Onderzoeksprojecten ( van 894)

www.researchportal.be - 2 Jul 2016 14:52:27

Onderzoeksprojecten (50 - 100 van 894) Zoekfilter: Classificaties: Microbiologie, bacteriologie, virologie, mycologie

Multifunctionele transcriptieregulators van het carbamoylfosfaatsynthetase operon carAB in Escherichia coli : werkwijze en oorsprong. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Dit project beoogt de ontrafeling, tot in de moleculaire details en met een multidisciplinaire aanpak, van het regulatorisch mechanisme dat de expressie van het Escherichia coli carAB operon (carbamoylfosfaat syntase) moduleert. Dit mechanisme is bijzonder complex; het integreert regulatorische signalen afkomstig van niet minder dan drie biosynthesewegen (arginine, pyrimidines en purines) en vereist minimum vijf regulatorische proteïnen, waarvan verscheidene multifunctioneel zijn, en sommige katalytische activiteit (zoals aminopeptidase of UMP-kinase) combineren met een regulatorische functie. Bovendien is carAB transcriptie ook onderworpen aan stringent control (ppGpp). De regulatiemechanismen steunen op proteïne-ligand, proteïne-DNA, en proteïne-proteïne interacties; bovendien speelt de vervormbaarheid van het DNA ook een belangrijke rol. Deze studie moet niet enkel leiden tot een betere kennis van complexe mechanismen van prokaryotische genexpressie, maar zal ook bijdragen tot de analyse van specifieke DNA recombinatiereacties (waarin ArgR en PepA, twee van de bestudeerde multifunctionele proteïne, eveneens betrokken zijn), en van effecten op lange afstand. Bovendien ligt het soort macromoleculaire interacties die we hier bestuderen ook aan de basis van talrijke vitale cellulaire processen. Wij stellen voor dat multifunctionele transcriptieregulators kunnen voortspruiten uit enzymen die een essentiële taak vervulden in de primitieve cel en die in de loop van de evolutie een functie toegevoegd hebben aan hun repertoire. Deze studie kan daarom ook een nieuw licht werpen op het ontstaan en de evolutie van regulatorische mechanismen en netwerken. Organisaties: • Biologie • Toegepaste Biologische Wetenschappen

Onderzoekers: • DANIEL CHARLIER • DOMINIQUE MAES

Retentie van silicaat langs het Schelde continuüm en de impact op eutrofiëring in de kustzone (SISCO) Universiteit Gent Abstract: Dit project evalueert de rol van het Schelde estuarium als ?sink? voor Si. Processen die onderzocht worden zijn de opname van Si door estuariene diatomeeënbloeien en de remineralisatie van biogeen Si. Het project omvat monitoring van Si en diatomeeën in het Schelde continuüm en experimenten gebaseerd op een cultuurcollectie van estuariene diatomeeën. De resultaten zullen in een ecosysteemmodel geïntegreerd worden. Organisaties: • Vakgroep Biologie

Onderzoekers: • Wim Vyverman

Functionele biopeptiden in de biggenvoeding Universiteit Gent Abstract: Een concept wordt ontwikkeld waarbij in situ d.i. in het spijsverteringskanaal (SVK) van biggen, functionele biopeptiden worden aangemaakt uit allerlei voedereiwitten, door dier-eigen proteasen, doch vooral door gerichte toepassing van exogene proteasen, met speciale aandacht voor hun potentiële immuno-modulerende en antibacteriële activiteit met inbegrip van hun repercussies op de gezondheid en de uiteindelijke prestaties van gepeende biggen. Organisaties: • Vakgroep Dierlijke productie

Onderzoekers: • Stefaan De Smet

Evaluatie van de bioveiligheid van probiotische melkzuurbacteriën bestemd voor humaan gebruik. (PROSAFE) Universiteit Antwerpen Abstract: Probiotische bacteriën, voornamelijk melkzuurbacteriën (MZB) (bv. lactobacilli, pediococci, enterococci en bifidobacteriën) worden als veilig beschouwd voor humaan gebruik. Toch hebben recente infecties, de verspreiding van antibiotica resistentiegenen en de ontwikkeling van nieuwe en/of gemodificeerde probiotische melkzuurbacteriën tot een zekere ongerustheid geleid op gebied van bioveiligheid. Het doel van dit project is dan ook om de bioveiligheid van deze probiotische MZB na te gaan. Isolaten van gezonde personen en immuungecompromiteerde patiënten, commercieel beschikbare en nieuwe probiotische MZB zullen bestudeerd worden. Na taxonomische identificatie van de probiotische MZB zal hun bioveiligheid worden nagegaan aan de hand van: (i) de detectie van antibiotica resistentie en horizontale transfer van antibiotica resistentiegenen; (ii) de detectie van nieuwe en gekende virulentiefactoren; (iii) evaluatie van immunologische effecten van MZB; (iv) overleving, kolonisatie en genetische stabiliteit van probiotische MZB in de darm. Het project zal leiden tot de ontwikkeling van bioveiligheidscriteria en testen van de bioveiligheid van MZB. De conclusies van het project zullen voorgesteld worden op de slotconferentie. Organisaties: • Medische microbiologie • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)

Onderzoekers: • Herman Goossens

Geattenueerd vaccin voor de bescherming van pluimvee tegen aviaire pathogene Escherichia coli en Salmonella enterica. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Het doel van dit project was carrier vaccinstammen te produceren die gelijktijdig pluimvee kunnen beschermen tegen aviaire pathogene Escherichia coli en Salmonella enterica. Voor dit doel werden geattenueerde aroA and guaB mutanten geproduceerd en getest, die virulentiegenen uitdrukken onder de controle van in vivo induceerbare promotors. Organisaties: • Genetische Virologie • Biologie • Toegepaste Biologische Wetenschappen

• Embryologie en Menselijke Genetica

Onderzoekers: • JEAN-PIERRE HERNALSTEENS • IRIS ADRIAENS • Connie ADRIAENSEN • NELE BUYS • HENRI DE GREVE

Drug targeting van Leishmania parasieten met behulp van colloïdale dragers. Universiteit Antwerpen Abstract: Het doel van het onderzoek is de ontwikkeling en optimalisatie van colloïdale dragers (liposomen en nanopartikels) die via endocytosis in de gastheercel van de parasiet worden opgenomen en het geneesmiddel (een krachtig, breed-spectrum saponine) vrijgeven. De invloed van de technologische parameters van de bereidingsprocedure op de fysicochemische eigenschappen en de endocytosis van de dragers zal onderzocht worden. Het therapeutisch effect zal in vitro en in vivo bestudeerd worden. Organisaties: • Laboratorium voor Farmaceutische Technologie en Biofarmacie

