PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

PLAGIAT PLAGIATMERUPAKAN MERUPAKANTINDAKAN TINDAKANTIDAK TIDAKTERPUJI TERPUJI

SIMULASI PENAMBATAN MOLEKULER COUMESTROL PADA RESEPTOR ESTROGEN ALFA SKRIPSI Diajukan untuk Memenuhi Salah Satu Syarat Memperoleh Gelar Sarjana Farmasi (S.Farm.) Program Studi Ilmu Farmasi

Oleh: Chandra Dewa Nata NIM: 108114190

FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS SANATA DHARMA YOGYAKARTA 2014

i


Persetujuan Pembimbing

SIMULASI PENAMBATAI\I MOLEKULER COT]MESTROL PADA RESEPTOR ESTROGEN ALFA

Skripsi yang diajukan oleh: Chandra Dewa Nata

NIM:108114190

Telah disetujui oleh:

Pembimbing Utama

Tanggal21 Februari 2014

Enade Pe\dqna Istyastono, Ph.D.. Apt.

Pembimbing Pendamping

Agustina Setiawati, M.Sc., Apt.

Tanggal

11

2lFebruan}Ol4


Pengesahan Skripsi Berjudul

SIMULASI PENAMBATAN MOLEKULTR COUMESTROL PADA RESEPTOR ESTROGEN ALFA

Oleh: Chandra Dewa Nata NIM: 108114190 Dipertahankan di Hadapan Panitia Penguji Skripsi Fakultas Farmasi iJniversitas Sanata Dharma Pada tanggal:20 Februari 2014

Mengetahui, Fakultas Farmasi

Universitas Sanata Dharma Dekan

ipang Djunarko, M.Sc., Apt.

Panitia Penguji Skripsi

1.

Enade Perdana Istyastono, Ph.D., Apt.

2. Agustina Setiawati, M.Sc., Apt. a

.Ieffu Julianus, M.Si.

4. Nunung Yuniarti, M.Si., Ph.D., Apt.

lll


PERNYATAAN KEASLIAN KARYA

Saya menyatakan dengan sesungguhnya bahwa skripsi yang berjudul "Simulasi Penambatan Molekuler Coumestrol pada Reseptor Estrogen Alfa", tidak memuat karya atau bagian karya orang lain, kecuali yang telah disebutkan dalam kutipan dan daftar pustaka, sebagaimana layaknya karya ilmiah.

Apabila di kemudian hari ditemukan indikasi plagiarisme dalam naskah ini, maka saya bersedia menanggung segala sanksi sesuai peraturan perundangundangan yang berlaku.

Yogy akarta,

2I

Febru ert 201 4

Penulis

ffiffi Chandra Dewa hlata

a

IV


LEMBAR PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI ILMIAH UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS

Yang bertanda tangan di bawah ini, saya mahasiswa Universitas Sanata Dharma

:

: Chandra Dewa }.{ata

NIama

Nomor

Mahasiswa : 108114190

Demi pengembangan ilmu pengetahuan, saya memberikan kepada Perpustakaan Universitas Sanata Dharma karya ilmiah saya yang berjudul: o'Simulasi Penambatan Molekuler Coumestrol pada Reseptor Estrogen Alfao beserta perangkat yang diperlukan (bila ada). Dengan demikian saya memberikan kepada perpustakaan Universitas Sanata Dharma hak untuk menyimpan, mengalihkan dalam bentuk media lain, mengelolanya dalam bentuk pangkalan data mendistribusikan secara terbatas, dan mempublikasikannya di Internet atau media lain untuk kepentingan akademis tanpa perlu meminta ijin dari saya maupun memberikan royalty kepada saya selama tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis.

Demikian pernyataan ini yang saya buat dengan sebenafitya. Dibuat di Yogyakarta Pada tanggal

:21 Februari 2AI4

Yang menyatakan

(Chandra Dewa Nata)


HALAMAN PERSEMBAHAN

“A good head and a good heart are always a formidable combination.” – Nelson Mandela

“All things are difficult before they are easy.” –Thomas Fuller

“Try not to become a man of success, but rather try to become a man of value.” –Albert Einstein ”I've failed over and over and over again in my life and that is why I succeed.”-Michael Jordan Karya kecilku ini kupersembahkan untuk: Tuhan yang Maha Esa yang telah membimbing, melindungi dan menyertai dalam kehidupanku Papa dan Mama yang selalu memberikanku dukungan, semangat, cinta dan kasih sayang Bapak/Ibu dosen dan staff pengajar Fakultas Farmasi USD Sahabat-sahabatku tersayang Serta

Almamaterku

vi


PRAKATA Puji syukur penulis panjatkan kepada Tuhan Yang Maha Esa atas rahmat karunia dan penyertaan yang telah diberikan sehingga penyusunan skripsi yang berjudul “SIMULASI PENAMBATAN MOLEKULER COUMESTROL PADA RESEPTOR ESTROGEN ALFA” dapat dilaksanakan dengan baik. Skripsi ini disusun sebagai salah satu syarat untuk meraih gelar Sarjana Farmasi (S.Farm.) di Fakultas Farmasi, Universitas Sanata Dharma, Yogyakarta. Selama proses penelitian dan penyusunan skripsi ini, penulis mendapatkan banyak bantuan dan dukungan dari berbagai pihak. Oleh karena itu, penulis mengucapkan terima kasih kepada: 1. Ipang Djunarko, M.Sc., Apt., selaku Dekan Fakultas Farmasi Universitas Sanata Dharma. 2. C.M. Ratna Rini Nastiti, M.Pharm., Apt., selaku Ketua Program Studi Fakultas Farmasi Universitas Sanata Dharma Yogyakarta. 3. Enade Perdana Istyastono, Ph.D., Apt., selaku dosen pembimbing yang telah memberikan bimbingan, masukan serta pengarahan dalam penelitian dan penyusunan skripsi ini. 4. Agustina Setiawati, M.Sc., Apt., selaku dosen pembimbing yang telah memberikan

bimbingan

serta

pengarahan

dalam

penelitian

dan

penyusunan skripsi ini. 5. Muhammad Radifar, S.Farm., yang telah memberi bantuan, bimbingan dan arahan selama proses pengerjaan skripsi.

vii


6. Mas Ottok selaku laboran Laboratorium Virtual Fakultas Farmasi Universitas Sanata Dharma yang senantiasa menemani dan memberikan fasilitas selama proses pelaksanaan penelitian di laboratorium. 7. Papa, mama, dan kedua kakakku yang telah memberikan doa, semangat, dan dukungan kepada penulis selama proses penyusunan skripsi. 8. Astuti Malyawati Soesanto dan Ricardo Kenny Chandra, teman seperjuangan yang bersama-sama berusaha, bertukar informasi dan saling memberi dukungan dalam pengerjaan skripsi. 9. Gisela Winda Permatasari, atas pengertian, semangat, doa, dan dukungannya selama proses penelitian dan penyusunan skripsi ini. 10. Sahabatku Hugo, Bram, Reza, Suryo, Christian, Tora atas canda tawa dalam perkuliahan ini 11. Teman-teman FST B 2010 atas kebersamaan, canda tawa, dan pengalaman berharga untuk penulis selama menjalani kuliah di Fakultas Farmasi Universitas Sanata Dharma. 12. Semua pihak yang tidak dapat penulis sebutkan satu per satu yang telah membantu dalam proses penyusunan skripsi ini. Akhir kata, penulis menyadari bahwa masih banyak kekurangan dalam penyusunan skripsi ini mengingat keterbatasan kemampuan dan pengetahuan penulis. Oleh karena itu, penulis mengharapkan kritik dan saran yang membangun dari semua pihak. Semoga skripsi ini dapat memberikan manfaat bagi pembaca. Penulis

viii


DAFTAR ISI HALAMAN JUDUL........................................................................................

i

HALAMAN PERSETUJUAN PEMBIMBING...............................................

ii

HALAMAN PENGESAHAN..........................................................................

iii

PERNYATAAN KEASLIAN KARYA...........................................................

iv

LEMBAR PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI ILMIAH UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS.........................................................

v

HALAMAN PERSEMBAHAN.......................................................................

vi

PRAKATA........................................................................................................ vii DAFTAR ISI.....................................................................................................

ix

DAFTAR TABEL.............................................................................................

xi

DAFTAR GAMBAR........................................................................................ xii DAFTAR LAMPIRAN.................................................................................... xiii DAFTAR SINGKATAN KATA...................................................................... xiv INTISARI.........................................................................................................

xv

ABSTRACT...................................................................................................... xvi BAB I. PENGANTAR .....................................................................................

1

A. Latar Belakang................................................................................

1

1. Permasalahan ...........................................................................

2

2. Keaslian Penelitian....................................................................

2

3. Manfaat Penelitian ...................................................................

3

a. Manfaat teoretis ...............................................................

3

b. Manfaat praktis .................................................................

3

B. Tujuan Penelitian ...........................................................................

3

1. Tujuan umum ..........................................................................

3

2. Tujuan khusus .........................................................................

3

BAB II. PENELAAHAN PUSTAKA..............................................................

4

A. Kanker ...........................................................................................

4

ix


B. Kanker Payudara............................................................................

5

C. Reseptor Estrogen..........................................................................

6

D. Coumestrol ....................................................................................

9

E. Penapisan Virtual Berbasis Struktur..............................................

10

F. Landasan Teori............................................................................... 13 G. Hipotesis ........................................................................................ 15 BAB III. METODE PENELITIAN..................................................................

16

A. Jenis dan Rancangan Penelitian.....................................................

16

B. Variabel dan Definisi Operasional................................................. 16 1. Variabel Penelitian................................................................... 16 a. Variabel utama...................................................................

16

b. Variabel pengacau.............................................................. 16 2. Definisi Operasional................................................................

16

C. Bahan dan Alat Penelitian.............................................................. 17 D. Tata Cara Penelitian....................................................................... 18 E. Tata Cara Analisis Hasil ...............................................................

20

BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN.........................................................

21

BAB V. KESIMPULAN DAN SARAN..........................................................

32

A. Kesimpulan ...................................................................................

32

B. Saran .............................................................................................. 32 DAFTAR PUSTAKA.......................................................................................

33

LAMPIRAN...................................................................................................... 36 BIOGRAFI PENULIS......................................................................................

x

76


DAFTAR TABEL Tabel I.

Tabel data RMSD penambatan ulang 4-hidroksi-tamoksifen......

22

Tabel II.

Tabel nilai Tc-PLIF tiap kelompok .............................................

29

xi


DAFTAR GAMBAR Gambar 1. Struktur hormon estrogen: (A) Estron, (B) Estradiol, (C) Estriol

6

Gambar 2. Struktur coumestrol.......................................................................

10

Gambar 3. Diagram pengambilan keputusan...................................................

19

Gambar 4. Histogram sebaran nilai Tc-PLIF coumestrol-REα.......................

24

Gambar 5. Histogram sebaran RMSD penambatan coumestrol-REα..............

25

Gambar 6. Plot kelompok RMSD coumestrol.................................................

26

Gambar 7. Interaksi 4-hidroksi-tamoksifen pada REα....................................

27

Gambar 8. (A) 3 pose ikatan coumestrol pada REα. Pose representatif kelompok 1, 2, 3 coumestrol pada REα (B, C, D)..........................

29

Gambar 9. Jarak ikatan coumestrol pada REα kelompok 1 (A) dan 2 (B).......

31

Gambar 10. Struktur usulan pengembangan coumestrol ................................... 31

xii


DAFTAR LAMPIRAN Lampiran 1.

Tabel nilai RMSD ChemPLP non filter 4-hidroksi-tamoksifen.

37

Lampiran 2.

Tabel nilai RMSD ChemPLP filter 4-hidroksi-tamoksifen........

45

Lampiran 3.

Tabel nilai RMSD Tc-PLIF non filter 4-hidroksi-tamoksifen...

53

Lampiran 4.

Tabel nilai RMSD Tc-PLIF filter 4-hidroksi-tamoksifen...........

60

Lampiran 5.

Script

untuk

melakukan penambatan ulang

4-hidroksi-

tamoksifen pada REα...................................................................

68

Lampiran 6.

Script untuk melakukan penambatan coumestrol pada REα........

69

Lampiran 7.

Script perhitungan nilai RMSD 4-hidroksi-tamoksifen pada protokol Tc-PLIF nonfilter........................................................... 70

Lampiran 8.

Script perhitungan nilai RMSD 4-hidroksi-tamoksifen pada protokol Tc-PLIF filter................................................................. 71

Lampiran 9.

Script perhitungan nilai RMSD 4-hidroksi-tamoksifen pada protokol ChemPLP nonfilter........................................................

72

Lampiran 10. Script perhitungan nilai RMSD 4-hidroksi-tamoksifen pada protokol ChemPLP filter..............................................................

73

Lampiran 11. Script perhitungan nilai RMSD coumestrol pada protokol ChemPLP filter............................................................................

74

Lampiran 12. Lampiran data statistik protokol Tc-PLIF filter ..........................

75

xiii


DAFTAR SINGKATAN KATA

AF

Activation function

ChemPLP

Chemical piecewise linear potential

DBD

DNA binding domain

EF1%

Enrichment factor 1%

ER

Estrogen receptor

ERE

Estrogen receptor element

HB-EGF

Heparin binding epitelial growth factor

IFP

Interaction finger print

LBD

Ligand binding domain

PLANTS

Protein ligand ant system

PVBS

Penapisan virtual berbasis struktur

PyPLIF

Python based protein ligand interaction fingerprint

RMSD

Root mean square deviation

SIRS

Sistem informasi rumah sakit

Tc

Tanimoto coefficient

Tc-PLIF

Tanimoto coefficient protein ligand interaction fingerprint

xiv


INTISARI

Kanker payudara merupakan kanker yang paling banyak diderita wanita. Salah satu yang berperan memicu sel kanker yaitu reseptor estrogen α (REα) yang diekpresikan berlebihan. Untuk mencegah kanker tersebut diperlukan senyawa yang dapat berperan sebagai antagonis REα. Coumestrol merupakan senyawa fitoestrogen yang terdapat dalam kacang-kacangan, bayam, kedelai, dan cengkeh. Secara in vitro dan in vivo diketahui bahwa coumestrol dapat berikatan dengan REα maupun REβ namun secara in silico belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui dan menguji apakah protokol yang dikembangkan oleh Radifar dkk. (2013) dapat mengenali coumestrol sebagai ligan bagi REα dan bagaimanakah posenya dalam kantung ikatan REα. Penelitian ini merupakan komputasi eksperimental dengan menggunakan protokol tervalidasi hasil pengembangan Anita dkk. (2012) dan divalidasi kembali oleh Radifar dkk. (2013) yang menggunakan perangkat lunak sidik jari interaksi Python-based Protein-Ligand Interaction Fingerprint (PyPLIF) yang telah terbukti dapat meningkatkan kualitas metode penapisan virtual berbasis struktur (PVBS) dalam proses validasi retrospektif untuk identifikasi ligan bagi REα. Hasil penelitian menunjukkan bahwa protokol yang dikembangkan oleh Radifar dkk. (2013) tidak dapat mengenali coumestrol sebagai ligan bagi REα selain itu protokol tersebut tidak dapat digunakan untuk elusidasi mode ikatan coumestrol karena tidak mampu mereproduksi mode ikatan ligan kokristal sehingga digunakan protokol PVBS tanpa sidik jari interaksi untuk elusidasi mode dan didapatkan setidaknya 3 pose coumestrol. Kata kunci: Coumestrol, reseptor estrogen α, PVBS, elusidasi mode

xv


ABSTRACT

Breast cancer is the most frequent cancer that happened in women. estrogen receptor alpha (ERα) that expressed excessively, has a role in breast cancer development. To prevent breast cancer, natural compound that has antagonistic activity on ERα is needed. Coumestrol is phytoestrogen compound which can be found in bean, spinach, soybean, and clove. Both in vitro and in vivo experimentals show that coumestrol can interact with ERα and ERβ but in silico experiment, the activity is not yet known. The purposes of this experiment are to test whether the protocol developed by Radifar et al. (2013) can identify coumestrol as ligand for ERα and to examine the pose of coumestrol in ERα binding pocket. The method of this experiment was computation experimental which utilized a validated protocol by Anita et al. (2012) and revalidated by Radifar et al. (2013) using interaction fingerprint (IFP) software named Python-based Protein-Ligand Interaction Fingerprint (PyPLIF) that could improve the quality of structure based virtual screening (SBVS) in retrospective validation to identify ligands for ERα. The results showed that the protocol developed by Radifar et al. (2013) could not identify coumestrol as ligand for ERα. Moreover the protocol could not be used for binding mode elucidation because the protocol could not reproduce co-crystal ligand binding mode, therefore SVBS protocol without IFP was used for binding mode elucidation and at least 3 pose of coumestrol are found. Keyword: Coumestrol, estrogen receptor α, SBVS, mode elucidation

xvi


BAB I PENGANTAR A. Latar Belakang Kanker payudara merupakan sekelompok sel abnormal yang disebabkan oleh proses pembelahan sel yang berlebihan dan tidak terkoordinasi yang terjadi pada payudara (Kumar, 2007). Saat ini kanker payudara merupakan kanker terbanyak kedua yang menyebabkan kematian setelah kanker paru-paru dan merupakan kanker terbanyak pada wanita. Sebanyak 203.000 kasus ditemukan pada setiap negara (rasio populasi 1:4) di Asia Tenggara dengan jumlah kematian 93.000 (Globocan, 2008). Di Indonesia, berdasarkan data Sistem Informasi Rumah Sakit (SIRS) tahun 2007, kanker payudara menempati urutan pertama pada pasien rawat inap di seluruh RS di Indonesia yaitu sekitar 16,85%. Salah satu yang berperan memicu sel kanker yaitu reseptor estrogen α (REα) dimana pada kanker payudara sekitar 70% ditemukan REα yang diekspresikan berlebihan (Deroo dan Korach, 2006). Peran REα terhadap kanker payudara yaitu peningkatan pengikatan estrogen pada REα dapat menstimulasi proliferasi dari sel payudara sehingga menyebabkan peningkatan pembelahan sel dan replikasi DNA yang memicu mutasi. Hal tersebut dapat mengganggu daur sel, apoptosis, dan perbaikan DNA sehingga terbentuk tumor (Deroo dan Korach, 2006). Melihat peran REα maka diperlukan anti kanker berupa ligan yang dapat berfungsi sebagai antagonis REα.

1


2

Berdasarkan penelitian Hopert, Beyer, Frank, Strunck, Wiinsche, dan Volimer (1998), coumestrol secara in vitro dapat berikatan dengan REα. Selain itu Jacob, Temple, Patisaul, Young, dan Rissman (2000) menunjukan bahwa coumestrol secara in vivo dapat berikatan dengan REα. Meskipun secara in vitro dan in vivo telah diketahui bahwa coumestrol dapat berfungsi sebagai ligan REα, namun perlu diketahui apakah secara in silico coumestrol dapat menjadi ligan REα, sehingga dapat digunakan untuk pengembangan obat. Penelitian ini menggunakan protokol tervalidasi hasil pengembangan Anita, Radifar, Kardono, Hanafi, dan Istyastono (2012) dan divalidasi kembali oleh Radifar, Yuniarti, dan Istyastono (2013). Untuk mengetahui dan menguji kemampuan protokol yang dikembangkan oleh Radifar dkk. (2013) diharapkan dapat mengenali coumestrol sebagai ligan pada REα serta mengetahui pose coumestrol pada kantung ikatan REα. 1.

Permasalahan Berdasarkan latar belakang tersebut, permasalahan pada penelitian ini

adalah: 1. Apakah coumestrol merupakan ligan bagi REα secara in silico menurut protokol penapisan yang dikembangkan Radifar dkk. (2013)? 2. Bagaimanakah pose coumestrol di dalam kantung ikatan REα? 2. Keaslian Penelitian Penelitian mengenai simulasi penambatan molekuler coumestrol pada REα belum pernah dilakukan. Adapun beberapa jurnal terkait antara lain Structure-Based Design of Eugenol Analogs as Potential Estrogen Receptor


3

Antagonists oleh Anita dkk. pada tahun 2012; In silico Screening and Binding Mode Analysis of Celexocib as a Ligand for Estrogen Receptor Alpha oleh Riswanto, Setiawati, Yuliani, dan Istyastono pada tahun 2013. 3. Manfaat Penelitian

a. Manfaat teoretis Hasil penelitian diharapkan dapat menambah pengetahuan tentang pengikatan coumestrol pada REα, sehingga dapat menjadi acuan dalam pengembangan antagonis REα dan mengetahui apakah protokol penapisan in silico yang dikembangkan Radifar dkk. (2013) mampu mengenali coumestrol sebagai ligan pada REα. b. Manfaat praktis Penelitian ini diharapkan menghasilkan protokol yang mampu mengenali ligan bagi REα. B. Tujuan Penelitian 1. Tujuan umum

Untuk mengidentifikasi senyawa yang dapat menjadi ligan bagi REα secara in silico. 2. Tujuan khusus

Untuk mengetahui dan menguji apakah protokol penapisan in silico yang dikembangkan Radifar dkk. (2013) mampu mengenali coumestrol sebagai ligan pada REα dan mengetahui pada level atomik pose coumestrol pada kantung ikatan REα.


BAB II PENELAAHAN PUSTAKA A. Kanker Kanker merupakan kumpulan sel-sel

yang tumbuh melampaui batas

normal, yang kemudian dapat menyerang suatu bagian tubuh dan dapat menyebar ke organ lain (metastasis). Kanker merupakan istilah umum untuk menunjukkan adanya neoplasma. Neoplasma didefinisikan sebagai massa abnormal jaringan yang pertumbuhannya berlebihan dan tidak terkoordinasikan dengan pertumbuhan jaringan normal walaupun rangsangan yang memicu pertumbuhan tersebut telah berhenti (Kumar, 2007). Karsinogenesis merupakan proses pembentukan sel kanker yang melalui banyak tahap, baik pada tingkat fenotip maupun genotip. Dalam kondisi normal, langkah-langkah proliferasi sel dapat dibagi sebagai berikut: (1) faktor pertumbuhan terikat pada reseptor pertumbuhan pada permukaan sel; (2) reseptor faktor pertumbuhan memberi sinyal untuk mengaktifkan protein tranduser; (3) sinyal ditransmisikan melewati sitosol melalui second messenger menuju inti sel; (4) faktor transkripsi inti yang memulai pengaktifan transkripsi DNA. Berbeda dengan sel normal, jumlah proliferasi sel kanker akan meningkat dan sel yang berapoptosis menurun (Kumar, 2007). Senyawa eksogen seperti pengawet makanan, agen radiasi, senyawa radikal bebas, virus dan senyawa endogen seperti hormon, sistem imun dapat menyebabkan terjadinya kanker. Tahap awal terjadinya kanker yaitu inisiasi. Tahap ini disebabkan oleh perubahan genetik yang irreversible sehingga memicu 4


5

perubahan sel normal dan meningkatkan proliferasi. Pada tahap ini terjadi kerusakan DNA yang dapat diperbaiki dengan mekanisme enzimatik. Bila pembelahan sel telah terjadi sebelum DNA diperbaiki maka dapat menyebabkan perubahan sel yang permanen dan irreversible. Pada tahap ini sel normal disebut juga sel inisiasi (Bertram, 2001). Promosi adalah tahap setelah inisiasi. Bila senyawa yang dapat menyebabkan kanker terus terpapar maka akan meningkatkan proliferasi sel, perubahan ekspresi gen dan peubahan pada kontrol pertumbuhan seluler sehingga sel inisiasi terus berkembang dan menjadi sel tumor (Trosko, 2001). Tahap selanjutnya adalah progresi. Pada tahap ini sel dapat berproliferasi tanpa adanya stimulus. Sel tumor akan semakin berkembang menjadi sel kanker yang disebabkan oleh perubahan DNA, ekspresi onkogen, dan mutasi tambahan. Karakteristik sel kanker yaitu irreversible, perkembangan yang sangat cepat, perubahan pada morfologi, biokimia, dan metabolisme sel (Dixon dan Kopras, 2004). B. Kanker Payudara Kanker payudara terjadi ketika sel yang terdapat di payudara membelah dan tumbuh dengan tidak terkontrol. Perkembangan tumor ini dapat terjadi selama 10 tahun atau kurang bergantung pada keganasan tumor tersebut. Payudara wanita terdiri dari lobulus, duktus, lemak dan jaringan konektif, pembuluh darah dan limfe. Sekitar 50-75% kanker payudara terjadi di bagian duktus, 10-15% di bagian lobus dan sisanya di jaringan payudara (Price, 2006).


6

Data WHO (Globocan, 2008) menunjukkan bahwa kanker payudara adalah kanker yang paling banyak menyebabkan kematian setelah kanker paruparu dan merupakan kanker yang paling banyak diderita wanita dengan 203.000 kasus ditemukan pada setiap negara (rasio populasi 1:4) di Asia Tenggara dengan jumlah kematian 93.000. Di Indonesia kanker payudara menempati urutan pertama pada pasien rawat inap di seluruh RS di Indonesia (16,85%), disusul kanker leher rahim (11,78%) (Yayasan Kanker Indonesia, 2012). C. Reseptor Estrogen Reseptor estrogen (RE) adalah salah satu anggota reseptor inti yang diaktivasi oleh hormon estrogen. tiga tipe utama hormon estrogen yang terdapat pada wanita adalah estron (E1) yang hanya dapat berikatan pada REα, estradiol (E2) yang dapat berikatan dengan REα maupun REβ, dan estriol (E3) yang hanya dapat berikatan dengan REβ. Estradiol merupakan hormon yang paling dominan diproduksi selama masa reproduksi. Peran estradiol digantikan oleh estriol pada saat wanita sedang mengandung. Setelah masuk masa menopause hormon estrogen yang paling berperan adalah estron (Kikandi, 2008). Struktur hormon estrogen ditunjukkan pada Gambar 1.

