ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI KITINOLITIK YANG TERDAPAT PADA CANGKANG LOBSTER AIR TAWAR (Cherax quadricarinatus) PROGRAM STUDI BUDIDAYA PERAIRAN

ADLN Perpustakaan Universitas Airlangga

SKRIPSI

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI KITINOLITIK YANG TERDAPAT PADA CANGKANG LOBSTER AIR TAWAR (Cherax quadricarinatus)

PROGRAM STUDI BUDIDAYA PERAIRAN

Oleh : RATIH KUSUMI KEDIRI- JAWA T

Oleh : ISTIKHARA MENTARI TITO SIDOARJO – JAWA TIMUR

FAKULTAS PERIKANAN DAN KELAUTAN UNIVERSITAS AIRLANGGA SURABAYA 2014

Skripsi

ISTIKHARA MENTARI TITO ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI KITINOLITIK YANG TERDAPAT PADA CANGKANG LOBSTER AIR TAWAR (Cherax quadricarinatus)


SKRIPSI

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI KITINOLITIK YANG TERDAPAT PADA CANGKANG LOBSTER AIR TAWAR (Cherax quadricarinatus)

Skripsi Salah Satu Syarat untuk Memperoleh Gelar Sarjana Perikanan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga

Oleh : ISTIKHARA MENTARI TITO NIM. 141011062

Menyetujui, Komisi Pembimbing

Skripsi

Pembimbing Utama

Pembimbing Serta

Prof. Dr. Hari Suprapto, Ir., M.Agr. NIP. 19580916 198502 1 001

Sudarno, Ir., M.Kes. NIP. 19550713 198601 1 001



SKRIPSI

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI KITINOLITIK YANG TERDAPAT PADA CANGKANG LOBSTER AIR TAWAR (Cherax quadricarinatus) Oleh : ISTIKHARA MENTARI TITO NIM. 141011062 Telah diujikan pada Tanggal

: 28 April 2014

KOMISI PENGUJI SKRIPSI Ketua

: Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Si.

Anggota

: Dr. Endang Dwi Masithah, Ir., MP. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si. Prof. Dr. Hari Suprapto, Ir., M.Agr Sudarno, Ir., M.Kes.

Surabaya, Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Dekan,

Prof. Dr. Hj. Sri Subekti,drh.DEA NIP. 19520517 197803 2 001

Skripsi



RINGKASAN ISTIKHARA MENTARI TITO. Isolasi dan Identifikasi Bakteri Kitinolitik yang terdapat pada Cangkang Lobster Air Tawar (Cherax quadricarinatus). Dosen pembimbing Prof. Dr. Hari Suprapto, Ir., M.Agr dan Sudarno, Ir., M.Kes. Perikanan air tawar memiliki beragam jenis komoditas unggulan yang tersebar di seluruh Indonesia salah satunya adalah lobster air tawar dikenal di Indonesia pada tahun 1990 sebagai ikan hias, memasuki tahun 2000, bisnis lobster air tawar mulai popular karena telah ditemukan teknik budidayanya. Selain kandungan yang baik bagi kesehatan, lobster air tawar juga memiliki kandungan kitin pada cangkangnya. Kitin dapat dimanfaatkan dalam berbagai aplikasi diantaranya dapat digunakan dalam bidang farmasi, biokimia, bahan campuran kosmetik dan lain sebagainya. Keberadaan kitin yang melimpah dengan cepat terdegradasi, karena adanya beberapa bakteri dan fungi yang mempunyai enzim kitinase yang mampu mendegradasi kitin. Bakteri kitinolitik merupakan kelompok bakteri yang mampu menghasilkan enzim kitinase untuk menguraikan zat kitin. Aktivitas kitinase secara kualitatif dapat diuji dengan penentuan zona bening disekitar pertumbuhan koloni pada media agar yang mengandung kitin. Rancangan yang digunakan dalam penelitian ini adalah secara deskriptif.

Berdasarkan penelitian yang dilakukan, diperoleh bahwa bakteri yang diisolasi dari cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) dapat tumbuh dan berkembang pada media uji yang berupa media kitin. Bakteri kitinolitik yang terdapat pada cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) adalah Bacillus sp., Pseudomonas sp. dan Aeromonas sp. Kesimpulan dari hasil penelitian didapatkan bakteri kitinolitik Aeromonas sp., Bacillus sp dan Pseudomonas sp. pada cangkang Lobster Air Tawar ( Cherax quadricarinatus ). Bakteri tersebut mampu untuk mendegradasi kitin yang ditandai dengan adanya zona bening di sekitar bakteri.

Skripsi



SUMARRY ISTIKHARA MENTARI TITO. Isolation and Identification of Chitinolytic Bacteria found on the Shells of Crayfish (Cherax quadricarinatus). Advisor Prof. Dr. Hari Suprapto, Ir., M.Agr and Sudarno, Ir., M.Kes. Freshwater fisheries have various types of leading commodity spread throughout Indonesia one of which is a freshwater crayfish known in Indonesia in 1990 as an ornamental fish, into 2000, business crayfish gaining popularity because it has found its cultivation techniques. In addition the content is good for health, freshwater lobster also contain chitin in their shells. Chitin can be utilized in a variety of applications which can be used in the fields of pharmaceutical, biochemical, cosmetic ingredient and so forth. The presence of abundant chitin rapidly degraded, due to the presence of some bacteria and fungi that have chitinase enzyme capable of degrading chitin. Chitinolytic bacteria are a group of bacteria that can produce chitinolytic enzymes to decompose chitin substances. Qualitatively chitinase activity can be tested by determining clear zone around the colony growth on agar medium containing chitin. The design used in this study is descriptive. Based on the research conducted, it was found that bacteria isolated from the shells of freshwater crayfish (Cherax quadricarinatus) can grow and develop in the test medium in the form of chitin media. Chitinolytic bacteria found on the shells of freshwater crayfish (Cherax quadricarinatus) is a Bacillus sp., Pseudomonas sp. and Aeromonas sp. The conclusion from the results, the chitinolytic bacterium Aeromonas sp., Bacillus sp and Pseudomonas sp. the shell Freshwater Lobster (Cherax quadricarinatus). Bacteria are able to degrade chitin is characterized by the presence of a clear zone around the bacteria.

Skripsi



KATA PENGANTAR

Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa atas limpahan rahmatNya, sehingga skripsi yang berjudul Isolasi dan Identifikasi Bakteri yang terdapat pada Cangkang Lobster Air Tawar (Cherax quadricarinatus) dapat terselesaikan. Laporan ini disusun berdasarkan hasil penelitian yang telah dilaksanakan di Balai Karantina Ikan Juanda, Sidoarjo pada bulan Mei hingga Juni 2014. Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih belum sempurna, sehingga diharapkan kritik dan saran yang membangun demi perbaikan dan kesempurnaan. Semoga skripsi ini bermanfaat dan memberikan informasi yang berguna bagi semua pihak. Penulis menyadari bahwa dalam penyusunan skripsi ini banyak melibatkan orang - orang yang sangat berarti, oleh karena itu pada kesempatan ini disampaikan ucapan terima kasih kepada : 1. Bapak Prof. Dr. Hari Suprapto, Ir., M.Agr selaku Dosen Pembimbing pertama yang telah memberikan bimbingannya sejak penyusunan usulan hingga penyelesaian skripsi. 2. Bapak Sudarno, Ir., M.Kes selaku Dosen Pembimbing kedua yang telah memberikan bimbingannya. 3. Ibu Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Si, Ibu Endang Dwi Masithah, Ir., MP dan Ibu Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si., selaku dosen penguji yang telah memberikan banyak saran dan masukan terhadap perbaikan skripsi ini. 4. Seluruh staf pengajar dan staf kependidikan Fakultas Perikanan dan Kelautan. 5. Terima kasih teman satu tim penelitian Oktantya Frenny A. yang selalu memberikan semangat dalam menyelesaikan skripsi ini 6. Terima kasih untuk motivasi khusus dari sahabat saya Amel, Devi, Sari, Mega, Fifit, Sari, Maya, Catur, Dhanik, Shinta dan Sha-sha, Sofy, dan Rahma. 7. Terima kassih kepada seluruh teman-teman budidaya perairan angkatan 2010 yang senantiasa memberikan semangat.

Skripsi



8. Terima kasih untuk Ariansyah Fitrawan atas motivasi dan semangat serta senantiasa menemani hingga skripsi ini terselesaikan. 9. Terima kasih kepada Ibu Laminem dan Ibu Ria para pendamping selama melakukan penelitian di Balai Karantina Ikan Juanda. 10. Terima kasih untuk seluruh saudara dan keluarga besar atas doa dan semangatnya. 11. Orang tua dan adik saya Titanty Sekardini yang selalu memberikan doa dan motivasi hingga selesainya skripsi.

