Verplichte keuze 1 uit 2 Verplichte keuze van 1 uit 2 Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Geschiedenis van de natuurwetenschappen

Periode 4

3.0

X_420148

Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen

Periode 4

3.0

X_420153

Naam

Periode

Credits

Code

Anorganische chemie 2

Periode 3

3.0

X_435290

Bioanalyse eiwitten

Periode 1

3.0

X_435099

Calculus 2

Periode 1+2

6.0

X_435002

Fysische chemie 2: Moleculaire interactie en dynamica

Periode 2

3.0

X_435108

Integrated Practical Course Periode 5

12.0

X_430516

Moleculaire quantummechanica

6.0

X_430571


Organische chemie 2

Periode 1

3.0

X_435007

Programmeren

Periode 3+4

6.0

X_435003

Project Katalyse

Periode 6

6.0

X_435102

Synthese practicum


6.0

X_435192

Theoretische chemie I

Periode 4

3.0

X_435194

Theoretische chemie II

Periode 4

3.0

X_435195


8-6-2012 - Pagina 3 van 88

Thermodynamica

Periode 1

3.0

X_435203

Derde jaar bachelor Scheikunde Derde jaar voor studenten gestart in 2008/2009 Het derde studiejaar is opgebouwd uit een aantal verplichte vakken, daarnaast is er veel keuzeruimte die ingevuld moet worden met een eindproject en daarnaast keuzevakken. In het tweede deel van het derde studiejaar zijn ook de cursussen oriëntatie op de C-, E-, en M-variant geprogrammeerd. Je moet, voordat je begint aan de afronding van de bacheloropleiding, goedkeuring van je programma vragen aan de examencommissie via het formulier 'aanvraag goedkeuring bachelorprogramma'. De studieadviseur zal je hier tijdig op wijzen en je helpen bij het invullen. Ook de coördinatoren van de secties kunnen advies en ondersteuning bieden bij de keuzes die gemaakt moeten worden. Opleidingsdelen: -

Individuele vakken Bachelorprojecten Keuze ruimte Verplichte vakken

Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Open House Analytical Chemistry and applied Spectroscopy

Periode 1

0.0

X_000009

Open house Chemical Biology

Periode 1

0.0

X_000010

Open House Comp. Med. Chem. & Tox.

Periode 1

0.0

X_000011

Open House DDS

Periode 1

0.0

X_000012

Open House Organic and Anorganic Chemistry

Periode 1

0.0

X_000015

Open House Physical Chemistry

0.0

X_000016

Open House Theoretical Chemistry

0.0

X_000017

Credits

Code

6.0

X_INDVAKI_09

Individuele vakken Vakken:

Naam

Periode

FEW individueel vak intern


8-6-2012 - Pagina 4 van 88

Bachelorprojecten Verplichte keuze van minimaal 12 ects en maximaal 24 ects, te besteden aan twee projecten van elk 12 ects, of een van 18 ects of een van 24 ects. Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Bachelorproject Bioanalytische screeningstechnieken

Ac. Jaar (september)

18.0

X_435117



24.0

X_435118



12.0

X_435460

Bachelorproject Farmacochemie BMA


12.0

X_430523



18.0

X_430524



24.0

X_430525

Bachelorproject Imaging en Ac. Jaar (september) Laser Control van FotoChemie

12.0

X_435052


18.0

X_435114


24.0

X_435116

Bachelorproject Med. Ac. Jaar (september) Chem., Drug Disc. & Target Find.

12.0

X_430529


18.0

X_430530


24.0

X_430531

Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.


12.0

X_430532



18.0

X_430533



24.0

X_430534

Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.


12.0

X_430535


8-6-2012 - Pagina 5 van 88



18.0

X_430536



24.0

X_430537

Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken


18.0

X_435122



24.0

X_435123



12.0

X_435490

Bachelorproject Organometaal synthese


12.0

X_435104



18.0

X_435133



24.0

X_435134

Bachelorproject Spectroscopische detectieen identificatietechnieken


18.0

X_435119



24.0

X_435121



12.0

X_435470

Bachelorproject Synthese en structuuranalyse


18.0

X_435128



24.0

X_435129



12.0

X_435550

Bachelorproject Theoretical Ac. Jaar (september) Chemistry

12.0

X_430517


18.0

X_435126


24.0

X_435127

Bachelorproject Toegepaste Ac. Jaar (september) theoretische chemie

18.0

X_435131


24.0

X_435132


12.0

X_435570

BP Farmacochemie MC, DD&S


18.0

X_430527

BP Farmacochemie MC, DD&S


24.0

X_430528


8-6-2012 - Pagina 6 van 88

BP Farmacochemie Ac. Jaar (september) Medicinal Chemistry, DD&S

12.0

X_430526

Keuze ruimte De keuzeruimte van 24, 18 of 12 sp kan worden ingevuld met een keuze uit onderstaande vakken. Voor de invulling van de keuzeonderdelen is de goedkeuring van de examencommissie vereist. Opleidingsdelen: -

Verdiepingsvakken Analytische Chemie en Toegepaste Spectroscopie Verdiepingsvakken Organische en Anorganische Chemie Verdiepingsvakken Theoretische Chemie Verdiepingsvakken Fysische Chemie Verdiepingsvakken Farmacochemie Keuze vakken Oriëntatie op de C/E/M variant Derde jaar bachelor Schei keuzevakken Minor Energie en duurzame chemie

Verdiepingsvakken Analytische Chemie en Toegepaste Spectroscopie Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie


3.0

X_435026

Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken


3.0

X_435028

Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction


3.0

X_435032

Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction


6.0

X_435033

Keuzevak Multidimensionale Ac. Jaar (september) scheidingstechnieken

3.0

X_435037

Keuzevak Spectroscopische detectieen identificatietechniek

6.0

X_430568

Keuzevak Spectroscopische Ac. Jaar (september) detectieen identificatietechniek

3.0

X_435039

Verdiepingsvakken Organische en Anorganische Chemie Vakken:


8-6-2012 - Pagina 7 van 88

Naam

Periode

Credits

Code

Computationele organische Ac. Jaar (september) chemie Computational Organic Chemistry

9.0

X_435017

Macromoleculen en katalyse Ac. Jaar (september)

6.0

X_435450

Natuurstoffen


6.0

X_435440

Organometaalchemie


3.0

X_435018

Practicum Moderne synthetische methoden


9.0

X_435016

Verdiepingsvakken Theoretische Chemie Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Keuzevak Theoretische Chemie


3.0

X_430538

Keuzevak Theoretische Chemie


6.0

X_430539

Credits

Code

Keuzevak Fysische Chemie Ac. Jaar (september)

3.0

X_430540

Keuzevak Fysische Chemie Ac. Jaar (september)

6.0

X_430541

Verdiepingsvakken Fysische Chemie Vakken:

Naam

Periode

Verdiepingsvakken Farmacochemie Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Heterologe expressie van biotransformatie enzymen


6.0

X_430549

Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth.


3.0

X_430542

Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth.


6.0

X_430543

Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.


3.0

X_430544

Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.


6.0

X_430545


8-6-2012 - Pagina 8 van 88

Keuzevak Mol. Tox., Comp. Ac. Jaar (september) Med. Chem. & Tox.

3.0

X_430546

Keuzevak Mol. Tox., Comp. Ac. Jaar (september) Med. Chem. & Tox.

6.0

X_430547

Keuzevak Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.

3.0

X_430548


Keuze vakken Oriëntatie op de C/E/M variant Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Oriëntatie op de M-variant

Periode 4

6.0

X_400375

Oriëntatie science educatie

Periode 4

6.0

O_ORIBETA

Wetenschapscommunicatie Periode 4 voor Bèta-onderzoekers

6.0

AB_470185

Derde jaar bachelor Schei keuzevakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Inleiding bioinformatica 1

Periode 3

3.0

X_401036

Structuurbiologie

Periode 1

6.0

X_430080

Minor Energie en duurzame chemie Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Experiments in Green and Sustainable Chemistry


6.0

X_430556

Green Chemistry


6.0

X_430557

Nuclear Chemistry

Periode 4

3.0

X_430558

Naam

Periode

Credits

Code

Computational (Pharmaco)Chemistry

Periode 2

6.0

X_435350



8-6-2012 - Pagina 9 van 88

Kernspinresonantie (NMR)

Periode 2

3.0

X_435012

Organische chemie 3: moderne organische synthese

Periode 3

3.0

X_435109

Spectroscopie

Periode 1

6.0

X_435064

Theoretische chemie III

Periode 1

3.0

X_435196

Wijsgerige vorming: natuurwetenschappen, filosofie en ethiek

Periode 1

3.0

X_435340

Analytische chemie Vakcode

X_435087 (435087)

Periode

Periode 3

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit

Faculteit der Exacte Wetenschappen

Coördinator

prof. dr. H. Irth

Docent(en)

prof. dr. H. Irth

Lesmethode(n)

Werkcollege

Literatuur Harris, D.C., Quantitative Chemical Analysis. Studiehandleiding verstrekt door de docent. Doelgroep 1S

Anorganische chemie 2 Vakcode

X_435290 (435290)

Periode

Periode 3

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. A.W. Ehlers

Docent(en)

dr. A.W. Ehlers

Lesmethode(n)

Werkcollege

Doel vak Het doel van dit college is het verder uitbreiden van de basiskennis op het gebied van de anorganische chemie opgedaan in het college Anorganische chemie I, in het bijzonder m.b.t. de coördinatiechemie en de organometaalchemie. Inhoud vak In het hoorcollege wordt aandacht besteed aan de volgende onderwerpen: - Coördinatiechemie (structuur en assymmetrie van overgangsmetaalcomplexen, binding en electronenstructuur, magnetisme, Jahn Teller verstoring, reacties van coördinatieverbindingen) - Organometaalchemie (18-electronenregel, carbonylcomplexen, Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 10 van 88

Dewar-Chatt model, metaal-metaalbinding) Onderwijsvorm Colleges (hoorcollege, werkcolleges), Zelfstudie. Toetsvorm Schriftelijk tentamen. Tot de tentamenstof behoort alle op het college behandelde stof, alsmede de genoemde delen van het studieboek. Herkansing mogelijk mondelijk. Literatuur Atkins, P. e.a., Shriver & Atkins: Inorganic Chemistry 4th ed. Oxford: Oxford University Press, 2006. i.h.b. hfdst. 7, 8, 18-21, 25..st. 9-16. Overige informatie Aanvullend materiaal is online beschikbaar via Blackboard.

Anorganische chemie I Vakcode

X_435141 (435141)

Periode

Periode 3

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. L. Visscher

Doel vak Het doel van dit college is het aanleren van basiskennis op het gebied van de anorganische chemie. Inhoud vak In het hoorcollege wordt aandacht besteed aan de volgende onderwerpen: - Atoomstructuur - Moleculaire structuur, binding, en reactiviteit - Structuur van en binding in vaste stoffen (metalen, covalente en ionogene roosterverbindingen) - Periodiek systeem der elementen (eigenschappen van hoofdgroepelementen) Onderwijsvorm Colleges (hoorcollege, instructiecollege) 26 uur. Literatuur Atkins, P. e.a., Shriver & Atkins: Inorganic Chemistry 5th ed. Oxford: Oxford University Press, 2010. Doelgroep 1S

Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken Vakcode

X_435117 (435117)

Periode


Credits

18.0


8-6-2012 - Pagina 11 van 88

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten (vakcode 435118).


X_435118 (435118)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 12 van 88

geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten (vakcode 435118).


X_435460 (435460)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie


8-6-2012 - Pagina 13 van 88

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten (vakcode 435118).

Bachelorproject Farmacochemie BMA Vakcode

X_430523 (430523)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Inhoud vak De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430523) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430524) of 24 studiepunten (vakcode 430525).


X_430524 (430524)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman



X_430525 (430525)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands


8-6-2012 - Pagina 14 van 88

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman


Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie Vakcode

X_435052 (435052)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. M.H.M. Janssen

Doel vak Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde imaging detectoren. Inhoud vak Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden uitgevoerd: - Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp van ultrasnelle femtoseconde lasers. - Fotodynamica van niet-adiabatische chemie. Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage ('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet. Literatuur Praktische handleidingen, boeken en literatuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 15 van 88

(vakcode 435116).


X_435114 (435114)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde imaging detectoren. Inhoud vak Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden uitgevoerd: - Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp van ultrasnelle femtoseconde lasers. - Fotodynamica van niet-adiabatische chemie. Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage ('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet. Literatuur Praktische handleidingen, boeken en literatuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten (vakcode 435116).