Gambar 1. Struktur hormon estrogen: (A) Estron, (B) Estradiol, (C) Estriol


7

Molekul RE memiliki tiga tempat ikatan spesifik, yaitu terhadap ligan yang disebut ligand binding domain (LBD) atau disebut juga activation function 2 (AF-2) atau terhadap growth factor yang biasa disebut AF-1 dan terhadap DNA yang disebut DNA binding domain (DBD). DBD yang nantinya akan berikatan dengan estrogen receptor element (ERE) (Gustaffson, 1999). Terdapat 2 mekanisme aktivasi RE yaitu aktivasi RE pada kompartemen inti (translation transactivation) dan aktivasi RE yang terdapat pada membran (signaling). Mekanisme aktivasi RE pada kompartemen inti yaitu ligan agonis berikatan dengan RE akan mengakibatkan terjadinya perubahan konformasi reseptor yang memungkinkannya berikatan dengan koaktivator. Kemudian kompleks ligan-reseptor akan berikatan dengan ERE. Setelah berikatan dengan ERE, kompleks tersebut akan berikatan dengan suatu protein koaktivator dan mengaktifkan faktor transkripsi. Aktivasi transkripsi gen tadi akan menghasilkan mRNA

yang

mengarah

pada

sintesis

protein

tertentu

dan

kemudian

mempengaruhi berbagai fungsi sel bergantung sel target (Gustaffson, 1999). Mekanisme aktivasi RE pada membran yaitu ligan agonis berikatan pada RE di membran, kemudian melalui heparin binding epitelial growth factor (HBEGF) mengaktivasi reseptor EGF yang kemudian memberi sinyal melalui jalur Ras/Raf/MAP kinase memberi sinyal kepada target gen seperti P53 yang akan menginaktivasi P53 sehingga tumor supressor gen tidak bekerja, C-Myc yang akan mengaktifkan gen tersebut sehingga terjadi proliferasi sel atau mengaktifkan c-jun yang akan mencegah terjadinya apoptosis (Levin, 2001).


8

Terdapat 2 jenis RE yaitu REα dan REβ yang disandi oleh gen yang berbeda. REα dapat ditemukan di endometrium, sel kanker payudara, dan hipotalamus (Yaghmaie, Saeed, Garan, Freitag, Timiras, dan Sternberg, 2005), sedangkan REβ dapat ditemukan pada ginjal, otak, tulang, jantung, prostat, paruparu, mukosa intestinal, dan sel endothelial (Babiker, De Windt, van Eickels, Grohe, Meyer, dan Doevendans, 2002). REα dan REβ dihasilkan oleh gen yang berbeda. Gen REα terletak pada kromosom 6 lokus q25.I, sedangkan gen REβ terletak pada pita q22-24 kromosom 14. REα dan REβ mempunyai kemiripan karakteristik, 95% domain ikatan DNA dan 55% domain ikatan ligan kedua jenis RE tersebut sama (Shaun, Susan, Sietse, dan Malcolm, 1997). REα dan REβ dapat membentuk heterodimer untuk merangsang transkripsi gen-gen yang mengatur proliferasi dan siklus sel. Pada organ yang mempunyai ekspresi REα lebih banyak dari REβ maka akan banyak terbentuk homodimer REα dan heterodimer REα/β dibandingkan dengan homodimer REβ. Bentuk heterodimer REα/β dapat berikatan pada DNA dengan afinitas yang sama dengan homodimer REα dan lebih besar daripada homodimer REβ. REβ dapat menghambat aktivasi transkripsional yang diperantarai oleh REα jika terdapat dalam bentuk heterodimer (Paruthiyil, Parmar, Kerekatte, Cunha, Firestone, Leitman, 2004). Salah satu yang berperan dalam kanker payudara adalah REα. Pada kanker payudara, sekitar 70% ditemukan REα yang diekspresikan berlebihan. Hubungan REα terhadap kanker payudara yaitu peningkatan pengikatan estrogen


9

pada REα dapat menstimulasi proliferasi dari sel payudara sehingga menyebabkan peningkatan pembelahan sel dan replikasi DNA. Laju replikasi yang sangat cepat akan menyebabkan sel menjadi rentan terhadap kesalahan penyandian genetik sehingga memicu mutasi. Hal tersebut mengganggu daur sel, apoptosis, dan perbaikan DNA yang berujung pada terbentuknya tumor (Deroo dan Korach, 2006). Radifar dkk. (2013) melakukan penelitian secara in silico dengan metode sidik jari interaksi dengan 4-hidroksi-tamoksifen sebagai ligan bagi REα. Dalam penelitian tersebut Asp351 diketahui berperan menjadi jangkar dalam ikatan suatu ligan dengan REα. D. Coumestrol Coumestrol (3,9-dihidroksi-6H-benzofuro[3,2-c] [1]benzopyran-6-one) merupakan senyawa polifenolik alami golongan pterokarpan yang terdapat dalam kacang-kacangan, bayam, kedelai, dan cengkeh. Coumestrol paling banyak terdapat dalam kedelai dan cengkeh dan dapat berfungsi sebagai antioksidan, antibakteri, antiviral, dan antifungi (Lee, Lee, Park, Sangurdekar, Chang 2012). Coumestrol merupakan senyawa fitoestrogen yang memiliki aktivitas biologis seperti estrogen sehingga memiliki reseptor yang sama dengan estrogen yaitu RE. Coumestrol dapat berikatan dengan REα maupun REβ dengan kemampuan ikatan dengan REβ lebih tinggi dibandingkan REα (Kuiper, Enmark, Pelto-Huikko, Nilsson, dan Gustaffson, 1996). Berdasarkan penelitian Hopert dkk. (1998) secara in vitro coumestrol dapat menjadi ligan bagi REα dengan kemampuan yang lebih baik dibandingkan genistein, daidzein, dan α-mangostin.


10

Selain itu, secara in vivo coumestrol dapat menjadi senyawa anti estrogen pada otak dan kelenjar pituitari yang bekerja dengan berikatan REα (Jacob dkk., 2000). Struktur coumestrol dapat dilihat pada Gambar 2.

Gambar 2. Struktur coumestrol

E. Penapisan Virtual Berbasis Struktur Penapisan virtual berbasis struktur (PVBS) adalah teknik komputasi dalam penemuan obat untuk mengidentifikasi bagaimana suatu senyawa dapat berikatan pada targetnya seperti enzim atau reseptor dimana struktur dari molekul target sudah diketahui sehingga dilakukan dengan cara menambatkan ligan dengan protein target kemudian dilanjutkan dengan scoring untuk memperkirakan afinitas ligan terhadap protein target (Kroemer, 2007). PVBS bersifat stochastic, oleh karena itu diperlukan validasi. Ada 2 macam validasi yaitu validasi internal dan validasi retrospektif. Validasi internal dilakukan dengan cara menambatkan kembali ligan standar dengan protein target untuk kemudian dilihat bagaimana pose penambatannya terhadap struktur kristal awal. Tujuan dilakukan validasi internal adalah untuk menguji apakah protokol PVBS dapat memberikan data yang reprodusibel (Anita dkk., 2012). Parameter yang digunakan pada validasi internal yaitu Root Mean Square Distance (RMSD).


Protokol suatu PVBS dapat diterima apabila memiliki nilai

11

RMSD ≤ 2 Å

(Marcou dan Rognan, 2007). Validasi retrospektif dilakukan dengan menggunakan senyawa yang aktif terhadap reseptor target (REα) dan pengecoh untuk ditambatkan menggunakan protokol yang sama kemudian dilihat nilai Enrichment Factor 1% (EF1%). Nilai EF1% didapat dengan membandingkan % True Positive pada 1% False Positive. Nilai EF1% tersebut kemudian dibandingkan dengan EF1% pada pertama kali dilakukan retrospektif PVBS terhadap REα. Apabila nilai EF1% lebih besar dari EF1% awal maka protokol tersebut dikatakan baik (Huang, Soichet, Irwin, 2006). Salah satu perangkat lunak penambatan yang dapat digunakan dalam penapisan virtual berbasis struktur adalah PLANTS 1.2 (Korb, Stutzle, dan Exner, 2007; Korb dkk., 2009). PLANTS 1.2 memberikan luaran ChemPLP (chemical piecewise linear potential) yang merupakan suatu scoring function yang menilai interaksi yang ada berdasarkan gaya tarik-menarik dan tolak-menolak antara protein (reseptor) dan ligan. Prinsip dari penilaian ChemPLP adalah memberi nilai suatu penambatan protein-ligan berdasarkan posisi ligan di dalam reseptor target. Nilai ChemPLP suatu ligan yang memiliki posisi penambatan yang sama persis dengan ligan lain akan selalu sama, karena penilaian ini berdasarkan perhitungan matematis (Korb dkk., 2007). Kualitas PVBS dapat ditingkatkan dengan menggunakan Interaction Fingerprint (IFP) (Marcou dan Rognan, 2007). Dasar dari IFP yaitu dengan mengubah bentuk 3 dimensi dari interaksi protein-ligan ke dalam 1 dimensi bitstrings. Bitstrings tersebut kemudian digunakan untuk membandingkan


12

interaksi protein-ligan pada docking tools terhadap ligan pembanding. Perbandingan ini menghasilkan nilai yang dapat digunakan untuk meningkatkan PVBS (Radifar dkk., 2013). Namun kebanyakan tools IFP berbayar sehingga kemampuan untuk megembangkan IFP terbatas. Oleh karena itu Radifar dkk. (2013) mengembangkan metode penapisan virtual yaitu PyPLIF (Python-based Protein-Ligan Interaction Fingerprint). PyPLIF merupakan pengembangan IFP dengan mengubah interaksi molekuler protein-ligan menjadi bitstrings sesuai dengan residu dan tipe interaksinya. Untuk setiap residu terdapat 7 bit yang mewakili 7 tipe interaksi yaitu (1) apolar, (2) interaksi aromatik (face to face), (3) interaksi aromatik (face to edge), (4) ikatan hidrogen (protein sebagai donor), (5) ikatan hidrogen (protein sebagai akseptor), (6) interaksi elektrostatik (protein bermuatan positif), dan (7) interaksi elektrostatik (protein bermuatan negatif). Kemudian bitstrings tersebut dibandingkan terhadap standar untuk dilihat kemiripanya dengan menggunakan Tanimoto coefficient Protein-Ligan Interaction Fingerprint (Tc-PLIF) (Radifar dkk., 2013). Tanimoto coefficient (Tc) merupakan hasil dari pembagian antara jumlah bit pada kedua ligan dengan jumlah bit pada ligan standar dan ligan yang ditambatkan dikurangi jumlah bit pada kedua ligan. Tc-PLIF menghasilkan nilai 0,000-1,000 dimana 0,000 menunjukkan tidak ada kemiripan dan 1,000 menunjukkan interaksi fingerprint ligan standar dan ligan yang ditambatkan identik (Radifar dkk., 2013). Suatu ligan dapat dikenali pada suatu protein target apabila memiliki nilai Tc-PLIF ≥ 0,600 (Marcou dan Rognan, 2007).


13

F. Landasan Teori Kanker adalah

pertumbuhan sel abnormal dimana pertumbuhan sel

tersebut tidak terkontrol dan tidak dapat berhenti meskipun rangsangan pertumbuhan sel tersebut telah dihentikan. Kanker payudara yaitu kanker yang terletak pada payudara yaitu sekitar 50 – 75% terjadi di bagian duktus. Kanker payudara merupakan kanker terbanyak yang diderita wanita dengan 93.000 kematian pada negara di Asia Tenggara selain itu berdasarkan data Sistem Informasi Rumah Sakit (SIRS) tahun 2007, kanker payudara menempati urutan pertama pada pasien rawat inap di seluruh RS di Indonesia yaitu sebesar 16,85%. RE yaitu reseptor yang memerlukan hormon estrogen dalam proses pengaktifannya. Aktivasi RE oleh ligan dapat melalui 2 jalur yaitu aktivasi pada RE dalam kompartemen inti (transactivation transcription) dan aktivasi RE pada membran (signaling). Sinyal ini dapat mengaktifkan gen C-Myc yang merupakan gen untuk proliferasi sel, menginaktivasi gen P53 yang merupakan gen penekan tumor dan mengaktifkan c-jun yang merupakan anti apoptosis. Terdapat 2 jenis RE yaitu REα dan REβ. Berdasarkan penelitian sekitar 70% REα diekspresikan berlebihan pada penderita kanker payudara dimana ekspresi berlebihan tersebut dapat mengganggu daur sel, apoptosis, dan perbaikan DNA sehingga dapat memicu terbentuknya tumor. Berdasarkan penelitian Radifar dkk. (2013) yang berperan sebagai jangkar ligan bagi REα adalah Asp 351. Coumestrol merupakan senyawa fitoestrogen dapat ditemukan dalam kacang-kacangan, bayam, kedelai, dan cengkeh. Secara in vitro maupun in vivo


14

coumestrol diketahui dapat berikatan dengan REα maupun REβ dengan kemampuan ikatan dengan REβ lebih tinggi dibandingkan REα. PVBS

adalah

teknik

komputasi

dalam

penemuan

obat

untuk

mengidentifikasi bagaimana suatu senyawa dapat berikatan pada targetnya yaitu dapat berupa enzim atau reseptor. PVBS bersifat stochastic, oleh karena itu diperlukan validasi yaitu validasi internal dan validasi retrospektif. Pada penelitian ini hanya digunakan validasi internal. Validasi internal dilakukan dengan menambatkan kembali ligan standar pada reseptor untuk menguji apakah protokol PVBS dapat menghasilkan kembali pose ligan ko-kristal. Parameter yang digunakan adalah RMSD ≤ 2 Å. Penelitian PVBS memerlukan perangkat lunak untuk menambatkan suatu ligan pada protein. Salah satu perangkat lunak yang dapat digunakan dan tidak berbayar adalah PLANTS 1.2 yang memberikan luaran ChemPLP, suatu scoring function yang menilai interaksi yang ada berdasarkan gaya tarik-menarik dan tolak-menolak antara protein (reseptor) dan ligan. Semakin negatif nilai ChemPLP maka afinitas suatu ligan dalam protein semakin tinggi. IFP merupakan metode yang dapat digunakan untuk meningkatkan kualitas PVBS, namun kebanyakan tools IFP berbayar sehingga Radifar dkk. (2013) membuat tools IFP yang tidak berbayar yaitu PyPLIF yang merupakan pengembangan IFP. PyPLIF mengubah interaksi molekuler protein-ligan menjadi bitstrings sesuai dengan residu dan tipe interaksinya. Untuk setiap residu terdapat 7 bit yang mewakili 7 tipe interaksi, setelah itu bitstrings tersebut dibandingkan terhadap standar untuk dilihat kemiripannya dengan menggunakan Tc-PLIF.


15

Tc-PLIF memiliki rentang antara 0,000 hingga 1,000 dimana nilai 0,000 memiliki arti tidak ada kemiripan dan nilai 1,000 menunjukkan interaksi sidik jari ligan standar dan ligan yang ditambatkan identik. Suatu ligan dapat dikatakan dikenali pada REα apabila memiliki nilai Tc-PLIF ≥ 0,600.

G. Hipotesis 1. Coumestrol merupakan ligan bagi REα secara in silico menurut protokol penapisan yang dikembangkan Radifar dkk. (2013) 2. Coumestrol dapat dielusidasi pada kantung ikatan REα


BAB III METODE PENELITIAN

A. Jenis dan Rancangan Penelitian Penelitian yang berjudul “Simulasi Penambatan Molekuler Coumestrol Pada Reseptor Estrogen Alfa” termasuk penelitian komputasi eksperimental yang terdapat intervensi terhadap variabel yang dilakukan dengan bantuan komputer. B. Variabel dan Definisi Operasional 1. Variabel Penelitian a. Variabel utama 1) Variabel bebas

: Protokol penambatan coumestrol pada REα

2) Variabel tergantung : Nilai Tc-PLIF, ChemPLP serta pose coumestrol di dalam kantung ikatan REα b. Variabel pengacau 1) Variabel pengacau terkendali a) Spesifikasi alat komputasi dan versi perangkat lunak 2) Variabel pengacau tak terkendali a) Sifat algoritma penambatan molekuler yang stochastic 2. Definisi Operasional 1. Protokol adalah algoritma penapisan visual yang dikembangkan oleh Anita dkk. (2012) dan telah direvalidasi oleh Radifar dkk. (2013).

16


17

2. Pose coumestrol adalah pose coumestrol di dalam kantung ikatan REα yang dipilih secara obyektif kuantitatif berdasarkan nilai Tc-PLIF dan atau ChemPLP. 3. Filter adalah penyaringan pose ligan yang memiliki interaksi dengan residu asam amino Asp351. C. Bahan dan Alat Penelitian 1. Bahan yang digunakan dalam penelitian a. Protokol yang telah dikembangkan oleh Anita dkk. (2012) dan telah divalidasi kembali oleh Radifar dkk. (2013) b. Struktur ko-kristal dari REα (didapatkan dari PDB kode: 3ERT). c. Struktur tiga dimensi coumestrol (didapatkan dari zinc.docking.org, dengan kode: ZINC00001219) d. Docking Software PLANTS 1.2 (Korb dkk., 2007; Korb dkk., 2009) untuk simulasi penambatan molekuler, PyPLIF (Radifar dkk., 2013) untuk menilai kembali pose penambatan, Open Babel sebagai pustaka fingerprinting open access, PyMol 1.2rl (Lill dan Danielson, 2011) untuk memvisualisasikan pose coumestrol, dan R 3.0.1. (R Development Core Team, 2013) untuk komputasi statistik. 2. Alat atau instrumen penelitian Server Laboratorium Virtual Fakultas Farmasi Universitas Sanata Dharma (Pharcomp.usd) HP Proliant ML110-67 dengan spesifikasi: CPU intel Xeon® E31220 @3.10GHz, RAM 8 GB, dengan sistem operasi Ubuntu 12.04, versi kernel 3.5.0-23-genetic. Visualisasi mode ikatan dan statistik


18

dilakukan pada komputer dengan spesifikasi: CPU intel i5-3230 @2.60GHz, RAM 4GB, dengan sistem operasi ubuntu 12.04 versi kernel 3.8.0-32. D. Tata Cara Penelitian

1. Pengunduhan ko-kristal REα Pengunduhan dilakukan dari website PDB (www.rcsb.org) dengan kode PDB: 3ERT. 2. Pengunduhan struktur coumestrol Struktur virtual coumestrol didapat dengan mengunduh dari zinc database dengan kode ZINC00001219 (http://zinc.docking.org/). 3. Penambatan ulang 4-hidroksi-tamoksifen (validasi internal) 4-hidroksi-tamoksifen ditambatkan pada REα sebanyak 1.000 kali dengan 3 kali replikasi. Setelah itu, dilakukan identifikasi sidik jari interaksi dari hasil penambatan menggunakan aplikasi PyPLIF (Radifar dkk., 2013) dilanjutkan penyaringan pada ikatan hidrogen dengan Asp351 (Radifar dkk., 2013) dan pengurutan nilai yang didapatkan. Luaran yang didapat terbagi menjadi empat bagian: (i) Nilai Tc-PLIF filter ikatan hidrogen dengan Asp351, (ii) Nilai Tc-PLIF nonfilter ikatan hidrogen dengan Asp351, (iii) Nilai ChemPLP filter ikatan hidrogen dengan Asp351, dan (iv) Nilai ChemPLP nonfilter ikatan hidrogen dengan Asp351. 4. Analisis hasil validasi internal Hasil Penambatan Ulang 4-hidroksi-tamoksifen dengan nilai terbaik dari masing-masing bagian luaran dipilih sebagai pose standar untuk menghitung nilai RMSD di masing-masing bagian tersebut secara berurutan


19

dimulai dari poin i sampai poin iv (tata cara 3). Simulasi penambatan coumestrol berdasar pada protokol yang dinyatakan valid sesuai Gambar 3.

Gambar 3. Diagram pengambilan keputusan

5. Simulasi penambatan coumestrol Ligan coumestrol ditambatkan pada REα sebanyak 1.000 kali dengan replikasi 3 kali. Dijalankan proses penambatan molekuler dan PyPLIF. Setiap replikasi, dilakukan perhitungan Tc-PLIF kemudian dilakukan penyaringan


20

pose yang memiliki ikatan dengan Asp351 (Radifar dkk., 2013) dan dipilih pose dengan nilai Tc-PLIF terbesar setiap replikasi. Jika dalam penambatan terdapat lebih dari satu pose dengan nilai Tc-PLIF terbesar, maka pose dengan nilai ChemPLP terbesar yang dipilih 6. Elusidasi pose ikatan coumestrol pada REα Pose penambatan dengan nilai terbaik sesuai luaran protokol yang dinyatakan valid (Gambar 3) dihitung nilai RMSD. RMSD yang didapat kemudian dikelompokkan menggunakan metode pengelompokkan k-means pada aplikasi R komputasi statistik. Nilai median RMSD pada masing-masing kelompok dipilih sebagai kelompok representatif. Kemudian kelompok tersebut digambar posenya menggunakan Pymol untuk menggambarkan bagaimana interaksi coumestrol dengan REα. E. Tata Cara Analisis Hasil Data Tc-PLIF dianalisis dengan aplikasi R komputasi statisik menggunakan shapiro-wilk untuk melihat distribusi data tiap kelompok. Jika didapatkan distribusi data yang normal maka dilanjutkan dengan var-test untuk mengetahui variansi antar kelompok. Apabila distribusi normal selanjutnya digunakan t-test bila tidak terdistribusi normal digunakan Wilcoxon-test. Ligan (coumestrol) dapat dikenali sebagai ligan bagi REα bila secara statistik (taraf kepercayaan 95%) nilai Tc-PLIF ≥ 0,600.


BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN Pendekatan

kimia

medisinal

komputasi

memiliki

peran

dalam

meningkatkan efisiensi penemuan obat. Protokol yang digunakan telah banyak dikembangkan salah satunya adalah protokol yang dikembangkan oleh Anita dkk. (2012) dan divalidasi kembali oleh Radifar dkk. (2013). Untuk melakukan pendekatan secara in silico dibutuhkan protokol yang tervalidasi. Penelitian ini menambatkan coumestrol yang secara in vitro (Hopert dkk., 1998) maupun in vivo (Jacob dkk., 2000) aktif sebagai ligan bagi REα dengan tujuan mengetahui dan menguji kemampuan protokol yang dikembangkan oleh Radifar dkk. (2013) dapat mengenali coumestrol sebagai ligan pada REα serta mengetahui pose coumestrol pada kantung ikatan REα. Coumestrol ditambatkan pada REα dengan menggunakan aplikasi PLANTS 1.2 (Korb dkk., 2007; Korb dkk., 2009) luaran yang didapatkan adalah nilai ChemPLP dimana nilai terendah merupakan nilai yang paling baik. Kemudian luaran tersebut digunakan untuk mengidentifikasi sidik jari interaksi REα-coumestrol menggunakan aplikasi PyPLIF (Radifar dkk., 2013). Untuk meningkatkan hasil penapisan dilakukan penyaringan pada pose yang memiliki ikatan hidrogen dengan ASP351 (Radifar dkk., 2013). Luaran dari PyPLIF memberikan nilai Tc-PLIF. Kemudian dipilih pose terbaik yang memiliki nilai Tc-PLIF atau ChemPLP yang paling baik.

21


22

Protokol yang digunakan dalam penelitian ini harus valid, oleh karena itu sebelum dilakukan penambatan coumestrol pada REα perlu dilakukan validasi internal dengan menambatkan kembali 4-hidroksi-tamoksifen pada REα untuk mengetahui apakah protokol yamg digunakan dapat menghasilkan kembali pose dari ligan ko-kristal dengan menggunakan parameter nilai RMSD. Protokol dapat diterima apabila 95% dari data mempunyai nilai RMSD ≤ 2 Å sesuai dengan diagram pengambilan keputusan (Gambar 3). Tabel I. Data RMSD penambatan ulang 4-hidroksi-tamoksifen % RMSD ≤ 2 Å ChemPLP % RMSD ≤ 2 Å Tc-PLIF Non Filter Filter Non Filter Filter Rep.I Rep.II Rep.III Rep.I Rep.II Rep.III Rep.I Rep.II Rep.III Rep.I Rep.II Rep.III 99,9% 99,8% 99,8% 100% 100% 99,9% 89,6% 89,9% 90,5% 91,2% 92,5% 90,6%

Berdasarkan tabel I dapat diketahui bahwa protokol yang menggunakan parameter Tc-PLIF tidak dapat menghasilkan kembali pose ko-kristal sedangkan protokol yang menggunakan parameter ChemPLP baik filter maupun non filter dapat menghasilkan kembali pose ko-kristal yang ditandai dengan lebih dari 95% data memiliki nilai RMSD ≤ 2 Å oleh karena itu protokol dengan parameter ChemPLP filter dapat digunakan untuk menentukan pose penambatan coumestrol pada REα. Salah satu tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui dan menguji kemampuan protokol yang dikembangkan oleh Radifar dkk. (2013) dapat mengenali coumestrol sebagai ligan pada REα. Dari data validasi internal diputuskan protokol dengan parameter ChemPLP filter yang digunakan, namun karena protokol tersebut berdasar pada nilai ChemPLP terbaik maka nila Tc-PLIF yang didapat belum tentu merupakan nilai yang terbaik, sehingga digunakan


23

protokol dengan parameter Tc-PLIF filter untuk menguji apakah protokol dapat mengenali coumestrol sebagai ligan pada REα. Protokol dengan parameter Tc-PLIF filter digunakan karena protokol tersebut telah divalidasi oleh Radifar dkk. (2013) bahwa protokol tersebut mampu mengenali ligan REα. Namun protokol tersebut belum dilakukan validasi apakah dapat menghasilkan kembali pose dari ligan ko-kristal. Oleh karena itu pada penelitian ini digunakan protokol dengan parameter Tc-PLIF filter untuk mengetahui dan menguji kemampuan protokol yang dikembangkan oleh Radifar dkk. (2013) dapat mengenali coumestrol sebagai ligan pada REα serta protokol dengan parameter ChemPLP filter untuk mengetahui pose coumestrol pada kantung ikatan REα. 4.1. Protokol Tc-PLIF filter Protokol ini berdasar pada nilai Tc-PLIF terbaik dari coumestrol yang memiliki ikatan hidrogen dengan ASP351 REα pada setiap penambatannya. Penambatan dilakukan sebanyak 1.000 kali (3 kali replikasi). Coumestrol dapat dikenali sebagai ligan pada REα apabila memiliki nilai Tc-PLIF ≥ 0,600 (Marcou dan Rognan, 2007). Untuk menguji apakah nilai Tc-PLIF yang didapatkan ≥ 0,600 digunakan aplikasi statistik R 3.0.1. (R Development Core Team, 2013). Dari penelitian yang dilakukan didapatkan nilai Tc-PLIF dengan nilai mean dan median berturut-turut 0,356 (SEM= 0,003) dan 0,417 (Lampiran 12) kemudian dilakukan uji Wilcoxon dengan Hi yaitu Tc-PLIF lebih kecil dari 0,600 didapatkan nilai p-value < 2,2e-16 (Lampiran 12) artinya Tc-PLIF < 0,600 sehingga protokol ini tidak dapat mengenali coumestrol sebagai ligan pada REα.


