Cell Structure and Function
UMUM •
Sel unit struktural dan fungsional dr kehidupan
•
cell theory: all living things are composed of cells, and new cells arise only from preexisting cells
•
Jenis sel berdasar internal organization –
Eukaryotes : has compartmentalized cytoplasm with
membrane-bounded organelles including a nucleus –
Prokaryotes
Cell Types Eukaryote: Single cells, colonies, multi-cellular
Prokaryotes: Single cell
Eukaryotic Cell Types : Animal vs. Plant
The CELL
Membran sel
Membran system
Membranous organella
Nonmembranous
√
CYTOPLASMA VS CYTOSOL
Terdiri Biomembran
ORGANELLA
Cytoplasm consists of all the cellular contents between the plasma membrane and the nucleus, and has two components: (1) the cytosol = (intracellular fluid), water, proteins, lipids, carbohydrates, & electrolytes. It contains masses of insoluble materials known as inclusions, or inclusion bodies (ex:glikogen)
(2) Organelles = specialized structures within thecell that have characteristic shapes; they perform specific functions
√
Membran sel
Membran system
Membranous organella
Nonmembranous
CYTOPLASMA VS CYTOSOL
Terdiri Biomembran
ORGANELLA
• The total surface area of internal membranes far exceeds that of the plasma membrane • ! membran internal/organel : membungkus organel
maintain discrete biochemical environments • Komposisi membran sel ~ membran internal :
consist of lipids, proteins, and carbohydrates. • 3 major classes of lipid: phospholipids, glycolipids, and cholesterol • 4 major types of phospholipid : sphingomyelin, phosphatidylcholine, phosphatidylserine, &
phosphatidylethanolamine
Membran Sel • Komponen :
membrane surface
1. Phospholipid : one polar
E-face
(hydrophilic) head and two
nonpolar (hydrophobic) fatty acid tails = lipid bilayer
noncovalent bonds
Cholesterol (dlm plasmalemma)
can limit lateral fluid movement contribute to the mechanical
stability of the plasmalemma. Unidentical membrane surface
P-face
Lipid rafts are microdomains containing cholesterol, sphingolipids, and certain membrane proteinsn sites for signaling across the plasma membrane
2. Karbohidrat :
Membran Sel
• p.u sbg oligosakarida dlm glikoprotrein atau
glikolipid • Glycolipids : lipids with attached sugar
residue (Sugar residues usually extend from the external surface) • struktur permukaan bercabang (=glycocalyx), utk adhesi, cell-to-cell and cell-to-interstitial matrix interactions; termasuk reaksi imun..
3. Protein p.u bentuk globular
Membran Sel
Macam : * Protein membran integral terikat erat dalam lapisan fosfolipid
* Protein membran perifer berikatan scr longgar pada permukaan, dg ikatan ionik function : transport, receptors signals, attach elements of the cytoskeleton, attach cells to the extracellular matrix (cell adhesion molecules), enzymatic activity when stimulated
Membran Sel membran plasma: membungkus sel integritas struktur dan fungsi Memisahkan dengan lingkungan sekitar
mengatur lalu-lintas molekul keluar/masuk sel selectively (semi) permeable Komunikasi & interaksi antar sel Signaling (transduksi signal ekstrasel intra) Mempertahankan perbedaan potensial
Membrane transport pasive
Passive transport • difusi & osmosis
?
?
Passive Processes of Membrane Transport
Active transport • = energy-requiring process 1. Na+–K+ pump : antiport transport 2. Glucose transport : involves the symport 3. ATP-binding cassette transporters (ABCtransporters) : transmembrane proteins that have two domains
other
• Endocytosis membran menyelubungi substansi extrasel sitoplasma (dalam vesikel membran). Cara : - fagositosis - Pinocytosis - Endocytosis dimediasi reseptor specific reactions as trigger
• Exocytosis mngeluarkan substansi dr sel. Dg vesikel fusi dg membran keluar
Microvilli • Extensions of the Plasmalemma diperkuat mikrofilamen • Terpancang pada terminal web
Membran sel
√
Membran system
√
Membranous organella
Nonmembranous
CYTOPLASMA VS CYTOSOL
Terdiri Biomembran
ORGANELLA
Mitochondria
Endoplasmic reticulum
Golgi apparatus
lysosomes
MEMBRANOUS ORGANELLA
Mitochondria Endoplasmic reticulum Golgi apparatus
lysosomes
Nucleus
Mitochondria • (dalam bentuk tunggal Mitochondrion) • Peran utama : Produksi ATP
• Sifat : – mobile and flexible. (pada beberapa sel,
cenderung ‘diam’; terutama di bagian yang memerlukan energi tinggi (ex: dekat flagella, antara miofibril) – self-reproducing, punya DNA sirkuler sendiri
Mitochondria
STRUKTUR • Membran 2 lapis Luar :Permukaan halus, berpori.
