Inovace vzdělávání v chemii a biologii s ohledem na aktuální trendy v biomedicinálním výzkumu reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0184
Zahraniční studentská stáž v IUPUI, Indianapolis, USA
Indianapolis
Ubytování
Apartments of Riverwalk
V apartmentu byly 2 ložnice, kuchyně s obývacím pokojem a koupelna. Apartment se nacházel asi 15min chůze od fakulty, případně 5 min školním autobusem.
Skvělí kamarádi
Studentský spolek Women in the science
Kampus
Faculty of science
Laboratoř
Kolektiv na univerzitě Náš vedoucí Geno Samaritoni a stážista z Taiwanu
V tomto kolektivu jsme se scházeli každý týden na meetingu
Příprava homogenní směsi pryskyřic a rozdělení do vialek O W O
H N
O W O
Fmoc BuOt
Homogenní směs pryskyřice
Pryskyřice v řadě A Bill Boardu
H N
Fmoc
Odchránění Fmoc protektivní skupiny a acylace O O
Piperidin, NMP (DMF), rt
O
H N
O R1
O H2N
R2CO2H (5 ekviv.) O
R1
DIC (5 ekviv.) HOBt (5 ekviv.) 1 den
O
H N
R2 O
O 1
R
Reakce prvního BB probíhala přes noc a reakční směs byla promíchávána
Štěpení produktů O
H N
2
R
O
O R1
TFA, DCM, H2O (35:60:5) 30 min, rt
Produkty štěpení byly vypuštěny do vialek
O
H N
R2 O
OH R1
První úkol: BB#1
A
H N
N
O
H N
OH
H N
O
O2N H N
OH
O
OH
OH
O
O
H N
OH
O OH
O
O
OH
O
H N
O
O
N
B
O2N
O
OH
OH
Druhý úkol: BB#2
A
N
H N
O
H N
OH
O
N
B
O
H N
H N
OH
H N
OH
O
O
H N
OH
O OH
O
O
OH
OH
O
O
O
O
OH
OH
Příprava vzorků na analýzy
Příprava TLC analýz
Aparatura na odfoukání roztoku z vialek dusíkem
P r o d u k t
Vyvíjení TLC (silika gel a CN-silika gel pod UV lampou)
HPLC/MS
Na HPLC/MS jsme analyzovaly všechny produkty, jak hrubé vzorky, tak přečištěné produkty
Látky byly analyzovány také NMR
Vyzkoušely jsme si samy vzorky na NMR připravit a spustit samostatnou analýzu
500MHz NMR spektroskop
Čištění produktů na chromatografických kolonkách
Produkt z BB#1 nebo BB#2 se nadávkoval na CN-silicagel kolonku a vysušil se dusíkem po dobu 2-4 hodin a pak následovala samotná chromatografie
Finální data z BB#1 řada A O 2N
O N
O
NH
OH
MT1-04A1
MW
NH OH
O
Značka produktu
O
NH
OH O
VC1-06-A1 MT1-04-A2
270,3
O
VC1-06-A2
MT1-04-A3
314,3
VC1-06-A3
345,4
Teoretický výtěžek (mg)
13,6
13,6
15,8
15,8
17,4
17,4
Výtěžek (mg)
18,2
20,6
15,6
17,1
14,5
15,4
QNMR Výtěžek (mg)
10,2
8,8
14,8
13,5
14,7
15,3
QNMR výtěžek (%)
74,6
64
85,7
85
84,5
88
Čistota - LC/MS při 210 nm Přečistěný výtěžek (mg)
76%
66%
93,9%
82%
94%
96%
7,2
7,5
8,8
9,9
7,3
9,3
Přečistěný výtěžek (%)
53
55
56
63
42
53
Finální data z BB#1 řada B O 2N
O
O NH
N
NH
O
OH
OH
NH
O
OH
O
O
OH OH
OH
Značka produktu
MT1-04-B1 VC1-06-B1
MT1-04-B2 VC1-06-B2
286,3
330,3
MW
MT1-04-B3
VC1-06-B3
361,4
Teoretický výtěžek (mg) Výtěžek (mg)
14,5
14,5
16,5
16,7
18,0
18,3
23,2
21,9
18,4
19,3
15,5
15,8
QNMR Výtěžek (mg)
13,8
12,3
13,0
13,1
15,5
15,0
QNMR výtěžek (%)
95,3
85
77,8
78
84,6
82
82%
87%
83%
88%
85%
5,6; 2,3
8,5
10,0
9,1
5,4
54
50,9
69
49,7
30
Čistota - LC/MS při 210 86% nm Přečistěný výtěžek 6,0; 2,9 (mg) Přečistěný výtěžek (%) 61
Finální data z BB#2 řada A O
O N
OH
O
O
MT2-13-A1 VC2-18-A1
