UNIVERSITAS GADJAH MADA FAKULTAS FARMASI

B i o l o g i M o l e k u l e r |1

UNIVERSITAS GADJAH MADA FAKULTAS FARMASI UJIAN TENGAH SEMESTER (UTS), SEM GASAL, TAHUN 2007 Fakultas : FARMASI Mata Ujian : BIOLOGI MOLEKULER Progdi :Semester : VI

JAWABAN PADA SEBELAH KIRI SOAL

Tgl. Hari Waktu Penguji

: 5 Nopember 2007 : Senin : 60 menit :

Nama mhs

: Muslim Satriotomo

NIM

: B 6305 UAR

No. Ujian

: RT 05 RW 049/ PG KDL

A. Pilih satu jawaban yang benar. 1.. Polisistronik adalah:

2.

3.

4.

5.

6.

7.

8.

A. Satu mRNA mengkode satu polipeptida B. Beberapa mRNA mengkode satu polipeptida C. Satu mRNA mengkode beberapa polipeptida D. Satu rRNA mengkode beberapa ribosom E. Beberapa mRNA mengkode beberapa polipeptida. Transkripsi tidak dapat berjalan bila Reseptor berikatan dengan : A. Ribosom D. Operon B. Terminator E. Kodon C. RNA polimerase Asam amino pertama yang dikode pada translasi Prokariot adalah : A. Metionin D. Arginin B. Tripsin E. Lisin C. Formil metionin Pribnow box adalah sekuen yang dikenali oleh: A. Polimerase DNA D. Metilase B. Polimerase RNA E. Eksonuklease E..Endonuklease C. Endonuklease Antibiotika yang menghambat transkripsi: A. Ampisilin D. Gentamisin B. Rifampisin E. Amikasin C. Basitrasin Sekuen Shine Dalgarno berada pada: A. DNA C. tRNA D.mRNA B. rRNA E. Ribosom Bagian mRNA eukariot yang dibuang adalah fragmen yang disebut: A. Sistron C. Operon D. Ekson B. Operator E. Intron Bagian dari RNA polimerase yang berperan pada fase elongasi transkripsi adalah:

B i o l o g i M o l e k u l e r |2 A. Enzim inti D. Sub unit beta B. Sub unit alfa E. Sub unit sigma C. Holo enzim 9. Pada proses pre inisiasi translasi prokariot, komponen yang melekat mRNA adalah: A. Ribosom 30S D. Ribosom 80S B. Ribosom 70S E. Ribosom 50S C. Ribosom 40S 10. TATA box pada promotor dikenali oleh enzim RNA polimerase sub unit : A. Alfa C. Gamma D. Delta B. Beta E. Sigma 11. Enzim yang meng “copy” DNA induk pada proses replikasi DNA adalah: A. Polimerase RNA I B. Polimerase DNA C. Polimerase RNA II D. Replikasi DNA E. Polimerase RNA III 12. Ligase DNA mempunyai aktivitas: A. Eksonuklease 5’ Æ 3’ B. Melekatkan dua ujung DNA C. Eksonuklease 3’ Æ 5’ D. Memotong ujung DNA E. Endonuklease 13. Protein yang mencegah kembalinya DNA untai tunggal menjadi untai ganda adalah: A. Replikasi D. Helikase B. Topoisomerase E. SSB C. Primase 14. Start kodon adalah A. UAG D. GAU B. AUG E. AGU C. UGA 15. Materi genetik yang mudah pindah tempat : A. Plasmid D. Mitokondria B. Transposon E. Vektor C. Kosmid 16. Enzim girase dapat merubah DNA bentuk : A. Sirkuler Æ linier B. SirkulerÆ superkoil negatif C. Linier Æ sirkuler D. Sirkuler Æ superkoil positif E. Superkoil Æ sirkuler 17. Enzim untuk membuka untai ganda pada replikasi DNA adalah: A. Polimerase D. Ligase B. Helikase C. Protease E. DNAse 18. Enzim yang TIDAK berperan pada awal replikasi : A. Helikase B. Primase C.. SSB D.Ligase E. Girase 19. RNA yang diperlukan untuk translasi sebagai pembawa kodon adalah: A. tRNA C. mRNA D. pRNA B. rRNA E. gRNA 20. Enzim yang berperan pada pemindahan aminasil – tRNA dari kamar A ke P adalah:

B i o l o g i M o l e k u l e r |3 A. B. C. D.

tRNA translokase tRNA sintetase Aminoasil translokase Aminoasil tRNA sintetase E. Aminoasil sintesa Petunjuk B. Jawablah, A. bila nomor 1, 2 dan 3 benar B. bila nomor 1 dan 3 yang benar C. bila nomor 2 dan 4 yang benar D. bila hanya satu nomor yang benar E. bila semua benar atau semua salah. 10. Sifat RNA polimerase adalah a. mengenali urutan basa DNA yang khas dari promotor b. melekat pada promotor dengan konformasi tepat, dilanjutkan dengan elongasi c. holoenzim melekat pada Pribnow Box d. Sub unit sigma melanjutkan elongasi. 11. Protein yang terlibat dalam proses Replikasi adalah 1. SSB 2. Rep protein 3. Ligase 4. Primase 12. Penyusun Polimerase RNA diantaranya adalah 1. subunit alfa 2. subunit sigma 3. subunit beta 4. subunit gama. 13. Pada terminasi replikasi : a. Pada replikasi satu arah terminasi pada origin b. Pada replikasi satu arah terminasi dapat terjadi pada gen term. c. Pada replikasi dua arah terminasi dapat terjadi pada gen term. d. Pada replikasi dua arah terminasi dapat terjadi pada origin 14. Protein yang terlibat pada replikasi bakteriofaga adalah : 1. Protein A. 2. SSB 3. Polimerase 4. Helikase 15. Yang mempengaruhi ekspresi suatu gen : 1. repressor 2. UAS 3. Inducer 4.spacer. 16. Enzim DNA Pol I mempunyai sifat a. dapat melakukan editing b. dapat menyambung fragmen Okazaki c. dapat mengubah primer menjadi DNA d. dapat mencegah s.s.DNA kembali menjadi d.s.DNA. 17. Enzim yang membuat Primer adalah 1. Primase 2. Ligase 3. RNA polimerase 4. DNA polimerase 23. Primer adalah : 1. DNA 2. RNA 3. Panjang lebih dari 20 pasang basa 4. panjang antara 1 s.d 20 pasang basa 24. Didalam sel, DNA terdapat sebagai : 1. Kromosom 2. Plasmid 3. Mitokondria 4. Klorofil 25. Dalam inti sel dari Eukariot terdapat : 1. DNA 2. RNA 3. Enzim 4. Ribosom.

