www.researchportal.be - 4 Feb 2016 13:23:22
Onderzoeksprojecten (1 - 50 van 391) Zoekfilter: Classificaties: Biotechnologie
Yield booster: ontrafeling van de moleculaire basis verantwoordelijk voor de biomassa-opbrengst van planten Universiteit Gent Abstract: Doelstelling van dit project is het ontrafelen van de moleculaire netwerken die verantwoordelijk zijn voor biomassa productie bij hogere planten. Arabidopsis en Branchypodium lijnen die meer biomassa produceren onder optimale en/of droogte stress condities zullen fenotypisch en moleculair vergeleken worden. Genen die opbrengst verhogen zullen gecombineerd worden. Organisaties: • Vakgroep Plantenbiotechnologie en Genetica
Onderzoekers: • Dirk Inzé
W&T-samenwerking Vietnam : Development of a plant-based veterinary oral vaccine to combat avian influenza in Vietnam. Vrije Universiteit Brussel Abstract: De virulente vogelgriepvirusstam H5N1 heeft zich verspreid in meer dan 40 landen in Azië, het Midden-Oosten, Europa en Africa en veroorzaakte reeds zeer grote financiële verliezen voor pluimveehouders. Transmissie van de H5N1 virusstam van vogels naar de mens gebeurt slechts zelden, maar de mortaliteit bij geïnfecteerde mensen is zeer hoog. Vaccinatie wordt als de belangrijkste maatregel beschouwd om een pandemie te voorkomen. Hoewel reeds verschillende types influenza vaccins bestaan, blijft er een grote nood voor ontwikkeling van betere vaccins, die goedkoper, gemakkelijker toe te dienen, gemakkelijker te stockeren, veiliger en doeltreffender zijn. Het doel van dit project is de ontwikkeling van een in planten aangemaakt, oraal toe te dienen vaccin voor gevogelte om vogelgriep in Vietnam te bestrijden. Daartoe zullen hemagglutinine genconstructen, gebaseerd op sequenties van H5N1 stammen uit Vietnam, in planten tot expressie gebracht worden onder controle van een zaadspecifieke promoter. De immuunrespons geïnduceerd door de antigenen die in zaad tot uitdrukking gebracht werden, en de mogelijkheid tot orale vaccinatie zullen geëvalueerd worden. Organisaties: • Plantengenetica • Toegepaste Biologische Wetenschappen
Onderzoekers: • GEERT ANGENON • Thanh Thu TRAN
W&T beurs N. Eloy (Brazilië) Universiteit Gent Abstract: Overexpressie van APC complex componenten leidt tot een toegenomen groeisnelheid in Arabidopsis. Binnen dit project zal de moleculaire en cellulaire basis van dit fenotype worden bepaald. Hiertoe zal doormiddel van kinematische analyses het effect op celdeling en celexpansie worden bepaald, zullen via TAP-tagging de interacterende proteïnen worden bepaald en met microarray studies de veranderingen in het transcriptoom. Organisaties: • Vakgroep Plantenbiotechnologie en Genetica
Onderzoekers: • Dirk Inzé
Werkingsmiddelen FWO-aspirant Siegfried Vlaeminck Universiteit Gent Abstract: De samenwerking tussen aërobe en anaërobe bacteriën in het OLAND-proces wordt bestudeerd. OLAND staat voor oxygen-limited autotrophic nitrification/denitrification. Dit proces verwijdert hoge concentraties ammonium uit afvalwater. Het onderzoeksproject zal focussen op het onderzoeken van de toepasbaarheid van nieuwe reactorypes, bijvoorbeeld met periodieke beluchting. Ook zal er fundamenteel werk verricht worden naar het metabolisme en de fysiologie van de anaërobe ammoniumoxiderende bacteriën. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Willy Verstraete
Werkingsmiddelen FWO-aspirant Peter Bruggeman Universiteit Gent Abstract: Het project omvat een theoretische studie van onderwaterplasma's. Het is daarbij de bedoeling om kennis te verwerven over de fysische mechanismen achter de plasmavorming en de tijdsevolutie van het plasma in een capillaire ontlading onder water. Werkingsmiddelen FWO-aspirant Peter Bruggeman. Organisaties: • Vakgroep Toegepaste fysica
Onderzoekers: • Christophe Leys • Jan Vierendeels
werkingsmiddelen FWO-aspirant Frederik Coppens Universiteit Gent Abstract: Op basis van microarray-analyses werden 51 onbekende genen geïdentificeerd die specifiek tot expressie komen in prolifererende cellen in zowel blad als wortel. Deze putatieve nieuwe regulatoren van het celdelingsproces zullen in het kader van dit project functioneel worden gecharacteriseerd. Hiervoor zullen transgene planten worden bestudeerd op fenotypisch en transcriptomisch niveau, waarna deze genen worden geplaatst in een functioneel celcyclus model. Organisaties: • Vakgroep Plantenbiotechnologie en Genetica
Onderzoekers: • Dirk Inzé
Voedselveiligheid. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Afdeling Bio-economie
Onderzoekers: • Erik Mathijs
Voedselketens en duurzame ontwikkeling. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Afdeling Bio-economie
Onderzoekers: • Miet Maertens
