Požadavky ke SZZ z biologie Bc. U kurzů, které nejsou uvedeny - hlavním vodítkem pro studium zůstávají sylaby předmětů (vč. doporučené a povinné literatury) uvedené v systému STAG
Obecná botanika Základní osnovou je sylabus Obecná botanika. Pletiva rostlin (dělivá, vodivá, krycí). Kořen, stonek, list, květ, květenství, plod – anatomie, morfologie, metamorfózy, význam. Pohlavní a nepohlavní rozmnožování, rodozměna. Fylogeneze a systém vyšších rostlin Základní charakteristika vybraných čeledí nebo (zpravidla u výtrusných rostlin) vyšších taxonomických jednotek; nejdůležitější zástupci, jejich význam. Vymezení taxonů „tradiční“ (používané ve většině učebnic) nebo moderní (podle APG II). Taxony v závorce jen orientačně. s. l. = sensu lato, v širším pojetí Rhyniophyta Lycopodiophyta: Lycopodiales, Sellaginales, (Lepidodendrales) Equisetophyta: Equisetaceae Polypodiophyta: Polypodiales (Lyginodendrophyta) (Cycadophyta) Pionophyta: Gingkoales; Pinaceae, Cupressaceae, Taxaceae Magnoliophyta Magnoliopsida: Magnoliaceae, Nymphaeaceae, Ranunculaceae (podčeledi), Fagaceae, Betulaceae, Caryophyllaceae (významné podčeledi), (Chenopodiaceae, Violaceae), Cucurbitaceae, Brassicaceae, Salicaceae, (Primulaceae), Rosaceae (s. l., podčeledi), Fabaceae, Apiaceae, (Rubiaceae, Loniceraceae s. l.), Boraginaceae, Solanaceae, Scrophulariaceae (s. l.), Lamiaceae, Campanulaceae, Asteraceae (důležité podčeledi) Liliopsida: Liliaceae (s. l.), Orchidaceae, Cyperaceae, Poaceae, (Arecaceae). Stručná charakteristika vývojových větví krytosemenných rostlin (podle APG II): Magnoliidová větev, jednoděložné rostliny, pravé dvouděložné rostliny (Rosidová větev, Asteridová větev).
Fyziologie rostlin 1.
Vodní režim rostlin a minerální výživa rostlin
2.
3.
4.
Vlastnosti vody, osmóza, vodní potenciál, transport látek na úrovni buňky, příjem, vedení a výdej vody rostlinou, adaptace rostlin na extrémní podmínky dostupnosti vody, transpirace, vodní režim a energetická bilance Fotosyntéza - primární pochody Sluneční záření, fotosyntetické struktury - listy, chloroplasty, fotosyntetické pigmenty, stavba fotosyntetického aparátu, pohlcení světla, separace elektrického náboje, transport elektronů, fotofosforylace, fotoinhibice, evoluce fotosyntetické fixace záření. Fotosyntéza - sekundární pochody Calvinův cyklus, fotorespirace, C4-cyklus, fixační cesta CAM, faktory ovlivňující fotosyntézu, metody měření rychlosti fotosyntézy Růst a vývoj rostlin - růstové regulátory, faktory růstu a vývoje rostlin Vývojové a růstové fáze rostlin, růstové procesy na buněčné úrovni, diferenciace, růst pletiv a orgánů rostliny, vnitřní faktory růstu, rostlinné hormony a mechanismy jejich účinku, vliv světla na růst rostliny, fytochromový systém, fotoperiodismus, fotomorfogeneze
Molekulární a buněčná biologie 1.
2.
3.
4.
5.