X_435116 (435116)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



8-6-2012 - Pagina 16 van 88

Doel vak Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde imaging detectoren. Inhoud vak Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden uitgevoerd: - Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp van ultrasnelle femtoseconde lasers. - Fotodynamica van niet-adiabatische chemie. Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage ('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet. Literatuur Praktische handleidingen, boeken en literatuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten (vakcode 435116).

Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. Vakcode

X_430529 (430529)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.N.M. Commandeur


Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 17 van 88

Vakcode

X_430530 (430530)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. Vakcode

X_430531 (430531)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. Vakcode

X_430532 (430532)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 18 van 88

Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430532) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430533) of 24 studiepunten (vakcode 430534).


X_430533 (430533)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator




X_430534 (430534)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm. Vakcode

X_430535 (430535)

Periode


Credits

12.0


8-6-2012 - Pagina 19 van 88

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator




X_430536 (430536)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator




X_430537 (430537)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430535) kan in overleg met de coordinator worden Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 20 van 88

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430536) of 24 studiepunten (vakcode 430537).

Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken Vakcode

X_435122 (435122)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen, waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende detectiesystemen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten (vakcode 435123).


X_435123 (435123)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.


8-6-2012 - Pagina 21 van 88

Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen, waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende detectiesystemen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten (vakcode 435123).


X_435490 (435490)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen, waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende detectiesystemen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten (vakcode 435123).


8-6-2012 - Pagina 22 van 88

Bachelorproject Organometaal synthese Vakcode

X_435104 (435104)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Doel vak Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie. Inhoud vak In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia, katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden, indien relvevant, X-ray structuren gemeten. Onderwijsvorm Practicumverslag Aanbevolen voorkennis Organische chemie I & II, practicum organische synthese. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten (vakcode 435134).


X_435133 (435133)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Doel vak Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie. Inhoud vak


8-6-2012 - Pagina 23 van 88

In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia, katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden, indien relvevant, X-ray structuren gemeten. Onderwijsvorm Practicumverslag Aanbevolen voorkennis Organische chemie I & II, practicum organische synthese. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten (vakcode 435134).


X_435134 (435134)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Doel vak Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie. Inhoud vak In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia, katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden, indien relvevant, X-ray structuren gemeten. Onderwijsvorm Practicumverslag Aanbevolen voorkennis Organische chemie I & II, practicum organische synthese. Doelgroep


8-6-2012 - Pagina 24 van 88

3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten (vakcode 435134).

Bachelorproject Spectroscopische detectieen identificatietechnieken Vakcode

X_435119 (435119)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. C. Gooijer

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten (vakcode 435121).


X_435121 (435121)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



8-6-2012 - Pagina 25 van 88

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten (vakcode 435121).


X_435470 (435470)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur.


8-6-2012 - Pagina 26 van 88

Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten (vakcode 435121).

Bachelorproject Synthese en structuuranalyse Vakcode

X_435128 (435128)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. ir. R.V.A. Orru

Doel vak Zelfstandig onderzoek. Inhoud vak In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie), bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek (kinetiek). Onderwijsvorm Zelfstandig onderzoek binnen de sectie. Toetsvorm Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge verslaglegging (proeve van bekwaamheid). Literatuur Wordt per project aangegeven. Aanbevolen voorkennis 435090: Organische chemie 1 435160: Organische chemie 2 435140: Anorganische chemie 1 435290: Anorganische chemie 2 435192: Practicum Synthese Doelgroep 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten (vakcode 435129).

Bachelorproject Synthese en structuuranalyse Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 27 van 88

Vakcode

X_435129 (435129)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Bachelorproject Synthese en structuuranalyse Vakcode

X_435550 (435550)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



8-6-2012 - Pagina 28 van 88


Bachelorproject Theoretical Chemistry Vakcode

X_430517 (430517)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de quantumtheoretische chemie. Inhoud vak Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 29 van 88

deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software (ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van f-elementen lanthanides, actinides). Onderwijsvorm De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de promovendi en/of postdocs van de sectie. Literatuur Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford University Press. Selectie van recente review artikelen. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten (vakcode 435127).


X_435126 (435126)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de quantumtheoretische chemie. Inhoud vak Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software (ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van f-elementen lanthanides, actinides). Onderwijsvorm


8-6-2012 - Pagina 30 van 88

De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de promovendi en/of postdocs van de sectie. Literatuur Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford University Press. Selectie van recente review artikelen. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten (vakcode 435127).


X_435127 (435127)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de quantumtheoretische chemie. Inhoud vak Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software (ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van f-elementen lanthanides, actinides). Onderwijsvorm De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de promovendi en/of postdocs van de sectie. Literatuur


8-6-2012 - Pagina 31 van 88

Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford University Press. Selectie van recente review artikelen. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten (vakcode 435127).

Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie Vakcode

X_435131 (435131)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. F.M. Bickelhaupt

Doel vak Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en biologische chemie. Inhoud vak De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput. Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door "uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt. Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO) model een centrale rol speelt. Onderwijsvorm De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling. Literatuur Fragmenten uit: Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985. Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 32 van 88

Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York: Wiley-VCH, Vol. 15. Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten (vakcode 435132).


X_435132 (435132)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en biologische chemie. Inhoud vak De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput. Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door "uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt. Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO) model een centrale rol speelt. Onderwijsvorm De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling. Literatuur Fragmenten uit: Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 33 van 88

in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985. Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York: Wiley-VCH, Vol. 15. Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten (vakcode 435132).


X_435570 (435570)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en biologische chemie. Inhoud vak De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput. Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door "uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt. Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO) model een centrale rol speelt. Onderwijsvorm De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling.


8-6-2012 - Pagina 34 van 88

Literatuur Fragmenten uit: Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985. Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York: Wiley-VCH, Vol. 15. Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten (vakcode 435132).

Basischemie Vakcode

X_435077 (435077)

Periode

Periode 1

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. K. Retra

Doel vak Het doel van de cursus is het aanleren van de basisprincipes van chemie en de farmacochemie, het gelijktrekken van het beginniveau van alle studenten. Inhoud vak In een geïntegreerd hoor-/werkcollege komen veel onderwerpen van de middelbare school weer aan orde, zoals zuur/base berekeningen, evenwichten, vormingsenergieën en elektrochemie. De nadruk ligt hierbij op berekeningen. Verder zullen nieuwe begrippen worden geïntroduceerd zoals thermodynamische begrippen en stofeigenschappen zoals pKa waarden. Tevens zal aandacht besteed worden aan de achtergrond van de basispractica. Onderwijsvorm Geïntegreerd hoor-/werkcollege. Literatuur Zumdahl, S.S., Chemical Principles 6th ed. En een studiehandleiding verstrekt door de docent. Doelgroep 1F, 1S

Basispracticum Scheikunde


8-6-2012 - Pagina 35 van 88

Vakcode

X_435092 (435092)

Periode

Periode 1

Credits

4.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Doel vak Het aanleren van basisvaardigheden die nodig zijn voor het uitvoeren van experimenten alsmede de kennismaking met (experimentele) technieken/methoden in de verschillende chemische richtingen. Inhoud vak Op het practicum worden enkele experimenten/projecten uitgevoerd waarin een aantal basisvaardigheden wordt geoefend. Deze vaardigheden worden daarna gebruikt bij het uitvoeren van onderzoeksprojecten later in het curriculum. Die vaardigheden betreffen o.a. het bestuderen van de theorie, literatuuronderzoek, definieren van een hypothese, opstellen van een plan van aanpak, ontwerpen van een experiment, uitvoeren van het experiment, bijhouden van een labjournaal, kritische beoordeling van de resultaten, alsmede mondelingen en schriftelijke rapportage. Onderwijsvorm Het practicum wordt wordt uitgevoerd als projectmatig onderwijs, waarbij de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke gegevens, de theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken en het experiment zelf vormgeven. Literatuur Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de opdrachten te kunnen uitvoeren. Doelgroep 1S

Basiswiskunde Vakcode

X_401069 ()

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator

drs. J.A. Los

Doel vak Het doel van deze cursus is het ophalen en bijbrengen van wiskundige basisvaardigheden die nodig zijn in vervolgcolleges zoals Calculus en Statistiek. Inhoud vak De cursus begint met een herhaling van vwo stof. Sommige onderwerpen zullen op wiskunde b niveau afgesloten worden. Ook komen een aantal nieuwe onderwerpen aan bod (deels afhankelijk van je vwo-voorkennis): integreren, goniometrie, limieten, complexe getallen en bewijzen met volledige inductie.


8-6-2012 - Pagina 36 van 88

Onderwijsvorm Gemengd hoor- en werkcollege en huiswerkopgaven. Toetsvorm Een afsluitend schriftelijk tentamen en een tussentoets. Literatuur Basisboek wiskunde (tweede editie), Jan van de Craats en Rob Bosch, Pearson, ISBN 978-90-430-1673-5. Aangevuld met een dictaat. Doelgroep 1F, 1MNW, 1S, 1SBI

Basiswiskunde Vakcode

X_400288 (400288)

Periode

Periode 1

Credits

2.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

drs. J.A. Los

Docent(en)

drs. J.A. Los

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkcollege

Doel vak Het doel van deze cursus is het ophalen en bijbrengen van wiskundige basisvaardigheden die nodig zijn in de vervolgcolleges Calculus en Statistiek Inhoud vak De cursus begint met een herhaling van vwo stof. Daarna komen een aantal nieuwe onderwerpen aan bod: complexe getallen en volledige inductie. Onderwijsvorm Gemengd hoor- en werkcollege. Met de huiswerkopgaven zal de student ongeveer vier uur per week bezig moeten zijn. Toetsvorm Afsluitende toets Literatuur Basisboek wiskunde (tweede editie), Jan van de Craats en Rob Bosch, Pearson, ISBN 978-90-430-1673-5. Aangevuld met een dictaat. Aanbevolen voorkennis vwo- wiskunde b1 Doelgroep 1S, 1MNW, 1SBI

Bioanalyse eiwitten Vakcode Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

X_435099 (435099) 8-6-2012 - Pagina 37 van 88

Periode

Periode 1

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J. Kool

Docent(en)

dr. J. Kool

Lesmethode(n)

Werkcollege

Biochemie Vakcode

X_435051 (435051)

Periode

Periode 2

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. M.H. Siderius

Doel vak Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van deze cellen en de manier waarop cellen energie winnen uit de afbraak van voedingsstoffen en deze energie gebruiken voor groei en deling, als ook basisprincipes van de moleculaire biologie van de levende cel, de manier waarop genetische informatie in cellen wordt opgeslagen en de verwerking van deze informatie tot de eiwitten van de cel. Ook de belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld. Inhoud vak Er wordt begonnen met het bespreken van de structurele en functionele opbouw van de levende cel, waarna de verschillende soorten (macro)moleculen die in de cel aanwezig zijn worden behandeld. Vervolgens wordt bekeken op welke manier een cel zijn energie verkrijgt uit voedsel. De afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen (koolhydraten en vetten) worden besproken, gevolgd door de structuur en functie van biologische membranen die een centrale rol spelen in de omzetting van de zo gewonnen energie in een voor de cel bruikbare vorm (ATP). Ook de fotosynthese komt aan bod. Tevens de behandeling van de structuur en functie van DNA en de manier waarop DNA in de celkern is opgevouwen tot chromosomen. Vervolgens de genetische informatiestroom DNA -> RNA -> eiwit en de manier waarop deze informatiestroom wordt gereguleerd. Tenslotte komen de belangrijkste onderdelen van de recombinant DNA technologie aan de orde (genetische modificatie, DNA volgorde analyse, PCR, etc.). Onderwijsvorm Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen toetsen. Toetsvorm Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw, bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 38 van 88

alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie, genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en energiehuishouding aan de orde komen. Literatuur Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. delen hieruit zoals aangegeven in de studiehandleiding bij dit college. Doelgroep 1F, 1MNW, 1S, 1SBI, 1W-B

Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW. Vakcode

X_000002 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Lesmethode(n)

Practicum

Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1 Vakcode

X_000003 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Lesmethode(n)

Hoorcollege

BP Farmacochemie MC, DD&S Vakcode

X_430527 (430527)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


BP Farmacochemie MC, DD&S Vakcode

X_430528 (430528)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



8-6-2012 - Pagina 39 van 88

BP Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S Vakcode

X_430526 (430526)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Calculus 1 Vakcode

X_400300 ()

Periode

Periode 2

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

drs. J.A. Los

Docent(en)

dr. C.M. Quant, drs. J.A. Los

Lesmethode(n)


Calculus 2 Vakcode

X_435002 (435002)

Periode

Periode 1+2

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. R. van der Hout

Docent(en)

dr. J.A. Sanders

Lesmethode(n)


Doel vak De bestudering van wat meer geavanceerde onderdelen van de calculus.

