6 Daftar Pustaka 1
Abotsi, G., (1996), Interfacial Properties of Coal: A Guide to Catalyst Loading and Dispersion for Coal Conversion, Energeia, 7(5), 1 – 6
2
Bakken, V., (2002), The Efficient Optimization of Molecular Geometries Using Redundant Internal Coordinates, J. Chem. Phys., 117 (20), 9160-9174
3
Coleman, G., Cyclohexene, http://www.orgsyn.org , accessed on June, 11th, 2007
4
Cramer, C., (2004), Essentials of Computational Chemistry: Theory and Models, 2nd edition, John Wiley & Sons, Ltd., Chichester, 105-130, 165-188, 249-268, 355-375, 524528
5
http://en.wikipedia.org
6
Hurt, R., Fundamental Models of Coal Char Formation and Combustion, In Advanced Coal-Based Power & Environmental Systems ‘98 Conference, 1998
7
Krane, K., Fisika Modern, Hans. J. Wospakrik (Penterjemah) (1996), edisi 1, Penerbit Universitas Indonesia, Jakarta, 172-174
8
Lueking A. D., Guiterrez, H. R., Fonseca, D. A., Narayanan D. L., Essendelft, D. V., Jain, P., Clifford, C. E. B., et. al., (2006), Combined Hydrogen Production and Storage with Subsequent Carbon Crystallization, J. Am. Chem. Soc., 128, 7758-7760
9
Montoya, A., Mondragon, F., Truong, T. N., (2003), CO2 adsorption on carbonaceous surfaces: a combined experimental and theoretical study, Carbon, 41, 29–39
10 Montoya, A., Mondragon, F., Truong, T. N., (2002), Adsorption on carbonaceous surfaces: cost-effective computational strategies for quantum chemistry studies of aromatic systems, Carbon, 40, 1863–1872 11 Saeys M., Reyniers, M. F., Neurock, M., Marin, G. B., (2005), Ab Initio Reaction Path Analysis of Benzene Hydrogenation to Cyclohexane on Pt(111), J. Phys. Chem. B, 109 (6), 2064 -2073 12 Schlegel, B., (1981), Optimization of Equilibrium Geometries and Transition Structures, J. Comp. Chem., 3(2), 214-218 13 Shuikin, N.I., (1962), Catalytic activity of birch charcoal in the dehydrogenation of cyclohexane, Russ. Chem. Bltn., 11(2), 1066-5285 33
14 Martoprawiro, M. A., (1998), Dissertation, University of Sidney, Sidney, 31, 33-34, 3628. 15 Putra, N. I., (2004), Skripsi, Institut Teknologi Bandung, 33-36.
34
Lampiran A Contoh Input GAMESS-UK $CONTRL SCFTYP=UHF MAXIT=199 RUNTYP=SADPOINT COORD=ZMT UNITS=ANGS MULT=6 QMTTOL=3.0E-6 NZVAR=99 $END ! $DFT DFTTYP=SVWN $END $SISTEM MWORDS=5 $END $GUESS MIX=.TRUE. $END $SCF DAMP=.TRUE. NOCONV=.TRUE. $END $BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 $END $STATPT NSTEP=150 DXMAX=0.03 METHOD=RFO PURIFY=.TRUE. HESS=READ HSSEND=.TRUE. $END $FORCE PURIFY=.TRUE. $END $ELDENS IEDEN=1 $END $DATA Transisi TS2+Grafit armchair base, UHF/6-31G(d) C1 C C 1 r2 C 2 r3 1 a3 ... r2 1.5149824 r3 1.5516468 a3 110.9504984 r4 1.5281780 ... a35 108.0965112 h35 173.5365635 $END $HESS ENERGY IS -761.5205847406 E(NUC) IS 1327.9077521640 1 1 5.00151674E-01 2.92755655E-01-7.25267868E-02-9.18668513E-022.32192591E-02 1 2-6.41532994E-03-1.00803885E-02-1.71197762E-02-3.83758201E-02 3.35655672E-04 ... 5 20-1.53132199E-05-2.00438693E-04-9.60011874E-04 2.58599654E-054.79035410E-05 5 21 2.03211720E-05 8.30383056E-05-1.04989714E-02-1.00580542E-03 7.21064012E-02 $END
35
Lampiran B Panduan Penyusunan Cluster Warewulf
1.
Skema Jaringan Jaringan Luar--(eth1)--master--(eth0)--
|--node0000 |--node0001 |--node0002 |--nodeN
Sebaiknya anda bekerja dengan satu node terlebih dahulu, kemudian bertambah jika sudah sukses.
2.
Tahapan Instalasi A.
Tahap Persiapan a.
Log in sebagai root di master
b.
Pastikan konfigurasi ethernet card sudah baik, eth0 untuk warewulf, eth1 untuk jaringan luar. ifconfig
c.
Pastikan software pengolah rpm telah terinstall
d.
Beberapa software pendukung yang perlu diinstall: Urpmi perl-Unix-Syslog dhcp-server tftp-server tftp urpmi pxelinux
e.
Konfigurasi eth0 file : /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0 vi /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0 DEVICE=eth0 BOOTPROTO=static IPADDR=172.17.0.1 NETMASK=255.255.255.0 NETWORK=172.17.0.0 BROADCAST=172.17.0.255 ONBOOT=yes
36
MII_NOT_SUPPORTED=no USERCTL=yes IPV6INIT=no IPV6TO4INIT=no PEERDNS=yes NETMASK=255.255.255.0 IPADDR=172.17.0.1
f.
