Uživatelská příručka Software HLA Fusion

Uživatelská příručka ™ Software HLA Fusion Software HLA Fusion™ verze 3.x.x Pro použití v diagnostice in vitro.

21001 Kittridge Street, Canoga Park, CA 91303-2801

Tel: (818)702-0042

www.onelambda.com

One Lambda, Inc.

Uživatelská příručka k softwaru HLA Fusion verze 3.x.x

LABType®, LABScreen® a FlowPRA® jsou registrované obchodní značky společnosti One Lambda, Inc. HLA Fusion™, LCT™, LAT™, Micro SSP™ and LABScan™ 100 jsou obchodní značky společnosti One Lambda, Inc. Luminex® je registrovaná obchodní značka společnosti Luminex Corporation. Windows® je registrovaná obchodní značka společnosti Microsoft Corporation. © Copyright 2012, One Lambda, Inc.

Všechny softwarové produkty společnosti One Lambda jsou navrženy jako pomůcky pro pracovníky se zkušenostmi v oblasti HLA analýzy a slouží pro navrhování výsledků typizace. Veškeré klinické a diagnostické výsledky však musí pro zajištění správnosti pečlivě zrevidovat osoba vyškolená v typizaci HLA. Tento software lze použít jako pomůcku pro návrh výsledků, neměl by se však používat jako jediná metoda pro určení vykazatelných výsledků. Tento software slouží jako laboratorní pomůcka, nikoli jako zdroj konečných výsledků. Software svou koncepcí nezmenšuje rizika spojená s tímto softwarem. Ředitel laboratoře nebo technolog vyškolený v testování histokompatibility musí revidovat všechna data a detekovat veškeré problémy týkající se softwaru. Tento dokument byl sestaven ještě před vydáním softwaru HLA Fusion. Můžete proto zaznamenat mírné odlišnosti v obsahu reálných aplikačních obrazovek.

HLAF-MAN-v3.x.x-CS-00, verze 0 (Uživatelská příručka pro HLA Fusion v3.x.x)

Pro použití při diagnostice in vitro

2


One Lambda, Inc.

Obsah ÚVOD ................................................................................................................................................................................... 14 ™

CO JE SOFTWARE HLA FUSION ? ..................................................................................................................................................... 14 PRODUKTOVÁ DOKUMENTACE A AKTUALIZAČNÍ SOUBORY ................................................................................................ 15 AKTUALIZACE PROGRAMU ................................................................................................................................................... 16 OMEZENÍ PROGRAMU ......................................................................................................................................................... 17 TECHNICKÁ PODPORA .......................................................................................................................................................... 18 ROZSAH TÉTO PŘÍRUČKY ...................................................................................................................................................... 19 NAVIGACE ............................................................................................................................................................................ 20 PŘIHLÁŠENÍ DO PROGRAMU FUSION ................................................................................................................................... 21 ZJIŠTĚNÍ ZAPOMENUTÉHO UŽIVATELSKÉHO JMÉNA A HESLA ................................................................................................................... 22 KLÍČOVÁ SYSTÉMOVÁ NASTAVENÍ ....................................................................................................................................... 23 ROZLIŠENÍ OBRAZOVKY ................................................................................................................................................................... 23 POVOLENÍ PRO SOUBORY ................................................................................................................................................................ 24 UŽIVATELSKÉ ROZHRANÍ ...................................................................................................................................................... 25 DOMOVSKÉ STRÁNKY FUSION .......................................................................................................................................................... 25 SPUŠTĚNÍ NAVIGÁTORU ................................................................................................................................................................. 27 Navigační strom................................................................................................................................................................... 27 SESKUPENÍ VÝSLEDKŮ..................................................................................................................................................................... 28 Seskupit podle produktu ...................................................................................................................................................... 28 Seskupit podle katalogu ...................................................................................................................................................... 29 Seskupit podle data testu .................................................................................................................................................... 29 ™

PŘÍSTUP K FUNKCÍM SOFTWARU HLA FUSION ................................................................................................................... 30 VOLBY HLAVNÍ NABÍDKY ................................................................................................................................................................. 30 Analýza dat .......................................................................................................................................................................... 30 Zprávy .................................................................................................................................................................................. 30 Data ..................................................................................................................................................................................... 30 Vzorek .................................................................................................................................................................................. 30 Informace o pacientovi ........................................................................................................................................................ 31



3

One Lambda, Inc.


Profil .................................................................................................................................................................................... 31 Pomocné nástroje ................................................................................................................................................................ 31 Nápověda ............................................................................................................................................................................ 31 Konec ................................................................................................................................................................................... 32 Tlačítka panelu nástrojů ...................................................................................................................................................... 32 Najít ..................................................................................................................................................................................... 33 Tisk zprávy ........................................................................................................................................................................... 34 Náhled zprávy ...................................................................................................................................................................... 35 Tisk obrazovky ..................................................................................................................................................................... 35 Zvětšit .................................................................................................................................................................................. 36 Zobrazit Navigátor............................................................................................................................................................... 36 Informace o pacientovi/dárci .............................................................................................................................................. 37 Související záznamy ............................................................................................................................................................. 38 Analýza vedle sebe .............................................................................................................................................................. 38 ANALÝZA DAT PRODUKTU ............................................................................................................................................................... 39 Navigace ve vzorcích ........................................................................................................................................................... 39 Datum vzorku ...................................................................................................................................................................... 40 ANALÝZA LABTYPE ............................................................................................................................................................... 41 SPUŠTĚNÍ ANALÝZY LABTYPE ............................................................................................................................................... 43 IMPORT DAT RELACE LABTYPE (JINÁ NEŽ HD) .................................................................................................................................... 43 ZÍSKÁNÍ DATA RELACE LABTYPE (HD) ............................................................................................................................................... 50 ANALÝZA RELACÍ EXON 4+ ................................................................................................................................................... 56 PŘEHLED RELACÍ LABTYPE .................................................................................................................................................... 59 Volič polí přehledu relací ..................................................................................................................................................... 59 Tlačítka Export, Náhled a Tisk ............................................................................................................................................. 60 KARTY PŘEHLEDU RELACÍ LABTYPE ................................................................................................................................................... 61 Karta Přehled ....................................................................................................................................................................... 61 Karta Kontrolní hodnota ...................................................................................................................................................... 62 Přehled pozitivních kontrol .................................................................................................................................................. 62 Přehled negativních kontrol................................................................................................................................................. 63 Přehled počtu perliček ......................................................................................................................................................... 63 KARTA ANALÝZA PERLIČKY .............................................................................................................................................................. 64 Přehled falešných reakcí ...................................................................................................................................................... 64 OBECNÉ VLASTNOSTI PŘEHLEDU RELACÍ ............................................................................................................................................. 68 Vyloučení vzorku z analýzy .................................................................................................................................................. 70 KONFIGURACE ANALÝZY LABTYPE PRO AKTUÁLNÍ VZOREK ................................................................................................. 71 ZMĚNA KONFIGURACE PRO AKTUÁLNÍ VZOREK..................................................................................................................................... 71 Přiřazení kódu ...................................................................................................................................................................... 72 Bw4/Bw6 v sérologii ............................................................................................................................................................ 72 Demografické informace ..................................................................................................................................................... 73 Minimální pozitivní kontrola................................................................................................................................................ 73



4

One Lambda, Inc.


Minimální počet perliček ..................................................................................................................................................... 74 Nastavit perličku jisté reakce ............................................................................................................................................... 74 Zobrazit QC .......................................................................................................................................................................... 75 Nastavení prahu pro nízké pozitivní .................................................................................................................................... 75 POUŽÍVÁNÍ OKNA ANALÝZA DAT LABTYPE ........................................................................................................................... 76 KLÁVESOVÉ ZKRATKY PRO NAVIGACI V ANALÝZE LABTYPE ..................................................................................................................... 80 KVADRANT 1 (HISTOGRAM QC) ...................................................................................................................................................... 80 Karta QC .............................................................................................................................................................................. 80 Karta Rxn (Reakce) .............................................................................................................................................................. 81 Karta Rozpoznávací místo ................................................................................................................................................... 83 Rozpoznávací pruh............................................................................................................................................................... 85 Karta Lokální QC .................................................................................................................................................................. 86 Karta Výsledky pacienta/vzorku .......................................................................................................................................... 86 KVADRANT 2 (DATA PERLIČKY) ........................................................................................................................................................ 87 Karta Perlička ...................................................................................................................................................................... 87 Karta Nezpracované ............................................................................................................................................................ 90 Karta Informace o perličce................................................................................................................................................... 91 KVADRANT 3 (REAKČNÍ PROFIL) ....................................................................................................................................................... 92 Reakční profil ....................................................................................................................................................................... 92 KVADRANT 4 ............................................................................................................................................................................... 95 Karta Páry ............................................................................................................................................................................ 96 Přiřazení páru alel ze seznamu navrhovaných..................................................................................................................... 97 Poklepáním na pár alel pod kartou Páry přiřadíte pár do oblasti závěrečného přiřazení párů alel. ................................... 97 Ruční přiřazení páru alel ...................................................................................................................................................... 98 Karta Vynutit ....................................................................................................................................................................... 98 Karta Typ/podtyp................................................................................................................................................................. 99 Karta Shoda ....................................................................................................................................................................... 100 Karta Sero .......................................................................................................................................................................... 100 Vyloučení sond Exon 3 pro lokus ........................................................................................................................................ 101 Přiřazení alelových kódů .................................................................................................................................................... 102 Přiřazení alelových kódů .................................................................................................................................................... 103 Ruční přiřazení alelových kódů .......................................................................................................................................... 103 Jiné přiřazení ...................................................................................................................................................................... 105 Opakovat analýzu .............................................................................................................................................................. 106 Analyzovat kombinované relace LABType ......................................................................................................................... 106 Přidání uživatelských komentářů do vzorků ...................................................................................................................... 107 Označení vzorku příznakem pro další testování ................................................................................................................ 108 Přiřazení výsledků sérologie a alelových kódů k pacientovi............................................................................................... 108 Náhled nebo tisk zpráv ...................................................................................................................................................... 109 Přiřadit kódované výsledky ................................................................................................................................................ 110 Přeložit ............................................................................................................................................................................... 110 Uložit přiřazení .................................................................................................................................................................. 110 Potvrdit přiřazení ............................................................................................................................................................... 111



5

One Lambda, Inc.


VOLBY NABÍDKY PO KLEPNUTÍ PRAVÝM TLAČÍTKEM MYŠI V NAVIGÁTORU PRO LABTYPE ................................................. 112 VOLBY NA ÚROVNI RELACE ............................................................................................................................................................ 112 Vytvořit laboratorní QC ..................................................................................................................................................... 112 Prohlížení relace ................................................................................................................................................................ 113 Opakovat analýzu s novou nomenklaturou ....................................................................................................................... 114 VOLBY NA ÚROVNI VZORKU ........................................................................................................................................................... 114 Související záznamy ........................................................................................................................................................... 115 Srovnávací analýza ............................................................................................................................................................ 115 Průzkumník aplikace Fusion............................................................................................................................................... 116 ANALÝZA MICRO SSP ......................................................................................................................................................... 118 SPUŠTĚNÍ ANALÝZY MICRO SSP ......................................................................................................................................... 119 KONFIGURACE ANALÝZY DAT MICRO SSP .......................................................................................................................... 123 Přiřazení kódu .................................................................................................................................................................... 123 Bw4/Bw6 v sérologii .......................................................................................................................................................... 124 Demografické informace ................................................................................................................................................... 124 POUŽITÍ OKNA ANALÝZY MICRO SSP .................................................................................................................................. 125 Panel testovacího gelu....................................................................................................................................................... 126 Zobrazení podrobností o jamce ......................................................................................................................................... 128 Práce s gelovými obrazy .................................................................................................................................................... 128 Přidání vzorků .................................................................................................................................................................... 130 Karta Spuštění (reakce)...................................................................................................................................................... 132 Počet přípustných falešných reakcí.................................................................................................................................... 134 Vynucení jedné falešné reakce........................................................................................................................................... 134 KOMBINOVANÁ ANALÝZA MICRO SSP ............................................................................................................................... 135 PROVEDENÍ PŘIŘAZENÍ TYPIZACE V ANALÝZE MICRO SSP .................................................................................................. 137 Přiřazení alelového páru ze seznamu navržených ............................................................................................................. 138 Karta shody ........................................................................................................................................................................ 138 Ruční přiřazení alelových párů ........................................................................................................................................... 139 Možné alelové kódy ........................................................................................................................................................... 139 Přiřazení alelového kódu ................................................................................................................................................... 140 Ruční přiřazení alelového kódu .......................................................................................................................................... 140 Neznámé alelové kódy ....................................................................................................................................................... 141 Jiná přiřazení...................................................................................................................................................................... 143 Pole možné sérologie ......................................................................................................................................................... 143 Převést (pouze neaktuální nomenklaturní formát)............................................................................................................ 144 Přidání poznámky ke vzorkům ........................................................................................................................................... 144 Označení vzorku značkou pro další testování .................................................................................................................... 145 Tisk okna aktuální analýzy ................................................................................................................................................. 145 Náhled nebo tisk zpráv ...................................................................................................................................................... 146 Přiřazení kódovaných výsledků .......................................................................................................................................... 146



6

One Lambda, Inc.


Uložení přiřazení ................................................................................................................................................................ 146 Potvrzení přiřazení ............................................................................................................................................................. 147 SOUHRN RELACE MICRO SSP .............................................................................................................................................. 148 MOŽNOSTI NABÍDKY KLEPNUTÍ PRAVÝM TLAČÍTKEM NA NAVIGÁTOR PRO RELACE MICRO SSP ........................................ 150 MOŽNOSTI NA ÚROVNI RELACE ...................................................................................................................................................... 150 Opakovaná analýza s novou nomenklaturou .................................................................................................................... 150 Možnosti na úrovni vzorku ................................................................................................................................................ 151 Související záznamy ........................................................................................................................................................... 151 Srovnávací analýza ............................................................................................................................................................ 151 ANALÝZA LABSCREEN ......................................................................................................................................................... 153 ZAHÁJENÍ ANALÝZY LABSCREEN ......................................................................................................................................... 154 POŘÍZENÍ DAT RELACE LABSCREEN ................................................................................................................................................. 154 OBRAZOVKA SOUHRNNÉ RELACE LABSCREEN ................................................................................................................................... 159 POUŽITÍ OKNA SMÍŠENÉ ANALÝZY LABSCREEN .................................................................................................................. 161 NAJÍT ANTIGEN ........................................................................................................................................................................... 162 ZOBRAZENÍ MOLEKULÁRNÍ TYPIZACE PRO ANTIGENY ........................................................................................................................... 163 Zobrazení výsledků screeningu protilátek MIC .................................................................................................................. 164 Úprava mezních hodnot .................................................................................................................................................... 164 Graf nezpracovaných ......................................................................................................................................................... 165 Tabulka nezpracovaných dat ............................................................................................................................................. 166 Zpráva o nezpracovaných datech ...................................................................................................................................... 166 PANEL CREG ............................................................................................................................................................................. 167 Provedení přiřazení ............................................................................................................................................................ 167 Uložení přiřazení ................................................................................................................................................................ 168 POTVRZENÍ PŘIŘAZENÍ .................................................................................................................................................................. 168 PŘIDÁNÍ POZNÁMKY KE VZORKŮM .................................................................................................................................................. 168 OZNAČENÍ VZORKU ZNAČKOU PRO DALŠÍ TESTOVÁNÍ .......................................................................................................................... 169 Tisk okna aktuální analýzy ................................................................................................................................................. 169 NÁHLED ZPRÁV A JEJICH TISK ......................................................................................................................................................... 169 POMOCÍ OKNA LABSCREEN PRA, JEDNOTLIVÝ ANTIGEN A JEDNOTLIVÁ ANALÝZA ............................................................. 171 TABULKA CREG ......................................................................................................................................................................... 172 Najít antigen ...................................................................................................................................................................... 173 Změna laboratorního měřítka ........................................................................................................................................... 174 Zobrazení molekulárních specificit .................................................................................................................................... 175 Úprava mezních hodnot .................................................................................................................................................... 175 Výběr minimálního pozitivního prahu................................................................................................................................ 176 Změna normalizačního vzorce ........................................................................................................................................... 176 Vyloučení antigenu(ů) z analýzy ........................................................................................................................................ 176 Zahrnutí/vyloučení Cw ....................................................................................................................................................... 177 Resetování všech možností na výchozí hodnotu ................................................................................................................ 178



7

One Lambda, Inc.


Vynucení pozitivního výsledku ........................................................................................................................................... 178 Graf nezpracovaných ......................................................................................................................................................... 178 Tabulka nezpracovaných dat ............................................................................................................................................. 179 Zpráva o nezpracovaných datech ...................................................................................................................................... 179 Zobrazení shody/neshody SPD (specifického antigenu dárce)........................................................................................... 180 Přidání poznámky ke vzorkům ........................................................................................................................................... 181 Označení vzorku značkou pro další testování .................................................................................................................... 181 Tisk okna aktuální analýzy ................................................................................................................................................. 181 Náhled zpráv a jejich tisk ................................................................................................................................................... 181 Provedení konečných přiřazení .......................................................................................................................................... 182 Ruční přiřazení ................................................................................................................................................................... 182 Přiřazení záporných hodnot vzorku ................................................................................................................................... 183 Odebrání přiřazení ............................................................................................................................................................. 183 Uložení přiřazení ................................................................................................................................................................ 183 Potvrzení přiřazení ............................................................................................................................................................. 184 Získání hodnot zbytkové analýzy (kromě jednotlivých analýz) .......................................................................................... 184 PRA dárce (kromě jednotlivých analýz) ............................................................................................................................. 184 Výběr minimálních pozitivních prahových mezních hodnot (kromě jednotlivých analýz).................................................. 185 Skrytí hodnot zbytkové analýzy (jednotlivý antigen) ......................................................................................................... 185 Navigace mezi třídou I a třídou II (zkombinovaná třída I a II PRA) .................................................................................... 186 Seřazení antigenů (jednotlivý antigen) .............................................................................................................................. 186 MOŽNOSTI NABÍDKY KLEPNUTÍ PRAVÝM TLAČÍTKEM NA NAVIGÁTOR PRO LABSCREEN.................................................... 188 Opakovaná analýza s novým nastavením/katalogem....................................................................................................... 188 Možnosti na úrovni vzorku ................................................................................................................................................ 189 Související záznamy ........................................................................................................................................................... 189 Srovnávací analýza ............................................................................................................................................................ 189 ANALÝZA LAT ..................................................................................................................................................................... 191 ZAHÁJENÍ ANALÝZY LAT ..................................................................................................................................................... 192 POŘÍZENÍ DAT RELACE LAT............................................................................................................................................................ 192 Ruční zadání jednotlivé relace ........................................................................................................................................... 193 Ruční zadání dávky ............................................................................................................................................................ 194 IMPORT SOUBORŮ CSV V ANALÝZE LAT .......................................................................................................................................... 195 POUŽITÍ OKNA SMÍŠENÉ ANALÝZY LAT .............................................................................................................................. 200 Zadání dat a reakčního schématu ..................................................................................................................................... 201 POUŽITÍ ČTEČKY ELISA ................................................................................................................................................................ 202 Provedení přiřazení ............................................................................................................................................................ 203 Uložení přiřazení ................................................................................................................................................................ 203 POTVRZENÍ PŘIŘAZENÍ .................................................................................................................................................................. 204 Přidání poznámky ke vzorkům ........................................................................................................................................... 204 Označení vzorku značkou pro další testování .................................................................................................................... 204 Přidání informací o kartě ................................................................................................................................................... 205 Export dat relace ............................................................................................................................................................... 205



8

One Lambda, Inc.


Tabulka nezpracovaných dat ............................................................................................................................................. 205 Rychlá zpráva o nezpracovaných datech ........................................................................................................................... 206 Tisk okna aktuální analýzy ................................................................................................................................................. 207 Náhled zpráv a jejich tisk ................................................................................................................................................... 207 POUŽITÍ OKNA ANALÝZY JEDNOTLIVÉHO ANTIGENU LAT/PRA ........................................................................................... 208 ZADÁNÍ REAKČNÍHO SCHÉMATU ..................................................................................................................................................... 208 POUŽITÍ ČTEČKY ELISA ................................................................................................................................................................ 210 HISTOGRAM LAT PRA/JEDNOTLIVÉHO ANTIGENU ............................................................................................................................. 210 Tabulka CREG .................................................................................................................................................................... 211 Najít antigen ...................................................................................................................................................................... 211 Zobrazení molekulárních specificit .................................................................................................................................... 212 Výběr minimálního pozitivního prahu................................................................................................................................ 212 Vyloučení antigenu z analýzy............................................................................................................................................. 212 Zahrnutí/vyloučení Cw ....................................................................................................................................................... 213 NAVIGACE MEZI TŘÍDOU I A TŘÍDOU II ............................................................................................................................................. 213 (Kombinovaná třída PRA I a II)........................................................................................................................................... 213 Tabulka nezpracovaných dat ............................................................................................................................................. 214 Zpráva o nezpracovaných datech ...................................................................................................................................... 214 Export dat relace ............................................................................................................................................................... 214 PRA dárce .......................................................................................................................................................................... 214 Přidání poznámky ke vzorkům ........................................................................................................................................... 215 Označení vzorku značkou pro další testování .................................................................................................................... 215 Náhled zpráv a jejich tisk ................................................................................................................................................... 215 PROVEDENÍ KONEČNÝCH PŘIŘAZENÍ ................................................................................................................................................ 215 Ruční přiřazení ................................................................................................................................................................... 216 Přiřazení záporných hodnot vzorku ................................................................................................................................... 216 Odebrání přiřazení ............................................................................................................................................................. 216 Uložení přiřazení ................................................................................................................................................................ 217 POTVRZENÍ PŘIŘAZENÍ .................................................................................................................................................................. 217 Získávání hodnot zbytkové analýzy ................................................................................................................................... 217 NAVIGACE MEZI TŘÍDOU I A TŘÍDOU II ............................................................................................................................................. 218 (Kombinovaná třída PRA I a II)........................................................................................................................................... 218 MOŽNOSTI NABÍDKY KLEPNUTÍM PRAVÝM TLAČÍTKEM NA NAVIGÁTOR PRO LAT ............................................................. 219 Opakovaná analýza s novým katalogem ........................................................................................................................... 219 MOŽNOSTI NA ÚROVNI VZORKU ..................................................................................................................................................... 220 Související záznamy ........................................................................................................................................................... 220 Srovnávací analýza ............................................................................................................................................................ 220 ANALÝZA LCT ..................................................................................................................................................................... 221 SPUŠTĚNÍ ANALÝZY LCT ..................................................................................................................................................... 222 POŘÍZENÍ DAT LCT ...................................................................................................................................................................... 222 OBRAZOVKA SOUHRNU RELACE LCT ............................................................................................................................................... 224



9

One Lambda, Inc.


POUŽITÍ OKNA ANALÝZY LCT .............................................................................................................................................. 227 VLOŽENÍ REAKCE A PANEL ANALÝZY................................................................................................................................................. 228 Přidání informací o kartě ................................................................................................................................................... 228 Najít antigen ...................................................................................................................................................................... 229 Tabulka CREG .................................................................................................................................................................... 229 Seřadit podle pozice jamky ................................................................................................................................................ 230 Výběr minimálního pozitivního prahu................................................................................................................................ 231 Vyloučení antigenu z analýzy............................................................................................................................................. 231 Zahrnutí/vyloučení Cw ....................................................................................................................................................... 232 Tabulka nezpracovaných dat ............................................................................................................................................. 232 Zpráva o nezpracovaných datech ...................................................................................................................................... 233 PRA dárce .......................................................................................................................................................................... 233 Přidání poznámky ke vzorkům ........................................................................................................................................... 234 Označení vzorku značkou pro další testování .................................................................................................................... 234 Tisk okna aktuální analýzy ................................................................................................................................................. 234 NÁHLED ZPRÁV A JEJICH TISK ......................................................................................................................................................... 235 PROVEDENÍ KONEČNÝCH PŘIŘAZENÍ ................................................................................................................................................ 235 Ruční přiřazení ................................................................................................................................................................... 235 Přiřazení záporných hodnot vzorku ................................................................................................................................... 236 Odebrání přiřazení ............................................................................................................................................................. 236 Uložení přiřazení ................................................................................................................................................................ 236 Potvrzení přiřazení ............................................................................................................................................................. 236 MOŽNOSTI NABÍDKY KLEPNUTÍ PRAVÝM TLAČÍTKEM NA NAVIGÁTOR PRO RELACE LCT .................................................... 237 Opakovaná analýza s novým katalogem ........................................................................................................................... 237 MOŽNOSTI NA ÚROVNI VZORKU ..................................................................................................................................................... 238 Související záznamy ........................................................................................................................................................... 238 Srovnávací analýza ............................................................................................................................................................ 238 ZPRÁVY .............................................................................................................................................................................. 239 POUŽÍVÁNÍ OKNA ZPRÁV ................................................................................................................................................... 240 Přístup k oknu zpráv .......................................................................................................................................................... 240 Vyberte typ zprávy ............................................................................................................................................................. 241 Upřesnění vstupu zprávy ................................................................................................................................................... 241 Výběr relace/vzorku ........................................................................................................................................................... 242 Zobrazení, tisk nebo export zpráv ...................................................................................................................................... 243 Export zprávy ..................................................................................................................................................................... 245 Přístup ke zprávám z nabídky oblíbených položek............................................................................................................. 245 Odebrání zpráv z oblíbených položek ................................................................................................................................ 246 NÁSTROJE ZPRÁV ............................................................................................................................................................... 247 PŘIZPŮSOBENÍ VZHLEDU ZPRÁVY .................................................................................................................................................... 247 Vytvoření vlastních šablon exportu dat ............................................................................................................................. 248 Vytvoření vlastních zpráv ................................................................................................................................................... 249



10

One Lambda, Inc.


Nastavení zprávy Molekulární vlastní a Protilátka vlastní ................................................................................................ 250 SOUHRN VZORKU ........................................................................................................................................................................ 251 SOUHRN VZORKU MOLEKULÁRNÍ TYPIZACE ....................................................................................................................................... 251 Souhrn vzorku screeningu protilátek ................................................................................................................................. 252 ZOBRAZENÍ ZÁZNAMŮ ....................................................................................................................................................... 253 INFORMACE O PACIENTOVI ........................................................................................................................................................... 254 ZPRÁVA O SLEDOVÁNÍ AUDITU ....................................................................................................................................................... 255 TYPY ZPRÁVY ..................................................................................................................................................................... 257 SPRÁVA DAT ...................................................................................................................................................................... 261 SPRÁVA RELACE ................................................................................................................................................................. 262 OKNO SPRÁVY DAT RELACE............................................................................................................................................................ 262 SPRÁVA VZORKU................................................................................................................................................................ 264 IMPORT SEZNAMŮ VZORKŮ .............................................................................................................................................. 265 FORMÁTY INFORMACÍ PRO SEZNAMY VZORKŮ ................................................................................................................. 266 Nový formát balení seznamů ............................................................................................................................................. 266 Sbalení seznamu: Vzorky „X“ podle starého standardu..................................................................................................... 266 Starý formát balení seznamů, „11“ pro vzorky AB/DR ...................................................................................................... 266 Formát oddělený čárkou .................................................................................................................................................... 266 Formát oddělený tabulátorem .......................................................................................................................................... 267 Formát SDF ........................................................................................................................................................................ 267 Pouze místní ID/ID vzorku/ID pacienta .............................................................................................................................. 267 ZOBRAZENÍ A ÚPRAVY INFORMACÍ O VZORKU.................................................................................................................................... 268 SEZNAMY TESTŮ ................................................................................................................................................................ 269 Vytvoření nových seznamů testů ....................................................................................................................................... 269 Zobrazení a úpravy existujících seznamů testů.................................................................................................................. 270 Odstranění seznamů testů ................................................................................................................................................. 270 Export seznamů testů ........................................................................................................................................................ 270 SEZNAMY LUMINEX ........................................................................................................................................................... 272 VYTVOŘENÍ SEZNAMŮ LUMINEX ..................................................................................................................................................... 272 Vytvoření pracovních seznamů vzorků .............................................................................................................................. 272 Vytvoření návrhu destičky ................................................................................................................................................. 273 INFORMACE O PACIENTOVI ............................................................................................................................................... 276 IMPORT SEZNAMŮ PACIENTŮ/DÁRCŮ ............................................................................................................................... 277 SPRÁVA ZÁZNAMŮ PACIENTA/DÁRCE ............................................................................................................................... 278 PŘIDÁNÍ NOVÝCH ZÁZNAMŮ PACIENTŮ/DÁRCŮ ................................................................................................................................. 278



11

One Lambda, Inc.


Vyhledání záznamů pacienta/dárce .................................................................................................................................. 279 Úpravy záznamů pacientů/dárců ...................................................................................................................................... 279 Spojení ID pacienta/dárce s ID vzorku ............................................................................................................................... 280 Převedení přidružených výsledků pacienta/dárce do nového alelového kódu .................................................................. 280 Přidružení záznamů pacienta a dárce................................................................................................................................ 281 Přidružení dárce k výsledkům PRA dárce ........................................................................................................................... 281 Tisk záznamů pacientů/dárců ............................................................................................................................................ 282 Export záznamů pacientů/dárců........................................................................................................................................ 282 Archivace záznamů pacientů/dárců .................................................................................................................................. 282 Odstranění záznamů pacientů/dárců ................................................................................................................................ 283 Vytvoření seznamů pacientů/dárců ................................................................................................................................... 283 SLEDOVÁNÍ PROTILÁTEK PACIENTA ................................................................................................................................... 285 SPRÁVA PROFILU ............................................................................................................................................................... 289 SPRÁVA UŽIVATELE ............................................................................................................................................................ 290 Zobrazování seznamu uživatelů......................................................................................................................................... 291 Přidání nových uživatelů .................................................................................................................................................... 291 Úprava uživatelských profilů ............................................................................................................................................. 291 Změna hesla....................................................................................................................................................................... 292 Resetování hesel ................................................................................................................................................................ 292 Změna uživatelských oprávnění......................................................................................................................................... 292 Deaktivace uživatelů.......................................................................................................................................................... 293 PROFIL LABORATOŘE ......................................................................................................................................................... 294 Úpravy profilu laboratoře .................................................................................................................................................. 295 Správa laboratorních kódů ................................................................................................................................................ 295 OBSLUŽNÉ PROGRAMY ...................................................................................................................................................... 296 SPRÁVA KATALOGOVÝCH REFERENČNÍCH SOUBORŮ ............................................................................................................................ 297 Aktualizace katalogových souborů z místní nebo síťové jednotky..................................................................................... 297 AKTUALIZACE KATALOGOVÝCH SOUBORŮ ZE STRÁNEK SPOLEČNOSTI ONE LAMBDA PRO STAHOVÁNÍ............................................................. 299 AKTUALIZACE REFERENČNÍCH SOUBORŮ MOLEKULÁRNÍ TYPIZACE ................................................................................... 301 Aktualizace kódů NMDP z místní nebo síťové jednotky ..................................................................................................... 301 Aktualizace souborů NMDP z webových stránek NMDP ................................................................................................... 302 Vytvoření souboru místního kódu ...................................................................................................................................... 302 Aktualizace souboru místního kódu ................................................................................................................................... 303 Aktualizace souboru ekvivalentu pro sérologii z webových stránek společnosti One Lambda .......................................... 303 SPRÁVA KATALOGU A INFORMACE .................................................................................................................................................. 304 Archivace katalogů ............................................................................................................................................................ 304 Zrušení archivace souborů ................................................................................................................................................. 306 Zobrazení informací o katalogovém souboru .................................................................................................................... 306 Odstranění informací o katalogovém souboru .................................................................................................................. 306 Vykazování informací o katalogovém souboru.................................................................................................................. 307



12

One Lambda, Inc.


Přidružení katalogových souborů produktu a šablon Luminex .......................................................................................... 307 Import souborů alelových frekvencí (demografická frekvence) ......................................................................................... 308 AKTUALIZACE SOUBORŮ ALELOVÝCH FREKVENCÍ (DEMOGRAFICKÁ FREKVENCE) ........................................................................................ 309 SPRÁVA INFORMACÍ O SEZNAMU CREG .......................................................................................................................................... 311 ZMĚNA KONFIGURAČNÍHO NASTAVENÍ PRODUKTU .......................................................................................................... 312 ZMĚNA KONFIGURACE MOLEKULÁRNÍHO PRODUKTU .......................................................................................................................... 312 Vytvoření kombinovaného katalogu relace LABScreen ..................................................................................................... 314 Změna výchozího negativního séra LABScreen .................................................................................................................. 315 Změna konfigurace smíšených produktů LABScreen ......................................................................................................... 315 Změna konfigurace analýzy screeningu protilátek ............................................................................................................ 316 Import souborů NS ............................................................................................................................................................. 317 VÝBĚR VŠEOBECNÝCH NASTAVENÍ ..................................................................................................................................... 318 Výchozí nastavení tiskárny ................................................................................................................................................ 318 NASTAVENÍ VÝCHOZÍCH ADRES URL A ADRESÁŘOVÝCH CEST APLIKACE HLA FUSION ................................................................................. 319 AKTIVACE PRODUKTŮ................................................................................................................................................................... 320 . ................................................................................................................................................. 320 KLEPNĚTE NA POLOŽKU OK OVĚŘENÍ SOFTWARU ......................................................................................................................................................... 321 IQ (ZPŮSOBILOST INSTALACE) ....................................................................................................................................................... 321



13


One Lambda, Inc.

Úvod ™

Co je software HLA Fusion ? HLA Fusion je doprovodný software v produktech společnosti One Lambda pro molekulární typizaci a screening protilátek. Tento software pracuje jak samostatně (na jednom počítači) tak v síťovém prostředí. Funkce softwaru umožňují následující činnosti: 

Import nezpracovaných dat z průtokového analyzátoru LABScan 100



Ruční zadávání reakčních schémat pro produkty Micro SSP, FlowPRA, LAT a LCT



Načítání výsledků ELISA pro produkty LAT



Analýza nezpracovaných dat a prohlížení výsledků v grafické podobě



Nastavení mezních hodnot pro vyčištění výsledků



Snadná aktualizace produktových informací (tj. informace o novém produktu a šaržích)



Vyhledávání konkrétních dat a vytváření standardních nebo vlastních zpráv

Poznámka:

Před importem katalogů nebo analyzováním relací/vzorků zkontrolujte, že jste si stáhli soubor nomenklatury z ledna 2011 nebo novější a soubor sérologických ekvivalentů. Ověřte také, že vaše kolace SQL Serveru se shoduje s kolací všech klientských instancí, (kolace kóduje pravidla řídící správné používání znaků určitého jazyka nebo abecedy). Nejste-li si jisti, ověřte tyto skutečnosti u správce systému/databáze.



14

One Lambda, Inc.


Produktová dokumentace a aktualizační soubory Online nápověda pro HLA Fusion obsahuje nejaktuálnější informace a postupy softwaru HLA Fusion. Je dostupná v softwarové aplikaci Fusion po stisknutí klávesy F1 nebo volbou položky Nápověda: Nápověda pro HLA Fusion. Tento dokument (Uživatelská příručka k softwaru HLA Fusion) je udržována v co nejaktuálnějším stavu, bývá však nutné ji poskytnout ještě před vydáním softwaru k vyhotovení překladů. Obecně se informace o aktualizaci produktu, jako například nové funkce a řešení problémů, nacházejí v souboru Poznámky k verzi softwaru HLA Fusion. Pokud je verze softwaru starší a poznámky k verzi nejsou aktualizované, je k dispozici soubor README se seznamem změn v softwaru a příslušnými informacemi, které nejsou obsaženy v uživatelské příručce. Kromě toho můžete vždy získat nejaktuálnější informace o aktualizacích produktu v nabídce Nápověda > Poznámky k aktualizaci produktu softwarové aplikace HLA Fusion, anebo je můžete stáhnout z webové stránky OLI.



15


One Lambda, Inc.

Aktualizace programu

Poznámka:

V zájmu dosažení optimálních výsledků ověřte, že používáte nejnovější verzi softwaru HLA Fusion™.

Software HLA Fusion automaticky detekuje dostupnou aktualizaci/opravnou verzi softwaru a informuje uživatele o jejich dostupnosti. Aktualizace softwaru HLA Fusion můžete vždy obdržet na vyžádání. Pro získání kopie softwaru se můžete obrátit na svého zástupce společnosti One Lambda, Inc. nebo si níže v textu oddílu Technická podpora vyhledejte další kontaktní informace. Aktualizace produktových informací (katalogové soubory a jiné) pro software HLA Fusion obdržíte od svého zástupce společnosti One Lambda Inc. nebo z webové stránky One Lambda: http://download.onelambda.com



16

One Lambda, Inc.


Omezení programu Všechny softwarové produkty společnosti One Lambda jsou navrženy jako pomůcky pro pracovníky se zkušenostmi v oblasti HLA analýzy a slouží pro navrhování výsledků typizace a screeningu protilátek. Výsledky však musí pro zajištění správnosti pečlivě zrevidovat osoba vyškolená v typizaci HLA nebo screeningu protilátek. Tento software lze použít jako pomůcku pro návrh výsledků, neměl by se však používat jako jediná metoda pro určení vykazatelných výsledků. Tento software slouží jako laboratorní pomůcka, nikoli jako zdroj konečných výsledků. Chce-li uživatel zachovat spolehlivost informací o pacientech uložených v databázi, musí zajistit, aby identifikátor pro každého pacienta byl jedinečný a aby také každý identifikátor vzorku byl jedinečný. Úložná kapacita softwaru HLA Fusion je omezena vaší verzí Microsoft SQL Serveru. Další informace o úložné kapacitě různých verzí SQL Serveru naleznete v Průvodci pro uživatele databázové aplikace Fusion Database Utility nebo na webové stránce společnosti Microsoft (www.microsoft.com). Software HLA Fusion předpokládá, že data pro každý požadovaný vstup jsou ve standardním formátu a tento formát nebyl modifikován. Soubory nezpracovaných dat musejí být v souborovém formátu CSV (hodnoty oddělené čárkami) a musejí splňovat tato pravidla: 

Datový soubor je soubor CSV vygenerovaný analyzátorem LABScan100 pomocí softwarové verze 1.7, 2.2, 2.3 nebo xPONENT 3.1.



Všechny produkty HD musí být získány v softwarové verzi 2.2, 2.3 nebo xPONENT 3.1.



Název datového souboru,(zvaný také ID relace) může mít délku 40 znaků nebo méně včetně souborové přípony .csv.



Data se generují na základě původních, nemodifikovaných šablon dodaných společností One Lambda, Inc.



Uživatel je odpovědný za závěrečné přiřazení a musí zrevidovat všechny navržené výsledky.



17

One Lambda, Inc.


Technická podpora Požadujete-li technickou podporu nebo chcete-li nahlásit problém se softwarem, obraťte se na svého zástupce pro produkty One Lambda. Ve Spojených státech můžete volat na číslo 800-822-8824 nebo v oblasti Los Angeles na číslo 818-702-0042. Můžete nás kontaktovat e-mailem na adrese: [email protected] Systémové požadavky zjistíte v Průvodci instalací softwaru HLA Fusion.



18

One Lambda, Inc.


Rozsah této příručky Tato příručka poskytuje informace o importu nezpracovaných dat, provádění změn mezních hodnot a jiných konfiguračních údajů, o úpravách ovládacích prvků, pokud to vyžaduje analýza, a dále o sledování výsledků analýzy a sestavování zpráv. Je důležité si uvědomit, že data QC (řízení kvality) používaná s tímto programem i výchozí hodnoty nastavené v tomto programu vycházejí ze zkušeností společnosti One Lambda s tímto produktem v přísně sledovaném výzkumném a vývojovém prostředí. Pro laboratoř, která provádí HLA typizaci nebo screening protilátek v jiném prostředí, bude pravděpodobně nutné znovu nastavit mezní hodnoty tak, aby odpovídaly zvláštním požadavkům laboratoře. Prostřednictvím hlavní nabídky softwaru HLA Fusion lze přistupovat ke třem hlavním komponentám programu: 

Analýza dat



Správa záznamů



Správa vzorků

Kromě toho jsou dostupné i následující funkce: 

Údaje pacienta



Pomocné nástroje



Nápověda



Konec

Tato příručka vám pomůže při prvních krocích se softwarem HLA Fusion od společnosti One Lambda. Obsahuje přehled systému a seznámí vás s postupem analýzy dat. Pokyny pro instalaci naleznete v Průvodci instalací softwaru HLA Fusion.



19

One Lambda, Inc.


Navigace Tento oddíl popisuje různé způsoby přístupu k nabídkám a funkcím softwaru HLA Fusion i způsob použití nástroje Navigátor pro přístup k relacím a vzorkům a jejich procházení.



20


One Lambda, Inc.

Přihlášení do programu Fusion 1. Poklepejte na ikonu HLA Fusion na pracovní ploše počítače. Program můžete také otevřít z nabídky Windows: Start > Programy > One Lambda > HLA Fusion.

Zobrazí se dialogové okno Zabezpečené přihlášení. Obrazovka zabezpečeného přihlášení do programu Fusion

Verze použitého SQL Serveru

Databáze, kterou program Fusion používá

Kolace databáze

Zadejte Uživatelské jméno a Heslo do systému HLA Fusion. Po klepnutí na tlačítko Přihlásit Poznámka:

se otevře program.

Pole Databáze zobrazuje databázi, ke které jste aktuálně připojeni.



21

One Lambda, Inc.


Zjištění zapomenutého uživatelského jména a hesla 

Jestliže zapomenete své uživatelské jméno pro systém HLA Fusion, klepněte na odkaz Zapomněl/a jsem uživatelské jméno, zadejte své křestní jméno a příjmení a vyberte svou roli v laboratoři (dozorující nebo technik). Systém zobrazí uživatelské jméno odpovídající zadaným údajům.



Jestliže zapomenete své heslo pro systém HLA Fusion, klepněte na odkaz Zapomněl/a jsem heslo a odpovězte na dvě bezpečnostní otázky, které byly položeny při vytváření uživatelského profilu.



Zodpovíte-li otázky správně, zobrazí se heslo.



22


One Lambda, Inc.

Klíčová systémová nastavení Rozlišení obrazovky Software HLA Fusion vyžaduje rozlišení obrazovky 1280 x 768. Je-li vaše aktuální rozlišení menší než předpokládané nastavení, software zobrazí zprávu. Poznámka:

Zobrazování zprávy můžete zrušit odkazem Upravit v oddíle Obecná konfigurace na domovské stránce.

Minimální rozlišení obrazovky

Zvolte Ano, pokud si přejete, aby systém provedl úpravu. Aplikace se bude nadále spouštět, i kdyby se rozlišení nepodařilo upravit. Anebo zvolte Ne a proveďte úpravu ručně. Dále pokud váš počítač používá operační systém Microsoft® Windows 7®, je nutné nastavit zobrazování textu na hodnotu Menší – 100 % (výchozí). Chcete-li upravit velikost zobrazení textu na obrazovce, postupujte takto: 1. Klepněte pravým tlačítkem myši na pracovní ploše počítače. Vyberte volbu Rozlišení obrazovky. Zobrazí se okno Rozlišení obrazovky. Okno Rozlišení obrazovky systému Windows 7



23


One Lambda, Inc.

Vyberte volbu Zobrazovat text a jiné položky větší nebo menší, (viz výše). 2. Vyberte Menší velikost textu. Windows – volba Menší

Povolení pro soubory Všichni uživatelé softwaru HLA Fusion musejí mít oprávnění pro čtení a zápis do následujících adresářů a souborů: 

OneLambda.Fusion.Interface.exe.config



ReportMap.xml



C:\OLI Fusion\(a všechny podadresáře a soubory v těchto podadresářích)



24

One Lambda, Inc.


Uživatelské rozhraní Domovské stránky Fusion Otevře okno Správa katalogu

Otevře okno Aktualizace referenčního souboru

Otevře okno Výběr produktu analýzy Upozornění, že jsou k dispozici nové nebo aktualizované katalogy Pro zjištění aktualizací softwaru Fusion Otevře okno nastavení tiskárny

Otevře obrazovku Seznam uživatelů

Otevře okno Nastavení Fusion pro obecná nastavení, (kontrolní sledování, povolení automatického stahování, typ pacienta a jiné) nastavení tiskárny, URL a cesty k adresářům

Otevře okno Vyhledávací kritéria Navigátoru Fusion Explorer – klepnutím na libovolné tlačítko se otevře příslušný produkt

Zeleně, je-li zapnuté automatické protokolování, červeně, je-li vypnuté

Stavový řádek

Tato volba uživatelského rozhraní zpřístupňuje domovské stránky jednotlivých produktů, okna importu dat a prohlížení analýzy. Umožňuje také prohlížení nebo přístup k údajům o systému a o produktu, ke staženým referenčním souborům a konfiguračním nastavením. Poznámka:

Pokud aktuální stránka po úpravě nebo stahování nezobrazí aktualizované informace, přejděte na hlavní domovskou stránku a poté se vraťte na domovskou stránku produktu, kde by se měly zobrazit změny.

Toto rozhraní se vám zobrazí při prvním přihlášení do programu HLA Fusion.



25


One Lambda, Inc.

Chcete-li zobrazit domovskou stránku jednoho z produktů v levé dolní oblasti stránky, klepněte na tlačítko nebo na volbu nabídky. Pro LABScreen: 

Na hlavní domovské stránce Fusion klepněte na tlačítko LABScreen nebo klepněte na tlačítko LABScreen na panelu nástrojů HLA Fusion v horní části obrazovky. NEBO



Vyberte položku Analýza dat > LABScreen v panelu nabídek programu Fusion.

Můžete si všimnout, jak se změní obrazovka, aby se na ní vešel vybraný produkt One Lambda? Poznámka:

Migrované a aktualizované databáze používají stejné rozhraní.

Chcete-li některou z domovských stránek produktů změnit na výchozí domovskou stránku, aby se tato konkrétní domovská stránka zobrazovala při každém přihlášení do programu HLA Fusion, proveďte tyto kroky: 1. Vraťte se na hlavní domovskou stránku programu Fusion klepnutím na tlačítko Domovská stránka nebo na levou část obrazovky nebo

na tlačítko Domovská stránka vlevo nahoře na obrazovce v panelu nástrojů Fusion.

2. Na domovské stránce klepněte na položku [Upravit] na pravé straně oddílu Obecná konfigurace. NEBO Klepněte na slovo Pomocné nástroje v panelu úloh Fusion. Na kartě Obecná nastavení klepněte na šipku rozbalovací nabídky a výběrem položky z rozbalovacího seznamu v poli Výchozí domovská stránka zvolte výchozí domovskou stránku.

3. Klepněte na položku Uložit a potom na Zavřít.



26


One Lambda, Inc.

Spuštění Navigátoru Jestliže se karta Navigátor ještě nezobrazuje vpravo v okně aplikace, klepněte na tlačítko Zobrazit Navigátor na panelu nástrojů, aby se aktivovala funkce Navigátor Nebo

Najeďte kurzorem na kartu Navigátor na pravém okraji okna aplikace, aby se Navigátor posunul a zobrazil. Navigační strom softwaru Fusion

Navigační strom Pomocí stromu Navigátor můžete snadno procházet analytické produkty, relace, vzorky a data testování.

Poznámka:

Poklepáním na relaci nebo klepnutím na znaménko + na levé straně modulu Katalog, Datum nebo Produkt zobrazíte seznam relací.

Produkty HLA Fusion

Relace v Navigát oru

Klepnutím na název vzorku se vzorek zobrazí v okně analýzy.



27


One Lambda, Inc.

Seskupení výsledků Relace a vzorky zobrazené pomocí nástroje Navigátor lze seřadit podle různých kritérií: 

Typ produktu



Datum relace



Katalog



Datum testu

Výchozí je seskupení podle Produktu. Podrobné údaje o různých volbách zobrazení naleznete v dalších několika oddílech.

Seskupit podle produktu Revidované/nerevidované relace

Nerevidované relace jsou MODRÉ. Revidované relace jsou ČERNÉ.

Navigátor zobrazuje importované relace pro každý typ produktu podle rozmezí dat a dalších kritérií nastavených ve volbě Najít. Jestliže se již nacházíte v analytickém režimu pro určitý produkt, zobrazí se pouze relace, které vyhovují rozmezí dat pro tento produkt. Klepnutím na znaménko + vedle typu produktu, který požadujete, se zobrazí jeho relace. 



Relace zobrazené modře jsou relace, které ještě nebyly zrevidovány. Jakmile zrevidujete relaci, změní se její barva v seznamu Navigátor na černou.

Klepnutím na název relace zobrazíte vzorky v rámci této relace. V případě produktu LABType a LABScreen systém také provede skupinovou analýzu Vzorek, který neprošel skupinovou analýzou a zobrazí výsledky v Přehledu relace. Pokud je vzorek z relace uveden červeně, znamená to, že vzorek neprošel skupinovou analýzou.



Klepnutím na název vzorku zobrazíte vzorek v okně analýzy.



28


One Lambda, Inc.

Seskupit podle katalogu

Seskupit podle katalogu Při výběru volby seskupení Katalog v Navigátoru se relace zobrazí abecedně seřazené podle názvu katalogu.

Seskupit podle data testu

Při výběru volby seskupení Datum testu se relace zobrazí chronologicky seřazené podle svého data testu. Jinak se nástroj používá stejně, jak bylo popsáno v části Seskupit podle produktu.

Seskupit podle data relace

Při výběru volby seskupení Datum relace se relace zobrazí seřazené podle svého data vytvoření.

Jinak se nástroj používá stejně, jak bylo popsáno v části Seskupit podle produktu.



29


One Lambda, Inc.

Přístup k funkcím softwaru HLA Fusion™ Volby hlavní nabídky

Volby v panelu nabídek Fusion

Funkce softwaru HLA Fusion jsou kdykoli přístupné v Hlavní nabídce panelu nástrojů, která se zobrazuje v horní části všech aplikačních oken HLA Fusion. V následujících oddílech je uveden seznam voleb dostupných v každé položce hlavní nabídky.

Analýza dat Každá volba v této položce nabídky je buď molekulární nebo protilátkový produkt, pro který můžete importovat soubory CSV nebo ručně zadat reakce a analyzovat data. Podrobné údaje naleznete v oddílech jednotlivých produktů v této uživatelské příručce. Panel nabídek: Analýza dat

Zprávy

Při výběru této položky nabídky se zobrazí strana Zprávy, kde můžete vytvářet zprávy pro data analýzy.

Data Při výběru této položky nabídky se zobrazí okno Data, kde můžete spravovat (tj. mazat, archivovat nebo přesouvat) relace a vzorky, mapovat alely relace do nové nomenklatury NMDP a prohlížet/tisknout protokolovací soubory dat relace.

Vzorek Volby v této položce nabídky se týkají importu, vytváření, správy a exportu informací o vzorcích. Tato nabídka se také používá pro správu seznamů testů Luminex a pro vytváření pracovních seznamů vzorků a návrhů destiček. Panel nabídek: Vzorek



30


One Lambda, Inc.

Informace o pacientovi Volby v této položce nabídky se týkají importu seznamů pacientů/dárců, správy informací o jednotlivém pacientovi/dárci a sledování dat o protilátkách pacienta. Panel nabídek: Informace o pacientovi

Profil

Panel nabídek: Profil

Volby v této položce nabídky slouží pro vytváření a správu vlastního uživatelského profilu, seznamů systémových uživatelů a oprávnění a informací o laboratoři. K dispozici je také volba pro přepínání mezi volbami domovské stránky v závislosti na vašich systémových a navigačních předvolbách.

Pomocné nástroje Volby v této položce nabídky se týkají importu katalogových, kódových a sérologických souborů, konfigurace molekulárních a protilátkových produktů, které analyzujete, nastavení systém HLA Fusion a validace systému.

Nápověda Panel nabídek: Pomocné nástroje

Tato položka nabídky umožňuje přistupovat k následujícím informacím softwaru HLA Fusion:

Panel nabídek: Nápověda



Online nápověda, která slouží jako vodítko pro používání softwaru HLA Fusion.



Odkazy na výuková a ukázková videa.



Oznámení o aktualizacích a popis nových funkcí v nejnovější verzi softwaru HLA Fusion.



31


One Lambda, Inc.



Dynamicky aktualizované Často kladené dotazy (FAQ) o softwaru HLA Fusion.



Číslo sestavení a verze softwarové aplikace HLA Fusion, kterou právě používáte.

Poznámka:

Online nápověda je přístupná odkudkoli v aplikaci HLA Fusion stisknutím klávesy na klávesnici. Stává se, že mezi vydáním verzí softwaru HLA Fusion dojde k aktualizaci online nápovědy. Aby bylo zajištěno, že máte nejaktuálnější soubor nápovědy, sledujte webovou stránku OLI pro stahování: download.onelambda.com/pub/tray_info/Windows/HLA_Fusion_Catalogs/ Document/

Konec Při výběru této položky nabídky se zobrazí dialogové okno, kde můžete volbou Ano ukončit a zavřít aplikaci HLA Fusion nebo volbou Ne můžete ponechat otevřenou aktuální relaci. Potvrzovací zpráva při ukončení

Tlačítka panelu nástrojů Software HLA Fusion nabízí panel nástrojů, který se zobrazuje pod panelem voleb hlavní nabídky a obsahuje běžně používané funkce. Tlačítka panelu nástrojů Fusion



Když najedete myší na tlačítka, zobrazí se vyskakovací popisek s názvem každého tlačítka.



Některá tlačítka jsou dostupná pouze na obrazovce Analýza. Následující tabulka popisuje jednotlivá tlačítka panelu nástrojů:



32


One Lambda, Inc.

Tlačítko

Ostatní tlačítka a ovládací prvky

Název

Název

Domů Analýza dat produktu Najít Nástroje navigace ve vzorcích (Zobrazuje se Tisk zprávy

pouze při analýze vzorku). Odkazem

<
Náhled zprávy Tisk obrazovky

Zobrazí datum aktuálního vzorku v okně analýzy.

