Biomedische wetenschappen BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen

Biomedische wetenschappen BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 20102011

Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

I

De opleiding Biomedische Wetenschappen richt zich op de biologie van de gezonde en de zieke mens, op het doen van wetenschappelijk onderzoek naar het ontstaan en verloop van ziektes en naar de mogelijkheden tot ingrijpen daarin. De opleiding wordt gekenmerkt door het aanbieden van kennis op alle in de biomedische wetenschappen te onderscheiden organisatieniveaus: van het moleculaire niveau tot en met het niveau van humane populaties en de samenleving. Met de opleiding wordt beoogd zodanige kennis, vaardigheid en inzicht bij te brengen op het gebied van de biomedische wetenschappen dat de afgestudeerde bachelor is toegerust voor een algemene, brede of specialistische masteropleiding in de biomedische wetenschappen of een aanverwante discipline, of kan uitstromen naar de arbeidsmarkt. Om de doelstellingen te bereiken is naast een brede biomedische basisopleiding aandacht voor algemene en academische vorming noodzakelijk. Belangrijke aspecten hierbij zijn het leren samenwerken en communiceren met collega's van diverse disciplines en vakgebieden. Eveneens is het essentieel dat de afgestudeerde zich bekwaamd heeft in het verantwoord kiezen in wetenschappelijke problematieken. Daarnaast is het noodzakelijk dat de student gedurende enige tijd actief deelneemt aan het biomedisch onderzoek. Bovenstaande doelen zijn uitgewerkt in de onderstaande eindtermen, ingedeeld volgens de Dublin-descriptoren. Het jaarschema 2010 - 2011 is te vinden op de FALW-website. Meer opleidingsinformatie is te vinden op de FALW-website. Een complete beschrijving van deze opleiding is te vinden in de Onderwijs- en Examenregeling op de FALW-website.


II

Inhoudsopgave

Honours Programme BMW Facultaire deel Honours programma

1 1

Stervariant cursussen Health & Life Sc.

1

Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen

1

Faculteitsoverstijgend deel HP Interdepartmental Honours Courses

2 2

BSc BMW jaar 1

3

BSc BMW jaar 2

3

BSc BMW jaar 2, keuzevakken

4

BSc BMW jaar 2, verplichte vakken

4

BSc BMW jaar 3

5

BSc BMW jaar 3, keuzevakken

5

BSc BMW jaar 3, verplichte vakken

6

Extern (buiten de VU) behaalde vakken op BSc-niveau

6

Vak: Bachelorstage (Bio / BMW)

6

Vak: Bachelorstage BMW

8

Vak: Bedreiging en afweer

9

Vak: Biochemie

11

Vak: Bioinformatica

12

Vak: Bioinformatica *

14

Vak: Biomedisch beleid & kennismanagement

14

Vak: Biomedische wetenschappen en maatschappij

15

Vak: Biotechnologie en maatschappelijke dynamiek

17

Vak: Brain and Behavior

18

Vak: Climate Change

18

Vak: Educating for the good life

18

Vak: Epidemiologie

19

Vak: Evolutie van de mens

20

Vak: Evolution and Human Behavior

21

Vak: Evolutionaire genetica

22

Vak: Evolutionaire genetica *

23

Vak: Five O’Clock Neurosciences (Honours)

23

Vak: Future Entrepreneur

25

Vak: Genen en diversiteit

25

Vak: God-Man-World

26

Vak: Governing Security

27

Vak: Honours course: Communication and Innovation in Health and Life Sciences

27

Vak: Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces

28

Vak: Honours Individueel Vak

29

Vak: Honours Leadership

29

Vak: How to survive 2050

29

Vak: HP AUC: Programming your World

29

Vak: HP UvA: Creativiteit

29


III

Vak: HP UvA: Governance of Aquatic

29

Vak: HP UvA: Intelligence Studies

30

Vak: HP UvA: Love

30

Vak: Humane anatomie en fysiologie

30

Vak: Humane Anatomie en Fysiologie *

32

Vak: Humane neurofysiologie

32

Vak: Humane ontwikkeling *

33

Vak: Humane ontwikkeling en evolutie

34

Vak: Illness-Image-Metaphor

35

Vak: Impact of an Empire

35

Vak: Individueel werk

36


36


36

Vak: Individueel werk ALW

36


36


36


37


37


37


37

Vak: Individueel werk pass/fail

37


37


38


38


38


38


38


38


39

Vak: Infectieziekten

39

Vak: Integratieve tumorcelbiologie

40

Vak: Internationale volksgezondheid

42

Vak: Levensvragen en wetenschap

43

Vak: Life and Work

44

Vak: Management van innovaties

45

Vak: Medical Genomics

46

Vak: Medische farmacologie

47

Vak: Methodologie en statistiek I

49

Vak: Methodologie en statistiek II

50

Vak: Moleculaire celbiologie

52

Vak: Moleculaire ontwikkelingsbiologie

53

Vak: Moleculaire ontwikkelingsbiologie *

55

Vak: Molecular Microbiology

55

Vak: Neurowetenschappen I

56

Vak: Neurowetenschappen I *

57


IV

Vak: Neurowetenschappen II: Genes and the brain

58

Vak: Neurowetenschappen III: monitoring the brain

59

Vak: New Anatomy

61

Vak: Oncologie

61

Vak: Oncologie *

63

Vak: Onderzoek in de biomedische wetenschappen I

64

Vak: Onderzoek in de biomedische wetenschappen II

64

Vak: Onderzoek in de biomedische wetenschappen III

65

Vak: Oriëntatie op onderzoek

66

Vak: Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij

67

Vak: Oriëntatie science educatie

68

Vak: Pathofysiologie van hart en circulatie

69

Vak: Pathologie

70

Vak: Pathologie *

72

Vak: Religion, Identity, Conflict

72

Vak: Structuurbiologie

72

Vak: The Roman Empire

74

Vak: The use of statistics in legal court cases

74

Vak: Theories of Consciousness

74

Vak: Uitbreiding bachelorthesis

74

Vak: Van molecuul tot mens

74

Vak: Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers

76

Vak: Wijsbegeerte in de biomedische wetenschappen

77


V

Honours Programme BMW Opleidingsdelen: - Facultaire deel Honours programma - Faculteitsoverstijgend deel HP

Facultaire deel Honours programma Opleidingsdelen: - Stervariant cursussen Health & Life Sc. - Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Uitbreiding bachelorthesis

Semester 2

3.0

A_HP-I-3

Stervariant cursussen Health & Life Sc. Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Bioinformatica *

Periode 4

3.0

A_HP470172

Evolutionaire genetica *

Periode 6

3.0

A_HP470053

3.0

A_HP470104

Humane Anatomie en Fysiologie * Humane ontwikkeling *

Periode 4

3.0

A_HP487008

Moleculaire ontwikkelingsbiologie *

Periode 5

3.0

A_HP470038

3.0

A_HP470199

3.0

A_HP470050

3.0

A_HP470042

Neurowetenschappen I * Oncologie *

Periode 6

Pathologie *

Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen Vakken:

Naam

Periode

Five O’Clock Neurosciences Periode 4+5 (Honours)

Credits

Code

6.0

A_HP003


8-6-2012 - Pagina 1 van 78

Honours course: Communication and Innovation in Health and Life Sciences

6.0

A_HP002

Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces

6.0

A_HP001

Faculteitsoverstijgend deel HP Opleidingsdelen: - Interdepartmental Honours Courses

Interdepartmental Honours Courses Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Brain and Behavior

Periode 5

6.0

OH_BAB

Climate Change

Periode 2

6.0

OH_CC

6.0

OH-EFG

Educating for the good life Evolution and Human Behavior

Periode 4

6.0

OH-EHB

Future Entrepreneur

Periode 5

6.0

OH_FE

God-Man-World

Periode 2

6.0

OH_GMW

Governing Security

6.0

OH_GS

Honours Individueel Vak

8.0

OH_EXT1

Honours Leadership

6.0

OH_LEAD

How to survive 2050

6.0

OH_HTS

HP AUC: Programming your World

6.0

OH_APYW

HP UvA: Creativiteit

6.0

OH_UCREA

HP UvA: Governance of Aquatic

6.0

OH_UGOAQ

HP UvA: Intelligence Studies

6.0

OH_UINST

HP UvA: Love

6.0

OH_ULOVE

Illness-Image-Metaphor

Periode 4

6.0

OH_IIM

Impact of an Empire

Periode 4

6.0

OH_IE

6.0

OH_LAW

Life and Work New Anatomy

Periode 1

6.0

OH_NA

Religion, Identity, Conflict

Periode 4

6.0

OH_RIC

The Roman Empire

6.0

OH_TRE

The use of statistics in legal court cases

6.0

OH-SLC


8-6-2012 - Pagina 2 van 78

Theories of Consciousness

Periode 1

6.0

OH_TOC

BSc BMW jaar 1 Met ingang van het academisch jaar 2010-2011 is het programma voor Biomedische wetenschappen herzien. Het eerste van jaar van het nieuwe curriculum start in september 2010, het tweede en derde jaar zal in september 2011 ingevoerd gaan worden. In het eerste jaar zijn alle vakken verplicht, er zijn geen keuzevakken. Het programma in het eerste jaar vormt een basis; het geeft een eerste overzicht van de Bio-medische wetenschappen en is bedoeld als een verbreding van de kennis op diverse terreinen. Er is voor gekozen om de cursussen van 8 weken thematisch op te zetten, en verschillende vakken met elkaar te integreren, zodat binnen een cursus alle organisatieniveaus aan de orde kunnen komen. De verschillende concepten van een cursus worden binnen de context van de gezonde en zieke mens aangeboden. De meeste cursussen behandelen per week een centraal thema. De thematische cursussen zijn in jaar 1: Genen en diversiteit, Van mens tot molecuul, Humane ontwikkeling en Evolutie en Bedreiging en afweer. De algemene en academische vaardigheden worden aangeleerd en geoefend in de thematische cursussen en verder verdiept in de cursussen van vier weken zoals Onderzoek in de biomedische wetenschappen I en II. Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Bedreiging en afweer

Periode 5

12.0

AB_470219

Genen en diversiteit

Periode 1

12.0

AB_470216

Humane ontwikkeling en evolutie

Periode 4

12.0

AB_470218

Onderzoek in de biomedische wetenschappen I

Periode 3

6.0

AB_470214

Onderzoek in de biomedische wetenschappen II

Periode 6

6.0

AB_470215

Van molecuul tot mens

Periode 2

12.0

AB_470217

BSc BMW jaar 2 Het tweede jaar van de bacheloropleiding is een verdere oriëntatie binnen de biomedische wetenschappen. Daarnaast wordt beoogd een verdieping van kennis, inzicht en vaardigheden op deelgebieden van de biomedische wetenschappen tot stand te brengen. Dit vormt de basis voor de differentiatie in het derde jaar. In het tweede jaar zijn alle vakken tot en met week 16 (2011) verplicht. Daarna, in de blokken van week 18-21 en 22-26, kunnen studenten twee maalkiezen uit meerdere keuzecursussen. Opleidingsdelen:


8-6-2012 - Pagina 3 van 78

- BSc BMW jaar 2, keuzevakken - BSc BMW jaar 2, verplichte vakken

BSc BMW jaar 2, keuzevakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Humane neurofysiologie

Periode 6

6.0

AB_487024

Infectieziekten

Periode 6

6.0

AB_471024

Internationale volksgezondheid

Periode 6

6.0

AB_470088

Moleculaire ontwikkelingsbiologie

Periode 5

6.0

AB_470038

Neurowetenschappen III: monitoring the brain

Periode 6

6.0

AB_470205

Oncologie

Periode 6

6.0

AB_470050

Oriëntatie op onderzoek

6.0

AB_470173

Pathofysiologie van hart en circulatie

6.0

AB_1015

BSc BMW jaar 2, verplichte vakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Biochemie

Periode 1

6.0

AB_470071

Biomedisch beleid & kennismanagement

Periode 2

6.0

AB_470022

6.0

AB_1011

Biomedische wetenschappen en maatschappij Humane anatomie en fysiologie

Periode 3

6.0

AB_470104

Medical Genomics

Periode 1

6.0

AB_487012

Medische farmacologie

Periode 4

6.0

AB_470032

Methodologie en statistiek I Periode 5

6.0

AB_470165

Neurowetenschappen I

6.0

AB_470199

Onderzoek in de biomedische wetenschappen III

6.0

AB_1014

Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij

1.0

AB_470098

6.0

AB_470042

Pathologie

Periode 2

Periode 1, Periode 4


8-6-2012 - Pagina 4 van 78

Wijsbegeerte in de biomedische wetenschappen

3.0

AB_1013

BSc BMW jaar 3 Het derde jaar vormt samen met het tweede jaar de tweede fase van de bacheloropleiding. In deze tweede fase is er ruimte voor een verdieping van kennis, inzicht en vaardigheden op deelgebieden. In het derde jaar kiezen studenten voor een deel hun eigen programma. Daarbij wordt ook tijd besteed aan oriëntatie op de verschillende richtingen die de masteropleiding biedt, zodat studenten aan het eind van het derde jaar een verantwoorde keuze maken uit verschillende differentiaties in de vervolg masteropleiding. Belangrijk onderdeel van het derde jaar is de bachelorstage. Opleidingsdelen: - BSc BMW jaar 3, keuzevakken - BSc BMW jaar 3, verplichte vakken - Extern (buiten de VU) behaalde vakken op BSc-niveau

BSc BMW jaar 3, keuzevakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Bioinformatica

Periode 4

6.0

AB_470172

Biotechnologie en Periode 5 maatschappelijke dynamiek

6.0

AB_487020

Epidemiologie

Periode 5

6.0

AB_470180

Evolutie van de mens

Periode 5

6.0

AB_470055

Evolutionaire genetica

Periode 6

6.0

AB_470053

Humane neurofysiologie

Periode 6

6.0

AB_487024

Infectieziekten

Periode 6

6.0

AB_471024

Integratieve tumorcelbiologie

Periode 5

6.0

AB_470057

Internationale volksgezondheid

Periode 6

6.0

AB_470088

Levensvragen en wetenschap

Periode 5

6.0

AB_470151

Management van innovaties Periode 6

6.0

AB_470195

Moleculaire celbiologie

Periode 6

6.0

AB_470079

Moleculaire ontwikkelingsbiologie

Periode 5

6.0

AB_470038

Molecular Microbiology

Period 5

6.0

AB_470610

Neurowetenschappen II: Genes and the brain

Periode 5

6.0

AB_470204

Neurowetenschappen III: monitoring the brain

Periode 6

6.0

AB_470205


8-6-2012 - Pagina 5 van 78

Oncologie

Periode 6

6.0

AB_470050

Oriëntatie science educatie

Periode 4

6.0

O_ORIBETA

Structuurbiologie

Periode 5

6.0

AB_470056

Wetenschapscommunicatie Periode 4 voor Bèta-onderzoekers

6.0

AB_470185

BSc BMW jaar 3, verplichte vakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Bachelorstage (Bio / BMW)

Semester 2

23.0

AB_470060

Bachelorstage BMW

23.0

AB_1070

Methodologie en statistiek II Periode 1

6.0

AB_470062

Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij

1.0

AB_470098

Extern (buiten de VU) behaalde vakken op BSc-niveau Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Individueel werk

0.0

ABE_001

Individueel werk

0.0

ABE_002

Individueel werk

0.0

ABE_003

Individueel werk ALW

0.0

ABE_004


0.0

ABE_005


0.0

ABE_006


0.0

ABE_007


0.0

ABE_008


0.0

ABE_009


0.0

ABE_010

Individueel werk pass/fail

0.0

ABE_011


0.0

ABE_012


0.0

ABE_013


0.0

ABE_014


0.0

ABE_015


0.0

ABE_016


0.0

ABE_017


0.0

ABE_018


0.0

ABE_019

Bachelorstage (Bio / BMW)


8-6-2012 - Pagina 6 van 78

Vakcode

AB_470060 (470060)

Periode

Semester 2

Credits

23.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit

Fac. der Aard- en Levenswetenschappen

Coördinator

dr. M.P. Bergman

Doel vak De bachelorstage heeft de volgende doelstellingen: Meewerken aan onderzoek in een omgeving waar Biomedisch en-/of Biologisch werk wordt verricht Training in academische vaardigheden. Hiertoe behoren: Een analyse maken van een Biomedisch/ Biologisch probleem Het schrijven van een individueel onderzoeksverslag Het geven van een mondelinge presentatie over onderzoeksresultaten Het maken en presenteren van een congresposter Oriënteren op een keuze voor een masteropleiding Eindtermen: Vakspecifiek: De student kan onder goede begeleiding zelfstandig onderzoek doen in het gekozen vakgebied en beschikt over praktische vaardigheden die hem daartoe in staat stellen. Met betrekking tot algemene academische vaardigheden: De student is in staat de wetenschappelijke literatuur m.b.t een nieuw onderwerp te ontsluiten en in korte tijd aan de hand van relevante artikelen kennis te nemen van de belangrijkste ontwikkelingen in het betreffende vakgebied; De student is in staat een projectvoorstel voor het eigen onderzoek te schrijven; De student heeft geleerd de voortgang tijdens de stage op een overzichtelijke wijze vast te leggen in een journaal; De student is in staat om over de door hem/haar behaalde wetenschappelijke resultaten tijdens de stage op een heldere wijze schriftelijk en mondeling te rapporteren, daarbij adequaat gebruik makend van diverse audiovisuele hulpmiddelen. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De bachelorstage vormt een belangrijk onderdeel van de bacheloropleiding. Tijdens deze stage oriënteert en specialiseert de student zich in een door hem/haar gekozen richting. De stage wordt afgesloten met het schrijven van een bachelorthesis. Tevens biedt de bachelorstage de student de gelegenheid zich te oriënteren op de keuzes die gemaakt moeten worden voor een masteropleiding en - binnen die opleiding - voor een keuze voor een onderzoekers- of maatschappijgerichte variant, of een afstudeertraject in de richting van communicatie en/of educatie. Onderwijsvorm De student loopt de onderzoeksstage op een wetenschappelijke afdeling of bij een onderzoeksinstelling of bedrijf waar wetenschappelijk onderzoek wordt gedaan Toetsvorm


8-6-2012 - Pagina 7 van 78

Het eindcijfer bestaat uit het cijfer van de stage, te bepalen door de stagebegeleiders. Hiervoor wordt een beoordelingsformulier gebruikt die beschikbaar is op de website van de faculteit. Literatuur Startliteratuur wordt aangedragen door de begeleider. De student zoekt vervolgens zelf verdere literatuur die nodig is om de stage tot een succes te maken. Informatie rond de stage is te vinden op de Blackboardsite. Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische wetenschappen. Overige informatie Studenten worden aangemoedigd reeds in het 2e jaar te beginnen met het oriënteren op - en voorbereiden van - hun onderzoeksstage om zich nog bewuster in hun toekomst (keuzevakken en masteropleiding) te verdiepen. Meer informatie over de gang van zaken tijdens de bachelorstage is te vinden op de Blackboard Community Bachelorstage BMW/BIO 201x-201x (jaar waarin je stage loopt) en op de facultaire website www.falw.vu.nl > Studenten > Regelingen). Op de Blackboard stagecommunity kunnen tweedejaars zichzelf inschrijven vanaf medio februari.

