DAFTAR PUSTAKA Ain, Yoshita Khurun. 2011. Isolasi Dan Kloning Gen P5cs (Pirolin-5-Karboksilat Sintetase) Dari Tanaman Karet. Skripsi. Departemen Biokimia. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Institut Pertanian Bogor. Agustin, Hanif Sri Wahyuni. 2013. Analisis Potensi Bakteri Kitinolitik Asal Limbah Udang dan Kepiting Kandidat Penghasil Enzim Kitinase serta Anti Jamur Saprolegnia sp. Menggunakan Marka Molekuler Gen 16S rRNA. Skripsi. Program Studi Perikanan. Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan. Universitas Padjadjaran. Jatinangor. Ambriyanto., K. S. 2010. Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Aerob Pendegradasi Selulosa dari Serasah Daun Rumput Gajah (Pennisetum purpureum schaum). Jurusan Biologi. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Institut Teknologi Sepuluh November. Surabaya. Anonim1. 2013. http//www.ncbi.nih.nlm.gov. diakses pada tanggal 22 Februari 2013. Anonim2. 2013. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/. diakses pada tanggal 22 Februari 2013. Angelia, Tri Octora. 2009. Kajian Metode Deteksi Bakteri Patogen Penyebab Penyakit Asal Pangan Di Pusat Riset Obat Dan Makanan Badan POM RI. Skripsi. Departemen Ilmu Dan Teknologi Pangan. Fakultas Teknologi Pertanian. Institut Pertanian Bogor. Ariestaningtyas, Y. 1991. Pemanfaatan Tongkol Jagung untuk Produksi Enzim Selulase oleh Trichoderma viride. Skripsi. Departemen Teknologi Pertanian. Fateta IPB. Bogor. Armstrong, Neali. Sun, Yu. Chen, Guo-Xiang and Gouaux, Eric. 1998. Structure of a glutamate-receptor ligand-binding core in complex with kainate. Department of Biochemistry and Molecular Biophysics, Columbia University, 650 W. 168th Street, New York, New York 10032, USA : Vol 395. Astuti, S. T. 2011. Real-Time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR/QPCR) Sebagai Pesaing Polymerase Chain Reaction (PCR) Konvensional. Jakarta : Badan Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan, Balai Uji Standar Karantina Ikan. 21 hlm. Astutik., Rahayu Puji. Kuswytasari., Nengah Dwianita. Shovitri., Maya. 2012. Uji Aktivitas Enzim Selulase Dan Xilanase Isolat Kapang Tanah Wonorejo
71
72
Surabaya. Jurnal. Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Institut Teknologi Sepuluh Nopember. Surabaya. Bravo, A.S., S. Sarabia, L. Lopez, H. Ontiveros, C. Abarca, A. Otrhz, L. Lina, F.J. Villalobos, G. Pena, M-E. Nunez-Valdes, M. Soberon and R. Quintero. 1998. Characterization of cry genes in Mexican Bacillus thuringiensis strain collection. Appl. Environ. Microbiol. 64: 4965-4972. Chalal, D.S 1983. Growth Characteristic Of Microorganism In Solid State Fermentation For Uppgrading Of Protein Values Of Lignocelluloses And Cellulose Production. American Chemical Society: 205 – 310. Chesson A. 1987. Supplementary enzymes to improve the utilization of pig and poultry diets. Di dalam Haresign dan Cole DA, editor. Advances in Animal Nutrition. London: Recent. hlm 71-89. Cook, N. And Korsten, L. 1996. Optimizing Culturing Conditions for Bacillus subtilis. South African Avocado Growers’ Association Yearbook. 19:5458. Coughlan MP. 1985. The properties of fungal and bacterial cellulases with comment on their production and application. Biotechnol Gen Eng Rev 3:39-109. David
Ng. 2005. Molecular Technique Lecture Note http://www.biotechubc.ca. Diakses pada tanggal 9 Maret 2013.
2005.
