HUBUNGAN KEKERABATAN BEBERAPA KULTIVAR PISANG (Musa sp.) UNTUK SIFAT KETAHANAN TERHADAP PENYAKIT BERDASARKAN RESISTANCE GENE ANALOG (RGA)
SKRIPSI
oleh :
SITI MAR’ATUSH SHOLIHAH NIM. 10620066
JURUSAN BIOLOGI FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI UNIVERSITAS ISLAM NEGERI MAULANA MALIK IBRAHIM MALANG 2014 i
HUBUNGAN KEKERABATAN BEBERAPA KULTIVAR PISANG(Musa sp.) UNTUK SIFAT KETAHANAN TERHADAP PENYAKIT BERDASARKAN RESISTANCE GENE ANALOG (RGA)
SKRIPSI
Diajukan Kepada : Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri (UIN)Maulana Malik Ibrahim Malang Untuk Memenuhi Salah Satu Persyaratan dalam Memperoleh Gelar Sarjana Sains (S. Si)
oleh : SITI MAR’ATUSH SHOLIHAH NIM. 10620066
JURUSAN BIOLOGI FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI UNIVERSITAS ISLAM NEGERI MAULANA MALIK IBRAHIM MALANG 2014 ii
iii
iv
MOTTO
“Bertakwalah kamu kepada Allah dan ketahuilah bahwa Allah Maha melihat apa yang kamu kerjakan” (Q.S Al- Baqarah 233).
وﺧﯾراﻟﻧﺎﺳﺄﻧﻔﻌﮭﻣﻠﻠﻧﺎس “Dan sebaik-baik manusia adalah orang yang paling bermanfaat bagi manusia.” (HR. Thabrani dan Daruquthni)”
Allah answer pray in 3 ways : Allah says YES n gives u what u want Allah says NO n gives u something better Allah says WAIT n gives u the best in his own time
“Penelitian Molekuler Mengajarkan Bahwa Sesuatu Yang Kelihatan Kecil Dapat Membawa Pengaruh Besar”
“Hwaiting Always”
v
Lembar Persembahan ﺑﺴﻢ ﷲ اﻟﺮ ﺣﻤﻦ اﻟﺮ ﺣﯿﻢ Ku persembahkan karya ini untuk kedua orang tuaku Ayah Nurul Huda dan Ibu Siti Almaidah yang selalu memotivasi, menasehati dan mendo’akan agar bersemangat dalam menuntut ilmu. Almarhum bapak H. Karnis, Bapak H. Tomo dan Almarhumah Mbah Ibu Hj. Siti Maimunah nasehat dan teladan yang engkau berikan semoga tetap terkenang Untuk Mbah H. Latifah terima kasih atas kasih sayang dan nasihat yang diberikan. Adikku Muhammad Miftahur Rizqi “si Hukting” yang selalu memotivasiku agar tetap terus bersemangat dan tidak mengeluh jika mendapat kesulitan. Dosen pembimbing Dr. Evika Sandi Savitri,M.P dan Andik Wijayanto, M.Si yang selalu memberikan saran dan nasehat dalam menyusun skripsi. Dosen Wali Dwi Suheriyanto, M.P yang selalu memberikan nasehat dan berbagi ilmu selama menempuh kuliah. Sahabat–sahabat Biologi B yang tercinta Arif, Mbak Bonek, Sahla ,Susi , Erika, Ririn, Afif, Ika, Zaim dan Khotim dan yang lainnya yang tidak dapat disebutkan satu-persatu tetaplah berjuang menggapai mimpi-mimpi kalian. Sahabat-Sahabat TravellingUs Subada, bang Satriyo, A.Shonhaji, Paqih, Mega dan Iva, semoga tetap selalu diberikan kesempatan untuk mengunjungi pesona alam yang indah dan terima kasih sudah membantu dalam pengambilan sampel daun pisang. Sahabat-Sahabat di Lab Biologi Molekuler Laboran Mas Ismail, Luluk, Asif, Mbak Nana, Fitrah,, Mbak Adel terima kasih sudah sering
vi
