Mitochondrie
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Krátká historie objevu mitochondrií Jako granulární struktury pozorovány v buňkách od poloviny 19. století 1886, Richard Altmann: popsal pozorování bioblastů a navrhl hypotézu, že se jedná o místo buněčné oxidace 1888, Albert von Kölliker: první jasná izolace a popis mitochondrií z hmyzího létacího svalu, popis membránového obalu 1898, Carl Benda: jméno mitochondrion – mitochondrie (do posud mitochondrie 1898 pojmenovávaly různě: sarcosomes, bioblasts, chondrioconts.) 1898, Michaelis: oxidoredukční změny v mitochondriích 1949, Eugene Kennedy a Albert Lehninger: důkaz že mitochondrie jsou místem oxidačního energetického metabolismu Rozvoj fluorescenční mikroskopie v posledních cca 30 letech: pozorování dynamiky mitochondrií v buňkách
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Ultrastruktura mitochondrií
E d Endosymbióza bió ((před ř d cca 1 1,5 5 miliardou ili d llet) t) Předchůdce dnešních alfaproteobakterií, snad Rickettsií
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Seminars in Cell & Developmental p Biology gy 21 ((2010)) 550–557
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Tvar mitochondrií
Živočišná buňka Buňka kvasinkyy Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
EMBO reports 2002 3(6):527-531
Pohyb mitochondrií v rostlinné buňce
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Dynamika mitochondrií
Plastické organely Dochází k neustálému dělení, fúzím a větvení mitochondrií:
Hypotéza nespojitého celku (Logan 2006)
PNAS 2004 101(20):7805–7808
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Mitochondrial fusion in onion bulb epidermal cells.
Ai Arimura S ett al. l PNAS 2004;101:7805-7808 2004 101 7805 7808
©2004 by National Academy of Sciences
Plant Physiology, 2008 148: 1380–1393,
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Plant Physiology, 2008 148: 1380–1393, Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Funkce mitochondrií
Hlavní funkce mitochondrií: Aerobní respirace P dílí se na ffotorespiraci Podílí t i i Produkce sacharidových stavebních kamenů pro další biosyntézy Mitochondriální kompartmenty: Vnější membrána Vnitřní membrána Mezimembránový prostor Matrix
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Journal of Experimental Botany, Vol. 57, No. 6, pp. 1225–1243, 2006
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Vnější membrána mitochondrií: -Propustná pro roztoky a molekuly menší než 10 kDa -Poriny -Translokázy Translokázy
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Mezimembránový prostor: -Není v kontaktu s matrix -Propojen s vnitřním prostorem krist úzkými kanály
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Vnitřní membrána mitochondrií: -Nepropustná p p -Četné přenašeče -Kardiolipin -Velmi zvrásněná – tvorba krist -Molekuly elektrontransportního řetězce (oxidativní fosforylace)
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Matrix: -DNA a ribozómy -Enzymy citrátového cyklu -Glycin Glycin dekarboxyláza
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Aerobní respirace: hlavní funkce mitochondrií Aerobní respirace: sled metabolických reakcí, ve kterém jsou oxidovány organické látky na CO2 a H2O, a uvolněná energie je uskladněna jako ATP. ATP Hlavní produkty respirace jsou tedy: CO2, H20 a ATP. 3 fáze aerobní respirace: 1. Gl 1 Glykolýza k lý 2. Citrátový (Krebsův) cyklus 3. Oxidativní fosforylace
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
1. Glykolýza - Probíhá v cytosolu - Zahrnuje enzymy, oxidující cukry na organické kyseliny, především pyruvát - Organické kyseliny jsou transportovány do matrix mitochondrií
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
2. Citrátový cyklus (CC) - Probíhá v matrix mitochondrie - Do CC vstupuje pyruvát, metabolizovány mohou být ale také aminokyseliny či mastné kyseliny - Cílem CC je kompletně oxidovat pyruvát na CO2 za redukce NAD+ a FAD a vzniku ATP
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
3. Oxidativní fosforylace (elektrontransportní řetězec) - Probíhá na vnitřní membráně mitochondrií - Redukované NADH a FADH2 jsou oxidovány složkami řetězce - Konečným akceptorem elektronů je molekula kyslíku za vzniku vody - Volná energie, uvolněná při oxidaci, je využívána na tvorbu elektrochemického gradientu na vnitřní membráně (H+ ionty se hromadí v mezimembránovém prostoru). - Gradient využívá ATP syntáza na tvorbu ATP (translokace protonů t ů po kkoncentračním t č í spádu) ád )
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
3. Oxidativní fosforylace (elektrontransportní řetězec)
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
3. Oxidativní fosforylace (elektrontransportní řetězec) - Alternativní oxidáza
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Membrána krist je místem oxidativní fosforylace
Imunolokalizace pomocí zlatých partikulí na tenkých řezech mitochondriemi buněk hovězího srdce:
P i Poriny
K Komplex l III
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
FEBS Letters 546 (2003) 355-358
Vliv metabolické aktivity na morfologii mitochondrií
Ortodoxní stav
Kondenzovaný stav
(zvětšený prostor matrix a málo krist)
(zvětšený prostor krist) Journal of Experimental Botany, Vol. 57, No. 6, pp. 1225–1243, 2006
