Vážené kolegyně, vážení kolegové,

01#$%*IT4Innovations#&0110&$%$01@%$##&#*@!@!10101#$ 01010! !@!1010 %011$#národní01$ !@% #0@##&#*@!#@&1 0 %@&@1@0$%@&@1@00%$0#@0#@�&@1
&01superpočítačové&01#@&1001#001010!@0#@&1@ 0% www.it4i.cz $0 $%@ #&$%$¢rum $@0@$0%$#@##&#*@!#@&1 0 %@&@1@00%$#@&#*0#1# $%011% #0@# &0110&$%$01@%$##&#*@!@!10101#$ 01010!@% %*@@&@1@00%$0#@ #1010 0 #*@!#@NEWSLETTER0%$0#@� !@% #1 0 %@&@1@0$%1@00%$0#@
/2014@00%$0 Vážené kolegyně, vážení kolegové, přestože od začátku roku uplynul už nějaký čas, dovolte mi, abych využil této příležitosti a poděkoval vám za dobrou práci v loňském roce. Dovolím si jej označit jako, pro naše centrum, velmi úspěšný.

DÍKY ANSELMU BUDE MÍT SEZNAM.CZ 3D MODELY MĚST Seznam.cz používá superpočítač Anselm v  IT4Innovations Národním superpočítačovém centru ke zpracování dat potřebných k vytvoření 3D modelů měst České republiky. Podkladem jsou letecké snímky měst a jejich blízkého okolí z různých úhlů pohledu. Z těchto dvourozměrných fotografií lze použitím výpočetně náročných algoritmů vytvořit 3D modely a jejich textury. Anselm takto zpracuje snímky pokrývající téměř 8000 km2. Tato rozloha odpovídá 1,5 násobku rozlohy Moravskoslezského kraje. Čas potřebný k realizaci se odhaduje na více než 6 měsíců. pokračování na str. 6

Úspěch by se dal vyjádřit několika významnými milníky – v  lednu jsme zahájili stavbu budovy IT4Innovations – Národního superpočítačového centra v Ostravě, v říjnu jsme ukončili stavbu IT4Innovations – Výzkumného centra informačních technologií v  Brně, v  květnu jsme uvedli do provozu superpočítač Anselm, který je v  posledním období průměrně vytížen na více než 80%. Zájem o výpočetní čas pravidelně převyšuje kapacity Anselma. K celkovému zdaru je třeba přičíst i dílčí kroky – rozšiřujeme spolupráci v oblasti smluvního výzkumu, kde se nám podařilo získat tak významného zákazníka jako je Seznam.cz, daří se nám v  oblasti vzdělávání, kde jsme zavedli pravidelné přednášky z různých oblastí HPC, na kterých pravidelně přednášejí špičkoví zahraniční lektoři, získáváme dotace v podávaných národních i mezinárodních projektech. Např. v 10. výzvě 7. rámcového programu jsme získali pro IT4Innovations tři projekty, přičemž v  této výzvě akademická sféra v  ČR získala celkově 6 projektů, tj. získali jsme 50% z  veškerých projektů, které získala akademická sféra v ČR. Věřím, že se tento trend přesune i do roku letošního a budeme úspěšní nejen na národní úrovni ale i na mezinárodní úrovni v  8. rámcovém programu H2020. Na druhé straně je třeba přiznat, že se potýkáme se stejnými problémy jako většina nových center, které mají vysoký objem investic z  evropských strukturálních fondů. Těmito problémy jsou vysoká administrativní zátěž, neustálé detailní kontroly a problematický zákon o veřejných zakázkách.