Onderzoekers: • Annick Ludwig

Analyse van de samenstelling van TRIM19 nucleaire- en TRIM5 cytoplasmatische-lichaampjes gedurende virusinfectie. Universiteit Antwerpen Abstract: Het is de bedoeling van dit project om de samenstelling en dynamiek van TRIM5- en 19 lichaampjes te bestuderen gedurende virusinfectie en dit door middel van de Tandem Affinity Purification (TAP) methodologie. Tevens wensen we na te gaan in hoeverre modificaties op eiwitniveau van TRIM5- en TRIM19 zijn opgetreden bij ESN individuen. Organisaties: • Proteïnechemie, proteoomanalyse en epigenetische signalisatie (PPES)

Onderzoekers: • Xaveer Van Ostade • Kim Mous

Chlamydiascreening in de huisartspraktijk: van een theoretisch model (efficacy) naar de praktijk (effectiveness). Universiteit Antwerpen Abstract: Chlamydia trachomatis is bij ons de meest frequente bacteriële SOA (prevalentie 3-8%); de meeste infecties verlopen asymptomatisch en worden niet gediagnosticeerd. Belangrijke complicaties en sequellen zijn echter PID, tubaire infertiliteit, extra-uteriene zwangerschap en chronische buikpijn. Vooral jonge vrouwen zijn at risk voor het oplopen van de infectie. Door het grote aantal asymptomatische infecties dringt screening zich op. De ontwikkeling en commercialisering van de DNA-amplificatietechnieken, die zeer goede testeigenschappen hebben en non-invasieve staalafname mogelijk maken, opent nieuwe perspectieven voor screening. Screening op Chlamydia heeft een hoge kostprijs en is arbeidsintensief; daarom is selectieve screening, op basis van een risicoprofiel, de meest haalbare strategie. Risicoprofielen zijn traditioneel bepaald bij hoogrisicopopulaties zoals in abortusklinieken, SOA klinieken, of bij bevolkingsgroepen van Afrikaanse afkomst. Deze risicoprofielen zijn niet zonder meer overdraagbaar naar de algemene patiëntenpopulatie in België. Om deze reden is het nodig een specifiek risicoprofiel te bepalen vanuit de huisartspraktijk. Dit project beoogt het ontwikkelen van een model voor selectieve screening op urogenitale Chlamydia bij vrouwen in de huisartspraktijk. Voorts worden de randvoorwaarden onderzocht waaraan moet worden voldaan om deze strategie in de praktijk te brengen. Bijzondere aandacht wordt besteed aan de feasibility en de aanvaardbaarheid van het model voor de betrokken actoren (m.n. huisartsen en patiënten).In een volgende fase wordt het model geimplementeerd en in de praktijk geëvalueerd. Een economische evaluatie van het screeningsmodel in de praktijk wordt vergeleken met de gezondheidswinst van het theoretische model. Organisaties: • Huisartsgeneeskunde • Eerstelijns - en interdisciplinaire zorg Antwerpen (ELIZA)

Onderzoekers: • Dirk Avonts • Veronique Verhoeven

In vivo evaluatie van een sojadrank gesupplementeerd met bifidobacterium animalis BB12 met betrekking tot probiotische effecten Universiteit Gent Abstract: Een sojadrank gesupplementeerd met Bifidobacterium animalis Bb12 aan een concentratie van 7 log KVE/ml wordt toegediend als probioticum in een studie met 15 gezonde vrijwilligers. Na een controleperiode van 2 weken zonder productinname volgen 3 weken warbij dagelijks 100 ml van de sojadrank wordt ingenomen. Vervolgens volgt een controleperiode van 2 weken zonder productinname. Evaluatie van de probiotische effecten zal gebeuren via microbiële analyse van wekelijkse fecale stalen. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie

Onderzoekers: • Willy Verstraete

Diagnose en pathogenese van invasieve aspergillose Universiteit Gent Abstract: Er zullen specifieke en gevoelige methoden ontwikkeld worden voor de detectie van filamenten van Aspergillus in biologische monsters van mensen en dieren, met het oog op resp. een snelle diagnose en de studie van de pathogenese van invasieve aspergillose. De Aspergillus filamenten zullen fluorescent gemerkt worden op basis van antigen antilichaamreacties en een specifieke enzymactiviteit (arabinosidase) en gedetecteerd worden mbv een microsoop-imager en vaste fase cytometrie (ChemScan). Organisaties: • Vakgroep Farmaceutische analyse

Onderzoekers: • Hans Nelis

Microbiële aspecten van pasteurisatie van levensmiddelen door middel van hoge-druk koolstofdioxide. Universiteit Gent

Abstract: In dit project wordt onderzoek verricht naar (1) de hoge-druk CO2 (HPCD)-gevoeligheid van een reeks levensmiddelenrelevante microorganismen, (2) de mogelijke resistentie-ontwikkeling van micro-organismen tegen HPCD-behandelingen, (3) de interactie van het levensmiddel op HPCD-afdodingsefficiëntie, (4) de afdoding van micro-organismen en houdbaarheid in een aantal HPCD-behandelde levensmiddelen, (5) het exacte inactivatiemechanisme, en (6) het opstellen en modelleren van inactivatiekinetieken. Organisaties: • Vakgroep Voedselveiligheid en Voedselkwaliteit

Onderzoekers: • Frank Devlieghere

Study of the mechanisms underlying the immune modulating effects of alcohol within the gastrointestinal tract : involvement of a bidirectional interaction of mast cells and (afferent) neural pathways. Universiteit Antwerpen Abstract: Study of the mechanisms underlying the immune modulating effects of alcohol within the gastrointestinal tract : involvement of a bidirectional interaction of mast cells and (afferent) neural pathways. Organisaties: • Laboratorium voor celbiologie en histologie

Onderzoekers: • Jean-Pierre Timmermans

Genotypering van Mycobacterium ulcerans, M. marinum, M. fortuitum, M. chelonae, M. abscessus en aanverwante species. Universiteit Antwerpen Abstract: M. ulcerans veroorzaakt Buruli Ulcer, een ernstige, necrotiserende aandoening aan huid en onderliggend weefsel die voorkomt in tropische landen, voornamelijk in West- en Centraal Afrika. Nauw verwant met M. ulcerans is M. marinum. M. marinum is een water gerelateerde mycobacterie die bij vissen leidt tot vermagering en futloosheid eindigend met de dood. M. fortuitum, M. chelonae en M. abscessus veroorzaken gelijkaardige ulceraties bij vissen en abcessen bij mensen. Een infectie bij mensen van M. fortuitum, M. chelonae of M. abscessus komt vooral na injecties of vaccinaties met niet-steriele stoffen voor, en leidt zelden tot de dood, maar kan ernstige complicaties met zich meebrengen. Er zijn identificatiemethodes voor handen voor de 5 species, maar subtypering op subspecies of genotype niveau is niet beschikbaar. Genotypering is belangrijk voor de identificatie van eventueel virulente en niet-virulente stammen en kan leiden tot de exacte herkenning van het reservoir en het infectiemechanisme. Typeren op subspecies niveau kan noodzakelijk zijn om een ideale antibioticatherapie te bepalen. Om mycobacteriën te kunnen isoleren uit water willen we een snelle filtermethode ontwikkelen die de sterk verdunde concentratie aan mycobacteriën kan concentreren in een werkbaar volume. Hiervoor zal er getest worden met verschillende filtersystemen en elutiemedia die bovendien selectief werken op mycobacteria. Organisaties: • Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Onderzoekers: • Luc Kestens • Pieter Stragier