berbagipikiran, lembur bareng di Lab, terus bersemangat untuk mencapai cita-cita. Para Laboran Biologi Mbak Lil, Mas Basyar , Mas Zulfan,dan admin Mas Saleh terima kasih atas bantuannya selama ini. Teman-Teman HMJ Biologi mbak rike, dek Ifa, dkk terima kasih sudah sebagai tempat diskusi selain kuliah juga bertukar pikiran tentang organisasi dan kehidupan.Terus berjuang untuk HMJ Biologi. Teman-teman Asisten Praktikum Elik, Eva, Mbak Yanti, Bagus, Riftin dan mbak evi dan yang lain, terima kasih telah menjadi partner yang baik dan memberikan banyak pengalaman. Sahabat-sahabat kos Wisma Asri Emil, Estu , mbak Firsty, mbak Hen, Riris, terima kasih telah menjadi keluarga diperantauan. Masih banyak orang- orang yang sangat berarti dalam hidup semoga silaturahmi diantara kita tetap terjaga. Amin ربّ اﻟﻌﺎ ﻟﻤﯿﻦ
vii
اﻟﺤﻤﺪ
viii
KATA PENGANTAR
Assalamualaikum Warrahmatullahi Wabarokatuh Alhamdulillahirobbil ‘Alamin, segala puji bagi Allah Subhanahu wata’ala yang senantiasa memberikan Rahmat, sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi yang berjudul “Hubungan Kekerabatan beberapa kultivar pisang (Musa sp)untuk
sifat
tahan
penyakit
berdasarkan
Resistance
Gene
Analog
(RGA)”.Penyusunan skripsi ini tidak terlepas dari bimbingan, bantuan dan dukungan dari berbagai pihak Oleh karena itu penulis mengucapkan terima kasih kepada : 1. Prof.Dr.H. Mudjia Rahardjo, M.Siselaku Rektor Universitas Islam Negeri (UIN) Maulana Malik Ibrahim Malang. 2. Dr.drh.Hj. Bayyinatul Muchtaromah, M.Si selaku Dekan Fakultas Sains dn Teknologi Universitas Islam Negeri (UIN) Maulana Malik Ibrahim Malang. 3. Dr. Evika Sandi Savitri,M.Siselaku Ketua Jurusan Biologi sekaligus dosen pembimbing I yang telah banyak memberikan pelajaran dan saran pada penelitian ini. 4. Andik Wijayanto, M.Si selaku dosen pembimbing II yang telah sabar memberikan bimbingan, pengarahan, dan saran dalam pembuatan skripsi ini. 5. Kholifah Holil, M.Si dan Ruri Siti Resmisari, M.Si yang telah memberikan pengarahan dan saran dalam pembuatan skripsi ini.
ix
6. Dwi Suheriyanto, M.P selaku dosen wali yang telah memberikan banyak nasehat. 7. Seluruh dosen, staf administrasi dan karyawan jurusan Biologi yang telah membantu dalam pembuatan skripsi ini. 8. Ayah H. Nurul Huda dan Ibunda Hj. Siti Almaidah yang telah memberikan dukungan dan do’a serta mendorong penullis untuk tetap semangat dalam menyelesaikan skripsi ini. 9. Adik Muhammad Miftahur Rizqi yang selalu memberikan semangat dalam menyelesaikan skripsi ini. 10. Ibu P.E.R Prahardini dan petugas BPP Kab. Lumajang yang telah memberikan dukungan dan bantuan untuk pembuatan skripsi ini. 11. Teman-teman seperjuangan di Laboratorium Biologi Molekuler dan Genetika : Luluk, Asif, Nana, dan Fitrah yang telah memberikan bantuan dan saran dalam penelitian. 12. Teman-Teman Biologi 2010 yang telah memberikan pengalaman berharga selama menempuh kuliah. Penulis berharap semoga skripsi ini bermanfaat dalam menambah pengetahuan khususnya dalam bidang Biologi.. Harapan lain adalah skripsi ini dapat menjadi inspirasi untuk penelitian selanjutnya, khususnya dalam penerapan bidang biologi molekuler untuk pemuliaan tanaman. Wassalamualaikum Warahmatullahi Wabarokatuh. Malang, 29 Agustus 2014
Penulis
x
DAFTAR ISI
HALAMAN JUDUL ......................................................................................
