Biologie BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie

Biologie BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

I

De opleiding Biologie richt zich op de bestudering van alle verschijningsvormen van leven en natuur en de processen die zich daarbinnen afspelen, op het doen van wetenschappelijk onderzoek hiernaar en op de toepassing van de zo verworven kennis. De opleiding wordt gekenmerkt door het aanbieden van algemene kennis op alle in de biologie te onderscheiden organisatieniveaus (van molecuul tot ecosysteem) en daaropvolgend een specialisatie in één der subdisciplines van de biologie: moleculaire biologie, ontwikkelingsbiologie, neurobiologie, ecologie, bio-informatica, wetenschapscommunicatie, en beleid, management en ondernemen. Studenten volgen eerst een brede bacheloropleiding van drie jaar, daarna stromen ze door naar een meer gespecialiseerde masteropleiding. Met de opleiding wordt beoogd zodanige kennis, vaardigheid en inzicht bij te brengen op het gebied van de biologie dat de afgestudeerde in aanmerking kan komen voor een algemene, brede of specialistische masteropleiding in de biologie. Dit kan een onderzoeksrichting zijn, maar ook een opleiding op het gebied van Communicatie en Educatie of een meer maatschappijgerichte opleiding. Eveneens is het essentieel dat de afgestudeerde zich bekwaamd heeft in het verantwoord kiezen in wetenschappelijke problematieken. Om deze doelstellingen te bereiken is in de eerste plaats een brede biologische basisopleiding nodig met daarin ook aandacht voor algemene academische vorming. Daarnaast is het noodzakelijk dat de student gedurende enige tijd actief deelneemt aan het biologisch onderzoek. Het jaarschema 2010 - 2011 is te vinden op de FALW-website. Meer opleidingsinformatie is te vinden op de de FALW-website. Een complete beschrijving van deze opleiding is te vinden in de Onderwijs- en Examenregeling op de FALW-website.


II

Inhoudsopgave

Honours Programme Biologie Facultaire deel Honours programma

1 1

Stervariant cursussen Health & Life Sc.

1

Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen

1

Faculteitsoverstijgend deel HP Interdepartmental Honours Courses

2 2

Bsc Biologie, jaar 1

3


3

Bsc Biologie, jaar 2, keuzevakken

3

Bsc Biologie, jaar 2, verplichte vakken

4


4


4

Bsc Biologie, jaar 3, verplichte vakken

5

Vak: Bachelorstage (Bio / BMW)

5

Vak: Bioinformatica

7

Vak: Bioinformatica *

8

Vak: Biotechnologie en maatschappelijke dynamiek

9

Vak: Brain and Behavior

10

Vak: Climate Change

10

Vak: Cyclus van het leven

11

Vak: De microbiële cel

12

Vak: Ecologie, mens en natuur

14

Vak: Ecotoxicologie

15

Vak: Educating for the good life

17

Vak: Evolutie en diversiteit van leven

17

Vak: Evolutie van de mens

19

Vak: Evolution and Human Behavior

20

Vak: Evolutionaire ecologie en gedrag

20

Vak: Evolutionaire genetica

22

Vak: Evolutionaire genetica *

23

Vak: Five O’Clock Neurosciences (Honours)

24

Vak: Future Entrepreneur

25

Vak: Genen, hersenen en gedrag

25

Vak: God-Man-World

26

Vak: Governing Security

26

Vak: Honours course: Communication and Innovation in Health and Life Sciences

27

Vak: Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces

28

Vak: Honours Individueel Vak

29

Vak: Honours Leadership

29

Vak: How to survive 2050

29

Vak: HP AUC: Programming your World

29

Vak: HP UvA: Creativiteit

29

Vak: HP UvA: Governance of Aquatic

29


III

Vak: HP UvA: Intelligence Studies

30

Vak: HP UvA: Love

30

Vak: Humane Anatomie en Fysiologie *

30

Vak: Humane ontwikkeling *

30

Vak: Illness-Image-Metaphor

30

Vak: Impact of an Empire

31

Vak: Kust en mariene ecosystemen

31

Vak: Levensvragen en wetenschap

32

Vak: Life and Work

34

Vak: Management van innovaties

34

Vak: Medical Genomics

36

Vak: Methodologie en onderzoek in de biologie

37

Vak: Methodologie en statistiek II

38

Vak: Moleculaire celbiologie

40

Vak: Moleculaire ontwikkelingsbiologie

41

Vak: Moleculaire ontwikkelingsbiologie *

43

Vak: Molecular Microbiology

43

Vak: Neurowetenschappen I *

44

Vak: Neurowetenschappen II: Genes and the brain

44

Vak: Neurowetenschappen III: monitoring the brain

46

Vak: New Anatomy

48

Vak: Oncologie *

48

Vak: Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij

49

Vak: Oriëntatie science educatie

50

Vak: Pathologie *

51

Vak: Regulatie en afweer bij dieren

51

Vak: Religion, Identity, Conflict

53

Vak: Structuurbiologie

53

Vak: Systeemecologie

54

Vak: The Roman Empire

55

Vak: The use of statistics in legal court cases

55

Vak: Theories of Consciousness

55

Vak: Trends in plantenwetenschappen

56

Vak: Uitbreiding bachelorthesis

57

Vak: Van gen tot gewas

57

Vak: Voorspellen en analyseren in de biologie

59

Vak: Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers

61


IV

Honours Programme Biologie Opleidingsdelen: - Facultaire deel Honours programma - Faculteitsoverstijgend deel HP

Facultaire deel Honours programma Opleidingsdelen: - Stervariant cursussen Health & Life Sc. - Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Uitbreiding bachelorthesis

Semester 2

3.0

A_HP-I-3

Stervariant cursussen Health & Life Sc. Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Bioinformatica *

Periode 4

3.0

A_HP470172

Evolutionaire genetica *

Periode 6

3.0

A_HP470053

3.0

A_HP470104

Humane Anatomie en Fysiologie * Humane ontwikkeling *

Periode 4

3.0

A_HP487008

Moleculaire ontwikkelingsbiologie *

Periode 5

3.0

A_HP470038

3.0

A_HP470199

3.0

A_HP470050

3.0

A_HP470042

Neurowetenschappen I * Oncologie *

Periode 6

Pathologie *

Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen Vakken:

Naam

Periode

Five O’Clock Neurosciences Periode 4+5 (Honours)


Credits

Code

6.0

A_HP003

8-6-2012 - Pagina 1 van 62

Honours course: Communication and Innovation in Health and Life Sciences

6.0

A_HP002

Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces

6.0

A_HP001

Faculteitsoverstijgend deel HP Opleidingsdelen: - Interdepartmental Honours Courses

Interdepartmental Honours Courses Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Brain and Behavior

Periode 5

6.0

OH_BAB

Climate Change

Periode 2

6.0

OH_CC

6.0

OH-EFG

Educating for the good life Evolution and Human Behavior

Periode 4

6.0

OH-EHB

Future Entrepreneur

Periode 5

6.0

OH_FE

God-Man-World

Periode 2

6.0

OH_GMW

Governing Security

6.0

OH_GS

Honours Individueel Vak

8.0

OH_EXT1

Honours Leadership

6.0

OH_LEAD

How to survive 2050

6.0

OH_HTS

HP AUC: Programming your World

6.0

OH_APYW

HP UvA: Creativiteit

6.0

OH_UCREA

HP UvA: Governance of Aquatic

6.0

OH_UGOAQ

HP UvA: Intelligence Studies

6.0

OH_UINST

HP UvA: Love

6.0

OH_ULOVE

Illness-Image-Metaphor

Periode 4

6.0

OH_IIM

Impact of an Empire

Periode 4

6.0

OH_IE

6.0

OH_LAW

Life and Work New Anatomy

Periode 1

6.0

OH_NA

Religion, Identity, Conflict

Periode 4

6.0

OH_RIC

The Roman Empire

6.0

OH_TRE

The use of statistics in legal court cases

6.0

OH-SLC


8-6-2012 - Pagina 2 van 62

Theories of Consciousness

Periode 1

6.0

OH_TOC

Bsc Biologie, jaar 1 In het eerste jaar zijn alle vakken verplicht, er zijn geen keuzevakken. Het programma in het eerste jaar vormt een basis; het geeft een eerste overzicht van de Biologie en is bedoeld als een verbreding van de kennis op diverse terreinen. Het eerste jaar van de bachelor heeft een oriënterende en selecterende functie. De student kan zich tijdens het eerste studiejaar oriënteren op de gekozen opleiding, dat wil zeggen: voldoet de opleiding aan de verwachting en is men er geschikt voor. Het programma van het eerste jaar geeft een eerste overzicht van de opleiding en geeft een verbreding van de biologische kennis. De selecterende functie komt vooral tot uiting in de studieresultaten. De studieresultaten worden gevolgd door de studieadviseur. Als het nodig is worden studenten opgeroepen voor een gesprek. Op grond van de cijfers aan het eind van het eerste jaar ontvangt elke eerstejaars een bindend studieadvies. Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Cyclus van het leven

Periode 1

12.0

AB_470174

Ecologie, mens en natuur

Periode 5

12.0

AB_470178

Evolutie en diversiteit van leven

Periode 2

12.0

AB_470175

Genen, hersenen en gedrag Periode 4

12.0

AB_470176

Methodologie en onderzoek Periode 2 in de biologie

6.0

AB_470209

Voorspellen en analyseren in de biologie

6.0

AB_470212

Periode 3, Periode 5

Bsc Biologie, jaar 2 Het tweede jaar van de bacheloropleiding is een verdere oriëntatie binnen de biologie. Daarnaast wordt beoogd een verdieping van kennis, inzicht en vaardigheden op deelgebieden van de biologie tot stand te brengen. Dit vormt de basis voor de differentiatie in het derde jaar. In het tweede jaar zijn alle vakken tot en met week 16 (2010) verplicht. Daarna, in de blokken van week 18-21 en 22-26, kunnen studenten tweemaal kiezen uit keuzecursussen. Opleidingsdelen: - Bsc Biologie, jaar 2, keuzevakken - Bsc Biologie, jaar 2, verplichte vakken



8-6-2012 - Pagina 3 van 62

Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Evolutionaire ecologie en gedrag

Periode 6

6.0

AB_470074

Management van innovaties Periode 6

6.0

AB_470195

Neurowetenschappen III: monitoring the brain

6.0

AB_470205

Periode 6

Bsc Biologie, jaar 2, verplichte vakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

De microbiële cel

Periode 2

12.0

AB_470201

Kust en mariene ecosystemen

Periode 5

12.0

AB_470203

Regulatie en afweer bij dieren

Periode 4

12.0

AB_470202

Van gen tot gewas

Periode 1

12.0

AB_470200

Bsc Biologie, jaar 3 Het derde studiejaar is opgebouwd uit een aantal verplichte vakken, daarnaast zijn er voornamelijk keuzecursussen. De onderdelen Methodologie en statistiek 2, Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij en de Bachelorstage zijn verplicht. Tijdens de bachelorstage wordt naast het doen van onderzoek veel aandacht gegeven aan de algemene vaardigheden van de student. Hieraan gekoppeld is het schrijven van een onderzoeksverslag. Het derde jaar vormt samen met het tweede jaar de tweede fase van de bacheloropleiding. In deze tweede fase is er ruimte voor een verdieping van kennis, inzicht en vaardigheden op deelgebieden. In het derde jaar kiezen studenten voor een groot deel hun eigen programma. Daarbij wordt ook tijd besteed aan oriëntatie op de verschillende richtingen die de masteropleiding biedt, zodat studenten aan het eind van het derde jaar een verantwoorde keuze maken uit verschillende differentiaties in de vervolg masteropleiding. Belangrijk onderdeel van het derde jaar is de bachelorstage. Opleidingsdelen: - Bsc Biologie, jaar 3, keuzevakken - Bsc Biologie, jaar 3, verplichte vakken



8-6-2012 - Pagina 4 van 62

Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Bioinformatica

Periode 4

6.0

AB_470172

Biotechnologie en Periode 5 maatschappelijke dynamiek

6.0

AB_487020

Ecotoxicologie

Periode 5

6.0

AB_470047

Evolutie van de mens

Periode 5

6.0

AB_470055


Periode 6

6.0

AB_470074

Evolutionaire genetica

Periode 6

6.0

AB_470053

Levensvragen en wetenschap

Periode 5

6.0

AB_470151

Management van innovaties Periode 6

6.0

AB_470195

Medical Genomics

Periode 1

6.0

AB_487012

Moleculaire celbiologie

Periode 6

6.0

AB_470079

Moleculaire ontwikkelingsbiologie

Periode 5

6.0

AB_470038

Molecular Microbiology

Period 5

6.0

AB_470610

Neurowetenschappen II: Genes and the brain

Periode 5

6.0

AB_470204

Neurowetenschappen III: monitoring the brain

Periode 6

6.0

AB_470205

Oriëntatie science educatie

Periode 4

6.0

O_ORIBETA

Structuurbiologie

Periode 5

6.0

AB_470056

Systeemecologie

Periode 1

6.0

AB_470044

Trends in plantenwetenschappen

Periode 4

6.0

AB_470213

Wetenschapscommunicatie Periode 4 voor Bèta-onderzoekers

6.0

AB_470185

Bsc Biologie, jaar 3, verplichte vakken Vakken:

Naam

Periode

Credits

Code

Bachelorstage (Bio / BMW)

Semester 2

23.0

AB_470060

Methodologie en statistiek II Periode 1

6.0

AB_470062

Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij

1.0

AB_470098

Bachelorstage (Bio / BMW) Vakcode

AB_470060 (470060)

Periode

Semester 2


8-6-2012 - Pagina 5 van 62

Credits

23.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit

Fac. der Aard- en Levenswetenschappen

Coördinator

dr. M.P. Bergman

Doel vak De bachelorstage heeft de volgende doelstellingen: Meewerken aan onderzoek in een omgeving waar Biomedisch en-/of Biologisch werk wordt verricht Training in academische vaardigheden. Hiertoe behoren: Een analyse maken van een Biomedisch/ Biologisch probleem Het schrijven van een individueel onderzoeksverslag Het geven van een mondelinge presentatie over onderzoeksresultaten Het maken en presenteren van een congresposter Oriënteren op een keuze voor een masteropleiding Eindtermen: Vakspecifiek: De student kan onder goede begeleiding zelfstandig onderzoek doen in het gekozen vakgebied en beschikt over praktische vaardigheden die hem daartoe in staat stellen. Met betrekking tot algemene academische vaardigheden: De student is in staat de wetenschappelijke literatuur m.b.t een nieuw onderwerp te ontsluiten en in korte tijd aan de hand van relevante artikelen kennis te nemen van de belangrijkste ontwikkelingen in het betreffende vakgebied; De student is in staat een projectvoorstel voor het eigen onderzoek te schrijven; De student heeft geleerd de voortgang tijdens de stage op een overzichtelijke wijze vast te leggen in een journaal; De student is in staat om over de door hem/haar behaalde wetenschappelijke resultaten tijdens de stage op een heldere wijze schriftelijk en mondeling te rapporteren, daarbij adequaat gebruik makend van diverse audiovisuele hulpmiddelen. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De bachelorstage vormt een belangrijk onderdeel van de bacheloropleiding. Tijdens deze stage oriënteert en specialiseert de student zich in een door hem/haar gekozen richting. De stage wordt afgesloten met het schrijven van een bachelorthesis. Tevens biedt de bachelorstage de student de gelegenheid zich te oriënteren op de keuzes die gemaakt moeten worden voor een masteropleiding en - binnen die opleiding - voor een keuze voor een onderzoekers- of maatschappijgerichte variant, of een afstudeertraject in de richting van communicatie en/of educatie. Onderwijsvorm De student loopt de onderzoeksstage op een wetenschappelijke afdeling of bij een onderzoeksinstelling of bedrijf waar wetenschappelijk onderzoek wordt gedaan Toetsvorm Het eindcijfer bestaat uit het cijfer van de stage, te bepalen door de stagebegeleiders. Hiervoor wordt een beoordelingsformulier gebruikt die beschikbaar is op de website van de faculteit.


8-6-2012 - Pagina 6 van 62

Literatuur Startliteratuur wordt aangedragen door de begeleider. De student zoekt vervolgens zelf verdere literatuur die nodig is om de stage tot een succes te maken. Informatie rond de stage is te vinden op de Blackboardsite. Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische wetenschappen. Overige informatie Studenten worden aangemoedigd reeds in het 2e jaar te beginnen met het oriënteren op - en voorbereiden van - hun onderzoeksstage om zich nog bewuster in hun toekomst (keuzevakken en masteropleiding) te verdiepen. Meer informatie over de gang van zaken tijdens de bachelorstage is te vinden op de Blackboard Community Bachelorstage BMW/BIO 201x-201x (jaar waarin je stage loopt) en op de facultaire website www.falw.vu.nl > Studenten > Regelingen). Op de Blackboard stagecommunity kunnen tweedejaars zichzelf inschrijven vanaf medio februari.

