Scheikunde BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde

Scheikunde BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

I

De opleiding Scheikunde richt zich op de bestudering van moleculen, op het doen van wetenschappelijk onderzoek hiernaar en op de toepassing van de verworven kennis. Binnen de bacheloropleiding doe je kennis op van alle gebieden binnen de scheikunde: biochemie, fysische chemie, organische chemie, theoretische chemie en analytische chemie. Met de opleiding wordt beoogd zodanige kennis, vaardigheid en inzicht bij te brengen op het gebied van de scheikunde dat de afgestudeerde in aanmerking kan komen voor een masteropleiding in de scheikunde. Dit kan een onderzoeksrichting zijn, maar ook een opleiding op het gebied van Communicatie en Educatie of een meer maatschappijgerichte opleiding. Eveneens is het essentieel dat de afgestudeerde zich bekwaamd heeft in het verantwoord kiezen in wetenschappelijke problematieken. Om deze doelstellingen te bereiken is in de eerste plaats een brede scheikundige basisopleiding nodig met daarin ook aandacht voor algemene academische vorming. Daarnaast is het noodzakelijk dat de student gedurende enige tijd actief deelneemt aan het scheikundig onderzoek. Meer opleidingsinformatie is te vinden op de de FEW-website. Een complete beschrijving van deze opleiding is te vinden in de Onderwijs- en Examenregeling op de FEW-website.


II

Inhoudsopgave

Honours programma

1

Eerste jaar bachelor Scheikunde

1

Verplichte vakken

1

Vervallen 1ejaarsvakken voor cohort 2010

2

Verplichte algemene onderdelen

2

Tweede jaar bachelor Scheikunde

3

Verplichte keuze 1 uit 2

3

Verplichte vakken

3

Verplichte vakken Open House

4

Derde jaar bachelor Scheikunde

4

Individuele vakken

4

Bachelorprojecten

4

Keuze ruimte

6

Verdiepingsvakken Analytische Chemie en Toegepaste Spectroscopie

7

Verdiepingsvakken Organische en Anorganische Chemie

7

Verdiepingsvakken Theoretische Chemie

8

Verdiepingsvakken Fysische Chemie

8

Verdiepingsvakken Farmacochemie

8

Keuze vakken Oriëntatie op de C/E/M variant

8

Derde jaar bachelor Schei keuzevakken

9

Minor Energie en duurzame chemie

9

Minor Ondernemerschap en Innovatie

9

Verplichte vakken

10

Vak: Analytische chemie

10

Vak: Anorganische chemie 2

11

Vak: Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken

12


12


13

Vak: Bachelorproject Farmacochemie BMA

14


14


15

Vak: Bachelorproject Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S

15

Vak: Bachelorproject Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S

16

Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie

17


18


19

Vak: Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.

20


20


20

Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.

21


21


21

Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.

22


III


22


23

Vak: Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken

23


24


24

Vak: Bachelorproject Ondernemerschap en innovatie

25

Vak: Bachelorproject Organometaal synthese

25


26


27

Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectieen identificatietechnieken

27


28


29

Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse

29


30


31

Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry

32


33


34

Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie

34


35


36

Vak: Basiswiskunde

38

Vak: Bioanalyse eiwitten

38

Vak: Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW.

39

Vak: Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1

39

Vak: BP Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S

39

Vak: Business Administration in the Service Industry

40

Vak: Calculus 2

41

Vak: Cellulaire biochemie, modelling en structuur

42

Vak: Chemie en licht

43

Vak: Climate and Policy

44

Vak: Climate Modelling

45

Vak: Computational (Pharmaco)Chemistry

46

Vak: Computationele organische chemie

47

Vak: Current Topics in Medicinal Chemistry

48

Vak: Current Topics in Medicinal Chemistry

48

Vak: Experiments in Green and Sustainable Chemistry

49

Vak: Fysica en medische fysica 2

50

Vak: Fysica van bio-energie 2

50

Vak: Gecondenseerde materie 2

51

Vak: Geschiedenis van de natuurwetenschappen

52

Vak: Green Chemistry

52

Vak: Heterologe expressie van biotransformatie enzymen

53

Vak: Inleiding bioinformatica 1

54

Vak: Inleiding computergebruik

56


IV

Vak: Integrated Practical Course

56

Vak: Introduction Entrepreneurship

57

Vak: Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie

58

Vak: Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken

59

Vak: Keuzevak Computational Medicinal Chemistry and Toxicology

59

Vak: Keuzevak Computational Medicinal Chemistry and Toxicology

60

Vak: Keuzevak Farmacochemie - Medicinal Chemistry, DDTF

61

Vak: Keuzevak Fysische Chemie

62

Vak: Keuzevak Fysische Chemie

62

Vak: Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction

63

Vak: Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction

63

Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.

64

Vak: Keuzevak Multidimensionale scheidingstechnieken

64

Vak: Keuzevak Spectroscopische detectieen identificatietechniek

65

Vak: Keuzevak Spectroscopische detectieen identificatietechniek

66

Vak: Keuzevak Theoretische Chemie

66

Vak: Keuzevak Theoretische Chemie

67

Vak: Levende chemie

67

Vak: Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen

68

Vak: Macromoleculen en katalyse

69

Vak: Mentoraat / Tutoraat

70

Vak: Minorproject Energie

70

Vak: Minorproject Energie

71

Vak: Moleculaire quantummechanica

71

Vak: Natuurstoffen

72

Vak: Nuclear Chemistry

73

Vak: Organische chemie 1

73

Vak: Organische chemie 2

74

Vak: Organische en anorganische chemie

75

Vak: Organometaalchemie

76

Vak: Oriëntatie op de M-variant

77

Vak: Oriëntatie science educatie

78

Vak: Practicum energie en duurzaamheid

80

Vak: Practicum Moderne synthetische methoden

81

Vak: Practicum van Atoom tot (Bio)molecuul

82

Vak: Principles of Chemical Reactivity

83

Vak: Programmeren

84

Vak: Structuurbiologie

84

Vak: Structuuropheldering en spectroscopie

85

Vak: Studie en loopbaan

86

Vak: Synthese practicum

87

Vak: Thermodynamica

88

Vak: Van atoom tot (bio)molecuul

88

Vak: Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min

90

Vak: Voorlichting door studentendecanen en CSL

90


V

Vak: Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers

90

Vak: Why Chemical Reactions Happen

91

Vak: Wijsgerige vorming 2: Wetenschapsfilosofie

92

Vak: Wiskunde en Natuurkunde voor chemici 1

93

Vak: Wiskunde en natuurkunde voor chemici 2

94


VI

Honours programma

Eerste jaar bachelor Scheikunde Eerste jaar voor studenten gestart in 2011/2012 Het eerste jaar van de opleiding is ingedeeld in thema’s. Je ziet direct de samenhang tussen de theorie en de praktijk. Daarmee ervaar je hoe scheikunde geïntegreerd is in je dagelijkse leven. De 6 actuele thema’s worden vanuit verschillende invalshoeken belicht. Per periode is er een thema. De thema's zijn - Van atoom tot (bio)molecuul: http://tinyurl.com/Thema-AtB - Levende chemie: http://tinyurl.com/Thema-LC - Speuren naar moleculen: http://tinyurl.com/Thema-SnM - Licht op moleculen: http://tinyurl.com/Thema-LoM - Energie en duurzaamheid: http://tinyurl.com/Thema-EeD - Moleculen en gezondheid: http://tinyurl.com/Thema-MeG In het eerste jaar zijn alle vakken verplicht, er zijn geen keuzevakken. Het programma in het eerste jaar vormt een basis; het geeft een eerste overzicht van de Scheikunde en is bedoeld als een verbreding van de kennis op diverse terreinen. Het eerste jaar van de bachelor heeft een oriënterende en selecterende functie. De student kan zich tijdens het eerste studiejaar oriënteren op de gekozen opleiding, dat wil zeggen: voldoet de opleiding aan de verwachting en is men er geschikt voor. Het programma van het eerste jaar geeft een eerste overzicht van de opleiding en geeft een verbreding van de kennis. De selecterende functie komt vooral tot uiting in de studieresultaten. De studieresultaten worden gevolgd door de studieadviseur. Als het nodig is worden studenten opgeroepen voor een gesprek. Op grond van de cijfers wordt aan het eind van het eerste jaar aan elke eerstejaars een (nietbindend) schriftelijk studieadvies gestuurd. Opleidingsdelen: - Verplichte vakken - Vervallen 1ejaarsvakken voor cohort 2010 - Verplichte algemene onderdelen

Verplichte vakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Analytische chemie

Periode 3

3.0

X_435087

Basiswiskunde

Periode 1

3.0

X_401069


6-3-2013 - Pagina 1 van 94

Cellulaire biochemie, modelling en structuur

Periode 6

6.0

X_430563

Chemie en licht

Periode 4

3.0

X_430564

Levende chemie

Periode 2

3.0

X_430569

Organische en anorganische chemie

Periode 5

6.0

X_430573

Practicum energie en duurzaamheid

Periode 5

3.0

X_430574

Practicum van Atoom tot (Bio)molecuul

Periode 1+2

6.0

X_430575

Principles of Chemical Reactivity

Periode 3

3.0

X_430576

Structuuropheldering en spectroscopie

Periode 4

6.0

X_430578

Van atoom tot (bio)molecuul Periode 1+2

6.0

X_430580

Wiskunde en Natuurkunde voor chemici 1

Periode 1+2

6.0

X_430572

Wiskunde en natuurkunde voor chemici 2

Periode 4+5

6.0

X_428005

Vervallen 1ejaarsvakken voor cohort 2010 Verplichte vakken voor studenten die in 2010 begonnen zijn aan het 1e jaar bachelor Scheikunde. In deze modulegroep zijn vakken opgenomen die in 2010 verplicht waren, maar in het curriculum 2011 niet opgenomen zijn. De vakken in deze modulegroep worden niet door andere vakken vervangen maar worden nog wel aangeboden bij andere opleidingen. Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Fysica en medische fysica 2 Periode 5

3.0

X_430061

Organische chemie 1

Periode 5

3.0

X_435091

Why Chemical Reactions Happen

Periode 4

3.0

X_435088

Verplichte algemene onderdelen Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW.

Periode 1

0.0

X_000002

Blusinstructie: Theorie: Periode 1 S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1

0.0

X_000003

Inleiding computergebruik

Periode 1

0.0

X_000004

Mentoraat / Tutoraat

Semester 1

0.0

X_000008


6-3-2013 - Pagina 2 van 94

Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min

Periode 1

0.0

X_000019

Voorlichting door studentendecanen en CSL

Periode 1

0.0

X_000007

Tweede jaar bachelor Scheikunde Tweede jaar voor studenten gestart in 2010/2011 In het tweede studiejaar wordt beoogd een verdieping van kennis, inzicht en vaardigheden op deelgebieden van de scheikunde tot stand te brengen. Dit vormt de basis voor de differentiatie in het derde jaar. In periode 4 is er een verplichte keuze tussen de vakken Maatschappelijke aspecten van natuurwetenschappen en Geschiedenis van de natuurwetenschappen. Daarnaast volg je het verplichte onderdeel Studie en Loopbaan in periode 4. Tijdens deze cursus wordt er expliciet aandacht besteed aan jouw competenties en vaardigheden, zodat jij je bewust wordt van jouw sterke punten. Daarnaast krijg je meer inzicht in keuzemogelijkheden binnen de opleiding en mogelijkheden na de bacheloropleiding. Opleidingsdelen: - Verplichte keuze 1 uit 2 - Verplichte vakken - Verplichte vakken Open House Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Studie en loopbaan

Periode 4

0.0

X_000018

Verplichte keuze 1 uit 2 Verplichte keuze van 1 uit 2 Deze keuze vervalt per 1-9-2012 voor 2S. Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Geschiedenis van de natuurwetenschappen

Periode 4

3.0

X_420148

Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen

Periode 4

3.0

X_420153



6-3-2013 - Pagina 3 van 94

Naam

Periode

Credits

Code

Anorganische chemie 2

Periode 3

3.0

X_435290

Bioanalyse eiwitten

Periode 1

3.0

X_435099

Calculus 2

Periode 1+2

6.0

X_435002

Integrated Practical Course Periode 5

12.0

X_430516

Moleculaire quantummechanica

Periode 4

6.0

X_430571

Organische chemie 2

Periode 1

3.0

X_435007

Programmeren

Periode 3+4

6.0

X_435003

Synthese practicum

Periode 2, Periode 3

6.0

X_435192

Thermodynamica

Periode 1

3.0

X_435203

Verplichte vakken Open House

Derde jaar bachelor Scheikunde Derde jaar voor studenten gestart in 2009/2010 Het derde jaar start met de minor van 30 EC. Je kunt je verdiepen in de scheikunde (Advanced Molecular Chemistry), maar ook juist een verbredende minor kiezen zoals Molecular Pharmaceutical Sciences, Green Chemistry of Ondernemerschap & Innovatie. Daarnaast is er in het tweede semester 21 EC keuzeruimte. Wanneer je een verbredende minor hebt gedaan, moet je deze keuzeruimte gebruiken om een eindproject binnen de scheikunde te doen. Wanneer je de verdiepende minor hebt gedaan, kun je deze keuzeruimte invullen met keuzevakken. Bijvoorbeeld de cursussen oriëntatie op de C-, E-, en M-variant zijn in het tweede semester geprogrammeerd. Opleidingsdelen: -

Individuele vakken Bachelorprojecten Keuze ruimte Minor Energie en duurzame chemie Minor Ondernemerschap en Innovatie Verplichte vakken

Individuele vakken

Bachelorprojecten Verplichte keuze van minimaal 12 ects en maximaal 24 ects, te besteden aan twee projecten van elk 12 ects, of een van 18 ects of een van 24 ects. Vakken:

Naam

Periode


Credits

Code 6-3-2013 - Pagina 4 van 94

Bachelorproject Bioanalytische screeningstechnieken

Ac. Jaar (september)

18.0

X_435117



24.0

X_435118



12.0

X_435460

Bachelorproject Farmacochemie BMA


12.0

X_430523



18.0

X_430524



24.0

X_430525

Bachelorproject Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S


18.0

X_430527

Bachelorproject Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S


24.0

X_430528

Bachelorproject Imaging en Ac. Jaar (september) Laser Control van FotoChemie

12.0

X_435052


18.0

X_435114


24.0

X_435116

Bachelorproject Med. Ac. Jaar (september) Chem., Drug Disc. & Target Find.

12.0

X_430529


18.0

X_430530


24.0

X_430531

Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.


12.0

X_430532



18.0

X_430533



24.0

X_430534

Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.


12.0

X_430535



18.0

X_430536


6-3-2013 - Pagina 5 van 94



24.0

X_430537

Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken


18.0

X_435122



24.0

X_435123



12.0

X_435490

Bachelorproject Organometaal synthese


12.0

X_435104



18.0

X_435133



24.0

X_435134

Bachelorproject Spectroscopische detectieen identificatietechnieken


18.0

X_435119



24.0

X_435121



12.0

X_435470

Bachelorproject Synthese en structuuranalyse


18.0

X_435128



24.0

X_435129



12.0

X_435550

Bachelorproject Theoretical Ac. Jaar (september) Chemistry

12.0

X_430517


18.0

X_435126


24.0

X_435127

Bachelorproject Toegepaste Ac. Jaar (september) theoretische chemie

18.0

X_435131


24.0

X_435132


12.0

X_435570

BP Farmacochemie Ac. Jaar (september) Medicinal Chemistry, DD&S

12.0

X_430526

Keuze ruimte


6-3-2013 - Pagina 6 van 94

De keuzeruimte van 24, 18 of 12 sp kan worden ingevuld met een keuze uit onderstaande vakken. Voor de invulling van de keuzeonderdelen is de goedkeuring van de examencommissie vereist. Opleidingsdelen: -

Verdiepingsvakken Analytische Chemie en Toegepaste Spectroscopie Verdiepingsvakken Organische en Anorganische Chemie Verdiepingsvakken Theoretische Chemie Verdiepingsvakken Fysische Chemie Verdiepingsvakken Farmacochemie Keuze vakken Oriëntatie op de C/E/M variant Derde jaar bachelor Schei keuzevakken

Verdiepingsvakken Analytische Chemie en Toegepaste Spectroscopie Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie


3.0

X_435026

Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken


3.0

X_435028

Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction


3.0

X_435032

Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction


6.0

X_435033

Keuzevak Multidimensionale Ac. Jaar (september) scheidingstechnieken

3.0

X_435037

Keuzevak Spectroscopische Ac. Jaar (september) detectieen identificatietechniek

3.0

X_435039

Keuzevak Spectroscopische Ac. Jaar (september) detectieen identificatietechniek

6.0

X_430568

Verdiepingsvakken Organische en Anorganische Chemie Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Computationele organische Ac. Jaar (september) chemie

9.0

X_435017

Macromoleculen en katalyse Ac. Jaar (september)

6.0

X_435450

Natuurstoffen


6.0

X_435440

Organometaalchemie


3.0

X_435018


6-3-2013 - Pagina 7 van 94

Practicum Moderne synthetische methoden


9.0

X_435016

Verdiepingsvakken Theoretische Chemie Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Keuzevak Theoretische Chemie


3.0

X_430538

Keuzevak Theoretische Chemie


6.0

X_430539

Credits

Code

Keuzevak Fysische Chemie Ac. Jaar (september)

3.0

X_430540

Keuzevak Fysische Chemie Ac. Jaar (september)

6.0

X_430541

Credits

Code

Current Topics in Medicinal Ac. Jaar (september) Chemistry

3.0

X_430542

Current Topics in Medicinal Ac. Jaar (september) Chemistry

6.0

X_430543

Heterologe expressie van biotransformatie enzymen


6.0

X_430549

Keuzevak Computational Medicinal Chemistry and Toxicology


3.0

X_430546

Keuzevak Computational Medicinal Chemistry and Toxicology


6.0

X_430547

Keuzevak Farmacochemie - Ac. Jaar (september) Medicinal Chemistry, DDTF

3.0

X_430544

Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.

