perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
VARIASI MORFOLOGI, POLA PITA PROTEIN, DAN UJI KANDUNGAN PROTEIN BIJI EMPAT VARIETAS Cucurbita moschata Durch DI WILAYAH PACITAN JAWA TIMUR
Skripsi
Untuk memenuhi sebagian persyaratan guna memperoleh gelar Sarjana Sains
Disusun oleh: Rebekca Cindy Yuswita M0408112
JURUSAN BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SEBELAS MARET SURAKARTA 2014 commit to user
i
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
commit to user
ii
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
PERNYATAAN
Dengan ini saya menyatakan bahwa skripsi ini adalah hasil penelitian saya sendiri dan tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar kesarjanaan di suatu Perguruan Tinggi, serta tidak terdapat karya atau pendapat yang pernah ditulis atau diterbitkan orang lain, kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka. Apabila dikemudian hari dapat ditemukan adanya unsur penjiplakan maka gelar kesarjanaan yang telah diperoleh dapat ditinjau kembali dan/atau dicabut.
Surakarta,
Januari 2014
Rebekca Cindy Y NIM. M0408112
commit to user
iii
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
Variasi morfologi, Pola Pita Protein, dan Uji Kandungan Protein Biji Empat Varietas Cucurbita moschata Durch di Wilayah Pacitan Jawa Timur
Rebekca Cindy Yuswita Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta.
ABSTRAK Penelitian ini bertujuan mengetahui variasi pola pita protein dan uji kandungan protein biji labu kuning. Metode yang digunakan untuk isolasi pola pita
protein
adalah
metode
SDS
–
PAGE(Sodium
Dodecyl
Sulphate
Polyacrylamide Gel Electrophoresis) dengan tegangan 100 V selama 1 jam, metode untuk analisis kandungan protein pada biji menggunakan metode Kjeldahl yang terdiri atas tahap destruksi, destilasi, dan titrasi. Penelitian ini menggunakan analisis kualitatif untuk melihat keragaman pola pita protein berdasarkan nilai Rf (nilai relatif) yang diperoleh dari perbandingan antara jarak migrasi protein terhadap migrasi loading dye. Hasil penelitian menunjukkan bahwa semua biji labu memiliki perbedaan, komposisi protein yang ditunjukkan dari tebal tipisnya pola pita protein. Kandungan protein biji labu juga bervariasi, labu oval memiliki kandungan protein tertinggi yaiutu (43,82%), kandungan protein yang terkecil (29,31%) ditemukan pada labu botol. Kata kunci : Cucurbita moschata Durch, pola pita protein, SDS – PAGE, elektroforesis, analisis kandungan protein, Rf
commit to user
iv
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
Variations Morphology, in the Pattern of Protein Bands and the Protein Content Test of Four Varieties of Seeds Cucurbita moschata Durch in the Region Pacitan East Java Rebekca Cindy Yuswita Biology Department, Faculty of Mathematics and Natural Sciences Sebelas Maret University, Surakarta. ABSTRACT The aims of this study were to determine whether variations in pattern of the seed protein bands and to examined the content of variation pumpkin seed protein. Running of protein banding pattern was done by SDS-PAGE (Sodium Dodecyl Sulphate polyacrylamide gel electrophoresis) with a voltage of 100 volt for 1 hour. Meanwhile analysis of protein content in the seed, was done by Kjeldahl method consists of stages destruction, distillation, and titration respectivety. The qualitative analysis of this experiment was done by detected the presence of the protein banding patterns according to the Rf values (Retardation factor) obtained from the comparison between the migration protein distance and migration of loading dye. The results showed that all of pumpkin seeds have a protein content differences which was indicated by thickness of banding patterns. The protein content as recorded as the highest (43,82%), and this based on percentage of protein the oval pumpkin, while the smallest percentage (29,31%) was found at the bottle type. Keywords: Cucurbita moschata Durch, the pattern of protein bands, SDS PAGE, electrophoresis, protein analysis, Rf
commit to user
v
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
PERSEMBAHAN
Skripsi ini saya dedikasikan untuk :
Yesus Kristus, Juru selamat dan Penebusku
Papa Richard Hutabarat, Mama Rumondang Hutabarat dan Rowena M D, Serta keluarga besar, atas cinta dan doanya kepada saya Teman-teman angkatan 2008, Atas bantuan dan dukungannya Almamater, commit to user Universitas Sebelas Maret
vi
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
