Klasifikační systémy a nomenklatury v medicíně

Klasifikační systémy a nomenklatury v medicíně Informační a komunikační technologie ve zdravotnictví 2008/2009

Nature Inspired Technology G r o u p

Typy informace  Data = konkrétní informace    

výsledky vyšetření biosignály – v čase proměnné obrazová informace ukládána v různých klinických modulech IS

 Znalosti = abstraktní modely světa    

zobecnění dat Literatura rozvoj systému pro zpracování znalostí vymezení znalostí, klasifikace, formální popis

 Interpretace  modely lidského myšlení, logické odvozování,

 pravděpodobnostní rozhodování, systémy umělé inteligence


Lékařská data – škály  Měření = prvku souboru se přiřazuje právě jedna hodnota příslušné škály (stupnice)  Kategorická (nominální) škála  slovní, kvalitativní data  zvl. pr. alternativní (0/1)

 Diskrétní (ordinální) škála  Spojitá (intervalová) škála  „Škálování“ – přiřazujeme jevům číselné hodnoty, které nelze přímo měřit  Metoda srovnání (párové, nejlepší objekt)  Metoda stejných intervalu


Normálnost dat  Problém normálnosti  Častost – řídkost  Co je „zdraví“  Jak poznáme, je-li jedinec zdráv

 Popisné koncepce normálnosti  Častost, průměrnost  V praxi 2x směrodatná odchylka nebo 95% populace

 Hodnotící koncepce normálnosti  Přiměřené zdraví / zdatnost  optimální zdraví / zdatnost (odstupňovaný model)

 Normální rozmezí (referenční interval)  Variabilita analytická a biologická

 Individuální norma zdraví


Variabilita dat  Srovnatelnost měření  Správnost (validita)  Přesnost

 (Analytická) variabilita  s jakou chybou jsme schopní daný parametr stanovit při opakovaném vyšetřovaní.  Je podkladem pro aktuální klinické rozhodování při použití daného parametru

 Biologická variabilita  Inter-individuální  ukazuje procentuální změny v hodnotě parametru měřeného u toho stejného jedince opakovaně po několik dní za sebou  Je podkladem pro aktuální klinické rozhodování při použití daného parametru

 intra-individuální  ukazuje procentuální změny v hodnotě parametru měřeného u více jedinců několik dní za sebou.  Je podkladem pro stanovení referenčních rozsahů Nature Inspired Technology G r o u p

Lékařský pojem a termín Pojem  Zobecnění objektu, vlastností a dějů  Definice  Název = Termín  Klasifikace

Vztahy příbuzných pojmu Názvy pojmu  Terminologie včetně synonym  Nomenklatura v utříděných systémech


Lékařský pojem a termín  Pojem je zobecnění objektů našeho zájmu a to:  Konkrétních předmětů (pacient, orgánů, histolog. struktury)  Vlastností (cyanóza, nauzea),  Dějů (biochemické vyšetření, progrese vyšetření)

 Pojem je dán současně abstrakcí a generalizací, kde pak:  Klasifikace - řeší vztahy mezi příbuznými pojmy  Definice - přesná formulace významu pojmu  Název (termín) - pojem pojmenovává

 Terminologie-souhrn všech názvů pro danou oblast (lékařský jazyk, synonyma)  snaha používat jediný výraz: synonyma


Definice a terminologie  Definice – typy:  Analytické, syntetické, korektivní

 Pragmatické hledisko  Přiměřenost, reálnost

 Sémantické hledisko  Nominální, klasická (aristotelská), kontextová, genetická, negativní

 Syntaktické hledisko  Terminologie  Lékařský jazyk (přirozený x formální)  Synonyma

 Systémovost  Přesnost  Úspornost (zkracování)  Funkčnost (užívanost, nosnost) Nature Inspired Technology G r o u p

Klasifikace  Hierarchie  Vztahy souřadnost, nad/podřazenost, zjemnění, ortogonalita  Hierarchie generická (rod ,druh) / partitivní (celek, část)  Klasifikace v jedné dimenzi / ve více dimenzích/ složený kód (SNOMED)

 Systémy klasifikace diagnóz  Mezinárodní klasifikace nemocí a příčin smrti (ICD)  ICD-O, TNM, DSM III, Endoskopická nomenklatura

