Acta hygienica, epidemiologica et microbiologica Číslo 3/2004
Výroční zpráva o mykobakteriologické diagnostice v České a Slovenské republice v roce 2003 Praha, říjen 2004
Předseda redakční rady: doc. MUDr. L. Komárek, CSc. Členové: prof. MUDr. V. Bencko, DrSc., MUDr. J. Mika, RNDr. F. Rettich, CSc., Mgr. J. Veselá, MUDr. J. Volf, Ph.D.
Vydává Státní zdravotní ústav v Praze ISSN 0862-5956
ACTA HYGIENICA, EPIDEMIOLOGICA ET MICROBIOLOGICA Číslo 3/2004 - 1. vydání - říjen 2004 Výroční zpráva o mykobakteriologické diagnostice v České a Slovenské republice v roce 2003 Autoři:
V. Príkazský, M. Havelková, SZÚ Praha J. Kaustová, ZÚ se sídlem v Ostavě L. Langšádl, NÚTaRCH Bratislava
Vytiskl:
Ústav jaderných informací, Praha 5 - Zbraslav Elišky Přemyslovny 1335
Vychází nepravidelně 7-8x ročně Náklad 500 výtisků Vydal Státní zdravotní ústav, 100 42 Praha 10, Šrobárova 48 Tel. redakce: 267082288, e-mail:
[email protected]
Obsah Vladimír Príkazský, Marta Havelková, SZÚ Praha Mykobakteriologická diagnostika v České republice v roce 2003 …………………………...………………..……. 4 J. Kaustová, ZÚ se sídlem v Ostravě Mykobakteriologická diagnostika Mycobacterium kansasii v roce 2003 ……………………………………………...……………...…..….. 39 L. Langšádl a pracovníci mykobaktériologických laboratórií v SR Referenčné laboratórium pre mykobaktérie NÚTaRCH Bratislava-Podunajské Biskupice Činnosť mykobaktériologických laboratórií v Slovenskej republike v roku 2003 ………………….………...……..……….. 45
Vladimír Príkazský, Marta Havelková SZÚ Praha Mykobakteriologická diagnostika v České republice v roce 2003 Každým rokem v této době uzavíráme hodnocení vývoje ve výskytu tuberkulózy v České republice. Informační systém bacilární tuberkulózy byl v roce 2003 propojen v Registrem tuberkulózy.Ve větvi registru kolegové konzultanti pro tuberkulózu v KHS vkládají a verifikují údaje hlášené podle pravidel Registru tuberkulózy. Fyzicky je Registr tuberkulózy veden v jediném místě, ke kterému mají přístup jen autorizované osoby. V každém okamžiku jsou tak aktualizovaná data ihned připravena k použití. Specifika Informačního systému bacilární tuberkulózy si vynutila dávkové zpracování dat a tak kolegové mikrobiologové do systému poskytují svá data jednou měsíčně. Tento způsob kompletace dat se v současnosti osvědčuje a vytváří tlak na ISBT, aby svá data pečlivě kontroloval a poskytoval. V roce 2003 mykobakteriologické laboratoře ČR vyšetřily celkem 165341 biologických materiálů, z nichž 6476 bylo pozitivních. I když se počet vyšetření snížil, pozitivita se zvýšila z 3,4% v roce 2002 na 3,9% v roce 2003. Nejčastějším důvodem prvního vyšetření jsou obtíže (86,5% u nemocných s zjištěnou tuberkulózou). Od nemocných s tuberkulózou se ve ¾ jedná o tuberkulózu s pozitivitou ve sputu. Sputum tvořilo 85% všech pozitivních biologických materiálů. Celkem bylo evidováno 849 pacientů s tuberkulózou; u 77 jsme zaznamenali průkaz M.tuberculosis complex molekulárně biologickými metodami. Pacienti s těmito výsledky jsou zahrnuti v celkovém počtu pacientů s tuberkulózou. M. bovis jsme zjistili u 2 pacientů. Prevalence tuberkulózy v roce 2003 byla 11,5/105 u mužů a 5,3/105 u žen (graf 1). Celkem pak byla 8,3/105. Poměr výskytu tuberkulózy u mužů a žen byl v tomto roce 2:1. Dále se mírně zvýšila prevalence u mužů (asi o 1%) a výrazněji se zvýšila u žen (o 11,7%!). U žen jde o malé zvýšení prevalence ve středním věku a významné zvýšení ve věkových skupinách od 70 do 80 let. Prevalence u mužů je vysoká ve středním věku a ve věku nad 60 let (>20/105) a u žen je mírně vyšší v mladším a středním věku (>4/105) a vysoká ve věku nad 60 let (>15/105). U mužů dosahuje v uvedených věkových skupinách více než dvojnásobku průměrné hodnoty a u žen je to trojnásobek průměrné hodnoty. U mužů se na výskytu tuberkulózy podílí cizinci asi ve stejné míře jako v minulém roce. U žen je jen velmi mírný nárůst tuberkulózy u cizinek a hlavní vzestup jde na vrub občanek ČR. Geografické rozdíly odpovídají dlouholetému trendu. Nejvyšší prevalence byla v Praze, Plzeňském a Karlovarském kraji (viz mapa). V Praze, Středočeském, Ústeckém, Libereckém, Brněnském a Zlínském kraji se prevalence zvýšila v porovnání s předešlým rokem. Naopak, v Plzeňském, 4
Karlovarském a Pardubickém kraji se prevalence snížila. Mikroskopicky pozitivní zdroje se vyskytovaly o 68% častěji než v roce 2002. Nejvyšší prevalence byla v Praze (8,3/105), v Plzeňském (5,2/105) a Karlovarském kraji (5,6/105). Národní referenční laboratoř pro mykobaktérie provedla u všech kmenů M. tuberculosis s multirezistencí zjištěnou v terénních laboratořích validační testy citlivosti. Celkem jsme zjistili u 95 osob kmeny s rezistencí na nejméně jedno antituberkulotikum. Ve 13 případech šlo o kmeny MDR. Z nich bylo 5 MDR kmenů izolováno u cizinců. V případě mykobakterióz vyvolaných podmíněně patogenními mykobaktérii se opět potvrdila jejich relativní „bezvýznamnost“, protože se vyskytly asi 8x méně často než tuberkulóza. Jako obvykle se etiologickými činiteli stalo M. kansasii, M. xenopi a M.avium-intracellulare. Závěr Situaci v České republice je možné považovat stále za stabilizovanou, i když podle údajů Informačního systému bacilární tuberkulózy došlo k mírnému nárůstu nemocných s tuberkulózou o 34 osob. Zaznamenali jsme významně vyšší počet nemocných s tuberkulózou plic, jejichž vzorky byly pozitivní při přímé mikroskopii biologického materiálu. V mykobakteriologických laboratořích České republiky bylo v roce 2003 zpracováno celkem 165341 vzorků materiálu, z nich bylo 6476 pozitivních (3,9%). M. tuberculosis bylo izolováno z biologického materiálu 849 osob a prevalence onemocnění byla 8,3/105 obyvatel. Z podmíněně patogenních mykobakterií převažovaly nálezy M. kansasii, M.avium-intracellulare a M. xenopi, tyto mykobakterie však byly ve srovnání s obligátně patogenním M. tuberculosis izolovány v podstatně menší míře. Za zneklidňující je považováno maximum výskytu onemocnění u mužů nižších věkových skupin a onemocnění cizinců nízkých věkových skupin.
5
Tabulka č. 1 Celkový počet vyšetření na mykobakteria, počet pozitivních nálezů a procento pozitivity TRN polikliniky Rok 1981 1982 1983 1984 1985 1986 1987 1988 1989 1990 1991 1992 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003
Počet Počet vyšetření pozitivních 336 413 1 314 333 952 1 398 322 776 1 388 302 477 1 400 274 873 1 164 185 099 1 070 134 812 971 129 967 1 060 129 334 1 080 122 375 1 568 108 969 1 395 105 569 1 496 95 071 1 395 89 740 1 515 86 446 1 546 81 433 1 589 75 444 1 334 71 495 1 226 65 088 1 154 60 371 1 139 56 869 1 143 54 837 880 50 411 1 063
% 0,4 0,4 0,4 0,5 0,4 0,6 0,7 0,8 0,8 1,3 1,3 1,4 1,5 1,7 1,8 1,9 1,8 1,7 1,8 1,9 2,0 1,6 2,1
TRN léčebny a lůžková oddělení Počet Počet % vyšetření pozitivních 181 339 7 780 4,3 182 220 7 236 4,0 187 675 7 348 3,9 181 831 6 806 3,7 169 925 5 710 3,4 157 205 5 329 3,4 151 590 5 106 3,4 145 510 5 183 3,6 146 822 5 726 3,9 137 259 5 559 4,1 130 972 6 101 4,7 126 242 5 754 4,6 124 338 5 311 4,3 119 357 5 036 4,2 118 890 5 572 4,7 115 989 5 526 4,8 101 372 5 189 5,1 95 522 5 170 5,4 94 546 4 683 5,0 85 737 5 221 6,1 85 362 5 172 6,1 85 606 4 765 5,6 77 079 4 760 6,2
6
Ne TBC zařízení a patologie Počet Počet vyšetření pozitivních 134 390 1 159 132 251 1 005 127 652 934 121 138 1 068 113 259 1 023 107 504 1 010 96 193 948 90 324 837 84 061 751 76 481 724 76 085 969 71 912 795 71 166 780 69 246 874 67 485 810 69 895 709 60 565 878 57 234 808 54 399 760 44 847 732 41 273 658 43 603 533 37 851 653
Celkem % 0,9 0,8 0,7 0,9 0,9 0,9 1,0 0,9 0,9 1,0 1,3 1,1 1,1 1,3 1,2 1,0 1,4 1,4 1,4 1,6 1,6 1,2 1,7
Počet Počet vyšetření pozitivních 652 142 10 253 649 123 9 639 638 103 9 670 605 444 9 274 558 057 7 897 449 808 7 409 382 603 7 025 365 801 7 080 360 217 7 557 336 115 7 851 316 026 8 465 303 723 8 045 290 575 7 577 278 343 7 425 272 821 7 928 267 317 7 824 237 381 7 515 224 251 7 374 214 033 6 599 190 955 7 092 183 504 6 973 184 065 6 178 165 341 6 476
% 1,6 1,5 1,5 1,5 1,4 1,6 1,8 1,9 2,1 2,3 2,7 2,6 2,6 2,7 2,9 2,9 3,2 3,3 3,1 3,7 3,8 3,4 3,9
Tabulka č. 2 Celkový počet vyšetření a pozitivních nálezů podle odesílajícího zařízení v roce 2003
Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Celkový součet
4540 6667 609 3276 96 3160 2757 2623 4613 1042 3210 5370 3648 8800 50411
157 6482 191 5310 12 1173 49 3546 2 72 4644 40 648 13 1666 37 910 3 2148 81 8371 40 626 79 3743 286 6403 1 1063 45670
393 259 52 82
54 6321 379 4596 113 1706 19 8094 1084 1356 1269 6418
15 1107 49 447 1 116
1975 31409
273 21 55 16 23 353 18 128 302
319
1107 3033 59 135 15 570 176 927 1219 63 697 157 133 1472
5 4 2 13
1976 4189 624 2499 34 1465 625 2245 3740 1476 2697 434 1118 4640
2785
9763
82 27762
404 79 92 156
7
20 8 5 8 3 14
29 67 52 46
18 3 9 10
17 12 15 11 5 100 15 28 91
76 20 33 30 3 8 15 7 10 10 114
1 1 3 33
14235 25540 2877 14082 258 11548 4225 7469 18591 5813 16338 7866 8652 27847
488
326
83
165341
3 2
Počet pozit. nálezů
Celkový součet Počet vyšetření
patologie Počet vyšetření Počet pozit. nálezů
Počet pozit. nálezů
Počet vyšetření
neTBC lůžkové odd.
