1 Jan :53:42 Onderzoeksprojecten ( van 894) Zoekfilter: Classificaties: Microbiologie, bacteriologie, virologie, mycologie De rol van VHHs of Nanobodi...
De rol van VHHs of Nanobodies tijdens de eindstrijd van poliovirus eradicatie. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Sinds mensenheugenis wordt de mensheid reeds getroffen door poliomyelitis, een ziekte veroorzaakt door het poliovirus. Tijdens de laatste twintig jaren heeft het Global Polio Eradication Initiative (OPEI) veel succes gekend, resulterend in een substantiele vermindering van het aantal gevallen van poliomyelitis en dit door het gebruik van het Oraal Poliovaccin tijdens intensieve vaccinatie-campagnes. Op zijn weg is het OPEI echter onvermijdbare obstakels tegengekomen die het onmogelijk maken om de transmissie van wild poliovirus een halt toe te roepen en om van deze wereld een poliovrije wereld te maken en deze ook te behouden in de toekomst. Nieuwe strategieen en wapens moeten er ontwikkeld worden om de doelstelling te behalen waarbij in eerste instantie aan nieuwe efficiente antivirale geneesmiddelen tegen polio wordt gedacht. In dit project zal de bruikbaarheid en toepassing van een nieuwe generatie van recombinante antilichaam fragmenten, nl. Nanobodiesf of VHHs, als een nieuwe klasse van antivirale moleculen tegen poliovirus worden onderzocht. Uit een pool van geisoleerde VHHs met bindingscapaciteit voor het poliovirus zullen de meest potente en toepasbare VHHs geselecteerd en geoptimaliseerd worden. De bekomen VHH(s) kunnen dan ook als model dienen voor de strijd tegen andere belangrijke humane picomavirussen zoals het hepatitis A virus(geelzucht) of rhinovirus sen (verkoudheden). Organisaties: • Farmaceutische Biotechnologie en Moleculaire Biologie
Onderzoekers: • BARTHOLOMEUS ROMBAUT
Tumor-microomgeving interacties in multipel myeloom: regulatie door epigenetische veranderingen en hypoxie. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Multipel myeloom (MM) is een B cel maligniteit die voornamelijk voorkomt in het beenmerg (BM). Binnen deze BM microomgeving is de tumor sterk afhankelijk van wederzijdse interacties met de BM stromale cellen. Dit resulteert enerzijds in de overleving en groei van de MM cellen en anderzijds in veranderingen binnen de BM microomgeving leidend tot angiogenese en inductie van botziekte. Binnen dit project wensen we de regulatie van deze interacties verder te bestuderen en meer specifiek op de rol van epigenetische modificaties (met nadruk op methylatie, acetylatie en miRNA) in MM cellen en mesenchyma Ie stamcellen en het effect van het hypoxisch BM op UPR en Notch signaling. Organisaties: • Hematologie
Onderzoekers: • Karin VANDERKERKEN
Biomarker based anti-EGFR/HER2neu treatment of lung cancer and overcoming resistance to anti-EGFR therapies. Vrije Universiteit Brussel Abstract: In subgroepen van longkanker worden nu genomische biomerkers ontdekt die toelaten om de efficientie van specifieke antikanker behandelingen te voorspellen. In dit project worden de Human Epidermal Growth factor (HER) familie genen onderzocht in tumormateriaal en indien een activerende mutatie wordt gevonden worden de patienten behandeld met specifieke tyrosinekinase inhibitoren in het kader van prospectieve klinische studies met EGFR en HER2-neu inhibitoren. Wanneer resistentie optreedt worden nieuwe biopten genomen om onderzoek te verrichten naar de mechanismen van resistentie. Door de beperktheid van klinische biopten is het vandaag niet mogelijk om die cruciale merker te bepalen in 25% van de patienten wat hen een belangrijke behandelingsmogelijkheid ontzegt. Daarom wordt in dit project onderzocht of circulerend DNA (met mutatiespecifieke opsporingsmethoden) en circulerende tumorcellen (met generische opsporingsmethode) kunnen gebruikt worden om te streven naar een mutatiebepaling in 100% van de patienten. Aan deze studie werken 17 klinische centra mee. Het translationele werk wordt verricht in het Laboratorium moleculaire oncologie (Oncologisch Centrum) en voor de circulerende tumorcellen is er samenwerking met prof Isabelle Vande Broek, MD, PhD, hematologie. Door analyse van andere kankergenen kan dit project ook leiden tot identificatie van bijkomende mogelijke therapeutische doelwitten (wat in het eerst deel van het project al gebeurde door het ontdekken van mutaties in HER3 (voorheen onbekend). Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • JACQUES DE GREVE
Rol van immunomodulaire drugs om de effectiviteit te verhogen van een anti-myeloma vaccinatie strategie Vrije Universiteit Brussel Abstract: Progressie in de behandeling van myeloma opent een venster naar een anti-myeloma vaccinatie strategie ondersteund door een behandeling met immunomodulaire medicijnen (Imid's) zoals lenalidomide. Het effect van Imid's op de immuunsysteem van de myeloompatiënt zijn nog vrij onbekend. Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • HENRI SCHOTS
onderbreking van transmissie van poliovirus in het eindstadium van poliovirus uitroeiing en erna, gebruik makend van recombinante antibody-derived proteins als antivirale geneesmiddelen Vrije Universiteit Brussel Abstract: onderbreking van transmissie van poliovirus in het eindstadium van poliovirus uitroeiing en erna, gebruik makend van recombinante antibody-derived proteins als antivirale geneesmiddelen Organisaties: • Toegepaste Biologische Wetenschappen • Farmaceutische Biotechnologie en Moleculaire Biologie
NKT cellen als target voor behandeling in multipel myeloom Vrije Universiteit Brussel
Abstract: Multiple myeloom is een ongeneesbaar bloedkanker met kankercellen die zich ontwikkelen in het beenmerg. We bestuderen een subtype van cellen genaamd de Natuurlijke Doder (NKT - Natural Killer) en we onderzoeken hoe we hun functionaliteit kunnen verbeteren door het immuunmodulerend medicijn genmaand lenalidomide te gebruiken. Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • Eline MENU • Karin VANDERKERKEN
OVER-MYR Vrije Universiteit Brussel Abstract: Multiple myeloma (MM) is een ongeneesbare kanker met een incidentie van 5 per 100000 inwoners. Er zijn jaarlijks ongeveer 25000 nieuwe patiënten in de EU en de ziekte heeft een zware impact zowel op de patiënten zelf als op de gezondheidseconomie. MM cellen zijn kwaadaardige plasmacellen die in het beenmerg (BM) groeien. De micro omgeving van dit BM bevordert tumor cel groei en overleving en verandert die omgeving bovendien waardoor er angiogenese, osteolytische botlesies, anemie en immunosuppressie optreedt. De overleving bij patiënten jonger dan 65-70 jaar is 8-9 jaar en de event-vrije overleving 3-4 jaar. De patiënten hervallen na initiële behandelingen en de MM cellen worden meer en meer resistent tegen behandeling, waardoor de patiënten finaal overlijden aan de ziekte. Op een moleculair niveau wordt de ziekte gekarakteriseerd door een duidelijke inter-patient heterogeniteit, zoals aangetoond door FISH, array-comparatieve genomische hybridisatie (aCGH) and gen expressie studies. De objectieven van het huidig project zijn: 1. Het ontrafelen van de mechanismen betrokken in drug resistentie (B, B, HDM en L) momenteel gebruikt in de kliniek 2. De bijdrage van de micro omgeving definiëren in de drug resistentie van de MM cellen 3. Identificeren van nieuwe therapeutica die de drug resistentie kunnen overkomen Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • Karin VANDERKERKEN
Generatie en activatie van myeloïde-afgeleide suppressor cellen door multiple myeloom cellen. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Een mogelijk mechanisme van immuunsuppressie door myeloom cellen is de generatie en activatie van myeloïde-afgeleide suppressor cellen (MASC). Deze zijn een heterogene myeloïde populatie die T-celproliferatie onderdrukken in pathologische omstandigheden. Het aantal MASC is verhoogd in het perifeer bloed van myeloom patiënten. Bovendien werden er in het 5TMM muismodel verscheidene MASC subsets geïdentificeerd in het beenmerg met de capaciteit om T-celproliferatie te onderdrukken. Het doel van deze studie is de generatie, expansie en activatie van MASC door myeloomcellen te onderzoeken, en de mechanismen te ontrafelen om multipel myeloom progressie beter te begrijpen en zo behandeling te verbeteren. Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • Karin VANDERKERKEN • ELS VAN VALCKENBORGH
Studie van de epigenetische regulatie van multipel myeloom cellen in de beenmerg micro-omgeving. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Histon deacetylase en DNA methyltransferase inhibitoren zijn 2 klassen van epigenetische modificerende middelen in vroege klinische ontwikkeling in MM. Toch blijven de exacte werkingsmechanismen van deze middelen slecht begrepen. Het doel van dit project is de werkingsmechanismen van deze epigenetische-modulerende middelen verder te ontrafelen en dit zowel in vitro als in vivo, waar de cellen beschermd worden door het BM niche. Een beter begrip van de cellulaire respons tegen de epigenetische gerichte behandelingen zal mogelijks leiden tot therapeutische vooruitgang. Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • Elke DE BRUYNE
NET-BESCHADIGING-BIJ-SEPSIS: Endotheliale beschadiging gedurende sepsis: dragen NET-gebonden proteasen bij tot dit proces? KU Leuven Abstract: "Neutrophil Extracellular traps" of NETs zijn extrusies van chromatine waarbij eiwitten extracellulair gebonden worden op DNA bij het afstervenvan neutrofiele granulocyten. In dit project wordt onderzocht of NET-gebonden proteasen, waaronder gelatinase B of matrix metalloproteïnase-9 (MMP-9) en neutrofiel elastase (NE), schade kunnen veroorzaken aan omgevingscellen, waaronder endotheelcellen. Dit onderzoek heeft implicaties bij ernstige infecties, waaronder sepsis door bacteriën. De vraagstellingen die onderzocht worden zijn: (a) Dragen MMP-9 en NE bij tot schade aan endotheelcellen van lever en longen? Voor dit onderdeel worden MMP-9 knockout muizen en Ne-inhibitoren gebruikt. (b) Wat is de kinetiek van NET-vorming en endotheelschade? Dit aspect wordt geanalyseerd met intravitale microscopie. (c) Welke biochemische vormen van proteasen worden in de NETs waargenomen? Hiervoor worden enzymetesten uitgevoerd. (d) Wat is het effect van MMP-9 en NE op de afdoding van microben? Dit wordt ge Organisaties: • Laboratorium Immunobiologie
Symbiotic and pathogenic interactions. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Jan Michiels • Kristine Stepanyan
De interactie tussen gist en brooddeeg KU Leuven Abstract: Fermentatie en het maken van brood zijn processen zo oud als de beschaving. Al ver voordat we enige kennis omtrent het bestaan van micro-organismen hadden, werden gist en biotechnologie onderdeel van het menselijk bestaan. Vandaag de dag is fermentatie nog steeds een belangrijk onderdeel van ons leven, echter we hebben inmiddels een groot inzicht in dit proces verworven en we leren nog steeds veel bij over hoe het te controleren en aan te passen aan onze behoeften en smaak.Het gedrag van gistcellen tijdens industriële processen zoals de productie van bier, wijn en bio-ethanol is reeds intensief bestudeerd. Echter, onze kennis van de gistfysiologie tijdens solid state processen, zoals de fermentatie van brooddeeg, kaas of cacao, is beperkt. In deze studie hebben wij veranderingen in het transcriptoom van drie genetisch verschillende Saccharomyces cerevisiae stammen tijdens de fermentatie van brooddeeg onderzocht. Onze resultaten tonen aan dat, ongeacht de genetische achtergrond, alle dr Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Kevin Verstrepen • Elham Aslankoohi
