KERAGAMAN KUCING (Felis domesticus) DI KECAMATAN BOGOR TENGAH BERDASARKAN KARAKTER MORFOLOGI
Oleh: NANDA ADITYA
DEPARTEMEN BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM INSTITUT PERTANIAN BOGOR BOGOR 2006
ABSTRAK NANDA ADITYA. Keragaman Kucing (Felis domesticus) di Kecamatan Bogor Tengah Berdasarkan Karakter Morfologi. Dibimbing oleh R. R. DYAH PERWITASARI dan ACHMAD FARAJALLAH. Karakter morfologi memberikan ciri khusus pada setiap kucing dan dapat menggambarkan karakter dari suatu populasi. Penelitian ini mempelajari mengenai 11 lokus yang mengekspresikan karakter morfologi, yaitu lokus w~W, o~O, A~a, B~b, C~cs~ca~c, Ta~T~tb, i~I, D~d, s~S, L~l, dan m~M. Karakter tersebut diamati melalui video dan frekuensi alel dianalisis menggunakan metode square-root. Keragaman kucing di Kecamatan Bogor Tengah dilihat dari nilai heterozigositas (h) dan heterozigositas rataan (Ĥ). Dari 11 kelurahan administratif di Kecamatan Bogor Tengah diperoleh 514 individu kucing. Pola warna Siam yang jarang ditemukan di Indonesia, terdapat pada Kelurahan Tegalega dan Gudang. Ekor pendek di Kecamatan Bogor Tengah memiliki nilai frekuensi yang tinggi seperti halnya pada kucing-kucing di Asia. Nilai heterozigositas (h) pada lokus w~W sebesar 0.7%, lokus o~O sebesar 43.2%, lokus A~a sebesar 49.9%, lokus B~b sebesar 31.7%, lokus C~cs~ca~c sebesar 9.7%, lokus Ta~T~tb sebesar 39.4%, lokus i~I sebesar 1.8%, lokus D~d sebesar 27.7%, lokus s~S sebesar 49.2%, lokus L~l sebesar 11.2%, dan lokus m~M sebesar 45.3%. Nilai heterozigositas rataan (Ĥ) di Kecamatan Bogor Tengah relatif tinggi, yaitu sebesar 28.2%. Hal ini disebabkan adanya karakter-karakter tipe mutan dari setiap kelurahan.
ABSTRACT NANDA ADITYA. Cat’s (Felis domesticus) Polymorphisms in Central Bogor Based on Morphological Characters. Under supervision of R. R. DYAH PERWITASARI and ACHMAD FARAJALLAH advisory. Morphological characters gave feature characteristic on cats and it also could gave population description. This study aimed to determine variability among 11 loci that expressed morphological traits, there are w~W, o~O, A~a, B~b, C~cs~ca~c, Ta~T~tb, i~I, D~d, s~S, L~l, and m~M loci. There were observed by camera and allele frequencies were calculated by using square-root method. Eleven loci were screened to estimate level of heterozygosity (h) and average heterozygosity (Ĥ). A total of 514 cat images were collected from 11 administrative areas (kelurahan) at Central Bogor. Siamese pattern – which is rare in Indonesia – were observed at Kelurahan Tegalega and Gudang. Kinky tail traits at Central Bogor showed high frequency as noted in other Asian countries. Estimation of heterozygosity of each locus were 0.7% (w~W locus), 43.2% ( o~O locus), 49.9% (A~a locus), 31.7% (B~b locus), 9.7% (C~cs~ca~c locus), 39.4% (Ta~T~tb locus), 1.8% (i~I locus), 27.7% (D~d locus), 49.2% (s~S locus), 11.2% (L~l locus), and 45.3% (m~M locus ). The value of average heterozygosity (Ĥ) in Central Bogor was relatively high. It was reached to 28.2%. The high level of average heterozygosity value were due to mutant characters.
KERAGAMAN KUCING (Felis domesticus) DI KECAMATAN BOGOR TENGAH BERDASARKAN KARAKTER MORFOLOGI
Skripsi sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Sains pada Departemen Biologi
Oleh: NANDA ADITYA
DEPARTEMEN BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM INSTITUT PERTANIAN BOGOR BOGOR 2006
Judul Skripsi : Keragaman Kucing (Felis domesticus) di Kecamatan Bogor Tengah Berdasarkan Karakter Morfologi Nama : Nanda Aditya NRP : G34102064
Menyetujui: Pembimbing I
Pembimbing II
Dr. Ir. R. R. Dyah Perwitasari, M.Sc. NIP 131916787
Dr. Ir. Achmad Farajallah, M.Si. NIP 131878947
Mengetahui: Dekan Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Institut Pertanian Bogor
Dr. Ir. Yonny Koesmaryono, M.S. NIP 131473999
Tanggal Lulus:
PRAKATA Puji syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT atas rahmat dan hidayahNya skripsi ini berhasil diselesaikan. Tema penelitian yang dipilih dan dilakukan pada bulan Januari hingga Juni 2006 ini ialah genetika populasi kucing dengan judul Keragaman Kucing (Felis domesticus) di Kecamatan Bogor Tengah Berdasarkan Karakter Morfologi. Terima kasih penulis ucapkan kepada Ibu Dr. Ir. R. R. Dyah Perwitasari, M.Sc. dan Bapak Dr. Ir. Achmad Farajallah, M.Si. selaku pembimbing, Ibu Dr. Anja Meryandini, M.S., Mas Berry, Mba Kanthi, serta seluruh staf Departemen Biologi, khususnya Staf Zoologi yang telah bersedia membimbing, memberikan fasilitas, saran dan masukan, serta membantu dalam penelitian dan pembuatan skripsi. Lantunan terima kasih penulis berikan kepada seluruh keluarga, karena skripsi ini tidak akan hadir tanpa doa serta kasih sayang yang telah diberikan oleh Ibunda, Ayahanda, Mas Dhita, Mba Rini, Mas Mardi, dan seluruh keluarga di Balikpapan. Tak lupa penulis ucapkan terima kasih kepada, Riza, Urip, Andros, Umar, Dania, teman-teman Rumah Merah, serta teman-teman Biologi atas hari-hari bahagia, motivasi, semangat, dan ikatan persahabatan yang diberikan. Penulis ungkapkan terima kasih untuk Ina Fajarwati beserta keluarga yang telah mencurahkan perhatian dan kasih sayang. Penulis menyadari bahwa tak ada gading yang tak retak, begitulah isi skripsi ini. Oleh karena itu kritik dan saran yang membangun sangat diharapkan atas kesempurnaan skripsi ini. Semoga hadirnya skripsi ini dapat memberikan informasi mengenai genetika populasi kucing dan bermanfaat bagi pembaca. Bogor, Juni 2006 Nanda Aditya
RIWAYAT HIDUP Penulis dilahirkan di Balikpapan pada tanggal 29 November 1984 dari ayah, Haryono Sirin, S.Sos. MM dan ibu, Sumarsih, S.Sos. Penulis merupakan anak ketiga dari tiga bersaudara. Tahun 2002 penulis lulus dari SMU Negeri 35 Jakarta dan pada tahun yang sama penulis lulus seleksi masuk IPB melalui jalur Seleksi Penerimaan Mahasiswa Baru (SPMB). Penulis memilih Departemen Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Selama mengikuti perkuliahan, penulis menjadi asisten praktikum mata kuliah Fisiologi Hewan, Biologi Sel dan Molekuler, Vertebrata, dan Biologi Dasar pada tahun ajaran 2005/2006. Penulis juga menjadi ketua Bidang Observasi Wahana Alam (OWA) dari Himpunan Mahasiswa Biologi (HIMABIO) pada tahun ajaran 2004/2005. Tahun 2003 penulis menjadi ketua Kegiatan Biologi Fotografi (BIOGRAF).
