MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA
Studijní katalog Biochemie v akademickém roce 2014/2015 Brno, květen 2014
2014 Masarykova univerzita ISBN 978-80-210-6833-9
OBSAH
Obsah Úvodní slovo
6
1
Harmonogram akademického roku 2014/2015
9
2
Personální obsazení Přírodovědecké fakulty
11
3
Jazyková příprava 3.1 Bakalářské studijní programy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.2 Magisterské studijní programy . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
15 15 16
4
Výuka tělesné výchovy na MU v akademickém roce 2014/2015
17
5
Základy práva, ekonomie a evropských studií
19
6
Bakalářský studijní program Biochemie 6.1 Studijní obor: Biochemie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Doporučené volitelné předměty pro bakalářský program Biochemie . . 6.2 Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika . . . . . . . . . Doporučené volitelné předměty pro obor Chemoinformatika a bioinformatika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
20 20 26 32
7
Bakalářský studijní program Aplikovaná biochemie 7.1 Studijní obor: Aplikovaná biochemie . . . . . . . . . . . . . . . .
40 41
8
Magisterský studijní program Biochemie 8.1 Studijní obor: Biochemie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Doporučené volitelné předměty pro magisterský program Biochemie . . 8.2 Studijní obor: Analytická biochemie . . . . . . . . . . . . . . . . Doporučené volitelné předměty pro magisterský program Analytická biochemie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8.3 Studijní obor: Biomolekulární chemie . . . . . . . . . . . . . . . 8.4 Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika . . . . . . . . . 8.5 Studijní obor: Genomika a proteomika . . . . . . . . . . . . . . .
49 50 53 58
38
62 67 75 81
3
Struktura záznamů v tabulkách Tabulky v doporučených studijních plánech mají následující strukturu: kód
název
kredity rozsah zakončení
učitel
kód název kredity
identifikace předmětu v rámci IS MU název předmětu kreditová hodnota předmětu ve formátu V + Z, kde V je tzv. implicitní počet kreditů, charakterizující zátěž spojenou s plněním průběžných požadavků a Z je počet kreditů za doporučené ukončení předmětu.1 Je-li Z = 0, pak je počet kreditů uveden pouze v jednoduchém tvaru V .
rozsah
v případě pravidelné týdenní výuky počet hodin ve struktuře p/c/l , kde p je počet hodin přednášky, c počet hodin cvičení a l počet hodin laboratorních cvičení v případě jednorázové blokové výuky číselný údaj se zkratkou h (hodiny), D (dny) nebo T (týdny)
zakončení
učitel
z zápočet kz klasifikovaný zápočet zk zkouška k kolokvium seznam osob vyučujících daný předmět
V případě nesrovnalostí mezi údaji ve Studijním katalogu a Informačním systému MU jsou směrodatné údaje v Informačním systému. Aktuální elektronická verze tohoto dokumentu je přístupná na adrese http://www.sci.muni.cz/katalog. 1 Je-li
to podmínkami studijního programu a konkrétního předmětu dovoleno, lze volit odlišné zakončení; v takovém případě se hodnota Z u předmětu PřF stanoví podle zvoleného zakončení
Úvodní slovo Milé studentky a milí studenti, jako každý rok bych vám chtěl napsat několik slov do úvodu této brožurky, která podává přehled o nabídce a možnostech studia na Přírodovědecké fakultě v nadcházejícím akademickém roce a stává se tak užitečnou pomůckou studentů na jejich cestě za vzděláním. Pro ty, kteří na půdu Přírodovědecké fakulty vstupují poprvé, dovolte úvodem alespoň stručnou informaci o historii fakulty. Ta vždy byla úzce spjata s historií Masarykovy univerzity, která byla založena v roce 1919. Společně s fakultou lékařskou, filosofickou a právnickou tak byla Přírodovědecká fakulta jednou ze zakládajících fakult Masarykovy univerzity. V současné době má fakulta akreditováno 126 oborů bakalářských, magisterských a doktorských, v nichž poskytuje vysokoškolské vzdělání v oblasti věd matematických, fyzikálních, chemických, biologických a v oblasti věd o Zemi. Na fakultě studuje přibližně 3800 studentů, z toho 920 studentů postgraduálních. Vysoký podíl postgraduálních studentů je jedním z charakteristických rysů fakulty. Fakulta se člení na 13 ústavů, které zajišťují veškerou činnost související s realizací výuky a výzkumu na fakultě. Fakulta má nově akreditované programy a obory jak odborné, tak učitelské. V odborných programech připravuje odborné a vědecké pracovníky, kteří nacházejí uplatnění v organizacích zabývajících se základním i aplikovaným výzkumem, v průmyslu, zemědělství, ochraně životního prostředí i státní správě. Cílem učitelských oborů je příprava budoucích učitelů středních škol. Vysoká úroveň poskytovaného vzdělání je podmíněna intenzivní vědeckou činností. V rámci Masarykovy univerzity je Přírodovědecká fakulta fakultou s nejvyšším vědeckým tvůrčím výkonem a patří v tomto aspektu mezi velice prestižní instituce nejen v národním, ale v případě některých oborů také v mezinárodním kontextu. Fakulta prošla v posledních letech mohutným investičním a stavebním rozvojem. V rámci VaVpI projektu CETOCOEN byl v kampusu Bohunice dokončen nový pavilon, který slouží jak pedagogické, tak i výzkumné činnosti. Dalšímu rozvoji tohoto výzkumného centra jistě napomůže přidělený projekt z Národního programu udržitelnosti. Začátkem roku 2014 byla zahájena výuka ve čtyřech pavilonech financovaných projektem CESEB, které jsou využívány biologickými obory. Dokončeny jsou rovněž pavilony projektu CEITEC na jehož realizaci se výraznou měrou podílejí pracovníci fakulty. Další významné investiční VaVpI prostředky posílí aplikovaný výzkum v oblasti nanotechnologii v rámci projektu CEPLANT. Modernizaci výuky slouží rovněž OPVK projekty. Tyto projekty sice postupně končí, nicméně fakulta již připravuje projekty do nových operačních programů. Závěrem bych rád popřál všem těm, kteří se svým studiem na fakultě teprve začínají, i těm, kteří v něm úspěšně pokračují, hodně zdaru v nadcházejícím akademickém roce. Věřím, že bude naplněn činorodým úsilím a snahou o dosažení co nejlepších výsledků při studiu i badatelské činnosti. Jaromír Leichmann, děkan
6
Úvodní slovo
Vážené a milé studentky, vážení a milí studenti, dovolte mi, abych vás před počínajícím akademickým rokem 2014/2015 přivítal na Přírodovědecké fakultě MU. Studijní katalog, který právě otvíráte, se skládá ze sedmi příruček odpovídajících sedmi skupinám studijních programů nabízených fakultou (matematika, fyzika, chemie, biochemie, biologie, geologie a geografie). Vedle obecných informací o fakultě a harmonogramu akademického roku 2014/2015, katalog obsahuje závazná pravidla, která musíte respektovat při sestavování vašeho vlastního studijního plánu. Podstatnou částí katalogu jsou pak doporučené studijní plány, jež představují optimální způsob, jak vyhovět požadavkům studijních programů a absolvovat celé studium během standardní doby. Současné studium na Přírodovědecké fakultě nabízí studentům značnou volnost při výběru zaměření a časového rozvržení studia. S touto volností je však spojena i vyšší míra zodpovědnosti uspořádat si studium tak, aby probíhalo v souladu s pravidly studijního programu i s nadřazenými právními normami a předpisy. Základními dokumenty stanovujícími pravidla studia na Přírodovědecké fakultě MU jsou: 1. Zákon č. 111/1998 Sb. O vysokých školách a o změně a doplnění dalších zákonů a jeho novely, 2. Statut Masarykovy univerzity a přílohy, 3. Statut Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity a přílohy, 4. Studijní a zkušební řád Masarykovy univerzity (SZŘ) a opatření děkana k tomuto řádu, 5. Opatření děkana Výuka a tvorba studijních programů, 6. Vnitřní předpis fakulty Disciplinární řád pro studenty. Uvedené dokumenty lze nalézt na www stránkách fakulty resp. univerzity, například na fakultní stránce http://www.sci.muni.cz (odkaz „O fakultě“ a „Legislativa“). Doporučuji věnovat pozornost zejména Studijnímu a zkušebnímu řádu. Podrobný komentář naleznete na http://is.muni.cz/auth/help/szr. Od 1. 2. 2012 platí na MU nový Studijní a zkušební řád, který v několika ustanoveních zpřísňuje podmínky úspěšného studia. V souladu s tímto řádem byla aktualizována i opatření děkana k tomuto řádu. Dovolte mně na tomto místě upozornit na některé vybrané pasáže výše zmíněných předpisů, které jsou nejčastějšími příčinami studijních problémů: •
v prvním a druhém semestru bakalářského studia si studenti musí zapsat všechny povinné a povinně volitelné předměty dle doporučeného studijního plánu (opatření k čl. 11, odst. 1 v druhém dokumentu pod číslem 4 výše uvedeného seznamu). Nesplnění této povinnosti může vést k dodatečnému zapsání předmětů studijním oddělením a následným komplikacím spojeným s jejich ukončením. Tato povinnost neplatí, pokud je zápis znemožněn nesplněním prerekvizity předmětu.
•
Pro zápis do dalšího semestru je nutné v předchozím semestru získat minimálně 20 kreditů, případně 45 kreditů v součtu za dva předchozí semestry. Do tohoto kriteria se
7
Úvodní slovo nezapočítávají kredity předmětů uznaných z předchozího studia (čl. 12, odst. 2 a čl. 14 odst. 6 v SZŘ). Výjimky z této povinnosti budou udělovány jen zcela ojediněle v závažných a řádně zdůvodněných případech. Navíc student musí mít úspěšně ukončeny všechny opakované předměty (čl. 12, odst. 1 tamtéž). Nový SZŘ připouští i další možnost pro zápis do následujícího semestru, detailně popsanou v SZŘ čl. 12, odst. 2d. •
Je nutné dodržovat termíny odevzdání bakalářských a diplomových prací stanovené harmonogramem akademického roku. Výjimky budou udělovány jen ojediněle v závažných a řádně zdůvodněných případech.
•
Od akademického roku 2014/2015 došlo k významné změně pravidel odevzdávání bakalářských a diplomových prací. Nově je možné práci odevzdat až poté, co student získá zápočet z předmětu Bakalářská práce 2 resp. Diplomová práce 4.
Budete-li mít jakékoliv nejasnosti týkající se vašeho studia, obracejte se na zástupce pro pedagogické záležitosti ředitele ústavu zodpovědného za realizaci vašeho studijního oboru (přiřazení oborů k ústavům je dáno opatřením děkana č. 4/2013), popřípadě na garanta vašeho studijního programu. Obtíže s interpretací Studijního a zkušebního řádu můžete řešit s pracovnicemi studijního oddělení nebo se mnou. Včasnou konzultací praktických otázek spojených s průběhem studia lze předejít vážným problémům při studiu. Závěrem mi dovolte popřát vám úspěšné studium, které vás dobře připraví na vaše budoucí povolání a současně vám přinese radost z poznávání přírodních věd. Zdeněk Bochníček, proděkan
8
1 Harmonogram akademického roku 2014/2015
1
Harmonogram akademického roku 2014/2015
Podzimní semestr Registrace Žádost o zápis do semestru (kromě 1. roku studia) Zápis do semestru (kromě 1. roku studia) Období pro zápis předmětů Výuka Období prázdnin Zkouškové období
2. června 2014 – 3. srpna 2014 26. května 2014 – 22. září 2014 1. srpna 2014 – 22. září 2014 7. září 2014 15. září 2014 22. prosince 2014 29. prosince 2014
– – – –
28. září 2014 19. prosince 2014 28. prosince 2014 6. února 2015
24. listopadu 2014 29. prosince 2014 2. února 2015 1. února 2015 16. února 2015 25. května 2015 4. července 2015
– – – – – – –
31. prosince 2014 23. února 2015 23. února 2015 1. března 2015 22. května 2015 3. července 2015 31. srpna 2015
Jarní semestr Registrace Žádost o zápis do semestru Zápis do semestru Období pro zápis předmětů Výuka Zkouškové období Období prázdnin
Ukončení studia v bakalářských a magisterských studijních programech
Podzimní semestr Odevzdání bakalářských a diplomových prací Státní závěrečné zkoušky
do 7. ledna 2015 2. února 2015 – 13. února 2015
Jarní semestr Státní závěrečné zkoušky – bakalářské studium Státní závěrečné zkoušky – magisterské studium Opravné závěrečné zkoušky – jen bakalářské studium
1. června 2015 – 30. června 2015 1. června 2015 – 30. června 2015 24. srpna 2015 – 4. září 2015
9
1 Harmonogram akademického roku 2014/2015
Odevzdání bakalářských a diplomových prací na jednotlivých ústavech Geografický ústav Ústav antropologie Ústav biochemie Ústav botaniky a zoologie
bakalářská práce 14. května 22. května 18. května 30. dubna
diplomová práce 7. května 22. května 18. května 30. dubna
Ústav experimentální biologie
12. května
12. května
Ústav fyzikální elektroniky
22. května
15. května
Ústav fyziky kondenzovaných látek
22. května
15. května
Ústav geologických věd Ústav chemie Ústav matematiky a statistiky
7. května 29. května 29. května
15. května 15. května 13. května
Ústav teoretické fyziky a astrofyziky obor Matematická biologie
22. května 25. května
15. května 25. května
Státní rigorózní zkoušky Příjem přihlášek Státní rigorózní zkoušky
1. září 2014 – 30. září 2014 1. listopadu 2014 – 31. ledna 2015
Doktorské studijní programy Registrace předmětů do podzimního semestru Registrace předmětů do jarního semestru Přihlášky ke studiu Přijímací zkoušky Hlavní přijímací komise Přihlášky ke státní doktorské zkoušce a obhajoby disertačních prací
10
2. června 2014 – 3. srpna 2014 24. listopadu 2014 – 31. prosince 2014 1. února 2015 – 30. dubna 2015 17. června 2015 24. června 2015 průběžně celý rok
2 Personální obsazení Přírodovědecké fakulty
2
Přírodovědecká fakulta
611 37 Brno, Kotlářská 2, telefon: 549 49 1111, 549 49 xxxx fax: 541 211 214
(xxxx viz http://www.muni.cz/sci/people/)
Děkanát Přírodovědecké fakulty Děkan: Proděkan pro rozvoj a vnější vztahy, statutární zástupce děkana: Proděkan pro ediční činnost a informační systémy: Proděkan pro ekonomiku: Proděkan pro výzkum, vývoj, zahraniční vztahy a doktorské studium: Proděkan pro studium: Tajemník fakulty: Sekretariát děkana: Studijní oddělení:
Oddělení pro vědu, výzkum, projektovou podporu, akademické kvalifikace, zahraniční vztahy a doktorské studium Referát pro akademické kvalifikace a doktorské studium
Referát pro koordinaci projektů vědy a výzkumu Referát pro podporu projektů operačních programů Oddělení personální a mzdové:
doc. RNDr. Jaromír Leichmann, Dr. doc. RNDr. Milan Gelnar, CSc.
1401 3920
prof. RNDr. David Trunec, CSc.
4660
prof. RNDr. Roman Šimon Hilscher, DSc. prof. RNDr. Viktor Kanický, DrSc.
4226
doc. RNDr. Zdeněk Bochníček, Dr. RNDr. Mgr. Daniela Dvorská Irena Pakostová Ing. Marcela Korčeková, vedoucí Alena Doupovcová Marie Halasová Hana Holubová Irena Mitášová Pavlína Ondráčková, DiS. Anna Rychtáříková
3221 1402 6360 1405 5549 6039 6398 5918 3303 3577
Roman Čermák M.Sc., vedoucí Ing. Zdeňka Rašková, vedoucí Mgr. Petr Bureš Mgr. Anísa Kabarová Iva Klímová Ing. Andrea Křížová Ing. Magdalena Vozárová, vedoucí personální složení na www stránkách děkanátu Roman Čermák M.Sc., vedoucí personální složení na www stránkách děkanátu Jana Kneblová, vedoucí Ing. Kristýna Anderlová Jana Kundrová Eva Pavlíková Bc. Eva Schneiderová Dana Stárková Eva Šťastníková Ing. Marcela Vrzalová Ing. Eva Žufanová
1406 6530 3278 6358 7277 7103 5458
4774
1406
4916 6945 4120 6422 5862 3438 8131 8238 3437
11
2 Personální obsazení Přírodovědecké fakulty Ekonomické oddělení:
Právník Technicko-provozní oddělení: Oddělení IKT: Ústřední knihovna: Botanická zahrada:
Ing. Roman Hladík, vedoucí Jarmila Fraňková, pokladna Ing. Jana Jirků Marcela Kočířová Lenka Miškechová Zdeňka Nekvapilová Helena Pilerová Dagmar Siláková Petra Rozíková Ing. Marcela Sochorová Hana Svobodová Mgr. Vlastimil Slovák Mgr. Dana Konečná, vedoucí RNDr. Čestmír Greger, vedoucí Mgr. Taťána Škarková, vedoucí Ing. Marie Tupá, vedoucí
Organizační struktura Přírodovědecké fakulty
14311010 — Ústav matematiky a statistiky 611 37 Brno, Kotlářská 2, telefon: 549 49 1482 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
prof. RNDr. Jiří Rosický, DrSc. RNDr. Pavel Horák http://www.muni.cz/sci/311010/people/ http://www.math.muni.cz/ http://www.math.muni.cz/studijni/
14312020 — Ústav fyziky kondenzovaných látek 611 37 Brno, Kotlářská 2, telefon: 549 49 6981 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
prof. RNDr. Josef Humlíček, CSc. Mgr. Dušan Hemzal, Ph.D. http://www.muni.cz/sci/312020/people/ http://www.physics.muni.cz/ufkl/ http://www.physics.muni.cz/ufkl/Vyuka/
14312030 — Ústav fyzikální elektroniky 611 37 Brno, Kotlářská 2, telefon: 549 49 3052 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
12
prof. RNDr. Mirko Černák, CSc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. http://www.muni.cz/sci/312030/people/ http://www.physics.muni.cz/kfe/ http://www.physics.muni.cz/kfe/
4246 3802 4350 3746 5910 6108 5650 6998 1111 4980 8222 5575 1409 1407 1408 7772
2 Personální obsazení Přírodovědecké fakulty
14312040 — Ústav teoretické fyziky a astrofyziky 611 37 Brno, Kotlářská 2, telefon: 549 49 4083 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
prof. RNDr. Rikard von Unge, Ph.D. Mgr. Michael Krbek, Ph.D. http://www.muni.cz/sci/312040/people/ http://www.physics.muni.cz/?q=utfa http://www.physics.muni.cz/?q=utfa
14313010 — Ústav chemie 625 00 Brno, Kamenice 5, telefon: 549 49 6000 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
doc. RNDr. Ctibor Mazal, CSc. doc. Mgr. Marek Nečas, Ph.D. http://www.muni.cz/sci/313010/people/ http://www.sci.muni.cz/chemsekce/ http://www.sci.muni.cz/chemsekce/
14313050 — Ústav biochemie 625 00 Brno, Kamenice 5, telefon: 549 49 3818 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
doc. Ing. Martin Mandl, CSc. doc. RNDr. Oldřich Janiczek, CSc. http://www.muni.cz/sci/313050/people/ http://www.sci.muni.cz/ustav/ubch http://www.sci.muni.cz/ustav/ubch
14313060 — Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí 625 00 Brno, Kamenice 3, telefon: 549 49 1474 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
prof. RNDr. Jana Klánová, Ph.D. doc. RNDr. Jakub Hofman, Ph.D. http://www.muni.cz/sci/313060/people/ http://www.recetox.muni.cz/ http://www.recetox.muni.cz/index.php?s=studium
14314010 — Ústav experimentální biologie 625 00 Brno, Kamenice 5, telefon: 549 49 8244 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. prof. RNDr. Renata Veselská, Ph.D., M.Sc. http://www.muni.cz/sci/314010/people/ http://www.sci.muni.cz/UEB/ http://www.sci.muni.cz/UEB/
13
2 Personální obsazení Přírodovědecké fakulty
14314020 — Ústav botaniky a zoologie 625 00 Brno, Kamenice 5, telefon: 549 49 1439 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
doc. RNDr. Jan Helešic, Ph.D. Mgr. Iveta Hodová, Ph.D. http://www.muni.cz/sci/314020/people/ http://botzool.sci.muni.cz/ http://botzool.sci.muni.cz/
14314070 — Ústav antropologie 603 00 Brno, Vinařská 5, telefon: 549 49 1432 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
prof. PhDr. Jiří Svoboda, DrSc. doc. RNDr. Miroslav Králík, Ph.D. http://www.muni.cz/sci/314070/people/ http://anthrop.sci.muni.cz/ http://anthrop.sci.muni.cz/
14315010 — Ústav geologických věd 611 37 Brno, Kotlářská 2, telefon: 549 49 4322 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
doc. RNDr. Josef Zeman, CSc. doc. Mgr. Martin Ivanov, Dr. http://www.muni.cz/sci/315010/people/ http://www.ugv.cz/ http://www.ugv.cz/
14315030 — Geografický ústav 611 37 Brno, Kotlářská 2, telefon: 549 49 1491 Ředitel ústavu: Pedagogický zástupce: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
doc. RNDr. Petr Dobrovolný, CSc. RNDr. Vladimír Herber, CSc. http://www.muni.cz/sci/315030/people/ http://www.geogr.muni.cz/ http://www.geogr.muni.cz/cz/studium/
14316000 — Národní centrum pro výzkum biomolekul 625 00 Brno, Kamenice 5, telefon: 549 49 5252 Ředitel ústavu: Seznam pracovníků: WWW ústavu: Informace pro studenty:
14
prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc. http://www.muni.cz/sci/316000/people/ http://ncbr.chemi.muni.cz/ http://ncbr.chemi.muni.cz/
3 Jazyková příprava
3
Jazyková příprava
Povinnosti, popsané v této části katalogu, představují pouze minimální požadavky, vztahující se na všechny studenty bakalářských a magisterských studijních programů PřF. V případě některých studijních programů nebo oborů jsou tyto požadavky zesíleny – podrobné informace naleznete v příslušné části studijního katalogu.
3.1
Bakalářské studijní programy
Každý student bakalářského studijního programu PřF musí před státní závěrečnou zkouškou absolvovat předmět: kód
název
kredity
rozsah
JA001
Odborná angličtina – zkouška
0+2 kr.