Zvětšit Zobrazit Navigátor

Pacient

Najít Klepnutím na tlačítko Najít otevřete okno Vyhledat aplikace HLA Fusion, kde můžete vyhledávat záznamy pomocí různých kritérií. Můžete zvolit vyhledávání podle ID pacienta, ID vzorku, ID relace, ID katalogu, (a specificity) nebo Jiné.

Související záznamy

Jiné znamená, že zadáte několik vyhledávacích kritérií včetně: rozmezí data, stav relace a typ katalogu.

Analýza vedle sebe

Dialogové okno Najít také umožňuje upravit kritéria řazení a zobrazení relací v Navigátoru.



33


One Lambda, Inc.

Vyhledávací obrazovka aplikace Fusion

Nastavte pořadí, ve kterém se výsledky vašeho vyhledávání budou zobrazovat.

Můžete tato vyhledávací kritéria zvolit pro základní vyhledávání. Volbou Jiné povolíte zobrazení Seřadit a Pole. Můžete vyhledávat podle rozmezí dat, stavu relace nebo typu katalogu.

Vyberte informace, které chcete zobrazovat.

Po výběru vyhledávacích kritérií klepnutím na tlačítko Najít spusťte vyhledávání.

Poznámka:

Zde nastavené rozmezí dat (v poli Datum relace) se použije jako výchozí rozmezí dat v celé aplikaci HLA Fusion, například v okně Navigátor a Zprávy. Kdykoli provedete změnu a klepnete na tlačítko Najít, změní se výchozí nastavení pro ostatní části aplikace.

Tisk zprávy Na obrazovce Analýza můžete klepnutím na tlačítko Tisk zobrazit seznam zpráv, které lze vytisknout (zobrazené zprávy patří k právě analyzovanému produktu, proto se vám může zobrazit jiný obsah než v tomto příkladu). V případě, že jste nastavili výchozí tiskárnu (konfiguruje se pomocí Pomocné nástroje > Nastavení tiskárny), odešle se vybraná zpráva do specifikované tiskárny. Jinak se zobrazí dialogové okno, ve kterém lze vybrat tiskárnu. Příklad voleb pro tisk zprávy



34


One Lambda, Inc.

Náhled zprávy Na libovolné obrazovce Analýza můžete klepnutím na zobrazit seznam zpráv a tyto tlačítko Náhled zprávy zprávy před tiskem zkontrolovat. Zobrazené zprávy patří k právě analyzovanému produktu. Zprávy se zobrazí v okně a Export v okně náhledu. Pomocí tlačítek Tisk náhledu můžete vytvořit výstup zprávy ve vybraném formátu. Klepnutím na tlačítko Zavřít v pravém horním rohu obrazovky můžete zavřít okno náhledu.

Příklad voleb pro náhled zprávy

Tisk obrazovky Na libovolné obrazovce Analýza můžete klepnutím na tlačítko Tisk obrazovky okno se zachycením obrazovky aktuálního okna analýzy. Klepnutím na tlačítko Tisk roh) odešlete zachycenou obrazovku přímo do tiskárny. Chcete-li toto okno zavřít, klepněte na tlačítko Konec

nebo na tlačítko Zavřít

otevřít nové (levý horní

.

Příklad výsledků tisku obrazovky



35

One Lambda, Inc.


Zvětšit V libovolném okně Analýza můžete klepnutím na tlačítko Zvětšit aktivovat lupu a zvětšit libovolnou část okna. Lupa se přemísťuje myší a výška a šířka zvětšované oblasti se zvětšuje nebo zmenšuje šipkovými klávesami na počítačové klávesnici. Klepnutím kdekoli na obrazovce deaktivujete lupu.

Zvětšit oblast

Zobrazit Navigátor Pokud není Navigátor aplikace Fusion zobrazen (normálně se zobrazuje na pravém straně okna aplikace), klepněte na tlačítko Zobrazit Navigátor na panelu nástrojů. Jakmile se karta Navigátor zobrazí, můžete pohybem kurzoru nad kartou posunovat panel Navigátor jako otevřený.

Navigátor Fusion



36


One Lambda, Inc.

Informace o pacientovi/dárci Na libovolné obrazovce Analýza můžete klepnutím na tlačítko Pacient zobrazit obrazovku Informace o pacientovi/dárci, kde můžete zadávat nebo upravovat informace týkající se pacienta nebo dárce a přiřadit je k aktuálnímu vzorku.

Obrazovka informací o pacientovi/dárci

Obrazovku Informace o pacientovi/dárci můžete také kdykoli otevřít klepnutím na položku Informace o pacientovi v panelu nabídek Fusion, a následně na položku Správa pacienta.



37


One Lambda, Inc.

Související záznamy Související záznam je vzorek, který je nějakým způsobem sdružen s aktuálním vzorkem nebo pacientem. Na libovolné obrazovce Analýza můžete klepnutím na tlačítko Související záznamy načíst všechny záznamy týkající se aktuálního vzorku do rozbalovacího seznamu v poli ID vzorku. Pomocí šipek navigace ve vzorcích můžete jednu po druhé zobrazit analýzu každého souvisejícího záznamu. Chcete-li ukončit režim Související záznamy a vrátit se na předchozí obrazovku analýzy, klepněte na nalevo od pole ID vzorku v horní části obrazovky. odkaz <
Tato funkce je také přístupná klepnutím pravým tlačítkem myši na vzorek v Navigátoru Fusion. Další informace o používání této funkce si prostudujte v příslušných oddílech této příručky.

Analýza vedle sebe Na obrazovce Analýza můžete klepnutím na tlačítko Analýza vedle sebe na panelu nástrojů Fusion porovnat aktuální analýzu vzorku (s šedým pozadím) s předchozími relacemi analýzy pro totéž ID vzorku.

Spuštění analýzy vedle sebe



Ze zobrazeného seznamu vyberte předchozí analýzu vzorku, která se porovná s aktuální. Obě okna analýzy se následně společně zobrazí pro srovnání.



Lze změnit rozměry každého okna a přesunovat okno tažením myší. Opětovným klepnutím na zrušíte srovnávací zobrazení. tlačítko Analýza vedle sebe



38


One Lambda, Inc.

Aktuální analýza

Předchozí analýza

Zobrazení analýzy vedle sebe

Poznámka:

Tato funkce je také přístupná klepnutím pravým tlačítkem myši na vzorek v Navigátoru Fusion.

Analýza dat produktu Klepnutím na jednotlivá tlačítka Analýza dat produktu na panelu nástrojů Fusion můžete zobrazit domovskou stránku produktu, importovat soubor relace, ručně zadat relaci nebo zobrazit a vybrat v seznamu Navigátoru předchozí importované relace pro Průzkumník Fusion produkt. 

Můžete také klepnout na libovolný produkt Fusion umístěný v Průzkumníku Fusion vlevo dole na obrazovce a otevřít domovskou stránku produktu.

Navigace ve vzorcích Nástroje Navigace ve vzorcích (přístupné z obrazovky Analýza) slouží pro přístup ke všem vzorkům v aktuální relaci. Jiný vzorek ve stejné relaci lze vybrat buď výběrem v rozbalovacím seznamu v poli ID vzorku anebo klepnutím na tlačítka šipek dopředu/dozadu vedle rozbalovacího seznamu.

Navigátor ve vzorcích



39


One Lambda, Inc.

Klepnutím na položku <


Výběrem vzorku v tomto seznamu v poli ID vzorku se vzorek stane aktivním v okně analýzy. Alternativně můžete použít tlačítka šipek dopředu nebo dozadu a volit jiné vzorky.



Klepnutím na toto na poslední vzorek.



Klepnutím na položku <
tlačítko přejdete na první vzorek. Klepnutím na toto

tlačítko přejdete

Datum vzorku

Datum vzorku Pro právě analyzovaný vzorek se v poli Datum vzorku zobrazí datum, kdy byl vzorek získán. Datum vzorku lze nastavit a automaticky vyplnit z tabulky Import vzorků.



40

One Lambda, Inc.


Analýza LABType Analytický modul HLA Fusion™ LABType® analyzuje výstupní soubory CSV Luminex pro produkty modulu LABType, včetně výstupních souborů HD. Výsledky analýzy jsou založeny na specifikacích katalogu, NMDP nebo Lokálních kódech a referenčních souborech sérologických ekvivalentů. Vše lze stáhnout a používat se softwarem Fusion. Před začátkem analytické relace doplňte nebo ověřte několik věcí: 

Před analýzou zkontrolujte, že máte nejnovější katalogové soubory i kód NMDP, lokální kód (pokud se používá) nebo referenční soubory sérologických ekvivalentů. Stávající katalogy lze načíst nebo aktualizovat z domovské stránky modulu LABType.



Před spuštěním analýzy zobrazte a upravte globální nastavení konfigurace produktu. Globální nastavení se zobrazí a lze jej modifikovat na domovské stránce modulu LABType nebo prostřednictvím nabídky Pomocné nástroje. Globální nastavení se použije ve všech nově importovaných relacích.



Import souborů CSV můžete zkrátit, pokud ověříte, že výchozí adresy URL a cesty k adresářům nebo složkám ukazují na umístění, kde jsou tyto soubory ve vašem systému nebo v síti obvykle uložené. Tato nastavení lze také upravit v oddíle Obecná konfigurace domovské stránky Průzkumníka Fusion.



Software HLA Fusion můžete nastavit tak, aby zůstal u právě uloženého nebo potvrzeného vzorku a nepřesouval se automaticky na další vzorek. Toto nastavení můžete provést v oddíle Obecná konfigurace domovské stránky Průzkumníka Fusion.

Poznámka:

Některé z výše uvedených úloh vyžadují oprávnění dohlížejícího uživatele. Provedení těchto úloh můžete rovněž u dohlížejícího pracovníka ověřit.



41


One Lambda, Inc.

Přehled modulu LABType Proces analýzy

Po importu relace (relací) ověřte v přehledové tabulce výskyt nízké pozitivní kontroly a nízkého počtu perliček. Zvažte odstranění těchto vzorků.

Zkontrolujte levý dolní graf obrazovky Analýza na výskyt blízkých reakcí –těsně nad nebo pod mezními body. Zkontrolujte také karty Kontrola a Analýza perličky.

Kartu Vynutit můžete použít při kontrole výsledků homozygotních a vzácných alel (pravý dolní kvadrant). Prohlédněte tabulku reakcí a zkontrolujte reaktivní schémata alel (levý horní kvadrant). Prohlédněte pole Blízké reakce pro další finalizaci přiřazení (pravý dolní kvadrant).

Proveďte nezbytné úpravy mezí (pravý horní nebo levý dolní kvadrant).

Vytvořte závěrečná přiřazení alelových párů, sérologie anebo kódovaná přiřazení (pravý dolní kvadrant).



42


One Lambda, Inc.

Spuštění analýzy LABType Import dat relace LABType (jiná než HD)



Klepněte na tlačítko LABType

na panelu Průzkumníka

Fusion, na tlačítko LABType na panelu nástrojů Fusion nebo klepněte na Analyzovat data na panelu nástrojů a zvolte LABType.

Zobrazí se domovská stránka LABType. Je-li použitým kódem NMDP, je zde uvedena verze.

Klepnutím otevřete Správce katalogu.

Klepnutím stáhněte aktualizované referenční soubory. Pro zjištění dostupných aktualizací referenčních souborů. Klepnutím zde upravte na Globální nastavení modulu LABType.

Klepnutím na tyto odkazy zobrazte dokumenty Katalog, Pracovní list a Sonda/primer

Funkce Aktualizace referenčních souborů (pravý horní roh) nefunguje pro NMDP nebo soubory sérologických ekvivalentů.



43


One Lambda, Inc.

Pr o kombinování souborů CSV k analýze Pro zobrazení přehledu dříve importovaných souborů CSV Po klepnutí můžete procházet soubory CSV. Soubory CSV relací Luminex

Tlačítko panelu nástrojů LABType Id relace

Datum je zvýrazněno žžžllluuutttěěě, pokud se Sdružení typu neshodují regionální Umožňuje pacienta nastavení mezi doplňující s odpovídajícím souborem CSV Nomenklatura/ analýzu ID pacienta ID katalogu verze IMGT a aplikací Fusion. (tj. lokus B s Bw4)

Vzorek/ Pacient – podrobné údaje

Tlačítko domovské stránky LABType

Poklepáním na ID Nastaví ID pacienta stejné vzorku zobrazíte seznam vzorků jako ID vzorku LABType (ID vzorku lze upravit).

Poznámka:

Zobrazí přehled Volbou automatické hodnot analýzy můžete pozitivních analyzovat všechny kontrol (PC) pro vzorky relace při každý vzorek importu

Poklepáním na ID pacienta zobrazíte aktuální seznam pacientů.

Otevřete pracovní listy a listy sond/primerů a ověřte přesnost čísel revizí (tyto dokumenty neobsahují čísla revizí ve svém názvu souboru).

2. Klepněte na malou ikonu Složka CSV.

a vyberte relaci (relace) na obrazovce Vybrat soubory

Výběr/import souborů CSV



44

One Lambda, Inc.

Poznámka:


Software HLA Fusion převádí data souborů CSV z programu Luminex, například datum a čas, na místní regionální kód, je-li v souboru CSV specifikován regionální kód. (Regionální kód nelze specifikovat pro soubory CSV vytvořené softwarem Luminex verze 2.2 nebo starší.) Je-li první pole data žlutě zvýrazněné, znamená to, že aplikace Fusion

detekovala neshodu regionálních kódů. V tomto případě se doporučuje použít rozbalovací selektor v druhém poli data a vybrat odpovídající datum podle odlišností regionálního datumového formátu. 3. Vyberte soubor v seznamu souborů CSV pro import nebo klepněte na ikonu Složka nad seznamem a procházejte soubory CSV modulu LABType na svém systému/síti. Mají-li vzorky v relaci hodnotu pozitivní kontroly nižší než minimální nastavení, označí se příznakem, aby bylo možné je snadno vybrat a odstranit z relace. Poznámka:

Mohou se zobrazit soubory CSV pro produkty jiné než LABType nebo jiné soubory CSV. To znamená, že musíte buď nejprve klepnout na podsložku pro LABType, anebo že se vaše soubory relací LABType nenacházejí v adresáři, na který ukazuje aplikace HLA Fusion.

4. Software HLA Fusion automaticky přiřadí ID relace (název souboru CSV). Alternativně můžete pole ID relace upravit. ID může být alfanumerické (může obsahovat písmena a číslice) a bude umístěno v abecedním pořadí vedle ostatních souborů relace LABType ve vaší databázi.

Pole ID relace

Poznámka:

ID relace musí být v databázi Fusion unikátní. Pokud již ID relace existuje, software HLA Fusion vás vyzve k přejmenování relace. Rovněž se doporučuje nepoužívat v tomto poli speciální znaky, protože mohou sloužit zvláštnímu účelu jako separátory polí.

Postup kombinování souborů CSV pro příslušnou analýzu doplňkové sady: Toto políčko zaškrtněte…

5. Zaškrtněte pole Kombinovat CSV. 6. Potom vyberte zaškrtávací pole nalevo od dvou nebo více souborů relací, které chcete zkombinovat. Ověřte, že kombinujete soubory relací loků z příslušné doplňkové sady. Poté, co zkombinujete relace, zobrazí se nové karty v tabulce Podrobné údaje o vzorku/pacientovi napravo od karty Aktuální, která představuje zkombinované soubory CSV.


…a vyberte dva nebo více souborů relace.


45


One Lambda, Inc.

Přidané karty pro kombinované relace.

7. Ověřte, že pole ID katalogu obsahuje ID kombinované relace zobrazené napravo od něj. Kombinované katalogy

8. Klepněte na tlačítko Import

.

V poli ID relace se zobrazí kombinovaná relace se slovem Kombinovaná před názvem ID relace. ID kombinované relace

Poznámka:

Jestliže se na kartě Kombinované nezobrazují žádné, zvolili jste relace, které nelze zkombinovat. Nelze kombinovat relace křížových loků (například lokus A a lokus B).

9. Klepnutím na soubor CSV zobrazíte s ním sdružené vzorky v tabulce Podrobné údaje o vzorku/pacientovi.

Relace LABType – tabulka Podrobné údaje o vzorku/pacientovi

Poznámka:

Tlačítko Doplňkové lze použít pro přidání relací, které již byly analyzovány, k aktuální relaci za účelem kombinované analýzy (například relace B7 s relacemi loku B). Tento postup nefunguje pro kombinace relací křížových loků (například lokus A a lokus B).



46


One Lambda, Inc.

10. Je-li vzorek již sdružen s pacientem, zobrazí se ID pacienta a existující nebo související informace o pacientovi. Chcete-li přidat informace o pacientovi, proveďte některou z následujících akcí: 

Chcete-li přidat údaje o pacientovi, které jsou již uloženy v systému, poklepejte na sloupci ID pacienta tabulky Podrobné údaje o vzorku/pacientovi nebo



Klepněte na Informace o pacientovi v panelu nabídek Fusion a volbou Importovat seznam pacientů proveďte import souboru informací o pacientech.



Chcete-li údaje o pacientovi přidat ručně, zadejte údaje přímo do polí týkajících se pacienta v tabulce. ID vzorku můžete automaticky přiřadit k prázdným polím ID pacienta zaškrtnutím políčka Nastavit prázdné ID pacienta ke vzorku.

11. Vyberte soubor katalogu. Způsob výběru katalogového souboru se liší v závislosti na soubor CSV a katalogových souborech, které již byly dříve importovány pro modul LABType. Poznámka:



Jestliže chcete importovat více katalogů, klepněte na odkaz [Stahování] na domovské stránce LABtype. Rozbalovací seznam Katalog se někdy po stažení katalogů během relace aktuálního importu nemusí ihned aktualizovat. V takovém případě klepněte na tlačítko Domů a potom se opětovným klepnutím na tlačítko LABType vraťte do procesu importu. Pokud soubor CSV specifikuje název šablony, (platí pouze pro soubory CSV ze softwaru Luminex 2.2 a novějšího) a jeden z dostupných katalogových souborů je sdružen s šablonou, bude pro všechny nové relace s toutéž šablonou automaticky zvolen tento katalog. Seznam katalogů

Jak je zde znázorněno, můžete také vybrat soubor katalogu jiný, než který vybrala aplikace Fusion: v rozbalovacím seznamu v poli ID katalogu vyberte některý uvedený katalogový soubor. Pokud se nenalezne shoda šablon, systém následně uvažuje nejbližší shodu perliček mezi relací a všemi dostupnými katalogovými soubory. Pokud téměř vyhovuje pouze jeden katalogový soubor, vybere se automaticky a vy můžete zkontrolovat, zda se vyskytly příznakem označené vzorky s nízkou pozitivní kontrolou (PC) nebo nízkým počtem perliček.



47

One Lambda, Inc.


12. Pokud je více než jeden vyhovující soubor, zobrazí se dialogové okno validace katalogu s nejlepšími shodami perličky. Vybraný soubor katalogu můžete potvrdit prostým klepnutím na tlačítko Zavřít. Anebo můžete poklepat na název souboru katalogu v seznamu Nabízené katalogy. Validace katalogu

Klepnutím na tlačítko na obrazovce Podrobnosti Validace katalogu otevřete okno Nevyhovující perličky, kde jsou uvedeny perličky, které nebyly nalezeny v relaci anebo v katalogu.

Klepnutím na tlačítko OK můžete okno zavřít.

Po validaci katalogového souboru se aplikace Fusion zeptá, zda si přejete sdružit daný název šablony se specifikovaným katalogovým souborem. Jestliže klepnete na možnost Ano pro jejich sdružení, systém automaticky zvolí tento soubor katalogu u budoucích importů všech souborů CSV, které odkazují na tuto šablonu.

Přiřazení katalogu

Poznámka:

Jestliže se sdruží nesprávný katalog a šablona, prostudujte si pokyny pro zrušení sdružení v části Sdružení souborů produktových katalogů a šablon Luminex.

Zkontrolujte, zda některé vzorky nebyly označeny příznakem jako vzorky s nízkou pozitivní kontrolou (PC) nebo nízkým počtem perliček; řádky nízká PC nebo nízký počet perliček jsou zvýrazněny šedou barvou.



48


One Lambda, Inc.

Pravděpodobně budete chtít tyto vzorky odstranit, protože často zpomalují analýzu. Po jejich odstranění však již nebudete moci sledovat tyto vzorky. Chcete-li odstranit některé z těchto vzorků, proveďte následující kroky: 13. Klepněte na okraji vlevo od sloupce Poloha jamky, aby se zvýraznil celý řádek vzorku.

Klepnutím zvolte vzorek a stisknutím klávesy Delete na klávesnici jej odstraňte.

14. Stisknutím klávesy Delete importování v rámci relace.

na počítačové klávesnici se odstraní vzorek a zabrání se jeho

15. Po ověření informací o relaci a vzorku klepněte na tlačítko Import relace se zobrazí ve stromu Navigátoru modře na začátku seznamu.

. Nově importovaná

Pokud jste zaškrtli volbu Automatická analýza, provede se po klepnutí na příkaz Import importuje i analýza relace a relace se v Navigátoru Fusion zobrazí jako analyzovaná relace. Můžete importovat další soubory relací Luminex anebo můžete klepnutím na relaci v Navigátoru spustit skupinovou analýzu. Poznámka:

Po importu souboru CSV se soubor již nezobrazuje v seznamu Import relací Luminex, dokud nezaškrtnete volbu Zahrnout importované . Tento trik lze použít pro opakovaný import relace pod novým názvem anebo jako jiný uživatel.



49


One Lambda, Inc.

Získání data relace LABType (HD) Chcete-li zobrazit relace HD v seznamu Název souboru CSV: Výběr souborů relací HD

Relace HD

1. Klepněte na ikonu Složka . Otevře se obrazovka Vybrat soubory CSV. Relace HD bude pravděpodobně nutné otevírat z umístění jiného, než je výchozí cesta pro soubory LABType. Po klepnutí na ikonu Složka můžete procházet umístění, kde jsou uloženy soubory LABType HD ve vašem systému/síti. 2. Klepněte na tlačítko Otevřít

Poznámka:

.

Software HLA Fusion převádí data souborů CSV z programu Luminex, například datum a čas, na místní regionální kód, je-li v souboru CSV specifikován regionální kód. (Regionální kód nelze specifikovat pro soubory CSV vytvořené softwarem Luminex verze 2.2 nebo dřívější.) Je-li první pole data žlutě zvýrazněné, znamená to, že je detekována

neshoda regionálních kódů. V tomto případě se doporučuje použít rozbalovací selektor v druhém poli data a vybrat odpovídající datum podle odlišností regionálního datumového formátu.

3. Po výběru relace HD v seznamu Název souboru CSV se zobrazí s ní sdružené vzorky v tabulce Podrobnosti o aktuálním vzorku/pacientovi, viz níže.



50


One Lambda, Inc.

Vzorky HD v tabulace Podrobnosti o aktuálním vzorku/pacientovi

Upozornění:

Luminex 2.2/2.3: Zkontrolujte, že soubor CSV volíte ze stejného adresáře jako adresář, který obsahuje všechny běhové soubory a soubor běhového indexu (obecně skrytý soubor v adresáři), které byly získány jako výstup zařízení Luminex do složky relace. Každý vzorek v relaci musí odpovídat běhovému souboru v tomto adresáři. Je to zcela nezbytné, pokud ještě není převeden soubor HD CSV; software HLA Fusion automaticky převádí každý nepřevedený soubor HD během importu, jestliže se nepřevedený výstupní soubor nachází ve stejném umístění jako běhové soubory a soubor běhového indexu pro tuto relaci. xPONENT 3.1: Výstupní soubor se může nacházet kdekoli. Soubor běhového indexu se nepoužívá. Běhové soubory však musejí být společně v adresáři, který je strukturován s adresářem relace, a pod ním se musejí nacházet běhové soubory. Převedený HD výstupní soubor

Původní HD výstupní soubor (nepřevedený)

V relaci HD by měl být běhový soubor pro každý vzorek.

Soubor RunFileIndex je obvykle skrytý. Chcete-li jej zobrazit, zvolte možnost Zobrazit skryté soubory

Seznam relací HD (Luminex 2.2/2.3)



51

One Lambda, Inc.


Aplikace Fusion podle výchozího nastavení přiřazuje ID relace. Alternativně můžete ID relace změnit. Pokud soubor HD nebyl převeden, bude mít název Výstup až do okamžiku importu a od tohoto okamžiku bude mít název původní výstupní složky relací (bez ohledu na to, zda složku přejmenujete) rozšířený o znaky „_HD“. Poznámka:

ID relace musí být v databázi Fusion unikátní. Pokud již ID relace existuje, software vás vyzve k přejmenování relace. Rovněž se doporučuje nepoužívat v tomto poli speciální znaky, protože mohou sloužit zvláštnímu účelu jako separátory polí.

Poznámka:

Chcete-li zobrazit soubor RunFileIndex a používáte systém Windows XP, otevřete Průzkumníka Windows a klepněte na tlačítko Složky. Potom klepněte na položku Zobrazit na pruhu záhlaví systému Windows a v rozbalovací nabídce zvolte Možnosti složky. Nyní klepněte na kartu Zobrazit a posuňte se na položku Skryté soubory a složky. Zvolte možnost Zobrazit skryté soubory a složky a Konec. Při přihlížení vybraných souborů CSV změňte Soubory typu na Všechny soubory, aby se zobrazil soubor RunFileIndex. V systému Windows Vista a Windows 7 otevřete Průzkumníka Windows a zvolte Nástroje >> Možnosti složky. Poté klepněte na kartu Zobrazit a vyberte možnost Zobrazit skryté soubory, složky a jednotky. Jestliže přejmenujete relaci, nepojmenovávejte ji výstup, protože toto slovo je rezervováno pro původní výstupní soubor HD.

Poznámka:

Tlačítko Doplňkové lze použít pro přidání dalších relací do aktuální relace (například doplňkové relace loku B u B7) pro analýzu. Tento postup nefunguje pro kombinace jiných typů testu (například lokus A a lokus B).

Je-li vzorek již sdružen s pacientem, zobrazí se ID pacienta a existující související informace o pacientovi. 4. Chcete-li přidat informace o pacientovi, proveďte některou z následujících akcí: 

Chcete-li přidat stávající údaje ze systému, poklepejte na sloupec ID pacienta v tabulce Podrobné údaje o vzorku/pacientovi nebo klepněte na tlačítko Seznam pacientů na panelu nástrojů. Zobrazí se okno Importovat pacienta, kde můžete provést import souboru s informacemi o pacientovi.



Chcete-li údaje o pacientovi přidat ručně, zadejte údaje přímo do polí týkajících se pacienta v tabulce.



ID vzorku můžete přiřadit k prázdným polím ID pacienta zaškrtnutím políčka Nastavit prázdné ID pacienta ke vzorku.

5. Vyberte soubor katalogu. Výběr katalogů se může provádět jedním z následujících způsobů výběru v závislosti na souboru CSV a katalogových souborech, které jste importovaly pro modul LABType: Poznámka:

Pokud nejsou pro výběr k dispozici žádné katalogové soubory nebo není k dispozici požadovaný soubor, prostudujte si v části Pomocné nástroje této příručky pokyny o přidávání nových katalogových souborů do databáze.



52


One Lambda, Inc.



Pokud soubor CSV specifikuje název šablony, (platí pouze pro soubory CSV ze softwaru Luminex 2.2 a novějšího) a jeden z dostupných katalogových souborů je sdružen s touto šablonou, bude automaticky zvolen tento katalogový soubor. Chcete-li vybrat jiný soubor katalogu, můžete použít rozbalovací seznam v poli ID katalogu a vybrat některý z uvedených katalogových souborů.



Pokud se nenalezne shoda šablon, systém následně uvažuje nejbližší shodu perliček mezi relací a všemi dostupnými katalogovými soubory. Zobrazí se dialogové okno validace katalogu. Vybraný soubor katalogu můžete potvrdit prostým klepnutím na tlačítko Zavřít . Anebo poklepejte na název jiného katalogu v seznamu Nabízené katalogy.

Poznámka:

Katalogy uvedené ve validačním dialogovém okně pro relace HD mohou také obsahovat katalogy jiné než HD. HD katalog poznáte podle písmene H v názvu (například RSSOH2B1_003_05).

Seznam všech katalogových souborů se stejnou nebo lepší úrovní shod.

Písmeno H znamená katalog HD.

6. Po validaci katalogového souboru se systém zeptá, zda si přejete sdružit daný název šablony se specifikovaným katalogovým souborem. Jestliže je sdružíte, budou všechny nové relace se stejnou šablonou automaticky volit tento katalog. Sdružení katalogu a šablony



53


One Lambda, Inc.

Poznámka:

Jestliže se sdruží nesprávný katalog a šablona jako ve výše uvedeném příkladě, prostudujte si pokyny pro zrušení sdružení v části Sdružení souborů produktových katalogů a šablon Luminex.

Zkontrolujte, zda některé vzorky nebyly označeny příznakem jako vzorky s nízkou pozitivní kontrolou (PC) nebo nízkým počtem perliček; řádky nízká PC nebo nízký počet perliček jsou zvýrazněny šedou barvou. Pravděpodobně budete chtít tyto vzorky odstranit, protože často zpomalují analýzu. Po jejich odstranění však již nebudete moci sledovat tyto vzorky. Chcete-li odstranit některé z těchto vzorků, proveďte následující kroky: 7. Klepněte na šedém okraji vlevo od sloupce Poloha jamky, aby se zvýraznil celý řádek vzorku.

Zvýraznění řádku vzorku pro odstranění

8. Stisknutím klávesy Delete v rámci relace.

na klávesnici se odstraní vzorek a zabrání se jeho importování

9. Po ověření informací o relaci a vzorku klepněte na tlačítko Import

.

Relace se nyní zobrazí modře na začátku stromu Navigátoru.

Jestliže zaškrtnete možnost Automatická analýza, provedl se při klepnutí na tlačítko Import jak import tak i analýza.

Relace se nyní zobrazuje v Navigátoru jako relace Analyzovaná.



54

One Lambda, Inc.


Můžete importovat další soubory relací Luminex anebo můžete klepnutím na relaci v Navigátoru spustit skupinovou analýzu. Poznámka:

Po importu souboru CSV se soubor již nezobrazuje v seznamu importu relací Luminex, dokud nezaškrtnete volbu Zahrnout importované CSV.



55


One Lambda, Inc.

Analýza relací Exon 4+ Software HLA Fusion umožňuje s generickými vzorky modulu LABType typu HD i jinými než HD analyzovat data Exon 4+ a dosáhnout výsledků s vyšším rozlišením. Rozlišení Exon 4+ můžete aplikovat na data pro typizaci loku A, B nebo C. Při analýze vzorků LABType s rozlišením Exon 4+ postupujte podle následujících kroků: 1. Klepněte na tlačítko LABType

.

Zobrazí se domovská stránka LABType. Domovská stránka LABType (Exon 4+)

2. Klepněte na odkaz [Stahování] vpravo nahoře na domovské stránce LABType a stáhněte si katalogy potřebné pro analýzu generického loku A, B anebo C a vzorků Exon 4+ LABType (například RSSO1E_001_00.cat). 3. V seznamu souborů CSV vlevo na domovské stránce LABType vyberte soubory, které chcete importovat pro doplnění o data Exon 4+. 

můžete procházet soubory CSV LABType na Anebo po klepnutí na ikonu Složka svém systému/síti a vyhledávat a vybírat soubory CSV.



56


One Lambda, Inc.

Zobrazí se tabulka Podrobné údaje o relaci/pacientovi modulu LABType. Import relace LABType (Exon 4+)

4. Relace obsahující vzorky, které chcete doplnit o data Exon 4, importujte stejným způsobem, jaký byl použit dříve pro import souborů CSV do aplikace Fusion. 5. Okno analýzy Fusion LABType můžete použít pro analýzu vzorků, které chcete použít v analýze s Exon 4+. 6. Klepnutím na tlačítko LABType se vrátíte na domovskou stránku LABType. 7. Ověřte, že jste si stáhli katalog (katalogy) Exon 4+ (například RSSO1E_001_00.cat). Pokud jste tento krok ještě neprovedli, klepněte na odkaz [Stahování] vpravo nahoře na domovské stránce LABType a stáhněte si potřebný katalog (katalogy). 8. Po přidání katalogu (katalogů) Exon 4+ do svého počítače nebo sítě vyberte relace Exon 4+ v seznamu souborů CSV vlevo na domovské stránce LABType. 

nad seznamem můžete procházet soubory CSV Anebo po klepnutí na ikonu Složka LABType na svém počítače nebo síti a vyhledávat a vybírat soubory CSV Exon 4+.

9. Tím se zobrazí vzorky Exon 4+ v tabulce Podrobných údajů o relacích vpravo v okně LABType. 10. Klepněte na tlačítko Doplňkové (pozor: tlačítko Import není pro relace Exon 4+ dostupné). Zobrazí se okno Doplňková analýza.



57


One Lambda, Inc.

Výběr doplňkové relace (Exon 4+)

Aplikace Fusion automaticky sdružuje vzorky Exon 4+ s generickými vzorky stejného loku. Barva pozadí řádky signalizuje následující skutečnosti: 

Neshoda nomenklatur, různá data: Růžová



Nepodařilo se najít žádné vzorky pro sdružení s konkrétním vzorkem Exon 4+: Oranžová



Více než jeden vzorek sdružený s jedním Exon 4+: Azurově modrá



Vzorek má falešnou reakci nebo žádné rozlišení: Světle šedá

Zkontrolujte, zda jsou vybrány vzorky, které chcete sdružit pro doplňkovou analýzu. Poznámka:

Sdružit lze pouze jeden vzorek s každým Exon 4+ na jeden lokus. Je-li pro sdružení s Exon 4+ určitého loku k dispozici více než jeden generický vzorek, systém podle výchozího nastavení vybírá poslední vytvořený vzorek. Chcete-li, můžete vybrat starší vzorek. Data Micro SSP lze kombinovat s daty Exon 4+ až po zkombinování s daty LABType. Data LABType kombinovaná s daty Exon 4+ nelze kombinovat s daty Micro SSP.

11. Klepněte na tlačítko Import

.

Doplňková relace a všechny sdružené vzorky se zobrazí v Navigátoru Fusion, kde je můžete volit pro analýzu v okně analýzy LABType.



58


One Lambda, Inc.

Přehled relací LABType Stránku přehledu relací lze spustit klepnutím na relaci ve stromu Navigace. Zobrazuje náhled výsledků analýzy a uvádí každý vzorek v relaci a odpovídající výsledky skupinové analýzy. Pro aplikaci Klepnutím přiřadíte seskupení P nebo výsledky analýzy jako G na vzorky závěrečné výsledky pro v relaci, které ještě všechny vzorky. nebyly uloženy.

Karty Přehled relací Přehledný graf zobrazuje datové body pro každý vzorek.

Vyhledejte vzorky pro kódy XX a nahraďte je aktualizovaným kódem NMDP.

Volič polí: Klepnutím můžete přidat nebo vyloučit sloupce.

Volné poznámky, které zde můžete zadat. Aplikace Fusion zaznamenává poslední akce, například

Stránka Přehled relací LABType

Volič polí přehledu relací

Po klepnutí zde se otevře volič polí.

Klepněte na tlačítko Volič polí úplně vlevo v záhlaví tabulky. Zobrazí se volič polí. Umožňuje zaškrtnutím nebo zrušením

zaškrtnutí vedle záhlaví sloupců přidat nebo vyloučit tyto sloupce z přehledové tabulky. Zaškrtnutím nebo zrušením zaškrtnutí v tomto okně se tabulka okamžitě aktualizuje.

Můžete také změnit pořadí polí přetažením libovolného názvu pole myší do nového umístění ve Voliči polí.



59


One Lambda, Inc.

Při zavření Voliče polí se zobrazí zpráva a vy můžete vybrat, zda si přejete provedené změny uložit či nikoli. Pokud klepnete na možnost Ano, změny se uloží pro všechny budoucí přehledy relací LABType na tomto počítači, dokud nebudou provedeny a uloženy další úpravy.

Poznámka: Pokud se vám nezobrazí konkrétní pole dostupné ve voliči polí, a přitom by se určitě mělo zobrazit, přejděte do složky C:\HLA Fusion\temp a odstraňte soubor nazvaný Labtype_Layout.xml.

Tlačítka Export, Náhled a Tisk Klepnutím na tlačítko Export na panelu nástrojů Fusion se zformátuje Přehled jako tabulka aplikace Microsoft Excel. Aplikace Fusion nabídne Název relace pro tabulku, lze jej však změnit. Po klepnutí na tlačítko Náhled před tiskem

na panelu nástrojů Fusion se jednak otevře nové okno, kde si můžete prohlédnout, jak bude relace vypadat vytištěná, a jednak budete moci zvolit stránky anebo určité části stránek, které se vytisknou.

Po klepnutí na tlačítko Tisk Odeslat přehled do tiskárny

Snímek Nástroj

se Přehled odešle přímo do tiskárny.

Náhled v šířce Náhled celé Rozbalovací stránky Náhled stránky seznam lupy Dynamic v šířce ká lupa Přiblížení Oddálení k okrajům

Přechod mezi stránkami

Náhled před tiskem

Náhled miniatur

Obrazovka Náhled před tiskem

Klepnutím na tlačítko Tisk

na obrazovce Náhled před tiskem odešlete vybrané snímky přímo

do tiskárny.



60


One Lambda, Inc.

Karty přehledu relací LABType Karta Přehled Karta Přehled relací LABType obsahuje Přehledový graf výsledků. Graf zobrazuje kvalitu výsledků skupinové analýzy pro každý vzorek: 

Shoda M signalizuje více vyhovujících výsledků (oranžová)



Shoda S signalizuje jediný vyhovující výsledek (červená)



Falešná signalizuje falešnou reakci ve výsledcích (růžová)



Chybí signalizuje, že nejsou k dispozici žádné navrhované výsledky (šedá)

Graf Přehled výsledků (karta Přehled)



Klepnutím na libovolný čtvereček v grafu Přehled výsledků zobrazíte okno analýzy odpovídajícího vzorku.



Je-li dole na obrazovce Přehled relace aktivováno tlačítko Automaticky přijmout vše, můžete klepnutím na něj přiřadit potenciální výsledky jako závěrečné výsledky pro všechny vzorky – kromě vzorků s nejednoznačnými výsledky.

Tato funkce se neaktivuje, dokud ji nezvolíte pomocí volby Konfigurace molekulárních produktů>>Konfigurace molekulární analýzy v nabídce Pomocné nástroje.



61


One Lambda, Inc.

Karta Kontrolní hodnota Tato karta umožňuje prohlížet kvalitu kontrolních hodnot pro každý vzorek. Tato karta je rozdělena na tři grafy s následujícími společnými prvky: 

Osa X udává vzorky seřazené podle polohy jamky.



Osa Y udává hodnoty nezpracovaných dat specifické pro každý graf (například hodnoty pozitivní nebo negativní kontroly).



V každém grafu můžete klepnutím pravým tlačítkem myši zvolit možnosti Vyloučit vzorek nebo Analyzovat vzorek.



Poklepáním na libovolnou značku přejdete na obrazovku analýzy tohoto vzorku.



Najetím kurzoru na libovolnou značku zobrazíte anotaci vzorku.

Přehled pozitivních kontrol Graf Přehled pozitivních kontrol (nahoře) zobrazuje hodnotu pozitivní kontroly pro každý vzorek. 

Osa X udává názvy ID vzorků seřazené podle polohy jamky.



Osa Y udává hodnoty nezpracovaných dat pozitivní kontroly.

Horizontální pruh udává nakonfigurovanou hodnotu pro minimální pozitivní kontrolu. Tuto hodnotu lze konfigurovat v nabídce Pomocné nástroje >Konfigurace molekulárních produktů nebo nakonfigurováním specifického nastavení pro vzorek v okně analýzy. 

Každý exon se zobrazuje různou barvou.



Poklepáním na libovolnou značku vyvoláte obrazovku analýzy pro vzorek. Graf přehledu pozitivních kontrol



62


One Lambda, Inc.

Přehled negativních kontrol Graf Přehled negativních kontrol (uprostřed) zobrazuje hodnotu negativní kontroly pro každý vzorek. 




Osa Y udává hodnoty nezpracovaných dat negativní kontroly.



Poklepáním na libovolnou značku vyvoláte okno analýzy pro daný vzorek. Graf přehledu negativních kontrol

Přehled počtu perliček Graf Přehled počtu perliček (dole) zobrazuje nejnižší počet perliček pro každý vzorek. 




Osa Y udává hodnoty nezpracovaných dat negativní kontroly.

Horizontální pruh udává nakonfigurovanou hodnotu pro minimální počet perliček. Tuto hodnotu lze globálně konfigurovat v nabídce Pomocné nástroje > Konfigurace molekulárních produktů. Specifické nastavení vzorku můžete nakonfigurovat přímo v okně analýzy. Poklepáním na libovolnou značku vyvoláte okno analýzy pro daný vzorek. Graf přehledu negativních kontrol



63

One Lambda, Inc.


Karta Analýza perličky Tato karta umožňuje prohlížet globální informace relací pro každou perličku. Tato karta obsahuje tři grafy popsané v následujících oddílech.

Karta Analýza perličky

Přehled falešných reakcí Na grafu v dolním panelu můžete prohlížet počet falešných reakcí (pozitivních i negativních) sdružených s každou perličkou v celé relaci. Přehled falešných reakcí



64


One Lambda, Inc.

Barva pruhu představuje typ falešné reakce, která se vyskytne:  Zelená = falešně negativní  Červená = falešně pozitivní Výška barevného pruhu signalizuje počet falešných reakcí na indikovanou perličku. Poklepáním na jeden z pruhů v grafu se změní příslušné grafy QC a Perlička na danou perličku. Podobně se příslušné grafy QC a Perlička změní na danou perličku poklepáním na jedno z ID perličky na ose X. Oba grafy v horním panelu srovnávají profily perliček aktuální relace (pravý graf) s histogramem stejných perliček na panelu One Lambda QC (levý graf). Je-li pro relaci použito lokální QC, zobrazí se histogram lokálního QC vlevo. Panel QC a graf Profil perličky

   

Najetím kurzoru na pruhy v histogramech zobrazíte informace o perličce. Klepnutím pravým tlačítkem myši na profilu perličky můžete zvolit možnost Vyloučit vzorek nebo Analyzovat vzorek. Poklepáním na libovolnou perličku přejdete přímo na obrazovku analýzy pro daný vzorek. Klepnutím na tlačítko Informace o perličce perličku.

zobrazíte alelové specificity pro aktuální

Tlačítko Informace o perličce – alelové specificity



Můžete také měnit velikost těchto grafů umístěním kurzoru v oblasti mezi grafy, aby se symbol kurzoru změnil na . Následně můžete klepnout a tažením změnit velikost grafů.



65

One Lambda, Inc.




Chcete-li změnit měřítko histogramů na panelovém grafu QC, zadejte hodnotu do textového pole Max. měřítko a stiskněte klávesu Enter na klávesnici. Tím se resetuje horní hodnota osy Y histogramu profilu perličky pro QC i aktuální relaci.



Pomocí tlačítek Perlička Navigace



Můžete také volit jednotlivé perličky v rozbalovacím seznamu.



odstraníte Zaškrtnutím pole Vyloučit perličku aktuální perličku z analýzy. Vyloučená perlička je uvedena v poli komentáře s poznámkou, že perlička byla vyloučena. Kromě toho se vyloučené perličky zobrazí na grafech během analýzy jako ŠEDÉ pruhy.



Úpravy mezních hodnot sondy v Analýze perličky se projeví u všech vzorků v této relaci. Předběžná úprava hodnot podle podmínek testování jednotlivých laboratoří může uspořit čas během analýzy, protože se změní všechny vzorky najednou (tj. globálně).

můžete procházet mezi perličkami. Rozbalovací seznam Perlička

Globální úpravy meze lze provést následujícím způsobem: 

Klepněte a podržte horizontální pruh nastavení mezí sondy a přetáhněte ji nahoru nebo dolů na nové nastavení meze.

Přetažením této čáry nahoru nebo dolů pomocí ukazatele myši upravíte nastavení meze sondy.

Úprava pruhu meze.



66


One Lambda, Inc.

Chcete-li resetovat mez, klepněte na tlačítko Resetovat mez v rozbalovacím seznamu.

a zvolte možnost resetování

Nabídka Resetovat mez



Při úpravě meze můžete určit, která perlička se po úpravě zobrazí buď zaškrtnutím nebo zrušením zaškrtnutí následujícího zaškrtávacího pole vpravo dole v okně Analýzy perličky:



Je-li pole zaškrtnuté, zobrazí se po úpravě meze další nejvyšší perlička falešné reakce.



Pokud pole není zaškrtnuté, bude se nadále zobrazovat perlička zobrazovaná před úpravou meze.

Dole jsou k dispozici dvě pole Komentářů — Uživatelský komentář pro záznam vlastních komentářů a pole Systémový, do kterého aplikace HLA Fusion zaznamenává poslední akce provedené v okně Přehled, například úpravu meze. Systémové komentáře nelze upravovat. Uživatelské a systémové komentáře



67

One Lambda, Inc.


Obecné vlastnosti přehledu relací Kromě funkcí na třech kartách Přehledu relací LABType jsou k dispozici funkce pro manipulaci s daty přehledové tabulky. Značky vzorků

Pole Volič

Sloupec Záhlaví

Vzorky

Tabulka Přehled relací



Poklepáním na vzorek v přehledové tabulce nebo jednoduchým klepnutím na značku vzorku v přehledovém grafu můžete přejít přímo na obrazovku analýzy pro daný vzorek.



Poklepáním na pole Uživatelské komentáře můžete přidat nebo upravit své poznámky. Systémově generované komentáře nelze upravovat.



úplně nalevo od záhlaví tabulky. Zobrazí se pole Volič polí. Klepněte na tlačítko Volič polí Umožňuje zaškrtnutím nebo zrušením zaškrtnutí vedle záhlaví sloupců přidat nebo vyloučit tyto sloupce z přehledové tabulky.



Zaškrtnutím nebo zrušením zaškrtnutí v tomto okně se tabulka okamžitě aktualizuje.

Poznámka:

Pokud se vám nezobrazí konkrétní pole dostupné ve voliči polí, a přitom by se určitě mělo zobrazit, přejděte do složky C:\HLA Fusion\temp a odstraňte soubor nazvaný: Labtype_Layout.xml.



68


One Lambda, Inc. Volič polí



Klepnutím na libovolné záhlaví sloupce přehledové tabulky můžete seřadit tabulku podle daného sloupce. Trojúhelníček v záhlaví sloupce signalizuje pořadí seřazení: nahoru pro vzestupné a dolů pro sestupné seřazení.



Přetažením sloupců lze také změnit jejich pořadí.



Při zavření Voliče polí se zobrazí vyskakovací zpráva a vy můžete vybrat, zda si přejete provedené změny uložit či nikoli. Pokud klepnete na možnost Ano, změny se uloží pro všechny budoucí přehledy relací LABType na tomto počítači, dokud nebudou provedeny a uloženy další úpravy.

Změna umístění pole



Klepnutím na tlačítko Export můžete uložit přehledovou tabulku na svém počítači nebo v síti (výchozí umístění je C:\OLI FUSION\data\report). Soubor se ukládá ve formátu Excel (*.XLS).



Klepnutím na tlačítko Tisk

se ihned vytiskne sestava přehledové tabulky.

Exportovaná přehledová tabulka (formát tabulkového listu Excel)



Klepnutím na tlačítko Náhled vytištěním nebo uložením.

zobrazíte náhled sestavy přehledové tabulky před Obrazovka Náhled před tiskem

Pomocí posuvníku můžete procházet stránky



69


One Lambda, Inc.



V okně Náhled před tiskem se na levé straně zobrazuje symbol pro každou stránku sestavy. Pomocí posuvníku se můžete pohybovat ze stránky na stránku, anebo můžete na konkrétní stránku přejít klepnutím na její ikonu.



Pomocí kolečka myši nebo klepnutím a pohybem myši nahoru a dolů můžete každou stránku v okně Náhled před tiskem přiblížit nebo oddálit.

Vyloučení vzorku z analýzy Jestliže chcete vyloučit vzorek z analytické relace, zaškrtněte pole Vyloučit vedle daného vzorku.

Můžete také klepnutím pravým tlačítkem myši na vzorek na libovolném grafu na kartě Kontrolní hodnota a zvolit možnost Vyloučit vzorek.

To znamená, že vybraný vzorek se přestane zobrazovat ve zprávách aplikace Fusion či v Analýze perličky, v datech kontrolní hodnoty nebo jako výsledky v okně analýzy vzorku. 

Řádky falešného vzorku jsou v přehledové tabulce zvýrazněny růžově; řádky vzorků s více shodami jsou zvýrazněny oranžově.



Pokud si přejete, aby software HLA Fusion vyhledal kódy XX v celé relaci a nahradil je nejaktuálnějšími kódy NMDP, které jste importovali, klepněte na tlačítko Nahradit kódy XX . Tuto funkci doporučujeme použít, pokud jste právě provedli import aktuálního souboru NMDP.

Poznámka:

U jednotlivých vzorků lze funkci nahrazení kódu provést výběrem tlačítka Znovu analyzovat v okně analýzy.



70


One Lambda, Inc.

Konfigurace analýzy LABType pro aktuální vzorek Globální výchozí konfigurace LABType lze nastavit v nabídce Pomocné nástroje. Kromě toho lze konfigurace pro aktuální vzorek také nastavit v okně analýzy LABType.

Změna konfigurace pro aktuální vzorek Před spuštěním analýzy můžete změnit volby analýzy pro aktuální vzorek pomocí níže zobrazené konfigurační nabídky. Změny konfiguračních nastavení během analýzy se projeví pouze na aktuálním vzorku. Chcete-li změnit konfigurační nastavení pro aktuální vzorek, klepněte na tlačítko Nastavit konfiguraci v horní části kvadrantu 1 okna analýzy. Tlačítko Nastavit konfiguraci v grafu QC na prvním kvadrantu



71


One Lambda, Inc.

Přiřazení kódu Možnosti konfigurace aktuálního vzorku

Podle výchozího nastavení aplikace Fusion přiřadí alelám kódy NMDP. Tyto kódy však můžete alternativně změnit na jednu z následujících voleb: 

Žádný kód – výsledky, alelové páry sestavené do řetězce s neformátovaným kódem, se jednoduše zkondenzují bez aplikace kódovaného formátu.



Lokální kód – přiřadí uživatelsky definované definice kódů (kódy používané vaší laboratoří) pro nabídnuté výsledky kódů.



Seskupení P – kóduje alelové řetězce v seskupení P podle IMGT.



Seskupení G – kóduje alelové řetězce v seskupení G podle IMGT.



Křížový kód – umožňuje alelové kombinace, které překračují sérologické skupiny (například EAPW = DRB1*04:03:01DRB1*04:03:03). Ve výchozím nastavení je křížové kódování vypnuté a alelové páry jsou zkondenzované pouze v rámci stejných alelových skupin.

Bw4/Bw6 v sérologii


Sérologie identifikovala četné páry HLA-B alel, které se zdají být odlišné pouze v oblasti Bw4/Bw6 — dva vzájemně exkluzívní sérologické epitopy. Zvolíte-li tuto možnost, přidá se Bw4/Bw6 do sérologických výsledků.



72

One Lambda, Inc.


Demografické informace Možnost Demografické informace umožňuje organizovat alely podle jejich frekvence. Na základě vámi provedeného demografického výběru software HLA Fusion zobrazí v seznamu alelových párů až tři alelové skupiny: 

Skupina 1: Frekventní na obou alelách



Skupina 2: Frekventní pouze na jedné nebo druhé z alel



Skupina 3: Frekventní na žádné alele

Demografická frekvence

Možnost demografické konfigurace

Poznámka:

Jestliže možnost Demografické informace není k dispozici (tj. je zšedlá), znamená to, že musíte importovat vstupní soubor frekvence alel. V panelu nabídek Fusion zvolte Pomocné nástroje > Aktualizovat reference > Frekvence alel. Klepněte na tlačítko procházení a vyhledejte soubory frekvence alel. Klepněte na příkaz Importovat frekvence alel.

Minimální pozitivní kontrola Nastavit minimální pozitivní kontrolu

Výchozí hodnota pole Minimální pozitivní kontrola přiřazená systémem je 1000. Podle potřeby zadejte do pole Minimální pozitivní kontrola novou hodnotu a stiskněte klávesu Enter na klávesnici.



73


One Lambda, Inc.

Vzorek se označí příznakem v systémových komentářích jako vzorek s nízkou pozitivní kontrolou, pokud některá ořezaná střední hodnota pozitivní kontroly v aktuálním vzorku spadá pod vámi nastavenou prahovou hodnotu. Na kartě Perlička analýzy jsou pruhy perliček pod vámi nastavenou prahovou hodnotou zbarveny ŠEDĚ.

Minimální počet perliček Nastavit minimální počet perliček

Výchozí hodnota pole Minimální počet perliček přiřazená systémem je 100. Podle potřeby zadejte novou hodnotu do pole Minimální hodnota počtu perliček. Vzorek se označí příznakem v komentářích jako vzorek s nízkým počtem perliček, pokud některý počet perliček v aktuálním vzorku spadá pod vámi nastavenou prahovou hodnotu.

Nastavit perličku jisté reakce 1. Klepněte na tlačítko Nastavit konfiguraci (vpravo nahoře), v konfigurační nabídce zvolte možnost Nastavit perličku jisté reakce a zadejte ID perliček, pro které chcete vynutit pozitivní nebo negativní hodnoty. Zobrazí se dialogové okno Vynutit jistou reakci. 2. Zde můžete zadat ID perliček, pro které chcete vynutit pozitivní (falešně pozitivní výsledky se považují za pravé pozitivní) nebo negativní (falešně negativní výsledky se považují za pravé negativní). Nastavit jistou reakci Zde zadejte ID perliček, u nichž chcete vynutit výsledek POZITIVNÍ. Zde zadejte ID perliček, u nichž chcete vynutit výsledek NEGATIVNÍ.

