PERNYATAAN MENGENAI DISERTASI DAN SUMBER INFORMASI Dengan ini saya menyatakan bahwa disertasi dengan yang judul: “STUDI KARAKTERISASI, PRODUKTIVITAS DAN DINAMIKA POPULASI KAMBING KACANG (Capra hircus) UNTUK PROGRAM PEMULIAAN TERNAK KAMBING DI MALUKU UTARA” adalah karya saya sendiri dengan arahan komisi pembimbing, bukan hasil jiplakan atau tiruan serta belum pernah diajukan dalam bentuk apapun untuk memperoleh gelar program sejenis di perguruan tinggi manapun. Sumber informasi yang berasal atau dikutip dari karya yang diterbitkan maupun tidak diterbitkan dari penulis lain telah disebutkan dalam teks dan dicantumkan dalam Daftar Pustaka di bagian akhir disertasi ini.
Bogor, Agustus 2008
Abdurahman Hoda NRP: D061050071
ABSTRACT ABDURAHMAN HODA. The Study of characteristic, productivity and population dynamics of capra hircus for glorifying program of goat livestock in North Mollucas Province. Under the supervision of MULADNO, SUBANDRIYO, and D.T.H.SIHOMBING The purpose of this research is to know the genetic characteristics, productivity and population dynamics of the Capra hircus livestock as an effort to desgin breeding programs in North Mollucas Province. This research was conducted in two steps: First, is a research to take blood sample measure and body productivity sizes, from January to August 2007. Second is molecular analysis which was has done in Genetic Laboratory Zoology, LIPI, in Cibinong from September to December 2007. This anlaysis use mitochondrial D-loop site after being amplified through Polymerase Chain Reaction (PCR) using primers of forward 15388F 5’ gcc cca cta tca aca ccc aaa gc 3’ and reverse primer CD-774R 5’ aat ggg cga ttt tag atg aga tgg c 3’. The results show that of 780 base nucleotides that had been sequence, its was found that there were 53 polymorphic sites and 41 haplotypes found in six islands, the haplotype diversity mean index was 0.132, genetic space between 0.010 and 0.022 with the whole mean 0.018. A total of 713 goats were characterized for 10 body size characters and analyzed by using General Linear Model (GLM) procedure, proc CANDISC and proc Discrim (SAS 1985) and fenogram tree construction using MEGA4 (Kumar et al. 2005). Result of the research show the goats located in Bacan Island, Sanana, Ternate and Sofifi belong to one group; those in Morotai and Jailolo for in to another group. Futhermore, the body length size, chest width, chest girth, chest depth were siqnificantly differrent (P < 0,01). The Rump length was olso significantly different (P < 0,05) doe to both island types and gender types. On the other hand, the shoulder height size and skull lenght did not show significantly different the (P > 0.05). Using the body length variable and skull length as the variables of goat productivity in North Mollucas. It is revealed that level of productivity of kacang goats in North Moluccas based on sex ratio was 1 : 4.84, calving interval was 330.1 day, litter size was 1.8 so that the acceleration of the main reproduction to became 1.99 individual/female/year. Perception on dynamics population of kacang goats in North Mollucas was shown by the following productivity conditions: Mortality rate of youngs was 15% and the adult mortality rate was 9.99%. Hence prediction of population of kacang goat in the year 2010 is 340,263; with adult male population is 30 624, while