Surabaya, Juli 2014

Penulis

Skripsi



DAFTAR ISI

Halaman Ringkasan .......................................................................................................... iv Sumarry ............................................................................................................. v Kata Pengantar .................................................................................................. vi Daftar Isi ........................................................................................................... vii Daftar Gambar .................................................................................................. x Daftar Tabel........ .............................................................................................. xi Pendahuluan.............................................................................................. 1

I.

1.1 Latar Belakang .................................................................................. 1 1.2 Rumusan Masalah ............................................................................. 4 1.3 Tujuan ............................................................................................... 4 1.4 Manfaat ............................................................................................. 4 II.

Tinjauan Pustaka ....................................................................................... 5 2.1 Lobster Air Tawar ............................................................................. 5 2.1.1 Klasifikasi. ..............................................................................

5

2.1.2 Morfologi................................................................................

5

2.2 Kitin .................................................................................................. 6 2.3 Sumber Kitin.. ................................................................................... 8 2.4 Penentuan Aktivitas Enzim Kitinase………………………………..

8

2.5 Bakteri Kitinolitik…………………………………………………... 9 2.6 Isolasi dan Identifikasi Bakteri..........................................................

11

III. Kerangka Konseptual dan Hipotesis.... ..................................................... 14 3.1 Kerangka Konseptual ........................................................................ 15 IV. Metodologi Penelitian ................................................................................. 16 4.1 Tempat dan Waktu ...........................................................................

16

4.2 Materi Penelitian ............................................................................... 16

Skripsi

4.3 Metodologi Penelitia.... ......................................................................

16

4.3.1 Rancangan Penelitian……………………………………………..

16

4.3.2 Prosedur Kerja…………………………………………………….

17



4.3.3 Analisis Data.... ...............................................................................

24

V. Hasil dan Pembahasan .................................................................................

25

VI.

Kesimpulan dan saran ..............................................................................

34

5.1 Kesimpulan .......................................................................................

34

5.2 Saran .................................................................................................

34

Daftar Pustaka ...................................................................................................

35

Skripsi



DAFTAR GAMBAR

Gambar

Halaman

1. Lobster Air tawar (Cherax quadricarinatus) ................................ 2. Struktur Kitin ................................................................................ 3. Kerangka Konseptual .................................................................... 4. Koloidal Kitin …………………………………………………… 5. Hasil Uji Hidrolisis Kitin .............................................................. 6. Bacillus sp. ....... ............................................................................ 7. Pseudomonas sp. .... ....................................................................... 8. Aeromonas sp. .............. .................................................................

Skripsi

6 7 16 19 28 29 30 30



DAFTAR TABEL

TABEL

HALAMAN

1. Hasil Karakteristik Bakteri..... ...............................................

Skripsi

26



I PENDAHULUAN 1.1

Latar Belakang

Indonesia memiliki kekayaan jenis ikan yang sangat tinggi. Dilihat dari jumlah jenis ikan air tawar, Indonesia menempati rangking ke dua di dunia setelah Brazil dan merupakan peringkat pertama di Asia. Jumlah ikan air tawar pada saat ini menunjukkan bahwa pengetahuan mengenai kekayaan sumber daya ikan ini masih relatif sangat kecil, tidak saja dari pengenalan jenis, tetapi juga pengetahuan mengenai potensinya (Budiman dkk, 2002). Ekspor lobster air tawar cenderung meningkat tiap tahun. Pada tahun 1990, ekspor lobster ke Belanda mencapai 745,132 ton atau 89,59% dari total ekspor lobster di Indonesia (862 ton). Pada tahun 1995, ekspor lobster Indonesia mencapai 182.065 ton/tahun, 2% dari total ekspor (3.641,3 ton) diantaranya adalah lobster air tawar. Total ekspor hasil lobster budidaya mencapai 94.511 ton / tahun. Pangsa pasar lobster air tawar tidak hanya terbatas di dalam negeri saja tetapi juga ke luar negeri (Iskandar, 2006). Sukardi (2002) menjelaskan bahwa di masa depan, pasokan hasil perikanan diharapkan berasal dari budidaya lebih besar dibandingkan dari hasil penangkapan. Dengan demikian, budidaya ikan merupakan salah satu sumber pertumbuhan ekonomi yang harus diwujudkan melalui sistem budidaya yang berdaya saing, berkelanjutan dan berkeadilan. Potensi yang ada di laut tidak hanya dimanfaatkan oleh,masyarakat pada saat ini juga memanfaatkan potensi perikanan yang ada di darat khususnya potensi perikanan air tawar. Perikanan air tawar memiliki beragam jenis komoditas unggulan yang tersebar di seluruh Indonesia. Salah satu jenis komoditas primadona yang unggul adalah lobster air tawar. Tumembouw (2011) mengatakan lobster air tawar atau yang lebih dikenal dengan red claw dan merupakan jenis lobster yang habitatnya berasal dari Quensland, Australia. Ciri utama dari

Skripsi



lobster ini adalah di kedua ujung capitnya berwarna merah. Lobster air tawar dikenal di Indonesia pada tahun 1990 sebagai ikan hias, memasuki tahun 2000, bisnis lobster air tawar mulai popular karena telah ditemukan teknik budidayanya. Sukmajaya dan Suharjo (2003) menjelaskan beberapa keunggulan lobster air tawar yaitu memiliki kandungan lemak, kolesterol dan garam yang rendah dibandingkan dengan lobster air laut serta dagingnya yang lunak dan mengandung protein yang cukup tinggi. Menurut Curtis dan Jones (1995) jenis red claw (Cherax quadricarinatus) memiliki nilai ekonomis yang paling tinggi dibandingkan dengan jenis lobster air tawar lainnya. Kebutuhan lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) di Eropa dan Asia Tenggara pada tahun 2004-2005 dapat mencapai 1.589 ton. Negara yang banyak mengimpor lobster jenis ini adalah Taiwan, Jepang, Hongkong, USA dan beberapa negara lain di Uni Eropa (Nurjanah, dkk 2008). Selain kandungan tersebut diatas, lobster air tawar juga memiliki kandungan kitin pada cangkangnya. Kitin merupakan bahan organik yang ada pada kelompok hewan mollusca, crustaceae, insekta dan arthropoda, karena cangkang kepiting, udang dan lobster kandungan kitinnya cukup tinggi yakni 20-50% (Hanjaya dkk, 2013). Kitin dapat dimanfaatkan dalam berbagai aplikasi diantaranya dapat digunakan dalam bidang farmasi, biokimia, bahan campuran kosmetik dan lain sebagainya. Keberadaan kitin yang melimpah dengan cepat terdegradasi, karena adanya beberapa bakteri dan fungi yang mempunyai enzim kitinase yang mampu mendegradasi kitin (Herdyastuti dkk, 2009). Kitinase merupakan enzim yang mampu menghidrolisa polimer kitin menjadi kitin oligosakarida atau monomer n-asetilglukosamin. Enzim kitinase ini dapat dihasilkan oleh bakteri, tanaman dan hewan (Rostinawati, 2008).

Skripsi



Fitri dan Yasmin (2011), menjelaskan bakteri kitinolitik merupakan kelompok bakteri yang mampu menghasilkan enzim kitinase untuk menguraikan zat kitin. Selain itu, manfaat dari bakteri kitinolitik adalah sebagai pengembangan strain melalui rekayasa genetika (Suhartono, 1989), agen biokontrol, biopestisida dan pembuatan protein sel tunggal (Patil dkk, 2000). Karakteristik dari bakteri kitinolitik dapat diketahui dengan melakukan pengamatan morfologi koloni bakteri, dimana dengan mengetahui ciri-ciri morfologi tersebut maka dapat mempermudah dalam melakukan identifikasi jenis bakteri kitinolitik. Dari latar belakang diatas, dilakukan isolasi dan identifikasi bakteri kitinolitik yang terdapat pada cangkang lobster air tawar. Uji biokimia yang dilakukan adalah mencakup bentuk dan warna koloni, mortalitas, bentuk sel dan sifat gram.

1.2

Rumusan Masalah Berdasarkan latar belakang diatas, dapat dirumuskan permasalahan dalam

penelitian ini yaitu : 1. Apakah bakteri kitinolitik dapat ditemukan pada cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) ? 2. Apa saja jenis bakteri kitinolitik yang terdapat pada cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) ?

1.3

Tujuan Tujuan dilaksanakan penelitian ini adalah sebagai berikut :

1. Untuk mengetahui adanya bakteri kitinolitik yang terdapat pada cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus).

Skripsi



2. Untuk mengetahui jenis-jenis bakteri kitinolitik yang terdapat pada cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus).

1.4

Manfaat Manfaat yang diharapkan dari hasil penelitian ini adalah dapat dijadikan data

acuan untuk mengetahui aktifitas dari macam-macam bakteri kitinolitik yang terkandung dalam cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus).