DAFTAR ISI Halaman DAFTAR TABEL ...................................................................... ...................................................vii DAFTAR GAMBAR ................................................................. ..................................................viii DAFTAR LAMPIRAN .............................................................. ....................................................ix PENDAHULUAN ..................................................................... .....................................................1 BAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat ............................................................... .....................................................1 Bahan dan Alat ..................................................................... .....................................................2 Metode .................................................................................. .....................................................2 HASIL Lokus w~W dan Lokus C~cs~ca~c ....................................... .....................................................5 Lokus o~O ............................................................................ .....................................................5 Lokus A~a ............................................................................ .....................................................5 Lokus Ta~T~tb ............................................................................................................................5 Lokus B~b dan Lokus D~d ........................................................................................................5 Lokus i~I dan Lokus L~l ...................................................... .....................................................6 Lokus s~S ............................................................................. .....................................................6 Karakter Ekor Pendek .......................................................... .....................................................6 Nilai Heterozigositas (h) dan Heterozigositas Rataan (Ĥ) ... .....................................................6 PEMBAHASAN Lokus w~W dan Lokus C~cs~ca~c ....................................... .....................................................7 Lokus o~O ............................................................................ .....................................................7 Lokus A~a dan Lokus s~S .................................................. .....................................................7 Lokus Ta~T~tb ...................................................................... .....................................................7 Lokus B~b dan Lokus D~d .................................................. .....................................................8 Lokus i~I dan Lokus L~l ...................................................... .....................................................8 Karakter Ekor Pendek .......................................................... .....................................................8 Nilai Heterozigositas (h) dan Heterozigositas Rataan (Ĥ) ... .....................................................8 SIMPULAN ............................................................................... .....................................................9 DAFTAR PUSTAKA ................................................................ .....................................................9 LAMPIRAN ............................................................................... ...................................................10
DAFTAR TABEL Halaman 1 Notasi alel-alel yang digunakan dalam penelitian (Wright & Walters 1980) ................................2 2 Jumlah fenotipe, frekuensi alel (q), dan heterozigositas (h) dari 11 lokus pada kucing di Kecamatan Bogor Tengah ................................................... ................................3 3 Nilai heterozigositas rataan (Ĥ) dari tiap kelurahan ..................................... ................................7
DAFTAR GAMBAR Halaman 1 Silver striped tabby longhair dengan genotipe A- B- C- D- I- T- ll .. ...........................................6 2 Brown abyssinian kinky tail dengan genotipe A- B- C- D- ii Ta- Mm ...........................................6 3 Brown striped tabby and white dengan genotipe A- B- C- D- ii T- S- ...........................................6
DAFTAR LAMPIRAN Halaman 1 Peta administratif Kecamatan Bogor Tengah (BAKOSURTANAL 1996) .. ..............................11 2 Nilai frekuensi alel (q) dan heterozigositas (h) dari setiap lokus pada populasi kucing di Kecamatan Bogor Tengah ............................................. ..............................12 3 Nilai heterozigositas (h) dan heterozigositas rataan (Ĥ) hasil analisis ulang dari 8 lokus karakter rambut dan karakter ekor pendek pada populasi kucing di 11 provinsi di Indonesia dan di Kabupaten Bogor (cetak tebal) (Nozawa et al. 1983) .................................................................................... ..............................12 4 Nilai heterozigositas (h) dan heterozigositas rataan (Ĥ) hasil analisis ulang dari 8 lokus karakter rambut dan karakter ekor pendek pada populasi kucing di beberapa negara di Asia (Kawamoto et al. 2002) ........................ ..............................13 5 Foto-foto kucing yang jarang dijumpai di Kecamatan Bogor Tengah ......... ..............................13
1
PENDAHULUAN Felis domesticus merupakan kucing peliharaan hasil domestikasi sejak zaman Mesir kuno. Kucing ini hanya ditemukan di Mesir dan negara sekitarnya saja, tidak terdapat di Eropa dan Amerika (VerhoefVerhallen 1996). Pugnetti (1983) mengemukakan, kucing domestik merupakan keturunan Felis silvestris (kucing hutan Eropa) dengan Felis lybica (kucing hutan Afrika). Kucing digolongkan ke dalam kelas Mamalia, ordo Karnivora, superfamili Feloidea, dan famili Felidae (Ewer 1973). Hampir seluruh ordo Karnivora merupakan pemakan daging. Ciri-ciri ordo ini dapat dilihat dari beberapa karakter morfologi, khususnya struktur gigi yang telah mengalami spesialisasi. Ordo Karnivora dibagi menjadi dua subordo, yaitu subordo Feliformia (catlike) dan subordo Caniformia (dog-like) (Feldhamer et al. 2003). Panjang tubuh kucing dewasa umumnya 50 cm dengan panjang ekor (normal) 25 sampai 30 cm dan berat tubuh berkisar antara 3,2 hingga 4 kg. Namun, pada kucing yang mengalami gigantisme, berat tubuhnya dapat mencapai 19,5 kg (Pugnetti 1983). Warna dan pola warna rambut kucing domestik lebih beragam daripada warna dan pola warna rambut kucing-kucing besar, karena kucing-kucing besar memerlukan pola warna dan warna tertentu agar dapat berkamuflase saat berburu (Kent & Robert 2001). Awalnya ekspresi warna rambut pada kucing diduga sangat dipengaruhi oleh keadaan lingkungan, tetapi belakangan ini, diketahui bahwa ekspresi warna rambut dipengaruhi oleh faktor genetik (Hinde 1996). Menurut Wright dan Walters (1980) warna hitam merupakan warna dasar dari semua kucing. Pigmen yang menghasilkan warna hitam pada rambut adalah melanin. Variasi warna rambut kucing merupakan hasil modifikasi bahan genetik. Semua alel yang menyandikan variasi warna kucing terletak pada kromosom autosom dan kromosom seks (X). Beberapa gen yang terdapat pada kromosom autosom yaitu, gen penyandi warna hitam (B) terletak pada lokus B~b, mutasi pada gen ini akan mengekspresikan warna coklat dan coklat muda. Kelompok kucing Burma (Burmese) mempunyai gen penyandi warna sepia (cb), sedangkan kelompok Siam (Siamese) membawa gen warna pointed (cs). Gen ini terletak pada lokus albino (C~cs~ca~c).