 Systémy klasifikace procedur  Klasifikace ICPM  Klasifikace VZP  Národní číselník laboratorních položek

 Komplexní klasifikační systémy  SNOMED, UMLS


Formalizace problému  Prostředky:  Množiny  Logická notace  Matematika a statistika  Procedurální popis  Algoritmizace

 Deklarativní popis  Báze znalostí – úplnost, nespornost, relativnost  Znalostní pravidla  Terapeutická, „dávkování“, diagnostická  Nezbytný symptom, postačující symptom, přispívající symptom


Příklad synonyma Seznam synonym pro jedno jediné onemocnění: Anafylaktoidní purpura  Nejčastější primární dětský zánět cév  Henoch-Schönlein purpura  Purpura DEBRÉ-LAMY  Esenciální atrombocytopenická purpura (Schultze)  Heberdenův-Willianův syndrom  Kapilaro toxická purpura (Frank)  Peliosis rheumatica  Purpura allergica  Purpura anaphylactica (Glanzmann)


Aspekty pro volby optimálních termínů

Ze stávajících synonym SYSTÉMOVOST PŘESNOST ÚSPORNOST FUNKČNOST


SYSTÉMOVOST  Prvořadý požadavek (z hlediska volby synonym),  Teprve pak získává terminologie (soubor odborných výrazů) vlastnosti nomenklatury (utříděného terminologického systému)  Prostředky pro vyjádření příslušnosti k systému v medicíně jsou  koncovky (především):  itis = zánět, patie = chronický neurčený stav, osa = chronické nezánětlivé onemocnění, aza = enzym, om nádor, áza enzym…  Jde vesměs o české formy latinských/řeckých názvů, s možností jejich skloňování v české větě!  Příklad: Mezinárodnípřed-, přípona - LYMFOgranulOM Eponymum - MorbusHodgkin X


SYSTÉMOVOST Prostředky pro vyjádření systémové příslušnosti v medicíně:  Formou složených výrazů:  Vztah „rod - druh – podskupina“ vyjadřován přívlastkem shodným (akutní krvácení)  Vztah „část – celek“ prezentován přívlastkem neshodným  (kůra nadledvinky, trn obratle) či obráceným slovosledem (příklopka hrtanová)  Koncovkami u jednoslovných termínů stejného základu základu:  Vztah „příčina příčina-následek“ ( embolizace – embolie)  U antonym má přednost lexikální negace (infekční – neinfekční a nikoliv – mikrobiální (neinfekční)


PŘESNOST  Druhý nejdůležitější požadavek na jednoznačnost a obsažnost slovního vyjádření.  Plurivalentní -mnohoznačné slovo, např. „operace“ znamená nejen prováděný výkon , ale i vlastní činnost – operování.  Základní vlastnost odborného termínu oproti slovům běžného jazyka je jeho kontextová nezávislost. Tím se zvyšuje přesnost popisu reality  Příklady  Adherentní (zevní) vlastnost pojmu –Anafylaktoidní purpura  Inherentní (vnitřní) vlastnost - Imunnívaskulitis X

 Doporučení:  Dávat přednost spíše znakům adherentním (jsou názornější)


ÚSPORNOST  Požadavek daný nezbytnou stručností komunikace = praktická potřeba ze strany uživatelů.  Sousloví v češtině  50% odborných termínů ze 2 slov, z 15% ze 3 slov a z 5% ze 4 a více slov.  Jednotlivá slova mají svá přesně určená místa, nelze je nahradit synonymy.  Jde často i o částečnou definici pojmu (chronické srdeční selhání, akutní infarkt myokardu, snímkování ze štítu, hladina krevního cukru).

