MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE

MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE Česká sbírka mikroorganismů (CCM) tel.: +420 549 491 430  fax +420 549 498 289 e-mail: [email protected]  http://www.sci.muni.cz/ccm

DOPORUČENÉ KONTROLNÍ KMENY PRO IDENTIFIKAČNÍ TESTY V KLINICKÉ MIKROBIOLOGII - Bakteriologie K ověření kvality identifikačních souprav a testů používaných v klinické mikrobiologii Česká sbírka mikroorganismů nabízí seznam vhodných testů a doporučených kontrolních kmenů. Forma dodání: želatinové disky nebo lyofilizáty 1 lahvička (= 20 disků, exspirace 1-2 roky) 1 lyofilizát

Cena (bez DPH): 910,- Kč 950,- Kč

Objednávky: CCM dodává kmeny na základě objednávky zaslané poštou, faxem nebo e-mailem. U faxové nebo e-mailové objednávky uveďte Vaše zákaznické číslo, které jste obdrželi z CCM na základě vyplněného "Zákaznického listu", který je ke stažení na www.sci.muni.cz/ccm. Zákaznické číslo je uvedeno na každém dodacím listu jako „Vaše ID“. Na objednávku zřetelně vyznačte, že objednáváte kultury na discích nebo lyofilizáty a jejich počet. Kmeny jsou dodávány ihned, v případě želatinových disků maximálně do 5-ti týdnů po obdržení objednávky. PŘEHLED POUŽÍVANÝCH TESTŮ PRO KLINICKOU BAKTERIOLOGII Test ANAEROtest 23 ATB – agardiluční metoda (anaeroby) ATB – disková difůzní metoda CLSI ATB – mikrodiluční metoda CLSI ATB – metody EUCAST Beta-glukuronidáza CAMP test Deaminace fenylalaninu Dekarboxylace lysinu Dekarboxylace ornitinu; Arginin dihydroláza ENTEROtest 24, ENTEROtest 24 N ENTERO-Rapid 24 E-test Fosfatáza Hydrolýza acetamidu Hydrolýza eskulinu Hydrolýza hippurátu Hydrolýza kaseinu Hydrolýza škrobu Hydrolýza želatiny Indol Kataláza King B médium (fluorescein) Koaguláza vázaná (clumping factor) Koaguláza volná KOH test Lecithináza (Egg-yolk agar) IP 127.01

Test Metyl-červeňový test NEFERMtest 24 N OF test ONPG Oxidace glukonátu Oxidáza Pohyblivost Protein A Pyrrolidonyl arylaminázový test (PYR) Redukce nitrátů Rezistence k bacitracinu H Rezistence k methicilinu (oxacilinu) Rezistence k novobiocinu Rezistence k optochinu Rezistence k vankomycinu (enterokoky – aminoglykosidy) Růst při různých teplotách Růst při 6,5 % NaCl Simmons citrát STAPHYtest 24 STREPTOtest 24 Triple Sugar Iron Agar (TSI) Urea Christensen Agar Utilizace acetamidu Utilizace malonátu Vibriostatické agens O/129 Voges-Proskauer test (acetoin) X a V faktor 1/9

Leucin aminopeptidázový test (LAP)

Žluč-eskulinový test

SEZNAM KMENŮ – identifikační testy Bakterie Acinetobacter lwoffii Aerococcus viridans Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila Bacillus cereus Bacillus coagulans Bacillus subtilis subsp. subtilis Bacteroides fragilis Bacteroides thetaiotaomicron Burkholderia sp. Clostridium perfringens Clostridium sordellii Cronobacter sakazakii Edwardsiella tarda Eggerthella lenta Enterobacter cloacae subsp. cloacae Enterococcus cecorum Enterococcus faecalis Enterococcus faecalis Enterococcus faecalis Enterococcus faecalis Enterococcus raffinosus Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Haemophilus haemoglobinophilus Haemophilus influenzae Haemophilus influenzae Haemophilus influenzae Haemophilus paraphrophilus Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae

CCM 5581 1914 7232 2010 2013 2216 4712 4713 3919 4435 4611 3461 2238 4714 1903 3659 1875 4224 4647 7000 4216 3954 3988 4225 6055 4456 4457 8432 6051 4985 2318 4415

ŽD Bakterie



   



          

Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kytococcus sedentarius Kytococcus sedentarius Lactobacillus rhamnosus Myroides odoratus Neisseria gonorhoeae Propionibacterium acnes Proteus hauseri Proteus sp. Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas fluorescens Salmonella enterica subsp. enterica sérovar Enteritidis

CCM

ŽD

5852 2699 2697 1828 3296 4500 3343 7011 1799 1960 3955 2115

      

4420



Salmonella enterica subsp. enterica sérovar Typhimurium

7205



Serratia marcescens subsp. marcescens Shigella flexneri Staphylococcus aureus subsp. aureus Staphylococcus aureus subsp. aureus Staphylococcus aureus subsp. aureus Staphylococcus epidermidis Staphylococcus epidermidis Staphylococcus gallinarum Staphylococcus pseudintermedius Staphylococcus lugdunensis Staphylococcus nepalensis Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus

303 4422 3953 4223 4750 2124 4418 3572 4710 4069 7046 883 883

    

Streptococcus agalactiae Streptococcus constellatus subsp. constellatus Streptococcus pneumoniae Streptococcus pyogenes Streptococcus sanguinis Vibrio fluvialis

6187 4043 4501 7418 4047 3689

  

    

Použitá literatura 

Garcia, L.S. 2010. Clinical Microbiology Procedures Handbook. Third Edition. Volume 1, Volume 3. ASM Press, Washington, D.C.



MacFaddin, J.F. 2000. Biochemical tests for identification of medical bacteria. Third edition. Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, USA.



Murray, P., Baron, J.E., Pfaller, M.A., Tenover, F.C., Yolken, R.H. 1999. Manual of Clinical Microbiology.

IP 127.01

2/9

7th Edition. ASM Press, Washington, D.C.

Základní identifikační testy (bakteriologie) Zkouška

Kontrolní kmeny

Kontrola kvality

ANAEROtest 23 Kmen L. rhamnosus C. sordellii P. acnes

CCM č. 1828 4611 3343

ATB – agardiluční metoda (anaeroby) Kmen B. fragilis B. thetaiotaomicron C. perfringens E. lentum

CCM č. 4712 4713 4435 4714

ATB – disková difůzní metoda CLSI Kmen E. coli E. coli S. aureus P. aeruginosa E. faecalis H. influenzae H. influenzae N. gonorhoeae S. pneumoniae

CCM č. 3954 4225 3953 3955 4224 4456 4457 4500 4501

ATB – mikrodiluční metoda CLSI Kmen E. coli E. coli P. aeruginosa S. aureus S.aureus E. faecalis E. faecalis H. influenzae H. influenzae S. pneumoniae K. pmeumoniae N. gonorhoeae

CCM č. 3954 4225 3955 4223 4750 4224 4647 4456 4457 4501 4985 4500

ATB –EUCAST – základní kontrola Kmen E. coli P. aeruginosa S. aureus E. faecalis S. pneumoniae H. influenzae C. jejun subsp. jejunii