Cellulaire biochemie, modelling en structuur


8-6-2012 - Pagina 40 van 88

Vakcode

X_430563 ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak • Het verkrijgen van inzicht in verschillende theoretische rekenmodellen om moleculaire interacties te beschrijven en de biologische activiteit van moleculen te begrijpen en te voorspellen. • Het verkrijgen van inzicht in de structuur en ruimtelijke organisatie van macromoleculaire complexen en organellen in de cellulaire context en op de karakteristieken van signaal overdracht en intracellulaire transport processen. Inhoud vak In de biochemie bepalen de eigenschappen van de moleculaire componenten samen hoe een cel, of een organisme, zich gedraagt. De (macro)moleculen in een levende cel zijn op een complexe manier georganiseerd in tal van complexen, membranen, en subcellulaire organellen. Deze vorm is geëvolueerd als een die goed functioneert, maar brengt ook complicaties met zich mee: Er is nu noodzaak tot het uitvoeren van ingewikkelde transport- en assemblage processen, en het reguleren en onderling afstemmen van de activiteit van de metabole routes die in de verschillende compartimenten actief zijn, met behulp van ingewikkelde signaal-transductie netwerken. Begrip van dit gedrag is relevant voor begrip van het functioneren van leven, en voor toepassingen zoals het ontwerpen van bijvoorbeeld nieuwe geneesmiddelen. Om de complexiteit van de moleculen en hun interacties te kunnen bevatten, hebben we theoretische modellen nodig. In deze cursus combineren we mathematische modellen om moleculair gedrag te beschrijven en begrijpen, met inzicht in de moleculaire basis van cellulair functioneren. Zo krijgen we inzicht in de manier waarop een cel reageert op zijn omgeving, en de manieren waarop wij dat gedrag kunnen manipuleren. Relevante eiwitten en hun liganden zullen op verschillende niveau’s worden bestudeerd: van gedetailleerde atomaire en moleculaire modellen tot de organisatie en interacties van de verschillende moleculen op (sub)cellulair niveau. We doen met behulp van hoorcolleges over cellulaire organisatie, in combinatie met practicum over cellulaire responsen op een signaal. Daarnaast berekenen we de conformaties van moleculen met behulp van moleculaire mechanica, waarbij ook verschillende sampling methodes worden behandeld (systematisch, stochastisch, moleculaire dynamica). Tevens zal worden ingegaan op het analyseren en voorspellen (via moleculaire docking) van de karakteristieken van eiwit-ligand interacties. Tijdens een individuele case studie zullen theoretische moleculaire mechanica berekeningen worden gecorreleerd met experimenteel bepaalde eiwit-ligand interactie geometrieën (kristal structuren) en affiniteiten (biologische activiteit en thermodynamische data). Onderwijsvorm Hoor-, en werkcolleges; experimenteel- en computer practicum (tutorials ChemDraw, Chem 3D, MOE), case study. Toetsvorm Practicumverslagen en schriftelijk tentamen


8-6-2012 - Pagina 41 van 88

Literatuur Boek: Essential Cell Biology, Second Edition (Bruce Alberts et al.), hoofdstukken 11, 12, 15, 16, 18 en 19. Reader en hoofdstukken uit volume 4 van Comprehensive Medicinal Chemistry II: Computer-Assisted Drug Design (E-Book) Aanbevolen voorkennis Practicumverslagen en schriftelijk tentamen Doelgroep 1S

Chemie / farmacochemie en samenleving Vakcode

X_435080 (435080)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.E. van Muijlwijk-Koezen

Doel vak 1. De studenten krijgen inzicht in de wereld van de chemie. Ze leren mensen en organisaties uit de chemie kennen en bouwen een netwerk op. 2. De studenten ontdekken hoe de samenleving eruit ziet, wat de samenleving weet van chemie en hoe de samenleving denkt over chemie. 3. De studenten ontwikkelen (verder) een aantal academische vaardigheden zoals projectmatig werken, presenteren, rapporteren, doelgericht interviewen, bewust zijn van eigen competenties en motivatie voor het opleidingsgebied, feedback geven en kritisch beoordelen. 4. De drie bovenstaande doelen hebben tot resultaat dat de studenten een houding ontwikkelen om een goed ambassadeur voor hun vak te zijn. Inhoud vak Tijdens de cursus wordt in projectvorm gewerkt. De wereld van de chemie wordt ingeleid met drie gastcolleges gegeven door drie chemici werkend voor organisaties die een belangrijke rol spelen in die wereld. Ook moeten de studenten drie chemici van buiten de VU interviewen uit het onderzoek, de industrie en het onderwijs. De studenten verkennen de samenleving door het uitvoeren van een onderzoek naar het imago van de chemie in de samenleving. Dit onderzoek wordt uitgevoerd in groepen. De studenten rapporteren mondeling en schriftelijk over dit onderzoek, waarbij verschillende vaardigheden aan bod komen. De cursus wordt feestelijk afgesloten met een borrel, waar de studenten zullen strijden om de eer van de beste elevator pitch over chemie, een van de individuele opdrachten. Onderwijsvorm Hoor- en werkcolleges, groepsopdrachten en individuele opdrachten Toetsvorm Beoordeling vindt plaats aan de hand van: - Het functioneren in het groepswerk. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 42 van 88

- De resultaten van de groepsopdrachten. - De resultaten van de individuele opdrachten. Doelgroep 1S, 1F

Chemische binding Vakcode

X_435079 (435079)

Periode

Periode 2

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Doel van het college is de introductie van quantummechanische concepten voor het beschrijven van atomen en moleculen om zicht te krijgen op hun chemische eigenschappen. Inhoud vak Na een introductie in de quantumwereld wordt het waterstofatoom behandeld en vervolgens de opbouw van het periodiek systeem besproken. Vervolgens komt het concept van chemische binding aan de orde eerst op basis van Lewis-structuren en daarna op basis van elektronen orbitals. Tenslotte zullen de elektronenspectroscopie en de vibratiespectroscopie worden geintroduceerd. Onderwijsvorm Gecombineerd hoorcollege en werkcollege Literatuur Zumdahl, S.S., Chemical Principles 6th ed, Houghton Mifflin Comp, 2009 (ISBN 0-618-94690-X). chapters 12, 13 and 14. Doelgroep 1F, 1S

Computational (Pharmaco)Chemistry Vakcode

X_435350 (435350)

Periode

Periode 2

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)

Hoorcollege, Practicum

Doel vak Het leren van moderne quantumchemische methoden en met name het toepassen daarvan bij het computerondersteund oplossen van chemische problemen. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 43 van 88

Onderwijsvorm De cursus bestaat uit een hoorcollege en een practicum, waarin een kort researchproject is opgenomen. Literatuur Cramer, C.J. Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models. Chichester: Wiley-VCH, 2002. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie In verband met het verschil in voorkennis van de studenten S en F is er voor een aantal colleges onderscheid gemaakt in verplichte en vrijwillige college-uren. De twee college-uren "Symmetrie en Hückel-theorie" zijn verplicht voor 3F studenten en vrijwillig voor 3S studenten. De twee college-uren "Modeling" zijn verplicht voor 3S studenten en vrijwillig voor 3F studenten.

Computationele organische chemie Computational Organic Chemistry Vakcode

X_435017 (435017)

Periode


Credits

9.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. A.W. Ehlers

Doel vak Kennismaken met moderne "computational chemistry" methoden om de structuur, eigenschappen en de reactiviteit van organische moleculen te onderzoeken. Onderwijsvorm Practicumproject. Literatuur Foresman, J.B., and Frisch, A., Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods 2nd ed. Gaussian Inc. of in overleg met de docent. Doelgroep 3S, 3F

Experiments in Green and Sustainable Chemistry Vakcode

X_430556 (430556)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



8-6-2012 - Pagina 44 van 88

Doel vak Praktische vaardigheden aan leren die van belang zijn bij het ontwerpen en uitdenken van duurzame chemische processen vanuit een chemisch perspectief. Inhoud vak Aan de hand van experimenten, vaak met een link naar de praktijk in de industrie, worden de principes en concepten achter green chemistry en duurzame chemische ontwikkeling geïllustreerd. Katalyse-experimenten, een-pots syntheses, ionic liquids, afval reductie en atoom/stap efficiëntie, fotochemie en fotokatalyse, biofuels etc etc. komen aan bod Onderwijsvorm Practicum. Toetsvorm Verslagen van de practicum opdrachten. Literatuur Experiments in Green and Sustainable Chemistry, Eds. Roesky and Kennepohl. Weinheim Germany: Wiley-VCN (ISBN 9783527325467). Aanbevolen voorkennis Organische chemie 1 & 2 en Green Chemistry Doelgroep 3S Overige informatie Het practicum maakt deel uit van de minor Energie en Duurzame Chemie.

FEW individueel vak intern Vakcode

X_INDVAKI_09 ()

Credits

6.0

Faculteit


Fysica en medische fysica 2 Vakcode

X_430061 (430061)

Periode

Periode 5

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. K.S.E. Eikema

Docent(en)

prof. dr. K.S.E. Eikema, prof. dr. M.L. Groot

Lesmethode(n)


Doel vak Doelstelling van het college Fysica en medische fysica II is de discussie van basisbegrippen van de natuurkunde uit te breiden en diegene te introduceren die ten grondslag liggen aan de elektrische en Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 45 van 88

magnetische verschijnselen in de levende natuur. Inhoud vak Fysica is de wetenschap die de eigenschappen van de materie beschrijft in termen van natuurwetten. De fysica speelt bij het begrijpen van de eigenschappen van de levende materie en het menselijk lichaam een essentiële rol. In dit college zullen de verschillende wetten behandeld worden die aan het einde de Maxwell vergelijkingen opleveren, die alle elektromagnetische verschijnsels beschrijven kunnen. In enkele colleges komt de relatie tussen elektromagnetisme en verschillende essentiële levensprocessen aan de orde. Onderwijsvorm Voorstudie, vragencollege, werkcollege en zelfstudie. Literatuur Giancoli, D.C., Physics for Scientists and Engineers with Modern Physics 4th ed. New Jersey: Prentice Hall. Doelgroep 1MNW, 1S, 1SBI

Fysische chemie 2: Moleculaire interactie en dynamica Vakcode

X_435108 (435108)

Periode

Periode 2

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)

Werkcollege

Doel vak In het college FC II zal men vertrouwd gemaakt worden met een aantal moderne begrippen en wetmatigheden vanuit een moleculair beschouwingswijze. Vanuit de individuele quantum eigenschappen van het molecuul verkrijgt men een fundamenteel inzicht in de fenomenologie van moleculaire wisselwerking en de interactie met andere deeltjes en electromagnetische straling. Inhoud vak De botsingsdoorsnede en de vrije moleculaire weglengte. Inter-moleculaire krachten, reactiemechanismen en reactiedynamica. Electromagnetische straling, absorptie, emissie, spectroscopie en structuur. Onderwijsvorm Hoorcollege en werkcollege (28 uur totaal) en zelfstudie. Literatuur Atkins, P.W., Physical Chemistry 8th ed. Aanbevolen voorkennis


8-6-2012 - Pagina 46 van 88

Chemische Binding, Fysische Chemie I, Kinetiek van Chemische Reacties, Mechanica, Calculus. Doelgroep 2S

Geschiedenis van de natuurwetenschappen Vakcode

X_420148 (420148)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. F.H. van Lunteren

Docent(en)

prof. dr. F.H. van Lunteren

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doelgroep 2F, 2MNW, 2N, 2S

Green Chemistry Vakcode

X_430557 (430557)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. K. Lammertsma

Docent(en)


Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Kennis maken met, en analyse van, algemene ideeën achter het concept "green chemistry" en haar belang voor het ontwikkelen van duurzame chemische technologie vanuit een chemisch perspectief. Onderwijsvorm Colleges, (groeps)opdrachten. Literatuur Lancaster, M., Green Chemistry: An Introductory text. Cambridge: RSC (ISBN 0854046208). Overige informatie Het college maakt deel uit van de minor Energie en Duurzame Chemie.