Vlaamse veldproef met genetisch gewijzigde Pi-resistente aardappelen Hogeschool Gent Abstract: De UGent, het ILVO, de VIB en de Hogeschool Gent werke samen aan een tweejarige veldproef in Vlaanderen met met genetisch gewijzigde Phytopthora infestans-resistente (Pi-resistente) aardappelen. Deze veldproef wil bijdragen tot de ontwikkeling van duurzaam Piresistente aardappelen voor de Vlaamse landbouw. Organisaties: • Departement Biowetenschappen en Landschapsarchitectuur • Vakgroep Plantaardige Productie
Onderzoekers: • Geert Haesaert
VIB-Rol van de AMPA sub-eenheid GluR2 in de pathogenese van ALS. Universiteit Antwerpen Abstract: Er zijn resultaten die aantonen dat excitotoxiciteit een rol speelt in de pathogenese van amyotrofe laterale sclerose (ALS). Excitotoxische dood van motorische neuronen wordt gemedieerd door de influx van Ca2+ via het AMPA-type van de glutamaat (Glu) receptor. De Ca2+ permeabiliteit van het AMPA receptor ionenkanaal wordt bepaald door de aanwezigheid van de GluR2 subeenheid: hoe meer GluR2 aanwezig is in het complex hoe lager de Ca2+ permeabiliteit is. Men kan dan ook verwachten dat hoe beter we de regulatie van de expressie van GluR2 begrijpen, hoe meer we weten van de pathogenese van ALS, en in het bijzonder over de oorzaak van de selectieve dood van de motorische neuronen in ALS. In dit project bestuderen we drie aspecten van de regulatie van GluR2 expressie. We onderzoeken het mechanisme van de gliale-neuronale regulatorische interactie. We onderzoeken de rol van VEGF in de GluR2 expressie in vitro en in vivo. En we evalueren de potentiële rol van GluR2 expressie niveaus in sporadische ALS door middel van genetische associatie studies met GluR2 promotor polymorfismen. Organisaties: • VIB DMG - Neurodegeneratieve Hersenziekten
Onderzoekers: • Christine Van Broeckhoven
VIB-Ophelderen van PGRN verlies van functie in neurodegeneratie. Universiteit Antwerpen Abstract: Dementie is de vierde voornaamste doodsoorzaak en beïnvloedt meer dan 30 miljoen individuen wereldwijd. De ziekte van Alzheimer (AD) en frontotemporale lobaire degeneratie (FTLD) zijn de twee meest voorkomende oorzaken van corticale dementie in het presenium. FTLD bestaat uit diverse vormen en het voornaamste type wordt gekarakteriseerd door inclusies van geübiquitineerde proteïnen aanwezig in neuronen en gliale cellen zowel in het cytoplasma als in de nucleus (waar deze typisch kat-oog vormig zijn). Dit type wordt FTLD-U (U voor ubiquitine) genoemd. Zeer recent werden mutaties die de vorming van een functioneel proteïne verhinderen, geïdentificeerd in het progranuline (GRN) gen als oorzaak van FTLD-U. Een proteïne genaamd TDP-43 werd eveneens onlangs geïdentificeerd als de voornaamste constituent van de neuronale en gliale inclusies. Zowel progranuline als TDP-43 zijn belangrijke proteïnen met vele functies, maar de exacte functie in de hersenen en in neurodegeneratie is nog niet gekend, net zoals de link tussen progranuline en TDP-43. Dit project heeft tot doel knockout en transgene muismodellen te ontwikkelen om te bestuderen hoe verlies van GRN proteïne neurodegeneratie kan veroorzaken en hoe het in verband kan gebracht worden met TDP-43 aggregatie. De aanwijzingen verkregen met deze diermodellen zullen ook belangrijk zijn om andere vormen van neurodegeneratie, zoals de ziekte van Alzheimer en amyotrofe laterale sclerose, te behandelen en/of te voorkomen. Organisaties: • VIB DMG - Neurodegeneratieve Hersenziekten
Onderzoekers: • Samir Kumar-Singh
VIB-Genetische Service Faciliteit: Ondersteuning Centrale Service Faciliteiten. Universiteit Antwerpen Abstract: De Genetische Service Faciliteit (GSF) werd opgericht als centrale faciliteit in het VIB - Departement voor Moleculaire Genetica om aan de onderzoekers verschillende genetische analyses aan te bieden via een robotica platform zoals DNA/RNA extracties, DNA sequentieanalyses, STR en SNP genotyperingen. Hiertoe beschikt de genetische faciliteit over Biomek FX en Biomek NX robotplatformen (Beckman) voor de automatisering van het samenstellen van PCR - reacties, drie "3730xl DNA analyzers" (Applied Biosystems) voor DNA sequentiebepaling en de analyse van microsatellieten, een SEQUENOM platform voor high throughput mass array spectrometrische SNP bepaling. De GSF beschikt eveneens over een 454 Life Sciences Genome Sequencer FLX voor ultra hoge doorvoer genoom sequentie analyses. Ook de isolatie van DNA en RNA uit verschillende bronnen en de aanmaak van EBV-getransformeerde cellijnen zijn gecentraliseerd in de GSF. Dankzij een geoptimaliseerd databanksysteem LIMS (Laboratory Information Management System) en GLP ("good laboratory practice") omgeving gebeurt de dataverwerking grotendeels automatisch en in optimale condities. De GSF voorziet eveneens capaciteit voor genetische services aan derden binnen de Universiteit van Antwerpen, maar ook binnen het VIB en extern. Gebruikers van binnen het VIB instituut krijgen via de financiële ondersteuning van de GSF als VIB GSF, DNA sequentie analyses aangeboden tegen marginale prijzen. Organisaties: • VIB DMG - Neurodegeneratieve Hersenziekten