0/0
učitel
zk
CJV MU
Cílem této zkoušky je prověřit základní akademické a odborné jazykové dovednosti, zejména ty, které jsou potřebné pro studium odborné literatury a pro pokračování v magisterském studiu. V případě absolvování předmětu JA002 Pokročilá odborná angličtina – zkouška již v bakalářském stupni není třeba skládat zkoušku JA001. Podpůrná (volitelná) výuka k této zkoušce je realizována prostřednictvím předmětů: kód
název
kredity
rozsah
JAC01 JAC02
Angličtina pro chemiky 1 Angličtina pro chemiky 2
2 kr. 2 kr.
0/2 0/2
učitel
z z
CJV MU CJV MU
Volitelná výuka kód
název
kredity
rozsah
JA003
Výběrová angličtina pro přírodovědce
4 kr.
0/4
učitel
z
CJV MU
Vypisovány jsou rovněž předměty, ověřující znalosti francouzštiny, němčiny, ruštiny a španělštiny ve stejném rozsahu jako v případě angličtiny. Tyto předměty jsou vypisovány jako volitelné (garant studijního programu může zakotvit povinnost absolvovat některý z těchto předmětů ve studijních plánech v příslušné části katalogu). kód
název
kredity
rozsah
JF001 JN001 JR001 JS001
Odborná francouzština – zkouška Odborná němčina – zkouška Odborná ruština – zkouška Odborná španělština – zkouška
0+2 kr 0+2 kr 0+2 kr 0+2 kr
0/0 0/0 0/0 0/0
učitel
zk zk zk zk
CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU
15
3.2 Magisterské studijní programy Podpůrná (volitelná) výuka k uvedeným zkouškám je realizována prostřednictvím předmětů: kód
název
kredity
rozsah
JFP01 JFP02 JNP01 JNP02 JRP01 JRP02 JSP01 JSP02
Francouzština pro přírodovědce 1 Francouzština pro přírodovědce 2 Němčina pro přírodovědce 1 Němčina pro přírodovědce 2 Ruština pro přírodovědce 1 Ruština pro přírodovědce 2 Španělština pro přírodovědce 1 Španělština pro přírodovědce 2
2 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr.
0/2 0/2 0/2 0/2 0/2 0/2 0/2 0/2
3.2
učitel
z z z z z z z z
CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU
Magisterské studijní programy
Každý student magisterského studijního programu PřF musí před státní závěrečnou zkouškou absolvovat alespoň jeden z předmětů: kód
název
kredity
rozsah
JA002 JF002 JN002 JR002 JS002
Pokročilá odborná angličtina – zkouška Pokročilá odborná francouzština – zkouška Pokročilá odborná němčina – zkouška Pokročilá odborná ruština – zkouška Pokročilá odborná španělština – zkouška
0+2 kr. 0+2 kr. 0+2 kr. 0+2 kr. 0+2 kr.
0/0 0/0 0/0 0/0 0/0
učitel
zk zk zk zk zk
CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU
Podpůrná (volitelná) výuka k uvedeným zkouškám je realizována prostřednictvím předmětů: kód
název
kredity
rozsah
JAC03 JAC04 JA003 JFP03 JFP04 JNP03 JNP04 JRP03 JRP04 JSP03 JSP04
Angličtina pro chemiky 3 Angličtina pro chemiky 4 Výběrová angličtina pro přírodovědce Francouzština pro přírodovědce 3 Francouzština pro přírodovědce 4 Němčina pro přírodovědce 3 Němčina pro přírodovědce 4 Ruština pro přírodovědce 3 Ruština pro přírodovědce 4 Španělština pro přírodovědce 3 Španělština pro přírodovědce 4
2 kr. 2 kr. 4 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr.
0/2 0/2 0/4 0/2 0/2 0/2 0/2 0/2 0/2 0/2 0/2
16
učitel
z z z z z z z z z z z
CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU CJV MU
4 Výuka tělesné výchovy na MU v akademickém roce 2014/2015
4
Výuka celouniverzitní tělesné výchovy na MU v akademickém roce 2014/2015
Sportovní aktivity – povinná forma výuky Výuku sportovních aktivit studentů prezenčního studia na Masarykově univerzitě zajišťuje Centrum univerzitního sportu (CUS) Fakulty sportovních studií (FSpS). Všichni studenti prezenčního studia bakalářských studijních programů mají povinnost během studia splnit podmínky pro udělení dvou zápočtů (1 zápočet = 1 kredit) z předmětů sportovních aktivit vypisovaných pod kódy P9.... Student si vybírá z nabídky předmětů sportovních aktivit podle svého sportovního zaměření, zájmu a časových možností. Nabídka je zveřejněna na ISu a na webových stránkách FSpS (http://www.fsps.muni.cz/cus/). Studenti si mohou během jednoho semestru zapsat jeden předmět sportovních aktivit s pravidelnou docházkou a jeden výcvikový kurz. Výuku lze absolvovat v libovolném semestru studia, nejpozději do konce zkouškového období šestého semestru. Žádost o osvobození od docházky si mohou podávat pouze studenti na základě lékařského doporučení a sportovci, kteří se pravidelně účastní tréninků vrcholového a výkonnostního sportu. Všechny informace týkající se nabídky sportovních aktivit, výcvikových kurzů, kontaktů na učitele CUS, informace k výuce, formuláře k žádostem sportovního a zdravotního osvobození, termíny akcí a soutěží pořádaných pro studenty jsou zveřejněny na http://www.fsps.muni.cz/cus/. Dotazy zasílejte na:
[email protected].
Sportovní aktivity – volitelná forma výuky Informace jsou zveřejněny na http://www.fsps.muni.cz/cus/.
17
4 Výuka tělesné výchovy na MU v akademickém roce 2014/2015
Důležité termíny FSpS pro akademický rok 2014/2015 Podzimní semestr Registrace Zveřejnění rozvrhu na stránkách FSpS Zápis do seminárních skupin Konec změn v zápisu předmětů Výuka
2. června 2014 – 31. srpna 2014 29. srpna 2014 2. září 2014 28. září 2014 15. září 2014 – 14. prosince 2014
Jarní semestr Registrace Zveřejnění rozvrhu na stránkách FSpS Zápis do seminárních skupin Konec změn v zápisu předmětů Výuka
18
2. ledna 2015 – 1. února 2015 30. ledna 2015 3. února 2015 1. března 2015 16. února 2015 – 17. května 2015
5 Základy práva, ekonomie a evropských studií
5
Základy práva, ekonomie a evropských studií
Přírodovědecká fakulta pro své studenty nabízí právní a ekonomickéh předměty z jiných fakult MU. Cílem těchto volitelných předmětů je poskytnout základní orientaci v právní a ekonomické problematice, a tak zvýšit šance absolventů na trhu práce ve státním i komerčním sektoru. Předměty nevyžadují žádné prerekvizity ani nadstandardní vstupní znalosti v dané problematice. Mohou si je zapisovat studenti bakalářských i magisterských oborů. Fakulta doporučuje využít pro tyto předměty tzv. zcela volné kredity, tedy kredity za předměty ze skupiny (f) dle čl. 2 odst. 1 opatření děkana Výuka a tvorba studijních programů (č. 8/2012). kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr BXX999Zk Základy práva pro neprávníky MX001Zk Základy práva životního prostředí pro neprávníky EVS126
Evropská unie - základní fakta a milníky
5 kr. 2/0 6 kr. 2/1
3 kr. 2/0
zk Právnická fakulta MU zk Dudová, Hanák, Jančářová, Pekárek, Průchová, Tkáčiková, Žídek zk Kaniok, Pitrová, Sychra
Jarní semestr BPE ZEKO Základy ekonomie MX001Zk Základy práva životního prostředí pro neprávníky
4 kr. 2/0 6 kr. 2/1
zk Jandová, Tomeš zk Dudová, Hanák, Jančářová, Pekárek, Průchová, Tkáčiková, Žídek
19
6 Bakalářský studijní program Biochemie
6
Bakalářský studijní program Biochemie
Garant studijního programu doc. Ing. Martin Mandl, CSc.
Cíle studia ve studijním programu Bakalářský obecný studijní program Biochemie připravuje vysokoškolsky vzdělané odborníky, kteří mají přehled o všech oblastech chemie, jako je biochemie, anorganická chemie, organická chemie, analytická chemie a fyzikální chemie, a biologie.
Doporučené studijní plány a pravidla pro jejich sestavování V doporučených studijních plánech jsou uvedeny vhodné kombinace předmětů a semestrální průchody, které zahrnují všechny povinné, povinně volitelné a některé doporučené předměty jednotlivých studijních oborů. Nejsou zde uvedeny předměty, které se v tomto školním roce nevypisují. Nejedná se v žádném případě o povinnost absolvovat předměty v uvedených semestrech studia s výjimkou 1. roku studia, kdy je doporučený studijní plán závazný. Zároveň však jde o doporučený plán, jehož realizace je fakultou garantována a který by měl umožnit ukončení studia v doporučené době.
6.1
Studijní obor: Biochemie
Garant studijního programu Doc. Ing. Martin Mandl, CSc. Pravidla pro sestavování studijního plánu Vytvoření studijního plánu podle pravidel studijního programu je zákonným právem studenta. Při sestavení studijního plánu musí student dodržet ustanovení Studijního a zkušebního řádu fakulty a Pravidla a podmínky pro vytváření studijního plánu v daném studijním programu. Jako východisko k tvorbě studijního plánu může student využít Doporučeného studijního plánu. Doporučený studijní plán rovnoměrně rozkládá studium do standardní doby tří let a může se stát závazným jedině volbou studenta. Zaručuje studentům, kteří podle něho studují splnění povinností nutných k ukončení vysokoškolského studia během standardní doby. Fakultní rozvrh (časová a prostorová alokace výuky předmětů pro daný semestr) je zpracován v návaznosti na doporučené studijní plány. Povinné a povinně volitelné předměty a jejich návaznosti jsou uvedeny v doporučeném studijním plánu. Povinnými předměty pro studijní obor Biochemie jsou předměty matematicko-fyzikálního základu, kurzy obecné chemie, anorganické chemie I, základy fyzikální chemie, biochemie i + II, dále Úvod do studia biochemie, přednášky Struktura a funkce buňky, Mikrobiologie a Molekulární biologie. Povinné praktické kurzy jsou laboratorní cvičení z obecné chemie, biochemie, mikrobiologie a molekulární biologie. Kurzy organické a analytické chemie jsou zařazeny jako povinně volitelné - student si volí, zda kurzy absolvuje pouze v rozsahu ”Základy”nebo kompletně v úrovních i a návazně II. Povinně volitelné jsou JA001 Odborná angličtina - zkouška a Bakalářská práce z biochemie. Dále si student musí vybrat minimálně jeden praktický kurz z chemie a minimálně jednu přednášku z biologie. Volitelné předměty představují minimálně 38 kreditů. Povinným předmětem bez kreditového hodnocení je dvouhodinová bloková přednáška C7777
20
6 Bakalářský studijní program Biochemie Zacházení s chemickými látkami, kterou musí každý student absolvovat na začátku každého akademického roku a jejíž absolvování je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami (laboratorních cvičení, bakalářských prací ap.) Student může požádat garanta programu, aby mohl namísto povinného předmětu zapsat předmět analogický obsahem, se stejným ukončením a stejného nebo většího rozsahu. Volitelné předměty jsou všechny předměty, které jsou na Přírodovědecké fakultě a ostatních fakultách Masarykovy univerzity v daném období vyučovány a jejichž zápis je pro studenty daného programu povolen. Výběr volitelných předmětů je omezen na povinnost absolvovat minimum 171 kreditů za předměty přírodovědeckých, matematických nebo informatických věd, z toho minimálně 144 kreditů za předměty z oboru chemických a biologických věd. Volitelné předměty zvláště vhodné pro bakalářský studijní obor Biochemie jsou uvedeny v doporučeném studijním plánu. Zakončení povinných a povinně volitelných přednášek je obvykle zkouškou, seminářů zápočtem a laboratorních cvičení klasifikovaným zápočtem. U volitelných předmětů si student vybírá z možných zakončení předmětu. Při tvorbě a plnění studijního plánu musí každý student studijního programu dodržet následující pravidla a podmínky: •
Student musí v prvním a druhém semestru studia zapsat všechny předměty podle doporučeného studijního plánu.
•
Na začátku každého akademického roku absolvovat povinný předmět bez kreditového hodnocení C7777 Zacházení s chemickými látkami.
•
Základní chemické discipliny, které nejsou povinné, ale povinně volitelné, absolvuje student tak, že zvolí v daném předmětu buď Základy (organické či analytické chemie) nebo předmět úrovně i a na ten povinně naváže stupněm II. Nelze volit tentýž předmět v základní i rozšířené (I+II) verzi.
•
Student musí úspěšně vykonat zkoušku z předmětu JA001 Odborná angličtina - zkouška před přihlášením k bakalářské státní závěrečné zkoušce. Může si však na základě svých znalostí zvolit přímo zkoušku z předmětu JA002 Pokročilá odborná angličtina - zkouška, která mu následně bude uznána v navazujícím mgr. studiu, pro které je povinná.
•
Musí do termínu konání bakalářské státní závěrečné zkoušky zapsat a úspěšně ukončit všechny předměty, které jsou ve studijním programu povinné a respektovat přitom stanovené návaznosti.
•
Získat za celé studium absolvováním povinných, povinně volitelných a volitelných předmětů nejméně 180 kreditů.
•
Za absolvování volitelných předmětů musí student získat minimálně 38 kreditů.
•
Zpracovat bakalářskou práci na zadané téma.
•
Absolvovat úspěšně všechny součásti bakalářské státní závěrečné zkoušky.
Samostatný projekt je jednosemestrový volitelný předmět, který může student zapsat i vícekrát během studia, avšak ne ve stejném semestru jako zapsal předmět Bakalářská práce. Úspěšně absolvovaný předmět nemůže být zapsán znovu. Samostatný projekt spočívá v individuální práci studenta pod vedením některého akademického pracovníka na základě
21
6.1 Studijní obor: Biochemie vzájemné dohody. Projekt může být založen na experimentální, teoretické nebo literární práci studenta. Výsledek samostatného projektu musí být zveřejněn formou elektronické publikace v rámci fakulty. Zveřejnění je podmínkou úspěšného zakončení předmětu. Podmínky zveřejnění určuje a zajišťuje rada Ústavu biochemie. Témata bakalářských prací vypisuje rada Ústavu biochemie na návrh učitelů a zveřejňuje jejich aktuální nabídku v dostatečném počtu. Student si z aktuální nabídky svobodně volí téma bakalářské práce. O zadání bakalářské práce na zvolené téma žádá student učitele, který téma navrhl. Požádat může nejdříve po získání 90 kreditů a úspěšném absolvování přednášky z Biochemie i a II. Zadáním bakalářské práce se učitel, který téma vypsal, stává pro studenta, který si ho vybral, vedoucím bakalářské práce. Rada Ústavu biochemie písemné zadání bakalářských prací registruje a archivuje. Student může kterémukoliv učiteli Ústavu biochemie navrhnout téma své bakalářské práce nebo se na tomto tématu dohodnout. V tomto případě navrhuje učitel téma bakalářské práce pro konkrétního studenta. Omezením výběru ze zveřejněných témat bakalářských prací mohou být jen předem uvedené kapacitní důvody pracoviště, na němž má být bakalářská práce zpracována, nebo dřívější obsazení tématu jiným studentem. Státní bakalářská zkouška je písemná. Povinnými předměty jsou obecná a fyzikální chemie, organická chemie, analytická chemie, biologie a biochemie. Požadavky jsou uveřejněny na URL http://orion.sci.muni.cz/pozadavky/szz bak.htm
Doporučené studijní plány 1. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C1020 C1040
Obecná chemie Obecná chemie - seminář
4+2 kr. 4/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z
C1061 C1200 C4222
Anorganická chemie i Úvod do studia biochemie Základní laboratorní výpočty
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+1 kr. 2/0/0 k 1 kr. 0/1/0 z
C7170 C7777 M1010
Struktura a funkce buňky Zacházení s chemickými látkami Matematika i
4 kr. 2/0/0 zk 0 kr. 0/0/0 z 3+2 kr. 3/0/0 zk
M1020
Matematika i - seminář
22
3 kr. 0/3/0 z
Pinkas Křivohlávek, Moravec, Nečas, Pinkas, Ševčík Příhoda, Babiak Zbořil Bouchal, Kašparovský, Lochman, Obořil Šerý Příhoda, Petlachová Došlá, Burešová, Dobrovolná, Obrdlíková, Reiss, Šišma, Liška Došlá, Burešová, Dobrovolná, Obrdlíková, Reiss, Šišma
6 Bakalářský studijní program Biochemie Doporučené volitelné předměty C1062
Anorganická chemie i - seminář
1 kr. 0/1/0 z
JAC01
Angličtina pro chemiky i
2 kr. 0/2/0 z
Křivohlávek, Novosad, Toužín Dlabolová, Složilová, Čoupková, Hranáčová, Kubrická, Kupčíková, Němcová, Ševečková
Jarní semestr Povinné předměty C4221 C4660 F2120
Biochemická laboratorní technika Základy fyzikální chemie Fyzika
4 kr. 0/0/4 kz 2+2 kr. 2/0/0 zk 3+1 kr. 2/1/0 k
M2010 M2020
Matematika II Matematika II - seminář
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z
Janiczek, Lochman Kubáček Bochníček, Hanák, Novotný Došlá Došlá, Burešová, Dobrovolná, Liška, Obrdlíková, Šišma, Vondra
Povinně volitelné předměty C2021 Organická chemie i C2700 Základy organické chemie Z výběru povinně volitelných předmětů 11 kr.
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Mazal Pazdera
Doporučené předměty JAC02
Angličtina pro chemiky II
2 kr. 0/2/0 z
Dlabolová, Složilová, Kratochvílová, Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, SuchomelováPolomska, Ševečková
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 6 kr.
2. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C3181 C3190 C7777
Biochemie i Biochemie i - seminář Zacházení s chemickými látkami
2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z 0 kr. 0/0/0 z
Zbořil Bouchal, Kašparovský Příhoda, Petlachová
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Komárek Paruch, Švenda Kanický, Preisler, Vaculovič
Povinně volitelné předměty C1660 C3022 C3100
Základy analytické chemie Organická chemie II/1 Analytická chemie i
Z výběru povinně volitelných předmětů 16 kr.
23
6.1 Studijní obor: Biochemie Doporučené volitelné předměty JAC03
Angličtina pro chemiky III
2 kr. 0/2/0 z
Dlabolová, Složilová, Čoupková, Hranáčová, Kubrická, Němcová, SuchomelováPolomska, Ševečková
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 5 kr.
Jarní semestr Povinné předměty Bi4020 Molekulární biologie Bi4020c Základní metody molekulární biologie C4182 Biochemie II C4185 Seminář k bakalářské práci i C4200 Biochemie II - seminář C4220 Biochemie - laboratorní cvičení
3+2 kr. 3/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 k
Doškař Pantůček
2+2 kr. 2 kr. 1 kr. 7 kr.
Zbořil Skládal Bouchal, Kašparovský Boublíková, Kašparovský
2/0/0 0/2/0 0/1/0 0/0/7
zk z z kz
Povinně volitelné předměty C4050 Analytická chemie II Z výběru povinně volitelných předmětů 5 kr.
2+2 kr. 2/0/0 zk
Lubal
Doporučené volitelné předměty JAC04
Angličtina pro chemiky IV
2 kr. 0/2/0 z
Dlabolová, Složilová, Čoupková, Hranáčová, Kubrická, Němcová, SuchomelováPolomska, Ševečková
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 5 kr.
3. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty Bi5710
Mikrobiologie
Bi5710c Mikrobiologie - cvičení
Bi7941 C7777
24
Molekulární biologie - laboratorní cvičení (pro obor biochemie) Zacházení s chemickými látkami
2+2 kr. 2/0/0 zk
3 kr. 0/3/0 z
Bidmanová, Damborská, Šebestová Vávrová, Krsek, Kopecká, Bardounová, Syrovátková, Geržová, Kubasová, Kýrová, Straková, Varmužová Pantůček
0 kr. 0/0/0 z
Příhoda, Petlachová
2 kr. 0/2/0 z
6 Bakalářský studijní program Biochemie Povinně volitelné předměty C5014
Bakalářská práce z biochemie i
5 kr. 0/0/5 z
Janiczek
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 12 kr. kód
název
kredity rozsah
učitel
Jarní semestr Povinné předměty CZBB C6185 C6200
Státní závěrečná bakalářská zkouška kr. 0/0/0 z biochemie Seminář k bakalářské práci II 2 kr. 0/2/0 z Biochemické metody 4+2 kr. 4/0/0 zk
Janiczek Skládal Glatz, Zbořil
Povinně volitelné předměty C6014
Bakalářská práce z biochemie II
10 kr. 0/0/10 z
Janiczek
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 10 kr.
Povinně volitelné předměty kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Bi5220 C1635
Imunologie Analytická chemie - praktikum
2+2 kr. 2/0/0 zk 3 kr. 0/3/0 z
C2200
Chemická syntéza - praktikum
8 kr. 0/0/8 kz
C3040 C3110 C4020 C4040 C5040 C5160
Organická chemie II/2 2 kr. Analytická chemie i - seminář 1 kr. Pokročilá fyzikální chemie 2+2 kr. Pokročilá fyzikální chemie - seminář 1 kr. Jaderná chemie 2+2 kr. Fyzikální chemie - praktikum 6 kr.
C5190
Instrumentální analytická chemie praktikum
C6220 C6230 C7150
Klinická biochemie Klinická biochemie - cvičení Funkční biochemie i - regulace metabolismu Funkční biochemie i - seminář Strukturní biochemie
C7160 C9530
0/2/0 0/1/0 2/0/0 0/1/0 2/0/0 0/0/5
z z zk z zk kz
5 kr. 0/0/5 kz 4+2 kr. 4/0/0 zk 4 kr. 0/4/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Lojek, Číž, Kubala Bittová, Lubal, Novotný, Táborský, Vaculovič, Vašinová Galiová, Vrbková Janků, Literák, Pálková, Petlachová, Filípková, Moravec Paruch, Švenda Kanický, Vaculovič Kubáček Kubáček Příhoda Sopoušek, Křivohlávek, Brož, Pavlů, Zobač Farková, Hrdlička, Preisler, Vašinová Galiová Wimmerová Tomandl Pavelka Pavelka Žídek, Plevka, Srb, Zachrdla
25
6.1 Studijní obor: Biochemie Jarní semestr Bi6180 Bi6180c Bi6790 Bi6790c
Biologie rostlin Biologie rostlin - cvičení Biologie živočichů Biologie živočichů - cvičení
2+2 kr. 2 kr. 2+2 kr. 2 kr.