Deihimi, Tahereh. Niazi, Ali. Ebrahimi, Mansour. Kajbaf, Kimia. Fanaee, Somaye. Bakhtiarizadeh, Mohammad Reza and Ebrahimie, Esmaeile. 2012. Finding the undiscovered roles of genes: an approach using mutual ranking of coexpressed genes and promoter architecture-case study: dual roles of thaumatin like proteins in biotic and abiotic stresses. Springer Plus Journal. Deng, SP and Tabatabai MA. 1994. Cellulase activity of soils. Soil Biol Biochem 26:1347-1354. Duff, S.J.B. and W.D. Murray. 1996. Bioconversion of forest products industry waste cellulosics to fuel ethanol: A review. Bioresour. Technol. 55: 1–33. Enari, T. M. 1983. Microbial Cellulase. Di dalam W. M. Fogarty (ed.). Microbial Enzymes and Biotechnology. New York. Applied Science Publisher. Ezeji, T., Qureshi, N., Blaschek, H.P., (2007). Production of acetone–butanol– ethanol (ABE) in a continuous flowbioreactor using degermed corn and Clostridium beijerinckii. Process Biochemistry 42 (2007) 34–39. Received
73
4 April 2006; received in revised form 19 June 2006; accepted 8 July 2006. Fan, L.T., Y.H. Lee, and M.M.Gharpuray. 1982. The Nature of Lignocellulosics and Their Pretreatment for Enzymatic Hydrolysis. Adv. Bichem. England. Fengel., Dietrich and Wegener., Gerd. 1995. Kayu. Gajah Mada University Press, Yogyakarta. Fithriani., D. Rodiah., N. Bakti., B. S. 2006. Ekstraksi Selulosa dari Limbah Pembuatan Karaginan. Jurnal Pascapanen dan Bioteknologi Kelautan dan Perikanan. 2(2).91-97. Fitriani, Emy. 2003. Aktivitas Enzim Karboksilmetil Selulase Bacillus pumilus Galur 55 pada Berbagai suhu Inkubasi. Skripsi. Program Studi Kimia, Jurusan Kimia, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Institut Pertanian Bogor. 22 hlm. Gao, Yuan and Wang, Hsien-yu. 2006. Casein Kinase 2 Is Activated and Essential for Wnt/ b-Catenin Signaling. J. Biol. Chem. 2006, 281:18394-18400. Hadioetomo. R. 1993. Mikrobiologi Dasar dalam Praktek. Gramedia Pustaka Utama. Jakarta. Haigler, H. C and P. J. Weiner (edition). 1991. Biosynthesis and Biodegradation of Cellulose. Marcel Dekker Inc, New York. Handayani. 2002. Pengaruh Suhu Inkubasi Terhadap Aktifitas Enzim Selulase Isolat Bakteri Selulolitik Dari Komunitas Mangrove Teluk Awur Jepara Jawa Tengah. Skripsi. Jurusan Biologi. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Universitas Diponegoro. Semarang. Hartanti. 2010. Isolasi dan Seleksi Bakteri Selulolitik Termofilik Dari Kawah Air Panas Gunung Pancar, Bogor. Skripsi. Departemen Biokimia. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Institut Pertanian Bogor. Hasjim., M., dan Toha., T. 2013. Pengembangan Energi Non-Minyak Bumi Yang Ramah Lingkungan. Makalah. Universitas Sriwijaya. Hatami, S., Alikhani, H. A., Besharati, H., Salehrastin, N., Afrousheh, M., and Jahromi, Y. Z. 2008. Investigation on aerobic cellulolytic bacteria in some of north forest and farming soils. American-Eurasian J. Agric. & Environ. Sci. 3 (5): 713-716. Holtzapple M.T. 1993. Cellulose. In: Encyclopedia of Food Science, Food Technology and Nutrition, 2: 2731-2738. Academic Press. London.
74
Holtzapple., Mark. Mosier., Nathan. Wyman., Charles. Dale., Bruce. Elander., Richard. Lee., Y. Y and Ladisch., Michael. 2003. Features of Promising Technologies for Pretreatment of Lignocellulosic Biomass. Bioresource Journal. Purdue University. Howard R.L., E. Abotsi, E.L.J. van Rensburg and S. Howard. 2003. Lignocellulose biotechnology: issues of bioconversion and enzyme production. African J. Biotechnol. 2 (12): 602-619. Innis, M.A. dan D. H. Gelfand. 1990. PCR Protocols. Academic Press, New York. Halaman 3-12. Kawaminami, Shunro. Takahashi, Hideo. Ito, Susumu. Arata, Yoji and Shimada, Ichio. 1999. A Multinuclear NMR Study of the Active Site of an Endoglucanase from a Strain of Bacillus. J. Biol. Chem. 1999, 274:1982319828 doi: 10.1074/jbc.274.28.19823. Keshavarzi., M. Salimi., H. Mirzanamadi., F. 2005. Biochemical and Physical Requirements of Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki For High Biomass Yield Production. J. Agric. Sci. Technol. (2005) Vol. 7: 41-47. Klemm D, Philipp B, Heinze T, Heinze U, dan Wagenknecht W. 1998. Comprehensive Cellulose Chemistry:Fundamentals and Analytical Methods. Vol.1. Weiheim:Wiley-VCH Verlag GmBH. Kulp K. 1975. Carbohydrases. Di dalam Reed G. Editor. Enzymes and Processing. New York: Academic Press. Kwalimwa, Daniel Anyika. 2012. Optimization of growth conditions of Bacillus thuringiensis isolates from various sources in Kenya and toxicity assays of their delta-endotoxin against Chilo partellus. Thesis. Degree of Master of Science in Biotechnology. Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology. Lehninger AL. 1993. Dasar-Dasar Biokimia. Jilid 1. Thenawidjaja M, penerjemah; Jakarta: Erlangga. Terjemahan dari: Principles of Biochemistry. Leonard, Thomas A. Rozycki, Bartosz. Saidi, Layla F. Hummer, Gerhard and Hurley, James H. 2011. Crystal Structure and Allosteric Activation of Protein Kinase C βII. Cell. 2011 January 7; 144(1): 55–66. Lin., L. Kan., X. Yan., D. Wang., D. 2012. Characterization of extracellular cellulose-degrading enzymes from Bacillus thuringiensis strains..Research Article. Anhui Normal Univerity. Repuplic of China. Electron. J. Biotechnol Vol. 15 No. 3, Issue of May 15, 2012.