Heterologe expressie van biotransformatie enzymen Vakcode

X_430549 (430549)

Periode


Credits

6.0


8-6-2012 - Pagina 47 van 88

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Dit vak heeft tot doel de student zich te laten verdiepen in de strategieën en experimentele benaderingen die worden gebruikt om specifieke biotransformatie-enzymen (zoals P450s, glutathione transferases, etc.) tot expressie te brengen in cellulaire organismen. Inhoud vak Biotransformatie, ook wel metabolisme genoemd, speelt een zeer belangrijke rol in de verwerking van geneesmiddelen door het lichaam. Aan de ene kant is biotransformatie vaak bepalend voor de halfwaardetijd waarmee een geneesmiddel wordt geëlimineerd vanuit het plasma. Aan de andere kant kunnen bij metabolisme reactieve metabolieten ontstaan die met cellulair materiaal reageren, zoals eiwitten, DNA of membranen. Het menselijke genoom codeert voor enkele honderden enzymen die in meer of mindere mate bij het metabolisme van geneesmiddelen betrokken kunnen zijn. Om de rol van de enzymen beter te kunnen bestuderen, zijn voor de belangrijkste biotransformatie-enzymen expressiesystemen ontwikkeld in verschillende organismes, zoals Escherichia coli, gist, insectcellen, Salmonella typhimurium, zoogdiercellen, etc. De keuze van het organisme hangt af van het doel wat wordt beoogd, bijv. grote schaal expressie (mg-gram) voor biocatalyse of kristallisatie, lage schaal expressie voor in vitro (geno)toxiciteit experimenten. Onderwijsvorm Aan de hand van een lijst van opdrachten zal een literatuurstudie worden uitgevoerd naar eigenschappen, expressie en mutagenese van een specifiek biotransformatie-enzym. Op verschillende momenten zal de voortgang worden besproken met de docenten. Toetsvorm Van de literatuurstudie wordt een rapport gemaakt, dat in een nabespreking mondeling dient te worden toegelicht. Aanbevolen voorkennis Dit vak borduurt voort op theorie die is behandeld in de cursus Biochemie (1e jaar) en de expressie-experimenten die zijn uitgevoerd in het Geintegreerde practicum (2e jaar). Ter ondersteuning van de literatuurstudie wordt aanbevolen het volgende boek aan te schaffen of te lenen: Primrose and Twyman, Principles of Gene Manipulation and Genomics 8th ed. Dit boek wordt later ook gebruikt voor het vak 'Chemistry of life' in de master Drug Discovery and Safety. Doelgroep 3F, 3S

Inleiding bioinformatica 1 Vakcode

X_401036 (401036)

Periode

Periode 3

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands


8-6-2012 - Pagina 48 van 88

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J. Heringa

Docent(en)

prof. dr. J. Heringa

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Literatuur Xiong, J., Essential Bioinformatics, Cambridge University Press, 2006, ISBN-13: 978-0521600828. Doelgroep 2MNW, 3F, Deficientiecursus voor mBio

Inleiding computergebruik Vakcode

X_000004 ()

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Integrated Practical Course Vakcode

X_430516 (430516)

Periode

Periode 5

Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)

dr. J.N.M. Commandeur, dr. J. Kool

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkcollege, Practicum

Doel vak Het verkrijgen van inzicht in de toepassing van biochemische, moleculair biologische, farmacologische/toxicologische en (bio)analytische technieken in (farmaco)chemisch onderzoek. Het ontwikkelen van praktische vaardigheden om deze technieken toe te passen in een geïntegreerd onderzoeksproject. Het leren mondeling en schriftelijk presenteren van verkregen onderzoeksresultaten. Onderwijsvorm Dit practicum heeft de opzet van een geïntegreerd onderzoeksproject en wordt afgesloten met een plenaire posterpresentatie. Literatuur Practicumhandleiding en aangeleverde literatuur. Doelgroep 2F, 2S


8-6-2012 - Pagina 49 van 88

Kernspinresonantie (NMR) Vakcode

X_435012 (435012)

Periode

Periode 2

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F.J.J. de Kanter

Docent(en)

dr. F.J.J. de Kanter

Lesmethode(n)

Werkcollege

Doel vak Het doel van deze cursus is om inzicht te verweven op het gebied van kernspinresonantie. Inhoud vak Tijdens het college zal ingegaan worden op een aantal theoretische aspecten van kernspinresonantie. Vanwege de belangrijke rol die NMR speelt bij structuurbepalingen van vaak zeer complexe verbindingen, staat dit aspect op de voorgrond. Interpretatie van NMR spectra zal worden geoefend tijdens werkcolleges. Onderwijsvorm Hoorcollege en werkcollege Toetsvorm De theorie en spectrum interpretatie worden getoetst door middel van een schriftelijk tentamen. Literatuur Collegedictaat.

Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie Vakcode

X_435026 (435026)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het introduceren van massaspectrometrische technieken die gebruikt kunnen worden voor de analyse van biologisch actieve verbindingen. Inhoud vak Massaspectrometrie is tegenwoordig de meest gebruikte methode om chemische verbindingen te karakteriseren, te identificeren en kwantitatief te bepalen. Allereerst zullen alle onderdelen van de verschillende typen massaspectrometers worden besproken, van massaspectometrie met de verschillende scheidingsmethoden. Tot slot zullen toepassingen aan de orde komen op het gebied van de bio-analyse, Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 50 van 88

metabolieten onderzoek, schreeningsmonitoringsprogramma's en karakteriseren en identificatie van complexe macro-moleculaire (bijv. eiwitten) systemen. Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk worden gevolgd. Literatuur Basisliteratuur en informatie van het internet. Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische chemie. Doelgroep 3F, 3S, 3MNW

Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken Vakcode

X_435028 (435028)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het doel is het verwerven van van theoretisch en/of praktisch inzicht aan de hand van een goed gedefinieerd bio-analytisch probleem. Inhoud vak De verschillende vormen van vloeistofchromatografie zijn tegenwooordig de meest gebruikte methoden om chemische verbindingen kwalitatief en/of kwantitatief te bepalen. Allereerst zullen de verschillende vormen van vloeistofchromatografie en de hierbij horende detectietechnieken worden besproken. Vervolgens zal uitgebreid worden inggegaan op de monstervoorbewerkingstechnieken die gebruikt kunnen worden. Tot slot zullen toepassingen aan de orde komen op het gebied van de bio-analyse, metabolieten onderzoek, screeningsmonitoringsprogramma's en karakteriseren en identificatie van complexe macro-moleculaire (bijv. eiwitten) systemen. Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk worden gevolgd. Literatuur Basisliteratuur en informatie van het internet. Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische chemie.


8-6-2012 - Pagina 51 van 88

Keuzevak Fysische Chemie Vakcode

X_430540 (430540)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.

Keuzevak Fysische Chemie Vakcode

X_430541 (430541)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction Vakcode

X_435032 (435032)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Doel vak Het introduceren van luminescentietechnieken die gebruikt kunnen worden voor de analyse van biologisch actieve verbindingen. Inhoud vak De onderwerpen die aan de orde komen omvatten de principes van fluorescentie, fosforescentie, lang-levende luminescentie, chemiluminescentie en bioluminescentie. Verder zal er aandacht worden besteed aan 'energy-transfer' mechanismen en andere processen die de luminescentie van organische processen beinvloeden. De mogelijkheden van het invoeren van luminescentie 'probes' en hoge resolutietechnieken zullen eveneens aan de orde komen. Tot slot zullen een aantal bio-analytische toepassingen worden besproken waarbij technieken als Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 52 van 88

laser fluorescentie en tijd-opgelost meten niet vergeten zullen worden. Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch gedeelte. Het theoretisch deel kan afzonderlijk gevolgd worden (zie de opmerking bij deze vakomschrijving). Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische en fysische chemie. Doelgroep 3F, 3S

Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction Vakcode

X_435033 (435033)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Doel vak Het introduceren van luminescentietechnieken die gebruikt kunnen worden voor de analyse van biologisch actieve verbindingen. Inhoud vak De onderwerpen die aan de orde komen omvatten de principes van fluorescentie, fosforescentie, lang-levende luminescentie, chemiluminescentie en bioluminescentie. Verder zal er aandacht worden besteed aan 'energy-transfer' mechanismen en andere processen die de luminescentie van organische processen beinvloeden. De mogelijkheden van het invoeren van luminescentie 'probes' en hoge resolutietechnieken zullen eveneens aan de orde komen. Tot slot zullen een aantal bio-analytische toepassingen worden besproken waarbij technieken als laser fluorescentie en tijd-opgelost meten niet vergeten zullen worden. Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch gedeelte. Het theoretisch deel kan afzonderlijk gevolgd worden (zie de opmerking bij deze vakomschrijving). Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische en fysische chemie. Doelgroep 3F, 3S

Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth. Vakcode

X_430542 (430542)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands


8-6-2012 - Pagina 53 van 88

Faculteit


Coördinator

dr. I.J.P. de Esch


Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth. Vakcode

X_430543 (430543)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. I.J.P. de Esch


Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. Vakcode

X_430544 (430544)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. I.J.P. de Esch


Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. Vakcode

X_430545 (430545)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. I.J.P. de Esch



8-6-2012 - Pagina 54 van 88

Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. Vakcode

X_430546 (430546)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in computersimulaties aan eiwitten. Inhoud vak Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen. Onderwijsvorm Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte literatuur, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart worden gebracht. Toetsvorm Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats. Literatuur Wordt beschikbaar gesteld door de docent. Aanbevolen voorkennis Dit vak bouwt verder op theorie die is behandeld in vakken als Moleculaire Modeling voor Farmacochemici (2F), en Computational (Pharmaco)Chemistry (3F en 3S). Doelgroep 3F

Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. Vakcode

X_430547 (430547)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



8-6-2012 - Pagina 55 van 88

Doel vak Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in computersimulaties aan eiwitten. Inhoud vak Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen. Onderwijsvorm Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte literatuur, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart worden gebracht. Toetsvorm Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats. Literatuur Wordt beschikbaar gesteld door de docent. Aanbevolen voorkennis Dit vak bouwt verder op theorie die is behandeld in vakken als Moleculaire Modeling voor Farmacochemici (2F), en Computational (Pharmaco)Chemistry (3F en 3S). Doelgroep 3F

Keuzevak Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm. Vakcode

X_430548 (430548)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak Biotransformatie, ook wel metabolisme genoemd, speelt een zeer belangrijke rol in de verwerking van geneesmiddelen door het lichaam. Aan de ene kant is biotransformatie vaak bepalend voor de halfwaardetijd waarmee een geneesmiddel wordt geëlimineerd vanuit het plasma. Aan de andere kant kunnen bij metabolisme reactieve metabolieten ontstaan die met cellulair materiaal reageren, zoals eiwitten, DNA of membranen. Het menselijke genoom codeert voor enkele honderden enzymen die in meer of mindere mate bij het metabolisme van geneesmiddelen betrokken kunnen zijn. Om de rol van de enzymen beter te kunnen bestuderen, zijn voor de belangrijkste biotransformatie-enzymen expressiesystemen ontwikkeld in verschillende Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 56 van 88

organismes, zoals Escherichia coli, gist, insectcellen, Salmonella typhimurium, zoogdiercellen, etc. De keuze van het organisme hangt af van het doel wat wordt beoogd, bijv. grote schaal expressie (mg-gram) voor biocatalyse of kristallisatie, lage schaal expressie voor in vitro (geno)toxiciteit experimenten. Overige informatie Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3 studiepunten (vakcode 430548) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430549).

Keuzevak Multidimensionale scheidingstechnieken Vakcode

X_435037 (435037)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het doel is het verwerven van theoretisch en/of praktisch inzicht aan de hand van een goed gedefinieerd complex analytisch probleem. Inhoud vak Het primaire doel is het introduceren van complexe analytische systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multidimensionale systemen en 'high-throughput' systemen zullen aan de orde komen. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende detectiesystemen (bijv. massaspectrometrie). Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk worden gevolgd. Literatuur Basisliteratuur en informatie van het internet. Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische chemie.