B i o l o g i M o l e k u l e r |4 26. Enzim DNA Pol III mempunyai sifat : 1. dapat melakukan polimerisasi. 2. dapat merusak Primer. 3. dapat melakukan editing secara eksonuklease 4. dapat menyambung fragmen Okazaki Petunjuk C.

Jawablah,

A: bila pernyataan benar, alasan benar , ada hubungan. B : bila pernyataan benar, alasan benar, tidak ada hubungan C: bila pernyataan benar, alasan salah D: bila pernyataan salah, alasan benar E: bila pernyataan dan alasan salah

27. Ketepatan dalam replikasi DNA adalah sangat penting, sebab bila DNA berubah maka akan dapat mengubah informasi genetik. 28. Intron pada DNA Eukariot harus dapat dibuang, sebab, dengan adanya Intron yang tetap pada mRNA tidak akan terjadi proses translasi. 29. Protein Rho berperan dalam terminasi translasi, sebab, protein Rho akan membantu untuk melepaskan mRNA dan enzim RNA polymerase dari DNA 30. Pada sel eukariot tidak terjadi polisom, sebab pada sel eukariot tidak ada gen berhimpitan yang hanya diatur oleh satu promotor 31. Polisistronik sering dijumpai pada sel Prokariot, sebab transkripsi dan translasi pada Prokariot sering terjadi secara bersamaan. 32. Enzim DNA Pol I dapat melakukan editing pada Replikasi, sebab, DNA Pol I dapat melakukan proses Nick Translation dan Strand Displacement 33. Pada translasi dikenal hanya 20 asam amino walaupun terdapat 64 kodon, sebab pada translasi satu asam amino dapat dikode oleh lebih dari satu kodon. 34. Pada terminasi transkripsi pada mRNA akan terbentuk konfigurasi stem dan loop atau bentuk tusuk konde, sebab, pada terminasi baik dependen maupun independent selalu memerlukan bentuk tusuk konde pada mRNA. .

Selamat bekerja

B i o l o g i M o l e k u l e r |5

SOAL 2 Nama

:

Sarmoko

No. Ujian

:

NIM

:

BE 7090 FA

Tanda tangan

PG DLGN :

---------------------------------

Petunjuk I : Pilih satu jawaban yang tepat 1.

Enzim beta galaktosidase mempunyai aktifitas memecah A. Laktosa Æ glukosa + fruktosa B. Laktosa Æ asam laktat + glukosa C. Laktosa Æ glukosa + galaktosa D. Laktosa Æ asam + galaktosa E. Laktosa Æ asam laktat + fruktosa

2. Reverse transcriptase diperlukan sintesa: A. rRNA Æ cDNA D. DNA Æ mRNA B. tRNA Æ cDNA E. DNA Æ rRNA C. mRNA Æ cDNA . 3.

Urutan asam amino pada N-terminus sebagai pembawa polipeptida kemembran sel adalah: A. Spacer C. Intron E. Histon B. Leader sekuen D. Reading frame

4.

Polistronik adalah: A. Satu mRNA mengkode satu polipeptida B. Beberapa mRNA mengkode satu polipeptida C. Satu mRNA mengkode beberapa polipeptida D. Satu rRNA mengkode beberapa ribosom

E. Beberapa mRNA mengkode beberapa polipeptida. 5. Transkripsi tidak dapat berjalan bila Reseptor berikatan dengan : A. Ribosom D. Operator B. Terminator E. Kodon C. RNA polimerase 6. Asam amino pertama yang dikode pada translasi Prokariot adalah : A. Metionin D. Arginin B. Tripsin E. Lisin C. Formil metionin 7.

Pada Prokariot, Transkripsi dan translasi sering berjalan bersamaan, peristiwa ini disebut A. Palindrom C. Nukleosom E. Rekombinasi B. Polisom D. Polimerisasi

8. Bagian mRNA eukariot yang diekspresikan menjadi polipeptida adalah fragmen yang disebut: C. Sistron C. Operon D. Operator D. Ekson 9.

E. Intron

Pada proses pre inisiasi translasi prokariot, komponen yang melekat mRNA adalah: D. Ribosom 30S D. Ribosom 80S E. Ribosom 70S E. Ribosom 50S F. Ribosom 40S