Bachelorstage BMW Vakcode

AB_1070 (450003)

Credits

23.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. M.P. Bergman

Doel vak De bachelorstage heeft de volgende doelstellingen: Meewerken aan onderzoek in een omgeving waar Biomedisch en-/of Biologisch werk wordt verricht Training in academische vaardigheden. Hiertoe behoren: Een analyse maken van een Biomedisch/ Biologisch probleem Het schrijven van een individueel onderzoeksverslag Het geven van een mondelinge presentatie over onderzoeksresultaten Het maken en presenteren van een congresposter Oriënteren op een keuze voor een masteropleiding Eindtermen: Vakspecifiek: De student kan onder goede begeleiding zelfstandig onderzoek doen in het gekozen vakgebied en beschikt over praktische vaardigheden die hem daartoe in staat stellen. Met betrekking tot algemene academische vaardigheden: De student is in staat de wetenschappelijke literatuur m.b.t een nieuw onderwerp te ontsluiten en in korte tijd aan de hand van relevante artikelen kennis te nemen van de belangrijkste ontwikkelingen in het betreffende vakgebied; De student is in staat een projectvoorstel voor het eigen onderzoek te schrijven; De student heeft geleerd de voortgang tijdens de stage op een overzichtelijke wijze vast te leggen in een journaal;


8-6-2012 - Pagina 8 van 78

De student is in staat om over de door hem/haar behaalde wetenschappelijke resultaten tijdens de stage op een heldere wijze schriftelijk en mondeling te rapporteren, daarbij adequaat gebruik makend van diverse audiovisuele hulpmiddelen. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De bachelorstage vormt een belangrijk onderdeel van de bacheloropleiding. Tijdens deze stage oriënteert en specialiseert de student zich in een door hem/haar gekozen richting. De stage wordt afgesloten met het schrijven van een bachelorthesis. Tevens biedt de bachelorstage de student de gelegenheid zich te oriënteren op de keuzes die gemaakt moeten worden voor een masteropleiding en - binnen die opleiding - voor een keuze voor een onderzoekers- of maatschappijgerichte variant, of een afstudeertraject in de richting van communicatie en/of educatie. Onderwijsvorm De student loopt de onderzoeksstage op een wetenschappelijke afdeling of bij een onderzoeksinstelling of bedrijf waar wetenschappelijk onderzoek wordt gedaan. Toetsvorm Het eindcijfer bestaat uit het cijfer van de stage, te bepalen door de stagebegeleiders. Hiervoor wordt een beoordelingsformulier gebruikt die beschikbaar is op de website van de faculteit. Literatuur Startliteratuur wordt aangedragen door de begeleider. De student zoekt vervolgens zelf verdere literatuur die nodig is om de stage tot een succes te maken. Informatie rond de stage is te vinden op de Blackboardsite. Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische wetenschappen. Overige informatie Studenten worden aangemoedigd reeds aan het eind van het 2e jaar te beginnen met het oriënteren op - en voorbereiden van - hun onderzoeksstage om zich nog bewuster in hun toekomst (keuzevakken en masteropleiding) te verdiepen. Meer informatie over de gang van zaken tijdens de bachelorstage is te vinden op de Blackboard Community Bachelorstage BMW 201x-201x (jaar waarin je stage loopt) en op de facultaire website www.falw.vu.nl > Studenten > Regelingen. Op de Blackboard stagecommunity kunnen tweedejaars zichzelf inschrijven vanaf medio maart.

Bedreiging en afweer Vakcode

AB_470219 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. F.C. Boogerd


8-6-2012 - Pagina 9 van 78

Docent(en)

prof. dr. H.V. Westerhoff, dr. F.C. Boogerd, dr. ir. J. Legler, dr. ir. T.H.M. Hamers, dr. M.P. Bergman, dr. R.E. Mebius

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum

Doel vak Het doel van de cursus is om te leren welke factoren vanuit het milieu de gezondheid bedreigen, hoe het lichaam op deze bedreiging reageert, hoe de immuunrespons tot stand komt en wat de eventuele gevolgen zijn wanneer deze afweer faalt. Bedreigingen die aan bod komen zijn (autonome) micro-organismen en giftige stoffen. Afweermechanismen die behandeld zullen worden zijn normale en pathologische immuunreacties, metabolisatie en uitscheiding. Inhoud vak Er zullen zes thema's worden behandeld: Who is who? Inleiding in microbiologie, immunologie, toxicologie. Microorganismen, afweercellen en -weefsels, mechanismen van blootstelling en toxicokinetiek Gezonde balans Gezonde microben, microbiële voeding, gunstige interacties, barrières, tolerantie, regulatie, co-stimulatie, uitgebalanceerde voeding, giftige essentiële stoffen, bestrijdingsmiddelen Acute bedreiging Microbiële groei, schadelijke microbiële interacties, Innate immuniteit, complement, NK-cellen, exo- en endotoxines, acute vergiftiging en milieurampen Op de lange termijn Microbiële evolutie, resistentie en medicijnen, adaptieve immuniteit, memory, vroege blootstelling/laat effect, chemische carcinogenese, hormoonverstoring. Ontwikkeling T- en B-cellen, diversiteit, clonale selectie, ontwikkelingstoxicologie Leven met bedreiging Groeicontrole, epidemiologie, microbiële ziektes, T- en B-cel immuniteit, immuunziekten, vaccinatie, dioxines en PCB, risicobeoordeling Meten = weten X-omics, diagnostiek, celbiologische technieken, ELISA, lymfoide organen, dosis-respons curve, microtox Onderwijsvorm Hoorcollege: de hier behandelde stof behoort tot de leerstof Werkcollege: werken in kleinere groepen aan berekeningen. Facultatief, maar wordt wel getoetst in het tentamen Werkgroep: werken in kleine groepen aan literatuur. Verplicht Practicum: experimenten uitvoeren. Verplicht Computerpracticum: facultatief, maar wordt wel getoetst in het tentamen COO: programma ter oefening van de leerstof. Facultatief Toetsvorm Twee deeltoetsen (meerkeuzevragen), die elk voor 50% meetellen voor het eindcijfer van de cursus. Beide dienen apart met een voldoende afgesloten te worden. Practica en werkgroepen zijn verplicht. Literatuur


8-6-2012 - Pagina 10 van 78

Klaassen, CD and Watkins III, JB: Casarrett and Doull's Essentials of Toxicology, second edition 2010 McGraw Hill ISBN 978-0-07-162240-0, ± 55 euro Madigan, Martinko, Dunlap, Clark: Brock Biology of Microorganisms, 12th ed., 60 euro Parham: The Immune System, 3rd ed., ± 55 euro Doelgroep Verplichte cursus voor eerstejaars BSc Biomedische Wetenschappen

Biochemie Vakcode

AB_470071 (450003)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

M.J.C. Scholts

Docent(en)

prof. H. Lill, M.J.C. Scholts, prof. dr. B. Teusink, dr. I.M. van Die

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep, Werkcollege, Practicum

Doel vak Begrip van hoe de macromoleculen in de levende cel in netwerken functioneren en hoe ze daarin samenwerken om de belangrijke levensprocessen uit te voeren. Bijzondere aandacht ligt op de cellulaire energiehuishouding, en op de samenhang en regulatie van metabole routes in de mens. Het practicum omvat voornamelijk proeven uit dit gebied. Eindtermen De student kan: - de ordenende en chaotische krachten die het leven bepalen benoemen; - de centrale rol van ATP in cellulaire systemen beschrijven; - aan de hand van voorbeelden in grote lijnen beschrijven welke mechanismen voor de productie van ATP gebruikt worden; - verschillen tussen chemische en chemiosmotische productie van ATP opnoemen en beschrijven; - mechanismen en drijvende krachten van elektronen transport ketens beschrijven; - de efficiëntie van Gibbs- energietransductie en Gibbsenergiedissipatie in oxidatieve fosforylering, ademhalingsketens, actieve transportprocessen en fotosynthese berekenen; - de paradox tussen de 2de hoofdwet en de ordening van levende organismen oplossen; - beschrijven hoe d. m. v koppeling bergafwaartse processen bergopwaartse processen drijven. - het onderlinge verband uitleggen tussen verschillende metabole routes in de mens, en hoe dat op cellulair nivo georganiseerd is - beschrijven wat de rol van de lever is in de glucose- en vethuishouding, en hoe de pancreas hormonen daarbij een essentiele rol spelen De student kent: - in grote lijnen de reacties en regulatie van glycolyse en fermentaties; - de glycogeen opbouwende en afbrekende reacties en hun regulatie;


8-6-2012 - Pagina 11 van 78

- in grote lijnen de reacties en regulatie van de citroenzuurcyclus - structuren en compartimenten in cellen, waar verschillende metabole reacties plaats vinden; - de principes van controle en regulatie; - opbouw en onderdelen van elektronen transportketens; - experimenten om deze reacties te onderzoeken. - de voornaamste metabole routes in de mens en hun onderlinge samenhang Niveau 2: verdieping Inhoud vak De colleges behandelen het samenwerken van reacties en enzymen in biochemische paden en reactieketens. Reacties en principes betrokken bij de cellulaire productie van ATP staan centraal. Thermodynamische grondslagen voor deze reacties worden besproken en vervolgens gebruikt om de resultaten van practicumproeven te bewerken. Tevens zal worden behandeld hoe biologische functies van eiwitten worden gereguleerd via posttranslationele modificaties. Onderwijsvorm Hoorcolleges (32 uur); werkcolleges (4 dagdelen); practicum (12 dagdelen). Deelname aan practica inclusief voor- en nabespreking en werkcolleges is verplicht. Deelname aan hoorcolleges wordt sterk aanbevolen (i. v. m. tentamen). Literatuur Voet, Voet & Pratt, " Fundamentals of Biochemistry", Wiley, ISBN 0-471-58650-1, ca. 50 Euro, Handleiding practica, Syllabus, en labjournaal totaal ca. 15 Euro. Aanbevolen voorkennis De inhoud van de eerstejaarscursus "Biologische chemie" wordt als bekend verondersteld. Doelgroep Verplicht voor tweedejaars studenten Biomedische Wetenschappen. Keuzecursus voor de tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. Overige informatie Bij het experimentele gedeelte is het dragen van een laboratoriumjas verplicht.

Bioinformatica Vakcode

AB_470172 (450003)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. ir. B.W. Kooi

Docent(en)

dr. ir. B.W. Kooi, dr. D.T. Jager

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Computerpracticum

Doel vak Het interdisciplinaire vakgebied Bioinformatica gebruikt mathematische/computer modellen en geavanceerde statistische analyse


8-6-2012 - Pagina 12 van 78

methoden om inzicht te krijgen in complexe biologische processen op alle niveaus van organisatie, van molecuul tot organisme tot populatie. Bioinformatica is tegenwoordig een onmisbaar onderdeel geworden van bijna alle gebieden binnen de biologische en biomedische wetenschappen. De moderne (medische) biologie bestudeert zulke complexe processen, en produceert zoveel data, bijvoorbeeld in de moleculaire biologie (expressie en activiteit van genen en proteïnen), neurowetenschappen (activiteit van neuronen en neuronale netwerken) en ecologie (biodiversiteit), dat die alleen met behulp van een bioinformatische benadering te onderzoeken en analyseren zijn. Deze cursus geeft een inleiding tot de bioinformatica en de methoden die binnen de bioinformatica gehanteerd worden. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De onderwerpen en specifieke doelen van de cursus zijn: Leren omgaan met de computer; Het schrijven van computer programma's; Leren omgaan met databases; Leren omgaan met cluster analyse programmas voor de analyse van, bijvoorbeeld gen en proteïne sequenties; Leren opstellen van eenvoudige mathematische modellen voor biologische processen, van molecuul tot populatie; Leren analyseren van modellen met behulp van numeriek wiskundige methoden; Kennismaken met modellen voor neuronen en met neurale netwerk modellen voor leren en geheugen; Kennismaken met ecologische en populatie modellen, bijvoorbeeld van predator-prooi interacties, verspreiding van ziektes, en tumorgroei. Onderwijsvorm Hoorcolleges, computerpractica, zelfstudie en werkstuk. Een belangrijk onderdeel van de cursus zijn de computerpractica (waarbij MATLAB wordt gebruikt) met betrekking tot programmeren, modelleren en data analyse. Toetsvorm Computeropgaven (30%) en schriftelijk tentamen (70%) Literatuur Syllabus en practicumhandleiding, prijs samen ongeveer 13 Euro. Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. De cursus wordt zeer aanbevolen voor studenten in de biomedische wetenschappen, neurowetenschappen, moleculaire en celbiologie en ecologie. Overige informatie Bij dit studieonderdeel is het voor studenten die het Bachelor Honoursprogramma Biologie of Biomedische Wetenschappen volgen, mogelijk te kiezen voor de stervariant. Bij de stervariant wordt aan het bovenomschreven studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 13 van 78

Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De stervariant wordt geregistreerd onder een aparte vakcode. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 EC boven de normale belasting van de cursus.

Bioinformatica * Vakcode

A_HP470172 ()

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator

prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van

Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.

Biomedisch beleid & kennismanagement Vakcode

AB_470022 (450003)

Periode

Periode 2

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J.E.W. Broerse

Docent(en)

prof. dr. J.E.W. Broerse, J.E. Elberse MSc, T.N. den Hertog MSc

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum

Doel vak Verwerven van kennis van en inzicht in: Beleidswetenschappen, met name beleidsprocessen, beleidstheorie en beleidsanalyse. De structuur en het beleid van de Nederlandse overheid met name op het gebied van biomedisch onderzoek. Project- en kennismanagement. Het toepassen van verkregen kennis en inzicht door: Het in de praktijk oefenen met het analyseren van een maatschappelijk probleem en het identificeren van beleidsopties. Het opdoen van leerervaringen ten aanzien van: Projectmatig werken in teamverband. Het kunnen toepassen van enkele praktische vaardigheden, zoals Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 14 van 78

onderzoeksopzet maken, literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk presenteren. Niveau 1: basiscursus Inhoud vak Beleid speelt op vele manieren en niveaus een rol in onze samenleving. Ook binnen de wetenschap heb je eigenlijk altijd met beleid te maken. Enerzijds speelt beleid een rol bij het stimuleren en/of reguleren van wetenschappelijk onderzoek. Anderzijds wordt wetenschap ingezet om beleid rondom een maatschappelijk probleem te ondersteunen of te adviseren. Inzicht in deze processen en principes maakt dat je begrijpt waarom bepaalde keuzes gemaakt worden en waarom wetenschappelijke kennis soms niet of nauwelijks wordt gebruikt. In het theoretisch deel van deze cursus leer je in werkgroepen over diverse beleidsaspecten en kennismanagement geïllustreerd aan de hand van casussen uit de biomedische sector. Dit deel wordt afgesloten met een tentamen. In het praktisch deel van de cursus vorm je met een aantal medestudenten een consultancy-team dat zich gespecialiseerd heeft in beleidsadvisering. Jullie krijgen van een opdrachtgever de vraag om een uitgebreid onderzoeksvoorstel te schrijven voor een later uit te voeren beleidsonderzoek rondom een actueel, maatschappelijk medisch-biologisch vraagstuk. Voorbeelden zijn de introductie van nieuwe vaccins, Functional Foods of euthanasie. Daarmee ontstaat een leersituatie die nauw aansluit bij de praktijk van beleidsmatig onderzoek en projectmatig werken. De resultaten, conclusies en aanbevelingen worden weergegeven in een voorstel voor beleidsonderzoek dat aan het eind van de cursus mondeling gepresenteerd wordt. Onderwijsvorm Hoorcollege, werkgroepen, groepsopdracht en zelfstudie Toetsvorm Individuele toetsing bestaat uit: (1) tentamen met multiple-choice en open vragen (50%), en (2) projectopdracht (50%). Individuele beoordeling van de projectopdracht vindt plaats op basis van individuele producten, het functioneren in de projectgroep en de beoordeling van groepsproducten. Beide onderdelen (1 en 2) moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Wordt bekendgemaakt via Blackboard Doelgroep Verplichte cursus voor tweedejaars bachelorstudenten Biomedische Wetenschappen. Overige informatie Aanwezigheidsplicht: iedere student mag maximaal eenmaal afwezig zijn bij de werkgroepen.

Biomedische wetenschappen en maatschappij Vakcode

AB_1011 (450003)

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator



8-6-2012 - Pagina 15 van 78

Doel vak Verwerven van kennis en inzicht in: • De plaats van biomedisch onderzoek in de maatschappelijke context en de maatschappelijke relevantie van de biomedische wetenschappen • Wisselwerking tussen biomedisch onderzoek enerzijds en de maatschappij en maatschappelijke ontwikkelingen anderzijds. • Wetenschapssociologie, Technologisch aspecten (TA) ondezoek en ELSA (Economic, Legal and Social Aspects) onderzoek (kwalitatief sociaalwetenschappelijk onderzoek) • Het beleid van de Nederlandse overheid op het gebied van biomedisch onderzoek. Het toepassen van verkregen kennis en inzicht door: • Het in de praktijk oefenen met het analyseren van nieuwe ontwikkelingen op het gebied van medische farmacologie en neurowetenschappen en de (mogelijke) maatschappelijke implicaties. Het opdoen van vaardigheden ten aanzien van: • Uitvoeren van een TA-onderzoeksproject middels literatuurstudie en interviews • Projectmatig werken in teamverband. • Opzetten, uitvoeren en analyseren van semi-gestructureerde interviews • Schriftelijke verslaglegging Inhoud vak In deze cursus staat de maatschappelijke context van de biomedische wetenschappen centraal. Het gaat om een expliciete reflectie op de wisselwerking tussen biomedisch onderzoek enerzijds en de maatschappij en maatschappelijke ontwikkelingen anderzijds. Het onderwijs is opgebouwd rondom een aantal praktijkvoorbeelden van biomedisch onderzoek, die gebaseerd zijn op de cursus ‘Medische farmacologie en neurowetenschappen’, zoals bijvoorbeeld ‘personalized medicine’ en ‘neuro-imaging’. Bij de bespreking van de casussen in het theoretische deel van de cursus wordt aandacht besteed aan huidige en toekomstige technologische ontwikkelingen en (mogelijke) maatschappelijke implicaties op het gebied van economie, beleid, sociale verhoudingen, ethiek, et cetera. Tevens wordt aandacht besteed aan de methodologie van wetenschapssociologie, technologische aspecten onderzoek en ELSA (Economic, Legal and Social Aspects) onderzoek. In het praktische deel van de cursus (dat parallel loopt aan het theoretische deel) wordt de opgedane kennis toegepast in een onderzoeksproject waarin de studenten groepsgewijs onder begeleiding een TA onderzoek uitvoeren naar een specifieke casus op het terrein van de medische farmacologie en/of neurowetenschappen. Dit mondt uit in een onderzoeksverslag met een advies voor overheidsbeleid, dat op de laatste dag van de cursus mondeling wordt gepresenteerd. Onderwijsvorm Hoorcollege, werkcollege, projectopdracht (onderzoekspracticum) en zelfstudie. Toetsvorm Individueel schriftelijk tentamen (50%), Projectverslag (30%) en –presentatie (20%). De verschillende onderdelen moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur


8-6-2012 - Pagina 16 van 78

Reader Doelgroep Verplicht vak voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen

Biotechnologie en maatschappelijke dynamiek Vakcode

AB_487020 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J.T. de Cock Buning

Docent(en)

prof. dr. J.T. de Cock Buning, dr. J.F.H. Kupper

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Verdere verdieping in de technische aspecten van recente biotechnologische technieken (cisgenese, gentherapie, cloneren, genomics, micro arrays) Historisch en sociologisch inzicht verwerven in de structuur van de maatschappelijke reacties op genetische modificatie. Inzicht verwerven in het juridische antwoord van de maatschappij/politiek op biotechnologische onzekerheden. Analyseren van wetenschappelijke en maatschappelijke aspecten van de media topics (Stier Herman, Schaap Dolly, Pompe Konijnen, Koreaanse stamcel fraude etc.) In de praktijk oefenen in argumentatie en debat met behulp van cases en team-opdrachten. Kunnen toepassen van enkele praktische en analytische vaardigheden, zoals het uitvoeren van literatuurstudie, kritisch analyseren van diverse wetenschappelijke publicaties, theorieën, hypotheses en argumenten, en de bevindingen zowel schriftelijk en mondeling kunnen verantwoorden en presenteren. Oriëntatie op interdisciplinair (gamma-bèta) onderzoek. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak Deze cursus bouwt voort op moleculaire basiskennis en gaat met enkele gastcolleges dieper in op specifieke technieken in het biomedische onderzoek m.b.t. virussen, bacteriën, planten en dierexperimenteel onderzoek. Daarnaast worden de ontwikkelingen van moleculair biologische technieken in historisch maatschappelijk perspectief geplaatst: vanaf de eerste recombinant discussies tot de huidige genomics discussies. De onrust van de maatschappij over het sleutelen aan de erfelijke machinerie van organismen, resulteerde in een grote hoeveelheid aan veiligheidsafspraken en wetgeving die wereldwijd nu gelden vanaf de gemeentelijke ontheffingen van een laboratorium tot mondiale VN verdragen zoals het Cartagena Protocol en Biodiversiteitsverdrag. Er zal worden ingegaan op theorieën en sleutelconcepten achter 'risk perception/assessement' en het 'voorzorgbeginsel'. In teams van vier tot zes studenten wordt er elke week gewerkt aan een casus, die de teams op grond van de theorie van de colleges en eigen literatuuronderzoek verder wetenschappelijk en sociologisch analyseren.