Ontwikkeling van krachtige en breed-spectrum remmers van rhinovirussen voor de behandeling/prophylaxis van rhinovirus infecties bij patiënten met asthma en COPD. KU Leuven Abstract: Reeds in de jaren vijftig werden rhinovirussen erkent als één van de infectieuze oorzaken van verkoudheden. Daarenboven zijn ze tevens betrokken in de etiologie van virus-geïnduceerde exacerbaties van astma en chronisch obstructief longziekte (COPD, chronic obstructive pulmonary disease). Momenteel zijn er meer dan 150 rhinovirus stammen gekend. Gezien dit nog steeds groeiend aantal, blijkt de ontwikkeling van een rhinovirus vaccin quasi onmogelijk. Reeds sinds de jaren 80 wordt er onderzoek uitgevoerd naar antivirale geneesmiddelen voor de behandeling van rhinovirus infecties. Ondanks de enorme maatschappelijke en klinische impact van deze virussen, is er nog steeds geen antivirale therapie beschikbaar. In het verleden werden deze inhibitoren ontwikkeld voor de behandeling van milde bovenste luchtweg infecties in gezonde mensen, waardoor weinig neveneffecten getolereerd werden. De rol van rhinovirussen in de ernstigere lage luchtweginfecties in astma en COPD patienten hernieuwde de i Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Johan Neyts • Céline Lacroix
HELIZOON: Helicobacter suis infectie: een opkomende zoönose gekenmerkt door maagproblemen Universiteit Gent Abstract: Helicobacter suis komt frequent voor in de maag van varkens. Het is de bedoeling van dit project om na te gaan wat het zoönotisch belang is van deze bacterie. Bovendien zal een specifieke serologische test op punt gesteld worden om infectie met deze kiem bij mensen aan te tonen. Organisaties: • Vakgroep Pathologie, bacteriologie en pluimveeziekten
Onderzoekers: • Richard Ducatelle • Freddy Haesebrouck • Kurt Houf • Frank Pasmans
European Training Network on (+)RNA virus replication and antiviral drug development. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Johan Neyts
Diversiteit en nutritionele modulatie van intestinale microbiota bij jachtluipaarden in gevangenschap Universiteit Gent Abstract: De intestinale microbiota van jachtluipaarden in gevangenschap zal worden gekarakteriseerd, waarbij de invloed van wijzigingen in het strikt carnivore dieet op de fecale microbiota betrokken bij de vertering wordt onderzocht. Aan de hand van moleculaire technieken (PCR-DGGE, real-time PCR) en gerichte in-vitro en in-vivo studies zullen indicatororganismen met gunstige fermentatieprofielen worden geïdentificeerd, en zullen meer inzichten worden bekomen in hun rol bij het behoud van een normale intestinale gezondheidsstatus. Organisaties: • Vakgroep Voeding, Genetica en Ethologie
Onderzoekers: • Geert Janssens
Interactie van alfaherpesvirussen met natural killer (NK) cellen Universiteit Gent Abstract: NK cellen zijn cruciaal in de immuunrespons tegenover alfaherpesvirussen. Er zal onderzocht worden of de virale glycoproteïnen gB, gC en gD de activiteit van NK cellen beïnvloeden door interactie met inhiberende/activerende receptoren en of het virale US3 proteïne kinase NKgemedieerde cellyse verstoort. Dit zal nieuwe inzichten verschaffen in de immuunrespons tegenover alfaherpesvirussen, wat kan leiden tot nieuwe antivirale strategieën. Organisaties: • Vakgroep Virologie, parasitologie en immunologie
Onderzoekers: • Herman Favoreel
Klinische mastitis op Vlaamse melkveebedrijven Universiteit Gent
Abstract: Het voorkomen van klinische mastitis wordt bestudeerd op 50 willekeurig gekozen Vlaamse melkveebedrijven gedurende 1 jaar. Bij ieder geval neemt de melkveehouder een melkstaal dat bacteriologisch onderzocht wordt in het Melkcontrolecentrum Vlaanderen. Naast incidentie en pathogeendistributie worden ook verbanden tussen pathogeen specifieke incidentie en bedrijfskenmerken nagegaan. Organisaties: • Vakgroep Verloskunde, voortplanting en bedrijfsdiergeneeskunde
Onderzoekers: • Sarne De Vliegher
Nieuwe massaspectrometrische benaderingen tot een hoge-doorvoer analyse van voedselveilige micro-organismen Universiteit Gent Abstract: Traditionele gefermenteerde levensmiddelen worden door de consument geapprecieerd omwille van hun organoleptische en gezondheidsbevorderende eigenschappen. In deze producten is het dikwijls onduidelijk welke micro-organismen verantwoordelijk zijn voor de kenmerkende eigenschappen. Onderhavig project beoogt de ontwikkelingen en validatie van een nieuwe MALDI-TOF massapectrometrie gesteunde strategie om dit microbiologisch potentieel sneller en efficiënter te analyseren, met het oog op de ontwikkeling van functionele starterculturen met toepassingsmogelijkheden in de voedingsindustrie. Organisaties: • Vakgroep Biochemie en Microbiologie
Onderzoekers: • Peter Vandamme
ZKC 6262 KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Moleculaire Virologie en Gentherapie
Onderzoekers: • Zeger Debyser
Onderzoek en dienstverlening in het kader van het GRACE-project (Genomics to combat Resistance against Antibiotics in Community-acquired LRTI in Europe). Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds Cardiff University. UA levert aan Cardiff University de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)
Onderzoekers: • Samuel Coenen • Herman Goossens
Malaria in wilde chimpansees (Pan troglodytes): epidemiologische karakteristieken Universiteit Gent Abstract: In dit project worden de epidemiologische karakteristieken van malaria besmetting bij wilde chimpansees onderzocht, met name de effecten van leeftijd, dracht, STLV infectie en klimaat op Plasmodium infectie. Dit onderzoek zal gebeurden door niet-invasieve staalname en collectie van gegevens van wilde gewende chimpansee groepen in het Tai chimpanzee Project in Ivoorkust, en analyse ervan in het Robert KochInstituut, Berlijn, Duitsland. Organisaties: • Vakgroep Virologie, parasitologie en immunologie
Onderzoekers: • Pierre Dorny
Het ontrafelen van de rol van porciene rotavirussen in de pathogenese van biggendiarree en de mogelijkheid van interspecies transmissie Universiteit Gent Abstract: In dit project zullen betere inzichten verkregen worden in de epidemiologie en pathogenese van porciene rotavirusinfecties bij biggen met kraamstal- en speendiarree. Tevens zal het gevaar van interspecies transmissie van porciene rotavirussen naar de mens en omgekeerd nagegaan worden in een nieuw te ontwikkelen in vitro model van humane en porciene enterocyten. Organisaties: • Vakgroep Virologie, parasitologie en immunologie
Onderzoekers: • Hans Nauwynck
Adaptatie aan droogte- en saliniteitsstress in Antarctische filamenteuse cyanobacteriën Universiteit Gent Abstract: Vooral in Antarctica heeft ?global change? potentieel verstrekkende gevolgen voor de biodiversiteit. Filamenteuse cyanobacteriën vormen hier de hoeksteentaxa. Er is echter nog maar weinig gekend over de genetische basis die hun adaptatie en overleving op Antarctica mogelijk maakt. Dit projectvoorstel heeft als doel een beter inzicht te verwerven in de genetische adaptaties aan saliniteit- en droogtestress van Antarctische filamenteuse cyanobacteriën. Organisaties: • Vakgroep Biologie
Onderzoekers: • Wim Vyverman
Mechanismen van kruisbescherming tegenover het H3N2 influenzavirus bij het varken en de mens (FLUCROSS) Universiteit Gent
Abstract: In FLUCROSS wordt onderzocht in welke mate infectie- of vaccinatie-immuniteit tegenover varkens- en humane influenzavirussen kunnen beschermen tegenover infectie met een al dan niet antigenisch sterk verschillend varkensinfluenzavirus. Onze aandacht gaat uit naar H3N2 varkensinfluenzavirus dat een potentiële kandidaat is voor een volgende pandemie. Daarnaast wordt onderzocht hoe de interpretatie van serologische resultaten tegenover varkensinfluenzavirussen bij de mens kan verbeteren. Organisaties: • Vakgroep Virologie, parasitologie en immunologie
Onderzoekers: • Eric Cox • Kristien Van Reeth
Confocale microscoop. KU Leuven Abstract: De confocale microscoop zal gebruikt worden voor de localizatie van specifieke proteïnes in levende cellen door gebruik te maken van GFP en andere fluorescerende tags. De bestemming van proteïnes in de cel na toevoegen van specifieke stimuli zal ook gevolgd worden met dezelfe tags. Een confocale microscoop biedt een belangrijk voordeel voor deze studies in vergelijking met conventionele fluorescentiemicroscopie omwille van de veel grotere resolutie in de drie dimensies. Het meeste werk zal uitgevoerd worden met gist- en plantencellen. De confocale microscoop zal gebruikt worden door verschillende onderzoeksgroepen op de Arenberg campus en in het departement biologie. Organisaties: • Afd. Molec. Microbiol. & Biotechnologie
Onderzoekers: • Freddy Delvaux • Patrick Van Dijck • Johan Thevelein
Evaluatie van fenotypische voorspellingen voor de erfelijke overdraagbaarheid van het darmmicrobioom Universiteit Gent Abstract: Het darmmicrobioom speelt een belangrijke rol bij tal van gezondheidsrelevante processen. De vraag stelt zich of de samenstelling van het microbioom deels gekenmerkt wordt door erfelijke overdraagbaarheid. In dit project zal worden gewerkt met genomische informatie van het microbioom van een uitgebreide cohorte monozygote en dizygote tweelingen en zal worden nagegaan of genomische verschillen zich ook uiten op fenotypisch en functioneel vlak. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Tom Van de Wiele
Virale vectortechnologie als gentherapeutische techniek in de zoektochtnaar een behandeling voor mucoviscidose. KU Leuven Abstract: Gentherapie biedt theoretischnbsp;één behandelingsoptie aan vooral de verschillende CFTR mutaties beschreven in mucoviscidose, in tegenstelling tot farmacologische molecules, die slechts specifieke mutaties corrigeren. Virale vector transductie is de meest efficiënte methode om genetisch materiaal binnen te brengen in de gastheer cel omdat die gebaseerd is op het natuurlijk mechanisme van virussen om te overleven in deze cellen. Onze onderzoeksgroep heeft uitgebreide ervaring in virale vector technologie. Wij willen neonatale of zelfs foetale gentherapie onderzoeken als behandeling voor mucoviscidose aangezien op die manier irreversibele schade in de betrokken organen kan vermeden worden. We zullen perinatale gentherapie experimenten uitvoeren in een muco muismodel en een mogelijke correctie van het CFTR eiwit evalueren aan de hand van nasale potentiaalmetingen in de muizenneus.Cellijnen die (mutant) CFTR tot expressie brengen zijn noodzakelijk in het onderzoek naar nieuwe medicijnen v Organisaties: • Moleculaire Virologie en Gentherapie
Onderzoekers: • Zeger Debyser • Rik Gijsbers
Ontwikkeling van moleculaire diagnostische mogelijkheden voor het beheer van multiresistente tuberculose Zuid-Kivu Universiteit Gent Abstract: Er zijn geen gegevens gekend wat betreft de prevalentie en incidentie van multidrug resistente tuberculose in het oosten van de Democratische Republiek Congo, die noodzakelijk zijn voor de ontwikkeling en uitvoering van een nationaal programma ter bestrijding van de epidemie. Via dit project worden diagnostische vaardigheden ontwikkeld om een opvolging in Noord-en Zuid-Kivu te starten, middels geavanceeerde moleculaire biologie (PCR). Organisaties: • Vakgroep Inwendige ziekten
Onderzoekers: • Dirk Vogelaers • Steven Callens
Ontrafeling van de functies van intra- en extra-thymische regulatorische T-cellen in fysiologie en pathologie. KU Leuven Abstract: Regulatorische T-cellen zijn een belangrijke groep witte bloedcellen die kunnen verhinderen dat ons immuunsysteem lichaamseigen componenten aantast (auto-immuniteit) of reageert op onschadelijke omgevingscomponenten (allergie). Om deze functie uit te oefenen, moeten regulatorische T-cellen aanleren welke componenten veilig zijn en beschermd moeten worden tegen aanvallen van het immuunsysteem. Aangezien er nog geen correcte instrumenten bestaan om functionele testen uit te voeren, blijft de locatie waar deze regulatorische T-cel educatie plaatsvindt tot op heden zeer controversieel. De doelstelling van dit project is het genereren van een gesofisticeerde set genetisch gewijzigde muizenstammen waarmee kan onderzocht worden waar regulatorische T-cellen worden opgevoed,en die kunnen gebruikt worden in modellen van auto-immuniteit en allergie. Meer inzicht verkrijgen in het educatieproces van regulatorische T-cellen zou in de toekomst kunnen leiden tot de ontwikkeling van nieuwe thera Organisaties: • Labo Genetica van Auto-immuniteit
Onderzoekers: • Adrian Liston
Capaciteitsopbouw om state of the art surveillance systemen te implementeren m.b.t. antibioticaconsumptie en resistentie in Kosovo (KOSOVO).
