STUDIEGIDS LEVENS- EN A ARDWETENSCHAPPEN B IOLOGIE B IOMEDISCHE WETENSCHAPPEN P SYCHOBIOLOGIE

Publicatie 1.book Page i Friday, July 14, 2006 4:11 PM

FACULTEIT DER NATUURWETENSCHAPPEN, WI S K U N D E E N I N F O R M A T I C A

STUDIEGIDS LEVENS- EN AARDWETENSCHAPPEN 2006-2007

F A C U L T E I T D E R NA T U U R W E T E N S C H A P P E N , W I S K U N D E E N I N F O R M A T I C A

StudiegidsLev ns-enAardwetnschapen206-207 A A R D W E T E N S C H A P P E N BI O L O G I E B I O M E D I S C H E W E T E N S C H A P P E N P S Y C H O B I O L O G I E

AARDWETENSCHAPPEN BIOLOGIE BIOMEDISCHE WETENSCHAPPEN PSYCHOBIOLOGIE

Publicatie 1.book Page ii Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Publicatie 1.book Page i Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Voorwoord

Voorwoord Voor u ligt de studiegids voor de Bacheloropleidingen Aardwetenschappen, Biologie, Bio-medische Wetenschappen en Psychobiologie. Deze gids is tevens onderdeel van het wettelijk verplichte Studentenstatuut. Het algemene deel van het Studentenstatuut (het “Studentenhandboek”) is te raadplegen op de UvA-website http://www.student.uva.nl/studentenhandboek ; het opleidingsspecifieke deel van het Studentenstatuut is deze Studiegids, die ook te vinden is op www.studiegids.uva.nl. Om de curricula aan te passen aan de universitaire 8-8-4 systematiek (cursussen van 8, 8 en 4 weken) is in het studiejaar 2006 – 2007 e.e.a. gewijzigd: Bij de Bacheloropleiding Aardwetenschappen is het curriculum voor 1e, 2e en 3e jaar per september 2006 aangepast aan de nieuwe systematiek. Voor de Bachelors Biologie, Bio-medische Wetenschappen en Psychobiologie is het 1e studiejaar niet alleen aangepast aan het 8-8-4 systeem, maar ook inhoudelijk ingrijpend gewijzigd; de indeling van 2e en 3e jaar is ongewijzigd gebleven. Dit betekent bijvoorbeeld, dat vakken die vroeger bijv. 7 weken duurden, nu 8 weken gaan duren of omgekeerd, of dat bepaalde vakken niet langer worden gegeven of vervangen zijn door andere vakken. Studenten uit het “oude” curriculum die vakken moeten inhalen of herkansen vinden in deze gids welke herkansmogelijkheden er zijn. De onderwijsherziening is een immense operatie. Dit betekent ook dat bij het ter perse gaan van de voorliggende Studiegids op een aantal punten nog onduidelijkheid over details kan hebben bestaan. In dat geval vindt u een vermelding als “wordt nader vastgesteld” of “opgave studiestof volgt”. Deze verdere details zullen zo snel mogelijk op de website worden aangevuld/aangepast. De Studiegids nodigt i.h.a. niet uit om eens lekker te lezen, maar het is zinnig om bij het begin van het jaar toch eens de vakbeschrijvingen voor het voor u geldende studiejaar te bekijken. Ook bevat de Studiegids alle relevante adressen, telefoonnummers en E-mail van betrokkenen bij het onderwijs. Bij onduidelijkheden: raadpleeg eerst de Studiegids! Dr C. de Groot Directeur Onderwijsinstituut Levens- en Aardwetenschappen

i

Publicatie 1.book Page ii Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Voorwoord

ii

Publicatie 1.book Page iii Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Voorwoord

Legenda Wetenschaps- en Technologiecentrum Watergraafsmeer (WTCW); Anna's Hoeve Locatie Kruislaan 314

Gebouw IV

kantine grote collegezaal K.008 bibliotheek CONGO-kamer

Kruislaan 316

Gebouw III

practicumzalen 1.04, 1.06 en 1.10 collegezaal 1.02 computergebruikersruimte I (zaal 2.02) computergebruikersruimte II (zaal 2.04)

Kruislaan 318

Gebouw I

centrale hal, informatie voor studenten

A-vleugel

computergebruikersruimte III (zaal 0.14) computergebruikersruimte IV (zaal 0.12) computergebruikersruimte V (zaal 0.12a) opleidingscoördinatoren secretariaat onderwijsbureau onderwijsbalie directeur opleidingen studieadviseurs

C-vleugel

collegezalen CK06, C005, secretariaat IBED, practicumzaal C108

Kruislaan 320

Gebouw II

collegezalen 1.04 en 2.15, secretariaat SILS

Kruislaan 404

Matrix IV

bestuur faculteit decaan International Office AMSTEL-instituut Studio Classroom portier

Kruislaan 413

CWI

collegezalen Z011 en Z010

iii

Publicatie 1.book Page iv Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Voorwoord

Bereikbaarheid met het openbaar vervoer (maandag t/m vrijdag) Buslijn 40: Amsterdam Amstelstation - Muiderpoortstation, halte Kruislaan 400 Uren

04 05 06 07 08 09 10 11 12

13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 00

maanda g t/m vrijdag

15 45

00 10 20 30 40 50

00 15 30 45

00 15 30 45

00 15 30 45

00 10 20 30 40 50

00 10 20 30 40 50

00 10 20 30 40 50

00 10 20 30 40 50

00 15 30 45

00 15 30 45

00 15 30 45

15 15 15 45 45 45

15 45

15 15 45

zaterda g

45

15 15 00 45 45 15 30 45

00 15 30 45

00 15 30 45

00 15 30 45

00 15 30 45

00 15 30 45

00 15 30 45

00 15 30 45

00 15 15 45 30 45

15 15 15 45 45 45

15 45

15 15 45

15 15 15 15 45 45 45 45

15 45

15 45

15 15 45 45

15 45

15 15 15 45 45 45

15 15 15 45 45 45

15 45

15 15 45

zondag

00 10 20 30 40 50

Buslijn 40: Muiderpoortstation - Amsterdam Amstelstation, halte Kruislaan 400 Uren

04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 00

maanda g t/m vrijdag

05 35 50

05 20 32 42 52

05 20 35 50

05 20 35 50

05 20 35 50

02 12 22 32 42 52

02 12 22 32 42 52

02 12 22 32 42 52

02 12 22 32 42 52

07 22 37 52

07 22 37 52

07 08 08 22 38 38 38

08 08 08 38 38 38

08

zaterda g

38

08 08 06 38 38 21 36 51

06 21 36 51

06 21 36 51

06 21 36 51

06 21 36 51

06 21 36 51

06 21 36 51

06 21 36 51

06 21 36 51

08 08 08 38 38 38

08 08 08 38 38 38

08

38 08 08 08 38 38 38

08 38

08 08 38 38

08 38

08 08 38 38

08 38

08 08 08 38 38 38

08 08 08 38 38 38

08

zondag

02 12 22 32 42 52

Vanaf Station Amsterdam CS: met de metro naar station Amsterdam Amstel. Vandaar: zie boven. Een alternatief is vanaf station CS tram 9 naar het kruispunt Middenweg / Kruislaan (ca. 30 min.) en vandaar lopend over de Kruislaan (ca. 1 km, 15 minuten). Bereikbaarheid met de auto Alle autowegen naar Amsterdam komen uit op de ringweg rond Amsterdam: de ring (A10). Vanuit de richting Amersfoort: ring nemen richting Utrecht/Den Haag. Vanuit de richting Utrecht/Den Haag/Schiphol/Haarlem of Zaandam: ring nemen richting Amersfoort. Op de ring de afslag 'Watergraafsmeer/S113' (ring Oost) nemen, aan het eind van de afrit borden 'Watergraafsmeer' Science Park blijven volgen. U komt dan op de Kruislaan; onder tunnel door, aan het eind van deze weg ligt aan de rechterkant Anna's Hoeve. Op het terrein is gelegenheid tot parkeren.

iv

Publicatie 1.book Page v Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Voorwoord

v

Publicatie 1.book Page vi Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Voorwoord

Legenda Roeterseilandcomplex (REC) Locatie A. Roeterstraat 15

collegezalencomplex A opleiding Psychologie

B. Nieuwe Achtergracht 166

opleiding Scheikunde en Aardwetenschappen onderwijsbureau Scheikunde en Aardwetenschappen Instituut voor Biodiversiteit en Ecosysteem Dynamica Van ’t Hoff Instituut voor Moleculaire Wetenschappen (voormalig ITS – Instituut voor Technische Scheikunde) collegezalencomplex B

C. Nieuwe Achtergracht 127

Instituut voor Biodiversiteit en Ecosysteem Dynamica collegezalencomplex C Swammerdam Instituut voor Life Sciences

D. Nieuwe Achtergracht 129

Van ’t Hoff Instituut voor Moleculaire Wetenschappen (voormalig IMC – Instituut voor Moleculaire Chemie) Didactiek der Scheikunde collegezalencomplex D

E/H. Roetersstraat 11

Mensa Agora Café Krater Opleiding Economie

G. Nieuwe Prinsengracht 130

collegezalencomplex G

I. Nieuwe Achtergracht 170

opleiding Natuurkunde

J/K. Valckenierstraat 65 - 67

opleiding Natuurkunde

M. Plantage Muidergracht 12

Swammerdam Instituut voor Life Sciences collegezalencomplex MC en M

N. Plantage Muidergracht 14

Administratief Centrum

P. Plantage Muidergracht 22

opleiding Natuurkunde opleiding Sterrenkunde opleiding Wiskunde opleiding Informatica onderwijsbureau Natuurkunde, Sterrenkunde, Wiskunde en Informatica

Bereikbaarheid met openbaar vervoer Metro: alle lijnen, halte Weesperplein, uitgang Sarphatistraat – Roeterstraat Tram: lijn 6, halte Roeterstraat; lijn 7 en 10, halte ‘s Gravensandestraat; lijn 9 en 14, halte Plantage Middenlaan Bereikbaar met de auto Volg de Ring Amsterdam (A10); Neem afslag S114 (richting Zeeburg, Centrum, Artis); Ga linksaf na de afrit. U volgt de weg door de Piet Heintunnel; Ga na de Piet Heintunnel linksaf (Panamaweg); Blijf de weg volgen en ga rechts bij de T-splitsing; Sla rechtsaf bij het bord Artis; U bent nu op de Plantage middenlaan; Ga rechtdoor en sla linksaf bij de

vi

Publicatie 1.book Page vii Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Voorwoord

verkeerslichten; U bent nu op de Plantage Kerklaan; Rijd rechtdoor de brug over en u ziet de faculteit in de witte gebouwen aan uw linkerhand. Vervoer met de auto wordt sterk afgeraden, in verband met de parkeerkosten. Het Roeterseilandcomplex is met het openbaar vervoer goed te bereiken. Roeters Eiland Complex (REC) De gebouwen op het Roeterseiland zijn overdag vrij toegankelijk. Na 18.00 uur moet je over een speciale avondpas beschikken om het gebouw in te kunnen komen; deze is verkrijgbaar via de Facilitheek. Terrein Biologisch Centrum (Anna’s Hoeve) Het hek dat toegang geeft tot het terrein Anna’s Hoeve is op werkdagen geopend van 07:00 tot 18:30 uur. Buiten openingstijden is een cardkey nodig. Openingstijden gebouwen: op werkdagen van 07:30 tot 17:15 uur. Buiten openingstijden gebouwen verlaten is mogelijk zonder cardkey. Om binnen te komen heeft men een cardkey nodig.

vii

Publicatie 1.book Page viii Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Voorwoord

viii

Publicatie 1.book Page ix Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Inhoudsopgave

Inhoudsopgave Voorwoord 1 Deel 1: Algemene informatie Algemene informatie UvA en FNWI Algemene studiezaken Algemene studiefaciliteiten en praktische zaken Contactindex

2 Deel 2: Bachelor Aardwetenschappen De Bacheloropleiding Structuur van de opleiding Onderwijs en studentzaken Doorstromen naar een Masteropleiding Blokkenschema's Cursusbeschrijvingen

3 Deel 3: Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie De Bacheloropleidingen Structuur van de opleiding Onderwijs en Studentzaken Doorstromen naar de Masteropleidingen Cursusbeschrijvingen Bijlage

i 1 5 13 17 33

39 43 47 51 69 75 77

139 143 145 151 163 169 301

4 Cursusindex

311

5 Trefwoordenlijst

315

ix

Publicatie 1.book Page x Friday, July 14, 2006 4:11 PM

Inhoudsopgave

x

Publicatie 1.book Page 1 Friday, July 14, 2006 4:11 PM

D E E L 1: A L G E M E N E I N F O R M A T I E

D E E L 1: A L G EM E N E I N F O R M A T I E

Algemene informatie



Inhoudsopgave 1

Algemene informatie UvA en FNWI 1.1 1.2 1.2.1 1.2.2 1.2.3 1.2.4 1.2.5 1.2.6 1.2.7

2

3

Universiteit van Amsterdam Faculteit der Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica (FNWI) Bestuur Medezeggenschap van studenten Onderwijsorganisatie Onderzoeksorganisatie Onderzoeksinstituten Levens- en Aardwetenschappen Leerstoelen Levens- en Aardwetenschappen Bereikbaarheid leerstoelgroepen

5 5 5 6 6 7 7 8 8 11

Algemene studiezaken

13

2.1 2.2 2.3 2.4 2.5 2.6 2.7 2.8 2.9

13 13 13 14 14 14 15 15 15

Studentenstatuut en de OER Studiepunten, studielast, cursusduur Beoordeling zak/slaagregeling Geldigheidsduur deelcijfers Evaluatie van het onderwijs Adreswijzigingen Studieonderbreking en herinschrijving na studieonderbreking Studiestop Dossierverklaring

Algemene studiefaciliteiten en praktische zaken

17

3.1 3.1.1 3.1.2 3.1.3 3.2 3.2.1 3.2.2 3.2.3 3.2.4 3.2.5 3.2.6 3.3 3.4 3.4.1 3.5 3.6 3.7 3.8 3.8.1

17 17 17 18 18 18 18 19 19 20 20 23 23 23 24 24 24 25 25

Faciliteiten Bibliotheek Facultaire computerfaciliteiten en studiecentra ICT diensten Informatievoorziening Algemeen Studentenhandboek Websites van de verschillende bacheloropleidingen UvA Blackboard Universiteitsblad Folia Studenten Services (StS) Kosten studie Financiele ondersteuning Veldwerk financiering Inrichting werkplekken Rechtsbescherming en klachtenregelingen Honoursprogramma Cursussen volgen buiten de FNWI Cursussen elders volgen

3

Algemene informatie

Inhoudsopgave


Inhoudsopgave

3.9 3.9.1 3.9.2 3.9.3 3.9.4 3.9.5 3.9.6 3.10

4

4

Studeren in het buitenland Uitwisselingsprogramma's Erkenning van studiepunten Beurzen Voorlichting Informatie Vaccinaties bij verblijf in het buitenland Verzekeringen en veiligheid

26 26 26 27 27 27 28 28

Contactindex

33

4.1 4.2

33 37

Docenten Onderwijsinstituut


Algemene informatie UvA en FNWI

1.1

Algemen informatie

Universiteit van Amsterdam

De opleidingen Aardwetenschappen, Biologie, Bio-medische wetenschappen en Psychobiologie maken deel uit van het onderwijsaanbod van de Universiteit van Amsterdam (UvA). In totaal worden aan de UvA ruim 60 bacheloropleidingen verzorgd. Deze zijn verdeeld over zeven faculteiten: ■ ■

■ ■ ■

■ ■

Faculteit der Economie en Bedrijfskunde (FEB) Faculteit der Geesteswetenschappen (FGW) Faculteit der Geneeskunde (FdG), Faculteit der Maatschappij- en Gedragswetenschappen (FMG) Faculteit der Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica (FNWI) Faculteit der Rechtsgeleerdheid (FdR) Faculteit der Tandheelkunde (ACTA)

Het bestuur van de universiteit is gevestigd in het Maagdenhuis op het Spui. Er wordt onderwijs gegeven op 36 locaties, verspreid over de hele stad. De meeste collegezalen bevinden zich op de grote locaties, zoals het Binnengasthuisterrein, de Oudemanhuispoort, het Roeterseiland Complex, de Watergraafsmeer (Anna’s Hoeve), het Academisch Medisch Centrum en de Letterengebouwen aan de Spuistraat. Het onderwijs wordt gegeven door universitair docenten, hoofddocenten en hoogleraren, en soms ook door tijdelijk medewerkers als assistenten-in-opleiding (aio’s) en studentassistenten. Voor bijna alle docenten die aan de universiteit verbonden zijn geldt dat ze behalve onderwijs geven ook wetenschappelijk onderzoek verrichten. Meer informatie over de Universiteit van Amsterdam is te vinden op http://www.uva.nl. Voor gedetailleerde informatie over voorzieningen en regelingen die voor de hele universiteit geldig zijn, wordt in deze studiegids ook verwezen naar het studentenhandboek: http://www.uva.nl/studentenhandboek.

1.2

Faculteit der Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica (FNWI)

De opleidingen Aardwetenschappen, Biologie, Biomedische wetenschappen, en Psychobiologie worden verzorgd door de Faculteit der Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica (FNWI). Deze faculteit verzorgt elf bachelor opleidingen. De FNWI heeft tien onderzoeksinstituten, drie onderwijsinstituten en een aantal algemene diensten.

5

Algemene informatie

1 Algemene informatie UvA en FNWI



1.2.1

Bestuur

De faculteit staat onder leiding van een decaan, prof. dr. K.J.F. Gaemers. De decaan houdt zich in de eerste plaats bezig met bestuurlijke zaken. Zo spreekt hij regelmatig met het College van Bestuur van de universiteit en met de Studentenraad van de faculteit over belangrijke veranderingen in de organisatie van het onderwijs. Het onderwijs en onderzoek dat door de FNWI wordt verzorgd kan op grond van wetenschappelijke verwantschap in enkele grote wetenschapsgebieden worden onderverdeeld. Deze wetenschapsgebieden zijn ondergebracht in vier afdelingen. De afdelingsvoorzitters adviseren de decaan inzake het strategisch onderwijs- en onderzoekbeleid en hebben een toezichthoudende rol ten aanzien van het HRM-beleid. De afdelingsvoorzitter voor Biologie en Fysische Geografie is prof. dr. M. Joëls. 1.2.2

Medezeggenschap van studenten

Aan de UvA hebben studenten en docenten elk hun eigen medezeggenschapsorganen. De medezeggenschap van studenten over de organisatie en het bestuur van het onderwijs is geregeld op drie niveau’s, te weten de opleidingscommissies (OC’s), de Facultaire Studentenraad (FSR) en de Centrale Studentenraad (CSR). Opleidingscommissie Iedere opleiding heeft een opleidingscommissie (OC), die advies geeft over het onderwijsprogramma. In deze commissie zitten zowel docenten als studenten. Voor meer informatie over de opleidingscommissie Aardwetenschappen, Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie zie paragraaf 3.3.2 in het opleidingsspecifieke deel van deze studiegids. Facultaire Studentenraad De medezeggenschap van studenten op de faculteit is geregeld via de Facultaire Studentenraad (FSR). De FSR geeft advies aan het bestuur van de faculteit en voert eens per drie weken overleg met de decaan. De FSR houdt zich bijvoorbeeld bezig met de verhuizing van de faculteit naar de Watergraafsmeer en signaleert knelpunten in het onderwijs. Verder kan je er ook terecht voor problemen die je tijdens je studie tegenkomt. De raad probeert je dan te helpen of verwijst je door. In de FSR zitten 12 studenten van verschillende opleidingen van de faculteit. De studenten worden eens per jaar democratisch gekozen. Iedere student kan zich voor de verkiezingen kandidaat stellen. Meer informatie over de FSR kun je vinden op http://www.science.uva.nl/studentenraad. Contact opnemen kun je via email: [email protected] of telefoonnummer: 020-525 5878. De Centrale Studentenraad De Centrale Studentenraad (CSR) is het hoogste inspraakorgaan voor studenten binnen de

6



1.2.3

Onderwijsorganisatie

Bij de Faculteit der Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica is de decaan verantwoordelijk voor het onderwijsbeleid. De decaan wordt voor het terrein onderwijs ondersteund door het hoofd onderwijs Academische Zaken. De onderwijsorganisatie kent drie onderwijsinstituten: ■

Levens- en Aardwetenschappen voor de opleidingen Aardwetenschappen, Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie: Onderwijsdirecteur: dr. C. de Groot Exacte Wetenschappen voor de opleidingen Bio-exact, Natuur-en Sterrenkunde, Scheikunde en Wiskunde; Onderwijsdirecteur: prof. dr. Ch. G. van Weert Informatiewetenschappen voor de opleidingen Informatiekunde, Informatica en Kunstmatige Intelligentie. Onderwijsdirecteur: prof. dr. J.A. Bergstra ■

■

■ ■

■

Dit laatste onderwijsinstituut is een interfacultair instituut waarvan de FNWI penvoerder is. Elk instituut heeft een onderwijsdirecteur die verantwoordelijk is voor de verzorging van de opleidingen en heeft een onderwijsbureau. De sector onderwijs van de dienst Academische Zaken zorgt voor de beleidsondersteuning en bedrijfsvoering van de onderwijsorganisatie. Voorts is het AMSTEL Instituut ondergebracht binnen de onderwijsorganisatie. Dit instituut heeft een taak op het gebied van didactisch onderzoek en onderwijstechnologie. 1.2.4

Onderzoeksorganisatie

Bij de Faculteit der Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica is de decaan verantwoordelijk voor het onderzoeksbeleid. De decaan wordt hierbij ondersteund door het hoofd onderzoek Academische Zaken. Elk van de tien onderzoeksinstituten voert zijn eigen wetenschappelijk onderzoeksprogramma uit, dat eens in de vier of vijf jaar opnieuw wordt vastgelegd. Daarnaast voeren instituten onderzoeksopdrachten uit van externe instanties, zoals de Nederlandse organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek (NWO), ministeries, de Europese Unie en bedrijven. Ieder onderzoeksprogramma en -project staat

7

Algemene informatie

UvA. De veertien leden van de CSR worden jaarlijks verkozen door degenen die stemmen van de ongeveer 22.000 studenten van de UvA. Elk jaar wordt er een nieuwe CSR gekozen. De bedoeling is dat er van elke faculteit twee studenten in de CSR plaatsnemen. Door overleg te voeren met het College van Bestuur van de UvA vertegenwoordigt de CSR de studenten van de UvA. In grote lijnen heeft de studentenraad twee belangrijke rechten: het instemmingsrecht en het recht om zowel gevraagd als ongevraagd advies te geven. Meer informatie over de CSR is te vinden op http://www.uva.nl/csr.



onder leiding van een hoogleraar. Bij de faculteit werken ongeveer 100 gewone hoogleraren (met doorgaans een voltijds aanstelling bij de universiteit) en 40 bijzondere hoogleraren (die voor doorgaans een dag in de week bij de universiteit gedetacheerd zijn). 1.2.5

Onderzoeksinstituten Levens- en Aardwetenschappen

Swammerdam Institute for Life Sciences (SILS) aandachtsgebieden: moleculaire biologie, moleculaire cytologie, fytopathologie, microbiologie, neurobiologie, plantenfysiologie, massaspectrometrie, biochemie, biofysica, bioinformatica directeur: dr. H.D. Veldhuis Instituut voor Biodiversiteit en Ecosysteem Dynamica (IBED) aandachtsgebieden: biodiversiteit en evolutie, geo-ecologie en dynamiek van ecosystemen directeur: prof. dr. P.H. van Tienderen De meeste instituten werken op grensgebieden van het onderzoek samen met andere instituten binnen of buiten de faculteit. In een aantal gevallen is daarvoor een aparte organisatie opgericht. Voorbeelden van dergelijke samenwerkingsverbanden zijn: ■

■ ■ ■

■ ■ ■

■

Amsterdam Centre for Computational Science Amsterdam Genomics Centre Cognitive Science Center Amsterdam Zoölogisch Museum Amsterdam Expertisecentrum voor Taxonomische Identificaties Nationaal Instituut voor Kernfysica en Hoge Energie Fysica Centre for Mathematics and Theoretical Physics Centrum voor Hoge Energie Astrofysica

Meer informatie over de onderzoeksinstituten van FNWI is te vinden op internet: http://www.science.uva.nl/onderzoek, klik op ‘onderzoekinstituten’. 1.2.6

Leerstoelen Levens- en Aardwetenschappen

De faculteit kent gewone, deeltijd en bijzondere leerstoelen. Bijzondere leerstoelen worden ingesteld en gefinancierd door een buitenuniversitaire instelling. Hieronder volgt een overzicht van de gewone en de bijzondere hoogleraren die actief zijn in het onderwijs. LeerstoelgroepenIBED ■ ■

■ ■

8

Aquatische Ecologie en Ecotoxicologie: Prof. dr. W. Admiraal Experimentele plantensystematiek: Prof. dr. P.H.van Tienderen Evolutiebiologie: Prof. dr. S.B.J. Menken Fysische Geografie i.h.b. processen in bodem en landschap: Prof. dr. J.M. Verstraten



■

■ ■

■ ■ ■

Algemene informatie

■

Paleoecologie en Landschapsecologie: Prof. dr. H. Hooghiemstra Populatiebiologie: Prof. dr. M.W. Sabelis Systematische en Geografische Dierkunde: Prof. dr. M. Veith Milieukunde : Prof. dr. L. Reijnders Theoretische Ecologie: Prof. dr. A.M. de Roos Aquatische Microbiële Ecologie: Prof. dr. J. Huisman Computational Bio-and Physical Geography: Prof. dr. W. Bouten

Bijzonder hoogleraren IBED ■

Vanwege de Maatschappij voor Wetenschappelijk Onderzoek in de Tropen (TREUB Maatschappij): Prof. dr. R.P.M. Bak: leerstoel Tropische Mariene Biologie Vanwege de Stichting Centraal Bureau voor de Schimmelcultures: Prof. dr. G.S. de Hoog: leerstoel Mycologie Vanwege het RIKZ: Prof. dr. R.W.P. Laane: leerstoel Marine Bio-geochemie Vanwege Stichting het Kronendak: Prof. dr. J.H.D. Wolf: leerstoel Fyllosfeerwetenschappen ■

■

■ ■

■

■

■

Hoogleraren SILS ■ ■

■ ■ ■

■ ■

■

■

■ ■ ■

■ ■ ■

Prof. dr. R.C. Aalberse: leerstoel Biologische Immunologie Dr. T.M. Breit: Micro Array Division and Bioinformatics Prof. dr. S. Brul: leerstoel Molecular Biology and Microbial Food Safety Prof. dr. B.J.C. Cornelissen: leerstoel Fytopathologie Prof. dr. R. van Driel: leerstoel Structure and Functional Organisation of the Cell Nucleus Prof. dr. Th. W.J. Gadella: Molecular Cytology Prof. dr. M.A. Haring: leerstoel Plantenfysiologie Prof. dr. K.J. Hellingwerf: leerstoel Molecular Microbial Physiology (incl. Biocatalysis) Prof. dr. M. Joëls: leerstoel Hormonal Regulation of Signal Transduction in the Brain Prof. dr. C.G. de Koster: leerstoel Mass Spectrometry of Biomacromolecules Prof. dr. A.P. Otte: leerstoel Epigenetic Regulation of Gene Expression Prof. dr. C.H.A. Pennartz: leerstoel Cognitive Physiology Prof. dr. A. Smilde: leerstoel Biosystems Data Analysis Prof. dr. W.J. Wadman: leerstoel Moleculaire en Cellulaire Neurobiologie Prof. dr. J. Wells: Cellular microbiology

Bijzonder hoogleraren SILS ■

Vanwege de Stichting tot bevordering van de Atoom- en Molecuulfysica: Prof. dr. J.J. Boon: leerstoel Moleculaire Paleobotanie ■

9



■

Vanwege de Stichting leerstoel C.H. van den Houtenfonds: Prof. dr. C.G. Kruse: leerstoel Geneesmiddelenonderzoek Vanwege het Nederlands Kanker Fonds: Prof. dr. J. Borst: leerstoel Experimentele Oncologie Vanwege Stichting Socrates: Prof. dr. J. Braeckman: leerstoel Filosofie en ethiek in de levenswetenschappen vanuit humanistisch perspectief Vanwege Stichting Beta Plus: Prof. dr. M.S. Oitzl: leerstoel Cognitieve Neurobiologie ■

■

■

■

■

■

■

10


Algemene informatie UvA en FNWI Algemene informatie

1.2.7

Bereikbaarheid leerstoelgroepen

Decaan

Telefoon

Fax

525 7864

-

Swammerdam Institute for Life Sciences (SILS) Moleculaire Cytologie (prof.dr Th.W. Gadella)

525 6327

-

Plantenfysiologie (prof. dr. M.A. Haring)

525 7931

525 7934

Fytopathologie (prof. dr. B.J.C. Cornelissen)

525 7931

525 7934

Dierfysiologie (prof. dr. C.M.A. Pennartz)

525 7638

525 7709

Algemene Dierkunde (prof. dr. M. Joëls)

525 7638

525 7709

Mol. en Cel. Neurobiologie (prof. dr. W.J. Wadman)

525 7638

525 7709

Structuur en Functionele Organisatie van de Cel Nucleus (prof. dr. R. van 525 6327 Driel

525 7934

Instituut voor Biodiversiteit en Ecosysteemdynamica (IBED) Paleoecologie en Landschapsecologie (prof. dr. H. Hooghiemstra)

525 7844/ 7193/7903

525 7832

Evolutiebiologie (prof. dr. S.B.J. Menken)

525 7903/ 7844/7193

525 7832

Experimentele Plantensystematiek (Prof. Dr. P.H. van Tienderen)

525 7844/ 7193/7903

525 7832

Populatiebiologie (prof. dr. M.W. Sabelis)

525 7193/ 7844/7903

525 7754

Theoretische ecologie (prof. dr. A.M. de Roos)

525 7193/ 7844/7903

525 7754

Aquatische Ecologie en Ecotoxicologie (prof. dr. W. Admiraal)

525 7726/ 7193/7844

525 7754

Aquatische Microbiële Ecologie (prof. dr. J. Huisman)

525 6201

525 7064

Fysische Geografie, i.h.b. processen in bodem en landschap (Prof. dr. J.M. 525 7451 Verstraten)

525 7431

Computational Bio and Physical geography (Prof. dr. ir. W. Bouten)

525 7451

525 7431

Systematische en Geografische Dierkunde (prof. dr. M. Veith)

525 7903/ 7844/7193

525 7832

11



12



2.1

Algemen informatie

Studentenstatuut en de OER

Universiteiten zijn verplicht om jaarlijks een studentenstatuut uit te brengen. Dit is een beschrijving van de rechten en plichten van studenten. Het Studentenstatuut bestaat uit twee delen: een algemeen deel en een meer gedetailleerde uitwerking per opleiding: het Opleidingsstatuut. Het algemene deel van het statuut is opgenomen in het Studentenhandboek. Verder bevat het Studentenhandboek allerlei nuttige informatie over voorzieningen aan de UvA en wordt jaarlijks per september opnieuw vastgesteld door het College van Bestuur na instemming van de Centrale Studentenraad. Het studentenhandboek is elektronisch beschikbaar op http://www.student.uva.nl/studentenhandboek en ligt ter inzage bij het onderwijsbureau. Het Opleidingsstatuut bevat de reglementen, regelingen en afspraken die op facultair niveau gemaakt zijn. Het Opleidingsstatuut wordt jaarlijks in april/mei vastgesteld door de decaan van de faculteit, na instemming van de facultaire Studentenraad. De Onderwijs- en Examenregeling (O.E.R.) is in te zien op de website www.student.uva.nl onder documenten bij de betreffende opleiding. Beide delen van het statuut zijn niet alleen beschrijvend van aard, maar hebben ook een rechtscheppend karakter, dat wil zeggen dat ze gebruikt kunnen worden om nieuwe afspraken tussen universiteit en studenten of faculteit en studenten vast te leggen. 2.2

Studiepunten, studielast, cursusduur

Bij de programmering van universitaire studies wordt uitgegaan van een standaard studiebelasting. Onder studiebelasting wordt verstaan: de tijd die een student gemiddeld nodig heeft om een studieonderdeel, een studiefase of een gehele opleiding te doorlopen. De studiebelasting wordt uitgedrukt in studiepunten. Het aantal punten dat voor vakken en stages gehaald kan worden wordt uitgedrukt in EC ( European Credits = Europese studiepunten). Deze punten worden internationaal gebruikt en zijn uitwisselbaar. Eén EC staat gelijk aan een werkbelasting van 28 uur. Eén studiejaar omvat 60 EC. De bacheloropleidingen omvatten allen 180 EC. De doctoraalfase of masteropleidingen hebben een omvang van 120 EC. 2.3

Beoordeling zak/slaagregeling

Binnen een vak wordt een student beoordeeld op basis van deelcijfers. De weegfactoren van de deelcijfers zijn opgenomen in de vakkenbeschrijvingen. In de meeste gevallen wordt geen deelcijfer verstrekt voor een praktische oefening. In deze gevallen is deelname verplicht voor toelating tot de theoretische (deel-)toetsen die op de praktische oefening voortbouwen.

13

Algemene informatie

2 Algemene studiezaken



Het eindcijfer wordt bepaald door gewogen middeling van deelcijfers. Als regel geldt dat men voor het behalen van een vak een 6,0 of hoger als eindcijfer moet hebben behaald en geen der deelcijfers mag lager beoordeeld zijn dan 5,0. Deelcijfers die lager uitvallen dienen altijd te worden herkanst. 2.4

Geldigheidsduur deelcijfers

Eerste jaars vakken De resultaten van de deeltentamens vervallen als het gehele vak niet met een voldoende wordt afgerond. Tweede en derde jaars vakken Eenmaal behaalde deelcijfers blijven tot twee jaar na de datum van toekenning van het behaalde deelcijfer geldig. 2.5

Evaluatie van het onderwijs

Om de kwaliteit van het onderwijs te waarborgen evalueert de Opleidingscommissie de programma’s. De evaluatie is studieonderdeelgericht en wordt uitgevoerd aan de hand van een onderwijsinstituut gebonden evaluatiesysteem, eventueel aangevuld met een interactieve evaluatie. De vragen hebben onder andere betrekking op het aanvangsniveau van de cursus, de moeilijkheidsgraad van de stof, de hoeveelheid tijd die aan een studieonderdeel moet worden besteed, de manier waarop de docent onderwijs geeft, het tentamen en hoeveel de student heeft geleerd. De evaluaties worden besproken in de Opleidingscommissie en indien nodig adviseert de OC de onderwijsdirecteur tot het ondernemen van actie. Daarnaast vindt periodiek een evaluatie plaats van het gehele eerste jaar, alsmede een evaluatie van de gehele bachelor- en masteropleiding. De evaluatie van de onderzoeksprojecten vindt plaats bij de aanvraag van het masterexamen. Studenten die problemen ondervinden tijdens een onderzoekproject (stage) worden aangeraden zo spoedig mogelijk contact op te nemen met de studieadviseur. 2.6

Adreswijzigingen

Het is van belang dat je een adreswijziging zo spoedig mogelijk bekend maakt bij de studentenadministratie van de UvA. Je kunt je adres -bij voorkeur- zelf wijzigen via Studieweb (http://studieweb.student.uva.nl). Deze wijziging komt dan automatisch terecht bij SIC. Je kunt je adreswijziging echter ook doorgeven aan:

14



2.7

Studieonderbreking en herinschrijving na studieonderbreking

Tot uiterlijk zes weken voor aanvang van een cursus/vak kun je je via Studieweb voor een vak afmelden. Als je met je studie stopt, meld je dit bij de Onderwijsbalie èn bij Studenten Services (StS), Binnengasthuisstraat 9, 1012 ZA Amsterdam, telefoon: 020-525 8080. Voor het (tijdelijk) staken van de studie moet een afspraak met een Studentendecaan worden gemaakt (zie het Studentenhandboek, http://www.uva.nl/studentenhandboek). Studenten die hun studie na een onderbreking willen hervatten, kunnen herinschrijvingsformulieren verkrijgen bij het Service en Informatiecentrum (telefoon: 020-525 8080). Studenten dienen vóór herinschrijving toestemming te vragen bij de studieadviseur van de opleiding. 2.8

Studiestop

De inschrijving kan beëindigd worden op grond van afstuderen. Ook kunnen ziekte of bijzondere familieomstandigheden of een andere reden die door het College van Bestuur erkend wordt (opgenomen in het Inschrijvingsbesluit UvA) als beëindiginggrond gelden. De student die de studie blijvend staakt, moet de Onderwijsbalie en de studieadviseur hiervan op de hoogte stellen. Ook is de student verplicht een afspraak met de studentendecaan te maken. 2.9

Dossierverklaring

Wanneer een student de studie voortijdig staakt kan door de Examencommissie op verzoek een dossierverklaring opgesteld worden met vermelding van alle met goed gevolg afgelegde studieonderdelen.

15

Algemene informatie

Service en Informatiecentrum (SIC) Binnengasthuisstraat 9 1012 ZA Amsterdam Telefoon: 020-525 8080 Ben je lid van een commissie dan moet je het desbetreffende secretariaat apart van je verhuizing op de hoogte brengen. Vergeet ook niet de Informatie Beheer Groep te informeren.



16



3.1 3.1.1

Algemen informatie

Faciliteiten Bibliotheek

De Universiteit van Amsterdam heeft een centrale bibliotheek (de universiteitsbibliotheek) aan de Singel en verscheidene faculteitsbibliotheken. Uitleen van boeken bij deze bibliotheken is voor UvA-studenten mogelijk op vertoon van hun collegekaart. Andere bezoekers kunnen een lenerspas aanvragen bij de verschillende balies. De uitleentermijn voor boeken is één maand. Verlenging is mogelijk, tenzij het boek gereserveerd is. Boeken kunnen aan alle balies van de UvA-bibliotheken ingeleverd worden. Tijdschriften, naslagwerken en studieboeken zijn niet uitleenbaar. Ze kunnen worden geraadpleegd in de bibliotheek en er kunnen kopieën worden gemaakt. Voor meer informatie kunt u zich wenden tot de bibliotheekmedewerkers. Meer informatie over de bibliotheken van de UvA is ook te vinden op http://www.uba.uva.nl En specifiek voor de FNWI -bibliotheken: http://www.uba.uva.nl/fnwi/ De catalogus van de UvA is te bereiken via deze sites. 3.1.2

Facultaire computerfaciliteiten en studiecentra

Bij het verwerken van de onderzoeksresultaten of bij het schrijven van een onderzoeksverslag of scriptie kun je gebruik maken van de computerfaciliteiten van de faculteit. De Universiteit van Amsterdam heeft zes computerzalen (studiecentra) die voor alle studenten toegankelijk zijn. De studiecentra zijn: ■ ■ ■

■ ■ ■

studiecentrum OMHP, Oudemanhuispoort 4-6 studiecentrum BG5, Oudezijds Achterburgwal 237 studiecentrum P.C. Hooft, Spuistraat 134 studiecentrum Roeterseiland, Roetersstraat 11 studiecentrum Bushuis, Kloveniersburgwal 48 studiecentrum Almere, P.J. Oudweg 29, Almere

Bij aanvang van de studie krijgen UvA-studenten een wachtwoord voor gebruik van de studiecentra per post thuisgestuurd. De gebruikersnaam - ook ' UvAnetID' genoemd - is gelijk is aan het collegekaartnummer. Met het UvAnetID en het bijbehorende wachtwoord kun je van meerdere digitale diensten voor studenten gebruik maken, zoals Studentenmail, Studieweb en Blackboard. Als je je wachtwoord kwijt bent kunt je op vertoon van een geldige collegekaart (met het daarbij behorende legitimatiebewijs) aan de balie

17

Algemene informatie

3 Algemene studiefaciliteiten en praktische zaken



van een van de studiecentra een nieuw wachtwoord laten maken. Bij de balies van de studiecentra kun je ook terecht voor een abonnement op UvA-inbel. Wil je je aanmelden voor UvA-dsl, dan kun je terecht bij de balie van Studiecentrum BG5.Voor meer informatie en openingstijden van de studiecentra kun je kijken op de website van de studiecentra: http://www.ic.uva.nl/studiecentra. 3.1.3

ICT diensten

Iedere student van de Universteit van Amsterdam (UvA) krijgt na inschrijving een UvAstudentenmailadres. Bij dit e-mailadres krijgt iedere student 100 MB opslagruimte. Je UvA-studentenmailadres is te bereiken via ‘MijnUvA’ of via http://webmail.student.uva.nl/ De UvA gebruikt je studentenmail om je op de hoogte te houden van UvAdiensten en ander nieuws. Raadpleeg daarom deze post regelmatig! 3.2 3.2.1

Informatievoorziening Algemeen

Informatie betreffende het onderwijsprogramma staat in deze studiegids. Daarnaast worden studenten gedurende het studiejaar via één of meerdere van onderstaande bronnen op de hoogte gehouden van mededelingen omtrent de studie: ■ ■ ■

■

de mededelingenborden; brieven vanuit de onderwijsbalie UvA student e-mail de digitale leeromgeving Blackboard (http://www.blackboard.ic.uva.nl).

3.2.2

Studentenhandboek

Het UvA Studentenhandboek is integraal op de UvA website te raadplegen: http://www.uva.nl/studentenhandboek. Deel A bevat algemene informatie die voor iedere student van belang kan zijn, bijvoorbeeld over het studeren zelf o.a. met tips voor planning en studiekeuze, maar ook over financiën tijdens de studie, de arbeidsmarkt, studentenvoorzieningen, diverse studieprogramma’s, en over de vele studentenvoorzieningen. Deel B bevat de informatie die elke instelling voor hoger onderwijs beschikbaar moet stellen aan studenten met o.a. informatie over toegang tot de studie en inschrijving, tentamens en examens, rechten en plichten van de student, rechtsbescherming, medezeggenschap, administratie en privacybescherming, beschrijvingen van procedures voor klachten, bezwaar en beroep en financiële ondersteuning bij studievertraging.

18



3.2.3

Websites van de verschillende bacheloropleidingen

Iedere bacheloropleiding heeft een eigen website: ■ ■

■ ■

Bacheloropleiding Aardwetenschappen: http://www.student.uva.nl/arw Bacheloropleiding Biologie: http://www.student.uva.nl/bio Bacheloropleiding Biomedische wetenschappen: http://www.student.uva.nl/bw Bacheloropleiding Psychobiologie: http://www.student.uva.nl/pb

Op de websites van de individuele bacheloropleiding is onder andere het volgende te vinden: ■

■ ■ ■

■ ■ ■

De mededelingen van het onderwijsbureau Informatie over het onderwijsbureau, de faculteit en universiteit De roosters Belangrijke formulieren en protocollen Het Onderwijs en Examenreglement (OER) Een link naar de digitale bibliotheek van de UvA Een link naar MijnUvA, met toegang tot studieweb, UvA Webmail en Blackboard

De informatie in MijnUvA is afgeschermd. Om hier in te komen gebruik je je UvAnetID met wachtwoord. Neem bij problemen met het UvAnetID contact op met het IC (http://www.ic.uva.nl). Bij problemen met de toegankelijkheid van Blackboard neem je contact op met het onderwijsbureau. Op de website http://studiegids.uva.nl is een groot deel van de studiegids opgenomen, hierop zijn de opleidingen, cursusbeschrijvingen en docenten te vinden. 3.2.4

UvA Blackboard

Als digitale leeromgeving wordt bij veel studieonderdelen aan de UvA Blackboard gebruikt. Blackboard biedt de mogelijkheid dat docenten lesmateriaal online beschikbaar kunnen maken, zodat studenten toegang hebben tot het onderwijsmateriaal onafhankelijk van tijd en plaats. Ook kunnen via Blackboard op een eenvoudige manier berichten en documenten uitgewisseld worden tussen docent en student en tussen studenten onderling, met de mogelijkheid om samen te werken in groepen. Daarnaast is het mogelijk via Blackboard elektronisch te discussieren en te chatten, waarbij de sessies worden gearchiveerd. Aan alle faculteiten van de UvA wordt Blackboard inmiddels gebruikt. Iedere UvAstudent heeft automatisch een Blackboard-account via het UvAnetID (collegekaartnummer + wachtwoord). Toegang tot vakinformatie is alleen mogelijk als je je aangemeld hebt voor het betreffende vak. Bij problemen met de toegankelijkheid van Blackboard

19

Algemene informatie

Alle hoofdstukken van het Studentenhandboek kunnen van het net worden gehaald, zodat je één hoofdstuk apart kunt uitprinten.



neem je contact op met de Onderwijsbalie. Voor meer informatie over Blackboard zie: http://www.science.uva.nl/onderwijs/blackboard. 3.2.5

Universiteitsblad Folia

Folia is het weekblad voor de Universiteit van Amsterdam. Folia is verkrijgbaar bij de ingangen van de gebouwen van het Roeterseilandcomplex, en in de gebouwen I, II, IV en de kantine van Biologisch Centrum Anna’s Hoeve. 3.2.6

Studenten Services (StS)

Studentenzaken Studenten, afgestudeerden en promovendi van de Universiteit van Amsterdam (UvA) die behoefte hebben aan advies en/of informatie over allerlei zaken met betrekking tot studeren kunnen langskomen in het Service & Informatiecentrum. Studentenzaken bestaat uit de afdelingen: Service & Informatiecentrum, Studentendecanen, Bureau Studentenpsychologen, Bureau Internationale Studentenzaken en Loopbaan Advies Centrum. Verder worden er het hele studiejaar diverse workshops & trainingen rondom studie en loopbaan georganiseerd door het Trainingscentrum van Studentenzaken. Adres:

Binnengasthuisstraat 9, 1012 ZA Amsterdam

Openingstijden:

ma t/m vr van 10.00 - 17.00 uur

Telefoon:

020-525 8080, bereikbaar op ma t/m vr van 09.00 - 17.00 uur

Internet:

http://www.uva.nl/studentenzaken

Service & Informatiecentrum Heb je vragen over studeren aan de UvA, bijvoorbeeld over in- en uitschrijving, studiemogelijkheden of studiefinanciering? Kom dan langs bij het Service & Informatiecentrum. Hier vind je brochures van alle opleidingen van de UvA. Tevens is er informatie over de arbeidsmarkt, het hoger onderwijs in Nederland en studeren in het buitenland. Wil je individueel advies bij vragen en problemen van persoonlijke aard, bezoek dan een studentendecaan, een loopbaanadviseur of een medewerker internationalisering tijdens een van de spreekuren. Een afspraak met een studentenpsycholoog maak je via Bureau Studentenpsychologen. Ben je op zoek naar een kamer? Het kamerbureau van de ASVA Studentenunie is ook in het Service & Informatiecentrum gevestigd.

20



020-525 8080, bereikbaar op ma t/m vr van 09.00 - 17.00 uur

Internet:


E-mail:

[email protected]

Studentendecanen Heb je behoefte aan advies bij vragen en problemen van meer persoonlijke aard? Voor een individueel gesprek kun je terecht bij de studentendecanen. Wij bieden dienstverlening die vooral gericht is op studiekeuze, -voortgang en -planning, inschrijvingsproblemen, financiële problemen en beroepsprocedures. Ook besteden de studentendecanen speciale aandacht aan bijzondere groepen studenten (buitenlandse studenten, topsporters en studenten met een functiebeperking). Schakel de hulp van de studentendecanen tijdig in, dan is de kans het grootst dat wij je kunnen helpen bij een oplossing. Voor studenten Gedrag en samenleving is er één keer per week een studentendecaan in Almere aanwezig. Telefonisch spreekuur:

di t/m vr van 09.00 - 10.00 uur (020-525 8080)

Spreekuur op afspraak:

afspraak maken via het Service & Informatiecentrum (020-525 8080)

Internet:


Bureau Studentenpsychologen Psychische of studiegerelateerde problemen (zoals faalangst) hebben vaak een nadelig effect op de studievoortgang. Heb jij een dergelijk probleem dan kun je terecht bij de studentenpsychologen. Wij bieden groepstrainingen en kortdurende individuele gesprekken. In geval van problemen waarbij langdurige begeleiding nodig is, werken wij samen met psychotherapeuten van Mentrum. Je kunt bij de studentenpsychologen ook terecht voor voorlichting over andere mogelijkheden van psychotherapeutische hulp. Bel ons tijdens het telefonisch spreekuur voor informatie en advies of om je aan te melden. Telefonisch spreekuur:

ma t/m vr van 10.30 - 12.30 uur (020-525 2599)


afspraak maken via Bureau Studentenpsychologen (020-525 2599)

E-mail:

[email protected]

Internet:


21

Algemene informatie

Telefoon:



Bureau Internationale Studentenzaken Heb je belangstelling om te studeren in het buitenland? Een tijdelijk verblijf in het buitenland biedt mogelijkheden je studie te verdiepen, intensief kennis te maken met een andere cultuur of je taalvaardigheid te verbeteren. Via Bureau Internationale Studentenzaken kun je er achter komen of je in aanmerking komt voor de diverse uitwisselingsprogramma's. De medewerkers van Bureau Internationale Studentenzaken adviseren en begeleiden je. In het Documentatiecentrum van Studentenzaken kun je documentatie van buitenlandse instellingen bekijken en de brochure Studeren in het buitenland halen. Telefonisch spreekuur:

di t/m do van 09.00 - 10.00 uur (020-525 8080)

Inloopspreekuur:

di t/m do van 11.00 - 12.00 uur

E-mail:

[email protected]

Documentatiecentrum:

adresgegevens en openingstijden zie: Studentenzaken

Internet:

http://www.uva.nl/studentenservices

Loopbaan Advies Centrum Welke studie past het beste bij mij? Wat zijn de mogelijkheden om verder te studeren na mijn bachelor? Hoe vind ik een baan na mijn studie? Ik overweeg om te promoveren, hoe pak ik dat aan? Hoe bereid ik me goed voor op een sollicitatiegesprek? Met dit soort vragen en voor feedback op je sollicitatiebrief en cv kun je terecht bij een van de loopbaanadviseurs van het Loopbaan Advies Centrum. Wij adviseren je over je studieen loopbaanoriëntatie: voor, tijdens én na je studie of promotie. Daarnaast verzorgen wij de trainingen Studiekeuze en Effectief Solliciteren en organiseren wij informatiebijeenkomsten over de verschillende sectoren van de arbeidsmarkt. Telefonisch spreekuur:

di t/m vr van 09.00 - 10.00 uur (020-525 8080)

Inloopspreekuur:

di t/m vr van 11.00 - 12.00 uur


afspraak maken via het Service & Informatiecentrum (020-525 8080)

E-mail:

[email protected] of [email protected]

Internet:


22



Om je vaardigheden met betrekking tot het maken van een goede studiekeuze, het studeren en het leren solliciteren (verder) te ontwikkelen, kun je workshops & trainingen bij het Trainingscentrum doen. Onder andere de volgende workshops & trainingen worden aangeboden: Studiebegeleiding, Omgaan met depressieve klachten, Vergroten van zelfvertrouwen, Studiekeuze, Time-Management, Fondsen werven voor je studie, Scriptie opstarten, Effectief Solliciteren, Psychologisch onderzoek en Angst voor presentaties. Het meest actuele programma staat op internet. Internet: 3.3


Kosten studie

Het Onderwijsinstituut draagt er zorg voor dat de (verplicht) te maken kosten (boeken, syllabi, excursies etc.) voor de studenten zo laag mogelijk blijven. Het Onderwijsinstituut is van mening dat ongeveer € 500,- per studiejaar de limiet is. Dit is een richtlijn van het College van Bestuur. De faculteit berekent geen kosten voor microscopen, breekgeld etc. Voor eventueel veldwerk als verplicht studie onderdeel worden geen extra kosten (reiskosten, onderdak) in rekening gebracht. Alleen de kosten voor levensonderhoud tijdens het veldwerk komen ten laste van de student. 3.4

Financiele ondersteuning

Het wel of niet voorhanden hebben van voldoende financiële middelen kan grote invloed hebben op de studie van een student. In de meeste gevallen zullen studenten aanspraak kunnen maken op studiefinanciering. De UvA heeft extra financiële regelingen voor studenten, waar studenten onder bepaalde voorwaarden aanspraak op kunnen maken. Voor een uitgebreide toelichting wordt verwezen naar het studentenhandboek paragraaf B.10 (http://www.student.uva.nl/studentenhandboek). Deze voorzieningen zijn alleen beschikbaar voor studenten die studiefinanciering ontvangen. Alleen het Noodfonds is beschikbaar voor alle studenten die zijn ingeschreven bij de UvA. 3.4.1

Veldwerk financiering

Er wordt geen eigen bijdrage van studenten gevraagd voor alle veldwerken in de Bachelorfase mits zij ingeschreven staan bij de opleidingen Aardwetenschappen of Biologie. Dit houdt in dat de kosten voor eventuele onderdak en vervoer (voor zover het gebruik van de OV jaarkaart niet voldoende is) voor rekening van het Onderwijsinstituut komt. De kosten van syllabi en de kosten van eigen levensonderhoud gedurende het veldwerk komen wél voor rekening van de student.

23

Algemene informatie

Trainingscentrum



3.5

Inrichting werkplekken

De werkplekken in de bibliotheek, de computergebruikersruimte (CGR) en de prakticumzalen zijn zo ingericht dat voor alle studenten een zo optimaal mogelijke werkhouding mogelijk is. Studenten die door handicap of andere beperkingen aanpassingen nodig hebben aan de werkplekken, kunnen contact opnemen met de studieadviseur. 3.6

Rechtsbescherming en klachtenregelingen

Individueel klachtrecht FNWI kent een facultaire klachtenregeling voor studenten. Deze regeling biedt individuele studenten (en andere studerenden) de mogelijkheid om klachten in te dienen over handelingen van personen, commissies, besturen en andere eenheden binnen de faculteit waarvoor geen andere klachten-, bezwaar-, of beroeps-procedures bestaan (wettelijk of binnen de Universiteit van Amsterdam geregeld). De student kan de klacht indienen bij de contactpersoon/klachtenfunctionaris van de opleiding. Indien de klacht op een of andere wijze betrekking heeft op de contactpersoon van de opleiding, kan de student de klacht ook indienen via de contactpersoon van een andere opleiding. De interne klachtenregeling voor studenten is te vinden op het web: http://www.uva.nl/ombudsman. De contactpersoon voor de afdeling Aardwetenschappen is mw dr. Annemieke Kooijman, e-mail: [email protected], tel. 020-525 7441/7812. De contactpersoon voor de afdeling Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie is mw. dr. Sandrine Ulenberg, e-mail: [email protected], tel. 020-525 6243. Overige regelingen Informatie over rechtsbescherming, universitaire en facultaire klachtenregelingen, bezwaar- en beroepsprocedures, ombudsman, juridische ondersteuning en privacyregelingen is te vinden in het Studentenhandboek. (http://www.student.uva.nl/studentenhandboek) 3.7

Honoursprogramma

De UvA biedt de mogelijkheid om een extra uitdaging te zoeken in de studie door middel van het honoursprogramma. Gemotiveerde en getalenteerde eerstejaarsstudenten kunnen naast hun reguliere Bachelor opleiding meedoen aan een extra onderwijsprogramma dat bestaat uit vakken aangeboden door het Instituut voor Interdisciplinaire Studies en disciplinaire vakken verzorgd door het Onderwijsinstituut Levens- en Aardwetenschappen. Het Honourstraject heeft als doel om bij te dragen aan de academische vorming van getalenteerde studenten. Door het grote aantal studenten en het volle studieprogramma ligt de

24



3.8 3.8.1

Cursussen volgen buiten de FNWI Cursussen elders volgen

Je kunt cursussen volgen of onderzoek doen bij een andere faculteit of universiteit. Als je de cursus of training wilt doen in het kader van het verplichte deel van je opleiding dien je vooraf toestemming te vragen aan de Examencommissie. Voor het volgen van cursussen bij andere universiteiten in Nederland moet je je bij die Universiteit (centrale studenten administratie) waar je de cursus wilt volgen, inschrijven als bijvakstudent. Deze dubbele inschrijving is voor studenten gratis. Voor deze dubbele inschrijving heb je doorgaans de volgende stukken nodig: ■ ■

■

bewijs van inschrijving aan de Universiteit van Amsterdam; bewijs van goedkeuring van de Faculteit Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica, afdeling ‘Aardwetenschappen’ of ‘Biologie’, UvA; eventueel een verklaring van de faculteit, waarin gesteld wordt dat de bij de andere universiteit te volgen cursus niet aan de UvA kan worden verzorgd;

25

Algemene informatie

nadruk in de eerste jaren van de studie vooral op het verwerven van kennis en in mindere mate op academische vorming. Binnen het honoursprogramma worden de studenten gestimuleerd tot logisch nadenken, redeneren en het gebruik en in een context plaatsen van de door hun opgedane kennis. Het interdisciplinaire deel biedt je een unieke kans om je breed te ontwikkelen en je te verdiepen in wetenschappelijke, maatschappelijke, culturele, filosofische en actuele thema’s. Je volgt een aantal collegereeksen die elk een thema vanuit een breed perspectief benaderen. Daarnaast neem je deel aan kleinschalige discoursgroepen, waarin je met medestudenten verder discussieert over de thema’s. Het disciplinaire deel bestaat uit het uitdiepen van een actueel biologisch onderwerp vanuit verschillende invalshoeken, in de vorm van literatuuronderzoek en discussies in groepen onder begeleiding van een docent als coach. Het afsluitende 6de semester wordt besteed aan de eindthesis van de bachelor. Overeenkomstig UvA-brede eisen voor een honours diploma zullen de studenten een verzwaarde invulling moeten geven aan deze eindthesis. Het Honoursprogramma gaat van start in het 2e semester en zal verder gedurende de gehele bachelor periode doorlopen. Het programma omvat in totaal 30 EC. Na afloop ontvang je een honourscertificaat, ondertekend door de Rector Magnificus, indien voldaan is aan de door de UvA gestelde eisen voor het verkrijgen van zo’n certificaat. Er vindt selectie plaats op basis van een aantal aspecten, zoals motivatie en studievoortgang. Spreekt een intellectuele uitdaging je aan? Schrijf je dan zo snel mogelijk in. Er is een beperkt aantal plaatsen beschikbaar. Voor aanmelding en meer informatie zie de website http://www.iis.uva.nl/honoursprogramma. Contactpersoon IIS: Saskia Siesling, tel. 020-525 5512, e-mail: [email protected] Contactpersoon Onderwijsinstituut Levens- en Aardwetenschappen: Drs. Anja Zoomer Tel. 020-525 7636, email: [email protected]



■

verklaring van de faculteit waar je de onderzoekstraining gaat volgen, waarin staat dat men ruimte heeft om de training aan een student van een andere instelling te geven.

3.9

Studeren in het buitenland

De Faculteit Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica vindt het belangrijk dat studenten tijdens hun studie internationale ervaring opdoen. Als student aan de Faculteit Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica heb je daarom mogelijkheden om een deel van je studie in het buitenland te volgen: via een uitwisselingsprogramma een aantal vakken volgen aan een buitenlandse universiteit bijvoorbeeld. Als je overweegt om een deel van je studie in het buitenland te volgen, begin dan op tijd (ideaal is een jaar voor vertrek) met de voorbereidingen. Oriënteer je op de verschillende mogelijkheden en bedenk waar jouw voorkeur naar uitgaat. Houd er rekening mee dat de meeste programma’s een deadline hebben voor aanmelding. Voor de meeste opleidingen geldt dat een studieverblijf in het buitenland in het eerste semester van het derde studiejaar kan plaatsvinden. Voor het volgen van onderwijs in het buitenland is goedkeuring door de examencommissie vereist. 3.9.1

Uitwisselingsprogramma's

In het kader van het Socrates programma heeft de Faculteit Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica overeenkomsten afgesloten met een dertigtal Europese universiteiten. Het gaat hierbij om een verblijf van drie tot twaalf maanden in het buitenland. Je hoeft geen collegegeld te betalen aan de gastinstelling en je ontvangt een maandelijkse toelage. De hoogte van deze toelage is ongeveer 100 euro per maand. De deadline voor aanmelding voor het Socrates programma voor het studiejaar 2007/2008 is 1 maart 2007. Een overzicht van de universiteiten waarmee een overeenkomst is afgesloten is verkrijgbaar bij mevr. Ir. J.A. Hendriks, de contactpersoon internationalisering ([email protected] of telefoon: 020-525 7681) of te downloaden van de opleidingspagina's, pagina buitenland. De Universiteit van Amsterdam heeft een aantal universiteitsbrede uitwisselingsprogramma’s met universiteiten in o.a. Australië, Canada, VS of Azië. Het betreft studieverblijven van minimaal een half jaar en maximaal een heel academisch jaar. Een overzicht van alle bestemmingen kun je vinden op de website http://www.uva.nl/internationaal, onder de kop ‘Mogelijkheden’, dan onder 'Studeren buiten Europa' en vervolgens de regio en eventueel het land van je keuze. Bij ieder programma is aangegeven wat de voorwaarden en eisen zijn en wanneer de deadline voor aanmelding is. 3.9.2

Erkenning van studiepunten

Voor je naar het buitenland vertrekt moet je goedkeuring vragen van de examencommissie voor de studieonderdelen die je in het buitenland wilt volgen.

