cobas® TaqScreen MPX Test for use on the cobas s 201 system IN VITRO DIAGNOSZTIKAI CÉLRA. ®
MPX
®
MPX CTL
®
TS WR
cobas TaqScreen MPX Test cobas TaqScreen MPX Control Kit cobas TaqScreen Wash Reagent
96 Tests
P/N: 04584244 190
6 Sets
P/N: 04626290 190
5.1 L
P/N: 04404220 190
®
A cobas TaqScreen MPX teszttel végzett kadáver minták vizsgálatához a felhasználónak az alábbi készleteken kívül a következő készletre van szüksége: ®
cobas TaqScreen Cadaveric Specimen Diluent Kit
CADV SPEC DIL 96 Tests
P/N: 05002125 190
FELHASZNÁLÁS MÓDJA ®
A cobas TaqScreen MPX teszt a cobas s 201 rendszerrel való együttes használatra egy kvalitatív, in vitro vizsgálat az 1-es típusú, M csoportú humán immundeficiencia vírus (HIV-1) RNS, 1-es típusú, O csoportú humán immundeficiencia vírus RNS, 2-es típusú humán immundeficiencia vírus (HIV-2) RNS, hepatitis C vírus (HCV) RNS és hepatitis B vírus (HBV) DNS direkt kimutatására humán plazmából. A vizsgálat célja a donorszűrő-vizsgálatok során a HIV-1 M csoportú, HIV-1 O csoportú, HIV-2, HCV RNS és HBV DNS kimutatása egyéni véradók plazmamintáiból, beleértve a teljes vér és véralkotórészek, forrásplazma donorait és egyéb élő donorokat. A vizsgálat használható továbbá egyéni szerv- és szövetdonorok szűrésére is, amennyiben a mintákat akkor vették le, amikor a donor szíve még dobogott, továbbá kadáver (nincs szívműködés) szerv- és szövetdonoroktól származó vérmintákban. A szűrés során az összes donortól származó plazmát egyéni mintaként kell kezelni. Teljes vér és véralkotórészek donorainak esetében a plazmaminták vizsgálhatóak külön-külön, illetve egyéni minták egyenlő részleteiből álló csoportokba gyűjtve, a HIV, HCV vagy HBV szerológiával egybekötve. Ez a vizsgálat nem a diagnózis elősegítésére való. A VIZSGÁLAT ÖSSZEGZÉSE ÉS MAGYARÁZATA A vér és véralkotórészek transzfúziója során lényeges problémát jelentenek a vírusfertőzések, különösen az 1-es és 2-es típusú humán immundeficiencia vírus (HIV-1, HIV-2), hepatitis C vírus (HCV) és hepatitis B vírus (HBV) esetleges átvitele. Ezen ágensek átvitele elsősorban fertőzött vér vagy vér- és plazmakészítmények, bizonyos szövetek vagy testfolyadékok által, nemi érintkezés során, illetve fertőzött anyáról újszülöttre lehetséges. A HIV-1 az egész világon elterjedt, előfordulási gyakorisága világszerte 1,1% (0,56% ÉszakAmerikában és 0,25% Nyugat-Európában). A HIV-1 fertőzött személyek rövid, kezdetben akut, influenzaszerű megbetegedést tapasztalhatnak, amelyhez a perifériás vérben magas szintű virémia 1 társul a fertőzéstől számított 3-6 hét múlva. Jelenleg a HIV-1 három fő genetikai csoportja ismert: M csoport (main, fő), N csoport (nem-M-nem-O) és O csoport (outlier, kívülálló). Az M csoport igen 2 elterjedt, és 9 szubtípusba, valamint számos cirkuláló rekombináns formába (CRF) sorolható A HIV-2-t 1986-ban izolálták először nyugat-afrikai betegekből. Mind a HIV-1 és a HIV-2 azonos módon vihető át és hasonló opportunista fertőzésekkel, valamint szerzett immunhiányos 3 tünetegyüttessel (AIDS) társul. A HIV-2 elterjedése egyes afrikai népek körében több, mint 1%-ra 4 tehető, és a HIV-2 Európa bizonyos részein és Indiában is növekvő problémát jelent. A HCV-t tartják 5,6 a poszttranszfúziós non-A, non-B hepatitis esetek 90%–95%-áért felelős fő fertőző ágensnek. A HCV világszerte előfordul, de elterjedtsége a fertőzés általános tünetmentessége miatt kevéssé ismert. Akárhogy is, a jelentett elterjedése a nyugat-európai 0,5 – 2,0%-tól az egyiptomi 20%-ig változhat. A ma élő emberek közül több, mint 2 milliárdan estek át életük folyamán HBV fertőzésen. 7-11 A világ Közülük világszerte nagyjából 350 millió egyén krónikus hordozója a vírusnak. népességének háromnegyede él magas átfertőzöttségű területeken. Évente több, mint 4 millió akut klinikai HBV eset fordul elő. A Dokumentum verzióinformációi rész a dokumentum végén található. 05888212044-01HU 1
Doc Rev. 5.0
A szerológiai szűrővizsgálatok jelentősen csökkentették, de nem számolták fel a vírusfertőzések vér és vérkészítmények transzfúziójával történő átvitelének kockázatát. A donoroktól levett teljes vér és plazma HBV szűrését az 1970-es évek elején kezdték meg HBsAg vizsgálattal, és az 1980-as években anti-HBc vizsgálattal. A HBV-szűrésen kívül rutinszerűen végzik a vér és plazma HIV-1, HIV-2 és anti-HCV szűrését enzim immunoassay (EIA) vizsgálatokkal. A transzfúziós készítmények fertőző ágensekre történő magasabb szintű szűrésére támasztott közigény előmozdította a nukleinsavvizsgálati (nucleic acid test, NAT) technológiák fejlődését. Klinikai vizsgálatok szerint a vírus12-14 5,13-16 17-20 HCV RNS és HBV DNS ) kimutatása tovább csökkentheti az nukleinsavak (HIV-1 RNS, ágensek ablakperiódus alatti véradásból eredő átviteli kockázatát. Az ablakperiódust átlagosan 21 22 napra becsülik, de a HIV-1 esetében akár 6 hónap is lehet . A HIV-1 kis csoportos minta (minipool) NAT vizsgálat kivitelezésével a fertőző ablakperiódus jelentősen lerövidíthető, így a HIV-1 13-15 Hasonlóan, átvitelének jelenlegi kockázatát hozzávetőleg 1-re becsülik 2 millió véradásból. 13-16 a HCV RNS NAT bevezetése az antitest negatív ablakperiódust körülbelül 60 napra csökkentette, a jelenlegi becsült kockázat hozzávetőleg 1 millió véradásból 1–2. A HBV DNS NAT szűrését egyre több helyen alkalmazzák. Az alacsony, közepes és magas HBV prevalenciájú országokban végzett klinikai vizsgálatok megmutatták a NAT eredményességét az ablakperiódus és késői HBV-fertőzött 15,19,20,22,23 donorok esetében, és bebizonyították a HBV transzfúziós átviteli esélyének csökkenését. A többszörös target vizsgálatok hatásfokának javítása érdekében a többféle vírus egyidejű kimutatására egy multiplex (MPX) polimeráz láncreakciót (PCR) fejlesztettek ki. A MPX PCR folyamán egy reakciócsőben egynél több targetszekvencia amplifikálása és kimutatása zajlik többféle primerpár és próba segítségével. ®
A cobas TaqScreen MPX teszt egy minőségi multiplex vizsgálat, amely lehetővé teszi a HIV-1 M és O csoport RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS és HBV DNS egyidejű szűrését és kimutatását fertőzött ® csoportos és egyéni plazmamintákból. A cobas TaqScreen MPX teszt általános nukleinsav® előkészítési eljárást alkalmaz a COBAS AmpliPrep készüléken. HIV-1 M és O csoport RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS és HBV DNS amplifikációja és kimutatása automatizált, valós idejű PCR eljárással ® ® történik a COBAS TaqMan analizátoron. Az eljárás egy belső kontrollt foglal magába a teljesítmény monitorozására minden egyes vizsgálat során, és a megelőzően amplifikált anyag (amplikon) által okozott potenciális szennyezés csökkentésére AmpErase (uracil-N-glikoziláz) enzimet alkalmaz. ® A cobas TaqScreen MPX teszt nem különbözteti meg, hogy melyik vírus mutatható ki a mintából. ® A HIV-1 M csoport, HCV és HBV megkülönböztető vizsgálatára a COBAS AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5, ® ® a COBAS AmpliScreen HCV teszt, v2.0 és a COBAS AmpliScreen HBV teszt áll rendelkezésre. HIV-1 O csoport és HIV-2 megkülönböztetésére alkalmas teszt nem áll rendelkezésre a Roche-tól. AZ ELJÁRÁS ALAPELVEI ®
A cobas TaqScreen MPX teszt cobas s 201 rendszeren való használatra 4 fő eljáráson alapul: ®
1.
Automatizált mintacsoportosítás és kontrollpipettázás a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor készülékkel
2.
Automatizált minta-előkészítés a COBAS AmpliPrep készülékkel
3.
Nukleinsavak automatizált amplifikációja és PCR termékek valósidejű kimutatása a COBAS ® TaqMan analizátorral
4.
Automatizált adatkezelés a csoportosító és adatkezelő (Pooling and Data Management, PDM) szoftverrel
®
®
Automatizált mintacsoportosítás és pipettázás a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorral A Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor automatizálja az egyéni donorminták pipettázását, a többszörös donorminták csoportosítását, a részletek átvitelét a mély lyukú lemezekre (opcionális) és a vizsgálati kontrollok pipettázását. A cobas s 201 rendszer a reaktív csoportokat visszabontja egyéni összetételű mintaeredményekké. A cobas s 201 rendszert a minták tételekben történő feldolgozására tervezték. Egy tétel meghatározása a minták és kontrollok olyan gyűjteménye, amelyek pipettázása, kivonása, amplifikációja és kimutatása egyszerre zajlik. Egy tétel pipettázását ® követően a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorral az egész mintaállvány a COBAS AmpliPrep készülékbe kerül az eljárás következő lépésének elvégzésére. Megjegyzés: Kadáver minták vizsgálatakor a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor alkalmazását megelőzően el kell végezni a minták 1:5 arányú manuális hígítását ® a cobas TaqScreen kadáver minta oldószerben [CADV SPEC DIL].
05888212044-01HU
2
Doc Rev 5.0
®
Automatizált minta-előkészítés a COBAS AmpliPrep készülékkel A targetből és a hozzáadott armored RNS belső kontroll (internal control, IC) molekulákból (amely a minta-előkészítési és amplifikációs/kimutatási eljárás során kontrollként szolgál) származó ® nukleinsavak feldolgozása egyszerre zajlik. A cobas TaqScreen MPX teszt reagensei segítségével ® öt egymást követő lépés megy végbe a COBAS AmpliPrep készüléken. A proteázoldat a fehérjék emésztésével elősegíti a lízist, inaktiválja a nukleázokat és lehetővé teszi az RNS és DNS felszabadítását a vírusrészecskékből. A lízisreagens hozzáadása a vírusok lízisét és a nukleázok inaktiválását eredményezi a fehérjék denaturálása által a mintában. Az RNS és DNS felszabadul és egyidejűleg védve van a nukleázok hatásától. A felszabadult nukleinsavak a hozzáadott mágneses üvegpartikulumok szilikonfelületéhez kötnek. Ez elsősorban az üvegpartikulumok felszínének nettó pozitív töltése és a nukleinsavak nettó negatív töltése miatt következik be a kaotróp sókoncentráció alatt és a lízisreakció ionerőssége miatt. A mosóreagens eltávolítja a nem kötött anyagokat és a szennyeződéseket, mint denaturált fehérjék, sejttörmelék és lehetséges PCR inhibitorok (például hemoglobin stb.), valamint csökkenti a sókoncentrációt. A mágneses üvegpartikulumokról a tisztított nukleinsavakat emelt hőmérsékleten az eluáló puffer szabadítja fel. ®
®
Nukleinsavak automatizált amplifikációja a COBAS TaqMan analizátor segítségével Az automatizált minta-előkészítés során a tisztított nukleinsavak humán plazmából történő izolálását követően a HIV-1 (M és O csoport), HIV-2 és HCV RNS, HBV DNS és IC RNS amplifikálása és ® kimutatása a cobas TaqScreen MPX master mix (MMX) segítségével történik. A mangán-acetátos ® aktiválást követően a cobas TaqScreen MPX master mix lehetővé teszi az RNS targetek reverz transzkripcióját, majd ezt követően a HIV-1 (M és O csoport), HIV-2 és HCV RNS, HBV DNS és IC RNS nagyfokban konzervált régióinak PCR amplifikációját specifikus primerekkel. Az amplifikált nukleinsavak párhuzamos kimutatása a master mixben ugyancsak jelenlevő HIV-1 (M és O csoport), HIV-2, HCV, HBV és IC-specifikus próbák 5'-nukleolitikus bontása során keletkező fluoreszcens jelek segítségével megy végbe. Két fluoreszcens festék használatos: az egyik festék az IC próbát jelöli, a másik pedig az összes targetspecifikus próbát, lehetővé téve ezáltal a vírustargetek többrétű, kombinált azonosítását, valamint az IC független azonosítását. Reverz transzkripció és PCR-amplifikálás A reverz transzkripciós és amplifikációs reakciókat egy hőstabil rekombináns enzim, a Z05 DNS2+ polimeráz végzi. Mangán (Mn ) jelenlétében a Z05 DNS-polimeráz reverz transzkriptáz és DNSpolimeráz aktivitással rendelkezik. Ez lehetővé teszi, hogy a reverz transzkripció és a PCR-amplifikálás ugyanazon reakcióelegyben menjen végbe. A PCR-amplifikálás a Z05 DNS-polimeráz segítségével megy végbe, amely a targettemplátok mentén meghosszabbítja a kapcsolódott primereket és dupla szálú DNS-t (amplikon) hoz létre. Ez a folyamat sok cikluson keresztül ismétlődik, és az amplikon DNS mennyisége minden ciklus során megduplázódik. Az targetgenomok amplifikálása csak a primerek közötti régiókban zajlik; a teljes genom nem amplifikálódik. Szelektív amplifikálás ®
A mintában található targetnukleinsav szelektív amplifikálását a cobas TaqScreen MPX teszt az AmpErase (uracil-N-glikoziláz) enzim és dezoxiuridin-trifoszfát (dUTP) használatával hajtja végre. Az AmpErase (uracil-N-glikoziláz) enzim felismeri és katalizálja az olyan DNS-szálak lebontását, 24 amelyek dezoxiuridint tartalmaznak , a dezoxitimidint tartalmazó DNS-ét és a ribouridint tartalmazó 25,26 . A dezoxiuridin a természetes DNS-ben nincs jelen, ugyanakkor az RNS-ét viszont nem amplikonokban mindig megtalálható, miután a master mix reagens a dNTP-k egyikeként dezoxiuridin-trifoszfátot használ timidin-trifoszfáttal; így csak az amplikonok tartalmaznak dezoxiuridint. A dezoxiuridin lehetővé teszi, hogy az AmpErase (uracil-N-glikoziláz) enzim a szennyező amplikont még a target DNS amplifikálását megelőzően lebontsa. Az AmpErase (uracil-N-glikoziláz) enzim lebont továbbá minden olyan nem specifikus terméket, amely a master mix kezdeti, mangán okozta aktiválódása után képződik. A master mix reagensben lévő AmpErase (uracil-N-glikoziláz) enzim katalizálja a dezoxiuridint tartalmazó DNS hasítását a dezoxiuridin-csoportoknál úgy, hogy a dezoxiribóz lánc felnyílását okozza a C1 helyen. Az első hevítési lépésben az amplikon DNS-lánc eltörik a dezoxiuridin helyén, tehát a DNS nem lesz amplifikálható. Az AmpErase (uracil-N-glikoziláz) enzim, ha egyszer 55 °C feletti hőmérsékletnek lett kitéve, hosszabb ideig inaktív marad, ezért nem semmisíti meg a PCR után képződött targetamplikont.