Struktura a funkce bílkovin a nukleových kyselin. Struktura bílkovin; modulární struktura proteinů; struktura a funkce nukleových kyselin; párování basí, denaturace, renaturace a hybridizace nukleových kyselin; další sekundární struktury NK; vyšší struktury DNA Replikace a reparace DNA Obecný mechanismus replikace; DNA polymerázy; iniciace replikace; topologické problémy při rozplétání dvoušroubovice DNA; replikační strategie; replikace chromosomu Escherichia coli; přímá oprava poškození nukleotidů; Excisní reparace; Mismatch reparace; Reparace dvojřetězcových zlomů Transkripce u prokaryot. Regulace genové exprese na úrovni transkripce, úpravy primárního transkriptu RNA polymeráza; vazba na promotor a aktivace RNAP; struktura promotoru; iniciace mRNA a opuštění promotoru; kontrola exprese genů na úrovni iniciace transkripce; elongace; terminace transkripce; sestřih mRNA jaderných genů; alternativní sestřih; Genetický kód, transferová DNA. Základní vlastnosti genetického kódu; čtení genetického kódu, struktura genu a mRNA; struktura mRNA a okolí startovacího kodonu; transferová RNA; aminoacyl-tRNA syntetázy; kolísání antikodonu; odchylky v kódování; supresorové mutace; Translace a posttranslační modifikace proteinů Základní schéma translace; mRNA a nasedání ribosomů; iniciace translace; elongace; translokace; terminace; struktura ribosomů; ustavení terciární struktury proteinů; transport proteinů v buňce; funkční modifikace proteinů; fosforylace;
Obecná zoologie jednooborová Bi Úvod do zoologie: živočišné organismy, zoologie jako věda, taxonomie, biologická hierarchie, společné znaky a vlastnosti živočichů. Chemické složení živé hmoty: makro- a mikroelementy, prvky skcesorické, voda v těle organismů, sušina, popeloviny a plyny, funkce, složení a význam sacharidů. Složení a význam
a funkce lipidů, aminokyselin, peptidů a proteinů, nukleové kyseliny (DNA, RNA), složení, funkce a význam enzymů jako biologických katalyzátorů, význam, přehled a charakteristika nejvýznamnějších vitamínů. Přehled a funkce nejvýznamnějších hormonů, feromony, prostaglandiny a pigmenty. Cytologie: buňka, buněčné formy života, Prokaryota (Archebakterie a Eubakterie), prokaryotické organismy, Eukaryota – struktura živočišné buňky. Cytosol, základní cytoplazma a funkční buněčné struktury, cytoplazmatická membrána, mechanismy přenosu látek přes membránu, buněčné jádro, mitochondrie, endoplazmatické retikulum, ribozómy, lysozómy, Golgiho aparát, cytoskelet, buněčné inkluze, peroxizómy, rozmnožování buněk: amitóza, mitóza a její modifikace (endomitóza, polytenie, pseudomitóza atd.), život buňkybuněčný cyklus, buněčná smrt (apoptóza), meióza Histologie: Charakteristika živočichů, tkáně-jejich vznik a původ, zárodečné listy, rozdělení živočišných tkání. Rozdělení, struktura a funkce epitelových tkání (epitelů). Pojivové tkáně (pojiva) – jejich struktura, rozdělení a funkce (zárodečné tkáně, vaziva, chrupavky, kost, zubní tkáň, osifikace kostí, tělní tekutiny jako pojiva trofická). Svalové tkáně – struktura a funkce myoepitelů, hladké svaloviny, Příčně pruhované svaloviny a myokardu (srdeční svaloviny). Nervové tkáně – stavba a funkce neuronu, synapse, buňky gliové, diferenciace nervové tkáně. Pohlavní buňky. Organologie: Soustava krycí a tělní pokryvy, kůže. Oporná soustava, exo- a endoskelet a pohybová soustava. Soustavy výměny a přeměny látek a energií: trávicí a dýchací soustava a orgány. Vylučovací a osmoregulační soustava, soustava tělních tekutin (krev, míza, krvomíza), krevní a mízní soustava a orgány, srdce, oběhová a cévní soustavy. Rozmnožovací soustava, svítivé orgány u živočichů, soustava dráždivá a regulační, smyslová soustava a orgány. Nervová soustava a soustava žláz s vnitřní sekrecí, endokrinní a neurosekreční soustavy