26



3.9.3

Beurzen

Als je deelneemt aan een Socrates programma krijg je een Socrates beurs, als je deelneemt aan een brede uitwisseling een zogenaamde STUNT beurs. Meer informatie hierover vind je op de website www.cms.uva.nl/studentenservices/Financiele_zaken.cfm. Als je niet via een uitwisselingsprogramma naar het buitenland gaat, kun je ook in aanmerking komen voor een STUNT beurs. De STUNT beurs is een eenmalige tegemoetkoming in de reis- en verblijfkosten en varieert tussen de 200 en 950 euro afhankelijk van het land waar je heen gaat. Bij het Documentatiecentrum (Studenten Services, Binnegasthuisstraat 9) of bij de Onderwijsbalie (Kruislaan 318, Gebouw I) kun je de Fondsendiskette en het Fondsenboek raadplegen. Herin vind je een overzicht van particuliere fondsen die je kunt aanschrijven. Op de website www.beursopener.nl van Nuffic is eveneens een overzicht van fondsen te vinden. 3.9.4

Voorlichting

In september verschijnt de brochure Studeren in het buitenland. Hierin staat algemene informatie over studeren in het buitenland en een overzicht van de brede uitwisselingsprogramma’s. Vanaf 27 september tot en met 4 oktober 2006 vindt de Nationale Wil Weg Week plaats. Op de hele universiteit vinden dan activiteiten plaats die te maken hebben met studeren in het buitenland. In januari of februari 2007 worden voorlichtingsbijeenkomsten over het Socrates programma georganiseerd. 3.9.5

Informatie

Facultaire contactpersoon internationalisering Voor informatie over studeren in het buitenland kun je contact opnemen met mevr. Ir. J.A. Hendriks, de contactpersoon internationalisering van de faculteit. Zij heeft inloopspreekuur op donderdag van 10.00-12.00 uur in kamer 205, Kruislaan 404, en op donderdag van 14:00-16:00 uur op de Nieuwe Achtergracht 129, kamer C.103. Afspraken op een andere tijd (niet op woensdag) kun je maken via e-mail: [email protected]. De website van FNWI met informatie over studeren in het buitenland is als volgt te bereiken: ga naar je opleidingspagina en klik vervolgens op Buitenland. Bureau Internationale Samenwerking Via Bureau Internationale Samenwerking kun je er achter komen of je in aanmerking komt voor de universiteitsbrede uitwisselingsprogramma's. In het Documentatiecentrum (Studenten Services, Binnengasthuisstraat 9) kun je documentatie van buitenlandse instel-

27

Algemene informatie

Voor landen buiten Europa bestaan verschillende systemen voor erkenning van studiepunten. Voor vragen hierover kun je contact opnemen met je studieadviseur.



lingen bekijken. Hier is ook de brochure Studeren in het buitenland verkrijgbaar. De medewerkers van Bureau Internationale Samenwerking kunnen je adviseren en begeleiden. Telefonisch spreekuur: di t/m do van 09.00 - 10.00 uur (020-525 8080) Inloopspreekuur: di t/m do van 11.00 - 12.00 uur Spreekuur op afspraak:afspraak maken via Studenten Services (020-525 8080) E-mail: [email protected] Documentatiecentrum: adresgegevens en openingstijden zie 'Studenten Services' 3.9.6

Vaccinaties bij verblijf in het buitenland

Voor buitenlandse veldwerken en stages is het raadzaam om 6 weken voor vertrek advies in te winnen over welke vaccinaties je nodig hebt. Dit kan bij de Arbo-, Milieu- en Veiligheidsdienst (AMVD) op de Plantage Muidergracht 14, Amsterdam. Vaccinaties vinden plaats op woensdag en op afspraak met de verpleegkundige: Patty Boers (e-mail: [email protected], telefoon 020-525 5545). 3.10 Verzekeringen en veiligheid Algemeen Voor verschillende activiteiten ten behoeve van de opleiding heeft de UvA een verzekering afgesloten. Deze worden hieronder beschreven. In alle gevallen is echter de particuliere aansprakelijkheid van studenten uitgesloten. Dit houdt in dat elke student verplicht is om een goede particuliere aansprakelijkheids verzekering (WA-verzekering) af te sluiten. Deze WA-verzekering kun je bij de eigen assurantietussenpersoon of verzekeraar afsluiten. In geval van schade dient de cursuscoordinator te allen tijde geïnformeerd te worden. Zij zullen de betrokken personen informeren en de schade aangifte begeleiden naar het centrale punt. In geval van persoonlijk letsel op buitenlandse reizen of veldwerk dient ALTIJD het noodnummer van de hulpverleningsinstantie gebeld te worden. De UvA aanvaardt geen enkele aansprakelijkheid tenzij er sprake is van ‘een de UvA verwijtbaar gedrag of tekortkoming’. Elke schadegeval wordt apart beoordeeld en is sterk afhankelijk van de omstandigheden. Schadeformulieren zijn bij Financiële Zaken van de FNWI beschikbaar, [email protected]. Aanspreekpunten Voor informatie over verzekeringen kunnen studenten terecht bij de onderwijsbalie. Het feitelijke beheer van alle schade verzekeringen vindt centraal plaats op het Maagdenhuis. Vaak zullen vragen dan ook doorgezonden worden naar deze beheerder. Primair aanspreekpunt voor docenten die veldwerken en excursies organiseren voor de opleiding is het secretariaat van het onderwijsinstituut, waar zij deelnemende studenten

28



Ongevallenverzekering De UvA heeft een ongevallenverzekering afgesloten voor alle studenten voor de duur van hun inschrijving. Het betreft een verzekering voor ongevallen op de onderwijslocatie, dan wel op weg naar de onderwijslocatie toe. Zodra er sprake is van een ongeval op de onderwijslocatie dan wel op weg van of naar de onderwijslocatie, laat dit dan onmiddellijk aan de cursuscoordinator weten. Ziektekostenverzekering Elke student en/of medewerker is verplicht om over een eigen ziektekostenverzekering te beschikken. Bij buitenlandse reizen en veldwerken moet de ziektekostenverzekering voldoende buitenland dekking geven. Laboratoriumwerk Studenten zijn verzekerd voor ongevallen in het laboratorium mits zij de aanwijzingen van de docent en/of laboratorium assistenten opvolgen. Mochten er situaties zijn, waarin sprake is van nalatigheid door de student, dan zal dit verhaald worden op de persoonlijke WA-verzekering van de student. Studiereizen / excursies Studenten die meedoen aan studiereizen of excursies, die in opdracht van de UvA georganiseerd zijn, zijn automatisch door de UvA verzekerd*. Studiereizen die georganiseerd worden door de studieverenigingen vallen hier dus niet onder, tenzij de studiereis in opdracht van de opleiding geschiedt en af te boeken is op een erkend WBS element nummer. Dit moet vóóraf geregeld zijn. (*uitgezonderd USA en Canada: zie bij ‘Uitzonderingen’) Stage in het buitenland Studenten, die stage lopen in het buitenland, zijn niet door de UvA verzekerd. Wel is er een reisdekking voor alle landen. De student moet voor het vertrek nagaan of zijn / haar WA-verzekering afdoende is en kan eventueel de verzekering ter plaatse regelen. Een uitzondering hierop vormen Canada en de USA. Hier gelden dusdanig specifieke eisen dat de student de verzekering van te voren goed moet hebben geregeld. Informatie hierover is te verkrijgen op de ambassades van deze landen. Reisdekking Voor alle landen is er vanuit de UvA een reisdekking. Een uitzondering hierop vormen Canada en de USA (zie ‘Uitzonderingen’) Verder geldt dat de reisdekking NIET geldt wanneer er een negatief reisadvies is uitgegeven voor het betreffende gebied. Uitzonderingen: Canada en de USA In Canada en de USA worden zeer specifieke eisen gesteld aan de WA-verzekeringen van

29

Algemene informatie

en mee te nemen apparatuur aanmelden. Andere reizen in het kader van werk moet docenten zelf aanmelden bij [email protected].



‘gasten’. Toegang tot deze landen wordt alleen verleend als de student / medewerker over een juiste verzekering beschikt voor deze landen. Informatie hierover is te verkrijgen op de ambassades van deze landen. Veldwerk Voor buitenlandse veldwerken* worden studenten altijd door de opleiding verzekerd. Voorwaarde is dat zij kennis hebben genomen van de veldinstructies van de docent en te allen tijde aanwijzingen van de docent opvolgen. Studenten die in opdracht van de opleiding veldwerk verrichten, moeten door de cursuscoördinator tijdig aangemeld worden bij het secretariaat van het onderwijsinstituut o.v.v. naam, en collegekaartnummer, waar en hoe lang het veldwerk plaatsvindt. Ook het veldwerkmateriaal, dat meegaat op veldwerk, moet gemeld worden. Het is het meest praktisch om dit op één formulier te zetten met de lijst studenten. NB: Indien de student op eigen initiatief een buitenlandse stage en/of veldwerk heeft geregeld, moet de student zichzelf aanmelden via het secretariaat van het onderwijsinstituut alsook de apparatuur dat meeverzekerd dient te worden (zie ook onder Apparatuur). (*uitgezonderd USA en Canada: zie bij ‘Uitzonderingen’) Privé eigendommen Tijdens veldwerk zijn ook persoonlijke eigendommen meeverzekerd. Voor bagage geldt een totale limiet van EUR 5.000,- onder te verdelen in diverse sublimieten voor fotocamera's, computerapp. e.d. Waardepapieren, bankpassen e.d. zijn NIET meeverzekerd. Veiligheid in het veld In belang van de veiligheid van de studenten vullen ze vóór vertrek naar een veldwerkgebied een medisch informatieformulier in, dat door de cursuscoördinator wordt uitgereikt. Het formulier moet worden opgestuurd naar de bedrijfsarts van de UvA: mevr. R. van Raalte, bedrijfsarts, Arbo- en Milieudienst, Antwoordnummer 10576, 1000 RA Amsterdam o.v.v. Medisch Geheim. Het is mogelijk dat de bedrijfsarts naar aanleiding hiervan contact met de student opneemt, de door de student verstrekte informatie blijft echter medisch geheim. Daarnaast ondertekenen studenten een formulier waarin zij akkoord gaan met de veiligheidsregels voor het betreffende veldwerkgebied. Dit formulier wordt door de cursuscoördinator bewaard. Veldwerkapparatuur De cursuscoördinator draagt zorg voor de verzekering van veldwerkmateriaal van groepsveldwerk (zie veldwerk). Studenten die materiaal lenen voor individueel veldwerk (zoals voor de Bachelorthesis) moeten dit zelf regelen. Het veldwerkmateriaal moet in dat geval apart worden verzekerd door dit op te geven aan het secretariaat van het onderwijsinstituut, o.v.v.: merk, omschrijving, type, serienummer, eigendom (UvA/Privé), nieuwwaarde, aantal dagen te verzeke-

30



Besturing busjes door studenten / studentassistenten / docenten In het algemeen geldt dat medewerkers altijd verzekerd zijn door de UvA, mits er geen sprake is van nalatigheid van de medewerker zelf. Dit betekent dat studenten zonder een betrekking bij de UvA, die busjes besturen tijdens veldwerken, NIET verzekerd zijn. Leerlingen en docenten middelbare school die op de UvA in het laboratorium werken Leerlingen en docenten van de middelbare school zijn verzekerd, mits dit van tevoren wordt doorgegeven.

31

Algemene informatie

ren. Apparatuur dat niet van tevoren is aangemeld, is NIET meeverzekerd!



32


Contactindex

4.1

Algemen informatie

Docenten

Naam

Telefoon

E-mail

prof. dr. R.C. Aalberse

+31 20 5123158

[email protected]

prof. dr. W. Admiraal

+31 20 5257710

[email protected]

prof.dr. J.M.F.G. Aerts

+31 20 5665156

[email protected]

drs. P. R. Assink

+31 20 5257672

[email protected]

prof. dr. F. Baas

+31 20 5665998

[email protected]

prof. dr. R.P.M. Bak

+31 22 2369300

[email protected]

dr. J.M. Bavinck

+31 20 5254185

[email protected]

mw. drs. H. Bergman

+31 20 5257378

[email protected]

mw. dr. T. den Blaauwen

+31 20 5255196

[email protected]

dr. M.C. Boerlijst

+31 20 5257758

[email protected]

mw. prof.dr. J. Borst

+31 20 5122056

[email protected]

drs. H.J. Bout

+31 20 4880309

[email protected]

prof.dr.ir. W. Bouten

+31 20 5257412

[email protected]

dr.ir. J.H. van Boxel

+31 20 5256216

[email protected]

prof.dr. J.A.S. Braeckman

+31 20 5255150

[email protected]

dr. J.A.J. Breeuwer

+31 20 5257745

[email protected]

prof.dr. S. Brul

+31 20 5257079

[email protected]

dr. L.H. Cammeraat

+31 20 5255890

[email protected]

prof.dr. A.M. Cleef

+31 20 5257840

[email protected]

dr M.J. Couzijn

+31 20 5251588

[email protected]

prof. dr. W. Crielaard

+31 20 5256425

[email protected]

dr. J. Don

+31 20 5254734

[email protected]

prof.dr. R. van Driel

+31 20 5255150

[email protected]

dr. J.F. Duivenvoorden

+31 20 5257812

[email protected]

dr. C.J.M. Egas

+3120 525 7748

[email protected]

dr A van der Ende

+31 20 5664862

[email protected]

dr.ir. P.F. Fransz

+31 20 5255153

[email protected]

33

Algemene informatie

4 Contactindex


Contactindex

Naam

Telefoon

E-mail

prof.dr. Th.W.J. Gadella

+31 20 5256259

[email protected]

dr. B. van Geel

+31 20 5257664

[email protected]

dr. H.G. van der Geest

+31 20 5257721

[email protected]

dr. W.E.J.M. Ghijsen

+31 20 5257620

[email protected]

mw. drs. E.K. van Haastrecht

+31 20 5252112

[email protected]

dr. P.E.M.H. Habets

+31 20 5664926

[email protected]

prof. dr. M.A. Haring

+31 20 5257663

[email protected]

prof. dr. K.J. Hellingwerf

+31 20 5257055

[email protected]

dr. R.B. de Heus

+31 20 5257615

[email protected]

dr. F. Hochstenbach

+31 20 5665137

[email protected]

dr.ir. H.C.J. Hoefsloot

+31 20 5255867

[email protected]

dr. J.A. van Hooft

+31 20 5257705

[email protected]

prof.dr. H. Hooghiemstra

+31 20 5257857

[email protected]

dr A.J.G. Horrevoets

+31 20 5665159

[email protected]

prof. dr. J. Huisman

+31 20 5256021

[email protected]

dr. A.R.M. Janssen

+31 20 5257751

[email protected]

mw. prof.dr. M. Joels

+31 20 5257626

[email protected]

dr. K. Johnk

+31 20 5257072

[email protected]

dr. H. de Jong

+31 20 5255207

[email protected]

drs K.H. de Jong

+31 20 5664920

[email protected]

dr. L. de Jong

+31 20 5255691

[email protected]

Ing. M.A. de Jong

+31 20 5257874

[email protected]

prof.dr M.L. Kapsenberg

+31 20 5664966

[email protected]

prof. dr. A. Kassenberg

+31 10 4071599

[email protected]

mw. drs. M.J.E. Kohinor

+31 20 5257378

[email protected]

dr. L.J. de Koning

+31 20 5255682

[email protected]

mw. dr. A.M. Kooijman

+31 20 5257441

[email protected]

dr. M. Kool

+31 20 5665170

[email protected]

dr. M.H.S. Kraak

+31 20 5257717

[email protected]

mw. drs C.M. van Krieken

+31 20 5251281

[email protected]

dr. H. Krugers

+31 20 5257621

[email protected]

34


Contactindex

Telefoon

Algemene informatie

Naam

E-mail

prof.dr. C.G. Kruse

+31 294 479268

[email protected]

dr. C.L. Kwa

+31 20 5256593

[email protected]

prof. dr. R.W.P.M. Laane

+31 20 5256578

[email protected]

prof.dr N.J. Leschot

+31 20 5665221

[email protected]

prof.dr R. van Lier

onbekend

[email protected]

dr.ir. E.E. van Loon

+31 20 5257448

[email protected]

dr. S. Lötters

+31 20 5257856

[email protected]

dr. P.J. Lucassen

+31 20 5257631

[email protected]

dr. J.H. van Maarseveen

+31 20 5255671

[email protected]

dr. E.M.M. Manders

+31 20 5256225

[email protected]

dr. J.C.P. Matthijs

+31 20 5257070

[email protected]

mw. dr. A.A. M'charek

+31 20 5256558

[email protected]

prof.dr. S.B.J. Menken

+31 20 5256297

[email protected]

drs. P.P.M. Molenaar

+31 20 5255956

[email protected]

prof. dr A.F.M. Moorman

+31 20 5664928

[email protected]

dr. J.M. van Mourik

+31 20 5257441

[email protected]

dr. M. Muller

+31 20 5256221

[email protected]

dr. T. Munnik

+31 20 5257763

[email protected]

dr. J.C.M. den Nijs

+31 20 5257660

[email protected]

prof. dr. C.J.F. van Noorden

+31 20 5664970

[email protected]

mw. prof. dr. M. Oitzl

+31 71 5276289

[email protected]

dr. J.G.B. Oostermeijer

+31 20 5257817

[email protected]

dr. R.J. Oostra

+31 20 5667821

[email protected]

prof.dr. A.P. Otte

+31 20 5255115

[email protected]

mw. dr.ir. B.B. Oude Essink

+31 20 5257963

[email protected]

dr. J.R. Parsons

+31 20 5256580

[email protected]

prof.dr. C.M.A. Pennartz

+31 20 5257638

[email protected]

mw. dr. A.C. Pierrot-Bults

+31 20 5257194

[email protected]

prof. dr J.H. Ravesloot

+31 20 5664829

[email protected]

drs. ing. G.B.A. van Reenen

+31 20 5257665

[email protected]

prof. dr. L. Reijnders

+31 20 5256269

[email protected]

35


Contactindex

Naam

Telefoon

E-mail

dr. M. Rep

+31 20 5257795

[email protected]

dr. H. Rijksen

+31 317 424786

[email protected]

dr. P. Roessingh

+31 20 5257732

[email protected]

prof.dr. A.M. de Roos

+31 20 5257747

[email protected]

prof. dr. M.W. Sabelis

+31 20 5257738

[email protected]

dr. D.P.E. Satijn

+31 20 5255114

[email protected]

dr.ir. R.C. Schuurink

+31 20 5257933

[email protected]

dr. A.C. Seijmonsbergen

+31 20 5257427

[email protected]

dr. R. Sluys

+31 20 5255445

[email protected]

dr. ir. J.W.N. van Smaalen

+31 20 5257665

[email protected]

mw. dr. G.J. Smits

+31 20 5255143

[email protected]

dr. R.W.M. van Soest

+31 20 5256901

[email protected]

dr. J.C. van der Spek

+31 20 5257921

[email protected]

prof. dr. L.J. Stal

+31 113 577497

[email protected]

dr. F.L.W. Takken

+31 20 5257797

[email protected]

dr. M.J. Teixeira de Mattos

+31 20 5257066

[email protected]

prof.dr. P.H. van Tienderen

+31 20 5257821

[email protected]

dr. A. Tietema

+31 20 5257458

[email protected]

mw. dr. S.A. Ulenberg

+31 20 5256243

[email protected]

dr. L.J. Valentijn

+31 20 5667536

[email protected]

drs. F.W. van der Vegte

+31 20 5257595

[email protected]

prof. dr. M. Veith

+31 20 5257761

[email protected]

prof. dr. R. Versteeg

+31 20 5665243

[email protected]

prof. dr. J.M. Verstraten

+31 20 5257415

[email protected]

ing. N.O.E. Vischer

+31 20 5256267

[email protected]

mw. dr. P.M. Visser

+31 20 5257073

[email protected]

dr. R. Vonk

+31 20 5256284

[email protected]

dr. W.P. de Voogt

+31 20 5256565

[email protected]

drs. C.N. de Vries

+31 20 5257442

[email protected]

drs. T. de Vries

+31 20 5256770

[email protected]

dr. T. Vulsma

+31 20 5662931

[email protected]

36


Contactindex

Telefoon

E-mail

prof.dr. W.J. Wadman

+31 20 5257637

[email protected]

dr. T.R. Werkman

+31 20 5257632

[email protected]

prof. dr. H.V. Westerhoff

+31 20 5987230

[email protected]

mw. drs. S.C. Witteveen

+31 20 5257718

[email protected]

prof. dr. J.H.D. Wolf

+31 20 5257820

[email protected]

dr. S.A.J. Zaat

+31 20 5664863

[email protected]

dr. J.B.F. van Zonneveld

+31 20 5256234

[email protected]

dr. G. Zwanenburg

+31 20 5256514

[email protected]

prof. dr. A.H. Zwinderman

+31 20 5665820

[email protected]

4.2

Algemene informatie

Naam

Onderwijsinstituut

Naam

Telefoon

E-mail

drs. K.M. Abcouwer

+31 20 5257199

[email protected]

Dr. C. de Groot

+31 20 5257703

[email protected]

L. Hoitinga

+31 20 5257437

[email protected]

mw. S. van Houten-Broers

+31 20 5257049

[email protected]

mw. M.E. Jans

+31 20 5257048

[email protected]

dr. W.H. Kaper

+31 20 5257986

[email protected]

mw. drs. L. Kerstens

+31 20 5256028

[email protected]

mw. drs. J.A.J.M. Koning

+31 20 5257047

[email protected]

L. de Lange

+31 20 5257416

[email protected]

B. de Leeuw

+31 20 5257414

[email protected]

mw. C. Lobach

+31 20 5257945

[email protected]

mw. M. Matala

+31 20 5257945

[email protected]

Onderwijsbalie Biologie

+31 20 5257945

[email protected]

Onderwijsbureau Exacte Wetenschappen

+3120 5257100

[email protected]

mw. C. Onrust-Wildschut

+3120 525 7791

[email protected]

mw. dr.ir. B.B. Oude Essink

+31 20 5257963

[email protected]

mw. drs. M. Seeman

+31 20 5257819

[email protected]

37


Contactindex

Naam

Telefoon

E-mail

mw. drs. T. de Vries

+31 20 5257945

[email protected]

P.E. Wartenbergh

+31 20 5257449

[email protected]

mw. drs. L.U. Wenting

+31 20 5255516

[email protected]

mw. J.W. Westerveld

+31 20 5257454

[email protected]

mw. drs. S.C. Witteveen

+31 20 5257718

[email protected]

mw. drs. A.M.L. Zoomer

+31 20 5257636

[email protected]

38


D E E L 2: B A C H E L O R A A R D W E T E N S C H A P P E N

D E E L 2: B A C H E L O R A A R D W E T E N S C H A P P E N

Opleiding Aardwetenschappen



Inhoudsopgave

Inhoudsopgave 1

3

43

1.1 1.2 1.2.1 1.2.2 1.3 1.4

43 44 44 45 46 46

Inleiding Het aanbod Overzicht bachelor opleidingen Onderwijsvormen en algemene vaardigheden Doelstellingen Eindtermen

Structuur van de opleiding

47

2.1 2.1.1 2.1.2 2.1.3 2.2 2.2.1 2.2.2 2.2.3

47 47 47 47 48 48 49 49

Het eerste jaar Opbouw eerste jaar Studiebegeleiding eerste jaar Studieadvies eerste jaar Het tweede en derde jaar Opbouw tweede en derde jaar Toelating tot tweede en derde jaar Ingangseisen cursussen tweede en derde jaar

Onderwijs en studentzaken

51

3.1 3.1.1 3.1.2 3.1.3 3.1.4 3.1.5 3.2 3.2.1 3.2.2 3.2.3 3.2.4 3.2.5 3.3 3.3.1 3.3.2 3.3.3 3.4 3.4.1 3.4.2 3.4.3 3.4.4 3.4.5 3.4.6

51 51 52 52 52 52 53 53 54 54 54 55 56 56 56 57 58 58 58 59 60 60 61

Het onderwijsbureau Taken onderwijsbureau Aanmelden cursus / module (Aanmelden) tentamens en hertentamens Afmelden cursus en/of tentamen Uitslagen studieresultaten Studiebegeleiding Studieadviseurs Vertrouwenspersoon Klachtrecht en verdere begeleiding Studie en handicap Studentenhuisartsen (Advies)commissies ten behoeve van het onderwijs Opleidingsteam Opleidingscommissie (OC) Examencommissie (Excie) Praktische zaken Verkoop van boeken, syllabi, loeps, geologische hamers en kompassen Veldwerkmateriaal: regeling betreffende beheer en uitleen Veldwerkmateriaal voor studenten Practicum en Collegezalen Computerfaciliteiten AW Verzekeringen


2

De Bacheloropleiding

41


Inhoudsopgave

3.4.7 3.4.8 3.5 3.5.1 3.5.2 3.5.3 3.5.4 3.5.5 3.6 3.6.1 3.6.2 3.6.3 3.7 3.7.1

4

5

6

61 61 61 61 63 63 63 63 64 64 65 65 66 66

Doorstromen naar een Masteropleiding

69

4.1 4.1.1 4.1.2 4.1.3 4.2 4.2.1

69 70 70 71 73 73

Masteropleiding Richtlijnen toelating tot de master-opleiding / Programma-coordinatoren Doorstroom naar Master buiten UvA Leraaropleiding Orientatie op de masteropleidingen Bèta Bedrijvencontactdag

Blokkenschema's

75

5.1 5.2

75 76

Blokkenschema Bachelor Aardwetenschappen Blokkenschema eerste semester derde jaar

Cursusbeschrijvingen 6.1 6.2 6.3 6.4

42

Prikborden / mededelingen Kopiëren Bachelorexamen Aanvraag bachelorexamen September regeling Toekenning predikaat 'Cum Laude' Diploma uitreiking Afstudeerverklaring Verenigingen Studieverenigingen Alumniverenigingen Beroepsverenigingen Kandidaatsfase / doctoraal opleiding aardwetenschappen Overgangsregeling bachelor en kandidaatsfase

Modules eerste jaar Modules tweede jaar Modules derde jaar Minorvakken voor niet Fysisch Geografen

77 77 97 111 126



1 De Bacheloropleiding 1.1

Opledi ngAardwetnschap en

Inleiding

Aardwetenschappen-Fysische Geografie is een brede wetenschap, die aandacht besteedt aan de fysisch geografische processen en patronen die zich afspelen in landschap en bodem. Van groot belang in het landschap is de wisselwerking tussen de factoren: dier, mens, reliëf, bodem, water, gesteente, atmosfeer en vegetatie. De vragen waar het de aardwetenschapper om gaat zijn: ■

■

■

Welke kennis kunnen we afleiden uit de patronen die we in het landschap waarnemen? Wat zijn de natuurlijke eigenschappen van het landschap, en welke processen veroorzaken veranderingen in het landschap? Hoe kan de mens het landschap en de bodem duurzaam gebruiken? Hoe worden eigenschappen van en processen aan het aardoppervlak door menselijke activiteiten veranderd of beïnvloed?

Het eerste jaar De studieonderdelen van het eerste jaar geeft de student een breed overzicht wat Aardwetenschappen en de exacte kant van de opleiding inhouden. De semesters geven niet alleen een overzicht over de theorie maar ook over de diverse vaardigheden (zoals veldwerk en presentatietechnieken). De zwaartepunten van de studie komen naar voren in vakken zoals de Inleiding Aardwetenschappen, Landschapsanalyse, en Atmosferische Fysica. Verder zijn er ondersteunende vakken zoals Wiskunde en de Natuurwetenschappelijke Basis en Organismen in het milieu. De laatste onderdelen van het jaar zijn het Basisveldpracticum waarin je het geleerde ook toepast in het veld. Je kunt ook aan het eind van het eerste jaar kiezen om alvast een zespunts keuzevak te volgen. Het tweede jaar Het programma van het tweede studiejaar in de bachelor opleiding is voor alle studenten die het studiepad Fysische Geografie volgen hetzelfde. De vakken dragen als kenmerk dat ze patroon- of procesgericht zijn en geven verdieping aan belangrijke fysisch geografische vakken. Toepassing van theoretische en praktische kennis vindt plaats in het veldpracticum van vijf weken in Luxemburg, dat wordt afgerond met een schriftelijk verslag en een mondelinge presentatie. In de tweede periode kun je wederom een zespunts keuzevak volgen. Het derde jaar In het derde jaar van de Bachelor volgt een verdere verbreding van kennis. Daarnaast besteedt je in alle programma's (zie onder aanbod) veel aandacht aan onderzoeksvaardigheden en doe je onderzoek naar processen die zich afspelen in de bodem en het landschap.

43


■



Over dit onderzoek schrijf je een verslag, de Bachelorthesis. Tot slot oriënteer je je op de keuze voor een Masteropleiding. 1.2 1.2.1

Het aanbod Overzicht bachelor opleidingen

De bacheloropleiding Aardwetenschappen is een voltijds en duurt drie jaar. De eerste twee jaar zijn georiënteerd op de Fysische Geografie en in het derde jaar kun je kiezen om je daarin verder te verdiepen, of je kunt je richten op een combinatie programma met een minor in de biologie, sociale geografie of milieukunde. Ook is het mogelijk een vrije keuze minor te doen. De vijf programma's zijn als volgt (zie ook het overzichtstabel 5.2) ■

■

■

■

44

programma Fysische Geografie: met dit programma ga je dieper in op vakken als klimatologie, Geografische informatie systemen, materiaal eigenschappen en kun je een oriënterende stage doen, waarna je in het tweede semester de verplichte vakken meetstrategieën, modelleren en de bachelorthesis volgt. Dit studiepad biedt inzicht in de plaats die de zwaartepunten geomorfologie, bodemkunde en landschapsecologie innemen in de Fysische geografie in relatie tot andere wetenschapsgebieden. programma met minor Aarde en Natuur: dit programma biedt ook een aantal ecologische en biologische keuzevakken in het eerste semester, waarna je in het tweede semester de verplichte vakken meetstrategieën, modelleren en de bachelorthesis volgt. Dit studiepad biedt inzicht in de plaats die de zwaartepunten geomorfologie, bodemkunde en landschapsecologie innemen in de Fysische geografie in de relatie tot andere wetenschapsgebieden in het bijzonder op het raakvlak Fysische Geografie, Ecologie en Biologie. programma met minor Aarde en Mens: dit programma biedt een aantal keuzevakken uit de Bachelor Sociale geografie in het eerste semester, waarna je in het tweede semester de verplichte vakken meetstrategieën, modelleren en de bachelorthesis volgt. Dit studiepad biedt inzicht in de plaats die de zwaartepunten geomorfologie, bodemkunde en landschapsecologie innemen in de Fysische geografie in de relatie tot andere wetenschapsgebieden in het bijzonder op het raakvlak Fysische Geografie en Sociale Geografie. programma met minor Aarde en Milieu: dit programma biedt ook een aantal milieukundige keuzevakken in het eerste semester, waarna je in het tweede semester de verplichte vakken meetstrategieën, modelleren en de bachelorthesis volgt. Dit studiepad biedt inzicht in de plaats die de zwaartepunten geomorfologie,



bodemkunde en landschapsecologie innemen in de Fysische geografie in de relatie tot andere wetenschapsgebieden in het bijzonder op het raakvlak Fysische Geografie en Milieukunde. ■

programma Vrije minor: 30 EC zijn in het eerste semester geheel naar eigen wens in te vullen onder goedkeuring van de Examencommissie. In het tweede semester volg je de verplichte vakken meetstrategieën, modelleren en de bachelorthesis.

Voor een compleet overzicht van alle vakken per studieprogramma, zie Hoofdstuk 5.3. 1.2.2

Onderwijsvormen en algemene vaardigheden

■

■

■

■

■

■

■

hoorcollege college waarbij de docent kennis en inzicht overdraagt aan de studenten. De studenten hebben slechts beperkt de mogelijkheid tot interactie door middel van vragen stellen of het voeren van discussie. werkcollege college waarbij een probleem of casus gerichte behandeling van de stof voorop staat. Studenten hebben de mogelijkheid vragen te stellen of discussiepunten voor te leggen aan de docent. werkgroep/colloquium onderwijs waarbij de interactie tussen studenten en docent voorop staat door middel van probleemoplossing, casusbehandeling of discussie. Van studenten wordt een actieve participatie gevraagd in de vorm van schriftelijke of mondelinge prestaties. practicum onderwijsvorm waarbij de student praktische werkzaamheden moet verrichten die betrekking hebben op voor de opleiding essentiële vaardigheden. Het zelf opdoen van vaardigheden door de student onder toezicht van een docent staat hierbij voorop. excursie onderwijsvorm waarbij de student onder begeleiding van een docent een buiten de faculteit gevestigde instantie, organisatie of gebied bezoekt. opdracht vorm waarbij de student de door de docent opgegeven werkzaamheden moet verrichten waarbij de uitkomsten worden weergegeven in een mondelinge of schriftelijke verslag of presentatie. veldwerk onderwijsvorm waarbij de student geheel zelfstandig in een bepaald gebied de theoretische kennis in de praktijk brengt.

Algemene vaardigheden

45


De opleiding verzorgt het onderwijs in de volgende vormen:



Tijdens de opleiding leer je verschillende soorten vaardigheden: van een mondelinge presentatie geven tot het opzoeken van literatuur en het lezen van een (geologische) kaart. Deze vaardigheden zijn verweven in verschillende cursusonderdelen, waarbij de moeilijkheidsgraad toeneemt naarmate je verder in de opleiding komt. De groei in je algemene vaardigheden zijn ook terug te vinden in de vier 'leerlijnen' van de opleiding, te weten: ■

■

■ ■

Zwaartepunten (kennis opdoen van geomorfologie, bodemkunde en landschapsecologie) Veldwerk (waarnemen en interpreteren van veldgegevens) Meten en Modelleren (kwantitatieve benadering van het vakgebied) Competenties (oefenen van communicatieve vaardigheden)

Gedurende de hele Bachelor oefen je algemene vaardigheden als onderdeel van een van de leerlijnen, zowel individueel als in groepsverband. 1.3

Doelstellingen

De bachelor opleiding Aardwetenschappen Fysische Geografie heeft tot doel de student kennis en vaardigheden bij te brengen op het gebied van 'systeem aarde' in het bijzonder van materiaalanalyse en fysisch geografisch patroon- en procesonderzoek, op een dusdanig niveau dat een afgestudeerde in staat is om, onder begeleiding, een gespecialiseerd Fysisch Geografisch onderzoek te formuleren en uit te voeren. De opleiding richt zich op het (leren) begrijpen van patronen en processen in de geomorfologie, bodemkunde, landschapsecologie en toepassingen hiervan binnen de geo-informatica en modellering. De Fysische Geografie is bij uitstek het domein waar gesteente, bodem, water, lucht en het leven bij elkaar komen. In de opleiding is accentuering binnen het vakgebied mogelijk door het kiezen van verschillende paden op het raakvlak van Fysische Geografie en Ecologie (Aarde en Natuur), het raakvlak Fysische en Sociale Geografie/Planologie (Aarde en Mens) en het raakvlak van Fysische Geografie en Milieuwetenschappen (Aarde en Milieu). De leerdoelen van de afzonderlijke vakken en onderwijselementen zijn beschreven bij het betreffende onderdeel in deze studiegids. 1.4

Eindtermen

De bachelor opleiding Aardwetenschappen heeft vijf studiepaden, per studiepad zijn de eindtermen afzonderlijk geformuleerd. De volledige eindtermen zijn te vinden in de Onderwijs en Examenregeling 2006-2007 ( http://www.studiegids.uva.nl)

46



2 Structuur van de opleiding 2.1 2.1.1


Het eerste jaar Opbouw eerste jaar

Opbouw eerste jaar

2.1.2

Studiebegeleiding eerste jaar

Tijdens de facultaire introductiedag van het eerste jaar worden alle studenten een ‘studentmentor’ toegewezen, vaak een tweedejaarsstudent, die je helpt bij het wegwijs worden op de universiteit. Dat gaat vooral over praktische zaken zoals: bij wie moet ik zijn voor veldwerkmaterialen, hoe moet ik me inschrijven voor tentamens en studieonderdelen, hoe werkt de repro, enz. Maar de studentmentor helpt je ook bij het indelen van je studiedag en geeft je tips hoe bepaalde boeken en literatuur te bestuderen. Voor inhoudelijke begeleiding kun je altijd bij de docent terecht en voor zaken als studievertraging meldt je je bij de studieadviseur (zie ook Hoofdstuk 2 van Boek 1: 'Algemene Informatie'). 2.1.3

Studieadvies eerste jaar

De opleiding is wettelijk verplicht aan het eind van het eerste studiejaar aan iedere student die voor de eerste maal is ingeschreven, een schriftelijk advies te geven over de voortzetting van de studie. De studieadviseur stuurt in december/januari een oproep voor een eerste gesprek aan

47


De studieonderdelen van het eerste en tweede semester geven de student een breed overzicht over wat Aardwetenschappen en de exacte kant van de opleiding inhouden. De semesters geven niet alleen een overzicht over de theorie maar ook over de diverse vaardigheden (zoals veldwerk en presentatietechnieken). De zwaartepunten van de studie komen naar voren in vakken zoals de Inleiding Aardwetenschappen en Landschapsanalyse. Verder zijn er ondersteunende vakken zoals Wiskunde en de Natuurwetenschappelijke Basis. Het voorlaatste onderdeel is Voorbereiding Veldwerk/Basisveldpracticum waarin je wat je geleerd hebt toepast in het veld (zie ook het volledige vakkenoverzicht in onderstaand schema).



studenten met geringe studieresultaten. De schriftelijke adviezen worden uiterlijk in augustus gegeven. Het eerste jaar is op dat ogenblik nog niet geheel voltooid, maar op basis van de op dat moment behaalde EC wordt een studieadvies gegeven. In overleg tussen student en studieadviseur zal een rooster voor de niet behaalde studieonderdelen worden opgesteld; dit is een onderdeel van het advies. Het studieadvies eerste jaar wordt gebaseerd op behaalde studiepunten. Het advies aan studenten aan het eind van het jaar ziet er als volgt uit: ■

■

■

■

60 EC (6 modules) behaald: positief advies; 40 of 50 EC (4 of 5 modules) behaald: positief advies, extra inspanning is vereist om de studieachterstand in te halen; 30 EC (3 modules) behaald: zeer twijfelachtig. De resultaten worden besproken in de Examencommissievergadering eind augustus. Afhankelijk van eventuele andere factoren die een rol kunnen spelen zover ze bekend zijn bij de studieadviseur, kan er een positief of negatief advies uitgebracht worden. minder dan 30 EC behaald: een negatief advies, de studieachterstand is dermate groot dat de studie waarschijnlijk niet met succes afgerond zal worden.

Studenten met een positief advies worden toegelaten tot het tweede jaar. Voorwaarde is dat studieachterstand uit de het eerste jaar weggewerkt is voor januari. 2.2 2.2.1

Het tweede en derde jaar Opbouw tweede en derde jaar

Het programma van het tweede studiejaar in de bachelor opleiding is voor alle studenten die het studiepad Fysische Geografie volgen hetzelfde. Doelstelling van het tweede jaar is verdieping van de theoretische en praktische kennis die is opgedaan tijdens de propedeuse fase. De vakken dragen als kenmerk dat ze patroon- of procesgericht zijn. Toepassing van theoretische en praktische kennis vindt plaats in het veldpracticum van vijf weken in Luxemburg, dat wordt afgerond met een schriftelijk verslag. In het derde jaar is er differentiatie mogelijk volgens de vier studieprogramma’s: Fysische Geografie, minor Aarde en Natuur, minor Aarde en Mens en minor Aarde en Milieu. In deze fase volgt een verdere verdieping van kennis, specialiseer je je in één van de boven genoemde minors en wordt de bacheloropleiding afgerond met een het uitvoeren van een onderzoek en het schrijven van een Bachelor Thesis, waarin ook je specialisatie tot uiting komt. Werkvormen tweede en derde jaar In de cursusperiodes van het tweede en derde jaar volg je hoorcolleges met een afsluitend tentamen en verricht je praktisch werk in de vorm van het doen van waarnemingen en/of het verrichten van experimenten, waarover mondeling en schriftelijk verslag gedaan wordt. Er zijn echter ook cursussen die een minder praktisch gericht karakter hebben.

48



Deze zijn vrijwel geheel gevuld met hoor- en werkcolleges en tentamen(s) of bestaan uit een literatuurstudie met schriftelijke rapportage. 2.2.2

Toelating tot tweede en derde jaar

De student kan deelnemen aan tweede en derde jaars onderwijs indien voldaan is aan de door de opleiding vastgestelde ingangseisen van de desbetreffende studie onderdelen (zie voor de beschrijvingen hoofdstuk 6). Voor de hieronder genoemde onderdelen gelden de volgende regels in de volgorde van de tentamens: ■

Wanneer niet aan deze voorwaarde is voldaan, moet de student contact opnemen met de studieadviseur. Voor individuele vakken zie ook ingangseisen in de studiegids op het web. 2.2.3

Ingangseisen cursussen tweede en derde jaar

Een student kan zich voor tweedejaars onderdelen inschrijven wanneer deze alle vakken heeft gehaald. Met name voor het Veldwerk Luxemburg kan men zich pas inschrijven als alle vakken uit het eerste jaar zijn behaald. In het algemeen geldt dat indien een veldwerk met een onvoldoende beoordeeld is, dat deze pas het jaar daarop overgedaan kan worden. Dit geldt voor: ■ ■ ■

■ ■

Veldpracticum Texel (onderdeel in 1e jaar periode 1) Basisveldpracticum (onderdeel in 1e jaar periode 5) Organismen in het milieu (onderdeel in 1e jaar periode 6) Veldpracticum Luxemburg (onderdeel 2e jaar periode 5 en 6) Veldwerkdeel Bachelor Thesis (onderdeel 3e jaar periode 5 en 6)

Ingangseisen derdejaars onderdelen bachelor opleiding De ingangseisen voor het derde jaar zijn: eerste en tweede jaar voltooid. Indien het eerste en tweede jaar niet voltooid zijn, kan er alleen toegang verleend worden na overleg en met instemming van de studieadviseur. Hierbij worden bijzondere eisen gesteld ten aanzien van de vakken in het tweede semester: De ingangseis voor de het vak ‘Bachelor Thesis' is dat er maximaal 10 EC deficiëntie mag zijn voor vakken uit het 2e jaar en dat het Luxemburg verslag is afgerond en met een voldoende is beoordeeld. Ingangseisen vrije minor Voor toegang tot het vrije minor programma moeten alle eerstejaars vakken gehaald zijn en bovendien mag men zich niet inschrijven voor een minor programma indien men 30

49


■

Voor toegang tot het tweedejaars onderdeel "veldpracticum Luxemburg" dienen alle onderdelen uit het eerste jaar te zijn behaald. Voor toegang tot het derdejaarsonderdeel "Bachelor Thesis" dienen alle onderdelen uit het eerste jaar te zijn behaald, en het onderdeel Luxemburg veldpracticum en verslaglegging met een voldoende te zijn afgesloten, en is een deficiëntie van vakken uit het tweede jaar ter grootte van maximaal 10 EC toegestaan.



EC studiepunten of meer deficiënt is. In dat geval dient de student een studieplan met de studieadviseur op te stellen.

50



3 Onderwijs en studentzaken 3.1


Het onderwijsbureau

Voor de primaire diensten van het onderwijsbureau kunnen studenten terecht bij het onderwijsbureau op de tweede verdieping van gebouw C (Roeterseilandcomplex C2.07). Correspondentieadres: Opleiding Aardwetenschappen, Nieuwe Achtergracht 166, 1018 WV Amsterdam, telefoon 020-525 7100. Dit is tevens het correspondentieadres van de Opleidingscommissie, Examencommissie en Colloquium Doctumcommissie. De openingstijden zijn: Maandag - Donderdag, 10:00 - 14:00.

3.1.1

Taken onderwijsbureau

Het Onderwijsbureau verzorgt de onderwijs- en studentenadministratie van de opleiding. Je kunt bij de balie van het Onderwijsbureau terecht voor: ■

■ ■ ■

■ ■

■ ■ ■

■ ■

■ ■ ■

■ ■

inschrijving bij de opleiding (eerstejaars studenten en doorstromers) inschrijving voor alle studieonderdelen van het curriculum aanmelden van het afstudeeronderzoek en keuzevakken aanvraag voor goedkeuring van masterprogrammaonderdelen voor de Examencommissie inleveren van evaluatieformulieren van studieonderdelen informatie over het studieprogramma informatie over studieen overgangsregelingen inzage in de studiegidsen van andere opleidingen aanvragen van het Bachelor en het Master examen, de aanvraag van het Bachelor / kandidaats- en Master / doctoraalexamen verklaring van afstuderen verstrekken/aanvragen van dossierverklaring bij het voortijdig afbreken van de studie verstrekken van goedkeuringsformulieren voor keuzeonderdelen buiten de opleiding verklaringen voor diverse instanties Engelse vertalingen van studieresultaten, verklaringen etc. inzage in diverse reglementen zoals de OER en het Privacyreglement afspraken met de studieadviseur

51


De eerste contactpersoon voor studenten Aardwetenschappen binnen het onderwijsbureau is Sietske van Houten, e-mail: [email protected], telephone: 020 - 525 7049. De coördinator van het onderwijsbureau is Margaret Jans, kamer C2.09, e-mail: [email protected], telephone: 020 - 525 7048. De studieadviseur voor studenten aardwetenschappen is Joke Koning, kamer C2.11, e-mail: [email protected], telefoon: 020 - 525 7047.



■ ■

■

studiegidsen en roosters aanvraagformulieren voor veldwerksubsidie (zie Mastergids) maken van afspraken

3.1.2

Aanmelden cursus / module

In het eerste semester van het eerste jaar worden studenten automatisch aangemeld voor studieonderdelen door het Onderwijsbureau. Vanaf het tweede semester van het eerste jaar moeten studenten zich echter zelf via studieweb individueel aanmelden voor deelname aan een studieonderdeel. De sluitingsdatum voor alle onderdelen die starten in september is één week voor aanvang van het onderdeel. Voor alle overige onderdelen geldt een sluitingstermijn van vier weken. Voor onderdelen van Biologie geldt een sluitingstermijn van zes weken. 3.1.3

(Aanmelden) tentamens en hertentamens

Iedere module wordt met één of twee (deel-)tentamens en eventueel een practicum-beoordeling afgerond. Het cijfer voor (deel-)tentamen(s) en practicum resulteert in één eindcijfer voor de periode. Wanneer het eindcijfer onvoldoende is (lager dan 6,0) bestaat de gelegenheid de theoretische gedeelten te herkansen. Elke module heeft twee herkansingsmogelijkheden. Het herkansingsrooster staat in een aparte bijlage. Studenten geven zich bij de modulecoördinator op voor een herkansing. Practica zullen in de regel het volgende jaar overgedaan moeten worden. De regels omtrent rechten en plichten betreffende tentaminering staan uitvoerig beschreven in de OER. De student dient zich apart aan te melden voor het tentamen. Met name via aanmelding op internet (studieweb) is dit van belang, want een aanmelding voor het studieonderdeel genereert niet automatisch een aanmelding voor het tentamen. De sluitingsdatum voor (her)tentamens is 1 week voor het tentamen. 3.1.4

Afmelden cursus en/of tentamen

Wanneer een student door omstandigheden na aanmelding toch niet kan deelnemen aan een studieonderdeel of (her)tentamen dan moet hij/zij zich persoonlijk zich bij het Onderwijsbureau én de modulecoördinator afmelden. Indien te laat (en dit mag alleen in geval van ziekte e.d. en problemen met ISIS-systeem), dient de student zich aan en af te melden bij Onderwijsbureau (via [email protected]). Alle aan- en afmeldingen worden via het Onderwijsbureau aan de docent(en) doorgegeven. 3.1.5

Uitslagen studieresultaten

Studieresultaten kunnen worden ingezien op Studieweb: http://studieweb.student.uva.nl. Voor individueel afgeronde studieonderdelen, zoals colloquium en scriptie, researchprac-

52



tica, stages, mondelinge tentamens e.d. wordt een tentamenbriefje/ beoordelingsformulier uitgeschreven. Iedere student ontangt via het studentenadministratie systeem ISIS automatisch een bericht van ingevoerde uitslagen op zijn/haar studentenmailadres of, indien een GSMnummer is opgegeven, een SMS-bericht. Verder ontvangt de student gedurende het studiejaar drie maal een uitdraai van de studieresultaten. Tussentijdse overzichten worden op aanvraag door de medewerkers van het Onderwijsbureau verstrekt. 3.2

Studieadviseurs

De studieadviseurs geven de studenten informatie en advies over de studie en alles wat daarmee samenhangt. Veel van dergelijke informatie vind je in de studiegids en vaak weten de medewerkers van het onderwijsbureau ook antwoord op een vraag. De studieadviseurs zijn er vooral voor de vragen (en problemen) die niet in een paar minuten te beantwoorden zijn, bijvoorbeeld: ■ ■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

■

informatie over het studieprogramma toelating tot studie met een buitenlands diploma wettelijke regelingen m.b.t. de studie vrijstellingen opheffing deficiënties studievoortgang en –advisering keuze afstudeeronderzoek en studieroutes beroepsoriëntatie externe (of buitenlandse) onderzoekstrainingen prestatiebeurs en studiefinanciering speciale studieen financiële regelingen speciale regelingen bij een lichamelijke handicap problemen in de persoonlijke sfeer die de studievoortgang nadelig beïnvloeden (tijdelijke) studiestaking problemen met studieplanning, studeermethodes problemen met docenten, assistenten roosterplanning, studievertraging en studieommezwaai studiekeuze doorverwijzingen naar een studentendecaan,-arts of –psycholoog of naar andere instellingen.

Ook worden tijdens de studie door de studieadviseurs verschillende voorlichtingsbijeenkomsten georganiseerd met informatie over afstudeerrichtingen, keuzemogelijkheden in de bachelor- en masterprogramma’s, stagemogelijkheden en beroepsperspectieven. In het

53


3.2.1

Studiebegeleiding



Documentatiecentrum vind je ook veel informatie. De studieadviseur is mw. drs. J.A.J.M. (Joke) Koning, REC, gebouw C, kamer C-2.11. Inloopspreekuur woensdag van 12:00 tot 13:30 of op afspraak via e-mail: [email protected]. Correspondentie- en bezoekadres: Nieuwe Achtergracht 166, 1018 WV Amsterdam. 3.2.2

Vertrouwenspersoon

De UvA wil seksuele intimidatie, agressie, geweld en discriminatie voorkomen en bestrijden. In het geval dat je te maken krijgt met seksuele intimidatie, agressie, geweld en discriminatie doe je er goed aan direct duidelijk te maken niet gediend te zijn van dit soort gedrag. Ook kun je naar een van de universitaire vertrouwenspersonen of een contactpersoon van jouw faculteit om je klacht te melden. Actie, bijvoorbeeld in de vorm van een officiële klacht, zal alleen ondernomen worden op verzoek en met uitdrukkelijke instemming van de betrokkene. De vertrouwenspersoon voor de opleiding Aardwetenschappen: mw. drs. Iris Hettelingh, tel. 020-525 5864, e-mail: [email protected]. De universitaire vertrouwenspersoon, Anneke Vijgeboom, is bereikbaar op maandag, dinsdag, donderdag en vrijdag tussen 10.00 en 15.00 op het nummer 020-52505548. Adres: Arbo- en Milieudienst, Plantage Muidergracht 14, e-mail: [email protected] (de mail wordt alleen gelezen door een van de vertrouwenspersonen en uiteraard met de grootst mogelijke vertrouwelijkheid behandeld.) 3.2.3

Klachtrecht en verdere begeleiding

Ook bestaat er aan de UvA een klachtenregeling voor studenten en personeel (zie ook: http://www.uva.nl/ombudsman en studentenhandboek, paragraaf. B11.9) en een klachtencommissie. Voor meer informatie over de studentendecanen, Bureau studentenpsychologen, de studentenhuisartsen en studeren met een handicap, zie het Studentenhandboek, of http://www.student.uva.nl/studentenhandboek 3.2.4

Studie en handicap

Studenten met een (lichte) handicap of een chronische en/of langdurige ziekte kunnen vertraging oplopen bij de studie. Een financiële tegemoetkoming is hiervoor mogelijk (zie studentenhandboek Hoofdstuk 4.1). Ook zijn aanpassingen en voorzieningen mogelijk om de studie succesvol te kunnen afronden. Dit kan inhouden dat tentamens in het ziekenhuis kunnen worden gemaakt, extra tijd wordt uitgetrokken voor een tentamen, aanpas-

54



singen op het practicum worden geregeld etc. Neem hiervoor contact op met de studieadviseur of de studentendecaan. Gehandicapte studenten kunnen zich ook formeel tot de examencommissie wenden met het verzoek om bepaalde voorzieningen. Een handige informatiebron is ook de organisatie Handicap en Studie, zie http://www.handicap-studie.nl. Op deze website zijn o.a. studietips te vinden voor studenten met een functiebeperking. Je kunt het gratis tijdschrift ‘Binding’ bestellen via [email protected] of telefoonnummer 030-275 3306. Op dit nummer is tevens de telefonische helpdesk te bereiken (alle werkdagen van 9.00 tot 12.30 uur). De gebouwen op het Roeterseiland zijn goed toegankelijk voor gehandicapten. Studentenhuisartsen

De studentenartsen verlenen studenten (en hun partners en kinderen) diensten als van een huisarts. Afspraakspreekuren: op alle werkdagen overdag en op maandag- en donderdagavond. Je kunt telefonisch een afspraak maken voor het spreekuur op werkdagen van 9.00 tot 12.00 uur, telefoon: 020-525 2878/4772, of direct aan de balie. Open spreekuren: op maandag t/m vrijdag van 9.00-9.45 uur en van 13.30-14.00 uur. Telefonisch spreekuur: op maandag t/m vrijdag van 12.30-13.00 uur. Huisbezoeken: het liefst voor 12.00 uur aanvragen. Vaccinatiespreekuur voor de tropen: zonder afspraak van maandag t/m vrijdag van 10.30 tot 11.00 uur. Het is raadzaam om ongeveer vijf weken voor vertrek een eerste bezoek te brengen. Assistentenspreekuur: van dinsdag t/m vrijdag tussen 14.00 en 16.00 uur kun je bij de praktijkassistenten terecht voor: - het behandelen van wratten met vloeibare stikstof - het verwijderen van hechtingen - het controleren van urine bij verdenking op, of controle na, blaasontsteking - het uitspuiten van oren - het geven van (herhalings)injecties - vervolgvaccinaties voor de tropen Oude Turfmarkt 151 1012 GC Amsterdam Tel: 020-525 2878/4772 Spoedhulp: 020-525 2889 Bel voor spoedeisende medische problemen buiten openingstijden en in het weekend: 020-592 3388. Er is altijd één van de artsen bereikbaar. Voor meer informatie en inschrijving: http://www.uva.nl/voorzieningen -> Welzijn & gezondheid -> Bureau Studentenartsen en huisartsen ‘Oude Turfmarkt’ Verwijzingen: http://www.uva.nl/voorzieningen/studentenartsen

55


3.2.5



3.3 3.3.1

(Advies)commissies ten behoeve van het onderwijs Opleidingsteam

Het Opleidingsteam van de opleiding Aardwetenschappen bestaat uit docenten en studenten. Zij bekijken regelmatig het curriculum op aanbod, inhoud en afstemming van de cursussen en maken (nieuw) beleid. Ook gaat het team over de dagelijkse gang van zaken bij de opleiding. Het opleidingsteam Aardwetenschappen bestaat uit vier docenten en één studentvertegenwoordiger en wordt ondersteund door een beleidsmedewerker van het Onderwijsinstituut Levens-en Aardwetenschappen, drs. L. Kerstens (Opleidingscoördinator Aardwetenschappen & Biologie LAW). Het Opleidingsteam vergadert maandelijks en is te bereiken via het secretariaat van IBED gevestigd op het Roeterseiland, kamer B. 2.25, [email protected], tel. 020-525 7451). Opleidingsteam Prof. Dr. Ir. W. Bouten (voorzitter) Dr. J. van Mourik (Algemene Bachelor-coördinator) Dr. A. Tietema (Algemene Master-coördinator) Dr. P. de Voogt (infrastructuur) C. Cusell (student vertegenwoordiger) 3.3.2

Opleidingscommissie (OC)

Iedere opleiding heeft een Opleidingscommissie. Deze bestaat voor 50% uit studenten en voor 50% uit docenten. Alle leden worden door de decaan aangewezen, student-leden worden door het Studenten Overleg aangedragen. De vergaderingen van de commissie hebben tot taak: ■

■ ■

■

het, gevraagd of ongevraagd, advies uitbrengen aan het bestuur van de opleiding of opleidingsdirecteur en aan de decaan over alle aangelegenheden betreffende het onderwijs in de desbetreffende opleiding; advies uit te brengen over de Onderwijs- en Examenregeling; het jaarlijks beoordelen van de wijze van uitvoeren van de Onderwijs- en Examenregeling; evalueren van het door de faculteit verzorgde onderwijs.

De voorzitter en secretaris van de OC hebben regelmatig overleg met de opleidingscoördinator over lopende zaken. De commissie vergadert ongeveer 6 keer per jaar. Studenten die graag mee willen praten over de inrichting en kwaliteit van het onderwijs kunnen lid worden van de opleidingscommissies. Nieuwe student-leden van de OC kunnen een korte cursus volgen bij de ASVA Studentenunie ter voorbereiding op hun taak. Als je meer informatie wilt of geïnteresseerd bent in een lidmaatschap, neem dan contact op met een van de huidige student-leden van de OC.

56



Opleidingscommissie Bachelor: dr. J.M. van Mourik (voorzitter) dr. A.C. Seijmonsbergen (docentlid) dr. A. Tietema(docentlid) N.Weiss (studentlid) R.A. Bom (Studentlid) M.Velthuis (studentlid)


Master/Vijf-jarige opleiding: dr. J.M. van Mourik (voorzitter) dr. A.C. Seijmonsbergen (docentlid) dr. A. Tietema(docentlid) Casper Cusell (studentlid, vice voorzitter) J. Stoffels (studentlid) M.L. Schijf (studentlid)

De opleidingscommissie vergadert maandelijks, met uitzondering van juli en augustus. Postadres van het secretariaat van de OCAW: p/a Onderwijsbureau, Nieuwe Achtergracht 166, 1018 WV Amsterdam, t.a.v. M. Jans, e-mail: [email protected], tel. 020 525 7048 kr. C 2.09 3.3.3

Examencommissie (Excie)

Iedere bacheloropleiding heeft een aparte Examencommissie. De Examencommissie behandelt de goedkeuringsaanvragen voor stages en scriptie, neemt de examens af, beoordeelt het niveau van afwijkende vooropleidingen en neemt schriftelijke verzoeken in behandeling voor niet-reguliere studieprogramma’s en voor vrijstellingen van studieonderdelen, op grond van een vorige studie. De commissie beoordeelt de aanvragen voor het volgen van keuzeonderdelen buiten de opleiding, die niet in de studiegids zijn opgenomen en neemt besluiten met betrekking tot toekenning van extra studiepunten bij verlenging van stages e.d.. Hiertoe moet de student een goed gemotiveerd schriftelijk verzoek (mede ondertekend door de examinator) indienen bij de secretaris van de Examencommissie. De Examencommissie kan een belangrijke rol spelen in het oplossen van klachten rondom tentamens en examens. Hierdoor kan in veel gevallen een procedure bij het College van Beroep voor de Examens worden voorkomen. Klachten over de afname of beoordeling van een tentamen kan binnen veertien dagen na bekendmaking van de uitslag bij de Examencommissie worden ingediend.

57



De Examencommissie beslist op haar eerstvolgende vergadering, maar niet later dan vijf weken na ontvangst van het verzoek (behalve in de maanden juli en augustus). Voorzitter: dr. L.H. Cammeraat Secretaris: dr. ir. J.H. van Boxel prof. dr. ir. W. Bouten dr. A. Tietema dr. A.M. Kooijman dr. P. de Voogt De studieadviseurs/onderwijsbureau bereiden de verzoeken voor de Examencommissie voor, zij maken geen deel uit van de Examencommissie. Correspondentie richten aan: Secretaris van de Examencommissie Aardwetenschappen, p/a Onderwijsbureau Aardwetenschappen, Nieuwe Achtergracht 166, 1018 WV Amsterdam, e-mail: [email protected] , tel. 020 525 6216 / 7048 (secretariaat) 3.4 3.4.1

Praktische zaken Verkoop van boeken, syllabi, loeps, geologische hamers en kompassen

Binnen de studievereniging GAOS is een boekencommissie actief. Via deze commissie zijn de meeste studieboeken die in de studiegids staan vermeld tegen een gereduceerde prijs verkrijgbaar. De verkoop van deze boeken en andere studiematerialen zoals loeps, geologische hamers en kompassen vindt plaats via de GAOS webshop (www.shop.svgaos.nl). Syllabi zijn bij aanvang van de cursus via de docent verkrijgbaar. Overige studieboeken zijn verkrijgbaar bij de boekhandel Scheltema op het Roeterseiland of het Koningsplein. 3.4.2

Veldwerkmateriaal: regeling betreffende beheer en uitleen

Deze regeling betreft uitsluitend veldwerkmateriaal van algemene aard (boormateriaal, spaden, Munsell Scales, FAO Guidelines, kompassen, hellingmeters, zandlinealen, humushappers e.d.). De regeling dient nageleefd te worden door een ieder die gebruik wil maken van het betreffende veldwerkmateriaal (personeel, studenten, promovendi, onderzoekers buiten dienstverband, gastonderzoekers). Voor het lenen van veldwerkmateriaal kan men terecht bij Bert de Leeuw (W.21; telefoon 020-525 7414). Voor veldwerkmateriaal van (bodem-)chemische aard (pH en EC meters, zoutzuur etc.) kan men terecht bij Leo Hoitinga (G1.22; telefoon 020-525 7437). Het is verstandig dit ruim van te voren te doen zodat je er verzekerd van bent dat het materiaal beschikbaar is. Bij het uitreiken van veldwerkmateriaal wordt een uitleentermijn afgesproken en schrifte-

58



3.4.3

Veldwerkmateriaal voor studenten

Door de student zelf verplicht aan te schaffen: ■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

Notitieboek met harde kaft, dat in zijzak of borstzak van veldjack past; Potlood (potloodschrift blijft leesbaar, als het veldboek nat mocht worden (dit in tegenstelling tot ballpoints en inktstiften) en vlakgum; Stevig zakmes (met terugklap beveiliging); 2 meter meetlint of duimstok met gemarkeerde 10 cm. verdeling; Loep (vergroting minimaal 10x); Spiegelkompas met clinometer; Geologische hamer; FAO Guidelines.

Veldwerkmateriaal te leen: ■

■ ■ ■

■

Zandliniaal; Spade; Boormateriaal; Hellingmeetapparaat (Abneylevel of hellingpistool); Soil Color Charts.

59


lijk vastgelegd. Als men de uitleentermijn wil verlengen, dient men dit uiterlijk op de dag van het verstrijken van de uitleentermijn te melden bij het secretariaat. Bij onaangekondigde overschrijding van de uitleentermijn is men een boete verschuldigd van € 5 per dag. Het geleende materiaal dient schoon te worden ingeleverd. Tot nader order wordt geen borgsom gevraagd voor uitgeleend veldwerkmateriaal. De lener ondertekent bij het in ontvangst nemen van het veldwerkmateriaal een verklaring dat hij/zij aansprakelijk is voor verlies van of schade aan het geleende materiaal. In het geval van groepswerk is de leider/coördinator van het veldwerk verantwoordelijk en aansprakelijk voor het geleende materiaal. Als schade is ontstaan bij normaal gebruik van het materiaal, zal de schade niet worden verhaald op de lener (ter beoordeling van de verantwoordelijke docent). Verlies wordt altijd verhaald op de lener. Het veldwerkmateriaal zal jaarlijks in oktober worden geïnventariseerd en bij gebleken behoefte zal nieuw materiaal worden aangeschaft. Degene die veldwerkmateriaal leent, gaat stilzwijgend akkoord met deze regeling. Geleend veldwerkmateriaal dienjt vooraf te worden opgegeven bij [email protected] i.v.m. de verzekering ervan. Zie ook Algemene studiefaciliteiten, praktische informatie en verzekeringen en veiligheid.



3.4.4

Practicum en Collegezalen

REC Het onderwijs wordt voornamelijk gegeven in de gebouwen B, C, D, en G van het Roeterseilandcomplex. Bij de portiers liggen de zalenroosters en daar kun je terecht voor algemene informatie. Biologisch Centrum Anna’s Hoeve De meeste biologie onderdelen binnen de Bachelor Aardwetenschappen worden gegeven in de gebouwen op de Kruislaan 318-326. Bij grote studentenaantallen wordt uitgeweken naar de collegezaal in het CWI op Kruislaan 413. Vóór aanvang van een module wordt het rooster bekend gemaakt (per post, op blackboard en/of per e-mail). Algemene regels In alle openbare gebouwen mag niet gerookt worden, dus ook niet in de kantine. In de collegezalen, laboratoriumzalen en Computer Gebruikers Ruimten (CGR) is het niet toegestaan te eten en drinken. Voor laboratoria en CGR gelden de regels die vermeld zijn in de zalen. 3.4.5

Computerfaciliteiten AW

Computerzalen voor Cursorisch Onderwijs De opleiding Aardwetenschappen heeft relatief veel computerondersteund onderwijs. Hiertoe wordt een aantal computerzalen frequent ingezet zoals de Studio Classroom en de GIS-ruimte in het Wetenschappelijk Centrum Watergraafsmeer, zaal C6.11 (REC) en de zalen van de Faculteit der Economische Wetenschappen en Econometrie (FEE) op het REC. Alle zalen zijn uitermate geschikt voor computeronderwijs omdat er moderne computers en schermen aanwezig zijn, studenten en docenten via hetzelfde computernetwerk werken, er beamers beschikbaar zijn voor projecties en er voldoende werkruimte is. De FNWI beschikt sinds 2000 over een Studio Classroom. In deze experimentele onderwijsruimte wordt college gegeven met optimale visuele- en audiomogelijkheden. In deze ruimte kunnen eenvoudige meetexperimenten worden uitgevoerd waarbij de meetapparatuur gekoppeld is aan de computer. Ook heeft de opleiding Aardwetenschappen samen met de opleiding Biologie sinds medio 2003 een eigen GIS-studio in de Watergraafsmeer. Deze ruimte is uitgerust met negen computers met geavanceerde GIS-programma’s. Computerwerkplekken Voor de studenten zijn er verschillende computerruimten beschikbaar (o.a. in het Studieen Informatiecentrum). Elke werkplek is voorzien van een snelle computer met internet en alle benodigde software, alleen voor speciale programma’s voor GIS en Remote Sensing is men aangewezen op de GIS-studio’s. De meeste van deze computerwerkplekken worden gedeeld met andere opleidingen en zijn verdeeld over verschillende gebouwen op het REC en dus goed bereikbaar. In de praktijk blijkt dat het aantal computerwerkplekken ruim voldoende is voor het aantal studenten, aangezien zelden alle

60



plekken in gebruik zijn. Als er een tijdelijk tekort aan studieplekken is, kunnen studenten uitwijken naar de algemene studiezaal op de 1e verdieping van gebouw A binnen het REC complex. Alle werkplekken zijn volgens ARBO richtlijnen ingericht en studenten worden gewezen op RSI gevaar bij veelvuldig computergebruik. 3.4.6

Verzekeringen

Zie hiervoor 3.9.7 in het algemene subboek. Voor verschillende activiteiten heeft de UvA een verzekering afgesloten. 3.4.7

Prikborden / mededelingen

3.4.8

Kopiëren

REC In gebouw B, Nieuwe Achtergracht 166, bevinden zich op de eerste verdieping aan het eind van de doorloop van gebouw A naar B een aantal kopieerapparaten. De kopieerkaarten zijn verkrijgbaar bij de repro achter de Facilitheek op de eerste etage. Biologisch Centrum Anna’s Hoeve Kopieermachines zijn te vinden op de volgende plaatsen: In gebouw I: één bij de hoofdingang en één op de eerste verdieping tussen gebouwdelen B en C; bij de bibliotheek (gebouw IV): naast collegezaal. Kopieerkaarten zijn te koop bij de portier in Matrix 4, Kruislaan 404. Let op: de kopieerkaarten op de twee locaties zijn verschillend, ze kunnen alleen gebruikt worden op de locatie waar ze zijn afgegeven 3.5 3.5.1

Bachelorexamen Aanvraag bachelorexamen

Studenten die de bachelor opleiding volgen sluiten hun opleiding af met het bachelor examen. Het propedeuse examen is bij de invoering van de Bachelor/Master structuur afgeschaft. Het examen kan worden aangevraagd wanneer alle studieonderdelen met een voldoende resultaat zijn afgerond (zie verder voor sluitingsdata van de aanvraag). Benodigdheden bij de aanvraag van een examen:

61


Mededelingen voor studenten verschijnen op de website van de opleiding onder ‘Mededelingen’ (http://www.student.uva.nl/arw/actueelarw.cfm). De uitslagen van tentamens en mededelingen omtrent de studie liggen ter inzage bij het onderwijsbureau van je opleiding. Op de prikborden op de 2e verdieping vind je onder andere informatie over congressen, voorlichtingsbijeenkomsten en activiteiten van de studievereniging.