Bioinformatica Vakcode

AB_470172 (450003)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. ir. B.W. Kooi

Docent(en)

dr. ir. B.W. Kooi, dr. D.T. Jager

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Computerpracticum

Doel vak Het interdisciplinaire vakgebied Bioinformatica gebruikt mathematische/computer modellen en geavanceerde statistische analyse methoden om inzicht te krijgen in complexe biologische processen op alle niveaus van organisatie, van molecuul tot organisme tot populatie. Bioinformatica is tegenwoordig een onmisbaar onderdeel geworden van bijna alle gebieden binnen de biologische en biomedische wetenschappen. De moderne (medische) biologie bestudeert zulke complexe processen, en produceert zoveel data, bijvoorbeeld in de moleculaire biologie (expressie en activiteit van genen en proteïnen), neurowetenschappen (activiteit van neuronen en neuronale netwerken) en ecologie (biodiversiteit), dat die alleen met behulp van een bioinformatische benadering te onderzoeken en analyseren zijn. Deze cursus geeft een inleiding tot de bioinformatica en de methoden die binnen de bioinformatica gehanteerd worden. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De onderwerpen en specifieke doelen van de cursus zijn: Leren omgaan met de computer; Het schrijven van computer programma's; Leren omgaan met databases;


8-6-2012 - Pagina 7 van 62

Leren omgaan met cluster analyse programmas voor de analyse van, bijvoorbeeld gen en proteïne sequenties; Leren opstellen van eenvoudige mathematische modellen voor biologische processen, van molecuul tot populatie; Leren analyseren van modellen met behulp van numeriek wiskundige methoden; Kennismaken met modellen voor neuronen en met neurale netwerk modellen voor leren en geheugen; Kennismaken met ecologische en populatie modellen, bijvoorbeeld van predator-prooi interacties, verspreiding van ziektes, en tumorgroei. Onderwijsvorm Hoorcolleges, computerpractica, zelfstudie en werkstuk. Een belangrijk onderdeel van de cursus zijn de computerpractica (waarbij MATLAB wordt gebruikt) met betrekking tot programmeren, modelleren en data analyse. Toetsvorm Computeropgaven (30%) en schriftelijk tentamen (70%) Literatuur Syllabus en practicumhandleiding, prijs samen ongeveer 13 Euro. Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. De cursus wordt zeer aanbevolen voor studenten in de biomedische wetenschappen, neurowetenschappen, moleculaire en celbiologie en ecologie. Overige informatie Bij dit studieonderdeel is het voor studenten die het Bachelor Honoursprogramma Biologie of Biomedische Wetenschappen volgen, mogelijk te kiezen voor de stervariant. Bij de stervariant wordt aan het bovenomschreven studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De stervariant wordt geregistreerd onder een aparte vakcode. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 EC boven de normale belasting van de cursus.

Bioinformatica * Vakcode

A_HP470172 ()

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator

prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van

Inhoud vak


8-6-2012 - Pagina 8 van 62

Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.

Biotechnologie en maatschappelijke dynamiek Vakcode

AB_487020 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J.T. de Cock Buning

Docent(en)

prof. dr. J.T. de Cock Buning, dr. J.F.H. Kupper

Lesmethode(n)

Hoorcollege

Doel vak Verdere verdieping in de technische aspecten van recente biotechnologische technieken (cisgenese, gentherapie, cloneren, genomics, micro arrays) Historisch en sociologisch inzicht verwerven in de structuur van de maatschappelijke reacties op genetische modificatie. Inzicht verwerven in het juridische antwoord van de maatschappij/politiek op biotechnologische onzekerheden. Analyseren van wetenschappelijke en maatschappelijke aspecten van de media topics (Stier Herman, Schaap Dolly, Pompe Konijnen, Koreaanse stamcel fraude etc.) In de praktijk oefenen in argumentatie en debat met behulp van cases en team-opdrachten. Kunnen toepassen van enkele praktische en analytische vaardigheden, zoals het uitvoeren van literatuurstudie, kritisch analyseren van diverse wetenschappelijke publicaties, theorieën, hypotheses en argumenten, en de bevindingen zowel schriftelijk en mondeling kunnen verantwoorden en presenteren. Oriëntatie op interdisciplinair (gamma-bèta) onderzoek. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak Deze cursus bouwt voort op moleculaire basiskennis en gaat met enkele gastcolleges dieper in op specifieke technieken in het biomedische onderzoek m.b.t. virussen, bacteriën, planten en dierexperimenteel onderzoek. Daarnaast worden de ontwikkelingen van moleculair biologische technieken in historisch maatschappelijk perspectief geplaatst: vanaf de eerste recombinant discussies tot de huidige genomics discussies. De onrust van de maatschappij over het sleutelen aan de erfelijke machinerie van organismen, resulteerde in een grote hoeveelheid aan veiligheidsafspraken en wetgeving die wereldwijd nu


8-6-2012 - Pagina 9 van 62

gelden vanaf de gemeentelijke ontheffingen van een laboratorium tot mondiale VN verdragen zoals het Cartagena Protocol en Biodiversiteitsverdrag. Er zal worden ingegaan op theorieën en sleutelconcepten achter 'risk perception/assessement' en het 'voorzorgbeginsel'. In teams van vier tot zes studenten wordt er elke week gewerkt aan een casus, die de teams op grond van de theorie van de colleges en eigen literatuuronderzoek verder wetenschappelijk en sociologisch analyseren. Onderwerpen voor cases zijn biotechnologische innovaties zoals Golden rice, xenotransplantatie, genetische enhancement, screening kits. Hier bij spelen op de achtergrond ook de discussies over stamceltherapie, gentherapie, micro arrays, patenttering van moleculaire informatie etc. Op deze manier leer je de vaardigheden om theorie en methodiek van exacte wetenschappen met die van sociale wetenschappen te integreren (gamma-beta-onderzoek). Iedere vrijdag presenteren de teams hun analyses aan elkaar (powerpoint), en zal de discussie tussen de analyses een verdieping van de stof opleveren. De participatie en leermomenten uit deze discussies worden bijgehouden in een persoonlijk portfolio dat deel uitmaakt van de individuele beoordeling. Onderwijsvorm De ochtenden bestaan uit kennis overdragende colleges die verzorgd worden door verschillende gastsprekers (onderzoekers, sociologen). Aanwezigheid bij deze colleges is onontbeerlijk. In de middagen wordt er gewerkt aan een groepsopdracht waarbij een case gezamenlijk wordt geanalyseerd op basis van de theorie uit de colleges. Elke vrijdag wordt die case (3-4 verschillende gedurende de cursus) gepresenteerd en bediscussieerd. Contacturen: colleges 10 x 1,5= 15 uur, presentaties 3x 3 uur= 9 uur. Toetsvorm Toetsing bestaat uit: beoordeling individuele bijdrage aan de case studies in de vorm van de portofolio(50%) en de beoordeling van de bijdrage in de vier case studies als groepsopdracht (50%). Beide onderdelen moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Blackboard Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven en derdejaars BSc Biologie en BSc Biomedische Wetenschappen.

Brain and Behavior Vakcode

OH_BAB (986009)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator

drs. L.H.C. Plantinga

Climate Change Vakcode

OH_CC (986003)

Periode

Periode 2


8-6-2012 - Pagina 10 van 62

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Cyclus van het leven Vakcode

AB_470174 (450003)

Periode

Periode 1

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. R.E. Koes

Docent(en)

dr. J.M. Kooter, dr. ing. E.J. Souer, prof. dr. R.E. Koes, dr. A.R. Stuitje

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum

Doel vak Het doel van de cursus is inzicht te geven in de basale moleculaire processen die ten grondslag liggen aan het functioneren van cellen en de ontwikkeling van complexe meercellige organismen, zoals plant en dier, uit een enkele bevruchte eicel. Niveau 1: basiscursus Inhoud vak De cursus richt zich achtereenvolgens op: de opbouw van cellen en belangrijke processen die een rol spelen tijdens de levenscyclus van cellen. processen die de specialisatie van cellen (differentiatie) reguleren, processen die de opbouw en ontwikkeling van complexe meercellige organismen (plant en dier), vanuit een enkele cel sturen de vorming van geslachtscellen, bevruchting en de overdracht van genetische informatie naar de volgende generatie Eindtermen De student: kan verschillende typen van levensvormen en en hun ontwikkelingscycli globaal beschrijven. kan de opbouw van een cel en zijn belangrijkste componenten (macromoleculen) beschrijven. kan de celcyclus beschrijven en de gebeurtenissen tijdens specifieke fases benoemen. kan de opbouw van genen en chromosomen in pro- en eukaryoten beschrijven heeft inzicht in replicatie, mutatie en DNA-repair mechanismen heeft inzicht in de synthese van een rijp mRNA (transcriptie, RNA processing) heeft inzicht in de synthese van eiwitten en het transport naar hun eindbestemming in de cel heeft inzicht in mechanismen die de activiteit van genen en differentiatie van cellen sturen kan de anatomische veranderingen tijdens (embryonale) de ontwikkeling van plant en dieren globaal beschrijven. heeft inzicht in de moleculaire mechanismen die de ontwikkeling van hogere organismen sturen heeft inzicht in processen die het geslacht en geslachtskenmerken Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 11 van 62

bepalen in verschillende soorten. heeft inzicht in de ontwikkeling van geslachtcellen (gameten), bevruchting en de gevolgen daarvan voor de overdracht van genen naar het nageslacht (Mendelse genetica) Onderwijsvorm Hoorcolleges (ca. 40 uur), werkgroepen en practica (ca 60 uur), excursies naar o. a Vrolik museum (16 uur) en zelfstudie (ca. 80 uur). Deelname aan het practicum en werkgroepen is verplicht. Toetsvorm De stof die hier wordt behandeld wordt geëxamineerd in 5 deeltoetsen. Het theoretische deel (hoorcolleges) wordt afgesloten met een tentamen aan het eind van de cursus. Het vak kan alleen met een voldoende afgesloten worden als deelgenomen is aan de blusinstructie. Studenten worden hiervoor ingeroosterd ofwel in het najaar 2010, ofwel in februari 2011. De indeling van deze groepjes wordt bekendgemaakt via de Blackboardsite van de cursus die op dat moment loopt voor de eerstejaars. Literatuur - Leerboek(en): Informatie over de te geburiken boek(en) wordt later bekendgemaakt. - Prakticumhandleiding (te verkrijgen bij aanvang cursus, prijs ca 10 euro). Additionele informatie wordt middels de cursussite op Blackboard (gratis) verstrekt Doelgroep Verplichte cursus voor de eerstejaars BSc Biologie

De microbiële cel Vakcode

AB_470201 (450003)

Periode

Periode 2

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. F.C. Boogerd

Docent(en)

dr. ir. B.W. Kooi, prof. dr. H.V. Westerhoff, dr. F.C. Boogerd, dr. W.F.M. Roling

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Computerpracticum, Practicum

Doel vak Het introduceren en verdiepen van biologische, modelmatige en ecologische concepten en technieken dat nodig is om de microbiële cel en zijn interne en externe interacties te kunnen gaan begrijpen als de kleinste en eenvoudigste eenheid van autonoom leven. Het introduceren en verdiepen van experimentele en modelmatige technieken waarmee dat leven en zijn interacties bestudeerd kan worden. Eindtermen: Inzicht in het verschil tussen de levende cel en zijn samenstellende moleculen. Overzicht van en inzicht in de microscopische methodes. Overzicht van en inzicht in van de structuren en functies in en van


8-6-2012 - Pagina 12 van 62

membranen. Overzicht van de microbiële metabole diversiteit. Inzicht in de diversiteit van kweekmethoden in samenhang met deze diversiteit. Overzicht van de overeenkomsten en verschillen tussen virussen en andere micro-organismen. Begrip van de controle van microbiële groei. Overzicht van de regulatiemethodes en de integratie van regulatie. Kennismaking met de wiskundige modellen in de microbiologie en microbiële ecologie. Begrip van en inzicht in de microbiële ecologie. Kennismaking met de industriële microbiologie. Vaardigheid in microbiële basistechnieken (aseptisch werken). Vaardigheid in de specifieke mogelijkheden geboden door microbiële experimenten. Vaardigheid in het gebruiken en opstellen van kleine modellen van microbiële groei en interactie. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus bestaat uit een microbiologisch basisdeel en vier speciale themadelen. In de basiscursus wordt de microbiologische theorie onderwezen en met experimenten geïllustreerd. Het eerste thema handelt over de georganiseerde microbiële cel. Integratie van cellulaire regulatie wordt theroretisch en practisch bestudeerd. De twee volgende thema's, de microbiële cel als model en de natuurlijke microbiële cel, worden geïntegreerd onderwezen in twee weken. Een aantal onderwerpen uit de microbiologie en de microbiële ecologie zal hierbij theoretisch, praktisch en modelmatig worden bestudeerd. Als laatste thema zal de nuttige microbiële cel centraal staan. Er wordt aandacht gegeven aan biotechnologische en maatschappelijke aspecten van de microbiologie en de microbiële ecologie. Onderwijsvorm Basisdeel: 22 uur hoorcolleges; 30 uur practicum. Themadelen: 31 uur hoorcollege; 33 uur practicum; 28 uur computerpracticum; 24 uur werkstuk, incl. verslag. Toetsvorm Na de basiscursus en het eerste themadeel wordt een schriftelijk tentamen afgenomen (theorie en praktijk). Over de resterende themadelen wordt ook een schriftelijk tentamen (60%) afgenomen. Het werkstuk/verslag (25%) en de computeropdracht (15%) tellen ook mee in de eindbeoordeling. Literatuur Madigan, Martinko, Dunlap and Clark: Brock; Biology of Microorganisms; twelfth international edition; Pearson, Prentice-Hall Inc. Prijs ca. 70 euro. De hoofdstukken 1-2, 4-6, 9-10, 13-18, 20-27 uit dit boek dienen (deels) bestudeerd te worden. De practicum- en computerhandleiding kost elk 10 euro. Naast het bovengenoemde boek dient ook de handleidingen (theorie en praktijk) bestudeerd te worden voor de twee schriftelijke tentamens. Aanbevolen voorkennis De eerstejaars vakken worden bekend verondersteld. Doelgroep


8-6-2012 - Pagina 13 van 62

Verplicht voor tweedejaars BSc Biologie. Overige informatie Een laboratoriumjas is verplicht.

Ecologie, mens en natuur Vakcode

AB_470178 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. M.P. Berg

Docent(en)

prof. dr. H.A. Verhoef, dr. ir. B.W. Kooi, prof. dr. M.A.P.A. Aerts, prof. dr. J.H.C. Cornelissen, dr. M.P. Berg

Lesmethode(n)


Doel vak Inzicht geven in en in het veldonderzoek toepassen van de relatie tussen organismen en hun milieu en de invloed van de mens op behoud en beheer van biodiversiteit en natuurlijke hulpbronnen. Eindtermen: De student is in staat: - de basisprincipes van populatiedynamica, levensgemeenschapssamenstelling en ecosysteem functioneren te benoemen en te begrijpen en aan de hand van wiskundige modellen te analyseren. - de basisprincipes van zelfregulerende mechanismen binnen ecosystemen te benoemen en te begrijpen - de samenhang tussen geologie, klimaat, bodemtype en het voorkomen van soorten te beschrijven - Nederlandse planten diergeografische districten te omschrijven en hun bijbehorende kensoorten te benoemen - de belangrijkste planten- en insecten families in het veld te herkennen - het begrip indicatorsoort te omschrijven en voorbeelden te benoemen voor diverse landschappen (duingebied, kwelders, moerassen, hoog- en laagveen, rivierdalen, dekzanden, stuwwal) - inventarisatie- en monitormethoden te selecteren en toepassen die een kwalitatieve of kwantitatieve beschrijving geven van veranderingen in biodiversiteit - de belangrijke factoren die natuurbeheer en biodiversiteitbehoud bepalen te benoemen - de belangrijke factoren te benoemen die de relatie mens en ecosysteem bepalen Cursusniveau: 1 (basiscursus) Inhoud vak Theoretisch algemeen deel - Algemene inleiding: Hoe kan een mens duurzaam leven op aarde? - Basisprincipes van de ecologie: het functioneren van ecosystemen - Basisprincipes van de ecologie: levensgemeenschappen, biomen en aquatische milieus - Basisprincipes van de ecologie: zelfregulerende mechanismen binnen ecosystemen - Natuurlijke successie


8-6-2012 - Pagina 14 van 62

- Populatiedynamica en in het bijzonder de menselijke populatie - Analyse van predator- prooi en concurrentiemodellen mbv stelsels differentiaalvergelijkingen en fasediagrammen - Patronen in biodiversiteit en het behoud ervan - Basisprincipes van de ecologie: stromen van energie en materie - Klimaatverandering en de rol van de mens daarin - Plagen en pesticiden - Natuurbeheer en -behoud Onderwijsvorm Theoretisch deel - Theorie colleges gedurende de eerste maand (28 uur) - Schriftelijke opdrachten maken over de theorie - Werkcollege - Computerpractica (2 dagdelen), waarin (a) menselijk populatiegroei wordt gesimuleerd; (b) effecten van atmosferische N- depositie en natuurbeheer op heides wordt gesimuleerd. inhoud en werkwijze praktisch deel Excursies, veldwerk en determineerpractica, incl bijbehorende colleges (totaal 5 weken; hoorcolleges, nabesprekingen en gastdocenten: 16 uur; opdrachten: 10 uur; practica: 18 uur; excursies: 26 uur, 4. 5 dag; Veldwerk: 54 uur, 8 dagen; resterende tijd: zelfstudie). - de duinen: kensoorten, vergelijking soortensamenstelling kalkrijke en - arme duinen, invloed abiotiek op soortensamenstelling - de veenweiden: kensoorten, waterkwaliteitbeoordeling met macrofauna en waterplanten - pleistocene dekzanden met rivieren en vennen: kensoorten, aanpassing aan droog- nat gradiënten, vangmethodieken en inventarisatiemethoden - practicum herkennen plantenfamilies en ongewervelden- groepen - veldwerk rivierduin- uiterwaardebos gradiënt, koppeling geomorfologie bodem aan vegetatie en fauna - eigen opdracht in tweetallen - veldpracticum Dijkgatsweide: herkenning van vogels en technieken op het gebied van broedvogelkartering. Literatuur Verplichte boeken: C.R. Townsend, M. Begon & J.L. Harper. Essentials of Ecology, Blackwell Science Publishers, Oxford. 2008 (3rd edition). ISBN 978-1-4051-5658-5 (prijs ± 50 euro). R. van der Meijden 2005. Heukels Flora van Nederland. Wolters-Noordhoff (23e druk), ±50 euro. M. Chinerey. 2004. Nieuwe Insectengids Tirion (5e druk) ±30 euro. Studiehandleiding (±13 euro). De aanschaf hiervan is verplicht. Doelgroep Verplicht voor eerstejaars BSc Biologie. Overige informatie Aanschaf van een loupe (15x) is verplicht. Voor de excursies en veldwerkweken is er een eigen bijdrage van 120 euro (50% van de werkelijke kosten).

