Welkom! Bert Visser Cen C t en r t e f r or e f G or en G et en i et c i Resour ou c r es,, T he Net h h e Net er h l er a l n a d n s d (CG (C N) G

Welkom! Bert Visser

Centre for Genetic Resources, The Netherlands (CGN)

Programma  12.35 u Werkzaamheden CGN: Sipke Joost Hiemstra  13.00 u Verzamelmissies, doel en ervaringen: Chris Kik  13.30 u Bezoek aan de genenbank en Nergena (pepers en paprika, Eeuwig Moes)

 14.30 u Wat kun je met de kennis van 150 tomaten genomen?: Richard Finkers

 15.00 u Klimaatverandering: effecten op genetische diversiteit: Marleen Cobben

 15.30 u Rol van oorspronkelijke kippenrassen in het onderzoek: Richard Crooijmans

 16.00 u Gezonde melk van oude koeienrassen: Myrthe Maurice  16.30 u Afspraken en borrel Centre for Genetic Resources, The Netherlands (CGN)

De rol van het CGN in behoud en stimulering van gebruik van genetische bronnen Sipke Joost Hiemstra en Bert Visser


Deze presentatie

 Opbouw en beheer genenbankcollecties  Ondersteuning instandhouding in situ  Bijdrage aan beleid  Europese samenwerking


Missie

 CGN draagt in nationaal, Europees en wereldwijd

verband bij aan het behoud, de ontwikkeling en het gebruik van genetische bronnen van gewassen, landbouwhuisdieren en bomen en struiken.

 ...en daarmee aan wereldwijde voedselzekerheid, meer duurzame productie, plattelandsontwikkeling en het behoud van cultureel erfgoed.

 CGN streeft ernaar één van de beste centra voor genetische bronnen te zijn.


CGN beheert genenbank collecties voor gewassen en landbouwhuisdieren

 Collecties relevant voor de Nederlandse landbouwsector  Lange termijn behoud van genetische diversiteit  Uitgifte materiaal voor veredeling, fokkerij en onderzoek  Cultuurhistorische waarde naast economisch belang  Goed gedocumenteerde, kwalitatief goede, toegankelijke collecties

 Overeenkomsten en verschillen tussen plant en dier


Plantaardige genenbank

 20 Gewas collecties met meer dan 22 000 accessies ● uit meer dan 100 landen ● geoptimaliseerde collecties, hoge kwaliteit

 Focus op groenten en aardappel ● nieuwe collecties van kleine oude groenten ● verzamelexpedities voor wilde verwanten

 Web site toonaangevend ● on-line selectie en aanvraag ● click-wrap SMTA


Plantaardige genenbank


Afgifte gewascollecties 2008 - 2012 Landen van bestemming

Nederland Europa overig OECD overig Rest

Type gebruikers

Aantal afgiftes per jaar

PP consortia privaat overig publiek NGO/particulier


CGN – Dierlijke genenbank collecties

Species

Breeds

Males

Straws

Cattle

9

7 - 4095

181753

Dog

2

3–7

162

Goat

2

6 – 25

3820

Horse

5

8 – 20

18200

Pig

16

7 – 47

69981

Chicken

20

5 – 19

18827

7

12 – 68

22147

Sheep


Genenbank bomen en struiken

 Ondersteuning SBB tbv

opbouw, instandhouding en uitbreiding collecties

 Advies selectie en opbouw collecties

 Documentatie gegevens en beheer website


Gerichte aanvulling collecties

 Bestaande collecties ● Ontwikkeling als Groente genenbank ● Core-collecties per dierras en gerichte aanvullingen ● Uitbreiding bomen/struiken - aanvullende herkomsten

 Nieuwe kleine groentesoorten ● Asperge, wortel, veldsla, schorseneer, bieslook

 Collecties kleine huisdiersoorten ● Boerderijhond, eend, gans, duif, konijn

 Nieuwe soorten inheemse bomen en struiken ● Meidoorn, lijsterbes, vuilboom, heide, e.a. Centre for Genetic Resources, The Netherlands (CGN)