Vynutit jistou reakci



74


One Lambda, Inc.

Zobrazit QC

Tento vyskakovací seznam zobrazuje alternativní panely QC (které jste vytvořili), které jsou k dispozici pro aktuální soubor katalogu, který lze zobrazit jako histogramy v kvadrantu 1 okna Analýza. Po klepnutí můžete vybírat z tohoto seznamu namísto použití OLI QC.

Panely QC lze také vytvořit klepnutím pravým tlačítkem myši na uloženou relaci LABType ve stromu navigátoru a vybráním volby Vytvořit lokální QC.

Konfigurovat alternativní panely QC

Nastavení prahu pro nízké pozitivní Nastavit práh pro nízké pozitivní

Výchozí hodnota Práh pro nízké pozitivní přiřazená systémem HLA Fusion je 200. Podle potřeby klepněte na tlačítko Nastavit konfiguraci a zadejte novou hodnotu do pole Práh pro nízké pozitivní v dolní části vyskakovací nabídky. Vzorky pod touto hodnotou jsou vykresleny grafem jako ŠEDÉ, vertikální pruhy v pravém horním kvadrantu (2) obrazovky Analýza perličky.



75

One Lambda, Inc.


Používání okna Analýza dat LABType Okno Analýza dat LABType nabízí podrobné informace o analýze pro každý vzorek v relaci. Můžete prohlédnout přiřazení alel navržené programem a upravit a přijmout přiřazení typizace. Software HLA Fusion navrhuje možné výsledky typizace, avšak závěrečné přiřazení musíte provést vy nebo váš dohlížející pracovník. V okně Analýza LABType můžete provádět následující akce: 

Přepínat mezi formáty kódu



Aplikovat Bw4/Bw6 na sérologické výsledky



Aplikovat frekvenční filtry



Zobrazit rozdíly mezi vygenerovaným signálem a mezním bodem každé perličky



Zobrazit reakci, rozpoznávací místo, nezpracovaná data a data perličky



Procházet mezi perličkami



Vyloučit perličku z analýzy



Upravovat meze



Přiřazovat nekódované alelové páry



Přiřazovat kódované alelové páry



Přiřazovat ekvivalenty pro sérologii



Provádět ruční přiřazení



Odstraňovat přiřazení



Ukládat a potvrzovat výsledky analýzy

Okno analýzy LABType je rozděleno na čtyři hlavní oddíly neboli kvadranty, z nichž každý poskytuje specifická data pro analýzu.



76


One Lambda, Inc.

Okno analýzy LABType

Zobrazuje reakční tabulku Zobrazuje OLIQC

Zobrazuje Uživatelské QC pro každou sondu

Zobrazuje rozpoznávací místo a data pro každou sondu

Zobrazuje LAB QC (je-li vytvořeno)

Zobrazuje výsledky loků pro aktuálního pacienta pro vybraný vzorek

Zde zadávejte nové hodnoty pro úpravu osy Y histogramu QC

Kvadrant 1 Kvadrant 1



77


One Lambda, Inc.

Kvadrant 2 Zobrazuje graf perličky

Zobrazuje nezpracovaná data perličky

Zobrazuje informace o perličce

Zaškrtnutím vyloučíte aktuální perličku

Nastavení počtu falešných reakcí

Resetuje mez pro vybranou perličku na hodnotu OLI nebo uživatelskou výchozí hodnotu

Používá se pro výběr perliček z aktuálního vzorku

Aktuální vzorek (červená)

BARVY PRUHŮ

Pozitivní reakce: Negativní reakce: Aktuální perlička: Á

Tyto pruhy signalizují normalizova nou hodnotu každé perličky ve vzorku.

Představuje hodnoty nezpracovanýc h dat pro perličky pozitivní a negativní kontroly v analýze LABType.

Šedé kosočtverce jsou aktuální mezí pro každou perličku.

Červenofial ová = pozitivní kontrola BBíílláá= negativní kontrola Normalizovaná hodnota

(procenta pozitivní)


Perličky v numerickém pořadí

Kvadrant 3


78


One Lambda, Inc.

Umožňuje jednu vynuceně pozitivní nebo negativní

Zobrazuje výsledky jako typy a podtypy

Seskupuje páry se stejným reakčním schématem

Zobrazuje sérologický ekvivalent alelových párů

Kvadrant 4

Zobrazuje alelové páry

Karta párů Přiřazení navržená softwarem HLA Fusion

Zde zadejte vlastní komentáře

Přesune jednoznačný možný alelový kód do seznamu přiřazených kódů

Toto políčko zaškrtněte na znamení, Uloží aktuální že jsou nutné další testy rozvržení okna

Poznámky pouze pro čtení zadané aplikací Fusion

Přiřazení výsledků na úrovni pacienta

Pro novou analýzu vzorku Pro analýzu po novém NMDP, reakcí ze sérologii nebo změně počtu povolených falešných dvou testů

Pro přiřazení a uložení všech výsledků

Uložení analýzy pro kontrolu a schválení

Dohlížející osoba zde klepne pro potvrzení výsledků analýzy

Každý kvadrant okna Analýza představuje jiné zobrazení stejného vzorku. Kvadranty jsou vzájemně provázané: změna provedená v kvadrantu 2 (například mez) ovlivní zobrazení v kvadrantech 1, 3 a 4. Velikost jednotlivých kvadrantů lze změnit vertikálně i horizontálně: . Klepněte



Pohybujte kurzorem mezi kvadranty, dokud se symbol kurzoru nezmění na a změňte velikost přetažením.



Anebo můžete upravit zobrazení kvadrantu klepnutím na tlačítko Maximalizovat kvadrantu.



na

79


One Lambda, Inc.

Klávesové zkratky pro navigaci v analýze LABType Následující tabulka definuje některé kombinace na počítačové klávesnici, které můžete použít pro rychlou navigaci ve vzorku LABType během analýzy.

Kombinace na klávesnici

Akce...

+N

Přechod na další perličku (z obrazovky analýzy perličky a analýzy vzorku)

+P

Přechod na předchozí perličku (z obrazovky analýzy perličky a analýzy vzorku)

+A

Přiřadit a přejít na další vzorek (z obrazovky analýzy vzorku)

Kvadrant 1 (Histogram QC) V tomto kvadrantu je k dispozici několik karet, které popisuje následující text.

Karta QC Karta QC zobrazuje histogram profilu reakce pro aktuální perličku ve srovnání se všemi vzorky panelu QC použitými v analýze. Každý pruh představuje vzorek QC a jeho výška představuje normalizovanou hodnotu reakce. Zde zadejte novou hodnotu maximálního měřítka

Najetím myši zobrazíte podrobnosti o vzorku



80


One Lambda, Inc.



Najetím kurzoru na libovolný vzorek se zobrazí podrobné údaje o vzorku včetně výsledků typizace (viz vyobrazení).



Chcete-li změnit měřítko histogramu, klepněte uvnitř rámečku Maximální měřítko, zadejte . nové meze a stiskněte klávesu Enter Funkce maximálního měřítka definuje maximální rozsah osy Y. Pokud zadáte novou hodnotu maximálního měřítka, histogramy dat QC a perličky automaticky aktualizují své zobrazení a zobrazí rozsah od nuly do nové maximální hodnoty.



Mezní linie představuje výchozí mezní hodnotou definovanou společností One Lambda.

Karta Rxn (Reakce) Karta Reakční schéma zobrazuje pozitivní reakce pro každou perličku, (osa X) vůči každé alele, (osa Y) definovaná v katalogovém souboru. V kvadrantu 1 v okně Analýza LABType klepnutím na kartu Rxn zobrazíte Tabulku reakčních schémat. Vyhledávání podle alely

Klepnutím seřadíte perličky podle reakce vzorku

Poklepáním zobrazíte vybranou perličku v grafu Data perličky (kvadrant 2)

Klepnutím zvětšíte nebo zmenšíte tabulku

Aktuální vzorek MODŘE

Pozitivní alely mají stínované pozadí

Písmeno „X“ označuje pozitivní reakci Klepnutím na tuto oblast se spustí hledání podle reakce



81


One Lambda, Inc.

Výchozí konfigurace: 

Perličky jsou seřazené podle reakce vzorku.



Aktuální vzorek se zobrazí na horním řádku tabulky modrým písmem



Pozitivní alely jsou uvedeny pod řádkem vzorku a mají vystíněné pozadí.



Lososová barva označuje falešně pozitivní.



Zelená označuje falešně negativní.

Pozitivní reakce se v tabulce zobrazují jako „X“, (modře aktuální vzorek černě ostatní). PC, NC a vyloučené perličky se v tabulce zobrazují jako nula „0“.

Chcete-li zvětšit tabulku na plnou velikost, klepněte na tlačítko Maximalizovat. Chcete-li zobrazení minimalizovat, klepněte znovu na tlačítko.

NEBO… Poklepáním kdekoli v oblasti nad tabulkou mezi tlačítky Resetování reakce a Max zvětšíte tabulku. Chcete-li vrátit tabulku do původní velikosti kvadrantu, poklepejte znovu na tutéž oblast.

Zadejte alelu do pole a klepnutím na tlačítko Najít alelu zobrazíte alelu a její reakční schéma v prvním řádku pod vzorkem. Poklepáním na název alely přesunete tuto alelu na začátek tabulky. Celou určitou skupinu alel můžete přesunout na začátek zadáním skupiny alel (například DRB1*03).

Klepnutím na prázdné, šedé záhlaví řádku nalevo od názvu alely nebo reakce přesunete všechny perličky v dané reakci doleva. Klepnutím na tlačítko Resetování reakce provedete reset tabulky na původní konfiguraci.



82


One Lambda, Inc.

Při klepnutí na záhlaví se tabulka seřadí podle kritéria reakce pro danou perličku. Prvním klepnutím se provede seřazení ve vzestupném pořadí shora dolů. Druhým klepnutím se provede seřazení v sestupném pořadí.

Poklepáním na sloupci alel přesunete vybranou alelu nahoru na začátek Tabulky reakčních schémat, bezprostředně pod vzorek.

k analýze dvou nebo více analýz Použijete-li tlačítko Analyzovat kombinované pro stejný vzorek, odliší se ID perliček v doplňkových analýzách od aktuálního ID v Tabulce reakcí pomocí podtržítka a pořadového čísla. Jestliže například aktuální vzorek obsahuje perličku s ID perličky002 a provedete analýzu vzorku v kombinaci s doplňkovou analýzou pro vzorek, bude tatáž perlička pro druhou analýzu vzorku v tabulce reakcí uvedena jako 002_0. Číslo za podtržítkem se zvětšuje pro další vzorky, které můžete přidávat do kombinované analýzy (_1 pro třetí test vzorek atd.).

Karta Rozpoznávací místo

Tento graf mapuje rozpoznávací místa všech sond ve vzorku a zvýrazňuje sondy, které detekují některou z obou alel vybraných uživatelem pro srovnání. 

Osa X: vazebné místo sondy ve vztahu k exonům amplifikovaným v použité testovací sadě

(počínaje exonem 2 vlevo až k exonu 4 nebo vyššímu vpravo, pokud to vzorek umožňuje). 

Osa Y: perlička

V okně analýzy LABType v kvadrantu 1 klepněte na kartu Rozpoznávací místo.



83

One Lambda, Inc.


Sondy, které jsou pozitivní, mají ČERVENOU barvu.

Sndy typu Gap nebo speciální sondy se zobrazují se žlutým konektorem.

Negativní sondy mají MODROU barvu.



Sondy, které jsou pozitivní pro vybrané alely, mají červenou barvu a zobrazují se ve vykreslení grafu nahoře. Negativní sondy mají modrou, barvu a zobrazují se pod pozitivními.



Sondy se poznají podle horizontálního pruhu v rozpoznávacím místě. Poloha sondy je opatřena štítkem vedle pruhu.



Když klepnete na sondu, provede se aktualizace grafu perličky v kvadrantu 2 a místní informační okno zobrazí následující pole: 1. ID perličky 2. Rozpoznávací místo 3. Číslo exonu



Mezera nebo speciální sondy jsou označeny žlutým konektorem, který spojuje dvě rozpoznávací místa. Data rozpoznávacího místa, která se zobrazí při klepnutí na speciální sondu, platí pro obě propojené sondy.



84


One Lambda, Inc.

Rozpoznávací pruh Rozpoznávací pruh můžete aktivovat klepnutím na tlačítko Rozpoznávací pruh . Nejprve se pruh zobrazí v grafu nalevo. Přetáhněte pruh ukazatelem myši doprava. Jakmile uvolníte pruh, systém zobrazí Přehled rozpoznávacích míst (pozitivní, negativní a vyloučené sondy) pro libovolné místo, kde tento pruh v okně umístíte.

Klepnutím aktivujte rozpoznávací pruh

Rozpoznávací pruh

Přehled všech sond, které leží v oblasti před novou polohou pruhu.

Přehled rozpoznávacích míst sond

Klepnutím na tlačítko OK

zavřete Přehled rozpoznávacích míst.



Po zadání až dvou alel oddělených mezerou do pole Textové pole alely na klávesnici. stiskněte tlačítko Enter



Anebo můžete vyhledat alely poklepáním na alelový pár v seznamu výsledků Možné alelové páry (v kvadrantu 4). Rozpoznávací místo – alelové páry



85

One Lambda, Inc.


Všechny sondy, které reagují na vybranou alelu (vybrané alely), mají zvláštní barvu: 

Alela 1: Červenofialová



Alela 2: Azurově modrá

Karta Lokální QC Karta Lokální QC obsahuje histogram reakčního profilu pro aktuální perličku vůči všem vzorkům, které tento uživatel spustil pro stejný produkt (stejnou šarži/revizi) během specifikovaného rozmezí dat.

One Lambda mezní linie

Karta Lokální QC

Každý zelený pruh představuje vzorek QC a jeho výška představuje normalizovanou hodnotu reakce. Slouží jako uživatelsky vytvořený graf QC.   

Najetím kurzoru na libovolný vzorek zobrazíte podrobnosti o vzorku. Graf se během analýzy produktu neustále v průběhu času aktualizuje. Mezní linie představuje výchozí mezní hodnotou definovanou společností One Lambda.

Karta Výsledky pacienta/vzorku Karta Výsledky pacienta/vzorku uvádí podrobné údaje všech výsledků pro všechny testy provedené na ID vzorku nebo ID pacienta. Vzhledem k tomu, že výsledky se ukládají pro každý lokus, zobrazí se v této sekci týkající se všech loků buď sérologické výsledky nebo kód alel pro každý lokus. Klepnutím na libovolnou štítkem označenou šedou kartu v horní části mřížky seřadíte výsledky vzestupně nebo sestupně. Směr malých trojúhelníků označuje způsob seřazení výsledků. Najetím myši na libovolný Možný kód alely zobrazíte celý kód alely.



86


One Lambda, Inc.

Pomocí myši můžete mřížku rozšířit, anebo můžete poklepáním mezi karty automaticky zvětšit šířku sloupce, aby se vešla všechna zobrazovaná data.

Karta Výsledky pacienta/vzorku

Kvadrant 2 (data perličky) V tomto kvadrantu jsou k dispozici tři karty popsané v následujícím textu.

Karta Perlička Karta Perlička První perlička obsahuje histogram pro aktuálně vybranou perličku. Každý pruh představuje jeden vzorek. Výška pruhu představuje normalizovanou reakční hodnotu pro vybranou perličku v daném vzorku.

Předchozí perlička

Další perlička

Poslední perlička

Klepnutím resetujte hodnoty na výchozí

Červený pruh představuje aktuálně vybraný vzorek. Mezní pruh


Karta Perlička


Aktuální vzorek

87


One Lambda, Inc.

Poklepáním na pruh přejdete na analýzu tohoto vybraného vzorku. Klepáním na tlačítka se šipkami můžete vybrat pruh perličky a zobrazit vybranou perličku v kvadrantu 2. Alternativně můžete také vybrat perličku v Návigátoru perličky nahoře. 

Osa X: Vzorky seřazené podle reaktivity (od nejslabší k nejsilnější).



Osa Y: Normalizovaná hodnota (% pozitivních).



Datové body: Pruhy představují normalizovanou hodnotu vzorku pro aktuální perličku.



Barvy pruhů: Všechny pruhy jsou zelené kromě aktuálního vzorku, který je červený.



Bílý pruh znamená vzorky s nízkou pozitivní kontrolou (PC).



Mezní linie: Mezní linie je umístěna na mezní hodnotě pro aktuální perličku (hodnoty nad touto linií jsou považovány za pozitivní).



Mezní linii v tomto histogramu lze upravovat. Postup úpravy mezních hodnot vzorku: 1. Klepněte a podržte horizontální mezní pruh a přetáhněte jej nahoru nebo dolů na nové nastavení meze. Mezní hodnota se zobrazí vedle kurzoru a změní se, jakmile přetáhnete pruh nahoru nebo dolů.

Úprava mezního pruhu

2. Chcete-li pro aktuální vzorek resetovat mezní hodnoty na výchozí hodnoty, klepněte na a vyberte výchozí volbu. tlačítko Reset 

Poklepáním na pruh vzorku se zobrazí analytický modul výsledků pro vybraný vzorek.



Najetím kurzoru na libovolný vzorek se změní barva pruhu na žlutou a zobrazí se podrobnosti o vzorku.



88


One Lambda, Inc.

Podrobnosti o vzorku



Pokud si přejete vyloučit některou perličku z analýzy, zaškrtněte pole Vyloučit. Je-li pole zaškrtnuté, vyloučí se aktuální perlička z analýzy aktuálního vzorku. Výsledky analýzy se aktualizují, aby odrážely změnu, a do pole Systémový komentář se přidá poznámka: Vyloučit perličku #[id perličky].

Vyloučená perlička v systémových komentářích



Není-li software HLA Fusion schopen určit žádné výsledky, které přesně vyhovují zadanému reakčnímu schématu, analyzuje reakci s předpokladem jedné falešné reakce ve vzorku. Pokud se přesto nenajde řešení, systém pokračuje ve vyhledávání pomocí doplňkových falešných reakcí, dokud se nevyčerpá počet přípustných falešných reakcí, anebo dokud se nenajde řešení. Nastavení falešné reakce musí být mezi minimálním nastavením 1 a maximálním nastavením 4.

Poznámka:

Bez ohledu na zde nastavený maximální počet falešných reakcí se analýza vzorku zastaví na první nalezené falešné reakci.



89


One Lambda, Inc.

Karta Nezpracované Zobrazí data pro aktuální vzorek jako tabulku hodnot. V okně analýzy LABType v kvadrantu 2 klepnutím na kartu Nezpracované zobrazíte tabulku Nezpracovaná data. Nastavení reakčního prahu blízkých perliček (pokud je zde provedeno, je konkrétní pro vzorek)

Negativní reakce Pozitivní reakce

Žádná reakce (při vyloučení perličky) Karta Nezpracované

Sloupce v tabulce Nezpracovaná data zobrazují následující typy dat: 

Reakce: (1=negativní, 8=pozitivní, 0=žádná reakce)



Nezpracovaná: nezpracovaná data pro ořezanou střední hodnotu fluorescenční



Normální: normalizovaná hodnota



Pozitivní kontrola: ID perličky s pozitivní kontrolou



Mez OLI: výchozí mez pozitivního prahu OLI



Mez vzorku: mez pozitivního prahu vzorku



Počet: počet perliček

Perličky s reakcemi, které spadají do rozsahu prahu blízkých perliček se zvýrazní žlutou barvou. 

Tyto blízké perličky jsou také uvedeny v textovém poli Blízká perlička v kvadrantu 4.



90


One Lambda, Inc.

Práh blízkých perliček pro nově importované relace LABType pomocí nabídky Pomocné nástroje > Konfigurace molekulárních produktů. Tím se nastaví rozsah blízkých perliček na základě normalizovaných hodnot, +/- k aktuální mezi u perličky, aby bylo možné perličku považovat za blízkou perličku a zvýraznit ji žlutě v tabulce nezpracovaných dat. Výchozí hodnota je 3. Chcete-li změnit prahovou hodnotu, zadejte novou hodnotu do pole Práh a stiskněte klávesu Enter. Tabulka nezpracovaných dat se ihned aktualizuje a řádky s blízkou perličkou se zvýrazní žlutou barvou. 

Klepnutím na tlačítko Maximalizovat můžete zvětšit tabulku Nezpracovaná data. Opětovným klepnutím na tlačítko tabulku Nezpracovaná data minimalizujete.



Klepnutím na libovolné záhlaví sloupce můžete seřadit tabulku Nezpracovaná data podle tohoto sloupce. Poklepáním na ID perličky vyberete perličku na kartě Perlička.



Hodnoty celkového počtu a odpovídající ID perliček červenou barvou jsou perličky, jejichž celkový počet je nižší než práh nízké pozitivní kontroly. Minimální práh počtu perliček lze nastavit pomocí nabídky Pomocné nástroje > Konfigurace molekulárních produktů nebo klepnutím na položku [Upravit] v části Konfigurace LABType domovské stránky LABType. Výchozí hodnota je 100.

Počet perliček nižší než práh nízké pozitivní kontroly

Karta Informace o perličce Po klepnutí na kartu Informace o perličce zobrazí karta alelové specificity naposledy vybrané perličky z histogramu QC nebo grafu profilu perličky a dále rozpoznávací místo sondy.

Karta Informace o perličce



91


One Lambda, Inc.

Kvadrant 3 (reakční profil) Reakční profil

Kvadrant 3 zobrazuje reakční profil pro aktuální vzorek vůči všem perličkám v analýze. Změňte hodnotu normalizovaného měřítka (osa Y)

Klepnutím zobrazíte rozdíl mezi intenzitou signálu a mezní hodnotou pro každou perličku.

Tlačítko Maximalizovat

Data reakce

Perličky v numerickém pořadí



Osa X: Perličky uvedené v číselném pořadí zleva doprava



Osa Y: Normalizovaná hodnota (% pozitivních)



Datové body: Pruh představuje normalizovanou hodnotu pro všechny perličky v aktuálním vzorku.



Barvy pruhů: Pozitivní reakce = červená; negativní reakce = modrá; aktuální perlička = zelená.



Falešně pozitivní nebo falešně negativní: světle modrá



Vyloučená perlička: šedá

Když vyberete pruh v tomto histogramu, obnoví se zobrazení histogramu profilu perličky (v kvadrantu 2) a histogramu panelu QC (v kvadrantu 1) a histogram zobrazí vybranou perličku.



92


One Lambda, Inc.

Tento histogram lze zvětšit klepnutím na tlačítko Maximalizovat v levém horním rohu. Histogram se maximalizuje na šířku obrazovky, pruhy v grafu se mohou zobrazit na větším prostoru. Opětovným klepnutím na tlačítko se vrátí původní velikost histogramu podle kvadrantu. Kosočtverce uvnitř histogramu označuje polohu aktuální meze pro každou perličku. Úpravy meze na úrovni perličky lze provádět v tomto kvadrantu přetažením šipek v pruzích. Postup úprav mezní hodnoty perličky: 

Klepněte a podržte kosočtverec meze perličky a přetáhněte jej nahoru nebo dolů na nové nastavení meze. Mezní hodnota se zobrazí vedle kurzoru a změní se, jakmile přetáhnete pruh nahoru nebo dolů. Upravte nastavení meze perličky

Klepněte a přetáhněte tyto kosočtverce -nahoru nebo dolůpro úpravu nastavení meze perličky.

Po provedení úpravy meze se kosočtverec změní na šipku ve tvaru delty , která ukazuje ve směru přesunu meze. Hrot šipky ukazuje k místu nové mezní hodnoty perličky na ose X. Šipka tvaru delta meze perličky

M ez Změnit příznak



93


One Lambda, Inc.

Po najetí ukazatelem myši na libovolný pruh se zobrazí podrobnosti perličky pro vzorek.

Ke vzorku můžete přidat komentáře zapsáním do pole Komentář dole. Poklepáním na toto textové pole se otevře větší okno pro zápis komentáře.

Do této oblasti zadávejte vlastní komentáře.

Barva červenofialová a bílá (nebo bezbarvý pruh vpravo) představují hodnoty nezpracovaných dat pro perličky s pozitivní nebo negativní kontrolou v analýze LABType:

Červenofialová Pozitivní kontrola

Nezpraco vaná data Hodnota

Osa X: Perličky v numerickém pořadí. Osa Y: Hodnota nezpracovaných dat (ořezaná střední hodnota).

Bílá

Negativní kontrola

Datové body: Pruhy představují hodnotu nezpracovaných dat perličky vůči reakci vzorku.

Perličky

Barvy/zobrazení pruhu: 

Pozitivní kontrola = červenofialová



Negativní kontrola = bílá

Chcete-li zvětšit histogram, poklepejte v prostoru mezi kvadrantem 1 a 3. Chcete-li vrátit histogram do původní velikosti, poklepejte znovu mezi kvadrant 1 a 3. Anebo klepněte na tlačítko Maximalizovat/minimalizovat .

Chcete-li zobrazit data Delta (rozdíl mezi vygenerovaným signálem a mezním bodem pro každou perličku), klepněte na tlačítko Zobrazit Delta. Kvadrant 3: Zobrazení Delta



94

One Lambda, Inc.


Chcete-li se vrátit do normalizovaného zobrazení, klepněte na stejné tlačítko, které nyní nese nápis Zobrazit normální . Přejete si zobrazení Delta nastavit jako výchozí zobrazení, aby se automaticky zobrazilo pokaždé, když se do okna analýzy LABType přenese vzorek?



Uložte rozvržení, když je tento kvadrant v režimu zobrazení Delta, klepnutím na tlačítko Uložit rozložení .

Po ukončení aplikace Fusion a novém přihlášení budou relace LABType zobrazovat kvadrant 3 v režimu zobrazení Delta.

Kvadrant 4 (výsledky testu)

Kvadrant 4 obsahuje výsledky typizace pro aktuální vzorek. Obecně výsledky typizace zahrnují možné výsledky a uživatelská přiřazení pro alelové páry, kódované výsledky, výsledky sérologického ekvivalentu a další přiřazení. Levá strana zobrazuje různá přiřazení párové karty navržená softwarem. Všechna závěrečná přiřazení musíte provést přenesením navrženého páru do oblasti závěrečného přiřazení nebo zapsáním alelového páru. Zde je k dispozici pět karet: 

Karta Páry obsahuje možné výsledky alelových párů, které vyhovují reakčnímu schématu pro vzorek.



Karta Vynutit obsahuje seznam alternativních možných výsledků alelových párů pro každou perličku, je-li povolena doplňková falešná reakce.



Pokud na kartě Typ/podtyp vyberete alelu v jednom seznamu, zvýrazní se vyhovující alela (alely) ve druhém seznamu na znamení možných shod.



Karta Shoda obsahuje kódovaný formát skutečného párování alel pro vzorek.



Karta Sero (sérologie) obsahuje data všech navržených sérologických ekvivalentů pro vzorek na základě možných párů alel.

Pravá strana zobrazuje možná přiřazení alelových kódů pro vzorek a reakce blízkých perliček.



95


One Lambda, Inc.

Kvadrant 4 – výsledky testu

Karta Páry Karta Páry obsahuje možné výsledky alelových párů, které vyhovují reakčnímu schématu pro vzorek. Páry navrhuje software HLA Fusion.



Seznam uvádí páry a seskupuje je buď podle párů s plnou shodou (žádné falešné reakce) nebo podle počtu falešných reakcí.



Výsledky s falešnými reakcemi jsou uvedeny s označenou falešně reagující perličkou/jamkou.



Výsledky se zobrazí s jedním párem alel na řádek.



Možné homozygotní NMDP kódované výsledky jsou zmíněny v poli Systémový komentář.



96


One Lambda, Inc.

Páry alel jsou seskupené podle skupin demografické frekvence: 

G1 (frekventní na obou alelách)



G2 (frekventní na jedné ze dvou alel)



G3 (není frekventní ani na jedné alele)

Každá skupina alelových párů je označena „(G#)“ na konci každého páru alel na znamení demografické frekvence. Pokud nejbližší vyhovující výsledky obsahují falešnou reakci, je uvedena také perlička s falešnou reakcí. Žádné řešení se zobrazí, pokud nejsou získány žádné výsledky, které by vyhovovaly reakcím vzorku v rámci přípustného počtu falešných reakcí. Pokud tato situace nastane, zvyšte počet falešných reakcí a zopakujte analýzu.

Přiřazení páru alel ze seznamu navrhovaných Poklepáním na pár alel pod kartou Páry přiřadíte pár do oblasti závěrečného přiřazení párů alel. Alternativně můžete klepnutím zvýraznit alelový pár v seznamu pod kartou Páry a klepnutím na šipku dolů V (přiřadit) vedle titulku Přiřazené alelové páry jej přidáte do oblasti závěrečného přiřazení. Lze přiřadit více alelových párů. Chcete-li zrušit přiřazení, klepněte a zvýrazněte přiřazení v seznamu Přiřazené alelové páry a klepněte na tlačítko X (odstranit). Přiřazení a odstranění párů alel

Poklepejte na pár a přesuňte jej do oblasti závěrečného přiřazení.

Proveďte výběr a klepnutím na tlačítko X odstraňte přiřazený pár.

…nebo klepněte zde na tlačítko Přiřadit.



97

One Lambda, Inc.


Ruční přiřazení páru alel

Ruční přiřazení musíte zadat v poli Ruční zadání, ve standardním formátu nomenklatury alel. Alely oddělujte mezerou. 1. Zadejte přiřazení do textového pole pod oblastí Přiřazené páry alel.

Oblast ručního přiřazení

2. Stiskněte klávesu Enter a zadejte typizovanou alelu do seznamu Přiřazené páry alel výše.

Přiřazení můžete také zadat do pole Ruční zadání: vyberte navržený alelový pár, klepněte na tlačítko . Přiřadit (V) a přesuňte pár do pole Ruční zadání a poté stiskněte klávesu Enter Poznámka:

Pokud zvýrazníte více než jeden alelový pár v seznamu párů, přiřadí se do pole ručního zadání pouze první zvýrazněný pár.

Karta Vynutit Karta Vynutit obsahuje seznam alternativních možných výsledků alelových párů pro každou perličku, je-li povolena doplňková falešná reakce. Jinými slovy, pokud je k dispozici výsledek s plnou shodou, systém vyhodnotí vzorek s jedinou falešnou reakcí. 

Tento seznam platí pouze pro jednu (1) vynucenou falešnou reakci.



Všechny výsledky jsou seskupeny podle perliček a reakcí: výchozí je seznam perliček ve vzestupném pořadí s falešně negativními reakcemi uvedenými nejdříve.



Tento nástroj používejte pro přiřazení homozygotních nebo vzácných alel.



Falešné reakce se zobrazí jako světle modré pruhy na histogramu v kvadrantu 3, což usnadňuje vyhledání a prohlížení dat perliček.



98


One Lambda, Inc.

Klepnutím na znaménko plus (+) zobrazíte navržené přiřazení alelového páru sdružené s perličkou a typem reakce.

Klepnutím seřadíte podle falešně pozitivních nebo falešně negativních

Klepnutím na znaménko minus (-) se informace sbalí.

Klepnutím zde otevřete všechny výsledky alelových párů pro všechny perličky.

Klepnutím na toto tlačítko zkopírujete a uložíte data do schránky a můžete je vložit do tabulky Excel.

Výsledky jsou seskupené podle perličky a typu reakce: falešně negativní (FN) nebo falešně pozitivní (FP). Pořadí můžete měnit klepnutím na tlačítko Alela 1, Alela 2 nebo FP/FN, dokud nejsou výsledky seřazeny podle vašeho gusta. 

Klepnutím na libovolné znaménko plus (+) zobrazíte navržené přiřazení alelového páru sdružené s perličkou a typem reakce.

Klepnutím na tlačítko Rozbalit vše otevřete zobrazení všech výsledků alelových párů pro všechny perličky. Klepnutím na tlačítko Sbalit vše zavřete souběžné zobrazení všech výsledků pro všechny perličky. 

Klepnutím na položku Kopírovat data odešlete kopii těchto dat do systémové schránky, aby je bylo možné vložit do tabulky aplikace Excel.

Karta Typ/podtyp

Alela 1 vyhovuje pro vybraný výsledek alely 2.

Je-li vybrána alela z levé strany seznamu, zvýrazní se na pravé straně vyhovující alela (alely) na znamení možných shod ve výsledcích.

Karta Typ/podtyp HLAF-MAN-v3.x.x-CS-00, verze 0 (Uživatelská příručka pro HLA Fusion v3.x.x)


99


One Lambda, Inc.

Poznámka:

Umístění dvou seznamů vedle sebe neznamená automaticky spárování alel.

Karta Shoda Karta Shoda obsahuje kódovaný formát skutečného párování alel pro vzorek. Vyhovující reakční pár je párem alel (nebo skupinou alel) s reakčním schématem, které úplně vyhovuje reakčnímu schématu aktuálního vzorku.



Tento výsledek se liší od výsledků Možný kód alely. Možný kód alely shrnuje výsledky pokud možno do jednoho kódu.



Najetím kurzoru na kódový formát alely se zobrazí definice jejího kódu.

Karta Shoda

Karta Sero Karta Sero (sérologie) obsahuje data všech navržených sérologických ekvivalentů pro vzorek na základě možných párů alel. Poznámka:

Zkontrolujte, že jste pomocí nabídky Pomocné nástroje importovali aktuální soubor ekvivalentů pro sérologii. Pokud jste v konfiguraci produktu LABType zaškrtli pole Sérologie přiřazená počítačem, bude mít úprava mezních hodnot vzorku automaticky za následek přiřazení sérologie.

U vzorku lze vždy provést pouze jedno přiřazení sérologie na jeden lokus. Aktuální přiřazení sérologie se proto při přiřazení jiné sérologie nahradí.



100


One Lambda, Inc.

Sérologický ekvivalent Alelové páry sdružené se sérologickým ekvivalentem

Přiřadit Tlačítko

Sérologické přiřazení

Karta Navržený ekvivalent pro sérologii

1. V kvadrantu 4 klepnutím na tlačítko Sero zobrazíte ekvivalenty pro sérologii pro aktuální vzorek v horním podokně karty nad sdruženými alelovými páry. 2. Poklepáním na ekvivalent nebo jeho zvýrazněním a následným klepnutím na tlačítko V (přiřadit) jej zkopírujte do pole Přiřazená sérologie. 3. Klepnutím na tlačítko X (odstranit) odstraňte přiřazení sérologie, anebo proveďte nahrazení vybráním a přiřazením jiné ekvivalence. Poznámka:

Chcete-li nastavit výsledky automaticky přiřazené sérologie, zvolte položku Sérologie přiřazená počítačem na stránce konfigurace produktu LABType.

Vyloučení sond Exon 3 pro lokus

Zaškrtávací pole DQB1 se zobrazuje kvůli výsledku Žádné řešení

Pokud analyzujete vzorky ze sady DPA/DPB nebo DQA/DQB obsahující sondy Exon 3, mohou některé výsledky vést k falešným reakcím nebo k žádnému řešení. Je to způsobeno omezenými sekvenčními informacemi dostupnými pro sondy Exon 3. U takových vzorků můžete zvolit analýzu bez sond Exon 3.



101


One Lambda, Inc.

Jak ukazuje příklad, pokud se u vzorků s těmito loky vyskytne falešná reakce nebo žádné řešení, zobrazí se zaškrtávací pole, které umožňuje vyloučit sondy Exon 3. Zaškrtávací pole se zobrazuje u falešných reakcí. Jestliže vyloučíte sondy Exon 3 pro určitý lokus, má to následující důsledky: 

Do pole systémového komentáře se přidá poznámka (Vyloučit sondy Exon 3 pro ).



Všechny sondy Exon 3 se zobrazí jako šedé pruhy v reakčním profilu (kvadrant 3).



Zobrazí se zaškrtávací pole se zaškrtnutím.

Poznámka:

Pokud napravíte výsledek s falešnou reakcí nebo žádným řešením pomocí úpravy mezí bez nutnosti vyloučit sondy Exon 3, přestane se zaškrtávací pole zobrazovat. Všechna ruční vyloučení sond Exon 3 anebo globální úpravy se zachovají tak, jak jsou, ať už jsou sondy Exon 3 přidány nebo vyloučeny.

Přiřazení alelových kódů Přiřazení alelových kódů se provádí na panelu kvadrantu 4 úplně vpravo. 

Pole Možný kód alely zobrazuje možné kódované výsledky pro všechny páry, které plně vyhovují vzorku.



Typ použitého kódu závisí na volbě v konfiguraci aplikace Fusion pro analýzu LABType, nebo pro tento příklad – kód NMDP, (výchozí) lokální kód, (uživatelsky definovaný) nebo žádný kód.



Možný kódovaný výsledek je uveden v horní části pole.



Kódovaná definice je uvedena pod ním.



Pokud nejsou k dispozici žádné kódy pro navrhované alely, uvede se návrh jako XX, tzn. kód není definován.



V případě více návrhů XX je každý návrh odlišen od ostatních číslováním, například XX1, XX2 atd.

Nedefinováno Kód alely

Nedefinovaný kód alely



Alelové kódy zobrazené v poli Možný kód alely jsou systémem kondenzovány na základě návrhů možných alelových párů v seznamu na kartě Páry.



102


One Lambda, Inc.



Kód alely je založen na aktuálním kódu NMDP nebo lokálním kódu nainstalovaném v systému. Podle výchozího nastavení systém přiřadí alelám kódy NMDP. Tyto kódy můžete alternativně změnit na Žádný kód, Lokální kód nebo Křížový kód.



Žádné řešení se zobrazí, pokud nejsou získány žádné výsledky, které by vyhovovaly reakcím vzorku v rámci přípustného počtu falešných reakcí. Jestliže vzorek neukazuje žádné řešení, zvyšte počet falešných reakcí v pravém horním kvadrantu pro navrhovaný výsledek.

Přiřazení alelových kódů



Poklepejte na možný kód alely nebo vyberte navržený kód a klepněte na tlačítko V (přiřadit).



Klepnutím na tlačítko X (odstranit) odstraníte přiřazení kódu alely.

Ruční přiřazení alelových kódů 1. Zadejte přiřazení do textového pole hned pod Přiřazeným kódem alely. Zkontrolujte zadání přiřazení ve správném formátu alelového kódu: 

Nový nomenklaturní formát: X*##:##(####) X*##:##(####), kde X=typ loku a #= číslo kódu).



Dřívější nomenklaturní formát: X*#### X*####, kde X=typ loku a #= číslo kódu).

Pokud tak neučiníte, aplikace Fusion nepřijme kód a vyzve vás k nápravě. Poznámka:

Jestliže klepnete na tlačítko Přeložit zobrazíte alely v novém nomenklaturním formátu, nemůžete zadat ruční kód alely, dokud nezopakujete analýzu vzorku a dokud se alely znovu nezobrazí v dřívějším nomenklaturním formátu.



103


One Lambda, Inc.

Stisknutím klávesy Enter Poznámka:

přemístíte zadaný kód alely do pole Přiřazený kód alely.

Máte-li homozygotní výsledek, lze přiřazený kód upravit v poli Ruční kód alely tak, aby zobrazoval homozygotní kódované výsledky jednou.

Neznámé kódy alel Neznámé kódy alel jsou označeny jako XX s následným pořadovým číslem. Čísla u každého vzorku a loku začínají od 1. Pokud se vám zobrazí neznámé kódy, ověřte nejprve, že jste importovali nejnovější soubor NMDP. Máte-li poslední soubor kódů, a přesto se zobrazují kódy XX, můžete tyto neznámé kódy uložit pro pozdější odeslání do NMDP v souboru .txt nazvaném nmdp_code_report.txt, (podle výchozího nastavení je uložen ve složce C:\OLI Fusion\data\NMDPExport), umístění však lze změnit úpravou cesty v položce Pomocné nástroje > URL a cesty). Kódové informace v tomto textovém souboru přibývají tak, jak se postupně přidávají; poslední přídavky jsou nejníže. 1. V poli Možný kód alely klepnutím na kód XX zobrazíte tlačítka Zprávy o kódech NMDP (napravo od pole Systémový komentář). Tlačítka zprávy o kódech NMDP: Klepněte na tlačítko Přiřadit (V) a vyberte jednu z následujících možností: 

Chcete-li odeslat informace o neznámých kódech do NMDP, klepněte na tlačítko +RPT . Jste-li připojeni k internetu, aplikace Fusion otevře webovou stránku Bioinformatics.NMDP.Org.



104


One Lambda, Inc.



Chcete-li přidat informace o neznámých kódech do textového souboru (podle výchozího nastavení uložen ve složce C:\OLI Fusion\data\NMDPExport), klepněte pravým tlačítkem myši na tlačítko +Rpt a vyberte položku Uložit do textového souboru.





Po uložení informací o neznámých kódech aplikace Fusion zobrazí potvrzovací zprávu, že testový soubor byl uložen.

Chcete-li přidat informace o neznámých kódech do souboru Excel (podle výchozího nastavení uložen ve složce C:\OLI Fusion\data\export\NMDPExport), klepněte pravým tlačítkem myši na tlačítko +Rpt a vyberte položku Uložit do souboru Excel.

Po uložení tabulkového souboru aplikace Fusion zobrazí potvrzovací zprávu.

Jakmile jste hotovi, můžete klepnutím na tlačítko Zavřít (napravo od tlačítka +Rpt) zrušit zobrazení tlačítek. Poznámka:

Tlačítko +Rpt zachová poslední provedený výběr (přímý, text nebo Excel), takže jej lze rychle použít. Pokud nezměníte výběr, můžete při příštím vytváření zprávy o kódech XX jednoduše klepnout na tlačítko +Rpt.

Jiné přiřazení Pole Jiné přiřazení lze použít pro vytvoření přiřazení, které není omezeno na určitý formát. Kromě toho můžete zvýraznit a přidat sérologii nebo pár alel nebo přiřazení kódu a přidat je do pole pro úpravu. Jiná přiřazení můžete vytvářet jedním ze dvou způsobů: 

Zadejte pár alel nebo kód alely do pole Jiné přiřazení.



Klepněte na tlačítko V (přiřadit) a vyberte jednu ze dvou možností:



105


One Lambda, Inc.

1. Chcete-li přiřadit pouze možný kód alely, vyberte položku Přiřadit možný kód alely, aby se zvýrazněný Možný kód alely přenesl do pole Jiné přiřazení. 2. Výběrem možnosti Přiřadit vše můžete přenést přiřazení Možný kód alely, Přiřazená sérologie nebo Přiřazené páry alel do pole Jiné přiřazení. Můžete také podle potřeby vybrat úpravu libovolného zkopírovaného kódu. Zadané alely se přiřadí a přidají do spouštěných zpráv, které obsahují tento vzorek, avšak přiřazení alel provedená tímto způsobem se neuvádějí v poli závěrečného přiřazení pro tento vzorek.

Opakovat analýzu Jestliže jste do systému importovali soubor nových kódů NMDP, lokálních kódů nebo ekvivalentů pro sérologii nebo změníte počet falešných reakcí přípustných pro vzorek bez řešení, můžete klepnutím na tlačítko Opakovat analýzu analyzovat data pomocí nového referenčního souboru (souborů) nebo reflektovat změny falešných reakcí. Tlačítko Opakovat analýzu

Poznámka:

Tato nová analýza nahrazuje pouze NMDP, lokální nebo sérologické kódy nebo analyzuje s odlišným nastavením falešných reakcí. Všechny ostatní změny nastavení obecně vedou k automatickému opakování analýzy vzorku bezprostřední po změně nastavení.

Analyzovat kombinované relace LABType Software HLA Fusion podporuje funkci kombinované analýzy pro relace analýzy LABType i Micro SSP. V kombinované analýze se reakce z obou testů stejného vzorku zkombinují do jediné analýzy, která může vygenerovat výsledek s vyšším rozlišením. Předchozí test musí mít stejné ID vzorku. Poznámka:

Chcete-li kombinovat generický vzorek nebo HD vzorek LABType pomocí Exon 4-7, je nutné kombinaci provést od Exon 4-7.



106

One Lambda, Inc.


V okně analýzy klepněte na tlačítko Analyzovat kombinované . Další místní okno zobrazí seznam předchozích relací, které použily stejný vzorek a sdílejí stejné ID vzorků.

1. Vyberte požadovanou předchozí relaci (relace) zaškrtnutím sdruženého pole Kombinovat. 2. Klepněte na tlačítko Analyzovat

dole v místním okně.



Tabulka reakčních schémat obsahuje informace o perličkách pro všechny testy vzorku. ID perliček v této tabulce slouží pro indikaci, že vybrané relace byly zkombinovány a zanalyzovány.



Jestliže zkombinujete jeden vzorek ve starším nomenklaturním formátu se vzorkem v novějším nomenklaturním formátu, zobrazí se možné a přiřazené páry alel i kód v novém formátu. Pokud vzorek se starším nomenklaturním formátem obsahuje alelu, která není součástí nové nomenklatury, bude starší alela zanedbána.

Chcete-li znovu spustit kombinovanou analýzu, klepněte na tlačítko Znovu analyzovat kombinované. 

Pokud nesouhlasí data aktuální nomenklatury a nomenklatury (nomenklatur), které se s ní kombinují, zvýrazní se vybraná relace (vybrané relace) červeně.



Jestliže klepnete na tlačítko Analyzovat a data nomenklatur nesouhlasí, zobrazí se varovná zpráva s možností pokračovat nebo přerušit kombinovanou analýzu. Pokud zvolíte pokračování, použije se nomenklatura testu vzorku vybraného pro zkombinování s aktuálním testem.

Přidání uživatelských komentářů do vzorků Komentáře, které uživatel nebo systém přidá do pole Komentáře, se zobrazí s výsledky funkcí aktuální relace analýzy, vyhledávání data a vytváření zpráv v softwaru HLA Fusion. Jsou rozděleny na uživatelské a systémové komentáře. Přidávat a upravovat můžete pouze komentáře v poli uživatelských komentářů.

1. V okně analýzy zadejte komentáře do pole Uživatelský komentář pod oblastí Přiřazení (maximálně 255 znaků).



107


One Lambda, Inc.

Pro otevření větší oblasti komentářů

Poklepejte kdekoli v této oblasti…

Pole Komentář

Komentáře se uloží až po klepnutí na tlačítko Uložit

nebo Potvrdit

.

Označení vzorku příznakem pro další testování

Nutnost dalšího testování vzorku můžete označit zaškrtnutím pole Další test. Indikace Další test se zobrazí ve výsledcích, vyhledávání dat a ve zprávách pro vzorek.

Přiřazení výsledků sérologie a alelových kódů k pacientovi Poznámka:

Tato funkce je dostupná pouze pro vedoucí pracovníky laboratoře a pro uložené vzorky.

Toto zaškrtávací políčko je zašedlé, dokud se vzorek neuloží nebo nepřiřadí, a může jej zaškrtnou pouze osoba s oprávněními vedoucího laboratoře. Je-li zaškrtnuté, výsledky sérologie a alelových kódů se následně přidají do záznamu pacienta. 

V okně analýzy zaškrtněte pole Přiřazení pacienta umístěné pod oblastí Přiřazení.



Klepnutím na volbu Potvrdit>> zachováte nastavení.



108

One Lambda, Inc.




Pokud jste předtím přiřadili k pacientovy výsledky, zobrazí se zpráva s dotazem, zda si přejete přepsat předchozí přiřazení.

Tlačítko Tisk obrazovky vytiskne aktuálně zobrazené okno analýzy. 

Na obrazovce analýzy můžete klepnutím na tlačítko Tisk obrazovky Fusion vytisknout aktuální obrazovku analýzy.

na panelu nástrojů

Náhled nebo tisk zpráv

Chcete-li zobrazit zprávu LABType pro aktuální vzorek, použijte tlačítko Náhled zprávy případně Tisk zprávy na panelu nástrojů. V okně Analýza klepnutím na tlačítko Náhled zprávy nebo na tlačítko Tisk zprávy zobrazit seznam zpráv, které lze prohlédnout nebo vytisknout pro aktuální vzorek.

Anebo najeďte ukazatelem myši na tlačítko Tisk zobrazil seznam dostupných zpráv.

Poznámka:

, aby se

Jestliže zvolíte Molekulární vlastní, nebudete moci v tuto chvíli vytvořit novou vlastní zprávu. V okně analýzy jsou dostupné pouze vlastní zprávy, které jste předtím vytvořili v okně Zprávy.



109

One Lambda, Inc.


Přiřadit kódované výsledky Pomocí tlačítka Přiřadit přiřaďte a uložte všechny jednoznačné možné kódované výsledky (výsledky, pro které je obdržen pouze jeden kódovaný výsledek). Pro přiřazení sérologických nebo alelových párů, nebo pokud si v případě nejednoznačných výsledků chcete vybrat, musíte výsledky ručně přesunout do . Přiřazených a klepnout na tlačítko Uložit

Přeložit (pouze jiný než aktuální nomenklaturní formát) Tlačítko Přeložit se zobrazí pouze v případě, že formát alely vzorku je ve starší nomenklatuře. Klepnutím na tlačítko Přeložit se provede následující: 

Přeloží a zobrazí všechny přiřazené (kromě pole Jiné přiřazení) a možný alelový kód/páry/haplo v nejnovějším nomenklaturním formátu.



Pokud nelze nalézt vyhovující alelu v novém formátu, zůstane alela zobrazená ve starém formátu.



Můžete zobrazit a vytisknout toto zobrazení, avšak výsledky nelze v tomto novém nomenklaturním formátu uložit ani z nich vytvořit zprávu.



Chcete-li se vrátit do staršího alelového formátu, můžete přejít na jiný vzorek a potom se vrátit na tento vzorek.

Uložit přiřazení Poznámka:

Zkontrolujte provedení přiřazení ještě před uložením.

Laboratorní technici a vedoucí pracovníci mohou uložit výsledky analýzy pro pozdější prohlížení a schvalování. Uložené vzorky jsou k dispozici pro potvrzení pouze vedoucím laboratoře. 

umístěné v pravém dolním rohu V okně analýzy klepnutím na tlačítko Uložit obrazovky analýzy můžete uložit výsledky analýzy pro všechny specificity aktuálně uvedené v rámečku výsledků Závěrečné přiřazení.



Tlačítko Uložit>> nepřiřazuje výsledky, pouze uloží výsledky vzorku a komentáře.



110

One Lambda, Inc.

Poznámka:


Jestli jsou přidány komentáře, je nutné uložit vzorek, aby se také uložily komentáře.



Po uložení aplikace Fusion automaticky přejde k dalšímu vzorku.



Pro potvrzení vedoucí potřebuje přístup ke vzorku, pro který jste uložili přiřazení. Na vzorek se můžete vrátit kdykoli před potvrzením.



Pokud potřebujete provést změny, klepněte na tlačítko Opakovat analýzu znovu na tlačítko Uložit.

a potom

Potvrdit přiřazení

Potvrdit výsledky může vedoucí laboratoře. Jakmile tak učiní, vzorky se označí jako Schválené. Tlačítko Potvrdit se zbarví fialově, když prohlížíte potvrzený vzorek. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Uložit umístěné v pravém dolním rohu okna můžete potvrdit všechny výsledky analýzy, které byly uloženy v rámečku výsledků Závěrečné přiřazení.



Automaticky se přesunete na další vzorek a pokračujete v potvrzování výsledků.



Když se poprvé vrátíte k potvrzenému vzorku, zobrazí se tlačítko Potvrdit fialové na znamení, že už vzorek již byl dříve potvrzen.



v barvě

111


One Lambda, Inc.

Volby nabídky po klepnutí pravým tlačítkem myši v Navigátoru pro LABType Volby na úrovni relace K dispozici jsou tři položky nabídky, které se zobrazí při klepnutí pravým tlačítkem myši na aktivní relaci v Navigátoru (nejprve vyberte relaci klepnutím levým tlačítkem myši): Volby nabídky Navigátoru na úrovni relace

Vytvořit laboratorní QC Umožňuje uložit soubor katalogu a parametry QC z vybrané relace jako panel Laboratorní QC. 

Lokální QC je nastaveno podobně jako soubor katalogu, kde uživatel může po spuštění nové analýzy vybrat lokální QC v seznamu katalogů. Informace lokální QC se pak používá v relaci analýzy namísto One Lambda QC.



Při výběru se zobrazí dialogové okno a vyzve uživatele k zadání názvu nového laboratorního QC (výchozí název = [aktuální ID katalogu]_LAB).

Dialogové okno Vytvořit novou relaci QC



112


One Lambda, Inc.

Po potvrzení nebo zadání názvu klepněte na tlačítko

Vytvořit.



Systém následně uloží aktuální relaci jako lokální QC s použitím vybraného názvu rozšířeného o datum a časové razítko (formát: rrrrmmddhhmmss).



U nových relací je toto lokální QC dostupné pro výběr z rozbalovacího seznamu katalogových souborů při importu relací LABType.



Toto QC je také uvedeno v rozbalovacím seznamu Zobrazit QC prostřednictvím nabídky konfigurace vzorků LABType, když otevřete novou relaci analýzy.

Lokální QC po výběru ze Zobrazit laboratorní QC

Prohlížení relace Tato položka nabídky po klepnutí pravým tlačítkem myši nabízí několik podnabídek (kritéria filtru) pro prohlížení vzorků v relaci podle typu obdržených výsledků: 

Prohlédnout vše (výchozí) – jsou uvedeny všechny vzorky a jsou dostupné pro analýzu.



Jediný pár – zobrazí se pouze vzorky s jednoznačnými výsledky (vzorky zobrazené s červenými čtvercovými značkami v grafu Přehled výsledků na kartě Přehled relace).



Několik párů – zobrazí se pouze vzorky s nejednoznačnými výsledky (vzorky zobrazené s oranžovými čtvercovými značkami v grafu Přehled výsledků na kartě Přehled relace).



