ISSN Volume 15 No.1 Maret 2001

ISSN.0215-2835

Volume 15 No.1 Maret 2001

A

.

.

WARTA BIOTEK XV NO.1

MARET 2001

KATAPENGANTAR Pada edisi Maret 200 I ini Warta Biotek mengambil tema tentang 'b ioteknologi hewan". Edi i kali ini diperkaya dengan bahan-bahan yang terkait dengan biotekno logi hewan dan Isu Biotek tentang peman faatan informasi genomik. Di sam ping itu, disajikan pula berita- berita rutin mengena i kegiatan biote knologi kumpulan artikel, naskah paten dan informas i tekn is koleksi terbaru Redaksi serta daftar buku bioteknol gi terbi tan terbaru. Berita dari In ternet menampilkan situs-s itus menarik yang berkaitan dengan biotekno logi. Redaksi tetap mengharapkan sumbangan artikel sem i populer dari semua pihak untuk d iterbitkan dalam Warta Biotek edisi mendatang. Tata cara penu lisannya dapat di li hat pada sampul belakang. Se lam at membaca. Redaksi

DAFTAR ISI Warta Biotek diterbitkan 4 x I tahun oleh Puslitbang Bioteknologi-L1PI. Mulai Vo l. 10 no. I, 1996 Warta Biotek memuat artike l semi populer bidang bioteknologi ata u yang terkait disamping berita-berita dan kegiatan bioteknologi dalam dan luar negeri. Wana Biotek diasuh oleh:

Redaksi Penanggung jawab: Kepa!a Bldang Jasa dan Infonnasi Puslitbang Bioteknologi-LiPI Redaks i Pelaksana: Ke tua A nggota

: M. Ahkam

ubroto

: Yantyati Widyastuti Tr i Muj i Ermayanti

u Biotek: Berbagai Aspek Pemant'aatan In('ormas! Ge nomik (l. l.C Atmosu\...arto ) ....

Artikel: - Manip ulasi Genom Hewan dengan Menggunakan Pendekatan Rekombinasi Ilomologus/Pcnlargetan Ge n (Ue. Almosukarto) . . ... ... .. .. . Membuat Sl lase: Upaya Me ngawetkan dan Me mpertahankan Nilai Nu tris i Hijauan Pakan Tcrnak (R . Ridwan & Y. Widya~tllli ) . .. - Difcrensiasi dan Pcmbentukan Otot Rangka pada I k wan ( '. M. Kaiin .. ... .. . ... ..... .

3

9 IS

Popu larisa.si Biotek: - . enJat ~ Baru Melawan £. coil (S Rah mawati) ..... .. .. . - Paten dan Bioteknologi (M.A. SubrolO) . - Biote\...nologi dan Negara Berkcmbang (T.M . Ermayanti)

21 23 27

Informasi: Kcterangan foto sampul depan: A. Inti spem1a tikus memasuki sel telur. B. Inti spenn a tikus selelah fertilisas i. C

permato zoa rik us .

(FOlO .

Syahrudd in aid)

• • -

Pene lilian dan Pengembangan . . ... ... .. . ... .. . . Terb itan Baru M~ngcnai Bioteknologl .. ...... . Beri ta dari Internet . .. ... ... .. .. Beasiswu .. . .. ... .. . .. ... .. Pertemuan Yang Akan Datang .. .. ..... .. . Kursu.sIPc lalihan Yang Akan Datang Pertemuan Yang Lalu ... .. .. .. .. ... . Tiniauan Buku Baru ... .. .. .. ..

Alamat Rcdaksi: Wat1a Biotek - Pusat Penclitinn dan Pengcmbnngan BiolckllOlog,i - Llt'l Jalan Raya Bogor Kill . 46. Kotak Pos Rogor 16004. Cibinong. l1ogur. Tclp. (U~ I) 875 1527. 8754587

Fax. (021) 875 4588. Email :

Warlabiolek ~~ h(}lmai l. colll

29

29 3_ 36

37 )8 38

40

ISU BIOTEK

BERBAGAI ASPEK PEMANF AATAN INFORMASI GENOMJK 1nes I. C. Atmosukarto Pu litbang Bioteknologi- LlPl

Sehubungan dengan dipublikasikannya ha il analisis pemetaan genom Illan u ia d i jurnal terkel11 uka Nature (15 Februari 2001), maka proyek Human Genome Proj ect (HGP) da n ana lisis genom secara umum diangkat sebagai topik isu biotek kali ini. JlGP merupakan stlatu kolaborasi multinasional yang dikoord inasikan oJeh ' Us. Department oj Energy ' dan "National InstitUle oj Health (Nfl!)" bertujuan untuk: (i) mengidentifikasi sem u gen pada DNA manusia (diperkirakan kurang lebih 30 000 gen); (ii) menetapkan ekuens ataa urutan dari sekurangnya tiga miJyar pasangan basa yang menyusun DNA manusia; ( iii) mengembangkan istem pangkalan data (daJabase) untuk penyimpanan infonnasi genorn ik; (iv) mengembangkan perangkat lunak untuk anaJisis/rnanipulasi infonnasi genomik; (v) mentransfer tekno log i dari akademisi/lembaga penelitian ke wasta; dan (vi) menyeJe aikan masalah etis, legal dan sosiaJ yang berhubungan dengan HGP . Sebagai proyek multinasiona l yang dibiayai oleh public fund. HGP menganut prinsip akses in fonnasi yang bebas. Hal ini ber eda dengan peru ahaan bioinfonnatika swasta seperti CeJera yang juga berhasi l mempublikasikan hasil p metaan genomnya pada tanggal 15 Febroari 200 I di maja\ah Science, yang didirikan sekitar tiga tahun yang lalu sebagai pe aing utama HGP. Kemampuan Celera untuk menyaingi HGP menggambarkan besarnya peranan perusahaan-perusahaan bioinfonnatika (yang didukung oleh dana yang umum nya besar) dalam penelitian ba 'ic ·ci~nce. Hal itu karena peru ahaan bioin~ nnatika umumnya menyadari besarnya potensi komersial yang dapat dipetik dari penelitian genomik yang dapat berupa perangkat lunak lisensi, konsultasi ataupun diagno lik. Sebagai gam baran, pangsa pa ar bioinformatika saat ini diperkirakan mendekati 1 milyar dolar US per t hun. Bioteknologi telah ampai pada suatu momentum yang bersejarah . Berbagai sequencing projects berlomba untuk menyele aikan pemetaan genom organisme-organi me yang umum digunakan di laboratorium lerrnasuk meneit, Drosophila melanogaster, Arabidopsis, dan aellorhabditis elegans . Hasil pernetaan tersebu t ibarat buku r ep yang menyimpan aturan -aturan molekLiler yang melandasi kehidupa n organisme itu. AtLiran itu perlLi diterjemahkan ' agar menjadi fondas i penelitian bioteknologi dan biomedikal di abad ke 2 1. Dengan berbagai infonnasi dan saran a yang tersedia, penelitian berfokus bukan lagi pada tingkat organisme ataupun tingkat seluler, melainkan pada tingkal moleku ler. Ram pungnya berbagai proyek pemetaan genom mencenninkan mu lai ditinggalkannya era genomik menuju era proteomik. Pendekatan proteomik ini bertuj uan untuk mem pelajarilmengidentifikasi pelaku -pe laku molek ul er (umumnya protein) yang menjalankan kehidupan seluler dan mekanisme dan pengaturan transduksi signal dari protein yang satll ke protein lainnya. Ap likasi penting dar i informas i genom ik ada pada bidang kedokteranlkesehatan (biomedical). Pemetaan ya,ng dilakukan HGP dapat memudahkan para peneJiti untuk menemukan mutasi -mutas i gen baru yang merupakan penyebab atau kontributor pada berbagai penyakit. Perusahaan-perusahaan bioteknologi telah menyadari besarnya pasaran tersebut dan bcrlomba untuk menciptakan uji-uji djagnostik untuk berbagai penyakit keturunan . Oleh karen a itu penguasaan infonnasi genomik (hak atas informasi tersebut) akan sangat menentukan kesuskesan (komersial) perusahaan- perusahaan lersebuL

VOL. 15 NO. I MARET 200 I

Dengan 'emak in banyaknya uji diagnostik genetik maka aturan penggunaan yang bertanggung jawab perlu dirancang sebab penggu naan inforrnasi yang tidak bertanggung jawab dapat berakibat diskriminatif seperti misalnya kasus dalam proses skrining lama ran pekerjaan ataupun untuk kepcrluan asuransi. Pentingnya pengaturan mcngingat efek dikriminatif tcrsebut tidak hanya akan mempengaruhi pribadi yang bersangkutan tetapi juga anggota keluarganya yang tentunya mempunyai komponen genetik yang sarna. Secara nyata, pemanfaatan informasi genomik di bidang biomedikal mempunyai dua tujuan yaitu untuk pengembangan tiildakan terapi dan tindakan preventif. Diidentifikasinya gen-gcn yang mendikte fungsi seluler yang kritis dapat membantu pengembangan terapi baru dengan prinsip rational dnJg design. Pendekatan ini menggunakan sekuens gen yang terkandung daJam DN A untuk mendapatkan kode urutan asam amino proteinnya. PengetaJman tersebut dilengkapi dengan informasi mengenai fungsi protein dan reglilasinya serta informasi mengenai struktur tiga dimensi protein untuk menciptakan obat-obat generasi baru yan g mempunyai target yang spesifik dan efek sampingan yang minim . Metode ini sangat berbeda dengan metode coba-coba (trials and error) yang secara konvensional di gunakan dalam pengembangan obat. Jenis terapi lain nya ya ng sal1gat potensial adalah terapi gen yang saogat berbeda dengan k loning yang akhir-akhir ini mendapat banyak sorotan dari medi a masa. Pada prinsipnya terapi gen bertujuan untuk memanipulasi ekspresi gen yang mengalami mutasi dengan tujuan untuk menyembuhkan atau mencegah suatu penyakit. Terapi jni membutuhkan tersedianya vektorlsistem delivery yang memadai seperti adena-associated virus, penghindaran reaksi dari sistem kekebaJan pasien dan ekspresi gen yang terkontrol. Sistem delivery ter ebut misalnya dapat digunakan untuk terapi yang mengg unakan protein seperti in ulin hormon pertumbuhan dan erythropoietin yang umumnya disuntikkan sehingga berbahaya, tidak praktis dan membutuhan biaya. Untuk pengobatan hemofilia mi salnya vektor yang membawa gen Factor IX dapat disuntikan pada sel otot untuk membuat sel otot tersebut memproduksi Factor IX yang akan meneegah pendarahan. erapi semacam ini akan menghindarkan penggunaan sunlikan yan g berulang- ulang dengan produk yang dapat merupakan sumber penyakit mcnular seperti hepatitis dan HIV. Terapi j enis ini sedang dalam proses pengembangan, beberapa telah memasuki tahap uji klinis. Oleh karena itu, dengan semakin banyaknya informasi genetiklgenomik maka target­ target untuk terapi gen ini akan semakin banyak . Maraknya manipulasi genetik dan semakin banyaknya informasi genetik yang tersedia telah melahirkan berbagai permasalahan etis, antara lain perlunya pengaturan akses dan kontrol inforrnasi genelik milik pribadi dan pengaturan penggunaan inforrnasi tersebut. Pengaruh pengetahuan informasi genetik terhadap k hidupan eseorang juga perlu dipertimbangkan, termasuk pada persepsi masyarakat luar terhadap individu tersebut. Aturan-aluran diagnosis genetik perlu diperjelas dan sektor kesehatan perlu disiapkan terutama dalam pemberian penyu luhan kepada orang tua. Hak orang tua untuk melakukan tes genetik pad a anak mereka untuk mendeteksi penyakit-penyakit yang bersifat lale onset j uga perlu dipertimbangan mengingat be arnya beban psikis yang akan ditimbulkan pada orang tua dan anak tersebut. Akhir kata, di era komersial yang penuh persaingan ini, pertanyaan yang sangat mendasar adaJaJ1 adakah yang berhak memil iki/m nguasai gen ataupun bagian-bagian DNA lainnya. Pertanyaan tersebut memang tidak mudah untuk dijawab, namun patut dipertimbangkan baik oleh para peneliti, maupun oleh pihak komersial. Sumber: Human Genome Project Information (http://www.ornl.gov/hgmis/)

2

WARTA BlOTEK

ARTIKEL

MANIPULA I GENO M HEWAN DENGAN MENGGUNAKAN PENDEKATAN

REKOMBTNASI HOMOLOGUS/ P NTARGETAN GEN

Ines Irene C. Atmosuk rto

Pusli lbang Bioteknolog i - LlPI

E-mail: inesa rio ind .neLid

Ringkasan

Tcknologi pentarget n gen dengan pendekatan rekombinas i homo logu telah Illcmungkinkan diclptakannya meneit dengan mutasi yang spesifik pad a lokus tertentu . emua I-egiatan manipu lasi DNA dapat dilakukan seeara in vitro dengan menggunakan el yang ber ifat pluripotensia l yang dikena l dengan nama sel ES (Embryonic Stem). Dengan perantaraan vektor pentargetan yang dirancang eeara khuSllS, mu ta i yang diinginkan dapat disis ipkan ke dalam DNA sel ES . Sel ES ini kemudian menjembatani peneiptaan meneit pembawa mutasi ter ebut berkat kemampuannya untuk menkoloni asikan organ reprod uksi mene il sete lah pengembaliannya pada em brio tadium blaslo is . Denoan beberapa tahap pengembangbiaka n maka meneit hetero igot dan hom osigot untuk mutasi tersebut dapat dip roleh untuk kemudian dianalis is lebi h lanjut. Pentargetan ge n sangat bermanfaat untuk pene litian fungsi gen da n juga untllk menghasilkan bahan penelitian penya"it menuru n sepert i mencit pembawa l1lutasi tertentu yang diketahui menyebabkan penyakit-penyakit keturunan pada 111 nu ia. Katu kunci: rekombi nasi h mo loglls (homologous recomb;lIat;on), pentargetan gen (gene targe ting), DNA,

eklor, e l ES. Pendabuluan

Manipulas i genelika genom mene it Le lah ban yak dilakukan da­ lam 15 Lahun terakhir in i. Re kom­ binasi ilo mologlls Le lah diper­ kcnalkan kurang lebih satu dckade • ang lal u. Pe noekatan in i telah han)al- dirergunal-an untuk memrl.!lajari fung i gen dcngan iolon I11cngh ilangkan fungsinya . Pen Iitian in i umul11 nya d ilakukan d ngan I11cngana lisis fe notip yang Jiakibutknll oleh hilangll ya fu11 '7si gl.!l1 pada men ·it. Yang pertama J itelili adalah akibat d ri peng­ hilullgun fungsi gen pada fertilitas

VOL. 15

O. I MARET 200 I

mcneit dan perkcm bangan 1.::111 bri o ba ik pad a tahap heteros igot mau ­ pun h mos ig 1. Jika gen tersebut terbukti ti dak mutlak dibuluhkan untul- kedua proses Lersebul maka aI-an dilanjutkan dengan penel ili­ an yang leb ih p sifil- pada meneit dewasa . ludi yang dapat dil akllkan antara lain meli puti proses-proses fi siologis da n per­ kem bangan, serta proses d iferen­ siasi se l akibat dari hilang nya fungsi gen. Kegu naan lai n dari teknol g i pentargetan gen adalah un tu k memproduk i meneit den an muta i te rtentu sebagai mode l untuk studi enyakit

menurun yang ull1 umnya d ite l11 u­ ka n pada manlJsia. Teknologi pentargetan geo

Teknologi pentargetan gen b rtujuan un tuk memp rod uk i menei t heterosig t dan homo igot un tuk mutasi yang sangat spesifik pad a lok ll tertentu. Jen is mutasi yang paling UI11 UI11 adalah unt ll k menghi langkan fungsi gen dcngan cara menghilangkan ekson ter­ tentu (u mumnya ekson yang terletak pad daerah 5' dari I kus yang d it uju) atau dengan me­ nyisipkan se-kllen DNA asing

3

(umumnya marka resistensi untuk antibiotika) untuk mengaeaukan sckuen eDNA yang ditarg tkan. Semua kegiala n ma nipulasi DNA dilakukan dengall menggu­ nakan sel Embryonic Stem (sel ES). Proses penghilangan fungsi gen pada el - S diakibatkan oleh proses rekombinasi homo loglls yang terjadi pada saar slIatu frag­ men DNA eksogen yang di­ tran fer dalam sel ES (an tara lain dengan teknik elektroporasi) dapal mengidentifikasi sekuen DNA yang homolog (sam a) pada genom sel, untuk kemudian diintegrasikan dengan cross over menjadi bagian dari genom/ DNA sel tersebut. Dengan dem ikian rragmen DNA eksogen dapat d iraneang wltuk mentargetkan lokasi-Ioka i yang sangat spesifik pada kromosom meneil. DNA ek ogen itu disebut sebagai vektor pentargetan. Veklor tersebut ter­ diri dari ekuen DNA homologu marka DNA un tu k selek i (umumnya gen pembawa resis­ lensi tcrhadap antibiotika tertentu) dan sekuen plasmid untuk me­ mudahkan manipulasi dan am­ plifika i DNA . Vektor in i d ikon­ truksi dengan tcknologi DNA re­ kombillan standar dan memer­ lukan karakterisasi sekuen DNA genomil... dari lokus yang dituju .

Vektor peotargetan eperLi yang tcrtera pada Gambar I ada dua maeam vektor pentargetan . Yang pertama di ­ k nal sebagai vektor pengganti (replacement vector) (Gam bar

4

[kson

A)

Eksoll

I Irui targt't

B)

1::1 son

Lokus

hll"gt't

><

Vt'ktor sisipan

Gambar I.

Desain vektor pentargetan.

I A) dan yang kedua adalah vektor sisipan (insertion vector) (Gam­ bar I B) . Vektor pengganti diran ­ eang dengan tujuan untuk meng­ h ilangkan sebagian dari sekuen DNA pada lokus yang ditargetkan dan menggantikannya dengan gen resistensi terhada p antibiotika. Vektor ini perlu dilinearisasi di luar daerah homologi dengan menggunakan enzim restriksi ebelum elektroporasi. Pcnyi­ sipannya dalam genom sel ES memerlukan dua kali cross over. Vektor sisipan berfungsi untuk menyisipkan gen resistens i ter­ hadap anlibiotika ke dalam ekson tertentu untuk mengacaukan sekuen DNA ekson ters bu t. Untuk itu vektor dilinearisasi di

daerah homologi dan inte­ grasinya hanya memerlukan atu kali cross over. Ada dua pcrkembangan Lekllologi yang t rjadi dalam satu dekade terakh ir ini yang me­ mungkinkan pendekatan pentar­ getan gen untuk studi fungsi gen pada mencit. Yang perta ma ada­ lah diisolas inya sel embrio meneit yang dapat dikulturkan secara in vitro tanpa meng-hilangkan sifat pluripotensialnya yang dinanlakan sel ES (Evans & Kaufman, 198 1; Martin, 198 1). Sifat pi uri­ potensial ini menggambarkan ke­ mampuan se l ES untuk ber­ diferensiasi menjadi jaringan atau organ meneit lermasuk organ reproduksi, walau pu n telah di-

WART A BIOTEK

kulturkan dan dipr servasl eeara krio (Bradley e( 1.1/, 1984). el ES diperoleh dari daerah I M (inlier cell /lUlSS) pada embrio la­

L\ ,\ IPI'I..\SI • EI~kl l " l loraSi • Selc~,i Anlih,.1Iib • "klllln, ". I Icl~,"b l ll il" h 1111010';'" I,"II~.", reR III," Smllhe' " Iliol

hap blast si .

