Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Mikrofluidní bioaplikace
Strana 1
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Mikrofluidní aplikace pro bioanalýzu • Transport, dávkování, promíchávání a adresování vzorků, pufrů a dalších elektrolytů. • Homogenní a heterogenní biologické interakce typu ligand-receptor. • Separace biologických molekul. • Detekce a kvantifikace biologických složek. • Zařízení integrující některé nebo všechny předešlé kroky.
Strana 2
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Typická zařízení pro mikrofluidní bioaplikace • Kapilární/mikrokanálkové elektroforetické a isoelektrické fokusační systémy. • Dielektroforetické a elektroosmotické třídiče a koncentrátory. • Mikrokanálkové struktury pro řízený elektrokinetický transport vzorků. • Mikrofluidní čipy pro proteinovou analýzu s různým stupněm integrace. • Vysoce integrované mikrofluidní čipy pro analýzu DNA/RNA. • Mikrofluidní PCR systémy. • Kontinuálně pracující biosenzory. • Průtokové cytometry
Strana 3
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 4
PCR – polymerázová řetězová reakce • Metoda používaná ke zmnožení molekuly DNA ze vzorku • Ke zmnožení je dostačující jedna kopie DNA molekuly, z toho plyne citlivost metody na kontaminaci vzorku biologickým materiálem • Metoda je založena na řízeném střídání teplotních cyklů, kdy dochází ke zmnožování DNA rychlostí 2n, kde n je počet teplotních cyklů • Cykly se skládají z následujících kroků – denaturace dvojšroubovice DNA při 92-95°C – hybridizace primeru na specifické místo ssDNA 62°C – syntéza komplementárního řetězce termofilní DNA polymerázou 68-80°C
• Řízení teplotního režimu je klíčovým problémem PCR metody • V mikrofluidice je kvalitní řízení teplotního režimu umožněno vysokým poměrem teplosměnné plochy vůči reakčnímu objemu
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 5
Mikrofluidní čip pro dynamickou PCR V dynamickém uspořádání protéká roztok obsahující vzorek DNA, primery, báze a DNA polymerázu opakovaně různými teplotními zónami. Amplifikace molekul DNA (cca 30 cyklů) trvá obvykle kolem 30 minut. Transport reakční směsi je obvykle proveden elektroosmoticky.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 6
Dynamická PCR v zařízení se segmentovaným tokem
V každé červené kapce probíhá amplifikace DNA. Jednotlivé kapky jsou odděleny olejovou fází. Kapky proudí v mikrokanálech v různých teplotních zónách – dochází k amplifikaci. Jedná se o kontinuální sériové uspořádání PCR. IMM Mainz.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 7
Mikrofluidní čip pro stacionární PCR Ve stacionárním uspořádání je vzorek a ostatní komponenty umístěn v mikrofluidní komoře. Pomocí topných tělísek je měněna okolní teplota v požadovaných cyklech. Běžně je dosahováno rychlosti změn teploty okolo 30 °C s-1. Toto uspořádání je typické pro klasické PCR systémy, kde je ovšem dosahováno mnohem pomalejších změn teploty. Mikrofluidní čipy jsou náchylnější na kontaminaci DNA kvůli vysoké vzájemné afinitě používaných konstrukčních materiálů a biologických molekul.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 8
Příklady komerčních PCR čipů Stacionární PCR
Dynamická PCR
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 9
Elektroforéza • Separační metoda založená na různé pohyblivosti iontů ve vloženém elektrickém poli. • Obvykle jsou separovány velké molekuly biologického původu – fragmenty DNA, proteiny atd. • K separaci dochází, pokud molekuly nesou odlišný efektivní elektrický náboj nebo se liší jejich molekulové hmotnosti. Nárůst molekulové hmotnosti koreluje s poklesem difúzního koeficientu složky. • Separace je obvykle prováděna na stacionárním médiu (vrstvě gelu) nebo v mikrokapiláře/mikrokanálku s axiálně vloženým stejnosměrným elektrickým napětím • Molekuly s odlišnou pohyblivostí se rozdělí do separovaných zón. • Velikost a poloha zón vypovídají o kvantitativním a kvalitativním složení separované směsi. • K elektroforetickému systému je připojen detektor.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 10
Princip kapilární elektroforézy v mikrofluidních systémech Odpadní rezervoár
W Rezervoár mobilní fáze - pufru
Odpadní rezervoár
Směr toku separovaných částic
B
Detektor
Separační kanál Dávkování vzorku
S Rezervoár vzorku
Zdroj stejnosměrného elektrického napětí
W
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 11
Využití elektroforézy – elektroforetické kapilární pole Radiální matice separačních kanálků
96 kanálové mikrozařízení určené pro elektroforetickou separaci molekul DNA. Zařízení je opatřeno fluorescenčním detektorem. Separační kanál má průměr 200 mm. Kanálky dávkovacích zařízení mají šíři 110 mm a hloubku 50 mm. Délka separačních kanálů je 33 mm.