8-6-2012 - Pagina 17 van 78

Onderwerpen voor cases zijn biotechnologische innovaties zoals Golden rice, xenotransplantatie, genetische enhancement, screening kits. Hier bij spelen op de achtergrond ook de discussies over stamceltherapie, gentherapie, micro arrays, patenttering van moleculaire informatie etc. Op deze manier leer je de vaardigheden om theorie en methodiek van exacte wetenschappen met die van sociale wetenschappen te integreren (gamma-beta-onderzoek). Iedere vrijdag presenteren de teams hun analyses aan elkaar (powerpoint), en zal de discussie tussen de analyses een verdieping van de stof opleveren. De participatie en leermomenten uit deze discussies worden bijgehouden in een persoonlijk portfolio dat deel uitmaakt van de individuele beoordeling. Onderwijsvorm De ochtenden bestaan uit kennis overdragende colleges die verzorgd worden door verschillende gastsprekers (onderzoekers, sociologen). Aanwezigheid bij deze colleges is onontbeerlijk. In de middagen wordt er gewerkt aan een groepsopdracht waarbij een case gezamenlijk wordt geanalyseerd op basis van de theorie uit de colleges. Elke vrijdag wordt die case (3-4 verschillende gedurende de cursus) gepresenteerd en bediscussieerd. Contacturen: colleges 10 x 1,5= 15 uur, presentaties 3x 3 uur= 9 uur. Toetsvorm Toetsing bestaat uit: beoordeling individuele bijdrage aan de case studies in de vorm van de portofolio(50%) en de beoordeling van de bijdrage in de vier case studies als groepsopdracht (50%). Beide onderdelen moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Blackboard Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven en derdejaars BSc Biologie en BSc Biomedische Wetenschappen.

Brain and Behavior Vakcode

OH_BAB (986009)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator

drs. L.H.C. Plantinga

Climate Change Vakcode

OH_CC (986003)

Periode

Periode 2

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Educating for the good life


8-6-2012 - Pagina 18 van 78

Vakcode

OH-EFG ()

Credits

6.0

Coördinator

prof. dr. D.J. de Ruyter

Epidemiologie Vakcode

AB_470180 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. M.W. Heijmans

Docent(en)

dr. M.W. Heijmans, dr. M.R. de Boer

Lesmethode(n)


Doel vak Het algemene doel is dat jullie aan het eind van deze cursus in staat zijn om zelfstandig verschillende onderdelen van epidemiologisch onderzoek te kunnen uitvoeren. Dit houdt in dat je een epidemiologisch onderzoeksdesign kan toepassen op een gezondheidsgerelateerde onderzoeksvraag. Ook zullen jullie na de cursus in staat moeten zijn om de juiste statistische technieken te kunnen kiezen om de wetenschappelijke onderzoeksvraag te beantwoorden en op de juiste manier verslaglegging te doen van het resultaat. Daarnaast moeten jullie in staat zijn na de cursus om zelf kritischer naar andere gezondheidswetenschappelijke problemen of artikelen te kijken. Ook zullen jullie moeten kunnen aangeven in hoeverre gepubliceerd materiaal op de juiste manier een probleem behandeld heeft en hier zo nodig punten van kritiek in kunnen aanbrengen. Niveau 1: basiscursus Inhoud vak De cursus biedt een inleiding op en toepassing van de epidemiologie en een uitbreiding van technieken uit de toegepaste biostatistiek. De volgende onderwerpen komen aan bod: Wetenschappelijk onderzoek met mensen Designs van epidemiologisch onderzoek Frequentie- en Associatiematen Bronnen van vertekening Statistische technieken, o.a. T-toets, regressietechnieken zoals lineaire, logistische en Cox regressie. Zelfstandig statistische technieken uit te voeren met behulp van het statistische programma SPSS. Onderwijsvorm Hoorcolleges Werkgroepen (verplicht) Practica Individuele opdracht Toetsvorm Tijdens het onderdeel epidemiologie wordt een opdracht gemaakt waarin zelf een onderzoeksdesign wordt uitgewerkt aan de hand van een epidemiologische gezondheidsgerelateerde onderzoeksvraag. Bij een Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 19 van 78

onvoldoende resultaat van de opdracht volgt aftrek van 0,5 punten van het eindcijfer. De cursus wordt afgesloten met een practicumtoets (SPSS-toets) en een schriftelijk tentamen. De practicumtoets bestaat uit open vragen die afgeleid zijn uit de computerpractica, werkgroepen en colleges. De schriftelijke tentamenvragen zijn afgeleid uit de werkgroepen en de colleges. Het schriftelijke tentamen bestaat uit een mix van kennis- en inzichtvragen. Het eindcijfer van de cursus wordt voor 75% bepaald door het resultaat van het schriftelijke tentamen en voor 25% bepaald door het resultaat van de practicumtoets (voor beide toetsen dient een voldoende behaald te worden). Daarnaast volgt zoals hierboven beschreven aftrek van 0,5 punten bij een onvoldoende ingeleverde epidemiologie-opdracht. Literatuur L.M. Bouter, M.C.I.M van Dongen en G.A. Zielhuis. Epidemiologisch onderzoek, opzet en interpretatie, vijfde herziene druk, 2005, Bohn Stafleu Van Loghum, Houten. Prijs 41,70 euro J.W.R. Twisk. Inleiding in de toegepaste biostatistiek. Elsevier Gezondheidszorg, Maarssen, Nederland. ISBN 97 890 352 2909 9 Doelgroep Deze cursus is bedoeld voor studenten Biomedische wetenschappen die geïnteresseerd zijn in epidemiologie en de statistische toepassingen daarbinnen. De cursus vormt een aanvulling op de cursussen Methodologie en Statistiek I en II. Ook studenten uit andere studierichtingen, o.a. geneeskunde of bewegingswetenschappen, kunnen instromen in de cursus. Voor de instroom in de Master International Public Health en alle andere gezondheidswetenschappelijke masters is deze cursus verplicht.

Evolutie van de mens Vakcode

AB_470055 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. N.M. van Straalen

Docent(en)

prof. dr. N.M. van Straalen, prof. dr. G.J. Boekschoten

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Practicum

Doel vak Kennismaking met discussies over de reconstructie van de evolutie van homininen. Verwerven van inzicht in de argumenten die vanuit verschillende disciplines gebruikt worden om zulke reconstructies te onderbouwen. Eindtermen De student is in staat: - de huidige stand van zaken met betrekking tot de afstammingsgeschiedenis van Homo sapiens en andere homininen uiteen te zetten; - bewijsmateriaal voor humane evolutie vanuit de moleculaire genetica, de palaeantropologie en de vergelijkende ethologie op hun waarde te schatten; - zich een oordeel te vormen over recente artikelen in Nature en Science waarin nieuwe palaeontologische vondsten en genetische gegevens


8-6-2012 - Pagina 20 van 78

gepresenteerd worden. Niveau 2: verdieping Inhoud vak In de cursus worden de principes van de evolutieleer en de fylogenetische analyse geïllustreerd, gevolgd door een analyse van fossiele en genetische gegevens en hun belang voor de reconstructie van de homininen- subfamilie. Achtereenvolgens komen aan de orde: - Historische visies op de evolutie van mensen; - Dateringsmethodes en tafonomie; - Fylogenetische reconstructies; - Bouwplannen van de primaten; - Sociale structuren en seksueel gedrag bij apen en mensen; - Anatomische overeenkomsten tussen mensapen en mensen; - De oorsprong van de homininen; - Evolutionaire verklaringen voor bipedalisme; - De Australopithecus- soorten; - Homo habilis en Homo erectus; - Verschillende culturen van stenen werktuigen; - Het raadsel van de neanderthalers; - De oorsprong van Homo sapiens: in Afrika?; - Evolutie van de hersenen, zelfbewustzijn en taal; - Migraties van Homo sapiens; - De landbouwrevolutie. Onderwijsvorm Responsiecolleges (8 uur); hoorcolleges (12 uur); osteologisch practicum met humane botten en modellen van fossiele schedels (8 uur); onbegeleide zelfstudie (120 uur); excursie (8 uur) Literatuur Verplicht studieboek: R. Lewin & R.A. Foley, Principles of Human Evolution, ; 2nd edition, ; Blackwell Science, Malden, ISBN 0 632 04704 6. Prijs ongeveer 55 euro. Tevens is een syllabus nodig, prijs ongeveer 20 euro, waarin tevens de toegang tot de grot van Sclayn en vervoer vanaf Maastricht begrepen is Aanbevolen voorkennis Basiskennis van evolutiebiologie op het niveau van de eerstejaars cursus voor biologen (470175) of biomedische wetenschappers (470154) wordt sterk aanbevolen. Voor de BSc Gezondheid en Leven wordt de kennis van; Mens en Evolutie; (487013) bekend verondersteld. Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars bachelorstudenten Biologie, Biomedische wetenschappen, Gezondheidswetenschappen. De cursus staat open voor belangstellenden vanuit andere opleidingen. Studenten uit andere studierichtingen moeten vooraf contact opnemen met de docent en goedkeuring vragen bij de examencommissie van hun eigen opleiding.

Evolution and Human Behavior Vakcode

OH-EHB ()

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Faculteit

Onderwijscentrum VU


8-6-2012 - Pagina 21 van 78

Evolutionaire genetica Vakcode

AB_470053 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. J.M. Kooter

Docent(en)

dr. J.M. Kooter, dr. H. Schat, dr. ir. T.F.M. Roelofs

Lesmethode(n)


Doel vak Verwerven van kennis en inzicht in : dynamische karakter van genetisch materiaal oorzaken genetische variatie op nucleotide, gen, en chromosoom-niveau genoomevolutie bij pro- en eukaryoten, en organellen evolutionaire gevolgen van sex ecologische en moleculaire oorzaken van soortvorming horizontale DNA overdracht moleculaire evolutie van pathogenen (bacterien, virussen, protozoa) gebruik van genomische databanken bij evolutiestudies modellen van de moleculaire oorsprong van leven op aarde reconstructie van fylogenetische bomen verschillende vormen van selectie en theoretische onderbouwing manieren waarop genetische variatie wordt gebruikt om oorzaken van stochastische en deterministische processen af te leiden toepassing van wiskundige regels die bestaan voor het gedrag van allelen van één of twee loci in ideale populaties, en voor genen met een kwantitatief effect Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus behandelt: - Genetische concepten die de basis vormen voor het begrijpen van de evolutietheorie, waaronder moleculaire evolutie, ontstaan van nieuwe genen en functies, genoom organisatie, vergelijkende genomics, soortvorming, evolutie humane genoom, relatie tussen ontwikkeling en evolutie (Evo- devo), en hypothesen over het ontstaan van `leven', - Theoretische principes van de populatie genetica, waaronder verschillende vormen van selectie, quantitatieve genetica, drift, en hun toepassingen bij het bestuderen van variatie en evolutie in natuurlijke populaties. - Fylogenetische reconstructies op basis van DNA sequenties met behulp van een cladistisch computerprogramma - Fylogeografie Onderwijsvorm - Hoor- en werkcolleges (60 uur) - Literatuurbespreking (verplicht, 9 uur) - Computerpracticum (verplicht, 9 uur) - Zelfstudie - Ondersteuning via Blackboard


8-6-2012 - Pagina 22 van 78

Toetsvorm Schriftelijk tentamen (0.8) en een literatuurbespreking (0.2). Beide moeten voldoende zijn. Literatuur Studieboek: 'Evolutionary Analysis', Scott Freeman and Jon C. Herron, Fourth Edition, 2007, Pearson, Prentice Hall Syllabus met Onderzoeks- en Reviewartikelen over onderwerpen die niet in het boek worden behandeld Aanbevolen voorkennis Kennis van Genetica en Moleculaire Biologie; sluit aan bij Evolutie van de mens of Evolutiebiologie uit het eerste jaar Doelgroep Keuzevak voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Overige informatie De cursus wordt gegeven door de afdelingen Genetica, Ecologie en Fysiologie van planten, en Dierecologie.

Evolutionaire genetica * Vakcode

A_HP470053 ()

Periode

Periode 6

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator



Five O’Clock Neurosciences (Honours) Vakcode

A_HP003 ()

Periode

Periode 4+5

Credits

6.0

Faculteit


Coördinator

prof. dr. H.D. Mansvelder

Docent(en)

prof. dr. H.D. Mansvelder, dr. R.M. Meredith, dr. K. Linkenkaer Hansen, dr. C.P.J. de Kock

Lesmethode(n)

Werkgroep


8-6-2012 - Pagina 23 van 78

Doel vak Leerdoelen van de cursus: de student heeft kennis van en doet ervaring op met - grote theorieën over de werking van het brein - het toetsen van theorieën aan wetenschappelijke realiteit - het wetenschappelijk debat - het houden van een betoog Naast een breed inzicht in de werking van het brein worden in deze cursus verschillende aspecten van wetenschappelijke theorievorming in de neurowetenschappen uitgelicht. Het toetsen van theorieën aan wetenschappelijke literatuur, het houden van een samenhangend mondeling betoog over feit en fictie van geopperde theorieën, het leiden van en deelnemen aan discussies daarover, en het schrijven van een essay bieden oefening in basale academische vaardigheden. Deze cursus oefent studenten in het denken buiten geëigende kaders, daagt studenten uit met overkoepelende visies op ons brein en dwingt studenten stelling te nemen ten aanzien van deze visies in mondelinge discussies en op papier. Inhoud vak Wat is bewustzijn? Hoe leren we iets? Bestaat vrije wil? Wie is er de baas in mijn brein? Theorieën over deze vragen staan centraal in de honourscursus Five O’Clock Neurosciences. Aan de hand van boeken van beroemde neurowetenschappers en wetenschappelijke artikelen ontdekken de studenten wat de laatste inzichten zijn in de werking van ons brein. Er zal naar worden gestreefd het hele terrein van zenuwcel tot mensgedrag te bespreken, en naast biomedische aspecten zullen ook elementen uit de psychologie, de psychiatrie en de medische wetenschappen aan de orde komen. De boeken die besproken zullen worden en die door studenten zelf gekozen worden, verschillen van het reguliere bacheloronderwijs en worden geselecteerd omdat ze vanuit een meer beschouwelijke visie geschreven zijn. Te denken valt daarbij aan ‘The error of Descartes’ van Antonio Damasio, ‘Musicophilia’ van Oliver Sacks, ‘Synaptic Self’ van Joseph Ledoux, en ‘Vrije wil bestaat niet’ van Victor Lamme. Deze literatuur wordt aangevuld met artikelen uit vooraanstaande tijdschriften om een weerslag te bieden van modern neurowetenschappelijk onderzoek dat probeert te ontrafelen hoe processen op moleculair, cellulair of netwerk niveau samenhangen met gedrag en het functioneren van de mens. Tijdens de inhoudelijke discussies wordt nagegaan waar de wetenschappelijke grenzen van theorieën over de werking van het brein liggen of overschreden worden. Onderwijsvorm - Boek- en artikelpresentaties door studenten - Discussiegroepen - Zelfstudie Vaardigheden en technieken die aan de orde komen: - Analyseren van wetenschappelijke en populair-wetenschappelijke teksten - Houden van een betoog - Deelname aan wetenschappelijk debat Bijeenkomsten vinden plaats 1x per week tussen 17 en 19 uur. Toetsvorm - Presentatie (40%) - Deelname aan discussies (10%) - Essay (50%)


8-6-2012 - Pagina 24 van 78

Literatuur - door student zelf te kiezen boek (wordt tijdens de 1e bijeenkomst toegelicht) - wetenschappelijke artikelen Aanbevolen voorkennis Gezien het niveau van besprekingen is kennis van de levenswetenschappen aan te bevelen, maar geen vereiste. Doelgroep De doelgroep voor deze cursus bestaat uit tweede- en derdejaars bachelorstudenten die geselecteerd zijn voor het VU honoursprogramma. Overige informatie Cursus loopt van 3 maart t/m 25 mei 2011. Van studenten wordt een actieve deelname in mondelinge presentaties en discussies verwacht. Deze cursus biedt een uitstekende orientatie en voorbereiding op de VU Master of Neurosciences (www.neurosciencecampus-amsterdam.nl).

Future Entrepreneur Vakcode

OH_FE ()

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Genen en diversiteit Vakcode

AB_470216 (450003)

Periode

Periode 1

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. J.M. Kooter

Docent(en)

dr. J.M. Kooter, prof. dr. P. Heutink, dr. ir. A.J.A. Groffen

Lesmethode(n)


Doel vak Verwerven van kennis en inzicht in: - moleculaire anatomie van het humane genoom en zijn genen - hogere orde structuur van DNA op chromatine en chromosomaal niveau en de effecten op gen expressie ("epigenetica") - RNA- en eiwitsynthese - regulatie van genexpressie in relatie tot celdifferentiatie en embryonale ontwikkeling - celcyclus, DNA replicatie, mitose, meiose - vormen van recombinatie en consequenties voor chromosoomstructuur: klinische cytogenetica - sexchromosomen en autosomen - Mendeliaanse overervingspatronen: dominante en recessieve allelen en eigenschappen, genetische interacties, genetische koppeling, epistasie


8-6-2012 - Pagina 25 van 78

- factoren die Mendeliaanse overerving compliceren en multifactoriele overerving - oorzaken van mutaties en genetische diversiteit: gevolgen, en gebruik in medisch onderzoek - populatie-genetica - genomics: bioinformatische technieken om genetische eigenschappen en diversiteit tussen individuen te analyseren - betekenis van genomische diversiteit tussen mensen - genetische verschillen tussen eukaryoten en prokaryoten in relatie tot bacteriële pathogenen - moleculair genetische technieken gebruikt bij onderzoek en diagnostiek - toepassing van dier-modelorganismen bij medisch wetenschappelijk onderzoek Inhoud vak De cursus behandelt de verschillende patronen van overerving van genetische eigenschappen bij de mens en de gevolgen daarvan. Er wordt ingegaan op moleculaire aspecten van het humane genoom, waaronder een beschrijving van de verschillende onderdelen van het genoom en hun samenhang, van de celdeling en DNA replicatie, van de verschillende soorten mutaties die kunnen optreden en hun oorzaken, alsmede de gevolgen van deze genetische diversiteit. Tevens wordt ingegaan op de verschillende niveaus van genregulatie, van RNA tot eiwitsynthese, en de variatie die daarbij wordt aangetroffen in relatie tot erfelijke ziekten. De behandeling van deze onderwerpen wordt geïllustreerd met vele voorbeelden uit de klinische praktijk waarna de student zelf de opgedane kennis gaat toepassen bij de vragen over diagnostiek, therapie, en mogelijk vervolgonderzoek. Een belangrijk onderdeel van de cursus omvat de toepassing van de genoemde kennis in het medisch wetenschappelijk onderzoek van de mens maar ook in diermodelsystemen. Verschillende technieken worden uitgevoerd in de practica. Toetsvorm 4 deeltoetsen (meerkeuzevragen, schriftelijk en digitaal). Het vak kan alleen met een voldoende afgesloten worden als deelgenomen is aan de blusinstructie. Studenten worden hiervoor ingeroosterd ofwel in het najaar 2010, ofwel in februari 2011. De indeling van deze groepjes wordt bekendgemaakt via de Blackboardsite van de cursus die op dat moment loopt voor de eerstejaars. Literatuur "Genetics , Analysis and Principles", Robert J. Brooker 3e editie, McGraw-Hill ISBN 978-0-07-128764-7 "Thompson & Thompson Genetics in Medicine" Nussbaum, McInnes, and Willard, 7th edition, Saunders Elsevier Practicumhandleiding

God-Man-World Vakcode

OH_GMW (986015)

Periode

Periode 2

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator



8-6-2012 - Pagina 26 van 78

Governing Security Vakcode

OH_GS (986008)

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Honours course: Communication and Innovation in Health and Life Sciences Course code

A_HP002 (450003)

Credits

6.0

Language of tuition

English

Faculty


Coordinator

prof. dr. J.T. de Cock Buning

Course objective Students will: • Obtain insight into some key technological innovations in health and life sciences and their impact on society. • Obtain insight into the characteristics of various communication models for science and technology (e.g. deficit model, contextual model, lay-expertise model, interactive model) • Obtain a thorough understanding of different methods for interactive communication on technology innovations. • Acquire insight into the current status of interactive communication on technological innovations in the health and life sciences. • Be able to critically analyze strengths and weaknesses of various interactive communication methods. • Be able to critically analyze and compare recent real-life cases in interactive communication on technological innovations in health and life sciences. • Be able to design an interactive communication project in relation to a specific innovation. • Be able to work in multidisciplinary teams. Form of tuition • Interactive lectures that provoke, engage, inform and stimulate academic discussion about communication, innovation and society (21 hours) • Training workshops on critical analysis of a selection of relevant scientific articles (9 hours) • Group assignment (intensive coaching and intervision): multidisciplinary teams of about 7 students (from various disciplinary backgrounds) (40 hours) • Excursion to an interactive communication project (3 hours) • Self study (64 hours) • Exam (3 hours) Attendance is compulsory Type of assessment


8-6-2012 - Pagina 27 van 78

• Written exam, individual (60%) • Group assignment: written report and oral presentation (40%) Each grade need to be at least 5.0 and together on average 6.0 to pass Course reading • Selected chapters of the book: “Misunderstanding Science? The public reconstruction of science and technology”, by A. Irwin and B. Wynne, Cambridge University Press, Cambridge, 1996 • Book: “Biotech on the menu: Society as a mirror for research policy” by Tj. De Cock Buning, B. Regeer and J. Bunders, RMNO, The Hague, 2007 • Selected recent articles from the Sage journals “Public Understanding of Science”, “Science, Technology & Human Values” • Other relevant reading materials Entry requirements The course is accessible for second and third year bachelor students with a wide variety of backgrounds.

Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces Course code

A_HP001 ()

Credits

6.0

Faculty


Coordinator

prof. dr. N.M. van Straalen

Course content Course topics: a. From matter to life and the first genetic material b. The RNA world c. Theories for the origin and early evolution of life d. Mutual effects of life on geology and climate e. From prokaryote to eukaryote f. Lateral gene transfer, evolution of organelles g. Major and minor extinctions h. Multilevel selection, group selection, kin selection, sexual selection i. Human behaviour explained from an evolutionary and adaptive perspective j. Evolution of consciousness and language k. Cultural evolution l. Controversies between evolutionary theory and religion Form of tuition In small meetings, the topics will be introduced by an expert and further explored in a ‘round-table’ discussion. Students are expected to study the handed-out papers and to actively participate. Each student will write an essay, and give an oral presentations. Type of assessment Written essays (40%), oral presentation (40%) and participation in discussions (20%) Course reading Scientific articles


8-6-2012 - Pagina 28 van 78

Remarks The course will be given every second year (not in 2010 - 2011; forthcoming course in 2012), February through April, in weekly evening classes, 17.00 – 20.00 h (16 sessions). The course is organized in four blocks, each block consisting of four sessions dealing with a specific aspect and involving introductory lectures, discussion about scientific articles, guest lectures and a student presentations. Attendanding all classes is indispensable.

Honours Individueel Vak Vakcode

OH_EXT1 ()

Credits

8.0

Voertaal

Nederlands

Coördinator

C. Holleman

Honours Leadership Vakcode

OH_LEAD ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Coördinator

drs. D.T.T. Kamsma

How to survive 2050 Vakcode

OH_HTS (986004)

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


HP AUC: Programming your World Vakcode

OH_APYW ()

Credits

6.0

Faculteit

Onderwijscentrum VU

Coördinator

C. Holleman

HP UvA: Creativiteit Vakcode

OH_UCREA ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

HP UvA: Governance of Aquatic Vakcode

OH_UGOAQ ()


8-6-2012 - Pagina 29 van 78

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit

Onderwijscentrum VU

HP UvA: Intelligence Studies Vakcode

OH_UINST ()

Credits

6.0

Faculteit

Onderwijscentrum VU

Coördinator

C. Holleman

HP UvA: Love Vakcode

OH_ULOVE ()

Credits

6.0

Faculteit

Onderwijscentrum VU

Humane anatomie en fysiologie Vakcode

AB_470104 (450003)

Periode

Periode 3

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. W.J.A.J. Smeets

Docent(en)

dr. W.J.A.J. Smeets, dr. A.A. van Lambalgen, Dr. W.J.A.J. Smeets

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep

Doel vak Het hoofddoel van deze cursus is de student inzicht te verschaffen in de bouw en functie van het spijsverteringssysteem, het urogenitale systeem en het bewegingsapparaat. Deze systemen spelen een belangrijke rol bij het in stand houden van het milieu interieur en bij de motoriek. De student wordt bovendien vertrouwd gemaakt met de anatomische en fysiologische terminologie zoals die in de dagelijkse omgang in de kliniek gebezigd wordt. Bij het onderwijs wordt ook aandacht besteed aan de embryologie van de verschillende systemen teneinde de student inzicht te verschaffen in het tot stand komen van congenitale afwijkingen. De fysiologie practica hebben ten doel de studenten inzicht te geven welke non-invasieve technieken te gebruiken zijn bij het onderzoek naar (patho)fysiologische processen bij de mens. Tenslotte heeft de cursus tot doel de studenten te leren om met elkaar aan de hand van casuïstiek uit te zoeken welke basale fysiologische processen ten grondslag liggen aan het functioneren of disfunctioneren van het menselijk lichaam. Eindtermen Aan het eind van de cursus kan de student: Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 30 van 78

De verschillende onderdelen van de behandelde orgaansystemen benoemen zowel in het Latijn (internationaal erkende nomenclatuur) als ook in het Engels (meest gebruikte nomenclatuur in internationale wetenschappelijke tijdschriften); Aangeven hoe de verschillende orgaansystemen zijn opgebouwd en wat de functionele betekenis is van de verschillende onderdelen binnen ieder orgaansysteem; Aangeven welke veranderingen de verschillende orgaansystemen in het menselijk lichaam ondergaan gedurende de embryonale ontwikkeling (organogenese) en heeft tevens enige kennis van het phylogenetische perspectief (bouwplan van vertebraten); Eenvoudige metingen verrichten m.b.t. het functioneren van deze systemen (dieet-en voedingsanalyses; diffusie- en filtratieprocessen; EMG, kracht-lengte/snelheid relaties; reflextijd, reactietijd) en beschrijven welke fysiologische principes daaraan ten grondslag liggen De regulatie van deze systemen beschrijven en de factoren (o.a. hormonen) benoemen die hierop van invloed zijn Het belang aangeven van een grondige kennis van de humane anatomie voor een goed begrip van zowel het functioneren als dysfunctioneren in het dagelijkse leven. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus is opgebouwd rondom 2 modules: spijsvertering, nier en uitscheiding: hierin komt ter sprake hoe deze orgaansystemen eruit zien en onstaan zijn, hoe het voedsel afgebroken wordt tot bouwstenen voor het lichaam, welke hormonen hierbij betrokken zijn, hoe het voedsel- en vloeistoftransport plaatsvindt, hoe afvalstoffen uit het lichaam verwijderd worden, hoe de volumeregulatie plaatsvindt en hoe deze orgaansystemen gereguleerd worden; beweging: dit betreft de wijze waarop het bewegingsapparaat (skelet, gewrichten, spieren, perifere zenuwen) is opgebouwd en functioneert. Ook wordt aandacht besteed aan de gevolgen van vermoeidheid van skeletspieren en aan het perifeer zenuwletsel met betrekking tot motorische/sensorische uitval. Deze onderdelen spelen een grote rol bij het instand houden van het milieu interieur en bij de motoriek. Aan de samenhang van bovengenoemde processen zal dan ook de nodige aandacht besteed worden. Onderwijsvorm De opzet van de modules is steeds gelijk: het anatomische gedeelte bestaat uit colleges en demonstratiepractica het fysiologie gedeelte bestaat uit zelfstudie, deelname aan practica voorafgegaan door COO's, opdrachten uitvoeren in werkgroepen en resultaten weergeven op "BlackBoard"; in werkcolleges worden vragen behandeld en moeilijke problemen besproken. Toetsvorm Aanwezigheidsplicht voor practica en werkgroepen. Schriftelijke toets aan het eind. Literatuur Martini FH. Fundamentals of Anatomy & Physiology, 7th or 8th edition(inclusief Applications Manual + CD-ROM), Pearson Education Inc. Larsen WJ. Human Embryology, 3rd edition, 2001, Churchill Livingstone, New York. ISBN 0-443-06583-7 Doelgroep


8-6-2012 - Pagina 31 van 78

Verplicht voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen. Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. Overige informatie Als communicatiemiddel zal gebruik gemaakt worden van Blackboard

Humane Anatomie en Fysiologie * Vakcode

A_HP470104 ()

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator


Humane neurofysiologie Vakcode

AB_487024 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. K. Linkenkaer Hansen

Docent(en)

dr. K. Linkenkaer Hansen

Lesmethode(n)


Doel vak Aan het einde van de cursus kan de student: • Uitleggen hoe de humane neurofysiologie bestudeerd kan worden en de voor/nadelen van verschillende beeldvormende technieken relativeren. • Verdedigen wat het belang is van neurofysiologisch onderzoek in gezonde mensen en patiënten. • Hersenactiviteit gedreven door zintuiglijke informatie (extern) en door spontane processen in de hersenen (intern) onderscheiden. • Argumenteren waarom het fenomeen van “dagdromen” en de neurale basis daarvan belangrijk te besturen is; tevens krijgt de student de vaardigheid om dit in de praktijk te onderzoeken. • Een creatief onderzoekidee formuleren en presenteren, en feedback geven op ideeën van medestudenten. • Het verband tussen hersenactiviteit en EEG signalen uitleggen en zelfstandig een EEG meting uitvoeren. • Gespecialiseerde programma’s gebruiken voor kwalitatieve analyse van EEG, bv. om EEG signalen van spieren hersenactiviteit te onderscheiden. • Kwantitatieve en statistische analyse van eigen data uitvoeren en op basis daarvan conclusies over het verband tussen hersenactiviteit en cognitie trekken. • Resultaten van eigen onderzoek samenvatten in figuren, interpreteren en verdedigen tijdens een posterpresentatie. Dus, de student krijgt zowel theoretisch als praktisch ervaring met elektroencephalografie (EEG). • Beoordelen of een persoon slaapt of niet op basis van een EEG en uitleggen hoe EEG in de praktijk gebruikt kan worden om slaapstoornissen te onderkennen. • Een gebalanceerd overzicht geven van mogelijkheden en uitdagingen Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 32 van 78

voor het toepassen van EEG technologie voor (1) de diagnose en therapie van ziektebeelden zoals epilepsie, concentratiestoornissen en dementie en (2) het sturen van machines of computers met behulp van gedachten. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak Tijdens deze cursus zal de neurofysiologie van de mens behandeld worden aan de hand van een overzicht van alle gangbare methoden waarmee deze bestudeerd kan worden. Het meten en analyseren van hoge dichtheid EEG worden in detail uitgelegd en geoefend in onderzoekspractica die gedeeltelijk door de studenten worden ontworpen en uitgevoerd. Hoorcolleges en practica geven extra aandacht aan de neurofysiologie van cognitieve processen die niet of heel moeilijk in dieren te bestuderen zijn, zoals vrije wil, intuïtie, gedachte (“dagdromen”) en de vaardigheid om zich in andere mensen te verplaatsen. Het belang van deze functies op het niveau van hersenactiviteit en cognitie wordt toegelicht en bediscussieerd in het perspectief van ziektebeelden, bv. depressie, dementie, en slaap- en concentratiestoornissen. Onderwijsvorm Hoorcolleges, practica, discussies, onderzoek in groepjes en presentaties Toetsvorm Groepspresentatie (20%), individuele posterpresentatie (40%) en schriftelijk tentamen (40%). Literatuur Artikelen in het Nederlands en in het Engels (via Blackboard) Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven, Biomedische Wetenschappen en Biologie. Keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheid en Leven, Biomedische Wetenschappen en Biologie. Overige informatie Deze cursus sluit naadloos aan op de eerder in het tweede jaar geprogrammeerde cursus Preklinische Neurowetenschappen en is verplicht voor studenten Gezondheid en Leven indien je stage wilt lopen bij het CNCR en/of wilt instromen in de VU/VUmc Master of Neuroscience onderzoeksopleiding. Cursusbeschrijving laatst bijgewerkt: 20 mei 2011.

Humane ontwikkeling * Vakcode

A_HP487008 ()

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de


8-6-2012 - Pagina 33 van 78

student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.

Humane ontwikkeling en evolutie Vakcode

AB_470218 (450003)

Periode

Periode 4

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. S. Spijker

Docent(en)

prof. dr. N.M. van Straalen, dr. ir. J. Legler, prof. dr. H.N. Lafeber, drs. M.W. van Emden, dr. Z. Bochdanovits

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep, Practicum, Computerpracticum

Doel vak Aan het einde van de cursus heeft de student kennis van en inzicht in: De anatomische, endocrinologische en moleculair-biologische achtergronden van oögenese en spermatogenese, fertilisatie, embryonale en foetale ontwikkeling, en geboorte, evenals de consequenties hiervan voor de morfogenese, met aandacht voor de hieruit te verklaren aangeboren afwijkingen Herkennen en beschrijven van de eerste ontwikkelingsstadia van de zebravis, basisprincipes van evolutie, ontstaan van genetische variatie, hoe transcriptionele regulatie in genen betrokken bij ontwikkelingsbiologie aanleiding kan geven tot diversiteit in anatomie en morfologie van dieren, evolutie van hox genen, fylogenetische reconstructie op basis van anatomische kenmerken en gensequenties en evolutie van pathogenen die de normale ontwikkeling verstoren Postnatale ontwikkeling op gebied van motorische, cognitieve, emotionele en sociale vaardigheden. Vaardigheden en technieken die aan de orde komen: Microscopie & tekenen/herkennen van anatomische structuren (b.v. de eerste ontwikkelingsbiologische stadia van de zebravis, het urogenitaal systeem). Het gebruik van anatomische and moleculaire kenmerken in fylogenetische reconstructie Fylogenetische reconstructie: UPGMA analyse en maximum parsimonie Verslaglegging van verkregen resultaten Kritisch kunnen lezen en begrijpen van een primair artikel en presentatie hiervan in een werkgroep Onderwijsvorm Hoorcolleges 102 uur. Werkcolleges 10 uur. Zebravis & Cladistiek: Aan het begin van week 2 & 3 worden vragen uitgegeven. De antwoorden worden in werkcolleges behandeld en zijn onderdeel van de uiteindelijke verslag legging.


8-6-2012 - Pagina 34 van 78

COO van snijpracticum: Opdracht wordt uitgevoerd om verdieping aan te brengen in anatomische kennis Presentatie artikel: Aan het einde van week 6 wordt een artikel uitgedeeld en bijbehorende vragen over onderwerpen zoals behandeld in blok 1 en 2. In een te geven presentatie wordt de stof verder uitgediept, hetgeen als leerstof dient voor de overige studenten. Practica: 16 uur Zebravis ontwikkeling: Embryologisch vouwen, ontstaan van kiemlagen wordt verdiept door het volgen van de ontwikkeling van een zebravis. Snijpracticum: Anatomische kennis wordt verdiept Toetsvorm - Toetsvorm (4-keuze vragen) - Deeltoetsen (2 deeltoetsen; 6 EC per toets) - Verslag practica en opdrachten werkgroepen - Presentatie artikel Aanwezigheid bij practica en werkgroepen is verplicht en kan niet worden herkanst tijdens deze cursus, maar wel een jaar later. Practicumverslag/presentatie telt in totaal voor 10% mee in het eindcijfer van elke deeltoets. Voor elke deeltoets en bijbehorend practicum geldt een waardering van 6 EC. Afwezigheid bij een deeltoets betekent het maken van een volledige herkansing voor die deeltoets, het behaalde practicumcijfer blijft geldig. Omgekeerd, wanneer een voldoende is gescoord voor de deeltoets, maar het practicumcijfer geeft een onvoldoende eindscore, blijft het deeltoetscijfer geldig en moet het practicum worden herkanst (volgend jaar). Het minimale cijfer voor de muliple choice deeltoets (90% eindcijfer) moet een 5.5 zijn. Literatuur Martini: Fundamentals of Anatomy and Physiology, Benjamin Cummings, 8e editie Langmans Medical Embryology (TW Sadler), 11e edition; From DNA to Diversity, SBCarroll et al. (Blackwell Publishing), 2de editie Doelgroep Eerstejaars BSc Biomedische Wetenschappen Overige informatie Bij de praktische onderdelen is het dragen van een labjas verplicht Let op: de oorspronkelijke titel (Ontwikkeling, diversiteit en evolutie) is vervallen.

Illness-Image-Metaphor Vakcode

OH_IIM (986012)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Impact of an Empire Vakcode

OH_IE (986005)


8-6-2012 - Pagina 35 van 78

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Individueel werk Vakcode

ABE_001 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_002 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_003 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Individueel werk ALW Vakcode

ABE_004 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_005 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_006 (450003)

Credits

0.0


8-6-2012 - Pagina 36 van 78

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_007 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_008 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_009 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_010 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Individueel werk pass/fail Vakcode

ABE_011 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_012 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



8-6-2012 - Pagina 37 van 78


ABE_013 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_014 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_015 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_016 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_017 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



ABE_018 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit



8-6-2012 - Pagina 38 van 78


ABE_019 (450003)

Credits

0.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Infectieziekten Vakcode

AB_471024 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. M.P. Bergman

Docent(en)

dr. M.P. Bergman, dr. R.J.M. van Spanning, dr. M.R. van Dijk, dr. J.P. van Ulsen, T.A.M. Hekker, prof. dr. W. Bitter

Lesmethode(n)

Werkgroep, Werkcollege, Computerpracticum, Hoorcollege, Practicum

Doel vak Het doel van deze cursus is de student inzicht te verschaffen in de pathogenese van microbiële, parasitaire en virale infecties. De student wordt vertrouwd gemaakt met de strategieën die bacteriën, virussen en parasieten gebruiken om de gastheer te koloniseren en te infecteren. Thema's die aan de orde komen zijn toxines, aanhechting, invasie, intracellulaire overleving, interacties met het immuun systeem, secretie van virulentiefactoren, ijzeropname en regulatie van virulentiefactoren. Bij het onderwijs wordt ook aandacht besteed aan vaccins en antibiotica, zoals de ontwikkeling, werking en toepassing van deze therapeutica. Tot slot moet de student een aantal microbiologische methoden kunnen toepassen om zo pathogene eigenschappen van micro-organismen te kunnen bestuderen. Eindtermen Aan het eind van de cursus kan de student: - aangeven wat de overeenkomsten en verschillen zijn in de strategieën die bacteriën, virussen en parasieten gebruiken om de gastheer te koloniseren en te infecteren. - aangeven hoe op moleculair niveau vaccins en antibiotica werken. - aangeven hoe vaccins en antibiotica worden ontwikkeld. - het belang aangeven van een grondige kennis over de virulentiefactoren van bacteriën, virussen en parasieten ter voorkoming en bestrijding van infecties. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus bestaat uit 5 onderdelen: microbiologie, parasitologie, virologie, vaccinologie en antibiotica. Al deze onderdelen zijn nodig om een goed begrip te kunnen krijgen van infectieziekten en hoe deze te voorkomen of te bestrijden zijn. Aan de samenhang van bovengenoemde onderdelen zal dan ook de nodige aandacht besteed worden. Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 39 van 78

Onderwijsvorm Hoorcolleges (20 uur); practicum verplicht (40 uur); zelfstudie (50 uur). Toetsvorm Schriftelijk tentamen (essayvragen). Toelating tot tentamen alleen indien het practicum met goed gevolg is afgelegd. Aanbevolen voorkennis Studenten Biomedische wetenschappen (BMW) moeten de eerstejaars cursussen Microbiologie en Immunologie met een voldoende hebben afgesloten. Studenten Gezondheid en Leven moeten de eerstejaars cursus Bedreiging & Bescherming I (microbiologie en immunologie) succesvol afgerond hebben. Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen en Gezondheid en Leven met een biomedisch profiel. De cursus wordt aanbevolen voor studenten die het masterprogramma "Infectious Diseases" in de 2-jarige MSc BMW of het programma Infectieziekte en Volksgezondheid in de 1-jarige MSc Health Sciences willen gaan volgen. Overige informatie In verband met het beperkte aantal practicum geld er een maximum van 60 studenten. BSc studenten Biomedische Wetenschappen en Gezondheid & Leven krijgen voorrang. Dit kan betekenen dat aangemelde studenten uit andere opleidingen worden afgewezen. Toelating tot de cursus geschiedt op basis van volgorde van inschrijven via TIS. Een laboratoriumjas is verplicht en is meteen op de eerste practicumdag nodig. Als communicatiemiddel zal zoveel mogelijk gebruik gemaakt worden van Blackboard. Belangrijk: Het maximum aantal deelnemers geldt niet voor recidivisten, zij kunnen toegang krijgen tot Blackboard wanneer zij een mail sturen naar de cursuscoördinator ([email protected]). Studenten Gezondheidswetenschappen dienen zich in te schrijven voor de cursus Infectieziekten & gezondheid (cursuscode 470232) (voorheen "Infectieziekten (471024), droge variant").