C2062 C2070
Anorganická chemie II Anorganická chemie II - seminář
2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z
C2200
Chemická syntéza - praktikum
8 kr. 0/0/8 kz
C3120
Analytická chemie - praktikum
2 kr. 0/0/2 kz
C3150 C7860
Základy fyzikální chemie - seminář 1 kr. 0/1/0 z Rostlinná biochemie 2+2 kr. 2/0/0 zk
C8155
Funkční biochemie II - signální dráhy
26
2/0/0 0/2/0 2/0/0 0/2/0
zk z zk z
2+2 kr. 2/0/0 zk
Gloser, Kummerová Baláž, Kummerová Vácha, Šimek Bartoš, Dobeš, Hyršl, Medalová, Slabý, Vácha Novosad Nečas, Novosad, Toužín Janků, Literák, Pálková, Petlachová Lubal, Táborský, Bittová Kubáček, Munzarová Kašparovský, Lochman Pavelka
6 Bakalářský studijní program Biochemie Doporučené volitelné předměty pro bakalářský program Biochemie kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Bi0580 Bi5000 Bi5040 Bi5220 Bi5580
Vývojová genetika 2+2 kr. Bioinformatika i - nukleové kyseliny 1+1 kr. Biostatistika - základní kurz 3+2 kr. Imunologie 2+2 kr. Obecná ekotoxikologie 2+2 kr.
Bi5580c Obecná ekotoxikologie - cvičení Bi5980 Statistické hodnocení biodiverzity
2/0/0 1/0/0 3/0/0 2/0/0 2/0/0
zk k zk zk zk
1 kr. 0/1/0 z 2+1 kr. 2/0/0 k
Chemické vlastnosti, struktura a interakce nukleových kyselin Molekulární biologie virů Bioinformatika II – proteiny
2+2 kr. 2/0/0 zk
1 kr. 1/0/0 k 1 kr. 0/1/0 z 2+1 kr. 0/2/0 k
C5001
Výpočetní technika i Výpočetní technika - cvičení Operační systém UNIX a základy programování Praktický úvod do superpočítání Organická chemie II - seminář Chemická literatura Makromolekulární chemie Chemie životního prostředí i Environmentální procesy Chemie životního prostředí III Zdroje znečištění, složky prostředí a jejich znečištění - hydrosféra, pedosféra, biosféra Samostatný projekt z biochemie
C5020 C5030 C5040 C5060
Chemická struktura Chemická struktura - seminář Jaderná chemie Metody chemického výzkumu
2+2 kr. 1 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
C5120 C5140
Počítače v chemii a chemometrie 1+1 kr. 1/0/0 k Počítače v chemii a chemometrie 2 kr. 0/2/0 z cvičení Organická analýza 1+2 kr. 1/0/0 zk
Bi7015 Bi7140 Bi9060 C1101 C1120 C2110 C2115 C3055 C3200 C4120 C4300 C4320
C5241
2+2 kr. 2/0/0 zk 1+1 kr. 1/0/0 k
2 kr. 2 kr. 1+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
0/2/0 0/2/0 1/0/0 2/0/0 2/0/0
k z zk zk zk
2+2 kr. 2/0/0 zk
5 kr. 0/0/5 z 2/0/0 0/1/0 2/0/0 2/0/0
zk z zk zk
Vyskot Pantůček, Damborská Jarkovský Lojek, Číž, Kubala Bláha, Jarque Ortiz, Michelová Novák Dušek, Jarkovský, Littnerová, Haruštiaková Fojta, Paleček, Fojtová, Vorlíčková Růžičková Damborský, Damborská, Pantůček, Šebestová Farková Farková Kulhánek, Janoš, Štěpán, Trnka Kulhánek, Štěpán Janků, Literák, Švenda Mazal, Nečas, Skládal Šindelář Holoubek Holoubek
Janiczek, Svobodová Vařeková Brož Brož Příhoda Táborský, Bittová, Preisler, Toužín, Trnková, Lubal, Heger, Klán, Literák, Mazal, Novotný, Prokeš, Sopoušek, Vrbková Farková Farková Farková, Lubal, Pazdera
27
6.1 Studijní obor: Biochemie Volitelné předměty – pokračování C5300
Statistická termodynamika
2+2 kr. 2/0/0 zk
C5320 C5340 C5440 C5920 C6220 C6230 C7031 C7050 C7060 C7080 C7110 C7187
Fyzikálně chemické základy NMR Nerovnovážné systémy Separační metody Správná laboratorní praxe Klinická biochemie Klinická biochemie - cvičení Atomová spektrometrie Elektroanalytické metody Stopová analýza Lasery v analytické chemii Výpočetní technika - aplikace Experimentální onkologie
3+2 kr. 2+2 kr. 1+2 kr. 1+2 kr. 4+2 kr. 4 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 1 kr. 2+2 kr.
C7201 C7280 C7301
Základy genomiky Elektrodová kinetika Základy genomiky - cvičení
1+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk 3 kr. 0/3/0 k
C7410 C7440 C7460
Struktura a reaktivita Koordinace a katalýza Identifikace organických látek cvičení Organokovové sloučeniny Inorganic Materials Chemistry Počítačová chemie a molekulové modelování i Počítačová chemie a molekulové modelování i - cvičení
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 1/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z
Pavlů, Šob, Vřešťál, Zouhar Sklenář, Fiala, Srb Kučera Mazal Bielská, Bláha, Vrana Wimmerová Tomandl Kanický, Otruba Trnková Komárek, Coufalík Novotný Farková Bouchal, Hrstka, Müller, Nenutil, Vojtěšek Hejátko, Konečná Trnková Hejátko, Skoupá, Pernisová, Konečná, Dobisová, Didi, Hrdinová, Žďárská Klán Pazdera Pazdera
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Novosad Moravec, Pinkas Koča, Kulhánek
1 kr. 0/1/0 z
Koča, Kulhánek, Štěpán Havel Mandl Glatz, Janiczek Zbořil Preisler
C7740 C7780 C7790 C7800 C7830 C7870 C7880 C7890 C7895 C7910 C7950 C7955 C8840 C9090 C9100
28
2/1/0 2/0/0 1/0/0 1/0/0 4/0/0 0/4/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 0/1/0 2/0/0
2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0
zk zk zk zk zk z zk zk zk zk z zk
Kapilární elektroforéza Biometrika Nové směry v bioanalytické chemii Chemická technika Hmotnostní spektrometrie biomolekul Metody chemického výzkumu Speciační analýza
2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
zk zk zk zk zk
Molekulová luminiscence Chemistry of macrocyclic compounds Sekundární metabolity Biosenzory
1+2 kr. 1/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Zbořil Kanický, Komárek, Lubal Táborský, Preisler Lubal
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Pluháček Skládal
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
6 Bakalářský studijní program Biochemie Volitelné předměty – pokračování C9500 C9920 F7460 GE091
Užitá chemie Úvod do kvantové chemie a elektronové struktury molekul Fyzika pevných látek pro nefyzikální obory Mineralogie a geochemie
2+1 kr. 2/0/0 k 3+2 kr. 2/1/0 zk
Pazdera Munzarová
2+2 kr. 2/0/0 zk
Holý
3 kr. 2/0/0 kz
Losos
29
6.1 Studijní obor: Biochemie Jarní semestr Bi6920 Bi8090 C2022 C2102 C4010 C4310
C4330 C4450 C4455 C5880 C6001 C6010 C6020 C6110 C6120 C6140 C6160 C6170 C6210 C6290 C6300 C6320 C6330 C6410 C6740 C6750 C6770 C6790 C6800 C6830 C6900
30
Vybrané nástroje ochrany životního prostředí - EIA a LCA Genové inženýrství Organická chemie i - seminář Výpočetní technika II - praktické cvičení Anorganická chemie III Chemie životního prostředí II Zdroje znečištění, složky prostředí a jejich znečištění - technosféra, atmosféra Chemie životního prostředí IV Látky znečišťující prostředí (environmentální polutanty) Organická chemie III - syntéza Organická chemie III - syntéza seminář Základy stereochemie Samostatný projekt z biochemie
2+1 kr. 2/0/0 k
Bittner, Anděl
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z 2 kr. 0/2/0 z
Doškař Janků, Literák, Švenda Farková
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Pinkas, Příhoda Holoubek
2+2 kr. 2/0/0 zk
Holoubek
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z
Paruch Paruch
2+2 kr. 2/0/0 zk 5 kr. 0/0/5 z
Nečas Janiczek, Svobodová Vařeková Picka Křivohlávek Komárek, Kuta
Toxikologie 1+2 kr. Jaderná chemie - praktikum 3 kr. Analytická chemie ŽP - anorganické 2+2 kr. polutanty Analytická chemie ŽP - anorganické 3 kr. polutanty - laboratorní cvičení Optimalizace a hodnocení 2+2 kr. analytických metod Analytická chemie II - seminář 2 kr. Analýza materiálů - praktikum 5 kr. Biotechnologie 2+2 kr. Atomová absorpční spektrometrie 1+2 kr. Optická a hmotnostní spektrometrie 1+2 kr. s indukčně vázaným plazmatem Chemická kinetika 2+2 kr. Chemická kinetika - seminář 1 kr. Organická analýza - praktikum 3 kr. Elektrické vlastnosti atomů 2+2 kr. a molekul Materiálová chemie kovů 2+2 kr. NMR Spectroscopy of Biomolecules 2+2 kr. Hmotnostní spektrometrie 2+2 kr. Multinukleární NMR spektroskopie 2+2 kr. Radioekologie 1+2 kr. Biofyzikální faktory ŽP 2 kr.
1/0/0 zk 0/0/3 kz 2/0/0 zk 0/0/3 kz 2/0/0 zk 0/2/0 z 0/0/5 kz
Komárek, Kuta, Vaculovič Farková
2/0/0 zk 1/0/0 zk 1/0/0 zk
Lubal Komárek, Nováková, Vaculovič Mandl Komárek Kanický
2/0/0 0/1/0 0/0/3 2/0/0
zk z kz zk
Sopoušek Sopoušek Farková, Pazdera Trnková
2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 1/0/0 2/0/0
zk zk zk zk zk k
Brož, Pavlů Žídek, Fiala Brož, Vřešťál Pinkas Křivohlávek Jašek
6 Bakalářský studijní program Biochemie Volitelné předměty – pokračování C6950 C8500 C8510 C8580 C8700 C8790 C8800 C8820 C8880 C8885 C8950 C9930 ENV016 F7460
Chemická exkurze Mechanismy organických reakcí Mechanismy organických reakcí seminář Analýza rizik Technologie chemických výrob Organická chemie ve farmacii Rtg strukturní analýza Metody studia rovnováh a kinetiky reakcí Vybrané metody analýzy pevných látek Supramolekulární chemie NMR - Strukturní analýza Metody kvantové chemie Udržitelný rozvoj II - souvislosti environmentálního pilíře Fyzika pevných látek pro nefyzikální obory
0 kr. 0/0/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z
Janků, Šindelář Klán Klán
2+2 kr. 2+2 kr. 2+1 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
Čupr Šindelář Smrž Marek Havel
2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0
zk zk zk zk zk
1+2 kr. 1/0/0 zk
Kanický, Otruba
2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 3+2 kr.
Mazal Marek Munzarová Bittner
2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/1/0
zk zk zk zk
2+2 kr. 2/0/0 zk
Holý
31
6.2 Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika
6.2
Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika
Garant studijního oboru Prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc. Pravidla pro sestavování studijního plánu Vytvoření studijního plánu podle pravidel studijního programu je zákonným právem studenta. Při sestavení studijního plánu musí student dodržet ustanovení Studijního a zkušebního řádu fakulty a Pravidla a podmínky pro vytváření studijního plánu v rámci daného studijním oboru. Při tvorbě a plnění studijního plánu musí každý student studijního oboru dodržet následující pravidla a podmínky: •
Student musí do termínu konání státní závěrečné zkoušky zapsat a úspěšně ukončit všechny předměty, které jsou ve studijním oboru povinné a respektovat přitom stanovené návaznosti.
•
Student musí získat odpovídající počet kreditů celkem za studium (tj. min. 180)
•
Student je povinen sestavovat svůj studijní plán tak, aby v každém semestru zapsal předměty v souladu s podmínkami obsahové a časové návaznosti, s výjimkou prvních dvou semestrů studia, kdy je povinen zapsat povinné předměty dle doporučeného studijního plánu. Pro získání práva dalšího zápisu je student povinen úspěšně ukončit všechny opakované předměty zapsané v předchozím semestru a získat alespoň 15 kreditů za předměty zapsané v předchozím semestru nebo alespoň 45 kreditů za předměty zapsané v předchozích dvou semestrech, viz článek 12 Studijního a zkušebního řádu.
•
Student si musí v 1. ročníku povinně vybrat jeden předmět s fyzikálním zaměřením buď F2120 nebo F1240+F2090.
•
Od 2. ročníku jsou zařazovány ”samostatné projekty”, které budou vypisovány ve formě ”balíčků témat”.
•
Pro úspěšné zvládnutí bakalářské práce je nezbytné absolvování předmětů Bakalářská práce i a II.
•
Student musí úspěšně vykonat jazykovou zkoušku JA001 Odborná angličtina - zkouška, případně JA002 Pokročilá odborná angličtina - zkouška před přihlášením k bakalářské státní závěrečné zkoušce.
•
Student musí v průběhu studia získat dva kredity z předmětu Sportovní aktivity. Předmět zajišťuje pro celou univerzitu Fakulta sportovních studií.
Povinným předmětem bez kreditového hodnocení je dvouhodinová bloková přednáška Zacházení s chemickými látkami, kterou musí každý student absolvovat na začátku každého akademického roku a jejíž absolvování je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami (laboratorních cvičení, diplomových prací ap.) Státní závěrečná zkouška studentů oboru Chemoinformatika a bioinformatika je písemná. Sestává z hlavního předmětu Chemoinformatika a bioinformatika, a dvou volitelných předmětů ze skupiny:
32
6 Bakalářský studijní program Biochemie •
fyzikální chemie
•
organická chemie
•
biochemie
•
analytická chemie
Požadavky jsou uveřejněny na URL http://orion.sci.muni.cz/pozadavky/szz bak chi.htm
Doporučené studijní plány 1. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C1020 C1040
Obecná chemie Obecná chemie - seminář
4+2 kr. 4/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z
C1470
Úvod do matematiky pro 1+2 kr. 1/0/0 zk chemoinformatiky a bioinformatiky
C1475
Úvod do matematiky pro 2+1 kr. 0/2/0 k chemoinformatiky a bioinformatiky - seminář
C2110 C4222
Operační systém UNIX a základy programování Základní laboratorní výpočty
C7777
Zacházení s chemickými látkami
2+1 kr. 0/2/0 k 1 kr. 0/1/0 z 0 kr. 0/0/0 z
Pinkas Křivohlávek, Moravec, Nečas, Pinkas, Ševčík Koča, Kříž, Svobodová Vařeková, Pravda, Sehnal, Ionescu, Raček Kříž, Koča, Svobodová Vařeková, Sehnal, Švandová, Ionescu Kulhánek, Janoš, Štěpán, Trnka Bouchal, Kašparovský, Lochman, Obořil Příhoda, Petlachová
Povinně volitelné předměty F1240
Fyzika pro chemiky i
F1241
Fyzika pro chemiky I, seminář
FI:PB001 Úvod do informačních technologií
2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Bochníček, Dosoudilová, Hanák, Novotný Bochníček, Dosoudilová, Hanák, Novotný Matyska, Hladká, Bujnošková, Fousek, Raček, Ručka, Sloup
Z výběru povinně volitelných předmětů 8 kr.
33
6.2 Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika Doporučené volitelné předměty C1061 C1062
Anorganická chemie i Anorganická chemie i - seminář
JAC01
Angličtina pro chemiky i
FI:PB029 Elektronická příprava dokumentů
2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z 2 kr. 0/2/0 z
3+2 kr. 2/1/0 zk
Příhoda, Babiak Křivohlávek, Novosad, Toužín Dlabolová, Složilová, Čoupková, Hranáčová, Kubrická, Kupčíková, Němcová, Ševečková Sojka, Růžička
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 5 kr.
Jarní semestr Povinné předměty C2130 C2140 C2150 C2160 C2700 C3150 C4221 C4660
Úvod do chemoinformatiky 2+2 kr. a bioinformatiky Aplikovaná matematika pro chemiky 1+2 kr. Zpracování informací a vizualizace 2+1 kr. v chemii Programování v jazyce C pro 2+1 kr. chemiky Základy organické chemie 2+2 kr. Základy fyzikální chemie - seminář 1 kr. Biochemická laboratorní technika 4 kr. Základy fyzikální chemie 2+2 kr.
2/0/0 zk 1/0/0 zk 0/2/0 k
Koča, Svobodová Vařeková, Wimmerová Kříž Kříž, Prokop
0/2/0 k
Prokop
2/0/0 0/1/0 0/0/4 2/0/0
Pazdera Kubáček, Munzarová Janiczek, Lochman Kubáček
zk z kz zk
Povinně volitelné předměty C4710
Aplikovaná matematika pro chemiky - seminář Internetové publikování
F2090 F2091
Fyzika pro chemiky II Fyzika pro chemiky II, seminář
3+2 kr. 3/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z
F2120
Fyzika
3+1 kr. 2/1/0 k
C2141
Z výběru povinně volitelných předmětů 4 kr.
34
1 kr. 0/1/0 z
Kříž
2 kr. 0/2/0 k
Svobodová Vařeková, doc. Ing Petr Zamostný, PhD Mikulík Bernatová, Dvořák, Mikulík Bochníček, Hanák, Novotný
6 Bakalářský studijní program Biochemie Doporučené volitelné předměty JAC02
Angličtina pro chemiky II
2 kr. 0/2/0 z
FI:VB000 Základy odborného stylu
2+1 kr. 1/1/0 k
Dlabolová, Složilová, Kratochvílová, Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, SuchomelováPolomska, Ševečková Pala, Hlaváčková, Peňáz, Nevěřilová, Nečas, Žižková
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 6 kr.
2. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C3210
Strukturní bioinformatika
1+2 kr. 1/0/0 zk
C3580 C7777
Biochemie Zacházení s chemickými látkami
3+2 kr. 3/0/0 zk 0 kr. 0/0/0 z
Koča, Prokop, Ionescu, Mishra Glatz Příhoda, Petlachová
Povinně volitelné předměty Bi5040 C2115 C3220 C4020 C4040 C5001
Biostatistika - základní kurz 3+2 kr. Praktický úvod do superpočítání 2 kr. Pokročilé programování v jazyce C 2+1 kr. pro chemiky Pokročilá fyzikální chemie 2+2 kr. Pokročilá fyzikální chemie - seminář 1 kr. Samostatný projekt z biochemie 5 kr.
C5020 Chemická struktura C5030 Chemická struktura - seminář Z výběru povinně volitelných předmětů 12 kr.
3/0/0 zk 0/2/0 k 0/2/0 k
Jarkovský Kulhánek, Štěpán Prokop
2/0/0 zk 0/1/0 z 0/0/5 z
Kubáček Kubáček Janiczek, Svobodová Vařeková Brož Brož
2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z
Doporučené volitelné předměty Bi1051 F3011 F5030 JAC03
Úvod do matematické biologie II Fyzika, filozofie a myšlení 1 Základy kvantové mechaniky Angličtina pro chemiky III
1 kr. 1+1 kr. 4+2 kr. 2 kr.
1/0/0 2/0/0 2/2/0 0/2/0
z k zk z
Dušek, Jarkovský Novotný, Švandová Munzar, Chaloupka Dlabolová, Složilová, Čoupková, Hranáčová, Kubrická, Němcová, SuchomelováPolomska, Ševečková
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 7 kr.
35
6.2 Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika Jarní semestr Povinné předměty Bi4020 C2135
Molekulární biologie Bioinformatika v praxi
3+2 kr. 3/0/0 zk 2+1 kr. 0/2/0 k
C4185 C6310 C6560
Seminář k bakalářské práci i Symetrie molekul Biochemie - laboratorní cvičení
2 kr. 0/2/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk 5 kr. 0/0/4 kz
Doškař Wimmerová, Houser, Malinovská Skládal Kubáček Boublíková, Kašparovský
Povinně volitelné předměty C4710
Internetové publikování
2 kr. 0/2/0 k
C5230 C6001
Analytická chemie Samostatný projekt z biochemie
2+2 kr. 2/0/0 zk 5 kr. 0/0/5 z
Svobodová Vařeková, doc. Ing Petr Zamostný, PhD Kanický, Novotný Janiczek, Svobodová Vařeková
Z výběru povinně volitelných předmětů 8 kr.
Doporučené volitelné předměty C6010 JAC04
Toxikologie Angličtina pro chemiky IV
1+2 kr. 1/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z
Picka Dlabolová, Složilová, Čoupková, Hranáčová, Kubrická, Němcová, SuchomelováPolomska, Ševečková
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 4 kr.
3. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C3200 C7777 C9530
Chemická literatura Zacházení s chemickými látkami Strukturní biochemie
C9531 JA001
Strukturní biochemie - seminář Odborná angličtina - zkouška
36
1+2 kr. 1/0/0 zk 0 kr. 0/0/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z 2 kr. 0/0/0 zk
Mazal, Nečas, Skládal Příhoda, Petlachová Žídek, Plevka, Srb, Zachrdla Zachrdla, Srb Ševečková, Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová
6 Bakalářský studijní program Biochemie Povinně volitelné předměty Kuglík, Lízal Sklenář, Fiala, Koča, Krejčí, Kříž, Kulhánek, Marek, Munzarová, Skládal, Štefl, Vaňáčová, Wimmerová, Žídek, Svobodová Vařeková C5015 Bakalářská práce i 5 kr. 0/0/5 z Janiczek, Svobodová Vařeková, Ionescu, Mishra C7410 Struktura a reaktivita 2+2 kr. 2/0/0 zk Klán C7415 Struktura a reaktivita - seminář 1 kr. 0/1/0 z Klán C7870 Biometrika 2+2 kr. 2/0/0 zk Mandl C8160 Enzymologie 2+2 kr. 2/0/0 zk Kučera Z výběru povinně volitelných předmětů 11 kr. Předměty Bi5040 a C7870 nelze zvolit současně Bi3060 CB060
Obecná genetika Seminář NCBR
3+2 kr. 3/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z
Doporučené volitelné předměty Bi0440 C5340 C9920
Lineární a adaptivní zpracování dat 3+2 kr. 2/1/0 zk Nerovnovážné systémy 2+2 kr. 2/0/0 zk Úvod do kvantové chemie 3+2 kr. 2/1/0 zk a elektronové struktury molekul
Schwarz Kučera Munzarová
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 9 kr. kód
název
kredity rozsah
učitel
Jarní semestr Povinné předměty CZBCI C6185
Státní závěrečná bakalářská zkouška z chemoinformatiky a bioinformatiky Seminář k bakalářské práci II
kr. 0/0/0 2 kr. 0/2/0 z
Svobodová Vařeková Skládal
Povinně volitelné předměty C6015
Bakalářská práce II
C6210 Biotechnologie Z výběru povinně volitelných předmětů 14 kr.