■

■

■

■

■

het meest recente overzicht van de studieresultaten dat door de onderwijsadministratie is verstrekt (indien nodig kan een nieuwe uitdraai worden gemaakt); resultaten waarvoor je een briefje hebt ontvangen en die nog niet op je overzicht van studieresultaten staan; een kopie van je paspoort of identiteitskaart, òf een uittreksel uit het bevolkings- of geboorteregister. Rijbewijs of andere identiteitsbewijzen zijn niet toegestaan; eventueel bij het examen behorende, door de examencommissie ondertekende, goedkeuringsformulieren van bijvoorbeeld keuzeonderdelen en stages buiten de opleiding, bedrijfsstages als keuzeonderdeel, afstudeerprogramma dat afwijkt van de OER; Goedgekeurde Bachelor Aardwetenschappen studieplan formulier.

Let op! Alvorens het examen aan te vragen moet aan alle inschrijvingsverplichtingen bij de UvA zijn voldaan, anders kan er geen diploma worden aangevraagd. Het bachelorexamen kan bij het Onderwijsbureau worden aangevraagd tot uiterlijk drieen-een-halve week voor de examendag (uitreikingsdatum), in de regel op maandag. Op het moment van aanvragen moeten alle cijfers bekend zijn. Voor de het aanvragen van het examen dient de student een afspraak te maken met het Onderwijsbureau (voor het afstudeergesprek en ter controle van de studiepunten). Het maken van een afspraak kan telefonisch (020 525 7100). De diploma-uitreikingen vinden plaats op de volgende data: Deadline aanvraag

Uitreiking diploma's

Maandag 4 september 2006*

Woensdag 20 september 2006

Maandag 10 oktober 2006 Maandag 20 november 2006

Woensdag 13 december 2006**

Maandag 8 januari 2007 Maandag 5 februari 2007 Maandag 5 maart 2007

Woensdag 28 maart 2007

Dinsdag 10 april 2007 Maandag 7 mei 2007 Maandag 11 juni 2007

Woensdag 4 juli 2007

Maandag 9 juli 2007 Maandag 6 augustus 2007

Woensdag 29 augustus 2007

N.B. Per maand geldt een deadline voor de aanvraag in die maand ook al is de uitreiking een paar maanden later; dit i.v.m. toezending stukken aan Bureau Examens en teruggave collegegeld vanaf de maand die volgt op de maand waarin het laatste resultaat van het afsluitende examen is behaald (bachelor, master en doctoraal).

62



De laatste datum is de allerlaatste datum waarop het examen voor de betreffende uitreikingsdatum aangevraagd kan worden. ■

■

* Bij uitzondering korter dan de ruim 3 weken van tevoren, vanwege mogelijke laatste cijfers in augustus 2006; voor 2007-2008 hoeft dan geen nieuw collegegeld betaald te worden voor de uitreiking in september. ** I.v.m. Kerstvakantie vroegere examenuitreikingen in december

Lokatie examens: Alle examens vinden plaats in zaal A, geb. A. 3.5.2

September regeling

3.5.3

Toekenning predikaat 'Cum Laude'

Wanneer de student tijdens de studie blijk heeft gegeven van uitzonderlijke bekwaamheid, kan dit op het getuigschrift worden vermeld met het predikaat ‘cum laude’. De examencommissie van de opleiding beslist over het al dan niet toekennen van de 'cum laude' aantekening. (Voor de voorwaarden voor het behalen van een 'cum laude' aantekening zie Onderwijs en Examenregeling (OER)). N.B. In bijzondere gevallen kan de examencommissie afwijken van deze regels. 3.5.4

Diploma uitreiking

De student wordt schriftelijk op de hoogte gebracht van de tijd en plaats van de uitreiking, waarbij familieleden en vrienden ook van harte welkom zijn. Bijlage bij het diploma Op de bulbijlage van het diploma worden de tot het examen behorende afgelegde studieonderdelen en bijbehorende studielast vermeld met de behaalde cijfers. 3.5.5

Afstudeerverklaring

Voor degenen die vóór de uitreiking een bewijs nodig hebben dat zij aan alle voorwaarden van het bachelor examen hebben voldaan kan op verzoek een bachelor afstudeerverklaring worden afgegeven.

63


Bachelor studenten van de opleiding Aardwetenschappen die uiterlijk 31 augustus van het studiejaar aan alle voorwaarden van het bachelorexamen hebben voldaan kunnen in september een bachelor diploma ontvangen dat op augustus is gedateerd. Zij hoeven zich dan niet in te schrijven voor het nieuwe studiejaar. Voorwaarde is dat het laatste resultaat in augustus gedateerd is, en dat dit tijdig gemeld wordt bij het Onderwijsbureau.



3.6 3.6.1

Verenigingen Studieverenigingen

Studievereniging Aardwetenschappen 'GAOS' GAOS (Geografische Activiteiten en Onderwijs voor Studenten) is de studievereniging voor en vooral ook door studenten Fysische Geografie, waarvan alle studenten lid kunnen worden. Het inschrijfgeld voor GAOS is eenmalig € 20,- en dit is dan voor de rest van je studie. GAOS heeft tot doel om tal van activiteiten te organiseren ten behoeve van ontspanning en ter verbetering van de sociale contacten onderling. Onze activiteiten bestaan bijvoorbeeld uit borrels, feesten, excursies, wandel- en fiets- weekenden. Als lid ben je altijd welkom op de activiteiten en, indien van toepassing, voor een gereduceerde prijs! Door het betrekkelijk kleine aantal studenten dat Fysische Geografie studeert, is GAOS in grote mate afhankelijk van een actieve inbreng van haar leden. Een groot voordeel van deze actieve inbreng is dat studenten uit de verschillende studiejaren elkaar leren kennen, en dat er niet aparte groepjes gevormd worden per studiejaar, maar dat de ‘groep’ het merendeel van alle studenten omvat. GAOS is niet politiek getint, maar heeft wel een kritische kijk op de onderwijskwaliteit. Daarom ook is GAOS vertegenwoordigd in verschillende raden en commissies, waar het de belangen van de studenten vertegenwoordigt. ■

■

■

Boekenverkoop: Wanneer je lid bent van GAOS krijg je een lidmaatschapskaart die korting geeft op je studieboeken bij Scheltema. In overleg met de boekencommissaris worden de boeken besteld en kun je deze zelf afhalen bij Scheltema in de vestiging Roeterstraat. Materiaalverkoop: Via de webwinkel van GAOS kun je tegen gereduceerd tarief loeps, geologische hamers en kompassen aanschaffen (http://www.shop.svgaos.nl). Bestuur Het bestuur is bereikbaar onder e-mail adres: [email protected], en wisselt 1x per jaar rond Valentijnsdag. Voorzitter: Joost Stoffels Secretaris: Maartje Faasse Penningmeester: Joost Brinkkemper Boekencommisaris: Bart Zwemmer Externe betrekkingen/EGEA: Natalie Haussmann Vergaderingen Iedereen die belangstelling heeft voor de activiteiten van GAOS, of voor zaken die binnen de faculteit spelen, kan naar onze vergaderingen komen. Deze worden eens in de 2 à 3 weken gehouden op wisselende locaties. Uiteraard is het mogelijk zelf ideeën of punten in te brengen voor een vergadering, deze kun je via de e-mail doorgeven. ■ ■ ■

■ ■ ■

64



■

Aankondigingen Alle activiteiten worden aangekondigd via de email. Wil je opgenomen worden in de mailinglist, stuur dan een mailtje naar [email protected]. Bovendien staan alle activiteiten en andere leuke wetenswaardigheden op onze website: http://www.svgaos.nl. Verder kun je berichten over de activiteiten van GAOS vinden op de prikborden bij de koffiekamer in B2.32. En natuurlijk kun je ook even langs komen op de GAOS-kamer om het aan iemand te vragen! We zitten in kamer B2.42.

3.6.2

Alumniverenigingen

Amsterdamse Universiteits Vereniging (AUV) De Amsterdamse Universiteits Vereniging (AUV) is de overkoepelende alumnivereniging van de UvA, opgericht in 1889. De AUV wil de band versterken tussen de UvA en haar afgestudeerden en tussen de alumni onderling. Lidmaatschap van de AUV staat open voor diegenen die aan de UvA een erkend diploma of examen - uitgezonderd de propedeuse hebben behaald. Daarnaast kent de AUV begunstigers. De contributie bedraagt € 30,- per kalenderjaar (in 2006). Alumnivereniging Lulofs De alumnivereniging van de fysisch geografen heet Lulofs. Het primaire doel van de alumnivereniging is om een uitwisseling tot stand te brengen tussen oud-studenten onderling en medewerkers en studenten. Lulofs doet dit door het opbouwen van een uitgebreid databestand van alumni. Het organiseert themamiddagen, borrels en excursies, waar uitwisseling van ervaringen plaats kan vinden en oude contacten hersteld kunnen worden. Bovendien geeft Lulofs een nieuwsbrief uit. Alle afgestudeerden zijn automatisch lid. Lulofs p.a. Secretariaat IBED-Fysische geografie, Nieuwe Achtergracht 166, 1018 WV Amsterdam. Telefoon: 020-525 7451; e-mail: [email protected] Actuele informatie over de alumniverenigingen van de UvA is te vinden op http://www.alumni.uva.nl/clubs/ 3.6.3 ■

Beroepsverenigingen

KNAG: Koninklijk Nederlands Aardrijkskundig Genootschap Het Koninklijk Nederlands Aardrijkskundig Genootschap (KNAG) is de vakvereniging voor geografen in Nederland en telt circa 4000 leden, waaronder

65


UvA-alumni hebben in het verleden verschillende verenigingen opgericht en er komen jaarlijks nieuwe verenigingsverbanden bij. Verder zijn er verenigingen en kringen van faculteiten en/of opleidingen. Deze komen regelmatig samen om ideeën en ervaringen uit te wisselen. Naast deze kringen voor alumni is er nog de sociëteit van de UvA, waar (oud)personeelsleden en alumni elkaar ontmoeten: de Amsterdamse Academische Club.



■

■

studenten sociale en fysische geografie en planologie. Als lid ontvang je tien keer per jaar de nieuwsbrief ‘KNAG-Nieuws’. Voor meer informatie zie: http://www.knag.nl. KTFG: De Kring voor Toegepaste Fysische Geografie De KTFG, opgericht in 1982, is een beroeps- en belangenvereniging van en voor fysisch geografen, aardwetenschappers en geomorfologen in Nederland en is een onderdeel van KNAG. De vereniging is ook toegankelijk voor studerende aardwetenschappers en fysisch geografen. Voor meer informatie zie http://www.KTFG.nl KNGMG: Koninklijk Nederlands Geologisch Mijnbouwkundig Genootschap Het KNGMG, opgericht in 1912, is de Nederlandse wetenschappelijke en beroepsvereniging voor aardwetenschappers met inmiddels zo'n 1500 leden. Voor meer informatie zie: http://www.kngmg.nl

3.7

Kandidaatsfase / doctoraal opleiding aardwetenschappen

De 5-jarige kandidaats/doctoraalopleidingen (de zogenaamde ongedeelde opleidingen) zijn een aantal jaren geleden overgegaan in de bachelor/masteropleidingen. Deze ongedeelde opleidingen zullen uiterlijk in 2008 ophouden te bestaan. Na die datum mogen er geen diploma’s van deze opleidingen meer worden uitgegeven (zie onderstaande tabel). Voor studenten in de oude Kandidaatsfase geldt dat ze tot september 2007 hun Kandidaatsdiploma kunnen behalen. Daarna vervalt die mogelijkheid. Studenten met een Kandidaatsdiploma moeten zich daarna inschrijven bij de opleiding Master Earth Sciences. Voor studenten die de oude Doctoraal opleiding Fysische geografie volgen geldt dat zij uiterlijk tot september 2007 hun Doctoraaldiploma kunnen behalen. Voor doctoraal studenten ingeschreven bij opleiding Aardwetenschappen geldt dat zij tot september 2008 uiterlijk hun Doctoraaldiploma kunnen behalen. Studenten die denken dat zij het betreffende diploma niet voor genoemde datum behalen, moeten zich met een herinschrijvingsformulier overschrijven naar de Master Earth Sciences. Neem voor de procedure contact op met het Onderwijsbureau. ■

■

■

Naam opleiding

Crohonummer

Diploma behalen voor

of overschijven naar

Aardwetenschappen

06986

31-8-2008

Master Earth Sciences

Fysische Geografie

06858

31-8-2007

Master Earth Sciences

3.7.1

Overgangsregeling bachelor en kandidaatsfase

In het studiejaar 2006-2007 wordt het 8-8-4 rooster systeem ingevoerd. Dien ten gevolge verandert in een aantal gevallen de inhoud van vakken of de zwaarte van de vakken. - Vakken die verdwijnen:

66



67


De vakken Experimentele Plantkunde, Hydrologie en Bodemfysische Eigenschappen zullen niet meer gegeven worden en kunnen nog twee keer worden herkanst in het studiejaar 2006-2007. Voor de bovengenoemde vakken komen de vakken Organismen in het Milieu en Water Management in de plaats. - Vakken waarvan de studielast (ECTS) geringer wordt: Voor de vakken die in aantal studiepunten (ECTS) omlaag gaan geldt dat bij de desbetreffende vakken bij een hertentamen in het studiejaar 2006-2007 een extra opdracht wordt gemaakt of extra stof wordt getentamineerd equivalent met het verschil in ECTS tussen de huidige en oude versie van het vak. Dit betreft de vakken Fysisch Geografische Systemen, Inleiding Aardwetenschappen, Luxemburg veldwerk en Materiaal Eigenschappen - Vakken waarvan de studielast (ECTS) groter wordt Studenten die een van deze vakken in het studiejaar 2005-2006 (of eerder) gevolgd hebben, maar niet zijn geslaagd voor het tentamen kunnen bij het tentamen en de herkansingen in het studiejaar 2006-2007 nog tentamen doen over de oude stof. Studenten die het vak nog niet gedaan hebben kunnen het vak direct in de nieuwe vorm volgen. Dit betreft de vakken Wiskunde, Landschapsanalyse, Atmosferische Fysica, Basis Veldpraktikum, Chemie van Bodem en Water en Programmeren. - Na het studiejaar 2006.2007: In het studiejaar 2007-2008 zullen geen hertentamens van vakken plaats vinden gebaseerd op of aangepast aan de situatie van het studiejaar 2005-2006. De ExamenCommissie Aardwetenschappen (ECAW) adviseert de studenten dan ook ervoor te zorgen dat zij in het studiejaar 2006-2007 alle veranderde vakken in ieder geval halen. Mocht dat niet lukken dan zal in overleg met de studieadviseur een individuele regeling worden getroffen, die ter goedkeuring wordt voorgelegd aan de ECAW.



68



4 Doorstromen naar een Masteropleiding 4.1


Masteropleiding

Als je het Bachelordiploma hebt behaald is de meest voor de hand liggende vervolgopleiding de Masteropleiding. Alle masteropleidingen bij FNWI duren twee jaar. In de masterfase doe je zelfstandig een of meerdere onderzoekstrainingen van in totaal een jaar bij de universiteit of bij een bedrijf en schrijf je een scriptie. Het andere jaar kan gekozen worden uit een onderzoeksvariant, een maatschappelijke variant (ST&PM profile) of een communicatieve/educatieve variant (CE-profile). Opleiding Aardwetenschappen

Algemene opbouw van de masteropleidingen:

69



4.1.1

Richtlijnen toelating tot de master-opleiding / Programma-coordinatoren

Alle bachelorprogramma’s gevolgd bij Aardwetenschappen geven toegang tot alle Masterprogramma's van Aardwetenschappen. Studenten die afwijken van de ingangeisen moeten contact opnemen met de coördinator van het desbetreffende programma. De deficiënte vakken kunnen in het masterprogramma gevolgd worden. Met de coördinator wordt een programma samengesteld. Dit moet ter goedkeuring voorgelegd worden aan de examencommissie. Masterprogramma

Coördinator

Computational Bio- and Physical Geography

prof. dr. ir. W. Bouten, 525 7412 [email protected]

Earth surface processes

dr. A. Tietema, 525 7458 [email protected]

Earth and Environmental Sciences

dr. P. de Voogt, 525 6565 [email protected]

Landscape Ecology

dr. A.M. Kooijman, 525 7422 [email protected]

4.1.2

Doorstroom naar Master buiten UvA

Een afgestudeerde Bachelor kan goed doorstromen naar een Engelstalige master in Earth Sciences of Physical Geography aan één van de Nederlandse universiteiten. Afhankelijk van het in de bachelor doorlopen studieprogramma kan een afgestudeerde Bachelor ook toegang krijgen tot een master in Biological Sciences of een master in Mathematics and Science Education aan de Universiteit van Amsterdam. Hiervoor is toestemming van de

70



desbetreffende examencommissie nodig en in sommige gevallen het volgen van een extra schakelprogramma vereist. De aansluiting op internationale masters is naar verwachting goed, daar een Nederlandse Bachelor diploma qua niveau goed aansluit bij internationale maatstaven. 4.1.2.1

Overstapmogelijkheden van en naar andere faculteiten

4.1.3

Leraaropleiding

Om leraar te worden is een eerstegraadsbevoegheid voor het schoolvak aardrijkskunde noodzakelijk. Deze bevoegdheid kan volgens twee trajecten bij de UvA behaald worden. Als men eenmaal over de bevoegdheid beschikt, kan men deze ook uitbreiden met de bevoegdheid voor het schoolvak algemene natuurwetenschappen. Een eerstegraadsbevoegheid geeft recht om les te geven in de tweede fase van HAVO en VWO (de bovenbouw), maar ook in het tweedegraadsgebied (VMBO en onderbouw HAVO/VWO). Als je hier interesse in hebt, dan dien je als Fysisch geograaf je pakket aan te vullen met onderdelen uit de sociale geografie (2 modules, in totaal 12 EC). In de bachelor kan men zich al oriënteren op het leraarsberoep. Fysisch geografen kunnen naast het verplichte onderdeel Oriëntatie op de Educatieve en Communicatie variant (tijdens de cursus Bachelor Thesis (pag. 124) (18 EC)), nog de uitbreiding Oriëntatie op de Educatieve en Communicatieve Variant voor bèta’s volgen op het Amstel Instituut (NA302014, 6 EC) of de cursus geografische informatie overdracht. Het opleidingsprogramma van een lerarenopleiding kent globaal drie fasen: 1. Oriëntatie op het beroep 2. Begeleide beginnende taakuitoefening 3. Begeleide zelfstandige taakuitoefening Fase 1: In de oriëntatiefase maakt de student intensief kennis met theoretische en praktische aspecten van het onderwijs, communicatie en didactiek, en een stage in het voortgezet onderwijs maakt deel uit van deze fase. Fase 2: In de fase van de beginnende taakuitoefening volgt de kandidaat-leraar onderwijs op het ILO of het Amstel Instituut. Van de kandidaat-leraar wordt verwacht dat deze meerdere dagdelen beschikbaar voor activiteiten op een opleidingsschool, waaronder observeren, het verrichten van onderwijsondersteunende taken en begeleid lesgeven.

71


In principe verschaft een afgeronde Bachelor (kandidaats) een goed uitgangspunt voor overstap naar de andere vergelijkbare opleidingen in het land. Studenten die een overstap overwegen kunnen contact opnemen met de studieadviseur van de opleiding en van de andere Universiteit. Ook kan men terecht bij het Documentatiecentrum van Studenten Services (Binnengasthuisstraat 9).



Fase 3: Gedurende de fase van begeleide zelfstandige taakuitoefening geeft de kandidaatleraar nu een flink aantal uren zelfstandig les als docent aan een van de opleidingsscholen die aan het ILO zijn verbonden, of heeft deze een functie aanvaard die aan bepaalde voorwaarden voldoet op een school buiten het systeem van opleidingsscholen.De leraar wordt begeleid door het opleidingsinstituut en op de school. Om leraar te worden kan men kiezen uit twee trajecten: 1. Een traject van 1 jaar op het Instituut voor de Leraaropleiding (ILO), nadat men de eigen opleiding heeft afgesloten met een Master of Science. Dit traject omvat 60 EC waarvan 30 EC instituutsonderdelen op het ILO en 30 EC stage op een school. Men verkrijgt de titel Master of Science Teaching Geography. Kenmerkend voor dit traject is dat men eerst de (onderzoeks)master heeft afgerond bij de faculteit en daarna bij het ILO de lerarenopleiding doet. Voor dit aanvullende traject kan men studiefinanciering aanvragen. 2. Via de Communicatieve en Educatieve variant in de Master (CE-variant). Men kan in een master kiezen voor de O-, M- of CE-variant. Het masterprogramma volgens de CEvariant bestaat uit een vakdeel en een CE-deel. Over het algemeen is het CE-deel 60 EC. Binnen het CE-deel kan men kiezen voor de specialisatie onderwijs, welk maximaal tweederde van het lerarenopleidingsprogramma omvat. Als men via dit programma de master of Science heeft behaald, kan men bij het ILO de eerstegraadsbevoegdheid verwerven door het aanvullende éénderde deel te doen. Men verwerft dan de titel: Master of Science Teaching Geography. Kenmerkend voor dit traject is dat men binnen het masterprogramma al een groot deel van de lerarenopleiding doet. In dit facultaire deel is wel meer ruimte ingericht voor vakdidactisch onderzoek. In het ILO-programma na de master staat vooral de stage centraal, die veelal in service (betaald) wordt verricht. De opleiding wordt verzorgd door het AMSTEL Instituut in samenwerking met het Instituut voor de lerarenopleiding (ILO). traject 1: Inlichtingen over de opleiding kan men verkrijgen bij het ILO, Wibautstraat 2-4, 1091 GM Amsterdam, http://www.ilo.uva.nl en bij de vakdidacticus biologie, Riny van Krieken ( [email protected]). traject 2: De Communicatieve en Educatieve variant wordt verzorgd door het AMSTEL instituut, http://www.science.uva.nl/amstelinstituut. Voor nadere inlichtingen kan men zich wenden tot de onderwijscoördinator van het AMSTEL instituut: drs. Diederik Slob, Kruislaan 404, 1098 SM Amsterdam ( [email protected]).

72



4.2 4.2.1

Orientatie op de masteropleidingen Bèta Bedrijvencontactdag

73


De Stichting Bèta Bedrijvencontactdag Amsterdam (SBBA) organiseert ieder voorjaar een bedrijvencontactdag bestemd voor bètastudenten van de Vrije Universiteit en de Universiteit van Amsterdam. De bedrijvencontactdag wordt jaarlijks gehouden begin april, afwisselend in de gebouwen van de VU of de UvA. Op de bedrijvendag wordt duidelijk welke functies er zijn binnen het bedrijfsleven. Het bijwonen van deze dagen werkt erg motiverend. Het wordt dan duidelijk wat je met al je verworven kennis kan gaan doen. De bedrijvendag is met name gericht op hogerejaars studenten en promovendi. Deze krijgen in de loop van maart een uitnodiging en het programmaboekje met het inschrijfformulier. Op de bèta bedrijvencontactdag is een informatiemarkt aanwezig waar bedrijven zich presenteren. Tevens zijn er verschillende lezingenrondes waarin enkele bedrijven de kans krijgen om het publiek te informeren over de arbeidsmogelijkheden die er voor bèta's zijn binnen dat bedrijf. De SBBA bestaat uit studenten van de VU en de UvA. Meer informatie over de SBBA of de bèta bedrijvencontactdag kan verkregen worden via de website http://www.sbba.nl.



74


Blokkenschema's

5 Blokkenschema's 5.1


Blokkenschema Bachelor Aardwetenschappen


* De invulling van het eerste semester van het derde jaar is afhankelijk van het gekozen studiepad. Zie hiervoor blokkenschema eerste semester derde jaar. ** Voor de grijze vakken mag ook een ander keuzevak gevolgd worden.

75


Blokkenschema's

5.2

Blokkenschema eerste semester derde jaar

Afhankelijk van het gekozen studiepad ziet het eerste semester van het derde jaar er zo uit:

* Voor het studiepad Aarde en Mens kunnen studenten contact opnemen met dr. H. Schmal ( [email protected]).

76


Cursusbeschrijvingen

6 Cursusbeschrijvingen 6.1


Modules eerste jaar

AW1026.

Fysisch Geografische Systemen Vakcode

AW1026

Studielast

9 Semester 1 blok 1

Onderwijsinstituut

Levens- en Aardwetenschappen

Verzorgd door

Instituut voor Biodiversiteit en Ecosysteem Dynamica (IBED)

Docent(en)

dr.ir. J.H. van Boxel, dr. J.M. van Mourik, dr. A. Tietema (coördinator)

(en

diverse andere docenten) Inlichtingen

dr. A. Tietema telefoon: +31 20 5257458 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Aardwetenschappen Minor Fysische Geografie

Leerdoel

Kennismaking met de verschillende onderdelen binnen de fysischegeografie en de samenhang ertussen; eerste kennismaking veldwerk en het doen van onderzoek; oefeningen in diverse vaardigheden. Inhoud

De module bestaat uit een serie colleges waarin het vak fysische geografie en de toepassing daarvan op het Nederlandse landschap wordt geïntroduceerd. Zelfstudie, gebruik van computer, een dag-excursie op Texel, en het uitvoeren van een mini-onderzoek inclusief veldwerk op Texel voeren de studenten verder in de stof. Het onderdeel wordt afgerond met het schrijven van een verslag. De module wordt ook gebruikt om de studenten bekend te maken met de bibliotheek, met het computernetwerk, met studievaardigheden en met mondeling en schriftelijk presenteren. Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau; in het eerste trimester meldt de studieadviseur de eerstejaars studenten aan. Onderwijsvorm

Hoorcolleges, zelfstudie, excursie, veldwerk, werken in groepen, practica. Studiemateriaal

Syllabi `Inleiding tot de Fysische Geografie` en `Texel`. Beiden worden aangeboden op Blackboard.

77


Periode(n)



Kosten

Alleen de verblijfskosten op Texel (eten en drinken) zijn voor eigen rekening. Toetsvorm

Schriftelijk tentamen; schriftelijk verslag en mondelinge presentatie minionderzoek. Bijzonderheden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl.

78



AW1042.

Natuurwetenschappelijke Basis I Vakcode

AW1042

Studielast

3

Periode(n)

Semester 1 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr.ir. E.E. van Loon (coördinator)

Inlichtingen

dr.ir. E.E. van Loon telefoon: +31 20 5257448 [email protected] Bachelor Aardwetenschappen

Leerdoel

De student kan: 1. causale relaties in een eenvoudig systeem identificeren en op abstract niveau concretiseren 2. abstracte relaties in de vorm van wiskundige vergelijkingen weergeven 3. m.b.v. Stella de relaties samenbouwen tot een functioneel model; de resultaten van het model spiegelen aan zijn eigen voorstellingsvermogen 4. aan de hand van een systeembeschrijving, in systeem theoretische zin analoge systemen verzinnen of vinden in de literatuur. Inhoud

In de NatuurwetenschappelijkeBasis wordt de link gelegd tussen bètavakken, die studenten kennen van het VWO, en de aardwetenschappelijke vraagstellingen waarmee ze binnen de Fysische Geografie te maken krijgen. In groepjes van twee werken ze in de Studio Classroom. Daar doen ze eerst een experiment in dezelfde vorm zoals ze dat van scheikunde, natuurkunde en biologie kennen. Vervolgens bootsen ze het experiment na met een zelf te maken simulatiemodel op de computer. Tenslotte zoeken ze naar vergelijkbare processen die in de natuur voorkomen, en simuleren deze op dezelfde manier. Zo leert de student relaties te leggen tussen de complexiteit van de werkelijkheid en de eenvoud van concepten. In het vervolg ( Natuurwetenschappelijke Basis II (pag. 81) (3 EC)) gaan de studenten meer zelfstandig aan het werk met ingewikkelde modellen en wordt NWB afgesloten met een klein project waarin de student zelf een aardwetenschappelijke systeem kiest en hiervan een simulatiemodel maakt. Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau; in het eerste semester meldt het onderwijsbureau de eerstejaars studenten aan.

79


Onderdeel van



Onderwijsvorm

Werkcolleges en practicum. Studiemateriaal

Werkboek. Toetsvorm

Schriftelijk tentamen (40% van eindcijfer), werkmateriaal (30% van eindcijfer), en eindopdracht (30% van eindcijfer). Deelname is verplicht; verzuim zonder gegronde redenen geeft een onvoldoende. Gemiste opdrachten moeten worden ingehaald. Bijzonderheden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl .

80



AW1043.

Natuurwetenschappelijke Basis II Vakcode

AW1043

Studielast

3

Periode(n)

Semester 1 blok 2

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)


Inlichtingen


Leerdoel

De student kan: 1. causalerelaties in een eenvoudig systeemidentificeren en op abstract niveau concretiseren 2. abstracte relaties in de vorm van wiskundigevergelijkingen weergeven 3. m.b.v. Stella de relaties samenbouwen tot een functioneelmodel; de resultaten van het model spiegelen aan zijn eigen voorstellingsvermogen 4. aan de hand van een systeembeschrijving, in systeem theoretische zin analogesystemen verzinnen of vinden in de literatuur. Inhoud

In de NatuurwetenschappelijkeBasis wordt de link gelegd tussen bètavakken, die studenten kennen van het VWO, en de aardwetenschappelijke vraagstellingen waarmee ze binnen de Fysische Geografie te maken krijgen. In groepjes van twee werken ze in de Studio Classroom. Daar doen ze eerst een experiment in dezelfde vorm zoals ze dat van scheikunde, natuurkunde en biologie kennen. Vervolgens bootsen ze het experiment na met een zelf te maken simulatiemodel op de computer. Tenslotte zoeken ze naar vergelijkbare processen die in de natuur voorkomen, en simuleren deze op dezelfde manier. Zo leert de student relaties te leggen tussen de complexiteit van de werkelijkheid en de eenvoud van concepten. Na een klassikaal deel aan de hand van een syllabus met theorie, uitleg en opgaven, ( Natuurwetenschappelijke Basis I (pag. 79) (3 EC)), gaan de studenten in dit onderdeel meer zelfstandig aan het werk met ingewikkelde modellen en wordt NWB afgesloten met een klein project waarin de student zelf een aardwetenschappelijksysteem kiest en hiervan een simulatiemodel maakt. Aanbevolen voorkennis

Natuurwetenschappelijke Basis I (pag. 79) (3 EC)

81


Onderdeel van



Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau; in het eerste semester meldt het onderwijsbureau de eerstejaars studenten aan. Onderwijsvorm

Werkcolleges en practicum. Studiemateriaal

Werkboek. Toetsvorm

Schriftelijk tentamen (40% van eindcijfer), werkmateriaal (30% van eindcijfer), en eindopdracht (30% van eindcijfer). Deelname is verplicht; verzuim zonder gegronde redenen geeft een onvoldoende. Gemiste opdrachten moeten worden ingehaald. Bijzonderheden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl

82



AW161.

Inleiding Aardwetenschappen Vakcode

AW1161

Studielast

9

Periode(n)

Semester 1 blok 2

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. L.H. Cammeraat, dr. A.C. Seijmonsbergen, dr. A. Tietema (coördinator)

Inlichtingen

dr. A. Tietema telefoon: +31 20 5257458 [email protected] Bachelor Aardwetenschappen Minor Fysische Geografie

Leerdoel

Inleiding en materialen Verkrijgen van inzicht in de verbanden tussen geologie, bodemkunde en geomorfologie en hun plaats in het terrestrischesysteem. Inzicht verkrijgen in de basisbegrippen van de petrologie. Inzicht verkrijgen in de basisbegrippen van verwering. Macroscopische determinatiegesteenten en bodemmaterialen. Geologie Kennis basistheorie van de algemene, historische en structurele geologie & de principes van de sedimentologie en petrologie. Vaardigheid met het tijdsbegrip in de geologie, integreren van tijden ruimtebepalende geologische factoren in vormen materiaal- en procesbepalende landschapselementen; het werken met Engelstalige vakdefinities; het interpreteren van geologische kaarten; lezen van geologischerapporten; rapporteren eigen waarnemingen. Geomorfologie Kennis van terminologie voor beschrijving van geomorfologischeverschijnselen en processen; kennis van de landschapsvormen in verschillende landschapstypen; inzicht in de samenhang tussen landschapsvormen, landschapsvormende processen en geomorfologische factoren. Bodemkunde Inzicht in het basale begrippenkader van de bodemkunde, de functies van de bodem als onderdeel van landschappelijke ecosystemen; kennis van de belangrijkste bodemvormende factoren en processen en eigenschappen van bodems; kennismaken met een aantal basale methoden en technieken in de bodemkunde (eenvoudige analyses, beschrijving, classificatie).

83


Onderdeel van



Illustratie Excursies Het verkrijgen van inzicht in de opbouw van Nederlandse landschappen, en de samenhang tussen geologie, geomorfologie en bodem. Samenvatten en presenteren Kritisch lezen van een geomorfologisch, geologisch of bodemkundig artikel uit wetenschappelijke tijdschriften; leren samenvatten en mondeling presenteren van aardwetenschappelijkke stof. Inhoud

Inleiding en materialen 1. Inleiding in de geologie, geomorfologie en bodemkunde 2. Inleiding in de petrologie en mineralogie 3. Inleiding in verweringsprocessen 4. Materiaal (gesteente en bodem) practicum Geologie 1. Inleiding in de historische geologie en sedimentologie. 2. Inleiding in de algemene en structurele geologie. Geomorfologie Systematische inleiding in de grondbeginselen van de geomorfologie door bestudering van het geomorfologische tekstboek plus additionele stof die behandeld wordt tijdens het college. Bodemkunde Ingegaan wordt op het verschijnsel ‘bodem’ als onderdeel van het ecosysteem en op de rol van bodemvormende factoren. Daarna volgt een overzicht van de belangrijkste eigenschappen en bodemvormende processen. Bodemclassificaties worden toegelicht en in de praktijk toegepast. Illustratie Excursies 1. Theoretische toelichting op de te bezoeken Nederlandse landschappen 2. Illustrerende excursies Aanbevolen voorkennis

Geen speciale voorkennis nodig. Aanmelden

Via Studieweb Onderwijsvorm

Hoorcolleges, zelfstudie, excursies, practica. Studiemateriaal

Inleiding en materialen Syllabus bij het practicum gesteenteherkenning (kan worden aangeschaft bij het begin

84



van de cursus). Loep (vergroting minimaal 10x) Geologie en Geomorfologie Understanding Earth, Vijfde Editie, 2007. Grotzinger, Jordan, Press & Siever, Freeman & Compagny, ISBN 0-7167-6682-5, 66 Euro. Bodemkunde M.R. Ashman & G. Puri: 'Essential Soil Science', Blackwell Publishing, ISBN 0632048859

Kosten

Syllabus € 20 Reader Geomorfologie ca. € 20,Verblijfskosten (eten en drinken) tweedaagse excursie Zuid Limburg. Toetsvorm

Deeltentamens over de onderdelen Geologie, Geomorfologie en Bodemkunde aan het eind van de cursus en een practicumtoets na de eerste week. Het eindcijfer van de module moet minsters 6.0 zijn, waarbij de practicumtoets voor 10% meetelt en de deeltentamens voor ieder 30%. Bovendien moeten alle deeltentamens minstens met een 5.0 beoordeeld zijn. Inleiding en materialen Practicumtoets over het practicum en de collegestof van de eerste week. Geologie Schriftelijk tentamen over het boek, de in het college behandelde stof en de excursies. Geomorfologie Schriftelijk tentamen over het boek, de in het college behandelde stof en de excursies. Bodemkunde Schriftelijk tentamen over het boek, de in het college behandelde stof en de excursies.

85


Illustratie Excursies -Geologisch kompas (alleen voor Fysisch Geografen) -Geologische hamer (alleen voor Fysisch Geografen) -OV-jaarkaart -Veldkleding en laarzen -Bodemmes met terugklap vergrendeling. De aanschaf van een geologische hamer en een geologisch kompas verdient aanbeveling i.v.m. de excursie. Deze zijn aan te schaffen bij de studievereniging. Voor Fysisch Geografen zijn deze attributen onontbeerlijk voor onderdelen later in hun studie.



Verder is het houden van een voordracht over een wetenschappelijk artikel verplicht. Bijzonderheden


86



AW1 1.

Wiskunde Vakcode

AW1111

Studielast

6

Periode(n)

Semester 1 blok 3

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)


Inlichtingen


Leerdoel

Het begrijpen van de rol die de wiskunde speelt in de ontwikkeling van de natuur en levenswetenschappen. Leren vertalen van een fysisch-geografisch probleem in een wiskundig probleem; beheersen van analytische en numerieketechnieken voor differentiatie, integratie en het onderzoeken van dynamische systemen. Inhoud

Aan de hand van oefenstof uit het lesboek maakt de student kennis met de rol van de wiskunde binnen de aard- en levenswetenschappen. De VWO wiskunde-stof wordt kort herhaald (onderwerpen die aan de orde komen: reeksen, functionele analyse, differentiëren, integreren, differentiaalvergelijkingen). Met behulp van realistische aardwetenschappelijke en biologische problemen wordt geoefend met het vertalen van een praktisch naar een wiskundig probleem. Studenten leren wiskundige software ( MATLAB) te gebruiken om integratie, differentiatie, functionele analyse (etc.) numeriek en symbolisch op te lossen. Iedere deelnemer geeft een presentatie over een klein deel van de lesstof om didactisch presenteren te oefenen. Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau; in het eerste semester meldt de studieadviseur de eerstejaars studenten aan. Onderwijsvorm

Hoor-/werkcolleges en computer practica. Studiemateriaal

M. de Gee (2003) 'Wiskunde in Werking. Deel 2 - analyse toegepast.' Epsilon Uitgaven. Utrecht (ca. euro. 20,-). Syllabus en een eenvoudige rekenmachine. Toetsvorm

Schriftelijk tentamen (80% van eindcijfer), beoordeling van een didactische presentatie (20% van eindcijfer). Deelname is verplicht; verzuim zonder gegronde redenen geeft een onvoldoende. Gemiste opdrachten moeten worden ingehaald.

87


Onderdeel van



Bijzonderheden


88



AW102.

Landschapsanalyse Vakcode

AW1102

Studielast

7

Periode(n)

Semester 2 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. L.H. Cammeraat, dr. A.C. Seijmonsbergen (coördinator)

Inlichtingen

dr. A.C. Seijmonsbergen telefoon: +31 20 5257427 [email protected] Bachelor Aardwetenschappen

Leerdoel

Na het volgen van deze cursus kan de student: ■

■ ■

■

■

Met behulp van de basisprincipes uit de Inleiding Aardwetenschappen (geologie, geomorfologie, bodemkunde en landschapsecologie) op stereoluchtfoto’swaarnemingen doen en deze begrijpen op de schaal van een landschap. Thematisch kaartmateriaal inhoudelijk interpreteren. Eenvoudige toegepaste fysisch geografische probleemstellingen m.b.v. luchtfoto’s en kaarten oplossen. Een eenvoudige tracing ( luchtfotokaart) maken gebaseerd op driedimensionaleinterpretatie. Met de Stereo-Analyst van ERDAS Imagine software en met Google Earth waarnemingen en metingen doen in 3Dlandschappen.

Inhoud

In de cursus wordt individueel gewerkt met een spiegelstereoscoop en thematische kaarten. De meest voorkomende landschapstypen worden behandeld waarbij (tijds)relaties tussen de abiotische ondergrond (geologie- bodem- geomorfologie), ruimtelijke processen en vegetatie centraal staan. Er worden luchtfoto’s uit de volgende landschappen behandeld: mediterrane en aride landschappen, alpiene landschappen, glaciale landschappen, kustlandschappen, fluviatiele landschappen, verweringslandschappen en vulkanische landschappen. In het begin van de cursus worden vooral natuurlijke landschappen behandeld. Later zullen ook cultuurlandschappen worden behandeld. Er wordt aandacht besteed aan het herkennen van hoofdgroepen van gesteentes, aan de verdeling en samenstelling van los materiaal, aan de geologische en geomorfologische ontwikkeling in een landschap en aan de relatie die er bestaan tussen substraat, bodemontwikkeling en vegetatiebedekking binnen de klimatologische randvoorwaarden. De student wordt actief aangemoedigd om het landschap in te delen in hoofdlandschapstypen en deze zo nodig onder te verdelen. De

89


Onderdeel van



student maakt zelf doorsneden door het landschap en tekent daarin de verzamelde informatie over geologie, de geomorfologische kenmerken en hydrologische relaties.Met behulp van 3D software en Internet worden ook waarnemingen en metingen gedaan digitale luchtfoto’s en satellietbeelden. Aanbevolen voorkennis

Basiskennis van aardwetenschappen (geologie, geomorfologie en ecologie) wordt aanbevolen. Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau. Onderwijsvorm

Twee instructiecolleges van 2 uur, 14 dagen practicum met veel zelfstudievragen en aansluitende klassikale discussies. Studiemateriaal

Kaartmateriaal en luchtfotomateriaal van Fysische Geografie, practicumsyllabus en teken/oefenmateriaal. Digitale luchtfoto’s en satellietbeelden en Google Earth. Toetsvorm

Schriftelijk tentamen over de stof in twee delen: - 1 uur tentamen over kaarten, dit bepaalt 40% van het eindcijfer - 2 uur tentamen over luchtfoto's, dit bepaalt 60% van het eindcijfer Bijzonderheden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl . Er mag niet meer dan tweemaal verzuimd worden tijdens het practicum. Tentamendatum wordt in overleg vastgesteld.

90



AW1062.

Atmosferische fysica Vakcode

AW1062

Studielast

5

Studiejaar

1

Ingangseis

Wiskunde en natuurkunde op VWO-niveau

Periode(n)

Semester 2 blok 1 (eerste studiejaar)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr.ir. J.H. van Boxel (coördinator)

Inlichtingen

dr.ir. J.H. van Boxel [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Aardwetenschappen

Leerdoel

Inzicht verkrijgen in de fysischeprocessen die een rol spelen bij het ontstaan van wind en luchtdruksystemen, fronten, wolken en neerslag, de algemene circulatie en de verdeling van de klimaten over het aardoppervlak. Vertrouwd raken met de fysisch mathematische benaderingswijze van geografische vraagstukken. Inhoud

In het eerste deel van de colleges wordt een aantal basisprincipes toegepast op atmosferische problemen. Na een inleiding over de chemische samenstelling en de opbouw van de atmosfeer volgen hoofdstukken over thermodynamica, atmosferische stabiliteit, het verband tussen luchtdruk en wind, het ontstaan van luchtdruksystemen, fronten en de vorming van wolken en neerslag. In het tweede deel worden deze basisprincipes toegepast op de grootschalige atmosferische circulatie en de oceaancirculatie. Uiteindelijk wordt dit geheel gebruikt om de verdeling van temperatuur, neerslag en de bijbehorende klimaten over het aardoppervlak te verklaren. Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het onderwijsbureau. Onderwijsvorm

Hoorcolleges (18 x 2uur) Studiemateriaal

Syllabus Atmosferische Fysica, ca. € 10,Toetsvorm

Schriftelijk tentamen.

91


telefoon: +31 20 5256216



Bijzonderheden


92



107.

1007 Organismen in het Milieu Vakcode

1007

Studielast

6

Periode(n)

Semester 2 (blok 6b: 4 juni t/m 29 juni 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.G.B. Oostermeijer (coördinator), prof. dr. M. Veith

Inlichtingen

dr. J.G.B. Oostermeijer telefoon: +31 20 5257817 [email protected] Bachelor Aardwetenschappen Bachelor Biologie

Leerdoel

1. Verdere kennismaking met biologische diversiteit (voortzetting van theorie uit blok 5 en 6a) 2. Onderscheiden en classificeren van levensvormen zoals die in de natuur worden waargenomen 3. Herkennen van de belangrijkste ecologische stressfactoren in verschillende ecosystemen 4. Herkennen van de adaptaties van de verschillende organismen aan deze stressfactoren Inhoud

Onderwerpen college (1e week) ■

■ ■

■

Principes van taxonomie Methoden van classificatie, identificatie m.b.v. sleutels Inleiding in de belangrijkste ecosystemen van Nederland en hun kenmerkende organismen Morfologische en fysiologische adaptatie

Onderwerpen excursies/veldwerk ■

■

■

2e week: excursies naar verschillende habitattypen: duinen (temperatuur- en droogtestress), water (zuurstofstress), bos (licht), zee (zout), urbaan (verstoring/vervuiling) 3e week: veldwerk Limburg. Training in verzamelen en classificeren van organismen in relatie tot milieufactoren. Onderzoeken van morfologische adaptaties aan de hand van microscopische preparaten. 4e week: zelfstandig veldwerk bij Amsterdam. In groepjes zelfstandig toepassen van de in week 3 geleerde kennis en methoden in een nieuwe, onbekende habitat.

Onderwerp practicum

93


Onderdeel van



■

■

“Minionderzoekstrainingen” die zullen bestaan uit het analyseren van de biodiversiteit van een deel van een natuurgebied in de buurt van Amsterdam. Leren verzamelen en determineren van de planten en verschillende diergroepen die tijdens de veldexcursies worden aangetroffen.

Aanmelden

Eerstejaars studenten hoeven zich voor dit vak niet aan te melden Onderwijsvorm

Het onderwijs wordt verzorgd door docenten van de IBED-onderzoeksgroepen Systematische en Geografische Dierkunde en Experimentele Plantensystematiek. In de eerste week wordt theorie gegeven in de vorm van hoorcolleges en zelfstudie aan de hand van delen uit het hoofdstuk ‘The Evolution of Diversity’ in Purves et al. en de ‘Tree of Life’ website. Deze week wordt afgesloten met een tentamen. In de tweede en derde week krijgen de studenten organismen in verschillende habitattypen gedemonstreerd en oefenen in verzamelmethoden en determineren. In week vier doen studenten in groepjes een zelfstandig onderzoek, waarover ze mondeling aan elkaar rapporteren. Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl . Studiemateriaal ■

■

■

■

Life: The Science of Biology, 7th ed, Purves et al., ISBN: 0716798565 (reeds aangeschaft bij cursus 1001). Studiestof wordt nader bekend gemaakt. Flora van Nederland; Heukels en Van der Meijden, 23e druk, Wolters-Noordhoff, Groningen, Prijs ca € 49,95 Extra syllabi over de classificatie van dieren zijn tegen betaling beschikbaar aan het begin van de cursus de kosten van levensonderhoud tijdens excursies zijn voor eigen rekening; evt. logies en vervoer is voor rekening OWI

Toetsvorm

Het deelnemen aan het veldwerk is verplicht. Tijdens het veldwerk worden de vaardigheden van de student enkele malen beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het veldwerk kunnen dit pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten gedaan die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen Academische Basis Vaardigheden.

94



De theorie wordt schriftelijk getoetst; het eigen onderzoeksproject wordt geëvalueerd op basis van de mondelinge presentatie. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer 6,0 of hoger bedraagt en als het veldwerk met voldoende is beoordeeld.


95



AW123.

Basis Veldprakticum Vakcode

AW1123

Studielast

12

Periode(n)

Semester 2

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.M. van Mourik (coördinator)

Inlichtingen

dr. J.M. van Mourik telefoon: +31 20 5257441 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Integratie van geomorfologische, bodemkundige en landschapsecologische theoretische concepten in een landschapsstudie d.m.v.: -voorstudie van landschappen op basis van luchtfoto's, kaartbestanden, artikelen en rapporten. -ontwikkeling en toepassing van veldbeschrijvingssystemen- en karteertechnieken tijdens geïntegreerde transectstudies in het landschap. -geïntegreerde veldopname die resulteert in een aantal thematische en integratie kaarten met toelichting. -bijdragen aan de productie van een cd-rom over het veldwerkgebied. Inhoud

Ter voorbereiding op het basisveld werk wordt geoefend in systematische verzameling van kennis van landschappen op grond van luchtfoto's, topografische en thematische kaartbestanden en rapporten. Daarnaast zullen de landschappen bestudeerd worden aan de hand van hoor- en of werkcolleges. Aandacht wordt besteed aan cartografische principes en classificatie procedures die van toepassing zijn op de diverse bestanden. De beschrijvingssystemen die ten grondslag liggen aan de thematische kaartopnames zullen worden geoefend tijdens twee transectstudies waarbij de verbanden tussen geologie, bodem, hydrologie en vegetatie centraal staan. Vervolgens wordt een veldkartering uitgevoerd waarbij de ruimtelijke samenhang tussen fysiotopen en biotopen centraal staat. De kaarten worden geproduceerd in het geografisch informatiesysteem ArcGIS en voorzien van een toelichting die de fysische geografie van het gebied beschrijft, de aardkundige en ecologische waarden nader uitwerkt en zo mogelijk in gaat op de natuurdoelen die in het beheer van het gebied worden nagestreefd de uitvoering van het basisveldwerk. Het eindproduct van de cursus is een cd-rom waaraan de deelnemers een herkenbare bijdrage zullen leveren. Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau.

96



Onderwijsvorm

Hoor-/werkcolleges, zelfstudie, excursies, veldwerk, computerpracticum, labpracticum. Studiemateriaal

Wordt nog bekendgemaakt. Toetsvorm

Eindtoets, schriftelijke presentatie van de resultaten (= bijdrage cd-rom), mondelinge presentatie van de resultaten tijdens een mini-symposium. Bijzonderheden

6.2


Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl Modules tweede jaar

AW2165.

Water Management Vakcode

AW2165

Studielast

7

Periode(n)

Semester 2 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof.dr.ir. W. Bouten (coördinator), dr. L.H. Cammeraat

Inlichtingen

prof.dr.ir. W. Bouten telefoon: +31 20 5257412 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Kennis over processen in de hydrologische kringloop; inzicht in onderdelen van de hydrologische kringloop, inclusief fysische bodemeigenschappen en het gedrag van water in de bodem. Inzicht in fysische grondslagen van deze processen, hun interactie en relatie met landschap en waterbeheer het kunnen plaatsen van actuele hydrologische problemen binnen maatschappelijke context; het kunnen toepassen van de opgedane kennis in eenvoudige probleemstellingen en modelmatige toepassingen. Aanmelden


12 hoorcolleges van 2 uur, 12 werkcolleges van 2,5 uur en zelfstandig te maken opdrachten. Deelname werkcolleges is niet verplicht, maar zeer aan te bevelen.

97



Studiemateriaal

Studie-materiaal Delen uit: P. Koorevaar, G. Menelik, C. Dirksen: Elements of Soil Physics, ISBN 0-44442242-0, Elsevier Science Publishers. Opgavebundel die uitgereikt wordt bij het college Delen uit: JJA Jones, Global Hydrology, 1997, Longman, ca. € 40,-. Toetsvorm

Schriftelijk tentamen. Bijzonderheden


98



AW2091.

Statistiek Vakcode

AW2091

Studielast

5

Periode(n)

Semester 1 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

drs. P. R. Assink, mw. drs. C.C. Klumpers, dr.ir. E.E. van Loon (coördinator)

Inlichtingen


Leerdoel

Beheersen van basistechnieken uit de statistiek. Inhoud

Aan de hand van concrete voorbeelden uit de Biologie en Aardwetenschappen komen de volgende onderwerpen aan bod: beschrijvende statistiek, kansrekening, stochastischevariabele en kansverdeling, normale verdeling, schatten, toetsen, parametervrije statistiek, variatieanalyse, regressie. Tijdens het computerpracticum past de student de behandelde technieken toe op bestaande datasets. Aanmelden

Zes weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau. Onderwijsvorm

Hoor-/werkcollege, practica. Studiemateriaal

Syllabus ca. euro 15. Een eenvoudige rekenmachine. Toetsvorm

Open boek tentamen, practicumverslagen. Bijzonderheden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl Inschrijven 6 weken van tevoren.

99


Onderdeel van



AW215.

Chemie, Bodem en Water I Vakcode

AW2155

Studielast

6

Periode(n)

Semester 1 blok 3

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.R. Parsons (coördinator)

Inlichtingen

dr. J.R. Parsons telefoon: +31 20 5256580 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Doel is het verkrijgen van inzicht in de voor aardwetenschappen belangrijke chemischebegrippen en processen. Een algemene inleiding in de chemie wordt gevolgd door een introductie in chemische processen in bodem, water en (in mindere mate) atmosfeer Inhoud ■ ■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

chemische evenwichten electrochemie oppervlakteinteracties en sorptie organische chemie analytische chemie biogeochemischecycli atmosferische chemie aquatische chemie bodemchemie

Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau Onderwijsvorm

16 x 2uur hoorcollege en 8x werkcollege Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelors op de website http://www.student.uva.nl . Studiemateriaal

R.M. Harrison & S.J. de Mora, Introductory Chemistry For The Environmental Sciences, Tweede Ed., Cambridge University Press, 1996, ISBN 0521484502 Syllabus incl. opgaven

100



Toetsvorm

Schriftelijk tentamen Bijzonderheden



101



AW2160.

Chemie, Bodem en Water II Vakcode

AW2160

Studielast

6

Periode(n)

Semester 1 blok 3

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.R. Parsons (coördinator)

Inlichtingen

dr. J.R. Parsons telefoon: +31 20 5256580 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Doel is het verkrijgen van inzicht in de chemie van bodemmaterialen en de chemischeprocessen in bodem, bodemwater en oppervlaktewater. Naast natuurlijke chemische processen wordt ook aandacht besteed aan processen van belang voor het gedrag van milieuvreemdeverbindingen. Inhoud ■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

■

bodem mineralen chemische verwering bodem organisch materiaal aquatische chemie oplossingsevenwichten van mineralen sorptie ionenuitwisseling redoxreacties verzuring

Aanmelden


16 x 2uur hoorcollege en 8x werkcollege Studiemateriaal

M.E. Essington, Soil And Water Chemistry: An Integrative Approach, CRC Press, 2004, ISB 0849312582 Syllabus incl. Opgaven Toetsvorm

Schriftelijk tentamen Bijzonderheden


102



AW2071.

Geomorfologische Processen Vakcode

AW2071

Studielast

6

Periode(n)

Semester 1 blok 3

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Inlichtingen


Onderdeel van


Verdieping en kennis van een aantal belangrijke geomorfologische processen. Inhoud

Van de genoemde groepen van geomorfologische processen worden behandeld: verschijnselen en herkenning in het veld; mechanismen; meetmethoden; factoren die het optreden en de snelheid van de processen beïnvloeden; resulterende erosie- en accumulatievormen. Aanmelden


Hoor-/werkcollege, thuis literatuur voorbereiden en opdrachten. Studiemateriaal

Wordt nog bekend gemaakt. Toetsvorm

Opdrachten, schriftelijk tentamen. Bijzonderheden


103


Leerdoel



AW2132.

Programmeren in Matlab Vakcode

AW2132

Studielast

4

Periode(n)

Semester 2 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof.dr.ir. W. Bouten (coördinator)

Inlichtingen


Onderdeel van


Leerdoel

1. De student kan een 'reken-probleem' vertalen naar een programmastructuur. 2. De student heeft vaardigheden ontwikkeld om eenvoudige computerprogramma's te schrijven voor de verwerking en visualisatie van gegevens. Inhoud

Doel van dit studieonderdeel is om te leren programmeren op een niveau te halen dat de student in staat stelt relatief eenvoudige rekenprogramma's te schrijven. Hierbij wordt gebruik gemaakt van Matlab omdat deze taal zich goed leent voor programmaontwikkeling. De stof omvat onder andere: programmastruktuur, modulair programmeren, functies, matrices, file I/O, visualisatie, debuggen, en het oefenen met fysisch geografische en biologische voorbeelden. Aanmelden


Werkcollege Deelname is verplicht! Studiemateriaal

Werkboek Programmeren in MATLAB. Toetsvorm

Opdrachten werkcollege en open boek tentamen. Bijzonderheden


104



AW2051.

GIS/Remote Sensing Vakcode

AW2051

Studielast

4

Periode(n)

Semester 2 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. A.C. Seijmonsbergen (coördinator)

Inlichtingen

dr. A.C. Seijmonsbergen telefoon: +31 20 5257427 [email protected] Bachelor Aardwetenschappen


Onderdeel van

Leerdoel

Na deze cursus: ■

■

■

kent de student de basistheorie van remote sensing ( RS) en van geografische informatie systemen ( GIS); is de student in staat ruimtelijkegegevens met behulp van GIS en RS software te verzamelen, te verwerken en te visualiseren; kan de student eenvoudige ruimtelijke problemen m.b.v. GIS oplossen

Inhoud

Er worden vier instructie colleges aangeboden die aansluiten bij het praktische gedeelte ( Intri GIS I+II, Remote Sensing en databases). Daarnaast wordt literatuur aangeboden die de student moet kennen. Aandacht zal o.a. worden gegeven aan vector-raster kaarten, geo databases, satelliet/ sensorsystemen en classificatie van beeldmateriaal. Het tweede gedeelte bestaat uit inleidende basisoefeningen GIS en RS. Deze oefeningen zullen grotendeels als zelfstudie modules worden uitgevoerd. In deze praktische modules wordt het volgende aangeboden: de “getting started with ArcGIS” tutorial van ESRI’s, classificatie van een Spotbeeld, geo-refereren in ArcMap, het maken van een fotomozaïek, voorspellen vegetatie verspreding van de op basis van puntgegevens, een database module en een module ‘GPS voor veldwerk’. Voor het gedeelte gericht op het Luxemburg veldwerk is een uitgebreide dataset van het veldwerk voorhanden. Van de student wordt verwacht dat hij/zij een eigen geodatabase opbouwt waarin de relevante gegevens voor het veldwerk van een klein gebied wordt ondergebracht. Deze gegevens bestaan o.a. uit remote sensing beeldmateriaal, een geologische kaart en een digitaal terrein model. Van de laatste zullen enkele belangrijke morfometrische afgeleiden worden bepaald met de ‘topographic modeller’ in ArcGIS, zoals een hellingklassenkaart en een “shaded relief” kaart. Dit laatste gedeelte sluit nauw bij het tweedejaars Veldprakticum Luxemburg (pag. 109) (18 EC). De uiteindelijke geodatabase wordt na het veldwerk gebruikt om GIS analyses te maken, gebaseerd op de gegevens die de student zelf in het veld heeft gemaakt.

105



Aanbevolen voorkennis

Kennisniveau propedeuse fysische geografie wordt aanbevolen Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau. Studiemateriaal

Er wordt gewerkt met speciaal in ArcGIS en ERDAS ontwikkelde onderwijsmodules. Beschikbare datasets: SPOT satellietbeeld, digitale luchtfoto’s en thematisch kaartmateriaal van het veldwerkgebied in Luxemburg. Literatuur wordt bekend gemaakt via Blackboard. Toetsvorm

Beoordeling vindt plaats aan de hand van de antwoorden op zelfstudievragen, de gemaakte geo-database en getoonde inzet en vooruitgang tijdens het practicum. Bijzonderheden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl Voor het computerpracticum geldt een deelnameplicht.

106



AW20 1.

Ecosystemen van de Wereld Vakcode

AW2021

Studielast

4

Periode(n)

Semester 2 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

mw. dr. A.M. Kooijman (coördinator)

Inlichtingen

mw. dr. A.M. Kooijman telefoon: +31 20 5257441 [email protected] Bachelor Aardwetenschappen Minor Fysische geografie Minor Fysische Geografie

Leerdoel

Systematisch inzicht in de kenmerken en het functioneren van de belangrijkste op de wereld voorkomende ecosystemen, zowel voor wat betreft de biotische als abiotische aspecten als van hun onderlinge samenhang en de invloed van de mens op deze systemen. Inhoud

Uitgegaan wordt van de boeken Biology of Plants en The Major Soils of the World, die gezamenlijk een systematisch overzicht van kenmerken en functioneren van de belangrijkste ecosystemen geven. Dit overzicht wordt, gegroepeerd op basis van klimaatszones en van drainage, behandeld. Aanmelden


Hoorcollege (11 x 2uur), gevolgd door een presentatie door de studenten van de belangrijkste ecosystemen in een bepaalde regio en hun functioneren, aan de hand van een kaartblad van de wereldbodemkaart. Studiemateriaal

Aan het begin van het college dienen studenten te beschikken over de boeken: P.H. Raven, R.F. Evert en S.E. Eichhorn: Biology of Plants, seventh edition, W.H. Freeman and Company Publishers (reeds aangeschaft in het 1ste jaar of in de bibliotheek verkrijgbaar) en Driessen, Decters, Spaargaren en Nachtegaele: Lecture Notes on the Major Soils of the World, FAO, 2001. Toetsvorm


107


Onderdeel van



Bijzonderheden


108



AW21 2.

Veldprakticum Luxemburg Vakcode

AW2112

Studielast

18

Ingangseis

Alle vakken uit het eerste jaar zijn behaald.

Periode(n)

Semester 2 blok 2 en 3

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. L.H. Cammeraat, dr. J.F. Duivenvoorden, mw. dr. A.M. Kooijman (coördinator), dr.ir. E.E. van Loon, dr. A.C. Seijmonsbergen

Inlichtingen

mw. dr. A.M. Kooijman [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel ■

■ ■

Praktisch inzicht in de landschappelijke relaties tussen geologie, geomorfologie, bodem, vegetatie en landgebruik ( processen, patronen). Theoretische kennis toepassen en integreren in karteringen en veldonderzoek. Training in karterings methoden en - technieken: studenten moeten in staat zijn om zelfstandig eenvoudige geomorfologische, bodemkundige en landschapsecologische karteringen uit te voeren en hierover te rapporteren.

Inhoud

1. 3 weken voorbereiding in Amsterdam, bestaande uit: specifieke voorbereiding op veldwerk in Luxemburg middels inleidingen in de regionale en lokale geologie en de geomorfologie, hydrologie, bodems en vegetatie van het gebied en bestudering van luchtfoto's ten behoeve van de geomorfologische interpretatie en interpretatie van het landgebruik (vervaardigen van kaart), en classificatie van satellietbeeld cursus multivariate analysetechnieken 2. 6 weken veldwerk in Luxemburg, bestaande uit een geologische excursie (ca. 1 week), algemene verkenning van het veldwerk, gevolgd door geomorfologisch veldwerk (ca. 2 weken) en geïntegreerd bodemkundig en landschapsecologisch veldwerk (ca. 3 weken). 3. 5 weken uitwerking in Amsterdam. Dit bestaat uit verslaggeving over resp. geomorfologie, fysiotoopkartering en landschapsecologie. ■

■

Het veldwerk gebeurt in groepen van drie studenten. Elke groep krijgt een gebied toegewezen voor het onderzoek. In het eerste deel ligt de nadruk op een grondige inventarisatie van de daarin voorkomende geomorfologische verschijnselen, op basis van een goed inzicht in de geologische processen die in het verleden zijn opgetreden, of op dit moment actief zijn. Tijdens het daarop volgende geïntegreerde bodemkundig en landschapsecolo-

109


telefoon: +31 20 5257441



gisch veldwerk worden allereerst in een aantal transecten bodem en vegetatie/landgebruik en hun onderlinge relatie beschreven en onderzocht. Met de gegevens wordt de legenda getoetst voor de fysiotoopkartering en de kartering van de bosgemeenschappen, die met behulp van de verzamelde gegevens worden uitgevoerd. De relaties tussen de geomorfologie en fysiotooptypen (met bijbehorende standplaatsfactoren) en de natuurlijke vegetatie (bos) worden getoetst a.d.h.v. multivariate analyse en GIS. De resultaten van het veldwerk dienen te worden vastgelegd in een verslag over een deelaspect van het veldwerk (geomorfologie, de fysiotoopkartering en de landschapsecologie van de bossen). Per groep worden in totaal drie verslagen geproduceerd. Aan het einde van het veldwerk wordt aangegeven wie een verslag gaat maken over welk van de drie deelaspecten. De uitwerking tot definitief verslag geschiedt in Amsterdam. Aanmelden


Practica, hoorcollege, veldwerk, rapportage. Studiemateriaal

Syllabus. Kosten

Levensonderhoud en reizen zijn voor eigen rekening. Toetsvorm

Beoordeling van kartering in het veld (50%) en verslag (50%). Bijzonderheden


110



6.3

Modules derde jaar

AW3242.