• " ,"~ 1" tv fl ln g

Sete lRh dikultur­

kan, .e l t rsebut dapat dikcm­ balil,a n ke da lam blaslosi r si­ pien yang I..ernudian dilran fer ke induk lainnya sehingga dapat me lanjutkan pe rkernbanga nnya eeara in vivo . etelall uilahirkan. umbangan scI E pada per­ kcmbangan mbrio dapat diukur berdasarkan tingkat kimerisme pada bul u mencit. Hal itu di­ mungkinkan karen3 bla tosi yang digunai
S.

biakan

Dengan Illeng mbang­ meneil II. imera mah.a

inC, rmasi genetik (D A) dari se l E, dapal disumbangkan kepada

mcneil berikutnya e­ hingcra dapal diha ilkan meneil

generasi yang

Ill cmiliki matcri yan h ra al dari el E .

genclik

ft

Per"-emban ran yang kedua berh II btl ngan dellgan d i laporkan­ n)" fenomenn reI.. Illbina i 11\ 1110­ logus padael E (Thomas & a­ peeehi, 1987: Doetschmall el a/. , 1987). Dengan demil.ian manipu­

Ie iDA dapat c1ilakLlkan eeara dengan m nggunakan sel E dan berbagai

in l'ilrO dan terkontrol

V L. 15 N

I MARE 2001

• El.-sII:m

I

sci

a t .. Sci FS

00,,"'" blastosis

- "'nil klloprc"il.!l"\ rl.~ i

MIKROINJF.K·I

,\

AL' IS

E~IBIU()

KIMER,\

N(1l1"~Jmern

killlera l i n~g.f

y

P~nI!Mnb"ngb i "k.n

killlt:r.... rt.:ndah

kimo .... lIenlln n pcrscntase tinggi

~X ~

. '/~; ~

~Ai0 ;b-I+J

~

hJen" ,k."

ambar 2.

hllm",,~olll.n~."

rnt

:" IOU

<;uulllcm 11101

' I..cmalit.. l..egiaLan unlul.. penlargctan gcn

muta i dap. I disisipkan pad a ge­ nom sci E Gambaran singkat dari J...e­ giatan p nelitian yang perlu di­ laku kan untuk memproduk i mcn ­ eil yang t lah dimanipu la i secara (yenetik dengan pendekatan re­ komb inasi homologu dapal Jil ihal pada Gambar 2. Tahap pertama men angl..ut desai n vektor yang akan dipergll­ nakan . Untllk menghasilkan vek­

tor ter ebut diperlukan fragmen

DNA genomik dari lokus yan g di­ targetkan yang telah dikarak­ terisasi . U mumnya sumber DNA ter ebut bersifat isogenik dengan DNA sel ES yang dipergunakan . Vektor di transfe r ke dalam sel ES dcngan cara elektroporasi dan se l yang berha il di lransforll1 as i dise­ leksi dengan mengg una kan anti­ biotika )Ia n ) se uai. Jika vek tor 'elah ter integrasi menjadi bagian dari genom el, Illaka se l tersebut menjadi re~iste n terhadap antibio-

5

tika tersebllt dan memben tuk SlI­ atu kolon i. Adaplill integra i t r­ sebut dapat berlang ung dengan dua cara yaitll secaI'a random dan rekombina i Ilomologus, Karena komp Jeksnya genom me ne it l11 aka s bag i n besar dar i integrasi me­ lalui jalur yang pertam a, sehing ra peril! dilak ukan skrining lI ntuk mengident ifikasika n se I res isten yang dihasilkan d ngan ja lur re­ komb inasi hOll1o logus , Kolon i yang diben tuk oleh sel ES mu dah dilihat d ngan mi kroskop. Kol oni tersebut kemud ian d iamb il satu per satll dengan mt: nogunakan ll1i­ kropipet, di llra i\" an menj ad i us­ pens i se l dengan menggunakan tripsin dan dieks pansi kan de ngan ku llur menggllt akan 2.J-we l! fray. Jumlah ko loni yang diamb il bia­ allya dipi lih antara 300-600, Karena langkanya fenome na re­ kombina i homologus maka pe rlu pengllj ian sampel yang ukup banyak . 'ete lah kult ur dinilai men uku pi maka DNA diekstrak­ ikan lI ntlik seliap ampel dan dianalisis dengan menggunakan outh0fll blot atau P R. Untuk mcmudahkan proses skri ning ini maka veklor perlu diranca ng se­ hingga integrasi dal am genom dcngan jal, n reko m inasi h01110­ logus a\"an me nghas il kRn suatu aIel yang mudah didetek i dengan ara-cara terse but d i atas. Parameter yang mempengaru hi rekombinasi bomologus

Ada be berapa parameter ya ng telah diketah ui mempenga­ ruh i fre kuen i rekom binasi hom o­

6

logus dalam jenis percobaa n ini, antara la in: I. Penggunaan DNA isogen ik un ­ tuk menciptak an vektor pe n­ targe t:1 n. Ha l ini sangat pen­ ting se perli yang di uraikan oleh van Deursen & Wierin g,a (1 992) da n Deng & Cap cehi ( 1992);

Panjangnya seku n DNA homo logus. Panjang ter cbut se­ ca ra idea l diharus kan min imal 2 kb karena frek tt ensi reko111 -binasi homologlls diketahui menin gkat seeara eksponensia l dengan men ingkatnya panjang sekuen homo logu (H asty el al. 1991 ; Deng & Capecc hi, 1992); 2. Jenis · e l E yang diper­ gunakan dan kondisi kultur sel pada sa at transfer DNA. Diketah ui bahwa sik llls ku ltllr sel S dapat mempen garu hi frekuen i rekombinasi ho mo­ logus sehingga se l ya ng sik lusnya cepat mempun ya i t ingkat rekom bi nasi yan g lebih ti ngg i (Udy et al ., 1997). Dengan dem ikian kond isi kl1 ltllr sel perl u diperhatikan untuk memmjang siklus sel yang optimal. 3. Umli mnya panj an g DNA as ing yang diin trod uksi ke dalam ge­ nom atau pun panj ang DN A yang tere liminasi ti dak mem­ p ngaruh i fr kuen i rekom ­ binasi hom logus (Mansour et 01.• 1990) .

Parameter la innya ya ng sa­ ngat mem pengaruhi keberhas il an tekno lo i pentargetan DN A adala h kesuksesan se l ES lIn hlk mengk lo nisasikan organ-orga n

reprodl1ksi he\' an kimera. kar na itu s cara langs ung akan mem­ pe ngaru h i kesu ksesan trans fe r informasi genetik dari h wan kime ra ke ge nera i berikut nya untuk men ghas ilkan hewan yang hcterosig 1. ahap ttl t mem­ butu hkan waktu dan biaya yang cuk up banyak karena menyang­ kllt perkem bangbi akan meneit untllk mengiden tiftkasikan he­ wan hClerosigot. Yang pa ling penting adala h penj agaan kultur sel ES yan g mcm bawa mutasi (se l ya ng telah tertargetkan) untuk menjaga gar tidak kehilangan i­ fa t pillri p tens ia ln a. Penurunan kolonisas i organ reprodu ksi se­ rin g disebabkan oleh abnormalitas pada kromo om sel S terutal1la trisomi kromosotl1 8 (L iu et al., 1997). Penurunan kua li tas sel ES juga diak ibat kan 01 h kultur yang berkepanjangan dan pen ingkatan j um la h passage pada waktu peng­ ku lturan (Nagy el aI. , 1990) . Akhirn ya bahan yan g dipergu tla­ kan lI ntuk ku ltll r sel ES j uga pe rlu diskrin ing de ngan ketat kare na fakto r- fa kto r difere nsias i yang da­ pat l11enurunkan sifat pili ripote n­ sial sel ES sering mengkontam i­ na i serum yang digunaka n un tuk kul lur. Oleh karena itll media dan serum yang dipergunakan umum­ nya di pe iftkas ikan untuk ku ltur se l ES. Manfaat

Te knologi pentargetan gen m mpunyai man faat yang sangat besa r bukan saja untuk studi dasar r ttlg i gen tetap i j uga untuk

WARTA BIOTEK

mengha ilkan mene it yang mem­ bawa mutasi tertentu yang di­ ketah ui menyebabkan penyakit­ penyakit keturu nan pada manusia. Gen yang menjad i sasaran teknologi 1111 banyak yang merupakan ge n yang diprediksi mempunyai fu ng i yang penting untuk perkembangan embrio. ayangnya, seringkali p ng­ hilangan gen tersebut pada em brio menyebabkall letalitas pada tahap awal embriogenesis ehi ngga tidak dapat dihasilkan hewan yang homosigot. Umurnnya pe­ nelitiall ini kemudian berfoku pada analisis ~ notip embrio mutan sebelu l11 terjadinya abortus. Anali is in vitro juga dapat di lakukan dellgall menggunakan pendekatall d ife rens iasi sel ES ill vitro. Pendekatan ini umulllnya digunakan untuk studi gen yang penting untuk pro. e hema­ topoiesis (p mbentukan se l darah, baik limfo it, se l eritroid ataupun sel mieloid) karena lingkat kesuksesan metod logi untuk diferen iasi el E in vitro untuk menghasilkan sel dara h tersebul 5a11gat tinggi . Pendekatan lainnya adalah den an menggllnakan vek­ tor pentargetan unluk menghasi l­ kan (;onciilionalllwlal1ls atau mu­ tasi )nng dapat diinduksi ll ntuk ha-Ilya mempengaruh i organ tertentu dengan menggu nakan sistcm ere.-Lox (Galli-Tal iadoros el £II. , 1995), Apapun jenis vektor yang dipergunakan, ataupun sistem anal isis yang dipilih, ma nfaat teknologi ini sangat besar. Para peneliti tidak lagi t rgan tull g pada

VOL. 15 NO. I MARET 2001

hasil mutas i eeara random (random mutagene 'i ) atau mutasj alami lI ntuk me neliti fll ngs i sualll gen . Tekn log i ini sudah diman­ faalka ll sangat lua . COlIJpendium o/ lmockouts yang dipllblikas ikan pada Lahllll 1995 sudah meli puti kurang I bih 300 gen yang telah ditargetkan (Brandon el £II., 1995) dan sejak itll jumlah laporan penggunaan tekno logi ini me­ ningkat tajam dan III ncapai ra­ lusan publika i per tahun, seperti d iinformasikan pada situs hltp:/­ /www.b i -sc ience.org/knocko LI tJ­ kno home.htm. Pcnutup

T kno logi penlargetan gen berpotensi sangat tinggi un tuk pe­ ne li tian dasar yang bertuj uan un­ tl1k menel iti fu ngsi gen tertentu. Dengan ter ele aikannya Human Genome Pro] c.:l dan ditcmukan­ nya berbaga i gen yang belum di­ ketahu i fll ll g inya maka jeni pen­ dekatanin i dapat memban tu ka­ rakterisasi gen tersebut. Walau­ pun penelitian ini diketahui memakan waktu dan biaya yang cukup besar, prosesnya te lah dipercepat denga n adanya bank DNA yang mena, rkall DNA genomik untuk penciptaan vcktor pentargetan. sehingga skrining pli taka DNA genomik dan karakterisasi stru ktur gen untuk mendelcks i batas intron dan ekson tida" harus dilakukan oleh pen 1iti yang bersangkutan. D ngan kemajuan kloning untuk spesies temak b ar seperti api, domba dan bab i maka di­

harap kan b hwa pendekatan Inl aka n dapat d iterapkan untuk j ill S hewan elain menei t. Hal Inl da pat bermanfaat misalnya untuk III nghilangkan fungsi gen pada hewan terna k yang diketahu i m rugikan secara komersial se­ perti penghilangan gen cellular priol1 protein yang diketahui merupa kan sumber penyakit sapi gi la atau Bovine pongiform Encephalopalh . (SSE) . Kegunaan lainnya ya ng tengah diper­ juangkan oleh perusahaan bio­ teknologi negara maj u adalah penggllnaan tekno logi ini dengan tujuan modi fi kasi genom babi aga r organ hew3 n tersebut dapat dipcrgunakan un tuk xcnotrans­ plantas; (Tearle el a i , 1996 ). Pen rapan tek nologi pentar­ getan gen pada hewan ternak pada 3wa lnya menga lami kendala yang cukup besar terutama ya ng ber­ hu bungan dengan pengadaan sel E untuk jenis h wan lersebut. Adanya metodologi kloning dengan somatic cell nu lear tramjer memll ngkinkan peng­ gunaan sel somatik untuk tahap man ipul as i genetik sehingga pengadaan se l ES ti dak menjadi yarat yang mutlak lagi. Oleh karena itu, diperkirakan dengan semakin banyaknya kemajuan di bidang kloni ng untu k hewan temak penerapan tek nologi pentargetan gen akan semakin meluas. Daftar Pustaka Orad lcy. A .. M. Evans. M. II. Kaufm an & 1:. Robertso n. 1984 . 1'0l111at10 11 of genn -linc

7

chimaeras

from embryo-derived tcrntocnr­ cci llincs . Iitun: 09 : 255 -6. Brandon . EP . R.I .. Idzerdn & G.S. M Knight. 19<)5 . Targeting the mouse genome : a compendium of knockouh . Current Biology 5 (6) 625-881. Dcng. C. & M.R. Capecchi. 1992. Rec:x ami­ nation of ent: targeting frequ ency as a function of th ~ extent of homo logy between the targeting vecto r and the target locus . Molecu lar and Ce ll ular Bio logy 12 336 - -3371 Doc chman. T .• R J . Gregg, N. Maed a. M.l Huoper. D.W . Melto n. S. Thompson & O. Smith ies. 1987. T rgclIcd correction uf a mutant HPRT gene in mo use emhryoni c tcm cd l . Nature 330 : 576­ 578. EvnRS. M J & M H. Kaufman . 1981. Esta­ blbhme nt in culture of plu ripotenl ial cell s fro m mou e embryos. Nature' 292 : 154- 156. Galli-Tal iadoros_ L. A.. J. D. Sedgwick. SA Wood & II Korner. 199 -. G\:m: kno ck­ ou t technology: a methodological overview J(]f the interested novi ce . Jo urn al r Immunological Method. 181 : ~ i nom a

1- 15. lIasty. P.. J. Ri era-Perez & A. Urndlcy. 199 1. The length uf homo logy requi re d for gene targetll1g in c:mbryoni st m cells. Mo lecular
Mansour. S.L., K. R. Thomas. C. X. Dcng & M R Ca pecchi . 1990 . Introduction of a Lac Z reporkr gene in the mouse int-2 locus by hUlllolo ' OliS recombination. Proceedings of the Nation a.l Academy of Science S 87 : 768R-7692. Mart in. <.i .R. 198 1 Iso lation or a [ll uri po tcnt cell line from earl y mouse embryos cultured in mo;dium conditionl1ed by terdtoearc inOllla tcm cells. Proceedin gs of the National cadem y of Science SA 78 763 -1- 7638 . Nagy. A .. E. roczaq. E.M. Di az. V .lt Pri deaux. E. Iv anyi . M. Markku la & 1.

Rossant . 1990. Embryonic stcm cells al ol11.: an! c. pable to support fetal dcvel opment in the mouse. Development 110. g15-821. Thom as . K R. & M.R. Capecchi . 1987 . Site directed mutagenesis by gene targeti ng ill mouse embryo-derived stem cell . Ce ll 5 1: 503 -5 12. Tearl e. R G. M.J . Tange. Z. L. Zanncll ino. M . Katcrclo s. T. A. Shinkcl, B.l . Van Dendere n. A . J. Lon ie. I. Lyons. M B. ottle. T. Cox. C. Becker, 1\ M. Peura. P. L . Wigley. R.1 . Crawfixd. A.L Robins. MJ. Pearse. AJ d'l\picc. 1996. Thc al[1ha-1.3-gal actosyltrans fe­ rase knockout mouse. Implication for xcnotransplantation. ransplantati oll 61 : 13-9. lIdy. G B . B.D. Parkes & D.N. Well s. 1997 . S cell cycle rate afTects gene ta rget ing frequen cies. Experimental Cell Rest:arch 23 1. 296-30 I . van Oeursen. J. & 8 . Wieri nga. 1992 . Targeting the creatine kinase M ge ne in embryonic stem cells using isogenk and noni sogeni c vectors. Nu cleic Acids Res earch 20: 38 15-3820.

TELAH TERBIT

PROSI DING SEM INA R HASIL PEN ELI TIAN DAN

PENGEM BAN GAN BI OTEKN OLOGI III

Pemesanan prosiding dapal dilakukan mulai sekarang

dengan harga Rp . 60.000,- lermasuk biaya pengiriman dalam n egeri

H ubungi Sekreta r iat

Puslitba ng Bioteknologi - LIPI

J alan Raya Bogor Km 46, Cibinong

Telpon 021 875 4587

Fax. 021 875 4588

8

W ARTA BIOTEK

ARTIKEL MEMBUAT SILA E: UP A Y A MENGAWETKAN DAN MEMPERT AHANKAN NILAI NUTRISI illJAUAN PAKAN TERNAK Roni Ridwan dan Yantyati Widyastuti Pusli tbang Bioteknologi - LIPI

E-mail: ywidya tuti@ hotma il.com

Ringkasan Kekurangan hijauan merupakan masalah yang dihadapi peternak . Upaya pengawetan hijauan atau rumput khususnya menjadi silase merupakan solusi yang baik. Pembuatan silase atau ensilase melibatkan proses biokimia dan mikrobiologi. Untuk meminimalkan kegagalan ensila e banyak dilakukan penambahan additive atau tambahan yang meliputi inhibitor, stimulan dan sumber nutri i. Pro es ensilase dan tambahan yang populer dipakai diulas pada makalah ini. Kata kunei : silase, ensi Jase, hijauan , additive, bakteri asam laktat, mo lases, enzim .

PendahuJuan Petemak di Indonesia umum­ nya mempunyai permasalahan dalam pengadaan hijauan pakan terna!< khususnya rumpUl yang berkaitan dengan keterbatasan ketersediaannya. Selama ini me­ mang belum ada upaya menyedia­ kan rllmput yang dengan sengaja ditanam lIntuk memenuhi ke­ butuhan pakM ternak. Oengan kata lain kapasitas tampungnya, yaitu perband;ngan ketersediaan rum put dan kebutllhannya belum sesuai . Kesulitan penanaman rum­ put selain memerlukan lahan juga disebabkan oleh iklim Iingkungan tropis yang kurang mendukung. Pada musim kemarall keter­ sediaan air tanah untuk tumbuhan sangat kllrang seh ingga hasi I panen rumput j um lahn ya menurun

VOL. 15 NO. I MARET 200 t

dan kualitas nutrisinya rendall. Keseimbangan air adalah faktor iklim yang sangat mempengaruhi hasil panen di daerab tropis (peter & Fisher. 1984). Sebaliknya pada musim penghuj an rum put dapat tumbuh ubllr dan kandungan nu­ trisinya leb ih tinggi . Sayangnya, panenan rumpul egar tidak tahan lama apabila dis impan tanpa per­ lakuan . Tingginya suh l! harian lingkungan yang diikuti dengan tingginya kelembaban menyebab­ kan banyak mikroorganisme se­ perti bakteri dan jamur tumbuh ubur d:m berkembang biak pada rumput tersebut sehingga dapat menurunkan kual itas. Salah satu solusi untuk da­ pat menyediakan hijauan rum put yang kontinyu sepanjang tahu n adalah dengan cara mengawetkan­ nya menjadi silase. Silase adalah

produk hijauan rumpul yang di­ awetk 11 melalui prose fermen­ tas; . Asam laktat mengubah rum­ put menjadi a am ehingga dapat disimpan lama karena tcrh indar dari pembu ukan oleh mikroor­ ganisme pembu uk . Walaupun rasanya asam, silase disukai ternak karena ballnya harum kha asam laktat. Oi amp ing ilu nilai glzlnya hampir sarna dengan rumput egar. bahkan bisa lebih tinggi apabi la pada waktll pem­ buatannya mendapat perlakllan tertentu. ila e merupakan produk yang angat populer di negara­ negara yang mempunyai iklim 4 musim. Silase diberikan pada ternak pada musim dingLn , di mana pada aat itu tidak me­ mungkinkan untuk mendapatkan hijauan egar. Jadi ila e sudah

9

di iapkan pada musim lainnya. Teknologi pembuatan silase udah lama ada ya itu scjak J 50-200 SM. Teknologi tersebut tergolong ke da lam bioteknologi konven­ sional. Walaupu n demikian, sa at ini teknoJogi pem buatan silase terus dikembangkan di berbagai negara, karena peternak sudah merasakan manfaat silase, bahkan mungkin , tergantung pada silase . Di Indone ia masih terbuka kemungk inan unl uk mengem ­ bangkan teknologi yan g sudah ada dengan berbagai m difika i yang di esuaikan dengan kondis i Indonesia. Pembuatan silase mempunyai prospek yang baik karena meru pakan salah satu upaya .yang menunjang penye­ diaan h ijauan pa kan ternak rum inansia baik untuk peternak skala be ar maupun menengah (Parakkasi. 1999). Makalah ini mengul as pro­ ses p mbualan silase h ijauan dan additjve yang populer dipakai. Ensilase Se lama pro es pe mbllatan ilase (ensilase) terjadi pr ses fen n cntasi asam lak tat. Fermen­ ta ~ i le rsebut merupakan suatu pr )s\! pemanfaatan gu la terlarut alau pcngllraian glll kosa terl arut 01 h bakteri a am laktat ecara anaerobik ehi ngga menghasilkan a am laktat. Bakte ri asam laktat dapat dibagi menj ad i 2 kelompok menurul produk fermentasi yang di hasilkan. Kelom pok pe rtama, disebllt homofermentatif, yaitu bakteri a am lakta t yang men g­

10

gunakan g lukosa untu k men g­ hasilkan asam laktat dan yang kedua, disebut heterofen nentatif yang menghasilkan asam laktat dan asam lain se rta etanol ( chlegel 1986). Ensilase me­ merlukan kerj a bakteri asam laktat homoti rmentati f. Beberapa

lase. Kondis i anaerobik dalam si lo dapat dicapai apabi la rumput yang tel h di p tong berukuran kurang lebih 5 em dimasu kkan dalam silo dan dipadatkan atau semaksimal mu ngkin ditekan sehingga tidak terdapat udara di dalam silo.

abel I. Jenis-j enis bakteri asam laktat penting dalam proses ensilase (Sumber: McDonald, el aI., 1991 ). Jenis Lactobacillus acidop hilus L. coryniformis L. curvatus L. plantarllffl L. salivarius L. brevis L. buchneri L. fermentum L. vir ides ens Pediococclls acidilac/ic i P. damnos us P. pento aceus Enterococcus faecal is E. jaecililn LaclOcoccUS lac/is Streptococcus bovis Leuconoslos mesenleroides

bakteri asam laktat yang berperan dalam proses ensilase disajikan pada Tabel I. Tempat pembuatan silase (si­ lo) dapat berupa gal ian tanah (bunker), tong atau drum (tower), bak semen atau kantong plastik teba!. Silo yang bai k adalah tidak tembus udara sehin gga dapat mem pertahankan kond isi an aero­ bik selama proses pembuatan si-

Tipe fermentasi gluko a homofermentatif

heterofermentatif homofermentatif

homofermentatif homofermentatif homofermentatif homo fermentatif

Pembuatan silase berlangsung dalam 4 fase (Boisen et at. , 1995), yaitu : I . Fa e aerob Setelah rumput d ipotong dan dimasukkan silo, rumput me­ ngalam i respiras i dan proteo­ lisis. Respirasi merupakan pe­ nguraian gul a menj adi C~, H20 dan panas. Seeara

WARTA BIOTEK

simultan terjadi pula degra­ dasi protein rumpul oleh enzim protease menjadi asam­ aS8m amino, amonia, peplida dan amida. Fase ini ber­ langsung singkal, hanya be­ berapa hari setelah silo ditutup . 2. Fasefermentasi Setelah fase aerob berakhir dan kondisi anaerobik terca­ pai maka bakteri anaerobik mulai tumbuh. Beberapa mi­ kroorganisme sepert i jeni­ jenis bakteri dari El1tero­ bacteriaceae. Clostridium sp., kapang dan kamir akan berkompetisi dalam mcng­ gunakan karboh idrat terl arut. Dalam keadaan ini bakteri asam laktat harus bisa tumbuh subur dan menghasilkan a am laktat seh ingga dapat me­ nekan pertllmbllhan mil·..ro­ organisllle lain . Di anlara bakleri asam laktat hOlllofer­ mentatif dan hcterofermen­ tatif yang ada akan ber­ kompetisi seh ingga menenlll­ kan produk akhir fermentasi . Fase ini berlangsung antara 7­ 30 hari . 3.

4.

Fase slabil Fase 1111 tereapai ctelah bakteri asam laktat tumbull. Pada fase ini mulai terjadi penurunan pH dan aklivitas biologi yang terjadi pada fase ini sangat keeil.

panrm Pada saat pembukaan silo.