Gentherapie : van gentransfer tot klinische toepassingen. Universiteit Antwerpen Abstract: Gentherapie is een experimentele therapie die binnen afzienbare tijd een belangrijke plaats zal innemen in de moderne geneeskunde. Deze WOG heeft tot doel om Vlaamse en Belgische laboratoria die een bewezen expertise hebben op het gebied van gentransfer en gentherapie, te bundelen in een netwerk om de interactie tussen de onderzoekspartners te verhogen en de complementariteit tussen de partners optimaal te benutten om alzo met de grotere buitenlandse onderzoeksgroepen te kunnen wedijveren op dit competitief gebied. De werkprogramma's zullen zowel fundamentele als toegepaste aspecten van gentherapie behandelen en zullen uiteindelijk bijdragen tot de uitbouw van een gezamenlijk wetenschappelijk gentherapie-forum in Vlaanderen en in België. Organisaties: • Moleculaire genetica • VIB DMG - Neurodegeneratieve Hersenziekten

Onderzoekers: • Christine Van Broeckhoven

Opwekken van cellulaire immuniteit tegen de regulatorische genproducten Tat en Rev als strategie voor eradicatie van HIV. Universiteit Antwerpen Abstract: Bij HIV-seropositieve personen zonder ziekteprogressie is er een sterke HIV-specifieke CD4+ en CD8+ T-celimmuniteit. Anderzijds worden bij personen met een progressief ziekteverloop ook HIV-specifieke CD8+ cytotoxische T-lymfocyten (CTL) aangetoond, maar deze cellen blijken functioneel deficiënt. Dit suggereert dat het kwalitatief verbeteren en versterken van T celresponsen gericht tegen HIV het ziekteverloop gunstig zou kunnen beïnvloeden. De huidige schema's van `highly active anti-retroviral therapy' (HAART) onderdrukken virale replicatie, maar er is geen volledige viruseradicatie. Bovendien vermindert HAART de anti-HIV CTL respons en ziet men geen complete reconstitutie van HIV-specifieke CD4+ T-helpercellen. Het opwekken van een sterke cellulaire immuunrespons gericht tegen de regulatorische HIV virus eiwitten Tat en Rev zou van bijzonder belang kunnen zijn voor de viruseliminatie. Het hoofddoel van dit project is dan ook de ex vivo sensitisatie van T cellen van HAART patiënten via het opladen van autologe monocyt-afgeleide dendritische cellen (Mo-DC) met het mRNA coderend voor de regulatorische Tat en Rev eiwitten alleen of in combinatie met het structurele Gag eiwit. Hierbij zijn we niet alleen geïnteresseerd in de inductie van CD8+ HIV-specifieke CTL, maar ook in de specifieke conditionering van DCs voor de activatie van CD4+ T helpercellen die de anti-HIV CTL respons in de hand kunnen werken of versterken. Ruime ervaring werd reeds opgedaan met het in vitro kweken van dendritische cellen, alsook met de electroporatie transfectietechniek die gebruikt zal worden voor het opladen van de bekomen dendritische cellen met HIV-1 mRNA. In dit project willen we dan ook aantonen dat het opwekken en/of versterken van een cellulaire immuunrespons tegen de vroeg tot expressie komende HIV eiwitten Tat en Rev een sleutelrol speelt in de ontwikkeling van een HIV immunotherapie. Organisaties: • Hematologie en bloedtransfusie • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)

Onderzoekers: • Robert Colebunders • Zwi Berneman • Vigor F I Van Tendeloo

Regulatie van bacteriële auxine biosynthese.

Universiteit Antwerpen Abstract: Auxinen, en meer specifiek indool-3-azijnzuur, worden aangemaakt in planten, schimmels en bacteria. Enkel voor planten is de fysiologische rol en de signaaltransductiecascade intens bestudeerd. De regulatie van de auxinebiosynthese is echter weinig begrepen. Het voorgestelde project beoogt de regulatie van IAA-biosynthese in Azospirillum brasilense te ontrafelen. Hiertoe worden experimenten op 3 niveaus uitgvoerd: (1) regulatie van ipdC genexpressie, (2) biochemische studie van het gezuiverde IPyA-decarboxylase en (3) kwantitatieve analyse van IAA metabolieten en mRNA's, overeenkomend het het IPyA-decarboxylase en regulatoreiwitten betrokken bij de ipdC expressie,onder strikt gecontrolleerde omgevingsomstandigheden. Organisaties: • Plantenbiochemie • Plantengroei en -ontwikkeling

Onderzoekers: • Els Prinsen

Resistentie en gebruik van antibiotica in het Middellandse-Zeegebied (ARMed). Universiteit Antwerpen Abstract: Gedurende 48 maanden zullen resistentie gegevens verzameld worden in de landen van het Middellandse- Zeegebied. De resultaten zullen onderworpen worden aan een programma voor kwaliteitscontrole. Epidiomiologische factoren die een invloed uitoefenen op de ontwikkeling van resistentie zullen in de studie betrokken worden. Gebruikscijfers van antibiotica zullen verzameld worden volgens de methode die ook in het Europese ESAC project gehanteerd wordt en het beleid in verband met infectiecontrole zal bestudeerd worden zoals in het HARMONY project wat de koppeling van de ARMed database met bestaande Europese databases zal vergemakkelijken. Organisaties: • Medische microbiologie • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)


Studie van interacties tussen virale en interferon-geïnduceerde eiwitten door functionele proteoomanalyse. Universiteit Antwerpen Abstract: In deze studie wensen we het moleculaire mechanisme van interferon antivirale activiteit tegen verschillende virussen, in kaart te brengen door toepassing van twee complementaire benaderingen. Enerzijds zal dit gebeuren door een systematisch gebruik van twee-hybriede technieken waarbij op analytische wijze associatie tussen gekende interferon-geinduceerde eiwitten met virale eiwitten wordt nagegaan. Anderzijds zullen interferon-geïnduceerde of virale eiwitten voorzien worden van een `tag' zodat co-immunoprecipitatie van de eiwitmengsels met anti-tag antilichamen, gevolgd door één- of tweedimensionale scheiding en identificatie van de associërende eiwitten door massaspectrometrie, mogelijk wordt. Organisaties: • Proteïnechemie, proteoomanalyse en epigenetische signalisatie (PPES)