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Transport proteinů do mitochondrií
DNA rostlinných mitochondrií kóduje 3-67 3 67 proteinů Odhadem 1000 proteinů musí být transportováno z cytoplazmy. Transportované proteiny obsahují signální presekvenci. (Transport do matrix – nutné dvě presekvence). Transport v nesbaleném nebo velmi volně sbaleném stavu. Translokázy: proteinové komplexy zajišťující transport skrze mitochondriální membránu: TOM komplex (Translocase of the Outer Membrane) TIM komplex (Translocase of the Inner Membrane)
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Transport proteinů do mitochondrií -TOM TOM komplex k l
Živočichové a houby
Rostliny a řasy
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Transport proteinů do mitochondrií -SAM SAM k komplex l (Sorting (S ti and d Assembly A bl Machinery) M hi ) pro membránové proteiny vnější membrány
Cell. Mol. Life Sci. 66 (2009) 1903 – 1923
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Transport proteinů do mitochondrií -TIM TIM komplexy: k l TIM22: transport do vnitřní membrány; funkce závislá na existenci transmembránového potenciálu. TIM23: translokace proteinů do matrix a některých proteinů do vnitřní membrány. y
Cell. Mol. Life Sci. 66 (2009) 1903 – 1923
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Genom rostlinných mitochondrií Mitochondriální genom:
Velikost:
Buněk živočichů Buněk hub B ěk rostlin Buněk tli
14-42kb 18-176kb 200 (Brassica) B i ) -2400kb 2400kb ((meloun) l )
Plastidový genom
120-200kb
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Genom rostlinných mitochondrií Mitochondriální genom:
Velikost:
Buněk živočichů Buněk hub B ěk rostlin Buněk tli
14-42kb 18-176kb 200 (Brassica) B i ) -2400kb 2400kb ((meloun) l )
Plastidový genom
120-200kb
Proteiny y kódované mitochondriálním g genomem: Živočichové Rostliny
cca 13 proteinů + komponenty pro translaci 57 známých proteinů + další předpokládané ORF
(geny pro: tRNA; rRNA pro malou a velkou ribozomání podjednotku; proteiny energetického metabolismu; několik ribozomálních proteinů; proteiny neznámé funkce) Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Genom rostlinných mitochondrií
Trends in Plant Science 1997 2(12):477 Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
New Phytologist (2010) 186: 299–317
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Invertované repetitivní sekvence
Přímé repetitivní sekvence
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
http://5e.plantphys.net/image.php?id=158
Dělení mitochondrií
Mitochondrie nevznikají de novo, ale pouze dělením. FtsZ (Filamentous temperature-sensitive temperature sensitive line Z) protein se podílí na dělení téměř všech prokaryot Dělení plastidů: plastidů Dělení mitochondrií:
pomocí PD prstence (obsah (obsahuje je FtsZ protein) pomocí MD prstence – složení?
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Dělení mitochondrií
Mitochondrie nevznikají de novo, ale pouze dělením. FtsZ (Filamentous temperature-sensitive temperature sensitive line Z) protein se podílí na dělení téměř všech prokaryot Dělení plastidů: plastidů Dělení mitochondrií:
pomocí PD prstence (obsah (obsahuje je FtsZ protein) pomocí MD prstence
Hlavní prokaryotní komponenty dělícího aparátu se v mitochondriích vyšších eukaryot nedochovaly (geny nenalezeny v Saccharomyces cerevisiae, Caenorhabiditis elegans ani Arabidopsis).
→ Nahrazeny byly eukaryotními proteiny – dynaminy v MD prstenci
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Dělení mitochondrií - Evoluční E l č í spojky jk -proteobakteriální FtsZ byl však nalezen u některých nižších eukaryotů jako je řasa Mallomonas splendens splendens, primitivní červená řasa Cyanidioschyzon merolae, nebo u Dictyostelium discoideum Geny pro FtsZ přesídlily do eukaryotického jádra. Dělící aparát mitochondrií řasy Cyanidioschyzon:
TRENDS in Plant Science Vol.8 No.9 September 2003
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Peroxisómy
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Peroxisómy (též microbodies) i b di ) -Zpravidla sférické organely o průměru 0,2-1,7 m -Obalené jednou membránou -Někdy y tubulární p propojení p j -Nalezeny ve všech eukaryotických buňkách -Rostlinné Rostlinné peroxisómy obsahují specifické složení enzymů: -oxidoreduktázy -katalázy katalázy -enzymy -oxidace mastných kyselin -enzymy pro biosyntézu bi té některých ěkt ý h FH
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Peroxisómy
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Peroxisómy
Typy ypy rostlinných ý p peroxisómů: P Peroxisómy i ó li t ý h b listových buněk ěk ((role l ve ffotorespiraci) t i i) Glyoxysómy (semena bohatá na MK jako zásobní látky, y, mobilizoványy -oxidací MK v p peroxisómech)) Peroxisómy P i ó ve specializovaných i li ý hb buňkách ňká h kořenů k ř ů bobovitých rostlin (role ve fixaci N2).
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Role peroxisómů ve fotorespiraci
Fotorespirace je výsledkem vlastností centrálního f t fotosyntetického t ti kéh enzymu enzymu Rubisco R bi v chloroplastech: hl l t h Karboxylázová x oxygenázová aktivita enzymu Rubisco
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Glykolátový cyklus - fotorespirace
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK
Rostlinná cytologie, Katedra experimentální biologie rostlin PřF UK