i
HALAMAN PERSETUJUAN ......................................................................
ii
HALAMAN PENGESAHAN ........................................................................
iii
MOTTO ..........................................................................................................
iv
PERSEMBAHAN...........................................................................................
v
PERNYATAAN ORISINALITAS PENELITIAN ......................................
vii
KATA PENGANTAR ....................................................................................
viii
DAFTAR ISI ...................................................................................................
x
DAFTAR TABEL ..........................................................................................
xiii
DAFTAR GAMBAR ......................................................................................
xiv
DAFTAR LAMPIRAN ..................................................................................
xv
ABSTRAK ......................................................................................................
xvi
ABSTRACT ......................................................................................................
xvii
ﻣﻠﺨﺺ اﻟﺒﺤﺚ.......................................................................................... xviii BAB I. PENDAHULUAN .............................................................................
1
1.1 Latar Belakang ................................................................................
1
1.2 Rumusan Masalah ...........................................................................
5
1.3 Tujuan Penelitian ............................................................................
6
1.4 Manfaat Penelitian ..........................................................................
6
1.5 Batasan Masalah ..............................................................................
6
BAB II. TINJAUAN PUSTAKA...................................................................
7
2.1 Deskripsi Tanaman Pisang (Musa sp.) ...........................................
7
2.1.1 Tanaman Pisang Dalam Al-Qur’an ........................................
7
2.1.2Klasifikasi Tanaman Pisang (Musa sp) ...................................
8
xi
2.1.3 Morfologi Tanaman Pisang (Musa sp.) .................................
8
2.1.4 Keanekaragaman Genetik tanaman Pisang (Musa sp.) ..........
11
2.1.5 Penyakit Pada Tanaman Pisang ..............................................
13
2.2 Bentuk-bentuk Ketahanan Tumbuhan ..............................................
17
2.2.1 Ketahanan Mekanis ................................................................
17
2.2.2 Ketahanan Kimiawi ................................................................
17
2.2.3 Ketahanan Fungsional ............................................................
18
2.3 Genetika Sifat Ketahanan ................................................................
18
2.3.1 Ketahanan Gen Tunggal .........................................................
18
2.3.2 Ketahanan Gen Ganda ............................................................
19
2.3.3 Pewarisan Ketahanan..............................................................
20
2.4 Penggunaan Marka Genetik ............................................................
21
2.4.1 Pengertian dan Penggunaan Marka Genetik .........................
21
2.4.2 Penggunaan Resistance Gene Analog (RGA) Untuk Mengelompokkan Tanaman ...................................................
25
2.5 Analisis Keakeragaman Genetik Dari Marka Molekuler ................
31
BAB III. METODE PENELITIAN ..............................................................
32
3.1 Rancangan Penelitian.......................................................................
32
3.2 Waktu dan Tempat ...........................................................................
33
3.3 Alat dan Bahan ...............................................................................
33
3.3.1 Alat ..........................................................................................
33
3.3.2 Bahan .......................................................................................
34
3.4 Cara Kerja ........................................................................................
34
3.4.1 Pengambilan Sampel Daun.....................................................
34
3.4.2 Ekstraksi DNA .......................................................................
35
3.4.3 Pengukuran Kuantitas dan Kemurnian DNA .........................
36
3.4.4 Pengukuran Kualitas DNA (Visualisasi DNA) ......................
36
3.4.5 Pembuatan Primer (Primer Design) .......................................
36
3.4.6 Amplifikasi DNA ...................................................................
37
xii
3.4.7 Analisis Data .........................................................................
38
3.5 Kerangka Konsep Penelitian............................................................
40
BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN .....................................................