Agouti (A) merupakan warna abu-abu kekuningan pada dasar rambut kebanyakan mamalia, sedangkan hitam merupakan hasil dari ekspresi gen non-agouti (alel a). Pola tabby merupakan garis/titik hitam (gelap) yang menutupi warna agouti (Robinson 1977). Gen penyandi warna oranye (alel O) terpaut kromosom seks (sex-linked) (Starbuck & Thomas 1994). Alel O terpaut kromosom seks dan bersifat kodominan. Kucing dengan genotipe homozigot resesif (oo) akan berwarna non-oranye, warna oranye hanya muncul jika homozigot dominan (OO) untuk betina dan hanya alel tunggal (O) untuk jantan. Individu dengan genotipe heterozigot (Oo) akan menghasilkan karakter yang disebut dengan tortoiseshell dan umumnya betina (Robinson 1977). Panjang ekor dikendalikan oleh gen Manx (M), yang menyebabkan pemendekan atau hilangnya ekor. Kucing berekor pendek memiliki genotipe heterozigot (Mm), karena jika homozigot (MM) individu tersebut pasti mati sebelum lahir (Wright & Walters 1980). Panjang rambut kucing umumnya sekitar 4,5 cm, sedangkan pada kucing pertunjukan yang sehat dapat mencapai sekitar 12,5 cm. Perbedaan ini terjadi karena adanya genotipe ll yang menyebabkan perkembangan folikel rambut tidak normal, sehingga rambut dapat lebih panjang dari biasanya sebelum mencapai fase dorman (Wright & Walters 1980). Karakter morfologi pada kucing seperti warna, pola, dan panjang rambut, warna mata, bentuk tubuh, panjang ekor, ukuran dan bentuk telinga sangat bervariasi dalam setiap kelompok. Menurut Cutts (2002) ada tujuh kelompok kucing, yaitu kelompok Persia (Longhair group), rambut setengah panjang (Semi-Longhair group), rambut pendek British (British Shorthair group), rambut pendek Asing (Foreign Shorthair group), rambut pendek Oriental (Oriental Shorthair group), Birma (Burmese group), dan Siam (Siamese group). Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari keragaman kucing di Kecamatan Bogor Tengah berdasarkan karakter morfologi.
BAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat Pengambilan sampel dilakukan dari bulan Januari hingga April di sebelas kelurahan pada Kecamatan Bogor Tengah, yaitu Kelurahan Tegalega, Kelurahan Babakan, Kelurahan Sempur, Kelurahan Pabaton, Kelurahan Cibogor, Kelurahan Ciwaringin, Kelurahan
2
Panaragan, Kelurahan Kebon Kalapa, Kelurahan Gudang, Kelurahan Babakan Pasar, dan Kelurahan Paledang. Waktu pengambilan sampel dilakukan pada pukul 07.30-12.00 WIB. Bahan dan Alat Bahan yang dianalisis berupa video dan/atau gambar dari karakter morfologi kucing. Peralatan yang digunakan untuk pengambilan sampel ialah Handycam JVC model GR-DZ7E. Metode Metode yang digunakan ialah road sampling (Ratti & Garton 1996) dengan melakukan survei pada setiap lokasi pengambilan sampel. Hal ini dilakukan untuk mengetahui saat ditemukannya jumlah sampel terbanyak. Langkah selanjutnya dilakukan pengambilan gambar berupa foto maupun video dari sampel yang ditemukan. Untuk menghindari duplikasi, pengambilan sampel dilakukan hanya sekali dalam satu hari dan berupa sweeping pada rute dari tiap lokasi. Sampel yang diperoleh dicatat berdasarkan genotipenya dengan mengacu kepada Wright dan Walters (1980). Frekuensi alel dihitung berdasarkan metode square-root (Nozawa et al. 1990). Alel-alel yang dianalisis tercantum dalam Tabel 1. Tabel 1 Notasi alel-alel yang digunakan dalam penelitian (Wright & Walters 1980) Alel A (Agouti) a (Non-agouti) B (Black) b (Brown) C (Full-colour) cs (Siamese) ca (Blue-eyed albino) c (Albino) D (Dense) d (dilute) i (pigmentasi normal) I (Inhibitor) L (rambut normal) l (rambut panjang) m (ekor normal) M (Manx)* o (warna normal) O (Oranye)* s (warna normal) S (Piebald)* T (Mackerel) Ta (Abyssinian)* tb (Blotched) w (warna normal) W (Putih dominan)*
Karakter Morfologi Pola tabby Tanpa pola Hitam/coklat (agouti) Coklat muda Pigmentasi maksimal Sepia, Pola points Putih, iris biru muda Putih, iris Pigmentasi penuh Pigmentasi pudar Pigmentasi sempurna Warna perak Rambut pendek Rambut panjang Ekor panjang (normal) Ekor pendek Selain oranye Oranye (terpaut sex) Tanpa daerah putih Dengan daerah putih Pola tabby garis Pola tabby abyssinian Pola tabby klasik Ekspresi penuh warna lain Warna putih menutupi warna lain
* Bersifat dominan terhadap tipe liar (bercetak tebal).
Penghitungan jumlah alel dari lokus w~W, A~a, B~b, C~cs~ca~c, Ta~T~tb, D~d, s~S, dan L~l dengan sifat dominan (D) dan resesif (R) yang berperan dalam pembentukan warna dan pola warna rambut kucing adalah: n=D+R frekuensi alel resesif (qx) dan dominan (px) dihitung dengan: qx = √R/n px = 1-qx simpangan baku dari frekuensi alel dihitung dengan: σ=√(1- qx2)/4n Alel o-O terpaut pada kromosom sex (X), sehingga dapat memberikan tiga macam warna yaitu oranye (a1), tortoiseshell (a2), dan non-orange (a3), maka dijumlahkan dengan cara: n=a1+a2+a3 penghitungan frekuensi alel O (qo) diasumsikan perbandingan jantan dan betina 1:1, kemudian dihitung dengan menggunakan metode maximum likelihood (Nozawa et al. 1990), berupa persamaan: 2(a1+a2)+(a1-3a2-3a3)qo(5a1+3a2+a3)qo2+2(a1+a2+a3)qo3=0 Simpangan baku alel o-O dihitung dengan: σ=√qo(1+qo)(1-qo)(2-qo)/3n Frekuensi alel ekor normal (qM) dan ekor pendek (qm) digunakan sebagai nilai karakteristik suatu populasi. Penghitungan frekuensi alel dan simpangan baku (σ) dilakukan menggunakan: qm= R/n qM= 1- qm σ=√qm.qM/n Heterozigositas (h) dan heterozigositas rataan (Ĥ) dihitung untuk mengetahui keragaman suatu alel (xi) dari jumlah individu (n) pada suatu lokasi, dengan menggunakan cara (Nei 1987): hi= 2n(1-∑xi2)/ 2n-1 Ĥ= ∑hi/nh simpangan baku (σ) untuk nilai h dan Ĥ dihitung dengan (Nei 1987): σhi= 2[2(2n-1)( ∑xi3-[∑xi2]2)+ ∑xi2-(∑xi2)2] 2n(2n-1) σĤ= ∑σhi/nh
3
HASIL Sampel yang diperoleh di 11 kelurahan Kecamatan Bogor Tengah sebanyak 514
individu kucing. Data berupa frekuensi alel dan heterozigositas (h) beserta simpangan baku dari genotipe yang diperoleh dapat dilihat pada tabel 2.