Oriënterende Stage Vakcode

AW3242

Studielast

12

Ingangseis

De eerste twee studiejaren van het curriculum Aardwetenschappen moeten zijn

Periode(n)

Semester 1 blok 2

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. A. Tietema

Inlichtingen

dr. A. Tietema

afgerond.

[email protected] Onderdeel van


Leerdoel

Het doel van de stage is een introductie op een van de drie afstudeervarianten. Inhoud

De student kiest een stage, passend binnen de gekozen afstudeervariant Onderzoek, Maatschappelijk of Educatief/ Communicatief. De stage biedt de mogelijkheid kennis maken met de praktijk en inzicht te krijgen in de dagelijkse gang van zaken op de stageplek. Aanmelden

Aanmelding incl. keuze voor de variant: zes weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau. Onderwijsvorm

Het maken van een verslag. Studiemateriaal

Wordt nog bekend gemaakt. Toetsvorm

Het verslag wordt beoordeeld en dient aan de volgende eisen te voldoen: 1. Een inhoudelijke verslaglegging waarvan de inhoud in overleg met de begeleider wordt vastgesteld (max. aantal blz. in overleg met begeleider) 2. Een evaluerend verslag in de vorm van een dagboek waarin de uitgevoerde werkzaamheden kort worden vermeld, inclusief de relevantie voor, resp. plaats in het dagelijks werk van de begeleider (beperkt of uitgebreid, afhankelijk van het inhoudelijk verslag, max. 4 blz.)

111


telefoon: +31 20 5257458



3. Een samenvattende evaluatie door de student. (heeft zij/hij een duidelijk beeld gekregen van de kennis en de vaardigheden die nodig zijn voor het vervullen van de functie van de begeleider/van het bedrijf) (max. 1 blz.) 4. Een korte evaluatie van de begeleider m.b.t. kennis en vaardigheden student (max. 1 blz.). Bijzonderheden

Rooster: Het onderdeel wordt 1 keer per jaar op een vast moment georganiseerd. Daarnaast is het mogelijk op andere momenten in het jaar stage te volgen. Dit is afhankelijk van de aanwezigheid van mogelijke stageplekken. Overleg hierover dient tijdig (uiterlijk 6 weken voor aanvang) met de coördinator te gebeuren.

112



AW2042.

Klimatologie Vakcode

AW2042

Studielast

4

Ingangseis

Propedeuse aardwetenschappen, wiskunde en natuurkunde op VWO-niveau

Periode(n)

Semester 1 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)


Inlichtingen

dr.ir. J.H. van Boxel telefoon: +31 20 5256216 Bachelor Aardwetenschappen

Leerdoel

Uitdiepen van de meteorologische/ klimatologische kennis, met name op het gebied van de stralingsbalans van het aardoppervlak en de grenslaagmeteorologie. Vertrouwd raken met de fysische benaderingswijze van geografische problemen, alsmede het verwerven van de vaardigheid om problemen op een fysisch-mathematische manier aan te pakken. Inhoud

Het klimaat wordt bepaald door astronomische, meteorologische, geografische en menselijke factoren. In het college klimatologie worden deze behandeld en zonodig gekwantificeerd. De meteorologische grondslagen zijn reeds behandeld in het eerstejaars college ( Atmosferische fysica (pag. 91) (5 EC)). Het centrale thema in het tweedejaars college is de energiebalans van het aardoppervlak. Daarbij wordt veel aandacht besteed aan de belangrijkste term van de warmtebalans, namelijk de netto straling en de componenten waaruit deze opgebouwd is. Daarna komen de overige termen aan de orde zoals de bodemwarmtestroom, de voelbarewarmtestroom en de latente warmtestroom ( verdamping). Aan verdamping wordt extra aandacht besteed vanwege het belang voor vele hydrologische en andere fysisch-geografische problemen. Aanmelden


Hoorcollege (16 x 2uur). Studiemateriaal

Syllabus Klimatologie, ca. € 10,Toetsvorm


113


[email protected] Onderdeel van



AW3286.

Theorie en Praktijk van GIS en Remote Sensing Vakcode

AW3286

Studielast

5

Ingangseis

GIS/Remote Sensing (pag. 105) (4 EC) of een vergelijkbaar niveau

Periode(n)

Semester 2 blok 3

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. A.C. Seijmonsbergen (coördinator)

Inlichtingen

dr. A.C. Seijmonsbergen telefoon: +31 20 5257427 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Na deze cursus: ■

■

■

kan de student de belangrijkste theoretische van de remote sensing ( RS) en van geografische informatie systemen ( GIS) toepassen is de student in staat ruimtelijkegegevens in een GIS-omgeving te verzamelen, te bewerken en te visualiseren; kan de student ruimtelijke relaties met behulp van GIS modellen oplossen.

Inhoud

Er worden 12 practicum dagen aangeboden en 6 instructiecolleges met theoretische verdieping. Tijdens de instructiecolleges worden de volgende onderwerpen behandeld: ‘ landcoverchange’, patroonanalyse van een landschap, foutenvoortplanting in GIS, werken met databases, beeldsegmentatie en classificatie, metadata RS van bodem en vegetatie. Het praktische gedeelte sluit nauw aan bij de instructiecolleges en omvat ‘ coached selftuition’ modules met een keuze uit de volgende technische en inhoudelijke onderwerpen: ‘change detection’ met behulp van satellietbeelden en luchtfoto’s - beeldsegmentatie en classificatie m.b.v. eCognition bepalen van vegetatieveranderingen aan de hand van vegetatie indices zoals de NDVI. digitale 3D luchtfoto interpretatie met de stereo ‘analyst’ van ERDAS werken met geo-databases in ArcGIS ‘image merging’ technieken gebruik van ‘virtual’GIS Het modelleren van de bio-geografische verspreiding van flora en fauna m.b.v. GIS

■

■

■ ■ ■

■ ■

De cursus wordt afgesloten met een kort GIS- of RS-project waarin het geleerde uit bovenstaande wordt toegepast op een nieuwe dataset. Afhankelijk van het aantal deelnemers wordt dit zelfstandig of in tweetallen uitgevoerd.

114




Basiskennis GIS en RS, b.v. de cursus GIS/Remote Sensing (pag. 105) (4 EC)of een cursus van vergelijkbaar niveau Aanmelden


Instructiecolleges, GIS- en RS- practicum Studiemateriaal

Aantal deelnemers

max. 20 Toetsvorm

De antwoorden op de modulevragen worden ingeleverd (50%), en er wordt een poster gemaakt van het korte miniproject (30%), de resultaten worden gepresenteerd in een afsluitende workshop op de laatste dag (20%). Bijzonderheden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl. Voor het computerpracticum geldt een deelnameplicht.

115


Er wordt gewerkt met ArcGIS, ERDAS en eCognition software. Praktische oefeningen kunnen worden uitgeprint in de GIS-studio. Aanbevolen boek: wordt nog bekend gemaakt.



AW3 5.

Microscopie Vakcode

AW3335

Studielast

3

Ingangseis

1e jaar + Veldprakticum Luxemburg (pag. 109) (18 EC)af

Periode(n)

Semester 1 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.M. van Mourik

Inlichtingen


Onderdeel van


Leerdoel

Het kennismaken met het uitvoeren van microscopische analyses van bodemmateriaal. Inhoud

Het uitvoeren van analyses door middel van microscopische technieken. Cursus opzet: De cursus begint met een introductie van de rol van microscopie in fysischgeografisch onderzoek. Daarna volgt de kennismaking met het gebruik van diverse microscopen en hun toepassingen. Vervolgens wordt materiaal bekeken onder de binoculair microscoop. Daarna worden geoefend in het beschrijven en analyseren van slijpplaten van ongestoorde grondmonsters en preparaten van extracten onder de polarisatie microscoop. Tijdens het practicum worden monsters en microscopische preparaten uit profielen van de reguliere veldwerkgebieden geanalyseerd Aanbevolen voorkennis

2e jaar Bachelor AWS af Aanmelden

4 weken van te voren bij het onderwijsbureau Onderwijsvorm

colleges laboratoriumpractica microscooppracticum zelfstudie n.b. dit is een voltijds onderdeel en er is deelname plicht aan alle praktische onderdelen Studiemateriaal

practicum handleidingen. Syllabi en readers.

116



Toetsvorm

practicumverslag presentatie Het vak is gehaald indien het eindcijfer met 6.0 of hoger gewaardeerd is. Bijzonderheden



117



AW3281.

Materiaal-eigenschappen Vakcode

AW3281

Studielast

5

Ingangseis

1e jaar + Veldprakticum Luxemburg (pag. 109) (18 EC)

Periode(n)

Semester 1 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Afdeling Aardwetenschappen

Docent(en)

prof.dr.ir. W. Bouten, dr. L.H. Cammeraat, dr. J.R. Parsons, dr. A. Tietema, dr. W.P. de Voogt

Inlichtingen

dr. W.P. de Voogt telefoon: +31 20 5256565 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Het kennismaken met theorie en praktijk van chemische en fysische analyses en analysemethoden van bodemmateriaal. Inhoud

Het uitvoeren van analyses van bodemmateriaal in het fysisch-chemisch laboratorium. Cursusopzet De cursus bestaat uit het leren uitvoeren van bodemchemische- en bodemfysische bepalingen aan bodemmateriaal. Technieken die hierbij aan bod komen zijn: het bepalen van kalk- en organische stofgehalten, gloeiverlies, bodemtextuur, pH, geleidbaarheid, organische en anorganisch fosfor, de microbiële biomassa van bodemmateriaal, bulk dichtheid, aggregaatverdeling en-stabiliteit, waterretentie, infiltratie en doorlatendheid. Verder komen kort aan bod monstername- en ontsluitingstechnieken, alsmede de bepaling van organische microverontreinigingen m.b.v. chromatografie. Aanbevolen voorkennis

2e j BSc AWS afgerond Aanmelden

4 weken van te voren bij onderwijsbureau Onderwijsvorm

Instructiecolleges, experimenteel laboratoriumwerk (practicum), zelfstudie n.b. de student dient er rekening mee te houden dat dit een voltijds studieonderdeel betreft, en dat deelname aan alle praktische onderdelen verplicht is Studiemateriaal

prakticumhandleiding, readers

118



Aantal deelnemers

2-20 Toetsvorm

Prakticumverslagen / presentatie


119



AW3290.

Meetstrategieën Vakcode

AW3290

Studielast

7

Periode(n)

Semester 2 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof.dr.ir. W. Bouten (coördinator), dr.ir. J.H. van Boxel, dr.ir. E.E. van Loon, dr. J.R. Parsons, dr. A. Tietema

Inlichtingen


Onderdeel van


Leerdoel

De student kent de essentie van de karakteristieke meetstrategieën in de Fysische Geografie. De student kan bij een bepaalde vraagstelling een optimale meetstrategie ontwerpen. De student kan het meetprogramma uitvoeren en de resultatenanalyseren in relatie tot de vraagstelling. Inhoud

In dit studieonderdeel wordt aandacht besteed aan de belangrijkste meetstrategieën in de Fysische geografie: 1. Meten van tijdreeksen. Met dataloggers worden meteorologische grootheden en bodemtemperaturen geregistreerd 2. Meten van ruimtelijke patronen. In een meetnet wordt het watergehalte van de bovengrond gekarteerd 3. Manipulatieexperimenten. Door de temperatuur te manipuleren wordt gemeten wat het effect van de omgeving is op de activiteit van micro-organismen. 4. Materiaalkarakterisering. In het bodemchemischlaboratorium wordt het bodemmateriaal gekarakteriseerd Het ontwerp van metingen en de verwerking van gegevens wordt besproken in colleges over ‘ experimental design’ en de ruimtelijk- statistische verwerking van gegevens. Begrippen en technieken uit de tijdreeksanalyse en de geostatistiek die aan bod komen zijn: temporele en ruimtelijkevariabiliteit, stochastisch proces en stochastisch veld, stationariteit, kriging en stochastische simulatie. Aanbevolen voorkennis

In dit studieonderdeel wordt kennis verondersteld van de studieonderdelen Inleiding Aardwetenschappen (pag. 83) (9 EC), Chemie, Bodem en Water I (pag. 100) (6 EC), Chemie, Bodem en Water II (pag. 102) (6 EC) , Water Management (pag. 97) (7 EC), Atmosferische fysica (pag. 91) (5 EC).

120



Aanmelden


Hoorcollege's, practica. Deelname is verplicht. Studiemateriaal

Reader Toetsvorm

Verslagen van de afzonderlijke onderdelen. Opleiding Aardwetenschappen

Bijzonderheden


121



AW310.

Modelleren en Simuleren Vakcode

AW3310

Studielast

5

Periode(n)

Semester 2 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof.dr.ir. W. Bouten (coördinator)

Inlichtingen


Onderdeel van


Leerdoel

De student kent een aantal verschillende technieken om ruimtelijk expliciete dynamische processen te modelleren. De student kent de mogelijkheden en beperkingen van deze technieken en is in staat om bij een gegeven probleemstelling de juiste simulatietechniek te kiezen. De student kan deze technieken ook toepassen bij een wetenschappelijke vraagstelling of een fysisch geografische toepassing. Inhoud

In dit studieonderdeel worden modellen gemaakt van warmtetransport in de bodem, interceptie en verdamping van regenwater in een bos, grondwaterstroming en erosie in het veldwerkgebied Luxemburg, lawines en de ontwikkeling van vegetatiepatronen in semiaride gebieden. Voor deze modellen wordt gebruik gemaakt van numerieke oplossingen van partiële differentiaalvergelijkingen en van cellulaire automaten. Als afsluiting vindt een discussie plaats over de zin en onzin van modelleren. Aanbevolen voorkennis

Programmeren in Matlab (pag. 104) (4 EC) Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het onderwijsbureau. Onderwijsvorm

Hoorcollege, werkcollege's Deelname is verplicht Studiemateriaal

Reader. Toetsvorm

Opdrachten, tentamen achter de computer

122



Bijzonderheden



123



AW3295.

Bachelor Thesis Vakcode

AW3295

Studielast

18

Ingangseis

eerste studiejaar af; tweede studiejaar af met max. 10 EC ontbrekende punten; de

Periode(n)

Semester 2 blok 2 en 3 (2 april – 6 juli 2007)

derde jaars cursus Meetstrategieën (pag. 120) (7 EC) afgerond. Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof.dr.ir. W. Bouten, dr.ir. J.H. van Boxel, dr. C.L. Kwa, dr.ir. E.E. van Loon, dr. A. Tietema, drs. F.W. van der Vegte (coördinator)

Inlichtingen

(en anderen)

drs. F.W. van der Vegte telefoon: +31 20 5257595 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

De student kan zelfstandig een statistisch verantwoord onderzoek uitvoeren met behulp van meetmethoden die gangbaar zijn in het bodemkundig, hydrologisch, geomorfologisch en meteorologisch procesonderzoek. De student kan zelfstandig onderzoek van beperkte omvang opzetten, uitvoeren en rapporteren binnen de afgesproken planning. De student maakt kennis met de beleidsgerichte en commerciële werkvelden van de fysisch geograaf en doet ervaring op met verschillende vormen van communicatie. Inhoud

Het studieonderdeel bestaat uit: (i) Zelfstandig opzetten en uitvoeren van procesonderzoek (ii) Schrijven en presenteren van de Bachelors Thesis (iii) Oriëntatie op de mastervarianten Onderzoek, Communicatie & Educatie en Maatschappelijk Toelichting: (i) Zelfstandig opzetten en uitvoeren van procesonderzoek De student kiest uit de lijst een onderzoeksonderwerp. De onderwerpen zijn zo gekozen dat ze een aspect van meten en een aspect van interpretatie m.b.v. een simulatiemodel of statistiek omvatten. De student werkt een eigen werkplan uit alvorens met het onderzoek gestart kan worden. Het voldoen aan de afgesproken planning van de werkzaamheden vormt onderdeel van de beoordeling. Het onderzoek omvat de volgende fasen: kennismaking met het onderzoeksgebied onderzoeksvoorstel schrijven en presenteren zelfstandig uitvoeren van procesonderzoek ■ ■ ■

124



(ii) Het schrijven en presenteren van een Bachelor Thesis De resultaten van het onderzoek worden gerapporteerd in een wetenschappelijk verslag van maximaal 20 pagina’s, excl. bijlagen, op het web (Blackboard) en in de vorm van een presentatie (power point) tijdens een symposium waarbij ook buitenstaanders aanwezig zijn. (iii) Oriëntatie op de mastervariant varianten Communicatie & Educatie Variant, Maatschappelijke Variant en de Onderzoek Variant

■ ■

■ ■ ■

■


1e en 2e jaar AW af, inclusief Programmeren in Matlab (pag. 104) (4 EC) en Meetstrategieën (pag. 120) (7 EC) Aanmelden

Intakegesprek met de coördinator voor 1 februari 2007. Definitieve aanmelding vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau. Onderwijsvorm

Colleges, laboratoriumwerkzaanheden, veldwerk, zelfstandig onderzoek. N.B.: Het gaat bij dit onderdeel om ‘full-time' onderwijs! Bijwonen van de ingeroosterde onderdelen is verplicht! Studiemateriaal

Practicumhandleiding, reader. Kosten

Eigen bijdrage reader; de kosten van veldbezoeken (excl. kosten voor levensonderhoud) worden gedragen door de UvA Aantal deelnemers

1 - 20

125


Aan het begin van de cursus wordt voorlichting gegeven over de Masterprogramma’s die bij IBED worden aangeboden. Later in de cursus vindt de Oriëntatie op de Mastervariant Communicatie & Educatie en de Maatschappelijke variant plaats. Onderdelen van de oriëntatie zijn: Overzicht Masterprogramma’s IBED Colleges Wetenschap en Maatschappij Colleges Schrijven van teksten en Presentatietechnieken Workshop Interviewtraining Bedrijfsbezoek en afnemen interview Essay schrijven (2 – 3 pagina’s) en presentatie m.b.v. power point



Toetsvorm

Onderzoeksvoorstel en werkplan (10%), bachelor thesis (60%), symposiumpresentatie (10%), planmatig werken (10%) o.a. de BSc thesis binnen vastgestelde termijn inleveren; verslag en presentatie onderdeel Oriëntatie (10%) worden apart getoetsd (tussen haakjes de bijdrage in procenten aan de eindbeoordeling). Bijzonderheden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl 6.4

Minorvakken voor niet Fysisch Geografen

AW1026.

Fysisch Geografische Systemen Vakcode

AW1026

Studielast

9

Periode(n)

Semester 1 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr.ir. J.H. van Boxel, dr. J.M. van Mourik, dr. A. Tietema (coördinator)

(en

diverse andere docenten) Inlichtingen


Onderdeel van


Leerdoel

Kennismaking met de verschillende onderdelen binnen de fysischegeografie en de samenhang ertussen; eerste kennismaking veldwerk en het doen van onderzoek; oefeningen in diverse vaardigheden. Inhoud

De module bestaat uit een serie colleges waarin het vak fysische geografie en de toepassing daarvan op het Nederlandse landschap wordt geïntroduceerd. Zelfstudie, gebruik van computer, een dag-excursie op Texel, en het uitvoeren van een mini-onderzoek inclusief veldwerk op Texel voeren de studenten verder in de stof. Het onderdeel wordt afgerond met het schrijven van een verslag. De module wordt ook gebruikt om de studenten bekend te maken met de bibliotheek, met het computernetwerk, met studievaardigheden en met mondeling en schriftelijk presenteren. Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau; in het eerste trimester meldt de studieadviseur de eerstejaars studenten aan.

126



Onderwijsvorm

Hoorcolleges, zelfstudie, excursie, veldwerk, werken in groepen, practica. Studiemateriaal

Syllabi `Inleiding tot de Fysische Geografie` en `Texel`. Beiden worden aangeboden op Blackboard. Kosten

Alleen de verblijfskosten op Texel (eten en drinken) zijn voor eigen rekening. Toetsvorm

Schriftelijk tentamen; schriftelijk verslag en mondelinge presentatie minionderzoek. Opleiding Aardwetenschappen

Bijzonderheden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl.

127



AW161.

Inleiding Aardwetenschappen Vakcode

AW1161

Studielast

9

Periode(n)

Semester 1 blok 2

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. L.H. Cammeraat, dr. A.C. Seijmonsbergen, dr. A. Tietema (coördinator)

Inlichtingen


Onderdeel van


Leerdoel

Inleiding en materialen Verkrijgen van inzicht in de verbanden tussen geologie, bodemkunde en geomorfologie en hun plaats in het terrestrischesysteem. Inzicht verkrijgen in de basisbegrippen van de petrologie. Inzicht verkrijgen in de basisbegrippen van verwering. Macroscopische determinatiegesteenten en bodemmaterialen. Geologie Kennis basistheorie van de algemene, historische en structurele geologie & de principes van de sedimentologie en petrologie. Vaardigheid met het tijdsbegrip in de geologie, integreren van tijden ruimtebepalende geologische factoren in vormen materiaal- en procesbepalende landschapselementen; het werken met Engelstalige vakdefinities; het interpreteren van geologische kaarten; lezen van geologischerapporten; rapporteren eigen waarnemingen. Geomorfologie Kennis van terminologie voor beschrijving van geomorfologischeverschijnselen en processen; kennis van de landschapsvormen in verschillende landschapstypen; inzicht in de samenhang tussen landschapsvormen, landschapsvormende processen en geomorfologische factoren. Bodemkunde Inzicht in het basale begrippenkader van de bodemkunde, de functies van de bodem als onderdeel van landschappelijke ecosystemen; kennis van de belangrijkste bodemvormende factoren en processen en eigenschappen van bodems; kennismaken met een aantal basale methoden en technieken in de bodemkunde (eenvoudige analyses, beschrijving, classificatie).

128



Illustratie Excursies Het verkrijgen van inzicht in de opbouw van Nederlandse landschappen, en de samenhang tussen geologie, geomorfologie en bodem. Samenvatten en presenteren Kritisch lezen van een geomorfologisch, geologisch of bodemkundig artikel uit wetenschappelijke tijdschriften; leren samenvatten en mondeling presenteren van aardwetenschappelijkke stof. Inhoud

Geologie 1. Inleiding in de historische geologie en sedimentologie. 2. Inleiding in de algemene en structurele geologie. Geomorfologie Systematische inleiding in de grondbeginselen van de geomorfologie door bestudering van het geomorfologische tekstboek plus additionele stof die behandeld wordt tijdens het college. Bodemkunde Ingegaan wordt op het verschijnsel ‘bodem’ als onderdeel van het ecosysteem en op de rol van bodemvormende factoren. Daarna volgt een overzicht van de belangrijkste eigenschappen en bodemvormende processen. Bodemclassificaties worden toegelicht en in de praktijk toegepast. Illustratie Excursies 1. Theoretische toelichting op de te bezoeken Nederlandse landschappen 2. Illustrerende excursies Aanbevolen voorkennis

Geen speciale voorkennis nodig. Aanmelden

Via Studieweb Onderwijsvorm

Hoorcolleges, zelfstudie, excursies, practica. Studiemateriaal

Inleiding en materialen Syllabus bij het practicum gesteenteherkenning (kan worden aangeschaft bij het begin

129


Inleiding en materialen 1. Inleiding in de geologie, geomorfologie en bodemkunde 2. Inleiding in de petrologie en mineralogie 3. Inleiding in verweringsprocessen 4. Materiaal (gesteente en bodem) practicum



van de cursus). Loep (vergroting minimaal 10x) Geologie en Geomorfologie Understanding Earth, Vijfde Editie, 2007. Grotzinger, Jordan, Press & Siever, Freeman & Compagny, ISBN 0-7167-6682-5, 66 Euro. Bodemkunde M.R. Ashman & G. Puri: 'Essential Soil Science', Blackwell Publishing, ISBN 0632048859 Illustratie Excursies -Geologisch kompas (alleen voor Fysisch Geografen) -Geologische hamer (alleen voor Fysisch Geografen) -OV-jaarkaart -Veldkleding en laarzen -Bodemmes met terugklap vergrendeling. De aanschaf van een geologische hamer en een geologisch kompas verdient aanbeveling i.v.m. de excursie. Deze zijn aan te schaffen bij de studievereniging. Voor Fysisch Geografen zijn deze attributen onontbeerlijk voor onderdelen later in hun studie. Kosten

Syllabus € 20 Reader Geomorfologie ca. € 20,Verblijfskosten (eten en drinken) tweedaagse excursie Zuid Limburg. Toetsvorm

Deeltentamens over de onderdelen Geologie, Geomorfologie en Bodemkunde aan het eind van de cursus en een practicumtoets na de eerste week. Het eindcijfer van de module moet minsters 6.0 zijn, waarbij de practicumtoets voor 10% meetelt en de deeltentamens voor ieder 30%. Bovendien moeten alle deeltentamens minstens met een 5.0 beoordeeld zijn. Inleiding en materialen Practicumtoets over het practicum en de collegestof van de eerste week. Geologie Schriftelijk tentamen over het boek, de in het college behandelde stof en de excursies. Geomorfologie Schriftelijk tentamen over het boek, de in het college behandelde stof en de excursies. Bodemkunde Schriftelijk tentamen over het boek, de in het college behandelde stof en de excursies.

130



Verder is het houden van een voordracht over een wetenschappelijk artikel verplicht. Bijzonderheden



131



AW2140.

Inleiding Klimatologie Vakcode

AW2140

Studielast

3

Periode(n)

Moduleperiode III

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)


Inlichtingen

dr.ir. J.H. van Boxel telefoon: +31 20 5256216 [email protected]

Onderdeel van

Minor Fysische geografie Minor Fysische Geografie

Leerdoel

Inzicht verkrijgen in de werking van het klimaatsysteem, de algemene circulatie en de processen die daaraan ten grondslag liggen. Inhoud

In het eerste deel van het college wordt de meteorologische basis behandeld: Samenstelling en opbouw van de atmosfeer, het verticale evenwicht in de atmosfeer, de vorming van wolken en neerslag, de krachten die een rol spelen bij het ontstaan van wind en de energieoverdracht door straling en warmtestromen. In het tweede deel wordt deze kennis toegepast op de algemene circulatie in de atmosfeer en in de oceaan. Uiteindelijk wordt dit geheel gebruikt om de verdeling van temperatuur, neerslag en de bijbehorende klimaten over het aardoppervlak te verklaren. Actuele problemen die in het college aan de orde komen zijn het broeikaseffect, aantasting van de ozonlaagEl Niño en vulkanen. De processen die zich afspelen in de atmosfeer kunnen niet worden beschreven zonder zich te beroepen op enkele natuurkundige principes. De beschrijving zal echter kwalitatief van aard zijn. Dit studieonderdeel richt zich met name op niet Fysisch Geografen, die inzicht willen krijgen in weer en klimaat. Aanmelden

Vier weken voor aanvang van de cursus bij het onderwijsbureau Aardwetenschappen. Onderwijsvorm

Hoorcolleges Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl Studiemateriaal

Syllabus Inleiding Klimatologie

132



Toetsvorm



133



AW102.

Landschapsanalyse Vakcode

AW1102

Studielast

7

Periode(n)

Semester 2 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. L.H. Cammeraat, dr. A.C. Seijmonsbergen (coördinator)

Inlichtingen

dr. A.C. Seijmonsbergen telefoon: +31 20 5257427 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Na het volgen van deze cursus kan de student: ■

■ ■

■

■

Met behulp van de basisprincipes uit de Inleiding Aardwetenschappen (geologie, geomorfologie, bodemkunde en landschapsecologie) op stereoluchtfoto’swaarnemingen doen en deze begrijpen op de schaal van een landschap. Thematisch kaartmateriaal inhoudelijk interpreteren. Eenvoudige toegepaste fysisch geografische probleemstellingen m.b.v. luchtfoto’s en kaarten oplossen. Een eenvoudige tracing ( luchtfotokaart) maken gebaseerd op driedimensionaleinterpretatie. Met de Stereo-Analyst van ERDAS Imagine software en met Google Earth waarnemingen en metingen doen in 3Dlandschappen.

Inhoud

In de cursus wordt individueel gewerkt met een spiegelstereoscoop en thematische kaarten. De meest voorkomende landschapstypen worden behandeld waarbij (tijds)relaties tussen de abiotische ondergrond (geologie- bodem- geomorfologie), ruimtelijke processen en vegetatie centraal staan. Er worden luchtfoto’s uit de volgende landschappen behandeld: mediterrane en aride landschappen, alpiene landschappen, glaciale landschappen, kustlandschappen, fluviatiele landschappen, verweringslandschappen en vulkanische landschappen. In het begin van de cursus worden vooral natuurlijke landschappen behandeld. Later zullen ook cultuurlandschappen worden behandeld. Er wordt aandacht besteed aan het herkennen van hoofdgroepen van gesteentes, aan de verdeling en samenstelling van los materiaal, aan de geologische en geomorfologische ontwikkeling in een landschap en aan de relatie die er bestaan tussen substraat, bodemontwikkeling en vegetatiebedekking binnen de klimatologische randvoorwaarden. De student wordt actief aangemoedigd om het landschap in te delen in hoofdlandschapstypen en deze zo nodig onder te verdelen. De

134



student maakt zelf doorsneden door het landschap en tekent daarin de verzamelde informatie over geologie, de geomorfologische kenmerken en hydrologische relaties.Met behulp van 3D software en Internet worden ook waarnemingen en metingen gedaan digitale luchtfoto’s en satellietbeelden. Aanbevolen voorkennis

Basiskennis van aardwetenschappen (geologie, geomorfologie en ecologie) wordt aanbevolen. Aanmelden

Vier weken voor aanvang bij het Onderwijsbureau. Twee instructiecolleges van 2 uur, 14 dagen practicum met veel zelfstudievragen en aansluitende klassikale discussies. Studiemateriaal

Kaartmateriaal en luchtfotomateriaal van Fysische Geografie, practicumsyllabus en teken/oefenmateriaal. Digitale luchtfoto’s en satellietbeelden en Google Earth. Toetsvorm

Schriftelijk tentamen over de stof in twee delen: - 1 uur tentamen over kaarten, dit bepaalt 40% van het eindcijfer - 2 uur tentamen over luchtfoto's, dit bepaalt 60% van het eindcijfer Bijzonderheden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl . Er mag niet meer dan tweemaal verzuimd worden tijdens het practicum. Tentamendatum wordt in overleg vastgesteld.

135


Onderwijsvorm



AW20 1.

Ecosystemen van de Wereld Vakcode

AW2021

Studielast

4

Periode(n)

Semester 2 blok 1

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

mw. dr. A.M. Kooijman (coördinator)

Inlichtingen

mw. dr. A.M. Kooijman telefoon: +31 20 5257441 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Aardwetenschappen Minor Fysische geografie Minor Fysische Geografie

Leerdoel

Systematisch inzicht in de kenmerken en het functioneren van de belangrijkste op de wereld voorkomende ecosystemen, zowel voor wat betreft de biotische als abiotische aspecten als van hun onderlinge samenhang en de invloed van de mens op deze systemen. Inhoud

Uitgegaan wordt van de boeken Biology of Plants en The Major Soils of the World, die gezamenlijk een systematisch overzicht van kenmerken en functioneren van de belangrijkste ecosystemen geven. Dit overzicht wordt, gegroepeerd op basis van klimaatszones en van drainage, behandeld. Aanmelden


Hoorcollege (11 x 2uur), gevolgd door een presentatie door de studenten van de belangrijkste ecosystemen in een bepaalde regio en hun functioneren, aan de hand van een kaartblad van de wereldbodemkaart. Studiemateriaal

Aan het begin van het college dienen studenten te beschikken over de boeken: P.H. Raven, R.F. Evert en S.E. Eichhorn: Biology of Plants, seventh edition, W.H. Freeman and Company Publishers (reeds aangeschaft in het 1ste jaar of in de bibliotheek verkrijgbaar) en Driessen, Decters, Spaargaren en Nachtegaele: Lecture Notes on the Major Soils of the World, FAO, 2001. Toetsvorm


136



Bijzonderheden



137



138


D E E L 3: B I O L O G I E , B I O M E D I S C H E WETENSCHAPPEN EN PSYCHOBIOLOGIE

D E E L 3: B I O L O G I E , B I O M E D I S C H E W E T E N S C H A P P E N E N P S Y C H O B I O L O G I E

Opleidingen Biologie



Inhoudsopgave

Inhoudsopgave 1

2

3

De Bacheloropleidingen

143

1.1 1.2

143 144

Inleiding bacheloropleidingen Doelstellingen


145

2.1 2.1.1 2.1.2 2.1.3 2.2 2.2.1 2.2.2 2.2.3

145 145 146 147 147 147 148 148

Het eerste jaar Opbouw eerste jaar Studiebegeleiding eerste jaar Studieadvies eerste jaar Het tweede en Derde jaar Opbouw tweede en derde jaar Toelating tot tweede en derde jaar Ingangseisen vakken tweede en derde jaar

151

3.1 3.1.1 3.1.2 3.1.3 3.1.4 3.1.5 3.2 3.2.1 3.2.2 3.3 3.3.1 3.3.2 3.3.3 3.4 3.4.1 3.4.2 3.4.3 3.4.4 3.4.5 3.4.6 3.5 3.5.1 3.5.2 3.5.3 3.5.4 3.6 3.6.1

151 151 152 152 153 153 153 153 154 154 154 155 156 157 157 157 157 158 158 158 158 158 159 159 160 160 160

Het Onderwijsinstituut Onderwijsbureau Aanmelden vakken via Studieweb Hertentamens Afmelden vak Uitslagen studieresultaten Studiebegeleiding Studieadviseurs Vertrouwenspersoon Commissies ten behoeve van het onderwijs Opleidingsteams Opleidingscommissie (OC) Examencommissie (Excie) Praktische zaken Verkoop van boeken en syllabi Practicum- en collegezalen Computerfaciliteiten Verzekeringen Mededelingen Kopieren Bachelorexamen Aanvraag Bachelorexamen Toekenning predikaat 'Cum Laude' Diploma uitreiking Afstudeerverklaring Verenigingen Studieverenigingen

141


Onderwijs en Studentzaken


Inhoudsopgave

3.6.2 3.6.3

4

6

163

4.1 4.1.1 4.1.2 4.1.3

163 163 165

Masteropleiding Overzicht aangeboden masterprogramma's Algemene Opbouw Masteropleiding Aansluitmasters bij de bacheloropleidingen Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie Andere mogelijkheden Orientatie op de masteropleidingen Mastervoorlichting Studie- en loopbaanweek Beta bedrijvencontactdag

166 167 167 167 167 168


169

5.1 5.2

169 197

Eerste jaars vakken Vakken tweede en derde jaar

Bijlage 6.1 6.2 6.3 6.4

142

161 161

Doorstromen naar de Masteropleidingen

4.1.4 4.2 4.2.1 4.2.2 4.2.3

5

Alumnivereniging Beroepsvereniging

301

Vakperiodes studiejaar 2006/2007 301 Onderwijsvrije dagen 302 Stroomschema's Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie303 Herkansingsrooster studiejaar 2006-2007 308



1 De Bacheloropleidingen 1.1

Opel idngenBiol gie

Inleiding bacheloropleidingen

Biologie (opleidingscoördinator mw. drs. L. Kerstens) De biologische wetenschap is van cruciaal belang voor de menselijke ontwikkeling. De omgeving kan immers naast een bron van voedsel ook een bedreiging zijn. En zonder kennis van de ziekten die het gewas bedreigen of van de wijze waarop erfelijke eigenschappen overerven, staat de moderne mens machteloos. Ook op andere terreinen is biologische kennis onontbeerlijk. Denk aan kwesties als de zorg om het milieu, het ontwikkelen van nieuwe geneesmiddelen, het beheren en behouden van de natuur en het verbeteren van landbouwtechnieken voor de derde wereld. ■ ■

■

programma Algemene Biologie programma Ecologie en Biodiversiteit programma Moleculaire Celbiologie en Bioinformatica

Biomedische wetenschappen (opleidingscoördinator mw. dr. ir. B.B. Oude Essink) Zolang de mensheid bestaat, wordt zij bedreigd door andere organismen. Met de grote roofdieren leerden onze voorouders al snel omgaan. Met gevaren als ziektes ligt dat anders: pas sinds de laatste driehonderd jaar leren we de biologie achter deze grootste bedreigingen kennen. Door de opkomst van de microbiologie, de ontdekking van het vaccineren en de moleculaire genetica weten we steeds meer ziektes te doorgronden. En er oplossingen voor te vinden. Tegenwoordig houden de Biomedische wetenschappen zich bezig met het zoeken naar oorzaken en het bestrijden van ziektes bij de mens. programma Biomedische wetenschappen

Psychobiologie (opleidingscoördinator mw. drs. S.C. Witteveen) De psychobioloog zoekt naar de biologische achtergrond van psychologische processen. Hiermee kan raadselachtig menselijk gedrag misschien verklaard worden, maar ook kan er gericht gezocht worden naar oplossingen voor psychische stoornissen als autisme, schizofrenie of de ziekte van Alzheimer. ■

programma Psychobiologie

Voor een goed overzicht van de (vakken in de) verschillende bacheloropleidingen zie de stroomschema's in de bijlage.

143


■



1.2

Doelstellingen

De opleidingen Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie zijn nauw met elkaar verweven. Grote delen van het onderwijsprogramma zijn gemeenschappelijk en de drie opleidingen worden verzorgd vanuit een biologisch perspectief. Het eerste jaar is breed, oriënterend en selecterend van opzet. In het tweede en derde jaar van de bachelor kunnen studenten een specialisatie kiezen. Voor de medische vakken wordt samengewerkt met de faculteit Geneeskunde (AMC), het Nederlands Kanker Instituut (NKI), Sanquin (voormalig Centraal Laboratorium van de Bloedtransfusiedienst - CLB), het Nederlands Instituut voor Hersenonderzoek (NIH) en het Interuniversitair Oogheelkundig Instituut (IOI). Ook het Centraal Bureau voor de Schimmelcultures (CBS) levert een bijdrage aan de diversiteit in het onderwijsaanbod. Voor de opleiding Psychobiologie wordt samengewerkt met de afdeling Psychologie van de Faculteit der Maatschappij en Gedragswetenschappen. Na het afronden van de bacheloropleiding is de student in staat, onder begeleiding in een masteropleiding, een gespecialiseerd onderzoek te verrichten en uit te voeren met als doel om nieuwe wetenschappelijke kennis te verwerven. Daarnaast kan de student binnen de mastervarianten Science, Technology and Public Management resp. Educatie en Communicatie leren deze kennis toe te passen in een maatschappelijke context.

144



2 Structuur van de opleiding 2.1 2.1.1

Opel idngenBiol gie

Het eerste jaar Opbouw eerste jaar

Het eerste studiejaar is voor Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie opgebouwd uit cursussen (ook wel “vakken” genoemd) van in principe 8, 8 en 4 weken. De eerste vier cursussen worden gezamenlijk gevolgd; vanaf de 5e cursusperiode gaan de verschillende opleidingen uiteen (zie schema). De studiestof voor de eerste 4 cursussen bestaat uit een voorgeschreven leerboek dat voor alle studenten hetzelfde is; vanaf de vijfde cursus zal de studiestof verschillend zijn. Het gehele studiejaar bestaat uit 40 weken, waarbinnen 60 EC’s verworven kunnen worden. Aan elke cursus is een aantal EC’s toegewezen op basis van de studielast voor de biologische basis (zie cursusbeschrijving). Daarnaast loopt in het gehele studiejaar een cursus Academische Basisvaardigheden ( 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)) en loopt gedurende de eerste vier cursussen een cursus Basis Statistiek ( 1012 Basis Statistiek (pag. 194) (6 EC)). Vanaf de vijfde cursus is de Statistiek verschillend voor de verschillende studierichtingen en geïntegreerd binnen de afzonderlijke cursussen.

Academische Basisvaardigheden (lezen, schrijven, samenvatten, presenteren,…) worden behandeld binnen de studieprocesbegeleiding (tutoraat), wat inhoudt dat groepen van ± 15 studenten elke week met een vaste tutor op een vast moment 2 uur bijeenkomen. In deze bijeenkomsten worden opdrachten gegeven, voorbereid, behandeld, etc. die gericht zijn op verwerking van de studiestof en op academische vaardigheden. Omdat niet elke student in elke cursus voor dezelfde academische vaardigheden aan bod komt, maar dit verspreid over het jaar zal plaatsvinden, zal de eindbeoordeling aan het eind van het eerste jaar plaatsvinden. Alle studenten zijn verplicht aan het tutoraat deel te nemen. Studenten die als eindoordeel

145


Biologische Basiskennis en vaardigheden wordt in onderscheiden cursussen gedoceerd op basis van een voorgeschreven studieboek. Naast dit studieboek kent elke cursus een syllabus, die algemene informatie en practicumhandleidingen bevat. In Hoorcolleges (voor het gehele of halve cohort) worden slechts de basisprincipes, rode draad, valkuilen van de studiestof behandeld. Daarnaast worden (verplichte) practica gegeven. De theorie wordt getoetst in (een) theorietoets(en); de practicumvaardigheden worden getoetst in een practicumtoets. In 8-weekse cursussen wordt terwille van de studeerbaarheid de theorie na 4 en 8 weken getoetst, maar evt. herkansing betreft altijd de gehele theorie, ongeacht eerder behaalde deelcijfers. De practica worden met “voldoende” of “onvoldoende” beoordeeld. Om naar het tweede jaar te kunnen moeten alle practica met “voldoende”zijn beoordeeld.



voor de academische vaardigheden een onvoldoende behalen, kunnen dit herkansen door middel van een of meer vervangende opdrachten, echter uitsluitend nadat alle andere verplichtingen van het eerste jaar zijn afgerond. Om naar het tweede jaar te kunnen moet de cursus Academische Basisvaardigheden met “voldoende” zijn beoordeeld. De studieprocesbegeleiding/tutoraat dient –naast het verwerven van Academische Basisvaardighedenook om studenten te ondersteunen bij het bestuderen van de studiestof (leren studeren, tijdig beginnen, etc.) en het voorbereiden van toetsen. Basisstatistiek (cursus 1012) wordt tijdens de eerste vier blokken gedoceerd tijdens en in de context van de biologische stof en ook gelijktijdig getoetst met de biologische studiestof. Bij elke toets zijn de vragen over Basisstatistiek afzonderlijk herkenbaar. Zo wordt bij elke toets een deel van het eindcijfer opgebouwd. Studenten die hiervoor zakken, dienen de gehele stof van de eerste vier cursussen te herkansen, ongeacht de cijfers die behaald zijn binnen de verschillende cursussen. Naast de colleges, practica en tutorgroepen zijn in elke cursus Service-slots. Hierin wordt aandacht besteed aan nabespreking van de voorafgaande toets(en), evaluatie van het onderwijs, voorlichting door studieadviseurs, etc. 2.1.2

Studiebegeleiding eerste jaar

Voor alle eerstejaars studenten worden de volgende begeleidingsactiviteiten georganiseerd: ■

■

■

■ ■

■

■

Introductie met studentmentoren van de opleidingen. Op de eerste dag van het cursusjaar (28 augustus) is de introductie op de faculteit. Deze dag valt tijdens de UvA Intreeweek. Deelname aan deze week is facultatief, maar aanwezigheid op de facultaire introductie dag is voor alle aankomende studenten verplicht. Op 8, 9 en 10 september wordt er een introductieweekend georganiseerd door de studievereniging CONGO voor alle eerstejaars studenten. De studieadviseurs geven tijdens elke cursus een presentatie over studiezaken die op dat moment belangrijk zijn voor studenten. De studieadviseurs bieden individuele begeleiding bij de studie (zie paragraaf 3.2.1) Studievoortganggesprekken: in december/januari worden studenten die nog weinig resultaten geboekt hebben, opgeroepen voor een studievoortgangsgesprek met de studieadviseur. Studenten de aan het eind van het studiejaar minder dan 40 EC hebben behaald worden opgeroepen voor een gesprek. Advies over bachelorprogramma: de studieadviseurs kunnen samen met de coördinatoren van de bachelorprogramma's helpen bij het samenstellen van het bachelorprogramma. Voorlichting over Masterprogramma's: De mastercoördinatoren kunnen ook door eerstejaars benaderd worden als deze al meer wil weten over de mogelijkheden na de bacheloropleiding. De namen staan in paragraaf 4.1.3 van deze gids.

146



2.1.3

Studieadvies eerste jaar

De opleiding is wettelijk verplicht aan het eind van het eerste studiejaar aan iedere student, die voor de eerste maal is ingeschreven bij de opleiding, een schriftelijk advies te geven over de voortzetting van de studie. In december/januari krijgt de student een voorlopig studieadvies en worden de studenten met geringe studieresultaten opgeroepen voor een studievoortgangsgesprek met de studieadviseur. De definitieve schriftelijke adviezen worden uiterlijk in augustus toegestuurd. Het eerste jaar is op dat ogenblik nog niet geheel voltooid, maar op basis van de op dat moment behaalde studiepunten wordt een studieadvies gegeven. Studenten die 40 EC in het eerste jaar hebben behaald, inclusief Academische Basisvaardigheden, alsmede aan alle practicum verplichtingen hebben voldaan, worden toegelaten tot het tweede jaar. Voorwaarde is dat studieachterstand uit de het eerste jaar weggewerkt is voor januari. Studenten die hieraan niet voldoen worden niet toegelaten tot het tweede jaar. Deze studenten worden opgeroepen voor een gesprek met de studieadviseur. 2.2 2.2.1

Het tweede en Derde jaar Opbouw tweede en derde jaar

147


Het tweede en derde jaar hebben tot doel om de basiskennis en -vaardigheden, in de verschillenden vakdisciplines gericht op specialisatiemogelijkheden en beroepsperspectieven uit te breiden. Naast vakinhoudelijke vaardigheden worden ook basisvaardigheden getraind zoals het overdragen van verworven kennis en vaardigheden aan anderen. Er worden verschillende programma’s onderscheiden. De studieprogramma’s worden formeel beschreven in de Onderwijs en Examenregeling (OER). De OER is te vinden op de site voor zittende studenten (http://www.student.uva.nl) en kan tevens op de FNWIwebsite worden geraadpleegd (http://www.science.uva.nl). Studenten die een van de programma’s van Biologie (Ecologie en Biodiversiteit, Moleculaire Celbiologie en Bioinformatica), Biomedische wetenschappen en Psychobiologie volgen, kunnen kiezen uit de vakken die door de programma’s worden aangeboden. Studenten die het programma Algemene Biologie volgen, kunnen kiezen uit vakken van de twee programma’s van Biologie en dat van Biomedische wetenschappen. Bij ieder programma is een aantal vakken verplicht, voor een overzicht van de verplichte vakken zie de stroomschema's in de bijlage (hoofdstuk 6). Voor de beschrijvingen van de vakken zie hoofdstuk 5. Het tweede en derde jaar zijn opgebouwd uit 12 vakperioden waarvan de meeste uit 7 weken bestaan. In periode 5 en 6 van het derde jaar, wordt de bachelor afgesloten met een oriëntatie op de masterfase. Naast de inhoudelijke vakken dient men een miniscriptie (290) te schrijven en daarover een mondelinge presentatie te geven. Tevens is men verplicht de cursus beroepsethiek (282) te volgen.



Werkvormen tweede en derde jaar In de vakken van het tweede en derde jaar volg je hoorcolleges met een afsluitend tentamen en verricht je praktisch werk in de vorm van het doen van waarnemingen en/of het verrichten van experimenten, waarover mondeling en schriftelijk verslag gedaan wordt. Er zijn echter ook cursussen die een minder praktisch gericht karakter hebben. Deze zijn vrijwel geheel gevuld met hoor- en werkcolleges en tentamen(s) of bestaan uit een literatuurstudie met schriftelijke rapportage. 2.2.2

Toelating tot tweede en derde jaar

Iedereen die eind augustus het eerste jaar heeft behaald, wordt toegelaten tot het tweede en/of derde jaar. Een student die eind augustus (inclusief de herkansingen van eind augustus) in het eerste inschrijvingsjaar 40 EC heeft behaald inclusief Academische Basisvaardigheden, alsmede aan alle practicum verplichtingen heeft voldaan, wordt toegelaten tot de vakkenperioden 1 t/m 3 van het tweede jaar, maar moet voorrang geven aan het behalen van het eerste jaar. De eerstejaars vakken die nog openstaan moeten tijdens de herkansingsperioden (zie bijlage herkansingsrooster) of als het eerstejaars vak wordt gegeven, herkanst worden. Na de herkansingen in januari worden de vorderingen opnieuw bekeken. De studenten die na de herkansingen in januari eerstejaarsvakken nog niet hebben afgerond, krijgen een aangepast studieprogramma gericht op het behalen van het eerste jaar. Het aangepaste studieprogramma wordt opgesteld door de Examencommissie in overleg met de studieadviseur. Aan het einde van het tweede studiejaar worden de vorderingen opnieuw bekeken. Indien de student de eerstejaarsvakken nog niet heeft behaald heeft zij/hij geen toegang meer tot het programma van het tweede en derde jaar en volgt een gesprek met de studieadviseur. Pas als het eerste jaar behaald is, heeft men weer toegang tot het tweede- en derdejaarsprogramma. In bijzondere gevallen kan van bovenstaande regel afgeweken worden. Raadpleeg daarvoor op tijd de studieadviseur. Studenten, die langer dan twee studiejaren ingeschreven staan en het eerste jaar nog niet hebben behaald, hebben geen toegang tot het tweede- en derdejaarsprogramma. Tweedejaars studenten die het eerste jaar niet hebben behaald mogen niet deelnemen aan vakken uit het derde studiejaar. 2.2.3

Ingangseisen vakken tweede en derde jaar

Bij sommige vakken uit het tweede en derde jaar worden ingangseisen gesteld. Voor het tweede jaar geldt dat het opgegeven vak gevolgd moet zijn om het onderwijs goed te kunnen volgen. Voor het derde jaar geldt dat je het opgegeven vak met een voldoende cijfer afgerond moet hebben. Bij aanmelding voor het vak wordt daarop gecontroleerd.

148



Geldigheid van deelcijfers uit het tweede en derde jaar is twee jaar gerekend vanaf het toekennen van het behaalde deelcijfer.


149



150



3 Onderwijs en Studentzaken 3.1

Opel idngenBiol gie

Het Onderwijsinstituut

Het Onderwijsinstituut bestaat uit de onderwijsdirecteur, het secretariaat, de opleidingscoördinatoren, de studieadviseurs, medewerker onderwijsevaluaties en de medewerkers van het onderwijsbureau. dr. C. de Groot

Onderwijsdirecteur

dr. ir. B.B. Oude Essink

Opleidingscoördinator Biomedische Wetenschappen en gezamenlijke basisvakken

drs. S.C. Witteveen

Opleidingscoördinator Psychobiologie

drs. L. Kerstens

Opleidingscoördinator Biologie en Aardwetenschappen

mw. C. Onrust

Coördinator evaluaties

3.1.1

Onderwijsbureau

Het Onderwijsbureau bevindt zich op Anna’s Hoeve in gebouw I, kamer A009, Kruislaan 318, 1098 SM Amsterdam. De vaste medewerkers van het Onderwijsbureau zijn: Tineke de Vries (coördinator), Cecile Lobach en Manon Matala.

Bij de balie is een brievenbus waarin post voor de Examencommissie, de studieadviseurs en de onderwijsadministratie kan worden gedeponeerd. De brievenbus wordt dagelijks geleegd. Correspondentieadres: Postbus 94062, 1090 GB Amsterdam, telefoon 020 525 7945 (alleen tijdens openingsuren), fax 020 525 7878. E-mailadres: [email protected]. Het Onderwijsbureau verzorgt de onderwijs- en studentenadministratie van de opleidingen. Alle studieresultaten worden door het onderwijsbureau verwerkt en opgeslagen in het studenten-registratiesysteem ISIS. Naast het verzorgen van de onderwijs- en

151


Openingstijden van de balie: maandag, dinsdag, donderdag en vrijdag van 11:00 tot 13:00 uur. Op woensdag is de balie de hele dag gesloten. Buiten de openingsuren kun je een bericht achterlaten op het telefonische antwoordapparaat of e-mailen naar: [email protected]. Let op: gedurende de zomermaanden gelden aangepaste openingstijden. Van 1 juli t/m 31 augustus 2006: maandag, dinsdag en donderdag van 10:00 tot 12:00 uur. Woensdag en vrijdag gesloten.



studentenadministratie verwerkt het onderwijsbureau o.a. de aanvragen voor goedkeuring van Bachelor en Master programma-onderdelen, de aanvragen van Bachelor- en Masterexamens (zie paragraaf 3.5.1.), de plaatsingsprocedure voor de vakken en het verstrekken van studiegidsen. Behaalde studieresultaten worden twee maal per jaar (na periode III en VI) automatisch aan de student ter controle toegestuurd. 3.1.2

Aanmelden vakken via Studieweb

Studenten die de studie beginnen in september 2006: Inschrijven voor eerstejaarsvakken, tentamens/toetsen en herkansingen is niet nodig als de vakken van de eigen studierichting worden gevolgd. Studenten die besluiten om een andere studierichting te gaan volgen dan waarvoor oorspronkelijk was ingeschreven (switchen) dienen zich vóór 1 januari 2007 te melden bij de Onderwijsbalie. Studenten die de studie begonnen zijn vóór september 2006: Inschrijven voor vakken via Studieweb volgens het schema in bijlage 6.1. Dit betekent tevens dat men is aangemeld voor het bijbehorend tentamen. Voor herkansingen dient men zich uiterlijk 2 weken tevoren aan te melden bij de desbetreffende coordinator. Studenten die de studie zijn begonnen in september 2005 en die eerstejaarsvakken moeten herkansen: Boven de reeds bestaande twee herkansingen kunnen deze studenten gebruik maken van een extra, derde, tevens laatste herkansing van het tentamen. Zij dienen zich hiervoor uiterlijk 2 weken tevoren aan te melden bij de desbetreffende coordinator. Indien zij een practicum(onderdeel) moeten herkansen, dan dienen zij zich vóór 15 september 2006 te melden bij de desbetreffende coordinator. De coordinator zal onderzoeken of een practicum(onderdeel) uit het nieuwe curriculum kan fungeren als herkansing. Zo niet, dan stelt de coordinator een vervangende opdracht vast. De data van herkansingen zijn te vinden in de tabel in de bijlage. 3.1.3

Hertentamens

Voor elk vak wordt een eindcijfer gegeven, afgerond op hele en halve cijfers. Deelcijfers en practica mogen niet lager dan 5.0 zijn. Wanneer het eindcijfer onvoldoende is (lager dan 6,0) bestaat de gelegenheid de theoretische gedeelten te herkansen. Het herkansingsrooster staat in de bijlage van deze gids (hoofdstuk 6). Studenten geven zich rechtstreeks bij de vakcoördinator op voor een herkansing. Praktica kunnen niet herkanst worden en moeten het volgende jaar overgedaan moeten worden. De regels omtrent rechten en plichten betreffende tentaminering en beoordeling staan uitvoerig beschreven in de OER. Heeft de student na twee herkansingen het vak nog niet behaald dan is overleg met de studieadviseur noodzakelijk.

152



3.1.4

Afmelden vak

Wanneer een student door omstandigheden na aanmelding via studieweb toch niet kan deelnemen aan een studieonderdeel dan is hij/zij verplicht zich persoonlijk bij de Onderwijsbalie én de vakcoördinator af te melden. Sta je op de deelnemerslijst en heb je je niet afgemeld dan wordt automatisch een NAV als resultaat ingevoerd (niet aan verplichtingen voldaan). 3.1.5

Uitslagen studieresultaten

Studieresultaten kunnen worden ingezien op Studieweb: http://studieweb.student.uva.nl. Iedere student ontvangt via het studentenadministratiesysteem ISIS automatisch een bericht van ingevoerde uitslagen op zijn/haar studentenmailadres of, indien een GSMnummer is opgegeven, een SMS-bericht. Verder ontvangt de student gedurende het studiejaar twee maal een uitdraai van de studieresultaten (na afloop van elk semester). Tussentijdse overzichten van behaalde studieresultaten kunnen bij de Onderwijsbalie worden aangevraagd. 3.2 3.2.1

Studiebegeleiding Studieadviseurs

De opleidingen hebben twee studieadviseurs, drs. Marion Seeman, drs. Anja Zoomer. Bezoekadres: Kruislaan 318, 1098 SM Amsterdam. Postadres: Postbus 94062, 1090 GB Amsterdam, t.a.v. de studieadviseur. Vragen kunnen ook gesteld worden via e-mail. ■

De studieadviseurs geven de studenten informatie en advies over de studie en alles wat daarmee samenhangt. Veel van dergelijke informatie vind je in de studiegids en vaak weten de medewerkers van het onderwijsbureau ook antwoord op een vraag. De studieadviseurs zijn er vooral voor de vragen (en problemen) die niet in een paar minuten te beantwoorden zijn. Voor meer informatie over de universitaire studiebegeleiding, zoals studentendecanen, Bureau studentenpsychologen, de studentenhuisartsen en studeren met een handicap, zie het Studentenhandboek, of kijk op http://www.cms.uva.nl/studentenservices/

153


■

Marion Seeman, Anna’s Hoeve, gebouw I, kamer A009a aanwezig maandag, dinsdag, woensdag en vrijdag; inloopspreekuur: elke woensdag van 10:30 tot 16:30 uur; telefoon: 020 525 7819 (bij geen gehoor 020-525 7945); e-mail: [email protected] Anja Zoomer, Anna’s Hoeve, gebouw I, kamer A009a aanwezig dinsdag, donderdag en vrijdag; inloopspreekuur: elke vrijdag van 10.00 tot 13.00 uur; telefoon: 020 525 7636 (bij geen gehoor 020 525 7945); e-mail: [email protected]



3.2.2

Vertrouwenspersoon

De UvA wil seksuele intimidatie, agressie, geweld en discriminatie voorkomen en bestrijden. In het geval dat je te maken krijgt met seksuele intimidatie, agressie, geweld en discriminatie doe je er goed aan direct duidelijk te maken niet gediend te zijn van dit soort gedrag. Ook kun je naar een van de universitaire vertrouwenspersonen of een contactpersoon van jouw faculteit om je klacht te melden. Actie, bijvoorbeeld in de vorm van een officiële klacht, zal alleen ondernomen worden op verzoek en met uitdrukkelijke instemming van de betrokkene. De facultaire vertrouwenspersoon is: studieadviseur mw. drs. Marion Seeman, tel. 020-525 7819, e-mail: [email protected] De universitaire vertrouwenspersoon, Anneke Vijgeboom, is tijdens kantooruren bereikbaar op maandag, dinsdag, donderdag en vrijdag, via telefoonnummer 020-525 5548. Tevens kan via het secretariaat een afspraak met de vertrouwenspersoon gemaakt worden, op telefoonnummer 020-525 6210. Adres: Arbo- en Milieudienst, Plantage Muidergracht 14, e-mail: [email protected] (de mail wordt alleen gelezen door een van de vertrouwenspersonen en uiteraard met de grootst mogelijke vertrouwelijkheid behandeld). 3.3 3.3.1

Commissies ten behoeve van het onderwijs Opleidingsteams

Een opleidingsteam bestaat uit een aantal docenten en een student van de betreffende opleiding. Zij bekijken regelmatig het curriculum van de opleiding op aanbod, inhoud en afstemming van de cursussen en maken beleid. Het team legt het voorgestelde beleid voor aan de onderwijsdirecteur die de eindverantwoordelijkheid voor het programma heeft. De onderwijsdirecteur kan op grond van praktische en/of inhoudelijke redenen veranderingen aanbrengen in de voorstellen van de opleidingsteams. Het opleidingsteam Bio- basis brengt advies uit over het gemeenschappelijke deel (eerste 4 vakken) van de drie opleidingen in het eerste jaar. Opleidingsteam Bio- basis: dr. J.A.J. Breeuwer, mw. dr. T. den Blaauwen, prof. dr. M. Haring, dr. R de Heus, prof. dr. A. de Roos, S. Molenaar (student-lid) en vacature (student-lid). Het opleidingsteam Biologie richt zich op het tweede en derde jaar van de bacheloropleiding Biologie en de laatste twee vakken uit het eerste jaar. Opleidingsteam Biologie: prof. dr. M. Sabelis, dr. M. Kraak, dr. J.G.B. Oostermeijer, dr. ir. R. Schuurink, dr. L.H. Cammeraat, mw. A. Brijder (student-lid) en vacature (student-lid). Het opleidingsteam Biomedische wetenschappen en Psychobiologie richt zich op het tweede en derde jaar van de bacheloropleidingen Biomedische wetenschappen en Psycho-

154



biologie en op de laatste twee vakken uit het eerste jaar. Het opleidingsteam Biomedische wetenschappen en Psychobiologie: prof. dr. W.J. Wadman, dr. P. Lucassen, dr. W.E.J.M. Ghijsen, dr. C.J.M. Egas, dr. M. Rep, dr. E.M.M. Manders, prof. dr. C.M.A. Pennartz, dr. R.J. Oostra (Faculteit Geneeskunde), prof. dr. J.H. Ravesloot (Faculteit Geneeskunde), dr. H.S. Scholte (Faculteit Maatschappij- en Gedragswetenschappen), prof. dr. J. Raaijmakers (Faculteit Maatschappij- en Gedragswetenschappen), mw. L. van Geel (student-lid), mw. C. Mas Cabre (student-lid), mw. E. Grunewald (student-lid) en J. Winkel (studentlid). Het opleidingsteam Statistiek richt zich op de leerlijn statistiek door de hele bacheloropleiding. Het opleidingsteam Statistiek: dr.ir. E.E. van Loon, drs. P. Assink, drs. S. Witteveen. 3.3.2

Opleidingscommissie (OC)

Iedere opleiding heeft een Opleidingscommissie, met een docenten een studentvertegenwoordiger. Alle docentleden worden door de decaan benoemd, studentleden nadat zij zijn voorgedragen door het Studenten Overleg. De vergaderingen van de commissies van de verschillende opleidingen binnen het onderwijsinstituut zijn gezamenlijk. De opleidingscommissie heeft tot taak: ■

■ ■

■

gevraagd of ongevraagd, advies uitbrengen aan de onderwijsdirecteur of aan de decaan over alle aangelegenheden betreffende het onderwijs in de desbetreffende opleiding; advies uit te brengen over de Onderwijs- en Examenregeling; het jaarlijks beoordelen van de wijze van uitvoeren van de Onderwijs- en Examenregeling; evalueren van het door de faculteit verzorgde onderwijs.

Docentleden: ■ ■

■ ■ ■

■

Bachelor Biologie: : dr. J.A.J. Breeuwer (voorzitter), dr. B.van Geel Bachelor Biomedische wetenschappen: dr. P. Fransz (secretaris OC vergaderingen) Bachelor Psychobiologie: drs. S.C. Witteveen Master Biologie: prof. dr. A.M. de Roos Master Levenswetenschappen: dr. G. Smits Master Biomedische wetenschappen: dr. R.J. Oostra

Studentleden: ■ ■

Bachelor en Master Biologie: B. Tulleners, N. van Leeuwen Bachelor en Master Biomedische wetenschappen: M. van de Klundert, I. Lako, S. Spruit

155


De voorzitter en secretaris van de OC hebben maandelijks overleg met de onderwijssdirecteur over lopende zaken. De commissie vergadert ongeveer 6 keer per jaar.



