Biologie BSc Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
I
De opleiding Biologie richt zich op de bestudering van alle verschijningsvormen van leven en natuur en de processen die zich daarbinnen afspelen, op het doen van wetenschappelijk onderzoek hiernaar en op de toepassing van de zo verworven kennis. De opleiding wordt gekenmerkt door het aanbieden van algemene kennis op alle in de biologie te onderscheiden organisatieniveaus (van molecuul tot ecosysteem) en daaropvolgend een specialisatie in één der subdisciplines van de biologie: moleculaire biologie, ontwikkelingsbiologie, neurobiologie, ecologie, bio-informatica, wetenschapscommunicatie, en beleid, management en ondernemen. Studenten volgen eerst een brede bacheloropleiding van drie jaar, daarna stromen ze door naar een meer gespecialiseerde masteropleiding. Met de opleiding wordt beoogd zodanige kennis, vaardigheid en inzicht bij te brengen op het gebied van de biologie dat de afgestudeerde in aanmerking kan komen voor een algemene, brede of specialistische masteropleiding in de biologie. Dit kan een onderzoeksrichting zijn, maar ook een opleiding op het gebied van Communicatie en Educatie of een meer maatschappijgerichte opleiding. Eveneens is het essentieel dat de afgestudeerde zich bekwaamd heeft in het verantwoord kiezen in wetenschappelijke problematieken. Om deze doelstellingen te bereiken is in de eerste plaats een brede biologische basisopleiding nodig met daarin ook aandacht voor algemene academische vorming. Daarnaast is het noodzakelijk dat de student gedurende enige tijd actief deelneemt aan het biologisch onderzoek. Het jaarschema 2011 - 2012 is te vinden op de FALW-website. Meer opleidingsinformatie is te vinden op de de FALW-website. Een complete beschrijving van deze opleiding is te vinden in de Onderwijs- en Examenregeling op de FALW-website.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
II
Inhoudsopgave
Honours Programme Biologie Facultaire deel Honours programma
1 1
Stervariant cursussen Health & Life Sc.
1
Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen
1
Faculteitsoverstijgend deel HP
2
Interdepartmental Honours Courses
2
Vervallen vakken bacheloropleidingen FALW
3
Bsc Biologie, jaar 1
5
Bsc Biologie, jaar 2
6
Bsc Biologie, jaar 2, keuzevakken
6
Bsc Biologie, jaar 2, verplichte vakken
6
Bsc Biologie, jaar 3 FALW-minoren voor Biologiestudenten
7 7
Minor Biomedical and Health Intervent.
7
Minor Biomolecular and Neurosc. track NS
8
Minor Biomolecular and Neurosc. track BS
8
Minor Brain and Mind
8
Minor Evolutionary Biology and Ecology
9
Minor Topics in Biomedical Sciences
9
Bsc Biologie, jaar 3, verplichte vakken
9
Extern (buiten de VU) behaalde vakken op BSc-niveau
10
Vak: Algemene vaardigheden en encyclopedie
10
Vak: Allergieën en autoimmuunziekten
11
Vak: Allergy and Autoimmunity
13
Vak: Analyseren van biologisch onderzoek
14
Vak: Bachelorstage Biologie
16
Vak: Bedreiging en bescherming II
17
Vak: Beheer en beleid in de gezondheidswetenschappen
18
Vak: Biochemical Regulation in Health and Disease
20
Vak: Biochemie
21
Vak: Biochemistry of Diseases
22
Vak: Bioinformatica
23
Vak: Bioinformatica *
25
Vak: Biomedisch beleid & kennismanagement
25
Vak: Biotechnologie en maatschappelijke dynamiek
27
Vak: Brain and Behavior
28
Vak: Climate Change
28
Vak: Clinical Trials and Health Care
29
Vak: Cognitive Neuroscience
30
Vak: Communicatietheorie en gezondheid
31
Vak: Current Issues in Psychopathology
32
Vak: Cyclus van het leven
32
Vak: De microbiële cel
34
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
III
Vak: Drugs en verslaving
35
Vak: Dynamiek van het historische landschap
36
Vak: Ecologie, mens en natuur
37
Vak: Ecologie, mens en natuur I
39
Vak: Ecologie, mens en natuur II
40
Vak: Ecotoxicologie
42
Vak: Educating for the good life
43
Vak: Environmental Toxicology
43
Vak: Ergonomie
44
Vak: Evolutie en diversiteit van leven
46
Vak: Evolutie van de mens
48
Vak: Evolution and Human Behavior
49
Vak: Evolutionaire ecologie en gedrag
49
Vak: Evolutionaire genetica
51
Vak: Evolutionaire genetica *
52
Vak: Evolutionary Genetics
52
Vak: Experimental Cell Biology I
54
Vak: Experimental Cell Biology II
55
Vak: Experimental Immunology
55
Vak: Experimentele immunologie
56
Vak: Farmacologie en medicijnontwikkeling
57
Vak: Five O’Clock Neurosciences (Honours)
59
Vak: From Protein to Cell
60
Vak: Future Challenges in Global Health
61
Vak: Future Entrepreneur
63
Vak: Genen, hersenen en gedrag
63
Vak: Geschiedenis van de levenswetenschappen
64
Vak: Gezondheid in grootstedelijke gebieden
65
Vak: Gezondheidsrecht
66
Vak: Global change
67
Vak: God-Man-World
67
Vak: Governing Security
68
Vak: Health and Psychosocial Factors
68
Vak: Histologie, pathologie en toxicologie
68
Vak: Honours course: Communication and Innovation in Health and Life Sciences
68
Vak: Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces
69
Vak: Honours Individueel Vak
70
Vak: Honours Leadership
70
Vak: How to survive 2050
71
Vak: HP AUC: Programming your World
71
Vak: HP UvA: Carte Blanche
71
Vak: HP UvA: Creativiteit
71
Vak: HP UvA: Governance of Aquatic
71
Vak: HP UvA: Intelligence Studies
71
Vak: HP UvA: Labyrint
72
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
IV
Vak: HP UvA: Learning Lab
72
Vak: HP UvA: Love
72
Vak: HP UvA: Master of Suspicion
72
Vak: HP UvA: wereldliteratuur
72
Vak: Human Evolution
72
Vak: Humane anatomie en fysiologie
74
Vak: Humane Anatomie en Fysiologie *
76
Vak: Humane genetica
76
Vak: Humane neurofysiologie
78
Vak: Humane ontwikkeling *
79
Vak: Illness-Image-Metaphor
79
Vak: Immunologie
80
Vak: Impact of an Empire
80
Vak: Individueel werk
80
Vak: Individueel werk ALW
80
Vak: Individueel werk ALW
80
Vak: Individueel werk ALW
81
Vak: Individuele onderwijsmodule
81
Vak: Infectieziekten en vaccinontwikkeling
81
Vak: Infectious Diseases and Vaccine Development
83
Vak: Inleiding mineralogie
84
Vak: Integratieve tumorcelbiologie
85
Vak: Interculturalisatie van de zorg
86
Vak: Key Strategies in Disability and Neuropathy
88
Vak: Kust en mariene ecosystemen
89
Vak: Levensvragen en wetenschap
91
Vak: Life and Work
92
Vak: Management en beleid in de gezondheidszorg
93
Vak: Mechanisms of Brain Diseases
94
Vak: Medische farmacologie
95
Vak: Mens en evolutie (G&L)
97
Vak: Methodologie en onderzoek in de biologie
98
Vak: Methodologie en statistiek I
99
Vak: Microbiologie
100
Vak: Mind and Machine
101
Vak: Moleculaire celbiologie
101
Vak: Moleculaire ontwikkelingsbiologie
102
Vak: Moleculaire ontwikkelingsbiologie *
104
Vak: Molecular Cell Biology
105
Vak: Molecular Microbiology
106
Vak: Molecular Principles of Brain Disorders
107
Vak: Multimedia
108
Vak: Nature versus Nurture
109
Vak: Natuur, leven en techniek I
110
Vak: Natuur, leven en techniek II
110
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
V
Vak: Neuronal Networks and Behavior
111
Vak: Neuronale en hormonale regulatie II
112
Vak: Neuronale en psychische pathologie
113
Vak: Neurowetenschappen I
114
Vak: Neurowetenschappen I *
115
Vak: Neurowetenschappen II: Genes and the brain
115
Vak: Neurowetenschappen III: monitoring the brain
117
Vak: New Anatomy
119
Vak: Oncologie *
119
Vak: Ontwikkeling en voortplanting van de mens
120
Vak: Oriëntatie op onderzoek
120
Vak: Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij
121
Vak: Paleontologie
122
Vak: Pathologie
123
Vak: Pathologie *
124
Vak: Power and Change
125
Vak: Preklinische neurowetenschappen stervariant
125
Vak: Regulatie en afweer bij dieren
125
Vak: Religion, Identity, Conflict
126
Vak: Ruimtelijke beeldvorming
127
Vak: Seksualiteit en gezondheid
127
Vak: Sport, beweging en gezondheid
129
Vak: Stervariant gezondheidseconomie
130
Vak: Structuurbiologie
130
Vak: Systeemecologie
132
Vak: Systems Ecology
132
Vak: Tailoring Medicine and Telemedicine
134
Vak: The Adaptive Brain
136
Vak: The Developing Brain
136
Vak: The Roman Empire
137
Vak: The use of statistics in legal court cases
137
Vak: Theories of Consciousness
138
Vak: Trends in plantenwetenschappen
138
Vak: Trends in volksgezondheid
139
Vak: Uitbreiding bachelorthesis
140
Vak: Van gen tot gewas
141
Vak: Van molecuul tot mens
143
Vak: Veldwerk 1e jaar
144
Vak: Veldwerk aarde en economie
145
Vak: Voeding en gezondheid stervariant
147
Vak: Volksgezondheid en genetica
147
Vak: Voorspellen en analyseren in de biologie
148
Vak: Water Governance: Full Course
150
Vak: Water Governance: Lectures
150
Vak: Wijsbegeerte en wetenschap
150
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
VI
Honours Programme Biologie Opleidingsdelen: - Facultaire deel Honours programma - Faculteitsoverstijgend deel HP
Facultaire deel Honours programma Opleidingsdelen: - Stervariant cursussen Health & Life Sc. - Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Uitbreiding bachelorthesis
Periode 4+5+6
6.0
A_HP-I-3
Credits
Code
Moleculaire ontwikkelingsbiologie *
3.0
A_HP470038
Neurowetenschappen I *
3.0
A_HP470199
3.0
A_HP470050
3.0
A_HP470042
Stervariant cursussen Health & Life Sc. Vakken:
Naam
Oncologie *
Periode
Ac. Jaar (september)
Pathologie * Preklinische neurowetenschappen stervariant
Ac. Jaar (september)
3.0
A_HP487016
Stervariant gezondheidseconomie
Ac. Jaar (september)
3.0
A_HP470091
Voeding en gezondheid stervariant
Ac. Jaar (september)
3.0
A_HP470206
Fac.Honourscursussen Levenswetenschappen Vakken:
Naam
Periode
Five O’Clock Neurosciences (Honours) Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
Credits
Code
6.0
A_HP003
6-3-2013 - Pagina 1 van 150
Honours course: Ac. Year (September) Communication and Innovation in Health and Life Sciences
6.0
A_HP002
Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces
6.0
A_HP001
6.0
A_HP-I-1
Ac. Year (September)
Individuele onderwijsmodule Ac. Jaar (september)
Faculteitsoverstijgend deel HP Opleidingsdelen: - Interdepartmental Honours Courses
Interdepartmental Honours Courses Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Brain and Behavior
Semester 2
6.0
OH_BAB
Climate Change
Periode 1+2
6.0
OH_CC
Current Issues in Psychopathology
Periode 4
6.0
OH_CIP
Educating for the good life
Periode 1+2
6.0
OH-EFG
Evolution and Human Behavior
Semester 2
6.0
OH-EHB
Future Entrepreneur
Semester 2
6.0
OH_FE
God-Man-World
6.0
OH_GMW
Governing Security
6.0
OH_GS
Health and Psychosocial Factors
Semester 2
6.0
OH_HPF
Honours Individueel Vak
Ac. Jaar (september)
8.0
OH_EXT1
Honours Leadership
Periode 1
6.0
OH_LEAD
How to survive 2050
6.0
OH_HTS
HP AUC: Programming your World
6.0
OH_APYW
HP UvA: Carte Blanche
Ac. Jaar (september)
6.0
OH_UCB
HP UvA: Creativiteit
Ac. Jaar (september)
6.0
OH_UCREA
HP UvA: Governance of Aquatic
Ac. Jaar (september)
6.0
OH_UGOAQ
HP UvA: Intelligence Studies
Ac. Jaar (september)
6.0
OH_UINST
HP UvA: Labyrint
Ac. Jaar (september)
6.0
OH_ULA
HP UvA: Learning Lab
Ac. Jaar (september)
6.0
OH_ULL
HP UvA: Love
Ac. Jaar (september)
6.0
OH_ULOVE
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 2 van 150
HP UvA: Master of Suspicion
Ac. Jaar (september)
6.0
OH_UMS
HP UvA: wereldliteratuur
Ac. Jaar (september)
6.0
OH_UWL
Illness-Image-Metaphor
Semester 2
6.0
OH_IIM
Impact of an Empire
Semester 2
6.0
OH_IE
6.0
OH_LAW
Life and Work New Anatomy
Periode 1+2
6.0
OH_NA
Power and Change
Ac. Jaar (september)
6.0
OH_UPC
Religion, Identity, Conflict
Semester 2
6.0
OH_RIC
The Roman Empire
6.0
OH_TRE
The use of statistics in legal Semester 2, Periode 2 court cases
6.0
OH-SLC
Theories of Consciousness
6.0
OH_TOC
Vervallen vakken bacheloropleidingen FALW De vakken die hieronder zijn gepresenteerd werden in studiejaar 20102011 voor het laatst aangeboden. Voor de vakken (.. nader) wordt in studiejaar 2011-2012 nog een herkansingsmogelijkheid aangeboden. Voor aanvang van het studiejaar 2011-2012 wordt onderstaande lijst gecomplementeerd. Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Algemene vaardigheden en Ac. Jaar (september) encyclopedie
4.0
AB_450235
Allergieën en autoimmuunziekten
6.0
AB_487009
Bedreiging en bescherming Ac. Jaar (september) II
6.0
AB_487042
Beheer en beleid in de Ac. Jaar (september) gezondheidswetenschappen
6.0
AB_470085
Biochemical Regulation in Health and Disease
6.0
AB_470168
Biochemie
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470071
Bioinformatica
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470172
3.0
A_HP470172
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470022
Biotechnologie en Ac. Jaar (september) maatschappelijke dynamiek
6.0
AB_487020
Communicatietheorie en gezondheid
6.0
AB_470207
Drugs en verslaving
6.0
AB_470081
6.0
AB_450212
12.0
AB_470178
Bioinformatica * Biomedisch beleid & kennismanagement
Dynamiek van het historische landschap
Ac. Jaar (september)
Ecologie, mens en natuur Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 3 van 150
Ecotoxicologie
6.0
AB_470047
6.0
AB_470092
Evolutie van de mens
6.0
AB_470055
Evolutionaire genetica
6.0
AB_470053
Evolutionaire genetica *
3.0
A_HP470053
Experimentele immunologie
6.0
AB_470229
Ergonomie
Ac. Jaar (september)
Farmacologie en medicijnontwikkeling
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_487022
Gezondheid in grootstedelijke gebieden
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_487021
6.0
AB_470208
Gezondheidsrecht Global change
Ac. Jaar (september)
4.0
AB_450234
Histologie, pathologie en toxicologie
Ac. Jaar (september)
6.0
A_470158
Humane anatomie en fysiologie
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470104
3.0
A_HP470104
6.0
AB_470080
3.0
A_HP487008
6.0
A_470113
6.0
AB_487023
Humane Anatomie en Fysiologie * Humane genetica
Ac. Jaar (september)
Humane ontwikkeling * Immunologie
Ac. Jaar (september)
Infectieziekten en vaccinontwikkeling Inleiding mineralogie
Ac. Jaar (september)
3.0
AB_450157
Integratieve tumorcelbiologie
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470057
Interculturalisatie van de zorg
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470184
Levensvragen en wetenschap
6.0
AB_470151
Management en beleid in de Ac. Jaar (september) gezondheidszorg
6.0
AB_487011
Medische farmacologie
6.0
AB_470032
Mens en evolutie (G&L)
6.0
AB_487013
Methodologie en statistiek I Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470165
Microbiologie
6.0
A_470159
6.0
AB_470079
Ac. Jaar (september)
Ac. Jaar (september)
Moleculaire celbiologie Multimedia
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470105
Natuur, leven en techniek I
Ac. Jaar (september)
3.0
AB_450207
Natuur, leven en techniek II Ac. Jaar (september)
3.0
AB_450208
Neuronale en hormonale regulatie II
3.0
AB_470226
6.0
AB_470086
6.0
AB_470199
6.0
AB_470204
Ac. Jaar (september)
Neuronale en psychische pathologie Neurowetenschappen I
Ac. Jaar (september), Periode 2
Neurowetenschappen II: Genes and the brain
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 4 van 150
Neurowetenschappen III: monitoring the brain
6.0
AB_470205
Ontwikkeling en voortplanting van de mens
Ac. Jaar (september)
6.0
A_470150
Oriëntatie op onderzoek
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470173
Paleontologie
Ac. Jaar (september)
3.0
AB_450070
Pathologie
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470042
Ruimtelijke beeldvorming
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_450065
Seksualiteit en gezondheid
6.0
AB_470148
Sport, beweging en gezondheid
6.0
AB_470093
Structuurbiologie
6.0
AB_470056
Systeemecologie
6.0
AB_470044
Trends in plantenwetenschappen
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470213
Trends in volksgezondheid
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_470149
Van molecuul tot mens
12.0
AB_470217
Veldwerk 1e jaar
5.0
AB_450239
Veldwerk aarde en economie
7.0
AB_450210
Volksgezondheid en genetica
6.0
AB_470075
Bsc Biologie, jaar 1 In het eerste jaar zijn alle vakken verplicht, er zijn geen keuzevakken. Het programma in het eerste jaar vormt een basis; het geeft een eerste overzicht van de Biologie en is bedoeld als een verbreding van de kennis op diverse terreinen. Het eerste jaar van de bachelor heeft een oriënterende en selecterende functie. De student kan zich tijdens het eerste studiejaar oriënteren op de gekozen opleiding, dat wil zeggen: voldoet de opleiding aan de verwachting en is men er geschikt voor. Het programma van het eerste jaar geeft een eerste overzicht van de opleiding en geeft een verbreding van de biologische kennis. De selecterende functie komt vooral tot uiting in de studieresultaten. De studieresultaten worden gevolgd door de studieadviseur. Als het nodig is worden studenten opgeroepen voor een gesprek. Op grond van de cijfers aan het eind van het eerste jaar ontvangt elke eerstejaars een bindend studieadvies. Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Cyclus van het leven
Periode 1
12.0
AB_470174
Ecologie, mens en natuur I
Periode 5
6.0
AB_1001
Ecologie, mens en natuur II Periode 6
6.0
AB_1002
Evolutie en diversiteit van leven
12.0
AB_470175
Periode 2
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 5 van 150
Genen, hersenen en gedrag Periode 4
12.0
AB_470176
Methodologie en onderzoek Periode 3 in de biologie
6.0
AB_470209
Voorspellen en analyseren in de biologie
6.0
AB_470212
Periode 5
Bsc Biologie, jaar 2 Het tweede jaar van de bacheloropleiding is een verdere oriëntatie binnen de biologie. Daarnaast wordt beoogd een verdieping van kennis, inzicht en vaardigheden op deelgebieden van de biologie tot stand te brengen. Dit vormt de basis voor de differentiatie in het derde jaar. In het tweede jaar zijn alle vakken tot en met week 16 (2010) verplicht. Daarna, in de blokken van week 18-21 en 22-26, kunnen studenten tweemaal kiezen uit keuzecursussen. Opleidingsdelen: - Bsc Biologie, jaar 2, keuzevakken - Bsc Biologie, jaar 2, verplichte vakken
Bsc Biologie, jaar 2, keuzevakken Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Evolutionaire ecologie en gedrag
Periode 6
6.0
AB_470074
Humane neurofysiologie
Periode 6
6.0
AB_487024
Moleculaire ontwikkelingsbiologie
Periode 6
6.0
AB_470038
Bsc Biologie, jaar 2, verplichte vakken Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
De microbiële cel
Periode 2
12.0
AB_470201
Kust en mariene ecosystemen
Periode 5
12.0
AB_470203
Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij
Periode 3+4+5+6
1.0
AB_470098
Regulatie en afweer bij dieren
Periode 4
12.0
AB_470202
Van gen tot gewas
Periode 1
12.0
AB_470200
Wijsbegeerte en wetenschap
Periode 3
6.0
AB_470160
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 6 van 150
Bsc Biologie, jaar 3 Het derde studiejaar is opgebouwd uit een aantal verplichte vakken, daarnaast zijn er voornamelijk keuzecursussen. De onderdelen Methodologie en statistiek 2, Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij en de Bachelorstage zijn verplicht. Tijdens de bachelorstage wordt naast het doen van onderzoek veel aandacht gegeven aan de algemene vaardigheden van de student. Hieraan gekoppeld is het schrijven van een onderzoeksverslag. Het derde jaar vormt samen met het tweede jaar de tweede fase van de bacheloropleiding. In deze tweede fase is er ruimte voor een verdieping van kennis, inzicht en vaardigheden op deelgebieden. In het derde jaar kiezen studenten voor een groot deel hun eigen programma, waaronder een minor. Daarbij wordt ook tijd besteed aan oriëntatie op de verschillende richtingen die de masteropleiding biedt, zodat studenten aan het eind van het derde jaar een verantwoorde keuze maken uit verschillende differentiaties in de vervolg masteropleiding. Belangrijk onderdeel van het derde jaar is de bachelorstage. Opleidingsdelen: - FALW-minoren voor Biologiestudenten - Bsc Biologie, jaar 3, verplichte vakken - Extern (buiten de VU) behaalde vakken op BSc-niveau
FALW-minoren voor Biologiestudenten Opleidingsdelen: -
Minor Biomedical and Health Intervent. Minor Biomolecular and Neurosc. track NS Minor Biomolecular and Neurosc. track BS Minor Brain and Mind Minor Evolutionary Biology and Ecology Minor Topics in Biomedical Sciences
Minor Biomedical and Health Intervent. Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Clinical Trials and Health Care
Period 2
6.0
AB_1043
Future Challenges in Global Period 1 Health
6.0
AB_1042
Infectious Diseases and Vaccine Development
Period 3
6.0
AB_1046
Key Strategies in Disability and Neuropathy
Period 1
6.0
AB_1045
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 7 van 150
Tailoring Medicine and Telemedicine
Period 2
6.0
AB_1044
Minor Biomolecular and Neurosc. track NS Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Experimental Cell Biology I
Period 1
6.0
AB_1047
Experimental Cell Biology II Period 1
6.0
AB_1048
Molecular Principles of Brain Period 2 Disorders
6.0
AB_1049
Neuronal Networks and Behavior
Period 3
6.0
AB_1051
The Adaptive Brain
Period 2
6.0
AB_1050
Minor Biomolecular and Neurosc. track BS Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Experimental Cell Biology I
Period 1
6.0
AB_1047
Experimental Cell Biology II Period 1
6.0
AB_1048
From Protein to Cell
Period 2
6.0
AB_1052
Molecular Cell Biology
Period 2
6.0
AB_1053
Molecular Microbiology
Period 3
6.0
AB_470610
Minor Brain and Mind The minor Brain and Mind is offered by the Faculty of Earth and Life Sciences in collaboration with other leading centres both in the Netherlands and abroad, including the FC Donders Centre in Nijmegen, University of Amsterdam, The University of North Carolina Chapel Hill and the State University of New York. The student will gain insight into the latest knowledge of how the brain works and also how this knowledge can be used to understand cognitive processes, social interactions between individuals, antisocial behavior as well as different brain diseases, such as depression, addictions, attention, or eating disorders. The nature-nurture debate will be discussed as well as recent updates in human genome research. In addition, the minor provides an introduction into the fields of neuroeconomics (decision making) and gaming behavior as well as into recent scientific technological advances in brain-machine interfaces, deep brain stimulation, and robotics. Integration between disciplines The integration between disciplines, such as biology, psychology, sociology and genetics plays a central role in this minor. Students learn to think critically about how knowledge of the brain and the human
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 8 van 150
genome can be applied to deal with societal issues. Target population: Third year BSc students alpha and gamma topics (sociology, psychology, economics, law etc.) and students from Life sciences (Biology, Biomedical sciences, Health & Life) with a broad interest. Students in the life sciences that plan to pursue a career in Neuroscience may also follow a more specialised minor in Cell- and Neuroscience. Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Cognitive Neuroscience
Period 1
6.0
AB_1056
Mechanisms of Brain Diseases
Period 2
6.0
AB_1058
Mind and Machine
Period 3
6.0
AB_1060
Nature versus Nurture
Period 1
6.0
AB_1057
The Developing Brain
Period 2
6.0
AB_1059
Minor Evolutionary Biology and Ecology Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Environmental Toxicology
Period 1
6.0
AB_1020
Evolutionary Genetics
Period 2
6.0
AB_1022
Human Evolution
Period 2
6.0
AB_1021
Systems Ecology
Period 1
6.0
AB_1019
Minor Topics in Biomedical Sciences Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Allergy and Autoimmunity
Period 1
6.0
AB_1024
Biochemistry of Diseases
Period 2
6.0
AB_1054
Experimental Immunology
Period 1
6.0
AB_1055
Mechanisms of Brain Diseases
Period 2
6.0
AB_1058
Bsc Biologie, jaar 3, verplichte vakken Vakken:
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 9 van 150
Naam
Periode
Credits
Code
Analyseren van biologisch onderzoek
Periode 4
3.0
AB_1003
Bachelorstage Biologie
Periode 4+5+6
23.0
AB_470060
Geschiedenis van de levenswetenschappen
Periode 4
3.0
AB_1004
Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij
Periode 3+4+5+6
1.0
AB_470098
Extern (buiten de VU) behaalde vakken op BSc-niveau Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Individueel werk
Ac. Jaar (september)
0.0
ABE_001
Individueel werk ALW
Ac. Jaar (september)
0.0
ABE_005
Individueel werk ALW
Ac. Jaar (september)
0.0
ABE_006
Individueel werk ALW
Ac. Jaar (september)
0.0
ABE_020
Water Governance: Full Course
Ac. Jaar (september)
6.0
AB_450351
Water Governance: Lectures
Ac. Jaar (september)
3.0
AB_450350
Algemene vaardigheden en encyclopedie Vakcode
AB_450235 (450003)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
4.0
Voertaal
Engels
Coördinator
dr. A.C. Lankreijer
Doel vak De opleiding Aarde en Economie leidt je op tot een "academische professional". Dat betekent dat je zelfstandig kunt opereren op academisch niveau. Of je er nu voor kiest om een onderzoeker te worden of een loopbaan ambieert buiten de universiteit, je zult een aantal academische vaardigheden moeten beheersen. Kennisontwikkeling op een universiteit betekent niet alleen leren uit boeken en van hoorcolleges, maar ook om samen met onderzoekers of docenten te zoeken naar antwoorden op wetenschappelijke vragen. Wetenschap is continue in beweging, en ieder antwoord roept weer nieuwe vragen op, waarop je met elkaar en de begeleiders de antwoorden moet zoeken. Om mee te kunnen doen in de academische wereld zul je de regels van het spel moeten kennen en een aantal essentiële academische vaardigheden moeten beheersen. Hiervoor is deze cursus bedoeld. Deze vaardigheden zul je niet alleen tijdens je studie gebruiken, maar ook later in je professionele loopbaan.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 10 van 150
Inhoud vak Aan het eind van deze cursus heb je kennis van, en geoefend met de volgende praktische academische vaardigheden: wetenschappelijk schrijven presenteren van onderzoekresultaten toepassen van interviewtechnieken Daarnaast heb je theoretische kennis van: de wetenschappelijke cyclus het opzetten en uitvoeren van een wetenschappelijk onderzoek ethische normen en waarden in onderzoek De cursus bestaat uit de volgende onderdelen: Een theoretische module over het opzetten van wetenschappelijk onderzoek aangevuld door een drietal practische workshops en een centrale opdracht De workshop Presenteren: Structuur van de presentatie, afstemming op het publiek, interactie met het publiek, oefeningen De workshop Wetenschappelijk Schrijven: over het systematisch schrijven van een goed opgebouwde wetenschappelijk tekst en het ontwikkelen en weergeven van een eigen visie op basis van literatuur De workshop Interviewtechnieken. Naast de theoretische achtergrond van het interviewen als onderzoeksmethode, wordt concreet geoefend met het ontwerpen van interviews en het concreet afnemen van interviews Practische opdracht wetenschappelijk schrijven Onderwijsvorm Werk- en hoorolleges, practische werkgroepen, en groepsopdracht. Studenten wonen tenminste 5 GeoVUsie Geoflex-lezingen bij. Deze lezingen dienen als oriëntatie op de wetenschap en beroepskeuze. De Geoflex-lezingen vinden plaats op de donderdagmiddag om 16.00 uur. Toetsvorm Werkstuk (60%) en schriftelijk tentamen (40%). Voor de workshops is deelname verplicht. Het vak kan alleen met een voldoende afgesloten worden als de verplichte taaltoets Nederlands behaald is. Studenten die de taaltoets niet met een voldoende hebben afgesloten, dienen de remediërende cursus schrijfvaardigheid te volgen. Literatuur Nader te bepalen.
Allergieën en autoimmuunziekten Vakcode
AB_487009 ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. M.P. Bergman
Docent(en)
dr. M.P. Bergman
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak Allergieën en auto-immuunziekten zijn aandoeningen van het immuunsysteem, waar velen van ons direct of indirect mee te maken krijgen (denk aan bijv. astma, hooikoorts, type 1 diabetes of reuma). Het hoofddoel van de cursus is op moleculair niveau kennis te Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 11 van 150
verkrijgen van de mechanismen die een rol spelen in het ontstaan van allergieën en auto-immuunziekten. Daarnaast zullen epidemiologie, sociale en economische gevolgen van allergieën en auto-immuunziekten aan de orde komen. Leerdoelen: Na het volgen van de cursus kan de student: Een aantal sociale en economische implicaties van allergieën en auto-immuunziekten (op zowel individueel als maatschappelijk niveau) beschrijven; De epidemiologie van een aantal allergieën en auto-immuunziekten beschrijven; De mechanismen benoemen en uitleggen, welke ten grondslag liggen aan ziekten die het gevolg zijn van een mankerend immuunsysteem (i.h.b. overgevoeligheid en auto-immuniteit); Aangeven welke erfelijke- en/of externe factoren en processen ten grondslag liggen aan ontsporingen (allergieën en auto-immuun reacties) van het immuunsysteem; Beschrijven hoe micro-organismen en gastheerfactoren kunnen bijdragen tot ontwikkeling van - of juist bescherming tegen auto-immuunziekten; De 'hygiëne-hypothese' verwoorden en kritisch kunnen beschouwen middels voor- en tegen-argumenten; Wetenschappelijke literatuur over immunologische onderwerpen lezen en begrijpen, daarbij de hoofdzaken van de bijzaken scheidend. Niveau 3: specialisatie Onderwijsvorm Hoorcolleges (23 uur) met interactieve elementen; Werkcolleges (7 uur), waarin op basis van geselecteerde literatuur in kleine groepen, een 'modelziekte' tot in detail bestudeerd wordt. Toetsvorm Het eindproduct van de werkcolleges - bestaande uit een powerpoint presentatie en een schriftelijk rapport - maakt 30% uit van het eindcijfer. Een afsluitend schriftelijk examen bepaalt de overige 70% van het eindcijfer. Voor het krijgen van een eindcijfer dient voor beide onderdelen een 5,5 of hoger behaald te worden. Literatuur Peter Parham, The Immune System, 3rd edition, Garland Science, New York and London, 2005. ISBN 0-8153-4093-1. Geselecteerde wetenschappelijke artikelen. Aanbevolen voorkennis Voor het kunnen volgen van deze cursus dient men basale kennis te hebben van immunologische concepten, op het niveau van de basiscursussen Immunologie (voor GZW vakcode 470114 en voor BMW vakcode 470113; laatste cursus is overigens in 2009 2010 voor het laatst aangeboden) en Bedreiging en Bescherming I (G&L). Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars bachelorstudenten Gezondheid en Leven en Biomedische Wetenschappen. Keuzecursus voor derdejaars bachelorstudenten Gezondheidswetenschappen met belangstelling voor moleculaire vakken. Overige informatie De cursus Allergieën en Auto-immuunziekten heeft dit jaar een maximum van 100 deelnemers. Toelating vindt plaats op basis van volgorde van inschrijving. Vervolgens krijgen derdejaars studenten voorrang bij Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 12 van 150
plaatsing. Tweedejaars studenten die niet worden toegelaten kunnen de cursus in het volgende jaar in de minor kiezen. Bij overschrijding van het maximum aantal plaatsen legt het studiesecretariaat een wachtlijst aan, van waaruit aanvulling plaats vindt op basis van bovenstaande regels. Belangrijk: het maximum van 100 deelnemers heeft alleen betrekking op studenten die de cursus voor de eerste keer volgen! Recidivisten die de werkgroepen met een voldoende rapport hebben afgesloten kunnen zich een maand voor aanvang van de cursus aanmelden via de cursuscoördinator (
[email protected]) en krijgen dan altijd toegang tot de cursussite en de colleges.
Allergy and Autoimmunity Course code
AB_1024 ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. M.P. Bergman
Teaching method(s)
Lecture, Study Group, Seminar
Course objective Asthma, hay fever, type 1 diabetes and rheumatoid arthritis are wellknown examples of immune-mediated diseases in Western populations. In fact, allergic and autoimmune diseases are likely to affect our lives… sooner or later, directly or indirectly. The main purpose of this course is to gain knowledge of the molecular mechanisms that play a role in the onset of allergic and autoimmune diseases. In addition, we will touch upon epidemiology and the social and economical impact of allergic and autoimmune diseases on society. Level 3: specialisation Course content After following this course, students will be able to: • Describe social and economical implications of important allergies and autoimmune diseases, for an individual patient, as well as the society; • Describe the epidemiology of a few important allergies and autoimmune diaseases; • Explain how immunological tolerance and homeostasis is established and maintained; • Explain the molecular events that underly disturbances of the immune system and the effector mechanisms that ultimately result in disease; • Indicate and explain the role of genetic predisposition and external factors that increase the risk of developing allergic or autoimmune disease(s); • Explain how microbial and host factors either predispose or protect individuals from developing autoimmune diseases; • Formulate and critically reflect on different versions of the 'hygiene hypothesis theory'; • Read, understand, summarize and interpret scientific papers in the field of immunology
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 13 van 150
Form of tuition Lectures by experts/clinicians in the field of allergy or autoimmunity (23 hrs); Project groups in which students study an allergic or autoimmune ‘model disease’ (7 hrs), resulting an oral presentation, written report and research proposal. Type of assessment Evaluation consists of a written examination (70%) in English, comprising both multiple choice questions and essay questions, and the project group report (30%). Course reading Peter Parham, The Immune System, 3rd edition, Garland Science, New York and London, 2009. ISBN 978-0-8153-4146-8; Selected scientific papers Entry requirements Basic knowledge of human immunology is essential to follow this course. VU students meet this requirement when they have successfully completed one of the following courses: Bedreiging en Afweer (BMW), Immunologie (GZW), Bedreiging & Bescherming 1 (Gezondheid & Leven). Students from outside the VU are requested to consult the course co-ordinator, Mathijs Bergman (
[email protected]). Target group This is a course in the Biomedical Sciences minor “Medical Biology” and the Health Sciences minor “Biomedical Trends in Public Health”.
Analyseren van biologisch onderzoek Vakcode
AB_1003 ()
Periode
Periode 4
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
drs. P. Vos
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum
Doel vak Voortbouwend op de statistiek onderwerpen behandeld in Voorspellen en Analyseren in de Biologie wordt een aantal meer geavanceerde statistische methoden voor complexe analyses in de biologische wetenschappen, met name factoriële variantieanalyse geintroduceerd en uitgewerkt, en de uitvoering daarvan wordt geoefend m.b.v. SPSS als voorbereiding op de BSc stage. Uitgezonderd deze uitbreiding van de gereedschapskist ligt het accent in deze cursus op verdieping. Ten dele betreft het een verdieping van de theorie (bijv. de behandeling van statistische power en de problemen bij meervoudig testen). Daarnaast zullen we aandacht besteden aan het kritisch beschouwen van methodologie en statistiek zoals die in de primaire onderzoeksliteratuur worden gepresenteerd. Tot slot wordt in korte projecten verdieping gezocht door onder andere m.b.v. simulatiestudies in Excel de relaties te onderzoeken tussen de (gesimuleerde) werkelijkheid en de resultaten van statistische analyse. Eindtermen Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 14 van 150
De student kan • kritisch analyseren hoe metingen tot stand zijn gekomen en welke consequenties dat heeft voor een statistische analyse van de gegevens; • centrale begrippen uit 'experimental design' (randomisatie, stratificatie, blocking e.d.) hanteren; • nagaan of een gegeven dataset voldoet aan de vooronderstellingen van een bepaalde statistische analyse; • zelf statistische analyses uitvoeren bij een gegeven experimenteel ontwerp zoals dat voor kan komen bij een BSc stage, de resultaten daarvan interpreteren, en de gegevens grafisch weergeven; • herkennen wanneer een non-parametrische techniek gebruikt moet worden; • de relatie tussen een statistische hypothese en een wetenschappelijke theorie verklaren; • simulaties in Excel uitvoeren en daarmee eigenschappen van een experimenteel design, een toets e.d. (e.g., power) onderzoeken onder verschillende condities • gekozen analyse-technieken en gepresenteerde resultaten in de wetenschappelijke literatuur kritisch beschouwen. Inhoud vak • Variantieanalyse (genest, factoriëel); • Regressieanalyse; • Experimental Design; • Statistische power en optimal design Onderwijsvorm • Hoorcolleges • Werkgroepen • Computerpractica met Excel en SPSS • Zelfstudie • Onderzoeksproject, waarin zelfstandig of in kleine groepjes gegevens worden verzameld en geanalyseerd; het project wordt afgesloten met een verslag. Toetsvorm Schriftelijk tentamen (70% van het eindcijfer); Verslag over project (30% van het eindcijfer); Beide onderdelen moeten voldoende zijn. Literatuur • Brigitte Baldi & David S. Moore (2009). The Practice of Statistics in the Life Sciences. W.H. Freeman and Company, New York. ISBN 1-4292-1876-2 (prijs ongeveer 60 euro) (N. B: Dit is hetzelfde boek als gebruikt in eerdere cursussen) • Diverse artikelen; tijdens de cursus zullen de URL's hiervoor op Blackboard verschijnen Vereiste voorkennis De cursus Voorspellen en Analyseren in de Biologie (AB_470212) moet met een voldoende zijn afgerond. Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biologie Overige informatie Deze cursus geldt als ingangseis voor het volgen van de masteropleiding Biologie.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 15 van 150
Bachelorstage Biologie Vakcode
AB_470060 ()
Periode
Periode 4+5+6
Credits
23.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. M.P. Bergman
Doel vak De bachelorstage heeft de volgende doelstellingen: Meewerken aan onderzoek in een omgeving waar Biomedisch en-/of Biologisch werk wordt verricht Training in academische vaardigheden. Hiertoe behoren: Een analyse maken van een Biomedisch/ Biologisch probleem Het schrijven van een individueel onderzoeksverslag Het geven van een mondelinge presentatie over onderzoeksresultaten Het maken en presenteren van een congresposter Oriënteren op een keuze voor een masteropleiding Eindtermen: Vakspecifiek: De student kan onder goede begeleiding zelfstandig onderzoek doen in het gekozen vakgebied en beschikt over praktische vaardigheden die hem daartoe in staat stellen. Met betrekking tot algemene academische vaardigheden: De student is in staat de wetenschappelijke literatuur m.b.t een nieuw onderwerp te ontsluiten en in korte tijd aan de hand van relevante artikelen kennis te nemen van de belangrijkste ontwikkelingen in het betreffende vakgebied; De student is in staat een projectvoorstel voor het eigen onderzoek te schrijven; De student heeft geleerd de voortgang tijdens de stage op een overzichtelijke wijze vast te leggen in een journaal; De student is in staat om over de door hem/haar behaalde wetenschappelijke resultaten tijdens de stage op een heldere wijze schriftelijk en mondeling te rapporteren, daarbij adequaat gebruik makend van diverse audiovisuele hulpmiddelen. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De bachelorstage vormt een belangrijk onderdeel van de bacheloropleiding. Tijdens deze stage oriënteert en specialiseert de student zich in een door hem/haar gekozen richting. De stage wordt afgesloten met het schrijven van een bachelorthesis. Tevens biedt de bachelorstage de student de gelegenheid zich te oriënteren op de keuzes die gemaakt moeten worden voor een masteropleiding en - binnen die opleiding - voor een keuze voor een onderzoekers- of maatschappijgerichte variant, of een afstudeertraject in de richting van communicatie en/of educatie. Onderwijsvorm De student loopt de onderzoeksstage op een wetenschappelijke afdeling of bij een onderzoeksinstelling of bedrijf waar wetenschappelijk onderzoek wordt gedaan Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 16 van 150
Toetsvorm Het eindcijfer bestaat uit het cijfer van de stage, te bepalen door de stagebegeleiders. Hiervoor wordt een beoordelingsformulier gebruikt die beschikbaar is op de website van de faculteit. Literatuur Startliteratuur wordt aangedragen door de begeleider. De student zoekt vervolgens zelf verdere literatuur die nodig is om de stage tot een succes te maken. Informatie rond de stage is te vinden op de Blackboardsite. Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische wetenschappen. Overige informatie Studenten worden aangemoedigd reeds in het 2e jaar te beginnen met het oriënteren op - en voorbereiden van - hun onderzoeksstage om zich nog bewuster in hun toekomst (keuzevakken en masteropleiding) te verdiepen. Meer informatie over de gang van zaken tijdens de bachelorstage is te vinden op de Blackboard Community Bachelorstage BMW/BIO 201x-201x (jaar waarin je stage loopt) en op de facultaire website www.falw.vu.nl > Studenten > Regelingen). Op de Blackboard stagecommunity kunnen tweedejaars zichzelf inschrijven vanaf medio februari.