adult female population is 149,716. The female a young is predected to be 81,772, and male youngs is 78,261. Finally, by considering internal factors for example human resources, livestock resources, glorifying targets, parameters genetics, selection and breeding, and external factor for example infrastructure, government policy, cultural social factors and market through focused discussion of this research it is recommended the glorifying pattern using two strata with the ‘open nucleus’ system as its glorifying pattern can be used for the development of livestock of kacang goat in North Mollucas. Keywords : characteristic genetic, productivity, population of dynamics, capra hircus
RINGKASAN ABDURAHMAN HODA. Studi Karakterisasi, Produktivitas dan Dinamika Populasi Kambing Kacang (Capra hircus) untuk Program Pemuliaan Ternak Kambing di Maluku Utara. Dibimbing oleh MULADNO, SUBANDRIYO, dan D.T.H SIHOMBING Kambing kacang memiliki nilai ekonomi yang penting dan disukai oleh sebagian besar masyarakat dan tersebar luas di tangan petani/peternak. Kontribusi ternak kambing dari total pendapatan pertanian untuk ruminansia kecil sangatlah substansial. Produksinya juga memegang peranan penting untuk menumbuhkan aktivitas pendapatan sebagian besar petani kecil, di samping menjadi sumber protein hewani yang menunjang ketahanan pangan nasional. Keinginan untuk mempercepat produktivitasnya melalui perkawinan silang dengan breed lain yang diimpor dari luar merupakan ancaman serius bagi plasma nutfah ternak kambing, sebelum adanya penelitian untuk memperoleh data dasar yang menyentuh aspek genetiknya. Kondisi ini diperparah dengan minimnya penelitian pada kambing bila dibandingkan pada sapi, domba dan unggas. Oleh karena itu, suatu penelitian telah dilakukan untuk mengetahui keragaman genetik, tingkat produktivitas dan dinamika populasi ternak kambing kacang sebagai upaya untuk merancang pola pemuliaan dan pengembangan ternak kambing di provinsi Maluku Utara. Penelitian ini dilakukan dua tahap, yaitu: tahap pertama, penelitian lapangan untuk pengambilan sampel darah dan pengukuran ukuran-ukuran tubuh ternak sekaligus pengamatan terhadap tingkat produktivitas ternak kambing di kondisi pedesaan. Tahap kedua, analisis molekuler yang dilakukan di Laboratorium Genetik bidang Zoologi LIPI Cibinong. Tujuhpuluh dua sampel darah kambing diekstraksi dan dipurifikasi untuk memperoleh DNA mitokondria kambing, kemudian melalui teknik perbanyakan DNA dengan Polymerase Chain Reaction menghasilkan produk PCR lalu dipurifikasi, kemudian disekuen menggunakan mesin DNA sekuenser untuk mengetahui runutan sekuen nukleotida dengan tepat. Direct sequencing terhadap segmen Hypervariabel 1 (HV1) daerah D-loop dilakukan dengan menggunakan primer 15388Forward. Hasilnya menunjukkan bahwa dari 780 basa nukleotida yang disekuen ditemukan 53 polimorfik site dengan 41 haplotipe yang ditemukan di enam pulau, rataan indeks keragaman haplotype 0,132, jarak genetik berada antara 0,01 sampai dengan 0,21 dengan rataan keseluruhan 0,18. Sebanyak 713 ekor ternak kambing yang telah dikarakterisasi untuk 10 karakter ukuran tubuh dan dianalisis menggunakan prosedur General Linier Model (GLM), Proc CANDISC dan Proc. Discrim (SAS 1985) dan konstruksi pohon fenogram menggunakan MEGA4 (Kumar et al. 2005). Hasil penelitian menunjukkan bahwa pengelompokan terjadi