Publiek-private samenwerking

 Financiële steun collectiemissies ● Crop wild relatives

 Donatie van genetisch materiaal ● Landbouwhuisdieren

 Financiële steun collectiebeheer ● Opslagkosten – vloeibare stikstof ● Regeneratie zaadvoorraden

 Gezamenlijke evaluatie gewaskenmerken  Ondersteuning fokprogramma’s PPS opgebouwd vóór Topsector ontwikkeling Centre for Genetic Resources, The Netherlands (CGN)

Technologische ontwikkelingen

 Gebruik van DNA merkers en sequence info ● Inzicht in verlies/behoud van genetisch diversiteit ● Optimale samenstelling van collecties ● Behoud van genetisch variatie in fokprogramma’s

 Zaadbewaring, cryobiologie en reproductie ● Efficiëntie en effectiviteit van conservering

 Opbouw nieuwe gebruiker-gerichte gewascollecties ● Volledige DNA sequence informatie van accessies ● Allelische diversiteit in relatie tot specifieke eigenschappen Centre for Genetic Resources, The Netherlands (CGN)

Internationale samenwerking  Drie Europese netwerken  Doelstellingen ● Meer rationeel systeem van behoud ● Informatie- en kennisuitwisseling ● Technische samenwerking ● Taakverdeling


Ondersteuning in situ behoud

 Maatschappelijke organisaties ● Stichting Zeldzame Huisdierrassen ● Rasorganisaties en stamboeken ● Netwerk Eeuwig Moes ● Bosschap

 Focus op ● Fokdoelen, fokstrategieën, beperking inteelt ● Themadagen, adviezen, strategiedagen ● Instandhouding en gebruik traditionele gewasdiversiteit ● Oranje lijst ● Bevordering gebruik inheemse bomen en struiken ● Rassenlijst bomen Centre for Genetic Resources, The Netherlands (CGN)

Beleidsadvisering

 Focus op genetische bronnen voor voedsel en landbouw  Belangrijke thema’s ● Conservering en duurzaam gebruik ● Access en Benefit-sharing (ABS); Intellectueel Eigendomsrecht

 Internationale verdragen ● CBD, Nagoya Protocol ABS, International Treaty, FAO Global Plans of Action

● Ondersteuning bij onderhandelingen en uitvoering

 Nationale implementatie en advisering ● Implementatie Global Plans of Action; National Focal Point on ABS; Advies Patent- en Kwekersrecht


Collecting expeditions: goals and experiences

September 12 2013, Chris Kik

Centre for Genetic Resources, the Netherlands

Content presentation

 Background collecting missions  Key issues collecting missions  Field impressions

Background: contribution to future food security

Increase world population

climate change

How to respond to these challenges?

 Reduce food waste  Reduce diets with meat  Develop improved varieties and cultivation methods

● high yield ● resistant to (a)biotic factors

The need for genetic variation

Loss of biodiversity occurs: genetic erosion

 How to conserve the biodiversity which is still present worldwide?

● In situ management (e.g. development of nature reserves)

● Ex situ management (e.g. storage of seeds in genebanks)

Overview major genebanks worldwide

7.5 million accessions stored by 1750 genebanks worldwide

CGN: vegetable genebank!

 In genebanks worldwide cereals and pulses account for 60% of their content; vegetables only 7% -> large gaps present.

 The Netherlands has a strong vegetable breeding sector, therefore the national gene bank CGN focuses on these type of crops

How to acquire plant seeds (=plant genetic resources)?

 amongst others via collecting expeditions

What is needed for a collecting expedition?

 Which crop to collect and where? ● gap analysis CGN, priorities stakeholders

 Agreement between CGN and country where collecting will take place

● biodiversity national sovereignty; CBD & IT-PGRFA

 Agreement between CGN and co-financers of expedition  Identification local experts

CGN collecting expeditions

origin of CGN accessions

Collecting expeditions Chris Kik

c

 Time period average collecting mission: 5 weeks  Number of accessions collected/ mission: 50-100

Collecting Asparagus 2012

http://youtu.be/gJdUpfBrd6g

After collecting....

