Laporan Tahun Penanggung Jawab Sutrisno. Redaksi Harnoto Asadi Budihardjo Soegiarto Karden Mulya ISSN Alamat

Laporan Tahun 2006

Penanggung Jawab Sutrisno Redaksi Harnoto Asadi Budihardjo Soegiarto Karden Mulya

ISSN 08252-6699

Alamat Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian Jl. Tentara Pelajar 3A, Bogor 16111 Tel. (0251) 337975, 339793 Faks. (0251) 338820

Kata Pengantar Peningkatan produktivitas pertanian, di samping pengentasan kemiskinan dan pelestarian lingkungan hidup, tetap menjadi salah satu isu sentral dalam pembangunan pertanian. Untuk itu, peningkatan produktivitas pertanian menjadi sasaran utama Badan Litbang Pertanian dalam pengembangan teknologi pertanian. Salah satu upaya pencapaian sasaran tersebut adalah menempatkan penelitian bioteknologi dan pengelolaan sumber daya genetik menjadi salah satu subprogram penelitian dan pengembangan pertanian. Tugas ini diemban oleh Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian (BB-Biogen). BB-Biogen dibentuk pada tahun 2003 berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pertanian Nomor 631/Kpts/OT.140/12/2003 dengan tugas melakukan/melaksanakan penelitian dan pengembangan bioteknologi serta pengelolaan plasma nutfah pertanian. Institusi ini merupakan hasil reorganisasi dari Balai Penelitian Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian (Balitbiogen). Laporan ini merupakan bagian dari upaya peningkatan akuntabilitas kegiatan dan sosialisasi hasil penelitian dan pengembangan di BB-Biogen. Laporan terdiri atas 5 Bab, pada Bab I dikupas kondisi umum, rencana stratejik, dan ruang lingkup laporan. Bab II berisikan status dan capaian dalam pengelolaan sumber daya institusi yang meliputi sumber daya manusia, fasilitas, dan keuangan. Bab III menguraikan secara singkat hasil penelitian unggulan, dan Bab IV berisikan hasil kajian kebijakan yang terkait dengan penerapan bioteknologi dan pengelolaan sumber daya genetik. Pada Bab V disajikan kegiatan diseminasi hasil penelitian dan pengembangan yang dilakukan oleh BB-Biogen. Besar harapan kami laporan ini dapat dijadikan sebagai salah satu bahan pertimbangan dalam pengambilan kebijakan penelitian dan pengembangan pertanian, khususnya bioteknologi dan sumber daya genetik pertanian.

Bogor,

November 2007

Kepala Balai,

Dr. Sutrisno NIP. 080.037.734

iii

Daftar Isi halaman Kata Pengantar …………………………………………………………….……………………..

iii

Daftar Isi …………………………………………………………….……………….....................

v

Daftar Tabel …………………………………………………………….………………...............

vii

Daftar Gambar ……………………………………………………….………………..................

ix

Daftar Lampiran …………………………………………………….………………....................

xi

I.

Pendahuluan ………………………………………………..……….…………..................

1

Kondisi Umum ……………………………….…………..…..……….................................

1

Pengelolaan Sumber Daya Institusi ……………………………………………………...

3

Sumber Daya Manusia ……………………………….…………..…..………....................

3

Fasilitas …………………………………………………………….………………………..

5

Keuangan ………………………………………………..……….………….......................

10

Kegiatan Penelitian …………………………………………………..……………………

13

Program Pengkayaan, Pengelolaan, Pemanfaatan, dan Pelestarian Sumber Daya Genetik Pertanian ...............................................................................................................

13

Program Pemanfaatan Kultur In Vitro untuk Perbanyakan Tanaman, Perbaikan Varietas, dan Produksi Senyawa Metabolit Sekunder ...................................................

29

Program Rekayasa dan Pemanfaatan Teknik Biologi Molekuler dan Rekayasa Genetik untuk Perbaikan Tanaman dan Ternak ............................................................

31

Kebijakan Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik Pertanian ….................................

41

Pengelolaan Sumber Daya Genetik Tanaman untuk Pangan dan Pertanian ……….

41

Pelestarian dan Pemanfaatan Sumber Daya Genetik Tanaman …………..................

43

Pengembangan Database Plasma Nutfah Tanaman Pangan .......................................

44

Pengembangan Database Plasma Nutfah Mikroba Pertanian .....................................

51

Keamanan Hayati dan Keamanan Pangan Produk Rekayasa Genetik ……………...

52

Bioetika ……………………………………………………………………………………..

56

Diseminasi Hasil Penelitian dan Pelayanan Informasi ……..................................…....

57

Publikasi …………………………………………………………………………………….

57

Seminar ……………………………………………………………………………………..

59

Pameran Partisipatif ………………………………………………………………………

65

Pameran Koordinatif …………………………………………………………...................

65

Demplot …………………………………………………………………………………….

66

II.

III.

IV.

V.

v

Daftar Tabel halaman Tabel II.1.

Keragaan SDM BB-Biogen 2006 ..............................................................................

3

Tabel II.2.

Rekapitulasi jumlah kepakaran peneliti BB-Biogen secara umum tanpa melihat usia ...............................................................................................................

3

Tabel II.3.

Keikutsertaan peneliti BB-Biogen pada pertemuan ilmiah di luar negeri pada TA 2006 .............................................................................................................

4

Tabel II.4.

Daftar pemanfaatan fasilitas tanah dan bangunan ………………………..........

5

Tabel II.5.

Kendaraan roda empat dan roda dua yang dikelola BB-Biogen pada tahun 2006 .............................................................................................................................

6

Tabel II.6.

Jenis dan ruang lingkup pekerjaan laboratorium BB-Biogen ............................

6

Tabel II.7.

Data luas kebun percobaan BB-Biogen dan lokasinya .......................................

7

Tabel II.8.

Jenis dan jumlah penambahan peralatan dan barang TA 2006 ........................

7

Tabel II.9.

Alokasi dan realisasi anggaran TA 2006 ................................................................. 11

Tabel III.1. Plasma nutfah padi toleran terhadap keracunan Al, Tamanbogo, MH 2006 .... 14 Tabel III.2. Penampilan plasma nutfah jagung yang agak toleran terhadap keracunan Al pada lahan kering masam, KP Tamanbogo, MH 2006 ........................................ 15 Tabel III.3. Plasma nutfah padi yang toleran terhadap keracunan Fe, KP Tamanbogo, MT 2006 ...................................................................................................................... 16 Tabel III.4. Plasma nutfah padi tahan penyakit HDB Grup IV dan VIII (skor 1) di Kebun STPP Bogor, MH 2006 ............................................................................................... 17 Tabel III.5

Plasma nutfah sorgum yang mempunyai kandungan amilosa tinggi (>37%)

19

Tabel III.6. Plasma nutfah kacang hijau dengan kandungan protein >25% ....................... 20 Tabel III.7. Distribusi kandungan pati pada 25 aksesi plasma nutfah ubi jalar ................... 21 Tabel III.8. Distribusi kandungan pati pada plasma nutfah ubi kayu .................................... 21 Tabel III.9. Plasma nutfah ubi kayu yang mempunyai kandungan pati >60% .................... 21 Tabel III.10. Plasma nutfah ubi kayu yang mempunyai kandungan HCN tinggi ................... 22 Tabel III.11. Distribusi kandungan pati pada plasma nutfah gembili dan ubi kelapa .......... 22 Tabel III.12. Plasma nutfah gembili dan ubi kelapa yang mempunyai kandungan pati >60% .......................................................................................................................... 22 Tabel III.13. Hasil biji galur-galur kedelai tahan SSV di Wonosari, Bogor, dan Lampung ... 24 Tabel III.14. Banyaknya buah, diameter buah, bobot buah, serta banyaknya biji rata-rata dari galur tomat transgenik bersama tanaman asalnya pada bulan ketiga, FUT, BB-Biogen ......................................................................................................... 27 Tabel III.15. Galur terpilih berdasarkan penampilan fenotipik di lapang, Sukamandi, MK 2006 ............................................................................................................................. 35

vii

Tabel IV.1. Jumlah aksesi plasma nutfah tanaman pangan tahun 2006 ............................

45

Tabel IV.2. Perkembangan pengelolaan data plasma nutfah tanaman pangan tahun 2002-2006 ................................................................................................................. 46 Tabel IV.3. Status entri data komputerisasi komoditas mikroba tahun 2006 ...................... 52 Tabel V.1. Naskah yang dimuat pada Prosiding Seminar Nasional Pemanfaatan Bioteknologi untuk Mengatasi Cekaman Abiotik pada Tanaman ................... 58

viii

Daftar Gambar halaman Gambar II.1.

Diagram alokasi dan realisasi anggaran per jenis belanja TA 2006 .............. 11

Gambar III.1. Penampilan galur kedelai tahan SSV pada stadia pengisian polong dan stadia masak, Wonosari, Yogyakarta, MK 2006 ............................................... 23 Gambar III.2. Penampilan galur kedelai tahan SSV pada stadia pembungaan dan pengisian polong di Bogor .................................................................................. 23 Gambar III.3. Penampilan galur tahan SSV di lahan masam Tamanbogo, Lampung ....... 24 Gambar III.4. Pengaruh kuantitas formula feromon terhadap daya tarik/tangkap imago jantan Spodoptera exigua pada bawang merah ............................................. 25 Gambar III.5. Pengaruh jenis perangkap terhadap jumlah imago jantan yang tertangkap ......................................................................................................................... 26 Gambar III.6. Irisan melintang buah tomat transgenik dan kontrol .....................................

27

Gambar III.7. Dendrogram hasil analisis virus gemini dari delapan daerah yang berbeda ....................................................................................................................... 29 Gambar III.8 Pembelahan sel asal protoplas dan pembentukan agregat sel IR64 pada media cair MS + kinetin 0,3 mg/l + AgNO3 3 mg/l + sukrosa 1% + manitol 0,5 M ........................................................................................................ 30 Gambar III.9. Penampakan protoplas IR64 dan O. officinalis sebelum fusi, dan beberapa fusan antara kedua jenis protoplas ................................................. 30 Gambar III.10. Dendogram yang dihasilkan dari 96 aksesi padi mggunakan 30 marka SSR dengan program PowerMarker ................................................................. 32 Gambar III.11. Keragaan 96 nomor aksesi plasma nutfah padi di Cikembar, Sukabumi, pada umur tanaman 5 minggu setelah tanam ................................................ 32 Gambar III.12. Keragaan tanaman tahan (a) dan peka (b) pada pengujian lapang di Cikembar, Sukabumi, pada saat fase anakan maksimum (kurang lebih umur tanaman 4 bulan setelah tanam) ............................................................ 33 Gambar III.13. Pola polimorfisme 7 marka SSR pada 24 genotipe kedelai ........................... 34 Gambar III.14. Fragmen-fragmen DNA dari PCR menggunakan primer-primer spesifik untuk Xa4, Xa7, dan Xa21 .................................................................................. 36 Gambar III.15. Composite Interval Mapping gen Pir4 (introgresi dari O. rufipogon) dan Pir7 (introgresi dari IR64) pada populasi BC5F2 dibandingkan dengan pada populasi BC2F2 ............................................................................................ 37 Gambar III.16. Penampilan galur haploid ganda terhadap serangan penyakit blas di lahan petgani di Sukabumi pada musim tanam tahun 2006 ......................... 38

ix

Gambar III.17. Hasil konfirmasi keberadaan fragmen gen OsWRKY76 pada plasmid pGEM-T easy yang dipotong dengan enzim BamHI dan SalI, menghasilkan fragmen dengan ukuran +3.000 bp (fragmen pGEM-T Easy) dan 1.200 bp (fragmen OsWRKY76 sampel nomor 1, 2, 4, dan 5). Sampel nomor 3 dan 6 menghasilkan ukuran fragmen yang tidak sesuai ................ 39 Gambar III.18. Hasil konfirmasi dari 2 sampel plasmid untuk mengetahui keberadaan gen kimera (promoter 35S, gen OsWRKY76, dan terminator 35S) pada plasmid biner pCAMBIA 1301, dengan menggunakan 2 cara pemotongan (a) pCAMBIA 1301 rekombinan dipotong dengan menggunakan enzim restriksi EcoRI menghasilkan produk hasil pemotongan dengan ukuran 210, 710, 1040, dan 11000 bp, dan (b) pCAMBIA rekombinan dipotong menggunakan 3 enzim restriksi HindIII, BamHI dan SalI, menghasilkan produk dengan ukuran 550, 1200, dan 11200 bp ............................................ 39 Gambar III.19. Skema konstruk 35S::OsWRKY76 dalam vektor biner pCAMBIA 1301 dengan situs pemotongan enzim restriksi, dan ukuran dari masingmasing fragmen ................................................................................................... 40 Gambar III.20. Hasil amplifikasi 5 sampel DNA Nipponbare dengan primer spesifik untuk gen OsWRKY76 ......................................................................................... 40 Gambar IV.1. Rapat Kerja Komisi IV DPR-RI dengan Menteri Pertanian dan Menteri Luar Negeri pada tanggal 9 Februari 2006 ....................................................... 42 Gambar IV.2. Rapat Paripurna ke-23 DPR-RI pada tanggal 28 Februari 2006 .....................

42

Gambar IV.1. Tampilan cover luar (menu utama) SIPNP v1.5 plasma nutfah tanaman pangan ................................................................................................................... 51 Gambar IV.2. Tampilan cover dalam (menu database plasma nutfah) SIPNP v1.5 plasma nutfah tanaman pangan ....................................................................... 51 Gambar V.1. Demplot Feromon-Exi di areal pertanaman bawang merah Brebes, Jawa Tengah ................................................................................................................... 68

x

Daftar Lampiran halaman Lampiran V.1. Daftar institusi penerima publikasi BB-Biogen ................................................. 69 Lampiran V.2. Artikel ilmiah para peneliti yang dipublikasikan tahun 2006 .......................... 70 Lampiran V.3. Daftar naskah Jurnal Agrobiogen Volume 2 Nomor 1 dan Nomor 2 ............. 73 Lampiran V.4. Daftar naskah Buletin Plasma Nutfah Volume 12 Nomor 1 dan Nomor 2 .... 74 Lampiran V.5. Seminar rutin BB-Biogen periode tahun 2006 ................................................... 75 Lampiran V.6. Daftar penelitian yang diseminarkan pada Seminar Hasil Penelitian TA 2005 ......................................................................................................................... 77 Lampiran V.7. Kertas kerja yang dipresentasikan pada International Seminar on the Status and Prospect of Modern Agricultural Biotechnology: Research, Regulation and Intelectual Property Rights ....................................................... 78 Lampiran V.8. Penelitian bioteknologi modern bidang pertanian di beberapa institusi ..... 79 Lampiran V.9. Keikutsertaan BB-Biogen dalam pameran yang dikoordinir/diselenggarakan Badan Litbang Pertanian ...................................................................... 80

xi

Laporan Tahun 2006 Hak Cipta © 2007, BB-Biogen

LAPORAN TAHUNAN BB-BIOGEN 2006

I. Pendahuluan KONDISI UMUM Departemen Pertanian melalui Badan Litbang Pertanian telah menetapkan bidang bioteknologi ke dalam kelompok prioritas tinggi yang perlu dilakukan melalui penyusunan dan pelaksanaan program penelitian yang terarah dan sistematis. Penelitian bioteknologi memerlukan fasilitas dan dana penelitan yang relatif mahal. Namun demikian, Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian (BBBiogen) tetap diharapkan dapat berperan dalam mendukung pembangunan pertanian ke arah tercapainya pertanian unggul. Untuk itu, BB-Biogen harus mampu menghasilkan teknologi terobosan, baik untuk mengatasi kendala yang dihadapi maupun untuk menciptakan peluang baru dalam usaha tani dan industri pertanian. Untuk dapat mewujudkan harapan tersebut, perlu dilakukan pengembangan kemampuan rekayasa genetik, peningkatan kemampuan laboratorium serta pengembangan dan pembinaan kerja sama dengan sektor lain. BB-Biogen merupakan Unit Pelaksana Teknis di bawah Badan Litbang Pertanian yang berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pertanian Nomor 631/Kpts/OT.140/12/2003 mempunyai mandat: (1) penyusunan program dan evaluasi penelitian dan pengembangan bioteknologi dan sumber daya genetik pertanian; (2) pelaksanaan penelitian konservasi dan karakterisasi yang meliputi fisik, kimia, biokimia, metabolisme biologis dan biomolekular sumber daya genetik

pertanian; (3) pelaksanaan penelitian bioteknologi sel, bioteknologi jaringan, rekayasa genetik dan bioprospeksi sumber daya genetik pertanian; (4) pelaksanaan penelitian keamanan hayati dan keamanan pangan produk bioteknologi; (5) pelaksanaan pengembangan sistem informasi hasil penelitian dan pengembangan bioteknologi sumber daya genetik pertanian; (6) pelaksanaan pengembangan komponen teknologi sistem dan usaha agribisnis produk bioteknologi pertanian; dan (7) pelaksanaan kerja sama dan pendayagunaan hasil penelitian bioteknologi dan sumber daya genetik pertanian dan pengelolaan tata usaha dan rumah tangga BB-Biogen. Rencana Stratejik Rencana stratejik BB-Biogen selama lima tahun telah tertuang dalam Rencana Strategi (Renstra) BB-Biogen 2005-2009, di mana untuk melaksanakan Renstra tersebut BB-Biogen memiliki Visi, yaitu “Menjadi lembaga penelitian dan pengembangan terbaik di tingkat nasional pada bidang bioteknologi dan pengelolaan plasma nutfah pertanian”. Kemudian untuk mewujudkan visi tersebut, BB-Biogen memiliki Misi, yaitu (1) meningkatkan kualitas sumber daya manusia (SDM) di bidang bioteknologi dan sumber daya genetik (SDG) pertanian, (2) mengelola dan memanfaatkan SDG untuk mendukung penelitian di bidang bioteknologi dan pemuliaan tanaman, (3) mengembangkan suatu program penelitian yang kuat dalam perbaikan sifat genetik ta-

1

PENDAHULUAN

naman dan mikroba, serta komponen teknologi budi daya pertanian dengan pendekatan bioteknologi, sehingga teknologi dan produk BB-Biogen berdaya saing tinggi, dan (4) berkontribusi pada pembangunan nasional pertanian dengan jalan mengembangkan dan mendiseminasikan teknologi yang sesuai untuk meningkatkan daya saing produk pertanian Indonesia di dalam pasar nasional dan global. Pada tahun anggaran 2006 yang merupakan tahun kedua pelaksanaan Renstra BB-Biogen, menetapkan 18 kegiatan penelitian. Jumlah kegiatan ini meningkat dari tahun sebelumnya yang hanya terdiri dari 14 kegiatan (RPTP). Penambahan kegiatan ini dimaksudkan untuk melaksanakan semua tupoksi BB-Biogen yang telah ditetapkan. Kegiatan penelitian tersebut dikelompokkan ke dalam tiga Program Utama Penelitian BB-Biogen, yaitu (1) Program Penelitian Pengkayaan, Pengelolaan, Pemanfaatan dan Pelestarian Sumber Daya Genetik Pertanian (tujuh kegiatan), (2) Program Penelitian Rekayasa dan Pemanfaatan

2

Teknik Biologi Molekuler dan Rekayasa Genetik untuk Perbaikan Tanaman dan Ternak (delapan kegiatan), dan (3) Program Penelitian Pemanfaatan Kultur In Vitro untuk Perbanyakan Tanaman, Perbaikan Varietas dan Produksi Senyawa Metabolit Sekunder (tiga kegiatan). Ruang Lingkup Laporan BB-Biogen Tahun 2006 mencakup kegiatan pengelolaan sumber daya institusi, penelitian, kebijakan bioteknologi dan SDG, diseminasi hasil penelitian dan pelayanan informasi. Seluruh kegiatan tersebut dilaksanakan berdasarkan anggaran pendapatan dan belanja negara (APBN) melalui DIPA BB-Biogen TA 2006 dan kerja sama. Laporan ini hanya menyajikan highlight kegiatan yang mengantar kepada laporan dari masing-masing kegiatan. Sedangkan laporan rinci untuk setiap kegiatan disajikan dalam dokumen laporan terpisah.


LAPORAN TAHUN 2006

II. Pengelolaan Sumber Daya Institusi SUMBER DAYA MANUSIA Setelah BB-Biogen mengalami beberapa kali perubahan mandat, peran dan koordinasi antar institusi terkait di tingkat nasional terus ditingkatkan. Untuk itu, perubahan struktur dan komposisi sumber daya manusia (SDM) dilaksanakan. Perubahan tersebut terjadi melalui pendidikan, pelatihan, dan mutasi tenaga. Pada akhir tahun 2006, BB-Biogen memiliki 272 orang pegawai negeri sipil (PNS), 24 orang calon pegawai negeri sipil (CPNS), 28 orang honorer yang sedang dalam proses pengangkatan menjadi CPNS, dan 13 orang honorer. Namun, di antara tenaga honorer tersebut delapan orang di antaranya tidak dapat diangkat menjadi CPNS berdasarkan Peraturan Pemerintah (PP) Nomor 48 Tahun 2005 karena faktor usia. Dari sisi keahliannya, pegawai tersebut terdiri atas 94 (34,6%) orang peneliti, 52 (19,1%) orang tenaga fungsional non peneliti, dan 40 (14,7%) tenaga administrasi, dan 86 (31,6%) penunjang lainnya yang meliputi pramu kantor, satpam, staf kebun percobaan, staf rumah kaca, staf kelompok peneliti, dan staf bidang (Tabel II.1). Tabel II.1. Keragaan SDM BB-Biogen 2006. Klasifikasi keahlian Peneliti non kelas Peneliti Fungsional non peneliti Administrasi kantor Pendukung* Jumlah

Jumlah (orang) 24 70 52 40 86 272

*Pramu kantor, satpam, staf kebun percobaan, staf rumah kaca, staf kelompok peneliti, dan staf bidang.