Fa.~e

VOL. 15 NO. I MARET 200 I

oksigen akan ma uk kc dala lll si 10 dan m ikroorga­ nisme aerob akan IUl1lbuh dan berkembang pesat. Mi­ kroorganisllle tersebut akan l11erusak kualila silase sehingga kehilangan gizi dan ti l11bulnya racun atau toksin yang membahayakan ternak yang mengkonsumsi silase terseb ut. Hal ini dapal diatasi dengan eara mem berikan silasc secepatnya pada ternak dan tidak mcmbiarkan silo terbuka lama. Henderson ( 1993) melll bagi ensilase menjadi 2 proses yaitu biokimia dan mikrobiologi .

c uaca

Pro es biokimia meliputi aktivitas respiras i, proteol isis dan enzim ­ enzim pemecah pol isakarida dari tanaman, sedangkan pad a proses mikrobiologi meliputi aktivitas bakleri asam laktat. Entero­ hacteria, kham ir. Clostridia dan kapang. Faktor-faktor yang mempcnga­ ruhi kualitas silasc

Proses pengawetan hijauan stau rum put menjadi silase ter­ gantung pada faktor-faktor bio­ log i da n teknologi yang saling berkaitan satu dengan lain nya (Gambar J). Um ur dan jenis hija uan ebagai bahan baku si la e akan

.......I----l~~



hijauan

hasil panen

rase kematangan

t

t

! pcnutupall Jan penyegelan Gambar

Faklor-fakt r yang mempengarllhi (Sumbcr: Boisen, (>1 aI., 1995) .

I.

kual itas silase

II

sangat menentukan ka ndungan bahan kering (BK), kandullgan gula dan kapasitas bufer yaitu ke­ tahanan terhadap asam . Tanaman jagu ng merupakan hija Ian yang ideal untuk dibllat sila e, semen­ lara a(falfa adalah hijauan yang paling sulit dibual sil asenya . Dibanding legum, rllmput biasa­ nya lebih ti llggi kandungall karbo­ hidrat terlarutnya dan lebih tahan pengasamall . Pad a cuaca yang baik, ba­ han kering hija uan akan me­ ningkat dan karbohidrat akan terkonsentrasi pad a bahan \...ering

kimianya yang tidak berbeda jau h bila diba ndingkan dengan bahan segarnya. Tabe l 2 memperli hat­ kan kompo isi kimia rumput rodes segar dan sila enya yang di bllat pada 3 macam suhu in ku­ basi yaitu 20. 30 dan 40°C (Ridla & Uchida, \998). Secara kuan­ titalif kompos i i kimia atau nilai nutri i ilase rum put tersebut se­ dikit menurun, tetapi masih ber­ tahan mendekati rumputegar­ nya . Walaupun demikian, tersc­ dianya silase terse but masih lebih baik untuk mempertahankan kondisi atau produh.tivita tcrnak .

' il kan. ifat dari zat-zat tambahall yang idea l ada lah man, dapat mengurang i kehllangan bahan keri ng (BK), memperbaiki kua­ litas ilase. menin gkatkan ni lai nutris i silase dan meneka n fer­ l11entasi sekullder yang dapat mengganggu proses ensilase (Hender on, 1993). Bol en tat., ( 1995) l11e­ ngelompokkan tambahan yang da­ pat menekan terjadinya femlen­ tas i seku nde r sebagai inhibitor, yang merangsang fermentasi asam laktat sebagai stimulan dan ebagai sumber- umber nutrisi

Tabel 2. Komposisi kimia rumpul !'Odes segar dan silasenya ( umber: Ridla & Uchida, \998) RUl11 put segar Sila e (20°C) Silase (30°C) Silase (40°C) Kompo isi 21,76 22,23 2 1,65 22,06 Bahan kering -*) 98,72 -*) -*) Bahan organik 10,38 9,89 10, 79 Protein kasar 9,49 28,15 erat ka ar -*) -*) -*) 65,34 64,22 64,56 66.42 NDF 39,44 39,15 40,51 38 , 18 ADF 3,59 7,14 3,5 7 3,92 ADL 2508 24,83 25,12 28.24 Hemiselulosa 36,94 3 1,04 35,52 35,56 elulosa \,06 5,01 0,95 1,06 WSC 67,64 68,32 67.27 IVDMD 69,10 . -*): ttdak ada data, NDF'neutral detergent fiber, ADF:acld detergent flher,WSC:waler soluble carbohydrate. IVDMD:in vitro dry matter didge libility. dan hal ini tidak telj adi pada cuaca yang 1idak baik . Pelayuan hijauan ya ng akan dibllat silase p rlu dilakukan untuk l11encapai kandungan bahan ker ing yang normal yaitu antara 25-45% (Bo isen, et at, 1995). Silase yang bagus kualitas­ nya dapat dilihat dari komp sisi

12

Tambaban (additive) pada pem­ buatan silase

Maksud dari penambahan zal-zat tertentu pada waklu pem­ buatan silase ada lah untuk memi­ nimal kan kegaga lan pada proses ensilase dan juga l11emperbaik i ni­ lai nutrisi dari silase yang diha­

untuk memperbaik i prose en ilase. Kelompok inhibitor me­ liputi berbagai asam dan bahan­ bahan kimia, kelompok stimulan terdiri dari inoku lan, berbagai enzim dan berbagai karbohidrat. edangkan yang termasuk kelom­ pok sumber nu tri si adalah ber­ bagai mineraL Woolford (1998)

WARTA BI0 EK

membedakan tambahan menjadi kelompok asan1, inhibitor. agen antibakteri yang spesifik dan st imlllan, Ke lompok stimulan me­ rupakan pendekatan biolog i yang paling popu ler dilakukan unruk merangsang perhlmbuhan bakteri asam laktat yang cepat atau mem­ buat dominasi bakteri asam laktat pada proses ensi lase, Stimulan yang ditambahkan dapat berupa inokulan, sumber-sumber karbihi­ drat atau enzim. Penam bahan en­ zim berfungsi lIntuk memecah komponen serat hijauan jadi akan menambah ketersediaan karboh i­ drat terlarut yang dapa t memper­ cepat pertum bu han bakteri sam laktat.

lnokulan bakleri asam laklat Berbagai produ k inokulan bakteri asam laktat telah dikem­ bangkan dan dipasarkan seperti Sil-All produksi Alltech yang me-ngand ung campuran L. planfarum. S. faec iuffl, p, acidiluClici, enzlln selulase, ami lase hemiselu lase dan (Meeske, 1998), Agros produksi Interprise Ltd, yang mengandung campuran bakteri asam laktat dan selulase, SAS5 produks i Micro­ ferm Ltd. yang mengandung L. plantarum, P acidilaclici, L. laclis dan bakteriofage clostridia (Johnson el aI., 1998) dan Snow Lact-L, yang mengandung L. easei (Ridla & Uchida, 1998). Penambahan inokulan bakteri a5am Isktat dimaksudkan untuk mencukupi popu lasi bakteri yang biasanya suda h ada pada rumpllt atau hijauan yang dibuat silase.

VOL. 15 NO. I MARET 200 I

Inokulan bakteri asam laktat yang ditambahkan pada hijauan di­ maksudkan untuk menjamin per­ tumbuhan bakteri asam laktat 10 5- J0 6 CFU (colony forming

bagai contoh, p ngaru h pe­ makairul inoku lan SASS terllad p kualitas s ilase Lalium perenne dapat dil i-hat pada Tabe l J. Salah satu keg iatan peneliti-

Tabel 3. Kom p sisi kimia silase Lolium perenne (Su mber. Johnson, el at, 1998) ko ntro l + SA55 Bah an kering (g/kg) 2 19,7 216,9 ME (MJ/kg BK) 9,27 9,30 PK (glkg BK) 163,3 149,1 pH 4,8 3 4,33 Amon iak N (% total N) 23,2 I ,3 TF A (g/kg BK) 95,0 79,5 Asam laktat (% TFA) 44,53 74,03 Asam asetat (g/Kg BK) 16,5 11,0 Asam butirat (glKg BK) 22,4 2,7 Me. energl terrnetabo lIs, Pk, prote m kasar, TFA : total asam ferm entasl.

unit) per gram hij auan (Henderson, 1993). Kr iteria kuhur bakteri yang dapat dipakai se­ baga i inokulan adalah (1) laju cepat dan pertum buhan nn ya dengan mampu berkompctisi m ikroorgani me lain yang bia a­ nya lum buh pada pembuatan silase, (2) homofermentatif (3) toleran terhadap asam dan dapat mencapai pH akhir 4 d ngan cepat, (4) harus bisa memfer­ mentasikan glllkosa. fruktosa, sukrosa, frukto an dan pentosan, (5) tidak memproduksi dekstran dari sukrosa atau manitol dari (6) tidak bereaksi fruktosa, dengan asam-asam orgru1ik, karena reaksi terhadap asam -asam seperti sitrat, malat dan suksinat akan menghambat pengasaman, dan (7) harus mempllnyai kisaran suh u tum bll h yang baik, terutama di atas 50°C agar dapat bertahan pada awal ens il ase (Whittenbury, 1961 dalam Woolford, 1998). e-

an yang edang d il akukan di Pus­ litbang Bioteknologi-UPI adalah memb uat inokulan si lase men g­ gunakan koleksi bakteri asam laktat yang ada. Dari hasil seleksi 50 iso lat bakteri asam iak at, Lactobacillus sp. 1A -2 merupa­ kan bakteri asam laktat un ggul untuk inokulan. Silase ru mput raja yang dihasilkan dengan menggunakan Lactobacillus sp. I A -2 sebagai inokulan me­ nllnjukkan kualitas silase terbaik dilihat dari kombinasi parameter yang meliputi pH, asam 1aktat, organoleptik kandu ngan amo­ niak-N dan karbohidrat terla­ rutnya (Yatno, 1999). Saat ini bakteri tersebut sedang dicoba dicampurkan dengan jenis bakteri asam laktat yang lain agar dapat lebill meningkatkan kualitas silase rumput gajah yang dihasilkan. Kegiatan ini dilakukan bekerjasa­ ma dengan petern ak sapi perah di desa Cisurupal1, Kabupaten Garut

13

ang membual silase jagung menggunakan inoku Ian tersebut. Sumber-sumber karbohidra/

Sumber-sumber karbo hidrat yang dapat dipakai sebagai ta m­ bahan pada pembuatan ilase ada­ lah molases atau tetes, whey. pulp jeruk dan kentang . Di antara ba­ han-ba han tersebut, molases merupakan salah satu sumber karboh idrat yang pal ing sering dipakai karena bermanfaat untuk hijauan yang rendah kandungan ka rboh idrat terlarutnya seperti legum dan rumput- ru mput dad daerah tropis (Henderson, 1993). Penambahan mo1ases sebanyak 20-30 kg per to n rumput pangola dapat meningkatkan populasi bakteri a am laktat homofer­ mentatif (Tjand raalmadja, el aI., I 994a). Sedangkan penggabungan molases dan legum telah pula dilaporkan dapat memperbaiki kualitas silase rumpu t pangola dan setaria (Tjandraatmadja, el al., 1994b). Enzim

Enzim -enz im pendegradasi dinding sel tanaman terutama se­ lulase dan h miselulase merupa­ kan tambahan yang akhi r-akhir ini mLilai populer di gunakan . Tam­ bahan inl biasa dikemas ber ama­ sarna dengan inoku lan bakteri a am laktat, atau beru pa produ k tunggal. Penambahan enz im pen­ degradasi dinding sel tanaman meningkatkan kualitas s ilase Italian ryegras~' (Kawamura, 1993), Ridla & Uchida (1998) menggunakan 2 maeam enzim selulase yaitu Acrernonillmsel u-

14

lase (enzim A, dari A remonium ellu'o ~yticus) dan Meise lase (enzim M. dari Trichoderma viride) bersama-sama dengan L. casei untuk pembuatan silase rumput rodes (ChloriJ' gayana) . Penambahan L. cas i + enzim selulase A dan M memperbaiki kualitas s il ase yang dihasi lkan , dilihat dar i nilai pH yang rendah dan konsentrasi asam laktat yang tinggi, tetapi kecemaan BK in vitro silase tersebut lebih rendah dibanding kontrolnya. Penutup

265 MCDonald , P.• A.R. Hen derso n & 5 1 . ,. Heron. 199 1. T he biochem istry of Silage. Cha lcomb.: puol ications. 2'''' ed.

Centcrb ury , K . Meeske. R. 1998 . The effect of an inocula nt on the preservation of a tropical gmss (£ragro.Ws cllrVIJ!a) and lu cc:me (MediL'a­ go sativa) in SOll th frica. Dalam ' Passport tu the year 2000 . BiClt.echno l ogy

Secara umum pem buatan i­ lase rumput tidal< sulit dan bahan­ bahan yang diperlukan tidak mahal. Rump ll t dapat ditanam se­ suai dengan kebll tuhan . Tempat pembuatan silase dapat dipilih yang sesua i dengan kondisi peter­ nak. Bak emen dengan luasan tertenlu mungkin yang pa ling sesuai denga n kondis i petern ak di Indonesia khusllsnya . Yang perlu diperhatikan dalam pemi lihan silo adalall yang dapat menjamin ter­ capainya kondisi anaerobik . 8a­ han-bahan ta mbahan dapat pula dipilih yang sesuai dengan selera dan kemampuan petemak . Se­ baiknya petern ak mencoba mem ­ buat silase dan merasakan man­ faatnya . Daftar Pustaka Boise n. KK .. G shbell & lM . Wilki nson . 1995 . Silage addit ives. D alam Biotec h­ nology in An im al Feeds Feeding. Wallace. RJ . &

10hn , 01l. f' N.. H F Grun d & A.P • ta n\\uy. 1998. T he effect of an in ocu l ant ild diti vc on th ~ ft:rmentariu n charac teristics or grass silage and hm' ine performance. Proceedi ng of the British Societ)· I f A nimal Science . Hal 144 Kawamura, 199J . Losses of the ce ll wall comr onents durin g ensil ing w ith and wi thout the cell wall degrading enzyme. Dalilm: Ge netics, bio chcrn i try alld ceo log.. of lignoce llul ose degradation. U ni publ is hers o. Ltd. him ad a. K.. S. !lushl no. K . hmiya. K . Sakka. Y. Kobay ash i & S. Kurita (Eds.) Hal. 262­

nd

nimal

A. Chesso n

(Eds.) VCII , We inhe im. Hal. 33-5 4 Henderson. N. 1993 . Silage addi ti ves. Animai Feed Sc ience and Technology, 45 :35-56 .

in the Feed Indm try. Proceedi ng of All tech 's 14'11 Annual symposium . HilI. 145 - 156.

PlUakkasi.

1999. IImu Nutrisi Mskanan Tem ak RUl1li nall sia. Univt:r; itns Indones ia

Press. Jakarta. Peter. R.G. & N .M . Fisher. 1984. isi{)lugi T nnamlll1 Bud idaya f ropik. TerjcmaJlan Tolm.i & Soedharocdji3n. Gajah Mada Uni versity P r~s YogyakarLa Ridl a. M. & S Uc hid a. 1998. Ef eelS ot' c mbincd treatme nt o f lactic acid bac teria and cell wa ll-degradi ng enzymes on fe rmen ta tio n ,lI1d com po iti on or Rhod 's­ grass (Chloris gayana K un th ) silage . As ian -Aust ralasian 10 umal or Ani mal Sciences vol I I (5): 522-529. Schl ege l, I1.G . 1980. General M icrob iol l1gy . S ixth edition Camhridge ni ersily Press . Camb ridge . Ho I. 274 -28 1 Tjand raatmadja, M . B. W. Norton & 1.(' Ma c rae . I 9 <,14 a. En sil age charac te ristic' of th ree tro pic al grasses a... infl uenced by stage of gTOwlh an d ad dition of molasse . Wurl d l oum al of Microbi ol ogy & Biotechnol ogy 10:74 -8 1 l J andraat madj a, M., B. W. Norton & I.e Mac Rae . 1994b. Ensil age of trop ical grosse mixed wi th legumes and mol asses. World Journ al o f M icrobi ol ogy & 8 io[l;Ochnol gy 10 82-!H. Wo olford, M.K 1998. 13aclcrinl devel opments: (hei r i mpl icat ioll;, for sil age product io n and a~ro bic stabili ty. Dulam : Passport to the year 2000 Biotechnology in the Feed In dustry . II tteh 's 14"1 A nnual Proceedi ng o f Sym pos ium. Ha l. 181-200. Yatno . 1999. Pcn Apisan bakleri a am Isk ull lakal untuK in okulan silas c .. es is pasca sarjana Institut Pcrtanian Bogo r.

WARTA BlOTEK

ARTIKEL DIFEREN IAS1 DAN PEM BENTUKAN OTOT RANGKA PADA HEWAN Ekayanti M. Kaii n

Pus li tbang Bioteknologi - LIP!

Ringkasan

Diferens iasi ada lah proses perubahan sel dari el embrio yang identik menjadi berbagai jenis sel yang berbeda akibat adanya determinasi sel. el otot adalall sekumpulan sel yang terspesial isas i un tu k berkontraksi. Diferensiasi sel otot dimu lai sewaktu el-sel prekursor bakal otot berubah bentuk menjadi mioblas yang kemudian berfu i membentuk tabung otot yang aklif m nsinte i akt in dan mio in. Protein kontraktil tersebut membentuk filamen kontraktil otot dan memenubi sitoplasma tabung otot sehingga terbentuk serabut otot. Perubahan mio blas menjadi sel otot rangka dip ngaruhi o leh aktivasi satu gen miogenik atau lebih . Ge n- gen tersebut mengkode protein gen regulator dari keluarga helix-loop-helix (HLH). Perbedaan sel otot ra ngka berda arkan fung inya d itentukan oleh perbedaan isofom, protein kontraktil yang dihas il kan. Perbedaan ter ebut disebabkan oJeh dua ll1ekanisme yaitu Lranskripsi diferens ial dari anggota gen multipel atau pengaturan penyambungan transkrip RNA pil ihan dari gen tunggal. Proliferasi sel-sel Olot juga dipengaruhi oleh beberapa hormoD dan faktor tumbul1.

Kata kunci: diferensiasi sel. otot rangka, mioblas aktin. miosin.

Pendahuloan

Sel-sel yang terdapat pada tUll1bllhan maupun he\ an ceara mikro kopik menunjukkan ada­ nya perbedaan bentuk, ukuran, proporsi inti dengan sitoplasma, jumlah dan jenis organel dan kemampuan pengikatan terhadap wama erta pcrilaku sel. Nall1un . 1- el pada jaringan yang sarna dari spe ie yang berbeda dapat Il1cmiliki sel yang serllpa. Penel itian mengenai proses pembenlukan berbagai jenis sel yang berbcda pada jaringan em­ brio maupun organisme dewasa lelah banyak dilakukan . Setelah fertil i asi, zigor akan mengalami

VOL. 15 NO. I MARET 200 I

pembelahan sel, sehingga tumbuh dan berkembang ll1enjadi orga­ nisme dc\ asa . PCll1belahan sel pada cmbrio lahap awal meng­ ha ilkan sc l-sel ang identik dan mempunyai keman1puan totipo­ tensi . Pada tahap perkembangan selanjutnya, embrio mengalam i proses di~ rensiasi sel yaitu perubahan sel menjadi berbagai jenis sel yang berlainan . Embrio tahap awa l me­ miliki bentuk sel yang sarna dan setelah diferensias i akan meng­ alami perubahan bentuk. Bentuk sel merupakan gambaran sp sifik dari beberapa jenis sci, tetapi kebanyakan tidak dapat dibedakan hanya berdasarkan bentuknya

saja melainkan melalui ident ifi­ kasi komposi i dan kemampllan peng ikatan \ arna spesifik dengan teknik pewarnaan hi lokim ia, im lI noh istokim is dan lai n-lain. Perubahan b ntuk se l biasanya disertai pengaturan beberapa organel di dalam scI. Berdasar­ kan analis is mikroskop elektron perubahan benlu k sel tersebut di­ sebabkan oleh perbedaan sitoske­ letnya yaitu mikrotublll dan mikrofi lamen (Albert et al. , \995). Selain itu, ana lisis mikroskop elektron dapat digunakan untuk mcngamati gambaran ultrastruk­ tur scI. Perubahan perilakll sel bia­ sanya terjadi setelal difere nsiasi.

15

Embrio tahap awal dan jaringan dewasa memiliki sifat saling me­ nempel satu sarna lain, tetapi ada jaringan lain eperti darah kehi­ langan kemampuan tersebut. Fa\.;­ tor lain yang berperan dalam di­ ferensiasi sel adalah aktivitas or­ ganel, substan i spesi fi k yang di­ hasilkan el, perbedaan komposisi dan metabolisme jaringan, serta sistern pengaturan dan intesis enzim/protei n yang diha ilkan oleh el. Diferensiasi se l dapat ber­ sifat pcrmanen atau mengalami perubahan, tetapi pada umumnya perubahan tersebut ber ifat tetap dan tidak dapal kembal i ke jenis el asal atau l11cnjadi jeni el lain _ Ke tabilal1 diferen iasi el atau sel-sel keturullallnya yang diperolell meJalui iklus pem­ belahan el merupakan fakt r pentlllg. el tidak hanya menjadi berbeda tctapi harus tetap dipcrtahankan kestabilannya e­ bagal satu jenl s I tertentu dan dapal menunlll kan kemampuan­ n a tersebut pada sel-sel ke­ turunannya, walaupll n keadaall lingkungannya berubah . Selain itu, diferensia i sci didukung juga oleh determinasi sel yang terjadi ebclum alall bersamaan dengan difercnsiasi sel sewaktu embrio . Pada jaringan d wasa, . el tersebut mempllilyai memori sel yang dapat mel11pertahankan keadaan dan keslabi Iall el tcrsebut erta mewari kannya kepada el-sel ketu runan nya. Pada industri peternakan terutama ang memproduksi da­ glng k n umsi, angatlah penting

16

untuk menghasilkan ternak dengan kua lita daging yang tinggi dan se uai dcngan ke­ inginan konsumen . elain itu, daging berkualitas ter eb ut harus memenuhi standar kesehatan dan juga dapat digunakan untuk industri pengolahan daging. Pengetahuan mengenai faktor­ faklor yang berperan dalam di­ ferensiasi, pengontrolan perkem­ bangan dan pertumbuhan serabut otot dan proliferasi sel lainnya yang ada di 010t, dapat digunakan untuk m ngcmbangkan penelitian terhadap pengembangbiakan dan pemel iharaan lernak potong. Otol merupakan jaringan yang kompl k da n angat su iit ditangani seeara ill Vllro kar na berupa jaringan multiseluler, tetapi dengal1 pengembangan metode kultur el otot, dapat digunakan untllk meneari jawaban mengenai beberapa masalah yang tidak dapaL dijelaskan secara in vivo . Tu lisan ini membahas mengenai pembentukan dan pcngaturan diferen jasj seI otot rangka, serta faklor yang berperan se ara il1 vitro . Pembentukan otot rllogka (mio­ genesis)

Perkembangan Olot rangka selama embriogenesis merupakan prose yang bertahap dengan melibalkan el-sel mesoderm yang merupakan prekursor eJ otot pembesaran kompartemen el dan diferensiasi yang meng­ hasilkan el-sel yang terspe iali­ sasi . Pel11bentukan olot rangka

dipengarllhi oleh lingkungan dan pengarllh sel itu sendiri (Braun et a/. 1994) . Olot terdiri dari sekum ­ pu Ian sel yang terspesia lisasi untuk me lakukan kontraksi . Si tern kontraksi otot pada sel -sel hewan mel ibatkan akti n dan miosin _ Sel -sel otot memiliki perkembanga n yang lebih tinggi pada sistem ini . Jenis sel otot pada mama lia ya ng terspe­ sialisasi untuk berkontraksi ada Iah sel otot rangka, sel otet jan tung, sel tot palos dan s I mioepilel. Otot ter ebut rna ing­ masing berbeda da lam fungsi, truktllr dan perk mbangann a. Keempat jeni olot tersebut memiliki item fi lamen aktin dan miosin tetapi masing-masing mempunyai molekul dengan Uflllan asam am in yang berbeda, pengaturan yang berbeda di dalam seI serta bera osiasi dengan protein yang berbeda pada pengontrolan kontraksi . Sel-sel otot rangka berukur­ an be ar dengall panjang 2-3 em dan diameter 100 mikrometer (pa­ da jaringan otot manusia dewasa) yang dikenal sebagai erabut Olot karena bentuknya yang meman­ .iang (Albert at a/., 1995). Orot rangka ertebrata berasal dari la­ pi an mesoderm em brio lahap gastrula. Sel-sel bakal mesoderm tersebul berinvaginasi sebagai lembaran ya ng maslIk melal u; bla toporus (Amfibi) atau ber­ migrasi sebagai sel tllnggal masuk melalui lapisan primilif(Aves dan Mamalia) ke dalam ruang di antara ektoderm dan endoderm .