Obecná zoologie dvouoborová Bi Na síti KBI UJEP jsou skripta z Obecné zoologie (poslední úprava 7. 3. 2013) a přednáškové prezentace, Na konci skript jsou uvedeny otázky a náměty k samo-ověření nastudovaných (!!!) znalostí. Nezačínejte však studovat podle otázek, abyste neztratili souvislosti poznatků, na které při ústním zkoušení přichází „řeč“ častěji, než při písemných testech. Cvičte proto i ústní projev vybraných partií. Pokud si u některé z otázek uvedené ve skriptech nebudete jisti, vraťe se k tématu v širším kontextu ve skriptech nebo jiné učebnici. Témata z Obecné zoologie, která vyžadují pozornost. 1.Společné znaky a vlastnosti živočichů. Hierarchie stavby těla živočichů (molekulybuňky—tkáně-orgány-orgánové systémy). Taxonomická klasifikace živočichů. Fylogenetický vývoj stavby těla (orgány homologické, analogické, rudimentární, atavistické). Společné funkce živočichů (toky látek, energie a informací, vnitřní prostředí- jeho vlastnosti, význam a mechanizmy udržování homeostázy, rozmnožování, thermoregulace, biorytmy atp.) a jejich molekulární a buněčné.mechamizmy (viz následující odstavec). 2. Stavba a funkce živočišné buňky. Fluidně-mozaikový model biomembrán, funkce lipidů a bílkovin biomembrán, stavba a funkce buněčných membránových organel, vč. transportních váčků a jejich typu (dle bílkovinného pláště), adresních molekul (COP I, COPII, t- a vSNARES) a jejich obsahu (sekreční dráha, endocytosa a její formy, ENDOZOMY,
endozomální-lysozomálni systém, membránový potenciál a jeho význam, cytoskelet a jeho stavba a funkce, molekulové motory, mezibuněčné spoje a adhezní bílkoviny (jejich typy, výskyt a funkce), buněčný cyklus a mechanismy jeho regulace (cykliny a cyklin dependentní kinázy, růstové faktory, kontrolní brzdné geny (p53, RB gen), transport látek do buněk a z buněk, receptorový příjem informaci (signalizace receptory v plazmatické mambráněsekundární posli, cytoplazmě a jádře, exprese genů a její regulace v průběhu diferenciace buněk, přeměna energie v buňce, thermodynamické zákony, kompartmentalizace přeměny energie v buňce – glykolýza a oxidativni fosforylace, struktura a funkce jádra, syntéza bílkovin, molekulární architektonika genomu a regulace jeho exprese, mutageneze, kyslíkové oxidativní radikály a jejich význam, reparační procesy (chaperony, proteiny tepelného šoku-hsp), kmenové buňky, buněčné dělení a buněčná smrt, jeji typy a mechanizmy. Viz též sylaby předmětů Dr. J. Ipsera a dr. O. Benady 3. Zakladní typy živočišných tkání vč. složeni a funkce
EXTRACELULARNÍ MATRIX.
4. Principy mikroskopických a molekulárně genetických technik (imunocytochemické metody, PCR, microarrays, atd., alespoň v rozsahu uvedeném ve skriptech OZ na síti UJEP). Principy a využiti biotechnologických metod a genetických modifikaci organizmů-GMO. Viz též sylaby mol.biologie. 4. Rozmnožováni. Determinace pohlaví, gametogeneze, oplozeni, blastogeneze (tvorba základních embryonálních listu a jejich derivátů). Viz též předměty speciální zoologie.. Základy genetiky (Mendelovy zákony, mimojaderná dědičnost, prinicpy a význam epigenetiky atd.). Viz též předměty dr. Ipsera a dr. J. Malého. Fyziologie živočichů a člověka. Na síti KBI - kombinované studium, je sylabus, vč. doporučené literatury přednáškových prezentací.. 1. Funkce jednotlivých orgánů a orgánových systémů, a to i s ohledem na jejich fylogenesi a ev. morfologii (viz doporučeni dr. Ipsera). POSTUPUJTE DLE SYLLABU FYZIOLOGIE NA MOODLE UJEP. Funkci organů studujte vždy až na buněčnou a molekulární úroveň. Zapojujte znalosti z Obecné zoologie. 2. Nepodceňte zdánlivě jednoduché kapitoly, např. složeni a funkce krve, činnost srdce a oběhového aparátu, tělni tekutiny, homeostáza vnitřního prostředí, vstřebávání látek ze střeva, především lipidů a jejich transport mízou a krví. Nepřehledněte imunitní reakce organismu, obecný adaptační syndrom vč. jeho příčin, fází a mechanizmů apod., na kterých se často "havaruje". Nepřehlednete srovnávací aspekty morfologie a funkce hlavních orgánových systemů.. Kámenem úrazu bývá LATKOVÉ SLOŽENÍ ŽIVÉ HMOTY (znát alespoň slovy názvy jednoduchých a složených organických molekul, funkčních skupin, základnich chemických vazeb, definici pH, význam typy enzymů, pufrů atp.). Viz kurz dr. Benady.