Jumlah tenaga dengan kualifikasi pendidikan S3 menunjukkan peningkatan setiap tahun. Pada tahun 2002 pegawai yang berpendidikan S3 hanya 21 orang, sementara pada tahun 2007 sebanyak 35 orang. Jumlah tenaga peneliti pada BB-Biogen saat ini sebanyak 86 orang, yang terdiri atas 64 orang peneliti pertama sampai dengan peneliti utama dan 22 orang calon penelti. Selain jabatan fungsional peneliti, di BBBiogen terdapat 48 orang teknisi litkayasa dan masing-masing 1 orang pustakawan, pranata komputer, dan statistisi. Tenaga fungsional yang masih dibutuhkan adalah arsiparis dan kehumasan. Dari segi kepakaran, terjadi ketimpangan antara peneliti yang memiliki latar belakang bioteknologi dan kultur jaringan dengan peneliti yang bergerak di bidang pengelolaan sumber daya genetik dan biokimia (Tabel II.2). Di samping itu, sebagian Tabel II.2. Rekapitulasi jumlah kepakaran peneliti BBBiogen secara umum tanpa melihat usia. Bidang keahlian

Jumlah

Bioteknologi Marka Molekuler Rekayasa genetik Fisiologi tanaman/kultur jaringan Pertanian Fisiologi hara Fitopatologi Entomologi Pengelola SDG Pemuliaan dan genetika tanaman Bioinformatika Biometrik Mikrobiologi Biokimia dan Kimia analitik

10 2 1 4 10

Total

94

18 18 16 1 8 6

3

PENGELOLAAN SUMBER DAYA INSTITUSI

besar peneliti di bidang pengelolaan sumber daya genetik telah berusia di atas 45 tahun. Padahal, usia peneliti di BB-Biogen yang umurnya di bawah 35 tahun hanya 18 orang. Sehingga sulit untuk melakukan peningkatan kapasitas SDM melalui pendidikan formal. Selain itu, berdasarkan peraturan perundangan baru tentang tenaga fungsional peneliti yang berusia 55 tahun ke atas memiliki potensi menjalani pensiun di usia tersebut apabila tidak dapat memenuhi kewajiban angka kredit fungsionalnya. Kondisi tersebut menjadi tantangan dalam mempertahankan kinerja BB-Biogen. Kebijakan pemerintah melalui PP 48/2005 yang memprioritaskan pengangkatan pegawai honorer sebagai CPNS mempunyai kontribusi menambah jumlah tenaga pendukung dan administrasi. Hanya saja, sebagian besar tenaga honorer tersebut mempunyai pendidikan SD s/d SLTA dan telah berusia cukup lanjut sehingga sulit untuk dilibatkan dalam program pengembangan SDM. Oleh karenanya, SDM bidang administrasi dihadapkan kepada persoalan yang sama dengan SDM peneliti, terutama SDM yang memiliki keahlian di

bidang pengelolaan keuangan dan hukum. Padahal, SDM di bidang pengelolaan keuangan dan hukum memiliki peran penting dalam menangani proses-proses administrasi berdasarkan peraturan perundangan yang semakin kompleks. Langkah-langkah yang perlu diambil dalam mengatasi kondisi SDM di BBBiogen adalah: 1. Perlu dilakukan analisis distribusi tenaga sesuai dengan beban dan tugas yang ada. 2. Apabila rekruitmen yang sesuai kepakaran tidak bisa dilaksanakan, maka, relokasi atau outsourcing yang sesuai dengan peraturan perundangan perlu dipertimbangkan. Dalam rangka peningkatan keterampilan dan kemampuan tenaga peneliti, beberapa tenaga BB-Biogen telah mengikuti pelatihan, seminar, pertemuan ilmiah, workshop, dan post doc di luar negeri (Tabel II.3). Peneliti yang sedang mengikuti tugas belajar sebanyak 14 orang peserta program S3 dan 4 orang peserta program S2, baik di dalam maupun di luar negeri.

Tabel II.3. Keikutsertaan peneliti BB-Biogen pada pertemuan ilmiah di luar negeri pada TA 2006. Jenis kegiatan

Negara tujuan

Negara/institusi penyandang donor

Pertemuan Ilmiah

IRRI, CYMMIT, FAO, USDA

Lokakarya

Cina, Perancis, Itali, Vietnam, Filipina, dan India Taiwan, Filipina, Jepang, Korea

Seminar Ilmiah Penelitian Pelatihan Post Doc Program studi S3

India, Thailand, Jepang Filipina, Perancis, USA Swedia Belanda, Jepang, Korea Korea, New Zeland

4

Cina-Taipei, ISAAA, APEC/RDA, USDA, Jepang USDA, IPGRI USDA, RUTI (Indonesia), USNSF Swedia Belanda, Jepang, Korea Korea, Australia

Jumlah orang berangkat 10 5 4 5 2 3 3

LAPORAN TAHUN 2006

FASILITAS Dalam rangka mendukung pelaksanaan tugas dan fungsinya, BB-Biogen didukung sejumlah fasilitas berupa sarana dan prasarana, yaitu tanah, bangunan, kendaraan serta sarana penelitian berupa laboratorium, rumah kaca, dan kebun percobaan. Di samping peralatan tesebut juga tedapat peralatan lainnya seperti peralatan kantor dan lainnya yang semua merupakan barang/kekayaan milik negara. Kekayaan milik negara di BB-Biogen tercatat pada Sistem Akuntansi Barang Milik Negara (SABMN) yang ditangani oleh Subbag Perlengkapan. Sarana dan Prasarana Umum Sarana dan prasarana umum merupakan salah satu fasilitas yang sangat penting dalam mendukung pelaksanaan tugas dan fungsi BB-Biogen, yang meliputi tanah, bangunan, kendaraan, dan peralatan pendukung lainnya. Lahan yang dikelola oleh BBBiogen seluas 420.391 m2 yang terdiri atas tanah dan bangunan. Secara rinci, pemanfaatan areal dan luasan masing-masing ba-

ngunan atau kebun disajikan pada Tabel II.4. Kendaraan dinas yang dikelola oleh BB-Biogen berjumlah 35 unit kendaraan, yang terdiri atas 22 unit kendaraan roda empat dan 13 unit kendaraan roda dua. Kendaraan dinas yang dikelola oleh BBBiogen sebagian besar sudah berusia di atas 10 tahun bahkan ada yang sudah berumur 34 tahun. Secara rinci data kendaraan tersebut disajikan pada Tabel II.5. Sarana dan Prasarana Penelitian Sarana penelitian yang digunakan oleh BB-Biogen untuk melaksanakan tugas dan fungsinya adalah laboratorium, rumah kaca, dan kebun percobaan. Laboratorium Laboratorium yang dikelola oleh BBBiogen terdiri dari sembilan jenis laboratorium yang dikelola oleh kelompok peneliti maupun dikoordinasikan langsung oleh Kepala Balai Besar sebagaimana disajikan pada Tabel II.6.

Tabel II.4. Daftar pemanfaatan fasilitas tanah dan bangunan. Pemanfaatan fasilitas

Luas (m2) Lokasi

Tanah bangunan pemerintah

398.893

Bangunan gedung kantor permanen Bangunan gudang tertutup permanen Bangunan gedung mekanikal permanen dan koperasi Bangunan gedung laboratorium permanen Rumah kaca Bangunan bengkel/garasi Bangunan gedung tempat ibadah Bangunan gedung tempat pertemuan permanen Mess/wisma/tempat peristirahatan

1.272 2.322 324

Kel. Ciwaringin, Kec. Bogor Tengah, Kel. Menteng, Kec. Bogor Barat, Citayam (Depok), dan Pacet (Cianjur) Bogor, Citayam, Pacet Bogor, Citayam, Pacet Bogor

9.940 5.197 1.158 272 700

Bogor Cikeumeuh dan Cimanggu (Bogor) Bogor Bogor Bogor

313

Pacet

5


Tabel II.5. Kendaraan roda empat dan roda dua yang dikelola BB-Biogen pada tahun 2006. Jenis kendaraan Roda empat

Roda dua

Tahun pembuatan

Jumlah

1980-2006 1968-1983 1968-1979 1999-2004 1981-1982 1979-1981

11 8 3 3 4 6

Kondisi Baik Rusak ringan Rusak berat Baik Rusak ringan Rusak berat

Tabel II.6. Jenis dan ruang lingkup pekerjaan laboratorium BB-Biogen. Jenis laboratorium

Tugas pokok

Peralatan utama

Laboratorium Biologi Molekuler Laboratorium Kultur Jaringan

Melakukan kegiatan penelitian biologi molekuler

PCR, chemidoc, elektroforesis

Melakukan kegiatan penelitian perbaikan dan perbanyakan tanaman secara in vitro, termasuk kultur haploid, fusi protoplas, seleksi in vitro, dan produksi metabolit sekunder Laboratorium Bank Gen Melakukan kegiatan penelitian untuk pengelolaan SDG Laboratorium Melakukan kegiatan penelitian di bidang mikrobiologi Mikrobiologi Laboratorium Biokimia/ Melakukan kegiatan penelitian identifikasi senyawa Kimia kimia dan pemanfaatan senyawa bioaktif Laboratorium Litbang Melakukan kegiatan penelitian biomolekuler Terpadu Fasilitas Uji Terbatas Melakukan kegiatan penelitian rekayasa genetika dan keamanan hayati tanaman hasil rekayasa genetik Laboratorium BBLaboratorium BB-Biogen mempunyai tugas Biogen (Laboratorium melakukan koordinasi dan pembinaan kepada Uji) laboratorium lingkup BB-Biogen untuk mendukung pelaksanaan tugas pokok dan fungsi BB-Biogen

Rumah kaca Rumah kaca merupakan sarana penunjang penelitian yang digunakan oleh para peneliti setelah penelitian di laboratorium. Jumlah rumah kaca yang dikelola oleh BB-Biogen sebanyak 38 unit menyebar di tiga kelompok lokasi, yaitu di Cimanggu (di sekitar kantor/gedung utama), Cikeumeuh, dan di sebelah gedung Kelti Biokimia. Pengguna rumah kaca yang dikelola oleh BB-Biogen, tidak hanya para peneliti

6

Growth chamber, inverted microscope

Deep freezer dan cool storage Liophillizer, ultracentrifuge, deep freezer GC/MS, Aktapurifier, GC Micro array, automatic gene analyzer, RT PCR, ultracentrifuge Fasilitas biosafety containment, gene gun, laser confocal microscope

di lingkungan BB-Biogen, tetapi juga digunakan oleh para peneliti dari instansi lain seperti BB Padi, Balittro, dan mahasiswa yang melakukan kerja sama dengan BBBiogen. Kebun percobaan Kebun percobaan yang dikelola oleh BB-Biogen adalah Kebun Percobaan (KP) Cikeumeuh, KP Pacet, dan KP Citayam. Data ketiga KP tersebut disajikan pada Tabel II.7. Luas lahan KP Cikeumeuh mulai ber-

LAPORAN TAHUN 2006

kurang karena ada pengalihan fungsi dari lahan percobaan ke sarana perkantoran lingkup Badan Litbang Pertanian. Pada tahun 2006, pemanfaatan areal KP Citayam untuk penelitian berkurang karena ketidakpastian rencana pengalihan status lahan penelitian menjadi lahan pemukiman oleh Departemen Pertanian pada tahun 2005. Permasalahan pengelolaan lahan KP Citayam semakin bertambah kompleks sehubungan adanya gugatan warga terhadap lahan seluas 4.671 m2 di hamparan KP tersebut. Padahal pada Sertifikat Hak Pakai atas nama Departemen Pertanian RIBadan Penelitian dan Pengembangan Pertanian cq. Balai Penelitian Tanaman Pangan Bogor yang diterbitkan tahun 1985 lahan tersebut termasuk lahan Badan Litbang Pertanian. Gugatan secara perdata yang diajukan ke Pengadilan Negeri Depok dimenangkan oleh pihak tergugat dengan dikeluarkannya Putusan Pengadilan Negeri Depok No. 26/Pdt/G/2006/PN.Dpk tanggal 7 Desember 2006. Tindak lanjut dari putusan

tersebut telah dilakukan banding ke tingkat Pengadilan Tinggi dengan mengajukan memori banding yang dilakukan oleh Departemen Pertanian. Peralatan dan Pendukung Lainnya Peralatan dan pendukung lainnya terdiri dari alat laboratorium, alat lapang, pengolah data dan peralatan pendukung (genset, travo, AC, dan lainnya). Dalam rangka mendukung dan meningkatkan kegiatan penelitian, peralatan-peralatan tersebut tentunya harus dalam kondisi baik dan berfungsi sebagai mana mestinya. Kondisi tersebut didukung dengan dilakukannya secara rutin pemeliharaan peralatan maupun dengan penambahan jumlah peralatan baru yang dibutuhkan (Tabel II.8). Perpustakaan Perpustakaan virtual Perpustakaan BB-Biogen pada saat ini mengelola aset koleksi sejumlah 3302 eksemplar buku, 803 judul majalah dalam

Tabel II.7. Data luas kebun percobaan BB-Biogen dan lokasinya. Kebun percobaan

Lokasi

Cikeumeuh Citayam Pacet

Bogor Citayam Cianjur

Jumlah

Luas lahan (m2)

Luas bangunan (m2)

116.155 22.870 13.848

1.846 284 1.326

152.873

3.456

Tabel II.8. Jenis dan jumlah penambahan peralatan dan barang TA 2006. Jenis alat/barang

Sumber dana

Peralatan laboratorium Kendaraan Peralatan pengolah data Peralatan jaringan LAN Pendingin ruangan Peralatan audio visual Peralatan kantor dan lainnya

DIPA TA 2006 DIPA TA 2006 HIBAH HIBAH DIPA TA 2006 DIPA TA 2006 DIPA TA 2006 dan HIBAH

Jumlah 19 1 8 4 10 25 58

7


dan luar negeri, dan 469 judul tesis/disertasi. Aset tersebut ditata dalam dua jenis katalog, yaitu katalog elektronik untuk koleksi baru dan katalog manual untuk koleksi lama. Aset koleksi lama secara bertahap disusun dalam katalog elektronik. Hal ini dilakukan sejalan dengan arah pengembangan perpustakaan BB Biogen yang menitikberatkan kepada perpustakaan virtual.

● Koneksi dengan e-journal Entomological Society of America (ESA) Publication

Penataan koleksi pustaka menggunakan sistem WIN-ISIS yang kemudian ditampilkan secara online ke media situs melalui IGLOO dengan menggunakan PHP scripting language dan PHP OpenISIS sebagai backend untuk membaca database natif ISIS. Pangkalan data diakses menggunakan web browser. Data yang telah diinput sekitar 226 data. Sistem ini menampilkan informasi lengkap berbentuk teks, gambar, audio, video berformat digital. Katalog online tersebut baru bisa diakses oleh pihak internal BB-Biogen. Selain itu, katalog online sudah terkoneksi dengan web intranet BB-Biogen, sehingga para pengguna tidak perlu menghafal alamat web katalog online. Alamat katalog online: http:// 10.1.1.167/igloo. Sistem ini sudah dikembangkan Pusat Perpustakaan dan Penyebaran Teknologi Pertanian (Pustaka) dan awal program pengembangan selanjutnya dalam grand design perpustakaan digital oleh Pustaka. Tampilan dan menu web hasil modifikasi diadaptasikan dengan kebutuhan BB-Biogen. Koleksi pustaka BBBiogen yang ditata dalam sistem elektronik antara lain:

● Koneksi dengan aplikasi bibliografi jurnal TEEAL

● Koneksi dengan e-journal (current publication): Proquest Agricultural Online Journals

5. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology

8

● Koneksi dengan e-book: Brock’s Biology of Microorganism ● Koneksi dengan e-journal: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM) ● Koneksi dengan e-journal: In Vitro Plant (SIVB)

● Koneksi dengan web katalog online Pustaka: www.pustaka-deptan.go.id ● Koneksi dengan daftar jurnal-jurnal ilmiah yang terdapat dalam publikasi Proquest Online Journals dan TEEAL (format pdf) ● Daftar buku/Jurnal terbaru Pengadaan buku baru Pengadaan buku dan jurnal ilmiah di Perpustakaan BB-Biogen bertujuan untuk meningkatkan akses peneliti terhadap perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi. Sehingga, kemudahan akses tersebut akan meningkatkan kualitas penelitian. Untuk itu, jenis buku dan jurnal ilmiah yang diadakan didasarkan atas permintaan dari peneliti. Buku/jurnal yang dibeli untuk melengkapi Perpustakaan BB-Biogen pada tahun 2006 adalah: 1. Entomological Society of America 2. Applied Environmental Microbiology 3. Crop Science 4. Eucarpia

6. In Vitro Plant Breeding

LAPORAN TAHUN 2006

7. Microbiology Molecular Biology Review 8. Physicochemical Plant Physiology

and

Environmental

9. Plant Genetic Resources 10. Plant Tissue Culture and Biotechnology 11. Plant Cell Tissue and Organ Culture 12. Invitro Plant Dari anggaran yang tersedia, terdapat empat buah buku dan jurnal, yaitu Molecular Breeding, Plant Cell Reports, Trends in Biotechnology, dan Plant Molecular Biology yang tidak dapat dibeli karena terjadi kenaikan harga sehingga tidak dapat dipenuhi melalui anggaran yang telah dialokasikan. Salah satu peluang di masa yang akan datang dalam pengadaan buku dan langganan jurnal adalah melalui akses online yang relatif lebih murah dan cepat. Saat ini, keberadaan koleksi terbaru Perpustakaan telah dipromosikan kepada peneliti melalui e-mail dan majalah dinding (mading). Beberapa buku/jurnal baru sudah tersirkulasi kepada para peneliti BBBiogen. Pelayanan jasa pustaka Pelayanan jasa pustaka dilakukan dalam bentuk pelayanan terhadap pengunjung perpustakaan, permintaan melalui email, dan mading. Untuk kunjungan yang berasal dari BB-Biogen, dalam setiap bulannya sekitar 80 orang peneliti dan non peneliti yang melakukan peminjaman bahan pustaka. Sedangkan dari luar BBBiogen, setiap bulannya sekitar 30 orang pengunjung, yang terbanyak berasal dari kalangan mahasiswa, dikuti oleh peneliti luar BB-Biogen, dosen, serta pelajar. Topik

literatur yang paling banyak dicari antara lain kultur jaringan, komoditas padi, dan tanaman pangan lainnya. Secara kuantitas pengunjung Perpustakaan BB-Biogen masih jauh dari jumlah yang diharapkan. Hal ini terkait dengan banyaknya pilihan dan semakin mudah dan cepatnya penelusuran literatur seperti penggunaan search engine untuk mendapatkan artikel gratis melalui internet. Selain informasi yang bisa diakses melalui katalog online, informasi yang berkenaan dengan perpustakaan dan koleksinya juga disampaikan melalui e-mail dan mading. Selama tahun 2006 informasi yang telah disampaikan kepada pengguna antara lain: ● Koleksi buku/jurnal baru ● Informasi alamat e-book dan e-journal ● Informasi fulltext dari artikel jurnal penelitian yang sudah dibuat versi offline. Pengembangan perpustakaan Dalam meningkatkan pelayanan dan kepuasan terhadap pelayanan Perpustakaan BB-Biogen, maka pengelola Perpustakaan BB-Biogen mengikuti pelatihan dan kunjungan benchmarking ke beberapa unit perpustakaan yang dianggap bisa menjadi acuan dalam pengelolaan Perpustakaan BB-Biogen seperti Perpustakaan ITB dan BPTP Jawa Barat. Materi pelatihan lebih difokuskan pada aplikasi pemanfaatan teknologi informasi dalam pengelolaan perpustakaan. Situs Web Biogen Online Pada bulan Agustus tahun 2004, BBBiogen me-launching situs dengan nama

9


domain www.indobiogen.or.id. Situs tersebut memuat: 1. Profil institusi, yang terdiri dari sejarah, visi, misi, mandat, struktur organisasi, lokasi, fasilitas, dan sumber daya manusia 2. Penelitian, yang terdiri dari program, hasil, dan produk unggulan 3. Layanan, yang terdiri dari jasa laboratorium, kerja sama, dan Unit Komersialisasi Teknologi 4. Publikasi, yang terdiri dari Warta, Jurnal Agrobio, Jurnal Agrobiogen, Prosiding, Laporan Tahunan, Buku, dan Leaflet. Pada tahun selanjutnya menu dalam web berkembang, dengan penambahan link ke instansi lingkup Badan Litbang Pertanian, Departemen Pertanian, dan instansi/organisasi yang berkaitan dengan BBBiogen, Katalog Elektronik Perpustakaan BB-Biogen, dan Buku Tamu. Pada tahun 2006, situs BB-Biogen dikunjungi oleh 13.418 pengunjung. Beberapa di antara pengunjung adalah pengusaha yang kemudian berkunjung ke BB-Biogen menanyakan informasi tertentu yang lebih lengkap. Dari data yang dilihat pada buku tamu, diketahui bahwa pengunjung tidak terbatas dari dalam negeri saja, tetapi terdapat beberapa pengunjung dengan alamat Perancis, Italy, Kanada, Taiwan, Inggris, dan USA. Mulai hadirnya pengunjung dari berbagai negara, menuntut situs BB-Biogen disajikan dalam Bahasa Indonesia dan Bahasa Inggris. Kenyataan bahwa website BB-Biogen diakses oleh berbagai kalangan dan dengan frekuensi kunjungan sangat padat,

10

memerlukan dukungan SDM pengelola website yang mandiri dan kapasitas yang memadai. Pengelola tersebut di samping menjaga kemutakhiran informasi yang disajikan juga harus menjaga situs dari gangguan pihak luar. Beberapa kali Buku Tamu Biogen disisipi pesan komersial produkproduk yang tidak terpuji. Ketekunan pengelola untuk menghapus pesan-pesan negatif tersebut perlu dilaksanakan secara terus-menerus. Pengelolaan situs juga harus dilengkapi mekanisme untuk merespon permintaan informasi dari masyarakat secara cepat dan tepat. KEUANGAN Anggaran yang dikelola BB-Biogen meliputi dana APBN dan dana PNBP serta dana Kerja Sama Penelitian. Dalam bahasan ini diuraikan secara ringkas perkembangan alokasi dan realisasi dari anggaran tersebut. Dana APBN Pada TA 2006, total APBN yang dikelola BB-Biogen sebesar Rp 27.709.249.000, yang dialokasikan pada Program Ketahanan Pangan (belanja gaji dan belanja mengikat lainnya, penelitian, dan kegiatan penunjang seperti kegiatan diseminasi, manajemen, SIM, Komisi Nasional Sumber Daya Genetik, dan lain-lain) sebesar Rp 26.499.249.000 termasuk target penggunaan kembali PNBP sebesar Rp 40.341.000 serta Program Agribisnis untuk kegiatan penelitian di Balai Penelitian Bioteknologi Perkebunan (Balit Biotekbun) sebesar Rp 1.210.000.000. Anggaran pada tahun 2006 mengalami kenaikan Rp 10.021.349.000

LAPORAN TAHUN 2006

atau 56,70% dibandingkan dengan TA 2005, yang dialokasikan untuk pembangunan gedung Bank Gen Pertanian Tahap I sebagai belanja modal Rp 8.000.000.000 dan sisanya untuk gaji dan belanja mengikat lainnya, serta pada kegiatan penyuluhan dan penyebaran informasi dan kegiatan penelitian di Balit Biotekbun (Tabel II.9). Total realisasi anggaran sampai dengan 31 Desember 2006 adalah sebesar Rp 25.638.989.098 atau 92,53% dari pagu. Realisasi belanja pegawai mengikat sebesar Rp 6.825.324.642 (93%) dari pagu, antara lain karena alokasi untuk pembayaran gaji CPNS belum dapat dibayarkan pada tahun 2006 karena Surat Keputusan sejumlah 24 orang CPNS belum terbit (Gambar II.1).

