IDENTIFIKASI DAN POLA KEPEKAAN BAKTERI YANG DIISOLASI DARI URIN PASIEN SUSPEK INFEKSI SALURAN KEMIH DI RSUP HAJI ADAM MALIK MEDAN
Oleh : ESTERIDA SIMANJUNTAK 110100141
FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2014
Universitas Sumatera Utara
IDENTIFIKASI DAN POLA KEPEKAAN BAKTERI YANG DIISOLASI DARI URIN PASIEN SUSPEK INFEKSI SALURAN KEMIH DI RSUP H. ADAM MALIK MEDAN
KARYA TULIS ILMIAH “Karya Tulis Ilmiah ini diajukan sebagai salah satu syarat untuk memeperoleh kelulusan Sarjana Kedokteran”
Oleh : Esterida Simanjuntak 110100141
FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2014
Universitas Sumatera Utara
i
LEMBAR PENGESAHAN
IDENTIFIKASI DAN POLA KEPEKAAN BAKTERI YANG DIISOLASI DARI URIN PASIEN SUSPEK INFEKSI SALURAN KEMIH DI RSUP H. ADAM MALIK MEDAN NAMA
: ESTERIDA SIMANJUNTAK
NIM `
: 110100141
Pembimbing,
dr. Evita Mayasari, M.Kes. NIP. 197710182003122003
Penguji I,
Prof. dr. Bidasari Lubis, Sp. A (K) NIP. 195303151979122001
Penguji II,
dr. Syamsul Bihar, Sp. P NIP. 198212192008121004
Medan, Januari 2015 Dekan Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara
Prof. dr. Gontar Alamsyah Siregar, Sp.PD., KGEH NIP. 195402201980111001
Universitas Sumatera Utara
ii
ABSTRAK Infeksi saluran kemih (ISK) merupakan salah satu penyakit infeksi yang sering ditemukan di masyarakat. Bakteri merupakan penyebab utama dari ISK, sehingga pasien dengan diagnosis ISK mendapatkan antibiotik sebagai terapi pengobatan. Penggunaan antibiotik yang tidak tepat sasaran dapat mengakibatkan bakteri resistan terhadap beberapa antibiotik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui prevalensi bakteri penyebab ISK serta bagaimana pola kepekaannya terhadap beberapa antibiotik. Penelitian ini menggunakan metode deskriptif dengan pendekatan cross sectional. Sampel merupakan urin pasien suspek ISK yang didapat dari RSUP Haji Adam Malik Medan dengan jumlah sampel sebanyak 45 yang kemudian diidentifikasi secara konvensional dan diuji pola kepekaannya terhadap beberapa antibiotik dengan metode difusi cakram. Pada penelitian ini didapati bakteri gram negatif sebagai penyebab utama ISK (95,4%) yang terdiri atas Escherichia coli (55,6%), Klebsiella pneumoniae (20%), Acinetobacter sp. (8,9%). Berdasarkan uji pola kepekaan ditemukan E.coli sensitif terhadap amikacin (70,8%) dan chloramphenicol (66,7%). K. pneumoniae sensitif terhadap amikacin (100%), chloramphenicol (88,9%) dan tazobactam (77,8%) sedangkan Acinetobacter sp. sensitif terhadap amikacin (100%) dan meropenem (100%). Berdasarkan hasil penelitian ini, maka disimpulkan E. coli merupakan penyebab utama ISK dan rata-rata bakteri gram negatif sensitif terhadap amikacin, chloramphenicol, dan tazobactam. Penelitian pola kepekaan bakteri terhadap antibiotika perlu dilakukan tiap periode waktu diakibatkan adanya perubahan pola kepekaan sehingga dapat mempermudah pengobatan serta mengurangi resistansi bakteri. Kata Kunci : Infeksi saluran kemih, Bakteri, Pola kepekaan
Universitas Sumatera Utara
iii
ABSTRACT Urinary tract infection (UTI) is one of the most common infectious diseases. Bacterial infection is a common cause of UTI, therefore patients with urinary tract infection need antibiotic treatment for this disease. On the other hand, ineffective use of the antibiotics may impact to the formation of multidrug resistant strain of bacteria. The aim of this study is to determine prevalence and sensivity pattern of bacteria isolated from UTI suspected patients. This is a descriptive study with cross sectional method. Forty-five urine samples were collected from UTI suspected patients in RSUP H. Adam Malik Medan. We were use a conventional method to identify the bacteria and a disc diffusion method for the antimicrobial sensitivity test. Gram negative bacteria were the common cause of UTI in this study, which consists of Escherichia coli (55,6%), Klebsiella pneumoniae (20%), Acinetobacter sp. (8,9%). E.coli isolates were sensitive to amikacin (70,8%) and chloramphenicol (66,7%). K. pneumoniae isolates were sensitive to amikacin (100%), chloramphenicol (88,9%) and tazobactam (77,8%). Acinetobacter sp. isolates were sensitive to amikacin (100%) and meropenem (100%). Based on the results, it is concluded that E. coli is a major cause of UTI and most of gram-negative bacteria are sensitive to amikacin, chloramphenicol, and tazobactam. In this study, we try to emphasize the importance of a regular antimicrobial sensitivity test in hospital settings due to a change in the pattern of sensitivity, as to facilitate treatment and reduce bacterial resistance. Keywords: Urinary Tract Infection, Bacteria, Sensitivity Pattern