Bedreiging en bescherming II Vakcode
AB_487042 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. M.P. Bergman
Docent(en)
dr. M.P. Bergman
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Werkcollege
Doel vak Studenten kennis en inzicht bij te brengen van diverse biologische processen verantwoordelijk voor het in stand houden van het 'milieu interieur' en van enkele hierbij relevante deeldisciplines van de gezondheidswetenschappen. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Tijdens Bedreiging en Bescherming II is darmkanker (multifactoriële en soms ook erfelijke bedreiging) het model voor "bedreiging van binnen uit", die bestudeerd wordt. Cel cyclus, apoptose, regulatie en cellulaire communicatie, boodschapper moleculen, receptoren, signaal transductie, immunologische tolerantie tegen 'zelf', en een introductie in de tumor-immunologie komen aan de orde. De student kan uitleggen hoe de celcyclus verloopt en hoe die gecontroleerd wordt, uitleggen wat apoptose is en hoe dat wordt gereguleerd en voorbeelden geven van cellulaire communicatie en
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 17 van 150
deze uitleggen. Tevens kan de student effecten van ioniserende straling en toxische stoffen op cellen en weefsels uitleggen en beschrijven welke processen een rol spelen bij de immunologische afweer tegen tumoren. Bij elk van deze bedreigingen zal een gezondheidswetenschappelijk aspect worden behandeld: Preventie: de student kan aan de hand van praktijkvoorbeelden doel en motief van preventie aangeven en de begrippen primaire, secundaire en tertiaire preventie onderscheiden. Tevens kan de student de stappen beschrijven voor een screenings programma en aan de hand van praktijkvoorbeelden doel en motief van preventie aangeven. Epidemiologie: de student kan de begrippen expositie, risicofactoren, mortaliteit, morbiditeit, incidentie, prevalentie en relatief risico onderscheiden. Tevens kan de student registratie van kankergevallen opzoeken. Vaardigheden: het maken van een conceptmap; presentatie; samenwerken; literatuurstudie; in histologische preparaten van de darm verschillende typen cellen herkennen en benoemen en gezonde cellen onderscheiden. Onderwijsvorm Hoorcolleges (18 uur), werkgroepen (14 uur) en zelfstudie Toetsvorm De beoordeling vindt plaats op grond van een rapport (50%) en een schriftelijk tentamen (50%). Voor het krijgen van een eindcijfer dienen beide onderdelen afgerond te worden met een 5,5 of hoger. Literatuur Alberts et al.: Essential Cell Biology, 3rd ed., Taylor & Francis Group; Lewis, Human Genetics, concepts and Applications; Martini, Essentials of Anatomy and Physiology, 8th ed.; Pearson (de boeken van Lewis en Martini et al. zijn al aangeschaft voor de cursus Humane Levenscyclus I en hoeven niet speciaal voor Bedreiging en Bescherming II te worden gekocht). Doelgroep Verplicht voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven Overige informatie Bedreiging en Bescherming II kan afzonderlijk van B&B-I gevolgd worden
Beheer en beleid in de gezondheidswetenschappen Vakcode
AB_470085 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. J.T. de Cock Buning
Docent(en)
prof. dr. J.T. de Cock Buning
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 18 van 150
Doel vak Inzicht verwerven hoe de maatschappij, politiek en media invloed hebben op, en reageren op, wetenschappelijke ontwikkelingen. Praktijk illustraties hoe in werkelijkheid het beleidsproces wordt aangestuurd en wat de verschillende bestuurlijke visies zijn op beleid. Inzicht verwerven in de interactieve beleidsprocessen. Kennismaken met gangbare managementmodellen en -stijlen en projectmanagement. In de praktijk oefenen met het analyseren van beleid via actornetwerkanalyses en causaalanalyses en het identificeren van beleidsopties. Ervaring opdoen met projectmatig werken in een team voor een externe opdrachtgever op een actuele probleemstelling. Kunnen toepassen van enkele praktische en analytische vaardigheden, zoals het formuleren van een onderzoeksopzet, uitvoeren van literatuurstudie, kritisch analyseren van diverse wetenschappelijke publicaties, theorieën, hypotheses en argumenten, en de bevindingen zowel schriftelijk en mondeling kunnen verantwoorden en presenteren. Oriëntatie op de M-variant, dan wel de masters Management, Policy Analysis and Entrepreneurship. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak In deze cursus krijg je in het eerste deel colleges over diverse beleids- en managementaspecten, die geïllustreerd worden aan de hand van casussen uit de gezondheidszorg en het gezondheidsonderzoek met een focus op doelmatig geneesmiddelenbeleid. Daarbij maak je specifiek kennis met diverse beleidstheorieën, o.a. de theorie van interactief beleid. Je leert een causaalanalyse te maken om beleidsproblemen te analyseren en je leert diverse managementmodellen te herkennen en de stappen van projectmanagement. Dit deel wordt afgesloten met een tentamen. Het tweede deel van de cursus vorm je in teams kleine consultancybureautjes die zich gespecialiseerd hebben in beleidsadvies. Jullie krijgen van een opdrachtgever de vraag om een concurrerend onderzoeksvoorstel te schrijven voor een later uit te voeren beleidsonderzoek rondom een actueel, maatschappelijk 'medisch' of 'volksgezondheids' vraagstuk in het kader van (overheids)beleid. Voorbeelden zijn de privatisering in de zorg of moeder-kind-transmissie van HIV. Je leert, als consultancy-team, in dit project omgaan met de interdisciplinaire praktijk van beleidsmatig onderzoek en projectmatig werken. De problematiek en de verschillende beleidsopties rond dit vraagstuk worden kritisch geanalyseerd volgens de modellen en instrumenten uit het eerste deel. De resultaten, analyses, conclusies en aanbevelingen worden vormgegeven in een officieel beleidsadviesrapport dat aan het eind van de cursus mondeling gepresenteerd en aangeboden wordt aan de opdrachtgever. Onderwijsvorm De eerste helft van de cursus zal bestaan uit (werk)colleges, de tweede helft uit het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband. contacturen: 19 uur (werk)colleges en 10- 20 uur begeleiding in projectteams Toetsvorm Individuele toetsing bestaat uit: (1) tentamen (50%), en (2) projectopdracht. Individuele beoordeling van de projectopdracht (25%)
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 19 van 150
vindt plaats op basis van individuele (tussen)producten, het functioneren in de projectgroep en de beoordeling van groepsproducten (25%). Beide onderdelen (1 en 2) moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Boek: Hoogerwerf, A. & M. Herweijer: Overheidsbeleid; Een inleiding in de beleidswetenschap. Kluwer, Alphen a/d/ Rijn. 8ste druk en hoger Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen
Biochemical Regulation in Health and Disease Vakcode
AB_470168 ()
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. I.M. van Die
Docent(en)
prof. dr. B. Teusink, dr. I.M. van Die, dr. A.J.G. Horrevoets, Dr. I.M. van Die
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum
Doel vak De cursus is een goede basis voor die studenten die zich in hun masterfase willen richten op immunologie, celbiologie, biochemie, infectieziekten en oncologie. Doel van de cursus is het verwerven van kennis en inzicht in moleculair biochemische aspecten van Regulatie mechanismen die verantwoordelijk zijn voor de communicatie tussen verschillende cellen van het menselijke lichaam Veranderingen van deze moleculaire mechanismen bij (chronische) ontstekingsreacties, en diverse ziekten, zoals hart en vaatziekten, tumor-metastasering en infectieziekten zoals Aids en bacteriële/parasitaire infecties. Er zal inzicht worden verkregen in fundamentele biochemische processen en hun rol in verschillende ziekten. Er zal aandacht worden besteed aan het belang van biochemische kennis voor het ontwikkelen van diagnostische testen en therapieën. Hierbij wordt de weg geopend naar "drugdesign". Meer gedetailleerde informatie over de cursus zal op blackboard worden bekendgemaakt. Niveau 2: verdieping Onderwijsvorm Colleges en practica, en een keuzeproject bestaande uit een praktische opdracht en literatuuronderzoek dat wordt afgesloten met een presentatie en/of poster. In de studiehandleiding zijn uitgebreide aanwijzingen opgenomen m.b.t. de studiestof. Het praktisch deel van de cursus omvat drie laboratoriumexperimenten m.b.t. de samenstelling van het bloedplasma t.a.v. lipoproteïnen, (glyco)proteïnen, bloedgroepen en metabolieten onder verschillende (patho)fysiologische omstandigheden. Daarnaast worden enkele computerpractica aangeboden (drugdesign, massa- spectometry). Tijdens het practicum zal ook vaardigheid worden aangeleerd in het bijhouden van een labjournaal.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 20 van 150
Toetsvorm Schriftelijke toets; practicum en project worden afzonderlijk beoordeeld en tellen mee bij de bepaling van het eindcijfer. Daarbij telt het tentamen voor 65%, het practicum voor 25% en het project voor 10% mee. Literatuur Medical Biochemistry van John Baynes en Marek H. Dominiczak, Uitgeverij Mosby, London (ISBN 0723430128), 2e druk (wordt mogelijk gewijzigd, zie tzt blackbord). Studiehandleiding met aanvullende studiestof. Doelgroep De cursus is een keuzecursus voor tweede- en derdejaars BSc Biomedische Wetenschappen Overige informatie Maximum aantal studenten is 110, op volgorde van inschrijving. Algemene communicatie verloopt via Blackboard. Studenten die deze cursus volgen dienen te zijn gevaccineerd tegen hepatitis B.
Biochemie Vakcode
AB_470071 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
M.J.C. Scholts
Docent(en)
prof. H. Lill, M.J.C. Scholts, prof. dr. B. Teusink, dr. I.M. van Die, dr. A.J.G. Horrevoets
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Werkcollege, Practicum
Doel vak Begrip van hoe de macromoleculen in de levende cel in netwerken functioneren en hoe ze daarin samenwerken om de belangrijke levensprocessen uit te voeren. Bijzondere aandacht ligt op de cellulaire energiehuishouding, en op de samenhang en regulatie van metabole routes in de mens. Het practicum omvat voornamelijk proeven uit dit gebied. Eindtermen De student kan: - de ordenende en chaotische krachten die het leven bepalen benoemen; - de centrale rol van ATP in cellulaire systemen beschrijven; - aan de hand van voorbeelden in grote lijnen beschrijven welke mechanismen voor de productie van ATP gebruikt worden; - verschillen tussen chemische en chemiosmotische productie van ATP opnoemen en beschrijven; - mechanismen en drijvende krachten van elektronen transport ketens beschrijven; - de efficiëntie van Gibbs- energietransductie en Gibbsenergiedissipatie in oxidatieve fosforylering, ademhalingsketens, actieve transportprocessen en fotosynthese berekenen; - de paradox tussen de 2de hoofdwet en de ordening van levende
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 21 van 150
organismen oplossen; - beschrijven hoe d. m. v koppeling bergafwaartse processen bergopwaartse processen drijven. - het onderlinge verband uitleggen tussen verschillende metabole routes in de mens, en hoe dat op cellulair nivo georganiseerd is - beschrijven wat de rol van de lever is in de glucose- en vethuishouding, en hoe de pancreas hormonen daarbij een essentiele rol spelen De student kent: - in grote lijnen de reacties en regulatie van glycolyse en fermentaties; - de glycogeen opbouwende en afbrekende reacties en hun regulatie; - in grote lijnen de reacties en regulatie van de citroenzuurcyclus - structuren en compartimenten in cellen, waar verschillende metabole reacties plaats vinden; - de principes van controle en regulatie; - opbouw en onderdelen van elektronen transportketens; - experimenten om deze reacties te onderzoeken. - de voornaamste metabole routes in de mens en hun onderlinge samenhang Niveau 2: verdieping Inhoud vak De colleges behandelen het samenwerken van reacties en enzymen in biochemische paden en reactieketens. Reacties en principes betrokken bij de cellulaire productie van ATP staan centraal. Thermodynamische grondslagen voor deze reacties worden besproken en vervolgens gebruikt om de resultaten van practicumproeven te bewerken. Tevens zal worden behandeld hoe biologische functies van eiwitten worden gereguleerd via posttranslationele modificaties. Onderwijsvorm Hoorcolleges (32 uur); werkcolleges (4 dagdelen); practicum (12 dagdelen). Deelname aan practica inclusief voor- en nabespreking en werkcolleges is verplicht. Deelname aan hoorcolleges wordt sterk aanbevolen (i. v. m. tentamen). Literatuur Voet, Voet & Pratt, " Fundamentals of Biochemistry", Wiley, ISBN 0-471-58650-1, ca. 50 Euro, Handleiding practica, Syllabus, en labjournaal totaal ca. 15 Euro. Aanbevolen voorkennis De inhoud van de eerstejaarscursus "Biologische chemie" wordt als bekend verondersteld. Doelgroep Verplicht voor tweedejaars studenten Biomedische Wetenschappen. Keuzecursus voor de tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. Overige informatie Bij het experimentele gedeelte is het dragen van een laboratoriumjas verplicht.
Biochemistry of Diseases Course code
AB_1054 ()
Period
Period 2
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 22 van 150
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. I.M. van Die
Teaching staff
dr. B. Tefsen, dr. I.M. van Die, dr. R.J. van Belle-van den Berg, dr. J. van Horssen, prof. dr. A.J.G. Horrevoets
Teaching method(s)
Computer lab, Study Group, Lecture, Practical
Course objective The aim of the course to increase knowledge and understanding of biochemistry at a fundamental level and to develop a perspective on the role of biochemistry in health and disease Course content Contents of the course: • Biochemical and molecular mechanisms by which cellular adhesion, communication and signalling is regulated in the human body • Changes of these mechanisms in diseases with clinical examples of congenital and acquired diseases such as heart and vascular diseases, (chronic) infectious diseases, multiple sclerosis, alzheimer, congenital disorders of glycosylation and cancer. Metabolic aspects of biochemistry are combined with their application to the diagnosis and monitoring of diseases, and the development of therapies including drug design. Form of tuition Lectures, learning in small groups, laboratory courses, and computer practica. In addition a project (optional subject) consisting of a laboratory part and literature study will be carried out and presented to all students. Type of assessment Written exam (80%); Laboratory course (10%) and project (10%) are assessed separately. Course reading - Michael A Lieberman and Alan Marks: Basic Medical Biochemistry: A Clinical Approach, 3e druk (ISBN-10: 0-7817-7022-X; ISBN-13: 978-0-78177022-4). - Essentials of Glycobiology: www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi? book=glyco2 (free internet book) - Additional information on Blackboard Recommended background knowledge Basic knowledge of biochemistry and immunology Target group The course provides an excelllent basis for students which aim to focus on medical biology (in particular immunology, infectious diseases and/or oncology) in their master period. Remarks Part of minor Topics in Biomedical Sciences
Bioinformatica
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 23 van 150
Vakcode
AB_470172 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. ir. B.W. Kooi
Docent(en)
dr. ir. B.W. Kooi
Lesmethode(n)
Computerpracticum
Doel vak Het interdisciplinaire vakgebied Bioinformatica gebruikt mathematische/computer modellen en geavanceerde statistische analyse methoden om inzicht te krijgen in complexe biologische processen op alle niveaus van organisatie, van molecuul tot organisme tot populatie. Bioinformatica is tegenwoordig een onmisbaar onderdeel geworden van bijna alle gebieden binnen de biologische en biomedische wetenschappen. De moderne (medische) biologie bestudeert zulke complexe processen, en produceert zoveel data, bijvoorbeeld in de moleculaire biologie (expressie en activiteit van genen en proteïnen), neurowetenschappen (activiteit van neuronen en neuronale netwerken) en ecologie (biodiversiteit), dat die alleen met behulp van een bioinformatische benadering te onderzoeken en analyseren zijn. Deze cursus geeft een inleiding tot de bioinformatica en de methoden die binnen de bioinformatica gehanteerd worden. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De onderwerpen en specifieke doelen van de cursus zijn: Leren omgaan met de computer; Het schrijven van computer programma's; Leren omgaan met databases; Leren omgaan met cluster analyse programmas voor de analyse van, bijvoorbeeld gen en proteïne sequenties; Leren opstellen van eenvoudige mathematische modellen voor biologische processen, van molecuul tot populatie; Leren analyseren van modellen met behulp van numeriek wiskundige methoden; Kennismaken met modellen voor neuronen en met neurale netwerk modellen voor leren en geheugen; Kennismaken met ecologische en populatie modellen, bijvoorbeeld van predator-prooi interacties, verspreiding van ziektes, en tumorgroei. Onderwijsvorm Hoorcolleges, computerpractica, zelfstudie en werkstuk. Een belangrijk onderdeel van de cursus zijn de computerpractica (waarbij MATLAB wordt gebruikt) met betrekking tot programmeren, modelleren en data analyse. Toetsvorm Computeropgaven (30%) en schriftelijk tentamen (70%) Literatuur Syllabus en practicumhandleiding, prijs samen ongeveer 13 Euro. Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. De cursus wordt zeer aanbevolen voor studenten in de biomedische Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 24 van 150
wetenschappen, neurowetenschappen, moleculaire en celbiologie en ecologie. Overige informatie Bij dit studieonderdeel is het voor studenten die het Bachelor Honoursprogramma Biologie of Biomedische Wetenschappen volgen, mogelijk te kiezen voor de stervariant. Bij de stervariant wordt aan het bovenomschreven studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De stervariant wordt geregistreerd onder een aparte vakcode. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 EC boven de normale belasting van de cursus.
Bioinformatica * Vakcode
A_HP470172 ()
Credits
3.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.
Biomedisch beleid & kennismanagement Vakcode
AB_470022 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. J.E.W. Broerse
Docent(en)
prof. dr. J.E.W. Broerse, J.E. Elberse MSc, T.N. den Hertog MSc
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 25 van 150
Doel vak Verwerven van kennis van en inzicht in: Beleidswetenschappen, met name beleidsprocessen, beleidstheorie en beleidsanalyse. De structuur en het beleid van de Nederlandse overheid met name op het gebied van biomedisch onderzoek. Project- en kennismanagement. Het toepassen van verkregen kennis en inzicht door: Het in de praktijk oefenen met het analyseren van een maatschappelijk probleem en het identificeren van beleidsopties. Het opdoen van leerervaringen ten aanzien van: Projectmatig werken in teamverband. Het kunnen toepassen van enkele praktische vaardigheden, zoals onderzoeksopzet maken, literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk presenteren. Niveau 1: basiscursus Inhoud vak Beleid speelt op vele manieren en niveaus een rol in onze samenleving. Ook binnen de wetenschap heb je eigenlijk altijd met beleid te maken. Enerzijds speelt beleid een rol bij het stimuleren en/of reguleren van wetenschappelijk onderzoek. Anderzijds wordt wetenschap ingezet om beleid rondom een maatschappelijk probleem te ondersteunen of te adviseren. Inzicht in deze processen en principes maakt dat je begrijpt waarom bepaalde keuzes gemaakt worden en waarom wetenschappelijke kennis soms niet of nauwelijks wordt gebruikt. In het theoretisch deel van deze cursus leer je in werkgroepen over diverse beleidsaspecten en kennismanagement geïllustreerd aan de hand van casussen uit de biomedische sector. Dit deel wordt afgesloten met een tentamen. In het praktisch deel van de cursus vorm je met een aantal medestudenten een consultancy-team dat zich gespecialiseerd heeft in beleidsadvisering. Jullie krijgen van een opdrachtgever de vraag om een uitgebreid onderzoeksvoorstel te schrijven voor een later uit te voeren beleidsonderzoek rondom een actueel, maatschappelijk medisch-biologisch vraagstuk. Voorbeelden zijn de introductie van nieuwe vaccins, Functional Foods of euthanasie. Daarmee ontstaat een leersituatie die nauw aansluit bij de praktijk van beleidsmatig onderzoek en projectmatig werken. De resultaten, conclusies en aanbevelingen worden weergegeven in een voorstel voor beleidsonderzoek dat aan het eind van de cursus mondeling gepresenteerd wordt. Onderwijsvorm Hoorcollege, werkgroepen, groepsopdracht en zelfstudie Toetsvorm Individuele toetsing bestaat uit: (1) tentamen met multiple-choice en open vragen (50%), en (2) projectopdracht (50%). Individuele beoordeling van de projectopdracht vindt plaats op basis van individuele producten, het functioneren in de projectgroep en de beoordeling van groepsproducten. Beide onderdelen (1 en 2) moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Wordt bekendgemaakt via Blackboard Doelgroep
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 26 van 150
Verplichte cursus voor tweedejaars bachelorstudenten Biomedische Wetenschappen. Overige informatie Aanwezigheidsplicht: iedere student mag maximaal eenmaal afwezig zijn bij de werkgroepen.
Biotechnologie en maatschappelijke dynamiek Vakcode
AB_487020 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. J.T. de Cock Buning
Docent(en)
prof. dr. J.T. de Cock Buning, dr. J.F.H. Kupper
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak Verdere verdieping in de technische aspecten van recente biotechnologische technieken (cisgenese, gentherapie, cloneren, genomics, micro arrays) Historisch en sociologisch inzicht verwerven in de structuur van de maatschappelijke reacties op genetische modificatie. Inzicht verwerven in het juridische antwoord van de maatschappij/politiek op biotechnologische onzekerheden. Analyseren van wetenschappelijke en maatschappelijke aspecten van de media topics (Stier Herman, Schaap Dolly, Pompe Konijnen, Koreaanse stamcel fraude etc.) In de praktijk oefenen in argumentatie en debat met behulp van cases en team-opdrachten. Kunnen toepassen van enkele praktische en analytische vaardigheden, zoals het uitvoeren van literatuurstudie, kritisch analyseren van diverse wetenschappelijke publicaties, theorieën, hypotheses en argumenten, en de bevindingen zowel schriftelijk en mondeling kunnen verantwoorden en presenteren. Oriëntatie op interdisciplinair (gamma-bèta) onderzoek. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak Deze cursus bouwt voort op moleculaire basiskennis en gaat met enkele gastcolleges dieper in op specifieke technieken in het biomedische onderzoek m.b.t. virussen, bacteriën, planten en dierexperimenteel onderzoek. Daarnaast worden de ontwikkelingen van moleculair biologische technieken in historisch maatschappelijk perspectief geplaatst: vanaf de eerste recombinant discussies tot de huidige genomics discussies. De onrust van de maatschappij over het sleutelen aan de erfelijke machinerie van organismen, resulteerde in een grote hoeveelheid aan veiligheidsafspraken en wetgeving die wereldwijd nu gelden vanaf de gemeentelijke ontheffingen van een laboratorium tot mondiale VN verdragen zoals het Cartagena Protocol en Biodiversiteitsverdrag. Er zal worden ingegaan op theorieën en sleutelconcepten achter 'risk perception/assessement' en het 'voorzorgbeginsel'. In teams van vier tot zes studenten wordt er elke week gewerkt aan een
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 27 van 150
casus, die de teams op grond van de theorie van de colleges en eigen literatuuronderzoek verder wetenschappelijk en sociologisch analyseren. Onderwerpen voor cases zijn biotechnologische innovaties zoals Golden rice, xenotransplantatie, genetische enhancement, screening kits. Hier bij spelen op de achtergrond ook de discussies over stamceltherapie, gentherapie, micro arrays, patenttering van moleculaire informatie etc. Op deze manier leer je de vaardigheden om theorie en methodiek van exacte wetenschappen met die van sociale wetenschappen te integreren (gamma-beta-onderzoek). Iedere vrijdag presenteren de teams hun analyses aan elkaar (powerpoint), en zal de discussie tussen de analyses een verdieping van de stof opleveren. De participatie en leermomenten uit deze discussies worden bijgehouden in een persoonlijk portfolio dat deel uitmaakt van de individuele beoordeling. Onderwijsvorm De ochtenden bestaan uit kennis overdragende colleges die verzorgd worden door verschillende gastsprekers (onderzoekers, sociologen). Aanwezigheid bij deze colleges is onontbeerlijk. In de middagen wordt er gewerkt aan een groepsopdracht waarbij een case gezamenlijk wordt geanalyseerd op basis van de theorie uit de colleges. Elke vrijdag wordt die case (3-4 verschillende gedurende de cursus) gepresenteerd en bediscussieerd. Contacturen: colleges 10 x 1,5= 15 uur, presentaties 3x 3 uur= 9 uur. Toetsvorm Toetsing bestaat uit: beoordeling individuele bijdrage aan de case studies in de vorm van de portofolio(50%) en de beoordeling van de bijdrage in de vier case studies als groepsopdracht (50%). Beide onderdelen moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Blackboard Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven en derdejaars BSc Biologie en BSc Biomedische Wetenschappen.
Brain and Behavior Vakcode
OH_BAB (986009)
Periode
Semester 2
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Coördinator
C. Holleman
Docent(en)
prof. dr. J.L. Theeuwes
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Climate Change Vakcode
OH_CC (986003)
Periode
Periode 1+2
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 28 van 150
Coördinator
drs. L.H.C. Plantinga
Docent(en)
dr. M.A. van Drunen
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Clinical Trials and Health Care Course code
AB_1043 ()
Period
Period 2
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
prof. dr. J.T. de Cock Buning
Teaching method(s)
Study Group, Practical, Lecture
Course objective § Acquire insight into the process and wider context of clinical trials § Gain knowledge on technical aspects of recent developments in biomedical en health sciences (e.g., gene therapy, stem cell therapy and genomics). § Obtain knowledge and insight into the juridical and financial factors concerning clinical trials and innovation processes. § Understand historical and sociological insights into societal dynamics in response to new technologies such as gene therapy, stem cell therapy and genomics. § Gain insight into societal and political responses to scientific uncertainties surrounding clinical trials, safety and innovative health interventions. § Be able to form lines of argumentation and participate in debate in the context of specific cases and team assignments. § Be able to apply practical and theoretical skills, such as conducting a literature study, critically analysing various scientific publications, hypotheses and arguments, and justifying and presenting findings both orally and in writing. § Get acquainted with interdisciplinary (gamma-beta) research Course content Clinical trials are a crucial step in the development process of many health interventions (e.g. new drugs, diagnostics, medical devices and therapy protocols). By setting up carefully designed quantitative experiments, new interventions are tested for safety, efficacy and costeffectiveness on human beings (initially healthy volunteers, later patients). In many countries clinical trials are required before the national regulatory authority allows the drug, device or therapy to be marketed and used on patients. Clinical trials are, however, not unproblematic. There are various accounts of prematurely terminated trials because of serious side effects or high death rates in the interventional arm of the study. Furthermore, some of the tested interventions have raised ethical concerns, because they involved the use of a controversial technology like stem cell therapy, or were conducted in a developing country without appropriate safety measures. There are also difficulties encountered in recruiting sufficient numbers of volunteers in experiments. Frustrated by being only treated as ‘subjects’, patients increasingly demand a ‘say’ in the design and Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 29 van 150
implementation of clinical trials. This course starts with a description of the clinical trial process and an historical perspective on the upcoming demands for safe drugs, healthy food and working therapies. In addition, your knowledge on molecular biology, including basic splicing and recombination techniques, will be refreshed. We will study early recombinant DNA discussions (where people protested with slogans like "No DNA in our village") and the recent genomics discussions. Also recent debates around clinical trials are highlighted. What does the UN have to say about safety? How can we assess and manage risks if there is uncertainty about how the risks look like? What precautions should we take from a medical and societal perspective before we decide to (not) start clinical trials on something as controversial as genetic enhancement? In teams of four to six students, you search and collect research data from scientific papers to develop and prepare your stance in favor or against the ‘statement of the week’. Examples could be genetic passports, patenting molecular information and viral therapy. At the end of the week, you will debate this statement from two opposing positions. Thus sharpening your discussion skills and deepening your knowledge about the latest scientific developments and the role of clinical trials to protect patients, consumers and societies. Level 3: specialisation Form of tuition Lectures, assignments, literature search, self study, scientific discussion Type of assessment Written exam (33%), portfolio (33%) and performance (33%). First two parts (exam and portfolio) need to be passed. Course reading To be announced Remarks Part of the minor Biomedical and health interventions
Cognitive Neuroscience Course code
AB_1056 ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. S. van der Sluis
Teaching method(s)
Practical, Computer lab, Study Group, Lecture
Course objective Introduction to neurogenomics; understanding the biological mechanisms underlying cognitive processes Course content In this course students examine how the brain perceives the outside world and how this leads to cognitive behavior. There is a general introduction into neurogenomics, after which the biological basis of cognitive processes such as perception, consciousness, language, Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 30 van 150
learning, memory, sleep, emotion, decision and stress will be discussed. Various techniques (e.g., MRI, EEG, histology) to study the brain will be demonstrated during practicals. Form of tuition Lectures, practicals, workgroups, student presentations Type of assessment Exam and presentation Course reading Please note: information updated August 16. "Foundations Of Behavioral Neuroscience" by N.R. Carlson (Pearson Education (US)) Remarks Part of minor Brain and Mind Central Academic Skill: Writing a summary / abstract
Communicatietheorie en gezondheid Vakcode
AB_470207 (450003)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Docent(en)
dr. M.J.W. Bos, dr. I.R. Hellsten
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak Inzicht krijgen in: de centrale begrippen in, alsmede het ontstaan van communicatiewetenschappen; de belangrijkste communicatietheorieën; de producenten en productieprocessen rond communicatie; de diverse inhouden en mogelijke effecten van communicatie; de verschillende 'publieken' van communicatie onderzoeksmethoden in communicatiewetenschappen. In staat zijn communicatieprocessen te analyseren op basis van begrippen en theorieën uit de communicatiewetenschappen. Niveau 2: verdieping Inhoud vak We leven in een snel veranderende 'global' samenleving waar communicatie cruciaal is en nieuwe media als internet niet meer zijn weg te denken. Inzicht in communicatieprocessen en communicatievaardigheden zijn voor academici centrale competenties geworden. Dit geldt ook zeker voor professionals op het gebied van gezondheidswetenschappen waarbij het communiceren van de resultaten van gezondheidsonderzoek of van een gezondheidsbevorderende boodschap naar specifieke doelgroepen zeer belangrijk zijn. In deze cursus leer je hoe media de publieke opinie beïnvloeden (en vice versa). De cursus geeft een overzicht van de belangrijkste communicatietheorieën en geeft inzicht in de macht en/of invloed van media. Je gaat kritisch kijken naar vragen als: Welke media zijn er? Wat maakt dat informatie nieuwswaarde heeft? En hoe wordt er gecommuniceerd over gezondheidsvraagstukken? En waarom juist op die Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 31 van 150
manier? Tevens komen onderzoeksmethoden als inhoudsanalyse en 'discourse analysis' aan bod. Deze theorie en methoden staan helemaal in het teken van de centrale groepsopdracht: Tijdens de cursus ga je zelf kijken naar media uitingen over gezondheidsvraagstukken. Dit onderwerp is afhankelijk van wat er op het moment speelt in de media. Zo ging het vorig jaar over beeldvorming naar aanleiding van berichtgeving over de Mexicaanse griep. Belangrijke vragen in die opdracht zijn: Welke publieken kun je onderscheiden? Welk publiek gebruikt welke media? Hoe wordt er gecommuniceerd over deze griep en wat is het effect hiervan op het publiek? Naast colleges is er een centrale groepsopdracht. Deze opdracht wordt in groepen van 3-4 studenten uitgevoerd en daarbij passen studenten een van de geleerde methoden toe op een recent onderwerp in de publieke discussie. Onderwijsvorm Hoorcolleges, werkcolleges, (groeps)opdrachten en zelfstudie Toetsvorm Tentamen 75%, groepsopdracht 25% Literatuur Het boek Media en Publiek van Connie de Boer en Swantje Brennecke (uitgeverij Boom) Aanvullende literatuur wordt tijdens de cursus aangeleverd. Doelgroep Keuze voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen
Current Issues in Psychopathology Vakcode
OH_CIP ()
Periode
Periode 4
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Docent(en)
prof. dr. A.C. Krabbendam
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Cyclus van het leven Vakcode
AB_470174 ()
Periode
Periode 1
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. R.E. Koes
Docent(en)
dr. ing. E.J. Souer, prof. dr. R.E. Koes
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum, Training
Doel vak
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 32 van 150
Het doel van de cursus is inzicht te geven in de basale moleculaire processen die ten grondslag liggen aan het functioneren van cellen en de ontwikkeling van complexe meercellige organismen, zoals plant en dier, uit een enkele bevruchte eicel. Niveau 1: basiscursus Inhoud vak De cursus richt zich achtereenvolgens op: de opbouw van cellen en belangrijke processen die een rol spelen tijdens de levenscyclus van cellen. processen die de specialisatie van cellen (differentiatie) reguleren, processen die de opbouw en ontwikkeling van complexe meercellige organismen (plant en dier), vanuit een enkele cel sturen de vorming van geslachtscellen, bevruchting en de overdracht van genetische informatie naar de volgende generatie Eindtermen De student: kan verschillende typen van levensvormen en en hun ontwikkelingscycli globaal beschrijven. kan de opbouw van een cel en zijn belangrijkste componenten (macromoleculen) beschrijven. kan de celcyclus beschrijven en de gebeurtenissen tijdens specifieke fases benoemen. kan de opbouw van genen en chromosomen in pro- en eukaryoten beschrijven heeft inzicht in replicatie, mutatie en DNA-repair mechanismen heeft inzicht in de synthese van een rijp mRNA (transcriptie, RNA processing) heeft inzicht in de synthese van eiwitten en het transport naar hun eindbestemming in de cel heeft inzicht in mechanismen die de activiteit van genen en differentiatie van cellen sturen kan de anatomische veranderingen tijdens (embryonale) de ontwikkeling van plant en dieren globaal beschrijven. heeft inzicht in de moleculaire mechanismen die de ontwikkeling van hogere organismen sturen heeft inzicht in processen die het geslacht en geslachtskenmerken bepalen in verschillende soorten. heeft inzicht in de ontwikkeling van geslachtcellen (gameten), bevruchting en de gevolgen daarvan voor de overdracht van genen naar het nageslacht (Mendelse genetica) Onderwijsvorm Hoorcolleges (ca. 40 uur), werkgroepen en practica (ca 60 uur), excursies naar o. a Vrolik museum (16 uur) en zelfstudie (ca. 80 uur). Deelname aan het practicum en werkgroepen is verplicht. Toetsvorm De stof die hier wordt behandeld wordt geëxamineerd in 5 deeltoetsen. Het theoretische deel (hoorcolleges) wordt afgesloten met een tentamen aan het eind van de cursus. Het vak kan alleen met een voldoende afgesloten worden als deelgenomen is aan de blusinstructie. Studenten worden hiervoor ingeroosterd ofwel in het najaar 2010, ofwel in februari 2011. De indeling van deze groepjes wordt bekendgemaakt via de Blackboardsite van de cursus die op dat moment loopt voor de eerstejaars. Literatuur
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 33 van 150
- Leerboek(en): Informatie over de te geburiken boek(en) wordt later bekendgemaakt. - Prakticumhandleiding (te verkrijgen bij aanvang cursus, prijs ca 10 euro). Additionele informatie wordt middels de cursussite op Blackboard (gratis) verstrekt Doelgroep Verplichte cursus voor de eerstejaars BSc Biologie
De microbiële cel Vakcode
AB_470201 ()
Periode
Periode 2
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. F.C. Boogerd
Docent(en)
prof. dr. H.V. Westerhoff, dr. ir. B.W. Kooi, dr. F.C. Boogerd, dr. W.F.M. Roling
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Het introduceren en verdiepen van biologische, modelmatige en ecologische concepten en technieken dat nodig is om de microbiële cel en zijn interne en externe interacties te kunnen gaan begrijpen als de kleinste en eenvoudigste eenheid van autonoom leven. Het introduceren en verdiepen van experimentele en modelmatige technieken waarmee dat leven en zijn interacties bestudeerd kan worden. Eindtermen: Inzicht in het verschil tussen de levende cel en zijn samenstellende moleculen. Overzicht van en inzicht in de microscopische methodes. Overzicht van en inzicht in van de structuren en functies in en van membranen. Overzicht van de microbiële metabole diversiteit. Inzicht in de diversiteit van kweekmethoden in samenhang met deze diversiteit. Overzicht van de overeenkomsten en verschillen tussen virussen en andere micro-organismen. Begrip van de controle van microbiële groei. Overzicht van de regulatiemethodes en de integratie van regulatie. Kennismaking met de wiskundige modellen in de microbiologie en microbiële ecologie. Begrip van en inzicht in de microbiële ecologie. Kennismaking met de industriële microbiologie. Vaardigheid in microbiële basistechnieken (aseptisch werken). Vaardigheid in de specifieke mogelijkheden geboden door microbiële experimenten. Vaardigheid in het gebruiken en opstellen van kleine modellen van microbiële groei en interactie. Niveau 2: verdieping Inhoud vak
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 34 van 150
De cursus bestaat uit een microbiologisch basisdeel en vier speciale themadelen. In de basiscursus wordt de microbiologische theorie onderwezen en met experimenten geïllustreerd. Het eerste thema handelt over de georganiseerde microbiële cel. Integratie van cellulaire regulatie wordt theroretisch en practisch bestudeerd. De twee volgende thema's, de microbiële cel als model en de natuurlijke microbiële cel, worden geïntegreerd onderwezen in twee weken. Een aantal onderwerpen uit de microbiologie en de microbiële ecologie zal hierbij theoretisch, praktisch en modelmatig worden bestudeerd. Als laatste thema zal de nuttige microbiële cel centraal staan. Er wordt aandacht gegeven aan biotechnologische en maatschappelijke aspecten van de microbiologie en de microbiële ecologie. Onderwijsvorm Basisdeel: 22 uur hoorcolleges; 30 uur practicum. Themadelen: 31 uur hoorcollege; 33 uur practicum; 28 uur computerpracticum; 24 uur werkstuk, incl. verslag. Toetsvorm Na de basiscursus en het eerste themadeel wordt een schriftelijk tentamen (100%) afgenomen (theorie en praktijk) over deel I. Het cijfer voor deel II bestaat uit drie onderdelen: (i) een schriftelijk tentamen (60%) over de resterende themadelen, (ii) een werkstuk/verslag (25%) en (iii) een computeropdracht (15%). Van deze drie cijfers mag u één 5.0 laten staan, mits u een voldoende heeft voor deel II als geheel. Literatuur Madigan, Martinko, Dunlap and Clark: Brock; Biology of Microorganisms; twelfth international edition; Pearson, Prentice-Hall Inc. Prijs ca. 70 euro. De hoofdstukken 1-2, 4-6, 9-10, 13-18, 20-27 uit dit boek dienen (deels) bestudeerd te worden. De practicum- en computerhandleiding kost elk 10 euro. Naast het bovengenoemde boek dient ook de handleidingen (theorie en praktijk) bestudeerd te worden voor de twee schriftelijke tentamens. Aanbevolen voorkennis De eerstejaars vakken worden bekend verondersteld. Doelgroep Verplicht voor tweedejaars BSc Biologie. Overige informatie Een laboratoriumjas is verplicht voor de Microbiologische practica.