Neanalyzováno – při výběru Navigátor zobrazí pouze vzorky nebo relace, které byly naimportovány, dosud se však neanalyzovaly. Tyto relace se zobrazí modře.



113

One Lambda, Inc.


Neshoda – zobrazí se pouze vzorky s žádným řešením (vzorky zobrazené s šedými čtvercovými značkami v grafu Přehled výsledků na kartě Přehled relace). 

Falešná reakce – zobrazí se pouze vzorky s falešnou reakcí (vzorky zobrazené s růžovými čtvercovými značkami v grafu Přehled výsledků na kartě Přehled relace).

Vzorky v relaci, na kterou klepnete pravým tlačítkem myši, jsou filtrované na základě vybrané volby podnabídky. Kritéria filtrování se následně načtou do seznamu dávkové navigace. Aplikace Fusion poté přejde do okna analýzy, kde se vzorky zobrazí seřazené podle seznamu dávkové navigace.

Opakovat analýzu s novou nomenklaturou Umožňuje opakovat analýzu relace s použitím nového nebo aktualizovaného katalogového souboru.

1. Upravte nebo přejmenujte ID staré relace zadáním ID nové relace. 2. Klepněte na šipku rozbalovacího seznamu v poli ID nového katalogu a vyberte v seznamu nový katalogový soubor. 3. Klepněte na tlačítko Analýza. Relace, na kterou jste klepli pravým tlačítkem myši, se nyní znovu zanalyzuje s použitím vybraného katalogového souboru.

Volby na úrovni vzorku Při klepnutí pravým tlačítkem myši na aktivní vzorek v Navigátoru se zpřístupní dvě volby nabídky (vyberte nejprve vzorek klepnutím levým tlačítkem myši) Související záznamy a Analýza vedle sebe.



114


One Lambda, Inc.

Související záznamy Související záznam je záznam, který je přidružen k aktuálnímu vzorku prostřednictvím pacienta nebo ID vzorku. Poznámka:

Tato možnost je také dostupná, když použijete tlačítko panelu nástrojů Související záznamy .

Výběrem této možnosti nabídky načtěte všechny záznamy související s aktuálním vzorkem do rozevíracího seznamu vzorků.

Rozevírací seznam vzorků pro související záznamy



Pomocí navigačních šipek vzorku zobrazte jednotlivě analýzu každého souvisejícího záznamu.



Pokud se chcete vrátit k zobrazení vzorků v aktuální relaci, klepněte na odkaz <<Souhrn v horní části okna.

Srovnávací analýza Tuto možnost použijte k porovnání analýzy aktuálního vzorku s dříve provedenou analýzou. Poznámka:

Tato možnost je dostupná také pomocí tlačítka panelu nástrojů Srovnávací analýza .

Aktuální analýza vzorku na obrazovce má světle hnědé pozadí.

Možnost nabídky srovnávací analýzy HLAF-MAN-v3.x.x-CS-00, verze 0 (Uživatelská příručka pro HLA Fusion v3.x.x)


115

One Lambda, Inc.


Výběrem předchozí analýzy vzorku ze zobrazeného seznamu proveďte porovnání s aktuální analýzou. 1. Klepněte na tlačítko OK a okna těchto dvou analýz se pak zobrazí v okně porovnání.

Aktuální analýza


Příklad oken srovnávací analýzy

Velikost jednotlivých oken lze změnit nebo je lze posunout pomocí funkce táhnout a pustit. 1. Klepnutím na tlačítko panelu nástrojů Srovnávací analýza

zobrazení porovnání zrušíte.

Průzkumník aplikace Fusion Možná dáte přednost odebrání Průzkumníka aplikace Fusion podél levé strany obrazovky (nazývané také panel domovské stránky) kvůli zvětšení plochy obrazovky dostupné pro analýzu, nebo z důvodu osobních preferencí.



116

One Lambda, Inc.


Chcete-li dočasně odebrat Průzkumník aplikace Fusion, postupujte takto: 1. Klepněte pravým tlačítkem na tmavě modré políčko v horní části Průzkumníka aplikace Fusion (pokud je šedé, klepněte na něj a změní se v modré). 2. Klepněte na tlačítko Skrýt a Průzkumník aplikace Fusion zmizí. Chcete-li Průzkumník aplikace Fusion obnovit, klepněte na ikonu Domů

na panelu nástrojů.

Chcete-li ponechat Průzkumník aplikace Fusion jako dočasně plovoucí nad oknem analýzy, postupujte takto: 1. Klepněte pravým tlačítkem na tmavě modré políčko v horní části Průzkumníka aplikace Fusion. 2. V rozevírací nabídce vyberte možnost Plovoucí a Průzkumník aplikace Fusion se změní na neukotvený. Klepnutím levým tlačítkem na tmavě modrou oblast změníte polohu Průzkumníku aplikace Fusion. a. Průzkumníka aplikace Fusion můžete umístit kamkoli v horní části okna analýzy. b. Nebo pomocí myši klepněte, táhněte a pusťte Průzkumníka aplikace Fusion podél horní části, dolní části nebo po stranách hlavní obrazovky a ukotvěte jej na novém místě. Chcete-li vrátit Průzkumníka aplikace Fusion zpět do výchozí polohy, klepněte, táhněte a pusťte Průzkumníka úplně vlevo na hlavní obrazovce.



117

One Lambda, Inc.


Analýza Micro SSP Typizační karty HLA Micro SSP™ používají technologii sekvenčně specifického primeru. Tyto karty jsou dostupné v 96jamkovém formátu. Výsledky analýzy jsou založeny na specifikacích katalogu, kódu NMDP a referenčních ekvivalentu pro sérologii, které můžete naimportovat prostřednictvím softwaru aplikace Fusion. Software navrhne přiřazení alelových párů, ale konečné přiřazení musí provést uživatel. Výsledky lze uložit v databázi pro další kontrolu laboratorními techniky a konečné schválení vedoucími laboratoře. Existuje několik dalších věcí, které by měly být dokončeny nebo ověřeny předtím, než spustíte relaci analýzy: 

Před provedením analýzy se ujistěte, že máte poslední katalogové soubory a také kód NMDP, místní kód (pokud se používá) nebo referenční soubory ekvivalentu pro sérologii. Katalogy můžete stáhnout nebo je aktualizovat z domovské stránky Micro SSP.



Zobrazit a upravit globální nastavení konfigurace produktu před spuštěním analýzy. Globální nastavení se zobrazuje a lze jej upravit na domovské stránce Micro SSP. Globální nastavení platí ve všech nově importovaných relacích.



Po uložení nebo potvrzení jednoho vzorku je výchozím nastavením aplikace HLA Fusion automatický přechod na další vzorek. Chcete-li zůstat u daného vzorku, proveďte změnu v části všeobecných konfigurací domovské stránky Průzkumníka aplikace Fusion.

Poznámka:

Některé výše uvedené úkoly vyžadují, abyste měli práva vedoucího uživatele. Možná si budete muset ověřit u svého vedoucího, zda byly tyto úkoly provedeny.



118


One Lambda, Inc.

Spuštění analýzy Micro SSP 1. Klepněte na tlačítko Micro SSP Micro SSP Micro SSP.

na panelu domovské stránky nebo na ikonu

na panelu nástrojů aplikace Fusion nebo vyberte možnost Analyzovat data >

Zobrazí se domovská stránka Micro SSP. Klepnutím otevřete obrazovku správy katalogu.

Klepnutím otevřete obrazovku aktualizace referenčních b ů Klepnutím otevřete obrazovku dostupných referenčních aktualizací. (katalogy zobrazují data nomenklatury a revizní poznámky)

Klepnutím otevřete globální nastavení MicroSSP.

Klepnutím na libovolný odkaz zobrazte vybraný katalog, pracovní list nebo pracovní listy sondy/primeru.

Poznámka:

Otevřením pracovních listů a listů sondy/primeru ověřte správnost čísel revizí (tyto dokumenty neobsahují ve svém názvu souboru číslo revize).

1. Začněte klepnutím na tlačítko Zadání dávky vlevo nahoře na obrazovce. Chcete-li vyvolat také dávky, které již byly importovány dříve, zaškrtněte políčko u položky Zahrnout importované. Zobrazí se okno Zadání dávky.



119


One Lambda, Inc. Vyberte lokus pro filtrování seznamu katalogů

Procházením vyhledejte soubory CSV analýzy Micro SSP

Pole Název vzorku

Pole ID pacienta

Spusťte novou dávku

Uložte aktuální informace o dávce

Přejděte na obrazovku analýzy

Systém automaticky přiřadí název dávky. Název můžete volitelně změnit. Poznámka:

Dávka musí být v rámci databáze aplikace Fusion pro každý typ produktu jedinečná. Pokud již existuje, software vás vyzve k přejmenování dávky. Důrazně doporučujeme, abyste v tomto poli nepoužívali žádné speciální znaky, protože mohou sloužit specifickému účelu jako oddělovače polí.

2. Pomocí tlačítka (...) ve spodní části okna vyhledejte a importujte jeden nebo více souborů Micro SSP .csv nebo postupujte podle níže uvedených kroků. 3. Pomocí rozevírací nabídky v poli Filtr lokusů vyberte lokus, podle kterého se bude filtrovat seznam katalogů. Tím se seznam katalogů v dalším poli omezí pouze na katalogy, které obsahují vybraný lokus. 4. Pomocí rozevírací nabídky v poli Katalog vyberte katalogový soubor. Poznámka:

Potřebujete-li importovat další katalogy, klepněte na odkaz Stahování na domovské stránce Micro SSP, kde najdete pokyny, jak přidat do databáze nové katalogové soubory. Pokud jste katalogy stáhli během této relace importu, rozevírací katalogový seznam se nemusí aktualizovat ihned. Možná budete muset klepnout na tlačítko Domů a poté se opětovným klepnutím na tlačítko Micro SSP vrátit k postupu importu.

5. Potvrďte název relace v poli Relace, nebo jej změňte. 6. Zadejte název do pole Název vzorku. Jde-li o existující název vzorku, ostatní pole, např. ID pacienta a etnická příslušnost, se vyplní existujícími údaji. Můžete také dvojím klepnutím na pole Název vzorku zobrazit okno Výběr vzorku, kde můžete vybrat vzorek.



120


One Lambda, Inc.

7. Klepněte na rozevírací šipku v poli Datum vzorku a vyberte datum. Zobrazí se okno analýzy pro tuto relaci. 8. Zadejte ID do pole ID pacienta. Jde-li o existující ID pacienta/dárce, ostatní pole, např. jméno a příjmení a etnická příslušnost, se vyplní existujícími údaji. Můžete také dvojím klepnutím na pole ID pacienta zobrazit okno Výběr pacienta, kde můžete vyhledat a vybrat ID pacienta. Pokud již nejsou tato pole vyplněná, můžete zadat jméno pacienta nebo dárce do pole Jméno a Příjmení. 9. Pokud toto pole není již vyplněno, klepnutím na rozevírací šipku v poli Etnická příslušnost vyberte etnickou příslušnost pacienta/dárce. 10. Pokud toto pole není již vyplněno, klepnutím na rozevírací šipku v poli Pacient/dárce vyberte pacienta, dárce nebo obojí. 11. Chcete-li přidružit gelový obraz ke vzorku, klepněte dvakrát na pole Gelový obraz a procházením vyhledejte umístění obrazu, který chcete ke vzorku přidat. Poznámka:

Aplikace Fusion podporuje formáty obrazu BMP, JPG, BMP a TIF. Verze systému Windows používaná ve vašem počítači však nemusí podporovat určité verze formátu TIF.

Výběr prohlížeče gelových obrazů



Výše uvedené kroky opakujte, dokud nevyplníte informace o dávce nebo dokud neuložíte a nedokončíte dávku později. Každá relace Micro SSP se může skládat z tolika vzorků, kolik jich chcete analyzovat pomocí stejných nebo různých katalogových informací.



121

One Lambda, Inc.


Jakmile jste připraveni ukončit vytváření dávky, proveďte jeden z následujících úkonů: 

Klepnutím na tlačítko Další>

otevřete okno analýzy Micro SSP.



Klepnutím na tlačítko Uložit později.

uložte informace o aktuální dávce a vraťte se k ní



Klepnutím na položku Nová dávka zahajte vytváření nové dávky.



Klepnutím na tlačítko Zavřít


ukončete okno Zadání dávky.


122


One Lambda, Inc.

Konfigurace analýzy dat Micro SSP Globální výchozí nastavení pro konfiguraci produktů Micro SSP lze nastavit na dvou místech:  

Domovská stránka Micro SSP Nabídka Obslužné programy na hlavní domovské stránce aplikace HLA Fusion.

Kromě toho lze konfigurace nastavit také v okně analýzy pro aktuální vzorek Micro SSP, a to klepnutím pravým tlačítkem kdekoli v okně analýzy, čímž se zobrazí místní seznam možností konfigurace. Po zahájení analýzy budete muset klepnutím pravým tlačítkem na oblast kousek vpravo od tlačítka Najít alelu otevřít nabídku konfigurace Micro SSP. Nabídka konfigurace na úrovni vzorku Micro SSP

Přiřazení kódu Systém implicitně přiřadí kódy NMDP k alelám. Uživatel však může tyto kódy volitelně změnit na jednu z následujících možností: 

Bez kódu – Výsledky, alelové páry sestavené do řetězců bez formátovaného kódu, jsou jednoduše zhuštěny bez použití kódovaného formátu.



Seskupení P – Zakóduje alelové řetězce v seskupení P, jak je publikováno v systému IMGT.



Seskupení G – Zakóduje alelové řetězce v seskupení G, jak je publikováno v systému IMGT.



Místní kód – přiřadí uživatelem definované definice kódu (kódu používaného vaší laboratoří) pro dosažení navrhovaných kódových výsledků.



123


One Lambda, Inc.



Křížový kód – umožňuje alelové kombinace, které kříží sérologické skupiny (např.EAPW = DRB1*04:01/33/35/38/72/76). Křížové kódování je implicitně vypnuté tak, aby alelové páry byly zhuštěny pouze v rámci stejných alelových skupin.





Sérologie identifikuje mnoho párů alel HLA-B, u nichž se zdá, že se liší pouze v oblasti Bw4/Bw6 – dvou vzájemně se vylučujících sérologických epitopů. Vyberete-li tuto možnost, k výsledkům sérologie bude přidána položka Bw4/Bw6.

Demografické informace

Možnost Demografické informace umožňuje uspořádat alely na základě jejich frekvence.

Na základě vámi provedeného demografického výběru zobrazí aplikace HLA Fusion v seznamu alelových párů až tři alelové skupiny: 

Skupina 1: Častá u obou alel



Skupina 2: Častá pouze u jedné nebo druhé z alel



Skupina 3: Není častá u žádné z alel

Není-li možnost Demografické informace aktivní, znamená to, že musíte importovat soubor vložení frekvence alel.



124

One Lambda, Inc.


Použití okna analýzy Micro SSP V okně analýzy se zobrazí podrobné informace o analýze pro jednotlivé vzorky v relaci. Můžete zkontrolovat alelová přiřazení navržená programem, upravit je a přijmout. Aplikace HLA Fusion navrhne možné výsledky typizace, ale konečné přiřazení musíte provést vy. Úpravy provedené v okně analýzy jsou specifické pro daný vzorek a mají vliv pouze na aktuální vzorek. V okně analýzy můžete: 

Pomocí panelu testovacího gelu změňte reakce a pozice řádků vzorku.



Změňte přípustný počet falešných reakcí.



Vynuťte jednu falešnou reakci.



Zobrazte a vytiskněte výsledky analýzy vzorku.



Přidejte poznámky a označte vzorek pro další testování.

Z okna analýzy se můžete kdykoli vrátit do souhrnu relace klepnutím na odkaz <<Souhrn na panelu nástrojů aplikace HLA Fusion vedle ID vzorku/relace.



125


One Lambda, Inc.

Obrazovka analýzy MicroSSP

Tabul-ka reakčních schémat.

Vstupní tabulky a tabulky analýzy

Seskupí a zhustí páry se stejným reakčním schématem.

Zobrazí alelové páry

Click here to view or add a gel image.

Oblast výsledků

Zaškrtnutím zde označíte nutnost dalších testů.

Zaškrtnutím zde se k pacientovi přiřadí výsledky analýzy.

Panel testovacího gelu Panel na levé straně okna zobrazuje jednotlivé jamky testu v řadách, které jsou určeny pro duplikací testovacího gelu. Každá jamka je zobrazena s tlačítkem reakce. Po klepnutí nebo zadání z klávesnice můžete změnit reakci u vybrané jamky na jedno z následujících nastavení: 

8 = pozitivní reakce



1 = negativní reakce



0= bez jasného zesílení (jamky s 0 budou z analýzy vyloučeny)



126

One Lambda, Inc.

Poznámka:


Klepnete-li pravým tlačítkem na černou oblast panelu testovacího gelu, můžete klepnutím na jamku vybrat odlišné pořadí reakcí: 0->1->8 nebo 8->1->0 atd.



Po analýze karty již nemůžete k dané kartě přidávat žádné informace o vzorku.



Pokud vzorek nebyl analyzován, označí se tlačítko úplně vpravo v dolní části tohoto panelu jako Analyzovat. Pokud již analýza pro daný vzorek existuje, je tlačítko označeno Znovu analyzovat.



Toto tlačítko je aktivováno pouze v případě, že bylo zadáno ID vzorku. Pokud nebylo ID vzorku při klepnutí na toto tlačítko zadáno, podle ID vzorku se označí značkou „!“ a analýza nebude provedena.



Pokud je reakce jiné než první jamky (1H) nastavena na nulu (0), zobrazí se hlášení umožňující zobrazit informace o systémem navrhované reakci, což vám pomůže rozhodnout se, zda chcete analyzovat jamku bez zesílení s pozitivním nebo negativním hodnocením. Je-li na nulu nastavena více než jedna jamka, hlášení se nezobrazí, ale informace o navrhované reakci lze přesto zobrazit.

Chcete-li zobrazit možné reakce, pokud by jamka byla pozitivní nebo negativní, klepněte na tlačítko Ano a procházejte směrem dolů seznamem Možné alelové páry na nadpis Neg. reakce, Poz. reakce. Nelze-li navrhnout žádný typ výsledku, nadpis je Bez řešení a výsledky za ním nebudou následovat.



127


One Lambda, Inc.

Možné výsledky pro jednu nezesílenou jamku

Nadpisy k vyhledání při zobrazení možných nezesílených výsledků jamek.

Zobrazení podrobností o jamce Umístěním kurzoru nad oblastí testovacího gelu v okně analýzy můžete zobrazit komplexní podrobnosti o aktuálním vzorku. Zobrazení podrobností o jamce (s myší umístěnou nad jamkou)

Práce s gelovými obrazy 

Pokud máte aktuální vzorek již propojen s gelovým obrazem, můžete jej zobrazit nebo propojení zrušit. NEBO



Můžete vyhledat a propojit s aktuálním vzorkem jiný gel.



128


One Lambda, Inc.

Gelový obraz můžete propojit s aktuálním vzorkem takto:

1. Klepněte na tlačítko Zobrazit gel vlevo dole na obrazovce gelového obrazu. Není-li s tímto vzorkem aktuálně propojen žádný obraz, uvidíte toto hlášení: 2. Klepněte na tlačítko Ano a aplikace Fusion otevře obrazovku Vybrat gelový obraz. 3. Procházením vyhledejte nový gelový obraz . a klepněte na tlačítko Otevřít 4. Aplikace Fusion otevře okno Gelový obraz a zobrazí vybraný gelový obraz. Velikost okna lze v případě potřeby změnit. Chcete-li tento obraz propojit s tímto vzorkem, klepněte na tlačítko Propojit obraz

.

Prohlížeč gelových obrazů



Pro přiblížení klepněte na tlačítko .



Pro oddálení klepněte na tlačítko .



Pro otočení obrazu klepněte na tlačítko . Otočit

-

Klepnutím zavřete prohlížeč gelových obrazů Přiblížit


Oddálit

Klepnutím otočte gelový obraz


Pro propojení obrazu s aktuálním vzorkem.

129


One Lambda, Inc.

Chcete-li Zrušit propojení obrazu již propojeného s aktuálním vzorkem: .

1. Klepněte na tlačítko Zobrazit gel

2. Když se obraz zobrazí v prohlížeči Gelový obraz, klepněte na tlačítko Zrušit propojení .

Přidání vzorků Existují dva způsoby přidání vzorků a provedení jejich analýzy v relaci: 1. Klepněte na tlačítko Přidat nový vzorek . 2. Do pole ID vzorku (nad gelovým obrazem) zadejte ID vzorku nebo název vzorku).

3. Vyberte položku Datum vzorku klepnutím na šipku dolův poli Datum vpravo od pole ID vzorku. 4. A klepněte na tlačítko Analyzovat

.

NEBO Toto je alternativní způsob přidání existujících vzorků pro analýzu v Micro SSP: 1. Klepněte na tlačítko Výběr vzorku vpravo od pole ID vzorku. Ze seznamu Dostupné vzorky vyberte existující vzorek.

Jako vyhledávací nástroj můžete použít textové pole v horní části.

2. Klepnutím na tlačítko OK ve spodní části tohoto okna přesunete vzorek ze seznamu dostupných vzorků do textového pole ID vzorku nad prohlížečem gelových obrazů. Můžete použít existující název vzorku nebo vytvořit nový.



130


One Lambda, Inc.

3. Vyberte/vytvořte Datum vzorku. 4. Klepněte na tlačítko Analyzovat

.

Zobrazení gelu V okně Sérologická analýza můžete zobrazit gel pro aktuální vzorek. Tento nástroj vyhledá soubor gelu (formát JPEG) přidružený k datovému souboru CSV a zobrazí jej v okně analýzy.

1. Klepněte na tlačítko Zobrazit gel. Zobrazí se obrázek gelu pro aktuální vzorek jako nové okno.

2. Klepnutím na tlačítko Zavřít nebo klepnutím na tlačítko X zavřete gel.

Změna počáteční pozice relace U karet pro více testů můžete klepáním na tlačítko Přidat nový vzorek přeskočit pozice karty tak, aby odpovídaly fotografii gelu tak dlouho, dokud se nezobrazí správná počáteční pozice.



131


One Lambda, Inc.

Karta Spuštění (reakce) Tabulka reakčních schémat zobrazí pozitivní reakce u každé jamky nebo perličky, pokud je zkombinována s analýzou LABType (osa x) oproti jednotlivým alelám (osa y) definovaným v aktuálním katalogu. 

V pravém panelu okna analýzy Micro SSP se zobrazí tabulka reakčních schémat.

Vyhledávání podle alely

Dvojím klepnutím na libovolné místo v této oblasti rozbalte tabulku na polovinu okna analýzy.

Klepnutím otevřete tabulku podle vybraných reakcí jamky.

Vyhledáván í podle reakčních schémat

Výchozí konfigurace:

Tlačítko Max rozbalí tabulku reakcí.

ID perliček pro testy LabType používané v kombinované analýze s aktuálním vzorkem MicroSSP.



Jamky (perličky, pokud jsou kombinované s testy LABType) jsou seřazeny podle reakce vzorku.



ID jamky závisí na řádku a umístění vzorku na panelu testovacího gelu.



Aktuální vzorek se zobrazí modřetěsně pod řádkem křížových lokusů.



Seznam pozitivních alel je zobrazen pod řádkem vzorků žlutě.



Jamky křížových míst jsou označeny křížkem (#).



Lososové zbarvení označuje falešnou pozitivitu. Zelená označuje falešnou negativitu.



132


One Lambda, Inc.



Pozitivní reakce jsou v tabulce zobrazeny jako „X“ (modře u aktuálního vzorku a černě u zbytku). PC, NC a vyloučené perličky jsou v tabulce zobrazeny jako „0“.



Chcete-li rozbalit tabulku na plnou velikost okna, klepněte na tlačítko jej minimalizovat můžete klepnutím na tlačítko .



Dvojím klepnutím do oblasti těsně nad tabulkou mezi tlačítka Najít alelu a Max rozbalíte tabulku tak, že bude zabírat polovinu okna analýzy. Zpět do původní velikosti dostanete tabulku opětovným dvojím klepnutím na stejnou oblast.



Do pole zadejte alelu a klepnutím na tlačítko Najít alelu zobrazíte alelu a její reakční schéma v prvním řádku. Dvojím klepnutím na název alely přeneste alelu do horní části tabulky. Zadáním alelové skupiny (např., DRB1*07) můžete přenést do horní části celou určitou skupinu.



Klepnutím na záhlaví prázdného řádku buď vlevo od názvu alely, nebo na reakci vzorku, přesunete všechny perličky s danou reakcí doleva. Klepnutím na tlačítko Reset reakce (nad tlačítkem Max) resetujte tabulky na její původní konfigurace.



Když klepnete na záhlaví sloupce, tabulka se seřadí podle kritéria reakce pro danou jamku nebo perličku, (pokud je zkombinovaná s analýzou LABType). Prvním klepnutím se provede seřazení ve vzestupném pořadí shora dolů. Druhým klepnutím se provede seřazení v sestupném pořadí.



Použijete-li tlačítko Analyzovat kombinované v okně analýzy k analýze testu LABType a testu Micro SSP, ID perliček z testu LABType se zobrazí na řádku ID jamky v tabulce reakcí. Lze je rozpoznat podle ID perličky, za kterým následuje podtržítko a 0.



. Znovu

133

One Lambda, Inc.


Počet přípustných falešných reakcí Pokud aplikace HLA Fusion nemůže určit žádné výsledky, které se přesně shodují se zadaným reakčním schématem, analyzuje reakci při předpokladu, že ve vzorku existuje jedna falešná reakce. Pokud řešení stále nelze najít, systém pokračuje v prohledávání dalších falešných reakcí, dokud není dosaženo přípustného počtu falešných reakcí nebo není nalezeno řešení. Nastavení falešné reakce umožňuje nastavit počet přípustných falešných reakcí: Minimální nastavení = 0 Maximální nastavení = 4



V poli Počet falešných reakcí klepáním na šipku nahoru nebo dolů změňte počet přípustných falešných reakcí.

Poznámka:

Bez ohledu na maximální zde nastavený počet falešných reakcí se analýzy vzorku zastaví u první nalezené falešné reakce.

Vynucení jedné falešné reakce Pokud má vzorek výsledek bez falešných reakcí (výsledek s přesnou shodou), funkce Vynutit1 přinutí aplikace HLA Fusion znovu analyzovat reakci tak, aby umožnila jednu možnou falešnou reakci v každé jamce. Tato funkce se používá k vyhledání výsledků, u kterých může jedna další reakce změnit výsledky.

1. V okně analýzy klepnutím na tlačítko Vynutit 1 přinuťte program, aby analyzoval vzorek s jednou falešnou reakcí. Klepnutím na tlačítko Znovu analyzovat

resetujte analýzu na původní výsledky.

Klepnutím na tlačítko Reset reakce vrátíte tabulku reakčních vzorců na výchozí nastavení.



134


One Lambda, Inc.

Kombinovaná analýza Micro SSP Software HLA Fusion podporuje funkci kombinované analýzy. Při kombinované analýze jsou reakce ze dvou testů jednoho vzorku zkombinovány do jediné analýzy. Předchozí test musí mít buď stejné ID vzorku, nebo musí být přidružen ke stejnému ID pacienta. Chcete-li zkombinovat výsledky určitého vzorku, musíte spustit test Micro SSP specifický pro alelu nebo v něm pokračovat a mít dříve uloženou relaci Micro SSP nebo LABType, se kterou tento test zkombinujete. Po zkombinování relací se zobrazí možná přiřazení typizace a tabulka reakčních schémat se změní tak, aby odrážela reakční schémata obou testů.

1. V okně analýzy klepněte na tlačítko Analyzovat kombinované pod tabulkou reakčních schémat. V okně Kombinovaná analýza se zobrazí seznam předchozích relací, které použily aktuální vzorek a sdílí stejné ID vzorku.

Zaškrtněte požadovanou předchozí relaci (relace) v příslušném políčku Kombinovat úplně vlevo. Klepněte na tlačítko Analyzovat

Poznámka:

ve spodní části místního okna.

Zkombinujete-li jeden vzorek v předchozím nomenklaturním formátu se vzorkem v novějším nomenklaturním formátu, budou možné a přiřazené alelové páry a kód zobrazeny v novém formátu. Pokud vzorek v předchozím nomenklaturním formátu obsahuje alelu, která není zahrnuta v nové nomenklatuře, bude tato stará alela vypuštěna.

Chcete-li se vrátit ke kombinované analýze, klepněte na tlačítko Znovu analyzovat kombinované.



135

One Lambda, Inc.




Pokud jsou data nomenklatury u aktuální nomenklatury, která je s ní kombinována, v rozporu, pak se relace, kterou jste vybrali, zvýrazní červeně.



a existuje rozpor mezi daty nomenklatury, Když klepnete na tlačítko Analyzovat zobrazí se výstražné hlášení, která vám poskytne možnost pokračovat v kombinované analýze, nebo ji zrušit. Pokud budete pokračovat, použije se nomenklatura testu vzorku, který jste vybrali ke kombinaci s aktuálním testem.

Poznámka:

Upozorňujeme, že tlačítko Analyzovat kombinované v okně analýzy se změní na Znovu analyzovat kombinované. Jde o označení, že vybrané relace byly zkombinovány. Jsou-li relace kombinované, do pole poznámek systému bude přidána poznámka.



136

One Lambda, Inc.


Provedení přiřazení typizace v analýze Micro SSP Aplikace HLA Fusion nabízí počítačem navržená přiřazení alelových párů a kódů. Konečná přiřazení typizace můžete provést pouze vy nebo váš vedoucí. V okně analýzy můžete: 

Přepínat mezi formáty kódů



Používat pro výsledky sérologie Bw4/Bw6



Používat filtry frekvence



Přiřadit nekódované alelové páry



Přiřadit kódované alelové páry



Přiřadit ekvivalenty pro sérologii



Provést ruční přiřazení



Odebrat přiřazení



Uložit a potvrdit přiřazení

Karta Páry Karta Páry zobrazuje možné výsledky možných alelových párů, které se shodují s reakčním schématem pro daný vzorek. Páry navrhuje software. 

V seznamu jsou označeny páry a jsou seskupeny buď jako páry s plnou shodou (bez falešných reakcí), nebo podle počtu falešných reakcí. Výsledky s falešnými reakcemi jsou uvedeny s identifikovanými falešně reagujícími perličkami/jamkami.



Výsledky zobrazují jeden alelový pár na každém řádku.



Možné homozygotní páry jsou označeny v poli Poznámky.



137


One Lambda, Inc.

Přiřazení alelového páru ze seznamu navržených 1. Dvojím klepnutím na alelový pár pod položkou Možné alelové páry proveďte jeho přiřazení k oblasti konečného přiřazení párů. Alternativně můžete zvýraznit alelový pár v seznamu pod kartou Páry a klepnutím na tlačítko V (přiřadit) u nadpisu Přiřazené alelové páry provést jeho přidání do oblasti konečného přiřazení. Chcete-li odebrat přiřazení, vyberte přiřazení v seznamu Přiřazené alelové páry a klepněte na tlačítko X (odebrat).

Dvojím klepnutím přiřaďte pár

Oblast konečného přiřazení Pole ručního zadání

Karta shody

Vyberte alelový pár (nebo páry) a klepnutím na toto tlačítko je odešlete do oblasti konečného přiřazení. Klepnutím na tlačítko „X“ odeberte alelové páry.

Tato datová mřížka zobrazuje kódový formát skutečných alelových párů pro daný vzorek. Shodný reakční pár je pár alel (nebo skupina alel) s reakčním schématem, které se plně shoduje s reakčním schématem aktuálního vzorku.

Umístěním ukazatele myši nad alelu zjistíte definici jejího kódu.



Tento výsledek se liší od výsledků položky Možný alelový kód. Položka Možný alelový kód zhustí výsledky do jediného kódu, pokud je to možné.



Umístěním ukazatele nad kódovanou alelu zobrazíte definici jejího kódu.



138


One Lambda, Inc.

Ruční přiřazení alelových párů 1. Ujistěte se, že přiřazení zadáváte ve správném formátu alelového kódu: 

Nový formát nomenklatury: X*##:##(####) X*##:##(####), kde X=typ lokusu a #= číslo kódu.



Předchozí formát nomenklatury: X*#### X*####, kde X=typ lokusu a #= číslo kódu.

Ručně zadané přiřazení.

Zadejte přiřazení do textového pole přímo pod seznamem Přiřazené alelové páry. Stisknutím klávesy Enter Přiřazené alelové páry.

na klávesnici přesuňte zadanou alelu nahoru do textového pole

Možné alelové kódy Pole Možný alelový kód zobrazuje možné kódované výsledky pro všechny výsledky, které se plně shodují se vzorkem. Typ použitého kódu závisí na vašem výběru konfigurace: kód NMDP, (implicitní) místní kód, (uživatelem definovaný) nebo žádný kód.

Možný alelový kód

Definice alelového kódu

Přiřazený alelový kód



139

One Lambda, Inc.




Možný kódovaný výsledek je uveden v horní části pole. Definice kódu je uvedena pod ním.



Pokud pro určitý návrh nejsou žádné kódy, bude u návrhu uvedeno XX, což znamená, že kód je nedefinovaný. U více návrhů s označením XX je každý návrh očíslován jako XX1, XX2 atd., aby byly rozlišené.



Aplikace Fusion zhustí alelové kódy zobrazené v poli Možný alelový kód na základě návrhů ze seznamu možných alelových párů zobrazených na záložce Páry.



Alelový kód vychází z aktuálního kódu NMDP nebo místního kódu instalovaného v systému. Systém implicitně přiřadí kódy NMDP k alelám. Volitelně můžete tyto kódy změnit buď na žádný kód, místní kód, nebo křížový kód.



Pokud neexistují žádné výsledky, které by se shodovaly s reakcemi vzorku v rámci přípustného počtu falešných reakcí, zobrazí se Bez řešení.

Přiřazení alelového kódu 1. Klepněte dvakrát na možný alelový kód nebo vyberte navrhovaný kód a klepněte na tlačítko V (přiřadit). Výběrem alelového kódu a klepnutím na tlačítko X (odebrat) odeberete přiřazení alelového kódu.

Ruční přiřazení alelového kódu 1. Zadejte přiřazení do textového pole přímo pod seznamem Přiřazené alelové kódy. Ujistěte se, že přiřazení zadáváte ve správném formátu alelového kódu: 

Nový formát nomenklatury: X*##:##(####) X*##:##(####), kde X=typ lokusu a #= číslo kódu.



Předchozí formát nomenklatury: X*#### X*####, kde X=typ lokusu a #= číslo kódu.

Jinak jej systém nepřijme a vyzve vás k provedení oprav. Poznámka:

Pokud klepnutím na tlačítko Převést zobrazíte alely v novém nomenklaturním formátu, nemůžete zadat ruční alelový kód, pokud neprovedete znovu analýzu vzorku a alely se znovu nezobrazí v předchozím nomenklaturním formátu.



140


One Lambda, Inc.

Stisknutím klávesy Enter přesunete alelový kód, který jste zadali, do pole Přiřazený alelový kód.

Poznámka:

Máte-li homozygotní výsledek, lze přiřazený kód upravit v poli Ruční alelový kód tak, aby se najednou zobrazily homozygotní kódované výsledky.

Neznámé alelové kódy Neznámé alelové kódy mají označení XX, za kterým následuje pořadové číslo. Čísla se u každého vzorku a lokusu resetují na 1. Když se zobrazí neznámé kódy, měli byste se nejprve ujistit, že jste naimportovali poslední soubor NMDP. Máte-li poslední kódový soubor a přesto se zobrazují kódy XX, můžete tyto neznámé kódy uložit pro pozdější odeslání do programu NMDP v souboru.txt s názvem nmdp_code_report.txt. Textový soubor je implicitně uložen do C:\OLI Fusion\data\NMDPExport,avšak toto umístění lze změnit úpravou cesty rozhraní. Informace o kódu jsou při přidání připojeny na konci tohoto textového souboru; poslední přidání jsou dole.

Výběrem kódu XX zde…

1. V okně Možný alelový kód výběrem kódu XX aktivujte tlačítka zpráv o kódu NMDP v dolní části obrazovky.

…aktivujte tlačítko zprávy NMDP zde. Klepnutím na tlačítko „X“ proveďte zrušení.



141

One Lambda, Inc.


Klepněte pravým-tlačítkem na tlačítko Zpráva

a vyberte jednu z následujících možností:

Chcete-li odeslat informace o neznámém kódu do programu NMDP, vyberte položku PřímýPožadavek na NMDP. 

Chcete-li přidat informace o neznámém kódu do textového souboru (implicitně uloženy na C:\OLI Fusion\data\NMDPExport), vyberte položku Uložit do textového souboru.



Chcete-li přidat informace o neznámém kódu do souboru Excel (implicitně uloženy na C:\OLI Fusion\data\NMDPExport), vyberte položku Uložit do souboru Excel, nebo jednoduše klepněte levým tlačítkem myši.

Po provedení tohoto kroku klepnutím na tlačítko Poznámka:

odeberte tlačítka ze zobrazení.

Tlačítko +Rpt uchovává poslední provedený výběr (přímo, text nebo Excel), takže jej lze použít jako klávesovou zkratku; pokud nechcete změnit svůj výběr, při dalším vykázání kódu XX ve zprávě jednoduše klepněte na tlačítko +Rpt.

Dále jsou uvedeny příklady jednotlivých výsledků:

Přímo do programu NMDP

Kód XX uložen jako tabulkový soubor (.csv). Kód XX uložen jako textový soubor (.txt).



142

One Lambda, Inc.


Jiná přiřazení Pole Jiná přiřazení lze použít k provedení jednoduchého přiřazení, které není omezeno na žádný formát. Kromě toho můžete zvýraznit a přidat přiřazení sérologie nebo alelového páru nebo kódu a přidat je do pole pro změny.

Jiná přiřazení kódu lze provést jedním ze dvou způsobů: 

Zadejte alelový pár nebo alelový kód do pole Jiné přiřazení.



Klepněte na tlačítko V (přiřadit) a vyberte jednu ze dvou možností: 1. Chcete-li přiřadit pouze možný alelový kód, vyberte možnost Přiřadit možný alelový kód. 2. Výběrem položky Přiřadit vše vyvolejte do pole Jiné přiřazení možnosti přiřazení možného alelového kódu, sérologie nebo přiřazeného alelového páru.



Poté můžete v případě potřeby libovolný zkopírovaný kód změnit.



Zadaná alela je přiřazena a je zahrnuta do zpráv, které jsou spuštěny a obsahují tento vzorek.



Není uvedena v žádných polích konečného přiřazení pro tento vzorek.

Pole možné sérologie Pole ekvivalentu pro sérologii zobrazuje všechny návrhy ekvivalentu pro sérologii pro daný vzorek na základě možných alelových párů. Když vyberete zobrazený ekvivalent pro sérologii, alelové páry, které jsou k němu přidružené, se zobrazí v okně dole. Poznámka:



Ujistěte se, že jste pomocí nabídky Obslužné programy naimportovali aktuální soubor ekvivalentu pro sérologii. Pokud se v přiřazeních ekvivalentu pro sérologii zobrazí nula (0), znamená to, že musíte naimportovat aktuální soubor ekvivalentu pro sérologii.

U vzorku lze provádět pouze jedno přiřazení ekvivalentu pro sérologii najednou. Pokud proto vyberete a přiřadíte jiné přiřazení, aktuální přiřazení sérologie bude nahrazeno.



143


One Lambda, Inc.

Poznámka:

Pokud jde o test s více lokusy, lze přiřadit více lokusů. Avšak u testů s jedním lokusem lze přiřadit pouze jeden lokus.

Ekvivalent pro sérologii

Související alelové páry

Sérologická přiřazení

1. Dvojím klepnutím na návrh sérologie nebo jeho zvýrazněním a klepnutím na tlačítko V (přiřadit) jej zkopírujte do pole Přiřazená sérologie. Vyberte ekvivalent pro sérologii a klepnutím na X (odebrat) jej odeberte. Nebo proveďte jeho nahrazení výběrem a přiřazením jiného ekvivalentu pro sérologii.

Tlačítko Přiřadit

Tlačítko Odebrat

Převést (pouze neaktuální nomenklaturní formát) Pokud je formát alel zobrazen se starší nomenklaturou, zobrazí se tlačítko Převést Klepnutím na tlačítko:

.



Zobrazí se všechny přiřazené a možné alelové kódy/páry (kromě těch z pole Jiná přiřazení) v posledním nomenklaturním formátu. Nelze-li najít souhlasnou alelu v novém formátu, zůstane alela zobrazená ve starém formátu.



Toto zobrazení můžete zobrazit a vytisknout, ale výsledky nelze uložit ani vykázat ve zprávě v tomto novém nomenklaturním formátu.



Chcete-li se vrátit ke staršímu formátu alel, můžete navigovat na další vzorek a pak se k tomuto vzorku vrátit.

Přidání poznámky ke vzorkům Poznámky, které vy nebo systém Fusion přidáte do pole Poznámky, se zobrazí s výsledky vzorků v aktuální relaci analýzy, ve funkcích vyhledávání dat a funkcemi hlášení v aplikaci HLA Fusion. 1. V okně analýzy zadejte do pole Poznámky uživatele pod oblastí přiřazení poznámku o typu vzorku.



144


One Lambda, Inc.

Nebo dvojím klepnutím na pole Poznámky uživatele otevřete větší prostor pro psaní.

Poznámky se uloží až po klepnutí na . tlačítko Uložit

Vaše vlastní poznámky (maximálně 255 znaků)

Poznámky zadané aplikací HLA Fusion

Poznámka:

Rozbalí se větší pole poznámek uživatele, které umožňuje zadat maximálně 255 znaků.

Označení vzorku značkou pro další testování

Potřebu dalšího testování vzorku můžete označit zaškrtnutím políčka Další testy a poté klepnutím na tlačítko Uložit >>. Označení Další testy se zobrazí ve výsledcích, vyhledávání dat a zprávách o daném vzorku. 

V okně analýzy zaškrtněte políčko Další testy umístěné pod části přiřazení.

Tisk okna aktuální analýzy Tlačítkem Tisk obrazovky vytisknete aktuálně zobrazené okno analýzy. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Tisk obrazovky obrazovku aktuální analýzy.


na panelu nástrojů vytiskněte


145


One Lambda, Inc.

Náhled nebo tisk zpráv Chcete-li zobrazit zprávu Micro SSP pro aktuální vzorek, použijte tlačítko Náhled zprávy nebo Tisk zprávy na panelu nástrojů.

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Náhled zprávy

nebo

zobrazíte seznam zpráv o aktuálním vzorku, které Tisk zprávy můžete zobrazit v náhledu nebo je vytisknout. Rozevírací nabídky zpráv jsou u náhledu zprávy i tisku zprávy stejné.

Poznámka:

Vyberete-li možnost Molekulární vlastní, nemůžete v tomto okamžiku vytvořit novou vlastní zprávu. Jediné vlastní zprávy dostupné z okna analýzy jsou zprávy vytvořené předtím v okně Zprávy.

Přiřazení kódovaných výsledků

Pomocí tlačítka Přiřadit přiřaďte a uložte všechny nejednoznačné možné kódované výsledky (tedy výsledky, u kterých je pouze jeden kódovaný výsledek).

Uložení přiřazení Laboratorní technici a vedoucí mohou uložit výsledky analýzy pro další kontrolu a schválení. Uložené vzorky jsou dostupné pro potvrzení pouzepro vedoucího laboratoře. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Uložit analýzy uložte výsledky analýzy.



Aplikace Fusion se automaticky přesune k dalšímu vzorku.



Vzorky musí být uloženy, aby mohly být přidruženy k případným poznámkám vytvořeným uživatelem v databázi nebo zprávách. Pro potvrzení musí mít vedoucí přístup ke vzorku, pro který jste uložili přiřazení.


umístěné v pravém dolním rohu okna


146

One Lambda, Inc.


Potvrzení přiřazení Výsledky analýzy mohou potvrzovat vedoucí laboratoře. Vzorky jsou označeny jako Potvrzené. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Potvrdit okna analýzy potvrďte všechny výsledky analýzy.

umístěné v pravém dolním rohu

Automaticky se přesunete na další vzorek, kde můžete pokračovat s potvrzováním výsledků. Když se poprvé vrátíte k potvrzenému vzorku, uvidíte, že tlačítko Potvrdit fialově, což znamená, že již byl potvrzen dříve.



je nyní zbarvené

147


One Lambda, Inc.

Souhrn relace Micro SSP Souhrnnou tabulku lze spustit klepnutím na relaci v položce Strom navigace úplně vpravo na obrazovce. Obsahuje seznam jednotlivých vzorků v relaci a všechny uložené výsledky analýz. 

Dvojím klepnutím na vzorek v souhrnné tabulce přejdete přímo na obrazovku analýzy pro daný vzorek.

Tlačítko voliče polí

Klepnutím na tlačítko Volič polí vlevo od nadpisů tabulky zobrazíte volič polí. V tomto okně můžete výběrem nebo vymazáním zaškrtávacích políček vedle nadpisu sloupce zahrnout nebo vyloučit tyto sloupce ze Souhrnné tabulky. Výběrem nebo vymazáním zaškrtávacích políček v tomto okně se tabulka ihned aktualizuje.

Poznámka:



Pokud nevidíte konkrétní pole dostupné prostřednictvím voliče polí a jste si jistí, že by tam mělo být, přejděte na C:\HLA Fusion\temp a smažte soubor s názvem SSP_Layout.xml.

Klepnutím na libovolné záhlaví sloupce v souhrnné tabulce proveďte seřazení tabulky podle daného sloupce. Malá šipka Nahoru nebo Dolův záhlaví sloupce označuje pořadí řazení: nahoru pro vzestupné a dolů pro sestupné.

Můžete také klepnutím na záhlaví a pomocí funkce táhnout a pustit změnit pořadí sloupce.



148

One Lambda, Inc.




Všechny změny v rozvržení, které jste provedli, můžete uložit klepnutím na tlačítko Ano v okně hlášení, jakmile se objeví.

Vaše změny se uloží pro všechny budoucí souhrny relace Micro SSP na tomto počítači, dokud nebudou provedeny a uloženy další změny.



Klepnutím na tlačítko Exportovat (umístěné ve spodní části obrazovky) uložte souhrnnou tabulku do svého počítače nebo na síť (výchozí umístění je C:\OLI FUSION\data\report). Soubor bude uložen ve formátu tabulky Excel (.XLS).



Klepnutím na tlačítko Tisk vytvoříte výtisk souhrnné tabulky.



Klepnutím na tlačítko Náhled zobrazíte souhrnnou tabulku před tiskem nebo můžete změnit její velikost.

V okně náhledu tisku zobrazuje posuvník náhledu stránky nalevo ikony pro jednotlivé stránky zprávy. 

Klepnutím na ikonu stránky zobrazíte danou zprávu v okně náhledu.



149


One Lambda, Inc.

Možnosti nabídky klepnutí pravým tlačítkem na navigátor pro relace Micro SSP Možnosti na úrovni relace Existuje nabídka, která se zobrazí, když klepnete pravým tlačítkem na aktivní relaci v navigátoru (nejprve klepnutím na levé tlačítko vyberte relaci):

Opakovaná analýza s novou nomenklaturou Umožňuje opakovanou analýzu relace pomocí nového nebo aktualizovaného katalogu. 1. Po klepnutí pravým tlačítkem na relaci se otevře obrazovka Vybrat nový produkt. 2. Přejmenujte relaci. 3. Klepněte na rozevírací šipku v poli ID nového katalogu a vyberte ze seznamu nový katalog. 4. Klepněte na tlačítko Analýza

.

Relace, na kterou jste klepli pravým tlačítkem, se nyní znovu analyzuje pomocí katalogu, který jste vybrali.



150


One Lambda, Inc.

Možnosti na úrovni vzorku

Pokud klepnete pravým tlačítkem na aktivní vzorek v navigátoru (nejprve klepnutím levým tlačítkem vyberte vzorek), zobrazí se dvě možnosti nabídky.

Související záznamy

Související záznam je záznam, který je přidružen k aktuálnímu vzorku prostřednictvím ID pacienta nebo ID vzorku. Poznámka:




Klepnutím pravým tlačítkem na vzorek v navigátoru a výběrem položky Související záznamy načtěte všechny záznamy související s aktuálním vzorkem do rozevíracího seznamu Vzorek (v horní středové části obrazovky). ID vzorku

Navigační tlačítka

Pomocí navigačních tlačítek vzorku zobrazte jednotlivě analýzu každého souvisejícího záznamu. Pokud se chcete vrátit k zobrazení vzorků v aktuálních relacích, klepněte na odkaz <<Souhrn v horní části okna.

Srovnávací analýza

Tuto možnost použijte k porovnání analýzy aktuálního vzorku s dříve provedenou analýzou. Poznámka:

Tato možnost je také dostupná, když použijete tlačítko panelu nástrojů Srovnávací analýza .



151

One Lambda, Inc.




Klepněte pravým tlačítkem na vzorek a vyberte položku Srovnávací analýzy.



Výběrem předchozí analýzy vzorku ze zobrazeného seznamu proveďte porovnání s aktuální analýzou. Okna těchto dvou analýz se pak zobrazí v okně porovnání. Zobrazení srovnávací analýzy

Aktuální analýza




Velikost jednotlivých oken lze změnit nebo je lze posunout pomocí funkce táhnout a pustit.



Opětovným klepnutím na tlačítko panelu nástrojů Srovnávací analýza zobrazení porovnání zrušíte.



152

One Lambda, Inc.


Analýza LABScreen Funkce analýzy LABScreen programu umožňuje analyzovat výstupní soubory CSV Luminex z produktů LABScreen. Výsledky analýzy jsou založeny na katalogových specifikacích dodaných se softwarem systému HLA Fusion. Existuje několik dalších věcí, které by měly být dokončeny nebo ověřeny předtím, než spustíte relaci analýzy: 

Ujistěte se, že máte poslední katalogové soubory.



Katalogy můžete stáhnout nebo je aktualizovat z domovské stránky LABScreen.



Některé funkce, například normalizace w632, nemusí být dostupné, pokud jste ještě nenaimportovali příslušný katalog (příslušné katalogy).



Zobrazit a upravit globální nastavení konfigurace produktu před spuštěním analýzy. Zobrazí se globální nastavení, které může být změněno na domovské stránce LABScreen nebo prostřednictvím nabídky obslužných programů. Globální nastavení platí ve všech nově importovaných relacích.



Při importu souborů CSV ušetříte čas, když ověříte, že implicitní adresy URL a cesty jsou nastaveny do umístění, kde jsou tyto soubory ve vašem systému nebo síti běžně ukládány. Tato nastavení lze upravit také v části Všeobecná konfigurace domovské stránky systému Fusion.



Dáváte-li přednost tomu, aby aplikace HLA Fusion zůstala u vzorku, který jste právě uložili a potvrdili, místo aby se automaticky přesunula na další vzorek, lze to nastavit v části Všeobecné konfigurace na domovské stránce Průzkumníka aplikace Fusion.

Poznámka:

Některé výše uvedené úkoly vyžadují práva vedoucího uživatele. Možná si budete muset ověřit u svého vedoucího, zda byly tyto úkoly provedeny.



153

One Lambda, Inc.


Zahájení analýzy LABScreen Poznámka:

Chcete-li nastavit normalizaci W632 jako výchozí nastavení pro jednotlivou analýzu LABScreen, vyberte a zaškrtněte políčko u položky Normalizace W632 na stránce konfigurace produktu jednotlivé analýzy LABScreen jako výchozí.

Pořízení dat relace LABScreen Vyberte tlačítko LABScreen na panelu Domovská stránka Poslední aktualizace katalogu.

nebo na panelu nástrojů Fusion Klepnutím otevřete správce katalogu.

Aktuální počet stažených katalogů dostupných pro jednotlivé produkty.

.

Klepnutím importujte aktualizované referenční soubory. Informace o dostupných aktualizacích referenčních souborů.

Výběrem karty… …zobrazte aktuální nastavení konfigurace.

Klepnutím změňte globální nastavení LABScreen.

Aktuální nastavení výstražného hlášení

Klepnutím na odkazy zobrazte katalog, pracovní listy a dokumenty sondy/primeru.

Zobrazí se domovská stránka LABScreen.



154


One Lambda, Inc.

Poznámka:


Zaškrtnutím zde zobrazíte dříve importované soubory CSV. Klepnutím na ikonu složky vyhledejte soubory CSV relace Luminex ve výchozím umístění.

Soubory relace zde nejsou uvedeny.

Vyberte relaci ze seznamu názvů souborů CSV.

Zobrazí se okno Import relace LABScreen.

Umístění souborů CSV na počítači nebo v síti. ID katalogu a verze nomenklatury/ IMGT. Klepnutím na libovolný z těchto nadpisů seřaďte ve vzestupném nebo sestupném pořadí.

ID verze

Luminex Verze

Datum bude zvýrazněno žlutě, pokud místní nastavení mezi Jsou-li importovány soubory CSV, vyberte automatickou aktuálním souborem CSV a aplikací Fusion nejsou v souladu. analýzu všech vzorků relace. Výchozí negativní hodnoty séra (NS) pro perličky. Klepnutím zde seřaďte podle pacienta nebo dárce.

Dvojím klepnutím na libovolné ID pacienta zobrazte aktuální seznam pacientů.


Přiřaďte typ pacienta k ID pacienta.


155

One Lambda, Inc.


1. Klepněte na malou ikonu složky v horní části seznamu názvů souborů CSV LABScreen.

Klepnutím na ikonu složky procházejte soubory CSV.