Počet pozit. nálezů
Počet vyšetření
neTBC poliklinika
Počet pozit. nálezů
TRN léčebna Počet vyšetření
Počet pozit. nálezů
TRN lůžkové odd. Počet vyšetření
Počet pozit. nálezů
Kraj
Počet vyšetření
TRN poliklinika
632 1635 179 634 3 489 76 99 468 110 632 234 240 1044 1 6476
Tabulka č. 2a Procento pozitivity podle odesílajícího zařízení v roce 2003 Kraj Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Celkový součet
TRN poliklinika 3.5 2.9 2.0 1.5 2.1 2.3 1.5 0.5 0.8 0.3 2.5 0.7 2.2 3.3 2.1
neTBC TRN TRN neTBC lůžkové patologie Celkem lůžkové léčebna poliklinika odd. odd. 6.1 27.8 1.8 1.5 23.7 4.4 4.9 17.5 0.3 1.6 15.0 6.4 4.4 12.9 8.5 8.3 27.3 6.2 2.3 9.7 0.0 1.8 33.3 4.5 0.9 0.0 0.0 1.2 5.9 6.8 1.4 1.2 100.0 4.2 3.2 0.0 1.7 1.9 1.8 3.3 1.5 0.7 25.0 1.3 1.8 5.0 0.0 0.3 0.0 2.5 1.1 7.3 0.0 0.3 1.9 4.2 6.8 0.7 3.7 14.3 3.9 2.9 12.3 2.5 3.5 10.0 3.0 3.4 1.5 2.5 30.0 2.8 4.7 5.0 0.9 2.0 28.9 3.7 4.3 8.9 0.8 1.8 25.5 3.9
8
Tabulka č. 2b Pozitivní výsledky vyšetření pocházející z jiného kraje než je vyšetřující laboratoř Počet „mimokrajských“ % „mimokrajských“ Celkový počet Laboratoř pozitivních výsledků pozitivních výsledků pozitivních výsledků 0101 29 10.4 280 0103 32 70 45.7 0104 23 71 32.4 0105 35 16.6 211 0107 1059 1438 73.6 2101 0.0 16 2102 19 22.4 85 2103 0.0 1 2104 6 6.3 95 3101 19 12.1 157 3102 2 2 100.0 3103 1 5.0 20 3201 313 634 49.4 4102 3 3 100.0 4201 2 1.1 185 4202 93 168 55.4 4203 0.0 16 4204 5 11 45.5 4205 0.0 55 4206 4 7.4 54 5101 0.0 76 5201 12 17.1 70 5202 29 29 100.0 5301 0.0 46 5302 0.0 2 5304 160 194 82.5 5305 116 226 51.3 6101 72 110 65.5 6201 133 22.7 586 6202 1 12.5 8 6204 18 38 47.4 7101 7 29.2 24 7102 35 19.9 176 7103 0.0 34 7201 13 8.5 153 7202 0.0 22 7203 4 6.2 65 8101 36 7.6 472 8102 31 15.6 199 8103 3 2.7 112 8104 0.0 207 8105 0.0 16 8106 0.0 38 9999 1 100.0 1 Celkem 2316 6476 35.8 9
Tabulka č. 3 Odesílající zdravotnické zařízení (1. vzorek) v roce 2003 s izolací M.tuberculosis Odesílající zařízení Celkový TRN neTBC TRN neTBC TRN součet lůžkové patologie lůžkové poliklinika poliklinika léčebna oddělení oddělení Praha 12 4 6 40 65 27 154 Středočeský 12 2 4 29 28 24 99 Jihočeský 5 0 0 9 7 4 25 Plzeňský 12 0 0 25 14 6 57 Karlovarský 4 0 1 18 7 6 36 Ústecký 7 1 2 4 47 14 75 Liberecký 7 1 0 11 3 6 28 Královéhradecký 8 1 0 16 8 15 48 Pardubický 4 0 0 17 4 4 29 Vysočina 6 1 0 6 10 1 24 Jihomoravský 15 2 1 5 55 10 88 Olomoucký 9 1 0 7 9 5 31 Zlínský 9 1 2 1 27 10 50 Moravskoslezský 12 0 5 24 36 18 95 Cizinci 3 1 0 1 5 0 10 Celkový součet 125 15 21 213 325 150 849 % 14.7 1.8 2.5 25.1 38.3 17.7 100.0 Kraj
10
Tabulka č. 4 Personální obsazení a kvalifikace pracovníků mykobakteriologických laboratoří v roce 2003
Kraj Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Celkem
Počet laboratoří 4 5 2 1 2 6 1 3 4 3 4 2 3 6 46
VŠ pracovníci Lékař 0,5 0,1 1,0 0,9 1,0 1,7 0,3 1,0 1,5 2,2 1,0 1,0 12,2
VŠ 2,5 3,5 1,0 2,0 0,25 0,7 3,0 2,0 0,5 2,6 18,05
SZP SZP s atestací 3,0 6,0 1,0 8,0 5,0 1,2 2,0 2,5 2,8 3,0 4,0 4,0 2,0 9,6 54,1
SZP bez atestace 5,0 5,5 1,0 3,0 3,0 4,0 2,0 3,0 3,9 30,4
11
Nižší zdravotnický Nezdravot. pracovník Celkem pracovníci V V laboratoři umývárně 2,6 13,6 3,0 4,4 2,15 24,65 2,0 4,0 2,0 1,0 13,0 3,0 0,5 13,5 0,7 1,9 0,9 8,85 1,0 4,0 4,2 0,5 2,3 0,5 11,1 3,0 12,0 1,0 2,5 0,1 14,1 1,0 7,7 1,0 0,5 4,5 3,5 1,25 1,1 22,95 12,3 24,35 6,75 158,15
Tabulka č. 5
Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský cizinci Celkový součet
146 82 25 35 25 72 25 38 22 23 88 31 45 67 10 734
1 6 0 5 2 0 1 2 1 0 0 0 0 14 0 32
2 5 0 17 9 2 2 8 6 1 0 0 2 10 0 64
12
Neuvedeno
Jiný důvod
Pitva
Kontrola dispenzárních skupin
Prevence
Kraj
Obtíže
Důvod prvního vyšetření na tuberkulózu u pacientů v roce 2003
4 4 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 2 4 0 15
0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2
Celkem
1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 2
154 99 25 57 36 75 28 48 29 24 88 31 50 95 10 849
Tabulka č. 6
Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Cizinci Celkový součet %
123 75 22 42 28 53 21 39 16 12 64 22 30 70 8 625 73.6
2 2 0 2 0 0 0 1 2 3 1 0 0 2 1 16 1.9
14 0 6 3 0 1 5 1 2 1 11 1 3 1 3 1 4 3 3 3 9 2 3 3 10 0 7 2 0 0 80 22 9.4 2.6
0 1 0 0 2 1 2 1 0 0 3 2 2 0 0 14 1.6
13
4 1 0 4 0 3 1 1 2 3 6 0 3 3 0 31 3.7
0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0.1
0 2 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 1 3 1 10 1.2
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0.1
2 2 1 0 1 1 0 0 1 0 1 0 2 1 0 12 1.4
jiný materiál
jiná tkáň
gynekologický materiál
periferní uzlina
likvor
pleur.tekutina
hnis
laryngeální výtěr bronchální materiál vč. BAL moč
Kraj
sputum
Druhy pozitivního materiálu u prvního vyšetření od nemocných s tuberkulózou v roce 2003 (osoby)
9 6 1 3 2 4 0 1 1 0 1 0 2 7 0 37 4.4
Celkem
154 99 25 57 36 75 28 48 29 24 88 31 50 95 10 849 100.0
Tabulka č. 6a
1080 466 127 254 140 295 90 141 144 51 308 156 158 400 76 3886 84.8
0 8 2 3 1 2 6 1 8 3 21 16 0 9 0 80 1.7
2 6 0 0 2 4 13 6 10 0 8 5 5 15 0 76 1.7
14
15 5 0 12 2 5 10 1 5 5 17 2 3 10 0 92 2.0
0 1 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0.1
0 3 0 4 0 2 0 1 0 0 2 1 8 4 1 26 0.6
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0.0
jiný materiál
jiná tkáň
gynekologický materiál
periferní uzlina
likvor
pleur.tekutina
42 22 6 11 6 24 6 7 11 6 21 7 19 20 0 208 4.5
hnis
15 5 0 2 1 3 0 9 4 11 6 2 1 3 1 63 1.4
moč
bronchální materiál vč. BAL
Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Cizinci Celkový součet %
laryngeální výtěr
Kraj
sputum
Druhy pozitivního materiálu ze všech vyšetření od nemocných tuberkulózou v roce 2003 (počty vyšetření)
5 21 3 12 1 1 4 15 2 2 1 8 0 3 0 8 1 4 0 0 1 3 2 1 2 4 4 40 0 0 26 122 0.6 2.7
Celkem
1180 531 137 307 156 344 128 174 187 76 387 193 200 505 78 4583 100.0
Tabulka č. 7 Počet pozitivních vyšetření v roce 2003 dělení podle výsledku identifikace Druh - výsledek identifikace M. tuberculosis jen průkaz D(R)NA M.tbc.kompl. M. AI M. aurum M. avium M. bohemicum M. bovis M. bovis BCG M. flavescens M. fortuitum M.gadium M. gordonae M. haemophilum M. chelonae M. intracellulare M. kansasii M. lentiflavum M. malmoense M. marinum M.neoaurum M. nonchromogenicum M. parafortuitum M. scrofulaceum M. simiae M. szulgai M. terrae M. triviale M. xenopi M. species pozitivní jen mikroskopicky jiná mykobakteria neroste v subkultuře kontaminace identifikace neprovedena Celkem
Celkem 4209 190 21 2 253 1 7 102 26 133 1 294 3 28 61 315 1 5 4 6 14 1 22 5 7 16 9 193 31 378 30 18 69 21 6476
15
% 65,0 2,9 0,3 0,0 3,9 0,0 0,1 1,6 0,4 2,1 0,0 4,5 0,0 0,4 0,9 4,9 0,0 0,1 0,1 0,1 0,2 0,0 0,3 0,1 0,1 0,2 0,1 3,0 0,5 5,8 0,5 0,3 1,1 0,3 100,0
Tabulka č. 8 Pozitivní vyšetření v roce 2003 - rozdělení všech záznamů podle krajů a výsledků identifikace
M. tuberculosis jen průkaz D(R)NA M.tbc.kompl. M.AI M.aurum M.avium M.bohemicum M.bovis M.bovis BCG M.flavescens M.fortuitum M.gadium M.gordonae M.haemophilum M.chelonae M.intracellulare M.kansasii M.lentiflavum M.malmoense Pokračování tabulky na další straně
1060 28 1
479 21
117 79 4
304 3
156
308 1 1
122 3
167 4
169 4
71 5 1
371 21 12
186 3 1
182 3
37
29
25
27
9
4
3
10
7
6
21
41
6
4 9
3
13 2 6
1
6
3
11
21
3
8 1 1
1
17
14
16
1 16 24
16 32 1 9 3 1 27 1
3 12 3 17
2
34
7
5 21 2
1
2
6
14
5
12
31
2
19
37
15
3 1 2
3 5 9
4 20 1 2 3
15 3 10
456 10 1 2 28 1
61 5
15 4 20 117 2 8 7 189 5
16
Celkem
neuvedeno
Moravskoslezský
Zlínský
Olomoucký
Jihomoravský
Vysočina
Liberecký
Ústecký
Karlovarský
Plzeňský
Jihočeský
Praha
výsledek indentifikace
Sředočeský
Druh
Pardubický
Královéhradecký
Kraj
7
4209 190 21 2 253 1 7 102 26 133 1 294 3 28 61 315 1 5
M.marinum M.neoaurum M.nonchromogenicum M.parafortuitum M.scrofulaceum M.simiae M.szulgai M.terrae M.triviale M.xenopi M.species jiná mykobakteria Pozitivní jen mikroskopicky Kontaminace neroste v subkultuře identifikace neprovedena Celkový součet
1 4
6
2 1
1
1
1 6 1
1 1 1 18 3 15 97 19 1 2 1377
2 5 4 4
13
13
3 13
4 52 3 1 720
2
2 1 1
14
17 1 3 21 7 1
15
280
370
185
446
3 1
1 42 2 1 30 1 1 592
8 2
16
10 8 1 2 194
5
4 14 10
1 1 4 2
1 213
1 239
129
3 2 1 35 5 1 7 321
1 5 9 53 6
7 2 2 16 65 4 10 1 12 7 287 1036
14
87
Pozn.: ostatní = kontaminace, identifikace neprovedena, identifikace založena, neroste v subkultuře. Pro přehlednost neuvádíme výsledek 0.