05888212044-01HU
3
Doc Rev 5.0
®
®
A PCR-termékek valósidejű automatizált kimutatása a COBAS TaqMan analizátor segítségével A PCR-amplifikálás ciklusai során a váltakozó magas hőmérsékleten a target- és IC-amplikon denaturálódik, és egyszálú DNS-molekula keletkezik. A specifikus kimutatási oligonukleotid próbák az amplifikált DNS egyszálú molekuláihoz hibridizálnak. Az amplifikálás, hibridizáció és kimutatás egymással egyidőben zajlik. A PCR-termékek kimutatása
27,28
®
A cobas TaqScreen MPX MMX a HIV-1 (M és O csoport), HIV-2, HCV, HBV, illetve IC nukleinsavra specifikus kimutatási próbákat tartalmaz. Mindegyik kimutatási próba jelölve van 1) a kettő közül egy, jelzőfestékként viselkedő, és 2) egy másik, blokkolófestékként viselkedő fluoreszcens festékkel. Az egyik specifikus jelzőfesték a vírusspecifikus próbákhoz kapcsolódik és egy meghatározott hullámhosszon lehet kimutatni. Egy másik jelzőfesték pedig az IC-specifikus próbához kapcsolódik és kimutatása egy eltérő hullámhosszon történik. Minden próba esetében egyféle blokkolófesték használatos. A rendszer lehetővé teszi, hogy az összes amplifikált vírustarget egy hullámhosszon, az amplifikált IC nukleinsav pedig egy másik hullámhosszon legyen kimutatható. A PCR-amplifikálás kezdete előtt a próbák még érintetlenek, és a blokkoló festék a jelzőfesték fluoreszcenciáját Förster-típusú energiatranszfer-effektus révén gátolja. A PCR-amplifikálás során a próbák a specifikus, egyszálú DNS-szekvenciákhoz hibridizálnak, amit az amplifikálással egyidőben a Z05 DNS-polimeráz 5' – 3' nukleáz aktivitása révén hasít. Amint a hasítás következtében a jelző- és a gátlófesték elválik, a jelzőfesték fluoreszcens aktivitásának gátlása megszűnik. Minden egyes PCRciklus során megnő a hasított próbák mennyisége, és ennek velejárójaként növekszik a jelzőfestékből származó jel összesített nagysága is. A PCR-termékek valós idejű kimutatása a felszabadult, vírustargeteket és IC-t egymástól függetlenül reprezentáló jelzőfestékek fluoreszcencenciájának mérésével megy végbe. Automatizált adatkezelés a PDM segítségével A Roche PDM adatkezelő lehetővé teszi, hogy a felhasználó áttekintse az eredményeket és jelentést készítsen. A Roche PDM adatkezelő minden vizsgálati eredményt nem reaktív, reaktív vagy érvénytelen jelöléssel lát el. A PCR-eredmények lekérésén és vizsgálatán felül a Roche PDM szoftver lehetővé teszi, hogy az üzemeltető a jelentéseket visszakeresés és tanulmányozás céljából kinyomtassa, az eredmények között keressen, a donoreredményeket elfogadja, illetve egy LIS kiszolgálóra továbbítsa. A ROCHE ÁLTAL BIZTOSÍTOTT ANYAGOK A HIV-1 (M és O csoport), HIV-2, valamint HCV RNS és HBV DNS kimutatására három készlet ® ® szükséges és áll rendelkezésre: 1) cobas TaqScreen MPX teszt, 2) cobas TaqScreen MPX ® kontrollkészlet és 3) cobas TaqScreen mosóreagens. Az anyagok biztonsági adatlapjai (MSDS) igény esetén hozzáférhetőek a helyi Roche irodában. ®
MPX
cobas TaqScreen MPX Test (P/N: 04584244 190)
96 teszt
MPX CS1 (MPX mágneses üvegpartikulum-reagens kazetta) MPX CS2 (MPX lízisreagens kazetta) MPX CS3 (MPX multireagens kazetta) MPX CS4 (MPX tesztspecifikus reagens kazetta)
05888212044-01HU
4
Doc Rev 5.0
®
cobas TaqScreen MPX Control Kit ® cobas TaqScreen MPX kontrollkészlet (P/N: 04626290 190)
MPX CTL
6 szett
HIV-1 M (+) C (HIV-1 M pozitív kontroll) HIV-1 O (+) C (HIV-1 O pozitív kontroll) HIV-2 (+) C (HIV-2 pozitív kontroll) HCV (+) C (HCV pozitív kontroll) HBV (+) C (HBV pozitív kontroll) TS (–) C ® [cobas TaqScreen negatív kontroll (humán plazma)] ®
TS WR
cobas TaqScreen Wash Reagent ® cobas TaqScreen mosóreagens (P/N: 04404220 190)
5,1 l
TS WR ® (cobas TaqScreen mosóreagens) MEGJEGYZÉS: A HIV-1 M csoport RNS, HIV-1 O csoport RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS és HBV DNS kimutatásához kadáver mintából a fent említett készleteken kívül a következő ® készlet szükséges és biztosított: cobas TaqScreen kadáver minta oldószer. ®
cobas TaqScreen Cadaveric Specimen Diluent Kit ® cobas TaqScreen kadáver minta oldószer készlet (P/N: 05002125 190)
CADV SPEC DIL
96 teszt
CADV SPEC DIL ® (cobas TaqScreen kadáver minta oldószer) EGYÉB SZÜKSÉGES, DE KÜLÖN ÁRUSÍTOTT ANYAGOK (A ROCHE-TÓL KÜLÖN VÁSÁROLHATÓ) A vizsgálatot a cobas s 201 rendszeren kell végezni. A cobas s 201 rendszert egy komplett rendszerkonfigurációként kell telepíteni és használni. A cobas s 201 rendszer egyes komponensei nem használhatóak különálló készülékekként, és más komponensek sem helyettesíthetőek. A cobas s 201 rendszer az alábbi komponenseket használja. Műszerezettség és szoftver a cobas s 201 rendszerhez •
Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor, Pooling Manager munkaállomás és szoftver
•
COBAS AmpliPrep készülék
•
COBAS TaqMan analizátor
•
AMPLILINK adatállomás és szoftver
•
Roche PDM adatkezelő szerver, Data Manager munkaállomás és szoftver
® ®
®
Állványok és egyszer használatos anyagok •
COBAS® AmpliPrep mintaállványok (SK24) (P/N: 28122172001)
•
COBAS AmpliPrep SPU-állványok (P/N: 05471664001)
•
COBAS AmpliPrep reagensállványok (P/N: 28122199001)
® ®
05888212044-01HU
5
Doc Rev 5.0
•
Mintafeldolgozó egységek (SPU) (P/N: 03755525001)
•
Mintabeviteli csövek (S-csövek) vonalkódklipszekkel (P/N: 03137040001)
•
K-hegy állványok (P/N: 03287343001)
•
K-cső doboz 12 x 96 (P/N: 03137082001)
•
COBAS TaqMan K-hordozó (P/N: 28150397001)
•
Nagy térfogatú CO-RE hegyek (1000 µl), filter (P/N: 04639642001)
•
Mély lyukú lemezek vonalkódcímkékkel (P/N: 04639634001)
•
Mély lyukú lemezek zárótetejei (P/N: 04789288001)
•
Mintahordozó 24 vizsgálati cső számára (P/N: 04639502001)
•
Mintahordozó 32 vizsgálati cső számára (P/N: 04639529001)
•
Hegyhordozó (P/N: 04639545001)
•
Mély lyukú lemez hordozó (P/N: 04639553001)
•
SK24 állványhordozó (P/N: 04639600001)
•
Microcide SQ™ vagy HAMILTON fertőtlenítő spray (P/N: 04864425001)
•
Egyszer használatos kesztyűk, púdermentes
®
®
REAGENSEK cobas® TaqScreen MPX Test (P/N: 04584244 190)
MPX
MPX CS1
2 x 48 teszt 2 x 7,0 ml
MGP (mágneses üvegpartikulumok) mágneses üvegpartikulumok 93% izopropanol Xi
96 teszt
93% (w/w) izopropanol
Irritatív F
93% (w/w) izopropanol
Igen tűzveszélyes MPX CS2
2 x 48 teszt
LYS (lízisreagens) nátrium-citrát-dihidrát 42,5% guanidin-tiocianát < 14% polidokanol 0,9% ditiotreitol Xn 42,5% (w/w) guanidin-tiocianát
2 x 78 ml
Ártalmas
05888212044-01HU
6
Doc Rev 5.0
MPX CS3
2 x 48 teszt 2 x 3,8 ml
Pase (proteináz oldat) trisz puffer < 0,05% EDTA kalcium-klorid kalcium-acetát ≤ 7,8% proteináz glicerin Xn ≤ 7,8% (w/w) proteináz
Ártalmas 2 x 7,0 ml
EB (eluáló puffer) trisz puffer 0,2% metilparabén tartósítószer MPX CS4
2 x 48 teszt
MPX MMX-R1 (MPX master mix reagens 1) trisz puffer kálium-acetát glicerin mangán-acetát betain 0,08% nátrium-azid
2 x 3,0 ml
MPX MMX-R2 (MPX master mix reagens 2) tricin puffer kálium-klorid kálium-hidroxid < 21% dimetil-szulfoxid glicerin EDTA Tween 20 Igepal CA630 < 0,09% dATP, dGTP, dCTP, dUTP, dTTP < 0,01% upstream és downstream HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV, HBV primerek < 0,01% fluoreszcens-jelölt HIV-1, HIV-2, HCV, HBV próbák < 0,01% fluoreszcens-jelölt belső kontroll próba < 0,01% oligonukleotid aptamer < 0,07% Z05 DNS-polimeráz (mikrobiális) < 0,4% AmpErase [uracil-N-glikoziláz] enzim (mikrobiális) 0,08% nátrium-azid
2 x 2,5 ml
MPX IC (MPX belső kontroll) trisz puffer ≤ 0,002% poli rA RNS (szintetikus) EDTA 0,05% nátrium-azid < 0,001% nem fertőző, szintetikus belső kontroll RNS, MS2 bakteriofág burokfehérjébe csomagolva
2 x 15 ml
05888212044-01HU
7
Doc Rev 5.0
®
MPX CTL
cobas TaqScreen MPX Control Kit ® cobas TaqScreen MPX kontrollkészlet (P/N: 04626290 190)
HIV-1 M (+) C (HIV-1 M pozitív kontroll) < 0,001% nem fertőző, szintetikus HIV-1 M csoportú RNS, MS2 bakteriofág burokfehérjébe csomagolva Negatív humán plazma, engedélyezett tesztek alapján nem reaktív HCV antitestre, HIV-1/2 antitestre és HBsAg-re; HIV-1 RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS és HBV DNS PCRtechnikákkal nem mutatható ki ® 0,1% ProClin 300 tartósítószer Xi
6 szett
6 x 1,6 ml
(3:1) 5-klór-2-metil-2H-izotiazol-3-on és 2-metil-2H-izotiazol-3-on keveréke Irritatív R36/38: Szem- és bőrizgató hatású. R43: Bőrrel érintkezve túlérzékenységet okozhat.
HIV-1 O (+) C (HIV-1 O pozitív kontroll) < 0,001% nem fertőző, szintetikus HIV-1 O csoportú RNS, MS2 bakteriofág burokfehérjébe csomagolva. Negatív humán plazma, engedélyezett tesztek alapján nem reaktív HCV antitestre, HIV-1/2 antitestre és HBsAg-re; HIV-1 RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS és HBV DNS PCRtechnikákkal nem mutatható ki ® 0,1% ProClin 300 tartósítószer Xi
6 x 1,6 ml
(3:1) 5-klór-2-metil-2H-izotiazol-3-on és 2-metil-2H-izotiazol-3-on keveréke Irritatív R36/38: Szem- és bőrizgató hatású. R43: Bőrrel érintkezve túlérzékenységet okozhat.
HIV-2 (+) C (HIV-2 pozitív kontroll) < 0,001% nem fertőző, szintetikus HIV-2 RNS, MS2 bakteriofág burokfehérjébe csomagolva Negatív humán plazma, engedélyezett tesztek alapján nem reaktív HCV antitestre, HIV-1/2 antitestre és HBsAg-re; HIV-1 RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS és HBV DNS PCRtechnikákkal nem mutatható ki ® 0,1% ProClin 300 tartósítószer Xi
6 x 1,6 ml
(3:1) 5-klór-2-metil-2H-izotiazol-3-on és 2-metil-2H-izotiazol-3-on keveréke Irritatív R36/38: Szem- és bőrizgató hatású. R43: Bőrrel érintkezve túlérzékenységet okozhat.
05888212044-01HU
8
Doc Rev 5.0
6 x 1,6 ml
HCV (+) C (HCV pozitív kontroll) < 0,001% nem fertőző, szintetikus HCV RNS, MS2 bakteriofág burokfehérjébe csomagolva Negatív humán plazma, engedélyezett tesztek alapján nem reaktív HCV antitestre, HIV-1/2 antitestre és HBsAg-re; HIV-1 RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS és HBV DNS PCRtechnikákkal nem mutatható ki ® 0,1% ProClin 300 tartósítószer Xi
(3:1) 5-klór-2-metil-2H-izotiazol-3-on és 2-metil-2H-izotiazol-3-on keveréke Irritatív R36/38: Szem- és bőrizgató hatású. R43: Bőrrel érintkezve túlérzékenységet okozhat. 6 x 1,6 ml
HBV (+) C (HBV pozitív kontroll) 0,001% nem fertőző, szintetikus HBV DNS, lambda bakteriofág burokfehérjébe csomagolva Negatív humán plazma, engedélyezett tesztek alapján nem reaktív HCV antitestre, HIV-1/2 antitestre és HBsAg-re; HIV-1 RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS és HBV DNS PCRtechnikákkal nem mutatható ki ® 0,1% ProClin 300 tartósítószer Xi (3:1) 5-klór-2-metil-2H-izotiazol-3-on és 2-metil-2H-izotiazol-3-on keveréke Irritatív R36/38: Szem- és bőrizgató hatású. R43: Bőrrel érintkezve túlérzékenységet okozhat.
6 x 1,6 ml
TS (–) C ® [cobas TaqScreen negatív kontroll (humán plazma)] Negatív humán plazma, engedélyezett tesztek alapján nem reaktív HCV antitestre, HIV-1/2 antitestre és HBsAg-re; HIV-1 RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS és HBV DNS PCRtechnikákkal nem mutatható ki ® 0,1% ProClin 300 tartósítószer Xi
(3:1) 5-klór-2-metil-2H-izotiazol-3-on és 2-metil-2H-izotiazol-3-on keveréke Irritatív R36/38: Szem- és bőrizgató hatású. R43: Bőrrel érintkezve túlérzékenységet okozhat.
®
TS WR
cobas TaqScreen Wash Reagent ® cobas TaqScreen mosóreagens (P/N: 04404220 190)
5,1 l
TS WR ® (cobas TaqScreen mosóreagens) nátrium-citrát-dihidrát 0,1% metilparabén tartósítószer ®
cobas TaqScreen Cadaveric Specimen Diluent Kit ® cobas TaqScreen kadáver minta oldószer készlet (P/N: 05002125 190)
96 teszt
4 x 100 ml
CADV SPEC DIL ® (cobas TaqScreen kadáver minta oldószer) EDTA
05888212044-01HU
CADV SPEC DIL
9
Doc Rev 5.0
TÁROLÁSI ÉS KEZELÉSI KÖVETELMÉNYEK A. A szobahőmérséklet meghatározása 15–30 °C. B. A reagenseket és kontrollokat ne fagyassza le. C. A MPX CS1, MPX CS2, MPX CS3 és MPX CS4 reagenseket 2 és 8 °C között tárolja. Használaton kívül ezek a reagensek a feltüntetett lejárati időn belül stabilak. D. Felbontást követően a reagensek 2–8 °C-on 30 napig, illetve a lejárati dátumig stabil, amelyik előbb következik. ®
E. A reagenseket a COBAS AmpliPrep készüléken legfeljebb 6 vizsgálati futtatás alakalmával és legfeljebb 40 összesített órán át lehet felhasználni. A futtatások között a reagenseket 2 és 8 °C ® között tárolja. Az AMPLILINK szoftver ellenőrzi a reagenskazetták COBAS AmpliPrep készülékben töltött összesített idejét, és meggátolja a kazetták felhasználását a 40. összesített óra elérése után. ®
F. A COBAS AmpliPrep készülékben a reagensek egyhuzamban összesen 24 órán keresztül ® maradnak stabilak. Az AMPLILINK szoftver nem ellenőrzi a reagenskazetták COBAS AmpliPrep készülékben töltött folyamatos idejét, sem a kazettákat felhasználó gépi ciklusok számát. A felhasználó felelőssége, hogy a 24 folyamatos óra vagy 6 gépi ciklus elérése után eldobja a reagenskazettákat. G. A HIV-1 M (+) C, HIV-1 O (+) C, HIV-2 (+) C, HCV (+) C, HBV (+) C és TS (–) C reagenseket 2 és 8 °C között tárolja. A kontrollok a feltüntetett lejárati időn belül stabilak. Felbontást követően a fel nem használt részt ki kell dobni. H. A TS WR reagenst 15 és 30 °C között tárolja. Felbontás nélkül a TS WR reagens a feltüntetett lejárati időn belül stabil. Felbontást követően ez a reagens 15 és 30 °C között 30 napig illetve a lejárati dátumig stabil, amelyik előbb következik. I.
A CADV SPEC DIL reagenst 15 és 30 °C között tárolja. Az oldószer a feltüntetett lejárati időn belül stabil. Felbontást követően a tartályban maradt fel nem használt oldószert ki kell dobni.
ÓVINTÉZKEDÉSEK IN VITRO DIAGNOSZTIKAI CÉLRA. A. A minták fertőzőek lehetnek. A vizsgálat kivitelezése során alkalmazza az általános érvényű 29,30 ® Csak a cobas TaqScreen MPX rendszer használatában jártas és a fertőző óvintézkedéseket. anyagok kezelésében képzett személy végezheti ezt az eljárást. Gondosan tisztítson meg, és desztillált vagy ioncserélt vízből frissen készített 0,5% nátrium-hipoklorit oldattal (hígított fehérítőszer) fertőtlenítsen minden laboratóriumi munkafelületet. Ezután törölje át 70%-os etanollal a felületet. B. FIGYELMEZTETÉS: A HIV-1 M (+) C, HIV-1 O (+) C, HIV-2 (+) C, HCV (+) C, HBV (+) C és TS (–) C reagensek emberi vérből származó humán plazmát tartalmaznak. A forrásanyag tesztekkel vizsgálva nem bizonyult reaktívnak HIV-1/2 antitestre, HCV antitestre és HBsAg® re. A forrásanyagot a cobas TaqScreen MPX teszttel is vizsgálták. A negatív humán plazma PCR-technikákkal történő vizsgálata során HIV-1 (M és O csoport) RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS vagy HBV DNS nem volt kimutatható. Egyetlen ismert vizsgálati módszer sem nyújthat teljes garanciát arra, hogy a humán vérkészítményekben nincs jelen fertőző anyag. Minden humán vér eredetű anyagot potenciálisan fertőzőnek kell tekinteni, és az általános érvényű óvintézkedések betartásával kezelni. Kiömlés esetén azt azonnal fertőtlenítse frissen készített 0,5%-os nátrium-hipoklorit oldattal (hígított fehérítőszer), illetve kövesse a megfelelő helyszíni eljárásokat. C. Alkalmazza a szokásos laboratóriumi óvintézkedéseket. Ne pipettázzon szájjal. Ne egyen, igyon vagy dohányozzon a kijelölt munkaterületen. Viseljen egyszer használatos kesztyűt, köpenyt és szemvédőt a minták és a készlet reagenseinek kezelése közben. A minták és tesztreagensek kezelését követően gondosan mosson kezet. D. Az MPX MMX-R1, MPX MMX-R2 és MPX IC reagensek tartósítószerként nátrium-azidot tartalmaznak. Ne használjon fém vezetékezést a reagenstranszferhez. Amennyiben azidot tartalmazó oldatot önt a vízvezeték-hálózatba, hígítsa azt fel, és öblítse le nagy mennyiségű folyóvízzel. Ezek az óvintézkedések arra szolgálnak, hogy elkerülje az üledék lerakódását a fém csővezetékben, ahol azáltal robbanásra alkalmas körülmények alakulhatnak ki. E. A heparinról kimutatták, hogy gátolja a PCR-t. Az eljáráshoz ne használjon heparinos plazmát.
05888212044-01HU
10
Doc Rev 5.0
F. Steril, egyszer használatos pipetták és nukleázmentes pipettahegyek használata javasolt. Álpozitív eredmények fordulhatnak elő, ha nem ügyel a minták keresztszennyeződésének elkerülésére a mintakezelés és -feldolgozás során. G. Az optimális vizsgálati feltételek biztosítása érdekében csak a szállított vagy az előírtan szükséges egyszer használatos eszközöket alkalmazza. H. A minták és kontrollok keresztszennyeződésének elkerülésére kezeljen minden mintát és kontrollt tartalmazó anyagot a helyes laboratóriumi gyakorlat (GLP) szerint. I.
Felhasználás előtt szemrevételezzen minden reagenskazettát, kontrollcsövet és mosóreagenst, hogy nem tapasztal-e szivárgásra utaló jeleket. Szivárgás esetén azt az anyagot ne használja fel a vizsgálathoz.
J.
Minden anyagot, amely mintákkal vagy reagensekkel kapcsolatba került, az országos, szövetségi, állami és helyi szabályozások szerint semmisítsen meg. ®
®
®
K. A cobas TaqScreen MPX tesztkészletet, cobas TaqScreen MPX kontrollkészletet, cobas ® TaqScreen mosóreagenst, illetve a cobas TaqScreen kadáver minta oldószer készletet a lejárati idő után ne használja fel. A különböző készletekből származó, illetve eltérő tételszámú reagensek felcserélése, összekeverése vagy kombinálása tilos. Ne töltsön kevert tételszámú reagenseket ® a COBAS AmpliPrep készülékbe. L. Az anyagok biztonsági adatlapjai (MSDS) igény esetén hozzáférhetőek a helyi Roche irodában.
M. Kerülje a reagensek bőrrel, szemmel vagy nyálkahártyákkal való érintkezését. Ha érintkezés mégis bekövetkezik, azonnal mossa le nagy mennyiségű vízzel, ellenkező esetben égési sérülés jelentkezhet. Ha ezek a reagensek kiömlenek, feltörlés előtt hígítsa fel azokat vízzel. Ne engedje, hogy a LYS reagens, amely guanidin-tiocianátot tartalmaz, nátrium-hipoklorit (fehérítőszer) oldattal érintkezzen. Az ilyen keverékből erősen mérgező gáz fejlődhet. N. A vizsgálat helyes kivitelezésének biztosítása végett szigorúan tartsa be a megadott eljárásokat és irányelveket. A megadott eljárásoktól és irányelvektől való bármilyen eltérés befolyásolhatja a vizsgálat teljesítményét. O. Ne használjon nagymértékben hemolizált élő donor mintákat. ®
P. A plazmaminták vörösvértest-szennyezettsége (> 2,5%) gátolhatja a cobas TaqScreen MPX vizsgálatot. Q. A vizsgálat egyik szakaszában se használjon sérült vonalkódú összetevőket. R. Kadáver donor eredetű minták vizsgálatakor a minták osztályozása: a szalmasárgától a rózsaszínűig mérsékelten hemolizált minta, a pirostól a sötétpiros, illetve barna színűig pedig nagyfokban hemolizált minta. KONTROLLOK ÉS REAGENSEK ELŐKÉSZÍTÉSE ®
A. A cobas TaqScreen MPX kontrollkészletet hagyja 30 percen át, hogy felvegye a szobahőmérsékletet, ® mielőtt betölti a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorba. A cobas TaqScreen MPX ® teszt reagenseit hagyja 30 percen át a COBAS AmpliPrep készülékben, hogy felvegyék a szobahőmérsékletet. MINTAVÉTEL, -TÁROLÁS ÉS -CSOPORTOSÍTÁS Megjegyzés: Valamennyi mintát fertőző ágensként kell kezelni. Élő donor minták A. EDTA, CPD, CPDA1, CP2D, ACDA és 4% nátrium-citrát antikoagulánssal levett plazmaminták ® dolgozhatóak fel a cobas TaqScreen MPX teszttel. Kövesse a mintacső gyártójának utasításait. B. Az EDTA-s vérminták a plazma elválasztását megelőzően 2–30 °C-on legfeljebb 72 óráig, 2–8 °C-on további 48 óráig tárolhatóak. Öt napnál hosszabb tároláshoz válassza el a plazmát a vörösvértestektől centrifugálással (800–1600 x g, 20 perc). A eltávolítást követően a plazma 2–8 °C között legfeljebb hét napig, ≤ -18 °C-on további 30 napig tárolható. Az EDTA-s plazma legfeljebb három (3) alkalommal fagyasztható le és olvasztható fel.