41
4.1 Ekstraksi DNA................................................................................
41
4.2 Amplifikasi DNA............................................................................
46
4.2.1 Amplifikasi DNA Menggunakan Primer NBS-LRR .....................
46
4.2.2 Amplifikasi DNA menggunakan Primer NLRR....................
48
4.3 Dendogram Pengelompokan Kultivar Pisang Untuk Sifat Ketahanan Terhadap Penyakit .........................................................
55
BAB V. PENUTUP .........................................................................................
60
5.1Kesimpulan ........................................................................................
60
5.2 Saran ................................................................................................
60
DAFTAR PUSTAKA .....................................................................................
61
LAMPIRAN-LAMPIRAN ............................................................................
69
xiii
DAFTAR TABEL Tabel 3.1 Kelompok sampel beberapa kultivar pisang .................................
32
Tabel 3.2 Hasil urutan sekuens basa primer RGA Pisang.............................
37
Tabel 3.3 Komposisi PCR Mix untuk 12 tabung PCR ..................................
37
Tabel 3.4 Pengkondisian suhu dan waktu PCR untuk primer NBS-LRR .....
38
Tabel 3.5 Pengkondisian suhu dan waktu PCR untuk primer NLRR ...........
38
Tabel 4.6 Pengukuran konsentrasi dan kemurnian DNA hasil ekstraksi ......
41
xiv
DAFTAR GAMBAR Gambar 2.1
Habitus tanaman, batang semu dan pelepah daun pisang........
9
Gambar 2.2
Bentuk daun tua dan daun muda pisang ...................................
9
Gambar 2.3
Tandan buah dengan braktea membuka, warna braktea bagian dalam, kepala putik, tepal, tepal bebas .........................
10
Gambar 2.4
Buah pisang Cavendish dan buah pisang Agung ......................
11
Gambar 2.5
Isolat dan konidia F. oxisforum ................................................
14
Gambar 2.6
Daun yang terserang penyakit F.oxisforum ..............................
14
Gambar 2.7
Gejala awal dan lanjut penyakit speackle daun ........................
16
Gambar 2.8
Contoh motif yang terkonservasi sebagai contoh target primer RGA..........................................................................................
28
Letak geografis Kecamatan Senduro dan Pasrujambeh Kabupaten Lumajang ...............................................................
33
Gambar 3.10 Kerangka konsep penelitian .....................................................
40
Gambar 3.11 Hasil ekstraksi DNA genom pisang dan keterangan sampel ....
43
Gambar 4.12 Hasil elektroforesis primer NBS-LRR dan keterangan sampel
47
Gambar 4.13 Hasil elektroforesis primer NLRR dan keterangan sampel ......
49
Gambar 4.14 Zimogram pita hasil amplifikasi dan keterangan sampel .........
50
Gambar 4.15 Dendogram pengelompokan berdasarkan primer RGA-NLRR
55
Gambar 3.9
xv
DAFTAR LAMPIRAN Lampiran 1. Skema Kerja ..............................................................................
69
Lampiran 2.
Pembuatan primer RGA berdasarkan NBS-LRR .....................
71
Lampiran 3.
Pembuatan dendogram pengelompokan ...................................
77
Lampiran 4.
Dokumentasi Penelitian ............................................................
78
Lampiran 5.
