2013. Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató
Gabor Varbiro MTA Ökológiai kutatóközpont 2013.11.11.
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató Tartalomjegyzék
Általános űrlapok..................................................................................................................................... 4 Bejelentkező képernyő ........................................................................................................................ 4 Biológiai Mintavételi helyek ................................................................................................................ 6 Mintavételi hely csoportok ................................................................................................................. 7 1. Fitoplakton........................................................................................................................................... 8 1. Taxonlista szerkesztése ................................................................................................................... 8 2. Mintavételi helyek ........................................................................................................................... 9 3. Mintavételek szerkesztése .............................................................................................................. 9 3. Új mintavétel ................................................................................................................................. 13 4. Adatbevitel .................................................................................................................................... 13 5. Mintavételek listája ....................................................................................................................... 13 6. Éves értékelés ................................................................................................................................ 14 7. Mintavételi helycsoportok ............................................................................................................ 14 8. Jegyzőkönyv nyomtatása ............................................................................................................... 15 9. Taxon keresése .............................................................................................................................. 16 10. Export .......................................................................................................................................... 16 2. Fitobenton ......................................................................................................................................... 17 1. Minősítés ....................................................................................................................................... 17 2. Mintavételi helyek ......................................................................................................................... 17 3. Mintavételek saját minták ............................................................................................................. 18 4. Mintavételek összes minta ............................................................................................................ 18 5. Adatbevitel .................................................................................................................................... 18 6. Minták státusza ............................................................................................................................. 19 7. Eportálás ........................................................................................................................................ 20 8. Fajkeresés ...................................................................................................................................... 20 3. Makrozoobenton ............................................................................................................................... 21 1. Fajkeresés ...................................................................................................................................... 21 2. Exportálás ...................................................................................................................................... 22 3. Mintavételi helyek bevitele ........................................................................................................... 23
2
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató
4. Mintavételi helyek táblázatos ....................................................................................................... 23
5. Mintavételek ................................................................................................................................. 24 6. Adatbevitel .................................................................................................................................... 24 4. Makrofita ........................................................................................................................................... 26 1. Mintavételi helyek ......................................................................................................................... 26 2. Adatbevitel .................................................................................................................................... 27 3. Exportálás ...................................................................................................................................... 27
3
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 4
Általános űrlapok Rekordok(adatok) közötti mozgás
első
előző
következő
utolsó
új rekord
Bejelentkező képernyő
Felhasználó neve: Családnév+keresztnév 1. betűje pl: varbirog Jelszó: keresztnév pl:gabor A bejelentkezés alapján szűri le a program a felhasználó területi illetékességét, így csak az ő területére vonatkozó fajlistákat, mintavételi helyeket szerkesztheti. Az exportálás során azonban már más területi szerv adatait és értékelési eredményét is természetesen meg lehet tekinteni.
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 5
Jelszó megváltoztatása: Meg kell adni a régi és kétszer az új jelszót.
Biológiai Mintavételi helyek
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató
táblázatos forma
egy űrlapos forma
A mintavételi helyek adatai közül a minősítéshez fontos mezők a Folyóvíz, tip_rw, tip_lw A mintavételi helyek adatai közül a térinformatikai megjelenítéshez fontos mezők : EOVX, EOVY, KTJ, Vt_vor Új Mintavételi hely esetén ne felejtsük el a saját TKTVF kiválasztani mert csak ekkor látjuk!
6
Mintavételi hely csoportok
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 7
Az exportálás űrlapokon a megjelenő helycsoport neve Az összes mintavételi hely
1. írjuk be a helycsoport nevét Válasszuk ki a kivánt mintavételi helyeket 2. válasszuk ki az aktuális KTVF-t (csak ennek A "<-" gombra kattinva elmenti a helyeket a helycsoportjait tudjuk szerkeszteni) az aktuális csoportba. 3. jelelöljük ki a "*" jelzett sort
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 8
1. Fitoplakton
8
1 2
5
3
6 7
4
1. Taxonlista szerkesztése
Számításnál fontos mezők: S érték, G érték. átlag biomassza, kodon folyó. kodon tó.