05888212044-01HU
11
Doc Rev 5.0
2 – 30 ºC
Hőmérséklet (oC)
30
EDTA véralvadásgátló
20
2 – 8 ºC
10
Teljes vér Plazma
0 0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
Levételt követő napok
C. A CPD, CPDA1 vagy CP2D antikoagulánssal levett minták a plazma elválasztását megelőzően 2–30 °C-on, legfeljebb 72 óráig tárolhatóak. 72 óránál hosszabb tároláshoz válassza el a plazmát a vörösvértestektől centrifugálással (800–1600 x g, 20 perc). A eltávolítást követően a plazma 2–8 °C között legfeljebb hét napig, ≤ -18 °C-on további 30 napig tárolható. A CPD, CPDA1, és CP2D-s plazma legfeljebb három (3) alkalommal fagyasztható le és olvasztható fel. 2 – 30 ºC
Hőmérséklet (oC)
30
CPD, CPDA1 vagy CP2D véralvadásgátló
20
2 – 8 ºC
10
Teljes vér Plazma
0 0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
Levételt követő napok
D. Az ACDA vagy 4% nátrium-citrát antikoagulánst tartalmazó elválasztott plazma a levételt követően 2–30 °C-on, legfeljebb 72 órán át tárolható. Az elválasztott plazma ≤ -18 °C-on további 30 napig tárolható. E. A következő, plazmatérfogatokra vonatkozó előírások 13 x 100 mm-es üveg vagy műanyag donorcsövekből Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorral történő pipettázásra alapulnak. A felsorolt térfogatok a leülepedett vörösvértestek tetejéről vett plazmára vonatkoznak és ® a cobas TaqScreen MPX teszt futtatásához alkalmazandóak. Csoporttípus Elsődleges csoport* Ismételt csoport Megerősítési csoport
Legkisebb plazmatérfogat 3 ml 1,5 ml 2 ml
*Mély lyukú lemezt használva (könyvtárlemez)
F. A teljes vért nem szabad lefagyasztani. G. A heparinról kimutatták, hogy gátolja a PCR-t. Heparinos plazma használata nem ajánlott. H. A lefedett mély lyukú lemezek 2–8 °C-on legfeljebb hét napig tárolhatóak attól az időponttól számítva, amikor a plazmát a vörösvértestekről eltávolították. Tárolásukra szükség esetén ≤ -18 °C-on, legfeljebb 7 napig van lehetőség. I.
Háromszori fagyasztás-olvasztás ciklusnak kitett plazmaminták esetében a vizsgálatra gyakorolt semmiféle nemkívánatos hatást nem figyeltek meg.
J.
Hagyja, hogy az csoportosított vagy egyéni donorminták felhasználás előtt felvegyék a szobahőmérsékletet.
05888212044-01HU
12
Doc Rev 5.0
K. Eltérő gyűjtési és tárolási feltételeket a felhasználónak validálnia kell. Amennyiben a minták szállítása szükséges, akkor azokat a minták és kóroki ágensek transzportjára vonatkozó 31 szövetségi és nemzetközi előírásoknak megfelelően kell csomagolni és felcímkézni. L. Álpozitív eredmények fordulhatnak elő a minták keresztszennyeződéséből adódóan, ha azok nem voltak megfelelően kontrollálva a mintakezelés és -feldolgozás során. Kadáver minták A.
Kadáver donor eredetű minták vizsgálatakor a minták osztályozása: a szalmasárgától a rózsaszínűig mérsékelten hemolizált minta, a pirostól a sötétpiros, illetve barna színűig pedig nagyfokban hemolizált minta.
B.
A cobas TaqScreen MPX teszttel EDTA antikoagulánst tartalmazó csövekbe, illetve szérumcsövekbe levett kadáver vérminták használhatóak. Kövesse a mintacső gyártójának utasításait. Az emelkedett hőmérséklet befolyásolja a minták stabilitását.
C.
Az EDTA-s kadáver vérminták a plazma elválasztását megelőzően 2–30 °C-on legfeljebb 24 óráig, 2 – 25 °C-on további 24 óráig tárolhatóak. Két napnál hosszabb tároláshoz válassza el a plazmát a vörösvértestektől centrifugálással (800–1600 x g, 20 perc). Eltávolítást követően a plazma 2–8 °C-on még további nyolc napig tárolható. Szükség esetén a plazma tárolására ≤ -18 °C-on, legfeljebb 30 napig van lehetőség. A kadáver EDTA-s plazma legfeljebb három (3) alkalommal fagyasztható le és olvasztható fel.
®
30 °C
20 10
25 °C
Kadáver minta EDTA antikoagulánsban
Teljes vér
Hőmérséklet (°C)
30
2 – 8 °C
Plasma 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15
Levételt követő napok
D.
A szérumként levett kadáver minták a centrifugálást megelőzően 2–30 °C-on legfeljebb 24 óráig, 2 – 25 °C-on további 24 óráig tárolhatóak. Két napnál hosszabb tároláshoz válassza el a szérumot az alvadéktól centrifugálással (800–1600 x g, 20 perc). Eltávolítást követően a szérumminták 2–8 °C-on még további három napig tárolhatóak. Szükség esetén az alvadéktól elválasztott szérum tárolására ≤ -18 °C-on, legfeljebb 15 napig van lehetőség. A kadáver szérumminta legfeljebb három (3) alkalommal fagyasztható le és olvasztható fel. 30 °C 25 °C
Kadáver szérum 20 10
Teljes vér
Hőmérséklet (°C)
30
2 – 8 °C
Szérum 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15
Levételt követő napok
E.
®
A cobas TaqScreen kadáver minta oldószerrel 1:5 arányban hígított kadáver minták 2 – 8 °C-on legfeljebb 1 napig tárolhatóak, és keverés után (fel-le pipettázás négy (4) alkalommal minden ® csőben) vizsgálhatóak a cobas TaqScreen MPX teszttel.
05888212044-01HU
13
Doc Rev 5.0
F.
Amennyiben a minták szállítása szükséges, akkor azokat a minták és kóroki ágensek transzportjára 31 vonatkozó szövetségi és nemzetközi előírásoknak megfelelően kell csomagolni és felcímkézni.
G.
Álpozitív eredmények fordulhatnak elő a minták keresztszennyeződéséből adódóan, ha azok nem voltak megfelelően kontrollálva a mintakezelés és -feldolgozás során.
MINTACSOPORTOSÍTÁS ÉS -PIPETTÁZÁS A.
A cobas s 201 rendszer a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettort használja minden pipettázási és csoportosítási tevékenységhez. A Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor elvégzi a vonalkódleolvasási és csoportosítási műveleteket, minek során a mintatérfogatok egyenlő részleteiből csoportokat hoz létre.
B.
Ha a cobas TaqScreen MPX teszt reaktív csoportot mutat kit, a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor pipettázza az egyéni mintákat a mély lyukú lemezekből vagy eredeti mintacsövekből a megerősítő vizsgálathoz.
C.
A forrásplazma esetében, ha a cobas TaqScreen MPX teszttel reaktív csoport mutatható ki, a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor pipettázza az egyéni mintákat a 2D csoportosítási, illetve a megerősítő csoportosítási eljárásnak megfelelően, ahogy az a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyvében olvasható.
®
®
ELJÁRÁSSAL KAPCSOLATOS MEGJEGYZÉSEK A. Felszerelés 1. A használathoz készítse elő a cobas s 201 rendszert a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyv utasításainak megfelelően. 2. A helyes működés érdekében végezze el a javasolt karbantartást a készülékeken. B. Reagensek ®
1. Felhasználás előtt a cobas TaqScreen MPX teszt reagenseit hagyja 30 percen át ® ® a COBAS AmpliPrep készülékben, hogy felvegyék a szobahőmérsékletet. A cobas ® TaqScreen MPX kontrollkészletnek és a cobas TaqScreen mosóreagensnek a felhasználáskor szobahőmérsékletűnek kell lennie. A reagensek tárolási körülményeire vonatkozóan tanulmányozza a Tárolási és kezelési előírások részt. ®
2. Valamennyi cobas TaqScreen MPX tesztkészlet összesen 96 vizsgálat elvégzéséhez elegendő reagenst tartalmaz, amelyek futtatását SK24 állványonként 24 vizsgálatot tartalmazó tételekben célszerű kivitelezni. Tételenként, illetve SK24 állványonként egy negatív kontrollt és egy pozitív kontrollt is fel kell dolgozni. A kontrollokat élő donor minta és kadáver minta esetében is azonos módon kell feldolgozni a cobas® TaqScreen MPX teszttel. ®
3. Minden cobas TaqScreen kadáver minta oldószer készlet összesen 96 vizsgálat elvégzéséhez elegendő reagenst tartalmaz, amelyek futtatását SK24 állványonként 24 vizsgálatot tartalmazó tételekben célszerű kivitelezni. Tételenként, illetve SK24 állványonként egy negatív kontrollt és egy pozitív kontrollt is fel kell dolgozni. A kontrollokat élő ® donor minta és kadáver minta esetében is azonos módon kell feldolgozni a cobas TaqScreen MPX teszttel. 4. Minden kontrollt csak egyszer lehet felhasználni. 5. A rendszer megakadályozza, hogy eltérő tételből származó reagenseket, a készülékben tölthető időt túllépő reagenseket, kevert reagenseket, illetve a négykazettás szettből olyan lejárt vagy kevert kazettákat használjon, amelyek használatára a rendszerben már előzőleg ® sor került. Ne töltsön kevert tételszámú reagenseket a COBAS AmpliPrep készülékbe. C. Mintafeldolgozás 1. A minták és kontrollok kezelése során ügyeljen a kesztyűk szennyezésének elkerülésére. 2. Legyen óvatos, hogy elkerülje a minták és a TS (–) kontroll szennyezését a pozitív kontrollal.
05888212044-01HU
14
Doc Rev 5.0
D. Megkülönböztető vizsgálat 1. Élő donorok: A megkülönböztető vizsgálatot megelőzően a mintát azonosítani kell egy ® érvényes csoporton belül és érvényes egyéni eredményt nyerni a cobas TaqScreen ® MPX teszt segítségével. Ez az egyéni reaktív minta a COBAS AmpliScreen HBV teszt, a COBAS® AmpliScreen HCV teszt, v2.0 és a COBAS® AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 megkülönböztető vizsgálatokkal futtatható. A megkülönböztető vizsgálati eljárásokra ® vonatkozóan tanulmányozza a COBAS AmpliScreen HBV teszt használati utasítását, ® ® a COBAS AmpliScreen HCV teszt, v2.0 használati utasítását és a COBAS AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 használati utasítását. További vizsgálatokra lehet szükség a HIV-1 O csoport és HIV-2 megkülönböztetésére. A Roche nem biztosít megkülönböztető teszteket a HIV-1 O csoport és HIV-2 vizsgálatára. ®
2. Kadáver donorok: Egy egyéni reaktív kadáver minta a COBAS AmpliScreen HBV teszt, ® ® a COBAS AmpliScreen HCV teszt, v2.0 és a COBAS AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 megkülönböztető vizsgálatokkal futtatható. A megkülönböztető vizsgálati eljárásokra vonat® ® kozóan tanulmányozza a COBAS AmpliScreen HBV teszt használati utasítását, a COBAS ® AmpliScreen HCV teszt, v2.0 használati utasítását és a COBAS AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 használati utasítását. HASZNÁLATI UTASÍTÁS A cobas s 201 rendszer négy fő eljárást foglal magában: Minta és kontroll pipettázása a Hamilton ® MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorral, minta-előkészítés a COBAS AmpliPrep készüléken ® ® ® a cobas TaqScreen MPX teszttel, amplifikálás/kimutatás a COBAS TaqMan analizátoron, valamint adatkezelés. ®
Minden cobas TaqScreen MPX tesztkészlet nyolc kazettát tartalmaz: két MPX CS1 kazetta mágneses üvegpartikulumokkal, két MPX CS2 kazetta lízisreagenssel, két MPX CS3 kazetta proteázzal és eluáló pufferrel, valamint két MPX CS4 kazetta az IC, MMX 1 és MMX 2 reagensekkel. A teszt® ® készletet a cobas TaqScreen MPX kontrollkészlettel és a cobas TaqScreen mosóreagenssel ® együtt kell használni, továbbá a minták feldolgozásához a cobas TaqScreen kadáver minta oldószer készlettel. Megjegyzés: Ne nyissa ki a kazettákat. Megjegyzés: Ne öntsön össze különböző tételekből, vagy azonos tételből, de különböző flakonokból származó reagenseket. Megjegyzés: Ne keverje a különböző készletből származó reagenseket (se a kazettákat). ®
Megjegyzés: Ne töltsön kevert tételszámú reagenseket a COBAS AmpliPrep készülékbe. Megjegyzés: Ne válassza le a kontrollcsöveket az adapterről. Végezzen el minden szükséges karbantartást a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyv utasításait követve. Részletes használati útmutatás céljából tanulmányozza a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyvét. A. Kontrollok és minták pipettázása a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorral Megjegyzés: A minták és kontrollok előkészítése során ügyeljen a kesztyűk szennyezésének elkerülésére. Megjegyzés: Keverje meg a kontrollokat háromszori óvatos döntögetéssel úgy, hogy ne képződjenek buborékok. Megjegyzés: Kadáver minták vizsgálatához a mély lyukú lemez használata nem volt hozzáférhető a cobas s 201 rendszer üzembe helyezésének időpontjában. 1. Helyezze üzembe a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettort, majd a képernyőn megjelenő utasításokat követve indítsa el a Roche PDM csoportosítási varázslót. 2. Ügyeljen rá, hogy ne sértse meg a mintacsövek és kontrollcső adaptorok azonosító vonalkódját. Ha sérült, a rendszer nem fogja felismerni a mintákat vagy kontrollokat.
05888212044-01HU
15
Doc Rev 5.0
3. Távolítsa el a kontrollcsövek kupakját és helyezze a mintákat, fogyóeszközöket és kontrollokat a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorba. A minták, fogyóeszközök és kontrollok betöltése után a készülék átviszi a kontrollokat és mintákat az S-csövekbe. 4. Egyéni kadáver minták esetében pipettázzon 2000 µl CADV SPEC DIL oldószert a megfelelően jelölt 13 x 100 mm-es csövekbe, mérjen minden egyéni csőbe 500 µl kadáver mintát és keverje meg azt négyszeri (4) fel-le pipettázással. Töltse be a hígított kadáver mintákat, fogyóeszközöket és kontrollokat a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorba. A hígított kadáver minták, fogyóeszközök és kontrollok betöltése után a készülék átviszi a kontrollokat és hígított mintákat az S-csövekbe. A hígított kadáver minták és MPX kontrollok a nyitott csövekben legfeljebb 6 óráig stabilak. 5. A pipettázási folyamatot követően tekintse át a figyelmeztetéseket és nyomtassa ki a csoportosítási jelentés(eke)t. Ellenőrizze a csoportokat és a mély lyukú lemezek lyukait. Érvénytelenítse a csoportokat és/vagy lyukakat, ha vörösvértest-szennyeződést észlel, illetve a térfogatok nem egyenletesek. ®
6. Zárja le az S-csöveket, és vigye át az SK24 állvány(oka)t a COBAS AmpliPrep készülékbe a nukleinsavkivonás lépésének elvégzésére. Ha megtörtént az átvitel az S-csövekbe, ott minden vírustarget és kontroll 6 óráig stabil. 7. Zárja le és tárolja a mély lyukú lemezeket (amennyiben lemezek készültek a pipettázási futás során). A mély lyukú lemezekben tárolva minden vírustarget 2–8 °C-on 7 napig, illetve ≤ -18 °C-on 7 napig marad stabil. 8. Távolítsa el a tároló- és donorcsöveket. A feltételek végett tanulmányozza a „Mintavétel, -tárolás és -csoportosítás” részt. 9. Távolítsa el és dobja ki a kontrollcsöveket. (A kontrollcsöveket csak egyszer lehet felhasználni.) ®
B. A cobas TaqScreen MPX tesztreagensek előkészítése és betöltése ®
Megjegyzés: Ügyeljen rá, hogy ne sértse meg a kazetták címkéit. A COBAS AmpliPrep készülék vonalkód leolvasója automatikusan leolvassa minden kazetta vonalkódcímkéjét a reagensállvány készülékbe történő betöltése folyamán. 1. A mintafeldolgozás megkezdése előtt a reagenseket hagyja 30 percen át a COBAS AmpliPrep készülékben. Nincs szükség egyéb reagens-előkészítési lépésre.
®
2. Az indítást megelőzően minden kazettából annyit kell betölteni, hogy elegendő legyen ® a feldolgozásra kerülő minták teljes számának befogadására a COBAS AmpliPrep készülék folyamatos üzeme során. Mindegyik kazetta 48 vizsgálatra elegendő reagenst tartalmaz. A reagensek folyamatos üzem során való betöltéséről a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyv vonatkozó részében tájékozódhat. 3. Helyezze az MPX CS1 kazettát a reagensállványba úgy, hogy a kazetta vonalkódja egy vonalban legyen az állvány jobb oldalán található vonalkóddal. Az MPX CS1 kazettákat együtt, egy másik reagensállványon kell betölteni, mint a többi kazettát. ®
4. Helyezze be az MPX CS1 kazettákat tartalmazó reagensállványt a COBAS AmpliPrep készülék A állványpozíciójába, és csúsztassa be a tűvel való ütközésig, majd várjon, amíg a reagensállvány LED zöldre vált, mielőtt az állványt a készülék belsejében elhelyezkedő végső pozíciójába tolja. Ne töltsön kevert tételszámú reagenseket a készülékbe. 5. Helyezzen egy-egy szett MPX CS2, MPX CS3 és MPX CS4 kazettát mindegyik MPX CS1 kazetta számára a reagensállvány(ok)ba úgy, hogy a kazetta vonalkódja egy vonalban legyen az állvány jobb oldalán található vonalkóddal. ®
6. Helyezze be a reagensállvány(oka)t a COBAS AmpliPrep készülék B, C, D, illetve E állványpozíciójába, és csúsztassa be a tűvel való ütközésig, majd várjon, amíg a reagensállvány LED zöldre vált, mielőtt az állványt a készülék belsejében elhelyezkedő végső pozíciójába tolja. ®
7. A COBAS AmpliPrep készülék állapotsorán a LED-ek zöldre váltanak, ha minden szükséges készlet és összetevő a készülékben van és a készülék felismerte azokat.
05888212044-01HU
16
Doc Rev 5.0
C. Nukleinsavak kivonása a pipettázott mintákból és kontrollokból Megjegyzés: Az alábbi lépéseket tiszta munkapadon végezze el. 1. Távolítsa el a mintafeldolgozó egység (SPU) csomagolását, de hagyja a szalagot és a műanyag fedőt érintetlenül. 2. Úgy, hogy az SPU-állvány nagy füle a felhasználó felé nézzen, illessze az SPU-öblítő köteget az SPU-állvány jobb oldalához. 3. Távolítsa el a szalagot és a műanyag fedőt az állványba illesztett SPU-król. Ellenőrizze, hogy minden SPU megfelelően benyomva, egy szintben legyen és teljes mértékben illeszkedjen az állványba. Egy elmozdult SPU műszerhibát okozhat. Ne nyomja meg a SPU-ban található S-hegyet. ®
4. Csúsztassa a betöltött SPU-állványokat a COBAS AmpliPrep készülék I, J, illetve K SPUpozícióiba addig, amíg teljesen nem illeszkednek és a készülék fel nem ismeri azokat. A készülék egyszerre 72 SPU befogadására alkalmas. Töltsön be a futtatáshoz megkívánt számú SPU-t, illetve helyezzen be továbbiakat, ha szükséges. 5. Távolítsa el a gyártó által betöltött K-csövek és K-hegyek celofán csomagolását, és vigyázzon, hogy ne döntse meg az állványokat. Ellenőrizze, hogy megfelelően illeszkednek-e. ®
6. Csúsztassa be legalább a szükséges számú K-cső és K-hegy állványt a COBAS AmpliPrep készülék M, N, O és P pozícióiba. 7. Az munkaállomáson az AMPLILINK szoftver segítségével adja meg a mintasorrendet. 8. Töltse be a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorral pipettázott mintákat és ® kontrollokat tartalmazó SK24 állványokat a COBAS AmpliPrep készülék F, G, illetve H pozícióiba. Csúsztassa kattanásig az állványokat. Ellenőrizze a rendszer mintaállapot ablakában, hogy a készülék az összes állvány összes mintáját felismerte-e. 9. Az AMPLILINK szoftver segítségével ellenőrizze, hogy elegendő mennyiségű reagens és fogyóeszköz lett-e betöltve a kívánt minta-előkészítési eljáráshoz. 10. Nyomja meg az AMPLILINK szoftver munkaállomás Start gombját, hogy elindítsa ® a COBAS AmpliPrep készülék minta-előkészítési eljárást. ®
11. Minden fel nem használt K-hegy és K-cső a COBAS AmpliPrep készüléken belül lezárva visszamarad a következő futtatásban való felhasználás céljára. D.
