igem TU Delft Leiden 2014

iGEM TU Delft Leiden 2014 1

iGEM Team:

Bronze, silver and gold medals can be earned in every iGEM competition. A list of requirements need to be met in order to earn each medal. On top of this there are

TU Delft Leiden 2014 2008 Prize: Best wiki page Temperature sensing E. Coli.

also prizes for the three best projects overall. In 2013 only 40 % earned a gold medal. The TU Delft iGEM team won gold medals in 2008, 2009, 2010, 2012 and 2013.

2009 Prize: Best information project A cell-to-cell communication

2012

2010 FINALIST Prize: Best presentation Cleaning oil spills with

system.

WHAT IS IGEM?

bacteria

Prize: Best debata A modular system for detecting volatile compounds.

2013 Antimicrobial peptides to kill antibiotic resistant MRSA.

Some teams also make their own gadget based on their synthetically enhanced organism.

The International Genetically Engineered Machine competition (iGEM) is the premiere undergraduate synthetic biology competition. iGEM started in 2003

In the first week of November, multi-disciplinary teams from around the world

with a month-long course during MIT’s Independent Activities Period; the first

will meet in Boston to compete in the Jamboree. Their work will be presented

year’s students designed biological systems to make cells blink.

to a large scientific community at the Hynes Convention Center.

This design course grew 5 teams in 2003 to 244 teams in 2014. The teams consist

This year, a team of 13 enthusiastic students, with diverse backgrounds, from

entirely of students and are guided by supervisors of different backgrounds.

TU Delft, Leiden University and Rotterdam University is aiming to bring biology

Working at their universities over the summer, teams design synthetically

and electronics closer together, resulting in a cool and necessary application.

enhanced organisms. Each iGEM team must also make its own wiki page and

We will design and produce an Escherichia coli strain that can transport

work on fundraising, budget, public relations and human practice.

electrons and detect landmines as a final application.

1

E ectrace

Demining:

a global issue

The

detection

of

landmines

is

Our project is called ELECTRACE,

important, because they need to

which

stands

be removed where possible. This

TRAnsport deviCE.

for

ELECtron

removal is essential, as landmines are always a danger, not only in time

We

are

going

to

design

an

of war, but also in time of peace.

Escherichia coli strain that can detect the chemicals that are secreted by

Landmines have been used during

landmines (which are primarily TNT,

war in many different countries over

DNT and DNB) and initiate a current

the past decades as a strategic

by using electron transport, resulting

military weapon, but when the war

in the visualisation of landmines in

is over and the danger seems past,

the ground.

these landmines are still active and can be triggered easily.

This can be done by using the relation between the concentration

Civilians that are passing by can

of the detected chemicals and the

trigger the landmine, causing a

distance to the landmine.

devastating explosion that causes imminent death in many cases. Most

Eventually,

victims are children, as they are

incorporate this into a ready-to-use

smaller in general and sometimes

device. This device will be easily

see modern colourful mines as toys.

usable

for

we

would

everyone,

like

to

including

children, all over the world. Annually there are 15,000 to 20,000 deaths caused by landmines, not even counting the injuries. These numbers are a reason for us to participate in iGEM with the project we chose.

2

Media attention

iGEM: a TU Delft Dream Team

The last couple of years the TU Delft iGEM teams have made an appearance

iGEM is a part of the large TU Delft Dream Team family! Dream Teams are

in newspapers, on websites and even on TV. The team of 2013 had an article

teams that pursue different goals in many different categories of science. Boats

on the websites Ad.nl, Telegraaf.nl, kennislink.nl and many more.

or racing cars that use solar energy, cars that travel a very large distance using only one litre of fuel, racing bikes that break the world’s speed record for human powered bikes and many others.

The team of 2012 made one of the biggest newspapers in the Netherlands, the NRC Handelsblad, with a two-page article. This year we even want more publicity, as we want to give people the chance to learn about synthetic biology.

NRC Handelsblad Dinsdag 7 augustus NRC Handelsblad Dinsdag 7 augustus

18 Mens& Zomertweets

alexander kraai @alexscooter weekdag: Eerste werkdag: #vertraging :( Tweede Het #gaatgoed, #verslapen + nat van de regen :( :) maar niet heus!! #bijnaweekend

& Woensdag 8 augustus 2012

19

& Woensdag 8 augustus 2012

Erna Temming @ErnaTemming Oisterwijk bij Supergezellig optreden gedaan in feest hier, #vakantiepark De Boskant, wat een GEZ ELLIG #ikhebjelief

Tjebbo @TjebboGerritsma rs die maar door Ik word gek van al die interviewe wel een feestje blijven zaniken of ‘Kromowidjojo gaat vieren’. Kuikens zijn het!! #goud

