IDENTIFIKASI BAKTERI PADA KOMODITAS IKAN AIR TAWAR DI BALAI KARANTINA IKAN PENGENDALIAN MUTU DAN KEAMANAN HASIL PERIKANAN KELAS I, SURABAYA I
PRAKTEK KERJA LAPANG PROGRAM STUDI S-1 BUDIDAYA PERAIRAN
Oleh: DAHLIA PONOROGO – JAWA TIMUR
FAKULTAS PERIKANAN DAN KELAUTAN UNIVERSITAS AIRLANGGA SURABAYA 2015
Yang bertanda tangan dibawah ini, saya: Nama
: DAHLIA
NIM
: 141211131206
Menyatakan dengan sebenarnya bahwa laporan PKL yang berjudul: IDENTIFIKASI BAKTERI PADA KOMODITAS IKAN AIR TAWAR DI BALAI KARANTINA IKAN PENGENDALIAN MUTU DAN KEAMANAN HASIL PERIKANAN KELAS I, SURABAYA I adalah benar hasil karya saya sendiri. Hal-hal yang bukan karya saya dalam laporan PKL tersebut diberi tanda citasi dan ditunjukkan dalam daftar pustaka. Apabila dikemudian hari terbukti pernyataan saya tidak benar, maka saya bersedia menerima sanksi akademik yang berlaku di Universitas Airlangga, termasuk berupa pembatalan nilai yang telah saya peroleh pada saat ujian dan mengulang pelaksanaan PKL. Demikian surat pernyataan yang saya buat ini tanpa ada unsur paksaan dari siapapun dan dipergunakan sebagaimana mestinya.
Surabaya, 1 Mei 2015 Yang membuat pernyataan,
DAHLIA NIM. 141211131206
IDENTIFIKASI BAKTERI PADA KOMODITAS IKAN AIR TAWAR DI BALAI KARANTINA IKAN PENGENDALIAN MUTU DAN KEAMANAN HASIL PERIKANAN KELAS I, SURABAYA I
Praktek Kerja Lapang sebagai Salah Satu Syarat untuk Memperoleh Gelar Sarjana Perikanan pada Program Studi S-1 Budidaya Perairan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga
Oleh : DAHLIA NIM : 141211131206
Mengetahui,
Menyetujui,
Dekan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga
Dosen Pembimbing,
Prof. Dr. Hj. Sri Subekti, drh., DEA NIP. 19520517 197803 2 001
Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., MP NIP. 19690912 199702 2 001
IDENTIFIKASI BAKTERI PADA KOMODITAS IKAN AIR TAWAR DI BALAI KARANTINA IKAN PENGENDALIAN MUTU DAN KEAMANAN HASIL PERIKANAN KELAS I, SURABAYA I
Oleh : DAHLIA NIM : 141211131206
Setelah mempelajari dan menguji dengan sungguh-sungguh, kami berpendapat bahwa Praktek Kerja Lapang (PKL) ini, baik ruang lingkup maupun kualitasnya dapat diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Perikanan
Telah diujikan pada Tanggal : 17 Juni 2015
KOMISI PENGUJI Ketua
: Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., MP
Anggota
: Dr. Laksmi Sulmartiwi, S.Pi.,MP. Prof. Dr. Hj. Sri Subekti, drh., DEA
Surabaya, 17 September 2015 Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Dekan,
Prof. Dr. Hj. Sri Subekti, drh., DEA NIP. 19520517 197803 2 001
RINGKASAN DAHLIA. Identifikasi Bakteri pada Komoditas Ikan Air Tawar Di Balai Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan Kelas I, Surabaya I, Dosen Pembimbing Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., MP Sektor kelautan dan perikanan merupakan salah satu sumber andalan dalam pembangunan perikanan di Indonesia. Produksi perikanan budidaya diproyeksikan meningkat rata-rata 4,9 % per tahun. Penghambat budidaya ikan adalah munculnya serangan penyakit. Penyakit ikan umumnya disebabkan oleh organisme patogen berupa bakteri. Pencegahan Penyebaran penyakit dapat dilakukan dengan tindakan karantina ikan melalui mencegahan masuk dan tersebarnya Hama dan Penyakit Ikan Karantina (HPIK). Praktek Kerja Lapang ini dilaksanakan di Balai Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan Kelas I, Surabaya I. Jalan Raya Juanda No.23 Semambung, Surabaya, Jawa Timur. Kegiatan ini dilaksanakan pada tanggal 12 Januari-8 Februari 2015 untuk mengetahui spesies bakteri apa saja yang ditemukan di Balai Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan Kelas I, Surabaya I pada komoditas ikan air tawar. Metode kerja yang digunakan dalam Praktek Kerja Lapang ini adalah metode deskriptif dengan pengambilan data meliputi data primer dan data sekunder. Pengambilan data dilakukan dengan cara partisispasi aktif, observasi, wawancara dan studi pustaka. Bakteri yang ditemukan pada ikan air tawar selama Praktek Kerja Lapang adalah sebagai berikut: Aeromonas hydropila pada benih ikan patin ikan patin (Pangasius pangasius), Plesidomonas shigelloides pada ikan cupang (Betta sp), Aeromonas caviae pada benih ikan lele (Clarias bathracus), dan Pseudomonas putida pada ikan mas koki (Cyprinus carpio).