6.0

X_430545

Verdiepingsvakken Fysische Chemie Vakken:

Naam

Periode

Verdiepingsvakken Farmacochemie Vakken:

Naam

Periode


Keuze vakken Oriëntatie op de C/E/M variant


6-3-2013 - Pagina 8 van 94

Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Oriëntatie op de M-variant

Periode 4

6.0

X_400375

Oriëntatie science educatie

Semester 2

6.0

O_ORIBETA

6.0

AB_470185

Wetenschapscommunicatie Periode 5 voor Bèta-onderzoekers

Derde jaar bachelor Schei keuzevakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Inleiding bioinformatica 1

Periode 3

3.0

X_401036

Structuurbiologie

Periode 1

6.0

X_430080

Minor Energie en duurzame chemie Verplichte keuze van 30 EC uit onderstaande onderdelen. Slechts een van de minorprojecten mag gekozen worden. Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Climate and Policy

Period 3

6.0

AM_450188

Climate Modelling

Period 3

6.0

AM_450004

Experiments in Green and Sustainable Chemistry


6.0

X_430556

Fysica van bio-energie 2

Periode 1

6.0

X_420527

Gecondenseerde materie 2 Periode 1+2

6.0

X_428003

Green Chemistry

Periode 1

6.0

X_430557

Minorproject Energie

Periode 1+2+3

12.0

X_420530

Minorproject Energie

Periode 1+2+3

6.0

X_420538

Nuclear Chemistry

Periode 2

3.0

X_430558

Credits

Code

Minor Ondernemerschap en Innovatie Vakken:

Naam

Periode


6-3-2013 - Pagina 9 van 94

Bachelorproject Ondernemerschap en innovatie


12.0

X_432740

Business Administration in the Service Industry

Periode 1

6.0

E_BK1_BASI

Introduction Entrepreneurship

Period 1

6.0

S_INTROE

Naam

Periode

Credits

Code

Computational (Pharmaco)Chemistry

Periode 4

6.0

X_435350

Wijsgerige vorming 2: Wetenschapsfilosofie

Periode 4

3.0

X_428002


Analytische chemie Vakcode

X_435087 (435087)

Periode

Periode 3

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit

Faculteit der Exacte Wetenschappen

Coördinator

dr. H. Lingeman

Docent(en)

dr. H. Lingeman

Lesmethode(n)

Werkcollege, Practicum

Doel vak Het verwerven van kennis en het aanleren van analytische technieken die gebruikt kunnen worden bij de kwantitatieve bepaling van organische en anorganische verbindingen in (complexe) matrices. Inhoud vak Tijdens de colleges en werkcolleges zullen de volgende onderwerpen aan de orde komen: calibratie methoden en data evaluatie technieken die gebruikt kunnen worden bij kwantitatieve instrumentele analyses, extractie en aanverwante monster voorbewerkingstechnieken en chromatografische scheidingstechnieken, inclusief die hierbij horende detectiemethoden. In het practische gedeelte van de cursus zullen enkele standaard experimenten worden uitgevoerd met behulp van spectrofotometrische en vloeistofchromatografische methoden. Onderwijsvorm De cursus bestaat uit een combinatie van hoorcollege/werkcollege en practicum. Toetsvorm De beoordeling zal plaatsvinden aan de hand van een schriftelijk tentamen en een verslag van de uitgevoerde experimenten. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 10 van 94

Literatuur Materiaal beschikbaar gesteld door de docenten. Uitgebreide informatie over de behandelde stof kan worden gevonden in D.C. Harris, Quantitative Chemical Analysis, Eighth Edition, W.H. Freeman and Company, New York, 2010. Doelgroep 1S

Anorganische chemie 2 Vakcode

X_435290 (435290)

Periode

Periode 3

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. A.W. Ehlers

Docent(en)

dr. A.W. Ehlers

Lesmethode(n)

Werkcollege

Doel vak Het doel van dit college is het verder uitbreiden van de basiskennis op het gebied van de anorganische chemie opgedaan in het college Anorganische chemie I, in het bijzonder m.b.t. de coördinatiechemie en de organometaalchemie. Inhoud vak In het hoorcollege wordt aandacht besteed aan de volgende onderwerpen: - Coördinatiechemie (structuur en assymmetrie van overgangsmetaalcomplexen, binding en electronenstructuur, magnetisme, Jahn Teller verstoring, reacties van coördinatieverbindingen) - Organometaalchemie (18-electronenregel, carbonylcomplexen, Dewar-Chatt model, metaal-metaalbinding) Onderwijsvorm Colleges (hoorcollege, werkcolleges), Zelfstudie. Toetsvorm Schriftelijk tentamen. Tot de tentamenstof behoort alle op het college behandelde stof, alsmede de genoemde delen van het studieboek. Herkansing mogelijk mondelijk. Literatuur Atkins, P. e.a., Shriver & Atkins: Inorganic Chemistry 4th ed. Oxford: Oxford University Press, 2006. i.h.b. hfdst. 7, 8, 18-21, 25..st. 9-16. Aanbevolen voorkennis Anorganische Chemie 1 Doelgroep 2S, 3F, mi-MC Overige informatie


6-3-2013 - Pagina 11 van 94

Aanvullend materiaal is online beschikbaar via Blackboard.

Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken Vakcode

X_435117 (435117)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten (vakcode 435118).


X_435118 (435118)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak


6-3-2013 - Pagina 12 van 94

Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten (vakcode 435118).


X_435460 (435460)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix.


6-3-2013 - Pagina 13 van 94

Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten (vakcode 435118).

Bachelorproject Farmacochemie BMA Vakcode

X_430523 (430523)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. M.H. Siderius

Inhoud vak De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430523) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430524) of 24 studiepunten (vakcode 430525).


X_430524 (430524)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Inhoud vak De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430523) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430524) of 24 studiepunten


6-3-2013 - Pagina 14 van 94

(vakcode 430525).


X_430525 (430525)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. M.H. Siderius


Bachelorproject Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S Vakcode

X_430527 (430527)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. M. Wijtmans

Doel vak In dit vak zullen studenten kennis maken met de spannende aspecten van onderzoek dat zich richt op het bedenken en maken van chemische stoffen met een bepaalde biologische activiteit. Inhoud vak Als de ziekte bestudeerd is en de biologische targets bepaald zijn moeten er stoffen gevonden worden die de biologische targets op de juiste manier moduleren en daarmee de ziekte kunnen genezen. Dit eindproject geeft de studenten de kans om zelfstandig onderzoek te verrichten naar moderne technieken om tot de design en synthese van deze nieuwe liganden te komen. Bij design gaat het om Computer-Aided Drug Design (CADD) benaderingen, waarbij met de computer bestaande informatie van liganden en biologische targets wordt verzameld en omgezet wordt in modellen die leiden tot een beter begrip van ligand-receptor interactie. Deze kunnen gebruikt worden om nieuwe liganden te zoeken of om ideeen voor synthese te genereren. In de organische synthese laboratoria wordt gebruik gemaakt van de modernste synthese technologieen, waaronder parallele chemie, geautomatiseerde labreactors, microwave chemistry en geautomatiseerde kolomchromatografie, om interessante moleculen te synthetiseren. Afhankelijk van de interesse van de student kan een project gedefinieerd worden dat alleen bestaat uit design, of alleen uit


6-3-2013 - Pagina 15 van 94

synthese, of uit een combinatie van deze twee disciplines. Ook is een nauwe samenwerking met Drug Discovery en Target Finding mogelijk, dit is de onderzoeksgroep waar de biologische activiteiten van de nieuwe verbindingen getest worden. Onderwijsvorm Dit eindproject bestaat uit een onderzoeksfase, waarbij de student een eigen project krijgt dat past binnen een actief onderzoeksprogramma van de afdeling. Over de stage wordt een verslag gemaakt en een presentatie gehouden. Literatuur Wetenschappelijke literatuur en handouts worden door de begeleiders aangeboden. De eerste 1 - 2 weken worden besteed aan het uitgebreid inlezen in de achtergrond van het onderzoeksproject. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Neem tiidig contact op met de coördinator ([email protected]) voor het bespreken van de mogelijkheden. Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 18 studiepunten (vakcode 430527) kan in overleg met de coördinator worden uitgebreid naar 24 studiepunten (vakcode 430528). Afhankelijk van de interesse van de student kan een project gedefinieerd worden dat alleen bestaat uit organische synthese, of alleen uit design, of uit een combinatie van deze twee disciplines.

Bachelorproject Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S Vakcode

X_430528 (430528)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. M. Wijtmans

Doel vak In dit vak zullen studenten kennis maken met de spannende aspecten van onderzoek dat zich richt op het bedenken en maken van chemische stoffen met een bepaalde biologische activiteit. Inhoud vak Als de ziekte bestudeerd is en de biologische targets bepaald zijn moeten er stoffen gevonden worden die de biologische targets op de juiste manier moduleren en daarmee de ziekte kunnen genezen. Dit eindproject geeft de studenten de kans om zelfstandig onderzoek te verrichten naar moderne technieken om tot de design en synthese van deze nieuwe liganden te komen. Bij design gaat het om Computer-Aided Drug Design (CADD) benaderingen, waarbij met de computer bestaande informatie van liganden en biologische targets wordt verzameld en omgezet wordt in modellen die leiden tot een beter begrip van ligand-receptor interactie. Deze kunnen gebruikt worden om nieuwe liganden te zoeken of om ideeen voor synthese te genereren. In de organische synthese laboratoria wordt gebruik gemaakt van de modernste synthese technologieen, waaronder Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 16 van 94

parallele chemie, geautomatiseerde labreactors, microwave chemistry en geautomatiseerde kolomchromatografie, om interessante moleculen te synthetiseren. Afhankelijk van de interesse van de student kan een project gedefinieerd worden dat alleen bestaat uit design, of alleen uit synthese, of uit een combinatie van deze twee disciplines. Ook is een nauwe samenwerking met Drug Discovery en Target Finding mogelijk, dit is de onderzoeksgroep waar de biologische activiteiten van de nieuwe verbindingen getest worden. Onderwijsvorm Dit eindproject bestaat uit een onderzoeksfase, waarbij de student een eigen project krijgt dat past binnen een actief onderzoeksprogramma van de afdeling. Over de stage wordt een verslag gemaakt en een presentatie gehouden. Toetsvorm Verslag, Presentatie en praktische uitvoering Literatuur Wetenschappelijke literatuur en handouts worden door de begeleiders aangeboden. De eerste 1 - 2 weken worden besteed aan het uitgebreid inlezen in de achtergrond van het onderzoeksproject. Vereiste voorkennis Alle vakken van het eerste jaar afgerond. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Neem tiidig contact op met de coördinator ([email protected]) voor het bespreken van de mogelijkheden. Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 18 studiepunten (vakcode 430527) kan in overleg met de coördinator worden uitgebreid naar 24 studiepunten (vakcode 430528). Afhankelijk van de interesse van de student kan een project gedefinieerd worden dat alleen bestaat uit organische synthese, of alleen uit design, of uit een combinatie van deze twee disciplines.

Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie Vakcode

X_435052 (435052)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. M.H.M. Janssen

Doel vak Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde imaging detectoren.


6-3-2013 - Pagina 17 van 94

Inhoud vak Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden uitgevoerd: - Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp van ultrasnelle femtoseconde lasers. - Fotodynamica van niet-adiabatische chemie. Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage ('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet. Literatuur Praktische handleidingen, boeken en literatuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten (vakcode 435116).


X_435114 (435114)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde imaging detectoren. Inhoud vak Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden uitgevoerd: - Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp van ultrasnelle femtoseconde lasers. - Fotodynamica van niet-adiabatische chemie. Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage ('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 18 van 94

onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet. Literatuur Praktische handleidingen, boeken en literatuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten (vakcode 435116).


X_435116 (435116)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde imaging detectoren. Inhoud vak Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden uitgevoerd: - Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp van ultrasnelle femtoseconde lasers. - Fotodynamica van niet-adiabatische chemie. Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage ('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet. Literatuur Praktische handleidingen, boeken en literatuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten (vakcode 435116). Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 19 van 94

Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. Vakcode

X_430529 (430529)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.N.M. Commandeur



X_430530 (430530)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. M.H. Siderius



X_430531 (430531)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



6-3-2013 - Pagina 20 van 94


Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. Vakcode

X_430532 (430532)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. C. de Graaf


Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. Vakcode

X_430533 (430533)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. C. de Graaf


Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 21 van 94

Vakcode

X_430534 (430534)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. C. de Graaf


Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm. Vakcode

X_430535 (430535)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator




X_430536 (430536)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 22 van 94

Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430535) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430536) of 24 studiepunten (vakcode 430537).


X_430537 (430537)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken Vakcode

X_435122 (435122)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen, waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende detectiesystemen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.


6-3-2013 - Pagina 23 van 94

Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten (vakcode 435123).


X_435123 (435123)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen, waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende detectiesystemen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten (vakcode 435123).


X_435490 (435490)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman


6-3-2013 - Pagina 24 van 94

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen, waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende detectiesystemen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten (vakcode 435123).

Bachelorproject Ondernemerschap en innovatie Vakcode

X_432740 ()

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Bachelorproject Organometaal synthese Vakcode

X_435104 (435104)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Doel vak Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie. Inhoud vak In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia, katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 25 van 94

de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden, indien relvevant, X-ray structuren gemeten. Onderwijsvorm Practicumverslag Aanbevolen voorkennis Organische chemie I & II, practicum organische synthese. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten (vakcode 435134).


X_435133 (435133)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Doel vak Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie. Inhoud vak In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia, katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden, indien relvevant, X-ray structuren gemeten. Onderwijsvorm Practicumverslag Aanbevolen voorkennis Organische chemie I & II, practicum organische synthese. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 26 van 94

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten (vakcode 435134).


X_435134 (435134)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Doel vak Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie. Inhoud vak In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia, katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden, indien relvevant, X-ray structuren gemeten. Onderwijsvorm Practicumverslag Aanbevolen voorkennis Organische chemie I & II, practicum organische synthese. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten (vakcode 435134).

Bachelorproject Spectroscopische detectieen identificatietechnieken Vakcode

X_435119 (435119)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren


6-3-2013 - Pagina 27 van 94

van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten (vakcode 435121).


X_435121 (435121)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie


6-3-2013 - Pagina 28 van 94

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten (vakcode 435121).


X_435470 (435470)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Inhoud vak Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen. Onderwijsvorm Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject. Literatuur Praktische handleidingen en basisliteratuur. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten (vakcode 435121).

Bachelorproject Synthese en structuuranalyse Vakcode

X_435128 (435128)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. ir. R.V.A. Orru

Doel vak Zelfstandig onderzoek.


6-3-2013 - Pagina 29 van 94

Inhoud vak In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie), bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek (kinetiek). Onderwijsvorm Zelfstandig onderzoek binnen de sectie. Toetsvorm Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge verslaglegging (proeve van bekwaamheid). Literatuur Wordt per project aangegeven. Aanbevolen voorkennis 435090: Organische chemie 1 435160: Organische chemie 2 435140: Anorganische chemie 1 435290: Anorganische chemie 2 435192: Practicum Synthese Doelgroep 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten (vakcode 435129).


X_435129 (435129)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Zelfstandig onderzoek. Inhoud vak In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie), bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek (kinetiek).


6-3-2013 - Pagina 30 van 94

Onderwijsvorm Zelfstandig onderzoek binnen de sectie. Toetsvorm Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge verslaglegging (proeve van bekwaamheid). Literatuur Wordt per project aangegeven. Aanbevolen voorkennis 435090: Organische chemie 1 435160: Organische chemie 2 435140: Anorganische chemie 1 435290: Anorganische chemie 2 435192: Practicum Synthese Doelgroep 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten (vakcode 435129).