Universitas Sumatera Utara
iv
KATA PENGANTAR Puji syukur, peneliti panjatkan ke hadirat Tuhan Yang Maha Esa atas kasih, dan anugerahnya, peneliti dapat menyelesaikan karya tulis ilmiah sebagai salah satu syarat menyelesaikan Program Pendidikan Sarjana Fakultas Kedokteran USU. Adapun judul yang dipilih adalah “ Identifikasi dan Pola Kepekaan Bakteri yang Diisolasi dari Urin Pasien Suspek Infeksi Saluran Kemih di RSUP H. Adam Malik Medan”. Dalam proses penulisan karya tulis ilmiah ini, peneliti mendapatkan banyak bantuan dari berbagai pihak. Untuk itu pada kesempatan ini, saya mengucapkan terima kasih yang sebesar-besarnya kepada : 1. Prof. dr. Gontar Alamsyah Siregar, Sp. PD., KGEH selaku Dekan Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara 2. dr. Evita Mayasari, M. Kes. selaku dosen pembimbing peneliti yang selalu sabar dan meluangkan waktunya untuk memberikan, bimbingan, serta ilmu yang bermanfaat bagi peneliti dalam proses penulisan karya tulis ilmiah ini. 3. Prof. dr. Bidasari Lubis, Sp. A.(K) selaku dosen penguji I dan dr. Syamsul Bihar, Sp. P. selaku dosen penguji II yang telah meluangkan waktu dan memberikan saran dan arahan untuk menyempurnakan karya tulis ilmiah. 4. dr. Cherry Siregar M.Kes yang telah membantu peneliti selama proses penelitian 5. Orang tua peneliti yang selalu memberikan semangat dan motivasi kepada peneliti dalam menyelesaikan karya tulis ilmiah ini. 6. Teman-teman peneliti yang membantu serta memberikan semangat kepada peneliti selama proses penelitian. Peneliti menyadari bahwa karya tulis ilmiah ini masih jauh dari kesempurnaan karena keterbatasan pengetahuan dan pengalaman peneliti. Oleh karena itu, saran dan kritik sangat berarti untuk menyempurnakan penelitian ini. Medan, Desember 2014
Peneliti
Universitas Sumatera Utara
v
DAFTAR ISI Halaman LEMBAR PENGESAHAN ................................................................................... i ABSTRAK ............................................................................................................. ii ABSTRACT .......................................................................................................... iii KATA PENGANTAR .......................................................................................... iv DAFTAR ISI .......................................................................................................... v DAFTAR GAMBAR .......................................................................................... viii DAFTAR TABEL ................................................................................................ ix DAFTAR SINGKATAN ....................................................................................... x DAFTAR LAMPIRAN ........................................................................................ xi BAB 1 PENDAHULUAN ..................................................................................... 1 1.1 Latar Belakang ..................................................................................... 1 1.2 Rumusan Masalah ................................................................................ 3 1.3 Tujuan .................................................................................................. 3 1.3.1. Tujuan Umum ............................................................................ 3 1.3.2. Tujuan Khusus ........................................................................... 3 1.4. Manfaat Penelitian................................................................................ 3 BAB 2 TINJAUAN PUSTAKA ............................................................................ 5 2.1 Infeksi Saluran Kemih ........................................................................... 5 2.1.1. Definisi ....................................................................................... 5 2.1.2. Epidemiologi .............................................................................. 5 2.1.3. Etiologi ....................................................................................... 6 2.1.4. Patogenesis ................................................................................. 6 2.1.5. Manifestasi Klinis ...................................................................... 