Skripsi



II TINJAUAN PUSTAKA 2.1 Lobster Air Tawar 2.1.1 Klasifikasi Menurut Wickins and Lee (2002), klasifikasi lobster air tawar adalah sebagai berikut : Phylum Subphlum Class Order Family Genus Spesies

: Arthropoda : Crustacea : Malacostraca : Decapoda : Parastacidae : Cherax : Cherax quadricarinatus

2.1.2 Morfologi Secara morfologi, tubuh lobster air tawar dibagi menjadi 2 bagian yaitu bagian depan yang merupakan gabungan antara kepala dan dada yang disebut dengan chepalothorax serta bagian belakang yang disebut abdomen dan ekor. Bagian kepala ditutupi oleh cangkangn (carapace) yang mengandung kitin yang dapat mengelupas (moulting) pada interval waktu tertentu untuk tujuan pertumbuhan (Wiyanto dan Hartono, 2003). Lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) merupakan spesies dimorfis, yakni terdiri dari jenis kelamin jantan dan betina. Jenis kelamin jantan dan betina dapat dibedakan secara pasti jika telah berumur dua bulan dengan panjang total rata-rata 5 – 7cm. Ciri-ciri primer pembeda jenis kelamin calon induk LAT adalah bentuk tertentu yang terletak ditangkai jalan dan ukuran capit. Sementara itu ciri-ciri sekunder yang dapat dilihat secara visual adalah kecerahan warna tubuhnya (Sukmajaya dan Suharjo, 2003)

Skripsi



Gambar 1. Lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) (Departement of Primary Industries, 1989)

2.2

Kitin Kitin merupakan senyawa polisakarida, polimer linier yang tersusun oleh

monomernya β-1,4-N-asetil-glukosamin. Kitin memiliki lingkar membentuk fibril linier. Kelimpahan kitin dialam menempati urutan terbesar kedua setelah selulosa dan terdistribusi luas di lingkungan biosfer seperti pada kulit crustacea (kepiting, udang dan lobster), ubur-ubur, komponen structural eksoskeleton insekta, dinding sel fungi (22%-40%). Pada binatang, kitin merupakan struktur yang rigrid pada eksoskeleton, hal ini dikarenakan pada rantai polimer Nasetil-glukosamin terdapat ikatan hydrogen antar molekul membentuk mikrofibril menghasilkan struktur yang stabil dan rigrid, tidak larut dalam air sehingga dapat mengkristal. Seperti halnya pada fungi, kitin yang ditemukan juga mendukung dinding selnya (Herdyastuti, dkk. 2009).

Skripsi



Gambar 2. Struktur dari molekul kitin (Susianty, 2006) Kitin memiliki ukuran molekul yang relatif besar dan kelarutan rendah, sulit diserap tubuh manusia, sehingga aplikasinya sangat terbatas dan menjadi sumber utama pencemaran senyawa organik. Pada tahun 1993 diperkirakan kitin dapat diperoleh kembali pada invertebrata laut sebanyak 37.000 ton dan meningkat menjadi 80.000 ton pada tahun 2000. Kitin tersebut berasal dari kulit atau hasil samping produk pengolahan udang beku, kepiting, lobster dan crustacean lainnya. Namun, hal ini mengindikasi bahwa kitin dapat diproduksi secara murah. Pemanfaataannya sekaligus membantu menyelesaikan masalah lingkungan serta memproduksi nilai ekonomis produksi laut (Haliza dkk, 2012). Kitin dapat ditemukan pada alga, nematode, kelompok arthropoda, crustaceae, mollusca, protozoa dan fungi. Sumber kitin terbanyak diperoleh dari kelas crustaceae. Kandungan kitin pada kulit udang lebih sedikit dibandingkan berasal dari kulit atau cangkang kepiting. Kandungan kitin pada kepiting mencapai 50-60%, sedangkan kandungan kitin pada udang 42-57%, sedangkan cumi-cumi dan kerang masing-masing 40% dan 14-35% (Rostinawati, 2008). Kitin memiliki kombinasi sifat-sifat khas seperti biodegradable (dapat terurai secara biologis), dan dapat dimanfaatkan di berbagai bidang industri, seperti bidang biokimia, obat-

Skripsi



obatan atau farmakologi, pangan dan gizi, pertanian, mikrobiologi, penanganan limbah, industry kertas, tekstil, membrane atau biofilm, dan kosmetika (Savitha and Timothy, 1997).

2.3

Sumber Kitin Sumber kitin di alam bermacam-macam seperti air laut dan sedimen laut (Donderski dan

Brezezinska, 2001), tanah (Chernin dkk, 1995), alga, nematoda, kelompok arthropoda, molluska, coelenterata, protozoa dan fungi (Suryanto, 2006) namun sampai saat ini sumber utama yang praktis dieskplorasi adalah cangkang binatang-binatang laut berkulit keras yang secara ekonomis potensial seperti udang, kepiting, rajungan, lobster dan sebagainya.

2.4

Penentuan Aktifitas Enzim Kitinase Menurut Ferniah (2011), aktivitas kitinase secara kualitatif dapat diuji

dengan penentuan zona bening disekitar pertumbuhan koloni pada media agar yang mengandung kitin. Potensi bakteri dalam memproduksi enzim kitinase ditentukan dengan menghitung nisbah antara diameter zona bening dengan diameter koloni bakteri. Nisbah diameter zona bening disekitar koloni (halo) dengan diameter koloni, merupakan indeks kitinolitik (Nasran dkk, 2003). Adanya zona bening disekitar koloni bakteri setelah waktu inkubasi tertentu, membuktikan bahwa bakteri tersebut mampu memproduksi enzim kitinase. Menurut Joklik and Smith (1968), zona bening terbentuk akibat enzim kitinase yang dibebaskan ke luar sel bakteri untuk memecahkan makromolekul kitin menjadi molekul kitin yang lebih kecil, sehingga bakteri dapat mengambil nutrisi dalam bentuk-molekul kecil. Enzim kitinase yang disekresikan bakteri dalam medium agar kitin kemudian diikat oleh partikel lain (koloidal kitin), sehingga kitin menjadi terdegradasi dan komposisi kitin dalam

Skripsi



medium menjadi berkurang. Degradasi oligomer kitin dan penggunaan molekul hasil degradasi tersebut oleh bakteri membuat medium tampak jernih, terutama disekitar koloni bakteri.

2.5

Bakteri Kitinolitik Bakteri kitinolitik merupakan kelompok bakteri yang mampu menghasilkan enzim

kitinase untuk menguraikan zat kitin (Budiani et al., 2004). Upaya untuk mengisolasi bakteri kitinolitik dari berbagai sumber telah banyak dilakukan din Indonesia. Isolat bakteri kitinolitik dapat diperoleh dari sumber air panas, tanah dan lumpur, serta dari sumber perairan lain seperti sungai dan laut (Fitri dan Yasmin, 2011). Enzim kitinase yang dihasilkan oleh bakteri kitinolitik berasal dari perairan dan berperan dalam proses daur ulang kitin, dengan adanya enzim kitinase ini maka proses penguraian kitin berlangsung berkesinambungan sehingga tidak terjadi akumulasi dari sisa-sisa cangkang udang, kepiting, cumi-cumi dan organism perairan lainnya. Perananan kitinase yang sangat prospektif terhadap kehidupan masyarakat banyak mendorong para ilmuwan dan peneliti melakukan eksplorasi mikroorganisme kitinolitik, yaitu mikroorganisme yang dapat mendegradasi kitin dengan menggunakan enzim kitinase. Mikroorganisme ini dapat dapat diperoleh dari berbagai sumber seperti

tanah atau dari lingkungan air seperti laut, danau atau limbah udang dan

sebagainya. Kitinase dapat diperoleh dari berbagai organisme termasuk virus, bakteri, jamur, serangga, tumbuhan tingkat tinggi dan hewan. Semua enzim yang dapat mendegradasi kitin disebut sebagai kitinase (Haliza dan Suhartono, 2012) Enzim kitinase adalah enzim yang mampu menghidrolisis kitin menjadi monomernya Nasetil glukosamin. Kitinase dapat dihasilkan oleh beberapa mikroorganisme dan mempunyai peran penting pada fisiologi dan ekologi. Kitinase dapat diisolasi dari mikroorganisme dengan