Onderzoekers: • Xaveer Van Ostade

Aërobe afvalwaterbehandeling: de invloed van protozoa op de performatie Universiteit Gent Abstract: In een eerste fase zal de invloed van een protozoabehandeling op de hergroei van de vlok en het herstel van de functionaliteit na een toxiciteitspuls in een actief slib reactor nagegaan worden. In een tweede fase zal de reductie van de slibproductie door protozoabehandeling onderzocht worden. In een derde fase zal de selectieve begrazing in kaart gebracht worden door DGGE. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie


Ontwikkeling van Fourier-Transform (FT) Micro-Raman Spectroscopische methoden voor de karakterisering en identificatie van micro-organismen Universiteit Gent Abstract: Micro-Raman Spectroscopische analysemethoden worden ontwikkeld en geoptimaliseerd om micro-organismen op een snelle en eenduidige manier te onderzoeken. Het onderzoek spitst zich toe op de moleculaire samenstelling van bacterien en fungi, waarbij het doel is om een snelle identificatiemethode te bekomen. Daarnaast wordt er aandacht besteed aan specifieke processen, zoals de vorming van afscheidingsproducten bij bacterien en de sporevorming van fungi. Organisaties: • Vakgroep Analytische chemie

Onderzoekers: • Luc Moens • Peter Vandenabeele

Ontwikkeling van een droge poederaerosol als alternatief voor spray-vaccinatie in de pluimvee-sector Universiteit Gent Abstract: Een droge poederaerosol, aangewend voor vaccinatie van pluimvee ten opzichte van virale luchtweg-aandoeningen (NCD- of IB-virus), wordt geproduceerd via micronisatie (jet-molen, kogelmolen, sproeidrogen) van een gelyofiliseerde cake tot partikels van respireerbare grootte. Toevoegen van hulpstoffen moet toelaten de infectiviteit van het vaccin-virus te waarborgen na micronisatie. Toevoegen van een drager (lactose) kan de vloei-eigenschappen en het aerosolisatie-gedrag van het poeder in een luchtstroom optimaliseren. Organisaties: • Vakgroep Geneesmiddelenleer

Onderzoekers: • Chris Vervaet • Kristien Van Reeth

Onderzoek naar microbiciden in een modelsysteem van dendritische cellen en T cellen, met speciale aandacht voor synergistische combinaties en het vermijden van resistentie-ontwikkeling. Universiteit Antwerpen Abstract: Dit doctoraatsproject kadert in het Europese EMPRO project, dat nieuwe kandidaat-microbiciden (preventieve anti-HIV middelen) wil ontwikkelen. Binnen EMPRO worden nieuwe producten ontworpen, die op verschillende fasen van de viruscyclus inwerken voorafgaande aan integratie. Deze moeten dan in een aantal in vitro en in vivo modellen met elkaar vergeleken worden, om ten slotte een klein aantal ook in fase 1

trial te brengen. Onze taak in het project is producten te testen voor hun activiteit en toxiciteit in een model systeem, dat de belangrijkste doelwitcellen, betrokken bij heteroseksuele transmissie nabootst. Het gaat dan om dendritische cellen en autologe CD4 T cellen. We hebben al een aantal actieve en weinig toxische producten van verschillende klassen geïdentificeerd. Een potentieel probleem van de bewust bedoelde laagdrempeligheid van microbiciden is het risico op transmissie van resistente virussen. Het is immers waarschijnlijk dat deze producten zullen gebruikt worden door HIV-geïnfecteerde vrouwen, die zich van hun serostatus niet bewust zijn. Herhaaldelijk gebruik van microbiciden zou tot resistente virussen kunnen leiden en secundair tot transmissie van deze resistente virussen Een eerste specifiek objectief voor het huidige doctoraatsproject is te onderzoeken welke producten uit verschillende klassen synergistische activiteit (zonder toegenomen toxiciteit) vertonen in ons modelsysteem. Een tweede objectief is producten te vergelijken voor het gemak waarmee ze in ons modelsysteem HIV resistentie kunnen induceren. Dit kan ook helpen om tussen producten met gelijkaardige hoge activiteit en lage toxiciteit diegenen te selecteren waartegen het minst gemakkelijk resistentie kan uitgelokt worden. Organisaties: • Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Onderzoekers: • Guido Vanham • Katty Terrazas Aranda

Inhibitie door plantenextracten van quorum sensing in biofilm-vormende bacteriën Universiteit Gent Abstract: In dit project zullen reportersystemen (genetische constructen) ontwikkeld worden voor het aantonen van quorum sensing (QS) in biofilm vormende bacteriën zoals Staphylococcus aureus, S. epidermidis, Streptococcus mutans, Pseudomonas aeruginosa en Brukholderia cepacia. Plantenextracten zullen getest worden op hun vermogen om QS en biofilm vorming te remmen. Inhibitie van QS kan een nieuwe strategie betekenen voor de behandeling van persistente infecties door de genomede bacteriën. Organisaties: • Vakgroep Farmaceutische analyse

Onderzoekers: • Hans Nelis • Tom Coenye

Diagnose van bijenziekten Universiteit Gent Abstract: Dienstverlening voor externe instituten inzake de identificatie van bijenpathogen en paraziekten in een L2 ingeperkte omgeving op het labo voor zoöfysiologie, UGent. Diagnose van bijenziekten. Organisaties: • Vakgroep Informatietechnologie

Onderzoekers: • Dirk de Graaf • Franciscus Jacobs

Transcriptieregulatie bij Archaea : Lrp-actige transcriptieregulatoren bij het hyperthermo-acidofiele crenarchaeon Sulfolobus solfataricus P2. Vrije Universiteit Brussel Abstract: De voorgestelde studie beoogt de ontrafeling van moleculaire mechanismen die aan de basis liggen van genregulatie bij Archaea, een nog bijzonder schaars gedocumenteerd proces. Transcriptie-initiatie bij Archaea is fundamenteel verschillend van het bacterieel proces, en is eigenlijk een sterk vereenvoudigde versie van het eukaryotische RNA PolII afhankelijk proces van mRNA synthese. De potentiële transcriptieregulators die men kan herkennen in archaeale genoomsequenties zijn echter haast uitsluitend van het bacterieel type. Het is dus zeer de vraag hoe deze regulatorische moleculen interageren met het transcriptieapparaat en de activiteit ervan moduleren in functie van wisselende omgevingsfactoren en cellulaire behoeften. Wij zullen in dit project tot in de moleculaire details trachten te ontrafelen hoe twee regulatorische proteïnen, Ss-Lrp en Ss-LrpB, van het hyperthermoacidofiel crenarchaeon Sulfolobus solfataricus P2 hun werking uitoefenen. Daarom zal een gedetailleerde in vitro studie van de binding van deze regulators met het controlegebied van hun eigen gen uitgevoerd worden (autoregulatie) en zullen andere potentiële targets op het genoom opgespoord worden door een combinatie van in silico screening en experimentele analyse van beloftevolle potentiële targets. Op die manier krijgen we een overzicht van de genen die onder controle staan van deze regulators en daarmee ook een idee van hun fysiologische rol. Organisaties: • Toegepaste Biologische Wetenschappen