10. Start kodon adalah

B i o l o g i M o l e k u l e r |6 A. UAG B. AUG C. UGA

D. GAU E. AGU

11. Inisiasi translasi adalah terbentuknya kompleks A. mRNA – ribosom 40S - tRNA B. rRNA – ribosom 50S - tRNA C. mRNA – ribosom 30S - tRNA D. mRNA – ribosom 50S - tRNA E. rRNA – ribosom 30S – tRNA 12. RNA yang diperlukan untuk translasi sebagai pembawa kodon adalah: A. tRNA C. mRNA E. gRNA B. rRNA D. pRNA 13. Enzim yang berperan pada pemindahan aminasil – tRNA dari kamar A ke P adalah: F. tRNA translokase G. tRNA sintetase H. Aminoasil translokase I. Aminoasil tRNA sintetase J. Aminoasil sintesa 14. Enzim Beta Galaktosidase akan memberikan warna biru bila pada media diberi substrat A. MTT B. X-Gal C. IPTG D. Etilen Bromida E. PEG 15. Apabila vektor pBR322 membawa suatu DNA asing , maka akan terjadi koloni yang : A. Hidup hanya pada media +Ampisilin, mati pada media + tetrasiklin. B. Hidup hanya pada media + tetrasiklin, mati pada media + ampisilin C. Hidup baik pada media+ampisilin maupun media+ tetrasiklin D. Mati baik pada media + ampisilin maupun media + tetrasiklin E. Mati pada media tanpa antibiotic. 16. Bila Operator mengalami mutasi, kemungkinan terjadi : A. Terjadi ekspresi gen, tetapi bila represor datang akan stop B. Terjadi ekspresi gen terus menerus C. Tidak terjadi ekspresi gen yang tidak terus menerus D. Tidak terjadi ekspresi gen terus menerus E. Ekspresi gen terjadi , tetapi bila inducer datang akan stop. 17. Preproinsulin terdiri dari A. Rantai A dan rantai B B. Rantai B dan rantai C C. Rantai A, B dan C D. Rantai A, B, C dan Leader E. Rantai A, B dan Leader 18. Baik pada kontrol negatif maupun positif, apabila dia datang dan aktif, maka akan menyebabkan ekspresi gen. Dia adalah A. Represor B. Korepresor C. Inducer D. Apoinducer E. Enhancer 19. Seperti no.18. tetapi menyebabkan sebaliknya, tidak ada ekspresi gen. Dia adalah : A. Represor B. Korepresor C. Inducer D. Apoinducer E. Enhancer

B i o l o g i M o l e k u l e r |7

20. Basa yang terdapat pada antikodon dan dapat berpasangan 3 basa pada kodon adalah A. Basa A B. Basa U C. Basa G D. Basa C Petunjuk II : jawab A. Bila 1, 2 dan 3 benar B. Bila 1 dan 3 benar C. Bila 2 dan 4 benar D. Bila hanya satu nomor yang benar E. Bila semua benar atau semua salah 21. Pada proses inisiasi translasi terjadi ikatan: 1. IF2 – ribosom 30S 3. IF3 – tRNA 2. IF3 – ribosom 30S 4. IF2 – Trna 22. Ribosom prokariot terdiri dari : 1. 50S 3. 70S 2. 30S 4. 60S 23. Apabila antikodon adalah UY’X’ maka akan dapat barpasangan dengan kodon : 1. XYU 3. XYC 2. XYA 4. XYG 24. Apabila kodon XYU dapat berpasangan dengan antikodon : 1. X’Y’G 2. X’Y’C 3. X’Y’I 4. X’Y’A 25. Apabila kodon XYA dapat berpasangan dengan 1. X’Y’C 2. X’Y’U 3. X’Y’G 4. X’Y’I 26.Pada terminasi translasi terjadi ikatan : 1. RF --- ribosom 2. RF --- stop kodon 3. RF --- GTP --- ribosom 4. RF --- GTP --- stop kodon 27. Formil akan hilang dari fMet bila Asam amino disebelah adalah 1. Arginin 2. Asparagin 3. Asam aspartat 4. Asam glutamat 28. Formil Met akan hilang bila disebelahnya Asam amino 1. Alanin 2. Valin 3. Glisin 4. Lisin 29. Pada Pasca Translasi, terjadi modifikasi protein antara lain : 1. Asetilasi 2. Hidroksilasi 3. Fosforilasi 4. Penempelan gula 30. Stop kodon adalah

E. Basa I

B i o l o g i M o l e k u l e r |8 1. UAG 2. UAA 3.UGA 4.UGG 31. Fenomena Supresor 1. Dapat memproduksi protein normal walau ada mutasi nonsense 2. Disebabkan adanya mutasi pada antikodon 3. Supresor dapat terjadi karena kelemahan pada editing 4. Kodon UAG dapat diterjemahkan menjadi suatu asam amino. 32. Antibiotik yang mengganggu Ribosom 30S adalah 1. Kloramfenikol 2. Tetrasiklin 3. Eritromisin 4. Streptomisin 33. Antibiotik yang mengganggu ribosom 50S adalah 1. Kloramfenikol 2. Tetrasiklin 3. Eritromisin 4. Streptomisin. 34. Apabila Vektor yang dipotong enzim dicampur dengan DNA yang dipotong Enzim yang sama kemudian + Ligase DNA, maka akan terjadi 1. Koloni yang membawa Vektor yang tidak membawa DNA asing. 2. Koloni yang membawa Vektor berisi DNA asing yang tidak dikehendaki 3. Koloni yang membawa Vektor berisi DNA asing yang dikehendaki. 4. Koloni yang membawa Vektor berisi DNA asing yang dikehendaki dan yang tidak dikehendaki. 35. Sekuen Signal 1. Disebut juga Sekuen Leader 2. Membawa protein ketempat lain 3. Sekuen terletak didepan bagian mRNA yang akan diproduksi untuk menjadi protein. 4. Setelah membawa protein, sekuen ini selalu berbeda ruangan dengan protein. 36. Modifikasi Pasca translasi dari Kimotripsinogen menjadi Kimotripsin 1. Hilangnya 4 asam amino 2. Terjadinya jembatan disulfida baru 3. Terjadi penumpukan rantai polipeptida 4. Menempel gula baru 37. Sifat mutan Silent 1. Protein membawa satu A. Amino berbeda dari WT. 2. mRNA membawa stop kodon. 3. Protein mempunyai panjang yang sama dengan WT. 4. mRNA kembali keaslinya. 38. Bila gen dari suatu repressor mengalami mutasi, kemungkinan terjadi : 1. Represor tidak dapat mengikat inducer. 2. Dapat terjadi ekspresi gen terus menerus. 3. Represor tidak mengenali operator. 4. Dapat tidak terjadi ekspresi terus menerus. 39. Untuk identifikasi (penapisan) klon mana yang membawa DNA yang kita inginkan, maka dipakai cara 1. Hibridisasi dengan memakai radio aktif (Southerb Blot). 2. Sequencing DNA 3. Hibridisasi dengan teknik antigen -antibodi 4. PCR dari DNA