Amplifikáció és kimutatás ®
®
1. Vigye át a feldolgozott mintákat tartalmazó az SK24 állványokat a COBAS TaqMan ® ® analizátorra. A COBAS TaqMan analizátor automatikusan megkezdi az amplifikálási és ® ® kimutatási eljárást. A futtatásnak a COBAS TaqMan analizátoron 1 órán belül el kell kezdődnie attól számítva, hogy az adott SK24 állványban befejeződött a minta-előkészítés. Ha 1 órán belül nem viszi át az SK24 állványokat, azokra érvénytelen eredményt fog kapni, kivéve az érvényes mintacsoportban levő reaktív eredményeket, amelyek reaktívként lesznek jelentve. ®
®
2. Ha befejeződött az amplifikálás és kimutatás a COBAS TaqMan analizátoron, a vizsgált minták automatikusan a hulladékgyűjtőbe kerülnek. 3. Az AMPLILINK szoftver adatállomáson fogadja el az eredményeket. 4. Az eredmények automatikusan a PDM szoftverre továbbítódnak.
05888212044-01HU
17
Doc Rev 5.0
E. Eredmények áttekintése és kiadása 1. Indítsa el a Roche PDM adatállomást. 2. Keresse ki a még nem értékelt tételeket az adatkezelő munkaállomás „Review Batches” füle alatt. 3. Tekintse át a figyelmeztetéseket úgy, hogy kijelöli a tételt és a „Next” gombra kattint. 4. Tekintse át a kontrolleredményeket a „Controls Review” fül alatt. A kontrollok érvényességi kikötéseinek megismerése céljából tanulmányozza a Minőség-ellenőrzés részt. 5. Tekintse át a csoporteredményeket a kiválasztott tétel „Alarms Review” füle alatt. A nem reaktív csoportok szükség esetén a felhasználó által manuálisan érvényteleníthetőek. Az érvénytelen csoportok minden donormintáját újra kell vizsgálni. 6. Tekintse át és adja ki a donoreredményeket a kiválasztott tétel „Donor Review” füle alatt. 7. Nyomtassa ki a jelentéseket és küldje tovább a laboratóriumi információs rendszerre (LIS), ha ilyen rendelkezésre áll. MINŐSÉG-ELLENŐRZÉS 1. Minden egyes tétellel együtt egy negatív kontrollt [TS (–) C] és az öt pozitív kontroll mindegyikéből egyet-egyet [HIV-1 M (+) C, HIV-1 O (+) C, HIV-2 (+) C, HCV (+) C és HBV (+) C] is fel kell dolgozni. 2. Tétel állapota: A „Complete, Valid” tételállapot jelenik meg, ha a tételkontrollok érvényesek. Ha a tételben bármelyik kontroll érvénytelen, az egész tétel eredménye érvénytelen lesz. Az eredmények kontrollhibából adódó érvénytelenítését a PDM szoftver automatikusan elvégzi. a. Negatív kontroll Ahhoz, hogy a negatív kontroll [TS (–) C] érvényes legyen, az eredmény értékelése nem reaktív, valamint a járulékos belső kontroll érvényes kell, hogy legyen. Amennyiben a belső kontroll érvénytelen, a negatív kontroll eredményének értékelése is érvénytelen lesz. Ha a negatív kontroll eredményének értékelése érvénytelen, az egész tétel érvénytelen lesz, és a vizsgálatot meg kell ismételni. b. Pozitív kontrollok Ahhoz, hogy az 5 pozitív kontroll (HIV-1 M (+) C, HIV-1 O (+) C, HIV-2 (+) C, HCV (+) C és HBV (+) C) érvényes legyen, minden egyes pozitív kontroll eredményének értékelése reaktív, valamint a járulékos belső kontroll érvényes kell, hogy legyen. Amennyiben a belső kontroll érvénytelen, a pozitív kontroll eredményének értékelése is érvénytelen lesz. Ha bármelyik pozitív kontroll eredményének értékelése érvénytelen, az egész tétel érvénytelen lesz, és a vizsgálatot meg kell ismételni. 3. Donorminták belső kontrollja a. Ahhoz, hogy a donorminta érvényes, nem reaktív (–) vizsgálati eredményt adjon, a járulékos belső kontroll érvényes kell, hogy legyen, ellenkező esetben a nem reaktív eredmény érvénytelen lesz, és a donorminta vizsgálatát meg kell ismételni. b. Ahhoz, hogy a donorminta érvényes, reaktív (Ct érték) vizsgálati eredményt adjon, a járulékos belső kontroll érvényes vagy érvénytelen is lehet.
05888212044-01HU
18
Doc Rev 5.0
EREDMÉNYEK 1. A mintaeredmények csak akkor érvényesek, ha a teljes, őket tartalmazó tétel érvényes. Az elfogadhatóság feltételeit a Minőség-ellenőrzés részben találja. Minden minta esetében két paraméter mérésére kerül sor, egyik a vírustargetre, másik a belső kontrollra vonatkozik. ®
2. A cobas TaqScreen MPX teszt PDM szoftver által jelentett végső donoreredményei a következők: Állapot
Jelentés
Complete Non-Reactive
A donor nem reaktív a vizsgált elem(ek)re.
Complete Reactive
A donor reaktív a vizsgált elem(ek)re.
Complete Unresolved
Az életképességi időkorlát lejárt, mielőtt a donor reaktív vagy nem reaktív státuszt kapott volna. A donor további vizsgálata nem végezhető el a rendszeren. (Az életképességi időkorlát leírásáért tanulmányozza a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyvét.)
3. További vizsgálatot igénylő donorok: az érvénytelen csoport-, illetve egyéni donor állapotú donorcsövek értékelése „Repeat Needed”, továbbá a reaktív csoportban található donorcső értékelése „Resolution Needed”. Repeat Needed Az „invalid” értékelésű csoport donorcsöveinek vizsgálatát meg kell ismételni egy ismétlési csoport részeként vagy egyéni meghatározás során. Csoportvizsgálat – Resolution Needed Amikor egy több mintát tartalmazó csoport kap reaktív értékelést, a cobas s 201 rendszer a csoportban található összes donort „Resolution needed” státusszal jelöli. Ezeket ez egyéni donormintákat a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor pipettázza (a mély lyukú ® lemezekből vagy az eredeti donorcsövekből), és további vizsgálatuk a cobas TaqScreen MPX teszttel történik a megerősítő eljárás részeként a reaktív és nem reaktív egyéni donorminták azonosítása céljából. A megerősítő vizsgálatra vonatkozó specifikus információk végett tanulmányozza a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyv utasításait. Amikor egy több mintát tartalmazó csoport értékelése nem reaktív, illetve egy vagy minden, megerősítő vizsgálat részét képező donorminta értékelése nem reaktív, az egyéni minta(ák) értékelése „Complete, Non-reactive” lesz. Minden reaktívnak talált egyéni minta további ® vizsgálata elvégezhető a COBAS AmpliScreen teszttel a vírus megkülönböztetése céljából. Csoportosított forrásplazma donorok A forrásplazma csoportok esetében a reaktív csoportok visszaoldása egyéni reaktív mintákká a 2D csoportosítási, illetve a megerősítő csoportosítási eljárásokkal történik, ahogy az a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyvében olvasható. Minden reaktívnak talált egyéni minta további ® vizsgálata elvégezhető a COBAS AmpliScreen teszttel a vírus megkülönböztetése céljából. Egyéni vizsgálat Ha a donor vizsgálatára eredetileg egyéni mintaként került sor és nem reaktív eredményt adott, a minta értékelése „Complete, Non-reactive”. Amennyiben az egyéni minta eredménye reaktív, a minta értékelése „Complete, Reactive”. Minden reaktívnak talált egyéni minta további vizsgálata ® elvégezhető a COBAS AmpliScreen teszttel a vírus megkülönböztetése céljából. Megjegyzés: Egy átfogó minőségbiztosítási program részeként a felhasználó további vizsgálatokat végezhet el, hogy meghatározza a minta reaktivitásának eredeti okát. 4. Megkülönböztető vizsgálat ®
Minden egyéni reaktív minta, amelyet a cobas TaqScreen MPX teszt reaktívnak ismert fel, tovább vizsgálható annak meghatározására, hogy melyik vírus(ok) kimutatása történt: HIV-1, HBV vagy HCV. A HIV-1 M csoport, HCV és HBV megkülönböztetése céljából tanulmányozza ® ® ® a COBAS AmpliScreen HBV teszt, a COBAS AmpliScreen HCV teszt, v2.0 és a COBAS
05888212044-01HU
19
Doc Rev 5.0
AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 használati útmutatójának multiprep mintafeldolgozási eljárásokra vonatkozó részét. Kadáver minták esetében a HIV-1 M csoport, HCV és HBV megkülönböztetése ® ® céljából tanulmányozza a COBAS AmpliScreen HBV teszt, a COBAS AmpliScreen HCV teszt, ® v2.0 és a COBAS AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 használati útmutatójának kadáver minta feldolgozási eljárásokra vonatkozó részét. HIV-1 O csoport és HIV-2 megkülönböztetésére alkalmas teszt nem áll rendelkezésre a Roche-tól. ®
®
Ha egy egyéni mintát a cobas TaqScreen MPX teszt reaktívnak talál és mind a három COBAS AmpliScreen teszt nem reaktívnak talál, a felhasználó további NAT vagy szerológiai vizsgálatokat végezhet el, illetve visszarendelheti a donort utánkövetéses vizsgálatokra. A donor utánkövetésére és esetleges visszavételére a felhasználóknak a helyi specifikus irányelveket/ eljárásokat kell követniük. ELJÁRÁSSAL KAPCSOLATOS KORLÁTOZÁSOK ®
®
1. A vizsgálatot kizárólag a cobas TaqScreen MPX tesztkészlet, cobas TaqScreen MPX kontrollkészlet, a cobas® TaqScreen mosóreagens és a cobas s 201 rendszer együttes használatára értékelték. ®
®
2. Kadáver minták vizsgálatára a cobas TaqScreen MPX tesztet csak a cobas TaqScreen ® ® kadáver minta oldószer készlet, a cobas TaqScreen MPX kontrollkészlet, a cobas TaqScreen mosóreagens és a cobas s 201 rendszer együttes használatára értékelték. 3. A heparinról kimutatták, hogy gátolja a PCR-t. Az eljáráshoz ne használjon heparinos plazmát. 4. A megbízható eredmény a megfelelő mintalevételen, valamint a helyes transzporteljárásokon múlik. 5. A plazmacsoportok automatikus előkészítésére csak a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD ® pipettort validálták a cobas TaqScreen MPX teszttel való együttes használatra. Ragaszkodjon a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyv és a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor felhasználói kézikönyv hardver utasításaihoz és biztonsági óvintézkedéseihez. 6. A HIV-1 M csoport RNS, HIV-1 O csoport RNS, HIV-2 RNS, HCV RNS és HBV DNS kimutatása függ a mintában jelenlevő vírusrészecskék számától, és befolyásolhatják a mintalevételi módszerek, betegfaktorok (azaz kor, tünetek megléte) és/vagy a fertőzés stádiuma, valamint a mintacsoport mérete. ®
7. Ritkán bár, de előfordulhat, hogy a cobas TaqScreen MPX teszt primerei és/vagy próbái által lefedett virális genomok nagyfokban konzervált régióiban levő mutációk következtében a vírus kimutatása sikertelen lesz. 8. A technológiák különbözősége miatt javasolt, hogy az egyik technológiáról a másikra való áttéréskor a felhasználók végezzenek korrelációs laboratóriumi vizsgálatokat, hogy a technológiák közötti különbség minősíthető legyen. A felhasználóknak a helyi specifikus irányelveket/eljárásokat kell követniük. TELJESÍTMÉNYJELLEMZŐK Élő donor minták Reprodukálhatóság ®
A cobas TaqScreen MPX teszt cobas s 201 rendszerrel való használatának reprodukálhatóságát 12 tagú, randomizált, két negatív plazmamintát és két-két, HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, ® HCV és HBV pozitív plazmamintát, minden vírus esetében megközelítőleg a cobas TaqScreen MPX teszt kimutatási határának (LOD) 0,54X és 3X koncentrációit tartalmazó vak panelű vizsgálattal állapították meg. A vizsgálatok kivitelezésére 3 vizsgálati helyen, helyenként 1 üzemeltető által, 3 különböző tételszámú ® cobas TaqScreen MPX tesztkészlet és 1 cobas s 201 rendszer alkalmazásával került sor. Mindegyik színhelyen naponta 4 panelt és 4 kontrollszettet vizsgáltak 5 napon keresztül mind a 3 tételű reagenskészlettel, a panelek minden egyes mintájával összesen 180 vizsgálatot végeztek (összesen 2160 vizsgálat).
05888212044-01HU
20
Doc Rev 5.0
Minden érvényes reprodukálhatósági adatot úgy értékeltek, hogy kiszámították valamennyi paneltag esetében a reaktív vizsgálati eredmények százalékos arányát. Az adatokat készlettétel és vizsgálati helyszín/üzemeltető szerint dolgozták fel. ®
Ez a vizsgálat megmutatta a cobas TaqScreen MPX teszt készlettétel és vizsgálati helyszín/ üzemeltető szerinti, eltérő napokon mért teljesítményének következetességét (1. táblázat). 1. táblázat ® cobas TaqScreen MPX teszt — Reprodukálhatósági eredmények Vírus
Koncentráció
Negatív
0
HIV-1 M csoport
0,54 X LOD*
HIV-1 O csoport
0,54 X LOD*
HIV-2
0,54 X LOD*
HCV
0,54 X LOD*
HBV
0,54 X LOD*
HIV-1 M csoport
3 X LOD*
HIV-1 O csoport
3 X LOD*
HIV-2
3 X LOD*
HCV
3 X LOD*
HBV
3 X LOD*
Készlettétel A B C A B C A B C A B C A B C A B C A B C A B C A B C A B C A B C
Reaktív eredmény Vizsgálati hely/ reagenstétel Üzemeltető alapján 0,0% (0/120) 1 0,0% (0/120) 2 0,0% (0/120) 3 75,0% (45/60) 1 80,0% (48/60) 2 75,0% (45/60) 3 96,7% (58/60) 1 98,3% (59/60) 2 98,3% (59/60) 3 83,3% (50/60) 1 81,7% (49/60) 2 73,3% (44/60) 3 81,4% (48/59) 1 78,3% (47/60) 2 61,7% (37/60) 3 98,3% (58/59) 1 98,3% (59/60) 2 95,0% (57/60) 3 100,0% (60/60) 1 98,3% (59/60) 2 100,0% (60/60) 3 100,0% (60/60) 1 100,0% (60/60) 2 100,0% (60/60) 3 100,0% (59/59) 1 100,0% (60/60) 2 100,0% (60/60) 3 100,0% (60/60) 1 100,0% (60/60) 2 100,0% (60/60) 3 100,0% (60/60) 1 100,0% (60/60) 2 100,0% (60/60) 3
Reaktív eredmény vizsgálati hely/ üzemeltelő alapján 0,0% (0/120) 0,0% (0/120) 0,0% (0/120) 75,0% (45/60) 71,7% (43/60) 83,3% (50/60) 100,0% (60/60) 95,0% (57/60) 98,3% (59/60) 73,3% (44/60) 80,0% (48/60) 85,0% (51/60) 71,7% (43/60) 71,2% (42/59) 78,3% (47/60) 96,7% (58/60) 98,3% (58/59) 96,7% (58/60) 98,3% (59/60) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60) 100,0% (59/59) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60) 100,0% (60/60)
* Kimutatási határ
05888212044-01HU
21
Doc Rev 5.0
®
A cobas TaqScreen MPX teszt reprodukálhatóságát egy olyan 6 tagú panel vizsgálatával is értékelték, amely 1 negatív és 1 pozitív HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV és HBV ® paneltagot tartalmazott, minden vírus esetében megközelítőleg a cobas TaqScreen MPX teszt kimutatási határának (LOD) 1X koncentrációi mellett. ®
A vizsgálatok kivitelezésére 1 vizsgálati helyen, 3 üzemeltető által, 3 különböző tételszámú cobas TaqScreen MPX tesztkészlet alkalmazásával került sor. Minden üzemeltető egyéni, részleges cobas ® ® ® s 201 rendszert használt (azaz COBAS AmpliPrep készülék és COBAS TaqMan analizátor AMPLILINK adatállomással). Mind a 6 paneltag négy ismétlésének vizsgálatára sor került 5 nap alatt, valamennyi reagenstétellel, mind a 3 készülék-üzemeltető páros által. Reagenskészlet-tételenként minden paneltag minimum 60 érvényes ismétlésének vizsgálatára sor került.