Wetenschappelijke evaluatie van de consumptie van antibiotica voor menselijk gebruik (ESAC2). Universiteit Antwerpen Abstract: Er zal getracht worden om de registratie van antibiotica in alle Europese landen te harmoniseren. Er zal een data collectie systeem ontwikkeld worden met gestandaardiseerde gegevens betreffende antibioticaverbruik in de verschillende Europese landen, uitgedrukt in volume en kostprijs, afzonderlijk voor de ambulante en de hospitaalsector. Bovendien zal deze databank ook gegevens bevatten ivm determinanten van antibioticagebruik, kwaliteitsindicatoren voor het opzetten van een degelijk antibioticabeleid, strategieën om het antibioticagebruik te beperken en een referentielijst van lopende projecten en gepubliceerde studies op nationaal en internationaal niveau. Zowel wetenschappers als gezondheidsdiensten zullen de databank kunnen raadplegen om verbruiksgegevens te koppelen aan resistentiepatronen en om de resultaten van interventies op het antibiotica gebruik te kunnen evalueren. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)


Wetenschappelijke evaluatie van de consumptie van antibiotica voor menselijk gebruik. (ESAC2-vervolg) Universiteit Antwerpen Abstract: Er zal getracht worden om de registratie van antibiotica in alle Europese landen te harmoniseren. Er zal een data collectie systeem ontwikkeld worden met gestandaardiseerde gegevens betreffende antibioticaverbruik in de verschillende Europese landen, uitgedrukt in volume en kostprijs, afzonderlijk voor de ambulante en de hospitaalsector. Bovendien zal deze databank ook gegevens bevatten ivm determinanten van antibioticagebruik, kwaliteitsindicatoren voor het opzetten van een degelijk antibioticabeleid, strategieën om het antibioticagebruik te beperken en

een referentielijst van lopende projecten en gepubliceerde studies op nationaal en internationaal niveau. Zowel wetenschappers als gezondheidsdiensten zullen de databank kunnen raadplegen om verbruiksgegevens te koppelen aan resistentiepatronen en om de resultaten van interventies op het antibiotica gebruik te kunnen evalueren. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)


Studie van de intestinale mucosale response en oxidatieve stress op het verloop van Giardia duodenalis infecties in proefdiermodellen. Universiteit Antwerpen Abstract: Het nieuw onderzoeksinitiatief bestudeert de micro-aerofiele intestinale protozoa Giardia intestinalis. Dit organisme heeft anti-oxidatieve verdedigingsmechanismen ontwikkeld om de aanwezige O2-spanning in weefsels en organen te weerstaan, o.a. via oxidatie van cellulaire thiols, superoxide dismutase en mogelijks nog andere mechanismen. Het belang van deze mechanismen wordt ondermeer geillustreerd door het feit dat de huidige geneesmiddelen (nitro-verbindingen) door selectieve verhoging van oxidative stress hun werking hebben. Het onderzoekplan omvat volgende stappen: 1. ontwikkelen/optimalisatie van een in vitro kweekmethode voor trophozoiten. 2. vastleggen van in vitro proefomstandigheden voor inductie van cysten 3. op punt stellen van een geschikt diermodel op laboratorium knaagdieren 4. evaluatie van oxidatieve stress op overleving in vitro en in vivo door in situ kwantificering van oxidatieve/antioxidatieve en inflammatoire processen 5. onderzoek naar nieuwe actieve molecules in de in vitro en in vivo testmodellen. 6. evaluatie van bestaande disinfectantia voor de inactivering van cysten in drinkwater 7. interactie van de parasiet op intestinaal weefsel (pathologie, inflammatie, e.a..) Organisaties: • Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Onderzoekers: • Dirk Adriaensen • Louis Maes • Paul F R C M Cos • Ely Bénéré

Preklinische ontwikkeling van RNA gemodifieerde dendritische celvaccins voor kanker en HIV. Universiteit Antwerpen Abstract: Met het oog op de ontwikkeling van een cellulair kankervaccin, zullen humane dendritische cellen (DCs) afkomstig van gezonde individuen, behandelde kankerpatiënten en HIV-seropositieve patiënten worden gekweekt vanuit perifere bloedmonocyten. Het hoofddoel van dit project bestaat erin om een transfer van gedefineerde tumor- of HIV-antigenen naar DC te bewerkstelligen d.m.v. transfectie met mRNA coderend voor het relevant antigeen via electroporatie. Deze met antigenen opgeladen DC zullen vervolgens gebruikt worden voor de in vitro generatie van antigenspecifieke autologe cytotoxische T-cellen die in staat zijn om autologe tumorcellen of HIV-geïnfecteerde cellen te eradiceren. In een latere fase zal worden overgegaan tot het laden van DC met ongefractioneerd autoloog tumormateriaal (totaal tumor mRNA, apoptotische cellen), wanneer er geen voorkennis is van tumorspecifieke tumorantigenen. Voor deze strategie zal worden gewerkt met tumormateriaal afkomstig van baarmoederhals- en lymfekankerpatiënten. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)

Onderzoekers: • Zwi Berneman • Vigor F I Van Tendeloo

Optimalisatie van Raman spectroscopie voor de analyse van fungi Universiteit Gent Abstract: Raman spectroscopie is een moleculair spectroscopische analysemethode die ingezet wordt voor de analyse van fungi. Tijdens dit project wordt gefocust op de analayse van de sporen en de analyse van de moleculaire samenstelling van exudaten van bepaalde zwammen, zoals de Lactarius soorten. Tijdens een tweede fase worden sporen van schimmels geanalyseerd, om zo een snelle en betrouwbare identificatiemethode te bekomen. Organisaties: • Vakgroep Analytische chemie

