2012
VÝROČNÍ ZPRÁVA
obsah
Úvodní slovo vedoucího lékaře..................................... 5
IV. Preimplantační diagnostika (PGD) ............................ 8
I. Úvod ......................................................................... 6
V. Postnatální laboratorní diagnostika.......................... 10
II. Výsledky prenatální diagnostiky................................. 6
VI. Kontrola kvality ...................................................... 10
III. Výsledky centra asistované reprodukce.................... 7
VII. Personální obsazení GENNET............................... 13
ÚVODNÍ SLOVO VEDOUCÍHO LÉKAŘE
Vážení pacienti, kolegové a spolupracovníci, dostává se Vám do rukou výroční zpráva společnosti GENNET, ve které si Vás dovolujeme seznámit s výsledky za rok 2012. Tento rok pro nás hlavně znamenal expanzi do zahraničí a zavedení nové unikátní technologie, která změní prenatální diagnostiku – neinvazivní prenatální diagnostiky trizomií (NIFTY). Vytvořili jsme asociaci s největší genomickou společností na světě BGI a společně s Asociací center lékařské genetiky ČR jsme představili projekt PRENASCAN (www.prenascan.eu), který zavádí do klinické praxe v České a Slovenské republice neinvazivní prenatální test trizomie chromozomů č. 21 – Downova syndromu, č. 18 – Edwardsova syndromua č. 13 – Patauova syndromu. V Londýně jsme otevřeli Centrum asistované reprodukce a fetální medicíny na adrese 16 St John Street, London, EC1M 4NT. Centrum nese název CITY FERTILITY a je první z našich zahraničních poboček. Zavedli jsme preimplantační screening aneuploidií novou metodou Array CGH, což nám umožní kontrolu počtu všech chromozomů v embryonálních buňkách s cílem zvýšit úspěšnost léčby neplodnosti u indikovaných párů. Naším cílem je poskytovat pacientům tu nejkvalitnější péči, a proto jsme opět kladli nejvyšší důraz na kvalitu a po splnění podmínek kontrolního auditu jsou nyní naše IVF a genetické laboratoře akreditovány dle normy ČSN EN ISO 15189:2007, a to až do května roku 2017. Stali jsme se partnerem MOVEMBERu, akce zaměřené na mužské zdraví, a zařadili jsme se tak mezi propagátory sloganu „změňme tvář mužského zdraví“. Náš tým také posílili další zkušení kolegové, a proto věříme, že i rok 2013 bude stejně úspěšný. Děkujeme za Vaši důvěru. MUDr. David Stejskal vedoucí lékař
Výroční zpráva
2012
stránka 5
I. Úvod Na klinikách v Praze a Liberci poskytujeme našim pacientům komplexní péči
Celkové výsledky prenatální diagnostiky
v oblasti lékařské genetiky, fetální medicíny a asistované reprodukce. V roce
Bylo zjištěno celkem 260 prenatálních vrozených vad:
2012 jsme vyšetřili 23 676 pacientů a 12 235 rodin.