Onderzoekers: • Jurgen Del-Favero • Christine Van Broeckhoven
Verbeterde generatie van humane iPS cellen via gerichte targeting van induceerbare en RMCE uitwisselbare herprogrammingsfactoren in de humane ROSA26 locus via ZFN Universiteit Gent Abstract: We beogen een verbeterde manier voor het genereren van humane iPS cellen door een gerichte targeting van dox-induceerbare en RMCE uitwisselbare herprogrammerings factoren (Yamanaka factors) in de humane ROSA26 locus door het gebruik van Zinc finger nuclease technologie Organisaties: • Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie
Onderzoekers: • Steven Goossens • Jody Haigh
Valorisatie van organische nevenstromen - Ontwikkeling van 2de generatie technologieën voor de biogebaseerde economie in Vlaanderen Universiteit Gent Abstract: Het project splitst zich op in 3 grote luiken: - de ontwikkeling van een databank van organische nevenstromen en technologische expertises beschikbaar in Vlaanderen; - de ontwikkeling van tweede generatie technologieën voor de transformatie van (afval)oliën en vetten en lignocelluloserijke nevenstromen naar basisgrondstoffen voor de bio-energie, chemie, papier, bouw, textiel,? - economische, logistieke en duurzaamheidsanalyses met het oog op reële implementatie in Vlaanderen. Organisaties: • Vakgroep Toegepaste biowetenschappen • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Wim Soetaert • Anita Van Landschoot • Ingeborg Stals
Validering van biomerkers SMRP en osteopontine bij longvlieskanker Universiteit Gent Abstract: Longvlieskanker of mesothelioom is een agressieve, asbest-gerelateerde kanker. Het gebruik van biomerkers voor mesothelioom in het beleid rond aan asbest blootgestelden kan zorgen voor betere en vroegere diagnose, screening in risicopopulaties, opvolgen van de therapierseepons, etc. In deze multicentrische studie van 600 deelnemers/patiënten, zullen SMPR en osteopontine, twee waardevolle biomerkers, verder gevalideerd worden, samen met de zoektocht naar andere potentiële biomerkers in mesothelioom. Organisaties: • Vakgroep Inwendige ziekten
Onderzoekers: • Jan Van Meerbeeck
Validatie van nieuwe cellulaire cofactoren voor retrovirale, nucleaire import en integratie KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Moleculaire Virologie en Gentherapie
Onderzoekers: • Zeger Debyser • Jan De Rijck • Caroline Weydert
Validatie van de geïnduceerde proteïne aggregatie technologie met de focus op calcineurine en onderzoek naar de rol van ascorbinezuur op de morfogenese van Candida albicans KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Afd. Molec. Microbiol. & Biotechnologie
Onderzoekers: • Patrick Van Dijck • Alessandro Fiori • Frédérique Van Hauwenhuyse
Uitvoeren van een gevarenanalyse voor migratie van chemische contaminanten uit drukinkten en lijmen (verpakking) naar levensmiddelen Universiteit Gent Abstract: Het doel van deze studie was om mogelijke migrerende componenten uit drukinkten/lijmen vanuit verpakkingsmaterialen te identificeren. Daarom werd een inventaris opgemaakt van de mogelijke chemische componenten die worden gebruikt als drukinkt/lijm gevolgd door een risicorangschikking. Voor diverse componenten werd het migratiepotentieel berekend door de toepassing van migratievoorspellende software in functie van type polymeer, dikte alsook initiële concentratie aan migrerende component. Organisaties: • Vakgroep Voedselveiligheid en Voedselkwaliteit
Onderzoekers: • Bruno De Meulenaer
Trichomen, de sleutel tot een verhoogde productie van artemisinine in Artemisia annua Universiteit Gent Abstract: In de trichomen produceert Artemisia annua L. kleine hoeveelheden artemisinine, werkzaam tegen malaria. De doelstelling is om genen te vinden die betrokken zijn in de biosyntheseweg van artemisinine en de trichoomvorming om zo tot A. annua cultivars te komen die meer artemisinine produceren of om gistcellen te modificeren zodat ze artemisinine produceren. Organisaties:
• Vakgroep Geneesmiddelenleer
Onderzoekers: • Dieter Deforce
Transplantatie van embryonale stamcel-afgeleide neurale stamcellen na ruggenmerg- en hersentrauma. Universiteit Antwerpen Abstract: In dit project stellen we als hypothese dat transplantatie van zeer specifiek gedefinieerde embryonale stamcel-afgeleide neurale stamcellen (ES-NSC), genetische gemodificeerd ter secretie van neurotrofe factoren, zal bijdragen tot versneld en/of verbeterd herstel na TBI en SCI. Dit versnelde en/of verbeterde herstel kan het gevolg zijn van: A) een verminderd secundair neuraal verlies door secretie van neurotrofe factoren, en/of B) een verhoogd neuraal herstel door functionele integratie van getransplanteerde ES-NSC en /of gerekruteerde endogene NSC. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)
