TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben
Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK, szakdolgozat diplomamunka Témáink
A genomi integritás és dinamika meghatározó tényezői
Szerkezeti biológia Genom Metabolizmus
Diákjaink Eredményei
TDK mind 1-3 helyezettek
OTDK Pro Scientia különdíj Zsűri különdíj
1 második díj
2 első díj OTDK 2013
Transzgénikus Drosophila törzsek vizsgálata
és Kémiai Biológia csoport
Humán ráksejtek DNS-javító útvonalai
Molekuláris biológiai eszközök
Karcinogenezis és fertőző betegségek elleni védekezés
További info: www.enzim.hu - Research – Vértessy Beáta www.biostruct.org, PubMed, Google Scholar
Módszerek és problémák Szerkezeti biológia Mechanizmusok vizsgálata Fajspecificitás Folding
Enzimkinetika (stacioner és tranziens) Konformációk – spektroszkópiai módszerek (CD, fluorimetria)
Fehérje-röntgenkrisztallográfia
Objektumok: Genom metabolizmus/integritás rendszerei
PDB ID: 4GV8 in 2013
Módszerek és problémák dUTPáz
dUTPáz
Élettani szerep vizsgálata
Fejlődésbiológia, sejtciklus szabályozás
Humán sejtvonal, Mycobacterium, Drosophila DNS javítás / sejthalál Timinmentes sejthalál mechanizmusa Kifejeződési mintázatok Sejten belüli lokalizáció Proteomika: kölcsönhatási hálózatok Transzgén élőlények Knock-out / RNS interferencia Magi/citoplazmás transzport Objektumok: Genom metabolizmus/integritás rendszerei
Jelentkezz önéletrajzzal •
[email protected] • További info: • www.enzim.hu - Research – Vértessy Beáta • www.biostruct.org, PubMed, Google Scholar
Bioinformatika TDK lehetőség - “Lendület” Membránfehérje Bioinformatika Kutatócsoport • Témavezető neve: Tusnády Gábor • Transzmembrán fehérjék elméleti szerkezet meghatározása, szerkezet modellezése, modern bioinformatikai eszközökkel – a genom által kódolt fehérjék 25-30%-a transzmembrán fehérje – a transzmembrán fehérjék szerkezetmeghatározása csak nagyon speciális körülmények oldhatók meg – alig 1000 transzmembrán fehérje szerkezetét határozták már meg kísérleti eszközökkel – de a ma kereskedelemben kapható gyógyszerek mintegy fele transzmembrán fehérjéken fejti ki a hatását – ezért a transzmembrán fehérjék elméleti szerkezet meghatározása modern statisztikai, számítástechnikai, illetve bioinformatikai eszközökkel rendkívül fontos feladat! – Elérhetőségek: • Honlap: • Telefon: • e-mail:
http://mbk.enzim.hu 061-382-6709
[email protected]
Dr. Reményi Attila kutatócsoportja • 1. Kutatási téma címe: Fehérje szerkezet alapú hatóanyag tervezés • 3D fehérje térszerkezetek meghatározása • A szerkezetek segítségével fényt derítettünk arra, hogy néhány aminosavból álló peptidek hogyan képesek akár nagyon hasonló fehérjekötő felszínekhez specifikus módon kötődni • szintetikus vegyületek létrehozása, amik a peptidekhez hasonló módon szelektíven kötnek az ERK, p38 és JNK nevű fehérjékhez • ERK, p38 és JNK: – a sejt jelátviteli folyamataiban foszforilációs enzimek (kinázok)
• szintetikus vegyületekkel ezen kinázoknak a fehérje-fehérje kölcsönhatásait szeretnék gátolni • Ezen szintetikus vegyületek élettani szerepe: a rákos és gyulladásos betegségek gyógyítása • Elérhetőségek: – Tanszék/ Munkahely: MTA TTK, Enzimológiai Intézet – Telefon: 06 1 3826613 – e-mail:
[email protected]
Dr. Reményi Attila kutatócsoportja • 2. Kutatási téma címe: Jelátviteli fehérje komplexek szerkezete • Sejtek a környezetükből érkező ingerekre válaszolnak, ennek egy lépése: – fehérje foszforilációra képes enzimek makromolekuláris komplexet hoznak létre
• A komplexeken belül kialakuló kölcsönhatások határozzák meg, hogy egy adott környezeti ingerre (pl. egy másik sejt jelenléte, hormonok, stressz, stb) milyen konkrét biológiai program (pl. sejtmozgás, osztódás, sejthalál, stb) valósul meg. • Cél: olyan fehérje-fehérje komplexek térbeli szerkezetének feltárása, melyek biokémiai analízise megtörtént, de a komplexek kialakításában fontos kötőfelszínek térbeli struktúrája még nem ismert • farmakológiai jellegű kutatások kiindulópontja • Elérhetőségek: – Tanszék/ Munkahely: MTA TTK, Enzimológiai Intézet – Telefon: 06 1 3826613 – e-mail:
[email protected]