antara kambing yang berada di pulau Bacan, Sanana, Ternate dan Sofifi disatu kelompok. Morotai dan Jailolo di kelompok lain, dengan analisis diskriminan diperoleh bahwa peubah panjang badan dan panjang tengkorak dapat dijadikan peubah pembeda ternak kambing di Maluku Utara. Pengamatan terhadap tingkat produktivitas kambing kacang yang dilakukan dari Januari-Oktober 2007 ditemukan bahwa dari 123 induk melahirkan anak tunggal (39.84%), kembar dua (40.65%), kembar tiga (18.70%) dan kembar empat (0,81%), dengan sex rasio anak kambing 48.72: 51.29. Kidding interval 330,1 hari
dengan jumlah anak 222 ekor diperoleh litter size sebesar 1.88, sehingga dengan keragaan reproduksinya seperti ini maka dapat dihitung Laju Reproduksi Induk (LRI) sebesar 1.99 anak/induk/tahun. Pengamatan terhadap dinamika populasi kambing kacang di Maluku Utara sesuai kondisi produktivitas yang dimiliki dengan tingkat mortilitas anak prasapih sebesar 15%, sesudah disapih sebesar 5% dan tingkat mortilitas kambing dewasa sebesar 9.99% maka prediksi populasi kambing kacang pada tahun 2010 sebesar 340 263 ekor dengan struktur populasi jantan dewasa 30 624 ekor, betina dewasa 149 716 ekor, betina muda dan anak 81 772 ekor dan jantan muda dan anak sebesar 78 261 ekor. Akhirnya, dengan mempertimbangkan faktor internal antara lain sumberdaya manusia, sumberdaya ternak, tujuan pemuliaan, parameter genetik, seleksi dan perkawinan, dan faktor eksternal antara lain adalah sarana dan prasarana, kebijakan pemerintah, pasar dan sosial budaya melalui diskusi terfokus dari penelitian ini dapat direkomendasikan pola pemuliaan dua strata dengan sistem perkawinan open nucleus sebagai pola pemuliaan yang dapat digunakan untuk pengembangan ternak kambing kacang di Maluku Utara. Kata kunci: Karakterisasi genetik, produktivitas, dinamika populasi, kambing kacang, program pemuliaan.
@Hak cipta milik IPB, tahun 2008 Hak cipta dilindungi 1. Dilarang mengutip sebagian atau seluruh karya tulis ini tanpamencantumkan atau mencantumkan sumber a. Pengutipan hanya untuk kepentingan pendidikan, penelitian, penulisan karya ilmiah, penyusunan laporan, penulisan kritik atau tinjauan suatu masalah b. Pengutipan tidak merugikan kepentingan yang wajar IPB 2. Dilarang mengumumkan dan memperbanyak sebagian atau seluruh karya tulis dalam bentuk laporan tanpa izin IPB
STUDI KARAKTERISASI, PRODUKTIVITAS DAN DINAMIKA POPULASI KAMBING KACANG (Capra hircus) UNTUK PROGRAM PEMULIAAN TERNAK KAMBING DI MALUKU UTARA
ABDURAHMAN HODA
Disertasi Sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Doktor pada Program Studi Ilmu Ternak
SEKOLAH PASCASARJANA INSTITUT PERTANIAN BOGOR 2008
Penguji pada Ujian Tertutup: Dr. Ir. Moh. Yamin, M.Agr
Penguji pada Ujian Terbuka : Prof. (R) Dr. Ir. Kusuma Diwyanto, MS Dr. Ir. Yuli Retnani, M.Sc
Judul Disertasi
Nama NRP Program Studi
: Studi Karakterisasi, Produktivitas dan Dinamika Populasi Kambing Kacang (Capra hircus) untuk Program Pemuliaan Ternak Kambing di Maluku Utara : Abdurahman Hoda : D061050071 : Ilmu Ternak
Disetujui Komisi Pembimbing
Dr. Ir. Muladno, MSA Ketua
Prof. Dr. Ir. Subandriyo, M.Sc., APU Anggota
Prof. Dr. D.T.H. Sihombing, M.Sc. Anggota
Mengetahui
Ketua Departemen Ilmu Produksi dan Teknologi Peternakan
Dr. Ir. Cece Sumantri, M.Agr.Sc.
Tanggal ujian : 1 September 2008
Dekan Sekolah Pascasarjana
Prof. Dr. Ir. Khairil A. Notodiputro, M.S.