Onderzoekers: • Philippe Jorens • Dirk Ysebaert • Dirk R Van Bockstaele • Peter De Deyn • Eric Van Marck • Zwi Berneman
Transplantatie van embryonale stamcel-afgeleide neurale stamcellen na ruggenmerg- en hersentrauma. Universiteit Antwerpen Abstract: In dit project stellen we als hypothese dat transplantatie van zeer specifiek gedefinieerde embryonale stamcel-afgeleide neurale stamcellen (ES-NSC), genetische gemodificeerd ter secretie van neurotrofe factoren, zal bijdragen tot versneld en/of verbeterd herstel na TBI en SCI. Dit versnelde en/of verbeterde herstel kan het gevolg zijn van: A) een verminderd secundair neuraal verlies door secretie van neurotrofe factoren, en/of B) een verhoogd neuraal herstel door functionele integratie van getransplanteerde ES-NSC en /of gerekruteerde endogene NSC. Organisaties: • Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)
Onderzoekers: • Peter Ponsaerts • Zwi Berneman
Transmembraan transport en proteïne fosforylatie in de regulatie van de cel Universiteit Gent Abstract: Dit project omvat drie delen: Eén, de ontwikkeling en het gebruik van fosfoproteomics in de studie van globale fosforylatie-patronen in gezonde en zieke cellen. Twee, de rol van fosfolipiden op de fosforylatie van actine-bindende eiwitten. Drie, TNF-geïnduceerde fosforylatie van het glyoxalase I affecteert de flux van metabole componenten van de glycolyse en signaleert dit gegeven naar een variëteit van cellulaire netwerken. Organisaties: • Vakgroep biochemie
Onderzoekers: • Joël Vandekerckhove • Jan Gettemans • Katia Vancompernolle • Kris Gevaert
Transgene Service faciliteit: ondersteuning kernfaciliteiten. Universiteit Antwerpen Abstract: De Transgenese Service Faciliteit (TgSF) is gestructureerd rond meerdere deelaspecten van de transgenese in muis en is werkzaam in het Specifiek Pathogeen Vrije (SPF) gedeelte van het animalarium van de Universiteit Antwerpen - CDE: productie van genetisch gewijzigde muizen via pronucleaire injectie, productie van knock-out en knock-in kloons via embryonale stamcellen, rederivatie van niet-SPF muizen en cryopreservatie van belangrijke muizenlijnen. Op het einde van 2007 werden alle activiteiten van de TgSF gestopt. Organisaties: • VIB DMG - Neurodegeneratieve Hersenziekten
Onderzoekers: • Christine Van Broeckhoven • Joseph Merregaert • Dirk Snyders
Traceerbaarheid en autocontrole van genetisch gemanipuleerde organismen in de voedermiddelenkolom Hogeschool Gent Abstract: Het voorliggende projectvoorstel heeft tot algemeen doel na te gaan hoe een GGO-autocontrolesysteem in de Belgische diervoedersector kan opgezet, verbeterd en geborgd worden. In deze context zullen de knelpunten in de huidige productiekolom en de randvoorwaarden voor een sluitende traceerbaarheid gedefinieerd worden. Dit omhelst onder meer de evaluatie van de huidige GGO-traceerbaarheid (b.v. haalbaarheid, betrouwbaarheid, controles, certificaten) doorheen de volledige productiekolom van de diervoeders (State-of-the-art). Het formuleren van bedrijfsspecifieke richtlijnen inzake de GGO-gecontroleerde productie van voedermiddelen biedt de producent de mogelijkheid tot autocontrole. Naast traceerbaarheid zal tevens de GGO-detecteerbaarheid doorheen de productiekolom onderzocht worden en dit zowel on-the-field door de producent (interne autocontrole) als in een volledig uitgerust laboratorium (externe autocontrole). Bijgevolg is het strikt noodzakelijk een optimalisatie en validatie door te voeren van beschikbare eiwitgebaseerde methodes (interne autocontrole) versus bestaande kwalitatieve én kwantitatieve DNA-gebaseerde GGO-analysemethodes (externe autocontrole). Bovendien zal de invloed van belangrijke productiestappen op de GGO-detecteerbaarheid onderzocht worden.Dit onderzoek zal uiteindelijk resulteren in een handleiding met richtlijnen met betrekking tot de ontwikkeling en implementatie van een geoptimaliseerd GGO-autocontrolesysteem in de voedermiddelenkolom. Organisaties: • Departement Biowetenschappen en Landschapsarchitectuur • Vakgroep Levensmiddelenwetenschappen en Technologie
Onderzoekers: • Kathy Messens • Ellen Vandeputte • Mia Eeckhout
Traceability of origin and authenticity of olive oil by combined genomic and metabolomic approaches