Kata kunci: sektor kelautan dan perikanan, budidaya, penyakit, bakteri.
SUMMARY DAHLIA. Identification Bacteria at Freshwater Fish Commodities in Fish Quarantine Quality Control and Safety of Fishery Class I, Surabaya I. Academic advisor Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., MP Marine and fisheries sector is one of resources mainstays in the development of fishery in Indonesia. The production of aquaculture as a whole projected increase an average of 4.9% in year. The problem most often considered to be a barrier fish farming is emergence of disease. Fish diseases are generally caused by pathogenic organisms such as bacteria. For measures to prevent the spread of the disease can be carried by fish quarantine measures to prevent the entry and spread through Pests and Diseases Fish Quarantine (HPIK). Field Work Practice was held in the Quarantine Fish Quality Control and Safety of Fishery Class I, Surabaya I. Jalan Raya Juanda Surabaya Semambung No.23, Surabaya, East Java. This activity was held on 12 January to 8 February 2015 to learn identification method and to know bacteria species was found at freshwater fish commodities in Fish Quarantine Quality Control and Safety of Fishery Class I, Surabaya I. The working methods used in Field Work Practice was a descriptive method with collection data includes primary and secondary data. Data collection was performed from active participation, observation, interview and literature study. Bacteria was found at freshwater fish during Field Work Practice follows: Aeromonas hydropila on seed catfish (Pangasius pangasius), Plesidomonas shigelloides on Betta fish (Betta sp), Aeromonas caviae in seed catfish (Clarias bathracus) and Pseudomonas putida in goldfish (Cyprinus carpio).
Keyword: Marine and fisheries sector, fish farming, diseases, bacteria.
KATA PENGANTAR Segala puji dan syukur kami panjatkan kehadirat Allah SWT atas limpahan rahmat dan hidayah-Nya, sehingga penulis dapat menyelesaikan penyusunan laporan Praktek Kerja Lapang tentang Identifikasi Bakteri pada Komoditas Ikan Air Tawar di Balai Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan Kelas I, Surabaya I yang dilaksanakan pada tanggal 12 Januari sampai dengan 8 Februari 2015. Karya Ilmiah Praktek Kerja Lapang ini disusun sebagai salah satu syarat memperoleh gelar Sarjana Perikanan pada Program Studi Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Surabaya. Laporan Praktek Kerja Lapang ini disusun sebagai salah satu syarat untuk memperoleh Gelar Sarjana Perikanan pada Program Studi S-1 Budidaya Perairan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Surabaya. Penulis
menyadari bahwa laporan ini
masih
sangat
jauh dari
kesempurnaan, sehingga kritik dan saran yang membangun sangat penulis harapkan demi perbaikan dan kesempurnaan di masa mendatang. Penulis berharap agar laporan Praktek Kerja Lapang ini bermanfaat bagi semua pihak, khususnya bagi mahasiswa Fakultas Perikanan dan Kelautan.
Surabaya, 1 Mei 2015
Penulis
UCAPAN TERIMA KASIH
Pada kesempatan ini penulis memanjatkan puji dan syukur yang sebesarbesarnya kepada Allah SWT atas segala rahmat dan hidayah-Nya. Penulis juga mengucapkan terima kasih kepada: 1.
Prof. Dr. Hj. Sri Subekti, drh., DEA sebagai Dekan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga.
2.
Bapak Agustono Ir., M.Kes., sebagai Dosen Pembimbing Akademik yang telah memberikan arahan dan bimbingan.
3.