2. Vyberte soubor ze seznamu všech dříve importovaných souborů CSV nebo klepnutím na ikonu Složka procházením vyhledejte umístění souboru(ů) CSV obrazovky LABScreen na vašem počítači nebo v síti. Procházením vyhledejte soubory relace LABScreen

3. Vyberte soubor(y) CSV relace a klepnutím na tlačítko Otevřít vzorky v tabulce Podrobnosti aktuálního vzorku/pacienta.

zobrazte jeho přidružené

Poznámka:

Můžete vidět soubory CSV u jiných produktů než produktů LABScreen nebo jiné různé soubory CSV. To znamená, že musíte nejprve klepnout na podložku pro analýzu LABScreen nebo že vaše soubory relace LABScreen nejsou obsaženy v jejich vlastní složce v adresáři, na kterou aplikace HLA Fusion ukazuje.

Poznámka:

Je-li v souboru CSV specifikován regionální kód, aplikace HLA Fusion převede data souboru CSV generovaná softwarem Luminex na místní regionální kód. (Regionální kód nelze specifikovat u souborů CSV vytvořených softwarem Luminex verze 2.2 nebo dřívější.) První datum pole je zvýrazněno žlutě a označuje nesoulad regionálního kódu. V tomto případě se doporučuje, abyste pomocí rozevíracího nástroje pro výběr v poli druhého data vybrali příslušné datum a vzali přitom v úvahu rozdíly v regionálních formátech dat.

Je-li vzorek již přidružen k pacientovi, zobrazí se ID pacienta a všechny existující související informace o pacientovi.



156


One Lambda, Inc.

Chcete-li přidat informace o pacientovi, proveďte jeden z následujících kroků: 

Chcete-li přidat data ze systému, klepněte dvakrát na sloupec ID pacienta v tabulce Podrobnosti vzorku/pacienta nebo klepněte na tlačítko Seznam pacientů na panelu nástrojů. Zobrazí se okno Import pacientů umožňující importovat soubor s informacemi o pacientovi.



Chcete-li data pacienta přidat ručně, zadejte data do polí tabulky souvisejících s pacientem.



ID vzorku můžete přiřadit k prázdným polím ID pacienta zaškrtnutím políčka u položky Nastavit prázdné ID pacienta pro vzorek.

Chcete-li přiřadit sekundární protilátku ke vzorku, proveďte jeden z následujících kroků: 

Chcete-li přiřadit sekundární protilátku k individuálním vzorkům, proveďte výběr z rozevíracího seznamu Sekundární protilátka nebo ji zadejte do přidruženého pole.



Chcete-li přiřadit sekundární protilátku ke všem vzorkům proveďte výběr z rozevíracího seznamu Použít pro všechny nebo ji zadejte do pole a poté zaškrtněte políčko Použít pro všechny.

Systém automaticky přiřadí ID relace. ID můžete volitelně změnit. Pole ID relace LABScreen

Poznámka:

ID relace musí být pro databázi systému jedinečné. Pokud již ID relace existuje, software vás vyzve k přejmenování relace. Také důrazně doporučujeme, abyste v tomto poli nepoužívali žádné speciální znaky, protože mohou sloužit specifickému účelu jako oddělovače polí.

4. Vyberte katalogový soubor. Způsob výběru katalogu bude v závislosti na souboru CSV a katalogových souborech, které jste importovali pro test LABScreen, jeden z následujících.

Poznámka:

Potřebujete-li importovat další katalogy, klepněte na odkaz [Stahování] na domovské stránce LABScreen a přidejte do databáze nové katalogové soubory. Pokud jste katalogy stáhli během této relace importu, rozevírací katalogový seznam se nemusí aktualizovat ihned. Možná budete muset klepnout na tlačítko Domů a poté se opětovným klepnutím na tlačítko LABScreen vrátit k postupu importu.

Pokud soubor CSV specifikuje název šablony (platí pouze pro soubory CSV počínaje verzí Luminex 2.2 a vyšší) a jeden z dostupných katalogů je přidružený k dané šabloně, pak bude automaticky vybrán tento katalog.



157


One Lambda, Inc.

Můžete také pomocí rozevíracího seznamu v poli ID katalogu a výběrem některého z uvedených katalogů vybrat jiný katalog než ten, který vybral systém. Neexistuje-li žádná shoda šablon, systém pak zváží nejbližší shodu perliček mezi relací a všemi dostupnými katalogy. Pokud těsná shoda existuje pouze u jednoho katalogu, je tento automaticky vybrán a můžete přejít na 5. Po ověření informací o relaci a vzorku klepněte na tlačítko Podrobnosti. Pokud existuje více než jedna shoda, zobrazí se dialogové okno ověření katalogu s nejlepšími shodami perliček. Vybraný katalog můžete potvrdit klepnutím na tlačítko Zavřít. Nebo můžete dvakrát klepnout na název katalogu v seznamu Navržené katalogy. Ověření katalogu LABScreen

Zobrazí seznam všech katalogovýc h souborů se stejným nebo vyšším počtem shod perliček.

6. Po ověření katalogu se systém může dotázat, zda chcete přidružit daný název šablony ke katalogu. To znamená, že v budoucnu systém u každého souboru CSV odkazujícího na tuto šablonu automaticky vybere tuto šablonu; pro soubor CSV však můžete ještě před jeho importem vybrat jiný katalog. Poznámka:

Chcete-li vidět vybrané negativní sérum (NS), vzorek překrytý výchozím NS pro aktuální vzorek, musíte tak učinit před importem relace.

Pokud vyberete soubor CSV jednotlivého antigenu třídy I a katalog obsahující data W6-32, zobrazí se zaškrtávací políčko Použít W6-32. Pokud se toto zaškrtávací políčko zobrazí, můžete si zvolit, zda chcete či nechcete zaškrtnutím tohoto políčka normalizovat importovaná data pro W6-32.



158


One Lambda, Inc.

Abyste mohli použít normalizaci W6-32, musíte naimportovat typ katalogu jednotlivého antigenu LABScreen a soubor CSV obsahující data W6-32. 7. Po ověření informací o relaci a vzorku klepněte na tlačítko Importovat zobrazí pro následnou analýzu ve stromu navigátoru vpravo.

. Relace se

Můžete pokračovat v importu souborů relace Luminex, nebo můžete klepnutím na relaci v navigátoru spustit analýzu. V obou případech můžete během analýzy navigovat různým způsobem mezi relacemi a vzorky.

Obrazovka souhrnné relace LABScreen Ve stromu navigátoru klepněte na název relace. Zobrazí se Souhrnná tabulka relace. Klepnutím otevřete volič polí.

Klepnutím zobrazte zprávu o dávce LABScreen

PRA dárce třídy I, II a MIC

Obrazovka souhrnné relace LABScreen






Procházením doleva a doprava zobrazíte všechny sloupce souhrnné tabulky.



Klepněte na tlačítko Volič polí vlevo od nadpisů tabulky. Zobrazí se pole Volič polí. Výběrem nebo vymazáním zaškrtávacích políček vedle nadpisu sloupce můžete zahrnout nebo vyloučit tyto sloupce ze souhrnné tabulky. Výběrem nebo vymazáním zaškrtávacích políček v tomto okně se tabulka ihned aktualizuje.



Klepnutím na tlačítko Automaticky přijmout vše umožníte automatické přiřazení a přijetí (zbytkové analýzy i analýzy epitopu) výsledků při importu.

Poznámka:

Pokud nevidíte konkrétní pole dostupné prostřednictvím voliče polí a jste si jistí, že by tam mělo být, přejděte na C:\HLA Fusion\temp a smažte soubor s názvem: X_X_X(antigen type)_Layout.xml. Seznam názvů používaných ke znázornění souborů rozvržení u různých produktů pro screening antigenů najdete v části Pojmenování souboru rozvržení souhrnu relace.



159


One Lambda, Inc.



Sloupce a pořadí souhrnné tabulky relace lze upravit a výběry uložit. Když ukončíte volič polí, zobrazí se místní hlášení s dotazem, zda chcete uložit změny, které jste ve voliči polí provedli. Pokud jste vybrali položku Ano, budou se na tomto stejném počítači zobrazovat pouze vybrané sloupce, dokud nebudou provedeny a uloženy další změny.

Poznámka:

I když uložíte nastavení voliče polí, dva sloupce dat relace se zobrazí vždy: ID vzorku a Poz. jamky.



Kromě voliče polí můžete klepnutím na záhlaví libovolného sloupce v souhrnné tabulce seřadit tabulku podle daného sloupce. Šipka v záhlaví sloupce ukazuje pořadí třídění – nahoru pro vzestupné a dolů pro sestupné. Můžete také klepnutím na záhlaví sloupce a pomocí funkce táhnout a pustit změnit pořadí sloupce.



uložíte souhrnnou tabulku ve vašem počítači nebo Klepnutím na tlačítko Exportovat síti jako tabulku Excel, (*xls) (výchozí umístění je C:\OLI FUSION\data\report).



Zde zobrazená tlačítka Tisk programy HLA Fusion.

a Náhled


nabízí podobné funkce jako jiné


160


One Lambda, Inc.

Použití okna smíšené analýzy LABScreen U každého vzorku smíšené analýzy LABScreen v aktuální relaci můžete zobrazit data testu, upravit mezní hodnoty, přiřadit výsledky screeningu a provádět další činnosti: 

Kontrola dat a provedení celkových přiřazení



Zakroužkování antigenů v tabulce specificit



Zobrazení molekulárních specificit



Zobrazení výsledků screeningu třídy I, třídy II a MIC



Úprava mezních hodnot



Kontrola všech perliček ve vzorku v tabulce nezpracovaných dat



Překrytí vzorku negativního séra na aktuálním vzorku



Přidání poznámek, označení vzorku pro další testování a zobrazení zprávy o analýze vzorku



Uložení a potvrzení přiřazení Obrazovka smíšené analýzy LABScreen: Vyhledání antigenu

(Najděte více antigenů uvedením jednotlivých antigenů oddělených mezerou.)

Nástroje analýzy

Specificity

Statistická tabulka

Zobrazené karty se mění podle typu použití sady.

Poznámky uživatele


Systémové Klepnutím zobrazte Uložit Potvrdit poznámky nezpracovaná data přiřazení přiřazení pro jednotlivé perličky


161

One Lambda, Inc.

Poznámka:


Dáváte-li přednost tomu, aby se Graf nezpracovaných stal při otevření okna analýzy LABScreen výchozím zobrazením, přejděte do nastavení konfigurace produktu a zaškrtněte políčko vedle možnosti Zobrazit graf nezpracovaných jako výchozí.



Třída I i třída II jsou zobrazeny v jednom okně na první záložce výsledků screeningu. Na následující záložce lze získat přístup k výsledkům MIC. Výsledky analýzy jsou buď pozitivní, negativní, nebo neurčené.



Normalizovaná hodnota je zobrazena pomocí poměrného vzorce pro jednotlivé perličky ve vzorku.



Perličky pokryté antigeny třídy I jsou uvedeny v histogramu třídy I v levé části okna Třída I/II a perličky pokryté antigeny třídy II jsou uvedeny v histogramu třídy II v pravé části okna. Popisky osy x znázorňují počty perliček a popisy osy Y uvádějí rozsahy hodnot normalizovaných perliček pro jednotlivé histogramy.

Barvy pruhů: 

Pozitivní =



Negativní =



Neurčeno =

Najít antigen Zadáním jednotlivého antigenu nebo vícenásobného antigenu zakroužkujte antigen(y) v (střední) oblasti specificity okna analýzy.

1. V okně analýzy zadejte antigeny oddělené mezerou do pole vedle tlačítka Najít Ag (antigen). Řetězce antigenu, které zadáte, se musí shodovat s antigenem zobrazeným v okně. Pole Najít antigen



162


One Lambda, Inc.

Klepnutím na tlačítko Najít Ag Poznámka:

zakroužkujte zadané antigeny.

Je-li zadaný antigen širokým antigenem, budou zakroužkovány jeho rozdělené antigeny. Pokud například zadáte A9, zakroužkuje se A23 a A4.

Můžete také klepnutím na libovolná pole na panelu CREG (jak je zobrazeno výše) zakroužkovat antigeny v oblasti specificity bez nutnosti zadat antigen do pole Najít antigen.

Chcete-li zde zakroužkovat …klepněte na okno CREG zde.

Zobrazení molekulární typizace pro antigeny 1. V okně analýzy zaškrtnutím políčka DNA pod položkou Název vzorku v horní části zobrazte molekulární typizace pro antigeny ve vzorku.

Molekulární typizace je zobrazena fialově ve středové oblasti obrazovky tedy oblasti specificity.

Zrušením zaškrtnutí políčka DNA se zobrazení vrátí k sérologickým specificitám.



163


One Lambda, Inc.

Zobrazení výsledků screeningu protilátek MIC Výběrem karty označené MIC zkontrolujte výsledky MIC pro daný vzorek.

1. V okně analýzy klepnutím na kartu MIC zobrazte výsledky screeningu MIC. Obrazovka analýzy protilátek MIC

Chcete-li se vrátit k výsledkům třídy I a třídy II, klepněte na kartu Třída I a II vlevo dole.

Úprava mezních hodnot Negativní mezní hodnoty pro jednotlivé vzorky můžete změnit klepnutím na čáry mezních hodnot v histogramech a jejich přesunutím. Můžete však změnit pouze jednu mezní hodnotu prahu najednou. 

V okně analýzy klepněte na pruh mezní hodnoty a pomocí funkce táhnout a pustit jej posunujte v grafu perliček tak, abyste dosáhli opětovné analýzy vzorku pomocí nové mezní hodnoty.

Pozitivní mezní hodnota snížená na 0,9 Čára negativní mezní hodnoty

Pozitivní mezní hodnota snížená na 1,3 (červená) Čára negativní mezní hodnoty (zelená)



164

One Lambda, Inc.


Barvy mezní hodnoty: 

Práh pozitivní mezní hodnoty je zbarven červeně.



Práh negativní mezní hodnoty je zbarven zeleně.

Resetování všech možností na výchozí hodnotu Všechny provedené změny lze vrátit na výchozí hodnoty. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Použít výchozí v pravé horní části okna vrátíte všechna změněná nastavení na výchozí hodnoty. Vzorek je znovu analyzován pomocí výchozích hodnot, které byly použity, když byl vzorek vybrán pro analýzu.

Graf nezpracovaných Graf nezpracovaných dat ukazuje nezpracovanou hodnotu střední fluorescenční hodnoty (MFI) jednotlivých perliček překrytých importovaným sérem NK MFI. v horní pravé části 1. V okně analýzy klepnutím na tlačítko Graf nezpracovaných okna zobrazte graf nezpracovaných dat s hodnotami pozadí z vybraného nebo výchozího NS pro jednotlivé perličky.



165


One Lambda, Inc.

2. Klepnutím na tlačítko Normální grafu.

(vpravo nahoře) se vrátíte k normalizovanému

Tabulka nezpracovaných dat

Informace o analýze se zobrazují v tabulkové formě. Pozitivní jamky jsou zobrazeny červeně. Řádky zvýrazněné žlutě mají reakční hodnoty nad prahem. 1. Chcete-li zobrazit data vzorku v tabulkové formě, klepněte na tlačítko Nezpracovaná data v dolní pravé části okna analýzy LABScreen. Tabulka nezpracovaných dat smíšené analýzy LABScreen

2. Klepnutím na záhlaví sloupce (např. Základní) proveďte seřazení tabulky podle daného kritéria. umístěné v horním pravém rohu obrazovky zavřete okno Tabulka 3. Klepnutím na tlačítko Zavřít nezpracovaných dat a vraťte se k analýze.

Zpráva o nezpracovaných datech Pro snazší navigaci, export a tisk můžete vytvořit zprávu obsahující informace o nezpracovaných údajích pro aktuální vzorek. 1. Po zobrazení tabulky nezpracovaných údajů klepnutím na tlačítko Zpráva v pravé spodní části okna tabulky nezpracovaných údajů zobrazíte zprávu o nezpracovaných údajích. K exportu dat můžete použít také tlačítko Tisk obrazovky


.


166


One Lambda, Inc.

Statistická tabulka Tato část okna smíšené analýzy LABScreen se nachází v dolním levém rohu okna a zobrazuje statistiku pro jednotlivé typy výsledků screeningu. Zobrazené hodnoty se liší podle toho, která karta výsledků screeningu je aktivní. Statistické tabulky smíšené analýzy LABScreen

Panel CREG

Provedení přiřazení Výběrová okénka Konečné přiřazení zobrazují přiřazení navržená aplikací Fusion. Chcete-li přijmout přiřazení tak, jak je zobrazeno, uložte nebo potvrďte vzorek. Chcete-li navržené přiřazení změnit, postupujte takto: 

V okně analýzy pomocí možností konečného přiřazení vyberte přiřazení pro jednotlivé třídy (pozitivní, negativní nebo neurčeno).



167

One Lambda, Inc.


Uložení přiřazení Laboratorní technici a vedoucí mohou uložit výsledky analýzy pro další kontrolu a schválení. Uložené vzorky jsou dostupné pro potvrzení pouze pro vedoucího laboratoře. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Uložit umístěné v pravém dolním rohu okna analýzy uložte výsledky analýzy pro všechny specificity aktuálně uvedené v poli Konečná přiřazení.

Po klepnutí na tlačítko uložení vás aplikace Fusion automaticky přesune k dalšímu vzorku. Pro potvrzení musí mít vedoucí přístup ke vzorku, pro který jste uložili přiřazení. Budete-li potřebovat provést změny, můžete se ke vzorku kdykoli před potvrzením vrátit. 

Klepněte na tlačítko Znovu analyzovat

a poté znovu na tlačítko Uložit

.

Potvrzení přiřazení Výsledky analýzy mohou potvrzovat vedoucí laboratoře. Když tak učiní, jsou vzorky označeny jako Potvrzené. Když zobrazujete potvrzené vzorky, tlačítko Potvrdit je fialové. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Potvrdit umístěné v pravém dolním rohu okna potvrďte všechny výsledky analýzy, které byly uloženy v okně výsledků konečných přiřazení.

Po potvrzení se automaticky přesunete na další vzorek, kde můžete pokračovat s potvrzováním výsledků. Když se poprvé vrátíte k potvrzenému vzorku, uvidíte, že tlačítko Potvrdit zbarvené fialově, což znamená, že již byl potvrzen dříve.

je nyní

Přidání poznámky ke vzorkům Ve všech analýzách, vyhledání dat a hlášení funkcí v systému HLA Fusion se zobrazují poznámky ke vzorku pro výsledky vzorku v relaci aktuálního vzorku. 

V okně analýzy zadejte do pole Poznámky pod oblastí přiřazení poznámku o typu vzorku.



Nebo dvojím klepnutím na některé z polí zobrazte místní okno, které umožňuje zadat více textových znaků.



168


One Lambda, Inc.

Do této oblasti napište své vlastní poznámky Klepnutím dvakrát do jednoho z textových polí

Poznámky systému, které je zde automaticky přidáno,

otevřete větší okno poznámek

Označení vzorku značkou pro další testování Potřebu dalšího testování vzorku můžete označit zaškrtnutím políčka Další testy a poté uložením. Označení Další testy se zobrazí ve výsledcích, vyhledávání dat a zprávách o daném vzorku.



Jsou-li potřeba další testy, v okně analýzy zaškrtněte políčko Další testy pod oblastí přiřazení.

Tisk okna aktuální analýzy

Tlačítko Tisk obrazovky na panelu nástrojů aplikace Fusion odešle aktuálně zobrazené okno analýzy do výchozí tiskárny.



V okně analýzy klepnutím na tlačítko Tisk obrazovky na panelu nástrojů vytiskněte obrazovku aktuální analýzy.



Vytiskne se na výchozí tiskárně, kterou jste vybrali pro tento počítač.

Náhled zpráv a jejich tisk Chcete-li zobrazit nebo vytisknout zprávu o smíšených datech screeningu protilátek pro aktuální vzorek, použijte tlačítko Náhled tisku na panelu nástrojů. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Náhled zprávy nebo Tisk zprávy zobrazíte seznam zpráv, které chcete vytisknout nebo získat jejich náhled v souvislosti s aktuálním vzorkem.



169


One Lambda, Inc.

Zprávy dostupné pro náhled nebo tisk



170

One Lambda, Inc.


Pomocí okna LABScreen PRA, Jednotlivý antigen a Jednotlivá analýza V okně LABScreen pro analýzu produktu PRA, jednotlivého antigenu a jednotlivé analýzy je několik úkolů, které můžete provést: 

Kontrolovat data a přiřazovat specificity



Zakroužkování antigenů v tabulce specificit



Zobrazení molekulárních specificit



Upravovat mezní hodnoty pro vzorek



Zobrazovat nezpracovaná data jako graf



Vyloučit antigen z analýzy



Seřazovat antigeny pro vzorky analýzy jednotlivého antigenu



Provádět přiřazení zbytkové analýzy nebo analýzy epitopu



Ručně zadávat přiřazení



Přiřadit vzorek jako negativní



Přidávat poznámky, označovat je pro další testování nebo zobrazit zprávu pro aktuální vzorek.



171


One Lambda, Inc. Klepnutím přejděte na Sledování protilátek

Specificity Panel CREG Statistická tabulka Zobrazuje seznam vyloučenýc h antigenů Pro uživatelem Zde vyberte definovanou normalizační mezní formuli hodnotu

Klepnutím otevřete obrazovku výběru dárce

Pole poznámek

Klepněte, pokud jsou požadovány další testy

Pro výsledky jako Uložit/potvrdit přiřazení nezpracovaná data

Dáváte-li přednost tomu, aby se Graf nezpracovaných stal při otevření okna analýzy LABScreen výchozím zobrazením, přejděte do nastavení konfigurace produktu a zaškrtněte políčko vedle možnosti Zobrazit graf nezpracovaných jako výchozí.

Tabulka CREG Skupiny CREG jsou zobrazeny v horní části tabulky a specificity dané skupiny jsou zobrazeny dole. Specificity jsou zvýrazněny jednou z těchto barev. Poznámka:

Chcete-li skrýt zobrazení panelu CREG, klepněte na název CREG v horní části okna. Objeví se dialogové okno s dotazem, zda chcete skrýt panel CREG. Skryjete ji klepnutím na tlačítko Ano. Chcete-li ji znovu zobrazit, klepněte znovu na název CREG a zobrazte ji klepnutím na tlačítko Ano.



Fialová = pozitivní přiřazení z okna výsledků analýzy epitopu



Růžová = přiřazení zbytkové analýzy, která jsou maskována analýzou epitopu



Modrá = přiřazení Cw



Zelená = přiřazení Bw4 a Bw6



172

One Lambda, Inc.



Klepnutím na skupinu CREG nebo antigeny zakroužkujte odpovídající specificity.



Klepnutím pravým tlačítkem přesuňte specificitu do okna Konečná přiřazení.


Chcete-li použít jinou tabulku CREG, postupujte takto: 

Klepněte na tlačítko LABScreen na domovské stránce nebo vyberte možnost Obslužné programy > Konfigurace produktů protilátek > Nastavení konfigurace analýzy.



Na domovské stránce klepnutím na odkaz Upravit zobrazte nabídku Nastavení konfigurace analýzy.



V rozevíracím seznamu CREG vyberte tabulku.



Klepněte na tlačítko Uložit v dolní části nabídky.

Poznámka:

Informace o vytvoření nebo úpravě seznamu CREG najdete v části Správa informací o seznamu CREG.

Najít antigen Chcete-li zadat více antigenů, použijte k oddělení jednotlivých položek mezeru. Všechny zadané antigeny jsou v poli specificity zakroužkované. Klepnutím na štítky pro pole výsledků zbytkové analýzy, výsledků analýzy epitopu nebo konečného přiřazení dojde k zakroužkování specificit uvedených ve vybraném poli výsledků. Klepnutím na označení pole Vyloučený antigen se zakroužkují vyloučené antigeny. Použijete-li funkci Najít antigen v okamžiku, kdy jsou v okně zobrazeny molekulární specificity, nemůžete vidět zakroužkované antigeny, dokud nezrušíte zaškrtnutí políčka DNA.



173


One Lambda, Inc.

1. Z okna analýzy zadejte antigeny nebo skupiny CREG (např. 1C nebo 2C) do pole vedle tlačítka Najít Ag (antigen). 2. Klepněte na tlačítko Najít Ag skupiny CREG.

a aplikace Fusion zakroužkuje zadané antigeny nebo

Když na tlačítko Najít Ag klepnete znovu, odeberete zakroužkování antigenů v poli specificity.

Změna laboratorního měřítka

Maximální hodnotu pro měřítko grafu perličky podle základní hodnoty, uživatele nebo vzorec nezpracovaných dat lze změnit v okně analýzy. Postup je následující: 

Klepněte pravým tlačítkem na oblast pozadí okna analýzy těsně nad horní hodnotu osy y v grafu perliček. Klepnutím pravým tlačítkem na světle modrou oblast změníte laboratorní měřítko.



Vyberte možnost Nastavit max. měřítko.



Do pole Měřítko zadejte novou hodnotu a stiskněte klávesu Enter

na klávesnici.

Chcete-li se vrátit k hodnotě měřítka LAB, postupujte podle výše uvedených kroků, ale vyberte možnost Měřítko LAB.



174


One Lambda, Inc.

Zobrazení molekulárních specificit Molekulární specificity se zobrazují v poli specificity okna analýzy a lze je použít k vytvoření přiřazení alel. Výsledky screeningu se zobrazí a uloží jako sérologické specificity.

1. V okně analýzy zaškrtnutím políčka DNA

poblíž horní části obrazovky analýzy

zobrazíte molekulární specificity. Zrušením zaškrtnutí tohoto políčka se vrátíte k sérologickým specificitám. Molekulární specificity se zobrazí, když je zaškrtnuté políčko DNA.

Úprava mezních hodnot Prahovou mezní hodnotu jednotlivých vzorků lze změnit. Můžete změnit pouze jednu mezní hodnotu prahu najednou. 1. V okně analýzy klepněte na pruh prahu, který chcete upravit. 2. Pomocí funkce táhnout a pustit upravte pruh mezní hodnoty a znovu analyzujte vzorek. Úprava prahových mezních hodnot



175


One Lambda, Inc.

Výběr minimálního pozitivního prahu Minimální pozitivní práh můžete změnit pomocí rozbalovací nabídky nad grafem perliček. 

V okně analýzy vyberte nový pozitivní práh z rozevíracího seznamu Práh (vedle nástrojů analýzy poblíž horní části okna). Vzorek se znovu analyzuje podle nového prahu. Účinky změny prahu jsou zobrazeny v polích výsledků.

Změna normalizačního vzorce Analýza LABScreen implicitně používá základní normalizační vzorec. Normalizační vzorec použitý v analýze můžete změnit na libovolný z následujících možností: poměrové hodnocení, smíšený a nezpracovaná data. Při použití normalizačního vzorce nezpracovaných dat se negativní kontrola vzorku zobrazí jako černá čára v grafu reaktivity perliček. Změny se vztahují pouze na aktuální vzorek. 

V okně analýzy vyberte v rozevíracím seznamu Vzorec nový normalizační vzorec. Vzorek se znovu analyzuje. Výběr normalizačního vzorce

Vyloučení antigenu(ů) z analýzy Všechny zadané antigeny jsou vyloučeny z analýzy. Chcete-li zadat více antigenů, použijte k oddělení antigenů čárku. 1. V okně analýzy klepněte na položku Vylouč. Ag. antigenu.


. Zobrazí se kontextové okno vyloučení


176


One Lambda, Inc.

2. Zadejte antigeny, které chcete vyloučit, a klepněte na tlačítko OK. Změníte-li své rozhodnutí a klepnete na tlačítko Vymazat položky budou odstraněny a zobrazí se toto hlášení:

, vaše

Vzorek je znovu analyzován a vyloučené antigeny jsou uvedeny v poli vyloučených antigenů v rámci okna statistiky analýzy.

Chcete-li tyto antigeny znovu zahrnout, klepněte znovu na tlačítko , klepnutím na tlačítko Vymazat odeberte Vylouč. Ag antigeny z pole a poté klepnutím na tlačítko OK znovu proveďte analýzu, při které jsou již tyto antigeny zahrnuty.

Poznámka:

Chcete-li vyloučit také všechny zadané antigeny u souvisejícího pacienta, zaškrtněte políčko Vyloučit typizaci pacienta.

Zahrnutí/vyloučení Cw Můžete zahrnout specificity antigenů Cw do analýzy nebo je z ní vyloučit.

1. Poblíž horní části okna analýzy zaškrtnutím políčka Cw znovu proveďte analýzu pomocí specificit Cw. Vymazáním zaškrtávacího políčka Cw znovu proveďte analýzu bez specificit Cw.



177


One Lambda, Inc.

Graf nezpracovaných dat

Normalizovaný graf

Resetování všech možností na výchozí hodnotu Všechny provedené změny lze vrátit na výchozí hodnoty. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Použít výchozí v pravém horním rohu okna vrátíte všechna změněná nastavení u tohoto vzorku na výchozí hodnoty.



Vzorek je znovu analyzován pomocí výchozích hodnot.

Vynucení pozitivního výsledku Má-li vzorek nízký počet perliček, zobrazí se tlačítko Vynutit + , které umožňuje vynutit pozitivní výsledek přepočítáním s povolenou odchylkou nízkého počtu perliček. 

U vzorků s nízkým počtem negativních kontrol klepnutím na tlačítko Vynutit + analyzujte vzorek jako pozitivní. Vzorek se znovu analyzuje.

Graf nezpracovaných Graf nezpracovaných dat ukazuje nezpracovanou hodnotu střední fluorescenční hodnoty (MFI) jednotlivých perliček překrytých importovaným sérem NK MFI.

1. V okně analýzy klepnutím na tlačítko Graf nezpracovaných

zobrazíte graf

nezpracovaných dat s hodnotami pozadí. Klepnutím na tlačítko Normální

se vrátíte k normalizovanému grafu.



178


One Lambda, Inc.

Tabulka nezpracovaných dat Pozitivní perličky jsou zobrazeny červeně. Žlutě zvýrazněné řádky mají normalizované hodnoty, které jsou nad hodnotou v poli Min. hodnota. Změny provedené v normalizačním vzorci a minimální normalizované hodnotě se vztahují pouze na tabulku nezpracovaných údajů a nikoli na analýzu.

1. V okně analýzy klepnutím na tlačítko Nezpracovaná data

v pravé dolní části okna

analýzy zobrazíte Tabulku nezpracovaných údajů.

Tabulka nezpracovaných dat PRA/SA LABScreen Klepnutím na záhlaví seřaďte tabulku podle dané kategorie.

Poznámka:

V rozevíracím seznamu Vzorec můžete vybrat jiný vzorec (základní, poměrové hodnocení nebo nezpracovaná data, ale pokud tak učiníte, musíte také upravit položku Min. hodnota (nejnižší hodnota pozitiva pro aktuální vzorek na základě vybraného reakčního prahu) tak, aby korelovala s novým vzorcem.

2. Klepnutím na tlačítko umístěné v pravém horním rohu tabulky nebo na tlačítko Zavřít ukončete toto okno a vraťte se k analýze.

Zpráva o nezpracovaných datech Pro snazší navigaci, export a tisk můžete vytvořit zprávu obsahující informace o nezpracovaných údajích pro aktuální vzorek.



179

One Lambda, Inc.


1. Po zobrazení tabulky nezpracovaných údajů klepnutím na tlačítko Zpráva

v pravé spodní části okna tabulky nezpracovaných údajů zobrazíte zprávu o nezpracovaných údajích.

Zobrazení shody/neshody SPD (specifického antigenu dárce) Klepnutím na tlačítko M můžete zobrazit všechny informace o shodě/neshodě SPD daného pacienta přidruženého k tomuto vzorku a dárce (dárců) přidružených k pacientovi. Poznámka:

Nemáte-li k tomuto vzorku přidruženého pacienta, obdržíte výstražné hlášení a nebudete moci zobrazit žádné informace o shodě/neshodě SPD, dokud nepřidružíte pacienta ke vzorku a přinejmenším jednoho dárce k pacientovi.

Tyto informace zobrazíte takto:

1. Klepněte na tlačítko M (vedle tlačítka T vpravo). Máte-li pacienta přidruženého k tomuto vzorku, otevře se okno Shoda/neshoda SPD.

V případě potřeby vyberte z rozevíracího seznamu ID dárce jiného dárce. Pomocí  nebo - tabulku rozbalte nebo sbalte. Barvy tabulky znamenají:




Zelená: označuje shodné antigeny.



Oranžová: označuje neshodné antigeny, které byly v konečném přiřazení potvrzeny.



Žlutá: označuje neshodné antigeny, které nebyly v konečném přiřazení ještě potvrzeny.


180

One Lambda, Inc.


Přidání poznámky ke vzorkům Poznámky, které vy nebo systém přidáte do pole poznámek, se zobrazí s výsledky v aktuální relaci analýzy, ve funkcích vyhledávání a hlášení v systému HLA Fusion.

1. V okně analýzy zadejte do pole Poznámky pod oblastí přiřazení poznámku o typu vzorku. Klepnutím na možnost Uložit se poznámky uloží.

Označení vzorku značkou pro další testování Potřebu dalšího testování vzorku můžete označit zaškrtnutím políčka Další testy  a poté uložením. Označení Další testy se zobrazí ve výsledcích, vyhledávání dat a zprávách o daném vzorku. umístěné pod části výsledků



V okně analýzy zaškrtněte políčko Další testy přiřazení.



Zobrazí se okno Výběr testu.



Zaškrtněte políčka u dalších testů, které chcete spustit.



Zadejte název seznamu testů, který vytváříte.



Klepnutím na tlačítko Uložit uložíte seznam testů a vrátíte se do okna analýzy.


V okně analýzy klepnutím na tlačítko Tisk obrazovky aktuální analýzy.

na panelu nástrojů vytiskněte obrazovku

Náhled zpráv a jejich tisk Chcete-li zobrazit nebo vytisknout zprávu pro aktuální vzorek, použijte tlačítko náhledu tisku na panelu nástrojů. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Náhled zprávy nebo Tisk zprávy zobrazíte seznam zpráv, které chcete vytisknout nebo získat jejich náhled v souvislosti s aktuálním vzorkem.



181


One Lambda, Inc.

Zprávy dostupné pro náhled/tisk

Poznámka:

Vyberete-li možnost Protilátka vlastní, nemůžete v tomto okamžiku vytvořit novou vlastní zprávu. Jediné vlastní zprávy dostupné z okna analýzy jsou zprávy vytvořené předtím v okně Zprávy.

Provedení konečných přiřazení Konečná přiřazení lze provést buď v poli výsledků Zbytková analýza (neplatí pro jednotlivé vzorky LABScreen), nebo v poli výsledků Epitop. Poznámka:

Chcete-li, aby se pro analýzu epitopu použily střední (normální) pozitivní hodnoty místo středních (nezpracovaných) pozitiv, zaškrtněte nastavení Použít střední normální hodnotu na obrazovce konfigurace produktu LABScreen PRA, jednotlivých antigenů a jednotlivých produktů.

V okně analýzy proveďte přiřazení pomocí jednoho z těchto úkonů:

 Dvojím klepnutím na specificitu antigenu v okně výsledků Zbytková analýza nebo Analýza epitopu přiřadíte specifikovaný antigen k seznamu Konečné přiřazení.

 Klepnutím zvýrazněte specificitu a klepnutím na tlačítko Přiřadit jednotlivě

ji

přesuňte do seznamu Konečné přiřazení. Klepnutím na tlačítko Přiřadit vše vpravo od seznamu zbytkové analýzy nebo epitopu přesuňte všechny aktuální výsledky v daném seznamu do oblasti Konečná přiřazení.

 Klepnutím pravým tlačítkem na specificitu nebo skupinu CREG v tabulce CREG ji přiřaďte k oblasti Konečná přiřazení.

Ruční přiřazení Ruční přiřazení lze zadat v poli pod oknem výsledků konečných přiřazení. Při zadání několika ručních přiřazení současně ponechejte mezi jednotlivými specificitami mezeru.



182


One Lambda, Inc.

1. V okně analýzy zadejte v poli pod oknem Konečné přiřazení ruční přiřazení specificity antigenu.

Pole ručního přiřazení

2. Klepnutím na tlačítko Přiřadit () těsně nad polem Ruční přiřazení nebo stisknutím klávesy Enter přidejte přiřazení do okna výsledků Konečné přiřazení.

Přiřazení záporných hodnot vzorku Ke vzorku můžete přiřadit zápornou hodnotu i v případě, že analýza ukazuje některé pozitivní výsledky. 

(nacházející se přímo nad polem V okně analýzy klepnutím na tlačítko Přiřadit – ručního přiřazení) vynutíte u daného vzorku negativní hodnotu.

Odebrání přiřazení Specificity lze odebrat v okně výsledků Konečná přiřazení. Přidržením klávesy Ctrl a klepnutím na jednotlivé specificity, které chcete odebrat, můžete odebrat více specificit. 

V okně analýzy klepněte na zvýrazněné specificity v seznamu konečných přiřazení (přidržením klávesy Ctrl vyberete více specificit) a klepněte na tlačítko Odebrat umístěné pod polem výsledků konečných přiřazení.

Uložení přiřazení

Laboratorní technici a vedoucí mohou uložit výsledky analýzy pro další kontrolu a schválení. Uložené vzorky jsou dostupné pro potvrzení pouze pro vedoucího laboratoře. 

umístěné v pravém dolním rohu okna V okně analýzy klepnutím na tlačítko Uložit analýzy uložte výsledky analýzy pro všechny specificity aktuálně uvedené v poli Konečná přiřazení.



183

One Lambda, Inc.


Aplikace Fusion se automaticky přesune k dalšímu vzorku. Pro potvrzení musí mít vedoucí přístup ke vzorku, pro který jste uložili přiřazení. Budete-li potřebovat provést změny, můžete se ke vzorku kdykoli před potvrzením vrátit. Klepněte na tlačítko Znovu analyzovat a poté znovu na tlačítko Uložit.

Potvrzení přiřazení

Výsledky analýzy mohou potvrzovat vedoucí laboratoře. Když tak učiní, jsou vzorky označeny jako Potvrzené. Když zobrazujete potvrzené vzorky, tlačítko Potvrdit je fialové. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Potvrdit umístěné v pravém dolním rohu okna potvrďte všechny výsledky analýzy, které byly uloženy v okně výsledků konečných přiřazení. Automaticky se přesunete na další vzorek, kde potvrdíte výsledky.

Když se poprvé vrátíte k potvrzenému vzorku, uvidíte, že tlačítko Potvrdit zbarvené fialově, což znamená, že již byl potvrzen dříve.

je nyní

Získání hodnot zbytkové analýzy (kromě jednotlivých analýz) Hodnoty zbytkové analýzy lze zobrazit v analýze s konečnými přiřazeními, avšak nejsou uchovávány pro vyhledávání nebo vykazování. 

Klepnutím na tlačítko T v okně analýzy umístěné v horním pravém rohu okna výsledků konečné analýzy zobrazíte hodnoty zbytkové analýzy v okně výsledků konečných přiřazení.

PRA dárce (kromě jednotlivých analýz) Můžete zobrazit procento PRA od dostupných dárců v systému nebo od skupin vybraných dárců, kteří odpovídají počítačem přiřazeným protilátkám u aktuálního vzorku.

Poznámka:

Chcete-li vybrat dárce nebo skupiny dárců, klepněte na tlačítko PRA dárce. Můžete také automaticky vybrat skupiny výběrem možnosti Obslužné programy > Všeobecná nastavení. Chcete-li vytvořit skupinu dárců, vyberte možnost Informace o pacientovi > Správa pacienta, v poli Pacient/dárce vyberte možnost Dárce a vyplňte pole skupiny dárců.



184

One Lambda, Inc.


1. U analýzy jednotlivého antigenu nebo PRA klepněte na tlačítko PRA dárce

. Kontextové okno zobrazí procento shodných dárců PRA a celkový počet dárců, kteří byly při výpočtu zohledněni.

Klepnutím na tlačítko OK zavřete okno. Procento a počet dárců zůstávají zobrazeny vedle tlačítka PRA dárce.

Výběr minimálních pozitivních prahových mezních hodnot (kromě jednotlivých analýz) Můžete zadat minimální pozitivní prahové mezní hodnoty, které budou použity u libovolného vzorku LABScreen PRA nebo vzorku jednotlivého antigenu. Chcete-li nastavit mezní hodnoty na X8 – X2, podívejte se do části Změna konfigurace analýzy screeningu protilátek. Pak můžete přepínat mezi mezními hodnotami poskytovanými OLI a mezními hodnotami definovanými prostřednictvím aplikace Fusion pomocí následujícího postupu: 

Chcete-li vybrat uživatelem definované mezní hodnoty, zaškrtněte políčko u položky Uživatelská mezní hodnota



Chcete-li se vrátit k používání mezních hodnot OLI, zrušte zaškrtnutí políčka Uživatelská mezní hodnota.

Skrytí hodnot zbytkové analýzy (jednotlivý antigen) Můžete se rozhodnout zobrazení hodnot zbytkové analýzy v analýze vzorku jednotlivého antigenu skrýt, tyto hodnoty však zůstávají uložené pro vyhledávání anebo vytváření zpráv. 1. Vyberte možnost nabídky Obslužné programy > Konfigurace produktů protilátek > Nastavení konfigurace analýzy. 2. V rozevírací nabídce Typ produktu v horní části zobrazení vyberte možnost Jednotlivý antigen LABScreen. 3. Zaškrtněte položku Skrýt okno zbytkové analýzy umístěné ve spodní části dialogového okna konfigurace produktu jednotlivého antigenu. 4. Klepněte na tlačítko Uložit


v dolní části nabídky.


185

One Lambda, Inc.


Vzorky jednotlivého antigenu LABScreen importované po této změně konfigurace nezobrazují v okně analýzy vzorku oblast přiřazení zbytkové analýzy.

Navigace mezi třídou I a třídou II (zkombinovaná třída I a II PRA) U relací kombinované třídy LABScreen PRA I a II je každá třída analyzována samostatně a je nutno ji uložit samostatně, aby se v databázi zobrazily kombinované výsledky. Před importem kombinovaných relací se ujistěte, že jste již vytvořili katalog kombinované třídy LABScreen PRA I a II. 

umístěné V okně analýzy klepnutím na tlačítko Spustit třídu I a Spustit třídu II v horní levé části okna analýzy přepněte mezi výsledky třídy I a třídy II u aktuálního vzorku.

Seřazení antigenů (jednotlivý antigen) Karty jednotlivých antigenů lze místo podle reakční hodnoty řadit podle specificity.

1. U analýzy jednotlivého antigenu klepněte na tlačítko Seřadit Ag.

Tlačítko.

Graf je seřazen podle počtu perliček.

2. Klepnutím na tlačítko Obnovit

se vrátíte k výchozímu grafu.

Smíšená dávková analýza LABScreen umožňuje rychle analyzovat relaci a uložit ji pro pozdější kontrolu a konečná přiřazení. Během dávkové analýzy nemůžete graficky zobrazovat vzorky a neprovádějí se žádná konečná přiřazení screeningu. 

Dávková analýza relace



Zobrazení zprávy o dávkové analýze



Uložení výsledků analýzy



186

One Lambda, Inc.


Přehled Po provedení dávkové analýzy se zobrazí zpráva o dávkové analýze LABScreen. Výsledky lze uložit, ale musí být jednotlivě potvrzeny.

Uložení dávkové analýzy Laboratorní technici a vedoucí mohou uložit výsledky dávkové analýzy pro další kontrolu a schválení. Vzorky jsou označeny jako Připravené.

1

Klepnutím na tlačítko Uložit>> v dolní části nabídky zpráv uložte všechny vzorky do databáze.

2 Klepnutím na tlačítko Konec seznam zavřete a vrátíte se do hlavní nabídky.

Kontrola/analýza vzorků Chcete-li zobrazit výsledky dávky po uložení podrobněji, po stisknutí tlačítka Analyzovat se v okně analýzy zobrazí relace. Pokud jste relaci dávkové analýzy neuložili před kontrolou výsledků dávky, musí být každý vzorek uložen samostatně.



187

One Lambda, Inc.


Možnosti nabídky klepnutí pravým tlačítkem na navigátor pro LABScreen

Poznámka:

Tyto možnosti se vztahují na všechny relace a vzorky LABScreen.

Existují dostupné možnosti analýzy prostřednictvím navigátoru – podle toho, zda se nacházíte v pohledu souhrnu relace LABScreen nebo na obrazovce analýzy pro daný vzorek. Klepnutím pravým tlačítkem na aktuální relaci v okně navigátoru zobrazíte možnosti nabídky, které umožňují ovlivnit relace analýzy LABScreen před analýzou nebo v jejím průběhu.

Opakovaná analýza s novým nastavením/katalogem

Umožňuje opakovanou analýzu relace pomocí nových nastavení nebo aktualizovaného katalogu. Postup: 1. Klepněte na rozevírací šipku v poli ID nového katalogu a vyberte ze seznamu nový katalog. 2. Přejmenujte relaci (relace musí mít jedinečné názvy). . 3. Klepněte na tlačítko Analýza Relace, na kterou jste klepli pravým tlačítkem, se znovu analyzuje pomocí katalogu, který jste vybrali.



188


One Lambda, Inc.

Možnosti na úrovni vzorku Pokud klepnete pravým tlačítkem na aktivní vzorek v navigátoru (nejprve klepnutím levým tlačítkem vyberte vzorek), zobrazí se dvě možnosti nabídky: Možnosti navigátoru na úrovni vzorku

Související záznamy Související záznam je záznam, který je přidružen k aktuálnímu vzorku prostřednictvím ID pacienta nebo ID vzorku.

Poznámka:




Klepnutím pravým tlačítkem na vzorek v navigátoru a výběrem položky Související záznamy načtěte všechny záznamy související s aktuálním vzorkem do rozevíracího seznamu vzorků (v horní části obrazovky). Pomocí navigačních šipek vzorku zobrazte jednotlivě analýzu každého souvisejícího záznamu.



Pokud se chcete vrátit k zobrazení vzorků v aktuálních relacích, klepněte na odkaz <<Souhrn v horní části okna.

Srovnávací analýza Tuto možnost použijte k porovnání analýzy aktuálního vzorku s dříve provedenou analýzou.

Poznámka:

Tato možnost je dostupná také pomocí tlačítka Srovnávací analýza nástrojů.

na panelu

Výběrový seznam srovnávací analýzy



189

One Lambda, Inc.




Klepněte pravým tlačítkem na vzorek v navigátoru a vyberte možnost Srovnávací analýza. Výběrem předchozí analýzy vzorku ze zobrazeného seznamu proveďte porovnání s aktuální analýzou. (Aktuální vzorek se zobrazí se světle hnědým pozadím.)



Okna těchto dvou analýz se pak zobrazí společně v okně porovnání.



Velikost jednotlivých panelů okna lze změnit nebo je lze samostatně posunovat pomocí funkce zobrazení táhnout a pustit. Klepnutím na tlačítko panelu nástrojů Srovnávací analýza porovnání zrušíte.



190

One Lambda, Inc.


Analýza LAT Funkce analýzy LAT™ programu analyzuje výstupní soubory CSV, ručně zadaná reakční schémata nebo výsledky ELISA jako novou relaci a může pokračovat v analýze dříve nedokončené relace. Výsledky analýzy jsou založeny na katalogových specifikacích dodaných se softwarem. Existuje několik dalších věcí, které by měly být dokončeny nebo ověřeny předtím, než spustíte relaci analýzy: 

Před provedením analýzy se ujistěte, že máte poslední katalogové soubory. Katalogy můžete stáhnout nebo je aktualizovat z domovské stránky LAT klepnutím na .



Zobrazit a upravit globální nastavení konfigurace produktu před spuštěním analýzy. Zobrazí se globální nastavení, které může být změněno na domovské stránce LABScreen klepnutím na nebo prostřednictvím nabídky obslužných programů. Globální nastavení platí ve všech nově importovaných relacích.



Při importu souborů CSV ušetříte čas, když ověříte, že implicitní adresy URL a cesty jsou nastaveny do umístění, kde jsou tyto soubory ve vašem systému nebo síti běžně ukládány. Tato nastavení lze upravit také v části Obslužné programy > Všeobecná nastavení domovské stránky aplikace Fusion.

Poznámka:

Některé výše uvedené úkoly vyžadují, abyste měli oprávnění vedoucího. Možná si budete muset ověřit u svého vedoucího, zda byly tyto úkoly provedeny.



191

One Lambda, Inc.


Zahájení analýzy LAT Pořízení dat relace LAT Existují čtyři základní metody pro import dat relace pro analýzu LAT v aplikaci HLA Fusion: 1. Ruční zadání dat z pouze jedné relace se zadává ručně pomocí klávesnice. 2. Zadání dávky data z několika relací jsou zadána ručně v sérii. 3. Soubor CSV  správně naformátovaný soubor CSV je importován přímo do aplikace Fusion pro analýzu LAT. 4. ELISA čte data analýzy přímo ze čtečky Biotek ELX 800 ELISA. Klepnutím na tlačítko LAT na panelu domovské stránky nebo ikonu LAT nástrojů aplikace Fusion otevřete program LAT.

na panelu

Zobrazí se domovská stránka LAT. Klepnutím otevřete správce katalogu Zaškrtnutím zde zahrňte dříve importované soubory CSV.

Klepnutím otevřete okno Aktualizace referenčního souboru Klepnutím otevřete okno Dostupné aktualizace referenčního souboru Klepnutím změňte globální nastavení LAT.

Seznam souborů CSV

Klepnutím na tyto odkazy zobrazte vybrané katalogy a dokumenty pracovního listu.

Poznámka:

Otevřením pracovních listů ověřte správnost čísel revizí (tyto dokumenty neobsahují ve svém názvu souboru číslo revize).



192


One Lambda, Inc.

Ruční zadání jednotlivé relace Chcete-li ručně zadat jednotlivou relaci pro analýzu LAT, postupujte takto: 1. Klepněte na tlačítko Ruční zadání v horní části domovského panelu LAT.

2. V horním textovém poli dalšího okna zadejte jedinečný název pro novou ručně zadanou relaci analýzy LAT. 3. Klepněte na šipkudolů v poli Vybrat katalog produktů a vyberte příslušný katalog produktů LAT. 4. Dále zadejte správné datum testu nebo klepnutím na šipkudolů zobrazte místní kalendář a vyberte datum testu.

5. Klepněte na tlačítko Další

.

Zobrazí se nabídka vložení dat.

Ta umožňuje vložit reakční hodnoty pro nový vzorek. Můžete zadat vzorky a reakce do relace – karta s 10 testy nebo karty s 20 testy. Data lze zadat ručně klepnutím na jednotlivé jamky nebo získáním hodnot nezpracovaných dat ze čtečky ELISA. 6. Zadejte Název vzorku (názvy). Pro analýzu je požadován jedinečný název. Datum vzorku zde lze v případě potřeby změnit.



193

One Lambda, Inc.


Ruční zadání dávky Chcete-li ručně zadat k analýze více než jednu relaci, postupujte takto: 1. Klepněte na tlačítko Zadání dávky. Otevře se obrazovka Souhrn relace.

Na rozdíl od ručního zadání, které je omezeno pouze na jednu relaci, vám zadání dávky umožňuje zadat skupinu relací pomocí obrazovky Souhrn relace. Ta umožňuje zadat data v tabulkovém formátu, kde každý řádek představuje jednu relaci.

2. Zadejte jedinečný název pro tuto dávku nebo přijměte implicitní název dávky, který navrhuje aplikace Fusion.

3. Ručně vyberte nebo zadejte data relace počínaje třídou HLA (I, II, PRA třídy + PRA třídy II a jednotlivá třída I) v levé části obrazovky souhrnu relace a pokračuje doprava, dokud nezadáte všechna dostupná data relace.

Pole označená hvězdičkou () jsou povinná. To zahrnuje pole, která se vyplňují pomocí rozevíracích seznamů (Název katalogu a Datum testu) a ID testu.



194


One Lambda, Inc.

Pokračujte v zadávání dat relace podle potřeby. Upozorňujeme, že po zadání dat relace a zahájení zadávání dat pro další relace se nemůžete vrátit na předchozí řádek dat relace. Po uložení však lze dávku znovu otevřít a upravit. 4. Po zadání všech dat dávky relace ve klepněte na tlačítko Uložit spodní části obrazovky. Dávka je uložena a zahrnuta do seznamu Existující dávky v rozevíracím seznamu v horní části obrazovky. 5. Po dokončení zadání dat relace pro tuto dávku klepněte na tlačítko Další

.

Podobně jako u ručního vložení dat relace, které je pojednáno výše, se objeví nabídka vložení dat a hlavní okno analýzy LAT.

Import souborů CSV v analýze LAT 1. Klepnutím na ikonu Složka soubory CSV.

otevřete seznam Vybrat

2. Ze seznamu Vybrat soubory CSV vyberte jednu nebo více relací. 3. Klepněte na tlačítko Otevřít

.

Soubory CSV jsou nyní zobrazeny v seznamu názvů souborů CSV.



195


One Lambda, Inc.

Poznámka:

Můžete vidět soubory CSV u jiných produktů než produktů LAT nebo jiné různé soubory CSV. To znamená, že musíte nejprve klepnout na podsložku pro analýzu LAT, nebo že vaše soubory relace LAT nejsou obsaženy v jejich vlastní složce v adresáři, na kterou aplikace HLA Fusion ukazuje.

4. Klepnutím na soubor CSV zobrazíte jeho přidružené soubory v tabulce Podrobnosti aktuálního vzorku/pacienta. Tabulka podrobností aktuálního vzorku/pacienta

Je-li vzorek již přidružen k pacientovi, zobrazí se ID pacienta a všechny existující související informace o pacientovi. Chcete-li přidat informace o pacientovi, proveďte jeden z následujících kroků: 1. Chcete-li přidat data ze systému, klepněte na tlačítko Seznam pacientů

.

Zobrazí se okno Import pacientů umožňující importovat soubor s informacemi o pacientovi. Klepnutím na tlačítko Procházet najdete seznam Informace o pacientovi.



196

One Lambda, Inc.


Chcete-li data pacienta přidat ručně, stačí zadat data do polí tabulky souvisejících s pacientem.