24

Namun berdasarkan penelitian Hopert, dkk. (1998) dan Jacob dkk. (2000) secara in vitro maupun in vivo coumestrol aktif sebagai ligan pada REα. Oleh karena itu protokol Radifar dkk. (2013) perlu dikembangkan agar dapat mengenali coumestrol sebagai ligan bagi REα. Kelemahan dari metode interaksi sidik jari yaitu metode tersebut sangat bergantung pada senyawa standar karena prinsip dari sidik jari interaksi yaitu mengukur kemiripan sidik jari interaksi ligan dengan sidik jari interaksi senyawa standar. Dalam protokol Radifar dkk. (2013) senyawa standar yang digunakan adalah 4-hidroksi-tamoksifen yang diketahui mempunyai afinitas yang sangat tinggi terhadap REα oleh karena itu usulan pengembangannya adalah dengan mengganti senyawa standar (4-hidroksi-tamoksifen) dengan senyawa ligan REα yang afinitasnya lebih rendah dari 4-hidroksi-tamoksifen. Usulan pengembangan lainnya yaitu dengan mengganti filter asam amino Asp351 degan asam amino lain yang berperan dalam pengikatan ligan bagi REα seperti Glu353, Arg394, Thr347.

Gambar 4. Histogram sebaran nilai Tc-PLIF coumestrol-REα


25

4.2. Protokol ChemPLP filter Protokol ini berdasar pada nilai ChemPLP terbaik dari coumestrol yang memiliki ikatan hidrogen dengan ASP351 REα pada setiap penambatannya. Protokol ini digunakan untuk mengetahui pose coumestrol pada kantung ikatan REα. Penambatan dilakukan sebanyak 1.000 kali dengan 3 kali replikasi, kemudian dipilih pose dengan nilai ChemPLP terbaik untuk menjadi pembanding dalam menghitung nilai RMSD dari setiap penambatan coumestrol pada REα. Data yang didapatkan ditampilkan pada Gambar 5.

Gambar 5. Histogram sebaran RMSD penambatan coumestrol-REα

Berdasarkan Gambar 5 dapat dilihat bahwa terdapat sebaran nilai RMSD coumestrol pada REα sehingga coumestrol memiliki berbagai pose. Oleh karena itu selanjutnya perlu dilakukan pengelompokan dengan metode pengelompokkan k-means pada aplikasi statistik R 3.0.1. (R Development Core Team, 2013) untuk mengidentifikasi jumlah pose coumestrol pada REα.


26

Sebaran nilai RMSD coumestrol kemudian ditampilkan dalam bentuk plot yang telah dilakukan pengelompokkan dengan menggunakan metode pengelompokkan k-means pada R 3.0.1. (R Development Core Team, 2013) yang ditampilkan pada Gambar 6.

Gambar 6. Plot kelompok RMSD coumestrol

Dari plot tersebut dapat dikatakan bahwa coumestrol setidaknya memiliki 3 pose penambatan, kemudian median dari tiap pose digunakan sebagai pose representatif penambatan coumestrol pada REα untuk divisualisasikan dengan menggunakan aplikasi PyMOL 1.2rl (Lill dan Danielson, 2011). Berdasarkan inspeksi visual struktur kristal REα 3ERT menunjukkan 70 residu asam amino yang membentuk kantung ikatan yaitu Leu327, Tyr328, Ser329, Glu330, Ser341, Met342, Met343, Gly344, Leu345, Leu346, Thr347, Asn348, Leu349, Ala350, Asp351, Arg352, Glu353, Leu354, Val355, Met357, Leu379, Glu380, Cys381, Ala382, Trp383, Leu384, Glu385, Ile386, Leu387,


27

Met388, Ile389, Gly390, Leu391, Val392, Arg394, Ser395, Leu402, Leu403, Phe404, Ala405, Leu408, Leu410, Gly415, Val418, Glu419, Gly420, Met421, Val422, Glu423, Ile424, Phe425, Leu428, Ile514, His516, Met517, Ser518, Asn519, Lys520, Gly521, Met522, Glu523, His524, Leu525, Tyr526, Ser527, Met528, Lys529, Cys530, Leu536, dan Leu539 (Anita dkk., 2012) dan ditemukan ikatan hidrogen yang diduga berperan penting dalam menentukan interaksi liganREα yaitu ikatan antara 4-hidroksi-tamoksifen dengan molekul air dan residu asam amino Glu353 dan Arg394 selain itu ikatan hidrogen antara 4-hidroksitamoksifen dengan residu asam amino Thr347 dan Asp351 (Anita dkk., 2012). Radifar dkk. (2013) menyatakan bahwa ikatan ligan dengan residu asam amino Asp351 yang berperan penting dalam ikatan 4-hidroksi-tamoksifen dengan REα. Interaksi 4-hidroksi-tamoksifen dengan REα dapat dilihat pada Gambar 7.

Gambar 7. Interaksi 4-hidroksi-tamoksifen pada REα


28

Menurut Marcou dan Rognan (2007), interaksi hidrogen dapat terjadi antara 2 atom yang berjarak hingga 3,5 Å, interaksi aromatik (face to face), interaksi aromatik (edge to face), interaksi π-kation dapat terjadi antara 2 atom yang berjarak hingga 4 Å, dan ikatan hidrofobik dapat terjadi pada jarak hingga 4,5 Å. Kantung ikatan suatu ligan pada reseptor yaitu asam amino yang berjarak sekitar 5 Å dari ligan (de Graaf dkk., 2011) sehingga untuk mendeteksi kemungkinan residu asam amino yang dapat berikatan dengan coumestrol dilakukan penyaringan dengan menunjukkan residu asam amino yang berjarak hingga 5 Å dari coumestrol. Kemudian ditentukan asam amino yang berinteraksi dengan coumestrol berdasarkan jarak maksimum sesuai jenis interaksinya. Berdasarkan inspeksi visual dan jarak interaksi hidrogen dibawah 3,5 Å, pada ketiga pose pengikatan coumestrol dalam REα (Gambar 8) pada semua kelompok didapatkan kemungkinan interaksi hidrogen antara bagian 3-hidroksi dari coumestrol dengan residu asam amino Asp351 selain itu pada kelompok 1 dan 2 terdapat ikatan hidrogen dari bagian karbonil coumestrol dengan residu asam amino Thr347. Selain itu terdapat ikatan hidrogen pada bagian 9-hidroksi coumestrol dengan residu asam amino Met522 serta ikatan hidrogen antara air dengan residu asam amino Glu353 dan Arg394 pada semua kelompok. Berdasarkan hasil pengelompokan diketahui bahwa kelompok 3 memiliki pose yang sangat berbeda dari kelompok 1 dan kelompok 2, perbedaan ini dapat disebabkan karena nilai Tc-PLIF yang jauh berbeda antara kelompok 3 dengan kelompok 1 dan 2. Nilai Tc-PLIF masing-masing kelompok dapat dilihat pada Tabel II.


29

Gambar 8. (A) 3 pose ikatan coumestrol pada REα. Pose representatif kelompok 1, 2, 3 coumestrol pada REα (B, C, D)

Tabel II. Tabel nilai Tc-PLIF tiap kelompok

Kelompok Replikasi Nama Ligan 1 1078 ZINC00001219_entry_00001_conf_38 2 786 ZINC00001219_entry_00001_conf_42 3 878 ZINC00001219_entry_00001_conf_32

Tc-PLIF 0,458 0,400 0,138

Berdasarkan nilai Tc-PLIF, semakin tinggi nilai Tc-PLIF maka sidik jari interaksi ligan yang ditambatkan akan semakin mirip dengan sidik jari interaksi ligan standar. Pada tabel II dapat dilihat bahwa kelompok 1 dan 2 memiliki nilai Tc-PLIF yang lebih tinggi dibandingkan kelompok 3 sehingga sidik jari interaksi


30

kelompok 1 dan 2 lebih mirip dengan sidik jari ligan standar (4-hidroksitamoksifen) dibandingkan dengan kelompok 3. Hal ini dapat dibuktikan pada Gambar 8 dimana coumestrol dapat berikatan dengan Asp351 dan Thr347 yang juga merupakan asam amino yang berikatan dengan 4-hidroksi-tamoksifen, sedangkan pada kelompok 3 coumestrol hanya berikatan dengan Asp351 dan Met522. Meskipun dapat menilai kemiripan sidik jari interaksi coumestrol dan 4hidroksi-tamoksifen, protokol sidik jari interaksi yang dikembangkan oleh Radifar dkk. (2013) tidak dapat mengenali coumestrol yang merupakan ligan bagi REα. Oleh karena itu perlu dilakukan pengembangan protokol agar mampu mengenali coumestrol sebagai ligan bagi REα serta dapat menghasilkan kembali pose ligan ko-kristal. Anita dkk. (2012) menyatakan bahwa ikatan hidrogen yang diduga berperan penting dalam menentukan interaksi ligan-REα yaitu ikatan ligan dengan air dan asam amino Glu353 dan Arg394 selain itu ikatan hidrogen antara ligan dengan residu asam amino Thr347 dan Asp351. Pada penambatan coumestol diketahui bahwa tidak ada bagian dari coumestrol yang berikatan dengan air dan asam amino Glu353 dan Arg394. Berdasarkan visualisasi pymol jarak ikatan antara coumestrol dengan air pada kelompok 1 dan kelompok 2 berturut-turut 8,7 Å dan 7,8 Å (Gambar 9) sedangkan menurut Marcou dan Rognan (2007) ikatan hidrogen dapat terjadi antara 2 atom yang berjarak hingga 3,5 Å. Oleh karena itu perlu pengembangan coumestrol agar dapat berikatan dengan air atau residu asam amino Arg394.


31

Usulan pengembangan yaitu dengan menambahkan gugus karboksilat pada bagian nomor 9 dari coumestrol. Dengan penambahan gugus karboksilat tersebut diharapkan akan terjadi interaksi elektrostatik antara senyawa pengembangan dan residu asam amino Arg394 dan ikatan hidrogen antara gugus karboksilat senyawa pengembangan dengan air. Struktur senyawa pengembangan coumestrol ditunjukkan pada Gambar 10.

Gambar 9. Jarak ikatan coumestrol pada REα kelompok 1 (A) dan 2 (B)

Gambar 10. Struktur usulan pengembangan coumestrol


BAB V KESIMPULAN DAN SARAN

A. Kesimpulan 1. Coumestrol bukan merupakan ligan bagi REα menurut Protokol penapisan in silico yang dikembangkan oleh Radifar dkk. (2013) karena protokol tersebut tidak mampu mengenali coumestrol sebagai ligan pada REα. 2. Didapatkan setidaknya 3 pose ikatan coumestrol pada REα dengan menggunakan protokol PVBS tanpa interaksi sidik jari untuk elusidasi mode.

B. Saran 1. Perlu dilakukan pengembangan terhadap protokol penapisan in silico yang dikembangkan oleh Radifar dkk. (2013) agar dapat mengenali senyawasenyawa yang sudah terbukti sebagai ligan pada REα 2. Dapat dilakukan penelitian lebih lanjut mengenai senyawa pengembangan coumestrol

apakah

memiliki

afinitas

terhadap

REα

lebih

baik

dibandingkan coumestrol setelah didapatkan pengembangan protokol PyPLIF yang baik.

32


33

DAFTAR PUSTAKA Anita, Y., Radifar, M., Kardono, L.B.S., Hanafi, M., dan Istyastono, E.P., 2012, Structure-based design of Eugenol Analogs as Potential Estrogen Receptor Antagonists, Bioinformation, 8 (19), 901-906. Babiker, F.A, De Windt, L.J., van Eickels, M., Grohe, C., Meyer, R., dan Doevendans, P.A., 2002, Estrogenic Hormone Action in the Heart: Regulatory Network and Function, Cardiovascular Research, 53 (3), 709–19. Bertram, J.S., 2001, The molecular biology of cancer, Molecular Aspects of Medicine, 21, 167–223. Deroo, B.J., dan Korach, K.S., 2006, Estrogen Receptors and Human Disease, Journal of Clinical Investigation, 116 (3), 561-567. de Graaf, C., Kooistra, A.J., Vischer, H.F., Katritch, V., Kuijer, M., Shiroishi, M., Iwata, S., Shimamura, T., Stevens, R.C., de Esch, I.J., Leurs, R., 2011, Crystal structure-based virtual screening for fragment-like ligands of the human histamine H(1) receptor, Journal of Medicinal Chemistry, 54 (23), 8195-8206. Dixon, K. dan Kopras, E, 2004, Genetic alterations and DNA repair in human carcinogenesis, Seminar in Cancer Biology, 14, 441–448. Globocan, 2008, Cancer Fact Sheet, http://globocan.iarc.fr/factsheets/ cancers/all.asp, diakses tanggal 13 September 2013. Gustaffson, J.A., 1999, Estrogen Receptor, a new dimension in estrogen mechanism of action, Journal of Endocrinology, 163, 379-383. Hopert A.C., Beyer A., Frank K., Strunck E., Wiinsche W., dan Volimer G., 1998, Characterization of Estrogenicity of Phytoestrogens in an Endometrialderived Experimental Model, Environmental Health Perspectives, 106 (9), 581-586. Huang, N., Soichet, B.K., dan Irwin, J.J., 2006, Benchmarking Sets for Molecular Docking, Journal of Medicinal Chemistry, 49 (23), 6789-6801. Jacob, D.A., Temple, J.L., Patisaul, H.B., Young, L.J., dan Rissman, E.F., 2000, Coumestrol Antagonizes Neuroendocrine Actions of Estrogen via the Estrogen Receptor α, Society for Experimental Biology and Medicine, 226 (4), 301-306. Kikandi, N.S., 2008, Understanding the Mode of Action Estrogenic Compound and Development of Novel Electroplating Method, Dissertation, 3, Binghamton University, New York.


34

Korb, O., Stutzle T., dan Exner, T.E., 2007, An ant colony optimization approach to flexible protein-ligand docking, Swarm Intelligence, 1, 115-134. Korb, O., Stutzle T., dan Exner, T.E., 2009, Empirical scoring function for advanced protein-ligand docking with PLANTS. Journal of Chemical Information and Modeling, 49 (1), 84-96. Kroemer, R.T., 2007, Structure-based drug design: docking and scoring Curr Protein Pept, Current Protein and Peptide Science, 8 (4): 312–328. Kuiper, G.J.M., Enmark, E., Pelto-Huikko, M., Nilsson S., dan Gustaffson, J., 1996, Cloning of a novel estrogen receptor expressed in rat prostate and ovary, Proceedings of the National Academy of Sciences, 93 (12), 5925-5930. Kumar, V., 2007, Buku Ajar Patologi, Ed. 7, EGC, Jakarta, PP.186-187. Lee, H., Lee, J., Park, K., Sangurdekar, D., Chang, W., 2012, Effect of Soybean Coumestrol on Bradyrhizobium japonicum Nodulation Ability, Biofilm Formation, and Transcriptional Profile, Applied and Environmental Microbiology, 78 (8), 2896–2903. Levin, E.R., 2001, Cell localization, physiology, and nongenomic actions of estrogen receptors, Journal of Applied Physiology, 91 (4), 1860-1867. Lill, M.A., dan Danielson, M.L., 2011, Computer-aided drug design platform using PyMOL, Journal of Computer-Aided Molecular Design, 25, 13-9. Linda, B., dan Maria, S., Mechanisms of Estrogen Receptor Signaling : Convergence of Genomic and Nongenomic Actions on Target Genes, Molecular Endocrinology 19 (4), 833–842. Marcou, G., dan Rognan, D., 2007, Optimizing fragment and scaffold docking by use of molecular interaction fingerprints, Journal of Chemical Information and Modeling, 47 (1), 195–207. Paruthiyil, S., Parmar, H., Kerekatte, V., Cunha, G.R., Firestone, G.L., Leitman, D.C., 2004, Estrogen Receptor β Inhibits Human Breast Cancer Cell Proliferation and Tumor Formation by Causing a G2 Cell Cycle Arrest, Cancer Research, 64, 423–428. Price, 2006, Patofisiologi Konsep Klinis Proses-Proses Penyakit, Ed. 6, EGC, Jakarta, PP. 150 -151 R Development Core Team, 2013, R:A Language and Environment for Statistical Computing, R foundation for Statistical Computing, Vienna. Radifar, M., Yuniarti, N., dan Istyastono, E.P., 2013, PyPLIF: Python-based Protein-Ligand Interaction Fingerprinting, Bioinformation, 9 (6), 325-328.


35

Riswanto, F.D.A, Setiawati, A., Yuliani, S.H., dan Istyastono, E.P., 2013, In silico Screening and Binding Mode Analysis of Celexocib as a Ligand for Estrogen Receptor Alpha, Indonesian Journal of Drug Design and Discovery, 1 (1). Shaun, M.C., Susan, H., Sietse, M., Malcolm, G.P., 1997, Estrogen Receptors α and β Form Heterodimers on DNA, The Journal of Biochemical Chemistry, 272 (32), 19858-19862. Trosko, J.E., 2001, Commentary: is the concept of “tumorpromotion” a useful paradigm?, Molecular Carcinogenesis, 30, 131–137. Yaghmaie, F., Saeed, O., Garan, S.A., Freitag, W., Timiras, P.S., dan Sternberg, H., 2005, Caloric restriction reduces cell loss and maintains estrogen receptor-alpha immunoreactivity in the pre-optic hypothalamus of female B6D2F1 mice, Neuro Endocrinology Letters, 26 (3), 197–203. Yayasan Kanker Indonesia, 2012, YKI Jakarta race, http://yayasankanker indonesia.org/2012/yki-jakarta-race/, diakses tanggal 23 april 2013.


LAMPIRAN

36

PLAGIAT PLAGIATMERUPAKAN MERUPAKANTINDAKAN TINDAKANTIDAK TIDAKTERPUJI TERPUJI Lampiran 1. Tabel nilai RMSD ChemPLP non filter 4-hidroksi-tamoksifen