Ibu Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., MP sebagai Dosen Pembimbing yang telah memberikan arahan dan bimbingan sejak penyusunan usulan hingga selesainya penyusunan laporan PKL ini.
4.
Bapak Dr. Nurhaidin, S.Pi, M.P sebagai Kepala Balai Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan Kelas I, Surabaya I yang telah memberikan ijin dan bantuan fasilitas selama pelaksanaan Praktek Kerja Lapang.
5.
Ibu Laminem S.Pi, M.P sebagai Pembimbing Lapang selama pelaksanaan Praktek Kerja Lapang di Balai Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan Kelas I,
Surabaya I yang telah memberikan
arahan dan bimbingan. 6.
Ibu Ria, Ibu Kristina, Ibu Ayu, Bapak Indra, Bapak Yusuf, Mas Rino, Bapak Toni, Ibu Iswati, Bu Marta dan Ibu Endang yang memberikan pengarahan dan bimbingan di lapangan selama pelaksanaan Praktek Kerja Lapang.
7.
Seluruh karyawan dan staf di Balai Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan Kelas I, Surabaya I
8.
Bapakku Sombloh yang telah berpulang kehadirat-Nya dan Ibuku tercinta Misinah yang telah memberikan dukungan moril maupun materi.
9.
Keluarga besar di Ponorogo atas dukungan baik moril, motivasi dan materiil dalam penyelesaian penyusunan usulan, pelaksanaan, hingga penyusunan laporan Praktek Kerja Lapang.
10. Rekan-rekan Ismi, Iit, Iin, Rinca, Sholeh, Yuny, Maisa, Ninik, Fadila, Nurul, Basofi, Feri serta teman-teman Barracuda angkatan 2012 atas kerjasamanya mulai penyusunan usulan, pelaksanaan hingga penyusunan laporan PKL. 11. Teman-teman Universitas Brawijaya Malang Angkatan 2011, PPDH Universitas Airlangga Fakultas Kedokteran Hewan Angkatan 2012, atas segala bantuan selama pelaksanaan Praktek Kerja Lapang. 12. Seluruh angkatan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga yang telah memberikan motivasi. 13. Semua pihak yang telah membantu penulis dalam pelaksanaan maupun penyelesaian Praktek Kerja Lapang ini.
DAFTAR ISI Halaman RINGKASAN ..................................................................................................
v
SUMMARY......................................................................................................
vi
KATA PENGANTAR .....................................................................................
vii
UCAPAN TERIMA KASIH ...........................................................................
viii
DAFTAR ISI ...................................................................................................
x
DAFTAR TABEL ...........................................................................................
xii
DAFTAR GAMBAR ......................................................................................
xiii
DAFTAR LAMPIRAN ...................................................................................
xv
I PENDAHULUAN ........................................................................................ 1.1 Latar Belakang ................................................................................. 1.2 Tujuan .............................................................................................. 1.3 Manfaat ............................................................................................
1 1 3 3
II TINJAUAN PUSTAKA .............................................................................. 2.1 Tinjauan Umum Bakteri .................................................................. 2.1.1 Pengertian Bakteri ........................................................................... 2.1.2 Faktor yang Mempengaruhi Pertumbuhan Bakteri ......................... 2.2. Identifikasi Bakteri .......................................................................... 2.2.1 Isolasi Bakteri ................................................................................. 2.2.2 Pengamatan Morfologi Koloni Bakteri ........................................... 2.2.3 Pewarnaan Gram ............................................................................. 2.2.4 Uji Biokimia .................................................................................... a. Uji Katalase ......................................................................... b. Uji Oksidase ........................................................................ c. Uji O/F ................................................................................. d. Uji Motility dan Produksi indol ........................................... e. Uji TSIA ............................................................................. f. Uji Gula ............................................................................... g. Uji Gelatin ........................................................................... h. Uji LIA ................................................................................
4 4 4 5 5 5 5 6 6 6 6 7 7 7 8 8 8
2.3 2.3.1 2.3.2
Bakteri pada Ikan Air Tawar .......................................................... Aeromonas hydrophila ................................................................... Staphylococcus aureus ...................................................................
8 8 10
III PELAKSANAAN ....................................................................................... 3.1 Tempat dan Waktu Pelaksanaan ..................................................... 3.2 Metode Kerja .................................................................................. 3.3 Metode Pengumpulan Data ............................................................ 3.3.1 Data Primer ..................................................................................... 3.3.2 Data Sekunder .................................................................................