17
Celkem
neuvedeno
Moravskoslezský
Zlínský
Olomoucký
Jihomoravský
Vysočina
Liberecký
Ústecký
Karlovarský
Plzeňský
Praha
výsledek indentifikace
Jihočeský
Sředočeský
Druh
Pardubický
Královéhradecký
Kraj
4 6 14 1 22 5 7 16 9 193 31 30 378 69 18 21 6476
Tabulka č. 8a Pozitivní vyšetření v roce 2003 – rozdělení všech záznamů podle krajů a výsledků identifikace v % (v sloupci)
M. tuberculosis jen průkaz D(R)NA M.tbc.kompl. M.AI M.aurum M.avium M.bohemicum M.bovis M.bovis BCG M.flavescens M.fortuitum M.gadium M.gordonae M.haemophilum M.chelonae M.intracellulare M.kansasii M.lentiflavum M.malmoense Pokračování tabulky na další straně
77,0 66,5 41,8 82,2 84,3 69,1 62,9 78,4 70,7 55,0 62,7 57,9 63,4 44,0 70,1 2,0 2,9 28,2 0,8 0,2 1,5 1,9 1,7 3,9 3,5 0,9 1,0 1,0 5,7 0,1 1,4 0,2 0,8 2,0 0,3 0,1 0,2 2,7 4,0 8,9 7,3 4,9 0,9 1,5 4,7 2,9 4,7 3,5 12,8 2,1 2,7 0,1 0,4 1,1 1,7 2,4 1,6 2,9 0,5 3,8 2,5 0,5 3,4 7,3 1,4 1,2 0,4 0,4 0,5 0,4 2,3 2,4 0,7 1,3 1,5 0,5 2,1 9,3 5,2 1,4 1,9 0,1 0,7 4,7 2,5 0,5 0,5 3,8 7,2 0,8 14,7 6,3 6,2 5,2 11,3 0,3 0,2 0,2 0,7 0,2 2,3 0,5 0,6 1,0 0,8 0,1 2,9 3,6 0,8 0,8 3,5 0,7 2,0 0,3 0,4 1,6 8,6 5,4 7,2 6,3 1,6 1,5 0,9 18,2 8,0 0,1 0,5
18
Celkem
neuvedeno
Moravskoslezský
Zlínský
Olomoucký
Jihomoravský
Vysočina
Pardubický
Liberecký
Ústecký
Karlovarský
Plzeňský
Jihočeský
Praha
výsledek indentifikace
Sředočeský
Druh
Královéhradecký
Kraj
65,0 2,9 0,3 3,9 0,1 1,6 0,4 2,1 4,5 0,4 0,9 4,9 0,1
M.marinum M.neoaurum M.nonchromogenicum M.parafortuitum M.scrofulaceum M.simiae M.szulgai M.terrae M.triviale M.xenopi M.species jiná mykobakteria Pozitivní jen mikroskopicky Kontaminace neroste v subkultuře identifikace neprovedena Celkový součet
0,4 0,3
0,8
0,6 0,3
0,2
0,5
Celkem
neuvedeno
Moravskoslezský
Zlínský
Olomoucký
Jihomoravský
Vysočina
Pardubický
Liberecký
Ústecký
Karlovarský
Plzeňský
Jihočeský
Praha
výsledek indentifikace
Sředočeský
Druh
Královéhradecký
Kraj
0,1 0,6
0,1 0,1 0,2
0,3
0,3 0,1 0,1 0,2 0,1 3,0 0,5 0,5 5,8 1,1 0,3 0,3 100
0,3 0,2
0,1 0,1 1,3 0,2 1,1 7,0 1,4 0,1 0,1 100
0,3 0,7 0,6 0,6
4,6
1,8
1,1 4,6
0,6 7,2 0,4 0,1 100
0,4
0,8 0,5 0,5
3,8
3,8 0,2 0,7 4,7 1,6 0,2
5,4
100
100
100
19
100
0,8
4,1 1,0
7,5
5,2 4,1 0,5 1,0 100
2,3
1,7 5,9 4,2
0,8 0,8 3,1 1,6
0,5 100
0,4 100
100
0,2
1,0
7,1 0,6 0,3 0,3 0,2 5,1 10,9 0,2 1,6 0,2 0,3 2,2 100 100
2,4 0,7 0,7 5,6 1,4 0,3 2,4 100
0,1 0,5 0,9 5,1 0,6 6,3 16,1 1,0 1,2 100
100
Ženy
0-9 1 10-19 6 20-29 33 30-39 27 40-49 31 50-59 20 60-69 27 70-79 69 80-89 53 90+ 9 Celkem 276 Muži a ženy 849 celkem
1 1 0 1 2 5 4 8 2 0 24
0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1
40 3 0 0 0 0 0 0 0 0 43
1 0 1 0 4 5 10 22 10 0 53
0 0 2 1 5 6 8 11 1 0 34
0 0 0 0 0 4 0 6 3 0 13
0 0 2 1 2 6 9 12 13 0 45
0 0 0 1 1 4 4 2 2 0 14
77
2
92 106
87
74 105
26
ostatní
pozitivní jen mikroskopicky
1 7 0 0 1 5 1 2 4 9 11 16 26 31 35 50 16 21 1 2 96 143
2 0 1 0 0 1 4 14 0 1 23
0 0 0 1 1 4 5 12 5 1 29
16 222 331
61
61
Ostatní: neroste v subkultuře, identifikace neprovedena, kontaminace Jiná mykobakteria: M.aurum, M.bohemicum, M.flavescens, M.gadium, M.haemophilum, M.malmoense, M.marinum, M.neoaurum, M.nonchromogenicum, M.parafortuitum, M.scrofulaceum, M.simiae, M.szulgai, M.terrae, M.triviale 20
0 0 0 1 1 6 6 16 2 0 32
ostatní
jiná mykobakteria
M. gordonae 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 2
2 0 1 6 4 9 7 8 1 0 38
pozitivní jen mikroskopicky
jiná mykobakteria
M. gordonae
M.species
0 0 4 0 0 1 0 2 2 1 2 4 0 4 7 4 20 34 5 39 51 3 46 68 1 12 16 0 1 1 14 126 188
M.species
M.chelonae 0 0 0 0 2 1 3 4 2 0 12
M.chelonae
M.fortuitum 0 1 0 2 3 8 20 18 8 0 60
M.fortuitum
M.xenopi 1 0 1 2 5 16 15 17 3 1 61
M.xenopi
M.kansasii 0 0 2 3 12 16 7 11 2 0 53
M.kansasii
M.AI complex 0 1 1 2 6 17 4 12 10 0 53
M.AI complex
M.bovis BCG 44 5 0 0 0 0 0 0 0 0 49
M.bovis BCG
jen průkaz D(R)NA M.tbc.kompl.
M.bovis 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1
M.bovis
věková skupina
2 0 1 4 4 12 14 12 4 0 53 jen průkaz D(R)NA M.tbc.kompl.