Integratieve tumorcelbiologie Vakcode

AB_470057 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. J. Lankelma

Docent(en)

dr. J. Lankelma

Lesmethode(n)


Doel vak Opfrissen en uitbreiden van celbiologische kennis, speciaal m.b.t. de celdeling: vertrouwdheid krijgen met de betrokken moleculen; Schematiseren van (cel)biologische regelsystemen in de gezonde cel en in de kankercel;


8-6-2012 - Pagina 40 van 78

Kennismaken met eigenschappen van moleculen en met structuren van "geschakelde moleculen" en bijbehorende systeemeigenschappen, mede m.b.v. biomathematische modelleren; Leren vergaren van celbiologische informatie en verkrijgen van inzicht in benodigde datanauwkeurigheid. Eindtermen De student kan: schematisch interacties tussen moleculen weergeven en demonstreren hoe veranderingen in hun functie of concentratie kunnen leiden tot kanker; benodigde ontbrekende informatie in de literatuur en op het Internet vinden; door middel van computersimulaties weergeven hoe systeemeigenschappen ontstaan en hoe microscopische veranderingen aanleiding geven tot macroscopische veranderingen; voorstellen formuleren voor metingen om informatie te verzamelen die kritisch is voor de behandeling van kanker. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Analytische methoden leveren steeds meer meetgegevens op van biologische systemen. Met microarrays is het in principe mogelijk mRNA concentraties te meten van alle humane genen. Electroforese, gekoppeld met selectieve detectie (met behulp van antilichamen of massaspectrometrie) kan ook over eiwitten een rijke oogst aan analytische informatie opleveren. In het "postgenoom" tijdperk is de uitdaging groot om deze uitgebreide kennis over de activiteit van componenten te integreren en de organisatie van moleculen tot cellen en cellen tot organen te doorgronden. De overvloed van gegevens drijft de ontwikkeling van een nieuwe biologische discipline: de integratieve biologie. In deze cursus worden defecten in de moleculaire organisatie behandeld, welke leiden tot kanker. Eerst wordt kort de basis van tumorcel-biologie behandeld en hoe benodigde kennis kan worden aangevuld uit databases via het worldwide web. Basiskennis van regulatie van celdeling en apoptose zal worden gedoceerd. Tevens zal de interactie tussen de kankercel en zijn directe omgeving worden belicht. Ook kwantitatieve aspecten zullen aandacht krijgen. De afweer door het lichaam van de patiënt en de cytostatische behandelingen, vormen een selectiedruk die selecteert voor robuuste organisatie-structuren. In deze structuren ligt de sleutel verborgen tot toekomstige selectievere behandelmethoden van kanker. Onderwijsvorm In de ochtend hoorcollege, 's middags werkcollege. Dit laatste bestaat uit het maken van opgaven, computersimulaties en biologische informatie zoeken op het internet. De behandelde stof dient op de voet gevolgd te worden en een aanwezigheid van meer dan 80 procent is verplicht. Toetsvorm Schriftelijke testen tijdens cursus Literatuur Een recent handboek over moleculaire celbiologie (bijvoorbeeld Molecular Biology of the Cell, Alberts e.a., The Biology of Cancer van R.A. Weinberg of een vergelijkbaar boek) wordt aangeraden, maar is niet verplicht. Een syllabus zal worden verstrekt tegen vergoeding van 10 euro.


8-6-2012 - Pagina 41 van 78

Aanbevolen voorkennis Kunnen werken met Excel Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Biomedische Wetenschappen en Gezondheid en Leven. Overige informatie De cursus is met name geschikt voor hen die een keuze voor de master Oncologie overwegen, maar ook voor mensen met interesse in systeembiologie en kwantitatieve cellulaire biologie.

Internationale volksgezondheid Vakcode

AB_470088 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator


Docent(en)

A.J. van der Ham MSc, D.R. Essink MSc, prof. dr. P.R. Klatser, prof. dr. J.E.W. Broerse

Lesmethode(n)


Doel vak Inzicht verkrijgen in de theoretische achtergronden en wetenschappelijke en maatschappelijke ontwikkeling van Internationale Volksgezondheid en mondiale gezondheidszorg Inzicht in de belangen, spanningsvelden en wensen van verschillende actoren die hierbij een rol spelen Inzicht verwerven in organisatie, management en beleid van volksgezondheid in een ontwikkelingscontext. Inzicht verwerven in de mogelijkheden en beperkingen van gezondheidszorg ten aanzien van ontwikkelingsvraagstukken. Inzicht verkrijgen in de mogelijkheden en toepassingen van onderzoek in Internationale Volksgezondheid. Inzicht krijgen in de samenhang van de problematiek op landenniveau. Niveau 2: Verdieping Inhoud vak In deze cursus verkrijg je inzicht in volksgezondheidsvraagstukken in internationaal verband. De nadruk ligt hierbij op gezondheidsproblemen in lage- en middeninkomenlanden en de verschillende benaderingen die landen toepassen om met die problemen om te gaan. Er wordt specifiek ingegaan op problemen en interventies op een aantal deelterreinen van de gezondheidszorg zoals infectieziekte, reproductieve gezondheid, en geestelijke gezondheid. Ook komen cross-cutting issues, zoals gezondheidssystemen, armoede en economie aan bod. De cursus sluit af met recente trends op het gebied van internationale samenwerking. Dit alles wordt op een transdisciplinaire manier benaderd, waarbij inzichten uit verschillende wetenschappelijke disciplines worden geïntegreerd en rekening wordt gehouden met de belangen en relaties tussen verschillende actoren. In de groepsopdracht waarin je een 'public health portfolio van een land maakt, breng je de theorie van de cursus in praktijk en zal de samenhang van de verschillende


8-6-2012 - Pagina 42 van 78

subthema's op landen niveau duidelijk worden. Onderwijsvorm Hoorcolleges en groepsopdracht Toetsvorm Schriftelijk tentamen (50%) en groepsopdracht (50%). Beide onderdelen moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Boek; Title: Essentials of Global Health.R. Skolnik, 2008. Jones and Bartlett Publishers. Verkrijgbaar: VU boekhandel. Doelgroep De cursus "Internationale Volksgezondheid" is een keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen en voor tweede- en derdejaars BSc Biomedische wetenschappen en Gezondheid en Leven. De cursus wordt sterk aanbevolen voor studenten die overwegen de masterdifferentiatie IPH te gaan volgen. Overige informatie Voor vragen: [email protected].

Levensvragen en wetenschap Vakcode

AB_470151 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

drs. J.F.H. Kupper

Docent(en)

drs. J.F.H. Kupper, prof. dr. J.T. de Cock Buning

Lesmethode(n)

Werkgroep

Doel vak Inzicht verwerven in: Verschillende filosofische ideeën over het menselijk bestaan De manieren waarop deze ideeën worden beïnvloed door nieuwe ontwikkelingen in de levenswetenschappen. Vaardigheden ontwikkelen in: Het kritisch analyseren van filosofische en wetenschappelijke teksten; Het voeren van analyserende discussies; Het verwoorden van sterke argumentatielijnen in een essay. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Deze cursus gaat over filosofie: nadenken over jezelf als mens en de wereld om je heen. Filosofie is wikken en wegen, zoeken en vragen stellen. Tijdens de cursus 'Levensvragen en wetenschap' onderzoek je het menselijk bestaan in het licht van zowel filosofische theorieën als de huidige stand van zaken in de levenswetenschappen. Vragen als 'wie ben ik', 'hoe kan ik de wereld kennen' en 'wat doe ik hier eigenlijk' staan daarbij centraal. Deze vragen hebben in de loop der eeuwen verschillende antwoorden gekregen van filosofen, geestelijken en wetenschappers. In deze cursus bestudeer je wat die antwoorden zoal


8-6-2012 - Pagina 43 van 78

zijn geweest aan de hand van de originele teksten en ga je bovenal op onderzoek uit naar jouw antwoord als wetenschapper anno 2011. Ontwikkelingen in de levenswetenschappen hebben in de twintigste eeuw gezorgd voor een enorme toename in de wetenschappelijke kennis over de mens en zijn omgeving. We denken steeds beter te weten wie wij zijn, maar is dat wel zo vanzelfsprekend? Zijn wij machines met gevoel of toch iets wezenlijk anders? Hoe weten we zeker dat wat we om ons heen zien werkelijk bestaat? En hoe moeten we kiezen voor 'het goede leven'? Volgens Wittgenstein zijn deze vragen van wezenlijk belang, maar kunnen ze nooit zinvol rationeel geanalyseerd worden. Hoe komen we dan aan antwoorden? Is elk antwoord mogelijk zoals de post-modernisten beweren? Op welke manier zijn de moderne psychologische en neurobiologische inzichten behulpzaam bij deze vragen? We vergelijken steeds antwoorden van de 'oude meesters' met de nieuwste inzichten. De thema's die onder andere aan de orde zullen komen, zijn: Wat is er echt? Een thema over wat bestaat en wat niet. Over de tegenstelling tussen realisme en idealisme, over feiten en hun hardheid. Wie ben ik? Een thema over mensbeelden. Aan de orde komen onder meer het lichaam-geest dualisme van Descartes, het behaviourisme en het idee dat het menselijk brein werkt als een computer. Waartoe ben ik hier? Een thema over de biologische reden van het mens-zijn (evolutie, Dawkins 'selfisch genes') en verschillende Westerse en niet-Westerse visies op de vraag 'waartoe zijn wij op aard'. Onderwijsvorm De cursus bestaat uit 4 weken waarin er regelmatig contact is met de docenten in werkcolleges. Veel tijd zal besteed worden aan het individueel lezen van teksten en het voorbereiden in tweetallen van discussies. Verder wordt er door jullie wekelijks over de thema's gediscussieerd op het Blackboardforum. Toetsvorm De toetsing bestaat uit drie onderdelen. 1) je actieve participatie in de werkgroepen. 2) je bijdrage aan de groepsdiscussie op blackboard. 3) een afsluitend essay waarin je een zelfgekozen onderwerp analyseert in relatie tot een van de thema's. Alle onderdelen tellen even zwaar mee en moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Syllabus met samengestelde teksten Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars (en hoger) BSc Biologie, Biomedische Wetenschappen, Gezondheidswetenschappen, Filosofie. Overige informatie Deze cursus wordt niet meer gegeven in 2011 - 2012; is vervangen door andere cursussen (voor Biologie resp. Biomedische Wetenschappen). Voor meer informatie over een eventuele laatste kans: stuur een e-mail naar [email protected].

Life and Work Vakcode

OH_LAW (986007)

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator



8-6-2012 - Pagina 44 van 78

Management van innovaties Vakcode

AB_470195 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator


Docent(en)

prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen, dr. J.F.H. Kupper, drs. W.P.C. Boon

Lesmethode(n)


Doel vak Verwerven van kennis van en inzicht in: Verschillende vormen van (1) management en (2) innovatie op verschillende niveau's (micro, meso en macro) De centrale concepten van innovatieprocessen en innovatiemanagement Verschillende mechanismen van innovatieontwikkeling, hun effecten en hun uitdagingen in verschillende culturele contexten. Verschillende theoretische perspectieven op innovatiestudies en management van technologie (o.a. strategisch innovatie management, wetenschap, technologie en samenlevingstudies) De belangrijkste actoren en hun onderlinge relatie in de (inter) nationale medische innovatie-arena. Verschillende manieren om de ontwikkeling van innovaties in de gezondheids- en levenswetenschappen te beïnvloeden. Het toepassen van verkregen kennis en inzicht door: De praktijk oefenen met het analyseren van verschillende innovatiestrategieën in de medische sector. Het opdoen van leerervaringen ten aanzien van: Projectmatig werken in teamverband. Het kunnen toepassen van enkele praktische vaardigheden, zoals onderzoeksopzet maken, literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk en mondeling presenteren. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Studenten met een biomedische of gezondheidswetenschappelijke achtergrond worden in hun toekomstige carrière steeds meer betrokken bij het tot stand komen van medische innovaties, zoals technische innovaties, zorginnovaties en systeeminnovaties. Bij deze innovaties spelen verschillende actoren een rol, zoals wetenschappers, gebruikers, verzekeraars, zorgverleners, industrie en patiënten. De verschillende perspectieven van deze actoren zijn van invloed op het welslagen van innovatieprocessen. Het betrekken van meerdere actoren zoals, o.a. patiënten, zorgverleners en onderzoekers in het innovatie proces is niet eenvoudig. In deze cursus wordt ingegaan op verschillende casussen waarin dit proces gerealiseerd is en hoe je de interactie tussen de verschillende groepen kunt managen. Voorbeelden zijn de ontwikkeling van cochleaire implantaten voor doven en slechthorenden, patiëntenparticipatie bij brandwondenonderzoek en het implementeren van het 'patiënt-centraal' concept in ziekenhuizen. We bespreken verschillende theoretische inzichten met betrekking tot het managen van medische innovaties (managementstrategieën en 'vormen). Ook gaan we in Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 45 van 78

op innovatiesystemen in de internationale context. In kleine groepjes studenten krijg je vervolgens de opdracht om een medisch innovatieproces (technologische, zorg- of systeeminnovatie) te analyseren met behulp van de theorieën en inzichten verkregen uit de colleges. Aan het einde van de cursus presenteren de verschillende groepen hun analyse aan de medestudenten. Onderwijsvorm De cursus zal bestaan uit hoorcolleges en het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband. Toetsvorm Individuele toetsing bestaat uit: (1) schriftelijk tentamen (50%), en (2) projectopdracht (50%). Individuele beoordeling van de projectopdracht vindt plaats op basis van individuele producten, het functioneren in de projectgroep en de beoordeling van groepsproducten. Beide onderdelen moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Syllabus. Eventueel een boek. Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen en Gezondheidswetenschappen. Speciaal aanbevolen voor studenten die de masteropleiding Management Policy Analysis and Entrepreneurship, of de differentiatie International Public Health binnen de masteropleidingen Health Sciences of Biomedical Sciences willen gaan volgen. Overige informatie Voor informatie over de cursus kun je contact opnemen met dr. R. Visser of W.S. Konijn MSc, tel 020-5987031

Medical Genomics Vakcode

AB_487012 (450003)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. ir. A.J.A. Groffen

Docent(en)

dr. R.J.M. van Spanning, prof. dr. A.B. Smit, prof. dr. P. Heutink, dr. J.M. Kooter

Lesmethode(n)


Doel vak Genomics richt zich op het bestuderen van het hele genoom. Terwijl verschillende species zich onderscheiden door verschillen in de samenstelling van hun genoom, verschillen ook individuen binnen een populatie door een beperkte mate van variatie. Zulke variaties zijn bepalend voor het gedrag en ziekten. De cursus Medical Genomics biedt inzicht in technieken voor het in kaart brengen van genomische overeenkomsten en verschillen. Als voorbeeld worden, naast toepassingen in research (biologie, levenswetenschappen), vele toepassingen in de gezondheidszorg behandeld. De hoofddoelen zijn:


8-6-2012 - Pagina 46 van 78

het verkrijgen van inzicht in de samenstelling en organisatie van het genoom en de benaderingen om dat te analyseren; het vergelijken van genomen van verschillende species; het inzichtelijk maken hoe genomische eigenschappen de basis vormen voor het functioneren van cellen en het gedrag van organismen; te begrijpen hoe individuele variatie kan worden gebruikt om ziektegenen op te sporen het verkrijgen van inzicht in hoe genoom-elementen bijdragen tot complexe biologische funkties of ziektes. Voor deze hoofddoelen worden de volgende vaardigheden bijgebracht: het vinden en gebruiken van databases waarin DNA-sequenties, transcriptomics en proteomics profielen in kaart zijn gebracht; het benutten van informatie uit genfunctie-onderzoek dat is uitgevoerd inverschillende modelorganismen; het identificeren van genetische diversiteit en variaties die bijdragen tot het onstaan van ziekte of de kwetsbaarheid hiervoor. Tenslotte heeft de cursus het doel de student te laten kennismaken met een aantal belangrijkse toepassingen van genoomanalyse: medische toepassingen (gene arrays, SNP-arrays, expressie profiling, proteomics) research toepassingen (genetische manipulatie in modelorganismen); biotechnologische en ecologische toepassingen; ethische aspecten van genomics en genetische modificatie. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus bouwt voort op basiskennis van genetica en begint met een 'opfriscollege' en een toets om een goed ingangsniveau te garanderen. Het hoofdbestanddeel van de cursus omvat elke ochtend een hoorcollege en elke middag een computerpracticum, dat op de VU of thuis mag worden gemaakt. In de laatste week is er tijd voor het afronden van opdrachten en voorbereiden van het tentamen. Onderwijsvorm Hoorcolleges (45 uur), computerpractica (45 uur) en zelfstudie (32 uur in laatste cursusweek) Toetsvorm Schriftelijk tentamen en ingeleverde werkopdrachten. Het eindcijfer wordt bepaald uit het gewogen gemiddelde van de scores voor het tentamen (80%) en de computerpractica (20%). Studenten kunnen alleen slagen nadat zij alle computerpractica hebben volbracht. Literatuur Syllabus (details zullen worden aangekondigd via Blackboard) Doelgroep Verplicht voor BSc Gezondheid en Leven (tweede of derde jaar). Keuzecursus voor BSc Biologie (derde jaar). Keuzecursus voor master Oncologie.

Medische farmacologie Vakcode

AB_470032 (450003)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels


8-6-2012 - Pagina 47 van 78

Faculteit


Coördinator

prof. dr. A.N.M. Schoffelmeer

Docent(en)

prof. dr. T.J. de Vries, prof. dr. A.N.M. Schoffelmeer, dr. T. Pattij, dr. L. Diergaarde, dr. B. Drukarch

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep, Practicum

Doel vak De student wordt bekend gemaakt met de basisprincipes en belangrijkste begrippen uit de medische farmacologie en het werkingsmechanisme van farmaca, met name van die geneesmiddelen die hun aangrijpingspunt hebben op de neuronale prikkeloverdracht in het perifeer en centraal zenuwstelsel. Aan het eind van de cursus dient de student de farmacologische wetmatigheden en begrippen in eigen woorden te kunnen reproduceren. De student wordt geacht medisch farmacologische problemen te kunnen oplossen in situaties analoog aan die welke tijdens de cursus aan de orde zijn gekomen. Eindtermen: De student dient de belangrijkste begrippen en basisprincipes uit de farmacokinetiek (de wijze waarop farmaca in het lichaam worden opgenomen, verdeeld, afgebroken en uitgescheiden) te kunnen omschrijven; De student kan een omschrijving geven van basisprincipes van de farmacodynamie ten aanzien van: - de rol van het zenuwstelsel bij het functioneren van organen, spieren, klieren en de hersenen; het werkingsmechanisme van farmaca, die hun aangrijpingspunt hebben op neurotransmitter receptoren; - de fysiologische en farmacotherapeutische betekenis van receptor heterogeniteit; De student kan een omschrijving geven van de wijze waarop de (bij)werkingen van geneesmiddelen klinisch wordt onderzocht. Niveau 2: verdieping Inhoud vak In de cursus staat de interactie tussen biologisch actieve stoffen en levende organismen in relatie tot het normaal functioneren van het organisme en de effectiviteit van geneesmiddelen bij ziekten centraal. Er wordt in detail aandacht besteed aan: Het lot van farmaca in het lichaam; Dosis-werkingsrelaties van geneesmiddelen; Pre- en postsynaptische signaaltransductie mechanismen; Neurotransmitter receptor heterogeniteit in relatie tot het functioneren van met name het cardiovasculair systeem, de ademhaling, het maag-darmkanaal en de skeletspieren; De farmacotherapeutische behandeling van psychiatrische en neurologische ziekten; De uitvoering van klinisch geneesmiddelenonderzoek. Onderwijsvorm Hoorcolleges (30 uur); Werkcolleges (6 uur); Practica (verplicht, 15 uur); PGO (verplichte zelfstudie, circa 20 uur), inclusief rapportage (referaat, essay). Toetsvorm Individuele PGO-toets (multiple choice vragen); Tentamen (essayvragen). (eindcijfer = cijfer tentamen + cijfer PGO-toets) Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 48 van 78

Literatuur Cursusboek Medische Farmacologie (prijs 25 euro) en daarin aangegeven literatuur. Aanbevolen voorkennis Basiskennis over anatomie en (neuro)fysiologie wordt als bekend verondersteld. Doelgroep Verplichte cursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen Overige informatie Er wordt gewerkt in 4 groepen. De groepsindeling wordt (rekening houdend met de voorkeur van studenten) tijdens de eerste ochtend gemaakt en is vanaf dat moment definitief. Ook dient dan het cursusboek te worden aangeschaft.