B i o l o g i M o l e k u l e r |9 40. Pada Regulasi sel Eukariot, terjadi beberapa peristiwa antara lain 1. Famili gen 2. Amplifikasi gen 3. Hilangnya gen 4. Perbedaan ekspresi gen : terjadi lebih dari satu polipeptida dari gen yang sama Petunjuk III: Jawab A. Bila pernyataan benar, alasan benar, ada hubungan B. Bila pernyataan benar, alasan benar, tidak ada hubungan C. Bila pernyataan benar, alasan salah D. Bila pernyataan salah, alasan benar E. Bila pernyataan salah, alasan salah 41. mRNA eukariot memerlukan proses “Splicing“ sebab mRNA eukariot mengandung ekson yang harus dibuang. 42. Mutasi pada operator mengakibatkan ekspresi gen meningkat sebab mutasi tersebut menyebabkan represor tidak dapat berikatan dengan operator.

43. Release faktor (RF) dapat menghentikan sintesa protein sebab RF dapat mengenali stop kodon AUG. 44. Ribosom 30S dapat stabil pada proses sintesa protein sebab ribosom 30S terus berikatan dengan ribosom 50S walaupun sintesa protein sudah selesai. 45. Pada prokaryot transkripsi dan translasi berjalan bersama sebab prokaryot tidak mempunyai nukleus 46. Kita tidak bisa mengklon gen Eukariot pada Prokariot secara langsung, sebab, gen Eukariot membawa intron sementara Prokariot tidak mengenal system pemotongan intron . 47. Fenomena supresor mengakibatkan terbentuknya protein utuh walaupun ada mutasi non sensse, sebab, tRNA mengalami mutasi sehingga antikodon dapat berpasangan dengan stop kodon. 48. Beberapa kodon dapat mengundang asam amino yang sama, sebab, satu antikodon dapat berpasangan dengan beberapa kodon. 49. Amilase yang dibuat pada kelenjar ludah dan liver berbeda panjang polipeptidanya, sebab, walau amylase pada kelenjar ludah dan liver berasal dari gen yang sama tetapi mengalami perbedaan splicing diawal mRNA nya. 50. Insulin biasanya dibuat secara rekayasa genetika dengan mengklon Proinsulin, sebab, mengklon masing-masing gen Insulin kemudian menyambungnya bisa menyebabkan polipeptida Insulin tidak berfungsi.

B i o l o g i M o l e k u l e r |10

SOAL 3 1.

2.

Enzim beta galaktosidase mempunyai aktifitas memecah A. Laktosa Æ glukosa + fruktosa B. Laktosa Æ asam laktat + glukosa C. Laktosa Æ glukosa + galaktosa D. Laktosa Æ asam + galaktosa E. Laktosa Æ asam laktat + fruktosa Senyawa yang dapat menginduksi sintesa beta- galagtosidase adalah : A. Isopropil galaktosida B. Tiometil glukosida C. Isopropil tiogalaktosida D. Isophenil tiogalaktosida E. Tioasetil galaktosida

3. Reverse transcriptase diperlukan sintesa: D. rRNA Æ cDNA D. DNA Æ mRNA E. tRNA Æ cDNA E. DNA Æ rRNA F. mRNA Æ cDNA 4. Protein dapat dipisahkan dengan : A. Monoakrilamid D. Agaros B. Poliakrilamid E. Polikrolamid C. Poli agaros 5.

6.

Urutan asam amino pada N-terminus sebagai pembawa polipeptida kemembran sel adalah: C. Spacer C. Intron E. Histon D. Leader sekuen D. Reading frame Polistronik adalah: F. Satu mRNA mengkode satu polipeptida G. Beberapa mRNA mengkode satu polipeptida H. Satu mRNA mengkode beberapa polipeptida I. Satu rRNA mengkode beberapa ribosom

J. Beberapa mRNA mengkode beberapa polipeptida. 7. Transkripsi tidak dapat berjalan bila Reseptor berikatan dengan : A. Ribosom D. Operon B. Terminator E. Kodon C. RNA polimerase 8. Asam amino pertama yang dikode pada translasi Prokariot adalah : A. Metionin D. Arginin B. Tripsin E. Lisin C. Formil metionin 9.

Pribnow box adalah sekuen yang dikenali oleh: A. Polimerase DNA D. Metilase B. Polimerase RNA E. Eksonuklease

E..Endonuklease

C. Endonuklease 10. Antibiotika yang menghambat transkripsi: C. Ampisilin D. Gentamisin D. Rifampisin E. Amikasin

C. Basitrasin 11. Sekuen Shine Dalgarno berada pada: C. DNA C. tRNA D.mRNA D. rRNA E. Ribosom

12. Bagian mRNA eukariot yang dibuang adalah fragmen yang disebut: E. Sistron C. Operon D. Ekson F. Operator E. Intron 13. Bagian dari RNA polimerase yang berperan pada fase elongasi transkripsi adalah:

B i o l o g i M o l e k u l e r |11

14.

15.

16.

17.