37

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

1

1,594

1,594

1,836

41

1,601

1,601

1,591

81

1,594

1,594

1,618

2

1,593

1,593

1,817

42

1,349

1,349

1,805

82

1,604

1,604

1,604

3

1,626

1,626

1,591

43

1,814

1,814

1,599

83

1,595

1,595

1,155

4

1,599

1,599

1,596

44

1,6

1,6

1,596

84

1,819

1,819

1,602

5

1,829

1,829

1,806

45

1,596

1,596

1,439

85

1,596

1,596

1,598

6

1,812

1,812

1,811

46

1,81

1,81

1,81

86

1,806

1,806

1,593

7

1,594

1,594

1,596

47

1,597

1,597

1,807

87

1,625

1,625

1,598

8

1,717

1,717

1,809

48

1,598

1,598

1,814

88

1,596

1,596

1,625

9

1,804

1,804

1,809

49

1,809

1,809

1,147

89

1,807

1,807

1,904

10

1,823

1,823

1,808

50

1,599

1,599

1,59

90

1,811

1,811

1,804

11

1,808

1,808

1,595

51

1,82

1,82

1,595

91

1,818

1,818

1,59

12

1,809

1,809

1,803

52

1,594

1,594

1,122

92

1,823

1,823

1,804

13

1,823

1,823

1,599

53

1,816

1,816

1,594

93

1,812

1,812

1,802

14

1,604

1,604

1,614

54

1,819

1,819

1,605

94

1,807

1,807

1,813

15

1,42

1,42

1,811

55

1,595

1,595

1,166

95

1,596

1,596

1,594

16

1,596

1,596

1,818

56

1,603

1,603

1,823

96

1,602

1,602

1,819

17

1,6

1,6

1,595

57

1,594

1,594

1,812

97

1,596

1,596

1,811

18

1,834

1,834

1,822

58

1,592

1,592

1,804

98

1,608

1,608

1,823

19

1,613

1,613

1,607

59

1,803

1,803

1,135

99

1,638

1,638

1,596

20

1,819

1,819

1,59

60

1,8

1,8

1,817

100

1,592

1,592

1,818

21

1,608

1,608

1,593

61

1,143

1,143

1,626

101

1,604

1,604

1,83

22

1,593

1,593

1,806

62

1,591

1,591

1,826

102

1,606

1,606

1,822

23

1,312

1,312

1,811

63

1,839

1,839

1,616

103

1,815

1,815

1,593

24

1,594

1,594

1,11

64

1,801

1,801

1,624

104

1,589

1,589

1,591

25

1,803

1,803

1,618

65

1,147

1,147

1,589

105

1,803

1,803

1,595

26

1,613

1,613

1,592

66

1,874

1,874

1,816

106

1,802

1,802

1,819

27

1,822

1,822

1,817

67

1,599

1,599

1,582

107

1,603

1,603

1,596

28

1,623

1,623

1,61

68

1,823

1,823

1,597

108

1,603

1,603

1,81

29

1,816

1,816

1,592

69

1,592

1,592

1,621

109

1,625

1,625

1,59

30

1,806

1,806

1,604

70

1,818

1,818

1,593

110

1,591

1,591

1,81

31

1,819

1,819

1,601

71

1,803

1,803

1,59

111

1,592

1,592

1,809

32

1,804

1,804

1,403

72

1,809

1,809

1,592

112

1,598

1,598

1,594

33

1,118

1,118

1,806

73

1,587

1,587

1,59

113

1,596

1,596

1,397

34

1,823

1,823

1,599

74

1,594

1,594

1,614

114

1,43

1,43

1,808

35

1,599

1,599

1,598

75

1,585

1,585

1,817

115

1,81

1,81

1,609

36

1,607

1,607

1,597

76

1,595

1,595

1,822

116

1,808

1,808

1,6

37

1,818

1,818

1,59

77

1,62

1,62

5,344

117

1,599

1,599

1,805

38

1,822

1,822

1,6

78

1,82

1,82

1,601

118

1,476

1,476

1,802

39

1,806

1,806

1,602

79

1,817

1,817

1,625

119

1,812

1,812

1,815

40

1,114

1,114

1,808

80

1,597

1,597

1,598

120

1,59

1,59

1,145


38

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

121

1,614

1,614

1,594

161

1,138

1,138

1,806

201

1,807

1,807

1,806

122

1,825

1,825

1,812

162

1,81

1,81

1,818

202

1,96

1,96

1,597

123

1,146

1,146

1,561

163

1,825

1,825

1,615

203

1,6

1,6

1,593

124

1,605

1,605

1,592

164

1,594

1,594

1,806

204

1,115

1,115

1,612

125

1,808

1,808

1,589

165

1,567

1,567

1,822

205

1,569

1,569

1,602

126

1,82

1,82

1,599

166

1,808

1,808

1,425

206

1,809

1,809

1,411

127

2,028

2,028

1,592

167

1,815

1,815

0,846

207

1,154

1,154

1,596

128

1,814

1,814

1,806

168

1,61

1,61

1,59

208

1,596

1,596

1,443

129

1,151

1,151

1,81

169

1,815

1,815

1,808

209

1,805

1,805

1,434

130

1,818

1,818

1,601

170

1,819

1,819

1,605

210

1,59

1,59

1,831

131

1,59

1,59

1,819

171

1,429

1,429

1,612

211

1,593

1,593

1,316

132

1,604

1,604

1,588

172

0,812

0,812

1,587

212

1,815

1,815

1,831

133

1,593

1,593

1,81

173

1,81

1,81

1,826

213

1,808

1,808

1,138

134

1,594

1,594

1,589

174

1,594

1,594

1,809

214

1,588

1,588

1,814

135

1,806

1,806

1,605

175

1,111

1,111

1,597

215

1,814

1,814

1,812

136

1,112

1,112

1,592

176

1,806

1,806

1,595

216

1,812

1,812

1,593

137

1,617

1,617

1,589

177

1,602

1,602

1,14

217

1,609

1,609

1,596

138

1,597

1,597

1,576

178

1,819

1,819

1,593

218

1,921

1,921

1,619

139

1,82

1,82

1,59

179

1,599

1,599

1,594

219

1,593

1,593

1,807

140

1,811

1,811

1,591

180

1,597

1,597

1,809

220

1,135

1,135

1,826

141

1,827

1,827

1,816

181

1,116

1,116

1,829

221

1,141

1,141

1,595

142

1,806

1,806

1,593

182

1,599

1,599

1,811

222

1,599

1,599

1,602

143

1,594

1,594

1,597

183

1,801

1,801

1,804

223

1,606

1,606

1,829

144

1,596

1,596

1,825

184

1,115

1,115

1,591

224

1,593

1,593

1,109

145

1,592

1,592

1,721

185

1,612

1,612

1,592

225

1,83

1,83

1,821

146

1,81

1,81

1,594

186

1,601

1,601

1,596

226

1,804

1,804

1,112

147

1,593

1,593

1,602

187

1,597

1,597

1,593

227

1,812

1,812

1,812

148

1,813

1,813

1,82

188

1,593

1,593

1,594

228

1,608

1,608

1,806

149

1,139

1,139

1,586

189

1,804

1,804

1,59

229

1,593

1,593

1,82

150

1,587

1,587

1,595

190

1,116

1,116

1,587

230

1,598

1,598

1,806

151

1,815

1,815

1,619

191

1,811

1,811

1,667

231

1,145

1,145

1,819

152

1,41

1,41

1,811

192

1,588

1,588

1,598

232

1,594

1,594

1,614

153

1,595

1,595

1,599

193

1,828

1,828

1,588

233

1,133

1,133

1,821

154

1,593

1,593

1,138

194

1,599

1,599

1,597

234

1,804

1,804

1,606

155

1,806

1,806

1,822

195

1,603

1,603

1,604

235

1,601

1,601

1,598

156

1,596

1,596

1,61

196

1,824

1,824

1,598

236

1,594

1,594

1,811

157

1,812

1,812

1,829

197

1,824

1,824

1,607

237

1,596

1,596

1,591

158

1,808

1,808

1,592

198

1,592

1,592

1,342

238

1,592

1,592

1,587

159

1,808

1,808

1,116

199

1,807

1,807

1,591

239

1,824

1,824

1,591

160

1,808

1,808

1,591

200

1,595

1,595

1,817

240

1,834

1,834

1,816


39

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

241

1,596

1,596

1,597

281

1,592

1,613

1,592

321

1,608

1,114

1,608

242

1,59

1,59

1,825

282

1,56

1,593

1,56

322

1,59

1,81

1,59

243

1,597

1,597

1,812

283

1,601

1,595

1,601

323

1,806

1,832

1,806

244

1,812

1,812

1,824

284

1,592

1,595

1,592

324

1,596

1,81

1,596

245

1,812

1,812

1,594

285

1,811

1,815

1,811

325

1,595

1,811

1,595

246

1,448

1,448

1,817

286

1,81

1,601

1,81

326

1,838

1,819

1,838

247

1,08

1,08

1,633

287

1,607

1,829

1,607

327

1,592

1,624

1,592

248

1,618

1,618

1,81

288

1,599

1,818

1,599

328

1,44

1,614

1,44

249

1,605

1,605

1,597

289

1,596

1,591

1,596

329

1,813

1,826

1,813

250

1,809

1,809

1,599

290

1,596

1,594

1,596

330

1,589

1,592

1,589

251

1,836

1,608

1,836

291

1,824

1,814

1,824

331

1,425

1,836

1,425

252

1,81

1,434

1,81

292

1,803

1,598

1,803

332

1,826

1,084

1,826

253

1,835

1,81

1,835

293

1,813

1,599

1,813

333

1,595

1,635

1,595

254

1,421

1,432

1,421

294

1,595

1,803

1,595

334

1,83

1,593

1,83

255

1,598

1,806

1,598

295

1,59

1,805

1,59

335

1,591

1,593

1,591

256

1,818

1,833

1,818

296

1,596

1,596

1,596

336

1,81

1,806

1,81

257

1,592

1,805

1,592

297

1,591

1,831

1,591

337

1,59

1,622

1,59

258

1,825

1,593

1,825

298

1,593

1,596

1,593

338

1,805

1,137

1,805

259

1,806

1,812

1,806

299

1,119

1,603

1,119

339

1,817

1,608

1,817

260

1,589

1,814

1,589

300

1,802

1,816

1,802

340

1,823

1,811

1,823

261

1,594

1,597

1,594

301

1,61

1,134

1,61

341

1,827

1,803

1,827

262

1,564

1,825

1,564

302

1,834

1,595

1,834

342

1,592

1,605

1,592

263

1,811

1,829

1,811

303

1,832

1,812

1,832

343

1,598

1,805

1,598

264

1,617

1,591

1,617

304

1,806

1,839

1,806

344

1,806

1,447

1,806

265

1,823

1,118

1,823

305

1,832

1,808

1,832

345

1,575

1,595

1,575

266

1,595

1,81

1,595

306

1,592

1,82

1,592

346

1,82

1,807

1,82

267

1,811

1,84

1,811

307

1,591

1,813

1,591

347

1,804

1,596

1,804

268

1,808

1,81

1,808

308

1,603

1,803

1,603

348

1,862

1,607

1,862

269

1,592

1,804

1,592

309

1,593

1,828

1,593

349

1,812

1,632

1,812

270

1,618

1,81

1,618

310

1,594

1,594

1,594

350

1,404

1,618

1,404

271

1,829

1,813

1,829

311

1,806

1,592

1,806

351

1,594

1,591

1,594

272

1,59

1,804

1,59

312

1,612

1,814

1,612

352

1,591

1,137

1,591

273

1,592

1,608

1,592

313

1,593

1,82

1,593

353

1,817

1,602

1,817

274

1,591

1,119

1,591

314

1,813

1,591

1,813

354

1,808

1,806

1,808

275

1,592

1,633

1,592

315

1,596

1,605

1,596

355

1,833

1,818

1,833

276

1,593

1,818

1,593

316

1,815

1,591

1,815

356

1,591

1,821

1,591

277

1,844

1,425

1,844

317

1,592

1,818

1,592

357

1,127

1,826

1,127

278

1,597

1,593

1,597

318

1,593

1,804

1,593

358

1,809

1,829

1,809

279

1,592

1,591

1,592

319

1,596

1,815

1,596

359

1,606

1,817

1,606

280

1,595

1,831

1,595

320

1,615

1,819

1,615

360

1,835

1,592

1,835


40

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

361

1,596

1,338

1,596

401

1,609

1,811

1,609

441

1,815

1,6

1,815

362

1,815

1,59

1,815

402

1,82

1,807

1,82

442

1,811

1,816

1,811

363

1,595

1,813

1,595

403

1,595

1,817

1,595

443

1,598

1,818

1,598

364

1,809

1,821

1,809

404

1,813

1,836

1,813

444

1,808

1,599

1,808

365

1,595

1,61

1,595

405

1,111

1,604

1,111

445

1,618

1,825

1,618

366

1,821

1,816

1,821

406

1,616

1,827

1,616

446

1,809

1,814

1,809

367

1,805

1,809

1,805

407

1,802

1,827

1,802

447

1,593

1,595

1,593

368

1,589

1,425

1,589

408

1,601

1,811

1,601

448

0,715

1,592

0,715

369

1,595

1,595

1,595

409

1,591

1,821

1,591

449

1,593

0,745

1,593

370

1,812

1,814

1,812

410

1,808

1,808

1,808

450

1,129

1,608

1,129

371

1,814

1,431

1,814

411

1,609

1,81

1,609

451

1,594

1,588

1,594

372

1,605

1,59

1,605

412

1,607

1,619

1,607

452

1,591

1,658

1,591

373

1,619

1,821

1,619

413

1,604

1,824

1,604

453

1,589

1,81

1,589

374

1,807

1,601

1,807

414

1,822

1,59

1,822

454

1,432

1,61

1,432

375

1,397

1,822

1,397

415

1,806

1,596

1,806

455

1,596

1,806

1,596

376

1,823

1,633

1,823

416

1,597

1,122

1,597

456

1,807

1,619

1,807

377

1,811

1,597

1,811

417

1,601

1,81

1,601

457

1,821

1,81

1,821

378

1,593

1,624

1,593

418

1,6

1,814

1,6

458

1,59

1,608

1,59

379

1,81

1,597

1,81

419

1,81

1,612

1,81

459

1,814

1,824

1,814

380

1,809

1,814

1,809

420

1,828

1,819

1,828

460

1,813

1,596

1,813

381

1,423

1,594

1,423

421

1,833

1,81

1,833

461

1,597

1,591

1,597

382

1,59

1,621

1,59

422

1,144

1,825

1,144

462

1,43

1,589

1,43

383

1,822

1,597

1,822

423

1,591

1,817

1,591

463

1,808

1,816

1,808

384

1,809

1,805

1,809

424

0,741

1,808

0,741

464

1,616

1,592

1,616

385

1,807

1,834

1,807

425

1,81

1,814

1,81

465

1,143

1,817

1,143

386

1,599

1,605

1,599

426

1,599

1,589

1,599

466

1,476

1,596

1,476

387

1,834

1,592

1,834

427

1,588

1,428

1,588

467

1,815

1,825

1,815

388

1,402

1,6

1,402

428

1,802

1,617

1,802

468

1,828

1,587

1,828

389

1,594

1,423

1,594

429

1,822

1,811

1,822

469

1,819

1,595

1,819

390

0,72

1,599

0,72

430

1,621

1,821

1,621

470

1,817

1,177

1,817

391

1,837

1,617

1,837

431

1,805

1,103

1,805

471

1,591

0,737

1,591

392

1,595

1,598

1,595

432

1,591

1,809

1,591

472

1,843

1,809

1,843

393

1,824

1,397

1,824

433

1,594

1,588

1,594

473

1,121

1,633

1,121

394

1,598

1,596

1,598

434

1,592

1,59

1,592

474

1,801

1,596

1,801

395

1,808

1,828

1,808

435

1,594

1,595

1,594

475

1,826

1,819

1,826

396

1,809

1,597

1,809

436

1,805

1,834

1,805

476

1,819

1,815

1,819

397

1,109

1,593

1,109

437

1,806

1,819

1,806

477

1,617

1,592

1,617

398

1,433

1,837

1,433

438

1,592

1,593

1,592

478

1,828

1,568

1,828

399

1,816

1,813

1,816

439

1,596

1,404

1,596

479

1,612

1,601

1,612

400

1,613

1,626

1,613

440

1,82

1,693

1,82

480

1,591

1,602

1,591


41

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

481

1,818

1,423

1,818

521

1,809

1,809

1,817

561

1,825

1,825

1,813

482

1,118

1,827

1,118

522

1,612

1,612

1,57

562

1,574

1,574

1,821

483

1,803

1,617

1,803

523

1,603

1,603

1,591

563

1,813

1,813

1,596

484

1,788

1,347

1,788

524

1,573

1,573

1,814

564

1,771

1,771

1,599

485

1,828

1,82

1,828

525

1,599

1,599

1,601

565

1,812

1,812

1,809

486

1,837

1,13

1,837

526

1,814

1,814

1,592

566

1,591

1,591

1,593

487

1,616

1,818

1,616

527

1,806

1,806

1,595

567

1,424

1,424

1,814

488

1,809

1,119

1,809

528

1,128

1,128

1,611

568

1,823

1,823

1,81

489

1,819

1,81

1,819

529

1,6

1,6

1,808

569

1,604

1,604

1,429

490

0,714

1,597

0,714

530

1,808

1,808

0,993

570

1,62

1,62

1,817

491

1,822

1,593

1,822

531

1,812

1,812

1,597

571

1,83

1,83

1,807

492

1,143

1,806

1,143

532

1,82

1,82

1,814

572

1,075

1,075

1,807

493

1,82

1,591

1,82

533

1,817

1,817

1,808

573

1,805

1,805

1,803

494

1,428

1,426

1,428

534

1,596

1,596

1,614

574

1,81

1,81

1,598

495

1,593

1,814

1,593

535

1,817

1,817

1,829

575

1,619

1,619

1,823

496

1,818

1,617

1,818

536

1,421

1,421

1,595

576

1,801

1,801

1,618

497

1,819

1,701

1,819

537

1,591

1,591

1,814

577

1,808

1,808

1,823

498

1,589

1,816

1,589

538

1,812

1,812

1,595

578

1,803

1,803

1,595

499

0,74

1,6

0,74

539

1,595

1,595

1,812

579

1,815

1,815

1,59

500

1,818

1,609

1,818

540

1,593

1,593

1,841

580

1,817

1,817

1,803

501

1,35

1,35

1,803

541

1,589

1,589

1,82

581

1,817

1,817

1,821

502

1,114

1,114

1,805

542

1,82

1,82

1,588

582

1,823

1,823

1,806

503

1,593

1,593

1,8

543

1,817

1,817

1,593

583

1,597

1,597

1,594

504

1,612

1,612

1,43

544

0,736

0,736

1,825

584

1,819

2,009

1,82

505

1,801

1,801

1,81

545

1,819

1,819

1,438

585

1,83

1,83

1,587

506

1,591

1,591

1,59

546

1,807

1,807

1,602

586

1,435

1,435

1,803

507

1,808

1,808

1,595

547

1,604

1,604

1,595

587

1,838

1,838

1,593

508

1,428

1,428

1,813

548

1,829

1,829

1,598

588

1,596

1,596

1,607

509

1,81

1,81

1,586

549

1,115

1,115

1,141

589

1,604

1,604

1,427

510

1,815

1,815

1,805

550

1,807

1,807

1,808

590

1,818

1,818

1,146

511

1,537

1,537

0,717

551

1,804

1,804

1,595

591

0,734

0,734

1,589

512

1,808

1,808

1,59

552

1,804

1,804

1,83

592

1,817

1,817

1,716

513

1,808

1,808

1,104

553

1,618

1,618

1,805

593

1,6

1,6

1,122

514

1,49

1,49

1,823

554

1,817

1,817

1,594

594

1,117

1,117

1,612

515

1,81

1,81

1,829

555

0,716

0,716

1,589

595

1,599

1,599

1,596

516

1,827

1,827

1,675

556

1,588

1,588

1,81

596

1,59

1,59

1,819

517

1,605

1,605

1,819

557

1,811

1,811

1,807

597

1,811

1,811

0,802

518

1,365

1,365

1,108

558

1,834

1,834

1,272

598

1,669

1,669

1,831

519

1,805

1,805

1,818

559

1,596

1,596

1,487

599

1,623

1,623

1,815

520

1,423

1,423

1,82

560

1,825

1,825

1,59

600

1,837

1,837

1,59


42

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

601

1,704

1,704

1,809

641

1,814

1,814

1,597

681

1,822

1,822

1,433

602

1,095

1,095

1,593

642

1,425

1,425

1,594

682

1,81

1,81

1,593

603

1,816

1,816

1,116

643

1,427

1,427

1,133

683

1,597

1,597

1,815

604

1,808

1,808

1,589

644

1,59

1,59

1,826

684

1,423

1,423

1,807

605

1,803

1,803

1,596

645

1,597

1,597

1,597

685

1,84

1,84

1,594

606

1,81

1,81

1,605

646

1,823

1,823

1,813

686

1,459

1,459

1,598

607

1,806

1,806

1,81

647

1,591

1,591

1,806

687

1,804

1,804

1,588

608

1,597

1,597

1,836

648

1,114

1,114

1,603

688

1,806

1,806

1,577

609

1,815

1,815

1,605

649

1,606

1,606

1,594

689

1,595

1,595

1,134

610

1,811

1,811

1,817

650

1,808

1,808

1,59

690

1,595

1,595

1,83

611

1,599

1,599

1,804

651

1,819

1,819

5,363

691

1,121

1,121

1,599

612

1,443

1,443

1,59

652

1,589

1,589

1,594

692

1,804

1,804

1,807

613

1,827

1,827

1,594

653

1,831

1,831

1,819

693

1,627

1,627

1,814

614

1,803

1,803

1,815

654

1,828

1,828

1,806

694

1,595

1,595

1,542

615

1,813

1,813

1,596

655

1,596

1,596

1,596

695

1,824

1,824

1,596

616

1,603

1,603

1,591

656

1,827

1,827

1,597

696

1,813

1,813

1,599

617

1,601

1,601

1,818

657

1,594

1,594

1,614

697

1,82

1,82

1,59

618

1,599

1,599

1,81

658

1,587

1,587

1,61

698

0,734

0,734

1,592

619

1,804

1,804

1,598

659

1,604

1,604

1,429

699

1,806

1,806

1,814

620

1,838

1,838

1,603

660

1,825

1,825

1,808

700

1,808

1,808

1,59

621

1,596

1,596

1,603

661

1,812

1,812

1,595

701

1,6

1,6

1,598

622

1,807

1,807

1,601

662

1,14

1,14

1,597

702

1,814

1,814

1,347

623

1,604

1,604

1,601

663

1,342

1,342

1,811

703

1,812

1,812

1,825

624

1,59

1,59

1,113

664

1,595

1,595

1,591

704

1,825

1,825

1,804

625

1,595

1,595

1,673

665

1,804

1,804

1,828

705

1,604

1,604

1,811

626

1,612

1,612

1,82

666

1,598

1,598

1,805

706

1,137

1,137

1,618

627

1,817

1,817

1,624

667

1,42

1,42

1,833

707

1,823

1,823

1,818

628

1,809

1,809

1,593

668

1,826

1,826

1,824

708

1,805

1,805

1,808

629

1,808

1,808

1,153

669

0,716

0,716

1,59

709

1,592

1,592

1,803

630

1,626

1,626

1,82

670

1,597

1,597

1,591

710

1,62

1,62

1,823

631

1,828

1,828

1,806

671

1,804

1,804

1,121

711

1,808

1,808

1,759

632

1,595

1,595

1,616

672

0,749

0,749

1,831

712

1,596

1,596

1,6

633

1,617

1,617

1,824

673

1,807

1,807

1,599

713

1,593

1,593

1,818

634

1,818

1,818

1,596

674

1,578

1,578

1,606

714

1,805

1,805

1,6

635

1,593

1,593

1,827

675

1,593

1,593

1,59

715

1,827

1,827

1,592

636

1,806

1,806

1,818

676

1,601

1,601

1,593

716

1,672

1,672

1,502

637

1,806

1,806

1,137

677

1,61

1,61

1,582

717

1,824

1,824

1,819

638

1,82

1,82

1,589

678

1,594

1,594

1,805

718

1,61

1,61

1,345

639

1,594

1,594

1,595

679

1,126

1,126

1,817

719

1,843

1,843

1,811

640

1,819

1,819

1,595

680

1,812

1,812

1,423

720

1,594

1,594

1,605


43

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

721

1,607

1,607

1,588

761

1,717

1,594

1,717

801

1,809

1,593

1,809

722

1,821

1,821

1,604

762

1,618

1,592

1,618

802

1,441

1,608

1,441

723

1,586

1,586

1,818

763

1,806

1,585

1,806

803

1,597

1,813

1,597

724

1,814

1,814

1,81

764

1,808

1,59

1,808

804

1,592

1,595

1,592

725

1,825

1,825

1,825

765

1,833

1,589

1,833

805

1,589

1,685

1,589

726

1,825

1,825

1,123

766

1,135

1,819

1,135

806

1,826

1,603

1,826

727

1,82

1,82

1,601

767

1,806

1,833

1,806

807

1,811

1,808

1,811

728

1,816

1,816

1,816

768

1,804

1,59

1,804

808

1,816

0,721

1,816

729

1,142

1,142

1,592

769

1,816

1,607

1,816

809

1,829

1,83

1,829

730

1,809

1,809

1,837

770

1,602

1,423

1,602

810

1,599

1,59

1,599

731

1,599

1,599

1,812

771

1,81

1,826

1,81

811

1,601

1,594

1,601

732

1,596

1,596

1,825

772

1,59

1,81

1,59

812

1,59

1,615

1,59

733

1,589

1,589

1,818

773

1,812

1,805

1,812

813

0,719

1,425

0,719

734

1,144

1,144

1,81

774

1,591

1,594

1,591

814

1,592

1,816

1,592

735

1,607

1,607

1,816

775

1,824

1,608

1,824

815

1,614

1,423

1,614

736

1,818

1,818

1,249

776

1,825

1,613

1,825

816

1,6

1,594

1,6

737

1,812

1,812

1,155

777

1,807

1,6

1,807

817

1,592

1,35

1,592

738

1,808

1,808

1,6

778

1,809

1,601

1,809

818

1,572

1,805

1,572

739

1,811

1,811

1,592

779

1,142

1,814

1,142

819

1,829

1,812

1,829

740

1,803

1,803

1,597

780

1,138

1,113

1,138

820

1,601

1,82

1,601

741

1,831

1,831

1,824

781

1,151

1,811

1,151

821

1,625

1,12

1,625

742

0,713

0,713

1,136

782

1,808

1,591

1,808

822

1,803

1,616

1,803

743

1,605

1,605

1,814

783

1,821

1,608

1,821

823

1,598

1,62

1,598

744

1,62

1,62

0,988

784

1,342

1,598

1,342

824

1,825

1,81

1,825

745

1,152

1,152

1,831

785

1,413

1,594

1,413

825

1,594

1,813

1,594

746

1,815

1,815

1,814

786

1,828

1,597

1,828

826

1,598

1,811

1,598

747

1,604

1,604

1,592

787

1,808

1,585

1,808

827

1,819

1,592

1,819

748

1,831

1,831

1,601

788

1,816

1,588

1,816

828

1,667

1,596

1,667

749

1,608

1,608

1,832

789

1,589

1,434

1,589

829

1,821

1,591

1,821

750

1,822

1,822

1,825

790

1,593

1,423

1,593

830

1,818

1,804

1,818

751

1,803

1,833

1,803

791

1,607

1,424

1,607

831

1,599

1,596

1,599

752

1,579

1,819

1,579

792

1,594

1,813

1,594

832

1,809

1,61

1,809

753

1,809

1,371

1,809

793

1,812

1,822

1,812

833

0,747

1,806

0,747

754

1,818

1,591

1,818

794

1,662

1,143

1,662

834

1,813

1,805

1,813

755

1,821

1,589

1,821

795

1,832

1,61

1,832

835

1,618

1,811

1,618

756

1,128

1,34

1,128

796

1,821

1,622

1,821

836

1,644

1,816

1,644

757

1,814

1,805

1,814

797

1,611

1,113

1,611

837

1,809

1,831

1,809

758

1,597

1,603

1,597

798

1,828

1,809

1,828

838

1,808

1,817

1,808

759

1,609

1,597

1,609

799

0,719

1,817

0,719

839

1,805

1,807

1,805

760

1,436

0,725

1,436

800

1,593

1,813

1,593

840

1,812

1,806

1,812


44

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

841

1,823

1,605

1,823

881

1,589

1,423

1,589

921

1,402

1,592

1,402

842

1,593

1,812

1,593

882

1,434

1,804

1,434

922

1,078

1,589

1,078

843

1,807

1,81

1,807

883

1,801

1,596

1,801

923

1,807

1,808

1,807

844

1,596

1,253

1,596

884

1,602

1,594

1,602

924

1,817

1,818

1,817

845

1,823

1,596

1,823

885

1,811

1,352

1,811

925

1,59

1,604

1,59

846

1,429

1,592

1,429

886

1,603

1,806

1,603

926

1,593

1,825

1,593

847

1,421

1,597

1,421

887

1,599

1,802

1,599

927

1,315

1,828

1,315

848

1,59

1,566

1,59

888

1,589

1,812

1,589

928

1,564

1,587

1,564

849

1,596

1,838

1,596

889

1,145

1,812

1,145

929

1,802

1,808

1,802

850

1,589

1,598

1,589

890

1,597

1,36

1,597

930

1,81

1,594

1,81

851

1,817

1,613

1,817

891

1,831

1,589

1,831

931

1,821

1,82

1,821

852

1,819

1,815

1,819

892

1,426

1,83

1,426

932

1,429

1,824

1,429

853

1,422

1,595

1,422

893

1,812

1,827

1,812

933

1,596

1,809

1,596

854

1,589

1,807

1,589

894

1,595

1,839

1,595

934

1,423

1,818

1,423

855

1,596

1,821

1,596

895

1,822

1,812

1,822

935

1,602

1,598

1,602

856

1,809

1,833

1,809

896

1,107

1,811

1,107

936

1,817

1,59

1,817

857

1,594

0,718

1,594

897

1,833

1,809

1,833

937

1,115

1,814

1,115

858

1,828

1,348

1,828

898

1,821

1,596

1,821

938

1,814

1,812

1,814

859

1,591

1,136

1,591

899

1,81

1,808

1,81

939

1,821

1,816

1,821

860

1,601

1,617

1,601

900

1,591

1,814

1,591

940

1,822

1,81

1,822

861

1,584

1,594

1,584

901

1,835

1,608

1,835

941

1,622

1,593

1,622

862

1,811

1,154

1,811

902

1,811

1,826

1,811

942

1,827

1,819

1,827

863

1,425

1,595

1,425

903

1,596

1,816

1,596

943

1,425

1,589

1,425

864

1,803

1,838

1,803

904

1,595

1,121

1,595

944

1,826

1,66

1,826

865

1,808

1,817

1,808

905

1,814

1,594

1,814

945

1,596

1,108

1,596

866

1,114

1,598

1,114

906

1,591

1,423

1,591

946

1,615

1,606

1,615

867

1,821

1,595

1,821

907

1,336

1,808

1,336

947

1,823

1,588

1,823

868

1,595

1,599

1,595

908

1,806

1,813

1,806

948

1,609

1,811

1,609

869

1,146

1,804

1,146

909

1,595

1,597

1,595

949

1,424

1,597

1,424

870

1,8

1,591

1,8

910

1,121

1,623

1,121

950

1,147

1,595

1,147

871

1,592

1,821

1,592

911

1,593

1,816

1,593

951

1,584

1,811

1,584

872

1,807

1,604

1,807

912

1,828

1,619

1,828

952

1,802

1,118

1,802

873

1,803

1,141

1,803

913

1,431

1,585

1,431

953

1,59

1,811

1,59

874

1,819

1,594

1,819

914

1,604

1,589

1,604

954

1,592

1,437

1,592

875

1,144

1,594

1,144

915

1,811

1,114

1,811

955

1,602

1,814

1,602

876

1,587

1,6

1,587

916

1,82

1,601

1,82

956

1,807

1,594

1,807

877

1,813

1,807

1,813

917

1,819

1,807

1,819

957

1,818

1,596

1,818

878

1,815

1,592

1,815

918

1,816

1,423

1,816

958

1,594

1,593

1,594

879

1,786

1,822

1,786

919

1,589

1,431

1,589

959

1,806

1,592

1,806

880

1,596

1,81

1,596

920

1,594

1,817

1,594

960

1,84

1,594

1,84


45

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

961

1,824

1,426

1,824

975

1,591

1,82

1,591

989

1,809

1,61

1,809

962

1,593

1,818

1,593

976

1,593

1,593

1,593

990

1,588

1,809

1,588

963

1,825

1,593

1,825

977

1,153

1,613

1,153

991

1,601

1,606

1,601

964

1,819

1,814

1,819

978

1,824

1,593

1,824

992

1,808

1,827

1,808

965

1,595

1,832

1,595

979

1,591

1,807

1,591

993

1,424

1,808

1,424

966

1,822

1,596

1,822

980

1,809

1,814

1,809

994

1,817

1,431

1,817

967

1,827

1,617

1,827

981

1,832

1,809

1,832

995

1,597

1,111

1,597

968

1,598

1,805

1,598

982

1,59

1,598

1,59

996

1,869

1,829

1,869

969

1,441

1,812

1,441

983

1,815

1,587

1,815

997

1,809

1,613

1,809

970

1,15

1,59

1,15

984

1,596

1,599

1,596

998

1,594

1,817

1,594

971

1,805

1,823

1,805

985

1,81

1,613

1,81

999

1,832

1,814

1,832

972

1,816

1,807

1,816

986

1,818

1,599

1,818

1000

1,593

1,818

1,593

973

1,604

1,594

1,604

987

1,82

1,813

1,82

974

1,161

1,804

1,161

988

1,825

1,136

1,825

RMSD ≤ 2 Å 99,90%

99,80%

99,80%

Lampiran 2. Tabel nilai RMSD ChemPLP filter 4-hidroksi-tamoksifen No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