10 kr. 0/0/10 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Janiczek, Svobodová Vařeková Mandl
Doporučené volitelné předměty C4830 Instrumentální biochemické metody 2+1 kr. C8140 Bioenergetika 2+2 kr. C9930 Metody kvantové chemie 2+2 kr. FI:PA081 Programování numerických výpočtů 2+2 kr.
2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0
k zk zk zk
Glatz Kučera Munzarová Křenek
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 11 kr.
37
6.2 Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika Povinně volitelné předměty kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Bi3060 Bi5040 CB060
Obecná genetika Biostatistika - základní kurz Seminář NCBR
3+2 kr. 3/0/0 zk 3+2 kr. 3/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z
C2115 C3220 C4020 C4040 C5001
Praktický úvod do superpočítání 2 kr. Pokročilé programování v jazyce C 2+1 kr. pro chemiky Pokročilá fyzikální chemie 2+2 kr. Pokročilá fyzikální chemie - seminář 1 kr. Samostatný projekt z biochemie 5 kr.
C5015
Bakalářská práce i
C5020 C5030 C7410 C7415 C7870 C8160
Chemická struktura Chemická struktura - seminář Struktura a reaktivita Struktura a reaktivita - seminář Biometrika Enzymologie
0/2/0 k 0/2/0 k 2/0/0 zk 0/1/0 z 0/0/5 z
5 kr. 0/0/5 z 2+2 kr. 1 kr. 2+2 kr. 1 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
2/0/0 0/1/0 2/0/0 0/1/0 2/0/0 2/0/0
zk z zk z zk zk
Kuglík, Lízal Jarkovský Sklenář, Fiala, Koča, Krejčí, Kříž, Kulhánek, Marek, Munzarová, Skládal, Štefl, Vaňáčová, Wimmerová, Žídek, Svobodová Vařeková Kulhánek, Štěpán Prokop Kubáček Kubáček Janiczek, Svobodová Vařeková Janiczek, Svobodová Vařeková, Ionescu, Mishra Brož Brož Klán Klán Mandl Kučera
Jarní semestr C5230 C6001
Analytická chemie Samostatný projekt z biochemie
C6015
Bakalářská práce II
C6210
Biotechnologie
2+2 kr. 2/0/0 zk 5 kr. 0/0/5 z 10 kr. 0/0/10 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Kanický, Novotný Janiczek, Svobodová Vařeková Janiczek, Svobodová Vařeková Mandl
Doporučené volitelné předměty pro obor Chemoinformatika a bioinformatika kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Bi0440 Bi1051 C1200 C5340 C9920 F3011 F5030
38
Lineární a adaptivní zpracování dat Úvod do matematické biologie II Úvod do studia biochemie Nerovnovážné systémy Úvod do kvantové chemie a elektronové struktury molekul Fyzika, filozofie a myšlení 1 Základy kvantové mechaniky
3+2 kr. 1 kr. 2+1 kr. 2+2 kr. 3+2 kr.
2/1/0 1/0/0 2/0/0 2/0/0 2/1/0
zk z k zk zk
1+1 kr. 2/0/0 k 4+2 kr. 2/2/0 zk
Schwarz Dušek, Jarkovský Zbořil Kučera Munzarová Novotný, Švandová Munzar, Chaloupka
6 Bakalářský studijní program Biochemie Jarní semestr Instrumentální biochemické metody 2+1 kr. Toxikologie 1+2 kr. Bioenergetika 2+2 kr. Metody kvantové chemie 2+2 kr. Molekulové interakce a jejich úloha 3+1 kr. v biologii a chemii FI:PA081 Programování numerických výpočtů 2+2 kr. C4830 C6010 C8140 C9930 F8310
2/0/0 1/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0
k zk zk zk k
2/0/0 zk
Glatz Picka Kučera Munzarová Šponer Křenek
39
7 Bakalářský studijní program Aplikovaná biochemie
7
Bakalářský studijní program Aplikovaná biochemie
Garant studijního programu Doc. RNDr. Oldřich Janiczek, CSc.
Cíle studia ve studijním programu Obor Aplikovaná biochemie je členěn do tří samostatných zaměření: Biotechnologie, Klinická biochemie a Bioanalytická chemie. Zařazení do daného zaměření si student podle svého zájmu volí po absolvování prvního semestru. Výsledkem dělení je bakalář - aplikovaný biochemik, který je dále specializován v aktuální oblasti aplikované biochemie. Cílem zaměření Biotechnologie je bakalářské studium zaměřené vedle obecných chemických a biochemických disciplín i na biologické obory souvisejícími s mikrobiologií, buněčnou biologií a genetikou, jakož i na výuku spojenou přímo s biotechnologií - využívání buněk a enzymů v široké oblasti průmyslu, zemědělství a životního prostředí. Cílem zaměření Klinická biochemie je bakalář s rozšířenou výukou v oblasti biomedicínských aplikací využívaných v klinických laboratořích. Cílem zaměření Bioanalytická chemie je bakalář specializovaný na využití analytických metod v biochemické praxi.
Doporučené studijní plány a pravidla pro jejich sestavování V doporučených studijních plánech jsou uvedeny vhodné kombinace předmětů a semestrální průchody, které zahrnují všechny povinné, povinně volitelné a některé doporučené volitelné předměty jednotlivých studijních oborů. Nejsou zde uvedeny předměty, které se v tomto školním roce nevypisují. Nejedná se v žádném případě o povinnost absolvovat předměty v uvedených semestrech studia s výjimkou 1. roku studia, kdy je doporučený studijní plán závazný. Zároveň však jde o doporučený plán, jehož realizace je fakultou garantována a který by měl umožnit ukončení studia v doporučené době. Témata bakalářských prací vypisuje rada Ústavu biochemie na návrh učitelů a zveřejňuje jejich aktuální nabídku v dostatečném počtu. Student si z aktuální nabídky svobodně volí téma bakalářské práce. O zadání bakalářské práce na zvolené téma žádá student učitele, který téma navrhl. Požádat může nejdříve po získání 90 kreditů. Zadáním bakalářské práce se učitel, který téma vypsal, stává pro studenta, který si ho vybral, vedoucím bakalářské práce. Rada Ústavu biochemie písemné zadání bakalářských prací registruje a archivuje. Student může kterémukoliv učiteli Ústavu biochemie navrhnout téma své bakalářské práce nebo se na tomto tématu dohodnout. V tomto případě navrhuje učitel téma bakalářské práce pro konkrétního studenta. Omezením výběru ze zveřejněných témat bakalářských prací mohou být jen předem uvedené kapacitní důvody pracoviště, na němž má být bakalářská práce zpracována, nebo dřívější obsazení tématu jiným studentem. Státní bakalářská zkouška je ústní. Povinnými předměty jsou Obecná biochemie a Biochemické metody. K tomu si student zvolí jeden z následujících předmětů - Anorganická chemie, Fyzikální chemie, Organická chemie, Analytická chemie nebo Molekulární biologie. Požadavky jsou uveřejněny na URL http://orion.sci.muni.cz/pozadavky/szz bak apl.htm
40
7 Bakalářský studijní program Aplikovaná biochemie
7.1
Studijní obor: Aplikovaná biochemie
Pravidla pro sestavování studijního plánu Vytvoření studijního plánu podle pravidel studijního programu je zákonným právem studenta. Při sestavení studijního plánu musí student dodržet ustanovení Studijního a zkušebního řádu fakulty a Pravidla a podmínky pro vytváření studijního plánu v daném studijním programu. Jako východisko k tvorbě studijního plánu může student využít Doporučeného studijního plánu. Doporučený studijní plán rovnoměrně rozkládá studium do standardní doby tří let a může se stát závazným jedině volbou studenta. Zaručuje studentům, kteří podle něho studují splnění povinností nutných k ukončení vysokoškolského studia během standardní doby. Fakultní rozvrh (časová a prostorová alokace výuky předmětů pro daný semestr) je zpracován v návaznosti na doporučené studijní plány. Povinné a povinně volitelné předměty a jejich návaznosti jsou uvedeny v doporučeném studijním plánu. Zakončení povinných a povinně volitelných přednášek je zkouškou, seminářů zápočtem a laboratorních cvičení klasifikovaným zápočtem. U volitelných předmětů si student vybírá z možných zakončení předmětu. Student může požádat garanta programu, aby mohl namísto povinného předmětu zapsat předmět analogický obsahem, se stejným ukončením a stejného nebo většího rozsahu. Studenti si sestavují studijní plány tak, aby do termínu státní bakalářské zkoušky splnili stanovené závazné podmínky, mezi než patří: •
student musí v prvním a druhém semestru studia zapsat všechny předměty podle doporučeného studijního plánu s výjimkou angličtiny.
•
po absolvování prvního semestru student volí zařazení do zaměření Biotechnologie, Klinická biochemie nebo Bioanalytická chemie.
•
na začátku každého akademického roku absolvovat povinný předmět bez kreditového hodnocení C7777 Zacházení s chemickými látkami.
•
získání odpovídajícího počtu kreditů celkem za studium (tj. min. 180) i pro jednotlivé skupiny předmětů – povinné (149) a volitelné.
•
splnit podmínky uzavření jednotlivých částí studia (semestrů a ročníků) a zápisu do dalších.
•
dodržet návaznost předmětů stanovenou v jejich katalogu nebo upravenou zvláštními ustanoveními.
•
složit úspěšně zkoušku z předmětu JA001 Odborná angličtina-zkouška před přihlášením se ke státní bakalářské zkoušce.
Duležité upozornění: Při sestavování studijního plánu je nutno vzít v úvahu požadavky pro státní závěrečnou zkoušku, jejichž sylaby jsou zveřejněny ve studijních materiálech. Jim se musí přizpůsobit výběr předmětů tak, aby student získal potřebné informace v celém požadovaném rozsahu, tj. povinné biochemii i vybraném dalším předmětu.
41
7.1 Studijní obor: Aplikovaná biochemie
Doporučené studijní plány 1. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C1020 C1040
Obecná chemie Obecná chemie - seminář
4+2 kr. 4/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z
C1061 C1062
Anorganická chemie i Anorganická chemie i - seminář
2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z
C1200 C1460
Úvod do studia biochemie Úvod do matematiky
2+1 kr. 2/0/0 k 1+2 kr. 1/0/0 zk
C1480
Úvod do matematiky - seminář
1 kr. 0/1/0 z
C4222
Základní laboratorní výpočty
1 kr. 0/1/0 z
C7170 C7777
Struktura a funkce buňky Zacházení s chemickými látkami
4 kr. 2/0/0 zk 0 kr. 0/0/0 z
Pinkas Křivohlávek, Moravec, Nečas, Pinkas, Ševčík Příhoda, Babiak Křivohlávek, Novosad, Toužín Zbořil Koča, Kříž, Svobodová Vařeková, Pravda, Raček, Sehnal, Ionescu Koča, Sehnal, Pravda, Raček, Kříž, Švandová, Svobodová Vařeková, Ionescu Bouchal, Kašparovský, Lochman, Obořil Šerý Příhoda, Petlachová
Doporučené volitelné předměty C1101 C3200 C7110 JAC01
Výpočetní technika i Chemická literatura Výpočetní technika - aplikace Angličtina pro chemiky i
1 kr. 1+2 kr. 1 kr. 2 kr.
1/0/0 1/0/0 0/1/0 0/2/0
k zk z z
Farková Mazal, Nečas, Skládal Farková Dlabolová, Složilová, Čoupková, Hranáčová, Kubrická, Kupčíková, Němcová, Ševečková
2/0/0 2/0/0 2/0/0 0/0/4 2/0/0 2/1/0
zk zk zk kz zk k
Gloser, Kummerová Vácha, Šimek Mazal Janiczek, Lochman Kubáček Bochníček, Hanák, Novotný
Volitelné předměty Z výběru doporučených volitelných předmětů 4 kr.
Jarní semestr - zaměření Biotechnologie Povinné předměty Bi6180 Bi6790 C2021 C4221 C4660 F2120
42
Biologie rostlin Biologie živočichů Organická chemie i Biochemická laboratorní technika Základy fyzikální chemie Fyzika
2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 4 kr. 2+2 kr. 3+1 kr.
7 Bakalářský studijní program Aplikovaná biochemie Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 4 kr.
Jarní semestr - zaměření Klinická biochemie Povinné předměty Bi6180 Bi6790 C2700 C4221 C4660 F2120
Biologie rostlin Biologie živočichů Základy organické chemie Biochemická laboratorní technika Základy fyzikální chemie Fyzika
2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 4 kr. 2+2 kr. 3+1 kr.
2/0/0 2/0/0 2/0/0 0/0/4 2/0/0 2/1/0
zk zk zk kz zk k
Gloser, Kummerová Vácha, Šimek Pazdera Janiczek, Lochman Kubáček Bochníček, Hanák, Novotný
2/0/0 2/0/0 2/0/0 0/0/4 2/0/0 2/1/0
zk zk zk kz zk k
Gloser, Kummerová Vácha, Šimek Pazdera Janiczek, Lochman Kubáček Bochníček, Hanák, Novotný
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 4 kr.
Jarní semestr - zaměření Bioanalytická chemie Povinné předměty Bi6180 Bi6790 C2700 C4221 C4660 F2120
Biologie rostlin Biologie živočichů Základy organické chemie Biochemická laboratorní technika Základy fyzikální chemie Fyzika
2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 4 kr. 2+2 kr. 3+1 kr.
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 4 kr.
2. rok studia Podzimní semestr - zaměření Biotechnologie Povinné předměty C1635
Analytická chemie - praktikum
3 kr. 0/3/0 z
C1660 C2200
Základy analytické chemie Chemická syntéza - praktikum
2+2 kr. 2/0/0 zk 8 kr. 0/0/8 kz
C3022 C3181 C3190 C7777
Organická chemie II/1 Biochemie i Biochemie i - seminář Zacházení s chemickými látkami
2+2 kr. 2+2 kr. 1 kr. 0 kr.
2/0/0 2/0/0 0/1/0 0/0/0
zk zk z z
Bittová, Lubal, Novotný, Táborský, Vaculovič, Vašinová Galiová, Vrbková Komárek Janků, Literák, Pálková, Petlachová, Filípková, Moravec Paruch, Švenda Zbořil Bouchal, Kašparovský Příhoda, Petlachová
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 9 kr.
43
7.1 Studijní obor: Aplikovaná biochemie Podzimní semestr - zaměření Klinická biochemie Povinné předměty C2200
Chemická syntéza - praktikum
8 kr. 0/0/8 kz
C3100
Analytická chemie i
2+2 kr. 2/0/0 zk
C3181 C3190 C7777
Biochemie i Biochemie i - seminář Zacházení s chemickými látkami
2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z 0 kr. 0/0/0 z
Janků, Literák, Pálková, Petlachová, Filípková, Moravec Kanický, Preisler, Vaculovič Zbořil Bouchal, Kašparovský Příhoda, Petlachová
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 10 kr.
Podzimní semestr - zaměření Bioanalytická chemie Povinné předměty C2200
Chemická syntéza - praktikum
8 kr. 0/0/8 kz
C3100
Analytická chemie i
2+2 kr. 2/0/0 zk
C3181 C3190 C4020 C7777
Biochemie i Biochemie i - seminář Pokročilá fyzikální chemie Zacházení s chemickými látkami
2+2 kr. 1 kr. 2+2 kr. 0 kr.
2/0/0 0/1/0 2/0/0 0/0/0
zk z zk z
3/0/0 2/0/0 0/2/0 0/1/0 0/0/7
zk zk z z kz
Janků, Literák, Pálková, Petlachová, Filípková, Moravec Kanický, Preisler, Vaculovič Zbořil Bouchal, Kašparovský Kubáček Příhoda, Petlachová
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 12 kr.
Jarní semestr - zaměření Biotechnologie Povinné předměty Bi4020 C4182 C4185 C4200 C4220
Molekulární biologie Biochemie II Seminář k bakalářské práci i Biochemie II - seminář Biochemie - laboratorní cvičení
3+2 kr. 2+2 kr. 2 kr. 1 kr. 7 kr.
C6210
Biotechnologie
2+2 kr. 2/0/0 zk
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 7 kr.
44
Doškař Zbořil Skládal Bouchal, Kašparovský Boublíková, Kašparovský Mandl
7 Bakalářský studijní program Aplikovaná biochemie Jarní semestr - zaměření Klinická biochemie Povinné předměty Bi4020 C3120
Molekulární biologie Analytická chemie - praktikum
3+2 kr. 3/0/0 zk 2 kr. 0/0/2 kz
C4050 C4182 C4185 C4200 C4220
Analytická chemie II Biochemie II Seminář k bakalářské práci i Biochemie II - seminář Biochemie - laboratorní cvičení
2+2 kr. 2+2 kr. 2 kr. 1 kr. 7 kr.
2/0/0 2/0/0 0/2/0 0/1/0 0/0/7
zk zk z z kz
Doškař Lubal, Táborský, Bittová Lubal Zbořil Skládal Bouchal, Kašparovský Boublíková, Kašparovský
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 4 kr.
Jarní semestr - zaměření Bioanalytická chemie Povinné předměty Bi4020 C3120
Molekulární biologie Analytická chemie - praktikum
3+2 kr. 3/0/0 zk 2 kr. 0/0/2 kz
C4050 C4182 C4185 C4200 C4220
Analytická chemie II Biochemie II Seminář k bakalářské práci i Biochemie II - seminář Biochemie - laboratorní cvičení
2+2 kr. 2+2 kr. 2 kr. 1 kr. 7 kr.
2/0/0 2/0/0 0/2/0 0/1/0 0/0/7
zk zk z z kz
Doškař Lubal, Táborský, Bittová Lubal Zbořil Skládal Bouchal, Kašparovský Boublíková, Kašparovský
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 5 kr.
3. rok studia
45
7.1 Studijní obor: Aplikovaná biochemie Podzimní semestr - zaměření Biotechnologie Povinné předměty Bi5710
Mikrobiologie
Bi5710c Mikrobiologie - cvičení
Bi7430
Molekulární biotechnologie
Bi7430c Molekulární biotechnologie cvičení
Bi7941 C5014 C7777 C7870
Molekulární biologie - laboratorní cvičení (pro obor biochemie) Bakalářská práce z biochemie i Zacházení s chemickými látkami Biometrika
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z
2+2 kr. 2/0/0 zk 4 kr. 0/4/0 z
3 kr. 0/3/0 z 5 kr. 0/0/5 z 0 kr. 0/0/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Bidmanová, Damborská, Šebestová Vávrová, Krsek, Kopecká, Bardounová, Syrovátková, Geržová, Kubasová, Kýrová, Straková, Varmužová Prokop, Dvořák, Turánek, Bidmanová, Beerens, Damborská Prokop, Turánek, Beerens, Chrást, Bidmanová, Štěpánková, Dvořák, Buryška Pantůček Janiczek Příhoda, Petlachová Mandl
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 4 kr.
Podzimní semestr - zaměření Klinická biochemie Povinné předměty Imunologie Molekulární biologie - laboratorní cvičení (pro obor biochemie) LF:BMAK051 Analýza klinických dat C5014 Bakalářská práce z biochemie i C6220 Klinická biochemie C6230a Klinická biochemie - cvičení C7777 Zacházení s chemickými látkami C7870 Biometrika Bi5220 Bi7941
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 4 kr.
46
2+2 kr. 2/0/0 zk 3 kr. 0/3/0 z
Lojek, Číž, Kubala Pantůček
2+1 kr. 5 kr. 4+2 kr. 4 kr. 0 kr. 2+2 kr.
Dušek, Jarkovský Janiczek Wimmerová Dastych Příhoda, Petlachová Mandl
0/0/0 0/0/5 4/0/0 0/4/0 0/0/0 2/0/0
zk z zk z z zk
7 Bakalářský studijní program Aplikovaná biochemie Podzimní semestr - zaměření Bioanalytická chemie Povinné předměty Bi7941 C5014 C5190 C6220 C6230a C7777 C7870 C9100
Molekulární biologie - laboratorní cvičení (pro obor biochemie) Bakalářská práce z biochemie i Instrumentální analytická chemie praktikum Klinická biochemie Klinická biochemie - cvičení Zacházení s chemickými látkami Biometrika Biosenzory
3 kr. 0/3/0 z
Pantůček
5 kr. 0/0/5 z 5 kr. 0/0/5 kz
Janiczek Farková, Hrdlička, Preisler, Vašinová Galiová Wimmerová Dastych Příhoda, Petlachová Mandl Skládal
4+2 kr. 4 kr. 0 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
4/0/0 0/4/0 0/0/0 2/0/0 2/0/0
zk z z zk zk
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 2 kr.
Jarní semestr - zaměření Biotechnologie Povinné předměty CZBAB C6014 C6185 C6200 JA001
Státní závěrečná bakalářská zkouška kr. z aplikované biochemie Bakalářská práce z biochemie II 10 kr. Seminář k bakalářské práci II 2 kr. Biochemické metody 4+2 kr. Odborná angličtina - zkouška 2 kr.
0/0/0 -
Janiczek
0/0/10 z 0/2/0 z 4/0/0 zk 0/0/0 zk
Janiczek Skládal Glatz, Zbořil Ševečková, Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová
0/0/0 -
Janiczek
0/0/10 z 0/2/0 z 4/0/0 zk 0/0/0 zk
Janiczek Skládal Glatz, Zbořil Ševečková, Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 10 kr.
Jarní semestr - zaměření Klinická biochemie Povinné předměty CZBAB C6014 C6185 C6200 JA001
Státní závěrečná bakalářská zkouška kr. z aplikované biochemie Bakalářská práce z biochemie II 10 kr. Seminář k bakalářské práci II 2 kr. Biochemické metody 4+2 kr. Odborná angličtina - zkouška 2 kr.
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 10 kr.