Realisasi belanja barang mengikat relatif rendah, yaitu 83,67%, hal ini terutama disebabkan realisasi untuk pembayaran retribusi listrik, telepon, gas, dan air (langganan daya dan jasa/LDJ) adalah rendah, yaitu sebesar Rp 972.823.624 atau 71,47% dari yang dialokasikan. Rendahnya realisasi pembayaran LDJ karena ada upaya penghematan, yang meliputi pengurangan pemakaian lampu penerangan, pengurangan pemakaian AC, penggunaan air PAM dikurangi melalui penggunaan sumur pompa, dan secara bertahap menggunakan lampu hemat energi. Sebagian dari belanja barang mengikat adalah untuk pemeliharaan, dan realisasi totalnya mencapai 98,18%. Biaya pemeliha-

Tabel II.9. Alokasi dan realisasi anggaran TA 2006. Alokasi belanja

Alokasi dana (Rp 000)

Realisasi (Rp 000)

Belanja mengikat: Belanja pegawai Belanja barang Belanja tidak mengikat/pembangunan: Kegiatan penunjang Penelitian Penyuluhan dan penyebaran informasi Belanja modal Total anggaran BB-Biogen Balit Biotekbun Total DIPA

7.367.030 2.641.978

6.825.325 2.210.604

93,00 83,67

2.825.556 3.284.520 1.005.674 9.374.491

2.474.721 3.276.108 820.264 8.795.235

87,58 99,74 81,56 93,82

26.499.249

24.402.256

92,20

1.210.000

1.210.000

100,00

27.709.249

25.638.989

92,53

10

Alokasi Realisasi

9,5 Rp miliar

Persentase

9 8,5 8 7,5 Belanja pegawai

Belanja barang

Belanja modal

Gambar II.1. Diagram alokasi dan realisasi anggaran per jenis belanja TA 2006.

11


raan yang tersedia belum dapat memenuhi semua kebutuhan pemeliharaan sarana dan prasarana, karena bangunan kantor, gedung laboratorium, kendaraan, dan sarana lainnya cukup banyak yang memerlukan perbaikan dengan biaya pemeliharaan cukup tinggi, sehingga perlu peningkatan alokasi anggaran setiap tahunnya. Alternatif pengurangan biaya pemeliharaan adalah dengan mengajukan proses penghapusan untuk kendaraan dan peralatan yang sudah tidak layak pakai karena sudah tidak efisien lagi. Pada tahun 2006 biaya penelitian sebesar Rp 3.284.520.000 untuk 18 judul penelitian, yang mengalami penurunan sebesar Rp 376.553.000 (10,29%) dibandingkan dengan tahun 2005, dan realisasinya sebesar Rp 3.276.108 (99,74%) dari pagu. Alokasi anggaran untuk kegiatan penunjang mencapai Rp 2.825.556.000 termasuk belanja honor tidak tetap dari beberapa kegiatan sebesar Rp 865.540.000 (di antaranya untuk honor nara sumber, honorhonor kuasa pengguna anggaran, pejabat pembuat komitmen, P4, bendahara pengeluaran, tunjangan kompensasi kerja (TKK), dan honor peneliti) serta biaya untuk kegiatan Komisi Nasional Plasma Nutfah (Komisi Nasional Sumber Daya Genetik) sebesar Rp 564.906.000. Realisasi anggaran kegiatan penunjang sebesar 87,58%, karena terkait dengan kegiatan Kebijakan Pengembangan Biologi dan Bioteknologi yang merupakan kegiatan nasional yang pelaksanaannya bergantung kepada instansi di luar Badan Litbang Pertanian. Realisasi belanja modal hanya 93,82% karena adanya penghematan biaya pemba-

12

ngunan gedung Bank Gen, pembatalan pengadaan alat pertanian akibat keterbatasan waktu panitia dalam melakukan lelang, dan pembatalan pembelian buku karena terjadi kenaikan harga buku di luar cakupan harga di RKAKL. Keterbatasan waktu panitia dalam proses pengadaan karena di BB-Biogen hanya ada satu panitia pengadaan. Pembentukan panitia tersebut berkaitan dengan mekanisme KEPPRES 80 tahun 2003 yang memerlukan persyaratan-persyaratan SDM yang mempunyai keahlian dalam hal kepanitiaan untuk menangani administrasi pengadaan yang kompleks, serta waktu yang dibutuhkan untuk penyelenggaraan proses tersebut cukup lama. Sehingga, panitia yang dibentuk kehabisan waktu untuk memproses pengadaan alat pertanian. Selain itu, proses pengadaan terkait juga dengan faktor eksternal, yaitu bonafiditas rekanan yang turut serta dalam pelelangan. Faktor-faktor tersebut juga mempunyai kontribusi terhadap realisasi anggaran. Realisasi penerimaan negara bukan pajak (PNBP) selama tahun 2006 adalah Rp 80.291.879 atau 60,70% dari target sebesar Rp 132.325.000, yang terdiri dari realisasi penerimaan umum Rp 43.941.879 dan realisasi penerimaan fungsional Rp 36.350.000. Penerimaan umum berasal dari sewa rumah dinas, penerimaan kembali belanja pegawai tahun yang lalu, serta pengembalian belanja gaji pokok PNS. Penerimaan fungsional terutama berasal dari penggunaan gedung auditorium, pandapatan jasa tenaga/pekerjaan informasi (kerja sama penelitian), serta penjualan hasil pertanian.


LAPORAN TAHUN 2006

III. Kegiatan Penelitian PROGRAM PENGKAYAAN, PENGELOLAAN, PEMANFAATAN, DAN PELESTARIAN SUMBER DAYA GENETIK PERTANIAN

besar (>0,6 g/rumpun/hari) dimiliki oleh varietas Terung, Pui, Ketan Haur, IR64, dan Fatmawati.

Evaluasi Laju Pengisian Biji pada Padi dan Kedelai

Laju pengisian biji kedelai dibagi dalam dua fase, yaitu fase pengisian biji awal dan fase pengisian biji akhir. Fase pengisian biji awal dimulai dari saat awal pengisian biji hingga fase pertengahan (10 hari kemudian), sedangkan fase pengisian biji akhir dari fase pertengahan hingga panen. Fase pengisian biji awal yang tertinggi ditemukan pada varietas Kipas Putih (0,206 g/tanaman/hari) dan diikuti oleh varietas Tidar (0,183 g/tanaman/hari). Namun laju pengisian biji pada fase akhir tertinggi ditemukan pada varietas Slamet (0,199 g/tanaman/hari). Secara rata-rata dari dua fase pengisian biji tersebut yang memiliki laju pengisian biji relatif tinggi dimiliki oleh varietas Tanggamus (0,177 g/tanaman/hari).

Laju pengisian biji merupakan karakteristik tanaman yang mempengaruhi tingkat produktivitas. Pola dari laju pengisian biji antar varietas diduga berbeda-beda. Laju pengisian biji yang tinggi dan relatif lama akan menghasilkan biji yang lebih besar dan bobot biji yang lebih berat selama biji dapat menampung asimilat. Sebaliknya walaupun biji cukup banyak tetapi asimilat rendah dapat mengakibatkan kehampaan pada biji. Penelitian ini merupakan bagian dari Rencana Penelitian Tingkat Peneliti (RPTP) yang berjudul Koleksi, Konservasi, Karakterisasi, dan Evaluasi Plasma Nutfah Tanaman Pangan. Karakterisasi laju pengisian biji dilakukan pada masing-masing 10 aksesi padi dan kedelai. Pengamatan laju pengisian biji dilakukan dengan memotong lima tanaman contoh yang dimulai dari saat pengisian biji dengan interval 10 hari hingga panen. Bobot biji, bobot biomas, dan luas daun dari setiap contoh diamati. Dari sepuluh varietas padi yang dipelajari, laju pengisian biji padi pada fase awal tertinggi dimiliki oleh varietas Ketan Haur (0,908 g/rumpun/hari), diikuti oleh varietas Fatmawati (0,79 g/rumpun/hari). Sedangkan laju pengisian biji padi pada fase akhir tertinggi dimiliki oleh varietas Pui (0,976 g/rumpun/hari). Rata-rata laju pengisian biji dari dua fase pengisian yang relatif

Evaluasi Ketahanan/Toleransi Plasma Nutfah Tanaman Pangan terhadap Cekaman Biotik dan Abiotik Evaluasi ketahanan/toleransi terhadap cekaman biotik dan abiotik merupakan bagian dari RPTP yang berjudul Koleksi, Konservasi, Karakterisasi, dan Evaluasi Plasma Nutfah Tanaman Pangan yang terdiri atas: evaluasi ketahanan plasma nutfah padi, jagung, dan kedelai terhadap keracunan aluminium (Al); evaluasi plasma nutfah padi terhadap keracunan besi (Fe); evaluasi ketahanan plasma nutfah padi terhadap penyakit hawar daun bakteri Grup IV dan VIII; evaluasi ketahanan plasma nutfah

13

KEGIATAN PENELITIAN

padi terhadap penyakit blas (Pyricularia oryzae Cav.); evaluasi ketahanan plasma nutfah jagung terhadap penyakit bulai (Perenosclerospora maydis); evaluasi ketahanan plasma nutfah padi terhadap hama wereng coklat (Nilaparvata lugens Stall.). Evaluasi ketahanan plasma nutfah padi, jagung, dan kedelai terhadap keracunan aluminium Keracunan Al pada lahan kering masam merupakan masalah bagi pertumbuhan tanaman pangan. Tanaman yang keracunan Al memperlihatkan gejala khlorosis mulai dari pinggir daun. Gejala keracunan Al lebih spesifik pada tanaman kedelai, daun kedelai berwarna kuning keemasan mulai dari pinggir hingga bagian tengah daun. Perakaran bobot kering tanaman (akar, batang, dan daun) tanaman yang mengalami keracunanan Al menjadi berkurang, akibatnya sangat mempengaruhi hasil biji. Tersedianya sumber gen pada padi, jagung, dan kedelai toleran keracunan

Al/lahan kering masam akan memberikan sumbangan yang sangat berarti mendukung program pemuliaan untuk toleransi terhadap keracunan Al/lahan kering masam. Sebanyak 200 aksesi padi telah dievaluasi di KP Tamanbogo pada musim hujan (MH) 2006. Lahan yang digunakan untuk evaluasi ini tergolong masam dengan pH (H2O) 3,9-4,2, kandungan Al tukar (Aldd) cukup tinggi (2,3-3,0 me) dan kejenuhan Al juga tinggi (61%). Dari hasil penelitian diperoleh 17 aksesi toleran terhadap keracunan Al (skor 1-3) (Tabel III.1). Sebanyak delapan galur plasma nutfah jagung mempunyai reaksi agak toleran terhadap keracunan Al. Bobot pipilan kering (ku/ha), tinggi tanaman (cm), dan jumlah tongkol dipanen disajikan pada Tabel III.2. Galur Si339 mempunyai bobot pipilan terberat, yaitu 1,05 t/ha, melebihi varietas toleran (Sukmaraga). Sedangkan Si367 mempunyai bobot pipilan kering sama dengan Sukmaraga, dan mempunyai tongkol

Tabel III.1. Plasma nutfah padi toleran terhadap keracunan Al, Tamanbogo, MH 2006.

14

No. Nomor registrasi

Nama aksesi

1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17.

Padai Pute Timay Padai Pulut Pute Iting Padai Mahak Padai Sekrit Padai Palapak Padai Jata Padai Ketan Hitam Padai Ubek Iyap Padai Utan Bulan Padai Mempat Padai Kelay PB52 Ranau Maninjau Gogo Cingkrik Gundil Padi Pejet

BKT 42 BKT 43 BKT 49 BKT 86 BKT 87 BKT 107 BKT 126 BKT 143 BKT 146 BKT 167 BKT 178 19649 19671 19672 20050 20086 20095

LAPORAN TAHUN 2006

Tabel III.2. Penampilan plasma nutfah jagung yang agak toleran terhadap keracunan Al pada lahan kering masam, KP Tamanbogo, MH 2006. No. Nama aksesi 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8.

ARC 194-3-3-1-2-4-xb3 DMRConvt-21178xKU1414 Si248 Si261 Si303 Si325 Si339 Si367 Arjuna Sukmaraga (toleran)

Bobot pipilan kering (t/ha)

Tinggi tanaman (cm)

Banyaknya tongkol normal

0,44 0,56 0,30 0,39 0,75 0,62 1,05 1,04 0,96 1,04

89,6 78,7 68,9 70,8 101,0 85,1 85,4 87,7 74,2 81,8

7 7 4 5 15 15 12 16 18 15

normal terbanyak di antara galur-galur lain, namun lebih sedikit dari Arjuna (18 tongkol). Dari 100 aksesi kedelai yang dievaluasi toleransinya terhadap keracunan Al sebanyak 18 aksesi memperlihatkan reaksi toleran-agak toleran (skor 2,5-3), enam aksesi di antaranya termasuk toleran terhadap keracunan Al (skor 2-2,25), yaitu aksesi 4194, 4346, 1314, 1593B, 3780, dan 4401. Pada tingkat kejenuhan Al tinggi (61%) secara umum kedelai tidak baik pertumbuhannya, kecuali varietas yang toleran. Lumut sebagai varietas cek rentan memiliki skor 3,75 (peka) dan Tanggamus sebagai varietas cek tahan memiliki skor 2,75 (agak peka), tampaknya Tanggamus lebih cocok dikembangkan di lahan yang tidak terlalu masam (pH >4) dengan kejenuhan Al di bawah 60% (sekitar 40-50%). Keenam aksesi pilihan (toleran Al) perlu diuji konfirmasi pada kondisi lahan dengan kemasaman yang sama (pH 4) dengan kejenuhan Al 60%, dan kondisi lahan yang agak masam (pH 5) dengan kejenuhan Al 45-50%.

Evaluasi plasma nutfah padi terhadap keracunan besi Perluasan areal tanaman padi keluar Jawa terutama diarahkan ke lahan gambut, seperti lahan gambut Sumatera dan Kalimantan. Keracunan Fe pada lahan sawah bukaan baru terutama lahan gambut sering menjadi kendala. Tersedianya sumber gen padi toleran keracunan besi akan memberikan sumbangan bagi pemulia dalam program perakitan varietas toleran keracunan Fe. Evaluasi plasma nutfah padi terhadap keracunan Fe telah dilakukan pada lahan sawah Tamanbogo Lampung dengan kandungan Fe >200 ppm. Pengujian dilakukan dengan metode stripe check, yaitu dengan menempatkan 1 varietas cek peka dan 1 varietas tahan yang ditanam 1-2 baris memanjang di antara varietas/aksesi yang diuji. sebagai cek peka digunakan IR64 dan sebagai cek tahan Mahsuri. Pengamatan keracunan Fe dilakukan pada saat tanaman berumur 4 dan 8 minggu setelah tanam. Hasil penelitian menunjukkan sebanyak 27 aksesi (Tabel III.3) toleran terhadap keracunan Fe (skor 1-3), 60 varietas tergolong sedang (skor 5), varietas IR64 sebagai pem-

15

KEGIATAN PENELITIAN

Tabel III.3. Plasma nutfah padi yang toleran terhadap keracunan Fe, KP Tamanbogo, MT 2006. No. Nomor registrasi 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 25. 26. 27.

BKT-27 BKT-48 BKT-81 BKT-175 BKT-185 BJB-144 R12167 R12461 R12478 R12579 R12961 R12968 R12983 R13137 R13236 R13255 R13290 R14747 R14865 R14915 R14944 R14984 R14986 R14989 R15005 R15007 R15320

Skor Fe

Nama aksesi Padai Pulut Bale Kulit Padai Timai Ladang Padai Pulut Mpeng Padai Samarinda Unggul Mesir Ringgit Ultri Merah Cere Kepel PB. Jawaher Yambai Padi Jambai Dempet Terong Sigae Lantiak Randah Denai Gogo Lempak Renjuna Pulut Bonai Dendak Beureum Jerai Lumbuk Ganefo Banda Mano Padi Kuning

4 mst

8 mst

3 3 3 3 3 3 1-3 1 1 1 1-3 1-3 1 1-3 3 1-3 1-3 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1

3 3 3 3 1-3 3 3 1-3 3 3 3 3 1-3 3 3 3 3 1-3 3 3 3 3 3 1-3 3 3 3

mst = minggu setelah tanam.

banding peka memiliki skor 7-9 sedangkan varietas Mahsuri sebagai cek tahan mempunyai skor 1-5. Evaluasi ketahanan plasma nutfah padi terhadap penyakit hawar daun bakteri Grup IV dan VIII Hawar daun bakteri (HDB) merupakan penyakit penting dan menyebabkan penurunan hasil padi di sawah maupun lahan kering. HDB mempunyai banyak varian sehingga dapat mematahkan ketahanan varietas padi. Sebanyak 150 varietas plasma nutfah padi diuji ketahanannya terhadap HDB Grup IV dan VIII pada MH 2006. Dari

16

150 varietas/galur padi yang diuji terdapat 33 varietas padi dengan skala serangan penyakit HDB Grup IV berkisar antara 1-5% dari luas daun atau skor 1, enam varietas padi tahan terhadap serangan penya-kit HDB Grup IV dan VIII dengan skor 1. Keenam genotipe plasma nutfah padi yang tahan terhadap HDB Grup VIII juga mempunyai kriteria tahan terhadap serangan HDB Grup IV (Tabel III.4).

LAPORAN TAHUN 2006

Tabel III.4. Plasma nutfah padi tahan penyakit HDB Grup IV dan VIII (skor 1), Kebun STPP Bogor, MH 2006. No. Nomor registrasi 1. 2. 3. 4. 5. 6.

BKT 61 BKT 72 BKT 121 BKT 123 BKT 130 BKT 181 IRBB7 (pembanding tahan) IR64 (pembanding rentan)

Nama aksesi Padai Batu Bolam Padai Talun Padai Ketan Mayong Padai Ciu Padai Siam Padai Langsat IRBB7 (skor 1) IR64 (skor 5)

STPP = Sekolah Tinggi Penyuluh Pertanian.

Evaluasi ketahanan plasma nutfah padi terhadap penyakit blas (Pyricularia oryzae Cav.) Di samping penyakit HDB, blas merupakan penyakit utama padi. Blas yang semula menjadi masalah pada padi gogo, sekarang sudah banyak menyerang padi sawah. Sebanyak 250 aksesi plasma nutfah padi telah diuji ketahanannya terhadap penyakit blas. Pengamatan penyakit blas menggunakan skor 1-9. Hasil pengamatan menunjukkan sebanyak 40 aksesi bereaksi sangat tahan hingga tahan terhadap blas daun (skor 1-3). Dari 145 aksesi yang diamati, sebanyak 26 aksesi mempunyai reaksi tahan terhadap blas leher (skor 1-3). Tiga aksesi (kultivar BKT-183-Ciu, kultivar R19658-IR70, dan R20429-Gadabung) di samping tahan terhadap penyakit blas daun juga tahan terhadap blas leher. Evaluasi ketahanan plasma nutfah jagung terhadap penyakit bulai (Perenosclerospora maydis) Bulai (downey mildew) merupakan peyakit penting pada tanaman jagung yang disebabkan oleh cendawan Perenosclerospora maydis. Akibat infeksi penyakit ini dapat menimbulkan kehilangan hasil hingga

100%. Sebanyak 100 aksesi plasma nutfah jagung telah diuji terhadap penyakit bulai di KP Cikeumeuh pada musim kering (MK) 2007. Hasil penelitian menunjukkan bahwa serangan penyakit bulai pada saat itu cukup berat. Varietas baku rentan Antasena terserang 82,3%, sedangkan Bisma sebagai varietas tahan terserang 27,8%. Tidak diperoleh aksesi yang tahan bulai, hanya satu aksesi, yaitu Lokal de Bringes (2071) yang agak tahan dengan tingkat serangan 14,8%. Evaluasi ketahanan plasma nutfah padi terhadap hama wereng coklat (Nilaparvata lugens Stall.) Hama wereng coklat (WCk) (Nilaparvarta lugens Stal) merupakan hama penting pada tanaman padi dan banyak menimbulkan kerugian. Masalah wereng coklat menjadi semakin rumit dengan adanya sifat mudah membentuk biotipe baru yang dapat mematahkan ketahanan varietas yang ditanam secara intensif dan terus menerus. Sebanyak 300 aksesi plasma nutfah telah dievaluasi ketahanannya terhadap hama WCk populasi IR42 dan IR64. Hasil evaluasi menunjukkan varietas Sunggal (No. Reg. 21294) bersifat tahan dan 48 aksesi lainnya agak tahan terhadap WCk populasi

17

KEGIATAN PENELITIAN

IR42, 11 aksesi agak tahan tehadap WCk populasi IR64, dan empat aksesi bersifat agak tahan terhadap kedua populasi WCk, yaitu Padai Unggul Tomita (BKT 190), Seribu (KT251), Padai Pulut Merah (BKT73), dan Padai Adang Bala (BKT575). Evaluasi Mutu Gizi Plasma Nutfah Tanaman Pangan Evaluasi mutu gizi merupakan bagian RPTP yang berjudul Koleksi, Konservasi, Karakterisasi, dan Evaluasi Plasma Nutfah Tanaman Pangan yang terdiri atas evaluasi kandungan amilosa pada padi, jagung, dan sorgum; kandungan β-karoten dan zat besi pada padi; kandungan protein pada kedelai, kacang tanah, dan kacang hijau; kandungan lemak pada kedelai dan kacang tanah; serta kandungan pati dan HCN pada ubi-ubian. Evaluasi kandungan amilosa pada padi Cita rasa dan mutu masak dari beras terutama ditentukan oleh kadar amilosanya. Berdasarkan kandungan amilosanya, beras dibagi menjadi empat golongan, yaitu ketan (2-9%), beras beramilosa rendah (9-20%), beras beramilosa sedang (2025%), dan beras beramilosa tinggi (2533%). Hasil uji amilosa dari 100 aksesi plasma nutfah padi berkisar antara 15,0235,09%. Varietas Tokong (No. Reg. 20414) mempunyai kandungan amilosa terendah (15,02%) dan varietas Kantul (No. Reg. 20385) kandungan amilosanya tertinggi (35,09%). Hanya ada dua aksesi yang kandungan amilosanya rendah, yaitu Tokong (No. Reg. 20414) 15,02% dan Pulut Serineu (No. Reg. 20359) 17,86%. Sebagai varietas standar PB-5 mempunyai kandungan ami-

18

losa 28,63%. Dari pengujian ini menunjukkan bahwa sebanyak 98 aksesi mempunyai kandungan amilosa tinggi (>25%). Dari 98 aksesi yang mempunyai kandungan amilosa tinggi di antaranya tiga varietas unggul, yaitu Dodokan (26,56%), Singkarak (29,10%), dan Jangkok (28,21%). Evaluasi jagung

kandungan

amilosa

pada

Dari 50 aksesi plasma nutfah jagung yang diuji, ditemukan empat galur yang mempunyai kandungan amilosa rendah, yaitu Arc1-94-3-3-1-2-4 (16,66%), Arc1-1781-4-1-3-1-2-3 (15,30%), P4S3-43-1 (16,91%), dan P4S3-41-1 (20,90%), sedangkan 44 galur lainnya mempunyai kandungan amilosa tinggi (>22%). Varietas Laga Ligo dan Pulut masing-masing mempunyai kandungan amilosa 25,63 dan 14,21%. Adapun kisaran kandungan amilosa dari 48 galur adalah 15,30-28,78%. Galur Arc1-178-1-4-1-3-1-2-3 terendah, sedangkan galur Arc127-3-3-3-1xb3 mempunyai kandungan amilosa tertinggi. Evaluasi sorgum

kandungan

amilosa

pada

Hasil analisis kandungan amilosa pada 30 aksesi plasma nutfah sorgum memperlihatkan keragaman yang cukup tinggi, yakni berkisar dari 15,35-38,67%, hanya satu aksesi yang mempunyai kandungan amilosa rendah, yaitu aksesi No. 753 sebesar 15,35%, sedangkan 29 aksesi lainnya mempunyai kandungan amilosa di atas 32%, sepuluh aksesi di antaranya mempunyai kandungan amilosa di atas 37% (Tabel III.5). Kandungan amilosa tertinggi ditemukan pada aksesi No. 860 (38,67%).