Ecotoxicologie Vakcode

AB_470047 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0


8-6-2012 - Pagina 15 van 62

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. ir. C.A.M. van Gestel

Docent(en)

dr. ir. C.A.M. van Gestel, dr. H. Schat, dr. D.T. Jager

Lesmethode(n)


Doel vak Kennismaken met de basisprincipes van de ecotoxicologie en in het bijzonder verwerven van inzicht in: de bronnen en eigenschappen van potentieel toxische stoffen; de lotgevallen van potentieel toxische stoffen in het milieu; de werkingsmechanismen van toxische stoffen; de reactie van levende organismen op potentieel toxische stoffen; de effecten van potentieel toxische stoffen op het niveau van individu, populatie en levensgemeenschap; de toepassing van ecotoxicologische kennis in de risicobeoordeling van stoffen. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus geeft een inleiding in de herkenning, analyse en voorspelling van milieuproblemen door potentieel toxische stoffen. De nadruk ligt op de relatie tussen het werkingsmechanisme van de stof en de effecten op populaties, inclusief de ontwikkeling van resistentie. In de cursus worden milieuchemische, toxicologische en ecologische aspecten geïntegreerd. Ten slotte komt de toepassing van ecotoxicologische gegevens in de milieunormstelling aan de orde. De aangeboden theorie omvat de volgende elementen: Overzicht milieugevaarlijke stoffen; Verspreiding en mobiliteit; Biologische beschikbaarheid en opname-/eliminatiekinetiek; Dosis-effect-relaties; Werkingsmechanismen; Structuur-werkingsrelaties; Mengseltoxiciteit; Resistentieontwikkeling; Effecten op populaties en ecosystemen; Diagnosemethoden; Modellen voor stofgehalten en effecten; Normen in de milieuwetgeving. Onderwijsvorm Hoorcolleges (± 26 uur); werkcolleges (± 12 uur); responsiecolleges (± 4 uur); zelfstudie (± 115 uur); tentamen (3 uur) Toetsvorm Schriftelijk tentamen Literatuur Principles of Ecotoxicology, Third Edition.C.H. Walker, et al. CRC Press Taylor & Francis Group, 2006, ISBN: 9780849336355, ISBN 10: 084933635X, prijs ongeveer; 50 euro. Aanbevolen voorkennis De bachelorcursus Ecologie, Mens en Natuur voor studenten Biologie of de bachelorcursus Histologie, Pathologie en Toxicologie voor studenten Biomedische wetenschappen of the bachelorcursus Gezondheid en Milieu Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 16 van 62

voor studenten Gezondheidswetenschappen. Doelgroep Keuzevak voor derdejaars bachelorstudenten Biologie. De cursus staat open voor belangstellenden vanuit andere opleidingen. Studenten uit andere; opleidingen moeten vooraf contact opnemen met de docent en goedkeuring vragen bij de examencommissie van hun eigen opleiding.

Educating for the good life Vakcode

OH-EFG ()

Credits

6.0

Coördinator

prof. dr. D.J. de Ruyter

Evolutie en diversiteit van leven Vakcode

AB_470175 (450003)

Periode

Periode 2

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. ir. C.A.M. van Gestel

Docent(en)

dr. ir. C.A.M. van Gestel, prof. dr. J.H.C. Cornelissen, prof. dr. N.M. van Straalen, prof. dr. J. Ellers

Lesmethode(n)


Doel vak Het doel van de cursus is inzicht te verkrijgen in de centrale rol van evolutionaire en ecologische processen bij de vorming van de hoofdlijnen van het leven van grotere taxonomische groepen organismen, de diversiteit en onderlinge samenhang van bouwplannen van bacteriën, archaea, protisten, planten, schimmels en dieren. Een belangrijk doel van de cursus is de onderliggende evolutionaire principes te analyseren en te beschrijven. Na afloop van de cursus is de student in staat: de voornaamste chemische bouwstenen van het leven te benoemen; de verdeling van macromoleculen over de stamboom van het leven en hun functionele betekenis te beschrijven; de belangrijkste bewijzen voor evolutie te omschrijven; de hoofdtijdperken in de evolutionaire geschiedenis aan te geven; de hoofdgroepen van bacteriën, protisten, planten, schimmels en dieren te benoemen en hun bouwplannen evenals de samenhang daartussen te beschrijven; de relatie aan te geven tussen bouwplannen en levenscycli van deze hoofdgroepen met hun leefomgeving in de loop van de evolutie inclusief het heden; met behulp van de microscoop en eenvoudig snijmateriaal de morfologie van planten en schimmels en de bouwplannen van hoofdgroepen van het dierenrijk te achterhalen; zelf overzichtstekeningen te maken van preparaten en bouwplannen (inzicht in structuren); de evolutie van de primaten en de mens te omschrijven;


8-6-2012 - Pagina 17 van 62

omschrijven welke factoren het ontstaan en behoud van genetische variatie bepalen; te berekenen hoe genfrequenties veranderen; m.b.v. computermodellen populatiegenetische processen analyseren; de mechanismen van soortvorming te omschrijven; zelf een fylogenetische reconstructie te kunnen maken; in staat een tot het schrijven van een verslag en een essay. Niveau 1: basiscursus Inhoud vak Theoretisch deel (gegeven als college, werkcollege en e-learning) De werking van evolutie: de genetische motor, natuurlijke selectie, soortsvorming en extinctie; Genetische variatie, genetisch evenwicht, koppelingsevenwicht tussen loci, genetische drift, flessenhalseffecten; Het aangepaste organisme: levensgeschiedenis, ecofysiologie, geboorte en sterfte, dispersie; Evolutionaire samenhang van de bouwplannen van bacteriën, archaea, protisten, dieren, schimmels en planten; Fylogenetische analyse, cladistiek, soortvorming; Datering, geschiedenis van het leven op aarde in relatie tot milieufactoren in de opeenvolgende tijdvakken; Chemische aspecten van de ontwikkeling van het leven op aarde; Evolutie en diversiteit van leven: genotypische en fenotypische diversiteit; Evolutiebiologie in het dagelijks leven: evolutie van geslachtelijkheid, voortplantingsstrategieën, sociale evolutie, evolutie en gedrag van de mens. Praktisch deel: Laboratoriumpractica over de externe en interne morfologie van planten, bacteriën, schimmels en dieren, inclusief de bouwplannen van gewervelde dieren; Excursie Naturalis, excursie Artis, practica in botanische tuinen en kassen, fossielenwandeling; Werkcolleges/practicum chemie van de oorsprong van het leven; Computerpractica: simulatie van evolutionaire processen, opstellen van fylogenetische bomen; Uitwerken themaopdracht en schrijven essay. Onderwijsvorm Hoorcolleges (60 uur) Practica (60 uur) Werkcolleges/ computerpractica (16 uur) Excursies (8 uur) Zelfstudie Toetsvorm De toetsing bestaat uit een viertal in de tijd gefaseerde schriftelijke deeltoetsen en een schriftelijk eindtentamen, waarbij vragen in verband met stof uit leerboek, colleges, studiehandleiding en practica centraal staan. Toetsing vindt plaats op zowel kennis van als inzicht in de leerstof. De themaopdracht wordt afgesloten met een essay. De practica en excursies worden afgerond met een verslag. De deeltoetsen en de themaopdracht tellen elk voor 10% mee in het eindcijfer, het eindtentamen voor 50%. Literatuur Futuyma, D.J. (2009). Evolution. Second Edition. Sinauer Associates Inc., U.S. Hardcover: 633 pp. ISBN: 978-0-87893-223-8. Prijs ongeveer Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 18 van 62

80 euro. Sadava, D., Hillis, D.M., Heller, H.C., Berenbaum, M.R., (2011). Life, The Science of Biology, Ninth Edition. Vol. II: Evolution, Diversity and Ecology: (Chs. 1, 21-33, 54-59). W.H. Freeman. Paperback, 389 pp. ISBN: 978-1-429-24644-6. Prijs ongeveer 50 euro. Syllabus ter ondersteuning van het snijpracticum, de practica in botanische tuinen, kassen en musea, en de computerpractica. Prijs ongeveer 30 euro, inclusief materialen voor snijpracticum en toegang tot het museum Naturalis en Artis. Aanbevolen voorkennis Het eerstejaarsvak Cyclus van het leven vormt de basis voor dit vak Doelgroep Verplicht vak voor eerstejaars bachelorstudenten Biologie. De cursus staat open voor belangstellenden vanuit andere opleidingen. Studenten uit andere opleidingen moeten vooraf contact opnemen met de docent en goedkeuring vragen bij de examencommissie van hun eigen opleiding. Overige informatie Een laboratoriumjas tijdens de practica is verplicht. Snijmaterialen kunnen aangeschaft worden bij het eerste snijpracticum (een volledige snijset kost ongeveer 25 euro).

Evolutie van de mens Vakcode

AB_470055 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. N.M. van Straalen

Docent(en)

prof. dr. N.M. van Straalen, prof. dr. G.J. Boekschoten

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Practicum

Doel vak Kennismaking met discussies over de reconstructie van de evolutie van homininen. Verwerven van inzicht in de argumenten die vanuit verschillende disciplines gebruikt worden om zulke reconstructies te onderbouwen. Eindtermen De student is in staat: - de huidige stand van zaken met betrekking tot de afstammingsgeschiedenis van Homo sapiens en andere homininen uiteen te zetten; - bewijsmateriaal voor humane evolutie vanuit de moleculaire genetica, de palaeantropologie en de vergelijkende ethologie op hun waarde te schatten; - zich een oordeel te vormen over recente artikelen in Nature en Science waarin nieuwe palaeontologische vondsten en genetische gegevens gepresenteerd worden. Niveau 2: verdieping


8-6-2012 - Pagina 19 van 62

Inhoud vak In de cursus worden de principes van de evolutieleer en de fylogenetische analyse geïllustreerd, gevolgd door een analyse van fossiele en genetische gegevens en hun belang voor de reconstructie van de homininen- subfamilie. Achtereenvolgens komen aan de orde: - Historische visies op de evolutie van mensen; - Dateringsmethodes en tafonomie; - Fylogenetische reconstructies; - Bouwplannen van de primaten; - Sociale structuren en seksueel gedrag bij apen en mensen; - Anatomische overeenkomsten tussen mensapen en mensen; - De oorsprong van de homininen; - Evolutionaire verklaringen voor bipedalisme; - De Australopithecus- soorten; - Homo habilis en Homo erectus; - Verschillende culturen van stenen werktuigen; - Het raadsel van de neanderthalers; - De oorsprong van Homo sapiens: in Afrika?; - Evolutie van de hersenen, zelfbewustzijn en taal; - Migraties van Homo sapiens; - De landbouwrevolutie. Onderwijsvorm Responsiecolleges (8 uur); hoorcolleges (12 uur); osteologisch practicum met humane botten en modellen van fossiele schedels (8 uur); onbegeleide zelfstudie (120 uur); excursie (8 uur) Literatuur Verplicht studieboek: R. Lewin & R.A. Foley, Principles of Human Evolution, ; 2nd edition, ; Blackwell Science, Malden, ISBN 0 632 04704 6. Prijs ongeveer 55 euro. Tevens is een syllabus nodig, prijs ongeveer 20 euro, waarin tevens de toegang tot de grot van Sclayn en vervoer vanaf Maastricht begrepen is Aanbevolen voorkennis Basiskennis van evolutiebiologie op het niveau van de eerstejaars cursus voor biologen (470175) of biomedische wetenschappers (470154) wordt sterk aanbevolen. Voor de BSc Gezondheid en Leven wordt de kennis van; Mens en Evolutie; (487013) bekend verondersteld. Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars bachelorstudenten Biologie, Biomedische wetenschappen, Gezondheidswetenschappen. De cursus staat open voor belangstellenden vanuit andere opleidingen. Studenten uit andere studierichtingen moeten vooraf contact opnemen met de docent en goedkeuring vragen bij de examencommissie van hun eigen opleiding.

Evolution and Human Behavior Vakcode

OH-EHB ()

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Faculteit

Onderwijscentrum VU



8-6-2012 - Pagina 20 van 62

Vakcode

AB_470074 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J. Ellers

Docent(en)

dr. G.J.J. Driessen, prof. dr. J. Ellers

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Computerpracticum, Practicum, Werkgroep

Doel vak Kennis en inzicht verwerven in de principes en de onderliggende mechanismen van de evolutionaire ecologie en de gedragsecologie. Eindtermen De student kan: de verschillen tussen een proximate en een ultimate benadering van ecologische vragen benoemen; optimaliteitstheorie en kosten-batenanalyses toepassen bij ecologische vraagstukken; de principes van de ideaal vrije verdeling uitleggen de voor- en nadelen van leven in groepen benoemen en hieruit de optimale groepsgrootte afleiden in verschillende ecologische context een vergelijking maken tussen verschillende typen paarsystemen en hun ecologische vereisten; alternatieve reproductieve strategieën benoemen en hun voorkomen verklaren; de evolutionaire consequenties van seksuele selectie omschrijven; een voorbeeld geven van co-evolutie en de onderliggende mechanismen identificeren ; uitleggen wat evolutionair stabiele strategieën zijn; de evolutie en functie van signalen en communicatie omschrijven het voorkomen van altruïsme verklaren aan de hand van evolutionaire theorie ecologische vragen, voortkomend uit bovenstaande benaderingen, omzetten in oplosbare deelproblemen en (veld)-experimenten ontwerpen om de geformuleerde deelproblemen te beantwoorden. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De cursus besteedt aandacht aan evolutionaire verklaringen voor ecologische patronen. De centrale vraag in deze cursus is hoe strategieën of gedragingen van een individu kunnen bijdragen aan de overleving of reproductie van dat individu. Onderwerpen die aan de orde komen zijn oa.: Natuurlijke selectie, ecologie en gedrag Economische beslissingen in individuen; Concurrentie om resources; Co-evolutie en wapenwedlopen Leven in groepen; Evolutionair stabiele strategieën Seksueel conflict en seksuele selectie; Paarsystemen en ouderlijke zorg Alternatieve reproductiestrategieen Communicatie en evolutie van signalen Onderwijsvorm


8-6-2012 - Pagina 21 van 62

Het eerste deel van de cursus bestaat uit hoorcolleges over de theorie. In het tweede deel zullen de studenten in kleine groepjes zelf experimenteel (veld)werk verrichten. De veldwerkweek wordt op Schiermonnikoog uitgevoerd en dit is een verplicht onderdeel. Er kan een financiële bijdrage van de student gevraagd worden. Toetsvorm Schriftelijk tentamen over de theorie (50%) Mondelinge en schriftelijke rapportage van het onderzoek (50%). Voor beide onderdelen moet minimaal een 5 worden gehaald. Literatuur An introduction to Behavioural Ecology.J.R. Krebs & N.B. Davies (3rd ed.). Doelgroep Keuzecursus voor tweede- en derdejaars BSc Biologie. Overige informatie De cursus heeft een maximum aantal deelnemers van 30 studenten. Voor HBO- en andere instromers die dit vak in hun Pre-Masterprogramma hebben is het theoretische deel van deze cursus (de eerste twee weken) afgesplitst als een apart vak: Evolutionaire Ecologie en Gedrag (theorie), vakcode 470951. Voor deze deelcursus geldt geen maximum aantal deelnemers.