Zaškrtnutím políčka pro přiřazení ID vzorku k prázdným ID pacienta můžete nechat přiřazení ID vzorku k prázdným polím ID pacienta na aplikaci Fusion.

2. Systém implicitně přiřadí ID relace. Volitelně můžete zadat jiné ID relace.

Poznámka:

ID relace musí být pro databázi systému jedinečné. Pokud již ID relace existuje, software vás vyzve k přejmenování relace. Důrazně doporučujeme, abyste v tomto poli nepoužívali žádné speciální znaky, protože mohou sloužit specifickému účelu jako oddělovače polí.

3. Přijměte zobrazený katalogový soubor nebo vyberte katalogový soubor z rozevíracího seznamu v poli ID katalogu. Poznámka:

Potřebujete-li importovat více katalogů, klepněte na odkaz Stahování na domovské stránce LAT. Pokud jste katalogy stáhli během aktuální relace importu, rozevírací katalogový seznam se nemusí aktualizovat ihned. Možná budete muset klepnout na tlačítko Domů a poté se opětovným klepnutím na tlačítko LAT vrátit k postupu importu.

4. Po ověření informací o relaci a vzorku klepněte na tlačítko . Relace je nyní zobrazena pro Importovat následnou analýzu ve stromu navigátoru aplikace Fusion v pravé části obrazovky analýzy.



197

One Lambda, Inc.


Výběrem relace ze stromu navigátoru aplikace Fusion můžete zobrazit její souhrn; poté výběrem vzorku ze souhrnu relace zobrazíte její analýzu. Nebo můžete pokračovat importováním vzorků ze seznamu Import vzorků. 5. Ve stromu navigátoru klepněte na položku Název relace. Zobrazí se Souhrnná tabulka relace. Pole PRA dárce

Klepnutím umožníte automatické přijetí přiřazení a výsledků (zbytkové analýzy i epitopu) při importu. (pouze u smíšené analýzy LAT)






Procházením doleva nebo doprava zobrazíte všechna pole souhrnné tabulky.



Klepněte na tlačítko Volič polí vlevo od nadpisů tabulky. V tomto okně můžete výběrem nebo vymazáním zaškrtávacích políček vedle nadpisu sloupce zahrnout nebo vyloučit tyto sloupce ze souhrnné tabulky. Výběrem nebo vymazáním zaškrtávacích políček v tomto okně se tabulka ihned aktualizuje.

Poznámka:

Pokud nevidíte konkrétní pole dostupné prostřednictvím voliče polí a jste si jistí, že by tam mělo být, přejděte na C:\HLA Fusion\temp a smažte soubor s názvem X_X_X(typ antigenu)_Layout.xml.



Klepnutím na libovolné záhlaví sloupce v souhrnné tabulce proveďte seřazení tabulky podle daného sloupce. Šipka v záhlaví sloupce ukazuje pořadí řazení – nahoru pro vzestupné a dolů pro sestupné. Pořadí sloupců lze také změnit jejich přetažením a puštěním.



Sloupce a pořadí souhrnné tabulky relace lze upravit. Když zavřete Volič polí, zobrazí se místní zpráva umožňující vybrat, zda chcete či nechcete uložit provedené změny. Klepnete-li na tlačítko Ano, vaše změny se uloží pro všechny budoucí souhrny relace LAT na tomto počítači, dokud nebudou uloženy další úpravy.



198


One Lambda, Inc.



Klepnutím na tlačítko Exportovat uložíte souhrnnou tabulku do svého počítače nebo sítě (výchozí umístění C:\OLI FUSION\data\report). Soubor se uloží ve formátu Excel (*.xls). Souhrnná tabulka vyexportovaná jako tabulka Excel



Klepnutím na možnost Tisk vytisknete zprávu souhrnné tabulky.



Klepnutím na možnost Náhled zobrazíte zprávu souhrnné tabulky.

Tisk/náhled souhrnné tabulky



V okně náhledu tisku umožňuje posuvník náhledu stránky vybírat různé stránky zprávy.



Sloupce a pořadí souhrnné tabulky relace lze upravit. Změny, které jste provedli v rozvržení, lze uložit klepnutím na tlačítko Uložit rozvržení. Vaše změny se uloží pro všechny budoucí souhrny relace LAT na stejném počítači, dokud nebudou provedeny a uloženy další změny.

Chcete-li vyloučit určitý vzorek z relace analýzy, zaškrtněte políčko Vyloučit vedle daného vzorku. Vzorek je stále zobrazený v seznamu vzorků v položce Zprávy; aby nedošlo k jeho zahrnutí do dat zprávy, neprovádějte při vytvoření zprávy výběr tohoto vzorku.



199


One Lambda, Inc.

Použití okna smíšené analýzy LAT U každého vzorku v aktuální relaci můžete zobrazit data testu a přiřadit výsledky screeningu. Když se přesunete na zobrazení daného vzorku, aplikace HLA Fusion jej analyzuje. Chcete-li analyzovat celou relaci, musíte zobrazit všechny vzorky v relaci a přiřadit výsledky. V okně analýzy můžete: 

Zobrazit a vytisknout výsledky analýzy vzorku



Zakroužkovat antigeny v tabulce specificit



Seřadit podle pozice jamky



Přidat poznámky a označit vzorek pro další testování



Zobrazit rychlou zprávu pro aktuální vzorek



Exportovat data reakce do souboru CSV

Poznámka:

Z okna analýzy se můžete kdykoli vrátit do souhrnu relace klepnutím na odkaz <<Souhrn na panelu nástrojů aplikace HLA Fusion vedle ID vzorku/relace. Obrazovka smíšené analýzy LAT



200


One Lambda, Inc.

Zadání dat a reakčního schématu Nabídka vložení dat zobrazí aktuální reakci pro existující vzorek nebo umožní vložit reakční hodnoty pro nový vzorek. Tato oblast umožňuje zadat vzorky a reakce do relace – karta s 10 testy nebo karta s 20 testy. Data lze zadat ručně nebo získáním hodnot nezpracovaných dat ze čtečky ELISA.

Vložení dat a reakčního schématu (karta s 10 testy)



Formát části vložení dat napodobuje pracovní list smíšené analýzy LAT. Panel vložení reakce má rozvržení karty. Řádek jamek pro aktuální test je zvýrazněn modrým trojúhelníkem.



Každá jamka je tlačítko, které cyklicky mění reakční hodnoty (1, 8, 6, 4, 2, 0). Tlačítka jsou barevně označená tak, aby odpovídala reakcím.



Reakce můžete zadat klepnutím na tlačítko a zadáním reakční hodnoty nebo klepáním na tlačítko, dokud se nezobrazí požadovaná reakce. Když se tlačítko změní, pozornost se přesune na další tlačítko.



Navigace tlačítky probíhá zleva doprava (1A –1F, 2A – 2F…atd.).



Tam, kde má produkt prázdnou jamku, je odpovídající tlačítko reakce deaktivováno.



Po straně panelu je uveden seznam/zadání vzorků pro danou kartu. Než bude možno uložit reakci do databáze, musíte zadat ID vzorku. Relace nevyžaduje, aby byly využity všechny jamky karty.



Po analýze karty již nemůžete k dané kartě přidávat žádné informace o vzorku.



201


One Lambda, Inc.

Použití čtečky ELISA Chcete-li část dat analýzy načíst přímo ze čtečky Biotek ELX 800 ELISA, musí být počítač, na kterém máte spuštěnou aplikaci HLA Fusion, připojen ke čtečce ELISA. Připojte a kalibrujte čtečku ELISA v souladu se specifikacemi produktu. Aplikace HLA Fusion dokáže analyzovat pouze 96miskové karty Terasaki. Čtečka ELISA čte karty a přenáší nezpracované údaje do aplikace HLA Fusion.  Poznámka:

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Číst z importujte data ze čtečky ELISA. Tlačítko Číst z se zobrazí pouze v případě, že je váš počítač připojen ke čtečce ELISA a pro aktuální test jste ještě nezadali ruční reakce.

Histogram smíšené analýzy LAT

Histogram pro smíšenou analýzu LAT

Tento histogram zobrazuje reakční hodnotu pro jednotlivé pozice jamek aktuální karty v relaci. Zobrazuje také průměrné jamky s negativní kontrolou u skupiny testů, a to jako úzký světle zelený proužek překrývající pruhy jednotlivých reakčních jamek. Jamky jsou seřazeny podle skupiny testů, třídy I, třídy II a kontrolní jamky jsou seřazeny společně. 

Osa x zobrazuje polohu jamky.



Osa y ukazuje rozsahy reakčních hodnot (např. 1 až 10).

Pruhy jsou barevně označené podle jejich reakční hodnoty: 

8 = červená



6 = oranžová



4 = zlatá



2 = modrá



1 = zelená



202

One Lambda, Inc.


Vodorovné čáry znázorňují pozitivní prahy, které jste nastavili pro třídu I a třídu II. Čára přebírá stejnou barvu, jakou má barevné označení RXN.

Provedení přiřazení Tlačítka možnosti Konečné přiřazení zobrazují softwarem navržené přiřazení (pozitivní, negativní nebo neurčeno). Chcete-li toto přiřazení přijmout, uložte nebo potvrďte vzorek (viz následující části). Chcete-li navržené přiřazení změnit, postupujte takto: 1. V okně analýzy pomocí tlačítek možnosti Konečné přiřazení vyberte přiřazení pro jednotlivé třídy – pozitivní, negativní nebo neurčeno. Oblast přiřazení LAT


umístěné v pravém dolním rohu okna V okně analýzy klepnutím na tlačítko Uložit analýzy uložíte výsledky analýzy pro všechny specificity aktuálně uvedené v okně výsledků konečných přiřazení.

Aplikace Fusion se automaticky přesune k dalšímu vzorku. Pro potvrzení musí mít vedoucí přístup ke vzorku, pro který jste uložili přiřazení. Ke vzorku se můžete kdykoli před potvrzením vrátit. Potřebujete-li provést změny, klepněte na tlačítko Znovu a poté znovu na tlačítko Uložit . analyzovat



203


One Lambda, Inc.

Potvrzení přiřazení Výsledky analýzy mohou potvrzovat pouze vedoucí laboratoře. Když tak učiní, jsou vzorky označeny jako Potvrzené. Když zobrazujete potvrzené vzorky, tlačítko Potvrdit je fialové. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Potvrdit potvrďte všechny výsledky analýzy.

, umístěné v pravém dolním rohu okna,

Automaticky se přesunete na další vzorek, kde můžete pokračovat s potvrzováním výsledků. je nyní

Když se poprvé vrátíte k potvrzenému vzorku, uvidíte, že tlačítko Potvrdit zbarvené fialově což znamená, že již byl potvrzen dříve.

Přidání poznámky ke vzorkům Poznámky, které vy nebo aplikace Fusion přidáte do polí Poznámky, se zobrazí s výsledky v aktuální relaci analýzy, ve funkcích vyhledávání dat a funkcemi hlášení v aplikaci HLA Fusion. 

V okně analýzy zadejte do pole Poznámky pod oblastí přiřazení poznámku o typu vzorku.

Do této oblasti napište své vlastní poznámky Klepnutím dvakrát do jednoho z textových polí

Poznámky systému, které je zde automaticky přidáno,

otevřete větší okno poznámek

Poznámky se uloží až po klepnutí na tlačítko Uložit nebo Potvrdit.

Označení vzorku značkou pro další testování Potřebu dalšího testování vzorku můžete označit zaškrtnutím políčka Další testy a uložením. Označení Další testy se zobrazí ve výsledcích, vyhledávání dat a zprávách o daném vzorku. 1. V okně analýzy zaškrtněte políčko Další testy přiřazení. vpravo dole.

umístěné pod části výsledků

2. Nastavení zachováte klepnutím na tlačítko Uložit


nebo Potvrdit


.

204

One Lambda, Inc.


Přidání informací o kartě Klepnutím na tlačítko Info můžete přidat informace o aktuální kartě, například datum exspirace. Když klepnete na toto tlačítko, zobrazí se následující dialogové okno umožňující přidat informace této kartě vzorků.

Export dat relace (umístěné vpravo dole nad tlačítkem Uložit>>) můžete Klepnutím na tlačítko Exportovat exportovat data relace do souboru podobného formátu výstupního souboru CSV Luminex. Máte-li pro čtečku ELISA a analýzu samostatnou pracovní stanici, lze vyexportovaný soubor importovat pro analýzu a použít jej v jiném počítači.

Tabulka nezpracovaných dat Pozitivní perličky jsou zobrazeny červeně. Řádky zvýrazněné žlutě mají normalizované hodnoty nad minimální hodnotou. Změny provedené v normalizačním vzorci a minimální normalizované hodnotě se vztahují pouze na tabulku nezpracovaných údajů a nikoli na analýzu. 1. V okně analýzy klepnutím na tlačítko Nezpracované zobrazíte tabulku nezpracovaných údajů.


v pravé dolní části okna analýzy


205


One Lambda, Inc.

Tabulka nezpracovaných dat

Klepnutím na záhlaví sloupce seřaďte tabulku podle dané kategorie. Klepnutím na tlačítko Konec

v pravém horním rohu tabulky zavřete okno a vrátíte se k analýze.

Rychlá zpráva o nezpracovaných datech Pro snazší navigaci, export a tisk můžete vytvořit zprávu obsahující informace o nezpracovaných údajích pro aktuální vzorek. Po zobrazení tabulky nezpracovaných údajů klepnutím na tlačítko Zpráva okna tabulky Nezpracovaná data zobrazíte zprávu o nezpracovaných údajích. Klepnutím na tlačítko Konec

v pravé spodní části

v pravém horním rohu tabulky zavřete okno a vrátíte se k analýze.

Klepnutím na tlačítko Tisk obrazovky nezpracovaných údajů.

zobrazíte náhled aktuálně viditelné části tabulky

Klepnutím na tlačítko Tiskárna

v levé horní části okna odešlete obrázek přímo do tiskárny.

Klepnutím buď na tlačítko Konec k analýze.

, nebo na tlačítko Zavřít


zavřete okno a vraťte se


206

One Lambda, Inc.


Tisk okna aktuální analýzy Tlačítko Tisk obrazovky odešle aktuálně zobrazené okno analýzy do výchozí tiskárny vašeho počítače. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Tisk obrazovky aktuálně viditelnou část obrazovky analýzy.

na panelu nástrojů vytiskněte

Náhled zpráv a jejich tisk Chcete-li zobrazit nebo vytisknout zprávu o smíšených datech screeningu protilátek pro aktuální vzorek, použijte tlačítko Náhled tisku na panelu nástrojů.



V okně analýzy klepnutím na tlačítko Náhled zprávy nebo Tisk zprávy zobrazíte seznam zpráv, které můžete pro aktuální vzorek vytisknout nebo zobrazit jako náhled.

Poznámka:

Vyberete-li možnost Protilátka vlastní, nemůžete v tomto okamžiku vytvořit novou vlastní zprávu. Jediné vlastní zprávy dostupné z okna analýzy jsou zprávy vytvořené předtím v okně Zprávy.



207


One Lambda, Inc.

Použití okna analýzy jednotlivého antigenu LAT/PRA Toto okno zobrazí podrobné informace o analýze pro jednotlivé vzorky v relaci. Umožňuje zkontrolovat přiřazení specificit navržená programem, upravit je a přijmout. Aplikace HLA Fusion navrhne možné výsledky screeningu, ale konečná přiřazení musí provést uživatel. V nabídce okna analýzy můžete provést:   Poznámka:

Výběr minimálního pozitivního prahu Vyloučit vybrané specificity nebo specificity Cw Z okna analýzy se můžete kdykoli vrátit do souhrnu relace klepnutím na odkaz <<Souhrn na panelu nástrojů aplikace HLA Fusion vedle ID vzorku/relace. Analýza LAT PRA/jednotlivého antigenu

Zadání reakčního schématu Klepnutím na jednotlivé jamky po jejich zvýraznění změňte jejich reakční hodnotu, nebo reakční hodnotu zadejte. Jamky s bílými okraji jsou kontrolní jamky, jamky s černými okraji jsou reakční jamky. 1. V okně analýzy zadejte do pole Horní/dolní vzorek název vzorku a stiskněte klávesu Enter (u dvou testovacích karet zadejte název horního i dolního vzorku). 2. Zadejte reakční schémata klepnutím na jamky, čímž se změní reakční hodnota. Nebo vyberte jamku a zadejte reakční hodnotu.



208


One Lambda, Inc.

3. Klepněte na tlačítko Znovu analyzovat

.

Neexistuje žádný požadavek na to, aby byly použity všechny jamky karty. Zadávání vstupů na kartu se provádí pomocí skupiny tlačítek znázorňujících jednotlivé jamky. U tlačítek se při klepnutí cyklicky mění reakční hodnoty (1, 8, 6, 4, 2, 0). Implicitně se zobrazuje hodnota 1. Barvy tlačítek odrážejí zadané hodnoty: 1=zelená, 2=světle modrá, 4=purpurová; 6=červená; 8=tmavě modrá. Reakce můžete zadat klepnutím na tlačítko a zadáním reakční hodnoty nebo klepáním na tlačítko, dokud se nezobrazí požadovaná reakce. Když se tlačítko reakční hodnoty změní, pozornost se přesune na další tlačítko. Navigace tlačítky probíhá zleva doprava (1A –1F, 2A – 2F atd.). Obrázek karty (pořadí tlačítek, pozice jamky atd.) napodobuje skutečnou kartu analýzy LAT, která probíhá. Takže u 2testové karty se pro první vzorek zobrazí nejprve horní část karty a dolní polovina karty se zobrazí jako druhá pro druhý vzorek. Když přidáte novou kartu, zobrazí se nejprve horní polovina, poté případně dolní polovina. můžete přidat informace o aktuální kartě, například datum Klepnutím na tlačítko + Info exspirace. Když klepnete na toto tlačítko, zobrazí se dialogové okno Další informace o testu umožňující přidat informace o této kartě: Přidání informací o testovací kartě



209


One Lambda, Inc.

Použití čtečky ELISA Chcete-li číst data analýzy přímo ze čtečky Biotek ELX 800 NB ELISA, musí být počítač, na kterém máte spuštěnou aplikaci HLA Fusion, připojen ke čtečce ELISA. Připojte a kalibrujte čtečku ELISA v souladu se specifikacemi produktu. Aplikace HLA Fusion dokáže analyzovat pouze 96miskové karty Terasaki. Čtečka ELISA čte karty a přenáší nezpracované údaje do aplikace HLA Fusion. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Část ze čtečky ELISA importujte data ze čtečky ELISA.

Poznámka:

Tlačítko Číst z se zobrazí pouze v případě, že je váš počítač připojen ke čtečce ELISA a pro aktuální test jste ještě nezadali ruční reakce.

Histogram LAT PRA/jednotlivého antigenu Zobrazí se reakce vzorku. Histogram pro analýzu LAT PRA/jednotlivého antigenu



Osa y = reaktivita, osa x = pozice jamky a pořadí vzorků.



Histogram je implicitně řazen od nejvyšší reakce po nejnižší. Můžete také klepnutím na tlačítko Seřadit podle pozice jamky provést takovéto seřazení.



Pruhy jsou zabarvené podle reakce: 1=zelená, 2= světle modrá, 4=žlutá; 6=hnědá; 8=červená.



Když umístíte kurzor nad pruh, zobrazí se místní okno ID perličky, pozice karty, reakce, nezpracovaných dat, prahu a specificity jamky.



210

One Lambda, Inc.


Tabulka CREG Skupiny CREG jsou zobrazeny v horní části tabulky a specificity dané skupiny jsou zobrazeny dole. Specificity jsou zvýrazněny jednou z těchto barev. Chcete-li skrýt zobrazení panelu CREG, klepněte na název CREG v horní části okna. Objeví se dialogové okno s dotazem, zda chcete skrýt panel CREG. Skryjete jej klepnutím na tlačítko Ano. Chcete-li jej znovu zobrazit, klepněte znovu na název CREG a zobrazte jej klepnutím na tlačítko Ano.

Poznámka:



Fialová = pozitivní přiřazení z okna výsledků analýzy epitopu












Klepnutím na skupinu CREG nebo antigeny zakroužkujte odpovídající specificity.



Klepnutím pravým tlačítkem přesuňte specificitu do okna Konečná přiřazení. Chcete-li použít jinou tabulku CREG, postupujte takto: 1. Klepněte na tlačítko domovské stránky LAT nebo vyberte možnost Obslužné programy > Konfigurace produktů protilátek > Nastavení konfigurace analýzy. 2. Na domovské stránce LAT klepnutím na odkaz [Upravit] zobrazte dialogové okno Nastavení konfigurace analýzy (pokud jste pro přístup k této položce použili nabídku obslužných programů, je toto dialogové okno již zobrazeno). 3. V rozevíracím seznamu CREG vyberte jinou tabulku. 4. Klepněte na tlačítko Uložit

ve spodní části této obrazovky.

Najít antigen Všechny zadané antigeny jsou v poli specificity zakroužkované. Chcete-li zadat více antigenů, použijte k oddělení antigenů mezeru. Klepnutím na štítky pro výsledky zbytkové analýzy, výsledky analýzy epitopu nebo konečné přiřazení dojde k zakroužkování specificit uvedených v oblasti výsledků. Klepnutím na štítek „Vyloučit antigen“ dojde k zakroužkování vyloučených antigenů.



211

One Lambda, Inc.

Poznámka:


Použijete-li funkci Najít antigen v okamžiku, kdy jsou v okně zobrazeny molekulární specificity, nemůžete vidět zakroužkované antigeny, dokud nezrušíte zaškrtnutí políčka DNA.

1. Z okna analýzy zadejte antigeny nebo skupiny CREG (např. 1C nebo 2C) do pole vedle tlačítka Najít Ag, (antigen). 2. Klepnutím na tlačítko Najít Ag zakroužkujte zadané antigeny nebo skupiny CREG. 3. Když na tlačítko Najít Ag klepnete znovu, odeberete zakroužkování antigenů v poli specificity.

Zobrazení molekulárních specificit Molekulární specificity se zobrazují pouze v poli specificity okna analýzy. Tabulka CREG a výsledky screeningu se zobrazí a uloží jako sérologické specificity. 1. V okně analýzy zaškrtnutím políčka DNA zobrazte molekulární specificity. 2. Zrušením zaškrtnutí políčka se zobrazení vrátí k sérologickým specificitám.

Výběr minimálního pozitivního prahu Minimální pozitivní práh můžete změnit pomocí rozbalovací nabídky. 

V okně analýzy vyberte nový pozitivní práh z rozevíracího seznamu Práh vedle nástrojů analýzy poblíž horní části okna. Vzorek se znovu analyzuje podle nového prahu. Účinky změny prahu jsou zobrazeny v polích výsledků.

Vyloučení antigenu z analýzy Chcete-li zadat více antigenů, použijte k oddělení antigenů čárku. Všechny zadané antigeny jsou vyloučeny z analýzy. 1. V okně analýzy klepněte na tlačítko Vylouč. Ag. Zobrazí se kontextové okno vyloučení antigenu.



212

One Lambda, Inc.


2. Zadejte antigeny, které chcete vyloučit, oddělené čárkou a klepněte na tlačítko OK. Vzorek je znovu analyzován a vyloučené antigeny jsou uvedeny v poli vyloučených antigenů v okně statistiky analýzy. 3. Chcete-li tyto antigeny znovu zahrnout, klepněte znovu na tlačítko Vylouč. Ag, klepnutím na tlačítko Vymazat to odeberte antigeny z pole a poté klepnutím na OK znovu proveďte analýzu, při které jsou již tyto antigeny zahrnuty.

Zahrnutí/vyloučení Cw Můžete si zvolit, zda chcete zahrnout specificity antigenů Cw do analýzy nebo je z ní vyloučit. 

Poblíž horní části okna analýzy zaškrtnutím políčka Cw znovu proveďte analýzu pomocí specificit Cw.

Vymazáním zaškrtávacího políčka Cw znovu proveďte analýzu bez specificit Cw.

Navigace mezi třídou I a třídou II (Kombinovaná třída PRA I a II) U relací kombinované třídy PRA I a II je každá třída analyzována samostatně a je nutno ji uložit samostatně, aby se v databázi zobrazily kombinované výsledky. Před importem kombinovaných relací se ujistěte, že jste již vytvořili katalogový soubor kombinované třídy PRA LAT I a II. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Spustit třídu I, nebo Spustit třídu II, umístěné v horní prostřední části okna analýzy, přepněte mezi výsledky třídy I a třídy II u aktuálního vzorku. (Po klepnutí na tlačítko Spustit třídu I a dokončení analýzy se tlačítko změní na Spustit třídu II a obráceně.)



213

One Lambda, Inc.


Tabulka nezpracovaných dat Pozitivní perličky jsou zobrazeny červeně. Řádky zvýrazněné žlutě mají normalizované hodnoty nad minimální hodnotou. Změny provedené v normalizačním vzorci a minimální normalizované hodnotě se vztahují pouze na tabulku nezpracovaných údajů a nikoli na analýzu. 1. V okně analýzy klepnutím na tlačítko Nezpracované v pravé dolní části okna analýzy zobrazíte tabulku nezpracovaných údajů. Proveďte jeden nebo více následujících kroků: 

Klepnutím na záhlaví v horní části řádku seřaďte tabulku podle dané kategorie.



Klepnutím na tlačítko Zpráva vytvořte zprávu tabulky nezpracovaných dat.



Klepnutím na tlačítko Tisk obrazovky vytiskněte to, co se zobrazuje na obrazovce.



Klepnutím na tlačítko Zavřít zavřete okno a vraťte se k analýze.

Zpráva o nezpracovaných datech Pro aktuální vzorek můžete vytvořit zprávu obsahující informace o nezpracovaných datech. 

Po zobrazení tabulky nezpracovaných údajů klepnutím na tlačítko Zpráva v pravé spodní části okna tabulky nezpracovaných dat zobrazíte zprávu o nezpracovaných datech.

Export dat relace Klepnutím na tlačítko Exportovat můžete vyexportovat data vzorku do výstupního souboru odděleného čárkou. Tento soubor bude importován k analýze. Tuto funkci lze použít, pokud máte pro systém ELISA a analýzu samostatnou pracovní stanici.

PRA dárce Můžete zobrazit procento PRA od dostupných dárců v systému nebo od skupin vybraných dárců, kteří odpovídají počítačem přiřazeným protilátkám u aktuálního vzorku. Poznámka:

Chcete-li vybrat skupinu(y) dárců, vyberte možnost Obslužné programy > Všeobecná nastavení. Chcete-li vytvořit skupinu dárců, vyberte možnost Informace o pacientovi > Správa pacienta, v poli Pacient/dárce vyberte možnost Dárce a vyplňte pole skupiny dárců.

1. U analýzy jednotlivého antigenu nebo PRA klepněte na tlačítko DPRA. Místní okno zobrazí procento shodných dárců PRA a celkový počet dárců,kteří byly při výpočtu zohledněni.



214

One Lambda, Inc.


2. Klepnutím na tlačítko OK zavřete okno. Procento a počet dárců zůstávají zobrazeny vedle tlačítka PRA dárce.

Přidání poznámky ke vzorkům Poznámky, které vy nebo systém Fusion přidáte do Pole poznámek, se zobrazí s výsledky v aktuální relaci analýzy, ve funkcích vyhledávání a hlášení v systému HLA Fusion.

 V okně analýzy zadejte do pole Poznámky pod oblastí přiřazení poznámku o typu vzorku. Velikost okna poznámek můžete změnit klepnutím do pravého dolního rohu a táhnutím. Poznámky se uloží až poté, co klepnete po dokončení analýzy na tlačítko Uložit.

Označení vzorku značkou pro další testování Označením vzorku pro další testování dojde k zobrazení zaškrtávacího políčka Další testy pro výsledky vzorku v aktuální relaci analýzy ve všech analýzách, vyhledání dat a hlášení funkcí v systému HLA Fusion. 

V okně analýzy zaškrtněte políčko Další testy umístěné pod částí výsledků analýzy epitopů.

Náhled zpráv a jejich tisk Chcete-li zobrazit nebo vytisknout zprávu LAT PRA/SA pro aktuální vzorek, klepněte na tlačítko Náhled zprávy na panelu nástrojů aplikace Fusion. 


Poznámka:

Vyberete-li možnost Molekulární vlastní, nemůžete v tomto okamžiku vytvořit novou vlastní zprávu. Jediné vlastní zprávy dostupné z okna analýzy jsou zprávy vytvořené předtím v okně Zprávy.

Provedení konečných přiřazení Konečná přiřazení lze provést ze seznamu výsledků zbytkové analýzy nebo analýzy epitopu. Jakmile je specificita přesunuta do oblasti konečných přiřazení, nezobrazuje se již ve svém původním okně výsledků.



215

One Lambda, Inc.


V okně analýzy proveďte přiřazení pomocí jednoho z těchto úkonů: 

Dvojím klepnutím na specificitu antigenu v okně výsledků Koncová analýza nebo Analýza epitopu zobrazíte seznam specifikovaných antigenů v poli Konečné přiřazení.



Klepnutím zvýrazněte specificitu a klepnutím na tlačítko Přiřadit jednotlivě ji přesuňte do seznamu Konečné přiřazení.



Klepnutím na tlačítko Přiřadit vše vpravo od seznamu zbytkové analýzy nebo analýzy epitopu přesuňte všechny aktuální výsledky v daném seznamu do oblasti Konečná přiřazení.



Klepnutím pravým tlačítkem na specificitu nebo skupinu CREG v tabulce CREG ji přiřaďte k oblasti Konečná přiřazení.

Ruční přiřazení Ruční přiřazení lze zadat v poli pod oknem výsledků konečných přiřazení. Při zadání několika ručních přiřazení ponechejte mezi jednotlivými specificitami mezeru. 1. V okně analýzy zadejte v poli pod oknem konečného přiřazení ruční přiřazení specificity antigenu. 2. Klepnutím na tlačítko Postoupit výsledků Konečné přiřazení.

těsně nad polem ručního přiřazení přidejte přiřazení do okna


(nacházející se přímo nad polem ručního V okně analýzy klepnutím na tlačítko Přiřadit – přiřazení) přiřadíte všem vzorkům v okně výsledků konečného přiřazení zápornou hodnotu.

Odebrání přiřazení Specificity lze odebrat v poli výsledků Konečná přiřazení. Přidržením klávesy Ctrl a klepnutím na jednotlivé specificity, které chcete odebrat, můžete odebrat více specificit. 

V okně analýzy klepněte na zvýrazněné specificity v seznamu konečných přiřazení (přidržením umístěné nad polem klávesy CTRL vyberete více specificit) a klepněte na tlačítko Odebrat výsledků Konečná přiřazení.



216

One Lambda, Inc.



V okně analýzy klepnutím na tlačítko Uložit >> (umístěné v pravém dolním rohu okna analýzy) uložíte výsledky analýzy pro všechny specificity aktuálně uvedené v okně výsledků konečných přiřazení. Automaticky se přesunete k dalšímu vzorku.

Pro potvrzení musí mít vedoucí přístup ke vzorku, pro který jste uložili přiřazení. Ke vzorku se můžete kdykoli před potvrzením vrátit. Potřebujete-li provést změny, klepněte na tlačítko Znovu analyzovat a poté znovu na tlačítko Uložit.

Potvrzení přiřazení Výsledky analýzy mohou potvrdit pouze vedoucí laboratoře. Když tak učiní, jsou vzorky označeny jako Potvrzené. Když zobrazujete potvrzené vzorky, tlačítko Potvrdit je fialové. 

Klepnutím na tlačítko Potvrdit v okně analýzy, umístěné v pravém dolním rohu okna, potvrďte všechny výsledky analýzy. Automaticky se přesunete na další vzorek, kde můžete pokračovat s potvrzováním výsledků.

Když se poprvé vrátíte k potvrzenému vzorku, uvidíte, že tlačítko Potvrdit je nyní zbarvené fialově, což znamená, že již byl potvrzen dříve.

Získávání hodnot zbytkové analýzy Hodnoty zbytkové analýzy lze zobrazit v poli výsledků Konečná přiřazení, avšak nejsou uchovávány pro vyhledávání nebo vykazování. 

v okně analýzy umístěné v horním pravém rohu okna Klepnutím na tlačítko výsledků konečné analýzy zobrazíte hodnoty zbytkové analýzy v poli výsledků konečných přiřazení.



Vzorky jednotlivého antigenu LAT importované po této změně konfigurace nezobrazují v okně analýzy vzorku oblast přiřazení zbytkové analýzy.



217

One Lambda, Inc.


Navigace mezi třídou I a třídou II (Kombinovaná třída PRA I a II) U relací kombinované třídy LABScreen I a II je každá třída HLA analyzována samostatně a je nutno ji uložit samostatně, aby se v databázi zobrazily kombinované výsledky. Před importem kombinovaných relací se ujistěte, že jste již vytvořili katalogový soubor kombinované třídy LABScreen PRA I a II. 

V okně analýzy klepnutím na tlačítko Spustit třídu I a Spustit třídu II umístěné v horní levé části okna analýzy přepněte mezi výsledky třídy I a třídy II u aktuálního vzorku.



218


One Lambda, Inc.

Možnosti nabídky klepnutím pravým tlačítkem na navigátor pro LAT Poznámka:

Tyto možnosti se vztahují na všechny relace a vzorky LAT.

Existují dostupné možnosti analýzy prostřednictvím navigátoru – podle toho, zda se nacházíte v pohledu souhrnu relace LAT, nebo na obrazovce analýzy pro daný vzorek. Klepnutím pravým tlačítkem buď na relaci, nebo na vzorek v okně navigátoru získáte přístup k možnostem nabídky, které umožňují ovlivnit relace analýzy LAT před analýzou nebo v jejím průběhu. Možnosti nabídky na úrovni relace navigátoru

Opakovaná analýza s novým katalogem Umožňuje opakovanou analýzu pomocí nového nebo aktualizovaného katalogu.

1. V navigátoru systému Fusion klepněte pravým tlačítkem na relaci a vyberte možnost Znovu analyzovat pomocí nových nastavení/katalogu. 2. Přejmenujte relaci s novým ID relace. 3. Klepněte na rozevírací šipku v poli ID nového katalogu a vyberte ze seznamu nový katalog.

4. Klepněte na tlačítko Analýza. Relace, na kterou jste klepli pravým tlačítkem, se znovu analyzuje pomocí nového ID relace s katalogem, který jste právě vybrali.



219

One Lambda, Inc.


Možnosti na úrovni vzorku Možnost Související záznamy a Srovnávací analýza se zobrazí, pokud klepnete pravým tlačítkem na aktivní vzorek v navigátoru (nejprve klepnutím na levé tlačítko vyberte vzorek):

Související záznamy Související záznam je záznam, který je spojen s aktuálním vzorkem prostřednictvím pacienta nebo ID vzorku.

Poznámka:

Tato možnost je dostupná také pomocí tlačítka na panelu nástrojů Související záznamy.

 Výběrem této možnosti nabídky načtěte všechny záznamy související s aktuálním vzorkem do rozevíracího seznamu vzorků. Pomocí navigační šipky vzorku zobrazte jednotlivě analýzu každého souvisejícího záznamu.

 Pokud se chcete vrátit k zobrazení vzorků v aktuálních relacích, klepněte na odkaz <<Souhrn v horní části okna.

Srovnávací analýza Tuto možnost použijte k porovnání analýzy aktuálního vzorku s předchozí provedenou analýzou vzorku. Poznámka: 

Tato možnost je dostupná také pomocí tlačítka na panelu nástrojů Srovnávací analýza.

Vyberte vzorek, který chcete porovnat s aktuálním vzorkem. Okna těchto dvou analýz se pak zobrazí společně v okně porovnání.



Velikost jednotlivých oken lze změnit nebo je lze posunout pomocí funkce táhnout a pustit.

Opětovným klepnutím na tlačítko panelu nástrojů Srovnávací analýza zobrazení porovnání zrušíte.



220

One Lambda, Inc.


Analýza LCT Funkce analýzy LCT programu analyzuje ručně zadané hodnoty reakcí jako novou relaci. Výsledky analýzy jsou založeny na katalogových specifikacích dodaných se softwarem systému HLA Fusion. Existuje několik dalších věcí, které by měly být dokončeny nebo ověřeny předtím, než spustíte relaci analýzy: 

Před provedením analýzy se ujistěte, že máte poslední katalogové soubory a také kód NMDP, místní kód (pokud se používá) nebo referenční soubory ekvivalentu pro sérologii. Katalogy můžete stáhnout nebo je aktualizovat z domovské stránky LCT.



Zobrazit a upravit globální nastavení konfigurace produktu před spuštěním analýzy. Globální nastavení se zobrazuje a lze jej upravit na domovské stránce LCT. Globální nastavení platí ve všech nově importovaných relacích.



Při importu katalogů a souborů ušetříte čas, když ověříte, že implicitní adresy URL a cesty jsou nastaveny do umístění, kde jsou tyto soubory ve vašem systému nebo síti běžně ukládány. Tato nastavení lze upravit také v části Konfigurace implicitní domovské stránky systému Fusion.

Poznámka:

Některé výše uvedené úkoly vyžadují, abyste měli práva vedoucího uživatele. Možná si budete muset ověřit u svého vedoucího, zda byly tyto úkoly provedeny.



221


One Lambda, Inc.

Spuštění analýzy LCT Pořízení dat LCT 1. Zvolte tlačítko LCT na panelu domovské stránky . Fusion

nebo panelu nástrojů aplikace

Zobrazí se domovská stránka LCT. Poznámka:

Nepoužíváte-li výchozí uživatelské rozhraní aplikace Fusion, data a odkazy zobrazované v pravé části okna se nezobrazí. Klepnutím otevřete Klepnutím otevřete okno okno správce aktualizace referenčního souboru katalogu

Klepnutím otevřete okno dostupné referenční aktualizace (katalogy zobrazují datum pojmenování a poznámky k revizím)

Klepnutím změňte globální nastavení LCT

Klepnutím na tyto odkazy zobrazte vybraný katalog, pracovní list nebo dokumenty sondy/ primeru.

Domovská stránka LCT

Poznámka:




222

One Lambda, Inc.


2. Klepněte na tlačítko Zadání dávky. Zobrazí se obrazovka zadání dávky LCT.

Všimněte si, že systém Fusion automaticky přiřadil název relace. Volitelně můžete tuto relaci přejmenovat. Poznámka:

ID relace musí být pro databázi systému jedinečné. Pokud již ID relace existuje, software vás vyzve k přejmenování relace. Také důrazně doporučujeme, abyste v tomto poli nepoužívali žádné speciální znaky, protože mohou sloužit specifickému účelu jako oddělovače polí.

3. Pomocí rozevírací nabídky v poli Katalog vyberte katalogový soubor.

Poznámka:

Potřebujete-li importovat více katalogů, klepněte na odkaz Download (Stáhnout) na domovské stránce LCT. Pokud jste katalogy stáhli během této relace importu, rozevírací katalogový seznam se nemusí aktualizovat ihned. Možná budete muset klepnout na tlačítko Domů a poté se opětovným klepnutím na tlačítko LCT vrátit k postupu importu.

4. Potvrďte aktuální datum nebo vyberte jiné datum testu a klepněte na tlačítko Další>. Zobrazí se okno analýzy pro tuto relaci.



223


One Lambda, Inc.

Okno analýzy LCT

Každá relace LCT se skládá z tolika vzorků, kolik chcete analyzovat pomocí stejných katalogových informací.

Obrazovka souhrnu relace LCT Souhrnnou tabulku lze spustit klepnutím na relaci ve stromu navigace. Je v něm uveden každý vzorek v relaci. Tato možnost umožňuje rychle analyzovat relaci a uložit ji pro pozdější kontrolu a konečná přiřazení. Volič pole

Pole PRA dárce

Tabulka souhrnu relace LCT



Dvojím klepnutím na vzorek v souhrnné tabulce nebo datový bod přejdete přímo na obrazovku analýzy pro daný vzorek.



Procházením doleva nebo doprava zobrazíte všechna pole souhrnné tabulky.



Klepněte na tlačítko Volič polí v levé části řádku nadpisu sloupce. Zobrazí se okno Volič polí. V tomto okně můžete výběrem nebo vymazáním zaškrtávacích políček vedle nadpisu sloupce zahrnout nebo vyloučit tyto sloupce ze souhrnné tabulky. Výběrem nebo vymazáním zaškrtávacích políček v tomto okně se tabulka ihned aktualizuje.



224


One Lambda, Inc.

Poznámka:

Pokud nevidíte konkrétní pole dostupné prostřednictvím voliče polí a jste si jistí, že by tam mělo být, přejděte na C:\HLA Fusion\temp a smažte soubor s názvem X_X_X(antigen type)_Layout.xml.

Souhrn relace LCT Volič pole



Klepnutím na libovolné záhlaví sloupce v souhrnné tabulce proveďte seřazení tabulky podle daného sloupce. Šipka v záhlaví sloupce ukazuje pořadí řazení – nahoru pro vzestupné a dolů pro sestupné. Pořadí sloupců lze také změnit jejich přetažením a puštěním.



Sloupce a pořadí souhrnné tabulky relace lze upravit. Když zavřete Volič polí, zobrazí se místní zpráva umožňující vybrat, zda chcete či nechcete uložit provedené změny. Klepnete-li na tlačítko Ano, vaše změny se uloží pro všechny budoucí souhrny relace LCT na tomto počítači, dokud nebudou uloženy další úpravy.



Klepnutím na tlačítko Exportovat uložíte souhrnnou tabulku do svého počítače nebo sítě (výchozí umístění je C:\OLI FUSION\data\report). Soubor se uloží ve formátu Excel (*.XLS).



Klepnutím na možnost Tisk vytisknete zprávu souhrnné tabulky.



Klepnutím na možnost Náhled zobrazíte zprávu souhrnné tabulky. Souhrn relace LCT exportovaný jako tabulkový soubor

Náhled tisku souhrnu relace LCT



V okně náhledu tisku umožňuje posuvník náhledu stránku vybírat různé stránky zprávy.



225

One Lambda, Inc.




Sloupce a pořadí souhrnné tabulky lze upravit. Změny, které jste provedli v rozvržení, lze uložit klepnutím na tlačítko Uložit rozvržení . Vaše změny se uloží pro všechny budoucí tabulky souhrnu relace LCT na tomto počítači, dokud nebudou uloženy další změny.



Chcete-li vyloučit určitý vzorek z relace analýzy, zaškrtněte políčko Vyloučit vedle daného vzorku. Vzorek je stále zobrazený v seznamu vzorků v položce Zprávy, takže aby nedošlo k jeho zahrnutí do dat zprávy, neprovádějte při vytvoření zprávy výběr tohoto vzorku.

Poznámka:

Některé sloupce dat jsou považovány za klíčové a nelze je vyloučit na dobu delší než aktuální zobrazení souhrnné tabulky. Vyloučíte-li jedno z těchto polí, jeho sloupec se nezobrazí, dokud nepřejdete do jiné části aplikace. Pokud se do této souhrnné tabulky vrátíte z okna analýzy vzorku nebo navigátoru, tento sloupec se znovu zobrazí. Datové sloupce považované za klíčové jsou specifické pro daný produkt.



226


One Lambda, Inc.

Použití okna analýzy LCT U každého vzorku LCT v aktuální relaci můžete zobrazit data testu, upravit mezní hodnotu a přiřadit výsledky screeningu. Z okna analýzy LCT můžete provést několik úkolů: 

Kontrolovat data a přiřazovat specificity



Zakroužkovat antigeny v tabulce specificit



Zobrazit molekulární specificity



Zobrazit výsledky screeningu



Přidat poznámky a označit vzorek pro další testování



Zobrazit zprávu pro aktuální vzorek Nastavení základního prahu

Okno hledání antigenu

Klepnutím seřadit podle pozice jamky

Reakce Vstupní panel

Graf perliček

Specificity Nástroje analýzy

Panel CREG

Oblast konečného přiřazení

Statistická tabulka Oblast poznámek (rozbalíte dvojím klepnutím)

Klepnutím zobrazíte % PRA dárce

Okno analýzy LCT


Vyberte, pokud je požadováno Více testů

Klepnutím zobrazíte výsledky jako nezpracované údaje


Tlačítka Uložit a Potvrdit

227


One Lambda, Inc.

Vložení reakce a panel analýzy Panel v horní levé části okna zobrazuje jednotlivá seskupení perliček testu na samostatné záložce. Každá perlička je uvedena se specificitou a tlačítkem reakce. Chcete-li přepnout mezi panely, klepněte na kartu vybrané skupiny perliček. Po klepnutí přepíná reakce u vybrané perličky mezi těmito čísly a barvami: Vložení reakce a panel analýzy



1 (zelená)



8 (červená)



6 (oranžová)



4 (zlatá)



2 (světle modrá)



0 (šedá)



Pokud změníte tlačítko reakce, zaměření se přesune na další tlačítko. Místo klepání na tlačítka můžete také zadat reakce ručně.



Tento panel spustí analýzu aktuálního vzorku pomocí posledních změn v reakci.



Pokud vzorek ještě nebyl analyzován, je tlačítko označeno Analyzovat. Pokud již analýza pro daný vzorek existuje, je tlačítko označeno Znovu analyzovat. Toto tlačítko je aktivováno pouze v případě, že bylo zadáno ID vzorku. Pokud nebylo ID vzorku při klepnutí na toto tlačítko zadáno, podle ID vzorku se označí značkou ! a analýza nebude provedena.

Přidání informací o kartě Klepnutím na tlačítko +Info můžete přidat informace o aktuální kartě, například datum exspirace . Když klepnete na toto tlačítko, zobrazí se následující dialogové okno umožňující přidat informace o této kartě vzorků. Obrazovka Přidání informací o kartě



228

One Lambda, Inc.


Najít antigen Chcete-li zadat více antigenů, použijte k oddělení antigenů mezeru. Všechny zadané antigeny jsou v poli specificity zakroužkované. Klepnutím na štítky pro výsledky zbytkové analýzy, výsledky analýzy epitopu nebo konečné přiřazení dojde k zakroužkování specificit uvedených v oblasti výsledků. Klepnutím na štítek „Vyloučit antigen“ dojde k zakroužkování vyloučených antigenů. Poznámka:

Použijete-li funkci Najít antigen v okamžiku, kdy jsou v okně zobrazeny molekulární specificity, nemůžete vidět zakroužkované antigeny, dokud nezrušíte zaškrtnutí políčka DNA.

1. D okna analýzy zadejte antigeny nebo skupiny CREG (např. 1C nebo 2C) do pole vedle tlačítka Najít Ag (antigen). 2. Klepnutím na tlačítko Najít Ag

zakroužkujte zadané antigeny nebo skupiny CREG.

Opětovným klepnutím na tlačítko Najít Ag odeberte zakroužkování antigenů v poli specificity.

Tabulka CREG Skupiny CREG jsou zobrazeny v horní části tabulky a specificity dané skupiny jsou zobrazeny dole. Specificity jsou zvýrazněny jednou z těchto barev. Poznámka:

Chcete-li skrýt zobrazení panelu CREG, klepněte na název CREG v horní části okna. Objeví se dialogové okno s dotazem, zda chcete skrýt panel CREG. Skryjete ji klepnutím na tlačítko Ano. Chcete-li ji znovu zobrazit, klepněte znovu na název CREG a zobrazte ji klepnutím na tlačítko Ano.



Fialová = kladná přiřazení z okna výsledků analýzy epitopu












229


One Lambda, Inc. Klepnutím na libovolnou z těchto oblastí na panelu CREG zakroužkujte antigeny v poli specificity výše.

1. Klepnutím na skupinu CREG nebo antigeny zakroužkujte odpovídající specificity. 2. Klepnutím pravým tlačítkem přesuňte specificitu do okna Konečná přiřazení. Chcete-li použít jinou tabulku CREG, postupujte takto: na domovské stránce nebo vyberte možnost Obslužné 1. Klepněte na tlačítko LCT programy > Konfigurace produktů protilátek > Nastavení konfigurace analýzy. 2. Na domovské stránce klepnutím na odkaz Upravit zobrazíte dialogové okno Nastavení konfigurace analýzy. (Toto dialogové okno je již zobrazené, pokud k němu získáváte přístup prostřednictvím nabídky obslužných programů.) 3. V rozevíracím seznamu CREG vyberte tabulku. 4. Klepněte na tlačítko Uložit.

Seřadit podle pozice jamky Toto tlačítko se objeví, když je histogram aktuálně seřazený podle reakce. Když na něj klepnete, seřadí histogram v pořadí jamek a označení tlačítka se změní na Obnovit. 1. V okně analýzy klepněte na tlačítko Seřadit podle pozice jamky 2. Chcete-li se vrátit k řazení podle reakce, klepněte na tlačítko Obnovit

. .

Před výběrem funkce seřazení podle jamky – v pořadí podle reakce.

Po výběru funkce seřazení podle jamky – v pořadí podle jamky.



230


One Lambda, Inc.

Výběr minimálního pozitivního prahu Minimální pozitivní práh můžete změnit pomocí rozbalovací nabídky. 

V okně analýzy vyberte nový pozitivní práh z rozevíracího seznamu Práh vedle nástrojů analýzy poblíž horní části okna. Vzorek se znovu analyzuje podle nového prahu. Účinky změny prahu jsou vidět v polích výsledků. Nastavení minimálního pozitivního prahu

Vyloučení antigenu z analýzy Všechny zadané antigeny jsou vyloučeny z analýzy. Chcete-li zadat více antigenů, použijte k oddělení antigenů čárku. 1. V okně analýzy klepněte na tlačítko Vylouč. Ag. antigenu.

. Zobrazí se kontextové okno vyloučení

Nastavení vyloučení antigenu

Zadejte antigeny, které chcete vyloučit, a klepněte na tlačítko OK. Poznámka:

Chcete-li vyloučit také všechny zadané antigeny u souvisejícího pacienta, zaškrtněte políčko Vyloučit typizaci pacienta.

Vzorek je znovu analyzován a vyloučené antigeny jsou uvedeny v poli vyloučených antigenů v rámci okna statistiky analýzy. Chcete-li tyto antigeny znovu zahrnout, klepněte znovu na tlačítko Vylouč. Ag, klepnutím na tlačítko Vymazat odeberte antigeny z pole a poté klepnutím na tlačítko OK znovu proveďte analýzu, při které jsou již tyto antigeny zahrnuty.



231


One Lambda, Inc.

Zahrnutí/vyloučení Cw Můžete si zvolit, zda chcete zahrnout specificity antigenů Cw do analýzy nebo je z ní vyloučit. 1. Poblíž horní části okna analýzy zaškrtnutím políčka Cw specificit Cw.

2. Vymazáním zaškrtávacího políčka Cw

znovu proveďte analýzu pomocí

znovu proveďte analýzu bez specificit Cw.

Tabulka nezpracovaných dat Pozitivní perličky jsou zobrazeny červeně. Žlutě zvýrazněné řádky mají normalizované hodnoty nad minimální hodnotou zadanou v poli min. hodnoty. Změny provedené v normalizačním vzorci a minimální normalizované hodnotě se vztahují pouze na tabulku nezpracovaných údajů a nikoli na analýzu. 1. V okně analýzy klepnutím na tlačítko Nezpracovaná data v pravé dolní části okna analýzy zobrazíte tabulku nezpracovaných dat. 2. Klepnutím na záhlaví seřaďte tabulku podle dané kategorie. 3. Klepnutím na

v pravém horním rohu tabulky zavřete okno a vrátíte se k analýze. Tabulka nezpracovaných dat



232


One Lambda, Inc.

Zpráva o nezpracovaných datech Pro snazší navigaci, export a tisk můžete vytvořit zprávu obsahující informace o nezpracovaných údajích pro aktuální vzorek. 1. Po zobrazení tabulky nezpracovaných dat klepnutím na tlačítko Zpráva v pravé spodní části okna tabulky nezpracovaných dat zobrazíte zprávu o nezpracovaných datech. Zpráva o nezpracovaných datech LCT

PRA dárce Můžete zobrazit procento PRA od dostupných dárců v systému nebo od skupin vybraných dárců, kteří odpovídají počítačem přiřazeným protilátkám u aktuálního vzorku.

Poznámka:

Chcete-li vybrat skupinu(y) dárců, vyberte možnost Obslužné programy > Všeobecná nastavení. Chcete-li vytvořit skupinu dárců, vyberte možnost Informace o pacientovi > Správa pacienta, v poli Pacient/dárce vyberte možnost Dárce a vyplňte pole skupiny dárců.

1. U analýzy jednoduchého antigenu nebo PRA klepněte na tlačítko DPRA .

Místní zpráva DPRA

Místní okno zobrazí procento shodných dárců PRA a celkový počet dárců,kteří byly při výpočtu zohledněni. 2. Klepnutím na tlačítko OK zavřete okno. Procento a počet dárců zůstávají zobrazeny vedle tlačítka PRA dárce.



233

One Lambda, Inc.


Přidání poznámky ke vzorkům Ve všech analýzách, vyhledání dat a hlášení funkcí v systému HLA Fusion se zobrazují poznámky ke vzorku pro výsledky vzorku v relaci aktuálního vzorku. 1. V okně analýzy zadejte do pole Poznámka pod oblastí přiřazení poznámku o typu vzorku.

Pole standardní poznámky Okno poznámek se zobrazí, když klepnete dvakrát na pole standardních poznámek.

Poznámky se uloží pouze v případě, že klepnete na tlačítko Uložit.

Označení vzorku značkou pro další testování Označením vzorku pro další testování dojde k zobrazení zaškrtávacího políčka Další testy pro výsledky vzorku v aktuální relaci analýzy ve všech analýzách, vyhledání dat a hlášení funkcí v systému HLA Fusion.



V okně analýzy zaškrtněte políčko Další testy umístěné pod části výsledků přiřazení.


V okně analýzy klepnutím na tlačítko Tisk obrazovky aktuální analýzy.


na panelu nástrojů vytiskněte obrazovku


234

One Lambda, Inc.