Sara Kroos @ KroosSara koeien en schapen. Soms vind ik het echt zielig voor ik bespeur Al zegt iedereen dat ze ertegen kunnen, toch soms een sippe blik. #regen

Lisa de Jong @Just_LisadeJong crackhok, #Chambre d’hote was een of ander ander Novotel. dus nu zijn we gestrand in een of kamer... =) Heerlijk met zijn 4’en in een 2-pers.

eur De vakantie van een fietstaxichauff

‘Een gratis sportschool is dit – en ik verdien eraan’ ben moe als ik thuiskom. Even naar de kroeg voor een koud biertje en dan duik ik m’n bed in. Dat het veel energie kost, laat ik overdag niet merken. Werkt: bij de FietstaxiAls ik met stevige menRotterdam in centrale sen achterin de Erasmusbrug op fiets, is het niet „Over de Maasboulevard leuk als ze zien dat ik affietsen met leuke menzie. Dan denken ze dat ze op Uitzicht sen achterin. te zwaar zijn en stappen Rotterdam en de rivier. ze misschien uit. Gewoon Zonnetje erbij. Vakantie blijven lachen dus.” in eigen stad, dat is de „Na een heel drukke vakantieperiode De van g omschrijvin beste dag neem ik weleens een brengt topdrukte in de mijn zomerbaan.” rustdag. Dat wil zeggen: toerismesector. Mensen „Ik ben nu een kleine dan fiets ik iets minder, reshotels, in werken die maand fietstaxichaufneem wat vaker pauze, taurants, langs stranden, feur. Dat doe ik in de vapak eens een terrasje. Ik als gids in steden of nakantie van mijn werk als maak het zo zwaar en tuurgebieden – wanneer sporthalbeheerder en leuk als ik zelf wil. Het gaan ze zelf met vakantie sportinstructeur. Buiten liefst rij ik natuurlijk met en waarheen? mijn werk ben ik als mapassagiers: dat is gezellig Deel 6 van een serie. rathonloper ook bezig en dan verdien ik ook met bewegen. Omdat ik nog wat. Want het geld jaar van sport hou en dit dat ik vang, mag ik houden. De fietstaxi ufniet op vakantie ga, leek fietstaxicha huur ik.” princifeur mij een leuke zomerbaan. In markante dingen mee. ook maak „Ik ik pe is dit een gratis sportschool. En dat zat er een schreeuwende vrouw Laatst denk Ik aan. eens verdien er ook nog met kinderen achterin. Ze ging tekeer man ik het na mijn vakantie in de weekenden tegen haar kinderen, terwijl haar blijf doen. Het is heerlijk.” sjokte met een blikje aan taxi de achter uitge„Fietstaxichauffeur is een bijzonder bier in z’n hand. Dat moet er raar om, beroep. Mensen op straat kijken zien hebben. ik vraag ritje sommigen zwaaien zelfs. Bij andere dat ieder van „Aan het eind ze tebaantjes heb je dat niet snel. Ik denk mensen wat ze er van vonden. Zijn van stapik passagiers meer dan een taxiritje vreden, dan ben ik dat ook. Vaak nog meestal hebben Ze Mijn a naar b bezorg. pen mensen uit met een glimlach. ik keer paar een nooit in een fietstaxi gezeten. En heeft Ze ook. dochtertje mooie ik breng ze naar leuke plekjes, neem achterin gezeten. Dan voelt het alsof twee routes. Zo bracht ik vanochtend toch nog op vakantie ben.” Eurovrouwen naar een terrasje bij de ik net.” mast. Ze zitten er nog steeds, zag Tekst & foto Tom Vennink Ik „Anderzijds is het een zware baan.

Naam: Adriaan van der Pol (41) Is: fietstaxichauffeur

In de race voor het wereldkampioenschap Studenten in de ‘life sciences’ ·(biologie en verwante wetenschap-

ale pen) doen mee aan een internation e onderzoekswedstrijd in synthetisch het biologie. Synthetische biologie, (al bouwen en verbouwen van cellen dan niet met behulp van genetische biode van onderdeel is ), modificatie technologie. De naam van de wedstrijd luidt ·iGEM (International Genetically Engi-

neered Machine). Wereldwijd doen waarbijna tweehonderd teams mee, onder vijf uit Nederland. bedoeling van de wedstrijd is dat ·deDeteams met behulp van gestandaar-

s’), die diseerde DNA-stukjes (‘biobrick le worden geleverd door commercië bedrijven, een eigenschap toevoegen een aan een micro-organisme, zoals zovirus, een gistcel, een bacterie, of dat er een maatschappelijk nuttige toepassing ontstaat. De studententeams bedenken hun zijn eigen project. De iGEM-projecten grotendeels afhankelijk van sponsors. De teams zijn zelf verantwoordelijk voor fondsenwerving.