B.
restart, lalu masuk ke tahapan Installasi
Tahap Installasi a.
buat direktori untuk menyimpan file source warewulf: mkdir /downloads cd /downloads
b.
install software berikut: urpmi perl-Term-Screen warewulf warewulf-tools
c.
C.
jika lancar, kita dapat masuk ke tahap Konfigurasi
Tahap Konfigurasi a.
JANGAN SEKALI-KALI MENJALANKAN wwinit --init, ini bisa menimbulkan banyak hal yang tak terduga. tahap konfigurasi ini tidak lebih dari editing file teks
b.
konfigurasi dhcp file : /etc/dhcpd.conf pastikan: 1. dhcpd jalan, 2. melayani boot lewat jaringan, 3. otomatis menyebarkan IP-address vi /etc/dhcpd.conf allow booting; allow bootp; default-lease-time
21600;
max-lease-time
21600;
not authoritative; ddns-update-style next-server
none; 172.17.0.1;
37
subnet 172.17.0.0 netmask 255.255.255.0 { authoritative; range 172.17.0.10 172.17.0.254; next-server #
172.17.0.1;
filename
"/tftpboot/linux.0";
filename
"X86PC/linux/linux.0";
}
c.
konfigurasi hosts dan exports file : /etc/hosts dan /etc/exports pastikan: 1. nama master 2. file yang akan dieksport vi /etc/hosts 127.0.0.1
localhost.localdomain localhost
167.205.72.12
kimia-12.chem.itb.ac.id
172.17.0.1
kimia-12.chem.itb.ac.id-admin
172.17.0.1
kimia-12.chem.itb.ac.id
172.17.0.1
kimia-12.chem.itb.ac.id-sharedfs
kimia-
12.chem.itb.ac.id-cluster
vi /etc/exports /home
172.17.0.1/255.255.255.0(rw,root_squash,async)
/vnfs 172.17.0.1/255.255.255.0(ro,no_root_squash,async)
c.
konfigurasi PXEboot mkdir /tftpboot ln -s /var/lib/tftpboot/X86PC/linux /tftpboot vi /tftpboot/pxelinux.cfg/default default ww label ww
38
kernel /kernel append
rw
initrd=wwinitrd.img
root=/dev/root
ramdisk=20480 warewulf=undef,172.17.0.1
d.
konfigurasi wwinitrd file : /etc/warewulf/wwinitrd.config pastikan : af_packet terdapat dalam KERNEL_MODULES file : /var/warewulf/wwinitrd/linuxrc pastikan : sebelum udhcpc dijalankan, load af_packet insmod af_packet
e.
konfigurasi warewulf file : /etc/warewulf/master.conf pastikan : boot device = eth0
file : /etc/warewulf/client.conf pastikan: warewulf master = localhost warewulf port = 9873
g.
restart seluruh daemon /etc/init.d/warewulf restart /etc/init.d/xinetd restart /etc/init.d/dhcpd restart /etc/init.d/wwnewd restart /etc/init.d/vnfsd restart /etc/init.d/nfs restart
h.
konfigurasi komputer node colokkan eth0 master ke hub yang menyala colokkan eth0 node / calon node ke hub di atas restart masuk BIOS jadikan LAN sebagai boot device (jadikan prioritas 1)
i.
hingga tahap ini, anda dapt lihat di layar komputer node pencarian DHCP offering, kemudian DHCP connected
39
download filesistem oleh tftp (wwinitrd) kerja yang sesuai dengan isi linuxrc (point d) pesan error root file sistem tidak ditemukan
j.
D.
waktunya masuk ke tahap VNFS-creation
Tahap VNFS-creation a.
buat direktori untuk menyimpan root file sistem node mkdir /vnfs
b.
jalankan script VNFS-creation: ./createVNFS_Mndrv2006_hasan.sh
beberapa perubahan pada script, dijelaskan di lampiran
c.
restart seluruh daemon /etc/init.d/warewulf restart /etc/init.d/xinetd restart /etc/init.d/dhcpd restart /etc/init.d/wwnewd restart /etc/init.d/vnfsd restart /etc/init.d/nfs restart
d.
restart komputer node, hingga tahap ini anda dapati: pesan error komputer node meminta konfigurasi muncul
file
berikut
pada
komputer
master:
/etc/warewulf/nodes/new/node0000
e.
copy file node0000 (point d) ke /etc/warewulf/nodes/nodegroup1
f.
restart komputer node
g.
seharusnya hingga tahap ini anda akan menemukan: pada komputer node : login prompt pada komputer master : wwlist, node0000 ready.
40
E.
Tahap Perbanyakan Node (Breeding) yang amat sederhana a.
jalankan langkah ini untuk seluruh komputer node colokkan eth0 calon node ke hub di atas restart masuk BIOS jadikan LAN sebagai boot device (jadikan prioritas 1)
b.
restart seluruh komputer node (satu per satu, berurutan) akan muncul file di master: /etc/warewulf/nodes/new/nodeXXXX
c.
copy seluruh file di master: /etc/warewulf/nodes/new/* /etc/warewulf/nodes/nodegroup1
d.
restart seluruh node
e.
periksa di komputer master: wwlist anda akan temukan seluruh node dalam keadaan ready.
SELESAI!!!!
3.
Kesimpulan Secara umum, resource dalam kerja ini terfokus pada tahap konfigurasi. jadi ada baiknya jika dipastikan file-file berikut terkonfigurasi dengan baik: /etc/dhcpd.conf /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0 /etc/dhcpd.conf /etc/hosts /etc/exports /var/lib/tftpboot/X86PC/linux/pxelinux.cfg/default /etc/warewulf/wwinitrd.config /var/warewulf/wwinitrd/linuxrc /etc/warewulf/client.conf /etc/warewulf/master.conf
41