■ ■

Bachelor en Master Psychobiologie: F. den Boon en E. Grünewald Toehoorder: drs M. Seeman (studie-adviseur)

Postadres OC: Postbus 94062, 1090 GB Amsterdam, t.a.v. mw. C. Onrust (gebouw I, kamer A011b) e-mail: [email protected]. 3.3.3

Examencommissie (Excie)

Iedere bachelor-opleiding heeft een aparte Examencommissie. De Examencommissie neemt de examens af, beoordeelt het niveau van afwijkende vooropleidingen en neemt schriftelijke verzoeken in behandeling voor niet-reguliere studieprogramma’s en voor vrijstellingen van studieonderdelen, op grond van een vorige studie. De commissie beoordeelt de aanvragen voor het volgen van keuzeonderdelen buiten de opleiding, die niet in de studiegids zijn opgenomen en verleent al dan niet goedkeuring aan onderzoeksprojecten en scripties en neemt besluiten met betrekking tot toekenning van extra studiepunten bij verlenging van projecten e.d.. Hiertoe moet de student een goed gemotiveerd schriftelijk verzoek (mede ondertekend door de examinator) indienen bij de secretaris van de examencommissie. De Examencommissies kunnen een belangrijke rol spelen in het oplossen van klachten rondom tentamens en examens. Hierdoor kan in veel gevallen een procedure bij het College van Beroep voor de Examens worden voorkomen. Klachten over de afname of beoordeling van een tentamen kan binnen veertien dagen na bekendmaking van de uitslag bij de Examencommissie worden ingediend. De Examencommissie beslist op haar eerstvolgende vergadering, maar niet later dan vijf weken na ontvangst van het verzoek (behalve in de maanden juli en augustus). De vergaderdata zijn te vinden op http://www.student.uva.nl bij de betreffende opleiding onder onderwijsbalie. Bacheloropleiding Biologie: Voorzitter: prof.dr. M.W. Sabelis Secretaris: dr. W.E.J.M. Ghijsen drs. A.M.L. Zoomer (studieadviseur) Bacheloropleiding Biomedische Wetenschappen: Voorzitter: prof. dr. M. Joëls Secretaris: dr. J.C. van der Spek drs. M. Seeman (studieadviseur) Bacheloropleiding Psychobiologie: Voorzitter: prof. dr. M. Joëls Secretaris: dr. J.C. van der Spek drs. M. Seeman (studieadviseur) De studieadviseurs/onderwijsbureau bereiden de verzoeken voor de Examencommissie voor, zij maken geen deel uit van de examencommissie.

156



Correspondentie richten aan: Secretaris van de Examencommissie Biologie, Biomedische wetenschappen of Psychobiologie, p/a Onderwijsbureau Biologie, Postbus 94062, 1090 GB Amsterdam 3.4 3.4.1

Praktische zaken Verkoop van boeken en syllabi

Voor leden van de studieverenigingCONGO zijn de prijzen van de boeken doorgaans 10% lager dan de prijzen die de boekhandel hanteert. Om de boekverkoop enigszins overzichtelijk te houden en om verzekerd te zijn van een boek moet je ruim voor aanvang van het vak waarvoor je een bepaald boek nodig hebt, intekenen op een lijst. Hiermee verplicht je je tevens tot het kopen van dat boek. CONGO doet haar uiterste best om iedereen ruim van tevoren te informeren, zodat je in staat bent in te tekenen. Bij CONGO's boekenverkoop kan uitsluitend betaald worden via een PIN-automaat. Overige studieboeken zijn verkrijgbaar bij de boekhandel Scheltema op het Roeterseiland of het Koningsplein. Klappers en syllabi zijn te verkrijgen bij de Onderwijsbalie tijdens openingsuren tegen betaling met een CHIP-pas. 3.4.2

Practicum- en collegezalen

Algemene regels In alle openbare gebouwen mag niet gerookt worden, dus ook niet in de kantine. In de collegezalen, laboratoriumzalen en Computer Gebruikers Ruimten (CGR) is het niet toegestaan te eten en drinken. Voor laboratoria en CGR gelden de regels die vermeld zijn in de zalen. 3.4.3

Computerfaciliteiten

Op Biologisch Centrum Anna’s Hoeve kun je terecht in verschillende Computer Gebruikers Ruimten, ( CGR) ■

■ ■ ■

CGR I: gebouw III, 2.02. 25 PC's (open van 8:00 tot 16:15); CGR II: gebouw III, 2.04: 9 PC's (open van 8:00 tot 16:15); In de bibliotheek in gebouw IV zijn 8 studieplekken voorzien van een PC; CGR III: gebouw I, A014. 14 PC's (open van 8:00 tot 17:15);

157


De meeste biologie onderdelen worden gegeven in de gebouwen op de Kruislaan 318-326 (zie ook legenda helemaal voor in de gids). Bij grote studentenaantallen wordt uitgeweken naar de collegezaal in het CWI op Kruislaan 413 of naar het Roeterseiland Complex (REC) op de Roeterstraat. Vóór aanvang van een vak wordt het rooster bekend gemaakt op de studentensite van de UvA (http://www.student.uva.nl).



■ ■

CGR IV: gebouw I, A012b. 9 PC's (open van 8:00 tot 18:00); CGR V: gebouw I, A012a, 9 PC’s (open van 9:00 tot 17:15).

Alle systemen zijn voorzien van een CDrom-drive en aangesloten op een laserprinter. Indien je gebruik maakt van bovengenoemde systemen word je geacht deze te kennen dan wel instructieboeken door te nemen. Gegevens kunnen het beste opgeslagen worden op de facultaire fileserver. Een aantal dagdelen per jaar is de CGR gereserveerd voor Computer Ondersteund Onderwijs. Het beheer van de systemen is in handen van de afdeling Informatisering (tel. 020-525 7756 / 7634). Het gebruik van de faciliteiten is geregeld bij het reglement dat op de zaal aanwezig is. De systemen zijn in verregaande mate beveiligd en afgeschermd. 3.4.4

Verzekeringen

Zie hiervoor 3.9.7 in het deel "algemene informatie" voorin. Voor verschillende activiteiten heeft de UvA een verzekering afgesloten. 3.4.5

Mededelingen

Mededelingen voor studenten verschijnen op de website van de opleiding (http://www.student.uva.nl, kies de eigen opleiding) onder ‘Mededelingen’. In de hal van gebouw I bij de leestafel ligt o.a. de volgende informatie ter inzage: studiegidsen van andere faculteiten van de UvA en van andere universiteiten, informatie over stagemogelijkheden, ervaringen van studenten in het buitenland, fondsenboeken, arbeidsmarktonderzoekgegevens, cursussen voor AIO’s. Verder zijn er brochures met betrekking tot studiefinanciering en studeren aan de UvA te verkrijgen. In gebouw IV hangt een plasmascherm waar mededelingen te vinden zijn van het onderwijsbureau, studievereniging CONGO en anderen. 3.4.6

Kopieren

Kopieermachines zijn te vinden op de volgende plaatsen: In gebouw I: één bij de hoofdingang en één op de eerste verdieping tussen gebouwdelen B en C; bij de bibliotheek (gebouw IV): naast collegezaal. Kopieerkaarten zijn te koop bij de portier in Matrix 4, Kruislaan 404. 3.5 3.5.1

Bachelorexamen Aanvraag Bachelorexamen

Studenten die de bachelor opleiding volgen sluiten hun opleiding af met het bachelorexamen en ontvangen een bachelorbul. Het propedeuse examen is bij de invoering van de

158



Bachelor/Master structuur afgeschaft. De bachelorbul kan pas worden aangevraagd wanneer alle studieonderdelen met een voldoende resultaat zijn afgerond. Benodigde documenten voor de aanvraag van een bachelorbul: ■

■ ■ ■

■ ■ ■

Aanvraagformulier bachelorbul Aanvraag getuigschrift Planningsformulier bachelor Inschrijving masterprogramma (als je doorstroomt) Wijzigingsformulier inschrijving van bachelor naar master Evaluatieformulier Een kopie van je paspoort of identiteitskaart, óf een uittreksel uit het bevolkings- of geboorteregister. Rijbewijs of andere identiteitsbewijzen zijn niet toegestaan;

Bij de Onderwijsbalie kun je een “ Aanvraag-bachelorbul-pakket” ophalen. Het volledig ingevulde pakket lever je, samen met een kopie van je paspoort, weer in bij de Onderwijsbalie. Let op! Alvorens het examen aan te vragen moet aan alle inschrijvingsverplichtingen bij de UvA zijn voldaan, anders kan het diploma niet aangevraagd worden. De bachelorbul kan ten allen tijde bij de Onderwijsbalie aangevraagd worden. 3.5.2

Toekenning predikaat 'Cum Laude'

3.5.3

Diploma uitreiking

De Onderwijsbalie vraagt de bachelorbullen aan bij het Bureau Examens van de UvA. Eén maal per jaar vindt er een officiële uitreiking van het bachelordiploma plaats. Wil je hier aan meedoen dan kun je je bul aanvragen tot uiterlijk vier weken voor de uitreikingsdatum . Op het moment van aanvragen moeten alle cijfers bekend zijn. De student wordt ca. twee weken voor de uitreiking schriftelijk op de hoogte gebracht van de tijd en plaats van de diplomauitreiking, waarbij familieleden en vrienden van harte welkom zijn. Wil je niet mee doen met de buluitreiking dan kun je je diploma bij de Onderwijsbalie ophalen tijdens de openingsuren. De uitreikingsdatum van het Bachelordiploma is:

159


Wanneer de student tijdens de studie blijk heeft gegeven van uitzonderlijke bekwaamheid, kan dit op het getuigschrift worden vermeld met het predikaat ‘ cum laude’. (Voor de voorwaarden voor het behalen van een 'cum laude' aantekening zie Onderwijs en Examenregeling (OER)). N.B. In bijzondere gevallen kan de examencommissie afwijken van deze regels.



■

dinsdag 28 november 2006

Bijlage bij het diploma Op het diplomasupplement van het diploma worden de tot het examen behorende afgelegde studieonderdelen en bijbehorende studielast vermeld met de behaalde cijfers. Het diploma en het diplomasupplement worden beiden in de engelse taal verstrekt. 3.5.4

Afstudeerverklaring

Voor degenen die vóór de uitreiking een bewijs nodig hebben dat zij aan alle voorwaarden van het bachelor examen hebben voldaan kan op verzoek een bachelor afstudeerverklaring worden afgegeven door de Onderwijsbalie. 3.6 3.6.1

Verenigingen Studieverenigingen

CONGO, opgericht in 1919 onder de uitgebreide naam "Comt onoos'len naerstighlyck gheleertheydt ontvanghen", is de oudste studievereniging van het land van en voor studenten Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie en is verbonden aan de UvA. Het hele jaar door organiseert CONGO activiteiten als feesten, sporttoernooien en meer ontspannende zaken. Hiernaast ook de meer serieuze zaken zoals lezingen, symposia, bedrijvendagen en de boekverkoop. Voor € 25,- ben je de gehele studietijd lid. Met je lidmaatschap krijg je korting bij CONGO-activiteiten en kun je boeken kopen tegen een gereduceerde prijs. CONGO heeft verschillende commissies en werkgroepen zoals de boekencommissie, activiteitencommissie, feestcommissie, redactiecommissie, onderwijscommissie, toneelwerkgroep, een congreswerkgroep en een introwerkgroep. Deze commissies en werkgroepen ontfermen zich over het organiseren van de activiteiten en kunnen de inzet van actieve leden altijd gebruiken. Verder onderhoudt CONGO goede banden met de politiek actieve studenten in de Facultaire studentenraad, de Opleidingscommissie en de Opleidingsteams. In januari wordt op de Algemene Ledenvergadering het nieuwe bestuur gekozen voor een bestuursjaar dat, in tegenstelling tot vele andere studieverenigingen, gelijk loopt met het kalenderjaar. In juni is er een tweede ALV om het bestuur tussendoor te controleren. De CONGO-kamer bevindt zich naast de ingang van gebouw IV (Kruislaan 314). Het telefoonnummer van de CONGO-kamer is (020) 525 7853 Het e-mail adres: [email protected]. Op het internet: http://www.congo.tk

160



3.6.1.1

Gymnorhina

Op min of meer regelmatige basis geeft CONGO een ledenblad uit, de Gymnorhina. Hierin staan, naast verhalen, interviews en roddels, ook de agenda wat betreft activiteiten. Het blad wordt over de faculteit verspreid. 3.6.2

Alumnivereniging

UvA-alumni hebben in het verleden verschillende verenigingen opgericht en er komen jaarlijks nieuwe verenigingsverbanden bij. Er is een overkoepelende, algemene alumnivereniging (de AUV), die al in 1889 werd opgericht. Verder zijn er verenigingen en kringen van faculteiten en/of opleidingen. Deze komen regelmatig samen om ideeën en ervaringen uit te wisselen. Naast deze kringen voor alumni is er nog de sociëteit van de UvA, waar (oud-)personeelsleden en alumni elkaar ontmoeten: de Amsterdamse Academische Club. Amsterdamse Universiteits Vereniging (AUV) De Amsterdamse Universiteits Vereniging (AUV) is de overkoepelende alumnivereniging van de UvA, opgericht in 1889. De AUV wil de band versterken tusen de UvA en haar afgestudeerden en tussen de alumni onderling. Lidmaatschap van de AUV staat open voor diegenen die aan de UvA een erkend diploma of examen - uitgezonderd de propedeuse hebben behaald. Daarnaast kent de AUV begunstigers. De contributie bedraagt ca. € 30,per kalenderjaar.

3.6.3

Beroepsvereniging

NIBI: Nederlands Instituut voor Biologie Het Nederlands Instituut voor Biologie - kortweg NIBI - is de beroepsvereniging voor biologen. Met de steun van haar leden, of dat nou ecologen, microbiologen, biologie docenten, biotechnologen, medisch biologen of milieuadviseurs zijn, zorgt het NIBI voor verbetering op de arbeidsmarkt, in het onderzoek en in het onderwijs. NIBI organiseert onder andere lezingen, congressen en (sollicitatie)cursussen voor biologen. Leden kunnen ook gratis gebruik maken van het NIBI Arbeidsmarkt Informatie Centrum. Het NIBI is gevestigd op Catharijnesingel 54, 3511 GC Utrecht, tel. 030 – 236 9244.

161


Contactpunt Biologen Alumni Er is geen alumnivereniging voor biologen, maar wel een Contactpunt Biologen Alumni. Contactpersonen zijn: Marga Coesel, p/a Bibliotheek Biologie UvA, Kruislaan 314, 1098 SM Amsterdam, Telefoon: 020-525 7230 (alleen donderdag). Miep Jacobi, p/a Cornelis van Alkemadelaan 41, 1065 AB Amsterdam, e-mail: [email protected] Actuele informatie over de alumniverenigingen van de UvA is te vinden op http://www.alumni.uva.nl/clubs/



Postadres: Postbus 19245, 3501 DE Utrecht. Verdere informatie kan gevonden worden op: http://www.nibi.nl

162



4 Doorstromen naar de Masteropleidingen 4.1

Opel idngenBiol gie

Masteropleiding

Als je het Bachelordiploma hebt behaald is de meest voor de hand liggende vervolgopleiding de Masteropleiding. Alle masteropleidingen bij de FNWI duren twee jaar. Binnen de masteropleidingen kun je kiezen uit verschillende programma's, maar ook kunnen onderdelen van verschillende programma's gecombineerd worden. Er is voor elke bacheloropleiding tenminste een aansluitende master (programma), waartoe een student direct wordt toegelaten (zie schema 4.1.3). Bij alle programma's kan gekozen worden voor de onderzoeksvariant (Research-profile), bij sommige programma's ook voor de maatschappelijke variant (Science, Technology and Public Management profile) of de educatieve/communicatieve variant (Communication & Education-profile). 4.1.1

Overzicht aangeboden masterprogramma's

Master Biological Sciences Coördinator

General Biology

dr. M. Rep, 020 525 7764 [email protected] dr. J.C.M. den Nijs, 020 525 7660, [email protected]

Ecology and Evolution met de specialisation tracks:

dr. C.J.M. Egas, tel. 020 525 7748 [email protected]

- Computational Bio-and Physical Geography (CBPG)

prof. dr. ir. W. Bouten, 020 525 7412, [email protected]

- Ecological and Evolutionary Dynamics

prof. dr. M.W. Sabelis, 020 525 7738, [email protected]

- Paleoecology and Climate Change

prof. dr. H. Hooghiemstra, 020 525 7857, [email protected]

- Spatial Ecology

dr. J.G.B. Oostermeijer, tel. 020 525 7817 [email protected]

- Tropical Ecology

dr. J.F. Duivenvoorden, 020 525 7812, [email protected]

- Systematic and Evolutionary Biology

dr. R. Vonk, 020 5256284 [email protected]

Limnology and Oceanography

prof. dr. J. Huisman, 020 525 7085 [email protected]

Integrative Plant Sciences

prof. dr. M.A. Haring , 020 525 7663 [email protected]


Masterprogramma

163



Master Biomedical Sciences Masterprogramma

Coördinator

Medical Biology

dr. J.C. van der Spek, 020 525 7921, [email protected] dr. A.J.G. Horrevoets, tel. 020 566 5159 [email protected]

Neurobiology

prof. dr. W.J. Wadman, 020 525 7641, [email protected] prof. dr. F. Baas, 020 566 5998, [email protected]

Immunology

prof. dr R.C. Aalberse, 020 512 3158, [email protected] prof. dr. R.A.W. van Lier, 020 566 6063, [email protected]

Medical Biochemistry

prof. dr. S. Brul, 020 525 7079 [email protected] prof. dr. J.M.F.G.Aerts, 020 566 5156, [email protected]

Oncology

prof. S.T. Pals, 020 566 5635, [email protected] prof. dr. J. Borst, 020 512 2056, [email protected]

Biology & Cognition

prof. dr. C.M.A. Pennartz, 020 5257638, [email protected]

Master Life Sciences Masterprogramma

Coördinator

Molecular Cell Biology and Bioinformatics

dr. D.P.E. Satijn, 020 525 5114, [email protected], prof. dr. A.H. Zwinderman, 020 566 5820, [email protected]

Andere masterprogramma's waaraan biologen, medisch biologen en psychobiologen kunnen denken: Binnen FNWI: Masterprogramma

Coördinator

Forensic Science* - Selectief**

R

dr. A.A. M'Charek, [email protected]

Mathematics & Science Education

CE

dr. M.E. Key, [email protected]

Cognitive Sciences - selectief**

R

drs. L.U. Wenting, [email protected]

164



Buiten FNWI: Masterprogramma

R

Coördinator

Psychology - selectief**

R

mw. drs. E.E. Zandvliet, [email protected]

* Onder voorbehoud van goekeuring Minister van Onderwijs ** Bij selectieve masters maakt selectie deel uit van de toelatingsprocedure 4.1.2

Algemene Opbouw Masteropleiding

In de masterfase volg je een of meer mastercursussen en doe je zelfstandig onderzoek bij een onderzoeksinstituut bij de universiteit of bij een ander onderzoeksinstituut, een instelling of een bedrijf. Verder schrijf je een scriptie. De opbouw van het masterprogramma hangt af van het gekozen profiel (Research, Science, Techonolgy & Public Management of Communication & Education). Bij de masterprogramma's met het ST&PM- en CE-profiel wordt onderscheid gemaakt tussen het eerste en tweede jaar. Het eerste jaar is een Research jaar. Het tweede jaar is bestemd voor het specifieke programma voor het profiel. Zie voor de opbouw van de programma's onderstaande tabel.


165



4.1.3

Aansluitmasters bij de bacheloropleidingen Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie

In onderstaand schema wordt weergegeven welk bachelorprogramma van FNWI direct toegang geeft tot welke masteropleiding. Bachelorprogramma FNWI

Aansluitend masterprogramma FNWI

Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie

Mathematics & Science Education Forensic Sciences (selectief)

Biologie: - Algemene Biologie

General Biology

- Ecologie en Biodiversiteit

General Biology Ecology and Evolution Limnology & Oceanography

166



- Moleculaire Celbiologie en Bioinformatica

General Biology Integrative Plant Sciences Molecular Cell Biology & Bioinformatics

Biomedische wetenschappen:

Medical Biology Neurobiology Immunology Medical Biochemistry Oncology Biology & Cognition

Psychobiologie:

Neurobiology Biology & Cognition Cognitive Science - selectief Aansluitende masterprogramma's buiten FNWI: Psychology - selectief

4.1.4

Andere mogelijkheden

Soms is het mogelijk om tot een ander masterprogramma dan het aansluitende masterprogramma te worden toegelaten. Mocht je dit willen, neem dan contact op met de coördinator van het masterprogramma of met de studieadviseur. In de meeste gevallen is het mogelijk eventuele deficiënties tijdens de master weg te werken. In een enkel geval zul je al in de bachelorfase rekening met je masterkeuze kunnen houden door bepaalde keuzevakken te kiezen.

4.2 4.2.1

Orientatie op de masteropleidingen Mastervoorlichting

Ieder jaar wordt in april een mastervoorlichting georganiseerd speciaal gericht op studenten Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie aan de Universiteit van Amsterdam. Deze voorlichting biedt de mogelijkheid studenten te informeren over de masterprogramma’s. Er worden onder andere korte informatieve lezingen gehouden door studenten die reeds afstudeeronderzoeken in binnen en/of buitenland voltooid hebben. 4.2.2

Studie- en loopbaanweek

Elk voorjaar organiseert de UvA in samenwerking met de HvA een studieen loopbaanweek. Een onderdeel van deze week is een mastermarkt. Studenten kunnen hier algemene

167


In principe verschaft een afgeronde Bachelor een goed uitgangspunt voor overstap naar de andere vergelijkbare opleidingen in het land. Studenten die een overstap overwegen kunnen contact opnemen met de studieadviseur van de faculteit en van de andere Universiteit. Bij de documentatiekast in de hal van gebouw I zijn studiegidsen te raadplegen van andere zusterfaculteiten. Ook kan men terecht bij het Documentatiecentrum van Studenten Services (Binnengasthuisstraat 9).



informatie krijgen over mastermogelijkheden aan de UvA en de HvA. Meer informatie is te vinden op de website: www.student.uva.nl/master 4.2.3

Beta bedrijvencontactdag

De Stichting Bèta Bedrijvencontactdag Amsterdam (SBBA) organiseert ieder voorjaar een bedrijvencontactdag bestemd voor bètastudenten van de Vrije Universiteit en de Universiteit van Amsterdam. Ouderejaars studenten krijgen in de loop van maart een uitnodiging en het programmaboekje met het inschrijfformulier. Op de bèta bedrijvencontactdag is een informatiemarkt aanwezig waar bedrijven zich presenteren. Tevens zijn er verschillende lezingenrondes waarin enkele bedrijven de kans krijgen om het publiek te informeren over de arbeidsmogelijkheden die er voor bèta's zijn binnen dat bedrijf. De SBBA bestaat uit studenten van de VU en de UvA. Meer informatie over de SBBA of de bèta bedrijvencontactdag kan verkregen worden via de website http://www.sbba.nl.

168



5 Cursusbeschrijvingen 5.1

Opel idngenBiol gie

Eerste jaars vakken

101.

1001 Biochemie & Celbiologie Vakcode

1001

Studielast

10

Periode(n)

Semester 1 blok 1 (4 september t/m 27 oktober 2006)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Swammerdam Instituut voor Levenswetenschappen (SILS)

Docent(en)

drs. P. R. Assink, mw. dr. T. den Blaauwen (coördinator), prof.dr. R. van Driel, prof.dr. Th.W.J. Gadella, dr. ir. J. Goedhart, dr. E.M.M. Manders, prof.dr. S.B.J. Menken

Inlichtingen

mw. dr. T. den Blaauwen telefoon: +31 20 5255196 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biomedische wetenschappen (Medische Biologie) Bachelor Biologie Bachelor Psychobiologie

Leerdoel

Basisbegrippen van de statistiek leren en deze leren toepassen. De volgende praktische vaardigheden worden geleerd: cel preparaten maken, gebruik van microscopen, beeldanalyse, analytisch pipetteren, eiwitzuivering, enzym kinetiek. Inhoud ■

■ ■ ■

■ ■

Algemeen overzicht van de biologie Organische chemie van veel voorkomende natuurlijke moleculen Eiwitten, DNA, RNA, polymeren en suikers Cellen en hun organellen, relatie tussen vorm en functie Membranen Metabolisme: glycolyse, Krebscyclus, ademhalingsketen, en energiehuishouding in de cel (ATP)

169


Het begrijpen van belangrijke processen en structuren in de cel op moleculair niveau, uitgaande van chemische en biologische principes. Voorbeelden van dergelijke processen zijn celdeling, de vermenigvuldiging van het erfelijke materiaal, eiwittransport, signaaltransductie, energievoorziening en metabolisme. Voorbeelden van belangrijke structuren zijn celorganellen, membranen, cytoskelet en chromosomen Deze module legt de basis voor een groot aantal volgende cursussen in de opleiding biologie en biomedische wetenschappen.



■ ■

■

Fotosynthese Chromosomen, celcyclus en celdeling Communicatie tussen cellen

Aanmelden

Eerstejaars studenten hoeven zich voor dit vak niet aan te melden. Onderwijsvorm

Hoorcolleges Studieprocesbegeleiding Practica Zelfstudie Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl . Studiemateriaal

Verplicht aan te schaffen: ■

■

■

■

■

■ ■

Life: The Science of Biology, 7th ed, Purves et al., ISBN: 0716798565 (prijs ± €71,-). Studiestof Hoofdstukken 1-9, 15, 24, 25 Practical Skills in Biomolecular Sciences, Reed et al., ISBN: 0130451428 (prijs ± €46,-). Studiestof wordt nader bekend gemaakt. Syllabus (practicumhandleidingen) (prijs ± €10,-) Syllabus Basisstatistiek (bevat ook de studiestof voor de statistiek in cursussen 1002, 1003 en 1004) (prijs ± €15,-) Labjournaal; model wordt nader bekend gemaakt (prijs ± €12,-) Labjas (verplicht voor het practicum in alle cursussen) (prijs ± €32,-) Snijset (ook en met name te gebruiken in cursus 1004) (prijs ± €18,-)

Boeken, snijset en labjas kunnen indien lid van CONGO bij hen tegen gereduceerd tarief worden besteld. De syllabi zijn voor aanvang van de cursus aan te schaffen bij de onderwijsbalie (tijdens openingsuren); betaling kan uitsluitend per chip. Toetsvorm

Het deelnemen aan de practica is verplicht. Tijdens de practica worden de vaardigheden van de student enkele malen beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het practicum kunnen het practicum pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten gedaan die de stof van de lopende cursus

170



behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen Academische Basis Vaardigheden. Tijdens de cursus wordt ter wille van de studeerbaarheid de theorie na 4 weken (over de eerste 4 weken) en na 8 weken (over week 5 t/m 8) schriftelijk getoetst. Beide toetsen dragen elk voor 50% bij aan het eindcijfer. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer 6,0 of hoger bedraagt en als het practicum met voldoende is beoordeeld. Een student die een eindcijfer behaalt dat lager is dan 6,0 moet de gehele theorie herkansen; individuele deeltoetsen kunnen niet worden herkanst. Het onderdeel Statistiek in deze cursus wordt tijdens de theorietoetsen getoetst in duidelijk herkenbare, aparte vragen. De beoordeling van de vragen over Statistiek telt niet mee in de beoordeling van de theorie van de huidige cursus, maar in de beoordeling van 1012 Basis Statistiek (pag. 194) (6 EC) en draagt voor 1/3 bij aan het eindcijfer van die cursus.


171



102.

1002 Genetica & Evolutie Vakcode

1002

Studielast

10

Periode(n)

Semester 1 blok 2 (30 oktober t/m 22 december 2006)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Instituut voor Biodiversiteit en Ecosysteem Dynamica (IBED) Swammerdam Instituut voor Levenswetenschappen (SILS)

Docent(en)

dr. J.A.J. Breeuwer (coördinator), prof.dr. S.B.J. Menken

Inlichtingen

dr. J.A.J. Breeuwer telefoon: +31 20 5257745 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Het begrijpen van de wijze waarop genetische informatie wordt geconserveerd, overgedragen, verandert en evolueert. Structuur en werking van DNA m.b.t. replicatie en transcriptie, RNA en translatie, eiwitproduktie. Inzicht in de relatie tuusen DNA-afwijkingen en ziekte. Inzicht in het ontstaan van leven op Aarde, evolutie en soortvorming. Basisbegrippen van de statistiek leren en deze leren toepassen. De volgende praktische vaardigheden worden geleerd: isolatie van DNA, DNA-fingerprinting, PCR-techniek, kruising van Drosophila en schimmels en statistische verwerking van kruisingsresultaten. Inhoud

Inzicht in: ■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

■

Structuur en werking van het genetisch materiaal, celdeling, celcyclus en controle Basale genetica, mutaties en extra-nucleaire overerving Moleculaire mechanismen van DNA-replicatie, transcriptie en translatie Virussen, prokaryoten en eukaryoten; eukaryote genexpressie Recombinant-DNA technologie Relatie tussen DNA-afwijkingen en ziekten Immuunrespons en antistofdiversiteit op basis van genherschikking Ontstaan van het leven op Aarde, evolutie en soortvorming Genomische informatie en reconstructie van de fylogenie

Aanmelden


Hoorcolleges Studieprocesbegeleiding

172



Practica Zelfstudie Onderwijstijden



■

■ ■ ■

■ ■

Life: The Science of Biology, 7th ed, Purves et al., ISBN: 0716798565 (reeds aangeschaft bij cursus 1001). Studiestof Hoofdstukken 9-14, 16-19, 21-24, 26. Practical Skills in Biomolecular Sciences, Reed et al., ISBN: 0130451428 (reeds aangeschaft bij cursus 1001). Studiestof wordt nader bekend gemaakt. Syllabus (practicumhandleidingen) (prijs ± €10,-) Syllabus Basisstatistiek (reeds aangeschaft bij cursus 1001) Labjournaal; model wordt nader bekend gemaakt (reeds aangeschaft bij cursus 1001) Labjas (reeds aangeschaft bij cursus 1001) Snijset (reeds aangeschaft bij cursus 1001)

Toetsvorm

Tijdens de cursus wordt om wille van de studeerbaarheid de theorie na 4 weken (over de eerste 4 weken) en na 8 weken (over week 5 t/m 8) schriftelijk getoetst. Beide toetsen dragen elk voor 50% bij aan het eindcijfer. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer 6,0 of hoger bedraagt en als het practicum met voldoende is beoordeeld. Een student die een eindcijfer behaalt dat lager is dan 6,0 moet de gehele theorie herkansen; individuele deeltoetsen kunnen niet worden herkanst. Het onderdeel Statistiek in deze cursus wordt tijdens de theorietoetsen getoetst in duidelijk herkenbare, aparte vragen. De beoordeling van de vragen over Statistiek telt niet mee in de beoordeling van de theorie van de huidige cursus, maar in de beoordeling van 1012 Basis Statistiek (pag. 194) (6 EC) en draagt voor 1/3 bij aan het eindcijfer van die cursus.

173


Het deelnemen aan de practica is verplicht. Tijdens de practica worden de vaardigheden van de student enkele malen beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het practicum kunnen het practicum pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten gedaan die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC) ). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen Academische Basis Vaardigheden.



103.

1003 Communicatie in de Biologie Vakcode

1003

Studielast

4

Periode(n)

Semester 1 blok 3 (8 januari t/m 2 februari 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

mw. prof.dr. J. Borst, dr. W.E.J.M. Ghijsen (coördinator), prof. dr. M.A. Haring (Docenten van SILS en IBED. Gastdocenten.)

Inlichtingen

dr. W.E.J.M. Ghijsen telefoon: +31 20 5257620 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Het verkrijgen van inzicht in de overeenkomsten en verschillen volgens welke diverse biologische vormen van leven, zoals populaties, organismen en cellen, met hun omgeving communiceren. Benadering van het thema communicatie in de biologie vanuit de diverse opleidingsrichtingen. Inhoud

De signalen waarvan organismen, organen en cellen gebruik maken om te communiceren met hun omgeving zullen benaderd worden vanuit verschillende invalshoeken: ■

■ ■

Biologie (ecologie) : Communicatie tussen planten en insecten Biomedische wetenschappen: Signaaloverdracht in tumorcellen Psychobiologie: Signaaloverdracht in de hersenen en gedrag

Aanmelden


Het thema Communicatie zal in een mini-symposium ingeleid worden door onderzoekers in de verschillende disciplines. Daarna zullen de onderwerpen verder uitgediept worden middels colleges, werkcolleges en/of practica. Groepsgewijze presentatie van verworven inzichten door de studenten middels posters of essays. Onderwijstijden


Verplicht aan te schaffen:

174



■

■ ■

■

Life: The Science of Biology, 7th ed, Purves et al., ISBN: 0716798565 (reeds aangeschaft bij cursus 1001). Studiestof Hoofdstukken 15, 17, 18, 44 Syllabus (prijs ± €15,-) Syllabus Basisstatistiek (reeds aangeschaft bij cursus 1001) Labjas (reeds aangeschaft bij cursus 1001)

Toetsvorm

Het deelnemen aan de practica is verplicht. Tijdens de practica worden de vaardigheden van de student enkele malen beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het practicum kunnen het practicum pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten gedaan die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen Academische Basis Vaardigheden. De theorie wordt schriftelijk getoetst aan het eind van de cursus. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer 6,0 of hoger bedraagt en als het practicum met voldoende is beoordeeld. Het onderdeel Statistiek in deze cursus wordt tijdens de theorietoets getoetst in duidelijk herkenbare, aparte vragen. De beoordeling van de vragen over Statistiek telt niet mee in de beoordeling van de theorie van de huidige cursus, maar in de beoordeling van 1012 Basis Statistiek (pag. 194) (6 EC) en draagt voor 1/6 bij aan het eindcijfer van die cursus. Opleidingen Biologie

175



104.

1004 Anatomie & Fysiologie van Dieren Vakcode

1004

Studielast

10

Periode(n)

Semester 2 ( blok 4: 5 februari t/m 30 maart 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Instituut voor Biodiversiteit en Ecosysteem Dynamica (IBED) Swammerdam Instituut voor Levenswetenschappen (SILS) Faculteit der Geneeskunde (AMC)

Docent(en)

dr. R.B. de Heus (coördinator)

Inlichtingen

dr. R.B. de Heus telefoon: +31 20 5257615 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Aan de hand van (functionele) anatomie en voorbeelden uit de fysiologie wordt geillustreerd hoe oplossingen in het dierenrijk zijn gevonden om dieren optimaal te laten functioneren. DEaarnaat leren studenten belangrijke basisbegrippen uit de zoologische embryologie correct te begrijpen en uit te leggen. Inhoud

1. Bouwplan dierenrijk; bouwplannen; evolutie; indeling dierenrijk; morfologie orgaansystemen; evolutie vanuit functioneel anatomisch oogpunt. 2. Embryologie: vroege embryonale ontwikkeling; gastrulatie; plooivorming; vroege organogenese; rol genexpressie. 3. Fysiologie; milieu interieur; homeostase; circulatie; spijsvertering; respiratie; endocrinologie; basisbegrippen (centraal) zenuwstelsel; beweging; seksualiteit. Aanmelden




176



Studiemateriaal


■

■

■ ■ ■

■

Life: The Science of Biology, 7th ed, Purves et al., ISBN: 0716798565 (reeds aangeschaft bij cursus 1001). Studiestof Hoofdstukken 19-21, 32-34, 41-52 Practical Skills in Biomolecular Sciences, Reed et al., ISBN: 0130451428 (reeds aangeschaft bij cursus 1001). Studiestof wordt nader bekend gemaakt. Syllabus (practicumhandleidingen) (prijs ± €10,-) Syllabus Basisstatistiek (reeds aangeschaft bij cursus 1001) Labjournaal; model wordt nader bekend gemaakt. (reeds aangeschaft bij cursus 1001) Labjas (reeds aangeschaft bij cursus 1001) Snijset (reeds aangeschaft bij cursus 1001)

Toetsvorm

Het deelnemen aan de practica is verplicht. Tijdens de practica worden de vaardigheden van de student enkele malen beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het practicum kunnen het practicum pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten gedaan die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen Academische Basis Vaardigheden.

Het onderdeel Statistiek in deze cursus wordt tijdens de theorietoetsen getoetst in duidelijk herkenbare, aparte vragen. De beoordeling van de vragen over Statistiek telt niet mee in de beoordeling van de theorie van de huidige cursus, maar in de beoordeling van 1012 Basis Statistiek (pag. 194) (6 EC) en draagt voor 1/6 bij aan het eindcijfer van die cursus. Bijzonderheden


177


Tijdens de cursus wordt ter wille van de studeerbaarheid de theorie na 4 weken (over de eerste 4 weken) en na 8 weken (over week 5 t/m 8) schriftelijk getoetst. Beide toetsen dragen elk voor 50% bij aan het eindcijfer. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer 6,0 of hoger bedraagt en als het practicum met voldoende is beoordeeld. Een student die een eindcijfer behaalt dat lager is dan 6,0 moet de gehele theorie herkansen, ongeacht evt. behaalde deeltoetsen; individuele deeltoetsen kunnen niet worden herkanst.



105.

1005 Biologie van Planten Vakcode

1005

Studielast

4

Periode(n)

Semester 2 (blok 5: 10 april t/m 4 mei 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof. dr. M.A. Haring, dr.ir. R.C. Schuurink (coördinator), prof.dr. P.H. van Tienderen

Inlichtingen

dr.ir. R.C. Schuurink telefoon: +31 20 5257933 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel ■ ■ ■

■ ■

Kennis van de diversiteit van planten en hun evolutie Kennis van de anatomie en opbouw van planten Inzicht in de fysiologie en hormoonhuishouding van planten Inzicht in de reacties van planten op (a)biotische stress Kennis van de reproductie van planten

Inhoud

Aan de hand van hoofdstukken 29, 30 en 35 t/m 40 van het boek Life, The Science of Biology, by Purves et al., wordt de studenten inzicht gegeven in de bouw en het functioneren van planten. Allereerst worden het plantenrijk en de hoofdlijnen van de evolutie van planten bekeken, in combinatie met een practicum systematiek. Vervolgens wordt de opbouw van de plant besproken in samenspel met een practicum anatomie. Aansluitend wordt bestudeerd hoe planten water en nutriënten opnemen en transporteren, voordat bekeken wordt hoe hormonen de ontwikkeling en het leven van een plant beïnvloeden. Dit wordt gecombineerd met een practicum fotosynthese. Tenslotte wordt uitgewerkt hoe planten zich reproduceren en reageren op (a)biotische stress. Deze laatste reacties worden ook in een practicum bekeken. Aanmelden


Hoorcolleges Studieprocesbegeleiding Practica Zelfstudie

178



Onderwijstijden


Life: The Science of Biology, 7th ed, Purves et al., ISBN: 0716798565 hoofdstukken 29, 30 en 35 t/m 40 Toetsvorm

Het deelnemen aan de practica is verplicht. Tijdens de practica worden de vaardigheden van de student enkele malen beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het practicum kunnen het practicum pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten gedaan die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen Academische Basis Vaardigheden. De theorie wordt schriftelijk getoetst aan het eind van de cursus. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer 6,0 of hoger bedraagt en als het practicum met voldoende is beoordeeld.


179



106.

1006 Ecologie I Vakcode

1006

Studielast

4

Periode(n)

Semester 2 (blok 6a: periode 7 mei t/m 1 juni 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. A.R.M. Janssen (coördinator), dr. J.G.B. Oostermeijer

Inlichtingen

dr. A.R.M. Janssen telefoon: +31 20 5257751 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel

1. Kennis en inzicht in de interacties die de verspreiding en het getalsmatig voorkomen van planten en dieren bepalen; de structuur en de levensgeschiedenis van populaties; levensgemeenschappen van organismen en voedselwebben 2. Uitvoeren van onderzoek en toetsen van gestelde hypothesen. Inhoud

Colleges ■ ■

■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

Organismen en hun omgeving; het adaptatie-begrip in de ecologie; life-tables (met nadruk op planten); effecten van zaadbanken op populatiedynamica van planten; stabiliteit, persistentie cyclische dynamica en chaos; intra- en interspecifieke concurrentie; herbivoor-plant interacties; predator-prooi interacties; parasitoid-gastheer interacties; parasiet-gastheer interacties; voedselwebben; directe en indirecte interacties; trophic cascades; omnivorie; ontogenetische niche-shifts; apparent competition; antipredator behaviour; grootte-afhankelijke role-reversals; directe en indirecte verdediging van planten; metapopulatie-dynamica van planten; coexistentie en persistentie.

Practica ■

■

■

Computerpracticum Classificatie van planten en dieren met behulp van de software Tree of Life “Minionderzoekstrainingen” waarin onderwerpen uit de populatiedynamica als onderzoeksthema fungeren. Toetsen van hypothesen en verwerken van gegevens

180



Aanmelden




De collegestof wordt aangeboden in de vorm van hand-outs tijdens de colleges en wordt op Blackboard aangeboden. Als achtergrondinformatie wordt het boek C.J. Krebs (2001) Ecology, 5th edition, Benjamin Cummings, San Francisco, USA, aangeraden. Classificatie van planten en dieren wordt gegeven aan de hand van de software Tree of Life. Toetsvorm

De theorie wordt schriftelijk getoetst; over de mini-onderzoekstraining wordt een poster gemaakt. Toetsing van het computerpracticum zal nader worden aangegeven. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer 6,0 of hoger bedraagt en als het practicum met voldoende is beoordeeld.

181


Het deelnemen aan de practica is verplicht. Tijdens de practica worden de vaardigheden van de student beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het practicum kunnen het practicum pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten bewerkt die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen Academische Basis Vaardigheden.



107.

1007 Organismen in het Milieu Vakcode

1007

Studielast

6

Periode(n)

Semester 2 (blok 6b: 4 juni t/m 29 juni 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.G.B. Oostermeijer (coördinator), prof. dr. M. Veith

Inlichtingen

dr. J.G.B. Oostermeijer telefoon: +31 20 5257817 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Aardwetenschappen Bachelor Biologie

Leerdoel

1. Verdere kennismaking met biologische diversiteit (voortzetting van theorie uit blok 5 en 6a) 2. Onderscheiden en classificeren van levensvormen zoals die in de natuur worden waargenomen 3. Herkennen van de belangrijkste ecologische stressfactoren in verschillende ecosystemen 4. Herkennen van de adaptaties van de verschillende organismen aan deze stressfactoren Inhoud

Onderwerpen college (1e week) ■

■ ■

■

Principes van taxonomie Methoden van classificatie, identificatie m.b.v. sleutels Inleiding in de belangrijkste ecosystemen van Nederland en hun kenmerkende organismen Morfologische en fysiologische adaptatie

Onderwerpen excursies/veldwerk ■

■

■

2e week: excursies naar verschillende habitattypen: duinen (temperatuur- en droogtestress), water (zuurstofstress), bos (licht), zee (zout), urbaan (verstoring/vervuiling) 3e week: veldwerk Limburg. Training in verzamelen en classificeren van organismen in relatie tot milieufactoren. Onderzoeken van morfologische adaptaties aan de hand van microscopische preparaten. 4e week: zelfstandig veldwerk bij Amsterdam. In groepjes zelfstandig toepassen van de in week 3 geleerde kennis en methoden in een nieuwe, onbekende habitat.

182



Onderwerp practicum ■

■

“Minionderzoekstrainingen” die zullen bestaan uit het analyseren van de biodiversiteit van een deel van een natuurgebied in de buurt van Amsterdam. Leren verzamelen en determineren van de planten en verschillende diergroepen die tijdens de veldexcursies worden aangetroffen.

Aanmelden


Het onderwijs wordt verzorgd door docenten van de IBED-onderzoeksgroepen Systematische en Geografische Dierkunde en Experimentele Plantensystematiek. In de eerste week wordt theorie gegeven in de vorm van hoorcolleges en zelfstudie aan de hand van delen uit het hoofdstuk ‘The Evolution of Diversity’ in Purves et al. en de ‘Tree of Life’ website. Deze week wordt afgesloten met een tentamen. In de tweede en derde week krijgen de studenten organismen in verschillende habitattypen gedemonstreerd en oefenen in verzamelmethoden en determineren. In week vier doen studenten in groepjes een zelfstandig onderzoek, waarover ze mondeling aan elkaar rapporteren. Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl . Studiemateriaal ■

■

■

Toetsvorm

Het deelnemen aan het veldwerk is verplicht. Tijdens het veldwerk worden de vaardigheden van de student enkele malen beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het veldwerk kunnen dit pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten gedaan die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen Academische Basis Vaardigheden.

183


■

Life: The Science of Biology, 7th ed, Purves et al., ISBN: 0716798565 (reeds aangeschaft bij cursus 1001). Studiestof wordt nader bekend gemaakt. Flora van Nederland; Heukels en Van der Meijden, 23e druk, Wolters-Noordhoff, Groningen, Prijs ca € 49,95 Extra syllabi over de classificatie van dieren zijn tegen betaling beschikbaar aan het begin van de cursus de kosten van levensonderhoud tijdens excursies zijn voor eigen rekening; evt. logies en vervoer is voor rekening OWI



De theorie wordt schriftelijk getoetst; het eigen onderzoeksproject wordt geëvalueerd op basis van de mondelinge presentatie. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer 6,0 of hoger bedraagt en als het veldwerk met voldoende is beoordeeld.

184



108.

1008 Neuro-anatomie & Fysiologie Vakcode

1008

Studielast

4

Periode(n)

Semester 2 (blok 5: 10 april t/m 4 mei 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Swammerdam Instituut voor Levenswetenschappen (SILS) Faculteit der Geneeskunde (AMC)

Docent(en)

dr. P.J. Lucassen (coördinator)

Inlichtingen

dr. P.J. Lucassen telefoon: +31 20 5257631 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biomedische wetenschappen (Medische Biologie) Bachelor Psychobiologie

Leerdoel ■ ■

■

■ ■ ■

Begrip van de globale opbouw van hersenen bij vertebraten. Kennis van de belangrijkste macrostructuren en systemen van hersenen van de rat en voornamelijk de mens. Inzicht in de drie-dimensionale aspecten van de hersenen van de rat en voornamelijk de mens. Kennis van de vergelijkende neuroanatomie tussen mens en rat. Kennis van de functionele neuroanatomie bij de mens. Begrip van elektrische en elektrochemische processen in de biologie, met name mbt neuronen.

Inhoud

Neurofysiologie: Er wordt kennis opgedaan van de natuurkunde achter de biologie, met name mbt; electriciteit, ionen en celmembranen, het voortgeleiden van een actiepotentiaal, neuronale netwerken en medische beeldverwerkingstechnieken. De bijbehorende practica behelzen: een computermodel over membraanpotentialen; een reuzeaxon Lumbricus; een Spierproef. Aanmelden

Eerstejaars studenten hoeven zich voor dit vak niet aan te melden

185


Neuroanatomie: Allereerst zal stilgestaan worden bij de globale opbouw van de hersenen bij vertebraten. Hierbij worden zowel de macrostructuur als enkele systemen binnen de hersenen besproken. Belangrijk is tevens het vergelijkende aspect, in het bijzonder tussen mens en rat. Naast een inleidend theoretisch kader zal de stof vooral praktisch worden verwerkt. Hiervan maken een snijpracticum, microscopisch practicum en computer ondersteunend onderwijs deel uit.



Onderwijsvorm

Hoorcollege Practica Zelfstudietijd Totaal Onderwijstijden


Wordt nader bekend gemaakt via Blackboard. Toetsvorm

Het deelnemen aan de practica is verplicht. Tijdens de practica worden de vaardigheden van de student enkele malen beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het practicum kunnen het practicum pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten gedaan die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen Academische Basis Vaardigheden. De theorie wordt na 4 weken schriftelijk getoetst. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer van de toets 6,0 of hoger bedraagt en als het practicum met voldoende is beoordeeld.

186



109.

1009 Mens en Ziekte Vakcode

1009

Studielast

10

Periode(n)

Semester 2 (blok 6: 7 mei t/m 29 juni 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Faculteit der Geneeskunde (AMC)

Docent(en)

prof.dr M.L. Kapsenberg (coördinator), dr. R.J. Oostra

Inlichtingen

prof.dr M.L. Kapsenberg telefoon: +31 20 5664966 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biomedische wetenschappen (Medische Biologie)

Leerdoel ■

■

■

■

■

■

■

Kennis van de basale anatomische principes en technieken Inzicht in de algemene bouw van het menselijk lichaam, inclusief de verschillende orgaansystemen; Kennismaking met de klinische aspecten van enkele ziektebeelden; Inzicht in lichamelijk onderzoek en laboratoriumonderzoek i.v.m. de diagnose van deze ziektebeelden; Kennis van en inzicht in de biologische en pathobiologische mechanismen m.b.t. deze ziektebeelden; Kennis van en inzicht in opzet en uitvoering van klinisch en niet–klinisch wetenschappelijk onderzoek van (patho-)biologische mechanismen; Inzicht in de betekenis van medisch-wetenschappelijk onderzoek voor diagnostiek en therapie. Opleidingen Biologie

Inhoud

1. Bouw van het menselijk lichaam: hart en bloedvaten longen en luchtwegen spijsverteringsorganen nieren, urinewegen en voortplantingsorganen bewegingsapparaat 2. Infectie en immuniteit Basisprincipes immunologie Bouw immuunsysteem Bacteriële en virale infecties Pathogenese-diagnostiek Preventie-vaccinaties Endotoxine shock: clinical trials Werking van antibacteriële en antivirale middelen ■ ■

■ ■ ■

■ ■

■ ■ ■

■ ■

187



3. Ontsteking Algemene aspecten van ontsteking Reumatoïde artritis Histologie en röntgenologie van gewrichten Cel en weefselbeschadiging Onderzoek van synovitis, clinical trials artritis, diermodellen Bloed en microcirculatie Auto-immuunfenomenen, overgevoeligheidsreacties 4. Oncologie Solide tumoren Oncogenese Groei en differentiatie-stoornissen, basale oncologie Epidemiologie Kankertherapie Onderzoek van tumormarkers ■

■ ■

■ ■ ■

■

■

■ ■ ■

■ ■

Aanmelden


Het contact-onderwijs omvat hoorcolleges en kleinschalige onderwijsvormen (werkcolleges, werkgroepen en practica). De hoorcolleges zijn facultatief maar worden onontbeerlijk geacht voor een goed begrip van de te tentamineren studiestof. Practica en tutoraat zijn verplicht. Verscheidene colleges worden gegeven met medewerking van patiënten. Ieder die aanwezig is op college waaraan een patiënt meewerkt, is gebonden aan het medische beroepsgeheim. Deze colleges zijn dan ook uitsluitend toegankelijk voor studenten die zich voor Biomedische Wetenschappen dan wel Geneeskunde hebben laten inschrijven. Onderwijstijden


Wordt nader bekend gemaakt Toetsvorm

Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten bewerkt die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen Academische Basis Vaardigheden. De precieze toetsvorm wordt aan het begin van de module bekend gemaakt.

188



Bijzonderheden

Locatie: AMC


189



101.

1010 Statistiek en Methodologie Vakcode

1010

Studielast

5

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Onderwijsinstituut Psychologie (FMG)

Docent(en)

mw. drs. S.C. Witteveen (coördinator)

Inlichtingen

mw. drs. S.C. Witteveen telefoon: +31 20 5256680 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Psychobiologie

Leerdoel ■

■ ■ ■

Basiskennis van de cognitieve en biologische psychologie; Kennis van methoden in sociaal wetenschappelijk onderzoek; Kunnen werken met het programma SPSS; Het verwerven van inzicht in de methodologische problemen die kunnen kleven aan onderzoek naar cognitie;

Inhoud

Veel vragen die empirisch onderzocht worden, vinden hun bron in eeuwenoude filosofische vragen over de aard van onze kennis, hoe we deze verwerven, hoe deze zich ontwikkelt en hoe deze gebruikt wordt. Om inzicht te krijgen in deze vragen zijn er in de loop van de jaren vele soorten taken ontwikkeld die specifieke psychologische functies bestuderen zoals aandacht, perceptie, geheugen en taal. De cursus geeft inzicht in de meest gangbare cognitief psychologische theorieën en de methoden en technieken om deze functies te bestuderen. Ook zal behandeld worden wat de fysiologische mechanismen zijn die verantwoordelijk zijn voor deze psychologische functies. Dit zal onder andere gebeuren aan de hand van de neuropsychologie. Onderwijsvorm

De cursussen 1010 en 1011 worden parallel gegeven. De onderwijsvormen zijn hoorcolleges en Computer ondersteund onderwijs (SPSS) Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelors op de website http://www.student.uva.nl . Studiemateriaal

Wordt nader bekend gemaakt via blackboard Toetsvorm

Het deelnemen aan de practica (bij cursus 1011 gaat het om de Coobijeenkomsten SPSS) is verplicht. Tijdens de practica worden de vaardigheden van de student enkele malen

190



beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het practicum kunnen het practicum pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten bewerkt die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen de cursus Academische Basis Vaardigheden. De theorie van zowel 1010 als 1011 wordt schriftelijk getoetst. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer van de toets 6,0 of hoger bedraagt en als het practicum met voldoende is beoordeeld.


191



101.

1011 Inleiding Gedrag Vakcode

1011

Studielast

5

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)


Inlichtingen


Onderdeel van


Leerdoel ■

■ ■ ■

Basiskennis van de cognitieve en biologische psychologie; Kennis van methoden in sociaal wetenschappelijk onderzoek; Kunnen werken met het programma SPSS; Het verwerven van inzicht in de methodologische problemen die kunnen kleven aan onderzoek naar cognitie;

Inhoud

Deze cursus geeft inzicht in de mogelijkheden, beperkingen en problemen van sociaal wetenschappelijk onderzoek. Hierbij zal ingegaan worden op de opzet en analyse van empirisch onderzoek, waarbij de nadruk valt op de ambachtelijke en technische aspecten van het wetenschapsbedrijf. Het ontwerpen van experimenten en quasi-experimenten en pogingen om het hoofd te bieden aan interpretatieproblemen van onderzoeksresultaten vormen de belangrijkste thema’s. Daarnaast zullen de studenten leren werken met het programma SPSS. Aanmelden


De cursussen 1010 en 1011 worden parallel gegeven. De onderwijsvormen zijn hoorcolleges en Computer ondersteund onderwijs (SPSS) Onderwijstijden


Wordt nader bekend gemaakt via blackboard Toetsvorm

Het deelnemen aan de practica (bij cursus 1011 gaat het om de Coobijeenkomsten SPSS) is verplicht. Tijdens de practica worden de vaardigheden van de student enkele malen

192



beoordeeld. Een voldoende beoordeling is voorwaarde voor de toekenning van het eindcijfer van de cursus. Studenten die een onvoldoende beoordeling hebben voor het practicum kunnen het practicum pas herkansen in het volgende studiejaar. Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Binnen de studieprocesbegeleiding worden zowel opdrachten bewerkt die de stof van de lopende cursus behandelen als opdrachten die gericht zijn op Academische Basis Vaardigheden (zie 1013 Academische Basisvaardigheden (pag. 196) (6 EC)). Beoordeling van opdrachten binnen de studieprocesbegeleiding wordt gedaan binnen de cursus Academische Basis Vaardigheden. De theorie van zowel 1010 als 1011 wordt schriftelijk getoetst. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer van de toets 6,0 of hoger bedraagt en als het practicum met voldoende is beoordeeld.


193



1012.

1012 Basis Statistiek Vakcode

1012

Studielast

6

Periode(n)

Semester 1 en 2 (Blok 1 t/m 4: 4 september 2006 t/m 30 maart 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

drs. P. R. Assink (coördinator)

Inlichtingen

drs. P. R. Assink telefoon: +31 20 5257672 [email protected]

Leerdoel

Het verkrijgen van inzicht in theorie en toepassing van basale statististische methoden en technieken. Inhoud

Basis Statistiek zal gegeven worden gedurende en in de context van de cursussen 1001, 1002, 1003 en 1004. Tijdens elke cursus zal aan een aantal aspecten van de Basis Statistiek aandacht worden besteed: 1. Cursus 1001: basisbegrippen; beschrijvende statistiek; kansrekenen; discrete kansverdelingen (alternatieve, binomiale, Poisson); continue kansverdelingen (normale, standaardnormale, Chi-kwadraat, Students t); centrale limietstelling. 2. Cursus 1002: puntschattingen & betrouwbaarheidsintervallen; toetsingstheorie; binomiaal toets, t-toets, Chi-kwadraat toets, Wilcoxon-Mann-Witney-toets; 3. Cursus 1003 en 1004: one way anova, Kruskal-Wallis (one way anova between subjects by ranks), Friedman (one way anova within subjects by ranks), two way anova, lineaire regressie, lineaire correlatie. Aanmelden


Hoorcolleges Zelfstudie en huiswerkopdrachten Onderwijstijden



Syllabus Basis Statistiek (prijs ± €10,-)

194



Toetsvorm

De theorie wordt tijdens de toetsing voor de lopende cursussen 1001, 1002, 1003 en 1004 schriftelijk getoetst. De vragen voor Basis Statistiek zijn duidelijk herkenbaar gemarkeerd ten opzichte van de vragen voor de biologische onderwerpen en zij worden apart beoordeeld. Elke keer wordt een deel van het eindcijfer verworven, te weten: in cursus 1001 en 1002: elk 1/3 deel van het eindcijfer en in cursus 1003 en 1004 elk 1/6 deel van het eindcijfer. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer van de toets 6,0 of hoger bedraagt. Een student die een eindcijfer behaalt dat lager is dan 6,0 moet de gehele theorie herkansen, ongeacht evt. behaalde deeltoetsen; individuele deeltoetsen kunnen niet worden herkanst.


195



1013.

1013 Academische Basisvaardigheden Vakcode

1013

Studielast

6

Periode(n)

Semester 1 en 2 (periode: hele jaar)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Afdeling Biologie

Leerdoel ■

■

Het aanleren en oefenen van academische basisvaardigheden, zoals literatuurstudie, samenvatten, mondeling presenteren inzicht krijgen in opbouw van wetenschappelijke publicaties en de wijze waarop deze tot stand komen.

Inhoud

Met een weloverwogen keuze van opdrachten – gevolgd door feedback – worden academische basisvaardigheden aangeleerd. Enkele voorbeelden van typen opdrachten zijn: ■ ■ ■

■

Literatuurstudie a.h.v. opgegeven, of zelf te zoeken bronnen. Onderzoek opzetten / uitvoeren / rapporteren (mondeling en/of schriftelijk). Peerreview schrijven, discussie voorbereiden en leiden Presenteren van literatuurstudie, onderzoek, web-search e.d.

Onderwijsvorm

Verplichte wekelijkse bijeenkomsten met de tutorgroep. Hierin worden opdrachten aangeboden en voorbereid, gepresenteerd en besproken. Zelfstudie, waarin opdrachten worden uitgewerkt en voorbereid. Onderwijstijden


Klapper en handouts (prijs wordt op website bekend gemaakt) Er zullen enige bijkomende kosten zijn i.v.m. bijv. kopiëren Toetsvorm

Het deelnemen aan de studieprocesbegeleiding (tutoraat) is verplicht. Tijdens het studiejaar zal elke student een aantal opdrachten moeten inleveren en een of meer presentaties en discussies moeten houden. Voor de opdrachten krijgt de student een beoordeling “voldoende” of “onvoldoende”. Een student die een of meer onderdelen “onvoldoende” scoort kan deze herkansen door het maken van een of meer vervangende opdrachten, maar slechts nadat aan alle andere verplichtingen van het eerste studiejaar is voldaan. De student is geslaagd voor de cursus als alle onderdelen met “voldoende” zijn afgerond.

196



5.2

Vakken tweede en derde jaar

28A.

282A Beroepsethiek voor Biologen, Biomedische wetenschappers en Psychobiologen Vakcode

282A

Studielast

4

Ingangseis

n.v.t

Periode(n)

Semester 1 (Periode 3: 4 t/m 22 december 2006, ALLEEN voor studenten Biologie, Ecologie en Biodiversiteit; 2e studiejaar) Semester 2 (Periode 6: 21 mei t/m 8 juni 2007 (groep 1); 18 juni t/m 6 juli 2007 (groep 2) voor Psychobiologen, Bio-medische wetenschappers en Biologen uit de afstudeerrichting Moleculair Celbiologie en Bio Informatica); 2e studiejaar. Dit vak alterneert met 290A/P de Miniscriptie.)

Onderwijsinstituut


Docent(en)

drs. H.J. Bout (coördinator)

Inlichtingen

drs. H.J. Bout

(docenten worden nader bekend gemaakt)

telefoon: +31 20 4880309 [email protected] Onderdeel van


Leerdoel

Inhoud

Wel eens getwijfeld over of je die dierproef nu wel of niet moest doen? Weet je ook niet meer of je die veldproeven nu toelaatbaar vindt of niet? Ook wel eens gemerkt dat het soms onmogelijk lijkt om mensen uit te leggen wat het belang is van het gebruik van ‘rest-embryo’s’ voor wetenschappelijk onderzoek? Moet je in Zaïre een ander soort bioloog zijn dan in Nederland? En wat is er nou zo problematisch aan biologische verklaringen voor menselijk gedrag? Het zijn allemaal vragen waar je misschien al eens voor hebt gestaan en die een appèl doen op je morele houding als bioloog. In deze cursus zul je in vogelvlucht kennis nemen van belangrijke morele principes voor de beroepspraktijk van biologen. Daarnaast zul je een aantal veel voorkomende morele problemen en discussies omtrent het werken als bioloog nader bekijken en ga je leren een dilemma systematisch te analyseren, een moreel beraad te voeren en een morele argumentatie op te zetten. Het hogere doel van deze cursus is dat je in de toekomst niet meer overrompeld zult

197


Leren herkennen van morele problemen Leren een weloverwogen oplossing te formuleren voor deze problemen Kennis krijgen over principes en normen die richtinggevend zijn voor het handelen van biologen in hun beroepspraktijk



worden door de morele aspecten van je werk en dat je handvatten mee hebt gekregen om deze problemen en vragen aan te pakken. Aanmelden ■

■

Biologen uit de afstudeerrichting Ecologie en Biodiversiteit: via studieweb voor 22 oktober 2006 Biomedische wetenschappers, Psychobiologen en Biologen uit de afstudeerrichting Moleculaire Celbiologie & Bio Informatica: via studieweb voor 8 april 2007.

Let op: Je moet je gelijktijdig voor Beroepsethiek (282A) en de 290A/P Miniscriptie (pag. 199) (6 EC) aanmelden! Onderwijsvorm

In dit college zal gebruik gemaakt worden van verschillende onderwijsvormen die je kennis en vaardigheden bijbrengen. Zo wordt er gebruik gemaakt van hoorcolleges, werkcolleges, films, simulatiespelen en van presentaties door medestudenten (eventueel gastcolleges door uitgenodigde gastsprekers). Daarnaast zal een dilemmatraining onderdeel uitmaken van de cursus. Onderwijstijden


Syllabus: € 10,Boek: “Ethiek in praktijk”, L.L.E. Bolt, M.F. Verweij, J.J.M. van Delden. 4e geheel herziene druk, 2003. ISBN: 90 232 3835 4 (€ 24,50) Toetsvorm

Weegfactoren: Schriftelijk tentamen: 70% Groepsopdracht: 30% De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is.

198



290A/P.

290A/P Miniscriptie Vakcode

290A/P

Studielast

6

Ingangseis

n.v.t.

Periode(n)

Semester 1 (periode 3: 8 januari t/m 2 februari 2007, ALLEEN voor studenten Biologie, Ecologie en Biodiversiteit, 2e studiejaar) Semester 2 (periode 6: 21 mei t/m 15 juni 2007 (groep 1); 11 juni t/m 6 juli 2007 (groep 2); voor Psychobiologen, Biomedische wetenschappers en Biologen uit de afstudeerrichting Moleculaire Celbiologie en Bioinformatica; 2e studiejaar. Dit vak alterneert met 282A Beroepsethiek. )

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Instituut voor Biodiversiteit en Ecosysteem Dynamica (IBED) Swammerdam Instituut voor Levenswetenschappen (SILS) Onderwijsinstituut Psychologie (FMG)

Docent(en)

dr. R.W.M. van Soest (coördinator), dr. J.C. van der Spek (coördinator), mw. drs. S.C. Witteveen (coördinator)

(Dr. J.C. van der Spek: coördinator voor

Biomedische wetenschappers en Biologen uit de afstudeerrichting MCB en BI. Dr. R. W.M. van Soest: coördinator voor de Biologen. Drs. S.C. Witteveen: coördinator voor de Psychobiologen. ) Inlichtingen

Onderwijsbalie Biologie telefoon: +31 20 5257945 [email protected]

Onderdeel van


De student is in staat: ■

■

■

■

■

Een samenvattende, duidelijke en logisch opgebouwde tekst in het engels te schrijven over een actueel onderwerp op het gebied van de leerstoelgroep aan de hand van een beperkt aantal artikelen uit de literatuur van het vakgebied. Over het geschrevene een wetenschappelijke gedachtenwisseling te voeren en heeft daartoe de benodigde kennis op het betreffende gebied paraat alsmede inzicht in algemene biologische principes op het vakgebied. Een kritische analyse te geven van hetgeen over een onderwerp in de literatuur wordt vermeld. Eigen inzichten of stellingname m.b.t. actuele discussiepunten beargumenteerd te verwoorden. Literatuur op te zoeken

199


Leerdoel



■

In een mondelinge presentatie de hoofdlijnen van de miniscriptie helder uiteen te zetten voor een groep medestudenten en docenten (geldt alleen voor de biologen uit de afstudeerrichting Ecologie en Biodiversiteit).