X_435550 (435550)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Zelfstandig onderzoek. Inhoud vak In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie), bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek (kinetiek). Onderwijsvorm Zelfstandig onderzoek binnen de sectie. Toetsvorm Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge verslaglegging (proeve van bekwaamheid). Literatuur Wordt per project aangegeven.


6-3-2013 - Pagina 31 van 94

Aanbevolen voorkennis 435090: Organische chemie 1 435160: Organische chemie 2 435140: Anorganische chemie 1 435290: Anorganische chemie 2 435192: Practicum Synthese Doelgroep 3S Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten (vakcode 435129).

Bachelorproject Theoretical Chemistry Vakcode

X_430517 (430517)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. L. Visscher

Doel vak Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de quantumtheoretische chemie. Inhoud vak Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software (ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van f-elementen lanthanides, actinides). Onderwijsvorm De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de promovendi en/of postdocs van de sectie. Literatuur Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford University Press. Selectie van recente review artikelen.


6-3-2013 - Pagina 32 van 94

Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten (vakcode 435127).


X_435126 (435126)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de quantumtheoretische chemie. Inhoud vak Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software (ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van f-elementen lanthanides, actinides). Onderwijsvorm De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de promovendi en/of postdocs van de sectie. Literatuur Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford University Press. Selectie van recente review artikelen. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten (vakcode 435127).


6-3-2013 - Pagina 33 van 94


X_435127 (435127)

Periode


Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de quantumtheoretische chemie. Inhoud vak Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software (ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van f-elementen lanthanides, actinides). Onderwijsvorm De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de promovendi en/of postdocs van de sectie. Literatuur Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford University Press. Selectie van recente review artikelen. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten (vakcode 435127).

Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie Vakcode

X_435131 (435131)

Periode


Credits

18.0

Voertaal

Nederlands


6-3-2013 - Pagina 34 van 94

Faculteit


Coördinator

prof. dr. F.M. Bickelhaupt

Doel vak Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en biologische chemie. Inhoud vak De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput. Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door "uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt. Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO) model een centrale rol speelt. Onderwijsvorm De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling. Literatuur Fragmenten uit: Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985. Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York: Wiley-VCH, Vol. 15. Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12 studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten (vakcode 435132).

Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie Vakcode

X_435132 (435132)

Periode



6-3-2013 - Pagina 35 van 94

Credits

24.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie


6-3-2013 - Pagina 36 van 94

Vakcode

X_435570 (435570)

Periode


Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator




6-3-2013 - Pagina 37 van 94

Basiswiskunde Vakcode

X_401069 ()

Periode

Periode 1

Credits

3.0

Coördinator

drs. J.A. Los

Docent(en)

dr. ir. R.F. Swarttouw, drs. J.A. Los

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkcollege

Doel vak Het doel van deze cursus is het ophalen en bijbrengen van wiskundige basisvaardigheden die nodig zijn in vervolgcolleges zoals Calculus en Statistiek. Inhoud vak De cursus begint met een herhaling van vwo stof. Sommige onderwerpen zullen op wiskunde b niveau afgesloten worden. Ook komen een aantal nieuwe onderwerpen aan bod (deels afhankelijk van je vwo-voorkennis): integreren, goniometrie, limieten, complexe getallen en bewijzen met volledige inductie. Onderwijsvorm Gemengd hoor- en werkcollege en huiswerkopgaven. Toetsvorm Een afsluitend schriftelijk tentamen en een tussentoets. Literatuur Basisboek wiskunde (tweede editie), Jan van de Craats en Rob Bosch, Pearson, ISBN 978-90-430-1673-5. Aangevuld met een dictaat. Doelgroep 1F, 1MNW, 1S, 1SBI

Bioanalyse eiwitten Vakcode

X_435099 (435099)

Periode

Periode 1

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Docent(en)

dr. J. Kool, dr. H. Lingeman

Lesmethode(n)

Werkcollege

Doel vak Het doel is het verwerven van theoretisch inzicht over de kwalitatieve en kwantitatieve analyse van biologische macromoleculen (vooral eiwitten) met behulp van ondermeer chromatografische, immunologische en affiniteitstechnieken.


6-3-2013 - Pagina 38 van 94

Inhoud vak Allereerst zullen de verschillende (vloeistof)chromatografische technieken (b.v. size-exclusion, ion-exchange, hydrophobic interaction, reversed-phase) worden besproken waarmee de genoemde verbindingen van elkaar kunnen worden gescheiden. Bijzondere aandacht zal hierbij worden gegeven aan gradientelutie systemen en biospecifieke en massaspectrometrische detectiesystemen. Verder zal het basisprincipe van de immunoassays en affiniteitstechnieken worden geïntroduceerd. Hierbij zal vooral worden gekeken naar de toepasbaarheid van deze technieken. Onderwijsvorm Het college begint met een theoretische inleiding gevolgd door enkele werkcolleges. Vervolgens zullen de studenten in kleine groepjes aan een casus werken. Over de casus wordt een verslag geschreven. Toetsvorm De beoordeling zal plaatsvinden aan de hand van een schriftelijk tentamen en het verslag. Beiden tellen even zwaar mee voor de eindbeoordeling. Literatuur Materiaal beschikbaar gesteld door de docenten. Uitgebreide informatie over de behandelde stof kan worden gevonden in K.M. Gooding, F.E. Regnier, HPLC of Biological Macromolecules, Chromatographic Science Series, Volume 51, Dekker 1990 en D.S. Hage, Handbook of Affinity Chromatography, Chromatographic Science Series, Volume 92, Dekker 2006. Doelgroep 2F, mi-MPS

Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW. Vakcode

X_000002 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Lesmethode(n)

Practicum

Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1 Vakcode

X_000003 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Lesmethode(n)

Hoorcollege

BP Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S Vakcode

X_430526 (430526)

Periode



6-3-2013 - Pagina 39 van 94

Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator



Business Administration in the Service Industry Vakcode

E_BK1_BASI (61111030)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit

Fac. der Economische Wet. en Bedrijfsk.

Coördinator

dr. M.J. Flikkema

Docent(en)

dr. M.J. Flikkema, drs. G.H. Teusink, drs. F.E. Driessen, drs. H.E.M. Binnendijk

Lesmethode(n)


Doel vak Verkrijgen van inzicht in: - het Bedrijfskundig model dat gedurende de bachelorfase wordt gebruikt - de relatie tussen soorten bedrijven, stakeholders, bedrijfsprocessen en bedrijfsfuncties - de wijze waarop veranderingen in bedrijfsprocessen en bedrijfsfuncties de relaties tussen dienstverleners en hun stakeholders, in het bijzonder klanten, beïnvloeden - de bijdragen die vanuit de verschillende bedrijfsfuncties worden geleverd aan het veranderen van de strategische positie van een dienstverlener Inhoud vak BASI is het introductievak Bedrijfskunde met bijzondere aandacht voor dienstverlenende bedrijven. De introductie begint met spelregels en een toelichting van het Bedrijfskundig model, aan de hand waarvan duidelijk wordt hoe het bachelorprogramma van de studie Bedrijfskunde aan de VU is opgebouwd en wat er van studenten wordt verwacht. Daarna wordt in zeven hoorcolleges een overzicht gegeven van soorten bedrijven, soorten stakeholders (bijvoorbeeld klanten en aandeelhouders) en hun onderlinge relatie. De variatie tussen bedrijven blijkt groot, in het bijzonder als we stilstaan bij de verschillende posities die bedrijven kunnen innemen in de markt, in netwerken en in waardeketens. De grote diversiteit aan stakeholders maakt duidelijk dat bij bedrijfskundige vraagstukken vaak verschillende belangen tegen elkaar moeten worden Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 40 van 94

afgewogen. Bedrijfsprocessen vormen belangrijke instrumenten voor het vormgeven en veranderen van de relatie met stakeholders. Denk maar eens aan de impact van thuisbankieren. Maar wat is nou precies een bedrijfsproces en hoe kun je dat beschrijven, modeleren, analyseren en verbeteren? Studenten zullen het niet alleen tijdens het hoorcollege, maar ook via een spel, een VISIO workshop en een praktijkcase ervaren. Dan zal ook duidelijk worden hoe bedrijfsprocessen, bedrijfsfuncties (zoals marketing, logistiek, ICT, HRM, inkoop, verkoop en finance) en afdelingen zich tot elkaar verhouden en hoe vanuit de verschillende bedrijfsfuncties bijdragen worden geleverd aan het veranderen van bedrijfsprocessen en de positie van de organisatie als geheel. Onderwijsvorm hoorcollege werkcollege Toetsvorm schriftelijk tentamen (100 procent) Literatuur - Looy, B. van, R. van Dierdonck & P. Gemmel, Services Management: An Integrated Approach. 2nd edition. London: Prentice Hall, 2003, ISBN 027367353 X.

Calculus 2 Vakcode

X_435002 (435002)

Periode

Periode 1+2

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Coördinator

dr. W. Kager

Docent(en)

dr. W. Kager

Lesmethode(n)


Doel vak Kunnen berekenen van integralen, afgeleiden en extreme waarden van functies van meerdere variabelen, en de theorie hiervan beheersen. Kennen van de stelling van Taylor en deze kunnen toepassen. Beheersen van reeksen en machtreeksen, en machtreeksen kunnen toepassen om differentiaalvergelijkingen op te lossen. Inhoud vak Differentiaal- en integraalrekening in meerdere variabelen, extreme waarden van functies van meerdere variabelen, reeksen en machtreeksen, stelling van Taylor, oplossen van differentiaalvergelijkingen met behulp van machtreeksen. Onderwijsvorm Hoorcollege en werkcollege. Toetsvorm Schriftelijk in twee deeltentamens.


6-3-2013 - Pagina 41 van 94

Literatuur R. Adams and C. Essex. Calculus: a complete course (7th. ed.) Aanvullende literatuur wordt tijdens het college verstrekt. Doelgroep 2MNW, 2S, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI

Cellulaire biochemie, modelling en structuur Vakcode

X_430563 ()

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak • Het verkrijgen van inzicht in verschillende theoretische rekenmodellen om moleculaire interacties te beschrijven en de biologische activiteit van moleculen te begrijpen en te voorspellen. • Het verkrijgen van inzicht in de structuur en ruimtelijke organisatie van macromoleculaire complexen en organellen in de cellulaire context en op de karakteristieken van signaal overdracht en intracellulaire transport processen. Inhoud vak In de biochemie bepalen de eigenschappen van de moleculaire componenten samen hoe een cel, of een organisme, zich gedraagt. De (macro)moleculen in een levende cel zijn op een complexe manier georganiseerd in tal van complexen, membranen, en subcellulaire organellen. Deze vorm is geëvolueerd als een die goed functioneert, maar brengt ook complicaties met zich mee: Er is nu noodzaak tot het uitvoeren van ingewikkelde transport- en assemblage processen, en het reguleren en onderling afstemmen van de activiteit van de metabole routes die in de verschillende compartimenten actief zijn, met behulp van ingewikkelde signaal-transductie netwerken. Begrip van dit gedrag is relevant voor begrip van het functioneren van leven, en voor toepassingen zoals het ontwerpen van bijvoorbeeld nieuwe geneesmiddelen. Om de complexiteit van de moleculen en hun interacties te kunnen bevatten, hebben we theoretische modellen nodig. In deze cursus combineren we mathematische modellen om moleculair gedrag te beschrijven en begrijpen, met inzicht in de moleculaire basis van cellulair functioneren. Zo krijgen we inzicht in de manier waarop een cel reageert op zijn omgeving, en de manieren waarop wij dat gedrag kunnen manipuleren. Relevante eiwitten en hun liganden zullen op verschillende niveau’s worden bestudeerd: van gedetailleerde atomaire en moleculaire modellen tot de organisatie en interacties van de verschillende moleculen op (sub)cellulair niveau. We doen met behulp van hoorcolleges over cellulaire organisatie, in combinatie met practicum over cellulaire responsen op een signaal. Daarnaast berekenen we de conformaties van moleculen met behulp van moleculaire mechanica, waarbij ook verschillende sampling methodes worden behandeld (systematisch, stochastisch, moleculaire dynamica). Tevens zal worden ingegaan op het analyseren en voorspellen (via moleculaire docking) van de karakteristieken van eiwit-ligand interacties. Tijdens een individuele case studie zullen theoretische moleculaire mechanica berekeningen Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 42 van 94

worden gecorreleerd met experimenteel bepaalde eiwit-ligand interactie geometrieën (kristal structuren) en affiniteiten (biologische activiteit en thermodynamische data). Onderwijsvorm Hoor-, en werkcolleges; experimenteel- en computer practicum (tutorials ChemDraw, Chem 3D, MOE), case study. Toetsvorm Practicumverslagen en schriftelijk tentamen Literatuur Boek: Essential Cell Biology, Second Edition (Bruce Alberts et al.), hoofdstukken 11, 12, 15, 16, 18 en 19. Reader en hoofdstukken uit volume 4 van Comprehensive Medicinal Chemistry II: Computer-Assisted Drug Design (E-Book) Aanbevolen voorkennis Practicumverslagen en schriftelijk tentamen Doelgroep 1S

Chemie en licht Vakcode

X_430564 ()

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak In het project wordt een wervend maar veilig demonstratie-experiment ontwikkeld op basis van in teamverband verzamelde en verwerkte informatie. De studenten bedenken zelf welke laboratoriumexperimenten nodig zijn en voeren die ook uit. Het project draagt in samenhang met Structuuropheldering en Spectroscopie bij aan de verwerving van theoretische en praktische kennis van de discipline. De vaardigheden die worden aangeleerd omvatten presenteren, informatieverwerking en projectmatig werken in teamverband. Inhoud vak Licht speelt in de moderne scheikunde een belangrijke rol. Het leven op aarde is mogelijk door de omzetting van de energie van het zonlicht via moleculaire fotochemische processen. Door chemici wordt de interactie van licht met materie ook veel gebruikt in technieken die ons iets leren over de structuur van materialen en moleculen (spectroscopie). In dit project ontwikkel je in een groep van 3-4 studenten in korte tijd een visueel aantrekkelijk (bio)chemisch demonstratie-experiment. Na een kort inleidend college verzamel je actief kennis met behulp van verschillende informatiebronnen en eigen experimenten in het laboratorium. Hiervoor zijn 7 dagdelen in het tweede semester ingeroosterd. Op het afsluitende symposium worden de experimenten gedemonstreerd en toegelicht voor een publiek bestaande uit Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 43 van 94

medestudenten, docenten en andere belangstellenden. Onderwijsvorm Werkgroepen: 1 dubbel-uur hoorcollege; 7 dagdelen practicum, slotsymposium (1 dag) Toetsvorm - Beoordeling projectmatig werken - Beoordeling resultaat: demonstratie-experiment + beschrijving van de uitvoering - Beoordeling resultaat: poster Aanbevolen voorkennis Scheikundevakken periode 1,2 en 3 Doelgroep 1S

Climate and Policy Course code

AM_450188 ()

Period

Period 3

Credits

6.0

Language of tuition

English

Faculty

Fac. der Aard- en Levenswetenschappen

Coordinator

prof. dr. J. Gupta

Teaching staff

prof. dr. J. Gupta

Teaching method(s)

Seminar

Course objective After studying this course, students should be able to define and explain key concepts of relevance to the climate change governance issue; understand the causes, impacts and effects of climate change and the key scientific controversies in the regime; be able to identify, explain and analyze the various policy options for mitigation and adaptation at different levels of governance; be able to understand the key political challenges in the climate change regime, the common problems facing all countries, the coalitions in the regime, the NorthSouth, North-North, South-South, European and domestic political issues; be able to explain the long-term objective, the principles, the commitments of countries and other key elements of the Climate Change Convention, the quantified commitments of developed countries, and the flexibility mechanisms under the Kyoto Protocol; be able to explain the role of forestry in the climate change regime, and the various aspects of policy with respect to deforestation and land degradation; be able to define and explain the role of market mechanisms in the climate change regime, their advantages and disadvantages, and their potential in addressing the climate change problem; be able to integrate the information learnt thus far to assess and identify possible long term solutions to the climate change problem and the research questions that emerge from a study of the climate change regime; and be able to make a judgment about which principles, policy instruments and approaches are likely to be most efficient, equitable and/or effective in addressing the climate change problem.