Minden érvényes reprodukálhatósági adatot úgy értékeltek, hogy kiszámították valamennyi paneltag esetében a reaktív vizsgálati eredmények százalékos arányát. Az adatokat készlettétel és készüléküzemeltető pár szerint dolgozták fel. ®
Ez a vizsgálat megmutatta a cobas TaqScreen MPX teszt készlettétel és vizsgálati készülék-üzemeltető pár szerinti, eltérő napokon, 1X LOD mellett mért teljesítményének következetességét (2. táblázat). 2. táblázat ® cobas TaqScreen MPX teszt – Reprodukálhatósági eredmények 1X LOD mellett
Vírus
Negatív
HIV-1 M csoport
HIV-1 O csoport
HIV-2
HCV
HBV
Koncentráció
0
1 X LOD*
1 X LOD
1 X LOD
1 X LOD
1 X LOD
Készlettétel
Reaktív eredmény reagenstétel alapján
Készüléküzemeltető pár
Reaktív eredmény készülék-üzemeltető pár alapján
1
0,0% (0/60)
1
0,0% (0/60)
2
1,7% (1/60)
2
0,0% (0/60)
3
0,0% (0/60)
3
1,7% (1/60)
1
100,0% (60/60)
1
100,0% (60/60)
2
98,3% (59/60)
2
98,3% (59/60)
3
98,3% (59/60)
3
98,3% (59/60)
1
100,0% (60/60)
1
98,3% (59/60)
2
98,3% (59/60)
2
100,0% (60/60)
3
100,0% (60/60)
3
100,0% (60/60)
1
100,0% (60/60)
1
100,0% (60/60)
2
100,0% (60/60)
2
100,0% (60/60)
3
98,3% (59/60)
3
98,3% (59/60)
1
100,0% (60/60)
1
100,0% (60/60)
2
100,0% (60/60)
2
100,0% (60/60)
3
98,3% (59/60)
3
98,3% (59/60)
1
100,0% (60/60)
1
98,3% (59/60)
2
98,3% (59/60)
2
100,0% (60/60)
3
100,0% (60/60)
3
100,0% (60/60)
* Kimutatási határ
05888212044-01HU
22
Doc Rev 5.0
Analitikai érzékenység — WHO nemzetközi szabvány/Roche szabvány ®
A cobas TaqScreen MPX teszt kimutatási határa a HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV és HBV ágensekre a következő szabványok alapján lett meghatározva: a WHO HBV nemzetközi 32 33 standard (NIBSC kód 97/746) , a WHO 2. HCV RNS nemzetközi standard (NIBSC kód 96/798) és a Roche HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport és HIV-2 standard. A Roche HIV-1 M csoport standard egy kereskedelmi forgalomban levő vírustörzs kultúra (HIV-1 LAV 8E5, PN 227, Boston Biomedica, st Inc.), amely visszavezethető a WHO 1 HIV-1 RNS nemzetközi standardra (NIBSC kód 97/656), és ® ® a COBAS TaqMan HIV-1 teszt nagy tisztaságú rendszerrel való felhasználásra módszerrel lett kalibrálva. HIV-1 O csoport és HIV-2 nemzetközi standard jelenleg nem áll rendelkezésre. A Roche HIV-1 O csoport és HIV-2 standardok kereskedelmi forgalomban levő vírustörzs kultúrák, PN 242O (Boston Biomedica, Inc.) és katalógusszám 10-127-000 (Advanced Biotechnologies, Inc.). A Roche HIV-1 O csoport RNS és HIV-2 RNS standardok visszavezethetőek, ebben a sorrendben: CBER HIV-1 Subtype RNA Reference Panel #1 Lot O1, CBER HIV-2 RNA Lot Release Panel ISD. Három független hígítási sorozatot készítettek minden vírusstandardból normál, vírus negatív plazmával. Mindegyik hígítási sorozatot három különböző tételű cobas® TaqScreen MPX tesztkészlettel vizsgálták, készletenként 22 ismétlésben, összesen 198 ismétlést végeztek koncentrációnként. A 95%-os kimutatási határt (LOD) és a kétoldali 95%-os fiduciális konfidencia-intervallumokat úgy határozták meg, hogy a vizsgált ismétlések egyesített adatival minden vírus esetében PROBIT analízist végeztek (3. táblázat). A 4-8. táblázat összefoglalja az analitikai érzékenységi vizsgálatok összesített eredményeit. 3. táblázat A vírusstandardok PROBIT analízise Elem
Standard
Mértékegységek
Átlag 95% LOD
95% alsó határ
95% felső határ
HIV-1 M csoport
Roche másodlagos standard
IU/ml
49
42,4
58,1
HIV-1 O csoport
Roche elsődleges standard
kópia/ml
89
56
217
HIV-2
Roche elsődleges standard
kópia/ml
59,3
51,9
69,7
HCV
WHO másodlagos nemzetközi standard
IU/ml
11
7,0
21,7
HBV
WHO nemzetközi standard
IU/ml
3,8
3,3
4,4
4 táblázat Analitikai szenzitivitás összefoglalása: Roche másodlagos HIV-1 M csoport standard HIV-1 M csoport RNS-koncentráció (IU/ml)
Reaktívak száma
Egyéni vizsgálatok száma
Reaktívak %
95% alsó konfidencia kikötés (egyoldali)
190
196
196
100%
98,5%
60
193
197
98,0%
95,4%
50
187
195
95,9%
92,7%
40
180
195
92,3%
88,4%
20 6
143 72
196 196
73,0% 36,7%
67,2% 31,0%
05888212044-01HU
23
Doc Rev 5.0
5 táblázat Analitikai szenzitivitás összefoglalása: Roche elsődleges HIV-1 O csoport standard HIV-1 O csoport RNS-koncentráció (kópia/ml)
Reaktívak száma
Egyéni vizsgálatok száma
Reaktívak %
95% alsó konfidencia kikötés (egyoldali)
293 147
194 198
194 198
100% 100%
98,5% 98,5%
117
196
198
99,0%
96,9%
93,8
191
197
97,0%
94,1%
29,3
98
198
49,5%
43,4%
9,4
46
189
24,3%
19,3%
6 táblázat Analitikai szenzitivitás összefoglalása: Roche elsődleges HIV-2 standard HIV-2 RNSkoncentráció (kópia/ml)
Reaktívak száma
Egyéni vizsgálatok száma
Reaktívak %
95% alsó konfidencia kikötés (egyoldali)
320
194
194
100,0%
98,5%
107
194
195
99,5%
97,6%
82,8
186
189
98,4%
95,9%
61,4
188
195
96,4%
93,4%
34,7
154
192
80,2%
74,9%
10,7
79
194
40,7%
34,8%
7 táblázat Analitikai szenzitivitás összefoglalása: WHO másodlagos HCV nemzetközi standard (96/798) HCV RNSkoncentráció (IU/ml)
Reaktívak száma
Egyéni vizsgálatok száma
Reaktívak %
95% alsó konfidencia kikötés (egyoldali)
30,0
188
192
97,9%
95,3%
15,4
183
184
99,5%
97,4%
11,3
183
186
98,4%
95,9%
10,0
180
193
93,3%
89,5%
3,0
128
192
66,7%
60,6%
1,0
67
192
34,9%
29,2%
8 táblázat Analitikai szenzitivitás összefoglalása: WHO HBV nemzetközi standard (97/746) HBV DNSkoncentráció (IU/ml)
Reaktívak száma
Egyéni vizsgálatok száma
Reaktívak %
95% alsó konfidencia kikötés (egyoldali)
12,0
193
193
100,0%
98,5%
5,0
194
197
98,5%
96,1%
4,0
186
193
96,4%
93,3%
3,6
186
197
94,4%
90,9%
1,3
121
192
63,0%
56,9%
0,4
47
191
24,6%
19,5%
05888212044-01HU
24
Doc Rev 5.0
Genotípus/szubtípus szenzitivitás és inkluzivitás ®
A cobas TaqScreen MPX teszt teljesítményét HIV-1 M csoport szubtípusok, HIV-1 O csoport, HIV-1 N csoport és HIV-2, továbbá HCV és HBV genotípusok alapján határozták meg. HIV-1 M csoport Ötven, ismert szubtípusú HIV-1 M csoportú klinikai minta és 25 izolátumkultúra (7 A szubtípus, 15 AE kevert szubtípus, 10 AG kevert szubtípus, 12 B szubtípus, 9 C szubtípus, 7 D szubtípus, 4 F szubtípus, 8 G szubtípus, 2 H szubtípus és 1 J szubtípus) mennyiségi meghatározását végezték ® el a COBAS AMPLICOR HIV-1 MONITOR teszt, v1.5 vizsgálattal, majd a minták normál, vírus ® negatív humán plazmával készült, a cobas TaqScreen MPX HIV-1 M csoport teszt kimutatási ® határának (LOD) megközelítőleg 3X és 1X hígításait vizsgálták a cobas TaqScreen MPX teszttel. Mind az 50 klinikai minta és 25 izolátumkultúra reaktív eredményt adott mind a 3X, mind az 1X LOD hígítások mellett. 9. táblázat HIV-1 M csoportú minták és izolátumkultúrák Szubtípus
Klinikai minták
Kultúra felülúszók
Összes izolátum
Reaktív 3X LOD mellett
Reaktív 1X LOD mellett
A
3
4
7
100% (7/7)
100% (7/7)
AE
10
5
15
100% (15/15)
100% (15/15)
AG
10
0
10
100% (10/10)
100% (10/10)
B
10
2
12
100% (12/12)
100% (12/12)
C
7
2
9
100% (9/9)
100% (9/9)
D F
2 1
5 3
7 4
100% (7/7) 100% (4/4)
100% (7/7) 100% (4/4)
G
4
4
8
100% (8/8)
100% (8/8)
H
2
0
2
100% (2/2)
100% (2/2)
J
1
0
1
100% (1/1)
100% (1/1)
HIV-1 O csoport és HIV-1 N csoport Nyolc HIV-1 O csoportú izolátumkultúrát és 1 HIV-1 N csoportú izolátumkultúrát vizsgáltak. Mivel nem áll rendelkezésre molekuláris módszer a HIV-1 O csoportú és N csoportú izolátumok mennyiségi meghatározására, fél-log hígításokat készítettek a törzskultúrákból normál, vírus negatív humán ® plazmával, és minden hígítást a cobas TaqScreen MPX teszttel vizsgáltak. ®
Mind a 8 HIV-1 O csoportú izolátum kimutatható volt a cobas TaqScreen MPX teszttel minden -7 -8 hígításban, egészen az 1 x 10 és 1 x 10 hígításokig. A HIV-1 N csoportú izolátum minden -10 hígításban kimutatható volt egészen a 3,3 x 10 hígításig. HIV-2 Kilenc HIV-2 izolátumkultúrát (5 A szubtípus, 1 A/B szubtípus, 1 B szubtípus és 2 nem ismert szubtípus) és 11 HIV-2 klinikai mintát (nem ismert szubtípus) vizsgáltak. Mivel nem áll rendelkezésre molekuláris módszer a HIV-2 minták mennyiségi meghatározására, fél-log hígításokat készítettek a törzskultúrákból és klinikai mintákból normál, vírus negatív humán plazmával, és minden hígítást ® a cobas TaqScreen MPX teszttel vizsgáltak. ®
Mind az 5 HIV-2 A szubtípusú izolátumkultúra kimutatható volt a cobas TaqScreen MPX teszttel -8 -9 minden hígításban, egészen az 1 x 10 és 3,3 x 10 hígításokig. A HIV-2 A/B szubtípusú izolátum az -9 -9 1 x 10 hígításig volt kimutatható. A HIV-2 B szubtípusú izolátum az 3,3 x 10 hígításig volt kimutatható. -9 A 2 nem ismert szubtípusú HIV-2 izolátumkultúra a 3,3 x 10 hígításig volt kimutatható. Mind a 11 ® HIV-2 klinikai minta (ismeretlen szubtípus) kimutatható volt a cobas TaqScreen MPX teszttel egészen az 1:100 (2 minta), 1:30 (3 minta), 1:10 (2 minta), 1:3 (3 minta) hígításokig, és hígítás nélkül (1 minta).
05888212044-01HU
25
Doc Rev 5.0
HCV Hetvennégy ismert genotípusú HCV klinikai minta (8 1a genotípus, 13 1b genotípus, 1 2 genotípus, 7 2a genotípus, 1 2a/c genotípus, 9 2b genotípus, 8 3a genotípus, 1 3a/b genotípus, 6 4 genotípus, 1 4a genotípus, 1 4b/4c genotípus, 1 4h genotípus, 2 5 genotípus, 9 5a genotípus, 2 6 genotípus és ® 4 6a genotípus) mennyiségi meghatározását végezték el a COBAS AMPLICOR HCV MONITOR ® teszt, v2.0 vizsgálattal, majd a minták normál, vírus negatív humán plazmával készült, a cobas ® TaqScreen MPX HCV teszt kimutatási határának (LOD) 3X és 1X hígításait vizsgálták a cobas TaqScreen MPX teszttel. Mind a hetvennégy izolátum reaktív eredményt adott 3X LOD hígítás mellett. 1X LOD hígítás mellett a 74 izolátumból 73 volt reaktív. Egy 1b genotípusú izolátum 1X LOD mellett nem volt reaktív, 3X LOD mellett viszont igen. 10. táblázat HCV minták Genotípus
Klinikai minták
Reaktív 3X LOD mellett
Reaktív 1X LOD mellett
1a 1b 2 2a 2a/c 2b 3a 3a/b 4 4a 4b/4c 4h 5 5a 6 6a
8 13 1 7 1 9 8 1 6 1 1 1 2 9 2 4
100% (8/8) 100% (13/13)* 100% (1/1) 100% (7/7) 100% (1/1) 100% (9/9) 100% (8/8) 100% (1/1) 100% (6/6) 100% (1/1) 100% (1/1) 100% (1/1) 100% (2/2) 100% (9/9) 100% (2/2) 100% (4/4)
100% (8/8) 92% (12/13)* 100% (1/1) 100% (7/7) 100% (1/1) 100% (9/9) 100% (8/8) 100% (1/1) 100% (6/6) 100% (1/1) 100% (1/1) 100% (1/1) 100% (2/2) 100% (9/9) 100% (2/2) 100% (4/4)
* Egy 1b genotípusú izolátum 3X LOD mellett reaktív eredményt adott, 1X LOD mellett viszont nem.
HBV Hatvannégy, ismert genotípusú HBV klinikai minta és egy molekuláris klón (13 A genotípus, 9 B genotípus, 10 C genotípus, 9 D genotípus, 14 E genotípus, 6 F genotípus, 2 G genotípus és 2 H genotípus) ® mennyiségi vizsgálatát végezték el a COBAS AMPLICOR HBV MONITOR teszttel, majd a minták ® normál, vírus negatív humán plazmával készült, a cobas TaqScreen MPX HBV teszt kimutatási ® határának (LOD) 3X és 1X hígításait vizsgálták a cobas TaqScreen MPX teszttel. Mind a 65 minta reaktív eredményt adott mind 3X, mind 1X LOD hígítás mellett.
05888212044-01HU
26
Doc Rev 5.0
11. táblázat HBV minták Genotípus
Klinikai minták
Reaktív 3X LOD mellett
Reaktív 1X LOD mellett
A B C D E F G H
13 9 10 9 14 6 2* 2
100% (13/13) 100% (9/9) 100% (10/10) 100% (9/9) 100% (14/14) 100% (6/6) 100% (2/2) 100% (1/1)**
100% (13/13) 100% (9/9) 100% (10/10) 100% (9/9) 100% (14/14) 100% (6/6) 100% (2/2) 100% (2/2)
* Egy G genotípusú minta klinikai minta helyett plazmid DNS-t tartalmazott ** Egy H genotípusú izolátum vizsgálatára 3X LOD mellett nem került sor az elégtelen térfogat miatt.
Szerokonverziós panelek ®
A cobas TaqScreen MPX teszt teljesítményét a szerokonverzió alatt HIV-1 M csoport, HCV és HBV esetében határozták meg 60, kereskedelmi forgalomban levő szerokonverziós panel segítségével. HIV-1 O csoportú és HIV-2 szerokonverziós panel nem áll rendelkezésre. HIV-1 szerokonverziós panelek Húsz, kereskedelmi forgalomban levő, plazmaferezis donoroktól HIV antitest szerokonverzió során ® levett szerokonverziós panelt vizsgáltak a cobas TaqScreen MPX teszttel. Minden mintát tisztán és ® 1:6 hígításban vizsgáltak, 6 tagú donorcsoport vizsgálatát szimulálva. A cobas TaqScreen MPX teszt eredményeit összehasonlították az ABBOTT PRISM HIV O Plus vizsgálat és az Abbott HIVAB HIV-1/HIV-2 EIA vizsgálat eredményeivel. ®
A cobas TaqScreen MPX teszt a tiszta mintákban 20-ból 20 panel esetében kimutatta a HIV RNS-t még a HIV antitest kimutathatóságát megelőzően, az ABBOTT PRISM HIV O Plus vizsgálattal és az ® Abbott HIVAB HIV-1/HIV-2 EIA vizsgálattal együtt. A cobas TaqScreen MPX teszt a tiszta mintákban a HIV RNS-t a HIV antitest ABBOTT PRISM HIV O Plus vizsgálattal és Abbott HIVAB HIV-1/HIV-2 EIA vizsgálattal való kimutathatóságához képest átlagosan 14 nappal előbb mutatta ki. ®
A cobas TaqScreen MPX teszt a 6-szoros hígítású mintákban a HIV RNS-t a HIV antitest ABBOTT PRISM HIV O Plus vizsgálattal és Abbott HIVAB HIV-1/HIV-2 EIA vizsgálattal való kimutathatósága ® előtt mutatta ki, 20-ból 20 panel esetében. A cobas TaqScreen MPX teszt a 6-szoros hígítású mintákban a HIV RNS-t a HIV antitest ABBOTT PRISM HIV O Plus vizsgálat és Abbott HIVAB HIV-1/ HIV-2 EIA vizsgálattal való kimutathatósága előtt átlagosan 13 nappal mutatta ki. ®
Azokat a paneleket, amelyek első vérsorozata a cobas TaqScreen MPX teszttel vizsgálva reaktív volt, amelyek minden vérsorozata szerológiai vizsgálattal nem reaktív eredményt adott, illetve azokat, amelyek esetében az első reaktív vérsorozat és az elsődleges vérsorozat között több, mint 21 nap telt el, kizárták a HIV-1/2 antitest kimutatását megelőző minimum, átlag és maximum napokat összegző számításokból.
05888212044-01HU
27
Doc Rev 5.0
12. táblázat ® A cobas TaqScreen MPX teszt teljesítménye HIV szerokonverziós panelekkel Napok a HIV-1/2 antitest kimutatása előtt ABBOTT PRISM HIV O Plus HIV szero Megjegy- Abbott HIVAB HIV-1/HIV-2 EIA ® konverziós panel zések cobas TaqScreen MPX teszt 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
A C A B, C
B, D
E B, C B
Minimum Átlag Maximum
Tiszta
1:6
Tiszta
1:6
15 14 18 5 9 10 17 7 10 13 19 25 19 7 19 89 7 14 11 15
15 14 18 5 9 10 11 7 10 13 19 25 14 7 19 89 7 11 7 15
15 14 18 5 14 10 17 10 10 13 19 25 19 7 19 9 7 14 11 15
15 14 18 5 14 10 11 10 10 13 19 25 14 7 19 9 7 11 7 15
7 14 25
7 13 25
7 14 25
7 13 25
®
A.
A cobas TaqScreen MPX teszt eredménye reaktív volt a teljes első sorozat minden tiszta és 1:6 hígított mintájának esetében; az összegző számításokból kihagyták.
B.
Nincs HIV antitest szerokonverzió az Abbott HIVAB HIV-1/HIV-2 EIA vizsgálattal; az Abbott HIVAB HIV-1/HIV-2 EIA összegző számításokból kihagyták. Nincs HIV antitest szerokonverzió az ABBOTT PRISM HIV O Plus vizsgálattal; az ABBOTT PRISM HIV O Plus összegző számításokból kihagyták. ® Az összegző számításokból kihagyták az első cobas TaqScreen MPX teszttel reaktív vérsorozat és az elsődleges vérsorozat között eltelt hosszú idő (40 nap) miatt. Az Abbott HIVAB HIV-1/HIV-2 EIA összegző számításokból kihagyták az első szerológiailag reaktív vérsorozat és az elsődleges vérsorozat között eltelt hosszú idő (80 nap) miatt.
C. D. E.
HCV szerokonverziós panelek Húsz, kereskedelmi forgalomban levő, plazmaferezis donoroktól HCV antitest szerokonverzió során ® levett szerokonverziós panelt vizsgáltak a cobas TaqScreen MPX teszttel. Minden mintát tisztán és ® 1:6 hígításban vizsgáltak, 6 tagú donorcsoport vizsgálatát szimulálva. A cobas TaqScreen MPX teszt eredményeit összehasonlították az ABBOTT PRISM HCV vizsgálat és az ORTHO HCV Version 3.0 ELISA Test System vizsgálat eredményeivel. ®
A cobas TaqScreen MPX teszt tiszta minták esetében a HCV RNS-t a HCV antitest ABBOTT PRISM HCV Assay vagy ORTHO HCV Version 3.0 ELISA Test System vizsgálattal való kimutathatósága előtt 20-ból 19 panelnél mutatta ki, 20-ból 1 panelnél pedig a HCV antitest kimutathatóságával megegyező napon mutatta ki. A cobas® TaqScreen MPX teszt tiszta minták esetében a HCV RNS-t a HCV antitest ABBOTT PRISM HCV vizsgálattal, illetve ORTHO HCV Version 3.0 ELISA Test System vizsgálattal való kimutathatósága előtt átlag 24, illetve 25 nappal korábban mutatta ki.
05888212044-01HU
28
Doc Rev 5.0
®
A cobas TaqScreen MPX teszt 6-szoros hígítású minták esetében a HCV RNS-t a HCV antitest ABBOTT PRISM HCV vizsgálattal vagy ORTHO HCV Version 3.0 ELISA Test System vizsgálattal való kimutathatósága előtt 20-ból 19 panelnél mutatta ki, 20-ból 1 panelnél pedig a HCV antitest ® kimutathatóságával megegyező napon mutatta ki. A cobas TaqScreen MPX teszt 6-szoros hígítású minták esetében a HCV RNS-t a HCV antitest ABBOTT PRISM HCV vizsgálattal, illetve ORTHO HCV Version 3.0 ELISA Test System vizsgálattal való kimutathatósága előtt átlag 23 nappal, illetve 24 nappal korábban mutatta ki. ®
Azokat a paneleket, amelyek első vérsorozata a cobas TaqScreen MPX teszttel vizsgálva reaktív volt, amelyek minden vérsorozata szerológiai vizsgálattal nem reaktív eredményt adott, illetve azokat, amelyek esetében az első reaktív vérsorozat és az elsődleges vérsorozat között több, mint 21 nap telt el, kizárták a HCV antitest kimutatását megelőző minimum, átlag és maximum napokat összegző számításokból. 13. táblázat ® A cobas TaqScreen MPX teszt teljesítménye HCV szerokonverziós panelekkel HCV szerokonverziós panel 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 Minimum Átlag Maximum A. B. C. D.