Permeabel thd molekul kecil. Mengandung porins Dalam : - kurang porous, bersifat semipermeabel
- membentuk lipatan cristae - memiliki subunit membran dalam => untuk sintesa ATP
*
Ruang intermembran (lanjut) intracristal space, berisi matrix Matrix berisi : air, granul2 matrix, DNA circular, ribosom, enzym2 utk fungsi mitokhondrion
The outer membrane is involved in lipid synthesis and fatty acid metabolism. The inner membrane contains the respiratory chain enzymes and transport proteins needed for the synthesis of ATP.
• Mitochondr • mtDNA was found to vary accordingia to cell type
– Low in platelets (Platelets have only two to six mitochondria).
– Red blood cells do not contain mitochondria • Highest in brain, liver, kidney
• Human mtDNA exhibits strict maternal inheritance
Mitochondria Endoplasmic reticulum Golgi apparatus
lysosomes
Nucleus
Endoplasmic Reticulum • Pada umumnya terletak antara inti dan Golgi-
kompleks. • Peran :
pembentukan vesikel atau cisternae dalam transpor vesikel dalam sintesa, pengemasan, dan pemrosesan berbagai substansi
Endoplasmic Reticulum
• 2 macam Tipe : * Rough ER: Memiliki ribosom. Peran : sintesa protein membran * Smooth ER: Tanpa ribosom. Peran :
- detoksifikasi - pemecahan glikogen - sintesa steroid - metabolisme lemak
Endoplasmic Reticulum
Endoplasmic Reticulum
SER • Membran lebih tipis dari membran sel • Bentuk: – Lamellar – Vesikular – Tubular
• • • •
Dinamik Untuk metabolisme molekul kecil Utk Mx detoksifikasisel Terlibat dlm sintesa lipid & steroid
Endoplasmic Reticulum
RER • T.u lamellar saling berhubungan • Ditempeli ribosom via riboforin • Utk sintesa protein • Dpt menjadi SER
Mitochondria Endoplasmic reticulum Golgi apparatus
lysosomes
Nucleus
Golgi apparatus • STRUKTUR : Seperti sekumpulan kantungkantung gepeng. Terdiri 3 kompartemen : * Saluran cisternae lengkung yang pipih * Vesikel2 di tepi cisternae tsb * Vakuol2 terkondensasi di bagian konkaf cisternae P.u berada dekat inti (juxtanuclear). Lain : dekat centriol.
Golgi apparatus FUNGSI : • Sintesa polisakarida • Modifikasi produk2 sekresi (via glikosilasi) • Menyeleksi produk2 sekresi
• Mengemas produk2 sekresi • Mengkonsentrasikan & penyimpanan produk2 sekresi
Mitochondria Endoplasmic reticulum Golgi apparatus
lysosomes
Nucleus
Lysosome STRUKTUR :
• Berupa vesikel sferis berisi materi seperti kristal. • ISi : enzym2 pencernaan seluler. P.u berupa glikoprotein. • Enzym terpenting (khas): Acid phosphatase
• Membran berupa lapisan lipid bilayer
Lysosome FUNGSI : • Pencernaan seluler : Mengandung + 40 enzym (hidrolitik) untuk pencernaan intersel. pH optimal : + 5. (asam)
MACAM :
Lysosome
• Lisosom Primer bersifat elektron dense tersebar di sitoplasma. Enzym pada umumnya inaktif (hrs
diglikosilasi di Golgi) • Lisosom Sekunder dr Fusi lisosom primer dg
fagosom. Residual Bodies berupa inklusi dalam
membran, mengandung materi yg tidak tercerna
Lysosome
peroxisomes • spherical membrane-bound organelles • contain a special enzyme that degrades peroxides (e.g., hydrogen peroxide) & enzymes needed for breaking down very– long-chain fatty acids, which are ineffectively degraded by mitochondrial enzymes • function in the control of free radicals • In liver cells, peroxisome involve in formation of the bile acids.