LAPORAN TAHUN 2006

Tabel III.5. Plasma nutfah sorgum yang mempunyai kandungan amilosa tinggi (>37%). No.

Nomor aksesi

Kandungan amilosa (%)

1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10.

740 746 846 850 852 881 856 860 861 768

37,50 37,18 37,41 37,32 37,69 37,27 38,39 38,67 37,18 37,08

Evaluasi kandungan β-karoten pada padi β-karoten merupakan senyawa pro vitamin A yang merupakan komponen nutrisi penting. Kandungan β-karoten pada 20 aksesi plasma nutfah padi berkisar dari 0,881,48 ppm. Kandungan β-karoten tertinggi ditemukan pada varietas Misik A (No. Reg. 20377) dan kandungan β-karoten terendah pada Ketan Baputih (No. Reg. 20398). Sebagai varietas pembanding (Padai Ketan Alle) mempunyai kandungan β-karoten 1,01 ppm. Dari penelitian ini diperoleh 11 aksesi yang mempunyai kandungan β-karoten >1 ppm. Evaluasi kandungan zat besi (Fe) pada padi Zat besi (Fe) merupakan mineral penting yang dapat mangatasi anemia. Beras dengan kandungan besi yang cukup tinggi sangat membantu dalam mengatasi kekurangan gizi (malnutrisi), terutama bagi penduduk Indonesia yang mayoritas makanan pokoknya beras. Hasil analisis kandungan Fe pada 20 aksesi padi berkisar dari 7,4816,23 ppm. Padai Pulut Jaleng Kelambu mempunyai kandungan Fe terendah, yaitu 7,48 ppm, sedangkan Ketan Bodas (No.

Reg. 20047) mempunyai kandungan Fe tertinggi, yaitu 16,23 ppm. Varietas IR64 mempunyai kandungan Fe 12,61 ppm. Sebanyak empat aksesi mempunyai kandungan Fe lebih tinggi dari varietas IR64, yaitu Ketan Bodas (No. Reg. 20047) (16,23 ppm), Ketan Kembang (No. Reg. 21077) (15,14 ppm), Pulut Rembulan (No. Reg. 21080) (15,92 ppm), dan Padai Pulut Pute (BKT 43) (14,75 ppm). Evaluasi kandungan lemak dan protein pada kedelai Lemak dan protein merupakan komponen nutrisi utama pada kedelai. Kandungan protein 30 aksesi kedelai yang dianalisis berkisar antara 26,6-41,7%. Kandungan protein tertinggi ditemukan pada aksesi 7702 (CKIV-6/2299) No. Reg. 3517 (41,7%). Sebanyak 19 aksesi memilki kandungan protein berkisar dari 35-40%, dan 10 aksesi berkisar dari <30-35%. Kandungan lemak 30 aksesi kedelai yang dianalisis bervariasi dari 11,38-19,52%. Lokal Pasuruan (No. Reg. 3666) mempunyai kandungan lemak terendah, sedangkan S9 (No. Reg. 3312) mempunyai kandungan lemak tertinggi. Varietas Pangrango memiliki kan-

19

KEGIATAN PENELITIAN

dungan lemak 15,46%. Enam aksesi kedelai, yaitu 3312, 3478, 4221, 3190, 3763, dan 3518 memiliki kandungan lemak lebih tinggi dari kandungan lemak Pangrango (>15,46%). Kandungan protein 30 aksesi kedelai yang dianalisis berkisar antara 26,641,7%. Kandunga protein tertinggi ditemukan pada aksesi 7702 (CKIV-6/2299) No. Reg. 3517 (41,7%). Sebanyak 19 aksesi memilki kandungan protein berkisar dari 3540%, dan 10 aksesi berkisar dari <30-35%. Evaluasi kandungan lemak dan protein pada kacang tanah Sama dengan kedelai, lemak dan protein merupakan komponen nutrisi utama pada kacang tanah. Kandungan lemak 20 aksesi kacang tanah yang dianalisis berkisar antara 43,0-50,5%. Galur AH 1932si (No. Reg. 2270) mempunyai kandungan lemak terendah, sedangkan varietas Lintang Nhutu B (No. Reg. 1446) mempunyai kandungan lemak tertinggi 50,5%. Varietas unggul Gajah sebagai varietas baku mempunyai kandungan lemak 46,61%. Sebanyak 12 aksesi mempunyai kandungan le-

mak lebih rendah daripada varietas Gajah, yaitu Pop Galur Gajah (No. Reg. 337), Pop Galur Gajah (No. Reg. 352A), galur AH762si (No. Reg. 2024), galur AH1183si (No. Reg. 2174), galur AH1194si (No. Reg. 2177), galur AH2190si (No. Reg. 2189), galur AH1293si (No. Reg. 2193), galur AH1307si (No. Reg. 2195), galur AH1410si (No. Reg. 2197), galur AH1932si (No. Reg. 2270), galur AH 1991si (No. Reg. 2286), dan galur AH2013si (No. Reg. 2303). Kandungan protein 30 aksesi kacang tanah yang dianalisis bervariasi antara 18,44-29,51%. Varietas Lintang Nhutu B (No. Reg. 1446) mempunyai kandungan protein terendah, yaitu 18,44%, sedangkan galur AH2013si (No. Reg. 2303) mempunyai kandungan protein tertinggi. Varietas Gajah mempunyai kandungan protein 25,78%. Evaluasi kandungan kacang hijau

20

Nomor aksesi

1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13.

VR20 VR226 VR260 VR261 VR262 VR263 VR264 (M) VR267 VR268 VR272 VR274 VR217 VR224

pada

Hasil analisis kandungan protein 30 aksesi plasma nutfah kacang hijau berkisar antara 19,97-28,36%, sebanyak 13 aksesi mempunyai kandungan protein di atas 25% (Tabel III.6), kandungan protein tertinggi

Tabel III.6. Plasma nutfah kacang hijau dengan kandungan protein >25%. No.

protein

Kandungan protein (%) 25,07 25,80 25,29 26,71 25,46 26,25 25,74 25,07 25,58 27,31 26,08 28,36 25,35

LAPORAN TAHUN 2006

(28,36%) ditemukan pada VR217, sedangkan terendah (19,97%) ditemukan pada VR230. Evaluasi mutu gizi plasma nutfah ubi jalar, ubi kayu, dan Dioscorea sp. Hasil analisis kandungan pati pada 25 aksesi plasma nutfah ubi jalar berkisar dari 30,64-53,35%. Tiga aksesi mempunyai kandungan pati >50% (Tabel III.7).

Keragaman kandungan pati dan HCN pada 30 aksesi plasma nutfah ubi kayu cukup besar. Kandungan pati berkisar antara 35,95-68,42% (Tabel III.8), kandungan pati terendah dijumpai pada BIC745 sebesar 35,95%, dan kandungan pati tertinggi ditemukan pada aksesi BIC732 (68,42%). Sebanyak 15 aksesi memiliki kandungan pati >60% (Tabel III.9). Hasil analisis kandungan HCN pada umbi ubi kayu berkisar dari 36,83-556,78

Tabel III.7. Distribusi kandungan pati pada 25 aksesi plasma nutfah ubi jalar. Kisaran kandungan pati (%)

Banyaknya aksesi Aksesi

30-40 40-50

7 15

>50

3

B0397, B0268, S0041, B0356, B0021, B0011, B0328 B0065, S0077, B0459, B0057, S0053, B0464, S0161, S0220, B0096, B0042, S0072, B0147, B0051, B0281, B0480 S0146, B0511, B0328

Tabel III.8. Distribusi kandungan pati pada plasma nutfah ubi kayu. Kisaran kandungan pati (%)

Banyaknya aksesi Nama aksesi

35-40 40-50 50-60 60-70

2 7 6 15

BIC745, BIC750 BIC741, 746, 747, 748, 749, 752, 753 BIC737, 740, 751, SPP, 727, 729 BIC725, 726, 728, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 738, 739, 742, 743, 744

Tabel III.9. Plasma nutfah ubi kayu yang mempunyai kandungan pati >60%. No.

Nomor aksesi

Kandungan pati (%)

1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15.

BIC725 BIC726 BIC728 BIC730 BIC731 BIC732 BIC733 BIC734 BIC735 BIC736 BIC738 BIC739 BIC742 BIC743 BIC744

65,84 64,70 60,32 62,12 61,70 68,42 65,66 61,52 61,22 61,28 60,02 61,46 62,06 62,06 62,00

21

KEGIATAN PENELITIAN

ppm, pada umumnya aksesi ubi kayu yang dianalisis mempunyai kadar HCN di bawah 100 ppm, aksesi BIC640 mempunyai kandungan HCN terendah (36,83 ppm). Sembilan aksesi memiliki kandungan HCN di atas 100 ppm, aksesi SPP mempunyai kandungan HCN tertinggi, yaitu 556,78 ppm (Tabel III.10). Hasil analisis kandungan pati dari 20 aksesi plasma nutfah Dioscorea sp. (gembili dan ubi kelapa) berkisar dari 46,2066,17%. Aksesi yang mempunyai kandungan pati terendah (46,20%) pada aksesi No.

Reg. 513, sebanyak 11 aksesi mempunyai kandungan pati 50-60%, sedangkan delapan aksesi mempunyai kandungan pati berkisar dari 60-70%. Kandungan pati tertinggi dijumpai pada aksesi No. Reg. 534, yaitu 66,17% (Tabel III.11 dan III.12). Evaluasi daya hasil kedelai tahan SSV

galur

harapan

Soybean stunt virus (SSV) atau dikenal dengan virus kerdil kedelai merupakan penyakit penting yang disebabkan oleh virus pada pertanaman kedelai. Akibat serangan

Tabel III.10. Plasma nutfah ubi kayu yang mempunyai kandungan HCN tinggi. No. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9.

No. aksesi

Kandungan HCN (ppm)

BIC645 BIC646 BIC745 BIC746 BIC747 BIC748 BIC749 BIC750 SPP

125,53 167,51 185,72 287,89 136,22 206,71 109,69 157,61 556,78

Tabel III.11. Distribusi kandungan pati pada plasma nutfah gembili dan ubi kelapa. Kisaran kandungan pati (%)

Banyaknya aksesi

40-50 50-60 60-70

1 11 8

Aksesi/nomor registrasi 513 570, 608, 692, 565, 665, 693, 662, 630, 721, 711, 522 534, 720, 530, 631, 547, 650, 559, 702

Tabel III.12. Plasma nutfah gembili dan ubi kelapa yang mempunyai kandungan pati >60%. No. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8.

22

Nomor registrasi

Kandungan pati (%)

534 720 530 631 547 650 559 702

66,17 61,29 64,29 63,64 63,83 64,81 65,39 64,81

LAPORAN TAHUN 2006

SSV dapat menimbulkan penurunan kualitas biji dan hasil yang cukup besar, yakni dapat menurunkan hasil lebih dari 50%. Penyakit SSV terutama ditularkan oleh serangga vektor Aphis glycine, dan biji yang terinfeksi. Dalam beberapa tahun ini BBBiogen telah mengembangkan galur-galur kedelai melalui pemaanfaatan teknik serologi ELISA dalam proses identifikasi sumber gen tahan dan seleksi pada kedelai untuk ketahanan terhadap SSV. Enzyme linked immunosorbant assay (ELISA) adalah suatu diagnosis serologi virus yang dapat diaplikasikan pada tanaman. Keuntungan teknik ini dibandingkan dengan cara konvensional sebagai berikut: (1) deteksi dapat dilakukan lebih awal (5-7 hari setelah inokulasi), (2) lebih akurat, kekeliruan dapat dihindari karena gejala yang disebabkan infeksi oleh berbagai virus saBio-B29-soy

ngat mirip, (3) relatif sederhana, (4) sangat peka, (5) dapat dilakukan secara masal/banyak sampel, dan (6) antiserum yang diperlukan lebih sedikit. Penelitian ini merupakan bagian dari RPTP yang berjudul Seleksi dan Evaluasi Galur Tanaman Pangan Produk Bioteknologi. Dari tahapan proses pemuliaan yang dilakukan sebelumnya telah diperoleh 16 galur kedelai tahan SSV yang berdaya hasil tinggi, dan telah dievaluasi daya hasilnya di Bogor, Wonosari (DIY), dan Tamanbogo (Lampung) (Gambar III.1, III.2, dan III.3). Di Bogor, curah hujan cukup tinggi selama proses pemasakan dan pemanenan, hasil biji tidak seperti yang diharapkan karena panen jadi terlambat dan proses penanganan pascapanen terganggu. Hasil percobaan di Yogyakarta cukup memuaskan karena faktor cuaca cukup mendukung. Di Tamanbogo kesuburan tanah Bio-B07-soy

Gambar III.1. Penampilan galur kedelai tahan SSV, Wonosari, Yogyakarta, MK 2006.

Gambar III.2. Penampilan galur kedelai tahan SSV pada stadia pembungaan dan pengisian polong di Bogor.

23

KEGIATAN PENELITIAN

relatif lebih rendah. Hasil analisis tanah menunjukkan pH tanah rendah (pH H2O: 4,1) dengan kejenuhan aluminium cukup tinggi (58,5%). Kondisi tanah tersebut kurang cocok untuk pertumbuhan tanaman kedelai terutama bagi genotipe yang rentan terhadap keracunan Al. Berdasarkan survei yang telah dilakukan beberapa tahun sebelumnya menunjukkan bahwa di Tamanbogo Lampung populasi tanaman kedelai yag terserang oleh SSV selalu ada dan cukup tinggi, sehingga daerah ini cocok untuk evaluasi galur-galur kedelai untuk ketahanan terhadap SSV. Sebagai varietas cek juga digunakan varietas toleran lahan masam

(Tanggamus), sehingga penelitian ini tujuannya selain memperoleh galur harapan tahan SSV berdaya hasil tinggi, juga mendapatkan galur harapan toleran keracunan Al/lahan masam. Berdasarkan evaluasi daya hasil pada tiga lokasi (Bogor, Wonosari, dan Tamanbogo) telah dipilih sembilan galur harapan kedelai tahan SSV terbaik yang berdaya hasil tinggi dan berpenampilan agronomi lebih baik dibandingkan dengan tetua-tetua asalnya untuk diuji di berbagai lokasi dan musim pada tahun berikutnya (Tabel III.13). Galur-galur tersebut adalah, Bio-P23-soy, Bio-B04-soy, Bio-B05-soy, BioP25-soy, Bio-B29-soy, Bio-B01-soy, Bio-B07-

Gambar III.3. Penampilan galur tahan SSV di lahan masam Tamanbogo, Lampung. Tabel III.13. Hasil biji galur-galur kedelai tahan SSV di Wonosari, Bogor, dan Lampung. Hasil

Galur/varietas Bio-P23-w/t-soy Bio-B04-p/b-soy Bio-B05-p/b-soy Bio-P25-w/t-soy Bio-B29-w/m-soy Bio-B01-p/b-soy Bio-B07-p/m-soy Bio-P03-p/b-soy Bio-P17-w/b-soy Wilis (rentan SSV) Pangrango (rentan SSV) Sindoro (toleran keracunan Al atau lahan masam) Tanggamus (toleran keracunan Al atau lahan masam) LSD (5%)

24

Wonosari (t/ha)

Bogor (t/ha)

Lampung (t/ha)

2,78 2,69 2,65 2,64 2,46 2,40 2,22 2,21 2,18 2,73 2,86 2,52 2,62 0,406

1,179 1,600 0,907 1,661 1,834 0,846 1,078 1,366 1,088 1,468 1,784 1,246 1,143 0,407

0,466 0,154 0,636 0,270 0,435 0,774 0,549 0,400 0,331 0,171 0,603 0,442 0,317

LAPORAN TAHUN 2006

soy, Bio-P03-soy, Bio-P17-soy. Ga-lur BioB07-soy dan Bio-B05-soy di samping tahan SSV, juga toleran terhadap keracunan aluminium atau lahan masam berdasarkan hasil evaluasi di lahan kering masam Tamanbogo, Lampung (Gambar III.3). Bioprospeksi Senyawa Bioaktif untuk Pengendalian Serangga Hama

Jumlah jantan/perangkap/malam

Bawang merah merupakan tanaman hortikultura yang mempunyai nilai ekonomi tinggi, dibudidayakan secara intensif sehingga memerlukan biaya tinggi, terutama untuk mengendalikan hama ulat bawang Spodoptera exigua Hbn. Petani bawang me-rah di sentra produksi seperti Cirebon, Brebes, dan Nganjuk sering menyemprot tanaman bawang merah dengan insektisida 2-3 kali per minggu untuk mengendalikan hama. BB-Biogen sejak tahun 2003 telah melaksanakan penelitian bioprospeksi senyawa bioaktif untuk memperoleh formula feromon yang atraktif menarik se-

rangga jantan S. Exigua Hbn., sehingga penggunaan insektisida dapat dikurangi. Pada tahun 2006 kegiat-an penelitian yang dilaksanaka n adalah (1) uji daya tarik formula feromon sintetik pada kondisi lapang dan (2) uji efisiensi jenis-jenis perangkap berferomon. Kedua penelitian tersebut dilaksanakan di lahan petani bawang merah di Brebes. Untuk kegiatan pertama hasil penelitian menunjukkan bahwa formula seks feromon yang terbaik adalah formula dengan kuantitas 100 μg per rubber septum. Formula tersebut dapat menarik serangga jantan S. exigua sebanyak 178,9 ekor/malam/perangkap. Sedangkan formula komersial Jepang hanya dapat menarik 30,3 ekor serangga jantan/malam (Gambar III.4). Untuk kegiatan kedua, yaitu uji efisiensi jenis-jenis perangkap berferomon, hasil penelitian menunjukkan bahwa perangkap jenis stoples berair adalah yang terbaik. Stoples berair tersebut dapat menangkap

200 180 160 140 120 100 80 60 40 20 0 0

50

100

250

500

1000

NP

Formula (µg/ rubber septum) NP = formula komersial buatan Jepang Gambar III.4. Pengaruh kuantitas formula feromon terhadap daya tarik/tangkap imago jantan Spodoptera exigua pada bawang merah.

25

KEGIATAN PENELITIAN

serangga jantan S. exigua sebanyak 389,3 ekor/perangkap/malam. Sedangkan pada perangkap sticky traps rata-rata 304,9 ekor, pada ember berair rata-rata 158,5 ekor dan Takeda traps rata-rata 1,6 ekor/perangkap/ malam (Gambar III.5). Seleksi/Uji Tanaman Tomat Transgenik

Jumlah jantan tertangkap

Perbaikan kualitas dan hasil pada tanaman sayuran melalui transfer gen telah mulai membuahkan hasil yang menggembirakan. Gen yang mengontrol pembentukan auksin (IAA), yaitu gen DeffH9iaaM dan DefH9-RI-iaaM berhasil diintroduksikan ke tanaman strawberry dan raspberry. Kedua jenis tanaman tersebut yang telah diinduksi gen DeffH9iaaM dan DefH9-RIiaaM menghasilkan ukuran buah yang lebih besar dan jumlah buah yang lebih banyak. Gen iaaM adalah gen yang menyandi pembentukan enzim indol acetamide, yaitu prekursor dalam pembentukan IAA. Adanya promotor DefH9 mengarahkan ekspresi gen hanya terjadi pada bagian ovari (bakal buah). Apabila gen tersebut terekspresi dengan baik maka produksi IAA akan meningkat di bakal buah sehingga menginduksi terbentuknya buah sebelum terjadi-

nya pembuahan (anthesis). Pembentukan buah yang terjadi sebelum pembuahan menyebabkan buah tidak berbiji atau berbiji sedikit. Dalam hal ini tidak adanya biji atau makin sedikitnya biji merupakan salah satu indikasi bahwa gen yang diintroduksikan dapat bekerja atau terekspresi dengan baik. Kedua gen ini telah diintroduksikan ke tanaman tomat varietas Ratna dan Opal, diharapkan tanaman transgenik yang diperolah memiliki sifat lebih baik dari kedua varietas asalnya, yakni memiliki buah yang berukuran lebih besar, rasa, dan kualitas yang lebih baik. Sebanyak 14 tanaman (galur) generasi 1 (R1) yang terdiri dari 11 tanaman transgenik asal varietas Ratna, dan dua tanaman transgenik asal Oval telah ditanam di rumah kaca Fasilitas Uji Terbatas (FUT) BB-Biogen Bogor. Dari hasil pertanaman R1 ini terlihat bahwa buah yang dihasilkan oleh masing-masing tanaman transgenik R1 umumnya lebih banyak dibandingkan dengan masing-masing varietas asalnya. Tanaman R1 yang berasal dari varietas Opal mampu menghasilkan buah yang lebih banyak dengan ukuran buah yang lebih besar dibandingkan dengan varietas Opal. Galur OvM2#10-1 dapat menghasilkan buah 5,7 kali lebih banyak dari-

900 800 700 600 500 400 300 200 100 0

1 malam

Em

St

Tk

2 malam

Ts

Jenis perangkap

Em = ember, St = stoples, Tk = Takeda trap, Ts = sticky trap. Gambar III.5. Pengaruh jenis perangkap terhadap jumlah imago jantan yang tertangkap.