1

1,596

1,594

1,836

24

1,119

1,594

1,11

47

1,594

1,597

1,807

2

1,816

1,593

1,817

25

1,805

1,803

1,618

48

1,812

1,598

1,814

3

1,816

1,626

1,591

26

1,807

1,613

1,592

49

1,816

1,809

1,147

4

1,619

1,599

1,596

27

1,605

1,822

1,817

50

1,801

1,599

1,59

5

1,427

1,829

1,806

28

1,821

1,623

1,61

51

1,582

1,82

1,595

6

1,819

1,812

1,811

29

1,596

1,816

1,592

52

1,592

1,594

1,122

7

1,814

1,594

1,596

30

1,811

1,806

1,604

53

1,615

1,816

1,594

8

1,83

1,829

1,809

31

1,813

1,819

1,601

54

1,802

1,819

1,605

9

1,592

1,804

1,809

32

1,815

1,804

1,403

55

1,811

1,595

1,166

10

1,598

1,823

1,808

33

1,807

1,118

1,806

56

1,62

1,603

1,823

11

1,805

1,808

1,595

34

1,596

1,823

1,599

57

1,837

1,594

1,812

12

1,594

1,809

1,803

35

1,602

1,599

1,598

58

1,595

1,592

1,804

13

1,819

1,823

1,599

36

1,596

1,607

1,597

59

1,609

1,803

1,135

14

1,822

1,604

1,614

37

1,584

1,818

1,59

60

1,608

1,8

1,817

15

1,816

1,42

1,811

38

1,632

1,822

1,6

61

1,596

1,143

1,626

16

1,827

1,596

1,818

39

1,618

1,806

1,602

62

1,433

1,591

1,826

17

1,588

1,6

1,595

40

1,807

1,114

1,808

63

1,813

1,839

1,616

18

1,594

1,834

1,822

41

1,626

1,601

1,591

64

1,614

1,801

1,624

19

1,809

1,613

1,607

42

1,6

1,349

1,805

65

1,817

1,147

1,589

20

1,595

1,819

1,59

43

1,427

1,814

1,599

66

1,616

1,597

1,816

21

1,81

1,608

1,593

44

1,6

1,6

1,596

67

1,804

1,599

1,582

22

1,809

1,593

1,806

45

1,823

1,596

1,439

68

1,831

1,823

1,597

23

1,805

1,811

1,811

46

1,82

1,81

1,81

69

1,82

1,592

1,621

PLAGIAT PLAGIATMERUPAKAN MERUPAKANTINDAKAN TINDAKANTIDAK TIDAKTERPUJI TERPUJI Lampiran 2. Tabel nilai RMSD ChemPLP filter 4-hidroksi-tamoksifen