Tanggal lulus:
PRAKATA
Puji dan syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah yang Maha Pengasih dan Penyayang, berkat karuniaNya, sehingga penulis dapat menyelesaikan penelitian dan penyusunan disertasi dengan judul, Studi Karakterisasi, Produktivitas dan Dinamika Populasi Kambing Kacang (Capra hircus) untuk Program Pemuliaan Ternak Kambing di Maluku Utara. Sungguh tidak mudah untuk menyusun urutan pernyataan penghargaan dan rasa terima kasih sesuai dengan peran dan jasa masing-masing, namun penulis ingin memanfaatkan kesempatan yang baik ini sebagai ungkapan perasaan. Kepada Dr. Ir. Muladno, MSA sebagai ketua komisi pembimbing. Prof (R).Dr. Ir. Subandriyo, M.Sc.APU. dan Prof. Dr. D.T.H Sihombing, M.Sc masing-masing sebagai anggota komisi, penulis menyampaikan rasa terima kasih yang tidak terhingga atas kesabaran, keikhlasan, kesediaan waktu, ketegasan selama proses pembimbingan sehingga penulis dapat menyelesaikan studi program Doktor. Kepada Rektor Universitas Khairun, Dekan Sekolah Pascasarjana IPB, Dekan Fakultas Peternakan IPB, Ketua Program Studi Ilmu Ternak, penulis mengucapkan terima kasih atas kesempatan belajar, bimbingan, saran dan bantuan yang sangat berarti bagi penulis. Kepada pihak sponsor, yaitu BPPS, Pemerintah Daerah Provinsi Maluku Utara penulis menyampaikan terimakasih atas bantuan terutama yang menyangkut pembiayaan selama mengikuti pendidikan sampai penulisan disertasi. Ucapan terimakasih penulis sampaikan kepada Ketua Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia Bidang Zoologi dan Biologi, Kepala Laboratorium Genetika LIPI Dr. Ir. Sri Sulandari dan Ir. M.S.A Zein serta jajarannya atas fasilitas serta kerjasama selama penulis melakukan penelitian. Mereka yang menjadi panutan saya, mama, papa serta mertua yang telah menggembleng penulis agar selalu sabar dan tabah dalam menghadapi kesulitan, Untuk itu semua, penulis menyampaikan sembah sujud dan cinta kasih yang mendalam. Demikian pula kepada istri tercinta Mirna Duwila, SH dan buah kasih kami Sabri Aljar Mirantoputra Hoda, Siti Chasanah Mirantoputri dan Rangga
Ramdhani Mirantoputra Hoda yang banyak berkorban dan ditinggalkan selama penulis mengikuti pendidikan, karya dan perolehan ini untuk kalian semua. Tidak lupa penulis ucapkan terima kasih kepada Dr. Ir. Muhajir Marsaoly, M.Si, Dr. Ir. Agus Nasri, M.Si., Dr. Ir. Bram Brahmantiyo, M.Si, Ir. Aris Winaya, M.Si, Ir. Hermon, M.Sc, Ir. M.Yajis, M.Si, serta rekan-rekan dan kerabat lainnya yang tidak dapat disebutkan satu persatu atas bantuan moril maupun materiil, hanya Allah SWT yang akan membalasnya. Akhir kata semoga disertasi ini dapat berguna dan mencapai tujuan yang diharapkan. Semoga Allah SWT meridhoinya.Amin.
Bogor, Agustus 2008
Abdurahman Hoda
RIWAYAT HIDUP
Penulis dilahirkan di Ternate tanggal 17 November 1968 yang merupakan anak pertama dari ayah Achmad Hoda dan Ibu Zubaidah Hasan. Pendidikan Sarjana ditempuh di Fakultas Peternakan Universitas Sam Ratulangi Manado lulus pada tahun 1991 dan lulus Magister Sains dari Program Studi Ilmu Ternak pada Program Pascasarjana Institut Pertanian Bogor tahun 2002. Pada tahun 2005 penulis mendapat kesempatan untuk melanjutkan studi Program Doktor di Sekolah Pascasarjana IPB dengan sponsor BPPS dari Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi, Departemen Pendidikan Nasional. Penulis saat ini bekerja sebagai staf pengajar pada Fakultas Pertanian Program Studi Peternakan Universitas Khairun sejak tahun 1994, jabatan terakhir adalah Lektor Kepala di Laboratorium Produksi Ternak.