D. Enzim inti D. Sub unit beta E. Sub unit alfa E. Sub unit sigma F. Holo enzim Pada proses pre inisiasi translasi prokariot, komponen yang melekat mRNA adalah: G. Ribosom 30S D. Ribosom 80S H. Ribosom 70S E. Ribosom 50S I. Ribosom 40S TATA box pada promotor dikenali oleh enzim RNA polimerase sub unit : C. Alfa C. Gamma D. Delta D. Beta E. Sigma Enzim yang meng “copy” DNA induk pada proses replikasi DNA adalah: F. Polimerase RNA I G. Polimerase DNA H. Polimerase RNA II I. Replikasi DNA J. Polimerase RNA III Ligase DNA mempunyai aktivitas: E. Eksonuklease 5’ Æ 3’ F. Melekatkan dua ujung DNA G. Eksonuklease 3’ Æ 5’ H. Memotong ujung DNA

E. Endonuklease 18. Protein yang mencegah kembalinya DNA untai tunggal menjadi untai ganda adalah: C. Replikasi D. Helikase D. Topoisomerase E. SSB

C. Primase 19. Start kodon adalah D. UAG E. AUG F. UGA

D. GAU E. AGU

20. Materi genetik yang mudah pindah tempat : A. Plasmid D. Mitokondria B. Transposon E. Vektor C. Kosmid 21. Enzim girase dapat merubah DNA bentuk : F. Sirkuler Æ linier G. SirkulerÆ superkoil negatif H. Linier Æ sirkuler I. Sirkuler Æ superkoil positif J. Superkoil Æ sirkuler 22. Enzim untuk membuka untai ganda pada replikasi DNA adalah: C. Polimerase D. Ligase D. Helikase C. Protease E. DNAse 23. Inisiasi translasi adalah terbentuknya kompleks F. mRNA – ribosom 40S - tRNA G. rRNA – ribosom 50S - tRNA H. mRNA – ribosom 30S - tRNA I. mRNA – ribosom 50S - tRNA J. rRNA – ribosom 30S - tRNA 24. RNA yang diperlukan untuk translasi sebagai pembawa kodon adalah: C. tRNA C. mRNA D. pRNA D. rRNA E. gRNA 25. Enzim yang berperan pada pemindahan aminasil – tRNA dari kamar A ke P adalah: K. tRNA translokase L. tRNA sintetase M. Aminoasil translokase N. Aminoasil tRNA sintetase O. Aminoasil sintesa

B i o l o g i M o l e k u l e r |12 Petunjuk II : jawab F. Bila 1, 2 dan 3 benar G. Bila 1 dan 3 benar H. Bila 2 dan 4 benar I. Bila hanya 4 yang benar J. Bila semua benar atau semua salah 26. Sifat-sifat enzim polimerase DNA I adalah: 1. Aktivitas nuclease 5’ Æ 3’ 2. Aktivitas eksonuklease 3’ Æ 5’ 3. Aktivitas endonuklease 4. Aktivitas strand displacement 27. Pada proses inisiasi translasi terjadi ikatan: 1. IF2 – ribosom 30S 3. IF3 – tRNA 2. IF3 – ribosom 30S 4. IF2 – tRNA 28. Peristiwa inisiasi pada transkripsi adalah: 1. Sub unit sigma pada polimerase mengenali DNA khas. 2. Polimerase RNA melekat dengan konformasi yang tepat 3. DNA terbuka secara lebar 4. Primer diperpanjang 29. Pada transkripsi : 1. Diperlukan tambahan deoksiribonukleotida 2. Reaksi berjalan dengan arah 5’ Æ 3’ 3. Diperlukan primer 4. Hanya satu DNA yang ditranskripsi 30. Pribnow box : 1. Terletak pada 10 basa upstream dari kodon pertama 2. Terletak pada 10 basa downstream dari kodon pertama 3. Sekuen pada umumnya TATAAT 4. Sekuen pada umumnya TTGACA 31. Tanda berakhirnya transkripsi antara lain : 1. Stop kodon 2. Pribnow box 3. Promotor 4. Loop pada daerah kaya GC 32. Aktivitas protein Rho adalah: 1. Sebagai terminator 2. Melepaskan RNA baru 3. Mencegah elongasi 4. Memulai sintesa RNA baru 33. Ribosom prokariot terdiri dari : 1. 50S 3. 70S 2. 30S 4. 60S 34. Apabila antikodon adalah UY’X’ makla akan dapat barpasangan dengan kodon : 1. XYU 3. XYC 2. XYA 4. XYG 35. Sifat dari polimerase RNA adalah : 1. Mengenali rangkaian DNA yang khas pada promotor 2. Melekat pada promotor dengan konformasi yang tepat, dilanjutkan proses elongasi 3. Holo enzim melekat pada Pribnow box 4. Pribnow box disebut juga CAAT box 36. Enzim yang diperlukan pada replikasi DNA pada lagging strand adalah: 1. Polimerase DNA I 3. Ligase 2. Polimerase DNA II 4. Girase 37. Prekursor pada sintesis DNA berasal dari : 1. Degradasi asam nukleat 3. NMP 2. Medium 4. ATP 38. Hal-hal yang berhubungan dengan mRNA Eukaryot adalah: 1. Waktu hidup lebih lama 2. Monosistronik

B i o l o g i M o l e k u l e r |13 3. Mempunyai Cap pada 5’ 4. Disintesa didalam sitoplasma 39. Pada terminasi translasi terjadi ikatan : 1. RF --- ribosom 2. RF --- stop kodon 3. RF --- GTP --- ribosom 4. RF --- GTP --- stop kodon 40. Enzim yang berperan pada awal replikasi : 1. Helikase 3. Primase 2. DNAse 4. Protein DNAB Petunjuk III: Jawab A. Bila pernyataan benar, alasan benar, ada hubungan F. Bila pernyataan benar, alasan benar, tidak ada hubungan G. Bila pernyataan benar, alasan salah H. Bila pernyataan salah, alasan benar I. Bila pernyataan salah, alasan salah

41. RNA Polimerase III dapat merusak primer sebab RNA Polimerase III mempunyai aktivitas nick translation dan stran displacement 42. Transkripsi dapat mengalami terminasi walaupun tanpa kehadiran protein Rho sebab transkripsi dapat berhenti bila menemui struktur DNA yang membentuk tusuk konde walaupun tanpa mengandung banyak pasangan GC dan diikuti poli U 43. mRNA eukariot memerlukan proses “Splicing“ sebab mRNA eukariot mengandung ekson yang harus dibuang. 44. Primer pada “lagging strand” disintesa oleh polimerase RNA sebab primer diperlukan pada sintesa RNA. 45. Mutasi pada operator mengakibatkan ekspresi gen meningkat sebab mutasi tersebut menyebabkan represor tidak dapat berikatan dengan operator. 46. Sekuen palindrom dapat menjadi penanda berakhirnya transkripsi sebab sekuen palindrom dapat membentuk stem and loop.