Dávkovací zařízení
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 12
Využití elektroforézy – automatizované 96-kapilárové zařízení pro separaci DNA
Zdroj vysokého napětí 96 jamkové destička se vzorky DNA
Separační kapiláry
Fluorescenční detektor
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Přednáška #12
Sekvenování DNA: Sangerova metoda
http://www.techcouncil.org/the-sanger-dna-sequencing-methods-1
Strana 13
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 14
384-kanálová kapilární zařízení pro sekvenování DNA Zařízení slouží k detekci různě velkých fragmentů DNA vzniklých syntézou komplementárního řetězce DNA při sekvenování. Každá báze je označena specifickou značkou (jednou ze čtyř), jejíž přítomnost je možno detekovat pomocí laserem indukované fluorescence. Z pořadí detekovaných zón a barvy lze určit sekvenci bazí.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 15
Příklad komerčních sekvenovacích zařízení s integrovanou kapilární elektroforézou
MegaBACE 4000 Capillary Array (jedno pole obsahuje 64 kapilár). Přístroj lze dále rozšířit.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 16
Využití elektroforézy – příprava koncentrovaného analytu Polopropustná vrstva
DF
Zvýšení koncentrace vzorku
Schéma koncentrátoru
Přivedení vzorku
DF
Odvedení koncentrátu na separaci
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 17
Isoelektrická fokusace Separační metoda využívající odlišnosti hodnoty isoelektrického bodu různých biomolekul. Isoelektrický bod odpovídá hodnotě pH, kdy daná molekula nese celkově nulový elektrický náboj.
Pokud je hodnota pH nižší, biomolekula získává celkově kladný elektrický náboj. Pro hodnoty pH vyšší je náboj biomolekuly celkově záporný.
Fokusační metoda je založena na faktu, že biologická molekula migruje v elektrickém poli pouze tehdy, pokud je její celkový elektrický náboj nenulový. Jestliže je molekula transportována do oblasti, kde hodnota pH je rovna isoelektrickému bodu, její migrace se zastaví. V tomto místě může být poté detekována. Obvykle je používáno sériové uspořádání (viz dále). Mikrofluidní systémy umožňují také paralelní uspořádání.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 18
Isoelektrická fokusace Klasické sériové uspořádání s imobilizovaným gradientem pH V klasickém uspořádání je vytvořen sendvič skládající se z gelových komůrek oddělených membránami. V každé komůrce je pomocí pufru nastavena určitá hodnota pH. Komůrky jsou řazeny v sérii tak, aby hodnota pH monotónně klesala nebo rostla. Na systém je vloženo elektrické pole a do některé komory je vložen vzorek obsahující biologické molekuly. Ty se poté migrují do komor, kde je hodnota pH blízká jejich isoelektrickému bodu.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 19
Isoelektrická fokusace
Paralelní uspořádání komor s různou hodnotou pH
V paralelním uspořádání jsou komůrky s rozdílně nastavenými hodnotami pH odděleny nepropustnou přepážkou. V mikrofluidice je možno vytvořit velké pole komůrek s velmi malým charakteristickým rozměrem. Kolmo k tomuto komůrkovému poli je vložen gradient elektrického potenciálu a vzorek obsahující biologické molekuly je umístěn nad a/nebo pod komorami. Biomolekuly jsou poté separovány podle svého isoelektrického bodu v odpovídajících komůrkách. Uvedené řešení výrazně urychluje fokusaci vzhledem ke krátkým transportním vzdálenostem v laterálním směru. Je možno také využít automatických detektorů.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Přednáška #12
Strana 20
SDS-PAGE
Western blot
Nterminus antibody T
Sch
250 150 100 75 50 25 10
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 21
Chemické a biochemické interakce Při interakci jedné nebo několika chemických komponent (reaktantů) může dojít k jejich chemické přeměně za vzniku produktů. Chemická přeměna probíhá za přítomnosti nebo bez přítomnosti katalyzátorů, které se přímo účastní transformace a snižují její aktivační energii.