Keuzevak Spectroscopische detectieen identificatietechniek Vakcode

X_430568 ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese


8-6-2012 - Pagina 57 van 88

Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Keuzevak Spectroscopische detectieen identificatietechniek Vakcode

X_435039 (435039)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema uit het grote aanbod van spectroscopische detectieen identificatietechnieken. Inhoud vak Het ontwikkelen en testen van nieuwe spectroscopische technieken die voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name om laser detectiesystemen voor chromatografie of electroforese en om Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie sytemen voor de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen. Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch gedeelte. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk worden gevolgd. Het volgen van zowel het theoretisch deel als het praktisch deel levert 3 extra studiepunten op voor een totaal van 6 studiepunten. Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische en fysische chemie. Doelgroep 3F, 3MNW, 3S

Keuzevak Theoretische Chemie Vakcode

X_430538 (430538)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Keuzevak Theoretische Chemie Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 58 van 88

Vakcode

X_430539 (430539)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Levende chemie Vakcode

X_430569 ()

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. M.H. Siderius

Doel vak Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van deze ce gebruiken voor groei en deling, als ook basisprincipes van de moleculaire biologie van de levende cel, de manier waarop genetische informatie belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld. Inhoud vak Er wordt begonnen met het bespreken van de structurele en functionele opbouw van de levende cel, waarna de verschillende soorten (macro)moleculen die in de cel aanwezig zijn worden behandeld. Aandacht voor eiwitstructuur en functie, met name in het metabolisme (Enzym activiteit, Michaelis-Menten kinetiek, Allostere effecten). De afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen (koolhydraten en vetten) worden rudimentair besproken. Tevens de behandeling van de structuur en functie van DNA en de manier waarop DNA in de celkern is opgevouwen tot chromosomen en de aspecten van DNA replicatie en herstel. Onderwijsvorm Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen Toetsvorm Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw, bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie, genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en energiehuishouding aan de orde komen. Literatuur


8-6-2012 - Pagina 59 van 88

Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. Hoofdstukken 1 t/m 6, aangevuld met delen zoals aangegeven in de studiehandleiding Doelgroep 1F, 1MNW, 1S, 1-SBI, 1W-B, mBio

Lineaire algebra Vakcode

X_400302 (400302)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J.J. Dijkstra

Docent(en)

prof. dr. J.J. Dijkstra, dr. T. Bauer

Lesmethode(n)


Doel vak Leren omgaan met vectoren en matrices. Inhoud vak Aan de orde komen de volgende onderwerpen: stelsels lineaire vergelijkingen, vectorvoorstellingen van lijn en vlak, inproduct en uitproduct, matrices, determinanten, eigenwaarden en eigenvectoren, stelsels lineaire differentiaalvergelijkingen. Onderwijsvorm Hoorcollege en werkcollege. Er wordt wekelijks ook huiswerk opgegeven. Toetsvorm Schriftelijk tentamen. Literatuur Delen uit het boek: R.A. Adams, Calculus, a complete course, 6th ed of later, en materiaal dat door de docent wordt verstrekt. Doelgroep 1S, 1MNW, 2SBI

Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen Vakcode

X_420153 (420153)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen

Docent(en)

prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak


8-6-2012 - Pagina 60 van 88

De student beschikt over kennis en inzicht in de interacties tussen wetenschap en maatschappij. De student beschikt over kennis en inzicht in de dynamiek van wetenschap- en technologie ontwikkeling en de rol van sociale processen daarbij. De student beschikt over kennis en inzicht in moderne instrumenten zoals, technology assessment en interactief beleid etc om wetenschap in maatschappelijk gewenste richtingen te sturen. De student is in staat om een gefundeerd oordeel geven over maatschappelijke en ethische aspecten van wetenschap. De student is instaat om kritisch te reflecteren op zijn maatschappelijke verantwoordelijkheid als wetenschapper. Inhoud vak De cursus gaat in op de wisselwerking tussen wetenschap, technologie en samenleving. Aan de hand van concrete, actuele vraagstukken wordt eerst ingegaan op recente knelpunten, dilemma's en controverses in de relatie wetenschap-maatschappij. Daarna gaat de cursus in op diverse inzichten en instrumenten (`Technology Assessment'), ethische aspecten, interactief beleid en maatschappelijk verantwoord ondernemen, die van belang zijn bij het tot stand brengen van een pro-actieve oordeels en besluitvorming over W&S ontwikkelingen. Na het theoretische gedeelte van de cursus, schrijf je samen met een groepje studenten een essay. In dit essay reflecteer je op een actuele natuurwetenschappelijke ontwikkeling die belangrijke maatschappelijke consequenties met zich meebrengt. Onderwijsvorm Hoorcollege Toetsvorm Toets en schriftelijke rapportage met mondelinge presentatie.Voor beide onderdelen moet minimaal een voldoende gehaald worden. Literatuur Syllabus. Doelgroep 2F, 2MNW, 2N, 2S Overige informatie Alle studenten N, S, F en MNW moeten kiezen tussen Geschiedenis van de natuurwetenschappen en Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen. Inlichtingen bij Joske Bunders kamer U-552 de Boelelaan 1081, tel. (020) 598 7030. Inschrijven in TIS, https://tis.vu.nl/tis/menu is voor dit vak verplicht! Inschrijven is mogelijk tot 14 dagen voor aanvang van de cursus.

Macromoleculen Vakcode

X_435094 (435094)

Periode

Periode 6

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit



8-6-2012 - Pagina 61 van 88

Coördinator

dr. E. Ruijter

Doel vak Doel van deze cursus is het verkrijgen van een overzicht van verschillende klassen van natuurlijke en synthetische macromoleculen, hun structuur en eigenschappen en de relatie daartussen. Inhoud vak Met de opgedane kennis van o.a. Organische chemie I worden de eerste stappen in de wereld van de macromoleculen gezet. Aan de hand van enkele inleidende hoorcolleges worden de verschillende klassen van biologische en synthetische macromoleculen geïntroduceerd. Vervolgens werken de studenten in groepsverband aan een project waarin aan de hand van een opdracht o.a. de (bio)synthetische en structurele aspecten en chemische en fysische eigenschappen van een bepaalde klasse van macromoleculen wordt besproken. De projecten worden afgesloten met een presentatie. Tenslotte wordt de verworven kennis uit het college en de gezamenlijke projecten schriftelijk getoetst. Onderwijsvorm Hoor-/werkcollege + project Literatuur Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press, 2001. Aanbevolen voorkennis Organische chemie I Doelgroep 1S

Macromoleculen en katalyse Vakcode

X_435450 (435450)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Doel vak Het kennisnemen van en inzicht verkrijgen in enkele belangrijke aspecten (synthese, eigenschappen, toepassingen) van synthetische macromoleculen. Inhoud vak In deze cursus wordt kort stilgestaan bij natuurlijk voorkomende macromoleculen, maar de nadruk ligt op synthetische polymeren. Er wordt een overzicht gegeven van de syntheseroutes, eigenschappen, en toepassingen van verschillende klassen polymeren. Aan de orde komen begrippen als: additie-polymeren, condensatie-polymeren, radicaal polymerisaties, ionische polymerisaties, gekatalyseerde polymerisaties (Ziegler-Natta), cross-linking, thermoplastics, fibers, elastomeren, thermohardende harsen, kunststof recycling.


8-6-2012 - Pagina 62 van 88

Onderwijsvorm Na een beperkte introductie waarbij ook twee experimenten zullen worden uitgevoerd (polymerisatie en depolymerisatie) zullen de studenten zich de stof vooral eigen maken door een speciale studie te maken van een industrieel belangrijk polymeer, daarover een korte scriptie te schrijven en de inhoud hiervan te presenteren. Literatuur Clayden e.a., Organic Chemistry. Oxford: Oxford University Press, 2001. hoofdstuk 52 en aanvullend materiaal. Aanbevolen voorkennis Organische chemie I en II Doelgroep 3S, 3F

Mentoraat / Tutoraat Vakcode

X_000008 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Lesmethode(n)

Hoorcollege

Overige informatie Iedere eerstejaars student Business Analytics is verplicht deel te nemen aan het Eerstejaars mentoraat in periodes 1 en 2. Het met een voldoende afronden van het vak Wiskunde wereldwijd is alleen mogelijk indien is deelgenomen aan het Eerstejaars mentoraat.

Moleculaire quantummechanica Vakcode

X_430571 ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak • Het verkrijgen van inzicht in de beginselen van de quantummechanica. • De golffunctie en energie kunnen berekenen voor exact oplosbare modelsystemen • Het kunnen toepassen van kwalitatieve MO theorie voor eenvoudige verbindingen Inhoud vak De onderwerpen die behandeld zullen worden zijn: De principes van de quantummechanica, de Schrödinger vergelijking. Modelsystemen: vrij deeltje, deeltje in een doos, het waterstofatoom. Electronspin en het Pauli principe. Elektronenstructuur van atomen. Variatietheorema, Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 63 van 88

seculairvergelijking en chemische binding in twee-atomige moleculen. De toepassing van (kwalitatieve) MO-theorie op moleculaire structuur. De rol van kinetische en potentiële energie in de chemische binding. Onderwijsvorm Hoor-, en werkcolleges. Toetsvorm Schriftelijk tentamen Literatuur Collegedictaat. Ter aanvulling worden delen van Atkins' Physical Chemistry aangeraden. Aanbevolen voorkennis Chemische Binding. Lineaire algebra. Calculus 1 en 2. Doelgroep 2S

Natuurkunde en Wiskunde voor chemici 1 Vakcode

X_430572 ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. P. Gori Giorgi

Doel vak Het vertrouwd raken met een aantal wiskundige basisbegrippen en technieken (beginselen matrixrekening, complexe getallen, differentiëren, integreren, oplossen eenvoudige differentiaalvergelijkingen). Het toepassen daarvan en verkrijgen van inzicht in en kennis van basisbegrippen, concepten en toepassingen van de mechanica. Inhoud vak Functies, in het bijzonder het algebraïsch manipuleren hiermee. Differentiëren: begrip, Taylorbenaderingen. Matrixrekening: beginselen, voornamelijk in dimensie 2 en 3. Integreren: basistheorie. Differentiaalvergelijkingen: vergelijkingen van de eerste orde en tweedeorde met constante coëfficiënten. In een geïntegreerde aanpak worden deze wiskundige beginselen o.a, toegepast in klassieke mechanica. Hierbij worden beweging in ruimte en tijd (1, 2 en 3 dimensies); Positie, snelheid en versnelling; Eenparige lineaire en cirkelbeweging; Radiele en tangentiele versnelling bersproken. Daarnaast komen de bewegingsvergelijking en Krachten; Traagheid en massa; Wetten van Newton; Energie van een systeem. Arbeid, kinetische energie, potentiële energie; Conservatieve en niet conservatieve krachten; Evenwichten; Behoud van energie; Geïsoleerde en niet geïsoleerde systemen. Impuls en botsingen. Impuls en behoud van impuls; Stoot; Elastische en inelastische botsingen. Samengestelde systemen; Massamiddelpunt; Traagheidsmoment; Beweging van meer deeltjes systemen. Rotatie en krachtmoment. Impulsmoment. Impulsmoment van niet geïsoleerd systeem; Impulsmoment van star lichaam; Behoud van impulsmoment.


8-6-2012 - Pagina 64 van 88

Onderwijsvorm Gecombineerd hoorcollege en werkcollege Toetsvorm Schriftelijk tentamen. Literatuur Robert A. Adams, 'Calculus: A Complete Course Jan van de Craats en Rob Bosch, 'Basisboek Wiskunde'. Physics for Scientists and Engineers door John W. Jewett, Jr. en Raymond A. Serway Aanbevolen voorkennis VWO wiskunde B en aansluitmodule wiskunde, VWO natuurkunde Doelgroep 1S

Natuurkunde en wiskunde voor chemici 2 Vakcode

X_428005 ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak De cursus beschrijving is beschikbaar op: http://studiegids.uva.nl/web/uva/sgs/nl/c/12128.html Doelgroep 1S Overige informatie Inschrijving is verplicht via http://studieweb.student.uva.nl

Natuurstoffen Vakcode

X_435440 (435440)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. E. Ruijter

Doel vak Doel van deze cursus is het verkrijgen van een overzicht over de structuur, eigenschappen en reacties van de verschillende hoofdklassen van natuurstoffen. Inhoud vak Aansluitend op de basiskennis organische chemie en biochemie worden in deze cursus een aantal aspecten van de natuurstofchemie behandeld. De Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 65 van 88

biologische activiteit van vele natuurstoffen hangt nauw samen met hun unieke en diverse structuren. De structurele kenmerken en biosynthetische aspecten van o.a. polyketiden, suikers, peptiden, terpenen en steroïden, alkaloïden en flavonoïden zijn de hoofdthema's van deze cursus. Hun specifieke rol in de natuur en een aantal specifieke fysische en chemische eigenschappen zullen worden behandeld. Onderwijsvorm Tutorial. Literatuur Dewick, P.M., Medicinal Natural Products 3rd ed, Wiley-VCH, 2009. Aanbevolen voorkennis Organische Chemie I en II, Biochemie (aangeraden: Organische Chemie III) Doelgroep 3F, 3S

Nuclear Chemistry Vakcode

X_430558 (430558)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak De mogelijkheden én problemen van het gebruik van kernenergie vanuit een chemisch perspectief kritisch beschouwen. Onderwijsvorm Colleges, (groeps)opdrachten. Toetsvorm Schriftelijk tentamen en verslagen van de gemaakte opdrachten. Literatuur Bryan, J.C., Introduction to Nuclear Science. CRC Press, 2009 (ISBN 978-1-4200-6164-2). Het hoorcollege maakt gebruik van delen van dit boek. Aanbevolen voorkennis Chemie op 2e jaars niveau.