Tabel 2 Jumlah fenotipe, frekuensi alel (q), dan heterozigositas (h) dari 11 lokus pada kucing di Kecamatan Bogor Tengah Lokus w~W
Genotipe ww W_ n qw qW h o~O oo Oo O n qo qO h A~a A_ aa n qA qa h B~b B_ bb n qB qb h C~cs~ca~c C_ cs_ ca_ cc n qC q cs q ca qc h D~d D_ dd n qD qd h Ta_ Ta~T~tb T_ Tb_ n q Ta qT qtb h i~I ii I_ n qi qI h s~S ss S_ n qs qS h
Tegalega 124 1 125 0.996±0.004 0.004±0.004 0.008±0.000 72 26 27 125 0.681±0.036 0.319±0.036 0.436±0.001 66 31 97 0.435±0.042 0.565±0.042 0.494±0.000 91 6 97 0.751±0.049 0.249±0.049 0.376±0.001 123 1 1 125 0.874±0.044 0.037±0.098 0.089±0.045 0.229±0.001 11 9 124 0.731±0.043 0.269±0.043 0.395±0.001 19 70 2 91 0.111±0.024 0.741±0.066 0.148±0.052 0.419±0.002 119 5 124 0.980±0.009 0.020±0.009 0.040±0.000 35 89 124 0.531±0.038 0.469±0.038 0.500±0.000
Sempur 56 56 1 0 32 10 14 56 0.666±0.054 0.334±0.054 0.449±0.001 30 12 42 0.465±0.065 0.535±0.065 0.504±0.000 38 4 42 0.691±0.073 0.309±0.073 0.432±0.002 56 56 1 0 52 4 56 0.733±0.064 0.267±0.064 0.395±0.002 10 24 6 40 0.134±0.04 0.479±0.114 0.387±0.073 0.611±0.001 54 2 56 0.982±0.013 0.018±0.013 0.036±0.001 22 34 56 0.627±0.052 0.373±0.052 0.472±0.001
Babakan 33 33 1 0 22 8 3 33 0.774±0.062 0.226±0.062 0.355±0.003 23 7 30 0.517±0.080 0.483±0.080 0.508±0.000 27 3 30 0.684±0.087 0.316±0.087 0.440±0.002 33 33 1 0 30 3 33 0.698±0.083 0.302±0.083 0.428±0.002 23 1 24 0.796±0.119 0.204±0.119 0.332±0.005 33 33 1 0 12 21 33 0.603±0.069 0.397±0.069 0.486±0.001
Ciwaringin 26 26 1 0 16 6 4 26 0.726±0.075 0.274±0.075 0.406±0.003 17 5 22 0.523±0.094 0.477±0.094 0.511±0.000 22 22 1 0 26 26 1 0 24 2 26 0.723±0.094 0.277±0.094 0.409±0.003 6 14 20 0.163±0.061 0.837±0.061 0.28±0.007 26 26 1 0 5 21 26 0.439±0.088 0.561±0.088 0.502±0.001
Cibogor 45 45 1 0 28 10 7 45 0.729±0.057 0.271±0.057 0.399±0.002 24 14 38 0.393±0.065 0.607±0.065 0.483±0.001 30 8 38 0.541±0.072 0.459±0.072 0.503±0.000 45 45 1 0 43 2 45 0.789±0.073 0.211±0.073 0.336±0.003 9 20 29 0.170±0.052 0.830±0.052 0.287±0.004 45 45 1 0 11 34 45 0.494±0.065 0.506±0.065 0.506±0.000
Pabaton 24 24 1 0 14 4 6 24 0.673±0.082 0.327±0.082 0.449±0.002 10 8 18 0.333±0.088 0.667±0.088 0.457±0.003 16 2 18 0.667±0.111 0.333±0.111 0.457±0.003 24 24 0 21 3 24 0.646±0.096 0.354±0.096 0.467±0.002 5 9 14 0.198±0.08 0.802±0.08 0.330±0.009 23 1 24 0.979±0.021 0.021±0.021 0.042±0.002 8 16 24 0.577±0.083 0.423±0.083 0.498±0.001
4
Lanjutan Lokus L~l
Genotipe Tegalega L_ 122 ll 3 n 125 qL 0.845±0.044 ql 0.155±0.044 h 0.263±0.001 Ekor 56 pendek* 69 + 125 n 0.448±0.044 qq+ 0.552±0.044 h 0.497±0.000 * (-) ekor normal, (+) ekor pendek
Sempur 56 56 1 0 19 37 56 0.339±0.063 0.661±0.063 0.452±0.001
Babakan 33 33 1 0 14 19 33 0.424±0.086 0.576±0.086 0.496±0.000
Ciwaringin 25 1 26 0.804±0.096 0.196±0.096 0.321±0.005 11 15 26 0.423±0.097 0.577±0.097 0.498±0.001
Cibogor 45 45 1 0 13 32 45 0.289±0.068 0.711±0.068 0.415±0.002
Pabaton 23 1 24 0.796±0.100 0.204±0.100 0.332±0.005 11 13 24 0.458±0.102 0.542±0.102 0.507±0.000
Lanjutan Lokus w~W
o~O
A~a
B~b
C~cs~ca~c
D~d
Ta~T~tb
Genotipe ww W_ n qw qW h oo Oo O n qo qO h A_ aa n qA qa h B_ bb n qB qb h C_ cs_ ca_ cc n qC q cs q ca qc h D_ dd n qD qd h Ta_ T_ Tb_ n q Ta qT qtb h
Paledang 38 38 1 0 20 9 9 38 0.644±0.067 0.356±0.067 0.465±0.001 21 8 29 0.475±0.079 0.525±0.079 0.507±0.000 28 1 29 0.814±0.091 0.186±0.091 0.308±0.004 38 38 1 0 38 38 1 0 8 20 1 29 0.149±0.049 0.665±0.124 0.186±0.091 0.510±0.004
Panaragan 35 1 36 0.986±0.014 0.014±0.014 0.028±0.001 16 9 11 36 0.569±0.071 0.431±0.071 0.497±0.004 17 7 24 0.460±0.086 0.540±0.086 0.507±0.000 24 24 1 0 35 1 36 0.833±0.082 0.167±0.082 0.282±0.004 33 2 35 0.761±0.082 0.239±0.082 0.369±0.003 3 21 24 0.065±0.036 0.935±0.036 0.123±0.004
Kebon Kalapa 26 26 1 0 16 6 4 26 0.726±0.075 0.274±0.075 0.406±0.003 15 7 22 0.436±0.088 0.564±0.088 0.503±0.001 21 1 22 0.787±0.104 0.213±0.104 0.343±0.005 26 26 1 0 26 26 1 0 9 10 19 0.275±0.079 0.725±0.079 0.409±0.005
Babakan Pasar 50 2 52 0.981±0.014 0.019±0.014 0.038±0.001 28 9 15 52 0.630±0.058 0.370±0.058 0.471±0.001 27 8 35 0.522±0.074 0.478±0.074 0.506±0.000 34 1 35 0.831±0.083 0.169±0.083 0.285±0.004 50 2 52 0.804±0.068 0.196±0.068 0.318±0.002 49 1 50 0.859±0.070 0.141±0.070 0.245±0.003 9 22 3 34 0.143±0.044 0.560±0.121 0.297±0.082 0.586±0.002
Gudang 53 53 1 0 31 13 9 53 0.702±0.054 0.298±0.054 0.422±0.001 33 11 44 0.500±0.065 0.500±0.065 0.506±0.000 42 2 44 0.787±0.074 0.213±0.074 0.339±0.003 52 1 53 0.863±0.068 0.137±0.068 0.239±0.002 53 53 1 0 10 31 1 42 0.127±0.038 0.719±0.099 0.154±0.076 0.449±0.003
5
Lanjutan Lokus i~I
Genotipe Paledang ii 37 I_ 1 n 38 qi 0.987±0.013 qI 0.013±0.013 h 0.026±0.001 s~S ss 10 S_ 28 n 38 qs 0.513±0.07 qS 0.487±0.07 h 0.506±0.000 L~l L_ 38 ll n 38 qL 1 ql h 0 Ekor 15 pendek* 23 + 38 n 0.395±0.079 qq+ 0.605±0.079 h 0.484±0.001 * (-) ekor normal, (+) ekor pendek
Panaragan 35 35 1 0 8 27 35 0.478±0.074 0.522±0.074 0.506±0.000 36 36 1 0 11 25 36 0.306±0.077 0.694±0.077 0.430±0.002
Lokus w~W dan Lokus C~cs~ca~c Rambut dengan warna putih polos – self – sangat jarang dijumpai di Kecamatan Bogor Tengah (Tabel 2). Warna polos ini disandikan oleh alel putih (W) pada lokus w~W atau juga oleh alel albino (ca/c) pada lokus C~cs~ca~c. Kelurahan Babakan Pasar memiliki frekuensi alel W dan ca lebih besar dibanding dengan kelurahan lainnya. Alel siam (cs) juga hampir tidak dapat ditemui, hanya terdapat pada Kelurahan Tegalega dan Gudang. Frekuensi alel cs di Kelurahan Gudang lebih tinggi dari pada di Kelurahan Tegalega. Keragaman kedua lokus tersebut juga sangat kecil, dengan nilai heterozigositas (h) lokus w-W sebesar 0.7% dan 9.7% untuk lokus C~cs~ca~c. Lokus o~O Nilai frekuensi alel oranye (O) pada kromosom seks paling tinggi terdapat di Kelurahan Panaragan, sedangkan frekuensi alel O terendah berada pada Kelurahan Babakan. Secara keseluruhan frekuensi alel di Kecamatan Bogor Tengah memiliki nilai sekitar 31.6%. Keragaman alel ini di setiap kelurahan relatif tinggi. Hal ini dapat dilihat dari nilai heterozigositas (h) seluruh kelurahan yang bernilai 43.2%. Lokus A~a Frekuensi alel A relatif sama dengan alel a, sehingga penyebaran warna berpola dengan warna polos di tiap kelurahan hampir sama. Namun, pada Kelurahan Cibogor dan Pabaton frekuensi kedua alel tersebut relatif rendah.
