Universitas Sumatera Utara

Estimasi Jarak Genetik Dan Faktor Peubah Pembeda Bangsa Babi (Berkshire, Duroc, Landrace Dan Yorkshire) Melalui Analisis Morfometrik

SKRIPSI Oleh: Netro Banjarnahor 090306059

PROGRAM STUDI PETERNAKAN FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA 2014

Universitas Sumatera Utara

ESTIMASI JARAK GENETIK DAN FAKTOR PEUBAH PEMBEDA BANGSA BABI (Berkshire, Duroc, Landrace dan Yorkshire) MELALUI ANALISIS MORFOMETRIK

SKRIPSI Oleh : NETRO BANJARNAHOR 090306059/PETERNAKAN Skripsi sebagai salah satu syarat untuk memperoleh Gelar sarjana di Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara

PROGRAM STUDI PETERNAKAN FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA 2014


Judul Skripsi Nama NIM Program Studi

: Estimasi jarak genetik dan faktor peubah pembeda bangsa babi (Berkshire, Duroc, Landrace dan Yorkshire) melalui analisis morfometrik. : Netro Banjarnahor : 090306059 : Peternakan

Disetujui Oleh: Komisi Pembimbing

Usman Budi S.Pt.,M.Si Ketua

Hamdan S.Pt.,M.Si Anggota

Mengetahui,

(Dr.Ir. Ma’ruf Tafsin., M.Si) Ketua Program Studi Peternakan

Tanggal lulus :

2014


ABSTRAK

NETRO BANJARNAHOR, 2014 : Estimasi Jarak Genetik dan Faktor Peubah Pembeda Bangsa Babi (Berkshire, Duroc, Landrace dan Yorkshire) melalui Analisis Morfometrik, dibimbing oleh USMAN BUDI dan HAMDAN. Jarak genetik yang dekat memberikan peluang yang sedikit untuk mendapatkan heterosis dalam persilangan. Oleh karena itu jarak genetik menjadi pedoman dalam melakukan persilangan. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui faktor peubah pembeda dan mengestimasi jarak genetik diantara bangsa babi (Berkshire, Duroc, Landrace dan Yorkshire). Penelitian ini dilakukan di Balai Pembibitan Ternak Unggul, Siborongborong menggunakan 17 ekor babi Berkshire, 22 ekor Duroc, 46 ekor Landrace dan babi Yorkshire 25 ekor. Pengambilan data dilakukan dengan cara mengukur tinggi pundak, tinggi pinggul, lebar pinggul, panjang badan, lingkar dada, dalam dada, panjang ekor, lingkar leher, panjang kepala, lebar kepala, panjang telinga dan lebar telinga. Data yang diperoleh diolah dengan analisis diskriminan sederhana dengan menggunakan program SAS (Statistical Analysis System) dan Dendogram menggunakan program MEGA (Molekuler Evolusioner Genetic Analysis). Hasil analisis campuran fenotifik menunjukkan bahwa bangsa babi Yorkshire memiliki kesamaan bangsa babi Duroc (20%). Kemurnian fenotifik masing-masing bangsa babi ialah bangsa Berkshire (88,24%), bangsa Duroc (86,36%), bangsa Landrace (89,13%) dan Yorkshire (68,00%). Hasil analisis kanonikal menunjukkan faktor peubah pembeda morfologi tubuh dari keempat bangsa babi ialah lebar telinga, panjang telinga, lebar kepala, panjang kepala dan panjang ekor. Jarak genetik Mahalanobis menunjukkan bahwa bangsa babi Berkshire dengan bangsa babi Yorkshire memiliki jarak genetik yang dekat, sebaliknya bangsa babi Duroc dengan bangsa babi Landrace memiliki jarak genetik yang jauh. Kata kunci: babi, morfologi, jarak genetik