46

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

70

1,81

1,818

1,593

111

1,6

1,592

1,809

152

1,821

1,41

1,811

71

1,593

1,803

1,59

112

1,828

1,598

1,594

153

1,587

1,595

1,599

72

1,613

1,809

1,592

113

1,601

1,596

1,397

154

1,809

1,593

1,138

73

1,809

1,587

1,59

114

1,322

1,43

1,808

155

1,145

1,806

1,822

74

1,589

1,594

1,614

115

1,805

1,81

1,609

156

1,804

1,596

1,61

75

1,807

1,585

1,817

116

1,818

1,808

1,6

157

1,594

1,812

1,829

76

1,819

1,595

1,822

117

1,824

1,599

1,805

158

1,834

1,808

1,592

77

1,811

1,62

5,344

118

1,807

1,811

1,802

159

1,829

1,808

1,116

78

1,821

1,82

1,601

119

1,814

1,812

1,815

160

1,592

1,808

1,591

79

1,826

1,817

1,625

120

1,813

1,59

1,145

161

1,819

1,138

1,806

80

1,595

1,597

1,598

121

0,744

1,614

1,594

162

1,824

1,81

1,818

81

1,806

1,594

1,618

122

1,809

1,825

1,812

163

1,806

1,825

1,615

82

1,805

1,604

1,604

123

1,815

1,146

1,561

164

1,818

1,594

1,806

83

1,61

1,595

1,155

124

1,592

1,605

1,592

165

1,817

1,567

1,822

84

1,81

1,819

1,602

125

1,593

1,808

1,589

166

1,808

1,808

1,425

85

1,834

1,596

1,598

126

1,592

1,82

1,599

167

1,601

1,815

1,619

86

1,829

1,806

1,593

127

1,593

1,82

1,592

168

1,42

1,61

1,59

87

1,592

1,625

1,598

128

1,808

1,814

1,806

169

1,817

1,815

1,808

88

1,591

1,596

1,625

129

1,83

1,151

1,81

170

1,815

1,819

1,605

89

1,819

1,807

1,904

130

1,351

1,818

1,601

171

1,082

1,429

1,612

90

1,815

1,811

1,804

131

1,593

1,59

1,819

172

1,811

0,812

1,587

91

1,814

1,818

1,59

132

1,597

1,604

1,588

173

1,833

1,81

1,826

92

1,588

1,823

1,804

133

1,808

1,593

1,81

174

1,593

1,594

1,809

93

1,596

1,812

1,802

134

1,59

1,594

1,589

175

1,804

1,111

1,597

94

1,592

1,807

1,813

135

1,614

1,806

1,605

176

1,594

1,806

1,595

95

1,809

1,596

1,594

136

1,135

1,112

1,592

177

1,59

1,602

1,14

96

1,826

1,602

1,819

137

1,813

1,617

1,589

178

1,604

1,819

1,593

97

1,589

1,596

1,811

138

1,818

1,597

1,576

179

1,587

1,599

1,594

98

1,825

1,608

1,823

139

1,63

1,82

1,59

180

1,593

1,597

1,809

99

1,814

1,638

1,596

140

1,595

1,811

1,591

181

1,6

1,116

1,829

100

1,59

1,592

1,818

141

1,619

1,827

1,816

182

1,614

1,599

1,811

101

1,814

1,604

1,83

142

1,594

1,806

1,593

183

1,808

1,801

1,804

102

1,589

1,606

1,822

143

1,811

1,594

1,597

184

1,592

1,115

1,591

103

1,821

1,815

1,593

144

1,805

1,596

1,825

185

1,587

1,612

1,592

104

1,608

1,589

1,591

145

1,816

1,592

1,2

186

1,59

1,601

1,596

105

1,139

1,803

1,595

146

1,589

1,81

1,594

187

1,589

1,597

1,593

106

1,821

1,802

1,819

147

1,618

1,593

1,602

188

1,807

1,593

1,594

107

1,615

1,603

1,596

148

1,819

1,813

1,82

189

1,617

1,804

1,59

108

1,839

1,603

1,81

149

1,607

1,139

1,586

190

1,143

1,116

1,587

109

1,825

1,625

1,59

150

1,589

1,587

1,595

191

1,832

1,811

1,601

110

1,59

1,591

1,81

151

1,822

1,815

1,619

192

0,792

1,588

1,598


47

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

193

1,607

1,828

1,588

234

1,606

1,804

1,606

275

1,823

1,633

1,592

194

1,815

1,599

1,597

235

1,577

1,601

1,598

276

1,81

1,818

1,593

195

1,822

1,603

1,604

236

1,593

1,594

1,811

277

1,141

1,425

1,844

196

1,815

1,824

1,598

237

1,802

1,596

1,591

278

1,824

1,593

1,597

197

1,595

1,824

1,607

238

1,813

1,592

1,587

279

1,809

1,591

1,592

198

1,594

1,592

1,342

239

1,596

1,824

1,591

280

0,715

1,831

1,595

199

1,818

1,807

1,591

240

1,814

1,834

1,816

281

1,597

1,613

1,592

200

1,841

1,595

1,817

241

1,596

1,596

1,597

282

1,808

1,593

1,608

201

1,605

1,807

1,806

242

1,609

1,59

1,825

283

0,723

1,595

1,601

202

1,608

1,595

1,597

243

1,806

1,597

1,812

284

1,593

1,595

1,592

203

1,607

1,6

1,593

244

1,59

1,812

1,824

285

1,825

1,815

1,811

204

1,809

1,115

1,612

245

1,803

1,812

1,594

286

1,814

1,601

1,81

205

1,453

1,569

1,602

246

1,812

1,448

1,817

287

1,818

1,829

1,607

206

1,13

1,809

1,411

247

1,803

1,08

1,633

288

1,832

1,818

1,599

207

1,804

1,154

1,596

248

1,603

1,618

1,81

289

1,816

1,591

1,596

208

1,804

1,596

1,443

249

1,806

1,605

1,597

290

1,82

1,594

1,596

209

1,816

1,805

1,434

250

1,83

1,809

1,599

291

1,592

1,814

1,824

210

1,601

1,59

1,831

251

1,596

1,608

1,836

292

1,594

1,598

1,803

211

1,819

1,593

1,603

252

1,611

1,434

1,81

293

1,595

1,599

1,813

212

1,822

1,815

1,831

253

1,597

1,81

1,835

294

1,606

1,803

1,595

213

1,589

1,808

1,138

254

1,613

1,432

1,421

295

1,809

1,805

1,59

214

1,822

1,588

1,814

255

1,61

1,806

1,598

296

1,614

1,596

1,596

215

1,807

1,814

1,812

256

1,808

1,833

1,818

297

1,806

1,831

1,591

216

1,587

1,812

1,593

257

1,814

1,805

1,592

298

1,62

1,596

1,593

217

1,83

1,609

1,596

258

1,835

1,593

1,825

299

1,825

1,603

1,119

218

1,817

1,921

1,619

259

0,767

1,812

1,806

300

1,438

1,816

1,802

219

1,816

1,593

1,807

260

1,591

1,814

1,589

301

1,604

1,134

1,61

220

1,802

1,135

1,826

261

1,819

1,597

1,594

302

1,802

1,595

1,834

221

1,594

1,141

1,595

262

1,594

1,825

1,105

303

1,588

1,812

1,832

222

1,598

1,599

1,602

263

1,593

1,829

1,811

304

1,817

1,839

1,806

223

1,833

1,606

1,829

264

1,813

1,591

1,617

305

1,592

1,808

1,832

224

1,63

1,593

1,109

265

1,428

1,118

1,823

306

1,603

1,82

1,592

225

1,138

1,83

1,821

266

1,136

1,81

1,595

307

1,825

1,813

1,591

226

1,834

1,804

1,112

267

1,807

1,84

1,811

308

1,809

1,803

1,603

227

1,807

1,812

1,812

268

1,589

1,81

1,808

309

1,826

1,828

1,593

228

1,412

1,608

1,806

269

1,613

1,804

1,592

310

1,589

1,594

1,594

229

1,827

1,593

1,82

270

1,592

1,81

1,618

311

1,818

1,592

1,806

230

1,806

1,598

1,806

271

1,593

1,813

1,829

312

1,589

1,814

1,612

231

1,804

1,145

1,819

272

1,808

1,804

1,59

313

1,819

1,82

1,593

232

1,825

1,594

1,614

273

1,587

1,608

1,592

314

1,589

1,591

1,813

233

1,801

1,133

1,821

274

1,814

1,119

1,591

315

1,636

1,605

1,596


48

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

316

1,596

1,591

1,815

357

1,811

1,826

1,127

398

1,138

1,837

1,433

317

1,593

1,818

1,592

358

1,106

1,829

1,809

399

1,821

1,813

1,816

318

1,823

1,804

1,593

359

1,599

1,817

1,606

400

1,829

1,626

1,613

319

1,593

1,815

1,596

360

1,6

1,592

1,835

401

1,596

1,811

1,609

320

1,814

1,819

1,615

361

1,615

1,338

1,596

402

0,731

1,807

1,82

321

1,812

1,114

1,608

362

1,837

1,59

1,815

403

1,604

1,817

1,595

322

1,816

1,81

1,59

363

1,592

1,813

1,595

404

1,594

1,836

1,813

323

1,811

1,832

1,806

364

1,597

1,821

1,809

405

1,808

1,604

1,111

324

1,42

1,81

1,596

365

1,808

1,61

1,595

406

1,809

1,827

1,616

325

1,6

1,811

1,595

366

1,6

1,816

1,821

407

1,602

1,827

1,802

326

1,566

1,819

1,838

367

1,408

1,809

1,805

408

1,592

1,811

1,601

327

1,612

1,624

1,592

368

1,603

1,425

1,589

409

1,593

1,821

1,591

328

1,819

1,614

1,44

369

1,421

1,595

1,595

410

1,816

1,808

1,808

329

1,591

1,826

1,813

370

1,809

1,814

1,812

411

1,815

1,81

1,609

330

1,119

1,592

1,589

371

1,598

1,431

1,814

412

1,61

1,619

1,607

331

1,59

1,836

1,425

372

1,821

1,59

1,605

413

1,821

1,824

1,604

332

1,814

1,084

1,826

373

1,534

1,821

1,619

414

1,806

1,59

1,822

333

1,817

1,635

1,595

374

1,825

1,601

1,807

415

1,599

1,596

1,806

334

1,816

1,593

1,83

375

1,817

1,822

1,397

416

1,145

1,122

1,597

335

1,821

1,593

1,591

376

1,803

1,633

1,823

417

1,591

1,81

1,601

336

1,818

1,806

1,81

377

1,602

1,597

1,811

418

1,596

1,814

1,6

337

1,808

1,622

1,59

378

1,611

1,624

1,593

419

1,816

1,612

1,81

338

1,821

1,137

1,805

379

1,841

1,597

1,81

420

1,431

1,819

1,828

339

1,807

1,608

1,817

380

1,815

1,814

1,809

421

1,594

1,81

1,833

340

1,594

1,811

1,823

381

1,81

1,594

1,423

422

1,81

1,825

1,144

341

1,848

1,803

1,827

382

1,601

1,621

1,59

423

1,803

1,817

1,591

342

1,81

1,605

1,592

383

1,425

1,597

1,822

424

1,585

1,808

0,741

343

1,817

1,805

1,598

384

1,62

1,805

1,809

425

1,814

1,814

1,81

344

1,812

1,447

1,806

385

1,603

1,834

1,807

426

1,833

1,589

1,599

345

1,594

1,595

1,575

386

1,611

1,605

1,599

427

1,806

1,428

1,588

346

1,817

1,807

1,82

387

1,806

1,592

1,834

428

1,823

1,617

1,802

347

1,805

1,596

1,804

388

1,592

1,6

1,402

429

1,811

1,811

1,822

348

1,601

1,607

1,628

389

1,819

1,423

1,594

430

1,829

1,821

1,621

349

1,819

1,813

1,812

390

1,596

1,599

0,72

431

1,594

1,103

1,805

350

1,819

1,618

1,404

391

1,809

1,617

1,837

432

1,596

1,809

1,591

351

1,602

1,591

1,594

392

1,826

1,598

1,595

433

0,793

1,588

1,594

352

1,596

1,137

1,591

393

1,634

1,397

1,824

434

1,816

1,59

1,592

353

1,616

1,602

1,817

394

0,751

1,596

1,598

435

1,592

1,595

1,594

354

1,591

1,806

1,808

395

1,812

1,828

1,808

436

1,593

1,834

1,805

355

1,398

1,818

1,833

396

1,824

1,597

1,809

437

1,141

1,819

1,806

356

1,808

1,821

1,591

397

1,827

1,593

1,109

438

1,826

1,593

1,592


49

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

439

1,61

1,404

1,596

480

1,601

1,602

1,591

521

1,593

1,809

1,817

440

1,59

1,693

1,82

481

1,808

1,423

1,818

522

1,593

1,612

1,57

441

1,594

1,6

1,815

482

1,839

1,827

1,118

523

1,59

1,603

1,591

442

1,594

1,816

1,811

483

1,82

1,617

1,803

524

1,833

1,573

1,814

443

1,804

1,818

1,598

484

1,591

1,347

1,788

525

1,81

1,599

1,601

444

1,592

1,599

1,808

485

1,808

1,82

1,828

526

1,819

1,814

1,592

445

1,811

1,825

1,618

486

1,352

1,13

1,837

527

1,593

1,806

1,595

446

1,6

1,814

1,809

487

1,824

1,818

1,616

528

1,806

1,128

1,611

447

1,607

1,595

1,593

488

1,11

1,119

1,809

529

1,811

1,6

1,808

448

1,812

1,592

0,715

489

1,819

1,81

1,819

530

1,621

1,808

0,993

449

1,604

0,745

1,593

490

1,807

1,597

0,714

531

1,67

1,812

1,597

450

1,83

1,608

1,129

491

1,599

1,593

1,822

532

1,825

1,82

1,814

451

1,591

1,588

1,594

492

1,59

1,806

1,143

533

1,43

1,817

1,808

452

1,838

1,658

1,591

493

1,81

1,591

1,82

534

1,603

1,596

1,614

453

1,824

1,81

1,589

494

1,597

1,426

1,428

535

1,81

1,817

1,829

454

1,821

1,61

1,432

495

1,805

1,814

1,593

536

1,591

1,421

1,595

455

1,817

1,806

1,596

496

1,808

1,617

1,818

537

1,589

1,591

1,814

456

1,818

1,619

1,807

497

1,592

1,819

1,819

538

1,833

1,812

1,595

457

1,809

1,81

1,821

498

1,824

1,816

1,589

539

1,438

1,595

1,812

458

1,817

1,608

1,59

499

1,139

1,6

0,74

540

1,808

1,593

1,841

459

1,833

1,824

1,814

500

1,11

1,609

1,818

541

1,819

1,589

1,82

460

1,613

1,596

1,813

501

1,818

1,35

1,803

542

1,591

1,82

1,588

461

1,808

1,591

1,597

502

1,824

1,114

1,805

543

1,822

1,817

1,593

462

1,594

1,589

1,43

503

1,617

1,593

1,8

544

1,818

0,736

1,825

463

1,842

1,816

1,808

504

1,809

1,612

1,43

545

1,823

1,819

1,438

464

1,593

1,592

1,616

505

1,595

1,801

1,81

546

1,59

1,807

1,602

465

1,586

1,817

1,143

506

1,595

1,591

1,59

547

1,596

1,604

1,595

466

1,603

1,596

1,601

507

1,614

1,808

1,595

548

1,806

1,829

1,598

467

1,142

1,825

1,815

508

1,832

1,428

1,813

549

1,803

1,115

1,141

468

1,807

1,587

1,828

509

1,407

1,81

1,586

550

1,821

1,807

1,808

469

1,111

1,595

1,819

510

1,598

1,815

1,805

551

1,802

1,804

1,595

470

1,648

1,177

1,817

511

1,831

1,809

0,717

552

1,611

1,804

1,83

471

1,594

0,737

1,591

512

1,589

1,808

1,59

553

1,11

1,618

1,805

472

1,811

1,809

1,843

513

1,804

1,808

1,104

554

1,82

1,817

1,594

473

1,811

1,633

1,121

514

1,809

1,49

1,823

555

1,806

0,716

1,589

474

1,593

1,596

1,801

515

1,597

1,81

1,829

556

1,595

1,588

1,81

475

1,601

1,819

1,826

516

1,813

1,827

1,675

557

1,421

1,811

1,807

476

1,81

1,815

1,819

517

1,811

1,605

1,819

558

1,811

1,834

1,272

477

1,834

1,592

1,617

518

1,109

1,365

1,108

559

1,59

1,596

1,589

478

1,119

1,568

1,828

519

1,626

1,805

1,818

560

1,816

1,825

1,59

479

1,822

1,601

1,612

520

1,597

1,423

1,82

561

1,802

1,825

1,813


50

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

562

1,596

1,574

1,821

603

1,807

1,816

1,116

644

1,588

1,59

1,826

563

1,815

1,813

1,596

604

1,588

1,808

1,589

645

1,815

1,597

1,597

564

1,602

1,576

1,599

605

1,595

1,803

1,596

646

1,598

1,823

1,813

565

1,813

1,812

1,809

606

1,31

1,81

1,605

647

1,594

1,591

1,806

566

1,81

1,591

1,593

607

1,59

1,806

1,81

648

1,603

1,114

1,603

567

1,833

1,424

1,814

608

1,812

1,597

1,836

649

1,816

1,606

1,594

568

1,601

1,823

1,81

609

1,806

1,815

1,605

650

1,596

1,808

1,59

569

1,835

1,604

1,429

610

1,818

1,811

1,817

651

1,817

1,819

1,826

570

1,809

1,62

1,817

611

1,597

1,599

1,804

652

1,59

1,589

1,594

571

1,402

1,83

1,807

612

1,344

1,443

1,59

653

1,806

1,831

1,819

572

1,826

1,075

1,807

613

1,596

1,827

1,594

654

1,831

1,828

1,806

573

1,599

1,805

1,803

614

1,589

1,803

1,815

655

1,814

1,596

1,596

574

0,708

1,81

1,598

615

1,81

1,813

1,596

656

1,275

1,827

1,597

575

1,814

1,619

1,823

616

1,837

1,603

1,591

657

1,593

1,594

1,614

576

1,593

1,801

1,618

617

1,808

1,601

1,818

658

1,596

1,587

1,61

577

1,821

1,808

1,823

618

1,622

1,599

1,81

659

1,593

1,604

1,429

578

1,104

1,803

1,595

619

1,883

1,804

1,598

660

1,805

1,825

1,808

579

1,813

1,815

1,59

620

1,594

1,838

1,603

661

1,828

1,812

1,595

580

1,589

1,817

1,803

621

1,593

1,596

1,603

662

1,832

1,14

1,597

581

1,599

1,817

1,821

622

1,812

1,807

1,601

663

0,723

1,342

1,811

582

1,628

1,823

1,806

623

0,726

1,604

1,601

664

1,59

1,595

1,591

583

1,802

1,597

1,594

624

1,817

1,59

1,113

665

1,835

1,804

1,828

584

1,817

1,618

1,82

625

1,6

1,595

1,673

666

1,82

1,598

1,805

585

1,59

1,83

1,587

626

0,72

1,612

1,82

667

1,594

1,42

1,833

586

1,594

1,435

1,803

627

1,804

1,817

1,624

668

1,59

1,826

1,824

587

1,422

1,838

1,593

628

1,595

1,809

1,593

669

1,822

0,716

1,59

588

1,109

1,596

1,607

629

1,607

1,808

1,153

670

1,108

1,597

1,591

589

1,807

1,604

1,427

630

1,614

1,626

1,82

671

1,588

1,804

1,121

590

1,817

1,818

1,146

631

1,356

1,828

1,806

672

1,817

0,749

1,831

591

1,591

0,734

1,589

632

1,812

1,595

1,616

673

1,827

1,807

1,599

592

1,594

1,817

0,971

633

1,599

1,617

1,824

674

1,611

1,578

1,818

593

1,81

1,6

1,122

634

1,591

1,818

1,596

675

1,824

1,593

1,59

594

1,822

1,117

1,612

635

1,824

1,593

1,827

676

1,844

1,601

1,593

595

1,822

1,599

1,596

636

1,422

1,806

1,818

677

1,59

1,61

1,582

596

1,146

1,59

1,819

637

1,826

1,806

1,137

678

1,591

1,594

1,805

597

1,601

1,811

0,802

638

1,421

1,82

1,589

679

1,592

1,126

1,817

598

1,835

1,669

1,831

639

1,835

1,594

1,595

680

1,621

1,812

1,423

599

1,814

1,623

1,815

640

1,827

1,819

1,595

681

1,428

1,822

1,433

600

1,593

1,837

1,59

641

1,6

1,814

1,597

682

1,595

1,81

1,593

601

1,813

1,591

1,809

642

1,811

1,425

1,594

683

1,82

1,597

1,815

602

1,616

1,095

1,593

643

1,608

1,427

1,133

684

1,591

1,423

1,807


51

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

685

1,595

1,84

1,594

726

1,81

1,825

1,123

767

1,817

1,833

1,806

686

1,593

1,81

1,598

727

1,362

1,82

1,601

768

1,828

1,59

1,804

687

1,817

1,804

1,588

728

1,59

1,816

1,816

769

1,592

1,607

1,816

688

1,598

1,806

1,577

729

1,59

1,142

1,592

770

1,588

1,423

1,602

689

0,733

1,595

1,134

730

0,806

1,809

1,837

771

1,592

1,826

1,81

690

1,814

1,595

1,83

731

1,612

1,599

1,812

772

1,596

1,81

1,59

691

1,827

1,121

1,599

732

1,132

1,596

1,825

773

1,808

1,805

1,812

692

1,813

1,804

1,807

733

1,589

1,589

1,818

774

1,601

1,594

1,591

693

1,616

1,627

1,814

734

1,6

1,144

1,81

775

1,821

1,608

1,824

694

1,821

1,595

1,542

735

1,603

1,607

1,816

776

1,115

1,613

1,825

695

1,591

1,824

1,596

736

1,591

1,818

1,823

777

1,614

1,6

1,807

696

1,811

1,813

1,599

737

1,597

1,812

1,155

778

1,594

1,601

1,809

697

1,593

1,82

1,59

738

1,421

1,808

1,6

779

1,597

1,814

1,142

698

1,595

0,734

1,592

739

1,818

1,811

1,592

780

1,35

1,113

1,138

699

1,828

1,806

1,814

740

1,593

1,803

1,597

781

1,806

1,811

1,151

700

1,808

1,808

1,59

741

1,822

1,831

1,824

782

1,807

1,591

1,808

701

1,587

1,6

1,598

742

1,594

0,713

1,136

783

1,603

1,608

1,821

702

1,813

1,814

1,347

743

1,818

1,605

1,814

784

1,805

1,598

1,342

703

1,83

1,812

1,825

744

1,11

1,81

0,988

785

1,84

1,594

1,413

704

1,59

1,825

1,804

745

1,614

1,152

1,831

786

1,615

1,597

1,828

705

1,596

1,604

1,811

746

1,819

1,815

1,814

787

1,594

1,585

1,808

706

1,337

1,137

1,618

747

1,813

1,604

1,592

788

1,592

1,588

1,816

707

1,811

1,823

1,818

748

1,6

1,831

1,601

789

1,592

1,434

1,589

708

1,432

1,805

1,808

749

1,136

1,608

1,832

790

1,83

1,423

1,593

709

1,83

1,592

1,803

750

1,614

1,822

1,825

791

1,82

1,424

1,607

710

1,814

1,62

1,823

751

1,136

1,833

1,803

792

1,106

1,813

1,594

711

1,596

1,808

1,606

752

1,596

1,819

1,579

793

1,599

1,822

1,812

712

1,812

1,596

1,6

753

1,136

1,371

1,809

794

1,807

1,143

1,662

713

1,813

1,593

1,818

754

1,603

1,591

1,818

795

1,604

1,61

1,832

714

1,587

1,805

1,6

755

1,812

1,589

1,821

796

1,833

1,622

1,821

715

1,806

1,827

1,592

756

1,598

1,34

1,128

797

1,113

1,113

1,611

716

1,598

1,672

1,593

757

1,595

1,805

1,814

798

1,594

1,809

1,828

717

1,613

1,824

1,819

758

1,593

1,603

1,597

799

1,809

1,817

0,719

718

1,593

1,61

1,345

759

1,427

1,597

1,609

800

1,427

1,813

1,593

719

1,6

1,843

1,811

760

1,599

0,725

1,436

801

1,594

1,593

1,809

720

1,118

1,594

1,605

761

0,71

1,594

1,717

802

1,811

1,608

1,441

721

1,595

1,607

1,588

762

1,837

1,592

1,618

803

1,801

1,813

1,597

722

1,822

1,821

1,604

763

1,595

1,585

1,806

804

1,598

1,595

1,592

723

1,6

1,586

1,818

764

1,6

1,59

1,808

805

1,807

1,702

1,589

724

1,589

1,814

1,81

765

1,587

1,589

1,833

806

1,596

1,603

1,826

725

1,598

1,825

1,825

766

1,82

1,819

1,135

807

1,81

1,808

1,811


52

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

808

1,838

0,721

1,816

849

1,806

1,838

1,596

890

1,592

1,36

1,597

809

1,811

1,83

1,829

850

1,83

1,598

1,589

891

1,809

1,589

1,831

810

1,82

1,59

1,599

851

1,819

1,613

1,817

892

1,617

1,83

1,426

811

1,804

1,594

1,601

852

1,587

1,815

1,819

893

1,804

1,827

1,812

812

1,822

1,615

1,59

853

1,818

1,595

1,422

894

1,583

1,839

1,595

813

1,596

1,425

0,719

854

1,591

1,807

1,589

895

1,809

1,812

1,822

814

1,59

1,816

1,592

855

1,82

1,821

1,596

896

1,586

1,811

1,107

815

1,674

1,423

1,614

856

1,824

1,833

1,809

897

1,612

1,809

1,833

816

1,594

1,594

1,6

857

1,593

0,718

1,594

898

1,832

1,596

1,821

817

1,103

1,35

1,592

858

1,589

1,348

1,828

899

1,815

1,808

1,81

818

1,434

1,805

1,572

859

1,815

1,136

1,591

900

1,604

1,814

1,591

819

1,605

1,812

1,829

860

1,835

1,617

1,601

901

1,59

1,608

1,835

820

1,429

1,82

1,601

861

1,122

1,594

1,584

902

1,596

1,826

1,811

821

1,82

1,12

1,625

862

1,808

1,154

1,811

903

1,592

1,816

1,596

822

1,807

1,616

1,803

863

1,14

1,595

1,425

904

1,598

1,121

1,595

823

1,812

1,62

1,598

864

1,591

1,838

1,803

905

1,589

1,594

1,814

824

1,806

1,81

1,825

865

1,595

1,817

1,808

906

1,591

1,423

1,591

825

1,59

1,813

1,594

866

1,81

1,598

1,114

907

1,601

1,808

1,336

826

1,604

1,811

1,598

867

1,83

1,595

1,821

908

1,81

1,813

1,806

827

1,608

1,592

1,819

868

1,812

1,599

1,595

909

1,813

1,597

1,595

828

1,592

1,596

1,667

869

1,824

1,804

1,146

910

1,146

1,623

1,121

829

1,117

1,591

1,821

870

1,817

1,591

1,8

911

1,816

1,816

1,593

830

1,593

1,804

1,818

871

1,808

1,821

1,592

912

1,612

1,619

1,828

831

1,591

1,596

1,599

872

1,599

1,604

1,807

913

1,822

1,585

1,431

832

1,153

1,61

1,809

873

1,806

1,141

1,803

914

1,431

1,589

1,604

833

1,816

1,806

0,747

874

1,589

1,594

1,819

915

1,617

1,114

1,811

834

1,614

1,805

1,813

875

1,612

1,594

1,144

916

1,832

1,601

1,82

835

1,638

1,811

1,618

876

1,153

1,6

1,587

917

1,817

1,807

1,819

836

1,59

1,816

1,809

877

1,591

1,807

1,813

918

1,827

1,423

1,816

837

1,59

1,831

1,809

878

1,822

1,592

1,815

919

1,826

1,431

1,589

838

1,605

1,817

1,808

879

1,834

1,822

1,786

920

1,822

1,817

1,594

839

0,813

1,807

1,805

880

1,809

1,81

1,596

921

1,809

1,592

1,402

840

1,594

1,806

1,812

881

1,606

1,423

1,589

922

1,823

1,589

1,078

841

1,811

1,605

1,823

882

1,821

1,804

1,434

923

1,802

1,808

1,807

842

1,807

1,812

1,593

883

1,817

1,596

1,801

924

1,588

1,818

1,817

843

1,805

1,81

1,807

884

1,815

1,594

1,602

925

1,119

1,604

1,59

844

1,827

1,253

1,596

885

1,601

1,352

1,811

926

1,802

1,825

1,593

845

1,613

1,596

1,823

886

1,595

1,806

1,603

927

1,596

1,828

1,587

846

1,815

1,592

1,429

887

1,598

1,802

1,599

928

1,818

1,587

1,564

847

1,601

1,597

1,421

888

1,817

1,812

1,589

929

1,812

1,808

1,802

848

1,809

1,566

1,59

889

1,803

1,812

1,145

930

1,801

1,594

1,81


53

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

931

1,805

1,82

1,821

955

1,804

1,814

1,602

979

1,817

1,807

1,591

932

1,429

1,824

1,429

956

1,823

1,594

1,807

980

1,606

1,814

1,809

933

1,589

1,809

1,596

957

1,59

1,596

1,818

981

1,595

1,809

1,832

934

1,813

1,818

1,423

958

1,608

1,593

1,594

982

1,831

1,598

1,59

935

1,825

1,598

1,602

959

1,849

1,592

1,806

983

1,593

1,587

1,815

936

1,595

1,59

1,817

960

1,607

1,594

1,84

984

1,615

1,599

1,596

937

1,137

1,814

1,115

961

1,824

1,426

1,824

985

1,824

1,613

1,81

938

1,805

1,812

1,814

962

1,591

1,818

1,593

986

1,6

1,599

1,818

939

1,808

1,816

1,821

963

1,587

1,593

1,825

987

1,824

1,813

1,82

940

1,617

1,81

1,822

964

1,812

1,814

1,819

988

1,814

1,136

1,825

941

1,607

1,593

1,622

965

1,802

1,832

1,595

989

1,112

1,61

1,809

942

1,596

1,819

1,827

966

1,597

1,596

1,822

990

1,594

1,809

1,588

943

1,825

1,589

1,425

967

1,6

1,617

1,827

991

1,404

1,606

1,601

944

1,817

1,66

1,826

968

1,812

1,805

1,598

992

1,6

1,827

1,808

945

0,782

1,108

1,596

969

1,807

1,812

1,441

993

1,592

1,808

1,424

946

1,135

1,606

1,615

970

1,594

1,59

1,15

994

1,114

1,431

1,817

947

1,812

1,588

1,823

971

1,61

1,823

1,805

995

1,83

1,111

1,597

948

1,596

1,811

1,609

972

1,621

1,807

1,816

996

1,614

1,829

1,833

949

1,825

1,597

1,424

973

1,836

1,594

1,604

997

1,596

1,613

1,809

950

1,116

1,595

1,147

974

1,814

1,804

1,161

998

1,818

1,817

1,594

951

1,817

1,811

1,584

975

1,81

1,82

1,591

999

1,591

1,814

1,832

952

1,609

1,118

1,802

976

1,823

1,593

1,593

1000

1,823

1,818

1,593

953

1,809

1,811

1,59

977

1,807

1,613

1,153

954

1,591

1,437

1,592

978

1,598

1,593

1,824

RMSD ≤ 2 Å 100%

100%

99,90%

Lampiran 3. Tabel nilai RMSD Tc-PLIF non filter 4-hidroksi-tamoksifen No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15

1,936 1,876 1,684 1,421 1,247 2,18 2,011 2,038 1,466 1,942 1,87 1,664 1,56 1,451 1,431

1,294 1,977 1,939 1,9 5,472 1,794 0,76 1,684 2,018 1,574 1,262 1,126 2,02 1,574 1,149

1,438 1,653 1,254 1,247 5,432 1,142 1,158 5,37 1,646 2,024 1,815 1,357 1,407 1,139 1,24

16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30

1,844 1,828 1,454 1,551 1,911 1,673 1,15 1,443 1,869 1,805 5,364 1,635 1,912 1,643 1,654

1,821 1,846 1,145 1,892 1,61 1,862 1,906 1,709 1,905 0,738 1,451 1,816 1,288 1,41 1,437

1,434 1,66 1,653 2,025 1,236 0,742 1,707 1,626 1,825 1,944 1,266 1,664 1,473 1,421 1,143

31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45

1,885 1,612 1,699 1,463 1,464 1,103 1,194 1,61 1,222 1,842 1,401 1,808 1,145 1,602 1,165

1,554 1,144 1,908 1,997 1,913 0,654 1,882 1,87 2,015 1,85 1,616 1,589 1,44 1,894 1,629

1,566 1,798 1,467 1,436 1,248 1,876 1,881 1,133 1,784 1,733 1,263 1,408 1,394 1,637 1,759

PLAGIAT PLAGIATMERUPAKAN MERUPAKANTINDAKAN TINDAKANTIDAK TIDAKTERPUJI TERPUJI Lampiran 3. Tabel nilai RMSD Tc-PLIF non filter 4-hidroksi-tamoksifen

54

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93

1,691 1,776 1,442 1,694 2,065 1,863 1,809 1,9 2,03 1,764 1,791 1,881 1,418 1,886 2,023 1,459 1,651 1,661 1,862 1,463 1 1,138 2,082 1,52 1,694 1,719 2,048 1,712 1,333 5,403 1,014 1,437 5,24 0,992 1,634 2 2,071 1,673 1,93 1,813 1,673 1,863 1,103 2,003 1,583 1,648 1,307 1,807

2,04 5,419 1,82 1,135 2,08 1,485 1,587 1,705 5,464 1,942 1,9 1,691 1,239 1,656 1,532 1,52 1,748 1,826 1,602 1,867 1,874 5,286 1,317 1,841 1,138 1,94 1,194 1,466 1,147 1,342 5,46 1,819 1,772 0,788 1,654 1,837 1,931 1,506 1,415 1,843 2 1,829 5,401 1,683 1,694 1,689 1,137 1,427

1,731 1,147 1,874 1,637 1,141 1,448 1,699 1,81 1,95 0,764 1,666 5,419 1,144 1,614 1,683 1,753 1,868 1,832 1,591 1,709 1,901 1,822 1,146 1,109 1,515 1,969 1,278 5,474 1,416 1,84 1,263 1,7 1,887 1,482 0,768 1,158 1,162 0,979 2,012 1,836 1,242 1,44 1,798 1,133 1,665 1,203 1,635 2,022

94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141

1,629 1,246 1,732 5,294 2,005 5,401 0,788 1,436 1,177 1,842 1,174 1,094 1,864 1,488 1,679 1,365 1,418 1,866 1,44 1,806 1,759 1,244 1,297 1,891 2,044 1,437 1,866 1,801 1,691 1,624 1,397 1,512 0,889 1,155 1,782 1,662 1,717 2,058 1,645 1,589 1,847 1,496 1,681 1,677 1,783 1,833 1,306 1,302

1,679 1,165 1,818 1,076 1,485 1,821 1,45 1,675 1,563 0,819 1,933 1,571 1,311 1,433 1,431 1,813 1,149 2,075 1,012 1,486 1,567 1,785 2,023 1,662 1,476 1,757 1,232 1,89 2,002 1,678 1,958 1,71 1,441 1,703 2,054 1,62 1,871 1,448 5,411 1,725 1,135 1,461 1,862 1,516 1,134 1,442 0,9 1,892

1,236 1,574 1,89 1,131 1,746 1,674 1,749 1,671 1,705 1,163 1,848 1,875 1,181 1,443 1,438 1,414 2,05 1,849 0,735 1,795 0,797 1,822 1,392 1,165 1,671 1,536 1,145 1,424 1,46 1,29 1,533 1,945 1,831 1,856 1,65 1,449 5,464 2,038 1,652 2,073 1,47 1,916 1,598 1,649 1,444 1,484 1,254 1,855

142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189

1,892 1,626 1,403 1,687 1,627 1,644 2,036 2,046 1,111 1,124 1,144 1,481 1,554 1,643 1,385 1,806 1,708 1,51 1,703 1,757 1,568 1,472 2,078 1,75 1,781 1,476 0,738 1,139 1,21 1,135 0,754 1,451 1,642 2,055 1,224 1,811 1,682 1,472 2,029 1,359 1,646 1,666 1,763 0,911 1,902 1,172 1,137 1,816

2,066 1,424 1,921 1,743 1,863 1,837 1,861 1,483 1,584 1,896 1,143 1,154 1,813 1,604 1,571 1,729 1,869 1,136 1,723 1,809 1,778 1,823 1,378 1,366 1,14 1,787 1,472 1,6 1,534 1,986 1,427 1,295 2,008 1,427 1,231 1,745 1,421 0,73 0,662 1,142 1,773 1,142 0,78 2,106 2,075 1,608 1,908 1,703

1,91 1,224 5,406 1,049 1,905 1,42 1,162 1,341 1,656 2,027 1,133 0,723 1,472 1,421 1,886 1,444 0,721 1,736 1,284 1,374 1,706 1,623 1,637 1,162 1,143 1,897 1,869 1,19 1,881 1,46 2,033 5,411 1,878 0,841 1,916 0,885 1,641 1,152 1,47 1,733 1,025 0,786 1,371 1,803 1,862 1,114 0,789 1,149


55

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237

1,45 1,451 1,161 1,867 1,139 0,81 1,146 1,825 0,801 1,455 1,659 1,619 5,345 1,418 1,998 1,169 1,142 1,429 1,65 5,26 1,272 0,865 1,668 5,268 1,44 1,077 1,936 1,926 2,054 1,668 1,112 1,424 1,502 1,895 2,026 1,842 1,097 1,377 1,611 1,519 1,63 1,832 1,248 1,875 1,157 1,853 1,376 1,587

1,577 1,142 1,166 1,997 1,717 1,149 1,139 2,078 1,653 1,361 1,229 1,456 1,65 1,197 0,809 1,596 2,053 1,726 1,364 1,634 1,503 1,907 0,855 1,143 1,143 1,542 1,883 1,89 1,824 1,925 1,63 1,454 1,153 1,136 1,482 0,802 1,646 5,374 1,875 1,146 1,824 1,375 1,478 1,53 5,264 1,439 1,749 1,871

1,807 1,651 1,554 1,669 0,72 1,374 2,003 0,933 1,442 1,137 1,829 1,811 1,899 1,593 1,804 1,865 1,909 0,936 1,954 1,768 1,88 1,577 1,662 1,639 1,461 1,117 1,891 1,625 1,1 1,691 1,868 1,449 1,42 1,68 1,379 1,667 1,708 0,765 1,441 1,721 1,029 2,07 1,986 1,188 1,876 1,568 1,951 1,877

238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285

1,674 1,853 0,755 1,439 1,25 2,03 1,757 1,981 1,304 1,911 1,738 1,665 1,456 1,127 1,142 1,997 1,459 1,303 1,727 1,867 1,919 1,217 1,473 1,426 1,668 1,113 1,131 1,664 0,716 1,437 1,237 1,904 1,804 5,302 1,459 1,173 1,167 1,497 2,057 1,141 5,486 2,039 0,585 1,31 1,307 1,733 1,161 1,376

1,661 1,7 1,595 1,842 1,85 1,145 1,728 1,848 1,732 1,15 1,44 1,424 1,846 1,455 1,147 1,679 0,797 1,652 2,034 1,637 0,718 1,43 1,713 1,442 1,272 1,992 1,836 1,566 1,737 0,638 1,856 5,459 1,773 1,673 1,405 1,335 1,454 0,773 1,306 1,619 1,688 1,753 0,796 1,879 1,43 1,722 1,547 1,194

2,015 1,908 0,947 1,606 1,389 1,68 1,633 1,912 2,07 1,42 1,797 1,518 1,404 1,656 1,755 1,409 1,149 1,908 1,755 1,718 1,909 1,116 1,589 1,704 1,418 1,395 1,897 2,111 5,451 2,062 1,671 1,844 2,054 1,524 1,45 1,47 1,144 1,144 1,466 2,001 1,141 1,148 1,619 1,816 1,902 1,889 1,88 1,652

286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333

1,111 1,689 0,752 1,919 1,82 1,862 1,503 1,133 1,554 1,201 1,144 0,881 1,453 1,459 2,096 1,673 5,443 1,855 1,622 1,187 1,896 1,69 1,736 1,417 1,385 1,733 1,139 2,037 5,404 2,011 1,406 1,323 1,751 1,177 1,504 1,357 5,27 1,573 1,162 2,019 1,83 2,055 2,013 1,365 1,551 1,768 1,463 1,14

1,909 2,072 1,151 2,079 1,445 0,688 1,273 1,436 1,145 1,722 2,055 1,687 1,148 1,828 2,061 1,442 1,471 2,037 1,689 2,027 1,734 1,143 1,513 1,421 1,462 1,16 0,781 1,917 5,271 1,193 1,666 1,91 1,439 1,731 1,721 1,429 1,898 1,497 1,837 1,88 1,437 1,958 1,452 1,728 1,371 1,36 1,531 1,955

1,69 1,251 1,136 1,861 1,278 5,441 1,971 1,445 1,887 1,096 1,158 1,299 5,452 1,69 1,836 1,835 1,144 5,424 1,149 1,442 1,305 1,84 1,548 2,034 1,126 0,786 5,424 0,617 1,847 1,629 1,147 1,211 1,852 1,989 1,684 1,889 2,009 1,623 1,634 1,175 0,944 1,268 1,44 1,572 1,877 1,576 1,137 2,043


56

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381

1,53 0,714 1,814 1,4 1,404 1,316 1,251 5,384 1,142 1,792 1,667 1,862 1,405 2,068 1,69 1,369 2,061 1,143 1,427 1,967 1,391 1,756 1,873 1,479 1,501 1,874 0,686 1,153 1,306 1,222 1,169 1,146 1,85 1,408 1,851 1,737 1,607 1,455 1,527 1,41 1,431 2,079 0,747 1,444 1,142 1,262 1,385 1,426

1,129 1,948 1,809 1,132 1,862 1,833 1,108 1,456 1,513 1,157 1,646 1,224 1,5 2,08 1,512 1,544 1,788 0,7 1,741 1,932 1,605 1,136 1,467 1,721 1,455 1,661 1,631 1,512 1,659 1,893 1,166 1,923 1,666 1,893 1,425 1,67 2,097 1,26 1,438 1,65 2,054 2,039 1,835 1,142 1,421 0,997 5,435 1,339

1,176 1,683 1,734 1,548 1,126 1,864 1,343 1,815 1,856 1,884 1,784 1,159 0,871 1,832 5,382 1,142 0,759 1,548 1,863 1,423 1,839 1,502 2,008 1,2 1,428 1,708 1,759 1,87 1,707 1,97 1,496 1,052 1,467 1,527 1,658 1,955 1,701 1,233 1,148 1,277 5,413 1,344 1,791 1,469 1,909 1,318 0,775 1,696

382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429

1,627 1,147 1,854 1,401 1,188 1,276 1,145 1,679 1,564 1,49 1,437 5,401 1,829 1,44 2,066 1,413 1,149 1,419 1,665 1,838 1,32 1,275 1,212 1,125 1,548 1,848 1,729 1,143 1,831 1,761 1,639 1,477 1,432 1,967 1,449 1,64 1,425 1,528 1,527 5,466 1,605 1,433 1,253 5,425 2,056 1,129 1,439 1,574

1,971 5,304 1,661 1,962 1,904 1,968 1,537 0,792 1,985 1,649 1,915 1,442 1,909 1,856 1,633 5,466 1,424 1,618 1,636 1,725 1,138 1,142 1,148 1,136 1,143 1,882 1,105 1,934 1,661 1,706 0,851 1,575 1,859 0,707 1,138 1,659 2,042 1,256 1,629 1,7 1,139 1,708 1,765 1,613 1,263 2,071 2,017 1,43

0,932 1,824 1,386 1,144 1,507 1,878 1,707 1,955 1,21 1,474 1,248 1,715 1,927 1,847 1,434 1,442 1,511 2,066 1,778 1,446 2,02 1,299 1,818 2,059 1,423 1,65 1,134 0,896 1,901 1,881 0,889 1,506 1,443 0,783 1,306 1,895 1,912 1,421 1,422 1,702 1,153 1,948 1,176 1,809 1,511 1,91 1,657 1,443

430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477

1,4 5,27 1,088 0,793 1,691 1,431 1,442 1,643 1,601 1,373 5,454 1,84 1,122 1,878 1,901 1,375 1,875 1,524 1,438 1,773 1,136 1,162 1,131 1,556 1,837 1,727 0,681 1,727 2,054 1,843 5,391 1,648 1,908 1,637 1,598 0,786 1,726 1,56 0,793 1,663 1,171 1,853 1,723 0,788 1,37 1,594 2,016 1,664

1,522 2,059 1,378 1,276 1,57 1,757 1,668 1,658 1,481 1,491 1,091 1,202 1,665 1,596 1,903 1,687 0,831 1,889 1,447 1,409 1,401 1,14 5,42 1,783 1,753 5,421 5,33 1,155 1,152 1,196 0,739 1,344 1,52 1,154 1,454 1,67 1,137 1,853 1,74 5,423 1,764 1,374 0,77 1,534 1,433 1,614 2,051 1,743

1,689 1,126 1,64 1,887 1,205 1,937 1,646 1,281 1,717 1,907 2,044 2,015 1,616 0,711 1,736 1,859 5,43 1,85 5,401 1,61 1,671 1,892 1,702 1,784 1,46 1,866 5,365 5,345 1,65 1,628 1,484 1,294 0,94 1,644 1,179 1,893 1,523 2,039 1,824 1,144 1,518 1,146 1,775 1,699 1,824 1,433 2,064 1,638


57

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525

1,186 1,456 1,426 1,842 0,87 1,473 1,884 1,659 2,063 1,659 1,563 1,19 2,04 1,13 1,428 2,036 1,92 1,28 1,832 1,7 1,692 1,613 1,021 0,8 2,031 1,564 1,656 1,632 2,007 0,968 1,237 1,972 1,614 1,269 1,187 1,821 1,693 1,425 1,758 0,844 1,765 1,933 1,81 1,219 1,153 1,869 1,718 2,037

1,149 1,336 1,797 1,594 1,546 1,657 1,603 1,126 1,295 1,731 1,913 1,468 1,686 1,53 1,664 1,449 0,793 1,687 1,467 1,965 1,702 1,649 1,667 1,203 0,998 1,604 2,067 1,67 0,722 1,773 1,791 1,591 1,62 1,664 5,257 1,661 1,819 1,383 1,314 1,183 1,15 1,591 1,485 1,904 0,675 1,877 1,004 1,897

1,643 1,524 1,645 1,481 1,689 1,765 1,14 1,691 1,166 1,765 1,399 1,71 1,778 1,472 1,728 1,876 1,9 1,169 1,209 1,638 1,079 1,705 1,403 1,354 2,031 0,804 1,899 1,683 1,426 2,026 1,386 1,458 0,812 2,032 1,908 1,483 1,594 1,498 1,203 0,776 1,187 1,844 1,519 5,416 1,728 1,444 1,634 1,336

526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573

1,477 0,8 1,459 1,283 1,835 1,845 1,658 5,468 1,629 0,666 5,449 1,882 1,808 1,619 1,917 1,387 1,422 1,681 1,854 1,468 1,456 1,449 1,425 1,512 1,142 1,5 0,955 1,49 1,141 1,781 1,952 1,693 1,402 1,317 1,444 1,779 1,467 0,793 1,143 2,013 1,708 1,973 1,168 1,744 1,154 1,932 1,875 1,885

1,447 1,422 2,045 1,867 1,68 1,903 2,052 1,67 1,351 1,913 1,881 1,891 1,627 1,669 1,653 1,231 1,85 1,998 0,985 1,978 1,577 1,137 1,771 1,526 1,882 1,147 0,855 2,012 1,202 0,923 1,997 1,149 2,031 1,151 1,168 1,709 1,631 2,007 1,445 1,447 1,174 1,657 1,416 1,644 1,77 1,43 0,906 1,14

1,667 1,756 1,826 1,748 1,456 1,143 1,261 1,753 1,448 1,188 1,849 5,416 1,894 1,627 1,385 1,852 1,859 1,569 5,421 1,901 1,15 1,68 2,082 1,25 1,45 1,854 1,689 1,551 1,926 5,453 1,625 2,053 1,78 1,456 5,438 1,128 0,937 2,079 1,567 1,703 1,036 1,248 1,162 1,124 1,564 1,427 1,431 1,64

574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621

1,865 1,136 1,132 5,495 1,137 1,342 0,773 1,852 1,146 0,849 2,074 1,859 1,677 5,433 1,133 1,155 1,999 1,904 5,411 1,787 1,663 1,602 1,53 1,43 1,674 1,72 2 1,225 1,401 1,915 1,149 1,369 1,647 1,912 1,691 1,524 0,722 5,357 1,056 1,449 1,87 1,877 1,451 5,347 5,519 2,029 1,444 1,181

5,438 1,227 1,907 1,443 5,28 1,567 5,286 1,513 1,849 1,804 1,094 1,383 1,952 1,987 1,85 1,865 1,697 1,441 1,989 1,136 0,783 1,603 1,379 1,676 1,393 1,592 1,851 1,841 1,455 1,483 0,807 1,145 1,559 2,034 1,689 1,801 1,177 1,889 1,971 2,068 1,771 1,141 1,237 2,021 5,413 1,694 1,828 1,006

1,576 0,882 1,338 1,141 1,652 1,998 1,782 1,216 1,371 0,833 5,404 1,724 2,058 2,044 1,9 1,829 1,376 1,223 1,636 1,906 1,749 1,198 1,662 1,585 1,527 2,022 1,879 5,39 1,898 2,082 0,865 1,926 1,865 2,06 1,155 5,393 1,204 1,681 1,135 1,913 1,653 1,483 1,651 1,278 1,671 1,833 1,91 1,55


58

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669

1,441 1,849 1,646 1,702 1,71 1,231 1,861 2,054 1,557 1,77 0,541 1,441 1,522 1,678 0,943 1,654 1,178 1,446 1,174 1,653 1,172 2,042 1,426 1,751 1,613 1,389 2,065 1,873 2,013 5,322 1,892 1,141 5,458 1,645 1,75 1,903 1,309 1,9 2,054 1,866 1,652 1,894 1,84 0,811 1,66 1,862 1,89 1,144