MOTTO
“Takut akan Tuhan adalah permulaan pengetahuan, tetapi orang bodoh menghina hikmat dan didikan”. (Amsal 1:7) “Setiap Orang Punya Jatah Gagal, Habiskan Jatah Gagalmu ketika Kamu Masih Muda”. (Dahlan Iskan)
commit to user
vii
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
KATA PENGANTAR 1. Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa atas berkat dan rahmat-Nya yang berlimpah sehingga penulis dapat menyelesaikan penelitian dan penyusunan skripsi dengan Judul Variasi Pola Pita Protein dan Uji Kandungan Protein Empat Varietas Biji Cucurbita moschata Durch Di Wilayah Pacitan Jawa Timur. Penyusunan skripsi ini merupakan salah satu syarat untuk memperoleh gelar kesarjanaan Strata 1 (S1) di Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta. 2. Penelitian dan penyusunan skripsi ini tidak terlepas dari masukan dan dukungan berbagai pihak yang sangat membantu dan bermanfaat kepada penulis. Oleh karena itu, penulis mengucapkan terima kasih kepada : 3. Dr. Agung Budiharjo, M.Si., selaku Ketua Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah memberikan izin dan dukungan selama penelitian. 4. Prof. Drs.Suranto,M.Sc.Ph.D, selaku Dosen Pembimbing I yang telah memberikan proyek penelitian, saran, bimbingan penelitian di laboratorium, hingga terselesaikannya penyusunan skripsi ini. 5. Dr. Ari Susilowati,M.Si., selaku Dosen Pembimbing II yang telah memberikan saran, dan ilmu yang sangat berharga bagi penulis, serta bimbingan dari awal penelitian hingga terselesaikannya penyusunan skripsi ini. 6. Dr. Artini Pangastuti,M.Si., selaku Dosen Penelaah I yang telah memberikan, saran, kritik, dukungan sehingga penulis mampu memahami materi dengan baik. 7. Siti Lusi Arum Sari,M.Biotech., selaku Dosen Penelaah II yang telah memberikan saran dan kritik hingga terselesaikannya penyusunan skripsi ini. commit to user
viii
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
8. Dr. Dra.Ratna Setyaningsih,M.Si selaku Kepala Laboratorium Jurusan Biologi FMIPA, Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah memberikan izin penelitian beserta sarana dan prasarana selama penelitian. 9. Dosen-dosen di Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah mendidik dan memberikan dorongan moral sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini. Staf dministrasi Jurusan Biologi, Mas Adenan, Mbak Atik,dan Mbak Nina yang selalu memberikan doa dan semangat bagi penulis. 10. FajarRidwansyah yang selalu memberi semangat, doa, dan setia mendampingi penulis sampai skripsi ini selesai. Christian Agung Nugraha, Lia Nandiar, Syarafina Putri, Bania Aprilla, Larasati Senja, Odise L, dan Maria Ima F atas dukungan bagi penulis dari awal penelitian hingga penyusunan skripsi. Teman-teman Biologi khususnya angkatan 2008 yang selalu memberikan motivasi dan dukungan kepada penulis. 11. Penulis menyadari sepenuhnya bahwa dalam melakukan penelitian hingga penyusunan skripsi masih jauh dari sempurna. Oleh karena itu, penulis sangat mengharapkan adanya masukan yang bersifat membangun. Semoga skripsi ini dapat bermanfaat. Surakarta, Januari 2014 Penulis
commit to user
ix
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR ISI
Halaman HALAMAN JUDUL........................................................................................ i HALAMAN PERSETUJUAN ......................................................................... ii PERNYATAAN ............................................................................................... iii ABSTRAK ....................................................................................................... iv ABSTRACT ..................................................................................................... v HALAMAN PERSEMBAHAN....................................................................... vi MOTTO............................................................................................................ vii KATA PENGANTAR ..................................................................................... viii DAFTAR ISI .................................................................................................... x DAFTAR TABEL ............................................................................................ xiii DAFTAR GAMBAR ....................................................................................... xiv DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................... xv BAB I.