Drugs en verslaving Vakcode
AB_470081 (450003)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. A.N.M. Schoffelmeer
Doel vak Het verkrijgen van inzicht in de pathogenese van drugs- en alcoholverslaving en van de verslavingszorg in Nederland. Niveau 2: verdieping
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 35 van 150
Inhoud vak De student zal kennis nemen van de meest moderne inzichten met betrekking tot de epidemiologie, psychologie, neurobiologie en farmacologie van verslaving aan middelen (nicotine, cocaïne, heroïne, amfetamine, alcohol, cannabis) en in contact treden met een aantal instellingen op het terrein van de verslavingszorg. De verkregen informatie zal worden verwerkt in een door de student te schrijven beleidsnotitie. Onderwijsvorm Hoorcolleges; Demonstraties; Literatuurstudie; Excursies naar verschillende instellingen in de regio; Mondelinge presentatie; Werkstuk. Toetsvorm Het cijfer wordt bepaald door beoordeling van de tijdens de cursus te schrijven beleidsnotitie Literatuur Recente overzichtsartikelen over de bij de hoorcolleges behandelde stof. Door zorginstellingen verschafte schriftelijke informatie. Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen en Gezondheid en Leven Overige informatie Voor het cursusboek dient de eerste dag een bedrag van; 25 euro te worden betaald. Inschrijving via TIS (regulier, dus mogelijk tot zes weken voor begin van de cursus). Daarnaast dient men, teneinde tijdig afspraken te kunnen maken met de participerende instellingen op het terrein van de verslavingszorg, zich uiterlijk 1 maand voor aanvang van de cursus in te schrijven bij de cursusleider (anm. schoffelmeer@vumc. nl). Te laat inschrijven betekent uitsluiting van deelname! Er kunnen maximaal 30 studenten meedoen aan deze cursus. Voorrang wordt verleend aan; studenten Gezondheidswetenschappen en Gezondheid en Leven.
Dynamiek van het historische landschap Vakcode
AB_450212 (450003)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. A.M.J. de Kraker
Docent(en)
dr. A.M.J. de Kraker
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Excursie
Doel vak Studenten verkrijgen de basale kennis over de historische geografie van Nederland. Doelstelling is ook het verkrijgen van kennis en inzicht in
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 36 van 150
ons cultureel erfgoed en in hoe processen van besluitvorming in het verleden nog steeds invloed hebben op het huidige landschap en ons leefmilieu. Inhoud vak Tijdens de cursus worden de belangrijkste landschaptypes in Nederland besproken en de interactie tussen mens en natuur op een tijdschaal van voornamelijk de laatste 1000 jaar. Hoe zijn deze landschappen voortdurend veranderd en wat zijn de belangrijkste factoren die dit proces van transformatie sturen? Hiervoor is kennis nodig van de belangrijkste sociale, politieke en economische systemen die gedomineerd hebben tijdens het laatste millennium. Hiervoor is ook kennis nodig van de natuurlijke processen in dit tijdvak, zoals zeespiegelstijging t.o.v. het landwinningsproces-/watermanagement en kustbeheer, klimaatveranderingen versus landbouwproductie en -systemen. Tijdens de cursus worden ook methoden en instrumenten besproken die door historisch geografen worden gebruikt, zoals geschreven bronnen en oude kaarten. Tenslotte wordt tijdens de cursus het kleilandschap in het veld nader toegelicht. Dit gebeurt door een bezoek aan de verdronken laatmiddeleeuwse structuren in de Zeeuwse Delta en vervolgens de oudste poldergebieden in Zeeuws-Vlaanderen. Onderwijsvorm Hoorcolleges, practica (paper en presentatie) en dagexcursie naar een der hoofdlandschapstypen Toetsvorm Schriftelijk tentamen Literatuur Barends, S., e.a. (eds. ) (2005) Het Nederlandse landschap. Een historisch-geografische benadering. 9e druk. Matrijs, Utrecht. Harde, Marty & Hans van Triest (eds. ) (1994) Jonge Landschappen 1800-1940. Het recente verleden in de aanbieding Matrijs Utrecht. Gedeelte uit: Berendsen, H.J.A. (2005) Landschap in delen. Overzicht van de geofactoren. Fysische geografie van Nederland. Koninklijke van Gorcum.
Ecologie, mens en natuur Vakcode
AB_470178 (450003)
Credits
12.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. M.P. Berg
Docent(en)
dr. ir. B.W. Kooi, prof. dr. M.A.P.A. Aerts, prof. dr. J.H.C. Cornelissen, dr. M.P. Berg
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Inzicht geven in en in het veldonderzoek toepassen van de relatie tussen organismen en hun milieu en de invloed van de mens op behoud en beheer van biodiversiteit en natuurlijke hulpbronnen. Eindtermen: Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 37 van 150
De student is in staat: - de basisprincipes van populatiedynamica, levensgemeenschapssamenstelling en ecosysteem functioneren te benoemen en te begrijpen en aan de hand van wiskundige modellen te analyseren. - de basisprincipes van zelfregulerende mechanismen binnen ecosystemen te benoemen en te begrijpen - de samenhang tussen geologie, klimaat, bodemtype en het voorkomen van soorten te beschrijven - Nederlandse plant- en diergeografische districten te omschrijven en hun bijbehorende kensoorten te benoemen - de belangrijkste planten- en insecten families in het veld te herkennen - het begrip indicatorsoort te omschrijven en voorbeelden te benoemen voor diverse landschappen (duingebied, kwelders, moerassen, hoog- en laagveen, rivierdalen, dekzanden, stuwwal) - inventarisatie- en monitormethoden te selecteren en toepassen die een kwalitatieve of kwantitatieve beschrijving geven van veranderingen in biodiversiteit - de belangrijke factoren die natuurbeheer en biodiversiteitbehoud bepalen te benoemen - de belangrijke factoren te benoemen die de relatie mens en ecosysteem bepalen Cursusniveau: 1 (basiscursus) Inhoud vak Theoretisch algemeen deel - Algemene inleiding: Hoe kan een mens duurzaam leven op aarde? - Basisprincipes van de ecologie: het functioneren van ecosystemen - Basisprincipes van de ecologie: levensgemeenschappen, biomen en aquatische milieus - Basisprincipes van de ecologie: zelfregulerende mechanismen binnen ecosystemen - Natuurlijke successie - Populatiedynamica en in het bijzonder de menselijke populatie - Analyse van predator- prooi en concurrentiemodellen mbv stelsels differentiaalvergelijkingen en fasediagrammen - Patronen in biodiversiteit en het behoud ervan - Basisprincipes van de ecologie: stromen van energie en materie - Klimaatverandering en de rol van de mens daarin - Plagen en pesticiden - Natuurbeheer en -behoud Onderwijsvorm Theoretisch deel - Theorie colleges gedurende de eerste maand (28 uur) - Schriftelijke opdrachten maken over de theorie - Werkcollege - Computerpractica (2 dagdelen), waarin (a) menselijk populatiegroei wordt gesimuleerd; (b) effecten van atmosferische N- depositie en natuurbeheer op heides wordt gesimuleerd. inhoud en werkwijze praktisch deel Excursies, veldwerk en determineerpractica, incl bijbehorende colleges (totaal 5 weken; hoorcolleges, nabesprekingen en gastdocenten: 16 uur; opdrachten: 10 uur; practica: 18 uur; excursies: 26 uur, 4. 5 dag; Veldwerk: 54 uur, 8 dagen; resterende tijd: zelfstudie). - de duinen: kensoorten, vergelijking soortensamenstelling kalkrijke en - arme duinen, invloed abiotiek op soortensamenstelling - de veenweiden: kensoorten, waterkwaliteitbeoordeling met macrofauna en waterplanten Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 38 van 150
- pleistocene dekzanden met rivieren en vennen: kensoorten, aanpassing aan droog- nat gradiënten, vangmethodieken en inventarisatiemethoden - practicum herkennen plantenfamilies en ongewervelden- groepen - veldwerk rivierduin- uiterwaardebos gradiënt, koppeling geomorfologie bodem aan vegetatie en fauna - eigen opdracht in tweetallen - veldpracticum Dijkgatsweide: herkenning van vogels en technieken op het gebied van broedvogelkartering. Literatuur Verplichte boeken: C.R. Townsend, M. Begon & J.L. Harper. Essentials of Ecology, Blackwell Science Publishers, Oxford. 2008 (3rd edition). ISBN 978-1-4051-5658-5 (prijs ± 50 euro). R. van der Meijden 2005. Heukels Flora van Nederland. Wolters-Noordhoff (23e druk), ±50 euro. M. Chinerey. 2004. Nieuwe Insectengids Tirion (5e druk) ±30 euro. Studiehandleiding (±13 euro). De aanschaf hiervan is verplicht. Doelgroep Verplicht voor eerstejaars BSc Biologie. Overige informatie Aanschaf van een loupe (15x) is verplicht. Voor de excursies en veldwerkweken is er een eigen bijdrage van 120 euro (50% van de werkelijke kosten).
Ecologie, mens en natuur I Vakcode
AB_1001 ()
Periode
Periode 5
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. M.P. Berg
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Computerpracticum, Practicum, Werkgroep
Doel vak Inzicht geven in de relatie tussen organismen en hun milieu en de invloed van de mens op behoud en beheer van biodiversiteit en natuurlijke hulpbronnen. Eindtermen: De student is in staat: • de basisprincipes van populatiedynamica, levensgemeenschapssamenstelling en ecosysteem functioneren te benoemen en te begrijpen en aan de hand van wiskundige modellen te analyseren. • de basisprincipes van zelfregulerende mechanismen binnen ecosystemen te benoemen en te begrijpen • de belangrijke factoren die natuurbeheer en biodiversiteitbehoud bepalen te benoemen • de belangrijke factoren te benoemen die de relatie mens en ecosysteem bepalen Niveau: 1 (basis). Inhoud vak Theoretisch algemeen deel • Algemene inleiding: Hoe kan een mens duurzaam leven op aarde? Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 39 van 150
• Basisprincipes van de ecologie: het functioneren van ecosystemen • Basisprincipes van de ecologie: levensgemeenschappen, biomen en aquatische milieus • Basisprincipes van de ecologie: zelfregulerende mechanismen binnen ecosystemen • Natuurlijke successie • Populatiedynamica en in het bijzonder de menselijke populatie • Analyse van predator-prooi en concurrentiemodellen mbv stelsels differentiaalvergelijkingen en fasediagrammen • Patronen in biodiversiteit en het behoud ervan • Basisprincipes van de ecologie: stromen van energie en materie • Klimaatverandering en de rol van de mens daarin • Plagen en pesticiden • Natuurbeheer en -behoud Onderwijsvorm • Theorie colleges (28 uur) • Schriftelijke opdrachten maken over de theorie • Werkcollege • Computerpractica (2 dagdelen), waarin (a) menselijke populatiegroei wordt gesimuleerd; (b) effecten van atmosferische Ndepositie en natuurbeheer op heides wordt gesimuleerd. Excursie en veldwerk, incl bijbehorende colleges (totaal 3 dagen; hoorcolleges, nabesprekingen en gastdocenten: 16 uur; opdrachten: 10 uur; practica: 18 uur; excursies: 6uur, 1 dag; Veldwerk: 12 uur, 2 dagen; resterende tijd: zelfstudie). • Oostvaardersplassen: Natuurbeheer en de rol van grote grazers daarin • Amsterdamse Bos en omgeving: Veldpracticum vogelherkenning, in kaart brengen van territoria en bepalen van populatieomvang. Toetsvorm Alle practische onderdelen van de cursus (incl. computerpractica, excursie en veldwerk) zijn verplicht. Als deze niet worden gevolgd, kan er geen eindcijfer worden gehaald. Het algemene theoretisch deel wordt afgesloten met een schriftelijk tentamen (90 % van het eindcijfer). Verder zijn er een aantal Web Research Questions (10%). Voor dit theoretische deel moet tenminste een 5,5 gehaald worden. Literatuur Verplichte boeken: C.R. Townsend, M. Begon &J.L. Harper. Essentials of Ecology, Blackwell Science Publishers, Oxford. 2008 (3rd edition). ISBN 978-1-4051-5658-5 (prijs ± 50 euro). Studiehandleiding (±15,- euro). De aanschaf hiervan is verplicht. Doelgroep Verplicht voor eerstejaars BSc Biologie.
Ecologie, mens en natuur II Vakcode
AB_1002 ()
Periode
Periode 6
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 40 van 150
Coördinator
dr. M.P. Berg
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Practicum
Doel vak Het kunnen omschrijven van de relatie tussen organismen en hun milieu en de invloed van de mens op deze realtie. In het veld toepassen van methoden om diversiteit te beschrijven. Eindtermen: De student is in staat: • de samenhang tussen geologie, klimaat, bodemtype en het voorkomen van soorten te beschrijven • Nederlandse plant- en diergeografische districten te omschrijven en hun bijbehorende kensoorten te benoemen • de belangrijkste planten- en insecten families in het veld te herkennen • het begrip indicatorsoort te omschrijven en voorbeelden te benoemen voor diverse landschappen (duingebied, kwelders, moerassen, hoog- en laagveen, rivierdalen, dekzanden, stuwwal) • inventarisatie- en monitormethoden te selecteren en toepassen die een kwalitatieve of kwantitatieve beschrijving geven van veranderingen in biodiversiteit Niveau: 1 (basis). Inhoud vak • de duinen: kensoorten, vergelijking soortensamenstelling kalkrijke en -arme duinen, invloed abiotiek op soortensamenstelling • de veenweiden: kensoorten, waterkwaliteitbeoordeling met macrofauna en waterplanten • pleistocene dekzanden met rivieren en vennen: kensoorten, aanpassing aan droog-nat gradiënten, vangmethodieken en inventarisatiemethoden • practicum herkennen plantenfamilies en ongewervelden-groepen • veldwerk rivierduin-uiterwaardebos gradiënt, koppeling geomorfologie bodem aan vegetatie en fauna Onderwijsvorm Excursies, veldwerk en determineerpractica, incl bijbehorende colleges (totaal 5 weken; hoorcolleges, nabesprekingen en gastdocenten: 16 uur; opdrachten: 10 uur; practica: 18 uur; excursies: 26 uur, 4.5 dag; Veldwerk: 40 uur, 8 dagen; resterende tijd: zelfstudie). Toetsvorm Alle practische onderdelen van de cursus (incl. excursies en veldwerkweek) zijn verplicht. Als deze niet worden gevolgd, kan er geen eindcijfer worden gehaald. De determineer- en veldwerkpractica worden afgesloten met een toets benoemen van planten resp. dieren (schriftelijk 40 %), deeltoets relatie landschap-organismen (essayvragen, 30 %), een vaardigheidstoets voor het determineren van planten en dieren (schriftelijk 20 %) en presentatie over een deel van het veldwerk (mondeling 10 %). Voor dit praktische deel moet tenminste een 5,5 gehaald worden om tot een voldoende eindresultaat voor de cursus te komen. Literatuur R. van der Meijden 2005. Heukels Flora van Nederland. Wolters-Noordhoff (23e druk), ±50 euro. H. Bellmann. 2009. Insectengids ±30 euro. Studiehandleiding (±15,- euro). De aanschaf hiervan is verplicht. Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 41 van 150
Doelgroep Verplicht voor eerstejaars BSc Biologie Overige informatie Aanschaf van een loupe (15x) is verplicht. Voor de excursies en veldwerkweken is er een eigen bijdrage van 140,- euro (50% van de werkelijke kosten).
Ecotoxicologie Vakcode
AB_470047 ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. ir. C.A.M. van Gestel
Docent(en)
dr. ir. C.A.M. van Gestel, dr. H. Schat, dr. D.T. Jager
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Computerpracticum
Doel vak Kennismaken met de basisprincipes van de ecotoxicologie en in het bijzonder verwerven van inzicht in: de bronnen en eigenschappen van potentieel toxische stoffen; de lotgevallen van potentieel toxische stoffen in het milieu; de werkingsmechanismen van toxische stoffen; de reactie van levende organismen op potentieel toxische stoffen; de effecten van potentieel toxische stoffen op het niveau van individu, populatie en levensgemeenschap; de toepassing van ecotoxicologische kennis in de risicobeoordeling van stoffen. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus geeft een inleiding in de herkenning, analyse en voorspelling van milieuproblemen door potentieel toxische stoffen. De nadruk ligt op de relatie tussen het werkingsmechanisme van de stof en de effecten op populaties, inclusief de ontwikkeling van resistentie. In de cursus worden milieuchemische, toxicologische en ecologische aspecten geïntegreerd. Ten slotte komt de toepassing van ecotoxicologische gegevens in de milieunormstelling aan de orde. De aangeboden theorie omvat de volgende elementen: Overzicht milieugevaarlijke stoffen; Verspreiding en mobiliteit; Biologische beschikbaarheid en opname-/eliminatiekinetiek; Dosis-effect-relaties; Werkingsmechanismen; Structuur-werkingsrelaties; Mengseltoxiciteit; Resistentieontwikkeling; Effecten op populaties en ecosystemen; Diagnosemethoden; Modellen voor stofgehalten en effecten; Normen in de milieuwetgeving. Onderwijsvorm
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 42 van 150
Hoorcolleges (± 26 uur); werkcolleges (± 12 uur); responsiecolleges (± 4 uur); zelfstudie (± 115 uur); tentamen (3 uur) Toetsvorm Schriftelijk tentamen Literatuur Principles of Ecotoxicology, Third Edition.C.H. Walker, et al. CRC Press Taylor & Francis Group, 2006, ISBN: 9780849336355, ISBN 10: 084933635X, prijs ongeveer; 50 euro. Aanbevolen voorkennis De bachelorcursus Ecologie, Mens en Natuur voor studenten Biologie of de bachelorcursus Histologie, Pathologie en Toxicologie voor studenten Biomedische wetenschappen of the bachelorcursus Gezondheid en Milieu voor studenten Gezondheidswetenschappen. Doelgroep Keuzevak voor derdejaars bachelorstudenten Biologie. De cursus staat open voor belangstellenden vanuit andere opleidingen. Studenten uit andere; opleidingen moeten vooraf contact opnemen met de docent en goedkeuring vragen bij de examencommissie van hun eigen opleiding.
Educating for the good life Vakcode
OH-EFG ()
Periode
Periode 1+2
Credits
6.0
Coördinator
prof. dr. D.J. de Ruyter
Docent(en)
prof. dr. D.J. de Ruyter
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Environmental Toxicology Course code
AB_1020 ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. ir. C.A.M. van Gestel
Teaching staff
prof. dr. J. Rozema, ing. L. Leewis MSc, dr. ir. C.A.M. van Gestel, dr. ir. T.H.M. Hamers, dr. D.T. Jager
Teaching method(s)
Study Group, Lecture, Computer lab, Practical
Course objective Become familiar with the basic principles of environmental toxicology and, more specifically, to obtain insight into: • Sources and properties of toxic chemicals; • Fate of toxic chemicals in the environment; • Methods of assessing the toxicity of chemicals; • Mode of action of toxic chemicals;
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 43 van 150
• Response of living organisms to toxic chemicals; • Effects of toxic chemicals at the biochemical, individual, population and community level; • Application of (eco)toxicological knowledge to the risk assessment of environmental chemicals. Course level: 2 Course content This course offers an introduction to the recognition, analysis and prediction of environmental and human health problems caused by potentially toxic chemicals. Emphasis lies on the relation between the mode of action of a chemical and its effects on individuals and populations. In this course, aspects from environmental chemistry and toxicology will be presented, while attention is also paid to aspects of ecology and risk assessment. The theory presented includes the following aspects: • History and aims of environmental toxicology; • Overview of potentially hazardous chemicals; • Distribution and mobility of chemicals in the environment; • Bioavailability, uptake and elimination kinetics; • Bioaccumulation, biotransformation and excretion; • Dose-response relationships; • Modes of action; • Structure-activity relationships; • Mixture toxicity; • Development of resistance; • Effects on populations and ecosystems; • Methods of environmental diagnosis; • Bioassays, biosensors and biomarkers; • Models for predicting chemical concentrations and effects; • Environmental and human risk assessment of chemicals; • Risk limits for chemicals in environmental legislation. Form of tuition Lectures (± 30 hours); work groups (± 10 hours); self study (± 115 hours); exam (3 hours). Type of assessment Written exam Course reading Principles of Ecotoxicology, Third Edition. C.H. Walker, et al. CRC Press Taylor & Francis Group, 2006, ISBN: 9780849336355, ISBN 10: 084933635X, approximately 50 Euros. Target group Optional for 3rd year bachelor students in the minor programmes Evolutionary Biology and Ecology (Biology) and Environmental Health (Health and Life Sciences). The course is open to students from other teaching programmes. Students from other programmes should contact the course coordinator and ask the examination committee of their own teaching programme for permission to attend the course.
Ergonomie Vakcode
AB_470092 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 44 van 150
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. M.J.M. Hoozemans
Docent(en)
dr. M.J.M. Hoozemans
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Practicum
Doel vak De student maakt kennis met het werkveld van de ergonomie. De student is in staat om modellen die gebruikt worden om ergonomische problemen te analyseren, te reproduceren, uit te leggen en toe te passen. De student kan diverse problemen op het gebied van mechanische, energetische en psychosociale arbeidsbelasting operationaliseren en uitleggen. De student kent gestructureerde methoden om ergonomische problemen op te lossen (zoals participatieve ergonomie) en weet ze toe te passen in verschillende situaties. De student toont inzicht in oplossingsstrategieën en effectiviteit van oplossingen specifiek voor de arbeidsgebonden gezondheidsproblemen 'lage rugpijn' en 'repetitive strain injury'. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Ergonomie streeft naar het zodanig ontwerpen van gebruiksvoorwerpen, technische systemen en taken, dat de veiligheid, de gezondheid, het comfort en het doeltreffend functioneren van mensen wordt bevorderd. Ergonomie speelt een belangrijke rol bij het functioneren van mensen tijdens het uitvoeren van dagelijkse handelingen bijvoorbeeld in het werk. In deze cursus zal de ergonomie dan ook vooral in relatie tot het verrichten van arbeid aan bod komen. Het functioneren van mensen kan daarbij bestudeerd worden vanuit de anatomie (mechanica), fysiologie en psychologie. Onder andere zullen de geometrie van werkplekken, de energetische belasting van brandweerlieden en psychosociale belasting van touringcarchauffeurs de revue passeren om aan te geven welke aspecten in het dagelijks werk belangrijk zijn om het werk zodanig in te richten dat gezondheidsklachten en ziekteverzuim kunnen worden vermeden. De modellen 'mens- machine- omgeving' en 'arbeidsbelasting' zullen in de cursus worden gebruikt om deze verschillende aspecten van het werk en het effect daarvan op het functioneren van mensen in een theoretisch kader te plaatsen. Onderwijsvorm Hoorcolleges en opdrachten/practica. Toetsvorm De eindbeoordeling van de cursus vindt plaats op grond van een schriftelijk individueel tentamen (2/3 van het eindcijfer) en een verplichte groepsopdracht (1/3 van het eindcijfer). Beide onderdelen dienen met een voldoende te worden afgesloten. Literatuur Syllabus met daarin opgenomen artikelen en boekhoofdstukken Doelgroep
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 45 van 150
Keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen Overige informatie De cursus zal doorgang vinden bij een minimale inschrijving van 8 deelnemers
Evolutie en diversiteit van leven Vakcode
AB_470175 ()
Periode
Periode 2
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. ir. C.A.M. van Gestel
Docent(en)
dr. ir. C.A.M. van Gestel, prof. dr. J.H.C. Cornelissen, prof. dr. N.M. van Straalen, prof. dr. J. Ellers
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Het doel van de cursus is inzicht te verkrijgen in de centrale rol van evolutionaire en ecologische processen bij de vorming van de hoofdlijnen van het leven van grotere taxonomische groepen organismen, de diversiteit en onderlinge samenhang van bouwplannen van bacteriën, archaea, protisten, planten, schimmels en dieren. Een belangrijk doel van de cursus is de onderliggende evolutionaire principes te analyseren en te beschrijven. Na afloop van de cursus is de student in staat: de voornaamste chemische bouwstenen van het leven te benoemen; de verdeling van macromoleculen over de stamboom van het leven en hun functionele betekenis te beschrijven; de belangrijkste bewijzen voor evolutie te omschrijven; de hoofdtijdperken in de evolutionaire geschiedenis aan te geven; de hoofdgroepen van bacteriën, protisten, planten, schimmels en dieren te benoemen en hun bouwplannen evenals de samenhang daartussen te beschrijven; de relatie aan te geven tussen bouwplannen en levenscycli van deze hoofdgroepen met hun leefomgeving in de loop van de evolutie inclusief het heden; met behulp van de microscoop en eenvoudig snijmateriaal de morfologie van planten en schimmels en de bouwplannen van hoofdgroepen van het dierenrijk te achterhalen; zelf overzichtstekeningen te maken van preparaten en bouwplannen (inzicht in structuren); de evolutie van de primaten en de mens te omschrijven; omschrijven welke factoren het ontstaan en behoud van genetische variatie bepalen; te berekenen hoe genfrequenties veranderen; m.b.v. computermodellen populatiegenetische processen analyseren; de mechanismen van soortvorming te omschrijven; zelf een fylogenetische reconstructie te kunnen maken; in staat een tot het schrijven van een verslag en een essay. Niveau 1: basiscursus Inhoud vak
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 46 van 150
Theoretisch deel (gegeven als college, werkcollege en e-learning) De werking van evolutie: de genetische motor, natuurlijke selectie, soortsvorming en extinctie; Genetische variatie, genetisch evenwicht, koppelingsevenwicht tussen loci, genetische drift, flessenhalseffecten; Het aangepaste organisme: levensgeschiedenis, ecofysiologie, geboorte en sterfte, dispersie; Evolutionaire samenhang van de bouwplannen van bacteriën, archaea, protisten, dieren, schimmels en planten; Fylogenetische analyse, cladistiek, soortvorming; Datering, geschiedenis van het leven op aarde in relatie tot milieufactoren in de opeenvolgende tijdvakken; Chemische aspecten van de ontwikkeling van het leven op aarde; Evolutie en diversiteit van leven: genotypische en fenotypische diversiteit; Evolutiebiologie in het dagelijks leven: evolutie van geslachtelijkheid, voortplantingsstrategieën, sociale evolutie, evolutie en gedrag van de mens. Praktisch deel: Laboratoriumpractica over de externe en interne morfologie van planten, bacteriën, schimmels en dieren, inclusief de bouwplannen van gewervelde dieren; Excursie Naturalis, excursie Artis, practica in botanische tuinen en kassen, fossielenwandeling; Werkcolleges/practicum chemie van de oorsprong van het leven; Computerpractica: simulatie van evolutionaire processen, opstellen van fylogenetische bomen; Uitwerken themaopdracht en schrijven essay. Onderwijsvorm Hoorcolleges (60 uur) Practica (60 uur) Werkcolleges/ computerpractica (16 uur) Excursies (8 uur) Zelfstudie Toetsvorm De toetsing bestaat uit een viertal in de tijd gefaseerde schriftelijke deeltoetsen en een schriftelijk eindtentamen, waarbij vragen in verband met stof uit leerboek, colleges, studiehandleiding en practica centraal staan. Toetsing vindt plaats op zowel kennis van als inzicht in de leerstof. De themaopdracht wordt afgesloten met een essay. De practica en excursies worden afgerond met een verslag. De deeltoetsen en de themaopdracht tellen elk voor 10% mee in het eindcijfer, het eindtentamen voor 50%. Literatuur Futuyma, D.J. (2009). Evolution. Second Edition. Sinauer Associates Inc., U.S. Hardcover: 633 pp. ISBN: 978-0-87893-223-8. Prijs ongeveer 80 euro. Sadava, D., Hillis, D.M., Heller, H.C., Berenbaum, M.R., (2011). Life, The Science of Biology, Ninth Edition. Vol. II: Evolution, Diversity and Ecology: (Chs. 1, 21-33, 54-59). W.H. Freeman. Paperback, 389 pp. ISBN: 978-1-429-24644-6. Prijs ongeveer 50 euro. Syllabus ter ondersteuning van het snijpracticum, de practica in botanische tuinen, kassen en musea, en de computerpractica. Prijs ongeveer 30 euro, inclusief materialen voor snijpracticum en toegang tot het museum Naturalis en Artis.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 47 van 150
Aanbevolen voorkennis Het eerstejaarsvak Cyclus van het leven vormt de basis voor dit vak Doelgroep Verplicht vak voor eerstejaars bachelorstudenten Biologie. De cursus staat open voor belangstellenden vanuit andere opleidingen. Studenten uit andere opleidingen moeten vooraf contact opnemen met de docent en goedkeuring vragen bij de examencommissie van hun eigen opleiding. Overige informatie Een laboratoriumjas tijdens de practica is verplicht. Snijmaterialen kunnen aangeschaft worden bij het eerste snijpracticum (een volledige snijset kost ongeveer 25 euro).
Evolutie van de mens Vakcode
AB_470055 ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. N.M. van Straalen
Docent(en)
prof. dr. N.M. van Straalen
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Practicum
Doel vak Kennismaking met discussies over de reconstructie van de evolutie van homininen. Verwerven van inzicht in de argumenten die vanuit verschillende disciplines gebruikt worden om zulke reconstructies te onderbouwen. Eindtermen De student is in staat: - de huidige stand van zaken met betrekking tot de afstammingsgeschiedenis van Homo sapiens en andere homininen uiteen te zetten; - bewijsmateriaal voor humane evolutie vanuit de moleculaire genetica, de palaeantropologie en de vergelijkende ethologie op hun waarde te schatten; - zich een oordeel te vormen over recente artikelen in Nature en Science waarin nieuwe palaeontologische vondsten en genetische gegevens gepresenteerd worden. Niveau 2: verdieping Inhoud vak In de cursus worden de principes van de evolutieleer en de fylogenetische analyse geïllustreerd, gevolgd door een analyse van fossiele en genetische gegevens en hun belang voor de reconstructie van de homininen- subfamilie. Achtereenvolgens komen aan de orde: - Historische visies op de evolutie van mensen; - Dateringsmethodes en tafonomie; - Fylogenetische reconstructies; - Bouwplannen van de primaten; - Sociale structuren en seksueel gedrag bij apen en mensen; - Anatomische overeenkomsten tussen mensapen en mensen; - De oorsprong van de homininen; Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 48 van 150
- Evolutionaire verklaringen voor bipedalisme; - De Australopithecus- soorten; - Homo habilis en Homo erectus; - Verschillende culturen van stenen werktuigen; - Het raadsel van de neanderthalers; - De oorsprong van Homo sapiens: in Afrika?; - Evolutie van de hersenen, zelfbewustzijn en taal; - Migraties van Homo sapiens; - De landbouwrevolutie. Onderwijsvorm Responsiecolleges (8 uur); hoorcolleges (12 uur); osteologisch practicum met humane botten en modellen van fossiele schedels (8 uur); onbegeleide zelfstudie (120 uur); excursie (8 uur) Literatuur Verplicht studieboek: R. Lewin & R.A. Foley, Principles of Human Evolution, ; 2nd edition, ; Blackwell Science, Malden, ISBN 0 632 04704 6. Prijs ongeveer 55 euro. Tevens is een syllabus nodig, prijs ongeveer 20 euro, waarin tevens de toegang tot de grot van Sclayn en vervoer vanaf Maastricht begrepen is Aanbevolen voorkennis Basiskennis van evolutiebiologie op het niveau van de eerstejaars cursus voor biologen (470175) of biomedische wetenschappers (470154) wordt sterk aanbevolen. Voor de BSc Gezondheid en Leven wordt de kennis van; Mens en Evolutie; (487013) bekend verondersteld. Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars bachelorstudenten Biologie, Biomedische wetenschappen, Gezondheidswetenschappen. De cursus staat open voor belangstellenden vanuit andere opleidingen. Studenten uit andere studierichtingen moeten vooraf contact opnemen met de docent en goedkeuring vragen bij de examencommissie van hun eigen opleiding.
Evolution and Human Behavior Vakcode
OH-EHB ()
Periode
Semester 2
Credits
6.0
Faculteit
Onderwijscentrum VU
Docent(en)
dr. G.C.F. Thomese
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Evolutionaire ecologie en gedrag Vakcode
AB_470074 ()
Periode
Periode 6
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. J. Ellers
Docent(en)
dr. G.J.J. Driessen, prof. dr. J. Ellers
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 49 van 150
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Computerpracticum, Practicum, Werkgroep
Doel vak Kennis en inzicht verwerven in de principes en de onderliggende mechanismen van de evolutionaire ecologie en de gedragsecologie. Eindtermen De student kan: de verschillen tussen een proximate en een ultimate benadering van ecologische vragen benoemen; optimaliteitstheorie en kosten-batenanalyses toepassen bij ecologische vraagstukken; de principes van de ideaal vrije verdeling uitleggen de voor- en nadelen van leven in groepen benoemen en hieruit de optimale groepsgrootte afleiden in verschillende ecologische context een vergelijking maken tussen verschillende typen paarsystemen en hun ecologische vereisten; alternatieve reproductieve strategieën benoemen en hun voorkomen verklaren; de evolutionaire consequenties van seksuele selectie omschrijven; een voorbeeld geven van co-evolutie en de onderliggende mechanismen identificeren ; uitleggen wat evolutionair stabiele strategieën zijn; de evolutie en functie van signalen en communicatie omschrijven het voorkomen van altruïsme verklaren aan de hand van evolutionaire theorie ecologische vragen, voortkomend uit bovenstaande benaderingen, omzetten in oplosbare deelproblemen en (veld)-experimenten ontwerpen om de geformuleerde deelproblemen te beantwoorden. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De cursus besteedt aandacht aan evolutionaire verklaringen voor ecologische patronen. De centrale vraag in deze cursus is hoe strategieën of gedragingen van een individu kunnen bijdragen aan de overleving of reproductie van dat individu. Onderwerpen die aan de orde komen zijn oa.: Natuurlijke selectie, ecologie en gedrag Economische beslissingen in individuen; Concurrentie om resources; Co-evolutie en wapenwedlopen Leven in groepen; Evolutionair stabiele strategieën Seksueel conflict en seksuele selectie; Paarsystemen en ouderlijke zorg Alternatieve reproductiestrategieen Communicatie en evolutie van signalen Onderwijsvorm Het eerste deel van de cursus bestaat uit hoorcolleges over de theorie. In het tweede deel zullen de studenten in kleine groepjes zelf experimenteel (veld)werk verrichten. De veldwerkweek wordt op Schiermonnikoog uitgevoerd en dit is een verplicht onderdeel. Let op: er wordt een financiële bijdrage van de student gevraagd voor de veldweek. Toetsvorm Schriftelijk tentamen over de theorie (50%) Mondelinge en schriftelijke rapportage van het onderzoek (50%). Voor beide onderdelen moet minimaal een 5 worden gehaald. Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 50 van 150
Literatuur An introduction to Behavioural Ecology.J.R. Krebs & N.B. Davies (3rd ed.). Doelgroep Keuzecursus voor tweede- en derdejaars BSc Biologie. Overige informatie De cursus heeft een maximum aantal deelnemers van 30 studenten. Voor HBO- en andere instromers die dit vak in hun Pre-Masterprogramma hebben is het theoretische deel van deze cursus (de eerste twee weken) afgesplitst als een apart vak: Evolutionaire Ecologie en Gedrag (theorie), vakcode 470951. Voor deze deelcursus geldt geen maximum aantal deelnemers.
Evolutionaire genetica Vakcode
AB_470053 ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. J.M. Kooter
Docent(en)
dr. J.M. Kooter, dr. H. Schat, dr. ir. T.F.M. Roelofs
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum
Doel vak Verwerven van kennis en inzicht in : dynamische karakter van genetisch materiaal oorzaken genetische variatie op nucleotide, gen, en chromosoom-niveau genoomevolutie bij pro- en eukaryoten, en organellen evolutionaire gevolgen van sex ecologische en moleculaire oorzaken van soortvorming horizontale DNA overdracht moleculaire evolutie van pathogenen (bacterien, virussen, protozoa) gebruik van genomische databanken bij evolutiestudies modellen van de moleculaire oorsprong van leven op aarde reconstructie van fylogenetische bomen verschillende vormen van selectie en theoretische onderbouwing manieren waarop genetische variatie wordt gebruikt om oorzaken van stochastische en deterministische processen af te leiden toepassing van wiskundige regels die bestaan voor het gedrag van allelen van één of twee loci in ideale populaties, en voor genen met een kwantitatief effect Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus behandelt: - Genetische concepten die de basis vormen voor het begrijpen van de evolutietheorie, waaronder moleculaire evolutie, ontstaan van nieuwe genen en functies, genoom organisatie, vergelijkende genomics, soortvorming, evolutie humane genoom, relatie tussen ontwikkeling en evolutie (Evo- devo), en hypothesen over het ontstaan van `leven', - Theoretische principes van de populatie genetica, waaronder verschillende vormen van selectie, quantitatieve genetica, drift, en hun toepassingen bij het bestuderen van variatie en evolutie in Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 51 van 150
natuurlijke populaties. - Fylogenetische reconstructies op basis van DNA sequenties met behulp van een cladistisch computerprogramma - Fylogeografie Onderwijsvorm - Hoor- en werkcolleges (60 uur) - Literatuurbespreking (verplicht, 9 uur) - Computerpracticum (verplicht, 9 uur) - Zelfstudie - Ondersteuning via Blackboard Toetsvorm Schriftelijk tentamen (0.8) en een literatuurbespreking (0.2). Beide moeten voldoende zijn. Literatuur Studieboek: 'Evolutionary Analysis', Scott Freeman and Jon C. Herron, Fourth Edition, 2007, Pearson, Prentice Hall Syllabus met Onderzoeks- en Reviewartikelen over onderwerpen die niet in het boek worden behandeld Aanbevolen voorkennis Kennis van Genetica en Moleculaire Biologie; sluit aan bij Evolutie van de mens of Evolutiebiologie uit het eerste jaar Doelgroep Keuzevak voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Overige informatie De cursus wordt gegeven door de afdelingen Genetica, Ecologie en Fysiologie van planten, en Dierecologie.
Evolutionaire genetica * Vakcode
A_HP470053 (470505)
Credits
3.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.