6-3-2013 - Pagina 44 van 94

Course content International policy on human-induced climate change and its mitigation is a hotly debated subject. Current (international) climate policy is the result of a complex and long-lasting negotiation process at multiple levels of governance. In this process, the science of the complex earth and climate system is closely linked to questions on the socio-economic effects of climate change, the options for global environmental governance as determined by the structure of international organizations, international economic and political relations and environmental law. These close relations between earth system research and economic/political questions make this course an interesting subject for students with a bachelor’s degree in different subjects . The course includes: - an overview of the science of climate change, its impacts (IPCC Fourth Assessment Report) uncertainties, mitigation, adaptation; - climate change policy options at multiple levels of governance; - analysis of the political challenges in climate change and the positions of different countries and actors; - assessment of the international legal instruments including the Climate Change Convention and the Kyoto Protocol, - assessment of the economics of climate change including analysing the flexible mechanisms (Emission trading, Clean Development Mechanisms) and options for Post Kyoto measures; and paper discussions on a topical area of climate governance. Form of tuition The course consists of 7-8 interactive lectures including class presentations and uses modern didactic approaches, films, and role play to help the students internalize many of the concepts and theoretical approaches developed. Type of assessment The students will be examined on the basis of a paper (50%); and a closed book written examination (50%). Course reading Reader

Climate Modelling Course code

AM_450004 ()

Period

Period 3

Credits

6.0

Language of tuition

English

Coordinator

prof. dr. H. Renssen

Teaching staff

prof. dr. H. Renssen

Teaching method(s)

Seminar, Computer lab

Course content Geological archives show convincingly that the climate system experiences variability on a wide range of time-scales. For Quaternary studies, climate variations at the following time-scales are most important: glacials-interglacials, millennia and centuries-decades. This course focuses at the mechanisms behind these variations, thereby using climate models as a tool, i.e. numerical computer models in which the dynamics of the climate system are calculated. The combination of Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 45 van 94

these models and geological data will be treated extensively. The course consists of lectures giving an overview of climate models and their application (different types for different time-scales) and of discussion meetings, in which students discuss the recent literature in detail. In this way the course considers case studies for the different time-scales and deals with recent developments in climate modelling. The following two questions are central to the course: 1) What is the driving mechanism behind climate change at a particular time-scale? 2) How can we optimise the combination of climate models and geological data in order to increase our understanding of climate evolution? Form of tuition Lectures, discussion meetings and computer exercises. Type of assessment Compulsory participation in discussion meetings, computer exercises, oral presentation and written exam. Course reading Lecture notes and selected papers (made available through Blackboard).

Computational (Pharmaco)Chemistry Vakcode

X_435350 (435350)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)

prof. dr. F.M. Bickelhaupt, dr. C. Fonseca Guerra, dr. D.P. Geerke

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Practicum

Doel vak Het leren van moderne quantumchemische methoden en met name het toepassen daarvan bij het computerondersteund oplossen van chemische problemen. Inhoud vak Computational chemistry is niet meer weg te denken uit de moderne scheikunde. Tal van moleculaire eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. De experimentator kan hierdoor veel gerichter te werk gaan en het beoogde doel sneller, met minder kosten en een lager verbruik aan grondstoffen en energie bereiken. Eén van de hoofddoelen van de cursus is het leren van en werken met state-of-the-art quantumchemische en moleculair mechanische methoden en computersoftware. Hierbij komen naast de traditionele ab initio-methoden (bijv. Hartree-Fock en post-Hartree-Fock-theorie) o.a. dichtheidsfunctionaaltheorie (DFT), semieëmpirische en krachtveld methoden aan de orde. Deze worden onder meer toegepast op het voorspellen van structuren, het verkennen van potentiaaloppervlakken


6-3-2013 - Pagina 46 van 94

(bijv. t.b.v. het verkrijgen van reactieprofielen), en moleculaire dynamica (bijv. t.b.v. het onderzoeken van eiwitdynamica en eiwitvouwing). Een tweede hoofddoel is het verkrijgen van de vaardigheid (experimenteel) chemische problemen te vertalen naar een computationele aanpak, die tot een praktische oplossing leidt. Er zal voorts een begin worden gemaakt met het interpreteren van berekende resultaten in termen van modellen van de elektronische structuur. Een wezenlijk punt in deze cursus is het unificerende karakter van computational chemistry: dezelfde theoretische methoden dienen als gereedschap voor het oplossen van diverse vraagstukken uit alle gebieden van de scheikunde, van theoretische en organische chemie tot farmaco- en biochemie. Onderwijsvorm De cursus bestaat uit een hoorcollege en een practicum, waarin een kort researchproject is opgenomen. Toetsvorm Tentamen en practicum (verslagen en presentatie). Zowel voor het tentamen als voor het practicum moet een voldoende behaald worden. Literatuur Cramer, C.J. Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models. Chichester: Wiley-VCH, 2002. Aanbevolen voorkennis Moleculaire Modelling (voor 3F), Moleculaire Quantummechanica (voor 3S) Doelgroep 3F, 3S Overige informatie In verband met het verschil in voorkennis van de studenten S en F is er voor een aantal colleges onderscheid gemaakt in verplichte en vrijwillige college-uren. De twee college-uren "Symmetrie en Hückel-theorie" zijn verplicht voor 3F studenten en vrijwillig voor 3S studenten. De twee college-uren "Modeling" zijn verplicht voor 3S studenten en vrijwillig voor 3F studenten.

Computationele organische chemie Vakcode

X_435017 (435017)

Periode


Credits

9.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. A.W. Ehlers

Doel vak Kennismaken met moderne "computational chemistry" methoden om de structuur, eigenschappen en de reactiviteit van organische moleculen te onderzoeken.


6-3-2013 - Pagina 47 van 94

Inhoud vak In de eerste week van deze cursus word je vertrouwd gemaakt met de methodes en de quantumchemische rekenprogramma's. Daarna ga je een deelprobleem uit lopend onderzoek zelfstandig bestuderen onder begeleiding van een promovendus en/of docent. De nadruk ligt hierbij op de voorspellende waarde van theoretische methoden t.o.v. experimenteel toegankelijke grootheden bij het identificeren van organische verbindingen. Het berekenen van de te verwachten NMR, IR of UV/vis spektra is hierbij van groot belang. Maar ook de bepaling van de absolute configuratie van optisch actieve stoffen met behulp van berekende VCD spectra behoort tot de mogelijke opdrachten. Onderwijsvorm Practicumproject. Literatuur Foresman, J.B., and Frisch, A., Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods 2nd ed. Gaussian Inc. of in overleg met de docent. Aanbevolen voorkennis Organische chemie I & II, Computational Chemistry. Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Current Topics in Medicinal Chemistry Vakcode

X_430542 (430542)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. I.J.P. de Esch

Inhoud vak De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Overige informatie Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3 studiepunten (vakcode 430542) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430543). Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Current Topics in Medicinal Chemistry Vakcode

X_430543 (430543)

Periode



6-3-2013 - Pagina 48 van 94

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. I.J.P. de Esch


Experiments in Green and Sustainable Chemistry Vakcode

X_430556 (430556)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. E. Ruijter

Docent(en)

dr. E. Ruijter

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Praktische vaardigheden aan leren die van belang zijn bij het ontwerpen en uitdenken van duurzame chemische processen vanuit een chemisch perspectief. Inhoud vak Aan de hand van experimenten, vaak met een link naar de praktijk in de industrie, worden de principes en concepten achter green chemistry en duurzame chemische ontwikkeling geïllustreerd. Katalyse-experimenten, een-pots syntheses, ionic liquids, afval reductie en atoom/stap efficiëntie, fotochemie en fotokatalyse, biofuels etc etc. komen aan bod Onderwijsvorm Practicum. Toetsvorm Verslagen van de practicum opdrachten. Literatuur Experiments in Green and Sustainable Chemistry, Eds. Roesky and Kennepohl. Weinheim Germany: Wiley-VCN (ISBN 9783527325467). Aanbevolen voorkennis Organische chemie 1 & 2 en Green Chemistry


6-3-2013 - Pagina 49 van 94

Doelgroep 3S Overige informatie Het practicum maakt deel uit van de minor Energie en Duurzame Chemie.

Fysica en medische fysica 2 Vakcode

X_430061 (430061)

Periode

Periode 5

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. R.N. Frese

Docent(en)

prof. dr. M.L. Groot, dr. R.N. Frese

Lesmethode(n)


Doel vak Doelstelling van het college Fysica en medische fysica II is de discussie van basisbegrippen van de natuurkunde uit te breiden en diegene te introduceren die ten grondslag liggen aan de elektrische en magnetische verschijnselen in de levende natuur. Inhoud vak Fysica is de wetenschap die de eigenschappen van de materie beschrijft in termen van natuurwetten. De fysica speelt bij het begrijpen van de eigenschappen van de levende materie en het menselijk lichaam een essentiële rol. In dit college zullen de verschillende wetten behandeld worden die aan het einde de Maxwell vergelijkingen opleveren, die alle elektromagnetische verschijnsels beschrijven kunnen. In enkele colleges komt de relatie tussen elektromagnetisme en verschillende essentiële levensprocessen aan de orde. Onderwijsvorm Voorstudie, vragencollege, werkcollege en zelfstudie. Literatuur Giancoli, D.C., Physics for Scientists and Engineers with Modern Physics 4th ed. New Jersey: Prentice Hall. Doelgroep 1MNW, 1S, 1SBI

Fysica van bio-energie 2 Vakcode

X_420527 (420527)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.T.M. Kennis

Docent(en)

dr. J.T.M. Kennis

Lesmethode(n)

Hoorcollege


6-3-2013 - Pagina 50 van 94

Doel vak Het doel van het vak is het ontwikkelen van inzicht in de voor ons uiterst belangrijke reacties waarbij water wordt gesplitst. Watersplitsing is de basis van bijna alle leven: bij de fotochemische reacties van oxygene fotosynthese is de eerste stap het splitsen van twee watermoleculen in zuurstof, vier protonen en vier electronen met behulp van vier fotonen. Het precieze mechanisme, waarbij een cluster van vier mangaanatomen een essentiele rol speelt, is niet bekend maar er wordt intensief onderzoek naar gedaan. Beter inzicht in de mechanismes die bij deze reacties een rol spelen, en de ontwikkeling van kunstmatige katalysatoren die iets dergelijks kunnen bewerkstelligen of zelfs de directe splitsing van water in zuurstof en waterstof mogelijk maken, vormen een belangrijk onderdeel van de ontwikkeling van een waterstofeconomie. Inhoud vak Het eerste deel van het college (~1 ECTS) zal gewijd worden aan een chemische inleiding in de beschrijving van chemische reacties en redoxprocessen. Vervolgens zal uitgebreid aandacht worden besteed (~3 ECTS) aan de thermodynamica van redoxreacties, waarbij begrippen als Gibbs vrije energie, efficiency, en de vergelijking van Nernst aan de orde komen. Hierbij zullen ook toepassingen zoals brandstofcellen en de electrochemische cel worden bestudeerd. De dynamica van electronoverdrachts processen - Marcus theorie - en de invloed van solvatatie, zowel voor electronoverdracht in oplossing, in eiwitten, als aan electrodes, sluiten dit onderdeel af. In het laatste onderdeel van het college (~2 ECTS) zullen specifieke aspecten van watersplitsing en H2 productie besproken worden. Hierbij wordt gedacht aan zowel biologische methodes (mangaancomplexen, hydrogenases) als aan organometaal verbindingen die deze processen katalyseren. Onderwijsvorm Hoorcollege en werkcollege gecombineerd met huiswerkopgaven. Toetsvorm Schriftelijk tentamen Doelgroep 3N, 3S, mi-En, mi-FvL

Gecondenseerde materie 2 Vakcode

X_428003 (428003)

Periode

Periode 1+2

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Lesmethode(n)

Hoorcollege

Inhoud vak De vakbeschrijving is te vinden via http://studiegids.uva.nl/web/uva/sgs/nl/c/983.html.


6-3-2013 - Pagina 51 van 94

Doelgroep 3N, 3S, mi-En Overige informatie Opgave via studieweb http://studieweb.student.uva.nl, is verplicht

Geschiedenis van de natuurwetenschappen Vakcode

X_420148 (420148)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. F.H. van Lunteren

Docent(en)

prof. dr. F.H. van Lunteren

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Inhoud vak Dit college behandelt aard en achtergronden van een aantal dramatische omslagpunten in het onderzoek van de natuur in een periode lopend van de klassieke Oudheid tot aan de 20ste eeuw. Behandeld worden onder meer de klassieke tradities, de Arabische wetenschap, de copernicaanse revolutie, de mechanisering van het wereldbeeld, de opkomst van het experiment, Newton, Linnaeus, de achttiende-eeuwse chemische revolutie, Darwin, Einstein en de twintigste-eeuwse revoluties in de fysica. Onderwijsvorm Hoorcollege; digitale leeromgeving Toetsvorm Tentamen. Literatuur Syllabus; collegestof op Blackboard Doelgroep 2F, 2MNW, 2N, 2S Overige informatie Alle studenten N, S, F en MNW moeten kiezen tussen Geschiedenis van de natuurwetenschappen of Maatschappelijke aspecten van wetenschap. Inlichtingen bij de docent, afdeling Algemene Vorming, De Boelelaan 1081, kamer T-036b, email: [email protected], tel. (020) 598 7979. Zie ook de website van de afdeling Algemene Vorming http://www.few.vu.nl/nl/onderzoek/algemene-vorming/index.asp

Green Chemistry Vakcode

X_430557 (430557)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit



6-3-2013 - Pagina 52 van 94

Coördinator

prof. dr. K. Lammertsma

Docent(en)


Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Kennis maken met, en analyse van, algemene ideeën achter het concept "green chemistry" en haar belang voor het ontwikkelen van duurzame chemische technologie vanuit een chemisch perspectief. Inhoud vak Duurzame technologische ontwikkeling en "green chemistry" gaan hand in hand. In dit vak komen een aantal concepten en principes aan de orde die dit illustreren. Het vak bouwt voort op Organische Chemie 1 & 2. We zullen ingaan op atom-economy en welke chemische reacties daarbij horen, maar ook chemische afvalproblematiek wordt besproken en hoe het ontwerpen van een chemisch productieproces hierbij het beste kan aansluiten. Onderwerpen als katalyse, oplosmiddelproblematiek, gebruik van biomassa, zonne-energie en het gebruik van andere alternatieve strategieën om de energieconsumptie van chemische processen te minimaliseren. Tenslotte wordt in het vak, in de vorm van een opdracht, gewerkt aan een eigen ontwerp voor een "groen" chemisch proces Onderwijsvorm Colleges, (groeps)opdrachten. Toetsvorm Schriftelijk/mondeling tentamen, opdrachten en verslagen. Literatuur Lancaster, M., Green Chemistry: An Introductory text. Cambridge: RSC (ISBN 0854046208). Aanbevolen voorkennis Organische chemie 1 & 2 voor 3S, voor mSBI in overleg met docent Doelgroep 3N, 3S, mCh-SBI, mi-En, mi-GC, mPhys-SBI Overige informatie Het college maakt deel uit van de minor Energie en Duurzame Chemie.

Heterologe expressie van biotransformatie enzymen Vakcode

X_430549 (430549)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Dit vak heeft tot doel de student zich te laten verdiepen in de strategieën en experimentele benaderingen die worden gebruikt om specifieke biotransformatie-enzymen (zoals P450s, glutathione transferases, etc.) tot expressie te brengen in cellulaire organismen. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 53 van 94

Inhoud vak Biotransformatie, ook wel metabolisme genoemd, speelt een zeer belangrijke rol in de verwerking van geneesmiddelen door het lichaam. Aan de ene kant is biotransformatie vaak bepalend voor de halfwaardetijd waarmee een geneesmiddel wordt geëlimineerd vanuit het plasma. Aan de andere kant kunnen bij metabolisme reactieve metabolieten ontstaan die met cellulair materiaal reageren, zoals eiwitten, DNA of membranen. Het menselijke genoom codeert voor enkele honderden enzymen die in meer of mindere mate bij het metabolisme van geneesmiddelen betrokken kunnen zijn. Om de rol van de enzymen beter te kunnen bestuderen, zijn voor de belangrijkste biotransformatie-enzymen expressiesystemen ontwikkeld in verschillende organismes, zoals Escherichia coli, gist, insectcellen, Salmonella typhimurium, zoogdiercellen, etc. De keuze van het organisme hangt af van het doel wat wordt beoogd, bijv. grote schaal expressie (mg-gram) voor biocatalyse of kristallisatie, lage schaal expressie voor in vitro (geno)toxiciteit experimenten. Onderwijsvorm Aan de hand van een lijst van opdrachten zal een literatuurstudie worden uitgevoerd naar eigenschappen, expressie en mutagenese van een specifiek biotransformatie-enzym. Op verschillende momenten zal de voortgang worden besproken met de docenten. Toetsvorm Van de literatuurstudie wordt een rapport gemaakt, dat in een nabespreking mondeling dient te worden toegelicht. Aanbevolen voorkennis Dit vak borduurt voort op theorie die is behandeld in de cursus Biochemie (1e jaar) en de expressie-experimenten die zijn uitgevoerd in het Geintegreerde practicum (2e jaar). Ter ondersteuning van de literatuurstudie wordt aanbevolen het volgende boek aan te schaffen of te lenen: Primrose and Twyman, Principles of Gene Manipulation and Genomics 8th ed. Dit boek wordt later ook gebruikt voor het vak 'Chemistry of life' in de master Drug Discovery and Safety. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.Studenten die dit vak wensen te doen, dienen zich twee weken van tevoren aan te melden bij dr. J.N.M. Commandeur ([email protected]). Het vak kan in voorkomende gevallen dienen als voorbereiding op een bachelorproject. Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3 studiepunten (vakcode 430548) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430549).