1,456 1,142 2,073 1,442 1,983 1,646 1,524 2,05 1,856 1,142 1,619 1,876 1,471 1,881 0,928 1,451 1,155 1,221 0,712 1,893 1,653 1,888 1,891 1,46 1,66 1,493 1,392 2,003 1,728 0,785 1,552 2,036 1,417 2,018 1,738 1,612 1,869 1,168 1,147 1,244 0,791 0,963 1,194 1,144 1,15 0,801 1,897 0,971

1,842 1,881 1,886 1,141 0,925 1,114 1,925 1,519 1,23 5,4 1,974 1,152 1,97 1,723 1,383 1,566 1,679 1,482 1,156 1,825 1,866 1,465 2,025 1,429 1,21 1,211 1,755 1,77 1,561 5,363 1,621 2,071 1,137 0,726 2,02 1,866 1,603 1,58 1,141 1,233 1,138 1,694 1,87 1,868 1,392 1,476 1,25 1,151

670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717

1,897 1,483 1,818 1,12 1,182 1,541 1,521 1,874 0,746 1,406 1,642 1,427 1,853 1,147 1,181 1,308 1,095 1,543 2,032 1,929 1,822 1,712 1,18 2,03 5,409 2,018 1,89 1,894 1,429 1,132 1,434 1,426 1,743 1,712 0,871 1,9 1,876 1,188 1,658 0,761 1,496 1,194 1,177 1,72 1,816 1,453 1,529 1,482

1,797 1,861 1,889 1,144 0,965 1,568 0,896 1,489 1,515 1,148 5,336 5,428 1,688 1,391 1,624 1,431 0,928 1,725 1,742 1,504 5,33 1,922 1,643 1,813 1,84 2,034 1,62 5,414 1,496 1,385 1,446 1,933 1,683 1,621 1,115 1,047 1,448 1,141 1,16 1,875 1,464 1,332 1,49 1,58 1,869 1,471 1,477 2,078

1,864 0,809 1,392 1,097 1,656 1,609 1,698 5,418 1,457 1,833 0,908 1,883 1,367 2,056 1,277 1,901 1,64 1,208 1,738 0,791 1,304 1,883 1,696 1,646 1,152 1,244 1,912 1,186 1,245 2,062 1,301 1,133 1,245 1,625 1,681 1,9 1,142 1,708 1,16 1,165 1,384 1,429 1,59 1,823 1,694 1,628 1,449 1,459

718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765

1,775 1,169 1,137 0,873 1,49 1,434 1,827 1,463 1,136 1,856 1,939 1,983 1,682 1,43 1,222 1,142 1,884 1,396 1,17 1,124 1,22 0,97 1,712 1,807 1,681 1,794 1,146 1,85 1,62 0,653 1,409 1,451 1,908 1,793 1,699 1,173 1,621 1,22 1,259 1,244 1,041 1,635 1,427 1,187 1,576 2,008 1,865 1,686

1,593 1,696 1,591 5,431 1,425 1,175 1,453 1,149 1,42 1,859 0,884 5,311 5,37 1,425 1,131 1,465 1,697 1,43 0,849 1,518 1,745 1,603 0,987 1,68 1,863 1,992 1,427 2,051 1,515 0,888 1,63 1,863 1,433 1,803 1,086 1,433 1,919 1,863 2,039 1,882 1,947 1,792 1,419 1,665 1,672 5,387 1,883 1,191

1,16 1,64 1,136 1,901 1,896 1,425 1,159 1,183 1,132 5,439 1,14 1,686 1,237 1,214 1,763 1,66 1,497 0,78 1,265 1,616 1,234 1,663 1,838 1,614 1,136 5,253 2,04 1,603 0,788 1,436 1,869 1,665 1,205 1,133 1,155 1,659 0,719 5,374 1,601 1,828 1,876 1,139 1,436 1,148 5,472 1,676 0,86 1,683


59

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813

1,66 0,898 1,812 1,85 1,731 1,647 1,151 1,223 1,354 1,686 1,47 1,164 1,615 1,92 1,863 1,457 1,162 1,827 1,486 0,754 1,09 1,141 1,697 1,632 5,411 0,784 1,223 1,883 1,879 1,237 0,767 1,435 1,867 1,329 1,792 1,362 1,659 1,673 1,474 1,434 1,447 1,811 1,855 1,627 1,17 1,319 1,65 1,848

0,821 1,149 1,911 1,925 0,9 1,496 1,144 1,984 1,881 1,472 5,414 1,873 1,345 2,067 1,368 1,969 1,208 1,741 1,207 1,704 1,686 1,696 1,472 0,787 1,181 1,662 2,048 1,838 1,515 1,401 1,226 1,451 1,403 5,431 1,501 1,3 1,398 2,047 1,922 1,246 1,876 1,39 1,883 1,144 1,468 2,017 0,882 1,162

1,135 1,144 5,337 1,712 1,419 1,142 1,552 1,212 5,33 1,441 1,485 1,313 0,768 1,145 1,858 1,248 1,149 1,356 1,158 0,788 1,225 1,987 1,45 1,661 1,84 1,438 1,146 1,445 1,843 1,807 1,027 1,337 1,435 1,442 1,563 1,143 1,173 5,458 1,466 1,778 2,039 1,109 1,136 1,452 1,836 1,16 0,673 1,642

814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861

0,889 1,625 1,605 1,338 1,445 1,881 1,387 1,578 1,454 1,155 1,604 1,269 1,682 1,278 1,896 1,732 1,148 1,426 1,891 1,87 1,621 1,756 2,044 1,537 1,832 1,807 1,307 1,254 1,672 1,9 1,58 1,562 1,812 1,857 1,96 1,826 1,473 1,594 1,263 1,017 1,459 1,385 1,663 1,607 1,48 1,521 1,845 1,302

1,68 1,073 1,91 0,812 1,865 1,664 0,751 1,824 1,164 1,794 2,055 2,059 1,66 1,135 1,394 1,235 1,755 1,937 1,561 1,107 1,178 1,422 1,597 1,093 1,502 2,076 1,509 1,283 1,7 1,473 1,49 1,424 1,638 1,133 1,456 1,689 1,437 1,87 1,426 1,476 5,421 1,362 5,389 1,793 1,885 1,815 1,46 1,874

0,794 1,432 1,84 1,84 1,234 2,009 1,648 1,48 1,204 1,521 1,906 1,239 5,379 0,801 1,542 1,836 1,544 1,431 1,133 1,332 1,151 1,566 1,644 1,882 1,201 0,833 2,053 1,694 1,688 1,328 1,618 1,502 1,402 1,564 1,825 1,483 1,72 1,698 5,405 1,178 1,642 1,802 1,809 1,297 0,748 1,142 1,865 1,236

862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909

1,142 1,891 1,448 1,508 1,297 1,692 1,284 1,493 1,8 1,341 1,926 1,712 0,895 1,655 0,967 2,043 1,15 1,122 1,372 1,845 1,636 1,709 1,874 1,326 1,144 1,138 1,665 1,877 1,865 1,189 1,53 1,252 1,637 1,155 2,063 1,21 1,373 1,444 1,533 1,844 1,855 1,465 2,052 1,863 1,946 1,287 1,515 1,288

1,233 1,919 1,293 1,042 1,813 1,868 1,612 0,693 1,227 1,364 1,886 1,465 1,663 1,862 1,434 2,024 1,493 2,051 1,642 1,307 1,856 1,335 1,503 1,548 1,154 1,429 0,824 1,148 1,54 1,148 1,668 1,208 2,038 1,438 1,883 1,559 1,445 1,844 1,714 1,828 1,121 1,606 1,872 1,123 1,628 1,772 1,225 1,09

1,709 1,396 1,692 1,871 1,533 1,527 5,324 1,146 1,845 5,404 1,588 1,666 1,481 1,144 1,848 1,871 1,083 1,569 0,77 1,158 1,615 1,511 1,327 2,068 1,899 1,652 1,942 1,054 1,577 1,147 1,501 1,458 1,573 1,435 1,554 1,872 1,304 1,601 1,712 1,187 1,67 1,421 1,25 1,14 1,179 1,87 1,847 1,881


60

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941

1,661 1,859 1,913 1,567 1,375 1,654 1,114 5,403 5,428 1,146 1,153 1,607 1,775 2,079 1,426 2,026 1,514 1,853 1,867 1,275 1,741 1,877 1,473 1,731 1,191 1,14 1,965 1,204 1,709 1,862 1,485 0,906

2,018 1,244 1,176 1,856 1,351 1,47 1,894 1,71 0,643 1,906 1,143 1,811 1,647 1,175 1,683 1,873 1,805 0,743 1,541 1,957 1,466 1,344 1,659 1,547 1,13 1,896 1,036 1,679 1,386 1,589 1,161 1,196

1,412 1,698 5,41 0,698 1,666 1,427 1,729 1,177 1,441 1,149 1,877 1,263 1,581 2,044 1,433 1,168 1,619 1,446 1,684 0,973 1,523 1,815 1,174 0,792 1,358 1,127 0,812 1,194 1,372 1,827 1,666 1,38

942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973

1,187 1,14 1,734 0,782 1,461 1,422 1,89 1,307 1,943 1,839 1,505 1,492 1,464 2,061 5,421 1,437 2,217 1,81 1,685 1,3 2,059 1,828 1,6 0,656 1,437 1,142 1,057 1,671 1,881 0,897 1,072 1,128

1,446 1,145 1,248 1,601 0,871 1,955 1,285 1,034 1,181 1,595 1,411 1,459 1,162 1,807 1,996 0,997 1,334 1,457 1,151 1,155 1,874 1,078 1,207 1,328 1,628 1,647 1,269 1,876 1,832 1,471 1,554 1,456

5,296 1,169 1,819 1,882 1,86 1,375 1,129 0,768 0,976 1,614 1,693 1,87 1,588 1,246 5,452 1,13 1,783 2,004 1,767 1,541 1,308 1,146 1,66 1,146 1,875 1,165 1,124 1,277 1,422 1,5 1,185 1,892

974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000

2,006 1,396 2,032 2,003 1,361 1,465 1,71 2,024 1,423 1,828 5,458 1,661 1,871 1,493 1,431 1,886 1,729 1,521 1,73 1,813 1,168 1,373 1,169 1,525 1,869 1,59 1,439 1,899 0,993 0,765 1,625 0,94 1,863 1,773 1,141 2,013 1,633 2,001 1,137 1,164 1,85 1,52 5,422 1,853 1,53 2,012 1,625 1,558 1,865 1,118 1,883 1,857 1,419 1,674 RMSD ≤ 2 Å

1,475 1,142 0,784 1,896 0,73 1,869 1,885 1,084 1,263 1,882 1,424 1,565 1,715 1,878 1,795 1,656 1,142 1,852 1,178 1,753 1,883 1,809 1,889 1,688 2,012 1,641 1,803

89,6 %

89,90%

90,50%

Lampiran 4. Tabel nilai RMSD Tc-PLIF filter 4-hidroksi-tamoksifen No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11

1,137 1,459 1,684 1,421 1,359 0,729 1,404 1,695 1,466 1,942 5,403

1,745 1,088 1,939 1,9 1,126 1,794 0,76 1,684 1,669 1,283 1,488

1,438 1,421 1,982 1,247 5,432 1,142 1,158 1,154 0,765 1,395 5,417

12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

1,594 1,377 1,822 1,431 1,168 1,697 1,586 1,551 1,679 1,698 1,15

1,126 1,752 1,444 1,149 1,747 1,768 1,145 1,892 1,438 1,618 1,906

1,678 1,147 1,139 1,335 1,818 5,412 1,39 1,198 1,264 1,593 1,707

23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33

1,443 1,451 1,805 1,653 1,528 5,437 1,422 1,149 1,127 1,69 1,699

1,709 1,905 0,738 1,451 1,379 0,866 1,165 1,437 1,554 1,144 0,791

1,545 1,208 1,944 1,439 1,456 1,146 1,421 1,143 1,891 1,798 1,467

PLAGIAT PLAGIATMERUPAKAN MERUPAKANTINDAKAN TINDAKANTIDAK TIDAKTERPUJI TERPUJI Lampiran 4. Tabel nilai RMSD Tc-PLIF filter 4-hidroksi-tamoksifen

61

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81

1,704 1,464 1,086 1,147 1,61 1,84 1,446 1,401 1,438 1,149 1,487 1,165 0,857 1,439 1,695 1,157 1,393 1,788 1,592 0,833 1,2 1,764 1,956 5,415 1,59 1,382 2,023 5,389 1,63 1,672 1,114 1,463 1,616 1,138 1,961 1,82 1,713 5,424 1,12 1,469 1,629 5,403 1,376 1,437 1,821 1,474 1,178 5,294

1,653 1,913 1,138 1,712 1,87 1,841 1,758 1,355 1,438 1,453 1,894 1,599 1,151 5,419 1,877 1,44 1,917 1,14 1,437 1,705 1,819 1,942 1,145 1,691 1,21 1,468 1,532 1,52 1,748 1,132 1,142 1,867 1,597 5,286 1,317 1,358 1,138 1,738 1,194 1,466 1,147 1,704 5,46 1,539 1,772 0,788 1,273 1,436

1,436 1,14 1,645 1,225 1,133 1,587 1,16 1,947 1,408 1,599 1,637 1,439 1,81 1,147 1,406 1,637 1,141 1,448 1,699 1,434 1,95 0,764 1,666 1,708 1,144 1,217 1,683 1,753 1,836 1,514 1,591 1,435 1,677 1,549 1,153 1,109 1,515 1,69 1,278 1,394 1,614 1,424 1,263 1,7 1,56 1,081 0,768 1,608

82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129

1,729 1,673 1,32 1,834 1,396 1,416 1,103 1,144 1,583 1,864 1,925 1,082 1,938 1,437 0,815 5,294 1,32 5,401 0,788 1,439 1,177 1,149 1,99 1,139 1,821 1,488 1,679 1,725 0,801 1,649 1,44 1,079 1,777 1,496 1,672 1,146 1,734 5,417 1,656 0,744 1,691 5,348 1,397 1,512 1,138 1,155 1,835 1,806

1,931 1,85 1,415 1,843 1,424 1,625 1,596 1,683 0,729 1,689 1,137 1,427 1,679 1,785 0,716 1,076 1,485 1,606 1,45 1,604 1,918 0,819 1,933 1,803 1,267 1,439 5,455 1,143 1,149 1,436 1,012 1,486 1,437 1,785 1,547 1,662 1,438 5,192 1,646 1,89 5,399 1,402 1,958 1,716 1,441 1,703 1,482 1,124

1,162 1,696 1,891 1,93 1,648 1,44 1,484 1,133 1,529 1,203 1,379 1,411 1,141 1,439 1,637 1,131 1,746 1,639 1,145 5,25 1,705 1,163 5,44 1,439 1,181 1,443 1,393 5,297 1,197 1,328 1,141 5,28 0,797 1,194 1,903 1,165 1,671 1,536 1,145 5,403 1,46 0,879 1,182 1,945 5,243 1,934 5,372 1,145

130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177

1,717 1,129 1,645 1,808 1,427 5,441 1,681 1,399 1,439 1,685 1,159 1,616 1,594 1,626 1,403 1,37 1,133 1,519 1,729 1,607 1,111 1,458 1,144 1,153 1,633 1,077 1,385 1,502 1,678 1,435 1,592 1,46 1,568 1,472 2,078 1,167 1,781 1,476 0,738 1,139 1,664 1,082 0,754 1,451 5,321 1,533 5,471 1,434

1,871 1,137 5,411 1,725 1,135 1,311 1,553 1,143 1,134 1,442 1,422 1,416 5,369 1,424 1,921 1,592 1,87 1,468 1,153 1,483 1,453 1,782 1,143 1,154 1,434 1,137 5,367 1,834 1,128 1,136 1,815 0,845 1,14 1,839 1,594 1,492 1,14 1,787 1,472 1,6 1,084 0,69 1,427 1,295 1,46 1,427 1,596 1,132

5,464 1,208 1,766 1,373 1,589 1,916 1,598 1,649 1,073 1,484 1,14 1,466 5,416 1,425 5,406 1,049 1,348 1,42 1,162 1,91 5,433 1,619 1,133 0,723 1,472 1,421 1,639 1,43 1,146 1,186 1,458 1,374 1,464 1,126 5,41 1,162 1,143 1,501 1,667 1,19 1,844 5,461 1,149 5,411 1,439 0,841 1,446 1,14


62

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225

1,892 1,915 1,64 1,587 1,646 1,666 1,763 1,18 1,902 1,172 1,137 1,947 1,45 1,451 1,437 1,459 1,139 1,144 1,146 1,923 0,801 1,818 1,659 1,127 5,345 1,418 1,444 1,169 1,142 1,363 1,922 1,662 1,601 0,865 1,668 5,268 1,44 1,093 1,936 1,119 1,41 1,668 1,437 1,424 1,502 1,172 2,026 1,434

0,573 0,73 0,662 1,142 1,27 1,142 0,78 1,612 1,56 1,56 1,908 1,703 1,841 1,142 1,166 1,696 1,487 1,149 1,139 1,824 1,664 1,079 1,229 1,456 1,954 1,197 0,809 1,596 1,597 1,563 1,364 1,461 1,503 1,907 1,685 5,449 1,143 1,076 1,453 1,146 1,921 1,925 1,135 1,141 1,153 1,136 1,482 0,802

1,515 1,152 1,809 1,324 0,785 0,786 1,371 1,136 1,641 1,114 0,789 1,149 1,842 1,262 1,598 1,569 0,72 1,711 1,598 1,174 1,442 1,137 1,526 1,131 1,142 1,915 1,804 1,453 1,909 1,143 1,912 1,768 1,175 1,603 1,612 1,102 1,461 1,531 1,74 1,596 1,619 1,691 1,279 1,595 1,243 1,829 1,833 1,865

226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273

1,144 1,147 5,384 1,687 5,385 1,766 1,248 1,233 1,157 1,644 1,933 1,802 1,524 1,596 0,755 1,596 1,25 1,806 1,757 1,751 1,246 1,85 1,63 1,481 1,439 1,127 1,142 1,442 1,575 1,438 1,727 1,202 1,14 1,217 1,473 1,426 1,141 1,259 1,682 1,664 1,306 1,437 1,67 1,77 0,784 5,302 1,459 1,173

1,697 5,374 1,895 1,146 1,892 1,375 5,385 1,133 5,264 1,439 1,232 1,103 1,661 1,7 1,832 1,583 1,85 1,145 1,46 1,138 1,732 1,15 1,44 1,079 1,237 1,455 1,147 1,679 0,797 1,473 5,42 1,637 1,998 1,43 1,814 1,442 1,139 1,829 5,45 1,566 0,655 0,638 1,501 5,459 1,144 1,673 1,405 5,36

1,704 1,812 1,441 1,721 1,139 1,775 1,614 1,188 1,657 1,568 1,14 1,591 1,285 1,908 1,7 1,438 1,389 1,68 1,216 1,912 1,817 1,42 1,797 1,924 1,544 1,181 1,392 1,141 1,149 1,908 1,731 1,544 1,515 1,116 1,589 1,704 1,418 1,395 1,523 5,354 1,595 1,811 1,143 1,621 1,12 1,694 1,925 1,47

274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321

1,167 1,497 5,451 1,141 1,235 1,431 1,187 1,132 1,189 1,733 1,161 1,376 1,111 1,689 0,752 1,816 1,82 1,76 1,503 1,133 1,382 1,696 1,692 0,881 1,453 1,459 2,096 1,345 5,443 1,855 1,723 0,738 1,888 1,825 1,56 1,421 2,031 1,733 1,139 5,415 5,404 2,145 1,596 1,323 1,751 1,177 1,793 1,461

1,454 0,773 1,818 1,619 1,866 1,869 0,796 1,987 1,136 1,143 1,547 1,641 1,909 0,772 1,151 5,329 1,445 1,521 1,17 1,543 1,145 1,722 5,404 1,687 1,148 1,669 5,293 1,442 1,918 1,721 1,14 1,17 1,15 1,143 1,474 1,421 1,462 1,125 1,14 1,39 5,271 1,598 1,639 1,142 1,439 1,731 1,721 1,801

1,144 1,144 1,692 1,469 1,141 1,148 1,139 1,373 1,902 1,416 1,463 1,046 1,69 5,37 1,136 1,394 1,278 5,441 1,891 1,46 1,887 1,139 1,158 0,75 5,452 1,69 1,746 2,013 1,803 5,424 1,149 1,664 1,548 5,464 1,161 1,765 1,126 0,786 5,424 1,128 1,139 1,596 1,857 1,211 1,634 5,413 1,136 1,147


63

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369

1,686 1,573 1,162 2,019 0,93 5,45 1,478 1,365 1,551 1,89 1,463 0,729 1,405 0,714 1,136 1,254 1,824 1,316 0,897 5,384 1,142 1,376 1,667 0,799 1,405 1,456 1,911 1,72 1,141 1,143 1,922 1,967 1,591 1,756 1,438 1,588 1,801 1,599 0,852 1,153 0,798 5,33 1,169 1,146 1,797 1,408 1,142 1,291

1,78 1,121 1,438 1,724 1,437 1,958 1,452 1,728 1,371 1,36 1,44 1,955 1,36 1,948 5,354 1,132 1,455 1,173 1,811 1,311 1,093 1,157 1,898 1,44 1,81 1,596 1,484 1,441 1,788 1,689 1,929 1,932 1,478 1,136 1,467 1,721 1,141 1,438 1,592 1,512 1,118 1,893 1,166 1,923 1,659 1,144 1,425 1,67

5,369 1,806 1,634 1,442 0,673 1,658 1,44 1,468 1,589 1,425 5,426 1,628 1,176 1,683 1,734 1,806 1,126 1,255 1,73 1,18 1,918 1,831 1,784 1,159 1,688 1,832 1,628 1,142 0,759 1,804 1,945 1,423 1,839 1,735 1,09 1,144 1,428 1,494 1,759 1,596 1,15 1,928 1,154 1,843 1,467 1,395 1,14 1,955

370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417

1,321 1,455 1,743 1,138 5,435 1,707 0,747 1,444 1,142 1,426 5,392 0,804 1,627 0,774 1,573 5,415 1,188 1,436 1,145 1,61 1,192 0,739 1,146 5,401 1,44 1,44 1,435 1,148 1,149 1,821 1,164 1,14 1,841 1,157 1,212 1,748 1,625 1,848 1,782 1,143 1,708 1,133 1,443 1,819 1,191 1,967 1,449 1,591

1,274 1,18 1,438 1,151 1,135 2,018 1,138 1,142 5,379 1,132 5,435 1,339 1,971 5,304 5,419 1,44 1,536 1,968 1,488 0,792 1,985 0,807 1,939 1,442 1,943 1,828 1,633 1,939 0,729 1,812 1,636 1,725 1,138 1,145 1,148 1,136 1,143 1,088 5,41 1,821 1,377 1,439 1,145 1,903 1,59 1,68 1,138 1,315

1,701 1,814 1,148 1,133 5,413 0,796 1,791 1,469 1,339 1,109 0,775 1,754 1,911 1,426 1,731 1,144 1,138 1,455 1,094 1,955 1,21 1,474 1,248 1,715 1,927 1,39 1,434 1,442 1,511 5,418 1,908 1,446 1,643 1,424 1,139 1,38 1,423 0,798 1,062 1,083 1,807 1,422 1,449 1,506 1,443 0,783 1,962 5,365

418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465

1,596 1,139 1,527 5,466 1,605 1,71 1,665 1,474 1,3 1,129 1,439 0,811 1,437 5,27 1,088 0,793 1,691 1,431 1,442 1,141 5,21 1,543 1,084 1,689 1,594 1,878 1,483 1,375 1,875 1,524 1,438 5,322 1,136 1,162 1,131 1,556 1,683 1,727 1,18 1,727 5,403 1,393 5,391 1,484 5,444 1,699 1,901 0,786

1,796 0,793 1,149 1,7 1,139 1,708 1,785 1,217 1,144 1,166 1,44 1,134 5,443 1,127 1,378 0,761 1,177 1,132 1,668 0,87 1,481 1,491 1,091 5,3 1,665 1,676 1,903 1,687 0,686 1,889 1,598 1,44 1,608 1,14 5,42 2,073 1,127 5,421 5,33 1,155 1,608 1,196 1,596 1,823 5,45 1,522 5,415 1,67

1,912 1,126 1,422 1,688 1,153 1,416 1,627 1,853 1,599 1,91 1,512 1,443 1,925 1,126 5,492 1,44 5,424 1,689 1,741 1,407 1,717 1,907 1,72 1,331 1,828 1,151 1,736 5,416 5,43 1,908 5,401 1,925 1,129 1,892 0,812 1,439 1,425 1,877 5,365 5,345 1,59 1,422 1,43 1,294 1,875 1,677 1,179 0,867


64

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513

5,394 1,56 0,793 0,867 1,171 1,732 1,723 0,788 1,593 1,42 1,434 1,664 1,186 1,456 1,601 1,838 0,87 1,473 1,426 1,445 1,736 1,5 0,798 1,19 0,737 1,13 1,428 1,675 1,098 1,673 1,808 1,592 1,442 1,139 1,144 0,8 1,459 1,16 1,57 1,632 2,007 1,135 1,436 1,972 1,95 1,269 1,187 1,804

1,596 1,437 1,74 1,978 1,177 5,458 0,77 1,633 1,433 1,614 0,803 1,592 1,145 1,442 1,797 1,802 1,173 1,15 1,182 0,81 1,095 1,731 1,459 1,468 1,483 1,53 1,664 1,449 0,793 1,687 1,145 1,692 1,702 1,479 1,609 1,17 1,139 1,604 1,612 1,67 1,641 1,773 1,791 5,185 1,742 1,664 5,257 1,661

1,601 5,423 0,664 1,144 1,52 1,146 1,843 1,699 1,433 0,774 1,461 5,404 1,643 1,437 1,129 1,133 0,786 1,765 1,14 1,691 1,634 1,616 1,399 1,826 1,397 1,472 1,143 1,447 5,386 1,169 5,441 1,638 1,079 1,199 1,436 1,354 1,475 0,804 0,838 1,423 1,426 1,595 1,386 1,458 0,812 1,742 1,908 0,79