0-9 1 10-19 10 20-29 53 30-39 64 40-49 114 50-59 155 60-69 60 70-79 76 80-89 35 90+ 5 Celkem 573
M. tuberculosis
Muži
věková skupina
M. tuberculosis
Tabulka č. 9 Věk a pohlaví osob s izolací vybraných druhů mykobakterií v roce 2003
Tabulka č. 10
154 99 25 57 36 75 28 48 29 24 88 31 50 95 10 849 81.8 8.3
7 12 23 0 0 1 1 2 2 1 17 0 1 10 0 77 7.4 0.8
17 10 4 6 2 0 1 6 3 1 8 2 3 9 0 72 6.9 0.7
0 7 0 0 0 3 0 0 0 1 1 0 1 6 0 19 1.8 0.2
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 2 0.2 0.0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0.1 0.0
0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0.2 0.0
21
0 12 0 6 3 13 1 8 5 0 3 6 20 15 0 92 8.9 0.9
3 5 0 0 0 1 0 0 0 2 3 1 3 8 0 26 2.5 0.3
13 3 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 3 0 20 1.9 0.2
25 15 2 0 0 5 1 1 3 9 23 0 4 17 0 105 10.1 1.0
1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0.1 0.0
7 15 3 2 1 16 10 0 0 18 31 15 12 92 0 222 21.4 2.2
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 2 0 3 0.3 0.0
11 2 1 4 2 2 6 0 2 2 3 1 0 50 1 87 8.4 0.9
M.malmoense
M.kansasii
M.haemophilum
M.gordonae
M.gadium
M.fortuitum
M.flavescens
M.chelonae
M.bovis BCG
M.bovis
M.bohemicum
M.aurum
M.intra-cellulare
M.avium
M.AI 1 0 4 0 0 1 0 0 0 1 6 1 0 1 0 15 1.4 0.1
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 3 0.3 0.0
Pokračování na další stránce
Praha Sředočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Cizinci celkový součet % relat. na 105
jen průkaz D(R)NA M.tbc.kompl.
Kraj
M. tuberculosis
Výsledky druhové identifikace v roce 2003
Praha Sředočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Cizinci celkový součet % relat. na 105
0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 1 0 4 0.4 0.0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0.1 0.0
3 2 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 9 0.9 0.1
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0.0
0 2 11 0 0 2 0 0 1 0 0 0 0 3 0 19 1.8 0.2
0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0.2 0.0
2 0 1 0 0 1 1 0 0 1 2 1 2 5 0 16 1.5 0.2
1 3 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0.5 0.0
22
1 2 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 2 5 0 13 1.3 0.1
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 7 0.7 0.1
4 7 2 2 0 4 2 2 0 0 22 2 2 25 0 74 7.1 0.7
11 1 0 0 0 2 0 0 1 1 1 0 1 0 0 18 1.7 0.2
1 10 7 0 0 2 0 0 2 2 9 10 3 13 2 61 5.9 0.6
16 2 0 0 0 1 6 0 2 2 1 5 3 5 0 43 4.1 -
0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2 1 0 0 5 0.5 -
Celkem
neroste v subkultuře
identifikace neprovedena
kontaminace
pozitivní jen mikroskopicky
jiná mykobakteria
M.xenopi
M.triviale
M.terrae
M.szulgai
M.species
M.simiae
M.scrofulaceum
M.parafortuitum
M.nonchromogenicum
M.neoaurum
Kraj
M.marinum
Tabulka č. 10 - pokračování
1 279 0 212 0 84 0 79 0 44 1 132 1 63 0 67 0 50 0 66 0 220 1 81 0 109 9 388 0 13 13 1887 1.3 100.0 -
Tabulka č. 11 Nemocní tuberkulózou vyvolanou M. tuberculosis v roce 2003 - dělení podle věku a pohlaví Pohlaví
Věková skupina
Muži Abs.
0-9 10-19 20-29 30-39 40-49 50-59 60-69 70-79 80-89 90+ Celkem %
Rel. 0.2 1.5 6.1 9.1 15.5 21.9 14.6 27.2 52.9 72.8 11.51 67.5%
1 10 53 64 114 155 60 76 35 5 573 -
Celkem
Ženy Abs.
Rel. 0.2 0.9 3.9 4.0 4.2 2.7 5.4 15.3 35.4 39.6 5.26 32,5%
1 6 33 27 31 20 27 69 53 9 276 -
Abs.
Rel. 0.2 1.2 5.0 6.6 9.9 12.0 9.6 19.9 40.7 47.3 8.30 100,0
2 16 86 91 145 175 87 145 88 14 849 -
Tabulka č. 12 - graf 1 Nemocní tuberkulózou vyvolanou M. tuberculosis v roce 2003 dělení podle věku a pohlaví 30.0
25.0
muži + cizinci ženy + cizinky
15.0
10.0
5.0
věkové skupiny
23
85
-8 4
80
-7 9
75
-7 4
-6 9
70
-6 4
65
60
-5 9
-5 4
55
-4 9
50
45
-4 4
40
-3 9
-3 4
35
-2 9
30
25
-2 4
-1 9
20
-1 4
15
-9
10
5
-4
0.0
0
rel./100000
20.0
Tabulka č. 13 Podíl mikroskopických metod na vyšetření pozitivních nálezů ve sputu v roce 2003
24
6 2 28 0 0 0 0 1 0 1 0 1 6 0 0 45
% pozitivity.
83.3 28.6 30.0 0.0 0.0 33.9 0.0 29.3 40.4 21.1 41.7 66.0 68.4 60.0 0.0 52.5
pozitivní
25 8 6 0 0 20 0 12 21 4 35 130 67 30 0 358
vyšetřeno
30 28 20 1 0 59 3 41 52 19 84 197 98 50 0 682
Celkem neprovedeno
54.6 50.2 54.5 44.5 40.5 61.6 30.6 41.1 48.2 9.6 37.5 47.8 43.5 44.3 54.8 47.8
% pozitivity
671 297 91 134 66 194 45 53 66 7 146 32 50 359 46 2257
pozitivní
1229 592 167 301 163 315 147 129 137 73 389 67 115 810 84 4718
vyšetřeno
% pozitivity
Praha Sředočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský cizinci Celkem
pozitivní
kraj
vyšetřeno
Mikroskopická metoda Fluorescenční Ziehl-Neelsen
1265 622 215 302 163 374 150 171 189 93 473 265 219 860 84 5445
696 305 97 134 66 214 45 65 87 11 181 163 117 389 46 2616
55.0 49.0 45.1 44.4 40.5 57.2 30.0 38.0 46.0 11.8 38.3 61.5 53.4 45.2 54.8 48.0
Tabulka č. 14 Mikroskopická pozitivita všech materiálů s identifikovaným M. tuberculosis Kraj Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Liberecký Ústecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Cizinci Celkem
Výsledek vyšetření negativní pozitivní neprovedeno Abs. % Abs. % Abs. % 1044 62.4 614 36.7 16 1.0 464 65.7 227 32.2 15 2.1 114 65.9 56 32.4 3 1.7 300 68.0 137 31.1 4 0.9 154 67.5 72 31.6 2 0.9 303 62.9 174 36.1 5 1.0 116 75.8 31 20.3 6 3.9 157 70.7 55 24.8 10 4.5 154 64.2 71 29.6 15 6.3 59 72.8 10 12.3 12 14.8 344 67.1 142 27.7 27 5.3 168 58.3 101 35.1 19 6.6 180 65.2 94 34.1 2 0.7 443 62.7 250 35.4 13 1.8 60 67.4 28 31.5 1 1.1 4060 64.7 2062 32.9 150 2.4
Celkem Abs. 1674 706 173 441 228 482 153 222 240 81 513 288 276 706 89 6272
% 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0
Tabulka č. 15 Délka kultivace M. tuberculosis podle doby odečítání výsledků v roce 2003 Kraj Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Liberecký Ústecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Cizinci Celkem
0 týdnů 1-4 týdnů 5-8 týdnů 9+ týdnů Abs. % Abs. % Abs. % Abs. % 3 0.3 726 68.5 300 28.3 31 2.9 2 0.4 273 57.0 158 33.0 46 9.6 0 0.0 46 39.3 38 32.5 33 28.2 0 0.0 116 38.2 102 33.6 86 28.3 0 0.0 50 32.1 68 43.6 38 24.4 3 1.0 152 49.4 114 37.0 39 12.7 0 0.0 40 32.8 61 50.0 21 17.2 0 0.0 68 40.7 85 50.9 14 8.4 0 0.0 63 37.3 86 50.9 20 11.8 0 0.0 23 32.4 25 35.2 23 32.4 0 0.0 117 31.5 180 48.5 74 19.9 1 0.5 59 31.7 117 62.9 9 4.8 0 0.0 37 20.3 106 58.2 39 21.4 0 0.0 196 43.0 208 45.6 52 11.4 0 0.0 29 47.5 30 49.2 2 3.3 9 0.2 1995 47.4 1678 39.9 527 12.5
25
Celkem 1060 479 117 304 156 308 122 167 169 71 371 186 182 456 61 4209
Tabulka č. 15a Kumulativní procento ukončených kultivací v roce 2003 kraj Praha Sředočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský cizinci Celkem
Kumulativní % ukončených kultivací podle týdnů 1 2 0.3 6.0 0.4 4.6 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 7.1 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.5 0.0 0.0 0.0 4.8 0.0 1.6 0.2 3.2
3 29.5 19.8 6.0 6.3 3.8 13.6 2.5 2.4 2.4 8.5 5.9 4.3 6.6 14.7 13.1 14.6
4 60.1 43.4 35.9 19.1 21.2 44.5 30.3 39.5 37.3 32.4 29.4 29.0 18.7 37.3 41.0 40.3
5 68.8 57.4 39.3 38.2 32.1 50.3 32.8 40.7 37.3 32.4 31.5 32.3 20.3 43.0 47.5 47.6
6 72.7 62.2 43.6 50.0 48.1 52.9 36.1 41.3 37.3 46.5 51.8 37.1 22.0 46.9 67.2 54.1
7 89.8 80.8 65.0 58.9 59.6 84.7 82.8 91.6 88.2 59.2 77.4 94.1 78.6 87.3 86.9 81.9
8 96.9 89.4 71.8 65.8 69.2 87.0 82.8 91.6 88.2 64.8 77.9 95.2 78.6 88.6 93.4 86.3