47
7.1 Studijní obor: Aplikovaná biochemie Jarní semestr - zaměření Bioanalytická chemie Povinné předměty CZBAB C6014 C6185 C6200 JA001
Státní závěrečná bakalářská zkouška kr. z aplikované biochemie Bakalářská práce z biochemie II 10 kr. Seminář k bakalářské práci II 2 kr. Biochemické metody 4+2 kr. Odborná angličtina - zkouška 2 kr.
0/0/0 -
Janiczek
0/0/10 z 0/2/0 z 4/0/0 zk 0/0/0 zk
Janiczek Skládal Glatz, Zbořil Ševečková, Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 8 kr. Výběr doporučených povinně volitelných a volitelných předmětů viz studijní plány oboru Biochemie.
48
8 Magisterský studijní program Biochemie
8
Magisterský studijní program Biochemie
Garant studijního programu Prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc.
Cíle studia ve studijním programu Magisterský program Biochemie připravuje vysokoškolsky vzdělané odborníky, kteří mají přehled o oblastech biochemie jako je enzymologie, aplikovaná mikrobiologie, bioanalytická chemie, enzymové inženýrství, klinické biochemie, apod., kteří budou schopni získané poznatky aplikovat při řešení výzkumných úkolů i všech odborných problémů v budoucím zaměstnání.
Doporučené studijní plány a pravidla pro jejich sestavování Studijní plány (viz. níže) jsou určeny pro studenty nastupujícího prvního semestru tohoto magisterského studia. Na základě nové akreditace jsme provedli změny u oboru Biochemie (studijní plán a obsah státní závěrečné zkoušky), Analytická biochemie (studijní plán) a Biomolekulární chemie (studijní plán a obsah státní závěrečné zkoušky). Tyto změny naleznete v akreditačních materiálech, které jsme zpřístupnili na webových stránkách ústavu biochemie, změny jsou barevně zvýrazněny: •
http://orion.sci.muni.cz/Biochemie.pdf
•
http://orion.sci.muni.cz/Analytická biochemie.pdf
•
http://orion.sci.muni.cz/Biomolekulární chemie.pdf
Studijní plány a obsah státní závěrečné zkoušky stávajících studentů uvedených studijních oborů zůstávají beze změn, totéž platí pro obory Chemoinformatika a bioinformatika a Genomika a proteomika V doporučených studijních plánech jsou uvedeny vhodné kombinace předmětů a semestrální průchody, které zahrnují všechny povinné, povinně volitelné a některé doporučené volitelné předměty jednotlivých studijních oborů. Nejsou zde uvedeny předměty, které se v tomto školním roce nevypisují. Nejedná se v žádném případě o povinnost absolvovat předměty v uvedených semestrech studia. Zároveň však jde o doporučený plán, jehož realizace je fakultou garantována a který by měl umožnit ukončení studia v doporučené době. Témata diplomových prací vypisuje rada Ústavu biochemie a rada NCBR na návrh učitelů a zveřejňuje jejich aktuální nabídku v dostatečném počtu. Student si z aktuální nabídky svobodně volí téma diplomové práce. O zadání diplomové práce na zvolené téma žádá student na začátku prvního semestru magisterského studia učitele, který téma navrhl. Zadáním diplomové práce se učitel, který téma vypsal, stává pro studenta, který si ho vybral, vedoucím diplomové práce. Rada Ústavu biochemie a rada NCBR písemné zadání diplomových prací registruje a archivuje. Student může kterémukoliv učiteli chemické sekce navrhnout téma své diplomové práce nebo se na tomto tématu dohodnout. V tomto případě navrhuje učitel téma diplomové práce pro konkrétního studenta. Omezením výběru ze zveřejněných témat diplomových prací mohou být jen předem uvedené kapacitní důvody pracoviště, na němž má být diplomová práce zpracována, nebo dřívější obsazení tématu jiným studentem. Magisterský studijní program Biochemie se dělí na následující obory:
49
8.1 Studijní obor: Biochemie •
Biochemie
•
Analytická biochemie
•
Biomolekulární chemie
•
Chemoinformatika a bioinformatika
•
Genomika a proteomika
8.1
Studijní obor: Biochemie
Garant studijního oboru Prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc. Pravidla pro sestavování studijního plánu Vytvoření studijního plánu podle pravidel studijního programu je zákonným právem studenta. Při sestavení studijního plánu musí student dodržet ustanovení Studijního a zkušebního řádu fakulty a Pravidla a podmínky pro vytváření studijního plánu v daném studijním programu. Jako východisko k tvorbě studijního plánu může student využít Doporučeného studijního plánu. Doporučený studijní plán rovnoměrně rozkládá studium do standardní doby dvou let a může se stát závazným jedině volbou studenta. Zaručuje studentům, kteří podle něho studují splnění povinností nutných k ukončení magisterského studia během standardní doby. Fakultní rozvrh (časová a prostorová alokace výuky předmětů pro daný semestr) je zpracován v návaznosti na doporučené studijní plány. Povinné předměty a povinně volitelné předměty a jejich návaznosti jsou uvedeny v doporučeném studijním plánu. Povinným předmětem bez kreditového hodnocení je dvouhodinová bloková přednáška Zacházení s chemickými látkami, kterou musí každý student absolvovat na začátku každého akademického roku a jejíž absolvování je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami (laboratorních cvičení, diplomových prací ap.) Student může požádat garanta programu, aby mohl namísto povinného předmětu zapsat předmět analogický obsahem, se stejným ukončením a stejného nebo většího rozsahu. Pokud student úspěšně absolvoval povinný předmět již během bakalářského studia nahradí ho jedním z povinně volitelných předmětů stejného nebo většího rozsahu. Povinně volitelné předměty jsou uvedeny v Doporučeném studijním plánu. Volitelné předměty jsou všechny předměty, které jsou na Přírodovědecké fakultě a ostatních fakultách Masarykovy univerzity v daném období vyučovány a jejichž zápis je pro studenty daného programu povolen. Výběr volitelných předmětů je omezen na povinnost absolvovat minimum 108 kreditů za předměty přírodovědeckých, matematických nebo informatických věd, z toho minimálně 96 kreditů za předměty z oboru chemických a biologických věd. Volitelné předměty zvláště vhodné pro magisterský studijní obor Biochemie jsou uvedeny v doporučeném studijním plánu. Student si může zapsat předmět figurující v seznamu povinně volitelných předmětů jako předmět volitelný. Zakončení povinných a povinně volitelných předmětů je zkouškou u přednášky, klasifikovaným zápočtem u laboratorního cvičení a zápočtem u semináře. Zakončení volitelných předmětů si student vybírá z možných zakončení předmětu. Při tvorbě a plnění studijního plánu musí každý student studijního programu dodržet následující pravidla a podmínky: •
50
Na začátku každého akademického roku absolvovat povinný předmět bez kreditového hodnocení C7777 Zacházení s chemickými látkami.
8 Magisterský studijní program Biochemie •
Musí do termínu konání magisterské státní závěrečné zkoušky zapsat a úspěšně ukončit všechny předměty, které jsou ve studijním programu povinné a respektovat přitom stanovené návaznosti.
•
Získat za celé studium absolvováním povinných, povinně volitelných a volitelných předmětů nejméně 120 kreditů. Povinně volitelné nutno absolvovat v rozsahu nejméně 14 kreditů za studium, nepočítaje v to diplomovou práci, oborový seminář a seminář k diplomové práci.
•
Za absolvování volitelných předmětů musí student získat minimálně 30 kreditů.
•
Zpracovat diplomovou práci na zadané téma. Kreditová hodnota diplomové práce je 50.
•
Student musí úspěšně vykonat zkoušku z předmětu JA002 Pokročilá odborná angličtina – zkouška před přihlášením k magisterské státní závěrečné zkoušce pokud tuto nevykonal v rámci svého předchozího bakalářského studia.
•
Absolvovat úspěšně všechny součásti magisterské státní závěrečné zkoušky.
Státní závěrečná zkouška pro studenty oboru biochemie sestává ze tří předmětů: •
pokročilá biochemie
•
molekulární biologie a genetika
•
biotechnologie
1. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C7777 C8160 C9320
Zacházení s chemickými látkami Enzymologie Metody biochemického výzkumu
0 kr. 0/0/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk 6 kr. 0/0/6 z
Příhoda, Petlachová Kučera Janiczek, Wimmerová, Mandl, Kašparovský, Lochman, Bouchal, Glatz, Kučera, Skládal, Pavelka, Šedo, Žídek, Srb
Povinně volitelné předměty C9300 Diplomová práce i (BC) 5 kr. 0/0/5 kz Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 2 kr.
Janiczek
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 13 kr.
Jarní semestr Povinné předměty C6206 C6210
Vybrané biochemické metody Biotechnologie
4 kr. 0/0/4 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Glatz Mandl
51
8.1 Studijní obor: Biochemie Povinně volitelné předměty C8210 Diplomová práce II (BC) 10 kr. 0/0/10 kz Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 2 kr.
Janiczek
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 4 kr.
2. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C7777
Zacházení s chemickými látkami
0 kr. 0/0/0 z
Příhoda, Petlachová
Povinně volitelné předměty C9002 C9220 C9310
Oborový seminář z biochemie III Seminář k diplomové práci i Diplomová práce III (BC)
2 kr. 0/2/0 z 2 kr. 0/2/0 z 10 kr. 0/0/10 kz
Mandl Mandl Janiczek
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 10 kr.
Jarní semestr Povinné předměty CZMB C8140 JA002
Státní závěrečna magisterská zkouška z biochemie Bioenergetika Pokročilá odborná angličtina zkouška
kr. 0/0/0 2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/0/0 zk
Janiczek Kučera Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová, Ševečková
Povinně volitelné předměty CA010 CA220 CA340
Oborový seminář z biochemie IV Seminář k diplomové práci II Diplomová práce IV (BC)
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 3 kr.
52
2 kr. 0/2/0 z 2 kr. 0/2/0 z 25 kr. 0/0/25 kz
Mandl Mandl Janiczek
8 Magisterský studijní program Biochemie Povinně volitelné předměty kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinně volitelné předměty Vývojová genetika Imunologie Chemické vlastnosti, struktura a interakce nukleových kyselin Jaderná chemie Oborový seminář z biochemie i Funkční biochemie i - regulace metabolismu Funkční biochemie i - seminář DNA diagnostika - cvičení Experimentální onkologie
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/0/2 z
C7195
Úvod do molekulární medicíny Úvod do molekulární medicíny cvičení Pokročilé praktikum z biochemie
C7870 C8170 C9090 C9100
Biometrika Enzymologie - seminář Sekundární metabolity Biosenzory
2+2 kr. 2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
Bi0580 Bi5220 Bi7015 C5040 C7010 C7150 C7160 C7176 C7187 C7188 C7189
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z 4 kr. 0/4/0 kz 2+2 kr. 2/0/0 zk
5 kr. 0/0/5 kz 2/0/0 0/2/0 2/0/0 2/0/0
zk z zk zk
Vyskot Lojek, Číž, Kubala Fojta, Paleček, Fojtová, Vorlíčková Příhoda Skládal Pavelka Pavelka Šerý, Bonczek Bouchal, Hrstka, Müller, Nenutil, Vojtěšek Slabý Slabý, Šána, Vychytilová Lochman, Kašparovský, Bouchal Mandl Kučera Pluháček Skládal
Jarní semestr Povinně volitelné předměty Bi6400 Bi8090 C4840 C6010 C6240 C7175 C7860 C8010 C8150 C8155
Metody molekulární biologie Genové inženýrství Metody značení a imobilizace biomolekul Toxikologie Xenobiochemie DNA diagnostika Rostlinná biochemie
3+2 kr. 3/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Šmarda, Pantůček Doškař Skládal
1+2 kr. 2+2 kr. 4 kr. 2+2 kr.
Oborový seminář z biochemie II Bioenergetika - seminář Funkční biochemie II - signální dráhy
2 kr. 0/2/0 z 2 kr. 0/2/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Picka Machala Šerý Kašparovský, Lochman Pavelka Kučera Pavelka
1/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0
zk zk zk zk
53
8.1 Studijní obor: Biochemie Doporučené volitelné předměty pro magisterský program Biochemie kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Doporučené volitelné předměty Bi5000 Bi5040 Bi5580
Bioinformatika i - nukleové kyseliny 1+1 kr. 1/0/0 k Biostatistika - základní kurz 3+2 kr. 3/0/0 zk Obecná ekotoxikologie 2+2 kr. 2/0/0 zk
Bi5580c Obecná ekotoxikologie - cvičení Bi7140 Molekulární biologie virů Bi7541 Analýza dat na PC
1 kr. 0/1/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 kz
Bi9060
Bioinformatika II – proteiny
1+1 kr. 1/0/0 k
C2110
Operační systém UNIX a základy programování Praktický úvod do superpočítání Organická chemie II/2 Chemická literatura Makromolekulární chemie Chemie životního prostředí i Environmentální procesy Chemie životního prostředí III Zdroje znečištění, složky prostředí a jejich znečištění - hydrosféra, pedosféra, biosféra Chemická struktura Chemická struktura - seminář Metody chemického výzkumu
2+1 kr. 0/2/0 k
C2115 C3040 C3200 C4120 C4300 C4320
C5020 C5030 C5060
2 kr. 2 kr. 1+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
0/2/0 0/2/0 1/0/0 2/0/0 2/0/0
k z zk zk zk
2+2 kr. 2/0/0 zk
Holoubek
2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Brož Brož Táborský, Bittová, Preisler, Toužín, Trnková, Lubal, Heger, Klán, Literák, Mazal, Novotný, Prokeš, Sopoušek, Vrbková Farková Farková
C5241
Počítače v chemii a chemometrie 1+1 kr. 1/0/0 k Počítače v chemii a chemometrie 2 kr. 0/2/0 z cvičení Organická analýza 1+2 kr. 1/0/0 zk
C5300
Statistická termodynamika
2+2 kr. 2/0/0 zk
C5320 C5340 C5440 C5870 C5920 C6220 C6230
Fyzikálně chemické základy NMR Nerovnovážné systémy Separační metody EPR spektroskopie Správná laboratorní praxe Klinická biochemie Klinická biochemie - cvičení
3+2 kr. 2+2 kr. 1+2 kr. 2+2 kr. 1+2 kr. 4+2 kr. 4 kr.
C5120 C5140
54
Pantůček, Damborská Jarkovský Bláha, Jarque Ortiz, Michelová Novák Růžičková Jarkovský, Malúšková, Kalina Damborský, Damborská, Pantůček, Šebestová Kulhánek, Janoš, Štěpán, Trnka Kulhánek, Štěpán Paruch, Švenda Mazal, Nečas, Skládal Šindelář Holoubek
2/1/0 2/0/0 1/0/0 2/0/0 1/0/0 4/0/0 0/4/0
zk zk zk zk zk zk z
Farková, Lubal, Pazdera Pavlů, Šob, Vřešťál, Zouhar Sklenář, Fiala, Srb Kučera Mazal Kubáček Bielská, Bláha, Vrana Wimmerová Tomandl
8 Magisterský studijní program Biochemie Volitelné předměty – pokračování C7031 C7050 C7060 C7080 C7110 C7186 C7201 C7280 C7301
Atomová spektrometrie Elektroanalytické metody Stopová analýza Lasery v analytické chemii Výpočetní technika - aplikace Molekulární psychiatrie Základy genomiky Elektrodová kinetika Základy genomiky - cvičení
2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 1 kr. 2+2 kr. 1+2 kr. 2+2 kr. 3 kr.
C7410 C7440 C7460
Struktura a reaktivita Koordinace a katalýza Identifikace organických látek cvičení Organokovové sloučeniny Inorganic Materials Chemistry Počítačová chemie a molekulové modelování i Počítačová chemie a molekulové modelování i - cvičení
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 1/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z
Kanický, Otruba Trnková Komárek, Coufalík Novotný Farková Šerý Hejátko, Konečná Trnková Hejátko, Skoupá, Pernisová, Konečná, Dobisová, Didi, Hrdinová, Žďárská Klán Pazdera Pazdera
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Novosad Moravec, Pinkas Koča, Kulhánek
1 kr. 0/1/0 z
Koča, Kulhánek, Štěpán Havel Glatz, Janiczek Zbořil Preisler
C7740 C7780 C7790 C7800 C7830 C7880 C7890 C7895 C7910 C7950 C7955 C8152 C8840 C8857 C8980c C9500 C9530
Kapilární elektroforéza Nové směry v bioanalytické chemii Chemická technika Hmotnostní spektrometrie biomolekul Metody chemického výzkumu Speciační analýza
2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 0/1/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 0/3/0
2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0
zk zk zk zk z zk zk zk k
zk zk zk zk
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Molekulová luminiscence 1+2 kr. Srovnávací biologie živočichů 2+2 kr. Chemistry of macrocyclic 2+2 kr. compounds Protein Preparation and 1+2 kr. Characterization III Protein-Mediated Interaction Příprava a charakterizace proteinů i - 2+1 kr. cvičení Užitá chemie 2+1 kr. Strukturní biochemie 2+2 kr.
1/0/0 zk 2/0/0 zk 2/0/0 zk
Zbořil Kanický, Komárek, Lubal Táborský, Preisler Šerý Lubal
1/0/0 zk
Krejčí
0/2/0 kz
Janda, Pekárová, Dopitová Pazdera Žídek, Plevka, Srb, Zachrdla Munzarová
2/0/0 k 2/0/0 zk
Úvod do kvantové chemie 3+2 kr. 2/1/0 zk a elektronové struktury molekul F7460 Fyzika pevných látek pro 2+2 kr. 2/0/0 zk nefyzikální obory GE091 Mineralogie a geochemie 3 kr. 2/0/0 kz FI:PB050 Modelování a predikce v systémové 2+2 kr. 1/1/0 zk biologii XV004 Výzkum a vývoj v praxi 4 kr. 2/2/0 kz C9920
Holý Losos Šafránek Janouškovcová, Alán55
8.1 Studijní obor: Biochemie Jarní semestr Doporučené volitelné předměty Bi5620
Ekotoxikologické biotesty
Bi5620c Ekotoxikologické biotesty - cvičení Bi6920 Bi7541 C2102 C3211 C4010 C4310
C4330 C4450 C4455 C5880 C6020 C6110 C6120 C6140 C6160 C6170 C6290 C6300 C6310 C6320 C6330 C6410 C6750 C6770 C6790 C6800
56
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/0/2 z
Vybrané nástroje ochrany životního 2+1 kr. 2/0/0 k prostředí - EIA a LCA Analýza dat na PC 2 kr. 0/2/0 kz Výpočetní technika II - praktické cvičení Aplikovaná bioinformatika
2 kr. 0/2/0 z 3 kr. 0/4/0 k
Anorganická chemie III 2+2 kr. Chemie životního prostředí II 2+2 kr. Zdroje znečištění, složky prostředí a jejich znečištění - technosféra, atmosféra Chemie životního prostředí IV 2+2 kr. Látky znečišťující prostředí (environmentální polutanty) Organická chemie III - syntéza 2+2 kr. Organická chemie III - syntéza 2 kr. seminář Základy stereochemie 2+2 kr. Jaderná chemie - praktikum 3 kr. Analytická chemie ŽP - anorganické 2+2 kr. polutanty Analytická chemie ŽP - anorganické 3 kr. polutanty - laboratorní cvičení Optimalizace a hodnocení 2+2 kr. analytických metod Analytická chemie II - seminář 2 kr. Analýza materiálů - praktikum 5 kr. Atomová absorpční spektrometrie 1+2 kr. Optická a hmotnostní spektrometrie 1+2 kr. s indukčně vázaným plazmatem Symetrie molekul 2+2 kr. Chemická kinetika 2+2 kr. Chemická kinetika - seminář 1 kr. Organická analýza - praktikum 3 kr. Materiálová chemie kovů 2+2 kr. NMR Spectroscopy of Biomolecules 2+2 kr. Hmotnostní spektrometrie 2+2 kr. Multinukleární NMR spektroskopie 2+2 kr.