Open House Analytical Chemistry and applied Spectroscopy Vakcode

X_000009 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands


8-6-2012 - Pagina 66 van 88

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Docent(en)

dr. H. Lingeman

Lesmethode(n)

Bijeenkomst

Open house Chemical Biology Vakcode

X_000010 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. M.H. Siderius

Docent(en)

dr. M.H. Siderius

Lesmethode(n)

Bijeenkomst

Open House Comp. Med. Chem. & Tox. Vakcode

X_000011 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. B.C. Oostenbrink

Docent(en)

dr. B.C. Oostenbrink

Lesmethode(n)

Bijeenkomst

Open House DDS Vakcode

X_000012 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. I.J.P. de Esch

Docent(en)

dr. I.J.P. de Esch

Lesmethode(n)

Bijeenkomst

Open House Organic and Anorganic Chemistry Vakcode

X_000015 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands


8-6-2012 - Pagina 67 van 88

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)

Bijeenkomst

Open House Physical Chemistry Vakcode

X_000016 ()

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Lesmethode(n)

Bijeenkomst

Open House Theoretical Chemistry Vakcode

X_000017 ()

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Organische chemie 1 Vakcode

X_435091 (435091)

Periode

Periode 5

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)


Literatuur Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press, 2001 (ISBN 019850346).

Organische chemie 2 Vakcode

X_435007 (435007)

Periode

Periode 1

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)



8-6-2012 - Pagina 68 van 88

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Het college beoogt het aanleren van basiskennis organische chemie. Inhoud vak Dit college vormt één geheel met het eerstejaarscollege. Het zet voort met de presentatie van specifieke reactietypen, nu eens niet georganiseerd naar functionele groepen, maar rondom een gemeenschappelijk mechanisme: nucleofiele substituties, eliminaties, addities aan meervoudige koolstof-koolstofbindingen, electrofiele aromatische substituties, addities en substitutie aan carbonylgroepen, omleggingen. Eveneens wordt aandacht besteed aan syntheseplanning. Onderwijsvorm Hoorcollege 16 uur; werkcollege 9 uur. Aanbevolen voorkennis Organische chemie I Doelgroep 2S, 2F

Organische chemie 3: moderne organische synthese Vakcode

X_435109 (435109)

Periode

Periode 3

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Docent(en)

prof. dr. ir. R.V.A. Orru, dr. E. Ruijter

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Uitbreiden van de basiskennis organische chemie en organische synthese. Inhoud vak Dit vak bouwt voort op de colleges organische chemie I en II en het practicum organische synthese. Er zal ruim aandacht worden besteed aan nieuwe ontwikkelingen in de organische synthese. Zo worden de basisprincipes van de combinatoriële chemie, solution en solid phase, diversity oriented benaderingen besproken, maar ook moderne parallelle synthese technieken, automatische opzuiveringstechnieken en database gestuurde synthese planning komen aan bod. Verder wordt het rationeel (computer ondersteund) ontwerpen van complexe syntheses besproken. Ook komen onderwerpen als asymmetrische katalyse, omleggings-, cycloadditie- en radicaalreacties aan bod. Onderwijsvorm Werkcolleges/opdrachten Toetsvorm Opdracht


8-6-2012 - Pagina 69 van 88

Literatuur Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press, 2001 (ISBN 019850346). Aanbevolen voorkennis Organische chemie I en II. Doelgroep 3F, 3S, mi-MC, mi-AMC

Organische en anorganische chemie Vakcode

X_430573 ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Inzicht verkrijgen in de relatie tussen de structuur en eigenschappen van moleculen en kennis verkrijgen van de belangrijkste begrippen van de organische en anorganische chemie. Inhoud vak Het onderdeel Organische Chemie concentreert zich op de driedimensionale structuur van diverse functionele groepen en op de relatie tussen structuur en reactiviteit. Voortbouwend op de kennis van atoom en molecuulbouw en de MO-theorie komen aspecten van structuur aan de orde: de structuur van alkanen, cycloalkanen, alkenen en alkynen, hybridisatie, conformatie-analyse, reactieve deeltjes, nomenclatuur, stereochemie, chiraliteit, resonantie, aromaticiteit, en reactietypen zoals substituties en eliminaties. In het college is ruim plaats voor het verwerken van de leerstof door het maken van vraagstukken en het oefenen met molecuulmodellen. Deze vraagstukken vormen zowel de intermezzo's in het hoorcollege als het hoofdbestanddeel van opdrachten uit de studiehandleiding, die tijdens werkcollege-uren worden besproken. Bij het onderdeel Anorganische Chemie Periodiek komen de volgende onderdelen aan bod: systeem der elementen (eigenschappen van hoofdgroepelementen), atoomstructuur, moleculaire structuur, geometrie, structuur van en binding in vaste stoffen (metalen, covalente en ionogene roosterverbindingen) kristalveld, ligandveld, valence bond and molecular orbital benaderingen, coördinatie- en organometaalchemie, klassen verbindingen, homogene katalyse. Onderwijsvorm Hoor- en werkcolleges Toetsvorm Schriftelijk tentamen en deeltoetsen Literatuur Chemistry 4/E, Catherine E. Housecroft & Edwin Constable, ISBN-10: 0273733087, ISBN-13: 9780273733089


8-6-2012 - Pagina 70 van 88

Aanbevolen voorkennis van Atoom tot (bio)molecuul (VU), Why Chemical Reactions Happen (VU), Bouwstenen van de chemie (UvA), Chemische reactiviteit van biomoleculen (UvA) Doelgroep 1S Overige informatie Dit vak is onderdeel van het thema “Energie en Duurzaamheid”. Al Gore won in 2006 een Oscar voor zijn documentaire “An Inconvenient Truth”. Sinsdien zijn broeikasgassen, de opwarming van de aarde en een duurzame ontwikkeling van onze high-tech westerse maatschappij thema’s die hoog op de politieke en sociaal-economische agenda’s staan. Energie-, afvalen grondstoffenproblematiek vormen dan ook een van de grootste uitdagingen voor de chemische wetenschappen. Het thema energie en duurzaamheid neemt dan ook een sleutelpositie in het curriculum en richt zich op het verkrijgen kennis om de verduurzaming van de chemie mogelijk te maken. Dit vak wordt gedoceerd door de VU docenten: Prof. dr. R.V.A. Orru, Dr. E. Ruijter en door de UvA docenten: Prof.dr. J.N.H. Reek en Prof.dr. C.J. Elsevier.

Organometaalchemie Vakcode

X_435018 (435018)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. A.W. Ehlers

Doel vak Het doel van dit college is het verdiepen van de basiskennis op het gebied van coordinatiechemie en de organometaalchemie. Inhoud vak Er wordt aandacht besteed aan de volgende onderwerpen: - organometaalchemie van overgangsmetalen - organometaalcomplexen en organische synthese - homogene katalyse - bio-anorganische chemie (metallo-enzymen, biomimetica). Onderwijsvorm Zelfstudie. Literatuur Elschenbroich, C., Organometallics 3rd ed. Weinheim: Wiley-VCH. of in overleg met de docent. Doelgroep 3S, 3F

Oriëntatie op de M-variant Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 71 van 88

Vakcode

X_400375 (400375)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Docent(en)

A. van Luijn MSc

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak - Het verwerven van kennis en inzicht in de met name in beleidsprocessen, beleidstheorie en beleidsanalyse; - Het verwerven van kennis en inzicht in de structuur en het beleid van de Nederlandse overheid met name op het gebied van wetenschap; - Het verwerven van kennis en inzicht in managementprocessen en -theorieën, met specifieke aandacht voor kennismanagement en projectmanagement; - De student is instaat om beleid te analyseren en beleidsopties te identificeren; - De student is instaat tot projectmatig werken in teamverband; - De student beschikt over vaardigheden, zoals onderzoeksopzet maken, literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk en mondeling presenteren; - Oriëntatie op de M-variant, dan wel de masters Management, Policy-Analysis and Entrepreneurship. Inhoud vak Beleid speelt op vele manieren en niveaus een rol in onze samenleving. Ook binnen de wetenschap heb je eigenlijk altijd met beleid te maken. Enerzijds speelt beleid een rol bij het stimuleren en/of reguleren van wetenschappelijk onderzoek. Anderzijds wordt wetenschap ingezet om beleid rondom een maatschappelijk probleem te ondersteunen of te adviseren. Ook management speelt in allerlei situaties en op allerlei niveaus een rol. Zo wordt wetenschappelijk onderzoek altijd intern aangestuurd door het management of direct door het hoofd van de afdeling, maar ook meer indirect door het faculteitsbestuur en College van Bestuur. Ook al lijken beleid en management veelal ad hoc vorm gegeven te worden, toch zijn er structurele processen en ordenende principes aan te wijzen. Inzicht in deze processen en principes maakt dat je begrijpt waarom bepaalde keuzes gemaakt worden en bijvoorbeeld waarom beleid er uitziet zoals het in een beleidsnota geformuleerd wordt. In het eerste deel van deze cursus krijg je colleges over diverse beleids- en managementaspecten geïllustreerd aan de hand van praktische casussen. Dit deel wordt afgesloten met een tentamen. Het tweede deel van de cursus bestaat uit een projectopdracht waarin de analyse van een actueel, maatschappelijk en natuurwetenschappelijk vraagstuk in relatie tot (overheids)beleid centraal staat. Voorbeelden zijn nanotechnologie, Q- koorts, orgaandonatie of biobrandstof. De nadruk ligt hierbij op zelfwerkzaamheid, eigen initiatief en oordeelsvorming en op het werken in teamverband. Wij willen daarmee een leersituatie creëren die nauw aansluit bij de praktijk van beleidsmatig onderzoek en projectmatig werken. De problematiek en de verschillende beleidsopties rond dit vraagstuk worden kritisch geanalyseerd. De resultaten, conclusies en aanbevelingen worden weergegeven in een beleidsadviesrapport dat aan het eind van de cursus mondeling Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 72 van 88

gepresenteerd wordt. Onderwijsvorm De eerste helft van de cursus zal bestaan uit werkcolleges, de tweede helft uit het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband. Literatuur Informatie over literatuur wordt via Blackboard verstrekt. Doelgroep Derdejaars FEW-studenten. Overige informatie Onderdeel van de M-oriëntatie.

Oriëntatie science educatie Vakcode

O_ORIBETA (991010)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Coördinator

ir. J.G. Schoonhoven

Doel vak Voor een student die deze cursus heeft doorlopen geldt: de student is bereid en in staat te reflecteren op zijn/haar functioneren, de student is in staat om aan te geven wat het betekent om een goede docent in de bovenbouw te zijn, de student is in staat om zijn eigen geschiktheid voor het beroep van docent te beoordelen, de student kan aangeven of het beroep van docent iets voor hem/haar is, de student verwerft een aantal communicatieve en didactische vaardigheden.

Inhoud vak De cursus bestaat de eerste week uit diverse werkcolleges, de volgende drie weken uit een stage op een school voor voortgezet onderwijs. elke week is er een praktijkbespreking en verdieping op de VU. De stage is het belangrijkste onderdeel van de cursus, deze voer je uit samen met een medestudent. In totaal zal de stage ongeveer twaalf dagen in beslag nemen. Tijdens de werkcolleges komen de volgende onderwerpen aan de orde: Hoe bouw je een presentatie op, hoe kom je over. Hoe vertaal je (wetenschappelijke) informatie naar het niveau van je doelgroep. Wat doet een (goede) leraar allemaal. Wat is het verschil tussen presenteren en onderwijzen. Welke kenmerken heeft de doelgroep en hoe kun je daar rekening mee houden. Hoe ontwerp je een (activerende) les. Hoe krijg je je doelgroep actief. Met welke communicatieve aspecten in de klas moet je rekening houden. Tijdens de stage onderneem je de volgende activiteiten: observeren van lessen;


8-6-2012 - Pagina 73 van 88

zelf minimaal vier lessen geven, in zowel onderbouw als bovenbouw; uitvoeren van een klein onderzoek; zo veel mogelijk deelnemen aan alle activiteiten op school en zo (hernieuwd) kennis maken met het voortgezet onderwijs vanuit het docenten perspectief.