7 2.1.6. Diagnosis dan Pemeriksaan Penunjang ...................................... 7 2.1.7. Penatalaksanaan ......................................................................... 8 2.2 Bakteri ................................................................................................... 9 2.2.1. Definisi ....................................................................................... 9 2.2.2. Klasifikasi Sesuai Pewarnaan Gram .......................................... 9 2.2.2.1. Bakteri Gram Positif .................................................... 10 2.2.2.2. Bakteri Gram Negatif .................................................. 11 2.2.3. Pertumbuhan dan Reproduksi .................................................. 12
Universitas Sumatera Utara
vi
2.3. Bakteri Penyebab Infeksi Saluran Kemih .......................................... 13 2.3.1. Bakteri Gram Positif ................................................................ 13 2.3.1.1. Staphylococcus aureus................................................. 13 2.3.1.2. Staphylococcus epidermidis......................................... 14 2.3.1.3. Staphylococcus saphrophyticus ................................... 15 2.3.1.4. Enterococci .................................................................. 15 2.3.2. Bakteri Gram Negatif ............................................................... 17 2.3.2.1. Escherichia coli ........................................................... 17 2.3.2.2. Klebsiella pneumonia .................................................. 18 2.3.2.3. Pseudomonas aeruginosa ............................................ 18 2.4. Resistansi Bakteri Terhadap Antibiotik ........................................... 19 2.4.1. Mekanisme Resistansi Bakteri Terhadap Antibiotik................ 20 2.4.2. Uji Resistansi ........................................................................... 20 BAB 3 KERANGKA KONSEP DAN DEFINISI OPERASIONAL ............... 22 3.1. Kerangka Konsep ............................................................................... 22 3.2. Definisi Operasional .......................................................................... 23 BAB 4 METODOLOGI PENELITIAN ............................................................ 24 4.1. Jenis Penelitian ................................................................................... 24 4.2. Waktu dan Tempat Penelitian ............................................................ 24 4.3. Populasi dan Sampel Penelitian ......................................................... 24 4.3.1. Populasi Penelitian ................................................................... 24 4.3.2. Sampel Penelitian ..................................................................... 24 4.4. Teknik Pengambilan Data .................................................................. 26 4.5. Alat dan Bahan ................................................................................... 26 4.5.1. Alat ........................................................................................... 26 4.5.2. Bahan........................................................................................ 26 4.6. Prosedur dan Teknik Penelitian.......................................................... 27 4.6.1. Persiapan Sampel ..................................................................... 27 4.6.2. Uji Identifikasi Bakteri ............................................................. 28 4.6.3. Pola Kepekaan .......................................................................... 28 4.7. Metode Pengolahan dan Analisa Data ............................................... 29 BAB 5 HASIL DAN PEMBAHASAN ............................................................... 30 5.1. Hasil Penelitian .................................................................................. 30 5.1.1. Karakteristik Sampel ................................................................ 30
Universitas Sumatera Utara
vii