Skripsi



cara menumbuhkan pada media yang mengandung kitin sebagai substrat dan diinkubasi pada waktu dan suhu tertentu (Herdyastuti dkk, 2009). Banyak bakteri dan fungi mengeluarkan kitinase untuk menguraikan kitin menjadi karbon dan nitrogen. Dua senyawa karbon dan nitrogen ini selanjutnya dipakai sebagai sumber biota lainnya. Dengan adanya kitinase penguraian kitin berlangsung kontinyu sehingga tidak terjadi akumulasi kitin dari sisa cangkang udang, kepiting, cumi-cumi dan organisme lainnya. Genus bakteri yang sudah banyak dilaporkan memiliki kitinase antara lain Aeromonas, Pseudomonas, Seratia, dan Bacillus (Harman et al., 1993). Bakteri kitinolitik memiliki beragam manfaat bagi kehidupan manusia. Produksi enzim kitinolitik banyak dilakukan dengan memanfaatkan bakteri kitinolitik karena medium pemeliharaannya yang dibutuhkan tidak mahal, sehingga dapat mengurangi biaya produksi enzim (Mejia dkk, 2006). Kemudahan dalam pemeliharaan dan pengembangan strain melalui rekayasa genetik juga menjadi alas an digunakannya bakteri kitinolitik (Suhartono, 1989). Manfaat lain dari bakteri kitinolitik adalah dapat dimanfaatkan sebagai agen biokontrol, biopestisida dan pembuatan protein sel tunggal (Patil dkk, 2000). Bakteri kitinolitik dapat diperoleh dengan cara mengisolasi atau memindahkan bakteri tersebut dari lingkungannya di alam bebas ke dalam medium buatan. Karakteristik dari bakteri kitinolitik dapat diketahui dengan melakukan pengamatan morfologi koloni bakteri, dimana dengan mengetahui ciri-ciri morfologi tersebut maka dapat mempermudah melakukan identifikasi jenis bakteri kitinolitik (Rostinawati, 2008).

2.6 Isolasi dan Identifikasi Bakteri Kegiatan isolasi dan identifikasi bakteri kitinolitik merupakan salah satu cara untuk mendapatkan jenis bakteri yang memiliki kemampuan mendegradasi kitin. Isolasi merupakan

Skripsi



kegiatan pemisahan mikroorganisme yang akan diuji dari mikroorganisme lain dengan menggunakan media selektif, sehingga diharapkan akan diperoleh biakan atau kultur murni. Media selektif adalah media khusus untuk menumbuhkan mikroorganisme tertentu yang mengandung nutrien-nutrien yang khusus dimanfaatkan oleh mikroorganisme tertentu yang tumbuh pada media selektif. Identifikasi merupakan kegiatan yang dilakukan untuk mengetahui jenis organisme tertentu dengan tahap pengamatan, pengujian, pencatatan, dan identifikasi berdasarkan hasil pengujian (Susatyo., 2006). Pewarnaan gram merupakan salah satu teknik identifikasi yang sangat penting dalam menentukan jenis bakteri. Bakteri digolongkan menjadi dua yaitu bakteri yang dapat menyerap warna violet atau biru tua disebut bakteri gram positif sedangkan bakteri yang dapat menyerap warna merah disebut bakteri gram negatif.

2.7

Uji Identifikasi Bakteri

2.7.1 Uji Oksidase Tujuan uji oksidase adalah untuk mengetahui ada tidaknya enzim oksidase pada bakteri dengan menggunakan paper oksidase yang dapat dilihat perubahan warna yang terjadi pada paper oksidase (Kusdawarti dan Sudarno, 2011). 2.7.2 Uji Katalase Uji Katalase digunakan untuk mengetahui sifat bakteri dalam menentukan sifat bakteri dalam menghasilkan enzim katalase (Kusdawarti dan Sudarno, 2011). 2.7.3 Uji O/F Uji O/F bertujuan untuk mengetahui sifat oksidatif atau fermentatif bakteri terhadap glukosa dengan menggunakan dua tabung media yang salah satunya ditutup dengan paraffin,

Skripsi



sehingga diharapkan di dalam media tidak terdapat udara yang dapat mendukung terjadinya fermentasi (Kusdawarti dan Sudarno, 2011) 2.7.4 Uji Motil Indol Ornithin (MIO) Uji motilitas bertujuan untuk mengetahui apakah bakteri tersebut motil atau tidak. Uji ini menggunakan media MIO (Motility Indole Ornitin) (Holt et al., 2000). 2.7.5 Uji Methyl Red dan Voges Proskauer Media uji MR-VP mengandung glukosa sebagai bahan uji kemampuan bakteri dalam mengubah glukosa menjadi asam organik dan alkohol. Bakteri yang mampu mengubah glukosa menjadi asam organik dan alkohol, maka setelah ditambahkan dengan reagen MR maka media akan berubah menjadi merah, jika bakteri tidak mampu mengubah glukosa menjadi asam organik dan alkohol maka media tetap berwarna kuning. Uji Voges Prokauer jika bakteri mampu mengubah glukosa menjadi asam organik dan alkohol, maka setelah ditambahkan dengan alfa naftol dan KOH 40% maka media akan berubah menjadi merah (Holt et al., 2000). 2.7.6 Uji Gula Uji gula-gula bertujuan untuk mendeterminasi kemampuan bakteri dalam mendegradasi gula dan menghasilkan asam organik yang berasal dari tiap jenis gula yaitu glukosa, sukrosa, maltose, arabinosa, manitol dan inositol (Holt et al., 2000). 2.7.7 Uji TSIA (Triptic Sugar Iron Agar) Uji TSIA bertujuan untuk membedakan jenis bakteri berdasarkan kemampuan memecahkan glukosa, laktosa dan sukrosa, selain itu uji TSIA berfungsi mengetahui apakah bakteri tersebut menghasilkan gas H2S atau tidak (Holt et al, 2000).

Skripsi



III. KERANGKA KONSTEPTUAL DAN HIPOTESIS

3.1

Kerangka Konsteptual

Indonesia memiliki kekayaan jenis ikan yang sangat tinggi. Dilihat dari jumlah jenis ikan air tawar, Indonesia menempati rangking ke dua di dunia setelah Brazil dan merupakan peringkat pertama di Asia. Kenyataan yang ada saat ini menunjukkan bahwa pengetahuan mengenai kekayaan sumber daya ikan ini masih relatif sangat kecil, tidak saja dari pengenalan jenis, tetapi juga pengetahuan mengenai potensinya (Budiman dkk, 2002). Perikanan air tawar memiliki beragam jenis komoditas unggulan yang tersebar di seluruh Indonesia. Salah satu jenis komoditas primadona yang unggul adalah lobster air tawar. Lobster air tawar juga memiliki kandungan kitin pada cangkangnya. Kitin merupakan bahan organik yang ada pada kelompok hewan mollusca, crustaceae, insekta dan arthropoda, karena cangkang kepiting, udang dan lobster kandungan kitinnya cukup tinggi yakni 20-50%. Kitin juga dapat dimanfaatkan dalam berbagai bidang seperti bidang kosmetik, bidang farmasi mikrobiologi, bidang farmako, boifirm dan obat-obatan (Hanjaya dkk, 2013). Keberadaan kitin yang melimpah dengan cepat terdegradasi, karena adanya beberapa bakteri dan fungi yang mempunyai enzim kitinase yang mampu mendegradasi kitin (Herdyastuti dkk, 2009). Bakteri Kitinolitik merupakan bakteri yang mengandung enzim kitin. Manfaat dari bakteri kitinolitik adalah dapat dimanfaatkan sebagai pengembangan strain melalui rekayasa genetika, agen biokontrol, biopestisida, pembuatan protein sel tunggal (Patil dkk, 2000). Dari kerangka konsteptual diatas, dilakukan isolasi dan identifikasi bakteri kitinolitik yang terdapat pada cangkang lobster air tawar. Pada tahap identifikasi dilakukan uji biokimia yang dilakukan adalah mencakup bentuk dan warna koloni, mortalitas, bentuk sel dan sifat gram.

Skripsi



Lobster Air Tawar (Cherax quadricarinatus) Melimpah di Indonesia

Limbah cangkang lobster Kitin B idang kosmetik

B

Pe nanganan Limbah P angan

idang Farmako

B idang Industri

B idang Biokimia

MIKRO BIOLOGI Bakteri Kitinolitik

O batobatan B iofilm

Enzim Kitinase Zona Bening pada Media Kitin Isolasi dan Identifikasi Bakteri Kitinolitik yang Terdapat pada Cangkang Lobster Air Tawar ( Cherax Quadricarinatus)

Gambar 3. Kerangka Konsteptual

Skripsi



IV METODOLOGI

4.1 Tempat dan Waktu Kegiatan penelitian ini dilakukan di dua lokasi yaitu Laboratorium mikrobiologi Balai Karantina Ikan Juanda Surabaya, Laboratorium Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga.

4.2 Materi Penelitian 4.2.1 Peralatan Penelitian Alat-alat yang digunakan antara lain, laminary air flow, refrigerator, inkubator, autoclave, labu erlenmeyer, tabung reaksi, hotplate stirer, cawan Petri atau Petri disk, obyek glass, sectio kit, cover glass, bunsen, ose, mikroskop, gelas ukur, pipet tetes. Peralatan lain yang digunakan antara lain alumunium foil, lemari pendingin, kapas, alat tulis, dan kamera digital.

