Současné možnosti a úskalí diagnostiky pertuse Mgr. Jana Zavadilová NRL pro pertusi a difterii Státní zdravotní ústav
Aktuality v diagnostice virových a bakteriálních infekcí, 26.5.2014, SZÚ
Výběr vhodné laboratorní metody Nástup symptomů
0
2
4
6
8
10
12
(týdny)
Kultivace PCR
Sérologie
u novorozenců a malých dětí
kultivace a PCR co nejdříve
u očkovaných dětí a dospělých - pokud kašel trvá méně než dva týdny - pokud kašel trvá déle než dva týdny
kultivace a PCR PCR a sérologie
Kultivace 100% specifická, sensitivita klesá s délkou trvání příznaků Faktory ovlivňující senzitivitu: o načasování odběru – konec inkubační doby, a 2 týdny trvání příznaků o ATB terapie o spolupráce pacienta o technika odběru - výtěr nebo aspirát z nosohltanu, ne stěr z tonzil, nosu, laryngeální výtěr ….
Odběr materiálu na kultivaci Výtěr z nosohltanu– ne vatový tampón Tampón ze syntetické bavlny na drátku s transportním médiem (Amies s aktivním uhlím)
Aspirát z nosohltanu
http://www.copanswabs.com
Odběr na kultivaci a PCR ze zadní stěny nosohltanu Tampón jemně zasunout přes nosní průduch těsně podél nosní přepážky a po spodní stěně nosní dutiny až k zadní stěně nosohltanu. Několikrát jemně pootočíme a tampón vytáhneme.
U dětí je nutná fixace!
Obrázek podle M. Riffelmann, Kodaň 2010
Transport vzorků pro kultivaci Materiál přepravovat a uchovávat do zpracování při pokojové teplotě – NE V LEDNICI ! Materiál zpracovat v laboratoři v den odběru, optimum do 4 hodin
Vhodný odběr v odběrovém místě mikrobiologické laboratoře
Kultivační média Charcoal agar (Regan-Lowe) neselektivní selektivní (+ cephalexin 40mg/l) Bordet – Gengou neselektivní selektivní (+ cephalexin 40mg/l) pH půdy 7,4±0.2, čerstvá krev půda na kultivační plotně vylitá do výšky 5 – 7 mm, skladovat max. 2 týdny Kultivační podmínky 35-36°C, minimálně 7 dní, denní odečítání ploten
Roste Bordetella pertussis na krevním agaru ? Zkoušeno na: o Columbia Oxoid o KA základ č. 3 Imuna o KA univerzální základ Imuna Otestováno 70 kmenů
Ano, ale jen na Columbia Oxoid krevním agaru Růst na KA neznamená, že se nejedná o B. pertussis
Makroskopická identifikace kolonií I B. pertussis vyrůstá za 48 až 72 hodin, vytváří drobné stříbřité polokulovité kolonie, při doteku kličkou se rozetřou (nepohybují se), po 3 - 4 dnech inkubace kolonie větší – „kapky rosy“, na Bordet-Gengou agaru zóna hemolýzy
;
www.hardydiagnostics.com ; faculty.matcmadison.edu/mljensen
Makroskopická identifikace kolonií II B. parapertussis vyrůstá do 48 hodin, kolonie jsou větší, šedostříbrné, při delší inkubaci vpadlé do půdy, na Bordet-Gengou agaru výrazná zóna hemolýzy a černohnědý pigment
http://www.cdc.gov/pertussis/lab.html
Identifikace bakteriální kultury Sklíčková aglutinace s diagnostickými séry po izolaci čisté kultury (ne starší než 48 hodin) MALDI-TOF MS (Matrix Assisted Desorption Ionization - Time Of Flight Spectrophotometry)
http://www.oxoid.com/CZ/blue/search/results.asp
Laser Mass
Sérotypizace izolátů B. pertussis v NRL Monoklonální Ab proti fimbriím Známy 2 typy fimbrií – Fim2 a Fim3 Rozeznáváme kmeny typu Fim2; Fim2,3 a Fim3 V současné době převažuje typ Fim3 Vzácně pasážováním může dojít ke změně sérotypu
Co dalšího děláme s izoláty B. pertussis ? Grant IGA MZ ČR (31.5. 2013 - 31.12. 2015) U izolátů provádíme: MAST MLST MLVA
Real-Time PCR Rychlá a vysoce citlivá metoda - význam hlavně u novorozenců a neočkovaných malých dětí Pozitivní výsledky i při ATB terapii (kultivace negativní) Jen v časné fázi onemocnění (po 3. týdnu klesá citlivost) Riziko kontaminace nižší než u klasického PCR – pozor na kontaminaci z prostředí
Riffelmann et al., 2005 J Clin Microbiol 43:4925-9
Odběr materiálu na PCR technika stejná jako u kultivace, jiná odběrová souprava Výtěr z nosohltanu Nylonový tampón na flexibilní plastové tyčince nebo odběrová souprava s tekutým médiem (Eswab, pro průkaz respiračních virů)