Systém a evoluce nižších rostlin 1. Obecné zákonitosti ve stavbě řasové stélky (uvést konkrétní příklady řas s jednotlivými typy stélek), rozlišení řasových oddělení, výskyt a význam řas v ekosystémech (sladkovodní a mořská řasová společenstva). 2. Cyanophyta - obecná charakteristika, stavba buňky, rozmnožování, geologické stáří, adaptabilita sinic, výskyt v přírodě, význam. Prochlorophyta - fylogenetický význam. 3. Rhodophyta - obecná charakteristika, stavba buňky a stélky, rozmnožování a rodozměna, vývojové vztahy, výskyt (bioindikační význam sladkovodních ruduch), využití (mikrobiologie - živné půdy aj.), zástupci. 4. Euglenophyta – stavba buňky, trofie, výskyt v přírodě. 5. Chlorophyta –obecná charakteristika oddělení, nejvýznamnější třídy a zástupci (Chlorophyceae - kolonie, cenobium, Ulvophyceae - aerofyta. Charophyta - stavba stélky, fylogeneze ). 6. Chromophyta (Heterokontophyta) - charakteristika oddělení, nejvýznamnější třídy a zástupci (stavba buňky a stélky, výskyt v přírodě, význam, rozsivky - stavba frustuly, rozmnožování, chaluhy - diferenciace stélky, látky produkované chaluhami, rodozměna, Vaucheria - fylogenetické vztahy). 7. Houby a houbové organismy - obecná charakteristika, rozmnožování, životní cykly, trofie, význam v ekosystémech. 8. Myxomycota – vegetativní a generativní část životního cyklu, zástupci (typy plazmódia a sporokarpů), výskyt. Plasmodiophoromycota - stavba stélky (paraplazmódium), životní cyklus, fytopatologický význam. 9. Oomycota (Peronosporomycota) – vegetativní stélka, nepohlavní a pohlavní rozmnožování (přechod na souš), fytopatologický význam, fylogenetické vztahy, významní zástupci. Chytridiomycota - vývojové vztahy, fytopatologický význam. 10. Ascomycota - vegetativní stélka, rozmnožování (anamorfa a teleomorfa - vřecka, plodnice), výskyt a význam. Přehled nejvýznamnějších řádů a zástupců (rostlinní parazité, dřevokazné houby). Fungi imperfecti. 11. Basidiomycota - vegetativní stélka (primární, sekundární a terciální mycelium), rozmnožování, plodnice, výskyt a význam, životní cykly parazitických zástupců (Uredinales, Ustilaginales, Tilletiales). 12. Basidiomycota - vegetativní stélka (primární, sekundární a terciální mycelium), rozmnožování, plodnice, výskyt a význam. Homobasidiomycetes (Agaricomycetes) vybraní zástupci (jedlé a jedovaté houby, dřevokazné houby, břichatky). 13. Lišejníky – mykobiont a fotobiont, anatomická stavba a morfologie stélky – příklady zástupců, rozmnožování, lišejníkové látky, lichenimetrie, bioindikace. 14. Mechorosty – rodozměna, fylogeneze, charakteristika 3 oddělení: Hepatophyta, Bryophyta, Anthocerotophyta, nejběžnější zástupci. 15. Fytopatologicky významné řády hub a jejich zástupci. Genetika, obecná biologie 1. Atributy života (autoreprodukce, autoregulace, metabolizmus, růst, pohyb, vývoj, dráždivost). 2. Komparace prokaryotické a eukaryotické buňky. 3. Základní formy rozmnožování a jejich charakteristika. Struktura a dynamika vývoje velké panmiktické a autogamií populace. Důsledky selekce, mutace, migrace a disperzivního procesu pro strukturu populací. 4. Fotosyntéza, respirace a fotorespirace – charakteristika a vzájemné vztahy.
