DAFTAR PUSTAKA
Agoes, Suhartati dan Suryadi. 2005. Simulasi Identifikasi Daerah Coding Pada Deoxyribonucleic Acid Dengan Menggunakan Discrete Fourier Transform. JETri, 5(2): 45-60. Alberts Bruce, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walter. 2008. Molecular Biology of The Cell, Fifth Edition. New York: Garland Science. Aliah Ratu Siti, Wahidah, Komar Sumantadinata, Estu Nugroho, dan Odang Carman. 2006. Karakteisasi Genetik Ikan Kerapu Tikus (Cromileptes altivelis) Generasi Pertama Hasil Program Domestikasi. Jurnal Akuakultur Indonesia, 5(1): 87-95. Amin, Edi Mulyadi dan Tuti Hariati. 1991. The Capture Fisheries of Segara Anakan, Indonesia. L.M. 51-56. Andhikka, Danang Bayu. 2011. Keragaman Genetik Populasi Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Florida F2 Yang Dibesarkan di Panti Pembenihan dan di Tambak BBPBAP Jepara. Skripsi. Semarang: UNDIP. Annisa, D. 2008. Studi Karakteristik Genetik Populasi Induk Udang Vanname (Litopenaeus vannamei) F1 dan F2 Asal Hawaii Berdasar Metode RFLP (Restriction Fragment Lenght Polymorphism). Skripsi. Malang: Universitas Brawijaya. Ariyanto, Dany. 2008. Studi Karakteristik Genetik Populasi Induk Udang Windu (Penaeus monodon) F1 dan F2 Asal Selat Sunda Dengan Teknik RFLPmtDNA Dan PCR. Skripsi. Malang: Universitas Brawijaya. Brown, T. A. 1992. Molecular Biology. Academic Press. Oxford. Campbell, N. A., J. B. Reece & L. G. Mitchell. 2007. Biologi. Terj. dari Biology, oleh Lestari, R., E. I. M. Adil, N. Anita, Andri, W. F. Wibowo, & W. Manalu. Jakarta: Erlangga. Chan, TY. 1998. Shrimps and Prawns dalam: Carpenter KE, VH Niem, eds. The Living Marine Resources of the Western Central Pacific. Vol. 2. Chepalopods, Crustaceans, Holothurians and Sharks. Food and Argiculture Organization of the United Nations Rome. Cowrie Genetic Database Project. 2010. DNA amplification. November 2005. 1 hlm. http://www.flmnh.ufl.edu/cowries/amplify.html.20 September 2013. pkl, 22.46.
67
68
Dall W, BJ Hill, PC Rothlesberg, DJ Sharples. 1990. The Biology of the Penaeidae. Advance dalam: Blaxter JHS, AJ Southward. Eds. Marine Biology Vol. 27. Academic press. Harcourt Brace Jovanovich, Publishers. London. Djamali A. 1991. Pengaruh Ekosistem Mangrove Terhadap Kelimpahan Pascalarva dan Juwana Udang Windu (P. monodon Fab.) dan Udang Jerbung (P. merguensis de Man) di Perairan Pantai Cilacap, Jawa Tengah. Disertasi. Bandung. Program Pascasarjana Universitas Padjadjaran. Dudley RG. 2000. Segara Anakan Fisheries Management Plan. Specialist Fisheries Consultant Report. BCEOM-DITJEN BANGDA, Jakarta. ECI (Engineering Consultant Inc) – Asian Development Bank. 1994. Segara Anakan Conservation And Development Projet. Final Report. Jakarta. Eknath, A.E., J.M. Macaranas, R.R Velasco, M.C.A. Ablan, M.J.R. Pante, dan Pullin. 1991. Biochemical and Morphometric Aproaches to Caracterize Farmed Tilapia. NAGA. 14(2): P7 – 9. Fatchiyah, Estri Laras A, Sri Widyarti dan Sri Rahayu. 2011. Biologi Molekular: Prinsip Dasar Analisis. Jakarta: Erlangga. Folmer O, M. Black, W. Hoeh, R. Lutz, and R. Vrijenhoek. 1994. DNA primers for amplification of mitocondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Molecular Marine Biology and Biotechnology. 3 (5). 294-299. Guyton, Arthur C and John E. Hall. 1996. Textboox ofMedical Physiology. Philadelphia: Saunders. Hidayat, Ahmad. 2007. Keragaman Genetik Udang Jari (Metapenaeus elegans De Man, 1907) Berdasarkan Karakter Morfometrik di Laguna Segara Anakan, Cilacap, Jawa Tengah. Skripsi. Bogor: IPB. Holthuis, L.B. 1980. Shrimps And Prawnsof The World: An Annotated Catalogue of Species of Interest to Fisheries.FAO Fisheries Synopsis. No. 125, Volume 1. Food And Agriculture Organization Of The United Nations. Irawan, Bambang. 2008. Genetika Molekuler. Surabaya: Airlangga University Press. Irmawati. 2003. Perubahan Keragaman Genetik Ikan Kerapu Tikus Generasi Pertama Pada Stok Hatchery. Thesis. Bogor: IPB. Jasin, Maskoeri. 1984. Sistematika Hewan (Invertebrata dan Vertebrata). Surabaya: Sinar Surya.