WARTA BIOTEK

e lanjulnya sel-sel mesenk im tersebut l1lembe tuk Japisan bilateral d i kedua sisi notokord . Bagian dar al lapisan mesode rm pada dekat notokord ter ebut berubah menjadi segmen-segme n yang berpasangan dari arah kran ial menuju kalldal. Bagian tersebut kem udia n disebu t sebagai som it. Beberapa bagian somit ver­ tebrata., eJ- eln ya akan terspe­ siali as i menjadi prekursor s I-sel otot (Gambar I a) yang kemlldian bermigrasi dari somit men uj u wilayah tertentu yang ak.an membentuk tot. Diferens iasi bakal el otot ini di pengarllh i oleh bum ung neural dan/atau nolo­ kord pada peri ode terten tu se lama

spi1ldle dik.enal s bagai miob las yang mell1 punyai banyak ribo om term8s uk pol iri bosoll1 hel iks yang mens intcsi miosin (Gam bar Jb). alah atu hal yang terpen­ ling daJam dife ensiasi adalah fusi mioblas mononuk leus menj ad i ta­ bung otot mu ltin uk leus. Pem­ bentukan tabung otot in i diserta i adallya akum ulasi prolein sp sifik otot seperti krealin kinase, miosin, aJ.. tin, tropomios ill dan reseptor asetilko lin (Pl!a rson & Ep tein, 1982 dalam Malorn i el al ., 1990) . Para ahli biologi perkem­ bangan te!a h mene!iti apakah tab li ng sel otot (m i tube) b rasa I dari fusi beberapa el prekursor otot mononukleus (m iob las) atau berasal dari mioblas lunggal yang

Gambar 1. Tahapan diferen iasi el oLot rangka : a. PreJ..lIr or se l otot, b. M i bla, c. Tabung otot. d. S rabut otot da n sel satel it (SlImber: Carl on, 1988 . pemb ntuJ..an so mit (Rong et at., 199_ dalam Bober el al., 1994 ). el-se l mesenkim bakal otot ll1 engalam i pembclahan . kemudi­ an berubah benLlIk menjad i scpe rti

VOL. 15 NO. I MARET 2001

mc ngalami pembelahan inti saja tanpa terjadi pem bel ahan sitop las­ ma (s itok inesis) . Hasi l dari bebe­ rapa penelitian l11el11 bllktikan bahwa tabling a t t terse but

fll si III ioblas berasal dari mononll kleus (M intz & Baker. 1967 dalam Gi lbert, 1998). Fus i mioblas Illembentuk tabling lot mela lui dua tahapan ya itu pro e migra i, pengenalan dan peng­ aturan sel, eJia proses fu si el itll sendiri. Kedua tahapan ter ebut dipengaruh i oleh ko nsentrasi ion ka l ium. Pengenal an dan fusi me­ rupakan proses terpent ing dalam 111 iogen sis. Proses tersebul lidak pe ies spesifik walau pun l11 io­ bla hanya dapat berfllsi dengan mioblas tetapi tidak hanJ d . ri spesies yang sarna. Yaffe & Feldman ( 1965) dalam Gil bert ( 1998) telah membuktikan b hwa mi oblas em brio ti ku dapat ber­ fll i dengan mio blas em brio ayam membent.uk tab un y otot hibrid. Kemampu n miob las berfusi diawali dcngan terhent inya pell1­ b lahan s I/s inte is DNA . Setelah ilLi di l11 11 lai inLes is protein spe­ sifik olot. Ta bu ng olot merupakan sel mullinukleus yan n panjang de­ nga n inl i ter! lak di tengah dan lldah mLl lai terbentuk ti lamen kontra ktil (Gambar Ie). Tabu ng otot aklif men inl i aktin dan miosi n ya ng meru pakan pro tein ko ntraktil tot. Mi o in ada lah protein tilame n besar yang terd iri dari beberapa subunit dan disin­ tesis oleh p liribosom heliks yang 50-60 ri bosom mengandu ng (Carlson, 1988). Protein ya ng disintes is tersebut kemudian memben tuk fi lamen tebal dan filamen tipis ya ng akan m nj di un it fungs ional mengelilingi wi layah peri fer tabli ng otot.

17

Sejal n dengan pematangan la­ bung otot, sej umla h besar prote in kontraktil menempati sitop lasma sehi ngga inti berm igras i ke daerah dekat me m bran plasma. Pada ta­ hap ini, tabung otot ber atu mem ­ bentuk serabul otot (Gam bar 1d). Pertumbuhan otot terj adi dengan eara pen ingka tan j uml ah, panjang dan ukura n lilitan dari el-sel yang sudah terdifcrensiasi tersebu t Serabut otot rangka tidak dapat membelah, sehingga terjadi proses fusi l11ioblas dengan serabut otot yan g ad a . Beberapa mioblas tidak berfusi dengan serabut otot tetapi tetap menjadi sel-sel mononukleus yang ti dak terspesialisasi dan menempati daerah an tara se ra but otot denga n lamina basal. Sel-sel ini d ikenal sebagai sel ate Iit (Gam bar 1d). Pada jaringan otot indiv idu sete­ lah lah ir, sel satelit ini akan aktif berploriferasi sebagai sumber sel untuk mem bentuk serabut otot baru. ela in itu, sel tersebut ber­ pera n pada proses regene ras i otot yang rusak pada j arin aan dewasa.

Pengaturan dan raktol· ya ng ber-peran dalam diferensiasi sel otot rangka Penel itian mengenai dife­ rensiasi m iogeni k secara in vitro Lelah berha il mengiso las i sejum­ lah gen regulator. Pada kondisi kultur, fus i dan ekspresi awal dari gen spes ifik otot memerlukan proses yang relat if cepat yaitu hanya beberapa hari, sedangkan pembentukan tabung otot memer­ lukan waktu yang lebih lam a.

18

Perubahan m iob las III n'adi satu sel jenis el otot terte ntu dipengamh i olch akt ivas i satu gen m iogenik ata u le bih (A lbert et at.. 1995). Gen-gen terse but meng ode protein ge n regul ator dari keluarga helix-loop-helix (J-ILH). Faktor miogenik dari kel uarga HLH yang terekspresi sel alll a pembentu kan som it ada lah myf-5, miogenin myf-6 (MRF4) dan M 00 yang merupakan fakto r penting unltlk penen tuan fe notip sel atat dan pengaturan diferensiasi terutama da lam kultur se l ( raun & Arnold , 1994) . Sewa ktli mio blas berfusi, terjadi aktivasi gen spes ifik otot yang terkoord ina i. Jika te rj adi fusi m ioblas maka inti tidak lagi me nga lami re pli kas i DNA. Pengena lan anLar m ioblas me­ nyebabkan terj adi nya fusi yang disebabkan oleh ades i molekul spesi fi k pada sel sehingga terjad i diferensiasi. etelah terbe ntuk, d i fere n­ siasi otof rangka akan menyes uai ­ kan dengan fungs i yang diper­ lukan. Genom sel olot rangka memp unya i kopi gen varian l11ul ­ t ipel yang mengkode bem1acam­ maca m protein spesi fi k se l otot rangka dan transkrip RNA gen­ g n tersebut yang dapat ber­ sambllngan de ngan beberapa eara. Berdasarkan stud i moleku ler ter­ hadap iso a rm pro tein kontraktil, di ketaJ1Ui du a mekan isme pe ng­ aturan produks i prote in isof rm terseb ut. Mekanis me yang per­ tam a adalah transkripsi diferensia l dari anggota keluarga ge n m lilti ­ pel, sedangkan yang lain oleh

pengaturan penyambu nga n tran ­ krip RNA pi lihan dari ge n tunggal. Pada bebe rapa orga­ nisme, isoform protein kontrakt i I otot ra ngka in i diproduks i o leh penyambungan RNA pi li han ter­ masuk ropom ios in, tropon in T ringan. dan miosi n rantai Mamalia mem pllnyai gen tropo­ m iosi n mul tipel, tetap i gen ini da­ p t menghasilkan protein isoform yang kompleks dar i penyambung­ an transkri p RNA pil ih an yang berasal dari gen tra p rnios in tung­ gal (Russo el al . 1992 . Protei n isofonn ya ng dihas ilkan akan menjadi kompo ne n kontrakt il sel otot rangka sesuai denga n fungs i­ nya seperti untuk kecep t n, kekuatan atau daya tahan pada fe tus, ayl maupun dew a. Penyusu nan strategi mo leku ler, ek pre i anggota ke \uarga gen dan penyam bu ngan RNA pili han menghas ilkan isofonn untuk protein kontraktil yang kompleks terse but berbeda beda untuk setiap jenis orga ni sme Mekan isme pengontro lan pembelaJl an sel-sel otot h nya dapat dipelaj ari dengan l1letode kllltllr sel. Telah berha il ditem u­ kan beberapa ho rmo n dan faktor tum buh yan g dapat mensti mul asi atau mengham bat plorifera i sel­ se t otot. Hormon dan faktor tu mbll h tersebut di antaranya ada­ lah insulin; insulin- like growth

jactors 1 dan 11. acidic and ba ic fib ro Ma t gro'wth f actors (FGF). epidermal gro wth jactor (EGF .

transfo rming

growth

Jactor

(TGF) , fetuin, transferri n, ACTH,

u - I>- dan y-M H, inter leukin-6,

WARTA B10TEK

Tabel I. Pengaruh beberapa hormon dan faktor tumbuh terhadap proliferasi dan diferensiasi ku !tur sel otot. (Sumber : Harper & Buttery, 1995) Jenis sel I nsu lin IGFs EGF POGF-BB TGF-p GH FGF P,O P,O NtP,­ Sel-sel L6 P,­ -,X N,P,O Nt P, 0 Sel satcl it tikus N,­ N,­ I,X N,P,X N,O Sel satelil sapi I,X P,X p.­ Mioblas sapi N,­ 1,P,X N ,­ P,­ Sel satelit dom ba N ,X P.P­, P,­ Mioblas domba I,X PO P,O? P,­ p.­ I,X Sel satel it babi P,­ P,­ Mioblas ayam N, O N,­ -,X -,0 N.O Miob las kalkun P, P,P,O N,­ Keteran g an: P = men y ebab kan p loriferasi ; 1 = men g hambat p loriferasi; N == tidak ada efek pada ploriferasi; D = menyebabkan diferensiasi; X = menghambat diferensiasi leukaemia inhibitory jaclor, dan p-agon ists (Fiorini el al., 1986, Dodson el al., 1988, Doumit et a/., 1993 dalam Harper & Buttery 1995). Selain itu, masih terdapat faktor lain yang belum diketahui misalnya pada otot yang terluka atau yang disekresikan oleh fibroblas otot. Mioblas distimulasi untuk berploriferasi oleh fakto r tumbuh diantaranya oleh FGF. Selain itu, mioblas dapat terus berproliferasi daJam kul tur dan tetap mem­ punyai kemampuan berdiferen­ iasi dan berfusi membentuk sel­ sel otot rangka pada kondisi kultur yang se uai. FGF dalam kullur menjaga mioblas (etap bcrploriferas i dan tidak meng­ alami diferensiasi. Sistem peng­ aturan ini sangat kompleks se­ h ingga pengurangan konsentrasi faktor tumbuh tersebut me­ nyebabkan miobla keluar dari fase G I siklus seluntuk kemud ian berfusi dan m ngalami proses di­ fcrensia i membentuk serabut otot. Tabel J memperlihatkan

VOL. 15 NO . I MARET 200 1

pengaruh beberapa harmon dan faktor tumbuh terhadap ploriferasi dan diferensiasi beberapa kultur selotot. Pada Tabel 1 terli hat ada­ nya perbedaan pengaruJl antara jenis harmon dan faktor tumbuh terhadap ploriferasi dan diferensi­ asi sel otot spe ies hewan yang berbeda. Selain itu, terdapat pula pcrbedaan pengaruhnya terhadap jenis sel otot pada spesies yan sarna, misalnya antara sel satelit dengan sel mioblas fetus sapi terhadap maupun dam ba pengaruh TGF-p. Pertambahan ukuran sci da n perbandingan sito plasma dengan inti pada otot merupakan bagian yang penti ng pada proliferasi sel yang tumbuh menjadi jaringan otot. eeara in vivo el- el otot akan berintegrasi tcrhadap stimu­ lus dari berbagai harmon dan faktor tumbllh pads saat yang bersamaan. Sel otot yang terdife­ rensiasi juga memiliki mekanisme khusus untuk prodllksi ATP de­ ngan eara metabol isme anacrob

atau aerob. Otot memiliki bebe­ rapa mitokondria yang disebut sarkosom yang merupakan tempat terjadinya fo sforilasi oksidatif sumber primer ATP . Sarkoplasma mengandung glikogen dan kreatin fosfat sebagai enzim glikolitik, kreatin fosfok inasc dan protein spesifik lain seperti mioglobin yang diperlukan untuk mengubah ADP menjadi ATP selama terjad i kontraksi otot. Penutup

Pengaturan diferensiasi otot rangka yang terjadi ewaktu em­ brio mallpun pada jaringan dewasa telah dite li ti dengan teknik kultur in vitro. Penelitian­ penelitian tersebut sudah me­ nemukan bagaimana proses di e­ rensiasi sampai tingkat molekuler ehingga dapat digunakan seba­ gai data tanl bahan untuk me­ ngetah ui perkembangan otot hewan seeara utuh . Masih banyak yang perlu dipelajari mengenai seluruh faktor yang berperan

19

dalam perkembangan se! otot dan bagaimana faklor- ra ktor tersebu l berperan dalam perkembanga n yang. normal secara in vil'o .

II1 I1LI~IlCC Irol11 3.\ lal structure ()c\cl"p-m cn t 120 J07J-30R 2. Oraul1 .1 & II Arnold 199-1 . I '>-Ct' ll s ~2rl') ing 11\ 0 inn tivat.:" my f-5 all el 's loml st..cldal mus cle ce lls activation of

of


:li tcrn:Hi\c

111)

f5-ind\:pcndc l1 l

Alhert . B . O. Bray. J Lewis. M Rare K Ro berts & J.D. W aL~o n . 1995. Molecular Biology of The Cel l. .\,., cd . Garland Publi -hing, Inc Yort.. , pp

,w

199' . Muscle

ce ll growt h Meat Fo cli s 1I1I crnati onai IW 323-J2~ Malum i. W_ P [ In doviml (j r:mci a. S. Mescilin i & M .T Sanl in i. J 990 Effccl l,l f Cesiu l1l on III myob l t

""1'0

diner,n t

Daftar Pustaka

pathwMY Dc cloprnc ntnl Ulo lpgy 164 24-3 Braun , T.. f: Bober. M II Rudni cki R. Jlltnisch. & II . Arnold . 1994 . Myll D c~Jlrcss i o !l m;lrks the
IIarpc r, J.M M & P 1. Outler

di lTcrcn ttati on an d cctron nll ctllscopic stud) III \ " 'I'{J Celt D<:\ clopmcnl B iology 26 399 -41 0. Y.CA.. . !3 rody . O. C ove & S ttolcnghi. 1992. Dc:vclorllllCl1 t. the molecu lar g~ nctic appro a h SpringVerlag Berli n

I<. l'-150 ,

Dev elopmen t 20: 3()82-309 Carlson O.M 1988 . Patlen 's Founda tion of

Fmhl1 olng} S"'\:d Me. Grow -Hill Boo k

1 1 7~ -1 179.

Bober. E.• B Brand-Sabe ri. C Eh.:nspcrger. J.

Wilting. R. Balling. IlM Paterson. H. Arno ld & 0 e hri [ 1994. Illitial st Jl$ of myogenesis in ~om i t es arc inci ependen t

Company. New York. pp.) 13-33 8 , i l b ~ rt , .F. 1998 Ocvc!opnll:lI ldJ Bio lugy . 5'" .d. inouer Associates.. Inc

Mnssachu sctl.

pr

347 -)5 1.

MAILING LIST BIOTEK Bergab unglah dengan Mailing List BIOTEK ya n g dik e.ola oleh Moderator dari Puslitbang Bioteknologi-LI P I Mailing List B IOTEK merupakan forum komunikasi ya n g ideal bagi a nda yang b e rminat denga n permas alahan bioteknologi di Indonesia

UNTUK BERGABUNG, KUNJUNGI SITUS h tip : Ilwww.egroups.comJinvite/biotek

DAN TEKAN TOMBOL "JOIN" alau

PENDAFTARAN DAPAT PULA DILAKUKAN DENGAN MENGIRIMKAN

PESAN EMAIL KE MODERATOR

([email protected] .jp)

Selamat bergabung

20

WARTA BIOTEK

POPUL RISA I BIOTEK

SE JATA BARU MELAWAN E. coli E\cherichia coli 0 157:H7 adalah saiah atl! ba kleri yang t r­ bawa mela lui maka nnn (/hod­ horne) yang paling berbahaya da­ lam kehidu pan. Bakteri ini berhu­ bungan dengan banyak ka us le­ dakan pcnyakil. Pada Lahu n 1993. lebih dari 700 orang lerinfcksi dan orang dianLaranya ml.!n illgga l s(:{eiah i1ll:makan Il1nkana n yang terc mar dari lIaLU re lorall Ji Pacific NOl1hwest. Kanada. Barll­ baru ini, 16 orang meninggal di Walkerton, ntario. Kanada keti ­ ka E. coli rnencemar i perscdiaan air mil Li m 'tempaL Bakteri ini masih kcrabal Illlkroba jinak )'dng n engh un i lISUS man u ia dun bcrbagai hewan ainnya. Pcnyak it ini paling b ­ nyuk bcrhubungan dengan daging api, namun . lada ai r. kecalllbah alfalfa. sari buah apel da n air rninulll juga dapot tercemar bila tcrcam pu r dcnga 11 kotoran atall limbah bllangan
VOL 15

. I M

RET 200 1

memperkirakan ba hwa 73,480 orang tcrin feks i E. co1i setiap ta­ hun dan sekitar 600 orang me­ ni nggal dunia. Masih banyak yang perlll d ilakukan untuk mengurang i gejala in leks i E. coli yang para h dan memrerkeci l kemungkinan timbulnya konlaminasi .

Alternatif p ngobatnn baru Hingga saal in i, . atu- atll­ nya c< 1'8 untuk mengobat i infek . i ya ll g eli ebabkan ole h E ,:o{i adalah dcngan menggunakan ant i­ biotik . amlin seb uah perusa haan yang berpu al eli Calgary. Kall ada, Syn orb Biotech Inc., baru-baru ini lelah mengembangkan sllatu obat yang dirancang lIntuk mence­ gah pe lepa an lok in yang Illenye­ babka n HUS. Obat terscbut yang diberi nama yn orb Pk F\ me­ ngandung uatu en) a'Wa yang mcnyenIpai rC'it:ptor karb hidrat yang ada pada 'iel darall merah, ginja l dan IIStl Mo lekul terscbut bcrpcran 'icpel1i sf) 111 til usus. member ihkal1 dan rncnclralisir toksin sebelul11 tok in lerscbut ITIaslik aliran darah dan ginjal. Tubuh k rn udian m rn buang obat dall raelln ter ebu t seperti kotoran biasa . Meskipun Synsorb Pk R be­ lum ciisetuj ui oleh bado n k.esehat­ all Kanada untuk dljua l bebas di pa aran , ekilar 30 do is tela h dilepas secara clIma-cuma pada ka u · ledakan penyakil di Walker-

Lon. Preside n

ynsorb Dav id Cox mengatakan bahwa meskipull pe ­ tensi pasa r Synsorb Pk R se mentara ini tidak besar, potensi c hat ini tidak bisa dia nggap reme h. Pro­ eksi tera khir memperkiraka n bahwa di Amerika serikaL saja bakteri in i telah menyebabkan 11 0.000 kasus infek i per tahun, atau s ki tar 250 .000 kasus per tahu n d i negara maju .

Mengatasi masalab pada sum­ bernya Pendekatan lain untuk. m ngobaLi atall mel1 genda likan infcks i E. coli ada lah denga n mengurangi infek i pada sapi. Para il muwa n memperkirakan % sa pi bahwa le bih dari lerinfeksi 01 h E. culi 0157 :H7. amun j umlah pasti ll ya sulil di ­ tentukan !-.arena bakteri in i tidak. rnellyebabknn sap i menderita sa­ kit. The Vt:terinar) Infect ious Di­ sease Organizalion (VIDO), )ailll Organisnsi PenyakiL l'vIell ul ar He­ wan, Ull i crsitas askatch wan di Sask.atoon. Ka naJa, seda ng mc nc­ lili suatu vaksi n un tuk E coli 0157 :1-17 . Yak ill ini dar at d ibe­ rikan kepada sap i 1I 1l tuk mengu­ rangi jum lah pe ncemaran bakteri di kandang dan gudang penyim­ pa llan pa kan, suatu tahap pertarna yang sangat pentin g dalam men­ cegah penyakit yang terbawa l11e­ lalui makanan.