IP 127.01

rozšířená kontrola CCM č. 3954 3955 4223 4224 4501 8432 6214

Kmen E. coli K. pmeumoniae E. faecalis H. influenzae

CCM č. 4225 4985 4647 4456

3/9

Zkouška

Kontrolní kmeny

Kontrola kvality

Beta-glukuronidáza Kmen E. coli K. pneumoniae

CCM č. 4225 4985

Reakce + -

Kmen S. agalactiae S. pyogenes S. pseudintermedius

CCM č. 6187 7418 4710

Reakce + základní kmen pro test

Kmen Proteus sp. E. coli

CCM č. 1799 3954

Reakce + -

Kmen K. pneumoniae E. cloacae

CCM č. 4985 1903

Reakce + -

Kmen E. cloacae K. pneumoniae

CCM č. 1903 4985

Reakce + -

Kmen S. marcescens Proteus sp. S. enterica E. cloacae

CCM č. 303 1799 4420 1903

CAMP test

Deaminace fenylalaninu

Dekarboxylace lysinu

Dekarboxylace ornitinu; Arginin dihydroláza

ENTEROtest 24

ENTEROtest 24 N (inovovaný) Kmen E. coli Proteus sp. S. enterica E. cloacae K. pneumoniae E. tarda

CCM č. 4225 1799 4420 1903 5852 2238

Kmen E. cloacae E. coli Proteus sp. S. marcescens

CCM č. 1903 3988 1799 303

ENTERO-Rapid 24

IP 127.01

4/9

Zkouška E-test

Kontrolní kmeny

Kontrola kvality

Kmen E. coli E. coli P. aeruginosa S. aureus E. faecalis E. faecalis H. influenzae H. influenzae N. gonorhoeae S. pneumoniae

CCM č. 3954 4225 3955 4223 4224 4647 4456 4457 4500 4501

Kmen S. aureus S. saprophyticus

CCM č. 3953 883

Reakce + -

Kmen P. aeruginosa P. fluorescens

CCM č. 1960 2115

Reakce + -

Kmen A. hydrophila P. aeruginosa

CCM č. 7232 3955

Reakce + -

Kmen S. agalactiae S. pyogenes

CCM č. 6187 7418

Reakce + -

Kmen B. subtilis E. coli

CCM č. 2216 4225

Reakce + -

Kmen B. subtilis E. coli

CCM č. 2216 4225

Reakce + -

Kmen P. aeruginosa E. coli

CCM č. 1960 3954

Reakce + -

Kmen E. coli P. aeruginosa

CCM č. 3954 3955

Reakce + -

Kmen S. aureus S. pyogenes

CCM č. 3953 7418

Reakce + -

Fosfatáza

Hydrolýza acetamidu

Hydrolýza eskulinu

Hydrolýza hippurátu

Hydrolýza kaseinu

Hydrolýza škrobu

Hydrolýza želatiny

Indol

Kataláza

IP 127.01

5/9

Zkouška

Kontrolní kmeny

Kontrola kvality

King B médium (fluorescein) CCM č. 3955 3954

Reakce + -

Kmen S. aureus S. epidermidis

CCM č. 3953 2124

Reakce + -

Kmen S. aureus S. epidermidis

CCM č. 3953 2124

Reakce + -

Kmen E. coli S. aureus

CCM č. 3988 3953

Reakce + -

CCM č. 2010 3954

Reakce + -

Kmen E. faecalis A. viridans

CCM č. 4224 1914

Reakce + -

Kmen E. coli K. pneumoniae

CCM č. 3954 2318

Reakce + -

Kmen P. aeruginosa M. odoratus Burkholderia sp. C. sakazakii

CCM č. 1960 3296 3919 3461

Kmen K. pneumoniae P. aeruginosa A. lwoffii

CCM č. 4415 3955 5581

Fermentace glukózy + -

Kmen E. coli Proteus sp.