Hilscherová, Maršálek, Hofman, Čupr Novák, Hilscherová, Rábová, Vašíčková Bittner, Anděl Jarkovský, Mužík, Kohút, Zdražil Farková
2/0/0 zk 2/0/0 zk
Wimmerová, Houser, Malinovská Pinkas, Příhoda Holoubek
2/0/0 zk
Holoubek
2/0/0 zk 0/2/0 z
Paruch Paruch
2/0/0 zk 0/0/3 kz 2/0/0 zk
Nečas Křivohlávek Komárek, Kuta
0/0/3 kz
Komárek, Kuta, Vaculovič Farková
2/0/0 zk 0/2/0 z 0/0/5 kz 1/0/0 zk 1/0/0 zk
Lubal Komárek, Nováková, Vaculovič Komárek Kanický
2/0/0 2/0/0 0/1/0 0/0/3 2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0
Kubáček Sopoušek Sopoušek Farková, Pazdera Brož, Pavlů Žídek, Fiala Brož, Vřešťál Pinkas
zk zk z kz zk zk zk zk
8 Magisterský studijní program Biochemie Volitelné předměty – pokračování Radioekologie 1+2 kr. Moderní metody analýzy 2+2 kr. organických polutantů C6900 Biofyzikální faktory ŽP 2 kr. C6950 Chemická exkurze 0 kr. C6960 Odborná praxe 0 kr. C8500 Mechanismy organických reakcí 2+2 kr. C8510 Mechanismy organických reakcí 1 kr. seminář C8580 Analýza rizik 2+2 kr. C8700 Technologie chemických výrob 2+2 kr. C8800 Rtg strukturní analýza 2+2 kr. C8820 Metody studia rovnováh a kinetiky 2+2 kr. reakcí C8857c Protein Preparation and 3 kr. Characterization III - practice C8860 Syntetické metody ”zelené”chemie 2+2 kr. C8862 Výpočty volných energií - cvičení 1 kr. C8863 Výpočty volných energií 2+1 kr. C8880 Vybrané metody analýzy pevných 1+2 kr. látek C8885 Supramolekulární chemie 2+2 kr. C8950 NMR - Strukturní analýza 2+2 kr. C8980 Příprava a charakterizace proteinů i - 2+2 kr. Exprese a purifikace C9085 Protein-RNA interactions 1+2 kr. C9095 RNA metabolism 2+2 kr. C9930 Metody kvantové chemie 2+2 kr. C9940 3-Dimensional Transmission kr. Electron Microscopy (3DEM) F7460 Fyzika pevných látek pro 2+2 kr. nefyzikální obory F8310 Molekulové interakce a jejich úloha 3+1 kr. v biologii a chemii F8390 Metalloproteins: structure and 1+1 kr. function FI:PA054 Formální modely v systémové 2+2 kr. biologii FI:PB051 Výpočetní metody v bioinformatice 2+2 kr. a systémové biologii C6830 C6860
1/0/0 zk 2/0/0 zk
Křivohlávek Klánová
2/0/0 0/0/0 0/0/0 2/0/0 0/1/0
k z z zk z
Jašek Janků, Šindelář Koča, Pinkas, Šindelář Klán Klán
2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0
zk zk zk zk
Čupr Šindelář Marek Havel
0/2/0 kz
Krejčí
2/0/0 0/1/0 2/0/0 1/0/0
zk z zk zk
Pazdera Kulhánek Kulhánek Kanický, Otruba
2/0/0 zk 2/0/0 zk 2/0/0 zk
Mazal Marek Janda, Pekárová, Dopitová, Žídek Štefl Vaňáčová Munzarová Plitzko
1/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/2
zk zk zk zk
2/0/0 zk
Holý
2/0/0 k
Šponer
1/0/0 k
Kozelka
2/0/0 zk
Šafránek
1/1/0 zk
Lexa, Šafránek, Bystrý
57
8.2 Studijní obor: Analytická biochemie
8.2
Studijní obor: Analytická biochemie
Garant studijního oboru Prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc. Pravidla pro sestavování studijního plánu Studijní plán si sestavuje každý student dle své volby podle pravidel studijního programu. Při sestavení studijního plánu musí student dodržet ustanovení Studijního a zkušebního řádu fakulty a Pravidla a podmínky pro vytváření studijního plánu v daném studijním programu. Jako východisko k tvorbě studijního plánu může student využít Doporučeného studijního plánu. Doporučený studijní plán rovnoměrně rozkládá studium do standardní doby dvou let a může se stát závazným jedině volbou studenta. Zaručuje studentům, kteří podle něho studují splnění povinností nutných k ukončení magisterského studia během standardní doby. Fakultní rozvrh (časová a prostorová alokace výuky předmětů pro daný semestr) je zpracován v návaznosti na doporučené studijní plány. Povinné předměty a povinně volitelné předměty a jejich návaznosti jsou uvedeny v doporučeném studijním plánu. Pro studijní obor Analytická biochemie jsou povinné předměty Biometrika, Metody biochemického výzkumu,Nové směry v bioanalutické chemii a Vybrané biochemické metody. Povinným předmětem bez kreditového hodnocení je dvouhodinová bloková přednáška Zacházení s chemickými látkami, kterou musí každý student absolvovat na začátku každého akademického roku a jejíž absolvování je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami (laboratorních cvičení, diplomových prací ap.) Student může požádat garanta programu, aby mohl namísto povinného předmětu zapsat předmět analogický obsahem, se stejným ukončením a stejného nebo většího rozsahu. Pokud student úspěšně absolvoval povinný předmět již během bakalářského studia nahradí ho jedním z povinně volitelných předmětů stejného nebo většího rozsahu. Povinně volitelné předměty jsou uvedeny v Doporučeném studijním plánu. Zakončení povinných a povinně volitelných předmětů je zpravidla zkouškou u přednášky, klasifikovaným zápočtem u laboratorního cvičení a zápočtem u semináře. Při tvorbě a plnění studijního plánu musí každý student studijního programu dodržet následující pravidla a podmínky:
58
•
Na začátku každého akademického roku absolvovat povinnou dvouhodinovou blokovou přednášku bez kreditového hodnocení Zacházení s chemickými látkami, jejíž absolvování je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami (diplomových prací ap.).
•
Do termínu konání magisterské státní závěrečné zkoušky zapsat a úspěšně ukončit zkouškou povinné předměty.
•
Získat za celé studium absolvováním povinných, povinně volitelných a volitelných předmětů nejméně 120 kreditů. Povinně volitelné nutno absolvovat v rozsahu nejméně 4 kredity za studium, nepočítaje v to diplomovou práci, oborový seminář a seminář k diplomové práci.
•
Za absolvování volitelných předmětů musí student získat minimálně 34 kreditů.
•
Zpracovat diplomovou práci na zadané téma. Kreditová hodnota diplomové práce je 50.
8 Magisterský studijní program Biochemie •
Volitelné předměty jsou všechny předměty, které jsou na Přírodovědecké fakultě a ostatních fakultách Masarykovy univerzity v daném období vyučovány a jejichž zápis je pro studenty daného programu povolen. Výběr volitelných předmětů je omezen na povinnost absolvovat minimum 108 kreditů za úspěšné ukončení předmětů povinných, povinně volitelných a volitelných z přírodovědeckých, matematický nebo informatických věd, z toho minimálně 96 kreditů za předměty z oboru chemických a biologických věd. Volitelné předměty zvláště vhodné pro magisterský studijní program Biochemie, obor Analytická biochemie, jsou uvedeny v Doporučeném studijním plánu.
•
Student musí úspěšně vykonat zkoušku z předmětu JA002 Pokročilá odborná angličtina – zkouška před přihlášením k magisterské státní závěrečné zkoušce pokud tuto nevykonal v rámci svého předchozího bakalářského studia.
•
Absolvovat úspěšně všechny součásti magisterské státní závěrečné zkoušky.
Státní závěrečná zkouška pro studenty oboru analytická biochemie sestává z hlavního předmětu analytická biochemie a dvou volitelných předmětů ze skupiny: •
klinická biochemie a patobiochemie
•
imunologie a imunochemie
•
molekulární biologie a genetika
•
instrumentální analytická chemie
Požadavky jsou uveřejněny na URL http://orion.chemi.muni.cz/pozadavky/szz.htm
1. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C7777 C7870 C9320
Zacházení s chemickými látkami Biometrika Metody biochemického výzkumu
0 kr. 0/0/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk 6 kr. 0/0/6 z
Příhoda, Petlachová Mandl Janiczek, Wimmerová, Mandl, Kašparovský, Lochman, Bouchal, Glatz, Kučera, Skládal, Pavelka, Šedo, Žídek, Srb
Povinně volitelné předměty C7010 Oborový seminář z biochemie i 2 kr. 0/2/0 z C9300 Diplomová práce i (BC) 5 kr. 0/0/5 kz Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 2 kr.
Skládal Janiczek
Doporučené volitelné předměty Z výběru doporučených volitelných předmětů 10 kr.
Jarní semestr Povinné předměty C6206
Vybrané biochemické metody
4 kr. 0/0/4 z
Glatz
59
8.2 Studijní obor: Analytická biochemie Povinně volitelné předměty C8010 Oborový seminář z biochemie II 2 kr. 0/2/0 z C8210 Diplomová práce II (BC) 10 kr. 0/0/10 kz Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 2 kr.
Pavelka Janiczek
Doporučené volitelné předměty Z výběru doporučených volitelných předmětů 9 kr.
2. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C7777 C7880
Zacházení s chemickými látkami 0 kr. 0/0/0 z Nové směry v bioanalytické chemii 2+2 kr. 2/0/0 zk
Příhoda, Petlachová Glatz, Janiczek
Povinně volitelné předměty C9002 C9220 C9310
Oborový seminář z biochemie III Seminář k diplomové práci i Diplomová práce III (BC)
2 kr. 0/2/0 z 2 kr. 0/2/0 z 10 kr. 0/0/10 kz
Mandl Mandl Janiczek
Doporučené volitelné předměty Z výběru doporučených volitelných předmětů 12 kr.
Jarní semestr Povinné předměty CZMAB JA002
Státní závěrečna magisterská zkouška z analytické biochemie Pokročilá odborná angličtina zkouška
kr. 0/0/0 2 kr. 0/0/0 zk
Janiczek Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová, Ševečková
Povinně volitelné předměty CA010 CA220 CA340
Oborový seminář z biochemie IV Seminář k diplomové práci II Diplomová práce IV (BC)
2 kr. 0/2/0 z 2 kr. 0/2/0 z 25 kr. 0/0/25 kz
Doporučené volitelné předměty Z výběru doporučených volitelných předmětů 3 kr.
60
Mandl Mandl Janiczek
8 Magisterský studijní program Biochemie Povinně volitelné předměty kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinně volitelné předměty Bi5220 C5920 C6220 C6230 C7073 C7150 C7160 C7176 C7187 C7188 C7189 C7195 C7895 C8160 C8170 C9100
Imunologie Správná laboratorní praxe Klinická biochemie Klinická biochemie - cvičení Bioanalytika i - Biomakromolekuly Funkční biochemie i - regulace metabolismu Funkční biochemie i - seminář DNA diagnostika - cvičení Experimentální onkologie
2+2 kr. 1+2 kr. 4+2 kr. 4 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
2/0/0 1/0/0 4/0/0 0/4/0 2/0/0 2/0/0
zk zk zk z zk zk
Lojek, Číž, Kubala Bielská, Bláha, Vrana Wimmerová Tomandl Havliš Pavelka
2 kr. 0/2/0 z 4 kr. 0/4/0 kz 2+2 kr. 2/0/0 zk
2+2 kr. 2/0/0 zk
Pavelka Šerý, Bonczek Bouchal, Hrstka, Müller, Nenutil, Vojtěšek Slabý Slabý, Šána, Vychytilová Lochman, Kašparovský, Bouchal Preisler
Úvod do molekulární medicíny Úvod do molekulární medicíny cvičení Pokročilé praktikum z biochemie
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/0/2 z
Hmotnostní spektrometrie biomolekul Enzymologie Enzymologie - seminář Biosenzory
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Kučera Kučera Skládal
5 kr. 0/0/5 kz
61
8.2 Studijní obor: Analytická biochemie Jarní semestr Povinně volitelné předměty Bi6400 Bi6405 Bi8090 C4840 C6010 C6140 C6210 C7072 C7175 C7860 C8155 C8202
62
Metody molekulární biologie Metody molekulární biologie cvičení Genové inženýrství Metody značení a imobilizace biomolekul Toxikologie Optimalizace a hodnocení analytických metod Biotechnologie Bioanalytika II - Analytické metody v klinické praxi DNA diagnostika Rostlinná biochemie Funkční biochemie II - signální dráhy Základy proteomiky
3+2 kr. 3/0/0 zk 3 kr. 0/3/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Šmarda, Pantůček Beneš, Neradil, Knopfová, Šmarda Doškař Skládal
1+2 kr. 1/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Picka Farková
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Mandl Havliš
4 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Šerý Kašparovský, Lochman Pavelka
2+2 kr. 2/0/0 zk 1+2 kr. 1/0/0 zk
Dopitová, Hejátko, Janda, Konečná, Lochmanová, Marek, Zdráhal
8 Magisterský studijní program Biochemie Doporučené volitelné předměty pro magisterský program Analytická biochemie kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Doporučené volitelné předměty Bi3030
Fyziologie živočichů
Bi3030c Fyziologie živočichů - cvičení
Bi5000 Bi5040 Bi5710
Bi7015 Bi7140 Bi7941 Bi9060
2 kr. 0/2/0 z
Bioinformatika i - nukleové kyseliny 1+1 kr. 1/0/0 k Biostatistika - základní kurz 3+2 kr. 3/0/0 zk Mikrobiologie 2+2 kr. 2/0/0 zk
Bi5710c Mikrobiologie - cvičení
Bi6882
2+2 kr. 2/0/0 zk
Biomarkers and toxicity mechanisms Chemické vlastnosti, struktura a interakce nukleových kyselin Molekulární biologie virů Molekulární biologie - laboratorní cvičení (pro obor biochemie) Bioinformatika II – proteiny
ESF:BPH ZMAN Základy managementu
2 kr. 0/2/0 z
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk 3 kr. 0/3/0 z 1+1 kr. 1/0/0 k
5 kr. 2/1/0 zk
1+2 kr. 1/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
C5020 C5030 C5040 C5060
Chemická literatura Chemie životního prostředí i Environmentální procesy Chemická struktura Chemická struktura - seminář Jaderná chemie Metody chemického výzkumu
C5120
Počítače v chemii a chemometrie
1+1 kr. 1/0/0 k
C3200 C4300
2+2 kr. 1 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
2/0/0 0/1/0 2/0/0 2/0/0
zk z zk zk
Vácha, Šimek, Bartoš, Hyršl, Pacherník, Slabý, Tomanová Vácha, Hyršl, Dobeš, Medalová, Bartoš, Slabý, Tomanová, Kupčíková Pantůček, Damborská Jarkovský Bidmanová, Damborská, Šebestová Vávrová, Krsek, Kopecká, Bardounová, Syrovátková, Geržová, Kubasová, Kýrová, Straková, Varmužová Bláha, Prof. Alice Hontela Fojta, Paleček, Fojtová, Vorlíčková Růžičková Pantůček Damborský, Damborská, Pantůček, Šebestová Blažek, Kuchynková, Pirožek, Částek, Hálek, Odehnalová, Rešlová, Smutný, Šafrová Drášilová, Žáková Talpová Mazal, Nečas, Skládal Holoubek Brož Brož Příhoda Táborský, Bittová, Preisler, Toužín, Trnková, Lubal, Heger, Klán, Literák, Mazal, Novotný, Prokeš, Sopoušek, Vrbková Farková
63
8.2 Studijní obor: Analytická biochemie Volitelné předměty – pokračování C5241
Počítače v chemii a chemometrie 2 kr. 0/2/0 z cvičení Organická analýza 1+2 kr. 1/0/0 zk
C5320 C5870 C7031 C7050 C7060 C7080 C7110 C7170 C7186 C7201 C7410 C7415 C7440 C7830 C7890 C7910 C7920
Fyzikálně chemické základy NMR EPR spektroskopie Atomová spektrometrie Elektroanalytické metody Stopová analýza Lasery v analytické chemii Výpočetní technika - aplikace Struktura a funkce buňky Molekulární psychiatrie Základy genomiky Struktura a reaktivita Struktura a reaktivita - seminář Koordinace a katalýza Kapilární elektroforéza Chemická technika Metody chemického výzkumu Struktura a funkce proteinů
C7925
Struktura a dynamika nukleovych 2+2 kr. kyselin Molekulová luminiscence 1+2 kr. Srovnávací biologie živočichů 2+2 kr. Příprava a charakterizace proteinů i - 2+1 kr. cvičení Sekundární metabolity 2+2 kr. Užitá chemie 2+1 kr. Strukturní biochemie 2+2 kr.
2/0/0 zk
Strukturní biochemie - seminář 1 kr. Úvod do kvantové chemie 3+2 kr. a elektronové struktury molekul F9070 Experimentální metody biofyziky(a) 1+1 kr. GE091 Mineralogie a geochemie 3 kr. FI:PB050 Modelování a predikce v systémové 2+2 kr. biologii XV004 Výzkum a vývoj v praxi 4 kr.
0/1/0 z 2/1/0 zk
Farková, Lubal, Pazdera Sklenář, Fiala, Srb Kubáček Kanický, Otruba Trnková Komárek, Coufalík Novotný Farková Šerý Šerý Hejátko, Konečná Klán Klán Pazdera Havel Zbořil Zbořil Brzobohatý, Damborský, Marek Šponer, Špačková, Islam Táborský, Preisler Šerý Janda, Pekárová, Dopitová Pluháček Pazdera Žídek, Plevka, Srb, Zachrdla Zachrdla, Srb Munzarová
2/0/0 k 2/0/0 kz 1/1/0 zk
Hofr, Vrána Losos Šafránek
2/2/0 kz
Janouškovcová, Alán
C5140
C7955 C8152 C8980c C9090 C9500 C9530 C9531 C9920
64
3+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 1 kr. 4 kr. 2+2 kr. 1+2 kr. 2+2 kr. 1 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
2/1/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 0/1/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 0/1/0 1/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0
zk zk zk zk zk zk z zk zk zk zk z zk zk zk zk zk
1/0/0 zk 2/0/0 zk 0/2/0 kz 2/0/0 zk 2/0/0 k 2/0/0 zk
Farková
8 Magisterský studijní program Biochemie Jarní semestr Doporučené volitelné předměty Bi4020 Molekulární biologie Bi4020c Základní metody molekulární biologie Bi5620 Ekotoxikologické biotesty Bi5620c Ekotoxikologické biotesty - cvičení Bi7250 Bi7490 C3211 C4310
C5850 C5880 C5990 C5991 C6110 C6120 C6160 C6250 C6290 C6300 C6310 C6320 C6410 C6770 C6790 C6800 C6830 C6860 C6950 C7670 C7680 C8140 C8150
Lékařská genetika a genetické poradenství Pokročilé neparametrické metody Aplikovaná bioinformatika
3+2 kr. 3/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 k
Doškař Pantůček
2+2 kr. 2/0/0 zk
2/0/0 zk
Hilscherová, Maršálek, Hofman, Čupr Novák, Hilscherová, Rábová, Vašíčková Gaillyová, Valášková, Vallová Komprdová Wimmerová, Houser, Malinovská Holoubek
2/0/0 2/0/0 2/0/0 0/2/0 2/0/0
Trnková Nečas Skládal Skládal Komárek, Kuta
2 kr. 0/0/2 z 2+2 kr. 2/0/0 zk 3+2 kr. 2/1/0 zk 3 kr. 0/4/0 k
Chemie životního prostředí II 2+2 kr. Zdroje znečištění, složky prostředí a jejich znečištění - technosféra, atmosféra Biofyzikální chemie i 2+2 kr. Základy stereochemie 2+2 kr. Aplikovaná enzymologie 2+2 kr. Aplikovaná enzymologie - cvičení 2 kr. Analytická chemie ŽP - anorganické 2+2 kr. polutanty Analytická chemie ŽP - anorganické 3 kr. polutanty - laboratorní cvičení Analytická chemie II - seminář 2 kr. Metody chemického výzkumu 5 kr. praktikum Atomová absorpční spektrometrie 1+2 kr. Optická a hmotnostní spektrometrie 1+2 kr. s indukčně vázaným plazmatem Symetrie molekul 2+2 kr. Chemická kinetika 2+2 kr. Organická analýza - praktikum 3 kr. NMR Spectroscopy of Biomolecules 2+2 kr. Hmotnostní spektrometrie 2+2 kr. Multinukleární NMR spektroskopie 2+2 kr. Radioekologie 1+2 kr. Moderní metody analýzy 2+2 kr. organických polutantů Chemická exkurze 0 kr. Izotopové metody 1+2 kr. Izotopové metody - laboratorní 3 kr. cvičení Bioenergetika 2+2 kr. Bioenergetika - seminář 2 kr.
zk zk zk z zk
0/0/3 kz
1/0/0 zk 1/0/0 zk
Komárek, Kuta, Vaculovič Lubal Farková, Hrdlička, Toužín Komárek Kanický
2/0/0 2/0/0 0/0/3 2/0/0 2/0/0 2/0/0 1/0/0 2/0/0
Kubáček Sopoušek Farková, Pazdera Žídek, Fiala Brož, Vřešťál Pinkas Křivohlávek Klánová
0/2/0 z 0/0/5 kz
zk zk kz zk zk zk zk zk
0/0/0 z 1/0/0 zk 0/2/0 kz
Janků, Šindelář Křivohlávek Křivohlávek, Pavelka
2/0/0 zk 0/2/0 z
Kučera Kučera
65
8.2 Studijní obor: Analytická biochemie Volitelné předměty – pokračování Mechanismy organických reakcí 2+2 kr. Mechanismy organických reakcí 1 kr. seminář C8700 Technologie chemických výrob 2+2 kr. C8800 Rtg strukturní analýza 2+2 kr. C8801 Krystalografie biomakromolekul 2+2 kr. C8835 Biokoordinační chemie 2+2 kr. C8855 Počítačová chemie a molekulové 1+1 kr. modelování II C8856 Počítačová chemie a molekulové 1 kr. modelování II cvičení C8860 Syntetické metody ”zelené”chemie 2+2 kr. C8880 Vybrané metody analýzy pevných 1+2 kr. látek C8885 Supramolekulární chemie 2+2 kr. C8950 NMR - Strukturní analýza 2+2 kr. C8980 Příprava a charakterizace proteinů i - 2+2 kr. Exprese a purifikace C9085 Protein-RNA interactions 1+2 kr. C9095 RNA metabolism 2+2 kr. C9940 3-Dimensional Transmission kr. Electron Microscopy (3DEM) F8310 Molekulové interakce a jejich úloha 3+1 kr. v biologii a chemii F8390 Metalloproteins: structure and 1+1 kr. function F8510 Fyzika biopolymerů 2+2 kr. FI:PA054 Formální modely v systémové 2+2 kr. biologii FI:PB051 Výpočetní metody v bioinformatice 2+2 kr. a systémové biologii C8500 C8510
66
2/0/0 zk 0/1/0 z
Klán Klán
2/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 1/0/0
Šindelář Marek Wimmerová Lubal, Táborský Koča, Kříž
zk zk zk zk k
0/1/0 z 2/0/0 zk 1/0/0 zk 2/0/0 zk 2/0/0 zk 2/0/0 zk
Koča, Kříž, Ionescu, Mishra Pazdera Kanický, Otruba
1/0/0 zk 2/0/0 zk 2/0/2 zk
Mazal Marek Janda, Pekárová, Dopitová, Žídek Štefl Vaňáčová Plitzko
2/0/0 k
Šponer
1/0/0 k
Kozelka
2/0/0 zk 2/0/0 zk
Špačková Šafránek
1/1/0 zk
Lexa, Šafránek, Bystrý
8 Magisterský studijní program Biochemie
8.3
Studijní obor: Biomolekulární chemie
Garant studijního oboru prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc. Pravidla pro sestavování studijního plánu Studijní plán si sestavuje každý student dle své volby podle pravidel studijního programu. Při sestavení studijního plánu musí student dodržet ustanovení Studijního a zkušebního řádu fakulty a Pravidla a podmínky pro vytváření studijního plánu v daném studijním programu. Jako východisko k tvorbě studijního plánu může student využít Doporučeného studijního plánu. Doporučený studijní plán rovnoměrně rozkládá studium do standardní doby dvou let a může se stát závazným jedině volbou studenta. Zaručuje studentům, kteří podle něho studují splnění povinností nutných k ukončení magisterského studia během standardní doby. Fakultní rozvrh (časová a prostorová alokace výuky předmětů pro daný semestr) je zpracován v návaznosti na doporučené studijní plány. Povinné předměty a povinně volitelné předměty a jejich návaznosti jsou uvedeny v doporučeném studijním plánu. Povinným předmětem bez kreditového hodnocení je dvouhodinová bloková přednáška Zacházení s chemickými látkami, kterou musí každý student absolvovat na začátku každého akademického roku a jejíž absolvování je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami (laboratorních cvičení, diplomových prací ap.). Student je dále povinen absolvovat alespoň jeden povinně volitelný předmět z každého z následujících čtyř okruhů: Okruh i (C8160 Enzymologie, C9100 Biosenzory a C8980 Příprava a charakterizace proteinů i - Exprese a purifikace), Okruh II (C7790 Počítačová chemie a molekulové modelování I, C7800 Počítačová chemie a molekulové modelování i - cvičení, C8855 Počítačová chemie a molekulové modelování II, C8856 Počítačová chemie a molekulové modelování II - cvičení), Okruh III (C5320 Fyzikální základy NMR spektroskopie, C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules) a Okruh IV (C8801 Krystalografie biomakromolekul, CB070 Proteinová krystalografie, CB080 Proteinová krystalografie - seminář). Dalšími povinně volitelnými předměty jsou Oborový seminář a Diplomová práce. Zakončení povinných a povinně volitelných předmětů je zpravidla zkouškou u přednášky, klasifikovaným zápočtem u laboratorního cvičení a zápočtem u semináře. Volitelné předměty zvláště vhodné pro magisterský studijní program Biochemie, obor Biomolekulární chemie, jsou uvedeny v Doporučeném studijním plánu. Zakončení volitelných předmětů si student vybírá z možných zakončení předmětu. Při tvorbě a plnění studijního plánu musí každý student studijního programu dodržet následující pravidla a podmínky: •
Na začátku každého akademického roku absolvovat povinnou dvouhodinovou blokovou přednášku bez kreditového hodnocení Zacházení s chemickými látkami, jejíž absolvování je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami (diplomových prací ap.).