9 97.1 90.4 71.8 71.7 75.6 87.3 82.8 91.6 88.2 67.6 80.1 95.2 78.6 88.6 96.7 87.5
10 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100
Celkem počet 1060 479 117 304 156 308 122 167 169 71 371 186 182 456 61 4209
Tabulka č. 16 Porovnání mikroskopického a kultivačního vyšetření sput v roce 2003 Kraj Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Cizinci Celkem
mpkp 566 212 54 106 57 182 31 57 62 7 138 123 97 340 31 2063
%
mnkp
44.7 486 34.1 241 25.1 52 35.1 110 35.0 69 48.7 139 20.7 85 33.3 92 32.8 86 7.5 51 29.2 168 46.4 89 44.3 88 39.5 449 36.9 27 37.9 2232
% 38.4 38.7 24.2 36.4 42.3 37.2 56.7 53.8 45.5 54.8 35.5 33.6 40.2 52.2 32.1 41.0
mpkn 130 93 43 28 9 32 14 8 25 4 43 40 20 49 15 553
% 10.3 15.0 20.0 9.3 5.5 8.6 9.3 4.7 13.2 4.3 9.1 15.1 9.1 5.7 17.9 10.2
mp - mikroskpicky pozitivní, mn - mikroskopicky negativní kp - kultivačně pozitivní, kn - kultivačně negativní 26
mnkn 83 76 66 58 28 21 20 14 16 31 124 13 14 22 11 597
% 6.6 12.2 30.7 19.2 17.2 5.6 13.3 8.2 8.5 33.3 26.2 4.9 6.4 2.6 13.1 11.0
Počet pozitivních vyšetření 1265 622 215 302 163 374 150 171 189 93 473 265 219 860 84 5445
Pro zjednodušení jsme provedli klasifikaci výsledků kultivace (tabulka a) a mikroskopie (tabulka b). Tabulka a Tabulka b Klasifikace výsledků kultivace Klasifikace výsledků mikroskopie kn mn kp mp KULTVYS (kultivačně (kultivačně Celkem MIKROVYS (mikroskopicky (mikroskopicky Celkem negativní) pozitivní) negativní) pozitivní) + 0 1011 + 0 1093 1011 1093 ++ 0 1210 ++ 0 792 1210 792 +++ 0 1356 +++ 0 731 1356 731 1-9 kolonií 0 718 0 718 negativní 2779 2779 kontaminace 116 0 116 neprovedeno 50 0 50 0 TOTAL 2829 negativní 959 959 2616 5445 neprovedeno 52 0 52 v inkubaci 23 0 23 Celkem 1150 4295 5445
27
Tabulka č. 17 Podíl nemocných s tuberkulózou dýchacího ústrojí mikroskopicky nevyšetřených Zjistili jsme 45 sput nevyšetřených mikroskopicky. Jednou nebylo mikroskopické vyšetření uvedeno a u ostatních bylo udáno „neprovedeno“. Zjistili jsme, že tyto materiály byly vyšetřeny 7 krát v Bactecu/MGIT 960, PCR 35 krát, jednou byl uveden výsledek mikroskopie bez uvedení metody a dvakrát nebylo vyšetřeno třetí z odebraných vzorků sputa. Celkem jsme nezjistili žádného pacienta, u kterého by nebylo sputum vyšetřeno mikroskopicky. Tabulka č. 18 Osoby vylučující rezistentní M. tuberculosis v roce 2003 dělení podle věku a pohlaví Věková skupina 0-9 10-19 20-29 30-39 40-49 50-59 60-69 70-79 80+ Celkem %
Pohlaví Celkem Muži Ženy 0 1 1 2 2 4 11 4 15 9 5 14 14 3 17 15 0 15 8 1 9 4 6 10 4 6 10 67 28 95 70% 30% 100%
28
Pr ah Sř a ed oč es k Ji ho ý če sk ý Pl ze ň sk Ka ý rlo va rs ký Ú st ec ký L i Kr be ál r ec ov ký éh ra de ck Pa ý rd ub ic ký Vy s oč Ji ho in a m or av sk O ý lo m ou ck ý M Z or lín av sk sk ý os le zs ne ký uv ed en o
Počet osob s TB 160 40.0
140 35.0
120
osoby
29
% 30.0
100 25.0
80 20.0
60 15.0
40 10.0
20 5.0
0 0.0
% osob s mono-pentarezistencí
Graf 2
Celkový počet osob s M.tuberculosis a podíl osob vylučujících (mono-penta) rezistentní M.tuberculosis
Tabulka č. 19 Rezistence M. tuberculosis ze všech materiálů roce 2003 Kraj Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Liberecký Ústecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský cizinci celkem % % z vyšetřených
Výsledek testování citlivosti citlivé mono- ditritetra- penta- nevyšetřeno Celkem kmeny 379 19 14 0 0 0 648 1060 184 7 7 0 0 0 281 479 32 2 0 1 0 0 82 117 277 0 3 0 1 0 23 304 134 1 19 0 0 0 2 156 128 18 2 0 0 0 160 308 52 5 2 0 0 0 63 122 44 10 2 2 1 0 108 167 34 2 0 1 0 0 132 169 23 3 0 0 0 1 44 71 151 12 4 0 0 0 204 371 51 2 0 0 0 0 133 186 99 0 8 0 2 0 73 182 129 4 0 4 13 0 306 456 26 1 0 0 0 0 34 61 1743 86 61 8 17 1 2293 4209 41.4 2.0 1.4 0.2 0.4 0.0 54.5 100.0 91.0 4.5 3.2 0.4 0.9 0.1
30
Tabulka č. 19a Rezistence M.tuberculosis ve vzorcích respiračního materiálu v roce 2003 Kraj Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Liberecký Ústecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský cizinci celkem % % z vyšetřených
Výsledek testování citlivosti citlivé mono- ditritetra- penta- nevyšetřeno Celkem kmeny 321 18 14 0 0 0 619 972 149 7 3 0 0 0 261 420 27 2 0 1 0 0 77 107 224 0 3 0 1 0 23 251 122 0 17 0 0 0 1 140 97 14 2 0 0 0 147 260 33 4 2 0 0 0 46 85 34 7 2 2 1 0 89 135 19 1 0 0 0 0 106 126 14 2 0 0 0 0 30 46 124 5 2 0 0 0 163 294 33 2 0 0 0 0 116 151 70 0 7 0 0 0 66 143 92 4 0 3 13 0 260 372 24 1 0 0 0 0 34 59 1383 67 52 6 15 0 2038 3561 38.8 1.9 1.5 0.2 0.4 0.0 57.2 100.0 72.2 3.5 2.7 0.3 0.8 0.0 -
31
1 1 3
1
1
2
1 2
3 1 2
3
2
1
neznámo
Moravskoslezský
Zlínský
Jihomoravský
Vysočina
Olomoucký
2
1
1
1 1
1
1 4
1 1
1 1 1 1
1
2 1
1 4 1
11 3
Pardubický
1
Královéhradecký
1
Liberecký
Ústecký
3
Karlovarský
7
Plzeňský
Sředočeský
H E R S Z ES HS HZ ESZ HSZ HR HER HRS HERS HERSZ Celkem
Praha
Rezistence a multirezistence
Jihočeský
Tabulka č. 20 Geografická distribuce nemocných vylučujících rezistentní M.tuberculosis v roce 2003 (spektrum rezistence v prvním vyšetření)
1
1
3
1
1 1 1
14
7
3
2 4
1
4
4 15
4 13
3
1 4
9
2
3
9
1
Celkem
19 2 6 5 29 1 16 1 2 1 3 1 2 6 1 95
Vysvětlivky: H - izoniazid, E - etambutol, R - rifampicin, S - streptomycin, Z - pyrazinamid
Tabulka č. 20 a Nemocní vylučující multirezistentní M.tuberculosis - distribuce podle věku a pohlaví 2003 Pohlaví Věková skupina 0–9 10 – 19 20 – 29 30 – 39 40 – 49 50 – 59 Celkem
Muži ČR Ciz.
Celkem
Ženy ČR Ciz. 1
6 1 7
1
1
1 1
1 3
1
2 32
0 1 1 3 6 2 13
Tabulka č. 21 Celková prevalence bacilární tuberkulózy a prevalence mikroskopicky pozitivních zdrojů tuberkulózy v roce 2003 (rel. /105) Kraje
Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Ostatní Celkem
2003 Celková prevalence Abs. Rel. 154 13.2 99 8.8 25 4.0 57 10.4 36 11.9 75 9.1 28 6.6 48 8.8 29 5.7 24 4.6 88 7.8 31 4.8 50 8.5 95 7.5 10 849 8.32
33
Mikroskopicky pozitivní Abs. Rel. 96 8.3 44 3.9 14 2.2 28 5.2 17 5.6 38 4.7 9 2.1 18 3.2 16 3.2 4 0.8 38 3.4 15 2.3 19 3.2 54 4.2 5 415 4.07
Graf k tabulce č. 21 Prevalence bakteriologicky potvrzené tuberkulózy v roce 2003 podle krajů 13,2 9,1
6,6
11,9
10,4
8,8 8,8
4,0
5,7 4,6 7,8
rel. / 105
34
7,5
4,8
8,5
Tabulka č. 22 Celková prevalence bacilární tuberkulózy a prevalence mikroskopicky pozitivních zdrojů tuberkulózy v letech 1989-2003 (rel./105) Rok 1989 1990 1991 1992 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003
Celková prevalence Abs. Rel. 1511 14,58 1505 14,52 1549 14,95 1420 13,77 1222 11,83 1161 11,23 1188 11,49 1095 10,62 1047 10,16 1065 10,34 990 9,62 947 9,22 907 8,83 815 7,99 849 8,32
Graf k tabulce č. 22
35
Mikroskopicky pozitivní Abs. Rel. 400 3,86 637 6,15 676 6,52 600 5,82 503 4,86 558 5,40 525 5,08 527 5,11 499 4,84 500 4,86 458 4,45 363 3,53 315 3,06 247 2,42 415 4,07
Tabulka č. 23 Metabolické detekční systémy v diagnostice mykobakteriálních infekcí v laboratořích ČR v r. 2003 - dělení podle druhu vyšetřovaného materiálu Vyšetřovaný materiál Kraj Praha
Metoda
MGIT MGIT, Bactec Středočeský MB/Bact, Bact Alert Jihočeský MB/Bact Plzeňský neuvedeno Karlovarský MB/Bact Bact Alert Ústecký MGIT Liberecký MB/Bact Královéhradecký MGIT Pardubický MB/Bact Vysočina MGIT Jihomoravský MGIT Olomoucký MGIT Zlínský MB/Bact Moravskoslezský MGIT, BIOFM CELKEM
410
9
jiný resp. 10
17335
57
2269 10865 186
sputum
LV
moč
hnis
punktát
gyn. mat.
likvor
jiná tkáň
uzlina
Celkem
jiný mat.