Evolutionaire genetica Vakcode

AB_470053 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. J.M. Kooter

Docent(en)

dr. J.M. Kooter, dr. H. Schat, dr. ir. T.F.M. Roelofs

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum

Doel vak Verwerven van kennis en inzicht in : dynamische karakter van genetisch materiaal oorzaken genetische variatie op nucleotide, gen, en chromosoom-niveau genoomevolutie bij pro- en eukaryoten, en organellen evolutionaire gevolgen van sex ecologische en moleculaire oorzaken van soortvorming horizontale DNA overdracht moleculaire evolutie van pathogenen (bacterien, virussen, protozoa) gebruik van genomische databanken bij evolutiestudies modellen van de moleculaire oorsprong van leven op aarde reconstructie van fylogenetische bomen verschillende vormen van selectie en theoretische onderbouwing manieren waarop genetische variatie wordt gebruikt om oorzaken van stochastische en deterministische processen af te leiden toepassing van wiskundige regels die bestaan voor het gedrag van allelen van één of twee loci in ideale populaties, en voor genen met een kwantitatief effect


8-6-2012 - Pagina 22 van 62

Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus behandelt: - Genetische concepten die de basis vormen voor het begrijpen van de evolutietheorie, waaronder moleculaire evolutie, ontstaan van nieuwe genen en functies, genoom organisatie, vergelijkende genomics, soortvorming, evolutie humane genoom, relatie tussen ontwikkeling en evolutie (Evo- devo), en hypothesen over het ontstaan van `leven', - Theoretische principes van de populatie genetica, waaronder verschillende vormen van selectie, quantitatieve genetica, drift, en hun toepassingen bij het bestuderen van variatie en evolutie in natuurlijke populaties. - Fylogenetische reconstructies op basis van DNA sequenties met behulp van een cladistisch computerprogramma - Fylogeografie Onderwijsvorm - Hoor- en werkcolleges (60 uur) - Literatuurbespreking (verplicht, 9 uur) - Computerpracticum (verplicht, 9 uur) - Zelfstudie - Ondersteuning via Blackboard Toetsvorm Schriftelijk tentamen (0.8) en een literatuurbespreking (0.2). Beide moeten voldoende zijn. Literatuur Studieboek: 'Evolutionary Analysis', Scott Freeman and Jon C. Herron, Fourth Edition, 2007, Pearson, Prentice Hall Syllabus met Onderzoeks- en Reviewartikelen over onderwerpen die niet in het boek worden behandeld Aanbevolen voorkennis Kennis van Genetica en Moleculaire Biologie; sluit aan bij Evolutie van de mens of Evolutiebiologie uit het eerste jaar Doelgroep Keuzevak voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Overige informatie De cursus wordt gegeven door de afdelingen Genetica, Ecologie en Fysiologie van planten, en Dierecologie.

Evolutionaire genetica * Vakcode

A_HP470053 ()

Periode

Periode 6

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen


8-6-2012 - Pagina 23 van 62

de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.

Five O’Clock Neurosciences (Honours) Vakcode

A_HP003 ()

Periode

Periode 4+5

Credits

6.0

Faculteit


Coördinator

prof. dr. H.D. Mansvelder

Docent(en)

prof. dr. H.D. Mansvelder, dr. R.M. Meredith, dr. K. Linkenkaer Hansen, dr. C.P.J. de Kock

Lesmethode(n)

Werkgroep

Doel vak Leerdoelen van de cursus: de student heeft kennis van en doet ervaring op met - grote theorieën over de werking van het brein - het toetsen van theorieën aan wetenschappelijke realiteit - het wetenschappelijk debat - het houden van een betoog Naast een breed inzicht in de werking van het brein worden in deze cursus verschillende aspecten van wetenschappelijke theorievorming in de neurowetenschappen uitgelicht. Het toetsen van theorieën aan wetenschappelijke literatuur, het houden van een samenhangend mondeling betoog over feit en fictie van geopperde theorieën, het leiden van en deelnemen aan discussies daarover, en het schrijven van een essay bieden oefening in basale academische vaardigheden. Deze cursus oefent studenten in het denken buiten geëigende kaders, daagt studenten uit met overkoepelende visies op ons brein en dwingt studenten stelling te nemen ten aanzien van deze visies in mondelinge discussies en op papier. Inhoud vak Wat is bewustzijn? Hoe leren we iets? Bestaat vrije wil? Wie is er de baas in mijn brein? Theorieën over deze vragen staan centraal in de honourscursus Five O’Clock Neurosciences. Aan de hand van boeken van beroemde neurowetenschappers en wetenschappelijke artikelen ontdekken de studenten wat de laatste inzichten zijn in de werking van ons brein. Er zal naar worden gestreefd het hele terrein van zenuwcel tot mensgedrag te bespreken, en naast biomedische aspecten zullen ook elementen uit de psychologie, de psychiatrie en de medische wetenschappen aan de orde komen. De boeken die besproken zullen worden en die door studenten zelf gekozen worden, verschillen van het reguliere bacheloronderwijs en worden geselecteerd omdat ze vanuit een meer beschouwelijke visie geschreven zijn. Te denken valt daarbij aan ‘The error of Descartes’ van Antonio Damasio, ‘Musicophilia’ van Oliver Sacks, ‘Synaptic Self’ van Joseph Ledoux, en ‘Vrije wil bestaat niet’ van Victor Lamme. Deze literatuur Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 24 van 62

wordt aangevuld met artikelen uit vooraanstaande tijdschriften om een weerslag te bieden van modern neurowetenschappelijk onderzoek dat probeert te ontrafelen hoe processen op moleculair, cellulair of netwerk niveau samenhangen met gedrag en het functioneren van de mens. Tijdens de inhoudelijke discussies wordt nagegaan waar de wetenschappelijke grenzen van theorieën over de werking van het brein liggen of overschreden worden. Onderwijsvorm - Boek- en artikelpresentaties door studenten - Discussiegroepen - Zelfstudie Vaardigheden en technieken die aan de orde komen: - Analyseren van wetenschappelijke en populair-wetenschappelijke teksten - Houden van een betoog - Deelname aan wetenschappelijk debat Bijeenkomsten vinden plaats 1x per week tussen 17 en 19 uur. Toetsvorm - Presentatie (40%) - Deelname aan discussies (10%) - Essay (50%) Literatuur - door student zelf te kiezen boek (wordt tijdens de 1e bijeenkomst toegelicht) - wetenschappelijke artikelen Aanbevolen voorkennis Gezien het niveau van besprekingen is kennis van de levenswetenschappen aan te bevelen, maar geen vereiste. Doelgroep De doelgroep voor deze cursus bestaat uit tweede- en derdejaars bachelorstudenten die geselecteerd zijn voor het VU honoursprogramma. Overige informatie Cursus loopt van 3 maart t/m 25 mei 2011. Van studenten wordt een actieve deelname in mondelinge presentaties en discussies verwacht. Deze cursus biedt een uitstekende orientatie en voorbereiding op de VU Master of Neurosciences (www.neurosciencecampus-amsterdam.nl).

Future Entrepreneur Vakcode

OH_FE ()

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Genen, hersenen en gedrag Vakcode

AB_470176 (450003)

Periode

Periode 4

Credits

12.0

Voertaal

Engels


8-6-2012 - Pagina 25 van 62

Faculteit


Coördinator

dr. H.K.E. Vervaeke

Docent(en)

dr. R.F. Jansen, prof. dr. M. Verhage, dr. R.O. Stiedl, prof. dr. R.E. Koes, dr. H.K.E. Vervaeke, prof. dr. A.B. Smit

Lesmethode(n)


Doel vak Kennis en inzicht verkrijgen in de functie van genen betrokken bij de bouw van de hersenen en het vormgeven van gedrag Het eerste deel van de cursus heeft als focus cellen, weefsels en systemen. Studenten krijgen inzicht in de bouw van zenuwstelsels in het gehele dierenrijk, inclusief het humane zenuwstelsel. Vervolgens leert de student begrijpen hoe neuronen communiceren. De student kan uitleggen hoe de actiepotentiaal tot stand komt en wordt voortgeleid doorheen het axon. De student heeft inzicht in het mechanisme van synaptische transmissie, intracellulaire signaalverwerking en hormonale regulatie. Vervolgens wordt er aandacht besteed aan gen-functie onderzoek modellen. De student kan uitleggen wat het belang is van het gebruiken van genetische modellen zoals gist, C. Elegans, Drosophila en muis in de neurobiologie. Het laatste deel van de cursus heeft als focus gedrag in het dierenrijk (communicatie, sociaal gedrag, angst, depressie, stress, biologische klok en evolutionaire aspecten). Niveau 1: basiscursus Onderwijsvorm Hoorcolleges en practica (verplicht). Naast het bijwonen van hoorcolleges, bestuderen studenten zelf de cellen en systemen van het zenuwstelsel door middel van een brain map computerpracticum, een hands-on snijpracticum varkensbrein en een lichtmicroscopie-practicum. Studenten doorgronden het proces van neurale communicatie met behulp van computertutorials over membraanpotentiaal, actiepotentiaal en synaptische transmissie. Ze onderzoeken zelf de eigenschappen van zenuwvezels in het hands-on practicum Actiepotentialen in de regenworm Toetsvorm Drie schriftelijke deeltoetsen Literatuur Syllabus; leerboek wordt aangekondigd op Blackboard. Doelgroep Verplicht voor eerstejaars BSc Biologie

God-Man-World Vakcode

OH_GMW (986015)

Periode

Periode 2

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Governing Security Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 26 van 62

Vakcode

OH_GS (986008)

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Honours course: Communication and Innovation in Health and Life Sciences Course code

A_HP002 (450003)

Credits

6.0

Language of tuition

English

Faculty


Coordinator

prof. dr. J.T. de Cock Buning

Course objective Students will: • Obtain insight into some key technological innovations in health and life sciences and their impact on society. • Obtain insight into the characteristics of various communication models for science and technology (e.g. deficit model, contextual model, lay-expertise model, interactive model) • Obtain a thorough understanding of different methods for interactive communication on technology innovations. • Acquire insight into the current status of interactive communication on technological innovations in the health and life sciences. • Be able to critically analyze strengths and weaknesses of various interactive communication methods. • Be able to critically analyze and compare recent real-life cases in interactive communication on technological innovations in health and life sciences. • Be able to design an interactive communication project in relation to a specific innovation. • Be able to work in multidisciplinary teams. Form of tuition • Interactive lectures that provoke, engage, inform and stimulate academic discussion about communication, innovation and society (21 hours) • Training workshops on critical analysis of a selection of relevant scientific articles (9 hours) • Group assignment (intensive coaching and intervision): multidisciplinary teams of about 7 students (from various disciplinary backgrounds) (40 hours) • Excursion to an interactive communication project (3 hours) • Self study (64 hours) • Exam (3 hours) Attendance is compulsory Type of assessment • Written exam, individual (60%) • Group assignment: written report and oral presentation (40%) Each grade need to be at least 5.0 and together on average 6.0 to pass


8-6-2012 - Pagina 27 van 62

Course reading • Selected chapters of the book: “Misunderstanding Science? The public reconstruction of science and technology”, by A. Irwin and B. Wynne, Cambridge University Press, Cambridge, 1996 • Book: “Biotech on the menu: Society as a mirror for research policy” by Tj. De Cock Buning, B. Regeer and J. Bunders, RMNO, The Hague, 2007 • Selected recent articles from the Sage journals “Public Understanding of Science”, “Science, Technology & Human Values” • Other relevant reading materials Entry requirements The course is accessible for second and third year bachelor students with a wide variety of backgrounds.

Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces Course code

A_HP001 ()

Credits

6.0

Faculty


Coordinator

prof. dr. N.M. van Straalen

Course content Course topics: a. From matter to life and the first genetic material b. The RNA world c. Theories for the origin and early evolution of life d. Mutual effects of life on geology and climate e. From prokaryote to eukaryote f. Lateral gene transfer, evolution of organelles g. Major and minor extinctions h. Multilevel selection, group selection, kin selection, sexual selection i. Human behaviour explained from an evolutionary and adaptive perspective j. Evolution of consciousness and language k. Cultural evolution l. Controversies between evolutionary theory and religion Form of tuition In small meetings, the topics will be introduced by an expert and further explored in a ‘round-table’ discussion. Students are expected to study the handed-out papers and to actively participate. Each student will write an essay, and give an oral presentations. Type of assessment Written essays (40%), oral presentation (40%) and participation in discussions (20%) Course reading Scientific articles Remarks The course will be given every second year (not in 2010 - 2011; forthcoming course in 2012), February through April, in weekly evening classes, 17.00 – 20.00 h (16 sessions). The course is organized in four blocks, each block consisting of four sessions dealing with a specific Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 28 van 62

aspect and involving introductory lectures, discussion about scientific articles, guest lectures and a student presentations. Attendanding all classes is indispensable.

Honours Individueel Vak Vakcode

OH_EXT1 ()

Credits

8.0

Voertaal

Nederlands

Coördinator

C. Holleman

Honours Leadership Vakcode

OH_LEAD ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Coördinator

drs. D.T.T. Kamsma

How to survive 2050 Vakcode

OH_HTS (986004)

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


HP AUC: Programming your World Vakcode

OH_APYW ()

Credits

6.0

Faculteit

Onderwijscentrum VU

Coördinator

C. Holleman

HP UvA: Creativiteit Vakcode

OH_UCREA ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

HP UvA: Governance of Aquatic Vakcode

OH_UGOAQ ()

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Faculteit

Onderwijscentrum VU


8-6-2012 - Pagina 29 van 62

HP UvA: Intelligence Studies Vakcode

OH_UINST ()

Credits

6.0

Faculteit

Onderwijscentrum VU

Coördinator

C. Holleman

HP UvA: Love Vakcode

OH_ULOVE ()

Credits

6.0

Faculteit

Onderwijscentrum VU

Humane Anatomie en Fysiologie * Vakcode

A_HP470104 ()

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator


Humane ontwikkeling * Vakcode

A_HP487008 ()

Periode

Periode 4

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.

Illness-Image-Metaphor Vakcode

OH_IIM (986012)

Periode

Periode 4


8-6-2012 - Pagina 30 van 62

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Impact of an Empire Vakcode

OH_IE (986005)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Kust en mariene ecosystemen Vakcode

AB_470203 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. ir. P.M. van Bodegom

Docent(en)

dr. ir. P.M. van Bodegom, dr. M.P. Berg, dr. G.J.J. Driessen

Lesmethode(n)


Doel vak Begrijpen van interacties tussen organismen onderling en tussen organismen en leefomgeving, toegepast op kust en mariene ecosystemen. Eindtermen: Kennis hebben van de organismen van kust en mariene ecosystemen. Theorie over het voorkomen en verspreiding van soorten begrijpen en toepassen op kust en mariene ecosystemen. Concepten om interacties tussen soorten, leidend tot een levensgemeenschap, kunnen beschrijven en toepassen op kust en mariene ecosystemen. Dynamiek in individuele populaties conceptueel koppelen aan die van levengemeenschappen en de consequenties van deze koppeling voor stabiliteit en diversiteit van levensgemeenschappen doorzien. Theorieën om de samenstelling van levensgemeenschappen te verklaren kunnen toepassen op kust en mariene ecosystemen. Conceptueel kunnen koppelen van de dynamiek van levensgemeenschappen aan grootschalige biogeografische patronen. Inzicht hebben in de mogelijkheden van modelbouw om biologische processen te vertalen naar wiskundige formuleringen middels het uitvoeren van opdrachten met computermodellen. Kunnen integreren van theorieën op verschillende schaalniveaus om i) de verbanden tussen theoretische concepten te analyseren, ii) een maatschappelijke context te analyseren om oplossingen aan te dragen voor maatschappelijke problemen rond kust en mariene ecosystemen. Zelfstandig onderzoek kunnen uitvoeren om theorieën over ecologische interacties toe te passen en te toetsen. Zelfstandig mondeling en schriftelijk kunnen rapporteren van Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 31 van 62

uitkomsten van opdrachten en onderzoeksresultaten. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus behandelt de volgende onderwerpen: Een aantal kusten mariene ecosystemen worden beschreven. De specifieke milieuomstandigheden van kust en mariene ecosystemen die selectiedruk uitoefenen op de daar voorkomende organismen worden behandeld. De principes van verspreiding, concurrentie- facilitatie, predatie en inhibitie in trofische interacties en toepassing van deze principes in verspreidingsmodellen en op zonering in kust en mariene ecosystemen en populatiemodellen, klassieke meta-populatie theorieën, voedselwebben, samenstelling van levensgemeenschappen, recente ontwikkelingen op het gebied van de assembly theorie en assembly filters, biogeografie, bioenvelope-modellen en macroecologie worden behandeld. Maatschappelijke implicaties worden geïntegreerd behandeld met de theorie en daarnaast wordt er afzonderlijk aandacht besteed aan de volgende onderwerpen: Kustdynamiek en effecten op kust en mariene levensgemeenschappen, natuurbescherming van gevoelige kustecosystemen in relatie tot eutrofiering, overexploitatie, windmolenparken, recreatiedruk, interactie tussen mariene ecosystemen en visserijbiologie en de toepassing in visserijmodellen, implementatie van Europese richtlijnen, zoals de waterrichtlijn en de habitatrichtlijn, invasie-ecologie in kustecosystemen, geïllustreerd voor de Nederlandse kusten. Onderwijsvorm Hoorcolleges over theorie en maatschappelijke implicaties, computerpractica over visserij- en dispersiemodellen, eendaagse veldexcursies, een essay-opdracht per peer-review, presentaties over de leerstof, ontwerpen van een eigen onderzoeksplan en een veldonderzoek van een week in Ambleteuse (Frankrijk). Toetsvorm Toetsing bestaat uit: mondelinge presentatie van het veldonderzoek (20%), verslag van vijf opdrachten (elk 10%) en tentamen over de theorie (30%) Literatuur Verplicht boek: Little., C., G. Williams and C.D. Trowbridge (2009) The biology of rocky shores. Oxford University Press (42 Euro). Naast het studieboek is er een digitale reader met een nadere uitwerking van theoretische concepten en van maatschappelijke implicaties en wordt het leerboek 'Essentials of Ecology' gehanteerd als achtergrondliteratuur. Aanbevolen voorkennis Het eerstejaarsvak Ecologie, mens en natuur (470178) Doelgroep Verplicht voor tweedejaars BSc Biologie Overige informatie Een eigen bijdrage voor het Ambleteuse- veldonderzoek is verplicht

