Schrijven van een artikel
Rolduc, 4 februari 2009 Dr. Daniel Kotz Department of General Practice School for Public Health and Primary Care (CAPHRI) Maastricht University Medical Centre The Netherlands
[email protected]
Van idee tot publicatie • Observatie probleem • Onderzoeksidee • Subsidievoorstel (financiering project) • Dataverzameling • Data-analyse • Publiceren van de resultaten (artikel)
www.daniel-kotz.de
2
1
Doel van een artikel • belangrijke, nieuwe kennis delen – wat heb ik te vertellen? – voor wie is het interessant en hoezo?
• “output” van wetenschappelijk werk • CV onderzoeker – subsidies – persoonsgebonden beurzen
3
www.daniel-kotz.de
Onderdelen van een artikel • Titel • Pagina 1 • Abstract • Inleiding • Methode • Resultaten … www.daniel-kotz.de
… • Discussie / conclusie • Dankwoord • Tabellen en figuren • Referentielijst • Appendix 4
2
Titel • Belang van een goede titel • Informatief (trefwoorden PubMed) • Spannend • “Advertentie” voor het artikel • Beperkt aantal woorden; geen overbodige woorden
www.daniel-kotz.de
5
Pagina 1 • Auteurs – alle gegevens “corresponding author” – affiliaties alle co-auteurs
• • • • • •
“Running title” Trefwoorden Trial registratie Aantal woorden tekst, abstract Aantal tabellen en figuren Conflicts of interest
www.daniel-kotz.de
6
3
www.daniel-kotz.de
7
www.daniel-kotz.de
8
4
Abstract • Zeer belangrijk want meest gelezen! • Meestal max. aantal woorden 250 • Structuur als artikel: – Inleiding – Methode – Resultaten – Discussie/conclusie
www.daniel-kotz.de
9
Abstract • Soms ook: – “what is already known” – “what does this study add”
www.daniel-kotz.de
10
5
www.daniel-kotz.de
11
www.daniel-kotz.de
12
6
Inleiding Trechter: • Overkoepelend probleem (“background”) • Specifiek probleem • Bestaande kennis/lacunes (referenties) • Heldere probleemstelling • Heldere doelstelling/vraagstelling www.daniel-kotz.de
13
www.daniel-kotz.de
14
7
www.daniel-kotz.de
15
www.daniel-kotz.de
16
8
Inleiding Primaire vraagstelling RCT: PICOT: Patient Iintervention Control Outcome Time (follow-up) www.daniel-kotz.de
17
Inleiding Observationeel onderzoek… Cross-sectioneel onderzoek… Diagnostisch onderzoek… Kwalitatief onderzoek…
www.daniel-kotz.de
18
9
Methode • Setting • Patiënten (steekproef); in/exclusie • Interventie/controle • Observatie • Meetinstrumenten en meetmomenten • Ethische toetsing (?)
www.daniel-kotz.de
19
Data-analyse • statistiek • intention-to-treat / per protocol • missende waarden
www.daniel-kotz.de
20
10
Richtlijnen rapportage • RCTs: CONSORT • Observationeel: STROBE • Review: QUORUM • Meta-analyse: MOOSE • Diagnostisch: STARD • Kwalitatief onderzoek: – Kuper et al. BMJ 2008; 337:a1035 – Greenhalgh et al. BMJ 1997; 315:740-3 www.daniel-kotz.de
21
Data-analyse • complexe data-analyse methoden goed uitleggen • vooral gecorrigeerde analyses – multiple regressie – ANCOVA’s
• aannames voor tests vermelden – normaliteit (lineaire regressie)
www.daniel-kotz.de
22
11
Resultaten • Beschrijving steekproef – inclusie van deelnemers = figuur 1 (flow chart) – baseline gegevens = tabel 1
• Hoofdanalyses (primaire vraag) • Subanalyses (secundaire vragen)
www.daniel-kotz.de
23
Flow-chart
www.daniel-kotz.de
24
12
Baseline tabel
www.daniel-kotz.de
25
Presenteren van data • altijd aantallen vermelden, samen met percentages
www.daniel-kotz.de
26
13
Discussie / conclusie • Heldere opbouw! – terug naar onderzoeksvraag/doelstelling – hoofdresultaten – nadere beschouwing, vergelijking met andere studies – voor/nadelen studie – conclusie – aanbevelingen toekomstig onderzoek
• Wees kritisch t.a.v. eigen resultaten! • Geen over-interpretaties! www.daniel-kotz.de
27
Interne / externe validiteit • interne validiteit – selectie bias – informatie bias – confounding
• externe validiteit – vertaalbaarheid resultaten naar andere setting, patiënten, ziekten etc.