pevně věřím, úspěšně zapojíme. Rovněž doufám, že se nadále bude posilovat naše spolupráce s  průmyslem. V  oblasti investic nás čeká dokončení redundantní datové přípojky pro budovu IT4Innovations v  Ostravě a dokončení interiérů této budovy, jakož i výběrové řízení na audiovizuální techniku. Pak bude administrativní část budovy zcela funkční a může začít stěhování, které by mělo proběhnout  koncem léta. V druhé půlce roku by měla začít výstavba datového sálu v druhém nadzemním patře naší budovy. Zde bude umístěn náš hlavní systém, pracovně nazývaný Velký cluster. Výběrové řízení na dodávku Velkého clusteru probíhá a jednání v  soutěžním dialogu se blíží ke svému konci. Podle výsledků jednání budou upraveny zadávací podmínky a doufáme, že závěrem roku budeme moct rozhodnout o výběru nejvhodnější nabídky. Pak bude naše centrum kompletní. I když rok 2014 bude náročný, přeji nám všem, abychom tento rok prožili v co největší pohodě a bez zbytečných stresů. Hezký den, Martin Palkovič ředitel IT4Innovations

Letos jsme vstoupili do roku, který bude pro naše centrum klíčový. Čekají nás významné události, od kterých se bude odvíjet budoucnost našeho centra. Začíná už zmíněný 8. rámcový program nazvaný H2020 do kterého se,

#&@1@00%$0#@ #1010010!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%%110010!@%#0@00%$0#@&@1@00%$0#@
#1010010

%$0#@!#@KRÁTCE%$0#@�!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%1@%1@00%$0#00%$0#@�%$0#@ #10100%1@00%$

ADMINISTRATIVNÍ ČÁST BUDOVY IT4I DOKONČENA Administrativní část budovy Národního superpočítačového centra IT4Innovations byla v průběhu března zkolaudována a oficiálně převzata investorem. V  současné době je v kampusu VŠB-Technické univerzity Ostrava realizována další stavba datová přípojka, která zajistí datové napojení objektu, a to dvěma nezávislými trasami. V  průběhu dubna bylo ukončeno výběrové řízení na dodavatele interiérů Národního superpočítačového centra, které budou dodány v  horizontu tří měsíců. Zaměstnanci by se měli do nové budovy stěhovat v průběhu léta. S celkovým dokončením, které zahrnuje výstavbu infrastruktury datového sálu a instalaci superpočítače s více než 10násobným výkonem oproti současnému superpočítači Anselm, počítáme v roce 2015.

Pohled do interiéru nové budovy IT4I

Budova Národního superpočítačového centra IT4Innovations

#&@1@00%$0#@ #1010010!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%%110010!@%#0@00%$0#@&@1@00%$0#@#1010010

VÝZKUMNÉ CENTRUM INFORMAČNÍCH TECHNOLOGIÍ OTEVŘELO NOVOU BUDOVU Výzkumné centrum informačních technologií (VCIT) otevřelo v  pátek 21. března 2014 novou budovu. Nové prostory poskytují kvalitní pracovní prostředí pro výzkumníky s přístupem k nejmodernější technice.

Slavnostní otevření budovy Výzkumného centra informačních technologií v Brně

Objekt VCIT je flexibilní z hlediska přestavitelnosti a modifikovatelnosti technologií a laboratoří, je plně klimatizovaný a splňuje přísná kritéria Evropské komise na centra excelence. Je umístěn v areálu Fakulty informačních technologií Vysokého učení technického v  Brně (VUT). VUT je jedním z partnerů IT4Innovations Národního superpočítačového centra.

Interiéry budovy Výzkumného centra informačních technologií

Pohled na budovu Výzkumného centra informačních technologií

#&@1@00%$0#@ #1010010!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%%110010!@%#0@00%$0#@&@1@00%$0#@#1010010

PRŮMYSLOVÝ SEMINÁŘ IT4INNOVATIONS Hlavním záměrem Průmyslového semináře, který se uskutečnil 18. března 2014, bylo představit činnost našich výzkumných programů, možnosti spolupráce s  průmyslem a navázat nové kontakty. Setkání se zúčastnilo zhruba 80 zástupců průmyslového sektoru.

K  hostům promluvil rektor VŠB – Technické univerzity Ostrava Ivo Vondrák i ředitel IT4Innovations Národního superpočítačového centra Martin Palkovič, kteří představili univerzitu i IT4Innovations v obecné rovině.

Stávající infrastrukturu, plány do budoucna, poskytované služby při využití superpočítače a možnost navázání spolupráce v oblasti výzkumu a vývoje představili Vít Vondrák, Jan Martinovič, Tomáš Kozubek, Tomáš Karásek a Tomáš Brzobohatý.