Evolutionary Genetics Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 52 van 150
Course code
AB_1022 ()
Period
Period 2
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. J.M. Kooter
Teaching method(s)
Lecture, Seminar, Computer lab
Course objective • To understand the dynamic nature of DNA and genomes and the mechanisms responsible for genomic changes, loss and gain of genetic material and their evolutionary consequences • To understand and apply the basic concepts and mathematics of population genetics and the various forms of selection • To gain insight into phylogenetic relations and be able to apply methods for constructing phylogenetic trees Course content • Causes and mechanisms of genetic variation at nucleotide, gene, and chromosomal level • Genome evolution in pro- and eukaryotes • Evolution of chloroplasts and mitochondria • Horizontal DNA transfer • Evolutionary consequences of genome evolution and sex • Speciation • Molecular evolution of pathogens • Origins of life? • The use of bioinformatics: comparative genomics • Population genetics: allele frequencies, Hardy-Weinberg principle • Different forms of selection: genetic drift, gene flow • Use of genetic variation to examine stochastic and deterministic processes • Application of simple mathematical rules to examine the behaviour of alleles of one and two loci in ideal populations, and for genes with a quantitative effect. • Reconstruction of phylogenetic trees using DNA sequences and cladistic computer programs • Phylogeography • Evo-Devo Form of tuition • Lectures • Working groups • Literature discussion • Computer practicals (mandatory) • Assignments Type of assessment Written exam (0.8) and literature discussion (0.2). To pass, the grades for both assessments have to be 5,5 Course reading • Book: 'Evolutionary Analysis', Scott Freeman and Jon C. Herron, Fourth Edition, 2007, Pearson, Prentice Hall • Reader containing research and overview articles on topics that are not thoroughly enough discussed in the book Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 53 van 150
Recommended background knowledge Basic genetics and molecular biology Target group Students of the Minor ‘Evolutionary Biology and Ecology’, and other 3rd year Bsc students Biology en Biomedical Sciences
Experimental Cell Biology I Course code
AB_1047 ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. D. Bald
Teaching method(s)
Practical, Study Group, Lecture
Course objective The student has insight in biological processes fundamental in living cells. The student has an overview of techniques used in Cell Biology . Course content We start with a brief repetition of basic cell biology and then go ahead with in-depth discussion of modern Cell Biology, with a particular focus on current and emerging experimental techniques. In Research Lectures, current topcis in Cell Biology will be discussed. Topics: • General cell organization and function, Protein, DNA and RNA function, cell cycle and (programmed) cell death • Transcription factors, gene expression, and epigenetics • Protein modification, sorting, and membrane transport • Receptors and signal transduction • Basic techniques in Cell Biology (PCR, Electrophoresis, ELISA, • Current models organisms in Cell Biology (e.g. E. coli, yeast, C. elegans, drosophila, zebra fish, mammalian models) • Visualization techniques in Cell Biology Each student will also work on a literature assignment. Form of tuition Lectures, lab excursions, journal clubs. Type of assessment Written exam (60 %), literature assignment (40%) Course reading Alberts, Molecular Biology of the Cell Recommended background knowledge Basic (first and second year level) courses in Cell Biology Remarks Compulsory Portal Course Minor Biomolecular Sciences & Neurosciences
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 54 van 150
Experimental Cell Biology II Course code
AB_1048 ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. D. Bald
Teaching method(s)
Study Group, Lecture
Course objective The student has an overview of advanced techniques in Cell Biology. The student is acquainted with current open questions and on-going developments in Cell Biology. The student can use the gained knowledge in Cell Biology for the design of a research proposal. Course content In-depth discussion of modern Cell Biology, with a particular focus on current and emerging experimental techniques. In Research Lectures, current state-of-the-art topics in Cell Biology will be discussed. During lab excursions advanced techniques in Cell Biology will be demonstrated. Lecture topics include advanced -omic approaches, such as genomics, proteomics, metabolomics and interactomics. Research lectures on • Protein (GFP) labeling and visualization techniques • (Confocal) Microscopy and Live Cell Imaging • Proteomics and mass spectrometry • Micro-arrays and quantitative PCR • Knock-out and RNAi techniques • Interactomics techniques The student will work out and submit a research proposal on a chosen topic in Cell Biology Form of tuition Lectures and Research Lectures, lab excursions, demonstrations of advanced experimental techniques, journal clubs. Type of assessment Written exam (60 %), research proposal (40%) Course reading Alberts, original and review research papers Recommended background knowledge Basic (first and second year level) courses in Cell Biology, participation in Experimental Cell Biology I. Remarks Compulsory Portal Course Minor Biomolecular Sciences & Neurosciences
Experimental Immunology
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 55 van 150
Course code
AB_1055 ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Teaching method(s)
Practical, Lecture
Course objective This course will further extend the basic immunological knowledge obtained in the bachelor course Immunology and will prepare the students for immunology internships and the master specialization Immunology. The aim of the course is to • Acquire practical experience in immunological techniques • Acquire theoretical knowledge about immunological techniques and model systems, how to address immunological questions and how to interpret experimental results. • Advance immunological knowledge about many aspects of the innate and adaptive immune system Course content Lectures, experimental training (practica) and presentations • Lectures which will address immunological techniques and current immunological research models. • Experimental training to gain ‘hands-on’ experience with immunological techniques • Students will have to give a presentation on a immunological subject Attendance of experimental training and presentations is compulsory. Attendance of lectures is highly recommended Form of tuition Immunology lectures and experimental training Type of assessment Written Exam (100%), experimental training (pass), oral presentation of assignment (pass) Course reading Parham: The Immune System, 2e druk (zie jaar 1 immunologie) Reader with experimental protocols and literature; ca. 15 euro. Target group Third year Bachelor students Biomedical Sciences that have passed the course Immunology. Remarks Hepatitis B vaccination is required. Maximum number of participants: 80.
Experimentele immunologie Vakcode
AB_470229 ()
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 56 van 150
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Practicum
Doel vak Deze cursus is bedoeld ter verdieping van de basiscursus Immunologie, ter voorbereiding op bijvoorbeeld stage en de masterdifferentiatie Immunologie. Het doel van de cursus is o.a.: het verwerven van praktische vaardigheden op het gebied van immunologische technieken het verwerven van kennis en inzicht in de experimentele benadering van vraagstellingen binnen de (klinische) immunologie het beoordelen van en leren uit literatuur Meer gedetailleerde informatie over de cursus zal op Blackboard worden bekendgemaakt. Inhoud vak De basisimmunologie toepassen in theorie en praktijk (laboratorium) Onderwijsvorm Colleges en practica. Hoorcolleges, waarbij veelgebruikte immunologische onderzoeksmethoden zullen worden toegelicht; Werkgroep/werkcollege, waarbij in kleine groepen zal worden gewerkt en gepresenteerd; Practica, het uitvoeren van immunologische onderzoeksmethoden en het leren van praktische vaardigheden Deelname aan werkgroepen en practica is verplicht. Collegebezoek zeer relevant. Toetsvorm Schriftelijk tentamen (100%), presentaties van studieopdrachten en practica (moet voldoende zijn) Literatuur Parham: The Immune System, 2e druk (zie jaar 1 immunologie), 3e druk Syllabus met practicumhandleiding, literatuur; ca. 15 euro. Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Biomedische wetenschappen, die de verplichte bachelorcursus Immunologie met goed gevolg hebben afgerond. Ook toegankelijk voor derdejaars bachelorstudenten Gezondheidswetenschappen. Aanbevolen voor differentiatie Immunologie in de masterfase. Overige informatie Coördinator: dr. J. den Haan (VUmc). Maximum aantal deelnemers: 60. Studenten die deze cursus volgen dienen gevaccineerd te zijn tegen hepatitis B.
Farmacologie en medicijnontwikkeling Vakcode
AB_487022 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 57 van 150
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. T.J. de Vries
Docent(en)
prof. dr. T.J. de Vries, dr. T. Pattij, prof. dr. S. Spijker, prof. dr. A.B. Smit, dr. I.J.P. de Esch
Lesmethode(n)
Computerpracticum, Practicum, Hoorcollege
Doel vak Inzicht verkrijgen in: - de basale begrippen in de farmacologie, met in het bijzonder de psychofarmacologie; - de werkingsmechanismen van psychofarmaca; - het onderzoek naar en de ontwikkeling van nieuwe medicijnen. De student: - krijgt basaal inzicht in de aangrijpingspunten van farmaca/geneesmiddelen in ons lichaam (farmacodynamiek); - krijgt basaal inzicht in de processen waaraan een werkzame stof in het lichaam wordt onderworpen (farmacokinetiek); - begrijpt en bestudeert hoe psychofarmaca ons gedrag kunnen beïnvloeden; - krijgt inzicht in de verschillende fasen van de ontwikkeling van nieuwe medicijnen: targetfinding, computermodelling, diermodellen, clinical trials, registratie. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak Theoretisch gedeelte bestaat uit hoorcolleges, waarbij het boek 'Psychopharmacology, Drugs, The Brain and Behavior - Jerrold S. Meyer & Linda F. Quenzer', als basis dient. Daarnaast worden gastcolleges verzocht door experts op het terrein van de farmacologie, targetfinding, clinical trials en farmacotherapie. In een tweetal practica met geïsoleerde organen leren de studenten omgaan met een aantal essentiële farmacologische principes. Verder wordt de carrière van een markant psychofarmacon (bv. Prozac, Mediwiet, Haloperidol, Valium) nader bestudeerd en beschreven in een werkstuk met aandacht voor de werking, het gebruik, de bijwerkingen en de onderliggende pathologie. Er is een excursie naar een farmaceutisch bedrijf. Tenslotte zullen studenten aan de hand van een computerpracticum het effect van cafeïne op de eigen cognitieve vaardigheden bestuderen. Onderwijsvorm Hoorcolleges (18 uur), practica (11 uur), zelfstudieopdrachten en; een excursie (halve dag). Toetsvorm Schriftelijk tentamen (50 %) over hoorcolleges met multiple choice en open eind vragen op parate kennis en inzicht, werkstuk (50% van eindcijfer). Literatuur Boek: Psychopharmacology, Drugs, The Brain and Behavior - Jerrold S. Meyer & Linda F. Quenzer, Sinauer Associates, 2005 edition; ISBN 0-87893-534-7. Artikelen van gastdocenten Doelgroep
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 58 van 150
Keuzecursus derdejaars BSc Gezondheid en Leven.
Five O’Clock Neurosciences (Honours) Vakcode
A_HP003 ()
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. H.D. Mansvelder
Docent(en)
prof. dr. H.D. Mansvelder, dr. R.M. Meredith, dr. K. Linkenkaer Hansen, dr. C.P.J. de Kock
Lesmethode(n)
Werkgroep
Doel vak Leerdoelen van de cursus: de student heeft kennis van en doet ervaring op met - grote theorieën over de werking van het brein - het toetsen van theorieën aan wetenschappelijke realiteit - het wetenschappelijk debat - het houden van een betoog Naast een breed inzicht in de werking van het brein worden in deze cursus verschillende aspecten van wetenschappelijke theorievorming in de neurowetenschappen uitgelicht. Het toetsen van theorieën aan wetenschappelijke literatuur, het houden van een samenhangend mondeling betoog over feit en fictie van geopperde theorieën, het leiden van en deelnemen aan discussies daarover, en het schrijven van een essay bieden oefening in basale academische vaardigheden. Deze cursus oefent studenten in het denken buiten geëigende kaders, daagt studenten uit met overkoepelende visies op ons brein en dwingt studenten stelling te nemen ten aanzien van deze visies in mondelinge discussies en op papier. Inhoud vak Wat is bewustzijn? Hoe leren we iets? Bestaat vrije wil? Wie is er de baas in mijn brein? Theorieën over deze vragen staan centraal in de honourscursus Five O’Clock Neurosciences. Aan de hand van boeken van beroemde neurowetenschappers en wetenschappelijke artikelen ontdekken de studenten wat de laatste inzichten zijn in de werking van ons brein. Er zal naar worden gestreefd het hele terrein van zenuwcel tot mensgedrag te bespreken, en naast biomedische aspecten zullen ook elementen uit de psychologie, de psychiatrie en de medische wetenschappen aan de orde komen. De boeken die besproken zullen worden en die door studenten zelf gekozen worden, verschillen van het reguliere bacheloronderwijs en worden geselecteerd omdat ze vanuit een meer beschouwelijke visie geschreven zijn. Te denken valt daarbij aan ‘The error of Descartes’ van Antonio Damasio, ‘Musicophilia’ van Oliver Sacks, ‘Synaptic Self’ van Joseph Ledoux, en ‘Vrije wil bestaat niet’ van Victor Lamme. Deze literatuur wordt aangevuld met artikelen uit vooraanstaande tijdschriften om een weerslag te bieden van modern neurowetenschappelijk onderzoek dat probeert te ontrafelen hoe processen op moleculair, cellulair of netwerk niveau samenhangen met gedrag en het functioneren van de mens. Tijdens de inhoudelijke discussies wordt nagegaan waar de wetenschappelijke grenzen van theorieën over de werking van het brein liggen of overschreden worden.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 59 van 150
Onderwijsvorm - Boek- en artikelpresentaties door studenten - Discussiegroepen - Zelfstudie Vaardigheden en technieken die aan de orde komen: - Analyseren van wetenschappelijke en populair-wetenschappelijke teksten - Houden van een betoog - Deelname aan wetenschappelijk debat Bijeenkomsten vinden plaats 1x per week tussen 17 en 19 uur. Toetsvorm - Presentatie (40%) - Deelname aan discussies (10%) - Essay (50%) Literatuur - door student zelf te kiezen boek (wordt tijdens de 1e bijeenkomst toegelicht) - wetenschappelijke artikelen Aanbevolen voorkennis Gezien het niveau van besprekingen is kennis van de levenswetenschappen aan te bevelen, maar geen vereiste. Doelgroep De doelgroep voor deze cursus bestaat uit tweede- en derdejaars bachelorstudenten die geselecteerd zijn voor het VU honoursprogramma. Overige informatie Cursus loopt van 3 maart t/m 25 mei 2011. Van studenten wordt een actieve deelname in mondelinge presentaties en discussies verwacht. Deze cursus biedt een uitstekende orientatie en voorbereiding op de VU Master of Neurosciences (www.neurosciencecampus-amsterdam.nl).
From Protein to Cell Course code
AB_1052 ()
Period
Period 2
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. D. Bald
Teaching method(s)
Practical, Computer lab, Lecture
Course objective Knowledge of protein structure, function and regulation/inhibition, in particular techniques used to study these properties. You can use this knowledge later e.g. to study the molecular mechanism of a disease (protein malfunction), or to get insight in the working of a drug (protein inhibition), but also for applications in biotechnology or for basic research. The student knows: • Principles and applications of protein expression, purification, structure, function, and inhibition as well as and the function of antibiotics as protein inhibitors. Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 60 van 150
The student can: • Apply protein bio-chemistry methods (protein expression, affinity chromatography, spectro-photometry, fluorescence, protein labeling methods, gel electrophoresis, activity tests). Level 3: insight Course content The course consists of a mixture of lectures, practicals, computer sessions and individual study. We will cover principles/methods/techniques that you can use to study a broad range of relevant questions, e.g: • How can I produce a protein using bacteria? • How can I purify a protein? • How can I investigate structure and function of a protein? • How can I predict structure and function of a protein? • How do antibiotics work as protein inhibitors? • How can I design my experimental strategy? • Which factors I have to think about to make my experiment successful? Form of tuition You carry out experiments in small groups (3-4 students) together with a supervisor, supplemented by lectures, computer sessions and self-study. As a group, you write experimental reports and you hold a presentation on one of the experiments. Type of assessment Reports (50 %), oral presentation (50 %). Course reading Lecture slides and experimental protocols. Any biochemistry textbook can be used for repetition. Recommended background knowledge Participation in the Portal Courses Experimental Cell Biology I and II. Remarks Part of the Minor Biomolecular Sciences & Neurosciences, Track Biomolecular Sciences. A lab coat is mandatory for the lab practical lab work.
Future Challenges in Global Health Course code
AB_1042 ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
prof. dr. J.E.W. Broerse
Teaching staff
prof. dr. J.E.W. Broerse, prof. dr. J.T. de Cock Buning
Teaching method(s)
Study Group, Lecture
Course objective • Acquire insight in current and future challenges in global health • Understand how new developments in the health and life sciences
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 61 van 150
interact with global health problems • Acquire insight in de different policies which have been developed at national and international level to address global health challenges • Obtain knowledge on how policy making processes take place and what different visions on policy exist • Get acquainted with various management theories and insights on project/program management; • Acquire skills on problem analysis, using methods such as actor analysis and causal analysis, and on the identification and analysis of possible interventions; • Gain experience in working in a team on a project addressing a real-world global health challenge; • Be able to apply several data collection and analytic skills, such as formulating a research design, conducting a literature study, critically analyse various scientific publications, theories, hypotheses and arguments, apply interview methods and justify and present findings both orally and in writing Course content The world of biomedical and healthcare interventions is in constant flux: new and emerging infectious diseases, changing disease patterns, demographic changes, rising costs of health care – they all add complexity to its already considerable challenges. At the same time, innovative answers to these challenges emerge, like novel pharmaceuticals, neurotechnologies, gene therapy, telemedicine and using your iPhone as a heart rate monitor or as a tool in Parkinson's research, and field test kits that replace whole laboratories. But how can we make these answers fit the challenges that are emerging? History shows numerous, at best, not-so-effective health interventions and curious unintended consequences (for example: how does an anti-malaria campaign lead to collapsing roofs and to cats being parachuted over Borneo?). This course explores how we can learn from these experiences and improve, and how we can create windows of opportunity for better biomedical and health care interventions. The course starts by providing an overview of current and future challenges and scientific developments in the field of global health. We will also study how various countries and organisation, like the WHO, EU and UN, have dealt with these challenges, and why their policies have (not) been effective. We use policy models and management theories to analyse these real-world policies and programs. Addressing challenges in global health not only requires thorough knowledge of the health problem and possible interventions, it is also crucial to understand the policy process, people's minds and to have insight in how interventions can be put into practice effectively. For example, there is an almost perfect intervention to prevent the spread of HIV/AIDS: a condom… and still the disease spreads, not because of a lack of knowledge. When is scientific knowledge important? Where do politics come in? Do we need to involve more people in setting up health interventions? Do we need to work in public-private partnerships? In the second part of the course, you use your newly acquired knowledge in small project teams. As policy advisors with thorough knowledge of biomedical interventions, you will write a research proposal for a policy study on a specific real-world global health challenge, e.g. about why millions of Americans do not have access to health care in one of the richest countries in the world, or about limited access of women to maternal health care services in low-income countries. In this way, you will learn to work with the interdisciplinary practice of policy research and project management. The problem description and the various Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 62 van 150
policy options of the global health challenge are critically analysed, written down in a report and presented to all course participants. Level 2: insight Form of tuition Lectures, assignment, self study Type of assessment Written exam (60%) and assignment (40%). Both parts need to be passed. Course reading Reader or book Remarks Part of the minor Biomedical and health interventions
Future Entrepreneur Vakcode
OH_FE ()
Periode
Semester 2
Credits
6.0
Coördinator
C. Holleman
Docent(en)
prof. dr. E. Masurel
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Genen, hersenen en gedrag Vakcode
AB_470176 ()
Periode
Periode 4
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. H.K.E. Vervaeke
Docent(en)
dr. R.F. Jansen, prof. dr. M. Verhage, dr. R.O. Stiedl, prof. dr. R.E. Koes, dr. H.K.E. Vervaeke, prof. dr. A.B. Smit
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Kennis en inzicht verkrijgen in de functie van genen betrokken bij de bouw van de hersenen en het vormgeven van gedrag Het eerste deel van de cursus heeft als focus cellen, weefsels en systemen. Studenten krijgen inzicht in de bouw van zenuwstelsels in het gehele dierenrijk, inclusief het humane zenuwstelsel. Vervolgens leert de student begrijpen hoe neuronen communiceren. De student kan uitleggen hoe de actiepotentiaal tot stand komt en wordt voortgeleid doorheen het axon. De student heeft inzicht in het mechanisme van synaptische transmissie, intracellulaire signaalverwerking en hormonale regulatie. Vervolgens wordt er aandacht besteed aan gen-functie onderzoek modellen. De student kan uitleggen wat het belang is van het gebruiken van genetische modellen zoals gist, C. Elegans, Drosophila en muis in de neurobiologie. Het laatste deel van de cursus heeft als focus gedrag in het dierenrijk
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 63 van 150
(communicatie, sociaal gedrag, angst, depressie, stress, biologische klok en evolutionaire aspecten). Niveau 1: basiscursus Onderwijsvorm Hoorcolleges en practica (verplicht). Naast het bijwonen van hoorcolleges, bestuderen studenten zelf de cellen en systemen van het zenuwstelsel door middel van een brain map computerpracticum, een hands-on snijpracticum varkensbrein en een lichtmicroscopie-practicum. Studenten doorgronden het proces van neurale communicatie met behulp van computertutorials over membraanpotentiaal, actiepotentiaal en synaptische transmissie. Ze onderzoeken zelf de eigenschappen van zenuwvezels in het hands-on practicum Actiepotentialen in de regenworm Toetsvorm Drie schriftelijke deeltoetsen Literatuur Syllabus; Boek ‘Neuroscience’ Dale Purves, George J. Augustine & David Fitzpatrick, Sinauer Associates Inc.,U.S., 4th Revised edition, augustus 2007 (laatste literatuurupdate: 16 dec 2011) Doelgroep Verplicht voor eerstejaars BSc Biologie
Geschiedenis van de levenswetenschappen Vakcode
AB_1004 ()
Periode
Periode 4
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. I.H. Stamhuis
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak -Inzicht verkrijgen in de historische wortels van hedendaagse theorieën en praktijken -Bewustwording van de belang van maatschappelijke factoren in de ontwikkeling van de levenswetenschappen -Leren omgaan met historische vragen en literatuur Inhoud vak Behandeld worden enkele belangrijke veranderingen in de levenswetenschappen van de twee laatste eeuwen: het ontstaan van de genetica, de evolutietheorie van Darwin in de context van de 19e eeuw, de moleculaire biologie van 1930 tot 1960, de eugenetische beweging tussen 1870 en 1960, en de opkomst van de ecologie. Deze veranderingen worden besproken tegen de achtergrond van het ontstaan in de 19e eeuw van disciplines binnen de moderne universiteiten, van de karakteristieken van wetenschappelijke ontdekkingen en van de interactie tussen wetenschap en samenleving.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 64 van 150
Onderwijsvorm Hoorcolleges. Groepsopdrachten die in presentaties resulteren. Een Blackboardsite is aanwezig. Toetsvorm Groepsopdracht (40%) en schriftelijke tentamen (60%) Literatuur Artikelen
Gezondheid in grootstedelijke gebieden Vakcode
AB_487021 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Docent(en)
prof. dr. ir. J. Legler, dr. ir. T.H.M. Hamers, prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Practicum
Doel vak De student verwerft inzicht in: de invloed van bevolkingsdichtheid- en samenstelling op de gezondheid van inwoners van grootstedelijke gebieden de invloed van sociaal-economische factoren op de gezondheid van inwoners van grootstedelijke gebieden de invloed van luchtverontreiniging (o.a. polycyclische aromatische koolwaterstofverbindingen en dioxines) op de gezondheid van inwoners van grootstedelijke gebieden spelen de invloed van geluidsoverlast op de gezondheid van inwoners van grootstedelijke gebieden De student verwerft praktische vaardigheden met betrekking tot toxicologisch onderzoek (o.a. HPLC) Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De gezondheidstoestand van de bevolking in grootstedelijke gebieden verschilt van die in meer rurale gebieden. In deze cursus wordt aandacht geschonken aan de bijdrage die o.a. bevolkingsdichtheid- en samenstelling, sociaal-economische factoren, geluidsoverlast, en met name verontreiniging van de lucht hebben op de gezondheid van inwoners van grootstedelijke gebieden. Eindtermen: Aan het eind van de cursus kan de student: de interactie tussen sociale leefomgeving en humane gezondheid in grootstedelijke gebieden beschrijven de interactie tussen luchtverontreiniging en humane gezondheid in grootstedelijke gebieden beschrijven de interactie tussen geluidsoverlast en humane gezondheid in grootstedelijke gebieden beschrijven (onder begeleiding) toxicologisch onderzoek verrichten
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 65 van 150
Onderwijsvorm Hoorcolleges (22 uur), werkcolleges (6 uur), practica (46 uur) Toetsvorm Presentatie Literatuur Wordt te zijner tijd bekendgemaakt. Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheid en Leven en BSc Biomedische wetenschappen.
Gezondheidsrecht Vakcode
AB_470208 ()
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. mr. B.J.M. Frederiks
Docent(en)
prof. dr. mr. J. Legemaate, dr. mr. B.J.M. Frederiks
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak De cursus heeft twee doelstellingen: 1. Het geeft de studenten inzicht in de achtergrond en uitgangspunten van het gezondheidsrecht; 2. Het geeft de studenten inzicht in de middelen en mogelijkheden om het gezondheidsrecht toe te passen in de dagelijkse praktijk van de gezondheidzorg en/of het onderzoek. Niveau 2: verdieping. Inhoud vak Tijdens deze cursus verdiept de student zich in vijf thema's: Uitgangspunten van het gezondheidsrecht Rechten van patiënten Omgaan met fouten en klachten van patiënten Patiëntveiligheid en kwaliteit van zorg Beroepenregulering Onderwijsvorm Werkcolleges; werkgroepen; bezoek aan het tuchtcollege; presentaties en het schrijven van een paper Toetsvorm Paper (40 %), presentatie en schriftelijk tentamen (60%). Literatuur Blackbord en twee basisboeken: W.R. Kastelein en J. Legemaate, SDU Wettenverzameling gezondheidsrecht. (Editie 2010) en Leenen, H.J.J., Gevers, J.M.K. en J. Legemaate (2007). Handboek gezondheidsrecht, Deel 1 Rechten van mensen in de gezondheidszorg, vijfde herziene druk, Houten: Bohn Stafleu Van Loghum.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 66 van 150
Doelgroep Keuzevak voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen. Overige informatie Maximum aantal studenten: 75. Studenten kunnen aansluitend in de master het verdiepingsvak Health Law (Gezondheidsrecht) volgen.
Global change Vakcode
AB_450234 (450003)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
4.0
Voertaal
Engels
Coördinator
dr. M.J. Waterloo
Doel vak De Global Change cursus verschaft de student inzicht in de oorzaken van historische en recente veranderingen in het aardse klimaat en de terrestrische en oceanische milieus aan de hand van kennis over fysische, chemische en biologische processen die hierin een cruciale rol spelen. Inhoud vak De cursus begint met een inleidend college over wat er onder global change verstaan wordt en welke rol de mens hierin vervuld heeft sinds de industriële revolutie. Dit college wordt gevolgd door inleidende colleges over de opbouw van de atmosfeer en de algemene processen die ons weer en klimaat bepalen. De invloed van astronomische en geografische factoren op het klimaat, en de interactie tussen atmosferische, oceanische en terrestrische (biosfeer) systemen op het huidige klimaat en dat in het verleden worden hierna uitgebreid behandeld. Aandacht wordt gegeven aan de tijdschalen waarop de processen in deze systemen werken. Tot slot behandelen we de mogelijkheden om negatieve effecten van menselijk ingrijpen op het klimaat en het milieu te beperken via internationale verdragen (Montreal, Kyoto-protocol), en de daaruit voortvloeiende milieumaatregelen. Onderwijsvorm Hoorcolleges en zelfstudie. Literatuur John Houghton, Global Warming, The Complete Briefing 3rd edition. 2004. Overige literatuur wordt verstrekt via Blackboard. Overige informatie Deze cursus sluit aan op de cursus Systeem Aarde (450067).
God-Man-World Vakcode
OH_GMW (986015)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Coördinator
drs. L.H.C. Plantinga
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 67 van 150
Governing Security Vakcode
OH_GS (986008)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Coördinator
drs. L.H.C. Plantinga
Health and Psychosocial Factors Vakcode
OH_HPF ()
Periode
Semester 2
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Coördinator
prof. dr. D.J.H. Deeg
Docent(en)
prof. dr. D.J.H. Deeg
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Histologie, pathologie en toxicologie Vakcode
A_470158 (450003)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Honours course: Communication and Innovation in Health and Life Sciences Course code
A_HP002 ()
Period
Ac. Year (September)
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
prof. dr. J.T. de Cock Buning
Course objective Students will: • Obtain insight into some key technological innovations in health and life sciences and their impact on society. • Obtain insight into the characteristics of various communication models for science and technology (e.g. deficit model, contextual model, lay-expertise model, interactive model) • Obtain a thorough understanding of different methods for interactive communication on technology innovations. • Acquire insight into the current status of interactive communication on technological innovations in the health and life sciences. Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 68 van 150
• Be able to critically analyze strengths and weaknesses of various interactive communication methods. • Be able to critically analyze and compare recent real-life cases in interactive communication on technological innovations in health and life sciences. • Be able to design an interactive communication project in relation to a specific innovation. • Be able to work in multidisciplinary teams. Course level: 3 Form of tuition • Interactive lectures that provoke, engage, inform and stimulate academic discussion about communication, innovation and society (21 hours) • Training workshops on critical analysis of a selection of relevant scientific articles (9 hours) • Group assignment (intensive coaching and intervision): multidisciplinary teams of about 7 students (from various disciplinary backgrounds) (40 hours) • Excursion to an interactive communication project (3 hours) • Self study (64 hours) • Exam (3 hours) Attendance is compulsory Type of assessment • Written exam, individual (60%) • Group assignment: written report and oral presentation (40%) Each grade need to be at least 5.0 and together on average 6.0 to pass Course reading • Selected chapters of the book: “Misunderstanding Science? The public reconstruction of science and technology”, by A. Irwin and B. Wynne, Cambridge University Press, Cambridge, 1996 • Book: “Biotech on the menu: Society as a mirror for research policy” by Tj. De Cock Buning, B. Regeer and J. Bunders, RMNO, The Hague, 2007 • Selected recent articles from the Sage journals “Public Understanding of Science”, “Science, Technology & Human Values” • Other relevant reading materials Entry requirements The course is accessible for second and third year bachelor students with a wide variety of backgrounds.
Honours course: Evolutionary Origin of Life and its Driving Forces Course code
A_HP001 ()
Period
Ac. Year (September)
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
prof. dr. N.M. van Straalen
Course content Course topics: a. From matter to life and the first genetic material Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 69 van 150
b. The RNA world c. Theories for the origin and early evolution of life d. Mutual effects of life on geology and climate e. From prokaryote to eukaryote f. Lateral gene transfer, evolution of organelles g. Major and minor extinctions h. Multilevel selection, group selection, kin selection, sexual selection i. Human behaviour explained from an evolutionary and adaptive perspective j. Evolution of consciousness and language k. Cultural evolution l. Controversies between evolutionary theory and religion Form of tuition In small meetings, the topics will be introduced by an expert and further explored in a ‘round-table’ discussion. Students are expected to study the handed-out papers and to actively participate. Each student will write an essay, and give an oral presentations. Type of assessment Written essays (40%), oral presentation (40%) and participation in discussions (20%) Course reading Scientific articles Remarks The course will be given every second year (not in 2010 - 2011; forthcoming course in 2012), February through April, in weekly evening classes, 17.00 – 20.00 h (16 sessions). The course is organized in four blocks, each block consisting of four sessions dealing with a specific aspect and involving introductory lectures, discussion about scientific articles, guest lectures and a student presentations. Attendanding all classes is indispensable.
Honours Individueel Vak Vakcode
OH_EXT1 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
8.0
Voertaal
Nederlands
Coördinator
C. Holleman
Honours Leadership Vakcode
OH_LEAD ()
Periode
Periode 1
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Coördinator
drs. D.T.T. Kamsma
Docent(en)
prof. dr. P.G.W. Jansen, dr. C.J. Vinkenburg, dr. K.M. Lasthuizen
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 70 van 150
Lesmethode(n)
Hoorcollege
How to survive 2050 Vakcode
OH_HTS (986004)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Coördinator
drs. L.H.C. Plantinga
HP AUC: Programming your World Vakcode
OH_APYW ()
Credits
6.0
Faculteit
Onderwijscentrum VU
Coördinator
C. Holleman
HP UvA: Carte Blanche Vakcode
OH_UCB ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
HP UvA: Creativiteit Vakcode
OH_UCREA ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
HP UvA: Governance of Aquatic Vakcode
OH_UGOAQ ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Onderwijscentrum VU
HP UvA: Intelligence Studies Vakcode
OH_UINST ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Faculteit
Onderwijscentrum VU
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 71 van 150
Coördinator
C. Holleman
HP UvA: Labyrint Vakcode
OH_ULA ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
HP UvA: Learning Lab Vakcode
OH_ULL ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
HP UvA: Love Vakcode
OH_ULOVE ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Faculteit
Onderwijscentrum VU
HP UvA: Master of Suspicion Vakcode
OH_UMS ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
HP UvA: wereldliteratuur Vakcode
OH_UWL ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Human Evolution Course code
AB_1021 ()
Period
Period 2
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
prof. dr. N.M. van Straalen
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 72 van 150
Teaching method(s)
Lecture, Study Group, Practical
Course objective This course provides a general introduction to the theory of evolution as applied to genetic variation, cultural diversity and evolution of the human species. Final goals: After completion of the course the student is able to: • Formulate the key concepts of evolutionary theory, its mechanisms and its application in explaining human genetic variation and associated aspects of cultural diversity, • Explain which data support the theory of evolution in humans, • Interpret phylogenetic trees and explain the concepts of coalescence theory, • Recapitulate the hominin phylogenetic tree with the various fossil species, • Describe the characteristics of the most important hominin fossils, their position in the phylogenetic tree and the arguments, • Describe specific aspects of the human body plan associated with its evolutionary history, such as bipedalism, skeletal traits and brain evolution, • Describe the various stone tools and other artefacts, plus their importance for inferring human evolutionary trends, • Provide explanations for human cultural diversity in terms of genetic and cultural group selection, sexual selection and neutral evolution as applied to, e.g., lactation, body size, skin colour, intelligence, language, theory of mind and self-consciousness, • Understand and explain the arguments supporting the Out of Africa model versus the model of multiregional evolution, • Indicate the crucial moments in human evolutionary history and their sequence in time, • Explain the origin and the dynamics of the agricultural revolution and its spread over Europe, • Discuss the evolutionary aspects of human disease. Level 2: insight Course content In modern biological sciences evolutionary theory takes a central position. The explanatory power of evolution also applies to biomedical and health sciences. Evolution may help to explain why the human body is not perfect, why there are pseudogenes and rudimentary organs, and why humans are susceptible to specific diseases. An evolutionary perspective is also necessary to understand geographical differences in the genetic composition of populations, in disease susceptibility, cultural traditions and language diversity. The human species today is the product of 7 million years of evolution since a partly bipedal ape-like creature evolved in Africa. Topics covered in the course: • Basic principles of evolutionary theory, cladistics • Coalescence theory, phylogenetics • Population genetics and Out of Africa • The descent of man; the hominin fossils • Comparative osteology of hominins and primates • Evolutionary origin of human behaviour and partner choice • Evolution of self-consciousness and language • Evolutionary aspects of disease, evolutionary medicine
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 73 van 150
Form of tuition Theory will be explained in lectures and elaborated in work groups. Skeletal adaptations of the human body and fossil hominins will be illustrated in an osteological practical. An analysis will be made of some recent papers reporting fossil finds and new insights into natural selection operating in human populations. An essay will be written on the topic: “Do humans still evolve?” Lectures (21 hours), Work groups (21 hours), Practicals (8 hours) Type of assessment Written exam (70% of final mark); essay (30% of final mark); report on the practicals Course reading L. Stone & P.F. Lurquin, 2007. Genes, Culture and Human Evolution. Blackwell Publishing, Malden, ± € 45,Target group BSc Biology (part of minor programme Evolutionary Biology and Ecology, 3rd year) and BSc Health and Life Sciences (optional course in 2nd year)
Humane anatomie en fysiologie Vakcode
AB_470104 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. W.J.A.J. Smeets
Docent(en)
dr. W.J.A.J. Smeets, dr. A.A. van Lambalgen, Dr. W.J.A.J. Smeets
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak Het hoofddoel van deze cursus is de student inzicht te verschaffen in de bouw en functie van het spijsverteringssysteem, het urogenitale systeem en het bewegingsapparaat. Deze systemen spelen een belangrijke rol bij het in stand houden van het milieu interieur en bij de motoriek. De student wordt bovendien vertrouwd gemaakt met de anatomische en fysiologische terminologie zoals die in de dagelijkse omgang in de kliniek gebezigd wordt. Bij het onderwijs wordt ook aandacht besteed aan de embryologie van de verschillende systemen teneinde de student inzicht te verschaffen in het tot stand komen van congenitale afwijkingen. De fysiologie practica hebben ten doel de studenten inzicht te geven welke non-invasieve technieken te gebruiken zijn bij het onderzoek naar (patho)fysiologische processen bij de mens. Tenslotte heeft de cursus tot doel de studenten te leren om met elkaar aan de hand van casuïstiek uit te zoeken welke basale fysiologische processen ten grondslag liggen aan het functioneren of disfunctioneren van het menselijk lichaam. Eindtermen Aan het eind van de cursus kan de student: De verschillende onderdelen van de behandelde orgaansystemen benoemen zowel in het Latijn (internationaal erkende nomenclatuur) als ook in
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 74 van 150
het Engels (meest gebruikte nomenclatuur in internationale wetenschappelijke tijdschriften); Aangeven hoe de verschillende orgaansystemen zijn opgebouwd en wat de functionele betekenis is van de verschillende onderdelen binnen ieder orgaansysteem; Aangeven welke veranderingen de verschillende orgaansystemen in het menselijk lichaam ondergaan gedurende de embryonale ontwikkeling (organogenese) en heeft tevens enige kennis van het phylogenetische perspectief (bouwplan van vertebraten); Eenvoudige metingen verrichten m.b.t. het functioneren van deze systemen (dieet-en voedingsanalyses; diffusie- en filtratieprocessen; EMG, kracht-lengte/snelheid relaties; reflextijd, reactietijd) en beschrijven welke fysiologische principes daaraan ten grondslag liggen De regulatie van deze systemen beschrijven en de factoren (o.a. hormonen) benoemen die hierop van invloed zijn Het belang aangeven van een grondige kennis van de humane anatomie voor een goed begrip van zowel het functioneren als dysfunctioneren in het dagelijkse leven. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus is opgebouwd rondom 2 modules: spijsvertering, nier en uitscheiding: hierin komt ter sprake hoe deze orgaansystemen eruit zien en onstaan zijn, hoe het voedsel afgebroken wordt tot bouwstenen voor het lichaam, welke hormonen hierbij betrokken zijn, hoe het voedsel- en vloeistoftransport plaatsvindt, hoe afvalstoffen uit het lichaam verwijderd worden, hoe de volumeregulatie plaatsvindt en hoe deze orgaansystemen gereguleerd worden; beweging: dit betreft de wijze waarop het bewegingsapparaat (skelet, gewrichten, spieren, perifere zenuwen) is opgebouwd en functioneert. Ook wordt aandacht besteed aan de gevolgen van vermoeidheid van skeletspieren en aan het perifeer zenuwletsel met betrekking tot motorische/sensorische uitval. Deze onderdelen spelen een grote rol bij het instand houden van het milieu interieur en bij de motoriek. Aan de samenhang van bovengenoemde processen zal dan ook de nodige aandacht besteed worden. Onderwijsvorm De opzet van de modules is steeds gelijk: het anatomische gedeelte bestaat uit colleges en demonstratiepractica het fysiologie gedeelte bestaat uit zelfstudie, deelname aan practica voorafgegaan door COO's, opdrachten uitvoeren in werkgroepen en resultaten weergeven op "BlackBoard"; in werkcolleges worden vragen behandeld en moeilijke problemen besproken. Toetsvorm Aanwezigheidsplicht voor practica en werkgroepen. Schriftelijke toets aan het eind. Literatuur Martini FH. Fundamentals of Anatomy & Physiology, 7th or 8th edition(inclusief Applications Manual + CD-ROM), Pearson Education Inc. Larsen WJ. Human Embryology, 3rd edition, 2001, Churchill Livingstone, New York. ISBN 0-443-06583-7 Doelgroep Verplicht voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen. Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 75 van 150
Overige informatie Als communicatiemiddel zal gebruik gemaakt worden van Blackboard
Humane Anatomie en Fysiologie * Vakcode
A_HP470104 ()
Credits
3.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Humane genetica Vakcode
AB_470080 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
P. Heutink
Docent(en)
P. Heutink
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Computerpracticum, Practicum
Doel vak De humane genetica is een vakgebied wat zich de laatste jaren stormachtig ontwikkeld door de komst van nieuwe technologieën en het gereedkomen van het humane genoom project. Gedurende de jaren 90 zijn honderden genen geïdentificeerd die ernstige, zeldzame ziekten kunnen veroorzaken. Screening van deze genen in patiënten wordt nu routinematig uitgevoerd in het laboratorium van de DNA diagnostiek. Het cytogenetisch laboratorium heeft tot taak het zichtbaar maken grotere chromosomale afwijkingen, die vaak de oorzaak zijn van meer complexe fenotypen of syndromen. Tegenwoordig staat de humane genetica voor de uitdaging om de genetische achtergrond van veelvoorkomende, complexe ziekten te achterhalen, waarvoor grote aantallen families en patiënten nodig zijn. De steeds grotere kennis op het gebied van de humane genetica brengt belangrijke maatschappelijke consequenties met zich mee. Daarom wordt er onderzoek gedaan naar het nut, de wenselijkheid en eventuele nadelige effecten van genetische testen voor de samenleving. Ook op het gebied van de forensische wetenschap speelt de humane genetica een belangrijke rol, waarbij DNA profielen in steeds meer rechtszaken een belangrijke rol spelen bij het vormen van een oordeel. Het doel van deze cursus is de student kennis te laten maken met al deze verschillende aspecten van de humane genetica. Tijdens de cursus zal inzicht worden gekregen in de verschillende patronen waarin erfelijk ziekten kunnen overerven. Tevens zal duidelijk worden hoe de diagnostiek van erfelijke aandoeningen wordt uitgevoerd, en hoe de uitslag via de genetische counseling aan de patiënt wordt uitgelegd en wat de implicaties hiervan voor de familie zijn. Ook zal de student inzicht krijgen in de bredere maatschappelijke aspecten van de humane genetica. Tevens zal kennis worden gemaakt met de nieuwste moleculair biologische en computer technieken die gebruikt worden in het humaan Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 76 van 150
genetisch onderzoek en zal de student een aantal van deze technieken ook zelf leren gebruiken tijdens laboratorium en computer practica. Tot slot zullen de methoden aan bod komen die gebruikt worden in het onderzoek naar de identificatie van nieuwe ziektegenen, zowel voor monogenetische als complexe aandoeningen. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De volgende aspecten zullen aan de orde komen: - Overervingpatronen van erfelijke ziekten en de implicaties hiervan voor de patiënt en zijn familieleden. Hierbij hoort ook een patiëntdemonstratie. - De verschillende soorten variatie die voorkomen in het menselijke genoom, hoe sommige van deze varianten ziektes veroorzaken en hoe normaal voorkomende variatie gebruikt kan worden in genetische studies. - De methoden die er zijn om ziektegenen te lokaliseren en identificeren, zowel voor zeldzame, monogenetische aandoeningen (veroorzaakt door één gen), als voor veelvoorkomende, complexe aandoeningen (veroorzaakt door meerdere genen). - Technieken die in de DNA diagnostiek gebruikt worden voor het opsporen van mutaties bij patiënten. - Het effect van een mutatie in een gen op RNA, eiwit, cel en organisme niveau. - Ontstaan, diagnose en implicatie van de verschillende soorten chromosomale afwijkingen. - Counseling van patiënten met een mogelijk erfelijke aandoening, en hun familieleden. - Maatschappelijke en ethische consequenties van erfelijkheidsonderzoek. - Tijdens het laboratorium practicum worden twee experimenten uitgevoerd: - Het identificeren van de dader van misdaad. Hiervoor wordt DNA van het slachtoffer, DNA uit een spoor dat op het slachtoffer is aangetroffen en DNA van verschillende verdachten met elkaar vergeleken m. b. v. polymorfe markers en wordt aan de hand hiervan een daderprofiel opgesteld. - Het uitvoeren van mutatieanalyse van een gen bij patiënten met een ernstige aandoening. Door het DNA van de patiënt te vergelijken met dat van gezonde mensen wordt gezocht naar een mutatie die de ziekte veroorzaakt. Onderwijsvorm In de ochtend worden twee hoorcolleges gegeven, waarna gezamenlijk een aantal kleine opdrachten worden gemaakt om de behandelde stof te verwerken. In de middag wordt de nieuw verworven kennis in praktijk gebracht d. m. v. computerpractica en laboratoriumexperimenten. Daarnaast wordt in kleine groepen een opdracht uitgewerkt, die aan het einde van de cursus wordt gepresenteerd. Toetsvorm Schriftelijk tentamen (70%), computer practicum (10%), laboratorium practicum (10%), eindopdracht (10%). Literatuur Boek: Strachan T. and Read A.P. Human Molecular Genetics, 4th edition, Garland Science| 2011. ISBN: 978-0-8153-4149-9. Let op: dit boek vervangt de 3e editie die vorig jaar is gebruikt. Doelgroep
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 77 van 150
Keuzevak voor derdejaars bachelorstudenten Biomedische wetenschappen Overige informatie Maximum aantal studenten is: 60.
