KELOMPOK:
KODE
:
DINI M. PUTRI
B1J006014
HENDRY WIJAYANTI
B1J006016
IKE LISTIANI A
B1J006020
K38-SPP-05
RINGKASAN
DESKRIPSI POSES TRANSLASI PADA BAKTERI DAN EUKARIOT, DENGAN TEKANAN PADA PERANAN BERMACAM FAKTOR TRANSLASI, DESKRIPSI MELIPUTI PENJELASAN BAGAIMANA TRANSLASI DIREGULASI DAN OUTLINE UNUSUAL EVENT, SEPERTI FRAMESHIFTING, TERJADI SELAMA FASE ELONGASI
Perbedaan utama inisiasi translasi bakteri dan eukariot, terjadi selama fase inisiasi. Komplek inisiasi translasi bakteri secara langsung menginisiasi kodon, sintesis protein dimulai. Sedangkan eukariot proses inisiasi tidak langsung, setelah subunit ribosom dihubungkan dengan inisiasi kompleks. Pada bakteri proses proses inisiasi berkonjugasi dengan faktor inisiasi IF-3, pada ribosom binding site (Shine-Dalgarno sequence). Ribosom binding site berkomplementer pada 3’ dan 16S rRNA pada subunit terkecil dan pasangan basa diantara keduanya dilibatkan dalam penambahan subunit terkecil mRNA.
Gambar 1. Ribosom binding site translasi bakteri. Sumber: Figure 11.14 (Brown, 2002) Penambahan ke dalam posisi ribosom binding site subunit terkecil dari akhir inisiasi kodon ribosom. Inisiator tRNAiMet membawa subunit terkecil ribosome oleh faktor inisiasi kedua IF‐2, dengan molekul GTP, sumber energi pada tahap akhir inisisasi.
Gambar 2. Inisiasi translasi pada Escherichia coli. Sumber: Figure 11.15 (Brown, 2002) Tabel 1. Fungsi Faktor Translasi Bakteri. Sumber: Table 11.2 (Brown, 2002)
Tabel 2. Contoh Ribosom Binding Sequence pada Escherichia coli. Sumber: Table 11.3 (Brown, 2002)
Beberapa eukariot mRNAs mempunyai ribosom binding site internal. Prosesnya memerlukan banyak faktor inisiasi dan beberapa fungsinya belum diketahui. Tabel 3. Faktor Translasi Eukariot. Sumber: Figure 11.14 ; (Brown, 2002)
Pemasangan kompleks pre-inisiasi berasosiasi dengan 5’ akhir mRNA. Langkah ini memerlukan cap binding komplek terdiri dari faktor inisiasi eIF‐4A, eIF‐4E and eIF‐4G. Kompleks pre-inisiasi, scaning mRNA sampai daerah kodon. Inisiasi ditempatkan dengan sekuens kozak konsesus. Scaning dibantu oleh eIF‐4A and eIF‐4B untuk aktivitas helicase.
Gambar 3. Inisiasi translasi eukariot. Sumber: Figure 11.16 ; (Brown, 2002) Inisiasi translasi penting untuk mengatur sintesis protein. Regulasi ribosomal bakteri, L11 operon Escherichia coli ditranskrip ke dalam mRNA yang membawa duplikat gen untuk L11 dan L1 protein ribosom. L1 binding site terdapat 23S rRNA, mengikat pada 5’ yang tidak diterjemahkan pada mRNA. Regulasi ferritin sintesis protein pada mamalia, mengikat 5’ yang tidak diterjemahkan pada ferritin mRNA, apabila besi tidak ada, mencegah sintesis protein.
Gambar 4. Regulasi transkrip spesifik translasi inisiasi. Sumber: Escherichia coli. Sumber: Figure 11.17 (Brown, 2002) Elongasi pada bakteri dan eukariot dimulai P atau peptidyl site, ditempati oleh inisiator tRNAiMet, yang mulai dielongasi,diperintahkan oleh N-formylmethionine atau methionine, dan pasangan basa kodon inisiasi. Bagian kedua A atau aminoacyl site, menutup kodon kedua dalam open reading frame.
Gambar 5. Elongasi translasi. Sumber: Figure 11.18 (Brown, 2002) Frameshifting diprogram selama translasi, spontan terjadi secara acak dan dihapus karena polipeptida disintesis setelah frameshifts memiliki sekuen asam amino yang tidak tepat. Sebagian kecil mRNA menggunakan frameshifts terprogram terjadi pada semua tipe organisme.
Gambar 6. Tiga unusual translasi elongasi yang terjadi dalam Escherichia coli. Sumber: Figure 11.20 (Brown, 2002)
Daftar Pustaka Brown, T. A. 2002. Genomes, Second Editions. John Wiley and Sons Inc.,New York. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.5279 Situs Terkait http://www.web.centre.edu/bmb/movies/bmb21otranscription.swf http://www.biomedicum.ut.ee/armpgb/1kursus/ani_mb7.swf http://www.download.101.com/CAM/conf/2006/wps7.pdf http://www.si.mahidol.ac.th/department/biochemistry/home/md/biochchemistry_tut orial/translation.swf http://www.brookscole.com/chemistry_d/templates/student_resources/shared_resou rces/animation/protein_synthesis/protein_synthesis.swf
