JIŘÍ JIRÁT ELSEVIER FREELANCE TRAINER
1
SERVING THE LIFE SCIENCES SPACE ADDRESSING KEY CHALLENGES ACROSS THE R&D VALUE CHAIN Characterize targets & analyze disease pathways
Characterize & discover molecules Identify & confirm lead compounds
Drug Candidate Selection Discovery
Broader full-text indexing of biomedical content
Search full-text, peerreviewed journal articles
Translate preclinical data in humans (Translational)
Go-No Go Decision Pre-clinical
Monitor drug adverse events & real-world evidence data in literature
Preclinical Data Validation Clinical
Managing risk Post-launch
Text Mining & Data Integration
Integrate the world of data & solutions
Largest database for access to abstract & citation data
2
CO OBSAHUJE TYPICKÝ CHEMICKÝ DOKUMENT (PUBLIKACE NEBO PATENT)? Téma, autor Může být nalezeno fulltextově, ale je těžké najít správný termín
Chemické reakce Nejde hledat full-textově
Lze hledat full-textově, ale nikdo nechce číst celý článek, když ho zajímá jen tato sekce!
Experimentální postupy
Nejde hledat full-textově
Chemické struktury
Nejde hledat full-textově
Spektra
Nejde hledat full-textově
Látky a jejich fyzikálně-chemické vlastnosti 3
NÁVRH REAXYSU
Chemie jako organizační princip
REAXYS JE TVOŘEN
Experimentálními daty z článků a patentů
Fyzikální data
Fyzikální data
Spektra
Spektra
Data o bioaktivitě
Data o bioaktivitě
Přírodní produkty
Přírodní produkty
Reaxys
CHEMIE JAKO ORGANIZAČNÍ PRINCIP
Chemical Structures
Chemical Syntheses
Reaxys zpracovává všechna relevantní data, dokonce z poznámek pod čarou a z textu
Physicochemical Properties
Pharmacology
STRUKTUROVANÝ PRO LEPŠÍ HLEDÁNÍ JINÉ DATABÁZE REAXYS Katalogizovaný a taxonomizovaný chemiky pro chemiky
ESENCIÁLNÍ TITULY
BIBLIOGRAFICKÝ PŘÍSTUP
NAPŘÍČ ČASEM/LITERATUROU ROZOSTŘENÉ VÝSLEDKY USE-CASE DRIVEN DALŠÍ HLEDÁNÍ NUTNÉ
RELEVANTNÍ ODPOVĚDI
50,000,000 VRÁCENÝCH VÝSLEDKŮ
7
REAXYS ZAHRNUJE
Pokrytí literatury: 16 000psané periodik Patentový obsah: Anglicky patenty z hlavních chemických zatřídění z Pokrytí 1771 - současnost patentových úřadů USA, EPO, WIPO
REAXYS ZAHRNUJE
Přes 500 miliónů faktů Přes 400+ prohledávatelných datových polí VYSOCE KVALITNÍ experimentální výsledky
CO JE REAXYS 2014? OBSAH: MNOHO DATABÁZÍ V JEDNÉ
Bibliografická databáze >46 mil. záznamů (z ~16 000 časopisů plus záznamy z klíčových patentových úřadů)
Databáze látek > 78 mil. látek (celkem) ~ 57 mil. látek (unikátních)
Reaxys 2014 Databáze chemických reakcí > 36 mil. jedno- a vícekrokových reakcí
Databáze vlastností > 500 mil. experimentálních vlastností > 400 polí > 130 tematických oblastí
10
SEARCH • Jaké jsou možnosti hledání? • Látky • Reakce • Literatura • Vlastnosti • Co “inteligentní hledání”? • Truncation • Proximity • Algoritmická interpretace NLQ
HLEDÁNÍ REAXYS: JEDNODUŠŠÍ HLEDÁNÍ, VÍCE INFORMACÍ K OBJEVENÍ
Hledání v literatuře
Ask Reaxys, rychlé a jednoduché hledání podle ‘tématu’
Formulář pro hledání reakcí Prohlížení databáze pomocí taxonomie, než pomocí hledání
Hledání dat podle „vlastností“ Hledání podle chemických struktur
Hledání pomocí chemických identifikátorů
Přístup k detailním Biodatům, a specifickým vlastnostem pro MedChem
11
HLEDÁNÍ LÁTEK HLEDÁNÍ STRUKTUR, NÁZVŮ NEBO VZORCŮ – PLNÝCH, NEBO I ČÁSTEČNÝCH STRUKTURA
CHEMICKÝ NÁZEV
VZOREC
Formula Builder: snadný způsob, jak najít sloučeninu pomocí periodické tabulky
As Drawn Substructure Similarity
✔ ✔ ✔
Chemical Name Part of Chemical Name Našeptavač Reaxysu
Formula ✔ ✔ Part of Formula ✔✔ Nápověda Reaxysu
✔ ✔ ✔✔
12
HLEDÁNÍ REAKCÍ HLEDÁNÍ PODLE STRUKTUR, DAT, NEBO TYPU STRUKTURA
DATA
TYP
Mapování atomů Tvorba/zánik vazby Hledání reakcí podle struktury Hledání reakcí podle reakčních podmínek ✔✔✔ ✔✔✔
Hledání reakcí podle typu nebo jména ✔✔✔
13
SEARCH LITERATURE CÍL: OBSAH LÉPE A SNADNĚJI VYHLEDATELNÝ Ask Reaxys
Reaxys Tree
Ask Reaxys zprostředkovává novou uživatelskou zkušenost z textového hledání: lepší vyhledatelnost obsahu,odpovědi okamžitě dostupné
ReaxysTree umožňuje uživateli „brouzdat“ databázi pomocí taxonomie: zvyšuje přesnost hledání a a úplnost odpovědí
Inteligentní interpretace dotazu ✔✔✔
Procházení taxonomie ✔✔✔
Možnost kontroly
Můžete hledat také pomocí truncation/proximity – jako v jiných rozhraních Možnost použití truncation/proximity ✔✔✔
14
HLEDÁNÍ VLASTNOSTÍ >500 MIL. EXPERIMENTÁLNÍCH VLASTNOSTÍ, >400 POLÍ, >130 TEMATICKÝCH OBLASTÍ PŘEDNASTAVENÉ
VYTVOŘTE SI VLASTNÍ
VLASTNOSTI ✔✔✔
snadné nastavit
OBSAH ✔✔✔
MedChem
POLE snadné hledat ✔✔✔
15
REAXYS 2014 PŘÍPRAVA LÁTKY
17
AUTOPLAN: AUTOMATIZUJE PROCES PRO SESTAVENÍ SYNTÉZNÍCH POSTUPŮ
18
REPORTY: POSBÍRÁNÍ A PŘÍPRAVA INFORMACÍ
19
JIŘÍ JIRÁT ELSEVIER FREELANCE TRANIER
20