4.2.2 Bahan Penelitian Bahan-bahan yang digunakan pada penelitian ini adalah media agar yaitu media TSA, media Urea, media MR-VP, glukosa (maltosa, sukrosa, ramnosa, arabinosa, sorbitol, inositol, laktosa, manitol dan media MHA.

4.3 Metode Penelitian 4.3.1 Rancangan Penelitian Penelitian ini menggunakan metode observasi untuk mengetahui adanya bakteri kitinolitik yang ada pada cangkang lobster air tawar. Data yang digunakan dalam penelitian ini adalah secara deskriptif.

Skripsi



4.3.2 Prosedur Kerja A. Pembuatan Media Tahap isolasi dan identifikasi pada bakteri kitinolitik adalah dengan menggunakan media yang diperkaya dengan kitin. Bahan-bahan yang diperlukan dalam pembuatan media agar kitin adalah NaNo3 1,5 gr, K2HPO4 0,5 gr, MgSO4 0,5 gr, Na2CO3 0,5 gr, CaCl2 0,1 gr, koloidal kitin 15 gr, agar 17 gr dan akuades 1 L (Herdyastuti dkk, 2010).

B. Strelisasi Alat Sterilisasi adalah suatu usaha untuk menghancurkan semua bentuk kehidupan mikroorganisme yang terdapat pada alat atau bahan (Pelczar dan Chan, 1988). Proses sterilisasi menggunakan autoclave yang dilakukan pada suhu 121ºC dengan tekanan sebesar 15 lbs (pounds) per inch persegi yang berarti 1 atmosfer per 1 cm2. Perhitungan waktu selama 15 atau 20 menit itu dimulai setelah termometer pada autoklaf menunjuk suhu 121 0C (Dwidjoseputro, 1994). Apabila medium berukuran besar disterilkan, maka waktu yang diperlukan akan lebih panjang, karena panas memerlukan waktu untuk menembus bahan tersebut (Volk dan Wheeler, 1993). Peralatan yang disterilisasi adalah cawan Petri, tabung reaksi, labu Erlenmeyer, pipet ukur.

C. Isolasi Bakteri Isolasi bakteri merupakan suatu cara untuk memisahkan atau memindahkan mikroba tertentu sehingga diperoleh kultur atau biakan murni. Isolasi bakteri dapat mempelajari sifat biakan, morfologi, dan sifat aslinya, maka organisme yang akan dipelajari harus dapat dipisahkan menjadi biakan murni yang hanya mengandung satu jenis bakteri saja. Teknik inokulasi merupakan suatu pekerjaan memindahkan bakteri dari medium yang lama ke medium

Skripsi



yang baru dengan tingkat ketelitian yang sangat tinggi. Dengan demikian akan diperoleh biakan mikroorganisme yang dapat digunakan untuk pembelajaran mikrobiologi. Dalam penelitian kali ini, langkah-langkah yang perlu dilakukan dalam kegiatan isolasi bakteri adalah dengan menyiapkan isolat bakteri yang berasal dari cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) dengan cara disuspensikan kedalam media TSB, diinkubasikan pada suhu 370C selama 18-24 jam. Tujuan dari diinkubasikan pada media TSB adalah agar berbagai bakteri yang terkandung dalam cangkang lobster air tawar dapat keluar lebih teliti. Media TSB (Triptoy Soy Broth) adalah media umum yang digunakan untuk isolasi pertumbuhan mikroorganisme yang telah diperkaya berbagi nutrisi sehingga dapat mendorong pertumbuhan mikroorganisme menjadi lebih teliti dan beragam. Komposisi dasi media TSB adalah 20 g/L pepton, 2,5 g/L glukosa, 5 g/ L NaCl dan 2,5 g/L K2HPO4 (Corning, 2012). Hasil inkubasi media TSB kemudian di goreskan pada media kitin dan selanjutnya diinkubasikan pada suhu 370C selama 18-24 jam . Selanjutnya isolat bakteri pada media TSB ditanam pada media TSA dan kemudian diinkubasikan pada suhu 370C selama 18-24 jam. Kemudian didapatkan beberapa koloni pada media TSA. Setelah itu, isolat bakteri tersebut dimurnikan kembali pada media TSA dan diinkubasi pada suhu 370C selama 24 jam. D. Pembuatan Media Kitin Menurut Nasran, dkk (2003) pembuatan koloidal kitin dapat dilakukan dengan beberapa cara yaitu ; 1.

Koloidal kitin dibuat dengan cara melarutkan 10g bubuk kitin dalam 200ml HCL 12N, kemudian didiamkan semalaman dalam keadaan tertutup pada suhu 40C. Larutan kemudian disaring lalu filtrate dicampur dengan 100 mL aquades dan dinetralkan dengan

Skripsi



menggunakan NaOH 12N hingga pH mencapai 7. Larutan kemudian disentrifugasi dengan kecepatan 8000 rpm selama 20 menit. Endapan kemudian ditambahkan aquades kembali dan kemudian disetrifugasi dengan kecepatan 8000rpm selama 20 menit. Endapan yang terbentuk merupakan koloidal kitin yang siap digunakan.

Gambar 4. Koloidal Kitin 2.

Penyiapan Media Uji Sebanyak 2% kitin disuspensikan ke dalam media.

3.

Pengujian aktivitas Enzim Kitinase Masing-masing koloni pada master plate diambil satu ose, kemudian digoreskan pada media uji. Aktivitas enzim kitinase ditunjukkan dengan terbentuknya zona bening pada sekitar koloni. Adapun caranya adalah sebagai berikut: a. Penyiapan Suspensi Bakteri Penghasil Enzim Kitinase Satu ose koloni bakteri penghasil enzim kitinase disuspensikan dalam media TSB dan diinkubasi pada suhu 370C selama 18-24 jam. b. Penyiapan Media Uji Sebanyak 2% kitin disuspensikan kedalam media kitin. Kemudian bakteri yang sudah diisolasi kemudian digoreskan pada media kitin.

Skripsi



c. Pengujian Aktivitas Enzim Bakteri yang telah digoreskan pada media kitin kemudian diinkubasi pada suhu 370C selama 18-24 jam. Aktivitas enzim kitinase ditunjukkan dengan terbentuknya zona lisis pada sekitar koloni. Semakin besar zona lisis yang terbentuk, maka semakin besar pula aktivitas enzim kitinase yang dimiliki bakteri uji tersebut.

E. Identifikasi Bakteri Kitinolitik 1. Pengamatan Morfologi Koloni Pengamatan morfologi koloni meliputi bentuk dan warna koloni pada media kitin. 2. Pewarnaan Gram Pewarnaan Gram dilakukan untuk membedakan bakteri Gram positif dan Gram negatif. Bakteri uji dioleskan diatas kaca objek dan difiksasi diatas api. Olesan bakteri tersebut digenangi dengan karbol gentian violet selama 1 menit dan digenangi kembali dengan lugol selama 1 menit. Olesan tersebut di cuci dengan pemucat alkohol 95% selama 30 detik dan dibilas dengan air mengalir. Olesan bakteri digenangi dengan pewarna safranin selama 30 detik sehingga zat warna tersebut larut, kemudian dibilas dengan menggunakan air mengalir. Olesan bakteri dikeringkan menggunakan kertas saring, kemudian ditetesi dengan minyak emersi dan diamati dibawah mikroskop dengan perbesaran 1000 kali. 3. Uji Biokimia a. Uji Fermentasi Karbohidrat Koloni yang akan diidentifikasi diambil menggunakan ose. Koloni tersebut diinokulasikan ke dalam tabung yang masing-masing berisi glukosa, laktosa,

Skripsi



manosa, maltose, dan sukrosa. Masing-masing larutan gula tersebut ditambahkan indikator phenol red dan dimasukkan ke dalam tabung durham dengan posisi terbalik. Suspensi mikroba tersebut diinokulasikan pada suhu 370C selama 18-24 jam. Bila warna medium berubah menjadi kuning, artinya koloni tersebut membentuk asam dari fermentasi karbohidrat. Bila pada tabung durham terdapat gelembung udara, artinya fermentasi tersebut membentuk gas. b. Uji Motil Indol Ornithin (MIO) Koloni bakteri yang diidentifikasi diambil dengan menggunakan ose. Koloni bakteri diinokulasikan pada suhu media uji motil indol urea yang berupa agar semi solid dengan cara ditusuk. Media diinkubasikan pada suhu kamar selama 1824 jam. Pergerakan bakteri ditunjukkan dengan adanya penyebaran koloni disekitar tusukan. Reaksi urea positif ditunjukkan perubahan warna media menjadi merah muda. Reaksi indol positif ditunjuukan dengan perubahan reaksi konvac yang kemudian akan menghasilkan cincin merah diatas permukaan, dan menunjukkan negatif apabila menghasilkan cincin jingga diatas permukaan. c. Uji Sitrat Koloni bakteri yang akan diidentifikasi diambil menggunakan ose. Koloni ditanamkan secara gores zig-zag pada media pembenihan simmons citrate agar. Kemudian media diinkubasikan pada suhu 370C selama 18-24 jam. Koloni berwarna biru menunjukkan hasil positif sedangkan koloni berwarna hijau menunjukkan reaksi negatif.