Na semináři se našim výzkumníkům podařilo navázat spolupráci s několika průmyslovými partnery.

Semináře se zúčastnilo zhruba 80 zástupců průmyslového sektoru.

Vít Vondrák na úvod vysvětlil význam HPC.

S možnostmi spolupráce seznámil účastníky semináře Tomáš Karásek.

Využívání knihoven pro rozsáhlé výpočty objasnil Tomáš Brzobohatý.

IT4INNOVATIONS JE PARTNEREM CENY J. FOURIERA 2014 IT4Innovations Národní superpočítačové centrum se zapojilo do vědecké soutěže Josepha Fouriera 2014, kterou pořádá Francouzské velvyslanectví spolu se společností Bull. Jednomu z  kandidátů na ocenění přidělí odborná porota výpočetní čas na superpočítači Anselm. Studenti, kteří se ve svém výzkumu zaměřují na výpočetní algoritmy a metody, které pracují s  velkými objemy dat, či na simulaci a modelování, si tak budou moci vyzkoušet práci s jedním z nejvýkonnějších superpočítačů ve střední Evropě. Kromě toho mají možnost získat zajímavé ceny a stipendia na výzkumnou stáž. Více informací o soutěži na www.bull.cz/fourier

#&@1@00%$0#@ #1010010!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%%110010!@%#0@00%$0#@&@1@00%$0#@#1010010

PERMONÍK - NOVÝ PŘÍRŮSTEK DO HARDWAROVÉHO VYBAVENÍ NAŠEHO SUPERPOČÍTAČOVÉHO CENTRA Permoník je náš mini-superpočítač sestavený z 8 karet Raspberry Pi, který se vejde do kabelky. Přes svou velikost demonstruje svým návrhem skutečný superpočítač, jakým je například Anselm, a umožňuje paralelní výpočty skrze Ethernetové propojení a knihovnu MPI. Samotná karta Raspberry Pi je velikosti kreditky ale má 700 MHz CPU a 512 MB operační paměti. Jako cluster pak má Permoník výkon 1 GFLOPS. Permoníka sestavili David Horák a Lubomír Říha u příležitosti prezentace PRACE (Partnership for Advanced Computing in Europe) na veletrhu Gaudeamus v  Praze, ale jako nepostradatelný pomocník pro přiblížení paralelního počítání studentům se ukázal také na dalších akcích.

Přednáška Davida Horáka a Víta Vondráka na 10. ročníku Školy matematického modelování.

Permoník na veletrhu Gaudeamus v Praze.

Mini-superpočítač Permoník.

#&@1@00%$0#@ #1010010!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%%110010!@%#0@00%$0#@&@1@00%$0#@#1010010

0%$0#!#@VĚDA#A@VÝZKUM%$0#@�!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%1@00%$0#@�%$0#@ #101001%1@00%$0

DÍKY ANSELMU BUDE MÍT SEZNAM.CZ 3D MODELY MĚST pokračování ze str. 1

ZAJÍMAVOSTI

Aplikace realizující výpočet byla pro Seznam.cz vyvíjena na míru externí firmou. Ve finální fázi vývoje aplikace výzkumníci IT4Innovations navrhli úpravy pro dosažení maximálního výkonu a efektivity při jejím nasazení na superpočítači Anselm. Výpočetní algoritmus využívá jak výkonu klasických procesorů, tak grafických akcelerátorů pro výpočty s vysokým stupněm paralelizace. Díky asistenci IT4Innovations je tedy k řešení plně využíván výkonný hardware, kterým Anselm disponuje.