47. Pada transkripsi genom eukaryotik diperlukan splising sebab genom eukaryotik berikatan dengan histon. 48. Release faktor dapat menghentikan sintesa protein sebab release faktor dapat mengenali stop kodon AUG. 49. Ribosom 30S dapat stabil pada proses sintesa protein sebab ribosom 30S terus berikatan dengan ribosom 50S walaupun sintesa protein sudah selesai 50. Pada prokaryot transkripsi dan translasi berjalan bersama sebab prokaryot tidak mempunyai nukleus

B i o l o g i M o l e k u l e r |14

SOAL 4 Nama  :  ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐  No. Ujian  :  ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐    N I M  :  ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐  Tanda tangan  :  ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐    Petunjuk I : Pilih satu jawaban yang tepat (Setiap nomor bernilai satu)    1.  Polisistronik adalah:  K. Satu mRNA mengkode satu polipeptida  L. Beberapa mRNA mengkode satu polipeptida  M. Satu mRNA mengkode beberapa polipeptida  N. Satu rRNA mengkode beberapa ribosom  O. Beberapa mRNA mengkode beberapa polipeptida.  2.  Transkripsi tidak dapat berjalan bila Reseptor berikatan dengan :    A.  Ribosom      D.  Operon    B.  Terminator      E.  Kodon    C.  RNA polimerase  3.  Asam amino pertama yang dikode pada translasi Prokariot adalah :    A.  Metionin      D.  Arginin    B.  Tripsin      E.  Lisin    C.  Formil metionin  4.  Pribnow box adalah sekuen yang dikenali oleh:    A.  Polimerase DNA    D.  Metilase  B.  Polimerase RNA    E.  Eksonuklease   E..Endonuklease    C.  Endonuklease  5.  Antibiotika yang menghambat transkripsi:   E. Ampisilin      D.  Gentamisin  F. Rifampisin      E.  Amikasin    C.  Basitrasin  6.  Sekuen Shine Dalgarno berada pada:  E. DNA     C. tRNA   D.mRNA  F. rRNA          E.  Ribosom  7.  Bagian mRNA eukariot yang dibuang adalah fragmen yang disebut:  G. Sistron    C. Operon    D. Ekson  H. Operator          E. Intron  8.  Bagian dari RNA polimerase yang berperan pada fase elongasi transkripsi adalah:  G. Enzim inti      D.  Sub unit beta  H. Sub unit alfa  E.  Sub unit sigma  I. Holo enzim    9.  Pada proses pre inisiasi translasi prokariot, komponen yang melekat mRNA adalah:  J. Ribosom 30S    D.  Ribosom 80S  K. Ribosom 70S    E.  Ribosom 50S  L. Ribosom 40S    10.  TATA box pada promotor dikenali oleh enzim RNA polimerase sub unit :  E. Alfa  C. Gamma    D. Delta  F. Beta              E. Sigma      11.  Enzim yang meng “copy” DNA induk pada proses replikasi DNA adalah:  K. Polimerase RNA I      L. Polimerase DNA        M. Polimerase RNA II   

B i o l o g i M o l e k u l e r |15 N. Replikasi DNA  O. Polimerase RNA III  12.  Ligase DNA mempunyai aktivitas:  I. Eksonuklease 5’ Æ 3’    J. Melekatkan dua ujung DNA  K. Eksonuklease 3’ Æ 5’   L. Memotong ujung DNA    E.  Endonuklease  13.  Protein yang mencegah kembalinya DNA untai tunggal menjadi untai ganda adalah:  E. Replikasi      D.  Helikase  F. Topoisomerase    E.  SSB    C.  Primase  14.  Start kodon adalah  G. UAG        D.  GAU  H. AUG        E.  AGU  I. UGA    15.  Materi genetik yang mudah pindah tempat :    A.  Plasmid    D.  Mitokondria    B.  Transposon    E.  Vektor    C.  Kosmid  16.  Enzim girase dapat merubah DNA bentuk :  K. Sirkuler Æ linier   L. SirkulerÆ superkoil negatif  M. Linier Æ sirkuler  N. Sirkuler Æ superkoil positif  O. Superkoil Æ sirkuler  17.  Enzim untuk membuka untai ganda pada replikasi DNA adalah:  E. Polimerase          D. Ligase    F. Helikase        C. Protease    E.  DNAse  18.  Enzim yang TIDAK berperan pada awal replikasi :  B. Helikase  B.  Primase    C.. SSB  D.Ligase    E. Girase    19.  RNA yang diperlukan untuk translasi sebagai pembawa kodon adalah:  E. tRNA      C. mRNA    D. pRNA  F. rRNA            E. gRNA  20. Enzim yang berperan pada pemindahan aminasil – tRNA dari kamar A ke P adalah:  P. tRNA translokase    Q. tRNA sintetase  R. Aminoasil translokase  S. Aminoasil tRNA sintetase  T. Aminoasil sintesa          Petunjuk II .Setiapnomor bernilai satu. Jawablah :  K. Bila 1, 2 dan 3 benar        L. Bila 1 dan 3 benar        M. Bila 2 dan 4 benar  N. Bila hanya 4 yang benar  O. Bila semua benar atau semua salah      21. Sifat‐sifat enzim polimerase DNA I adalah:  1. Aktivitas nuclease 5’ Æ 3’         