 Regeneration of accessions together with partners  Describing the accessions collected via morphological

traits, but also via evaluating the material for disease and pest resistance or other traits (taste,...) together with partners

 Documentation of accession in own and international databases

 Distributing the accessions to users (a genebank is not a stamp collection!)

Thanks for your attention More info: http://www.wageningenur.nl/en/Expertise-Services/Legal-research-tasks/ Centre-for-Genetic-Resources-the-Netherlands-1.htm


Wat kun je met de kennis van 150 tomaten genomen? http://www.tomatogenome.net 12 September 2013, Richard Finkers

Sleutelwoorden

 Genotype ● Samenstelling DNA

 Phenotype ● Waarneembare eigenschappen

Rodríguez et al (2011) Plant physiology 156: 275-

Plantenveredeling

 Benutten natuurlijke genetische variatie

 Selectie verbeterd

genotype -> nieuw ras

 Nieuwe moleculaire tools veranderen traditionele plantenveredeling

● Sequensen

Bepalen van sequentie

 11 dagen  25-36 GB nucleotiden ● Minimaal 30x het tomatengenoom

 8 genotypes tegelijkertijd  Kosteneffectief

Wat te sequensen?  Beperkt variatie in commercieel germplasm

 Landrassen: lokale domesticatie  Wilde soorten: bron voor genetische diversiteit, o.a.: ● Verschillen leefklimaat ● Variatie in bloemen en vruchten

 Verwante wilde soorten zijn kruisbaar met tomaat (introgressie veredeling)

 Beschikbaar via genenbanken zoals CGN

(re-)sequencing collectie

54 Lycopersicon group

3 3 2 2 2 2 1 3 2 7 2

Arcanum group

Eriopersicon group

Neolycopersicon group

Tree according to Anderson et al. (2010), redrawn from Moyle 2008

Genome re-sequencing in tomaat 



Mapping reads tegen S. lycopersicum cv. Heinz referentie Opsporen van variatie

FW9-2-5 variation (Lin5)

S. galapagense

Kid in the candy store

FW9-2-5 variation (Lin5)

Plantenveredeling

 Efficiënter benutten

natuurlijke genetische variatie

● Kennis: Welke ouder bezit welk allel

 Gerichter verbeteren

genotype -> snellere ontwikkeling nieuw ras

 Simplificatie: Meer

factoren spelen een rol!

Veredeling industrie in een paar cijfers

 Omzet: 2.1 Miljard (2009)  8.000-10.000 werknemers (2009) ● Grootste bedrijf > 10000 werknemers

 Belangrijke spelers wereldwijd  Wereldwijd ~20% van de genen in planten en dieren

(voedsel) komt van Nederlandse veredeling’s activiteiten

 EU: Zaad, 6.8 Miljard -> Ex-farm, 70 Miljard -> Processing 700 Miljard

Plant reproduction materials. LEI, Februari 2012

Key challenges 

Produceren van voldoende voedsel voor de wereld (2x meer met 2x minder)



Verbeteren voedsel veiligheid en kwaliteit



Meer productie per ha



Minder input per ha



Gebruik biomassa voor bio-brandstof en groene chemie

Noodzaak voor nieuwe kennis & breakthrough technologieen

..en natuurlijk (genetische variatie) goed gekarakteriseerd plant materiaal!

Vragen?