26

LAPORAN TAHUN 2006

pada Opal. Galur-galur transgenik yang berasal dari Ratna memiliki ukuran buah (diameter panjang dan lebar) tidak jauh berbeda dibandingkan dengan varietas Ratna, kecuali galur RtnM2#6-2, ukuran dan bobot buahnya relatif lebih besar dibandingkan dengan Ratna. Banyaknya biji galur-galur

transgenik per buah umumnya lebih sedikit dibandingkan varietas non transgenik (Ratna), bahkan ada beberapa galur yang sama sekali tidak dapat menghasilkan biji (OvM210-1 dan OvM211-4) (Tabel III.14). Irisan melintang buah tomat transgenik disajikan pada Gambar III.6.

Tabel III.14. Banyaknya buah, diameter buah, bobot buah, serta banyaknya biji rata-rata dari galur tomat transgenik bersama tanaman asalnya pada bulan ketiga, FUT, BB-Biogen. Galur/somaklon RtnM2#14-3 RtnM2#6-1 22 Ratna OvP#5-3 OvP#1-2 OvP#3-1 OvM2#10-1 OvM2#6-2 14 11 OvM2#3-1 OvM2#13-1 OvM2#11-4 OvM2#5-3 Opal

Banyaknya Diameter panjang buah buah/tanaman (cm) 19 20 51 14 46 37 8 80 29 22 40 22 28 11 10 14

2,54 2,78 2,56 2,71 3,33 3,56 4,00 3,09 3,37 2,94 3,33 2,96 2,85 3,79 3,30 2,97

Diameter lebar buah (cm)

Bobot buah (g)

Banyaknya biji/buah

2,51 3,10 2,42 2,75 2,40 2,22 2,60 2,31 2,49 2,22 2,12 2,53 2,03 3,60 2,30 2,16

16,06 27,81 13,42 22,06 18,55 16,44 24,44 18,17 22,15 15,96 12,15 19,24 14,39 39,91 16,44 16,18

3 10 51 20 0,55 7 6 0 21 6 4 1 13 0 10 20

a

b

c

d

a dan b = buah dari tanaman kontrol, c dan d = buah dari tanaman transgenik. Gambar III.6. Irisan melintang buah tomat transgenik dan kontrol.

27

KEGIATAN PENELITIAN

Produksi Sel Hibrida Potensial terhadap RTV, RS, dan Perbanyakannya sebagai Komponen Utama Perakitan Immuno Kit Mc Ab RTV Epidemi penyakit rice tungro virus (RTV) pada tanaman padi dan penyakit bakteri yang disebabkan Ralstonia solanacearum (RS) pada tanaman kacang tanah, kentang, dan cabai sering terjadi dan menimbulkan kerugian besar. Penggunaan varietas tahan sering menghadapi kendala di lapang. Deteksi dini patogen merupakan langkah awal penting menuju pengendalian penyakit yang efektif dan ramah lingkungan. Deteksi dan identifikasi patogen secara cepat dan tepat sangat bermanfaat mengantisipasi terjadinya ledakan penyakit dan mengetahui penyebab penyakit dengan cepat sehingga tindakan pengendalian dapat dilakukan cepat dan tepat. Pemanfaatan teknik serologi Mc Ab untuk deteksi dan identifikasi patogen mempunyai beberapa kelebihan di antaranya (1) reaksinya dapat dibuat spesifik, (2) antibodi yang dihasilkan konsisten, (3) suplai antibodi dalam jumlah besar mudah dilakukan. Penelitian ini merupakan salah satu kegiatan RPTP yang berjudul Pengembangan Teknik dan Aplikasi Antibodi Monoklonal untuk Deteksi Dini Rice Tungro Virus dan Ralstonia solanacearum. Tujuan penelitian untuk meningkatkan produksi sel hibridima spesifik terhadap RTV dan RS. Penelitian ini memperoleh hasil biakan sel hibrodoma RTV potensial sebanyak 20 ampul, biakan sel hibridoma RS potensial sebanyak dua ampul, hibridoma penghasil Mc Ab untuk RTV sebanyak dua sel, dan hibridoma penghasil Mc Ab untuk RS sebanyak dua sel.

28

Studi Diversitas Genetik Virus Gemini Virus gemini merupakan penyakit penting pada tanaman tomat, akibat infeksinya dapat menyebabkan kehilangan hasil yang cukup tinggi, hingga 100%. Virus gemini yang menyerang tanaman tomat adalah tomato yellow leaf curl virus (TYLCV). Tanaman yang terserang TYLCV memperlihatkan gejala daun keriting dan mengecil, tepi daun melengkung ke atas, anak tulang daun menebal, daun menguning, dan pertumbuhan tanaman terhambat. Keragaman genetik virus gemini pada tingkat molekuler di Indonesia belum banyak dilaporkan. Penelitian ini merupakan bagian dari RPTP yang berjudul Studi Diversitas Genetik Phytophthora infestans pada Kentang dan Virus Gemini (YLCV) dan CMV pada Tomat di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari keragaman genetik isolat virus gemini di Indonesia. Prosedur penelitian sebagai berikut: 1. Pengambilan sampel daun tanaman tomat yang diduga terserang virus gemini (yang menunjukkan gejala daun keriting, daun menjadi kecil, tepi daun melengkung ke atas, penebalan anak tulang daun, daun menguning, dan pertumbuhan tanaman terhambat). Tanaman contoh diambil dari daerah Sumatera, Jawa Barat, Jawa Tengah, Daerah Istimewa Yogyakarta, dan Jawa Timur. 2. Ekstraksi DNA dan analisis PCR. 3. Pemotongan produk PCR dengan enzim restriksi. Analisis kekerabatan antara isolatisolat virus gemini berdasarkan profil produk PCR dengan menggunakan program

LAPORAN TAHUN 2006

0,40

0,55

0,70

0,85

Brastagi Cibitung Karanganyar

- Sumut - Jabar - Jateng

Ketep

- Jateng

Malang

- Jatim

Blitar

- Jatim

Boyolali

- Jateng

Kaliurang

- DIY

1,00

Gambar III.7. Dendrogram hasil analisis virus gemini dari delapan daerah yang berbeda.

NT Sys. 2.1. Hasil penelitian menunjukkan adanya tiga kelompok yang berbeda pada tingkat similaritas 70% (Gambar III.7). Dari gambar tersebut terlihat bahwa pada tingkat similaritas 70%, isolat-isolat virus gemini terbagi tiga kelompok besar, yaitu Kelompok 1 terdiri atas isolat Brastagi, Cibitung, Karang Anyar, dan Ketep. Kelompok 2 terdiri atas isolat Malang, Blitar, dan Boyolali. Sedangkan Kelompok 3 hanya terdiri atas satu isolat, yaitu Kaliurang. PROGRAM PEMANFAATAN KULTUR IN VITRO UNTUK PERBANYAKAN TANAMAN, PERBAIKAN VARIETAS, DAN PRODUKSI SENYAWA METABOLIT SEKUNDER Metode Pembentukan Mikrokalus dari Protoplas Padi Liar (Oryza officinalis) dan Kultivar IR64 dan Fusi Protoplas Pemindahan gen dari satu spesies ke spesies lainnya dapat dilakukan melalui rekayasa genetik dan fusi protoplas. Pemindahan gen melalui fusi protoplas mempunyai beberapa keuntungan antara lain lebih

murah, tidak perlu mengisolasi gen terlebih dahulu dan tidak memerlukan penelitian regenerasi. Penelitian ini merupakan bagian dari RPTP Hibridisasi Somatik Multispesies pada Tanaman Padi untuk Introgresi Gen Ketahanan terhadap Penyakit yang bertujuan untuk mendapatkan metode pembentukan mikrokalus dari protoplas padi liar (Oryza officinalis) dan padi budi daya kultivar IR64 serta untuk mendapatkan metode fusi protoplas pada kedua jenis padi tersebut. Penelitian terdiri dari dua kegiatan, kegiatan pertama adalah uji media kultur, yaitu dengan cara melakukan berbagai perlakuan baik komposisi media maupun faktor fisik lainnya yang diduga dapat mempengaruhi pembentukan mikrokalus yang berasal dari protoplas. Kegiatan kedua merupakan optimasi isolasi dan fusi protoplas. Hasil uji media kultur menunjukkan bahwa kedua proptolas yang berasal dari padi liar dan kultivar IR64 dapat bertahan hidup pada media dasar MS dan N6 dengan penambahan 2,4-D 0,5 mg/l + kinetin 0,3 mg/l + sukrosa 1% + manitol 0,5

29

KEGIATAN PENELITIAN

M (Gambar III.8). Tetapi respon pembelahan sel hingga menjadi agregat sel hanya terjadi pada kultivar IR64 yang ditanam pada media yang mengandung AgNO3 3 mg/l (Gambar III.9). Diduga masih banyak faktor lain yang mempengaruhi pertumbuhan protoplas untuk menjadi mikrokalus. Pemindahan/subkultur agregat sel yang terbentuk pada media induksi kalus MS + zeatin 0,1-1 mg/l + BA 2-5 mg/l + 2,4-D 0,5 mg/l tidak memperoleh respon pembentukan kalus karena sel-sel umumnya pecah dan sebagian mengalami kontaminasi. Pembentukan Galur Pemulih Kesuburan Haploid Ganda Homozigot melalui Teknik Kultur Antera Teknik kultur antera diperlukan dalam rangka mempercepat perakitan padi hibri-

da karena teknik kultur antera dapat mempercepat pembentukan galur pemulih kesuburan haploid ganda homozigot yang diperlukan dalam perakitan padi hibrida. Penelitian ini merupakan bagian dari RPTP Teknik Biologi Molekuler untuk Perbaikan Padi Hibrida yang bertujuan untuk memperoleh galur pemulih kesuburan secara cepat. Hasil pengujian berbagai media untuk pembentukan planlet menunjukkan bahwa salah satu komposisi media yang digunakan selalu menghasilkan 22 tanaman hijau haploid ganda homozigot calon galur pemulih kesuburan melalui kultur antera F1 RHS/IRB7 dan F1 RHS/IRBB 21. Tanaman haploid dan dihaploid diidentifikasi menggunakan teknik pewarnaan kromosom. Selain itu, penelitian ini menghasilkan lebih 20 benih F1 dari setiap persi-

a

b

c

a = protoplas IR64, b = pembelahan sel, c = pembentukan agregat sel. Gambar III.8 Pembelahan sel asal protoplas dan pembentukan agregat sel IR64 pada media cair MS + kinetin 0,3 mg/l + AgNO3 3 mg/l + sukrosa 1% + manitol 0,5 M. a

b

c

Gambar III.9. Penampakan protoplas IR64 (a) dan O. officinalis (b) sebelum fusi, dan beberapa fusan antara kedua jenis protoplas (c).

30

LAPORAN TAHUN 2006

langan antara 18 galur haploid ganda homozigot dengan enam jenis galur mandul jantan (cytoplasmic male sterile/CMS). Semua galur homozigot terseleksi tersebut akan diuji di Balai Besar Penelitian Tanaman Padi, Sukamandi. PROGRAM REKAYASA DAN PEMANFAATAN TEKNIK BIOLOGI MOLEKULER DAN REKAYASA GENETIK UNTUK PERBAIKAN TANAMAN DAN TERNAK Pencarian Alel-Alel Baru untuk Gen-Gen Penting Toleran Cekaman Biotik dan Abiotik pada Padi Kekayaan keragaman genetik merupakan bahan dasar untuk memperbaiki berbagai karakter padi. Kesulitan yang dihadapi adalah bagaimana alel-alel yang menguntungkan yang cukup langka dapat ditemukan secara efisien di antara ribuan koleksi padi. Pendekatan pemetaan quantitative trait loci (QTL) dapat menunjukkan bahwa alel-alel yang menguntungkan sering tersembunyi dan hanya dapat diperoleh dengan teknologi molekuler. Penelitian ini merupakan bagian dari RPTP Pencarian Alel-alel Baru untuk Gen-gen Penting Toleran Cekaman Biotik dan Abiotik pada Padi yang bertujuan untuk melakukan klasterisasi struktur populasi keragaman 96 plasma nutfah padi untuk sifat toleran penyakit hawar daun bakteri (HDB) dan memperoleh data skoring ketahanan 96 plasma nutfah padi terhadap blas.

Penelitian ini didahului dengan penentuan struktur populasi plasma nutfah padi lokal Indonesia melalui studi keragaman genetik. Kegiatan selanjutnya adalah melakukan studi association mapping untuk gen ketahanan terhadap HDB Xa7 dengan menggunakan subset plasma nutfah, setelah memperhitungkan struktur populasi yang ada. Hasil yang diperoleh pada akhir tahun 2006, dari 96 nomor aksesi yang digunakan sebagai materi genetik penelitian, menunjukkan adanya klasterisasi padi subspecies Tropical Japonica dan Indica (Gambar III.10). Nilai kedekatan nenek moyang dari kedua kelompok ini sebesar 89%. Total alel yang terdentifikasi sebanyak 418 alel dengan rata-rata 14 alel per lokus. Rata-rata alel dominan yang terdeteksi pada lokus RM283 dan RM474 mencapai 63,8%. Rata-rata nilai diversitas gen mencapai 0,7801 sedangkan nilai PIC (polymorphism information content) yang diperoleh 0,761. Hasil pengujian tingkat ketahanan 96 nomor aksesi plasma nutfah terhadap patogen blas diperoleh hasil bahwa padi Sibau adalah varietas/galur yang tahan terhadap lima ras P. grisea (ras 041, 033, 073, 133, dan 173). Varietas lokal ini menunjukkan konsistensi ketahanannya terhadap penyakit blas daun baik di rumah kaca (terhadap lima ras yang digunakan) dan lapang (Gambar III.11 dan III.12). Sedangkan varietas yang bersifat tahan terhadap blas leher berjumlah 16 aksesi. Aksesi-aksesi ini akan digunakan dalam kegiatan SNP genotyping untuk pencarian alel-alel potensial untuk sifat tahan penyakit blas.

31

KEGIATAN PENELITIAN

Javanica/Tropical Japonica

PPuti

Rias

Ppulut Saleng Semirit Padi Juwa PKley PHitam Plong Liyo Ppulut Longbanga PKendanggang Pubek Bala GundilPketanPMayun Pulut Timuru Sit PAtok PSeribu Pketan Merah Pandan Dupa PSekrit PImban PTelengusan PKelawit Ppulut Jangan

Bumbuy Inih

Hawara Bunar

Manggar Padi Tinggi Mendalet PBelanda

PPui

Pketan Alay Pbat Kanjat

P Timai

PKrayan

Pare Kaligo Lara Sibau Pare Mangata Melaya IR54 PTimai

Kuntu Ameh Nippon Padi Banten Batanghari Indragiri Buban

PSiam

PLibang Pare Lambeun

Ketupat

Utri Deli Gemas

Gondok

Ciganjur Lantiak

Getik

Arias Halus Bulang Inceklabu Bintang Ladang Condong Pulut Pagae

Menta Djedah

Tjere Bandung Kartuna Markuti Jerai Komas a Ileuy Sirentek Kruet Sintang Padi Belanak K Padi Lungkai Mashuri Pulut Namang SulingPuteh Gaca Teratai Lima Bulan Kamang Pae Gudo PA'gan Mutu Sampang Gendjah Mada

Sirandah Hitam EkorNuri Bura Pare Bakatokaka Sipulut Merah A Ganefo PBa'an

Indika

PJata

Rumbay

Pudak Kuning

Gambar III.10. Dendogram yang dihasilkan dari 96 aksesi padi mggunakan 30 marka SSR dengan program PowerMarker.

Gambar III.11. Keragaan 96 nomor aksesi plasma nutfah padi di Cikembar, Sukabumi, pada umur tanaman 5 minggu setelah tanam.

32

LAPORAN TAHUN 2006

a

b

Gambar III.12. Keragaan tanaman tahan (a) dan peka (b) pada pengujian lapang di Cikembar, Sukabumi, pada saat fase anakan maksimum (kurang lebih umur tanaman 4 bulan setelah tanam).

Pembentukan dan Perbanyakan Benih Hasil Persilangan Tetua Toleran dan Peka Keracunan Al dan Metode Cepat Skrining Tanaman Kedelai Tahan Al Keracunan Al merupakan salah satu kendala utama dalam budi daya kedelai pada lahan masam. Skrining tanaman kedelai untuk sifat toleran keracunan Al di lapang sering sulit memperoleh hasil yang akurat karena keragaman tanah masam yang cukup tinggi. Penelitian ini merupakan bagian dari RPTP berjudul Marka Molekuler Ketahanan Tanaman Kedelai terhadap Keracunan Al yang bertujuan untuk membentuk populasi dan memperbanyak benih F2 hasil persilangan tetua toleran dan peka keracunan Al serta mencari metode cepat skrining tanaman kedelai toleran Al menggunakan sistem hidroponik. Enam kombinasi persilangan dari tiga calon tetua toleran dan dua tetua peka telah dibuat untuk memperoleh tanaman F1 heterozigot. Tanaman F1 tersebut dikonfirmasi menggunakan marka SSR Salf-070 dan Salf-100. Tanaman F2 dikonfirmasi segre-

gasinya menggunakan marka SSR Salf-070. Hasil pengujian terhadap pasangan persilangan dengan menggunakan 15 marka SSR menunjukkan bahwa hanya pasangan B3462 x B3293, B3462 x B3442, B4378 x B3293, dan B3851 x B3442 yang memiliki diversitas genetik dan tingkat polimorfisme yang tinggi dengan menghasilkan populasi berturut-turut 210, 220, 212, dan 215 individu tanaman F2 (Gambar III.13). Pasangan persilangan B3462 x B3293 dan B3462 x B3442 memiliki diversitas genetik dan tingkat polimorfisme yang tinggi sehingga populasi yang dihasilkan diuji lebih lanjut dan telah memperoleh benih F2.3 dari masingmasing penampilan tersebut. Berdasarkan hasil penelitian ini, sistem hidroponik menggunakan bak kaca yang diberi larutan aluminium mengalir dapat digunakan untuk menskrining toleransi tanaman kedelai terhadap keracunan Al, tetapi masih perlu dicari dosis optimum AlCl3.6H2O yang akan digunakan.

33

KEGIATAN PENELITIAN

M 1 24

2

3

4

5

6

7

8

9

10 11 12 13 14 15 16 17 18

19 20 21 22 23 Satt100 Satt070 Satt230 Satt1311 Satt222 Satt300 Satt409

M = 100 bp DNA ladder, 1 = B4377, 2 = B4374, 3 = B4408, 4 = B4376, 5 = B4372, 6 = B3866, 7 = B4311, 8 = B4409, 9 = B4403, 10 = B435, 11 = B3898, 12 = B4410, 13 = B4408, 14 = B4411, 15 = B1958, 16 = B3614, 17 = B3614, 18 = B4368, 19 = B3442, 20 = B438, 21 = B3851, 22 = B3462, 23 = B3293, 24 = Wilis. Ukuran pita DNA berkisar antara 100-300 bp. Gambar III.13. Pola polimorfisme 7 marka SSR pada 24 genotipe kedelai.

Identifikasi Marka Molekuler untuk Seleksi Tetua Pemulih Kesuburan Padi hibrida yang memanfaatkan gejala heterosis mampu meningkatkan potensi hasil varietas padi sebesar 15-20%. Pengembangan padi hibrida di Indonesia menggunakan sistem tiga galur yang membutuhkan galur mandul jantan (CMS), galur pemulih kesuburan (restorer), galur pelestari (maintainer) menggunakan marka molekuler akan mempercepat dan meningkatkan ketepatan identifikasi tetua pemulih kesuburan. Penelitian ini merupakan bagian dari RPTP Teknik Biologi Molekuler untuk Perbaikan Padi Hibrida yang bertujuan mengidentifikasi marka yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi tetua pemulih kesuburan. Hasil penelitian menunjukkan telah diperoleh 30 primer yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi gen pemulih kesuburan Rf1. Kombinasi primer RM410, Rf1-7, dan RM4-5aRfa-R memiliki pita yang berbeda dengan IR24 (1500 bp)

34

dari Koshihikari (1000 bp). Kombinasi ini akan dikonfirmasi menjadi marka molekuler untuk identifikasi gen pemulih kesuburan Rf1, pada kegiatan penelitian tahun 2007. Identifikasi Sifat Tahan Bakteri Hawar Daun Bakteri pada Populasi Haploid Ganda Silangan IR64 dan Oryza rupifogon Jenis gen yang mengendalikan sifat tahan padi terhadap penyakit hawar daun bakteri (HDB) dalam varietas unggul yang telah dirakit masih terbatas, sedangkan patogen penyebab penyakit HDB memiliki keragaman genetik yang tinggi. Dalam rangka menambah keragaman genetik ketahanan terhadap HDB, O. rupifogon dipilih sebagai sumber gen untuk diintrogresikan ke varietas komersial. Penelitian ini merupakan bagian dari penelitian Identifikasi Gen Tahan Bakteri Hawar Daun (Xanthomonas oryzae pv. oryzae) pada populasi haploid ganda silangan IR64 dan O. rupifogon. Metode

LAPORAN TAHUN 2006

yang digunakan adalah persilangan antara padi varietas budidaya IR64 dengan padi liar O. rupifogon, dilanjutkan dengan kultur antera untuk mendapatkan populasi haploid ganda. Populasi haploid ganda tersebut selanjutnya digunakan untuk melakukan (1) evaluasi sifat ketahanan terhadap HDB patotipe III, IV dan VIII, dan (2) identifikasi galur-galur tahan HDB secara molekular. Evaluasi ketahanan terhadap HDB dilakukan pada MH 2005 dan MK 2006 di Sukamandi. Jumlah galur haploid ganda yang diuji sebanyak 92 galur. Dari hasil pengujian pada musim hujan tahun 2005 diperoleh 62 galur yang agak tahan (skor IRRI = 3) patotipe III, 11 galur agak tahan terhadap patotipe IV dan patotipe VIII, serta delapan galur agak tahan terhadap patotipe III, IV dan VIII. Sedangkan pada musim kemarau tahun 2006 diperoleh sembilan galur tahan (skor IRRI = 1) terhadap patotipe III

dan satu galur tahan terhadap patotipe III, IV dan VIII; serta 70 galur agak tahan terhadap patotipe III, 20 galur agak tahan terhadap patotipe III dan IV, tiga galur agak tahan terhadap patotipe IV dan VIII, dan tiga galur agak tahan terhadap ketiga patotipe. Pada MK 2006, telah diamati pula penampilan fenotipenya dan telah terpilih sekitar 12 galur yang memiliki penampilan baik galur-galur tersebut tertera pada Tabel III.15. Sedangkan hasil amplifikasi dengan primer spesifik disajikan pada Gambar III.14. Beberapa galur haploid ganda yang menunjukkan sifat tahan terhadap penyakit HDB telah diidentifikasi dengan PCR menggunakan primer spesifik gen Xa. Hasil menunjukkan bahwa BIO 15 dan BIO 18 mempunyai gen Xa7. Gen Xa7 juga terdeteksi pada kedua tetuanya (IR64 dan O. rufipogon) dan IRBB7 (sebagai kontrol positif) dan juga Kencana Bali (sebagai kontrol ne-

Tabel III.15. Galur terpilih berdasarkan penampilan fenotipik di lapang, Sukamandi, MK 2006.