Kebon Kalapa 25 1 26 0.981±0.019 0.019±0.019 0.039±0.001 9 17 26 0.588±0.079 0.412±0.079 0.494±0.001 26 26 1 0 4 22 26 0.154±0.071 0.846±0.071 0.265±0.005
Babakan Pasar 46 46 1 0 5 45 50 0.316±0.067 0.684±0.067 0.437±0.001 50 2 52 0.804±0.068 0.196±0.068 0.318±0.002 17 35 52 0.327±0.065 0.673±0.065 0.444±0.001
Gudang 52 1 53 0.991±0.009 0.009±0.009 0.019±0.000 15 38 53 0.532±0.058 0.468±0.058 0.503±0.000 53 53 1 0 31 22 53 0.585±0.068 0.415±0.068 0.490±0.000
Hal yang berbeda ditunjukkan dari keragaman karakter ini dari setiap kelurahan. Keragaman tertinggi terdapat pada Kelurahan Ciwaringin, dengan nilai heterozigositas (h) sebesar 51.1%, dan secara keseluruhan nilai heterozigositas (h) dari karakter ini di Kecamatan Bogor Tengah bernilai 49.9%. Keragaman dari rambut berpola dan polos di Kecamatan Bogor Tengah cukup tinggi. Lokus Ta~T~tb Pola abyssinian dari alel Ta memiliki nilai frekuensi yang jauh lebih rendah dari pada alel mackerel (T). Bahkan pada Kelurahan Babakan sama sekali tidak teramati pola abyssinian. Pola classic (tb) merupakan alel resesif, dengan nilai frekuensi yang relatif sama terhadap alel Ta pada beberapa kelurahan, tetapi pola classic sangat jarang dijumpai di setiap lokasi. Pola tabby di Kelurahan Sempur sangat beragam, dengan nilai heterozigositas (h) sebesar 61.1%. Keragaman pola tabby di Kelurahan Panaragan sangat rendah, dengan nilai heterozigositas sebesar 12.3%, sehingga jarang sekali ditemukan pola tabby lain selain tabby garis (mackerel) pada kelurahan ini. Lokus B~b dan Lokus D~d Frekuensi alel b relatif lebih kecil terhadap alel B, namun pada Kelurahan Cibogor memiliki nilai yang relatif sama. Hal yang sama ditunjukan pada alel dilute (d), yang memiliki nilai frekuensi alel lebih kecil dibandingkan dengan alel Dense (D).
6
Keragaman kedua karakter ini di Kecamatan Bogor Tengah tergolong tinggi, yaitu 31.7% untuk alel B~b dan 27.7% untuk alel D~d. Lokus i~I dan Lokus L~l Gen inhibitor (I) yang menghasilkan warna perak – silver – pada pola warna rambut, sangat jarang ditemukan di Kecamatan Bogor Tengah. Nilai frekuensi alel tersebut sangat rendah, bahkan pada beberapa kelurahan sama sekali tidak ditemukan kucing dengan warna rambut perak. Frekuensi alel I yang relatif tinggi terdapat pada Kelurahan Pabaton, bernilai 2.1%. Hal yang sama ditunjukan oleh karakter rambut panjang (alel l) dengan frekuensi tertinggi pada Kelurahan Pabaton dengan nilai 20.4%. Keragaman karakter panjang rambut relatif beragam dengan nilai 11.2% di setiap kelurahan, sedangkan warna rambut perak hampir tidak beragam yang bernilai 1.8%. Genotipe pada salah satu kucing yang diperoleh di Kecamatan Bogor Tengah ditampilkan pada Gambar 1.
41.5%. Nilai heterozigositas (h) karakter ini juga cukup tinggi dari setiap kelurahan, hanya pada Kelurahan Kebon Kalapa yang terendah, yaitu bernilai 26.5%. Kucing dengan ekor normal pada pola Tabby dapat dilihat dari adanya warna hitam yang panjang pada ujung ekor, sedangkan pada individu ekor pendek warna hitam tersebut tidak panjang atau hilang sama sekali. Perbedaan ini diperlihatkan pada Gambar 2 dan 3.
Gambar 2 Brown abyssinian kinky tail dengan genotipe A- B- C- D- ii Ta- Mm.
Gambar 1 Silver striped tabby longhair dengan genotipe A- B- C- D- I- Tll. Lokus s~S Gen Piebald (S) memberikan karakter corak putih (white spotting) pada rambut kucing. Frekuensi alel S tertinggi ditemukan pada Kelurahan Babakan Pasar dengan nilai 68.4%. Kelurahan lainnya memiliki nilai frekuensi alel yang relatif tinggi. Nilai heterozigositas (h) dari setiap kelurahan jika dirata-ratakan memberikan hasil 49.2%. Dengan nilai tersebut, karakter ini mempunyai keragaman yang tinggi di Kecamatan Bogor Tengah. Karakter Ekor Pendek Jumlah individu dengan ekor pendek yang teramati sangat banyak. Frekuensi ekor pendek memiliki nilai yang tinggi, hampir seluruh kelurahan bernilai lebih dari 50%, hanya pada Kelurahan Gudang yang bernilai
Gambar 3 Brown striped tabby and white dengan genotipe A- B- C- D- ii T- S-. Nilai Heterozigositas (h) dan Heterozigositas Rataan (Ĥ) Nilai heterozigositas (h) memberikan informasi mengenai keragaman dari tiap lokus pada suatu populasi. Nilai h dari setiap lokus pada masing-masing kelurahan di Kecamatan Bogor Tengah diperlihatkan pada Tabel 2. Nilai heterozigositas rataan (Ĥ) memberikan informasi mengenai keragaman kucing di Kecamatan Bogor Tengah, yang tercantum pada Tabel 3. Nilai heterozigositas rataan (Ĥ) dari 11 lokus di Kecamatan Bogor Tengah sebesar 28.2%.