Inhoud

Biologie en Biomedische wetenschappen Bij aanvang van de miniscriptie wordt startliteratuur en een kleine handleiding voor het schrijven van een scriptie uitgedeeld. In de handleiding staan de volgende punten vermeld: het tijdschema; de opzet van de scriptie; de beoordelingscriteria; enkele wenken voor het schrijven van een scriptie. De biologen uit de afstudeerrichting Ecologie en Biodiversiteit ontvangen tevens een handleiding mondeling presenteren. Psychobiologie De onderwerpen voor de miniscriptie worden per email van te voren bekend gemaakt. Er worden een aantal keuzes opgegeven door de student. Daarna vindt indeling plaats. Aanmelden ■

■

■

Biologen uit de afstudeerrichting Ecologie en Biodiversiteit via studieweb voor 22 oktober 2006 (290A) Biomedische wetenschappers enBiologen uit de afstudeerrichting MCB & BI via studieweb voor 8 april 2007 (290A). Psychobiologen voor 8 april 2007 (290P)

Let op: Je moet je gelijktijdig voor de Miniscriptie (290A/P)en voor 282A Beroepsethiek voor Biologen, Biomedische wetenschappers en Psychobiologen (pag. 197) (4 EC)aanmelden Onderwijsvorm

De miniscriptie wordt geschreven onder begeleiding van docenten verbonden aan het SILS, IBED en de afdeling Psychologie FMG. De miniscriptie moet afgerond zijn voordat aan de masterfase wordt begonnen. Onderwijstijden


Syllabus: handleiding bij het schrijven van literatuurverslagen. Ca. 10 euro. (Reeds aangeschaft in jaar 1) Toetsvorm

Biologie en Biomedische wetenschappen De beoordeling vindt plaats op basis van de miniscriptie en op basis van de gedachtenwisseling daarover tijdens de bespreking van de scriptie. Bij sommige vakgroepen kan een voordracht voor de studenten en enkele stafleden van de vakgroep gehouden worden. Het eindcijfer van de biologen uit de afstudeerrichting Ecologie en Biodiversiteit bestaat voor

200



80% uit de beoordeling van de miniscriptie en de bijbehorende gedachtewisseling en voor 20% uit de beoordeling van de mondelinge presentatie. Psychobiologie Bij een onvoldoende beoordeling van de eindversie wordt een aanvullende opdracht gegeven. De scriptie dient, inclusief eventueel aanvullende opdrachten tijdig afgerond en als voldoende beoordeeld te zijn. Is dit niet het geval dan heeft men niet voldaan aan de verplichtingen voor deze cursus en dient men de cursus opnieuw te volgen. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. LET OP: de miniscriptie wordt getoetst op plagiaat. Vermoedens van plagiaat worden gemeld aan de Examen Commissie. Sancties op het plegen van plagiaat zijn na te lezen in de OER. Bijzonderheden

Locatie: Biologie en Biomedische wetenschappen: FNWI, Anna’s Hoeve, Kruislaan Psychobiologie: FMG afdeling Psychologie, Roetersstraat Let op: De miniscriptie dient in het Engels geschreven te worden. De mondelinge presentatie mag in het Nederlands gehouden worden.


201



ECDO.

ECDO Onderwijsaanbod Expertisecentrum Duurzame Ontwikkeling Vakcode

ECDO

Studielast

24( afhankelijk van het gevolgde onderdeel kan de studielast variëeren tussen 5-24

Ingangseis

Het Expertisecentrum Duurzame Ontwikkeling biedt het komende studiejaar

EC) verschillende keuzemodules (waaronder een interdisciplinaire minor) aan op het gebied van duurzame ontwikkeling. Alle modules zijn open voor studenten van alle faculteiten van alle hogescholen en universiteiten. Het eerste studiejaar dient op z’n minst te zijn gehaald. Ook is het mogelijk om een stage op het gebied van duurzame ontwikkeling via het ECDO te doen. Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Expertisecentrum Duurzame Ontwikkeling (ECDO)

Inlichtingen

dr. J.B.F. van Zonneveld telefoon: +31 20 5256234 [email protected]

Onderdeel van

Masterprogramme General Biology Masterprogramme Medical Biology Bachelor Biomedische wetenschappen (Medische Biologie) Bachelor Biologie

Inhoud

Vrije keuzemodules op het gebied van duurzame ontwikkeling Duurzame Ontwikkeling Duurzame ontwikkeling gaat over meer dan het milieu alleen. Het gaat om de ecologische, sociale en economische consequenties van ons handelen. Niet alleen ‘hier en nu’, maar ook ‘daar en later’. Bij duurzame ontwikkeling gaat het om een voortdurend zoeken naar evenwicht en integratie van die verschillende aspecten. Het streven naar een duurzame samenleving vraagt om maatschappelijke en technologische vernieuwing, die alleen gerealiseerd kan worden als mensen daarop toegerust zijn. Inleiding Duurzame Ontwikkeling - 12 EC Startdatum: September 2006 In multidisciplinair samengestelde werkgroepen bediscussieer je het concept duurzame ontwikkeling naar aanleiding van literatuur. Verschillende gastsprekers belichten vanuit hun discipline en invalshoek hun visie. Tot slot voer je samen met je werkgroep een korte onderzoeksopdracht uit op gebied van duurzame ontwikkeling voor een organisatie. European Virtual Seminar - 5 EC Looptijd: half oktober - eind januari Contactdagen: zelf in te plannen, geen vaste tijden Samen met studenten uit andere Europese landen voer je via Internet een onderzoeksop-

202



dracht uit op het gebied van duurzame ontwikkeling en de uitbreiding van de EU. Onderzoeksthema’s kunnen zijn: landbouw, water, planning en energie. Stages Duurzame Ontwikkeling in NL en buitenland Het ECDO kan je begeleiden bij een stage op het gebied van duurzame ontwikkeling in binnen- en buitenland. Heb je zelf ideeën en een eventuele stageplek en wil je je graag laten begeleiden door iemand met kennis op het gebied van duurzame ontwikkeling, neem dan gerust contact op. Of kijk op http://www.uva.nl/ecdo, voor het actuele onderwijsaanbod en stageplaatsen in Nederland of op http://www.noord-zuid.nl voor stages in Brazilië, Ghana en Benin (W-Afrika). Aanmelden

Het Expertisecentrum Duurzame Ontwikkeling vind je in Gebouw B, 3.15. Telefoonnummer: 020-5255292 Adres: Nieuwe Achtergracht 166 1018 WV Amsterdam Projectcoördinator: Hans van Zonneveld, [email protected] Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd op de website http://www.student.uva.nl . Bijzonderheden

Het actuele onderwijs aanbod en meer info over het ECDO op www.uva.nl/ecdo of bel 020- 525 5292


203



GE201.

GE201 Algemene Anatomie en Fysiologie van de Mens Vakcode

GE201

Studielast

10

Ingangseis

SI201 Celbiologie II (pag. 258) (10 EC) gevolgd hebben

Periode(n)

Semester 2 (periode 4: 5 februari t/m 23 maart 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. P.E.M.H. Habets (coördinator), dr. R.J. Oostra, prof. dr J.H. Ravesloot

(en

gastdocenten) Inlichtingen

dr. P.E.M.H. Habets telefoon: +31 20 5664926 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Leerdoelen van de module Algemene anatomie en fysiologie van de mens (GE201) : ■

■ ■

Inzicht in de algemene bouw en ontwikkeling van het menselijk lichaam Inzicht in de algemene fysiologie van het menselijk lichaam Kennis van verschillende anatomische en fysiologische meetmethoden en onderzoekstechnieken

Inhoud

Het onderwijs in deze module is gegroepeerd in een vijftal thema’s: 1. Basale anatomische en fysiologische principes en technieken (o.a. bouwplan, regelsystemen, allometrie en reconstructie) 2. Luchtwegen en ademhaling 3. Hart, bloedvaten en circulatie 4. Spijsvertering, urogenitaal systeem en endocrinologie 5. Baansystemen, perifeer zenuwstelsel en bewegingsapparaat In het kleinschalig onderwijs (werkcolleges, practica etc.) zullen de onderwerpen die tijdens de hoorcolleges aan bod komen verder uitgediept worden. Aanmelden

Via studieweb voor 24 december 2006 Onderwijsvorm

Het contact-onderwijs omvat hoorcolleges en kleinschalige onderwijsvormen (werkcolleges, werkgroepen en practica). De practica zijn verplicht. De overige contacturen zijn facultatief maar worden onontbeerlijk geacht voor een goed begrip van de te tentamineren studiestof.

204



Hoorcolleges

191 slu

Practica/werkcolleges

25 slu

Literatuurstudie

24 slu

Zelfstudie en tentamen

40 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl . Studiemateriaal ■ ■

■

■ ■

Silverthorn DU (ed). Human Physiology. An Integrated Approach. 3rd ed., ca. €140,Fritsch H, Kühnel W. Sesam Atlas van de Anatomie, deel 2: Inwendige organen, 16de druk, 2002, ca €25,Kahle W. Sesam Atlas van de Anatomie, deel 3: Zenuwstelsel en zintuigen, 16de druk, 2001, ca €25,syllabus, ca €10,Aanbevolen naslagwerken: Netter FH. Atlas of Human Anatomy, 2nd ed., €100,-

Toetsvorm

Eindcijfer tentamen = cijfer eindtoets + het eventueel behaalde hele of halve bonuspunt. Bijzonderheden

Locatie: AMC


205



GE305.

GE305 Moleculaire en Klinische Genetica Vakcode

GE305

Studielast

10

Ingangseis

gevolgd hebben: SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T

Periode(n)

Semester 1 (periode 1: 4 september 2006 t/m 20 oktober 2006)

(pag. 260) (8 EC) Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. M. Kool (coördinator), prof.dr N.J. Leschot, dr. L.J. Valentijn, prof. dr. R. Versteeg

Inlichtingen

(en gastdocenten)

dr. M. Kool telefoon: +31 20 5665170 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Moleculaire en Klinische Genetica (GE305) : ■

■

■ ■

■ ■

■

■

Inzicht in de genetica van groei en ontwikkeling en de hierbij optredende ziekten: erfelijke/ aangeboren afwijkingen, familiaire tumoren en sporadische tumoren. Inzicht in de gemeenschappelijke moleculaire pathways die bovengenoemde ziekten veroorzaken Inzicht in de rol van deze processen in erfelijke en sporadische colon tumoren Inzicht in het proces rond colon tumoren in een academisch ziekenhuis: diagnose, behandeling, erfelijkheidsadvisering, counseling, DNA diagnostiek, fundamenteel onderzoek, experimentele moleculair-gerichte therapieën. Inzicht in de klinische implicaties voor dragers van genetische aandoeningen Inzicht in de ethische problemen die kunnen ontstaan bij het klinisch-genetisch onderzoek en de erfelijkheidsadvisering door artsen en andere hulpverleners Inzicht in het Human Genome Project en de daaruit voortgekomen technieken zoals micro-arrays en bio-informatische analyses. Het kunnen beoordelen van artikelen op het terrein van de klinische genetica en fundamentele humane moleculaire genetica.

Inhoud

Genetica is een brede discipline en speelt een belangrijke rol in vele verschillende ziekten. Om een goed beeld te krijgen van alle aspecten van genetica in relatie tot humane ziekten, is voor een thematische opzet van de cursus gekozen. Er zijn drie hoofdthema’s: 1. Colon kanker: Een model waarin de nieuwste ontwikkelingen in biomedische wetenschappen aan bod komen: zowel de moleculair genetische, celbiologische en klinische aspecten worden behandeld, maar ook de psychosociale en maatschappelijke dilemma’s. Topics zijn kliniek, diagnostiek, geassocieerde erfelijke syndromen,

206



multistep carcinogenese model, moleculaire pathways in ontwikkeling en kanker zoals de Wnt-APC, Hedgehog, Myc, TGF/Smad en HNPCC pathways, counseling, DNA diagnostiek, populatiescreening, nieuwe technologieën van het Human Genome Project zoals SAGE en micro-arrays, diermodellen en ten slotte innovatieve therapie mogelijkheden. 2. Gezamenlijke oorzaken van erfelijke ontwikkelingsstoornissen en kanker: beiden worden vaak door dezelfde genen in een paar belangrijke moleculaire pathways veroorzaakt. 3. Wat is genetica in de setting van een academisch ziekenhuis? Hoe werken de verschillende disciplines samen in onderzoek, diagnostiek etc. Doel is de studenten kennis te laten maken met de dynamiek van een instelling waar patiëntenzorg en onderzoek samengaan. Naast deze thematische opzet, is er ruime aandacht voor algemene aspecten van klinische genetica. Aan bod komen basisbegrippen op gebied van genlocalisatie en overerving, erfelijkheidsadvisering gericht op eigen leven en op nakomelingen, DNA diagnostiek, prenatale diagnostiek en ethische dilemma’s. Referaat Het houden van een referaat over een artikel uit de klinisch-genetische wetenschappelijke literatuur (individueel). Aanmelden

Via studieweb voor 23 juli 2006 Onderwijsvorm

Hoorcolleges

220 slu 60 slu

Totaal

280 slu


Werkcolleges

Onderwijstijden


Medical Genetics, 3rd edition. Edited by LB Jorde et al. Plus klapper met artikelen die bij aanvang van de cursus wordt uitgereikt. Aantal deelnemers

Maximaal 30 studenten

207



Toetsvorm

Individuele beoordeling op basis van: 1. het tentamen met essayvragen, 2. presentatie van het referaat. De weegfactoren voor het eindcijfer zijn: - Tentamen: 85% - Referaat:15% De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: AMC

208



GE302A.

GE302A Medische Microbiologie; Bacteriologie, Virologie en Parasitologie Vakcode

GE302A

Studielast

10

Ingangseis

SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T (pag. 260) (8 EC) en

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr A. Bart, dr M.G.H.M. Beld, dr. A. van der Ende, dr T. van Gool, mw. dr Y.

SI215 Immunologie TP (pag. 262) (6 EC) behaald.

Pannekoek, dr. H. Zaaier, dr. S.A.J. Zaat (coördinator) Inlichtingen

dr. S.A.J. Zaat telefoon: +31 20 5664863 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Medische Microbiologie; Bacteriologie, Virologie en Parasitologie (GE302A): Theorie Kennis van de verschillende soorten infectieziekten en enkele karakteristieke verwekkers, traditionele en moderne diagnostiek, mechanismen van pathogenese van microbiële infecties, interactie met de gastheer, afweermechanismen van de gastheer, de wijze van infectie en transmissie, en mogelijkheden tot preventie.

Inhoud

Colleges Bacteriologie: ■ ■

■ ■ ■

■ ■

Moleculaire epidemiologie van infectieziekten Antimicrobiële middelen Virulentiefactoren betrokken bij kolonisatie Afweermechanismen op het lichaamsoppervlak Afweermechanismen van weefsels en bloed, en vaccins Mechanismen van virulentie: exotoxines Regulatie van de expressie van virulentiegenen

209


Praktijk De student moet de behandelde onderzoeksmethoden en begrippen uit de medische microbiologie en epidemiologie kunnen toepassen. Hieronder vallen: Basistechnieken: werken en omgaan met pathogene micro-organismen, microscopie; Analyse technieken; moleculair biologisch, immunochemisch, histochemisch, biochemisch



Practicum Bacteriologie: ■

■ ■ ■

■ ■

Klassieke en moderne diagnostiek van bacteriële infecties Resistentie tegen antimicrobiële middelen Klonale analyse van bacteriën Samenstelling van buitenmembraaneiwitten Buitenmembraaneiwitten, beschermende antistoffen, en vaccinontwikkeling Bacteriële hechting en toxinewerking - Regulatie expressie virulentie

Colleges Virologie: ■ ■

■ ■ ■

Inleiding in de animale virologie Virale oncogenese Retrovirussen Cytomegalovirus en Epstein-Barr virus Herpes Simplex Virus en Varicella Zoster Virus

Practicum Virologie: ■

■

■ ■

■ ■

■

Virus-geïnduceerd cytopathologisch effect (cpe) en de remming door antivirale middelen Diagnosticeren van een diarrhee-virus, Humaan Rotavirus, d.m.v. extractie van het gesegmenteerde dubbelstrengs-RNA genoom uit faeces, gevolgd door gelelectroforese Isolatie van Adenovirus-DNA: Vergelijking van twee lysis condities Gaat de inductie van onmiddellijk vroege genen van CMV gepaard met apoptose of juist niet? Het aantonen van EBV DNA in wangepitheelcellen Polymerase Chain Reaction (PCR); haar kracht & haar “zwakte”: detectie van Adenovirus DNA op het nivo van enkele moleculen in een vijandige omgeving Polymerase Chain Reaction: het gebruik van Uracil-N-glycosylase in de PCR Colleges

Parasitologie: ■ ■

■ ■ ■

Inleiding parasitologie en parasitisme Epidemiologie Pathogenese Hygiënisme en economische betekenis Diagnostiek en bestrijding van medisch belangrijke dierlijke parasieten.

Practicum Parasitologie: ■

Identificeren van de meest voorkomende medisch belangrijke parasieten: morfologische diagnostiek

210



■

■

Het volgen van een ontwikkelingscyclus (bijvoorbeeld coccidiën, mijnwormen) het begrip prepatentie Bestudering van pathogeniteit van parasieten

Aanmelden


Verplichte werkcolleges en practicum. In de werk/hoorcolleges wordt de leerstof behandeld en wordt getoetst door middel van opdrachten. Er wordt gebruik gemaakt van Powerpoint en schoolbord/flap-over. Hoewel van enkele onderwerpen syllabi worden uitgereikt, wordt van de studenten verwacht dat zij zelf dictaat maken. Er is gelegenheid tot het stellen van vragen. Ieder practicumonderdeel wordt voorafgegaan door een korte inleiding. Aan de hand van deze inleiding en de practicumhandleiding worden in groepjes of zelfstandig de handelingen uitgevoerd waarbij assistentie aanwezig is. Wanneer het practicumonderdeel het karakter heeft van een proef wordt verwacht, dat de gegevens worden genoteerd en weergegeven in de vorm van tabellen en grafieken. Aan het eind van een dergelijk onderdeel worden de resultaten groepsgewijs besproken. Werkcollege

30 slu

Practicum

130 slu

Literatuurstudie

32 slu

Eigen project

48 slu

Extra studietijd

40 slu

Totaal

280 slu Opleidingen Biologie

Onderwijstijden


Laboratoriumjas Aantal deelnemers

Minimaal 18 en maximaal 24 studenten Toetsvorm

De op college behandelde stof wordt getentamineerd samen met de theoretische achtergrondkennis opgedaan tijdens het practicum met behulp van essayvragen. Aanwezigheid bij werk/hoorcolleges en practica is verplicht. De kennis wordt getoetst tijdens het tentamen (75% van eindcijfer) en door middel van het eigen project (25% van eindcijfer).

211



De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: AMC (exacte plaats wordt door coördinator bekend gemaakt)

212



GE30 A.

GE303A Anatomie en Ontwikkelingsbiologie Vakcode

GE303A

Studielast

10

Ingangseis

n.v.t.

Periode(n)

Semester 1 (periode 2: 23 oktober 2006 t/m 1 december 2006)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr M.J.B. van den Hoff, drs K.H. de Jong (coördinator), prof. dr A.F.M. Moorman, dr. R.J. Oostra

Inlichtingen

drs K.H. de Jong telefoon: +31 20 5664920 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Aan het einde van de cursus Anatomie en Ontwikkelingsbiologie (GE303a) heeft de student kennis van en inzicht in: ■

■

de topografische anatomie van borst-, buik- en bekkenorganen van de mens en de ontwikkeling van deze organen; de moleculair-biologische achtergronden van de ontwikkeling van hart en vaten, alsmede de consequenties hiervan voor de morfogenese, met aandacht voor de hieruit te verklaren aangeboren afwijkingen.

Inhoud

Aanmelden

Via studieweb voor 10 september 2006 Onderwijsvorm

Hoorcolleges

100 slu

Practicum/ werkcollege

140 slu

213


Topografische anatomie en embryologie van de organen van borst, buik en bekken van de mens (hoorcollege, werkcollege en practicum); basisprocessen van de ontwikkelingsbiologie bestudeerd aan de morfogenese van het hart en de grote vaten, alsmede de teratologie hiervan (hoorcollege, werkcollege en practicum); met de kennis van bovenstaande elementen: het schrijven van een onderzoeksvoorstel voor een onderzoek op het gebied van hartontwikkeling. Tijdens deze module zal gewerkt worden met kippenembryonen.



Presentatieopdracht

40 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl. Studiemateriaal

Aanbevolen: ■ ■

■

■

Syllabus ( ca. € 10,-) H. Leonardt, Sesam atlas van de Anatomie, deel 2 (Inwendige organen), 16de druk 2000 of recenter, Intro, Baarn (ca. € 31,-); W. Kahle, Sesam atlas van de Anatomie, deel 3 (Zenuwstelsel), 16de druk 2001, of recenter, Intro, Baarn (ca. € 31,-) of; Frank H. Netter, atlas of human anatomy, Icon Learning Systems, (ca.€ 80); K.L. Moore, Essential clinical anatomy, 2e ed. -

Aantal deelnemers

Maximaal 30 studenten Toetsvorm

Presentatieopdracht (15%) Toets (85%) De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Voor de practica dient men in het bezit te zijn van een snijset en een witte jas. Locatie: Afdeling Anatomie en Embryologie, AMC, L2-noord

214



GE304A.

GE304A Medische Biochemie Vakcode

GE304A

Studielast

10

Ingangseis

gevolgd SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T (pag. 260) (8 EC) en SI217 Moleculaire Biologie en Biochemie P (pag. 264) (6 EC)

Periode(n)

Semester 1 (periode 3: 4 december 2006 t/m 2 februari 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. F. Hochstenbach (coördinator)

(en stafleden van de medische research

afdelingen van het AMC) Inlichtingen

dr. F. Hochstenbach telefoon: +31 20 5665137 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Medische Biochemie (GE304A): ■

■

■

Inhoud

Gedurende de eerste week worden door middel van hoorcolleges en werkgroepen de biochemische achtergronden van metabole ziekten ingeleid. Zodoende wordt een relatie gelegd tussen biochemische afwijkingen en de klinische manifestaties van Leverziekten, Genetische metabole ziekten, Lysosomale stapelingsziekten, Peroxisomale ziekten en Hart- en vaatziekten. Vervolgens wordt in groepen van 2-4 studenten, gedurende 3 weken praktisch biochemisch werk uitgevoerd op de medische researchlaboratoria van de afdelingen Medische Biochemie, Vasculaire Geneeskunde, Genetische Metabole Ziekten en het Levercentrum. Daarnaast vinden korte theoretische en practische introducties plaats van biomedische toepassingen van genomics, proteomics, metabolomics aan de hand van korte case studies.

215


Biochemische achtergronden van een aantal belangrijke humane ziekten, met als gemeenschappelijke achtergrond de verstoring van metabole processen op cellulair, orgaan en/of systemisch niveau. Kennisname en praktisch toepassen van moderne methoden van biochemisch onderzoek in medische researchlaboratoria, waarbij moleculair-biologische technieken en kennis van het humane genoom een grote rol spelen (practische bioinformatica, genomics, proteomics, metabolomics). Het leren integreren en toepassen van de opgedane kennis middels het uitdiepen van een breed medisch onderzoeksvraagstuk.



Tenslotte wordt een brede biomedische onderzoekscasus uitgediept voor de bestudering van een medische/klinische afwijking in groepen van 2-4 studenten. In deze casus komen, naast de biochemie, ook biomedische onderzoeksmethoden, klinische data en ethische/maatschappelijke randvoorwaarden voor onderzoek in een academisch medisch centrum aan de orde. Gedurende de laatste week wordt deze casus schriftelijk uitgewerkt en vervolgens gepresenteerd aan alle medestudenten en betrokken stafleden en verdedigd in de vorm van een paneldiscussie tijdens een afsluitend minisymposium. Aanmelden

Via studieweb voor 22 oktober 2006 Onderwijsvorm

Hoorcollege

40 slu

Practicum/werkcollege

160 slu

Opdracht

80 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Reader met introducties van de studiestof en beschrijving van de experimenten zal op de eerste dag van de module worden verstrekt (€ 10,-). Powerpoint-presentaties zijn beschikbaar via Blackboard Naslagwerk: Molecular Biology of the Cell (Alberts et al; reeds aangeschaft voor module SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T (pag. 260) (8 EC)) Aantal deelnemers

Maximaal 24 studenten. Toetsvorm

Theorie: 60% Praktijk: 40% De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: Medische research laboratoria van het Academisch Medisch Centrum, Meibergdreef 15, 1105 AZ te Amsterdam. Exacte locaties van de verschillende medische researchlaboratoria worden circa 2 weken vooraf door de coördinator bekend gemaakt.

216



IB202.

IB202 Evolutionaire Genetica Vakcode

IB202

Studielast

10

Periode(n)

Semester 1 (periode 1: 4 september t/m 20 oktober 2006)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.A.J. Breeuwer, prof.dr. S.B.J. Menken, dr. P. Roessingh (coördinator), prof.dr. P.H. van Tienderen

Inlichtingen

dr. P. Roessingh telefoon: +31 20 5257732 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel

Inhoud

De cursus geeft een inleiding in de basisprincipes van populatiegenetica en kwantitatieve genetica, met nadruk op processen van populatiedifferentiatie en soortvorming, met andere woorden, van evolutionaire processen op en onder het soortniveau. Oorzaken van populatie- en soortverschillen in mate van genetische variatie en in ruimtelijke verdeling van deze variatie worden besproken. Diverse typen kenmerken waarmee deze processen bestudeerd kunnen worden passeren de revue en hun bruikbaarheid en gevoeligheid worden geëvalueerd. Verschillende soortvormingsprocessen zullen worden behandeld, waarbij facetten als ecotypische differentiatie, polyploidisatie en variatie en dynamiek van voortplantingssystemen (a-sexualiteit, sexualiteit, kruis- en zelfbevruchting e.d.) worden besproken.

217


Definiëren van relevante populatie-genetische en kwantitatief-genetische begrippen; Beschrijven van stochastische en deterministische processen in natuurlijke populaties; Beschrijven en verklaren van verschillen in de hoeveelheid en de organisatie van variatie in natuurlijke populaties; Voorspellen van populatiestructuur aan de hand van kennis omtrent historie, voortplantingssystemen en interactie tussen de diverse stochastische en deterministische processen. Uitvoeren en interpreteren van biochemisch/genetische en DNA analyses op steekproeven uit natuurlijke populaties; Beschrijven van diverse modellen van soortvormingsprocessen in relatie tot de biologie van de organismen, inclusief facetten van hybridisatie, polyploidie, reproductie- en verspreidingsbiologie; Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoek, presenteren en evalueren van resultaten zowel mondeling als schriftelijk; Kritisch lezen, samenvatten en bediscussiëren van wetenschappelijke artikelen.



Enige facetten van plant-dier-relaties en hun evolutie worden besproken. Lopend onderzoek van eigen promovendi wordt belicht. Genetische variatiewordt praktisch onderzocht m.b.v. DNA-analyses in endosymbionte bacteriën, bloemplanten, insecten en mijten, vooral ten behoeve van het bepalen van verwantschappen, populatiestructuur en hybridisatiepatronen. Andere praktische oefeningen betreffen: fenotypische plasticiteit, ecotypische differentiatie en polyploïde complexen en soortvorming via hybridisatie. Theoretisch wordt inzicht in populatiegenetische processen en fylogegografie onderbouwd via computersimulaties. Aanmelden


Na een theoretische introductie volgen de diverse praktische onderdelen. In het populatiegenetische en moleculair genetische deel stellen studenten zelf een proefopzet op, voeren deze uit en maken hierover een verslag. Parallel aan het practicum wordt de theorie in hoorcollege en werkcollege uitgebouwd, totdat de studenten in staat zijn zelf wetenschappelijke artikelen te bestuderen en becommentariëren. Simulatiepractica zorgen verder voor een inzichtelijke toetsing. Hoorcolleges

96 slu

Werkcolleges

18 slu

Practica

75 slu

Verslagen + praatje

35 slu

COO

16 slu

Extra studietijd

40 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Verplicht: Futuyama, D.J. (2005) Evolution, Sinauer, Sunderland, ISBN 0-087893-187-2 Er is geen collegedictaat; practicumhandleiding en ondersteunende software worden tijdens de cursus verkocht (ca. 8 euro). Website cursus: zie http://blackboard.ic.uva.nl Toetsvorm

Schriftelijk tentamen (75%), verslagen, labjournaal en inzet (25%). De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer gelijk is aan of hoger dan 6,0 en de deelcijfers voor tentamen en verslagen niet lager zijn dan 5,0.

218



IB201.

IB201 Systematiek en Biogeografie Vakcode

IB201

Studielast

10

Ingangseis

IB202 gevolgd.

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. H. de Jong, dr. S. Lötters, dr. R. Sluys (coördinator), prof. dr. M. Veith

Inlichtingen

dr. R. Sluys telefoon: +31 20 5255445 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Systematiek en Biogeografie (IB201) zijn: ■

■

■ ■

■ ■

■

■ ■

Inhoud

Evolutie leidt tot een hiërarchisch geordende verscheidenheid (biodiversiteit). Systematiek ontrafelt en organiseert deze verscheidenheid in het licht van haar evolutie. Biogeografie beschrijft en verklaart de verspreiding van de organismen over de aarde. Het doel is inzicht te krijgen in de evolutionaire geschiedenis van taxa en in de patronen van diversiteit en verspreiding. De module gaat in op de grondslagen van systematiek en biogeografie. Fylogenetische onderwerpen: reconstructie van de fylogenie; ongewortelde en gewortelde bomen; gebruik van evolutiemodellen; maximum parsimony, maximum likelihood, minimum evolution, Bayesian methode; vooronderstellingen en bezwaren van de verschillende algorithmen; gebruik van diverse fylogenetische programma’s. Biogeografische onderwer-

219


■

Kennis en inzicht verkrijgen in principes en achtergronden van fylogenetische systematiek; Praktische toepassing van de fylogenetische systematiek; Analyse van moleculaire en morfologische datasets Gebruik van computerprogramma’s en verschillende algorithmen voor het construeren van fylogenetische bomen; Kennis van taxonomische principes, achtergronden, en werkwijzen; Kennis van patronen en processen van geografische verspreiding van organismen als resultaat van recente en historische omstandigheden; Leren gebruiken van computerprogramma’s voor het analyseren van biogeografische gegevens; Kritisch lezen, becommentariëren en samenvatten van wetenschappelijke artikelen; Inzicht in belang van museale collecties voor wetenschap en maatschappij; Schriftelijk presenteren van eigen wetenschappelijk onderzoek.



pen: algemene aspecten van de verspreiding van soorten; arealen, barrières, biogeografische rijken; biogeografische modellen; eilandbiogeografie; relatie tussen fylogenetische systematiek en biogeografie, gebiedscladistiek, fylogeografie, coalescence theorie. Theoretische en wetenschapsfilosofische achtergronden: soortbegrippen; hypothetisch-deductive methode. Aanmelden


Het onderwijs wordt gegeven in de vorm van hoorcolleges en werkcolleges, afgewisseld met practica. Bij de colleges wordt als basisliteratuur gebruikt: Futuyma, D. J. 2005, Evolution. Een deel van de practica wordt gedaan in de vorm van een mini-onderwerp op een van de afdelingen van IBED, het Zoölogisch Museum Amsterdam of Naturalis, Leiden. Over dit mini-onderwerp wordt een kort verslag geschreven. Bij de groepspractica en bij het mini-onderwerp wordt gebruik gemaakt van gespecialiseerde computerprogramma's. Hoorcolleges

108 slu

Practica

36 slu

Mini-onderwerp + praatje 46 slu Werkcolleges

10.5 slu

Totaal

200 slu

Onderwijstijden


Het boek kan besteld worden bij Congo. Kosten

Er wordt wat aanvullend studiemateriaal verstrekt; hieraan zijn enige kosten verbonden. Toetsvorm

Deeltentamen I: 10 %; verslag mini-onderwerp: 30%; practica: 16%; deeltentamen II: 44 % De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Toetsdata

Deeltentamen I: 10 november; deeltentamen II: 17 november Bijzonderheden

Locatie: Zal tegelijk met het rooster bekend gemaakt worden.

220



IB209.

IB209 Aquatische en Terrestrische Ecologie (Ecologie II) Vakcode

IB209

Studielast

20

Ingangseis

006A Ecologie I (10 EC) gevolgd

Periode(n)

Semester 2 (periode 5 en 6: 26 maart t/m 6 juli 2007, deze cursus beslaat 2

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof. dr. W. Admiraal, dr. L.H. Cammeraat, dr. J.F. Duivenvoorden

periodes)

(coördinator), dr. B. van Geel, mw. dr. A.M. Kooijman, dr. M.H.S. Kraak, dr.ir. E.E. van Loon, dr. A.C. Seijmonsbergen, mw. dr. S.A. Ulenberg

(en


dr. J.F. Duivenvoorden telefoon: +31 20 5257812 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel ■ ■

■

■

Het verwerven van kennis over het functioneren van geo-ecologische systemen Het leren toepassen van Geografische Informatie Systemen en Remote Sensing in een landschapsecologische context Het verwerven van inzicht in het functioneren van ecosystemen gebaseerd op interacties tussen biotische en abiotische processen op verschillende schaalniveaus Zelfstandig uitvoeren van veldonderzoek en toetsen van gestelde hypothesen

Inhoud

■

■ ■ ■

■ ■

■

■

■

De abiotische omgeving: substraat en landschapsprocessen Basis concepten uit de landschapsecologie Vegetatiepatronen De wederzijdse relatie tussen biotische factoren en de abiotische omgeving Theorie en toepassing van GIS en remote-sensing Abiotische processen: licht, warmte, diffusie, nutrientcycli, koolstofkringloop, redox, zuurstof, stoichiometry Physiologische karateristieken van meren, rivieren en bodemtypes; habitats • Ecosysteemprocessen: primaire productie, secundaire productie, decompositie Biotsche interacties: herbivorie, predatie. Interacties: de relatie tussen (water)bodem en (water)bodemfauna de relatie tussen bodem en vegetatie de overgang van land naar water; het litoraal ■ ■

■

221


Onderwerpen college



aanpassingen aan leven in (stromend) water Dynamiek van levensgemeenschappen: vegetatiesuccessie, seizoensdynamiek, successiemodellen, eutrofiering, feedback mechanismen Determinatie van phytoplankton, zooplankton, macrofauna, macrophyten, flora ■

■

■

Onderwerpen practicum • • • • • • ■

■ ■ ■

■ ■

Digitaliseren van kaarten Werken met geografische informatie systemen Werken met (ruimtelijke) databasis Ruimtelijke analyse van vegetatie en landschapspatronen Determinatie van phytoplankton, zooplankton, macrofauna, macrophyten, flora Voor en na de veldwerkfase wordt ruime aandacht besteedt aan data-analyse met accent op onderzoeksaanpak en de verwerking van multivariate data

Onderwerp veldwerk Eifel In aansluiting op de eerstejaars cursus Ecologie, wordt aandacht besteed aan de bodemontwikkeling in verschillende landschapstypen en de betekenis hiervan voor het voorkomen van plantengemeenschappen. Tevens komt de ontwikkeling van vegetatiestructuur in relatie tot omgeving aan de orde alsmede mechanismen van vegetatiesuccessie en successiemodellen. Verder wordt er geoefend in het waarnemen van ruimtelijke patronen en successiestadia in vegetatie, in relatie tot biotische en abiotische factoren. De karakteristieke levensgemeenschappen van rivieren worden bestudeerd, onder meer in relatie tot stroomsnelheid en eutrofiegraad, waarbij het ‘river continuum concept’ centraal staat. Tenslotte wordt de relatie tussen insecten en de bodem onderzocht. Aanmelden

Via studieweb voor 11 februari 2007 Onderwijsvorm

De cursus bestaat uit hoor- en werkcolleges, practica, en een veldperiode waarin veldonderzoekstechnieken en zelfstandig onderzoek aan de orde zijn. Tijdens veldwerk en practica wordt individueel of in groepen gewerkt. Het veldwerk in Eifel wordt afgesloten met een veldonderzoek van een week dat elke student zelfstandig (of samen met een medestudent) verricht. Over het veldonderzoek wordt aan het eind van de cursus op individuele basis schriftelijk en mondeling gerapporteerd. Colleges (waaronder werkcolleges)

210 slu

Practica

84 slu

Veldtrainingen

168 slu

Uitwerking en Rapportage

98 slu

Totaal

560 slu

222



Onderwijstijden


College-aantekeningen en klappermateriaal, loupe en notitieboekje, veldwerkkleding. De student dient zelf voor het vervoer van en naar de Eifel te zorgen, en over vervoer tijdens de veldtraining in Eifel te beschikken (bijvoorbeeld een fiets met versnellingen en vooral goede remmen). Voorts wordt getentamineerd over stof uit de volgende boeken: Walter K. Dodds. Freshwater Ecology - Concepts and Environmental applications. 2002 Academic Press ISBN 0-12-219135-8. Prijs: € 82,50 De kosten voor de veldtraining en excursies voor de UvA-cursist worden nader bekend gemaakt Toetsvorm

Voor de afreis naar de Eifel wordt er een schriftelijk tentamen afgenomen over de tot dan toe behandelde stof. Daarnaast wordt de schriftelijke en mondelinge rapportage van het onderzoek aan het eind van de module met een enkel cijfer beoordeeld. Tentamen en rapportage gelden als deelcijfers en dragen in gelijke mate bij tot het eindcijfer. De student is geslaagd voor de cursus wanneer men aan de verplichtingen ten aanzien van werkcolleges, practica, en veldtraining heeft voldaan, deelcijfers heeft behaald die niet lager zijn dan 5,0 en een eindcijfer heeft dat 6,0 of hoger is. Bijzonderheden

Locatie: Anna's Hoeve en Roeterseilandcomplex (REC), veldwerk in de Eifel Opleidingen Biologie

223



IB210.

IB210 Evolutie en Gedrag Vakcode

IB210

Studielast

10

Periode(n)

Semester 2 (periode 4: voor biologen 2e studiejaar en voor psychobiologen 3e studiejaar, 5 februari 2007 t/m 23 maart 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. C.J.M. Egas (coördinator), prof. dr. M.W. Sabelis

Inlichtingen

dr. C.J.M. Egas

(en gastdocenten)


Bachelor Biologie Bachelor Psychobiologie

Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Evolutie en Gedrag (IB210): Brede inleiding in de evolutionaire ecologie, gericht op de evolutionaire benadering van de bestudering van gedrag. Hierbij zal deels aandacht worden besteed aan dieren in het algemeen en deels aan mensen specifiek. Specifieke leerdoelen: Het zich eigen maken van kennis van algemene evolutionair-ecologische theorieën (optimalisatie, speltheorie, adaptieve dynamica); het verwerven van inzicht in evolutionairecologische processen voorzover deze zich afspelen op het niveau van de populatie en levensgemeenschap; het leren vertalen van deze theorieën in praktisch uitvoerbare experimenten waarmee hypothesen kunnen worden getoetst. Het schrijven van een individueel verslag over het uitgevoerde praktisch werk en de bestudeerde literatuur; het houden van voordrachten over een wetenschappelijk artikel en over het uitgevoerde praktische werk. Inhoud

Onderwerpen college: Evolutie, gedrag, en evolutie van gedrag; optimalisatietheorie; speltheorie en evolutie; adaptieve dynamica; vormen van natuurlijke selectie en de hiërarchie van selectie-niveaus (gen, individu, groep, soort, oecosysteem); verwantschapsselectie; seksuele selectie; partnerkeuze; ouder-kind conflicten; evolutionair stabiele strategieën; levensgeschiedenisstrategieën; sexe-allocatiestrategieën; foerageerstrategieën; evolutie van paringssystemen; evolutie van seksuele voortplanting; evolutie van altruïsme en coöperatief gedrag via directe en indirecte reciprociteit; evolutie van het sociaal zijn bij insecten, evolutie van communicatie; coëvolutionair stabiele strategieën; culturele evolutie; coëvolutie van genen en cultuur.

224



Onderwerpen practica: Onderzoek aan (de genetische basis van) paringsgedrag in Nasonia sluipwespen en stekelbaarsjes (onder voorbehoud). Speltheoretisch en experimenteel onderzoek aan sociaal gedrag bij mensen. Deze onderwerpen worden afgesloten met presentaties (eindresultaten). Literatuur-discussie en presentatie. Aanmelden

Via studieweb voor 24 december 2006, Let op: Biologen melden zich op Studieweb aan voor IB210B en Psychobiologen voor IB210P. Onderwijsvorm

Hoorcolleges

120 slu

Werkcolleges

20 slu

Practica

120 slu

Schrijven verslag

20 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Aantal deelnemers

Voor Biologen verplicht. max. 30 Psychobiologen Toetsvorm

De collegestof wordt tegen het eind van de 7e week schriftelijk getoetst door middel van open tentamenvragen. De studenten worden wat het praktisch werk betreft beoordeeld naar aanwezigheid op de practica, inzet en accuratesse bij de uitvoering van het werk, alsmede op het verslag, en de mondelinge voordrachten. Weging: tentamen 65%; praktisch werk 35%. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer gelijk is aan of hoger is dan een 6.0 en de deelcijfers niet lager zijn dan een 5.0. Bijzonderheden

Locatie: Kruislaan 320 (Anna’s Hoeve)

225


Er zijn twee studieboeken, een met meer nadruk op gedrag van dieren, de ander met meer nadruk op gedrag van mensen. Een van de twee boeken volstaat. J. R. Krebs & N. B. Davies, An introduction to behavioural ecology, 3rd edition, 1993, Blackwell Scientific Publications, Oxford (ca. € 40,-) J. Cartwright, Evolution and human behaviour, 1st edition, 2000, Palgrave Macmillan Ltd, (ca. € 35,-)



IB301.

IB301 Paleo-ecologie Vakcode

IB301

Studielast

10

Ingangseis

IB209 Aquatische en Terrestrische Ecologie (Ecologie II) (pag. 221) (20 EC) gevolgd

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.F. Duivenvoorden, dr. B. van Geel (coördinator), prof.dr. H. Hooghiemstra, prof.dr. P.H. van Tienderen

Inlichtingen

dr. B. van Geel telefoon: +31 20 5257664 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel

Het leerdoel van de module Paleo-ecologie (IB301) is het verkrijgen van inzicht in de werkwijze en de toepasbaarheid van de palynologie/paleo-ecologie, waarmee de basis wordt gelegd voor het opzetten en uitvoeren van onderzoek op het gebied van de paleoecologie en paleo-klimatologie, 'climate change' studies, land-zee correlaties en vergelijkende studies met output van computermodellen. Tijdens het veldwerk ligt het accent op het verkrijgen van inzicht in de ontwikkeling van vegetatie, bodem en landschap in de periode tijdens en na de laatste IJstijd, waarbij ook de rol van de mens aan de orde komt. De bruikbaarheid en waarde van paleo-archieven in de vorm van sedimenten in meren en moerassen wordt duidelijk door het gezamenlijk verrichten van een paleo-ecologisch onderzoek. Inhoud

De grotendeels op palynologisch/geologisch onderzoek van terresterische en mariene sedimenten gebaseerde reconstructies van de geschiedenis van vegetatie en klimaat worden behandeld. Dit betreft 'global climatic change' tijdens Laat-Tertiair en Kwartair in Europa, tropisch Afrika en Zuid-Amerika. Daarbij komen aspekten van de paleoecologie, de biogeografie en de paleoklimatologie op geïntegreerde wijze aan de orde. De toepasbaarheid van ‘Ancient DNA’ studies wordt behandeld. Verbanden tussen ontwikkelingen op de verschillende continenten en in verschillend klimaatgordels worden gelegd, waarbij ondermeer de volgende aspekten worden behandeld: land-zee correlatie van klimaatrecords; astronomische sturing van klimaatveranderingen; veranderende zonne-activiteit als een van de klimaatbepalende factoren; klimaatregistratie in mariene sedimenten en polaire ijskappen; invloed van klimaat op migratieroutes; menselijke invloed op vegetatie en landschap. De cursus leidt tot de volgende vaardigheden:

226



■

■

■

■

■

■

kunnen identificeren en interpreteren van de meest voorkomende pollentypen van het Laatglaciaal en het Holoceen in NW-Europa. Het interpreteren van fossiele resten van andere informatiedragende microfossielen, zoals sporen van schimmels, algen en cyanobacteriën en het ontwikkelen van inzicht in relaties tussen pollenregen, vegetatie en klimaat. gebruiken van andere proxies (ijskernen, Milankovitch variabelen, elementanalyse, sedimentanalyse, enz.) in samenhang met pollendiagrammen ter reconstructie van paleomilieus. inzicht in relaties tussen klimaatveranderingen en ontwikkeling van prehistorische culturen. inzicht in samenhang tussen de geschiedenis van vegetatie en klimaat en biogeografische aspecten (relatie biodiversiteit en global change over langere tijdschalen). evalueren van ontwikkelingen betreffende recente en toekomstige veranderingen van het klimaat. Inzicht ontwikkelen in de rol van de diverse klimaatsturende factoren, zoals 'orbital forcing', versterkt broeikaseffect, fluctuerende zonneactiviteit met versterkingsmechanismen, en de rol van de thermohaliene oceaancirculatie. numerieke verwerking van paleogegevens, waaronder zonering via clusteranalyse en tijdserie-analyse.

Aanmelden


Colleges, 35 uur

105 slu

Practicum palynologie en paleo-ecologie, 24 uur

32 slu

Practicum paleo-gegevensverwerking (inclusief inleidingen), 20 slu 15 uur Veldcursus Twente (Excursies, praktisch werk, presentaties), 84 slu 63 uur Zelfwerkzaamheid (literatuurstudie, schriftelijk en mondeling 39 slu verslag), 39 uur Totaal

280 slu

227


De zelfwerkzaamheid van de cursisten zal worden gestimuleerd door het verschaffen van te bestuderen literatuur. Van de cursisten wordt verwacht dat ze individueel komen tot een korte presentatie over het onderwerp dat hen is toebedeeld. De onderwerpen worden jaarlijks vastgesteld. De excursies (veldcursus) worden dagelijks afgesloten met presentaties door cursisten, meestal aan de hand van een poster. De onderwerpen van de excursies worden vervolgens door studenten en staf gezamenlijk bediscussieerd.



De mondelinge en schriftelijke presentaties door cursisten worden naar keuze van de student in het Engels dan wel in het Nederlands gehouden, respectievelijk geschreven. In het geval er niet-nederlandstalige deelnemers zijn is de voertaal Engels. Onderwijstijden


Klappers tegen kostprijs, ca.€ 10,-. Voor de practica zijn tekenmateriaal en papier nodig. De cursist dient daar zelf voor te zorgen. De kosten van de veldcursus zullen in totaal maximaal € 107,- bedragen. Aantal deelnemers

maximaal 25 Toetsvorm

De cursus wordt afgerond met een schriftelijk tentamen waarop in principe alle tijdens de cursus opgedane kennis kan worden getoetst. Men mag deelnemen aan het tentamen wanneer men aan de practica en de veldcursus heeft deelgenomen en ook de mondelinge presentatie heeft gegeven. De weegfactoren voor de deelcijfers zijn: Practicum, veldcursus en mondelinge presentatie: 20% Tentamen: 80% De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en de deelcijfers niet lager zijn dan 5,0. Bijzonderheden

Locatie: Anna's Hoeve en een kampeerboerderij in Twente. Let op: deelname aan de veldcursus is gedurende de gehele periode (incl. het weekend) verplicht.

228



IB303.

IB303 Natuurbehoud en Biodiversiteit Vakcode

IB303

Studielast

10

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.A.J. Breeuwer, dr. M.H.S. Kraak, dr. J.C.M. den Nijs (coördinator), dr. J.G.B. Oostermeijer, mw. dr. A.C. Pierrot-Bults, dr. H. Rijksen, dr. R. Sluys, prof.dr. P.H. van Tienderen, prof. dr. J.H.D. Wolf

Inlichtingen

dr. J.C.M. den Nijs telefoon: +31 20 5257660 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel

Het leerdoel van het vak Natuurbehoud en Biodiversiteit (IB303) is: ■

■ ■

■

■

Inhoud

Speciale aandacht wordt besteed aan: ■

■

■

herkennen en analyseren van patronen van biodiversiteit met hun evolutionaire én historische (landbouw/cultuur) achtergronden analyseren van de (biologische) achtergronden van de aantasting van ecosystemen en het achteruitgaan en uitsterven van soorten (cultuur/ontginning/landbouw/visserij); de rol van ecologisch, demografisch en genetisch procesonderzoek en monitoring; de noodzaak van het behoud van soorten en ecosystemen en van een natuurgerichte milieukwaliteit (het belang van natuurbehoud voor evolutie);

229


■

Kennis verwerven over de verspreiding van biodiversiteit en over de aard en de omvang van de bedreiging van de natuur en biodiversiteit, zowel op het land als in het water, en op nationale én wereldschaal. Inzicht verwerven in de uiteenlopende opvattingen over het begrip natuur Inzicht verwerven in de ecologische achtergronden en biologische processen van uitsterven. Bewustwording van de ethische en sociaal-economische verwevenheid van de natuurbehoudsproblematiek. Verkrijgen van inzicht in juridische basisprincipes met betrekking tot natuurbescherming (nationaal en internationaal). Het leren zien en leren ontwikkelen van mogelijkheden om, met behulp van wetenschappelijke kennis, te komen tot een duurzaam behoud van biodiversiteit, hierbij inbegrepen aspecten van restoration biology.



■

■

■

■

■

■

■

de mogelijkheden tot herstel en behoud van terrestrische zowel als aquatische habitats en hun biota; de verwevenheid van sociaal-economische problemen met natuurbehoud, alsmede van wijsgerige en ethische motieven voor natuurbehoud; de voornaamste juridische instrumenten (nationale en internationale, ook die m.b.t. de zee) die het natuurbehoud en het streven naar "duurzame ontwikkeling" ter beschikking staan; de instelling van natuurreservaten, nationaal en internationaal, structuur en situering (ecologische infrastructuur); nationale en internationale ontwikkelingen in het beleid (Habitatrichtlijn-EU, EECONET-European Ecological Network, Convention on Biological Diversity, Law of the Sea, etc.). zelfstandig leren omgaan met aspecten van de natuurbeschermingsproblematiek, o.a. door uitwerken van een keuzeonderwerp tot presentatie als mini-college. kennismaking met praktijk van natuurbescherming en natuurontwikkeling in Nederland door middel van excursies en discussies met terreinbeheerders.

Aanmelden


Hoorcolleges

150 slu

Werkcolleges

30 slu

Excursies

24 slu

Voorbereiding referaten

64 slu

Symposium

12 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Hambler, C. Conservation. Studies in Biology. Cambridge University Press 2004. ISBN 0521000386 (ca. €35,-) Verdiepingsliteratuur, aangeboden via Blackboard. Aantal deelnemers

n.v.t.

230



Toetsvorm

Weegfactoren zijn: tentamen over stof uit college, boek en verdiepingsaanbod, inclusief excursies 70%; referaat 30%. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: Wordt voor aanvang van de cursus bekend gemaakt.


231



IB306.

IB306 Epidemiologie Vakcode

IB306

Studielast

10

Ingangseis

n.v.t.

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. M.C. Boerlijst (coördinator), dr. N. Dukers, prof. dr. M.W. Sabelis

Inlichtingen

dr. M.C. Boerlijst telefoon: +31 20 5257758 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Leerdoelen van het vak Epidemiologie (IB306) zijn: ■ ■ ■

■ ■ ■

Statistische analyse van epidemiologische gegevens Kennisoverdracht m.b.t. diversiteit van parasieten en infectiecycli Inzicht in veronderstellingen en modelstructuur van epidemiologische modellen Overzicht van mogelijkheden tot preventie en bestrijding van infectieziekten Inzicht in populatiedynamiek en evolutionaire dynamiek van infectieziekten Kritisch lezen van wetenschappelijke literatuur en presentatie in de vorm van voordracht/verslag

Inhoud

Statistische Epidemiologie ■

■ ■ ■

■ ■ ■

■ ■

■

studieopzet (case-control studie, cross-sectionele studie, cohort studie) interactie en confounding epidemiologische maten statistische modellen (logistische regressie, survival analyse) outbreak studies experimental trials and community intervention trials preventie en bestrijding van infectieziekten verspreiding van infectieziekten moleculair-epidemiologische technieken voor traceren van oorsprong van infectieziekten natuurlijke reservoirs en “host-jumps”

Theoretische Epidemiologie Het doel van dit college is om studenten inzicht te geven in de mechanismen die tot epidemieën leiden. Epidemiologische modelvorming van pathogeen/parasiet-gastheer interacties en toetsing van modelvoorspellingen is hiervoor onontbeerlijk. Het gaat daarbij

232



vooral om de vraag hoe eigenschappen van individuen (parasieten en gastheren) populatiedynamische verschijnselen bepalen in spatiëel en temporeel opzicht (epidemische golven), en tevens om de vraag hoe natuurlijke selectie de (genetische) samenstelling van populaties beïnvloedt m.b.t. die eigenschappen van individuen (virulentie, resistentie). Bovendien wordt aandacht besteed aan de betekenis van leeftijdstructuur, contactnetwerk structuur, genetische structuur en verworven immuniteit. De te behandelen onderwerpen zijn: ■

■ ■

■ ■ ■

■ ■ ■

■

■

■ ■ ■

de rol van mathematische modellen in de epidemiologie tijdschaalargumenten voor classificatie van parasieten: micro- en macroparasieten condities voor het uitbreken van een epidemie: microparasieten met directe of indirecte transmissie dynamische modellen van microparasitaire ziekten: SIR-modellen verklaringen voor fluctuatiepatronen bij kinderziekten: limietcycli en chaos dynamische modellen van macroparasitaire ziekten: "Worm Load" modellen homogene vs inhomogene menging: metapopulatiedynamica rol van sexuele structuur, leeftijdsstructuur, genetische heterogeniteit, sociale structuur een Darwiniaanse visie op de Medische Biologie evolutie van virulentie: enkelvoudige infectie, super-infectie, co- infectie, spatiotemporele processen coevolutie tussen parasiet en gastheer: 'Red Queen' hypothese, gen-om-gen hypothese parasieten en de evolutie van sexuele reproductie en sexuele selectie spatiële structuur: epidemische golven binnen gastheer dynamiek, competitieve exclusie en quasi species dynamiek

Aanmelden

Via studieweb voor 10 september 2006 Opleidingen Biologie

Onderwijsvorm

Hoorcolleges

135 slu

Practicum en Opdracht

90 slu

Seminars

15 slu

Extra studietijd

40 slu

Totaal

280 slu

Tijdens de cursus wordt een aantal seminars gegeven door gastsprekers. Deze seminars vormen een illustratie bij de colleges, maar zijn geen tentamenstof. Bijwonen van de seminars is verplicht.

233



Onderwijstijden


Syllabus/reader wordt aan het begin van de cursus tegen kostprijs verstrekt. De volgende boeken worden aanbevolen, maar zijn niet verplicht: ■

■

■

R.M. Anderson & R.M. May (1992; herdruk 1998). Infectious Diseases of Humans: Dynamics and Control. Oxford Science Publications, ca. € 76 M.A. Nowak & R.M. May (2000), Virus dynamics. Oxford University Press, ca. € 48 Dieckmann, U. J.A.J. Metz, M.W. Sabelis & K. Sigmund (2002). The Adaptive Dynamics of Infectious Diseases: In Pursuit of Virulence Management. Cambridge University Press, Cambridge, ca. € 88

Aantal deelnemers


De op college behandelde stof wordt getentamineerd. Practica en seminars zijn verplicht. De opdracht (week 5) wordt geëvalueerd aan de hand van de presentatie. In week 1 moet een presentatie van een onderzoeksvoorstel worden gegeven. De weegfactoren voor de deelcijfers zijn: deelcijfer I:

tentamen

: 40 %

deelcijfer II:

tussentoets

: 20 %

presentatie week 1

: 10 %

opdracht week 4

: 10 %

referaat week 5

: 20 %


Locatie: wordt door coördinator bekend gemaakt

234



IB308.

IB308 Mariene Biologie Vakcode

IB308

Studielast

10

Ingangseis

n.v.t.

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof. dr. J. Huisman (coördinator), dr. K. Johnk, mw. dr. P.M. Visser

Inlichtingen

prof. dr. J. Huisman telefoon: +31 20 5256021 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel

Het leerdoel van het vak Mariene Biologie (IB308) is het verkrijgen van inzicht in de biologische, fysische, en chemische interacties in mariene ecosystemen, op schaalniveau’s van enkele millimeters (turbulentie en de groei van het plankton) tot duizenden kilometers (oceaanstromen en hun rol in het klimaat). Het leren omgaan met informatie vanuit verschillende wetenschappelijke disciplines, zoals biologische, chemische en fysische oceanografie. De cursus is toegankelijk voor studenten van zowel Biologie als Aardwetenschappen. De cursus past goed in een ecologisch opleidingspakket, in combinatie met cursussen zoals IB209 Aquatische en Terrestrische Ecologie (Ecologie II) (pag. 221) (20 EC) en IB311 Microbiële Ecologie (pag. 238) (10 EC). Tevens sluit de cursus goed aan bij een algemeen aardwetenschappelijk pakket en een algemeen biologisch pakket. Een groot deel van de aardoppervlakte (ruim 70%) bestaat uit zeeën en oceanen. Hoe werken deze ecosystemen? Wat zijn de patronen en processen? De cursus begint met een introductie in de geologie, fysica, en chemie van mariene ecosystemen. Daarna duiken we langzaam het voedselweb in, vanaf het kleine fytoplankton via het zooplankton, naar mariene voedselwebben. Voorts wordt aandacht besteed aan de effecten van menselijk handelen op het functioneren van mariene ecosystemen. Colleges over de volgende onderwerpen: ■ ■

■ ■ ■

■

Ontstaan van de oceanen Fysisch-chemische eigenschappen van water Oceaan-circulatie patronen Mariene biogeochemie Fytoplankton, nutriënten en licht Zooplankton

235


Inhoud



■ ■

■ ■

■

Mariene voedselwebben Mariene biogeografie en biodiversiteit Remote sensing van de oceanen Vissen en visserijbiologie De rol van oceanen in de koolstofcyclus en klimaatsveranderingen

Naast de reguliere colleges verzorgd door docenten, wordt iedere student uitgedaagd om op basis van een literatuurstudie over een marien onderwerp naar keuze zelf een college te verzorgen. Er wordt kennisgemaakt met het mariene onderzoek in Nederland, door een dagexcursie naar het Nederlands Instituut voor Onderzoek der Zee (NIOZ) op Texel, en een dagexcursie naar het RijksInstituut voor Visserij Onderzoek (RIVO) in IJmuiden Veldwerk: Het praktisch deel van de cursus bestaat uit 2 weken veldwerk en practica op het Observatoire Oceanologique in Villefranche-sur-Mer, aan de Middellandse Zee (nabij Nice, Zuid Frankrijk). Zie ook: http://www.obs-vlfr.fr Tijdens deze 2 weken wordt speciale aandacht besteed aan het opzetten en uitvoeren van laboratorium experimenten en veldmetingen. Ook komen tijdens het veldwerk verschillende bemonsterings-technieken aan de orde, zoals CTD, plankton bemonstering en analyse, en trawling. Voor diegenen die in het bezit zijn van een duikbrevet is er gelegenheid om te duiken. Uiteraard zullen we uitgebreid aandacht besteden aan de vele mariene organismen die we tijdens het veldwerk tegenkomen. Aanmelden


Het theoretisch deel van de cursus bestaat uit colleges, werkcolleges, en een literatuurstudie. De resultaten van de literatuurstudie worden mondeling gepresenteerd, in de vorm van een college. Het veldwerk is hierboven beschreven. Hoorcolleges

120 slu

Werk & Internet-colleges 40 slu Literatuurstudie en presentatie

40 slu

Practica

20 slu

Veldwerk

60 slu

Totaal

280 slu

236



Onderwijstijden


Nybakken, J.W. en Bertness, M.D. (2005). 'Marine Biology: An Ecological Approach' (6th.edition.) Adison Wesley/Benjamin Cummings, USA. Dit boek is verplicht voor deze cursus (ca. € 75,-) Een deel van de kosten voor het veldwerk in Villefranche-sur-Mer wordt vergoed door de UvA. De hoogte van de eigen bijdrage in de kosten voor reis en verblijf worden nog bekend gemaakt. Aantal deelnemers

max. 30 Toetsvorm

De weegfactoren voor de deelcijfers zijn: deelcijfer I: mondelinge presentatie (25%) en veldwerkverslag (25%) deelcijfer II: afsluitend tentamen (50%) De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: Colleges en werkcolleges worden gehouden op Roeterseiland


237



IB31 .

IB311 Microbiële Ecologie Vakcode

IB311

Studielast

10

Ingangseis

n.v.t.

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.C.P. Matthijs (coördinator), prof. dr. L.J. Stal

Inlichtingen

dr. J.C.P. Matthijs

(en diverse gastdocenten)


Bachelor Biologie

Leerdoel

De rode draad en het globale leerdoel bij deze cursus is een kennismaking met de rol van microorganismen in de stofstromen op aarde. Microorganismen staan aan de basis van alle voedselketens, maar waarop leven ze dan zelf? Verrassend misschien, maar de aardkorst, het water en de atmosfeer kunnen voorzien in alle behoeften voor de groei van vele soorten bacterien, zonlicht kan daarbij helpen met extra energie. Je ziet bacterien niet maar hun bijdrage aan de mondiale stofstromen is gigantisch, daarover zul je leren. Gerusstellend is dat de basisprincipes van de celopbouw en het metabolisme uniform zijn. Variaties op het basisplan zorgen echter voor diversiteit en grote functionele adaptatie die direct zijn verbonden met de eigenschappen van de habitat-ecosystemen. De evolutie van microorganismen, de symbiose theorie en de fylogenetische relaties worden daarmee in logisch verband gebracht Moleculaire detectiemethoden voor diversiteit bij bacterien zijn nu heel verfijnd, we weten nu zelfs dat er veel meer bacterien in ecosystemen voorkomen en (vermoedelijk) actief zijn dan de slechts 20% die er buiten het ecosysteem in kweek zijn gebracht. Heel spannend is dat er processen op aarde plaatsvinden waarvan de reactievergelijkingen niet kloppend zijn te maken en die daarom gedacht worden tot stand te komen door nog onbekende microorganismen. De vermoedens dat er nog veel onbekende bacterien daarin een grote rol spelen komen inmiddels uit. Maar hoe vind je die organismen dan en hoe bepaal je hun adaptatievermogen? Het is heel leuk om kennis te maken met hoe je bacterien kunt isoleren en hoe je ze dan verder kweekt en bestudeert om meer van hun eigenschappen te leren kennen. Naast de theorie zijn er aansluitend bij de colleges eenvoudige (demonstratie) experimenten om het een en ander in de praktijk te laten zien. Inhoud

De cursus bestaat uit drie onderdelen: 1 Hoor- en werkcolleges bij het boek Brock ‘Biology of Microorganisms’ De achtergronden over hoe microorganismen de substraten en energie voor hun groei ver-

238



krijgen en hoe die eigenschappen gedurende de ontwikkeling van het leven op aarde tot stand zijn gekomen. Verschillende voorbeelden van microbiële (terrestrische en aquatische) ecosystemen worden behandeld als onderdeel van de colleges. Onderwerpen van de colleges zijn: ■

■ ■

■ ■

■

Functionele opbouw van de cel: celwanden, biomembranen, flagellen, gasvacuolen, opslagsystemen Groei van microorganismen: theorie, cultuurmedia en verschillende cultuurtechnieken Energie om te leven: redox reacties en licht, metabole diversiteit, cycli der elementen (H, C, N, O, P, S, Fe, Mn, Cu) Archea, Eukaryota, Bacteria; diversiteit bij prokaryoten,en moleculaire fylogenie Micro-organismen in de natuur: hun rol en metabole interacties in terrestrische en aquatische ecosystemen Speciale colleges over de rol van microorganismen in waterzuivering, biofilms, getijdegebieden en in de open oceanen.