Galur

Bio 1-AC-Blas/BLB-03 Bio 2-AC-BLB-03 Bio 3-AC-BLB-05 Bio 9-AC-BLB-05 Bio 10-AC-BLB-05 Bio 14-AC-BLB-05 Bio 34-AC-BLB-05 Bio 37-AC-BLB-05 Bio 38-AC-BLB-05 Bio 61-AC-Blas/BLB-03 Bio 62-AC-Blas/BLB-03 Bio 71-AC-BLB-03 IR64 TN1 Code Angke

Sifat ketahanan III-IV-VIII* R-MR-MR MR-MR-MR MS-S-S MR-MR-S R-R-R MR-MS-MS MR-MS-MS R-MS-MS MR-MS-MS MR-MS-MR MS-MS-MS MR-MS-MS

Hasil pada galur harapan ukuran 1 x 1 m GKP (g)

GKG (g)

Persentase kenaikan terhadap IR64

922 935 1.055 9.645 1.033 968 897 972 896 931 996 966 686 649 1.068 1.007

861,64 858,89 948,64 815,53 942,91 906,54 851,10 921,59 850,78 879,03 936,24 912,08 648,50 608,02 972,37 914,14

32,86 32,44 46,28 25,72 45,39 39,79 31,24 42,11 31,19 35,54 44,37 40,64 0,00 6,24 49,94 40,96

*R = tahan, MR = agak tahan, MS = agak peka, S = peka; GKP = gabah kering panen; GKG = gabah kering giling.

35

KEGIATAN PENELITIAN

Atas:

1, 4, 7, 10, 13, 16 = menggunakan primer-primer Xa4; 2, 5, 8, 11, 14, 17 = menggunakan primer-primer Xa7; 3, 6, 9, 12, 15, 18 = menggunakan primer-primer Xa21.

Bawah: L = 100 bps ladder, 14 = BIO15, 79 = BIO 18, P = IR64, P2 = O. rufipogon, IRBB4, 7, 21 = IRBB4, IRBB7, IRBB21, KBI = Kencana Bali. Gambar III.14. Fragmen-fragmen DNA dari PCR menggunakan primer-primer spesifik untuk Xa4, Xa7, dan Xa21.

gatif). Berdasarkan data skrining sifat ketahanan dan data molekular, mengindikasikan bahwa kemungkinan galur-galur haploid ganda yang tahan terhadap penyakit HDB tidak hanya mengandung gen Xa7, tetapi juga gen Xa yang lain. Hal ini karena galur-galur haploid ganda tersebut bersifat tahan sedangkan Kencana Bali yang merupakan kontrol negatif bersifat rentan. Oryza rufipogon merupakan sumber gen dalam program perbaikan varietas padi. Dalam usaha mengeksploitasi gen-gen berguna dari O. ropifogon, populasi silang balik lanjut dan populasi haploid ganda hasil persilangan IR64 dengan O. rupifogon telah digunakan untuk memetakan gen ketahanan terhadap penyakit blas. Penelitian yang merupakan bagian dari penelitian Developing Blast Durable Resistance by Using the Wild Rice Species Oryza rupifogon ini bertujuan untuk (1) mengidentifikasi dua gen yang berikaitan dengan sifat

36

tahan terhadap blas, yaitu Pir4(t) yang berasal dari O. rofipogon dan Pir7(t) yang berasal dari padi IR64, pada kromosom 2, dan (2) mengevaluasi sifat tahan galur haploid ganda yang diturunkan dari populasi BC2F3 hasil persilangan antara IR64 x O. rufipogon terhadap penyakit blas. Pada penelitian tahun 2005 berhasil dipetakan posisi gen Pir (4&7) yang berada pada dua marka Simple Sequence Repeat (SSR), yaitu marka RM263-RM250, dengan jarak 28,5 cM. Pada penelitian tahun 2006 dilakukan pemetaan lebih detail untuk menentukan lokasi gen secara pasti. Untuk tujuan tersebut, dipilih dua galur BC5, yaitu 317-25-1-6 dan 317-251-3. Analisis posisi gen dilakukan dengan pendekatan analisis insilico pada puncak daerah yang berada diantara marka RM263-RM250. Pada daerah ini terdapat sekitar 25 gen putatif ketahanan terhadap penyakit. Gen-gen putatif tersebut dianalisis berdasarkan sekuens basa dari gen ter-

LAPORAN TAHUN 2006

pilih untuk dijadikan dasar dalam design primer spesifik berdasarkan TIGR gene genome browser. Primer yang dihasilkan merupakan primer Single Nucleotide Polymorphism (SNP) yang memiliki tingkat polimorfisme yang tinggi untuk memetakan posisi suatu gen. Pengembangan Galur Tahan terhadap Penyakit Blas Menggunakan Kerabat Liar Padi Hasil dari interval mapping analysis (Gambar III.15) pada populasi BC5F2 menunjukkan bahwa nilai LOD tertinggi diperoleh sebesar 17,1, sedangkan pada populasi BC2F3 nilai LOD tertinggi hanya sekitar 3.59. Analisis GLM untuk uji asosiasi menunjukkan adanya perbedaan nyata antara primer PiSNP4 (yang berada di posisi 110,9

cM) dengan patogen blas isolat ID31 yang mempunyai alel avr2 (CM28) pada lokus gen avr-nya. Primer PiSNP7, dengan nilai LOD 7,3, berbeda nyata untuk patogen blas isolat ID9 yang mempunyai alel avr1 (PH14) pada gen avr gen lokus ACE1. Hasil dari uji progeni (progeny contrast test) untuk dua gen target menunjukkan bahwa IR64 tahan terhadap patogen blas isolat ID9 (PH14) tetapi peka terhadap isolat ID31 (CM28). Sebaliknya, O. rufipogon tahan terhadap isolat ID31 tetapi peka terhadap isolat ID9. Berdasarkan dari analisis introgresi pada progeni BC5F2 menunjukkan bahwa galur NIL 317-25-1-6 yang memiliki introgresi dari IR64 pada posisi Pir7 tahan terhadap isolat ID9, sedangkan galur NIL 317-25-1-3 yang memiliki itrogresi dari

RM263 : 103,9-105,8 cM R_ins1 : 106,6 cM R_ins2 : 107,4-109,3 cM R_ins3 :110,7 cM R_ins4 :110,9 cM Pir4, Pval = 0.0007, LOD = 17.1, Rsq = 0,23 R_ins5 : 112,6 cM RM221 : 114 cM R_ins6 :118,1 cM R_ins7 : 122,8 cM RM6 : 125,6 cM

Pir7, Pval = 0,0012, LOD = 7,3, Rsq = 0,16

28,5 cM

R_ins8 : 126,4-128,3 cM R_ins9: 129,4 cM RM250 : 138-140,9 RM208 :154,1 cM R_ins10 : 156 cM RM266 : 157,9 cM 3,8 cM

15

10 5 Skor LOD

0

BC5F2 Pir4 introgresi dari O. rufipogon BC2F3 Pir7 introgresi dari IR64

Gambar III.15. Composite Interval Mapping gen Pir4 (introgresi dari O. rufipogon) dan Pir7 (introgresi dari IR64) pada populasi BC5F2 dibandingkan dengan pada populasi BC2F2.

37

KEGIATAN PENELITIAN

Tahan

Peka

Tahan

Peka

Gambar III.16. Penampilan galur haploid ganda terhadap serangan penyakit blas di lahan petani di Sukabumi pada musim tanam tahun 2006.

O. rufipogon pada posisi Pir4 tahan terhadap isolat ID31. Ketahanan dari kedua galur ini diperoleh dari populasi BC5 yang sama dengan tetuanya, IR64 dan O. rufipogon. Galur-galur haploid ganda yang diturunkan dari BC2F3 dievaluasi ketahanannya di lapang untuk mengetahui durabilitas sifat tahan dari galur tersebut terhadap penyakit blas. Pada tahun 2006, uji lapang dilakukan di Sukabumi. Hasil pengamatan di lapang menunjukkan beberapa galur memiliki sifat tahan terhadap serangan penyakit blas (Gambar III.16). Isolasi Gen Ketahanan Blas dan Hawar daun Bakteri pada Padi Menggunakan Strategi Over-Ekspresi Serangan penyakit jamur blas dan bakteri hawar daun menyebabkan kehilangan hasil yang nyata pada budidaya padi. Produksi tanaman di daerah-daerah yang mengalami serangan penyakit bisa ditingkatkan dan distabilkan dengan pengembangan dan penggunaan kultivar yang tahan. Pendekatan pemuliaan klasik seperti silang balik perlu dilengkapi dengan pendekatan transgenik, mengingat di lapangan kedua penyakit ini melakukan adaptasi se-

38

cara cepat untuk mematahkan kultivarkultivar tahan yang baru dilepas. Dalam penelitian ini dilakukan strategi over-ekspresi kandidat gen yang menyandi faktor transkripsi yang terkait mekanisme defensif. Pendekatan tambahan yang dilakukan adalah melakukan strategi over-ekspresi skala besar (high-throughput) menggunakan teknik penanda aktivasi. Melalui pendekatan ini akan didapatkan tanaman mutan yang akan diseleksi ketahanannya terhadap penyakit jamur blas dan bakteri hawar daun. Penelitian ini meliputi tiga kegiatan, yaitu (1) perakitan vektor overekspresi kandidat gen ketahanan penyakit, (2) pengembangan galur-galur padi transgenik yang mengandung rakitan overekspresi kandidat gen ketahanan penyakit, dan (3) pengembangan galur-galur padi transgenik yang mengandung rakitan penanda aktivasi. Pemilihan gen kandidat ketahanan penyakit dilakukan dengan pendekatan positional candidate gene. Pengembangan galur-galur padi transgenik dilakukan dengan metode transformasi menggunakan Agrobacterium tumefaciens strain Agl-1. Hasil penelitian menunjukkan (1) telah diperoleh satu vektor rakitan over-

LAPORAN TAHUN 2006

konstruk 35S-OsSHN1 dan OsWRKY76 secara berurutan (Gambar III.20), dan 5 lini independen Asemandi transgenik (27 tanaman) yang mengandung vektor rakitan penanda aktivasi.

ekspresi gen OsWRKY76 (Gambar III.17, III.18, dan III.19), (2) telah didapatkan 5 lini independen (10 tanaman) dan 5 lini independen (18 tanaman) padi Nipponbare transgenik dari hasil transformasi dengan

Kb

1

2

3

4

5

6

3.000 1.200

Gambar III.17. Hasil konfirmasi keberadaan fragmen gen OsWRKY76 pada plasmid pGEM-T easy yang dipotong dengan enzim BamHI dan SalI, menghasilkan fragmen dengan ukuran +3.000 bp (fragmen pGEM-T Easy) dan 1.200 bp (fragmen OsWRKY76 sampel nomor 1, 2, 4, dan 5). Sampel nomor 3 dan 6 menghasilkan ukuran fragmen yang tidak sesuai.

Kb

1

2 31 (a)

3 Kb

4

5

6

13 (b) 3.000

11.000

11.200 1.200

1.040 710

1.200 550

210

Gambar III.18. Hasil konfirmasi dari 2 sampel plasmid untuk mengetahui keberadaan gen kimera (promoter 35S, gen OsWRKY76, dan terminator 35S) pada plasmid biner pCAMBIA 1301, dengan menggunakan 2 cara pemotongan (a) pCAMBIA 1301 rekombinan dipotong dengan menggunakan enzim restriksi EcoRI menghasilkan produk hasil pemotongan dengan ukuran 210, 710, 1040, dan 11000 bp, dan (b) pCAMBIA rekombinan dipotong menggunakan 3 enzim restriksi HindIII, BamHI dan SalI, menghasilkan produk dengan ukuran 550, 1200, dan 11200 bp.

39

KEGIATAN PENELITIAN

RB

LB 35SP

OsWRKY76

550 bp HindIII & EcoRI

490 bp BamHI

EcoRI

35ST

710 bp

210 bp

EcoRI & SalI

EcoRI

Gambar III.19. Skema konstruk 35S::OsWRKY76 dalam vektor biner pCAMBIA 1301 dengan situs pemotongan enzim restriksi, dan ukuran dari masing-masing fragmen. DNA Nipponbare

Kb

1200

Gambar III.20. Hasil amplifikasi 5 sampel DNA Nipponbare dengan primer spesifik untuk gen OsWRKY76. Ukuran Gen OsWRKY76 +1200 bp ditandai dengan anak panah.

40


LAPORAN TAHUN 2006

IV. Kebijakan Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik Pertanian PENGELOLAAN SUMBER DAYA GENETIK TANAMAN UNTUK PANGAN DAN PERTANIAN Pada 1 November 2001, Perserikatan Bangsa-Bangsa melalui FAO membuat suatu perjanjian mengenai sumber daya genetik (SDG) tanaman untuk pangan dan pertanian, yaitu International Treaty on Plant Genetic Resouces for Food and Agriculture (IT-PGRFA). Perjanjian tersebut bertujuan melestarikan dan memanfaatkan SDG tanaman untuk pangan dan pertanian secara berkelanjutan, dan pembagian keuntungan secara adil dan merata yang berasal dari pemanfaatannya. Perjanjian ini selaras dengan Konvensi Keanekaragaman Hayati yang sudah diratifikasi Indonesia, melalui Undang-Undang (UU) Nomor 5 Tahun 1994. Perjanjian IT-PGRFA merupakan dasar untuk melindungi hak-hak petani dan komunitasnya termasuk pengetahuan tradisional, pembagian keuntungan untuk melestarikan dan mengembangkan SDG tanaman menurut peraturan/kebijakan nasional negara yang bersangkutan. Pengaturan akses dan pembagian keuntungan secara transparan terhadap sekitar 64 tanaman dan hijauan pakan utama (tertera dalam Lampiran 1 IT-PGRFA), dilaksanakan melalui multilateral system (MS). Pengaturan pengalihan SDG tanaman (material transfer agreement = MTA) dalam MS akan ditentukan oleh governing body (GB)

yang terdiri atas Para Pihak yang 40 pertama meratifikasi IT-PGRFA. Salah satu hasil keputusan Konferensi Para Pihak (COP)-7, Konvensi Keanekaragaman Hayati mengenai pembahasan thematic issues tentang pengelolaan keanekaragaman sumber daya genetik pertanian, yakni mendesak Para Pihak agar segera meratifikasi IT-PGRFA. Himbauan agar Para Pihak segera meratifikasi IT-PGRFA juga disampaikan sebagai Deklarasi (butir 35) Pertemuan Puncak Pangan Dunia 2002 (World Food Summit; five years later) International Alliance Against Hunger. Mensikapi hasil-hasil pertemuan tersebut, Departeman Pertanian melalui Komisi Nasional Plasma Nutfah dan Badan Litbang Pertanian menyiapkan dan menyelenggarakan pembahasan antar Departemen mengenai Rancangan Undang-Undang (RUU) untuk mensahkan perjanjian mengenai SDG tanaman untuk pangan dan pertanian selama tahun 2005. Pada tanggal 12 Januari 2006, Presiden RI Dr. H. Susilo Bambang Yudhoyono menyampaikan Amanat Presiden yang ditujukan kepada Pimpinan Dewan Perwakilan Rakyat-Republik Indonesia (DPR-RI) yang berisi RUU Pengesahan Perjanjian Mengenai Sumber Daya Genetik Tanaman untuk Pangan dan Pertanian untuk dibahas bersama dengan DPR, guna mendapatkan persetujuan. Presiden dalam amanatnya menugaskan Menteri Pertanian

41

KEBIJAKAN BIOTEKNOLOGI DAN SUMBER DAYA GENETIK PERTANIAN

dan Menteri Luar Negeri untuk mewakili Presiden RI dalam pembahasan tersebut. Pembahasan RUU pengesahan ITPGRFA dengan DPR dilakukan sejak tanggal 17 Januari sampai dengan 23 Februari 2006 (Gambar IV.1). Hasil pembahasan tersebut pada tanggal 28 Februari 2006 dibawa ke Sidang Paripurna ke-23 masa sidang III tahun sidang 2005-2006 dengan acara khusus: Pembicaraan Tingkat II/ Pengambilan Keputusan terhadap RUU tentang Pengesahan IT-PGRFA (Gambar IV.2). Sidang

Paripurna memutuskan bahwa DPR-RI menerima dan mengesahkan UU tentang Pengesahan IT-PGRFA. Setelah pengesahan UU oleh DPR-RI (tanggal 28 Februari 2006), maka Menteri Pertanian pada tanggal 10 Maret 2006 mengirimkan surat resminya untuk mendepositkan UU Nomor 4 Tahun 2006 ke Sekretariat Treaty di Roma, sehingga sejak hari itu Indonesia tercatat sebagai anggota Dewan Pengatur Treaty. Dengan demikian, Indonesia mempunyai hak suara sebagai anggota Badan Pengatur. Kedu-

Gambar IV.1. Rapat Kerja Komisi IV DPR-RI dengan Menteri Pertanian dan Menteri Luar Negeri pada tanggal 9 Februari 2006.

Gambar IV.2. Rapat Paripurna ke-23 DPR-RI pada tanggal 28 Februari 2006.

42

LAPORAN TAHUN 2006

dukan Indonesia sebagai anggota Badan Pengatur ini langsung dimuat dalam daftar di situs Treaty. Pengesahan UU Nomor 4 Tahun 2006 dilakukan pada tanggal 20 Maret 2006 oleh Presiden RI dan dicatat sebagai Lembaran Negara Republik Indonesia Nomor 23 Tahun 2006, sedangkan Penjelasan UU Nomor 4 Tahun 2006 dicatat sebagai Tambahan Lembaran Negara Republik Indonesia Nomor 4612.

pelestarian, pemanfaatan serta pengeluaran, dan pemasukan SDG tanaman, BBBiogen dan Komisi Nasional Plasma Nutfah terlibat dalam penyusunan Rancangan Peraturan Menteri Pertanian (Permentan) tentang pencarian, pengumpulan, pelestarian, pemanfaatan serta pengeluaran, dan pemasukan SDG tanaman. Rancangan Permentan tersebut terdiri atas 70 pasal yang memuat: 1. KETENTUAN UMUM, sebanyak 3 pasal;

PELESTARIAN DAN PEMANFAATAN SUMBER DAYA GENETIK TANAMAN

2. PELESTARIAN SUMBER DAYA GENETIK

Sumber daya genetik tanaman merupakan kekayaan negara yang tidak ternilai harganya dan merupakan bahan dasar yang penting untuk dimanfaatkan dalam kegiatan pemuliaan untuk memperoleh varietas tanaman unggul baru. Oleh karenanya keberadaan SDG harus dipertahankan dan potensinya perlu terus digali dan dimanfaatkan melalui kegiatan pencarian, pengumpulan, pemuliaan, dan pengembangannya. Di samping SDG yang berasal dari dalam negeri, untuk memenuhi kebutuhan pemuliaan diperlukan juga SDG yang berasal dari luar wilayah Republik Indonesia. Perolehan SDG dari luar wilayah Republik Indonesia umumnya dilakukan melalui cara tukar-menukar. Pemerintah mengatur keperluan di atas melalui Peraturan Pemerintah (PP) Nomor 44 Tahun 1995 tentang Perbenihan Tanaman. Untuk mengimplementasikan PP tersebut, dipandang perlu mengatur masalah pencarian, pengumpulan, pelestarian, pemanfaatan serta pengeluaran, dan pemasukan SDG tanaman.

b. Kebun Koleksi dan Tempat Penyimpanan sebanyak 19 pasal

Dalam memenuhi kebutuhan pengaturan tentang pencarian, pengumpulan,

a. Eksplorasi sebanyak 16 pasal

3. PEMANFAATAN a. Pemasukan Sumber Daya Genetik sebanyak 10 pasal b. Pengeluaran Sumber Daya Genetik 4. KETENTUAN PERALIHAN 5. KETENTUAN PENUTUP Penyusunan Rancangan Permentan dilakukan di Badan Litbang Pertanian. Selanjutnya Rancangan tersebut dibahas oleh Biro Hukum dan Humas, Deptan bersamasama dengan Direktorat Jenderal terkait. Pada tanggal 29 Desember 2006 Rancangan Permentan tersebut disahkan oleh Menteri Pertanian menjadi Permentan 67/Permentan/OT.140/12/2006. Permentan 67/2006, merupakan prosedur pemberian izin untuk melaksanakan pelestarian SDG yang meliputi eksplorasi, koleksi, kebun koleksi, dan tempat penyimpanan, serta pemanfaatan yang meliputi pengeluaran dan pemasukan SDG tanaman. Pemberian izin melaksanakan kegiatan tersebut dilakukan oleh Badan Lit-