► C  elkově bude zpracováno území o rozloze 8000 km2. ► M  odely budou vytvářeny pro více než 250 měst a obcí. ► Z  a 24 hodin Seznam.cz zpracuje 3443 leteckých fotografií. ► M  odel vyrobený za 24 hodin pokrývá 133 km2. ► P  rvním zpracovaným místem, které bude sloužit jako ukázka, byl Špindlerův Mlýn. Lubomír Říha

#&@1@00%$0#@ #1010010!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%%110010!@%#0@00%$0#@&@1@00%$0#@#1010010

LUBOMÍR ŘÍHA Doktorát získal jak na ČVUT v Praze, tak na Bowie State University v USA. Na této univerzitě poté působil tři roky jako výzkumný pracovník. Další tři roky pracoval na George Washington University, kde se věnoval výzkumu a vývoji v oblasti vysoce výkonných analytických aplikací. V IT4Innovations je zapojen do projektu EXA2CT a pracuje na optimalizaci algoritmů. Je hlavním řešitelem zakázky od společnosti Seznam.cz. Jak začala spolupráce se společností Seznam.cz? Seznam oslovil naše výzkumníky, podstatné informace získali na našem webu industry.it4i.cz. Vzhledem k tvorbě 3D modelů map je zajímalo především využití grafických karet. A protože má Anselm jedny z nejvýkonnějších, chtěli otestovat, jak rychle mohou modely vytvářet na superpočítači. Co konkrétně jste tedy pro Seznam. cz vytvářel? Seznam.cz měl vyvinutou aplikaci, ovšem pro jiné prostředí, než je superpočítač. Sice by na něm fungovala, ovšem nevyužila plně výkonu, který jí Anselm může nabídnout. Navrhli jsme změny, kterými se dosáhlo optimálního vytížení jak grafických karet, tak procesorů. Dále jsme pro Seznam.cz navrhli metodologii, jak Anselm používat.

doba mohla zkrátit až 10krát. Pokud budeme předpokládat, že by velký cluster měl 200 akcelerovaných uzlů, můžeme očekávat, že zpracování stejného množství dat by trvalo zhruba jeden měsíc. Co je hlavní náplní Vaší práce? Působím na projektu EXA2CT, který se zabývá především vývojem algoritmů a runtime systémů pro následující generaci exascale superpočítačů, které se budou stavět kolem roku 2020. V rámci Vašeho výzkumu i hodně cestujete. Chystáte se na nějakou cestu? V dubnu odjíždím v rámci projektu POSTDOCI II s kolegou Tomášem Brzobohatým na tříměsíční stáž do USA. V rámci spolupráce se Standford University budeme pracovat na algoritmech. Výzkum se bude částečně překrývat s projektem EXA2CT. Dále plánuji 3 měsíční stáž v americkém Národním úřadu pro letectví a kosmonautiku (NASA). Jak jste se dostal k superpočítačům? Začínal jsem programováním hradlových polí (FPGA) na ČVUT a poté přešel ke grafickým kartám na Bowie State, které jsem používal pro zpracování obrazu a signálu. Na George Washington University jsem pracoval v HPC laboratoři, kde jsem si svém obzory v HPC výrazně rozšířil.

Na IT4I se věnuji mimo jiné optimalizaci algoritmů. Moje role v IT4Innovations není matematika, tou se zabývají spíše kolegové. Já se věnuji urychlování výpočtů pomocí přídavných akcelerátorů, jako jsou například právě ony grafické karty a novým hardwarovým trendům. V současné době se z nových technologií nejvíce rozšiřují akcelerátory Intel Xeon Phi, které například „pohání“ nejvýkonnější počítač světa (čínský Tianhe II) a které máme také na Anselmu. Šest let jste žil a pracoval ve Spojených státech. Jak se liší podmínky v HPC u nás a v USA? V USA jsem pracoval v menší ale zaběhlé laboratoři, kde mimo jiné ve spolupráci s dalšími významnými partnery vznikl programovací jazyk Unified Parallel C (UPC). IT4Innovations je superpočítačové centrum, které se mimo výzkumu věnuje také poskytování služeb a spolupráci s ostatními HPC centry v rámci PRACE. Obě pracovní pozice jsou pro mě velkým zdrojem zkušeností, ale netroufám si hodnotit. Co Vás vedlo k tomu, že jste se z USA vrátil zpět do ČR? V USA jsme se s rodinou již zabydleli a prakticky nic mi nechybělo. Nechtěl jsem se vrátit za každou cenu. Tím, že bylo otevřeno IT4Innovations, se ale otevřela možnost dělat HPC „doma“ a v Evropě. A tak jsme to zkusili a vrátili se zpět.