Humane neurofysiologie Vakcode
AB_487024 ()
Periode
Periode 6
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. K. Linkenkaer Hansen
Docent(en)
dr. K. Linkenkaer Hansen
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum
Doel vak Aan het einde van de cursus kan de student: • Uitleggen hoe de humane neurofysiologie bestudeerd kan worden en de voor/nadelen van verschillende beeldvormende technieken relativeren. • Verdedigen wat het belang is van neurofysiologisch onderzoek in gezonde mensen en patiënten. • Hersenactiviteit gedreven door zintuiglijke informatie (extern) en door spontane processen in de hersenen (intern) onderscheiden. • Argumenteren waarom het fenomeen van “dagdromen” en de neurale basis daarvan belangrijk te besturen is; tevens krijgt de student de vaardigheid om dit in de praktijk te onderzoeken. • Een creatief onderzoekidee formuleren en presenteren, en feedback geven op ideeën van medestudenten. • Het verband tussen hersenactiviteit en EEG signalen uitleggen en zelfstandig een EEG meting uitvoeren. • Gespecialiseerde programma’s gebruiken voor kwalitatieve analyse van EEG, bv. om EEG signalen van spier- en hersenactiviteit te onderscheiden. • Kwantitatieve en statistische analyse van eigen data uitvoeren en op basis daarvan conclusies over het verband tussen hersenactiviteit en cognitie trekken. • Resultaten van eigen onderzoek samenvatten in figuren, interpreteren en verdedigen tijdens een posterpresentatie. Dus, de student krijgt zowel theoretisch als praktisch ervaring met elektroencephalografie (EEG). • Beoordelen of een persoon slaapt of niet op basis van een EEG en uitleggen hoe EEG in de praktijk gebruikt kan worden om slaapstoornissen te onderkennen. • Een gebalanceerd overzicht geven van mogelijkheden en uitdagingen voor het toepassen van EEG technologie voor (1) de diagnose en therapie van ziektebeelden zoals epilepsie, concentratiestoornissen en dementie en (2) het sturen van machines of computers met behulp van gedachten. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak Tijdens deze cursus zal de neurofysiologie van de mens behandeld worden aan de hand van een overzicht van alle gangbare methoden waarmee deze bestudeerd kan worden. Het meten en analyseren van hoge dichtheid EEG worden in detail uitgelegd en geoefend in onderzoekspractica die
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 78 van 150
gedeeltelijk door de studenten worden ontworpen en uitgevoerd. Hoorcolleges en practica geven extra aandacht aan de neurofysiologie van cognitieve processen die niet of heel moeilijk in dieren te bestuderen zijn, zoals vrije wil, intuïtie, gedachte (“dagdromen”) en de vaardigheid om zich in andere mensen te verplaatsen. Het belang van deze functies op het niveau van hersenactiviteit en cognitie wordt toegelicht en bediscussieerd in het perspectief van ziektebeelden, bv. depressie, dementie, en slaap- en concentratiestoornissen. Onderwijsvorm Hoorcolleges, practica, discussies, onderzoek in groepjes en presentaties Toetsvorm Groepspresentatie (20%), individuele posterpresentatie (40%) en schriftelijk tentamen (40%). Literatuur Artikelen in het Nederlands en in het Engels (via Blackboard) Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven, Biomedische Wetenschappen en Biologie. Keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheid en Leven, Biomedische Wetenschappen en Biologie. Overige informatie Deze cursus sluit naadloos aan op de eerder in het tweede jaar geprogrammeerde cursus Preklinische Neurowetenschappen en is tevens verplicht indien je stage wilt lopen bij het CNCR en/of in wilt stromen in de VU/VUmc Master of Neuroscience onderzoeksopleiding. Maximum aantal deelnemers: 80
Humane ontwikkeling * Vakcode
A_HP487008 ()
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.
Illness-Image-Metaphor Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 79 van 150
Vakcode
OH_IIM (986012)
Periode
Semester 2
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Coördinator
drs. L.H.C. Plantinga
Immunologie Vakcode
A_470113 (450003)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Impact of an Empire Vakcode
OH_IE (986005)
Periode
Semester 2
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Coördinator
C. Holleman
Docent(en)
prof. dr. D.G. Yntema
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Individueel werk Vakcode
ABE_001 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Individueel werk ALW Vakcode
ABE_005 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Individueel werk ALW Vakcode
ABE_006 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 80 van 150
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Individueel werk ALW Vakcode
ABE_020 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Individuele onderwijsmodule Vakcode
A_HP-I-1 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Infectieziekten en vaccinontwikkeling Vakcode
AB_487023 ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
A. van Luijn MSc
Docent(en)
D.R. Essink MSc, prof. dr. P.R. Klatser
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak Verwerven van kennis en inzicht in: - Algemene kennis van (door vaccinatie te bestrijden) infectieziekten en hun gevolg; - Inzicht in het Rijksvaccinatie programma (RVP) - Kennis over werkzaamheid en effectiviteit van vaccins; - Inzicht in publieke opinie, communicatie en scare stories - Inzicht in productie en kwaliteitsbewaking vaccins - Kennis van passieve en actieve immunisatie - Inzicht in WHO- EPI voor vaccinatie in ontwikkelingslanden - Kennis over reizigersvaccinatie - Kennis over diagnostische toetsen - Inzicht in beheersingsstrategieën - Kennis en inzicht van de verschillende typen actoren die een rol spelen bij infectieziekten; en vaccinatie/ vaccinontwikkeling; - Kennis over vaccinontwikkeling en regelgeving en richtlijnen die in acht worden genomen tijdens de ontwikkeling van vaccins; Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 81 van 150
- Kennis over de Internationale regels die van toepassing zijn voor de productie van vaccins; - Kennis over good manufacturing practices (GMP) en good laboratory practices (GLP); Niveau 3: specialisatie Inhoud vak Deze cursus is bedoeld een inzicht te geven in de preventieve gezondheidszorg op het gebied van bestrijding van infectieziekten door middel van vaccinatie. Aan de orde komen bijna alle infectieziekten die bestreden kunnen worden door middel van vaccinatie. Dit geldt niet alleen voor Nederland maar ook internationaal. In de colleges wordt duidelijk gemaakt dat overal in de wereld de bestrijding van infectieziekten anders is georganiseerd. Het verschilt niet alleen in vaccinatie schema's, maar de verschillen worden ook bepaald of gebieden endemisch zijn voor bepaalde infecties. In eerste instantie wordt het vaccinatie beleid in Nederland onder de loep genomen, waarbij de rol van de overheid, de Gezondheidsraad, het RIVM en het Nederlands Vaccin Instituut uitvoerig naar voren komen. Ook wordt uitgebreid stilgestaan bij de toekomst van het RVP. Het vaccinatie programma in Nederland is niet meer alleen gericht op zuigelingen maar wordt steeds meer een programma voor alle leeftijden. Daarnaast wordt ook de belangrijke rol van communicatie en publieke opinie belicht. Los van dit alles staat de reizigersvaccinatie, maar het spreekt bijna van zelf hoe belangrijk deze is. Vaccineren moet worden gezien als het moduleren van het afweersysteem. Met het oog daarop wordt een opfris college immunologie gegeven om goed inzicht te krijgen in de immunologische aspecten van vaccins en vaccinatie. Een vaccin is geen geneesmiddel als een pil met 10 in een doosje, daarom zal intensief worden ingegaan op de bereiding, productie, kwaliteitsbewaking (GMP) en opslag van vaccins als mede nieuwe ontwikkelingen hierbij. Aandacht wordt uiteraard besteed aan de farmaceutische industrie die een grote invloed heeft bij het ontwikkelen en vervaardigen van vaccins. Bij het vaststellen van de werkzaamheid van vaccins maar ook bij het vaststellen van infecties speelt diagnostiek een grote rol, ook hierop zal uitvoerig worden ingegaan. Tot slot zal de rol van activiteiten en campagnes van organisaties als de WHO en Unicef bij de bestrijding van infectieziekten op mondiaal niveau worden belicht en bekijken, als voorbeelden van de situatie in landen in ontwikkeling de situatie in Vietnam en Ghana. Onderwijsvorm Het onderwijs wordt gegeven d. m. v. hoorcolleges (39 uur) en opdrachten (6 uur). Studenten worden in groepen ingedeeld en iedere groep krijgt één van de 12 vaccins die via een vast stramien mondeling aan de groep moet worden gepresenteerd. Communicatie op gebied van vaccinatie campagnes zal geoefend worden in de vorm van een Lagerhuis debat. Indien mogelijk: bezoek aan het Nederlands Vaccin Instituut, Bilthoven en Sanquin, Amsterdam. (10 uur) Toetsvorm Een schriftelijk tentamen moet met een voldoende worden afgesloten Literatuur Syllabus Doelgroep
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 82 van 150
Keuzevak voor derdejaars studenten BSc Gezondheid en Leven en Biomedische Wetenschappen. Overige informatie Coördinator: P. Steerenberg (contact via Anna van Luijn). Vak wordt niet meer gegeven per 2011 - 2012, alleen een laatste (bezem) toets.
Infectious Diseases and Vaccine Development Course code
AB_1046 ()
Period
Period 3
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
prof. dr. J.F. van den Bosch
Teaching method(s)
Lecture
Course objective Acquire knowledge on and insight in: • Infectious diseases (for which a vaccine exists) and their consequences • The Dutch national vaccination program • Knowledge about effectiveness and efficacy of vaccines • Public opinions, communication and scare stories • Production and quality control of vaccines • Passive and active immunisation • WHO-EPI for vaccination in developing countries • Obstacles and successes in vaccine technology transfer to developing countries • Vaccination of travelers asylium-seekers, illegal immigrants, refugees, soldiers during their mission, ill people or during pregnancy and lactation • Diagnostic testing • Control strategies • Various actors who play a crucial role in vaccination and vaccine development for infectious diseases • Rules and regulations rules and regulations for vaccine development and vaccine production • Gain skills in analysing a vaccination strategy for a specific infectious disease in a specific country, and communicating vaccination programs to the larger public. Course content This course gives insight into current and future preventive health care concerning control of infectious diseases through vaccination. It will be a mixture between biomedical sciences and health policy and management. First, we will refresh your knowledge on immunology as a method of modulating the immune system, to gain a well-founded insight into the immunological aspects of vaccines and vaccination. We focus on the manufacturing of vaccines, which differs significantly from e.g. pills. Explicit attention is paid to the development, production, quality control (GMP) and storage of vaccines, and new developments in this field. Diagnostics, essential for testing vaccine efficacy and prevalence of diseases, are also discussed. Then we will focus on the influence of different actors on vaccine Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 83 van 150
development. Influence of the pharmaceutical industry on development and production of vaccines is evident, but there are probably more reasons why there is no vaccine against HIV or malaria yet. We look at a number of infectious diseases that can be prevented by vaccines in national and international context, and how they differ internationally. How do geography, the nature of the disease itself and health care systems influence disease prevention? How do these differences affect vaccination programmes? With this knowledge, we will analyse the Dutch vaccination program and the role of key actors, such as the government, the Dutch health council, governmental research institute on health and environment (RIVM) and the Dutch vaccine institute. The future outline and challenges of the Dutch vaccination program are discussed in detail and we will see how public opinion influences preventive medicine. Via traveller's vaccination, we expand our view to the global level: how do international organisations like the WHO and UNICEF contribute to disease prevention and vaccination? What other factors influence the global spread of infectious diseases? We will combine case studies of Vietnam and Ghana with this global perspective. In this course, you will do a group assignment, focusing on a specific infectious disease. The results are presented to all course participants. Communication skills of and bringing across clear arguments for vaccination programs are practiced through a ‘Lagerhuis’ debate. If there are possibilities, we will visit the National Vaccine Institute in Bilthoven and pay a visit to the Blood Supply Foundation Sanquin in Amsterdam showing the way potential infectious diseases are contained. Level 3: insight Type of assessment Written exam Course reading Reader Remarks Part of the minor Biomedical and health interventions. Optional course for a variety of minors, highly recommended for students that consider following the master Management Policy Analysis and entrepreneurship or the master specialisations International Public Health specialisation or Infectious Diseases.
Inleiding mineralogie Vakcode
AB_450157 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. W. van Westrenen
Docent(en)
dr. J.P. Chadwick
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 84 van 150
Het verkrijgen van inzicht in de inwendige bouw en de classificatie van mineralen Het beheersen van de methodes gebruikt voor het macroscopisch determineren van mineralen Inhoud vak Principes van mineralogie en kristallografie: Fysische eigenschappen van mineralen als basis voor macroscopische determinatie. Chemische mineralogie: coördinatieprincipes, binding in mineralen, opbouw van mineraalformules, mengreeksen. Kristallografie: uitwendige vormen, symmetrie-elementen, symmetrie-operaties, kristalstelsels, Miller indices. Onderwijsvorm Hoorcolleges, practica en take home-opdrachten. Toetsvorm Schriftelijk theorietentamen, en beoordelingen practica en take home-opdrachten Literatuur Dyar, Gunter, & Tasa (2007). Mineralogy and Optical Mineralogy.
Integratieve tumorcelbiologie Vakcode
AB_470057 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. J. Lankelma
Docent(en)
dr. J. Lankelma
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum
Doel vak Opfrissen en uitbreiden van celbiologische kennis, speciaal m.b.t. de celdeling: vertrouwdheid krijgen met de betrokken moleculen; Schematiseren van (cel)biologische regelsystemen in de gezonde cel en in de kankercel; Kennismaken met eigenschappen van moleculen en met structuren van "geschakelde moleculen" en bijbehorende systeemeigenschappen, mede m.b.v. biomathematische modelleren; Leren vergaren van celbiologische informatie en verkrijgen van inzicht in benodigde datanauwkeurigheid. Eindtermen De student kan: schematisch interacties tussen moleculen weergeven en demonstreren hoe veranderingen in hun functie of concentratie kunnen leiden tot kanker; benodigde ontbrekende informatie in de literatuur en op het Internet vinden; door middel van computersimulaties weergeven hoe systeemeigenschappen ontstaan en hoe microscopische veranderingen aanleiding geven tot macroscopische veranderingen;
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 85 van 150
voorstellen formuleren voor metingen om informatie te verzamelen die kritisch is voor de behandeling van kanker. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Analytische methoden leveren steeds meer meetgegevens op van biologische systemen. Met microarrays is het in principe mogelijk mRNA concentraties te meten van alle humane genen. Electroforese, gekoppeld met selectieve detectie (met behulp van antilichamen of massaspectrometrie) kan ook over eiwitten een rijke oogst aan analytische informatie opleveren. In het "postgenoom" tijdperk is de uitdaging groot om deze uitgebreide kennis over de activiteit van componenten te integreren en de organisatie van moleculen tot cellen en cellen tot organen te doorgronden. De overvloed van gegevens drijft de ontwikkeling van een nieuwe biologische discipline: de integratieve biologie. In deze cursus worden defecten in de moleculaire organisatie behandeld, welke leiden tot kanker. Eerst wordt kort de basis van tumorcel-biologie behandeld en hoe benodigde kennis kan worden aangevuld uit databases via het worldwide web. Basiskennis van regulatie van celdeling en apoptose zal worden gedoceerd. Tevens zal de interactie tussen de kankercel en zijn directe omgeving worden belicht. Ook kwantitatieve aspecten zullen aandacht krijgen. De afweer door het lichaam van de patiënt en de cytostatische behandelingen, vormen een selectiedruk die selecteert voor robuuste organisatie-structuren. In deze structuren ligt de sleutel verborgen tot toekomstige selectievere behandelmethoden van kanker. Onderwijsvorm In de ochtend hoorcollege, 's middags werkcollege. Dit laatste bestaat uit het maken van opgaven, computersimulaties en biologische informatie zoeken op het internet. De behandelde stof dient op de voet gevolgd te worden en een aanwezigheid van meer dan 80 procent is verplicht. Toetsvorm Schriftelijke testen tijdens cursus Literatuur Een recent handboek over moleculaire celbiologie (bijvoorbeeld Molecular Biology of the Cell, Alberts e.a., The Biology of Cancer van R.A. Weinberg of een vergelijkbaar boek) wordt aangeraden, maar is niet verplicht. Een syllabus zal worden verstrekt tegen vergoeding van 10 euro. Aanbevolen voorkennis Kunnen werken met Excel Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Biomedische Wetenschappen en Gezondheid en Leven. Overige informatie De cursus is met name geschikt voor hen die een keuze voor de master Oncologie overwegen, maar ook voor mensen met interesse in systeembiologie en kwantitatieve cellulaire biologie. Let op: in 2012 - 2013 wordt de cursus niet meer aangeboden, alleen nog een laatste herkansing (bezemtoets).
Interculturalisatie van de zorg Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 86 van 150
Vakcode
AB_470184 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. F. de Boer
Docent(en)
prof. dr. I.N. Wolffers, dr. F. de Boer
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak Het doel van de cursus is om de student inzicht te geven in de theorie en praktijk van de interculturalisatie van de zorg: de afstemming van de inhoud en organisatie van de zorg op de multiculturele samenleving. Om interculturalisatie van de zorg goed te kunnen begrijpen zullen verschillende thema's belicht worden, zoals gevolgen van migratie op gezondheid, gezondheidsverschillen en -determinanten tussen verschillende bevolkingsgroepen, de rol van cultuur en religie in de zorg; interculturele communicatie, de ontwikkeling van een intercultureel zorgaanbod, de aansturing van het proces van interculturalisatie, interculturele ouderenzorg, geestelijke gezondheidszorg voor migranten en zorg voor ongedocumenteerden. Eindtermen: De student begrijpt hoe migratie het leven van mensen ingrijpend verandert, dat migratie een "cultuur op zich" is die overal ter wereld een aantal herkenbare verschijnselen tot gevolg heeft. De student kan deze onderscheiden van culturele factoren en begrijpt het belang van het verschil; de student heeft inzicht in de relatie tussen migratie en gezondheid, waaronder risicofactoren, kwetsbaarheid etc.; heeft inzicht in gezondheidsverschillen en determinanten tussen verschillende bevolkingsgroepen; heeft inzicht in beleid van interculturalisatie in de zorg , begrijpt wat het concept inhoudt en hoe het bevorderd kan worden; is op de hoogte van maatregelen die ontwikkeld zijn om migranten en vluchtelingen beter te kunnen bereiken; heeft kennis van verschillende theorieën over interculturele communicatie en begrijpt hoe deze gebruikt kunnen worden om de culturele competentie van hulpverleners te bevorderen; heeft inzicht in hoe cultuur, religie en sekse van invloed zijn op (uitingen van ) gezondheid, hulpzoekgedrag en ziekte(gedrag); kan in groepsverband een onderdeel van het interculturalisatieproces analyseren, doorgronden en hierover schriftelijk en mondeling rapporteren. Niveau 2: verdieping Inhoud vak In- en uitsluiting van de zorg Racisme en discriminatie Gezondheidsverschillen tussen verschillende bevolkingsgroepen Zorgverlening aan specifieke groepen Migratie, gezondheid, ziekte en zorg Migratie & geestelijke gezondheid Interculturele communicatie Gezondheidsbeleving van specifieke groepen Cultuur, religie en gezondheidszorg Het beleid van interculturalisatie Interculturele ouderenzorg Tijdens de cursus bezoeken de studenten een zorginstelling en doorlopen, aan de hand van opdrachten en oefeningen verschillende Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 87 van 150
stappen in het interculturalisatieproces. Onderwijsvorm Hoorcolleges, werkgroepen, opdrachten, oefeningen, werkbezoek instellingen. Tijdens de werkgroepen worden de onderwerpen van de cursus verder uitgediept. Toetsvorm Aanwezigheid: Aanwezigheid bij de werkgroepbijeenkomsten telt mee in de beoordeling. Indien meer dan één werkgroepbijeenkomst wordt gemist, dient het blok het jaar erna opnieuw te worden gevolgd. Van studenten wordt tevens verwacht dat zij het merendeel van de colleges aanwezig zijn. Toetsing vindt plaats door middel van een schriftelijk tentamen en beoordeling van werkgroepopdrachten plus presentatie. Het tentamen bestaat uit open vragen, gebaseerd op verplicht opgegeven literatuur en de behandelde stof tijdens de colleges. Samen vormen zij het eindcijfer, waarbij het tentamen voor 60% meetelt en de werkgroepopdracht inclusief presentatie voor 40% in de bepaling van het eindcijfer. Voor alle onderdelen dient een voldoende behaald te worden, d.w.z. minimaal een 6. Literatuur Gezondheidszorg en Cultuur, Ivan Wolffers en Anke van der Kwaak (red.),VU uitgeverij, 2004, 24,50 euro, ISBN nr. 90 5383 796 5 Cecil G Helman. Culture, Health and Illness. London: Hodder Arnold, 2007 (5e druk) Artikelen (op blackboard) horend bij de colleges. Doelgroep Aanbevolen voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen. Keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheid en Leven.
Key Strategies in Disability and Neuropathy Course code
AB_1045 ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. W.H. van Brakel MD
Teaching method(s)
Study Group, Lecture
Course objective § Gain insight into the issues and intervention strategies concerning common causes of disability, using neuropathy as a model § Gain insight into strategies for the prevention of disabilities and rehabilitation § Gain insight into ethical debates surrounding prevention of disability practices § Obtain insight into the most recent developments concerning stigma and discrimination of people with disabilities § Gain insight into various philosophical ideas about the meaning of disability and diversity: how do people experience disability, and what does this mean for the choices that matter (in management, policy Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 88 van 150
and personal life) § Gain insight into how these ideas are influenced by innovations in the field of biomedical sciences § Develop skills in participating in scientific discussions § Practice research skills during the problem-based learning sessions (formulation of research objectives, literature research, abstracting, summarising and giving feedback on findings) § Develop skills in formulating lines of argumentation in the form of an essay Course content This course starts with an introduction into the issues surrounding disability, using neuropathy (nerve damage) as a model. This would concern e.g. neuropathy caused by diabetes, leprosy, HIV/AIDS and spinal cord injury. The course reviews relevant interventions and various technologies used to address these health problems. During the course you investigate questions such as ‘How do different worldviews (including my own) influence how people see disability, ‘differentness’ and diversity? ‘What does an ideal world look like with regard to diversity?’ ‘What is the meaning of this for my own and other people’s lives?’ During the 20th century, developments and innovations in health and life sciences have resulted in an exponential growth in scientific knowledge about man, society and environment. The idea that we know who we are seems to increase, but is this truly the case? For example, what does a disability mean for our identity and our image of human nature? Innovations bring forth possibilities for new interventions and technological gadgets (e.g. bionic prosthetics, cochlear implants, microchips that enhance intelligence), but how do we select and use these? Who decides what is appropriate for whom, in particular in the majority world? In this course you learn to reflect on various philosophical perspectives related to disability and diversity and think about your own perspective. These skills are applied while analysing interventions of various marginalised and stigmatised groups of people, such as people suffering from diabetes, leprosy, HIV/AIDS and spinal cord injury. You write your analysis and argumentation regarding appropriate technology interventions and how to deal with diversity in the form of an essay. Level 3: insight Form of tuition Lectures, problem-based learning assignments, self study Type of assessment Written exam and assignment. Both parts need to be passed. Remarks Part of the minor Biomedical and health interventions
Kust en mariene ecosystemen Vakcode
AB_470203 ()
Periode
Periode 5
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 89 van 150
Coördinator
dr. ir. P.M. van Bodegom
Docent(en)
dr. ir. P.M. van Bodegom, dr. M.P. Berg, dr. G.J.J. Driessen
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Begrijpen van interacties tussen organismen onderling en tussen organismen en leefomgeving, toegepast op kust en mariene ecosystemen. Eindtermen: Kennis hebben van de organismen van kust en mariene ecosystemen. Theorie over het voorkomen en verspreiding van soorten begrijpen en toepassen op kust en mariene ecosystemen. Concepten om interacties tussen soorten, leidend tot een levensgemeenschap, kunnen beschrijven en toepassen op kust en mariene ecosystemen. Dynamiek in individuele populaties conceptueel koppelen aan die van levengemeenschappen en de consequenties van deze koppeling voor stabiliteit en diversiteit van levensgemeenschappen doorzien. Theorieën om de samenstelling van levensgemeenschappen te verklaren kunnen toepassen op kust en mariene ecosystemen. Conceptueel kunnen koppelen van de dynamiek van levensgemeenschappen aan grootschalige biogeografische patronen. Inzicht hebben in de mogelijkheden van modelbouw om biologische processen te vertalen naar wiskundige formuleringen middels het uitvoeren van opdrachten met computermodellen. Kunnen integreren van theorieën op verschillende schaalniveaus om i) de verbanden tussen theoretische concepten te analyseren, ii) een maatschappelijke context te analyseren om oplossingen aan te dragen voor maatschappelijke problemen rond kust en mariene ecosystemen. Zelfstandig onderzoek kunnen uitvoeren om theorieën over ecologische interacties toe te passen en te toetsen. Zelfstandig mondeling en schriftelijk kunnen rapporteren van uitkomsten van opdrachten en onderzoeksresultaten. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus behandelt de volgende onderwerpen: Een aantal kust- en mariene ecosystemen worden beschreven. De specifieke milieuomstandigheden van kust en mariene ecosystemen die selectiedruk uitoefenen op de daar voorkomende organismen worden behandeld. De principes van verspreiding, concurrentie- facilitatie, predatie en inhibitie in trofische interacties en toepassing van deze principes in verspreidingsmodellen en op zonering in kust en mariene ecosystemen en populatiemodellen, klassieke meta-populatie theorieën, voedselwebben, samenstelling van levensgemeenschappen, recente ontwikkelingen op het gebied van de assembly theorie en assembly filters, biogeografie, bioenvelope-modellen en macroecologie worden behandeld. Maatschappelijke implicaties worden geïntegreerd behandeld met de theorie en daarnaast wordt er afzonderlijk aandacht besteed aan de volgende onderwerpen: Kustdynamiek en effecten op kust en mariene levensgemeenschappen, natuurbescherming van gevoelige kustecosystemen in relatie tot eutrofiering, overexploitatie, recreatiedruk, interactie tussen mariene ecosystemen en visserijbiologie en de toepassing in visserijmodellen, implementatie van Europese richtlijnen, zoals de waterrichtlijn, de habitatrichtlijn en de mariene richtlijn, invasieecologie in kustecosystemen, geïllustreerd voor de Nederlandse kusten.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 90 van 150
Onderwijsvorm Hoorcolleges over theorie en maatschappelijke implicaties, computerpractica over visserij- en dispersiemodellen, eendaagse veldexcursies, een essay-opdracht per peer-review, presentaties over de leerstof, ontwerpen van een eigen onderzoeksplan en een veldonderzoek van een week in Ambleteuse (Frankrijk). Toetsvorm Toetsing bestaat uit: mondelinge presentatie van het veldonderzoek (20%), verslag van vijf opdrachten (elk 10%) en tentamen over de theorie (30%) Literatuur Verplicht boek: Little., C., G. Williams and C.D. Trowbridge (2009) The biology of rocky shores. Oxford University Press (42 Euro). Naast het studieboek is er een digitale reader met een nadere uitwerking van theoretische concepten en van maatschappelijke implicaties en wordt het leerboek 'Essentials of Ecology' gehanteerd als achtergrondliteratuur. Aanbevolen voorkennis Het eerstejaarsvak Ecologie, mens en natuur (470178) Doelgroep Verplicht voor tweedejaars BSc Biologie Overige informatie Een eigen bijdrage voor het Ambleteuse- veldonderzoek is verplicht
Levensvragen en wetenschap Vakcode
AB_470151 (450003)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. J.F.H. Kupper
Docent(en)
dr. J.F.H. Kupper, prof. dr. J.T. de Cock Buning
Lesmethode(n)
Werkgroep
Doel vak Inzicht verwerven in: Verschillende filosofische ideeën over het menselijk bestaan De manieren waarop deze ideeën worden beïnvloed door nieuwe ontwikkelingen in de levenswetenschappen. Vaardigheden ontwikkelen in: Het kritisch analyseren van filosofische en wetenschappelijke teksten; Het voeren van analyserende discussies; Het verwoorden van sterke argumentatielijnen in een essay. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Deze cursus gaat over filosofie: nadenken over jezelf als mens en de wereld om je heen. Filosofie is wikken en wegen, zoeken en vragen stellen. Tijdens de cursus 'Levensvragen en wetenschap' onderzoek je het menselijk bestaan in het licht van zowel filosofische theorieën als Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 91 van 150
de huidige stand van zaken in de levenswetenschappen. Vragen als 'wie ben ik', 'hoe kan ik de wereld kennen' en 'wat doe ik hier eigenlijk' staan daarbij centraal. Deze vragen hebben in de loop der eeuwen verschillende antwoorden gekregen van filosofen, geestelijken en wetenschappers. In deze cursus bestudeer je wat die antwoorden zoal zijn geweest aan de hand van de originele teksten en ga je bovenal op onderzoek uit naar jouw antwoord als wetenschapper anno 2011. Ontwikkelingen in de levenswetenschappen hebben in de twintigste eeuw gezorgd voor een enorme toename in de wetenschappelijke kennis over de mens en zijn omgeving. We denken steeds beter te weten wie wij zijn, maar is dat wel zo vanzelfsprekend? Zijn wij machines met gevoel of toch iets wezenlijk anders? Hoe weten we zeker dat wat we om ons heen zien werkelijk bestaat? En hoe moeten we kiezen voor 'het goede leven'? Volgens Wittgenstein zijn deze vragen van wezenlijk belang, maar kunnen ze nooit zinvol rationeel geanalyseerd worden. Hoe komen we dan aan antwoorden? Is elk antwoord mogelijk zoals de post-modernisten beweren? Op welke manier zijn de moderne psychologische en neurobiologische inzichten behulpzaam bij deze vragen? We vergelijken steeds antwoorden van de 'oude meesters' met de nieuwste inzichten. De thema's die onder andere aan de orde zullen komen, zijn: Wat is er echt? Een thema over wat bestaat en wat niet. Over de tegenstelling tussen realisme en idealisme, over feiten en hun hardheid. Wie ben ik? Een thema over mensbeelden. Aan de orde komen onder meer het lichaam-geest dualisme van Descartes, het behaviourisme en het idee dat het menselijk brein werkt als een computer. Waartoe ben ik hier? Een thema over de biologische reden van het mens-zijn (evolutie, Dawkins 'selfisch genes') en verschillende Westerse en niet-Westerse visies op de vraag 'waartoe zijn wij op aard'. Onderwijsvorm De cursus bestaat uit 4 weken waarin er regelmatig contact is met de docenten in werkcolleges. Veel tijd zal besteed worden aan het individueel lezen van teksten en het voorbereiden in tweetallen van discussies. Verder wordt er door jullie wekelijks over de thema's gediscussieerd op het Blackboardforum. Toetsvorm De toetsing bestaat uit drie onderdelen. 1) je actieve participatie in de werkgroepen. 2) je bijdrage aan de groepsdiscussie op blackboard. 3) een afsluitend essay waarin je een zelfgekozen onderwerp analyseert in relatie tot een van de thema's. Alle onderdelen tellen even zwaar mee en moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Syllabus met samengestelde teksten Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars (en hoger) BSc Biologie, Biomedische Wetenschappen, Gezondheidswetenschappen, Filosofie. Overige informatie Deze cursus wordt niet meer gegeven in 2011 - 2012; is vervangen door andere cursussen (voor Biologie resp. Biomedische Wetenschappen). Voor meer informatie over een eventuele laatste kans: stuur een e-mail naar
[email protected].