Inleiding bioinformatica 1 Vakcode

X_401036 (401036)

Periode

Periode 3

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands


6-3-2013 - Pagina 54 van 94

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J. Heringa

Docent(en)

prof. dr. J. Heringa

Lesmethode(n)


Doel vak We kunnen nu de DNA sequentie van ieder menselijk genoom aflezen, maar begrijpen we eigenlijk wel hoe deze genen werken en samen een levend organisme vormen? Bioinformatica richt zich op de vraag wat de biologisch betekenis en functie van DNA (en eiwit) sequenties is, en lost dit op met behulp van computationele technieken. Het vak Inleiding Bioinformatica (I en II) geeft een overzicht van de bioinformatica en de belangrijkste technieken op dit vakgebied. In Inleiding Bioinformatica I worden de belangrijkste aspecten en methoden op het gebied van genomics en sequentie analyse behandeld. Aan het eind van deze cursus kunnen studenten de biologische en computationele achtergrond van de technieken begrijpen en zelfstandig een genoom- en sequentieanalyse uit te voeren. Inhoud vak De volgende onderwerpen komen aan bod: Theorie: - Genomics en sequentie databases (genoom, sequentie, afgeleide databases, etc.) - Genome sequencing technieken - Gen voorspellingsalgoritmen - Sequentie analyse (pairwise en multiple sequence alignment, dynamic programming, sequence database searching) - Clustering, fylogenie en fylogenetische methoden - Comparative genomics Praktijk opdrachten: - Bioinformatica databases - hoe vind je een eiwit of een gen? - Multiple Sequence Alignment - hoe vergelijk je meerdere eiwit sequenties? - BLAST - zoek naar homologe sequenties van eiwitten of DNA. Onderwijsvorm 13 colleges, bestaande uit 10 hoorcolleges en 3 practica. Literatuur Xiong, J., Essential Bioinformatics, Cambridge University Press, 2006, ISBN-13: 978-0521600828. Vereiste voorkennis Voor tweedejaars studenten van een biologisch of beta discipline is geen extra voorkennis noodzakelijk. Doelgroep 2MNW, 3F, 3S, 3-SBI, mBio, mi-Sc, mi-BI Overige informatie Verplicht voor 2MNW studenten. Derdejaars Bachelor student in elke beta of life science discipline (inclusief Medicijnen) mogen instromen. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 55 van 94

Inleiding computergebruik Vakcode

X_000004 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Integrated Practical Course Vakcode

X_430516 (430516)

Periode

Periode 5

Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)

dr. J.N.M. Commandeur, dr. J. Kool

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkcollege, Practicum

Doel vak Het verkrijgen van inzicht in de toepassing van biochemische, moleculair biologische, farmacologische/toxicologische en (bio)analytische technieken in (farmaco)chemisch onderzoek. Het ontwikkelen van praktische vaardigheden om deze technieken toe te passen in een geïntegreerd onderzoeksproject. Het leren mondeling en schriftelijk presenteren van verkregen onderzoeksresultaten. Inhoud vak Technieken die in dit practicum aan bod komen zijn: - Site-directed en random mutagenese van genen van eiwitten die centraal staan in het lopende onderzoek (m.n. GPCRs, Cyt P450s); - Maken van DNA-constructen ten behoeve van (heterologe) expressie van (menselijke) eiwitten in E. coli en/of S. cerevisiae; - Identificatie, affiniteitszuivering en enzymkinetische karakterisering van geëxpresseerde enzymen m.b.v. spectrofotometrische en fluormetrische enzymbepalingen; - Gelelectroforese van eiwitten en DNA, PCR, Western blotting; - Karakterisering van geëxpresseerde receptoren en daaraan gekoppelde signaaltransductie routes in (diverse) modelsystemen middels farmacologische bindingsstudies, reportergen assays en/of second messenger analyses; - Opzetten van (bio)analytische methodes (HPLC, GC) ten behoeve van de identificatie en kwantificatie van stabiele en reactieve metabolieten die gevormd worden door geëxpresseerde mutante en wild-type vormen van Cyt P450. Onderwijsvorm Dit practicum heeft de opzet van een geïntegreerd onderzoeksproject en wordt afgesloten met een plenaire posterpresentatie. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 56 van 94

Toetsvorm Verslagen, Meetrapporten en labjournaal Literatuur Practicumhandleiding en aangeleverde literatuur. Aanbevolen voorkennis Levende Chemie Biochemie Van Molecuul tot Medicijn Innovatieproject Geneesmiddelen Project Analytische Chemie Farmaceutische Toxicologie Doelgroep 2F, 2S

Introduction Entrepreneurship Course code

S_INTROE ()

Period

Period 1

Credits

6.0

Language of tuition

English

Faculty

Faculteit der Sociale Wetenschappen

Coordinator

dr. I.A.M. Wakkee

Teaching staff

dr. I.A.M. Wakkee

Teaching method(s)

Lecture, Study Group

Course objective After completing the course students will: - Be familiar with the key concepts of the domain of entrepreneurship research. - Have developed knowledge and insight into the core processes of entrepreneurship as the pursuit of opportunities. - Have developed an understanding of the function and position of entrepreneurs and entrepreneurship in society. - Have developed an understanding of different theoretical perspectives of entrepreneurship as a field of research. In relation to the development of skills they have developed the ability to: - Formulate arguments in group discussions. - Critically reflect on the literature. - Meet with and discuss entrepreneurship related topics with entrepreneurs in various sectors. Course content This course lies the theoretical foundation for the Minor programme. Students are introduced to the basic concepts of entrepreneurship (opportunities, entrepreneurial process, role of the entrepreneur in the entrepreneurial process) and different theoretical visions (e.g. Schumpeter, Kirzner, Hayek, Zahra, Venkateraman, Shane).


6-3-2013 - Pagina 57 van 94

Form of tuition Interactive lectures. Students prepare for the lectures by studying selected reading materials and by preparing a number of individual assignments or group based assignments such as preparing and analysing interviews with entrepreneurs and professionals working with entrepreneurs; analysing policy reports and conducting international comparisons. Type of assessment Active participation, Completion of assignments, written exam Course reading To be announced Target group Students of the Minor Entrepreneurship, bijvakkers, exchange

Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie Vakcode

X_435026 (435026)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het introduceren van massaspectrometrische technieken die gebruikt kunnen worden voor de analyse van biologisch actieve verbindingen. Inhoud vak Massaspectrometrie is tegenwoordig de meest gebruikte methode om chemische verbindingen te karakteriseren, te identificeren en kwantitatief te bepalen. Allereerst zullen alle onderdelen van de verschillende typen massaspectrometers worden besproken, van massaspectometrie met de verschillende scheidingsmethoden. Tot slot zullen toepassingen aan de orde komen op het gebied van de bio-analyse, metabolieten onderzoek, schreeningsmonitoringsprogramma's en karakteriseren en identificatie van complexe macro-moleculaire (bijv. eiwitten) systemen. Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk worden gevolgd. Literatuur Basisliteratuur en informatie van het internet. Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische chemie. Doelgroep 3F, 3S, 3MNW


6-3-2013 - Pagina 58 van 94

Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken Vakcode

X_435028 (435028)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het doel is het verwerven van van theoretisch en/of praktisch inzicht aan de hand van een goed gedefinieerd bio-analytisch probleem. Inhoud vak De verschillende vormen van vloeistofchromatografie zijn tegenwooordig de meest gebruikte methoden om chemische verbindingen kwalitatief en/of kwantitatief te bepalen. Allereerst zullen de verschillende vormen van vloeistofchromatografie en de hierbij horende detectietechnieken worden besproken. Vervolgens zal uitgebreid worden inggegaan op de monstervoorbewerkingstechnieken die gebruikt kunnen worden. Tot slot zullen toepassingen aan de orde komen op het gebied van de bio-analyse, metabolieten onderzoek, screeningsmonitoringsprogramma's en karakteriseren en identificatie van complexe macro-moleculaire (bijv. eiwitten) systemen. Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk worden gevolgd. Toetsvorm Mondeling tentamen Literatuur Basisliteratuur en informatie van het internet. Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische chemie. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Keuzevak Computational Medicinal Chemistry and Toxicology Vakcode

X_430546 (430546)

Periode


Credits

3.0


6-3-2013 - Pagina 59 van 94

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in computersimulaties aan eiwitten. Inhoud vak Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen. Onderwijsvorm Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte literatuur, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart worden gebracht. Toetsvorm Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats. Literatuur Wordt beschikbaar gesteld door de docent. Aanbevolen voorkennis Dit vak bouwt verder op theorie die is behandeld in vakken als Moleculaire Modeling voor Farmacochemici (2F), en Computational (Pharmaco)Chemistry (3F en 3S). Doelgroep 3F Overige informatie Studenten die het vak wensen te doen, wordt geadviseerd zich twee weken van tevoren aan te melden bij genoemde docent. Het vak kan in voorkomende gevallen dienen als voorbereiding op een bachelorproject. Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3 studiepunten (vakcode 430546) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430547). Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Keuzevak Computational Medicinal Chemistry and Toxicology Vakcode

X_430547 (430547)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands


6-3-2013 - Pagina 60 van 94

Faculteit


Coördinator


Doel vak Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in computersimulaties aan eiwitten. Inhoud vak Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen. Onderwijsvorm Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte literatuur, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart worden gebracht. Toetsvorm Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats. Literatuur Wordt beschikbaar gesteld door de docent. Aanbevolen voorkennis Dit vak bouwt verder op theorie die is behandeld in vakken als Moleculaire Modeling voor Farmacochemici (2F), en Computational (Pharmaco)Chemistry (3F en 3S). Doelgroep 3F Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent. Studenten die het vak wensen te doen, wordt geadviseerd zich twee weken van tevoren aan te melden bij genoemde docent. Het vak kan in voorkomende gevallen dienen als voorbereiding op een bachelorproject. Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3 studiepunten (vakcode 430546) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430547).

Keuzevak Farmacochemie - Medicinal Chemistry, DDTF Vakcode

X_430544 (430544)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. I.J.P. de Esch


6-3-2013 - Pagina 61 van 94


Keuzevak Fysische Chemie Vakcode

X_430540 (430540)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent. Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3 studiepunten (vakcode 430540) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430541).

Keuzevak Fysische Chemie Vakcode

X_430541 (430541)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent. Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3 studiepunten (vakcode 430540) kan in overleg met de coordinator worden Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 62 van 94

uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430541).

Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction Vakcode

X_435032 (435032)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Doel vak Het introduceren van luminescentietechnieken die gebruikt kunnen worden voor de analyse van biologisch actieve verbindingen. Inhoud vak De onderwerpen die aan de orde komen omvatten de principes van fluorescentie, fosforescentie, lang-levende luminescentie, chemiluminescentie en bioluminescentie. Verder zal er aandacht worden besteed aan 'energy-transfer' mechanismen en andere processen die de luminescentie van organische processen beinvloeden. De mogelijkheden van het invoeren van luminescentie 'probes' en hoge resolutietechnieken zullen eveneens aan de orde komen. Tot slot zullen een aantal bio-analytische toepassingen worden besproken waarbij technieken als laser fluorescentie en tijd-opgelost meten niet vergeten zullen worden. Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch gedeelte. Het theoretisch deel kan afzonderlijk gevolgd worden (zie de opmerking bij deze vakomschrijving). Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische en fysische chemie. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent. De variant van dit vak van 6 studiepunten (vakcode 435033) behandelt beide gedeeltes; de variant van 3 studiepunten (vakcode 435032) behandelt alleen het theoretische gedeelte.

Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction Vakcode

X_435033 (435033)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese


6-3-2013 - Pagina 63 van 94

Doel vak Het introduceren van luminescentietechnieken die gebruikt kunnen worden voor de analyse van biologisch actieve verbindingen. Inhoud vak De onderwerpen die aan de orde komen omvatten de principes van fluorescentie, fosforescentie, lang-levende luminescentie, chemiluminescentie en bioluminescentie. Verder zal er aandacht worden besteed aan 'energy-transfer' mechanismen en andere processen die de luminescentie van organische processen beinvloeden. De mogelijkheden van het invoeren van luminescentie 'probes' en hoge resolutietechnieken zullen eveneens aan de orde komen. Tot slot zullen een aantal bio-analytische toepassingen worden besproken waarbij technieken als laser fluorescentie en tijd-opgelost meten niet vergeten zullen worden. Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch gedeelte. Het theoretisch deel kan afzonderlijk gevolgd worden (zie de opmerking bij deze vakomschrijving). Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische en fysische chemie. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent. De variant van dit vak van 6 studiepunten (vakcode 435033) behandelt beide gedeeltes; de variant van 3 studiepunten (vakcode 435032) behandelt alleen het theoretische gedeelte.

Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. Vakcode

X_430545 (430545)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. I.J.P. de Esch


Keuzevak Multidimensionale scheidingstechnieken Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 64 van 94

Vakcode

X_435037 (435037)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. H. Lingeman

Doel vak Het doel is het verwerven van theoretisch en/of praktisch inzicht aan de hand van een goed gedefinieerd complex analytisch probleem. Inhoud vak Het primaire doel is het introduceren van complexe analytische systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde multidimensionale systemen en 'high-throughput' systemen zullen aan de orde komen. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende detectiesystemen (bijv. massaspectrometrie). Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk worden gevolgd. Toetsvorm Mondeling tentamen Literatuur Basisliteratuur en informatie van het internet. Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische chemie. Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Keuzevak Spectroscopische detectieen identificatietechniek Vakcode

X_435039 (435039)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Doel vak Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald thema uit het grote aanbod van spectroscopische detectieen identificatietechnieken. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 65 van 94

Inhoud vak Het ontwikkelen en testen van nieuwe spectroscopische technieken die voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name om laser detectiesystemen voor chromatografie of electroforese en om Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie sytemen voor de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen. Onderwijsvorm Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch gedeelte. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk worden gevolgd. Het volgen van zowel het theoretisch deel als het praktisch deel levert 3 extra studiepunten op voor een totaal van 6 studiepunten. Aanbevolen voorkennis Basiskennis analytische en fysische chemie. Doelgroep 3F, 3MNW, 3S Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Keuzevak Spectroscopische detectieen identificatietechniek Vakcode

X_430568 ()

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Keuzevak Theoretische Chemie Vakcode

X_430538 (430538)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent. Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3


6-3-2013 - Pagina 66 van 94

studiepunten (vakcode 430538) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430539).

Keuzevak Theoretische Chemie Vakcode

X_430539 (430539)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent. Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent. Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3 studiepunten (vakcode 430538) kan in overleg met de coordinator worden uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430539).

Levende chemie Vakcode

X_430569 ()

Periode

Periode 2

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. M.H. Siderius

Docent(en)

dr. M.H. Siderius, J.C. Vos

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van deze ce gebruiken voor groei en deling, als ook basisprincipes van de moleculaire biologie van de levende cel, de manier waarop genetische informatie belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld. Inhoud vak Er wordt begonnen met het bespreken van de structurele en functionele opbouw van de levende cel, waarna de verschillende soorten (macro)moleculen die in de cel aanwezig zijn worden behandeld. Aandacht voor eiwitstructuur en functie, met name in het metabolisme (Enzym activiteit, Michaelis-Menten kinetiek, Allostere effecten). De afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen (koolhydraten en vetten) worden rudimentair besproken. Tevens de behandeling van de structuur en functie van DNA en de manier waarop DNA in de celkern is opgevouwen tot chromosomen en de aspecten van DNA replicatie en herstel.


