BIOMEDICÍNSKÁ INFORMATIKA A JEJÍ ÚLOHA V PERSONALIZOVANÉ MEDICÍNĚ Petr Lesný1, Kryštof Slabý1, Tomáš Holeček2, Jan Vejvalka1 1 2
Fakultní nemocnice v Motole, Praha
Fakulta humanitních studií UK, Praha
Abstrakt: - Limitem současné medicíny je využívání standardizovaných postupů, jejichž účinnost při léčbě konkrétního pacienta lze předvídat jen omezeně. Moderní trendy v biomedicíně, zejména pak personalizovaná medicína, využívají informatické technologie pro identifikaci a analýzu faktorů, které stojí za individuální účinností léků nebo léčebných postupů, predikci jejich účinnosti a jejich případné modifikace. Klíčová slova: - personalizovaná medicína, algoritmická medicína, medicína založená na důkazech
1. ÚVOD
Klasická medicína založená na předávání empirických poznatků mezi lékaři se setkává se dvěma zásadními limity. Prvním z těchto omezení je neustále se zvyšující tempo vydávání odborných biomedicínských informací (obr. 1), které činí řadu netriviálních publikací zastaralými již v okamžiku vydání. Druhé z těchto omezení se týká nesouladu mezi víceméně konstantní rychlostí, kterou je člověk schopen přijímat informace a získávat nové empirické zkušenosti, a požadavkem na to, aby byl mladý lékař co nejdříve po škole schopen samostatné práce. Schopnost práce s informacemi je dnes pro lékaře i sestry nezbytností; tomu je také přizpůsobena výuka na lékařských fakultách, které učí studenty zvládnout najednou enormní množství informací. Na rozdíl od situace v minulosti, kdy byla základem zpracování informací v biomedicíně schopnost nalézt relevantní informace, dnes se setkáváme spíše s nutností identifikovat relevantní informace v záplavě informačních zdrojů. V moderní medicíně se pak objevují tři významné trendy pro
Information, Konwledge, Innovation 2008
práci s informacemi: je to medicína založená na důkazech, personalizovaná medicína a algoritmická medicína.
Obr.1. Počet odborných článků indexovaných v nejčastěji používaném a nejrozsáhlejším on-line zdroji pro biomedicínu [1] za posledních 20 let. 800000 700000 600000 500000 400000 300000 200000 100000 0
1987
1992
1997
2002
2007
2. PERSONALIZOVANÁ MEDICÍNA
Dnešní
farmakoterapie je postavena na principu „jeden lék pro všechny“.
Léčivo je připraveno a testováno na vybrané populaci; u některých pacientů účinkuje, u jiných nikoliv. U některých pacientů účinkuje extrémně dobře, u jiných vyvolává závažné nežádoucí reakce. Pokud je víc žádoucích než nežádoucích účinků a ekonomická analýza vychází jako zisková, je lék uveden na trh. Přirozeným důsledkem této situace je to, že léky (obecně léčebné postupy) nezabírají u všech pacientů stejně a je obtížné předvídat jejich účinnost u konkrétního pacienta. Personalizovaná medicína (personalized medicine) si klade za cíl jednak identifikovat a analyzovat faktory, které stojí za individuální účinností léků nebo léčebných postupů u jednotlivých pacientů, jednak predikovat efekt léku nebo terapeutického postupu u konkrétního pacienta a případně modifikovat léčivo tak, aby byl jeho efekt maximální. Cílem personalizované medicíny je individuální a maximálně účinná léčba konkrétních pacientů. Nejjednodušší metody, které personalizovaná medicína využívá jsou založeny na vyhodnocení předchozí reakce pacienta na stejné nebo podobné léky; nejsofistikovanějším trendem je identifikace a analýza součástí genetického kódu
Information, Konwledge, Innovation 2008
pacienta,
které
zodpovídají
za
reakci
na
lék
nebo
terapeutický
postup
(farmakogenomika). Důležitou vlastností personalizované medicíny je důraz na práci s informacemi.
