Cystás fibrózisos betegek légúti mikrobiótái a MALDI "érában"
Kristóf Katalin, Juhász Emese, Pongrácz Júlia, Iván Miklós Semmelweis Egyetem, Laboratóriumi Medicina Intézet Klinikai Mikrobiológiai Diagnosztikai Laboratórium
CF és légúti patogének
A légúti fertőzések időbeli kezelése nagyban befolyásolja a CF-s betegek életkilátásait • Az un. nem-fermentáló baktériumok klasszikus identifikálása alacsony specificitású • Automata rendszerek alkalmazása nem megbízható - CF-s betegek P. aeruginosa azonosítási találata: 57%-non-mukoid; 40%mukoid (téves identifikálás: P.fluorescens/P. putida, Alcaligenes spp.)
• Molekuláris módszerek - 16S és 23S rRNS PCR – genus szinten vagy „group” szinten; RFLP analízis 16S rRNS vagy recA gén - Genomovariánsok azonosítására még specifikusabb próbák szükségesek
• MALDI-TOF - Rutinban alkalmazható, gyors eredményt adó módszer • Jövő: komplex, mikróba-közösségek vizsgálata (szekvenálásos technikák)
Vizsgálati eredményeink 2013-2014
Ábra: CF betegek hány %-a fertőződött/kolonizálódott a jelzett patogénekkel a légúti mintáik vizsgálatai alapján (tisztított adatok)
Achromobacter xylosoxidans (Alcaligenes xylosoxidans)
Növekvő prevalencia (3-8%) Gyakori ko-fertőzésekben Leírások keresztfertőzésekről
- Nemfermentáló, oxidáz-pozitív - Lassan növő (EM: laktóz negatív) -
Kataláz pozitív, indol negatív, H2S negatív, ureáz:negatív
- Biofilmképző - Tüdőgyulladás/károsítás~ PA
Achromobacter xylosoxidans – antibiotikum rezisztencia
Béta-laktamázok: - intrinsic OXA114, OXA243, OXA2 - Cefalosporinázok, blaampC - Szerzett karbapenemázok (blaIMP )
Efflux mechanizmus (AxyABM, AxyXY-OprZ): - VELESZÜLETETT AMINOGLIKOZID REZISZTENCIA - cefepim, karbapenem, fluorokinolon, (tetracyclin, erythromycin) rezisztencia
Enzimtermelés: - Aminoglikozidokat bontó enzimek (AAC(6’)-Ib és aadA1)
EUCAST – Rezisztens:ertapenem, ceftriaxon Egyéb ajánlások - Rezisztens: amoxycillin/klavulánsav, cefepim, ciprofloxacin, AG, fosfomycin
Achromobacter xylosoxidans – terápiás lehetőségek Irodalmi in vitro érzékenységi eredmények : Piperacillin/tazobactam: 40-100% Meropenem: 52-100% Sulphametoxazole/trimethoprim: 0-92% – növekvő R tendencia Ceftazidim: 45-85% (többi CS R) Minocyclin/Tigecyclin 44-51% – TIG MIC 4ug/ml! Colistin: 28-70 % Chloramphenicol: 22-82% Fluorokinolonok: LEV/MXF alacsonyabb MIC
Elsőként választandó: piperacillin/tazobactam Meropenem Sulphametoxazole/trimethoprim Esetleg: Ceftazidim Minocyclin Colistin Chloramphenicol Kombináció: MEM+CIP/LEV+/-colistin inhaláció Általában javasolt a kombináció
Pseudomonas genus - Taxonómiai változások!