ABSTRACT

NETRO BANJARNAHOR, 2014 : Genetic Distance Estimation and Variable Differential Factor of pig breeds (Berkshire, Duroc, Landrace and Yorkshire) through Morphometrics analysis. Under supervisied by USMAN BUDI and HAMDAN. Genetic distances provide little opportunity to obtain heterosis in crosses. Therefore the genetic distance be a guide in conducting cross. Research on conducted to identify factors differentiating variables and estimate the genetic distance between the pig breeds (Berkshire, Duroc, Landrace and Yorkshire). This research was conducted in the Superior Livestock Breeding Center, Siborongborong using 17 Berkshire pigs, 22 Duroc pigs, 46 Landrace pigs and 25 Yorkshire pigs. Data collection was done by measuring the observed variables are shoulder height, hip height, hip width, body length, chest girth, inchest, tail length, neck circumference, head length, head width, ear length and ear width. The data obtained were processed using a simple discriminant analysis using the SAS program (Statistical Analysis System) and Dendogram using the program MEGA (Molecular Evolutionary Genetic Analysis). The results of the analysis show that the phenotypically mixture Yorkshire pigs have in common breeds Duroc pigs (20%). Phenotypically purity of each breeds is a breeds of Berkshire pigs (88.24%), Duroc pigs (86.36%), Landrace pigs (89.13%) and Yorkshire pigs (68.00%). The results of the canonical analysis showed variable distinguishing factor body morphology is ear width, ear length, head width, head length and tail length. Mahalanobis genetic distance showed breeds Berkshire with breeds Yorkshire has a close genetic distance, while the breeds Duroc with breeds Landrace has a genetic distance away. Keywords : pig , morphological , genetic distance


RIWAYAT HIDUP Penulis dilahirkan di Hutapaung pada tanggal 18 Februari 1991 dari ayah Jamantir Banjarnahor dan Ibu Duma Lumban Gaol. Penulis merupakan putra kelima dari tujuh bersaudara. Tahun 2009 penulis lulus dari SMA Negeri I, Pollung dan pada tahun yang sama masuk ke Program Studi Peternakan Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara melalui jalur ujian tertulis Seleksi Nasional Mahasiswa Perguruan Tinggi Negeri (SNMPTN). Selama mengikuti perkuliahan, penulis aktif sebagai anggota Ikatan Mahasiswa Peternakan (IMAPET), anggota Ikatan Mahasiswa Kristen Peternakan (IMAKRIP), tahun 2012 sebagai ketua perayaan Natal keluarga besar Ikatan Mahasiswa Kristen Peternakan (IMAKRIP), aktif dalam Komisi

Pembinaan

AKK (Anggota Kelompok Kecil) Unit Kegiatan Mahasiswa (UKM) Kebaktian Mahasiswa Kristen (KMK) USU Unit Pelayanan Fakultas Pertanian pada periode 2013. Selain itu penulis juga aktif dalam organisasi esktrauniversitas yaitu Persatuan Muda-Muda Hutapaung Se-Kodya Medan (PMHM) menjabat sebagai ketua Badan Pengurus Harian (BPH) pada periode 2012/2013. Penulis melaksanakan Praktek Kerja Lapangan (PKL) di Kabupaten Samosir mulai bulan Juli sampai Agustus 2012.


KATA PENGANTAR

Puji dan syukur penulis ucapkan kehadirat Tuhan Allah Yang Maha Esa atas berkat dan rahmat-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan hasil penelitian yang berjudul “Estimasi jarak genetik dan faktor peubah pembeda bangsa babi (Berkshire, Duroc, Landrace dan Yorkshire) melalui analisis morfometrik” . Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terimakasih kepada orangtua penulis yaitu J. Banjarnahor dan D.Lumban Gaol yang senantiasa mendidik dan mendukung penulis selama ini. Penulis juga mengucapkan terimakasih kepada bapak Usman Budi S.Pt. M.Si selaku ketua komisi pembimbing dan kepada bapak Hamdan S.Pt., M.Si selaku anggota pembimbing atas segala bimbingan dan arahan dalam penelitian ini. Penulis juga menyampaikan terimakasih kepada Ibu Ir. Tri Hesti Wahyuni MSc dan Bapak Ir.Edhy Mirwandhono MSi selaku dosen undangan yang telah memberikan berbagai masukan pada penulis dan kepada staf anak kandang Balai Pembibitan Ternak Unggul

Kerbau dan Babi (BPTU)

Siborong-borong dalam kerjasama pengambilan data. Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih jauh dari kesempurnaan. Oleh karena itu, penulis mengharapkan kritik dan saran yang membangun demi perbaikannya di selanjutnya. Akhir kata penulis mengucapkan terimakasih.