Reaktanty
katalyzátor
Produkty
V biochemických reakcích dochází velmi často při interakci ligandu a receptoru ke tvorbě ligandreceptorového komplexu a/nebo jeho zpětné disociaci
Ligand + Receptor
Komplex
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 22
Uspořádání chemické interakce • Homogenní – všechny reaktanty i katalyzátor jsou v jedné fázi, obvykle kapalné – například kompetitivní imunoanalýza v roztoku Ag (aq) + Ab (aq)
C (aq)
• Heterogenní – jeden nebo více reaktantů nebo katalyzátor je umístěn v jiné fázi než ostatní reaktanty – například heterogenní imunoanalýza s antigenem nebo protilátkou vázanou na pevný nosič Ag (s) + Ab (aq)
C (s)
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 23
Heterogenní biochemické reakce Heterogenní uspořádání je obvyklé u všech vysoce paralelizovaných aplikací – DNA čipů nebo různých proteinových čipů. Jeden z reaktantů – receptor je imobilizován buď na povrchu pevné fáze nebo v gelové vrstvě. Receptorem může být antigen, protilátka, proteinové ligandy a receptory (GF, EGFR), jiné proteiny, ssDNA, RNA atd.
Rozpoznávání se děje na základě specifity komplementární interakce mezi antigenem a protilátkou, ssDNA-ssDNA, enzymem a substrátem atd. Zatímco DNA čipy obsahují velké množství vazných míst (až desítky tisíc), u proteinů to bývají obvykle jednotky až desítky.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
hemaglutinace
http://en.wikipedia.org/wiki/Blood_type
Přednáška #12
Strana 24
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 25
DNA čipy • Zařízení pro detekci specifické sekvence bází v molekule DNA nebo RNA • DNA čip je tvořen maticí detekčních míst (microarray) • Detekční místa jsou obvykle tvořena gelem s imobilizovaným receptorem – ssDNA (denaturovaná jednořetězcová DNA) • V analyzovaném vzorku jsou přivedeny fluorescenčně značené ssDNA (ligandy) • V případě komplementarity ligandu a receptoru proběhne hybridizace a stabilní dsDNA (dvouřetězcová DNA) je vytvořena v detekčním místě • Po odmytí nenavázané ssDNA, může být provedena fluorescenční detekce.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 26
DNA čipy • DNA čipy vykazují extrémní specifitu, která je závislá na počtu párů bází (pb) ve vzniklém komplexu ligandreceptor (~ 4n, kde n je počet pb). • Charakteristický rozměr detekčních míst bývá v mm, což umožňuje vytváření obrovských matic detekčních míst (fotolitografie, microspotting, inject printing). • Na jednom DNA čipu mohou být vázány všechny sekvence DNA kódující nějaký gen určitého organizmu (cca desítky tisíc míst) • DNA čipy jsou využívány pro detekci genetických poruch (mutací), identifikaci osob (DNA fingerprint), detekci přítomnosti virových nebo bakteriálních infekcí, zjišťování nejúčinnějšího léčebného postupu u závažných onemocnění (personal therapy)
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 27
Princip DNA čipu- schéma
Typický fluorescenční obraz DNA čipu po hybridizaci
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Přednáška #12
Strana 28
http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_microarray
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 29
DNA čipy • Pod detekčním místem (gelem) bývá umístěna elektroda • Vložené elektrické pole urychluje transport DNA ze vzorku k detekčnímu místu vlivem elektroforetické migrace • Analýzu na čipu tak lze urychlit z hodin na minuty • Zapojením vybraných elektrod je možné složky vzorku usměrňovat (adresovat) pouze ke zvoleným detekčním místům • Vzhledem k univerzálnosti interakce ssDNAssDNA a její vysoké specificitě, je již mnoho DNA čipů dodáváno komerčně
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 30
Příklady komerčních DNA čipů DNA čip firmy Nanogen se 100 testovacími místy s uloženými mikroelektrodami pro adresování.