7
Tabel 3 Nilai heterozigositas rataan (Ĥ) di Kecamatan Bogor Tengah Kelurahan
Ĥ (11 lokus)
Ĥ Ĥ (9 lokus)* (9 lokus)**
Tegalega
0.332
0.335
0.360
Sempur
0.305
0.324
0.320
Babakan
0.277
0.289
0.289
Ciwaringin
0.266
0.289
0.325
Cibogor
0.266
0.270
0.270
Pabaton
0.322
0.306
0.338
Paledang
0.255
0.278
0.275
Panaragan
0.249
0.305
0.305
Kebon Kalapa
0.224
0.235
0.231
Babakan Pasar
0.332
0.338
0.374
Gudang
0.270
0.292
0.290
Rata-rata
0.282
0.297
0.307
* tanpa lokus B~b dan L~l sebagai pembanding terhadap populasi di Indonesia (Lampiran 3) ** tanpa lokus B~b dan i~I sebagai pembanding terhadap populasi di Asia (Lampiran 4)
PEMBAHASAN Lokus w~W dan Lokus C~cs~ca~c Keberadaan warna dan pola warna yang diekspresikan oleh kedua lokus tersebut – menurut penelitian Nozawa et.al. (1983) – disebabkan terjadinya perkawinan antara kucing lokal (kucing yang terdapat pada lokasi pengambilan sampel) dengan kucing non-lokal (kontes). Rendahnya keragaman kedua lokus ini dipengaruhi oleh dominasi alel tipe liar (alel w dan alel C) di daerah pemukiman, dan hanya terdapat beberapa kucing lokal maupun non-lokal dengan alel mutant (alel W, cs, ca, dan c). Lokus o~O Kucing dengan warna rambut oranye (alel O) di Kecamatan Bogor Tengah memiliki frekuensi alel O sebesar 31.6%. Sedangkan hasil penelitian Nozawa et al. (1983), di Kabupaten Bogor memiliki nilai frekuensi alel O sebesar 23% dari 182 sampel. Hal ini dimungkinkan karena dalam 23 tahun terakhir populasi kucing yang membawa alel O lebih banyak atau jumlah sampel yang diperoleh pada saat itu relatif kecil. Menurut Todd (1977), di kota-kota Eropa bagian Barat frekuensi alel O bernilai 15% atau kurang, sedangkan di Turki dan Mesir bernilai lebih dari 25%. Nilai frekuensi alel O di Mesir berkisar dari 21% sampai 31% (Kawamoto et al. 2002).
Lokus A~a dan Lokus s~S Rambut berpola – agouti – disandikan oleh gen agouti (A) dan gen tabby (T). Daerah putih (white spotting) yang dihasilkan oleh gen Piebald (S) sangat banyak ditemukan. Frekuensi alel dari lokus A~a dan s~S memiliki nilai yang mendekati 50%, yaitu 46% untuk alel A dan 48.2% untuk alel S. Nilai tersebut menunjukkan bahwa kucingkucing yang membawa alel A dan alel S memiliki persebaran yang merata. Menurut Nozawa et al. (1983), frekuensi alel A di Indonesia lebih tinggi dari pada di negara Amerika, Eropa, dan Jepang; begitu pula nilai frekuensi alel S yang tinggi pada populasi kucing di seluruh dunia. Lokus Ta~T~tb Alel Ta merupakan alel dominan pada lokus Ta~T~tb. Sedikitnya variasi pola warna tabby disebabkan oleh dominasi alel tipe liar (alel T) di Kecamatan Bogor Tengah yang tersebar luas pada setiap kelurahan. Alel T memiliki nilai frekuensi yang paling tinggi, yaitu 73.6%, ini disebabkan alel tersebut merupakan tipe liar dari lokus Ta~T~tb dan menunjukkan kucing dengan pola tabby garis mempunyai persebaran yang sangat luas. Kucing dengan pola abyssinian (alel Ta) dan pola tabby classic (alel tb) memiliki persebaran yang sempit, dengan nilai frekuensi masing-masing sebesar 13.9% dan 12.5%. Nilai frekuensi alel Ta tersebut tergolong tinggi, seperti halnya frekuensi dari alel yang sama di Filipina, berkisar antara 3% sampai 15% (Nozawa et al. 2003). Berdasarkan laporan Nozawa et al. (1983), pola abyssinian dan classic di Indonesia berbanding terbalik dengan pola yang sama pada negara-negara Eropa dan Amerika. Di Indonesia terdapat pola abyssinian dengan frekuensi yang relatif tinggi dan pola classic yang rendah, sedangkan di negara-negara Eropa dan Amerika pola abyssinian memiliki frekuensi yang rendah, namun frekuensi pola classic jauh lebih tinggi. Menurut hasil penelitian yang ada, awal penyebaran alel Ta berasal dari negara Asia bagian Selatan, kemungkinan besar berasal dari Bengal (India) yang memiliki nilai frekuensi alel Ta sebesar 72% (Kawamoto et al. 2002). Begitu pula menurut Nozawa et al. (2003), nilai frekuensi alel Ta di Myanmar sebesar 48%, yang diduga karena masuknya alel Ta dari Bengal akibat migrasi.