6-3-2013 - Pagina 67 van 94

Onderwijsvorm Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen Toetsvorm Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw, bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie, genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en energiehuishouding aan de orde komen. Literatuur Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. Hoofdstukken 1 t/m 6, aangevuld met delen zoals aangegeven in de studiehandleiding Doelgroep 1F, 1MNW, 1S, 1-SBI, 1W-B, mBio

Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen Vakcode

X_420153 (420153)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen

Docent(en)

prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak De student beschikt over kennis en inzicht in de interacties tussen wetenschap en maatschappij. De student beschikt over kennis en inzicht in de dynamiek van wetenschap- en technologie ontwikkeling en de rol van sociale processen daarbij. De student beschikt over kennis en inzicht in moderne instrumenten zoals, technology assessment en interactief beleid etc om wetenschap in maatschappelijk gewenste richtingen te sturen. De student is in staat om een gefundeerd oordeel geven over maatschappelijke en ethische aspecten van wetenschap. De student is instaat om kritisch te reflecteren op zijn maatschappelijke verantwoordelijkheid als wetenschapper. Inhoud vak De cursus gaat in op de wisselwerking tussen wetenschap, technologie en samenleving. Aan de hand van concrete, actuele vraagstukken wordt eerst ingegaan op recente knelpunten, dilemma's en controverses in de relatie wetenschap-maatschappij. Daarna gaat de cursus in op diverse inzichten en instrumenten (`Technology Assessment'), ethische aspecten, interactief beleid en maatschappelijk verantwoord ondernemen, die van belang zijn bij het tot stand brengen van een pro-actieve oordeels en besluitvorming over W&S ontwikkelingen. Na het theoretische gedeelte van


6-3-2013 - Pagina 68 van 94

de cursus, schrijf je samen met een groepje studenten een essay. In dit essay reflecteer je op een actuele natuurwetenschappelijke ontwikkeling die belangrijke maatschappelijke consequenties met zich meebrengt. Onderwijsvorm Hoorcollege Toetsvorm Schrijven van een adviesrapport –groepswerk en individuele beoordeling Literatuur Syllabus. Doelgroep 2F, 2MNW, 2N, 2S Overige informatie Alle studenten N, S, F en MNW moeten kiezen tussen Geschiedenis van de natuurwetenschappen en Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen. Inlichtingen bij Joske Bunders kamer U-552 de Boelelaan 1081, tel. (020) 598 7030.

Macromoleculen en katalyse Vakcode

X_435450 (435450)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Doel vak Het kennisnemen van en inzicht verkrijgen in enkele belangrijke aspecten (synthese, eigenschappen, toepassingen) van synthetische macromoleculen. Inhoud vak In deze cursus wordt kort stilgestaan bij natuurlijk voorkomende macromoleculen, maar de nadruk ligt op synthetische polymeren. Er wordt een overzicht gegeven van de syntheseroutes, eigenschappen, en toepassingen van verschillende klassen polymeren. Aan de orde komen begrippen als: additie-polymeren, condensatie-polymeren, radicaal polymerisaties, ionische polymerisaties, gekatalyseerde polymerisaties (Ziegler-Natta), cross-linking, thermoplastics, fibers, elastomeren, thermohardende harsen, kunststof recycling. Onderwijsvorm Na een beperkte introductie waarbij ook twee experimenten zullen worden uitgevoerd (polymerisatie en depolymerisatie) zullen de studenten zich de stof vooral eigen maken door een speciale studie te maken van een industrieel belangrijk polymeer, daarover een korte scriptie te schrijven en de inhoud hiervan te presenteren. Literatuur


6-3-2013 - Pagina 69 van 94

Clayden e.a., Organic Chemistry. Oxford: Oxford University Press, 2001. hoofdstuk 52 en aanvullend materiaal. Aanbevolen voorkennis Organische chemie I en II Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Mentoraat / Tutoraat Vakcode

X_000008 ()

Periode

Semester 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Lesmethode(n)


Overige informatie Iedere eerstejaars student Business Analytics is verplicht deel te nemen aan het Eerstejaars mentoraat in periodes 1 en 2. Het met een voldoende afronden van het vak Wiskunde wereldwijd is alleen mogelijk indien is deelgenomen aan het Eerstejaars mentoraat.

Minorproject Energie Vakcode

X_420530 (420530)

Periode

Periode 1+2+3

Credits

12.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. R.J. Wijngaarden

Docent(en)


Lesmethode(n)

Practicum

Doel vak Het verwerven van praktische of theoretische ervaring met energie-opwekking, -besparing, -opslag, of -conversie. Inhoud vak Samen met onerzoekers van een van de vakgroepen die onderzoek doen op het gebied van energie, wordt een onderzoeksproject uitgevoerd op een van de gebieden energie-opwekking, -besparing, -opslag, of -conversie. Van onderzoek wordt schriftelijk (in de vorm van een onderzoeksrapport of artikel) en mondeling (in de vorm van een voordracht) verslag gedaan. Doelgroep


6-3-2013 - Pagina 70 van 94

3N, miEn

Minorproject Energie Vakcode

X_420538 (420538)

Periode

Periode 1+2+3

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Doel vak Het verwerven van praktische of theoretische ervaring met energie-opwekking, -besparing, -opslag, of -conversie. Inhoud vak Samen met onerzoekers van een van de vakgroepen die onderzoek doen op het gebied van energie, wordt een onderzoeksproject uitgevoerd op een van de gebieden energie-opwekking, -besparing, -opslag, of -conversie. Van onderzoek wordt schriftelijk (in de vorm van een onderzoeksrapport of artikel) en mondeling (in de vorm van een voordracht) verslag gedaan. Doelgroep 3N, miEn

Moleculaire quantummechanica Vakcode

X_430571 ()

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)


Doel vak • Het verkrijgen van inzicht in de beginselen van de quantummechanica. • De golffunctie en energie kunnen berekenen voor exact oplosbare modelsystemen • Het kunnen toepassen van kwalitatieve MO theorie voor eenvoudige verbindingen Inhoud vak De onderwerpen die behandeld zullen worden zijn: De principes van de quantummechanica, de Schrödinger vergelijking. Modelsystemen: vrij deeltje, deeltje in een doos, het waterstofatoom. Electronspin en het Pauli principe. Elektronenstructuur van atomen. Variatietheorema, seculairvergelijking en chemische binding in twee-atomige moleculen. De toepassing van (kwalitatieve) MO-theorie op moleculaire structuur. De Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 71 van 94

rol van kinetische en potentiële energie in de chemische binding. Onderwijsvorm Hoor-, en werkcolleges. Toetsvorm Schriftelijk tentamen Literatuur Collegedictaat. Ter aanvulling worden delen van Atkins' Physical Chemistry aangeraden. Aanbevolen voorkennis Chemische Binding. Lineaire algebra. Calculus 1 en 2. Doelgroep 2S

Natuurstoffen Vakcode

X_435440 (435440)

Periode


Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. E. Ruijter

Doel vak Doel van deze cursus is het verkrijgen van een overzicht over de structuur, eigenschappen en biosynthese van de verschillende klassen van natuurstoffen. Inhoud vak Aansluitend op de basiskennis organische chemie van het eerste en tweede studiejaar worden in deze cursus een aantal aspecten van de natuurstofchemie behandeld. De biologische activiteit van vele natuurstoffen hangt nauw samen met hun structurele kenmerken. De structurele kenmerken van met name vetzuren, suikers, aminozuren, terpenen en steroïden, alkaloïden en flavonoïden komen aan de orde. Hun specifieke rol in de natuur en een aantal specifieke fysische en chemische eigenschappen komen aan bod. In de cursus ligt een sterke nadruk op de biosynthese van natuurstoffen. Onderwijsvorm De student bestudeert zelfstandig meerdere hoofdstukken uit het cursusboek, waarbij de docent steeds beschikbaar is voor vragen. Toetsvorm Mondeling tentamen Literatuur Medicinal Natural Products, P.M. Dewick, 3rd Ed., Wiley (2009). ISBN: 978-0-470-74167-2 Aanbevolen voorkennis


6-3-2013 - Pagina 72 van 94

Organische Chemie 1, 2 en 3 en Biochemie Doelgroep 3F, 3S Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Nuclear Chemistry Vakcode

X_430558 (430558)

Periode

Periode 2

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak De mogelijkheden én problemen van het gebruik van kernenergie vanuit een chemisch perspectief kritisch beschouwen. Inhoud vak In dit college komen verschillende aspecten van het gebruik van kernenergie aan de orde. Na een introductie die typen van radioactief verval en gecontroleerde kernsplitsing behandelt, wordt ingegaan op chemische aspecten van het gebruik van kernenergie. Onderwerpen die aan bod komen zijn hierbij: mijnbouw en zuivering van actinides, verrijking, omzetten naar brandstof, opwerking en langetermijn opslag van gebruikte brandstof. Naast deze chemische aspecten wordt ook aandacht besteed aan maatschappelijke aspecten als veiligheid en (non)proliferatie. Onderwijsvorm Colleges, (groeps)opdrachten. Toetsvorm Schriftelijk tentamen en verslagen van de gemaakte opdrachten. Literatuur Bryan, J.C., Introduction to Nuclear Science. CRC Press, 2009 (ISBN 978-1-4200-6164-2). Het hoorcollege maakt gebruik van delen van dit boek. Aanbevolen voorkennis Chemie op 2e jaars niveau. Doelgroep 3F, 3N, 3S, mi-En, mi-MC, mi-AMC, mi-GC

Organische chemie 1


6-3-2013 - Pagina 73 van 94

Vakcode

X_435091 (435091)

Periode

Periode 5

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)

prof. dr. K. Lammertsma, prof. dr. ir. R.V.A. Orru

Lesmethode(n)


Doel vak Het college beoogt het bijbrengen van kennis van de organische chemie waarmee men in staat moet zijn: a) te voorspellen hoe een bepaalde functionele groep of een combinatie van verschillende functies onder gegeven omstandigheden zal reageren. b) het verloop van een reactie te beschrijven aan de hand van het mechanisme c) de volgorde van de verschillende reacties in een eerstapssynthese te begrijpen Inhoud vak Dit college concentreert zich op de driedimensionale structuur van diverse functionele groepen en op de relatie tussen structuur en reactiviteit. Voortbouwend op de kennis van atoom en molecuulbouw en de MO-theorie komen aspecten van structuur aan de orde: de structuur van alkanen, cycloalkanen, alkenen en alkynen, hybridisatie, conformatieanalyse, reactieve deeltjes, nomenclatuur, stereochemie, chiraliteit, resonantie, aromaticiteit, reactietypen. In het college is ruim plaats (10 uur) voor het verwerken van de leerstof door het maken van vraagstukken en het oefenen met molecuulmodellen. Deze vraagstukken vormen zowel de intermezzo's in het hoorcollege als het hoofdbestanddeel van opdrachten uit de studiehandleiding, die tijdens werkcollege-uren worden besproken. Onderwijsvorm Hoorcollege 16 uur; werkcollege 9 uur. Toetsvorm De stof wordt schriftelijk getentamineerd. Literatuur "Organic Chemistry" Clayden, Greeves, Warren & Wothers, Oxford University press (ISBN 019850346). Aanbevolen voorkennis Bij de behandeling van de leerstof wordt ervan uitgegaan dat de stof uit de hoofdstukken 1, 2, 4, 5, 7, 8, 12, 14 en 16 uit “Clayden” bekend is uit de eerdere eerste jaars colleges. Doelgroep 1F

Organische chemie 2 Vakcode


X_435007 (435007) 6-3-2013 - Pagina 74 van 94

Periode

Periode 1

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)


Doel vak Het college beoogt het aanleren van basiskennis organische chemie. Inhoud vak Dit college vormt één geheel met het eerstejaarscollege. Het zet voort met de presentatie van specifieke reactietypen, nu eens niet georganiseerd naar functionele groepen, maar rondom een gemeenschappelijk mechanisme: nucleofiele substituties, eliminaties, addities aan meervoudige koolstof-koolstofbindingen, electrofiele aromatische substituties, addities en substitutie aan carbonylgroepen, omleggingen. Eveneens wordt aandacht besteed aan syntheseplanning. Onderwijsvorm Hoorcollege 16 uur; werkcollege 9 uur. Toetsvorm De stof wordt schriftelijk getentamineerd. Literatuur "Organic Chemistry" Clayden, Greeves, Warren & Wothers, Oxford University press (ISBN 019850346). Aanbevolen voorkennis Organische chemie I Doelgroep 2S, 2F

Organische en anorganische chemie Vakcode

X_430573 ()

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)

dr. E. Ruijter, prof. dr. ir. R.V.A. Orru

Lesmethode(n)


Doel vak Inzicht verkrijgen in de relatie tussen de structuur en eigenschappen van moleculen en kennis verkrijgen van de belangrijkste begrippen van de organische en anorganische chemie.


6-3-2013 - Pagina 75 van 94

Inhoud vak Het onderdeel Organische Chemie concentreert zich op de driedimensionale structuur van diverse functionele groepen en op de relatie tussen structuur en reactiviteit. Voortbouwend op de kennis van atoom en molecuulbouw en de MO-theorie komen aspecten van structuur aan de orde: de structuur van alkanen, cycloalkanen, alkenen en alkynen, hybridisatie, conformatie-analyse, reactieve deeltjes, nomenclatuur, stereochemie, chiraliteit, resonantie, aromaticiteit, en reactietypen zoals substituties en eliminaties. In het college is ruim plaats voor het verwerken van de leerstof door het maken van vraagstukken en het oefenen met molecuulmodellen. Deze vraagstukken vormen zowel de intermezzo's in het hoorcollege als het hoofdbestanddeel van opdrachten uit de studiehandleiding, die tijdens werkcollege-uren worden besproken. Bij het onderdeel Anorganische Chemie Periodiek komen de volgende onderdelen aan bod: systeem der elementen (eigenschappen van hoofdgroepelementen), atoomstructuur, moleculaire structuur, geometrie, structuur van en binding in vaste stoffen (metalen, covalente en ionogene roosterverbindingen) kristalveld, ligandveld, valence bond and molecular orbital benaderingen, coördinatie- en organometaalchemie, klassen verbindingen, homogene katalyse. Onderwijsvorm Hoor- en werkcolleges Toetsvorm Schriftelijk tentamen en deeltoetsen Literatuur Chemistry 4/E, Catherine E. Housecroft & Edwin Constable, ISBN-10: 0273733087, ISBN-13: 9780273733089 Aanbevolen voorkennis van Atoom tot (bio)molecuul (VU), Why Chemical Reactions Happen (VU), Bouwstenen van de chemie (UvA), Chemische reactiviteit van biomoleculen (UvA) Doelgroep 1S Overige informatie Dit vak is onderdeel van het thema “Energie en Duurzaamheid”. Al Gore won in 2006 een Oscar voor zijn documentaire “An Inconvenient Truth”. Sinsdien zijn broeikasgassen, de opwarming van de aarde en een duurzame ontwikkeling van onze high-tech westerse maatschappij thema’s die hoog op de politieke en sociaal-economische agenda’s staan. Energie-, afvalen grondstoffenproblematiek vormen dan ook een van de grootste uitdagingen voor de chemische wetenschappen. Het thema energie en duurzaamheid neemt dan ook een sleutelpositie in het curriculum en richt zich op het verkrijgen kennis om de verduurzaming van de chemie mogelijk te maken. Dit vak wordt gedoceerd door de VU docenten: Prof. dr. R.V.A. Orru, Dr. E. Ruijter en door de UvA docenten: Prof.dr. J.N.H. Reek en Prof.dr. C.J. Elsevier.

Organometaalchemie Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 76 van 94

Vakcode

X_435018 (435018)

Periode


Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. A.W. Ehlers

Doel vak Het doel van dit college is het verdiepen van de basiskennis op het gebied van coordinatiechemie en de organometaalchemie. Inhoud vak Er wordt aandacht besteed aan de volgende onderwerpen: - organometaalchemie van overgangsmetalen - organometaalcomplexen en organische synthese - homogene katalyse - bio-anorganische chemie (metallo-enzymen, biomimetica). Onderwijsvorm Zelfstudie. Toetsvorm Mondeling tentamen Literatuur Elschenbroich, C., Organometallics 3rd ed. Weinheim: Wiley-VCH. of in overleg met de docent. Aanbevolen voorkennis Anorganische Chemie 2 Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Oriëntatie op de M-variant Vakcode

X_400375 (400375)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

A. van Luijn MSc

Docent(en)

A. van Luijn MSc

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak - Het verwerven van kennis en inzicht in de met name in beleidsprocessen, beleidstheorie en beleidsanalyse; - Het verwerven van kennis en inzicht in de structuur en het beleid van de Nederlandse overheid met name op het gebied van wetenschap; Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 77 van 94

- Het verwerven van kennis en inzicht in managementprocessen en -theorieën, met specifieke aandacht voor kennismanagement en projectmanagement; - De student is instaat om beleid te analyseren en beleidsopties te identificeren; - De student is instaat tot projectmatig werken in teamverband; - De student beschikt over vaardigheden, zoals onderzoeksopzet maken, literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk en mondeling presenteren; - Oriëntatie op de M-variant, dan wel de masters Management, Policy-Analysis and Entrepreneurship. Inhoud vak Beleid speelt op vele manieren en niveaus een rol in onze samenleving. Ook binnen de wetenschap heb je eigenlijk altijd met beleid te maken. Enerzijds speelt beleid een rol bij het stimuleren en/of reguleren van wetenschappelijk onderzoek. Anderzijds wordt wetenschap ingezet om beleid rondom een maatschappelijk probleem te ondersteunen of te adviseren. Ook management speelt in allerlei situaties en op allerlei niveaus een rol. Zo wordt wetenschappelijk onderzoek altijd intern aangestuurd door het management of direct door het hoofd van de afdeling, maar ook meer indirect door het faculteitsbestuur en College van Bestuur. Ook al lijken beleid en management veelal ad hoc vorm gegeven te worden, toch zijn er structurele processen en ordenende principes aan te wijzen. Inzicht in deze processen en principes maakt dat je begrijpt waarom bepaalde keuzes gemaakt worden en bijvoorbeeld waarom beleid er uitziet zoals het in een beleidsnota geformuleerd wordt. In het eerste deel van deze cursus krijg je colleges over diverse beleids- en managementaspecten geïllustreerd aan de hand van praktische casussen. Dit deel wordt afgesloten met een tentamen. Het tweede deel van de cursus bestaat uit een projectopdracht waarin de analyse van een actueel, maatschappelijk en natuurwetenschappelijk vraagstuk in relatie tot (overheids)beleid centraal staat. Voorbeelden zijn nanotechnologie, Q- koorts, orgaandonatie of biobrandstof. De nadruk ligt hierbij op zelfwerkzaamheid, eigen initiatief en oordeelsvorming en op het werken in teamverband. Wij willen daarmee een leersituatie creëren die nauw aansluit bij de praktijk van beleidsmatig onderzoek en projectmatig werken. De problematiek en de verschillende beleidsopties rond dit vraagstuk worden kritisch geanalyseerd. De resultaten, conclusies en aanbevelingen worden weergegeven in een beleidsadviesrapport dat aan het eind van de cursus mondeling gepresenteerd wordt. Onderwijsvorm De eerste helft van de cursus zal bestaan uit werkcolleges, de tweede helft uit het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband. Literatuur Informatie over literatuur wordt via Blackboard verstrekt. Doelgroep Derdejaars FEW-studenten. Overige informatie Onderdeel van de M-oriëntatie.