Mitochondria Endoplasmic reticulum Golgi apparatus
lysosomes
Nucleus
Nukleus Terdiri dari : a. Chromatin (tdd DNA-protein complex) b. nuclear envelope terdiri dari membran bilayer - Memiliki pori-pori (untuk keluar-masuk substansi) - Berhubungan dengan ER c. Nucleolus (pl :nucleoli) tempat sintesa rRNA -Tempat dimulainya terbentuknya ribosom d. Nucleoplasma e. Nuclearpore
Nukleus
NUCLEAR ENVELOPE -membran ganda, luar ditempati ribosom, dalam berdinding lamina fibrous NUCLEAR PORE -Berbentuk octagonal -Untuk lewat substansi2
NUCLEOPLASMA - fibrillar, dpt mengikat reseptor horman & DNA baru
NUCLEOLUS • Mensintesa rRNA • Pars granulosa : bergranul padat, utk pematangan subunit ribosom • Pars fibrosa : tdd transkrip r RNA baru KROMATIN - Tdd DNA dan protein - Type : heterochromatin gelap, pasif Euchromatin pucat, aktif
In the constitutive pathway, vesicles fuse spontaneously with the plasma membrane. In the regulated pathway, the vesicles fuse only when triggered by a signal such as a hormone.
Membran sel
Membran system
Membranous organella
√
Nonmembranous
CYTOPLASMA VS CYTOSOL
Terdiri Biomembran
ORGANELLA
Ribosomes
Cytoskeleton
NONMEMBRANOUS ORGANELLA
Centrioles
Centrosome
Ribosomes
Cytoskeleton
Centrioles
Centrosome
Ribosome • Tersusun dari 2 subunit; besar dan kecil • Type: mitochondrial (20nm) dan cytoplasmic (25nm)
• Untuk sintesa protein
When protein synthesis is complete, the subunits separate
• 2 macam, berdasar ikatannya – free cytoplasmic ribosome tersebar dlm sitoplasma, relatif inaktif – Polysome/polyribosome ribosome yang
menempel pada mRNA
Ribosomes
Cytoskeleton
Centrioles
Centrosome
cytoskeleton • = rangka sel, yang berada dalam sitoplasma bentuk, gerak, transpor, dinamika sel • Terdiri dari 3 macam protein : microtubule, intermediate filament, and microfilament.
cytoskeleton • MIKROTUBULE : – paling tebal. Tdd sub unit α dan β tubulin. – di MTOC melekat pada inti & kromosom – dari centrosome – Membentuk cilia, flagella, dan basal bodies • MICROFILAMEN : – paling tipis, lbh fleksible – Berada di sitoplasma, atau terakumulasi lokal (terminal web, tepi sel, mikrovilli) – T.u actin • INTERMEDIATE : – berbentuk spt tali. – Berada di antara inti dan sitoplasma
cytoskeleton
cytoskeleton FUNGSI KHUSUS : • Mikrotubule : membentuk ‘jalan’, utk pergerakan organella, perpindahan kromosom saat mitosis, dan membentuk organel lain (ex:centriole, cilia) • Mikrofilamen : kontaktil & untuk mechanical support. • Intermediate : stabilisasi (struktur & bentuk) stabilisasi posisi organel, & transpor material. Ex : neurofilamen.
cytoskeleton
Microvilli • Extensions of the Plasmalemma diperkuat mikrofilamen • Terpancang pada terminal web
Ribosomes
Cytoskeleton
Centrioles
Centrosome
Centriole STRUKTUR Terdiri dari 9 pasang triplet mikrotubul • Berbentuk tabung pendek • Dikelilingi materi (yang tercat padat) pericentriolar material (pd interfase) Peran : * pembentukan basal bodies * mengatur struktur sel * mengatur lalu lintas dalam sel * Pembelahan sel : mengatur gelendong pembelahan
Centriole
Centriole
CILIA - Motil, spt cemeti - Pusat=axoneme : tdd 9 mikrotubular perifer + 1 ps mikrotubular central
FLAGELLA
BASAL BODIES
-Spt cilia, lbh panjang
-Dr migrasi Centriol ke apex
-Axoneme terpisah dg plasmalemma
-Berada di dasar cilia dan flagella - Struktur mirip Centriol