Life and Work
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 92 van 150
Vakcode
OH_LAW (986007)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Coördinator
drs. L.H.C. Plantinga
Docent(en)
prof. dr. T.G. van Tilburg
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Management en beleid in de gezondheidszorg Vakcode
AB_487011 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. J.T. de Cock Buning
Docent(en)
prof. dr. J.T. de Cock Buning
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Werkcollege, Computerpracticum
Doel vak Inzicht verwerven in hoe de maatschappij invloed heeft op, en reageert op, wetenschappelijke ontwikkelingen. Praktijk illustraties hoe in werkelijkheid het beleidsproces wordt aangestuurd en wat de verschillende sturingsvisies op beleid zijn. Inzicht verwerven in interactieve beleidsprocessen; Kennismaken met gangbare managementmodellen en -stijlen, en projectmanagement; In de praktijk oefenen met het analyseren van beleid via actoranalyse, causaalanalyse en het identificeren van beleidsopties; Ervaring opdoen met projectmatig werken in een team voor een externe opdrachtgever op een actuele probleemstelling; Kunnen toepassen van enkele praktische en analytische vaardigheden, zoals het formuleren van een onderzoeksopzet, uitvoeren van literatuurstudie, kritisch analyseren van diverse wetenschappelijke publicaties, theorieën, hypotheses en argumenten, en de bevindingen zowel schriftelijk en mondeling kunnen verantwoorden en presenteren; Oriëntatie op de M-variant master Biomedische Wetenschappen, dan wel de masters Management, Policy-Analysis and Entrepreneurship. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Theoretisch deel: Werkcolleges waarin diverse beleids- en managementaspecten aan de orde komen. Deze aspecten worden geïllustreerd aan de hand van concrete casussen uit de gezondheidszorg en het gezondheidsonderzoek. Te behandelen onderwerpen zijn: Beleidsmodellen en beleidsprocessen; Beleidsvoorbereiding en -analyse: beleidstheorie, causaalanalyse, etc; Interactieve beleidsvorming; Managementmodellen en -theorieën; Projectmanagement. Wat komt er bij kijken als je zelf sturing zou gaan geven aan de ontwikkeling van beleid? Een beleidsmedewerker moet behalve kennis over Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 93 van 150
de gezondheidszorg ook weten hoe het beleidsspel, dat Nederland regeert, gespeeld wordt. Hoe zit een beleidscyclus in elkaar? Wanneer is wetenschappelijke kennis belangrijk en wanneer wordt het politiek? En wat is je rol als manager, adviseur of beleidsambtenaar dan? In deze cursus krijg je in het eerste deel colleges over diverse beleids- en managementaspecten, die geïllustreerd worden aan de hand van casussen uit de gezondheidszorg en het gezondheidsonderzoek. Daarbij maak je specifiek kennis met diverse beleidstheorieen, o.a. de theorie van interactief beleid. Je leert een causaalanalyse te maken om beleidsproblemen te analyseren en je leert omgaan met diverse managementmodellen en projectmanagement. Dit deel wordt afgesloten met een tentamen. Praktisch deel: Het tweede deel van de cursus vorm je in teams kleine consultancy-bureautjes die zich gespecialiseerd hebben in beleidsadvies. Jullie krijgen van een opdrachtgever de vraag om een concurrend onderzoeksvoorstel te schrijven voor een later uit te voeren beleidsonderzoek rondom een actueel, maatschappelijk 'medisch' of 'volksgezondheids' vraagstuk in het kader van (overheids)beleid. Voorbeelden zijn de privatisering in de zorg of moeder-kind-transmissie van HIV, Je leert, als consultancyteam, in dit project omgaan met de interdisciplinaire praktijk van beleidsmatig onderzoek en projectmatig werken. De problematiek en de verschillende beleidsopties rond dit vraagstuk worden kritisch geanalyseerd volgens de modellen en instrumenten uit het eerste deel. De resultaten, analyses, conclusies en aanbevelingen worden vormgegeven in een officieel beleidsadviesrapport dat aan het eind van de cursus mondeling gepresenteerd en aangeboden wordt aan de opdrachtgever. Onderwijsvorm Projectwerk, (werk)college, zelfstudie contacturen: 19 uur (werk)colleges en 10-20 uur begeleiding in projectteams Toetsvorm Individuele toetsing bestaat uit: (1) tentamen (50%), en (2) projectopdracht. Individuele beoordeling (25%) van de projectopdracht vindt plaats op basis van individuele producten, het functioneren in de projectgroep en de beoordeling van groepsproducten (25%). Beide onderdelen (1 en 2) moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Boek: Hoogerwerf, A. & M. Herweijer: Overheidsbeleid; Een inleiding in de beleidswetenschap. Kluwer, Alphen a/d/ Rijn. 8ste druk en hoger Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven
Mechanisms of Brain Diseases Course code
AB_1058 ()
Period
Period 2
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
prof. dr. T.J. de Vries
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 94 van 150
Teaching staff
prof. dr. M.S. van der Knaap
Teaching method(s)
Computer lab, Study Group, Lecture
Course objective Gain insight into the etiology, expression and treatment of various brain diseases, as well as models used in preclinical science. Course content Our brain enables us to perform even the most complex tasks. Sometimes however, diseases of the brain compromise its optimal function. In this course students learn what the clinical manifestations are of the neurological diseases, and what type of cellular or animal models are around to learn us more on how disturbed processes and systems in the brain lead to these illnesses and that may provide us with clues on treatment options. Topics include illnesses as neurodegenerative (e.g., Parkinson’s disease, white matter disease) and neuropsychiatric diseases (e.g. addiction, depression). In addition, we will try to shed light on the cognitive disturbances associated with these diseases, and will elude on comorbidity in symptoms of various brain diseases. Various treatments options for these conditions, including the use of pharmacological agents and deep brain stimulation will be discussed. Form of tuition Lectures, discussion panel, workgroups, brain demo, self study Type of assessment Exam (70%), presentation (25%), participation in discussion (5%). Course reading Papers, presentations and reader. Remarks Part of minor Brain and Mind. Central Academic Skill: How to convey your message; public presentations.
Medische farmacologie Vakcode
AB_470032 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. A.N.M. Schoffelmeer
Docent(en)
prof. dr. T.J. de Vries, dr. T. Pattij, dr. L. Diergaarde, dr. B. Drukarch
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Practicum
Doel vak De student wordt bekend gemaakt met de basisprincipes en belangrijkste begrippen uit de medische farmacologie en het werkingsmechanisme van farmaca, met name van die geneesmiddelen die hun aangrijpingspunt hebben op de neuronale prikkeloverdracht in het perifeer en centraal zenuwstelsel. Aan het eind van de cursus dient de student de
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 95 van 150
farmacologische wetmatigheden en begrippen in eigen woorden te kunnen reproduceren. De student wordt geacht medisch farmacologische problemen te kunnen oplossen in situaties analoog aan die welke tijdens de cursus aan de orde zijn gekomen. Eindtermen: De student dient de belangrijkste begrippen en basisprincipes uit de farmacokinetiek (de wijze waarop farmaca in het lichaam worden opgenomen, verdeeld, afgebroken en uitgescheiden) te kunnen omschrijven; De student kan een omschrijving geven van basisprincipes van de farmacodynamie ten aanzien van: - de rol van het zenuwstelsel bij het functioneren van organen, spieren, klieren en de hersenen; het werkingsmechanisme van farmaca, die hun aangrijpingspunt hebben op neurotransmitter receptoren; - de fysiologische en farmacotherapeutische betekenis van receptor heterogeniteit; De student kan een omschrijving geven van de wijze waarop de (bij)werkingen van geneesmiddelen klinisch wordt onderzocht. Niveau 2: verdieping Inhoud vak In de cursus staat de interactie tussen biologisch actieve stoffen en levende organismen in relatie tot het normaal functioneren van het organisme en de effectiviteit van geneesmiddelen bij ziekten centraal. Er wordt in detail aandacht besteed aan: Het lot van farmaca in het lichaam; Dosis-werkingsrelaties van geneesmiddelen; Pre- en postsynaptische signaaltransductie mechanismen; Neurotransmitter receptor heterogeniteit in relatie tot het functioneren van met name het cardiovasculair systeem, de ademhaling, het maag-darmkanaal en de skeletspieren; De farmacotherapeutische behandeling van psychiatrische en neurologische ziekten; De uitvoering van klinisch geneesmiddelenonderzoek. Onderwijsvorm Hoorcolleges (30 uur); Werkcolleges (6 uur); Practica (verplicht, 15 uur); PGO (verplichte zelfstudie, circa 20 uur), inclusief rapportage (referaat, essay). Toetsvorm Individuele PGO-toets (multiple choice vragen); Tentamen (essayvragen). (eindcijfer = cijfer tentamen + cijfer PGO-toets) Literatuur Cursusboek Medische Farmacologie (prijs 25 euro) en daarin aangegeven literatuur. Aanbevolen voorkennis Basiskennis over anatomie en (neuro)fysiologie wordt als bekend verondersteld. Doelgroep Verplichte cursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen Overige informatie
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 96 van 150
Er wordt gewerkt in 4 groepen. De groepsindeling wordt (rekening houdend met de voorkeur van studenten) tijdens de eerste ochtend gemaakt en is vanaf dat moment definitief. Ook dient dan het cursusboek te worden aangeschaft.
Mens en evolutie (G&L) Vakcode
AB_487013 ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. N.M. van Straalen
Docent(en)
dr. ir. T.F.M. Roelofs
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak In deze cursus geven we een algemene inleiding in de evolutietheorie en bespreken de relevantie van die theorie voor de genetische en culturele diversiteit van de menselijke soort Eindtermen: Na afloop van de cursus is de student in staat om: de sleutelconcepten van de evolutietheorie zelf te verwoorden, en deze toe te passen ter verklaring van diversiteit bij de mens uit te leggen welke gegevens de evolutietheorie ondersteunen; fylogenetische stambomen te interpreteren; de evolutionaire afstamming van de mens globaal te kunnen weergeven; van een aantal genoemde soorten een ruwe datering te geven; de specifieke kenmerken van de mens te kunnen benoemen, en aan te kunnen geven welke selectieve krachten mogelijk menselijke adaptaties hebben gevormd (bipedaliteit; grote hersenen & hoge intelligentie; taal; theory of mind; cultuur); de cruciale momenten in de evolutionaire geschiedenis van de mensachtigen in de tijd te kunnen ordenen; uit te leggen waarom het ontstaan van landbouw een cruciaal belang is geweest voor ziekte en gezondheid bij de mens; de selectieve waarde van ziektesymptomen te duiden; de evolutionaire aspecten van ziektes te bespreken; Niveau 2: verdieping Inhoud vak De evolutietheorie neemt binnen de biologie een centrale positie in. Omdat de (bio)medische wetenschappen sterk geworteld zijn in de moderne biologie, zijn evolutionaire overwegingen ook voor de medische wetenschappen van groot belang. Dit blijkt onder meer wanneer we willen begrijpen waarom het menselijk lichaam niet perfect is, rudimentaire organen heeft, en vatbaar is voor veel ziektes. Ook voor het begrijpen van regionale verschillen in genfrequenties is een evolutionair perspectief onontbeerlijk. Een evolutionair raamwerk biedt verder mogelijkheden functionele vragen te stellen over verschillende gedragsaspecten, en verschillen tussen man en vrouw. Tot slot komt de evolutionaire afstamming van de mens aan bod. Te behandelen onderwerpen: basisconcepten van de evolutietheorie; populatiegenetica; afstamming van de mens; evolutionaire oorsprong van gedrag van de mens; Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 97 van 150
evolutionaire aspecten van taal; evolutionaire aspecten van ziekte en gezondheid. Onderwijsvorm De stof zal in een hoorcolleges worden toegelicht en vervolgens in werkcolleges worden uitgediept. Aan de hand van opdrachten gaat de student zich nader in één onderwerp verdiepen; over dit onderwerp schrijft de student een essay. Hoorcollege 21 uur Werkcollege 21 uur Toetsvorm Schriftelijk tentamen (70% eindcijfer); essay (30% eindcijfer) Literatuur L. Stone & P.F. Lurquin, 2007. Genes, Culture and Human Evolution. Blackwell Publishing, Malden, ± 45 euro Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven.
Methodologie en onderzoek in de biologie Vakcode
AB_470209 ()
Periode
Periode 3
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
drs. P. Vos
Docent(en)
H.R. Zoomer, dr. L.D.J. Kuijper, dr. J.M. Koene, drs. P. Vos
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Na afloop van de cursus kan de student zelfstandig op een veilige wijze een eenvoudig biologisch experiment uitvoeren en naar aanleiding daarvan de bevindingen schriftelijk rapporteren. De student kan zelfstandig betrouwbaarheidsintervallen bepalen bij eenvoudige biologische bepalingen, met behulp van Excel. De student leert bronnen uit de wetenschappelijke biologische literatuur op waarde te schatten en te gebruiken om een wetenschappelijke onderzoeksvraag te onderbouwen. De student weet waaraan een goede mondelinge presentatie voldoet en u kunt deze ook voorbereiden. Niveau 1: basiscursus Inhoud vak De volgende onderwerpen komen aan de orde - Kansrekening - Onderzoeksdesigns - Populaties en steekproeven - Beschrijvende statistiek - Schatten en betrouwbaarheidsintervallen - Verslagschrijven en mondelinge presentaties Eindtermen: De student - kan verschillende onderzoeksdesigns benoemen en beschrijven
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 98 van 150
- kan laten zien hoe je uit een populatie een verantwoorde steekproef neemt - is in staat beschrijvende statistische operaties uit te voeren in Excel - weet hoe kansmodellen gebruikt worden om betrouwbaarheidsintervallen te berekenen - leert op verantwoorde wijze laboratoriumwerk te verrichten - kan onder begeleiding een proefopzet passend bij een eenvoudige onderzoeksvraag bedenken - is in staat een goed geschreven onderzoeksverslag te maken - leert technieken voor een aansprekende mondelinge presentatie Onderwijsvorm - Hoorcolleges - Werkcolleges - Computerpractica - Laboratoriumpractica / leeronderzoek - Mondelinge presentaties Toetsvorm • Tentamen over Statistiek (50%) • Verslag over leeronderzoek Methodologie (15%) • Verslag over laboratoriumexperimenten (10%) • Exceltoets (15%) • Mondelinge presentatie (10%) Literatuur The Practice of Statistics in the Life Sciences. Brigitte Baldi & David S. Moore, W.H. Freeman and Company, New York. ISBN 1-4292-1876-2 (prijs ongeveer 60 euro) Overige informatie Het vak kan alleen met een voldoende afgesloten worden als de verplichte taaltoets Nederlands behaald is. Studenten die de taaltoets niet met een voldoende hebben afgesloten, dienen de remediërende cursus schrijfvaardigheid te volgen.
Methodologie en statistiek I Vakcode
AB_470165 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. L.D.J. Kuijper
Docent(en)
dr. K. Krab, H.R. Zoomer, dr. L.D.J. Kuijper
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum
Doel vak In deze cursus maak je allereerst kennis met de theorie van proefopzetten. Als voorbereiding op het onderdeel Statistiek leer je omgaan met relevante aspecten van kansrekening. Tenslotte maak je kennis met elementaire statistische methoden voor enkele veel voorkomende proefopzetten in de biologische en biomedische wetenschappen. In de cursus benadrukken we de praktische aspecten van
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 99 van 150
de statistische analyse door het gebruik van Excel. Eindtermen De student kan - gegevens op een juiste wijze grafisch weergeven - grafische weergaven van gegevens interpreteren - gegevens op de juiste wijze samenvatten in enkele maten, die locatie en spreiding beschrijven - de samenhang tussen twee variabelen berekenen en interpreteren - Simpson's paradox herkennen, en de gegevens zo presenteren dat de paradox verdwijnt - de sterke en zwakke punten van observationeel en experimenteel onderzoek benoemen en herkennen - uitleggen hoe je met informatie uit een steekproef algemene uitspraken kan doen over een statistische populatie - in een concrete situatie aangeven in hoeverre een steekproef voldoet aan het ideaalbeeld van een toevalssteekproef - de terminologie van proefopzetten correct gebruiken. - de basale regels van de kansrekening correct toepassen - de regel van Bayes toepassen - werken met de besproken kansverdelingen - werken met z- waarden - omgaan met de kansverdeling van steekproefgemiddelde en - proportie - betrouwbaarheidsintervallen berekenen voor populatiegemiddelde en proportie - uitleggen wat een betrouwbaarheidsinterval is - de gedachtegang van een statistische toets in eigen bewoordingen weergeven - uitleggen wat de relatie is tussen een statistische toets en een betrouwbaarheidsinterval - uitleggen aan welke voorwaarden de gegevens moeten voldoen, wil het resultaat van een statistische analyse betrouwbaar zijn - uitleggen wat een toetsingsgrootheid (test statistic) is, en wat een P- waarde is Niveau 1: basiscursus Inhoud vak - Theorie van proefopzetten; - Inleiding kansrekening en basale theorie van kansverdelingen - Statistische Theorie en toepassing daarvan. Onderwijsvorm Hoorcolleges; werkcolleges; computerpracticum; zelfstudie Literatuur B. Baldi & D.S. Moore (2009). The practice of statistics in the life sciences. Freeman and Co., New York. ISBN: 1-4292-1876-2 Doelgroep Verplicht voor tweedejaars bachelorstudenten Biomedische wetenschappen. Overige informatie Een voldoende cijfer voor deze cursus is ingangseis voor deelname aan de cursus Methodologie en statistiek 2 (470062); in het derde studiejaar.
Microbiologie Vakcode Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
A_470159 (450003) 6-3-2013 - Pagina 100 van 150
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Mind and Machine Course code
AB_1060 ()
Period
Period 3
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. L.N. Cornelisse
Teaching method(s)
Computer lab, Study Group, Lecture
Course objective To relate science fiction to science within the themes of (1) creating an artificial brain, (2) integrating brains and computers, and (3) applications of neural strategies. Course content People have always been fascinated with the idea to create intelligent robots or to integrate computers in the brain to manipulate or enhance its performance. In this course, the current status in creating an artificial brain is discussed. Students learn the theory behind integrating brains and computers, and experience hands-on how brain activity can control computers to write or play computer games. The application of neural strategies and artificial intelligence to solve societal problems is explained and demonstrated during visits to commercial partners. Students work in groups to investigate how close science has come to science fiction for specific themes. Form of tuition Lectures, practicals, group project and poster presentation Type of assessment Exam, report, and presentation Course reading To be decided Remarks Part of minor Brain and Mind. Central Academic Skills: Search, sort and review literature. Perform experiments with human subjects. Relate ideas and concepts (film) to reality (science). Think out of the box: imagination may push basic science into applications and create business opportunities. Present and defend data and opinions (poster and PowerPoint).
Moleculaire celbiologie Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 101 van 150
Vakcode
AB_470079 ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. R.J.M. van Spanning
Docent(en)
prof. dr. H.V. Westerhoff, dr. R.J.M. van Spanning, dr. K. Krab
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum
Doel vak Het verkrijgen van inzicht in het functioneren van cellen en het kennis maken met methodes om dat in de levende cel en erbuiten te bestuderen. Eindtermen: Het kunnen ontwerpen en uitvoeren van eenvoudige genexpressie-, signaaltransductie- en metabole experimenten Het kunnen maken en interpreteren van 'live' opnamen van wat er in levende cellen gebeurt met betrekking tot energiehuishouding, zuurstofschade, apoptose, DNA structuur, en signaaltransductie. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Organisatie, functie en regulering van de cellulaire ademhaling en productie van ATP, in relatie tot verstoringen van celfunctie zoals die optreden bij diabetes en veroudering; Regulatie van genexpressie tijdens de adaptieve respons van microorganismen bij verandering van de groeiconditie; Kwantitatieve beschrijving van de controle van cellulaire processen, met nadruk op het verband tussen de eigenschappen van individuele reacties en de eigenschappen van het netwerk waar die reacties deel van uitmaken (systeembiologie). Demonstratie van de bovenstaande principes aan de hand van de rol van signaaltransductie in bacterie, gist en mitochondrion. Onderwijsvorm Hoorcolleges; practicum op de afdeling Moleculaire Celfysiologie; computerpracticum. Toetsvorm Schriftelijk tentamen over collegestof en practicum (75%), eindpresentatie (25%) Literatuur Syllabus, prijs ongeveer 5 euro, en powerpoints hoorcolleges. Aanbevolen voorkennis Microbiologie en Biochemiecursussen of equivalent. Doelgroep Keuzevak derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Overige informatie Een laboratoriumjas is verplicht. Na afloop van het practicum wordt de labjas gesteriliseerd.
Moleculaire ontwikkelingsbiologie
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 102 van 150
Vakcode
AB_470038 ()
Periode
Periode 6
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. R.E. Koes
Docent(en)
prof. dr. R.E. Koes
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Practicum
Doel vak Het doel van deze cursus is inzicht te geven in - het functioneren van genen en complexere netwerken van meerdere genen in de sturing van complexe processen. - hoe genen en netwerken de ontwikkeling sturen van een enkel cel, de bevruchte eicel of zygote tot een complex eukaryoot organisme bestaande uit miljarden cellen met de juiste organen, weefsels en celtypes op de juiste plaats. - moleculair genetische onderzoek methodes en technieken waarmee we (ontwikkelings)biologische processen kunnen ontrafelen. Specifieke onderwerpen die daarbij aan de orde zullen komen zijn: - Moleculair mechanismen die de expressie van genen reguleren via DNA bindende eiwitten (transcriptie factoren), DNA- methylering en chromatinestructuur. - het functioneren van simple genetische circuits in de differentatie van verschillende celtypes en de moleculaire grondslag van "cell memory" (d. i de onomkeerbarheid van differentiatie). - Rol van "mobiel DNA" tijdens sex-differentiatie en gist en de ontwikkeling van B- lymphocyten in de mens. - regulatie en genetische controle van opvolgende fases in de cel cyclus (rol van checkpoint) - Specificatie van de lichaamsopbouw (anterior- posterior en dorsalventral lichaamsassen, segmenten, organe etc) tijdens vroege embryogenese. - Conservering van ontwikkelingsgenen (o. a. Hox genen) van insect tot muis. - Variatie tussen Hox genen en het ontstaan van diversiteit bij dieren. ("evo-devo" aspecten) - Ontwikkeling van een hogere plant Het doel van het practicum is: - Experimentele vaardigheden op te doen met enkele breed toepasbare moleculair genetische technieken. - Het leren interpreteren van experimentele resultaten en het bedenken van vervolg experimenten. - Het inzicht te verdiepen in de regulatie van genexpressie en de functie tijdens ontwikkelingsprocessen. Niveau van de cursus: 2 (verdieping) Inhoud vak De cursus start met twee "opfriscolleges" en een korte toets om een goede achtergrondkennis te verzekeren. Het hoofddeel van de cursus omvat hoorcolleges, werkcolleges en een "nat" practicum waarin we een aantal verschillende aspecten en moleculair mechanismen behandelen die ten grondslag liggen aan de ontwikkeling van hogere eukaryote organismes (zie doelen).
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 103 van 150
Onderwijsvorm Hoorcolleges (24 uur); werkcolleges (4 uur); practicum (circa 40 uur); zelfstudie (80 uur). Toetsvorm De benodigde voorkennis en de inleidende practicumtheorie wordt schriftelijk getoetst bij aanvang van de 2e cursusweek (10% van eindcijfer). Het practicum wordt beoordeeld aan de hand van een schriftelijke toets (40% van eindcijfer). De collegestof wordt schriftelijk getentamineerd (50% eindcijfer). Literatuur - Handboek: Wordt nader bekendgemaakt - Uittreksels (powerpoint files) van collegestof (gratis te downloaden van Blackboard); - Practicumhandleiding (ongeveer 7 euro) - Computerfiles (pdf) van artikelen gebruikt bij het practicum (gratis te downloaden via Blackboard). Doelgroep Keuzecursus voor tweede en derdejaars Bsc Biologie, Biomedische Wetenschappen. Keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. Overige informatie Bij dit studieonderdeel is het voor studenten die het Bachelor Honoursprogramma; Biologie, Bio- medische Wetenschappen of Gezondheid; en Leven; volgen, mogelijk te kiezen voor de stervariant. Bij de stervariant wordt aan het bovenomschreven studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De stervariant wordt geregistreerd onder een aparte vakcode. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 EC boven de normale belasting van de cursus.
Moleculaire ontwikkelingsbiologie * Vakcode
A_HP470038 ()
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 104 van 150
individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de normale belasting van de cursus.
Molecular Cell Biology Course code
AB_1053 ()
Period
Period 2
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. K. Krab
Teaching method(s)
Practical, Study Group, Lecture, Computer lab
Course objective To obtain a basic understanding of the functioning of living cells and introduction to qualitative and quantitative methods applicable inside and outside the living cell. To learn to design and execute studies where these methods are applied, and to interpretate the results. Course content General skills • Design and execution of simple experiments concerning gene expression, signal transduction and metabolic processes. • Application of Metabolic Control Analysis to quantify distribution of control and regulation of cellular processes by individual cellular reactions. • The use and interpretation of information about energy metabolism, oxygen damage, apoptosis, DNA structure and signal transduction pathways. Specialised topics • Introduction to Metabolic Control Analysis, and extension of this method to include gene expression. • Regulation of gene expression during nitrification and denitrification in microorganisms. • Application of the presented methods to a case study: fighting the parasite that causes sleeping sickness. Form of tuition Lectures; practical project in the department of Molecular Cell Physiology; computer practical. Type of assessment Written exam covering the lectures and the practical work (70%). A presentation about the practical project (30%). Course reading A syllabus is available on the Blackboard site. Entry requirements Courses "Van Molecuul tot Mens" and "Bedreiging en Afweer" or equivalent (biochemistry and microbiology).
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 105 van 150
Remarks Part of the minor Biomolecular Science and Neuroscience, track Biomolecular Science. A laboratory coat is required. After the course, the coat will be sterilised.
Molecular Microbiology Course code
AB_470610 ()
Period
Period 3
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. J.P. van Ulsen
Teaching staff
dr. R.J.M. van Spanning, prof. H. Lill, dr. S. Luirink, dr. M.P. Bergman, prof. dr. W. Bitter, dr. J.P. van Ulsen
Teaching method(s)
Lecture, Computer lab, Symposium
Course objective • Molecular interactions between host and bacterial pathogens are the basis of bacterial infections. The bacterial component of these interactions reside in the bacterial cell envelope. This course unravels the biogenesis of the bacterial cell-envelope, its components and their function. The emphasis is on structure and function of those components that have a role in bacterial pathogenesis, for example in disesases like peritonitis and tuberculosis, and their importance for vaccine development. • To teach how theory in the scientific literature and experimental practice in the lab are combined to answer a research question. At the end, the students are able to understand and know: • fundamental molecular processes in disease-causing bacteria that are important for growth, functioning and pathogenicity. • practical approaches in the molecular microbiology area, immunology, bacterial DNA technology, protein techniques, etc. Level 3: specialisation Course content Theory: • Lectures on: 1) biogenesis and functional aspects of the bacterial cell envelope, 2) the structure of its components (proteins and LPS); 3) secretion systems that transport virulence factors across the bacterial cell envelope; 4) the role of virulence factors in bacterial pathogenesis; 5) the mechanisms with which bacteria escape the human immune system; 6) vaccine development and vaccine target selection. Practical: • Students design and perform a research project within the departments that participate in the course (Molecular Microbiology, Structural Biology, Molecular Celfysiology). The project involves writing a research proposal, performing the project in the lab and reporting the results in a symposium (oral presentation with discussion).
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 106 van 150
Form of tuition • Lectures series based upon provided literature • Research project, with theoretical component (writing research proposal, practical component (laboratory work) and presentation) Type of assessment Written exam (50%, minimal mark to succeed is 5) and assesment of the laboratory project (50%), with marks for the research proposal (20%), the laboratory journal (10%) and the presentation (20%) Course reading Reader (ca. 10 Euro) Target group Final course of the minor Biomolecular & NeuroSciences, - track Biomolecular Sciences. When avaialblem students of other minors can participate (Evolutionary Biology and Biology; Topics in Biomedical Sciences. This course is taught at a level of third year BSc students Biology, Biomedical Sciences and Biochemistry, as well as MSc students in molecular cell biology / immunology / infection /biomolecular sciences, with a deficiency in the field of molecular microbiology. Maximum amount of students to enrol: 44; Students following the Biomolecular Sciences Minor are certain of placement. Remarks Much direct contact with the professors, associate and assistant professors, PhD's and postdocs. Laboratory projects in the departments.
Molecular Principles of Brain Disorders Course code
AB_1049 ()
Period
Period 2
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. H.K.E. Vervaeke
Teaching method(s)
Practical, Computer lab, Study Group, Lecture
Course objective Gain insight into the etiology, expression and treatment of various brain diseases, as well as models used in preclinical science. Course content Our brain enables us to perform even the most complex tasks. Sometimes however, diseases of the brain compromise its optimal function. In this course students learn what the clinical manifestations are of the neurological and psychiatric diseases, and what type of cellular or animal models are around to learn us more on how disturbed processes and systems in the brain lead to these illnesses and that may provide us with clues on treatment options. Topics include illnesses as neurodegenerative (e.g., Parkinson’s disease, white matter disease, Alzheimer’s disease) and neuropsychiatric diseases (e.g. addiction, depression, schizophrenia, autism). Various treatments options for these conditions, including the use of pharmacological agents and deep brain stimulation will be discussed.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 107 van 150
Form of tuition Lectures, discussion panel, literature review Type of assessment Exam (70%), literature study (30%) Course reading Papers and reader Recommended background knowledge Basic (first and second year level) courses in Cell Biology and Neurosciences Remarks Course in the track ‘Neurosciences’ in the minor ‘Biomolecular Sciences and Neurosciences’. The track ‘Neurosciences’ is an excellent preparation for the Master Neurosciences.
Multimedia Vakcode
AB_470105 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Docent(en)
dr. M.J.W. Bos, R.C. van Koten MSc
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak Theoretisch inzicht verkrijgen in multimedia in relatie tot gezondheids- en biomedische wetenschappen Inzicht verkrijgen in een aantal voorbeelden van het gebruik van multimedia in de (bio-)medische context Kennis verwerven op het kruispunt van multimedia en wetenschapscommunicatie op drie terreinen, namelijk datavisualisatie, webdesign en Internetjournalistiek Inzicht verkrijgen in toepassingen van multimedia om gezondheids- en wetenschapscommunicatie effectiever te maken Praktische vaardigheden verwerven voor het ontwerpen van een multimedia toepassingen voor een specifiek onderwerp op het gebied van gezondheids- en biomedische wetenschappen Inhoud vak De cursus Multimedia richt zich op de belangrijkste elementen van gezondheids- en wetenschapscommunicatie via multimedia. De cursus bestaat uit (gast)colleges verspreid over de eerste drie weken, individuele opdrachten, een groepsopdracht en een schriftelijk tentamen. Er wordt een overzicht gegeven van de diverse begrippen in het veld: nieuwe media, multimedia, data visualisatie, digitale communicatie en de relatie met onderzoek en praktijk van gezondheidsen biomedische wetenschappen. Verder wordt ingegaan op verschillende vormen van multimedia voor communicatie en onderzoek. Tijdens de cursus werken studenten in groepen van 3 of 4 aan het ontwerpen van een multimediale site. De website heeft als doel de communicatie tussen meerdere actoren (bijvoorbeeld overheid, patiënten, Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 108 van 150
wetenschappers, journalisten) te verbeteren op een zelf te kiezen onderwerp in de Gezondheids- en Levenswetenschappen. Onderwijsvorm Colleges, (groeps)opdrachten en zelfstudie Toetsvorm Schriftelijk tentamen 40%, individuele opdracht 20%, groepsopdracht 40%. Alle onderdelen moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Literatuur wordt nog aangekondigd Doelgroep Studenten Gezondheids- en Biomedische wetenschappen
Nature versus Nurture Course code
AB_1057 ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. J.C. Polderman
Teaching method(s)
Practical, Computer lab, Study Group, Lecture
Course objective To understand causes of individual differences in human cognitive, social and political behavior, and to evaluate critically the ongoing nature-nurture debate. Course content Human traits show considerable individual differences, which are caused by differences in the individual’s genes and/or by differences in their environment. In this course the influence of genes and environment on psychological, social and political behavior will be dissected using empirical evidence based on experiments with human subjects and animals. The human traits that play a central role in this course are derived from socially relevant topics such as social and antisocial behavior, political attitude/voting behavior, the effects of violent computer games on aggression, and empathy. Students will be introduced to the world of of DNA and genetic information and will get hands-on experience with DNA techniques (DNA collection, isolation, and genotyping), with the analysis of DNA at crime scenes, and with discussions about the the ethical aspects of DNA research. Evolution of human brain development and behavior will be clarified by pointing out the intriguing parallels with social cognitive skills of other primates. Form of tuition Lectures, practicals, workgroups, excursions Type of assessment Exam, debate, presentation Course reading
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 109 van 150
‘The origin of species’ by Darwin, ‘The nurture assumption’ by Judith Harris, ‘The age of empathy’ by Frans de Waal, and a selection of papers and chapters of handbooks. Remarks Part of minor Brain and Mind Central Academic Skill: Debating and discussing
Natuur, leven en techniek I Vakcode
AB_450207 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Engels
Coördinator
prof. dr. P.A.M. Andriessen
Docent(en)
prof. dr. P.A.M. Andriessen
Lesmethode(n)
Werkcollege
Doel vak Het doel van de cursus is: het inzichtelijk maken dat bepaalde elementaire kennis op het gebied van scheikunde en natuurkunde noodzakelijk is; het verkrijgen van gerichte elementaire kennis, basisprincipes en wetmatigheden, die dienen als basis voor andere cursussen.; door het oefenen met berekeningen de opgedane kennis toepassen en testen Inhoud vak Voor de opleiding Aarde en economie is een minimale basiskennis van scheikunde nodig. In het vak Natuur, Leven en Techniek 1 worden fundamentele concepten van scheikunde behandeld en komen de volgende onderwerpen aan bod: Atoombouw, Periodiek Systeem, Chemische bindingen, Zuren, Basen en Zouten, Chemische evenwichten, Evenwichtsconstante, Hydrolyse, Dissociatie, pH, Chemisch rekenen, Oplosbaarheid en oplosbaarheidsproduct, Waterige oplossingen. Het gaat niet alleen om het weten, maar ook om het kunnen en dus wordt er voldoende tijd ingeruimd voor het maken van opgaven. De opzet is dat de student zich de theorie en concepten eigen maakt door het maken van oefenopgaven tijdens de cursus. Bovendien zullen er voorbeelden worden behandeld die afkomstig zijn uit de Aardwetenschappen. Onderwijsvorm Hoorcolleges, werkcolleges en oefenopgaven. Toetsvorm Schriftelijk tentamen Literatuur Dictaat "Natuur, Leven en Techniek 1, Chemische gereedschapkist" (Paul Andriessen). Blackboard wordt o.a. benut voor aanvullend studiemateriaal en oefeningen.
Natuur, leven en techniek II Vakcode Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
AB_450208 () 6-3-2013 - Pagina 110 van 150
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Engels
Coördinator
prof. dr. P.A.M. Andriessen
Docent(en)
prof. dr. P.A.M. Andriessen
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak Het doel van de cursus is: het inzichtelijk maken dat bepaalde elementaire kennis op het gebied van natuurkunde noodzakelijk is; het verkrijgen van gerichte elementaire kennis, basisprincipes en wetmatigheden, die dient als basis voor andere cursussen; door het oefenen met berekeningen de opgedane kennis toepassen en testen. Inhoud vak Voor de opleiding Aarde en economie is een minimale basiskennis van natuurkunde nodig. In het vak Natuur, leven en techniek II worden fundamentele concepten van natuurkunde behandeld en; komen de volgende onderwerpen aan bod: Beweging en Kracht (Newton); Behoud van Momentum en Energie; Materie; Temperatuur en Warmte; Golven en Trillingen; Elektriciteit en Magnetisme, Elektromagnetische golven; Licht, inclusief de kwantum aard van licht; Reflectie, Refractie en Dispersie. Het gaat niet alleen om het weten, maar ook om het kunnen en dus wordt er voldoende tijd ingeruimd voor het maken van opgaven. De opzet is dat de student zich de theorie en concepten eigen maakt door het maken van oefenopgaven tijdens de cursus. Bovendien zullen er voorbeelden worden behandeld die afkomstig zijn uit de Aardwetenschappen. Onderwijsvorm Colleges, werkcolleges en zelfstudie Toetsvorm Afsluitend schriftelijk tentamen Literatuur Dictaat "Natuur, Leven en Techniek II; Natuurkunde"; (Paul Andriessen). Aanvullende ondersteunende informatie en uitwerkingen van de oefenopgaven worden op Blackboard geplaatst.
Neuronal Networks and Behavior Course code
AB_1051 ()
Period
Period 3
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. H.K.E. Vervaeke
Teaching method(s)
Practical, Computer lab, Lecture, Study Group
Course objective Gain insight into neuronal networks (sensory systems, hippocampus and neocortex) and behavior. Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 111 van 150
Practice laboratory skills. Course content Perception (auditory system, chemical senses, visual system), hippocampus, neocortex, startle reflex & emotion Form of tuition Lectures, laboratory practicals, computer practicals, poster presentation The focus of this course is on scientific experiments: (1) a practical on startle reflex modulation in humans; (2) a laboratory practical on neurophysiology in mice brain slices and (3) a computer practical on neuroinformatics. Students choose one of these practicals to make a scientific poster which they present individually on the ‘poster symposium’ of the course. Type of assessment Multiple Choice exam (60%) and poster presentations (40%) Course reading Neuroscience, Dale Purves c.s. Sinnauer Associates, Fourth Edition 2008 Recommended background knowledge Basic (first and second year level) courses in Cell Biology and Neurosciences Remarks Course in the track ‘Neurosciences’ in the minor ‘Biomolecular Sciences and Neurosciences’. The track ‘Neurosciences’ is an excellent preparation for the Master Neurosciences.
Neuronale en hormonale regulatie II Vakcode
AB_470226 (450003)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. R.E. van Kesteren
Docent(en)
prof. dr. S. Spijker, dr. R.E. van Kesteren, dr. M.H.G. Verheijen
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak Doel: Inzicht verwerven in de wijze waarop het zenuwstelsel en het hormonale systeem diverse lichaamsfuncties en gedrag reguleren, en hoe een aantal veel voorkomende neurologische, psychiatrische en endocriene aandoeningen zijn terug te voeren op ontregeling van deze systemen. Eindtermen: De student kent de basisprincipes van neuronale en hormonale communicatie; De student kent de belangrijkste onderdelen van het zenuwstelsel en het endocriene systeem; De student begrijpt hoe complex gedrag en cognitie tot stand komen
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 112 van 150
De student begrijpt hoe ontregeling van het zenuwstelsel of het endocriene systeem leidt tot ziekte; Niveau 1: basiscursus Inhoud vak Basisprincipes van neuronale en hormonale communicatie; de belangrijkste hersengebieden en (neuro)endocriene systemen en hun functies; de belangrijkste neurotransmitters en (neuro)hormonen en hun werkingsmechanismen; sensorische informatieverwerking; cognitie, leren en geheugen; verslaving; sexualiteit; stress; eten en drinken; interacties van het zenuwstelsel en het endocriene systeem; dysfuncties van het zenuwstelsel (o.a. ziekte van Parkinson, schizofrenie, verslaving); dysfuncties van het neuroendocriene systeem (o.a. diabetes mellitus, diabetes insipidus, depressiviteit, eetstoornissen). Onderwijsvorm Hoorcolleges, zelfstudie Toetsvorm Schriftelijk tentamen (multiple choice) Literatuur Martini: Fundamentals of Anatomy and Physiology, 7th edition 92006), ISBN 0-321-31198-1 Doelgroep Verplicht voor eerstejaars BSc Gezondheidswetenschappen. Overige informatie Let op: deze cursus is een verkorte versie van Neuronale en hormonale regulatie I, en daarom 3 EC waard.
Neuronale en psychische pathologie Vakcode
AB_470086 ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. T. Pattij
Docent(en)
dr. T. Pattij, dr. A.M.W. van Dam
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak Het doel van de cursus is om de studenten inzicht te laten verwerven in de biologische mechanismen, diagnostiek en therapieën van een aantal neuronale en psychische aandoeningen en welke maatschappelijke aspecten van belang zijn. Niveau 2: verdieping Inhoud vak In de cursus zullen de volgende aandoeningen aan de orde komen: Multiple Sclerose, ziekte van Parkinson, ziekte van Alzheimer, hersentumoren, cerebrovasculair accident, ADHD, Schizofrenie, Asperger/PDD-NOS en autisme. Van deze ziektebeelden wordt behandeld: De onderliggende biologische mechanismen; Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 113 van 150
Op basis van welke diagnostische criteria ze gesteld worden; Welke farmacologische en niet-farmacologische therapieën hedendaags worden toegepast; Welke hypothesen kunnen leiden tot vernieuwend therapeutisch gericht onderzoek; Maatschappelijke aspecten Onderwijsvorm Hoorcolleges, projectgroepen en een excursie naar een verpleeghuis. De excursie en de presentaties door de projectgroepen zijn verplicht. Toetsvorm Schriftelijk tentamen (70%), verslag en presentatie (30%) Literatuur Nader bekend te maken Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen Overige informatie Er kunnen maximaal 40 studenten aan de cursus deelnemen. Voorrang wordt verleend aan BSc studenten Gezondheidswetenschappen.