Skripsi



d. Uji Oksidatif Fermentatif (OF) Uji OF dilakukan dengan cara memasukkan koloni bakteri ke dalam dua tabung reaksi yang berisi media O/F. Kemudian ditambahkan 2-3 ml minyak paraffin ke dalam salah satu tabung reaksi. Setelah itu diinkubasi selama 24-48 jam pada suhu ruang dan diamati hasil uji apakah termasuk bakteri fermentatif atau oksidatif. e. Uji Metil Red (MR) Koloni bakteri yang akan diidentifikasikan diambil dengan menggunakan ose. Koloni bakteri diinokulasi pada suhu 370C selama 18-24 jam. Kemudian ditambahkan tiga sampai empat tetes indikator merah metal. Warna merah menunjukkan reaksi positif. f. Uji Voges-Prokauser (VP) Koloni bakteri yang akan diidentifikasi diambil dengan menggunakan ose. Koloni diinokulasikan pada media MR-VP dan diinkubasi pada suhu 370C selama 18-24 jam kemudian ditambahkan dengan Barrit. Suspensi tersebut di kocok selama 2030 detik. Reaksi VP positif bila terjadi pembentukan asam yang ditandai dengan berubahnya warna medium menjadi merah muda setelah penambahan pereaksi Barrit. g. Uji TSIA Koloni yang diuji dipindahkan ke agar miring TSIA dengan cara menggores bagian miringnya dan menusuk bagian tegaknya. Diinkubasi pada suhu 37⁰C selama 24-48 jam. Di amati perubahan-perubahan sebagai berikut pada bagian tegak, jika bakteri dapat memfermentasikan glukosa, warna media berubah dari

Skripsi



orange menjadi kuning. Koloni bakteri yang tidak memfermentasi sukarosa, media tetap berwarna merah. Koloni bakteri yang dapat membentuk gas H2S, warna media berubah dari orange menjadi hitam, karena bakteri mampu mendesulfurasi asam amino dan metion yang akan menghasilkan H2S, dan H2S akan bereaksi dengan Fe+2 yang terdapat pada media yang menghasilkan endapan hitam. Pada bagian miring, jika bakteri dapat memfermentasi laktosa dan sukarosa, warna media berubah warna jadi kuning, tidak dapat memfermentasi laktosa atau sakarosa, warna media tetap orange atau tidak berubah.

4.3.4 Analisis Data Data yang diperoleh dianalisis secara deskriptif yaitu penyajian data tentang morfologi dan karakteristik dari bakteri kitinolitik yang diisolasi dari cangkang lobser air tawar (Cherax quadricarinatus) dan dibandingkan dengan morfologi dan karakteristik bakteri kitinolitik dengan literatur yang sesuai.

Skripsi



V HASIL DAN PEMBAHASAN

5.1 Hasil 5.1.1 Isolasi Bakteri Kitinolitik Berdasarkan penelitian yang dilakukan, diperoleh bahwa bakteri yang diisolasi dari cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) dapat tumbuh dan berkembang pada media uji. Media uji tersebut berupa media TSA dan media kitin. Bakteri diisolasi berdasarkan bentuk dan warna koloni. Sampel yang telah diinkubasi selama 24 jam didapatkan 8 koloni yang diantaranya memiliki warna putih susu, krem tipis, krem tebal, coklat, kuning, putih keruh, putih dimana koloni tersebut tumbuh padat pada media TSA.Koloni tersebut juga memiliki bentuk batang, bulat dan pipih. Koloni tersebut kemudian dimurnikan kembali pada media TSA dan diinkubasi selama 24 jam. Hasil dari pemurnian tersebut beberapa koloni dikelompokkan sesuai dengan warna dan bentuk yang sama sehingga dari hasil pengelompokkan tersebut didapatkan 4 isolat bakteri. Koloni hasil isolasi dipilih sebanyak 4 isolat dengan berbagai bentuk yang berbeda. Isolat tersebut kemudian diberi tanda 1, 2, 3 dan 4. Masing-masing isolat memiliki morfologi koloni yang berbeda satu sama lain. Berikut ini adalah tabel yang menjelaskan tentang karakteristik bakteri dan dicocokkan dengan referensi yang ada.

Tabel 1. Hasil Karakteristik Bakteri Karakteristik Uji Gram Warna Morfol ogi sel Oksidas e

Skripsi

Aeromonas sp.

Aeromonas sp.

krem batang

krem batang

+

Bacillus sp.

Pseudomonas sp. +

putih batang

+

Putih Batang

-

+



Katalas e O/F

+

+

+ N

F

F

R

As/As -

As/As -

s/NR

+ + + + + +

+ NR

A TSIA LIA Motilita s Indole MR Vp Citrate Urease Glukosa Laktosa Sukrosa Arabino sa Manitol Inositol Maltos e

+

As/As +

+ + + + +

+ -

+ + +

+ -

+ -

+ V

-

+

+

+

+

Setelah didapatkan hasil karakteristik dan uji biokimia, kemudian dicocokkan dengan literatur yang ada, yakni menggunakan buku Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology. Karakteristik

Aeromonas sp.

Aeromonas sp.

-

-

Bacillus sp.

Pseudomonas sp.

Uji Gram

+

-

Morfol ogi sel

batang

batang

batang

Batang

Oksidas e

+

+

-

+

+

+

+ N

+

O/F

F

F

R

TSIA

As/As

As/As

s/NR

Katalas e

NR A

Skripsi

As/As



LIA Motilita s Indole MR Vp Citrate Urease Glukosa Laktosa Sukrosa Arabino sa Manitol Inositol Maltos e

-

-

+

+

+ + + + + +

+ + + + +

+ -

+ + +

+ -

+ -

+ v

-

+

+

+

+

(Holt et al., 2000) Dari hasil pengujian tersebut didapatkan jenis – jenis bakteri yaitu Aeromonas sp., Bacillus sp. dan Pseudomonas sp.. Keempat isolat tersebut selanjutnya dilakukan uji hidrolisis kitin 5.1.2 Uji Hidrolisis Bakteri Kitinolitik Bakteri yang telah diisolasi dengan menggunakan media TSA juga kemudian diisolasi menggunakan media yang mengandung kitin. Uji hidrolisis bakteri kitinolitik ditandai dengan adanya zona bening yang dihasilkan dari bakteri tersebut. Hal tersebut ditunjukkan pada gambar 4.

Skripsi



Zona bening

Gambar 5. Hasil dari uji hidrolisis kitin

5.1.3 Karakteristik Bakteri Ciri-ciri utama suatu bakteri yang perlu diketahui dalam mengkarakterisasi bakteri adalah melalui beberapa uji morfologi dan biokimia (Sudarsono, 2008). Dari hasil uji morfologi dan uji biokimia pada ke empat isolat dapat dilihat pada lampiran 1. Hasil uji morfologi dan uji biokimia yang dibandingkan dengan buku Bergey’s Determinative Bacteriology (Holt et al., 1994) didapatkan kecocokan karakteristik pada jenis bakteri Bacillus sp., Aeromonas sp. dan Pseudomonas sp. Bakteri Bacillus sp. memiliki sel berbentuk batang dan lurus yang berukuran 0,52,5 x 1,2-1,0 µm dan seringnya tersusun secara berpasangan atau tunggal dengan ujung yang berbentuk bulat atau persegi. Bacillus sp. termasuk bakteri gram positif, memiliki endospora yang berbentuk oval atau bundar atau silindris dan Bascillus sp. sangat resistan terhadap kondisi yang merugikan. Termasuk bakteri aerob. Dapat ditemukan pada berbagai habitat. Beberapa spesies Bacillus sp. patogen terhadap invertebrate atau vertebrata.

Skripsi



Gambar 6. Bacillus sp. Pseudomonas sp. merupakan kelompok bakteri yang memiliki habitat yang cukup beragam. Pseudomonas sp. dapat ditemui di tanah, sebagai pathogen pada hewan atau manusia dan di tubuh tanaman sebagai bakteri endofik maupun parasit, di perairan tawar maupun di perairan laut. Bakteri Pseudomonas sp. berbentuk batang melengkung lurus tapi tidak heliks, berukuran 0,5-1,0 x 1,5-5,0 µm. Pseudomonas sp. termasuk gram negatif. Bersifat aerob. Beberapa spesies menjadi pathogen terhadap manusia, hewan dan tumbuhan. Pseudomonas sp. memberikan hasil positif pada uji katalase dan oksidase dan bersifat motil.