Universiteit Antwerpen Abstract: Verhoging van onderzoekscapaciteit in de gezondheidszorg in Kosovo om de prevalentie te bepalen van antibiotica-resistente bacteriën en de kwaliteit van het voorschrijven van antibiotica te verbeteren in Kosovo, met als algemeen doel om de gezondheid en het welzijn van patiënten en hun gezinnen, besmet met antimicrobieel resistente organismen, te verbeteren in Kosovo. Organisaties: • Medische microbiologie • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)
Onderzoekers: • Herman Goossens
Microbiële analyse van luchtdragend fijn stof uit vervuilde lucht Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds Erasmus Mundus. UA levert aan Erasmus Mundus de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract. Organisaties: • Milieu Ecologie en Microbiologie (ENdEMIC)
Onderzoekers: • Sarah Lebeer
De Rol van de IL-17 cytokine familie in de inductie van een beschermende immuniteit tegen F4+ enterotoxigene Eschericha coli (ETEC) infectie. Universiteit Gent Abstract: F4+ETEC is belangrijke oorzaak van neonale en speendiarree. Dit project beoogt om de oorsprong van ETEC-geïnduceerde IL-17 na vroege infectie te identificeren en om de rol van IL-17 secreterende cellen in de inductie van een beschermende immuniteit tegen f4+ETEC te bepalen om nieuwe strategieën te ontwikkelen die een vroege infectie kunnen verhinderen of de effectiviteit van ETEC-gerichte vaccins verhogen. Organisaties: • Vakgroep Virologie, parasitologie en immunologie
Onderzoekers: • Eric Cox
Lessen uit plant-bacterie interacties: inzichten in regeneratie recalcitrantie en toepassing van bacteriële morfogenen bij in vitro propagatie van recalcitrante planten Hogeschool Gent Abstract: Abstract nog niet beschikbaar Organisaties: • Departement Biowetenschappen en Landschapsarchitectuur • Vakgroep Plantaardige Productie
Onderzoekers: • Stefaan Werbrouck • Danny Vereecke
Routine diagnostisch hulpmiddel voor infecties van de urinewegen veroorzaakt door ESBL en carbapenamase producerende bacteriën (ROUTINE). Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds EU. UA levert aan EU de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)
Onderzoekers: • Herman Goossens • Surbhi Malhotra
Virulentiegenen van Helicobacter heilmannii betrokken in adhesie aan het maagslijnvlies Universiteit Gent Abstract: Helicobacter heilmannii, die van nature uit de maag van honden en katten koloniseert, kan ook een maaginfectie veroorzaken bij mensen. Het is nog niet geweten hoe deze bacterie de maag koloniseert en hoe het ziekte veroorzaakt. In dit project zullen H. heilmannii genen die betrokken zijn bij adhesie aan het maagslijmvlies geïdentificeerd worden en hun rol in de pathogenese zal bepaald worden. Organisaties: • Vakgroep Pathologie, bacteriologie en pluimveeziekten
Onderzoekers: • Freddy Haesebrouck
De invloed van bacterie-bacterie en gastheer-bacterie signalen op de larvicultuur van de reuzenzoetwatergarnaal Macrobrachium rosenbergii Universiteit Gent Abstract: De reuzenzoetwatergarnaal Macrobrachium rosenbergii is een belangrijk zoetwater aquacultuur species. In dit onderzoek onderzoeken we de invloed van het verstoren van bacteriële cel tot cel communicatie en van het detecteren van stresshormonen geproduceerd door de gastheer op bacteriële infecties in Macrobrachium. Het verstoren van deze interacties zou een duurzaam alternatief kunnen bieden voor het gebruik van antibiotica. Organisaties: • Vakgroep Dierlijke productie
Onderzoekers: • Peter Bossier • Tom Defoirdt
Impact van de genoomvariaties, de epidemiologie en de immunologie van het Puumalavirus op het ziektebeeld van hantavirussen KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract
Onderzoekers: • Marc Van Ranst • Piet Maes • Valentijn Vergote
Interactomics analysis of the replication of Flaviviridae: in search ofnovel drugable targets KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Johan Neyts • Jan Paeshuyse • Mareike Grabner
Het auxine indool-3-azijnzuur als signaalmolecule in bacteriën. KU Leuven Abstract: De synthese van het plantenhormoon indool-3-azijnzuur (IAA) is niet beperkt tot planten. Voor diverse species van bacteriën is de synthese van auxinen, reeds lang gekend. Tot voor kort werd bacteriëel IAA uitsluitend gezien als een effectormolecule, hetzij in relatie tot virulentie (fytopathogenen), hetzij in relatie tot stimulatie van wortelontwikkeling (plantengroeibevordering). Meer recent is de bevinding dat IAA ook een signaalmolecule is in bacteriën en lagere eukaryoten. Voor de plantengroeibevorderende rhizobacterie Azospirillum brasilense werd reeds aangetoond dat de expressie van een sleutelgen in de biosynthese van IAA gereguleerd wordt door het eindproduct IAA. In dit project willen we de signaalfunctie van IAA op moleculair niveau ontrafelen op basis van een transcriptoomanalyse van IAA-geïnduceerde A. brasilense cellen. In een tweede deel zal getracht worden om bacteriële auxinereceptoren en -transcriptiefactoren, die tussenkomen in auxinesignalisatie, te identificeren en Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Jozef Vanderleyden • Stijn Spaepen
Ontwikkeling en implementatie van digitale microfluïdica voor de gedetailleerde hoge-doorvoer analyse van gestresseerde bacteriële populaties KU Leuven Abstract: De fysiologie van micro-organismen wordt steeds meer op het niveau van de individuele cel (i.e. single-cell) bestudeerd. Om deze resolutie te kunnen bereiken, wordt vaak gebruik gemaakt van fluorescente merkers die op een uiterst gevoelige, selectieve en niet-invasieve manier de detectie van specifieke intracellulaire structuren en processen mogelijk maken. Wanneer deze merkers nu gecombineerd worden met de opkomende technologie van time-lapse fluorescentiemicroscopie (TLFM), dan wordt informatie verkregen over zowel (i) de lokalisatie (spatiale resolutie) van het fluorescentiesignaal in de cel als (ii) de verdere evolutie (zowel wat betreft intensiteit als lokalisatie) ervan in de tijd (temporele resolutie) en dit op single-cell niveau. Een belangrijk obstakel bij het uitbuiten van deze nieuwe experimentele en analytische mogelijkheden, wordt gevormd door het gebrek aan technologie waarmee grote aantallen van cellen onder de microscoop geïncubeerd en gemanipuleerd kunnen worden.De doe Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers: • Abram Aertsen • Ioannis Passaris
Een nieuwe aanpak om genetische mechanismen te identificeren die aan debasis liggen van het complexe multidrug toleerante fenotype en onderzoek naar de evolutie van dit fenotype. KU Leuven Abstract: Persistors zijn uitzonderlijke cellen in een bacteriële populatie en maken slechts een fractie uit van de totale cultuur. Ze groeien niet maar zijn ook niet dood. Deze zombietoestand zorgt ervoor dat ze antibioticumbehandeling kunnen overleven en terug een populatie kunnen opbouwen na de behandeling die dezelfde fractie persistors herbergt. Deze cellen zijnde oorzaak van het hervallen van chronische ziekten zoals tuberculose en blaasontstekingen. In staat om rampen te overleven, kunnen deze cellenbeschouwd worden als een vorm van levensverzekering voor de populatie. Ondanks dat persistentie reeds lange tijd gekend is, zijn de onderliggende mechanismen voor de vorming van een dergelijke subpopulatie slecht gekend. In dit project zal getracht worden om deze mechanismen en de hierin betrokken belangrijke genen te identificeren en de evolutie door selectie te bestuderen. Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Jan Michiels • Bram Van den Bergh
Studie van het antifungaal werkingsmechanisme van het plantdefensine RsAFP2 uit radijs en ontwikkeling van een RsAFP2-gebaseerde sensor voor schimmel- en gistdetectie. KU Leuven Abstract: Schimmelpathogenen, zoals Aspergillus fumigatus, Candida albicans en C. glabrata, kunnen invasieve infecties veroorzaken bij de mens. Deze infecties komen vooral voor bij gehospitaliseerde patiënten die kampen met hematologische maligniteiten (33%),orgaantransplantaties (22,9%), AIDS (acquired immunodeficiency syndrome, 19,7%), kanker (4,8%) en andere ziektebeelden (3,5%). De hoge mortaliteitsgraad geassocieerd met aspergillose en candidose (30-40%) is het resultaat van verschillende factoren, waaronder de aard van de onderliggende ziekte, het infecterend micro-organisme en de tijd en keuze van antifungale behandeling, die specifiek gericht moet zijn tegen de pathogeen. Zo worden vooral fluconazole en voriconazole frequent gebruikt als therapie bij infecties veroorzaakt door Candida spp. en Aspergillus spp., respectievelijk. Tot op heden wordt gebruik gemaakt van traditionele schimmel- en gistculturen voor de diagnose van fungale infecties. Groei van deze pathogenen kan worden gedetect Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers:
• Bruno Cammue • Kim Vriens
Mechanisme en gevolg van stress-geïnduceerde proteïneaggregatie in een prokaryoot modelsysteem. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers: • Abram Aertsen • Sander Govers
Zebravis als nieuw model gastheer voor morfologische en onontdekte immunologische kenmerken van in vivo Candida albicans biofilms. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Afd. Molec. Microbiol. & Biotechnologie
Onderzoekers: • Sona Kucharikova
Microchip-gebaseerde Impedantie Sensoren voor in situ Evaluatie van Bacteriële Biofilmvorming (See2B). KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Hans Steenackers
Evolutionaire reconstructie van virale verspreiding in tijd en ruimte. KU Leuven Abstract: Vele virale infecties vormen een belangrijke bedreiging voor de gezondheid van de mens en kunnen zich in onze mobiele wereld zeer snel verspreiden, getuige hiervan de H1N1 influenza A uitbraak. Voor het achterhalen van de mechanismen die aan de basis liggen van ziekteuitbraken, de plaatsgebonden instandhouding van ziektes en hun epidemische uitbreiding, ishet noodzakelijk om de verspreiding van de ziekteverwekker in tijd en ruimte in kaart te brengen. In dit project willen we verschillende statistische modellen ontwikkelen om de geografische verspreiding van virussenop basis van hun genetische data te reconstrueren en hypothesis hieromtrent te testen. Spatiotemporele voorspellingen vanuit deze modellen kunnen bijdragen tot de ontwikkeling van effectieve interventie- en preventiestrategieën. Organisaties: • Klinische & Epidemiologische Virologie
Onderzoekers: • Philippe Lemey
LEDGF/p75 als nieuw doelwit voor de behandeling van acute leukemie. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Moleculaire Virologie en Gentherapie
Onderzoekers: • Zeger Debyser • Jan De Rijck • Katerina Cermakova
Validatie van nieuwe cellulaire cofactoren voor retrovirale, nucleaire import en integratie KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Moleculaire Virologie en Gentherapie
Onderzoekers: • Zeger Debyser • Jan De Rijck • Caroline Weydert
Onderzoek naar de rol van de HIV enveloppe glycanen in de virale infectie en de antivrale activiteit van suiker-bindende moleculen. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Jan Balzarini • Dominique Schols • Leen Mathys
Ontwikkeling van antivirale strategieën tegen het hepatitis E virus. KU Leuven Abstract: Acute virale hepatitis is een ontsteking van de lever die veroorzaakt wordt door een infectie met een virus. Zo'n infectie veroorzaakt een typische geelzucht en verder ook vermoeidheid, misselijkheid,... Hepatitis Avirus en hepatitis E virus zijn de voornaamste oorzaken van een dergelijke virale hepatitis.Hoewel er een vaccin beschikbaar is tegen hepatitis A, komen er nog regelmatig uitbraken voor en bij bepaalde personen kan dit tot ernstige ziekte leiden. Momenteel zijn er echter geen geneesmiddelen beschikbaar voor de behandeling van hepatitis A. Dergelijke geneesmiddelen zouden erg nuttig zijn om uitbraken in te perken en om ernstig zieke patiënten te behandelen. Om de ontwikkeling van nieuwe
geneesmiddelen mogelijk te maken, heb ik enkele methoden ontwikkeld waarmeede antivirale activiteit van chemische moleculen getest kan worden in het labo. Hiermee kunnen grote bibliotheken van molecules getest worden om zo tot een kandidaat-geneesmiddel te komen.Hepatitis E virus veroorzaakt v Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Johan Neyts • Yannick Debing
Het lipide metabolisme van de gastheercel als potentieel doelwit voor de inhibitie van de replicatie van het hepatitis C virus. KU Leuven Abstract: Wereldwijd zijn naar schatting 170 miljoen mensen chronisch geïnfecteerd met het hepatitis C virus (HCV). Deze mensen hebben dus een verhoogd risico op het ontwikkelen van fatale leverziekte. De huidige standaardtherapie voor de behandeling van HCV-infecties is effectief in de helft vande patiënten en wordt geassocieerd met ernstige bijwerkingen. Daarom zijn krachtigere en beter verdraagbare geneesmiddelen nodig om HCV geïnfecteerde patiënten te behandelen. Zoals voor alle virussen is HCV sterk afhankelijk van de gastheercel voor vrijwel alle stappen in zijn infectiecyclus. Een bijzonder kenmerk van HCV is de nauwe band met het lipide metabolisme van de gastheercel. Daarom kan de inhibitie van enzymen van het lipide metabolisme een nieuwe benadering zijn voor de remming van HCV. In dit onderzoek willen we aspecten van de sterke afhankelijkheid van HCV van het lipide metabolisme van de gastheercel bestuderen. Verder willen we onderzoeken of deze link tussen het virus en degastheer kan w Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Johan Neyts • Leen Delang
Nieuwe strategieën voor de behandeling van virale infecties en van dooreïnduceerde tumoren. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Johan Neyts
Een systeembiologische studie voor een diepgaand inzicht in de ontwikkeling en adaptatie van Leishmania donovani. Universiteit Antwerpen Abstract: Dit PhD-project zal een systeembiologische benadering aanwenden om de ontwikkeling en adaptatie van Leishmania te bestuderen. De integratie van -omics data van verschillende functionele niveaus (genoom, transcriptoom, proteoom en metaboloom) moet leiden tot een meer holistische visie op de cellulaire processen in deze parasiet. Organisaties: • Departement Biomedische Wetenschappen - overige
Een kwantitatieve analyse van varicella-zoster virus infectie: van immunologie tot epidemiologie. Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk OnderzoekVlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)
Onderzoekers: • Pierre Van Damme • Philippe Beutels • Vigor F I Van Tendeloo • Niel Hens • Benson Ogunjimi
De impact van gastheer-pathogeen interacties op de virulentie van luminescente virbios tegenover pekelkreeftjes (Artemia franciscana) Universiteit Gent Abstract: De virulentie van luminescente vibrios wordt bepaald door de expressie van verschillende virulentiegenen. In dit project zal een modelsysteem met gnotobiotische pekelkreeftjes gebruikt worden om de expressie van virulentiegenen te bestuderen tijdens infectie. Bovendien zal de invloed van bacteriële cel-tot-cel communicatie (quorum sensing) en stresshormonen geproduceerd door de gastheer op de expressie van virulentiegenen eveneens bestudeerd worden. Organisaties: • Vakgroep Dierlijke productie
Onderzoekers: • Peter Bossier