Homozygous vs. Heterozygous feature rate

CGN15820

 Accessions ● S. lycopersicum cv. Moneymaker ● CGN15820 ● Four other S. cheesmaniae / S. galapagense accessions

Klimaatverandering en genetische diversiteit Marleen Cobben 12 september 2013


Genetische diversiteit

 … variatie aan genen binnen een soort

 en dus verschillende eigenschappen van die soort

Klimaatverandering

Toename van de gemiddelde temperatuur Toename van weersextremen Grote lokale verschillen, ook in neerslag

Klimaatverandering en landbouw

Overstromingen en droogte Lokaal verminderende opbrengsten door suboptimale omstandigheden Toenemende druk van pestsoorten en ziektes

Klimaatverandering en landbouw

Initiatieven om gewassen te wapenen tegen klimaatverandering Inkruisen van eigenschappen zoals bepaalde ziekteresistenties Bron van zulke eigenschappen zijn vaak wilde verwanten van zulke gewassen

Wilde verwanten

Wilde verwanten

Wilde soorten, in het veld Onderworpen aan omgevingsfactoren en bedreigd door: - Verlies en verslechtering van habitat - Invasieve soorten - Overexploitatie - Verontreiniging en ziektes - Klimaatverandering

source: IUCN webpage

Wilde verwanten

Wilde soorten, in het veld Onderworpen aan omgevingsfactoren en bedreigd door: - Verlies en verslechtering van habitat - Invasieve soorten - Overexploitatie - Verontreiniging en ziektes - Klimaatverandering

source: IUCN webpage

Dus

Klimaatverandering bedreigt de voedselvoorziening

-

(de genetische diversiteit van) wilde verwanten wordt gezien als een gedeelte van de oplossing

Maar worden op hun beurt ook bedreigd door klimaatverandering

Klimaatverandering en wilde soorten

 Directe effecten: toename van CO2, temperatuur en weersextremen

 Reacties van soorten: ecologische en evolutionaire, of uitsterven

● Timing van gebeurtenissen, zoals bloeidatum ● Schuiven van verspreidingsgebieden ● Soortinteracties ● Evolutie

Reacties op klimaatverandering en genetische diversiteit

 Uitsterven  Evolutie  Verschuiven van verspreidingsgebieden

Uitsterven

source: Pounds et al. Nature 2006

Evolutie Natuurlijke selectie voor specifieke eigenschappen: verlies van genetische diversiteit

nat

droog


Toename van extreme omstandigheden: verlies van specialisten nat

droog


Toename van extreme omstandigheden: verlies van specialisten nat

droog

Verschuiven verspreidingsgebieden

a

b

Verschuiven verspreidingsgebieden Kolonisteneffect



Verschuiven verspreidingsgebieden

a

b

Verschuiven verspreidingsgebieden Rekolonisatie na de laatste ijstijd

Source: Hewitt 2000 Nature

CGN

Behoud en beschikbaar maken van genetische diversiteit

 van gecultiveerd materiaal  van wilde soorten, die verwant zijn aan het gecultiveerde materiaal: wilde verwanten

 PGR: 3362 van de 22754 beschikbare accessies in de genenbank hebben de status ‘wild materiaal’: 15%

Wild materiaal

Alleen van nut

 als de wilde soort kruisbaar is met gecultiveerde soorten: genepool

 als te verwachten is dat de soort of populatie interessante eigenschappen bevat

Mind the gap:

29 belangrijke gewassen, oa

rijst, aardappel en tarwe

Lactuca georgica

Lactuca georgica

Klimaatverandering en genetische diversiteit

 Belangrijke genetische

diversiteit wordt verzameld om te voorkomen dat het verloren gaat (bijvoorbeeld door klimaatverandering)

 En beschikbaar gemaakt voor

veredeling van gewassen die beter bestand zijn tegen veranderende omstandigheden onder klimaatverandering

Dankjewel voor je aandacht

Genomic variation in chicken: insight in the genetics and molecular mechanisms underlying selection Richard Crooijmans

Outline presentation

 history on domestication/breed formation  Chicken genome characteristics  Genomic Toolbox  Examples of projects

Domestication and breeding of livestock: 10,000 years of selection

 What changes have occurred in the genomes of these animals and what can we learn from it?