 Funkčnější je vždy obecně složené slovo než složený výraz.  Příklad:  Složené slovo – Imunodefekt  Složený výraz – Imunodeficitní stav X

 Kratší podobu mohou získat sousloví vypuštěných slov – elipsou (cekum, komoce, dura apod.) Jsou často na pomezí slangu


ÚSPORNOST Zkracování:  nejúspornější forma slovního vyjádření pojmu:  Zkratky hláskové –iniciálové (EKG, EEG, MNR, CT, RTG)  Značky -obvykle symbolu (Kg, m)

 Slabičné  Zkrácené části slov (echo)

Uplatnění:  hlavně v psaném projevu

Při slovní řečové adaptaci mají slangovou formu (RS – roztroušená skleróza – ereska)


FUNKČNOST Užívanost  Termín musí být „živý“ – univerzálně využitelný včetně své zevní grafické podoby. Ne vždy jsou v souladu se spisovnými normami – praxe ukazuje, že jsou ale postupně jazykem asimilovány i do slovníků.  Slova s přeneseným významem často velmi přesně a názorně charakterizují pojem (tzv. významová průzračnost).  Jedná se obvykle o metafory, jež se ale významově neutralizovaly, takže nepůsobí nežádoucí asociace  Příklad:  Metaforie  Přirození„zabíječi „ … namísto kódového označení CD7T – lymfocyty


FUNKČNOST Nosnost  Termín musí být „nosný“ – umožnit tvorbu odvozených slov - zejména adjektiv a sloves ze substantiv. Obecně nosnější jsou slova mezinárodního původu.

Příklad:  Mikroskop –mikroskopie –mikroskopický  To české slovo „drobnohled „ neumožňuje, proto postupně archaizuje.

Morfologie  Vypouštění nefunkčních hlásek (nevyjadřují znaky pojmu, plní jen formální úlohu (thrombocyt –trombocyt, phenylketonurie – fenylketonurie.  Používání počešťujících hlásek (c –k: Chloramphenicol – chloramfenikol, s –z: katalasa –kataláza).


Klasifikační systémy a nomenklatury v medicíně  Mezinárodní klasifikace nemocí (MKN) pro zpracování údajů o    

Zdravotním stavu Nemocnosti Úmrtnosti Prevenci – apod.

 Nejen ve zdravotnictví nutná klasifikace nemocí, která musí zahrnovat        

Nemoci Úrazy Otravy komplikace léčebné péče stavy způsobené zevními příčinami Vrozené a získané vady Přidružené zdravotní problémy kontakty osob se zdravotnickými službami bez nemoci nebo subjektivní stížnosti. Nature Inspired Technology G r o u p

MKN a ICD  Mezin. klasifikace nemocí a příčin smrti – MKN http://www.uzis.cz/cz/mkn/uvod.htm

 ICD –International Classification of Diseases. http://www.who.int/classifications/icd/en/

 Pod záštitou WHO (Svět. zdravotnické organizace)  je každých cca 10 let přepracována.

 Nedostatek: nevhodná pro další kódování komplexní lék. informace (chybí pojmy pro příznaky a terapii).  Současná 10. revize je řešena alfanumericky  místo 1.číslice je nyní písmeno latinské abecedy  další místa jsou číslice dekadické soustavy  Takto všechny nemoci tříděny do 21. skupin s více základními položkami.


Podvojná (duální) klasifikace  Podvojná (duální) klasifikace má dva kódy.  Jeden obsahuje informaci o základním chorobném procesu a je označen křížkem (†).  Je uveden v té části klasifikace, ve které je onemocnění zařazeno podle zásad MKN, tj. podle základní nemoci.  Druhý kód, který obsahuje informaci o lokalizovaném projevu (manifestaci) či komplikaci je označen (*).  Je uveden v kapitole, která se vztahuje na tu orgánovou soustavu, kterou postihuje lokalizovaný projev nebo komplikace.  Příklad:, 2. aplikace ICD – Ve skupině B jsou kupř. zařazeny infekce dle typu infekčního agens, ve skupině I jsou pak srdeční onemocnění.  Přínos: Lze dohledat v rámci obou uvedených skupin – aspektů. Nature Inspired Technology G r o u p

ICD příklad 1: B37 – Kandidóza - candidiasis  .0 Kandidovástomatitida  .1 Plicní kandidóza  .2 Kandidóza kůže a nehtů  .3+Kandidóza vulvya pochvy (N77.1*)  .4+Kandidóza jiných močových a pohlavních lokalizací  .5+ Kandidovámeningitida (G02.1*)  .6+ Kandidováendokarditida (139.8*)  .7 Kandidová septikémie  .8 Kandidóza jiných lokalizací  .9 Kandidóza, NS