MW Teoretický výtěžek (mg) 13,9
NH
OH
OH
Značka produktu
O
NH
NH
270,28 13,9
O
MT2-13-A2 VC2-18-A2
MT-13-A3
VC2-18-A3
13,8
269,3 13,8
16,4
319,35 16,4
Výtěžek (mg) QNMR Výtěžek (mg) QNMR výtěžek (%) Čistota - LC/MS při 210 nm Přečistěný výtěžek (mg)
19,5 12,5 89,6 92%
19 12,6 91 95%
15 12,9 93,3 96%
13,5 12,7 92 91%
17,4 15,1 92,1 97%
16,9 15,9 97 98%
-
8,0
-
8,2
-
10,9
Přečistěný výtěžek (%)
-
58
-
59
-
66
Finální data z BB#2 řada B O N
O
NH
O
NH
OH O
OH
O
O
OH
OH
Značka produktu MW Teoretický výtěžek (mg) Výtěžek (mg) QNMR Výtěžek (mg) QNMR výtěžek (%) Čistota - LC/MS při 210 nm Přečistěný výtěžek (mg) Přečistěný výtěžek (%)
NH
OH
OH
MT2-13-B1 VC2-18-B1 MT2-13-B2 VC2-18-B2 286,28 285,3 14,7 14,7 14,6 14,6
MT2-13-B3 VC2-18-B3 335,35 17,2 17,2
21,9 11,6 86,4 91%
20,9 13,5 92 93%
16,1 13,0 89,0 92%
15,9 14,4 99 93%
18,9 15,0 87,2 96%
18,7 15,9 92 96%
-
6,9
-
10,4
-
10,8
-
47
-
71
-
63
BB#3 • Příprava produktů v BB3 se od předchozích dvou trochu lišila 1. Alkylace celého BB#3
R1X,(3 ekviv.) BTPP (3 ekviv.)
N O
O NMP, rt, 1 den
N
R1
O
O
Schéma reakcí BB#3 2. Neutralizace a hydrolýza celého BB#3 1)HCl:THF (1:2) 20min N
R1
O
O
2)DIEA
H2N O
R1 O
Schéma reakcí BB#3 3. Acylace řady B
O H2N
O R1
R2CO2H (5ekviv.) DIC (5 ekviv.) HOBt (5ekviv) NMP, 1 den, rt
O
H N O
O R1
Schéma reakcí BB#3 4. Odštěpení produktů O H2N
(35:60:5) 30 min, rt O
R1
O
O R1
H2N
OH R1
O
H N
O
(35:60:5) 30 min, rt
O
H N O
OH R1
BB#3
A
O
O H2N
H2N
O H2 N
OH
OH
OH
CH3
B
H N O
O
H N
OH
Br
O
H N
OH
O OH
O
O CH3
Br
TLC analýza • TLC analýza produktů z BB3 se prováděla na skleněné desce silikagelu • Látky neobsahovaly dostatečný chromofor, proto jsme skvrny musely vizualizovat • Vizualizace skvrn se provedla ponořením plátu do roztoku ninhydrinu a po vyjmutí z roztoku jsme plát zahřívaly, až se objevily barevné skvrny.
Vizualizace v ninhydrinu
TLC desky po vizualizaci
Finální data z BB#3 řada A H2N
OH
Značka produktu MW Teoretický výtěžek (mg) Výtěžek (mg)
H2N
O H3C
O
H2N
O
OH
Br
OH
MT3-19-A1 VC3-34-A1 MT3-13-A2 VC3-34-A2 MT3-13-A3 VC3-34-A3 165,2 179,2 244,1 8,6 8,6 9,3 9,3 12,7 12,7
167,4 s NMP QNMR Výtěžek (mg) 3,4 QNMR výtěžek (%) 39,4 Čistota - LC/MS při 210 66.3% bez nm NMP; 8,3% s NMP Přečistěný výtěžek (mg) Přečistěný výtěžek (%) -
11,7
19,2
20,1
12,4 s NMP
19,6
6,1 71 77%
7,4 79,6 79,5% bez NMP; 54% s NMP
8,2 88 57%
3,7 10,6 29,2 83 69% bez 68% NMP; 8.6% s NMP
1,1; 2,6
-
1,4; 3,0
-
1,4; 3,6
43
-
47
-
39
Finální data z BB# řada B O
O
NH
O OH
NH
OH
OH
O
NH
O
Br O CH3
Značka produktu MW Teoretický výtěžek (mg) Výtěžek (mg)
MT3-13-B1 VC3-34-B1 MT3-13-B2 VC3-34-B2
14.3
275,3 14,3
16.0
MT3-13-B3
VC3-34-B3
15.0
289,4 15,0
18.4
354,2 18,4
11,9
12.6
13,8
15.4
15,3
QNMR Výtěžek (mg) 36.1 QNMR výtěžek (%) 252 Čistota - LC/MS při 210 82.3% nm
19,8 138% 79%
17.9 119.4 76.7%
24,6 164% 80%
27.5 149.6 74.4%
28,4 154% 80%
Přečistěný výtěžek (mg) Přečistěný výtěžek (%)
-
5,5
-
5,7
-
7,3
-
38
-
38
-
40
Celý pobyt nebyla jen práce aneb výlet do Chicaga
Willis Tower
Tradiční americké jídla =)