B i o l o g i M o l e k u l e r |16 2. Aktivitas eksonuklease 3’ Æ 5’  3. Aktivitas endonuklease  4. Aktivitas strand displacement  22.  Peristiwa inisiasi pada transkripsi adalah:  1. Sub unit sigma pada polimerase mengenali DNA khas.  2. Polimerase RNA melekat dengan konformasi yang tepat  3. DNA terbuka secara lebar  4. Primer diperpanjang  23.  Pada transkripsi  :  1. Diperlukan tambahan deoksiribonukleotida      2. Reaksi berjalan dengan arah 5’ Æ 3’  3. Diperlukan primer  4. Hanya satu DNA yang ditranskripsi  24. Pribnow box :  1. Terletak pada 10 basa upstream dari kodon pertama        2. Terletak pada 10 basa downstream dari kodon pertama  3. Sekuen pada umumnya TATAAT    4.  Sekuen pada umumnya TTGACA  25.  Tanda berakhirnya transkripsi antara lain :  1. Stop kodon  2. Pribnow box  3. Promotor  4. Loop pada daerah kaya GC   26.  Aktivitas protein Rho adalah:  1. Sebagai terminator        2. Melepaskan RNA baru  3. Mencegah elongasi    4.  Memulai sintesa RNA baru  27.  Sifat dari polimerase RNA adalah :  1. Mengenali rangkaian DNA yang khas pada promotor  2. Melekat pada promotor dengan konformasi yang tepat, dilanjutkan proses elongasi  3. Holo enzim melekat pada Pribnow box  4. Pribnow box disebut juga CAAT box  28.  Enzim yang diperlukan pada replikasi DNA pada lagging strand adalah:  1. Polimerase DNA I    3.  Ligase  2. Polimerase DNA II    4.  Girase  29.  Hal‐hal yang berhubungan dengan mRNA Eukaryot adalah:  1. Waktu hidup lebih lama     2. Monosistronik    3. Mempunyai Cap pada 5’  4. Disintesa didalam sitoplasma      30.  Pada terminasi translasi terjadi ikatan :  1. RF ‐‐‐ ribosom     2. RF ‐‐‐ stop kodon    3. RF ‐‐‐ GTP ‐‐‐ ribosom    4.  RF ‐‐‐ GTP ‐‐‐ stop kodon    Petunjuk III: ( Masing‐masing nomor mempunyai nilai  2).  Jawab   A. Bila pernyataan benar, alasan benar, ada hubungan  B. Bila pernyataan benar, alasan benar, tidak ada hubungan 

B i o l o g i M o l e k u l e r |17 C. Bila pernyataan benar, alasan salah  D. Bila pernyataan salah, alasan benar  E. Bila pernyataan salah, alasan salah    31.  RNA  Polimerase  III  dapat  merusak  primer  sebab  RNA  Polimerase  III  mempunyai  aktivitas  nick  translation dan stran displacement  32.  Transkripsi  dapat  mengalami  terminasi  walaupun  tanpa  kehadiran  protein  Rho  sebab  transkripsi  independent  dapat  berhenti  bila  menemui  struktur  DNA  yang  membentuk  tusuk  konde  walaupun  tanpa mengandung banyak pasangan GC dan diikuti poli U  33.  mRNA eukariot memerlukan proses “Splicing“ sebab mRNA eukariot mengandung ekson yang harus  dibuang.  34.  Primer pada “lagging strand” disintesa oleh polimerase RNA sebab primer diperlukan pada sintesa  RNA.    35.  Mutasi pada operator mengakibatkan ekspresi gen meningkat sebab mutasi tersebut menyebabkan  represor tidak dapat berikatan dengan operator.  36.  Sekuen  palindrom  dapat  menjadi  penanda  berakhirnya  transkripsi  sebab  sekuen  palindrom  dapat  membentuk stem and loop.  37.  Pada  transkripsi  genom  eukaryot  memerlukan  protein  TF  sebab  genom  eukaryotik  berikatan  dengan histon.  38.  Release  faktor  dapat  menghentikan  sintesa  protein  sebab  release  faktor  dapat  mengenali  stop  kodon AUG.  39.  Ribosom  30S  dapat  stabil  pada  proses  sintesa  protein  sebab  ribosom  30S  terus  berikatan  dengan  ribosom 50S walaupun sintesa protein sudah selesai  40.  Pada  prokaryot  transkripsi  dan  translasi  berjalan  bersama  sebab  prokaryot  tidak  mempunyai  nukleus 

B i o l o g i M o l e k u l e r |18 SOAL 5 Petunjuk I (Setiap nomor bernilai 1): Pilih satu jawaban yang tepat 1. Salah satu sifat mRNA Eukaryot adalah: A. Waktu hidup lebih lama B. Polisistronik C. Mempunyai poli C pada ekornya D. Di sintesa di dalam sitoplasma E. Langsung ditranslasi di dalam inti sel 2. Enzim yang membuat primer adalah enzim : A. Helikase B. Primase C. DNAse

D. Protein SSB

E. Ligase.

3. Reverse transcriptase diperlukan sintesa: A. rRNA Æ cDNA D. DNA Æ mRNA B. tRNA Æ cDNA E. DNA Æ rRNA C. mRNA Æ cDNA 4. Polistronik adalah: A. Satu mRNA mengkode satu polipeptida B. Beberapa mRNA mengkode satu polipeptida C. Satu mRNA mengkode beberapa polipeptida D. Satu rRNA mengkode beberapa ribosom E. Beberapa mRNA mengkode beberapa polipeptida. 5. Ligase DNA mempunyai aktivitas: A. Eksonuklease 5’ Æ 3’ B. Melekatkan dua ujung DNA C. Eksonuklease 3’ Æ 5’ D. Memotong ujung DNA E. Endonuklease 6. Pada Prokariot, transkripsi dan translasi sering berjalan bersamaan, peristiwa ini disebut A. Palindrom C. Nukleosom E. Rekombinasi B. Polisom D. Polimerisasi 7. Bagian mRNA eukariot yang diekspresikan menjadi polipeptida adalah fragmen yang disebut: A. Sistron C. Operon E. Intron B. Operator D. Ekson 8. Pada proses A. Ribosom B. Ribosom C. Ribosom

pre inisiasi translasi prokariot, komponen yang melekat mRNA adalah: 30S D. Ribosom 80S 70S E. Ribosom 50S 40S