Levensvragen en wetenschap


8-6-2012 - Pagina 32 van 62

Vakcode

AB_470151 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

drs. J.F.H. Kupper

Docent(en)

drs. J.F.H. Kupper, prof. dr. J.T. de Cock Buning

Lesmethode(n)

Werkgroep

Doel vak Inzicht verwerven in: Verschillende filosofische ideeën over het menselijk bestaan De manieren waarop deze ideeën worden beïnvloed door nieuwe ontwikkelingen in de levenswetenschappen. Vaardigheden ontwikkelen in: Het kritisch analyseren van filosofische en wetenschappelijke teksten; Het voeren van analyserende discussies; Het verwoorden van sterke argumentatielijnen in een essay. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Deze cursus gaat over filosofie: nadenken over jezelf als mens en de wereld om je heen. Filosofie is wikken en wegen, zoeken en vragen stellen. Tijdens de cursus 'Levensvragen en wetenschap' onderzoek je het menselijk bestaan in het licht van zowel filosofische theorieën als de huidige stand van zaken in de levenswetenschappen. Vragen als 'wie ben ik', 'hoe kan ik de wereld kennen' en 'wat doe ik hier eigenlijk' staan daarbij centraal. Deze vragen hebben in de loop der eeuwen verschillende antwoorden gekregen van filosofen, geestelijken en wetenschappers. In deze cursus bestudeer je wat die antwoorden zoal zijn geweest aan de hand van de originele teksten en ga je bovenal op onderzoek uit naar jouw antwoord als wetenschapper anno 2011. Ontwikkelingen in de levenswetenschappen hebben in de twintigste eeuw gezorgd voor een enorme toename in de wetenschappelijke kennis over de mens en zijn omgeving. We denken steeds beter te weten wie wij zijn, maar is dat wel zo vanzelfsprekend? Zijn wij machines met gevoel of toch iets wezenlijk anders? Hoe weten we zeker dat wat we om ons heen zien werkelijk bestaat? En hoe moeten we kiezen voor 'het goede leven'? Volgens Wittgenstein zijn deze vragen van wezenlijk belang, maar kunnen ze nooit zinvol rationeel geanalyseerd worden. Hoe komen we dan aan antwoorden? Is elk antwoord mogelijk zoals de post-modernisten beweren? Op welke manier zijn de moderne psychologische en neurobiologische inzichten behulpzaam bij deze vragen? We vergelijken steeds antwoorden van de 'oude meesters' met de nieuwste inzichten. De thema's die onder andere aan de orde zullen komen, zijn: Wat is er echt? Een thema over wat bestaat en wat niet. Over de tegenstelling tussen realisme en idealisme, over feiten en hun hardheid. Wie ben ik? Een thema over mensbeelden. Aan de orde komen onder meer het lichaam-geest dualisme van Descartes, het behaviourisme en het idee dat het menselijk brein werkt als een computer. Waartoe ben ik hier? Een thema over de biologische reden van het mens-zijn (evolutie, Dawkins 'selfisch genes') en verschillende Westerse en niet-Westerse visies op de vraag 'waartoe zijn wij op aard'. Onderwijsvorm


8-6-2012 - Pagina 33 van 62

De cursus bestaat uit 4 weken waarin er regelmatig contact is met de docenten in werkcolleges. Veel tijd zal besteed worden aan het individueel lezen van teksten en het voorbereiden in tweetallen van discussies. Verder wordt er door jullie wekelijks over de thema's gediscussieerd op het Blackboardforum. Toetsvorm De toetsing bestaat uit drie onderdelen. 1) je actieve participatie in de werkgroepen. 2) je bijdrage aan de groepsdiscussie op blackboard. 3) een afsluitend essay waarin je een zelfgekozen onderwerp analyseert in relatie tot een van de thema's. Alle onderdelen tellen even zwaar mee en moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Syllabus met samengestelde teksten Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars (en hoger) BSc Biologie, Biomedische Wetenschappen, Gezondheidswetenschappen, Filosofie. Overige informatie Deze cursus wordt niet meer gegeven in 2011 - 2012; is vervangen door andere cursussen (voor Biologie resp. Biomedische Wetenschappen). Voor meer informatie over een eventuele laatste kans: stuur een e-mail naar [email protected].

Life and Work Vakcode

OH_LAW (986007)

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Management van innovaties Vakcode

AB_470195 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J.E.W. Broerse

Docent(en)

prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen, dr. J.F.H. Kupper, drs. W.P.C. Boon

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep

Doel vak Verwerven van kennis van en inzicht in: Verschillende vormen van (1) management en (2) innovatie op verschillende niveau's (micro, meso en macro) De centrale concepten van innovatieprocessen en innovatiemanagement Verschillende mechanismen van innovatieontwikkeling, hun effecten en hun uitdagingen in verschillende culturele contexten. Verschillende theoretische perspectieven op innovatiestudies en Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 34 van 62

management van technologie (o.a. strategisch innovatie management, wetenschap, technologie en samenlevingstudies) De belangrijkste actoren en hun onderlinge relatie in de (inter) nationale medische innovatie-arena. Verschillende manieren om de ontwikkeling van innovaties in de gezondheids- en levenswetenschappen te beïnvloeden. Het toepassen van verkregen kennis en inzicht door: De praktijk oefenen met het analyseren van verschillende innovatiestrategieën in de medische sector. Het opdoen van leerervaringen ten aanzien van: Projectmatig werken in teamverband. Het kunnen toepassen van enkele praktische vaardigheden, zoals onderzoeksopzet maken, literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk en mondeling presenteren. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Studenten met een biomedische of gezondheidswetenschappelijke achtergrond worden in hun toekomstige carrière steeds meer betrokken bij het tot stand komen van medische innovaties, zoals technische innovaties, zorginnovaties en systeeminnovaties. Bij deze innovaties spelen verschillende actoren een rol, zoals wetenschappers, gebruikers, verzekeraars, zorgverleners, industrie en patiënten. De verschillende perspectieven van deze actoren zijn van invloed op het welslagen van innovatieprocessen. Het betrekken van meerdere actoren zoals, o.a. patiënten, zorgverleners en onderzoekers in het innovatie proces is niet eenvoudig. In deze cursus wordt ingegaan op verschillende casussen waarin dit proces gerealiseerd is en hoe je de interactie tussen de verschillende groepen kunt managen. Voorbeelden zijn de ontwikkeling van cochleaire implantaten voor doven en slechthorenden, patiëntenparticipatie bij brandwondenonderzoek en het implementeren van het 'patiënt-centraal' concept in ziekenhuizen. We bespreken verschillende theoretische inzichten met betrekking tot het managen van medische innovaties (managementstrategieën en 'vormen). Ook gaan we in op innovatiesystemen in de internationale context. In kleine groepjes studenten krijg je vervolgens de opdracht om een medisch innovatieproces (technologische, zorg- of systeeminnovatie) te analyseren met behulp van de theorieën en inzichten verkregen uit de colleges. Aan het einde van de cursus presenteren de verschillende groepen hun analyse aan de medestudenten. Onderwijsvorm De cursus zal bestaan uit hoorcolleges en het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband. Toetsvorm Individuele toetsing bestaat uit: (1) schriftelijk tentamen (50%), en (2) projectopdracht (50%). Individuele beoordeling van de projectopdracht vindt plaats op basis van individuele producten, het functioneren in de projectgroep en de beoordeling van groepsproducten. Beide onderdelen moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Syllabus. Eventueel een boek. Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen en Gezondheidswetenschappen. Speciaal aanbevolen voor studenten die de masteropleiding Management Policy Analysis and Entrepreneurship, of de Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 35 van 62

differentiatie International Public Health binnen de masteropleidingen Health Sciences of Biomedical Sciences willen gaan volgen. Overige informatie Voor informatie over de cursus kun je contact opnemen met dr. R. Visser of W.S. Konijn MSc, tel 020-5987031

Medical Genomics Vakcode

AB_487012 (450003)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. ir. A.J.A. Groffen

Docent(en)

dr. R.J.M. van Spanning, prof. dr. A.B. Smit, prof. dr. P. Heutink, dr. J.M. Kooter

Lesmethode(n)


Doel vak Genomics richt zich op het bestuderen van het hele genoom. Terwijl verschillende species zich onderscheiden door verschillen in de samenstelling van hun genoom, verschillen ook individuen binnen een populatie door een beperkte mate van variatie. Zulke variaties zijn bepalend voor het gedrag en ziekten. De cursus Medical Genomics biedt inzicht in technieken voor het in kaart brengen van genomische overeenkomsten en verschillen. Als voorbeeld worden, naast toepassingen in research (biologie, levenswetenschappen), vele toepassingen in de gezondheidszorg behandeld. De hoofddoelen zijn: het verkrijgen van inzicht in de samenstelling en organisatie van het genoom en de benaderingen om dat te analyseren; het vergelijken van genomen van verschillende species; het inzichtelijk maken hoe genomische eigenschappen de basis vormen voor het functioneren van cellen en het gedrag van organismen; te begrijpen hoe individuele variatie kan worden gebruikt om ziektegenen op te sporen het verkrijgen van inzicht in hoe genoom-elementen bijdragen tot complexe biologische funkties of ziektes. Voor deze hoofddoelen worden de volgende vaardigheden bijgebracht: het vinden en gebruiken van databases waarin DNA-sequenties, transcriptomics en proteomics profielen in kaart zijn gebracht; het benutten van informatie uit genfunctie-onderzoek dat is uitgevoerd inverschillende modelorganismen; het identificeren van genetische diversiteit en variaties die bijdragen tot het onstaan van ziekte of de kwetsbaarheid hiervoor. Tenslotte heeft de cursus het doel de student te laten kennismaken met een aantal belangrijkse toepassingen van genoomanalyse: medische toepassingen (gene arrays, SNP-arrays, expressie profiling, proteomics) research toepassingen (genetische manipulatie in modelorganismen); biotechnologische en ecologische toepassingen; ethische aspecten van genomics en genetische modificatie. Niveau 2: verdieping


8-6-2012 - Pagina 36 van 62

Inhoud vak De cursus bouwt voort op basiskennis van genetica en begint met een 'opfriscollege' en een toets om een goed ingangsniveau te garanderen. Het hoofdbestanddeel van de cursus omvat elke ochtend een hoorcollege en elke middag een computerpracticum, dat op de VU of thuis mag worden gemaakt. In de laatste week is er tijd voor het afronden van opdrachten en voorbereiden van het tentamen. Onderwijsvorm Hoorcolleges (45 uur), computerpractica (45 uur) en zelfstudie (32 uur in laatste cursusweek) Toetsvorm Schriftelijk tentamen en ingeleverde werkopdrachten. Het eindcijfer wordt bepaald uit het gewogen gemiddelde van de scores voor het tentamen (80%) en de computerpractica (20%). Studenten kunnen alleen slagen nadat zij alle computerpractica hebben volbracht. Literatuur Syllabus (details zullen worden aangekondigd via Blackboard) Doelgroep Verplicht voor BSc Gezondheid en Leven (tweede of derde jaar). Keuzecursus voor BSc Biologie (derde jaar). Keuzecursus voor master Oncologie.

Methodologie en onderzoek in de biologie Vakcode

AB_470209 (450003)

Periode

Periode 2

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

drs. P. Vos

Docent(en)

H.R. Zoomer, dr. L.D.J. Kuijper, dr. J.M. Koene

Lesmethode(n)


Doel vak Na afloop van de cursus kunt u zelfstandig op een veilige wijze een eenvoudig biologisch experiment uitvoeren en naar aanleiding daarvan uw bevindingen schriftelijk rapporteren. U kunt zelfstandig betrouwbaarheidsintervallen bepalen bij eenvoudige biologische relaties, met behulp van Excel. U kunt bronnen uit de wetenschappelijke biologische literatuur op waarde schatten en gebruiken om een wetenschappelijke onderzoeksvraag te onderbouwen. U weet waaraan een goede mondelinge presentatie voldoet en u kunt deze ook voorbereiden. Niveau 1: basiscursus Inhoud vak De volgende onderwerpen komen aan de orde - Kansrekening - Onderzoeksdesigns - Populaties en steekproeven - Beschrijvende statistiek


8-6-2012 - Pagina 37 van 62

- Schatten en betrouwbaarheidsintervallen - Verslagschrijven en mondelinge presentaties Eindtermen: De student - kan verschillende onderzoeksdesigns benoemen en beschrijven - kan laten zien hoe je uit een populatie een verantwoorde steekproef neemt - is in staat beschrijvende statistische operaties uit te voeren in Excel - weet hoe kansmodellen gebruikt worden om betrouwbaarheidsintervallen te berekenen - leert op verantwoorde wijze laboratoriumwerk te verrichten - kan onder begeleiding een proefopzet passend bij een eenvoudige onderzoeksvraag bedenken - is in staat een goed geschreven onderzoeksverslag te maken - leert technieken voor een aansprekende mondelinge presentatie Onderwijsvorm - Hoorcolleges - Werkcolleges - Computerpractica - Laboratoriumpractica / leeronderzoek - Mondelinge presentaties Toetsvorm Tentamen over Statistiek (50%) Verslag over leeronderzoek Methodologie (15%) Verslag over laboratoriumexperimenten (10%) Exceltoets (15%) Mondelinge presentatie (10%) Het vak kan alleen met een voldoende afgesloten worden als de verplichte taaltoets Nederlands behaald is. Studenten die de taaltoets niet met een voldoende hebben afgesloten, dienen de remediërende cursus schrijfvaardigheid te volgen. Literatuur The Practice of Statistics in the Life Sciences. Brigitte Baldi & David S. Moore, W.H. Freeman and Company, New York. ISBN 1-4292-1876-2 (prijs ongeveer 60 euro) Overige informatie Het vak kan alleen met een voldoende afgesloten worden als de verplichte taaltoets Nederlands behaald is. Studenten die de taaltoets niet met een voldoende hebben afgesloten, dienen de remediërende cursus schrijfvaardigheid te volgen.