12 12 12 12 13 15
IV HASIL DAN PEMBAHASAN .................................................................. 4.1 Keadaan Umum Lokasi ................................................................... 4.1.1 Sejarah Balai Karantina Ikan ........................................................... 4.1.2 Tugas Pokok dan Fungsi Karantina ................................................. 4.1.3 Visi dan Misi ................................................................................... 4.1.4 Struktur Organisasi dan Tenaga Kerja ............................................. 4.1.5 Letak Geografis ............................................................................... 4.1.5 Sarana dan Prasarana ....................................................................... 4.2 Kegiatan Di Lokasi Praktek Kerja Lapang ...................................... 4.2.1 Persiapan dan Sterilisasi Alat .......................................................... 4.2.2 Penyiapan Media Penguji ................................................................ 4.2.3 Isolasi Bakteri .................................................................................. 4.2.4 Pemurnian Bakteri ........................................................................... 4.2.5 Pengamatan Morfologi Koloni Bakteri ........................................... 4.2.6 Pewarnaan Gram .............................................................................. 4.2.7 Uji Biokimia .................................................................................... 4.2.8 Identifikasi Bakteri ..........................................................................
16 16 16 17 18 19 20 20 22 22 25 26 28 30 31 33 41
V SIMPULAN DAN SARAN ........................................................................ 5.1 Simpulan .......................................................................................... 5.2 Saran ................................................................................................
47 47 48
DAFTAR PUSTAKA ......................................................................................
49
LAMPIRAN ....................................................................................................
53
DAFTAR TABEL
Tabel
Halaman
4.1 Sumber Daya Manusia Balai Karantina Ikan Kelas I Juanda.. .............
19
4.2 Data Pejabat Fungsional Balai Karantina Ikan Kelas I Juanda .............
19
4.3 Komposisi Gram pada Pewarnaan Bakteri............................................
32
4.4 Bakteri yang Ditemukan di Balai Karantina Ikan Kelas I Juanda ........
42
DAFTAR GAMBAR
Gambar
Halaman
2.1
Bakteri Aeromonas hydrophila Perbesaran 1000 ..........................
9
2.2
Bakteri Staphylococcus aureus Perbesaran 1000x ........................
11
4.1
Pemberian Kapas di Tabung Reaksi ..............................................
24
4.2
Proses Pelapisan Kertas pada Cawan Petri ....................................
24
4.3
Penyiapan Media TSA ...................................................................
26
4.4
Penggoresan Sample Bakteri pada Media TSA .............................
27
4.5
Pemberian Label pada Cawan Petri Sebelum Diinkubasi .............
28
4.6
Antibiotik Menghambat Pertumbuhan Sample Bakteri .................
30
4.7
Pengamatan Morfologi Koloni pada Sample Bakteri ...................
31
4.8
Bakteri Gram Negatif dan Positif Perbesaran 1000x ....................
33
4.9
Pengolesan Sampel Bakteri pada Paper Oxidase ..........................
34
4.10 Penggoresan Sampel Bakteri pada Cairan H2O2 3% .....................
34
4.11 Pemberian Paraffin pada Salah Satu Media Oksidatif/Fermentatif
35
4.12 Sample Bakteri Diinokulasikan pada Media MIO ......................... 36 4.13 Perubahan Warna Media TSIA ......................................................
37
4.14 Sample Bakteri Diinokulasikan pada Media Gelatin ..................... 38 4.15 Hasil Inokulasi Bakteri pada Media LIA .......................................
39
4.16 Media Gula yang Digunakan untuk Uji Gula ................................
39
4.17 Sample Bakteri yang Diinokulasi pada Media Urease ..................
40
4.18 Bakteri Aeromonas hydropila Perbesaran 1000x ..........................
43
4.19 Bakteri Plesiomonas shigelloides Perbesaran 1000x .................... 44 4.20 Bakteri Aeromonas caviae Perbesaran 1000x ................................ 45 4.21 Bakteri Pseudomonas putida Perbesaran 1000x ............................ 46
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran
Halaman
1. Denah Lokasi .........................................................................................
53
2. Struktur Organisasi ................................................................................
54
3. Peralatan dan Bahan untuk Identifikasi Bakteri ............................... ....
55
4. Gambar Peralatan dan Bahan untuk Identifikasi Bakteri ......................
58
5. Bakteri yang Ditemukan pada Bulan Januari 2015 ................................
61