21

Departem n Pertani an Amc­ ri ka Serik' t ( SDA ) ju ga me n­ po n or i bebera pa upa ya p nel iti­ an yang bertuj uall ulltu k mCl11 ber­ sihkan sap i da n kot fannya dafi E coli ya ng berac ull. Satu pcndekat­ an yang palin g menjanj ikan ada­ lah denga n mel11 asuk kall bakteri pelllb ull uh E. 'oli ke da la m ma­ kanan sapi. Michae l Doyle, Direk­ tm Pusal K eamanan dan Pell ing­ katan Kua litas Pangan U ni ers itas Georg ia mengataka n "Ka mi Le lah men eleksi tiga ga lur bakte ri ber­ manfaat ya ng III ng has il ka n an ti mikro ba ya ng dapat m Ill bun uh 0 157" , Da lam uatu pene litian banl-barLi in i pa ra peneliti di Georgia mem beri peri akua n 20 sapi dewasa de ngan 01 57: 1-1 7,

kemudian 10 dari mercka mereka dibcri pakan yang I11cngandung

bakteri probiotik crscbut. Setclah 33 ha ri 10 sapi yan g lidak d iberi probioti k !l1ilsih pos itif l1l engan­ dung 0 157: H7. Dari 10 sa pi yang men dapat perla kuan probioti k. ha­ Ilya satu ya ng Ill as ih po itif mc­ ngandu ng 0 157: H7 .

ebe lul11 ynsorb Pk R ata u vaksi n untuk E. coli te rsed ia se­ ea ra k mer ial, cara yang terb, ik me nangan i bakteri ini ada lah de­ ngan men hi ndari infe!"'si . Cuci

tangan anda sebelulll d n se udah Ill engolah makanan, dan Llsahak an a l I-al t d pur dan perll1 ukaa n tempal bekerj a [elap ber ih, scba­ iknya dib r ihkan dengan larutan Meadl (pem utih) yang encer dan

air. Simpan dag ing mentah dan segala sesll tu yang di
LABORATORIUM KIMIA BAHAN ALAM

PUSLITBANG BIOTEKNOLOGI-LIPI

Melayani : • Analisis mioyak a tsiri dengan kromatografi gas • Analisis senyawa kimi a bah a n a la m i dengan HPLC • Konsulta i analisis kimia ba han alam

Hubungi:

Telpon : 021-8754587

F ax : 021 -8754688

22

WARTA BIOTEK

POPULARISAST BIOTEK

PAT N DAN BIOTEKNOLOGI Apakah bioteknologi itu? B iotek no logi me libatkan penggunaan pro es-p r es biolo­ gis dari mikroba, sc i tanaman dan hewan lIntllk kelln tungan lImat manu ia. Ma nu ia Lelah menggu­ nakan biotekno logi selama ribuan tahun ebagai contoh, untuk membuat roti, bir dan kej u. Namun t knik-lek nik biologi mo­ leklilcr modern, terutama rekayasa genetika, te lah membuka kt:mung­ kinan-h.emungh.i nan bam yang pen ting dalam banyak industri . Apakah rckayasa genetika itu ? Para ilmuwan saat ini telah mema ham i s istem pengkodean yang melanda i in truksi -instruks i kim ia alat! gen ya ng diturunkan dari atu generasi ke generasi b ril utnya yang di dasarka n pada ub tan i yang disebut Deoxyribo­ nucleic Acid (DNA Ge n sebe­ namya merupa kan potongal D A dengan pesan yang dik dekan da lam struktur kim ia nya . Ketika para ilmu an Le lah mema ham i h.odc.: DAter ebut, mereka mu lai mencari cara-cnnl lIntuh. me ngu­ bah in truksi -in truks i yang d iba­ \Va o leh oe n-g n untuk mengintro­ duk ikan instruksi-instruksi baru yang aka n menyebabkan e[ untll k rnemproduks i ba han-ba han killl ia yallg dipe rlukan, alau m lakukan proses-proses yang bermanfaat, atau memberikan ka rakter-karak-

VOL. 15

O. I MARET 200 I

ter ya ng di inginkan kepada suatu organi me. Ha ilnya ada lah reka­ ya a genet ika modern, yaitu pro­ se manipulasi dan pern inda han in trllksi-instruk i ki mia dari s tu sel ke sel lai nnya . Apakah fla ten itu '? Si tern pate n dira ncang untuk rn enyediakan insentif bagi suatu inovasi, se hin gga mereka yang !cln h rnenginvestasikan uang pada penelitian dan pl,;ngembang­ an dapal menerirna kescmpatan lIlltuk mcndapatkan pengha rgaan yang layak ata peng luaran me­ r ka, dan unluk m nyebarluaskan ilmu pengetahuan. Paten merupakan hak mo­ n poli yang d iberikan pemerintah kepada penem t1 dalam j angka waktll Le rtentu. Paten 111 em beri­ kan pCl11 egangnya (patentee. yaitu penemu at t1 se eorang yan g me­ nerima hak paten tersebut dari penemunya) hak eks kilisif Ll ntu k melll buat, me nggunakan atat! menjual penemuan nya selama hak paten itu berlaku. Pemegang pa­ ten dapat memi lih un tu k meJakll­ kannya sendiri alall memberi kan hak liscns i ke orang la in unruk melaksanakan penel11uannya te­ sebut. Palen lllemberi hak kepada pemegangnya untuk mengambil tindakan huku m terhadap pihak lain yang memb uat atall menggll­ n kan penemtla nnya secara ko­ mersiaJ atau pihak ya ng menjual

penemuannya tersebut tanpa ij in pemegang p ten. Namu n pate n ti dak memberi hak kepada peme­ gangny untuk me larang orang lain me lakukan aktivitas tersebut sebelum tangga l pemberian paten. Paten diberi kan secara terbatas dalam suatu wi layah negara. Ka­ rena itu, paten yang diberikan di Austra lia tidak mempunyai penga­ ruh di Amerika Serikat atau Inggris. Jangka \Vaktu pemberia n paten juga berbeda antara s, ttl negara dcngan negara lainnya, \ alauplll1 da lam perj anjian GAIT ( 'eneral Agreement 011 Tariffs and Trade) j angka waklll perlin­ d ungan paten te lah diseragamkan menjadi 20 tahu n sejak tangga l pendaftaran (filing date). Oi Austral ia, sej ak bulan Juli 1995 j angka waktll perl indu ngan paten adalah 20 tah un sejak tanggal pendaftaran, sepanjan ' biay pe­ me liharaan paten dibayar setiap tahun nya. Banyak negara yang meng iji nka n perpanj angan j angka waktll perlindun gan paten untuk penem uan di bidang tertentu sc­ perti farmas i yang se ri ngkali mengala mi penun daan da lam per­ o lehan ijin dari pemerintah sebe­ Ili m dipasarkan. Setelah masa berlaku perl indu ngan pate n habis (exp ired), maka penemu an terse­ but menj adi beba un tuk digu na­ kan oleh Umlll11 .

23

Apa yang harus diLakukan uo­ tuk mendapatkan paten?

Agar dapal dipatenkan, se­ buah penemuan hanls bam dan menga nd ung I nokah inven ti f. Selaill itu p mohon paten harus mendaftark 11 temuan nya da la m bentuk spesi fi kas i paten ya ng rn erupakan do kum en yang d it ulis secara hati-hati dan menj ela kan pe nel1lLlanny . eeara rine i seh ing­ ga memungki nk an ran g lain y ng ah li di bida ng itLl Llntuk mc laksa­ nakan penemuan itl1 hanya dcngan mengacu pada pe ilika i tersebut tanpa harus melakukan percobaan ya ng tidak perl u atau membuang­ buano banyak waktll . Dalam hal penemuan yang melibatkan orga­ nisme hid up. spe itt kasi ter ebut dapat dilengk · pi dengan penyim­ pana n am p I d, ri orga nisl11c hi­ dup ang dibuat berdasarkan trak­ tat Bud apest. Oi Au tral ia, The ustral ian Governm ent Analytica l Laboratori e merl1 pakan lembaga ko leksi kultur yang di aku i oleh traktat Bud apest. (Di Ind nes ia, lembaga kolcksi ku ltu r yan g di­ akui oleh traktat Budapest be lum ada karena Indonesia belu m men­ jad i 8.nggo ta trakt t Budapest) . i b berapa nega ra, term a­ ·uk Au tralia da n Amerika Seri­ kat, da lam pesifikasi paten p rl u j uga dij la kan ten tang metode terba ik untuk me lak anakan p ne­ muan terseb ut ya ng diketahui oleh pemohon pada saat pendaft aran . Bila kemudian terbukl i bahwa pemohon Lelah mencoba untuk menyelllbll nyikan lll etode yang lebi h baik dari yang dijelaskan dalalll spesifikasi. maka paten terseb ut tidak dapat dil, ksanakan.

24

Persyaratan un tuk mem buka seeara lengkap suatu temuan d ­ la111 dokum en paten dimaksll dkan untllk mema ti kan bah wa set la h paten tersebllt ti dak be rlaku lag i maka semlla informasi yang ada dalam dokumen paten tersebllt secara bebas tersedia untuk publik seh ingga penelllua n terse but dapat digun akan oleh orang lai n. Hal ini merupakan imbal balik dari hak m nopoli yang di berikan ke­ pada pemegang paten. Spesifikas i paten Illerupak an sum ber inform a­ j tekni yang snngat penting; kebanya kan informa 'i ini tidak dida patkan dalam literatur umu m.

K ebaruan dan langkah inventir Agar suatu penemuan dapat dipaten kan, maka penemu8 n terse­ but harus baru dan In ngandung la ngkah inventif Karenn il Ll, pt!­ nemuan yang diseblltkan da lam klaim harus berbeda dari apa yang sebel umnya telah di ketahui atau digunakan. dan perbedaan tersebllt harus merupakan seSlIatu yang ti­ da k terduga sebetllm ll ya 01 h orang ya ng ahli di bidang ter ebut. Di kebanyakan negara. permo hon­ an paten di peri ksa leh Kantor Paten untuk un ur kebaru an dan langkah inv ntif Pemeriksa Pa­ t n kan me laku kan penelusuran do kume n pat n da n literalur il miah, an mereka akan memban­ d ingkan penem uan ter eb It se per­ ti yang dijelaskan dal am spes ifi ­ kas i dan dinll l1 l1skan dala m kl aim ­ klai mnya dengan doklll1l en-doku­ men rel eva n yan g pa ling mende­ katL Pemoh n harus dapal me­ nangga pi setiap ke beratan yang ada berdasarkan pengetahuan ter­

dahu lu tersebu t (prior art). yang dapat dilak ukan baik dengan cara mera tat klaim-kl a im nya atau de­ ngan memberi kan sanggaha n. Pa­ da ul11 umnya p mohon diharuskan un tuk menyemp ilkan lingk up kl a­ im- klaim yang dibuat aga r permo ­ honan paten nya dapat diteri ma. Da patkah pemcga ng pa ten seca­ ra otoma tis menggunakan te­ muannya?

Paten memberikan hak eks­ klusif kepada pem gangnya. In i berarti paten memberi kan hak kepada pemegangnya untuk III la­ ran o orang lai n melaku kan apapun yang berkenaan clengan lingkup paten penemuannya seperti yang dirumuskan oleh kla im- klai m yan:r ad a eli spesifikas i paten. Na­ mll n paten ti dak memberi kan persetuj uan kepada pemegangnya lI ntuk me lakukan sesuatu apapu n. Karena itu, Llntuk dapat m nggll­ nai-.an pe nemua nnya yang telah dipatenka n, p megang paten harllS mengikuti selmuh atman yang ad a L1n luk bidang te rtentu dar i pene­ mllan itll, lTlisa lnya keam anan pro­ duk, perl ind ungan hewan, ling­ ku ngan, dan peraturan-peraturan tenta ng kesela matan kerja. Selai n itl! , kemamp uan pemegang paten lI11tuk 111enggunaka n penemuan­ Ilya akan tergantl1n g pula pad a ad a tida knya paten-paten ebelum nya di bidang ter eb ut da n apa kah paten-paten terdahll lu tersebut mencakup pu la penemuan ter­ sebut. Kebanyakan paten sebe­ narn ya merupakan perbaikan dari teknolog i sebe lu mnya. ka rena itu ada lah sesuatu ha l yang umU111 bagi pemega ng sLlatu paten lmtuk

W ARTA BIOTEK

mendapatkan lisen i dari peme­ gang- pemegang paten terdahulll sehingga mereka dapat menggu­ nakan penemuannya ang lebih baik tersebut; da n j uga sebaliknya, pemegang paten se belum nya da­ pat pula menggunakan paten yang telah dikembangkan rer ebut.

Jeni -jew peDcm uan biotekno­ Jogi apa saja yang da pat dipa­ tenkan? Protein, asam nllkleat dan molekul-molekul biolog i lainnya adalah senyawa-senya a kimia. dan mereka diperlakukan oleh hu­ kum paten ama eperti senyawa­ enyawa kim ia lainnya. Karena itu, a alkan klaim untuk protein atall a am nukleat ter ebul merne­ nuhi persyaratan norma l untuk un ur kebaruan dan langkah in­ v ntif, maka senyawa-senyawa ter ebUl dapal dipatenkan. elama bertahlln-tahun, or­ ganisme hidup dianggap ti da.k dapat dijelaskan eeara eukup detail untuk memenllhi persya­ ratan keterbllkaan . Namun eka­ rang telah dapat diteri ma bahwa de kripsi dalam pe ifika 1 dapat dilengkap i dengan reterensi pe­ nyimpanan sampel da ri organisme hidup t ~ rscbul. Hampir semua negara indu tri ll1aju aat 1111 eeara rutin dapal ll1emberikan paten untuk organisme hidup. tcrmasuk bakteri, khamir virus, el mamalia s perti hibridoma dan tanaman . Kla im-klaim untuk ma­ nusia termasuk em brio secara eksplisit dikecualikan dalam per­ aturnn perundang-undangan atau d ianggap bertentangan dengan hukum-hukum yang la in sehingga

VOL. IS NO. I MARET 200!

pematenannya tidak diijinkan. Di Au tTalia, klaim-klaim yang ber­ kenaan dengan manu ia dan pr ­ ses-proses biologis yang berhu­ bungan dengan manusia ecara eksp li it dikecualikan dalam the Palent Act 1990. Banyak negara, termasuk mercka ynng tergabung dalanl the Europe.an Patent Convention, juga seeara spesifik mengecual ikan metode-metode untuk kedokteran atau operasi maJlU ia dan hewan, juga arietas tanaman dan hewan dan pro es-proses biologis untuk Namun proses­ pembuatannya. proses mikrobiologi dan prod uk­ produknya mentpakan perkecual i­ Kantor an (dapal dipatenkan). Paten Er pa menginterpreta ikan pcngeeualian ter ebut ecara sem­ pit. Contoh-contoh penemuan bioleknologi yang dapal dipaten­ kan tennasuk : organisme hidup ( elain manu ia), galur e l, aksin, ant igen antibodi. forrnulasi obat, kultur slarler (i nokulum) untuk anggur, keju. bir, dll., produk­ produk fermenta i seperti antibio­ tika, makanan dan minuman, me­ rode pengolahan lill1bah dan bio­ remediasi tanah dan air yang ter­ cemar. dan proses-proses kimia menggunakan enzim atau orga­ nisme hidup Australia mengabul­ kan paten untuk organ isme hidup pertama kali pada tahun t 976 (galur kham ir unggul untuk pem­ buatan roti) dan hewan transgenik pada tahun 1990.

Paten dan penelitian Banya" orang termasuk pa­ ra ilmuwan takut bahwa keberada­

an paten atau aplikasi yang poten­ ial akan mempengarul,i peneli­ tian d i bidang tersebut. Kelakutan ini didasarkan atas ke a lahpaha­ man tentang pengertian ba hwa penel itian ilU sendiri merupakan s ualu pelanggaran terhadap paten . Namun sebuah paten han a men­ cakup penggunaan pen muan t r­ ebut secara komersial. Penelitian seear spesifik dikecualikan oleh hukum atall melalui kepllt san pengadiJan telah ditetapkan bahwa penelitian bukan tennasuk kegi­ atan pelanggara n paten. Karena itu, penelitian yang diarahkan un tuk membuat penemua n baru. meningkatkan penemuan yang telah ada., menemukan pengguna­ an baru dari suatu penemuan atau memproduksi prod uk baru, bukan merupakan suatu pelanggaran. Hanya ada satu perkecualian di sin i bahwa di banyak negara, uji klin is atau uji lapang yang d il a­ kuka n unlllk mendapatkan ijin dari pemerintah d ianggap sebagai ebuah pelanggaran . Kekhawatir an terhadap paten makhluk hidup Sebagian orang dan orga­ ni asi berpendapat bahwa pembe­ rian paten untllk makhluk hidup. terutama tanaman dan hewan ti ngkat tinggi. secara moral adalah salah . Pendapat ini menge am­ pingkan fakta bahwa seluruh ke­ giatan pertani an tergantung pada pemilikan hewan dan tanaman, dan bahwa para petani dan lainnya telah melakukan pengembangbi­ akan secara elekti f untuk karak­ ter-karakter yang diinginkan sejak permu laan sejarah umat manu ia .

2S

Pend apat yang menyatakan bahwa pematenan l11 ak hluk hi dup atau pe nel11 uan biotekn logi lai n­ nya akan men ak ibatkan efek­

terutama di bidang yang kompleks seperti bioleknolog i, upaya ini akun penuh de ngan k ulitan dan dapat berak ibal pem hon memba­

efek negalif perti t...erusakan struktur kekerabatan. bah aya ter­ hadap IiI gkul1 g n alau pen urun an

ta lka n nialnya untuk mcmatenkan tern uannya. atau perl indungan yang diperolch akan terlalu SC I11 ­

K on sullan paten menyiap kan spe ili kas i paten ber­ dasarkan kon u Itas i dengall p ne­ mu. menyiapka n dan menyerah­ kan selunlh dokumen yang d iper­ lukan, menje las krul esensi kebe­

keanekaragaman haynli adalah ha l

pi t. Ke Lli itan ter ebul akan lebill be ar lagi bila erl indungan di

ratan-keberat an Pemeriksa Palen dan l11enyar ankan alte rn atif-a lt r­

negar a-negara lain diper lukan . Karena ilu, adalah sualu hal yang biasa bi la pemohon menunj uk seorang kon ulta n paten untuk

n lif tan ggapannya, dan mena­ ngani se luruh lIrusan yang ber­ hubungan dengan Ka ntor Paten . Bila apl ikasi paten ke negara lain d iperlukrul , maka konsultan paten akan bekerj asama dengan ko n ul­ tan paten di ncgara-negara yang di l Lij u karena diperlu kan alamat pelayanan di setiap negara untuk surat-meny ural secara re mi. (M. Ah kam Subroto: A ustra lian Bio­ techno logy Assoc iation. leaflet no . 12: Patents and B iotech­ no logy, 1996).

yang l11 enyesatkan. Ere k-efek ne­ gati r Ie ebul adaiah merllpakan hasi l dari sebab- eb b lain dan tidak ada hubul1gannya dengan pem beri an paten terhadap pel e­ rnuan- penemuan semacam ilu .

iapaka b kons ul tan paten ? Dimun~k in ka l1

bagi seorang pemohon paten ull tllk I11cmpers i­ apkan dan mengaj ukan sendiri aplikasi dan spes ilika i paten se rta

menanggapi keberatan-k beratan Namun,

dari Pcmeriksa Paten.

mewakil inya. D i A u tral ia. kon ul tan pa­ len ada lah eseorang yang mem­ punyai gelar atau kua l i fi kas i se­ deraj at dalam bidang te kni yang scsuai, dan tcla h lu lus ujian hi ngga erdaftar oleh the Patent

Almmeys Professional Slandards Buard. KOl1su llan pa ten bertindak sebagai pcnghuhung an tara pcmo­

han dengan kantor-ka ntor paten di elu ruh dunia.