514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561

1,693 1,425 1,758 1,701 1,109 1,261 1,906 1,593 1,153 1,476 1,718 1,21 1,665 1,593 1,459 1,14 5,423 1,55 1,438 1,16 1,118 1,7 5,449 1,136 1,388 1,846 5,421 1,387 1,422 1,696 1,37 1,275 0,812 1,048 1,149 1,404 1,142 1,5 5,45 1,49 1,141 1,805 1,952 1,693 0,806 1,062 1,444 1,107

1,913 1,383 1,608 1,183 1,15 1,381 1,546 1,904 1,142 1,603 1,597 1,897 1,138 1,422 1,437 1,9 1,68 1,701 1,151 1,154 1,986 1,437 1,687 1,143 1,134 1,224 1,227 1,231 1,754 1,817 1,427 0,788 1,577 1,137 5,419 1,526 1,714 1,147 1,465 1,365 1,817 1,884 1,588 1,149 1,681 1,151 1,168 1,709

1,594 1,829 1,425 0,776 1,187 1,137 1,726 5,416 1,728 1,444 2,006 1,153 1,592 1,984 1,829 1,748 1,161 1,143 0,748 5,299 1,492 1,418 1,621 5,416 1,894 5,383 1,29 1,319 1,42 5,358 5,421 1,499 1,15 1,15 1,147 1,545 5,417 1,205 1,689 1,344 1,926 1,848 1,613 5,419 1,439 1,646 5,438 1,128

562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609

1,596 0,793 1,143 1,813 1,543 1,715 1,168 1,744 1,154 1,216 1,439 5,415 1,865 1,153 1,593 5,364 1,513 5,327 5,425 1,438 1,146 0,849 1,129 1,59 1,442 5,433 1,133 1,155 1,542 1,547 5,411 1,164 1,449 1,602 1,684 1,43 1,801 5,217 1,593 1,813 1,401 1,141 1,149 1,369 1,31 1,912 1,444 1,141

1,581 1,674 1,445 1,141 1,174 1,158 1,416 1,866 0,84 1,43 1,075 1,14 5,438 1,227 1,441 1,443 5,28 1,815 5,286 1,142 1,823 1,382 1,226 1,375 1,952 1,425 2,135 1,135 1,697 1,441 1,817 1,136 0,783 1,603 1,134 1,676 1,471 1,623 1,491 1,841 1,436 1,816 0,807 1,145 1,81 1,806 1,689 1,322

1,209 5,348 1,567 1,703 1,036 5,443 1,81 1,124 1,817 1,427 1,431 1,816 1,576 1,704 1,386 1,141 1,652 1,59 1,782 1,821 1,462 0,833 5,404 1,223 1,435 1,437 1,9 1,829 1,553 1,417 1,636 1,502 1,749 1,424 1,553 1,211 1,831 1,141 1,718 5,39 1,898 1,542 2,017 1,926 1,605 1,439 1,759 5,393


65

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657

0,722 1,406 1,429 1,449 1,893 5,365 1,143 1,436 1,089 5,403 1,536 1,181 1,441 1,375 1,646 1,702 1,315 1,958 1,623 1,478 1,614 1,435 1,739 1,441 1,522 1,957 1,493 1,654 1,178 1,836 1,174 1,902 1,172 5,415 1,682 1,751 1,465 1,923 1,149 1,71 1,709 1,817 1,694 1,141 5,458 1,667 1,572 1,903

1,177 1,106 1,971 1,827 1,803 1,141 1,594 2,021 5,413 1,173 1,434 1,683 1,456 1,142 1,902 1,142 1,983 1,754 1,524 1,143 1,152 1,142 1,642 1,059 1,471 1,593 1,394 1,451 1,155 1,116 0,712 1,147 1,192 1,232 1,59 1,625 1,66 1,609 1,645 1,854 1,728 0,807 1,552 1,146 1,417 2,018 1,738 5,37

1,6 1,681 1,135 1,783 1,815 1,483 1,888 1,169 1,438 1,584 1,91 1,55 1,99 1,23 1,801 1,141 1,736 1,696 1,925 1,519 1,82 5,4 1,721 1,418 1,767 1,827 1,44 1,137 1,589 1,482 1,156 1,143 1,866 1,465 1,437 1,429 1,21 1,211 1,603 1,594 1,141 1,389 1,447 1,806 1,137 0,726 2,02 1,44

658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705

1,745 1,891 1,695 1,456 1,135 1,832 1,133 0,811 1,141 2,051 1,141 1,144 1,801 1,483 1,439 1,343 1,182 1,434 1,465 1,463 0,746 1,406 1,642 1,144 1,268 1,147 1,181 1,42 1,095 5,357 1,598 1,142 1,472 1,738 1,18 1,411 5,409 1,591 1,44 1,951 0,762 1,132 1,296 1,426 1,743 1,712 1,424 1,9

1,869 1,604 1,147 1,244 0,791 1,443 1,442 1,144 1,15 0,801 1,679 1,236 1,597 0,793 1,438 1,144 1,543 1,593 0,896 1,489 1,515 1,148 5,336 2,093 1,688 0,802 0,904 1,319 1,944 1,696 1,476 1,186 5,19 1,376 1,916 1,627 1,097 1,501 1,537 5,414 1,253 1,79 1,446 1,933 1,15 1,621 1,44 5,423

5,423 1,127 1,141 5,421 1,158 1,694 1,725 1,537 1,733 1,476 1,33 1,151 1,396 0,809 1,392 1,097 1,656 1,878 1,698 5,418 1,457 1,637 1,813 1,712 1,367 1,78 1,277 1,901 1,618 1,588 1,354 0,791 1,746 1,123 1,696 1,159 1,152 1,135 1,912 1,186 1,592 1,168 1,72 1,133 1,837 1,719 1,182 1,69

706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753

1,162 1,188 1,953 0,761 1,496 1,216 1,177 1,11 1,888 1,453 2,088 1,141 2,005 1,169 1,137 1,595 1,121 1,434 1,841 1,247 1,136 1,137 1,939 1,983 1,657 1,43 0,662 1,142 1,884 1,141 1,17 1,124 1,182 1,09 1,712 1,45 1,681 1,794 1,146 1,144 1,412 0,777 1,141 1,451 1,908 1,54 5,428 1,448

1,448 1,141 1,16 1,944 1,464 1,421 1,49 1,58 2,052 1,471 1,477 1,448 1,593 1,696 1,591 5,431 1,425 1,175 1,453 1,149 1,609 1,69 1,408 5,311 5,431 1,525 1,131 1,465 1,448 1,438 1,277 1,154 1,411 1,172 1,138 1,142 1,197 1,549 1,427 1,62 1,438 1,904 1,427 5,385 1,433 1,803 1,086 1,803

1,142 5,458 1,16 1,428 1,384 1,429 1,59 1,617 1,6 1,21 1,449 1,805 1,16 5,42 1,136 1,901 1,668 1,425 1,159 1,825 1,132 5,439 1,14 1,139 1,237 1,214 1,763 1,818 1,143 0,78 1,925 1,423 5,475 1,933 1,489 1,463 1,136 5,253 1,85 1,438 0,788 0,759 5,423 1,665 1,205 1,129 1,155 1,437


66

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801

1,142 1,424 1,254 1,556 1,041 1,243 1,427 1,187 5,418 1,595 1,925 0,763 1,66 1,421 1,438 1,542 1,977 5,484 1,151 1,223 1,884 1,686 1,47 1,927 1,594 1,92 1,458 1,457 1,162 1,908 1,805 0,754 1,09 1,141 1,226 1,474 5,411 0,784 1,223 1,154 1,43 1,688 0,767 1,463 1,349 1,541 1,792 1,895

1,919 1,436 5,43 1,439 1,083 1,623 1,419 1,988 1,426 5,387 1,134 1,908 0,821 1,149 1,911 1,925 1,845 1,496 1,144 1,451 5,46 1,472 0,829 1,873 1,684 1,124 1,147 1,59 1,591 1,206 1,207 1,143 1,56 1,585 1,397 0,787 1,181 1,818 1,759 1,822 1,515 1,903 5,425 1,451 1,403 5,431 1,501 1,146

0,719 5,374 1,128 1,437 1,15 0,759 1,436 1,148 5,472 1,143 0,809 1,683 1,135 1,144 1,144 1,175 1,884 1,142 1,552 1,212 5,33 1,477 1,485 1,677 0,768 1,145 0,82 1,151 1,149 1,845 1,158 0,788 1,828 1,439 1,45 2,006 1,9 1,438 1,146 1,445 1,14 5,4 1,159 2,029 1,435 1,442 1,563 1,143

802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849

5,409 1,673 1,474 1,434 1,447 5,413 1,437 1,353 1,17 1,438 1,437 1,897 0,889 1,625 1,164 0,803 1,445 0,82 1,387 1,82 1,781 1,155 1,604 1,979 5,42 1,278 1,469 1,811 1,148 1,426 1,891 1,816 1,435 1,415 1,139 1,537 1,92 1,439 1,594 0,955 1,672 1,453 5,424 5,342 1,476 5,396 1,264 1,42

1,138 1,13 1,133 1,702 1,922 1,64 1,441 1,144 1,468 5,445 5,42 1,162 0,763 1,073 1,91 0,812 1,078 1,136 0,751 1,824 1,164 1,944 1,465 1,645 1,66 1,135 1,394 1,188 1,145 1,937 1,478 1,387 1,178 1,422 5,43 1,823 1,817 1,72 0,884 1,536 1,7 1,473 1,253 1,424 1,638 1,442 1,456 1,62

1,173 5,458 1,592 1,124 1,76 1,955 1,137 1,452 1,132 1,16 0,673 1,433 0,794 1,267 1,702 1,592 1,826 5,469 2,079 1,48 1,204 1,542 1,143 0,739 1,444 1,141 1,542 5,381 1,747 1,431 1,133 1,432 1,151 1,921 1,443 1,518 1,201 0,833 1,789 1,694 1,373 1,436 1,179 1,823 1,429 1,375 1,072 1,483

850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897

1,473 1,174 1,263 1,501 1,145 1,385 1,424 1,607 1,48 1,815 1,44 1,142 1,142 1,672 1,082 1,508 1,722 1,692 1,172 1,213 1,143 1,341 1,45 1,248 0,895 1,552 0,967 0,955 1,674 1,122 1,446 0,735 1,164 1,709 0,722 1,907 1,663 1,138 1,665 1,338 1,53 1,415 1,53 5,301 1,907 1,155 1,553 1,21

1,437 1,384 1,426 1,476 5,421 0,832 5,389 1,793 1,151 1,44 1,46 1,696 0,868 1,919 1,838 1,042 1,239 1,987 1,61 0,693 1,227 1,364 1,886 1,518 1,173 1,438 1,434 1,138 2,039 1,327 1,642 1,726 1,147 1,431 1,503 1,814 1,154 1,429 0,824 1,812 1,858 1,148 1,489 1,827 1,839 1,438 1,145 1,444

1,72 1,698 5,405 1,178 1,939 1,377 1,809 1,879 0,748 1,142 1,601 1,236 1,709 1,303 1,692 1,147 1,157 1,806 5,417 1,146 5,415 5,404 1,18 1,666 1,432 1,144 1,403 1,437 1,314 1,569 0,77 1,158 1,824 1,084 5,436 1,463 1,142 1,141 1,955 1,712 0,94 1,388 5,464 1,458 1,573 1,435 1,554 1,147

PLAGIAT PLAGIATMERUPAKAN MERUPAKANTINDAKAN TINDAKANTIDAK TIDAKTERPUJI TERPUJI Lampiran 4. Tabel nilai RMSD Tc-PLIF filter 4-hidroksi-tamoksifen No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

Rep. I

Rep. II

Rep. III

No.

898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933

1,373 1,444 1,135 1,444 1,455 1,465 1,598 1,418 1,946 1,14 1,456 1,813 1,146 5,401 1,818 1,839 1,375 1,617 1,458 5,403 5,428 1,146 1,153 1,524 1,775 0,778 1,426 1,501 1,137 1,664 1,778 1,812 1,846 1,144 1,473 1,165

1,445 1,653 1,814 1,543 1,439 1,538 1,707 1,96 0,716 1,772 1,813 1,09 1,495 1,475 1,176 1,349 1,909 1,47 5,469 1,71 1,723 1,481 1,143 5,4 0,952 1,43 1,76 1,604 1,431 0,743 1,541 1,808 1,136 1,132 1,144 5,355

1,087 1,208 1,451 1,187 1,67 1,421 1,569 1,14 1,179 1,87 1,439 1,928 1,412 0,737 5,41 1,399 1,666 1,427 1,729 1,177 1,441 1,149 2,06 1,187 1,803 1,957 1,433 1,168 1,871 1,446 1,495 1,139 1,14 1,786 1,174 0,792

934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969

1,17 1,14 1,965 1,448 1,709 1,449 1,151 1,607 1,187 1,14 1,734 0,782 1,461 1,422 1,699 1,859 1,593 1,765 1,505 1,788 1,464 1,407 5,421 1,437 2,217 1,81 1,459 1,159 1,578 1,828 1,6 1,802 1,437 1,802 5,422 1,526

1,13 1,985 1,438 1,679 1,386 1,153 1,161 1,196 1,446 1,145 1,133 0,877 0,871 1,955 1,811 1,597 5,381 1,403 1,125 1,144 1,162 1,824 1,178 1,885 1,104 1,151 1,151 1,155 1,432 2,088 1,793 1,832 1,465 1,136 1,378 0,673

1,454 1,127 0,812 1,194 1,372 5,415 1,141 1,38 5,296 1,169 1,465 1,596 1,272 1,505 1,129 0,768 1,147 1,075 1,693 1,87 2,043 1,246 1,398 1,13 1,395 1,483 1,767 1,541 2,041 5,422 1,341 1,146 1,651 1,147 1,181 1,744

970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000

Rep. I

67 Rep. II

5,415 1,832 1,92 1,422 5,379 1,45 0,768 1,142 0,798 1,804 1,649 1,252 1,361 1,465 0,985 1,388 1,423 5,427 5,458 1,661 1,44 1,814 1,431 0,871 1,729 1,144 0,773 1,587 1,168 1,373 1,138 1,381 1,438 1,59 1,439 1,813 1,572 0,765 1,625 1,971 1,834 1,773 1,141 1,437 1,149 1,451 1,137 1,164 1,85 1,425 5,422 1,14 1,441 1,433 1,418 1,613 1,433 1,522 1,215 1,549 5,367 1,458 RMSD ≤ 2 Å 91,20% 92,50%

Rep. III 1,15 1,805 1,185 1,892 1,475 1,142 0,784 1,734 0,73 1,436 1,137 1,832 1,59 1,921 1,424 1,139 1,818 5,445 1,706 1,542 1,142 1,233 1,197 1,753 1,435 1,196 1,158 1,666 1,438 1,077 2,033 90,60%

PLAGIAT PLAGIATMERUPAKAN MERUPAKANTINDAKAN TINDAKANTIDAK TIDAKTERPUJI TERPUJI 68

Lampiran 5.

Script untuk melakukan penambatan ulang 4-hidroksitamoksifen pada REα

#!/bin/sh alias plants='/home/enade/program/PLANTS/PLANTS1.2' alias pyplif='/home/enade/.pyplif/pyplif.py' mkdir Docking/ERa-OHT cd Docking/ for i in $(seq 1 3); do mkdir ERa-OHT/replication_$i cd ERa-OHT/replication_$i for j in $(seq 1 1000); do mkdir dock_$j cd dock_$j/ cp /home/chandra/work/plants/plants.configoht . cp /home/chandra/work/plants/protein.mol2 . cp /home/chandra/work/plants/water.mol2 . cp /home/chandra/work/pyplif/config.txt . cp /home/chandra/work/pyplif/OHT.mol2 . cp /home/chandra/work/pyplif/ER_site.mol2 . plants --mode screen plants.configoht pyplif rm plants.configoht protein.mol2 water.mol2 config.txt ER_site.mol2 OHT.mol2 grep results pyplif.csv > nohead.csv awk '{if(substr($4,103,1)=="1") {print $1,$2,$3} else {print "N/A"}}' nohead.csv > filter_asp.csv echo dock_$j >> ../docklist.txt cd ../ done cd ../../ done


Lampiran 6. Script untuk melakukan penambatan coumestrol pada REα #!/bin/sh alias plants='/home/enade/program/PLANTS/PLANTS1.2' alias pyplif='/home/enade/.pyplif/pyplif.py' mkdir Docking/ mkdir Docking/ERa-coumestrol cd Docking/ for i in $(seq 1 3); do mkdir ERa-coumestrol/replication_$i cd ERa-coumestrol/replication_$i for j in $(seq 1 1000); do mkdir dock_$j cd dock_$j/ cp /home/chandra/work/plants/plants.config . cp /home/chandra/work/plants/protein.mol2 . cp /home/chandra/work/plants/coumestrol.mol2 . cp /home/chandra/work/plants/water.mol2 . cp /home/chandra/work/pyplif/config.txt . cp /home/chandra/work/pyplif/OHT.mol2 . cp /home/chandra/work/pyplif/ER_site.mol2 . plants --mode screen plants.config pyplif rm plants.config protein.mol2 coumestrol.mol2 water.mol2 config.txt ER_site.mol2 OHT.mol2 grep results pyplif.csv > nohead.csv awk '{if(substr($4,103,1)=="1") {print $1,$2,$3} else {print "N/A"}}' nohead.csv > filter_asp.csv echo dock_$j >> ../docklist.txt cd ../ done cd ../../ done


Lampiran 7.

Script perhitungan nilai RMSD 4-hidroksi-tamoksifen pada protokol Tc-PLIF nonfilter

#!/bin/sh for i in $(seq 1 3); do mkdir -p Docking/ERa-OHT/analisis_hasil/replication_$i cd Docking/ERa-OHT/analisis_hasil/replication_$i cp ~/work/rmsd_oht/rmsd.pml . cp ~/work/rmsd_oht/ref.pdb . for j in $(seq 1 1000); do cp ../../../ERa-OHT/replication_$i/dock_$j/nohead.csv . awk '{print $1","$2","$3}' nohead.csv | sort -t, -k3rn -k2n | head -n1 > nonfilter_tc.csv awk -F, '{print "babel -d -imol2 dock"$1" -opdb selected.tcplif.pdb"}' nonfilter_tc.csv > temp.sh sed "s/dock/..\/..\/..\/ERa-OHT\/replication_$i\/dock_$j\//g" temp.sh > convert.sh chmod u+x convert.sh ./convert.sh rm temp* nohead.csv nonfilter_tc.csv convert.sh mv selected.tcplif.pdb nonfilter_tcplif_$j.pdb cp nonfilter_tcplif_$j.pdb ligand.pdb pymol -c rmsd.pml | grep "Executive" | awk '{print $4}' > tmp echo "$j `cat tmp`" >> rmsd.nonfilter_tc.csv rm tmp ligand.pdb done rm rmsd.pml ref.pdb cd ../../../../ done


Lampiran 8.

Script perhitungan nilai RMSD 4-hidroksi-tamoksifen pada protokol Tc-PLIF filter

#!/bin/sh for i in $(seq 1 3); do mkdir -p Docking/ERa-OHT/analisis_hasil/replication_$i cd Docking/ERa-OHT/analisis_hasil/replication_$i cp ~/work/rmsd_oht/rmsd.pml . cp ~/work/rmsd_oht/ref.pdb . for j in $(seq 1 1000); do cp ../../../ERa-OHT/replication_$i/dock_$j/nohead.csv . awk '{if (substr($4,103,1)==1) print $0}' nohead.csv | awk '{print $1","$2","$3}' | sort -t, -k3rn -k2n | head -n1 > filter_tc.csv awk -F, '{print "babel -d -imol2 dock"$1" -opdb filtered.tcplif.pdb"}' filter_tc.csv > temp.sh sed "s/dock/..\/..\/..\/ERa-OHT\/replication_$i\/dock_$j\//g" temp.sh > convert.sh chmod u+x convert.sh ./convert.sh rm temp* filter_tc.csv convert.sh mv filtered.tcplif.pdb filter_tcplif_$j.pdb cp filter_tcplif_$j.pdb ligand.pdb pymol -c rmsd.pml | grep "Executive" | awk '{print $4}' > tmp echo "$j `cat tmp`" >> rmsd.filter_tc.csv rm tmp ligand.pdb done rm rmsd.pml ref.pdb cd ../../../../ done


Lampiran 9. Script perhitungan nilai RMSD 4-hidroksi-tamoksifen pada protokol ChemPLP nonfilter #!/bin/sh for i in $(seq 1 3); do mkdir -p Docking/ERa-OHT/analisis_hasil/replication_$i cd Docking/ERa-OHT/analisis_hasil/replication_$i cp ~/work/rmsd_oht/rmsd.pml . cp ~/work/rmsd_oht/ref.pdb . for j in $(seq 1 1000); do cp ../../../ERa-OHT/replication_$i/dock_$j/nohead.csv . awk '{print $1","$2","$3}' nohead.csv | sort -t, -k2n -k3rn | head -n1 > nonfilter_chemplp.csv awk -F, '{print "babel -d -imol2 dock"$1" -opdb selected.chemplppyplif.pdb"}' nonfilter_chemplp.csv > temp.sh sed "s/dock/..\/..\/..\/ERa-OHT\/replication_$i\/dock_$j\//g" temp.sh > convert.sh chmod u+x convert.sh ./convert.sh rm temp* nohead.csv nonfilter_chemplp.csv convert.sh mv selected.chemplp-pyplif.pdb nonfilter_chemplp_$j.pdb cp nonfilter_chemplp_$j.pdb ligand.pdb pymol -c rmsd.pml | grep "Executive" | awk '{print $4}' > tmp echo "$j `cat tmp`" >> rmsd.nonfilter_chemplp.csv rm tmp ligand.pdb done rm rmsd.pml ref.pdb cd ../../../../ done


Lampiran 10. Script perhitungan nilai RMSD 4-hidroksi-tamoksifen pada protokol ChemPLP filter

#!/bin/sh for i in $(seq 1 3); do mkdir -p Docking/ERa-OHT/analisis_hasil/replication_$i cd Docking/ERa-OHT/analisis_hasil/replication_$i cp ~/work/rmsd_oht/rmsd.pml . cp ~/work/rmsd_oht/ref.pdb . for j in $(seq 1 1000); do cp ../../../ERa-OHT/replication_$i/dock_$j/nohead.csv . awk '{if (substr($4,103,1)==1) print $0}' nohead.csv | awk '{print $1","$2","$3}' | sort -t, -k2n -k3rn | head -n1 > filter_chemplp.csv awk -F, '{print "babel -d -imol2 dock"$1" -opdb filtered.chemplppyplif.pdb"}' filter_chemplp.csv > temp.sh sed "s/dock/..\/..\/..\/ERa-OHT\/replication_$i\/dock_$j\//g" temp.sh > convert.sh chmod u+x convert.sh ./convert.sh rm temp* filter_chemplp.csv convert.sh mv filtered.chemplp-pyplif.pdb filter_chemplp_$j.pdb cp filter_chemplp_$j.pdb ligand.pdb pymol -c rmsd.pml | grep "Executive" | awk '{print $4}' > tmp echo "$j `cat tmp`" >> rmsd.filter_chemplp.csv rm tmp ligand.pdb done rm rmsd.pml ref.pdb cd ../../../../ done


Lampiran 11. Script perhitungan nilai RMSD coumestrol pada protokol ChemPLP filter #!/bin/sh for i in $(seq 1 3); do mkdir -p Docking/ERa-coumestrol/analisis_hasil/replication_$i cd Docking/ERa-coumestrol/analisis_hasil/replication_$i cp ~/Documents/work/rmsd_cou/rmsd.pml . cp ~/Documents/work/rmsd_cou/ref.pdb . for j in $(seq 1 1000); do cp ../../../ERa-coumestrol/replication_$i/dock_$j/nohead.csv . awk '{if (substr($4,103,1)==1) print $0}' nohead.csv | awk '{print $1","$2","$3}' | sort -t, -k2n -k3rn | head -n1 > filter_chemplp.csv awk -F, '{print "babel -d -imol2 dock"$1" -opdb filtered.chemplppyplif.pdb"}' filter_chemplp.csv > temp.sh sed "s/dock/..\/..\/..\/ERa-coumestrol\/replication_$i\/dock_$j\//g" temp.sh > convert.sh chmod u+x convert.sh ./convert.sh rm temp* filter_chemplp.csv convert.sh mv filtered.chemplp-pyplif.pdb filter_chemplp_$j.pdb cp filter_chemplp_$j.pdb ligand.pdb pymol -c rmsd.pml | grep "Executive" | awk '{print $4}' > tmp echo "$j `cat tmp`" >> rmsd.filter_chemplp.csv rm tmp ligand.pdb done rm rmsd.pml ref.pdb cd ../../../../ done


Lampiran 12. Lampiran data statistik protokol Tc-PLIF filter tc=read.csv(filter_tc_gabung.csv) tcplif=tc$tc mean(tcplif) [1] 0.356 median(tcplif) [1] 0.417 Std.error(tcplif) [1] 0.003 tcstandard = rep (c(0.600), each=2943) var.test(tcplif,tcstandard) data: tcplif and tcstandard F = Inf, num df = 2942, denom df = 2943, p-value < 2.2e-16 alternative hypothesis: true ratio of variances is not equal to 1 95 percent confidence interval: Inf Inf sample estimates: ratio of variances Inf shapiro.test(tcplif) Shapiro-Wilk normality test data: tcplif W = 0.6301, p-value < 2.2e-16 wilcox.test(tcplif,tcstandard, alternative="less") Wilcoxon rank sum test with continuity correction data: tcplif and tcstandard W = 0, p-value < 2.2e-16 alternative hypothesis: true location shift is less than 0


BIOGRAFI PENULIS

Chandra Dewa Nata lahir di Cilacap pada tanggal 30 Mei 1993. Merupakan anak ketiga dari F.Soedarmadi dan F. Linawati. Riwayat pendidikan penulis yaitu TK Pius Sidareja, Cilacap kemudian melanjutkan ke SD Pius Sidareja, Cilacap selama 6 tahun. Setelah lulus SD penulis kemudian melanjutkan ke SMP Negeri 1 Sidareja, Cilacap selama 3 tahun. Setelah lulus SMP penulis melanjutkan sekolah di SMA Pangudi Luhur Van Lith, Muntilan selama 3 tahun barulah penulis melanjutkan studi di Fakultas Farmasi Universitas Sanata Dharna Yogyakarta. Dalam perkuliahan penulis pernah menjadi asisten praktikum Biokimia (2012), Analisis Farmasi (2013), dan Validasi Metode Analisis (2013).

PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

Recommend Documents