Karakterisasi morfologi pisang Agung Semeru, Mas
Kirana (kontrol tahan) dan Pisang Embug (kontrol rentan) .............................
xvi
80
ABSTRAK Sholihah, Siti Mar’atush. 2014. Hubungan Kekerabatan Beberapa Kultivar Pisang (Musa sp.) Untuk Sifat Ketahanan Terhadap Penyakit Berdasarkan Resistance Gene Analog (RGA). Skripsi. Jurusan Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim Malang. Pembimbing Biologi : Evika Sandi Savitri. Pembimbing Agama : Andik Wijayanto. Kata Kunci : Kultivar Pisang (Musa sp), Ketahanan Terhadap Penyakit, RGA. Pisang (Musa sp.) merupakan salah satu tanaman yang mempunyai keanekaragaman genetik tinggi, sehingga sifat-sifat dari tanaman ini juga beragam. Salah satu sifat unggul dari tanaman ini adalah tahan terhadap penyakit(contoh kultivar kultivar Mas Kirana dan Agung Semeru) dan rentan (kultivar Embug).Ketahanan dan kerentanan terhadap penyakit dikendalikan oleh RGA.Sekuens daerah terkonservasi pada RGA dapat digunakan sebagai dasar pembuatan primer, sehingga terdapat perbedaan pita amplifikasi antara kultivar tahan dan rentan. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hubungan kekerabatan beberapa kultivar pisang (Musa sp.) untuk sifat ketahanan terhadap penyakit berdasarkan RGA. Sampel yang digunakan dalam penelitian ini adalah daun 12 kultivar pisang. Pisang Agung Semeru dan Mas Kirana digunakan sebagai kontrol tahan. Sedangkan kontrol rentan adalah kultivar Embug, untuk dibandingkan pita DNA dengan 9 kultivar lain. Primer yang digunakan adalah primer daerah terkonservasi NBS-LRR dan NLRR. Tahap Penelitian meliputi ekstraksi DNA, Amplifikasi DNA dan pembuatan dendogram dengan softwere NTSys 2.01.Parameter data dalam penelitian ini adalah konsentrasi DNA, elektroforesis DNA genom, hasil amplifikasi DNA dan dendogram hubungan kekerabatan. Hasil penelitian menunjukkan konsentrasi DNA yang didapat berkisar antara 159,2 sampai 1131 ng/µl. Elektroforesis DNA menunjukkan beberapa sampel mepunyai pita yang tebal dan beberapa masih terdapat smear. Amplifikasi DNA menghasilkan pita berukuran 100 sampai 700 bp dan bersifat polimorfik. Hasil analisis hubungan kekerabatan menghasilkan Kultivar Mas Kirana sebagai kultivar tahan I berkerabat jauh dengan kelompok rentan dan tahan II dengan indeks kemiripan 0,54. Kultivar Embug sebagai kultivar rentan berkerabat dengan kultivar Barley dan Raja Nangka dengan indeks kemiripan 1, sedangkan dengan kultivar Kepok mempunyai indeks kemiripan 0,81. Kultivar Agung Semeru sebagai kontrol tahan II berkerabat dengan kultivar Susu dengan indeks similaritas kedua varietas ini adalah 1, sedangkan dengan kultivar Agung Jawa, Ambon Hijau dan Raja Mala indeks kemiripannya 0,91. Kultivar Cavendih berkerabat dengan kultivar tahan II dengan indeks kemiripan 0,73 dan kultivar Kidang dengan indeks kemiripan 0,68.
xvii
ABSTRACT Sholihah, Siti Mar'atush. 2014. Phylogenetic Relationship Some cultivars Banana (Musa sp.) For Resistanceof the Disease Based on Resistance Gene Analog (RGA). Thesis. Department of Biology, Faculty of Science and Technology of the State Islamic University of Maulana Malik Ibrahim Malang. Biology Supervisor: Dr.Evika Sandi Savitri, M.P.Religion Supervisor: Andik Wijayanto, M.Si. Keywords: Banana Cultivars (Musa sp), Resistance of the Disease, RGA.