The four Gallus species

Gallus Lafayetii

Gallus Sonneratii

Gallus varius

Gallus gallus

Origin of the four commercial breeds

Breeds  Hundreds of breeds  Domesticated for thousands of years  Breeds present due to combined factors:  Geographical isolation  Selection for desired characteristics  Behavioural traits  Breeds distinguished by physical traits (breed standards):  Size, plumage color, comb type, skin color, number of toes, amount of feathering, egg color, place of origin  Primary use: eggs, meat, ornamental purposes

Why the chicken genome was among the earliest vertebrates sequenced

 Model species in embryology and development  Agricultural relevance  Phylogenic position  Good genomic resources

Estimated genome size 1.2 billion bp

 Red Jungle Fowl inbred line  Whole genome Shotgun 6.6x

coverage (Wash. Univ., St.Louis)  1.06 billion bp of assembled sequence  2.8 million SNPs based on 0.25x coverage of broiler, layer and silkie (BGI, Beijing) now >9 million SNPs

Examples of ongoing chicken projects: ABG  

Whole genome sequence improvement Traditional breeds

● Netherlands ● Vietnam ● Kenia (genetic make-up and ecotypes)



Selection

● Genome-wide assessment of worldwide chicken SNP diversity (Muir et al., 2008, PNAS)

 

Copy number variation Comaparitive mapping, expression of genes and regulation

Genetic relationships (phylogenetic tree)

Changes in time

Distribution of native chickens Vietnam

Examples projects

 Whole genome sequence improvement  Traditional breeds ● Netherlands ● Vietnam ● Kenia (genetic make-up and ecotypes)

 Selection ● Genome-wide assessment of worldwide chicken SNP genetic diversity (Muir et al., 2008, PNAS)

 Copy number variation  Comaparitive mapping, Expression of genes and regulation

Identification of selective sweeps

Likelihood ratio

Chromosome 2

Location (bp)

Trait association

Examples projects  





Selection

● Genome-wide assessment of worldwide chicken SNP genetic diversity. (Muir et al., 2008, PNAS)

 

Copy number variation Comaparitive mapping, Expression of genes and regulation

Example: Late feathering locus

 180 Kb duplication on Z-chromosome ● Partial duplication of PRLR and SPEF2 gene

 Affecting feather development  Used for sexing 1 day old chicks

• Elferink et al.,(2008) Partial duplication of the PRLR and SPEF2 genes at the late feathering locus in chicken. BMC Genomics. 9:391 • Crooijmans et al., (2013) Large scale variation in DNA copy number in chicken breeds. BMC Genomics. 14:398

Examples projects  





Selection

● Genome-wide assessment of worldwide chicken SNP genetic diversity. (Muir et al., 2008, PNAS)

 

Copy number variation Comaparitive mapping, expression of genes and regulation

Comparative genomics to find functional sequences Genome size Find common sequences 2,900

2,400

Human

Identify functional sequences: ~ 145 Mbp

All mammals 1000 Mbp

2,500

Mouse

Rat

1,200 million base pairs (Mbp)

Also birds: 72Mb

Acknowledgements 

Wageningen University, NL  Marien Groenen  Hendrik-Jan Megens  Martin Elferink  Kiplagat Ngeno  Bert Dibbits



International chicken whole genome sequencing consortium



International chicken variation consortium



CAU, Beijing, China • Ning Li



Stichting zeldzaam huisdier • Kor Oldenbroek

Expression patterns of ZNF536 and ZNF537 in mouse and chicken overlap but also differ in many respects High expression in brain Expression in internal organs

ZNF536

ZNF537

Expression in spinal cord ZNF536

Expression in internal organs

ZNF537

Vetzuren in de melk van oude runderrassen Genetische variatie in vetzuursamenstelling van melk binnen en tussen verschillende runderrassen 12 september 2013, Myrthe Maurice – van Eijndhoven


De Nederlandse rundveehouderij - vroeger

Fries Roodbonte koe

Lakenvelder koe

Maas-Rijn-IJssel koe

Fries Hollandse koe

Groninger Blaarkop


De Nederlandse rundveehouderij – de verandering Specialisatie (bijv. bij MRIJ)

Holstein Friesian

Verder zoeken?