Antigeen-presentatie door macrofagen na sialoadhesine-gemediëerde endocytose, een stap in het onbekende Universiteit Gent Abstract: Moleculaire analyse van de cytoplasmatische staart van sialoadhesine, de drijvende kracht achter deze multifunctionele receptor. Alsook analyse van de signalisatie-wegen geactiveerd door ligand-geïnduceerde endocytose van sialoadhesine en het effect hiervan op antigeenpresentatie. Organisaties: • Vakgroep Virologie, parasitologie en immunologie
Onderzoekers:
• Hans Nauwynck
Hitteschokproteinen en hun inducerende stoffen als bescherming tegen vibriose Universiteit Gent Abstract: Antibioticagebruik in aquacultuur is verboden omwille van bezorgdheid voor de menselijke gezondheid. In deze studie wordt het gebruik van hitteschokproteïne (Hsp70)en zijn inducerende stoffen verkend als strategie tegen ziektes. Het doel is het actieve epitoop van Hsp70 te bepalen, zijn immunogeniciteit en beschermingsefficiëntie in Artemia te testen. Daarna, worden de beschermende effecten van Hsp-inducerende stoffen in Vibrio-blootgestelde Artemia bepaald. Organisaties: • Vakgroep Dierlijke productie
Onderzoekers: • Patrick Sorgeloos • Peter Bossier
Gamma-glutamyl transpeptidase als belangrijke virulentiefactor van Helicobacter suis: mechanismen die bijdragen tot epitheliale cel necrose en immunomodulatie Universiteit Gent Abstract: Helicobacter suis is de meest voorkomende niet-Helicobacter pylori Helicobacter soort bij mensen met maagklachten. Het doel van dit onderzoek is om na te gaan hoe deze bacterie en een gesecreteerd enzyme, het gamma-glutamyl transpeptidase, in staat zijn om epitheliale celnecrose te veroorzaken en daarenboven de immuunrespons van de gastheer te moduleren. Organisaties: • Vakgroep Pathologie, bacteriologie en pluimveeziekten
Onderzoekers: • Freddy Haesebrouck
De rol van Nef in HIV-1 transmissie tussen dendritische cellen en T cellen Universiteit Gent Abstract: De rol van Nef in de transmissie van HIV van dendritische cellen naar T cellen zal onderzocht worden met cel- en weefselkweek (vaginaal weefsel explanten). Hierbij zal de vorming van virale synapsen en de dynamiek van het cytoskelet bestudeerd worden in infectie met wildtype en nef-gemuteerde HIV reportervirussen. Organisaties: • Vakgroep Klinische biologie, microbiologie en immunologie
Onderzoekers: • Bruno Verhasselt
Pathogeen-gestuurde gastrointestinale microbiota bij Passeriformen: anthropogeen beïnvloede omgeving als model Universiteit Gent Abstract: Salmonella enterica serotype Typhimurium kan de oorzaak zijn van fatale septicaemie bij wilde vogels. De hypothese van dit project is dat vogels levende in urbane, suburbane en rurale gebieden zich lokaal kunnen aanpassen aan verhoogde infectiedruk van pathogenen door veranderingen in de gastro-intestinale microbiota, met verlaging van de virulentie van deze pathogenen tot gevolg. Deze hypothese zal onderzocht worden in veldpopulaties van huismussen levende langsheen een urbanisatie-gradiënt. Organisaties: • Vakgroep Pathologie, bacteriologie en pluimveeziekten
Onderzoekers: • An Martel
Ontwikkeling van fotonische structuren voor versterkte intracellulaire Raman spectroscopie Universiteit Gent Abstract: Het doel is het ontwerpen van een micrometer-grote structuur die binnen in een biologische cel kan opgenomen worden en van daaruit (door middel van resonanties) de Raman scattering van nabije molecules kan versterken. Met behulp van deze techniek zullen we verscheidene intracellulaire processen toelichten op een labelvrije wijze. Organisaties: • Vakgroep Informatietechnologie
Onderzoekers: • Roeland Baets
De ontwikkeling van in vitro modellen om de invloed van de microbiota op chemotherapie-geïnduceerde mucositis in het spijsverteringsstelsel te bestuderen. Universiteit Gent Abstract: In dit project zullen de in vitro effecten van irinotecan en 5-fluorouracil op de microbiota van het spijsverteringsstelsel en de mucosa bestudeerd worden. Hiervoor zal gebruik worden gemaakt van in vitro mucositis modellen en de SHIME (Simulator of the Human Intestinal Microbial Ecology). De resultaten zullen worden vergeleken met in vivo resultaten van experimenten met het Dark Agouti rattenmodel. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Tom Van de Wiele • Barbara Vanhoecke
Onderzoek naar de rol van secretiesystemen in de virulentie van Burkholderia cenocepacia, de oorzaak van cepacia syndroom bij mucoviscidosepatienten. Universiteit Gent Abstract: Burkholderia cenocepacia is een opportunistische pathogeen die ernstige verwikkelingen kan veroorzaken bij mucoviscidosepatiënten. Wij zullen, door gebruik te maken van proteoomanalyse, de door de type III en IV secretiesystemen in de gastheercel gesecreteerde eiwitten identificeren en de invloed van omgevingsfactoren op de secretie van virulentiefactoren meten. Het effect van de gesecreteerde eiwitten op de leefbaarheid en de immuunrespons bij de gastheercellen zal bestudeerd worden. Met dit project wensen we het potentieel van het bacterieel secretiesysteem als doelwit voor antibiotica te evalueren. Organisaties: • Vakgroep Biochemie en Microbiologie
Onderzoekers: • Bart Devreese
De rol van het F-box proteïne MAX2 tijdens endosymbiotische interacties van planten. Universiteit Gent Abstract: Nodulatie en arbusculare mycorrhizatie zijn endosymbiotische interacties van legumineuze planten waarbij strigolactonen (SLn) een rol spelen. MAX2 is een F-box proteïne dat nog onbekende componenten van de SL signalisatie selecteert voor proteasomale degradatie. De functie en targets van MAX2 moeten ontdekt worden voordat verder de rol van SLn tijdens beide types symbioses kan begrepen worden. Organisaties: • Vakgroep Plantenbiotechnologie en Genetica
Onderzoekers: • Sofie Goormachtig
Onderzoek naar de prevalentie en epidemiologie van Mycoplasma gallisepticum en Mycoplasma meleagridis stammen, en opsporen van wildreservoirs Universiteit Gent Abstract: Het doel van dit project is het bepalen van de prevalentie van M. gallisepticum en M. meleagridis infecties bij pluimvee en wildlevende vogels alsook het bepalen van de diversiteit van M. gallisepticum en M. meleagridis stammen in België teneinde advies te kunnen geven ter preventie van de aandoening Organisaties: • Vakgroep Pathologie, bacteriologie en pluimveeziekten
Onderzoekers: • Patrick Butaye • An Martel
Optimalisatie van bestrijding van infecties met intestinale brachyspiren bij varkens Universiteit Gent Abstract: Brachyspira infecties worden in toenemende mate geassocieerd met darmaandoeningen bij varkens. Bestrijding van deze infecties is problematisch. In dit project zullen duurzame bestrijdingsmaatregelen ontwikkeld worden die moeten leiden tot een significante reductie van de hoeveelheden gebruikte antimicrobiële middelen Organisaties: • Vakgroep Pathologie, bacteriologie en pluimveeziekten
Onderzoekers: • Frank Pasmans
Biosurfing: New-to-nature biosurfactants door metabolic engineering: productie en toepassing Universiteit Gent Abstract: Het project beoogt de biotechnologische productie van new-to-nature en tailor-made glycolipide biosurfactantia. Het project wil tegen de achtergrond van een groeiende ecologische bewustwording het aanbod van interessante biologische surfactantia verbreden, verder modificeren en aanpassen aan de noden van de markt zodanig dat het toepassingsdomein van deze interessante moleculen verder uitgebreid kan worden. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Wim Soetaert • Bart Devreese
Thermofiele consortia voor stikstofverwijdering: transpositie van natuurlijke rijkdom naar biotechnologie Universiteit Gent Abstract: Dit onderzoek focust op de verwijdering van schadelijk ammonium uit afvalwater door conversie tot schadeloos stikstofgas, dat in de atmosfeer vrijkomt. Ten opzicht van de gevestigde mesofiele temperatuurscondities, wordt biotechnologie op thermofiele temperatuur verondersteld verschillende voordelen te hebben: hogere stabiliteit, snellere reacties, lagere slibproductie en betere hygiënisatie. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Nico Boon
Transitiemanagement van bacteriële en archaeale nitrificatie Universiteit Gent Abstract: Recent werd ontdekt dat naast ammonium-oxiderende bacteriën (AOB), ook ammonium-oxiderende archaea (AOA) een rol spelen in nitrificatie. Hoewel AOA eigenschappen bezitten waardoor ze beter geschikt zouden zijn voor bepaalde toepassingen dan de AOB, zijn deze nog niet onderzocht. In dit project zullen grenswaarden van de fysico-chemische AOA-promotoren/AOB-onderdrukkers worden geïndentificeerd om de transitie van bacteriële naar archaeale nitrificatie te verwezenlijken in een zandfilter. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Nico Boon
Identificatie en karakterisatie van tumor-initiërende cel in multipel myeloom. Vrije Universiteit Brussel Abstract: De hypothese van het kankerstamcel model is dat een kleine subpopulatie van de tumorcellen, de kankerstamcel, in staat is om nieuwe tumoren te vormen. Belangrijke eigenschappen van deze tumor-initiërende cel is dat deze zich kan vernieuwen en alle heterogene celtypes van de tumor kan vormen. Deze populatie zou resident zijn tegen huidige therapiën resulterend in herval van de patiënt. Verscheidene onderzoeker hebben de kankerstamcel hypothese onderzocht in de hematologische kanker, multipel myeloom (MM). deze kanker, gekarakteriseerd door groei van kwaadaardige cellen in het beenmerg, is opgebouwd uit een mix van minder gedifferentieerde B-cellen (CD138neg) tot plasmablast/plasmacellen (CD138pos). Het project bestaat uit de identificatie en karakterisatie van de MM stamcel in het syngeen en immuuncompetent 5TMM muismodel. Voor de identificatie van de tumorigene cel zal de clonogene en tumor-initiërende capaciteit van verschillende MM fracties worden onderzocht, maar zal er ook worden gekeken naar de overblijvende tumorcelpopulatie na behandeling van zieke muizen met chemotherapie. Vervolgens zullen de karakteristieken van de MM stamcel worden geanalyseerd gaande van homing capaciteiten, lokalisatie in het beenmerg, profileratie, celcyclus, zelfvernieuwing en resistentie tot een meer uitgebreid onderzoek van genexpressie met micro-
arrays en kinoom analyse met pepchips met als doel een gerichte therapie te ontwikkelen tegen deze kankerstamcel. Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • ELS VAN VALCKENBORGH
Ontrafeling van resistentie mechanismen in multiple myeloom cellen en de beenmerg micro-omgeving Vrije Universiteit Brussel Abstract: Het doel van dit project is om modellen te ontwikkelen om in in vivo verworven resistentie aan de nieuwe drugs bortezomib en lenalidomide te bestuderen. We zullen gebruik maken van de 5TMM muismodel met fluorescent (groene proteïnefluorescent), gelabelde 5T33MMvt muiscellen voor deze studies. Resistente cellen, ontwikkeld in de muis BM omgeving, worden gebruikt voor verdere omgeving interacties te onderzoeken, weerstand tegen andere drugs, om drugsweerstand mechanismen door gen expressie profilering te verhelderen en nieuwe therapeutische doelen te identificeren. Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • Karin VANDERKERKEN
PHARIN:Competenties voor apothekers in de biotechnologische industrie Vrije Universiteit Brussel Abstract: Phar-IN is een EU Erasmus Lifelong Learning project dat is ontstaan uit de vaststelling dat er een tijdskloof in verband met kennisoverdracht bestaat tussen de Europese farmaceutische industrie en de farmacie opleidingen en onderwijs. Die vaststelling werd onder meer gemaakt tijdens het afgelopen EU LLP project PHARMINE dat de inventaris maakte van het Europees farmacie onderwijs. Het farmacie onderwijs en de industrie werken met verschillende tijdschalen. Opleidingen op het niveau van hoger onderwijs worden vier of vijfjaarlijks gevalideerd door de nationale agentschappen en dus langzaam aangepast. In de industrie daarentegen zijn aanpassingen soms maar een kwestie van maanden om concurrentie het hoofd te bieden. Dat is vooral merkbaar in de Europese biotechnologische industrie die - alhoewel van wereldklasse - weinig of met vertraging onderwezen wordt aan de instellingen voor hoger onderwijs. Er zijn dus onderwijssystemen nodig die zich eveneens op korte tijd kunnen aanpassen en die op het juiste moment de juiste persoon met de juiste competenties creëren. De ontbrekende schakel voor een dergelijke ontwikkeling is een systeem waarbij onderwijsinstellingen regelmatige en snelle feedback van de industrie kunnen krijgen over wat ze moeten leren en hoe. Phar-IN wil een DELPHI instrument ontwikkelen voor feedback en geavanceerde cursussen voor biotechnologie produceren. Er wordt hierbij gefocust op biotechnologie omdat men van mening is dat dit onderzoeksdomein een belangrijk knelpunt is en mogelijk voor veelbelovende oplossingen kan zorgen voor de behandeling van ziekten als Alzheimer, chronisch hartfalen en andere resistente kwalen waar tot nu toe geen therapie voor bestaat. Het consortium bestaat uit zes partnergroepen en kan steunen op de jarenlange samenwerking tussen EAFP leden (European Association of Faculties of Pharmacie), J. Atkinson ere-voorzitter en director van Phar-IN, G. Ronsisvalle toenmalige vice-voorzitter, en K. De Paepe, exco member en coördinator van Phar_IN en EIPG (European Industrial Pharmacists Group), vertegenwoordigd door L. Martini en J. Nicholson. Organisaties: • Farmaceutische en Farmacologische Wetenschappen • Farmaceutische Biotechnologie en Moleculaire Biologie
Onderzoekers: • BARTHOLOMEUS ROMBAUT • KRISTIEN DE PAEPE
Getting more out wheat: revisiting wheat fractionation processes KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers: • Jan Delcour • Niels De Brier
Studie naar de specifieke rol van eiwit- en eigeelproteïnen in de cakebereiding KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers: • Jan Delcour • Kristof Brijs • Lomme Deleu
DNA damage-inducible genome plasticity and its contribution to bacterial adaptation KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers: • Abram Aertsen • Joachim Vandecraen
Selectie van een optimale microbiële startercultuur voor cacaofermentaties KU Leuven
Abstract: Dit doctoraatsproject heeft als doel het isoleren, selecteren en op natuurlijke wijze verbeteren van zowel Saccharomyces als nietSaccharomyces giststammen, met als doel een optimale microbiële startercultuur voor de productie van chocolade te ontwikkelen. De nadruk van het project ligt specifiek op een startercultuur die zorgt voor een efficiënte fermentatie waarbij tevens specifieke aromastoffen geproduceerd worden. Deze laten toe om speciale, hoogstaande chocolade te produceren. Daarom zal de fermentatie-efficiëntie en de aromaproductie van honderden verschillende gisten bepaald worden. Om deze karakteristieken verder te optimaliseren, worden de beste natuurlijke gisten verder geoptimaliseerd door kruising en evolutionaire engineering. In een derde fase worden gecontroleerde fermentaties op semi-industriële schaal uitgevoerd, waarna ookchocolade gemaakt wordt om het effect van de starterculturen te bepalen. Dit onderzoek vormt de basis voor nieuwe ontwikkelingen in de chocolade-indu Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Kevin Verstrepen • Esther Meersman
In search for new effective anti-Salmonella treatments using a systems biology approach KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Jozef Vanderleyden • Hans Steenackers • Anna Elizabeth Johanna Yssel