5. Aplikace teorie informace, teorie systémů a teorie řízení v biologii. Termodynamika buňky jako základního biologického (otevřeného) systému. Informační biomakromolekuly – charakteristika, struktura a funkce. 6. Replikace, transkripce, translace a regulace genové exprese v prokaryotické a eukaryotické buňce. Posttranskripční a posttranslační úpravy. Genetický kód. Vertikální a horizontální přenos genetické informace (konjugace, transdukce, transformace, transfekce). 7. Buněčný cyklus, buněčný růst, diferenciace a specializace buněk, apoptóza a nekróza. 8. Princip segregace a kombinace vloh, polyhybridizmus, genové interakce, vazba vloh a genetické mapování. Komparace jaderné a cytoplazmatické (mitochondriální, chloroplastové) dědičnosti. 9. Obecná charakteristika a specifika genetiky kvalitativních a kvantitativních znaků. Metody genetické analýzy (na úrovní molekulární, buněčné, organizmální a populační). 10. Mutace, mutageny, mutageneze. Teratogeny, teratogeneze. Karcinogeny, karcinogeneze. 11. Evoluce biologických systémů s akcentem na mechanizmy mikroevoluce (speciace, přírodní výběr, pohlavní výběr, náhodný genový posun, tok genů, evoluční tahy, mutace a selekce v evoluci, deterministické a stochastické procesy v biologické evoluci). Biologie prokaryot a virů 1. Principy taxonomie bakterií a virů. Obecná charakteristika virů, eubakterií a archebakterií. 2. Složení a struktura virové částice a bakteriální buňky. 3. Struktura a organizace genomu bakterií a virů. Replikace, transkripce, translace a regulace genové exprese u bakterií. 4. Strategie a mechanizmy reprodukce virů. 5. Reprodukce bakterií (růst, typy rozmnožování). 6. Konjugace, transdukce a transformace u prokaryot. 7. Plazmidy, fágy, fagmidy, cosmidy – charakteristika a jejich využití při genových manipulacích. 8. Základní typy metabolizmu bakterií a jejich charakteristika (fototrofie, chemotrofie, mixotrofie, respirace anaerobní a aerobní, fotosyntéza u prokaryot – anoxygenní vs oxygenní). 9. Infekční proces a jeho fáze. Lytická a lyzogenní infekce. 7. Charakteristika mikrobiálních ekosystémů, úloha mikroorganizmů v oběhu látek a energií v biosféře. Biologie a ekologie člověka Základy cytologie- stavba buňky, dělení buněk, organismus jako celek. Základy histologieepitelová, pojivová, kostní, srdeční a nervová tkáň, úvod do anatomie člověka. Kosterní soustava- složení a stavba kosti, spojení, růst a vývoj kostí, kostra trupu, hlavy a končetin, nemoci kostry. Svalová soustava- funkce, stavba a fyziologie svalu, typy svalů, svaly hlavy, krku, hrudníku, břicha, zad a končetin, nemoci svalstva. Krev a tělní tekutiny- funkce a složení krve, krevní tělíska, krevní skupiny, míza. Oběhová soustava - krevní oběh- srdce, cévy, velký a malý oběh, projevy srdeční činnosti, nemoci krve a OS. Soustava dýchacíhorní a dolní cesty dýchací, plíce, ventilace plic, zevní a vnitřní dýchání, nemoci DS. Trávicí soustava- dutina ústní, zuby, hltan a jícen, žaludek, tenké a tlusté střevo, játra, slinivka břišní, nemoci TS. Přeměna látek a energií, metabolismus, živiny a vitamíny, zásady správné výživy, její poruchy. Kožní soustava- funkce a stavba kůže, tělesná teplota, choroby kůže, termoregulace. Vylučovací soustava- ledviny a močové cesty, nemoci VS. Pohlavní soustava- pohlavní ústrojí muže a ženy, menstruační cyklus, oplození, antikoncepce, choroby PS. Soustava žláz s vnitřní sekrecí- hormony. Nervová soustava- funkce a stavba, mozek a
mícha, mozkové a míšní nervy. Vyšší nervová činnost, paměť, spánek, učení, choroby NS. Smyslová soustava- ústrojí zraku, sluchu, rovnováhy, kožní, chuťové a čichové. Imunita a obrana organismu. Zdraví a životospráva člověka- zdraví a nemoc, její léčení, životospráva člověka, civilizační choroby, toxikománie (alkohol, kouření, drogy), člověk a prostředí, základy první pomoci
Ekologie Ekologie jako nauka o vztazích mezi organismy a prostředím, definice, terminologie, hierarchie, hraniční obory a její rozdělení. Prostředí organismů, ekologické názvosloví, typy adaptací organismů, divergence, konvergence. Ekologické faktory (abiotické x biotické), typy klimatu. Terestrické a akvatické biomy. Prostor jako zdroj, formy výživy organismů. Pedosféra, hydrosféra, atmosféra. Ekologie populací, jejich charakteristiky a vlastnosti (hustota, rozmístění, struktura, natalita, migralita, migralita, růst a dynamika), terminologie. Mezidruhové a vnitrodruhové interakce. Ekologie společenstev, jejich charakteristiky a vlastnosti (hustota, abundance, produkce, dominance, prezence a absence, frekvence, konstance, fidelita, koordinance). Biodiverzita, její složky, indexy. Ekosystém, jeho struktura a funkce. Biosféra, koloběhy nejvýznamnějších prvků v přírodě.