Oriëntatie science educatie Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 78 van 94

Vakcode

O_ORIBETA (991010)

Periode

Semester 2

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Coördinator

ir. J.G. Schoonhoven

Docent(en)

ir. J.G. Schoonhoven

Lesmethode(n)

Werkcollege

Doel vak Voor een student die deze cursus heeft doorlopen geldt: de student is bereid en in staat te reflecteren op zijn/haar functioneren, de student is in staat om aan te geven wat het betekent om een goede docent in de bovenbouw te zijn, de student is in staat om zijn eigen geschiktheid voor het beroep van docent te beoordelen, de student kan aangeven of het beroep van docent iets voor hem/haar is, de student verwerft een aantal communicatieve en didactische vaardigheden.

Inhoud vak De cursus bestaat de eerste week uit diverse werkcolleges, de volgende drie weken uit een stage op een school voor voortgezet onderwijs. elke week is er een praktijkbespreking en verdieping op de VU. De stage is het belangrijkste onderdeel van de cursus, deze voer je uit samen met een medestudent. In totaal zal de stage ongeveer twaalf dagen in beslag nemen. Tijdens de werkcolleges komen de volgende onderwerpen aan de orde: Hoe bouw je een presentatie op, hoe kom je over. Hoe vertaal je (wetenschappelijke) informatie naar het niveau van je doelgroep. Wat doet een (goede) leraar allemaal. Wat is het verschil tussen presenteren en onderwijzen. Welke kenmerken heeft de doelgroep en hoe kun je daar rekening mee houden. Hoe ontwerp je een (activerende) les. Hoe krijg je je doelgroep actief. Met welke communicatieve aspecten in de klas moet je rekening houden. Tijdens de stage onderneem je de volgende activiteiten: observeren van lessen; zelf minimaal vier lessen geven, in zowel onderbouw als bovenbouw; uitvoeren van een klein onderzoek; zo veel mogelijk deelnemen aan alle activiteiten op school en zo (hernieuwd) kennis maken met het voortgezet onderwijs vanuit het docenten perspectief.

Onderwijsvorm Je levert aan het eind van de cursus een verslag in. Het verslag is een samenhangend verhaal dat een beeld geeft van jouw leerproces tijdens de cursus. Met je verslag laat je zien waar je staat als mogelijk toekomstig docent. Het gaat primair om het zichtbaar maken van je ontwikkeling, niet noodzakelijk om te bewijzen dat je een goede docent bent. Werkcolleges en stage vormen samen een voltijds programma, het is niet mogelijk gelijktijdig andere colleges te volgen. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 79 van 94

Doelgroep Deelname aan de cursus staat open voor derdejaars bachelorstudenten van de faculteiten Exacte Wetenschappen en Aard- en Levenswetenschappen. De cursus wordt aangeraden voor studenten die overwegen de lerarenopleiding te gaan volgen binnen de masteropleiding (E- variant) of aansluitend op hun masteropleiding. Ook voor studenten die vaardigheden op willen doen in het verzorgen van wetenschappelijke presentaties is de cursus interessant. Overige informatie Meer informatie is te verkrijgbaar bij Arjan Schooonhoven: a.schoonhoven@ond. vu. nl, of te vinden op www.onderwijscentrum.vu.nl

Practicum energie en duurzaamheid Vakcode

X_430574 ()

Periode

Periode 5

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Doel vak Het doel van het practicum is de student vaardigheid bij te brengen in de preparatieve organische en anorganische chemie in het kader van energie en duurzaamheid, alsook een beeld te geven hoe de (an)organisch chemicus zijn experimentele resultaten verkrijgt. Inhoud vak In dit geïntegreerde practicum dat in het teken staat van Energie en duurzaamheid komen verscheidene onderwerpen aan bod die de theorie van de vakken Organische en Anorganische Chemie en Natuurkunde in de chemie II in de praktijk brengen. Nadruk ligt op de symbiose van deze disciplines in het gebied van de katalyse en duurzame chemie. Experimenten die aan bod komen zijn bijvoorbeeld: Recycling of PET-bottles. Regeneration of valuable materials en High temperature chemistry using a microwave oven: synthesis of coloured glass. Tijdens dit practicum ligt aanvankelijk het accent op het aanleren van een aantal basale identificatietechnieken. Vervolgens worden tijdens een aantal eenstapssyntheses een aantal, isolatie- en zuiveringstechnieken zoals kristalliseren of sublimeren geleerd. De syntheses worden deels op macroschaal (2-10 g) en deels op microschaal (50-100 mg) uitgevoerd. Later worden enkele meerstapssyntheses uitgevoerd, waarbij het van belang is elk tussenproduct goed te zuiveren en te karakteriseren. De meeste experimenten kennen een 'probleem-oplossende' aanpak, waarbij aandacht wordt besteed aan onderzoeksmethodiek. Onderwijsvorm De student werkt individueel binnen een groep o.l.v. een assistent Toetsvorm Experimentele vaardigheid, zelfstandigheid, voorbereiding, mondelinge en schriftelijke communicatie.


6-3-2013 - Pagina 80 van 94

Literatuur Multiscale Operational Organic Chemistry: a problem-solving approach to the laboratory course, 2nd edition, John W. Lehman. ISBN: 978-0-13702840-5 Practicumhandleiding Practicum Energie en Duurzaamheid Aanbevolen voorkennis Van Atoom tot (bio)molekuul (VU), Why Chemical Reactions Happen (VU), Bouwstenen van de chemie (UvA), Chemische reactiviteit van biomoleculen (UvA) Doelgroep 1SK (Amsterdam Bachelor Scheikunde) Overige informatie Dit vak is onderdeel van het thema “Energie en Duurzaamheid”. Al Gore won in 2006 een Oscar voor zijn documentaire “An Inconvenient Truth”. Sinsdien zijn broeikasgassen, de opwarming van de aarde en een duurzame ontwikkeling van onze high-tech westerse maatschappij thema’s die hoog op de politieke en sociaal-economische agenda’s staan. Energie-, afvalen grondstoffenproblematiek vormen dan ook een van de grootste uitdagingen voor de chemische wetenschappen. Het thema energie en duurzaamheid neemt dan ook een sleutelpositie in het curriculum en richt zich op het verkrijgen kennis om de verduurzaming van de chemie mogelijk te maken.

Practicum Moderne synthetische methoden Vakcode

X_435016 (435016)

Periode


Credits

9.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. E. Ruijter

Doel vak Kennismaken met nieuwste experimentele ontwikkelingen in de organische synthese. Inhoud vak In dit vak maak je kennis met de nieuwste experimentele technieken in de organische synthese. Je gaat werken aan een project dat direct met lopend onderzoek verknoopt is. Parallelle synthese methodiek met behulp van semi-automatische apparatuur wordt toegepast in combinatie met parallelle opwerkingstechnieken m.b.v. indampmodules en automatische kolomchromatografie. Ook leer je syntheses en zuiveringen absoluut water- en zuurstofvrij uitvoeren d.m.v. Schlenk-technieken en het werken met een glovebox. Onderwijsvorm Practicumproject Literatuur Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press (ISBN 019850346). Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 81 van 94

Aanbevolen voorkennis Organische chemie I & II, practicum organische synthese, kernspinresonantie (NMR). Doelgroep 3S, 3F Overige informatie Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.

Practicum van Atoom tot (Bio)molecuul Vakcode

X_430575 ()

Periode

Periode 1+2

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Docent(en)

dr. J.C. Slootweg

Lesmethode(n)


Doel vak Het aanleren van basisvaardigheden die nodig zijn voor het uitvoeren van experimenten alsmede de kennismaking met (experimentele) technieken/methoden in de verschillende chemische richtingen. Inhoud vak Op het practicum worden enkele experimenten/projecten uitgevoerd waarin een aantal basisvaardigheden wordt geoefend. Deze vaardigheden worden daarna gebruikt bij het uitvoeren van (onderzoeks)projecten later in het curriculum. Die vaardigheden betreffen o.a. het bestuderen van de theorie, literatuuronderzoek, definiëren van een hypothese, opstellen van een plan van aanpak, ontwerpen van een experiment, uitvoeren van het experiment, bijhouden van een labjournaal, kritische beoordeling van de resultaten, alsmede mondelinge en schriftelijke rapportage. Tijdens het practicum van Atoom tot (Bio)molecuul zullen de studenten organische en anorganische experimenten uitvoeren waarbij ze leren destilleren, (her) kristalliseren, sublimeren, analyseren (NMR, IR, m.p., event. optische rotatie), tevens zullen de studenten biochemische experimenten doen waarbij de volgende aspecten aan bod komen: enzym kinetiek (ijklijnen), eiwit scheiding en detectie, analyse mutanten en biotechnologie. Onderwijsvorm Het practicum van Atoom tot (Bio)molecuul wordt zo uitgevoerd dat de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke gegevens, de theoretische achtergrond en de voorschriften kan opzoeken en zo het experiment zelf kan vormgeven. Toetsvorm handvaardigheid, voorbereiding, mondelinge en schriftelijke communicatie. Literatuur


6-3-2013 - Pagina 82 van 94

Practicumhandleiding Practicum van Atoom tot (Bio)molecuul Doelgroep 1S, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI Overige informatie Dit vak is onderdeel van het thema “van Atoom tot Biomolecuul”. Chemie is de wetenschap van stoffen, hun structuur en eigenschappen, en met name hun omzetting via chemische reacties. Binnen de natuurwetenschappen neemt de chemie een centrale plaats in en heeft vele raakvlakken met de andere disciplines, van de fysica tot en met de biologie. Daarmee is chemie een toonbeeld van een multidisciplinaire wetenschap. Het thema van deze periode, "Van Atoom tot Biomolecuul", accentueert dit aspect en plaatst zodoende de chemie in de context van de verschillende natuurwetenschappen. Studenten 1IDS volgen het vak Practicum van atoom tot (bio) molecuul X_ 430575 alleen in periode 1, maar staan ingeschreven bij X_430596 en daar wordt ook het cijfer op gegeven.

Principles of Chemical Reactivity Vakcode

X_430576 ()

Periode

Periode 3

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)

prof. dr. K. Lammertsma, dr. A.W. Ehlers

Lesmethode(n)


Doel vak Het doel van het college is - in nauwe aansluiting met het voorafgaande college Algemene - nader in te gaan op de quantummechanische beschrijving van moleculen en de basis te leggen voor de beantwoording van de vraag waarom en wanneer chemische reacties plaatsvinden. Veel aandacht wordt besteed aan evenwichtsconstanten in relatie tot de tweede hoofdwet van de thermodynamica. Inhoud vak Molecular orbitals voor homo- en hetero-tweeatomige moleculen; elektronenverdeling in grotere moleculen; een aantal basale chemische reacties; chemische evenwichten; reactiesnelheden; binding in geconjugeerde systemen. Onderwijsvorm Gecombineerd hoorcollege en werkcollege, practicum Toetsvorm schriftelijk tentamen, herkansing mogelijk mondeling Literatuur Keeler, J., and Wothers, P., Why Chemical Reactions Happen, New York: Oxford University Press, 2003 (ISBN 0-19-924-9733). Housecraft, C. E. and Constable E. C., Chemistry, Pearson, 4th Ed. (ISBN


6-3-2013 - Pagina 83 van 94

978-0-273-71545-0) Doelgroep 1S, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI Overige informatie Periode 3 voor 1e jrs Scheikunde, 1e jrs IDS Periode 4 voor 1e jaars FAR

Programmeren Vakcode

X_435003 (435003)

Periode

Periode 3+4

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)


Doel vak Aanleren van voor chemici relevante kennis van algoritmiek en programmeervaardigheden. Inhoud vak In de cursus wordt de programmeertaal C++ geïntroduceerd als voorbeeld van in de chemie veel gebruikte programmeertalen als C++, Fortran en Python. De behandelde stof (syntax, algoritmes) wordt in de praktijk gebracht middels het schrijven van eenvoudige programma’s en het aanbrengen van modificaties in bestaande programma’s. Hierbij ligt de nadruk op de algemene principes van programmeren en op het schrijven van correcte, goed gestructureerde en gedocumenteerde programma's. Er wordt aandacht besteed aan zowel het zelfstandig programmeren van toepassingen in de chemie alsmede de kennis van chemisch relevante algoritmen. Onderwijsvorm College, computerpracticum. Toetsvorm Opdrachten en deeltentamens Literatuur Etter, D.M., Engineering Problem Solving with C++ 2nd ed. New Jersey: Prentice Hall, 2008. Doelgroep 2S

Structuurbiologie Vakcode

X_430080 (430080)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands


6-3-2013 - Pagina 84 van 94

Faculteit


Coördinator

dr. D.P. Geerke

Docent(en)

dr. D.P. Geerke

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Het verkrijgen van inzicht in de moleculaire elementen die de basis vormen van de structuur en functie van biomoleculen. Tevens, het opdoen van kennis over de methoden die gebruikt worden om de structuur en functie van eiwitten te analyseren. Inhoud vak Er wordt begonnen met het bespreken van de moleculaire eigenschappen van structurele elementen van DNA, lipiden en eiwitten zoals alpha-helices, beta-strands en beta-sheets, en veelvoorkomende motieven zoals coiled-coils, beta-barrels, helix-turn-helix e.a. De krachten en interacties die bepalend zijn voor de structuur, de functie en de flexibiliteit van eiwitten zullen hierbij besproken worden. Tevens worden de grondbeginselen en toepassingen van een aantal van de technieken die gebruikt wordt om de macromoleculaire structuur experimenteel te bepalen en de dynamische structuurveranderingen zichtbaar te maken, behandeld. Daaronder vallen de NMR spectrometrie, kristallisatie gecombineerd met Röntgen diffractie, fluorescentie spectroscopie en elektronen en licht microscopie. Ook zullen de principes van computationele structuur bepaling, in het bijzonder eiwit modelering en dynamiek behandeld worden. Onderwijsvorm Hoorcolleges, zelfstudie, opdrachten. Toetsvorm Schriftelijk tentamen Literatuur Branden, C., and Tooze, J., Introduction to Protein Structure, Garland, 1999. Aanbevolen voorkennis Project Kanker (MNW), Cursus Biochemie (S/F/MNW). Doelgroep 3F,3S, mi-AMPS

Structuuropheldering en spectroscopie Vakcode

X_430578 ()

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. F. Ariese

Lesmethode(n)