Typická čtečka signálu DNA čipů
DNA čip s možností adresování standardního připojení k řídící jednotce.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 31
Na DNA čipu může být umístěn celý genom libovolného organizmu DNA čip – Escherichia coli 18880 detekčních míst (25 pb) o průměru 11 mm Sledování exprese až 5500 transkriptů Affymetrix, Inc. DNA čip – Drosophila melanogaster (octomilka) 18880 detekčních míst (25 pb) o průměru 11 mm Sledování exprese až 18500 transkriptů Affymetrix, Inc. DNA čip – Myš 18880 detekčních míst (25 pb) o průměru 11 mm Sledování exprese až 39000 transkriptů Affymetrix, Inc. DNA čip – Člověk 18880 detekčních míst (25 pb) o průměru 11 mm Sledování exprese až 47000 transkriptů Affymetrix, Inc.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Příklady komerčních DNA čipů • Vzhledem k vysoké specificitě hybridizační reakce lze princip DNA čipů použít např. ke zvýšení bezpečnosti různých čipových karet • Každá sekvence DNA je spojena se specifickým signálem elektronického čipu karty. Tento signál může být identifikován pomocí čtecího zařízení s komplementárním signálem.
Strana 32
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 33
Proteinové čipy • Interakce mezi dvěma komplementárními proteiny nebo proteinem a molekulou nebílkovinné povahy • Proteiny jsou velmi rozmanité molekuly – – – – – –
proteiny, lipoproteiny, glykoproteiny fibrilární a globulární hydrofilní nebo hydrofóbní charakter povrchu isoelektrický bod, celkový elektrický náboj protilátky, antigeny, enzymy, receptory, ligandy, substráty řádové rozdíly v molekulární hmotnosti
• Specificita nebývá absolutní, enzym je schopen zpracovávat více substrátů, protilátky se mohou vázat na více antigenů (epitopů)
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 34
Proteinové čipy • Z uvedených vlastností plyne, že žádný proteinový čip nemůže být tak univerzální a specifický jako DNA čipy • Přístup ke konstrukci proteinového čipu také není univerzální, protože každá aplikace vyžaduje zvláštní přístup, což je determinováno charakterem zkoumaného proteinového systému • Obvykle není vyžadován vysoký stupeň paralelizace (jedno až několik desítek detekčních míst) • Typickým příkladem může být čip pro paralelní detekci několika antigenů spjatých s různými infekčními chorobami
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 35
Proteinové čipy • Proteinové čipy mají řádově menší charakteristické rozměry než klasické systémy pro detekci proteinů (např. ELISA destičky) – – – – –
řádové snížení doby analýzy (např. rychlá diagnostika) snížení spotřeby proteinových reaktantů (cena) přenositelnost systému (k pacientovy, na místo analýzy) snadnější paralelizace reprodukovatelnější reakční podmínky (přesné dávkování, lepší homogenizace vzorku, …)
• Protože proteinové čipy nejsou masově rozšířené – chybí univerzální porty – ceny analýz jsou podstatně dražší než v klasických systémech, protože pořizovací náklady na detektory, obslužné zařízení i samotné čipy jsou obrovské – čipy jsou vyráběny v malých sériích – výhody proteinových čipů nepronikly mezi odbornou veřejnost
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 36
Příklad imunoanalýzy v homogenním uspořádání Kompetitivní imunoanalytické stanovení teofylinu v homogenním uspořádání. Dávkování reaktantů a manipulace s roztoky je založena na elektroosmotickém transportu.Teofylin ze vzorku (5) a známé množství značeného teofylinu (6) jsou nejprve smíchány. Poté jsou inkubovány s omezeným množstvím protilátky (7). Vznikají komplexy značeného a neznačeného teofylinu s protilátkou a zůstává část nespotřebovaného značeného teofylinu. Značený teofylin a značený teofylin v komplexu jsou následně na základě různé elektroforetické mobility odděleny v separačním kanále a jejich množství je detekováno.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 37
Příklad imunoanalýzy v homogenním uspořádání Míchání a inkubace
Separace
Kalibrační křivka – relativní poměr značeného teofylinu volného a v komplexu vypovídá o koncentraci neznačeného teofylinu ve vzorku.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 38
Příklad imunoanalýzy v homogenním uspořádání Vysoce integrované šestikanálové zařízení pro paralelní imunoanalýzu v homogenním uspořádání. Zařízení obsahuje pouze jeden fluorescenční detektor. Separace komplexu a značeného antigenu se provádí na základě rozdílných elektroforetických mobilit. Využit elektroosmotický transport roztoků.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 39
Mikrofluidní čip pro detekci proteinů na pevné fázi
Reakční komora
Zařízení kombinuje následující procesy: imobilizace proteinu, inkubace, proplachování, detekce a regenerace. Transport je uskutečněn výhradně elektrokineticky.