Napok a HCV antitest kimutatása előtt Megjegyzések
A A A A A, B A A A A, B A A A A
C C D
ORTHO HCV Version 3.0 ELISA
ABBOTT PRISM HCV Plus
®
cobas TaqScreen MPX teszt 1:6 Tiszta 97 97 85 85 16 13 7 7 7 3 27 24 19 13 8 8 14 14 9 7 23 16 21 18 39 37 32 32 31 28 23 23 33 39 32 32 38 38 0 0
Tiszta 97 85 16 7 7 27 19 8 14 9 23 21 39 32 31 23 39 32 38 0 7 25 39
7 24 33
3 24 39
1:6 97 85 13 7 3 24 13 8 14 7 16 18 37 32 28 23 33 32 38 0 3 23 33
®
A cobas TaqScreen MPX teszt eredménye reaktív volt az első vérsorozat minden tiszta és 1:6 hígítású mintájának esetében; az összegző számításokból kihagyták. Nincs HCV antitest szerokonverzió az ORTHO HCV Version 3.0 ELISA vizsgálattal; az ORTHO HCV Version 3.0 ELISA összegző számításokból kihagyták. Az összegző számításokból kihagyták az első, szerológiailag reaktív vérsorozat és az elsődleges vérsorozat között eltelt hosszú idő (18. panel 28 nap; 19. panel 31 nap) miatt. Az összegző számításokból kihagyták az első, minden módszerrel nem reaktív vérsorozat és a második, minden módszerrel reaktív vérsorozat között eltelt hosszú idő (69 nap) miatt.
05888212044-01HU
29
Doc Rev 5.0
HBV szerokonverziós panelek Húsz, kereskedelmi forgalomban levő, plazmaferezis donoroktól HBsAg szerokonverzió során levett ® szerokonverziós panelt vizsgáltak a cobas TaqScreen MPX teszttel. Minden mintát tisztán és 1:6 ® hígításban vizsgáltak, 6 tagú donorcsoport vizsgálatát szimulálva. A cobas TaqScreen MPX teszt ® eredményeit összehasonlították az ABBOTT PRISM HBsAg vizsgálat és az ORTHO® HBsAg ELISA Test System 3 vizsgálat eredményeivel. ®
A cobas TaqScreen MPX teszt tiszta minták esetében a HBV DNS-t a HBsAg ABBOTT PRISM HBsAg vizsgálattal való kimutathatósága előtt 20-ból 17 panelnél mutatta ki, 20-ból 2 panelnél a HBsAg kimutathatóságával megegyező napon, 20-ból 1 panelnél pedig a HBsAg kimutathatósága ® után mutatta ki. Az ORTHO HBsAg ELISA Test System 3 vizsgálattal összehasonlítva, a cobas TaqScreen MPX teszt tiszta minták esetében a HBV DNS-t a HBsAg kimutathatósága előtt 20-ból ® 19 panelnél mutatta ki, és a HBsAg kimutathatósága után 20-ból 1 panelnél mutatta ki. A cobas TaqScreen MPX teszt tiszta minták esetében a HBV DNS-t a HBsAg ABBOTT PRISM HBsAg vizsgálattal, illetve ORTHO HBsAg ELISA Test System 3 vizsgálattal való kimutathatósága előtt átlag 19 nappal, illetve átlag 24 nappal mutatta ki. ®
A cobas TaqScreen MPX teszt 6-szoros hígítású minták esetében a HBV DNS-t a HBsAg ABBOTT PRISM HBsAg vizsgálattal való kimutathatósága előtt a 20-ból 15 panelnél mutatta ki, 20-ból 3 panelnél a HBsAg kimutathatóságával megegyező napon, 20-ból 2 panelnél pedig a HBsAg kimutathatósága után mutatta ki. Az ORTHO HBsAg ELISA Test System 3 vizsgálattal összehasonlítva, ® a cobas TaqScreen MPX teszt 6-szoros hígítású minták esetében a HBV DNS-t a HBsAg kimutathatósága előtt a 20-ból 17 panelnél mutatta ki, 20-ból 2 panelnél a HBsAg kimutathatóságával ® megegyező napon, 20-ból 1 panelnél pedig a HBsAg kimutathatósága után mutatta ki. A cobas TaqScreen MPX teszt 6-szoros hígítású minták esetében a HBV DNS-t a HBsAg ABBOTT PRISM HBsAg vizsgálattal, illetve ORTHO HBsAg ELISA Test System 3 vizsgálattal való kimutathatósága előtt átlag 8 nappal, illetve átlag 13 nappal mutatta ki. ®
Azokat a paneleket, amelyek első vérsorozata a cobas TaqScreen MPX teszttel vizsgálva reaktív volt, és amelyeknél az első reaktív vérsorozat és az elsődleges vérsorozat között több, mint 21 nap telt el, kizárták az összegző számításokból. Ezen felül egy panelt, amelynek első vérsorozata az ® ABBOTT PRISM HBsAg vizsgálattal reaktív volt, és egy panelt, amely a cobas TaqScreen MPX teszttel vizsgálva időszakosan volt reaktív egy 97 napos időtartamon át, kizártak a HBsAg kimutatását megelőző minimum, átlag és maximum napokat összegző számításokból.
05888212044-01HU
30
Doc Rev 5.0
14. táblázat ® A cobas TaqScreen MPX teszt teljesítménye HBV szerokonverziós panelekkel Napok a HBsAg kimutatása előtt HBV szerokonverziós panel 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 Minimum Átlag Maximum A. B. C. D. E.
Megjegyzések
E A, B B, C, D A, B A, B A, B A, B A, B A, B
D A, B A, C, D
ORTHO HBsAg ELISA Test System 3
ABBOTT PRISM HBsAg Plus
®
cobas TaqScreen MPX teszt Tiszta
1:6
Tiszta
1:6
-5 18 35 31 7 21 8 13 14 18 28 7 19 21 21 26 12 18 35 21
-7 16 35 24 43 0 8 13 14 18 16 7 19 12 9 0 12 18 12 17
22 16 35 21 -36 21 4 9 7 7 26 2 12 23 19 8 0 7 0 18
20 14 35 14 0 0 4 9 7 7 14 2 12 14 7 -18 0 7 -23 14
18 24 31
0 13 24
8 19 26
-18 8 14
®
A cobas TaqScreen MPX teszt eredménye reaktív volt az első vérsorozat minden tiszta mintája esetében; az összegző számításokból kihagyták. ® A cobas TaqScreen MPX teszt eredménye reaktív volt az első vérsorozat minden 1:6 hígítású mintája esetében; az összegző számításokból kihagyták. Az ABBOTT PRISM HBsAg vizsgálat eredménye reaktív volt az első sorozat minden mintája esetében; az ABBOTT PRISM HBsAg vizsgálat összegző számításaiból kihagyták. ® Az összegző számításokból kihagyták az első cobas TaqScreen MPX teszttel reaktív vérsorozat és az elsődleges vérsorozat és között eltelt hosszú idő (5. panel 36 nap, 17. panel 146 nap, 19. panel 23 nap) miatt. ® A cobas TaqScreen MPX teszt tiszta mintáinak reaktív eredményeit a 4., 16. és 26. napokon nem vették bele a „Napok ® a kimutatás előtt” számításba, mivel a 7., 19., 23., 76. és 101. napok nem reaktív eredményt adtak. A cobas TaqScreen MPX teszt 4. napi 1:6 hígítású minta reaktív eredményét nem vették bele a „Napok a kimutatás előtt” számításba, mivel a következő 8 minta (7–106. nap) nem reaktív eredményű volt. Ezt a panelt kihagyták az összegző számításokból hosszú, időszakosan reaktív periódus miatt.
05888212044-01HU
31
Doc Rev 5.0
Analitikai specificitás – Potenciálisan keresztreagáló és zavarást okozó mikroorganizmusok ®
A cobas TaqScreen MPX teszt analitikai specificitását egy 17 mikroorganizmust, ezen belül 12 vírusizolátumot, 4 baktériumtörzset és 1 élesztőizolátumot tartalmazó panel vizsgálatával értékelték. A mikroorganizmusokat normál, vírus-negatív humán plazmához adták, és HIV-1 M csoport, HIV-1 ® O csoport, HIV-2, HCV vagy HBV hozzáadása nélkül, továbbá minden vírus esetében a cobas TaqScreen MPX teszt kimutatási határának 3X hígításai mellett vizsgálták. ®
A cobas TaqScreen MPX teszttel mindegyik, HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV vagy HBV hozzáadása nélküli mikroorganizmus-minta nem reaktív eredményt adott. A vizsgált mikro® organizmusok nem adtak keresztreakciót a cobas TaqScreen MPX teszttel. Mindegyik, HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV vagy HBV hozzáadásával vizsgált mikroorganizmus minta ® reaktív eredményt adott. A vizsgált mikroorganizmusok nem zavarják a cobas TaqScreen MPX tesztet. 15. táblázat Vizsgált mikroorganizmusok Analitikai specificitás — Vizsgált mikroorganizmusok Adenovírus 2
Humán herpes vírus 6
Staphylococcus aureus
Cytomegalovírus
Humán T-lymphotrop vírus I
Candida albicans
Epstein-Barr vírus
Humán T-lymphotrop vírus II
Propionibacterium acnes
Hepatitis A vírus
Staphylococcus epidermidis
Herpes simplex vírus 1
Influenzavírus
Staphylococcus haemolyticus
Herpes simplex vírus 2
Hepatitis G vírus (GBV C)
Varicella-zoster vírus
Analitikai specificitás – Egyéb kórállapotok Minden egyes, a következőkben felsorolt betegségkategóriára (Cytomegalovírus-fertőzés, Hepatitis A vírus-fertőzés, Epstein-Barr vírus-fertőzés, valamint autoimmun megbetegedések, azaz antinukleáris ellenanyagok, rheumatoid arthritis) vizsgáltak plazmamintákat HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, ® HIV-2, HCV vagy HBV hozzáadása nélkül és hozzáadásával, minden vírus esetében a cobas ® TaqScreen MPX teszt kimutatási határának 3x hígításai mellett. A cobas TaqScreen MPX teszt nem reaktív teszteredményeket szolgáltatott minden kórállapotú mintára HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV vagy HBV hozzáadása nélkül egy minta kivételével, amely kezdetben reaktívnak, majd az ismételt vizsgálat során nem reaktívnak bizonyult, és reaktív eredményt szolgáltatott minden kórállapotú mintára HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV vagy HBV hozzáadása mellett. ® Ezek a kórállapotok nem zavarják a cobas TaqScreen MPX teszt szenzitivitását, illetve specificitását.
05888212044-01HU
32
Doc Rev 5.0
Potenciálisan zavaró anyagok Endogén zavarást okozó anyagok Abnormálisan magas szintű triglicerideket (3186 mg/dl-ig), hemoglobint (472 mg/dl-ig), nem kötött bilirubint (63 mg/dl-ig), albumint (9,6 g/dl-ig), illetve humán DNS-t (0,4 mg/dl-ig) tartalmazó plazmamintákat vizsgáltak HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV vagy HBV hozzáadásával és ® anélkül, minden vírus esetében a cobas TaqScreen MPX teszt kimutatási határának 3X hígításai ® mellett. Ezek az endogén anyagok nem zavarják a cobas TaqScreen MPX teszt szenzitivitását, illetve specificitását. Abnormálisan nagy mennyiségben hozzáadott vörösvértesteket (10% v/v-ig) tartalmazó plazmamintákat vizsgáltak HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV vagy HBV ® hozzáadásával és anélkül, minden vírus esetében a cobas TaqScreen MPX teszt kimutatási ® határának 3X hígításai mellett. A plazma vörösvértest tartalma 2,5% (v/v) alatt nem zavarta a cobas TaqScreen MPX teszt szenzitivitását, illetve specificitását. A plazma vörösvértest tartalma 5,0% (v/v) ® fölött csökkentette a HCV kimutatásának szenzitivitását a cobas TaqScreen MPX teszttel. A plazma vörösvértest tartalma 10,0% (v/v) fölött zavarta a HBV, HCV, HIV-1 O csoport és HIV-2 kimutatásának szenzitivitását a cobas® TaqScreen MPX teszttel. Exogén zavaró anyagok Abnormálisan nagy koncentrációjú acetaminophen (1324 µmol/l), acetil-szalicilsav (3,62 µmol/l), aszkorbinsav (342 µmol/l), atorvastatin (600 Eq/l), fluoxetin (11,2 µmol/l), ibuprofen (2425 µmol/l), loratadin (0,78 µmol/l), nadolol (3,88 µmol/l), naproxen (2170 µmol/l), paroxetin (3,04 µmol/l), fenilefrin HCl (491 µmol/l) és sertralin (1,96 µmol/l) tartalmú humán plazmamintákat vizsgáltak HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV vagy HBV hozzáadásával és anélkül, minden vírus esetében ® a cobas TaqScreen MPX teszt kimutatási határának 3X hígításai mellett. Ezek az exogén anyagok ® nem zavarják a cobas TaqScreen MPX teszt szenzitivitását, illetve specificitását. Kadáver donor minták Reprodukálhatóság Húsz, egyéni kadáver EDTA-s plazmamintát vizsgáltak, melyekhez a hemolízis mértékének megfelelően megközelítőleg 3X LOD végkoncentrációban adtak HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV vagy HBV vírustargetet a Roche másodlagos HIV-1 M csoport standard, Roche elsődleges HIV-1 O csoport és HIV-2 standard, Roche másodlagos HCV standard és WHO nemzetközi HBV standard (NIBSC 97/746) felhasználásával. Ezenfelül húsz, egyéni élő donor EDTA-s plazmamintájához is hozzáadták ezeket a standardokat, megközelítőleg 3X LOD mennyiségben, hatos ® csoportokban. A kadáver mintákat manuálisan hígították 1:5 arányban a cobas TaqScreen kadáver minta oldószerrel és a kadáver minta vizsgálati eljárást alkalmazva vizsgálták, az élő donor mintákat 1:6 arányban hígították negatív EDTA-s plazmával a Hamilton MICROLAB STAR IVD pipettor segítségével a 6-os csoportokat kiértékelő élő donor eljárás részeként. Mind a 20 élő donor és ® kadáver mintát 2 üzemeltető vizsgálta három különböző készlettételű cobas TaqScreen MPX teszttel. Egy üzemeltető egy cobas s 201 rendszeren dolgozott, két üzemeltető-készülék párt alkotva. Minden érvényes reprodukálhatósági eredményt elemeztek, összehasonlítva a kadáver és élő donor mintákba oltott HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV vagy HBV vírustargetek reaktív arányát három készlettételen keresztül (16. táblázat), és a két üzemeltető-készülék pár szerint (17. táblázat). Az eredményeket az egyoldalas Fisher egzakt próba segítségével értékelték annak meghatározására, hogy az élő donor és kadáver minták közötti reaktívak arányának különbsége szignifikáns-e.
05888212044-01HU
33
Doc Rev 5.0
16. táblázat ® A cobas TaqScreen MPX teszt reprodukálhatóságának összefoglalása kadáver és élő donor minták esetében – Eredmények készlettétel szerint Egyoldalas p-érték élő vs. kadáver minta, targetenként
Vírustarget
Donortípus
1. tétel
2. tétel
3. tétel
HIV-1 M csoport
Kadáver
40 / 40 100%
40 / 40 100%
40 / 40 100%
Élő
40 / 40 100%
39 / 39* 100%
39 / 39* 100%
HIV-1 O csoport
Kadáver
39 / 40 97,5%
40 / 40 100%
40 / 40 100%
Élő
39 / 39* 100%
40 / 40 100%
40 / 40 100%
Kadáver
40 / 40 100%
40 / 40 100%
40 / 40 100%
Élő
39 / 39* 100%
40 / 40 100%
40 / 40 100%
Kadáver
40 / 40 100%
40 / 40 100%
39 / 39* 100%
Élő
38 / 39* 97,4%
40 / 40 100%
40 / 40 100%
Kadáver
40 / 40 100%
40 / 40 100%
40 / 40 100%
Élő
39 / 39* 100%
40 / 40 100%
39 / 39* 100%
0,75
1
1
HIV-2 HCV HBV
Egyoldalas p-érték élő vs. kadáver minta, reagenstételenként
1 1 1 0,5 1
–
* Egy ismétlés érvénytelen volt
17. táblázat A cobas® TaqScreen MPX teszt reprodukálhatóságának összefoglalása kadáver és élő donor minták esetében – Eredmények üzemeltető-készülék pár szerint
Vírustarget
Donortípus
1. üzemeltetőkészülék pár
HIV-1 M csoport
Kadáver
60 / 60 100%
60 / 60 100%
Élő
60 / 60 100%
58 / 58** 100%
HIV-1 O csoport
Kadáver
59 / 60 98,3%
60 / 60 100%
Élő
59 / 59* 100%
60 / 60 100%
Kadáver
60 / 60 100%
60 / 60 100%
Élő
59 / 59* 100%
60 / 60 100%
Kadáver
60 / 60 100%
59 / 59* 100%
Élő
59 / 59* 100%
59 / 60 98,3%
Kadáver
60 / 60 100%
60 / 60 100%
Élő
58 / 58** 100%
60 / 60 100%
1,0
0,5
HIV-2 HCV HBV
Egyoldalas p-érték élő vs. kadáver minta, készüléküzemeltető páronként
2. üzemeltetőkészülék pár
Egyoldalas p-érték élő vs. kadáver minta, targetenként 1 1 1 0,5 1 –
*Egy ismétlés érvénytelen volt **Két ismétlés érvénytelen volt
05888212044-01HU
34
Doc Rev 5.0
Érzékenység HBV, HCV, HIV-1 M csoport Hatvan, véletlenszerűen kiválasztott kadáver EDTA-s plazmamintát, amely nem reaktív HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2, HCV RNS-re és HBV DNS-re, hemolízisszint szerint osztályoztak [mérsékelten hemolizált minta (szalmasárgától rózsaszínűig), illetve nagyfokban hemolizált minta (pirostól sötétpiros, vagy barna színűig)], és egyenlő arányban 5, csoportonként 12 mintát tartalmazó tesztfertőzött klinikai mintacsoportba soroltak. Minden kadáver mintát az adott csoportokon belül beoltottak az öt egyéni, egyszeresen fertőzött HIV-1 M csoport, HCV, vagy HBV ismert koncentrációit tartalmazó klinikai minta egyikével a kimutatási határ (LOD) 3x végkoncentrációiban, a hemolízis ® szintjének megfelelően. A vizsgálat előtt minden mintát manuálisan hígítottak 1:5 arányban a cobas TaqScreen kadáver minta oldószerrel. Három reagenstételt használtak a vizsgálat során és minden csoportot megosztottak a tételek között, így összesen 20 minta jutott targetenként és tételenként. A hatvan vizsgált kadáver minta reaktivitási aránya minden target esetében 100% [95% CI: 94 – 100%] ® volt a HIV-1 M csoport, HCV és HBV vírustargetre a cobas TaqScreen MPX teszttel. Az érzékenységi vizsgálat eredményeinek összefoglalása a 18. táblázatban látható. HIV-1 O csoport, HIV-2 HIV-1 O csoportú és HIV-2 vírustargetekként a Roche elsődleges standardokat használták a kadáver EDTA-s plazmaminták beoltására, megközelítően 3X LOD mennyiségben, a hemolízis szintjének megfelelően [mérsékelten hemolizált minta (szalmasárgától rózsaszínűig), illetve nagyfokban hemolizált minta (pirostól sötétpiros, vagy barna színűig)] . A targeteknek következetesen csak egy ® tesztcsoportja volt. A vizsgálat előtt minden mintát manuálisan hígítottak 1:5 arányban a cobas TaqScreen kadáver minta oldószerrel. Három reagenstételt használtak a vizsgálat során és minden csoportot megosztottak a tételek között, összesen 12 mintát eredményezve, és mindegyiket vizsgálták HIV-1 O csoport és HIV-2 RNS-re. A tizenkét kadáver minta HIV-1 O csoport és HIV-2 ® vizsgálata során a reaktivitás aránya 100% [95% CI: 73.5-100%] volt a cobas TaqScreen MPX teszttel. Az érzékenységi vizsgálat eredményeinek összefoglalása a 18. táblázatban látható. 18. táblázat ® A cobas TaqScreen MPX Test érzékenységi vizsgálatának összefoglalása mérsékelten hemolizált (MH) és nagyfokban hemolizált (HH) kadáver minták esetében Reagenstétel
Hemolízisszint
HIV-1 M csoport
HIV-1 O csoport
HIV-2
HCV
HBV
MH
14/14
3/3
3/3
14/14
14/14
HH
6/6
1/1
1/1
6/6
6/6
Összes
20/20
4/4
4/4
20/20
20/20
MH
13/13
3/3
3/3
13/13
13/13
HH
7/7
1/1
1/1
7/7
7/7
Összes
20/20
4/4
4/4
20/20
20/20
MH
16/16
3/3
3/3
16/16
16/16
HH
4/4
1/1
1/1
4/4
4/4
Összes
20/20
4/4
4/4
20/20
20/20
100%
100%
100%
100%
100%
94,0 – 100% CI
73,5 – 100% CI
73,5 – 100% CI
94,0 – 100% CI
94,0 – 100% CI
1. tétel
2. tétel
3. tétel
Érzékenység
05888212044-01HU
35
Doc Rev 5.0
Specificitás Hetven egyéni, szeronegatív élő donor (pre-mortem) és hetvenegy egyéni, szeronegatív kadáver (post-mortem) EDTA-s plazmamintát három csoportba soroltak, és minden csoport mintáit a három ® reagenstételű cobas TaqScreen MPX tesztkészlet egyikével vizsgáltak. A kadáver mintákat három, ® 25, 21 és 25 mintát számláló csoportra osztották, manuálisan 1:5 arányban hígították a cobas TaqScreen kadáver minta oldószerrel és a kadáver minta vizsgálati eljárással vizsgálták. Az élő donor mintákat három, 25, 20 és 25 mintát számláló csoportra osztották, manuálisan 1:6 arányban hígították csoportos EDTA-s plazmával (HIV-1 M csoport, HIV-1 O csoport, HIV-2 RNS, HCV RNS és ® HBV DNS negatív) a vizsgálat előtt, hogy így a cobas TaqScreen MPX teszt hat ajánlott vizsgálati eljárásának csoportjait szimulálják. A kadáver minták esetében hetven érvényes eredményt kaptak a három készlettétel alkalmazásával. Három minta már a vizsgálat kezdetekor reaktívnak bizonyult. A vizsgálat megismétlésekor két példányban, a háromból két minta maradt reaktív és egy adott nem reaktív eredményt. A megerősítő ® vizsgálat során a COBAS AmpliScreen HIV-1, HCV és HBV tesztek megerősítették, hogy mind a három minta reaktív volt HCV RNS-re. Ezt a három reaktív mintát ezért, mivel valódi víruspozitív minták voltak, kizárták a specificitási analízisből. Az élő donor minták esetében hetven érvényes eredményt kaptak a három készlettétel alkalmazásával. Mind a hetven eredmény nem reaktív eredményt adott. A specificitási vizsgálat eredményeinek összefoglalása a 19. táblázatban látható. 19. táblázat ® A cobas TaqScreen MPX test specificitási vizsgálatának összefoglalása kadáver és élő donor minták esetében Kadáver donor minták ® (1:5 hígítás cobas TaqScreen kadáver minta oldószerben)
Élő donor minták (1:6 hígítás negatív EDTA-s plazmában)
Reagenstétel
Érvényes eredmények száma
Nem reaktív eredmények száma
Reaktív eredmények száma
Érvényes eredmények száma
Nem reaktív eredmények száma
Reaktív eredmények száma
1. tétel
24
24
0
25
25
0
2. tétel
21
21
2*
20
20
0
3. tétel
25
25
1**
25
25
0
Összes
70
70
3
70
70
0
Specificitás
100%***
100%
* A két példányban történt ismételt vizsgálat során egy minta volt nem reaktív és egy minta volt reaktív; mindkét minta ® reaktív volt a COBAS AmpliScreen HCV teszttel. ® ** A két példányban történt ismételt vizsgálat során ez a minta reaktív volt; a minta reaktív volt a COBAS AmpliScreen HCV teszttel is. ® *** Számított specificitás a 3, COBAS AmpliScreen HCV teszttel megerősítetten reaktív minta eltávolítása után.