Process structure function relations of pectin in plant based food systems KU Leuven Abstract: Samenvatting onderzoek Recente studies tonen aan dat de biotoegankelijkheid van bepaalde nutriënten, en in het bijzonder van lipofiele micronutriënten, in levensmiddelen sterk beïnvloed worden door de microstructuur van het levensmiddelen die op zijn beurt sterk beïnvloed wordt door procesvoering (Parada & Aguilera, 2007). In fruit- en groentegebaseerde levensmiddelen zijn wijzigen in de microstructuur dikwijls gerelateerd aan wijzigingen in de structuur van pectine, een belangrijk polymeer aanwezig in de plantencelwand. Chemische en/of enzymatische wijzigingen in de pectinestructuur, die resulteren in wijzigingen van de structuur/textuurkwaliteit van fruit- en groentegebaseerde matrices, kunnen optreden tijdens procesvoering. Vermits lipofiele micronutriënten gelokaliseerd zijn binnenin de plantencel (en celorganellen), kunnen dergelijke wijzigen de biotoegankelijkheid van micronutriënten gunstig beïnvloeden (Parada & Aguilera, 2007). Om hoogkwalitatieve, verwerkte producten t Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers: • Marc Hendrickx • Zahra Jamsazzadeh Kermani
Opschaling van de hoogwaardige opzuivering van hydrofobine HFBII van Trichoderma reesei voor gebruik in koolzuurhoudende dranken: Gedrag van de hydrofobe patch KU Leuven Abstract: Hydrofobines zijn een familie van eiwitten met een laag moleculair gewicht die vier intra-moleculaire disulfide bruggen bevatten en voorzien zijn van een buitengewone hydrofobe patch. Onder typische omstandigheden kan deze patch interageren met gasvormig CO2 en in gecarbonateerde dranken zoals bier een sleutelrol in de vorming van stabiele CO2 nanobellen spelen; deze zijn dan omgeven door een elastisch membraan. Deze nanobellen liggen aan de basis van het fenomeen van primaire gushing in zulke dranken. Hydrofobines vertonen sterke oppervlakte-actieve eigenschappen en vinden mogelijke toepassingen in tal van wetenschappelijke en technologische domeinen. Zo kunnen ze gebruikt worden als biosurfactant en als stabilisator voor specifieke verbindingen zoals geur- en smaakstoffen in de aroma- en drankenindustrie en voor medicinale verbindingen in de farmaceutische industrie. De toepassing van deze eiwitten vereist echter hun grootschalige productie en zuivering. Afhankelijk van de aard v Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers: • Guy Derdelinckx • Mohammadreza Khalesi
Development of a molecular alternative for classical microbiological subtyping methods, Salmonella phage typing as a case study KU Leuven Abstract: Voor een up-to-date diagnostiek en surveillance van infectieziekten is het belangrijk om snel en efficiënt een subtypering van pathogenen te kunnen uitvoeren. Bovendien is het cruciaal om door vergelijking van verschillende pathogene stammen de link tussen voedsel (oorsprong)- en humaanisolaat aan te tonen om zo een uitbraak snel in te perken. De uitdagingligt echter in het vinden van een snelle, goedkope en voldoende discriminerende methode voor deze subtypering van pathogenen.Dit project beoogt de ontwikkeling van een alternatieve, moleculaire methode voor de (sub)typering van een pathogeen, waarbij Salmonella als case studygebruikt wordt. Salmonella enterica is de belangrijkste oorzaak van voedselvergiftiging. De huidige methoden voor subtypering van Salmonella zijn MLVA, PFGE en faagtypering. Geen enkele van deze technieken is echter ideaal. MLVA is een snelle methode, maar duur en slechts discriminerend voor een klein deel van de VTI (S. Typhimurium). PFGE is middelmatig discrimin Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Kathleen Marchal • N. N.
Characterization of the hydrophobic structure of hydrophobins KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers:
• Guy Derdelinckx • Christiaan Michiels • David Santiago Riveros Galan
Network-based eQTL analysis KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Quality Evolution during Ambient Storage of Heat Treated Orange / MangoJuice KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers: • Ann Van Loey • Wibowo Scheling
Inactivatie van bacteriële sporen door hoge druk in combinatie met antimicrobiële componenten KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Processing, food (micro)structure and physical functionality of mango-based juices KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers: • Ann Van Loey • N. N.
Identificatie van de eigenschappen en moleculaire mechanismen van de antivirale activiteit van nieuwe poliovirus replicatie remmers KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Johan Neyts • Aloys Tijsma
Donorleeftijd en versnelde veroudering van transplantnieren KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Laboratorium Nefrologie
Understanding the pathogenesis and clinical presentation of human T-lymphotropic virus 1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis in Peru using data mining techniques KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Klinische & Epidemiologische Virologie
Impact van genetische, epidemiologische en immunolgoische interacties op de persistentie van Puumala hantavirus in Myodes glareolus KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Klinische & Epidemiologische Virologie
Onderzoekers: • Marc Van Ranst • Piet Maes
• Lies Laenen
Onderzoek naar het verband tussen sfingolipiden, specifieke signaleringswegen en niet-coderende DNA-regio's in processen die leiden tot celdood, celgroei en stressresistentie in gist. KU Leuven Abstract: Het hoofddoel van het voorgestelde IOF mandaat is het ontrafelen van derol van (i) sfingolipiden en (ii) een DNA regio die gepostuleerd werd niet te coderen voor ORFs (open reading frames), in processen die leiden tot celdood, celgroei en stress-resistentie in gist. Deze informatie kandan immers gebruikt worden voor valorisatie in de domeinen van (i) controle van schimmelinfecties bij mens en dier, en (ii) controle van ziekten die gekarakteriseerd zijn door een verhoogde apoptose (zoals neurodegeneratieve ziekten) of door afwezigheid van apoptose (zoals in kanker). Hiertoe werd een samenwerking opgestart tussen CMPG-PFI (Prof. Cammue, promotor) en LFB (Prof. Winderickx, copromotor) met als doel het onderzoekop CMPG-PFI, gericht op de betrokkenheid van sfingolipiden bij celdood in gist, en het onderzoek op LFB, gericht op stressresistentie, nutirëntsignalering en groeicontrole in gist, samen te voegen. Het geplande onderzoek voor dit IOF mandaat zal zich toespitsen op (i) de identificat Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Joris Winderickx • Bruno Cammue • Karin Thevissen
Aminozuursignalering via de Gap1 transceptor in de gist Saccharomyces cerevisiae. KU Leuven Abstract: Recent werd aangetoond dat de gist Gap1 aminozuurtransporter ook een functie uitoefent als receptor voor aminozuurgeïnduceerde activatie van deprotein kinase A signaalweg. Deze signaalweg controleert vele eigenschappen die geconnecteerd zijn met fermentatieve groei en met stationaire fase. De signaleringsfunctie van de Gap1 transceptor is reeds goed gekarakteriseerd, maar specieke domeinen betrokken bij deze signalering alsookde stroomafwaarts gelegen signaalweg zijn nog grotendeels ongekend. In dit project zullen we gebruik maken van de recente vooruitgang in identificatie van Gap1-interagerende proteïnen om enerzijds domeinen betrokkenbij signalering te identificeren. Anderzijds zullen we zo een beter inzicht proberen te verwerven in de stroomafwaarts gelegen signaalweg. Hiervoor zullen we Gap1 transceptoren trachten te identificeren die verantwoordelijk zijn voor de Gap1-onafhankelijke signalering, alsook zullen we de identificatie bevestigen van door Gap1 getransporteerde aminozure Organisaties: • Afd. Molec. Microbiol. & Biotechnologie
Onderzoekers: • Johan Thevelein • Griet Van Zeebroeck
Ontwikkeling van een softarepakket voor het voorspellen van de microbiële houdbaarheid in verpakte, gekookte vleeswaren: een tool voor innovatie en productontwikkeling in de vleeswarensector. KU Leuven Abstract: Inzicht geven in de specifieke bederfproblematiek van gekookte vleeswaren en in de mate waarin verschillende intrinsieke factoren deze houdbaarheid beïnvloeden. Organisaties: • Afd. Chem. en Biochem. Procestechnol.
Onderzoekers: • Jan Van Impe
Ontwikkeling van krachtige selectieve antivirale geneesmiddelen tegen het hepatitis C virus. KU Leuven Abstract: Hepatitis C is een chronische infectie die geleidelijk aan kan leiden tot aftakeling van de leverfunctie of zelfs leverkanker. Momenteel kan infectie met het hepatitis C virus (HCV) enkel worden behandeld met de combinatie (gepegyleerd) interferon en ribavirine. Deze behandeling werkt echter niet bij alle patiënten en vertoont talrijke, ernstige nevenwerkingen. Er is dus dringend nood aan de ontwikkeling van krachtige en selectieve antivirale geneesmiddelen. Recent werden in onze onderzoeksgroep verschillende nieuwe moleculen geïdentificeerd met sterke antivirale activiteit tegen HCV. Na ontdekking van deze en andere nieuwe lead moleculen,wordt, in nauwe samenwerking met de betrokken medicinale scheikundige, een structuur-activiteits-relatie opgesteld met als doel nieuwe en nog veel krachtiger analogen te kunnen ontwikkelen. Vervolgens wordt het exacte werkingsmechanisme van deze producten ontrafeld en eventueel de weerkzaamheid in proefdiermodellen bestudeerd alvorens verdere ontwikke Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Pieter Leyssen • Johan Neyts
Bacterievretertje KU Leuven Abstract: Ontwikkelen van het product 'bacterievretertje' om de zelfredzaamheid van kinderen in het algemeen en in het bijzonder uit kwetsbare gezinnen op een speelse manier te stimuleren zodat ze op zelfstandige wijze komen tot gedragsverandering inzake handhygiëne. Organisaties: • Interfac. Centr. Biomed. Ethiek & Recht
Onderzoekers: • Bart Hansen
Milieu- en voedselreservoirs van antibiotica resistente organismen en de link met menselijke ziektes. Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds VLIR. UA levert aan VLIR de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)
Onderzoekers: • Herman Goossens • Surbhi Malhotra
De relatie tussen microbiële diversiteit en eigenheid van Vlaamse Oud Bruin bieren Universiteit Gent Abstract: De microbiotia in oud bruin fermentaties is grotendeels onbekend. Hierdoor is hun beschrijving en bescherming onmogelijk. Met dit onderzoek willen we de microbiota en de productkarakteristieken van deze bieren karakteriseren via nieuwe high-throughput benaderingen. Op basis van deze data zullen we generische en specifieke criteria van oud bruin bieren kunnen opstellen en tevens een tool voor kwaliteitsbeoordeling aanreiken. Organisaties: • Vakgroep Biochemie en Microbiologie
Onderzoekers: • Peter Vandamme
Eco-evolutionaire impact van endosymbionten op het dispersiegedrag van hun gastheer Universiteit Gent Abstract: Bacteriële endosymbionten manipuleren de verbreiding van hun gastheer via zowel proximatie als evolutionaire mechanismen. Door experimenten in artificiële metapopulaties met spintmijten te koppelen aan de ontwikkeling van individu gebaseerde modellen zullen inzichten verworven worden van het belang van eco-evolutionaire terugkoppelingsmechanismen voor het voortbestaan van herbivoor-parasiet populaties. Organisaties: • Vakgroep Biologie
Onderzoekers: • Dries Bonte
Onderzoek naar de moleculaire pathogenese van Chlamydophila psittaci Universiteit Gent Abstract: Het project wil meer inzicht verwerven in de bacteriële gastheercel interactie, met bijzondere aandacht voor de moleculaire pathogenese en herprogrammatie van de cel door de obligat intracellulaire bacterie. Hiervoor beschikken we over gekarakteriseerde stammen met gekende virulentieverschillen in vitro en in vivo. Organisaties: • Vakgroep Moleculaire biotechnologie
Onderzoekers: • Daisy Vanrompay
Ontwikkeling van een voedercomponent om jonge biggen te beschermen tegen speendiarree Universiteit Gent Abstract: Als een oplossing voor de herhaaldelijk voorkomende economische verliezen geïnduceerd door F4+ETEC gerelateerde diarree, hebben de aanvragers eerder aangetoond dat de oligoclonale mix van nieuwe monomere, dimere en secretorische lgAs-VHH-anti-F4+ETEC antilichamen, geproduceerd in de plant Arabidopsis, biggen beschermt tegen F4+ETEC infectie wanneer toegediend in varkensvoeder in een dosis van 20mg/varken/dag. Voor verdere valorisatie van deze positieve resultaten via de ontwikkeling van een voeder gericht op profylaxis tegen F4+ETEC, moet het ideale/werkzame formaat van VHH-lgA worden bepaald, dwz ofwel monomeer, dimeer of secretorisch lgA. Vervolgens zal het juiste platform voor kosteneffectieve bulkproductie bepaald worden dat ook moet voldoen aan de regulatorische wetgeving. Dit zal bereikt worden door de opeenvolgende uitvoering van de volgende doelstellingen. Organisaties: • Vakgroep Virologie, parasitologie en immunologie
Onderzoekers: • Eric Cox
Financiering: IOF-Proof of Concept: Klinische translatie van gentherapie voor hemofilie: conosolidatie van een spin-off bedrijf. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Hemofilie (ook wel bloederziekte genoemd) is een erfelijke stoornis in de bloedstolling. Het bloed kan niet goed stollen omdat een bepaalde stollingsfactor in het bloed ontbreekt. Er zijn twee typen hemofilie. Bij hemofilie A heeft de patiënt onvoldoende factor VIII; wanneer er te weinig factor IX is, spreken we van hemofilie B. Hemofilie komt vrijwel uitsluitend voor bij mannen omdat de productie van factor VIII en IX worden geregeld door een gen op het X-chromosoom. Vrouwen kunnen slechts drager zijn van de ziekte. Slechts in zeer zeldzame gevallen komt hemofilie ook bij vrouwen voor. Indien er sprake is van een tekort van een van de andere stollingsfactoren, hebben we het niet over hemofilie maar over een ander stollingsprobleem. Hemofilie is een tamelijk zeldzame ziekte, ongeveer 1 op de 10.000 mensen heeft hemofilie. Hemofilie A komt het meest voor (80%). Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • Thierry VANDENDRIESSCHE
Ontwikkelen van een platform voor de selectie en formulering van nasofaryngeale probotica. Universiteit Antwerpen Abstract: Probiotica zijn vooral gekend als voedingssupplementen die een positief effect kunnen hebben op de humane gezondheid door de microbiële balans in het darmsysteem te verbeteren. Infecties van neus en keel vertonen een gelijkaardig microbieel onevenwicht, maar hiervoor zijn probiotica nog maar weinig onderzocht. Locale sprays of tabletten met gecontroleerde vrijzetting en adhesie, en dan vooral met Lactobacillus species, zouden de bestaande therapie van deze infecties kunnen verbeteren. Organisaties: • Milieu Ecologie en Microbiologie (ENdEMIC)
Onderzoekers: • Sarah Lebeer • Filip Kiekens
De invloed van sigarettenrook op interacties tussen microbioom en darm: implicaties voor de Ziekte van Crohn Universiteit Gent Abstract: De ziekte van Crohn (CD) is een inflammatoire aandoening van de darmtractus. De meest prominente risicofactor voor ontwikkeling van CD is roken. Vanuit dit oogpunt zullen we de invloed van rookblootstelling op de immuunhomeostase in de darm en de interactie tussen het microbioom en de darmmucosa onderzoeken. Daarbij wensen we tevens de rol van roken op de ontwikkeling van intestinale inflammatie te ontrafelen.