Seznam tedy využívá Anselm úplně? Záleží na tom, kolik úloh v danou chvíli spustí. Pravdou je, že jsou schopni vytížit veškeré uzly s grafickými kartami na Anselmu a pokud bychom jich měli více, nebyl by problém zpracování dat dále škálovat. Je možné odhadnout, jak dlouho budou výpočty trvat? Celkem by mělo být spočítáno kolem 8000 km2. Díky optimálnímu využití superpočítače by tato plocha měla být spočítána zhruba za půl roku. Na velkém clusteru by se tato

#&@1@00%$0#@ #1010010!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%%110010!@%#0@00%$0#@&@1@00%$0#@#1010010

0%$0#!#@OBRAZEM%$0#@�!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%1@00%$0#@�%$0#@&%1@00%$0##010#1010010!@

#&@1@00%$0#@ #1010010!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%%110010!@%#0@00%$0#@&@1@00%$0#@#1010010

0%$0#@!#@VYUŽITÍ#SUPERPOČÍTAČE0ANSELM%$0#@�!@%#0@##&#*@!#@&%1@00%$0#10%@&@1@0$%1@00%$0#@�%

VÝSLEDKY GRANTOVÝCH SOUTĚŽÍ Před koncem loňského roku byla vyhodnocena hned dvě kola grantových soutěží - 3. kolo Interní grantové soutěže a 2. kolo Veřejné grantové soutěže. Výpočetní čas na superpočítači Anselm tak pod stromeček dostalo 27 týmů. Úspěšných bylo 12 projektů v interní grantové soutěži a 15 ve veřejné. Celkem jsme rozdali 2.485.600 core hours interním žadatelům a 5.782.000 core hours žadatelům externím.

Zatímco v  Interní grantové soutěži porazilo výpočetní chemii o chloupek inženýrství, ve veřejné grantové soutěži je výpočetní chemii věnováno zdaleka největší množství core hours, celkem 4.600.000, což je 80% všech v tomto kole přidělených prostředků.

III. KOLO INTERNÍ GRANTOVÉ SOUTĚŽE

II. KOLO VEŘEJNÉ GRANTOVÉ SOUTĚŽE

1% 1,0% 2,1% 2,0%

1%

1%

3%

2,3%

4%

6,1%

10% 40,2%

Výpočetní chemie Inženýrství Informatika Fyzika Hydrologie

1% 1%

Výpočetní matematika Geovědy

1%

46,3%

3%

80%

4%

%

40,2%

Výpočetní chemie

Výpočetní chemie

Inženýrství

Meteorologie

Informatika

Fyzika

Fyzika

Biomedicínské inženýrství

Hydrologie

Materiálové inženýrství

Výpočetní matematika

Inženýrství

Geovědy

Geovědy

#&@1@00%$0#@ #1010010!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%%110010!@%#0@00%$0#@&@1@00%$0#@ #1010010 80%

VÝPOČET SCHOPNOSTI FOSFOPEPTIDŮ VÁZAT SE NA PROTEINY SKUPINY 14-3-3 Hlavní řešitel: Jozef Hritz Alokace: 700 000 core hours Proteiny skupiny 14-3-3 jsou součástí každé eukaryotické buňky. Hrají důležitou roli v buněčném cyklu při regulaci, řízeném odumírání buněk a při genové expresi. Tyto proteiny jsou ale rovněž spojovány s  onkogenními a neurodegenerativními chorobami. Cílem tohoto výzkumu je pomocí superpočítače vypočítat vazebnou afinitu těchto proteinů s  vybranými fosfopeptidy. Příprava dostatečného množství fosforylovaných peptidů pro laboratorní testy je téměř nemožná. Po ověření vypočtených dat bude možné stejnou metodu použít pro téměř všech 850 známých vazebných partnerů. Výsledky mají své použití v  neurobiochemii při výzkumu neurodegenerativních onemocnění. MODELOVÁNÍ KVALITY OVZDUŠÍ V PROSTŘEDÍ MĚSTSKÝCH AGLOMERACÍ Hlavní řešitel: Jaroslav Resler Alokace: 500 000 core hours Kvalita ovzduší je důležitým faktorem ovlivňujícím zdraví a kvalitu života velké části populace. Doprava se na znečišťování ovzduší významně podílí hlavně ve velkých městech. Zásadním nástrojem pro kvantitativní určení dopadu dopravy i dalších zdrojů znečištění na kvalitu ovzduší jsou simulace, jejichž výsledky pomáhají při efektivním zavádění nápravných opatření. Hlavním cílem projektu je vytvořit pilotní simulaci kvality ovzduší pomocí Eulerovského chemického transportního modelu (CTM) ve velmi vysokém rozlišení se zaměřením na silně urbanizované oblasti. Pro simulace bude využita verze numerického modelu počasí speciálně konfigurovaná pro městské oblasti a návazný CTM umožňující modelovat koncentrace primárních i sekundárních látek v ovzduší. Takto koncipovaný modelový systém by měl přinést nové možnosti při zkoumání závislostí emisních zdrojů a znečištění ovzduší. SIMULACE PRŮTOKU KRVE PRO SPECIFICKOU GEOMETRII PACIENTA Hlavní řešitel: Jaroslav Hron Alokace: 100 000 Motivací tohoto výzkumu je otázka, zda matematické modelování může