www.daniel-kotz.de
28
14
Interpretatie data • interventieonderzoek – effectiviteit (“efficacy/explanatory”) – doelmatigeheid (“effectiveness/pragmatic”)
• observationeel onderzoek – meer aandacht trekken conclusies – meer potentiële bias
• kwalitatief onderzoek – externe validteit?
www.daniel-kotz.de
29
Dankwoord • Subsidiegevers • Mensen die geholpen hebben hele proces
www.daniel-kotz.de
30
15
Tabellen en figuren • Tabellen en figuren – vanzelfsprekend! – opslagruimte voor veel gegevens – toelichting tekst (hoofdpunten) – nummeren 1 – x (chronoloog tekst) – voetnoten voor uitleg
• Tabel: titel boven • Figuur: titel onder www.daniel-kotz.de
31
Referenties • elke statement moet een referentie hebben! • letterlijk overgenomen tekst “tussen haakjes” • stijlen – Vancouver – APA – tijdschrift specifiek www.daniel-kotz.de
32
16
Referentie stijlen • Vancouver (geneeskunde) …as shown in the BOLD study.10
(10) Buist AS, McBurnie MA, Vollmer WM, Gillespie S, Burney P, Mannino DM, et al. International variation in the prevalence of COPD (the BOLD Study): a population-based prevalence study. Lancet. 2007 Sep 1;370(9589):741-50.
• APA (psychologie) …as shown in the BOLD study.(Buist et al., 2007) Buist, A. S., McBurnie, M. A., Vollmer, W. M., Gillespie, S., Burney, P., Mannino, D. M., et al. (2007). International variation in the prevalence of COPD (the BOLD Study): a population-based prevalence study. Lancet, 370(9589), 741750. www.daniel-kotz.de
33
Referentielijst • Gebruik EndNote etc. !!! – voordelen gebruik – beheer database met referenties (EndNote import vanuit PubMed)
www.daniel-kotz.de
34
17
Keuze tijdschrift • doelgroep • nationaal vs. internationaal • algemeen (medisch) vs. specialistisch • paper vs. elektronisch (open access) • tijdschriften organisaties (b.v. ERJ) • vergelijkbare publicaties tijdschrift? – check referenties in eigen artikel – voeg eventueel referenties uit betr. tijdschrift toe www.daniel-kotz.de
35
Keuze tijdschrift • Impact Factor – hoe hoger hoe beter (?) – hoe hoger hoe moeilijker te publiceren (BMJ accepteert 2%)
www.daniel-kotz.de
36
18
Keuze tijdschrift • eisen tijdschrift aan manuscript – type manuscript (original article, review, comment, letter to the editor) – max. aantal woorden abstract, hoofdtekst – max. aantal tabellen, figuren – opbouw (onderdelen) – referenties
www.daniel-kotz.de
37
Schrijven voorbereiden • data volledig verzameld, gecleaned, geanalyseerd? • primaire / secundaire doelstelling helder?
www.daniel-kotz.de
38
19
Outline maken • maak secties (inleiding, methode, resultaten, discussie) • werk met headings, subheadings, paragrafen, tabellen en figuren • hoofdpunten definiëren • subpunten definiëren • wat wordt de kernboodschap?
www.daniel-kotz.de
39
Tips om te beginnen • schrijf wanneer je geconcentreerd bent, stop wanneer je moe wordt • plan tijd in (planning, deadlines) • begin met inleiding! (abstract laatste) • schrijf in eerste instantie “erop los”; niet te gedetailleerd • schrijf snel, laat het lopen (“flow”) • laat je niet afleiden (door b.v. editing) www.daniel-kotz.de
40
20
Tips om te beginnen • houdt altijd kernboodschap en outline in gedachten • laat alles weg wat niet hiermee te maken heeft • wees consistent (vooral bij meerder co-auteurs)
www.daniel-kotz.de
41
Tips om te beginnen • het werk laten rusten (het slimme onbewuste) • oppakken, herformuleren totdat het “lekker loopt” • begin wat uitgebreider, kort dan in (let op max. aantal woorden tijdschrift)
www.daniel-kotz.de
42
21
Hoe ga ik verder? • laten rusten, opnieuw beginnen • co-auteurs – op tijd mailen – deadlines zetten – timing wanneer opsturen
• meerdere feedback rondes • “working paper” versie aan externe (niet co-auteurs) voorleggen www.daniel-kotz.de
43
Schrijfstijl • je schrijft voor een lezer! • denk aan je doelgroep! • schrijf voor iemand die je onderzoek niet kent! vermijd jargon! • schrijf dusdanig dat onderzoek gerepliceerd kan worden! • zo beknopt mogelijk, zo uitgebreid nodig • helderheid! www.daniel-kotz.de
44
22
Schrijfstijl • tijd: – inleiding: • probleemstelling: tegenwoordige tijd • bestaande kennis/lacunes: – feiten: tegenwoordige tijd – eerder onderzoek: volt. tegenw. tijd/verleden tijd
– methode/resultaten: verleden tijd – discussie: • hoofdresultaten: verleden tijd • beschouwing/extrapolatie: tegenwoordige tijd • conclusie: tegenwoordige tijd • toekomstig onderzoek: toekomstige tijd www.daniel-kotz.de