75
Luthfy S. 1988. Mempelajari ekstraksi karaginan dengan metode semi refined dari Eucheuma cottonii. skripsi. Fakultas Teknologi Pertanian, Institut Pertanian Bogor. hlm 60. Machmud, Muhammmad. 2001. Teknik Penyimpanan dan Pemeliharaan Mikroba. Balai Penelitian Bioteknologi Tanaman Pangan. Bogor. Marganingtyas., D.D. 2011. Potensi Bakteri Selulolitik Indigenous Mangrove terhadap Komposisi Limbah Tambak Udang. Skripsi. Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Brawijaya. Malang. Maulana., P dan Wibowo., A.S. 2011. Mengganti Bensin dengan Rumput Laut. Yayasan Rumput Laut Indonesia. Semarang. http//www.mediaindonesia.com. (diakses tanggal 10 maret 2013). Medzihradszky, KF. 2008. Characterization of site-specific N-glycosylation. Department of Pharmaceutical Chemistry, School of Pharmacy, University of California San Francisco, San Francisco, CA, USA. Meryandini., A. Widosari., W. Maranatha., B. Sunarti., T.C. Rachmania., N dan Satria., H. 2009. Isolasi Bakteri Selulolitik dan Karakterisasi Enzimnya (MAKARA, SAINS, VOL. 13, NO. 1, APRIL 2009: 33-38). Pusat Penelitian Sumberdaya Hayati dan Bioteknologi, Departemen Biologi, FMIPA, Departemen Teknologi Industri Pertanian, FATETA, PS Bioteknologi, Sekolah Pasca Sarjana. Institut Pertanian Bogor. Microbiology Faculty. 2010. Microbiology Laboratory Manual. Northeast State Technical Community College : 1-51. Muladno., Sjaf dan Arifin., A.Y. 2007. Struktur Usaha Ayam Broiler di Indonesia. PT Permata Wacana Lestari (200 hal). Mursini., T. Santoso., W.J. Prasetyo., H. Kholisoh., S.D. Sukadarti., S. 2010. Produksi Gula Reduksi dari Sabut Kelapa Menggunakan Jamur Trichoderma reesei. Prosiding Seminar Nasional Teknik Kimia. Yogyakarta. 7 hlm. Nugraha, Roni. 2006. Produksi Enzim Selulase Oleh Penicillum nalgiovense SS240 Padda Substrat Tandan Sawit. Skripsi. program studi biokimia, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Institut Pertanian Bogor. Nuringtyas, Tri Rini. 2010. Karbohidrat. Gajah Mada University Press, Yogyakarta.