DOKINFO

BIDANG JASA DAN INFORMASI

PUSLITBANG BIOTEKNOLOGI-LIPI

Sub Bidang Dokumentasi dan Informasi menyediakan : 1. Penelusuran literatur (manual, internet, CD-ROM, CCOD dan OPAC) 2. Sirkulasi buku dan majalah (termasuk inter-library loan) 3. 8erbagai manual & prosiding Bioteknologi 4. Terbitan berseri (Annales 80gorienses, Warta Biotek & Abstrak Biotek)

Untuk m engeta hui lebih la nj ut dapa t menghubungi :

DOKINFO, Puslitbang Bioteknologi-LIPI

Telpon : 021 -875 1527 Fax : 021-8754588

E-mail : bioteklib@ hotm a il.com

26

WARTA BIOTEK

POPULARISASI BlOTEK

BIOTEKNOLOGI DAN NEGARA BERKEMBANG

Kontro t'r i

Janji bioteknologi untuk perta­ nian

Pendukung bi tel-.no logi mera a bahwa biotekno logi dapat Pada rahun 1960-an rev lu j membantu masyarakat di Ilegara­ hijau mcni ngl-.atkan prod uksi pa­ negara berkembang dell 'an me­ ngal1 di selumh dunia dengan ma nfaalkan lahan perta ni annya, menyed iak.an varielas tanaman menghidupi keluarganya, dan pangan yang berproduksi linggi mencegahnya dar i kesellgsaraan bagi petani seperli ga ndum dan dan penyakit. Namull kritik yang jagung. Tetapi meningkatnya pro­ ada menyatakan bahwa biotek n ­ duksi juga memcrlukan biaya logi merupakan perbaikall tekllo­ tanaman m merlukan kondisi logi (techl1o-jix ) untuk pel1T\asa­ ik lim tcrtcntu, tanah yang subur lahan yang berhubungan de ngan dan banyak air dan pupuk, e­ isu-i u polilik, penyebaran kese­ ringkali. varietas-varictas ini lebih jahteraan yang tidak merata dan renta n terhadap erangan hama kelanjutan dari praktek-praktel-. dibandingk.an dengan arietas pertanian yang tidak 'rke, inam­ scbelumnya sehingga pctani haru bungan . Beberapa penentang bie­ I11cnggunakan pcslisida , Akibat­ teknologi pertanian di negara­ nyu kcunlun gan lItama lidak llntllh.. negara berkem bang merasa bah­ si mi s/"in , wa biotekllologi sebe narnya apat Biotek.no logi modem yang menillgkalkan input dan biaya ba­ d igunaka n ecara bersa rn
OL. 15

O. I MARET 200 I

mutu pada tanaman a Ii . Tanaman yang dihasi lkan akan me njad i produ ktif p' da !ingkungan lokal tanpa m merl ukan inpul tal11 bahan karena lanal11 an lersebut dapat di rekayasa 1I11tuk bisa membuat pestisida endiri atau menambat nitrogen atau dapat t Ll III buh pada lahan dengan sedikit a ir. Lebih banyak lahan yang masi h asli atau belul11 peman dijamah yang ada di bumi in i terdapat di negara-negara berkembang, tempat tingga l jenis­ jenis langka dan yang belum teridentifika i. Bi teknologi perta­ n ian merupakan suatu alat yang dapat berpcran dalam mcmperta­ hankan sumb rdaya lingk.ungan di negara-negara berkembang de­ ngan cara membuat lahan per­ lanian ll1enjadi lebill produktif dan menct:gah pClllbukaan lahan bartl. Makanan yang menyebatkan: Vaksin yang dapat dimal an Salah satu cara lain ya ng dapat d illlanfaatkan dari biotek­ nologi untuk mern aj ukan negara­ negara berkclllbang ada lah mela­ lui pencegahan penyaki t. Bayang­ kan ji ka and a dapat makan pisang atau kentang yang letah di ak­ sinasi tcrhadap suatu penyakit yang dapat mematikan . Kcdengar­ annya lebih baik daripada vaksin yang distl ntikkall di lengan kila . Pertimba ngkan bahwa sebagian anak-anak di negara-negara ber­ kembang belu01 pernah melihal

27

seorang dokter dan bahkan belum pernah berurusan dengan jarum . untik yang dapat menyelamatkan hidupnya. Visi para peneliti ada­ lah bahwa vaksin yang dapat dimakan dapat membantu anak­ anak terse but karena buah-buahan atau sayuran yang mengandung vaksin dapat dikeringkan untuk kemudahan penyimpanan dan transportasi, atau ditumbuhkan se­ cara lokal dan tidak memerlukan penanganan perawat atau dokter. Pada musim panas tahun 2000 suatu vaksin untuk virus Nork­ walk yang diekspresikan pada kentang telah diujicobakan pada manllsia dan berhasi I mening­ katkan respon kekebalan. Virus ini merupakan virus penyebab penyakit yang terbawa dalam ma­ kanan. alah seorang penelitinya, Charles J. Arntzen dari Boyce Thompson Institute for Plant Re earch di Cornell University, A sedang mengembangkan vak­ s in yang dapat dima kan untuk hepatitis B. Vaksin yang dapat dim akan untuk kolera, infeksi o leh E. coli dan virus rabies telah sukscs pul a diuj icobakan pada hewan .

Golden rice Salah satu dari tawaran bio­ lck nologi yang menjanjikan ada­

28

lah potensi bioteknologi untuk perbaikan nutrisi bagi tanaman pangan utama dunia. Sejak bulan Juli 2000, hal ini bukan hanya kemungkinan , namun suatu ke­ nyataan. Para ilmuwan dari Swiss Federal Institute of Technology dan . University of Freiburg di Jerman telah membuat pad i me­ [alu i rekayasa genetika untuk memproduksi beta karoten di bagian bijinya yang dapat dima­ kan yaitu endosperma. Badan kita mengkonversi kan beta karoten menjadi vitamin A. Lebih dari dua milyar pen­ duduk di Asia Tenggara meng­ konsumsi beras sebagai makanan pokok . Penduduk di belahan bumi ini tergantung pada beras antara 30-70% untuk memenuhi kebu­ tuhan harian kalorinya; satu dari 3 orang di dunia tergantung pada beras untuk lebih dari separo makanan hariannya. Namun, ma­ kanan yang mengandung sebagian besar beras dapat menghasilkan defisiensi gizi dan vitamin karena beras tidak mengandung beberapa komponen esensial yang diperlu­ kan tubuh untuk kesehatan . Di seluruh dunia, 800 juta penduduk­ hampir setengahnya adalah anak­ anak, menderita defisiensi vitamin A (VAD) yang mengakibatkan gejala mulai dari buta di malam hari pad a kasus sedang hingga

menyebabkan kematian pada ka­ yang parah . Kejadian ini menimpa 13% penduduk di dunia. Beta karoten, yang terdapat secara alam i pada wortel, mangga dan aprikot, bertanggungjawab pada sifat warna oranye. Padi yang telah dikembangkan oleh para i1muwan yang dipimpin oleh Dr. Ingo Potrykus mempunyai warna kekuningan karena kan­ dungan beta karoten di dalam endospennanya, oleh karena itu disebut " Golden Rice" (beras emas). Alasan lain pemberian nama ini adalah janji-emas bahwa tanaman ini diperu ntukkan bagi penduduk yang menderita VAD di negara-negara berkembang. Pene­ litian masih dilakukan untuk meningkatkan kandungan vitamin A pada beras dan untuk me­ mindahkan sifat ini pada varietas lainnya. Mungkin masih diper­ lukan beberapa tahun lagi agar Golden Rice ini tersedia bagi para petani di negara-negara berkem­ bang. Namun, kendala ilmiah dan politik yang telah dipecahkan da­ lam pengembangan Golden Rice merupakan langkah besar yang sangat berarti bagi aplikasi pe­ manfaatan bioteknologi di negara­ negara berkembang (T.M . Erma­ yanti; AgBiotech lnfosource (su 61, Pebruari 200 I). SliS

WARTA BlOTEK

PENELITIAN DAN

PENGEMBANGAN

traosgcnil< yang mengan­ dung lisostafio: kemungki na n untuk mengobati mastitis SUSII

Mastitis adalah suatu infeks i pada kelenjar mamae yang meng­ infeksi lebih dari separo dan Jum ­ lah sapi perah yang tcrdapat di Amerika Serikat. Akibat infeksi ini industri susu el i negara ini menge luarkan lebih dari 180 USD untuk etiap ekor sapi etiap ta­ hunnya sehingga diperkiraka n le­ bih dari salu milyar dola hilang akibat penyakit ini . Pada umum­ nya infeksi in i dis babkan o/eh bakteri Staphylococclis Qureus yang menyebabkan rusaknya ja­ ringa n dan menu runkan produksi u u. Infeksi ini su li t dikontro l den gun menggu nakan antibiotik . JlIrnal attire Biotechnolo­ gy edi i bulan Januar i 200 I lalu tela h Illemberitakan hasil peneliti ­ an para ilmllwan dari niver ity of Vermont, In titute for Animal Health di Inggris dan U DA Agri­ cultural Research Service (Be­ thesda, MD) lentang kem ungkinan penggunaan bioteknologi dalam mengatasi mastitis. Kelol pol,. pcnelitl ini telah mengelllbangkan tiku transgenik yang dapat me­ ngel uarkan susu yang nH~ngan ­ dung protein ,.mti-.\fl.1p/~l'lucoc;cal yang disebut lisostafin (lysnstl.1­ phin). Li ostafin adalah pepfido­ Kly cQn hydroluse ya ng secara normal diprocluksi oleh bakteri ,taphyloc.:uc;cus silllulans . Tiklls lransgenik yang dapat mengel,. ­

OL. IS NO. I MARET 200 I

TE RBITAN BAR U MENGENA I BIOTEKNOL OGI Ar tikel

Daftar art ikel berikut merupakan koleksi dari para staf peneliti Puslitbang Biotekno logi di Cibin ong. Bylund, F., A. Castan, R. Mikkola, A. Ve ide & G. Larsson . 2000. Innuence of scale-up on the quality of recombinant human growth hormone. Biotechnology and Bioengineering 69 (2): I 9­ 128. (YW) Casazza, A.P., A. Basner, R. Hofgen & H. lIes e. 2000. Expression of threonine synthese from Solanum tuberosum L. is not n~etabo licall regu lated by photosynthesis-related signals or by IlItrogenous compounds. Plant Science 15 7: 43- 50. (MA ) Dehority, B.A. & P.A. Tirabasso. 2000 . Antibiosi between rum ina l bacteria and ruminal fungi . Applied and Environmental Microbiology 66 (7): 2921 -2927. (YW) Galindo. E., A.W. Pacek & A.W. Nienow . 2000 . Study of drop and bubble size in a sti mulated mycelial fennentation broth of up to fou r phases . Biotechn logy and Bioengineering 69 (2): 213 -22 1.

CVW) Gandolfi, F. 2000. penn-mediated transgenesis. Theriogenology 53: 127 -137. (IICA) Ge erick, c., H.P.J . Bonar iu , L. Ko ngersle , H. Hauser & P.P. Mueller. 2000. Enhanced pr ducti vlty during controlled proliferat ion of BHK cell in continuously perfused bioreaclors. Biotechnology and Bioengineering 69 (3): 266-2 74. (YW) Hirata, T. , Y . Tamura, N . Yo"-obatak , K. Shimoda & Y. Ashida . 2000 . A 38 kDa allylic alcohol dehydrogenase fro m the cultured l;e ll of Nicofiana rabacum. Phytochemistry 55 : 297-303 . (MAS) Kaufmann. 11. , J.e . Bailey & M. Fu enegger. 200 1. U e of antibodies for detection of phosphorylated protei ns separated by tw -dimentiOl al gel electrophoresis. Proteom ics I: 194-199 . (MA ) Kubota. C., H. Yamakuch i, J. Todori, K. Mizosh ita, N. Tabara, M. Barber & Z. Yang. 2000 . ix cloned calves produced from adul t fibrob last cells after long-term cu ltu re. PNAS 97 (3): 990-995 . (IICA) Li acek, F.C., M.D. Train i, D. Sexton, J.L. Harry & M.R. Wil kins. 200 I. Strategy for protein isoform identitication from expressed equence tags and it applicati n to peptide mass fingerprinting . Proteomlcs 1: 186- 193 . (MAS) .

29

presikan Ii 0 latin ternyata res is­ le n Lerhadap infck i yan g discbab­ kan oleh S. aureus . Tiklls transge nik yang me­ ngandun g gen liso Lafi n dik el11­ bangkan mc lal ui met de standar yaitLl dengan mi ro injeksi D A ke da lam oos it yang t la h I11cng­ alam i ferti li asi . Namun prosedur 1111 tidak se ederhana sepert i mengambil ge n lisostati n dan menginjeksikan kc talam 0 0 it tiku saja. Pene lilian penda huillan menunjul,J..an bahwa ekspresi gen lisostafi n dari bakteri pad sci eukariot menyebabkan produksi lisostafin yang ti dak akt if kare na terjadinya glikosilasi protein . Oleh karena itu diperl ll kan modi fikasi terhadap gen Ii ost fi n agar be­ berapa 3sam am inonya tidak mengalami glikosilas i. Dengan demikian sel -sel eukariot yano mengandung gen lisostafi n yang tela h l11 engalami moditi kas i gene­ tik ini dapat mengek presikan pro­ tein yang aktifsecara bio logi. eba nyak 8 tik lls transge nik te lah dikcmbangkan . Dua dianta­ rany lidak Im:nurunka n gcn Ii '0­ stafi n kepada anak-anaknya. Tiga eko r diantara nya ll1e n geks presi~ n liso tatin pada prod uksi susunya dengan konsentrasi yang sangat rendah (k urang dari 0,02 mg/ml). Tiga ekor lainnya mengekspre i­ kan lisostafin dcngan Konsentrasi rendah (0,06 mg/111 I), mediu m (0,13 mglml) da n ti nggi (0,8-1 ,3 mg/ml). eperti yang diharapkan, ek pre ii i ostafin h nya terjadi pad a ke lenjar mam ae karena digunakan prom oter ovine b la­ lactoglubolin ya ng digunakan untuk ek pres i gen Ii 0 tafi n dan sangat spesifik untuk kelcnjar ini.

30

Mikl s, G.L.G. & R. Maleszka. 200 I. Pr tein functions and biologica l contents . Proteomics 1: 169- I 78. (MA S) Moy nagh , J. 2000 . EU regul ati n and consum er demand fo r nim al welfare. AgBioForum 3 (2&3 : 107-1 14 . (MAS) Osawa, R., K. Kuro iso, S. Goto & A. Shimizu . 2000. Isolati on of tanni n-degrading lactobaci ll i fr m humans and fenn ented foods. App lied and nviro nl11 ental Microb io logy 66 (7): 3093-3097. (YW )

Pawson, & P.. ash. 2000 . Prote in-protein interactions defi ne peciticity in igna l transdu ti n. Genes and Developm nt 14 : 1027- 1047 . (IICA) Rieth, A., F. Pothier & M.A . Si rard. 2000. Electroporation of bovine spermatozoa to carry DNA contat in ing high ly rep tit ive sequences into oocyte an d detection of homo logous recombinati on events. Mo l cul ar Reproduction and Development 57: 338-345. (IlCA Rieth, A. F. Poth ier, M. Gagn & M.A . Sirard. 1999. U e of Bovine satel lite sequen es to increase tra n genei integrati n by hom logous recomb ination in bovine embryos. Molecula Reproducti n and Deve lopment 53: 1-7 . (lICA) Saeed, A.M., M.J . E criba, M.A. Si lvestre & F. Garc ia-X imenez. 2000 . Vitrification and rapid-freezi ng of cumul us ce lls fro rabbi t and pi gs. Th riogenology 54 (9): 1359-1 371. (IICA) S jc, L. , D. Grll bi ic & G. Vunjak-Novakov ic . 2000 . Bioreactors for plan t engi neering: an outl ok fo r Furth r resea rch. Biochemical ng incering JOllrna l 4: 89-99 . (M S) Shemesh, M, M. Gurev ich, E Ilarek-Markowitz, I. Benvenis ti, L.S. ' hore & Y. , tram 2000 . Gene Integration into bov ine perm genorne and its express i 11 in transge nic off: pri ng Mo lec ul ar Reproductio n and evclopment 56 : 306-308 . (!I CA) Sicl, mann, 1\ . & H. Meyer. 200 I. Phosphoam ino acid analy is. Proteomics I : 200-206. (MA ) Tama I ire, K. ., T. Wa kayama, D.C. Blanchard & R. Yanagimachi. 2000 . Postnatal gro wth and behavioural deve lopment 0 mice cloned Crom ad ult cumu lus cells. Bi J Ty of Reproduction 63 : 328-33 4. ( IICA) Tani, T., Y. K to & Y. Ts unoda. 2000. Developmental potenti al of cumulus ce ll-derived culture ce ll froze n in a qu iescent state after nuclear transfer. Theriogenology 53: 1623 - 1629. (ileA) Weitzhandler, M., D. Farnan, J.S . Rohrer & N. Avdalovic . 200 I. Protein varian t separations lIsi ng cati on exc hange chr matography on gratified, polymeric tali nary phases. Prot omics 1: 179- 185. (MAS ) Wolf, ., W. Schern thaner, V. Zakhartchenko, K. Prelle, M. toj kovic & G. Brem. 2000. Transgenic technol gy in farm an ima ls ­ progress and perspectives. Experimental Physio logy 85 (6): 2 110 625 . (II 'A)

WARTA BIOTEK

Unt uk evaluasi res istensi terhadap infek i S. aureus, ke­ lenjar mamae dari tikus- tih. u lra nsgenik diinok ul asikan dengan 10.000 partikc l S aureus. Pad a dosis in i, semua kelenj ar mamae non-transge nik terinfeksi oleh S. aurem," . Sebaliknya, ke lenjar dari semua ti klls transgenik yang me­ ngandung lisostafin tinggi resisten terhadap infeksi, dan sebanyak 40% kelenjar yang bera al dari tikus transgenlk yang mengan­ dung lisostafi n rendah da n tingg i juga resisten terhadap infeksi. Dilambahkan pula bahwa kelenjar tikus k ntro l yang dii nfe si mengalam i kerusakan jaringa n. sedangkan kelenjar likus Lra ns­ genii< yang diinfeks i menu nju kkan l11orfologi jaringan y ng nonna l. Penelitian ini menu nj ukkan bahwa tikus transge ni k mengek ­ presikan protei n lisostafin anti­ staphylococclis yang mellingkat­ kan resistensi terhadap infek i dari s. <1l1reus . Tiku transg nik tetap normal dilihat secara fis iologi, kesuburan. integrita ke lenjar m ­ mae, da n profi l protein sus unya. Namu n, resi tens i ini bukan ber­ arti j uga rcs isten terhadap infek i yang di ebabkan ole h bakteri nont. phylococcu maupun infeks i pada saat tidak mcnYlI sui . Namll n I mikian pcnemuan ini Illerupa­ ka n karya yang sallgal III njanj i­ kan untuk mengontro [ rna ti tis. Langkah selanjutnya adala h membuat sapi perah tran genik yang mengandung lisostafin untuk mengetahui respon yang sa m terhadap infeksi S. lureu ·. Akti­ vitas Ii ostafi n sa ngat sp si fik terhadap bakteri staphyloccocus, sehingga susu yang dihasi lkan

VOL. ISNO. I MARET200 1

Buku Buku berikul merupakan ko leksi dari Redaks i. Ganjar, 1., R.A. Samson, K. van den Twee l-Verm eulen, A. Oetari & I. Santoso. 2000. Pengenalan Kapang Tropik Umu m. Yayasan Obor Indonesia. ISBN: 979-46 1-289-8. Te bal: xi ii + 136 halaman . Harga: Rp. 45.000 . (M AS)

lnformasi Teknis Dokum n lengkap Infonnasi Teknis di bawah in i merupaka n ko l ks i yang dimiliki oleh para staf peneliti Puslitbang Bioteknologi. Fotokop i dapat diperoleh dari Redaksi dellgan mengganti biaya fotokopi dan ongkos kirim. Becker. O.K., B. Dugda le. B., M.K. mith R.M. Harding & OJ . Dale. 2000. enetic tran formation of Cavend is h banana (Musa spp. AAA gro up) cv 'Grand Nain' v ia microprojectile bombard ment. Plant Cell Reports {9: 229-234 . (TME) Berlann ino, M.M. & M. Mili. 2000. Agrobac! rium- med iated genetic transfomlati on of a phalaenopsis orchid. Plan t Ce ll Reports 19: 435 -442 . (TME) Call i II, G., P.K. Wa lsh & D. Donnelly. 2000. Detenni nation of yeast glycogen con ten t by indivi du al ce ll spectrosc Pi' usi ng image analy is. Biotechno logy and Bioengineering 69 (3): 3 12-322. (YW) eh , M.-J., C.D. Ha & P.G. Lemaux. 2000. Productio n of transgeni ta ll feseu and red fescue plants by particle b mbardment of mature seed-derived high ly regenerative tissues. Plant Cell Reports 19: 1084- 1089. (TME) Cushman. J.C., T. Wu lan, N. Kuscuoglu & M.D. Spatz. 2000 . Efficient plant regeneration of MesembryanthemulII crysllIllinul11 via somatic I;;mbryogenesis. Plant Cell Reports 19: 459-463. (TME) Folt • K.M. & L.S . Kaufma n. 2000 . Preparation of transcriptionally active nuclei fr m eli lated Arabidopsis thaliana . Pla nt C II Reports 19: 504-5 10. (TME) Frisc her, ME., J.M . Danforth, M.A.N. Healy & F.M.S aunders . 2000. Whol -cell versus total RNA extraction for analys is of microb ial cOlTI munnity structure with 16S rRNA -targeted oli gonucleotide probes in salt mars h sediments. App lied and Environment I Mi robio logy 66 (7): 303 7-3043. (YW) Ka hn ,D.W., M. D. Butler, D.L. Cohen, M. Gordon. J. W. Kahn & M.E. Winkler. 2000. Purification of plasmid DNA by tangential fl ow fi ltration. Biotechnology and Bioengineeri ng 69 ( 1):101 - 106 . (YW)

31

I

lidak mempunyai pengaruh ter­ hadap ku ltur bakteri yang d ipergu­ nakan pada in dustri makanan yang mengandung u u. Dengan dem i­ kian susu tetap In rupakan ma­ kanan yang menyehatkan, bahkan menjadi I ih ba ik. Sumber: [SB New Report Pebru­ ari 2001 . (TM E)

BERITA DARI INTERN T

KafeBiotek, Situs Bioteknologi Pcrtama di Indone ia (http ://www.kafebiote k.or.id) Se buah situs Web tentan g bioteknologi d iluncurkan tanggal 7 Pebruari 200 I yang lalu . Situs yang dikel la oleh LSM H nd al (Wahana Pendayaguna n S umber­ daya Alam) in i d imak ud kan se­ bagai media informasi, komun ika­ si dan diskusi tenta ng bioteknol ­ g i. Dalam KafeBiotek, masyarakat tidak semata bisa mencari tahll infonn asi bi tekno logi , namun mereka bisa melakukan k m uni· kas t dan di klls i dengan pengasli h website maupun komullikas i antar pengunj ung website. elai n ttll, web ite ini j uga dimakslId kan se­ bagai ajang pertemua n "-elompok masyarakat yang menaruh III inat dala m bida ng tcknologi . Men urut pe ngelolanya, data dan in formasi situs ini aktual dan akan sela lll di­ update . Sa at in i aka n di -update setiap l11 inggu, na mun pada tri­ wllian terakh ir tahu n 200 1 mudah-

32

Kozwich . D., K.A . Jo hansen, K. Land au, C.A. Roehl, S . Woronoff & P.A. Roehl. 2000 . D velopment of a novel, rapid integrated OYp',osporidiuni parvwn. detl;ction assay. Applied a nd Environmenta l Microbio logy 66 (7): 271 t -2717. (YW )

Paten Doku men paten be ri kut merupakan koleksi dari Redaks i. Fotokopi dapat diperoleh dari Redaksi dengan mengganti blaya fotokopi dan ongkos kirim .

d~k ll m en ter~ebu t

Brown, I.L., K.J. McNaught, R .N . Ganly, P.L. Conway, A.J. Evans, D.L. Toppi ng & X. Wang. 2000. Prob iotic compos itions. US Patent No. 6,060 ,050. (MAS) John. M.E. 2000. Cotton fiber-spec ific promoters . US Paten t No. 6,096,950 . (MAS) Kerr, R.G. 2000 . Method for produc ing marine-derived compounds and novel compounds prod uced therefrom . US Patent No. 6,046,041 . (MAS) Lajo ie, C.A., CJ . Kel ly, A.C. Layton & G .S . Say ler. 2000. Biolumi nescent reporter bacter ium. US Patent No. 6 110661. (MAS) , , Lu, S.-F.., F . -~ . Lee & H. -K. Chen. 2000. T herm otoleran t a nd hi gh acetic aCid -producing AcelObacler bacterium . US Patent No. 6,096,528 . (MAS) McMahon, P. 2000. System for the cell cu lture and cryopreservation of marine invertebrates. US Patent No. 6,054,3 J 7. (M AS) Pep in, M .F., J . Archambault & C . Chavarie. 2000. Method for increa ing the growth of plant cell cu ltures. US Patent No. 6,069,009 . (MAS) Sa kuranaga, M . & K . Kato . 2000 . Pro cess for remediation of conta mi nat d soil. U Pate nt No . 6,12 1,040 . (MAS) Slater, M.R., F. Huang, J.R. Hartnett, E. Bolchakova, D.R. Storts P. Otto, K.M . Mi ll er, A. Novikov & G .A. Velik d v rskaya. 2000. Thermophilic DNA polyrnerases from Thermo/aga neapolitana. US Patent No . 6,077,664. (MA ) Welling. G . W., F. Schut. P.S . Langendijk, GJ . Jansen M.H .F. Wi l"-ingson & P. Elffrich. 2000. US Patent No. 6, J 07.03 3. (MAS) Zhang, M.L., C .-X. Peng & Y .-F. Zhou. 2000 . Methods and compositions employ ing red ri ce fermentation prod ucts. US Patent No . 6,046022 . (MAS)

Skripsi Skripsi berikut rnerupakan hasil penelitian mahasiswa S I dari berbagai pergurua n tinggi yang dilakukan di Puslitbang Biotekno log i-LIPI.

WARTA BlOTEK

muda han sudah bisa di -lIpdate etiap hari. Di KafeBi otek juga akan d ised iakan ruang untuk kegiatan em inar-E dan Gagas . Masyara­ kat yang benn inat dapat berpar­ tisipasi dengan mengirimkan ma­ kalah lllaUpUIl tanggapan . Sedang­ kan ruang Gagas menyajikan ga­ gasan yang erka itan dengan bi ­ teknologi . Lingkup Gagas menca­ kup riset, pengembangan, pene­ rapaJ1 bioteknologi serta penguat­ an kelem bagaan dan kapasitas lokal. Di ruang Gagas ini orang bi a mengirimkan suatu u ulan yang memerlukan duk ungan pe­ nguatan konseptual, penguatan keorgan isasian, mau pun da na dari pihak lai n. Bahkan bisa pu la mengajukan tawara n keg iatan, yang dana I11UllPUIl keorganisasi­ annya udah tersedia nam un perlu partisipa i pihak lain. Unluk m mberikan layanan yang maksimal , KafeBiotek dia­ suh oleh tiga pene liti biotekn logi dar; IPB yaitl! Dwi Andreas Santosa, Anton ius Suwan to dan Sudarsono. Disamping itu, Kare­ Biotek juga menyediakan koneksi langsung dengan be berapa web­ site lain eperti asosia i perda­ gan gan. indu tri pangan dan per­ tan inn, lembaga advokasi, lemba­ ga pemerintah, lem baga riset ya­ ya an, organ isasi petan i dan pro­ sesor bij i-bijian. umber: A taga!com, 0 7 Februari 2001 . (MA ') Palell

Untuk Arlequin

Versi

2.000

Pada Warta Biotek Tahu n XI No. 1-2, Maret-Juni 1997 (hal.

VO . 15 NO. I MARET 200 1

Hel mia h. 2000. nalisis pr til DNA genom beberapa galur Baci!1us thuringiensis dengan elektroforesis gel medan berpulsa (PFGE). Skrips i Sal:jana Jurusan Ki mia, Fakultac;; Matemati ka dan Jlmu .:eng taiwan Alam, Institut Pertan ian Bogor. vi + 18 hal. (MA ) MUJlantoro, A. 2000 . Optilll asi produksi bakterio in ya ng dihas ilkan oleh Lactobacillus sp . galll r DSS 2 . 1. Skripsi Sarj ana Jurusan Farmasi, F ku ltas Matematika dan II mu Pengetah uan Alam, Universitas Indonesia. xi + 69 hal. (YW) Mul uk, T. 2000. Anali is molekuler gen Cry dari ga lur-gal ur muta n Bacillus Ihuril1giensi ub p. kursfaki HD-I dengan teknik P R (Polymerase Chai n Reaction). Skripsi arjana Jurusan K imia, Fakulta Matelllatika dan II mu Peng tallLlan Alam, Institut Pertan ian Bogor. vii i + 19 hal. (MAS) Novianti, F. 2000. Skrining bakteri asam laktat ungg ulan penghasil asam laktat. Skripsi Sarjana Jurusan Farmasi Fakultas Matematik dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Indonesia. x + 75 hal. (YW) Sari, M. 200 1. Peningkatan produksi spora dan protein kristal delta­ endot ksin bahan aktif biopestisida asal bakteri Bacillus lhuringiensis da lam medi um kaldu hati sapi . Skripsi Sarjana Jurusan Kimia , Faku ltas Mat malika dan II mu Pengetah uan Alam, Universitas Nusa Bangsa, Bogor. x + 51 hal. (MAS) Sasamin ingsih, A. 2000. Akt ivitas enzi m-enzim ekstrase luler pada sistem aluran pencemaan ikan guram i. kri psi Sarjana Juru an Kimia, Fak ulta Matematika dan II mli Pengetahuan Alam. Institut Pertanian Bog r. ix + 25 hal. (MA ) Suhendar, A.D. 2000. Bioremedi asi pestisida organofosfat di azinon secara ex situ denga n menggu nakan mikrob indigenous dari areal Skripsi Sarj ana Jurusan Tekno logi Industri pcrsawahan . Pertanian, Fakultas Teknologi Pertanian, Ins titul Pertanian Bogor. vii + 60 hal. (MAS) Su ilo, J. 2000. Pemanfaatan limbah se baga i medium ferm ntasi Bacillu' thuringiensis ubsp . kurstaki HD- l untuk memproduks i spora sebagai bahan bioinsektisida. Skrips i Sarj ana JUrLlsan Ki mia, Fakultas Matematika dan Il mu Pengelahuan Alam , Instit ut Pertanian Bogor. xi ii + 15 hal. (MAS) Wahyuni, T. 200 I. Fitoremediasi limbah organik pestis ida diazin n menggunakan kultul' akar ram but Solanum nigrum L. kripsi Sarjana Program Studi Kimi a, Fakulta Matematika dan Ilrnu Pcngetahuan Alam. Institut Pertanian Bogor. vi i + 2 8 hal. (MA )

Katalog Katalog berikut merupakan kole"s i dari Redak i.

33

33) telah d iberitaka n ten tang perangkat lupak untuk ana lisis data genetika po pulasi yang disebut Arlequi n. Saat in i tela h tersedia Arlequ in versi 2.000 dan baru-banl ini telah pula di kel u­ arkan palc:h untuk versi 2.000 yang dapat di-dowl1load dari In­ ternet secara gratis. Dalam patch illi tidak terdapat metode perhi­ tungan baru, namun hanya mem­ perbaiki beberapa bug yang meng­ ganggu dari versi 2 .000 . Untuk dapat menggunakan p atch ini, Arlequin ver i 2.000 harus sudah terinstal di komputer. Arlequ in 2.0 0 dan pal 'II-Ilya (versi 2.00 I ) dapat di-download dari Internet secara gratis de ngan alamat: http://lgb.uni ge.ch/arlequi n/softwa

Institute for Fermentati on , Osaka (IFO). 2000. List of Culture: Microorganisms. 1111 • edit ion . xxiv + 903 hal. (YW) Saono, S., N.R. Prayitno, A. Oetari , Harsojo, S. Hastiono, E.S . Rahayu G. Rahayu, S.1. Soemara, P. Sudarmono, E.K. Supardiyono, M. Udi harto, P. Wahyudi, M.S . Wibowo & Y. Widyastuti. 2000. Daftar Biakan Mikroorgani me In donesia. Edi j Kedua. Fomrn Komunikasi Kurator Koleks i Mikr organ isme Ind nesia (Forkom ikro). ISBN : 979-9 77-04-2. ix + 72 ha l. (Y W) The Institute of Physical and Chem ical Research RIKEN). 1999. Japan Collection ofMi roorganisms (JCM) : Cata logue of Strain Seventh ed ition (CD-ROM). (YW). Direktori

Dircktori berikut merupakan koleksi dari Redaksi. Ag-West Biotech Inc. 1999 . Saskatoon An imal Bi otechnology Direct ry. 33 Ih I. (MAS)

rei

Perangkat Lunak

Inform asi lebih lanjut dapat diperoleh dari : Laurent Excoffier Arlequin development team Genetics and Biometry Lab, Unive rsity of Geneva, Sw itzerland Emai l: [email protected] http://lgb. lI n i~e . c h/arleq uinl (MA )

Program kom puter di bawah ini merupakan ko leksi dari Redaksi. Bagi yang berminat dapat memperolehnya dari Redaks i (versi lengkap • untuk program freeware/shareware dan versl demo untuk program komersial).

itDS BarD Kultur Jaringan Ta­ naman

I

Red~\soft

Penerbi t Tah un terbit Sistem Operasi Harga Kegunaan

(http://aggie-horticulture.tam u .e­ du/tisscu Itldataba e/ ) Situs ini diperuntukkan bagi pengembangan bi dang kultur ja­ ringan tanaman dan m ikropropa­ gasi . I inya antara lai n pangkalan data untuk penelusuran resep­ resep ku ltur jaringan, formulasi media, label berat molekul, kal­ kulator pengenceran larutan stok. pangkalan data untuk penelusuran

34

Visual Cloning 2000

: Redasoft Inc. (http://www.redasoft .com) : 2000 : Win 95/98/2000INT : U $ 399.00 (untuk peneliti dan akadem isi). : Redasoft Visual Cloni ng merupakan perang­ kat lunak inovatif untuk menggambar peta genetik dan anal isis sekuens. Terdapat , banyak fitur yang sangat bermanfaat seperti grafik anal isis restriks i, penel usuran ORF, perancangan primer, dan integrasi dengan Internet.

Kontak

: tefanie Carmichael, Visual Cloni ng Team , mail : [email protected]. http:/­ Iwww.redasoft.com . (MAS)

WARTA BJOTEK

media. danar pemasok peralatan dan bahan lI.im ia. d n banyal-.. in­ formasi umLlm tenlang ku ltur ja­ ringan tanama n. Situ ini merupakan pe­ ngembangan dari situs 'Plant Ti' ue Culture INFORMATION EXCH NGE" dengan pengelola yang sarna. In onllasi lebih lanjut dapatdiper leh da ri: Dan Lineberger and April Herri ng D partment of Horticultural ci­ ence, Texa A&M University. SA. -mail: danl ineberger@TAMU.­ DU MAS) Layana.n Brita dari Genom­ Web (http://ww.genomweb.com/sub scrib rsignup .htm)

GenomWeb.com saat in i da­ pat melayani pengiriman berita­ b rita yang berhll bungan dengan bi ni dan teknologi gen mik me­ lalui mail secara gratis. Hanya diperlllkan beberapa menit untuk mendaftar di alamat tersebut di alas . etclah terda ftar, b rila-bc­ rita terbaru akan dikirimkan mc­ lalui email ecara rutin de naan topik-topik antara lain: ... Perangkat lunak bioinf nllatik.a & enomik. * NP. Gcn typing & ck pre i g n.

Majalah Baru JURNAL AGROBIOTEK IS N: 14 11-6758. Pel1al1gglll1g .lawah: ugiono Moeljopawiro . Dewan Reclaksi: Djoko Sal1toso, Ika Mariska, Bambang Purwall tara, Sus no Saono dan Komar Sumantadinata. Redaksi Pelaksul/a: Ilusn i Ka illl , Joko Prasetiy no dan Jda N. Orbani.

Juma l AgroBiotek diterbitkan oleh Perh imp un all Biotekn I gi Pertanian Indonesia didukung pendanaannya oleh Asia-Pacific Crop Protection Associat ion (APCP ) dan Asosiasi Industri Perlind ungan Tanaman Indonesia. Jurnal ini terbit dua kali set hun dan Vo l. I , No. 1 tel h terbil pada bulan Juli 2000. Na kah dengan topik bi tekn log i pertanian dapat diterbitkan dalam jumal in i denga n mengik uti fonnat yang di cantumkan pad sampu l belakang bagian dalam . Artikel dapal ditlili dalam baha a Indonesia tau [nggris. V I I, No. I yan g te lah terbit memua t 6 artikcl yang secara Iengkap ditu lis dalam bahasa Indone ia d ng n topik "embriogene i dan organogenesis ubi jalar". "penggunaan marka T dan RAPD untuk identifikasi gen Pi-2(l) pada ranaman padi", " r du !..si litase leh Bacillus coagll/cms". "iso lasi , identifika i dan uji aktivitas antimikro a bakteri asam laktat dari terasi " "ekrcsi interferon-tau oleh blastosi' dari domba" dan "antibodi monoklonal anti Aeromonas hydrophila '. Informasi lebih leng ap tentangj uma l ini dapat diperoleh di alamat redaksi: Balai Penelitian Bioteknologi Tanaman Pangan JaIan Tentara Pelaj r 3A, Bogor 161 II -mai l: borif@ indo.nt.idatallrifcb@ ind.net.id Telepo n: 0251 -337975,339793,316897 Fax.: 0251-338820 (TME) INDONESIAN.TO RNAL OF AGRJCULTURAL CIENCES

I SN: 1345-9635

Editor-ill - hief Arief Budi Witarto (LIPI).

Editorial Board. Agung Purnomoadi, Abdul Iladi, M. Ahkam Subroto,

Tachrir athoni, Ocky Kama Radjasa, Jaka Widada, Arman Wijonarko,

I Wayan Nu~iaya, Kasdi ubagyono .

international Advisory Editors : Prof. Fumio Takashi m (Tokyo

University of Fisheries), Prof. Dr. Toyoki Kozai (Chiba Uni versity).

'" K rjasamagenolll ik. spektrometri massa. ... Pangl-..alan data genomik & integrasi data. ... i chips & Microarrays. ... Pasar dan kcuangan genomik. ... Manajemen genomik .

Indonesian Journal of Agricultural Sciences (IJAS) merupakan jurnal ilmiah in ternasional berbahasa Inggris terbitan resmi dari th Indonesian Agricultural Sciences Association (IASA, http://go.to/iasa). IJA menerbitkan naskah asli hasil penelitian di bidang pertanian

VOL. 15 NO. I MARET 200 I

3S

* Proteom ik &

umber: GenomeW b News er­ ices (genomenews ,genome­ web.com). (MAS) AgBioForum: Vol. 3 No. 2&3 pring! ummer 2000 (http://www.agbioforum.org)

dalam pengertian luas. termasuk kehutanan, peri ka nan, peternakan dan

laill- ain. askah tentang ilmu baru seperti genetika da n biologi

l110lekuler yang berhubungan dengan pertanian j uga dapat diterima.

IJAS akan diterbilkan setahun 2 ka li dan edisi pertama akan ter it Ju ni

200 I. Informas i lebih lanjut dapat diperoleh dari Editor-in-Chief

( mail: [email protected]). (MA )

PROTEOMICS

N(cetak): 1615-9853 .

Editor-in-Chief Michael J. Dunn (l mperial College, Lond n, UK).

I SN(online): 1615-986 1;[

Majalah eleklronik AgBio­ Forum edisi pring! ummer 2000 (Vol. 3 o. 2&3) Lelah terbit dan dapal dibaea atau di-doll'lI/oacl dalam format PDF dari alamat di alas. Edi i kal i ini mengangkat isu khu us t ntang "Under tan­ ding The DifTerences In S - EU Biotech Regulation". Bagi pem­ baea yang belum mempunyai ak­ ses kc [ntemet dupat memperoleh soficupv-n a dari Redat-sl , (MA ) BEASISWA

Tbe British Cb vening Award Program beasiswa Chevell­

ing ini diberikan oleh pemerintah [nggris dan dikelola oleh Briti h Council etiap talu1I1 kurang lebill 60 orang mencrima beasiswa ini baik ulltuk program master maupun kur u -kursus profe ional ingkat (5-10 minggu), sehingga \.!jak tahun 1984 sampai ekarang sudah lebih dari 700 orang yang mcndapat bea i wa dari program inL Pr gram master dan kursu profesional dapat dilak anakan di berbagai un ivcrsitas dan in titu i d i I nggri untuk b rbaga i bidang studio Beasiswa ang diberikan meliputi biaya hidup selama di [nggrrs, uang ku liah dan tiket p awat ke dan dari Inggris.

36

Proteo11lics merupakan jurnal il11liah internasional baru yang unLuk 11lenjadi ' umber inrormasi internasional di bidang proteom it-. Proteom ie mengintcgrasikan pengem bangan metodo[ogi di bidang pcmisahan dan karakterisasi protei n, kemajuan di bidang bioinformatika, dan aplikasi baru proteol11ik di sclu ru h bidang ilmu hayati dan industri . Proteomics ter dia dalam dua format yaitu versi elak dan eleklronik .online), V I. I No . I telah terb it bulan Januari 200!. Ver I online-nyu dapat diakses secara gratis di Internet hingga bulan April alamat htlp://www.wj[ey­ 2001 pada vch .de/homeJprO[COI11ICS. Informasi lebih lanjut dapat dip roleh dari penerbilnya, yaiLu: diran~1ng

Wiley-yell Verlag Gmbll P. . Box ! 0 1 I 6 ! 0 -69451 Weinheim

Gelman} Telp.: +49-620 1-606-0 Fa.'.: +49-6201-606-328 Telek : 465516 chwh d E-mail : subservice(. .wiley-vch.de (MA

Pengumuman mengenai program ini biasanya dilakllkan melalui pemberitaan nasional atau daerah pada bulan Oesember atau Januari seliar tahunnya. sedangkan . fonnulir aplikasinya dapat diperoleh dari kantor British Council di Jakarta atau Surabaya. Selain itu, informasi dapat pula diperoleh dari www britcoun .or.id mulai awal Januari sampai akhir Februari !iap tahun , P r yaratan

untuk melamar beasiswa ini an­ tara lain adalah umur kur ng dari 40 tahun, I.P minimal 2, 7, mampll menulis dan berb icara bahasa Ing­ gris, tela h bekerja selama mi nimal 3 tahun dan mampu untuk berpe­ ran da[am menjalin hu bungan bi­ lateral antara Indonesia dan Ing­ gris. Proses selek i untuk pene­ rima beasiswa ini diawa[i dari pen ilaian formu lir lamaran dan

WARTA BIOTEK

bagi yang memenuhi kriter ia akan d iteruskan dengan tes bahas Jng­ gri dan wawa ncara . Bagi yang ILilus akan dipanggi l un tu k mengikut i kurstl s bahas Inggris di British Cou ncil. Selama kursu ini, kandidat penerima beasiswa akan diberi pengarahan oIeh taf Kedutaan Inggris da n British Coun il tenta ng persyaratan ll1 e­ masuki universitas di Inggris. Tahull ajaran di Inggris dimula i pada bulan September atau Oktober. Informas i lebih lanjllt dapat diperoleh dari : Ibu Yeyet . lIryant i atau Ibu Indah Kanna Til Brit ish Coullcil Gcdung Widj ojo Center, lanta i , JI. lendral ' udirrnao 71 Jakarta 12190 Telpon: 021 -2514 11 5 pe . 147 dan 176 Fak imili :021-2524 129 E-mail : Indah.Kanna@british­ cOll nei Lor. id ( YW)

S-3/Ri 'et Pa ca 8-3 dan YAN­ BINBANG SDM IPTEK ejak didirika nnya, Yaya­ san Pembi naan Pengernbangan umber Daya Manu ia dalam Ilmu P ngetahllan dan Teknologi (Y I3rNl3ANG DM IPTEK) pada tanggal 12 Mei 1997, yayasan ini telah melaksanakan program pembcriao beasiswa S3/ri et pasca S-3 lllltuk SDM Indo nesia di oalam dan di luar negeri . Maks ud J ari program tersebut adala h l11endorong dan m nggerakt...an percepatan llpaya p ngemba ngan Sumber Daya ~Ianusia SDM) Indone ia yang

VOL. IS NO. I MAR.ET 200 1

bcrkualit di bidang Ilmu Penge­ tahuan dan Tekoo! gi . Persyaratan penerima beasiswa ada lah llmur ti dak lebi h dari 35 tahun tln tuk S­ 3 dan 45 t. hun untuk Pa ca S-3 dan tidak sedang menerima b a­ siswa lain. Program in i dilak anakan seti ap ta hull pada tanggal 12 Mei dan 10 Nopember. Ta nggal pe nu­ tupan penerimaan lamaran beasis­ wa adalah ta nggal 21 Apri l dan 20 Oktober untuk masing-mas ing pe­ riode peneri maan beasiswa. Pemi­ Jihan penerima bca iswa dilaku­ kan oleh panitia selek i beasiswa. Pengajuan lamaran di lakllkan de­ ngan mengi i formulir pendaftar­ an Jan jiscrtai dokumen yang telah diletapkan dalam formul ir ter ebut. Lamaran dupat dikirim me lalui pos atau diantar langsung ke ekretariat Y A BINBANG OM IPTEK . Informasi lebih lan­ jut dapat diperoleh dari: S kretariat YANBrNBANG S M IPTEK The Ha bi bie Center Bui ld ing JI. Ke mang Selat n no 98 Jakarta Se latan Telp. 021 -78 172 11, 7802987 Fax. 02 1-7 8 17212 E-mai l: [email protected] URL: http://www.habibie.net (YW) PERTEMUAN YANG AKAN DATANG 4-7 JUDi 2001: III situ an d On-site

Bioremed iation - 6th International

Sympo illm, San Diego, Cal ifor­

nia. Kon tak: http://www.batte lle .­

org/conferences

(TME)

4-8 JUDi 2001 : The IV Latin­

American Meeti ng on Plant

Biotechnology (REDBIO' 200 I).

Go iania, Goia • Brazi l. Ko ntak:

h tlp:l/www .fll nape.lI rg.br/redbio2

00 1

(MAS )

10-14 JU Di 2001: ESACT 200 1

European Society for Animal Cell

Technology Annual Confere nce,

Ty losand, Sweden. Kontak

http://www.esact.org/esact200 I

(TME)

Juni 2001: ICABR

15-18 Biotechnology, clence and Mo­

dern Agriculture : a New Indll try

at the Dawn of the C ntury,"

Ravel lo, Italy . Kontak:

htlp://www .econom ia.u ni roma2. itl

conferenze/icabr/Program. htm

(TME)

24-2 7 JUDi 2001: BIO 200 1 In­

temational onvention and Ex­

hibition , San Diego, Cali fornia.

Kontak:

http://www.bi . rg!events/200 1/e

vent2 00 I hom .htm I

(TME)

8-12 Juli 2001: 10th European

Congres 0 11 Biotechnology: Bio­

technological hallenge in the

e Millenillm, Madrid panyol. Kontak: E-mai l: [email protected] (TME) J9-22

September 2001: 1$1 Internati on al Symposium n Acc!imatiz tion and Establish­ men t of Micropropagated Plants. Conventi on Center of Sani Beach

37

Hotel Resort, San i-Ha lkidi ki,

Greece . Kontak:

Sekretariat :

Syntonos Congress

I 8A Ermou St.

GR-546 24 Thes aloniki, G re ceo

Telpon : 30-3 1-244987

Fax: 30-31 -239926

E-mail: [email protected]

(TME)

15-17 200J:

Oktober Biotechnology and ustainab le

o ve lopment: V ices 0 the So uth and the North, Kairo, Mesir. Kontak: Dr. ( ma il Serageldin Chair, Program Comm ittee clo ICARDA Cairo office P.O . Box 2416 Cairo, Egypt Tel.: (+20-2)

5724358/5725785/5735829 Fax: (+20-2) 5728099 E-mail: icarda-cai ro@cg iar.org (MA ) 2~-26 Oktober 200J: T he 2 Indonesian Biotechno logy on fe­ renee. An Internati na l Confe­ rence and Exhibitio n. Jakarta Convention Center. Indooesia. Kontak: S kretariat: Pu at Pengk j ian dan Penerapan Bioteknologi, BPPT Gedung 63 0 Kawasan Pu piptek, Serpong Tangerang 153 14 Telpon. 021-7563! 20 Fax . 021 -7560208 E-mail: [email protected]. id http://www. ibc.200 1.net (TME) nd

12-16: November 2001: Bio­ afety 3: "Advanced issues in

38

biosafety: Risk monitoring and

pub lic perception of biotechno lo­

gy", Caracas, Venezuela. Kontak:

ICGEB Progra mme and Tra ini ng

Uni t

Tel : +39-04 -37573 33

Fax: +39-040-226555

Email: courses@ icgeb.trieste.it

http://www.icgeb.trieste .itl- bsafes

rv/bsfn OO 11. htm

(MAS)

15-18 September 2002: Agr icul­

tural Biotechnology International

Confere nce . Kontak :

Luci ll Richardson

Telep n : 1-306-683-2242

E-ma il: nbic@ab ic. net or

http://www.abie.net)

CTME)

KURSUS/PELATIRAN YANG AKA DATANG

25-28 Juni 200J: 14th Advanced urse in Pharmaceutical Sci­ ences 200 I, Y ogyakarta. Kon tak: Fakultas Farmasi UGM Yogyakarta Telp.0274-543 120 Fax. 0274­ 5431~0; 546858 e-mail : [email protected] (MAS) 20-29 Juni 2001 : Functional Ge­ nomlcs. 25-31 Juli 2001 : Human Genom e Analysis: Genetic Analysis of Mu lt ifactorial Diseases . 10-18 September 200J : Genetic Molecular and In formatic Me­ thods for C. e{egans.

Untuk ketiga kursus/pelatihan ter­

sebut di atas ko ntak:

Dr. Pelin Fair

dvan ed C ur c Manager The Wellcome Tru t 188 Eusto n Road London NW I 2BE Fax . +44 0 20 7611 8688 E-mail: advancedcourseS@well ­ come.ae.uk (IICA)

PERTEMUAN YANG LALU

Pertemuan JSP Tentang "M.i­ crobial Utilization of Uno. ed Organic R 'ources in A ian Countries" Mataram, 20-21 opember 2000 Pada tangga l 20-21 Nopem ­ ber 2000 telah diselenggarakan "Workshop on Microbial Utili­ zation of Un used OrganIc Re­ ouree in A 'ian Countries' di engg ig i, Mataram, Lombok. Work hop tersebut lllerupakan kegiatan lahunan dalam rangka kerja ama multilateral Japan 0­ ciely for Prollll)ting ciences (JSPS) dengan Indonesia (L1Pl), Phi lipp ines (DO T), Thai land (NRCT) dan Malay ia (VCC) untuk periode 1999-200 I, yang dihadiri 14 pe erta kerjasama ter­ cbut dan beberapa staf pengajar Fakultas Pertanian, Universitas Mataram . Makalah-makalah yang disampaikan pada pertemuan ter­ sebut meliputi biokonversi dan pemanfaata n limbah, produksi dan pemanfaatan en zi m dan mikro­ biologi yang terkait dalam peman­ faatan limbah seperti effective

WARTA BIOTEK

microbe. M). ebaga i pembica­ ra pertama ada lah ko rdinator proyek ter ebut, Dr. Yasuo Igara­ shi yang menggaris bawahi pen­ tin mya pengembangan tekno logi lIn luk pemanfaatan lim ba h di negara-negara . sia. Disampaikan pula bahwa untuk abad 21 hal in i akan menj adi semak in pen ting s hubungan dengan men in ll-..atnya jumlah limbah organi k di daerah perkotaan. Hn il-hasil p nelitian yang telah dicapai elama ini baik dengun menggunakan tekn ik konvensiona l mallpll n modern juga menjadi bahan pembicaraan. Selanjutnya disam pail-..an hasil­ hasil penelilian mengenai pemanfaatan limbah tallU. limbah pulp dan indll tri kertas, li mbah kayu. lill1bah udang, li mbah k lapa sawit. limbah ke lapa.. limbah organik dar i ampah kola dan limbah pertanian berupa jerami padi Pemanfaatan lim bah Lersebut bervariasi mula i dari pemaka ian sebaga i ubstrat llntuk produksi enzim. gas hid rogen, kompos dan pakan ternak . Di samping itu , disampai kan pula mengenai hasil penelitian lilllbah cair peternakan babi di Phil ippi nes yang dipakai ebagai media per­ tumbllhan Sp ir7l!ino p lalensis. Td,ni k mod rn yang di pakai unLllk memantall komunitas mi ­ kroorganisme da lam proses degra­ dasi limbah ru ll1ah tangga adalah denafUT'ing gradient gel 'eiecll'o­ pharesis (DGG/:,) dan .fluores­ cence III situ hyhridization (FISH) . Pada akhi r workshop d i­ ballas pula rencana-re ncana "egi­ atan lanj ulan maupun kegiatan

V L. IS O. IMARET2001

baru dalam rangka kerja ama ter­ se but. (YW)

International eminar on Bio­ technology and fofOl'matics J I-.. arta, 13 Pebruari 200 1 Semi nar sehari tentang Bio­ teknologi d n Informatika te lall di selengg raka n o Jeh Universitas K tholik Atmajaya bekerja ama dengan IPB di Hotel Menara P ninsula Jakarta . eminar diha­ diri oleh peneliti, star akademika baik dari pergllruan tinggi negeri dan wata, swasta dan maha iswa. Beberapa topik menarik Jibahas o leh pakar dari da lam dan luar negeri temlaSlIk teknologi terkini di bidang bioteknologi yang se­ dang berkembang yaitu micro­ array technology. etelall acara pembukaan o /eh rekt r Unika Atmajaya, sebagai pemb icara pertama Pr f. F.G. Wi narno dari IPB (juga sebagai salah satu anggota Atma­ jaya Fo undation) memberikan to­ pi k pe nti ngnya peran bioteknologi dalam produksi pangan dan obat­ obatan dengan judul "The role of biotechnology for food production and medic ine". Se lanjulnya bebe­ rapa pakar luar negeri memberi­ kan topik-topik mutal-..hir yaitu Dr. Kam M. lIui dari Divi ion of Cell ular and Molecular Research Nat i nal Cancer Ce nter, Singa ­ pura melllbawakan j lldu l Genera­ tion of cancer databa e using mi­ croarray techno logy' . Dr. Wong Sek Man dari Department of Bio­ log i al Sci n es, National ni ver­ sity f Si ngapore, Singapura membawaka n topik berjudul "Mo­ lecular beacons and microarray

techno logy fo r pathogen detect­ i n", Dr. Wi m Yerm aa dan Department of Plant Bio logy ang Ce nter for th e Study of Early Even ts in Pho tosynthesis Arizona St te Un iver it)', USA, mempre­ se ntasikan top ik berj ud ul "Bi ­ tech nol gy to teach ol d photo­ synthetic organisms new trick ' dan pembicara terakbir ada lah Dr. Thomas chafer dari Torben Veden, Novozymes AlS. Den­ mark membahas "Prod uct deve­ lopment at novozymes-i ntegrated research effort : M icrabial screen­ ing, prot in engineering and ar­ t ificial evolution". (TME)

Workshop on Biotechnology Awarene sand Communicatiou Bogor, 14-1 5 P bruari 200 1 Perhim pun an Bioteknologi Pertanian Indonesia (PBPI) beker­ jasama dengan Internationa l cr­ vice for Acqu i ilion of Agri-Bio­ tech App lic lion (I SAAA) telah menyelenggarakan " Workshop on Biotechno logy Aw reness and Com muni cation' pada langgal ! 4­ 15 Pebruari 200 1 bertem pat di aul a Balai Pe neli tian Biotekno l gi Tananlan Pangan-Bal itbio, Ci­ manggu-B gor. Workshop bertu­ juan u!lLu k membahas isu-isli yang berkembang saat ini meng na i aspek-aspek keulllanan hayati , ke­ 31ll anall pangall, sosial ekon Illi dan tanggapun masyara kat terha­ dap produk bioteknologi. Work­ shop dihadiri I h sekitar 40 orang peserta y n d iu ndang dari un ivers itas, lelll baga penelitian, beberapa in stan i p merintah dan pengllrus PBPI.

39

Workshop dibuka oleh pa­ nitia penyelenggara yang diwakili leh Dr. M. l-Ierman dari Balitbio dilanjutkan dengan perwaJ...ilan dari I AAA . Dr. Margarita E­ caler (dari Fi lipina). ebagai pernbicara pertama ya itu Dr. Paul Teng dari Monsanto mengemuka­ ka n ha il urv i tentang "Public awarness and concern about btotechnology ur ey re ult for Indonesia. ASEAN. and world­ wide" dilanjutkan dengan topik pcngantar belj udu I "I ntroduction to frequentl . asked que tions on biotechnology". Dr. Paul Teng juga mempresentasikan topik­ topik lainnya yang berj udul "Ho,. wi ll biotechnology addres food security problems. and wi ll it lead to more equ itable distribution of food?" dan "[s biotechnology compatible with IPM and sustainable agriculture?". Topik berjudul "What are the ethical, religioLls, and choise considera­ tions 0 tra nsferring anima l genes into plants" disampaikan oleh Dr. Andrea anto a dari IPB dan Dr. Ery . ofiuri dari Balai Penelitian Tanama n Sayur-sayuran. Lem­ bang. elanjutnyn Dr. Andre.as Santosa memb rikan topik baha­ annya berj udul "What are the effects of GMO crops n non­ target rganism such as il microbes, butterflies, etc?" . dan " hould fa d af t test for GM food be the same as those for convcnti nal foodT . Pada hari yang sum3 Dr. (nez J I. . Loedin tlari Puslitbang BioleJ...n logi L1PI tampil sebagai pembicara dengan t pik berjudul "What the effects do GMOs have on natura l e 0 ­ systems a a results of phenomena

40

such as spe les " Does G lential to ion?" .

outcro sing. geneflow, d i placements?" dan 1 food hay morc po­ cause allergen ic react­

Dr.

Margarita

E caler

mcmpreserH3sikan "Docs the 35S promoter, \\ hich i: \ iral in urigin. ha e any potential to induce nc\ vint e 1" dllanjutJ...an dengan dua topik lainnya ) ang dipresentasi­ J...an pada har! J...edu berjudul "What are th socia l and ethica l issues in patenting life fonns?' dan "Who benelits from bio­ technology and who controls seed Duree'? ' . r. Antonius uwanto dari I PB membahas isu dengan judu l "What is known of the toxicity f GM food or GM products (L-tryptophan case)?' dan "What are the safety con­ siderations of using antibiot ic re­ istance markers in G f plants?". Dr. M. Herman dari Balitbio membaha isu berjudul "What are the safeguard to avoid negative en ironmental effect by GMOs after their releas '1". Sebagai pem­ bicara tera"-hir pada hari pertama, Dr. Kartika Adiwilaga dari PT Monagro Kimia mediskusikan to­ pik berjudu l ' What i ' the statu of tenninator technology?". Pada had kedua etelah Dr. Escaler mem prescntasikan lopik ten tang "patenting life forms" dan "siapa yang beruntlmg dari pene­ rapan hasil bioteknologi", Dr. Pau l Teng memberikan bahasan tentang beberapa topiJ... antma lain "E lements of communicating i sues of high concern to stake­ holders, what are risJ... ommu­ nication skills and the scientific basis for ri k communication, the credibility ladder dan me sage

mapping". Workshop diakh iri de­ ngan simu lasi cara-cara berko­ munikasi dalam kc lompok-kelom­ pok pes rta workshop. Simulasi direkam dalam video kem udia n ditayangkan ulang unluk dibahas bersama. (TME)

TINJAUAN BUKU BARU

Judul

Pengenalan Kapang Tr pik

Umum. Penul is : Indrawati Ganjar, Robert A. Samson, Karin van den Tweel- Vermeulen, Ariyant i Oetari dan Iman San toso. Tahu n : 2000 ISBN : 979-46 1-289-8 Pe nerbit; Yayas n Obor Lndonesia Tebal : xiii + 136 halaman I-/arga . Rp . 45 ,000

Buku beruk tran panjang 23 cm dan lebar 19 cm (setebal xiii + 136 hal) lilt disusun secara menarik oleh para penyu unn ya. Sampul depa nn ya menampilkan gambar kapang berwama yang sangat tajam. Buku ini diawali ekacip dengan ekap ur Sirih Pinang oleh Mien A. Rifa i, Kata Pengantar oleh penu li ,s dangkan pada bagian isi dari buku ini terdiri dari pendah lll uan dan des­ kripsi spes ies kapang yang ber­ jumla h 60 spe ies. Membacajudul buku ini sampai pendahuluan, pembaca dibuat bingung olch i tilah yang dipakai penulis secara tidak konsisten . lstilah kapang, jamur dan fungi dipakai silih berganti tanpa ada penjelasan batasannya mas ing-masing. Pada pendahuluan justru diuraikan me-

WART A BI0TEK

ngenai defini i da n habi tat fungi mengapa tidak detinis i dan habitat kapang yang lebi h sesua i dellgan

judu l buk u? Pendahulu 3n diawali de­ ngan uraian mengenai mi kologi dan peran fun gi da lall1 berbagai bi dang seperti pertan ian, perke­ bunan, kehuta nan farmas i kedok­ lera n dan kesehatan, baik yang pos itip maupun yang ne gati p. Disebutka n fungi sebagai bahan baku anlibiotik, enzim da n senya­ wa-senyawa organil-- tertentu, teta­ pi j uga sebagai pe nyebab penya­ kit, karena sebagian fu ng i bersifat

patogen . Se lanj utny bagian inti bu ku in i beri i de krips i Illa tng­ masi ng jenis kapang yang nama­ nya disLisun secara al fabetis da n uraian habitatnya . Masing-mas ing jenis ditall1pil kan pul a dalum ben­ tuk gam bar ll1 orfo loginya. Bag ian Lampiran memuat daftar isti lah yang umum dipakai dalam mi­ kologi da n komposisi beberapa media yang sering digunakan un­ tuk menumbuhkan dan meme liha­ ra kapang di laboratorium. Buku ini sesuai dcngan makslid penulis yan g ditllj ukan tlllt uk para pemula di bidang miko logi, para no n

III ikol ogiwan

yang bekerja di industri dan mengguna kan kapang seb gai agen unluk produk -pro­ du k terten tu . para ah li kesehatan masya rakat dan para mahas iswa yan g mengamb il mi kologi sebagai mata kuli ah pil ihan. Kehad irall buku in i ten lu saja merupakan ' iraman air huja n di tengah terik kegersanga n kemarau, karena dapat mengisi ]..ekosongan yang sudah lama dirasakan', scperti yang ditul iskan pada Kata Pengantar buk u in i. (Y. Widyastuti)

JASA PEMBIMBINGAN Puslilbang Bioteknologi-LIPI menyediakan j asa pembimbingan untuk Mahasiswa

•

Sf . S2 dan S3.

•

Topik p enelitian disesuaikan dengan kegiatan p ene lifian yang sedang berjalan dan dibalasi pada bidang biolekno!ogi dan ilmu-ilmu p enunjangnya seperli kim ia, bi%gi, mikrohiologi, teknologi lingkungan dan peternakan.

•

Mahasiswa y ang akan melakukan penelilian harus memenuhi persyaratan sebagai Beriku! : Memiliki IPK min imum 2.75. Mengaju ka n permohonan mela lu i f ak ultas at au j urusan mas ing-ma si ng. Bersedia mem bayar biaya pemblm bi ngan sebesar Rp. 40.000.- (untuk S1) dan Rp. 5 0.000 ,- (untu S2dan S3) per bulan atau dit entukan kemud ian. Memi liki mina t pad a penelit ian di bidang bioteknologi at au bi dang la in yang be rhubu ngan. Memen uhi per'sya ratan la in yang ditentukan oleh pemb imbing.

•

Sural Permohonan untuk rnemperoleh pembimbingan d;rujukan kepada Kepa/a Bidang Jasa dan lnjorrnas( Puslitbang Bioteknologi-LIPI.

• Keterangan lebih lanjut bisa diperoleh

del1gan menghubungi Sub-Bidang

KeljasamaPus/ilbang Biolekno!ogi-LIP1.

VOL. 15 NO. I MARET 200 I

41

PETUNJUK PENULISAN NASKAH

I . WarLa Bialek memuat tulisan asli (bulean lerjemahan) berupa ulasan semi populcr dalam bidang

bioteknologi. 2. Naskah dit ulis dalam bahasa Indonesia yang baik dan benar. diawali dengan ringkasan. kata kunei . pendahuluan . isi. daflar puslaka dan kesimpulan (penutup). 3. Naskah ditulis dengan pengolah kata Microsoft Word 7.0lWindows 95 at au ya ng lcrbaru. Tabel. grafik. i1ustrasi dan foto (jika ada) agar dimasukkan ke dalam leks. Foto harus hitam plItih. 4 . Naskah ditulis 1.5 spasi dengan kertas berukuran A4. tidak timbal balik. Bentuk huruf Times New Roman 12. dengan batas kiri 3 cm. kanan 2.5. alas 3 cm dan bawah 2.5 cm . 5. Naskah harap dikirim rangkap 3 (termasuk asli) dcngan jumlah maksimum iO halaman lennasuk labcl. grafik. iluslrasi dan foto. Harap disertakan disketnya (3.5"). Naskah dapat d,ianlar langsu ng ke Rcdaksi alau dikirim melalui pos. 6. Contoh penulisan pustaka : Bulm : . a. Lindsay, K. & M.G.K. Jones. 1989. Plant Biotechnology in Agriculture . Open University Press, London. pp. 544. b. Chesson, A. & C .W . Forsberg. 1988. Polysaccharide degradation by ru men microorganisms. Dalam : P.N. Hobson (Ed.), The Rumen Microbial Ecosystem. Elsevier Applied Science, London, pp. 251 - 184.

MajaJab : Pras. N., H.J. Woerdenberg & W. van Uden. 1995. The power of plan t enzymes in bioconversions.

AgBiotech News and Information 7 (12): 231 N-243N.

Prosiding :

McLean. R.G. 1990. Some legal aspect of strategic alliances for Australian Bi otechnology

Companies. Dalam: Proceedings of the 9th AusLralian Biotechnology Conference. Gold Coast: Uni ­

versity of Qeensland. pp. 36-40.

Paten :

Zhu, Q . & C.J . Lamb. 1995. Rice chitinase promoter. US Patent No. 05399680.

MAILING LIST HAKI Bergabunglah dengan Mailing Li t HAKI ) ang dikelola olch M dcrat r dari

Puslilbang Bioteknologi-LIPI

Mailing 1 ist J IAKI merupakan media kornunikasi yang ideal bagi anda yang

bl;!rrn inat dengan rnasalah per-IlAKl-an di Indonesia

Kunj ungi silllS : http://www.geocities.com/ahkamsub/ a/all

http://haki-Iipi.listbot.com

pcndaftaran Japat diJakukan Jang::.ung eli situ' ini

Selamat bergabung dan ber-HAKI-ria

PT. DIASTIKA BIOTEKINDO entra Pemuda Kav. 30 - 31 .n. Pemuda No. 61

J a ka r ta 13220. P hon 02L-489 J 7 18 ( bunting),

47547 16. Fax 021 -4754707

Email : di as lilii\ll(d nI.L nl.t.itl

Exclusive Oi tribu tor of: BIORAO- USA: Elect r plloresi , peR . ELl SA, Chroma tog raph y, FTI R Spectrophotometer, 'apil lary Electrop horc<; i , HPLC Colul1ln,

PROMEGA - USA: En)') mes, pe R and Molecular Bio log) Reagents

o

PAKET PELATIl-JAN

di

PUSLITBANG

BIOT EKNOLOGI

LIPI

I. Embrio transfer dan tcknik fCl,tili asi ternak 2. Transformasi gen pada tanaman 3. Analisis peR, Western Blot, RAPD dan isoenzim . t Bioremediasi 5. Pcmbuatan nata de coco 6. Pembuatan pupuk bio

PrOlrtega

Kendro/SORVALL: Ce ll Was her

entrifuges,CClll ritcch, and

lIubungi:

Tclpon. 021-~754~87 Fax. 021-875"588

dLalx1r,letxy Kendra Pmduro

'LA BORATORIUM FERMENTASI

Balai Tc knologi Proses Pu Iitban g Biotckn ologi-LIPI

Siap membantu anda untuk : • Pela tihan teknologi fermentasi • Pemurnian en zim /pro tein • Analisis asam amino Silah kan menghubungi :

Te lpon 021 -8754587

Fax. 021-8754588