Organisaties: • Vakgroep Pathologische anatomie
Onderzoekers: • Claude Cuvelier
Gedrag van pesticiden in wetland bufferzones: reactief transport en invloed van seizoensgebonden omgevingsveranderingen KU Leuven Abstract: Natte oeverzones worden toegepast als een mogelijk benadering om de afvloei van landbouwcontaminanten zoals nitraat naar het oppervlaktewater te reduceren. Wat betreft verwijdering van (matig sorberende) pesticiden in wetlands is er echter weinig kennis. Verwacht wordt dat hier voornamelijk biodegradatie een rol zal spelen en dat seizoensgebonden veranderingen in het milieu (droogte in de zomer of winterkoude) kunnen leiden totbelangrijke dynamieken in de populatiegrootte van pesticide afbrekende micro-organismen. Dit laatste kan een negatieve invloed hebben op de pesticide verwijderingsefficiëntie van het systeem. Huidige reactief transport modellen houden met dergelijke dynamieken geen rekening. Dit projectheeft als doel om de rol in de verwijdering van matig sorberende pesticiden te kwantificeren van enerzijds biodegradatie en anderzijds de dynamiek van pesticide afbrekende micro-organismen (als resultante van seizoensgebonden milieuveranderingen). Dit zal gedaan worden aan de hand Organisaties: • Afdeling Bodem- en Waterbeheer
Onderzoekers: • Jan Diels • Dirk Springael • Pieter Vandermeeren
Glycoproteins in probiotic bacteria: exploring the glycosylation potential of Lactobacillus rhamnosus GG (LGG) by genomics and glycoproteomics. KU Leuven Abstract: De grote diversiteit aan glycoconjugaten op de celwand van prokaryoten zijn van groot belang bij het mediëren van stamspecifieke interacties envormen een unieke barcode. De meeste studies van de glycobiologie van prokaryoten focussen op pathogenen. In dit project wordt het belang van glycosylatie bij het modelprobioticum Lactobacillus rhamnosus GG (LGG) onderzocht. Een systematische aanpak via genoom-, structuur- en glycoproteoomanalyses van de glycoproteïnen van LGG tracht duidelijkheid te brengen rond glycosylatieprocessen van proteïnen in probiotica. Enkele interessante glycosyltransferases zullen geselecteerd worden en hiervan zullen knock-out mutanten worden gemaakt. Deze mutanten zullen breed gekarakteriseerd worden, met een speciale focus op een doorgedreven glycoproteoomanalyse om de substraten van de glycosyltransferases te ontdekken. Door het effect van de mutanten te vergelijken met wild type LGG kan de rol van de bijhorende glycoproteïnen in de gunstige interactinbsp;es van Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Jozef Vanderleyden • Joris Winderickx • Hanne Tytgat
Biologie en ecologie van bacteriële en fungale biofilmen bij de mens. KU Leuven Abstract: De algemene doelstelling van deze onderzoeksgemeenschap is om het ontstaan en de structuur van bacteriële en fungale biofilmen bij de mens beter te begrijpen zodat er op termijn doeltreffende kan tegen opgetreden worden. De vorming van een biofilm gebeurt in verschillende stappen waarbij eerst cellen zich vasthechten op een substraat. Naast adhesie aan het substraat zijn ook cel-cel interacties (in het geval van polymicrobiële biofilmen is dit tussen cellen van verschillende microbiële species) belangrijk voor de ontwikkeling, structuur en de activiteit van een biofilm. Naast celwand gerelateerde componenten is microbiële communicatie (quorum sensing) hierbij essentieel. Een belangrijk onderzoekstopic zal dan ook het bestuderen van cel-cel interacties in biofilmen zijn. Een ander belangrijk onderzoekstopic in het netwerk behandelt de vraag naar de onderliggende mechanismen van de sterk verhoogde resistentie van cellen aanwezig in een biofilm tegenover antimicrobiële producten. De vraag Organisaties: • Afd. Molec. Microbiol. & Biotechnologie
Onderzoekers: • Patrick Van Dijck
Network-based intergration strategy to leverage dedicated analysis withpublic knowledge KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Kathleen Marchal • Dries De Maeyer
Systeem- en synthetische biologie: synthetische cellulaire systemen. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Kathleen Marchal
Kinetische beschrijving van de vorming van procesgeïnduceerde contaminanten in plantgebaseerde levensmiddelen. KU Leuven Abstract: Door langzaam verschuivende consumentenverwachtingen en nieuwe technologische ontwikkelingen zijn de levensmiddelenindustrie en onderzoekers steeds op zoek naar nieuwe mogelijke manieren voor de behandeling van levensmiddelen. Deze innovatieve behandelingstechnieken kunnen echter geen echte alternatieven betekenen zolang hun effecten op zowel de veiligheid als de kwaliteit van levensmiddelen voldoende zijn aangetoond.Het doel van dit project is om op een kwantitatieve manier de vorming van procesgeïnduceerde contaminanten te beschrijven in plantgebaseerde levensmiddelen. Afhankelijk van het type en de intensiteit van de toegepaste behandelingstechniek kan de vorming van bepaalde componenten immers leiden tot serieuze gezondheidsrisico's en aanzienlijke
kwaliteitsverliezen. Eenmathematisch model dat de vorming van zulke componenten beschrijft in functie van de procesparameters kan een hulpmiddel zijn voor de levensmiddelenindustrie bij problemen van procesontwerp en -optimalisatie. Organisaties: • Centr. Levensmidd.- & Microb. Technol.
Onderzoekers: • Ann Van Loey • Tara Grauwet • Stijn Palmers
Genoom-wijde analyse van de stress respons bij bakkersgist opgegroeid in het ruimtestation ISS. KU Leuven Abstract: In dit door ESA gesteund onderzoeksproject zullen we het gedrag van gistcellen in de ruimte onderzoeken na een hitte of osmoshock. Verschillende partners dragen bij aan dit onderzoek en onze taak is om na te gaan wat de reactie is van de gistcellen op microgravity na een hitteschok of na een osmotische schok. Zowel genomics als transcriptomics analyse zal worden uitgevoerd. We zullen ook kijken naar celbiologische processen en naar het effect op flocculatie. Organisaties: • Afd. Molec. Microbiol. & Biotechnologie
Onderzoekers: • Patrick Van Dijck
Microben met een geheugen - ontrafeling van hysteresis in biologische regulatienetwerken. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Jan Michiels • Kevin Verstrepen • Abram Aertsen
Karakterisering van het primase DnaG van Staphylococcus aureus, een potentieel doelwit voor nieuwe antibiotica. KU Leuven Abstract: De toenemende resistentie van bacteriën voor antibiotica is een grote uitdaging voor de gezondheidszorg. Infecties veroorzaakt door (multi)resistente pathogenen veroorzaken nog steeds ernstig ziekteleed en sterfte. Een groot deel van deze bacteriële infecties wordt veroorzaakt door methicilline-resistente vormen van Staphylococcus aureus (S. aureus) (MRSA). Ondanks de grote impact op de volksgezondheid zijn er de laatste jaren weinig nieuwe antibiotica op de markt gekomen. In ditproject zullen we daarom het primase DnaG van S. aureus beschouwenals een mogelijk doelwit waartegen nieuwe antibiotica kunnen worden ontwikkeld. Omdat de zoektocht naar het moleculair doelwit bij de whole-cell screening-methode in het antibiotica-onderzoek erg moeilijk is, en omdat langs de andere kant veel hits die via de high-throughput screeningmethode (HTS) worden gevonden geen antibacteriële activiteit hebben, zullen we in het eerste deel van dit project een DnaG-knockdownstam aanmaken waarbij genomisch Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Johan Van Lint • Kenneth Segers • Mathias Cobbaut
De genetische traceerbaarheid van virale pathogenen KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Klinische & Epidemiologische Virologie
Onderzoekers: • Philippe Lemey • Nídia Sequeira Trovão
Single molecule analyse van LEDGF/p75-chromatine interactie en de rol in de pathogenese van AIDS en leukemie. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Moleculaire Virologie en Gentherapie
Onderzoekers: • Zeger Debyser • Steven De Feyter
Nieuwe strategieën voor de ontwikkeling van flavivirus remmers via interventie ter hoogte van de virale RNA promotor. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Laboratorium Virologie en Chemotherapie
Onderzoekers: • Johan Neyts • Kai Henrik Dallmeier
Gastroenteritis in rotavirus vaccinated infants in Belgium and Vietnam:the effect of maternal antibodies through breastfeading and the identification of (new) pathogens. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties:
• Klinische & Epidemiologische Virologie
Onderzoekers: • Marc Van Ranst
Nucleaire import van HIV als doelwit voor nieuwe antiretrovirale therapie KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Moleculaire Virologie en Gentherapie
Biologie en ecologie van bacteriële en fungale biofilmen bij de mens. Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk OnderzoekVlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel. Organisaties: • Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)
Onderzoekers: • Paul F R C M Cos
Dynamiek en mechanismen van paromomycine en miltefosine resistentie in de protozoaire parasiet Leishmania. Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk OnderzoekVlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel. Organisaties: • Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)
Onderzoekers: • Louis Maes • Paul F R C M Cos
Karakteriseren van gastheer-pathogeen interacties en biofilmvorming bij patiënten met ventilator-geassocieerde pneumonie. Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk OnderzoekVlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)
Onderzoekers: • Samir Kumar-Singh • Herman Goossens • Surbhi Malhotra
Inductie van breed-potente Hiv-1 suppressieve immuun responsen door dendritische cellen opgeladen met gag mRNA. Universiteit Antwerpen Abstract: Recent onderzoek heeft aangetoond dat een therapeutische vaccinatie met dendritische cellen (DC), opgeladen met mRNA coderend voor subtype B consensus Gag of chimeer Tat-Rev-Nef, in Hiv-1 geïnfecteerde patiënten veilig is. De vaccinatie gaf aanleiding tot een toename van de antivirale cellulaire immuun responsen. Het doel van dit project is de DC vaccinatie verder te optimaliseren door gebruik te maken van: - Een meer stabiel mRNA, - Een antigen dat immuunresponsen opwekt tegen verschillende varianten wereldwijd, - Costimulatoire signalen om de immunogeniciteit van de DC verder te verhogen. Organisaties: • Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)
Onderzoekers: • Guido Vanham • Lotte Bracke
Rol van bacteriële biofilms als oorzaak van therapeutisch falen in intensieve zorgeenheden: in vitro en in vivo studie van 'biofilm' virulentiefactoren. Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds IWT. UA levert aan IWT de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract. Organisaties: • Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)
Onderzoekers: • Louis Maes • Marian Van kerckhoven
Kwantitatieve real-time PCR voor analyse van polyhydroxyalkanoaat (PHA)-producerende micro-organismen in actief slib Universiteit Antwerpen Abstract: Productie van poly-3-hydroxyalkanoaat (PHA) bioplastic door actief slib is een veelbelovende strategie voor de valorisatie van afvalwater, die tegelijkertijd voor een reductie kan zorgen van de nog te hoge productiekosten van PHAs. Het doel van dit project is de ontwikkeling van een snel en betrouwbaar kwantitatieve PCR assay voor routinematige analyse van PHA-producerende micro-organismen in actief slib. Organisaties: • Biochemische ingenieurstechnieken (BIT)
Onderzoekers: • Sarah Lebeer • Jolien D'aes
Modelleren van microbiële groei tijdens solid state fermentatie Universiteit Antwerpen Abstract: Ondanks goede prestaties van solid state fermentatie (SSF) op laboschaal, bezit het proces op industriële schaal een aantal nadelen zoals slechte warmteoverdracht en moeilijke pH-regeling. Knelpunt is het gebrek aan informatie over de microbiële kinetiek in SSF als gevolg van de heterogene aard en complexiteit. Dit project beoogt het modelleren van groeikinetiek van Monascus op rijst op basis van experimenten in een computergestuurde SSF-reactor. Organisaties: • Biochemische ingenieurstechnieken (BIT)
Onderzoekers: • Sandra Apers • Paul F R C M Cos • Iris Cornet
Gastro-enteritis bij zuigelingen ingeënt tegen rotavirus in België en Vietnam: het effect van maternale antistoffen via borstvoeding en de identificatie van (nieuwe) pathogenen. Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk OnderzoekVlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)
Onderzoekers: • Pierre Van Damme • Elke Leuridan