76
Nurmayani, Desi. 2007. Isolasi dan Uji Potensi Mikroorganisme Selulolitik Asal Tanah Gambut dan Kayu Sedang Melapuk dalam Mendekomposisi Kayu. Skripsi. Universitas Sumatera Utara. Medan. 87 hlm. Nur’utami, D. A. 2011. Metode Analisis Isolasi dan Identifikasi Salmonella Typhimurium Pada Susu Dengan Metode Real Time PCR (Polymerase Chain Reaction). Skripsi. Fakultas Teknologi Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Oikawa T, Takagi M, Ameyama MA. 1994. Detection of carboxymethyl cellulase activity in Acetobacter xylinum KU-1. Biosci Biotech Biochem 58: 21022103. Ooshima H, Sakata H, dan Harano Y. 1985. Simultaneous saccharification and fermentation of cellulose: Effect of ethanol on enzymatic saccarification of cellulose. Biotechnol Bioeng 27: 389-397. Palmer, Trevor. 1995. Understanding Enzymes Fourth Edition. Prentice Hall/ Ellis Horwood. London. Phillips, Kristen., Zaidan, Frederic., Elizondo, O.R., Lowe, K.L. 2012. Phenotypic characterization and 16S rDNA identification of culturable non-obligate halophilic bacterial communities from a hypersaline lake, La Sal del Rey, in extreme South Texas (USA). Research Article. Aquatic Biosystems. Department of Biology, University of Texas - Pan American, Edinburg, Texas. USA. Prescott SC and Dunns CG. 1981. Industrial Microbiology. Eastport: AV1 Pub Connecticut. President's DNA Initiative. 2013. Primer Annealing http://www.nfstc.org. diakses pada tanggal 18 Juli 2013.
Temperature.
Prihandana, R., E. Hambali, S. Mujdalifah dan R. Hendroko. 2007. Meraup Untung dari Jarak Pagar. Agromedia Pustaka Utama, Jakarta. 106 hlm. Primrose, S.B and Twyman, R.M. 2006. Principles of Gene Manipulation and Genomics. Seventh Edition. Blackwell Publishing. Rachim, R.F. 2008. Isolasi dan Karakterisasi Gen Pengkode Endoglukanase Termostabil dari Sumber Air Panas Secara Metagenomik. Thesis. Bioteknologi, Institut Teknologi Bandung. Ramadhan, Luthfi. 2012. Analisis Potensi dan Karakterisasi Molekuler Gen 16S rRna Bakteri Selulolitik yang Diisolasi dari Makroalga Euchema sp dan Sargassum sp Sebagai Penghasil Enzim Selulase. Skripsi. program studi
77
perikanan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan. Universitas Padjadjaran. Jatinangor. Rybicki, E.P. 1996. PCR primer design and reaction optimisation. In Molecular Biology Techniques Manual. Ed. V.E. Coyne, M.D. James, S.J. Reid & E.P. Rybicki. Dept.of Microbiology. Univ. Cape Town. Sambrook, J., E.F. Fritsch, and T. Maniatis. 1989. Molecular Cloning. A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York. Samsuri., M. Gozan., M. Mardias., R. Baiquni., M. Hermansyah., H. Wijanarko., A. Prasetya., B dan Nasikin., M. 2007. Pemanfaatan Sellulosa Bagas Untuk Produksi Ethanol Melalui Sakarifikasi Dan Fermentasi Serentak Dengan Enzim Xylanase. MAKARA, TEKNOLOGI, VOL. 11, NO. 1, APRIL 2007: 17-24. Sarikaya., Elif dan Gurgun., Velittin. 1999. Increase of the a-amylase yield by Some Bacillus Strains. Turk J Biol 24 (2000) 299–308. Sastrohamidjojo, H. 2005. Kimia Organik, Stereokimia, Karbohidrat, Lemak, dan Protein. Yogyakarta : Gadjah Mada. Setiawan, D. 2003. Deteksi DNA Canine Parvovirus Tipe 2 (CPV-2) Isolat Lokal Menggunakan Teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) .Skripsi. Fakultas Kedokteran Hewan, Institut Pertanian Bogor. Silva., Roberto da. Lago., Ellen. S. Merheb., Carolina. W. Machione., Mariana. M. Park., Yong Kun and Gomes., Eleni. 2005. Production of xylanase and CMCase on solid state fermentation in different residues by Thermoascus auranticus miehe. Braz J Microbiol 36:235-241. Sjőstrőm, Eero. 1995. Kimia Kayu Dasar – Dasar dan Penggunaan. Edisi 2. Gadjah Mada University Press : Yogyakarta. Sopyan. 2009. Karakterisasi Fisiologi dan Identifikasi Molekuler Isolat-Isolat Bacillus spp Penghasil Bakteriosin Asal Hutan Wana Wisata Cangkuang. Skripsi. Departemen Biologi. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Institut Pertanian Bogor. Sreekumar., G dan Soundrajan., K. 2010. Temperature Adaptation Study on Probiotic Bacillus subtilis SK09 Based on its Extracellular Proteins. Advance Journal of Food Science and Technology 2(5): 246-249. Stroh S, Maurer. Eisenhaber B and Eisenhaber F. 2002. N-terminal Nmyristoylation of proteins: refinement of the sequence motif and its taxonspecific differences. J Mol Biol. 2002 Apr 5;317(4):523-40.