Banana(Musa sp.) is one of theplants that have high genetic diversity, so that the propertiesof this plant are also diverse. One of thesuperior properties of this plantis resistant todisease (eg.cultivar Mas Kirana and Agung Semeru) and susceptible (cultivar Embug). Resistance and susceptible to diseaseis controlled by the RGA. Sequences of conserve dregionsin the RGA can be used as the basis for the primer design, so that there is a difference between resistant cultivars band amplificationand suspectible. Therefore,this studyaims to determine the phylogenetic relationship several cultivars of banana (Musa sp.) resistance the of disease based on RGA. The sample used in this study were 12 cultivars of banana leaves. Agung Semeru and Mas Kirana cultivar used asresistant controls. While cultivar Embug used as susceptible, tocompare DNA band with 9 other cultivars. Primer- primer used was NBS-LRR conserved regions and NLRR. The research phase includes DNA extraction, DNA amplification and manufacturedendogramwithNTSYS softwere 2.01. Data Parameter in this study is the concentration of DNA, genomic DNA electrophoresis, DNA amplification and dendogram results phylogenetic relathionship. The results showed that the DNA concentration sobtained ranged from159.2 to1131 ng/ µl. DNA electrophoresis showed some samples had thick ribbon and some still are smears. DNA amplification product measuring tape of 100 to700 bp and are polymorphic. The results ofthe analysis of phylogenetic relationship produce cultivars Mas Kirana as idistantly related cultivars resistantt osusceptible and resistant group II with similarity index of 0.54. Embug cultivars susceptible cultivarsas related to the Barley cultivars and Raja Nangka withsimilarityindex of 1,00 whereas the cultivars Kepok have similarity index of 0.81. Agung Semeru as control cultivars resistant II is related Susu Cultivar index similarity of both is 1,00, whilethe Agung Jawa Cultivar, Ambon Hijau and Raja Mala has similarity index of 0.91. Cavendish cultivars related with resistant cultivars II has a similarity index of 0.73 and Kidang cultivars the similarity index is 0.68.
xviii
ﻣﺴﺘﺨﻠﺺ اﻟﺒﺤﺚ اﻟﺼﺎﻟﺤﺔ.ﺳﺘﻲ ﻣﺮأة .2014ﻋﻼﻗﺔ اﻷﺳﺮﯾﺔ ﻟﻤﺘﻨﻮﻋﺔ اﻟﺠﻨﺎس ﻓﻲ اﻟﻤﻮز ﻋﻦ اﻟﺼﻔﺔ اﻟﺪﻓﺎﻋﯿﺔ و اﻟﻤﻘﺎوﻣﺔ ﻋﻦ اﻷﻣﺮاض ﻋﻠﻰ ﺣﺴﺐ اﻟﺘﺤﻠﯿﻠﯿﺔ اﻟﺘﻨﺎظﺮﯾﺔ. ﺑﺤﺚ ﻋﻠﻤﻲ ﻓﻲ ﻗﺴﻢ اﻟﺒﯿﻮﻟﻮﺟﯿﺎ ﻓﻲ ﻛﻠﯿﺔ اﻟﻌﻠﻮم واﻟﺘﻜﻨﻮﻟﻮﺟﯿﺎ ﺑﺠﺎﻣﻌﺔ ﻣﻮﻻﻧﺎﻣﺎﻟﻚ إﺑﺮاھﯿﻢ اﻹﺳﻼﻣﯿﺔ اﻟﺤﻜﻮﻣﯿﺔ ﻣﺎﻻﻧﻖ. اﻟﻤﺸﺮف اﻷول :دﻛﺘﻮرأﻓﯿﻜﺎ ﺳﺎﻧﺪي ﺳﺎﻓﻄﺮي .اﻟﻤﺸﺮف اﻟﺪﯾﻨﻲ :أﻧﺪﯾﻚ وﯾﺠﺎﯾﺎﻧﻄﻮاﻟﻤﺎﺟﺴﺘﯿﺮ. اﻟﻜﻠﻤﺎت اﻷﺳﺎﺳﯿﺔ :أﺻﻨﺎف اﻟﻤﻮز ،اﻟﻤﻘﺎوﻣﺔ ﻋﻦ اﻷﻣﺮاض ،اﻟﺘﺤﻠﯿﻠﯿﺔ اﻟﺘﻨﺎظﺮﯾﺔ اﻟﻤﻮز ﻣﻦ إﺣﺪى اﻟﻨﺒﺎت اﻟﺘﻲ ﻟﮭﺎ ﻣﺘﻨﻮﻋﺔ اﻟﺠﻨﺲ اﻟﻌﺎﻟﯿﺔ وﺻﻔﺎت اﻟﻨﺒﺎت اﻟﻤﺘﻨﻮﻋﺔ أﯾﻀﺎ .ﻣﻦ ﺻﻔﺎﺗﮫ اﻟﻤﺘﻔﻮﻗﺔ ھﻲ دﻓﺎﻋﮫ وﻗﻮﺗﮫ ﻣﻦ اﻷﻣﺮاض ) أﺻﻨﺎف ﻣﺎس ﻛﯿﺮاﻧﺎ وأﻏﻮﻧﻖ ﺳﻤﯿﺮو(و ﻋﺮﺿﺔ )أﺻﻨﺎف أﻣﺒﻮك( .