DAFTAR ISI

ABSTRAK ................................................................................................... i ABSTRACT ................................................................................................... ii RIWAYAT HIDUP ...................................................................................... iii KATA PENGANTAR .................................................................................. iv DAFTAR TABEL ........................................................................................ vi DAFTAR GAMBAR .................................................................................... vii DAFTAR LAMPIRAN ................................................................................. viii PENDAHULUAN Latar Belakang ............................................................................................. 1 Tujuan Penelitian .......................................................................................... 3 Kegunaan Penelitian ..................................................................................... 3 TINJAUAN PUSTAKA Babi ............................................................................................................ Babi Landrace............................................................................................... Babi Duroc ................................................................................................... Babi Yorkshire ............................................................................................. Babi Berkshire .............................................................................................. Fenotifik ....................................................................................................... Keragaman Fenotifik .................................................................................... Karakterisasi ................................................................................................. Morfologi dan Morfometrik .......................................................................... Analisis Diskriminan .................................................................................... Analisis Kanonikal ....................................................................................... Jarak Genetik ................................................................................................ Pohon Filogenik............................................................................................

4 4 5 6 6 7 7 8 8 9 10 10 11

BAHAN DAN METODE PENELITIAN Lokasi dan Waktu Penelitian......................................................................... Bahan dan Alat Penelitian ............................................................................. Bahan .................................................................................................... Alat ........................................................................................................ Metode Analisis ............................................................................................ Pengukuran Bagian Tubuh ............................................................................ Analisis Data ................................................................................................ Sifat Kuantitatif ..................................................................................... Analisa Morfometrik .............................................................................

14 14 14 14 14 15 17 17 17

HASIL DAN PEMBAHASAN Perbandingan Morfometrik Babi Jantan ........................................................ Perbandingan Morfometrik Babi Betina ........................................................ Perbandingan Morfometrik Bangsa Babi....................................................... Nilai Campuran Fenotifik Bangsa Babi ......................................................... Peta Penyebaran Bangsa Babi ....................................................................... Penentuan Estimasi Jarak Genetik dan Dendogram antar Bangsa Bai ............

19 21 24 27 28 29


KESIMPULAN DAN SARAN ..................................................................... Kesimpulan .................................................................................................. Saran ............................................................................................................ DAFTAR PUSTAKA ................................................................................... LAMPIRAN .................................................................................................

32 32 32 33 34


DAFTAR TABEL

No.

Hal. Rataan, simpangan baku, koefisien keragaman ukuran-ukuran tubuh babi jantan ..................................................................................

19

2. Rataan, simpangan baku, koefisien keragaman ukuran-ukuran tubuh bangsa babi betina .......................................................................

21

3. Rataan, simpangan baku, koefisien keragaman ukuran-ukuran tubuh bangsa babi .................................................................................

24

4. Total struktur kanonikal bangsa babi .....................................................

26

5. Persentase kesamaan fenotifik dalam bangsa dan antar bangsa babi berkshire, duroc, landrace dan yorkshire ........................................

28

6. Matriks jarak genetik bangsa babi .........................................................

30

1.


DAFTAR GAMBAR

No.

Hal.

1. Bagian-bagian tubuh yang diukur ..........................................................

16

2. Plot kanonikal penyebaran bangsa babi .................................................

29

3. Dendogram bangsa babi Berkshire, Yorkshire, Duroc dan Landrace.........................................................................................

30


DAFTAR LAMPIRAN

No.

Hal.

1. Data ukuran-ukuran tubuh bangsa babi (Berkshire, Duroc, Landrace dan Yorkshire) .............................................................................................

34

2. Output SAS DISCRIM, CANDISC dan GLM .......................................

37


Universitas Sumatera Utara

Recommend Documents