·

De Delftse studenten (aangevuld ·met twee studenten uit Leiden) ge-

bruiken als biobrick een standaard-geurdetector die op de aanwerezigheid van tuberculosebacterieën De uitageert door groen op te lichten. daging is deze detector in te bouwen in gistcellen, zodat met een eenvoudituge blaastest goedkoop en effectief . berculose kan worden opgespoord

All these projects are very progressive and many of these projects are well known to people all over the world. iGEM has been part of the Dream Team family since 2011 and is proud to be part of this family.

Straatbeeld

5 tot 7 oktober vindt aan de VU ·inVan Amsterdam de Europese voorronde besplaats. Er doen 52 teams mee. De de te achttien teams mogen door naar het finale, van 2 tot 5 november aan MIT in Boston.

TU In 2010 eindigde een team van de ·Delft met een olie-afbrekende bacterie bij de beste zes van de wereld.

en student Menno Witteveen. Foto

NRC Handelsblad, Rien Zilvold

t lab Fijne vakantie, gewoon thuis, in he

Van links af: student Lizah van der

Aart, begeleider Esengül Yildirim

: doorwerken, Ook een manier van vakantie nemen de wereld te worden. aan een wedstrijd, om de beste van orium van laborat een t Brigit Kooijman bezoch van warm weer; ik biotechnologen in Delft. „Ik hou niet t.” aanstaa airco de waar ben liever in het lab ‘het ls studente Lizah van der Aart (20) ze leven is echt supermooi’ zegt, heeft liggen het niet over op het gras in de zon op de vraag met een ijsje. Het is haar antwoord de biolovakgebied, haar wat haar zo boeit aan hoe alles met gie. „Het is fantastisch om te zien en dieren, elkaar in verband staat. Hoe planten zijn bacteriën en alle organismen opgebouwd lete kunnen en van elkaar afhankelijk zijn om in ons lab een ven. Hoe die kleine gistcelletjes cascade aan enzymen in zich hebben.” in We zitten op een klein terras, verscholen In het gede Hortus Botanicus van de TU Delft. met tien bouw achter ons werkt Lizah, samende hele zoandere studenten en zes begeleiders,

A

promer aan een biotechnologisch onderzoeks ale wedject in het kader van een internationtijdens de team strijd, iGEM. Ze hoopt met haar de scoren, Europese voorronde in oktober goed aan het beBoston in later maand een ze zodat of Technology faamde Massachusetts Institute roem. (MIT) kan meedingen naar eeuwige Lizahs favoIn de zon liggen is sowieso niet warm weer, ik riete bezigheid. „Ik hou niet van aanstaat. Al ben liever in het lab waar de airco in de horhier vind ik het wel fijn om elke dag lab hebhet In lunchen. te tus, onze achtertuin, voor mij is dit ben we het gezellig met zijn allen, tie.” een prima besteding van de zomervakankrijgen, Lizah kan er studiepunten voor haar heeft ze want nodig, maar die heeft ze niet te leren – uit ‘bachelor’ al. „Ik doe mee om ervan Mijn medepure nieuwsgierigheid eigenlijk. heel normaal, studenten bij biologie vinden het werken. te hard om gewend daar is iedereen besteden, is Veertig uur per week aan je studie bent geweest, standaard; als je een week ziek in te halen wat moet je alle zeilen bijzetten om reniging is je gemist hebt. Bij mijn studentenve veel waarwel dat anders, daar hechten mensen waarom de aan hun zomervakantie. Ze vroegenals ik erMaar ik dit in gódsnaam ging doen. supertof.” allemaal het ze vinden over vertel,

Glazen trofee van de bloeOok Esengül Yildirim (37) geniet zij het voornamen en de planten in de hortus, laboratorimelijk van achter het raam van haar ze de hewerkt um. Net als haar studententeam dagen. ,,Heel le zomer door, en maakt lange vrienden in soms, als ik vakantiefoto’s zie van denk ik: ‘ooo, de bergen of bij een waterval, verder Maar zijn’. willen wel daar had ik nu ook alleen toevalniet. Ik reis de hele wereld rond,

lig niet in de zomer.” omdat De ‘iG EM-mama’ wordt ze genoemd, jaar de elk ze al vanaf de eerste keer, in 2008, in praktistudenten begeleidt bij hun labwerk: zin. Wie te sche, maar ook in psychologische op hooi te veel weinig doet, spoort ze aan, wie laat een glazen zijn vork neemt, remt ze af. Ze 2010’. trofee zien met de tekst ‘Beste begeleider gekregen.” Liefdevol: „Van mijn studentjes molein erd Yildirim is analist, gespecialise jaar aan de culaire genetica. Ze werkt al vijftien ze veel plezier TU Delft. De laatste jaren heeft ; ooit liet gekregen in educatie en voorlichting oplosze een groep scholieren een moordzaak Maar ook es. DNA-proefj van behulp sen met in het laborahet biotechnologische handwerk „Het is net torium vindt ze nog steeds prachtig.