II. Výsledky prenatální diagnostiky Výsledky screeningu vrozených vad v I. a II. trimestru. Celkem bylo hodnoceno 19 693 prenatálních screeningových testů ve screeningových centrech Praha a Liberec. Bylo hodnoceno: 5 005 kombinovaných testů v I. trimestru (průměrný věk testovaných osob 33 let; 3,7 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/100 a vyšším) 8 280 integrovaných testů v I. a II. trimestru (průměrný věk testovaných 31 let; 1,7 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21
132 nálezů chromozomálních vrozených vad (109 závažných) 158 morfologických vad (39 chromozomální aberací) 141 těhotných požádalo o přerušení těhotenství
Chromozomální VVV Downův syndrom (trizomie 21)
48
Edwardův syndrom (trizomie 18)
10
Patauův syndrom (trizomie 13)
13
Turnerův syndrom (X0)
11
Aneuploidie pohlavních chromozomů
13
Triploidie
2
Strukturální aberace
12
Všechny závažné aberace
109
1/150 a vyšším) 6 408 triple testů ve II. trimestru (průměrný věk testovaných 31 let; 4,4 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/250 a vyšším) Ultrazvukem bylo primárně zjištěno nebo následně potvrzeno 158 vrozených vad plodu. Celkem bylo provedeno: 5 225 ultrazvukových vyšetření v I. trimestru 12 493 ultrazvukových vyšetření ve II. a III. trimestru
Invazivní výkony
Morfologické VVV (mnohočetné vvv uváděny opakovaně) Defekty neurální trubice (rozštěpy páteře)
8
Vady CNS
18
Orofaciální vady (rozštěpy rtu)
22
Srdeční vady
58
Vady hrudníku a nitrohrudních orgánů
4
Vady trávicího ústrojí
1
Vady močopohlavního ústrojí
31
Vady končetin
26
Bylo vyšetřeno: 194 odběrů choria – CVS s 62 (32 %) nálezy chromozomálních vad
Vyšetření produktů koncepce (spontánní potraty v I. trimestru)
1 958 amniocentéz – AMC s 59 (3 %) nálezy chromozomálních vad.
Molekulárně genetickými technikami bylo vyšetřeno celkem 161 produktů kon-
U všech vyšetření choriových klků a 81 % vyšetření plodových vod byla
cepce na nejčastěji se vyskytující aneuploidie (chromozomů č. 2, 7, 13, 14,
provedena rychlá diagnostika nejčastějších chromozomálních vad techni-
15, 16, 18, 21, 22, X, Y), triploidie a uniparentální diploidie (kompletní mola) a
kou QF-PCR.
trombofilní mutace (FVL – Leidenská).
Prenatální vyšetření technikou SNP microarray bylo provedeno u 140 plodů. U 29 (20,7 %) byl zjištěn nález.
U 19 % produktů koncepce byla zjištěna chromozomální etiologie.
Neinvazivní prenatální testy (NIPT) V projektu PRENASCAN bylo dosud vyšetřeno více než 300 těhotných. Byly diagnostikovány a přímým vyšetření plodu potvrzeny tři trizomie (2x trizomie č. 21 a jednou trizomie č. 13.)
Výroční zpráva
2012
stránka 6
III. Výsledky centra asistované reprodukce V roce 2012 se úspěšnost metod, které pacientům nabízíme, pohybovala na vysoké úrovni. Snažíme se o individuální péči, při níž má každý pacient svého lékaře, který provádí všechny výkony. Dosahujeme tak dalšího zlepšování výsledků.
KET
2006
2007
2008
2009
2010
2011
2012
ET
46
218
207
357
351
328
522
Těhotenství
10
57
46
127
117
127
201
Těhotenství na ET v%
22 %
26 %
22 %
36 %
33 %
39 %
Také jsme začali nabízet onkologicky nemocným ženám a dívkám možnosti zachování fertility i po léčbě. Chemoterapie a radioterapie přestavu-
KET
je potenciální hrozbu pro reprodukční schopnosti žen. Moderní techniky
600
asistované reprodukce (ART) nabízejí více možností, jak uchovat fertilitu
500
u žen po onkologické léčbě (zamražení embryí, zamražení oocytů nebo ovariální tkáně). Všechny tyto metody již úspěšně používáme. Pro zlepšení výsledků provádíme také narušení sliznice děložní pod optickou kontrolou při zavedení hysteroskopu. Jedná se o jednoduchý ambulantní zákrok trvající pár minut, který lze provést i bez celkové anestezie, pokud je to pro pacientku výhodnější. Dle současných poznatků, ověřených několika studiemi, může narušení endometria u vybraných
39 %
400 300 200 100 0 2006 2007
pacientek zvýšit receptivitu endometria, respektive zlepšit jeho implantační schopnost.