Neurowetenschappen I Vakcode
AB_470199 ()
Periode
Ac. Jaar (september), Periode 2
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. H.K.E. Vervaeke
Docent(en)
prof. dr. H.D. Mansvelder, dr. H.K.E. Vervaeke, dr. J.J. Koksma
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Kennis en inzicht verkrijgen in de bouw en functie van het zenuwstelsel. Niveau 2: verdieping Inhoud vak De cursus bestaat uit drie onderscheiden maar integraal onderwezen modules, te weten: Module 1: Neuroanatomie. Naast colleges zal aan de hand computer tutorials, demonstratie- en snijpractica inzicht worden verworven in de opbouw van de hersenen. Module 2: Van synapsen naar netwerken, waarbij de nadruk ligt op de moleculaire en celfysiologische benadering van zenuwcellen en netwerken. Naast colleges zal aan de hand computer simulaties en metingen op biologische preparaten inzicht worden verworven in het functioneren van ons zenuwstelsel. Module 3: Cognitie, Gedrag en Ziekte, waarbij de nadruk ligt op het cognitieve gedrag van mens en dier, de erfelijkheid daarvan en de verschillen tussen mensen.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 114 van 150
Onderwijsvorm Iedere module bevat een aantal colleges, computer tutorials en practica welke onder begeleiding zullen worden doorlopen. In iedere module zullen bepaalde onderdelen via Blackboard responders en/of practicumopdrachten worden getoetst. Toetsvorm Neurowetenschappen I wordt afgesloten met een schriftelijk examen aan het einde van de cursus, bestaande uit open vragen. Herkansing van de eindtoets is eenmaal per jaar mogelijk, de practica worden alleen in noodzakelijke gevallen op individuele basis herkanst. Literatuur Neuroscience, Dale Purves c.s. Sinnauer Associates, Fourth Edition 2008 Aanbevolen voorkennis Aanbevolen voorkennis: kennis en interesse opgedaan in andere gerelateerde vakken zoals Cellulaire Biologie (1e jaars BMW) of Vorm en Functie (1e jaars Gezondheid en Leven) Doelgroep Neurowetenschappen I is een verplichte cursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen en een keuzecursus voor tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. De cursus vormt een goede oriëntatie op (en is een ingangseis voor) de vervolgcursussen Neurowetenschappen II en III, beide belangrijk ter oriëntatie op een eventuele bachelor stage op het terrein van de Neurowetenschappen en later bij de toelating tot de Master of Neurosciences aan de VU/VUmc. Meer informatie hierover kunt u verkrijgen via de cursusleiding. Overige informatie Studenten Gezondheid & Leven die kiezen voor de cursus Neurowetenschappen I (470199) kunnen niet de cursus Preklinische Neurowetenschappen (487016) volgen. Slechts één van beide cursussen wordt toegestaan binnen het examenprogramma van Gezondheid en Leven.
Neurowetenschappen I * Vakcode
A_HP470199 ()
Credits
3.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Neurowetenschappen II: Genes and the brain Vakcode
AB_470204 ()
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. H.K.E. Vervaeke
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 115 van 150
Docent(en)
dr. K.W. Li, prof. dr. S. Spijker, dr. R.E. van Kesteren, prof. dr. M. Verhage, dr. R.F.G. Toonen, prof. dr. A.B. Smit, dr. P. van Nierop, dr. H.K.E. Vervaeke, dr. H. de Wit, dr. J.J. Koksma
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Deze cursus is gericht op het leren begrijpen van de relatie tussen moleculaire en cellulaire processen in het brein en het functioneren van het brein als geheel. De student zal na deze cursus een goed inzicht hebben en vaardigheden bezitten in het van gebruik van moleculaire en celbiologische technieken. Zelfstandig leren werken en een ontplooiingsmogelijkheid bieden voor academisch talent zijn daarbij belangrijke uitgangspunten. Niveau van de cursus: 2, inzoomen op deelgebieden van de neurobiologie, state of the art kennis met betrekking tot lopend wetenschappelijk onderzoek, aanleren van specifieke methoden en technieken; niveau 3: theorievorming op basis van onderzoeksgegevens, aanzet tot specialisatie, leren verwerken van primaire en secundaire wetenschappelijke literatuur. Inhoud vak Aan de hand van theorievorming en secundaire wetenschappelijke literatuur zal een begin gemaakt worden met de integratief neurowetenschappelijke benadering van de moleculaire biologie van ons brein, de cellulaire biologische methodes en de principes van de gedragsgenetica. Aan de hand van een drietal modules zullen studenten vervolgens vaardigheden opdoen en onderzoek leren verrichten. Deze modules zijn: Moleculaire Neurobiologie, gericht op methodiek in de moleculaire neurobiologie Cellulaire Neurobiologie, gericht op functionele analyse en imaging Van Gen naar Gedrag Onderwijsvorm De cursus heeft een sterk experimenteel karakter, er is veel aandacht voor laboratoriumwerk en opzet en verslaglegging van experimenten. Studenten zullen in subgroepen werken aan een aantal experimentele modules. Er worden vier practica aangeboden, waarbij zowel computers als laboratorium faciliteiten worden gebruikt. Toetsvorm Neurowetenschappen II wordt afgesloten met een schriftelijk examen aan het einde van de cursus, welke gecombineerd met drie practicumverslagen die tezamen het eindcijfer van de cursus vormen. De multiple choice-eindtoets telt mee voor 40% en de drie practicumverslagen elk voor 20%. Om te kunnen slagen voor de cursus moet voor ieder van deze onderdelen afzonderlijk een voldoende worden gehaald. Herkansing van alleen de eindtoets is eenmaal per jaar mogelijk, de practicumbeoordelingen worden op individuele basis herkanst bij een volgende cursus. Bij uitzondering zal een vervangende opdracht kunnen worden gegeven. Literatuur Neuroscience, Dale Purves c.s. Sinnauer Associates, Fourth Edition 2008 Vereiste voorkennis
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 116 van 150
Voor studenten Biomedische Wetenschappen geldt als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I (dus een voldoende gehaald). Voor studenten Biologie geldt als ingangseis de cursus Genen, hersenen en gedrag (dus een voldoende gehaald). Bij voldoende capaciteit geldt voor studenten Gezondheid en Leven, die van hun examencommissie toestemming hebben aan de cursus deel te nemen, als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I of Preklinische Neurowetenschappen (dus een voldoende gehaald). Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars (en derdejaars) Bsc Biologie, Biomedische Wetenschappen en Gezondheid en Leven. Het volgen van Neurowetenschappen II is een goede oriëntatie op een eventuele neurowetenschappelijke stage aan de Neuroscience Campus Amsterdam of elders. Tevens is het volgen van Neurowetenschappen II een pré bij de toelating tot de Master of Neurosciences van de VU/VUmc. Meer informatie kunt u verkrijgen via dr. W. Smeets (coördinator Master of Neurosciences) en/of via internet (www.neurosciencecampus-amsterdam.nl; zie Master of Neurosciences). Overige informatie Neurowetenschappen II sluit mooi aan bij Neurowetenschappen III en is daarmee de ideale voorbereiding op een verdere academische specialisatie. Hoewel Neurowetenschappen II een specialisatiecursus is welke op niveau 2 en/of 3 haar onderdelen aanbiedt, is er een redelijke capaciteit aangezien de cursus instituutbreed gedragen zal worden. Door de intensieve begeleiding zal het beoogde werkgroepkarakter behouden blijven. Per jaar kunnen zich maximaal 80 studenten inschrijven voor deze cursus. Voorrang wordt verleend aan tweedejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Cursus is bij voldoende capaciteit wel opengesteld voor derdejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen en tweedejaars BSc Gezondheid en Leven. Studenten van andere richtingen komen alleen in aanmerking als er plaatsen over zijn (en moeten eerst contact opnemen met de docent omtrent ingangseisen). Overigens is er een minimum aantal inschrijvingen van 25 een voorwaarde voor de cursus om door te gaan.
Neurowetenschappen III: monitoring the brain Vakcode
AB_470205 ()
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. H.K.E. Vervaeke
Docent(en)
prof. dr. H.D. Mansvelder, dr. R.O. Stiedl, dr. A. van Ooijen, dr. H.K.E. Vervaeke, dr. J.J. Koksma
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Cursus gericht op het leren begrijpen van het brein, met name op het terrein van 'monitoring the brain'. De student zal na deze cursus goed inzicht hebben en vaardigheden bezitten op het terrein van gedrags- en neurofysiologische technieken en onderzoeksvragen. Tevens wordt het afleiden van zenuwcellen, het monitoren van diergedrag en de theorievorming middels computermodellen gedemonstreerd. Zelfstandig leren werken en een playground bieden voor Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 117 van 150
academisch talent zijn daarbij belangrijke uitgangspunten. Niveau van de cursus: 2, inzoomen op deelgebieden van de neurobiologie, aanleren van specifieke methoden en technieken; niveau 3: theorievorming op basis van onderzoeksgegevens, aanzet tot specialisatie, leren verwerken van primaire en secundaire wetenschappelijke literatuur. Inhoud vak Aan de hand van theorievorming en secundaire wetenschappelijke literatuur zal een begin gemaakt worden met de integratief neurowetenschappelijke benadering van synaptische transmissie, neuronale netwerken en diergedrag. Aan de hand van een drietal experimentele modules zullen studenten vervolgens vaardigheden opdoen en onderzoek leren verrichten. Deze modules zijn: Neuroinformatics, gericht op neuronale netwerken en modelbouw Zintuigfysiologie, gericht op sensorische informatie verwerking Gedragsbiologie, gericht op het leren begrijpen van gedrag van proefdieren Onderwijsvorm Basisstof wordt behandeld in de vorm van hoorcolleges, adhv het tekstboek van Purves en aanvullende literatuur. Het accent in de cursus ligt op het zelf bestuderen van de fysiologie van het brein in een drietal practica. Over een van deze drie onderzoeken maken de studenten een wetenschappelijke poster die gepresenteerd wordt tijdens het postersymposium aan het eind van de cursus. Toetsvorm Neurowetenschappen III wordt afgesloten met een schriftelijk multiple choicetentamen aan het einde van de cursus, dat voor 60% het eindcijfer bepaalt. Naast dit tentamen maken de studenten een poster die voor 40% meetelt en moeten de studenten aan verdere practicumverplichtingen hebben voldaan. Om te kunnen slagen voor de cursus moet voor ieder van deze onderdelen afzonderlijk een voldoende worden gehaald. Herkansing van alleen de eindtoets is eenmaal per jaar mogelijk, de practicum beoordelingen worden op individuele basis herkanst. Literatuur Neuroscience, Dale Purves c.s. Sinnauer Associates, Fourth Edition 2008 Aanbevolen voorkennis Voor studenten Biomedische Wetenschappen geldt als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I (dus een voldoende gehaald). Voor studenten Biologie geldt als ingangseis de cursus Genen, hersenen en gedrag (dus een voldoende gehaald). Bij voldoende capaciteit geldt voor studenten Gezondheid en Leven, die van hun examencommissie toestemming hebben aan de cursus deel te nemen, als ingangseis de cursus Neurowetenschappen I of Preklinische neurowetenschappen (dus een voldoende gehaald). Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars (en derdejaars) Bsc Biologie en Biomedische Wetenschappen. Het volgen van Neurowetenschappen III is een goede oriëntatie op een eventuele neurowetenschappelijke stage aan de Neuroscience Campus Amsterdam of elders. Tevens is het volgen van Neurowetenschappen III een 'pre' bij de toelating tot de Master of Neurosciences van de VU/VUmc. Meer informatie kunt u verkrijgen via dr. Wil Smeets (coördinator Master of Neurosciences) en/of via www.neurosciencecampus-amsterdam.nl/en/education/master-of-neuroscience.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 118 van 150
Overige informatie Hoewel Neurowetenschappen III een specialisatiecursus is welke op niveau 2 en/of 3 haar onderdelen aanbiedt, is er een redelijke capaciteit aangezien de cursus instituutbreed gedragen zal worden. Door de intensieve begeleiding zal het beoogde werkgroepkarakter behouden blijven. Per jaar kunnen zich maximaal 80 studenten inschrijven voor deze cursus. Voorrang wordt verleend aan tweedejaars BSc Biologie en Biomedische Wetenschappen en studenten Gezondheid en Leven. Cursus is bij voldoende capaciteit wel opengesteld voor derdejaars studenten. Studenten van andere richtingen komen alleen in aanmerking als er plaatsen over zijn (en moeten eerste contact opnemen met de docent omtrent ingangseisen). Studenten die geen ingang krijgen in de cursus Neurowetenschappen III wordt gewezen op de mogelijkheid deel te nemen aan de cursus Humane Neurofysiologie van de opleiding Gezondheid en Leven die gelijktijdig wordt aangeboden vanuit dezelfde afdelingen. Overigens is er een minimum aantal inschrijvingen van 25 een voorwaarde voor de cursus om door te gaan.
New Anatomy Vakcode
OH_NA (986010)
Periode
Periode 1+2
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Onderwijscentrum VU
Coördinator
drs. L.H.C. Plantinga
Docent(en)
prof. dr. H.E.J. Veeger
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Oncologie * Vakcode
A_HP470050 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Inhoud vak Bij de stervariant wordt aan het gelijknamige studieonderdeel een individueel literatuuronderzoek toegevoegd naar een onderwerp dat binnen de cursus aan de orde komt. Over dit literatuuronderzoek rapporteert de student in een verslag, dat de vorm heeft van een wetenschappelijk artikel. Het thema van dit literatuuronderzoek wordt in overleg tussen de docent en de student vastgesteld. Het literatuuronderzoek wordt individueel begeleid door de docent die voor de cursus verantwoordelijk is. Het verslag wordt apart beoordeeld met een cijfer. De beoordeling van de stervariant telt niet mee in de eindbeoordeling van de cursus zelf. De studielast van de stervariant van de cursus bedraagt 3 stp. boven de
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 119 van 150
normale belasting van de cursus.
Ontwikkeling en voortplanting van de mens Vakcode
A_470150 (450003)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Oriëntatie op onderzoek Vakcode
AB_470173 (450003)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
drs. E.J.M. van de Grint
Docent(en)
drs. E.J.M. van de Grint
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum
Doel vak De studenten maken kennis met: de manier waarop wetenschappelijke vragen gesteld en beantwoord worden in het onderzoek. twee onderzoeksgroepen Eindtermen Na afloop van de cursus ben je in staat: over een op een wetenschappelijke afdeling verkregen verzameling meetgegevens - een verslag te schrijven - een mondelinge presentatie te houden - een poster te maken en uit te leggen twee wetenschappelijke afdelingen met elkaar te vergelijken op grond van de door hun gebruikte methodologie eenvoudige data analyses uit te voeren een analyse te maken over je eigen belangstelling voor het wetenschappelijk onderzoek Niveau 2: verdieping Inhoud vak Wetenschappelijk onderzoek verschaft antwoorden op vragen. Het onderzoeksproces is te onderscheiden in een aantal stadia. Na het stellen van de onderzoeksvraag wordt informatie verzameld over het onderwerp om te achterhalen wat al bekend is. Vervolgens zal de vraag moeten leiden tot een hypothese, die leidt tot een proefopzet. In de proef worden gegevens verzameld, vaak met technisch geavanceerde apparatuur. De verkregen gegevens moeten na analyse een antwoord opleveren. Tot slot doet men verslag van het onderzoek in een artikel. In deze cursus ga je aan al deze punten gericht aandacht besteden. Je maakt kennis met het onderzoek op twee afdelingen, en gaat uitvoerig kijken naar enkele methoden en instrumenten waarmee gegevens worden Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 120 van 150
verzameld/ metingen worden verricht. Afsluitend doe je verslag van het onderzoek. Onderwijsvorm Twee projecten waarin je op een afdeling intensief kennismaakt met het onderzoek van die afdeling; je wordt hierbij begeleid door een AIO of postdoc; Verplichte werkgroepen en practica, laboratorium experimenten. De beoordeling bestaat uit een aantal onderdelen. Voor alle onderdelen moet een voldoende worden behaald. een onderzoeksvoorstel behorende bij module A (10%) een verslag behorende bij module A (25%) een mondelinge presentatie behorende bij module A (25%) een onderzoeksvoorstel behorende bij module B (10%) een poster en de uitleg daarvan behorende bij module B (25%) een reflectieverslag (5%) participatie tijdens de groepsbijeenkomsten de wijze van samenwerken = procesbeoordeling Toetsvorm De opdrachten (het onderzoeksvoorstel, het schriftelijke verslag, de mondelinge presentatie, en poster) dienen allemaal met een voldoende zijn afgesloten. Er is geen tentamen. Literatuur Syllabus, te downloaden via Blackboard. Overige literatuur wordt verstrekt tijdens de bijeenkomsten. Doelgroep Keuzecursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen. Overige informatie Aantal deelnemers: minimaal 25, maximaal 50 studenten
Oriëntatie op studie, loopbaan en maatschappij Vakcode
AB_470098 ()
Periode
Periode 3+4+5+6
Credits
1.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. M.H. Donker
Docent(en)
dr. M.H. Donker
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak Het onderdeel Oriëntatie op Studie, Loopbaan en Maatschappij heeft tot doel de student na te laten denken over de keuzes die met het afsluiten van de bachelor gemaakt moeten worden. Dat betreft vooral keuzes voor het al dan niet vervolgen van de studie met een masteropleiding, maar, in het verlengde daarvan, ook al keuzes die uiteindelijk gemaakt worden voor een werkkring. Daarbij is het van belang voor de student er achter te komen welke interesses en vaardigheden hij/zij bezit, maar ook welke wensen er bestaan ten aanzien van de mogelijkheden op de arbeidsmarkt. Eindtermen:
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 121 van 150
Op basis van het door de student gemaakte persoonlijk profiel en de individuele en groepsgewijze oriëntatie op de arbeidsmarkt kan de student gemotiveerd kiezen voor een - Onderwerp voor de bachelorstage - Masteropleiding - Specialisatiegebied Niveau 2: verdieping Inhoud vak In kleine werkgroepen wordt met de studenten nagedacht over de vragen: Welke richting moet er gekozen worden in de masterfase? Wat zijn de wensen ten aanzien van het toekomstig beroep? Middels een persoonlijke competentieanalyse, een advertentieanalyse en een netwerkinterview oriënteert de student zich individueel en in een kleine groep op het voor hem of haar meest wenselijke en geschikte vervolgtraject in de masterfase en uiteindelijk op de door hem/haar geambieerde plaats in de maatschappij. Onderwijsvorm Plenair 2 introductiecolleges (eind januari en eind maart 2010) Dit college wordt gevolgd door; 2; werkgroepbijeenkomsten in april, die vooral gericht zijn op de keuze voor het vakgebied en onderwerp van de bachelorstage. In mei en juni zijn 2 werkgroepbijeenkomsten waarin de student zich via o. a. een advertentieanalyse en een netwerkinterview oriënteert op de arbeidsmarkt. Tijdens de bachelorstage in het 3e studiejaar vinden twee terugkombijeenkomsten plaats, gericht op het uitwisselen van ervaringen bij de stage en de keuze van de master. De stage wordt afgesloten met een 3e terugkomdag waarin het gedane onderzoek wordt gepresenteerd door middel van een poster. Literatuur Opdrachten en achtergrondinformatie via de Blackboardsite Doelgroep Tweede- en derdejaars BSc Biologie, Biomedische Wetenschappen en Gezondheidswetenschappen. Overige informatie Verplichte cursus.
Paleontologie Vakcode
AB_450070 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. B.P. Zoetemeijer
Doel vak Inzicht in de ontwikkeling van het leven, gekoppeld aan de evolutie van planeet Aarde. Het leren herkennen van biota van karakteristieke sedimentaire milieus.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 122 van 150
Inhoud vak Evolutie van het leven in relatie tot plaattektoniek en klimaat. Stratigrafisch/ecologische betekenis van de belangrijkste macro/micro-fossielgroepen uit terrestrische en mariene milieus. Onderwijsvorm Colleges en practica. De behandelde fossielgroepen worden in handstuk bestudeerd. Toetsvorm Schriftelijk tentamen Literatuur Syllabus en internet
Pathologie Vakcode
AB_470042 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. R.D.M. Steenbergen
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak Brede introductie in het ontstaan van ziekteprocessen en de bijbehorende (bio)medische terminologie Kennismaken met het klinisch voorkomen en gangbare diagnostiek en behandelwijzen van een aantal belangrijke ziekten Inzicht krijgen in experimentele benaderingen die bijdragen tot vergroting van het inzicht in ziekteprocessen Inzicht verkrijgen in experimentele mogelijkheden bij de ontwikkeling van nieuwe diagnostische en therapeutische benaderingen Inzicht verkrijgen in het biomedisch onderzoek binnen de Pathologie Eindtermen: De student bezit parate kennis betreffende: Relevante medische terminologie Voor elk van de behandelde ziekten de belangrijkste punten van het ontstaansmechanisme, diagnostiek en/of therapeutische mogelijkheden Het verschil tussen pathogenen en etiologie Betekennissen van symptomen, syndromen en ziektekenmerken Raadpleging van medische tekstboeken en databases zodanig dat kort en bondig ook essentialia van niet aan de orde gekomen ziekten aangegeven kunnen worden Mogelijkheden om primaire medische literatuur mbt de behandelde ziekten te raadplegen en nieuwe inzichten daaruit samen te vatten Principes van de behandelde experimentele benaderingen en de toegepaste medisch-biologisch relevante technieken. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Algemene introductie in de pathologie en de bijbehorende medische terminologie Genetische processen betrokken bij ontstaan ziektes; erfelijke Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 123 van 150
afwijkingen Groei en ontwikkelingsstoornissen Morfogenese Deposities, intoxicaties, infarcten, trombose, ischemie en shock Ontstekingsprocessen: betrokken cellen en mediatoren Ziekteprocessen samenhangend met ongewenste immunologische reactiviteit, met name transplantaatafstoting, auto-immuniteit (reuma, schildklierziekten) en allergie (hooikoorts, contactallergie) Ziekteprocessen waarbij ongewenst zwakke immuniteit optreedt, met name immuundeficiënties (aangeboren of verworven, aids), chronisch recidiverende infecties en tumorgroei Hiernaast worden vele andere aspecten van de oncologie (tumorleer) behandeld, onder meer ontstaansmechanismen, prevalentie, diagnostische en therapeutische benaderingen Aantasting van bloedvaten: atherosclerose, hartinfarct Longziekten, darmziekten (tumoren en ontstekingen), endocriene stoornissen(met name suikerziekte) Ziekten van vrouwelijk en mannelijk genitaal stelsel; endocriene stoornissen (ontsteking en tumoren) Neurologische aandoeningen, zoals Multiple Sclerose, Alzheimer Moleculaire, Genetische, Celbiologische en Immunologische technieken Onderwijsvorm Hoorcolleges aan de hand van leerboek; seminars: introducties recent wetenschappelijk onderzoek; practicum macro pathologie, mortuarium bezoek, literatuuropdracht, repetitie/leerstofbegeleidingscollege; zelfstudie Toetsvorm Schiftelijk tentamen, met mix van korte essay- en multiple choice vragen. Schriftelijke herkansing: 1x per jaar Literatuur J.C.E. Underwood, General and Systematic Pathology,5th edition, Churchill Livingstone, New York Edinburgh, 2009 . Prijs ongeveer 75,-. (Boek is ook gebruikt tijdens eerstejaars cursus Gezondheid en Milieu) Doelgroep Verplicht voor derdejaars BSc Biomedische Wetenschappen en tweedejaars BSc Medische Natuurwetenschappen; keuzecursus voor Pre-Masterstudenten Gezondheidswetenschappen met een BSc diploma Diëtetiek en derdejaars BSc Gezondheid en Leven. Overige informatie Let op: in 2010 - 2011 wordt de cursus in periode 4 alleen aangeboden voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen c.q. Gezondheid en Leven; in periode 1 alleen voor derdejaars van genoemde opleidingen.
Pathologie * Vakcode
A_HP470042 ()
Credits
3.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 124 van 150
Power and Change Vakcode
OH_UPC ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Preklinische neurowetenschappen stervariant Vakcode
A_HP487016 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. H.K.E. Vervaeke
Regulatie en afweer bij dieren Vakcode
AB_470202 ()
Periode
Periode 4
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. J.M. Koene
Docent(en)
dr. R.F. Jansen, prof. dr. N.M. van Straalen, dr. R.O. Stiedl, dr. J.M. Koene
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Deze cursus heeft als doel inzicht te geven in fysiologische en immunologische principes van homeostase van het interne milieu bij dieren en in de evolutionaire samenhang van de mechanismen van regulatie en afweer. Daarnaast, zullen vaardigheden worden bijgebracht die nodig zijn voor de interpretatie van histologische preparaten van dierlijke weefsels, in het bijzonder gericht op verstoringen door infecties en parasitisme. Bij het uitvoeren van experimenten met levende dieren zal vooral ook aandacht besteed worden aan experimenteel ontwerp, weergave van resultaten en wetenschappelijke rapportage. Eindtermen: 1. De student heeft kennis en inzicht in de volgende onderwerpen uit de dierfysiologie: Dierlijke respiratie in lucht en water, Circulatie, transport van zuurstof en kooldioxide, Aanpassing aan temperatuurextremen, Osmoregulatie en excretie, Bewegingsfysiologie, Diversiteit aan parasieten en afweerreacties, Immunologische verdediging, Experimentele aanpak, Interpretatie en presentatie van gegevens. 2. De student kan zijn standpunt ten aanzien van dierproeven in het openbaar toelichten en verdedigen. Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 125 van 150
3. De student bezit vaardigheden nodig voor het werken met levende dieren en het doen van fysiologische waarnemingen en bepalingen. 4. De student kan histologische preparaten van organen betrokken bij afweer en regulatie, alsmede preparaten van parasitaire wormen interpreteren en zelf weergeven. 5. De student kan zelfstandig hypotheses ontwikkelen over de werking van homeostatische systemen in dieren, deze toetsen in experimenten en daarover mondeling en schriftelijk verslag uitbrengen. Niveau 2: verdieping Inhoud vak In het eerste gedeelte van de cursus worden een aantal fundamentele onderwerpen uit de dierfysiologie behandeld zoals: Respiratie in lucht en water, circulatie, transport van zuurstof en kooldioxide, aanpassing aan temperatuurextremen, osmoregulatie en excretie, bewegingsfysiologie, energieverwerking en voeding. Tevens wordt door middel van een forumdiscussie met uitgenodigde experts van buiten invulling gegeven aan meningsvorming omtrent dierproeven. Het tweede gedeelte van de cursus behandelt de mechanismen die door dieren ingezet worden om weerstand te bieden aan bedreigingen in de vorm van toxische stoffen, infecties en parasieten. Daarbij wordt ingegaan op de volgende onderwerpen: Diversiteit aan stoffen die giftig zijn voor dieren, toxicologische verdedigingsmechanismen, biotransformatie, diversiteit aan parasieten, afweerreacties en immunologische verdediging. De practica behandelen onderwerpen als spierfysiologie, osmoregulatie, en de hartslag bij slakken en mensen. De microscooppractica behandelen de histologie van de lever, lymfeknoop en diverse parasieten. De studenten kunnen uiteindelijk de leerstof toepassen door een meerdaags experiment te ontwerpen en uit te voeren, waarbij ook de statistiek uit eerdere cursussen kan worden toegepast en, indien nodig, kan worden verdiept (o.l.v. de cursusleider). Onderwijsvorm Colleges (± 40 uur), fysiologische (computer)practica (± 40 uur), histologische practica (± 24 uur), forum, presentaties en verslag. Enkele colleges zullen in het Engels gegeven worden. Toetsvorm Drie deeltoetsen, elk 26,7% van het eindcijfer, essay, verslagen en presentatie (samen 20%) Literatuur R.W. Hill, G.A. Wyse, & M. Anderson (2008) Animal Physiology. Second Edition. Sinauer Associates, Sunderland, ISBN 978-0-87893-317-4 (nieuwe uitgave, prijs ±; 70 euro), practicumhandleiding Aanbevolen voorkennis Genen, hersenen en gedrag (AB_470176, eerste jaar Biologie) Doelgroep Verplicht voor tweedejaars BSc Biologie
Religion, Identity, Conflict Vakcode
OH_RIC (986001)
Periode
Semester 2
Credits
6.0
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 126 van 150
Voertaal
Engels
Coördinator
drs. L.H.C. Plantinga
Docent(en)
prof. dr. R.R. Ganzevoort
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Ruimtelijke beeldvorming Vakcode
AB_450065 (450003)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Coördinator
dr. H. Stel
Doel vak De student ontwikkelt ruimtelijk inzicht door geometrische oefeningen op kaarten en profielen. Hij verkrijgt kennis en vaardigheden om eenvoudige geologische/geomorfologische kaarten te interpreteren en om een geologisch profiel te tekenen. Inhoud vak De student leert werken met: -De weergave van het aardoppervlak in het platte vlak, topografische kaart, hoogtelijnen, topografisch profiel, blokdiagram. -Ruimtelijke geometrische constructies (isohypsen, dagzomen, breuken, plooien met horizontale en duikende plooiassen). -Geologische kaarten: verwerking van kwantitatieve gegevens in kaarten, kaart- en legendaopbouw, geologische geschiedenis afleiden uit kaarten (formaties, plooiing, discordanties, breuken, dikes etc. ); het lezen van een geologische/geomorfologische kaart. -Geomorfologische kaarten, landschapselementen -Profielen, constructie van profielen uit de geologische kaart en luchtfoto's. Onderwijsvorm Werkcollege. Literatuur Prakticumhandleiding.
Seksualiteit en gezondheid Vakcode
AB_470148 ()
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. F. de Boer
Docent(en)
prof. dr. I.N. Wolffers, dr. F. de Boer
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 127 van 150
Het doel van de cursus is om de student inzicht te geven in de relatie tussen seksualiteit, identiteit en gezondheid vanuit verschillende wetenschappelijke perspectieven, waaronder het sociaal-culturele perspectief. Tevens biedt de cursus inzicht in de toepassing van wetenschappelijke inzichten over dit onderwerp in de gezondheidszorg in zowel Nederland als in het buitenland. Algemene eindtermen: De student heeft inzicht in de relatie tussen identiteit, seksualiteit, welzijn en gezondheid. De student kan de risicofactoren benoemen die de seksuele gezondheid beïnvloeden. De student kan fysieke, sociale en psychologische uitingen van verstoring van seksuele gezondheid herkennen. De student is op de hoogte van verschillende publieke gezondheidprogrammas om seksuele gezondheid te bevorderen. De student begrijpt de redenen om doelgroepen, zoals jongeren, sekswerkers, migranten, bij de ontwikkeling van deze programmas te betrekken. De student heeft inzicht in vormen van curatieve zorg die proberen tegemoet te komen aan problemen op het gebied van seksuele en reproductieve gezondheid. De student heeft inzicht in gender- en cultuurspecifieke factoren die bij seksuele gezondheid een rol kunnen spelen. De student heeft kennis van globalisering en de gevolgen daarvan op seksueel gedrag en seksuele gezondheid. De student kan - op basis van de aangeboden kennis - een opdracht of een klein onderzoek uitvoeren op het gebied van seksuele gezondheid. Specifieke Eindtermen: De student heeft inzicht in de geschiedenis van de seksualiteit. De student heeft kennis van de biologische basis van seksuele ontwikkeling. De student heeft kennis van concepten en begrippen uit de reproductieve gezondheidzorg en weet deze kritisch te benaderen. De student kan de meest voorkomende SOA's, HIV & AIDS en hun uitingsvormen benoemen als ook de impact van deze SOA's, HIV en AIDS op de seksuele gezondheid. De student heeft kennis van het seksuele identiteitsdiscours en kan aangeven hoe dat discours grotendeels plaatsvindt vanuit een heteroseksueel perspectief De student kan de variëteit aan seksuele oriëntaties en identiteiten benoemen. De student heeft kennis van sociale, culturele en maatschappelijke factoren, die de expressie van seksualiteit beïnvloeden. De student kan factoren, die seksuele voorlichting en preventie voor verschillende culturele groepen faciliteren of juist verhinderen, herkennen en benoemen. De student kan het seksualiteitsdebat binnen een globaliserende samenleving plaatsen. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Tijdens de cursus komen de volgende onderwerpen aan bod: Geschiedenis van de seksualiteit Reproductieve gezondheid Globalisering van seksualiteit Seksuele identiteiten ABC vs. CNN Voorlichting over seksualiteit SOA's, HIV en AIDS Preventieprogramma's ter bevordering van seksueel gezond gedrag Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 128 van 150
Seks, werk en gezondheid Seksuele diversiteit & identiteit en de relatie met gezondheidszorg en discriminatie De invloed van Internet op seksueel gedrag Onderwijsvorm Hoorcolleges, werkgroepen, excursies, filmobservatie. Tijdens de werkgroepen zullen de onderwerpen van de cursus verder uitgediept worden aan de hand van opdracht(en). Toetsvorm Toetsing vindt plaats door middel van een schriftelijk tentamen en beoordeling van werkgroepopdrachten plus presentatie. Het tentamen bestaat uit open vragen gebaseerd op de verplichte literatuur en de inhoud van de colleges. Samen vormen zij het eindcijfer, waarbij het tentamen voor 75% meetelt en de werkgroepopdracht inclusief presentatie voor 25% in de bepaling van het eindcijfer. Voor alle onderdelen dient een voldoende behaald te worden, d.w.z. minimaal een 6. Aanwezigheid bij de werkgroepbijeenkomsten telt mee in de beoordeling. Literatuur De verplichte literatuur is terug te vinden op Blackboard Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen
Sport, beweging en gezondheid Vakcode
AB_470093 ()
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
drs. R.I. Hutter
Docent(en)
drs. R.I. Hutter
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak Studenten beschikken over kennis van en inzicht in de relatie tussen (recreatieve) sport of beweging en psychische en lichamelijke gezondheid. Zij zijn in staat deze inzichten toe te passen in het opstellen en evalueren van motivatiestrategieën en bewegingsprogramma's. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De cursus beoogt de studenten te introduceren in het domein van sport en beweging in relatie tot lichamelijke en psychische gezondheid. Aan de hand van diverse hoofdstukken uit overzichtsboeken over 'the psychology of physical activity, 'exercise psychology' en inspanningsfysiologie wordt de stand van zaken gepresenteerd en kennisgemaakt met de belangrijkste onderwerpen. Daarnaast oefenen de studenten met de toepassing van begrippen uit de inspanningsfysiologie en 'bewegingspsychologie' op verschillende cases. Aan de orde komen de onderstaande onderwerpen: de relatie tussen beweging en psychologisch welzijn fysiologie van bewegen en gezondheid en onderliggende werkingsmechanismen Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 129 van 150
beweeggedraag (recente modellen, theoriën en praktische implicaties) het meten van fysieke capaciteit, lichamelijke activiteit en gezondheidseffecten motivatie en groepsprocessen interventiestrategieën beweging(sbevordering) bij specifieke doelgroepen Onderwijsvorm Combinatie van hoor- en werkcolleges. De cursus vraagt een actieve werkhouding van de studenten; zij bereiden de werkcolleges voor door huiswerkopdrachten te maken, die worden gepresenteerd, dan wel ter plekke gezamenlijk worden uitgewerkt (23 uur hoor/werkcollege; 67 uur voorbereiding en nabereiding colleges; 67 uur zelfstudie; 3 uur tentamen). Toetsvorm Een tentamen, bestaande uit een multiple choice-gedeelte en een aantal open vragen. De tentamenstof bestaat uit de basisliteratuur en de handouts van de colleges. Literatuur Verschillende hoofdstukken uit de volgende handboeken: Weinberg, R.S. & Gould, D. (2007). Foundations of Sport and Exercise Psychology. Champaign, IL: Human Kinetics. Wilmore, J.H., Costill, D.L., & Kenney, W.L. (1994). Physiology of Sport and Exercise. Human Kinetics, 4th edition (2008). Carron, A.V., Hausenblas, H.A. & Estabrooks, P.A. (2003). The psychology of physical activity. Mc Graw-Hill, New York. Aanbevolen voorkennis Kennis over humane anatomie en fysiologie wordt aanbevolen. Doelgroep Kezuecursus voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen en Gezondheid en Leven. Overige informatie Deze cursus zal gedeeltelijk in het Engels worden gedoceerd
Stervariant gezondheidseconomie Vakcode
A_HP470091 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Structuurbiologie Vakcode
AB_470056 ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 130 van 150
Coördinator
dr. D. Bald
Docent(en)
dr. D. Bald
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Computerpracticum
Doel vak Kennis van structuur, functie en remming van eiwitten, met name methodes waarmee je deze eigenschappen kunt bestuderen. Je kunt deze kennis later gebruiken als je b.v. het moleculaire mechanisme van een ziekte (eiwit misfunctie) of de werkwijze van medicijnen (remming van een eiwit) wilt verhelderen, maar ook voor biotechnische toepassingen of voor fundamenteel onderzoek. Eindtermen De student kent: Grondslagen/toepassingen van eiwit expressie, zuivering, structuur functie, remming, werking van antibiotica. De student kan: eiwit-biochemische methodes toepassen (eiwit expressie, affiniteits-chromatografie, spectrofotometrie, fluorescentie, eiwit-labelling methodes, gel-electroforese, activiteitbepalingen). Niveau 2: verdieping Inhoud vak Wij beginnen met een repetitie/overzicht van eiwit structuur en functie. Vervolgens gaan wij met practica aangevuld door colleges, computer sessies en zelfstudie aan de slag en behandelen beginselen/methodes/technieken die je voor welk eiwit dan ook kunt gebruiken zoals: Hoe kan je een eiwit met behulp van bacteriën produceren? Hoe kan je een eiwit zuiveren? Hoe kan je structuur en functie van een eiwit onderzoeken? Hoe werken antibiotica als enzym remmers? Hoe kan ik een experimentele strategie plannen? Welke factoren zijn belangrijk voor het slagen van mijn experiment? Onderwijsvorm Je doet zelf experimenten in kleine groepen (2- 4 studenten) op het Structuurbiologie lab samen met begeleider (50 uur), aangevuld door hoorcolleges (15 uur), computersessies en zelfstudie. In groepjes schrijf je een verslag en houd je een praatje over de experimenten. Toetsvorm Verslag (50 %), voordracht (50 %) Literatuur CD met collegestof en practicumhandleiding Aanbevolen voorkennis Cursussen Biologische chemie en Biochemie Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars Bsc Biologie, Biomedische wetenschappen en Gezondheid en Leven. De cursus staat open voor studenten van andere opleidingen en wordt aanbevolen voor Masterstudenten Biomolecular Sciences en andere Masterstudenten die praktische waardigheden willen bijspijkeren.
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 131 van 150
Overige informatie Bij het experimentele gedeelte is het dragen van een laboratoriumjas verplicht. Maximum aantal deelnemers 40. Voorrang wordt verleend aan BSc studenten Biomedische Wetenschappen en Biologie. De colleges worden in het Engels gegeven, de andere onderdelen (practicum, verslag, voordracht) zijn in het Nederlands.
Systeemecologie Vakcode
AB_470044 ()
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. J. Rozema
Docent(en)
prof. dr. J. Rozema, ing. L. Leewis MSc
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Practicum
Inhoud vak Theorie (ochtenden week 1 en 2): Behandeling van leerstof uit Leerboek Principles of Terrestrial Ecosystem Ecology door middel van hoorcolleges en een handleiding. Onderwerpen: Het ecosysteemconcept, het systeem klimaat aarde, geologie en bodem, water in terrestrische ecosystemen en de energiebalans, koolstofbalans van terrestrische ecosystemen, primaire productie, decompositie, nutriëntengebruik, kringlopen van voedingsstoffen, globale stofkringlopen, trofische relaties, ecosyteemdynamica in ruimte en tijd, en beheer van natuurgebieden. Veldpracticum; (middagen week 1 en 2, week 3): Verrichten van veldecologisch en laboratoriumonderzoeknaar de gevolgen van opwarming van ecosystemen van duinvalleien en van de arctische toendra; onderzoek over aanpassingen van kustplanten Onderwijsvorm Hoor- en werkcolleges leerboek (ochtenden week 1 en 2); veld- en laboratoriumonderzoek middagen week 1 en 2, week 3; verslaglegging en studiepauze week 4. Hoorcolleges over leerboek Principles of Terrestrial Ecosystem Ecology Literatuur F. Stuart Chapin III, P.A. Matson en H.A. Mooney. 2002. Principles of Terrestrial Ecosystem Ecology. Springer (64. 00 euro); en een cursushandleiding (7, 50 euro) Aanbevolen voorkennis Alle voorgaande oecologische cursussen. Doelgroep Keuzevak voor derdejaars Bsc Biologie en Milieuwetenschappen. Overige informatie Ter info: er is in het studiejaar 2010 - 2011 geen excursieweek Ecosystemen Ardennen (zie ook announcement op de Blackboardsite).