Onderwijsvorm Je levert aan het eind van de cursus een verslag in. Het verslag is een samenhangend verhaal dat een beeld geeft van jouw leerproces tijdens de cursus. Met je verslag laat je zien waar je staat als mogelijk toekomstig docent. Het gaat primair om het zichtbaar maken van je ontwikkeling, niet noodzakelijk om te bewijzen dat je een goede docent bent. Werkcolleges en stage vormen samen een voltijds programma, het is niet mogelijk gelijktijdig andere colleges te volgen. Doelgroep Deelname aan de cursus staat open voor derdejaars bachelorstudenten van de faculteiten Exacte Wetenschappen en Aard- en Levenswetenschappen. De cursus wordt aangeraden voor studenten die overwegen de lerarenopleiding te gaan volgen binnen de masteropleiding (E- variant) of aansluitend op hun masteropleiding. Ook voor studenten die vaardigheden op willen doen in het verzorgen van wetenschappelijke presentaties is de cursus interessant. Overige informatie Meer informatie is te verkrijgbaar bij Arjan Schooonhoven: a.schoonhoven@ond. vu. nl, of te vinden op www.onderwijscentrum.vu.nl

Practicum Analytische chemie Vakcode

X_435083 (435083)

Periode

Periode 6

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J. Kool

Doel vak Het doel is het aanleren van de basisprincipes van de analytische chemie en het leren opzetten en uitvoeren van analytisch-chemische experimenten. Inhoud vak Dit betekent dat allereerst de, uit analytisch oogpunt belangrijke, fysisch-chemische eigenschappen van de te onderzoeken verbindingen bestudeerd zullen worden. Vervolgens worden de analytisch-chemische technieken opgezocht waarmee deze verbindingen bepaald kunnen worden, waarna een analysevoorschrift wordt opgesteld. Hierna worden de bepalingen uitgevoerd en worden de resultaten in een verslag weergegeven. De noodzakelijke theoretische achtergrond wordt gegeven in de vorm van werken instructiecolleges. Onderwijsvorm Het practicum wordt uitgevoerd als projectmatig onderwijs, waarbij de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke gegevens, de Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 74 van 88

theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken en het experiment zelf vormgeven. Literatuur Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de opdrachten te kunnen uitvoeren. Doelgroep 1S

Practicum Anorganische chemie Vakcode

X_435089 (435089)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. A.W. Ehlers

Docent(en)

dr. A.W. Ehlers

Lesmethode(n)


Doel vak Het doel van het practicum is de student vaardigheid bij te brengen in de preparatieve anorganische chemie en een beeld te geven hoe de anorganisch chemicus zijn experimentele resultaten verkrijgt. Inhoud vak Tijdens dit practicum ligt aanvankelijk het accent op het aanleren van een aantal basale identificatietechnieken. Vervolgens worden tijdens een aantal eenstapssyntheses een aantal, isolatie- en zuiveringstechnieken zoals kristalliseren of sublimeren geleerd. De syntheses worden deels op macroschaal (2-10 g) en deels op microschaal (50-100 mg) uitgevoerd. Later worden enkele meerstapssyntheses uitgevoerd, waarbij het van belang is elk tussenproduct goed te zuiveren en te karakteriseren. De meeste experimenten kennen een 'probleem-oplossende' aanpak, waarbij aandacht wordt besteed aan onderzoeksmethodiek. Onderwijsvorm De student werkt individueel binnen een groep o.l.v. een assistent. Toetsvorm Er is geen eindtoetsing. Tijdens het practicum beoordeelt de assistent experimentele vaardigheid, zelfstandigheid, theoretische voorbereiding en verslag. Literatuur Wordt via Blackboard bekend gemaakt. Doelgroep 1S

Practicum energie en duurzaamheid Vakcode Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

X_430574 () 8-6-2012 - Pagina 75 van 88

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Practicum Moderne synthetische methoden Vakcode

X_435016 (435016)

Periode


Credits

9.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. E. Ruijter

Doel vak Kennismaken met nieuwste experimentele ontwikkelingen in de organische synthese. Inhoud vak In dit vak maak je kennis met de nieuwste experimentele technieken in de organische synthese. Je gaat werken aan een project dat direct met lopend onderzoek verknoopt is. Parallelle synthese methodiek met behulp van semi-automatische apparatuur wordt toegepast in combinatie met parallelle opwerkingstechnieken m.b.v. indampmodules en automatische kolomchromatografie. Ook leer je syntheses en zuiveringen absoluut water- en zuurstofvrij uitvoeren d.m.v. Schlenk-technieken en het werken met een glovebox. Onderwijsvorm Practicumproject Literatuur Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press (ISBN 019850346). Aanbevolen voorkennis Organische chemie I & II, practicum organische synthese, kernspinresonantie (NMR). Doelgroep 3S, 3F

Practicum van Atoom tot (Bio)molecuul Vakcode

X_430575 ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Docent(en)

dr. J.C. Slootweg

Lesmethode(n)



8-6-2012 - Pagina 76 van 88

Doel vak Het aanleren van basisvaardigheden die nodig zijn voor het uitvoeren van experimenten alsmede de kennismaking met (experimentele) technieken/methoden in de verschillende chemische richtingen. Inhoud vak Op het practicum worden enkele experimenten/projecten uitgevoerd waarin een aantal basisvaardigheden wordt geoefend. Deze vaardigheden worden daarna gebruikt bij het uitvoeren van (onderzoeks)projecten later in het curriculum. Die vaardigheden betreffen o.a. het bestuderen van de theorie, literatuuronderzoek, definiëren van een hypothese, opstellen van een plan van aanpak, ontwerpen van een experiment, uitvoeren van het experiment, bijhouden van een labjournaal, kritische beoordeling van de resultaten, alsmede mondelinge en schriftelijke rapportage. Tijdens het practicum van Atoom tot (Bio)molecuul zullen de studenten organische en anorganische experimenten uitvoeren waarbij ze leren destilleren, (her) kristalliseren, sublimeren, analyseren (NMR, IR, m.p., event. optische rotatie), tevens zullen de studenten biochemische experimenten doen waarbij de volgende aspecten aan bod komen: enzym kinetiek (ijklijnen), eiwit scheiding en detectie, analyse mutanten en biotechnologie. Onderwijsvorm Het practicum van Atoom tot (Bio)molecuul wordt zo uitgevoerd dat de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke gegevens, de theoretische achtergrond en de voorschriften kan opzoeken en zo het experiment zelf kan vormgeven. Toetsvorm handvaardigheid, voorbereiding, mondelinge en schriftelijke communicatie. Literatuur Practicumhandleiding Practicum van Atoom tot (Bio)molecuul Doelgroep 1S, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI Overige informatie Dit vak is onderdeel van het thema “van Atoom tot Biomolecuul”. Chemie is de wetenschap van stoffen, hun structuur en eigenschappen, en met name hun omzetting via chemische reacties. Binnen de natuurwetenschappen neemt de chemie een centrale plaats in en heeft vele raakvlakken met de andere disciplines, van de fysica tot en met de biologie. Daarmee is chemie een toonbeeld van een multidisciplinaire wetenschap. Het thema van deze periode, "Van Atoom tot Biomolecuul", accentueert dit aspect en plaatst zodoende de chemie in de context van de verschillende natuurwetenschappen. Studenten 1IDS volgen het vak Practicum van atoom tot (bio) molecuul X_ 430575 alleen in periode 1, maar staan ingeschreven bij X_430596 en daar wordt ook het cijfer op gegeven.

Principes van chemische reactiviteit Vakcode

X_430576 ()

Credits

3.0


8-6-2012 - Pagina 77 van 88

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het doel van het college is - in nauwe aansluiting met het voorafgaande college Algemene - nader in te gaan op de quantummechanische beschrijving van moleculen en de basis te leggen voor de beantwoording van de vraag waarom en wanneer chemische reacties plaatsvinden. Veel aandacht wordt besteed aan evenwichtsconstanten in relatie tot de tweede hoofdwet van de thermodynamica. Inhoud vak Molecular orbitals voor homo- en hetero-tweeatomige moleculen; elektronenverdeling in grotere moleculen; een aantal basale chemische reacties; chemische evenwichten; reactiesnelheden; binding in geconjugeerde systemen. Onderwijsvorm Gecombineerd hoorcollege en werkcollege, practicum Toetsvorm schriftelijk tentamen, herkansing mogelijk mondeling Literatuur Keeler, J., and Wothers, P., Why Chemical Reactions Happen, New York: Oxford University Press, 2003 (ISBN 0-19-924-9733). Housecraft, C. E. and Constable E. C., Chemistry, Pearson, 4th Ed. (ISBN 978-0-273-71545-0) Doelgroep 1S, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI Overige informatie Periode 3 voor 1e jrs Scheikunde, 1e jrs IDS Periode 4 voor 1e jaars FAR

Programmeren Vakcode

X_435003 (435003)

Periode

Periode 3+4

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)


Literatuur Etter, D.M., Engineering Problem Solving with C++ 2nd ed. New Jersey: Prentice Hall, 2008. Doelgroep


8-6-2012 - Pagina 78 van 88

2S

Project Katalyse Vakcode

X_435102 (435102)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Docent(en)

dr. J.C. Slootweg

Lesmethode(n)


Doel vak Het verwerven van theoretisch inzicht in fundamentele concepten van homogene, heterogene en biokatalyse, alsmede het verkrijgen van een overzicht van de ontwikkelingsstrategieën van nieuwe katalysatoren en katalytische processen. Inhoud vak Tijdens de inleidende hoorcolleges wordt een breed spectrum van katalytische reacties belicht met aandacht voor de moleculaire benadering, mechanistische aspecten en fundamentele reactiestappen, de kinetica, de invloeden van de katalysator structuur op activiteit, selectiviteit en stabiliteit, katalysatorbereiding en karakterisering. Aandacht wordt besteed aan de rol van organometaalcomplexen, metalen op drager en (metallo)enzymen bij toepassingen in het laboratorium en de industrie. Ook krijgt het gebruik van computermodellen om katalytische reacties te begrijpen en om nieuwe katalysatoren te vinden speciale aandacht. Na deze theoretische inleiding wordt in teamverband gewerkt aan een uitgebreide opdracht waarin een bepaalde katalysator of gekatalyseerde reactie centraal staat. De nadruk ligt op de moleculaire principes die hieraan ten grondslag liggen, waarbij de werking, eigenschappen en toepassing in de industriële praktijk zullen worden belicht. Een bedrijfsbezoek aan Thermphos B.V. zal deze industriële aspecten illustreren. Onderwijsvorm College met werkcollege aangevuld met een excursie, uitvoeren van een projectopdracht in teamverband. Literatuur Rothenberg, G., Catalysis: Concepts and Green Applications, Wiley-VCH, 2008 (ISBN 978-3-527-31824-7). en aanvullend materiaal. Aanbevolen voorkennis Organische Chemie I en II en Anorganische Chemie I en II. Doelgroep 2S

Spectroscopie Vakcode


X_435064 (435064)

8-6-2012 - Pagina 79 van 88

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Docent(en)

dr. F. Ariese

Lesmethode(n)

Werkcollege

Doel vak Het doel van deze cursus is om inzicht en praktische vaardigheden te verwerven op het gebied van optische moleculaire (laser)spectroscopie. Inhoud vak De achtergronden van de verschillende spectroscopische technieken worden behandeld, waarbij verbanden worden gelegd met fundamentele fysisch-chemische eigenschappen van moleculen. De volgende technieken zullen aan bod komen: UV-Vis absorptiespectroscopie, vibratiespectroscopie (infrarood en Raman), fluorescentiespectroscopie, en laserspectroscopische technieken in de gas- en de gecondenseerde fase. Toepassingen van de diverse technieken binnen het huidige scheikundige onderzoek zullen tijdens het college en practicum aan bod komen. Spectroscopische berekeningen en interpretatie van spectra zullen worden geoefend tijdens werkcolleges. Het practicum wordt afgesloten met een symposium waar de resultaten worden gepresenteerd en besproken aan de hand van voordrachten en posters. Onderwijsvorm Hoorcollege, werkcollege en practicum. Literatuur Harris, D.C. Quantitative Chemical Analysis. Achtergrondkennis, hoeft niet apart te worden aangeschaft. Van Hecke, G.R., and Karukstis, K.K., A Guide to Lasers in Chemistry. Collegedictaat.

Structuurbiologie Vakcode

X_430080 (430080)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. D.P. Geerke

Docent(en)

dr. D.P. Geerke

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Het verkrijgen van inzicht in de moleculaire elementen die de basis vormen van de structuur en functie van biomoleculen. Tevens, het opdoen van kennis over de methoden die gebruikt worden om de structuur en functie van eiwitten te analyseren.