Heterogenní stanovení IgG ze vzorku vazbou na imobilizovaný Protein A
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 40
Mikrofluidní čip pro detekci proteinů na pevné fázi Fluorescenční detekce vázané protilátky
Kvantifikace signálu v elektroosmotickém biosenzoru – kalibrační křivka
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 41
Polystyrénový mikročip pro detekci IgG
Experimentální mikročip testovaný pro přímou a sendvičovou detekci lidských IgG na Proteinu A. Protein A je imobilizován na stěně zařízení. Vzorek je přiveden v roztoku. Doba inkubace je 5 minut.
Paralelizace kanálů umožňuje sestavení kalibračních křivek nebo paralelní detekci různých vzorků.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 42
Polystyrénový mikročip pro detekci IgG Intenzita fluorescenčního zabarvení v konkrétním kanále po vymytí zbytku vzorku vypovídá o koncentraci imobilizovaného komplexu PA-hIgG nebo PA-hIgGgIgG a tedy i o původní koncentraci IgG v analyzovaném vzorku.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 43
Polystyrénový mikročip pro detekci IgG Analýzou intenzity fluorescenčního signálu je možno získat kalibrační křivky mikrofluidního zařízení. Z nich lze pomocí matematického modelu určit rovnovážné a kinetické konstanty vazby ligand-receptor. Rychlostní konstanta kon Ab Ag C
Rovnovážná konstanta
K d koff kon
Imobilizovaný Protein A a lidské IgG v roztoku kon = 5.5 m3mol-1s-1 Kd 3×10-6 mol m-3
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 44
PDMS mikročip pro kvantifikaci protilátek Mikročip z polydimethylsiloxanu (PDMS) Vynikající optické vlastnosti, snadná výroba Hydrofobní charakter povrchu
Dvoukroková detekce myších protilátek mIgG hIgG
glutardialdehyde
mIgG
FITC-gIgG
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 45
PDMS mikročip pro kvantifikaci protilátek Měřen profil fluorescenční emise napříč čipem
Schéma detekční aparatury
Zařízení obsahuje excitační laser a fotonásobič
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 46
PDMS mikročip pro kvantifikaci protilátek Výsledkem je kalibrační závislost intenzity fluorescenčního signálu na koncentraci myších protilátek ve vzorku
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 47
Mikročip pro heterogenní imunoanalýzu na vrstvě částic
Sendvičová heterogenní imunoanalýza – stanovení CEA (carcinoembryonic antigen) při diagnostice rakoviny. Mikrofluidní zařízení obsahuje mikročástice s imobilizovanou Ab proti CEA. CEA ze vzorku se váže na protilátku. Na vzniklý komplex se váží protilátky proti CEA a dále zlatem značené protilátky proti CEA protilátkám. Komplex obsahující zlaté částice může být detekován.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 48
Mikročip pro heterogenní imunoanalýzu na vrstvě částic
Zařízení obsahuje lože mikročástic. Úniku mikročástic je zabráněno zúžením kanálku. Roztoky obsahující analyty jsou dávkovány tlakem řízenou konvekcí. Zařízení je schopno zpracovávat paralelně několik vzorků.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 49
Příklad komerčních proteinových čipů Kompaktní analyzátor Sandia fluorescenčně značených proteinových toxinů – nM koncentrace
Modrý diodový laser excituje fluorescenční značku proteinů
Jádrem analyzátoru je mikrofluidní čip fungující na principu kapilární elektroforézy
Transport vzorků je realizován elektrokineticky
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Průtoková cytometrie
50
Metoda slouží k identifikaci a kvantifikaci specifických buněk – třídění buněk Typické aplikace – detekce rakovinných buněk v krvy, detekce mikroorganizmů Buňky se pohybují v sérii kanálkem a specifické buňky (například značené fluoreskující protilátkou) jsou opticky detekovány
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Průtokový cytometr v mikrofluidním čipu
Chen HT, Wang YN, MICROFLUIDICS AND NANOFLUIDICS 6, 529-537, 2009
51
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Přednáška #12
Strana 52
FACS - fluorescence activated cell sorting
http://www.thoughtyoumayask.com/picsbtqq/fluorescence-activated-cell-sorting/2
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Elektrostatický dezintegrátor buněk Krátkodobé pulsy (50 ms) silného elektrického pole (1×107 Vm-1) dezintegrují buněčnou membránu/stěnu
Carlos de la Rosa et al, IEEE TRANSACTIONS ON BIOMEDICAL ENGINEERING, VOL. 55, NO. 10, OCTOBER 2008
53