Universiteit Gent Abstract: Het toenemend belang van olijfolie is enerzijds te wijten aan het vetzuurprofiel en anderzijds de aanwezigheid van antioxidatieve polyfenolen. Het project houdt een vergelijkend onderzoek in betreffende de genomische eigenschappen en het metabolieten profiel om een duidelijke identificatie mogelijk te maken van de ongeveer 200 cultivars olijfsoorten in Zuid-Europa. Organisaties: • Vakgroep Duurzame Organische Chemie en Technologie
Onderzoekers: • Roland Verhé
Towards discovery and exploitation of novel marine-based bio-actives. KU Leuven Abstract: Marine biodiversity is far from being fully explored. The potential of the marine environment as a source of novel drugs holds great potential due to the specific physical and chemical conditions of the marine ecosystems.Through close cooperation between 6 SMEs, 5 academic partners and 5 research institutes, the SEAKING project will collect, isolate and classify marine organisms, ranging from sponges to seaweeds and marine bacteria and fungi, in an environmentally responsible manner, and prepare extracts from these organisms. The impact of SEAKING onenvironmental and societal aspects will be monitored by involving specific marine focus groups. The marine organisms and extracts thereofwill be included in various bio-resources banks and collections from SEAKING partners. Their sustainable use as well as access and benefit sharing aspects will be duefully managed. The extracts will be tested against a highly representative and diverse panel of high-throughput bioactivity assays, including Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Karin Thevissen
Towards a Latin America & Caribbean Knowledge based Bio-Economy (KBBE) in partnership with Europe Universiteit Gent Abstract: Globaal wordt gestreefd naar duurzame voedsel- en energievoorziening, en industriële productie op basis van hernieuwbare grondstoffen. Deze bio-gebaseerde economie is van belang voor geindustrialiseerde landen maar ook voor groei- en ontwikkelingslanden. In dit project beogen organisaties van de EU en Latijns Amerika concrete samenwerkingsvoorstellen te formuleren voor toepassingen van de bio-economie relevant voor Latijns-Amerika. Organisaties: • Vakgroep Plantenbiotechnologie en Genetica
Onderzoekers: • Ivan Ingelbrecht
To the roots of induced systemic resistance in the Arabidopsis-Trichoderma-Fusarium tripartite interaction (To the roots of ISR). KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Centr. Microbiële en Plantengenetica
Onderzoekers: • Bruno Cammue
The six-member Candida albicans general amino-acid permease family-transporters and tranceptors KU Leuven Abstract: Wetenschappelijke samenvatting De laatste jaren is gekarakteriseerd door een sterke toename in het aantal schimmel infecties bij de mens. De meeste infecties worden veroorzaakt door Candida albicans, een schimmel die normaal bij de meeste personen als commensaal aanwezig is. Bij personen met een verzwakt immuunsysteem kan deze schimmel echter leiden tot een waaier aan verschillende ziektepatronen, gaande van cutaan, subcutaan tot systemisch. Heel wat onderzoekers zijn op zoek naar nieuwe doelwitten voor antimycotica. Deze doelwitten zijn preferentieel essentieel voor de overleving en specifiek voor de schimmel. Een localisatie ter hoogte van de celmembraan of celwand is ook interessant daar de drugs dan niet in de cel zelf moeten geraken. C. albicans kan in bijna elke niche van de gastheer groeien. Dit betekent dat hij de omgeving waarin hij zich bevindt goed moet kunnen voelen. Het kunnen detecteren van suikers en aminozuren is hierbij belangrijk daar dit een idee kan geven van waar i Organisaties: • Afd. Molec. Microbiol. & Biotechnologie
Onderzoekers: • Patrick Van Dijck
The Role of Trehalose and 2-deoxyglucose-6-phosphate Phosphatases (DOG)in Candida albicans Stress Tolerance KU Leuven Abstract: Trehalose is a disaccharide composed of two molecules of glucose. It isvery common in bacteria and fungi and it is the blood sugar in insects.Trehalose levels have been shown to correlate very well with cellular stress resistance in a variety of organisms and developmental stages. Thetrehalose-6-phosphate phosphatase (encoded by the TPS2 gene) catalizes the last step in trehalose synthesis in most organisms and when deleted in the human pathogen Candida albicans the strain turned out to be strongly affected in stress tolerance and in virulence. Nevertheless, there is still a considerable amount of trehalose accumulated by a tps2?/tps2?mutant, which may be the reason why this mutant is not completely avirulent. A possible explanation for these observations is that unspecific sugar phosphatases take over the function of the Tre6P phosphatase in a tps2 mutant. In Saccharomyces cerevisiae there are two candidates to fulfill this function, DOG1 and DOG2, encoding a 2deoxyglucose-6-phospha Organisaties: • Afd. Molec. Microbiol. & Biotechnologie
Onderzoekers: • Patrick Van Dijck • N. N.