Onderzoekers: • Luc Moens • Peter Vandenabeele • Annemieke Verbeken

Stabiliteit van geselecteerde probiotica in de maag en dunned arm en hun evaluatie in de TWINSHIME setup Universiteit Gent Abstract: In dit experiment werd de overleving van geselecteerde probiotica in specifieke matrices geëvalueerd in een in vitro setup. Tevens werd de stabiliteit en efficiëntie van de probiotica in het maag-darm stelsel getest in een lange termijn proef met behulp van de TWINSHIME setup. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie


Prefermentatie van sojakiemen door het equol-producerend microbieel consortium EPC4 Universiteit Gent Abstract: Optimalisatie van de parameters voor de in vitro fermentatie van daidzine in equol in een aangereikt extract van sojakiemen met behulp van een microbieel consortium, gekarakteriseerd als EPC4. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie


Toepassingsmogelijkheden van de DGGE techniek met het oog op een efficiënte monitoring van de bacteriële houdbaarheid en veiligheid van levensmiddelen Hogeschool Gent Abstract: Abstract nog niet beschikbaar Organisaties: • Departement Biowetenschappen en Landschapsarchitectuur • Vakgroep Plantaardige Productie • Vakgroep Levensmiddelenwetenschappen en Technologie

Onderzoekers: • Kathy Messens • Kris Audenaert • Tony Ruyssen

Dubbel blind placebo gecontroleerde randomisatiestudie naar het effect van pre-emptieve aciclovir therapie in het voorkomen van lage luchtweginfectie met Herpes simplex virus bij patiënten op intensieve zorgen. Universiteit Antwerpen Abstract: Objectieven van de studie: -Het effect van pre-emptieve aciclovir therapie is het voorkomen van HSV infecties van de LLW te beoordelen aan de hand van dubbel blind, placebo gecontroleerde randomisatiestudie bij patiënten op INZO met HSV reactivatie in de bovenste luchtwegen; om zo eventuele verschillen in outcome tussen beide groepen aan te tonen. -Verdere gegevens omtrent de incidentie van HSV in de luchtwegen te verzamelen. -Verdere risicofactoren voor HSV reactivatie in de lucntwegen te identificeren. -Na te gaan of herpesvirussen, geïsoleerd uit de keel en uit de lagere luchtwegen, genomisch identisch of verschillend zijn bij éénzelfde patiënt en/of tussen verschillende patiënten. -Door middel van moleculaire technieken de gevoeligheid van de PCR ten opzichte van de conventionele viruskweek te evalueren en door het gebruik van kwantitatieve PCR technieken na te gaan of er een verband bestaat tussen de virale lading en de ziekte-progressie en/of outcome. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)

Onderzoekers: • Philippe Jorens • Margareta Ieven • Herman Goossens

Analyse van Promyelocytic Leukemia Nuclear Bodies (PML-NBs) gedurende virusinfectie: toepassing TAP methode en nagaan van een nieuwe strategie voor detectie van eiwit-eiwit interacties. Universiteit Antwerpen Abstract: Het is de bedoeling van dit project de samenstelling en dynamiek van Promyelocytic Leukemia protein-Nuclear Bodies (PML-NBs) te bestuderen gedurende VSV of HIV virusinfectie en dit dmv de Tandem Affinity Purification (TAP) methodologie. Daarenboven wensen we zelf een techniek voor de identificatie van partnereiwitten te ontwikkelen welke een aantal nadelen van de huidige technologieën omzeilt en die tevens toegepast kan worden op de PML-NBs. Organisaties: • Proteïnechemie, proteoomanalyse en epigenetische signalisatie (PPES)

Onderzoekers: • Xaveer Van Ostade • Ellen Van Damme

Ontwikkeling en validatie van een microtitreerplaat model voor de evaluatie van biociden tegen Staphylococcus aureus biofilms. Universiteit Antwerpen Abstract: Biofilms worden gedefinieerd als een gestructureerde populatie bacteriën, ingebed in een zelfgeproduceerde polymere matrix en vastgehecht aan een inert of levend oppervlak. Omdat biofilms een zeer hoge resistentie bezitten tegen biociden wordt een methode voor de detectie van Staphylococcus aureus biofilms ontwikkeld. Daarnaast worden verschillende bestaande en nieuwe biociden getest op hun capaciteit om biofilmgroei te inhiberen of bestaande biofilms te doden. Organisaties: • Farmacognosie, Functionele voeding en Farmaceutische Analyse (NatuRA) • Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Onderzoekers: • Paul F R C M Cos

Proteoomonderzoek naar de biosynthese van oppervlakte actieve stoffen in gist. Universiteit Antwerpen Abstract: Door gebruik te maken van een proteeomtechnische benadering wordt getracht een metabool profiel van een fermentatie op te stellen. Hierbij wordt Candida bombicola als model gebruikt voor de fermentatie van recycleerbare oliën en de productie van sophorolipiden. Door de cultuurparameters te optimaliseren wordt de lipide productie met het fenotype geliëerd met als doel een stam te selecteren die voor industriële fermentatie gebruikt kan worden. Organisaties: • Plantengroei en -ontwikkeling • Biomolecular & Analytical Mass Spectrometry (BAMS)

Onderzoekers: • Erwin J M Witters

Bacteriële fytohormoonsynthese en stikstoffixatie : De sleutel voor overleving bij nodulerende Psychotria ? Universiteit Antwerpen Abstract: Bacteriële bladnodulatie is een voorbeeld van uitzonderlijke samenwerking tussen bacteriën en hogere planten waarbij beide partners zeer strikt samenleven. De aanwezigheid van de endosymbiont is absoluut noodzakelijk voor het overleven van de gastheer. Stikstoffixatie en bacteriële productie van plantengroeiregulatoren zijn mogelijke factoren betrokken in deze symbiose. Door bacteriële genen die coderen voor stikstoffixatie en/of hormoonsynthese op te sporen, willen wij dit onderzoek een genetische basis geven om de omvang en aard van de interacties tussen deze twee organismen te evalueren. Organisaties:

• Plantengroei en -ontwikkeling

Onderzoekers: • Els Prinsen

Biobeschikbaarheid van fyto-oestrogenen uit soja en hop Universiteit Gent Abstract: Soja-isoflavonen en hop-prenylflavonoïden zijn fyto-oestrogenen en kunnen daarom een rol spelen in de preventie of behandeling van hormoonafhankelijke aandoeningen. Na consumptie worden deze componenten ofwel onmiddellijk opgenomen in de bloedbaan ofwel eerst gemetaboliseerd door de colon microbiota. De opname, het metabolisme en de distributie in borstweefsel van deze fyto-oestrogenen en hun metabolieten zullen in vivo bestudeerd worden. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie

Onderzoekers: • Denis De Keukeleire • Willy Verstraete

Biobeschikbaarheid van fyto-oestrogeen uit soja en hop Universiteit Gent Abstract: Soja-isoflavonen en hop-prenylflavonoïden zijn fyto-oestrogenen en kunnen daarom een rol spelen in de preventie of behandeling van hormoonafhankelijke aandoeningen. Na consumptie worden deze componenten ofwel onmiddellijk opgenomen in de bloedbaan ofwel eerst gemetaboliseerd door de colon microbiota. De opname, het metabolisme en de distributie in borstweefsel van deze fyto-oestrogenen en hun metabolieten zullen in vivo bestudeerd worden. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie

Onderzoekers: • Denis De Keukeleire • Willy Verstraete

Onderzoek naar de rol van Protozoa in de transmissie van thermofiele Campylobacter species in pluimvee Universiteit Gent Abstract: In recent onderzoek werd de mogelijkheid tot overleving, vermenigvuldigen en genuitwisseling van voedselpathogenen in Protozoa gerapporteerd. Momenteel zijn over de transmissie van Protozoa en de aanwezigheid van geinternaliseerde Campylobacter in (pluim)veebedrijven geen gegevens beschikbaar. Doelstelling van het project is het verwerven van wetenschappelijk kennis over de rol van Protozoa als vector, reservoir en "evolutionaire kribbe" voor Campylobacter op pluimveebedrijven. Organisaties: • Vakgroep Biologie • Vakgroep Veterinaire volksgezondheid en voedselveiligheid

Onderzoekers: • Koen Sabbe • Kurt Houf

SB Ellen Van Belle - Ontwikkeling van een M-cel gemedieerde immunisatiemethode met behulp van een genetisch gewijzigde Lactococcus lactis Universiteit Gent Abstract: Het doel van dit project is het ontwikkelen van een methode om een efficiënte mucosale en systemische immuunrespons te induceren. Hiervoor zullen Lactococcus lactis bacteriën die het gewenste antigen tot expressie brengen, gericht worden naar de M-cellen in de darm. Met dit project hopen we een nieuwe strategie voor mucosale vaccinatie te ontwikkelen, om zowel nieuwe mucosale vaccins te kunnen ontwikkelen alsook alternatieven aan te bieden voor de bestaande parenterale vaccins. Organisaties: • Vakgroep Pathologische anatomie

Onderzoekers: • Claude Cuvelier

Optimalisering van het Pichia pastoris expressiesysteem voor de productie van gehumaniseerde therapeutische glycoproteïnen Universiteit Gent Abstract: De doelstelling van dit project is drievoudig: (1) we willen een verzameling P. pastoris stammen creëren die van elk eiwit slechts één gedefinieerde glycovorm aanmaken. (2) we willen de secretiecapaciteit van deze stammen opdrijven zodat ook "moeilijke secreteerbare" eiwitten in aanvaardbare niveaus worden aangemaakt. (3) we willen de invloed van N-glycanen op de biologische eigenschappen van glycoproteïnen (in vitro en in vivo) nagaan. Organisaties: • Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie

Onderzoekers: • Roland Contreras

Systematiek en fylogenie van Lactarius subgenus Plinthogali Universiteit Gent Abstract: Binnen het geslacht van de Melkzwammen vormt Lactarius subgenus Plinthogali (Russulales, Basidiomycota) een duidelijk afgebakende groep ectomycorrhizavormende macrofungi met een subkosmopolitische distributie. Via de combinatie van DNA-onderzoek (ITS, LSU, RPB, GPD) en morfologische analyse wordt onderzocht hoe deze ectomycorrhizavormers zijn geëvolueerd en gediversifieerd, welke de primitieve en de afgeleide kenmerken zijn, waar het ontstaansgebied is en welke gastheeromschakelingen hebben plaatsgevonden. Organisaties: • Vakgroep Biologie

Onderzoekers: • Annemieke Verbeken

Systematiek en fylogenie van het genus Lactarius (Russulales, Fungi) Universiteit Gent Abstract: Lactarius is een kosmopolietisch, ectomycorrhizaveromend genus met naar schatting minstens 600 soorten (nu ongeveer 400 gekend). Deze studie wil een 5-tal belangrijke vragen omtrent de fylogenie, de evolutie en de biodiversiteit van het genus onderzoeken. Via morfologische en

moleculaire gegevens en gecombineerde analyses worden deze vragen aangepakt. Organisaties: • Vakgroep Biologie

Onderzoekers: • Annemieke Verbeken

Ontwikkeling van een DNA vaccin gebaseerd op het influenza A virus nucleoproteïne en het M2 eiwit Universiteit Gent Abstract: Het project beoogt de constructie en validering van een DNA vaccin waarbij een fusie tussen het ectodomein van het influenza A M2-eiwit en het nucleoproteïne tot expressie wordt gebracht door een constitutieve dierlijke promotor. De beschermende werking als profylactisch vaccin tegen influenza A infectie zal in het muismodel worden onderzocht. Organisaties: • Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie

Onderzoekers: • Xavier Saelens • Nico Callewaert

Inhibitie van biofilm vorming op staal Universiteit Gent Abstract: Het doel van deze studie is om te bepalen welke materialen die gebruikt worden voor de productie van mariene viskooien resistent zijn tegen microbiële biofilmvorming. Organisaties: • Vakgroep Farmaceutische analyse

Onderzoekers: • Hans Nelis

Basale en gereguleerde transcriptie-initiatie by hyperthermofiele Archaea : fysiologie en moleculair mechanisme van Lrpachtige transcriptieregulators en van pyrimidine-specifieke regulatie by Sulfolobus. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Archaea zijn echte prokaryoten, maar verschillen toch zodanig sterk van de Bacteria, dat zij een apart domein van het leven vormen. De informatieverwerkende machineries (replicatie, transcriptie, translatie) van de archaea zijn zelf nauwer verwant met de eukaryotische dan met bacteriële homologen. Wat transcriptie betreft vertonen de archaea een intrigerende mozaïek-structuur. Het basaal transcriptieapparaat is duidelijk van het eukaryotische type, aar de meeste potentiële transcriptieregulators die in silico kunnen opgespoord worden in genoomsequenties zijn van het bacteriële type, met een helix-turn-helix DNA-bindend motief. De analyse van archaeale transcriptieregulatie staat nog in de kinderschoenen. Toch is hat van fundamenteel belang om op moleculair vlak de wisselwerkingen tussen deze componenten van heterologe samenstelling te ontrafelen om de fysiologie en de evolutie van de archaea beter te begrijpen. In dit project bestuderen wij drie potentiële transcriptieregulators van de hyperthermoacidofiele crenarchaeota Sulfolobus solfataricus en S. Acidocaldarius ie behoren tot de familie van de Lrp-achtigen (Leucine responsive Regulatory Protein). Daarnaast bestuderen we eveneens de pyrimidine-specifieke regulatie van het pyrimidine gencluster. We spitsen ons toe op de onrafeling van het werkingsmechanisme en de fysiologie van deze systemen. Organisaties: • Biologie • Toegepaste Biologische Wetenschappen