05888212044-01HU
36
Doc Rev 5.0
Forrásplazma Szerokonverziós panelek Harminc szerokonverziós panelt (10 HBsAg szerokonverziós panel, 10 anti-HCV szerokonverziós panel és 10 anti-HIV-1 szerokonverziós panel) vizsgáltak tisztán (hígítatlanul) és 1:96 hígítás mellett. HIV-1 szerokonverziós panelek ®
Minden tisztán vizsgált HIV-1 panel (100%) reaktív eredményt adott a cobas TaqScreen MPX ® teszttel, minden szerológiai vizsgálatot megelőzve. A cobas TaqScreen MPX teszt kimutatás előtti mediánja 21-42 nap között volt. Ezenfelül, minden 1:96 hígításban vizsgált panel (100%) reaktív ® eredményt adott a cobas TaqScreen MPX teszttel, minden szerológiai vizsgálatot megelőzve. ® A cobas TaqScreen MPX teszt kimutatás előtti mediánja az 1:96 hígítású mintáknál 9-28 nap között volt. 20. táblázat A cobas® TaqScreen MPX teszt teljesítménye HIV-1 szerokonverziós panelekkel Napok a HIV antitest kimutatása előtt Abbott HIV-1 EIA
bioMerieux Genetic Vironostika Systems rLAV HIV-1 Microelisa EIA System
Abbott HIV-1/2 EIA
Genetic Systems HIV-1/2
®
cobas TaqScreen MPX teszt Tiszta
1:96
Tiszta
1:96
Tiszta
1:96
Tiszta
1:96
Tiszta
1:96
Átlag
22
12
40
27
27
16
21
10
28
19
Medián
21
12
42
28
32
14
22
9
24
14
5, 18
16, 67
16, 36
7, 40
7, 30
2, 38
2, 28
14, 49
14, 37
Min., max. 10, 33
Megjegyzés: min. = minimum; max. = maximum.
HCV szerokonverziós panelek ®
Minden tisztán vizsgált HCV panel (100%) a cobas TaqScreen MPX teszttel reaktív eredményt adott az Abbott 2.0 Anti-HCV szerológiai vizsgálattal (medián = 37 nap), illetve az Ortho ELISA AntiHCV EIA 3.0 szerológiai vizsgálattal (medián = 32 nap) való kimutathatóság előtt. Ezenfelül, minden 1:96 hígításban vizsgált panel (100%) reaktív eredményt adott az Abbott 2.0 Anti-HCV szerológiai vizsgálattal (medián = 34 nap), illetve az Ortho ELISA Anti-HCV EIA 3.0 szerológiai vizsgálattal (medián = 32 nap) való kimutathatóság előtt. 21. táblázat ® A cobas TaqScreen MPX teszt teljesítménye HCV szerokonverziós panelekkel Napok a HCV antitest kimutatása előtt Abbott 2.0 Anti-HCV
Ortho ELISA Anti-HCV EIA 3.0 ®
cobas TaqScreen MPX teszt Tiszta
1:96
Tiszta
1:96
Átlag
34
32
31
28
Medián
37
34
32
32
Min., max.
3, 49
3, 49
7, 39
7, 39
Megjegyzés: min. = minimum; max. = maximum.
05888212044-01HU
37
Doc Rev 5.0
HBV szerokonverziós panelek ®
Minden tisztán vizsgált HBV panel (100%) a cobas TaqScreen MPX teszttel reaktív eredményt adott ® az Abbott Auszyme Monoclonal HBsAg szerológiai vizsgálattal (medián = 32 nap), illetve a Genetic Systems HBsAg (2.0) vizsgálattal (medián = 37 nap) való kimutathatóság előtt. Az 1:96 hígítás mellett ® vizsgált panelek közül 90% (9/10) adott reaktív eredményt a cobas TaqScreen MPX teszttel az Abbott Auszyme Monoclonal HBsAg szerológiai vizsgálattal (medián = 18 nap) való kimutathatóság előtt, és ® 100% adott reaktív eredményt a cobas TaqScreen MPX teszttel a Genetic Systems HBsAg (2.0) vizsgálattal (medián = 15 nap) való kimutathatóság előtt. Az egy, 1:96 hígítás mellett vizsgált panel esetében, amelynél az Abbott Auszyme Monoclonal HBsAg vizsgálat előbb mutatott reaktív eredményt, ® mint a cobas TaqScreen MPX vizsgálat, az Abbott Auszyme Monoclonal HBsAg vizsgálat a 21. és 25. napokon bizonyult reaktívnak, a 28. és 35. napokon nem reaktívnak, majd a 39. napon reaktívnak, ® míg a cobas TaqScreen MPX teszttel reaktivitás a 35. napon és azután volt kimutatható. 22. táblázat ® A cobas TaqScreen MPX teszt teljesítménye HBV szerokonverziós panelekkel Napok a HBsAg kimutatása előtt Abbott Auszyme Monoclonal HBsAg
Genetic Systems HBsAg (2.0) ®
cobas TaqScreen MPX teszt Tiszta
1:96
Tiszta
1:96
Átlag
33
15
36
17
Medián
32
18
37
15
Min., max.
11, 51
-14, 33
14, 47
3, 40
KLINIKAI ALKALMAZÁS Reaktivitás teljes vér donor populációban ®
A cobas TaqScreen MPX teszt klinikai specificitását véletlenszerűen kiválasztott véradási teljes vér mintákban vizsgálták három külső laboratóriumi helyszínen. A vizsgálatot mind a leadott egyéni vérből, mind egyéni véradások egyenlő részleteiből készített csoportosított mintákból elvégezték. ® Összesen 72 281 véradási vizsgálat alapján a cobas TaqScreen MPX teszt klinikai specificitása 99,98% (72 266/72 281; 95% CI = 99,97–99,99). A csoportosított formában vizsgált donorminták esetében a reaktív csoportokat visszabontották az eredményt okozó egyéni véradási minta további vizsgálatára. A klinikai specificitás vizsgálata során egy esetben a donor HBV DNS pozitívnak bizonyult, ® amit adott laboratórium jelenlegi vizsgálati módszereivel nem sikerült kimutatni. A csoportok cobas TaqScreen MPX teszttel végzett vizsgálatának összesített eredménye a 23. táblázatban látható alább. 23. táblázat Csoportreaktivitás önkéntes véradóknál Kategória
Csoportok
Százalék
Vizsgált csoportok
10 090
100%
Nem reaktív csoportok
10 054
99,64%
Eredetileg reaktív csoportok
36
0,36%
Eredetileg reaktív csoportok pozitív donorstátusszal
23
0,23%
Pozitív csoportok a kimutatott eset miatt
1
0,01%
Eredetileg reaktív csoportok negatív donorstátusszal (álpozitív)
12
0,12%
05888212044-01HU
38
Doc Rev 5.0
Reaktivitás a forrásplazma donor populációban Összesen 1130 db, 96 tagú, 24 238 forrásplazma-donortól származó, 108 216 véradást reprezentáló csoportot vontak be a csoport reaktivitási vizsgálatokba (megj.: 178 csoport 90-95 tagú volt). Ebből ® az 1130 csoportból 1094 (96,8%) eredménye volt nem reaktív a cobas TaqScreen MPX teszttel és 36 (3,2%) volt reaktív. Az 1094 nem reaktív csoport közül 1046 csoport csak negatív státuszú véradási mintát, 13 csoport pedig legalább egy pozitív státuszú véradási mintát tartalmazott. Ebből a 13 csoportból 12 csoport mindegyike tartalmazott egy pozitív donor státuszú véradási mintát az anti-HCV szerológia vagy anti-HIV-1/2 szerológia pozitív eredménye alapján (ezek közül 4 esetben a szerológiai eredmény álpozitívnak bizonyult), és 1 csoport tartalmazott egy olyan véradási mintát, ® amely a COBAS AmpliScreen HBV teszt csoport vizsgálat során kapott pozitív státuszt (ez ® a véradási minta a cobas TaqScreen MPX teszttel egyénileg vizsgálva reaktív eredményt adott). További 35 nem reaktív csoport (3,1%) tartalmazott legalább egy megerősítetlen státuszú véradási mintát. ®
A 36 cobas TaqScreen MPX teszttel reaktív csoport közül 29 csoport legalább egy pozitív státuszú véradási mintát tartalmazott, 7 csoport pedig csak negatív státuszú véradási mintát tartalmazott. Ebből a 29 csoportból 5 csoportban fordult elő kimutatott esetet tartalmazó véradási minta. Mind az ® 5 kimutatott esetet tartalmazó véradási minta reaktív eredményt adott a cobas TaqScreen MPX ® teszttel a csoportokban, és negatív eredményt a COBAS AmpliScreen tesztekkel (csoportokban) és ® szerológiával (egyéni véradási minták). Ezek a véradási minták pozitívak voltak a COBAS ® ® AmpliScreen tesztekkel (4 COBAS AmpliScreen HBV teszt pozitív és 1 COBAS AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 pozitív) a következő véradási minta csoportokban vagy az utánkövetés során az ® egyéni vizsgálatok alkalmával. Ezek a donorok a COBAS AmpliScreen HBV vagy HIV-1 tesztekkel is pozitívak voltak az első véradási minta egyéni vizsgálatakor. Az 1130 csoport vizsgálati eredményeit a 24. táblázat foglalja össze. 24. táblázat ® A cobas TaqScreen MPX teszt reaktivitása csoportokra 96 forrásplazma mintáig Csoportok száma
Vizsgált csoportok százaléka
Összes vizsgált 96-os* csoport:
1130
100
Nem reaktív csoportok**
1094
96,8
1046
92,6
13
1,2
35
3,1
36
3,2
Reaktív csoportok legalább egy pozitív donorstátusszal
29
2,6
Reaktív csoportok csak negatív donorstátusszal (álpozitív csoportok)
7
0,6
Kategória
Nem reaktív csoportok csak negatív donorstátusszal Nem reaktív csoportok legalább egy pozitív donorstátusszal Nem reaktív csoportok legalább egy megerősítetlen donorstátusszal Reaktív csoportok**
* Megjegyzés: az 1130 csoportból 178 csoport 90-95 tagú volt. **A donorstátusz meghatározása az első és további (ha volt ilyen) COBAS AmpliScreen teszteredmények alapján, szerológiai eredmények alapján és az utánkövetéses vizsgálatok eredményei alapján (ha hozzáférhető) történt. ®
A cobas TaqScreen MPX teszt forrásplazmára vonatkozó klinikai specificitását 24 194 véradótól származó 107 170 értékelhető véradás alapján a csoportok vizsgálatával határozták meg. Az értékelhető ® véradások érvényes eredményt adtak a cobas TaqScreen MPX és COBAS AmpliScreen HBV, HCV és HIV-1 tesztekkel csoportos vizsgálatokban és érvényes szerológiai eredményt adtak (az elemek által) az egyéni véradási minták vizsgálatával. Ebből a 107 170 értékelhető véradási mintából ® 107 127 negatív donorstátuszt kapott, amelyből 107 127 a cobas TaqScreen MPX teszttel nem reaktív eredményt adott a csoportvizsgálati algoritmus segítségével elvégzett megerősítő vizsgálatot ® követően, ami 100%-os klinikai specificitást jelent (95% CI = 99,997% – 100%). Hét, cobas TaqScreen MPX teszttel álreaktív 96-os csoport a csoportvizsgálati algoritmus segítségével elvégzett ® megerősítő vizsgálatot követően a cobas TaqScreen MPX teszttel nem reaktív véradási mintákat tartalmazóknak bizonyultak.
05888212044-01HU
39
Doc Rev 5.0
HIVATKOZÁSOK 1. Kahn JO, Walker BD. Current Concepts: acute human immunodeficiency virus type 1 infection. N Engl J Med. 1998; 339:33-39. 2. McCutchan FE. Global Epidemiology of HIV. Journal of Medical Virology, 78:S7-S12 (2006). 3. Centers for Disease Control and Prevention (www.cdc.gov). Fact Sheet – Human Immunodeficiency Virus Type 2. October 1998. 4. Reeves JD and Doms WR. Human Immunodeficiency Virus Type 2. Journal of General Virology (2002), 83:1253-1265. 5. Choo Q-L, Weiner AJ, Overby LR, et al. Hepatitis C virus: the major causative agent of viral non-A, non-B hepatitis. Br Med Bull. 1990; 46(2):423-441. 6. Alter HJ. Descartes before the horse: I clone, therefore I am: the hepatitis C virus in current perspective. Ann Intern Med. 1991; 115(8):644-649. 7. Chisari FV, Ferrari C. Viral Hepatitis. In: Nathanson N et al., eds. Viral Pathogenesis, Philadelphia, Lippincott-Raven, 1997: 745-748. 8. Hollinger FB, Liang TJ. Hepatitis B Virus. In: Knipe DM et al., eds. Fields Virology, 4th ed. Philadelphia, Lippincott Williams & Wilkins, 2001: 2971-3036. 9. Mahoney FJ, Kane M. Hepatitis B Vaccine. In: Plotkin SA and Orenstein WA, eds. Vaccines, 3rd ed. Philadelphia, W.B. Saunders Company, 1999: 158-182. 10. Viral Hepatitis Prevention Board. Prevention and Control of Hepatitis B in the Community. Communicable Disease Series, 1996: 1. 11. World Health Organization. Introduction of Hepatitis B Vaccine into Childhood Immunization Services. Geneva, WHO, 2001 (unpublished document WHO/V&B/01.31 available on request from Department of Vaccines and Biologicals, World Health Organization, 1211 Geneva 27, Switzerland). 12. Murthy KK, Henrard DR, Eichberg JW, et al. Redefining the HIV-infectious window period in the chimpanzee model: evidence to suggest that viral nucleic acid testing can prevent blood-borne transmission. Transfusion. 1999; 39:688-693. 13. Stramer SL, Glynn SA, Kleinman SH, et al. Detection of HIV-1 and HCV infections among antibody-negative blood donors by nucleic acid-amplification testing. N Engl J Med. 2004; 351:760-768. 14. Busch MP, Glynn SA, Stramer SL, et al. A new strategy for estimating risks of transfusiontransmitted viral infections based on rates of detection of recently infected donors. Transfusion. 2005; 45:254-264. 15. Offergeld R, Faensen D, Ritter S, Hamouda O. Human immunodeficiency virus, hepatitis C and hepatitis B infections among blood donors in Germany 2000-2002: risk of virus transmission and the impact of nucleic acid amplification testing. Euro Surveill. 2005; 10(2):8-11. 16. Hitzler WE, Runkel S. Routine HCV PCR screening of blood donations to identify early HCV infection in blood donors lacking antibodies to HCV. Transfusion. 2001; 41:333-337. 17. Roth WK, Weber M, Petersen D, et al. NAT for HBV and anti-HBc testing increase blood safety. Transfusion. 2002; 42:869-875. 18. Biswas R, Tabor E, Hsia CC, et al. Comparative sensitivity of HBV NATs and HBsAg assays for detection of acute HBV infection. Transfusion. 2003; 43:788-798. 19. Minegishi K, Yoshikawa A, Kishimoto S, et al. Superiority of minipool nucleic acid amplification technology for hepatitis B virus over chemiluminescence immunoassay for hepatitis B surface antigen screening. Vox Sang. 2003; 84:287-291.
05888212044-01HU
40
Doc Rev 5.0
20. Kleinman SH, Strong DM, Tegtmeier GE, et al. Hepatitis B virus (HBV) DNA screening of blood ® donations in minipools with the COBAS AmpliScreen HBV test. Transfusion. 2005; 45:1247-1257. 21. Busch MP, Lee LL, Satten GA, et al. Time course of detection of viral and serologic markers preceding human immunodeficiency type 1 seroconversion: implications for screening blood and tissue donors. Transfusion. 1995; 35:91-97. 22. Yoshikawa A, Gotanda Y, Itabashi M, et al. Hepatitis B NAT virus-positive blood donors in the early and late stages of HBV infection: analyses of the window period and kinetics of HBV DNA. Vox Sang. 2005; 88:77-86. 23. Comanor L and Holland P. Hepatitis B virus blood screening: unfinished agendas. Vox Sanguinis 2006; 91:1-12. 24. Longo MC, Berninger MS, Hartley JL. Use of uracil DNA glycosylase to control carry-over contamination in polymerase chain reactions. Gene. 1990; 93:125-128. 25. Savva R, McAuley-Hecht K, Brown T, Pearl L. The structural basis of specific base-excision repair by uracil-DNA glycosylase. Nature. 1995; 373:487-493. 26. Mol CD, Arvai AS, Slupphaug G, et al. Crystal structure and mutational analysis of human uracilDNA glycosylase: structural basis for specificity and catalysis. Cell. 1995; 80:869-878. 27. Higuchi R, Dollinger G, Walsh PS, Griffith, R. Simultaneous amplification and detection of specific DNA sequences. Biotechnology (NY). 1992; 10:413-417. 28. Heid CA, Stevens J, Livak JK, Williams PM. Real time quantitative PCR. Genome Res. 1996; 6:986-994. 29. Richmond JY, McKinney RW, eds. Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories. HHS Publication Number (CDC) 99-8395, 1999. 30. Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI). Protection of Laboratory Workers from Occupationally Acquired Infections; Approved Guideline – Third Edition. CLSI Document M29-A3 Wayne, PA:CLSI, 2005. 31. International Air Transport Association. Dangerous Goods Regulations. 41st ed. Quebec, Canada. 2000. 32. Saldanha J, Gerlich W, Lelie N, Dawson P, Heermann K, Heath A & The WHO Collaborative Study Group: An international collaborative study to establish a World Health Organization international standard for hepatitis B virus DNA nucleic acid amplification techniques. Vox Sang. 2001; 80:63-71. 33. Saldanha J, Heath A, Aberham C, Albrecht J, Gentili G, Gessner M and Pisani G: WHO Collaborative Study to Establish a Replacement WHO International Standard for HCV RNA NAT Assays. WHO/BS/03.1958 Expert Committee on Biological Standardization, Geneva, 17 to 21 February 2003.
