Werken met gecodeerde data in a biobank, Hebben we TTP wel nodig? Peter Riegman
WEON Coreon sessie Holiday Inn Ijmuiden Seaport Beach 10 Juni 2011
Presentation Type biobank Procedures Data Vastleggen Data Security Data uitgeven / Netwerken TTP?
Acquired disease No Apparent Disease
Disease development Birth Genetic personal susceptibility
Biomarkers of Susceptibility & Predisposition
Environmental exposures Biologically effective dose
Biomarkers of exposure
Early biological lesion Sub clinical (pre-invasive) disease Clinical disease (cancer) Prognosis & Diagnosis
Biomarkers of disease Prognostic & Predictive Markers
Response to clinical intervention Personalized Medicine
Weefsel Bank voor Medisch Research Pathologie Afdeling Gevroren weefsel (overgebleven) Chirurgische resectie preparaten Gevroren weefsel (niet overgebleven) Biopsies Secties FFPE archief materiaal
Lifecycle of frozen tissue samples Medical Treatment
Donor Consent
Medical/ Transport Processing Surgical Receiving Procedures
Measure in Minutes
Pre-acquisition Antibiotics Other drugs Type of anesthesia Anesthesia duration Arterial clamp time Warm Ischemia Cold Ischemia
Medical Research
Hospital integrated Biobanking
Acquisition Processing Time Temperature Warm Ischemia Cold Ischemia Fixation Agent Precooled Isopentane SOP’s / Workinstructions
Annotation Storage
Quality
Release, Scientific Restocking/ Distribution Analysis Destruction Transport
Measure in Years
Post Acquisition Storage Media Storage Method Storage Temperature Quality Controls Pathology Review Disease Site Clinical Data Data Standards SOP’s / Workinstructions
Release Study Design Multidisciplinary Ethics Statistics Equipment Cohort Definition SOP’s / Workinstructions Material Transfer Agreement
30 minutes
Pre-analytical phase
Courtesy Manuel Morente, The Marble Arch Working Group
Weefselbank Bank SOPs, QC and QA Protocollen verzamelen en opslaan Review 1% nieuwe samples elk jaar Random selectie (Zeldzame herkiezen) Sampel identificatie (bar code, labelling) Confirm diagnose met H&E coupes RNA extractie voor RNA kwaliteit bepaling
Weefselbank Bank SOPs, QC and QA Protocollen verzamelen en opslaan Review 1% nieuwe samples elk jaar Random selectie (Zeldzame herkiezen) Sampel identificatie (bar code, labelling) Confirm diagnose met H&E coupes RNA extractie voor RNA kwaliteit bepaling QC Snel diagnostiek vergelijk bekende klinische diagnose met de H&E gekleurde coupe
Regelgeving Overgebeleven weefsels Niet bestemd voor hergebruik in patienten
Code Goed Gebruik (FMWV). www.fmwv.nl
Opt-out systeem -> Bezw aar P rocedure
Regelgeving Overgebeleven weefsels Niet bestemd voor hergebruik in patienten
Code Goed Gebruik (FMWV). www.fmwv.nl
Opt-out systeem -> Bezw aar P rocedure
Regelgeving Overgebeleven weefsels Niet bestemd voor hergebruik in patienten
Code Goed Gebruik (FMWV). www.fmwv.nl
Opt-out systeem -> Bezw aar P rocedure
Informatie brochure + Bezwaar formulier
Regelgeving omtrent uitgifte Aanvraag Protocol voor gevroren of FFPE samples: Questionnaire: Persoonlijke data werknemer / aanvrager Doel studie en geplande experimenten Weefsel type en benodigde hoeveelheden METC -> Test niet WMO plichtig / Privacy)
Regelgeving omtrent uitgifte
Evaluatie door Weefselbank Commissie: Hoofd Erasmus MC weefselbank. Patholoog gespecialiseerd op aangevraagd weefsel type Onderzoeker(s) gespecialiseerd op aangevraagd weefsel type Clinici betrokken bij medisch onderzoek Overdracht met getekend Material Transfer Agreement
Data Vastleggen
Data Security
Data Security
Data Security
Weefselbank Personeel is bewust: Data moet discreet worden behandeld
Data uitgifte
De plaatjes met data die ik in deze presentatie heb laten zien worden niet vrijgegeven op het internet en zijn verwijderd. Dit is gedaan niet omdat ik daarmee de privacy van patiënten zou kunnen schaden, want de identiteit valt niet uit de gepresenteerde data op te maken omdat deze dubbel gecodeerd is, maar om het vertrouwen van de patiënten in het algemeen niet te schaden. Ik hoop hiermee tevens te demonstreren dat het privacy aspect en het vertrouwens aspect bij de Erasmus MC weefselbank hoog in het vaandel staan. Peter Riegman – Hoofd Erasmus MC weefselbank
European Translational Cancer Research Infrastructure
Dreamteams: Breast
= Comprehensive Cancer Center
European Translational Cancer Research Infrastructure
Dreamteams: Breast Colon cancer
= Comprehensive Cancer Center
European Translational Cancer Research Infrastructure
Dreamteams: Breast Colon cancer Lung
= Comprehensive Cancer Center
European Translational Cancer Research Infrastructure
Dreamteams: Breast Colon cancer Lung Prostate Colon cancer 2
= Comprehensive Cancer Center
European Translational Cancer Research Infrastructure
Dreamteams: BBMRI Biobanking and Bio Molecular Resources Research Infrastructure
Breast
Colon cancer Lung Prostate Colon cancer 2
= Comprehensive Cancer Center
PSI gebruikt TTP
PSI relateert samples van een patiënt in de centrale database met het BSN nummer als sleutel
Wanneer is TTP de norm
Waar dubbele codering volstaat is geen TTP nodig
Acknowledgements Erasmus MC Tissue Bank
Pearl String Initiative
Uniting Dutch academic clinical biobanks
Network of Excellence WG cancer biobanks OECI-TuBaFrost
EuroBoNeT WP5.3 Project Driven Virtual Tissue Bank
BBMRI
European Platform for Translational Cancer Research
Standardisation and improvement of generic pre-analytical tools and procedures for in vitro diagnostics
Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure
Acknowledgements
Past President
Vice President
Acknowledgements Erasmus MC
Erasmus MC Pathology:
Tissue Research Support Unit:
Center location and Daniel den Hoed
Peter Riegman
Pathologists and assistants
Bas de Jong Marcel Kap
CO & Histology Personnel
Monique Oomen Shazia Arshad
Erasmus MC Surgery and Oncology
Lisette de Vogel Winand Dinjens Wolter Oosterhuis
DONOREN