69
Lewis, Ricki. 2005. Human Genetics: Concepts and Application. New York: McGraw-Hill. Lovett, DL. 1981. A guide to the shirmp, prawns, lobsters, and crab of Malaysia and Singapore. Occasionaly Publication No.2. Faculty of Fisheries and Marine Science. Universitas Pertanian Malaysia. Mandayasa, I Wayan Gede. 2007. Studi Keragaman Genetik Populasi Udang Galah (Marcobrachium rosenbergii) Berdasarkan Polimorfisme Mitokondria DNA. Skripsi. Bogor: IPB. Melnick D, Hoelzer J, Honeycut. 1992. The mitochondrial genome: its uses in the anthropological research in molecular application in biological anthropological, p. 179 – 233. Cambridge University Press. Motoh, H. 1981. Study on Fisheries biology of the Giant Tiger Prawn Penaeus monodon in the Philippines. SEADEC. Technical report no.7. Najjar, Zaghlul. 2006. Pembuktian Sains Dalam Sunnah Jilid 2. Jakarta: AMZAH. Penerjemah: M. Lukman (STP Sabda). Judul Asli: Al-I’Jas Al-‘Ilmy fi As-Sunnah An-Nabawiyyah Al-Juz’u Ats-Tsaniy. NCBI (=National Center for Biotechnology Bioinformation). 2013. The BLAST sequence analysis tool : 1 hlm. http:// www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/, 15 November 2013, pk. 20.15. NCBI (=National Center for Biotechnology Bioinformation). 2013. Taxonomy: 1 hlm. http:// www.ncbi.nlm.gov/taxonomy/, 16 November 2013, pk. 01.30. Nugroho, E. 1997. Practical Manual on Detection of DNA Polymorphisme in Fish Population Study. In: Bulletin of Marine Science and Fisheries No. 17/1997. Pp, 109-129. Kochi University, Japan. Palit Epiphani I.Y, Alvian Sroyer, dan Hendrikus M.B Bolly. 2012. Analisis Filogenetik Daerah D-loop DNA Mitokondria Manusia pada Populasi Papua Melalui Proses Makrov. Prosiding InSINas. 0377: 192-199. Passarge, Eberhard. 2007. Color Atlas of Genetics. New York: Theime Stuttgart. Prasetyo Didik dan Jito Sugardjito. 2007. Variasi Genetik Orangutan Kalimantan Timur Berdasarkan DNA Mitokondria. BIODIVERSITAS. Vol 8(4): 300304. Primavera JH. 1990. External and Internal anatomy of adult penaeid prawns/shirmp. http://www.fao.org/docrep/T072E/10726e19.gif, 5 September 2013, pk. 02.00.