8
Lokus B~b dan Lokus D~d Frekuensi alel b dan d di Kecamatan Bogor Tengah masing-masing bernilai 22.2% dan 18.7%. Berdasarkan hasil penelitian Nozawa et al. (2000), di Jepang sama sekali tidak terdapat alel b. Nilai frekuensi alel d di Kecamatan Bogor Tengah relatif lebih besar dari pada di Filipina (Nozawa et al. 2003) dan Myanmar (Nozawa et al. 2003) yang masingmasing bernilai 3.97% dan 14.85%. Menurut Kawamoto (1998), Malaysia memiliki nilai frekuensi alel d yang lebih tinggi dari pada Indonesia (Nozawa et al. 1983), yaitu 16.8% berbanding 8.86% (pada saat itu di Kabupaten Bogor sama sekali tidak ditemukan alel d). Kecamatan Bogor Tengah memiliki nilai frekuensi alel d sebesar 18.7%. Dari nilai tersebut dapat diketahui dalam kurun waktu 23 tahun terjadi invasi alel d di Bogor, khususnya Kecamatan Bogor Tengah. Kejadian ini dapat diduga karena adanya migrasi alel d dari kucing-kucing non-lokal (kontes) yang dibawa oleh manusia. Kemudian terjadi perkawinan antara kucingkucing tersebut dengan kucing-kucing lokal dalam 23 tahun terakhir. Lokus i~I dan Lokus L~l Warna rambut perak (alel I) dan karakter rambut panjang (alel l) merupakan karakter mutan. Adanya kedua karakter ini di Kecamatan Bogor Tengah besar kemungkinan disebabkan terjadinya perkawinan antara kucing lokal dengan non-lokal (kontes). Oleh karena itu dapat diasumsikan bahwa pada beberapa kelurahan terdapat kucing non-lokal yang dipelihara. Karakter Ekor Pendek Nilai frekuensi ekor pendek di Kecamatan Bogor Tengah sebesar 62.3%. Hal ini bersesuaian dengan hasil penelitian Nozawa et al. (1983), yang menyatakan ekor pendek merupakan karakter khusus pada kucingkucing di Asia. Nilai frekuensi ekor pendek di Kecamatan Bogor Tengah sangat tinggi, berdasarkan hasil penelitian Nozawa et al. (1983) di Indonesia yang menunjukkan nilai frekuensi ekor pendek berkisar dari 47% hingga 86%. Banyaknya kucing berekor pendek di Kecamatan Bogor Tengah dipengaruhi faktor persebaran yang luas dari kucing-kucing tersebut. Nilai frekuensi karakter ekor pendek yang tinggi juga terjadi di Thailand, berkisar dari 22% sampai 68% (Kawamoto & Nozawa
2000). Sedangkan di Jepang nilai frekuensi karakter ini hanya bernilai 32% (Nozawa et al. 2000). Okinawa dan Taiwan memiliki nilai frekuensi karakter ekor pendek yang jauh lebih kecil, dengan nilai masing-masing sebesar 17% (Nozawa et al. 2000) dan 7%13% (Nozawa et al. 2001). Dari nilai tersebut dapat diasumsikan bahwa frekuensi karakter ekor pendek mengalami penurunan nilai jika secara geografis diamati dari Selatan menuju Utara, yaitu dari Indonesia menuju Taiwan dan Okinawa, namun terjadi kenaikan nilai dari Okinawa menuju Jepang (Nozawa et al. 2003). Nilai Heterozigositas (h) dan Heterozigositas Rataan (Ĥ) Nilai heterozigositas (h) lokus w~W, A~a, s~S, dan karakter ekor pendek di Kecamatan Bogor Tengah relatif tidak berubah terhadap Kabupaten Bogor dalam kurun waktu 23 tahun (Lampiran 2 dan 3). Hal ini dapat disebabkan luasnya penyebaran kucing-kucing yang membawa gen tersebut dan dominasi dari alel tipe liar (alel w) pada lokus w~W. Lokus o~O dan D~d mengalami peningkatan nilai h yang diakibatkan dari luasnya penyebaran dari kucing yang membawa alel O. Munculnya alel d disebabkan adanya invasi dari kucing-kucing non-lokal (kontes) dalam kurun waktu 23 tahun terakhir. Sedangkan penurunan nilai h pada lokus C~cs~ca~c, Ta~T~tb, dan i~I disebabkan besarnya dominasi dari alel-alel tipe liar. Semua lokus dan karakter ekor pendek pada populasi kucing di Kecamatan Bogor Tengah memiliki nilai h yang relatif lebih besar terhadap populasi kucing di Indonesia (Lampiran 3). Kecamatan Bogor Tengah juga menunjukkan nilai h yang relatif tinggi dari pada populasi kucing di Asia (Lampiran 4). Hal yang paling mungkin ialah karena luasnya penyebaran kucing-kucing di Kecamatan Bogor Tengah. Namun jumlah sampel yang diperoleh juga sangat berpengaruh terhadap nilai h. Menurut Nei (1987), nilai heterozigositas rataan sangat dipengaruhi oleh adanya kawin acak dalam populasi. Nilai heterozigositas rataan (Ĥ) Kecamatan Bogor Tengah sebesar 28.2% pada 11 lokus yang dianalisis. Dibandingkan dengan nilai Ĥ di Indonesia, sebesar 27.6% (Lampiran 3), dan terhadap negara-negara di Asia yang bernilai 25.7% (Lampiran 4), Kecamatan Bogor Tengah memiliki nilai yang relatif tinggi (Tabel 3). Hal ini disebabkan oleh luasnya penyebaran kucing-kucing di Kecamatan Bogor Tengah.
9
Selain itu perkembangan kebudayaan masyarakat di pemukiman Kecamatan Bogor Tengah untuk lebih memelihara kucing nonlokal (kontes), yang umumnya memiliki karakter-karakter mutan hasil dari perkawinan ekstensif oleh para breeder juga sangat berpengaruh. Oleh karena itu dapat diketahui pada beberapa kelurahan di Kecamatan Bogor Tengah terdapat kucing-kucing non-lokal yang dipelihara dan terjadi kawin acak.
SIMPULAN Variasi warna dan pola warna rambut berikut karakter morfologi lain pada kucing di Kecamatan Bogor Tengah lebih didominasi oleh gen-gen tipe liar. Hasil yang berbeda ditunjukan pada alel A terhadap alel a dan alel s terhadap alel S, yang memiliki nilai frekuensi relatif sama. Karakter ekor pendek di Kecamatan Bogor Tengah memiliki frekuensi tinggi, yaitu sebesar 62.3%. Kecamatan Bogor Tengah memiliki nilai heterozigositas rataan (Ĥ) yang relatif tinggi, yaitu sebesar 28.2%. Hal ini disebabkan banyaknya masyarakat Kecamatan Bogor Tengah yang memelihara kucing non-lokal (kontes), sehingga terjadi perkawinan acak antara kucing lokal (kucing di Kecamatan Bogor Tengah) dengan kucing non-lokal. Keberadaan kucing non-lokal dapat dilihat dari ditemukannya karakter-karakter mutan pada kucing di Kecamatan Bogor Tengah.
SARAN Penelitian mengenai keragaman kucing di Indonesia masih sangat terbatas, oleh karena itu perlu dilakukan penelusuran yang lebih luas, agar didapatkan perbandingan data di seluruh Indonesia.
DAFTAR PUSTAKA Cutts P. 2002. Cats Pocket Reference Book. Bath: Parragon. Ewer RF. 1973. The Carnivores. New York: Cornell University Pr. Feldhamer GA, Lee CD, Stephen HV, Joseph FM. 2003. Mammalogy: Adaptation, Diversity,and Ecology. New York: McGraw-Hill Companies. Hinde RA. 1996. Animal Behaviour. 2nd Ed. New York: The McGraw-Hill Companies. Kawamoto Y, Nozawa K. 1998. Coat-Color and Other Morphogenetic Variations of
The Cats in Malaysia. Rep. Soc. Res. Native Livestock 16: 161-172. Kawamoto Y, Nozawa K, Wangchuk T, Sherub. 2002. Coat-Color Variations of The Cats in Bhutan. Rep. Soc. Res. Native Livestock 20: 55-64. Kent GC, Robert KC. 2001. Comparative Anatomy of The Vertebrates. New York: The McGraw Companies. Nei M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. New York: Columbia University Pr. Nozawa K, Kawamoto Y, Kondo K, Namikawa T. 1983. Coat-Color Polymorphisms of The Cats in Indonesia. Rep. Soc. Res. Native Livestock 10:226-235. Nozawa K, Maeda Y, Hasegawa Y, Kawamoto Y. 2000. Genetic Polymorphisms in Coat-Color and Other Morphological Traits of The Japanese Feral Cats – Report of The 3rd Compilation of Data. Rep. Soc. Res. Native Livestock 18: 225-268. Nozawa K, Masangkay JS, Namikawa T, Kawamoto Y, Tanaka H. 2003. Morphogenetic Traits and Gene Frequencies of The Feral Cats in The Philppines. Rep. Soc. Res. Native Livestock 21: 275-295. Nozawa K et al. 2003. Coat-Color and Other Morphogenetic Polymorphisms in The Cats of Myanmar. Rep. Soc. Res. Native Livestock 21: 245-256. Pugnetti G. 1983. Simon & Schuster’s Guide to Cats. New York: Simon & Schuster, Inc. Ratti JT, Garton EO. 1996. Research and Experimental Design. Di dalam: Bookhout TA, editor. Research and Management Techniques for Wildlife and Habitats. Maryland: The Wildlife Society, Inc. hlm. 1-23. Robinson R. 1977. Genetics for Cat Breeders. 2nd Ed. London: Pergamon Press. Starbuck O, David T. 1994. Cat Color Genetics. http://www.cfainc.org. html [23 Agustus 2005]. Todd NB. 1977. Cats and Commerce. Scientific American 227:100-107. Verhoef-Verhallen EJJ. 1996. The Complete Encyclopedia of Cats. Lisse: Rebo International. Wright M, Walters S. 1980. The Book of The Cat. London: Pan Book Ltd.