Methodologie en statistiek II Vakcode

AB_470062 (450003)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. L.D.J. Kuijper

Docent(en)

dr. ir. P.M. van Bodegom, H.R. Zoomer, dr. L.D.J. Kuijper

Lesmethode(n)



8-6-2012 - Pagina 38 van 62

Doel vak Herhaling en opfrissing van de onderwerpen statistiek behandeld in Methodologie & Statistiek I; kennismaking met statistische methoden voor enkele meer complexe proefopzetten in de biologische en biomedische wetenschappen, zoals variantieanalyse en regressieanalyse. Het accent in deze cursus ligt op verdieping van de stof aangeboden in de cursus Methodologie & Statistiek I. Ten dele betreft het een verdieping van de theorie (bijv. het onderwerp power). Daarnaast zullen we aandacht besteden aan het interpreteren van statistische resultaten zoals die in de primaire literatuur worden gepresenteerd. In de cursus benadrukken we de praktische aspecten van de statistische analyse door het gebruik van Excel. Tot slot besteden we aandacht aan de structuur van wetenschappelijke redeneringen. Eindtermen De student kan - kritisch analyseren hoe metingen tot stand zijn gekomen, en welke consequenties dat heeft voor een statistische analyse van de gegevens. - nagaan of een gegeven dataset voldoet aan de vooronderstellingen van een bepaalde statistische analyse - de volgende analyses zelf uitvoeren, de resultaten interpreteren, en de gegevens grafisch weergeven: t- toets, ANOVA (one- way en two- way), correlatie- en regressieanalyse, chikwadraattoetsen, e. a. - herkennen wanneer een non- parametrische techniek gebruikt moet worden; - de relatie tussen een statistische hypothese en een wetenschappelijke theorie verklaren; - basale begrippen uit; 'experimental design' toepassen; - een geschikte toets kiezen gegeven een experimental design dat in de cursus behandeld is; - middels simulaties in Excel de kansverdeling van toetsingsgrootheden zelf genereren - met simulaties in Excel powerberekeningen doen - de power bepalen van enkele veel voorkomende eenvoudige toetsen mbv Excel - statistische resultaten zoals die in de literatuur gepresenteerd worden interpreteren en beoordelen; - wetenschappelijke redeneringen reconstrueren en analyseren. De student moet alle hierboven genoemde toetsen kunnen uitvoeren met Excel. Niveau 2: verdieping Inhoud vak - Variantieanalyse (one-way en two-way); - Regressieanalyse; - Analysis of Categorical Data, Matched pairs designs; - Experimental Design; - Argumentatietheorie; - Simulaties Onderwijsvorm Hoorcolleges; werkcolleges; Excelpracticum; zelfstudie; onderzoeksproject, waarin zelfstandig of in kleine groepjes gegevens worden verzameld en geanalyseerd; het project wordt afgesloten met een verslag. Toetsvorm


8-6-2012 - Pagina 39 van 62

Schriftelijk tentamen (70% van het eindcijfer); verslag over project (30% van het eindcijfer); Beide onderdelen moeten voldoende zijn. Literatuur - Baldi, B & Moore, D.S. 2009. The Practice of Statistics in the Life Sciences. - (N. B: Dit is hetzelfde boek als gebruikt in de cursus Methodologie & Statistiek I) - Diverse artikelen; tijdens de cursus zullen de URL's hiervoor op Blackboard verschijnen. Vereiste voorkennis De cursus Methodologie en statistiek 1, code 470142 of 470165, moet met een voldoende zijn afgerond. Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische wetenschappen. Keuze voor derdejaars BSc Gezondheid en Leven. Overige informatie Deze cursus geldt als ingangseis voor het volgen van elke masteropleiding.

Moleculaire celbiologie Vakcode

AB_470079 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. R.J.M. van Spanning

Docent(en)

prof. dr. H.V. Westerhoff, dr. R.J.M. van Spanning, dr. K. Krab

Lesmethode(n)


Doel vak Het verkrijgen van inzicht in het functioneren van cellen en het kennis maken met methodes om dat in de levende cel en erbuiten te bestuderen. Eindtermen: Het kunnen ontwerpen en uitvoeren van eenvoudige genexpressie-, signaaltransductie- en metabole experimenten Het kunnen maken en interpreteren van 'live' opnamen van wat er in levende cellen gebeurt met betrekking tot energiehuishouding, zuurstofschade, apoptose, DNA structuur, en signaaltransductie. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Organisatie, functie en regulering van de cellulaire ademhaling en productie van ATP, in relatie tot verstoringen van celfunctie zoals die optreden bij diabetes en veroudering; Regulatie van genexpressie tijdens de adaptieve respons van microorganismen bij verandering van de groeiconditie; Kwantitatieve beschrijving van de controle van cellulaire processen, met nadruk op het verband tussen de eigenschappen van individuele


8-6-2012 - Pagina 40 van 62

reacties en de eigenschappen van het netwerk waar die reacties deel van uitmaken (systeembiologie). Demonstratie van de bovenstaande principes aan de hand van de rol van signaaltransductie in bacterie, gist en mitochondrion. Onderwijsvorm Hoorcolleges; practicum op de afdeling Moleculaire Celfysiologie; computerpracticum. Toetsvorm Schriftelijk tentamen over collegestof en practicum (75%), eindpresentatie (25%) Literatuur Syllabus, prijs ongeveer 5 euro, en powerpoints hoorcolleges. Aanbevolen voorkennis Microbiologie en Biochemiecursussen of equivalent. Doelgroep Keuzevak derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Overige informatie Een laboratoriumjas is verplicht. Na afloop van het practicum wordt de labjas gesteriliseerd.

Moleculaire ontwikkelingsbiologie Vakcode

AB_470038 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. R.E. Koes

Docent(en)

prof. dr. R.E. Koes

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Werkgroep, Practicum

Doel vak Het doel van deze cursus is inzicht te geven in - het functioneren van genen en complexere netwerken van meerdere genen in de sturing van complexe processen. - hoe genen en netwerken de ontwikkeling sturen van een enkel cel, de bevruchte eicel of zygote tot een complex eukaryoot organisme bestaande uit miljarden cellen met de juiste organen, weefsels en celtypes op de juiste plaats. - moleculair genetische onderzoek methodes en technieken waarmee we (ontwikkelings)biologische processen kunnen ontrafelen. Specifieke onderwerpen die daarbij aan de orde zullen komen zijn: - Moleculair mechanismen die de expressie van genen reguleren via DNA bindende eiwitten (transcriptie factoren), DNA- methylering en chromatinestructuur. - het functioneren van simple genetische circuits in de differentatie van verschillende celtypes en de moleculaire grondslag van "cell memory" (d. i de onomkeerbarheid van differentiatie). - Rol van "mobiel DNA" tijdens sex-differentiatie en gist en de


8-6-2012 - Pagina 41 van 62

ontwikkeling van B- lymphocyten in de mens. - regulatie en genetische controle van opvolgende fases in de cel cyclus (rol van checkpoint) - Specificatie van de lichaamsopbouw (anterior- posterior en dorsalventral lichaamsassen, segmenten, organe etc) tijdens vroege embryogenese. - Conservering van ontwikkelingsgenen (o. a. Hox genen) van insect tot muis. - Variatie tussen Hox genen en het ontstaan van diversiteit bij dieren. ("evo-devo" aspecten) - Ontwikkeling van een hogere plant Het doel van het practicum is: - Experimentele vaardigheden op te doen met enkele breed toepasbare moleculair genetische technieken. - Het leren interpreteren van experimentele resultaten en het bedenken van vervolg experimenten. - Het inzicht te verdiepen in de regulatie van genexpressie en de functie tijdens ontwikkelingsprocessen. Niveau van de cursus: 2 (verdieping) Inhoud vak De cursus start met twee "opfriscolleges" en een korte toets om een goede achtergrondkennis te verzekeren. Het hoofddeel van de cursus omvat hoorcolleges, werkcolleges en een "nat" practicum waarin we een aantal verschillende aspecten en moleculair mechanismen behandelen die ten grondslag liggen aan de ontwikkeling van hogere eukaryote organismes (zie doelen). Onderwijsvorm Hoorcolleges (24 uur); werkcolleges (4 uur); practicum (circa 40 uur); zelfstudie (80 uur). Toetsvorm De benodigde voorkennis en de inleidende practicumtheorie wordt schriftelijk getoetst bij aanvang van de 2e cursusweek (10% van eindcijfer). Het practicum wordt beoordeeld aan de hand van een schriftelijke toets (40% van eindcijfer). De collegestof wordt schriftelijk getentamineerd (50% eindcijfer). Literatuur - Handboek: Wordt nader bekendgemaakt - Uittreksels (powerpoint files) van collegestof (gratis te downloaden van Blackboard); - Practicumhandleiding (ongeveer 7 euro) - Computerfiles (pdf) van artikelen gebruikt bij het practicum (gratis te downloaden via Blackboard). Doelgroep Keuzecursus voor tweede en derdejaars Bsc Biologie, Biomedische Wetenschappen. Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. Maximaal 40 deelnemers. Overige informatie Bij dit studieonderdeel is het voor studenten die het Bachelor Honoursprogramma; Biologie, Bio- medische Wetenschappen of Gezondheid; en Leven; volgen, mogelijk te kiezen voor de stervariant. Bij de stervariant wordt aan het bovenomschreven studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 42 van 62

rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De stervariant wordt geregistreerd onder een aparte vakcode. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 EC boven de normale belasting van de cursus.

Moleculaire ontwikkelingsbiologie * Vakcode

A_HP470038 ()

Periode

Periode 5

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.

Molecular Microbiology Course code

AB_470610 (450003)

Period

Period 5

Credits

6.0

Language of tuition

English

Faculty


Coordinator

dr. J.P. van Ulsen

Teaching staff

dr. R.J.M. van Spanning, prof. H. Lill, dr. S. Luirink, dr. M.P. Bergman, prof. dr. W. Bitter, dr. J.P. van Ulsen

Teaching method(s)

Lecture, Computer lab, Symposium

Course objective To show the molecular processes that are the basis of bacterial infections. The complex molecular processes in and biogenesis of the bacterial cell-envelope serve as central themes. The emphasis is on structure and function of the bacterial cell envelope and its role in bacterial pathogenesis in disesases like peritonitis and tuberculosis and its importance for vaccine development. To teach how theory in the scientific literature and practical Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 43 van 62

approaches in the lab are combined to answer a research question. At the end, the students are able to understand and know: fundamental molecular processes in disease-causing bacteria that are important for growth, functioning and pathogenicity. practical approaches in the molecular microbiology area, immunology, bacterial DNA technology, protein techniques, etc. Level 3: specialisation Course content Theory: Lectures on: biogenesis and functional aspects of the bacterial cell envelope and the structure of its components (proteins and LPS); secretion systems in the bacterial cell envelope; the role of virulence factors in bacterial pathogenesis; the mechanisms with which bacteria escape the human immune system; vaccine development and vaccine target selection. Practical: Students design and perform a research project within the departments that participate in the course. The project involves writing a research proposal, performing the project in the lab and reporting the results in a project symposium (oral presentation with discussion). Form of tuition Lectures series based upon provided literature Research project, with theoretical component (writing research proposal, practical component (laboratory work) and presentation Type of assessment Written exam (50%, minimal mark to succeed is 5) and assesment of the laboratory project (50%), with marks for the research proposal (20%), the laboratory journal (10%) and the presentation (20%) Course reading Reader (ca. 10 Euro) Target group Optional course for Master students in Molecular cell biology / Immunology / Infection / Biomolecular sciences, with a deficiency in the field of molecular microbiology third-year BSc Biology, Biomedical Sciences and Biochemistry Second- and third-year BSc Health and Life Remarks Taught in English when necessary; much direct contact with the professors, associate and assistant professors, PhD's and postdocs.

Neurowetenschappen I * Vakcode

A_HP470199 (450003)

Credits

3.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator


Neurowetenschappen II: Genes and the brain Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 44 van 62

Vakcode

AB_470204 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. H.K.E. Vervaeke

Docent(en)

dr. K.W. Li, prof. dr. S. Spijker, dr. R.E. van Kesteren, prof. dr. M. Verhage, dr. R.F.G. Toonen, prof. dr. A.B. Smit, prof. dr. P. Heutink, dr. P. van Nierop, dr. H.K.E. Vervaeke, dr. H. de Wit, dr. J.J. Koksma

Lesmethode(n)


Doel vak Deze cursus is gericht op het leren begrijpen van de relatie tussen moleculaire en cellulaire processen in het brein en het functioneren van het brein als geheel. De student zal na deze cursus een goed inzicht hebben en vaardigheden bezitten in het van gebruik van moleculaire en celbiologische technieken. Zelfstandig leren werken en een ontplooiingsmogelijkheid bieden voor academisch talent zijn daarbij belangrijke uitgangspunten. Niveau van de cursus: 2, inzoomen op deelgebieden van de neurobiologie, state of the art kennis met betrekking tot lopend wetenschappelijk onderzoek, aanleren van specifieke methoden en technieken; niveau 3: theorievorming op basis van onderzoeksgegevens, aanzet tot specialisatie, leren verwerken van primaire en secundaire wetenschappelijke literatuur. Inhoud vak Aan de hand van theorievorming en secundaire wetenschappelijke literatuur zal een begin gemaakt worden met de integratief neurowetenschappelijke benadering van de moleculaire biologie van ons brein, de cellulaire biologische methodes en de principes van de gedragsgenetica. Aan de hand van een drietal modules zullen studenten vervolgens vaardigheden opdoen en onderzoek leren verrichten. Deze modules zijn: Moleculaire Neurobiologie, gericht op methodiek in de moleculaire neurobiologie Cellulaire Neurobiologie, gericht op functionele analyse en imaging Van Gen naar Gedrag Onderwijsvorm De cursus heeft een sterk experimenteel karakter, er is veel aandacht voor laboratoriumwerk en opzet en verslaglegging van experimenten. Studenten zullen in subgroepen werken aan een aantal experimentele modules. Er worden vier practica aangeboden, waarbij zowel computers als laboratorium faciliteiten worden gebruikt. Toetsvorm Neurowetenschappen II wordt afgesloten met een schriftelijk examen aan het einde van de cursus, welke gecombineerd met drie practicumverslagen die tezamen het eindcijfer van de cursus vormen. De multiple choice-eindtoets telt mee voor 40% en de drie practicumverslagen elk voor 20%. Om te kunnen slagen voor de cursus moet voor ieder van deze onderdelen afzonderlijk een voldoende worden gehaald. Herkansing van alleen de eindtoets is eenmaal per jaar mogelijk, de practicumbeoordelingen worden op individuele basis herkanst bij een Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 45 van 62

volgende cursus. Bij uitzondering zal een vervangende opdracht kunnen worden gegeven. Literatuur Neuroscience, Dale Purves c.s. Sinnauer Associates, Fourth Edition 2008 Vereiste voorkennis Voor studenten Biomedische Wetenschappen geldt als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I (dus een voldoende gehaald). Voor studenten Biologie geldt als ingangseis de cursus Genen, hersenen en gedrag (dus een voldoende gehaald). Bij voldoende capaciteit geldt voor studenten Gezondheid en Leven, die van hun examencommissie toestemming hebben aan de cursus deel te nemen, als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I of Preklinische Neurowetenschappen (dus een voldoende gehaald). Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars (en derdejaars) Bsc Biologie, Biomedische Wetenschappen en Gezondheid en Leven. Het volgen van Neurowetenschappen II is een goede oriëntatie op een eventuele neurowetenschappelijke stage aan de Neuroscience Campus Amsterdam of elders. Tevens is het volgen van Neurowetenschappen II een pré bij de toelating tot de Master of Neurosciences van de VU/VUmc. Meer informatie kunt u verkrijgen via dr. W. Smeets (coördinator Master of Neurosciences) en/of via internet (www.neurosciencecampus-amsterdam.nl; zie Master of Neurosciences). Overige informatie Neurowetenschappen II sluit mooi aan bij Neurowetenschappen III en is daarmee de ideale voorbereiding op een verdere academische specialisatie. Hoewel Neurowetenschappen II een specialisatiecursus is welke op niveau 2 en/of 3 haar onderdelen aanbiedt, is er een redelijke capaciteit aangezien de cursus instituutbreed gedragen zal worden. Door de intensieve begeleiding zal het beoogde werkgroepkarakter behouden blijven. Per jaar kunnen zich maximaal 80 studenten inschrijven voor deze cursus. Voorrang wordt verleend aan tweedejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Cursus is bij voldoende capaciteit wel opengesteld voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen en tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. Studenten van andere richtingen komen alleen in aanmerking als er plaatsen over zijn (en moeten eerst contact opnemen met de docent omtrent ingangseisen). Overigens is er een minimum aantal inschrijvingen van 25 een voorwaarde voor de cursus om door te gaan.

