LIMS - levensader van dierziekte bestrijding bij Centraal Veterinair Instituut Eric de Kluijver
©03-2012
Het Centraal Veterinair Instituut Historie 1959
Centraal Diergeneeskundig Instituut (CDI) Fusie tussen Rijks Serum Inrichting uit Rotterdam (1904) en Staats Veeartsenijkundig Onderzoekinstituut uit Amsterdam (1929)
1994
ID-DLO fusie tussen CDI, IVO, IVVO en COVP
1999
ID-Lelystad
2002
Centraal Instituut DierziekteControle (CIDC-Lelystad) Centraal Veterinair Instituut (CVI)
2008
Wat is het Centraal Veterinair Instituut Een internationaal gerenommeerde kennisorganisatie op het gebied van diergezondheid Uitvoering wettelijke onderzoekstaken aangifteplichtige ziekten bij dieren. Nationaal referentie laboratorium. Verantwoordelijk voor de uitvoering van diagnostiek en advies bij verdenkingen van besmettelijke aangifteplichtige dierziekten (vogelgriep, Schmallenbergvirus, MKZ, varkenspest) Exportcertificeringsdiagnostiek Contractonderzoek (onderzoeks- en kennistransferopdrachten, vaccinontwikkeling) 250 medewerkers Jaaromzet van 36 miljoen euro.
Het begin Februari 1997- juni 1998 Varkenspest uitbraak in Nederland 2,3 miljoen samples onderzocht
Wat kon beter? Tracking and tracing, Overzicht
● Samples ● Bedrijven ● Inzendingen
Start met een nieuw LIMS December 2000 BSE problematiek in Engeland – sinds 1 januari 2001 verplicht BSE onderzoek bij koeien op het slachthuis Nieuw onderzoek – nieuw LIMS
Unilab van Siemens (toen nog Compex) Aantal monsters per dag: 2500-3000 Logistiek en LIMS op beter op elkaar afgestemd Tracking en tracing nu goed geregeld
Belang van LIMS bij het CVI Verdenking besmettelijke aangifteplichtige dierziekte snelheid diagnostiek en uitslagen, 24/7 informatie over de voortgang Uitbraak van een besmettelijke dierziekte snelheid diagnostiek en uitslagen, overzicht onderzochte monsters en monsters in onderzoek totaalbeeld voor inzet mensen en materieel. Export certificering onderzoek grote economische belangen voor de export (o.a. zorgvuldigheid, tijdigheid onderzoek/uitslagen) Gecodeerde buizen lab gebruikt alleen nog de code van de buis (plaats in blok, werkprotocol, uitslag)
Belang LIMS, maar minder urgent
Inzicht in monsteraanbod per test efficiëntie van testen en kosten van onderzoek Koppeling LIMS aan het financiële pakket van CVI onderzoeken met prijzen on line op de website Automatisch te generen overzichten snel informatie beschikbaar, bijvoorbeeld voor seroprevalentiestudie Schmallenbergvirus Automatische facturering van afgeronde onderzoeken
Unilab van Siemens
Tracking en tracing van samples goed geregeld
● Status van onderzoek goed te volgen ● Door buiscode en serienummer monsters goed te traceren en te verplaatsen Werkprotocollen worden aangemaakt met gegevens uit LIMS. Omdat serie en positie vastliggen kunnen deze ook worden gebruikt om resultaten automatisch vanaf randapparatuur te plaatsen in het LIMS Gemakkelijk overzichten te maken m.b.v. BO XI
Uitbraken van de afgelopen 10 jaar
2003
Vogelgriep
Gelderse vallei/Peel
2006
Dreiging vogelgriep wilde vogels H5N1
2006
Varkenspest (net over de grens in Duitsland)
2006-2010 Blauw tong 2008-2012 Diverse laag pathogene vogelgriep uitbraken 2012
Schmallenberg virus
Volgen van updates voor LIMS Start 2001 nu 2012 Diverse updates/migraties LIMS software Database updates (Oracle) Diverse Windows updates Servers vervangen Randapparatuur vervangen (soms met software) 1982
8 bit
heden 64 bit
Belang volgen van updates voor het CVI
Het LIMS mag niet uit de lucht CVI een 24/7 functie Snelheid en tijdigheid onderzoek is cruciaal Verwerking van gecodeerde buizen moet ononderbroken doorgaan Automatisch inlezen van testuitslagen vanaf randapparatuur moet continu mogelijk zijn Voldoen aan wensen van opdrachtgevers (m.b.t. uitwisseling van data) Support op software moet mogelijk blijven (lastig bij verouderde versies)
Overgang naar Unilab versie 6.4 Vanwege overgang naar Windows 7 (64 bit versie) Direct overgestapt naar hogere Oracle versie (database) en hogere versie van Business Objects (rapportage) Noodzakelijke aanpassingen aan customizaties Plan van Aanpak en uitvoering – 6 maanden (waarvan 2 maanden vakantieperiode) Nieuwe omgeving ingericht en uitvoerig getest. Bij overgang alleen data vanuit oude omgeving naar nieuwe omgeving verplaatst. Kosten: voornamelijk intern (testwerk, aanpassen rapporten, e.d.) en uren ATOS
Reserveringen voor up dates
Updates zijn belangrijk voor CVI maar niet ten koste van alles Financiële reserveringen worden gemaakt Wensen zoveel mogelijk binnen bestaande software Eventuele gewenste customizaties laten ontwikkelen door service provider en opnemen in onderhoudscontract i.v.m. toekomstige upgrades.
Knelpunten bij een migratie Software randapparatuur mogelijk niet compatibel met nieuwe besturingsplatform (bv. software voor het lezen van de gecodeerde buizen) Andere opbouw van een database Andere opbouw van een besturingssysteem
Vraag voor later: Hoe gaan andere labs om met data van randapparatuur welke alleen nog door de verouderde software van dat apparaat is te benaderen?
Door je systeem te upgraden blijft het jong en vitaal
Dank voor uw aandacht