43


bang Pertanian atas nama Menteri Pertanian sebagaimana diamanatkan oleh Permentan tersebut. PENGEMBANGAN DATABASE PLASMA NUTFAH TANAMAN PANGAN Informasi karakteristik aksesi-aksesi yang disimpan dalam bank gen harus dapat diakses secara cepat dan mudah. Oleh karena itu, dikembangkan sistem database plasma nutfah. Sistem database plasma nutfah disusun dalam bentuk program aplikasi berbasis Microsoft Access. Database plasma nutfah yang dikembangkan meliputi database plasma nutfah tanaman pangan dan database plasma nutfah mikroba pertanian. Database plasma nutfah tanaman pangan menghimpun data paspor, karakterisasi, evaluasi, dan pengelolaan benih (hasil pengujian viabilitas benih, tata letak benih dalam bank gen, monitoring kondisi alat penyimpan benih serta pengguna benih). Sementara itu, database plasma nutfah mikroba pertanian menghimpun data paspor, karakterisasi, dan evaluasi dari koleksi plasma nutfah mikroba pertanian yang meliputi bakteri, fungi berfilamen, yeast, dan virus. Data yang didokumentasikan dalam database plasma nutfah tanaman pangan meliputi data paspor (data yang berkaitan dengan asal materi plasma nutfah), karakterisasi (data yang berkaitan dengan karakter-karakter morfologi dan agronomi), dan evaluasi (data yang berkaitan dengan mutu gizi/nutrisi serta ketahanan/toleransi terhadap cekaman biotik dan abiotik). Data plasma nutfah tanaman pangan yang tersusun dalam bentuk sistem database yang

44

baik akan memiliki karakteristik mudah dalam pemasukan data ke dalam media penyimpanan, tervalidasinya data selama tahap pemasukan, fleksibel dalam pengoperasian entry dan akses data, ketersediaan data senantiasa terbaharui (up to date), dan memungkinkan untuk dilakukan pertukaran (exchange) data secara cepat. Dari hasil inventarisasi, telah diperoleh data plasma nutfah tanaman pangan hasil karakterisasi dan evaluasi sebanyak 654 record, yang meliputi: 1. Data hasil karakterisasi morfologi plasma nutfah terigu (66 aksesi), 2. Data hasil karakterisasi morfologi plasma nutfah talas (176 record), 3. Data hasil karakterisasi morfologi plasma nutfah sorgum (211 record), 4. Data hasil evaluasi ketahanan plasma nutfah padi terhadap keracunan Fe (200 record). Pada tahun 2006, database plasma nutfah tanaman pangan telah menampung sebanyak 9.811 record yang meliputi 3.867 aksesi padi (41 deskriptor), 708 aksesi jagung (29 deskriptor), 211 aksesi sorgum (22 deskriptor), 839 aksesi kedelai (28 deskriptor), 619 aksesi kacang tanah (19 deskriptor), 1025 aksesi kacang hijau (20 deskriptor), 434 aksesi ubi kayu (23 deskriptor), 1.447 aksesi ubi jalar (35 deskriptor), 112 aksesi kacang tunggak (22 deskriptor), 88 aksesi padi liar (5 deskriptor), 64 aksesi terigu (5 deskriptor), dan 397 aksesi ubi-ubian minor. Ubi-ubian minor terdiri atas 176 aksesi talas (5 deskriptor), 58 aksesi belitung (5 deskriptor), 34 aksesi ubi kelapa (5 deskriptor), 33 aksesi gembili (5

LAPORAN TAHUN 2006

deskriptor), 48 aksesi ganyong (5 deskriptor), 13 aksesi suweg (5 deskriptor), 18 aksesi gadung (5 deskriptor), dan 17 aksesi patat/garut (5 deskriptor). Gadung, garut, dan suweg merupakan komoditas ubi-ubian minor yang baru dimasukkan ke dalam database pada kegiatan tahun 2006. Dari keseluruhan komoditas plasma nutfah tanaman pangan, hanya empat komoditas kacang-kacangan minor yang datanya belum masuk ke dalam database, yaitu kacang gude, kacang komak, kacang koro, dan kacang Bogor. Banyaknya aksesi masing-masing komoditas dan banyaknya karakter yang telah berhasil dientri ke dalam database disajikan pada Tabel IV.1. Pengelolaan data plasma nutfah tanaman pangan dalam tahun 2006 ini lebih banyak dilakukan dalam hal pembaharuan

dan koreksi data. Hal tersebut berakibat pada beberapa komoditas justru mengalami pengurangan karena terjadi koreksi data dalam database. Untuk komoditas padi liar, terigu, dan beberapa komoditas ubiubian minor (belitung, ubi kelapa, gembili, gadung, garut, ganyong, dan suweg) data yang masuk baru berupa data paspor saja (sebanyak 5 deskriptor) yang meliputi: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, provinsi asal, dan negara asal. Pada komoditas padi liar dan terigu, telah dilakukan kegiatan karakterisasi morfologi namun data belum dientri karena masih diverifikasi di masing-masing kurator. Sementara pada komoditas ubi-ubian minor belum dilakukan kegiatan karakterisasi morfologi sehingga data karakteristik morfologi pada kelompok komoditas ini belum ada. Seca-

Tabel IV.1. Jumlah aksesi plasma nutfah tanaman pangan tahun 2006. Komoditas

Jumlah aksesi Dalam Bank Gen

1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9.

Padi Jagung Sorgum Kedelai Kacang tanah Kacang hijau Ubi kayu Ubi jalar Kacang-kacangan minor: a. Kacang tunggak (Vigna unguiculata) 10. Ubi-ubian minor: a. Talas (Colocasia esculenta (L.)) b. Belitung c. Ubi kelapa (Dioscorea alata (L.)) d. Gembili (Dioscorea esculenta (L.)) e. Gadung (Dioscorea hispida (Dent.)) f. Garut (patat) (Maranta arundinacea (L.)) g. Ganyong (Canna edulis (Ker.)) h. Suweg (Amorphophalus campanulatus) 11. Padi liar 12. Terigu (Triticum aestivum) Jumlah

3.867 800 211 900 1.194 1.025 434 1.506 (141) 112 (397) 176 58 34 33 18 17 48 13 88 64 10.627

Dalam database 3.867 708 211 839 619 1.025 434 1.447 112 176 58 34 33 18 17 48 13 88 64 9.811

45


daun, warna telinga daun, warna buku daun, warna helaian daun, warna pelepah daun, warna lidah daun, panjang daun, lebar daun, warna ruas batang, ketegaran batang, tipe malai, tangkai malai, panjang malai, panjang lemma steril, warna lemma dan palea, warna lemma steril, warna ujung gabah, bulu ujung gabah, warna bulu ujung gabah, warna kepala putik, golongan varietas, umur berbunga, umur panen, banyaknya anakan, tinggi tanaman, habitus, dan kerontokan.

ra lebih terinci perkembangan status pengelolaan database plasma nutfah tanaman pangan pada tahun 2002-2006 disajikan pada Tabel IV.2. Sampai dengan kegiatan tahun 2006 data plasma nutfah tanaman pangan yang telah disimpan dalam database meliputi: 1. Padi a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, provinsi, dan negara asal. b. Data karakterisasi: permukaan daun, posisi daun bendera, warna leher

Tabel IV.2. Perkembangan pengelolaan data plasma nutfah tanaman pangan tahun 2002-2006.

Komoditas

1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9.

Padi Jagung Sorgum Kedelai Kacang tanah Kacang hijau Ubi kayu Ubi jalar Kacang minor a. Kacang tunggak b. Kacang gude c. Kacang komak d. Kacang koro e. Kacang Bogor 10. Ubi-ubian minor a. Talas b. Belitung c. Ubi kelapa d. Gembili e. Gadung f. Garut (patat) g. Ganyong h. Suweg (iles-iles) 11. Padi liar 12. Terigu Jumlah

Jumlah aksesi dalam Bank Gen 3.872 800 211 900 1.194 1.025 434 1.506 (141) 112 10 10 7 2 (397) 176 58 34 33 18 17 48 13 88 66 10.627

Jumlah aksesi dalam database tahun 2002 1

2003 2

2005

2006

2

1

2

1

2

1

2

41 3.653 29 705 22 174 28 771 19 270 20 1.024 23 434 35 998

41 29 22 28 19 20 23 35

3.653 734 210 771 619 1.024 434 1.426

41 29 22 28 19 20 23 35

3.872 749 211 859 671 1.024 434 1.426

41 29 22 28 19 20 23 35

3.867* 708* 211 839* 619* 1.025 434 1.447

41 29 22 28 19 20 23 35

112 -

22 -

112 -

22 -

112 -

22 -

112 -

22 -

112 -

22 -

-

-

34 33 48 88 -

5 5 5 5 -

115 58 34 33 48 88 64

5 5 5 5 5 5 5

176 58 34 33 48 88 66

12 5 5 5 5 5 5

176 58 34 33 16 17 48 13 88 64

12 5 5 5 5 5 5 5 5 5

3.563 705 174 771 270 1.024 434 912

7.965

1

2004

8.345

9.423

9.861

* Penurunan jumlah aksesi pada tahun 2006 karena ada duplikasi aksesi pada tahun sebelumnya. 1 = aksesi, 2 = deskriptor.

46

9.811

LAPORAN TAHUN 2006

c. Data evaluasi: kadar amilosa, ketahanan terhadap bacterial leaf blight, ketahanan terhadap hama daun bergaris putih, ketahanan terhadap hama ganjur, ketahanan terhadap keracunan aluminium, dan ketahanan terhadap kekeringan. d. Data manajemen benih: hasil pengujian daya tumbuh benih (baru dilakukan pada beberapa aksesi) dan pengguna benih. 2. Jagung a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, provinsi asal, dan negara asal. b. Data karakterisasi: warna biji, tipe biji, susunan biji, banyaknya baris, bobot 300 biji (g), warna batang, panjang daun (cm), lebar daun (cm), warna daun, warna urat daun, warna pelepah daun, panjang malai (cm), panjang tangkai malai (cm), jumlah cabang malai, susunan malai, warna sekam, tinggi tongkol (cm), panjang tongkol (cm), diameter tongkol (cm), jumlah daun tongkol, warna rambut, tinggi tanaman (cm), umur panen (hari), dan umur berbunga (hari). c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. d. Data majemen benih: hasil pengujian daya tumbuh benih (baru dilakukan pada beberapa aksesi) dan pengguna benih. 3. Sorgum a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, provinsi asal, kabupaten asal, institusi donor, dan negara asal.

b. Data karakterisasi: tinggi tanaman (cm), umur berbunga (hari), umur masak (hari), banyaknya daun, panjang daun (cm), lebar daun (cm), panjang malai (cm), panjang tangkai malai (cm), banyaknya cabang malai, bobot malai biji per 10 malai (g), sifat malai, banyaknya biji per malai, warna biji, warna sekam, sifat sekam, dan bobot 100 biji (g). c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. d. Data manajemen benih: hasil pengujian daya tumbuh benih dan pengguna benih. 4. Kedelai a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, provinsi asal, instansi donor, negara asal, tetua jantan, dan tetua betina. b. Data karakterisasi: warna biji, bobot 100 biji (g), warna hilum, warna hipokotil, warna bunga, warna polong, banyaknya polong, warna bulu, tipe tanaman, umur berbunga (hari), umur masak (hari), tinggi tanaman berbunga (cm), tinggi tanaman panen (cm), banyaknya cabang, banyaknya buku, diameter batang (cm), panjang daun (cm), dan lebar daun (cm). c. Data evaluasi: kadar protein biji (%) dan ketahanan terhadap penyakit karat. d. Data manajemen benih: hasil pengujian daya tumbuh benih (baru dilakukan pada beberapa aksesi) dan pengguna benih.

47


5. Kacang tanah a. Data paspor: nomor aksesi, nama varietas/galur, kabupaten asal, provinsi asal, dan negara asal.

a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, provinsi asal, dan negara asal.

b. Data karakterisasi: umur berbunga (hari), tinggi tanaman (cm), banyaknya cabang, banyaknya polong tua, warna batang, warna bunga, bobot polong per tanaman (g), warna kulit biji, bobot 100 biji (g), bentuk paruh, bentuk pinggang, jaringan kulit, keberadaan Rhizobium, dan bobot biji per polong (g).

b. Data karakterisasi: warna pucuk, warna tangkai atas, warna tangkai bawah, panjang tangkai (cm), panjang daun (cm), lebar daun (cm), banyaknya lobus daun, warna batang atas, warna batang bawah, tinggi tanaman (cm), indeks panen, bobot umbi (g), warna umbi luar, warna umbi dalam, daging umbi, diameter umbi (cm), dan panjang umbi (cm).

c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. d. Data manajemen benih: hasil pengujian daya tumbuh benih (baru dilakukan pada beberapa aksesi) dan pengguna benih. 6. Kacang hijau a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, provinsi asal, institusi donor, dan negara asal. b. Data karakterisasi: warna biji 1, kondisi 1, warna biji 2, kondisi 2, warna biji 3, kondisi 3, bobot 100 biji (g), banyaknya biji per polong, banyaknya polong per tanaman, bobot tanaman per plot (g), bobot tanaman (g), umur polong masak (hari), umur berbunga (hari), dan tinggi tanaman (cm). c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. d. Data manajemen benih: hasil pengujian daya tumbuh benih (baru dilakukan pada beberapa aksesi) dan pengguna benih.

48

7. Ubi kayu

c. Data evaluasi: kadar pati (%) 8. Ubi jalar a. Data paspor: nomor referensi, nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, provinsi asal, dan negara asal. b. Data karakterisasi: kemampuan membelit, tipe batang, diameter ruas (cm), panjang ruas (cm), warna batang utama, warna batang sekunder, rambut batang, bentuk daun, bentuk umum, tipe lobus, banyaknya lobus, bentuk lobus tengah, ukuran daun, warna petulangan daun, warna daun tua, warna daun pucuk, panjang tangkai daun, warna tangkai daun, bentuk umbi, cacat umbi, tebal korteks, warna kulit predominan, intensitas warna kulit, warna sekunder kulit, warna daging predominan, warna sekunder daging, distribusi warna sekunder daging, dan formasi umbi.

LAPORAN TAHUN 2006

c. Data evaluasi: kandungan bahan kering (%). 9. Kacang-kacangan minor: kacang tunggak a. Data paspor: nomor aksesi dan nama aksesi. b. Data karakterisasi: umur masak (hari), tinggi tanaman (cm), banyaknya cabang, banyaknya polong, bobot 100 biji (g), bobot biji per polong (g), banyaknya biji per polong, diameter polong (cm), panjang polong (cm), panjang daun (cm), lebar daun (cm), warna batang, warna daun, warna bunga, warna polong, warna biji, dan tipe tanaman. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. 10. Ubi-ubian minor, meliputi: i. Ubi kelapa (Dioscorea alata (L.)) a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, dan provinsi asal. b. Data karakterisasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. ii. Gembili (Dioscorea esculenta) a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, dan provinsi asal. b. Data karakterisasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database.

iii. Ganyong (Canna edulis) a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, dan provinsi asal. b. Data karakterisasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. iv. Talas (Colocasia esculenta) a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, dan provinsi asal. b. Data karakterisasi: manifestasi cormus, panjang cormus, cabang cormus, bentuk cormus, bobot cormus, warna cormus, warna daging cormus, warna serat daging cormus, kulit cormus, tebal kulit cormus, tingkat serabut cormus, dan warna tunas cormus. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. v. Belitung (Xanthossoma sp.) a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, dan provinsi asal. b. Data karakterisasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. vi. Gadung (Dioscorea hispida) a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, dan provinsi asal.

49


b. Data karakterisasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. vii. Garut (Maranta arundinaceae) a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, dan provinsi asal. b. Data karakterisasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. viii. Suweg (Amorphophalus campanulatus) a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, dan provinsi asal. b. Data karakterisasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. 11. Padi liar a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, provinsi asal, dan negara asal. b. Data karakterisasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. d. Data majemen benih: hasil pengujian daya tumbuh benih (baru dilakukan pada beberapa aksesi) dan pengguna benih.

50

12. Terigu a. Data paspor: nomor aksesi, nama aksesi, kabupaten asal, provinsi asal, dan negara asal. b. Data karakterisasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. c. Data evaluasi: belum ada data yang masuk ke dalam database. d. Data majemen benih: hasil pengujian daya tumbuh benih (baru dilakukan pada beberapa aksesi) dan pengguna benih. Guna lebih memudahkan dalam pengelolaan data, maka disusun sistem database plasma nutfah tanaman pangan berbasis Microsoft Access. Penambahan serta pengembangan program aplikasi database plasma nutfah tanaman pangan terus dilakukan guna meningkatkan kinerja sistem database yang ada. Dengan adanya sistem database ini, maka kegiatan entri data, validasi data, akses data, monitoring data serta pertukaran data dapat dilakukan secara lebih mudah, cepat, dan akurat. Pengembangan sistem database juga dilakukan pada menu entri data manajemen benih. Pada bagian ini telah ditambahkan dan disempurnakan beberapa form untuk mengakomodasi kegiatan entri data manajemen benih pada komoditas padi, padi liar, jagung, sorgum, kedelai, kacang tanah, kacang hijau, dan terigu. Kegiatan penyempurnaan menu untuk entri ini merupakan lanjutan penyempurnaan dari kegiatan tahun 2005. Pada kegiatan tahun 2006, form entri tersebut secara operasional telah digunakan untuk melakukan kegiatan entri data manajemen benih plasma nutfah tanaman pangan. Tampilan

LAPORAN TAHUN 2006

Gambar IV.3. Tampilan cover luar (menu utama) SIPNP v1.5 plasma nutfah tanaman pangan.

Gambar IV.4. Tampilan cover dalam (menu database plasma nutfah) SIPNP v1.5 plasma nutfah tanaman pangan.

PENGEMBANGAN DATABASE PLASMA NUTFAH MIKROBA PERTANIAN

Data yang telah dientri dan divalidasi dengan program yang telah disusun kemudian disimpan dalam hard disk. Software yang digunakan untuk pengembangan database mikroba pertanian ialah program Microsoft Access 2000. Program ini merupakan sistem manajemen database relasional untuk Microsoft Windows yang memiliki kemampuan untuk menyortir, mengatur, dan melaporkan informasi penting yang diperlukan.

Pada tahun 2005 telah disempurnakan satu prototipe database untuk empat komoditas, yaitu (1) bakteri, (2) fungi berfilamen dan yeast, dan (3) virus. Entri data dilakukan untuk 200 record mikroba pertanian yang terdiri atas record agensia biokontrol dan biofertilizer.

Dengan adanya kemajuan teknologi informasi, aktivitas pendataan dapat dilakukan secara cepat dan akurat melalui sistem komputerisasi. Bahkan telah disediakan suatu perangkat lunak (software) khusus untuk kegiatan pembuatan pangkalan data (database), yaitu Microsoft Acces. Da-

menu SIPNP v1.5 plasma nutfah tanaman pangan disajikan pada Gambar IV.3 dan IV.4. Dalam rangka pelayanan kepada masyarakat telah didistribusikan benih-benih plasma nutfah untuk keperluan penelitian sesuai dengan permintaan dari institusi/ lembaga riset dan perguruan tinggi.

51


tabase yang merupakan kumpulan data ini dapat berfungsi sebagai penampung data dengan mengintegrasikan penggunaan obyek-obyek seperti tabel, form, report, makro, dan modul secara saling berkaitan. Software ini bersifat user friendly, sehingga memudahkan pengguna memahami dan menggunakannya, tanpa memerlukan pengetahuan khusus.

fertilizer dan biodekomposer). Pada tahun 2006 tidak dilakukan entri untuk komoditas virus, karena lebih ditekankan pada agensia biofertilizer dan biokontrol. Foto-foto masing-masing isolat masih disimpan secara terpisah karena masih adanya sedikit kendala dalam format prototipe database ini untuk kolom gambar/foto.

Pada TA 2005 telah dibuat prototipe baku untuk tiga komoditas mikroba, yaitu (1) bakteri, (2) fungi berfilamen dan yeast, dan (3) virus dengan jumlah total entri data sebanyak 250 record. Sebanyak 250 record plasma nutfah mikroba tersebut terdiri atas (1) 110 record bakteri, (2) 50 record fungi berfilamen dan yeast, dan (3) 90 record virus. Pada tahun 2006 telah dilakukan penambahan 200 record plasma nutfah mikroba yang disajikan pada Tabel IV.3.