-
2
5
-
-
-
-
-
436
794
758
79
608
4
2
12
16
141
19806
5 3 1
125 1156 -
154 727 23
25 21 1
159 542 15
8 17 1
6 2 -
73 46 -
53 37 -
380 8
2877 13796 235
1391
1
264
16
2
69
-
-
2
-
29
1774
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
4339
-
782
451
18
585
21
-
10
17
137
6360
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2552
139
432
779
18
199
3
2
1
-
79
4204
9798 751 -
179 17 -
1736 535 -
1402 50 -
102 2 -
790 74 -
32 2 -
3 -
11 9 -
20 -
235 30 -
14305 1473 -
2765
167
1585
487
16
404
34
-
46
92
365
5961
52661
578
7419
4847
286
3450
122
15
210
235
1404
71227
36
Tabulka č. 24 Molekulárně biologické metody v diagnostice mykobakteriálních infekcí v laboratořích ČR v r. 2003 dělení dle druhu vyšetřovaného materiálu. Vyšetřovaný materiál Kraj Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský CELKEM
Metoda MTD MTD PCR neuvedeno PCR PCR PCR PCR MTD,PCR
sputum 84 2936 250 421 70 590 678 310 882 6221
LV 189 2 18 22 5 106 342
jiný resp. 106 957 67 132 11 424 666 162 444 2969
moč 56 159 23 49 56 170 51 44 280 888
hnis 7 8 10 5 8 2 7 47
37
punktát 128 424 98 65 4 314 211 88 150 1482
likvor 11 9 10 8 2 18 32 1 23 114
gyn.mat. uzlina -
10 5 2 5 22
jiná tkáň 7 18 9 12 7 54 107
jiný mat. 194 11 8 399 38 76 158 884
Celkem 385 4892 485 695 152 1955 1715 688 2109 13076
Tabulka č.25 Izolace mykobakterií ze vzorků prostředí Počet vyšetřených vzorků
Kraj
Druh vzorků (voda, půda)
Ústecký
voda
Původ odběru (vodovodní, odpadová voda apod.) akvarijní
stěry
z vnitřních stěn dveří
8
ryba uhynulá voda bahno stěry
vnitřnosti odpadová voda bahno stěry ze sprchových růžic a přívodního potrubí
1 19 15 60
Pardubický Moravskoslezský
6
38
Počet pozitivních Počet izolovaných kmenů vzorků podle druhů (pokud lze specifikovat) M.gordonae 3 4 M.scrofulaceum 1 Mycobacterium jiné 1 6 M. gordonae 4 M.kansasii 1 0 0 0 24 M.gordonae 21 M.kansasii 3 AM rychlerostoucí 5
Jarmila Kaustová ZÚ se sídlem v Ostravě Mykobakteriologická diagnostika Mycobacterium kansasii v roce 2003 V roce 2003 bylo Mycobacterium kansasii (M.kansasii) izolováno v České republice ze vzorků 89 osob, z toho se v jednom případě jednalo o cizího státního příslušníka (SR). V porovnání s předcházejícím rokem se o 4 osoby snížil počet případů s první izolací M.kansasii (v tomto počtu není zahrnut cizí státní příslušník) a o stejný počet se snížil i počet osob, u nichž bylo M.kansasii izolováno již v dřívějších letech. Stejně jako v dřívějších letech, bylo M.kansasii nejčastěji izolováno u obyvatel Moravskoslezského kraje (48,3 % s první izolací, 56,8 % z celkového počtu osob s bydlištěm v ČR). Ve skupině případů s první i dřívější izolací převažují muži (58,3 % a 60,7 %) (tab. 1). Průměrný věk mužů s první izolací byl nižší u mužů než žen (57,9 a 62,2 let), ve věkových skupinách 60 a více let bylo 11 mužů a 15 žen (tab. 2 a 3). NRL pro M.kansasii se dosud nepodařilo získat možnost hodnocení incidence onemocnění vyvolaných M.kansasii v ČR na základě povinných hlášení. Nejčastěji bylo M.kansasii izolováno ze sput, u 13 osob i z jiných vzorků (BAL, LV). Kromě M.kansasii byl u 3 osob izolován 1x i jiný mykobakteriální druh (M.tuberculosis, M.gordonae a jiné PPM) (tab. 4). V tabulce 5 jsou uvedeny výsledky testů citlivosti na základní antituberkulotika u kmenů z první izolace v roce 2003. Do NRLMk bylo k ověření výsledků testů zasláno z laboratoří mimo MSk pouze 9 kmenů, přestože je z tabulky zřejmé, že u některých osob se jedná o výsledky diskutabilní, stejně jako u vyšetření citlivosti kmene opakovaně v průběhu jednoho měsíce. NRLMk se podílela na řešení grantu GAČR - stanovení citlivosti M.kansasii, M.tuberculosis a M.avium na vybrané chemické preparáty. Provedla rovněž stanovení antimykobakteriálních protilátek tříd IgA, IgG a IgM v séru 1360 pacientů. Ze 60 vzorků stěrů odebraných ze sprchových růžic v důlním závodě izolovala tbc laboratoř Havířov (ZÚ se sídlem v Karviné) 29 kmenů, které byly identifikovány v NRLMk jako M.kansasii (3), M.gordonae (21) a rychle rostoucí PPM (5).
39
Tabulka 1 Soubor osob, u nichž bylo v jednotlivých krajích České republiky izolováno v roce 2003 M.kansasii Kraj Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Cizinci (SR) Česká republika
dřívější izolace M.kansasii ženy muži celkem 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 2 1 1 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 9 12 21 0 0 0 11 17 28
první izolace M.kansasii ženy muži celkem 3 7 10 2 0 2 0 1 1 3 1 4 0 2 2 1 0 1 3 1 4 0 0 0 1 1 2 0 2 2 0 3 3 0 0 0 0 0 0 12 17 29 0 1 1 25 36 61
40
počet osob s izolací M.kansasii ženy muži celkem 3 8 11 2 0 2 0 1 1 3 1 4 0 2 2 1 2 3 4 2 6 0 0 0 1 1 2 0 2 2 0 4 4 1 0 1 0 0 0 21 29 50 0 1 1 36 53 89
Tabulka 2 Průměrný věk osob, u nichž bylo v roce 2003 Mycobacterium kansasii izolováno poprvé Kraj počet Praha Středočeský Jihočeský Plzeňský Karlovarský Ústecký Liberecký Královéhradecký Pardubický Vysočina Jihomoravský Olomoucký Zlínský Moravskoslezský Cizinci (SR) Česká republika *
3 2 0 3 0 1 3 0 1 0 0 0 0 12 0 25
ženy průměrný věk 61,0 67,5 64,0 54,0 64,3 48,0 62,6
počet
62,2
7 0 1 1 2 0 1 0 1 2 3 0 0 17 1 36
muži průměrný věk 52,9 79,0 72,0 57,0 63,0 49,0 62,5 56,3 56,3 * 57,9
celkem počet 10 2 1 4 2 1 4 0 2 2 3 0 0 29 1 61
věk cizince není v ISBT uveden
Tabulka 3 Věková distribuce obyvatel ČR s první izolací M.kansasii v roce 2003 věková skupina 10 - 19 20 - 29 30 - 39 40 - 49 50 - 59 60 - 69 70 - 79 80 - 89 celkem
celkem
pohlaví ženy 2 2 6 5 7 3 25
muži 3 8 13 2 6 3 35
41
2 3 10 19 7 13 6 60
Tabulka 4 Přehled vzorků a frekvence izolací M.kansasii u obyvatel České republiky v roce 2003 Vzorek sputum 1x
počet osob 35
sputum 2x sputum 3x a více
6 35
BAL 1x sputum 2x + BAL 1x sputum 3x a více + BAL 1x
3 1 4
sputum 1x + BAL 2x sputum 2x + sekční materiál 1x sputum 3x a více + sekční materiál 1x sputum 3x + BAL 1x + LV 1x LV 1x + sekční materiál 1x celkem
1 1 1 1 1 89
42
poznámka u jedné osoby bylo izolováno i 1x jiné PPM u jedné osoby bylo izolováno i 1x M.gordonae u jedné osoby bylo izolováno i 1x M.tuberculosis
Tabulka 5 Přehled citlivosti kmenů M.kansasii na antituberkulotika u osob s první izolací kmene v roce 2003 (první izolace kmene u pozitivní osoby) Kraj/lék výsledek 1 Praha Středočeský 2 2 Jihočeský 3 Plzeňský Karlovarský 3٭ 2o Ústecký 2 Liberecký Královéhradecký 4 Pardubický 2 Vysočina Jihomoravský 2 Olomoucký Zlínský Moravskoslezský5 Cizinci (SR) Česká republika C R K N
streptomycin C R K N 7 3 0 0 2 0 0 0 1 0 0 0 4 0 0 0 2 0 0 0 0 1 0 0 3 1 0 0 2 0 0 0 1 1 0 0 0 2 1 0 29 0 0 0 0 1 0 0 51 9 1 0
C 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1
isoniazid R K 9 0 2 0 1 0 4 0 2 0 1 0 3 1 2 0 2 0 2 1 29 0 1 0 58 2
N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
C 6 2 1 4 2 1 4 2 0 2 29 1 54
etambutol R K 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 1 0 0 0 0 6 1
kmen hodnocen jako citlivý kmen hodnocen jako rezistentní výsledek znehodnocen kontaminací nespecifickou bakteriální flórou počet osob, u nichž nebyl test proveden
Pokračování tabulky na další straně
43
N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
C 3 2 1 4 2 1 4 2 2 2 29 1 53
rifampicin R K 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 7 1
N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
pyrazinamid C R K N 0 2 7 1 0 2 0 0 0 1 0 0 4 0 0 0 2 0 0 0 1 0 0 0 4 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 1 0 2 1 0 26 2 1 0 0 1 0 0 38 12 9 2
1 2 3
٭ o 4 5
NRLMk ověřen výsledek u pěti osob – u 3 rozdílné výsledky, u dvou původní výsledek polyrezistentní – u kmenů zaslaných do NRLMk: kontaminace nespecifickou bakteriální flórou NRLMk nebyly kmeny zaslány NRLMk ověřen výsledek u dvou osob – závěr shodný během jednoho měsíce provedeno u pacienta 1 – 7 testů (za 6 měsíců celkem 15) vyšetření vzorků a stanovení citlivosti provedeno během dvou měsíců 14 x, 4 x vyšetřeny vzorky z jednoho dne ve dvou laboratořích paralelně, rozdílné výsledky testů citlivosti NRLMk ověřen výsledek u dvou osob, rozdílné hodnocení u streptomycinu stanovení citlivosti provedeno u všech osob v NRLMk
44
Činnosť mykobaktériologických laboratórií v Slovenskej republike v roku 2003 L. Langšádl a pracovníci mykobaktériologických laboratórií v SR Referenčné laboratórium pre mykobaktérie NÚTaRCH Bratislava-Podunajské Biskupice Cieľ: Okrem surveillance tuberkulózy na území Slovenskej republiky je potrebné analyzovať aj činnosť mikrobiologických laboratórií vykonávajúcich mykobakteriologickú diagnostiku. Metodika: Všetkých 17 laboratórií vykonávajúcich mykobakteriologickú diagnostiku v SR vyplnilo 19-ti tabuľkový formulár o laboratórnych výkonov, izolovaných kmeňov a ich rezistencii na tuberkulostatiká. Sledované dáta boli spracované vo formáte Excel v programe Epi-info 2002. Výsledky: V roku 2003 bolo v SR vyšetrených 125 990 vzoriek biologického materiálu a bolo vykonaných 125 897 vyšetrení, z ktorých bolo pozitívnych 2 150 vyšetrení, čo znamená 1,71% pozitivitu. Pri porovnaní s rokom 1993 sa počet vyšetrení znížil o 49%. Spútum bolo najčastejšie vyšetrovaným biologickým materiálom. V roku 2003 bolo vykonaných 95 301 vyšetrení spúta z ktorých sa podarilo izolovať Mycobacterium tuberculosis /MT/ v 1899 prípadoch, čo znamená 1,99% pozitivitu. Na území SR v roku 2003 vylučovalo MT 534 osôb. Hodnota prevalencie na 105 obyvateľov, bola 9,92. U 60 osôb boli izolované kmene MT rezistentné na tuberkulostatiká. Závery: Spracované údaje sú súčasťou dát pre projekt Euro-TB.