8-6-2012 - Pagina 80 van 88

Onderwijsvorm Hoorcolleges, zelfstudie, opdrachten. Literatuur Branden, C., and Tooze, J., Introduction to Protein Structure, Garland, 1999.

Studie en loopbaan Vakcode

X_000018 ()

Periode


Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

drs. M. Touwen

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Overige informatie In periode 1 voor 3F en 3S, in periode 5 voor 2F en 2S.

Synthese practicum Vakcode

X_435192 (435192)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Docent(en)

dr. J.C. Slootweg

Lesmethode(n)


Doel vak Het doel van het practicum is de student vaardigheid bij te brengen in de preparatieve organische en (in mindere mate) anorganische chemie, alsook een beeld te geven hoe de (an)organisch chemicus zijn experimentele resultaten verkrijgt. Inhoud vak Tijdens dit practicum ligt aanvankelijk het accent op het aanleren van een aantal basale isolatie- en zuiveringstechnieken zoals kristalliseren, destilleren, sublimeren, extraheren, chromatografie (GLC, kolomchromatografie). Deze technieken worden geleerd tijdens een aantal eenstapssyntheses, die tevens de collegestof illustreren. De syntheses worden deels op macroschaal (2-10 g) en deels op microschaal (50-100 mg) uitgevoerd. In de eerste periode wordt tevens het werkcollege spectroscopische technieken gegeven, ten behoeve van de interpretatie van de in de loop van het practicum op te nemen IR, UV, NMR, en ook massaspectra. Later worden enkele meerstapssyntheses uitgevoerd, waarbij het van belang is elk tussenproduct goed te zuiveren en te karakteriseren. De meeste experimenten kennen een 'probleem-oplossende' aanpak, waarbij aandacht wordt besteed aan onderzoeksmethodiek.


8-6-2012 - Pagina 81 van 88

Onderwijsvorm De student werkt individueel binnen een groep o.l.v. een assistent. Literatuur Lehman, J.W., Multiscale Operational Organic Chemistry 2nd ed, New Jersey: Prentice Hall, 2009. Aanbevolen voorkennis Organische chemie 1 en 2. Doelgroep 2S, 2F

Theoretische chemie I Vakcode

X_435194 (435194)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. E.J. Baerends

Doel vak Verkrijgen van inzicht in de theorie van de moleculaire kwantummechanica. Inhoud vak De collegestof van Theoretische Chemie I (en II) is neergelegd in een dictaat dat bij de VU-boekhandel aangeschaft moet worden. Delen uit P. Atkins, Physical Chemistry vormen een aanvulling daarop (Engel en Reid, Physical Chemistry kan ook dienen). De onderwerpen die behandeld zullen worden zijn: principes van de quantummechanica, Schrödinger vegelijking voor de golffunctie en eerste toepassingen daarvan. Onderwijsvorm Hoorcollege 16 uur; werkcollege 16 uur. Literatuur Collegedictaat. Ook wordt gebruikt: Atkins' Physical Chemistry of (naar eigen keuze) Engel and Reid's Physical Chemistry. Doelgroep 2S

Theoretische chemie II Vakcode

X_435195 (435195)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



8-6-2012 - Pagina 82 van 88

Doel vak Verkrijgen van inzicht in de theorie van de moleculaire quantummechanica. Inhoud vak De collegestof van Theoretische Chemie II (en I) is neergelegd in een dictaat dat bij de VU-boekhandel aangeschaft moet worden. Delen uit P. Atkins, Physical Chemistry vormen een aanvulling daarop (Engel en Reid, Physical Chemistry kan ook dienen). De onderwerpen die behandeld zullen worden zijn: De elektronenstructuur van atomen. Variatietheorema, seculairvergelijking en chemische binding in twee-atomige moleculen. De toepassing van (kwalitatieve) MO-theorie op moleculaire structuur. Tenslotte de rol van kinetische en potentiële energie in de chemische binding. Onderwijsvorm Hoorcollege 16 uur; werkcollege 16 uur. Literatuur Collegedictaat. Ook wordt gebruikt: Atkins' Physical Chemistry of (naar eigen keuze) Engel and Reid's Physical Chemistry. Doelgroep 2S

Theoretische chemie III Vakcode

X_435196 (435196)

Periode

Periode 1

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)


Doel vak Verkrijgen van inzicht in de theorie van de chemische binding. Inhoud vak De collegestof van Theoretische Chemie 3 is neergelegd in een dictaat. Delen uit Atkins, Physical chemistry, vormen een aanvulling daarop. De onderwerpen die zullen worden behandeld zijn tweeatomige systemen, molecuulspectra en molecuulsymmetrie, meer-atomige moleculen, elektrontheorie en reacties. Onderwijsvorm Hoorcollege 16 uur; werkcollege 14 uur. Literatuur Atkins, P., and De Paula, J., Atkins' Physical Chemistry 7th ed, Oxford: Oxford University Press. Collegedictaat. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 83 van 88

Aanbevolen voorkennis Moleculaire Quantummechanica (voor 3S), Molecular Modelling (voor 3F)

Thermodynamica Vakcode

X_435203 (435203)

Periode

Periode 1

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. G. van der Zwan

Docent(en)

dr. G. van der Zwan

Lesmethode(n)


Doel vak Leren toepassen van thermodynamica op chemische processen. Inhoud vak Het eerste deel van het college zal bestaan uit het bestuderen van warmte en arbeid, de afleiding van de grootheid entropie en het bepalen van de richting van spontane processen. Nieuwe grootheden als enthalpie en vrije energie zullen worden ingevoerd, en de toepassing van de twee hoofdwetten van de thermodynamica (je kan geen energie uit niets maken, en warmte stroomt spontaan van warm naar koud) op chemische processen zal vervolgens aan de orde komen. Chemisch evenwicht, en effecten van druk en temperatuur daarop kunnen dan effectief worden bestudeerd. Toepassing van de thermodynamica op redox reacties, de wet van Nernst en de electrochemische cel vormen het laatste onderdeel van dit college. Onderwijsvorm Hoor- en werkcolleges. Literatuur Atkins, P., and De Paula, J., Physical Chemistry 8th ed, Part 1, Oxford: Oxford University Press. Doelgroep 2S, 2MNW

Van atoom tot (bio)molecuul Vakcode

X_430580 ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. F. Bickelhaupt

Doel vak Dit vak beoogt de bouwstenen aan te dragen waarop alle chemische disciplines rusten en zodoende een solide fundament voor de gehele Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 84 van 88

hierop volgende studie te leggen. Tegelijkertijd wordt ernaar gestreefd de scheikunde in de context van andere natuurwetenschappen te plaatsen (thema "Van Atoom tot Biomolecuul") alsmede haar relevantie voor het verschijnsel leven duidelijk te maken (thema "Levende Chemie"). Inhoud vak Chemie is de wetenschap van stoffen, hun structuur en eigenschappen, en met name hun omzetting via chemische reacties. Binnen de natuurwetenschappen neemt de chemie een centrale plaats in en heeft vele raakvlakken met de andere disciplines, van de fysica tot en met de biologie. Binnen het thema "Van Atoom tot Biomolecuul" (periode 1) wordt het multidisciplinaire karakter geaccentueerd door het behandelen van fundamentele scheikundige begrippen die relevant zijn in de context van de verschillende natuurwetenschappen. In dit kader zullen o.a. aan bod komen: “evenwichten”, “pH berekeningen”, “oplosbaarheid”, “oxidatietoestand” en “redoxchemie”. Bij de overgang naar het thema "Levende Chemie" (periode 2) verschuift het zwaartepunt van het vak "Van Atoom tot Biomolecuul" naar complexere aspecten van de scheikunde, beginnend bij de fysische en anorganische chemie via de (metaal)organische chemie tot aan de biologische chemie. De volgende onderwerpen worden in dit kader behandeld: "alles is chemie", "atomen en het periodieke systeem", "moleculaire structuur", "electronische structuur en chemische binding", "chemische reacties", "thermodynamica", "kinetiek", "inleiding organische chemie", "inleiding biochemie", "zelf gegevens opzoeken in de chemische literatuur". Onderwijsvorm De cursus bestaat uit een hoorcollege en een werkcollege. Toetsvorm tentamen Literatuur Steven S. Zumdahl, Chemical Principles, 6th Ed., Houghton Mifflin Company: Boston, New York, 2009 Doelgroep 1F, 1S, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI Overige informatie Voor studenten 1S: Het met een voldoende afronden van het vak Van atoom tot (bio)molecuul is alleen dan mogelijk, indien de onderdelen van Tutoraat SK 1A naar behoren zijn afgerond. Deze slagingseis geldt alleen voor 1S, niet voorde andere doelgroepen.

Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min Vakcode

X_000019 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Voorlichting door studentendecanen en CSL Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 85 van 88

Vakcode

X_000007 ()

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers Vakcode

AB_470185 (450003)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit

Fac. der Aard- en Levenswetenschappen

Coördinator

R.C. van Koten MSc

Docent(en)

prof. dr. J.E.W. Broerse, R.C. van Koten MSc, dr. M.J.W. Bos

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep

Doel vak Verwerven van kennis en inzicht in de verschillende modellen van wetenschapscommunicatie (deficiet, context, interactie en participatie), haar parameters en gebruikelijke applicatiedomeinen. Verwerven van kennis en inzicht van de beperkingen en mogelijkheden van de verschillende media waarin de modellen tot uitdrukking kunnen komen (journalistiek, TV en film, het Internet, musea en science centra). Verkrijgen van vaardigheid in het ontwerpen van een doelgroepgerichte communicatie Het opdoen van leerervaring met het werken in een multidisciplinaire groep Inhoud vak Wetenschap heeft verstrekkende gevolgen voor de maatschappij (bv. ICT, biotechnologie, nanotechnologie, farmacie). Maar hoe kijkt de maatschappij eigenlijk naar wetenschappelijke ontwikkelingen? Wat vindt de industrie van wat we uitgevonden hebben en wat denken andere wetenschappers van onze kennis? De visie van deze mensen over ons en ons werk is van groot belang voor de richting die het onderzoek in de nabije toekomst gaat nemen. Daarom is communicatie over wetenschap van cruciaal belang. In deze cursus raak je vertrouwt met een aantal modellen van wetenschapscommunicatie, het herkennen van hun toepassingen in de praktijk en de verschillende soorten publiek die men ermee kan aanspreken (populariseren voor leken, informatieoverdracht voor de industrie, faciliteren van interdisciplinair onderzoek in de wetenschap). Door middel van opdrachten raak je bekend met de praktische kant van wetenschapscommunicatie, bijvoorbeeld wetenschapsjournalistiek, voorlichting, etc. De opdrachten worden deels individueel uitgevoerd en deels in een multidisciplinaire groep. Onderwijsvorm Colleges, opdracht, zelfstudie


8-6-2012 - Pagina 86 van 88

Literatuur (Online) syllabus Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Biomedische Wetenschappen en Biologie. Speciaal aanbevolen voor studenten die overwegen de C- variant (wetenschapscommunicatie) in hun masterprogramma op te nemen. Overige informatie Voor meer informatie: [email protected]

Why Chemical Reactions Happen Vakcode

X_435088 (435088)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)

prof. dr. C. Gooijer, prof. dr. K. Lammertsma

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Het doel van het college is - in nauwe aansluiting met het voorafgaande college Chemische Binding - nader in te gaan op de quantummechanische beschrijving van moleculen en de basis te leggen voor de beantwoording van de vraag waarom en wanneer chemische reacties plaatsvinden. Veel aandacht wordt besteed aan evenwichtsconstanten in relatie tot de tweede hoofdwet van de thermodynamice. Inhoud vak Molecular orbitals voor homo- en hetero-tweeatomige moleculen; elektronenverdeling in grotere moleculen; een aantal basale chemische reacties; chemische evenwichten; reactiesnelheden; binding in geconjugeerde systemen. Onderwijsvorm Gecombineerd hoorcollege en werkcollege Literatuur Keeler, J., and Wothers, P., Why Chemical Reactions Happen, New York: Oxford University Press, 2003 (ISBN 0-19-924-9733). Doelgroep 1S, 1F

Wijsgerige vorming: natuurwetenschappen, filosofie en ethiek Vakcode

X_435340 (435340)

Periode

Periode 1

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit



8-6-2012 - Pagina 87 van 88

Coördinator

dr. G.C. Eigner

Lesmethode(n)


Literatuur Horsten, L. Douven, I. en Weber, E., Wetenschapsfilosofie. Assen: Van Gorcum, 2007.


8-6-2012 - Pagina 88 van 88

Scheikunde BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde

Recommend Documents