2 Bespreking van een recent artikel door de deelnemers Er wordt door de docenten aan iedere student een artikel uitgedeeld dat in twee dagen moet worden bestudeerd en bewerkt voor een mondelinge met powerpoint ondersteunde presentatie in de groep. 3 Practicum (2 weken + 1 week verslag) Dit deel omvat laboratorium experimenten ten dele gebaseerd op veldwerk, globale onderwerpen zijn: Biofilms en inzicht in moleculaire fylogenie op lokatie Yerseke (Oosterschelde practicum) Ecofysiologie van fototrofe groei, C/N metabolisme, op locatie Amsterdam AMB UvA

■

■


Aanmelden

Via studieweb voor 23 juli 2006 Tijdige aanmelding is echt nodig i.v.m. kamerreservering voor het Oostschelde practicum. Onderwijsvorm

Hoor en werk colleges, inclusief excursie en studietijd

136 slu

Praatje

24 slu

Practica, inclusief veldwerk en verslag

120 slu

Totaal

280 slu

239



Onderwijstijden


Het volgende boek is verplicht lesmateriaal voor de cursus: Brock Biology of Microorganisms, 10th ed., Prentice Hall Publ. Er wordt voor een verwijsschema gezorgd bij gebruik van de achtste of negende druk. Er is geen aparte syllabus, in beknopte vorm wordt de collegestof via Blackboard beschikbaar gesteld. Aantal deelnemers

minimaal 5 en maximaal 18 Toetsvorm

Het eindcijfer berust op een gewogen gemiddelde van het gecombineerde cijfer voor het tentamen en de werkcolleges (60%), het cijfer voor het practicum en het verslag erbij (30%) en het cijfer voor de literatuurbespreking (10%). De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Toegang tot de cursus: De cursus is toegankelijk voor studenten Biologie, Aardwetenschappen en ook voor Chemici met milieu en/of biologische belangstelling. De cursus is in IBED verband geschikt voor zowel geïnteresseerden met een terrestrische als met een aquatische specialisatievoorkeur. De cursus is ook functioneel en goed aansluitend bij een algemeen aardwetenschappelijke pakket,een algemeen biologisch en een algemeen milieuchemisch pakket. Er zijn geen specifieke toegangseisen. Locatie Colleges,werkcolleges en de helft van de practica worden gehouden op het Roeterseiland. De andere helft van het practicum (1 week) wordt gehouden bij een instituut van de KNAW, het NIOO-CEMO in Yerseke Zeeland. Dat laboratorium ligt prachtig aan de rand van de Oosterschelde en heeft gastaccommodaties. Hoe eerder hoe eerder je er bij bent, hoe groter de kans dat je een kamer kunt krijgen. De aanmelding hiervoor is centraal bij de coordinator van de cursus.

240



IB312.

IB312 Theoretische Biologie Vakcode

IB312

Studielast

10

Ingangseis

n.v.t.

Periode(n)

Semester 2 (periode 4: 5 februari 2007 t/m 23 maart 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. M.C. Boerlijst, prof.dr. A.M. de Roos (coördinator)

Inlichtingen

prof.dr. A.M. de Roos telefoon: +31 20 5257747 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel

Leerdoelen van het vak Theoretische Biologie (IB312) zijn: kennismaking met de theoretische en mathematische biologie. Vaardigheid in het vertalen van biologische vraagstellingen op het gebied van de biologie, medische biologie als ook de psychobiologie naar wiskundige modellen dan wel computersimulaties. Introductie tot onderzoeksmethoden voor modellen, zowel analytische, grafische als numerieke methoden. Vaardigheid in het analyseren van parameter-afhankelijkheid van de modellen en vertaling van de resultaten naar biologische conclusies. Inhoud

De cursus is bedoeld als algemene inleiding tot dynamische systemen, modelvorming en modelanalyse voor studenten uit alle richtingen van de (medische/psycho) biologie. Het eerste gedeelte van de cursus zal een theoretische inleiding zijn, waarin de volgende onderwerpen worden behandeld: Formulering van eenvoudige modellen van biologische systemen in termen van differentiaalvergelijkingen door het opstellen van balansvergelijkingen. Berekenen van evenwichtstoestanden. ■

■

241


Bij het onderzoeken van biologische, medisch-biologische en psychobiologische vraagstukken wordt in toenemende mate gebruik gemaakt van wiskundige modellen als onderzoeksmethode. De onderzochte systemen bestaan meestentijds uit veel verschillende componenten, waarvan de onderlinge wisselwerking cruciaal is voor het functioneren van het systeem als geheel. De centrale onderzoeksvraag is daarbij hoe de dynamiek van het complexe systeem als geheel te begrijpen en verklaren is uit de samenstelling en wisselwerking tussen de systeemcomponenten. Als (nog relatief eenvoudige) voorbeelden van dit soort complexe, dynamische systemen kunnen genoemd worden metabole reactienetwerken in cellen, clusters van samenhangende neuronen in het zenuwstelsel, sociale netwerken van personen met verschillende gedragspatronen en netwerken van populaties in een ecosysteem.



■ ■

■

■

Analyse van dynamiek m.b.v. fasevlakmethoden. Stabiliteitsbepaling van evenwichten (linearisatie nabij evenwicht, stabiliteitscriteria, reële en complexe eigenwaarden, limietcycli). Cycli, complexe dynamiek en chaos in continue en discrete tijdmodellen. Bifurcatietheorie: de afhankelijkheid van de dynamiek van systeemparameters.

Deze theoretische inleiding vormt de basis, waarop de volgende delen van de cursus voortbouwen. Het tweede gedeelte van de cursus zal gericht zijn op modellen van systemen, waarin de ruimtelijke afhankelijkheid tussen systeemcomponenten een rol speelt, dan wel modellen waarin de componenten een netwerkstructuur vormen. M.b.v. cellulaire automaten zal een reeks van case studies worden geanalyseerd, waaronder: populatiedynamiek en evolutie in ruimtelijk heterogene omgevingen “voting models” en spel-theoretische modellen (o.a. het Prisoner’s Dilemma) in een ruimtelijke context evolutie van altruïsme modellen voor groei en ontwikkeling ■

■

■

■

In het laatste deel van de cursus zal teruggekomen worden op de theorie uit het eerste deel van de cursus door het bespreken van case studies uit de biologie, medische biologie en psychobiologie, waarin modelvorming is gebruikt voor het verkrijgen van onderzoeksresultaten. Deze case studies zullen worden besproken met een nadruk op de concepten die behandeld zijn in het eerste gedeelte van de cursus. Ze vormen zodoende tevens een voorbereiding op het afsluitende tentamen. De volgende lijst geeft een aantal voorbeelden van case studies, die aan bod kunnen komen: ■ ■ ■

Competitie en predatie tussen populaties van verschillende soorten Activatie en deactivatiecycli in neuronen Markovketen-modellen voor het analyseren van gedragspatronen

Dit laatste gedeelte zal afgesloten worden door het geven van een presentatie over een theoretisch biologisch artikel, eventueel aangevuld met resultaten uit eigen modelonderzoek. Aanmelden


Hoorcolleges

120 slu

Werkcolleges

120 slu

Voorbereiding referaat

30 slu

242



Extra studietijd

10 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Verplicht: Tijdens cursus uit te reiken readers en syllabi. Kosten ca. € 15,-. Aantal deelnemers

30 Toetsvorm

Beoordeling van praktisch werk (presentatie, practica):

50%

Tentamen over theorie behandeld in de colleges:

50%


Locatie: Anna's Hoeve Let op: Cursus is bedoeld voor derde jaars studenten, alsmede master studenten.


243



IB31 .

IB313 Ecosystemen van de Wereld/Tropische Ecologie (Ecologie III) Vakcode

IB313

Studielast

10

Ingangseis

IB209 Aquatische en Terrestrische Ecologie (Ecologie II) (pag. 221) (20 EC) en IB201 Systematiek en Biogeografie (pag. 219) (10 EC) of vergelijkbare cursussen elders behaald hebben.

Periode(n)

Semester 1 (periode 3: 4 december 2006 t/m/ 2 februari 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr.ir. J.H. van Boxel, prof.dr. A.M. Cleef, dr. J.F. Duivenvoorden (coördinator), prof.dr. H. Hooghiemstra, mw. dr. A.M. Kooijman, prof. dr. J.H.D. Wolf

(en

diverse gastdocenten) Inlichtingen

dr. J.F. Duivenvoorden telefoon: +31 20 5257812 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel

Leerdoelen van het vak Ecosystemen van de Wereld/Tropische Ecologie (Ecologie III) (IB313) zijn het verkrijgen van systematisch inzicht in de kenmerken en het functioneren van de belangrijkste op de wereld voorkomende ecosystemen, zowel voor wat betreft de biotische als abiotische aspecten als van hun onderlinge samenhang en de invloed van de mens op deze systemen. Speciale aandacht wordt besteed aan de belangrijkste landecosystemen van de vochtige tropen, zowel van laagland als van gebergten, en de belangrijkste sturende processen binnen en tussen de verschillende tropische systemen, waaronder het inzicht in de werking van het klimaatsysteem, de algemene circulatie en de processen die daaraan ten grondslag liggen. Voorts wordt een eerste inzicht verkregen in de dynamiek van ecosystemen sinds de laatste ijstijd, en het verantwoord ecologisch en maatschappelijk gebruik/ beheer, en bescherming van deze ecosystemen, alsmede de mogelijkheden tot herstel van gedegradeerde tropische systemen. Inhoud

A. Ecosystemen van de wereld (3 weken) Uitgegaan wordt van de boeken Elements of Ecology en The Major Soils of the World, die gezamenlijk een systematisch overzicht van kenmerken en functioneren van de belangrijkste ecosystemen geven. Dit overzicht wordt behandeld, gegroepeerd op basis van klimaatszones en van drainage. B. Tropische Ecologie (4 weken) In dit onderdeel wordt in detail, in aansluiting op de algemene vergelijkende patronen die in de periode voor de kerst zijn behandeld, de belangrijkste tropische landecosystemen besproken met nadruk op de vochtige equatoriale tropen (tropisch-alpiene graslanden en

244



bergregenbossen, laaglandregenwoud en savannes) en hun onderlinge samenhang in ruimte en tijd. Bij elk van de ecosystemen wordt ingegaan op de effecten van menselijk handelen (brand, begrazing, kappen, zwerflandbouw, bodem-degradatie) en consequenties voor regeneratie. Voorts is er speciale aandacht voor de lange-termijn dynamiek sinds de laatste ijstijd, en de vertaling van deze informatie naar interpretatie van ecologisch functioneren en de rol van de mens daarin in de moderne tijd. Daarnaast wordt speciale aandacht besteed aan het kronendak, ingaande op specifieke milieu en diversiteit van epipfyten, hun betekenis in het procesmatig functioneren van het regenwoudecosysteem en aspecten van bescherming en duurzaam gebruik (canopy farming). Tevens komt de rol van het klimaat aan de orde via een (merendeels kwalitatieve) inleiding in de samenstelling en opbouw van de atmosfeer, het verticale evenwicht in de atmosfeer, de vorming van wolken en neerslag, de krachten die een rol spelen bij het ontstaan van wind en de energieoverdracht door straling en warmtestromen, uitlopend in een behandeling van het algemene circulatie in de atmosfeer en in de oceaan en de verklaring van de verdeling van temperatuur, neerslag en de bijbehorende klimaten over het aardoppervlak. Daarbij komen ook actuele problemen aan de orde komen zoals het broeikaseffect, aantasting van de ozonlaag en El Niño. Geoefend wordt ook in het opstellen van een onderzoeksvoorstel, volgens eisen en richtlijnen van WOTRO. Aan het eind van de periode wordt een dagsymposium georganiseerd met gastsprekers die ingaan op hun eigen recente onderzoek in tropische ecologie. Aanmelden


deel B: Tropische Ecologie: colleges en werkcolleges, excursies (ondermeer naar de Hortus Botanicus en instellingen in Nederland die zich bezig houden met ecologisch onderzoek in de tropen), presentaties onderzoeksvoorstel en symposium.

245


deel A: Ecosystemen van de wereld: hoorcollege (11 x 2uur), gevolgd door een presentatie door de studenten van de belangrijkste ecosystemen in een bepaalde regio en hun functioneren, aan de hand van een kaartblad van de wereldbodemkaart.



Ecosystemen van de wereld Hoorcolleges

22 slu

Werkcolleges

Tropische Ecologie 40 slu 15 slu

Excursies (incl. Hortus)

32 slu

Symposium

8 slu

Extra studietijd

98 slu

65

Totaal

120 slu

160 slu

Onderwijstijden


Syllabi (voor kostprijs) Voorts is aanbevolen literatuur: R.L. Smith & T.M. Smith: Elements of Ecology, 5th ed., Addison Wesley Longman, Inc., San Francisco Driessen, Decters, Spaargaren en Nachtegaele: Lecture Notes on the Major Soils of the World, FAO, 2001. Archibold, O.W. 1995. Ecology of world vegetation. Chapman & Hall, London. Osborne, P.L. 2000. Tropical ecosystems and ecological concepts. 464 pp. Cambridge University Press. Walter, H. 1970. Vegetationszonen und Klima. Ulmer, Stuttgart. * Lüttge, U. 1997. Physiological ecology of tropical plants. Springer, Berlin. Kellman, M. & R.Tackaberry 1997. Tropical Environments. Routledge, London. Whitmore, T. 1990. An introduction to tropical rain forests. Clarendon, Oxford ■

■

■

■

■

■ ■ ■

* Ook in Engelse vertaling op de markt. Aantal deelnemers

50 Toetsvorm

Deel A: Ecosystemen van de wereld wordt afgesloten met een schriftelijk tentamen (leidend tot deelcijfer I). Deel B: Tropische ecologie, 4 weken wordt afgesloten met een schriftelijk tentamen (leidend tot deelcijfer II). Deel A telt voor 3/7 mee in het eindcijfer, deel B telt voor 4/7 deel mee in het eindcijfer. Men is geslaagd voor de gehele cursus wanneer het eindcijfer hoger dan of gelijk is aan

246



6,0 en de beide deelcijfers niet lager zijn dan 5,0. Voor diegenen die separaat deel A of B volgen geldt het betreffende deelcijfer na 3 resp. 4 weken (zie boven) als eindcijfer. Bijzonderheden

Locatie: Biologisch Centrum Anna's Hoeve, Kruislaan, Amsterdam; Roeterseilandcomplex (REC)


247



LO260.

LO260 Didactiek en Communicatie Vakcode

LO260

Studielast

10

Ingangseis

Tenminste 1 schoolstageplaats regelen

Periode(n)

Semester 1 (periode 1: derde en hogere studiejaren, 4 september 2006 t/m 20 oktober 2006 (Niet voor de psychobiologen)) Semester 2 (periode 4: derde en hogere studiejaren, 5 februari 2007 t/m 23 maart 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

AMSTEL Instituut (AMST) Instituut voor de Lerarenopleiding (ILO)

Docent(en)

dr M.J. Couzijn, mw. drs C.M. van Krieken (coördinator), drs. P.P.M. Molenaar

Inlichtingen

mw. drs C.M. van Krieken telefoon: +31 20 5251281 [email protected]

Onderdeel van

Masterprogramme Molecular Cell Biology and Bioinformatics Masterprogramme General Biology Masterprogramme Medical Biology Bachelor Biomedische wetenschappen (Medische Biologie) Bachelor Biologie Bachelor Psychobiologie Communication and Education Profile (CE-profile)

Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Didactiek en Communicatie (LO260) : Kennis verwerven van het huidige en toekomstige voortgezet onderwijs en de rol van de docent. Motivatie en capaciteiten voor het beroep docent bij jezelf verhelderen. Sterke en zwakke kanten in je schriftelijke en mondelinge communicatie expliciteren. Mondelinge en schriftelijke communicatie verbeteren. Ervaring opdoen in onderwijs ontwerpen en geven. Onderwijs van anderen analyseren. Oriënteren op de de lerarenopleiding en de educatieve communicatieve richting in de Master. Inhoud

Oriëntatie op voortgezet onderwijs Schoolstage op twee zeer verschillende scholen (of op 1 school naast een bedrijfsstage) waarin o.a. de volgende activiteiten thuishoren: ■

■ ■ ■

Observeren bij zoveel mogelijk klassen en docenten. Meso-activiteiten volgen. Leerlingen en medewerkers interviewen. Theorie toetsen aan de praktijk in de vorm van gerichte observatie, zelfreflectie en onderzoek.

248



■ ■

■

Zelf lesgeven in onder- en bovenbouw. Assisteren bij practica. Ervaringen gekoppeld aan theorie vastleggen in een verslag.

Oriëntatie op educatieve functie in een bedrijf of educatieve instelling (facultatief) Stage, waarin de volgende activiteiten thuishoren: ■

■ ■

Zicht krijgen op het dagelijkse werk van een academicus aldaar. Een taak uitvoeren. Zicht krijgen op werving en selectie van het bedrijf.

Oriëntatie op de minor Educatie en Communicatie en Lerarenopleiding Het houden van diverse presentaties ■

■ ■ ■

■

Rekening houden met doel en publiek. Goed gebruik van spreekschema. Adequaat gebruik van duidelijke audiovisuele middelen. Interactie met het publiek bewerkstelligen. Tijdbewaking.

Het schrijven van verschillende teksten voor onderwijs ■ ■ ■

■ ■

Rekening houden met doel en publiek. Actuele biologie aanhaken aan bestaande kennis. Vragen ontwerpen op het gebied van vaardigheden, attituden en cognities. Publiceren op internet Aandacht voor lay-out, spelling en stijl.

Communicatie algemeen ■

■ ■ ■

■


■

Brieven schrijven. Solliciteren. Communicatiemodellen. Communicatiestoornissen onderkennen en voorkomen. Argumenteren en debatteren. Multiculturele communicatie

Onderwijskunde en didactiek ■ ■ ■

■ ■ ■

■

Begripsontwikkeling; voorschoolse beelden Leerstijlen. Multicultureel onderwijs. Motivatie. Practicum en demonstraties in de natuurwetenschappen. ITC en onderwijs. Samenwerkend leren.

249



■ ■

Ontwerpen van onderwijs. Internationalisering in onderwijs

Expliciteren eigen capaciteiten ■ ■

Inventariseren eigen capaciteiten en mogelijkheden in een later beroep. Reflectie over eigen capaciteiten m.b.v. video-opnamen en verslagen van anderen.

Aanmelden

Via studieweb voor deelname in periode I voor 23 juli 2006 en voor deelname in periode IV voor 25 december 2006 Onderwijsvorm

Werkcolleges

98 slu

Stage

50 slu

Voorbereiding presentaties

24 slu

Voorbereiding stage act.

22 slu

Schrijfopdrachten

19 slu

Voorbereiding werkcollege

18 slu

Reflectie

6 slu

Dossieropbouw

5 slu

Stageverslag

14 slu

Extra studietijd

24 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd op de website http://www.student.uva.nl . Studiemateriaal

Twee syllabi (onderwijs en communicatie) en wat aanvullende materialen. Kosten ca. € 25,Aantal deelnemers

18, te verdelen over de natuurwetenschappelijke vakken Toetsvorm

De cursus bestaat voornamelijk uit het trainen van vaardigheden. Daarom moet de student alle bijeenkomsten aanwezig zijn. Tussen de bijeenkomsten wordt een actieve blackboard participatie verwacht. Door het goed uitvoeren van de opdrachten, implementatie van theorie in zowel stage als verslagen en door een overzichtelijke opbouw van het dossier, gevolgd door een eindgesprek aan de hand van het portfolio, heeft de student aan de eisen

250



voldaan. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: Amstel Instituut, Kruislaan 404. N.B.: Afhankelijk van het aantal studenten uit verschillende vakrichtingen en hun interesse voor onderwijs of communicatie is er differentiatie binnen de groep mogelijk. Ook kan meer aandacht gevraagd worden voor multimedia-applicaties. De cursus is ook onderdeel van de Master communicatie en educatie.


251



ORFA.

ORFA Oriëntatiefase (Eindthesis) Vakcode

ORFA

Studielast

20

Ingangseis

n.v.t.

Periode(n)

Semester 2 (periode 5 en 6: 26 maart t/m 6 juli 2007, beslaat 2 periodes)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Instituut voor Biodiversiteit en Ecosysteem Dynamica (IBED) Swammerdam Instituut voor Levenswetenschappen (SILS) Ned. Inst. v. Hersenonderzoek (NIH) Nederlands Kanker Instituut-Antoni van Leeuwenhoek Zkhs Sanquin (CLB) Onderwijsinstituut Psychologie (FMG) Faculteit der Geneeskunde (AMC)

Docent(en)

mw. dr.ir. B.B. Oude Essink (coördinator)

(en medewerkers van SILS, IBED en

aan de FNWI gelieerde instellingen) Inlichtingen

mw. dr.ir. B.B. Oude Essink telefoon: +31 20 5257963 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel ■

■

■

Cursussen: aanleren van extra technische vaardigheden en/of het opdoen van theoretische kennis die nodig kunnen zijn in de bachelor. Bachelor Eindthesis: Het toepassen van de in de bachelor opgedane kennis en vaardigheden: het uitvoeren van een kort onderzoek, het schrijven van een eindwerkstuk gerelateerd aan het onderzoek en het houden van een mondelinge presentatie hierover. Tevens is deze periode een oriëntatie op het te kiezen afstudeeronderzoek in de master en een beroepsoriëntatie.

Inhoud

In week 1 t/m 3 kan worden gekozen uit een aantal korte cursussen. Deze cursussen zijn bedoeld om nog enkele technieken te leren of te optimaliseren voordat aan het afstudeeronderzoek in de master begonnen wordt. Week 4 is enerzijds een oriëntatie op de mogelijkheden om onderzoeksstages uit te voeren in de masterfase en anderzijds een oriëntatie op de beroepsmogelijkheden. De oriëntatiefase wordt afgesloten met een eindwerkstuk, de bachelor eindthesis: hierbij wordt een een korte wetenschappelijke onderzoekstage uitgevoerd, waarvan de resultaten verwerkt worden in een Engelstalig artikel en met behulp van Powerpoint in het Engels mondeling gepresenteerd worden. Het eindwerkstuk moet gezien worden als de afsluiting van de bachelorfase. De inhoud van de korte cursussen en

252



korte onderzoeksstages wordt bekend gemaakt in de studiegids ‘Oriëntatiefase’ die in de loop van het jaar zal verschijnen. In het najaar (de exacte datum wordt nog bekendgemaakt) wordt voorlichting gegeven over de exacte invulling van de oriëntatiefase en wordt het keuzeformulier uitgereikt. Het keuzeformulier moet ingeleverd zijn bij de onderwijsbalie. In het voorjaar 2006 wordt nog een extra voorlichting gegeven over de master. Aanmelden

Via formulier dat in het najaar 2006 tijdens de voorlichting wordt uitgereikt Onderwijsvorm

Cursussen, korte onderzoeksstage, bedrijfsbezoeken, beroepsoriëntatie Onderwijstijden

Wordt tijdens de voorlichting bekend gemaakt. Studiemateriaal

Wordt tijdens de voorlichting bekend gemaakt Toetsvorm

Wordt tijdens de voorlichting bekend gemaakt Bijzonderheden

Locatie: wordt tijdens de voorlichting bekend gemaakt


253



PS201.

PS201 Onderzoek in de Psychologie Vakcode

PS201

Studielast

12

Ingangseis

010/011A Inleiding in de cognitieve en biologische Psychologie (20 EC) gevolgd hebben en statistiek in de modules 001A Inleiding in de Biologie (10 EC) en 002A Celbiologie I (10 EC) gevolgd hebben

Periode(n)

Semester 1 (periode 1 en 2: 9 oktober t/m 1 december 2006 Let op: PS201 begint al in periode 1)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)


(docenten van de afdeling

Psychonomie) Inlichtingen


Onderdeel van


Leerdoel

In het vak Onderzoek in de psychologie (PS201) verdiept de student zijn kennis over het opzetten, uitvoeren en analyseren van onderzoek. Er wordt geoefend met het schrijven van onderzoeksverslagen. Inhoud

Gedurende het vak loopt een collegereeks over statistische analyses en methoden van onderzoek. Daarnaast wordt een cursus SPSS verzorgd. Tevens zijn er werkcolleges waarin geoefend wordt met het opzetten en analyseren van onderzoeken en waarvoor enkele onderzoeksverslagen worden geschreven. Naast de onderzoeksverslagen wordt een onderzoeksopzet naar aanleiding van zelf gekozen literatuur geschreven. Aanmelden


Hoorcolleges

70 slu

SPSS

50 slu

Werkcolleges + opdrachten

200 slu

Totaal

320 slu

Onderwijstijden


254



Studiemateriaal ■

■ ■

■ ■

W.P. van den Brink en P. Koele. Statistiek deel 3: Toepassingen ISBN: 9053527052. Prijs 38 euro Hoogstraten, J. De machteloze onderzoeker. ISBN: 9085060079. Prijs 25 euro Brace, Kemp & Snelgar. SPSS for Psychologists 2nd editionISBN: 0333986334. Prijs 29,29 Syllabus statistiek. Ongeveer 15 euro. Syllabus verslaglegging etc. Ongeveer 10 euro.

Syllabi zijn verkrijgbaar via de Onderwijsbalie Biologie. Aantal deelnemers

n.v.t. Toetsvorm

De beoordeling vindt plaats op basis van een gecombineerd tentamen statistiek en methoden van onderzoek en op basis van ingeleverde opdrachten. Voor de werkcolleges en de cursus SPSS is een aanwezigheidsplicht. Men is geslaagd als het eindcijfer gelijk aan of hoger is dan 6,0. Het eindcijfer wordt bepaald door een gewogen gemiddelde van de opdrachten en het tentamens. Om te slagen mag het tentamencijfer niet lager zijn dan 5,0, de opdrachten moeten allen voldoende gemaakt worden. Bijzonderheden

Locatie: FMG afdeling Psychologie, Roetersstraat 15


255



PS30.

PS300 Psychonomie Vakcode

PS300

Studielast

30( de 30 EC zijn verdeeld over een aantal korte cursussen die tussen de 1 en de 7 EC omvatten)

Ingangseis

PS201 Onderzoek in de Psychologie (pag. 254) (12 EC)en 290A/P Miniscriptie (pag. 199) (6 EC)behaald

Periode(n)

Semester 1 (Deze cursus omvat een heel semester: 4 september 2006 t/m 2 februari 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)


Inlichtingen


Onderdeel van


Inhoud

In het eerste semester van het derde jaar Psychobiologie worden onderdelen bij de opleiding Psychologie gevolgd binnen de programmagroep Psychonomie samen met derdejaars studenten Psychologie. Het betreft een verplicht programma van 30 EC, bestaande uit verschillende blokken die naast elkaar gevolgd moeten worden. De opzet is als volgt: Blok 1 en 2: Inleiding en Perceptie en Bewustzijn - 5 EC Blok 3: Aandacht, Actie en Controle -3 EC Blok 4: Leren en Geheugen - 4 EC Blok 5: Hogere Mentale Processen - 2 EC Blok 6: Taal- 3 EC Blok 7: Emoties – 3 EC Blok 8.1: Experimentatie- 6 EC Blok 8.3: Symposium – 1 EC Blok 9: Experimental Design - 3 EC Aanbevolen voorkennis

Zie ingangseisen. Aanmelden

Via studieweb voor 23 juli 2006 Onderwijstijden


256



Studiemateriaal

Het studiemateriaal staat vermeld in de studiegids van Psychologie. Kosten

Ongeveer 200 euro Toetsvorm

Informatie over toetsen staat vermeld in de studiegids van Psychologie. Bijzonderheden

Voor dit vak wordt het Onderwijs en Examenreglement (OER) van het onderwijsinstituut Psychologie (FMG) aangehouden. Dit betekent oa dat de tentamens van de verschillende blokken 1 herkansing kennen.


257



SI201.

SI201 Celbiologie II Vakcode

SI201

Studielast

10

Ingangseis

Cursus 002A Celbiologie I (10 EC) en SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en

Periode(n)


Microbiologie T (pag. 260) (8 EC) gevolgd Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr.ir. P.F. Fransz, dr. W.E.J.M. Ghijsen, dr. T. Munnik, dr. M. Rep (coördinator), mw. dr. G.J. Smits

Inlichtingen

dr. M. Rep telefoon: +31 20 5257795 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Na afloop van de cursus Celbiologie II (SI201) dient de student in staat te zijn: ■

■

■

de relaties tussen structuur en functie voor de behandelde cellulaire systemen te kunnen uitleggen; de behandelde celbiologische verschijnselen en processen te herkennen en te kunnen beschrijven; de verworven inzichten toe te kunnen passen op voorgelegde vraagstukken;

Verder zal de student ervaring te hebben opgedaan met het interpreteren van wetenschappelijke artikelen. Inhoud

De cursus celbiologie II is een theoretische cursus en valt uiteen in twee delen. Het eerste deel is algemeen en bedoeld om studenten kennis te laten verwerven omtrent de werking van de cel op moleculair niveau. Hiertoe zullen een aantal basale cellulaire processen behandeld worden. In het tweede deel van de cursus zal een verdieping volgen, waarbij recent wetenschappelijk onderzoek zal worden bestudeerd en besproken. De rode draad van de cursus is de overdracht van signalen. De volgende onderwerpen / processen zullen ter sprake komen: ■

■ ■ ■

■

structuur van de celmembraan en dynamische processen hierin; signaaloverdracht tussen cellen en binnen de cel; lipiden-afgeleide signaal moleculen; signaaloverdracht en genexpressie; regulatie van de celcyclus;

258



■ ■

apoptose; celdifferentiatie.

Aanmelden


Deze theoretische cursus zal gegeven worden in de vorm van hoor- en werkcolleges. In de (verplichte) werkcolleges zal worden geoefend met het lezen, intepreteren en presenteren van wetenschappelijke artikelen. Hoorcolleges

150 slu

Werkcolleges

64 slu

Opdrachten

66 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


De te behandelen stof staat deels beschreven in een klapper en deels in ‘Molecular Biology of the Cell” Cell Biology’ (Alberts et al., 4e editie). Dit boek wordt ook gebruikt in module 002. Aanschaf is verplicht. Additioneel studiemateriaal zal door docenten uitgereikt worden. Kosten Opleidingen Biologie

De klapper zal ongeveer 10 euro kosten (de exacte prijs wordt later bekend gemaakt). Toetsvorm

Ongeveer halverwege de cursus zal er een schriftelijke deeltoets worden afgenomen (weegfactor 60%). In week zeven volgt een tweede schriftelijke deeltoets (weegfactor 40%). De student is geslaagd voor de cursus indien het eindcijfer cijfer hoger dan, of gelijk is aan een 6,0 en geen van beide deelcijfers lager is dan 5,0

259



SI213.

SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T Vakcode

SI213

Studielast

8

Ingangseis

002A Celbiologie I (10 EC) en 004A Microbiologie, Moleculaire Biologie en

Periode(n)

Semester 1 (tweede studiejaar, 4 september 2006 t/m 6 oktober 2006)

Mathematische Modellen (10 EC) gevolgd Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof. dr. W. Crielaard, dr. M. Rep (coördinator), dr. J.C. van der Spek, dr. F.L.W. Takken, dr. M.J. Teixeira de Mattos

Inlichtingen


Onderdeel van

Bachelor Biomedische wetenschappen (Medische Biologie) Bachelor Biologie

Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T (SI213): Het beheersen van basisbegrippen in de biochemie, microbiologie en moleculaire biologie en het kunnen uitleggen van een aantal voorbeelden van 1) regulatie van genexpressie, 2) moleculair biologische technieken, 3) de werking en regulatie van enzymen, 4) werking en regulatie van centrale biochemische routes, 5) metabolisme van micro-organismen Inhoud

Moleculaire biologie: Structuur van DNA en RNA; DNA-replicatie; Regulatie van transcriptie in prokaryoten en eukaryoten; RNA-processing; Eiwitsynthese; Genetische systemen van organellen; Gebruik van computers voor sequentie-analyse. Biochemie en Microbiologie: Belangrijke concepten uit de biochemie zoals eiwitvouwing en katalytische mechanismen worden behandeld. De rol van chaperones worden aan de hand van een voorbeeld toegelicht. Daarna wordt ingegaan op de enzymkinetiek: Michaelis Menten kinetiek, affiniteitsconstante, competitieve/niet-competitieve remming, eiwitfosforylering. De thermodynamische verklaringen voor enzym gekatalyseerde reacties worden geïntroduceerd. Transport van macromoleculen binnen de cel en de rol van GTP bindende eiwitten. Een en ander wordt geïllustreerd aan de hand van ziekten die gerelateerd zijn aan foutief gevouwen eiwitten. Vervolgens komen de mechanismen van energieconservering aan de orde met als hoofdpunten de glycolyse, de citroenzuurcyclus en de ademhalingsketen waarbij aandacht besteed wordt aan electronenoverdracht en redoxreacties in het

260



algemeen. De algemene principes uit de biochemie worden vervolgens toegepast bij de behandeling van de metabole diversiteit van micro-organismen, zoals chemolithotrofie, anaerobe ademhaling en fermentatie. Hier komt ook de fotosynthese aan de orde. Verder komen specifieke eigenschappen van prokaryoten aan de orde: de celwandstructuur en het werkingsmechanisme van penicilline, endosporevorming en ontkieming van bacteriën, stikstoffixatie, groeikinetiek, energetica en celopbrengst. De consequenties van een aantal van deze eigenschappen voor milieu (de koolstofcyclus), voeding (voedselbederf en – bereiding) en gezondheid (kolonisatie, virulentie, toxineproductie, caries) worden uitgelegd Aanmelden

Via studieweb voor 23 juli 2006. Let op: Je moet je voor 3 modules tegelijk aanmelden: SI213, SI215 en SI217! Onderwijsvorm

Tijdens de cursus zullen ca. 12 hoorcolleges moleculaire biologie, 10 hoorcolleges biochemie en 10 hoorcolleges microbiologie worden gegeven. Ter ondersteuning van moleculaire biologie zal een dagdeel bioinformatica worden gegeven. Tevens zullen opdrachten worden gegeven waarvan de beoordeling meetelt voor het eindcijfer. Hoorcolleges

100 slu

Werkcolleges

70 slu

Zelfstudie

30 slu

Totaal

200 slu


Hoofdstukken uit Molecular Biology of the Cell, 4e druk, Alberts et al. Garland Publ. Inc. New York. Toetsvorm

Er wordt een schriftelijk tentamen afgenomen. Het tentamen bestaat uit 2 deeltentamens: Moleculaire Biologie (weegfactor 40%) en Biochemie/Microbiologie (weegfactor 60%). De student is geslaagd als het gewogen gemiddelde gelijk of hoger is dan 6,0 en geen der deeltentamens lager is beoordeeld dan een 5,0.

261


Onderwijstijden



SI215.

SI215 Immunologie TP Vakcode

SI215

Studielast

6

Ingangseis

SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T (pag. 260) (8 EC)gevolgd

Periode(n)

Semester 1 (periode 1en 2: 9 oktober t/m 3 november 2006 en van 6 november t/m 1 december 2006. Alterneert met SI217)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door

Sanquin (CLB)

Docent(en)

prof. dr. R.C. Aalberse (coördinator), J. van Leeuwen (coördinator)

Inlichtingen

prof. dr. R.C. Aalberse telefoon: +31 20 5123158 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Immunologie TP (SI215): Theorie: Na afloop van de cursus heeft de student zich de theoretische grondbeginselen van de immunologie eigen gemaakt. Praktijk: Het verwerven van praktische vaardigheid, vooral in het werken met antistoffen Inhoud

Theorie ■ ■

■ ■ ■

■ ■

■ ■

de structuur van antistoffen de basis van antistof-variabiliteit effector-functies van antistoffen functies van lymfocyten antigeen-presenterende cellen en de functie van eiwitten van het ‘major histocompatibiliteits complex’ regulatie van lymfocytenfunctie door cytokinen rol van cel-cel contact en de regulatie van de verantwoordelijke adhesiemoleculen immunologische tolerantie mucosale immuniteit

Practicum ■ ■

■

Isoleren van antistoffen uit antiserum en uit kweeksupernatant: Niet-competitieve en competitieve immuno-assay Preparatief werken met antistoffen: immuno-affiniteits chromatografie

262



■ ■

■ ■

Werken met radioactiviteit Immunocytologie/histologie Biologische effecten van antistoffen Lymfocyten kweken

Aanmelden

Via studieweb voor 23 juli 2006. Let op: Je moet je voor 3 modules tegelijk opgeven: deze cursus, SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T (pag. 260) (8 EC) en SI217 Moleculaire Biologie en Biochemie P (pag. 264) (6 EC)! Onderwijsvorm

Hoorcollege

12 slu

Practica, incl. uitwerken en toetsing

108 slu

Werkcollege

4 slu

Extra studietijd

36 slu

Totaal

160 slu

Onderwijstijden


Toetsvorm

Het eindcijfer bestaat uit de volgende deelcijfers: theorie (50%) en praktijk (50%). De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: Kruislaan 318 (Anna's Hoeve), gebouw III.

263


Laboratoriumjas is verplicht. Immunobiology / The Immune System in Health and Disease, Sixth edition, C.A. Janeway, ISBN 0 4430 7309 0 (paperback incl. cd) Churchill Livingstone (reeds aangeschaft voor module 008). Practicumhandleiding aan te schaffen bij de aanvang van de cursus (prijs nog niet bekend).



SI217.

SI217 Moleculaire Biologie en Biochemie P Vakcode

SI217

Studielast

6

Ingangseis

SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T (pag. 260) (8 EC) gevolgd

Periode(n)

Semester 1 (periode 1 en 2: 9 oktober t/m 3 november 2006 en van 6 november t/m 1 december 2006. Alterneert met SI215)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. L. de Jong, Ing. M.A. de Jong, dr. J.C. van der Spek (coördinator), dr. M.J. Teixeira de Mattos

Inlichtingen

dr. J.C. van der Spek telefoon: +31 20 5257921 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

De cursus Moleculaire Biologie en Biochemie P (SI217) geeft een belangrijke basis om laboratorium-onderzoek in de levenswetenschappen zelfstandig uit te kunnen voeren. Elementaire technieken en werkwijzen op het vlak van de deelgebieden biochemie en moleculaire biologie zul je leren gebruiken, toepassen en combineren. Een hoger doel hierbij is om ook inzicht te krijgen in de toepasbaarheid van werkwijzen en technieken, afhankelijk van de vraagstelling en het te onderzoeken materiaal. Om dit te bereiken zul je belangrijke principes en processen in de biochemie en moleculaire biologie leren begrijpen, zowel afzonderlijk als in hun onderlinge samenhang. Inhoud

In deze cursus zal een groot aantal biochemische en moleculair-biologische technieken aan de orde komen, zoals: homogenisatie en fractionering van weefsels en cellen, productie en isolatie van eiwitten, verschillende methodes om eiwitten te zuiveren, activiteitsbepalingen van eiwitten, enzymkinetiek, energiemetabolisme, klonering en isolatie van DNA, gel-electroforese, restriktie-kartering, PCR, analyse van DNA- en eiwitsequenties met behulp van de computer, microscopie, massaspectrometrie. Aanmelden

Via studieweb voor 23 juli 2006. Let op: Je moet je voor 3 modules tegelijk opgeven: Moleculaire Biologie en Biochemie P (SI217), SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T (pag. 260) (8 EC) en SI215 Immunologie TP (pag. 262) (6 EC) . Onderwijsvorm

De module bestaat in de eerste plaats uit een praktisch gedeelte van ruim drie weken. Tijdens het practicum zal de opgedanbe kennis verdiept worden met behulp van theoretische vraagstukken, experiment verslagen en een verslag inb de vorm van een artikel. De

264



cursus wordt afgesloten met het schrijven van een protocol om een wetenschappelijk probleem aan te pakken en de presentatie van het protocol tijdens een werkbespreking. Inleidingen/college

16 slu

Prakticum/werkcollege

120 slu

Opdracht

24 slu

Totaal

160 slu

Onderwijstijden


Alle noodzakelijke informatie wordt verstrekt in cursusklappers (kosten ca. € 10 euro). Tevens moet men op het practicum de beschikking hebben over de klapper behorende bij SI213. Een laboratoriumjas en -bril zijn verplicht. Toetsvorm

De beoordeling wordt gebaseerd op de bijdrage van de student aan het opzetten, uitvoeren en interpreteren van de experimenten, inclusief vraagstukken, verslagen en de eindopdracht. De eindbeoordeling zal bestaan uit het gemiddelde van de onderdelen Biochemie en Moleculaire Biologie. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk an 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

265


Locatie: de cursus wordt gegeven in het Van ‘t Hoff Instituut, Roeterseiland. Het practicum wordt gegeven in de cursuszaal van microbiologie in Gebouw B, 8ste verdieping.



SI218.

SI218 Moleculaire Biologie en Biochemie T (voor Psychobiologen) Vakcode

SI218

Studielast

6

Ingangseis

002A Celbiologie I (10 EC) gevolgd

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof. dr. W. Crielaard, mw. prof. dr. M. Oitzl, dr. M. Rep (coördinator), dr. J.C. van der Spek, dr. F.L.W. Takken, dr. M.J. Teixeira de Mattos

Inlichtingen


Onderdeel van


Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Moleculaire Biologie en Biochemie T (SI218): Het beheersen van basisbegrippen in de biochemie en moleculaire biologie en het kunnen uitleggen van een aantal voorbeelden van 1) regulatie van genexpressie, 2) moleculair biologische technieken, 3) de werking en regulatie van enzymen, 4) werking en regulatie van centrale biochemische routes en 5) de betekenis hiervan voor gedrag. Inhoud

Moleculaire biologie Structuur van DNA en RNA; DNA-replicatie; Regulatie van transcriptie in prokaryoten en eukaryoten; RNA-processing; Eiwitsynthese; Genetische systemen van organellen; Gebruik van computers voor sequentie-analyse. Biochemie Belangrijke concepten uit de biochemie zoals eiwitvouwing en katalytische mechanismen worden behandeld. De rol van chaperones worden aan de hand van een voorbeeld toegelicht. Daarna wordt ingegaan op de enzymkinetiek: Michaelis Menten kinetiek, affiniteitsconstante, competitieve/niet-competitieve remming, eiwitfosforylering. De thermodynamische verklaringen voor enzym gekatalyseerde reacties worden geïntroduceerd. Transport van macromoleculen binnen de cel en de rol van GTP bindende eiwitten. Een en ander wordt geïllustreerd aan de hand van ziekten die gerelateerd zijn aan foutief gevouwen eiwitten. Vervolgens komen de mechanismen van energieconservering aan de orde met als hoofdpunten de glycolyse, de citroenzuurcyclus en de ademhalingsketen waarbij aandacht besteed wordt aan electronenoverdracht en redoxreacties in het algemeen.

266



Gedrag Besproken zal worden hoe interferentie met de synthese van moleculen in de hersenen (waaronder eiwitten) kan leiden tot veranderingen in functionele processen, in het bijzonder gedrag. Op deze wijze zal geillustreerd worden hoe de koppeling tussen gen en gedrag onderzocht kan worden. Hierbij is aandacht voor zowel de moleculair biologische als de gedragsbiologische technieken. Aanmelden

Via studieweb voor 23 juli 2006. Let op: Je moet je tegelijkertijd ook voor PS201 aanmelden! Onderwijsvorm

Tijdens de cursus zullen ca. 12 hoorcolleges moleculaire biologie, 10 hoorcolleges biochemie en 6 hoorcolleges gedrag worden gegeven. Ter ondersteuning van moleculaire biologie zal een dagdeel bioinformatica worden gegeven. Voor moleculaire biologie zal zelfstandig aan een opdracht gewerkt worden Tevens zullen ondersteunende werkcolleges worden gegeven. Onderwijstijden


Hoofdstukken uit Molecular Biology of the Cell, 4e druk, Alberts et al. Garland Publ. Inc. New York. vormen de voornaamste basis van de hoorcolleges Moleculaire biologie en Biochemie. Voor het onderdeel Gedrag zal gebruik gemaakt worden van enkele geselecteerde artikelen. Toetsvorm

Bijzonderheden

Locatie: wordt later bekend gemaakt

267


Er wordt een schriftelijk tentamen afgenomen. Het tentamen bestaat uit 2 deeltentamens: Moleculaire Biologie (weegfactor 40%) en Biochemie + Gedrag (weegfactor 60%). De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is.



SI219.

SI219 Celregulatie en Moleculaire Microscopie van de Levende Cel Vakcode

SI219

Studielast

10

Ingangseis

gevolgd hebben: SI201 Celbiologie II (pag. 258) (10 EC)

Periode(n)

Semester 2 (periode 5: 26 maart 2007 t/m 18 mei 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

mw. dr. T. den Blaauwen, prof.dr. Th.W.J. Gadella (coördinator), dr. ir. J. Goedhart, dr. E.M.M. Manders, prof. dr. C.J.F. van Noorden, ing. N.O.E. Vischer

Inlichtingen

(en postdoc's en aio's )

prof.dr. Th.W.J. Gadella telefoon: +31 20 5256259 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

De cursus Celregulatie en moleculaire microscopie van de levende cel (SI219) is half theoretisch en half praktisch en heeft tot doel de student in te voeren in de moderne moleculaire celbiologie van dynamische structuren in levende cellen in relatie tot celregulatie. Nadruk zal worden gelegd op subcellulaire communicatie, dynamische structuren in cellen (zoals het cytoskelet) en moleculaire mechanismen van celdeling. Deze processen vormen de basis van celregulatie die kan leiden tot celdifferentiatie vanuit stamcellen, apoptose, of kanker. Tevens zullen methodologische aspecten van celbiologische technieken aan de orde komen, zoals moderne lichtmicroscopische technieken, labelingstechnieken en beeldbewerking. De gekozen onderwerpen zijn afkomstig van prokaryoten (bacteriën) en eukaryote cellen (zoogdier-cellijnen). Het belangrijkste leerdoel is de koppeling tussen theorie en onderzoekspraktijk m.b.t. celregulatie. Niet alleen: hoe werkt het op papier (in het tekstboek), maar hoe doe je onderzoek hieraan en wat zijn de vragen waarmee men momenteel worstelt. Inhoud

Theorie: Celcommunicatie, celgroei, celcyclus, celdifferentiatie en morfogenese bij zoogdiercellen (en bacteriën). Aan de orde komen: signaaltransductie, regulatie van het cytoskelet, mechanisme van mitose, celdifferentiatie, stamcellen, apoptose en carcinogenese. Praktijk: Zoveel mogelijk zullen moderne technieken worden toegepast dan wel worden gedemonstreerd waarbij de bovengenoemde theoretische onderwerpen kunnen worden bestudeerd in levende cellen. Specifiek zal ervaring worden opgedaan met 2-D en 3-D digitale beel-

268



danalyse, fluorescentiemicroscopie, confocale scanning laser microscopie, dynamische localisatie van GFP-gelabelde eiwitten, celmanipulatie, immunolabeling en FRET-microscopie. Proefobjecten zullen zijn: zoogdiercellen en bacteriën. Aanbevolen voorkennis

Molecular Biology of the Cell (4e ed) van Alberts et al., 1e en 2e jaars colleges Aanmelden


Hoorcolleges

60 slu

Werkcolleges/COO

24 slu

Practicum

120 slu

Presentatie/verslag

40 slu

zelfstudie

36 slu

Totaal:

280 slu

Onderwijstijden


269


In de eerste 3 weken zullen er hoor/werkcolleges gegeven worden uit Alberts (hoofdstukken 15, 16, 18, 22 en 23). Er zullen ca. 20 hoorcolleges worden gegeven. Voor histologie van weefsels wordt bovendien gebruik gemaakt van computer ondersteund onderwijs waarbij via het internet en zelftoetsing op een actieve manier met de leerstof wordt omgegaan. Op een aantal onderdelen zal dieper worden ingegaan door specialisten bij het AMC en SILS. Hiertoe zullen enkele voorbeelden uit lopend onderzoek en de kliniek nader worden geïllustreerd via rondleidingen en case studies. Ook zal een klein essay geschreven worden over een aantal artikelen dat wordt uitgereikt. Over het theoretische gedeelte wordt aan het eind van de derde week in de module een tentamen afgelegd (essayvragen). Het practicum dat daarop volgt zal drie weken (full time) in beslag nemen. Daarin wordt aandacht besteed aan moderne digitale beeldanalyse, microscopie van de levende cel en histologie. De onderwerpen in het practicum zullen aansluiten op het theoretische gedeelte zodat praktische vaardigheid wordt opgedaan met microscopiseren van levende cellen, visualiseren van signaaltransductie, celdifferentiatie vanuit stamcellen, carcinogenese en van apoptose. Over het praktisch werk, literatuuronderwerpen en demonstraties worden in de laatste week presentaties voorbereid die plenair mondeling worden gepresenteerd in een afsluitend symposium.



Studiemateriaal

Laboratoriumjas. Kopieën van de practicumhandleiding worden tegen kostprijs verstrekt. Molecular Biology of the Cell (Alberts) 4e editie, hoofdstukken 15, 16, 18, 22 en 23 Toetsvorm

Het eindcijfer wordt vastgesteld door het gewogen gemiddelde te bepalen van het cijfer voor het tentamen en de mondelinge presentatie en het praktische werk. Als weegfactoren gelden: tentamen:

50%

practicum en mondelinge presentatie:

50%


Locatie: Kruislaan 316, Gebouw III (Anna's Hoeve) en AMC

270



SI20.

SI220 Neurofysiologie Vakcode

SI220

Studielast

10

Ingangseis

SI201 Celbiologie II (pag. 258) (10 EC) gevolgd

Periode(n)

Semester 2 (periode 5: 26 maart 2007 t/m 18 mei 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. W.E.J.M. Ghijsen (coördinator), dr. R.B. de Heus, mw. prof.dr. M. Joels, prof.dr. C.M.A. Pennartz, prof.dr. W.J. Wadman

Inlichtingen

(en diverse gastdocenten)

dr. W.E.J.M. Ghijsen telefoon: +31 20 5257620 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Leerdoelen van het vak Neurofysiologie (SI220) zijn: ■ ■

■ ■

■

■

De behandelde neurofysiologische processen herkennen en beschrijven; De onderlinge samenhang doorzien; De histologische bouw van de besproken hersengebieden herkennen; Mondeling en schriftelijk rapporteren over een recent onderzoeksartikel en deze plaatsen in het kader van de behandelde stof; De gelezen literatuur kritisch kunnen beoordelen op de consistentie van resultaten en conclusie Een verslag maken van een klein onderzoek.

Inhoud

Histologie: De in de colleges besproken hersengebieden en zintuigprocessen zullen microscopisch nader worden bekeken. Aanmelden


De in de colleges besproken onderwerpen worden in een practicum gevisualiseerd. Met behulp van computer-simulaties worden de besproken onderwerpen geïllustreerd en

271


Colleges: De basisprincipes van de Neurofysiologie (de samenstellende elementen, vormen van signaaloverdracht) zullen ingeleid worden en behandeld voor wat betreft hun rol in integratieve processen (synaptische intergratie, plasticiteit en modulatie; ontwikkeling van het zenuwstelsel; autonoom zenuwstelsel en hypothalamus-bijnier as). Daarnaast zal de fysiologie van de zintuigen (geur, smaak, gevoel, gehoor, oog) besproken worden, en zullen enkele pathofysiologische processen in de hersenen (epilepsie, ziekte van Parkinson, ischemie) aan bod komen.



geoefend. Er wordt aan de hand van een neurofysiologisch artikel een korte voordracht gehouden. Er zal een neurofysiologische proef worden uitgevoerd, waarover een verslag wordt geschreven. Hoorcolleges

130 slu

Practicum / werkcolleges 75 slu Opdracht referaat, essay, 75 slu verslag Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Voor de colleges Neurofysiologie zal het boek “Principles of Neural Science” van Kandel en co-auteurs (4th edition) als naslagwerk dienen, en voor het Histologie gedeelte het boek “Functionele Histologie” van Junqueira en Carneiro (10e druk). Relevante stof uit klapper Celbiologie II van cursus SI201. De in de colleges gebruikte power point plaatjes, inhoud van het histologie en neurofysiologie practicum en werkcolleges, zullen via blackboard beschikbaar zijn. Aantal deelnemers

80 Toetsvorm

Deelcijfer I: practica, essay en voordracht, weegfactor 50%. Het practicum Histologie wordt afgesloten met een toets. Het Neurofysiologiepracticum wordt beoordeeld aan de hand van het verslag. Deelcijfer II: colleges Neurofysiologie, weegfactor 50%. De stof behandeld in de colleges zal worden getentamineerd. Het aantal vragen per onderwerp is gerelateerd aan de aantallen colleges. Daarnaast zullen er werkcolleges zijn over patho-neurofysiologische onderwerpen De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: Anna’s Hoeve.

272



SI21.

SI221 Moleculaire Celbiologie (stress en adaptatie) Vakcode

SI221

Studielast

10

Ingangseis

gevolgd hebben: SI201 Celbiologie II (pag. 258) (10 EC) en SI213 Moleculaire

Periode(n)

Semester 2 (periode 4: 5 februari t/m 23 maart 2007)

Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. T. Munnik (coördinator), dr. M. Rep, dr.ir. R.C. Schuurink, mw. dr. G.J.

Biologie, Biochemie en Microbiologie T (pag. 260) (8 EC)

Smits, dr. F.L.W. Takken, dr. M.J. Teixeira de Mattos Inlichtingen

dr. T. Munnik telefoon: +31 20 5257763 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie

Leerdoel

De cursus Moleculaire Celbiologie (stress en adaptatie) (SI221) is een gecombineerde theoretische- en praktische cursus die er op is gericht een breder inzicht te verschaffen in de moleculaire- en celbiologische processen die ten grondslag liggen aan het vermogen van een organisme om zich continu aan zijn veranderende leefomgeving aan te kunnen passen. Het theoretische deel bestaat uit hoorcolleges die een introductie vormen op werkcolleges waarin een aantal publicaties uit de recente literatuur zal worden besproken. Het practische gedeelte bestaat uit een 3-weekse ministage waarbij studenten deel zullen nemen aan het lopende onderzoek. Inhoud

273


Centraal in deze cursus staan Stress en Adaptatie. De moleculaire mechanismes hierachter zijn vaak universeel en cruciaal voor het leven van planten, dieren en microorganismen. Microorganismen staan bijvoorbeeld continu bloot aan veranderende temperaturen, zuurgraad, vochtigheid, zuurstofgehaltes en nutriënten. Hoe meten microorganismen veranderingen in hun omgeving, hoe passen ze zich aan, en met welke meetmethoden kan een onderzoeker dat zichtbaar maken en kwantificeren? Vele microorgansimen gebruiken de mens of planten als gastheer. Sommige van deze micro-organismen zijn ziektemakend of zelfs dodelijk (pathogeen) terwijl anderen ons weer van dienst zijn, en dat is wederzijds (symbiotisch). Maar hoe weet de gastheer nu of het een ‘vriend’ of een ‘vijand’ betreft? Hoe herkent hij ze, hoe weert hij ze af, of hoe haalt hij ze binnen in het geval van een symbiose? Het pathogene micro-organisme probeert alle verdedigingslinies van de gastheer te omzeilen. De gastheer zal op zijn beurt weer proberen de pathogeen te slim af te zijn. Pathogenen veroorzaken niet als enige stress bij planten en dieren. Planten staan bijvoorbeeld continu bloot aan verschillende ‘abiotische’ vormen van stress; denk aan uitdroging, hitte, kou, overstroming en zuurstof tekort. De plant kan niet voor deze stress



weglopen zoals wij dat kunnen en zal zich dus (fenotypisch) moeten aanpassen. Het aanpassend vermogen van planten en microorganismen is tot op het moleculaire niveau zeer goed uitgezocht en is een illustratie van de complexiteit van biologische regelsystemen. De stressresponsen van planten en microorganismen, hun wederzijdse moleculaire interacties en de signaal transductie systemen die de fysiologische aanpassingen sturen, zullen in deze cursus uitgebreid aan de orde komen. Aanmelden

via studieweb voor 24 december 2006 Onderwijsvorm

Tijdens de eerste 3 weken worden s’ochtends hoor- (en werk-) colleges gegeven om elk onderwerp te introduceren. Hierbij wordt materiaal uitgedeeld voor zelfstudie s’middags, als voorbereiding op de werkcolleges van de volgende ochtend. Aan het einde van de 3e week is er een tentamen. In de weken 4-6 zullen de studenten, individueel of in kleine groepjes (afhankelijk van aantal aanmeldingen), participeren in het lopende onderzoek, onder directe begeleiding van aio’s en postdocs in een van onze laboratoria (Microbiologie, Fytopathologie of Moleculaire Plantenfysiologie). Het praktijkgedeelte zal worden afgesloten met een presentatie en een kort verslag in week 7. Hoorcolleges

30 slu

Werkcolleges

90 slu

Practicum

120 slu

Extra studietijd

40 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Handouts en wetenschappelijke artikelen worden ter plekke verstrekt tegen kostprijs Toetsvorm

Toetsing vindt plaats door schriftelijke beantwoording van vragen over de stof behandeld in de hoor- en werkcolleges en door het schrijven van een uitreksel van een artikel dat tijdens de werkcolleges wordt uitgereikt. Practisch werk wordt beoordeeld op grond van de inzet en het inzicht die tijdens de ministage en in het verslag zijn getoond. Als weegfactoren voor het eindcijfer gelden: theoretisch gedeelte 50% (1/3 uitreksel, 2/3 toets), praktijk gedeelte 50%, (2/3 praktijk, 1/3 verslag). Men is geslaagd voor de cursus als het gewogen gemiddelde van de twee deelcijfers tenminste 6,0 bedraagt en geen der deelcijfers lager is dan een 5,0.

274



Bijzonderheden

Locaties: REC en Anna's Hoeve. Specifieke locaties worden door de coördinator tijdig bekend gemaakt


275



SI301.

SI301 Endocrinologie Vakcode

SI301

Studielast

10

Ingangseis

SI201 Celbiologie II (pag. 258) (10 EC) en GE201 behaald

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

mw. prof.dr. M. Joels, dr. H. Krugers (coördinator), dr. P.J. Lucassen, dr. T. Vulsma

Inlichtingen

dr. H. Krugers telefoon: +31 20 5257621 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Na afloop van de cursus Endocrinologie (SI301) dient de student inzicht te hebben in hormonale regelsystemen in het dierenrijk, begrip te hebben over pathologie en op de hoogte te zijn van de toepassing van hormonen in de industrie en samenleving. Voorts moet de student in staat zijn om in korte tijd overzicht te krijgen van een afgebakend onderwerp in de endocrinologie aan de hand van literatuur, en hier mondeling en schriftelijk over te kunnen rapporteren. Inhoud

In het eerste deel van de cursus worden onderstaande onderwerpen in de vorm van werkcolleges behandeld: Werkingsmechanisme van hormonen (Herhalingsopdrachten); Hypothalamus en hypofyse; Vloeistofregulatie; Stress en adaptatie; Vet- en glucosehuishouding; Sexualiteit en reproductie; Calcium en botgroei; Vergelijkende endocrinologie; Schildklier en metabolisme; Groei en ontwikkeling Aanmelden


Als voorbereiding op de werkcolleges wordt studenten gevraagd een aantal opdrachten uit te voeren gebruik makend van literatuur die van te voren wordt verstrekt. Tijdens het werkcollege wordt dieper op de opdrachten ingegaan. Aan het eind van ieder werkcollege wordt een flitstoets gehouden die betrekking heeft op de stof die tijdens het werkcollege aan de orde is gekomen. Men moet tenminste 8 van de in totaal 9 flitstoetsen hebben afgelegd. Het gemiddelde cijfer van deze toetsen telt mee voor het eindcijfer. Het tweede gedeelte van de cursus bestaat uit een schrijfopdracht waarin een afgebakend onderwerp over hormonen in industrie en samenleving wordt uitgewerkt. Deze opdracht

276



zal aan het eind van de cursus mondeling worden gepresenteerd. Een aantal opdrachten zal worden gebundeld in een syllabus. Daarnaast zal de relatie tussen hormonen en industrie worden belicht door een werkbezoek aan een farmaceutisch bedrijf. Literatuurstudie

105 slu

Practicum / werkcollege

35 slu

Opdracht

100 slu

Extra studietijd

80 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Syllabus (ca. € 20) Aantal deelnemers

Minimaal 10, maximaal 24 studenten Toetsvorm

Toetsing vind plaats door schriftelijke beantwoording van (herhalings)vragen over de stof behandeld in de hoor/werkcolleges. De opdracht wordt beoordeeld op grond van het verslag en mondelinge presentatie. Als weegfactoren voor het eindcijfer gelden: schriftelijke toets(en) 60%, opdracht 40%. De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Opleidingen Biologie

Bijzonderheden

Locatie: Kruislaan 320 (Anna’s Hoeve)

277



SI303.

SI303 Neurobiologie Vakcode

SI303

Studielast

10

Ingangseis

SI201 Celbiologie II (pag. 258) (10 EC) behaald

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. J.A. van Hooft (coördinator)

(en diverse docenten van het SILS, het IOI en

het NIH) Inlichtingen

dr. J.A. van Hooft telefoon: +31 20 5257705 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Na afloop van de cursus Neurobiologie (SI303) heeft de student inzicht in: ■ ■

■ ■

■

■

■ ■

de macro- en microanatomie van de hersenen. de elektrische voortgeleiding en chemische overdracht van signalen in het centraal zenuwstelsel. de vorming van cellulaire contacten in de hersenen, met name tijdens de ontwikkeling. de basisprocessen tijdens synaptische plasticiteit, leren en geheugen. de mechanismen van celdood, toxiciteit, neuro-degeneratie en -regeneratie en herstel, alsmede de betekenis hiervan voor neurodegeneratieve ziektes. de rol van de hersenen in homeostatische controle (voedselinname, sexueel gedrag, bioritmiek, slaap). de processen tijdens episodische ziekteprocessen zoals epilepsie en migraine. de fysiologie van de retina en de mechanismen van verwerking van visuele informatie door de hersenen.

De student heeft kennis gemaakt met enkele basistechnieken in het neurobiologisch onderzoek. De student is in staat om over een geselecteerde probleemstelling in de neurobiologie samen te vatten 1) wat de huidige inzichten zijn, 2) welke vragen op dit moment nog open zijn en 3) welke experimentele benadering men zou moeten kiezen om deze vragen te kunnen beantwoorden. Inhoud

Tijdens het eerste deel van de cursus zal uitgebreid worden ingegaan op de macro-en microanatomie van de hersenen en basisprincipes van de neurotransmissie. Deze onderwerpen worden geïntegreerd aangeboden in de vorm van hoorcolleges, werkcolleges en practica. Er zal ook worden stilgestaan bij de technieken die gebruikt worden om vorm en functie van het zenuwstelsel te bestuderen. Dit deel wordt afgesloten met een multiple

278



choice toets, waarvoor een voldoende gehaald moet worden om aan de rest van de curus te mogen deelnemen. In het vervolg van de cursus zal nader worden ingegaan op de (plastische) veranderingen in het zenuwstelsel tijdens ontwikkeling, het volwassen leven en neurodegeneratieve processen. Onderwerpen als synapsvorming, degeneratie en regeneratie, en synaptische plasticiteit op cellulair en moleculair niveau bv. tijdens leer- en geheugenprocessen zullen aan de orde komen. De rol van deze processen bij een aantal ziektes, zoals Parkinson, Huntington, prionenziektes en ischemie alsmede de mogelijkheden die deze inzichten geven bij de causale behandeling van neurodegeneratieve aandoeningen zal worden toegelicht. Verder zal aandacht besteed worden aan de rol van de hypothalamus bij homeostatische controle: voedselinname, sexueel gedrag en sexuele differentiatie, en de biologische klok. Verder zal uitgebreid aandacht worden besteed aan de processing van visuele informatie, van retina tot visuele hersenschors. Dit deel wordt afgesloten met een (open boek) tentamen. Aanmelden


Afgezien van het eerste onderdeel wordt het onderwijs d.m.v. hoorcolleges tijdens de ochtend aangeboden De cursus wordt afgesloten met een schrijfopdracht, in het Engels. Hierbij gaan studenten dieper in op een van de onderwerpen die tijdens de cursus aan de orde zijn gekomen. Van de studenten wordt gevraagd 1) een overzicht te geven van de huidige inzichten betreffende het onderwerp en 2) aan te geven hoe dit onderzoek zou kunnen worden voortgezet (en van welke diermodellen hierbij gebruik wordt gemaakt). De schrijfopdracht wordt nabesproken met de begeleidende docent. 105 slu


55 slu

zelfstudie/essay

120 slu

Totaal

280 slu


Hoorcolleges

Onderwijstijden


De colleges worden aan de hand van een leerboek gegeven (Principles of Neural Science, 4th edition, Kandel et al.). Het boek kan via de coördinerende docent worden aangeschaft (nadere informatie volgt voorafgaande aan de cursus). Kosten (met korting) ca. € 90,-. Overig lesmateriaal wordt tegen kostprijs verstrekt.