Baktérium
Klinikum/izolátum forrása
P. fluorescens P. putida
CF-s beteg légúti mintája, transzfúziós szövődményként szepszis, pseudobakterémia nozokomiális szepszis, pneumónia, ÚTI; (CF, idős kor, immundeficiencia - fontos alapbetegség)
Pseudomonas monteilli
P. veronii
gasztrointesztinális gyulladásos pseudotumor
P. monteilii
bizonytalan klinikum - széklet, epe, placenta, bronchusváladék, pleurális folyadék, vizelet
Pseudomonas putida
P. mosseilii
bizonytalan klinikum - számos különböző klinikai minta
P. stutzeri
CF-s beteg légúti mintája, alkohol-abúzus melleti pneumónia, immunkomprimált beteg bakterémiája, meningitise, pneumóniája, osteomyelitis, iatrogén endphtalmitis, pseudobakterémia; bizonytalan klinikum - intubált beteg légúti mintája, vizelet, sebváladék
P. mendocina
endocarditis
P. alcaligenes
endocarditis (BMT) meningitis; köpet izolátum - bizonytalan klinikum;sebváladék - társfertőzőként - bizonytalan klinikum bakterémia, cellulitis, osteomyeltis, peritonitis, endocarditis, műtét utáni meningitis centrális vénás kanül eredetű bakterémia immunkomprimált betegben, peritonitis peritoneális dialízis után, cellulitis, tályog, sebfertőzés, műtét utáni meningitis
P. pseudoalcaligenes P. luteola P. oryzihabitans
- Általában érzékenyek az antipseudomonas szerekre - EUCAST P.aeruginosa-ra vonatkozó ajánlás alkalmazható
Pseudomonas fluorescens Pseudomonas stutzeri Pseudomonas mosselii
Felnőttek pseudomonas sp.-nek faji megoszlása (2013-14: 14 beteg) Gyermekek: 3 beteg P. monteilii 1 beteg P. stutzeri
Egyéb nem fermentáló baktériumok
Ochrobactrum antropi Paracoccus yeeii Sphingobacterium multivorum gyermek
Pandorea sputorum
felnőtt Chryseobacterium gleum Delftia acidovorans Rhizobium radiobacter 0
1
2
3
4
5
Ábra: kolonizált/fertőzött betegek száma 2013-14
6
Pandoraea sputorum Pandoraea : 2000-ben a korábbi Pseudomonas rRNA group II.ből leválasztott nemzetség Jelenleg 9 faj (mindegyik CF-s betegből izolált) Burkholderia vagy Ralstonia fajoknak azonosíthatjuk biokémiai tesztekkel (filogenetikai hasonlóság) Általában érzékeny: piperacillin-tazobactam, imipenem, trimethoprim-sulfamethoxazol
Általában rezisztens: aminoglikozidok, cefotaxim/ceftriaxon, ceftazidim, ciprofloxacin amoxicillin-klavulánsav, meropenem, Egyedi pontos vizsgálat!
Lassan növő, oxidáz-pozitív, nem fermentáló baktérium Nyákos telepek (biofilmképzés) Colistin rezisztens!
Ochrobactrum anthropi (Achromobacter sp.) Korábban Achromobacter A, C, D (előtte CDC Vd-1, Vd-2)- (Név eredete: ochro: pale yellow) Rezisztencia tulajdonságok: AmpC típusú β-laktamáz ⇒ Általános β-laktám R ⇒ Imipenem terápia hatástalansága Érzékeny: SXT, fluorokinolonok Mérsékelt/variábilis érzékenység: Aminoglikozidok, tetracyclinek
- Lassan növő, nyákos telepek - Oxidáz pozitív, EM: laktóz negatív, nem-fermentáló - Biofilmképzés! Colistin rezisztens!
Rhizobium radiobacter (Agrobacterium radiobacter) Jól ismert növénypatogén Katéter/kanülasszociált fertőzések okozója főleg Alacsony virulencia Variábilis atb. érzékenység Általában érzékenyek: Cefepim, harmadik generációs CS, piperacillin-tazobactam, karbapenemek, ciprofloxacin, sulfamethoxazole/trimethoprim – re ! Indukálható cefalosporináz termelő
Lassan növő, nyákos, oxidázpozitív, EM: laktóz negatív telepek
És a többiek… Delftia acidovorans (Comamonas acidovorans, Pseudomonas acidovorans) Paracoccus yeeii Chryseobacterium gleum (Flavobacterium IIb)
Összefoglalás
• Egyéb nem-fermentálók jelentősége nő • Lehetőségeink szerint pontos identifikálás (előtte izolálás!) => természetes rezisztencia => beteg nyomonkövetése
Filogenetikai diagramja egy CF-s köpetmintának: 169 OUT Plos One 2012; 7(9)
Köszönöm a figyelmet!