2008
2009
ET
2010
2011
2012
Těhotenství
IVF/ICSI
2006
2007
2008
2009
2010
2011
2012
OPU
384
622
1020
1120
1373
1432
1554
ET
333
534
877
985
1173
1189
1497
Těhotenství
102
174
326
437
509
476
687
Těhotenství na ET v%
ED
2008
2009
2010
2011
2012
31 %
33 %
37 %
44 %
43 %
40 %
46 %
ET
51
147
209
261
314
Těhotenství
26
79
111
158
217
Těhotenství na ET v%
51 %
54 %
53 %
61 %
Úspěšnost dle věkových skupin: 35 <
46 %
2006
2007
69 %
35 – 38 45 % > 38
ED
31 %
IVF/ICSI
350 300
1500
250 200
1000
150 100
500
50 0
0 2006 2007
2008 ET
Výroční zpráva
2012
2009
2010
2011
Těhotenství
2012
2006 2007
2008 ET
2009
2010
2011
2012
Těhotenství
stránka 7
IV. Preimplantační diagnostika (PGD) PGD provádíme v našem centru úspěšně již několik let. Naše akreditované laboratoře pracují i pro ostatní IVF centra v Čechách i v zahraničí. V současnosti jsou dostupné tyto metody:
PGD metodou PCR byla v roce 2012 provedena v 69 cyklech, celkem bylo provedeno již 243 cyklů. Pro vyšetření monogenních chorob používáme nepřímou metodu užívající výsledky haplotypové rodinné analýzy. Tuto metodu lze použít prakticky u všech monogenních chorob.
PGS – screening aneuploidií metodou FISH, v případech indikovaných gePGD monogenních onemocnění
netikem vyšetření pohlaví PGS – screening aneuploidií metodou Array CGH
Rok
PGD metodou FISH u nosičů translokace PGD metodou PCR u monogenních chorob
Dokončené přípravy (nové geny)
Provedené cykly
2007
2
3
2008
10
20
Zavedli jsme do praxe novou metodu PGS Array CGH pro vyšetření 24 chro-
2009
12
32
mozomů. Pro optimální výsledek doporučujeme metodu tzv. PGD dislokace,
2010
16
49
kdy k transferu dochází v následujícím cyklu po vitrifikaci embryí a jejich vyšet-
2011
12
70
ření.
2012
13
69
Dislokace má kromě výrazného ekonomického efektu tyto výhody:
Celkem
65
243
1. Koncentrace pouze na stimulaci a OPU a následně na transfer 2. Relativní indikace ICSI
Výsledky 2007 - 2012
3. Naturální selekce embryí do 5. dne 4. Nižší pravděpodobnost poškození embryí biopsií trofoektodemu 5. Více materiálu pro PGD a více času k uzavření diagnózy 6. Pravděpodobně lepší kvalita potomstva ve srovnání s fresh transfery •
Druhá naturální selekce při rozmrazování embryí
•
Lepší příprava endometria a lepší placentace
Počet cyklů (SC)
225
Embryotransfer (ET)
161
Klinické těhotenství (CP) CP/ET
77 40 %
PGD metodou FISH byla v roce 2012 provedena v 57 cyklech. Metodou FISH provádíme převážně vyšetření dědičných chromozomálních translokací. Výsledky PGD/PGS metodou FISH – GENNET 2007 - 2012 CHA Páry
X-váz
PGS
202
Celk. 202
Započatý cyklus (SC)
163
22
61
246
Biopsie embrya
606
55
321
1403
Embryotransfer (ET)
88
14
45
147
Klinické těhotenství (CP)
30
6
16
52
34 %
42 %
36 %
37 %
CP/ET