Hoorcollege


6-3-2013 - Pagina 85 van 94

Doel vak Leerdoelen zijn de correlatie tussen moleculaire structuur en spectroscopische eigenschappen, structuurbepaling uit spectra, de interactie tussen elektromagnetische straling en materie. Doel is om vertrouwd te raken met molecuulspectroscopische technieken, zowel de fysisch-chemische achtergronden als toepassingsmogelijkheden op het gebied van detectie en identificatie. De opgedane kennis en vaardigheden zijn van essentieel belang in de verdere studie van moleculaire aspecten van de chemie. Inhoud vak De interactie tussen elektromagnetische straling en materie is essentieel in ons dagelijks leven. Denk aan de lichtpulsjes (1500 nm) die door de glasvezelkabels van het internet flitsen en de MRI scan in het ziekenhuis, naast de fotosynthese en de processen tijdens de visuele waarneming. Interacties van atomen en moleculen met specifieke delen van het elektromagnetische spectrum vormen de basis voor verschillende vormen van spectroscopie. Tijdens een serie geïntegreerde hoorcollege/werkcolleges zullen de volgende technieken worden behandeld: elektronenspectroscopie (UV-vis en fluorescentie/fosforescentie), vibratie spectroscopie (IR en Raman), kernspinresonatie (13C-NMR en 1H-NMR), massaspectrometrie. Hierbij zal aandacht worden geschonken aan kwalitatieve en kwantitatieve analyse en structuuropheldering, incl. zgn. combinatie-vraagstukken en fotofysische vraagstukken. Het practicum zal een cursorisch karakter krijgen, waar enkele behandelde technieken in de praktijk zullen worden toegepast en/of gedemonstreerd. Waar mogelijk zal de link met vakken uit het eerste semester worden onderstreept. Onderwijsvorm Geintegreerd hoor/werkcollege, practicum, posterpresentatie op slotsymposium (1 dag, samen met “Chemie en Licht”) Toetsvorm theorie (3/4): Huiswerkopgaven (2x), totaal 1 bonuspunt; tussentoets (1 bonuspunt); eind-tentamen practicum 1/4 practicumverslag, incl. nabespreking, + poster over één van de experimenten. Ingangseisen tentamen: afgerond practicum Literatuur Chemistry 4/E, by Catherine E. Housecroft & Edwin Constable, (hoofdstukken 10 – 14) ISBN-10: 0273733087; ISBN-13: 9780273733089 aangevuld met extra materiaal; practicumhandleiding Aanbevolen voorkennis Scheikundevakken periode 1,2 en 3 Doelgroep 1S

Studie en loopbaan Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 86 van 94

Vakcode

X_000018 ()

Periode

Periode 4

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

drs. M. Touwen

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doelgroep 2F, 3F, 2S, 3S

Synthese practicum Vakcode

X_435192 (435192)

Periode

Periode 2, Periode 3

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. J.C. Slootweg

Docent(en)

dr. J.C. Slootweg

Lesmethode(n)


Doel vak Het doel van het practicum is de student vaardigheid bij te brengen in de preparatieve organische en (in mindere mate) anorganische chemie, alsook een beeld te geven hoe de (an)organisch chemicus zijn experimentele resultaten verkrijgt. Inhoud vak Tijdens dit practicum ligt aanvankelijk het accent op het aanleren van een aantal basale isolatie- en zuiveringstechnieken zoals kristalliseren, destilleren, sublimeren, extraheren, chromatografie (GLC, kolomchromatografie). Deze technieken worden geleerd tijdens een aantal eenstapssyntheses, die tevens de collegestof illustreren. De syntheses worden deels op macroschaal (2-10 g) en deels op microschaal (50-100 mg) uitgevoerd. In de eerste periode wordt tevens het werkcollege spectroscopische technieken gegeven, ten behoeve van de interpretatie van de in de loop van het practicum op te nemen IR, UV, NMR, en ook massaspectra. Later worden enkele meerstapssyntheses uitgevoerd, waarbij het van belang is elk tussenproduct goed te zuiveren en te karakteriseren. De meeste experimenten kennen een 'probleem-oplossende' aanpak, waarbij aandacht wordt besteed aan onderzoeksmethodiek. Toetsvorm Experimentele vaardigheid, zelfstandigheid, voorbereiding, mondelinge en schriftelijke communicatie Literatuur Lehman, J.W., Multiscale Operational Organic Chemistry 2nd ed, New Jersey: Prentice Hall, 2009.


6-3-2013 - Pagina 87 van 94

Aanbevolen voorkennis Organische chemie 1 en 2. Doelgroep 2F Overige informatie Studenten 2S volgen dit vak in periode 2. Studenten 2F volgen dit vak in periode 3.

Thermodynamica Vakcode

X_435203 (435203)

Periode

Periode 1

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. G. van der Zwan

Docent(en)

dr. G. van der Zwan

Lesmethode(n)


Doel vak Leren toepassen van thermodynamica op chemische processen. Inhoud vak Het eerste deel van het college zal bestaan uit het bestuderen van warmte en arbeid, de afleiding van de grootheid entropie en het bepalen van de richting van spontane processen. Nieuwe grootheden als enthalpie en vrije energie zullen worden ingevoerd, en de toepassing van de twee hoofdwetten van de thermodynamica (je kan geen energie uit niets maken, en warmte stroomt spontaan van warm naar koud) op chemische processen zal vervolgens aan de orde komen. Chemisch evenwicht, en effecten van druk en temperatuur daarop kunnen dan effectief worden bestudeerd. Toepassing van de thermodynamica op redox reacties, de wet van Nernst en de electrochemische cel vormen het laatste onderdeel van dit college. Onderwijsvorm Hoor- en werkcolleges. Toetsvorm Schriftelijk tentamen Literatuur Thomas Engel en Philip Reid: "Thermodynamics, Statistical Thermodynamics, and Kinetics, Pearson, ISBN 978-0-321-64311-7. Aanbevolen voorkennis Basiswiskunde en Calculus 1 Doelgroep 2S, 2MNW

Van atoom tot (bio)molecuul Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 88 van 94

Vakcode

X_430580 ()

Periode

Periode 1+2

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

prof. dr. F. Bickelhaupt

Docent(en)

dr. M. Wijtmans

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Dit vak beoogt de bouwstenen aan te dragen waarop alle chemische disciplines rusten en zodoende een solide fundament voor de gehele hierop volgende studie te leggen. Tegelijkertijd wordt ernaar gestreefd de scheikunde in de context van andere natuurwetenschappen te plaatsen (thema "Van Atoom tot Biomolecuul") alsmede haar relevantie voor het verschijnsel leven duidelijk te maken (thema "Levende Chemie"). Inhoud vak Chemie is de wetenschap van stoffen, hun structuur en eigenschappen, en met name hun omzetting via chemische reacties. Binnen de natuurwetenschappen neemt de chemie een centrale plaats in en heeft vele raakvlakken met de andere disciplines, van de fysica tot en met de biologie. Binnen het thema "Van Atoom tot Biomolecuul" (periode 1) wordt het multidisciplinaire karakter geaccentueerd door het behandelen van fundamentele scheikundige begrippen die relevant zijn in de context van de verschillende natuurwetenschappen. In dit kader zullen o.a. aan bod komen: “evenwichten”, “pH berekeningen”, “oplosbaarheid”, “oxidatietoestand” en “redoxchemie”. Bij de overgang naar het thema "Levende Chemie" (periode 2) verschuift het zwaartepunt van het vak "Van Atoom tot Biomolecuul" naar complexere aspecten van de scheikunde, beginnend bij de fysische en anorganische chemie via de (metaal)organische chemie tot aan de biologische chemie. De volgende onderwerpen worden in dit kader behandeld: "alles is chemie", "atomen en het periodieke systeem", "moleculaire structuur", "electronische structuur en chemische binding", "chemische reacties", "thermodynamica", "kinetiek", "inleiding organische chemie", "inleiding biochemie", "zelf gegevens opzoeken in de chemische literatuur". Onderwijsvorm hoorcollege en werkcollege. Toetsvorm tentamen Literatuur Steven S. Zumdahl, Chemical Principles, 6th Ed., Houghton Mifflin Company: Boston, New York, 2009 Doelgroep 1F, 1S, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI Overige informatie Voor studenten 1S: Het met een voldoende afronden van het vak Van atoom tot (bio)molecuul is alleen dan mogelijk, indien de onderdelen van Tutoraat SK 1A naar behoren zijn afgerond. Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 89 van 94

Deze slagingseis geldt alleen voor 1S, niet voorde andere doelgroepen.

Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min Vakcode

X_000019 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Voorlichting door studentendecanen en CSL Vakcode

X_000007 ()

Periode

Periode 1

Credits

0.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers Vakcode

AB_470185 ()

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit

Fac. der Aard- en Levenswetenschappen

Coördinator

dr. J.F.H. Kupper

Docent(en)

prof. dr. J.E.W. Broerse, R.C. van Koten MSc, dr. M.J.W. Bos

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep

Doel vak - Verwerven van kennis en inzicht in de rol van communicatie rondom nieuwe ontwikkelingen in wetenschap en technologie - Verwerven van kennis en inzicht in de verschillende modellen van wetenschapscommunicatie (deficiet, context, interactie en participatie), haar parameters en gebruikelijke applicatiedomeinen. - Verwerven van kennis en inzicht van de beperkingen en mogelijkheden van de verschillende media waarin de modellen tot uitdrukking kunnen komen (journalistiek, TV en film, het Internet, musea en science centra). - Verkrijgen van vaardigheid in het ontwerpen van een doelgroepgerichte communicatie - Het opdoen van leerervaring met het werken in een multidisciplinaire Inhoud vak Wetenschap heeft verstrekkende gevolgen voor de maatschappij (bv. biotechnologie, neurowetenschappen, farmacie). Maar hoe kijkt de maatschappij eigenlijk naar wetenschappelijke ontwikkelingen? Wat vindt Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 90 van 94

de industrie van wat we uitgevonden hebben en wat denken andere wetenschappers van onze kennis? De visie van deze mensen over ons en ons werk is van groot belang voor de richting die het onderzoek in de nabije toekomst gaat nemen. Daarom is communicatie over wetenschap van cruciaal belang. In deze cursus raak je vertrouwt met een aantal modellen van wetenschapscommunicatie, het herkennen van hun toepassingen in de praktijk en de verschillende soorten publiek die men ermee kan aanspreken (populariseren voor leken, informatieoverdracht voor de industrie, faciliteren van interdisciplinair onderzoek in de wetenschap, participatie van burgers en patiënten in onderzoek). Door middel van opdrachten raak je bekend met de praktische kant van wetenschapscommunicatie, bijvoorbeeld wetenschapsjournalistiek, voorlichting, dialogen en debatten, etc. De opdrachten worden deels individueel uitgevoerd en deels in een groep. Niveau cursus: 2 (verdieping) Onderwijsvorm Colleges, opdracht, zelfstudie Toetsvorm Schriftelijk tentamen (50%), groepsopdr. (25%), individuele opdr. 25%) Literatuur (Online) syllabus Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen en Biologie en BSc. Gezondheid en Leven. Speciaal aanbevolen voor studenten die overwegen de C-variant (wetenschapscommunicatie) of M-variant (beleid en management) in hun masterprogramma op te nemen. Overige informatie Voor meer informatie: [email protected]

Why Chemical Reactions Happen Vakcode

X_435088 (435088)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Docent(en)


Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Het doel van het college is - in nauwe aansluiting met het voorafgaande college Chemische Binding - nader in te gaan op de quantummechanische beschrijving van moleculen en de basis te leggen voor de beantwoording van de vraag waarom en wanneer chemische reacties plaatsvinden. Veel aandacht wordt besteed aan evenwichtsconstanten in relatie tot de tweede hoofdwet van de thermodynamice. Inhoud vak


6-3-2013 - Pagina 91 van 94

Molecular orbitals voor homo- en hetero-tweeatomige moleculen; elektronenverdeling in grotere moleculen; een aantal basale chemische reacties; chemische evenwichten; reactiesnelheden; binding in geconjugeerde systemen. Onderwijsvorm Gecombineerd hoorcollege en werkcollege Literatuur Keeler, J., and Wothers, P., Why Chemical Reactions Happen, New York: Oxford University Press, 2003 (ISBN 0-19-924-9733). Doelgroep 1S, 1F

Wijsgerige vorming 2: Wetenschapsfilosofie Vakcode

X_428002 (428002)

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. G.C. Eigner

Lesmethode(n)


Doel vak De leerdoelen van de cursus bestaan uit het opdoen van wetenschapsfilosofische kennis, het kunnen toepassen van deze kennis op je eigen vakgebied, en aan de hand hiervan reflecteren op je vak. De kennis die aan bod komt in de cursus bestaat uit verschil-lende visies op wetenschapsfilosofische onderwerpen, zoals de wetenschappelijke methode, realisme, empirisme, reductionisme, het doel van de wetenschap, wetenschappelijke verklaringen, en de grenzen van wetenschap. Het hoofddoel van de cursus is dat je door toepassing van deze wetenschapsfilosofische kennis op situ-aties uit de praktijk van je vakgebied een onderbouwde en genu-anceerde visie ontwikkelt over de waarde van de kennis die je in je studie aangeboden krijgt, over de status van wetenschap in on-ze samenleving, en over je toekomstige verantwoordelijkheid in de beroepspraktijk. Een nevendoel van de cursus is dat je vaar-digheden ontwikkelt op het gebied van tekstanalyse en kritische discussie. Inhoud vak Het college behandelt moderne opvattingen met betrekking tot aard en methode van de natuurwetenschappen; hun ontwikkeling; hun relatie met praktijk; en de normatieve en ethische aspecten van wetenschapsbeoefening. Deze thema’s worden steeds behandeld aan de hand van concrete voorbeelden uit de natuurwetenschappen. Toetsvorm Het eindcijfer voor de cursus is een gewogen gemiddelde van drie deelcijfers: het cijfer behaald voor tussentijdse toetsen die worden afgenomen tijdens het tweede en derde werkcollege (20%), het cijfer behaald voor een verslag dat wordt geschreven in groepen van drie studenten (30%) en het cijfer behaald voor een individu-eel geschreven afsluitend essay (50%). Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde - 2011-2012

6-3-2013 - Pagina 92 van 94

Literatuur Peter Godfrey-Smith, Theory and Reality: An Introduction to the Philosophy of Science (Chicago University Press, 2003). Aanvullende literatuur wordt bekendgemaakt in de studiehandleiding en via Blackboard. Doelgroep 3F, 3S, 3-SBI Overige informatie Inlichtingen bij de docent, dr. K. Eigner, HG-13A30, [email protected]. Inschrijving verplicht via Blackboard.

Wiskunde en Natuurkunde voor chemici 1 Vakcode

X_430572 ()

Periode

Periode 1+2

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator

dr. P. Gori Giorgi

Docent(en)

dr. P. Gori Giorgi

Lesmethode(n)


Doel vak Het vertrouwd raken met een aantal wiskundige basisbegrippen en technieken (beginselen matrixrekening, complexe getallen, differentiëren, integreren, oplossen eenvoudige differentiaalvergelijkingen). Het toepassen daarvan en verkrijgen van inzicht in en kennis van basisbegrippen, concepten en toepassingen van de mechanica. Inhoud vak Functies, in het bijzonder het algebraïsch manipuleren hiermee. Differentiëren: begrip, Taylorbenaderingen. Matrixrekening: beginselen, voornamelijk in dimensie 2 en 3. Integreren: basistheorie. Differentiaalvergelijkingen: vergelijkingen van de eerste orde en tweedeorde met constante coëfficiënten. In een geïntegreerde aanpak worden deze wiskundige beginselen o.a, toegepast in klassieke mechanica. Hierbij worden beweging in ruimte en tijd (1, 2 en 3 dimensies); Positie, snelheid en versnelling; Eenparige lineaire en cirkelbeweging; Radiele en tangentiele versnelling bersproken. Daarnaast komen de bewegingsvergelijking en Krachten; Traagheid en massa; Wetten van Newton; Energie van een systeem. Arbeid, kinetische energie, potentiële energie; Conservatieve en niet conservatieve krachten; Evenwichten; Behoud van energie; Geïsoleerde en niet geïsoleerde systemen. Impuls en botsingen. Impuls en behoud van impuls; Stoot; Elastische en inelastische botsingen. Samengestelde systemen; Massamiddelpunt; Traagheidsmoment; Beweging van meer deeltjes systemen. Rotatie en krachtmoment. Impulsmoment. Impulsmoment van niet geïsoleerd systeem; Impulsmoment van star lichaam; Behoud van impulsmoment.


6-3-2013 - Pagina 93 van 94

Onderwijsvorm Gecombineerd hoorcollege en werkcollege Toetsvorm Schriftelijk tentamen. Literatuur Robert A. Adams, 'Calculus: A Complete Course Jan van de Craats en Rob Bosch, 'Basisboek Wiskunde'. Physics for Scientists and Engineers door John W. Jewett, Jr. en Raymond A. Serway Aanbevolen voorkennis VWO wiskunde B en aansluitmodule wiskunde, VWO natuurkunde Doelgroep 1S

Wiskunde en natuurkunde voor chemici 2 Vakcode

X_428005 ()

Periode

Periode 4+5

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit


Coördinator


Lesmethode(n)

Hoorcollege

Inhoud vak De cursus beschrijving is beschikbaar op: http://studiegids.uva.nl/web/uva/sgs/nl/c/12128.html Doelgroep 1S Overige informatie Opgave via https://www.sis.uva.nl tot 4 weken voor aanvang van het semester is verplicht Course registration at the UVA is compulsory at least 4 weeks before the start of the semester via https://www.sis.uva.nl Het Wiskunde gedeelte wordt in periode 4 aan de UvA gegeven, het Natuurkunde gedeelte in periode 5 aan de VU.


6-3-2013 - Pagina 94 van 94

Scheikunde BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Scheikunde

Recommend Documents