The role of the G-protein coupled receptor in methionine-induced morphogenesis in C. albicans. KU Leuven
Abstract: I will investigate which receptors, transporters and possibly transceptors are important in the methionine induced morphogenesis in the opportunistic pathogen Candida albicans. Therefore I will study if methionine transport is necessary for this process or not. I will further investigate the receptor Gpr1, which is thought to be a receptor for methionine and which is known to be of high importance for methionine induced filamnetation. I will also test whether all my findings are relevant for in vivo systems, by testing my interesting deletion and mutation strains in a mouse tail vein injection model for disseminated candidiasis and a macrophage interaction assay. Organisaties: • Afd. Molec. Microbiol. & Biotechnologie
Onderzoekers: • Patrick Van Dijck • Sanne Schrevens
Thermofiele consortia voor stikstofverwijdering: transpositie van natuurlijke rijkdom naar biotechnologie Universiteit Gent Abstract: Dit onderzoek focust op de verwijdering van schadelijk ammonium uit afvalwater door conversie tot schadeloos stikstofgas, dat in de atmosfeer vrijkomt. Ten opzicht van de gevestigde mesofiele temperatuurscondities, wordt biotechnologie op thermofiele temperatuur verondersteld verschillende voordelen te hebben: hogere stabiliteit, snellere reacties, lagere slibproductie en betere hygiënisatie. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Nico Boon
Terugkijken in de toekomst: ancestrale reconstructie als een strategie voor enzyme engineering Universiteit Gent Abstract: Hedendaagse enzymen vertonen vaak niet meer voldoende plasticiteit om serieus aan hun substraatsvoorkeur te gaan sleutelen. Daarom zal in dit project gebruik worden gemaakt van een progenitor om nieuwe specificiteiten te creëren. Zo?n ancestrale sequentie zou zich moeten gedragen als een pluripotente stamcel die nog in staat is om verschillende gespecialiseerde taken op zich te nemen. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Tom Desmet
Terugkeermandaat LAROY Wouter Universiteit Gent Abstract: De in deze vakgroep ontwikkelde DSA-FACE techniek voor de gevoelige analyse van glycanen met hoge doorvoer, wordt verder geoptimaliseerd en toegepast. Aanpassing van het werkplatform naar meer moderne apparatuur en de mogelijkheid van analyse van meerder glycaantypes zijn mogelijke aanvullingen. Toepassingen zijn te zoeken in de diagnostiek. In eerste instantie worden glycaanveranderingen bij leverziekten, borstkanker, alzheimer en inflammatie onderzocht. Organisaties: • Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie
Onderzoekers: • Roland Contreras
Technologische Dienstverlening (TD) industriële biotechnologie Universiteit Gent Abstract: Voor verscheidene bedrijven zijn de mogelijkheden die industriële (witte) biotechnologie kan bieden inzake productieverhoging, kostenverlaging, verlaagde milieuimpact ed. onvoldoende gekend. De voornaamste projectdoelstelling is innovaties mogelijk maken in bedrijven door adviesverlening bij gebruik van witte biotechnologie in producten en processen. De tweede doelstelling is de creatie van een 'kennismakelaarsfunctie' door de TD-adviseur tussen Vlaamse bedrijven en kenniscentra om een link tussen vraag en aanbod te leggen. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Wim Soetaert
Systeembiologie, chemical genomics en endomembraan traffiek Universiteit Gent Abstract: Het bezoek van N. Raikhel zal bijzonder waardevol zijn om de link te bestendigen tussen de technologieplatforms in PSB zoals chemical genomics, functional genomics en functional proteomics met de platforms in Prof. Raikhel's labo. Door onze kennis te combineren zal er toegevoegde waarde worden gecreëerd voor de Universiteit Gent wat zal leiden tot high impact publicaties tussen de twee universiteiten. Dit zal ook de aanzet zijn tot een langdurige samenwerking tussen beide instituten. Organisaties: • Vakgroep Plantenbiotechnologie en Genetica
Onderzoekers: • Jiri Friml
Sunlight Hoogwaardige lipiden en hernieuwbare energie uit microalgen Universiteit Gent Abstract: Sunlight heeft tot doel om nieuwe biologische hulpbronnen en technologieën voor de cultuur van microalgen in gesloten fotobioreactoren te creëren en valideren. Het project bouwt voor top de ruime kennis van de levensloop en de moleculaire biologie van diatomeeën en expertise op vlak van productie van microalgen, analyse van lipiden en productie van bio-energie. Parallel wordt een economische analyse uitgevoerd van het toekomstige potentieel van producten en technologieën gebaseerd op kiezelwieren, meer in het bijzonder hun inzetbaarheid in de strijd tegen vervuiling via een geïntegreerde economische levenscyclus. Organisaties: • Directie Onderzoeksaangelegendheden
Onderzoekers: • Willy Verstraete • Dirk Inzé • Wim Vyverman
• Johan Albrecht • Koen Sabbe • Greta Van Eetvelde