Obecná parazitologie OBECNÁ PARAZITOLOGIE, klasifikace parazitů, makro- a mikroparaziti, přenos a šíření parazitů, typy hostitelů parazitů, faktory prostředí, životní cyklus, bariéry přenosu obranné mechanismy hostitele, organismus jako prostředí parazita, imunita PROTOZOOLOGIE = PARAZITIČTÍ PRVOCI, charakteristika prvoků, rozmnožování a buněčná stavba prvoků, klasifikace a systém, řád: Kinetoplastida (trypanosomóza, spavá nemoc), řád: Kinetoplastida (leishmanióza), řád: Trichomonadida (trichomonóza + zástupci), řád: Diplomonadida (giardióza + zástupci), řád: Amoebida (měňavky, úplavice), řád: Schizopyrenida kmen: Apicomplexa: obecná charakteristika, klasifikace, životní cyklus a zástupci (kokcidóza, toxoplazmóza), kmen: Apicomplexa: kryptosporidióza, malárie, kmen: Ciliophora (balantidióza), řád: Microsporidia (parazitické Fungi) HELMINTOLOGIE= PARAZITIČTÍ HLÍSTI, charakteristika helmintů, kmen: Plathelminthes, třída: Trematoda = motolice (schistosomóza, dikrocelióza, opistorchióza), fasciolóza, paragonimóza, třída: Cestoda = tasemnice, teniidózy, difylobothrióza, hymenolepiózy, kmen: Nemathelminthes třída: Nematoda = hlístice, trichurióza, třída: Nematoda: trichinelóza, askarióza, larvální toxokaróza, třída: Nematoda: stromgyloidóza, enterobióza, tropické filariózy, terapie střevních helmintů, kmen: Acanthocephala = vrtejši ARACHNOENTOMOLOGIE= PARAZITIČTÍ ČLENOVCI, kmen: Arthropoda = členovci, třída: Arachnida, Řád: Acarina = roztoči, třída: Insecta, řád: Anoplura (vši), řád: Mallophaga (všenky), řád: Heteroptera (ploštice), řád: Diptera, řád: Siphonaptera (blechy), přehled laboratorní diagnostiky parazitů
Chemie a fyzika živých soustav Hlavním vodítkem pro přípravu je sylabus ChFZS, který je pro každý kurs dostupný na MOODLE. Hlavní učebnicí pro studium je kniha Biologie (Neil A. Campbell; Jane B. Reece) především vybrané kapitoly (1 - 6 a 8), které byly probírány v kursu. Další literatura, jak je uvedena v sylabu. Témata, která vyžadují zvláštní pozornost: 1. Atributy živých systémů: Chemické složení živých organismů; anorganické a organické látky; biopolymery; základní princip tvorby polymerních látek v živých systémech. 2. Základy fyziky a chemie živých systémů: Stavba atomů a molekul, principy vytváření chemických vazeb; hmotnost, množství, složení látek; roztoky, koncentrace, pH; fyzikálně-chemické vlastnosti vody. 3. Biomolekuly – jednoduché a polymerní molekuly: Základní funkční skupiny biomolekul; lipidy, nukleové kyseliny, sacharidy, polysacharidy a proteiny; hydrofilní a hydrofóbní interakce; monomery, oligomery a polymery; principy tvorby vyšších molekulárních a makromolekulárních struktur: primární – sekundární – terciární – kvarterní. 4. Základní metody analýzy buněčných molekulárních a makromolekulárních struktur: Centrifugace, elektroforéza, sloupcová chromatografie, spektroskopické stanovení koncentrace látek. 5. Základní principy biokatalýzy: Enzymy, koenzymy, prostetické skupiny; základy enzymové kinetiky; principy regulace enzymové aktivity. 6. Bioenergetika: Princip redukce a oxidace biologických sloučenin; makroergické sloučeniny; základy metabolismu sacharidů; princip glykolýzy; princip cyklu trikarbonových kyselin, typy generace ATP; Pasteurův efekt. 