Gambar 7. Pseudomonas sp.

Skripsi



Bakteri Aeromonas sp. berbentuk batang bulat, memiliki diameter 0,3-1,0 µm dan panjang 1,0-3,5 µm. Aeromonas sp. termasuk gram negatif. Dapat ditemukan secara tunggal berpasangan atau berbentuk rantai pendek, bersifat fakultatif anaerob. Tempratur optimalnya 22280C tetapi kebanyakan spesies dapat tumbuh optimal dalam suhu 370C. Aeromonas sp. dapat ditemukan di perairan yang bagus dan di perairan yang tercemar.

Gambar 8. Aeromonas sp.

5.2 Pembahasan Untuk mempelajari sifat-sifat dan karakteristik dari mikroba, maka masingmasing mikroba harus dipisahkan dari satu dengan yang lainnya sehingga didapatkan kultur atau biakan murni dari mikroba tersebut. Untuk mendapatkan isolat bakteri dari suatu bahan yang mengandung campuran mikroba dapat dilakukan isolasi (Fardiaz, 1989). Setelah didapatkan 4 isolat bakteri yang kemudian dilanjutkan dengan uji kitinolitik. Uji kitinolitik tersebut bertujuan untuk menunjukkan bahwa bakteri tersebut merupakan bakteri kitinolitik. Hal tersebut ditunjukkan dengan terbentuknya zona bening yang

Skripsi



timbul di sekeliling bakteri. Aktivitas kitinolitik secara kualitatif dapat ditentukan adanya zona bening di sekitar koloni bakteri yang tumbuh pada medium agar kitin (Gohel dkk, 2006). Zona bening terbentuk akibat enzim kitinolitik yang dibebaskan ke luar sel bakteri untuk memecah makromolekul kitin menjadi molekul kitin yang lebih kecil, sehingga bakteri dapat mengambil nutrisi dalam bentuk molekul-molekul kecil (Joklik and Smith, 1968). Enzim kitinolitik yang disekresikan bakteri dalam medium agar kitin kemudian diikat oleh partikel kitin (koloidal kitin), sehingga kitin menjadi terdegradasi dan komposisi kitin dalam medium menjadi berkurang. Degradasi oligomer kitin dan penggunaan molekul hasil degradasi tersebut oleh bakteri membuat medium tampak jernih, terutama di sekitar koloni bakteri (Chen and Lee, 1994). Hasil uji hidrolisis kitin menujukkan bahwa isolat tersebut merupakan bakteri kitinolitik. Hal tersebut ditandai dengan terbentuknya zona bening di sekitar bakteri. Hal itu menunjukkan bahwa bakteri dapat mengambil nutrisi dalam bentuk molekul-molekul kecil. Semakin besar zona bening yang terbentuk, maka semakin besar pula kemampuan isolat dalam mendegradasi kitin (Yusmarini dkk., 2009). Selanjutnya isolat yang mempunyai aktivitas enzim kitinase dilakukan uji identifikasi. Dari hasil pengamatan semua bakteri dilakukan pewarnaan gram yang menunjukkan semua bakteri menunjukkan gram negatif dan gram positif. Berdasarkan hasil isolasi bakteri, morfologi bakteri yang diisolasi dari cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) memiliki koloni yang dengan bentuk bulat, tidak beraturan dan ada pula yang datar. Hal tersebut menunjukkan karakteristik dari bakteri tersebut. Uji sifat morfologi koloni bakteri sangat penting untuk identifikasi bakteri karena karakteristik koloni bakteri pada medium lempeng dapat memiliki nilai identitas (Prabaningtyas, 2003). Hasil

Skripsi



uji identifikasi tersebut kemudian dilanjutkan dengan uji biokimia dan hasil dari uji tersebut dicocokkan dengan Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology. Dari hasil uji identifikasi dan uji biokimia didapatkan 3 bakteri kitinolitik yaitu Aeromonas sp., Bacillus sp dan Pseudomonas sp. ketiga bakteri yang diidentifikasi tersebut memiliki kemampuan untuk mendegradasi kitin. Menurut Thompson dkk. (2001), beberapa genus bakteri yang mampu menghasilkan enzim kitinolitik adalah Aeromonas, Bacillus, Enterobacter, Pseudomonas dan Serratia. (Goodday, 1994).

Skripsi



VI. KESIMPULAN DAN SARAN 6.1 Kesimpulan Dari hasil penelitian didapatkan bakteri kitinolitik Aeromonas sp., Bacillus sp dan Pseudomonas sp. pada cangkang Lobster Air Tawar ( Cherax quadricarinatus ). Bakteri tersebut mampu untuk mendegradasi kitin yang ditandai dengan adanya zona bening di sekitar bakteri. 6.2 Saran Perlu dilanjutkan penelitian lanjutan mengenai bakteri kitinolitik yang terdapat pada cangkang lobster air tawar (Cherax quadricarinatus) sebagai daya hambat maupun keperluan lainnya untuk budidaya.

Skripsi



DAFTAR PUSTAKA Agung, M. U. K. 2007. Penelurusan Efektivitas Beberapa Bahan Alami sebagai Kandidat Antibakteri dalam Mengatasi Penyakit Vibriosis pada Udang Windu. Makalah Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan. Universitas Padjadjaran. Bandung. 31 hal. Budiardi, T., D. Salleng dan N. B. P,. Utomo. 2005. Penokolan Udang Windu (Penaeus monodon) dalam Hapa pada Tambak Intensif dengan Padat Tebar Berbeda. Jurnal Akuakultur Indonesia. 4(2) : 153-158. Budiani, A., Santoso, D.A., Susanti, I.Mawardi S., dan Siswanto. 2004. Ekspresi β-1,3 Glukanase danKitinase pada Tanaman Kopi Arabika (Coffea Arabica L.) Tahan dan RentanKarat Daun. Jurnal Menara Perkebunan. 72 (2): 57-71. Chen, J. P. and M. S. Lee. 1994. Simultaneous Production and Partition of Chitinase during Growth of Serratia Marcescens in an Aqueous Two-phase System. Biotecnology Techniques. 8(11):783-788. Chernin, L., Z. Ismailov, S. Harnan and I. Chet. 1995. Chitinolytic enterobacter agglomerans antagonis to fungi plant pathogens. Appl. Environ. Microbiol. 1720-1726.

61 (5) :

Dara, F. 2013. Isolasi dan Identifikasi Bakteri dalam Saluran Pencernaan Teripang Phyllophorus sp. dari Pantai Timur Surabaya sebagai Kandidat Probiotik. Skripsi. Program Studi S1 Budidaya Perairan. Universitas Airlangga. Surabaya. hal : 19-23 Departement of Primary Industries. 1989. Overview of Redclaw (Cherax quadricarinatus). Departement Primary Industries. Brisbane Direktorat Kementrian Budidaya. 2011. Manfaat Ekstrak Daun Sirih terhadap Budidaya Udang Windu. http://perikanan.sidoarjokab.go.id. 10/14/2013. 1 hal. Direktorat Perikanan Budidaya, 2011. Analisis Statistik Capaian Target Produksi Komoditas. Kementrian Kelautan Perikanan, Jakarta. 5 hal.

Semua

Donderski, W dan M.S. Brzezinska. 2001. Occurence of chitinolytic bacteria in water and bottom sediment of eutrophic lakes in Hawski Lake District. Publish Journal of Environmental Studies. 10 (5) : 331-336. Dwidjoseputro, D. 1994. Dasar Dasar Mikrobiologi. Djambatan. Jakarta. hal. 40-43. Fardiaz, S. 1989. Petunjuk Laboratorium. Analisis Mikrobiologi Pangan. Bogor: Pusat Antar Universitas Pangan dan Gizi. Direktorat Jendral Pendidikan Tinggi, Departemen Pendidikan dan Kebudayaan. Institut Pertanian Bogor.