Methodologie en statistiek I Vakcode

AB_470165 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. L.D.J. Kuijper

Docent(en)

dr. K. Krab, H.R. Zoomer, dr. L.D.J. Kuijper

Lesmethode(n)


Doel vak In deze cursus maak je allereerst kennis met de theorie van proefopzetten. Als voorbereiding op het onderdeel Statistiek leer je omgaan met relevante aspecten van kansrekening. Tenslotte maak je kennis met elementaire statistische methoden voor enkele veel voorkomende proefopzetten in de biologische en biomedische wetenschappen. In de cursus benadrukken we de praktische aspecten van de statistische analyse door het gebruik van Excel. Eindtermen De student kan - gegevens op een juiste wijze grafisch weergeven - grafische weergaven van gegevens interpreteren - gegevens op de juiste wijze samenvatten in enkele maten, die locatie en spreiding beschrijven - de samenhang tussen twee variabelen berekenen en interpreteren - Simpson's paradox herkennen, en de gegevens zo presenteren dat de paradox verdwijnt - de sterke en zwakke punten van observationeel en experimenteel onderzoek benoemen en herkennen - uitleggen hoe je met informatie uit een steekproef algemene uitspraken kan doen over een statistische populatie - in een concrete situatie aangeven in hoeverre een steekproef voldoet aan het ideaalbeeld van een toevalssteekproef - de terminologie van proefopzetten correct gebruiken. - de basale regels van de kansrekening correct toepassen - de regel van Bayes toepassen


8-6-2012 - Pagina 49 van 78

- werken met de besproken kansverdelingen - werken met z- waarden - omgaan met de kansverdeling van steekproefgemiddelde en - proportie - betrouwbaarheidsintervallen berekenen voor populatiegemiddelde en proportie - uitleggen wat een betrouwbaarheidsinterval is - de gedachtegang van een statistische toets in eigen bewoordingen weergeven - uitleggen wat de relatie is tussen een statistische toets en een betrouwbaarheidsinterval - uitleggen aan welke voorwaarden de gegevens moeten voldoen, wil het resultaat van een statistische analyse betrouwbaar zijn - uitleggen wat een toetsingsgrootheid (test statistic) is, en wat een P- waarde is Niveau 1: basiscursus Inhoud vak - Theorie van proefopzetten; - Inleiding kansrekening en basale theorie van kansverdelingen - Statistische Theorie en toepassing daarvan. Onderwijsvorm Hoorcolleges; werkcolleges; computerpracticum; zelfstudie Literatuur B. Baldi & D.S. Moore (2009). The practice of statistics in the life sciences. Freeman and Co., New York. ISBN: 1-4292-1876-2 Doelgroep Verplicht voor tweedejaars bachelorstudenten Biomedische wetenschappen. Overige informatie Een voldoende cijfer voor deze cursus is ingangseis voor deelname aan de cursus Methodologie en statistiek 2 (470062); in het derde studiejaar.

Methodologie en statistiek II Vakcode

AB_470062 (450003)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. L.D.J. Kuijper

Docent(en)

dr. ir. P.M. van Bodegom, H.R. Zoomer, dr. L.D.J. Kuijper

Lesmethode(n)


Doel vak Herhaling en opfrissing van de onderwerpen statistiek behandeld in Methodologie & Statistiek I; kennismaking met statistische methoden voor enkele meer complexe proefopzetten in de biologische en biomedische wetenschappen, zoals variantieanalyse en regressieanalyse. Het accent in deze cursus ligt op verdieping van de stof aangeboden in de cursus Methodologie & Statistiek I. Ten dele betreft het een verdieping van de theorie (bijv. het onderwerp power).


8-6-2012 - Pagina 50 van 78

Daarnaast zullen we aandacht besteden aan het interpreteren van statistische resultaten zoals die in de primaire literatuur worden gepresenteerd. In de cursus benadrukken we de praktische aspecten van de statistische analyse door het gebruik van Excel. Tot slot besteden we aandacht aan de structuur van wetenschappelijke redeneringen. Eindtermen De student kan - kritisch analyseren hoe metingen tot stand zijn gekomen, en welke consequenties dat heeft voor een statistische analyse van de gegevens. - nagaan of een gegeven dataset voldoet aan de vooronderstellingen van een bepaalde statistische analyse - de volgende analyses zelf uitvoeren, de resultaten interpreteren, en de gegevens grafisch weergeven: t- toets, ANOVA (one- way en two- way), correlatie- en regressieanalyse, chikwadraattoetsen, e. a. - herkennen wanneer een non- parametrische techniek gebruikt moet worden; - de relatie tussen een statistische hypothese en een wetenschappelijke theorie verklaren; - basale begrippen uit; 'experimental design' toepassen; - een geschikte toets kiezen gegeven een experimental design dat in de cursus behandeld is; - middels simulaties in Excel de kansverdeling van toetsingsgrootheden zelf genereren - met simulaties in Excel powerberekeningen doen - de power bepalen van enkele veel voorkomende eenvoudige toetsen mbv Excel - statistische resultaten zoals die in de literatuur gepresenteerd worden interpreteren en beoordelen; - wetenschappelijke redeneringen reconstrueren en analyseren. De student moet alle hierboven genoemde toetsen kunnen uitvoeren met Excel. Niveau 2: verdieping Inhoud vak - Variantieanalyse (one-way en two-way); - Regressieanalyse; - Analysis of Categorical Data, Matched pairs designs; - Experimental Design; - Argumentatietheorie; - Simulaties Onderwijsvorm Hoorcolleges; werkcolleges; Excelpracticum; zelfstudie; onderzoeksproject, waarin zelfstandig of in kleine groepjes gegevens worden verzameld en geanalyseerd; het project wordt afgesloten met een verslag. Toetsvorm Schriftelijk tentamen (70% van het eindcijfer); verslag over project (30% van het eindcijfer); Beide onderdelen moeten voldoende zijn. Literatuur - Baldi, B & Moore, D.S. 2009. The Practice of Statistics in the Life Sciences. - (N. B: Dit is hetzelfde boek als gebruikt in de cursus Methodologie & Statistiek I) - Diverse artikelen; tijdens de cursus zullen de URL's hiervoor op Blackboard verschijnen.


8-6-2012 - Pagina 51 van 78

Vereiste voorkennis De cursus Methodologie en statistiek 1, code 470142 of 470165, moet met een voldoende zijn afgerond. Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische wetenschappen. Keuze voor derdejaars BSc Gezondheid en Leven. Overige informatie Deze cursus geldt als ingangseis voor het volgen van elke masteropleiding.

Moleculaire celbiologie Vakcode

AB_470079 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. R.J.M. van Spanning

Docent(en)

prof. dr. H.V. Westerhoff, dr. R.J.M. van Spanning, dr. K. Krab

Lesmethode(n)


Doel vak Het verkrijgen van inzicht in het functioneren van cellen en het kennis maken met methodes om dat in de levende cel en erbuiten te bestuderen. Eindtermen: Het kunnen ontwerpen en uitvoeren van eenvoudige genexpressie-, signaaltransductie- en metabole experimenten Het kunnen maken en interpreteren van 'live' opnamen van wat er in levende cellen gebeurt met betrekking tot energiehuishouding, zuurstofschade, apoptose, DNA structuur, en signaaltransductie. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Organisatie, functie en regulering van de cellulaire ademhaling en productie van ATP, in relatie tot verstoringen van celfunctie zoals die optreden bij diabetes en veroudering; Regulatie van genexpressie tijdens de adaptieve respons van microorganismen bij verandering van de groeiconditie; Kwantitatieve beschrijving van de controle van cellulaire processen, met nadruk op het verband tussen de eigenschappen van individuele reacties en de eigenschappen van het netwerk waar die reacties deel van uitmaken (systeembiologie). Demonstratie van de bovenstaande principes aan de hand van de rol van signaaltransductie in bacterie, gist en mitochondrion. Onderwijsvorm Hoorcolleges; practicum op de afdeling Moleculaire Celfysiologie; computerpracticum.


8-6-2012 - Pagina 52 van 78

Toetsvorm Schriftelijk tentamen over collegestof en practicum (75%), eindpresentatie (25%) Literatuur Syllabus, prijs ongeveer 5 euro, en powerpoints hoorcolleges. Aanbevolen voorkennis Microbiologie en Biochemiecursussen of equivalent. Doelgroep Keuzevak derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Overige informatie Een laboratoriumjas is verplicht. Na afloop van het practicum wordt de labjas gesteriliseerd.

Moleculaire ontwikkelingsbiologie Vakcode

AB_470038 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. R.E. Koes

Docent(en)

prof. dr. R.E. Koes

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep, Practicum

Doel vak Het doel van deze cursus is inzicht te geven in - het functioneren van genen en complexere netwerken van meerdere genen in de sturing van complexe processen. - hoe genen en netwerken de ontwikkeling sturen van een enkel cel, de bevruchte eicel of zygote tot een complex eukaryoot organisme bestaande uit miljarden cellen met de juiste organen, weefsels en celtypes op de juiste plaats. - moleculair genetische onderzoek methodes en technieken waarmee we (ontwikkelings)biologische processen kunnen ontrafelen. Specifieke onderwerpen die daarbij aan de orde zullen komen zijn: - Moleculair mechanismen die de expressie van genen reguleren via DNA bindende eiwitten (transcriptie factoren), DNA- methylering en chromatinestructuur. - het functioneren van simple genetische circuits in de differentatie van verschillende celtypes en de moleculaire grondslag van "cell memory" (d. i de onomkeerbarheid van differentiatie). - Rol van "mobiel DNA" tijdens sex-differentiatie en gist en de ontwikkeling van B- lymphocyten in de mens. - regulatie en genetische controle van opvolgende fases in de cel cyclus (rol van checkpoint) - Specificatie van de lichaamsopbouw (anterior- posterior en dorsalventral lichaamsassen, segmenten, organe etc) tijdens vroege embryogenese. - Conservering van ontwikkelingsgenen (o. a. Hox genen) van insect tot muis. - Variatie tussen Hox genen en het ontstaan van diversiteit bij dieren.


8-6-2012 - Pagina 53 van 78

("evo-devo" aspecten) - Ontwikkeling van een hogere plant Het doel van het practicum is: - Experimentele vaardigheden op te doen met enkele breed toepasbare moleculair genetische technieken. - Het leren interpreteren van experimentele resultaten en het bedenken van vervolg experimenten. - Het inzicht te verdiepen in de regulatie van genexpressie en de functie tijdens ontwikkelingsprocessen. Niveau van de cursus: 2 (verdieping) Inhoud vak De cursus start met twee "opfriscolleges" en een korte toets om een goede achtergrondkennis te verzekeren. Het hoofddeel van de cursus omvat hoorcolleges, werkcolleges en een "nat" practicum waarin we een aantal verschillende aspecten en moleculair mechanismen behandelen die ten grondslag liggen aan de ontwikkeling van hogere eukaryote organismes (zie doelen). Onderwijsvorm Hoorcolleges (24 uur); werkcolleges (4 uur); practicum (circa 40 uur); zelfstudie (80 uur). Toetsvorm De benodigde voorkennis en de inleidende practicumtheorie wordt schriftelijk getoetst bij aanvang van de 2e cursusweek (10% van eindcijfer). Het practicum wordt beoordeeld aan de hand van een schriftelijke toets (40% van eindcijfer). De collegestof wordt schriftelijk getentamineerd (50% eindcijfer). Literatuur - Handboek: Wordt nader bekendgemaakt - Uittreksels (powerpoint files) van collegestof (gratis te downloaden van Blackboard); - Practicumhandleiding (ongeveer 7 euro) - Computerfiles (pdf) van artikelen gebruikt bij het practicum (gratis te downloaden via Blackboard). Doelgroep Keuzecursus voor tweede en derdejaars Bsc Biologie, Biomedische Wetenschappen. Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. Maximaal 40 deelnemers. Overige informatie Bij dit studieonderdeel is het voor studenten die het Bachelor Honoursprogramma; Biologie, Bio- medische Wetenschappen of Gezondheid; en Leven; volgen, mogelijk te kiezen voor de stervariant. Bij de stervariant wordt aan het bovenomschreven studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De stervariant wordt geregistreerd onder een aparte vakcode. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 EC boven de Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 54 van 78

normale belasting van de cursus.

Moleculaire ontwikkelingsbiologie * Vakcode

A_HP470038 ()

Periode

Periode 5

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator



Molecular Microbiology Course code

AB_470610 (450003)

Period

Period 5

Credits

6.0

Language of tuition

English

Faculty


Coordinator

dr. J.P. van Ulsen

Teaching staff

dr. R.J.M. van Spanning, prof. H. Lill, dr. S. Luirink, dr. M.P. Bergman, prof. dr. W. Bitter, dr. J.P. van Ulsen

Teaching method(s)

Lecture, Computer lab, Symposium

Course objective To show the molecular processes that are the basis of bacterial infections. The complex molecular processes in and biogenesis of the bacterial cell-envelope serve as central themes. The emphasis is on structure and function of the bacterial cell envelope and its role in bacterial pathogenesis in disesases like peritonitis and tuberculosis and its importance for vaccine development. To teach how theory in the scientific literature and practical approaches in the lab are combined to answer a research question. At the end, the students are able to understand and know: fundamental molecular processes in disease-causing bacteria that are important for growth, functioning and pathogenicity. practical approaches in the molecular microbiology area, immunology, bacterial DNA technology, protein techniques, etc. Level 3: specialisation


8-6-2012 - Pagina 55 van 78

Course content Theory: Lectures on: biogenesis and functional aspects of the bacterial cell envelope and the structure of its components (proteins and LPS); secretion systems in the bacterial cell envelope; the role of virulence factors in bacterial pathogenesis; the mechanisms with which bacteria escape the human immune system; vaccine development and vaccine target selection. Practical: Students design and perform a research project within the departments that participate in the course. The project involves writing a research proposal, performing the project in the lab and reporting the results in a project symposium (oral presentation with discussion). Form of tuition Lectures series based upon provided literature Research project, with theoretical component (writing research proposal, practical component (laboratory work) and presentation Type of assessment Written exam (50%, minimal mark to succeed is 5) and assesment of the laboratory project (50%), with marks for the research proposal (20%), the laboratory journal (10%) and the presentation (20%) Course reading Reader (ca. 10 Euro) Target group Optional course for Master students in Molecular cell biology / Immunology / Infection / Biomolecular sciences, with a deficiency in the field of molecular microbiology third-year BSc Biology, Biomedical Sciences and Biochemistry Second- and third-year BSc Health and Life Remarks Taught in English when necessary; much direct contact with the professors, associate and assistant professors, PhD's and postdocs.

Neurowetenschappen I Vakcode

AB_470199 (450003)

Periode

Periode 2

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. H.K.E. Vervaeke

Docent(en)

prof. dr. H.D. Mansvelder, dr. H.K.E. Vervaeke, dr. J.J. Koksma

Lesmethode(n)


Doel vak Kennis en inzicht verkrijgen in de bouw en functie van het zenuwstelsel. Niveau 2: verdieping


8-6-2012 - Pagina 56 van 78

Inhoud vak De cursus bestaat uit drie onderscheiden maar integraal onderwezen modules, te weten: Module 1: Neuroanatomie. Naast colleges zal aan de hand computer tutorials, demonstratie- en snijpractica inzicht worden verworven in de opbouw van de hersenen. Module 2: Van synapsen naar netwerken, waarbij de nadruk ligt op de moleculaire en celfysiologische benadering van zenuwcellen en netwerken. Naast colleges zal aan de hand computer simulaties en metingen op biologische preparaten inzicht worden verworven in het functioneren van ons zenuwstelsel. Module 3: Cognitie, Gedrag en Ziekte, waarbij de nadruk ligt op het cognitieve gedrag van mens en dier, de erfelijkheid daarvan en de verschillen tussen mensen. Onderwijsvorm Iedere module bevat een aantal colleges, computer tutorials en practica welke onder begeleiding zullen worden doorlopen. In iedere module zullen bepaalde onderdelen via Blackboard responders en/of practicumopdrachten worden getoetst. Toetsvorm Neurowetenschappen I wordt afgesloten met een schriftelijk examen aan het einde van de cursus, bestaande uit open vragen. Herkansing van de eindtoets is eenmaal per jaar mogelijk, de practica worden alleen in noodzakelijke gevallen op individuele basis herkanst. Literatuur Neuroscience, Dale Purves c.s. Sinnauer Associates, Fourth Edition 2008 Aanbevolen voorkennis Aanbevolen voorkennis: kennis en interesse opgedaan in andere gerelateerde vakken zoals Cellulaire Biologie (1e jaars BMW) of Vorm en Functie (1e jaars Gezondheid en Leven) Doelgroep Neurowetenschappen I is een verplichte cursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen en een keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. De cursus vormt een goede oriëntatie op (en is een ingangseis voor) de vervolgcursussen Neurowetenschappen II en III, beide belangrijk ter oriëntatie op een eventuele bachelor stage op het terrein van de Neurowetenschappen en later bij de toelating tot de Master of Neurosciences aan de VU/VUmc. Meer informatie hierover kunt u verkrijgen via de cursusleiding. Overige informatie Studenten Gezondheid & Leven die kiezen voor de cursus Neurowetenschappen I (470199) kunnen niet de cursus Preklinische Neurowetenschappen (487016) volgen. Slechts één van beide cursussen wordt toegestaan binnen het examenprogramma van Gezondheid en Leven.

Neurowetenschappen I * Vakcode

A_HP470199 (450003)

Credits

3.0

Voertaal

Engels


8-6-2012 - Pagina 57 van 78

Faculteit


Coördinator


Neurowetenschappen II: Genes and the brain Vakcode

AB_470204 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. H.K.E. Vervaeke

Docent(en)

dr. K.W. Li, prof. dr. S. Spijker, dr. R.E. van Kesteren, prof. dr. M. Verhage, dr. R.F.G. Toonen, prof. dr. A.B. Smit, prof. dr. P. Heutink, dr. P. van Nierop, dr. H.K.E. Vervaeke, dr. H. de Wit, dr. J.J. Koksma

Lesmethode(n)


Doel vak Deze cursus is gericht op het leren begrijpen van de relatie tussen moleculaire en cellulaire processen in het brein en het functioneren van het brein als geheel. De student zal na deze cursus een goed inzicht hebben en vaardigheden bezitten in het van gebruik van moleculaire en celbiologische technieken. Zelfstandig leren werken en een ontplooiingsmogelijkheid bieden voor academisch talent zijn daarbij belangrijke uitgangspunten. Niveau van de cursus: 2, inzoomen op deelgebieden van de neurobiologie, state of the art kennis met betrekking tot lopend wetenschappelijk onderzoek, aanleren van specifieke methoden en technieken; niveau 3: theorievorming op basis van onderzoeksgegevens, aanzet tot specialisatie, leren verwerken van primaire en secundaire wetenschappelijke literatuur. Inhoud vak Aan de hand van theorievorming en secundaire wetenschappelijke literatuur zal een begin gemaakt worden met de integratief neurowetenschappelijke benadering van de moleculaire biologie van ons brein, de cellulaire biologische methodes en de principes van de gedragsgenetica. Aan de hand van een drietal modules zullen studenten vervolgens vaardigheden opdoen en onderzoek leren verrichten. Deze modules zijn: Moleculaire Neurobiologie, gericht op methodiek in de moleculaire neurobiologie Cellulaire Neurobiologie, gericht op functionele analyse en imaging Van Gen naar Gedrag Onderwijsvorm De cursus heeft een sterk experimenteel karakter, er is veel aandacht voor laboratoriumwerk en opzet en verslaglegging van experimenten. Studenten zullen in subgroepen werken aan een aantal experimentele modules. Er worden vier practica aangeboden, waarbij zowel computers als laboratorium faciliteiten worden gebruikt. Toetsvorm


8-6-2012 - Pagina 58 van 78

Neurowetenschappen II wordt afgesloten met een schriftelijk examen aan het einde van de cursus, welke gecombineerd met drie practicumverslagen die tezamen het eindcijfer van de cursus vormen. De multiple choice-eindtoets telt mee voor 40% en de drie practicumverslagen elk voor 20%. Om te kunnen slagen voor de cursus moet voor ieder van deze onderdelen afzonderlijk een voldoende worden gehaald. Herkansing van alleen de eindtoets is eenmaal per jaar mogelijk, de practicumbeoordelingen worden op individuele basis herkanst bij een volgende cursus. Bij uitzondering zal een vervangende opdracht kunnen worden gegeven. Literatuur Neuroscience, Dale Purves c.s. Sinnauer Associates, Fourth Edition 2008 Vereiste voorkennis Voor studenten Biomedische Wetenschappen geldt als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I (dus een voldoende gehaald). Voor studenten Biologie geldt als ingangseis de cursus Genen, hersenen en gedrag (dus een voldoende gehaald). Bij voldoende capaciteit geldt voor studenten Gezondheid en Leven, die van hun examencommissie toestemming hebben aan de cursus deel te nemen, als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I of Preklinische Neurowetenschappen (dus een voldoende gehaald). Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars (en derdejaars) Bsc Biologie, Biomedische Wetenschappen en Gezondheid en Leven. Het volgen van Neurowetenschappen II is een goede oriëntatie op een eventuele neurowetenschappelijke stage aan de Neuroscience Campus Amsterdam of elders. Tevens is het volgen van Neurowetenschappen II een pré bij de toelating tot de Master of Neurosciences van de VU/VUmc. Meer informatie kunt u verkrijgen via dr. W. Smeets (coördinator Master of Neurosciences) en/of via internet (www.neurosciencecampus-amsterdam.nl; zie Master of Neurosciences). Overige informatie Neurowetenschappen II sluit mooi aan bij Neurowetenschappen III en is daarmee de ideale voorbereiding op een verdere academische specialisatie. Hoewel Neurowetenschappen II een specialisatiecursus is welke op niveau 2 en/of 3 haar onderdelen aanbiedt, is er een redelijke capaciteit aangezien de cursus instituutbreed gedragen zal worden. Door de intensieve begeleiding zal het beoogde werkgroepkarakter behouden blijven. Per jaar kunnen zich maximaal 80 studenten inschrijven voor deze cursus. Voorrang wordt verleend aan tweedejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Cursus is bij voldoende capaciteit wel opengesteld voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen en tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. Studenten van andere richtingen komen alleen in aanmerking als er plaatsen over zijn (en moeten eerst contact opnemen met de docent omtrent ingangseisen). Overigens is er een minimum aantal inschrijvingen van 25 een voorwaarde voor de cursus om door te gaan.