Toepassing van sequentie-gebaseerde methoden ter verkenning van schimmel- en protistgemeenschappen in bodems. Universiteit Antwerpen Abstract: De schimmel- en protistgemeenschappen die in de bodem leven zijn belangrijk voor verschillende ecosystem functies, zoals de intern recyclen van nutrienten. Dit project zal nieuwe DNA-amplicon sequencing methoden voor de profileren van bodem microbiele gemenschappen optimiseren. Deze protocols zal toegepast worden om een verband te leggen tussen de samenstelling van bodem microbiele gemeenschappen en milieuomstandigheden. Organisaties: • Planten- en vegetatie-ecologie (PLECO)
Onderzoekers: • James Weedon
Het potentieel van exopolysacchariden en glycoproteïnen van lactobacillen als veilige vaccinadjuvantia. Universiteit Antwerpen Abstract: Tijdens de zoektocht naar nieuwe adjuvantia op basis van liganden van receptoren van het aangeboren immuunsysteem is gebleken dat de gewenste immunostimulatie vaak gepaard gaat met toxiciteit. Deze liganden, ook wel 'microbe-associated molecular patterns' of MAMPs genoemd, komen ook voor op het oppervlak van lactobacillen met een 'generally recognized as safe'-status. Verschillende studies hebben al aangetoond dat bepaalde lactobacillen en hun oppervlaktemoleculen specifieke effecten op het immuunsysteem van de gastheer uitoefenen. Het potentieel van lactobacillen en hun MAMPs zoals exopolysacchariden (EPSs) en glycoproteïnen als veilige en effectieve vaccinadjuvantia moet nog verder onderzocht worden. Hiertoe bestaat het project uit drie belangrijke doelstellingen: eerst zullen de moleculaire interacties tussen de EPSs en glycoproteïnen van probiotische stammen met receptoren zoals Toll-like receptoren en C-lectine receptoren in kaart gebracht worden, daarna zal de in vitro immuunrespons van deze moleculen in immunologisch belangrijke cellen bestudeerd worden. Tenslotte zal hun potentieel als vaccinadjuvans gevalideerd worden in een muismodel. Organisaties: • Milieu Ecologie en Microbiologie (ENdEMIC)
Onderzoekers: • Sarah Lebeer • Peter Delputte
Evolutie van de influenza A virus quasispecies in de naïeve en immune gastheer Universiteit Gent Abstract: De invloed van het cellulaire en humorale adaptieve immuunantwoord op de genetische stabiliteit van influenza A virussen zal worden onderzocht. De immuunselectiedruk door conventionele en nieuwe experimentele influenzavaccins zal worden vergeleken Organisaties: • Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie
Onderzoekers: • Xavier Saelens
De rol van oxidatieve stress tolerantie in de antibioticum resistentie van biofilms gevormd door Gram-negatieve bacteriën Universiteit Gent Abstract: De rol van oxidatieve stress tolerantie in de antibioticum resistentie van biofilms gevormd door Gram-negatieve bacteriën. Organisaties: • Vakgroep Farmaceutische analyse
Onderzoekers: • Tom Coenye
De rol van fotoheterotrofe en chemoautotrofe prokaryoten in het microbieel voedselweb in terrestrisch Antarctica: cultivering in combinatie met functionele analyse Universiteit Gent Abstract: We zullen de diversiteit bestuderen van belangrijke genen in mechanismen voor CO2 fixatie en voor het gebruik van zonneenergie bij bacteriën. Een grootschalige isolatiecampagne zal gebeuren uit een selectie van terrestrische Antarctische stalen om bacteriële culturen te bekomen die deze alternatieve mechanismen bevatten en om deze te gebruiken voor het testen van hypothesen over hun rol in de gemeenschap. Organisaties: • Vakgroep Biochemie en Microbiologie
Onderzoekers:
• Paul De Vos • Geert Huys • Anne Willems • Kim Heylen
MINSPEC-PRO Universiteit Gent Abstract: Het project heeft tot doel om de bacterie gastheercel interactie van Chlamydia psittaci te bestuderen Organisaties: • Vakgroep Moleculaire biotechnologie
Onderzoekers: • Daisy Vanrompay
Het mechanisme van cortisol geïnduceerde proliferatie van Salmonella Typhimurium in varkensmacrofagen Universiteit Gent Abstract: Salmonella infecties bij varkens kunnen onder invloed van stress terug opflakkeren. Dit is geassocieerd met een onder invloed van cortisol verhoogde proliferatie van de bacterie in de macrofagen. In dit project wordt het onderliggende mechanisme onderzocht. Organisaties: • Vakgroep Pathologie, bacteriologie en pluimveeziekten
Onderzoekers: • Freddy Haesebrouck • Frank Pasmans
Kwantificatie en moleculaire differentiatie van Campylobacter in de productieketen van braadkippen om interventies te definiëren met als doel een daling in het aantal humane campylobacteriosen te bekomen Universiteit Gent Abstract: Ontwikkeling van een kwantitatieve RT-PCR voor de telling van Campylobacter op pluimveevlees. Kwantificatie van de Campylobacter contaminatie tijdens het slachten en versnijden van braadkipkarkassen afkomstig van positieve en negatieve tomen en onderzoek naar risicofactoren die het contaminatieniveau beïnvloeden. Formuleren van interventiemaatregelen ter beheersing van deze contaminatie en schatting van de te verwachten reductie in de Campylobacter blootstelling voor de consument. Organisaties: • Vakgroep Veterinaire volksgezondheid en voedselveiligheid • Vakgroep Voedselveiligheid en Voedselkwaliteit
Onderzoekers: • Lieven De Zutter • Mieke Uyttendaele
Flow Cytometrische fingerprinting voor microbiele kwaliteitsborging Universiteit Gent Abstract: IWT/SB-lichting 2014 IWT/SB/Benjamin Buysschaert/131370 Flow Cytometrische fingerprinting voor microbiele kwaliteitsborging Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Nico Boon
Een genetische benadering voor de studie van Notch signalisatie in normale en maligne hematopoëse bij de mens Universiteit Gent Abstract: IWT/SB-lichting 2014 IWT/SB/Dolens Anne-Catherine/131203 Een genetische benadering voor de studie van Notch signalisatie in normale en maligne hematopoëse bij de mens Organisaties: • Vakgroep Klinische biologie, microbiologie en immunologie
Onderzoekers: • Tom Taghon
Starmerella bombicola als platform organisme voor de productie van op maat gemaakte bio-surfactants Universiteit Gent Abstract: IWT innovatiemandaat 130867 Sophie Roelants: niet beschikbaar Starmerella bombicola as a platform organism for the production of tailor-made bio-surfactants Het doel van het Project is om een portfolio van giststammen te ontwikkelen die nieuwe bio-surfactanten produceren met voldoende selectiviteit (uniforme producten) en productiviteit (Fase I) om de structurele verscheidenheid van vermarktbare bio-surfactanten uit te breiden. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Wim Soetaert
Gist Bioreactor : Netwerk biologie van stress reacties en cel flocculatie van Saccharomyces cerevisiae gekweekt in een continue bioreactor in microzwaartekracht voorwaarden Universiteit Gent Abstract: niet beschikbaar Organisaties: • Vakgroep Biochemie en Microbiologie
Onderzoekers:
• Bart Devreese
Nieuwe antibacteriële geneesmiddelen actief tegen DNAPol III Universiteit Gent Abstract: niet beschikbaar Organisaties: • Vakgroep Organische chemie (WE)
Onderzoekers: • Johan Van der Eycken
Microbial Resource Research Infrastructure Universiteit Gent Abstract: niet beschikbaar Organisaties: • Vakgroep Biochemie en Microbiologie
Onderzoekers: • Paul De Vos • Peter Dawyndt
Ontwikkeling van aanpasbare geattenueerde en vectorvaccins ter bescherming tegen het porcien reproductief en respiratoir syndroom (PRRS), essentieel voor een succesvolle bestrijding Universiteit Gent Abstract: Het porcien reproductief en respiratoir syndroom virus (PRRSV) is momenteel moeilijk te controleren met de huidig geregistreerde vaccins. De geïnactiveerde vaccins induceren geen beschermende immuniteit. Ze kunnen enkel een boost-reactie geven bij immune dieren wanneer de stam in het vaccin genetisch overeenkomt met de circulerende stam. De geattenueerde vaccins hebben in de negentiger jaren een zeer goede bescherming gegeven. Het laatste decennium is de werkzaamheid sterk achteruit gegaan door het genetisch en antigenisch wegdrijven van de circulerende virussen. In het laboratorium van de promoter van dit projectvoorstel is recent een aanpasbaar geïnactiveerd vaccin ontwikkeld waarvan recent de werking in het veld werd aangetoond. Dit nieuw geïnactiveerd vaccin zal gebruikt worden om de bestaande immuniteit te boosten bij zeugen. Met het huidig onderzoek zal een aanpasbaar geattenueerd en/of vectorvaccin ontwikkeld worden dat kan gebruikt worden bij naïeve dieren (gelten en mestbiggen). Wildtype virus zal geattenueerd worden door passages op twee cellijnen die in het laboratorium van de promotor werden ontwikkeld: PK15 en ch0. Door een ingenieus selectiesysteem (verminderde vermeerdering in macrofagen maar normale vermeerdering in cellijnen) zal de attenuatie in vitro gevolgd worden. De mutanten die goed groeien in celculturen maar niet in macrofagen zullen verder in vivo getest worden op hun veiligheid en werkzaamheid (inductie van neutraliserende antistoffen en reductie viremie). Daarnaast zal het Barthavaccin gebruikt worden als vector voor het tot expressie brengen van de extodomeinen van GP2, GP3 en GP4 van PRRSV die onder regulatie staan van bepaalde eiwitten van het Barthavirus (gC, gC, tegumeneiwit...). De recombinante Barthavirussen zullen vervolgens in vivo uitgetest worden. De intramusculaire vaccinatie zal vergeleken worden met intranasale en perorale vaccinatie. Organisaties: • Vakgroep Virologie, parasitologie en immunologie
Onderzoekers: • Hans Nauwynck
De ontwikkeling van preklinische modellen voor de evaluatie van combinatietherapieën met als doel het verbeteren van de werking van dendritische cell-gebaseerde immuuntherapie Vrije Universiteit Brussel Abstract: Melanoom is een aggressieve vorm van huidkanker met een hoge incidentie en mortaliteit. Enkel volledige chirurgische verwijdering in een vroeg stadium is genezend. Vanaf het moment dat de kanker zich verspreid heeft naar andere delen van het lichaam, is de kans op compleet herstel klein. Twee nieuwe strategieën staan onder ontwikkeling voor de behandeling van malign melanoom: immuuntherapie en molecule-gerichte therapieën. Wij hebben reeds een uitgebreide expertise in de ontwikkeling van autologe vaccins gebaseerd op dendritische cellen (DCs). Op dit ogenblik coelectroporeren wij DCs met een TriMix van costimulatoire molecules en een tumor geassocieerd antigen. Hoewel we vaak antigen-specifieke T cellen observeren, zien we zelden klinische responsen. Dit is waarchijnlijk te wijten aan het feit dat de geïnduceerde T cellen niet in staat zijn om de T cel tolerantie in het tumor milieu te doorbreken. Er wordt algemeen aanvaard dat de combinatie van DC-gebaseerde immuuntherapie met molecule-gerichte therapie kan leiden tot T cel gemedieerde tumor rejectie. Maar het is nog niet duidelijk hoe deze twee modaliteiten best geïntegreerd worden. Met dit project wensen we dit te onderzoeken, zowel door middel van in vitro humane modellen, als in vivo muis modellen. Verder zal dit onderzoek ook leiden tot een beter begrip van de tumo-biologie en -immunologie. Organisaties: • Immunologie en Microbiologie • Fysiologie
Onderzoekers: • Bart NEYNS • Aude BONEHILL
Interpretatie - in vitro en in vivo - van het gebruik van nieuwe combinaties van geneesmiddelen in multiple myeloma Vrije Universiteit Brussel Abstract: Multipel myeloom (MM) is een B-cel maligniteit die gelokaliseerd isin het beenmerg (BM). Hier ontvangen de MM-cellen signalen om te overleven, groeien en ontsnappen aan drug-geïnduceerde celdood. De implementatie van medicijnen die deze interacties targeten hebben de alghele overleving van MM patienten reeds aanzienlijk verbeterd. Desalnietemin hervallen de meeste patiënten nog steeds en is er dus nood aan nieuwe thearpeutische doelwitten en therapeutische benaderingen. In het huidige project zullen we twee nieuwe combinaties van geneesmiddelen uittesten. Deze combinaties worden geselecteerd op basis van een hoge waarschijnlijkheid van synergie tussen de geneesmiddelen en we zullen hiervoor gebruik maken van zowel humane MM cellen en het 5T33MM muismodel. In een tweede stap, zullen we dan proberen om de onderliggende mechanismen van de potentiële synergetische anti-MM-activiteit te ontrafelen en dit zowel in vitro als in vivo, waar de MM cellen beschermd worden door het BM micromilieu. Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • Karin VANDERKERKEN • Elke DE BRUYNE
ontwikkeling van een multidisciplinair platform om nieuw preventieve en therapeutische strategieën te ontwikkelen tegen orale mucositis Universiteit Gent Abstract: Orale mucositis is een veel voorkomende aandoening die heel wat kankerpatiënten treft tijdens en na een irradiatie of chematherapeutische behandeling. Dit veroorzaakt secundaire infecties en verlaagt de genezingskansen. In dit onderzoek wordt het belang van de orale microbiota in de ontwikkeling en preventie en bestrijding van mucositis onderzocht. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Tom Van de Wiele
Rol en positie van de verzekeringsarts in Europa en de bijbehorende opleiding. Een systematisch vergelijkend onderzoek KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Omgeving en Gezondheid