De grote vraag Gezondere melk

Behoud van oude runderrassen

• Consument wil gezond(er) eten • We willen ons levend erfgoed behouden: ook in situ! Maas-Rijn-IJssel koe

Fries Hollands e koe

Groninger Blaarkop

• Vetzuursamenstelling in melk wordt mede genetisch bepaald Centre for Genetic Resources, the Netherlands

Doel van het onderzoek Zijn er verschillen in vetzuursamenstelling in de melk binnen en tussen verschillende runderrassen?

Verhogen kennis van belang vanwege relatie met: • Humane gezondheid • Mogelijk unieke raseigenschappen maar ook met • Verwerkbaarheid • Methaan emissie Centre for Genetic Resources, the Netherlands

Zijn er verschillen in melkvetzuursamenstelling tussen bedrijven met verschillende rassen?


Wat heb ik gedaan Verzamelde data:



Melkmonsters van: 54 Maas-Rijn-IJssel koeien (MRY); 47 Fries Hollandse koeien (DF); 45 Groninger Blaarkoppen (G); en 46 Jersey koeien (JER).



Verzameld op 12 verschillende bedrijven



november 2008 - maart 2009.



Vetzuursamenstelling in de melk geanalyseerd met behulp van Gas Chromatografie. Centre for Genetic Resources, the Netherlands

Resultaten

Onverzadigde vetzuren (g/100g vet)

Verzadigde vetzuren (g/100g vet) 76 74 72

74.27

74.06 72.32

70 68

68.86

66 MRY

•

DF

G

JER

28 27 26 25 24 23 22 21 20

26.73 24.26 23.18

MRY

DF

22.68

G

JER

Conclusie: Er zijn verschillen in melk-vetzuursamenstelling tussen bedrijven met verschillende rassen.


Zijn er verschillen in melk vetzuursamenstelling binnen en tussen verschillende runderrassen in Nederland?


Wat heb ik gedaan 

MIR profielen verzameld tijdens reguliere melkcontrole van oktober t/m december 2006;



De uiteindelijke dataset bevatte 159.437 records van in totaal 99.250 koeien, zowel zuivere als kruislingen van de rassen: Maas-Rijn-IJssel (MRY);

Jersey koeien (JER);

Fries Hollands (DF);

Holstein Friesian (HF).

Groninger Blaarkop (GHW);



Data voor verschillen binnen rassen:

HF MRY

Aantal records

Aantal koeien

Pedigree

155.319

96.315

405.968

2.916

2.049

13.506


Resultaten - verschillen tussen rassen

Verzadigde vetzuren (g/dL melk)

Onverzadigde vetzuren (g/dL melk)

3.40

1.45

3.35

3.37

1.40

3.30

1.35

3.25 3.20

1.39

1.41 1.38

1.37

1.30 3.22

3.24

3.23

1.25

3.20

3.15

1.24

1.20 1.15

3.10 MRY

DF

GWH

JER

MRY

HF

DF

GWH

JER

HF

C16:0 (g/dL melk) 1.54 1.52

1.53

1.50 1.48

1.49

1.46 1.44 1.42

1.49

1.46 1.43*

1.40 1.38 MRY DF GWH * significant verschillend van DF, GWH, JER, and HF

JER

HF


Resultaten - verschillen binnen de rassen HF en MRY HF

MRY

h2

Var A

h2

Var A

P-value

Vet%

0.49

20.38

0.21

6.77

0.0000

Eiwit%

0.48

4.29

0.27

2.08

0.0001

Erfelijkheidsgraden (h2) voor verzadigde Vetzuren g/dL milk C14:1cis9

0.48 0.00004

0.27 0.00002

0.0000

C16:1cis9

0.41

0.17 0.00004

0.0000

Verzadigde vetzuren 0.53 0.1412 0.28 0.0551 Maas-Rijn-IJssel rond 30%)

0.0000

vetzuren aanzienlijk voor beide rassen C16:0 0.51 0.0385 0.34 0.0181 0.0000 0.0001

(voor Holstein 0.17 Friesian rond 50%0.1328 en voor C18:1cis9 0.0042 0.1 0.0025 Onverzadigde vetzuren C4:0-C10:0 C12:0-C16:0