45
Tabulka č. 1 Rozmiestenie laboratórií na území Slovenské republike v roku 2003 a kvalifikačné predpoklady ich vedúcich Kraj Bratislavský
Počet laboratórií 2
Trnavský Trenčianský Nitranský
0 1 2
Banskobystrický
2
Žilinský Košický
1 3
Prešovský
6
Spolu
17
Okres Bratislava Senica Iľava Nitra Komárno Banská Bystrica Revúca Žilina Košice Michalovce Trebišov Prešov Poprad Humenné
Počet laboratórií 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 4 1 17
Počet lekárov Počet VŠ s atestáciou s atestáciou 1 0 0 1 0 0 0 1 0 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 1 2 1 0 9 6
Tabulka č. 2 Analýza činnosti mykobaktériologických laboratórií podľa rozmiestenia a vyťaženosti Počet laboratórnych pracovníkov Kraj Bratislavský Banskobystrický Trnavský Trenčianský Nitranský Žilinský Košický Prešovský Spolu
n
na 100 tisíc obyvateľ
na 1000 vyšetrení
18 11 0 6 18 7 18,5 30 108,5
3,00 1,67 0,00 1,00 2,53 1,01 2,41 3,78 2,02
1,15 0,79 0 0,47 0,77 0,53 1,43 0,88 0,86
46
Počet izolátov M.tuberculosis na lab. pracovníka 4,94 4,45 0,00 5,50 3,22 11,57 6,22 2,97 4,85
Tabulka č. 3 Počet vzoriek a vyšetrení vykonaných v mykobaktériologických laboratóriách na území Slovenskej republike v roku 2003 Slovenská republika 1. TBC odd. zdravotné strediská (dospelí) 2. TBC odd. zdravotné strediská (deti) 3. TBC odd. nemocníc a liečební (dospelí) 4. TBC odd. nemocníc a liečební (deti) 5. Ostatné zdravotnícke zariadenia
6. 1-5 SPOLU
Biologický materiál
Počet vzoriek
Počet vyšetrení
laryngeálny výter spútum moč iný materiál SPOLU laryngeálny výter spútum moč iný materiál SPOLU laryngeálny výter spútum moč iný materiál SPOLU laryngeálny výter spútum moč iný materiál SPOLU laryngeálny výter spútum moč iný materiál SPOLU laryngeálny výter spútum moč iný materiál SPOLU
1833 53782 2535 1091 59241 3 699 6 10 718 5338 35477 3686 6751 51252 626 62 33 223 944 891 5281 3771 2892 12835 8691 96301 10031 10967 125990
2739 53782 2535 1091 60150 9 699 6 10 724 5260 35477 3686 6754 51177 804 42 33 223 1122 783 5281 3771 2892 12727 9595 95301 10031 10970 125897
47
Percentá Počet pozitívnych pozitívnych vyšetrení vyšetrení 0 0,00 196 0,36 16 0,63 6 0,55 218 0,36 0 0,00 0 0,00 0 0,00 0 0,00 0 0,00 16 0,30 1663 4,69 30 0,81 113 1,67 1822 3,56 0 0,00 0 0,00 0 0,00 8 3,59 8 0,71 3 0,38 40 0,76 16 0,42 35 1,21 94 0,74 19 0,20 1899 1,99 62 0,62 170 1,55 2150 1,71
Tabulka č. 4 Počty vyšetrení podľa biologických materiálov a počty pozitívnych vyšetrení podľa pracovísk biologický materiál
laryngeálne výtery
laboratórium
počet vyšetrení
pozitívne vyšetrení
4620 0 206 460 672 585 153 874 98 669 38 305 39 0 486 345 45 9595
6 0 0 3 0 0 0 3 0 4 0 3 0 0 0 0 0 19
OKM NÚTaRCH OKM NsP Myjava OKM NsP Iľava OKM NsP B. Bystrica OKM TaRCH Pr. Hora OKM TaRCH Lefantovce OKM NsP Komárno OKM NsP Žilina OKM FNsP L. Pasteura OKM NsP Michalovce OKM NsP Trebišov OKM NsP Prešov OKM TaRCH Vyšné Hágy OKM TaRCH Nová Polianka OKM TaRCH Kvetnica OKM TaRCH Dolný Smokovec OKM NsP Humenné SPOLU
spútum % pozitívnych vyšetrení 0,13 0,00 0,00 0,65 0,00 0,00 0,00 0,34 0,00 0,60 0,00 0,98 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,20
počet vyšetrení 7534 453 10862 10069 611 16262 3387 10569 3559 3421 2451 6125 9131 621 5653 42 4551 95301
pokračování tabulky na další straně
48
pozitívne vyšetrení 158 0 99 137 20 195 6 193 93 80 149 61 481 0 134 0 93 1899
moč % pozitívnych vyšetrení 2,11 0,00 0,91 1,37 3,27 1,20 0,18 1,84 2,61 2,34 6,12 1,00 5,27 0,00 2,37 0,00 2,04 1,99
počet vyšetrení 835 55 627 1158 1 766 79 1153 621 1125 147 682 1855 28 308 4 587 10031
% pozitívne pozitívnych vyšetrení vyšetrení 6 0,72 0 0,00 3 0,48 20 1,73 0 0,00 1 0,13 0 0,00 11 0,95 0 0,00 5 0,44 1 0,68 3 0,44 12 0,65 0 0,00 0 0,00 0 0,00 0 0,00 62 0,62
Počty vyšetrení podľa biologických materiálov a počty pozitívnych vyšetrení podľa pracovísk - pokračovanie biologický materiál laboratórium OKM NÚTaRCH OKM NsP Myjava OKM NsP Iľava OKM NsP B. Bystrica OKM TaRCH Pr. Hora OKM TaRCH Lefantovce OKM NsP Komárno OKM NsP Žilina OKM FNsP L. Pasteura OKM NsP Michalovce OKM NsP Trebišov OKM NsP Prešov OKM TaRCH Vyšné Hágy OKM TaRCH Nová Polianka OKM TaRCH Kvetnica OKM TaRCH Dolný Smokovec OKM NsP Humenné SPOLU
iný materiál počet vyšetrení 2057 33 991 879 0 1766 215 588 419 265 108 611 1167 24 1293 146 408 10970
pozitívne vyšetrení 24 0 24 4 0 30 0 4 12 15 4 7 24 0 2 8 12 170
spolu % pozitívnych počet vyšetrení vyšetrení 1,02 15046 0,00 541 2,42 12686 0,46 12566 0,00 1284 1,64 19379 0,00 3834 0,68 13184 2,86 4697 5,66 5480 3,70 2744 1,15 7723 2,06 12192 0,00 673 0,15 7740 5,48 537 2,94 5591 1,55 125897
49
pozitívne vyšetrení 192 0 126 165 20 225 6 212 105 104 155 74 517 0 136 8 105 2150
% pozitívnych vyšetrení 1,28 0,00 0,99 1,31 1,56 1,16 0,16 1,61 2,24 1,90 5,65 0,96 4,24 0,00 1,76 1,49 1,88 1,71
Tabulka č. 5 Počet vzoriek a vyšetrení vykonaných v mykobaktrériologických laboratóriách na území jednotlivých krajov Slovenskej republike v roku 2003 Kraj Zdravot. zariadenie 1. TBC odd. zdravotné strediská (dospelí) 2. TBC odd. zdravotné strediská (deti)
bratislavský trnavský trenčianský
počet vyšetrení 7774 počet pozit. vyšetrení 32 % pozit. vyšetrení 0,41 počet vyšetrení 30 počet pozit. vyšetrení 0 %pozit. vyšetrení 0 3. TBC odd. počet nemocníc vyšetrení 5864 a liečební počet pozit. (dospelí) vyšetrení 149 % pozit. vyšetrení 2,50 4. TBC odd. počet nemocníc vyšetrení 440 a liečební počet pozit. (deti) vyšetrení 0 % pozit. vyšetrení 0,00 Pokračovanie tabulky na další strane
nitranský
žilinský
banskobystrický
košický
prešovský
Spolu
0
9099
14327
7135
7120
3889
10806
60150
0
12
20
32
53
39
30
218
0
0
0,14
0,45
0,74
1,03
0,28
0,36
0
0
0
0
626
68
0
724
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1992
7953
4350
4716
5125
21177
51177
0
95
208
164
125
292
789
1822
0,00
4,77
2,62
3,77
2,65
5,70
3,73
3,56
0
0
0
23
0
121
538
1122
0
0
0
0
0
0
8
8
0,00
0,00
0,00
0,00
0,00
0,00
1,49
0,71
50
Tabulka č. 5 - pokračovanie 5. Ostatné zdravotnícke zariadenia 6. 1-5 SPOLU
počet vyšetrení počet pozit. vyšetrení % pozit. vyšetrení počet vyšetrení počet pozit. vyšetrení % pozit. vyšetrení
1482
0
1595
933
1676
1388
3718
1935
12727
4
0
19
3
16
7
32
13
94
0,27
0,00
1,19
0,32
0,95
0,50
0,86
0,67
0,74
15587
0
12686
23213
13184
13850
12921
34456
125897
192
0
126
231
212
185
364
840
2150
1,23
0,00
0,99
1,00
1,61
1,34
2,82
2,44
1,71
51
Tabulka č. 6 Počty mykobaktériologických vyšetrení vykonaných v Slovenskej republike v rokoch 1993-2003 rok 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003
počet vyšetrení 254724 257682 248569 243532 229786 191139 164558 154205 149111 142758 125897
Počet vzoriek M.tuberculosis + 5539 4965 4513 4240 3741 3280 2991 2942 2646 2551 2150
Počet osob M.tuberculosis + 1139 1165 961 849 783 744 651 680 669 554 534
prevalencia na 105 obyvateľov 22,4 22,5 17,9 15,8 14,5 13,8 12,9 13,2 13 11,8 9,9