Ontwikkeling en evaluatie van geattenueerde vaccins op basis van fimbriële adhesinen. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Probleemstelling en doelstelling. Vasthechting van een bacterie aan receptoren op de mucosa van de gastheer is de eerste stap van een bacteriële infectie. Daar deze vasthechting vaak gebeurt via fimbriële adhesinen, is het opwekken van antilichamen tegen deze adhesinen ter hoogte van de mucosa potentieel een interessante strategie om bacteriële infecties te voorkomen. Het adhesine bestaat bij de onderzochte fimbriae uit twee domeinen, een lectinedomein dat de receptor herkent en een pilinedomein, dat zorgt voor vasthechting op de basisstructuur van de pilus. Het doel van dit project is de ontwikkeling van recombinante vaccins gebaseerd op het lectinedomein van fimbriële adhesinen. Twee adhesinen werden uitgekozen als model, namelijk het FimH adhesine van type 1 fimbriae en het F17G adhesine van F17 fimbriae. Type 1 pili komen voor bij vele Enterobacteriaceae en worden beschouwd als een belangrijke virulentiefactor van uropathogene Escherichia coli (UPEC). De UPEC zijn de belangrijkste oorzaak van infecties aan de urinewegen bij de mens. Aanhechting van de kiemen aan het oppervlak van epitheelcellen van de blaas gebeurt via het FimH adhesine, op de top van bacteriële type 1 pili. F17 fimbriae komen voor bij bepaalde enterotoxigene E. coli (ETEC) van runderen en laten deze toe te binden aan het intestinaal epitheel. Methodiek. Er zal gebruik gemaakt worden van geattenueerde Salmonella stammen die in levende vorm toegediend worden. De lectinedomeinen van de adhesinen zullen op het oppervlak van de Salmonella vaccinstammen uitgedrukt worden als fusieproteïnen met een E. coli autotransportereiwit. Van de F17G zullen twee varianten, een met interne zwavelbrug (F17a-G) en een zonder zwavelbrug in het lectinedomein (F17b-G) onderzocht worden. Om te controleren of de adhesinen op het oppervlak van de bacteriecellen uitgedrukt zijn, zal gebruik gemaakt worden van (i) agglutinatietesten, (ii) herkenning door specifieke antilichamen in immunofluorescentie experimenten, (iii) enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) van hele cellen en (iv) degradatie door extern toegediende proteasen, gevolgd door sodiumdodecylsulfaat-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) en Western blot. Als de lectinedomeinen op het oppervlak uitgedrukt worden, zal overgegaan worden naar vaccinatie-experimenten waarbij het immuunantwoord op deze lectinedomeinen zal nagegaan worden. Verschillende vaccinatiestrategieën zullen uitgetest en vergeleken worden. In eerste instantie zullen als proefdieren BALB/c muizen gebruikt worden die oraal en nasaal geïmmuniseerd worden met (i) levende en (ii) afgedode Salmonella vaccinstammen die het lectinedomein van de adhesinen uitdrukken op het oppervlak. Er zal tevens geïmmuniseerd worden door injectie van (iii) gezuiverde totale fimbriae en (iv) gezuiverde lectinedomeinen om na te gaan of het gebruik van een carrierbacterie de verwachte voordelen biedt. Telkens zal, op verschillende tijdstippen na immunisatie, met behulp van ELISA de titer aan IgAs en IgGs tegen het lectinedomein van de adhesinen in serum en in speeksel nagegaan worden. Verder zal gecontroleerd worden of de antilichamen de binding van bacteriën kunnen inhiberen. Dit is mogelijk door inhibitie van agglutinatie te bepalen aan de hand gist- (voor type 1 fimbriae) en erythrocytsystemen (voor F17 fimbriae). Voor F17-fimbriae zal tevens een in vitro systeem gebruikt worden om de binding van de bacteriën aan intestinale villi, in aan- en afwezigheid van antilichamen na te gaan. Indien inhibitie van binding slaagt, kan onderzocht worden of gevaccineerde muizen na challenging resistent blijken te zijn. Hiervoor zal voor F17 het Duchet-Suchaux neonatal ETEC challenge model en het intranasaal ETEC model gebruikt worden. Voor UPEC zal het

experimenteel muismodel voor bacteriële cystitis gebruikt worden. Verder kan, als de muisexperimenten positief zijn, overgegaan worden op proeven met andere dieren. Samenwerkingen. VUB onderzoeksgroep Ultrastructuur (expressie en zuivering lectinedomeinen) VUB onderzoeksgroep Cellulaire en Moleculaire Immunologie (vaccinatie-experimenten) Organisaties: • Biologie

Onderzoekers: • JEAN-PIERRE HERNALSTEENS • Nani VAN GERVEN

Basale en gereguleerde transcriptie-initiatie bij hyperthermofiele archaea: fysiologie en moleculair mechanisme van Lrpachtige transcriptieregulators en van pyrimidine-specifieke regulatie bij Sulfolobus. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Archaea zijn echte prokaryoten, maar verschillen toch zodanig sterk van de Bacteria, dat zij een apart domein van het leven vormen. De informatieverwerkende machineries (replicatie, transcriptie, translatie) van de archaea zijn zelf nauwer verwant met de eukaryotische dan met bacteriële homologen. Wat transcriptie betreft vertonen de archaea een intrigerende mozaïek-structuur. Het basaal transcriptieapparaat is duidelijk van het eukaryotische type, aar de meeste potentiële transcriptieregulators die in silico kunnen opgespoord worden in genoomsequenties zijn van het bacteriële type, met een helix-turn-helix DNA-bindend motief. De analyse van archaeale transcriptieregulatie staat nog in de kinderschoenen. Toch is hat van fundamenteel belang om op moleculair vlak de wisselwerkingen tussen deze componenten van heterologe samenstelling te ontrafelen om de fysiologie en de evolutie van de archaea beter te begrijpen. In dit project bestuderen wij drie potentiële transcriptieregulators van de hyperthermoacidofiele crenarchaeota Sulfolobus solfataricus en S. Acidocaldarius ie behoren tot de familie van de Lrp-achtigen (Leucine responsive Regulatory Protein). Daarnaast bestuderen we eveneens de pyrimidine-specifieke regulatie van het pyrimidine gencluster. We spitsen ons toe op de onrafeling van het werkingsmechanisme en de fysiologie van deze systemen. Organisaties: • Toegepaste Biologische Wetenschappen

Onderzoekers: • DANIEL CHARLIER

Onderzoeksprojecten ( van 894)

Recommend Documents