0.22

0.0102

0.11

0.0050

0.0262

0.5

0.0023

0.27

0.0010

0.0000

0.53

0.0947

0.28

0.0362

0.0000

Standard error h2 HF 0.01 en standard error h2 MRY 0.05-0.06


Resultaten - verschillen binnen de rassen HF en MRY HF

MRY

h2

Var A

h2

Var A

P-value

Vet%

0.49

20.38

0.21

6.77

0.0000

Eiwit%

0.48

4.29

0.27

2.08

0.0001

Vetzuren g/dL milk Erfelijkheidsgraden (h2) voor onverzadigde C14:1cis9

0.48 0.00004

0.27 0.00002

0.0000

C16:1cis9

0.41

0.0001

0.17 0.00004

0.0000

Verzadigde vetzuren

0.53

0.1412

0.28

0.0551

0.0000

C4:0-C10:0 0.0023 hoger dan voor0.5MRY)

0.27

0.0010

0.0000

0.28

0.0362

0.0000

vetzuren wisselen voor 0.34 beide C16:0 0.51 0.0385 0.0181rassen 0.0000 (van matig (11%) tot aanzienlijk (48%) en C18:1cis9 0.17 0.0042 0.1 0.0025 0.1328 voor Holstein Friesian over het algemeen iets Onverzadigde vetzuren 0.22 0.0102 0.11 0.0050 0.0262 C12:0-C16:0

0.53

0.0947

Standard error h2 HF 0.01 and standard error h2 MRY 0.05-0.06


Resultaten samengevat

•

Er zijn verschillen gevonden tussen rassen in gedetailleerde vetzuursamenstelling gevonden in de melk; • Verschillende verzadigde vetzuren  met name een hogere productie door JER

• De Groninger Blaarkop lijkt op basis van deze studie relatief meer onverzadigde vetzuren te produceren

• Geen/weinig verschil tussen HF, MRY en DF

 Erfelijkheidsgraden en genetische variatie in HF hoger dan in MRY


Wat nog komt: Genotype data  Onderzoeksvraag: In hoeverre is genotypische variatie in melkvetzuursamenstelling rasspecifiek?

 Data van 110 GHW; 89 DF; 154 MRY koeien: ● Melk geanalyseerd mbv Gas Chromatografie ● Neusswaps verzameld  genotyperen 777k SNP ● Van een aantal bedrijven ook melk verzameld van HF dieren waarvan de melk wordt geanalyseerd door MIR.

 Aanvullend zal HF genotype data uit het Milk Genomics Initiative project mee worden genomen. Centre for Genetic Resources, the Netherlands

Interesse in melk componenten Interesse in de samenstelling van melk ook in andere landen oa

 Groot onderzoeksproject: Dutch Milk Genomics Initiative ● Vetzuursamenstelling in melk van HF ● Eiwitsamenstelling in melk van HF ● Daarnaast ook gekeken naar mineralen en antilichamen in melk van HF

 Pilot study eiwitsamenstelling Nederlandse runderrassen Centre for Genetic Resources, the Netherlands

Rassen eiwit en caseine Aantal koeien

Eiwit (N*6.38)

Caseine getal

Zwarte Blaarkop

5

3.68

78.8

Rode Blaarkop

4

3.72

78.3

Lakenvelder

5

3.30

78.9

Het Brandrode Rund

4

3.35

83.3

MRY

4

3.11

84.1

Zwartbont Fries Holland

4

3.50

83.3

Roodbont Fries Holland

5

3.35

78.9

3.48

82.7

Ras

Holstein-Friesian Jeroen Heck, 2007


Met dank aan:

Kennis basis

Dank voor uw aandacht!

De veehouders Melk op Maat Dutch Milk Genomics Initiative


Welkom! Bert Visser Cen C t en r t e f r or e f G or en G et en i et c i Resour ou c r es,, T he Net h h e Net er h l er a l n a d n s d (CG (C N) G

Recommend Documents