Náhled zpráv a jejich tisk Náhled nebo tisk zpráv

Chcete-li zobrazit nebo vytisknout zprávu o smíšených datech screeningu protilátek pro aktuální vzorek, použijte tlačítko náhledu tisku na panelu nástrojů. 


Provedení konečných přiřazení Konečná přiřazení lze provést ze seznamu výsledků zbytkové analýzy nebo analýzy epitopu. Jakmile je specificita přesunuta do oblasti konečných přiřazení, nezobrazuje se již ve svém původním okně výsledků. Přidržením klávesy Ctrl a klepnutím na více specificit může vybrat v daném poli výsledků více než jednu specificitu. V okně analýzy proveďte přiřazení pomocí jednoho z těchto úkonů: 

Dvojím klepnutím na specificitu antigenu v okně výsledků Zbytková analýza nebo Analýza epitopu přiřadíte specifikovaný antigen k poli Konečné přiřazení.



Klepnutím zvýrazněte specificitu a klepnutím na tlačítko Přiřadit jednotlivě pole Konečné přiřazení.



Klepnutím na tlačítko Přiřadit vše vpravo od seznamu zbytkových analýz nebo analýz epitopů přesuňte všechny aktuální výsledky v daném seznamu do pole Konečná přiřazení.



Klepnutím pravým tlačítkem na specificitu nebo skupinu CREG v tabulce CREG ji přiřaďte k oblasti Konečná přiřazení.

ji přesuňte do

Ruční přiřazení Ruční přiřazení lze zadat v poli pod polem výsledků Konečná přiřazení. Při zadání několika ručních přiřazení ponechejte mezi jednotlivými specificitami mezeru. 1. V okně analýzy zadejte v poli pod oknem konečného přiřazení ruční přiřazení specificity antigenu.



235

One Lambda, Inc.


Klepnutím na tlačítko Přiřadit těsně nad polem přiřazení přidejte přiřazení do okna výsledků Konečné přiřazení.

Ruční Oblast ručního přiřazení


(nacházející se přímo nad polem ručního V okně analýzy klepnutím na tlačítko Přiřadit – přiřazení) přiřadíte všem vzorkům v okně výsledků konečného přiřazení zápornou hodnotu.

Odebrání přiřazení Specificity lze odebrat v poli výsledků Konečná přiřazení. Přidržením klávesy Ctrl na jednotlivé specificity, které chcete odebrat, můžete odebrat více specificit. 

a klepnutím

V okně analýzy klepněte na zvýrazněné specificity v seznamu konečných přiřazení (přidržením klávesy CTRL vyberete více specificit) a klepněte na tlačítko Odebrat umístěné pod polem výsledků konečných přiřazení.


umístěné v pravém dolním rohu okna analýzy V okně analýzy klepnutím na tlačítko Uložit uložte výsledky analýzy pro všechny specificity aktuálně uvedené v poli Konečná přiřazení. Aplikace Fusion se automaticky přesune k dalšímu vzorku.

Pro potvrzení musí mít vedoucí přístup ke vzorku, pro který jste uložili přiřazení. Budete-li potřebovat provést změny, můžete se ke vzorku kdykoli před potvrzením vrátit. Klepněte na tlačítko Znovu a poté znovu na tlačítko Uložit . analyzovat

Potvrzení přiřazení Výsledky analýzy mohou potvrdit pouze vedoucí laboratoře. Když tak učiní, jsou vzorky označeny jako Potvrzené. Když zobrazujete potvrzené vzorky, tlačítko Potvrdit je fialové. 

umístěné v pravém dolním rohu okna V okně analýzy klepnutím na tlačítko Potvrdit potvrďte všechny výsledky analýzy, které byly uloženy v okně výsledků konečných přiřazení. Automaticky se přesunete na další vzorek, kde můžete pokračovat s potvrzováním výsledků. Když se poprvé vrátíte k potvrzenému vzorku, uvidíte, že tlačítko Potvrdit je nyní zbarvené fialově , což znamená, že již byl potvrzen dříve.



236


One Lambda, Inc.

Možnosti nabídky klepnutí pravým tlačítkem na navigátor pro relace LCT Existují dostupné možnosti analýzy prostřednictvím navigátoru – podle toho, zda se nacházíte v pohledu souhrnu relace LCT, nebo na obrazovce analýzy pro daný vzorek. Klepnutím pravým tlačítkem buď na relaci, nebo na vzorek v okně navigátoru, když je zobrazen buď souhrn relace, nebo okno analýzy, získáte přístup k možnostem nabídky, které umožňují ovlivnit relace analýzy LCT před analýzou nebo v jejím průběhu. Možnosti klepnutí pravým tlačítkem (na úrovni vzorku)

Možnosti klepnutí pravým tlačítkem (na úrovni relace)

Opakovaná analýza s novým katalogem Umožňuje opakovanou analýzu relace pomocí nového nebo aktualizovaného katalogového souboru. 1. Přejmenujte relaci. 2. Klepněte na rozevírací šipku v poli ID nového katalogu a vyberte ze seznamu nový katalog. 3. Klepněte na tlačítko Analýza. Relace, na kterou jste klepli pravým tlačítkem, se znovu analyzuje pomocí katalogového souboru, který jste právě vybrali. Opakovaná analýza s novým katalogem

Přejmenování m nové relace zabráníte duplikování názvů relací.



237

One Lambda, Inc.


Možnosti na úrovni vzorku Možnosti nabídky Související záznamy a Srovnávací analýza jsou dostupné, pokud klepnete pravým tlačítkem na aktivní vzorek v navigátoru (nejprve klepnutím na levé tlačítko aktivujte vzorek):

Související záznamy Související záznam je záznam, který je spojen s aktuálním vzorkem prostřednictvím pacienta nebo ID vzorku. Poznámka:




Výběrem této možnosti nabídky načtěte všechny záznamy související s aktuálním vzorkem do rozevíracího seznamu vzorků. Pomocí navigační šipky vzorku zobrazte jednotlivě analýzu každého souvisejícího záznamu.



Pokud se chcete vrátit k zobrazení vzorků v aktuálních relacích, klepněte na odkaz <<Souhrn v horní části okna.

Srovnávací analýza Tuto možnost použijte k porovnání analýzy aktuálního vzorku s dříve provedenou analýzou. Poznámka:

Tato možnost je dostupná také pomocí tlačítka na panelu nástrojů Srovnávací analýza

.

Srovnávací analýza

Aktuální analýza


1. V navigátoru klepněte pravým tlačítkem na vzorek. Zobrazí se seznam dostupných vzorků. 2. Výběrem předchozí analýzy vzorku ze zobrazeného seznamu proveďte porovnání s aktuální analýzou. Okna těchto dvou analýz se pak zobrazí v okně porovnání. Velikost jednotlivých oken lze změnit nebo je lze posunout pomocí funkce táhnout a pustit. Klepnutím na tlačítko panelu nástrojů Srovnávací analýza zobrazení porovnání zrušíte.



238

One Lambda, Inc.


Zprávy Aplikace HLA Fusion™ nabízí různé formáty zprávy, ve kterých můžete vyhotovit data a výsledky analýzy. V nabídce zpráv můžete: 

Vytvořit, vytisknout a exportovat zprávy pro data analýzy u všech podporovaných produktů.



Vytvořit vlastní zprávy, pro které určíte typ obsahu.



Vytvořit zprávy pro elektronické odeslání, například zprávy NMDP HML.



Pro pohodlný přístup uložit až 18 zpráv do seznamu oblíbených.



Změnit vzhled libovolné zprávy, např. písma, formátování a barvy pozadí (pouze vedoucí).

Kromě toho můžete před vytvořením zpráv v aplikaci HLA Fusion zvážit tyto možnosti: 

Datum zprávy je zobrazeno písmem odlišným od ostatního obsahu zprávy. Cílem je umožnit, aby se datové pole zprávy Crystal Reports zobrazilo ve formátu PDF v různých jazycích a místních nastaveních.



Zprávy a data během procesu instalace a ověření ověřte.



Všechny soubory zpráv jsou vám dostupné tak, abyste mohli uspořádat pole a nastavit jejich velikost tak, aby odpovídaly vašim potřebám.

Poznámka:

Chcete-li zobrazovat zprávy, musí mít váš počítač nainstalovanou nějakou formu ovladače tiskárny. Nemáte-li nainstalovaný ovladač tiskárny, můžete si stáhnout zdarma kopii aplikace PDF Distiller ze stránek Adobe.com nebo aplikaci Microsoft Office Document Image Writer ze stránek Microsoft.com. Kromě toho můžete tyto zprávy vytisknout a exportovat z okna analýzy nebo souhrnu dávky. Ve zprávách, stejně jako v ostatních formulářích a seznamech aplikace HLA Fusion, jsou ID vzorku, ID pacienta, IS jamky, alely, sérologie atd. řazeny alfanumericky.



239


One Lambda, Inc.

Používání okna zpráv Následující části popisují, jak vytvořit, uložit a vytisknout zprávu obsahující vaše data analýzy. Toto jsou kroky, které musíte provést k vytvoření zprávy z tohoto okna: 1. 2. 3. 4.

Vyberte typ zprávy. Dle potřeby vyberte kritéria, abyste upřesnili vstup pro zprávu, například rozsah dat. Vyberte relace nebo vzorky, které chcete zahrnout do zprávy. Vyberte možnost Zobrazit zprávu nebo tlačítko Exportovat zprávu

Přístup k oknu zpráv Přístup k oknu zpráv můžete získat dvěma způsoby:  

Na domovské stránce klepněte na tlačítko Zprávy Fusion. Nebo klepněte na panel nabídek aplikace

v aplikaci Fusion Explorer.

Zobrazí se okno Zprávy se seznamem všech relací, které spadají do datového rozsahu (na základě datového rozsahu relace stanoveného v dialogovém okně Najít ). Nezobrazí-li se žádná relace, zkuste upravit datový rozsah. Nastavení pořadí a seřazení kritérií pro sloupce zprávy. Typy zprávy

Klávesové zkratky k ostatním možnostem nabídky Fusion.

Vytvoření samostat né Zavření zprávy okna pro každý zpráv vzorek

Uložení a přístup až k 18 různým zprávám

Formátování zpráv a vytvoření šablon exportu dat

Datový rozsah Pro zobrazené relace Klepnutím filtrujte relace podle vybraných kritérií Můžete spárovat ID katalogu a alely (které odpovídají alelám v alelovém páru nebo přiřazeném poli alel.)

Zobrazení, přizpůsobení, export zprávy nebo její odeslání e-mailem. Název zprávy

Seznam relací Filtrováno podle typu zprávy a vstupních kritérií.

Kritéria pro upřesnění dat zprávy (filtruje zobrazené relace)

Výběrem karty zobrazte buď relaci, nebo vzorek.



240


One Lambda, Inc.

Vyberte typ zprávy 

Vyberte zprávu z možností nabídky typu zprávy zobrazených v horní části okna Zprávy. Seznam relací v pravém panelu okna zpráv je filtrován tak, aby zobrazoval pouze relace související s vybraným typem zprávy. Typy zprávy

Upřesnění vstupu zprávy V případě potřeby pomocí levého panelu okna Zprávy proveďte další filtrování relací, které chcete zahrnout do své zprávy. Existuje řada kritérií, která můžete nastavit:

1. Zadejte ID pacienta, pole ID relace nebo vzorku nebo vyhledejte informace procházením pomocí tlačítka Procházet

.

Klepnutím provedete filtrování relací podle vybraných kritérií.

2. Nastavte datový rozsah. Pomocí rozevíracích kalendářů v poli Datum relace vyberte odlišné datum začátku a konce. 3. Zadejte nebo procházením vyhledejte specifické charakteristiky nebo stav vzorku (viz níže).

Vzorek, stav relace nebo jiné charakteristiky jako kritéria vyhledávání

4. Když nastavíte kritéria a klepnete na tlačítko Najít v levém panelu okna Zprávy, proběhne odpovídající filtrace seznamu relací v pravém panelu okna.



241


One Lambda, Inc.

Výběr relace/vzorku 

V seznamu vzorků/relací klepnutím na znaménko + vedle libovolné relace rozbalíte zobrazení jejích vzorků. Zobrazení podle relací nebo podle vzorků

Relace s některými, avšak nikoli všemi vybranými vzorky

Relace

Relace se všemi vybranými vzorky

Vzorky

1. Zaškrtněte políčka vedle každého vzorku, který chcete zahrnout do zprávy. Výběrem zaškrtávacího políčka vedle ID relace zahrnete všechny její vzorky. (Zrušte zaškrtnutí všech vzorků nebo relací, které nechcete do zprávy zahrnout.) 2. Pokud byl pro relaci vybrán alespoň jeden vzorek, buňka Zahrnout pro danou relaci se zvýrazní šedě. Jsou-li vybrány všechny vzorky pro relaci, v buňce zahrnutí se objeví zaškrtávací políčko. 3. (Volitelné) Chcete-li zobrazit všechny dostupné vzorky nebo zobrazit pouze vzorky, které jste doposud vybrali, klepněte na kartu Vzorky a zaškrtněte nebo zrušte zaškrtnutí plíčka pro Ukázat vybrané vzorky. 4. Alternativně můžete klepnout pravým tlačítkem na relaci nebo vzorek a použít jednu z následujících možností:



242


One Lambda, Inc.

Poznámka:



Vybrat vše: vybere všechny relace a vzorky pro zahrnutí do zprávy.



Zrušit výběr všech: zruší výběr všech relací a vzorků pro zahrnutí do zprávy.



Výběr analýzy: specifikuje typ zprávy produktu analýzy (LABType, Micro SSP, LABScreen atd.)



Výběr kategorie: vyberte kategorii zprávy – molekulární nebo metodologická.

Chcete-li vytvořit zprávu pro každý vybraný vzorek, zaškrtněte políčko vedle možnosti 1 vzorek na zprávu.

Zobrazení, tisk nebo export zpráv 

Po výběru typu zprávy a všech vzorků klepněte na položku Zobrazit zprávu. Zpráva se zobrazí v samostatném okně Prohlížeč zpráv. Příklad zprávy zobrazené v prohlížeči zpráv



243


One Lambda, Inc.

Prohlížeč zpráv obsahuje řadu různých tlačítek panelu nástrojů, které umožňují provést export, tisk a navigaci vaší zprávou. Funkčnost těchto tlačítek je popsána v následující tabulce: Panel nástrojů prohlížeče zpráv

Tlačítko panelu nástrojů

Funkce Export zprávy: Vyexportuje zprávy v jednom z několika dostupných formátů včetně Crystal Reports, PDF a Microsoft Word. Tisk zprávy: Odešle aktuální zprávu přímo do tiskárny. Přepnutí stromu skupin: Otevře panel stromu v levé části okna prohlížeče zpráv, kde se zobrazí seznam všech vzorků obsažených v aktuální zprávě. Navigátor stránek zprávy: Má-li zpráva více stránek, umožňují tato tlačítka přesun na první stránku, další stránku, předchozí stránku nebo poslední stránku. Najít text: Klepnutím na toto tlačítko se otevře textové pole, které umožňuje vyhledávat a nacházet text ve zprávě. Zvětšení: Klepnutím na šipku dolů na tomto tlačítku si zvolíte nastavení zvětšení, zobrazení celé stránky zprávy nebo zobrazení podle šířky stránky zprávy.

Chcete-li zavřít okno Prohlížeč zpráv, klepněte na tlačítko Zavřít prohlížeče.


v pravém horním rohu


244


One Lambda, Inc.

Export zprávy 1. Chcete-li exportovat zprávu v jednom z několika standardních formátů, klepněte na tlačítko . Zobrazí se dialogové okno Vybrat výstupní adresář a uložit typ. Exportovat zprávu Cíl exportované zprávy/uložení souboru jako typové obrazovky

1. Zadejte název aktuální exportované zprávy nebo procházením vyhledejte soubor zprávy, kterou chcete exportovat. 2. V rozbalovacím seznamu v Uložit jako typ vyberte formát (Excel, Acrobat, Word nebo Rich Text). 3. Klepněte na tlačítko OK. Soubor je implicitně uložen na C:\OLI Fusion\data\report).

Přístup ke zprávám z nabídky oblíbených položek Nabídka Oblíbené položky je pohodlným způsobem, jak generovat a získat přístup ke zprávám, které používáte nejčastěji. V rozevíracím seznamu Oblíbené položky můžete mít k dispozici až 18 typů zpráv včetně vlastních. Přidání na seznam nebo odstranění z něj je snadné.

Přidání zpráv od oblíbených položek 1. Ujistěte se, že jste vybrali zprávu, kterou chcete přidat do nabídky Oblíbené položky (zkontrolujte, zda je její název zobrazen v části Možnosti zprávy okna Zprávy). Přidání nové zprávy do nabídky Oblíbené



245

One Lambda, Inc.


2. Vyberte položku Oblíbené položky > Přidat k oblíbeným položkám. Název aktuální zprávy je přidán do nabídky Moje oblíbené menu. Chcete-li generovat tuto zprávu, stačí klepnout na její název ve spodní části nabídky Oblíbené položky.

Uložené zprávy jsou uvedeny pod touto čárou a lze k nim kdykoli získat přístup.

Odebrání zpráv z oblíbených položek 1. Vyberte položku Oblíbené položky a vyberte zprávu, kterou chcete odebrat ze seznamu všech zpráv ve spodní části nabídky. Nabídka Oblíbené položky se zavře. 2. Vyberte možnost Oblíbené položky > Odebrat z oblíbených položek.

Zpráva, kterou jste vybrali v kroku 1, již není zobrazena ve spodní části nabídky Oblíbené položky.



246


One Lambda, Inc.

Nástroje zpráv Přizpůsobení vzhledu zprávy Poznámka:

Abyste tuto funkci mohli používat, musíte být uživatelem aplikace HLA Fusion na úrovni vedoucího a mít na svém počítači nainstalovaný software Crystal Report Designer.

Tato funkce umožňuje formátovat vzhled zpráv aplikace HLA Fusion tak, aby splňovaly specifické potřeby. Můžete například změnit styl písma, jeho velikost a barvu a také umístění textových a datových polí ve zprávě. 

Aplikace HLA Fusion automaticky spustí návrháře zpráv, pokud byl nainstalován ve výchozím adresáři (C:\Program Files\Business Objects\Business Objects Enterprise 12.0\win32_x86\crw32.exe).



K otevření souboru OneLambda.Fusion.Interface.exe umístěného na C:\Program Files\One Lambda\HLAFusion\IVD použijte aplikaci Poznámkový blok. Ujistěte se, zda je na následujícím řádku tohoto soubor (viz obrázek níže) zadán název cesty aplikace Crystal Report Designer: Úpravy OneLambda.Fusion.Interface.exe

 Upozorňujeme, že všechny soubory zprávy použité v aplikaci HLA Fusion jsou nainstalovány v adresáři C:\OLI Fusion\rpt a všechny mají příponu .rpt. Tyto soubory mohou být pro účely centrálního přístupu



247


One Lambda, Inc.

přesunuty kamkoli, ale aby bylo nové místo reflektováno, musíte aktualizovat soubor OneLambda.Fusion.Interface.exe (viz obrázek nahoře).

 Když otevřete zprávu za účelem jejího přizpůsobení, vytvoří se automaticky záložní kopie s časovou známkou jako příponou názvu zprávy. To vám umožní v případě potřeby vyhledat původní formát zprávy. 1. Vyberte možnost Zprávy > Nástroje > Přizpůsobení zprávy. Ke změně vzhledu zprávy použijte nástroje aplikace Crystal Report Designer. Po provedení změn ve formátu zprávy zprávu uložte. Zkontrolujte, zda jste nezměnili název souboru zprávy. Při příštím spuštění této zprávy v systému HLA Fusion bude mít zpráva vzhled, který jste naposledy uložili v aplikaci Crystal Report Designer.

Vytvoření vlastních šablon exportu dat 1. Výběrem možnosti Nástroje > Nastavení exportu přizpůsobte export dat zprávy tím, že nastavíte šablony, které určují, jaký typ dat zprávy (relace, vzorek, pacient, výsledky atd.) bude exportován, když danou šablonu vyberete.

Zobrazí se dialogové okno Nastavení exportu dat, které umožňuje vybrat název šablony exportu, pole, která mají být zahrnuta, a pořadí polí požadované pro danou šablonu. Zaškrtnutím políček vlevo vyberte kategorii a pole. V pravé části dialogového okna přemístěte pole pomocí funkce táhni a pusť nebo změňte jejich pořadí přidržením klávesy CTRL a stisknutím kláves se šipkou nahoru/dolů.

Obrazovka nastavení exportu dat



248


One Lambda, Inc.

2. Po dokončení klepněte na tlačítko Uložit. Z nabídky Nástroje > Exportovat data je k dostupným šablonám exportu přidána nová šablona. Šablona exportu dat – výběr

3. Když jste připraveni exportovat data, nejprve vyberte všechny relace z dostupného seznamu, které chcete zahrnout. Poté vyberte možnost Nástroje > Exportovat data a vyberte jednu ze šablon. Zobrazí se dialogové okno Exportovat data. Export dat – umístění uložení souboru

4. Vyberte formát pro exportovaná data – XML, CSV nebo Text. Soubor vyexportovaných dat je implicitně uložen v C:\OLI Fusion\data\export.

Vytvoření vlastních zpráv Určité typy zprávy umožňují přizpůsobit typy polí, které chcete zahrnout. Poznámka:

U vlastních molekulárních zpráv nebo vlastních zpráv o protilátkách se musíte ujistit, zda je ve vašem počítači instalováno písmo Free 3 of 9 Extended —jinak nebude čárový kód rozpoznán. V případě potřeby můžete tento font zdarma stáhnout na adrese http://www.free-barcode-font.com/.

1. Chcete-li vytvořit vlastní zprávu, vyberte typ zprávy obsahující v názvu slovo „Custom“ (např. Molecular Custom v nabídce typu zprávy Obecná typizace). 2. Klepněte na tlačítko Nastavení v části okna Možnosti zprávy.



249

One Lambda, Inc.


Obrazovka nastavení zprávy Protilátka vlastní

Obrazovka nastavení zprávy Molekulární vlastní

Zobrazí se okno Vlastní nastavení zprávy umožňující přizpůsobit obsah zprávy výběrem z různých kategorií a polí.

Nastavení zprávy Molekulární vlastní a Protilátka vlastní 1. Zadejte název nebo jej vyberte z rozevíracího seznamu. 2. Zaškrtněte políčko vedle každého pole, které chcete zahrnout do této zprávy. Poznámka:

Chcete-li zahrnout všechny související pole, klepnutím na tlačítko Zaškrtnout vše vyberte všechna pole v dané kategorii.

3. Klepnutím na tlačítko Uložit


uložíte nastavení vlastní zprávy, které jste právě vybrali.


250


One Lambda, Inc.

Souhrn vzorku Funkce přehledu vzorku obsahuje seznam více vzorků a výsledky jejich typizace. 

Vyberte vzorky pomocí okna Zprávy.



Klepněte na tlačítko Souhrn vzorku. Zobrazí se okno Souhrn vzorku; obsahuje dvě karty – Molekulární a Protilátka. Okno souhrnu vzorku

Souhrn vzorku molekulární typizace Vybrané záznamy typizace antigenů jsou zobrazeny na záložce Molekulární obrazovky souhrnu vzorku. Informace o typizaci můžete zobrazit ve zhuštěném formátu a také můžete zobrazit více podrobností o libovolném vzorku. 1. Vyberte vzorky pomocí okna Zprávy. 2. Klepněte na tlačítko Souhrn vzorku. Implicitní kartou je Molekulární. 3. V rozevíracím seznamu Vybrat typ dat k zobrazení vyberte jednu možnost. Obrazovka Zprávy – souhrn vzorku



251


One Lambda, Inc.

Zobrazené okno závisí na vybrané možnosti. 

Klepnutím na tlačítko Exportovat



Klepnutím na tlačítko DNA

4. Klepnutím na tlačítko Zavřít Zprávy.

exportujte zobrazená data jako soubor Excel. exportujte molekulární specificity jako soubor Excel.

v pravém horním rohu okno zavřete a vrátíte se k oknu

Souhrn vzorku screeningu protilátek Vybrané záznamy screeningu protilátek jsou zobrazeny na záložce Protilátka obrazovky souhrnu vzorku. Informace o screeningu můžete zobrazit ve zhuštěném formátu a také můžete zobrazit více podrobností o libovolném vzorku. 1. Vyberte vzorky pomocí okna Zprávy. 2. Klepněte na tlačítko Souhrn vzorku

.

3. Klepněte na kartu Protilátka.

Obrazovka Zprávy – souhrn vzorku



Klepnutím na tlačítko Exportovat



Klepnutím na tlačítko DNA exportujte molekulární specificity jako soubor Excel.

4. Klepnutím na tlačítko Zavřít Zprávy.

exportujte zobrazená data jako soubor Excel.




252


One Lambda, Inc.

Zobrazení záznamů Funkce zobrazení záznamů představuje výsledky typizace a podrobnosti o analýze u jednotlivých vybraných vzorků. Informace o vzorku se zobrazují vždy u jednoho vzorku současně. Z nabídky zobrazení záznamů můžete zobrazit samostatně záznamy o screeningu a typizaci. 1. Záznamy dat vyberte pomocí okna Zprávy.

Obrazovka Zprávy – zobrazení záznamů

2. Klepněte na tlačítko Zobrazit záznamy 3. Navigujte vzorky pomocí tlačítek se šipkami 4. Klepnutím na tlačítko Zobrazit analýzu

. . otevřete okno analýzy pro aktuální vzorek.

Velikost okna analýzy lze změnit.



253


One Lambda, Inc.

Obrazovka Zprávy – zobrazení záznamů

5. Klepnutím na tlačítko Zavřít

zavřete okno a vrátíte se k oknu Zprávy.

Informace o pacientovi Záznamy pacienta související s vybranými vzorky můžete zobrazit klepnutím na kartu informací o pacientovi. Informace o pacientovi lze zobrazit také podle ID pacienta pomocí funkce vyhledání pacienta v nabídce správy pacienta. V nabídce Informace o pacientovi můžete zobrazit záznamy pacienta/dárce. Chcete-li zobrazit informace o pacientovi, musí vybrat vzorek (vzorky). Zobrazené informace si můžete prohlížet, avšak nemůžete je upravovat. 1. V okně Zprávy vyberte relace nebo vzorky, které mají související ID pacienta/dárce. 2. Klepněte na tlačítko Informace o pacientovi

.

Zobrazí se obrazovka informací o pacientovi/dárci.



254


One Lambda, Inc.

Obrazovka informací o pacientovi

3. Klepnutím na tlačítko Test Info zobrazíte dané informace pro aktuálního pacienta/dárce. Pokud se zobrazí více než jedna karta informací, použijte k navigaci v záznamech pacientů tlačítka se šipkami. 4. Klepnutím na tlačítko Zavřít Zprávy.


Zpráva o sledování auditu Můžete zobrazit a vytisknout zprávu o aktivitě uživatele u aktuální databáze. Tato data jsou dostupná pouze v případě, že jste: 

Nastavili a připojili se k databázi sledování auditu (viz Uživatelská příručka HLA Fusion Database Utility).



Povolili protokolování auditu z výchozí domovské stránky aplikace HLA Fusion.



255


One Lambda, Inc.

Pokud jste provedli výše uvedené a chcete zobrazit data protokolu auditu, postupujte takto: Přístup k oknu zpráv můžete získat dvěma způsoby: 

Na domovské stránce klepněte na tlačítko Vytvořit zprávy.



V možnostech hlavní nabídky aplikace Fusion vyberte položku Zprávy.

Vyberte možnost Různé > Protokol sledování auditu. Zobrazí se dialogové okno protokolu sledování auditu. Obrazovka protokolu sledování auditu



Pomocí rozevírací šipky vyberte uživatele, u něhož chcete zobrazit akce databáze.



Vyberte datový rozsah a možnosti, které má zpráva zahrnovat.

Klepnutím na položku Seznam zobrazíte zprávu. Chcete-li exportovat zprávu sledování auditu do . Excelu, klepněte na položku Exportovat



256

One Lambda, Inc.


Typy zprávy K dispozici je několik typů zprávy. I když je v této části uvedena většina typů zpráv, upozorňujeme, že jelikož mezi aktualizacemi jsou někdy do této uživatelské příručky přidávány nové zprávy, můžete v softwaru vidět více zpráv. Pacient – (všichni pacienti v databázi aplikace Fusion) 

Souhrn pacienta – (souhrn výsledků testování typizace i protilátek souvisejících s ID pacienta)



Typizace pacienta pro dávku – (souhrnná zpráva o typizaci z různých míst pro sadu vzorků na základě vybrané relace)



Pacient vlastní – (vyberete typ dat pacienta, která chcete zahrnout u vybraných vzorků)

Obecná typizace – (data typizace z analyzovaného vzorku LABType a MicroSSP) 

Molekulární vlastní – (vyberete typ molekulárních dat, která chcete zahrnout u sady vzorků)



Vlastní výsledky typizace podle vzorku – (vyberete typ molekulárních dat, která chcete zahrnout u vybraných vzorků)



Souhrn alel – (zpráva o typizaci možných párů alel a výsledků přiřazených kódů alel u sady vzorků)



Alelový kód – (zpráva o typizaci možných kódů alel a výsledků přiřazených kódů alel u sady vzorků)



Souhrn molekulární typizace – (zpráva o typizaci možného kódu alel, přiřazeného kódu alel, přiřazených párů alel, přiřazené sérologie a dalších přiřazení u sady vzorků)

LABType – (data z analyzovaných vzorků LABType) 

Souhrn panelu – (zpráva o kódovaném přiřazení NMDP a pozitivních sondách u sady vzorku v relaci)



Přehled kontroly kvality – (souhrn vzorků s nízkým počtem perliček, nízkým počtem pozitivních kontrol, globálními změnami mezní hodnoty před analýzou a také specifickými změnami vzorků u relace vzorků)



Kombinovaný souhrn panelu (NMDP) – (tabulka konečných přiřazení kódu NMDP u jedné nebo více relací)



257

One Lambda, Inc.


MicroSSP – (data z analyzovaných vzorků MicroSSP) 

Zpráva SSP – (podrobná zpráva o typizaci pro testy Micro SSP™, kterou lze přizpůsobit)

Obecná protilátka – (data protilátek z analyzovaných vzorků LABScreen, FlowPRA, LAT nebo LCT) 

Protilátka vlastní – (Uživatel může přizpůsobit zprávu o datech protilátek u sady vzorků)



Screening/ID protilátky – (zpráva o datech protilátek, která má pevný formát)



Výsledky screeningu protilátek – (souhrnná tabulka pro vybranou sadu vzorků, která obsahuje celkové dosažené konečné výsledky, %PRA, ostatní přiřazení a poznámky)

LABscreen – (data z analyzovaných vzorků LABscreen) 

LSM Detail (podrobné informace o testu u záznamů smíšené analýzy)



LSM Summary (celkové výsledky testu u záznamů smíšené analýzy protilátek)



Přehled LSM (celkové výsledky testů u záznamů smíšené analýzy protilátek zahrnující celkový počet kladných, záporných a neurčených výsledků. Uživatel může vybrat nejvyšší nebo nejnižší poměr perliček nalezený pro jednotlivé vzorky)

LAT – (data z analyzovaných vzorků LAT) 

Nezpracovaná data smíšené analýzy LAT (výsledky více vzorků u karty smíšené analýzy LAT včetně rozvržení karty vzhledem k vložení původních nezpracovaných dat a výsledků testů)



Smíšená analýza LAT (výsledky jednoho vzorku u karty smíšené analýzy LAT včetně rozvržení karty vzhledem k vložení původních nezpracovaných dat a výsledků testů)



Nezpracovaná data specificit analýzy LAT (Nezpracované výsledky pro specificitu LAT nebo karty HD včetně rozvržení karet vzhledem k vložení původních nezpracovaných dat a výsledků testů)



Specificita LAT (úplná zpráva o specificitě pro specificitu analýzy LAT a karty HD včetně celkových přiřazení, přiřazení zbytkové analýzy, přiřazení epitopů, ručního přiřazení zbytkové analýzy a podrobností o testu)

LCT – (data z analyzovaných vzorků LCT) 

LCT Specificity (podrobnosti testu u jednoho vzorku na kartě analýzy LCT)

FlowPRA – (data z analyzovaných vzorků FlowPRA) 

Flow PRA Specificity (podrobnosti testu u jednoho vzorku na kartě analýzy FlowPRA®)



258

One Lambda, Inc.


Specialita – (zprávy vytvořené pro zvláštní účel) 

Reakce protilátky – (souhrnná tabulka počítačových přiřazení specificit na základě hodnocení reakce)



SCORE – (zpráva o exportu používaná softwarem SCORE)



LABType – (zpráva o exportu obsahující výsledky LABType)



LABScreen – (zpráva o exportu obsahující výsledky LABScreen) 

Zpráva o přiřazení reakce – (zpráva o exportu obsahující ID vzorků a reakční řetězec)



Zpráva o kódu NMDP

Následující zvláštní zprávy jsou přizpůsobeny pro specifické uživatele: 

LBSW



HML V0.2



HML V0.3



LC



NBS



Thai Export



UMC-Utrecht Report



BML



ABMDR



CMDP

Statistická – (statistická nebo souhrnná data pro sledování trendů, měření, monitorování atd.) 

Frekvence alelových skupin (zobrazuje frekvenci alelových skupin na základě prvních dvou číslic přiřazení alely u vybraných relací nebo databáze)



Rozšířená frekvence alelových skupin – (zobrazuje frekvenci alelových skupin na základě výsledků kódu NMDP nebo přiřazení alelové úrovně u vybraných relací nebo databáze)



Souhrn úpravy mezních hodnot (souhrn všech změn mezních hodnot provedených u vybraných relací nebo na základě specifického katalogového souboru)



259

One Lambda, Inc.


Různé – (zprávy, které nespadají do jedné z výše uvedených kategorií) 

Informace o databázi (popisuje použití aktuální databáze)



Souhrn souboru dávkových dat (protokol stavu všech relací spuštěných v systému)



Ekvivalent pro sérologii (seznam alel a definic jejich ekvivalentů pro sérologii)



Kód NMDP (seznam kódů NMDP a definic jejich alel)



Dotazy typizace (zpráva o prohledávání databáze s uvedením seznamu vzorků nalezených u vybrané alely)



Protokol sledování auditu (protokol se všemi zadanými aktivitami u vybraných uživatelů v aktuální databázi aplikace Fusion)

Oblíbená položka – (libovolná z výše uvedených zpráv uložená v seznamu oblíbených) 

Uvedené zprávy závisí na tom, co jste v této nabídce uložili.



260

One Lambda, Inc.


Správa dat Když vyberete položku nabídky Data, zobrazí se okno umožňující spravovat soubory relace a také vytvářet protokolové soubory dat relací. V této nabídce můžete odstraňovat, archivovat, aktivovat a přesunovat relace do jiné databáze. Můžete také mapovat alely v relaci do nového nomenklaturního formátu.



261


One Lambda, Inc.

Správa relace Chcete-li spravovat data na úrovni relace, použijte možnost Data v hlavní nabídce aplikace HLA Fusion. Když vyberete hlavní nabídku Data, zobrazí se okno správy dat. Vyberte záznamy pacienta, které chcete archivovat nebo odstranit.

Seřazení/výběr možností zobrazení

Zobrazte data relace a přidejte poznámky.

Nastavte kritéria hledání

Ukončete okno správy dat. Kopírování dat pacienta do jiné databáze

Přesunutí relací do jiné databáze.

Převod alel relace do nového formátu

Odstranění Vytiskne Archivace Obnovte podrobnosti vybrané archivovanou vybraných relaci záznamů o tom, které relace. a zpřístupněte testy byly ji k použití. provedeny, kým atd.

Okno správy dat relace 

Když klepnete na položku Převést alely , všechny konečné páry a kódy alel pro vybrané relace budou převedeny na nový nomenklaturní formát a uloženy v databázi.



Když klepnete na položku Přesunout relace Fusion, do které budou přesunuty vybrané relace.

, můžete vybrat jinou databázi aplikace

Aplikace HLA Fusion vám poskytuje možnost vytvářet protokolové soubory vybraných relací analýzy, které pak můžete vytisknout nebo archivovat. 1. Pomocí rozevíracích nabídek a tlačítek vyhledávání v levé části okna Data zadejte všechny potřebné vstupní informace o relaci. Po provedení výběru relace se informace o ní zobrazí v pravé části okna v panelu Informace o relaci, kde můžete přidávat informace.



262

One Lambda, Inc.


2. Jakmile máte všechny informace, které chcete zahrnout do protokolu, klepněte na položku Uložit. Po zobrazení požadovaného protokolu relace pomocí tlačítka Tisk protokolu relace, archiv, Aktivní a Odstranit v dolní části okna proveďte správu protokolu.

Poznámka:

Vzorky lze odstranit také jednotlivě, aniž by bylo nutno odstranit celou relaci. Jedinou výjimkou jsou vzorky LABType nebo Micro SSP, které byly sloučeny.

Aplikace HLA Fusion umožňuje přesunovat záznamy pacientů. 1. Vyberte položku ID pacienta jako Úroveň seřazeného výběru. Zobrazí se okno Výběr pacienta. 2. Vyberte jednoho nebo více pacientů. Zobrazí se toto okno:

3. Výběrem procházení (...) v poli Cílová databáze vyberte databázi, do které chcete přesunout vybrané záznamy pacienta. 4. Po výběru cílové databáze klepněte na položku Odeslat do cílové databáze.



263

One Lambda, Inc.


Správa vzorku Seznamy vzorků v aplikaci HLA Fusion představují snadný způsob, jak vložit velký seznam ID vzorků a dalších informací o vzorku do databáze pro účely použití v relacích analýzy. Seznamy vzorků mohou být ve formátu souboru .xls, CSV nebo .txt. V nabídce importu seznamu vzorků můžete importovat seznamy vzorků nebo upravovat seznamy vzorků před provedením importu. Poznámka:

Ověřte, zda u všech dat, která importujete do aplikace HLA Fusion, proběhne minimální ověření dat při importu.



264


One Lambda, Inc.

Import seznamů vzorků Seznamy vzorků představují snadný způsob, jak vložit rozsáhlý seznam ID vzorků a dalších informací o vzorku do databáze pro účely použití v relacích analýzy. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Vzorek > Import seznamu vzorků. Obrazovka importu seznamu vzorků

Zobrazí se okno importu seznamu vzorků. 2. Klepněte na tlačítko Vyhledat seznam vzorků; procházením najděte seznam vzorků, který chcete importovat, a klepněte na položku Otevřít. 3. Do pole Uvést ID zadejte název a v případě potřeby vyberte kód laboratoře nebo možnost ID kontaktu v rozevíracím seznamu. 4. Potvrďte informace o vzorku a v případě potřeby je upravte. 5. Klepnutím zrušte zaškrtnutí políček u vzorků, které nechcete importovat. 6. Klepnutím na položku Importovat seznam importujte vybrané seznamy vzorků. 7. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do Hlavní nabídky.



265

One Lambda, Inc.


Formáty informací pro seznamy vzorků Informace v seznamu vzorků importovaném do aplikace HLA Fusion musí být v jednom z následujících formátů.

Nový formát balení seznamů Tento soubor poskytuje následující pole (v tomto pořadí): ShipmentLoc(1 – 13),SampleIDName(0198-0398-0),SampleType(AB, DR nebo AB/DR), TurnaroundTime(14, 21 nebo 14AB/21DR),DCN (3 číslice). Vzorový řádek: 1 – 13,0198-0398-0,AB/DR,14AB/21DR,074

Sbalení seznamu: Vzorky „X“ podle starého standardu Tento soubor poskytuje následující pole (v tomto pořadí): ShipmentLoc,SampleIDName,SampleType (1, 2, 3... a „X“ pro vzorky AB/DR),DCN

Vzorový řádek: 1 – 12,0287-7867-8,X,074

Starý formát balení seznamů, „11“ pro vzorky AB/DR Tento soubor obsahuje (v tomto pořadí): ShipmentLoc, SampleIDName, SampleType (1, 2, 3... a „11“ pro vzorky AB/DR), DCN

Vzorový řádek: 1 – 15,0287-0779-2,11,074

Formát oddělený čárkou Každé pole je odděleno čárkami. Použití uvozovek kolem pole je volitelné a je vyžadováno pouze v případě, že je v obsahu pole použita čárka, která by mohla při oddělování polí mást. Tento soubor obsahuje (v tomto pořadí): ShipmentLoc, SampleIDName, SampleType (AB, DR nebo AB/DR), TurnaroundTime (14, 21 nebo 14AB/21DR), DCN

Vzorový řádek: "1","12","0287-7867-8","AB/DR","14AB/21DR","074"



266


One Lambda, Inc.

Formát oddělený tabulátorem Každé pole je odděleno tabulátorem. Tento soubor obsahuje (v tomto pořadí): ShipmentLoc, SampleIDName, SampleType (AB, DR nebo AB/DR), TurnaroundTime (14, 21 nebo 14AB/21DR), DCN

Vzorový řádek: 1

12

0287-7867-8

AB/DR

14AB/21DR

074

Formát SDF Každé pole je odděleno čárkami. Tento soubor obsahuje (v tomto pořadí): BoxSlot, DonarID, SampleType (AB, DR nebo AB/DR), TurnaroundTime (14, 21 nebo 14AB/21DR), DonarCenter Vzorový řádek: 1120287-7867-8AB,DR14,21074

Pouze místní ID/ID vzorku/ID pacienta Tento soubor je ve formátu Microsoft Excel. Tento soubor obsahuje (v tomto pořadí): Řádek 1: Nadpis sloupce „Místní“ a „Vzorek“ a „Pacient“ Sloupec A: LocalID Sloupec B: SampleIDName (povinné) Sloupec C: PatientIDName Sloupec D: Date

Příklad:



267


One Lambda, Inc.

Zobrazení a úpravy informací o vzorku Informace o vzorku lze upravovat, avšak související ID pacienta nikoli – lze přidávat pouze ID nových pacientů. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Vzorek > Správa informací o vzorku.

Obrazovka správy vzorků

2. Pomocí filtrů vyhledejte vzorky a klepněte na položku Zobrazit vzorek. Poznámka:

V poli ID vzorku lze k rozšíření výsledků použít zástupné znaky.

3. Upravte informace o vzorku. Poznámka:

Vzorek můžete přejmenovat změnou názvu v poli ID vzorku. ID vzorků jsou řazena alfanumericky, přičemž jako první jsou uvedena všechna ID začínající číslem.

4. Uložte klepnutím na položku Uložit. Nebo vzorek odstraňte klepnutím na položku Odstranit. 5. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky. Poznámka:

Není povoleno odstraňovat vzorek, který je součástí relace, která již byla analyzována.



268


One Lambda, Inc.

Seznamy testů Seznam testů je seznam ID vzorků, která lze použít opakovaně k automatickému zápisu ID vzorků do analýzy relace, kterou lze číst zařízením Luminex®. Jde o užitečný nástroj, pokud máte skupinu vzorků, které mají projít více testy. V nabídce seznamu testů můžete: 

Vytvářet nové seznamy testů



Zobrazit a upravit existující seznamy testů



Odstranit seznamy testů



Exportovat seznamy testů do souboru .txt

Vytvoření nových seznamů testů Seznamy testů musí být vytvořeny v pořadí, v jakém mají být vzorky analyzovány. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Vzorky > Správa seznamu testů. Obrazovka správy seznamu testů

2. U nového seznamu testů zadejte jeho název a klepněte na tlačítko Pokračovat>>.



269


One Lambda, Inc.

3. Pomocí polí hledání vyhledejte vzorky, které chcete přidat do seznamu testů, a klepnutím na položku Použít zobrazte výsledky hledání. 4. Zvýrazněte vzorky a klepnutím na položku Přidat>> 5. Klepnutím na tlačítko Uložit 6. Klepnutím na tlačítko Zavřít

je přidejte do seznamu testů.

nový seznam testů uložíte. se vraťte do hlavní nabídky.

Zobrazení a úpravy existujících seznamů testů Seznamy testů lze kdykoli zobrazit nebo upravit. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Správa vzorků > Správa seznamu testů. 2. Pomocí rozevíracího seznamu vyberte seznam testů a klepněte na tlačítko Pokračovat>>. 3. Klepnutím na položku Odstranit seznam trvale odstraníte vybraný seznam testů. 4. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do Hlavní nabídky.

Odstranění seznamů testů Odstraněním seznamu testů dojde k odebrání seznamu z databáze, ale ID vzorků nelze z databáze odstranit ani je změnit. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Správa vzorků > Správa seznamu testů. 2. Pomocí rozbalovací nabídky vyberte seznam testů a klepněte na tlačítko Pokračovat>>. 3. Podle potřeby přidejte, odeberte nebo přesuňte vzorky. 4. Klepnutím na tlačítko Uložit nový seznam testů uložíte. 5. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Export seznamů testů Seznamy testů lze exportovat mimo aplikaci HLA Fusion pouze jako soubory .txt. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Správa vzorků > Správa seznamu testů. 2. Pomocí rozbalovací nabídky vyberte seznam testů a klepněte na tlačítko Pokračovat>>. 3. Klepnutím na položku Export exportujte podrobnosti seznamu testů do souboru .txt.



270

One Lambda, Inc.


4. Budete-li před exportem vyzváni k uložení testu, klepnutím na Ano provedete uložení a můžete pokračovat v práci. 5. Vyberte místo k uložení seznamu testů a zadejte pro něj název souboru. 6. Klepněte na tlačítko Uložit. 7. Budete-li vyzváni k vytvoření vstupu seznamu pacientů Luminex, klepněte na tlačítko Ne. 8. Klepnutím na tlačítko Zavřít seznam zavřete a vrátíte se do hlavní nabídky.



271

One Lambda, Inc.


Seznamy Luminex Aplikace HLA Fusion může vytvořit seznam Luminex z nových nebo existujících seznamů testů. Tento seznam můžete použít k rychlému přidání informací, např. ID vzorku, ještě před vytvořením výstupního souboru CSV Luminex. V okně Vytvoření/úpravy seznamu testů můžete vytvořit seznam Luminex

Vytvoření seznamů Luminex Soubory seznamů Luminex lze po jejich vyexportování upravovat, avšak v seznamu testů, ze kterých byly soubory vytvořeny, se změny neodrazí. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Vzorky > Správa seznamu testů. 2. Pomocí rozbalovací nabídky vyberte seznam testů a klepněte na tlačítko Pokračovat>>. 3. Klepnutím na položku Exportovat proveďte export. 4. Vyberte místo k uložení seznamu testů a zadejte název souboru. 5. Klepněte na tlačítko Uložit. 6. Budete-li vyzváni k vytvoření vstupu seznamu Luminex, klepněte na položku Ano. 7. Klepnutím na tlačítko OK v hlášení s potvrzením se vrátíte k oknu Seznam testů. 8. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Vytvoření pracovních seznamů vzorků Poznámka:

Funkce pracovního seznamu je dostupná pouze v případě, že máte nainstalovaný software SQL 2005 a vyšší. Vytvoření pracovního seznamu vzorků

Funkce pracovního seznamu v softwaru HLA Fusion vám poskytuje flexibilitu při přiřazování různých testů k vybraným vzorkům. Tyto informace se používají při navrhování destiček pro zpracování na přístroji Luminex.



272


One Lambda, Inc.

1. V hlavní nabídce systému vyberte možnost Vzorek > Vytvořit pracovní seznam vzorku. Vyhledejte vzorky pomocí jednoho z následujících kroků: a. Klepněte na kartu Hledání podle vzorku, pomocí kritérií vyhledávání specifikujte vzorky, ke kterým chcete přiřadit testy, a klepněte na Hledat. b. Klepněte na seznam Hledání podle testu, pomocí kritérií vyhledávání specifikujte vzorky, ke kterým chcete přiřadit testy, a klepněte na Hledat. 2. Vyberte jeden vzorek nebo vyberte více vzorků (přidržením a táhnutím myši). 3. Vybrané vzorky se zvýrazní. 4. Nyní zaškrtnutím políček pro testy, které chcete u vzorků spustit (seznam je uveden pod položkou Testy LABScreen nebo Testy LABType) přiřaďte jeden nebo více testů. 5. Po dokončení přiřazování testů ke všem vybraným vzorkům klepnutím na položku Uložit pracovní seznam uložte.

Vytvoření návrhu destičky Poznámka:

Funkce Plate Designer je dostupná pouze v případě, že máte nainstalovaný software SQL 2005 a vyšší.

Funkce Plate Designer v softwaru HLA Fusion zajišťuje flexibilitu při organizování a plánování vzorku v destičkovém formátu, který je připravený pro zpracování pomocí systému Luminex. Nejprve musíte vytvořit pracovní seznam vzorků. Vytvoření návrhu destičky – vyhledávání podle vzorku

1. V hlavní nabídce aplikace HLA Fusion vyberte položku Vzorek > Vytvořit návrh destičky.



273


One Lambda, Inc.

2. Zadejte název nové destičky nebo výběrem existujícího názvu destičky z rozevíracího seznamu Název destičky můžete destičku upravit.

3. Vyberte položku LABScreen nebo LABType z rozevíracího seznamu Typ analýzy. 4. Vyhledejte vzorky pomocí jednoho z následujících kroků: 

Klepněte na kartu Hledání podle vzorku, pomocí kritérií vyhledávání specifikujte vzorky, . ke kterým chcete přiřadit jamky destičky, a klepněte na položku Hledat



Klepněte na kartu Hledání podle seznamu vzorků, pomocí kritérií vyhledávání specifikujte seznamy vzorků, ke kterým chcete přiřadit jamky destičky, a klepněte na položku . Hledat Vytvoření návrhu destičky – vyhledávání podle seznamu testů

5. Vyberte jeden nebo více vzorků (přidržením a táhnutím myši) a pomocí tlačítka se šipkami doleva <

274


One Lambda, Inc.

8. Chcete-li zobrazit a vytisknout zprávu s informacemi o návrhu destičky, klepněte na položku Zpráva: poloha jamky, název ID vzorku a název ID testu. 9. Klepnutím na položku Exportovat do systému Luminex IS vytvořte návrh destičky, který je vyexportován a může být otevřen a použit ze softwaru Luminex IS software. Zvolíte-li tuto možnost, budete muset přiřadit šablony Luminex ke každému typu testu v návrhu destičky. Zprávy – přiřazení šablon Luminex



275

One Lambda, Inc.


Informace o pacientovi Aplikace HLA Fusion™je schopen uchovávat informace o pacientovi a spojovat ID vzorku s pacienty a dárci. Veškeré informace o typizaci a screeningu můžete uložit pro každého pacienta na jedno místo. Poznámka:

Ověřte, zda u všech dat, která importujete do aplikace HLA Fusion, proběhne minimální ověření dat při importu.



276

One Lambda, Inc.


Import seznamů pacientů/dárců Po vytvoření seznamu pacientů/dárců můžete importovat informace do aplikace HLA Fusion. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Informace o pacientovi > Importovat seznam pacientů. Zobrazí se okno importu pacientů:

Okno importu pacientů

2. Zaškrtněte políčko ve sloupci Import pro jednotlivé pacienty, které chcete importovat. 3. Klepnutím na tlačítko Importovat importujte zaškrtnuté pacienty. 4. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky. Poznámka:

Aplikace HLA Fusion zkontroluje seznam pacientů/dárců, které se snažíte importovat, aby ověřila, že systém Fusion podporuje všechny znaky obsažené v datech. Pokud seznam obsahuje nepodporované znaky, zobrazí se hlášení s příslušným oznámením a seznam se nenaimportuje. Záznamy nově importovaného pacienta zobrazí alely v novém nomenklaturním formátu. Existující záznamy pacienta zobrazí alely v existujícím formátu alel.



277


One Lambda, Inc.

Správa záznamů pacienta/dárce Nabídka správy pacientů/dárců umožňuje spravovat jeden záznam v jednom okamžiku. V nabídce správy pacientů/dárců můžete: 

Přidat nové záznamy pacientů/dárců



Vyhledat existující záznamy pacientů/dárců



Upravit záznamy pacientů/dárců



Spojit ID pacienta/dárce s ID vzorku



Spojit záznamy pacienta a dárce



Přiřadit dárce k PRA dárce



Tisknout, exportovat a archivovat záznamy pacientů

Přidání nových záznamů pacientů/dárců Informace o pacientovi můžete přidat pomocí nabídky informací o pacientovi/dárci. Jde o nejlepší možnost, jak přidat malé množství záznamů o pacientovi. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. Klepnutím zobrazíte seznam pacientů/dárců v databázi aplikace Fusion, který můžete prohledat pomocí řady kritérií.

Po výběru pacienta nebo dárce zaškrtnutím zde upravíte pole informací. Nástroje pro správu informací o pacientovi a dárci.


Převede přiřazený alelový kód a páry na nový nomenklaturní formát a uloží tyto informace do databáze aplikace Fusion.


278

One Lambda, Inc.


2. Zadejte ID do pole Pacient/dárce. ID může být alfanumerické (obsahuje písmena nebo čísla), nebo klepněte na položku Hledat a vyberte pacienta/dárce ze seznamu. 3. Zadejte informace o pacientovi/dárci. Pole označená hvězdičkou (*) jsou povinná. 4. Klepnutím na položku Přidat nové uložte data a přidejte informace o pacientovi/dárci k databázi aplikace Fusion. 5. Klepnutím na tlačítko Zavřít zavřete položku a vrátíte se do hlavní nabídky.

Vyhledání záznamů pacienta/dárce Tato možnost umožňuje procházet záznamy nebo vyhledávat konkrétní záznamy. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. 2. Zadejte ID pacienta/dárce a klepnutím na položku Načíst zobrazte informace o pacientovi. Nebo klepnutím na položku Hledat procházejte záznamy pacientů a vyhledávejte podle jména, ID pacienta, podle toho, zda je aktivní nebo archivovaný atd. 3. Zvýrazněte záznam pacienta a zobrazte jej klepnutím na tlačítko OK.