279



Aantal deelnemers


Deelcijfer I: toets (10%), en essay (40%) Deelcijfer II: tentamen (50%) De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. De cursus wordt pas als afgerond beschouwd als de schrijfopdracht is nabesproken met de begeleidende docent. Bijzonderheden

Locatie: Anna’s Hoeve

280



SI304.

SI304 Voeding Vakcode

SI304

Studielast

10

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof.dr. S. Brul (coördinator)

Inlichtingen

prof.dr. S. Brul

(en gastdocenten)



Leerdoel

De behandelde grondbeginselen van de voedingsleer, de fysiologie en patho-fysiologie in relatie tot voeding kennen en kunnen toepassen in verschillende aspecten van voeding en gezondheid, voedselveiligheid en voedingsonderzoek. Het kunnen toepassen van genomics technologieën op deze gebieden. Artikelen over voedingsonderzoek kritisch kunnen lezen en dat doen blijken in het kunnen rapporteren in woord en geschrift over recente ontwikkelingen in het voedingsonderzoek. Inhoud

Bij start van de cursus wordt de (humane) celbiologie kennis uit het eerste jaar als bekend aangenomen. Vervolgens wordt aandacht geschonken aan de volgende thema's: ■

■

281


■

Fysiologie van de voeding met als onderwerpen: de biochemische omzetting van voedsel- componenten en fysiologische regeling van voedselopname; biochemie en metabolisme van de voeding; micronutrienten; interactie tussen nutrienten en geneesmiddelen; radicalen, antioxidanten en kanker; additieven, contaminanten en voedselinfecties; ondervoeding, voedselhulp en interventiestrategieen. (2 weken) Ziekte en voeding met als onderwerpen: voeding van zuigelingen, kinderen en adolescenten; voeding van volwassenen en ouderen; obesitas; anorexia; hart- en vaatziekten; allergie en IBS met voedingsvezel; IBD en voeding; de ziekte van Crohn; microbieel voedselbederf & infectie. (2 weken) Toegepast onderzoek betreffende voeding, gezondheid en voedselveiligheid omvat een aantal bedrijfsbezoeken naar o.a. Centre for Food Science, Numico; NIZO; TNO Kwaliteit van Leven te Zeist; Unilever Food Research Center Vlaardingen. Overzichten van het onderzoekprogramma, productontwikkeling, functional foods, kwaliteitssystemen, conserveren en verpakken, en consumentengedrag worden onder meer gepresenteerd naast bezoeken aan verschillende afdelingen binnen het bedrijf. (2 weken)



■

De vaardigheidstraining bestaat uit het schrijven van een miniscriptie over een voedingsgerelateerd onderwerp en een voordracht over dit onderwerp aan de hand van zelfgemaakte powerpoint presentaties.


Humane Celbiologie Alberts, het programma van jaar 1 en 2 Aanmelden


-Hoorcolleges in de ochtenden van de eerste vier weken van de cursus. -Werkuren in de middagen met te voren vastgelegde contacturen -Tentamen gevolgd door, -Literatuur opdracht met contacturen. De laatste 2 weken van de cursus bevat de bedrijfsbezoeken en twee eindpresentaties Hoorcolleges

150 slu


50 slu

Opdracht

80 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Staat op Blackboard De volgende twee boeken worden als achtergrond informatie aanbevolen: Advanced Nutrition and Human Metabolism 4th edition Gropper et al., Thompson Wadsworth, USA kosten ~100 euro Food Microbiology: An Introduction Montville, T.J. & Mathews K.R. (eds.) kosten ~70 euro Gezien de kostprijs van de boeken zullen ze ter inzage worden aangeboden tijdens de cursus. Kosten

Geen extra kosten. Er wordt sterk geadviseerd de bovengenoemde boeken aan te schaffen (wellicht tweedehands).

282



Aantal deelnemers

25 Toetsvorm

Tentamen 50% en referaat plus essay 50%. Men is geslaagd als het eindcijfer gelijk aan of hoger dan 6,0 is en de deelcijfers niet lager zijn dan 5,0. Bijzonderheden

Locatie: Roeterseiland, AMC, Bedrijfsbezoeken (onder voorbehoud): Wageningen, Vlaardingen, Zeist


283



SI305.

SI305 Bio-informatica Vakcode

SI305

Studielast

10

Ingangseis

n.v.t.

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof. dr. W. Crielaard, prof. dr. M.A. Haring, dr.ir. H.C.J. Hoefsloot (coördinator), dr. M. Rep, prof. dr. H.V. Westerhoff, prof. dr. A.H. Zwinderman

Inlichtingen

dr.ir. H.C.J. Hoefsloot telefoon: +31 20 5255867 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biomedische wetenschappen (Medische Biologie) Bachelor Biologie Bachelor Bio-exact (pag. 260)

Leerdoel

Begrip van de basisprincipes die ten grondslag liggen aan gangbare methoden die gebruikt worden in de bioinformatica. Er zal niet diep worden ingegaan op de wiskundige aspecten; het doel is eerder om vanuit een pragmatisch oogpunt een overzicht over de verschillende beschikbare methoden te geven. Het zelf leren omgaan met bioinformatische databases, algorithmes en tools is een essentieel onderdeel van deze cursus. Inhoud

In de module Bio-informatica (SI305) komen o.a. de volgende onderwerpen aan de orde: ■ ■

■

■

■

■

■

Inleiding (internet-gebruik, bioinformatische databases, medline) Sequentie-analyse van eiwitten en DNA (sequence alignment m.b.v. FASTA en BLAST, motif searching, gene finding) Analyse van microarray-experimenten (digitaliseren grafische intensiteiten, clustering van expressie-profielen, detectie van regel-elementen in niet-coderend DNA) Alternative cluster analyses Proteomics (identificatie van expressieprofielen op eiwitniveau via massaspectrometrie) Moleculaire structuur (visualisatie van eiwitten m.b.v. RASMOL, dynamisch modelleren van eiwitten, homology modelling) Analyse en simulatie van metabole netwerken & systeem biologie (pathway databases, metabolic control analysis, simulatie van metabole netwerken)

Aanmelden

Via studieweb voor 22 oktober 2006

284



Onderwijsvorm

Week 1 t/m 4: Colleges en Computerpractica De ochtenden worden besteed aan hoorcolleges, de middagen zijn gereserveerd voor computerpractica, waarin de in de colleges besproken methoden in de praktijk worden toegepast. Week 5: Toets Gereserveerd voor een toets over de in week 1 t/m 4 behandelde stof. Week 6 & 7: Miniproject & Sympiosum Mini-projecten in kleine groepjes. Keuze uit het toepassen van bioinformatische methoden op een biologisch probleem, of een eenvoudige programmeeropdracht. Voorbereiding en geven voordracht voor een symposium met medestudenten als gehoor; nabespreking miniproject en symposium. Hoorcolleges

120 slu


80 slu

Miniproject & Symposium

80 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Aantal deelnemers


Miniproject & symposium (30%) Schriftelijke toets, opdrachten tijdens practica & werkcolleges (70%) De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: Kruislaan 318 (Anna's Hoeve), Kruislaan 404 (Matrix IV) en Roeterseiland.

285


Aangeraden, niet verplicht. Fundamental Concepts of Bioinformatics, Dan E. Krane & Michael L. Raymer ISBN: 0-8053-4633-3 (Publisher: Benjamin Cummings), nieuwste editie. Handouts en cd-roms worden tijdens cursus uitgereikt tegen kostprijs (ca. € 15,-)



SI306.

SI306 Cognitieve Neurowetenschappen Vakcode

SI306

Studielast

10

Ingangseis

SI303 Neurobiologie (pag. 278) (10 EC) gevolgd

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof.dr. C.M.A. Pennartz (coördinator)

(Docenten van het SILS-CNS en

docenten van diverse andere instituten) Inlichtingen

prof.dr. C.M.A. Pennartz telefoon: +31 20 5257638 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Na afloop van de cursus Cognitieve Neurowetenschappen (SI306) hebben de studenten inzicht in: ■

■

■

■ ■

■

■

■

de centrale verwerking van sensorische informatie; de neurale grondslagen van perceptie, attentie en neurale processen die een rol spelen bij bewustzijn; de neurale grondslagen van leerprocessen, geheugen en emotie; theorie en computermodellen van neuronale netwerken voor leerprocessen; functies die samenhangen met de prefrontale cortex: strategie en planning, sociaal gedrag en waardering van omgevingsprikkels; de manier waarop informatie in de hersenen wordt gecodeerd door neuronale populaties; functionele stoornissen zoals depressie, schizofrenie, angststoornissen en verslaving; technieken die in de cognitieve neurofysiologie gebruikt worden: single-unit afleiding, ensemble afleidingen, gedragsstudie, neurofarmacologie, humane brain imaging en informatie theorie.

Studenten zullen participeren in onderzoek binnen de cognitieve neurowetenschappen en zullen naar aanleiding hiervan een schriftelijke en mondelinge rapportage verzorgen. Hierbij zullen zij getraind worden in het opzetten en uitvoeren van experimenten en het plaatsen van een onderzoeksproject in een bredere, theoretische en biomedische context. Medisch Biologen volgen het volledige programma van hoorcolleges; voor Psychobiologen die de psychonomie-module 'Brein & Cognitie' hebben gevolgd, geldt vrijstelling voor een beperkt aantal inleidende colleges. In plaats hiervan krijgt de laatste groep een vervangende opdracht (schrijven van een onderzoeksvoorstel).

286



Inhoud

In deze cursus staat een fundamentele vraag centraal: hoe zijn groepen van hersencellen in staat om complexe cognitieve processen uit te voeren, zoals visuele perceptie, opslag en recall van herinneringen, sociaal gedrag en zelfs bewustzijn? Deze algemene vragen worden in de cursus uitgewerkt door allereerst in te gaan op zowel de "microscopische"(single-cell) als "macroscopische" processen die te maken hebben met visuele informatieverwerking, aandacht, geheugen, emoties en functies van de prefrontale cortex zoals planning. Qua methodes ligt de nadruk op technieken zoals afleiding van de elektrische aktiviteit van de enkele hersencel (single-unit recording), gedragsstudies, neurologisch onderzoek naar effecten van hersenbeschadiging en humane brain imaging. Vervolgens gaan we dieper in op nieuwe technieken om een brug te slaan tussen het microscopische niveau van het enkele neuron en het macroscopische niveau van gedrag en cognitie. Hierbij staat onderzoek aan neuronale netwerken centraal, zowel theoretisch als experimenteel. Het theoretische onderzoek naar neuronale netwerken wordt uitgelegd aan de hand van computermodellen van associatief geheugen. In het experimentele onderzoek worden technieken onder de loep genomen, waarmee electrische aktiviteit van tientallen neuronen tegelijk kan worden gemeten en richten we ons op vragen als: hoe werken groepen van neuronen samen om na een leerervaring een geheugenspoor vast te leggen en te consolideren? Wat is de rol van synchronie in neurale aktiviteit bij perceptie en geheugenvorming? Hoe worden bewegingen gecodeerd door groepen neuronen in de motorische cortex? Tenslotte wordt aandacht besteed aan stoornissen in cognitieve functies, zoals angst, schizofrenie, depressie en drugsverslaving. Hierbij wordt voortgebouwd op de inleidende colleges over aanverwante onderwerpen in SI303 Neurobiologie (pag. 278) (10 EC)(Med.Biologie) en Psychonomie (Psychobiologie).


SI303 Neurobiologie (pag. 278) (10 EC) Aanmelden

Via studieweb voor 24 december 2006

287


De cursus bevat twee praktische onderdelen. Ten eerste worden er Research Workshops georganiseerd waarin de student participeert in experimenteel onderzoek in de cognitieve neurowetenschappen. Verdieping van de theoretische achtergrond van dit onderzoek vindt plaats door literatuurstudie, maar veel aandacht gaat ook uit naar het structureren van een experiment, technieken en analysemethoden. Ten tweede bevat de cursus een computerpraktikum waarin elementaire simulaties van neurale netwerken worden uitgevoerd en geanalyseerd. De praktische onderdelen worden afgesloten met schriftelijke rapportages en een mondelinge presentatie voor de groep.



Onderwijsvorm

De cursus bestaat voornamelijk uit hoorcolleges, participatie in onderzoek en computersimulaties. Participatie in onderzoek gebeurt in groepen van 3-4 studenten. Verdere componenten zijn: literatuurstudie, verslaglegging en mondelinge presentatie. De hierboven beschreven stof wordt getoetst middels een schriftelijk tentamen. Voor Psychobiologie studenten geldt een lichtelijk aangepast programma in verband met hun voorkennis vanuit de cursus Brein en Cognitie. Zij volgen minder colleges en worden gevraagd een onderzoeksvoorstel te schrijven. Hoorcolleges Med.Biologen

110 slu

Participatie in experimenten, onderzoek, verslag, presentatie 100 slu computermodellen

70 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


De colleges worden aan de hand van een syllabus gegeven die tegen kostprijs (inclusief auteursrechten) wordt aangeboden. Kosten ca. € 20,-. Daarnaast wordt gebruik gemaakt van een nader te bepalen leerboek. Aantal deelnemers

Maximaal 20 studenten, deze cursus is alleen toegankelijk voor studenten Biomedische Wetenschappen. Toetsvorm

Deelcijfer I: tentamen (50%) Deelcijfer II: research workshop (30% verslag en mondelinge presentatie), computerpraktikum (20%). De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: Anna's Hoeve. Voertaal is in principe Nederlands; kan veranderen in Engels afhankelijk van de deelnemerspopulatie Cursus staat ook open voor Master of Science studenten (Cognitive Science en Biology & Cognition) indien er plaats is en aan ingangseisen voldaan is.

288



SI308.

SI308 Eukaryote Genregulatie Vakcode

SI308

Studielast

10

Ingangseis

cursus SI201 Celbiologie II (pag. 258) (10 EC)behaald hebben

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof.dr. R. van Driel (coördinator), dr.ir. P.F. Fransz

Inlichtingen

prof.dr. R. van Driel

(en gastdocenten)



Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Eukaryote genregulatie (SI308): Het verwerven van inzicht in: (1) genregulatie mechanismen die ten grondslag liggen aan celdifferentiatie. De nadruk ligt op chromatine structuur en epigenetische regulatie mechanismen; (2) celkern-architectuur in relatie tot genregulatie; (3) multidisciplinaire aanpak om genregulatie te bestuderen. Inhoud

Het onderwijs wordt gegeven in de vorm van colleges, analyse van recente publicaties en enkele projecten. De projecten worden uitgevoerd in kleine groepjes (2 – 4 studenten).

289


Eukaryote genomen bevatten 6.000 (gist) tot 35.000 genen (mens). Om optimaal te kunnen functioneren moet een individu deze genen selectief en op het juiste moment en op de juiste plaats in een meercellig organisme tot expressie laten komen, bijvoorbeeld tijdens de embryonale ontwikkeling of in reactie op externe stimuli. De eukaryote celkern heeft een aantal mechanismen op verschillende niveaus van DNA organisatie om groepen genen specifiek tot expressie te laten komen of om deze juist te onderdrukken. Daarbij speelt de structuur en opvouwing van chromatine een belangrijke rol. Het onderzoek naar factoren die betrokken zijn bij de hogere orde genregulatie is vooral de laatste jaren sterk tot ontwikkeling gekomen. Tijdens deze cursus komen de volgende onderwerpen aan bod: (1) klassieke modellen en moderne concepten van genregulatie, (2) chromosoom-organisatie en de rol van niet-coderend DNA sequenties, (3) transcriptie factoren, (4) chromatinestructuur, (5) epigenetica (de studie van overerfbare veranderingen in genfunctie, die niet verklaard kunnen worden door wijzigingen in de nucleotidensequentie van het DNA), (6) nieuwe onderzoeksmethoden, en toepassingen in moderne technologieën (biotechnologie, biomedische aspecten), en (7) toepassingsvelden, zoals bijv. genetische modificatie van eukaryoten, klonering van organismen en gentherapie.



Tijdens een project wordt de kennis van de stof verbreed en verdiept, resulterend in een voordracht of een poster-presentatie. Aanmelden


Hoorcolleges

50 slu

Projecten

92 slu

Rapportage

12 slu

Literatuurstudie

126 slu

Totaal

280

Onderwijstijden


Wordt nader bekend gemaakt en tijdens de module uitgereikt. Aantal deelnemers


De toetsing vindt plaats door beoordeling van de uit te voeren projecten (50%) en een tentamen over collegestof (50%). De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: Alle hoorcolleges worden gegeven op Anna’s Hoeve.

290



SI31.

SI313 Neurofarmacologie Vakcode

SI313

Studielast

10

Ingangseis

SI201 Celbiologie II (pag. 258) (10 EC) behaald hebben

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. A.E. Alewijnse, prof.dr. C.G. Kruse, dr. J.H. van Maarseveen, prof. dr M.C. Michel, dr. S.L.M. Peters, dr. T.R. Werkman (coördinator)

Inlichtingen

dr. T.R. Werkman telefoon: +31 20 5257632 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel ■

■

■

■

Inhoud

De cursus Neurofarmacologie (SI313) start met een uiteenzetting over een hersenziekte, de huidige behandeling met geneesmiddelen en de problemen / beperkingen die daarbij optreden. Vervolgens wordt duidelijk gemaakt hoe tijdens de verschillende onderdelen van de cursus wordt ingegaan op de basisprincipes van geneesmiddelenontwikkeling en de huidige vraagstellingen daarin. Tijdens het eerste deel van de cursus wordt diep ingegaan op de farmaco-kinetische en dynamische aspecten van geneesmiddelen: hoe en met welke snelheid verdelen geneesmiddelen zich over de verschillende lichaamscompartimenten? Verder worden de huidige

291


■

Na afloop dient de student inzicht te hebben in het werkingsmechanisme, metabolisme en de verdeling van geneesmiddelen, in het bijzonder neurofarmaca. Algemene principes van de werking van geneesmiddelen op signaaltransductie worden bekend verondersteld. De student heeft dan tevens inzicht en vaardigheden in de technieken en testen die bij farmacologisch onderzoek worden toegepast. De student heeft kennisgemaakt met de verschillende aspecten van research & development van geneesmiddelen in een farmaceutisch bedrijf. Specifieke aspecten die hiermee samenhangen, zoals bv. octrooi aanvragen, zijn na de cursus in essentie bekend. De student heeft kennis genomen van moderne methodes bij ontwikkeling van geneesmiddelen, zoals bv. drug-modelling. De student is in staat om over een specifiek toepassingsgebied in korte tijd samen te vatten welke neurofarmaca er momenteel beschikbaar zijn, welke problemen aan het gebruik van de beschikbare middelen kleven en hoe eventueel nieuwe geneesmiddelen zouden kunnen worden ontwikkeld.



farmacotherapieën bij verschillende ziektebeelden besproken, in het bijzonder bij neurologische en psychiatrische aandoeningen. Ook maken studenten tijdens dit deel van de cursus kennis met de structuur van organische verbindingen. Zo wordt inzicht verkregen in het belang van de ruimtelijke structuur van verbindingen, die voor een belangrijk deel hun werkzaamheid als geneesmiddel bepaalt. Vervolgens maken de studenten gedurende circa drie dagen kennis met de ontwikkeling van geneesmiddelen in een farmaceutisch bedrijf, t.w. Solvay Pharmaceuticals. Het complete traject van Research en Development zal worden toegelicht door medewerkers van het bedrijf en waar mogelijk geïllustreerd worden aan voorbeelden uit de praktijk. Het laatste onderdeel van de cursus betreft een individuele schrijfopdracht. Studenten wordt gevraagd om over een bepaald ziektebeeld aan te geven 1) welke farmacotherapie op dit moment beschikbaar is, 2) op welke punten de bestaande therapie te kort schiet, 3) welke nieuwe, causale therapie ontwikkeld zou kunnen worden en 4) welk R & D traject hiervoor zou moeten worden ontwikkeld. Aanbevolen voorkennis

Een basale kennis over onderwerpen uit de neurobiologie zoals neurotransmitters, receptoren, second messengers, ion kanalen etc. is onontbeerlijk. Studenten van andere studierichtingen en/of opleidingen die niet de cursus van de ingangseis hebben gedaan, dienen voor inschrijving eerst contact op te nemen met de coördinator van de cursus dr. T.R. Werkman. Aanmelden

Via studieweb voor 24 december 2006. Let op: Biomedische Wetenschappers melden zich aan voor SI313M en Psychobiologen voor SI313P. Onderwijsvorm

Het eerste onderdeel van de cursus wordt aangeboden als geïntegreerd geheel van hoor-en werkcolleges, computerondersteund onderwijs en practicumproeven. Over dit onderdeel zal een schriftelijk tentamen (neurofarmacologie) worden afgenomen. Aan het eind van het bezoek aan Solvay (de kennismaking met een farmaceutisch bedrijf) zal een schriftelijke toets worden afgenomen over het onderdeel R&D in het bedrijfsleven. Het laatste deel van de cursus bestaat uit een individuele schrijfopdracht, waarover tevens een mondelinge presentatie moet worden gehouden. De opdracht wordt in de laatste week van de cursus met de student besproken. Hoorcollege's / zelfstudie 120 slu Practicum / werkcollege

60 slu

Opdracht

100 slu

Totaal

280 slu

292



Onderwijstijden


Handleidingen worden tegen kostprijs verkocht. Nadere informatie wordt voorafgaand aan de cursus verstrekt. Aantal deelnemers

Maximale capaciteit is: 12 studenten Biomedische Wetenschappen en 13 studenten Psychobiologie. Toetsvorm

Tentamen neurofarmacologie (weegfactor 50 %); onderdeel R&D in het bedrijf / schrijfopdracht / voordracht (resp. weegfactoren 10, 30 en 10%). De student is geslaagd voor de cursus als 1) het gewogen gemiddelde van de twee deelcijfers tenminste 6,0 bedraagt en 2) geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

De cursus wordt in het Engels gegeven Locatie: AMC; Solvay Pharmaceuticals, Weesp, Science Park Amsterdam


293



SI314.

SI314 Communicatie en Signaaltransductie Vakcode

SI314

Studielast

10

Ingangseis

behaald hebben SI201 Celbiologie II (pag. 258) (10 EC)

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

dr. T. Munnik, dr. M. Rep, dr.ir. R.C. Schuurink (coördinator), dr. F.L.W. Takken

Inlichtingen

(en eventuele gastdocenten)

dr.ir. R.C. Schuurink telefoon: +31 20 5257933 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biologie Bachelor Bio-exact (pag. 260)

Leerdoel

Leerdoelen van de cursus Communicatie en Signaaltransductie (SI314): Zelfwerkzaamheid en inzicht ontwikkelen met betrekking tot communicatie en signaaloverdracht-systemen in de biologie. Kennismaken met de concepten en onderliggende moleculaire processen. Leren verwerken van vakliteratuur en dit presenteren. Zelfstandig een project uitvoeren waarbij biochemische en moleculaire technieken aan de orde komen en de uitgevoerde experimenten kunnen interpreteren en presenteren, zowel mondeling als schriftelijk. Inhoud

Nadruk ligt op signaleringssystemen die planten gebruiken om intern en extern te kunnen communiceren en om op verschillende biotische en abiotische stressfactoren te kunnen reageren. Er zal gekeken worden naar de activatoren, zoals hormonen, feromonen en pathogeen-gecodeerde virulentie en avirulentie factoren en de bijbehorende receptoren en cellulaire signaalstoffen. Deze signaleringssystemen zullen vergeleken worden met die in dieren en micro-organismen. Vragen met betrekking tot de implicatie van communicatie en signaaloverdracht-systemen voor het functioneren van organismen in hun ecologische niche worden behandeld. De cursus beweegt zich op het raakvlak van de moleculaire biologie, de biochemie, de fysiologie en de fytopathologie. Aanmelden


Na een inleidend college verdiepen de studenten zich in de meest recente vakliteratuur en bediscussiëren bestaande concepten en modellen. Het theoretische gedeelte wordt met een toets afgesloten. Daarna gaan de studenten indien mogelijk individueel aan een project werken (indien het deelname aantal te groot is, zal er in groepjes worden

294



gewerkt). Hierbij kan naar keuze ervaring opgedaan worden met: 1) vluchtige signaalstoffen die planten gebruiken om met elkaar en met insecten te communiceren, gebruikmakend van mutanten en transgene planten; 2) signaaltransductie-routes waarbij fosfolipiden een sleutelrol spelen, gebruikmakend van eiwit- en lipidebiochemie en transgene planten waarin signaleringsgenen up- of down-gereguleerd zijn; 3) karakterisatie van factoren die een pathogeen in staat stellen een plant te infecteren; en 4) analyse van plantreceptoren betrokken bij pathogeen-perceptie (R eiwitten). Het praktijkgedeelte wordt afgesloten met een presentatie en een kort verslag. Hoorcolleges

30 slu

Werkcolleges

90 slu

Practicum/Opdracht

120 slu

Extra studietijd

40 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


Achtergrondinformatie en artikelen worden ter plekke verstrekt tegen kostprijs Aantal deelnemers

18 Toetsvorm


Locatie: Anna’s Hoeve, collegezaal en laboratorium plantenfysiologie en fytopathologie

295


50% theorie (1/3 abstracts en presentatie, 2/3 toets) = deelcijfer 1 50% praktijk (1/3 praktisch werk, 1/3 presentatie, 1/3 verslag) = deelcijfer 2



SI315.

SI315 Medische Moleculaire Biologie Vakcode

SI315

Studielast

10

Ingangseis

behaald hebben: SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T

Periode(n)


(pag. 260) (8 EC) Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof.dr. S. Brul, mw. dr. G.J. Smits, dr. J.C. van der Spek (coördinator)

(en


dr. J.C. van der Spek telefoon: +31 20 5257921 [email protected]

Onderdeel van

Bachelor Biomedische wetenschappen (Medische Biologie) Bachelor Biologie Bachelor Bio-exact (pag. 260)

Leerdoel

Verdieping van de kennis van de moleculaire- en celbiologische processen die de basis vormen van humane ziektebeelden. Het kunnen benoemen/beschrijven en toepassen/gebruiken van moleculair biologische technologieën en modelorganismen die ingezet worden bij de diagnose en verdere studie van deze ziekten. Inhoud

De cursus Medische Moleculaire Biologie (SI315) omvat drie delen: ■

■

■

Verdieping fundamenteel moleculair biologische principes (genexpressie en transcriptionele netwerken; de wereld van het RNA; diversiteit van eiwitten; dynamiek en stabiliteit van DNA) Moleculaire Biologie en ziekten (o.a. Moleculaire diagnostiek; Nutrigenomics en voedsel-gerelateerde infecties; Prionziekten; Mitochondriale ziekten). Moleculaire biologie: technologieën en modelsystemen (o.a. Moleculaire biologie en selectie; Gist als modelsyteem; C. elegans als modelsysteem; Celkweek en RNAi; Medische biotechnologie)

Demonstratie: gebruik van verschillende modelsystemen en moleculair biologische technologieën, waaronder micro-array technologie en kwantitatieve PCR. Aanmelden


Tijdens het eerste deel van de module (ca. vier weken) zullen hoorcolleges worden gegeven. De leerstof zal tijdens werkcolleges worden verwerkt en verdiept, waarbij vaar-

296



digheden zullen worden getraind die nodig zijn voor het uitvoeren en ontwikkelen van onderzoek. Daarnaast zullen demonstraties worden gegeven die gericht zijn op kennismaking met en het kunnen toepassen/gebruiken van verschillende moleculair-biologische technologieën en modelsystemen. Voor het tweede deel van de module (ca. drie weken), het schrijven van een onderzoeksvoorstel, heb je keuze uit verschillende projecten. Je werkt in kleine groepen waarin discussie en een goede taakverdeling centraal staan. Na evaluatie van een voorlopig onderzoeksvoorstel door andere groepen zal het onderzoeksvoorstel door middel van een verslag worden gerapporteerd en op een minisymposium worden gepresenteerd. Het doel is om alle aspecten van een onderzoeksvoorstel aan de orde te laten komen, waarbij er voldoende ruimte is voor discussie, reflectie en het mondeling of schriftelijk presenteren van de bevindingen aan medestudenten. Hoorcollege

60 slu

Practicum/demonstratie

20 slu

Literatuurstudie

20 slu

Opdrachten

20 slu

Eigen project

120 slu

Extra studietijd

40 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd bij de desbetreffende Bachelor op de website http://www.student.uva.nl . Hand-outs, artikelen etc. zullen tijdens de module worden verstrekt. Aantal deelnemers

24 Toetsvorm

Aanwezigheid bij werkcolleges is verplicht. De kennis wordt getoetst tijdens het tentamen (essayvragen over de stof die in de hoor- en werkcolleges behandeld is; weegfactor 60%) en door middel van het onderzoeksvoorstel (weegfactor 40%). De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is.

297


Studiemateriaal



SI316.

SI316 Mechanismen en Modellen in de Cognitieve Neurowetenschappen Vakcode

SI316

Studielast

10

Ingangseis

SI220 Neurofysiologie (pag. 271) (10 EC) behaald

Periode(n)


Onderwijsinstituut


Verzorgd door


Docent(en)

prof.dr. C.M.A. Pennartz (coördinator)

(Docenten van het SILS-CNS en

docenten van diverse andere instituten) Inlichtingen

prof.dr. C.M.A. Pennartz telefoon: +31 20 5257638 [email protected]

Onderdeel van


Leerdoel

Na afloop van de cursus Mechanismen en Modellen in de Cognitieve Neurowetenschappen (SI316) hebben de studenten inzicht in: ■

■

■

■ ■

■

■

■

de centrale verwerking van sensorische informatie de neurale grondslagen van perceptie, attentie en neurale processen die een rol spelen bij bewustzijn de neurale grondslagen van leerprocessen, geheugen en emotie theorie en computermodellen van neuronale netwerken voor leerprocessen functies die samenhangen met de prefrontale cortex: strategie en planning, sociaal gedrag en waardering van omgevingsprikkels de manier waarop informatie in de hersenen wordt gecodeerd door neuronale populaties functionele stoornissen, zoals depressie, schizofrenie, angststoornissen en verslaving technieken die in de cognitieve neurofysiologie gebruikt worden: single-unit afleiding, ensemble afleidingen, gedragsstudie, neurofarmacologie, humane brain imaging en informatie theorie

Studenten zullen participeren in onderzoek binnen de cognitieve neurowetenschappen en zullen naar aanleiding hiervan een schriftelijke en mondelinge rapportage verzorgen. Hierbij zullen zij getraind worden in het opzetten en uitvoeren van experimenten en het plaatsen van een onderzoeksproject in een bredere, theoretische en biomedische context. Deze module vertoont een sterke overlap met cursus SI306 Cognitieve Neurowetenschappen (pag. 286) (10 EC) voor Medisch Biologen. Indien deelnemende Psychobiologie studenten de psychonomie-module ‘Brein & Cognitie’ hebben gevolgd, geldt vrijstelling voor een beperkt aantal inleidende colleges. In plaats hiervan wordt een vervangende opdracht uitgevoerd (schrijven van een onderzoeksvoorstel). De inhoud van de colleges is

298



afgestemd op de stof uit “Brein en Cognitie” en gaat met name dieper in op de hersenmechanismen en modellen van cognitieve processen, die voorheen vooral op psychologisch niveau zijn behandeld. Inhoud

In deze cursus staat een fundamentele vraag centraal: hoe zijn groepen van hersencellen in staat om complexe cognitieve processen uit te voeren, zoals visuele perceptie, opslag en recall van herinneringen, sociaal gedrag en zelfs bewustzijn? Deze algemene vragen worden in de cursus uitgewerkt door allereerst in te gaan op zowel de "microscopische" (single-cell) als "macroscopische" processen die te maken hebben met visuele informatieverwerking, aandacht, geheugen, emoties en functies van de prefrontale cortex zoals planning. Qua methodes ligt de nadruk op technieken zoals afleiding van de elektrische aktiviteit van de enkele hersencel (single-unit recording), gedragsstudies, neurologisch onderzoek naar effecten van hersenbeschadiging en humane brain imaging.

De cursus bevat twee praktische onderdelen. Ten eerste worden er Research Workshops georganiseerd waarin de student participeert in experimenteel onderzoek in de cognitieve neurowetenschappen. Verdieping van de theoretische achtergrond van dit onderzoek vindt plaats door literatuurstudie, maar veel aandacht gaat ook uit naar het structureren van een experiment, technieken en analysemethoden. Ten tweede bevat de cursus een computerpraktikum waarin elementaire simulaties van neurale netwerken worden uitgevoerd en geanalyseerd. De praktische onderdelen worden afgesloten met schriftelijke rapportages en een mondelinge presentatie voor de groep. Aanbevolen voorkennis

Psychobiologen: (SI220)

299


Vervolgens gaan we dieper in op nieuwe technieken om een brug te slaan tussen het microscopische niveau van het enkele neuron en het macroscopische niveau van gedrag en cognitie. Hierbij staat onderzoek aan neuronale netwerken centraal, zowel theoretisch als experimenteel. Het theoretische onderzoek naar neuronale netwerken wordt uitgelegd aan de hand van computermodellen van associatief geheugen. In het experimentele onderzoek worden technieken onder de loep genomen, waarmee electrische aktiviteit van tientallen neuronen tegelijk kan worden gemeten en richten we ons op vragen als: hoe werken groepen van neuronen samen om na een leerervaring een geheugenspoor vast te leggen en te consolideren? Wat is de rol van synchronie in neurale aktiviteit bij perceptie en geheugenvorming? Hoe worden bewegingen gecodeerd door groepen neuronen in de motorische cortex? Tenslotte wordt aandacht besteed aan stoornissen in cognitieve functies, zoals angst, schizofrenie, depressie en drugsverslaving. Hierbij wordt voortgebouwd op de inleidende colleges over aanverwante onderwerpen in SI303 Neurobiologie (pag. 278) (10 EC) en PS300 Psychonomie (pag. 256) (30 EC).



Aanmelden


De cursus bestaat voornamelijk uit hoorcolleges, participatie in onderzoek en computersimulaties. Participatie in onderzoek gebeurt in groepen van 3-4 studenten en omvat het schrijven van een onderzoeksvoorstel. Verdere componenten zijn: literatuurstudie, verslaglegging en mondelinge presentatie. De hierboven beschreven stof wordt getoetst middels een schriftelijk tentamen. Hoorcolleges Psychobiologen

90 slu

Participatie in experimenten, onderzoek, verslag, presentatie 120 slu Computermodellen

70 slu

Totaal

280 slu

Onderwijstijden


De colleges worden aan de hand van een syllabus gegeven die tegen kostprijs (inclusief auteursrechten) wordt aangeboden. Kosten ca. € 20,-. Daarnaast wordt gebruik gemaakt van een nader te bepalen leerboek. Aantal deelnemers

max. 20, deze cursus is alleen toegankelijk voor Psychobiologen Toetsvorm

Deelcijfer I: tentamen (50%) Deelcijfer II: research workshop (30%; verslag, onderzoeksvoorstel en mondelinge presentatie), computerpraktikum (20%). De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer hoger dan of gelijk aan 6,0 is en geen der deelcijfers lager dan 5,0 is. Bijzonderheden

Locatie: Anna's Hoeve. Voertaal is Nederlands; kan echter veranderen in Engels afhankelijk van de deelnemerspopulatie. Cursus staat ook open voor Master of Science studenten (Cognitive Science en Biology & Cognition) indien er plaats is en aan ingangseisen voldaan is.

300


Bijlage

6 Bijlage 6.1

Opel idngenBiol gie

Vakperiodes studiejaar 2006/2007

Het studiejaar begint op maandag 4 september 2006. Vanwege de invoering van een nieuw semestersysteem zijn de periodes en de einddatum voor het eerste jaar anders dan voor het tweede en derde jaar. Het eerste jaar eindigt 29 juni. Het tweede en derde jaar eindigt op 6 juli. Eerste jaar 1e semester

start week 36:

4 september 2006

Sluiting studieweb

Blok 1

week 36 t/m 43

4 september t/m 27 oktober 2006

Geen inschrijving voor eerstejaars vakken

Blok 2

week 44 t/m 51

30 oktober t/m 22 december 2006


Blok 3

week 2 t/m 5

8 januari t/m 2 februari 2007


2e semester

start week 6:

5 februari 2007

Blok 4

week 6 t/m 13

5 februari t/m 30 maart 2007


Blok 5

week 15 t/m 18

10 april t/m 4 mei 2007


Blok 6a

week 19 t/m 22

7 mei t/m 1 juni 2007


Blok 6b

week 23 t/m 26

4 juni t/m 29 juni 2007

Geen inschrijving voor eerstejaars vakken Opleidingen Biologie

301


Bijlage

Tweede en Derde jaar 1e semester

start week 36:

4 september 2006

Sluiting studieweb

periode 1

week 36 t/m 42

4 september t/m 20 oktober 2006

23 juli 2006

periode 2*

week 43 t/m 48

23 oktober t/m 1 december 2006

10 september 2006

periode 3

week 49 t/m 5

4 december 2006 t/m 2 februari 2007

22 oktober 2006

*Let op: periode 2 duurt 6 weken! 2e semester

start week 6:

5 februari 2007

Sluiting studieweb

periode 4

week 6 t/m 12

5 februari t/m 23 maart 2007

24 december 2006

periode 5

week 13 t/m 20

26 maart t/m 18 mei 2007

11 februari 2007

periode 6

week 21 t/m 27

21 mei t/m 6 juli 2007

9 April 2007

6.2

Onderwijsvrije dagen

Onderwijsvrije dagen Kerstvakantie: 25 december 2006 t/m 5 januari 2007 Vakantie: 2 april t/m 9 april 2007, LET OP: 3 en 5 april HERKANSING Koninginnedag: maandag 30 april 2007 Dag van de Arbeid: dinsdag 1 mei 2007 Hemelvaart: 17, 18 mei 2007 Pinksteren: 28 mei 2007 Zomervakantie 1e jaars: 2 juli t/m 31 augustus 2007 Zomervakantie 2e en 3e jaars: 9 juli t/m 31 augustus 2007

302

Blok 1

(1/3)

Blok 2

(1/6)

Blok 3

Blok 4

1013 Academische Basisvaardigheden 6 EC

(1/3) (1/6) 1012 Basis Statistiek 6 EC

1002 Genetica & Evolutie 10 EC


1001 Biochemie & Celbiologie 10 EC

1004 1003 Communicatie Anatomie & Fysiologie van Dieren in de Biologie 10 EC 4 EC

Alle studierichtingen Bio-medische wetenschappen + Psychobiologie Biologie Bio-medische wetenschappen Psychobiologie

Blok 5

1005 Biologie van Planten 4 EC

1008 Neuroanatomie & Fysiologie 4 EC

Blok 6a

Blok 6b

1007 Organismen in het Milieu 6 EC

Blok 6

1006 Ecologie I 4 EC

1009 Mens en Ziekte 10 EC

1010 Statistiek & Methodologie 5 EC 1011 Inleiding Gedrag 5 EC

ACADEMISCHE BASISVAARDIGHEDEN

BASIS STATISTIEK

(bijdrage aan eindcijfer)

BIOLOGIE

BIO-MEDISCHE WETENSCHAPPEN

PSYCHOBIOLOGIE

6.3

INRICHTING EERSTE STUDIEJAAR BIOLOGIE, BIO-MEDISCHE WETENSCHAPPEN EN PSYCHOBIOLOGIE CURRICULUM PER SEPTEMBER 2006


Bijlage

Stroomschema's Biologie, Biomedische wetenschappen en Psychobiologie

303

304 Inleiding Aardwetenschappen

IB303 Natuurbehoud en Biodiversiteit 10 EC

Periode 2

Minor Aardwetenschappen Ecosystemen v/d Wereld/ Geomorfol. Processen/ Inleiding Klimatologie

Landschapsanalyse/ Inleiding Remote Sensing/ GIS

LO260 Communicatie en Didactiek 10 EC

IB312 Theoretische Biologie 10 EC

IB308 Mariene Biologie 10 EC

Periode 4

IB210B Evolutie en Gedrag 10 EC

Periode 4

IB313 Ecosystemen v/d Wereld & Tropische Ecologie (Ecol. III) 10 EC

290A Miniscriptie 6 EC

Periode 3

Periode 3

282A Beroepsethiek 4 EC

* In periode 2 t/m 4 van het 3e studiejaar is het mogelijk een minor Aardwetenschappen te volgen. ** In periode 1 t/m 4 van het 3e studiejaar is het mogelijk 1 vrij keuzevak van 10 EC te volgen.


IB311 Microbiële Ecologie 10 EC

IB301 Paleo-ecologie 10 EC

Periode 1

IB201 Systematiek en Biogeografie 10 EC

IB202 Evolutionaire Genetica 10 EC

3E JAAR

Periode 2

Periode 1

2E JAAR Periode 6

Periode 5

Oriëntatiefase Eindthesis Afsluiten Bachelor Voorbereiding Master 20 EC

Periode 6

IB209 Aquatische en Terrestrische Ecologie (Ecologie II) 20 EC

Periode 5

BACHELORPROGRAMMA BIOLOGIE ECOLOGIE EN BIODIVERSITEIT 2006-2007


Bijlage

Periode 1

Periode 3

SI305 Bioinformatica 10 EC

Periode 3

SI201 Celbiologie II 10 EC


Periode 4

LO 260 Communicatie en Didactiek 10 EC

SI308 Eukaryote Genregulatie 10 EC

Periode 4

SI221 Moleculaire Celbiologie (Stress en Adaptatie) 10 EC

* In periode 1 t/m 4 van het 3e studiejaar is het mogelijk 1 vrij keuzevak van 10 EC te volgen.


Periode 2

altern.met SI215

Periode 2 SI217 Mol.Biol. en Biochem. P 6 EC

SI314 Communicatie en Signaaltransductie 10 EC

alternerend met SI217

SI215 Immunologie TP 6 EC

SI315 Medische Moleculaire Biologie 10 EC

3E JAAR

Periode 1 SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie, Microbiologie T 8 EC

2E JAAR

Periode 5

Periode 6

altern.290A

Periode 6 282A 290A BeroepsMiniscriptie ethiek 6 EC 4 EC alternerend met 282A

Oriëntatiefase Eindthesis Afsluiten Bachelor Voorbereiden Master 20 EC

Periode 5 SI219 Celregulatie en Moleculaire Microscopie van de Levende Cel 10 EC

BACHELORPROGRAMMA BIOLOGIE MOLECULAIRE CELBIOLOGIE EN BIOINFORMATICA 2006-2007


Bijlage

305

306 SI301 Endocrinologie 10 EC

IB306 Epidemiologie 10 EC

GE302A Medische Microbiologie, Bacteriologie, Virologie en Parasitologie 10 EC

SI315 Medische Moleculaire Microbiologie 10 EC

Periode 4

SI313 Neurofarmacologie 10 EC

GE304A Medische Biochemie 10 EC

SI304 Voeding 10 EC


SI308 Eukaryote Genregulatie 10 EC

SI306 Cognitieve Neurowetenschappen 10 EC

SI303 Neurobiologie 10 EC

Periode 4

SI305 Bioinformatica 10 EC

GE201 Algemene Anatomie en Fysiologie van de Mens 10 EC

Periode 3


Periode 3

* In periode 1 t/m 4 van het 3e studiejaar is het mogelijk 1 vrij keuzevak van 10 EC te volgen


GE303A Anatomie en Ontwikkelingsbiologie 10 EC

GE305 Moleculaire en Klinische Genetica 10 EC

SI217 Mol. Biol. en Biochemie P 6 EC altern. met SI215

Periode 2

Periode 2

alternerend met SI217

SI215 Immunologie TP 6 EC

Periode 1

3E JAAR

Periode 1 SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T 8 EC

2E JAAR

Periode 5

Periode 6

alternerend met 282A

290A Miniscriptie 6 EC

Periode 6 282A Beroepsethiek 4 EC altern. 290A


Periode 5 SI219 Celregulatie en Moleculaire Microscopie van de Levende Cel 10 EC

BACHELORPROGRAMMA BIO-MEDISCHE WETENSCHAPPEN 2006-2007


Bijlage

Periode 1

3E JAAR

Periode 2

Periode 2

PS201 Onderzoek in de Psychologie 12 EC

Periode 3


Periode 3

PS300 Derdejaarsvakken Psychonomie bij de opleiding Psychologie 30 EC

Periode 1

SI218 Moleculaire Biologie en Biochemie T 8 EC


2E JAAR


IB210P Evolutie en Gedrag 10 EC

SI313 Neurofarmacologie 10 EC

Periode 4 SI316 Mechanismen en modellen i.d. cognitieve Neurowetenschappen 10 EC

GE201 Algemene Anatomie en Fysiologie van de Mens 10 EC

Periode 4

Periode 5

Periode 6

altern. 290P

Periode 6 282A 290P BeroepsMiniscriptie ethiek 6 EC 4 EC alternerend met 282A


SI220 Neurofysiologie 10 EC

Periode 5

BACHELORPROGRAMMA PSYCHOBIOLOGIE 2006-2007


Bijlage

307


Bijlage

6.4

Herkansingsrooster studiejaar 2006-2007

o = ochtend 9-12 uur m = middag 13-16 uur Bachelorcursus

2e herkansing

laatste kans vervallen vakken

001

9 januari 2007, o

002

9 januari 2007, m

003

3 april 2007, o

004/009

3 april 2007, m

005

8 januari 2007, o

5 april 2007, o

006

8 januari 2007, m

5 april 2007, m

007

8 januari 2007, o

5 april 2007, o

008

8 januari 2007, m

5 april 2007, m

010

5 april 2007, o

011

29 mei 2007, 13-15 uur

Bachelorcursus

1e herkansing

2e herkansing

1001 Biochemie & Celbiologie

8 januari 2007, o

16 juli 2007, o

1002 Genetica & Evolutie

5 april 2007, o

20 juli 2007, m

1003 Communicatie in de Biologie 9 juli 2007, o

20 augustus 2007, o

1004 Anatomie & Fysiologie van Dieren

13 juli 2007, m

1e semester 2007-2008

1005 Biologie van planten

20 juli 2007, o


1006 Ecologie

17 augustus 2007, o


1007 Organismen in het milieu

17 augustus 2007, m


1008 Neuroanatomie/fysiologie

20 juli 2007, o


1009 Mens en ziekte

17 augustus 2007, o


1010 Statistiek Psychobiologie

17 augustus 2007, o


1011 Inleiding gedrag

17 augustus 2007, m


1012 Basis statistiek

6 juli 2007, o

24 augustus 2007, m

Periode I: IB202, IB301, IB311, LO260, SI213, SI218, SI315, GE305, GE302A

8 januari 2007, o

16 juli 2007, m

308


Bijlage

Periode II: IB201, IB303, SI215, SI217, SI314, GE303A, SI301, IB306, PS201

5 april 2007, m

20 juli 2007, m

Periode III: 282A Bio, IB313, IB308, SI201, SI305, GE304A, SI303, SI304

16 juli 2007, o


PS300

apart herkansingsrooster

Periode IV: IB210, IB312, LO260, SI221, GE201, SI308, SI306, SI313, SI316

20 juli 2007, o


Periode V: SI219, SI220

13 augustus 2007, o


Periode VI: IB209, 282A Biomed. en Psychobio, Orientatiefasecursussen

17 augustus 2007, o

1e semester 2007- 2008


309


Bijlage

310


Cursusindex AW1026 AW1042 AW1043 AW1161 AW1111 AW1102 AW1062 1007 AW1123 AW2165 AW2091 AW2155 AW2160 AW2071 AW2132 AW2051 AW2021 AW2112 AW3242 AW2042 AW3286 AW3335 AW3281 AW3290 AW3310 AW3295 AW1026 AW1161 AW2140 AW1102 AW2021 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008

Fysisch Geografische Systemen Natuurwetenschappelijke Basis I Natuurwetenschappelijke Basis II Inleiding Aardwetenschappen Wiskunde Landschapsanalyse Atmosferische fysica 1007 Organismen in het Milieu Basis Veldprakticum Water Management Statistiek Chemie, Bodem en Water I Chemie, Bodem en Water II Geomorfologische Processen Programmeren in Matlab GIS/Remote Sensing Ecosystemen van de Wereld Veldprakticum Luxemburg Oriënterende Stage Klimatologie Theorie en Praktijk van GIS en Remote Sensing Microscopie Materiaal-eigenschappen Meetstrategieën Modelleren en Simuleren Bachelor Thesis Fysisch Geografische Systemen Inleiding Aardwetenschappen Inleiding Klimatologie Landschapsanalyse Ecosystemen van de Wereld 1001 Biochemie & Celbiologie 1002 Genetica & Evolutie 1003 Communicatie in de Biologie 1004 Anatomie & Fysiologie van Dieren 1005 Biologie van Planten 1006 Ecologie I 1007 Organismen in het Milieu 1008 Neuro-anatomie & Fysiologie

77 79 81 83 87 89 91 93 96 97 99 100 102 103 104 105 107 109 111 113 114 116 118 120 122 124 126 128 132 134 136 169 172 174 176 178 180 182 185

311


1009 1010 1011 1012 1013 282A

1009 Mens en Ziekte 187 1010 Statistiek en Methodologie 190 1011 Inleiding Gedrag 192 1012 Basis Statistiek 194 1013 Academische Basisvaardigheden 196 282A Beroepsethiek voor Biologen, Biomedische wetenschappers en Psychobiologen 197 290A/P 290A/P Miniscriptie 199 ECDO Onderwijsaanbod Expertisecentrum Duurzame Ontwikkeling 202 ECDO GE201 GE201 Algemene Anatomie en Fysiologie van de Mens 204 GE305 GE305 Moleculaire en Klinische Genetica 206 GE302A GE302A Medische Microbiologie; Bacteriologie, Virologie en Parasitologie209 GE303A GE303A Anatomie en Ontwikkelingsbiologie 213 GE304A GE304A Medische Biochemie 215 IB202 IB202 Evolutionaire Genetica 217 IB201 IB201 Systematiek en Biogeografie 219 IB209 IB209 Aquatische en Terrestrische Ecologie (Ecologie II) 221 IB210 IB210 Evolutie en Gedrag 224 IB301 IB301 Paleo-ecologie 226 IB303 IB303 Natuurbehoud en Biodiversiteit 229 IB306 IB306 Epidemiologie 232 IB308 IB308 Mariene Biologie 235 IB311 IB311 Microbiële Ecologie 238 IB312 IB312 Theoretische Biologie 241 IB313 Ecosystemen van de Wereld/Tropische Ecologie (Ecologie III) 244 IB313 LO260 LO260 Didactiek en Communicatie 248 ORFA ORFA Oriëntatiefase (Eindthesis) 252 PS201 PS201 Onderzoek in de Psychologie 254 PS300 PS300 Psychonomie 256 SI201 SI201 Celbiologie II 258 SI213 SI213 Moleculaire Biologie, Biochemie en Microbiologie T 260 SI215 SI215 Immunologie TP 262 SI217 SI217 Moleculaire Biologie en Biochemie P 264 SI218 SI218 Moleculaire Biologie en Biochemie T (voor Psychobiologen)266 SI219 Celregulatie en Moleculaire Microscopie van de Levende Cel 268 SI219 SI220 SI220 Neurofysiologie 271 SI221 SI221 Moleculaire Celbiologie (stress en adaptatie) 273 SI301 SI301 Endocrinologie 276 SI303 SI303 Neurobiologie 278 SI304 SI304 Voeding 281 SI305 SI305 Bio-informatica 284

312


SI306 SI308 SI313 SI314 SI315 SI316

SI306 Cognitieve Neurowetenschappen 286 SI308 Eukaryote Genregulatie 289 SI313 Neurofarmacologie 291 SI314 Communicatie en Signaaltransductie 294 SI315 Medische Moleculaire Biologie 296 SI316 Mechanismen en Modellen in de Cognitieve Neurowetenschappen 298

313


314


Trefwoordenlijst

206

Numerics 3d 89, 134 A Aanvraag-bachelorbul-pakket 159 Aardoppervlak 91, 113, 132 Aardwetenschappelijk 81 Aardwetenschappen 99, 100 Abiotische 107, 136 Abstract 79, 81 Adreswijziging 14 Afstudeervarianten 111 Afstudeerverklaring 160 Algemene anatomie en fysiologie van de mens (ge201) 204 Algemene biologie 143 Alumni 161 Alumnivereniging (de auv) 161 Analoge 81 Analyse 99, 109 Analyseren 120 Analyses 116 Analytische 87, 100 Anatomie en ontwikkelingsbiologie (ge303a) 213 Aquatische 100, 102 Arcgis 105, 114 Arcmap 105 Artikel 84, 129 Astronomische 113 Atmosfeer 91, 100, 132 Atmosferische 91, 100

B Bachelorbul 158 Bachelordiploma 163 Bachelorexamen 158 Bachelors thesis 124

bacteriologie, virologie en parasitologie (ge302a) 209 Basis 79, 81 Basisbegrippen 83, 128 Basisprincipes 91 Basistechnieken 99 Basistheorie 105 Bedrijvencontactdag 168 Beeld 114 Begeleidingsactiviteiten 146 Begrijpen 87 Begrippen 100 Beroepsethiek (282a) 198 Beroepsvereniging voor biologen 161 Beschrijvende 99 Bibliotheek 17 Bijvakstudent 25 Biogeochemische 100 Bio-informatica (si305) 284 Biologie 99 Biomedische wetenschappen 147 Biotische 107, 136 Blackboard 17, 19 Bodem 89, 100, 102, 109, 114, 134 Bodemchemie 100 Bodemchemisch 120 Bodemkunde 83, 128 Bodemmateriaal 116 Bodemmaterialen 83, 128 Bodemvormende 83, 128 Bodemwarmtestroom 113 Bodemwater 102 Boekverkoop 157 Broeikaseffect 132 Buitenland 26

C

Causale 79, 81 Celbiologie ii (si201) 258 Celregulatie en moleculaire microscopie van de levende cel (si219) 268 Centrale studentenraad (csr) 6 Cgr 157 Change 114 Chemie 100, 102

315


Chemische 91, 100, 102 Circulatie 91 Classificatie 83, 105, 109, 114, 128 Coached self-tuition 114 Cognitieve neurowetenschappen (si306) 286 Collegekaart 17 Collegezaal 157 Collegezalen 5 Communicatie & educatie 124 Communicatie en signaaltransductie (si314) 294 Computer gebruikers ruimten 157 Computerpracticum 99 Computerprogramma 104 Computerzalen 17 Concretiseren 79, 81 Congo 157, 160 Contactpersoon internationalisering 26, 27 Contactpunt biologen alumni 161 Cum laude’ 159 Cycli 100

D

Databases 105, 114 Debuggen 104 Decaan 6 Deelcijfers 13 Determinatiegesteente 83, 128 Didactiek en communicatie (lo260) 248 Differentiaalvergelijkingen 87 Differentiatie 87 Differentiëren 87 Digitale 90, 135 Documentatiecentrum 27 Documentatiekast 167 Dossierverklaring 15 Driedimensionale 89, 134 Dynamische processen 122 Dynamische systemen 87

E Ecognition 114 Ecologie en biodiversiteit 143 Ecosystemen 83, 107, 128, 136

316

Ecosystemen van de wereld/tropische ecologie (ecologie iii) (ib313) 244 Eerste jaar 144 Eigenschappen 83, 128 Eindcijfer 14 El niño 132 Electrochemie 100 en 132 Endocrinologie (si301) 276 Energiebalans 113 Epidemiologie (ib306) 232 Erdas 89, 114, 134 Erosie 103 Esri 105 European credits 13 Evaluatie 14, 112 Evenwichten 100 Evolutie en gedrag (ib210) 224 Examencommissie 156 Excursie 84, 109, 129 Experiment 79, 81 Experimental design 120 Experimenten 120

F Facultaire fileserver 158 Facultaire studentenraad (fsr) 6 File i/o 104 Financiële regelingen 23 Folia 20 Foutenvoortplanting 114 Fronten 91 Functie 112 Functies 104 Functioneel 81 Functionele analyse 87 Functioneren 107, 136 Fysiotoop 109 Fysiotooptypen 110 Fysisch 91, 116 Fysische 77, 91, 113, 126 Fysisch-geografische 113 Fysisch-mathematische 113


G

Gegevens 104, 105, 114 Gekarteerd 120 Gekwantificeerd 113 Geodatabase 105 Geo-databases 114 Geografie 77, 126 Geografisch 116 Geografische 113 Geografische informatie systemen 105, 114 Geologie 83, 90, 109, 128, 135 Geologische 83, 128 Geomorfologie 83, 89, 109, 128, 134 Geomorfologische 83, 128 Geomorfologische processen 103 Geo-refereren 105 Geostatistiek 120 Gesteente 89, 134 Gis 105, 114 Google earth 89, 134 Grenslaagmeteorologie 113 Grondmonsters 116 Gymnorhina 161

H Hydrologie 109 Hydrologische 113

I Identificeren 81 Immunologie tp (si215) 262 Informatie beheer groep 15 Inleiding 100 Instituut voor biodiversiteit en ecosysteem dynamica (ibed) 8 Integratie 87 Integreren 87, 109 Interacties 100 Interpretatie 89, 109, 114, 134 Interpreteren 83, 89, 128, 134 Intri 105 Introductie 146 Inzicht 100, 102, 109 Ionenuitwisseling 102

K Kaart 109 Kaarten 83, 89, 128, 134 Kaartmateriaal 89, 134 Kansrekening 99 Kansverdeling 99 Karteringen 109 Kenmerken 107, 136 Kennismaking 77, 126 Klimaat 113 Klimaatsysteem 132 Klimaatszones 107, 136 Klimaten 91, 132 Klimatologie 113 Klimatologische 113 Kopieerkaarten 158 Kopieermachines 158 Kriging 120

L

Laboratorium 116, 120 Landcover 114 Landgebruik 109 Landschap 77, 83, 84, 89, 114, 126, 128, 129, 134 Landschappelijke 109 Landschappen 89, 134 Landschapsecologie 109 Landschapsecologische 109 Landschapstypen 83, 89, 128, 134 Landschapsvormen 83, 128 Latente 113 Leerdoelen van de cursus eukaryote genregulatie (si308) 289 Leerdoelen van de cursus moleculaire biologie, biochemie en microbiologie t (si213) 260 Leerstoelen 8 Leestafel 158 Literatuur 79, 81 Luchtdruk 91 Luchtdruksystemen 91 Luchtfoto 109 Luchtfoto’s 114 Luchtfotokaart 89, 134

317


Luxemburg 105, 109

Multivariate 109

M

N

Maatschappelijk 124 Manipulatie 120 Mariene biologie (ib308) 235 Masteropleiding 163 Mastervoorlichting 167 Materiaalkarakterisering 120 Matlab 87, 104 Mechanismen 103 Mechanismen en modellen in de cognitieve neurowetenschappen (si316) 298 Mededelingen 158 Medezeggenschap 6 Medische biochemie (ge304a) 215 Medische microbiologie 209 Medische moleculaire biologie (si315) 296 Meetmethoden 103 Meetstrategie 120 Meetstrategieën 120 Menselijke 113 Metadata 114 Meten 120 Meteorologische 113 Methoden 83, 109, 128 Microscoop 116 Microscopen 116 Microscopie 116 Microscopische 116 Mijnuva 19 Milieuvreemde 102 Mineralen 102 Mineralogie 84, 129 Miniscriptie (290a/p) 200 Model 79, 81 Modellen 81, 114 Modelleren 122 Moleculaire biologie en biochemie p (si217) 264 Moleculaire biologie en biochemie t (si218) 266 Moleculaire celbiologie (stress en adaptatie) (si221) 273 Moleculaire celbiologie en bioinformatica 143

Natuurbehoud en biodiversiteit (ib303) 229 Natuurlijke 102 Natuurwetenschappelijke 79, 81 Ndvi 114 Nederlands 84, 129 Neerslag 91, 132 Neurobiologie (si303) 278 Neurofarmacologie (si313) 291 Neurofysiologie (si220) 271 Nibi 161 Noodfonds 23 Normale verdeling 99 Numerieke 87

318

O Oceaan 132 Oceaancirculatie 91 Onderwijs- en examenregeling 13 Onderwijs en examenregeling (oer) 147 Onderwijs en examenreglement (oer) 19 Onderwijsdirecteur 7 Onderwijsinstituut 7 Onderzoek 77, 126 Onderzoeken 87 Onderzoeksvoorstel 124 Ontstaan 91 Ontwerp 120 Ontwikkeling 87 Opbouw 91 Opleidingscommissie 155 Opleidingscommissie (oc) 6 Opleidingsteam 154 Oplossingsevenwichten 102 Oppervlakte 100 Oppervlaktewater 102 Organisch 102 Organische 100 Oriëntatie 124 Overstap 167 Ozonlaag 132


P Paleo-ecologie (ib301) 226 Parametervrije statistiek 99 Patronen 109 Patroonanalyse 114 Petrologie 83, 128 Practica 116 Practicum 116 Praktijk 111 Praktisch 109 Preparaten 116 Presentatie 87 Probleem 87 Proces 83, 128 Procesonderzoek 124 Processen 79, 81, 83, 89, 91, 100, 102, 109, 128, 132, 134 Programmaontwikkeling 104 Programmastructuur 104 Programmeren 104 Psychobiologie 147

R

Rapporten 83, 128 Rapporteren 83, 109, 128 Reacties 102 Redox 102 Reeksen 87 Regressie 99 Rekenprogramma 104 Relaties 79, 81, 109 Remote sensing 105, 114 Resultaten 79, 81, 120 Rs 105, 114 Ruimtelijke 105, 114, 120 Ruimtelijke patronen 120

S

Samenhang 77, 83, 107, 126, 128, 136 Satelliet 90, 105, 114, 135 Satellietbeeld 109 Schaal 89, 134 Schatten 99 Sedimentologie 83, 128

Segmentatie 114 Sensor 105 Simulatiemodel 79, 81 Simulatietechniek 122 Simuleren 79, 81 Slijpplaten 116 Socrates programma 26 Sorptie 100, 102 Specialisatiemogelijkheden 147 Spiegelstereoscoop 89, 134 Spotbeeld 105 Stabiliteit 91 Stage 111 Stationariteit 120 Statistiek 99 Statistisch 120 Stella 79, 81 Stereo-analyst 89, 134 Stereoluchtfoto’s 89, 134 Stichting bèta bedrijvencontactdag amsterdam (sbba) 168 Stochastisch proces 120 Stochastisch veld 120 Stochastische 99 Stochastische simulatie 120 Straling 113, 132 Stralingsbalans 113 Stroomschema's 147 Studenten services 28 Studentendecanen 153 Studentenhandboek 18 Studentenhuisartsen 153 Studentenmail 17, 18 Studentenpsychologen 153 Studentenstatuut 13 Studeren in het buitenland 27 Studieadvies 147 Studieadviseurs 153 Studiebelasting 13 Studiecentra 17 Studiecentrum 17 Studiepunten 27 Studieresultaten 153 Studievereniging 157, 160 Studieweb 17, 153

319


Swammerdam institute for life sciences (sils) 8 Symbolisch 87 Systeem 79, 81, 83, 128 Systeembeschrijving 79, 81 Systemen 81, 105

T

Technieken 83, 87, 99, 109, 116, 120, 122, 128 Temperatuur 91, 132 Temporele 120 Terrestrische 83, 128 Texel 77, 126 Theoretische 81 Theoretische biologie (ib312) 241 Thermodynamica 91 Tijdreeksen 120 Toepassen 109 Toepassing 77, 126 Toepassingen 116 Toetsen 99 Tracing 89, 134

U Uitwisselingsprogramma 26 Universiteit van amsterdam 5 Uva-dsl 18 Uva-inbel 18 Uvanetid 17

V

Vaardigheden 77, 104, 126 Variabele 99 Variabiliteit 120 Variant 111 Variatie 99 Vector-raster kaarten 105 Vegetatie 105, 109, 114 Vegetatiepatronen 122 Veldonderzoek 109 Veldwerk 77, 109, 126 Verbanden 83, 128 Verbindingen 102 Verdamping 113

320

Verdeling 91 Vergelijkingen 79, 81 Verschijnselen 83, 128 Vertalen 87, 104 Vertrouwenspersoon 154 Verwering 83, 102, 128 Verweringsprocessen 84, 129 Verwerking 104, 120 Verzuring 102 Visualisatie 104 Visualiseren 105 Voeding 281 Voelbare 113 Voorbereiding 109

W

Waarnemingen 83, 89, 128, 134 Warmtebalans 113 Warmtestromen 132 Warmtestroom 113 Water 100 Website 19 Werk 111 Wetenschappelijk 84, 129 Wind 91, 132 Wiskunde 87 Wiskundige 79, 81 Wiskundige software 87 Wolken 91 wolken 132

Z Zelfstudie 105

STUDIEGIDS LEVENS- EN A ARDWETENSCHAPPEN B IOLOGIE B IOMEDISCHE WETENSCHAPPEN P SYCHOBIOLOGIE

Recommend Documents