lékařům pomoci s rozhodováním při léčení určitých stavů kardiovaskulárního systému, jmenovitě aneurysmatu. Aneurysma je specifické lokální rozšíření cévní stěny, jehož prasknutí (ruptura) může být fatální. S rostoucí popularitou počítačové tomografie a magnetické rezonance je aneurysma často diagnostikováno jako vedlejší diagnóza. Nabízí se otázka, zda je možné identifikovat indikátory poukazující na zvýšené riziko jeho případné ruptury. Geometrie každého případu je unikátní a vyžaduje přesné výpočty. Důležitou roli zde hrají reologické poměry krve a přidružené chemické reakce jako například proces koagulace a také interakce s cévními stěnami. Přesná identifikace, které z těchto faktorů jsou pro rozhodnutí lékařů o léčbě nejdůležitější, vyžaduje rozsáhlé výpočty, které jsou náročné na výpočetní zdroje. MODELOVÁNÍ A TVAROVÁ OPTIMALIZACE PERIODICKÝCH NANOSTRUKTUR Hlavní řešitel: Lukáš Halagačka Alokace: 58 000 core hours Tento projekt je zaměřen na modelování a optimalizaci optické a magnetooptické odezvy periodických struktur. Protože šíření světla v  komplexních strukturách nelze popsat pomocí jednoduchých modelů, je potřeba pokročilé metody numerického modelování. Pro zvolenou oblast výzkumu byl vyvinut, implementován a optimalizován simulační software založen na metodě vázaných módů (RCWA, Rigorous Coupled Wave Algorithm). Modelováním a tvarovou optimalizací byly studovány 1D periodické nanostruktury, které skýtají aplikační potenciál v oblastech optických telekomunikačních technologií, ochranných holografických prvcích a solárních článcích 3. generace s vyšší účinností. PODPORA PROJEKTU EXA2CT Hlavní řešitel: David Horák Alokace: 100 000 core hours V současnosti je pouze jedno procento kódů připraveno pro nasazení na stroje s desítkami či stovkami tisíc jader, přičemž již jsou k dispozici superpočítače s více než třemi milióny jader. Projekt EXA2CT se zabývá vývojem nových a optimalizací stávajících algoritmů s  cílem efektivně využít tyto stroje a rovněž budoucí generace superpočítačů označované jako exascale systémy. Nejslabší částí paralelních výpočtů je komunikace probíhající mezi výpočetními jádry, proto se první fáze projektu