CCM č. 3954 1799

Reakce + -

Kmen P. aeruginosa E. coli

Koaguláza vázaná (clumping factor)

Koaguláza volná

KOH test

Lecithináza (Egg-yolk agar) Kmen B. cereus E. coli

Leucin aminopeptidázový test (LAP)

Metyl-červeňový test

NEFERMtest 24 N

OF test Oxidace glukózy + + -

ONPG

IP 127.01

6/9

Médium

Kontrolní kmeny

Kontrola kvality

Oxidace glukonátu Kmen P. aeruginosa E. coli

CCM č. 1960 4225

Reakce + -

Kmen P. aeruginosa E. coli

CCM č. 3955 3954

Reakce + -

Kmen E. coli S. aureus

CCM č. 3954 3953

Reakce + -

Kmen S. aureus S. epidermidis

CCM č. 3953 2124

Reakce + -

Kmen E. faecalis S. agalactiae

CCM č. 7000 6187

Reakce + -

Kmen P. aeruginosa E. coli A. lwoffii

CCM č. 3955 3954 5581

Reakce + + -

Kmen S. pyogenes H. influenzae

CCM č. 7418 4457

Vlastnost citlivý rezistentní

Kmen S. aureus S. aureus

CCM č. 4750 4223

Vlastnost rezistentní citlivý

Kmen S. saprophyticus S. aureus

CCM č. 883 3953

Kmen S. pneumoniae S. constellatus

CCM č. 4501 4043

Oxidáza

Pohyblivost

Protein A

Pyrrolidonyl arylaminázový test (PYR)

Redukce nitrátů

Rezistence k bacitracinu H

Rezistence k methicilinu (oxacilinu)

Rezistence k novobiocinu Vlastnost rezistentní citlivý

Rezistence k optochinu Vlastnost rezistentní citlivý

Rezistence k vankomycinu (enterokoky – aminoglykosidy) Kmen E. faecalis E. faecalis IP 127.01

CCM č. 4224 4647

citlivý rezistentní 7/9

Zkouška

Kontrolní kmeny

Kontrola kvality

Růst při různých teplotách Kmen B. coagulans P. aeruginosa P. fluorescens

CCM č. 2013 1960 2115

Vlastnost růst při 56 °C růst při 37 i 42 °C růst při 5 °C

Kmen E. faecalis S. sanguinis

CCM č. 4224 4047

Růst + -

Kmen E. cloacae E. coli

CCM č. 1903 3954

Reakce + -

Kmen S. epidermidis S. gallinarum S. lugdunensis S. nepalensis S. sciuri. K. sedentarius

CCM č. 4418 3572 4069 7046 4657 2699

Kmen E. cecorum E. raffinosus S. sanguinis E. faecalis K. sedentarius

CCM č. 3659 4216 4047 1875 2699

Růst při 6,5 % NaCl

Simmons citrát

STAPHYtest 24

STREPTOtest 24

Triple Sugar Iron Agar (TSI) Kmen E. coli S. enterica S. flexneri P. aeruginosa

CCM č.

Růst

ŠA

Vpich

Plyn

H2S

3954 4420 4422 3955

+ + + +

+ -

+ + + -

+ + -

+ -

* šikmý agar

Urea Christensen Agar Kmen E. coli P. hauseri S. enterica

CCM č. 3954 7011 7205

Růst + + +

Kmen P. aeruginosa E. coli

CCM č. 3955 3954

Reakce + -

Barva + (červená) -

Utilizace acetamidu

IP 127.01

8/9

Zkouška

Kontrolní kmeny

Kontrola kvality

Utilizace malonátu Kmen K. pneumoniae E. coli

CCM č. 4985 3954 7798

Reakce + -

Kmen A. hydrophila V. fluvialis

CCM č. 7232 3689

Vlastnost rezistentní citlivý

Kmen K. pneumoniae E. coli

CCM č. 4415 3954

Reakce + -

Kmen H. haemoglobinophilus H. paraphrophilus

CCM č. 6055 6051

Kmen E. faecalis S. sanguinis

CCM č. 4224 4047

Vibriostatické agens O/129

Voges-Proskauer test (acetoin)

X a V faktor Vlastnost vyžaduje pouze X faktor vyžaduje pouze V faktor

Žluč-eskulinový test

Dotazy: [email protected] Objednávky: [email protected]

IP 127.01

Růst + -

Brno 2/2015

9/9