PGD metodou Array CGH byla provedena doposud v 16 cyklech s těmito výsledky: Počet cyklů
16
Bioptovaná embrya
46
Úspěšná amplifikace DNA
46
Úspěšná PGD array (44z 46)
44
Norma (14 ze 44)
14
32 %
Počet pacientek s doporučeným KET
10
63 %
Výroční zpráva
2012
96 %
stránka 8
CHROMOZOM
CMT 1A
AD
PMP22
17p12
Junkční epidermolysis bullosa
NÁZEV ONEMOCNĚNÍ
TYP DĚDIČNOSTI
GEN
ZKRATKA
Charcot-Marie-Tooth typu 1A
TYP DĚDIČNOSTI
NÁZEV ONEMOCNĚNÍ
ZKRATKA
Seznam monogenních chorob připravených pro preimplantační diagnostiku
GEN
JEB
AR
LAMB3
1q32.2
CHROMOZOM
Cystická fibróza
CF
AR
CFTR
7q31.2
BRCA2
BRCA2
AD
BRCA2
13q13.1
Marfanův syndrom
MS
AD
FBN1
15q21.1
Huntingtonova chorea
HCH
AD
IT15
4p16.3
Porucha mitochondriální beta-oxidace MK, deficit LCHAD
LCHAD
AR
HADHA
2p23.3
RhD aloimunizace
RhD
AD
RHD
1p36.11
Alportův syndom
AS
XR
COL4A5
Xq22.3
AR
ADSL
22q13.1-q13.2
AD
VHL
3p25-p26
AR
ADA
20q13.12
MPS1
AR
IDUA
4p16.3
IP
XD
NEMO
Xq28
AD
MYH9
22q12.3
Deficit adenylosukcinátlyáz
Myotonická dystrofie typu 1
MD1
AD
DMPK
19q13.32
Syndrom fragilního X
FRAXA
XD
FMR1
Xq27.3
X-vázaná těžká kombinovaná imunodeficience
Von Hippel-Lindaův syndrom
SCID
XR
IL2RG
Xq13.1
Deficit adenosindeaminázy
XR
Factor VIII
Xq28
AR
PKHD1
6p12.2
Hemofilie A Polycystické ledviny – autozomálně recesivní forma
ARPKD
AR dědičná hluchota Hereditární sensorická neuropatie 1
HSN1
Morbus Crouzon BRCA1
AR
GJB2 (Connexin26)
13q12.11
AD
SPTLC1
9q22.31
AD
FGFR2
10q26.13
Mukopolysacharidóza I Incontinentia pigmenti
VHL
MYH9 related disorders (e.g. Epstain syndrome) Facioscapulohumerální muskulární dystrofie
FSHD
AD
FRG1
4q35
Smith-Lemli-Opitz syndrom
SLOS
AR
DHCR7
11q13.4
Kongenitální adrenální hyperplazie
CAH
AR
CYP21
6p2.1-3
Mukopolysacharidóza III, typ A (Sanfilipův syndrom)
MPS3
AR
SGSH
17q25.3
BRCA1
AD
BRCA1
17q21.31
Duchennova svalová dystrofie
DMD
XR
dystrofin
Xp21.1
Neurofibromatóza 1
NF1
AD
NF1
17q11.2
Spinální muskulární atrofie
SMA
AR
SMN1
5q12.2-13.3
Currarino syndrom
CS
AD
HLXB9
7q36.3
Treacher Collins syndrom
TCS
AD
TCOF1
5q33.1
Deficit alfa1-antitrypsinu
A1AT
AR
SERPINA1
14q32.1
Erytropoetická protoporfýrie
EPP
AD
FECH
18q21.3
Mnohočetná endokrinní neoplázie 2A
MEN2A
AD
RET
10q11.2
IPEX syndrom
Zadní polymorfní dystrofie rohovky
PCCD1
AD
celý lokus
20p11.2
Waardenburgův syndrom
WS
AD
PAX3
2q35-2q37
IV
AD
FLG1
1q21.3
AR
ALPL
1p36.12
XR
OCRL
Xq25-26.1
AD
MSH2
2p21 Xp21.1-Xp11.4
IPEX
XR
FOXP3
Xp11.23
Propionová acidémie
PA
AR
PCCB
3q21-3q22.3
Alagillův syndrom
AS
AD
JAG-1
20p12
AD
keratin 14 (KRT14)
17q21.2
Epidermolysis bullosa
EB
Lynchův syndrom
HNPCC
AD
MLH1
3p22.2
Pelizaeus-Merzbacher syndrom
PMD
XR
PLP1
Xq22.2
Charcot-Marie-Tooth –gonozomálně dominantní typ
CMTX1
XD
GJB1,Cx32
Xq13.1
Leidenská mutace, faktor V
FV
AR
Factor V