Systems Ecology
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 132 van 150
Course code
AB_1019 ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
prof. dr. J. Rozema
Teaching method(s)
Lecture, Practical
Course objective • Understanding of ecosystem concept, climate of the earth, the water and energy balance of ecosystems, the fixation of atmospheric carbon, biomass production and decomposition of terrestrial ecosystems, nutrient use, biogeochemical cycling of elements, trophic relationships within ecosystems, feedback processes in ecosystems and between water, land and atmosphere. In particular the impact of global warming on ecosystems will be considered. • Learning and practising research in experimental field ecology, including lab-analyses. Particular focus will lie on adaptations of plants to abiotic conditions and the uptake and use of nutrients. • Learning to analyse and report results of field and lab research. This implies the design of graphs and figures, statistical analysis of the data and interpretation. Final qualifications Theoretical part • Thorough understanding of treated parts of the text book as described above. • Insight into the integration between atmosphere, lithosphere and biosphere, and related processes. • The skill to interpret and evaluate research results summarized in Tables and Figures. Practical part • To develop hypotheses and research questions based on the subject matter and project information, and test these based on performed measurements during the practical • To conduct field and lab research both in a team and independently according to rules for field and lab research. This may imply chemical analyses, taking into account lab safety rules. • Summarizing and analyzing measurements using Excel and SPSS or similar programmes. • Prepare and deliver a Poster with a summary of results and conclusions and Powerpoint presentation (about 5 minutes) of the practical topic. Course content Theory: Treatment of chapters from textbook Principles of Terrestrial Ecosystem Ecology in lectures (mornings of week 1 and 2) and via information on Blackboard. Topics: Ecosystem concept, system climate-earth, water in terrestrial ecosystems and energy balance, carbon balance of terrestrial ecosystems, primary production, decomposition, nutrient use, cycling of nutrients, global element cycling, trophic relationships, ecosystem dynamics in space and time, management of nature reserves. Field and laboratory research into the consequences of warming of ecosystems of dune valleys and the arctic tundra. Field and lab research on adaptations of coastal Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 133 van 150
plants in salt marsh ecosystems in relation to the development of saline agriculture. Saline agriculture aims at cultivation of crops irrigated with (diluted) seawater. Excursions: The first excursion will be in the dune area north of Bergen aan Zee. Since 2005 we measure and analyse the response of three heather species to experimental warming (Open Top Chambers), increased precipitation and increased cloudiness. The second excursion will be to the salt marsh ecosystems on the Island of Texel where halophytic plants have evolved remarkable adaptations to seawater inundation. We will study and analyse these adaptations. Sea level is steadily rising through global warming (melting ice on polar caps) and increased evapotranspiration because arable land is becoming drier and saline. Certain crops, often derived from halophytic plants, grow well under saline soil conditions. Since 2004 we participate in saline agricultural trials on the Island of Texel. Both in the lab and under field conditions, we study the growth of, among others, Sea kale (Crambe maritima), Sea beet (Beta maritima), Common glasswort (Salicornia europaea) and other crops in response to increasing salinity. Form of tuition Lectures in mornings of week 1 and 2, practicals in afternoons of week 1, 2 and 3, two excursions on day 2 and 3 of the course, data analysis, study break in week 4 Type of assessment Poster and powerpoint presentations (50% of final grade) and written exam (essay questions, 50 % of final grade). Course reading F. Stuart Chapin III, P.A. Matson en H.A. Mooney. 2002. Principles of Terrestrial Ecosystem Ecology. Springer (±64 Euro) available in VUbookshop and via Gyrinus Natans R. van der Meijden. Heukels Flora van Nederland. Wolters-Noordhoff (last edition), ±50 Euro. Recommended background knowledge All preceding ecological courses in the curriculum Target group BSc Biology (part of minor programme Evolutionary Biology and Ecology, 3rd year)
Tailoring Medicine and Telemedicine Course code
AB_1044 ()
Period
Period 2
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
prof. dr. J.E.W. Broerse
Teaching method(s)
Study Group, Lecture
Course objective • Gain insight in two important developments in health care – tailoring medicine and telemedicine – in which new technological Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 134 van 150
developments in the field of multimedia have played an important role • Acquire theoretical insight in the different aspects of multimedia signal processing and systems in the life sciences and health care in general • Obtain knowledge on how multimedia and (science) communication interact in three areas: data visualisation, web design and internetaided diagnostics • Gain insights in the opportunities and pitfalls of multimedia in making communication and health care more effective • Learn how to analyse communicative aspects of emerging technologies • Acquire skills in the facilitation of groups discussions Course content Developing medicines becomes ever more complex, expensive and timeconsuming. The simple solutions have been found and exploited. The cost of the traditional, linear development of new drugs has become almost prohibitive. National health systems face great difficulties in providing adequate care for an affordable price. New solutions are being investigated to speed up these processes and to make them more affordable. A promising development is the combined use of hitherto separated sources of information, such as modalities in imaging diagnostics, continuous physiological monitoring, and audio and video monitoring. Each modality presents its own problems, but combined together (multimedia), analysis of all this data can enable fast discoveries in life sciences and lead to novel health care interventions. The young research field of translational medicine is one of the solutions that pharmaceutical industries, governments, universities and hospitals invest in. But how do you get these different actors to work together and share their data? How can we make sure that financial interests do not interfere with patient care? How do we combine all data and ensure privacy? Another promising field is telemedicine, enabling e.g. the Heart Institute of the Caribbean to build upon the expertise of renowned heart surgeons in Switzerland, at only a marginal cost. Personalised medicine is another example that we will discuss: how we can improve the effect of drugs (or even prevent diseases!) by combining outcomes from large epidemiological studies with a single individual's characteristics like single nucleotide polymorphisms, gene and protein expression, or diet? Last, but not least, we discuss the impact of multimedia on communicating scientific findings to different publics. To what extent may the combined use of for example video clips and interactive websites improve the effectiveness of health promotion programs? In teams of four students, you will study how multimedia applications in health care change expert – patient/user interaction and communication. To this end you will learn how to use the focus group method as a tool to engage lay people in a technology debate. Level 2: insight Form of tuition Lectures, assignment, self study Type of assessment Written exam (60%) and group assignment (40%). Both parts need to be passed. Course reading Reader or book
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 135 van 150
Remarks Part of the minor Biomedical and health interventions.
The Adaptive Brain Course code
AB_1050 ()
Period
Period 2
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. H.K.E. Vervaeke
Teaching method(s)
Practical, Computer lab, Study Group, Lecture
Course objective Gain insight into molecular and cellular neurobiology, with a focus on adaptive mechanisms in the brain. Practice molecular and cellular biological laboratory skills. Course content Molecular signal transduction, synaptic plasticity, early brain development, construction of neural circuits, modification of brain circuits as a result of experience, repair and regeneration in the nervous system Form of tuition Lectures, laboratory practical, computer practicals, student presentations The focus of this course is on scientific experiments: (1) a laboratoy practical on molecular biological techniques; (2) a computer practical on neuronal and synaptic imaging techniques and (3) a computer practical on genetics. Type of assessment Multiple Choice exam (60%) and student presentations (40%) Course reading Neuroscience, Dale Purves c.s. Sinnauer Associates, Fourth Edition 2008 Recommended background knowledge Basic (first and secnd year level) courses in Cell Biology and Neurosciences Remarks Course in the track ‘Neurosciences’ in the minor ‘Biomolecular Sciences and Neurosciences’. The track ‘Neurosciences’ is an excellent preparation for the Master Neurosciences.
The Developing Brain Course code
AB_1059 ()
Period
Period 2
Credits
6.0
Language of tuition
English
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 136 van 150
Faculty
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coordinator
dr. R.E. van Kesteren
Teaching method(s)
Practical, Computer lab, Study Group, Lecture
Course objective This course has the purpose to discuss the various stages of brain development that shape the life of individuals over time. Course content The brain performs differently at various ages; the young brain being very plastic, whereas the aging brain is gradually losing its adaptive capacity. At the same time the growing brain can be affected by developmental diseases and is prone to specific environmental factors, whereas aging diseases easily disturb the adult brain. In this course we will discuss pre- and postnatal brain development. We will focus both on early development in relation to diseases as autism and schizophrenia, as well as on puberty and adolescence, and issues related to this stage of development, such as the effects on the brain of early drug use (alcohol, nicotine). In the aging brain, we will discuss specific diseases of aging, such as progeria and Alzheimer’s, considering the factors that determine lifespan. Form of tuition Lectures, morphological practicals, scientific writing, workgroups Type of assessment Exam (60%), scientific reports (40%). Note that a minimum mark of 5.5 should be obtained for the exam. Course reading Readers, presentations Remarks Part of minor Brain and Mind. Central Academic Skill: Search databases for relevant scientific literature based on general symptoms of disease and write scientific report.
The Roman Empire Vakcode
OH_TRE ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Coördinator
drs. L.H.C. Plantinga
The use of statistics in legal court cases Vakcode
OH-SLC ()
Periode
Semester 2, Periode 2
Credits
6.0
Faculteit
Onderwijscentrum VU
Coördinator
prof. dr. R.W.J. Meester
Docent(en)
prof. dr. R.W.J. Meester
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 137 van 150
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Theories of Consciousness Vakcode
OH_TOC (986002)
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Coördinator
drs. L.H.C. Plantinga
Trends in plantenwetenschappen Vakcode
AB_470213 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. ir. A.H. de Boer
Docent(en)
dr. ir. A.H. de Boer, dr. H. Schat, dr. ing. E.J. Souer
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak Deze cursus is er op gericht om de studenten kennis te laten maken met moderne ontwikkelingen in de plantenbiologie. Een aantal recente review artikelen worden bestudeerd, gepresenteerd voor de groep en daarna besproken. Daarnaast maken de studenten een analyse/review van een aantal aanverwante artikelen, over een onderwerp waar nog geen consensus over bestaat. Naast een verdieping van een aantal geselecteerde theoretische onderwerpen, worden ook technische ontwikkelingen behandeld. Voor zover mogelijk zal er ook ruimte zijn om een aantal technieken zelf uit te voeren in het laboratorium. Belangrijk in deze cursus is dat de student de theorie leert te koppelen aan experimentele vaardigheden. Aan het eind van de cursus heeft de student inzicht in een aantal hot-spots in het plantenonderzoek. Tevens is hij/zij in staat om zelf een aantal geavanceerde technieken toe te passen en op hun waarde te beoordelen. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak De cursus omvat werkcolleges/presentaties en practica in de laboratoria van de diverse plantengroepen. Er zal een selectie gemaakt worden uit de nieuwe theoretische inzichten. De onderwerpen varieren van jaar tot jaar. Voorbeelden zijn: plantenreceptoren, uniek voor planten? gene targeting, is homologe recombinatie in planten nabij? plant VOC (volatile organic carbon) emissions toepassingen in de plantenbiotechnologie planten modelsystemen targeting van membraaneiwitten nitric oxide (NO), het nieuwe signaal molecuul hydrotropisme. Voorbeelden van methodes/technieken die aan de orde kunnen komen: transiente expressie systemen, hoe werkt het en wat kun je ermee Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 138 van 150
hoe gaat een transformatie met Agrobacterium in de praktijk? hoe kun je een transgen in een gewas volgen de AFLP techniek electrofysiologische technieken om iontransport te meten toepassing van green fluorescent protein hoe gaat een mutantenscreen in de praktijk? analyse van eiwit complexen met `pull-down', TAP-tag expressie of yeast two-hybrid. Onderwijsvorm Geselecteerde onderwerpen worden aan de hand van review artikelen bestudeerd en in werkgroep verband geanalyseerd. Studenten kiezen een eigen onderwerp om uit te diepen en te presenteren. Het boek Taiz & Zeiger dient als naslagwerk. Voor het practische gedeelte werken de studenten in tweetallen aan een aantal experimenten. Eigen inbreng en initiatief bij de opzet en uitvoering van de experimenten zal voorop staan. Resultaten worden gepresenteerd en in een verslag uitgewerkt. Deelname aan de practica inclusief voor- en nabespreking werkcolleges is verplicht. Toetsvorm Beoordeling geschiedt aan de hand van een schriftelijke toets over theoretische stof en practicumonderwerpen, de presentaties en het verslag over de uitgevoerde proeven. Gewicht van afzonderlijke toetsonderdelen wordt aan het begin van de cursus bekendgemaakt. Literatuur Geselecteerde artikelen, powerpoint presentaties, en het boek Taiz, L. & Zeiger, E. Plant Physiology 4th edition (2006) uit het 1e en 2e jaar als naslagboek. Vereiste voorkennis Cursus Van gen tot gewas Doelgroep Keuzecursus voor BSc Biologie Overige informatie Bij het experimentele gedeelte is het dragen van een laboratoriumjas verplicht.
Trends in volksgezondheid Vakcode
AB_470149 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. D.J.H. Deeg
Docent(en)
Dr. D.J.H. Deeg
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak De cursus is bedoeld voor studenten met belangstelling voor de gezondheid van ouderen en voor de gevolgen van trends hierin voor de
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 139 van 150
volksgezondheid als geheel. Het doel van de cursus is om inzicht te krijgen in: - trends in de tijd in de gezondheid van de bevolking in het algemeen en van de oudere bevolking in het bijzonder - leeftijd- , periode- en cohort- effecten als verklaringen voor trends in de gezondheid van de oudere bevolking - gevolgen van de geobserveerde trends voor de volksgezondheid en het beslag op zorgvoorzieningen door ouderen in de nabije toekomst. Na deze cursus is de student in staat om: - het concept van epidemiologische transities (Omran 1971) en recente uitbreidingen van dit concept (o. a. Robine & Michel 2004) te beschrijven - de hypothese van "compressie van morbiditeit" (Fries 1980) te beschrijven en aan te geven aan welke voorwaarden moet worden voldaan om aan deze hypothese te voldoen - een beschrijving te geven van trends in de tijd in sterfte en gezondheid in verschillende ontwikkelde landen en van verklaringen voor deze trends - recente trends in de gezondheid van ouderen in Nederland te beschrijven en te verklaren met onderscheid van leeftijd- , cohort- en periode- effecten - de gevolgen van deze recente trends te beredeneren in termen van volksgezondheid en beslag op zorgvoorzieningen in de nabije toekomst. Niveau 3: specialisatie Inhoud vak In deze cursus worden twee theorieën van bevolkingstrends in sterfte en gezondheid behandeld en becommentarieerd: epidemiologische transitie en compressie van morbiditeit. In het licht van deze theorieën worden beschikbare empirische gegevens behandeld afkomstig uit Nederland en andere ontwikkelde landen. Hierbij wordt gezocht naar verklaringen voor de geobserveerde trends, en komt aan de orde welke verdere gegevens nodig zijn om verklaringen te ondersteunen. Met name wordt hierbij onderscheid gemaakt tussen leeftijd- , cohort- en periode- effecten. Tenslotte wordt ingegaan op extrapolatie van recente trends naar het jaar 2030 om voor dat jaar de ziektenlast en het beslag op zorgvoorzieningen te kunnen voorspellen. Onderwijsvorm - Colleges - Werkcolleges: bespreken literatuur, opstellen verklaringsmodellen - Opdrachten: werkstuk extrapolatie van specifieke gezondheidstrend - Zelfstudie Toetsvorm Beoordeling van opdrachten plus eindpresentatie (40%); schriftelijk tentamen (60%; meerkeuzevragen) Literatuur Wetenschappelijke artikelen (de oudere in syllabus, de recente te vinden op Internet) en RIVM-rapport "Ouderen nu en in de toekomst" Doelgroep Keuzecursus voor derdejaars studenten BSc Algemene Gezondheidswetenschappen; met interesse in de onderzoeksrichting, en postdoctorale cursisten epidemiologie.
Uitbreiding bachelorthesis Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 140 van 150
Vakcode
A_HP-I-3 ()
Periode
Periode 4+5+6
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Van gen tot gewas Vakcode
AB_470200 ()
Periode
Periode 1
Credits
12.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. ir. A.H. de Boer
Docent(en)
dr. ir. A.H. de Boer, prof. dr. J.T. de Cock Buning, A. Roelofsen
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum, Practicum
Doel vak Middels theorie en praktijk inzicht geven in de fysiologie van planten. Daarbij gaat het zowel om alle basale processen die voor groei en ontwikkeling nodig zijn, alsmede om de wijze waarop de plant communiceert met zijn omgeving, biotisch en abiotisch. Tevens beoogt de cursus inzicht te geven in maatschappelijke ontwikkelingen waarin 'het gewas' centraal staat. Er wordt ingegaan op de beleids- en juridische aspecten van discussies rondom genetisch gemodificeerde organismen, de opkomst van bio-energie en farmagewassen. Eindtermen: De student kan: De onderdelen waaruit een plant en zijn cellen is opgebouwd benoemen. De wijze waarop en de moleculaire mechanismen waarmee een plant water en ionen opneemt, transporteert en gebruikt beschrijven. De licht- en koolstofreacties van de fotosynthese benoemen en een aantal aanpassingen aan specifieke omstandigheden benoemen en uitleggen. Beschrijven hoe de plant zich beschermt tegen vraat en pathogene organismen. Heeft inzicht in de moleculaire mechanismen die de groei, ontwikkeling en bloei van de plant bepalen en kan beschrijven hoe licht en hormonen deze processen beïnvloeden. Beschrijven hoe een plant zich aan kan passen aan abiotische stress in zijn leefmilieu. Beschrijven hoe men een transgene plant maakt en de diverse maatschappelijk aspecten van genetisch gemodificeerde organismen (GMOs) beschrijven. Verwerven van kennis van en inzicht in: De historische ontwikkeling van gewassen als bio-socioeconomische producten. Maatschappelijke, juridische en wetenschappelijke discussie over landbouw en natuur. Beleidsprocessen, actor analyse, strategisch gedrag van belangengroeperingen en beleidsanalyse. Managementprocessen, en -theorieën, met specifieke aandacht voor Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 141 van 150
projectmanagement. Het toepassen van verkregen kennis en inzicht door: Het in de praktijk oefenen met het analyseren van gewas- en/of natuurbeleid en het identificeren van beleidsopties. Het opdoen van leerervaringen ten aanzien van projectmatig werken in teamverband. Het toepassen van enkele praktische vaardigheden, zoals onderzoeksopzet maken, literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk en mondeling presenteren. Inhoud vak De cursus richt zich op alle aspecten van de moderne plantenfysiologie. Hierbij komen aan de orde: transport van water, ionen en suikers, de fotosynthese, ontwikkeling en bloei, de rol van hormonen, licht en adaptatie aan biotische (insecten, schimmels) en abiotische (droogte, zout) stress. Alle processen worden behandeld op diverse niveaus: de hele plant, de cel en de moleculen (genen, eiwitten etc.). Daarnaast is er aandacht voor de discussie omtrent transgene gewassen, de relatie tussen klimaatverandering en de plant als energiebron en de introductie van zogenaamde farmagewassen. De laatste twee weken van de cursus bestaan uit een projectopdracht waarin de analyse van een actueel, maatschappelijk biologisch vraagstuk (gerelateerd aan de thema's in het eerste deel van de cursus) in relatie tot het (overheids)beleid centraal staat. De aard van de problematiek, de betrokken actoren en de verschillende beleidsopties rond dit vraagstuk worden kritisch geanalyseerd. De resultaten, conclusies en aanbevelingen worden vormgegeven in een voorstel voor een beleidsondersteunend onderzoeksproject dat aan het eind van de cursus mondeling gepresenteerd wordt. Onderwijsvorm De eerste zes weken van de cursus bestaan uit colleges en practica, de laatste twee weken uit het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband. Hoorcolleges (ca 50 uur), practica en computerpracticum (ca 54 uur), excursie (6 uur), project (ca. 70 uur). Deelname aan practica, computerpractica, excursie en projectwerkgroepen is verplicht. Toetsvorm Alle praktische delen zijn verplicht; geen cijfer wordt gegeven als de praktische onderdelen niet gevolgd zijn. Het eindcijfer wordt bepaald door: • Tentamen (in twee delen) over de behandelde collegestof: 60%. • Uitvoering en verslag van practica: 15% • Rapport en presentatie van de projectopdracht: 25%. Een individuele beoordeling van de projectopdracht vindt plaats op basis van individuele producten, het functioneren in de projectgroep en de beoordeling van groepsproducten. Alle drie onderdelen moeten met een voldoende worden afgesloten. Literatuur Het volgende leerboek is verplicht: - Plant Physiology 5e druk, Eds. Taiz & Zeiger (ISBN 978-0-87893866-7); prijs 85 euro. Daarnaast is er een practicumhandleiding, te verkrijgen bij aanvang cursus (5 euro). Doelgroep Verplichte cursus voor tweedejaars BSc Biologie
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 142 van 150
Van molecuul tot mens Vakcode
AB_470217 (450003)
Credits
12.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. H. Lill
Docent(en)
dr. K. Krab, M.J.C. Scholts, dr. S. Luirink, dr. M.H.G. Verheijen, dr. H. de Wit, dr. W.J.A.J. Smeets, dr. A.A. van Lambalgen, dr. A.J.G. Horrevoets
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Werkcollege, Computerpracticum, Practicum
Doel vak De cursus moet aan de hand van het systeem en proces van spijsvertering de basis leveren voor de moleculaire vakken. De klemtoon ligt dan ook op het gebied van de Biochemie en de Cellulaire biologie. Kennis verkrijgen in opbouw en functie van de verschillende organen en weefsels van het spijsverteringssysteem Kennis en inzicht verkrijgen in de structuur en het functioneren van de cel, waaronder het cytoskelet, signaaltransductie en transportprocessen binnen de cel, alsmede in de rol van de verschillende celorganellen en de processen die zich daar afspelen in biomedische context Kennis maken met de bouwstenen van biochemisch relevante macromoleculen. Inzicht in structurele opbouw en functie van eiwitten en membranen, alsook mechanismen, kinetiek en regulatie van enzymen Begrip van hoe de macromoleculen in de levende cel in netwerken functioneren en hoe ze daarin samenwerken om de belangrijke levensprocessen uit te voeren. Bijzondere aandacht ligt op de cellulaire energiehuishouding, en op de concepten, de samenhang en regulatie van metabole routes in de mens Kennis en toepassing van methoden gebruikelijk in het biochemisch onderzoek Inhoud vak Week 1: "Het spijsverteringssysteem: organen en weefsels" De anatomie en histologie van het spijsverteringssysteem worden in hoorcolleges uitgelegd. In een snij- en een microscopiepracticum worden de onderwerpen verdiept. Week 2: "Cellen, bouwstenen, en energie" In deze week worden in hoorcolleges de fundamenten gelegd voor het begrip van celopbouw en celfunctie (structuren, transport en signaaldoorgifte) en voor verschillende onderwerpen in de moleculaire biologie. Ook start in deze week het praktische onderwijs in laboratoriumvaardigheden. Week 3: "Eiwitten: vorm en functie" Aan de hand van o.m. "collagen diseases" behandelen wij in hoorcolleges en een afsluitend werkcollege het vouwen en de stabiliteit van eiwitten en de samenhang van structuur en functie. Week 4: "Enzymes: defining the speed of life" In deze week gaan de hoorcolleges over de meest belangrijke rol van eiwitten in ons lichaam: katalyse. Aan de hand van acute en chronische pancreatitis kijken we in het afsluitende werkcollege naar de gevolgen van misvouwing en/of verstoorde regulatie. Het practicum Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 143 van 150
"labvaardigheden" sluit in deze week af. Week 5: "Membranen en transport" In de hoorcolleges van deze week kijken we naar de bij de spijsvertering behorende transportprocessen. Als voorbeeld van wat er mis kan gaan bij deze processen wordt in het afsluitende werkcollege de Cholera behandeld. In deze week begint het praktische onderzoeksproject over respiratie, dat doorloopt tot aan het eind van week 7. Week 6: "Concepten van het katabolisme" In week 5 is transport van moleculen het lichaam in behandeld. In week 6 gaat het in de hoorcolleges om de vraag: Hoe verder? Aan de hand van de verwerking van suiker moleculen worden de concepten van katabolisme behandeld en de daaraan aansluitende transformaties van energie. Thema van het afsluitende werkcollege zijn mitochondriale ziekten. Week 7: "The bigger picture" In deze week zetten we het eerder geleerde in relatie tot elkaar. Aan de hand van Diabetes type I als leiddraad worden het netwerk en de fysiologische aspecten van spijsvertering in hoorcolleges en werkcolleges behandeld. In de met het practicum parallel lopende werkcolleges worden de kwantitatieve aspecten verdiept. Onderwijsvorm Hoorcolleges 64 uur. Werkcolleges 9 uur. Aan het begin van een weekthema worden vragen uitgegeven. De antwoorden worden in afsluitende werkcolleges behandeld. Ook het verdiepen van de kwantitatieve aspecten gebeurt in werkcolleges. Onderzoekspracticum 53 uur. Een zwaartepunt van deze cursus is het aanleren van praktische labvaardigheden. Toetsvorm De theoretische onderdelen van de cursus worden getoetst met een schriftelijk tentamen (6 EC, mengsel uit open en meerkeuze vragen). Tijdens de praktische onderdelen wordt de deelname van studenten bijgehouden. Verder worden het voeren van het labjournaal, een onderzoeksplan en eindverslagen beoordeeld (6 EC). Literatuur Martini: Fundamentals of Anatomy and Physiology, Benjamin Cummings Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter: Essential Cell Biology, Garland Science Berg, Tymoczko, Stryer: Biochemistry, Freeman Doelgroep Eerstejaars BSc Biomedische wetenschappen Overige informatie Bij de laboratoriumpractica is het dragen van een labjas verplicht
Veldwerk 1e jaar Vakcode
AB_450239 (450003)
Credits
5.0
Voertaal
Engels
Coördinator
dr. B. Andeweg
Docent(en)
dr. B. Andeweg, dr. H.B. Vonhof
Lesmethode(n)
Veldwerk, Practicum, Bijeenkomst
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 144 van 150
Doel vak Toepassing van de aardwetenschappelijke kennis die je in het eerste jaar hebt verkregen. Training in het verrichten van aardwetenschappelijk onderzoek. Je onderzoekt de relatie tussen morfologische eenheden en processen aan het oppervlak met de lithologische eenheden en geologische structuur in de ondergrond. Tijdens het veldwerk ontwikkel je vaardigheden, zoals waarnemen, beschrijven, verzamelen van geologische en geomorfologische gegevens, het opslaan van deze gegevens (dagboek, gegevenskaart), het met elkaar in verband brengen van deze gegevens (stratigrafische kolom, profielen, geologische en geomorfologische kaart) en het interpreteren van de geologische en geomorfologische geschiedenis van het gebied. Inhoud vak Tijdens het veldwerk maak je een geologische gegevenskaart, een geologische interpretatiekaart met bijbehorende lithostratigrafische kolom, profielen en een geomorfologische kaart. Je definieert en karteert lithostratigrafische en morfologische eenheden en je houdt alle gegevens bij in een dagboek. Op basis van de gegevens maak je een interpretatie van het gebied in termen van afzettinggeschiedenis en structurele en morfologische ontwikkeling. Onderwijsvorm Veldwerk van drie weken in Zuid-Spanje (omgeving Jumilla) in juni. Voorbereiding in Amsterdam in mei (zie rooster). Toetsvorm Je wordt ter plaatse aan het eind van het veldwerk beoordeeld op inzicht, betrokkenheid en vaardigheden in het veld en op de inhoudelijke aspecten van de volgende gegevensbestanden: het dagboek (inclusief de beschrijving van de lithologische eenheden en de geomorfologische processen), de gegevenskaart, de geologische afgedekte kaart, de geomorfologische kaart, de profielen en de stratigrafische kolom. Zie voor de uiteindelijke verslaglegging het studieonderdeel Veldwerkverslag 1e jaar (450250). Vereiste voorkennis Deelname aan het eerstejaars veldwerk is alleen mogelijk als je voor 15 april van het jaar van inschrijving 18 EC hebt gehaald uit de tot dan geprogrammeerde studieonderdelen. Deze toelatingseis wordt getoetst door de Examencommissie. Overige informatie Naast reguliere inschrijving uiterlijk 15 maart een e-mail aan
[email protected]. Een eerste voorlichting over het veldwerk wordt gegeven tijdens de 1e jaars voorlichtingsbijeenkomst in januari. Zie voor uitgebreide informatie: Blackboardsite Veldwerk 1e jaar Aardwetenschappen.
Veldwerk aarde en economie Vakcode
AB_450210 (450003)
Credits
7.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 145 van 150
Coördinator
dr. M.P. Bokhorst
Doel vak Het doel van het veldwerk is een integrale aardwetenschappelijke en economische visie op een gebied te ontwikkelen. Tijdens het veldwerk wordt de toekomst van Zuid-Limburg: delfstofwinning en toerisme in relatie tot het landschap als case study genomen. • De basis van het leren onderzoeken van Aarde-en-economische kwesties in de praktijk; • Ervaring opdoen met gebruikelijke technieken van een basale landschaps- en stakeholderanalyse (enquete- en interviewtechnieken); • Onderzoeksgegevens leren rapporteren en presenteren. Inhoud vak Studenten ontwikkelen een totaalbeeld van de landschappelijke problematiek van delfstofwinning en toerisme. Er wordt inzicht verkregen in het systeem ‘landschap’ van Zuid Limburg en vervolgens hoe verschillende stakeholders beïnvloed worden door de ingreep in dat landschap door deze economische sectoren. Van een aardwetenschappelijke landschapsanalyse, interviews en enquêtes onder stakeholders wordt verslag gedaan. Deze gegevens worden verwerkt tot een eindrapport en een eindpresentatie per tweetal. Onderwijsvorm In een voorbereidingstraject van drie weken krijgen de studenten inleidende colleges over het gebied, de problematiek en de regionaal economische situatie. In het voorbereidingstraject worden groepen van twee samengesteld en wordt per groep een stakeholder uit een beschikbare lijst toegewezen. Men bereidt zich voor met rapporten en beschikbaar kaartmateriaal. Er wordt een onderzoeksopzet en de basis van het verslag gemaakt (inleiding, doelstelling, werkwijze). Vragenlijsten worden opgesteld en men maakt afspraken met instanties/personen die men men wil interviewen gedurende het bezoek aan Zuid-Limburg (in de tweede week van het veldwerk). Tijdens het veldbezoek van twee weken wordt eerst kennisgemaakt met het gebied middels excursies. Tijdens de excursies wordt een overzicht van de aardwetenschappelijke structuur van het landschap duidelijk. Het verkregen inzicht wordt verwerkt tot een aardwetenschappelijk profiel. Daarnaast wordt er aandacht besteed aan de cultuurhistorie van het gebeid en een bezoek gebracht aan andere relevante A&E-gerelateerde ingrepen in het landschap zoals de Grensmaas, de ENCI en een lösswinner in Belgie. Daarnaast is het veldwerk bedoeld om interviews af te nemen en enquêtes te houden in relevante delen van het gebied, en de verzamelde gegevens te verwerken. De gegevens worden verwerkt tot resultaten in de avonduren en tijdens de uitwerkdagen. Het veldwerk wordt afgesloten met een eindopdracht waarin al het verkregen inzicht in de situatie ter plaatse. Toetsvorm De student wordt beoordeeld op de inhoudelijke aspecten van verzamelde en verwerkte gegevens, en inzet. In een eindgesprek wordt een oordeel over het voorbereidend en veldonderdeel van deze cursus gegeven. Literatuur Relevante beleids- en onderzoeksrapporten, divers kaartmateriaal, internetbronnen. Boek: Babbie, E. : The Practice of Social Research. ISBN 0 534 57474 2 Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 146 van 150
Vereiste voorkennis Deelname aan de eerstejaars veldoefening (en voorbereiding) is alleen mogelijk indien de student vóór 15 april van het jaar van inschrijving 18 EC heeft gehaald uit de tot dan geprogrammeerde studieonderdelen. Deze toelatingseis wordt getoetst door de Examencommissie. Overige informatie Een eerste voorlichting over het veldwerk wordt gegeven tijdens de eerstejaars voorlichtingsbijeenkomst in januari. Zie voor uitgebreide informatie de Blackboardsite. Deelname aan alle onderdelen is verplicht. Zie voor uitgebreide informatie: Blackboardsite Veldwerk aarde en economie.
Voeding en gezondheid stervariant Vakcode
A_HP470206 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M. van Eck van der Sluijs-van
Volksgezondheid en genetica Vakcode
AB_470075 ()
Credits
6.0
Voertaal
Engels
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
prof. dr. M.C. Cornel
Docent(en)
prof. dr. D.R.M. Timmermans, prof. dr. A.H.L.M. Pieters, dr. C.G. van El
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak De student kan aan het einde van de cursus uitleggen dat sommige ziekten volgens Mendeliaanse principes overerven, maar dat erfelijkheid een andere rol speelt bij veel ziekten die belangrijk zijn voor de volksgezondheid (zoals hart- en vaatziekten, kanker, diabetes mellitus). Hij/zij kan beschrijven op welke wijze gen en omgeving samen van invloed zijn op het ontstaan van ziekte; De student kan aan het einde van de cursus uitleggen dat preventie-op-maat met name van klinisch nut is, wanneer er sprake is van interactie tussen gen en omgeving. De student kan aan het einde van de cursus beschrijven hoe en waar in de gezondheidszorg in Nederland genetica/genomics een rol speelt (klinische genetica, genetische screening). Tevens kan hij/zij aangeven waar verdere ontwikkelingen te verwachten zijn; De student kan aan het einde van de cursus de verschillende doelen van public health en genetica bespreken, alsmede de ethische dilemma's hierin; De student kan aan het einde van de cursus uitleggen hoe kennis van de genetica/genomics in de gezondheidszorg geïmplementeerd kan worden, Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 147 van 150
en welke moeilijkheden hierbij verwacht kunnen worden. Niveau 2: verdieping Inhoud vak Aan de orde komen de volgende onderwerpen: Verschillende manieren waarop afwijkingen in DNA of chromosomen leiden tot ziekte; De impact van genetische aandoeningen op individu en samenleving; Populatiegenetica; Gezondheidszorg rond genetische aandoeningen (klinische genetica, genetische screening, hielprik, prenatale screening, preconceptiezorg); Risicocommunicatie, risicoperceptie, informed decision making; Het spanningsveld tussen public health en genetica; Ethische, juridische, historische en sociale aspecten van genetica; Implementatie: hoe verloopt het proces van nieuwe kennis naar algemeen beleid? Gen-omgevingsinteractie, susceptibiliteitstesten, criteria voor screening, direct-to-consumer testing, duizend dollar genoom. Onderwijsvorm - Hoorcollege; - Referaten voor de hele groep; - Discussies rond actuele dilemma's op het gebied van Volksgezondheid en Genetica; - Werkgroepen Per week zijn er 14 contacturen. Tussendoor bereidt de student de opdrachten voor. De eerste presentatie wordt al op de tweede cursusdag gegeven. Bij de contacturen (exclusief hoorcolleges) is aanwezigheid verplicht. Bij afwezigheid (max 1 keer) dient een paper geschreven te worden, ter beoordeling aan de docent. Toetsvorm Er is een schriftelijk tentamen bestaande uit 20 multiple choice en 5 essay vragen aan het einde van de cursus. Dit bepaalt 60% van het eindcijfer, en moet met minimaal 5.0 zijn beoordeeld. De overige 40% wordt bepaald door de beoordeling van de referaten. Literatuur Verplicht: Boek: Stewart A, Brice Ph, Burton H, Pharoah P, Sanderson S & Zimmern R. Genetics, Health Care and Public Policy. 2007. Cambridge University Press. ISBN-13: 9780521529075. Doelgroep Keuze voor derdejaars BSc Gezondheidswetenschappen en Gezondheid en Leven. Overige informatie Het blok wordt verzorgd door de Afdeling Klinische Genetica van het VU medisch centrum. Maximum aantal deelnemers is 48.
Voorspellen en analyseren in de biologie Vakcode
AB_470212 ()
Periode
Periode 5
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 148 van 150
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
drs. P. Vos
Docent(en)
dr. ir. B.W. Kooi, H.R. Zoomer, drs. P. Vos
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep, Computerpracticum
Doel vak Introductie van basiskennis en -technieken, nodig voor het op juiste wijze en plaats kunnen gebruiken van modelbouw en statistische analyse in de biologische wetenschappen. Aan de hand van een reeks voorbeelden wordt een wiskundige basis gelegd voor modelbouw en statistiek, er wordt kennis opgedaan en vaardigheden geleerd die nodig zijn voor het opstellen en gebruiken van simpele modellen voor de beschrijving van biologische processen en systemen en voor het zelfstandig uitvoeren van statistische analyses van eenvoudige datasets. Onderweg wordt kennis gemaakt met software voor rekenen (Excel), modelbouw (Stella) en statistiek (SPSS). De student is aan het eind van deze cursus in staat uit te leggen • wat de functie en mogelijkheden zijn van gebruik van wiskundige modellen bij onderzoek in de biologie, • wat de theoretische achtergrond is bij de in de cursus behandelde statistische technieken De student kan • de juiste statistische analyses beredeneren op eenvoudige datasets en gegeven een experimental design, • deze analyses zelfstandig uitvoeren (in Excel en/of SPSS) en • de resultaten c.q. computeroutput juist interpreteren en rapporteren, e.e.a. mede gebaseerd op een conceptueel begrip, • kleine modellen van metabole processen en biologische systemen zoals ecosystemen analyseren (Stella) Inhoud vak • Opfrissen van middelbare-schoolwiskunde: differentiëren en primitiveren; integralen en primitieven; product-, quotiënt- en kettingregel; polynoom-, alsook exponentiële en logaritmische functies • Opfrissen statistiek van de cursus Methodologie en Onderzoek in de Biologie: populaties en steekproeven; typen variabelen en beschrijvende statistiek; kansrekening; kansverdelingen; basale onderzoeksdesigns; schatten en betrouwbaarheidsintervallen • Functies: e-machten, parabolen, hyperbolen, goniometrische functies • Differentiëren en integreren • Gemiddelde van een functie, oppervlaktes, lokale benaderingen • Eenvoudige differentiaalvergelijkingen • De theoretische grondslag van statistische toetsing • Ontwerp van experimenten en de relatie met statistische techniek • Analyse van categoriale data: toetsen voor proporties en verschil in proporties (Binomiale toets, z-toets, chi-kwadraat-toets), goodnessof-fit en samenhang (chi-kwadraat-toetsen) • Analyse van kwantitatieve gegevens: toetsen voor gemiddelden en verschillen in gemiddelden (één- en twee-steekproeven t-toets, gepaarde t-toets, één-factor ANOVA) • Correlatie- en regressieanalyse. Onderwijsvorm • Hoorcolleges • Werkgroepen • Computerpractica met zowel Excel, SPSS en Stella Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 149 van 150
• Zelfstudie Toetsvorm • Computertoets (1/3) • Tentamen (2/3) Literatuur • Brigitte Baldi & David S. Moore (2009). The Practice of Statistics in the Life Sciences. W.H. Freeman and Company, New York. ISBN 1-4292-1876-2 (prijs ongeveer 60 euro) • Syllabus en practicumhandleiding Modelbouw (prijs samen ongeveer 8 Euro) Overige informatie Let op: de huidige derdejaars studenten die deze cursus nog niet met een voldoende hebben afgerond krijgen in januari 2012 één herkansing (bezemtoets), omdat de cursus voor eerstejaars, hoewel dezelfde titel en code hebbend, anders wordt getoetst. Deze groep wordt op de hoogte gehouden door de coördinator.
Water Governance: Full Course Vakcode
AB_450351 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Water Governance: Lectures Vakcode
AB_450350 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
drs. M.A. Molendijk
Wijsbegeerte en wetenschap Vakcode
AB_470160 ()
Periode
Periode 3
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. L.B. Decock
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Vrije Universiteit Amsterdam - Fac. der Aard- en Levenswetenschappen - B Biologie - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 150 van 150