Neurowetenschappen III: monitoring the brain Vakcode

AB_470205 (450003)

Periode

Periode 6

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. H.K.E. Vervaeke

Docent(en)

prof. dr. H.D. Mansvelder, dr. R.O. Stiedl, dr. A. van Ooijen, dr. H.K.E. Vervaeke, dr. J.J. Koksma

Lesmethode(n)



8-6-2012 - Pagina 46 van 62

Doel vak Cursus gericht op het leren begrijpen van het brein, met name op het terrein van 'monitoring the brain'. De student zal na deze cursus goed inzicht hebben en vaardigheden bezitten op het terrein van gedrags- en neurofysiologische technieken en onderzoeksvragen. Tevens wordt het afleiden van zenuwcellen, het monitoren van diergedrag en de theorievorming middels computermodellen gedemonstreerd. Zelfstandig leren werken en een playground bieden voor academisch talent zijn daarbij belangrijke uitgangspunten. Niveau van de cursus: 2, inzoomen op deelgebieden van de neurobiologie, aanleren van specifieke methoden en technieken; niveau 3: theorievorming op basis van onderzoeksgegevens, aanzet tot specialisatie, leren verwerken van primaire en secundaire wetenschappelijke literatuur. Inhoud vak Aan de hand van theorievorming en secundaire wetenschappelijke literatuur zal een begin gemaakt worden met de integratief neurowetenschappelijke benadering van synaptische transmissie, neuronale netwerken en diergedrag. Aan de hand van een drietal experimentele modules zullen studenten vervolgens vaardigheden opdoen en onderzoek leren verrichten. Deze modules zijn: Neuroinformatics, gericht op neuronale netwerken en modelbouw Zintuigfysiologie, gericht op sensorische informatie verwerking Gedragsbiologie, gericht op het leren begrijpen van gedrag van proefdieren Onderwijsvorm Basisstof wordt behandeld in de vorm van hoorcolleges, adhv het tekstboek van Purves en aanvullende literatuur. Het accent in de cursus ligt op het zelf bestuderen van de fysiologie van het brein in een drietal practica. Over een van deze drie onderzoeken maken de studenten een wetenschappelijke poster die gepresenteerd wordt tijdens het postersymposium aan het eind van de cursus. Toetsvorm Neurowetenschappen III wordt afgesloten met een schriftelijk multiple choicetentamen aan het einde van de cursus, dat voor 60% het eindcijfer bepaalt. Naast dit tentamen maken de studenten een poster die voor 40% meetelt en moeten de studenten aan verdere practicumverplichtingen hebben voldaan. Om te kunnen slagen voor de cursus moet voor ieder van deze onderdelen afzonderlijk een voldoende worden gehaald. Herkansing van alleen de eindtoets is eenmaal per jaar mogelijk, de practicum beoordelingen worden op individuele basis herkanst. Literatuur Neuroscience, Dale Purves c.s. Sinnauer Associates, Fourth Edition 2008 Aanbevolen voorkennis Voor studenten Biomedische Wetenschappen geldt als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I (dus een voldoende gehaald). Voor studenten Biologie geldt als ingangseis de cursus Genen, hersenen en gedrag (dus een voldoende gehaald). Bij voldoende capaciteit geldt voor studenten Gezondheid en Leven, die van hun examencommissie toestemming hebben aan de cursus deel te nemen, als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I of Preklinische neurowetenschappen (dus een voldoende gehaald).


8-6-2012 - Pagina 47 van 62

Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars (en derdejaars) Bsc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Het volgen van Neurowetenschappen III is een goede oriëntatie op een eventuele neurowetenschappelijke stage aan de Neuroscience Campus Amsterdam of elders. Tevens is het volgen van Neurowetenschappen III een 'pre' bij de toelating tot de Master of Neurosciences van de VU/VUmc. Meer informatie kunt u verkrijgen via dr. Wil Smeets (coördinator Master of Neurosciences) en/of via www.neurosciencecampus-amsterdam.nl/en/education/master-of-neuroscience. Overige informatie Hoewel Neurowetenschappen III een specialisatiecursus is welke op niveau 2 en/of 3 haar onderdelen aanbiedt, is er een redelijke capaciteit aangezien de cursus instituutbreed gedragen zal worden. Door de intensieve begeleiding zal het beoogde werkgroepkarakter behouden blijven. Per jaar kunnen zich maximaal 80 studenten inschrijven voor deze cursus. Voorrang wordt verleend aan tweedejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen en studenten Gezondheid en Leven. Cursus is bij voldoende capaciteit wel opengesteld voor derdejaars studenten. Studenten van andere richtingen komen alleen in aanmerking als er plaatsen over zijn (en moeten eerste contact opnemen met de docent omtrent ingangseisen). Studenten die geen ingang krijgen in de cursus Neurowetenschappen III wordt gewezen op de mogelijkheid deel te nemen aan de cursus Humane Neurofysiologie van de opleiding Gezondheid en Leven die gelijktijdig wordt aangeboden vanuit dezelfde afdelingen. Overigens is er een minimum aantal inschrijvingen van 25 een voorwaarde voor de cursus om door te gaan.

New Anatomy Vakcode

OH_NA (986010)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit

Onderwijscentrum VU

Coördinator


Oncologie * Vakcode

A_HP470050 ()

Periode

Periode 6

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator


Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen


8-6-2012 - Pagina 48 van 62

de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.

Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij Vakcode

AB_470098 (450003)

Credits

1.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. M.H. Donker

Docent(en)

dr. M.H. Donker

Lesmethode(n)


Doel vak Het onderdeel Oriëntatie op Studie, Loopbaan en Maatschappij heeft tot doel de student na te laten denken over de keuzes die met het afsluiten van de bachelor gemaakt moeten worden. Dat betreft vooral keuzes voor het al dan niet vervolgen van de studie met een masteropleiding, maar, in het verlengde daarvan, ook al keuzes die uiteindelijk gemaakt worden voor een werkkring. Daarbij is het van belang voor de student er achter te komen welke interesses en vaardigheden hij/zij bezit, maar ook welke wensen er bestaan ten aanzien van de mogelijkheden op de arbeidsmarkt. Eindtermen: Op basis van het door de student gemaakte persoonlijk profiel en de individuele en groepsgewijze oriëntatie op de arbeidsmarkt kan de student gemotiveerd kiezen voor een - Onderwerp voor de bachelorstage - Masteropleiding - Specialisatiegebied Niveau 2: verdieping Inhoud vak In kleine werkgroepen wordt met de studenten nagedacht over de vragen: Welke richting moet er gekozen worden in de masterfase? Wat zijn de wensen ten aanzien van het toekomstig beroep? Middels een persoonlijke competentieanalyse, een advertentieanalyse en een netwerkinterview oriënteert de student zich individueel en in een kleine groep op het voor hem of haar meest wenselijke en geschikte vervolgtraject in de masterfase en uiteindelijk op de door hem/haar geambieerde plaats in de maatschappij. Onderwijsvorm Plenair 2 introductiecolleges (eind januari en eind maart 2010) Dit college wordt gevolgd door; 2; werkgroepbijeenkomsten in april, die vooral gericht zijn op de keuze voor het vakgebied en onderwerp van de bachelorstage. In mei en juni zijn 2 werkgroepbijeenkomsten waarin de student zich via o. a. een advertentieanalyse en een netwerkinterview oriënteert op de arbeidsmarkt. Tijdens de bachelorstage in het 3e studiejaar vinden twee terugkombijeenkomsten plaats, gericht op het uitwisselen van ervaringen bij de stage en de keuze van de master. De stage wordt afgesloten met Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 49 van 62

een 3e terugkomdag waarin het gedane onderzoek wordt gepresenteerd door middel van een poster. Literatuur Opdrachten en achtergrondinformatie via de Blackboardsite Doelgroep Tweede- en derdejaars BSc Biologie, Biomedische Wetenschappen en Gezondheidswetenschappen. Overige informatie Verplichte cursus.

Oriëntatie science educatie Vakcode

O_ORIBETA (991010)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Nederlands

Coördinator

ir. J.G. Schoonhoven

Doel vak Voor een student die deze cursus heeft doorlopen geldt: de student is bereid en in staat te reflecteren op zijn/haar functioneren, de student is in staat om aan te geven wat het betekent om een goede docent in de bovenbouw te zijn, de student is in staat om zijn eigen geschiktheid voor het beroep van docent te beoordelen, de student kan aangeven of het beroep van docent iets voor hem/haar is, de student verwerft een aantal communicatieve en didactische vaardigheden.

Inhoud vak De cursus bestaat de eerste week uit diverse werkcolleges, de volgende drie weken uit een stage op een school voor voortgezet onderwijs. elke week is er een praktijkbespreking en verdieping op de VU. De stage is het belangrijkste onderdeel van de cursus, deze voer je uit samen met een medestudent. In totaal zal de stage ongeveer twaalf dagen in beslag nemen. Tijdens de werkcolleges komen de volgende onderwerpen aan de orde: Hoe bouw je een presentatie op, hoe kom je over. Hoe vertaal je (wetenschappelijke) informatie naar het niveau van je doelgroep. Wat doet een (goede) leraar allemaal. Wat is het verschil tussen presenteren en onderwijzen. Welke kenmerken heeft de doelgroep en hoe kun je daar rekening mee houden. Hoe ontwerp je een (activerende) les. Hoe krijg je je doelgroep actief. Met welke communicatieve aspecten in de klas moet je rekening houden. Tijdens de stage onderneem je de volgende activiteiten: observeren van lessen; zelf minimaal vier lessen geven, in zowel onderbouw als bovenbouw; uitvoeren van een klein onderzoek;


8-6-2012 - Pagina 50 van 62

zo veel mogelijk deelnemen aan alle activiteiten op school en zo (hernieuwd) kennis maken met het voortgezet onderwijs vanuit het docenten perspectief.

Onderwijsvorm Je levert aan het eind van de cursus een verslag in. Het verslag is een samenhangend verhaal dat een beeld geeft van jouw leerproces tijdens de cursus. Met je verslag laat je zien waar je staat als mogelijk toekomstig docent. Het gaat primair om het zichtbaar maken van je ontwikkeling, niet noodzakelijk om te bewijzen dat je een goede docent bent. Werkcolleges en stage vormen samen een voltijds programma, het is niet mogelijk gelijktijdig andere colleges te volgen. Doelgroep Deelname aan de cursus staat open voor derdejaars bachelorstudenten van de faculteiten Exacte Wetenschappen en Aard- en Levenswetenschappen. De cursus wordt aangeraden voor studenten die overwegen de lerarenopleiding te gaan volgen binnen de masteropleiding (E- variant) of aansluitend op hun masteropleiding. Ook voor studenten die vaardigheden op willen doen in het verzorgen van wetenschappelijke presentaties is de cursus interessant. Overige informatie Meer informatie is te verkrijgbaar bij Arjan Schooonhoven: a.schoonhoven@ond. vu. nl, of te vinden op www.onderwijscentrum.vu.nl

Pathologie * Vakcode

A_HP470042 (450003)

Credits

3.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator


Regulatie en afweer bij dieren Vakcode

AB_470202 (450003)

Periode

Periode 4

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. J.M. Koene

Docent(en)

dr. R.F. Jansen, prof. dr. N.M. van Straalen, dr. R.O. Stiedl, dr. J.M. Koene

Lesmethode(n)


Doel vak Inzicht geven in fysiologische en immunologische principes van homeostase van het interne milieu bij dieren, inzicht in de evolutionaire samenhang van de mechanismen van regulatie en afweer, vaardigheden bijbrengen die nodig zijn voor het uitvoeren van experimenten met levende dieren en voor de interpretatie van Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 51 van 62

histologische preparaten van dierlijke weefsels, in het bijzonder gericht op verstoringen door infecties en parasitisme, inzicht in experimenteel ontwerp en wetenschappelijke rapportage. Eindtermen: 1. De student heeft kennis en inzicht in de volgende onderwerpen uit de dierfysiologie: Dierlijke respiratie in lucht en water Circulatie, transport van zuurstof en kooldioxide Aanpassing aan temperatuurextremen Osomoregulatie en excretie Bewegingsfysiologie Diversiteit aan parasieten, afweerreacties Immunologische verdediging Experimentele aanpak Interpretatie en presentatie van gegevens 2. De student kan zijn standpunt ten aanzien van dierproeven in het openbaar toelichten en verdedigen 3. De student bezit vaardigheden nodig voor het werken met levende dieren en het doen van fysiologische waarnemingen en bepalingen 3. De student kan histologische preparaten van organen betrokken bij afweer en regulatie, alsmede preparaten van parasitaire wormen interpreteren en zelf weergeven 4. De student kan zelfstandig hypotheses ontwikkelen over de werking van homeostatische systemen in dieren, deze toetsen in experimenten en daarover mondeling en schriftelijk verslag uitbrengen Niveau 2: verdieping Inhoud vak In het eerste gedeelte van de cursus worden een aantal fundamentele onderwerpen uit de dierfysiologie behandeld zoals: Respiratie in lucht en water, circulatie, transport van zuurstof en kooldioxide, aanpassing aan temperatuurextremen, osmoregulatie en excretie, bewegingsfysiologie, energieverwerking en voeding. Het tweede gedeelte van de cursus behandelt de mechanismen die door dieren ingezet worden om weerstand te bieden aan bedreigingen in de vorm van toxische stoffen, infecties en parasieten. Daarbij wordt ingegaan op de volgende onderwerpen: Diversiteit aan stoffen die giftig zijn voor dieren, toxicologische verdedigingsmechanismen, biotransformatie, diversiteit aan parasieten, afweerreacties en immunologische verdediging. Daarnaast bevat de cursus een hoeveelheid theorie op het gebied van de statistiek, toegepast op de resultaten die in experimenten verkregen zijn. De practica behandelen onderwerpen als de hartslag van Lymnaea o. i. v. temperatuur, osmoregulatie bij littorale Crustacea, het energiebudget van Lymnaea, effecten van stress op coelomocyten bij regenwormen, histologie van parasieten, histologie van de lymfeknoop. Tevens wordt door middel van een forumdiscussie met uitgenodigde experts van buiten invulling gegeven aan meningsvorming omtrent dierproeven. Onderwijsvorm Colleges (± 40 uur), fysiologische practica (± 40 uur), histologische practica (± 24 uur), statistiekpractica, forum, excursie, presentaties en verslag. Enkele colleges zullen in het Engels gegeven worden. Toetsvorm Drie deeltoetsen, elk 26,6% van het eindcijfer, verslag en presentatie (20%)


8-6-2012 - Pagina 52 van 62

Literatuur R.W. Hill, G.A. Wyse, & M. Anderson (2008) Animal Physiology. Second Edition. Sinauer Associates, Sunderland, ISBN 978-0-87893-317-4 (nieuwe uitgave, prijs ±; 70 euro), practicumhandleiding Aanbevolen voorkennis Genen, hersenen en gedrag (AB_470176, eerste jaar Biologie) Doelgroep Verplicht voor tweedejaars BSc Biologie

Religion, Identity, Conflict Vakcode

OH_RIC (986001)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


Structuurbiologie Vakcode

AB_470056 (450003)

Periode

Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. D. Bald

Docent(en)

dr. D. Bald

Lesmethode(n)


Doel vak Kennis van structuur, functie en remming van eiwitten, met name methodes waarmee je deze eigenschappen kunt bestuderen. Je kunt deze kennis later gebruiken als je b.v. het moleculaire mechanisme van een ziekte (eiwit misfunctie) of de werkwijze van medicijnen (remming van een eiwit) wilt verhelderen, maar ook voor biotechnische toepassingen of voor fundamenteel onderzoek. Eindtermen De student kent: Grondslagen/toepassingen van eiwit expressie, zuivering, structuur functie, remming, werking van antibiotica. De student kan: eiwit-biochemische methodes toepassen (eiwit expressie, affiniteits-chromatografie, spectrofotometrie, fluorescentie, eiwit-labelling methodes, gel-electroforese, activiteitbepalingen). Niveau 2: verdieping Inhoud vak Wij beginnen met een repetitie/overzicht van eiwit structuur en functie. Vervolgens gaan wij met practica aangevuld door colleges, computer sessies en zelfstudie aan de slag en behandelen beginselen/methodes/technieken die je voor welk eiwit dan ook kunt gebruiken zoals: Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 53 van 62

Hoe kan je een eiwit met behulp van bacteriën produceren? Hoe kan je een eiwit zuiveren? Hoe kan je structuur en functie van een eiwit onderzoeken? Hoe werken antibiotica als enzym remmers? Hoe kan ik een experimentele strategie plannen? Welke factoren zijn belangrijk voor het slagen van mijn experiment? Onderwijsvorm Je doet zelf experimenten in kleine groepen (2- 4 studenten) op het Structuurbiologie lab samen met begeleider (50 uur), aangevuld door hoorcolleges (15 uur), computersessies en zelfstudie. In groepjes schrijf je een verslag en houd je een praatje over de experimenten. Toetsvorm Verslag (50 %), voordracht (50 %) Literatuur CD met collegestof en practicumhandleiding Aanbevolen voorkennis Cursussen Biologische chemie en Biochemie Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars Bsc Biologie, Biomedische wetenschappen en Gezondheid en Leven. De cursus staat open voor studenten van andere opleidingen en wordt aanbevolen voor Masterstudenten Biomolecular Sciences en andere Masterstudenten die praktische waardigheden willen bijspijkeren. Overige informatie Bij het experimentele gedeelte is het dragen van een laboratoriumjas verplicht. Maximum aantal deelnemers 40. Voorrang wordt verleend aan BSc studenten Biomedische Wetenschappen en Biologie. De colleges worden in het Engels gegeven, de andere onderdelen (practicum, verslag, voordracht) zijn in het Nederlands.