Skripsi



Febriana, S. P. 2013. Isolasi dan Identifikasi Bakteri pada Cangkang Abalon (Haliotis asining). Skripsi. Program Studi S1 Budidaya Perairan. Universitas Airlangga. Surabaya. hal : 13-17. Ferniah, R.S., S. Pujiyanto., S. Purwantisari dan Supriyadi. 2011. Interaksi Kapang Patogen Fusarium oxysporum dengan Bakteri Kitinolitik Rizosfer Tanaman Jahe dan Pisang. Jurnal Natur Indonesia. Jurusan Biologi. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Universitas Diponegoro. Semarang. 14 (1) : 57. Fidyandini, H. P. 2012. Identifikasi dan Prevalensi Ektoparasit pada Ikan Bandeng (Chanos chanos) yang Dipelihara di Karamba Jaring Apung UPBL. Situbondo dan Ditambak Desa Bangunrejo Kecamatan Jabon Sidoarjp. Skripsi. Budidaya Perairan. Fakultas Perikanan dan Kelautan. Universitas Airlangga. Surabaya. 51 hal. Gooday, G. W. 1994. Physiology of Microbacterial Degradation of Chitin and Chitosan. Biochemistry of Microbacterial Degradation. Netherlands. Gohel, V., A. Singh, M. Vimal, P. Ashwini and H. S. Chatpar. 2006. Bioprospecting and Antifungal Potential of Chitinolytic Microorganism. African Journal of Biotechnology. 5(2) : 54-72. Gufran, H. 2012. Jurus Jitu Pengelolaan Tambak untuk Budidaya Perikanan Ekonomis. Lily Publisher. Jakarta. Hal. 28-29. Haliza, W dan M. T. Suhartono. 2012. Karakteristik Kitinase dari Mikroba. Buletin Teknologi Pascapanen Pertanian. Bogor. Institut Pertanian Bogor. 8 (1):1 Hargono, A dan I., Sumantri. 2008.Pembuatan Kitosan dari Limbah Cangkang Udang serta Aplikasinya dalam Mereduksi Kolesterol Lemak Kambing. Fakultas Teknik Kimia. Universitas Diponegoro. Semarang. vol 12 (1) : hal 53-57. Harman, G. E., C. K. Hayes, M. Lorito, R. M. Broadway, A. Di Pietro, C. Peterbauer and A. Tronsmo. 1993. Chytinolytic Enzymes of Trichoderma harzianum : Purification of Chitobiosidase and Endochitinase. Phytopathology 83 : 313-318. Herdyastuti, N., T. J. Raharjo, Mudasir and S. Matsjeh. 2009. Chitinase and Chitinolytic Microorganism : Isolation, Characterization and Potential. Departement of Chemistry. Universitas Negeri Surabaya. 9(1), 37-47. Holt, J.G and N.R. Krieg. 2000. Bergey’s Manual Of Determinative Bacteriology. 9th Edition. Lippincott Williams & Wilkins. A Wolters Kluwer Company. Philadelphia. USA. Iskandar, 2006, Budidaya Lobster Air Tawar, Agro Media Pustaka, Jakarta. Joklik, W. F and D. T Smith. 1968. Microbiology. 15th Edition. Prentice-Hall, Inc., New York : xviii + 1120 hlm.

Skripsi



Lenni, F. dan Y. Yasmin. 2011. Isolasi dan Pengamatan Morfologi Koloni Bakteri Kitinolitik. Jurnal Ilmiah Pendidikan Biologi, III (2) : 20-25. Mahasri, G, Mubarak, S dan Irawan B. 2008. Gambaran Patologi Insang dan Kulit Udang Windu (Penaeus monodon) yang Terserang Ciliata Patogen dari Famili Vorticillidae (Zoothamnium sp.). Berkala Ilmiah Perikanan, vol. 3(1) : 95-103. Maryani., Dana., dan Sukena,. 2002. Peranan Ekstrak Kelopak dan Buah Mangrove terhadap Infeksi Bakteri Vibrio harveyi pada Udang Windu (Penaeus monodon). Jurnal Akuakultur Indonesia 1(3) : 129-138 hal. Mejia Saules, J.E, K. N Walizewski, M. A Gracia and R. Cruzcamarillo. 2006. The Use of Crude Shrimp Shell Powder for Chithinase Production by Serratia marcescens. Food Techno. Biotechnology. 44(1):95-100. Milasari., N., V,. 2011. Kebijakan Pengelolaan Perikanan Tangkap di Surabaya Jawa Timur. Skripsi. Pemanfaatan Sumberdaya Perikanan. Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan. Intitut Pertanian Bogor. Bogor. 91 hal. Murachman., Nuhfil, H., Soemarno dan Sahri, M. 2010. Model Polikultur Udang Windu (Penaeus monodon), Ikan Bandeng (Chanos chanos) dan Rumput Laut (Gracillaria sp.) secara Tradisional. Vol 1(1) : 1-10. Nasran, S., F. Afriyani, dan N. Indriati. 2003. Produksi Kitinase dan Kitin Deasetilase dari Vibrio Harveyi. Jurnal Penelitian Perikanan Indonesia. 9(5): 33-38. Patil, R. S., J. Lee and H. K Lee. 2000. Purification and Characterization of Chitinase from Marine Bacterium Vibrio sp. The Journal Microbiology. 26: 473-483. Pelczar, M dan Chan, E. C. S. 1986. Dasar-Dasar Mikrobiologi. Penerbit Universitas Indonesia. Jakarta. Prabaningtyas, S. 2003. Karakteristik Bakteri Koleksi Laboratorium Mikrobiologi Universitas Negeri Malang. Malang. Chimera Volume III. No.2. Rostinawati, T. 2008. Skrining dan Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Kitinase dari Air Laut di Perairan Pantai Pondok Bali. Penelitian Mandiri. Fakultas Farmasi. Universitas Padjadjaran. Jatinangor. hal 22-25. Savitha, V. and Timothy, J.S. 1997. Chitosan Membrane Interaction And Their Propable Role in Chitosan – Medical Transfection. Biotechnology and applied Biochemistry. 27, 265-267. Siregar dan Hariyadi. 2011. Identifikasi Parameter Oceanografi Utama untuk Penentuan Daerah Penangkapan Ikan Lemuru dengan Menggunakan Citra Satelit Modis di Perairan Selat Bali. Jurnal Akuatik. 1(1) : 32-38.

Skripsi



Suhartono, M. T. 1989. Enzim dan Bioteknologi. Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Direktorat Jendral Pendidikan Tinggi antar Universitas Bioteknologi Institut Pertanian Bogor. Bogor. VI. 322 hlm. Sukmajaya, Y dan I. Suharjo. 2003. Lobster Air Tawar. Agro Media Pustaka. Suryanto, D dan E. Munir. 2006. Potensi pemanfaatan isolat bakteri kitinolitik lokal untuk pengendalian hayati jamur. Prosiding Seminar Hasil-hasil Penelitian. Departemen Biologi. Fakultas MIPA. Universitas Sumatera Utara. Hal 15. Susatyo, I., D. 2006. Isolasi dan Identifikasi Bakteri Gelatinolitik Asal Tambak Daerah Gresik dan lamongan. Skripsi. Program Studi S1 Budidaya Perairan. Universitas Airlangga. Surabaya. hal: 6-7. Susianthy, M. 2006. Pengaruh Jenis Alat Penggiling terhadap Karakteristik Kitin dari Kulit Rajungan. Skripsi. Program Studi Teknologi Hasil Perikanan. Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan. Institut Pertanian Bogor. hal 11. Thompson, S. E., M. Smith, M. C. Wilkinson and K. Peek. 2001. Identification and Characterization of a Chitinase Antigen from Pseudomonas aeruginosa Strain 385. Appl Environ. Microbiol.

Tumebow, S. S. 2011. Kualitas Air pada Kolam Lobster Air Tawar (Cherax quadricarinatus) di BBAT Tatelu. Jurnal Perikanan dan Kelautan Tropis. Fakultas Perikanan dan Kelautan. Universitas Sam Ratulangi. Manado. vol 7(3). Volk, W. A., dan Wheeler, M. F. 1993. Mikrobiologi Dasar. Erlangga. Jakarta. hal 39-44. Wickins, J.F. and. D.O. Lee. 2002. Crustacean Farming: Ranching and Culture. 2end edition. London: Blackwell Science. Wiyanto, R.H dan Hartono, R. 2003. Lobster Air Tawar Pembenihan dan Pembesaran. Penebar Swadaya. Jakarta Wardana, Y., M. 2011. Kajian Prospek Komoditas Induk Udang Windu pada Kawasan Pesisir Perairan Pantai di Daerah Kabupaten Aceh Besar. Vol 12(1) : 19. Wardoyo., R., S., A,. 2000. Peranan Tandon dalam Memperbaiki Mutu Air di Tambak Tradisional. Skripsi. Manajemen Sumberdaya Perairan. Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan. Institut Pertanian Bogor. Bogor. 31 hal. Yusmarini, R. Indrati, T. Utami, dan Y. Marsono. 2009. Isolasi dan identifikasi Bakteri Asam Laktat Proteolitik dari Susu Kedelai yang Terfermentasi Spontan. Program Studi Teknologi Hasil Pertanian. Universitas Riau Pekanbaru dan Fakultas Teknologi Pertanian. Universitas Gajah Mada Yogyakarta. Jurnal Natur Indonesia.

Skripsi


ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI KITINOLITIK YANG TERDAPAT PADA CANGKANG LOBSTER AIR TAWAR (Cherax quadricarinatus) PROGRAM STUDI BUDIDAYA PERAIRAN

Recommend Documents