Úpravy záznamů pacientů/dárců Poznámka:

Abyste mohli upravovat záznam pacienta/dárce, musíte být vedoucí.

Upravovat lze všechny informace o pacientovi/dárci (kromě ID pacienta/dárce). 1. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. 2. Vyberte záznam pacienta/dárce. 3. Zaškrtněte políčko vedle položky Upravit režim. U obou kartových formulářů je stejné zaškrtávací políčku Upravit režim. 4. Upravte informace o pacientovi/dárci na jedné nebo obou kartových formulářích. Pole označená hvězdičkou (*) jsou povinná. 5. Uložte změny klepnutím na položku Uložit. 6. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.



279


One Lambda, Inc.

Spojení ID pacienta/dárce s ID vzorku ID vzorku nelze spojit s více než jedním záznamem pacienta nebo dárce, avšak záznam pacienta nebo dárce může být spojen s více než jedním ID vzorku. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. 1. Vyberte kartu Testy HLA.

Obrazovka informací o pacientovi/dárci – karta Testy HLA

2. Klepněte na tlačítko Spojit ID vzorku. 3. V okně Přidružení vzorku pacienta/dárce zvýrazněte ID vzorku a klepnutím na > jej přidejte do seznamu Seznam vzorků pacientů/dárců. (Klepnutím na < odeberete zvýrazněné ID vzorku ze seznamu.) 4. Klepnutím na položku Uložit data uložte. 5. Klepnutím na tlačítko OK se vrátíte k záznamu pacienta. 6. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Převedení přidružených výsledků pacienta/dárce do nového alelového kódu Výsledky pacienta nebo dárce mohou být převedeny tak, aby se názvy alelových kódů aktualizovaly do nového formátu alelového kódu NMDP. HLAF-MAN-v3.x.x-CS-00, verze 0 (Uživatelská příručka pro HLA Fusion v3.x.x)


280

One Lambda, Inc.


Nový formát ovlivní alelový kód a alelové páry přiřazené k vybranému pacientovi/dárci a bude uložen v novém formátu v databázi aplikace Fusion. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. 2. Vyberte záznam pacienta/dárce. 3. Klepněte na položku Převést alely. 4. Klepnutím na položku Uložit data uložte. 5. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Přidružení záznamů pacienta a dárce ID pacienta nelze přidružit k více než jednomu záznamu dárce, avšak k ID dárce může být přidružen více než jeden záznam pacienta. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. 2. Vyberte záznam pacienta/dárce. 3. Klepněte na kartu Informace o testu. 4. Klepněte na tlačítko Přidružit ID dárce. 5. V okně Přidružení vzorku pacienta/dárce zvýrazněte ID dárce a klepnutím na > jej přidejte do seznamu Seznam vzorků pacientů/dárců. (Klepnutím na < odeberete zvýrazněné ID dárce ze seznamu.) 6. Klepnutím na položku Uložit data uložte. 7. Klepnutím na tlačítko OK se vrátíte k záznamu pacienta. 8. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Přidružení dárce k výsledkům PRA dárce ID pacienta lze zahrnout do výpočtu procenta PRA dárce u antigenových produktů. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. 2. Vyberte dárce nebo vytvořte nového. 3. Ujistěte se, že pole Pacient/dárce je nastaveno na možnost Dárce.



281

One Lambda, Inc.


4. Zaškrtněte políčko Zahrnout do PRA dárce PRA.

Tisk záznamů pacientů/dárců Aplikace HLA Fusion vytiskne obě karty Správa záznamů bez ohledu na to, která karta se právě zobrazuje. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. 2. Vyberte záznam pacienta/dárce. 3. Tisk spustíte klepnutím na položku Tisk. 4. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Export záznamů pacientů/dárců Záznamy pacientů/dárců lze exportovat jednotlivě do souboru CSV. Soubor má stejný formát jako seznam pacientů. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. 2. Vyberte záznam pacienta/dárce. 3. Klepnutím na položku Exportovat proveďte export. 4. Vyberte místo k uložení souboru CSV a zadejte název souboru. 5. Klepněte na tlačítko Uložit. 6. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Archivace záznamů pacientů/dárců Archivované záznamy pacienta/dárce nejsou dostupné pro vykazování nebo přidružování. Přesto můžete po zrušení zaškrtnutí políčka archivu archivované záznamy zobrazit a znovu je aktivovat. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. 2. Klepněte na kartu Všeobecné informace. 3. Vyberte záznam pacienta/dárce. 4. V okně Seznam pacientů/dárců vyberte položku Archivovat v rozevíracím seznamu Aktivní/archivovat.



282

One Lambda, Inc.


5. Uložte klepnutím na položku Uložit. 6. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Odstranění záznamů pacientů/dárců Záznamy pacientů/dárců lze odstranit pomocí možnosti nabídky Správa pacienta. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Informace o pacientovi > Správa pacienta. 2. Klepněte na kartu Všeobecné informace. 3. Vyberte záznam pacienta/dárce. 4. Klepnutím na položku Odstranit odstraňte záznam pacienta/dárce z databáze aplikace Fusion. 5. Klepněte na tlačítko Uložit.

Vytvoření seznamů pacientů/dárců Následuje příklad seznamu pacientů, který lze vytvořit, a pokyny, jak přitom postupovat. Seznam pacientů musí být naformátovaný pro import prostřednictvím programu, jako je Excel nebo Poznámkový blok, a uložen jako soubor CSV kompatibilní se systémem Windows. První pole/oddíl musí obsahovat názvy polí se seznamy pacientů s jednotlivými názvy odděleným čárkou. Poznámka:

Vytvoření nového seznamu pacientů lze usnadnit, pokud nejprve exportujete existující seznam do formátu CSV a pomocí polí v tomto formátu vypracujete nový seznam.

Názvy a formát polí seznamu pacientů PatientIDName,CategoryGrp,FamilyID,FirstName,MiddleName,LastName,Ssn,Dob,Gender,Ethni city,Address,City,State,Region,Country,ZipCode,Email,Phone,WkPhone,Cellular,Fax,Emplo yer,SpouseName,SpouseBloodType,EmergencyContact,EmrgncyTel,DCN,HospitalName,Division, BloodType,Disease,RhBloodType,PatientDonorFlg,Associated SampleIDs,Associated DonorIDs,HLA1_A,HLA2_A,HLA1_B,HLA2_B,HLA1_BW,HLA2_BW,HLA1_C,HLA2_C,HLA1_DRB1,HLA2_DRB 1,HLA1_DRB3,HLA2_DRB3,HLA1_DRB4,HLA2_DRB4,HLA1_DRB5,HLA2_DRB5,HLA1_DQB1,HLA2_DQB1,HLA 1_DQA1,HLA2_DQA1,HLA1_DPB1,HLA2_DPB1,HLA3,HLA1_DRB4,HLA2_DRB4,HLA1_DRB5,HLA2_DRB5,HLA 1_DQB1,HLA2_DQB1,HLA1_DQA1,HLA2_DQA1,HLA1_DPB1,HLA2_DPB1,HLA1_DPA1,HLA2_DPA1,HLA1_MIC A,HLA2_MICA,HLA1_MICB,HLA2_MICB,HLA_KIR,ClassI_AbSpec,ClassII_AbSpec,MIC_AbSpec,Unacc eptableAntigens,AcceptableAntigens,Notes,SHLA1_A,SHLA2_A,SHLA1_B,SHLA2_B,SHLA1_Cw,SHL A2_Cw,SHLA1_DR,SHLA2_DR,SHLA1_DR345,SHLA2_DR345,SHLA1_DQ,SHLA2_DQ,SHLA1_DP,SHLA2_DP,D onorType,IncludeInDonorPRA

Následné řádky musí uvádět vlastní informace o pacientech v alfanumerickém pořadí (mohou být obsažena písmena nebo čísla) a oddělené čárkou. I když v určitém poli není o pacientovi žádná informace, vyžaduje toto pole čárku jako zástupný znak.



283


One Lambda, Inc.

Poznámka:

U všech ručních položek sérologie musí před hodnotou předcházet místo. Například pro místo A o hodnotě 23 musíte zadat A23. Příklad seznamu pacientů/dárců



284


One Lambda, Inc.

Sledování protilátek pacienta U každého pacienta můžete sledovat sílu protilátek v čase. Sledované informace jsou převzaty z dat typizace uložených na jejich kartě informací o pacientech/dárcích a datech o protilátkách v jejich vzorcích analýzy (jednotlivý antigen LABScreen a jednotlivé položky LABScreen) pro určený datový rozsah. Pomocí následujících kroků zobrazíte grafy a data, která sledují data o protilátkách pacienta. Ujistěte se, že jste do aplikace HLA Fusion zadali informace o pacientovi a dárci. Pokud tomu tak není, můžete je importovat ze seznamu pacientů nebo data zadat ručně na záložce Informace o testu na kartě Informace o pacientovi/dárci. Záznamy o pacientovi a dárci musí být přidružené. 1. Vyberte položku Informace o pacientovi > Sledování protilátky. Zobrazí se okno Sledování protilátek pacienta.

Klepnutím na tlačítko Uložit zde uložíte všechny vzorky uvedené na tomto místě pro budoucí analýzu jako vzorky v rámci vybraného datového rozsahu.

Okno Sledování protilátek pacienta

2. Klepnutím na rozevírací šipku vedle pole ID pacienta proveďte výběr ze seznamu pacientů uložených ve vaší databázi aplikace Fusion. Nebo klepněte na položku Hledat a proveďte vyhledání podle ID pacienta, jména nebo příjmení atd. 3. Pole molekulární a sérologické typizace se automaticky vyplní dostupnými daty daného pacienta. 4. Vyberte počáteční a koncové datum rozsahu, ve kterém chcete zobrazit data o antigenu pro tohoto pacienta (klepnutím na rozevírací šipku v datových polích zobrazíte kalendář). 5. Můžete vybrat položku Sekundární protilátka, nebo vybrat svou vlastní. Takto lze filtrovat vzorky, což znamená, že vzorky, které chcete vyvolat, musí mít tuto sekundární protilátku. Jinak nebudou při klepnutí na položku Najít dostupné.



285


One Lambda, Inc.



(Volitelně) Můžete zobrazit procento PRA od dostupných dárců v systému nebo od skupin vybraných dárců, kteří odpovídají počítačem přiřazeným protilátkám u aktuálního vzorku.

6. Klepnutím na tlačítko PRA dárce vyvoláte následující dialogové okno, ve kterém můžete vybrat skupiny dárců nebo všechny dárce. Vedle tlačítka PRA dárce se zobrazí výpočet PRA dárce.

Výběr skupiny dárců

7. Klepnutím na tlačítko Najít zobrazíte seznam vzorků pro tohoto pacienta, které jsou v zadaném datovém rozsahu. Vyhledání seznamu pacientů

Poznámka:

Chcete-li ke vzorku přidat konečná přiřazení, dvojím klepnutím do sloupce Konečné přiřazení u vzorku zobrazíte okno analýzy a přidání přiřazení. Do tohoto sledování lze také zahrnout pouze vzorky s datem. Je-li sloupec Datum vzorku u určitého vzorku prázdný, klepněte na prázdnou buňku Datum vzorku a pomocí rozevíracího vyhledávače data přidejte datum.



286


One Lambda, Inc.

8. Zaškrtněte políčko ve sloupci Zahrnout u vzorku(ů), které chcete zahrnout do grafů a dat sledování protilátek. Zobrazí se grafy (chcete-li zobrazit určitý typ grafu, klepněte na související kartu). 9. Zaškrtněte políčko u antigenu(ů), které chcete zahrnout do sledování. Molekulární Sérologická typizace Datový rozsah

Vzorky

Příklady grafů, které lze zobrazit, se sledováním protilátek

Dostupné možnosti, pokud klepnete pravým tlačítkem na graf. Zahrnout seznam antigenů

10. Klepnutím na rozevírací šipku v poli Vzorec (Výchozí nebo nezpracovaný) vyberte vzorec, který chcete použít pro grafy. Vzorec lze po zobrazení grafů také změnit, pokud chcete toto sledování porovnat s jinými vzorci. Dvojím klepnutím můžete graf rozbalit. U každého grafu (viz schéma výše) jsou k dispozici možnosti při klepnutí pravým tlačítkem. K rozbalení grafů můžete použít také tlačítka pro rozbalení/sbalení v pravém horním rohu.



287


One Lambda, Inc.



(Volitelné) V případě potřeby můžete přidat data dárce pomocí rozevírací šipky vedle pole ID dárce, a vybrat tak ze seznamu dárců přidruženého k vybranému pacientovi. Také můžete za běhu vytvořit nového dárce tak, že do pole ID dárce zadáte jedinečné jméno a vyplníte molekulární a sérologickou typizaci.



(Volitelné) Zadejte číselnou hodnotu do pole Uživatelem definovaná mezní hodnota. Chcete-li sledovat sílu signálu protilátek s aplikovanými mezními hodnotami nebo bez nich, vyberte nebo zrušte výběr zaškrtávacích políček vedle položky Uživatelem definovaná mezní hodnota.



(Volitelné) Zaškrtnutím políčka vedle položky Sledovat SPD provedete sledování specifických antigenů dárce. Je-li tato možnost vybrána a existují specifické antigeny dárce, které nejsou testovány soupravou produktů OLI, budou tyto antigeny uvedeny.

Rozevírací seznam ID dárce. Výběrem zahrnete sledování třídy II. Výběrem provedete sledování specifických antigenů dárce.

Zobrazení seznamu antigenů, které nebyly testovány testovacími soupravami OLI.

Informace o protilátkách dárce



(Volitelné) Zaškrtnutím políčka DQA/DPA zahrnete tyto položky do sledování třídy II.



(Volitelné) Ručně zadejte typizaci dárce do pole Sérologická typizace.

11. Klepnutím na tlačítko Datová tabulka zobrazíte soubor CSV datové tabulky se signálem antigenu pacienta během určitého časového období. Tabulku lze vytisknout nebo exportovat.



288

One Lambda, Inc.


Správa profilu Aplikace HLA Fusion™ sleduje všechny změny dat analýzy provedené uživateli a díky dvouúrovňovému potvrzení výsledků analýzy umožňuje zvýšenou bezpečnost dat (uložení a potvrzení). Aplikace HLA Fusion také uchovává všeobecné informace o laboratoři, které jsou používány ve zprávách, včetně vícenásobných smluvních laboratorních kódů.



289


One Lambda, Inc.

Správa uživatele V hlavní nabídce profilu můžete: 

Přidat nové uživatele



Upravovat existující profily uživatelů



Měnit hesla



Resetovat hesla



Archivovat uživatele

Aplikace HLA Fusion používá ke zlepšení bezpečnosti a kontroly výsledků typizace a screeningu dvě úrovně uživatelů.

Vedoucí může...

Laboratorní technik může...

Měnit všechna konfigurační nastavení produktu

Měnit všechna konfigurační nastavení produktu – kromě povolení možnosti Automaticky přijmout vše a Počítačem generovaná sérologie u produktu LABType a Micro SSP

Ukládat a potvrzovat výsledky analýzy

Analyzovat data a ukládat výsledky analýzy

Aktualizovat referenční soubory, např. katalogy a kódy NMDP

(Pouze se souhlasem vedoucího) – Aktualizovat referenční soubory, např. katalogy a kódy NMDP

Archivovat katalogy

Archivovat katalogy

Měnit a odstraňovat data relací a vzorků

(Pouze se souhlasem vedoucího) – Měnit a odstraňovat data relací a vzorků

Měnit vlastní i jiné uživatelské účty

Měnit pouze vlastní účet

Měnit laboratorní profil

Spravovat informace o vzorcích a pacientech



290

One Lambda, Inc.


Zobrazování seznamu uživatelů Možnost Seznam uživatelů zobrazuje seznam všech uživatelů, kteří jsou aktuálně v databázi, aktivních i neaktivních. Lze provádět vyhledání a výběr uživatelských profilů. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Profil > Seznam uživatelů. 2. Zadejte jméno a klepnutím na položku Hledat vyhledejte aktuální uživatele. 3. Dvojím klepnutím na levou část položky uživatele zobrazíte profil. 4. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Přidání nových uživatelů Vedoucí mohou přidávat nové uživatele na úrovni vedoucího nebo technika. Technici nemohou přidávat nové uživatele. Pole označená hvězdičkou (*) jsou povinná. 1. V hlavní nabídce vyberte položku Profil > Seznam uživatelů. 2. Klepnutím na položku Přidat uživatele přidejte nového uživatele. 3. Zadejte informace o novém uživateli. 4. Zaškrtnutím políčka Aktivní pod polem role aktivujte uživatelský účet. Poznámka:

Pokud jde o profil laboratorního technika a chcete povolit oprávnění k aktualizaci referenčních souborů nebo správě dat pro tohoto uživatele, zaškrtněte příslušná políčka.

5. Klepnutím na položku Uložit uložte nové informace o uživateli a vraťte se do hlavní nabídky, nebo klepnutím na položku Zavřít změny zrušte a vraťte se do hlavní nabídky bez uložení.

Úprava uživatelských profilů Vedoucí mohou upravovat uživatelský profil libovolného uživatele. Technici mohou upravovat pouze své vlastní profily. Pole označená hvězdičkou (*) jsou povinná. 1. Chcete-li upravit svůj vlastní profil, vyberte možnost Profil > Můj profil. 2. Chcete-li provést výběr ze seznamu uživatelů pro úpravy, vyberte možnost Profil > Seznam uživatelů a dvojím klepnutím vlevo od uživatele vyberte daný profil. 3. Upravte informace o uživateli.



291

One Lambda, Inc.


4. Klepnutím na tlačítko Uložit uložte informace o uživateli a vraťte se do hlavní nabídky. 5. Klepnutím na tlačítko Zavřít změny zrušte a vraťte se do hlavní nabídky bez uložení.

Změna hesla Vedoucí mohou hesla měnit u libovolného uživatele, ale musí mít staré heslo daného uživatele. Technici mohou měnit pouze svá vlastní hesla. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Profil > Můj profil. 2. V uživatelském profilu klepněte na tlačítko Změnit heslo. 3. Zadejte současné a nové heslo. 4. Změňte heslo klepnutím na tlačítko Uložit heslo. Nebo klepnutím na tlačítko Zavřít zavřete okno a vraťte se do hlavní nabídky bez změny hesla.

Resetování hesel Pokud uživatel heslo ztratí nebo zapomene, aplikace HLA Fusion může heslo resetovat. Nové heslo je stejné jako uživatelské jméno uživatele. Resetovat heslo uživatele může pouze vedoucí. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Profil > Seznam uživatelů a vyberte uživatele. 2. V uživatelském profilu klepněte na tlačítko Resetovat heslo. 3. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Změna uživatelských oprávnění Změnit úroveň oprávnění uživatele může pouze vedoucí. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Profil > Seznam uživatelů. 2. Dvojím klepnutím vlevo od uživatele otevřete jeho profil. 3. V uživatelském profilu zaškrtnutím políčka vedle položky Správa dat nebo Aktualizovat referenční soubory nebo obou přidělíte vybranému uživateli oprávnění těmto aktivitám v rámci aplikace Fusion. 4. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.



292

One Lambda, Inc.


Deaktivace uživatelů Vedoucí mohou deaktivovat uživatele, kteří již aplikaci HLA Fusion nepoužívají. Informace o uživateli jsou stále uloženy v databázi, ale uživatel se do programu nemůže přihlásit. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Profily > Seznam uživatelů a vyberte uživatele, kterého chcete upravit. 2. Zrušením zaškrtnutí políčka Aktivní deaktivujte uživatele. 3. Klepnutím na položku Uložit uložte informace o uživateli a vraťte se do hlavní nabídky, nebo klepnutím na položku Zavřít změny zrušte a vraťte se do hlavní nabídky bez uložení. Poznámka:

Pokud je ID uživatele stále přidruženo k záznamům analýzy, ID uživatele nelze odstranit.



293


One Lambda, Inc.

Profil laboratoře Nabídka profilu laboratoře zobrazuje kontaktní informace o vaší laboratoři, síťové informace používané aplikací HLA Fusion a smluvní laboratorní kódy NMDP. Většina těchto informací se zadává během instalace, ale lze je kdykoli aktualizovat. Profil laboratoře může změnit pouze vedoucí. V nabídce profilu laboratoře můžete: 

Upravovat profil laboratoře



Přidávat, upravovat a odebírat laboratorní kódy



Měnit cestu sítě



Měnit název e-mailového serveru Obrazovka informací o profilu laboratoře



294

One Lambda, Inc.


Úpravy profilu laboratoře Informace o laboratoři se zobrazují u většiny zpráv a zahrnují kontaktní informace o vaší laboratoři. Tyto informace jsou prvotně vloženy během instalace a mohou být příležitostně upravovány v nabídce Profil laboratoře. Pole označená hvězdičkou (*) jsou povinná. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Profil > Profil laboratoře. 2. Upravte informace o profilu laboratoře. 3. Klepnutím na položku Uložit uložte změny vraťte se do hlavní nabídky, nebo se klepnutím na položku Zavřít vraťte se do hlavní nabídky bez uložení změn.

Správa laboratorních kódů Laboratorní kódy se používají ve zprávách NMDP k označení smluvních laboratoří. Do aplikace HLA Fusion lze vložit a uchovávat v ní více laboratorních kódů. Při vytváření zprávy NMDP můžete vybrat laboratorní kód, který chcete použít. Ve zprávách NMDP se používají pouze první tři číslice laboratorního kódu, popisy laboratorního kódu se do zprávy nezahrnují. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Profil > Profil laboratoře. Můžete přidávat, upravovat a odebírat laboratorní kódy: 

Klepnutím na položku Přidat laboratorní kód přidáte nový laboratorní kód. Informace zadejte do nového řádku.



Zvýrazněte laboratorní kód, který chcete upravit. Klepnutím na položku Upravit laboratorní kód upravte laboratorní kód.

2. Upravte informace o laboratorním kódu. 3. Zvýrazněte laboratorní kód, který chcete odstranit. 4. Klepnutím na položku Odstranit laboratorní kód odstraňte laboratorní kód. 5. Klepnutím na položku Uložit uložte změny a vraťte se do hlavní nabídky, nebo klepnutím na položku Zavřít změny zrušte a vraťte se do hlavní nabídky bez uložení.



295

One Lambda, Inc.


Obslužné programy Aplikace HLA Fusion™ využívá pro analýzu dat řadu referenčních souborů, které je potřeba aktualizovat pro nové produkty, šarže a revize. Můžete také změnou mnoha globálních nastavení produktu přizpůsobit analýzu vaší laboratoři a můžete změnit výchozí nastavení systému tak, aby odráželo váš osobní nebo síťový systém souborů. Varování: Pro analýzu používejte vždy poslední referenční soubory. Jinak nemusí být výsledky analýzy přesné.



296


One Lambda, Inc.

Správa katalogových referenčních souborů Katalogové referenční soubory obsahují všechny specifické informace o reakcích, které jsou potřebné pro analýzu, a to včetně těchto: 

Specificity perliček a jamek



Informace o kontrole kvality



Hodnoty mezních hodnot



Informace o perličce a primeru

Aby byla správná, vyžaduje každá nová šarže nebo revize produktu svůj vlastní katalogový soubor pro výsledky analýzy.

Aktualizace katalogových souborů z místní nebo síťové jednotky Vedoucí laboratoře může vložit nové katalogové soubory pro použití při analýze v okamžiku, kdy se nové produkty, šarže nebo aktualizace stanou dostupnými. Katalogové soubory jsou dostupné také na stránkách společnosti One Lambda pro stahování. 1. Na hlavní domovské stránce nebo domovské stránce libovolného produktu klepněte na odkaz [Download (Stáhnout)] nebo v hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizovat reference > Aktualizovat referenční soubor. Zobrazí se dialogové okno Aktualizace referenčního souboru.

Adresářový strom souborů

Katalogy

Možnosti katalogu



297


One Lambda, Inc.

Jsou-li vaše informace o sérologii zastaralé nebo jste je ještě nenaimportovali, zobrazí se hlášení podobné tomu, které je zobrazeno níže. Nechcete-li tento typ hlášení zobrazovat, přejděte na další krok. Uvidíte-li toto hlášení, klepnutím na položku OK otevřete dialogové okno Import sérologie. Oznámení souboru ekvivalentu pro sérologii

Zkontrolujte, zda je vybrána možnost Katalog. 2. Pomocí stromu adresáře souborů vlevo najděte katalogové soubory, které chcete importovat.

Počet katalogů, které jsou aktuálně ve vaší databázi aplikace Fusion. Aktualizované a revidované katalogy dostupné ke stažení. Seznam všech dostupných katalogů

Poznámka:

Dostupné katalogy, které nejsou ve vaší databázi Fusion.

Pro určení toho, který z dostupných katalogů je poslední, se aplikace HLA Fusion podívá nejprve na číslo šarže a poté na číslo revize. Aktualizované číslo šarže bude označeno jako poslední verze katalogu, i když od posledního stahování katalogů existuje také aktualizace čísla revize předchozí šarže.

3. Zvýrazněte soubory, které chcete importovat, nebo klepnutím na položku Vybrat vše vyberte všechny soubory v seznamu.



298

One Lambda, Inc.


Vyberete-li k importu katalog, který je ve starém alelovém formátu, budete upozorněni hlášením. Pokud toto hlášení nevidíte, přejděte na další krok. Pokud hlášení vidíte, vyberte možnost převodu, kterou chcete použít před přechodem k dalšímu kroku. Poznámka:

Vyberete-li možnost Ano nebo Ano všem, software převede starý alelový formát do nejnovějšího formátu. U molekulárních produktů (LABType nebo Micro SSP) software alely ve starém formátu úplně vypustí, pokud v seznamu nových formátů nenajde odpovídají alelu. Pokud software u protilátkových produktů nenajde odpovídající alelu v novém formátu, alelu ve starém formátu ponechá, ale přidá dvojtečku. Možnost převodu alel

4. Klepnutím na položku Ano nebo Ano všem importujte vybrané katalogové soubory. Poznámka:

Pokud vyberete převod alel, import katalogu trvá déle.

5. Zobrazí se dialogové okno s potvrzením, klepněte na položku Zavřít. 6. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vraťte do nabídky aktualizace referencí. Importované katalogové soubory lze použít bez restartování aplikace Fusion.

Aktualizace katalogových souborů ze stránek společnosti One Lambda pro stahování 

Katalogové soubory jsou dostupné také na stránkách společnosti One Lambda pro stahování (http://download.onelambda.com).

1. Na hlavní domovské stránce nebo domovské stránce libovolného produktu klepněte na odkaz Download (Stáhnout) nebo v hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizovat reference > Aktualizovat referenční soubor. Zobrazí se dialogové okno Aktualizace referenčního souboru. 2. Klepnutím na položku Automatická aktualizace aktualizací katalogu One Lambda.

otevřete okno Výběr

3. Zaškrtněte políčko vedle souborů, které chcete importovat. Klepnutím na znaménko plus nebo mínus ve stromu adresáře souborů najděte katalogové soubory pro jednotlivé produkty. Také můžete klepnutím na položku Vybrat vše nebo Zrušit výběr všech zaškrtnout nebo zrušit zaškrtnutí všech políček najednou.



299

One Lambda, Inc.

4. Klepnutím na položku Importovat


importujte vybrané katalogové soubory.

5. Když se v dialogovém okně s potvrzením zobrazí výsledky importu, klepněte na OK. 6. Klepnutím na položku Zavřít referencí.

a poté na položku Ano se vrátíte do nabídky aktualizace

Importované katalogové soubory lze použít bez restartování aplikace Fusion.

Poznámka:

Můžete také klepnout na položku Přejít na OLI, klepnout na odkazy na produkty a katalogové soubory, které chcete importovat, a postupovat podle pokynů ke stahování. Pokud automatická aktualizace neodpovídá, ověřte své síťové připojení a to, zda je adresa URL, kterou jste zadali pro společnost One Lambda v položce Obslužné programy > Adresy URL a cesty, správná.



300


One Lambda, Inc.

Aktualizace referenčních souborů molekulární typizace Referenční soubory obsahují informace o alelovém kódu a ekvivalentu pro sérologii používané při analýze. Je důležité je pravidelně aktualizovat kvůli správnému alelovému kódu a přiřazením sérologie. V nabídce aktualizace referencí můžete stáhnout potřebné soubory: 

Kódy NMDP



Místní kódy



Soubory ekvivalentů pro sérologii

Aktualizace kódů NMDP z místní nebo síťové jednotky Národní program dárců kostní dřeně (NMDP) poskytuje seznam alelových kódů, které lze používat při analýze molekulární typizace. Máte-li v místní nebo síťové jednotce uložen aktuální seznam, pomocí tohoto postupu jej naimportujete tak, aby k němu aplikace HLA Fusion měla přístup. Nejaktuálnější soubor kódu NMDP je k dispozici na stránkách NMDP pro stahování. 1. Na hlavní domovské stránce nebo domovské stránce libovolného produktu klepněte na odkaz Download (Stáhnout) nebo v hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizovat reference > Aktualizovat referenční soubor. Zobrazí se dialogové okno Aktualizace referenčního souboru.

Složka/ kmen adresáře

2. Vyberte možnost NMDP.

Možnost kódu NMDP Informace o posledním stahování a aktualizaci

Aktualizace kódu NMDP



301

One Lambda, Inc.


3. Pomocí stromu Importovat adresář navigujte na soubor NMDP na místní nebo síťové jednotce. 4. Klepnutím na položku Importovat NMDP importujte vybraný soubor. 5. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vraťte do nabídky aktualizace referencí.

Aktualizace souborů NMDP z webových stránek NMDP Pomocí tohoto postupu importujte seznam NMDP z webových stránek NMDP. 1. Na hlavní domovské stránce nebo domovské stránce libovolného produktu klepněte na odkaz Download (Stáhnout) nebo v hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizovat reference > Aktualizovat referenční soubor. 2. Zobrazí se dialogové okno Aktualizace referenčního souboru. 3. Vyberte možnost NMDP. 4. Klepněte na položku Automatická aktualizace, která automaticky importuje aktuální soubor NMDP pro použití s aplikací HLA Fusion. Nebo klepněte na položku Přejít na NMDP a postupujte podle pokynů pro stahování souboru NMDP z webové stránky. Poznámka:

Pokud automatická aktualizace neodpovídá, ověřte své síťové připojení a to, zda je adresa URL, kterou jste zadali pro NMDP v položce Obslužné programy > Adresy URL a cesty, správná.

Vytvoření souboru místního kódu Soubory místního kódu jsou vytvářeny jednotlivými laboratořemi; místní kódy jsou vytvářeny tak, aby usnadňovaly uložení a čtení nejednoznačných přiřazení typizace. Například nejasnosti jako B*1501/1501N/1502 mohou být pro jednodušší vedení záznamů zhuštěny pomocí kódu na B*15AB. 1. Zkopírujte šablonu místního kódu z CD aplikace HLA Fusion CD do místní jednotky. 2. Pomocí textového editoru upravte šablonu a přidejte definice kódu. 3. Podle vzorového formátu pomocí položky Tabulátor oddělte jednotlivá pole a pomocí lomítka oddělte vícenásobné hodnoty v poli: 

kód písmene číselná přípona alely, ke které se kód vztahuje

4. Soubor uložte jako local_code.txt

Informace o importu souboru najdete v další části Aktualizace souboru místního kódu.



302


One Lambda, Inc.

Aktualizace souboru místního kódu Po vytvoření souboru místního kódu je nutno tento kód v aplikaci HLA Fusion aktualizovat. 1. Na hlavní domovské stránce nebo domovské stránce libovolného produktu klepněte na odkaz Download (Stáhnout) nebo v hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizovat reference > Aktualizovat referenční soubor. Zobrazí se dialogové okno Aktualizace referenčního souboru. Aktualizace referenčního souboru: Místní kód

Strom adresáře/ složky

Místní kód Možnost

2. Vyberte možnost Místní kód. 3. Pomocí stromu Importovat adresář najděte a vyberte soubor místního kódu, který chcete importovat. 4. Klepnutím na položku Importovat místní kód importujte vybraný soubor(y). 5. Klepnutím na položku Zavřít se vraťte do nabídky Aktualizace referencí.

Aktualizace souboru ekvivalentu pro sérologii z webových stránek společnosti One Lambda Soubor ekvivalentu pro sérologii lze automaticky aktualizovat ze stránek společnosti One Lambda pro stahování (http://download.onelambda.com). 1. Na hlavní domovské stránce nebo domovské stránce libovolného produktu klepněte na odkaz Download (Stáhnout) nebo v hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizovat reference > Aktualizovat referenční soubor.



303


One Lambda, Inc.

Zobrazí se dialogové okno Aktualizace referenčního souboru. Aktualizace referenčního souboru: Ekvivalent pro sérologii

Strom adresáře/ složky

Možnost ekvivalentu pro sérologii

2. Vyberte možnost Ekvivalent pro sérologii. 3. Klepnutím na položku Automatická aktualizace aktualizací katalogu One Lambda.

otevřete okno Výběr

4. Zaškrtněte políčko vedle všech souborů, které chcete importovat. 5. Klepnutím na položku Importovat sérologii importujte vybrané soubory. Katalogové soubory jsou připraveny pro použití bez restartování aplikace HLA Fusion. 6. Dialogové okno s potvrzením zobrazí výsledky importu; klepněte na položku OK. 7. Klepnutím na položku Zavřít referencí. 

a poté na položku Ano se vrátíte do nabídky aktualizace

Pokud automatická aktualizace neodpovídá, ověřte své síťové připojení a to, zda je adresa URL, kterou jste zadali pro sérologii v položce Obslužné programy > Adresy URL a cesty, správná.

Správa katalogu a informace Archivace katalogů Katalogové soubory, které se již nepoužívají, můžete archivovat. Informace o katalogu v databázi stále existují, ale nejsou zahrnuty do seznamu dostupných katalogových souborů pro analýzu. Katalogové soubory mohou být také obnoveny pro použití při analýze.



304

One Lambda, Inc.


1. V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizace referencí > Informace/správa katalogu.

Archivace katalogu

2. Zaškrtněte políčko S (vybrat) u katalogových souborů, které chcete archivovat, a klepněte na . položku Archivovat 3. Když se zobrazí místní zpráva Data uložena, klepněte na položku OK. 4. Klepnutím na položku Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky. Poznámka:

Když importujete novou verzi katalogového souboru, systém automaticky archivuje předchozí verzi.



305


One Lambda, Inc.

Zrušení archivace souborů U archivovaných katalogových souborů se zobrazí A ve sloupci Stav, pokud zobrazíte seznam katalogů a zaškrtnete políčko u možnosti Ukázat archivované katalogy. Zaškrtávací políčko Archivované katalogy

Archivace a zrušení archivace katalogových souborů

Zde zaškrtněte a klepnutím na tlačítko Zrušit archivaci zrušte archivaci katalogu.

Písmeno „A“ ukazuje, že katalog byl archivován.

Zde zaškrtněte a klepnutím na tlačítko Archivovat archivujte katalog.



V okně Archivovat katalog zaškrtněte políčko u katalogů, jejichž archivaci chcete zrušit, a klepněte na položku Zrušit archivaci.

Zobrazení informací o katalogovém souboru V nabídce Informace o katalogu můžete zobrazit informace o katalogovém souboru a generovat zprávu. Katalogové soubory, které se zobrazují s označením A ve stavovém sloupci, jsou archivované. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizace referencí > Správa katalogu. 2. Chcete-li provést seřazení seznamu katalogových souborů, klepněte na záhlaví sloupce. 3. Klepnutím na položku Zpráva zobrazíte tisknutelnou, exportovatelnou zprávu s informacemi o aktuálně zobrazeném katalogu.

Odstranění informací o katalogovém souboru Katalogový soubor můžete v nabídce Správa katalogu odstranit. Katalogové soubory, které se zobrazují s označením A ve stavovém sloupci, jsou archivované.



306

One Lambda, Inc.


1. V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizace referencí > Informace/správa katalogu. 2. Zaškrtněte políčko vedle všech souborů, které chcete odstranit. 3. Klepnutím na položku Odstranit odeberete informace o katalogu.

Vykazování informací o katalogovém souboru V nabídce Informace o katalogu můžete zobrazit a vykázat informace o katalogovém souboru a generovat zprávu. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizace referencí > Správa katalogu. 2. Chcete-li provést seřazení seznamu katalogových souborů, klepněte na záhlaví sloupce. 

(Volitelné) Chcete-li zprávu ve starém formátu, zaškrtněte políčko u položky Zpráva ve starém

formátu. 3. Klepnutím na položku Zpráva zobrazíte tisknutelnou, exportovatelnou zprávu s informacemi o aktuálně zobrazeném katalogu.

Přidružení katalogových souborů produktu a šablon Luminex Katalogový soubor můžete přidružit k názvu šablony Luminex použitému pro konkrétní produkt. Aplikace HLA Fusion při prvním spuštění analýzy u produktu automaticky přidruží ID katalogu k názvům šablon. Po provedení přidružení aplikace HLA Fusion při spuštění analýzy automaticky vybere katalogový soubor přidružený k šabloně použité v souboru CSV. Přidružení můžete také ručně přidávat, odebírat nebo měnit. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Přidružení šablon katalogů. Přidání, odebrání nebo změna přidružení: 2. Přidejte Nové přidružení. 3. Vyberte katalogový soubor. 4. Zadejte nový název šablony nebo klepnutím na položku Procházet vyberte soubor šablony Luminex (formát .lxt) pro přidružení k názvu souboru. 5. Odebrání přidružení. 6. Vyberte katalogový soubor. 7. Vyberte název šablony a klepněte na položku Odebrat.



307


One Lambda, Inc.

Změna přidružení: 1. Vyberte katalogový soubor. 2. Upravte existující název (názvy) šablon. 3. Uložte změny klepnutím na položku Uložit. 4. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vrátíte do hlavní nabídky.

Import souborů alelových frekvencí (demografická frekvence) Soubory alelové frekvence můžete importovat pro použití při analýze na základě demografických údajů. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizace referencí > Alelová frekvence. 2. Vyberte možnost Vytvořit demografickou skupinu. Import alelové frekvence

3. Klepněte na tlačítko procházet

a najděte soubory alelové frekvence.

4. Klepněte na položku Importovat.



308

One Lambda, Inc.


Když je soubor alelové frekvence úspěšně naimportován, v položce Demografická skupina a frekvence v databázi se vyjmenují skupiny, které soubor obsahuje. 5. Klepněte na tlačítko Uložit. Je-li záhlaví sloupce některého souboru alelové frekvence prázdné, celý sloupec se do aplikace Fusion nenaimportuje, a to bez ohledu na jakákoliv jiná data, která obsahuje. Jsou-li sloupce duplicitní, aplikace Fusion zobrazí chybové hlášení a neprovede import souboru alelové frekvence. Data obsažená v souboru alelové frekvence mohou vypadat podobně jako na tomto obrázku.

Aktualizace souborů alelových frekvencí (demografická frekvence) Soubory alelové frekvence můžete před jejich použitím v analýze změnit na základě demografických údajů. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizace referencí > Alelová frekvence.



309


One Lambda, Inc.

Import alelové frekvence

2. Vyberte možnost Aktualizovat alely a frekvence. 3. Klepněte na tlačítko procházet aktualizovat.

a najděte soubor alelové frekvence, který chcete

4. Klepněte dvakrát na soubor nebo klepněte na položku Otevřít v okně prohlížeče. 5. Proveďte změnu souboru pomocí některého nebo všech následujících možností: 

Přidání/odstranění alel



Odstranění existujících demografií



Změna alelových frekvencí



Převod alelového formátu

6. Klepněte na položku Převést alely 7. Klepněte na položku Aktualizovat. 8. Klepněte na položku Zavřít.



310


One Lambda, Inc.

Správa informací o seznamu CREG Můžete změnit existující seznamy CREG nebo vytvořit nové, které budou použity při analýze PRA a LABScreen jednotlivého antigenu, FlowPRA, LAT nebo analýze LCT. Seznam CREG změníte pomocí následujících kroků: 1. Vyberte možnost Obslužné programy > Aktualizace referencí > Správa informací o skupině CREG. Zobrazí se okno správy CREG. Obrazovka správy CREG

2. V rozevíracím seznamu Typ CREG vyberte existující skupinu CREG, nebo zadejte název nové skupiny do pole Nový typ CREG. Proveďte jeden z následujících kroků: 

Zadejte nové informace nebo změňte existující informace v poli Název skupiny nebo Podrobnosti skupiny a klepněte na položku Uložit.



Zvýrazněte řádek informací o existující skupině a klepněte na položku Odstranit skupinu.

3. Po dokončení vytvoření nebo změny skupiny CREG klepněte na položku Zavřít. Poznámka:

Před uložením data ověřte a nesměšujte v rámci jedné tabulky CREG alely ve starém nomenklaturním formátu s alelami v novějším formátu.



311


One Lambda, Inc.

Změna konfiguračního nastavení produktu Změny v nastavení analýzy produktu se vztahují pouze na vzorky, které nebyly dříve analyzovány. Dříve analyzované vzorky musí být znovu analyzovány, aby se změny uplatnily. V nabídce Konfigurace produktu můžete: 

Změnit konfiguraci produktu Micro SSP



Změnit konfiguraci produktu LABType



Změnit nastavení produktu pro smíšenou analýzu LABScreen



Změnit nastavení analýzy screeningu protilátek



Změnit výchozí záporné hodnoty séra pro analýzu LABScreen

Změna konfigurace molekulárního produktu Změny v nastavení analýzy LABType a Micro SSP se uplatní pouze na vzorky, které ještě nebyly uloženy ani potvrzeny. Chcete-li změnit nastavení analýzy pro dříve uložené nebo potvrzené vzorky, musíte změnit nastavení v okně analýzy produktu a vzorek znovu analyzovat. 1. Na domovské stránce LABType nebo Micro SSP klepněte na položku Uložit nebo vyberte možnost Obslužné programy > Konfigurace molekulárních produktů > Konfigurace molekulární analýzy v hlavní nabídce aplikace HLA Fusion. 2. V rozevírací nabídce Typ produktu vyberte buď LABType, nebo Micro SSP.

Nastavení konfigurace LABType a Micro SSP



312


One Lambda, Inc.

3. Změňte hodnoty konfigurace dle potřeby. 

Možnost Uložit páry s vynucením 1 uloží během analýzy páry s vynucením 1 do databáze. Páry s vynucením 1 jsou zobrazeny také ve zprávách, které obsahují tyto informace.



Možnost Umožnit automatické přijetí všech může být vybrána pouze osobou s uživatelskými oprávněními vedoucího a umožňuje výběrem tlačítka v souhrnu relace LABType přijmout výsledky analýzy dávky pro všechny vzorky.



Možnost Počítačem přiřazená sérologie může být vybrána pouze osobou s uživatelskými oprávněními vedoucího a automaticky vyplní pole přiřazení sérologie analýzy LABType a Micro SSP a také uloží výsledky do databáze. Je-li vybrána tato položka, zobrazí se výstraha připomínající, že přiřazení představují odhad a neměla by být přijata bez ověření. Výstraha automatického přiřazení sérologie

4. Uložte změny klepnutím na položku Uložit 5. Klepnutím na položku Zavřít


.

se vraťte do nabídky aktualizace referencí.


313


One Lambda, Inc.

Vytvoření kombinovaného katalogu relace LABScreen Chcete-li spustit kombinovanou relaci analýzy LABScreen třídy I a II, vytvořte pro použití při relaci kombinovaný katalog. Musíte použít katalogový soubor třídy I a katalogový soubor třídy II, které mají stejné pozitivní a negativní kontrolní perličky, avšak nemají žádné společné perličky. 1. V hlavní nabídce aplikace HLA Fusion vyberte položku Obslužné programy > Konfigurace produktů protilátek. 2. Klepnutím na položku Vytvořit kombinované produkty otevřete nabídku kombinovaných produktů. Kombinování katalogových souborů LABScreen

3. Vyberte první katalog produktů, který chcete kombinovat, a klepněte

.

4. Vyberte druhý katalog produktů, který chcete kombinovat, a klepněte na

.

Ve spodní části nabídky výběru se objeví název nového katalogového souboru. 5. Klepnutím na položku Uložit analýze LABScreen. 

uložte nový kombinovaný katalogový soubor pro použití při

Volitelné: Klepnutím na položku Vymazat resetujte výběr a začněte znovu.

6. Klepněte na položku Zavřít


.


314


One Lambda, Inc.

Změna výchozího negativního séra LABScreen Negativní kontrolní séra lze u jednotlivých produktů nebo šarží upravit. U každé perličky můžete jednotlivě změnit upravenou střední hodnotu fluorescence. 1. V hlavní nabídce aplikace HLA Fusion vyberte položku Obslužné programy > Konfigurace produktů protilátek. 2. Klepnutím na položku Nastavit výchozí negativní hodnotu séra otevřete obrazovku Výchozí negativní hodnota séra. Nastavení výchozí negativní hodnoty séra

3. Vyberte katalogový soubor. 4. Vyberte existující negativní sérum, nebo 5. Výběrem položky Přidat nový název NS z rozbalovací nabídky vytvořte nové negativní sérum. 6. Do pole Aktuální NS zadejte název pro nové negativní sérum. 7. Upravte výchozí hodnoty NS pro požadované perličky. 8. Klepnutím na položku Uložit změny uložte. 9. Klepněte na položku Zavřít.

Konfigurace smíšených produktů LABScreen

Změna konfigurace smíšených produktů LABScreen Můžete změnit nastavení pozitivních a negativních prahů smíšené analýzy LABScreen pro jednotlivé produkty nebo šarže. Při každé relaci analýzy pro daný produkt nebo šarži se použijí nové hodnoty prahu mezní hodnoty. 1. Na domovské stránce LABScreen klepněte na položku Upravit nebo vyberte možnost Obslužné programy > Konfigurace produktů protilátek. 2. Klepnutím na položku Nastavit konfiguraci smíšeného produktu otevřete nabídku Smíšená konfigurace LABScreen.



315


One Lambda, Inc.

3. V rozevíracím seznamu ID katalogu vyberte katalog produktu. 4. Upravte prahové hodnoty. U smíšených katalogů LABScreen lze prahové hodnoty nastavit na úrovni perličky. 5. Uložte hodnoty klepnutím na položku Uložit 6. Klepněte na položku Zavřít

.

.

Změna konfigurace analýzy screeningu protilátek Změny v konfiguraci analýzy screeningu protilátek se provádějí podle typu produktu a použijí se pouze na relace analyzované po provedení změn. 1. Na domovské stránce LABScreen, FlowPRA, LAT nebo LCT klepněte na položku [Upravit] nebo vyberte možnost Obslužné programy > Konfigurace produktů protilátek v hlavní nabídce aplikace HLA Fusion. 2. Klepnutím na položku Nastavit konfiguraci analýzy otevřete nabídku Nastavení konfigurace analýzy. 3. V rozevíracím seznamu Typ produktu vyberte typ produktu. 4. Změňte hodnoty dle potřeby. 5. Uložte hodnoty klepnutím na položku Uložit. 6. Klepněte na položku Zavřít.



316


One Lambda, Inc.

Import souborů NS Soubory negativního séra (NS) lze importovat tak, aby se na ně během analýzy mohlo odkazovat. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Konfigurace produktů protilátek. 2. Klepnutím na položku Import souborů NS otevřete nabídku importu souborů NS. Import souborů NS

3. Klepnutím na tlačítko procházet

najděte a vyberte soubory NS.

4. Klepněte na položku Importovat soubor NS. Když je soubor NS úspěšně naimportovaný, je uveden v seznamu Existující soubory NS. 5. Klepnutím na tlačítko Zavřít se vraťte do nabídky aktualizace referencí.



317


One Lambda, Inc.

Výběr všeobecných nastavení Můžete nastavit řadu všeobecných systémových nastavení včetně výchozích nastavení tiskárny a adres URL a cest. 1. V hlavní nabídce aplikace HLA Fusion vyberte položku Obslužné programy > Všeobecná nastavení. Zobrazí se dialogové okno Všeobecná nastavení.

Všeobecná nastavení aplikace Fusion

2. Výběry v tomto dialogovém okně proveďte pomocí rozevíracích nabídek nebo zaškrtnutím políček. 3. Po provedení všech výběrů klepněte na položku Uložit.

Výchozí nastavení tiskárny Na záložce Nastavení tiskárny v dialogovém okně Všeobecná nastavení můžete vybrat nastavení, jako je výchozí tiskárna a velikost papíru, která budou použita při tisku zpráv nebo tisku obrazovky.



318


One Lambda, Inc.

1. Vyberte možnost Obslužné programy > Všeobecná nastavení a klepněte na kartu Nastavení tiskárny.

Nastavení tiskárny

2. Pro panel Tisk obrazovky i Tisk zprávy dialogového okna vyberte z následujících možností: 

Chcete-li vidět při každém tisku náhled tisku nebo dialogové okno zprávy tisku, ujistěte se, že je vybrána možnost Ano. Jinak vyberte možnost Ne.



Nechcete-li vybírat při každém tisku tiskárnu, vyberte v rozevíracích nabídkách výchozí tiskárnu a velikost papíru.

Poznámka:

Tuto výchozí konfiguraci tiskárny lze přepsat specifickými vlastnostmi stránky určitých zpráv.

3. Klepněte na položku Uložit

.

Nastavení výchozích adres URL a adresářových cest aplikace HLA Fusion Možnost Adresy URL a cesty v nabídce Všeobecná nastavení umožňují nastavit výchozí adresy URL pro webové stránky OLI a NMDP pro stahování referenčních a katalogových souborů a pro aktualizace produktů. Tato možnost umožňuje také nastavit adresářovou cestu tam, kde se v aplikaci HLA Fusion implicitně ukládají katalogy, relace/dávkové soubory, zprávy atd. Změna adres URL nebo cest předem umožňuje vyhnout se procházení souborů pokaždé, když je potřebujete.



319


One Lambda, Inc.

1. Klepněte na položku [Upravit] v pravé části panelu Všeobecná konfigurace na výchozí domovské stránce aplikace HLA Fusion nebo vyberte možnost Obslužné programy > Všeobecná nastavení v hlavní nabídce aplikace HLA Fusion. Vyberte kartu Adresy URL nebo kartu Cesty.

Karta Adresy URL

Karta Cesty

2. Zadejte adresu URL a klepnutím na ověřte, zda funguje. U cest pomocí tlačítka procházení najděte adresář, který chcete použít pro určitý účel (např. kam chcete ukládat zprávy po jejich vygenerování). 3. Klepněte na položku Uložit

.

Aktivace produktů Možnost Výběr produktů v nabídce Obslužné programy umožňuje aktivovat různé produkty analýzy OLI, které mohou být použity s aplikací HLA Fusion. 1. V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Výběr produktů. Zaškrtněte nebo zrušte zaškrtnutí políček u produktu(ů), které chcete aktivovat nebo deaktivovat. Výběr/aktivace produktů

Klepněte na položku OK

.



320

One Lambda, Inc.


Ověření softwaru Software aplikace HLA Fusion disponuje funkcí podporující postup ověření požadovaný laboratořemi, klinikami a nemocnicemi kvůli splnění předpisů GCP, GLP a GMP. Ověření softwaru aplikace HLA Fusion pro vaše laboratorní prostředí z regulačních nebo výkonnostních důvodů lze automatizovat pomocí možnosti IQ (Způsobilost instalace) a OQ (Provozní způsobilost) v nabídce Obslužné programy > Ověření. Vaše laboratoř se může rozhodnout, že bude tyto postupy používat jako standardní regulační proces ověření při odstraňování potíží nebo k zajištění informací pro přípravu aktualizace softwaru.

IQ (Způsobilost instalace) Postup IQ vám díky zabudované funkci pomůže se způsobilostí instalace softwaru HLA Fusion. Po dokončení kvalifikace instalace bude vygenerována zpráva o výsledcích, kterou můžete uložit, vytisknout nebo vyexportovat do souboru Excel. Poznámka:

Pokud se vám výsledky IQ zdají problematické, vyexportujte je do souboru Excel a soubor zašlete e-mailem na oddělení podpory zákazníků OLI.

1. V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Ověření IQ. Spustí se ověřovací test. Po jeho dokončení se zobrazí zpráva s následujícími kategoriemi dat: 

Systémové informace (např. provozní systém)



Prostředí (např. cesta k adresáři, kam jsou ukládány soubory programu HLA Fusion)



Adresy URL (např. adresa URL stránek pro stahování katalogů)



Informace o databázi (např. název databáze)



Počet a typ instalovaných souborů (např. dll)



Informace o laboratoři (např. název a adresa vaší laboratoře)



Konfigurace analýzy pro jednotlivé produkty (např. nízký počet perliček pro analýzu LABType)

2. Výběr, zda chcete zprávu uložit, zobrazit její náhled, vytisknout nebo vyexportovat do souboru Excel.



321

One Lambda, Inc.


Vzorová zpráva IQ

Typická zpráva IQ

IQ (Způsobilost instalace) Postup IQ poskytuje zabudovanou funkci, čímž napomáhá při postupu způsobilosti instalace. Toto lze provést pouze v případě, že jste provedli postup IQ, který je vysvětlen výše. Kvalifikace instalace prochází řadou procesů kontroly kvality, které analyzují předem načtenou dávku a katalog, a porovnává je s předem definovanými výsledky. Po dokončení ověření instalace bude vygenerována zpráva o výsledcích, kterou můžete uložit, vytisknout nebo vyexportovat do souboru Excel. Pokud se vám výsledky zdají problematické, vyexportujte je do souboru Excel a tento soubor zašlete e-mailem na oddělení podpory zákazníků OLI. 

V hlavní nabídce vyberte možnost Obslužné programy > Ověření> Instalace (IQ).

Spustí se ověřovací test. Po jeho dokončení se zobrazí zpráva s daty týkajícími se činnosti aplikace HLA Fusion ve vašem počítačovém prostředí.



322

Uživatelská příručka Software HLA Fusion

Recommend Documents