PENDAHULUAN ............................................................................ 1 A. Latar Belakang Masalah ............................................................ 1 B. Perumusan Masalah ................................................................... 3 C. Tujuan Penelitian ....................................................................... 3 D. Manfaat Penelitian ..................................................................... 3
BAB II. LANDASAN TEORI ........................................................................ 4 A. Tinjauan Pustaka........................................................................ 4 1. Klasifikasi labu kuning ........................................................ 4 2. Morfologi labu kuning. ........................................................ 5 3. Kondisi geografis wilayah Pacitan . .................................... 11 4. Protein ................................................................................. 12 5. Pola pita protein dan elektroforesis............................ ......... 13 6. SDS-PAGE............................ .............................................. 14 7. Analisis kandungan protein............................ ..................... 16 B. Kerangka Pemikiran .................................................................. 20 commit to user
x
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
BAB III. METODE PENELITIAN.................................................................. 22 A. Waktu dan Tempat Penelitian ..................................................... 22 B. Alat dan Bahan Penelitian .......................................................... 23 C. Cara Kerja ................................................................................... 25 D. Analisis kandungan protein ......................................................... 29 E. Analisis Data ............................................................................... 30 BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ........................................................ 31 A. Morfologi biji labu kuning ........................................................ 31 B. Pita protein biji labu kuning ...................................................... 36 C. Kandungan protein biji labu kuning .......................................... 52 BAB V. KESIMPULAN DAN SARAN .......................................................... 57 A. Kesimpulan ................................................................................. 59 B. Saran ........................................................................................... 59 DAFTAR PUSTAKA ...................................................................................... 60 LAMPIRAN ..................................................................................................... 64 DAFTAR RIWAYAT HIDUP......................................................................... 69
commit to user
xi
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR TABEL
Halaman Tabel 1. Morfologi Labu Kuning dan Biji Labu Kuning .............................. ..... 32 Tabel 2. Ukuran dan berat biji dari empat varietas labu kuning .........................35 Tabel 3. Nilai biner Rf berdasarkan banyaknya pola pita yangmuncul.......................................... ................................................. 41 Tabel 4. Perhitungan Rf dan Log BM markerprotein........... .............................. 43 Tabel 5. Hasil analisis SDS-PAGE berat molekul protein.................................. 44 Tabel 6. Hasil perhitungan profil pola pita protein biji dari keempat varietas labu kuning di wilayah Pacitan berdasarkan Tebal pita, Jarak migrasi, Rf,dan Berat molekul..........................................................................
49
Tabel 7. Kandungan protein biji dari empat varietas labu kuning ...................... 52
commit to user
xii
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR GAMBAR
Halaman Gambar 1.
Labu kuning (Cucurbita moschata)…………..................
4
Gambar 2.
Labu Kuning Varietas Bokor……………........................
7
Gambar 3.
Labu Kuning Varietas Botol…...…………......................
8
Gambar 4.
Labu Kuning Varietas Oval….…....................................... 8
Gambar 5.
Labu Kuning Varietas Ular….............................................. 9
Gambar 6.
Bagan Kerangka Pemikiran……………………………….. 21
Gambar 7.
Hasil elektroforesis pola pita protein biji labu kuning…….. 37
Gambar 8.
Redrawing elektroforesis pola pita protein biji labu kuning.. 38
commit to user
xiii
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR LAMPIRAN
Halaman Lampiran 1. Kurva standar marker SDS-PAGE…………………
64
Lampiran 2. Bobot molekul pita protein keseluruhan……………
64
Lampiran 3. Redrawing biji labu kuning varietas bulat…………..
67
Lampiran 4. Redrawing biji labu kuning varietas oval……………
67
Lampiran 5. Redrawing biji labu kuning varietas ular…………….
68
Lampiran 6. Redrawing biji labu kuning varietas botol……………
68
commit to user
xiv
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR SINGKATAN Singkatan
Kepanjangan
APS
Ammonium Persulphate
HCl
Asam klorida
NaH2PO4
Natrium dihidrogen-fosfat
Na2HPO4
Dinatrium hidogren-fosfat
Rf
Retardation factor
Var.
Varietas
SDS
Sodium Dodecyl sulfate
TEMED
N’N’N’N’ tetramethyl-ethilenediamine
commit to user
xv