Systeemecologie Vakcode

AB_470044 (450003)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

prof. dr. J. Rozema

Docent(en)

prof. dr. J. Rozema, prof. dr. M.A.P.A. Aerts, ing. L. Leewis MSc

Lesmethode(n)

Hoorcollege, Practicum

Inhoud vak Theorie (ochtenden week 1 en 2): Behandeling van leerstof uit Leerboek Principles of Terrestrial Ecosystem Ecology door middel van hoorcolleges en een handleiding. Onderwerpen: Het ecosysteemconcept, het systeem klimaat aarde, geologie en bodem, water in terrestrische ecosystemen en de energiebalans, koolstofbalans van terrestrische ecosystemen, primaire productie,


8-6-2012 - Pagina 54 van 62

decompositie, nutriëntengebruik, kringlopen van voedingsstoffen, globale stofkringlopen, trofische relaties, ecosyteemdynamica in ruimte en tijd, en beheer van natuurgebieden. Veldpracticum; (middagen week 1 en 2, week 3): Verrichten van veldecologisch en laboratoriumonderzoeknaar de gevolgen van opwarming van ecosystemen van duinvalleien en van de arctische toendra; onderzoek over aanpassingen van kustplanten Onderwijsvorm Hoor- en werkcolleges leerboek (ochtenden week 1 en 2); veld- en laboratoriumonderzoek middagen week 1 en 2, week 3; verslaglegging en studiepauze week 4. Hoorcolleges over leerboek Principles of Terrestrial Ecosystem Ecology Literatuur F. Stuart Chapin III, P.A. Matson en H.A. Mooney. 2002. Principles of Terrestrial Ecosystem Ecology. Springer (64. 00 euro); en een cursushandleiding (7, 50 euro) Aanbevolen voorkennis Alle voorgaande oecologische cursussen. Doelgroep Keuzevak voor derdejaars Bsc Biologie en Milieuwetenschappen. Overige informatie Ter info: er is in het studiejaar 2010 - 2011 geen excursieweek Ecosystemen Ardennen (zie ook announcement op de Blackboardsite).

The Roman Empire Vakcode

OH_TRE ()

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator


The use of statistics in legal court cases Vakcode

OH-SLC ()

Credits

6.0

Faculteit

Onderwijscentrum VU

Coördinator

prof. dr. R.W.J. Meester

Theories of Consciousness Vakcode

OH_TOC (986002)

Periode

Periode 1

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Coördinator



8-6-2012 - Pagina 55 van 62

Trends in plantenwetenschappen Vakcode

AB_470213 (450003)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. ir. A.H. de Boer

Docent(en)

dr. ir. A.H. de Boer, dr. H. Schat, dr. ing. E.J. Souer

Lesmethode(n)


Doel vak Deze cursus is er op gericht om de studenten kennis te laten maken met moderne ontwikkelingen in de plantenbiologie. Een aantal recente review artikelen worden bestudeerd, gepresenteerd voor de groep en daarna besproken. Daarnaast maken de studenten een analyse/review van een aantal aanverwante artikelen, over een onderwerp waar nog geen consensus over bestaat. Naast een verdieping van een aantal geselecteerde theoretische onderwerpen, worden ook technische ontwikkelingen behandeld. Voor zover mogelijk zal er ook ruimte zijn om een aantal technieken zelf uit te voeren in het laboratorium. Belangrijk in deze cursus is dat de student de theorie leert te koppelen aan experimentele vaardigheden. Aan het eind van de cursus heeft de student inzicht in een aantal hot-spots in het plantenonderzoek. Tevens is hij/zij in staat om zelf een aantal geavanceerde technieken toe te passen en op hun waarde te beoordelen. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De cursus omvat werkcolleges/presentaties en practica in de laboratoria van de diverse plantengroepen. Er zal een selectie gemaakt worden uit de nieuwe theoretische inzichten. De onderwerpen varieren van jaar tot jaar. Voorbeelden zijn: plantenreceptoren, uniek voor planten? gene targeting, is homologe recombinatie in planten nabij? plant VOC (volatile organic carbon) emissions toepassingen in de plantenbiotechnologie planten modelsystemen targeting van membraaneiwitten nitric oxide (NO), het nieuwe signaal molecuul hydrotropisme. Voorbeelden van methodes/technieken die aan de orde kunnen komen: transiente expressie systemen, hoe werkt het en wat kun je ermee hoe gaat een transformatie met Agrobacterium in de praktijk? hoe kun je een transgen in een gewas volgen de AFLP techniek electrofysiologische technieken om iontransport te meten toepassing van green fluorescent protein hoe gaat een mutantenscreen in de praktijk? analyse van eiwit complexen met `pull-down', TAP-tag expressie of yeast two-hybrid. Onderwijsvorm


8-6-2012 - Pagina 56 van 62

Geselecteerde onderwerpen worden aan de hand van review artikelen bestudeerd en in werkgroep verband geanalyseerd. Studenten kiezen een eigen onderwerp om uit te diepen en te presenteren. Het boek Taiz & Zeiger dient als naslagwerk. Voor het practische gedeelte werken de studenten in tweetallen aan een aantal experimenten. Eigen inbreng en initiatief bij de opzet en uitvoering van de experimenten zal voorop staan. Resultaten worden gepresenteerd en in een verslag uitgewerkt. Deelname aan de practica inclusief voor- en nabespreking werkcolleges is verplicht. Toetsvorm Beoordeling geschiedt aan de hand van een schriftelijke toets over theoretische stof en practicumonderwerpen, de presentaties en het verslag over de uitgevoerde proeven. Gewicht van afzonderlijke toetsonderdelen wordt aan het begin van de cursus bekendgemaakt. Literatuur Geselecteerde artikelen, powerpoint presentaties, en het boek Taiz, L. & Zeiger, E. Plant Physiology 4th edition (2006) uit het 1e en 2e jaar als naslagboek. Vereiste voorkennis Cursus Van gen tot gewas Doelgroep Keuzecursus voor BSc Biologie Overige informatie Bij het experimentele gedeelte is het dragen van een laboratoriumjas verplicht.

Uitbreiding bachelorthesis Vakcode

A_HP-I-3 ()

Periode

Semester 2

Credits

3.0

Faculteit


Coördinator


Van gen tot gewas Vakcode

AB_470200 (450003)

Periode

Periode 1

Credits

12.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

dr. ir. A.H. de Boer

Docent(en)

dr. ir. A.H. de Boer, prof. dr. J.T. de Cock Buning, A. Roelofsen

Lesmethode(n)



8-6-2012 - Pagina 57 van 62

Doel vak Middels theorie en praktijk inzicht geven in de fysiologie van planten. Daarbij gaat het zowel om alle basale processen die voor groei en ontwikkeling nodig zijn, alsmede om de wijze waarop de plant communiceert met zijn omgeving, biotisch en abiotisch. Tevens beoogt de cursus inzicht te geven in maatschappelijke ontwikkelingen waarin 'het gewas' centraal staat. Er wordt ingegaan op de beleids- en juridische aspecten van discussies rondom genetisch gemodificeerde organismen, de opkomst van bio-energie en farmagewassen. Eindtermen: De student kan: De onderdelen waaruit een plant en zijn cellen is opgebouwd benoemen. De wijze waarop en de moleculaire mechanismen waarmee een plant water en ionen opneemt, transporteert en gebruikt beschrijven. De licht- en koolstofreacties van de fotosynthese benoemen en een aantal aanpassingen aan specifieke omstandigheden benoemen en uitleggen. Beschrijven hoe de plant zich beschermt tegen vraat en pathogene organismen. Heeft inzicht in de moleculaire mechanismen die de groei, ontwikkeling en bloei van de plant bepalen en kan beschrijven hoe licht en hormonen deze processen beïnvloeden. Beschrijven hoe een plant zich aan kan passen aan abiotische stress in zijn leefmilieu. Beschrijven hoe men een transgene plant maakt en de diverse maatschappelijk aspecten van genetisch gemodificeerde organismen (GMOs) beschrijven. Verwerven van kennis van en inzicht in: De historische ontwikkeling van gewassen als bio-socioeconomische producten. Maatschappelijke, juridische en wetenschappelijke discussie over landbouw en natuur. Beleidsprocessen, actor analyse, strategisch gedrag van belangengroeperingen en beleidsanalyse. Managementprocessen, en -theorieën, met specifieke aandacht voor projectmanagement. Het toepassen van verkregen kennis en inzicht door: Het in de praktijk oefenen met het analyseren van gewas- en/of natuurbeleid en het identificeren van beleidsopties. Het opdoen van leerervaringen ten aanzien van projectmatig werken in teamverband. Het toepassen van enkele praktische vaardigheden, zoals onderzoeksopzet maken, literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk en mondeling presenteren. Inhoud vak De cursus richt zich op alle aspecten van de moderne plantenfysiologie. Hierbij komen aan de orde: transport van water, ionen en suikers, de fotosynthese, ontwikkeling en bloei, de rol van hormonen, licht en adaptatie aan biotische (insecten, schimmels) en abiotische (droogte, zout) stress. Alle processen worden behandeld op diverse niveaus: de hele plant, de cel en de moleculen (genen, eiwitten etc.). Daarnaast is er aandacht voor de historische lijn van gewasontwikkeling, de discussie omtrent transgene gewassen, de relatie tussen klimaatverandering en de plant als energiebron en de introductie van zogenaamde farmagewassen. De laatste twee weken van de cursus bestaat uit een projectopdracht waarin de analyse van een actueel, maatschappelijk biologisch vraagstuk (gerelateerd aan de thema's in het eerste deel van de cursus) in relatie tot het (overheids)beleid centraal staat. De aard van de Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2010-2011

8-6-2012 - Pagina 58 van 62

problematiek, de betrokken actoren en de verschillende beleidsopties rond dit vraagstuk worden kritisch geanalyseerd. De resultaten, conclusies en aanbevelingen worden vormgegeven in een voorstel voor een beleidsondersteunend onderzoeksproject dat aan het eind van de cursus mondeling gepresenteerd wordt. Onderwijsvorm De eerste zes weken van de cursus bestaan uit colleges en practica, de laatste twee weken uit het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband. Hoorcolleges (ca 50 uur), practica en computerpracticum (ca 54 uur), excursie (6 uur), project (ca. 70 uur). Deelname aan practica, computerpractica, excursie en projectwerkgroepen is verplicht. Toetsvorm Alle praktische delen zijn verplicht; geen cijfer wordt gegeven als de praktische onderdelen niet gevolgd zijn. Het eindcijfer wordt bepaald door: Tentamen (in twee delen) over de behandelde collegestof: 60%. Uitvoering en verslag van practica: 15% Rapport en presentatie van de projectopdracht: 25%. Een individuele beoordeling van de projectopdracht vindt plaats op basis van individuele producten, het functioneren in de projectgroep en de beoordeling van groepsproducten. Alle drie onderdelen dienen met een voldoende te worden afgesloten. Literatuur Het volgende leerboek is verplicht: Plant Physiology 5e druk, Eds. Taiz & Zeiger (ISBN 978-0-87893-866-7); prijs 85 euro. Daarnaast is er een practicumhandleiding, te verkrijgen bij aanvang cursus (5 euro). Doelgroep Verplichte cursus voor tweedejaars BSc Biologie

Voorspellen en analyseren in de biologie Vakcode

AB_470212 (450003)

Periode

Periode 3, Periode 5

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

drs. P. Vos

Docent(en)

dr. ir. B.W. Kooi, H.R. Zoomer, drs. P. Vos

Lesmethode(n)


Doel vak Introductie van basiskennis en -technieken, nodig voor het op juiste wijze en plaats kunnen gebruiken van modelbouw en statistische analyse in de biologische wetenschappen. Aan de hand van een caleidoscopische reeks voorbeelden wordt een wiskundige basis gelegd voor modelbouw en statistiek, er wordt kennis opgedaan en vaardigheden geleerd die nodig zijn voor het opstellen en gebruiken van simpele modellen voor de beschrijving van biologische processen en systemen en voor het zelfstandig uitvoeren van statistische


8-6-2012 - Pagina 59 van 62

analyses van eenvoudige datasets, onder andere gericht op empirische verificatie van theoretische modellen. Onderweg wordt kennis gemaakt met software voor rekenen (Excel), modelbouw (Stella) en statistiek (SPSS). De student is aan het eind van deze cursus in staat uit te leggen wat de functie en mogelijkheden zijn van gebruik van wiskundige modellen bij onderzoek in de biologie, wat de de theoretische achtergrond is bij de in de cursus behandelde statistische technieken De student kan de juiste statistische analyses beredeneren op eenvoudige datasets en gegeven een experimental design, deze analyses zelfstandig uitvoeren (in Excel en/of SPSS) en de resultaten c.q. computeroutput juist interpreteren en rapporteren, e.e.a. mede gebaseerd op een conceptueel begrip, kleine modellen van metabole processen en biologische systemen zoals ecosystemen gebruiken en opstellen (Stella), kleine op onderzoek georiënteerde projecten uitvoeren en daarin het gebruik van modellen en statistiek een juiste plaats en uitvoering weten te geven Inhoud vak Opfrissen van middelbare-schoolwiskunde: differentiëren en primitiveren; integralen en primitieven; product-, quotiënt- en kettingregel; polynoom-, alsook exponentiële en logaritmische functies Opfrissen statistiek van de cursus Methodologie en Onderzoek in de Biologie: populaties en steekproeven; typen variabelen en beschrijvende statistiek; kansrekening; kansverdelingen; basale onderzoeksdesigns; schatten en betrouwbaarheidsintervallen Kleinste kwadraten versus maximum likelihood Inverse functies: e-machten, parabolen, hyperbolen Eenvoudige differentiaalvergelijkingen Gemiddelde van een functie, oppervlaktes, lokale benaderingen Principes van statistische toetsing Ontwerp van experimenten en de relatie met statistische techniek Analyse van categoriale data: toetsen voor proporties en verschil in proporties (binomiale toets, z-toets, x2-toets), goodness-of-fit en samenhang (x2-toetsen) Analyse van kwantitatieve gegevens: toetsen voor gemiddelden en verschilen in gemiddelden (één- en twee-steekproeven t-toets, gepaarde t-toets, ANOVA Correlatie en regressieanalyse, goodness-of-fit voor theoretische modellen (F-toets) Onderwijsvorm Hoorcolleges Werkcolleges Computerpractica met zowel Excel, SPSS en Stella Zelfstudie Projecten waarin modelbouw en statistiek zelfstanding moeten worden toegepast. Mondelinge presentaties en/of schriftelijk verslag Toetsvorm Projectverslag (20%) Computertoets (30%) Tentamen (50%) Voor elk onderdeel dient minimaal een 5 te worden behaald.


8-6-2012 - Pagina 60 van 62

Literatuur Brigitte Baldi & David S. Moore (2009). The Practice of Statistics in the Life Sciences. W.H. Freeman and Company, New York. ISBN 1-42921876-2 (prijs ongeveer 60 euro) Syllabus en practicumhandleiding Modelbouw (prijs samen ongeveer 13 Euro) Overige informatie Let op: in 2010 - 2011 wordt de cursus in periode 5 alleen aangeboden voor de eerstejaars BSc Biologie; in periode 3 alleen voor tweedejaars BSc Biologie.

Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers Vakcode

AB_470185 (450003)

Periode

Periode 4

Credits

6.0

Voertaal

Engels

Faculteit


Coördinator

R.C. van Koten MSc

Docent(en)

prof. dr. J.E.W. Broerse, R.C. van Koten MSc, dr. M.J.W. Bos

Lesmethode(n)


Doel vak Verwerven van kennis en inzicht in de verschillende modellen van wetenschapscommunicatie (deficiet, context, interactie en participatie), haar parameters en gebruikelijke applicatiedomeinen. Verwerven van kennis en inzicht van de beperkingen en mogelijkheden van de verschillende media waarin de modellen tot uitdrukking kunnen komen (journalistiek, TV en film, het Internet, musea en science centra). Verkrijgen van vaardigheid in het ontwerpen van een doelgroepgerichte communicatie Het opdoen van leerervaring met het werken in een multidisciplinaire groep Inhoud vak Wetenschap heeft verstrekkende gevolgen voor de maatschappij (bv. ICT, biotechnologie, nanotechnologie, farmacie). Maar hoe kijkt de maatschappij eigenlijk naar wetenschappelijke ontwikkelingen? Wat vindt de industrie van wat we uitgevonden hebben en wat denken andere wetenschappers van onze kennis? De visie van deze mensen over ons en ons werk is van groot belang voor de richting die het onderzoek in de nabije toekomst gaat nemen. Daarom is communicatie over wetenschap van cruciaal belang. In deze cursus raak je vertrouwt met een aantal modellen van wetenschapscommunicatie, het herkennen van hun toepassingen in de praktijk en de verschillende soorten publiek die men ermee kan aanspreken (populariseren voor leken, informatieoverdracht voor de industrie, faciliteren van interdisciplinair onderzoek in de wetenschap). Door middel van opdrachten raak je bekend met de praktische kant van wetenschapscommunicatie, bijvoorbeeld wetenschapsjournalistiek, voorlichting, etc. De opdrachten worden deels individueel uitgevoerd en deels in een multidisciplinaire groep.


8-6-2012 - Pagina 61 van 62

Onderwijsvorm Colleges, opdracht, zelfstudie Literatuur (Online) syllabus Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Biomedische Wetenschappen en Biologie. Speciaal aanbevolen voor studenten die overwegen de C- variant (wetenschapscommunicatie) in hun masterprogramma op te nemen. Overige informatie Voor meer informatie: [email protected]


8-6-2012 - Pagina 62 van 62

Biologie BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie

Recommend Documents