Onderzoekers: • Karel Hoppenbrouwers • Annette Elisabeth de Wind
Ecologie van het Lassa virus en het aanverwante arenavirus in de natuurlijke gastheer Mastomys natalensis. Universiteit Antwerpen Abstract: Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds DFG. UA levert aan DFG de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract. Organisaties: • Evolutionaire ecologie (EVECO)
Onderzoekers: • Herwig Leirs
Assessing the role of the follicular regulatory T cell in controlling autoantibody production during arthritis and lupus. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Labo Genetica van Auto-immuniteit
Onderzoekers: • Patrick Matthys • Adrian Liston • Annemarie van Nieuwenhuijze
Ontwikkeling van een 'Rapid Point-of-Care testplatform' voor infectieziekten (RAPP-ID). Universiteit Antwerpen Abstract: RAPP-ID is een 5 jaar durend Europees project met 10 academische en 9 industriële partners (4 KMO's en 5 grote farmaceutische ondernemingen) dat ondersteund wordt door de Europese Commissie via IMI-JU financiering. Dit project heeft als doel een testplatform te ontwikkelen dat een snelle diagnose van de aanwezigheid en de oorzaak van een bacteriële, virale of fungale infectie kan bewerkstelligen. Bovendien zal bijkomende informatie worden bekomen over de resistentie tegen antibiotica in geval van een bacteriële infectie. In tegenstelling tot de huidige diagnostische testen, die enkele dagen kunnen duren, zal een snelle diagnostische test (in de ziekenhuissetting binnen de 2 uur en bij de huisarts binnen een half uur) leiden tot een gerichte behandeling en correcter gebruik van antibiotica. Hiertoe worden binnen RAPP-ID de modernste biotechnologische en biochemische technieken gecombineerd met ultragevoelige detectie-technologieën. RAPP-ID focust op bloedstroominfecties, lage luchtweginfecties en tuberculose. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)
Onderzoekers: • Herman Goossens
PHAR-QA: Quality Assurance in PHARmacy Educationand training in Europe. Vrije Universiteit Brussel Abstract: Phar-QA (Quality assurance in European pharmacy education and training) is een EU Erasmus Lifelong Learning project met betrekking tot de vernieuwing van de Europese farmacie opleidingen. Het project is een uitbreiding van het afgelopen PHARMINE project (Pharmacy Education in Europe) dat een inventaris maakte van de opleiding. Phar-QA betreft de ontwikkeling van een competentiekader van alle farmaceutische activiteiten uitgeoefend door een apotheker. Daarnaast wordt eveneens een gedegen systeem uitgewerkt voor de noodzakelijke kwaliteitsgarantie van deze competenties. Phar-QA wil een systeem van kwaliteitsverzekering realiseren zodat alle Europese instellingen voor hoger farmacie onderwijs gekwalificeerde vakmensen voortbrengen die efficiënt kunnen werken in een Europees regelgevend kader dat onafhankelijk is van de instelling. Bovendien wil het de competenties definiëren die overeenstemmen met de huidige trends inzake: * Reorganisatie van de universiteiten naar een Europees kader voor hoger onderwijs met betrekking tot de Bologna principes en - onder meer aanpassing van de Bachelor en Master cursussen; * De economische aspecten en organisatie van de officina-apothekers en ziekenhuisapothekers die een belangrijke rol spelen in het stroomlijnen van de Europese systemen voor gezondheidszorg; * Vooruitgang in de farmaceutische biotechnologische industrie van innovatieve geneesmiddelen naar behandelingen van biomedische oorsprong, geproduceerd door kleine en middelgrote ondernemingen. De rode draad doorheen dit project is patiëntveiligheid. Dit is de primordiale zorg van de apotheker zowel in de dagelijkse praktijk van de openbare en ziekenhuisapotheken, als in de industrie of tijdens de research. Steeds staat de ontwikkeling en productie van efficiënte en veilige geneesmiddelen voorop. De uiteindelijke belanghebbende van het Phar-QA-project is dan ook de Europese bevolking. Phar-QA is een consortium van universiteiten die het voortouw nemen in het onderzoek naar onderwijsvernieuwing in de farmacie opleidingen. Het wordt gecoördineerd door het Farmaceutisch Instituut van de Vrije Universiteit Brussel onder het coördinatorschap van Prof. Kristien De Paepe en Prof. Jeffrey Atkinson (Pharmacolor Consultants, Nancy, Frankrijk) als director; en dit met medewerking van: * Universiteit van Granada, Spanje * Kapodistrias Universiteit van Athene, Griekenland
* * * * *
Universiteit van Tartu, Estland Universiteit van Helsinki, Finland Universiteit van Ljubljana, Slovenië Jagiellonian Universiteit van Krakau, Polen Medical and Pharmaceutical University Carol Davila van Boekarest, Roemenië
Phar-QA zal ook nauw samenwerken met de European Association of Faculties of Pharmacy (EAFP) en andere Europese organisaties. Bovendien beschikt Phar-QA over een internationale adviesraad met deskundigen inzake kwaliteitsverzekering uit België, Frankrijk, het Verenigd Koninkrijk, Spanje en de Verenigde Staten. De resultaten van het project zullen verspreid worden onder meer dan 200 Europese instellingen voor hoger onderwijs; opleiding en gezondheidszorg instellingen van de verschillende nationale regeringen; EU-DG's en de beroepsorganisaties van apothekers. De Phar-QA bevindingen zullen ook ter beschikking zijn van: * Studenten en medewerkers van de farmaceutische faculteiten; * EU-apothekers (officina-apothekers, ziekenhuisapothers, industrie apothekers en anderen); * Nationale en Europese gezondheidszorg gespecialiseerde groepen; * De leden van de Europese farmaceutische, biotechnologische, chemische, agrarische (vooral farmaceutische voedingswetenschappen) industrieën. Informatie zal ook worden verstrekt aan geïnteresseerde niet-Europese landen die het consortium wensen te volgen en eventueel het Phar-QA competentiekader willen toepassen. Organisaties: • Farmaceutische en Farmacologische Wetenschappen • Farmaceutische Biotechnologie en Moleculaire Biologie
Onderzoekers: • BARTHOLOMEUS ROMBAUT • KRISTIEN DE PAEPE
Antimicrobiële resistentie - impact van kruisbesmetting van diervoeders met antimicrobiële middelen op de resistentieontwikkeling. Universiteit Gent Abstract: Kruiscontaminatie van voeders met antibiotica vormen mogelijk een niet gewilde slectiedruk voor antibioticum resistentie. Er is evenwel weinig tot geen literatuur beschikbaar in verband met het effect van lage dosissen antibiotica op resistentie selectie. De hoofdvraag is of deze lage dosissen een effect hebben op de selectie van resistente kiemen in de darm en de overdracht van resistentie tussen kiemen verhogen. De antwoorden op de volgende onderzoeksvragen zullen hiertoe bijdragen: 1. De resistentieselectie wordt voornamelijk ter hoogte van de darm verwacht. Vandaar dat men in de eerste plaats moet bepalen wat de concentratie van het betreffende antibioticum bij een versleping van 3% in de darm is. 2. Een tweede grote vraag is of voor alle kiemen de resistentie selectie even groot is alsook voor de verschillende resistentie genen de overdracht van resistentie genen tussen kiemen verhoogd. 3. Tenslotte wordt aan de hand van een risico analyse model en gebasseerd op de bekomen data in de verschillende studies nagegaan wat de impact is van de versleping op de resistenieontwikkeling op dierpopulatieniveau. Organisaties: • Vakgroep Farmacologie, Toxicologie en Biochemie • Vakgroep Verloskunde, voortplanting en bedrijfsdiergeneeskunde
Onderzoekers: • Siska Croubels • Jeroen Dewulf
Een beter begrip van de immuun-afweermechanismen van Mycobacterium bovis Bacille Calmette Guerin (M. bovis BCG) om een echt beschermend tuberculose (TB)-vaccin te genereren. Universiteit Gent Abstract: We bestuderen het immunomodulatorische werkingsmechanisme van een fosfatase gesecreteerd door pathogene Mycobacteria, en de geattenueerde vaccin-stam M. bovis BCG. Uitschakeling ervan in BCG leidt tot een vaccin dat in proefdieren aanleiding geeft tot verlengde protectie tegen lethale TB infectie. Deze mutatie zal ook gecombineerd worden met verdere BCG-verbeterende manipulaties om synergisme na te gaan naar een sterk verbeterd TB vaccin. Organisaties: • Vakgroep Biochemie en Microbiologie
Onderzoekers: • Nico Callewaert
De associatie van de voedselpathogeen Campylobacter jejuni met vrijlevende protozoa: het ontrafelen van celbiologische en moleculaire mechanismen betrokken bij hun interactie. Universiteit Gent Abstract: Campylaobacter jejuni associeert met vrijlevende protozoa, waardoor overleving onder ongunstige condities, verspreiding in de omgeving en introductie in nieuwe leefmilieus vergemakkelijkt wordt. In dit project worden celbiologische en moleculair-genomische technieken gebruikt om interactiemechanismen tussen C. jejuni en de modelprotozoa Acanthamoeba te ontrafelen. De invloed van de passage door protozoa op het genetische profiel en de virulentie van Campylobacter worden onderzocht. Organisaties: • Vakgroep Veterinaire volksgezondheid en voedselveiligheid
Onderzoekers: • Kurt Houf
Het effect van omgevingsstress op lineage sorting en de populatie genetische structuur van sleuteltaxa in fytoplanktongemeenschappen Universiteit Gent Abstract: Dit project beoogt een bijdrage te leveren tot een beter begrip van het belang van de populatiegenetische diversiteit en ecofysiologische differentiatie tussen en binnen soorten voor het voorspellen van (i) de resistentie van fytoplanktonpopulaties voor veranderingen in het milieu en (ii) potentiële veranderingen in de gemeenschapsstructuur van aquatische ecosystemen ten gevolge van klimaatveranderingen en eutrofiëring. Organisaties:
• Vakgroep Biologie
Onderzoekers: • Wim Vyverman
ANTI-RSV. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Klinische & Epidemiologische Virologie
Onderzoekers: • Marc Van Ranst
Klimaatswijziging en Antarctische microbiële diversiteit - CCAMBIO Universiteit Gent Abstract: Het objectief van CCAMBIO is om de diversiteit, biogeografische verspreiding, evolutieve ontwikkeling and genomkische samenstelling van lacustriene microbiële matten gemeenschappen in het Antarctisch gebied te bestuderen om hun veerkracht en lokale en regionale gevolgen van global change na te gaan. Organisaties: • Vakgroep Biochemie en Microbiologie
Onderzoekers: • Wim Vyverman • Anne Willems
Klimaatverandering en Antarctische microbiële biodiversiteit CCAMBIO Universiteit Gent Abstract: CCAMBIO heeft tot doel de diversiteit, biogeografische zonering, evolutionaire geschiedenis en de genomische kenmerken van lacustriene microbiële matten in het Antarctische biogeografisch rijk te bestuderen teneinde hun resiliëntie en lokale en regionale respons op global change te kwantificeren. Organisaties: • Vakgroep Biologie
Onderzoekers: • Wim Vyverman • Anne Willems
Moleculaire karakterisatie van glucose sensors en door glucose geïnduceerde signaaltransductieprocessen in de pathogene schimmels Candida albicans en Aspergillus fumigatus. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Afd. Molec. Microbiol. & Biotechnologie
Onderzoekers: • Patrick Van Dijck
Identificatie van nieuwe antimicrobiële plant peptiden en de ontrafeling van hun werkingsmechanisme. KU Leuven Abstract: Antimicrobiële peptiden (AMPs) komen veelvuldig voor in het plantenrijken spelen een belangrijke rol in het aangeboren afweersysteem van planten. Verder zijn zij ook waardevol in landbouwkundige en medische toepassingen. O.b.v. recent onderzoek blijkt dat hun aantal in de plantenwereld onderschat is. In dit project wensen we nieuwe AMPs te idenficeren in de modelplant Arabidopsis thaliana alsook in de gewasplanten Coffea arabica en Theobroma cacao. Deze nieuwe AMPs zullen verder gekarakteriseerd worden m.b.t. hun antifungale activiteit en het werkingsmechanisme daarvan. Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Bruno Cammue • Karin Thevissen
BUTGIT : evalueren van de effecten van het verstrekken van butyraat tot afzonderlijke delen van het maag-darmkanaal om de diergezondheid,kolonisatie van pathogenen en nutriëntenbenutting in veedieren te verbeteren Universiteit Gent Abstract: niet beschikbaar Organisaties: • Vakgroep Pathologie, bacteriologie en pluimveeziekten • Vakgroep Geneesmiddelenleer
Onderzoekers: • Jean Remon • Filip Van Immerseel
Immuun therapie in MM: kunnen iNKT cellen worden gericht? Vrije Universiteit Brussel Abstract: Kankeronderzoek Organisaties: • Immunologie en Microbiologie
Onderzoekers: • Eline MENU • Karin VANDERKERKEN
Muismodel voor chemisch-geïnduceerd astma: mechanismen KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract
Organisaties: • Arb_verzek_g
Onderzoekers: • Peter Hoet • Jeroen Vanoirbeek • Vanessa De Vooght • Fien Devos
Immunological and molecular interaction between the host and Candida Albicans biofilm. KU Leuven Abstract:
