Genetické parametry a plemenná hodnota pro
hodnocení JUT skotu systémem SEUROP
Ing. Zdeňka Veselá, Ph.D.
[email protected]
Hodnocení jatečně upravených těl systémem SEUROP
Hmotnost JUT Zmasilost – 6 tříd (S,E,U,R,O,P)
Přečíslována 1 = P až 6 = S
Protučnělost – 5 tříd (1,2,3,4,5)
Hodnocení jatečně upravených těl systémem SEUROP
Odhad plemenných hodnot
Irsko, Švédsko, Francie, Norsko, Dánsko
Interbeef plánuje zahrnout do mezinárodního hodnocení
Aktuálně odstavová hmotnost Další plánované znaky:
Hmotnost JUT (S)EUROP klasifikace zmasilosti a protučnělosti Obtížnost porodu
Cíl práce
Výběr vhodného modelu Odhad genetických parametrů Odhad plemenných hodnot
Materiál
Soubor od PLEMDAT
959224 zvířat (48% býci) Poražených 2004 – 2010
Frekvence podle věku při porážce 40% 35% 30% 25% 20% 15% 10% 5% 0% 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26
Frekvence podle věku při porážce 40% 35% 30% 25% 20% 15%
61,41% zvířat poraženo do 2 let
10% 5% 0% 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26
Soubor pro odhad plemenných hodnot
Vyřazení
Zvířat hodnocených v roce 2004 a 2005 Zvířata poražena ve vyšším věku než 900 dní Věk < 200 dní Hmot JUT < 150 kg Neprůkazné rodokmeny (22% souboru) Netto přírůstek od narození do porážky menší, či větší než 3SO od průměru uvnitř skupiny dle věku při porážce (v rocích) a pohlaví Chybné a chybějící údaje
Frekvence podle kategorie v celém souboru
A - mladý býk (31,9%) B - býk (16%) C - volek (0,2%) D - kráva (42,7%) E - jalovice (9,2%)
Frekvence podle kategorie v souboru mladých zvířat
A - mladý býk (57%) B - býk (31%) C - volek (0,3%) D - kráva (0,5%) E - jalovice (11,2%)
Frekvence podle užitkového typu Masný 14%
Dojený 86%
Frekvence podle hodnocení zmasilosti v
celém souboru 60% 50% 41,8% 40%
34,1%
30% 20%
16,8% 8,2%
10%
0,2%
0,0%
E
S
0% P
O
R
U
Frekvence podle hodnocení zmasilosti v
souboru mladých zvířat 60% 48,3%
50% 40%
35,0%
30% 20% 10%
8,7%
7,7% 0,2%
0,0%
E
S
0% P
O
R
U
Frekvence podle hodnocení zmasilosti v souboru mladých zvířat masných plemen 60%
55,7%
50% 40% 30% 20,9%
19,1%
20% 10% 2,3%
2,0%
0% P
O
R
U
E
0,0% S
Frekvence podle hodnocení protučnělosti v celém souboru 70% 60%
54,3%
50% 40% 26,7%
30% 20%
12,2%
10%
5,2%
1,0%
0% 1
2
3
4
5
Frekvence podle hodnocení protučnělosti v souboru mladých zvířat 70%
65,0%
60% 50% 40% 30%
22,0%
20% 10,6% 10%
2,2%
0,2%
4
5
0% 1
2
3
Frekvence podle hodnocení protučnělosti v souboru mladých zvířat masných plemen 70%
65,4%
60% 50% 40% 30% 21,3% 20% 10,5% 10%
2,6%
0,3%
4
5
0% 1
2
3
Frekvence podle plemene v souboru mladých zvířat Plemeno
Jedinců
%
ČESTR
138209
41,1
Ayshire
244
0,1
Braunvieh
328
0,1
Jersey
168
0,0
154367
45,9
302
0,1
Holštýn Normandský skot
Frekvence podle plemene v souboru mladých zvířat Plemeno
Jedinců
%
Charolais
16174
4,8
Limousine
4944
1,5
Hereford
2940
0,9
Galloway
762
0,23
Aberdeen angus
9816
2,9
Blonde d‘Aquitaine
1820
0,5
Piemontese
3508
1,0
Belgické modré
1647
0,5
Gasconne
577
0,2
Salers
528
0,2
Highland
261
0,1
Frekvence podle podílu krve hlavního plemene
Podíl krve
%
100%
43,1
75 – 99%
33,6
50 – 74%
23,3
Soubory pro odhad genetických parametrů
Masná plemena
Podmínky:
5 polosourozenců po otci 5 jedinců ve skupině vrstevníků 5 hodnocených jedinců klasifikátorem
19178 jedinců s hodnocením SEUROP 78069 jedinců v rodokmenu
Model pro odhad genetických parametrů a plemenných hodnot
Multitrait model pro všechny znaky společně
HMOT JUT ZMAS PROT
Model pro odhad genetických parametrů a plemenných hodnot
Zohledněné prostřeďové efekty
Klasifikátor – fixní efekt SRO (skupina vrstevníků) – náhodný efekt
Chov – rok – období - jatka
Heterozní efekt – fixní lineární regrese Věk při porážce * pohlaví * plemeno
Fixní regrese na věk při porážce pomocí Legendreova polynomu druhého stupně Samostatně podle plemene a pohlaví
Vliv klasifikátorů na výsledky hodnocení JUT metodou SEUROP
Poměrně vysoký především u hodnocení zmasilosti a protučnělosti
Směrodatné odchylky vlivu klasifikátora
HMOT JUT ZMAS PROT
20,86 0,52 0,34
Vliv SRO na výsledky hodnocení JUT metodou SEUROP
Vyšší, než u klasifikátorů pro HMOT JUT Nižší, než u klasifikátorů pro ZMAS a PROT
Směrodatné odchylky vlivu SRO
HMOT JUT ZMAS PROT
28,20 0,24 0,27
Vliv heterozního efektu na hodnocení JUT metodou SEUROP
Poměrně nízký
HMOT JUT 4,49 ZMAS - 0,01 PROT 0,03
Závislost hmotnosti JUT na věku při porážce (ve dnech) 250
Hmotnost JUT (kg)
200
150
100
50
0 200
300
400
500
600
-50 Věk při porážce (dny)
700
800
900
Závislost hodnocení zmasilosti na věku při porážce (ve dnech) 2
Zmasilost (body)
1,5
1
0,5
0 200
300
400
500
600
Věk při porážce (dny)
700
800
900
Závislost hodnocení protučnělosti na věku při porážce (ve dnech) 2
Protučnělost (body)
1,5
1
0,5
0 200
300
400
500
600
Věk při porážce (dny)
700
800
900
Koeficienty dědivosti h2 (na diagonále) a genetické korelace σg
HMOT ZMAS PROT
HMOT ZMAS PROT 0,26 0,78 0,48 0,22 0,16 0,12
Koeficienty dědivosti h2 (na diagonále) a genetické korelace σg
HMOT ZMAS PROT
HMOT ZMAS PROT 0,26 0,78 0,48 0,22 0,16 0,12
Koeficienty dědivosti h2 (na diagonále) a genetické korelace σg
HMOT ZMAS PROT
HMOT ZMAS PROT 0,26 0,78 0,48 0,22 0,16 0,12
Model pro odhad genetických parametrů a plemenných hodnot
Vysoká korelace mezi HMOT a ZMAS PH pro ZMAS budou velmi podobné jako PH pro HMOT Možnost očistit PH pro ZMAS a PROT o HMOT pomocí regrese Multitrait model pro zmasilost a protučnělost
Přidán efekt
Hmotnost JUT – fixní regrese pomocí Legendreova polynomu druhého stupně
ČZMAS, ČPROT
Koeficienty dědivosti h2 (na diagonále) a genetické korelace σg
ČZMAS ČPROT ČZMAS 0,13 -0,44 ČPROT 0,11
Koeficienty dědivosti h2 (na diagonále) a genetické korelace σg
ČZMAS ČPROT ČZMAS 0,13 -0,44 ČPROT 0,11
Koeficienty dědivosti h2 (na diagonále) a genetické korelace σg
ČZMAS ČPROT ČZMAS 0,13 -0,44 ČPROT 0,11
Závislost hodnocení zmasilosti a protučnělosti na hmotnosti JUT 2
Hodnocení (body)
1,5
1
ZMAS PROT
0,5
0 100
150
200
250
300
350
-0,5
-1
Hmotnost (kg)
400
450
500
550
600
Závislost hodnocení zmasilosti a protučnělosti na hmotnosti JUT 2
Vyšší genetická korelace mezi HMOT a ZMAS
Hodnocení (body)
1,5
1
ZMAS PROT
0,5
0 100
150
200
250
300
350
-0,5
-1
Hmotnost (kg)
400
450
500
550
600
Odhad plemenných hodnot
Do výpočtu vstupují všechna mladá zvířata – dojená i masná
S cílem využití co největšího množství informací
Vstupní genetické parametry získané pro masná plemena
S cílem získat PH pro masná plemena Ale využít i vzájemné provázanosti a příbuznosti s dojenými plemeny
Soubor pro odhad plemenných hodnot
336595 poražených jedinců 1126926 jedinců v rodokmenu 97 jatek 196 klasifikátorů 13789 chovů 6840 otců
Soubor pro odhad plemenných hodnot Prům HMOT 336,2 ZMAS 2,65 PROT 2,16
SO Min Max 65,4 150 804 0,78 1 6 0,64 1 5
Průměrné plemenné hodnoty pro hmotnost JUT podle plemen Limousine Charolais Salers Gasconne Normandský skot Blonde d'Aquitaine Belgické modré Aberdeen angus Piemontesse Highland ČESTR Hereford Braunvieh Galloway Holštýn Jersey Ayshire -15,0000
-10,0000
-5,0000
0,0000
5,0000
Plemenné hodnoty
10,0000
15,0000
20,0000
Průměrné plemenné hodnoty pro zmasilost podle plemen Belgické modré Limousine Salers Charolais Piemontesse Blonde d'Aquitaine Gasconne Normandský skot Highland ČESTR Galloway Aberdeen angus Hereford Braunvieh Jersey Ayshire Holštýn -0,3
-0,2
-0,1
0
0,1 Plemenné hodnoty
0,2
0,3
0,4
0,5
Průměrné plemenné hodnoty pro čistou zmasilost (ČZMAS) podle plemen Belgické modré Piemontesse Salers Limousine Charolais Blonde d'Aquitaine Gasconne Galloway Highland Normandský skot ČESTR Hereford Aberdeen angus Jersey Ayshire Braunvieh Holštýn -0,3
-0,2
-0,1
0
0,1 Plemenné hodnoty
0,2
0,3
0,4
0,5
Průměrné plemenné hodnoty pro protučnělost podle plemen Aberdeen angus Ayshire Hereford Holštýn ČESTR Highland Jersey Normandský skot Charolais Braunvieh Blonde d'Aquitaine Gasconne Salers Limousine Galloway Belgické modré Piemontesse -0,2
-0,15
-0,1
-0,05 Plemenné hodnoty
0
0,05
0,1
Průměrné plemenné hodnoty pro čistou protučnělost (ČPROT) podle plemen Ayshire Hereford Aberdeen angus Jersey Holštýn ČESTR Braunvieh Highland Galloway Normandský skot Blonde d'Aquitaine Charolais Gasconne Salers Limousine Belgické modré Piemontesse -0,2
-0,15
-0,1
-0,05 Plemenné hodnoty
0
0,05
0,1
Vztah SEUROP k ostatním vlastnostem u masného skotu 1.
Polní test
2.
Odchovny plemenných býků
3.
1 PH pro 1 vlastnost - vlastní přírůstek býků
Popis zevnějšku mladých zvířat
4.
10 PH pro 5 vlastností (maternální efekt)
10 PH pro 10 znaků
SEUROP
3 (resp. 5) PH pro 3 vlastnosti
Korelace PH pro SEUROP s PH pro polní test HMOT ZMAS ČZMAS PROT
ČPROT
PHobt
0,02
-0,13
-0,19
-0,09
-0,11
PHnar
0,10
0,22
0,25
0,04
0,00
PH120
0,14
-0,04
-0,15
-0,06
-0,15
PH210
0,13
-0,04
-0,15
-0,04
-0,13
PH365
0,19
0,19
0,14
0,09
-0,02
Maobt
-0,02
0,13
0,19
0,05
0,07
Manar
-0,16
-0,13
-0,07
0,06
0,15
Ma120
0,01
0,12
0,16
0,09
0,09
Ma210
0,01
0,13
0,17
0,08
0,08
Ma365
0,06
0,13
0,14
0,02
-0,01
Korelace PH pro SEUROP s PH pro polní test HMOT ZMAS ČZMAS PROT
ČPROT
PHobt
0,02
-0,13
-0,19
-0,09
-0,11
PHnar
0,10
0,22
0,25
0,04
0,00
PH120
0,14
-0,04
-0,15
-0,06
-0,15
PH210
0,13
-0,04
-0,15
-0,04
-0,13
PH365
0,19
0,19
0,14
0,09
-0,02
Maobt
-0,02
0,13
0,19
0,05
0,07
Manar
-0,16
-0,13
-0,07
0,06
0,15
Ma120
0,01
0,12
0,16
0,09
0,09
Ma210
0,01
0,13
0,17
0,08
0,08
Ma365
0,06
0,13
0,14
0,02
-0,01
Korelace PH pro SEUROP s PH pro polní test HMOT ZMAS ČZMAS PROT
ČPROT
PHobt
0,02
-0,13
-0,19
-0,09
-0,11
PHnar
0,10
0,22
0,25
0,04
0,00
PH120
0,14
-0,04
-0,15
-0,06
-0,15
PH210
0,13
-0,04
-0,15
-0,04
-0,13
PH365
0,19
0,19
0,14
0,09
-0,02
Maobt
-0,02
0,13
0,19
0,05
0,07
Manar
-0,16
-0,13
-0,07
0,06
0,15
Ma120
0,01
0,12
0,16
0,09
0,09
Ma210
0,01
0,13
0,17
0,08
0,08
Ma365
0,06
0,13
0,14
0,02
-0,01
Korelace PH pro SEUROP s PH pro přírůstky býků v odchovnách HMOT ZMAS ČZMAS PROT Odchovny
0,08
0,03
-0,01
0,10
ČPROT 0,05
Korelace PH pro SEUROP s PH pro popis zevnějšku mladých zvířat HMOT ZMAS ČZMAS PROT
ČPROT
KRIZ
-0,07
-0,06
-0,07
0,00
0,04
DELKA
-0,07
-0,05
-0,05
0,03
0,06
HMOT
-0,07
-0,11
-0,15
0,12
0,15
SHR
0,20
0,23
0,18
-0,03
-0,14
HLHR
0,07
0,06
0,02
0,07
0,02
ZAD
0,34
0,42
0,37
-0,15
-0,34
OPLEC
0,28
0,33
0,31
-0,13
-0,27
OHRBET
0,25
0,33
0,31
-0,13
-0,26
OZAD
0,39
0,48
0,43
-0,20
-0,41
TYP
0,34
0,38
0,31
-0,10
-0,28
Korelace PH pro SEUROP s PH pro popis zevnějšku mladých zvířat HMOT ZMAS ČZMAS PROT
ČPROT
KRIZ
-0,07
-0,06
-0,07
0,00
0,04
DELKA
-0,07
-0,05
-0,05
0,03
0,06
HMOT
-0,07
-0,11
-0,15
0,12
0,15
SHR
0,20
0,23
0,18
-0,03
-0,14
HLHR
0,07
0,06
0,02
0,07
0,02
ZAD
0,34
0,42
0,37
-0,15
-0,34
OPLEC
0,28
0,33
0,31
-0,13
-0,27
OHRBET
0,25
0,33
0,31
-0,13
-0,26
OZAD
0,39
0,48
0,43
-0,20
-0,41
TYP
0,34
0,38
0,31
-0,10
-0,28
Korelace PH pro SEUROP s PH pro popis zevnějšku mladých zvířat HMOT ZMAS ČZMAS PROT
ČPROT
KRIZ
-0,07
-0,06
-0,07
0,00
0,04
DELKA
-0,07
-0,05
-0,05
0,03
0,06
HMOT
-0,07
-0,11
-0,15
0,12
0,15
SHR
0,20
0,23
0,18
-0,03
-0,14
HLHR
0,07
0,06
0,02
0,07
0,02
ZAD
0,34
0,42
0,37
-0,15
-0,34
OPLEC
0,28
0,33
0,31
-0,13
-0,27
OHRBET
0,25
0,33
0,31
-0,13
-0,26
OZAD
0,39
0,48
0,43
-0,20
-0,41
TYP
0,34
0,38
0,31
-0,10
-0,28
Korelace PH pro SEUROP s PH pro popis zevnějšku mladých zvířat HMOT ZMAS ČZMAS PROT
ČPROT
KRIZ
-0,07
-0,06
-0,07
0,00
0,04
DELKA
-0,07
-0,05
-0,05
0,03
0,06
HMOT
-0,07
-0,11
-0,15
0,12
0,15
SHR
0,20
0,23
0,18
-0,03
-0,14
HLHR
0,07
0,06
0,02
0,07
0,02
ZAD
0,34
0,42
0,37
-0,15
-0,34
OPLEC
0,28
0,33
0,31
-0,13
-0,27
OHRBET
0,25
0,33
0,31
-0,13
-0,26
OZAD
0,39
0,48
0,43
-0,20
-0,41
TYP
0,34
0,38
0,31
-0,10
-0,28
Korelace PH pro SEUROP s PH pro popis zevnějšku mladých zvířat HMOT ZMAS ČZMAS PROT
ČPROT
KRIZ
-0,07
-0,06
-0,07
0,00
0,04
DELKA
-0,07
-0,05
-0,05
0,03
0,06
HMOT
-0,07
-0,11
-0,15
0,12
0,15
SHR
0,20
0,23
0,18
-0,03
-0,14
HLHR
0,07
0,06
0,02
0,07
0,02
ZAD
0,34
0,42
0,37
-0,15
-0,34
OPLEC
0,28
0,33
0,31
-0,13
-0,27
OHRBET
0,25
0,33
0,31
-0,13
-0,26
OZAD
0,39
0,48
0,43
-0,20
-0,41
TYP
0,34
0,38
0,31
-0,10
-0,28
Závěr
Vypočteny PH a genetické parametry Odhad PH připravený pro rutinní využití Odhadovat PH pro čistou ZMAS a PROT?
Děkuji za pozornost