Sucrose synthase als kosteneffectief middel in glycosyleringsreacties Universiteit Gent Abstract: Centraal in dit project staat de glycosyltransferase sucrose synthase, dat ingezet wordt om dure nucleotide geactiveerde suikerdonoren te recyleren die nodig zijn om organische moleculen te glycosyleren met glycosyltransferasen. Door enzyme engineering wordt een verbeterde versie van het sucrose synthase bekomen. Na optimalisatie wordt getracht om het kosteneffectief proces op te schalen zodat de geglycosyleerde moleculen commercieel kunnen worden aangeboden. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Tom Desmet
Sucrose synthase als biokatalysator voor de productie van nucleotide suikers Universiteit Gent Abstract: Glycosyltransferasen zijn uiterst efficiënte enzymen, maar vereisen wel heel dure nucleotide suikers als glycosyl donor. Het huidig project wil dit probleem oplossen door deze componenten te produceren vanuit sucrose (en analogen) als goedkoop en reactief substraat, met behulp van (gemuteerd) sucrose synthase as biokatalysator. Organisaties: • Vakgroep Biochemische en microbiele technologie
Onderzoekers: • Tom Desmet
Study of microbiological applications for real-time PCR Hogeschool Gent Abstract: De laatste jaren doen moleculair biologische technieken en real-time PCR in het bijzonder, hun intrede in het onderzoek naar de diagnostiek van pathogene micro-organismen. In het Laboratorium voor Bacteriologie Research (LBR) van de Vakgroep Klinische Microbiologie, Immunologie en Microbiologie (Faculteit Geneeskunde, UGent) werden voor onderzoeksdoeleinden unieke protocollen op punt gesteld met real-time PCR voor de identificatie van verschillende bacteriële soorten. Toestellen die hiervoor gebruikt werden zijn de LightCycler (Roche) en de ABI7000 (Applied Biosystems). Dit onderzoeksproject beoogt een vergelijkende studie van de verschillende real-time PCR-toestellen en detectietechnologieën die in medische laboratoria gebruikt worden zodat de effectieve implementatie van de hierboven vermelde ontwikkelde protocollen in routine laboratoria mogelijk wordt (deelproject 1). Daarnaast zal de real-time PCR-technologie voor enkele klinisch relevante kiemen, waarvoor tot op heden nog geen real-time PCR-protocol ontwikkeld werd, op punt gesteld worden (deelproject 2). Implementatie in de routine bacteriologie van die formats, waarvoor we kunnen aantonen dat ze een verbetering van de huidige diagnostiek met zich meebrengen, is de uiteindelijke doelstelling van deze samenwerking. Dit onderzoeksproject biedt een antwoord op een actuele vraag van een uitgebreid werkveld en laat toe dat studenten van de opleiding Biomedische Laboratoriumtechnologie via practica en scripties participeren aan technologisch onderzoek dat representatief is voor hun toekomstig werkterrein. Het biedt docenten van deze opleiding de mogelijkheid tot professionaliseren en tot actualiseren van verschillende opleidingsonderdelen. De expertise die opgebouwd wordt door het opdoen van directe praktische ervaring met verschillende aspecten van deze toegepaste biomedische hedendaagse technologie kan het departement en de Hogeschool Gent ten goede kan komen via dienstverlening. Organisaties: • Departement Gezondheidszorg Vesalius • Vakgroep Biomedische - en exacte wetenschappen
Onderzoekers: • Ellen Decat • Stefan Vermeulen • Els Van Mechelen
Studie van ubiquitinatie van sleuteleiwitten in de jasmonaatsignaaltransductiecascades van de modelplant Arabidopsis thaliana Universiteit Gent Abstract: We gaan E3 Ubiquitine ligases die mogelijks betrokken zijn in jasmonaatsignalisatie in de modelplant Arabidopsis thaliana bestuderen. We beogen (1) de eigenlijke substraten te identificeren, (2) mechanistisch inzicht te verwerven in hun eigen regulatie, en hun interactie met en ubiquitinatie van de substraten, en (3) Arabidopsis planten met gewijzigde expressie van de deze E3 Ub ligases fenotypisch te karakteriseren om zo hun precieze role op plantenniveau te bepalen. Organisaties: • Vakgroep Plantenbiotechnologie en Genetica
Onderzoekers: • Alain Goossens
Studie van transitieve en systemische posttranscriptionele gensilencing in planten Universiteit Gent Abstract: Om het proces van transitieve en systemische silencing te ontrafelen, wordt de invloed van de expressieniveaus van het RNA afhankelijk RNA polymerase onderzocht. Ook wordt de graad van silencing vergeleken bij gebruik van verscheidene silencing inducers (sense transgen- en hairpin loci), en van primaire en secundaire targets (transgenen versus endogenen). Verder wordt de mate van spreiding van silencing onderzocht. Organisaties: • Vakgroep Plantenbiotechnologie en Genetica
Onderzoekers: • Anna Depicker
Studie van strigolactonsignalisatie door middel van chemische genetica Universiteit Gent