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Přednáška #12
Strana 54
Dielektroforéza v AC elektrickém poli • • • •
• •
• •
Dielektroforetická síla působí částice dielektrika v nehomogenním elektrickém poli Jedná se o interakci časově proměnného elektrického pole (AC) a parciálního náboje molekul nebo částic dielektrika (dipólu) Částice nemusí nést celkový elektrický náboj Velikost dielektroforetické síly závisí na tvaru částice, elektrických vlastnostech částic a okolního kapalného média, frekvenci AC elektrického pole Dielektroforetická síla nezávisí na polaritě elektrického pole Částice jsou vtahovány do oblastí s nejvyšší intenzitou elektrického pole, pokud je jejich dielektrická konstanta vyšší (jsou lépe polarizovatelné) než dielektrická konstanta okolního média (pozitivní dielektroforéza) Částice jsou vtahovány do oblastí s nejnižší intenzitou elektrického pole, pokud je jejich dielektrická konstanta nižší (jsou hůře polarizovatelné) než dielektrická konstanta okolního média Vysoce selektivní metoda pro manipulaci a separaci mikro a nanočástic, buněk atd.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Přednáška #12
Strana 55
Dielektroforéza v mikročipu - příklad
• Separování a koncentrování směsi kvasinek a polystyrénových mikročástic • Buňky – malé, světlé • Polystyrénové mikročástice – velké, tmavé (Zhou et al., 2005)
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Přednáška #12
Strana 56
Dielektroforéza - princip • • • •
Frekvenčně závislá – pozorovatelná až při velmi vysokých frekvencích (reorientace dipólů) Lépe (rychleji) jsou polarizovány dielektrika s větší dielektrickou konstantou Tato více polarizovaná dielektrika jsou vtahovány do oblasti větších intenzit elektrického pole (pozitivní dielektroforéza) Částice více polarizované vytlačují z těchto míst částice méně polarizované (negativní dielektroforéza)
+
d d+
d d+
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Dielektroforéza – celková síla působící na kulovou částici • Pro malé frekvence je ClausiusMossotiho faktor (člen v závorce záporný) • Pro vyšší frekvence je kladný * * p m DEP 3 Erms 2 F 2r m * 2 * m p g k* k i 2f
Strana 57
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 58
Detektor červených krvinek založený na dielektroforéze Minerick et al. Electrophoresis (2003).
• Ve AC elektrickém poli se částice s odlišnou dielektrickou konstantou než má nosný elektrolyt koncentrují v místech největší nebo nejmenší intenzity elektrického pole. • Buňky jsou také odpuzovány z povrchu elektrod vlivem elektrodové polarizace interagující s polarizací buněčné membrány.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 59
Kombinovaný AC elektroosmotický mísič a dielektroforetický koncentrátor • Systém dvou soustředných elektrod na které je vloženo AC elektrické pole. • Tangenciální coulombovskou silou je ke středu centrální elektrody strháván elektrický náboj tvořený polarizací elektrody. • Pohybující se náboj strhává tekutinu, která proudí tangenciálně ke středu elektrody a poté normálovým směrem od elektrody. • Dochází tak k promíchávání roztoku. • Nad středem centrální elektrody jsou potom dielektroforetickou silou selektivně zachytávány molekuly DNA.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 60
Detektor bakterií založený na elektroosmotickém transportu ve střídavém elektrickém poli
Zachycení Escherichia coli ve stagnantních bodech elektrod. Wu et al. Microfluid Nanofluid (2005).
• Páry ko-planárních elektrod. • AC zdroj vytváří časově proměnné elektrické pole. • Vlivem tangenciální složky elektrického pole dochází ke tvorbě vírů. • Nad určitým místem elektrod vzniká stagnantní bod s nulovou tangenciální coulombovskou silou a bez pohybu tekutiny, kde jsou zachycovány částice – buňky.
Vícefunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Strana 61
Hlavní budova ÚFE je situována v severní části Prahy, v Kobylisích, a je snadno dostupná z MHD. Nejjednoduším způsobem, jak se dopravit k hlavní budově ÚFE, je využití Pražského metra. Vystupte z metra na trase C v zastávce "KOBYLISY". Odtud je to již přibližně 10 minut pěšky. Můžete ale rovněž nasednout do tramvaje č. 17 ve směru "VOZOVNA KOBYLISY". Hlavní budova ÚFE se nachází mezi zastávkami "LÍBEZNICKÁ" a "VOZOVNA KOBYLISY". Hned po vystoupení z tramvaje uvidíte velkou žlutou budovu s malou věžičkou a anténami (parabolami) na střeše.