ICD příklad 2:  I 39* Zánět srdeční nitroblány - endokarditis při nemocech zařazených jinde  Patří sem postižení endokardu při:  kandidové infekci ( B37 . 6 +)  gonokokové infekci ( A54 . 8 +)  revmatoidní artritidě ( MO5 . 3 +)

 .0 * Nemoci dvojcípé chlopně  .1 * Onemocnění aortální chlopně  .2 * Onemocnění trojcípé chlopně  .3 * Onemocnění pulmonální chlopně  .4 * Mnohočetná onemocnění chlopní  .5 * Endokarditis neurčené chlopně


Komplexní klasifikační systémy Systém SNOMED ( systemizovaná nomenklatura medicíny) umožňuje popis jakékoliv situace v medicíně pomocí 6 úrovní: T - Topografie M - Morfologie, E - Etiologie, F - Funkce, P - Procedura, S - Syndrom a 5 - místným kódem (hexadecimální kód 0-9, A-F) Nature Inspired Technology G r o u p

SNOMED Příklad  V ledvině je absces stafylokokového původu projevující se bolestí a vyvolávající sepsi, pro který je provedena nefrotomie. Stav je popsán jako konjunkce kódů pro ledvinu,abscedující záněty, stafylokoka, bolest, chirurgickou incizi a sepsi:  Topografie – ledvina – T 71000  Morfologie – absces – M 41710  Etiologie – Staphylococcus – E 24400  Funkce – bolest – F 82600  Procedura – nefrotomie – P 10000  Syndrom – sepse – S 00800  T 71000^M 41710^E 24400^F 82600^P 10000^S 00800


Unified Medical Language System  Projekt US National Library of Medicine - tři základní části  Metathesaurus Slovník, sestavený z více než 100 různých informačních zdrojů (SNOMED,ICD10...) Termíny jsou seskupeny, resp. začleněny do jednotlivých „Pojmů“ (Concept) Každý pojem má unikátní „Concept ID“ Pokud příslušný informační zdroj obsahuje relace,spojující pojem s jinými pojmy (is_a, is_part_of), jsou tyto relace v Metathesauru zachovány

 Semantic Network Pokus o ontologii postavenou nad pojmy Metathesauru 135 sémantických typů, 54 relací

 SPECIALIST Lexicon Syntaktický, morfologický a ortografický slovník anglických biomedicínských termínů (pro nástroje pro porozumění textu).


Příklad aplikace s IS  Existují záznamy signálů, které by bylo dobré uchovávat v nějaké integrovanější formě  Co ještě chceme uchovávat:  chceme  chceme  chceme  chceme  chceme  chceme

ukládat záznamy ukládat některé údaje o pacientovy ukládat osobní a rodinou anamnézu ukládat medikaci ukládat údaje a výsledky laboratorních vyšetření pracovat se signálem

 Nechceme pouze uchovávat  Předpokládáme do budoucna možnost data miningu


Příklad aplikace s IS

Pro uchování informací volíme databázi Je potřeba zvolit aplikační a databázovou platformu V našem případě  Aplikační platforma – Java  Databázová platforma – Oracle  Nyní je potřeba vytvořit ER diagram databáze  Je zřejmé, že musíme definovat v partitivní hierarchii  Sestavme si seznam možných entity a jejich vazeb


Příklad aplikace s IS  Možné entity  Pacient – id., jméno, příjmení, pohlaví, datum narození (předpoklad šifrování)  Pat_info – jeden pacient může mít více informací a mění se  Pat_diag – jeden pacient může mít více diagnóz  Pat_meds - jeden pacient může mít více medikací  Measurement – základní jednotka vyšetření, pacient může mít x vyšetření  Results – jedno vyšetření muže mít několik výstupů ne něj navazuje několik detailních entit  Laboratory – výsledky laboratoře

Číselníky  Diagnoses, Medication, Professions, Point_types, Parameters Nature Inspired Technology G r o u p

Příklad aplikace s IS  Jako úložiště dat zvolíme databázi



Máme problém – chceme ukládat signály ze dvou různých zdrojů Máme tedy dva různé formáty souborů Možné řešení  model bude přistupovat k vybranému souboru a sjednocovat načtená data









Práce s číselníkem  Přidávat  Ubírat  Upravovat

Pozor na integritu


Klasifikační systémy a nomenklatury v medicíně

Recommend Documents