9
10
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 9
2. Mintavételi helyek lsd. általános űrlapok
3. Mintavételek szerkesztése Ugrás a kiválasztott mintavételre 3a 3b
3c 3d
3e 3f 3g
3a Algaszám Alga ind/L kiszámolását segíti. Beállithatjuk a kamra mérétét a nagyitást. Lehetőség van két nagyitás eredményét is egyszerre figyelembe venni pl 63x, 20,
A tárolás gombra a program eltárolja a mintavételhez a számított értéket.
3b Alga biomassza Ha meg van adva az össz alga ind/L akkor kiszámolja az összbiomasszát a mentés gombra a mintavételhez eltárolja
3c térfogatszámítás Az alga térfogatát tudjuk meghatározni
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 10
3d fajlista export Teljes fajlista exportálása Biomassza ug/L
3e alga ind/l Algataxonok ind/L
3f taxonlista relgyak Teljes taxonlista taxoncsoportok szerint
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 11
3g Jelentés nyomtatása
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató
A jelentés fejléce az aktuális KTVF megadott adataiból kerül kitöltésre.
12
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató Adatbevitel menete 1. Válasszuk ki a mintavételi helyet 2. Töltsük ki a mintavételre vonatkozó adatokat (mintaszám, dátum, klorofill-a, alga ind/L) 3. Töltsük fel a fajlistát az egyedszámokkal 4. Minősítsük le és tároljuk a minősítés eredményét
3. Új mintavétel Az előző űrlap beviteli módban csak új minta bevitelére alkalmas
4. Adatbevitel A mintavételek feltöltése adatbeviteli módban,
Ez az adatbeviteli modul a megkönnyíti az Excel táblákból ill. korábbi adatbázisból a fajlisták importálását.
5. Mintavételek listája
13
Ez a KTVF összes mintavételét kilistázza
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató
6. Éves értékelés Egy kiválasztott mintavételi hely évenkénti értékelését adja meg. A rekordkijelelők segítségével átmásolhatóak az adatok excelbe, ill. egy grafikont is készít a program ami szintén másolható.
7. Mintavételi helycsoportok Lsd. Általános űrlapok
14
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 8. Jegyzőkönyv nyomtatása Egy választott minta jegyzőkönyvének nyomtatása.
15
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 16
9. Taxon keresése Egy kiválasztott taxon előfordulási helyeit mutatja meg.
10. Export
kiválasztott mintavételek évenkénti minősítése kiválasztott mintavételek adatmátrix exportálása kiválasztott mintavételek minősítési értékeinek exportálása
Az exportálás űrlapon keresztül minden adat elérhető (nemcsak az aktuális KTVF adatai)
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 17
2. Fitobenton 1 2 3 4 5 6 7 8
A bejelentkezés után ez az űrlap indul el.
1. Minősítés Egy kiválasztott vízfolyás minősítési eredményeit listázza.
2. Mintavételi helyek lsd. Általános űrlapok
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 3. Mintavételek saját minták Ez a fő adatbevivő modul. Adatbevitel menete 1. Válasszuk ki a mintavételi helyet 2. Töltsük ki a mintavételre vonatkozó adatokat (mintaszám, dátum, preparátum szám) 3. Töltsük fel a fajlistát az egyedszámokkal 4. Minősítsük le és tároljuk a minősítés eredményét
4. Mintavételek összes minta Az adatbázis összes( nemcsak a saját) mintavételi eredményét böngészhetjük
5. Adatbevitel A mintavételi modul táblázatos formája, megkönnyíti az egyes adatbázisok közötti másolást.
18
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 19
6. Minták státusza Ezezn az űrlapon lehetőség van a minták státuszát rögzíteni. (QC miatt), lehetséges státuszok (Beérkezett, roncsolt, kész, megnézett,rögzített)
7. Eportálás
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató
Az össze minta, mátrix alapú ill. minősítési eredményeinek exportálása.
8. Fajkeresés A kiválasztott faj előfordulásait kereshetjük meg az űrlappal.
20
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 21
3. Makrozoobenton
1 2
3 4 5 6
A bejelentkezés utáni fő űrlap.