45
Schrijfstijl • gebruik van acroniemen – zuinig zijn; acroniemen gaan ten koste van leesbaarheid – eerste keer altijd uitschrijven! ook is het voor de hand liggen
“Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is characterized by…”
– hetzelfde geldt ook voor symbolen
“...were at increased risk of getting Alzheimer; Odds Ratio (OR) = 1.3, 95% Confidence Interval (CI) = 1.1, 2.6”
www.daniel-kotz.de
46
23
Schrijfstijl • beschrijving data / statistische tests – klinisch relevant – statistisch significant (p<0.05)
www.daniel-kotz.de
47
Schrijfstijl • publiceren in een andere taal (Engels) – feilloos taalgebruik essentieel – native speaking co-auteur? – ready-to-submit version laten checken – cursussen UM
www.daniel-kotz.de
48
24
Over (co-)auteurschap • International Committee of Medical Journal Editors (ICMJE) http://www.icmje.org • auteurschap gebaseerd op: – substantiële bijdrage design studie, verzameling, analyse en/of interpretatie data – schrijven aan / reviseren van artikel – finale goedkeuring voor submissie www.daniel-kotz.de
49
Voorbereiden submissie • op moment artikel klaar, niet meteen submitten • nog een keer grondig proeflezen – loopt het lekker? – alles logisch en duidelijk? – spelfouten corrigeren! maken slechte indruk
www.daniel-kotz.de
50
25
Voorbereiden submissie • Layouten van het manuscript – lettertype (Arial, Times New Roman) – lettergrootte 12 – regelafstand 2 – page breaks – paginanummering – versienummer, datum – marges www.daniel-kotz.de
51
Begeleidende brief • begeleidende brief – kort en bondig (wordt slecht gelezen) – 1-2 zinnen over relevantie publicatie – vermelden indien relatie met andere publicaties – overige belangrijke opmerkingen
www.daniel-kotz.de
52
26
Begeleidende brief To: ERJ, editorial board Reference: DKO/005/CL Date: 19 June 2007 Dear Editor, Please find enclosed our manuscript that we would like to submit for publication in the ERJ, entitled "External validation of a chronic obstructive pulmonary disease (COPD) diagnostic questionnaire in smokers". www.daniel-kotz.de
53
Begeleidende brief … In this article, we present results from the external validation of questionnaire which was designed by Price et al. to identify patients at increased risk of airflow obstruction (Respiration, 2006, 73: 285295). It has attracted considerable attention in the field and has been implemented in the guideline for chronic airways diseases of the International Primary Care Airways Group (IPAG). Before a new diagnostic questionnaire can be accepted and applied reliably in clinical practice, the analysis of the underlying model must be repeated on new data collected from an appropriate sample of subjects from a different setting. www.daniel-kotz.de
54
27
Begeleidende brief … We suggest the manuscript to be reviewed by other researchers than those involved in the development of the questionnaire (David Price, Ron Halbert etc.) as they may have a conflict of interest.
www.daniel-kotz.de
55
Begeleidende brief … Neither the work nor any part of its essential substance, tables or figures have been or will be published or submitted to another scientific journal or is being considered for publication elsewhere. We are looking forward to hearing from you. With kind regard, also on behalf of the co-authors, Daniel Kotz
www.daniel-kotz.de
56
28
Reviewers • preferred / non-preferred reviewers
www.daniel-kotz.de
57
Submissie • online • status manuscript • duur proces
www.daniel-kotz.de
58
29
Reviewer commentaar • soort commentaar • beantwoorden commentaar – begeleidende brief – point-by-point reaction
• toon van het antwoord • appeals
www.daniel-kotz.de
59
Afgewezen… en nu? • don’t panic! • afwijzingen komen vaker voor dan acceptaties (op alle niveaus) • een artikel wordt vaak 2-3 x ingediend • be a good loser
www.daniel-kotz.de
60
30
Afgewezen… en nu? • laat afgewezen artikel niet lang liggen • waaraan heeft het gelegen? – keuze tijdschrift? – kwaliteit onderzoek? – kwaliteit manuscript?
• eventueel verbeteren • her-submitten
www.daniel-kotz.de
61
Logboek bijhouden • overzicht alle publicaties • status van publicaties • weten wanneer reminder nodig is • weten wanneer welk artikel waar ingediend is • spreiding artikelen over tijdschriften
www.daniel-kotz.de
62
31
www.daniel-kotz.de
63
www.daniel-kotz.de
64
32