LAMPIRAN
11
Lampiran 1 Peta administratif Kecamatan Bogor Tengah (BAKOSURTANAL 1996)
Keterangan: Batas administratif Kecamatan Bogor Tengah ditandai dengan garis putih. Kecamatan Bogor Tengah memiliki sebelas kelurahan, yaitu Kelurahan Paledang, Kelurahan Tegalega, Kelurahann Babakan, Kelurahan Sempur, Kelurahan Pabaton, Kelurahan Cibogor, Kelurahan Ciwaringin, Kelurahan Kebon Kalapa, Kelurahan Panaragan, Kelurahan Gudang, dan Kelurahan Babakan Pasar.
12
Lampiran 2 Nilai frekuensi alel (q) dan heterozigositas (h) dari setiap lokus pada populasi kucing di Kecamatan Bogor Tengah Lokus w~W n = 514 o~O n = 514 A~a n = 401 B~b n = 401 C~cs~ca~c n = 514 D~d n = 510 Ta~T~tb n = 366
Alel
Frekuensi alel (q)
w W
0.997±0.003 0.003±0.003
L~l n = 514 Ekor pendek* n = 514
0.007±0.0001
o O
0.684±0.063 0.316±0.063
0.432±0.002
A a
0.460±0.075 0.540±0.075
0.499±0.001
B b
0.778±0.087 0.222±0.087
0.317±0.002
C cs ca c
0.943±0.079 0.016±0.015 0.026±0.010 0.015±0.007
0.097±0.001
D d
0.814±0.078 0.186±0.078
0.277±0.002
Ta T tb
0.139±0.046 0.736±0.086 0.125±0.043
0.394±0.004
i I
0.991±0.008 0.009±0.008
0.018±0.000
s S
0.518±0.068 0.482±0.068
0.492±0.000
L l
0.932±0.079 0.068±0.079
0.112±0.001
+ -
0.623±0.075 0.377±0.075
0.453±0.001
i~I n = 506 s~S n = 510
Heterozigositas (h)
* (-) ekor normal, (+) ekor pendek
Lampiran 3 Nilai heterozigositas (h) dan heterozigositas rataan (Ĥ) hasil analisis ulang dari 8 lokus karakter rambut dan karakter ekor pendek pada populasi kucing di 11 provinsi di Indonesia dan di Kabupaten Bogor (cetak tebal) (Nozawa et al. 1983) Propinsi & kabupaten
h
n w~W
o~O
A~a
C~cs
Ta~T~tb
D~d
s~S
i~I
Q+/-
Ĥ
Sumatera Utara
270
0.004
0.385
0.500
0.000
0.189
0.158
0.498
0.012
0.437
0.242
Sumatera Barat
594
0.007
0.415
0.500
0.089
0.509
0.237
0.480
0.006
0.490
0.303
Lampung
59
0.380
0.428
0.388
0.000
0.310
0.000
0.499
0.000
0.238
0.249
Jawa Barat
348
0.009
0.400
0.496
0.113
0.486
0.102
0.499
0.046
0.501
0.295
Kab. Bogor
182
0.006
0.362
0.496
0.151
0.530
0.000
0.496
0.058
0.490
0.288
Jakarta
1239
0.007
0.430
0.499
0.000
0.383
0.241
0.495
0.007
0.499
0.285
Jawa Tengah
90
0.458
0.427
0.501
0.000
0.239
0.000
0.502
0.000
0.450
0.286
Jawa Timur
223
0.000
0.466
0.463
0.148
0.439
0.255
0.488
0.000
0.452
0.301
Bali
225
0.450
0.493
0.501
0.000
0.384
0.309
0.467
0.000
0.500
0.345
Lombok
140
0.000
0.501
0.502
0.000
0.038
0.000
0.478
0.000
0.300
0.202
Sumbawa
221
0.501
0.494
0.435
0.000
0.097
0.206
0.496
0.000
0.262
0.277
Sulawesi Selatan
109
0.009
0.460
0.480
0.000
0.100
0.182
0.502
0.023
0.415
0.241
Total/Rata-rata
3700
0.152
0.438
0.480
0.042
0.309
0.141
0.492
0.013
0.419
0.276
13
Lampiran 4 Nilai heterozigositas (h) dan heterozigositas rataan (Ĥ) hasil analisis ulang dari 8 lokus karakter rambut dan karakter ekor pendek pada populasi kucing di beberapa negara di Asia (Kawamoto et al. 2002) Negara Bhutan Pakistan (Rawalpindi) Bangladesh (Dhaka) Malaysia (Penang) Thailand (Central)
h
n
Ĥ
w~W
o~O
A~a
C~cs~cb
Ta~T~tb
D~d
s~S
L~l
Q+/-
41
0.000
0.232
0.494
0.000
0.476
0.000
0.271
0.000
0.000
0.164
206
0.030
0.366
0.469
0.000
0.309
0.000
0.501
0.000
0.000
0.186
112
0.008
0.374
0.480
0.000
0.391
0.000
0.487
0.171
0.022
0.215
226
0.014
0.413
0.491
0.000
0.458
0.307
0.485
0.000
0.408
0.286
902
0.204
0.429
0.346
0.469
0.134
0.340
0.483
0.000
0.492
0.322
Laos (Vientiane)
215
0.010
0.436
0.292
0.297
0.016
0.280
0.429
0.000
0.457
0.246
Vietnam (South)
81
0.012
0.477
0.482
0.389
0.429
0.000
0.348
0.000
0.469
0.290
Taiwan (Taipei)
99
0.051
0.452
0.475
0.276
0.320
0.186
0.488
0.246
0.233
0.303
China (Kumming)
259
0.053
0.418
0.421
0.273
0.160
0.388
0.474
0.450
0.012
0.294
Mesir (Kairo)
242
0.008
0.431
0.388
0.000
0.447
0.429
0.474
0.247
0.000
0.269
Total/Rata-rata
2383
0.039
0.403
0.434
0.170
0.314
0.193
0.444
0.111
0.209
0.257
Lampiran 5 Foto-foto kucing yang jarang dijumpai di Kecamatan Bogor Tengah
Foto 1 Chocolate classic tabby kinky (genotipe A- bb C- D- ii tbtb Mm)
Foto 2 Solid cream (genotipe C- dd ii O ss)
Foto 3 Solid blue (genotipe aa B- C- dd ii ss)
Foto 5 Solid white (albino), odd eye (genotipe cac)
Foto 4 Blue tabby (lynx) point (genotipe A- B- cscs dd)