1q24.2
Fábryho choroba
FD
XD
GLA
Xq22.1
ADPKD
AD
PKD1
16p13.3
XR
Factor IX
Xq27.1
Polycystické ledviny – autozomálně dominantní forma Hemofilie B
Výroční zpráva
2012
Ichthyosis vulgaris Hypofosfatázie Okulocerebrorenální syndrom (Loweho syndrom)
OCRL
Lynchův syndrom OTC deficit (porucha ornitintranskarbamylázy)
OTC
XR
Delece OTC (okolních genů RPGR+TSPAN7)
Fenylketonurie
PKU
AR
PAH
12q23.2
Hypertrofická myopatie
HKMP
AD
MYH7
14q12
Tuberkulózní skleróza
TSC1
AD
TSC1
9q34.13
stránka 9
V. Postnatální laboratorní diagnostika Cytogenetická laboratoř provedla 4 447 postnatálních vyšetření. U 2,7 % případů byl nález patologický. Metody molekulární cytogenetiky (FISH) byly použity u 183 případů. Metodou SNP microarray bylo vyšetřeno 513 případů. U 11,9 % případů byl nález pozitivní.
Molekulárně genetická laboratoř vyšetřila postnatálně celkem 5 165 vzorků. Seznam provedených vyšetření: 2 828 vyšetření trombofilních mutací
12
1 912 vyšetření mutací CFTR genu
43
vyšetření genů SPG3,SPG4,SPG31
145
vyšetření delecí dlouhého raménka chr. Y
188
vyšetření genu COX26
692
vyšetření polymorfismu N680S pro FSHr
3
vyšetření genu SOD1
67
vyšetření expanze v genu pro FRAXA
3
vyšetření genu MARVELD2
32
vyšetření delecí genu SMN1
1
vyšetření genu NBS1
92
vyšetření genů BRCA1, BRCA2
6
vyšetření mutace CMS_1267del G
5
vyšetření mikrosatelitové nestability - MSI
vyšetření nejčastějších mutací HFE genu
VI. Kontrola kvality Naším cílem je, aby výsledek každé léčby byl úspěšný. K dosažení tohoto cíle je nutné, abychom pacientům poskytovali kvalitní a odbornou péči, což potvrzujeme každý rok při absolvování auditu certifikace systému řízení jakosti podle normy ČSN EN ISO 9001:2009, zároveň jsme také držiteli akreditace ČSN EN ISO 15189:2007 pro naši zdravotnickou laboratoř č. 8068.
Výroční zpráva
2012
stránka 10
Každoročně se cytogenetická a molekulárně genetická laboratoř účastní mezilaboratorních kontrol kvality, a to na republikové i mezinárodní úrovni.
CEQA (Cytogenetic European Quality Assessment): v tomto hodnocení dosáhla cytogenetická laboratoř plného počtu bodů.
Mezilaboratorní externí kontrola kvality: stanovení vrozených genetických trombofilních markerů
Československá společnosti pro forenzní genetiku: Mezilaboratorní porovnávání forenzně genetických zkoušek 2012
Výroční zpráva
2012
stránka 11
UK Neqas for molecular genetics: Preimplantation Genetic Diagnosis Molecular Genetics External Quality Assurance Pilot Schemes 2011-12
External Quality Assessment Scheme: Haemochromatosis (whole blood)
Splněním podmínek a kritérií potřebných pro získání certifikátů kontroly kvality a akreditace jsme potvrdili svou odbornost, objektivitu a nezávislost nezbytnou pro vykonávání naší práce.