•
Získat 8 kreditů za absolvování předmětů CB060 a CC060 Seminář NCBR (zakončen zápočtem).
•
Zpracovat diplomovou práci na zadané téma. Kreditová hodnota diplomové práce je 50 kreditů.
67
8.3 Studijní obor: Biomolekulární chemie •
Do termínu konání magisterské státní závěrečné zkoušky získat nejméně 12 kreditů absolvováním povinně volitelných předmětů ze seznamu uvedeného v Doporučeném studijním plánu. Povinně volitelné přednášky jsou ukončené zkouškou, cvičení zápočtem a jedna z povinně volitelných přednášek může být ukončena kolokviem.
•
Do termínu konání magisterské státní závěrečné zkoušky získat absolvováním povinných, povinně volitelných a volitelných předmětů 120 kreditů. Volitelné předměty jsou všechny předměty, které jsou na Přírodovědecké fakultě a ostatních fakultách Masarykovy univerzity v daném období vyučovány a jejichž zápis je pro studenty daného programu povolen. Výběr volitelných předmětů je omezen na povinnost absolvovat minimum 108 kreditů za úspěšné ukončení předmětů přírodovědeckých, matematických nebo informatických věd, z toho minimálně 96 kreditů za předměty z oboru chemických a biologických věd.
•
Student musí úspěšně vykonat zkoušku z předmětu JA002 Pokročilá odborná angličtina – zkouška před přihlášením k magisterské státní závěrečné zkoušce pokud tuto nevykonal v rámci svého předchozího bakalářského studia.
•
Úspěšně absolvovat všechny součásti magisterské státní závěrečné zkoušky.
Státní závěrečná zkouška studentů oboru biomolekulární chemie sestává z hlavního předmětu biomolekulární chemie, a dvou volitelných předmětů ze skupiny: •
molekulové modelování a bioinformatika
•
experimentální metody strukturní biologie
•
molekulární biologie a genetika
•
biofyzika
Doporučené studijní plány 1. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C7777 C7920
Zacházení s chemickými látkami Struktura a funkce proteinů
0 kr. 0/0/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
C7925
Struktura a dynamika nukleovych kyselin
2+2 kr. 2/0/0 zk
Příhoda, Petlachová Brzobohatý, Damborský, Marek Šponer, Špačková, Islam
Povinně volitelné předměty CB060
Seminář NCBR
2 kr. 0/2/0 z
C9300 Diplomová práce i (BC) 5 kr. 0/0/5 kz Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 3 kr.
68
Sklenář, Fiala, Koča, Krejčí, Kříž, Kulhánek, Marek, Munzarová, Skládal, Štefl, Vaňáčová, Wimmerová, Žídek, Svobodová Vařeková Janiczek
8 Magisterský studijní program Biochemie Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 12 kr.
Jarní semestr Povinné předměty C2135
Bioinformatika v praxi
2+1 kr. 0/2/0 k
Wimmerová, Houser, Malinovská
Povinně volitelné předměty CC060 Seminář NCBR 2 kr. 0/2/0 z C8210 Diplomová práce II (BC) 10 kr. 0/0/10 kz Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 8 kr.
Koča, Sklenář Janiczek
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 10 kr.
2. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C7777
Zacházení s chemickými látkami
0 kr. 0/0/0 z
Příhoda, Petlachová
2 kr. 0/2/0 z
Sklenář, Fiala, Koča, Krejčí, Kříž, Kulhánek, Marek, Munzarová, Skládal, Štefl, Vaňáčová, Wimmerová, Žídek, Svobodová Vařeková Janiczek
Povinně volitelné předměty CB060
Seminář NCBR
C9310 Diplomová práce III (BC) 10 kr. 0/0/10 kz Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 4 kr.
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 12 kr.
Jarní semestr Povinné předměty JA002
Pokročilá odborná angličtina zkouška
2 kr. 0/0/0 zk
Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová, Ševečková
Povinně volitelné předměty CA340 CC060
Diplomová práce IV (BC) Seminář NCBR
25 kr. 0/0/25 kz 2 kr. 0/2/0 z
Janiczek Koča, Sklenář
69
8.3 Studijní obor: Biomolekulární chemie Povinně volitelné předměty kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinně volitelné předměty CB070 CB080 C5320 C7790 C8160 C9100
Proteinová krystalografie Proteinová krystalografie - seminář Fyzikálně chemické základy NMR Počítačová chemie a molekulové modelování i Enzymologie Biosenzory
1+2 kr. 1 kr. 3+2 kr. 2+2 kr.
1/0/0 0/1/0 2/1/0 2/0/0
zk z zk zk
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Marek Marek Sklenář, Fiala, Srb Koča, Kulhánek Kučera Skládal
Jarní semestr Povinně volitelné předměty C6770 C8801 C8855 C8856 C8980
70
NMR Spectroscopy of Biomolecules 2+2 kr. Krystalografie biomakromolekul 2+2 kr. Počítačová chemie a molekulové 1+1 kr. modelování II Počítačová chemie a molekulové 1 kr. modelování II cvičení Příprava a charakterizace proteinů i - 2+2 kr. Exprese a purifikace
2/0/0 zk 2/0/0 zk 1/0/0 k
Žídek, Fiala Wimmerová Koča, Kříž
0/1/0 z
Koča, Kříž, Ionescu, Mishra Janda, Pekárová, Dopitová, Žídek
2/0/0 zk
8 Magisterský studijní program Biochemie Doporučené volitelné předměty kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Doporučené volitelné předměty Bi0580 Bi5000 Bi5220 Bi5580
Vývojová genetika 2+2 kr. Bioinformatika i - nukleové kyseliny 1+1 kr. Imunologie 2+2 kr. Obecná ekotoxikologie 2+2 kr.
Bi7015
Chemické vlastnosti, struktura a interakce nukleových kyselin Molekulární biologie virů Bioinformatika II – proteiny
2+2 kr. 2/0/0 zk
Operační systém UNIX a základy programování Praktický úvod do superpočítání Chemická literatura Chemie životního prostředí i Environmentální procesy Chemie životního prostředí III Zdroje znečištění, složky prostředí a jejich znečištění - hydrosféra, pedosféra, biosféra Chemická struktura Chemická struktura - seminář Metody chemického výzkumu
2+1 kr. 0/2/0 k
Počítače v chemii a chemometrie Počítače v chemii a chemometrie cvičení Nerovnovážné systémy Klinická biochemie Bioanalytika i - Biomakromolekuly Charakterizace proteinů hmotnostní spektrometrií Charakterizace proteinů hmotnostní spektrometrií - cvičení Počítačová chemie a molekulové modelování i - cvičení
1+1 kr. 1/0/0 k 2 kr. 0/2/0 z
Bi7140 Bi9060 C2110 C2115 C3200 C4300 C4320
C5020 C5030 C5060
C5120 C5140 C5340 C6220 C7073 C7250 C7350 C7800 C7830 C7870 C7880
2/0/0 1/0/0 2/0/0 2/0/0
zk k zk zk
2 kr. 0/2/0 k 1+2 kr. 1/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Vyskot Pantůček, Damborská Lojek, Číž, Kubala Bláha, Jarque Ortiz, Michelová Fojta, Paleček, Fojtová, Vorlíčková Růžičková Damborský, Damborská, Pantůček, Šebestová Kulhánek, Janoš, Štěpán, Trnka Kulhánek, Štěpán Mazal, Nečas, Skládal Holoubek
2+2 kr. 2/0/0 zk
Holoubek
2+2 kr. 2/0/0 zk 1 kr. 0/1/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Brož Brož Táborský, Bittová, Preisler, Toužín, Trnková, Lubal, Heger, Klán, Literák, Mazal, Novotný, Prokeš, Sopoušek, Vrbková Farková Farková
2+2 kr. 2/0/0 zk 1+1 kr. 1/0/0 k
2+2 kr. 4+2 kr. 2+2 kr. 1+1 kr.
2/0/0 4/0/0 2/0/0 1/0/0
zk zk zk k
1 kr. 0/1/0 z 1 kr. 0/1/0 z
Kapilární elektroforéza 2+2 kr. 2/0/0 zk Biometrika 2+2 kr. 2/0/0 zk Nové směry v bioanalytické chemii 2+2 kr. 2/0/0 zk
Kučera Wimmerová Havliš Zdráhal, Konečná, Pospíšilová Zdráhal Koča, Kulhánek, Štěpán Havel Mandl Glatz, Janiczek
71
8.3 Studijní obor: Biomolekulární chemie Volitelné předměty – pokračování C7895 C7910 C7950
Hmotnostní spektrometrie biomolekul Metody chemického výzkumu Speciační analýza
2+2 kr. 2/0/0 zk
Preisler
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk 2/0/0 zk
Zbořil Kanický, Komárek, Lubal Fiala, Žídek
0/2/0 z 1/0/0 zk
Kučera Krejčí
0/2/0 kz
Janda, Pekárová, Dopitová Munzarová
F5030 F5351
Advanced Methods of Biomolecular 2+2 kr. NMR Enzymologie - seminář 2 kr. Protein Preparation and 1+2 kr. Characterization III Protein-Mediated Interaction Příprava a charakterizace proteinů i - 2+1 kr. cvičení Úvod do kvantové chemie 3+2 kr. a elektronové struktury molekul Základy kvantové mechaniky 4+2 kr. Základy molekulární biofyziky 2+2 kr.
F9070 XV004
Experimentální metody biofyziky(a) 1+1 kr. 2/0/0 k Výzkum a vývoj v praxi 4 kr. 2/2/0 kz
C7995 C8170 C8857 C8980c C9920
72
2/1/0 zk 2/2/0 zk 2/1/0 zk
Munzar, Chaloupka Kozelka, Šponer, Trantírek, Mládek Hofr, Vrána Janouškovcová, Alán
8 Magisterský studijní program Biochemie Jarní semestr Doporučené volitelné předměty Bi8090 C3211
Genové inženýrství Aplikovaná bioinformatika
2+2 kr. 2/0/0 zk 3 kr. 0/4/0 k
C4010 C4310
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
2+2 kr. 2/0/0 zk
Holoubek
2+2 kr. 2/0/0 zk
Skládal
1+2 kr. 4+2 kr. 2+2 kr. 1+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2 kr. 0 kr. 0 kr. 2+2 kr.
Picka Glatz, Zbořil Mandl Glatz Kubáček Pinkas Jašek Janků, Šindelář Koča, Pinkas, Šindelář Havliš
C7860
Anorganická chemie III Chemie životního prostředí II Zdroje znečištění, složky prostředí a jejich znečištění - technosféra, atmosféra Chemie životního prostředí IV Látky znečišťující prostředí (environmentální polutanty) Metody značení a imobilizace biomolekul Toxikologie Biochemické metody Biotechnologie Metody separace proteinů Symetrie molekul Multinukleární NMR spektroskopie Biofyzikální faktory ŽP Chemická exkurze Odborná praxe Bioanalytika II - Analytické metody v klinické praxi Rostlinná biochemie
Doškař Wimmerová, Houser, Malinovská Pinkas, Příhoda Holoubek
C8140 C8150 C8202
Bioenergetika Bioenergetika - seminář Základy proteomiky
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z 1+2 kr. 1/0/0 zk
C8302
Základy proteomiky - cvičení
C8800 C8857c
Rtg strukturní analýza Protein Preparation and Characterization III - practice Výpočty volných energií - cvičení Výpočty volných energií NMR - Strukturní analýza Protein-RNA interactions RNA metabolism Introduction to soft matter models of membranes and proteins Metody kvantové chemie
C4330 C4840 C6010 C6200 C6210 C6260 C6310 C6800 C6900 C6950 C6960 C7072
C8862 C8863 C8950 C9085 C9095 C9925 C9930
1/0/0 4/0/0 2/0/0 1/0/0 2/0/0 2/0/0 2/0/0 0/0/0 0/0/0 2/0/0
zk zk zk zk zk zk k z z zk
2+2 kr. 2/0/0 zk
2+2 kr. 2/0/0 zk 3 kr. 0/2/0 kz
Kašparovský, Lochman Kučera Kučera Dopitová, Hejátko, Janda, Konečná, Lochmanová, Marek, Zdráhal Hejátko, Zdráhal, Nejedlá, Konečná, Borkovcová, Váňová, Lochmanová Marek Krejčí
1 kr. 2+1 kr. 2+2 kr. 1+2 kr. 2+2 kr. 2+1 kr.
Kulhánek Kulhánek Marek Štefl Vaňáčová Vácha
3 kr. 0/3/0 k
0/1/0 2/0/0 2/0/0 1/0/0 2/0/0 2/0/0
z zk zk zk zk zk
2+2 kr. 2/0/0 zk
Munzarová
73
8.3 Studijní obor: Biomolekulární chemie Volitelné předměty – pokračování C9940 F8310 F8390 F8510
74
3-Dimensional Transmission kr. 2/0/2 Electron Microscopy (3DEM) Molekulové interakce a jejich úloha 3+1 kr. 2/0/0 v biologii a chemii Metalloproteins: structure and 1+1 kr. 1/0/0 function Fyzika biopolymerů 2+2 kr. 2/0/0
zk
Plitzko
k
Šponer
k
Kozelka
zk
Špačková
8 Magisterský studijní program Biochemie
8.4
Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika
Garant studijního oboru prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc. Pravidla pro sestavování studijního plánu Studijní plán si sestavuje každý student dle své volby podle pravidel studijního programu. Při sestavení studijního plánu musí student dodržet ustanovení Studijního a zkušebního řádu fakulty a Pravidla a podmínky pro vytváření studijního plánu v daném studijním programu. Jako východisko k tvorbě studijního plánu může student využít Doporučeného studijního plánu. Doporučený studijní plán rovnoměrně rozkládá studium do standardní doby dvou let a může se stát závazným jedině volbou studenta. Zaručuje studentům, kteří podle něho studují splnění povinností nutných k ukončení magisterského studia během standardní doby. Fakultní rozvrh (časová a prostorová alokace výuky předmětů pro daný semestr) je zpracován v návaznosti na doporučené studijní plány. Povinné předměty a povinně volitelné předměty a jejich návaznosti jsou uvedeny v doporučeném studijním plánu. Pro studijní obor Chemoinformatika a bioinformatika jsou povinné předměty C2136 Pokročilá chemoinformatika, C2137 Pokročilá chemoinformatika - seminář, C2138 Pokročilá bioinformatika, C2139 Pokročilá bioinformatika - seminář, VSAG011 Moderní technologie pro analýzu genomu, C7790 Počítačová chemie a molekulové modelování I, IB002 Návrh algoritmů i a Diplomová práce. Povinným předmětem bez kreditového hodnocení je dvouhodinová bloková přednáška C7777 Zacházení s chemickými látkami, kterou musí každý student absolvovat na začátku každého akademického roku a jejíž absolvování je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami (laboratorních cvičení, diplomových prací apod.). Student může požádat garanta programu, aby mohl namísto povinného předmětu zapsat předmět analogický obsahem, se stejným ukončením a stejného nebo většího rozsahu. Pokud student úspěšně absolvoval povinný předmět již během bakalářského studia nahradí ho jedním z povinně volitelných předmětů stejného nebo většího rozsahu. Student je dále povinen absolvovat alespoň jeden povinně volitelný předmět z každého z následujících tří okruhů: •
Okruh I: Prohloubení znalostí o nukleových kyselinách (C7925 Struktura a dynamika nukleových kyselin, C7175 DNA diagnostika)
•
II: Pokročilé matematické metody (PV027 Optimalizace, Bi7491 Regresní modelování)
•
III: Programování v moderním objektovém programovacím jazyce (PB162 Programování v jazyce Java, PV178 Úvod do vývoje v C#/.NET)
Dalšími povinně volitelnými předměty jsou CB060 Seminář NCBR a CC060 Seminář NCBR. Zakončení povinných a povinně volitelných předmětů je zpravidla zkouškou u přednášky, klasifikovaným zápočtem u cvičení a zápočtem u seminářů. Povinný předmět VSAG011 Moderní technologie pro analýzu genomu je zakončen kolokviem a předměty zvolené z Okruhu II a Okruhu III je možno zakončit rovněž kolokviem. Při tvorbě a plnění studijního plánu musí každý student studijního programu dodržet následující pravidla a podmínky: •
Na začátku každého akademického roku absolvovat povinnou dvouhodinovou blokovou přednášku bez kreditového hodnocení C7777 Zacházení s chemickými látkami.
75
8.4 Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika •
Úspěšně absolvovat všechny předměty, které jsou ve studijním programu povinné.
•
Získat 4 kredity za absolvování předmětů CB060 a CC060 Seminář NCBR (zakončeny zápočtem).
•
Za absolvování volitelných předmětů musí student získat minimálně 34 kreditů.
•
Zpracovat diplomovou práci na zadané téma. Kreditová hodnota diplomové práce je 50 kreditů.
•
Získat nejméně 9 kreditů absolvováním nejméně jednoho povinně volitelného předmětu z každého z výše uvedených Okruhů i až III. Předměty zvolené z Okruhu II a Okruhu III je možno zakončit kolokviem.
•
Získat absolvováním povinných, povinně volitelných a volitelných předmětů 120 kreditů. Volitelné předměty jsou všechny předměty, které jsou na Přírodovědecké fakultě a ostatních fakultách Masarykovy univerzity v daném období vyučovány a jejichž zápis je pro studenty daného programu povolen. Výběr volitelných předmětů je omezen na povinnost absolvovat minimum 108 kreditů za úspěšné ukončení předmětů přírodovědeckých, matematických nebo informatických věd, z toho minimálně 96 kreditů za předměty z oboru chemických, biologických a informatických věd. Volitelné předměty zvláště vhodné pro magisterský studijní program Biochemie, obor Chemoinformatika a bioinformatika, jsou uvedeny v Doporučeném studijním plánu. Zakončení volitelných předmětů si student vybírá z možných zakončení předmětu.
•
Úspěšně vykonat zkoušku z předmětu JA002 Pokročilá odborná angličtina – zkouška (pokud již student nevykonal tuto zkoušku v rámci svého předchozího bakalářského studia).
•
Úspěšně absolvovat všechny součásti magisterské státní závěrečné zkoušky. (Před termínem této zkoušky musí mít student splněny všechny výše uvedené podmínky.)
Státní závěrečná zkouška studentů oboru Chemoinformatika a bioinformatika sestává z hlavního předmětu bioinformatika a chemoinformatika a dvou volitelných předmětů ze skupiny: •
biochemie
•
organická chemie
•
fyzikální chemie
Požadavky jsou uveřejněny na URL http://orion.sci.muni.cz/pozadavky/szz.htm
76
8 Magisterský studijní program Biochemie Doporučené studijní plány 1. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C2136
Pokročilá chemoinformatika
2+2 kr. 2/0/0 zk
C2137
Pokročilá chemoinformatika seminář
1 kr. 0/1/0 z
C7777 C9300
Zacházení s chemickými látkami Diplomová práce i (BC)
0 kr. 0/0/0 z 5 kr. 0/0/5 kz
Koča, Svobodová Vařeková, Geidl, Ionescu, Mishra Svobodová Vařeková, Koča, Geidl, Ionescu, Mishra Příhoda, Petlachová Janiczek
Povinně volitelné předměty CB060
Seminář NCBR
2 kr. 0/2/0 z
Sklenář, Fiala, Koča, Krejčí, Kříž, Kulhánek, Marek, Munzarová, Skládal, Štefl, Vaňáčová, Wimmerová, Žídek, Svobodová Vařeková
Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 3 kr.
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 12 kr.
Jarní semestr Povinné předměty C2138 C2139 C2142
Pokročilá bioinformatika kr. 2/0/0 zk Pokročilá bioinformatika - seminář kr. 0/1/0 z Návrh algoritmů pro přírodovědce 3+2 kr. 1/2/0 zk
C8210 Diplomová práce II (BC) FI:IB002 Algoritmy a datové struktury i
10 kr. 0/0/10 kz 4+2 kr. 2/2/0 zk
Wimmerová Wimmerová Svobodová Vařeková, Raček Janiczek Černá, Bezděk, Ďurovský, Janík, Klimoš, Klučár, Kotrbčík, Kubíček, Lauko, Madzin, Obdržálek, Popa, Řehák, Svoboda, Ulman
Povinně volitelné předměty CC060 Seminář NCBR 2 kr. 0/2/0 z Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 3 kr.
Koča, Sklenář
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 7 kr.
77
8.4 Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika 2. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C7777 C7790 C9310
Zacházení s chemickými látkami Počítačová chemie a molekulové modelování i Diplomová práce III (BC)
0 kr. 0/0/0 z 2+2 kr. 2/0/0 zk
Příhoda, Petlachová Koča, Kulhánek
10 kr. 0/0/10 kz
Janiczek
25 kr. 0/0/25 kz kr. 0/0/0 -
Janiczek Janiczek, Svobodová Vařeková
2 kr. 0/0/0 zk
Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová, Ševečková
Povinně volitelné předměty Z výběru povinně volitelných předmětů 3 kr.
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 12 kr.