واﻟﻤﻘﺎوﻣﺔ واﻟﺪﻓﺎﻋﺔ ﻋﻦ اﻷﻣﺮاض ﯾﻘﺒﻀﮫ اﻟﺘﺤﻠﯿﻠﯿﺔ اﻟﺘﻨﺎظﺮﯾﺔ .وﺗﺴﻠﺴﻞ اﻟﻤﻨﻄﻘﺔ اﻟﻤﺤﻔﻮظﺔ ﻓﻲ ،اﻟﺘﺤﻠﯿﻠﯿﺔ اﻟﺘﻨﺎظﺮﯾﺔ ﯾﺴﺘﺨﺪم ﻛﺎﻟﻤﻮاد اﻷﺳﺎﺳﯿﺔ ﻓﻲ ﺻﻨﺎﻋﺔ اﻷﺳﺎﺳﯿﺔ ﺣﺘﻰ ﺗﻜﻮن اﺧﺘﻼف ﺑﯿﻦ اﻟﻔﺮﻗﺔ اﻟﺘﻀﺨﯿﻢ وأﺻﻨﺎف اﻟﻤﻘﺎوﻣﺔ واﻟﻌﺮﺿﺔ. ﻟﺬﻟﻚ ﯾﮭﺪف ھﺬا اﻟﺒﺤﺚ ﻟﻤﻌﺮﻓﺔ اﻟﻌﻼﻗﺔ ﺑﯿﻦ أﺻﻨﺎف اﻷﺳﺮﯾﺔ ﻓﻲ اﻟﻤﻮز ﻓﻲ ﺻﻔﺔ اﻟﻤﻘﺎوﻣﺔ ﻋﻦ اﻷﻣﺮاض ﻋﻠﻰ ﺣﺴﺐ اﻟﺘﺤﻠﯿﻠﯿﺔ اﻟﺘﻨﺎظﺮﯾﺔ. واﻟﻌﯿﻨﺔ اﻟﻤﺴﺘﺨﺪﻣﺔ ﻓﻲ ھﺬا اﻟﺒﺤﺚ ھﻲ 12ﺻﻨﻒ اﻟﻤﻮز .وأﺻﻨﺎف ﻣﺎس ﻛﯿﺮاﻧﺎ وأﻏﻮﻧﻖ ﺳﻤﯿﺮوﺗﻜﻮن رﻛﺰا ﻓﻲ رﻛﺰ اﻟﻤﻘﺎوﻣﺔ و أﺻﻨﺎف أﻣﺒﻮك ﻛﺮﻛﺰ اﻟﻌﺮﺿﺔ ﻟﯿﻘﺎرن ﺑﺎﻟﻔﺮﻗﺔ DNAﺑـ 9ﻓﺮق أﺧﺮى .وأول ﻣﺎ ﯾﺴﺘﺨﺪم ھﻮ أﺳﺎس اﻟﻤﻨﻄﻘﺔ اﻟﻤﺤﻔﻮظﺔNBS-LRRو .NLRRواﺣﺘﻮى اﻟﺒﺤﺚ ﻋﻠﻰ ﻣﻘﺘﻄﻒ ،DNAﺗﻀﺨﯿﻢ DNAوﺻﻨﺎﻋﺔ dendogramﺑـ . 2،01 softwere NTSysواﻟﺒﺎراﻣﺘﺮ اﻟﻤﺘﻮﺳﻂ اﻟﻤﺴﺘﺨﺪﻣﺔ ﻓﻲ ھﺬا اﻟﺒﺤﺚ رﻛﺰ ،DNA ،elektroforesis DNA genomوﻧﺘﯿﺠﺔ amplifikasi DNAو dendogramﻋﻼﻗﺔ اﻷﺳﺮﯾﺔ. وﻧﺘﯿﺠﺔ ھﺬا اﻟﺒﺤﺚ ﺗﺪل ﻋﻠﻰ رﻛﺰ DNAاﻟﻤﻜﺘﺴﺐ ﻓﻲ رﻗﻢ ﻣﺎ ﺑﯿﻦ 1131 – 159،2 .ng/µlوﺗﻀﺨﯿﻢ DNAﯾﺪل ﻋﻠﻰ ﻋﯿﻨﺎت اﻟﺸﺮﯾﻂ اﻟﺘﻀﺨﯿﻢ وﻓﯿﮭﺎ .smearوﺗﻀﺨﯿﻢ DNA ﯾﻨﺘﺞ اﻟﺸﺮﯾﻂ ﺑـ bp 700-100وھﻮ .polimorfikوﻧﺘﯿﺠﺔ ﻋﻼﻗﺔ اﻷﺳﺮﯾﺔأﺻﻨﺎف ﻣﺎس ﻛﯿﺮاﻧﺎ ﻛﺼﻨﻒ ﻣﻘﺎوﻣﺔ 1ﺑﺎﻷﺳﺮﯾﺔ اﻟﺒﻌﯿﺪة ﺑﺼﻨﻒ اﻟﻌﺮﺿﺔ اﻟﻤﻘﺎوﻣﺔ 2ﺑﺎﻟﺘﺸﺎﺑﮫ .0،54و أﺻﻨﺎف أﻣﺒﻮك ﻛﺼﻨﻒ اﻟﻌﺮﺿﺔ ﺑﺎﻷﺳﺮﯾﺔ ﻣﻊ ﺻﻨﻒ ﺑﺮﻟﻲ ورﺗﺠﺎ ﻧﺎﻧﻜﺎ ﺑﺎﻟﺘﺸﺎﺑﮫ ،1و ﺻﻨﻒ ﻛﻔﻮك ﺑﺎﻟﺘﺸﺎﺑﮫ .0،81وﺻﻨﻒ وأﻏﻮﻧﻖ ﺳﻤﯿﺮو ﻛﺮﻛﺰ ﻣﻘﺎوﻣﺔ 2ﺑﺎﻷﺳﺮﯾﺔ ﻣﻊ ﺻﻨﻒ ﺳﻮﺳﻮ ﺑﺎﻟﺘﺸﺎﺑﮫ ،1و ﻓﻲ ﺻﻨﻒ Agung Jawa, Ambon Hijau dan Raja Malaﺑﺎﻟﺘﺸﺎﺑﮫ.0،91 وﺻﻨﻒ Cavendishﺑﺎﻷﺳﺮﯾﺔ ﺑﺼﻨﻒ اﻟﻤﻘﺎوﻣﺔ 2ﺑﺎﻟﺘﺸﺎﺑﮫ 0،73وﺻﻨﻒ Kidangﺑﺎﻟﺘﺸﺎﺑﮫ .0،68
xix