05888212044-01HU
41
Doc Rev 5.0
Dokumentum verzióinformáció Doc Rev. 5.0 3/2010
Az EGYÉB SZÜKSÉGES, DE KÜLÖN ÁRUSÍTOTT ANYAGOK, Állványok ® és egyszer használatos anyagok szakasz frissítve lett, mert a COBAS AmpliPrep SPU állvány azonosítási száma megváltozott (P/N: 05471664001). ®
A REAGENSEK szakasz frissítve lett a ProClin 300 tartósítószer veszélyére való figyelmeztetéssel. A HASZNÁLATI UTASÍTÁS, Amplifikáció és kimutatás szakasz az alábbira változott: •
Vigye át a feldolgozott mintákat tartalmazó az SK24 állványokat ® ® ® ® a COBAS TaqMan analizátorra. A COBAS TaqMan analizátor automatikusan megkezdi az amplifikálási és kimutatási eljárást. ® ® A futtatásnak a COBAS TaqMan analizátoron 1 órán belül el kell kezdődnie attól számítva, hogy az adott SK24 állványban befejeződött a minta-előkészítés. Ha 1 órán belül nem viszi át az SK24 állványokat, azokra érvénytelen eredményt fog kapni, kivéve az érvényes mintacsoportban levő reaktív eredményeket, amelyek reaktívként lesznek jelentve.
A védjegyekre vonatkozó megjegyzések frissítve lettek. Ez a terméket Svájcban gyártják a Roche Molecular Systems számára. Doc Rev. 4.0 11/2009
A FELHASZNÁLÁS MÓDJA rész frissítése tartalmazza a minták szűrését forrásplazma donoroktól, valamint kadáver szövet- és szervdonoroktól. ®
A cobas TaqScreen MPX teszttel végzett kadáver minták vizsgálatához ® a felhasználónak a cobas TaqScreen kadáver minta oldószer készletre van szüksége. Az A VIZSGÁLAT ÖSSZEGZÉSE ÉS MAGYARÁZATA rész frissítése a jelenlegi információkkal történt. Az Automatizált mintacsoportosítás és pipettázás a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorral rész tartalmát felülvizsgálták, hogy megemlítse: •
a Hamilton MICROLAB STARlet IVD pipettor használható.
•
*mély lyukú lemez használata opcionális.
•
kadáver minták vizsgálatakor a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor alkalmazását megelőzően el kell végezni a minták 1:5 ® arányú kézi hígítását a cobas TaqScreen kadáver minta oldószerrel [CADV SPEC DIL]. ®
A REAGENSEK rész frissítése tartalmazza a cobas minta oldószer készletre vonatkozó információkat.
TaqScreen kadáver
A TÁROLÁSI ÉS KEZELÉSI KÖVETELMÉNYEK rész a következő frissítéseket tartalmazza: ®
•
Az AMPLILINK szoftver ellenőrzi a reagenskazetták COBAS AmpliPrep készülékben töltött összesített idejét, és meggátolja a kazetták felhasználását a 40. összesített óra elérése után.
•
Az AMPLILINK szoftver nem ellenőrzi a reagenskazetták COBAS AmpliPrep készülékben töltött folyamatos idejét, sem a kazettákat felhasználó gépi ciklusok számát. A felhasználó felelőssége, hogy a 24 folyamatos óra vagy 6 gépi ciklus elérése után eldobja a reagenskazettákat.
•
A CADV SPEC DIL reagenst 15 és 30 °C között tárolja. Az oldószer a feltüntetett lejárati időn belül stabil. Felbontást követően a tartályban maradt fel nem használt oldószert ki kell dobni.
®
Az ÓVINTÉZKEDÉSEK rész frissítése az alábbiakat foglalja magában
05888212044-01HU
•
A cobas TaqScreen kadáver minta oldószer készletet ne használja fel a lejárati ideje után.
•
Ne használjon nagymértékben hemolizált élő donor mintákat.
®
42
Doc Rev 5.0
A MINTAVÉTEL, -TÁROLÁS ÉS -CSOPORTOSÍTÁS részt a következő módon dolgozták át: Élő donor minták •
Az EDTA-s vérminták a plazma elválasztását megelőzően 2–30 °C-on legfeljebb 72 óráig, 2–8 °C-on további 48 óráig tárolhatóak. Öt napnál hosszabb tároláshoz válassza el a plazmát a vörösvértestektől centrifugálással (800–1600 x g, 20 perc). A eltávolítást követően a plazma 2–8 °C között legfeljebb hét napig, ≤ -18 °C-on további 30 napig tárolható. Az EDTA-s plazma legfeljebb három (3) alkalommal fagyasztható le és olvasztható fel.
•
A CPD, CPDA1 vagy CP2D antikoagulánssal levett minták a plazma elválasztását megelőzően 2–30 °C-on, legfeljebb 72 óráig tárolhatóak. 72 óránál hosszabb tároláshoz válassza el a plazmát a vörösvértestektől centrifugálással (800–1600 x g, 20 perc). A eltávolítást követően a plazma 2–8 °C között legfeljebb hét napig, ≤ -18 °C-on további 30 napig tárolható. A CPD, CPDA1, és CP2D-s plazma legfeljebb három (3) alkalommal fagyasztható le és olvasztható fel.
•
Az ACDA vagy 4% nátrium-citrát antikoagulánst tartalmazó elválasztott plazma a levételt követően 2–30 °C-on, legfeljebb 72 órán át tárolható. Az elválasztott plazma ≤ -18 °C-on további 30 napig tárolható.
•
A lefedett mély lyukú lemezek 2–8 °C-on legfeljebb hét napig tárolhatóak attól az időponttól számítva, amikor a plazmát a vörösvértestekről eltávolították. Tárolásukra szükség esetén ≤ -18 °C-on, legfeljebb 7 napig van lehetőség.
Kadáver minták
05888212044-01HU
•
Kadáver donor eredetű minták vizsgálatakor a minták osztályozása: a szalmasárgától a rózsaszínűig mérsékelten hemolizált minta, a pirostól a sötétpiros, illetve barna színűig pedig nagyfokban hemolizált minta.
•
A cobas TaqScreen MPX teszttel EDTA antikoagulánst tartalmazó csövekbe, illetve szérumcsövekbe levett kadáver vérminták használhatóak. Kövesse a mintacső gyártójának utasításait. Az emelkedett hőmérséklet befolyásolja a minták stabilitását.
•
Az EDTA-s kadáver vérminták a plazma elválasztását megelőzően 2–30 °C-on legfeljebb 24 óráig, 2 – 25 °C-on további 24 óráig tárolhatóak. Két napnál hosszabb tároláshoz válassza el a plazmát a vörösvértestektől centrifugálással (800–1600 x g, 20 perc). Eltávolítást követően a plazma 2–8 °C-on még további nyolc napig tárolható. Szükség esetén a plazma tárolására ≤ -18 °C-on, legfeljebb 30 napig van lehetőség. A kadáver EDTA-s plazma legfeljebb három (3) alkalommal fagyasztható le és olvasztható fel.
•
A szérumként levett kadáver minták a centrifugálást megelőzően 2–30 °C-on legfeljebb 24 óráig, 2 – 25 °C-on további 24 óráig tárolhatóak. Két napnál hosszabb tároláshoz válassza el a szérumot az alvadéktól centrifugálással (800–1600 x g, 20 perc). Eltávolítást követően a szérumminták 2–8 °C-on még további három napig tárolhatóak. Szükség esetén az alvadéktól elválasztott szérum tárolására ≤ -18 °C-on, legfeljebb 15 napig van lehetőség. A kadáver szérumminta legfeljebb három (3) alkalommal fagyasztható le és olvasztható fel.
•
A cobas® TaqScreen kadáver minta oldószerrel 1:5 arányban hígított kadáver minták 2 – 8 °C-on legfeljebb 1 napig tárolhatóak, és keverés után (fel-le pipettázás négy (4) alkalommal minden csőben) vizsgálhatóak ® a cobas TaqScreen MPX teszttel.
•
Amennyiben a minták szállítása szükséges, akkor azokat a minták és kóroki ágensek transzportjára vonatkozó szövetségi és nemzetközi 31 előírásoknak megfelelően kell csomagolni és felcímkézni.
•
Álpozitív eredmények fordulhatnak elő a minták keresztszennyeződéséből adódóan, ha azok nem voltak megfelelően kontrollálva a mintakezelés és -feldolgozás során.
®
43
Doc Rev 5.0
A MINTACSOPORTOSÍTÁS ÉS -PIPETTÁZÁS részt a következő módon ® frissítették: A forrásplazma esetében, ha a cobas TaqScreen MPX teszttel reaktív csoport mutatható ki, a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettor pipettázza az egyéni mintákat a 2D csoportosítási, illetve a megerősítő csoportosítási eljárásnak megfelelően, ahogy az a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyvében olvasható. A ELJÁRÁSSAL KAPCSOLATOS MEGJEGYZÉSEK részt a következő módon frissítették: Reagensek •
Valamennyi cobas TaqScreen MPX tesztkészlet összesen 96 vizsgálat elvégzéséhez elegendő reagenst tartalmaz, amelyek futtatását SK24 állványonként 24 vizsgálatot tartalmazó tételekben célszerű kivitelezni. Tételenként, illetve SK24 állványonként egy negatív kontrollt és egy pozitív kontrollt is fel kell dolgozni. A kontrollokat élő donor minta és kadáver minta esetében is azonos módon kell feldolgozni a cobas® TaqScreen MPX teszttel.
•
Minden cobas TaqScreen kadáver minta oldószer készlet összesen 96 vizsgálat elvégzéséhez elegendő reagenst tartalmaz, amelyek futtatását SK24 állványonként 24 vizsgálatot tartalmazó tételekben célszerű kivitelezni. Tételenként, illetve SK24 állványonként egy negatív kontrollt és egy pozitív kontrollt is fel kell dolgozni. A kontrollokat élő donor minta és kadáver minta esetében is azonos módon kell feldolgozni a cobas® TaqScreen MPX teszttel.
®
®
Megkülönböztető vizsgálat •
Élő donorok: A megkülönböztető vizsgálati eljárásokra vonatkozóan ® tanulmányozza a COBAS AmpliScreen HBV teszt használati utasítását, ® a COBAS AmpliScreen HCV teszt, v2.0 használati utasítását és ® a COBAS AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 használati utasítását.
•
Kadáver donorok: Egy egyéni reaktív kadáver minta a COBAS ® AmpliScreen HBV teszt, a COBAS AmpliScreen HCV teszt, v2.0 és ® a COBAS AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 megkülönböztető vizsgálatokkal futtatható. A megkülönböztető vizsgálati eljárásokra vonatkozóan tanulmányozza ® ® a COBAS AmpliScreen HBV teszt használati utasítását, a COBAS ® AmpliScreen HCV teszt, v2.0 használati utasítását és a COBAS AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 használati utasítását.
®
A Kontrollok és minták pipettázása a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorral részt a következő módon frissítették:
05888212044-01HU
•
Keverje meg a kontrollokat háromszori óvatos döntögetéssel úgy, hogy ne képződjenek buborékok.
•
Kadáver minták vizsgálatához a mély lyukú lemez használata nem volt hozzáférhető a cobas s 201 rendszer üzembe helyezésének időpontjában.
•
Ügyeljen rá, hogy ne sértse meg a mintacsövek és kontrollcső adaptorok azonosító vonalkódját. Ha sérült, a rendszer nem fogja felismerni a mintákat vagy kontrollokat.
•
Egyéni kadáver minták esetében pipettázzon 2000 µl CADV SPEC DIL reagenst a megfelelően jelölt 13 x 100 mm-es csövekbe, mérjen minden egyéni csőbe 500 µl kadáver mintát és keverje meg azt négyszeri (4) fel-le pipettázással. Töltse be a hígított kadáver mintákat, fogyóeszközöket és kontrollokat a Hamilton MICROLAB STAR/STARlet IVD pipettorba. A hígított kadáver minták, fogyóeszközök és kontrollok betöltése után a készülék átviszi a kontrollokat és hígított mintákat az S-csövekbe. A hígított kadáver minták és MPX kontrollok a nyitott csövekben legfeljebb 6 óráig stabilak.
•
Ha megtörtént az átvitel az S-csövekbe, ott minden vírustarget és kontroll, 6 óráig stabil.
•
A mély lyukú lemezekben tárolva minden vírustarget 2–8 °C-on 7 napig, illetve ≤ -18 °C-on 7 napig marad stabil.
44
Doc Rev 5.0
A Nukleinsavak kivonása a pipettázott mintákból és kontrollokból részt a következő módon frissítették: •
Távolítsa el a mintafeldolgozó egység (SPU) csomagolását, de hagyja a szalagot és a műanyag fedőt érintetlenül.
•
Úgy, hogy az SPU-állvány nagy füle a felhasználó felé nézzen, illessze az SPU-öblítő nyalábot az SPU-állvány jobb oldalához.
•
Távolítsa el a szalagot és a műanyag fedőt az állványba illesztett SPUkról. Ellenőrizze, hogy minden SPU megfelelően benyomva, egy szintben legyen és teljes mértékben illeszkedjen az állványba. Egy elmozdult SPU műszerhibát okozhat. Ne nyomja meg a SPU-ban található S-hegyet.
•
Csúsztassa be legalább a szükséges számú K-cső és K-hegy állványt ® a COBAS AmpliPrep készülék M, N, O és P pozícióiba.
A MINŐSÉG-ELLENŐRZÉS részt a következő módon frissítették: •
Az eredmények kontrollhibából adódó érvénytelenítését a PDM szoftver automatikusan elvégzi.
•
Ahhoz, hogy a donorminta érvényes, nem reaktív (–) vizsgálati eredményt adjon, a járulékos belső kontroll érvényes kell, hogy legyen, ellenkező esetben a nem reaktív eredmény érvénytelen lesz, és a donorminta vizsgálatát meg kell ismételni.
Az EREDMÉNYEK részt a következő módon frissítették: •
Csoportosított forrásplazma donorok A forrásplazma csoportok esetében a reaktív csoportok visszaoldása egyéni reaktív mintákká a 2D csoportosítási, illetve a megerősítő csoportosítási eljárásokkal történik, ahogy az a cobas s 201 rendszer felhasználói kézikönyvében olvasható. Minden reaktívnak talált egyéni ® minta további vizsgálata elvégezhető a COBAS AmpliScreen teszttel a vírus megkülönböztetése céljából.
•
Egyéni vizsgálat. Megkülönböztető vizsgálat. Kadáver minták esetében a HIV-1 M csoport, HCV és HBV ® megkülönböztetése céljából tanulmányozza a COBAS AmpliScreen ® ® HBV teszt, a COBAS AmpliScreen HCV teszt, v2.0 és a COBAS AmpliScreen HIV-1 teszt, v1.5 használati útmutatójának kadáver minta feldolgozási eljárásokra vonatkozó részét.
Az ELJÁRÁSSAL KAPCSOLATOS KORLÁTOZÁSOK részt a következő módon frissítették: •
Kadáver minták vizsgálatára a cobas TaqScreen MPX tesztet csak a cobas ® TaqScreen kadáver minta oldószer készlet, a cobas TaqScreen MPX ® kontrollkészlet, a cobas TaqScreen mosóreagens és a cobas s 201 rendszer együttes használatára értékelték.
•
A korrelációs vizsgálatok elvégzésekor a felhasználóknak a helyi specifikus irányelveket/eljárásokat kell követniük.
®
®
A TELJESÍTMÉNYJELLEMZŐK részt élő donor mintákra, kadáver donor mintákra és forrásplazma mintákra osztották. Élő donor minták
05888212044-01HU
•
Bevették a reprodukálhatósági eredményeket 1X LOD mellett (2. táblázat)
•
A PROBIT analízis vírusstandardokra adatait frissítették a 3. táblázatban. A Roche HIV-1 O csoport RNS és HIV-2 RNS standardok visszavezethetőek, ebben a sorrendben: CBER HIV-1 Subtype RNA Reference Panel #1 Lot O1, CBER HIV-2 RNA Lot Release Panel ISD.
•
A HIV-1 O csoport RNS-koncentrációt kijavították az 5. táblázatban.
•
A HIV-2 RNS-koncentrációt kijavították az 6. táblázatban.
•
Frissítették a genotípus/szubtípus szenzitivitási és inkluzivitás adatokat HIV-1 M csoportra (9. táblázat).
45
Doc Rev 5.0
Kadáver donor minták •
Bevették a reprodukálhatósági eredményeket (16. és 17. táblázat).
•
Bevették a szenzitivitási eredményeket (18. táblázat).
•
Bevették a specificitási eredményeket (19. táblázat).
Forrásplazma •
Bevették a szerokonverziós panelekből származó teljesítményadatokat (20., 21. és 22. táblázat).
KLINIKAI ALKALMAZÁS •
Bevették a forrásplazma véradási minták 96-os csoportjainak reaktivitási eredményeit (24. táblázat).
A HIVATKOZÁSOK részt frissítették. A leányvállalatok címeit frissítették. Amennyiben kérdése van, kérjük, lépjen kapcsolatba a Roche helyi képviselőjével.
05888212044-01HU
46
Doc Rev 5.0
Gyártva Svájcban: Roche Molecular Systems, Inc., Branchburg, NJ 08876 USA A Roche csoport tagja
Roche Diagnostics (Schweiz) AG Industriestrasse 7 6343 Rotkreuz, Switzerland
Roche Diagnostics 2, Avenue du Vercors 38240 Meylan, France
Roche Diagnostics GmbH Sandhofer Straße 116 68305 Mannheim, Germany
Distributore in Italia: Roche Diagnostics S.p.A. Viale G. B. Stucchi 110 20052 Monza, Milano, Italy
Roche Diagnostics S.L. Avda. Generalitat, 171-173 E-08174 Sant Cugat del Vallès Barcelona, Spain
Distribuidor em Portugal: Roche Sistemas de Diagnósticos Lda. Estrada Nacional, 249-1 2720-413 Amadora, Portugal
Roche Diagnostica Brasil Ltda. Av. Engenheiro Billings, 1729 Jaguaré, Building 10 05321-010 São Paulo, SP Brazil
A ROCHE, COBAS, COBAS S, TAQMAN, TAQSCREEN, AMPLISCREEN, AMPLICOR, AMPLILINK, AMPERASE, HIGH PURE és AMPLIPREP a Roche védjegye. A ROCHE RESPONSE CENTER a Roche szolgáltatási védjegye. A MICROLAB a Hamilton Company védjegye. Az ARMORED RNA egy szabadalommal védett technológia, amelyet az Ambion, Inc. és a Cenetron Diagnostics, LLC. fejlesztett ki. A #5,677,124, #5,919,625, és #5,939,262 U.S. szabadalmak, valamint más folyamatban lévő szabadalmak vonatkoznak rá. Az ARMORED RNA az Ambion és a Cenetron védjegye. A PROCLIN a Rohm and Haas Company védjegye. A MICROCIDE SQ a Global Biotechnologies, Inc. védjegye. A PRISM és az AUSZYME az Abbott Laboratories Corporation védjegye. Az ORTHO az Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. védjegye. A termékben található cianin festékeket a GE Healthcare Bio-Sciences Corp. és a Carnegie Mellon University szabadalmi jogai védik, és a Roche kizárólagos engedéllyel rendelkezik, hogy azokat a kutatásban és in vitro diagnosztikai rendszerek komponenseiként felhasználja. Az ilyen rendszereknek nem kutatási vagy nem in vitro diagnosztikai célú felhasználása a GE Healthcare Bio-Sciences Corp., Piscataway, New Jersey, USA és a Carnegie Mellon University, Pittsburgh, Pennsylvania, USA további engedélyét kívánja meg. Copyright 2010 Roche Molecular Systems, Inc. Minden jog fenntartva. 3/2010 Doc Rev. 5.0
05888212044-01HU
(05888212001-01ENGL) 05888212044-01
47
Doc Rev 5.0