7. Základní znalosti chemických výpočtů užívaných v biologických laboratořích: Roztoky - látková koncentrace, pH, procentuální koncentrace, biologické pufry. Fylogeneze a systém strunatců Položené otázky zahrnují vždy velký taxon a 1) evoluční novinky, které jsou pro tento taxon charakteristické 2) morfologii a anatomii 3) základy systému. Mezi tyto velké taxony patří Tunicata, Cephalochordata, sliznatky a mihule, paryby, paprskoploutvé ryby, Sarcopterigii, obojživelníci, plazi, ptáci, savci. Obzvlášť pečlivě se se naučte charakterizovat skupinu Tetrapoda, charakterizovat skupinu Amniota a Anamnia, vývoj sekundárního čelistního kloubu u savců, vývoj žaberních oblouků, typ šupin. U paryb nezapomínejte na chiméry, u Sarcopterigii na bahníky a jak že je to s latimérií a plicním vakem. U paprskoploutvých ryb nezapomínejte na charakteristiku podtříd, plynový měchýř (jak se dostane plyn do plynového měchýře, jak z měchýře pryč), labyrint a Weberův aparát. Doporučuji se učit podle powerpointových prezentací z přednášek, které jsou k dispozici na moodle v adresáři předmětu až k „ptákům“. Ptáky se naučte podle Gaislera 2007, prosím nezapomínat na dělení podle báze lebky a na rozdíl v péči o mláďata u paleognátních a neognátních. Návod, jak se učit savce, naleznete na moodle v adresáři předmětu, zdrojem je opět Gaisler 2007. Budu chtít slyšet podrobnosti o zubech a zubních vzorcích a základní charakteristiku ptakořitných, vačnatců a placentálů, zejména co se týče urogenitální soustavy. Naučte se zařadit člověka do systému.
Důležité je nepanikařit při jednoduchých otázkách typu co je systém, co je fylogeneze, co je kladogram, co je klad, kam zařadíte člověka, vyjmenujte podkmeny kmene strunatci, nadtřídy, třídy… atd. Pokud budete mít nejasnosti ohledně fylogenze, nahlédněte do publikace Zrzavý J., Fylogenze živočišné říše Scientia 2006. Zkušení kolegové doporučují studentům zopakovat si u savců druhy s utajenou březostí, odloženou březostí, oddálenou dobou oplození, druhy s pravým zimním spánkem (hibernací) a prodlouženým spánkem, taxony s rohy a taxony s parohy a zdůrazňují, že je dobré se učit taxon podle nějakého zástupce a znát způsob života tohoto zástupce. Historický vývoj organismů na Zemi Paleontologie a historická geologie Rozdělení geologické historie Země Pangea, vznik kontinentů, odraz v paleontologii Nejstarší organismy na Zemi Největší rozvoj života na Zemi Výstup organismů z vodního prostředí na souš Typické skupiny zkamenělin (prvohory, druhohory), nejdůležitější mikrofosilie, důležitá rostlinná společenstva (karbon), včetně vymřelých skupin.
Geologie Stavba Země, základní poznatky o Zemi Tektonika lito sférických desek Magmatismus a vulkanismus, vyvřelé horniny Vrstvy, zvrstvení, sedimentární horniny Metamorfóza, přeměněné horniny Vrásy, zlomy Zvětrávání, vznik půd Geologická činnost vody Krasové jevy Geologická činnost ledu, větru, člověka Vrstvy a souvrství, stratigrafické korelace Hlavní skupiny minerálů, krystalografické soustavy Rozdělení historie Země od prekambria do recentu Nejdůležitější vrásnění, datování Vznik a vývoj života během geologické historie Charakteristika jednotlivých geologických ér Stavba Českého masívu Karpatská soustava