Abstract: Strigolactonen zijn fytohormonen met een economisch belang, maar waarover moleculair inzicht van hun werkingsmechanisme ontbreekt. We zullen chemische genetica in Arabidopsis gebruiken om het moleculaire mechanisme van strigolacton signalisatie te ontrafelen. Door de identificatie van chemische moleculen en hun doelwiteiwitten zullen we nieuwe inzichten verwerven over hoe de strigolactonsignalisatie werkt. Organisaties: • Vakgroep Plantenbiotechnologie en Genetica
Onderzoekers: • Tom Beeckman • Sofie Goormachtig
Studie van stamcelculturen op een digital microfluidisch platform. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Afdeling MeBioS
Onderzoekers: • Jeroen Lammertyn • Jan Schrooten • Federica Toffalini
Studie van nucleaire receptor-gebaseerde cross-talk mechanismen in de strijd tegen inflammatie Universiteit Gent Abstract: Als strategie om de glucocorticoïd (GC)-geassocieerde neveneffecten bij anti-inflammatoire therapieën te vermijden, ligt de focus van mijn werk zowel op de ontrafeling van fundamentele Glucocorticoïde Receptor (GR)-gemedieerde transrepressiemechanismen als op een mechanistische studie van de werking van niet-steroïdale gedissocieerde GR liganden. Hiernaast bestudeer ik de toepasbaarheid van een alternatieve manier om een verbeterde therapeutische response te bereiken en dat is via een duale nucleaire receptor activatie. Dit houdt in dat we combinatieschema?s opstellen waarbij GR agonisten gecombineerd worden met peroxisoom proliferator-geactiveerde receptor agonisten. Organisaties: • Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie
Onderzoekers: • Jan Tavernier
Studie van methylglyoxaal-afgeleide "Advanced Glycation End products" in Tumor Necrosis Factor-geinduceerde celdood Universiteit Gent Abstract: Methylglyoxaal (MG) is een cytotoxisch bijprodukt van de glycolyse en wordt normaal getoxifieerd door het glyoxalase systeem. Recente resultaten bekomen in onze onderzoeksgroep tonen aan dat de gefosforyleerde vorm van glyoxalase I, rechtstreeks of onrechtstreeks, de toxische effecten van MG medieert via de vorming MG-afgeleide AGEs op op specifieke moleculen. De doelstelling is deze moleculen te identificeren en hun functionele rol na te gaan in celdood. Organisaties: • Vakgroep biochemie
Onderzoekers: • Joël Vandekerckhove
Studie van het verouderingsproces: de rol van N-glycosylatie, hormonen en het Klotho gen. Universiteit Gent Abstract: N-glycosylatie fluctueert tijdens het verouderen. Specifieke glyco-genen zijn hiervoor verantwoordelijk. Wij willen de gen-expressie regulatie van deze glyco-genen onderzoeken adhv in silico analyze en functionele promoter studies. Daarnaast willen we nagaan hoe Nglycosylatie fluctuaties het verouderingsproces en verouderings gerelateerde signalisatiewegen beïnvloeden. Dit zal onderzocht worden in vitro (hepatocyten) en in vivo (muizen). Organisaties: • Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie
Onderzoekers: • Claude Libert
Studie van een "Membrane Associated Guanylaat Kinase" (MAGUK) eiwit in de signalisatie naar celdood Universiteit Gent Abstract: Tumor Necrosis Factor is een potent anti-kanker agens en de molecule bij uitstek om het moleculair mechnaisme te ontrafelen van hoe een kankercel op een efficiënte manier kan afgedood worden. Recent werden in onze onderzoeksgroep een aantal moleculen geïdentificeerd die zouden betrokken zijn in dit celdood proces. De doelstelling van dit doctoraatsproject is het functioneel belang van één van deze moleculen te achterhalen in TNF-geïnduceerde celdood. Organisaties: • Vakgroep biochemie
Onderzoekers: • Joël Vandekerckhove • Katia Vancompernolle
Studie van de interacties tussen alfa-synucleïne en ATP13A2, twee eiwitten gelinkt met de ziekte van Parkinson. KU Leuven Abstract: Geen Nederlandstalig Abstract Organisaties: • Onderzoeksgr_Neurobio_en Gentherapie
Onderzoekers: • Patrizia Agostinis • Veerle Baekelandt • Peter Vangheluwe
Studie van de functie van progranuline in frontaalkwab dementie via cellulaire en muismodellen. Universiteit Antwerpen
Abstract: Dit doctoraatsproject heeft als doel de rol van progranuline (PGRN) te bestuderen in FTD met behulp van zowel in vitro experimenten als in vivo muismodellen. In vitro zal door middel van RNA interferentie (RNAi) bestudeerd worden of een verminderde expressie van PGRN leidt tot verminderde overleving van gecultiveerde neuronale cellen en primaire neuronen. Voor de in vivo experimenten zal een progranuline constitutief en conditioneel knock-out muismodel ontwikkeld worden. Met deze muizen willen we bestuderen wat de exacte functie van progranuline in de hersenen is en hoe verlies van PGRN specifieke neurodegeneratie in de frontale kwab van de hersenen veroorzaakt. Tenslotte zullen eveneens primaire neuronale culturen afkomstig van verschillende regio's van muishersenen ex vivo bestudeerd worden om het PGRN expressiepatroon te onderzoeken en op te helderen waarom verlies van PGRN meer kritiek is voor neuronen in de voorste hersenregio's. Organisaties: • VIB DMG - Neurodegeneratieve Hersenziekten
Onderzoekers: • Christine Van Broeckhoven • Samir Kumar-Singh • Hans Wils