wat je als met kunst. Je hebt iets in gedachteniets wat wilt maken. Iets nieuws, iets origineels,als in de net nog nooit eerder gedaan is. En kunst laat je je inspireren door anderen.” van een Op haar bureau ligt een proefschrift ontworheeft vriendin, waarvoor ze het omslag in de traditie pen. Eiwitmoleculen, gemaakt geboorteland, van de marmerkunst uit haar Turkije. de weer met In het lab is Lizah intussen in buisje. Ze een in een snotachtige substantie de celwand van heeft zojuist met een soort zeep de cel het een gistcel afgebroken, om binnenin Het uitDNA-materiaal te kunnen wijzigen. ct is iGEM-proje Delftse eindelijke doel van het dat gistcellen zodanig genetisch te modificeren De gistcellen ze tuberculose kunnen opsporen. r, die in worden uitgerust met een geurdetecto ‘ruiken’. te bacterie staat is een tuberculose van het Net als Esengül Yildirim houdt Lizah is een „Het ‘knippen en plakken’ in het lab. ook, en soort creatiedrang. Ik teken en schilder ik hou van koken.” (24), stuHaar teamgenoot Menno Witteveen hij als dat dent chemische technologie, vertelt maken. kind altijd al bezig was met dingen karrevrachten „Hutten bouwen, en lego. Ik had vol lego.”

vooral een Voor Menno is het iGEM-project „te werken unieke kans om, zoals hij het zegt, van de aan mijn eigen toekomst en de toekomst bedrijf een wereld”. Hij wil na zijn afstuderen medipatiënten opzetten dat voor individuele behulp van cijnen op maat ontwikkelt met mij de geleDNA-onderzoek. „Dit project geeft en contacten te genheid de sector te verkennen leggen.” opofferen, Dat hij zijn zomer eraan moet ik echt mis, is neemt hij voor lief. „Het enige wat Zij zitde jaarlijkse vakantie met mijn vrienden. in Twente, en ten nu met zijn allen in een huisje het moment ik ben er niet bij. Terwijl dat nu juist hebt.” is waarop je nog eens een goed gesprekgek bezig ik „Sommige vrienden vinden dat te vinden”, ben door mijn werk zo belangrijk kinderen vertelt Esengül Yildirim. „Zij hebben uit. Bij naar en daar gaat hun grootste aandacht in oktober ik mij is het anders gelopen. Maar als zie studenten mijn voorfinale bij de Europese voor doe.” schitteren, weet ik waar het allemaal en om Oproep. Wie besteedt ook vakantiedag een aan niet dan al werken’, te ’gewoon door rc.nl. bijzonder project? Mail naar mensen@nop lezen De reacties zijn volgende week te www.nrc.nl/mensen.

te wachten, zag ik ik voor een brug in Groningen stond Jeanet Alice Klinkert: „Laatst, toen te doen.” was gestapt en gymoefeningen begon deze man, met hond, die uit zijn auto in de publieke ruimte zichtbaar mens de van sporen waarop In deze rubriek staan foto’s foto plus toelichting en kunstzinnige uitingen. Stuur uw teksten , afbeeldingen in gemaakt zijn naar [email protected]

niet als bijlage, de zomermaanden juli en augustus Het katern Mens& verschijnt in katern van de krant. maar in verkorte vorm in het eerste

3

Benefits BENEFITS PACKAGE: Interaction with top students

Contact Bronze BRONZE

Silver SILVER

Gold GOLD

If you still have questions, do not hesitate to contact us!

from TU Delft, Leiden, and Rotterdam Universities Investing in Sustainability

iGEM office

Named Partner

Room 0.620 Biotechnology building TU Delft

Named Investor

Julianalaan 67

Logo on the iGEM wiki page Logo on the Facebook page CVs of team members

2628 BC Delft The Netherlands +3115 2783394 [email protected]

Featured post on Facebook page Featured post on Twitter Logo on the iGEM poster in Boston Logo at the end of presentation Logo on every presentation slide Logo on the lab coats Logo on iGEM team clothing Participation to the in-house day Distribution of promotional

Fundraising responsible Janna Bogers [email protected] +316 16502602 Dutch and English

Team leader Anamaria Buda [email protected] +316 19139547 English only

materials

4