Výroční zpráva
2012
stránka 12
VII. Personální obsazení GENNET Vedoucí lékař prim. MUDr. David Stejskal Vedoucí lékař oddělení fetální medicíny prim. MUDr. Dagmar Smetanová, CSc. Vedoucí IVF programu a GENNET Scientific Board prim. MUDr. Milada Brandejská
PRAHA LETNÁ Lékařská genetika prim. MUDr. Eva Hlavová MUDr. Michaela Hejtmánková MUDr. Věra Krutílková MUDr. Dagmar Rašková MUDr. David Stejskal
Fetální medicína prim. MUDr. Dagmar Smetanová, CSc. MUDr. Eduard Kulovaný, CSc.
Laboratoř IVF
Dětská kardiologie
vedoucí laboratoře Ing. Josef Míka, Csc.
MUDr. Jiří Gilík
MUDr. Dita Kilijánová
Laboratoř molekulárně genetická
Neurologie (privátní)
MUDr. Martin Doležal
vedoucí laboratoře RNDr. Martina Putzová, Ph.D.
MUDr. Jana Zárubová
MUDr. Martin Hynek MUDr. Sabina Březinová
Centrum asistované reprodukce prim. MUDr. Milada Brandejská
Laboratoř cytogenetická
MUDr. Alena Langerová
vedoucí laboratoře RNDr. Jiří Horáček
MUDr. Lenka Vykysalá
Fetální kardiologie (privátní)
MUDr. Radka Jarošová
Doc. MUDr. Jan Marek, Ph.D.
MUDr. Simona Bukvová
MUDr. Viktor Tomek
Andrologie MUDr. Viktor Vik
Vrchní sestra Ivana Hrodějová
PRAHA ARCHA Centrum asistované reprodukce
Lékařská genetika
MUDr. Milan Daněk
Doc. MUDr. Alice Baxová, CSc.
MUDr. Michaela Bartošová
Urologie a andrologie
MUDr. Tereza Kosová
MUDr. Viktor Vik
MUDr. Miroslav Landfeld
Výroční zpráva
2012
Gynekologie
MUDr. Jiří Vokroj
Doc. MUDr. Jozef Záhumenský, PhD.
Laboratoř IVF
Vrchní sestra
vedoucí laboratoře Ing. Vlastimil Weber
Blanka Koutková
stránka 13
LIBEREC Lékařská genetika prim. MUDr. David Stejskal MUDr. Gabriela Křečková
Fetální medicína MUDr. Vendula Johannová MUDr. Jaroslav Soukeník
Centrum asistované reprodukce prim. MUDr. Ivo Petr MUDr. Veronika Mokrá
Laboratoř IVF prim. MUDr. Ivo Petr
Laboratoř cytogenetická vedoucí laboratoře Ing. Jitka Zatloukalová
Vrchní sestra genetiky Jana Vacková
Vrchní sestra IVF Jana Benešová, DiS
LONDON CITY FERTILITY Centrum asistované reprodukce MUDr. Martin Hrehorčák MUDr. Vivienne Hall
Vrchní sestra Jane Holman
Konzultant Gosia Heeley
Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Maria Bonada
Koordinátor Suky Kaur
Výroční zpráva
2012
stránka 14
CENTRUM LÉKAŘSKÉ GENETIKY A REPRODUKČNÍ MEDICÍNY GENNET Na Poříčí 26, 110 00 Praha 1
CENTRUM LÉKAŘSKÉ GENETIKY A REPRODUKČNÍ MEDICÍNY GENNET Kostelní 9, 170 00 Praha 7
CENTRUM LÉKAŘSKÉ GENETIKY A REPRODUKČNÍ MEDICÍNY GENNET Liliová 1, 460 01 Liberec
CITY FERTILITY LONDON 16 St John Street, London EC1M 4NT
[email protected] | www.gennet.cz