Aspirát z nosohltanu http://www.copanswabs.com
Transport vzorků pro PCR Nylonový tampón je přepravován suchý - v den odběru přepravovat při pokojové teplotě - při nutnosti skladování přepravovat zmrazený (-20°C)
Odběrová souprava s tekutým médiem - v den odběru transport při 2-8°C - při nutnosti skladování zmrazit (-20°C) V laboratoři okamžitě zpracovat nebo skladovat při -20°C do zpracování
Real-Time PCR sekvence B. pertussis, B. parapertussis IS481 – v mnoha kopiích u B.pertussis, ale není 100% specifická Tato sekvence se vyskytuje i u dalších bordetel: B. holmesii, B. bronchiseptica PT promoter (ptxA-Pr)- sekvence specifická pro B. pertussis, ale má nižší sensitivitu IS1001 – v rutinním provozu specifická pro B. parapertussis
Reischl et al., 2001
Real-Time PCR interpretace výsledků IS481 pozitivní a ptxA-Pr pozitivní - infekce způsobená B.pertussis IS481 pozitivní - infekce pravděpodobně způsobená B.pertussis IS1001 pozitivní - infekce pravděpodobně způsobená B.parapertussis
Riffelmann et al. 2005; Caro et al. 2009
Využití odběrového systému ESwab Recovery of Bordetella pertussis from PCR – positive nasopharyngeal samples is dependent on bacterial load (J. Clin. Microbiol. 12: 4114-4115) Z této odběrové soupravy se úspěšně dařila kultivace u vzorků pozitivních v metodě Real-Time PCR
B. pertussis
Vzorky byly před odesláním ke kultivaci skladovány při 4 °C max. týden Laboratoře, které používají tuto odběrovou soupravu – poslat médium do NRL na kultivaci!
Sérologie pertuse I Nelze odlišit protilátky postinfekční od postvakcinačních Hodnota protektivní koncentrace protilátek proti pertusovému toxinu není stanovena – nemá smysl plošně vyšetřovat Ab u ohrožených skupin, je známa pouze hodnota séropozitivity (tzn. reakce IS na setkání s PT)
Riffelmann et al., 2010; Guiso et al., 2010; Watanabe et al., 2006
Sérologie pertuse II Průkaz onemocnění (ELISA, IU/ml) – stanovení dynamiky IgG Ab proti pertusovému toxinu v párových vzorcích Vyžaduje 2 vzorky séra (akutní a rekonvalescentní) s odstupem 3 týdnů - poskytuje pozdní, retrospektivní diagnózu Séra se vyšetřují současně v jedné laboratoři! Diagnostická sérologie nemůže být správně interpretována po dobu 1 roku od očkování acelulární pertusovou vakcínou (aP) – u těchto pacientů kultivace, PCR
Riffelmann et al., 2010; Guiso et al., 2010; Watanabe et al., 2006
Sérologie pertuse - interpretace výsledků Pro správné hodnocení - data odběru obou vzorků - datum narození pacienta - vakcinační anamnéza pacienta ELISA (Pertuse): jako signifikantní (svědčící pro proběhlé onemocnění) se hodnotí vzestup koncentrace Ab o 100% počáteční hodnoty (hodnota naměřená v prvním z párových sér) nebo pokles koncentrace Ab o 50% počáteční hodnoty (platí pro soupravy detekující IgG proti PT v IU/ml)
Doporučená literatura
Guidance and protocol for the serological diagnosis of human infection with Bordetella pertussis (ECDC, Technical document)
Guidance and protocol for the use of real-time PCR in laboratory diagnosis of human infection with Bordetella pertussis or Bordetella parapertussis (ECDC, Technical document)
What to do and what not to do in serological diagnosis of pertussis: recommendations from EU reference laboratories (Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 30: 307-312)
Recovery of Bordetella pertussis from PCR – positive nasopharyngeal samples is dependent on bacterial load (J. Clin. Microbiol. 12: 4114-4115)
Laboratory manual for the diagnosis of whooping cough caused by Bordetella pertussis /Bordetella parapertussis (WHO/IVB/04.14 manual)
Poděkování Laboratořím, které nám zasílají izoláty a séra ke konfirmaci Epidemiologie: MUDr. Kateřině Fabiánové Kolektiv laboratoře: MUDr. Daniele Lžičařové Haně Klemové Janě Šimlové
Děkuji za pozornost http://www.szu.cz/narodni-referencni-laborator-pro-pertusi-a-difterii
SZÚ- budova č. 2 1. patro, č.d. 17
Tel.: 267 082 242 E-mail:
[email protected]