9. Start kodon adalah A. UAG B. AUG C. UGA

D. GAU E.

AGU

10. RNA yang diperlukan untuk translasi sebagai pembawa kodon adalah: A. tRNA C. mRNA D. pRNA B. rRNA E. gRNA 11. Asam amino pertama yang dikode pada translasi Prokariot adalah :

B i o l o g i M o l e k u l e r |19 A. Metionin

D.Arginin

B.Tripsin

E.Lisin

C. Formil metionin

12. Pribnow box adalah sekuen yang dikenali oleh: A. Polimerase DNA D. Metilase B. Polimerase RNA E. Eksonuklease C. Endonuklease 13. Antibiotika yang menghambat transkripsi: A. Ampisilin D. Gentamisin B. Rifampisin E. Amikasin C. Basitrasin 14. Bagian mRNA eukariot yang dibuang adalah fragmen yang disebut: A. Sistron C. Operon D. Ekson B. Operator E. Intron 15. Bagian dari RNA polimerase yang berperan pada fase elongasi transkripsi adalah: A. Enzim inti D. Sub unit beta B. Sub unit alfa E. Sub unit sigma C. Holo enzim 16. TATA box pada promotor dikenali oleh enzim RNA polimerase sub unit : A. Alfa C. Gamma D. Delta B. Beta E. Sigma 17. Enzim yang meng “copy” DNA induk pada proses replikasi DNA adalah: A. Polimerase RNA I B. Polimerase DNA C. Polimerase RNA II D. Replikasi DNA E. Polimerase RNA III 18. Protein yang mencegah kembalinya DNA untai tunggal menjadi untai ganda adalah: A. Replikasi D. Helikase B. Topoisomerase E. SSB C. Primase 19. Protein yang menyusun Kromosom Eukariot adalah : A. Rho B. RF C. Histon D. Sigma E. Alfa 20. Protein yang terlibat pada terminasi transkripsi yang dependent adalah : A. Rho B. RF C. Histon D. Sigma E. Alfa. Petunjuk II (setiap nomor bernilai 1): jawab A. Bila 1, 2 dan 3 benar B. Bila 1 dan 3 benar C. Bila 2 dan 4 benar D. Bila hanya satu nomor yang benar E. Bila semua benar atau semua salah 21. Peristiwa inisiasi pada transkripsi adalah: 1. Sub unit sigma pada polimerase mengenali DNA khas. 2. Polimerase RNA melekat dengan konformasi yang tepat 3. DNA terbuka secara lebar 4. Primer diperpanjang

B i o l o g i M o l e k u l e r |20 22. Pada transkripsi : 1. Diperlukan tambahan deoksiribonukleotida 2. Reaksi berjalan dengan arah 5’ Æ 3’ 3. Diperlukan primer 4. Hanya satu DNA yang ditranskripsi 23.Pribnow box : 1. Terletak pada 10 basa upstream dari kodon pertama 2. Terletak pada 10 basa downstream dari kodon pertama 3. Sekuen pada umumnya TATAAT 4. Sekuen pada umumnya TTGACA 24. Tanda berakhirnya transkripsi antara lain : 1. Stop kodon 2. Pribnow box 3. Promotor 4. Loop pada daerah kaya GC 25. Aktivitas protein Rho adalah: 4. Sebagai terminator 5. Melepaskan RNA baru 6. Mencegah elongasi 4. Memulai sintesa RNA baru 26. Antibiotik yang mengganggu Ribosom 30S adalah 1. Kloramfenikol 2. Tetrasiklin 3. Eritromisin 4. Streptomisin 27. Antibiotik yang mengganggu ribosom 50S adalah 1. Kloramfenikol 2. Tetrasiklin 3. Eritromisin 4. Streptomisin. 28. Sekuen Signal 1. Disebut juga Sekuen Leader 2. Membawa protein ketempat lain 3. Sekuen terletak didepan bagian mRNA, diproduksi untuk menjadi protein. 4. Setelah membawa protein, sekuen ini selalu berbeda ruangan dengan protein. 29. Enzim yang diperlukan pada replikasi DNA pada lagging strand adalah 3. Polimerase DNA I 3. Ligase 4. Polimerase DNA II 4. Girase 30. Prekursor pada sintesis DNA berasal dari : 1. Degradasi asam nukleat 3. NMP 2. Medium 4. ATP Petunjuk III: Setiap nomor bernilai 5. Jawab A. Bila pernyataan benar, alasan benar, ada hubungan B. Bila pernyataan benar, alasan benar, tidak ada hubungan C. Bila pernyataan benar, alasan salah D. Bila pernyataan salah, alasan benar E. Bila pernyataan salah, alasan salah

B i o l o g i M o l e k u l e r |21 31. mRNA eukariot memerlukan proses “Splicing“ sebab mRNA eukariot mengandung ekson yang harus dibuang. 32. Mutasi pada operator mengakibatkan ekspresi gen meningkat sebab mutasi tersebut menyebabkan represor tidak dapat berikatan dengan operator. 33. Pada prokaryot transkripsi dan translasi berjalan bersama sebab prokaryot tidak mempunyai nukleus 34. Kita tidak bisa mengklon gen Eukariot pada Prokariot secara langsung, sebab, gen Eukariot membawa intron sementara Prokariot tidak mengenal system pemotongan intron 35. Beberapa kodon dapat mengundang asam amino yang sama, sebab, satu antikodon dapat berpasangan dengan beberapa kodon.