1. Fajkeresés A kiválasztott faj előfordulásait listázhatjuk.
duna 2007.06.30.
0
3 Annelida
4 Mollusca
6 Crustacea
7 Insecta
Malomzug-Décsipusztai csat.,
Malomzug-Décsipusztai csat.,
Malomzug-Décsipusztai csat.,
Malomzug-Décsipusztai csat.,
Malomzug-Décsipusztai csat.,
Malomzug-Décsipusztai csat.,
Malomzug-Décsipusztai csat.,
Korhány-csatorna, Geszt,
Korhány-csatorna, Geszt,
Korhány-csatorna, Geszt,
Korhány-csatorna, Geszt,
Korhány-csatorna, Geszt,
Korhány-csatorna, Geszt,
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Kettős-Körös, Mezőberény híd
Holt-Sebes-Körös, Biharugrai híd
Folyáséri fcs., Körösladány-Gyoma
Folyáséri fcs., Körösladány-Gyoma
Folyáséri fcs., Körösladány-Gyoma
Folyáséri fcs., Körösladány-Gyoma
Taxoncsoport diagram, egyedszám alapján/LAT
Folyáséri fcs., Körösladány-Gyoma
2. Exportálás
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató
A teljes adatmennyiséget látjuk, más KTVF adatai is. Exportálhatjuk a minősítés eredményit ill. falista mátrixokat is.
Előre meghatározott grafikonokat is képezhetünk a kiválasztott mintavételek alapján.
40
30
20
10
22
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató
BMWP átlagpontszám
BMWP átlagpontszám
23
4,4 4,3 4,2 4,1 4 3,9 3,8 3,7 3,6 3,5 Batárpatak, Uszka 2005.05.12.
Rovarcsoport diagram, taxonszám alapján/HU
Batárpatak, Uszka 2006.05.16.
Batárpatak, Uszka 2007.04.03.
Batárpatak, Uszka 2009.05.12.
20 18 16
Taxonszám
14 12 10 8 6 4 2 0 MZ/2005/42 MZ/2005/98 MZ/2006/27 MZ/2006/91 MZ/2007/45 MZ/2008/85 MZ/2009/49 MZ/2009/83 Batár-patak, Batár-patak, Batár-patak, Batár-patak, Batár-patak, Batár-patak, Batár-patak, Batár-patak, Uszka Uszka Uszka Uszka Uszka Uszka Uszka Uszka 2005.05.12. 2005.10.20. 2006.05.16. 2006.09.16. 2007.04.03. 2008.09.18. 2009.05.12. 2009.09.08.
16 Kérészek 22 Tegzesek
3. Mintavételi helyek bevitele Lsd. Általános Űrlapok
4. mintavételi helyek táblázatos Lsd. Általános Űrlapok
17 Szitaköt?k 23 Vízi lepkék
18 Álkérészek 24 Kétszárnyúak
19 Vízi poloskák 25 Bogarak
20 Vízi fátyolkák
5. Mintavételek
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató
Adatbevitel menete 1. Válasszuk ki a mintavételi helyet 2. Töltsük ki a mintavételre vonatkozó adatokat (mintaszám, dátum, megjegyzés, habitat) 3. Töltsük fel a fajlistát az egyedszámokkal 4. Minősítsük le és tároljuk a minősítés eredményét
6. Adatbevitel Az előző űrlap adatbeviteli módban. Megkönnyíti az adatbázisok k9z9tti másolást.
24
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 25
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 26
4. Makrofita Bejelentkezés után az alábbi űrlap jelenik meg
1 2 3
1. Mintavételi helyek lsd. Általános űrlapok
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 2. Adatbevitel
Adatbevitel menete 1. Válasszuk ki a mintavételi helyet 2. Töltsük ki a mintavételre vonatkozó adatokat (mintaszám, dátum, megjegyzés) 3. Töltsük fel a fajlistát az egyedszámokkal 4. Minősítsük le és tároljuk a minősítés eredményét . A minősítés automatikus, de a tárolás manuális.
3. Exportálás
27
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 28
Biológiai adatbázisok Kezelési Útmutató 29