Neurowetenschappen III: monitoring the brain Vakcode

AB_470205 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0


8-6-2012 - Pagina 59 van 78

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. H.K.E. Vervaeke

Docent(en)

prof. dr. H.D. Mansvelder, dr. R.O. Stiedl, dr. A. van Ooijen, dr. H.K.E. Vervaeke, dr. J.J. Koksma

Lesmethode(n)


Doel vak Cursus gericht op het leren begrijpen van het brein, met name op het terrein van 'monitoring the brain'. De student zal na deze cursus goed inzicht hebben en vaardigheden bezitten op het terrein van gedrags- en neurofysiologische technieken en onderzoeksvragen. Tevens wordt het afleiden van zenuwcellen, het monitoren van diergedrag en de theorievorming middels computermodellen gedemonstreerd. Zelfstandig leren werken en een playground bieden voor academisch talent zijn daarbij belangrijke uitgangspunten. Niveau van de cursus: 2, inzoomen op deelgebieden van de neurobiologie, aanleren van specifieke methoden en technieken; niveau 3: theorievorming op basis van onderzoeksgegevens, aanzet tot specialisatie, leren verwerken van primaire en secundaire wetenschappelijke literatuur. Inhoud vak Aan de hand van theorievorming en secundaire wetenschappelijke literatuur zal een begin gemaakt worden met de integratief neurowetenschappelijke benadering van synaptische transmissie, neuronale netwerken en diergedrag. Aan de hand van een drietal experimentele modules zullen studenten vervolgens vaardigheden opdoen en onderzoek leren verrichten. Deze modules zijn: Neuroinformatics, gericht op neuronale netwerken en modelbouw Zintuigfysiologie, gericht op sensorische informatie verwerking Gedragsbiologie, gericht op het leren begrijpen van gedrag van proefdieren Onderwijsvorm Basisstof wordt behandeld in de vorm van hoorcolleges, adhv het tekstboek van Purves en aanvullende literatuur. Het accent in de cursus ligt op het zelf bestuderen van de fysiologie van het brein in een drietal practica. Over een van deze drie onderzoeken maken de studenten een wetenschappelijke poster die gepresenteerd wordt tijdens het postersymposium aan het eind van de cursus. Toetsvorm Neurowetenschappen III wordt afgesloten met een schriftelijk multiple choicetentamen aan het einde van de cursus, dat voor 60% het eindcijfer bepaalt. Naast dit tentamen maken de studenten een poster die voor 40% meetelt en moeten de studenten aan verdere practicumverplichtingen hebben voldaan. Om te kunnen slagen voor de cursus moet voor ieder van deze onderdelen afzonderlijk een voldoende worden gehaald. Herkansing van alleen de eindtoets is eenmaal per jaar mogelijk, de practicum beoordelingen worden op individuele basis herkanst. Literatuur Neuroscience, Dale Purves c.s. Sinnauer Associates, Fourth Edition 2008 Aanbevolen voorkennis


8-6-2012 - Pagina 60 van 78

Voor studenten Biomedische Wetenschappen geldt als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I (dus een voldoende gehaald). Voor studenten Biologie geldt als ingangseis de cursus Genen, hersenen en gedrag (dus een voldoende gehaald). Bij voldoende capaciteit geldt voor studenten Gezondheid en Leven, die van hun examencommissie toestemming hebben aan de cursus deel te nemen, als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I of Preklinische neurowetenschappen (dus een voldoende gehaald). Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars (en derdejaars) Bsc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Het volgen van Neurowetenschappen III is een goede oriëntatie op een eventuele neurowetenschappelijke stage aan de Neuroscience Campus Amsterdam of elders. Tevens is het volgen van Neurowetenschappen III een 'pre' bij de toelating tot de Master of Neurosciences van de VU/VUmc. Meer informatie kunt u verkrijgen via dr. Wil Smeets (coördinator Master of Neurosciences) en/of via www.neurosciencecampus-amsterdam.nl/en/education/master-of-neuroscience. Overige informatie Hoewel Neurowetenschappen III een specialisatiecursus is welke op niveau 2 en/of 3 haar onderdelen aanbiedt, is er een redelijke capaciteit aangezien de cursus instituutbreed gedragen zal worden. Door de intensieve begeleiding zal het beoogde werkgroepkarakter behouden blijven. Per jaar kunnen zich maximaal 80 studenten inschrijven voor deze cursus. Voorrang wordt verleend aan tweedejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen en studenten Gezondheid en Leven. Cursus is bij voldoende capaciteit wel opengesteld voor derdejaars studenten. Studenten van andere richtingen komen alleen in aanmerking als er plaatsen over zijn (en moeten eerste contact opnemen met de docent omtrent ingangseisen). Studenten die geen ingang krijgen in de cursus Neurowetenschappen III wordt gewezen op de mogelijkheid deel te nemen aan de cursus Humane Neurofysiologie van de opleiding Gezondheid en Leven die gelijktijdig wordt aangeboden vanuit dezelfde afdelingen. Overigens is er een minimum aantal inschrijvingen van 25 een voorwaarde voor de cursus om door te gaan.

New Anatomy Vakcode

OH_NA (986010)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit

Onderwijscentrum VU

Coördinator


Oncologie Vakcode

AB_470050 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit



8-6-2012 - Pagina 61 van 78

Coördinator

dr. T.D. de Gruijl

Doel vak Het doel van deze cursus is kennis en inzicht te verkrijgen in het ontstaan en klinisch voorkomen van diverse vormen van kanker, maar ook over diagnostiek en therapievormen van kanker. Na het volgen van deze cursus kunt u de algemene principes, concepten en de epidemiologie van kanker beschrijven. Tevens beschikt u over een gedegen kennis omtrent de genetische, virale en chemische factoren die een rol kunnen spelen bij het ontstaan van kanker. Daarnaast kunt u de belangrijkste immunologische en celbiologische processen die een rol spelen bij kanker uitleggen en de verschillende methodes van kankerbehandeling en kankerpreventie benoemen en vergelijken. Niveau 2: verdieping, bij deze cursus is het mogelijk voor de stervariant te kiezen en 3 EC extra te verkrijgen; zie onderstaande paragraaf opmerkingen. Inhoud vak Kanker is één van de belangrijkste doodsoorzaken in Nederland, en zal door de ouder wordende populatie in de nabije toekomst een steeds grotere maatschappelijke impact gaan krijgen. Kankeronderzoek heeft zich in de laatste decennia in vele verschillende richtingen uitgebreid. Inzicht in de moleculaire, immunologische en celbiologische processen die een rol spelen bij kanker is noodzakelijk voor het verrichten van fundamenteel onderzoek op het gebied van kanker. Kennis over de verschillende ontstaansvormen en behandelwijzen van kanker is essentieel voor het opstellen van toegepaste onderzoeksprotocollen voor de diagnostiek of behandeling van specifieke patiëntengroepen. Tevens is deze kennis van belang voor de goede communicatie tussen de medici en de onderzoekers die binnen dit vakgebied opereren. De cursus Oncologie zal een gedegen overzicht geven over het ontstaan van kanker en de verschillende behandelmethodes. De volgende onderwerpen worden behandeld: Definities en epidemiologie van kanker Genetische factoren bij het ontstaan van kanker Chemische en virale oncogenese Celbiologie van tumorcellen, proliferatie, metastasering, angiogenese Tumorimmunologie, tumormarkers Farmacologische en biologische effecten van cytostatica Nieuwe anti-tumormiddelen, o.a. kinase-remmers Onderwijsvorm Zelfstudie van basisstof, waar nodig aangevuld met passages uit recente reviews (worden uitgedeeld tijdens de colleges). De zelfstudie wordt aangevuld met interactieve werkcolleges (12 keer 1, 5 uur) over de meer complexe onderwerpen binnen de verschillende hoofdstukken en de meest recente ontwikkelingen door gastdocenten. Tevens wordt door de deelnemers een kort schriftelijk (en mondeling gepresenteerd) artikel samengesteld over "hot topics" in het veld. Alleen studenten die de desbetreffende hoofdstukken bestudeerd hebben en de voorbereidingsopdrachten hebben gemaakt zijn welkom tijdens de werkcolleges, daar er gelegenheid is aan de hand van uw vragen tekst en figuren toe te lichten. Tevens zal er geoefend worden op tentamenvragen. Toetsvorm Schriftelijk tentamen aan het einde van de vierde week van de cursus. De tentamenstof betreft hoofdstukken uit het gebruikte boek, waar nodig aangevuld met passages uit recente reviews (die worden uitgedeeld Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 62 van 78

tijdens de colleges). Het tentamen bestaat uit een combinatie van korte essayvragen en enkele multiple choicevragen. NB: mondelinge en schriftelijk rapportage over de literatuuropdrachten telt mee voor 0,5 punt in het eindcijfer. Studenten die bij de werkcolleges meer dan twee van de twaalf geroosterde dagdelen afwezig zijn, zullen niet tot dit schriftelijke tentamen toegelaten worden, maar dienen te wachten tot het herkansingstentamen of een vervolgcursus. Er is 1x per jaar een schriftelijk herkansingstentamen, waarvan de datum nader bekendgemaakt zal worden. Literatuur Molecular Biology of Cancer (2e druk), Lauren Pecorino, Oxford University Press, Recente reviews (nader uit te delen op de werkcolleges). Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars bachelorstudenten Biomedische Wetenschappen en Gezondheid en Leven. De cursus is verplicht voor studenten die de masteropleiding Oncologie willen gaan volgen. Overige informatie Maximaal 150 deelnemers. Bij dit studieonderdeel is het voor studenten die het Bachelor Honoursprogramma Biomedische Wetenschappen of Gezondheid en Leven volgen, mogelijk te kiezen voor de stervariant. Bij de stervariant wordt aan het bovenomschreven studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De stervariant wordt geregistreerd onder een aparte vakcode. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 EC boven de normale belasting van de cursus.

Oncologie * Vakcode

A_HP470050 ()

Periode

Periode 6

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk


8-6-2012 - Pagina 63 van 78

is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.

Onderzoek in de biomedische wetenschappen I Vakcode

AB_470214 (450003)

Periode

Periode 3

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. L.D.J. Kuijper

Lesmethode(n)


Doel vak Aan het eind van de cursus: - Heeft de student kennis gemaakt met de manier waarop wetenschappelijke vragen gesteld en beantwoord worden in het biomedische onderzoek; - Kan de student een verslag schrijven en mondelinge presentatie houden. - Heeft de student geleerd hoe onderzoeksgegevens kunnen worden weergeven in tabellen en figuren; - Beheerst de student de elementaire kansrekening; - Kan de student uitleggen wat de relatie tussen populaties en steekproeven is; - Kan de student effectschattingen met betrouwbaarheidsintervallen construeren rond kwantitatieve gegevens en rond proporties. Inhoud vak Tijdens cursus werken de studenten aan vragen die afkomstig zijn uit de wetenschappelijke afdelingen die de twee aan het project voorafgaande cursussen, verzorgen. De studenten leren een onderzoeksvraag te formuleren en gegevens te verzamelen, te analyseren en op verschillende wijze te presenteren. Onderwijsvorm Colleges, werkcolleges, practica Toetsvorm Tentamen Methodologie en statistiek (60%), verslag (40%). Beide moeten voldoende zijn. Het vak kan alleen met een voldoende afgesloten worden als de verplichte taaltoets Nederlands behaald is. Studenten die de taaltoets niet met een voldoende hebben afgesloten, dienen de remediërende cursus schrijfvaardigheid te volgen. Literatuur Baldi & Moore: the Practice of Statistics in the Life Sciences Doelgroep Verplichte cursus voor eerstejaars BSc Biomedische wetenschappen

Onderzoek in de biomedische wetenschappen II


8-6-2012 - Pagina 64 van 78

Vakcode

AB_470215 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. J.M. Koene

Lesmethode(n)


Doel vak Na afloop van de cursus - Heeft de student de kennis met de manier waarop wetenschappelijke vragen gesteld en beantwoord worden in het biomedische onderzoek verdiept; - Heeft de student zich verder bekwaamd in mondelinge en schriftelijke presentatie vaardigheden; - Kan de student onderzoeksgegevens in tabellen en figuren overzichtelijk weergeven; - Kan de student elementaire statistische analyses kunnen uitvoeren (ztests, t-tests, X2-test, correlatietests, relatieve risico's en odds ratio's Inhoud vak Deze cursus is een vervolg op de cursus Onderzoek in de Biomedische wetenschappen I. Tijdens cursus werken de studenten aan vragen die afkomstig zijn uit de wetenschappelijke afdelingen die de twee, aan deze cursus voorafgaande cursussen, verzorgen. De studenten leren een onderzoeksvraag te formuleren en gegevens te verzamelen, te analyseren en op verschillende wijze te presenteren. Onderwijsvorm Colleges, werkcolleges, practica Toetsvorm Tentamen Methodologie en statistiek (60%), presentatie (40%). Beide moeten voldoende zijn Literatuur Baldi & Moore: the Practice of Statistics in the Life Sciences Doelgroep Verplichte cursus voor eerstejaars BSc Biomedische wetenschappen

Onderzoek in de biomedische wetenschappen III Vakcode

AB_1014 (450003)

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Literatuur - Baldi, B & Moore, D.S. 2009. The Practice of Statistics in the Life Sciences (N. B: Dit is hetzelfde boek als gebruikt in de cursussen Onderzoek in de Biomedische Wetenschappen I en II) - Diverse artikelen; tijdens de cursus zullen de URL's hiervoor op Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 65 van 78

Blackboard worden gepubliceerd

Oriëntatie op onderzoek Vakcode

AB_470173 (450003)

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

drs. E.J.M. van de Grint

Docent(en)

drs. E.J.M. van de Grint

Lesmethode(n)


Doel vak De studenten maken kennis met: de manier waarop wetenschappelijke vragen gesteld en beantwoord worden in het onderzoek. twee onderzoeksgroepen Eindtermen Na afloop van de cursus ben je in staat: over een op een wetenschappelijke afdeling verkregen verzameling meetgegevens - een verslag te schrijven - een mondelinge presentatie te houden - een poster te maken en uit te leggen twee wetenschappelijke afdelingen met elkaar te vergelijken op grond van de door hun gebruikte methodologie eenvoudige data analyses uit te voeren een analyse te maken over je eigen belangstelling voor het wetenschappelijk onderzoek Niveau 2: verdieping Inhoud vak Wetenschappelijk onderzoek verschaft antwoorden op vragen. Het onderzoeksproces is te onderscheiden in een aantal stadia. Na het stellen van de onderzoeksvraag wordt informatie verzameld over het onderwerp om te achterhalen wat al bekend is. Vervolgens zal de vraag moeten leiden tot een hypothese, die leidt tot een proefopzet. In de proef worden gegevens verzameld, vaak met technisch geavanceerde apparatuur. De verkregen gegevens moeten na analyse een antwoord opleveren. Tot slot doet men verslag van het onderzoek in een artikel. In deze cursus ga je aan al deze punten gericht aandacht besteden. Je maakt kennis met het onderzoek op twee afdelingen, en gaat uitvoerig kijken naar enkele methoden en instrumenten waarmee gegevens worden verzameld/ metingen worden verricht. Afsluitend doe je verslag van het onderzoek. Onderwijsvorm Twee projecten waarin je op een afdeling intensief kennismaakt met het onderzoek van die afdeling; je wordt hierbij begeleid door een AIO of postdoc; Verplichte werkgroepen en practica, laboratorium experimenten. De beoordeling bestaat uit een aantal onderdelen. Voor alle onderdelen moet een voldoende worden behaald. een onderzoeksvoorstel behorende bij module A (10%) een verslag behorende bij module A (25%) Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 66 van 78

een mondelinge presentatie behorende bij module A (25%) een onderzoeksvoorstel behorende bij module B (10%) een poster en de uitleg daarvan behorende bij module B (25%) een reflectieverslag (5%) participatie tijdens de groepsbijeenkomsten de wijze van samenwerken = procesbeoordeling Toetsvorm De opdrachten (het onderzoeksvoorstel, het schriftelijke verslag, de mondelinge presentatie, en poster) dienen allemaal met een voldoende zijn afgesloten. Er is geen tentamen. Literatuur Syllabus, te downloaden via Blackboard. Overige literatuur wordt verstrekt tijdens de bijeenkomsten. Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen. Overige informatie Aantal deelnemers: minimaal 25, maximaal 50 studenten

Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij Vakcode

AB_470098 (450003)

Credits

1.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. M.H. Donker

Docent(en)

dr. M.H. Donker

Lesmethode(n)


Doel vak Het onderdeel Oriëntatie op Studie, Loopbaan en Maatschappij heeft tot doel de student na te laten denken over de keuzes die met het afsluiten van de bachelor gemaakt moeten worden. Dat betreft vooral keuzes voor het al dan niet vervolgen van de studie met een masteropleiding, maar, in het verlengde daarvan, ook al keuzes die uiteindelijk gemaakt worden voor een werkkring. Daarbij is het van belang voor de student er achter te komen welke interesses en vaardigheden hij/zij bezit, maar ook welke wensen er bestaan ten aanzien van de mogelijkheden op de arbeidsmarkt. Eindtermen: Op basis van het door de student gemaakte persoonlijk profiel en de individuele en groepsgewijze oriëntatie op de arbeidsmarkt kan de student gemotiveerd kiezen voor een - Onderwerp voor de bachelorstage - Masteropleiding - Specialisatiegebied Niveau 2: verdieping Inhoud vak In kleine werkgroepen wordt met de studenten nagedacht over de vragen: Welke richting moet er gekozen worden in de masterfase? Wat zijn de wensen ten aanzien van het toekomstig beroep? Middels een persoonlijke competentieanalyse, een advertentieanalyse en een netwerkinterview oriënteert de student zich individueel en in een kleine groep op het Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 67 van 78

voor hem of haar meest wenselijke en geschikte vervolgtraject in de masterfase en uiteindelijk op de door hem/haar geambieerde plaats in de maatschappij. Onderwijsvorm Plenair 2 introductiecolleges (eind januari en eind maart 2010) Dit college wordt gevolgd door; 2; werkgroepbijeenkomsten in april, die vooral gericht zijn op de keuze voor het vakgebied en onderwerp van de bachelorstage. In mei en juni zijn 2 werkgroepbijeenkomsten waarin de student zich via o. a. een advertentieanalyse en een netwerkinterview oriënteert op de arbeidsmarkt. Tijdens de bachelorstage in het 3e studiejaar vinden twee terugkombijeenkomsten plaats, gericht op het uitwisselen van ervaringen bij de stage en de keuze van de master. De stage wordt afgesloten met een 3e terugkomdag waarin het gedane onderzoek wordt gepresenteerd door middel van een poster. Literatuur Opdrachten en achtergrondinformatie via de Blackboardsite Doelgroep Tweede- en derdejaars BSc Biologie, Biomedische Wetenschappen en Gezondheidswetenschappen. Overige informatie Verplichte cursus.

Oriëntatie science educatie Vakcode

O_ORIBETA (991010)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Coördinator

ir. J.G. Schoonhoven

Doel vak Voor een student die deze cursus heeft doorlopen geldt: de student is bereid en in staat te reflecteren op zijn/haar functioneren, de student is in staat om aan te geven wat het betekent om een goede docent in de bovenbouw te zijn, de student is in staat om zijn eigen geschiktheid voor het beroep van docent te beoordelen, de student kan aangeven of het beroep van docent iets voor hem/haar is, de student verwerft een aantal communicatieve en didactische vaardigheden.

Inhoud vak De cursus bestaat de eerste week uit diverse werkcolleges, de volgende drie weken uit een stage op een school voor voortgezet onderwijs. elke week is er een praktijkbespreking en verdieping op de VU. De stage is het belangrijkste onderdeel van de cursus, deze voer je uit samen met een medestudent. In totaal zal de stage ongeveer twaalf dagen in beslag nemen. Tijdens de werkcolleges komen de volgende onderwerpen aan de orde:


8-6-2012 - Pagina 68 van 78

Hoe bouw je een presentatie op, hoe kom je over. Hoe vertaal je (wetenschappelijke) informatie naar het niveau van je doelgroep. Wat doet een (goede) leraar allemaal. Wat is het verschil tussen presenteren en onderwijzen. Welke kenmerken heeft de doelgroep en hoe kun je daar rekening mee houden. Hoe ontwerp je een (activerende) les. Hoe krijg je je doelgroep actief. Met welke communicatieve aspecten in de klas moet je rekening houden. Tijdens de stage onderneem je de volgende activiteiten: observeren van lessen; zelf minimaal vier lessen geven, in zowel onderbouw als bovenbouw; uitvoeren van een klein onderzoek; zo veel mogelijk deelnemen aan alle activiteiten op school en zo (hernieuwd) kennis maken met het voortgezet onderwijs vanuit het docenten perspectief.