Jarní semestr Povinné předměty CA340 CZMCI JA002
Diplomová práce IV (BC) Státní závěrečna magisterská zkouška z chemoinformatiky a bioinformatiky Pokročilá odborná angličtina zkouška
Povinně volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 3 kr.
Povinně volitelné předměty kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinně volitelné předměty Struktura a dynamika nukleovych kyselin FI:PB162 Programování v jazyce Java C7925
78
2+2 kr. 2/0/0 zk 4+2 kr. 2/2/0 zk
Šponer, Špačková, Islam Pitner, Ošlejšek, Bártek, Bydžovská, Čecháček, Grochal, Húska, Jakubík, Kozlíková, Labuda, Nevěřilová, Ševčík, Vašeková, Zlámal, Žáková, Fikejs, Plhák, Sklenák
8 Magisterský studijní program Biochemie Jarní semestr Povinně volitelné předměty Bi7491 Regresní modelování C7175 DNA diagnostika FI:PV178 Úvod do vývoje v C#/.NET
3+2 kr. 2/1/0 zk 4 kr. 2/0/0 zk 3+1 kr. 1/2/0 k
Dušek, Májek, Pavlík Šerý Pelikán, Bühnová, Gešvindr
Doporučené volitelné předměty kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Doporučené volitelné předměty C3215
Základy farmakochemie
C5003
Projekt z chemoinformatiky a bioinformatiky Klinická biochemie Klinická biochemie - cvičení DNA diagnostika - cvičení Úvod do molekulární medicíny Úvod do molekulární medicíny cvičení Počítačová chemie a molekulové modelování i - cvičení
4+2 kr. 4 kr. 4 kr. 2+2 kr. 2 kr.
C9220 Seminář k diplomové práci i FI:IA101 Algoritmika pro těžké problémy FI:PB006 Principy programovacích jazyků FI:PV206 Communication and Soft Skills
2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 5+2 kr.
C6220 C6230 C7176 C7188 C7189 C7800
2+2 kr. 2/0/0 zk
2 kr. 0/0/2 z 4/0/0 0/4/0 0/4/0 2/0/0 0/0/2
zk z kz zk z
1 kr. 0/1/0 z 0/2/0 2/0/0 2/0/0 3/2/0
z zk zk zk
doc. Ing. František Hampl, CSc., Mgr. Roman Holakovský, Ph.D. Pravda, Svobodová Vařeková Wimmerová Tomandl Šerý, Bonczek Slabý Slabý, Šána, Vychytilová Koča, Kulhánek, Štěpán Mandl Černá, Beneš Obdržálek Motschnig, Pitner, Ludík, Kolář, Kalábová, Žáková, Coufal, Mládek, Pařilová, Smiga, Struhár, Matějková
79
8.4 Studijní obor: Chemoinformatika a bioinformatika Jarní semestr Doporučené volitelné předměty Fyziologie působení farmak a toxických látek Bi7527 Analýza dat v R CA220 Seminář k diplomové práci II C5002 Projekt z chemoinformatiky a bioinformatiky C9085 Protein-RNA interactions C9095 RNA metabolism FI:IA012 Složitost FI:PB051 Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii FI:PV209 Person Centered Communication Bi6726
80
2+2 kr. 2/0/0 zk
Vondráček, Machala
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z 2 kr. 0/0/2 z
Budinská Mandl Pravda, Svobodová Vařeková Štefl Vaňáčová Černá, Beneš Lexa, Šafránek, Bystrý
1+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+2 kr.
1/0/0 2/0/0 2/0/0 1/1/0
zk zk zk zk
3+1 kr. 2/1/0 k
Motschnig, Pitner, Matějková
8 Magisterský studijní program Biochemie
8.5
Studijní obor: Genomika a proteomika
Garant studijního oboru prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc. Pravidla pro sestavování studijního plánu Studijní plán si sestavuje každý student dle své volby podle pravidel studijního programu. Při sestavení studijního plánu musí student dodržet ustanovení Studijního a zkušebního řádu fakulty a Pravidla a podmínky pro vytváření studijního plánu v daném studijním programu. Jako východisko k tvorbě studijního plánu může student využít Doporučeného studijního plánu. Doporučený studijní plán rovnoměrně rozkládá studium do standardní doby dvou let a může se stát závazným jedině volbou studenta. Zaručuje studentům, kteří podle něho studují splnění povinností nutných k ukončení magisterského studia během standardní doby. Fakultní rozvrh (časová a prostorová alokace výuky předmětů pro daný semestr) je zpracován v návaznosti na doporučené studijní plány. Povinné předměty a povinně volitelné předměty a jejich návaznosti jsou uvedeny v doporučeném studijním plánu. Povinným předmětem bez kreditového hodnocení je dvouhodinová bloková přednáška Zacházení s chemickými látkami, kterou musí každý student absolvovat na začátku každého akademického roku a jejíž absolvování je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami (laboratorních cvičení, diplomových prací ap.). Povinně volitelné předměty jsou uvedeny v Doporučeném studijním plánu (Genomika, Proteomika, Metody v genomice a proteomice, Bioinformatika i - nukleové kyseliny, Bioinformatika II – proteiny, Bioinformatika – cvičení, Základy genomiky – cvičení, Základy proteomiky – cvičení, Struktura a funkce proteinových komplexů, Biometrika, Vývojová biologie, Struktura a funkce eukaryotických chromozomů) v rozsahu nejméně 14 kreditů za studium, dále jsou to Oborový seminář BGP a Diplomová práce. Zakončení povinných a povinně volitelných předmětů je zpravidla zkouškou u přednášky, klasifikovaným zápočtem u laboratorního cvičení a zápočtem u semináře. Volitelné předměty zvláště vhodné pro magisterský studijní program Biochemie, obor Biochemie genomů a proteomů, jsou uvedeny v Doporučeném studijním plánu. Zakončení volitelných předmětů si student vybírá z možných zakončení předmětu. Při tvorbě a plnění studijního plánu musí každý student studijního programu dodržet následující pravidla a podmínky: •
Na začátku každého akademického roku absolvovat povinnou dvouhodinovou blokovou přednášku bez kreditového hodnocení Zacházení s chemickými látkami, jejíž absolvování je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami (diplomových prací ap.).
•
Získat 8 kreditů za absolvování předmětů CG100, CG200, CG300 a CG400 – Oborový seminář BGP i – IV (zakončen zápočtem).
•
Zpracovat diplomovou práci na zadané téma. Kreditová hodnota diplomové práce je 50 kreditů.
•
Do termínu konání magisterské státní závěrečné zkoušky získat nejméně 14 kreditů absolvováním povinně volitelných předmětů ze seznamu uvedeného v Doporučeném studijním plánu. Povinně volitelné přednášky jsou ukončené zkouškou, cvičení zápočtem a jedna z povinně volitelných přednášek může být ukončena kolokviem.
81
8.5 Studijní obor: Genomika a proteomika •
Do termínu konání magisterské státní závěrečné zkoušky získat absolvováním povinných, povinně volitelných a volitelných předmětů 120 kreditů. Volitelné předměty jsou všechny předměty, které jsou na Přírodovědecké fakultě a ostatních fakultách Masarykovy univerzity v daném období vyučovány a jejichž zápis je pro studenty daného programu povolen. Výběr volitelných předmětů je omezen na povinnost absolvovat minimum 108 kreditů za úspěšné ukončení předmětů přírodovědeckých, matematických nebo informatických věd, z toho minimálně 96 kreditů za předměty z oboru chemických a biologických věd.
•
Student musí úspěšně vykonat zkoušku z předmětu JA002 Pokročilá odborná angličtina – zkouška před přihlášením k magisterské státní závěrečné zkoušce pokud tuto nevykonal v rámci svého předchozího bakalářského studia.
•
Úspěšně absolvovat všechny součásti magisterské státní závěrečné zkoušky.
Státní závěrečná zkouška studentů oboru Genomika a proteomika se sestává ze tří hlavních předmětů - genomika, proteomika, a strukturní biochemie, a jednoho volitelného předmětu ze skupiny: •
molekulární biologie
•
pokročilá analytická chemie
Požadavky jsou uveřejněny na URL http://genpro.sci.muni.cz/zaverecna-zkouska/
Doporučené studijní plány 1. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty CG010
Proteomika
2+2 kr. 2/0/0 zk
CG020
Genomika
2+2 kr. 2/0/0 zk
C7777
Zacházení s chemickými látkami
0 kr. 0/0/0 z
Havliš, Zdráhal, Hejátko, Marek, Paleček Hejátko, Hobza, Konečná, Pernisová, Růžička Příhoda, Petlachová
Povinně volitelné předměty CG040 Diplomová práce i 5 kr. 0/0/5 kz CG100 Oborový seminář BGP i 2 kr. 0/2/0 z Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 9 kr.
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 14 kr.
82
Havliš Fojtová, Havliš
8 Magisterský studijní program Biochemie Jarní semestr Povinné předměty CG080
Metody v genomice a proteomice
2+2 kr. 2/0/0 zk
Dopitová, Fajkus, Fojtová, Havliš, Hejátko, Marek, Paleček, Procházková Schrumpfová, Zdráhal
Povinně volitelné předměty CG060 Diplomová práce II 10 kr. 0/0/10 kz CG200 Oborový seminář BGP II 2 kr. 0/2/0 z Z výběru ostatních povinně volitelných předmětů 8 kr.
Havliš Fojtová, Havliš
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 12 kr.
2. rok studia kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinné předměty C7777
Zacházení s chemickými látkami
0 kr. 0/0/0 z
Příhoda, Petlachová
Povinně volitelné předměty CG050 Diplomová práce III CG300 Oborový seminář BGP III Z výběru povinně volitelných předmětů 3 kr.
10 kr. 0/0/10 kz 2 kr. 0/2/0 z
Havliš Fojtová, Havliš
Volitelné předměty Z výběru volitelných předmětů 14 kr.
Jarní semestr Povinné předměty JA002
Pokročilá odborná angličtina zkouška
2 kr. 0/0/0 zk
Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová, Ševečková
Povinně volitelné předměty CG070 CG400
Diplomová práce IV Oborový seminář BGP IV
25 kr. 0/0/25 kz 2 kr. 0/2/0 z
Havliš Fojtová, Havliš
83
8.5 Studijní obor: Genomika a proteomika Povinně volitelné předměty kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Povinně volitelné předměty Bi5000 Bi9060
Bioinformatika i - nukleové kyseliny 1+1 kr. 1/0/0 k Bioinformatika II – proteiny 1+1 kr. 1/0/0 k
2+2 kr. 2/0/0 zk
Pantůček, Damborská Damborský, Damborská, Pantůček, Šebestová Pantůček, Brezovský, Damborský, Mašlaňová, Bednář, Daniel, Kaushik, Beerens, Damborská Hejátko, Skoupá, Pernisová, Konečná, Dobisová, Didi, Hrdinová, Žďárská Mandl
Bi9061
Bioinformatika – cvičení
2 kr. 0/2/0 z
C7301
Základy genomiky - cvičení
3 kr. 0/3/0 k
C7870
Biometrika
Struktura a funkce proteinových komplexů Základy proteomiky - cvičení
2+2 kr. 2/0/0 zk
Paleček, Marek
Vývojová biologie Struktura a funkce eukaryotických chromozomů
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Jarní semestr Povinně volitelné předměty CG030 C8302
C8545 C9041
84
3 kr. 0/3/0 k
Hejátko, Zdráhal, Nejedlá, Konečná, Borkovcová, Váňová, Lochmanová Hejátko Fajkus, Fojtová
8 Magisterský studijní program Biochemie Doporučené volitelné předměty kód
název
kredity rozsah
učitel
Podzimní semestr Doporučené volitelné předměty
Bi7016
Biostatistika - základní kurz 3+2 kr. 3/0/0 zk Chemické vlastnosti, struktura 2+2 kr. 2/0/0 zk a interakce nukleových kyselin Chemie nukleových kyselin - cvičení 1 kr. 0/1/0 z
Bi7420
Microarrays
Bi7430
Molekulární biotechnologie
Bi5040 Bi7015
Bi7430c Molekulární biotechnologie cvičení
1 kr. 1/0/0 kz 2+2 kr. 2/0/0 zk 4 kr. 0/4/0 z
Jarkovský Fojta, Paleček, Fojtová, Vorlíčková Fojta, Brázda, Brázdová, Pivoňková Trbušek, Pospíšilová, Malčíková, Tichý, Mráz Prokop, Dvořák, Turánek, Bidmanová, Beerens, Damborská Prokop, Turánek, Beerens, Chrást, Bidmanová, Štěpánková, Dvořák, Buryška Budinská
2+2 kr. 2/0/0 zk
Bi8600
Analýza genomických a proteomických dat Vícerozměrné metody
CB070 C3210
Proteinová krystalografie Strukturní bioinformatika
1+2 kr. 1/0/0 zk 1+2 kr. 1/0/0 zk
C4865
Objevte vědu - vědecké poznání a myšlení Správná laboratorní praxe Klinická biochemie Klinická biochemie - cvičení Separační metody DNA diagnostika - cvičení Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii - cvičení
2+2 kr. 2/0/0 zk
Jarkovský, Budinská, Littnerová, Haruštiaková, Janoušová Marek Koča, Prokop, Ionescu, Mishra Havliš
1+2 kr. 4+2 kr. 4 kr. 2+2 kr. 4 kr. 2+2 kr.
Bielská, Bláha, Vrana Wimmerová Tomandl Havliš Šerý, Bonczek Hofr
Bi7528
C5920 C6220 C6230 C7030 C7176 C7230 C7235
C7250 C7350 C7490
3+2 kr. 2/1/0 zk
1/0/0 4/0/0 0/4/0 2/0/0 0/4/0 2/0/0
zk zk z zk kz zk
2+1 kr. 0/2/0 k
Charakterizace proteinů hmotnostní 1+1 kr. 1/0/0 k spektrometrií Charakterizace proteinů hmotnostní 1 kr. 0/1/0 z spektrometrií - cvičení Molekulární diagnostika vrozených 1+2 kr. 1/0/0 zk poruch
Hofr, Zimmermann, Bencúrová, Dvořáčková, Hluchý, Janoušková, Klos, Nečasová, Peška Zdráhal, Konečná, Pospíšilová Zdráhal Fajkusová
85
8.5 Studijní obor: Genomika a proteomika Volitelné předměty – pokračování C7895 C8160 C8170 C8857 C8980c C9025 C9320
Hmotnostní spektrometrie 2+2 kr. biomolekul Enzymologie 2+2 kr. Enzymologie - seminář 2 kr. Protein Preparation and 1+2 kr. Characterization III Protein-Mediated Interaction Příprava a charakterizace proteinů i - 2+1 kr. cvičení Evoluční a srovnávací cytogenetika 2+2 kr. rostlin Metody biochemického výzkumu 6 kr.
FI:IV105 Seminář z bioinformatiky FI:IV107 Bioinformatika i FI:IV108 Bioinformatika II FI:IV114 Projekt z bioinformatiky a systémové biologie JAC01 Angličtina pro chemiky i
1+1 kr. 2+2 kr. 2+2 kr. 2+1 kr.
2/0/0 zk
Preisler
2/0/0 zk 0/2/0 z 1/0/0 zk
Kučera Kučera Krejčí
0/2/0 kz
Janda, Pekárová, Dopitová Lysák, Mandáková
2/0/0 zk 0/0/6 z
0/1/0 2/1/0 1/1/0 0/1/1
k zk zk k
2 kr. 0/2/0 z
JAC03
Angličtina pro chemiky III
2 kr. 0/2/0 z
JA001
Odborná angličtina - zkouška
2 kr. 0/0/0 zk
JFP01
Francouzština pro přírodovědce 1
2 kr. 0/2/0 z
JFP03 JF001 JF002
2 kr. 0/2/0 z 2 kr. 0/0/0 zk 2 kr. 0/0/0 zk
JNP01
Francouzština pro přírodovědce 3 Odborná francouzština - zkouška Pokročilá odborná francouzština zkouška Němčina pro přírodovědce 1
JNP03
Němčina pro přírodovědce 3
2 kr. 0/2/0 z
JN001
Odborná němčina - zkouška
2 kr. 0/0/0 zk
JN002
Pokročilá odborná němčina zkouška
2 kr. 0/0/0 zk
86
2 kr. 0/2/0 z
Janiczek, Wimmerová, Mandl, Kašparovský, Lochman, Bouchal, Glatz, Kučera, Skládal, Pavelka, Šedo, Žídek, Srb Lexa Lexa Lexa Lexa Dlabolová, Složilová, Čoupková, Hranáčová, Kubrická, Kupčíková, Němcová, Ševečková Dlabolová, Složilová, Čoupková, Hranáčová, Kubrická, Němcová, SuchomelováPolomska, Ševečková Ševečková, Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová Světlíková, Šumberová, Němcová Světlíková, Němcová Světlíková, Němcová Světlíková, Němcová Mészárosová, Němcová Mészárosová, Němcová Mészárosová, Němcová Mészárosová, Němcová
8 Magisterský studijní program Biochemie Volitelné předměty – pokračování JRP01 JRP03 JR001 JR002 JSP01 JSP03 JS001
Ruština pro přírodovědce 1 Ruština pro přírodovědce 3 Odborná ruština - zkouška Pokročilá odborná ruština - zkouška Španělština pro přírodovědce 1 Španělština pro přírodovědce 3 Odborná španělština - zkouška
2 kr. 2 kr. 0 kr. 0 kr. 2 kr. 2 kr. 2 kr.
0/2/0 0/2/0 0/0/0 0/0/0 0/2/0 0/2/0 0/0/0
z z zk zk z z zk
JS002
Pokročilá odborná španělština zkouška
2 kr. 0/0/0 zk
Ševečková, Němcová Ševečková, Němcová Ševečková, Němcová Ševečková, Němcová Simbartlová, Němcová Simbartlová, Němcová Simbartlová, Matyášová, Němcová Simbartlová, Němcová
87
8.5 Studijní obor: Genomika a proteomika Jarní semestr Doporučené volitelné předměty Bi6270 Bi8090 C2135
Cytogenetika Genové inženýrství Bioinformatika v praxi
2+2 kr. 2/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk 2+1 kr. 0/2/0 k
C3705
Správná laboratorní praxe v chemické laboratoři Správná laboratorní praxe v chemické laboratoři - cvičení Objevte vědu - vědecké poznání a myšlení Biotechnologie Metody separace proteinů Bioanalytika II - Analytické metody v klinické praxi DNA diagnostika Vývojová a buněčná biologie rostlin
1+2 kr. 1/0/0 zk
C3706 C4865 C6210 C6260 C7072 C7175 C8535 C8560 C8570 C8857c C8980 C9042
2 kr. 0/2/0 kz
Farková
2+2 kr. 2/0/0 zk
Havliš
2+2 kr. 2/0/0 zk 1+2 kr. 1/0/0 zk 2+2 kr. 2/0/0 zk
Mandl Glatz Havliš
4 kr. 2/0/0 zk 2+1 kr. 2/0/0 k
Šerý Friml, Nodzynski, Zwiewka Trifonov Trifonov Krejčí
Genetic codes 2 kr. Early Molecular Evolution 2 kr. Protein Preparation and 3 kr. Characterization III - practice Příprava a charakterizace proteinů i - 2+2 kr. Exprese a purifikace Analýza struktury chromatinu 2 kr. praktikum
2/0/0 k 2/0/0 k 0/2/0 kz 2/0/0 zk 0/2/0 z
C9095 JAC02
RNA metabolism Angličtina pro chemiky II
2+2 kr. 2/0/0 zk 2 kr. 0/2/0 z
JAC04
Angličtina pro chemiky IV
2 kr. 0/2/0 z
JA001
Odborná angličtina - zkouška
2 kr. 0/0/0 zk
JFP02 JFP04
Francouzština pro přírodovědce 2 Francouzština pro přírodovědce 4
2 kr. 0/2/0 z 2 kr. 0/2/0 z
88
Kuglík Doškař Wimmerová, Houser, Malinovská Farková, Vrana
Janda, Pekárová, Dopitová, Žídek Fajkus, Sýkorová, Procházková Schrumpfová, Fojtová Vaňáčová Dlabolová, Složilová, Kratochvílová, Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, SuchomelováPolomska, Ševečková Dlabolová, Složilová, Čoupková, Hranáčová, Kubrická, Němcová, SuchomelováPolomska, Ševečková Ševečková, Čoupková, Dlabolová, Hranáčová, Kubrická, Němcová, Složilová Světlíková, Němcová Světlíková, Němcová
8 Magisterský studijní program Biochemie Volitelné předměty – pokračování 0 kr. 0/0/0 zk 0 kr. 0/0/0 zk
Světlíková, Němcová Světlíková, Němcová
JNP02
Odborná francouzština - zkouška Pokročilá odborná francouzština zkouška Němčina pro přírodovědce 2
2 kr. 0/2/0 z
JNP04
Němčina pro přírodovědce 4
2 kr. 0/2/0 z
JN001
Odborná němčina - zkouška
2 kr. 0/0/0 zk
JN002
2 kr. 0/0/0 zk
JRP02 JRP04 JR001 JR002 JSP02 JSP04
Pokročilá odborná němčina zkouška Ruština pro přírodovědce 2 Ruština pro přírodovědce 4 Odborná ruština - zkouška Pokročilá odborná ruština - zkouška Španělština pro přírodovědce 2 Španělština pro přírodovědce 4
JS001
Odborná španělština - zkouška
2 kr. 0/0/0 zk
Mészárosová, Němcová Mészárosová, Němcová Mészárosová, Němcová Mészárosová, Němcová Ševečková, Němcová Ševečková, Němcová Ševečková, Němcová Ševečková, Němcová Simbartlová, Němcová Simbartlová, Matyášová, Němcová Simbartlová, Matyášová, Němcová Simbartlová, Němcová
JF001 JF002
2 kr. 2 kr. 2 kr. 0 kr. 2 kr. 2 kr.
0/2/0 0/2/0 0/0/0 0/0/0 0/2/0 0/2/0
z z zk zk z z
Pokročilá odborná španělština 2 kr. 0/0/0 zk zkouška FI:PB051 Výpočetní metody v bioinformatice 2+2 kr. 1/1/0 zk a systémové biologii JS002
Lexa, Šafránek, Bystrý
89
Studijní katalog Přírodovědecké fakulty MU Akademický rok 2014/2015 Biochemie Vydala Masarykova univerzita v roce 2014 1. vydání, 2014 náklad 250 výtisků 90 stran Tisk: Tiskárna KNOPP, Černčice 24, 549 01 Nové Město nad Metují ISBN 978-80-210-6833-9