70
Qurthubi, Syaikh Imam. 2009. Tafsir Al Qurthubi (14). Jakarta: Pustaka Azzam. (Penerjemah: Muhyiddin Mas Rida). Sambrook, Joseph and David W. Russell. 2001. Molecular Clonning: A Laboratory Manual. 3th ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. Book 1&2. Saputra, Suradi Wijaya. 2005. Dinamika Populasi Udang Jari (Metapenaeus elegans de Man 1907) Dan Pengolaannya di Laguna Segara Anakan Cilacap Jawa Tengah. Skripsi. Bogor: IPB. Saputra, Suradi Wijaya. 2008. Distribusi dan Ruaya Udang Jari (Metapenaeus elegans de Man 1907) di Laguna Segara Anakan Cilacap Jawa Tengah. Jurnal Saintek Perikanan. Vol. 3(2): 1-8. Shihab, M. Quraish. 2002. Tafsir Al-Mishbah. Jakarta: Lentera hati. Sofro, As.S.M. 1994. Keanekaragaman Genetik. Yogyakarta: Penerbit Andi Offset. Sudarmono. 2006. Pendekatan Konservasi dengan Teknik Molekuler Elektroforesis. Program Doktor. University Osaka City, Osaka, Jepang. Sudoyo, H. 1995. Mutasi DNA Mitokondria Sebagai Penyebab Kelainan Genetika. Bagian Biologi Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, Jakarta. Sumantri, Danang. 2012. Perbedaan Karakerisasi Genetik Udang Vannamei (Litopenaeus vannamei) yang Terinfeksi White Spot Syndrome Virus (WSSV) di Tambak Porong dan Tambak Bangil. Skripsi. Malang: Universitas Brawijaya. Suryanto, Dwi. 2003. Melihat Keanekaragaman Organisme Melalui Beberapa Teknik Genetika Molekuler. Sumatera Utara: USU digital library, 23 Juni 2013, pk. 19.00. Susminarsih, T. 2010. Peran Genetik DNA Mitokondria (mtDNA) Pada Motilitas Spermatozoa. Majalah Kesehatan PharmaMedika. Vol 2(2): 178-184. Tarwinangsih Wiwin, A. Farajallah, C. Sumantri dan E. Andreas. 2011. Analisis Keragaman Genetik Kerbau Lokal (Bubalus bubalis) Berdasarkan Haplotipe DNA Mitokondria. Seminar Nasional Teknologi Peternakan dan Veteriner 2011. Hlm.59 – 67. Taylor, G. R, M. J. McPherson, B. D. Hames. 1995. PCR 2: A Practical Approach. New York: Oxford University Press.
71
Toha AHA. 2001. Deoxyribo Nucleic Acid: Keanekaragaman, Ekspresi, Rekayasa, dan Efek Pemanfaatannya. Bandung: Alfabeta. Wahyudi, Tri Harsono. 2007. Pengaruh Suhu Annealing dan Jumlah Siklus yang Berbeda Pada Program PCR Terhadap Keberhailan Iolasi dan Amplifikasi mtDNA Ikan Patin (Pangasius hypothalmus). Skripsi. Bogor: ITB Williams ST, JAH Benzie. 1997. Indo-West Pacifict Patterns of Genetic Differntiation in High-Dispersal Starfish Linckialaevegata. Mol. Ecol. 6: 559-573. Wilson Kate, Valma Cahill, Elizabeth Ballment, and John Benzie. 2000. The Complete Sequence of the Mitochondrial Genome of the Crustacean Penaeus monodon: Are Malacostracan Crustaceans More Closely Related to Insect than to Branchipods. Journal for Molecular Biology and Evolution. Vol 17(6): 863-874. Wolstenholme, D. R. 1992. Animal mitochondrial DNA: structure and evolution. Int. Rev. Cytol. 141: 173-216. Zarochman. 2003. Laju Tangkap Udang dan Masalah Jaring Apong di Pelawangan Timur Laguna Segara Anakan. Tesis. Semarang: Universitas Diponegoro. Zein, M. Syamsul Arifin dan Sri Sulandari. 2008. Keragaman Genetik Ayam Lombok Berdasarkan Sekuen D-loop DNA Mitokondria. JITV 13(4): 307-314. Zhao Hongyu, Ruth Pfeiffer and Mitchell H Gail. 2003. Haplotype analysis in population genetics and association studies. Pharmacogenomics 4(2): 171-178.