Onderwijsvorm Je levert aan het eind van de cursus een verslag in. Het verslag is een samenhangend verhaal dat een beeld geeft van jouw leerproces tijdens de cursus. Met je verslag laat je zien waar je staat als mogelijk toekomstig docent. Het gaat primair om het zichtbaar maken van je ontwikkeling, niet noodzakelijk om te bewijzen dat je een goede docent bent. Werkcolleges en stage vormen samen een voltijds programma, het is niet mogelijk gelijktijdig andere colleges te volgen. Doelgroep Deelname aan de cursus staat open voor derdejaars bachelorstudenten van de faculteiten Exacte Wetenschappen en Aard- en Levenswetenschappen. De cursus wordt aangeraden voor studenten die overwegen de lerarenopleiding te gaan volgen binnen de masteropleiding (E- variant) of aansluitend op hun masteropleiding. Ook voor studenten die vaardigheden op willen doen in het verzorgen van wetenschappelijke presentaties is de cursus interessant. Overige informatie Meer informatie is te verkrijgbaar bij Arjan Schooonhoven: a.schoonhoven@ond. vu. nl, of te vinden op www.onderwijscentrum.vu.nl

Pathofysiologie van hart en circulatie Vakcode

AB_1015 (450003)

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. E.C. Eringa

Doel vak Student inzicht verschaffen in het functioneren van het cardiovasculaire systeem, de pathogenese van hart- en vaatziekten en in de mogelijkheden die er zijn om therapeutisch in te grijpen. Dit zal meer specifiek bestudeerd worden aan de hand van processen die kunnen leiden tot het ontstaan van het myocardinfarct en de herstelmogelijkheden, waarbij zowel de (micro)circulatie als het hart en


8-6-2012 - Pagina 69 van 78

hartfunctie aan bod komen. Inhoud vak De cursus bestaat uit de volgende onderwerpen: - Macrocirculatie en atherosclerose - Microcirculatie en vasoregulatie - Bloed en bloedstolling - Hartfunctie en het myocardinfarct - Angiogenese en arteriogenese In het eerste onderdeel zullen de eigenschappen van macro- en microcirculatie aan bod komen, de regulatie van hun eigenschappen en de veranderingen in de vaatwand die kunnen leiden tot een verhoogde bloeddruk en atherosclerose. In het tweede onderdeel zal de werking van het hart op verschillende niveaus besproken worden en de afwijkingen die kunnen ontstaan en bedreigingen die op kunnen treden m.b.t. de hartfunctie, tenslotte leidend tot hartfalen. In het derde onderdeel zal nader ingegaan worden op bloedsamenstelling, stolling en thrombusvorming. In het vierde en laatste onderdeel wordt bekeken welke mogelijkheden er zijn, om na een myocardinfarct de hartfunctie te herstellen, met specifieke aandacht voor angiogenese en arteriogenese. Onderwijsvorm - Colleges - Werkgroepen (voorbereiden en bespreken opdrachten) - Practica (op de laboratoria en in de practicumzaal van Fysiologie) - Demonstraties (in de kliniek) - Zelfstudie Toetsvorm - Tentamen - Essay/werkstuk Literatuur - Crash course: Cardiovascular System, uitgever Elsevier, 3rd edition - Syllabus - Review-artikelen Aanbevolen voorkennis Voldoende en aantoonbare kennis van de fysiologie en anatomie van het cardiovasculaire en respiratoire systeem (zoals bijv. BMW-cursus ‘Mens als Systeem’ of GZW cursus CRS) Doelgroep Bachelorstudenten BMW, G&L, GZW, 2e jaar of hoger. Overige informatie Studenten die de Master Cardiovascular Research gaan kiezen wordt aangeraden om deze cursus te volgen.

Pathologie Vakcode

AB_470042 (450003)

Periode

Periode 1, Periode 4


8-6-2012 - Pagina 70 van 78

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. R.D.M. Steenbergen

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Brede introductie in het ontstaan van ziekteprocessen en de bijbehorende (bio)medische terminologie Kennismaken met het klinisch voorkomen en gangbare diagnostiek en behandelwijzen van een aantal belangrijke ziekten Inzicht krijgen in experimentele benaderingen die bijdragen tot vergroting van het inzicht in ziekteprocessen Inzicht verkrijgen in experimentele mogelijkheden bij de ontwikkeling van nieuwe diagnostische en therapeutische benaderingen Inzicht verkrijgen in het biomedisch onderzoek binnen de Pathologie Eindtermen: De student bezit parate kennis betreffende: Relevante medische terminologie Voor elk van de behandelde ziekten de belangrijkste punten van het ontstaansmechanisme, diagnostiek en/of therapeutische mogelijkheden Het verschil tussen pathogenen en etiologie Betekennissen van symptomen, syndromen en ziektekenmerken Raadpleging van medische tekstboeken en databases zodanig dat kort en bondig ook essentialia van niet aan de orde gekomen ziekten aangegeven kunnen worden Mogelijkheden om primaire medische literatuur mbt de behandelde ziekten te raadplegen en nieuwe inzichten daaruit samen te vatten Principes van de behandelde experimentele benaderingen en de toegepaste medisch-biologisch relevante technieken. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Algemene introductie in de pathologie en de bijbehorende medische terminologie Genetische processen betrokken bij ontstaan ziektes; erfelijke afwijkingen Groei en ontwikkelingsstoornissen Morfogenese Deposities, intoxicaties, infarcten, trombose, ischemie en shock Ontstekingsprocessen: betrokken cellen en mediatoren Ziekteprocessen samenhangend met ongewenste immunologische reactiviteit, met name transplantaatafstoting, auto-immuniteit (reuma, schildklierziekten) en allergie (hooikoorts, contactallergie) Ziekteprocessen waarbij ongewenst zwakke immuniteit optreedt, met name immuundeficiënties (aangeboren of verworven, aids), chronisch recidiverende infecties en tumorgroei Hiernaast worden vele andere aspecten van de oncologie (tumorleer) behandeld, onder meer ontstaansmechanismen, prevalentie, diagnostische en therapeutische benaderingen Aantasting van bloedvaten: atherosclerose, hartinfarct Longziekten, darmziekten (tumoren en ontstekingen), endocriene stoornissen(met name suikerziekte) Ziekten van vrouwelijk en mannelijk genitaal stelsel; endocriene stoornissen (ontsteking en tumoren) Neurologische aandoeningen, zoals Multiple Sclerose, Alzheimer Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 71 van 78

Moleculaire, Genetische, Celbiologische en Immunologische technieken Onderwijsvorm Hoorcolleges aan de hand van leerboek; seminars: introducties recent wetenschappelijk onderzoek; practicum macro pathologie, mortuarium bezoek, literatuuropdracht, repetitie/leerstofbegeleidingscollege; zelfstudie Toetsvorm Schiftelijk tentamen, met mix van korte essay- en multiple choice vragen. Schriftelijke herkansing: 1x per jaar Literatuur J.C.E. Underwood, General and Systematic Pathology,5th edition, Churchill Livingstone, New York Edinburgh, 2009 . Prijs ongeveer 75,-. (Boek is ook gebruikt tijdens eerstejaars cursus Gezondheid en Milieu) Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biomedische Wetenschappen en tweedejaars BSc Medische Natuurwetenschappen; keuzecursus voor Pre-Masterstudenten Gezondheidswetenschappen met een BSc diploma Diëtetiek en derdejaars BSc Gezondheid en Leven. Overige informatie Let op: in 2010 - 2011 wordt de cursus in periode 4 alleen aangeboden voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen c.q. Gezondheid en Leven; in periode 1 alleen voor derdejaars van genoemde opleidingen.

Pathologie * Vakcode

A_HP470042 (450003)

Credits

3.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator


Religion, Identity, Conflict Vakcode

OH_RIC (986001)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Structuurbiologie Vakcode

AB_470056 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit



8-6-2012 - Pagina 72 van 78

Coördinator

dr. D. Bald

Docent(en)

dr. D. Bald

Lesmethode(n)


Doel vak Kennis van structuur, functie en remming van eiwitten, met name methodes waarmee je deze eigenschappen kunt bestuderen. Je kunt deze kennis later gebruiken als je b.v. het moleculaire mechanisme van een ziekte (eiwit misfunctie) of de werkwijze van medicijnen (remming van een eiwit) wilt verhelderen, maar ook voor biotechnische toepassingen of voor fundamenteel onderzoek. Eindtermen De student kent: Grondslagen/toepassingen van eiwit expressie, zuivering, structuur functie, remming, werking van antibiotica. De student kan: eiwit-biochemische methodes toepassen (eiwit expressie, affiniteits-chromatografie, spectrofotometrie, fluorescentie, eiwit-labelling methodes, gel-electroforese, activiteitbepalingen). Niveau 2: verdieping Inhoud vak Wij beginnen met een repetitie/overzicht van eiwit structuur en functie. Vervolgens gaan wij met practica aangevuld door colleges, computer sessies en zelfstudie aan de slag en behandelen beginselen/methodes/technieken die je voor welk eiwit dan ook kunt gebruiken zoals: Hoe kan je een eiwit met behulp van bacteriën produceren? Hoe kan je een eiwit zuiveren? Hoe kan je structuur en functie van een eiwit onderzoeken? Hoe werken antibiotica als enzym remmers? Hoe kan ik een experimentele strategie plannen? Welke factoren zijn belangrijk voor het slagen van mijn experiment? Onderwijsvorm Je doet zelf experimenten in kleine groepen (2- 4 studenten) op het Structuurbiologie lab samen met begeleider (50 uur), aangevuld door hoorcolleges (15 uur), computersessies en zelfstudie. In groepjes schrijf je een verslag en houd je een praatje over de experimenten. Toetsvorm Verslag (50 %), voordracht (50 %) Literatuur CD met collegestof en practicumhandleiding Aanbevolen voorkennis Cursussen Biologische chemie en Biochemie Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars Bsc Biologie, Biomedische wetenschappen en Gezondheid en Leven. De cursus staat open voor studenten van andere opleidingen en wordt aanbevolen voor Masterstudenten Biomolecular Sciences en andere Masterstudenten die praktische waardigheden willen bijspijkeren.


8-6-2012 - Pagina 73 van 78

Overige informatie Bij het experimentele gedeelte is het dragen van een laboratoriumjas verplicht. Maximum aantal deelnemers 40. Voorrang wordt verleend aan BSc studenten Biomedische Wetenschappen en Biologie. De colleges worden in het Engels gegeven, de andere onderdelen (practicum, verslag, voordracht) zijn in het Nederlands.

The Roman Empire Vakcode

OH_TRE ()

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


The use of statistics in legal court cases Vakcode

OH-SLC ()

Credits

6.0

Faculteit

Onderwijscentrum VU

Coördinator

prof. dr. R.W.J. Meester

Theories of Consciousness Vakcode

OH_TOC (986002)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Uitbreiding bachelorthesis Vakcode

A_HP-I-3 ()

Periode

Semester 2

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator


Van molecuul tot mens Vakcode

AB_470217 (450003)

Periode

Periode 2

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. H. Lill


8-6-2012 - Pagina 74 van 78

Docent(en)

dr. K. Krab, M.J.C. Scholts, dr. S. Luirink, dr. M.H.G. Verheijen, dr. H. de Wit, dr. W.J.A.J. Smeets, dr. A.A. van Lambalgen

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep, Werkcollege, Computerpracticum, Practicum

Doel vak De cursus moet aan de hand van het systeem en proces van spijsvertering de basis leveren voor de moleculaire vakken. De klemtoon ligt dan ook op het gebied van de Biochemie en de Cellulaire biologie. Kennis verkrijgen in opbouw en functie van de verschillende organen en weefsels van het spijsverteringssysteem Kennis en inzicht verkrijgen in de structuur en het functioneren van de cel, waaronder het cytoskelet, signaaltransductie en transportprocessen binnen de cel, alsmede in de rol van de verschillende celorganellen en de processen die zich daar afspelen in biomedische context Kennis maken met de bouwstenen van biochemisch relevante macromoleculen. Inzicht in structurele opbouw en functie van eiwitten en membranen, alsook mechanismen, kinetiek en regulatie van enzymen Begrip van hoe de macromoleculen in de levende cel in netwerken functioneren en hoe ze daarin samenwerken om de belangrijke levensprocessen uit te voeren. Bijzondere aandacht ligt op de cellulaire energiehuishouding, en op de concepten, de samenhang en regulatie van metabole routes in de mens Kennis en toepassing van methoden gebruikelijk in het biochemisch onderzoek Inhoud vak Week 1: "Het spijsverteringssysteem: organen en weefsels" De anatomie en histologie van het spijsverteringssysteem worden in hoorcolleges uitgelegd. In een snij- en een microscopiepracticum worden de onderwerpen verdiept. Week 2: "Cellen, bouwstenen, en energie" In deze week worden in hoorcolleges de fundamenten gelegd voor het begrip van celopbouw en celfunctie (structuren, transport en signaaldoorgifte) en voor verschillende onderwerpen in de moleculaire biologie. Ook start in deze week het praktische onderwijs in laboratoriumvaardigheden. Week 3: "Eiwitten: vorm en functie" Aan de hand van o.m. "collagen diseases" behandelen wij in hoorcolleges en een afsluitend werkcollege het vouwen en de stabiliteit van eiwitten en de samenhang van structuur en functie. Week 4: "Enzymes: defining the speed of life" In deze week gaan de hoorcolleges over de meest belangrijke rol van eiwitten in ons lichaam: katalyse. Aan de hand van acute en chronische pancreatitis kijken we in het afsluitende werkcollege naar de gevolgen van misvouwing en/of verstoorde regulatie. Het practicum "labvaardigheden" sluit in deze week af. Week 5: "Membranen en transport" In de hoorcolleges van deze week kijken we naar de bij de spijsvertering behorende transportprocessen. Als voorbeeld van wat er mis kan gaan bij deze processen wordt in het afsluitende werkcollege de Cholera behandeld. In deze week begint het praktische onderzoeksproject over respiratie, dat doorloopt tot aan het eind van week 7. Week 6: "Concepten van het katabolisme" In week 5 is transport van moleculen het lichaam in behandeld. In week 6 Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 75 van 78

gaat het in de hoorcolleges om de vraag: Hoe verder? Aan de hand van de verwerking van suiker moleculen worden de concepten van katabolisme behandeld en de daaraan aansluitende transformaties van energie. Thema van het afsluitende werkcollege zijn mitochondriale ziekten. Week 7: "The bigger picture" In deze week zetten we het eerder geleerde in relatie tot elkaar. Aan de hand van Diabetes type I als leiddraad worden het netwerk en de fysiologische aspecten van spijsvertering in hoorcolleges en werkcolleges behandeld. In de met het practicum parallel lopende werkcolleges worden de kwantitatieve aspecten verdiept. Onderwijsvorm Hoorcolleges 64 uur. Werkcolleges 9 uur. Aan het begin van een weekthema worden vragen uitgegeven. De antwoorden worden in afsluitende werkcolleges behandeld. Ook het verdiepen van de kwantitatieve aspecten gebeurt in werkcolleges. Onderzoekspracticum 53 uur. Een zwaartepunt van deze cursus is het aanleren van praktische labvaardigheden. Toetsvorm De theoretische onderdelen van de cursus worden getoetst met een schriftelijk tentamen (6 EC, mengsel uit open en meerkeuze vragen). Tijdens de praktische onderdelen wordt de deelname van studenten bijgehouden. Verder worden het voeren van het labjournaal, een onderzoeksplan en eindverslagen beoordeeld (6 EC). Literatuur Martini: Fundamentals of Anatomy and Physiology, Benjamin Cummings Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter: Essential Cell Biology, Garland Science Berg, Tymoczko, Stryer: Biochemistry, Freeman Doelgroep Eerstejaars BSc Biomedische wetenschappen Overige informatie Bij de laboratoriumpractica is het dragen van een labjas verplicht

Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers Vakcode

AB_470185 (450003)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

R.C. van Koten MSc

Docent(en)

prof. dr. J.E.W. Broerse, R.C. van Koten MSc, dr. M.J.W. Bos

Lesmethode(n)


Doel vak Verwerven van kennis en inzicht in de verschillende modellen van wetenschapscommunicatie (deficiet, context, interactie en participatie), haar parameters en gebruikelijke applicatiedomeinen. Verwerven van kennis en inzicht van de beperkingen en mogelijkheden


8-6-2012 - Pagina 76 van 78

van de verschillende media waarin de modellen tot uitdrukking kunnen komen (journalistiek, TV en film, het Internet, musea en science centra). Verkrijgen van vaardigheid in het ontwerpen van een doelgroepgerichte communicatie Het opdoen van leerervaring met het werken in een multidisciplinaire groep Inhoud vak Wetenschap heeft verstrekkende gevolgen voor de maatschappij (bv. ICT, biotechnologie, nanotechnologie, farmacie). Maar hoe kijkt de maatschappij eigenlijk naar wetenschappelijke ontwikkelingen? Wat vindt de industrie van wat we uitgevonden hebben en wat denken andere wetenschappers van onze kennis? De visie van deze mensen over ons en ons werk is van groot belang voor de richting die het onderzoek in de nabije toekomst gaat nemen. Daarom is communicatie over wetenschap van cruciaal belang. In deze cursus raak je vertrouwt met een aantal modellen van wetenschapscommunicatie, het herkennen van hun toepassingen in de praktijk en de verschillende soorten publiek die men ermee kan aanspreken (populariseren voor leken, informatieoverdracht voor de industrie, faciliteren van interdisciplinair onderzoek in de wetenschap). Door middel van opdrachten raak je bekend met de praktische kant van wetenschapscommunicatie, bijvoorbeeld wetenschapsjournalistiek, voorlichting, etc. De opdrachten worden deels individueel uitgevoerd en deels in een multidisciplinaire groep. Onderwijsvorm Colleges, opdracht, zelfstudie Literatuur (Online) syllabus Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Biomedische Wetenschappen en Biologie. Speciaal aanbevolen voor studenten die overwegen de C- variant (wetenschapscommunicatie) in hun masterprogramma op te nemen. Overige informatie Voor meer informatie: [email protected]

Wijsbegeerte in de biomedische wetenschappen Vakcode

AB_1013 (450003)

Credits

3.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. E. Koster

Doel vak Het algemene doel van deze basiscursus is de verdieping van je inzicht in wetenschap en wetenschappelijke kennisvorming. Meer specifiek betekent dat: • Kennismaken met een aantal verschillende filosofische visies op wetenschap en wetenschappelijke kennisvorming; • Inzicht krijgen in de rol van theorieën bij observatie,


8-6-2012 - Pagina 77 van 78

verklaring en experiment; • Inzicht krijgen in het sociale en culturele karakter van wetenschappelijke kennisvorming; • Expliciteren van de eigen opvattingen over wetenschap en wetenschappelijkheid; Niveau 1: basiscursus Inhoud vak Tijdens deze cursus verdiep je je inzicht in de werkwijze en de waarde van wetenschap en wetenschappelijke kennis, mede op basis van filosofische en sociaalwetenschappelijke ideeën. Wanneer noemen we iets 'wetenschap'? Wie bepaalt dat eigenlijk en op grond waarvan? Je gaat de algemene en soms abstracte ideeën van filosofen en sociale wetenschappers toepassen op een concrete problemen: Spelen waarden een rol in het onderzoek naar de evolutie van de mens? Moet homeopathie als pseudo-wetenschap van de hand worden gewezen zoals veel wetenschappers doen of niet? Op welke wijze komt consensus onder wetenschappers tot stand bij het ontwikkelen van geneesmiddelen? Onderwijsvorm Hoorcollege en responsiecollege; literatuurstudie aan de hand van opdrachten Toetsvorm Opdrachten en tentamen Literatuur Edwin Koster (red.), Wat is wetenschap? Een inleiding voor levenswetenschappers en medici (VU University Press). Let op: in de studiehandleiding wordt vermeld welke druk van dit boek wordt voorgeschreven! Het gebruik van dit boek is verplicht. Doelgroep Verplicht voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen. Overige informatie De studiehandleiding is ruim voor aanvang van de cursus beschikbaar via Blackboard.


8-6-2012 - Pagina 78 van 78

Biomedische wetenschappen BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biomedische Wetenschappen

Recommend Documents