Tabulka č. 7 Porovnanie percentá pozitivity vyšetrenia na Mycobacterium tuberculosis v jednotlivých laboratóriách v rokoch 1997-2003 Laboratórium / rok OKM NÚTaRCh OKM NsP Myjava OKM NsP Iľava OKM NsP B. Bystrica OKM TaRCH Pr. Hora OKM TaRCH Lefantovce OKM NsP Komárno OKM NsP Žilina OKM FNsP L. Pasteura OKM NsP Michalovce OKM NsP Trebišov OKM NsP Prešov OKM TaRCH Vyšné Hágy OKM TaRCH Nová Polianka OKM TaRCH Kvetnica OKM TaRCH Dolný Smokovec OKM NsP Humenné SPOLU
1997 1,6 0,7 0,9 1,3 2,8 1,1 0,9 1,9 1,1 1,1 4,6 1,5 2,4 2,0 4,1 0,3 2,3 1,8
1998 1,4 0,7 0,8 1,5 4,5 1,1 0,7 1,7 1,6 1,5 4,0 1,5 2,9 2,3 5,2 0,3 2,4 2,0
1999 1,1 0,7 1,4 1,2 5,1 1,1 0,5 1,3 1,3 1,0 5,3 1,5 3,7 0,0 7,9 0,2 3,2 2,1
52
2000 1,4 0,3 1,3 1,6 7,7 1,1 0,3 1,3 1,2 0,9 6,7 2,0 4,4 4,2 5,1 0,7 2,4 2,5
2001 1,3 0,2 0,9 1,4 5,0 1,3 0,6 1,3 1,8 1,1 6,7 1,5 4,4 0,0 5,2 1,1 2,3 2,1
2002 1,1 0,6 1,1 1,1 6,2 1,1 0,2 1,2 1,8 1,1 9,0 1,6 4,5 0,6 2,5 1,8 2,2
2003 1,3 0,0 0,9 1,3 1,6 1,2 0,2 1,6 2,2 1,9 5,6 1,0 4,2 0,0 1,8 1,5 1,9 1,7
Tabulka č. 8
Biologický materiál
Porovnanie počtu pozitívnych výsledkov získaných kultivačným a mikroskopickým vyšetrením
Likvor Spútum Moč Iný materiál Spolu
Vzorky vyšetrené paralelne mikroskopicky a kultivačne
Pozitívne vzorky Počet Kultivačne Kultivačne Kultivačne + + Mikroskop. Mikroskop. Mikroskop. + +
Celkový počet 368 85460 4834 8090
1 1889 45 150
0 813 1 27
1 887 30 95
0 141 0 12
0 48 14 16
98752
2085
841
1013
153
78
Kultivačne + Mikroskopicky nevyšetrené
Tabulka č. 9 Prehľad o pozitivite spút, paralelne vyšetrených mikroskopicky a kultivačne v Slovenskej republike v rokoch 1997-2003
Rok 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003
Celkový počet pozitívnych spút paralelne vyšetrených 3141 2789 2530 2452 2277 2221 1889
z toho mikroskopicky
kultivačne
n
%
n
%
1804 1476 1446 1248 1101 1167 954
57,4 52,9 57,1 50,9 48,3 52,5 50,3
2888 2571 2335 2252 2134 2134 1700
91,9 92,2 92,3 91,8 93,7 90,7 89,6
53
Tabulka č. 10 Prehľad o paralelne mikroskopicky a kultivačne vykonaných vyšetreniach spúta v jednotlivých laboratóriách na území Slovenskej republike v roku 2003
Materiál spútum
laboratórium OKM NÚTaRCH OKM NsP Myjava OKM NsP Iľava OKM NsP B. Bystrica OKM TaRCH Pr. Hora OKM TaRCH Lefantovce OKM NsP Komárno OKM NsP Žilina OKM FNsP L. Pasteura OKM NsP Michalovce OKM NsP Trebišov OKM NsP Prešov OKM TaRCH Vyšné Hágy OKM TaRCH Nová Polianka OKM TaRCH Kvetnica OKM TaRCH Dolný Smokovec OKM NsP Humenné SPOLU
Vzorky vyšetrené paralelne mikroskop. a kultivačne celkový počet 5408 453 10862 10069 611 14792 3387 6175 3559 3421 2451 6125 9131 621 5653 42 2700 85460
Vzorky pozitívne
Spolu n % 159 0 99 138 20 195 6 194 89 80 150 61 481 0 134 0 83 1889
2,94 0,00 0,91 1,37 3,27 1,32 0,18 3,14 2,50 2,34 6,12 1,00 5,27 0,00 2,37 0,00 3,07 2,21
kultivačne a mikroskopicky
kultivačne
mikroskopicky
Pozitívne vzorky pri kultivácii mikroskopicky nevyšetrené
n
%
n
%
n
%
n
%
88 0 51 69 0 66 4 94 56 15 111 27 147 0 66 0 19 813
1,63 0,00 0,47 0,69 0,00 0,45 0,12 1,52 1,57 0,44 4,53 0,44 1,61 0,00 1,17 0,00 0,70 0,95
53 0 46 48 20 119 2 58 33 32 39 34 285 0 68 0 50 887
0,98 0,00 0,42 0,48 3,27 0,80 0,06 0,94 0,93 0,94 1,59 0,56 3,12 0,00 1,20 0,00 1,85 1,04
18 0 2 16 0 10 0 33 0 0 0 0 48 0 0 0 14 141
0,33 0,00 0,02 0,16 0,00 0,07 0,00 0,53 0,00 0,00 0,00 0,00 0,53 0,00 0,00 0,00 0,52 0,16
2 0 0 5 0 0 0 7 0 31 0 0 1 0 0 0 2 48,00
0,00 0,00 0,00 0,05 0,00 0,00 0,00 0,11 0,00 0,91 0,00 0,00 0,01 0,00 0,00 0,00 0,07 0,06
54
Tabulka č. 11 Metabolické detekčné systémy v diagnostike mykobakteriálnych infekcií v laboratóriách SR v roku 2003 Pracovisko Biologický materiál Spútum BSC/BAL Moč Likvor Punktát pleurálny Punktát iný Ortopedický punktát Uzlina Gynekolog. materiál Hnis Iný materiál Spolu
NUTaRCH ÚTPCH a RCH Lefantovce Kvetinica Dolný Smokovec OKM Iľava Slovenská republika % Počet Počet Počet Počet Počet Počet Počet Počet Počet Počet Počet Počet Počet Počet pozit. pozit. vypozit. vyšetre- pozit. vypozit. vypozit. vypozit. pozit. vyvyvyvyšetrení vyní vyšetrení vyšetrení vyšetrení vyvyšetrení šetrení šetrení šetrení šetrení šetrení šetrení šetrení šetrení šetrení 11 1 174 44 107 1 26 1 38 0 242 1 645 48 7,44 14 0 131 2 114 3 36 3 33 0 109 2 447 10 2,24 0 0 13 1 7 0 0 0 3 0 0 0 24 1 4,17 3 0 2 0 5 0 1 0 0 0 5 0 16 0 0,00 8 0 44 2 0 0 7 0 3 0 54 0 118 2 1,69 6 11
0 0
2 1
0 0
1 1
0 0
0 0
0 0
0 0
0 0
7 0
0 0
16 13
0 0
0,00 0,00
2 3
0 0
0 0
0 0
0 0
0 0
0 0
0 0
0 0
0 0
3 0
2 0
5 3
2 0
40,00 0,00
4 12 74
0 0 1
16 0 383
3 1 53
0 14 249
0 0 4
0 180 250
0 0 4
1 99 177
0 0 0
6 4 430
0 0 5
30 310 1625
3 1 67
10,00 0,32 4,12
55
Tabulka č. 12 Druhy biologického materiálu, zo ktorých bolo u 534 osôb v Slovenskej republike vylučované Mycobacterium tuberculosis Druh biologického materiálu Exudát Likvor Lymfatická uzlina Výpotok z brucha Výter z abscesu Pitevný materiál Uzlina Tumor Pitevný materiál Hnis Výplach z kanála Žaludočná šťava Laryngeálny výter Bronchiálny sekrét Moč BAL Pleurálny punktát Spútum Total
Počet
%
1 1 1 1 1 2 2 3 5 6 7 8 9 10 15 16 18 428 534
0,19 0,19 0,19 0,19 0,19 0,37 0,37 0,56 0,94 1,12 1,31 1,50 1,69 1,87 2,81 3,00 3,37 80,15 100,00
Tabulka č. 13 Typy polyrezistencie izolovaných kmeňov Mycobacterium tuberculosis izolovaných od 60tích osôb vylučujúcich rezistentné kmene Typ rezistencie Monorezistencia Birezistencia Trirezistencia tetrarezistencia
Počet kmeňov 28 14 10 3
56
% kmeňov 50,9 25,4 18,2 5,5
Tabulka č. 14 Typy polyrezistencie izolovaných kmeňov Mycobacterium tuberculosis izolovaných od 60tích osôb vylučujúcich rezistentné kmene Rezistencia na Počet Percento rezistentných kmeňov Izoniazid Streptomycín Rifampicín Etambutol Pyrazinamid C C C C R 2 3,64 C R C C C 5 9,09 R C C C C 21 38,18 R C C C R 2 3,64 R C C C R 4 7,27 R C R C C 1 1,82 R R C C C 7 12,73 R C R C R 1 1,82 R R R C C 4 7,27 R C R C R 4 7,27 R C R R C 1 1,82 R C R R R 1 1,82 R R R C R 2 3,64 7C/48R 37C/18R 41C/14R 52C/2R 39C/16R 55 100,00 Tabulka č. 15 Výskyt podmienene patogénnych mykobaktérií v SR v roku 2003 Druhy mykobaktérií M.kansasií M.avium-intracelluláre M.gordonae M.flavescens M.nonchromogenicum terrae M.fortuitum – chelonae M.xenopi M.smegmatis M.marínum IV.skupina – saprofyt M.triviale M.parafortuitum Saprofyt III. sk. Neurčené Atypické, bližšie neurčené Spolu
osôb 5 2 143 2 12 21 52 7 3 10 2 1 5 1 10 276
57
Počet izol. kmeňov 12 4 157 2 14 28 77 8 3 14 2 1 5 1 12 340
Tabulka č. 16 Pacienti, od ktorých boli v Slovenskej republike izolované BCG kmene Vek v rokoch 1 2 3 11 12 Spolu Pohlavie Mužské Ženské Spolu
Počet pacientov 9 2 1 1 1 14
% pacientov 64,30 14,30 7,10 7,10 7,10 100,00
Počet 5 9 14
% 35,70 64,30 100,00
Tabulka č. 17 Pacienti, od ktorých bol v Slovenskej republike izolovaný BCG kmeň Kraj Bratislavský Trnavský Trenčianský Nitranský Banskobystrický Žilinský Košický Prešovský Spolu
Počet pacientov 8 0 0 0 5 1 0 0 14
58
% pacientov 57,10 0 0 0 35,70 7,10 0 0 100,00