5.1.1. Deskripsi Bakteri Penyebab Infeksi Saluran Kemih ................ 31 5.1.2. Deskripsi Pola Kepekaan Bakteri ................................................ 32 5.2. Pembahasan ................................................................................................ 38 5.2.1. Bakteri Penyebab Infeksi Saluran Kemih .................................... 38 5.2.2. Pola Kepekaan Bakteri Penyebab Infeksi saluran Kemih ......... 40 5.2.2.1. Escherichia coli ................................................................. 40 5.2.2.2. Klebsiella pneumoniae .................................................... 41 5.2.2.3. Acinetobacter sp ............................................................... 42 5.2.2.4. Enterobacter cloacae ....................................................... 43 5.2.2.5. Pseudomonas sp. .............................................................. 44 5.2.2.6. Providencia stuartii ......................................................... 44 5.2.2.7. Enterococcus faecalis dan Staphylococcus sciuri........ 45 BAB 6 KESIMPULAN DAN SARAN ............................................................... 46 6.1. Kesimpulan..........................................................................................46 6.2. Saran ....................................................................................................46 DAFTAR PUSTAKA .......................................................................................... 48 LAMPIRAN
Universitas Sumatera Utara
viii
DAFTAR GAMBAR No
Judul
Halaman
Gambar 2.1 Kultur Staphylococcus aureus dengan warna koloni kuning pada agar darah................................................................................ 14 Gambar 2.2 Pewarnaan gram pada Escherichia coli ........................................... 17 Gambar 2.3 Pigmen pycosianin (biru-hijau) yang dihasilkan oleh Pseudomonas aeruginosa menyebar pada agar ...................................................... 19 Gambar 2.4 Contoh Agar Diffusion Test terlihat adanya Zona inhibisi di sekitar disk .................................................................................................. 21 Gambar 3.1 Kerangka Konsep .............................................................................. 22
Universitas Sumatera Utara
ix
DAFTAR TABEL No
Judul
Halaman
Tabel 3.1. Definisi Operasional...................................................................... 23 Tabel 5.1. Distribusi Frekuensi Sampel Berdasarkan Jenis Kelamin............. 31 Tabel 5.2. Distribusi Frekuensi Sampel Berdasrakan Usia Sampel ............... 31 Tabel 5.3. Distribusi Frekuensi Sampel Berdasarkan Gejala Klinis Sampel . 31 Tabel 5.4. Frekuensi Bakteri Penyebab Infeksi Saluran Kemih..................... 31 Tabel 5.5. Distribusi Escherichia coli berdasarkan pola kepekaannya terhadap beberapa antibiotika........................................................ 32 Tabel 5.6. Distribusi Klebsiella pneumoniae berdasarkan pola kepekaannya terhadap beberapa antibiotika ....................................................... 33 Tabel 5.7. Distribusi Acinetobacter sp. berdasarkan pola kepekaannya terhadap beberapa antibiotika....................................................... 34 Tabel 5.8. Distribusi Enterobacter cloacae berdasarkan pola kepekaannya terhadap beberapa antibiotika........................................................ 35 Tabel 5.9. Distribusi Pseudomos sp. berdasarkan pola kepekaannya terhadap beberapa antibiotika ...................................................................... 36 Tabel 5.10. Distribusi Providencia stuartii berdasarkan pola kepekaannya terhadap beberapa antibiotika........................................................ 36 Tabel 5.11. Distribusi Enterococcus faecalis berdasarkan pola kepekaannya terhadap beberapa antibiotika........................................................ 37 Tabel 5.12. Distribusi Staphylococcus sciuri berdasarkan pola kepekaannya terhadap beberapa antibiotika........................................................ 37
Universitas Sumatera Utara
x
DAFTAR SINGKATAN
CDC
: Center for Disease Control and Prevention
CFU
: Colony Forming Unit
DNA
: Deoxyribose Nucleic Acid
ESBL
: Extended Spectrum β-lactamase
ISK
: Infeksi Saluran Kemih
IUGA
: International Urogynecological association
MHA
: Mueller Hinton Agar
MIC
: Minimum Inhibitory Concentration
Universitas Sumatera Utara
xi
DAFTAR LAMPIRAN Lampiran 1.
Daftar riwayat hidup peneliti
Lampiran 2.
Data induk penelitian
Lampiran 3.
Hasil pengolahan data penelitian dengan software komputer
Lampiran 4.
Dokumentasi penelitian
Lampiran 5.
Surat Ethical clearance
Lampiran 6.
Surat izin penelitian dari RSUP H. Adam Malik Medan
Lampiran 7.
Surat keterangan selesai penelitian dari Laboratorium Mikrobiologi Fakultas Kedokteran USU
Universitas Sumatera Utara