věnuje přeuspořádání existujících škálovatelných algoritmů tak, aby se tato výměna informací mezi jádry skryla či omezila. BEM4I Hlavní řešitel: Michal Merta Alokace: 50 000 core hours Cílem projektu BEM4I je vývoj stejnojmenné knihovny paralelních řešičů založených na metodě hraničních prvků. Tuto metodu lze efektivně využít např. k modelování šíření zvuku kolem karoserie auta, šíření elektromagnetických vln, vedení tepla nebo při optimalizaci tvaru nejrůznějších součástek. Protože se však jedná o výpočetně a paměťově poměrně náročný proces, je třeba jej vhodně paralelizovat a přizpůsobit pro provoz na clusteru ANSELM. Po dokončení může knihovna sloužit také komerčním partnerům IT4Innovations. SIMULACE CHOVÁNÍ ČISTÝCH A DOPOVANÝCH KLASTRŮ MOLEKUL VODY PŘI NENULOVÉM TLAKU Hlavní řešitel: Aleš Vítek Alokace: 300 000 core hours Tento projekt je zaměřen na počítačové modelování fyzikálně-chemických vlastností sub-nano systémů, shluků (klastrů) molekul vody s příměsovou částicí. Konkrétně se jedná o příměsi tvořené atomy vzácných plynů, molekulou metanu a oxidu uhličitého. V makroskopickém měřítku molekuly vody vytváří „klecovou“ strukturu obsahující tyto hydrofobní částice. Cílem projektu bude zkoumání, za jakých termodynamických podmínek (nenulová teplota a tlak) shluky několika málo molekul vody (řádově 20 molekul) vytvoří kolem příměsové molekuly obdobnou klec tvořenou molekulami vody. Pro numericky náročné simulace budou mimo jiné použity nejaktuálnější výpočetní metody rozvíjené na ústavu IT4Innovations. Tento dílčí projekt je součástí širší spolupráce s Consejo Superior de Investigationes Científicas, Madrid (prof. Pablo Villarreal) a svou povahou spadá do základního výzkumu. Rozpouštění např. molekul oxidu uhličitého či molekul metanu ve vodě při nízkých teplotách a tlacích však souvisí s velmi aktuálními tématy, jako je např. globální oteplování či hledání nových zdrojů energie.

#&@1@00%$0#@ #1010010!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%%110010!@%#0@00%$0#@&@1@00%$0#@ #101001

0##*@!#@POZVÁNKY%$0#@&#%1@00%$0#0!@%#0@##&#*@!#@&10%@&@1@0$%1@00%$0#@�%$0#@ #1010010!@

15.-16.5.2014 Intel® Xeon Phi™ Co-Processor Workshop Lektoři: Georg Zitzlsberger, Michael Steyer (Intel Německo) Dvoudenní kurz zaměřený na akcelerátory Intel® Xeon Phi™, novou perspektivní paralelní architekturu slibující vysoký výkon díky velkému počtu jader při zachování „klasického“ způsobu programování, a to v podání nanejvýš kompetentních lektorů přímo „od zdroje“. První den bude věnován úvodu do vývoje kódů pro tuto architekturu, druhý den pokročilým aspektům a praktickým cvičením na serveru speciálně dovezeném pro tento kurz. http://prace.it4i.cz/PHI-05-2014?language=en

27.-28.5.2014 Praktická výkonnostní analýza paralelních aplikací Lektoři: Brian Wylie (Jülich Supercomputing Centre), Bert Wesarg, Thomas William (TU Dresden) Další dvoudenní kurz, tentokrát o metodách a technikách analýzy paralelních kódů, zda a jak jsou s to využít výkonu moderních HPC architektur. Při praktických ukázkách a cvičeních budou představeny a aplikovány nástroje jako Score-P, Scalasca či Vampir. Účastníci budou moci analyzovat za asistence lektorů také své vlastní aplikace. Přednášející z TU Dresden jsou členy týmu vyvíjejícího Vampir. http://prace.it4i.cz/PPAPA-05-2014?language=en

9.-10.6.2014 Elmer Lektor: Peter Råback (CSC - IT Center for Science, Finsko) Elmer je volně dostupný software pro multifyzikální simulace vyvíjený především ve finském CSC - IT Center for Science, k jehož úspěchu přispěli svými paralelními algoritmy také pracovníci IT4Innovations. Kurz, vedený jedním z hlavních představitelů vývojového týmu a trvající jeden a půl dne, seznámí posluchače s tímto systémem a dotkne se i vybraných složitějších prvků matematického modelování v Elmeru. http://prace.it4i.cz/ELMER-06-2014?language=en

IT4Innovations# národní01$ !@% #0 superpočítačové centrum $@0@$0%$