3. MEDICÍNA ZALOŽENÁ NA DŮKAZECH
Medicína založená na důkazech (evidence based medicine) je často definována jako integrace nejlepšího důkazu získaného výzkumnou činností s klinickou zkušeností a indikátory daného pacienta [2]. Metoda klade důraz na rychlé využívání vědeckých poznatků pro léčení konkrétních pacientů tak, aby z nich nemocný měl co nejdříve užitek a přináší požadavek důsledného hodnocení kvality a relevance použitých informačních zdrojů základního i aplikovaného výzkumu z hlediska aktuálních potřeb pacienta. Vzhledem k tomu, že základním informačním zdrojem je zde „klinická studie“, soustředila se největší organizace věnující se medicíně založené na důkazech, Cochrane collaboration [3], na systematické shromažďování dat o klinických studiích a vývoj mechanismů pro shromažďování dat o nejvýznamnějších klinických studiích, jejich metaanalýzy a hodnocení kvality. Teoretický koncept medicíny založené na důkazech pomáhá lékaři, který se setká s netriviálním problémem nalézt v odborné literatuře (pokud existuje) relevantní zdroj informací, které mu budou prospěšné pro léčbu pacienta.
4. ALGORITMICKÁ MEDICÍNA
Lékař se vždy pohybuje na průsečíku tří informačních zdrojů. Prvním z nich jsou jeho empirické „klinické“ zkušenosti, druhým jsou odborné informační zdroje a třetím jsou indikátory informující jej o stavu pacienta. Algoritmická medicína (algorithmic medicine) je pokusem zjednodušit tuto situaci pomocí přímé aplikace vhodně uzpůsobených odborných informací v podobě vhodně zapsaných algoritmů nebo pracovních postupů (guidelines) na vybrané indikátory stavu pacienta. Vybraným algoritmem jsou pak indikátory stavu pacienta transformovány na indikátory, které bezprostředně ovlivňují jeho terapii.
Information, Konwledge, Innovation 2008
V řadě případů probíhají pokusy o integraci algoritmické medicíny do běžné lékařské praxe v podobě například automatizovaných výpočtů v nemocničních informačních systémech, nebo předepsaných postupů přikázaných lékařům jejich profesními organizacemi. Vzniká řada knihoven algoritmů i více či méně sofistikovaných nástrojů usnadňujících rozhodování lékařů (decision support tools), například [4]. Širší aplikace algoritmické medicíny je však dosud v začátcích.
5. ZÁVĚR
Současné moderní trendy v biomedicíně (medicína založená na důkazech, personalizovaná medicína, algoritmická medicína) kladou na lékaře vysoké požadavky z hlediska schopnosti zpracovávat veliké objemy informací. Právě aplikací informatických postupů dostává lékař, který je schopen léčit průměrného pacienta s průměrným efektem nástroje pro vyléčení konkrétního pacienta s konkrétním problémem. Z tohoto hlediska si zaslouží pozornost specializované nástroje a postupy pro práci s informacemi, které mají za úkol ulehčit, zkvalitnit a zrychlit rozhodování zdravotnických pracovníků při práci s velkými objemy informací.
Poděkování Podpořeno z grantu AV ČR 1ET202090537 (MediGrid).
Literatura 1. PubMed http://pubmed.com. 2. Evidence-Based Medicine, How to practice and teach EBM. Eds D.L. Sackett, S.E. Straus, W. Scott Richardson, W. Rosenberg, R.B. Haynes. 2nd edition. Churchill Livingstone, 2000. 3. The Cochrane Collaboration http://cochrane.org. 4. MediGrid http://www.medigrid.cz.
MUDr. Petr Lesný
Information, Konwledge, Innovation 2008
Klinika ušní, nosní a krční UK 2. LF a Fakultní nemocnice v Motole V Úvalu 84 Praha 5 – Motol 150 06
[email protected]
Information, Konwledge, Innovation 2008