78
Sukenda. Dwinanti., S. H. Yuhana., M. 2009. Keberadaan White Spot Syndrome Virus (WSSV), Taura Syndrome Virus (TSV) dan Infectious Hypodermal Haematopoitic Necrosis Virus (IHHNV) Di Tambak Intensif Udang Vannamei Litopenaeus vannamei Di Bakauheni, Lampung Selatan. Jurnal Akuakultur Indonesia, 88(2): 1-8 (2009). Sukumaran., Rajeev. K. Singhania., Reeta Rani and Pandey., Ashok. 2005. Microbial cellulases-Production, applications and challenges. Journal of Scientific & Industrial Research. Vol 64. November 2005, pp. 832-844. Sunarto, A. 2006. Prosedur Polymerase Chain Reaction (PCR). Jakarta. 18 hlm. Susanti, Evi. dan Bintari, Yoni Rina. 2013. Karakterisasi ekstrak kasar sistem selulase potensial dari Bacillus subtilis. Prosiding Seminar Nasional Kimia UGM. Syamsu, K, Mulyorini Rahayuningsih dan Farida Yulianti. 2011. Pengaruh Aerasi terhadap Produksi Bioinsektisida oleh Bacillus thuringiensis subsp. Israelensis pada Bioreaktor Tangki Berpengaduk dan Kolom Gelembung. Jurusan Teknologi, Ilmu Pertanian, Fakultas Teknologi Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Syamsudin, Purwati S, Taufik AR. 2008. Efektifitas aplikasi enzim dalam sistem lumpur aktif pada pengolahan limbah pulp dan kertas. Berita Selulosa Vol 43(2). Hal 83-92. Tae-Il., K. Han., J.D. Jeon., B.S. Yang., C.B. Kim., K.N. Kim., M.K. 2000. Isolation from Cattle Manure and Characterisation of Bacillus licheniformis NLRI-X33 Secreting Cellulase. Asian-Aus. J. Anim. Sci. 13 Supplement July 2000 A: 427-431. Teather., R.M and Wood., P.J. 1981. Use of Congo Red-Polysaccharidae Interactions In Enumeration and Characterization Of Cellulolytic Bacteria From The Bovine Rumen. Appl Environ Microbiol 43:777-780. Thimann, Kenneth .V. 1955. The Life Of Bacteria. New York : The Macmillan Company, p. 46-689. Tim Akademisi FPIK Unpad. 2012. Panduan Penyusunan Skripsi Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan Universitas Padjadjaran. 46 hlm. Todar K. 2011. The Genus Bacillus. http://www.textbookofbacteriology.net (diakses pada tanggal 2 Juli 2013) Toha., M.T. Hasjim., M. 2013 Pengembangan Energi Non-Minyak Bumi yang Ramah Lingkungan. Makalah Forum Rektor Indonesia.
79
Van-Thuoc., Doan. Huu-Phong., Tran. Thi-Binh., Nguyen. Thi-Tho., Nguyen. Minh-Lam., Duong dan Quillaguaman., Jorge. 2012. Polyester production by halophilic and halotolerant bacterial strains obtained from mangrove soil samples located in Northern Vietnam. MicrobiologyOpen 2012; 1(4): 395–406. Wijiyono. 2009. Keanekaragaman Bakteri Serasah Daun Avicennia marina Yang Mengalami Dekomposisi Pada Berbagai Tingkat Salinitas Di Teluk Tapian Nauli. Tesis. Sekolah Pascasarjana. Universitas Sumatera Utara. Medan. Xiong, Jin. 2006. Essential Bioinformatics. Cambridge University Press. United States of America, New York. Yagi., Norio. Satonaka., Kazuhiro. Horio., Mitsuzo. Shimogaki., Hiroyoshi. Tokuda., Yoshio. Maeda., Sakan. 1996. The Role of DNase and EDTA on DNA Degradation in Formaldehyde Fixed Tissues. Journals Biotechnic and Histochemistry. Volume 71 (3). Yuwono, T. 2005. Biologi Molekuler. Penerbit Erlangga. Yogyakarta. Yuwono, T. 2006. Teori dan Aplikasi Polymerase Chain Reaction. Penerbit ANDI. Yogyakarta. Zhang., Y. H. Percival. Himmel., Michael. E dan Mielenz., Jonathan. R. 2006. Outlook for cellulase improvement: Screening and selection strategies. Biotechnology Advances 24 (2006) : 452–481. Zobell, C. E. 1990. Marine Microbiology. Bishen Singh Mahendra Pal Singh. Dehradun, India.