KEAMANAN HAYATI DAN KEAMANAN PANGAN PRODUK REKAYASA GENETIK

Isolat-isolat yang dimasukkan ke dalam prototipe baku database mikroba adalah isolat yang telah disimpan pada penyimpanan jangka panjang, baik dengan teknik freeze drying, liquid drying maupun freezing. Isolat mikroba tersebut merupakan koleksi sendiri dari hasil eksplorasi tim konservasi dan karakterisasi mikroba dan sebagian merupakan koleksi titipan dari Balai Besar Pascapanen Pertanian (BB Pascapanen) (koleksi agensia bioindustri) dan juga Balai Besar Sumber Daya Lahan Pertanian (BBSDLP) (koleksi agensia bioTabel IV.3. Status entri data komputerisasi komoditas mikroba tahun 2006. Jenis isolat Bakteri Fungi berfilamen dan yeast Virus

52

Jumlah isolat 175 25 0

Pengkajian Teknis Keamanan Hayati Vaksin Rekombinan Bird Close 5.1 Vaksin Bird Close 5.1 merupakan vaksin hasil rekombinasi genetik untuk mengendalikan virus flu burung (avian influenza) yang dikembangkan atas kerja sama antara PT Shigeta dengan Institut Pertanian Bogor (IPB). IPB mengajukan proposal untuk pengkajian keamanan hayati vaksin tersebut kepada Direktorat Kesehatan Hewan, Direktorat Jenderal Peternakan, berhubung vaksin yang akan dilepas merupakan hasil rekombinasi genetik. Sesuai dengan Undang-Undang Nomor 4 Tahun 2004 tentang Ratifikasi Protokol Cartagena, Peraturan Pemerintah Nomor 25 Tahun 2005 tentang Keamanan Hayati Produk Rekayasa Genetik, dan Surat Keputusan Bersama (SKB) Empat Menteri tentang Keamanan Hayati dan Keamanan Pangan Produk Rekayasa Genetik, Direktorat Jenderal Peternakan menyampaikan proposal kepada Komisi Keamanan Hayati dan Keamanan Pangan (KHKP) untuk mengkaji keamanan hayati pelepasan vaksin tersebut. Komisi KHKP sesuai dengan kewenangannya sebagaimana diamanatkan pada SKB menugaskan Tim Teknis Keamanan Hayati dan Keaman-

LAPORAN TAHUN 2006

an Pangan (TTKHKP) untuk melakukan pengkajian keamanan hayati dari segi teknis (keilmuan) atas vaksin tersebut. Pengkajian keamanan hayati vaksin Bird Close 5.1 melibatkan para ahli anggota Kelompok Hewan dan Kelompok Mikroba. Pengkajian dilakukan atas data dan informasi yang disampaikan oleh proponen bersamaan dengan proposal. Mengingat virus yang direkayasa merupakan virus yang bersifat zoonosis yang memiliki efek letal terhadap manusia, belum pernah digunakan di negara manapun, dan akan diproduksi secara masal di Indonesia, maka pengkajian dilakukan secara hati-hati. Hasil analisis terhadap informasi yang disediakan oleh pemohon dan informasi lain yang dikumpulkan para pakar disimpulkan: 1. Vaksin Bird CLOSE 5.1 adalah vaksin hasil rekayasa genetik yang diturunkan dari A/Chicken/Legok/I/2004 (H5N1) yang telah dimodifikasi secara genetik untuk menghilangkan virulensinya dan A/Puerto Rico/8/34 (H1N1) sebagai strain host yang direkomendasi WHO untuk pembuatan vaksin influenza reverse genetic. 2. Vaksin Bird CLOSE 5.1 belum pernah diproduksi dan dipakai di Indonesia maupun di negara lain. 3. Data yang disampaikan oleh pemohon terbatas pada data skala laboratorium, sedangkan percobaan lapang terbatas belum ada. Berdasarkan data yang terbatas tersebut, diketahui bahwa: a Working seed dari vaksin Bird CLOSE 5.1 dan vaksinnya tidak menyebabkan ayam sakit dan karena itu kemungkinan kecil menyebab-

kan penyakit pada manusia dan makhluk lain, b Virus dalam working seed vaksin Bird CLOSE 5.1 tidak dikeluarkan oleh ayam melalui feses, trakea, dan swab cloaca, dan karena itu kemungkinan kecil mencemari lingkungan, c Tidak terdeteksi virus hidup pada vaksin inaktif Bird CLOSE 5.1 dan karena itu kemungkinan kecil menyebabkan penyakit pada manusia dan makhluk lain, d Dalam jangka pendek tidak terjadi riversi atau mutasi virus yang dilemahkan dalam working seed vaksin Bird CLOSE 5.1 dan karena itu kemungkinan kecil menyebabkan penyakit pada manusia dan makhluk lainnya, e Dalam jangka panjang kemungkinan terjadinya riversi atau mutasi pada working seed dari vaksin Bird CLOSE 5.1 belum dapat diprediksi dan karena itu sulit menduga bahayanya terhadap manusia, makhluk lainnya, dan lingkungan pada masa-masa atau generasi yang akan datang, f

Tidak ada strategi jangka panjang pengelolaan risiko bahayanya terhadap manusia, makhluk lainnya, dan pengelolaan pencemaran lingkungan,

g Kurang-lengkapnya data ilmiah primer vaksin Bird CLOSE 5.1. Berdasarkan data tersebut di atas dan menyadari bahwa:

53


1. Vaksin Bird CLOSE 5.1 merupakan produk yang belum pernah dipakai di negara manapun di dunia,

Konsultasi Penetapan Rekomendasi Keamanan Hayati Vaksin Rekombinan Bird Close 5.1

2. Belum dilakukannya penelitian/percobaan di lapangan uji terbatas dan atau lapangan bebas,

Pertemuan dihadiri oleh 15 anggota dari 26 anggota Komisi dan anggota Tim Teknis dan dipimpin oleh Dr. Achmad Suryana/Ketua I Komisi KHKP. Pada pembukaan, pimpinan rapat mengkonfirmasikan bahwa berdasarkan amanat PP 21 Tahun 2005 tentang Keamanan Hayati Produk Rekayasa Genetik, Komisi yang ada saat ini masih legal untuk melakukan pertemuan dan pengkajian. Pimpinan rapat menjelaskan bahwa vaksin Bird CLOSE 5.1 diajukan oleh Direktorat Jenderal Peternakan kepada Komisi KHKP dan TTKHKP untuk melakukan pengkajian. Pimpinan rapat menjelaskan bahwa Komisi telah menjembatani TTKHKP untuk melakukan pertemuan dengan pihak terkait dalam mempercepat proses pengkajian vaksin Bird CLOSE 5.1.

3. Tidak adanya strategi jangka panjang pengelolaan risiko bahayanya terhadap manusia, makhluk lainnya, dan pengelolaan pencemaran lingkungan, 4. Kurang-lengkapnya data ilmiah primer dari seed vaksin Bird CLOSE 5.1, 5. Perlu menghindari hal-hal merugikan yang mungkin timbul di kemudian hari, 6. Perlu membantah pendapat bahwa Indonesia dijadikan daerah/kelinci percobaan. TTKHP berpendapat bahwa pemohon perlu melengkapi: 1. Hasil penelitian di lapangan uji terbatas dan lapangan bebas. 2. Strategi pengelolaan risiko bahayanya terhadap manusia, makhluk lainnya, dan pencemaran lingkungan sebelum memproduksi dan melepas vaksin Bird CLOSE 5.1 ke lapangan. 3. Data ilmiah primer dari seed vaksin Bird CLOSE 5.1. 4. Bukti/pernyataan tertulis yang menyatakan bahwa pemohon bersedia bertanggung jawab terhadap segala kerugian yang mungkin timbul akibat produksi dan pelepasan vaksin tersebut. 5. Bukti/pernyataan tertulis bahwa instansi yang melakukan pengujian telah memenuhi persyaratan WHO untuk menguji vaksin hasil teknologi reverse genetik (strain virus A/IPB-SGT/I/2004).

54

Diskusi atas laporan dari Tim Teknis menghasilkan catatan sebagai berikut: 1. Berdasarkan PP Nomor 21 Tahun 2005 tentang Keamanan Hayati Produk Rekayasa Genetik pada Bab IV pasal 3 yang menyatakan bahwa produk rekayasa genetik dalam taraf litbang perlu diuji di laboratorium, rumah kaca, dan lapang, sehingga apa yang dilakukan oleh TTKHKP sejalan dengan PP Nomor 21 Tahun 2005. 2. Pemohon perlu melaksanaan pengujian di lapangan uji terbatas dan memberikan jaminan tertulis untuk kesediaanya dalam mempertanggungjawabkan segala kerugian yang timbul akibat pelepasan vaksin Close Bird 5.1.

LAPORAN TAHUN 2006

3. Penjelasan pemohon harus didukung oleh data ilmiah baik berupa publikasi ilmiah atau laporan ilmiah.

Pengkajian Proposal Penelitian Tanaman Kentang Transgenik Tahan terhadap Penyakit Late Blight

4. Atas dasar laporan TTKHKP dan diskusi, disimpulkan bahwa:

Penyakit late blight (lodoh daun) yang disebabkan oleh jamur Phytophthora infestans merupakan kendala utama dalam budi daya kentang di daerah sentra produksi di Indonesia. Berbagai varietas tahan yang dikembangkan patah sifat ketahanannya setelah beberapa waktu karena terjadinya perubahan genetik dari patogen di lapang. Untuk itu, sumber ketahanan baru perlu dikembangkan. Gen RB adalah gen yang mengendalikan sifat tahan terhadap P. infestans yang berada pada kerabat liar kentang, Solanum bulbocastanum. Pemindahan sifat ini dari kerabat liar ke varietas komersial secara konvensional selalu dihadapkan kepada kesulitan terbawanya sifatsifat lain yang tidak menguntungkan asal kerabat liar yang terbawa waktu persilangan konvensional karena pemindahan sifat secara konvensional tidak secara selektif. Untuk itu, dipilih teknologi rekayasa genetik untuk memindahkan hanya satu gen saja, yaitu gen RB dari kerabat liar (S. bulbocastanum) ke varietas komersial.

i. Komisi menyampaikan laporan kepada Direktorat Jenderal Peternakan. ii. Berdasarkan data/informasi yang merupakan hasil penelitian di fasilitas uji terbatas (skala laboratorium) yang diberikan oleh pemohon dapat disimpulkan bahwa vaksin Bird CLOSE 5.1 kemungkinannya kecil menyebabkan sakit pada manusia dan hewan, serta kemungkinannya kecil mencemari lingkungan. Namun demikian, kesimpulan itu perlu dikonfirmasi lagi dengan cara melakukan penelitian lanjutan di lapangan uji terbatas sesuai dengan peraturan yang berlaku (SKB 4 Menteri 1999 dan PP Nomor 21 Tahun 2005 Keamanan Hayati Produk Rekayasa Genetik). iii. Komisi KHKP menyarankan agar Direktur Kesehatan Hewan, Direktorat Jenderal Peternakan meminta Pemohon untuk melakukan penelitian di lapangan uji terbatas dalam rangka mengkonfirmasi hasil yang telah diperoleh dari penelitian di fasilitas uji terbatas, sebelum mengizinkan Pemohon untuk memproduksi dan memasarkan vaksin Bird CLOSE 5.1. iv. Ditjen Peternakan dapat menggunakan perangkat Komisi atau perangkat di lingkup Ditjen Peternakan.

Peraturan Pemerintah Nomor 21 Tahun 2005 tentang Keamanan Hayati Produk Rekayasa Genetik selain mengatur mengenai pelepasan tanaman transgenik/GM untuk komersialisasi, juga mengatur mengenai penelitian dan pengembangan. Untuk itu, penelitian mengenai kentang transgenik tersebut dikaji terlebih dahulu oleh TTKHKP berkaitan dengan jaminan teknis keamanan pelaksanaan penelitiannya. Beberapa perubahan pada proposal berkaitan dengan pengamanan penelitian diwajibkan oleh Tim Teknis untuk dilakukan oleh pe-

55


neliti sesuai dengan Draft Pedoman Pengujian lapangan uji terbatas. Inisiasi Jejaring Kerja Laboratorium Uji GMO Meskipun Indonesia telah mempunyai peraturan perundangan mengenai keamanan pangan termasuk GMO (Mentan Nomor 7 Tahun 1996; Peraturan Pemerintah Nomor 69 Tahun 1999 tentang Label dan Iklan Pangan; dan PP Nomor 28 Tahun 2004 tentang Keamanan Pangan) namun sampai sekarang Indonesia belum mengimplementasikan status keamanan pangan bagi produk rekayasa genetika yang sudah banyak beredar di pasaran. Oleh karena itu, sangat perlu pembentukan jejaring pengujian GMO di Indonesia agar kapasitas yang ada bisa dimaksimalkan. Pertemuan Pertama Inisiasi Pembentukan Jejaring Nasional Laboratorium Penguji GMO dilaksanakan pada tanggal 12 April 2006 yang dihadiri oleh perwakilan dari Badan Pengawasan Obat dan Makanan (POM), Direktorat Jenderal P2HP-Deptan, Pusat Penelitian Hayati dan Bioteknologi-IPB, Pusat Penelitian Bioteknologi-LIPI, Balai Penelitian Bioteknologi Perkebunan, dan PT Saraswanti Indo Genetech. Pada pertemuan ini dibahas lima kertas kerja, yaitu Metode GMF Testing: Prospek dan Kendala (Bahagiawati, BB Biogen), Peranan GMF Testing dalam Marketing Produk Pertanian Indonesia (Achmad Suhadiyanto dan Ananto K. Seta, Ditjen P2HP), Pengujian GMO Laboratorium Bioteknologi PPOMN (Badan POM), Kegiatan dan Fasilitas Uji GMF BB-Biogen (Saptowo J. Pardal), dan Uji Pangan Hasil Rekayasa Genetika di PT Saraswanti Indo Genetech (Adinugroho K. Santosa, PT Saraswanti

56

Indo Genetech). Hasil dari penyarian status penelitian rekayasa genetik dan penangan pangan hasil rekayasa genetik telah dilaporkan di Forum ASEAN pada tanggal 9-10 Mei 2006 di Bangkok, Thailand. Pada pertemuan tersebut juga disepakati pembentukan Jejaring Kerja Laboratorium Penguji GMO dengan koordinator BB-Biogen. Jejaring nasional ini diharapkan bisa mendukung keanggotaan Indonesia dalam ASEAN GMF Testing Network. BIOETIKA Salah satu bagian dari Komisi Bioetika Nasional adalah Kelompok Kerja Sumber Daya Genetik (Pokja) yang dipimpin oleh Dr. Sutrisno (Kepala BB-Biogen). Mensikapi kondisi nasional yang ada, Pokja SDG memfokus pengkajian terhadap masalahmasalah utama, antara lain sexing. Perkembangan teknologi sexing pada ternak telah membuka peluang timbulnya masalah di tataran etika. Secara teknis, sexing merupakan upaya pemilihan dan pemisahan sperma ternak, sehingga diprediksi turunannya sesuai dengan harapan. Teknik ini dapat dilakukan secara sederhana. Berdasarken perkembangan teknologi, peluang untuk mengembangkan teknik ini menjadi lebih akurat. Persoalannya adalah apabila teknik ini dikembangkan ke manusia. Bagaimana kalau sexing sperma dan IVM/IVF dikembangkan untuk manusia? Apakah perlu dilakukan pengaturan? Peraturan dan perangkat pengaturan untuk hal ini belum ada. Potensi ini dipandang oleh Pokja perlu menangani masalah ini. Untuk itu, dipandang perlu Pokja mengundang peneliti yang bergerak dibidang ini untuk memperoleh penjelasan sebelum pengkajian terhadap masalah ini dilaksanakan.


LAPORAN TAHUN 2006

V. Diseminasi Hasil Penelitian dan Pelayanan Informasi PUBLIKASI Publikasi yang dihasilkan BB-Biogen pada tahun 2006 adalah (1) Jurnal Agrobiogen Volume 2 Nomor 1 dan 2, (2) Buletin Plasma Nutfah Volume 12 Nomor 1 dan 2, (3) Warta Biogen Volume 2 Nomor 1 s/d 3, (4) Warta Plasma Nutfah Indonesia Nomor 18, (5) Prosiding Seminar Nasional Pemanfaatan Bioteknologi untuk Mengatasi Cekaman Abiotik pada Tanaman, (6) Laporan Tahunan Tahun 2005, Poster, dan Leaflet. Publikasi cetak tersebut, kecuali Poster, diedarkan ke berbagai pihak baik dalam kerangka pemenuhan permintaan institusi lain atau pribadi, dibagikan pada saat BBBiogen mengikuti pameran atau tamu yang berkunjung ke BB-Biogen, atau disampaikan secara rutin ke institusi tertentu. Institusi yang menerima publikasi BB-Biogen, yaitu Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian, Pusat Litbang di lingkup Badan Litbang Pertanian, Pusat Analisis Penelitian Sosial Ekonomi dan Kebijakan Pertanian, Pusat Perpustakaan dan Penyebaran Teknologi Pertanian, LRPI dan Pusat Penelitian di lingkup LRPI, Balai Besar di lingkup Badan Litbang Pertanian, Balai dan Loka Penelitian di Lingkup Badan Litbang Pertanian, Balai Pengkajian Teknologi Pertanian, Pusat dan Balai Penelitian di lingkup LIPI, Balai Pengkajian Bioteknologi BPPT, Direktorat Jenderal dan Pusat di lingkup Departemen Pertanian, Perpustakaan Nasional, PDII LIPI, Biotrop, IndoBIC, Dinas Pertanian

di tingkat Dati I dan Dati II, Perguruan tinggi negeri dan swasta (Lampiran V.1). Artikel ilmiah para peneliti yang dipublikasikan tahun 2006 disajikan dalam Lampiran V.2. Sedangkan, poster digunakan sebagai materi yang disajikan pada saat mengikuti atau menyelenggarakan pameran. Jurnal Agrobiogen Jurnal Agrobiogen memuat artikel primer dan sekunder hasil penelitian bioteknologi dan sumber daya genetik tanaman, serangga, dan mikrob pertanian. Jurnal ini diterbitkan dua kali setahun pada bulan April dan Oktober. Jumlah naskah yang diterima redaksi pada tahun 2006 sebanyak 17 naskah. Berdasarkan hasil pertemuan Dewan Redaksi, 12 naskah dapat dimuat dalam Jurnal Agrobiogen Volume 2 Nomor 1 dan Nomor 2. Lima naskah dikembalikan ke penulisnya untuk diperbaiki sesuai dengan saran Dewan Redaksi (Lampiran V.3). Buletin Plasma Nutfah Buletin Plasma Nutfah terbit dua kali setahun memuat tulisan hasil penelitian dan tinjauan ilmiah tentang eksplorasi, konservasi, karakterisasi, evaluasi, dan utilisasi plasma nutfah tanaman, ternak, ikan, dan mikrob. Jumlah naskah yang diterima redaksi pada tahun 2006 sebanyak 20 naskah. Berdasarkan hasil pertemuan Dewan Redaksi, 15 naskah dapat dimuat dalam Buletin Plasma Nutfah Volume 2 Nomor 1

57

DISEMINASI HASIL PENELITIAN DAN PELAYANAN INFORMASI

dan Nomor 2. Empat naskah dikembalikan ke penulisnya untuk diperbaiki sesuai dengan saran Dewan Redaksi dan satu naskah ditolak (Lampiran V.4).

Genetik Pangan dan Pertanian, Pengelolaan Plasma Nutfah di Daerah, dan berita lainnya.

Warta Biogen dan Plasma Nutfah Indonesia

Prosiding memuat naskah Seminar Nasional Pemanfaatan Bioteknologi untuk Mengatasi Cekaman Abiotik pada Tanaman yang diselenggarakan pada tanggal 2324 Agustus 2005. Judul naskah yang diprosiding disajikan pada Tabel V.1.

Warta Biogen merupakan warta internal lingkup BB-Biogen yang memuat informasi kebijakan, artikel bebas, abstrak hasil seminar atau berita lain. Warta Biogen terbit tiga kali setahun, bahan berita biasanya ditulis oleh redaksi atau dari Laporan Bulanan BB-Biogen yang ditulis untuk bahan Rapim Badan Litbang Pertanian. Artikel yang dimuat pada ketiga edisi warta selama tahun 2006 meliputi Pengelolaan Plasma Nutfah (3 artikel), Biologi Molekuler dan Rekayasa Genetik (3 artikel), Kultur Jaringan (1 artikel), Pemanfaatan Feromon (1 artikel), Pupuk dan Pestisida Hayati (1 artikel), dan berita lainnya. Warta Plasma Nutfah Indonesia merupakan media komunikasi dan pemasyarakatan plasma nutfah. Pada tahun 2006, warta terbit satu edisi memuat artikel tentang Pengesahan Perjanjian Sumber Daya

Prosiding

Poster dan Leaflet Visualisasi yang dihasilkan BB-Biogen pada tahun 2006 adalah (1) Poster Biopestisida Jamur Patogen Serangga, Nematoda Patogen Serangga sebagai Biopestisida Unggulan, Feromon Serangga Biorasional Insektisida Ulat Bawang (Spodoptera exigua), Improvement of Hybrid Rice Parental Lines through Biotechnology, Perbaikan Tetua Padi Hibrida melalui Bioteknologi, Biophos, Produksi Bibit Gaharu melalui Kultur In Vitro, Perbanyakan Bibit Tanaman Buah melalui Kultur Jaringan, Perbanyakan Bibit Tanaman Hias, dan (2) Leaflet Profil BB-Biogen (Bahasa Indonesia dan Inggris),

Tabel V.1. Naskah yang dimuat pada Prosiding Seminar Nasional Pemanfaatan Bioteknologi untuk Mengatasi Cekaman Abiotik pada Tanaman. No. Judul naskah 1. Cekaman Abiotik Utama dalam Peningkatan Produktivitas Tanaman (Dr. Abdul Karim Makarim, Balai Penelitian Tanaman Padi, Sukamandi) 2. Eksplorasi Gen-gen Toleran Cekaman Abiotik pada Tanaman (Dr. Suharsono, Institut Pertanian Bogor) 3. Seleksi In Vitro untuk Toleransi terhadap Faktor Abiotik pada Tanaman Padi dan Kedelai (Dr. Ika Mariska, Balai besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian) 4. Parthenocarpy, a Strategy for Fruit Development under Adverse Environmental Conditions (Dr. Agostino Falavigna, Research Institute for Vegetable Crops Montanaso-Lombardo, Italy) 5. Pengembangan Produk Rekayasa Genetika Berorientasi Komersial: Prospek dan Tantangan (Ir. Edwin Saragih, CropLife, Jakarta) 6. Functional Genomic Approaches to Plant Stress Resistance (Dr. Adi Pancoro, Institut Teknologi Bandung) 7. Photosynthesis-related Stress on Plants and Their Resistance to It (Prof. Masaaki Takahashi, Ph.D, Osaka Prefecture University, Jepang)

58

LAPORAN TAHUN 2006

NPS Bioinsektisida, Feromon-Exi Biorasional Insektisida Unggulan, Kit ELISA untuk Deteksi Dini Peanut Stripe Virus, Teknologi Produksi Bibit Abaka melalui Kultur Jaringan, Fasilitas Uji Terbatas, Spesies Padi Liar Oryza spp. SEMINAR Berdasarkan frekuensi penyelenggaraannya seminar di BB-Biogen dikelompokkan atas seminar bulanan dan tahunan. Substansi yang dibahas pada seminar bulanan lebih bersifat menjawab perkembangan penelitian dan sosialisasi peraturan atau kebijakan yang berkaitan dengan tugas pokok dan fungsi BB-Biogen, sedangkan pada seminar tahunan terdapat dua bentuk, yaitu seminar evaluasi hasil penelitian tahun anggaran 2005 dan seminar internasional yang membahas topik Status dan Prospek Produk Bioteknologi Modern. Seminar Rutin BB-Biogen Seminar rutin merupakan upaya peningkatan kapasitas yang berkaitan dengan substansi penelitian atau kebijakan yang berkaitan dengan penelitian. Pada tahun 2006, telah dibahas sebanyak 20 kertas kerja berkaitan dengan penelitian dan 12 kertas kerja non penelitian (Lampiran V.5). Dari 20 kertas kerja yang berkaitan dengan penelitian, terdiri atas sembilan kertas kerja mengenai penelitian bioteknologi modern, lima kertas kerja mengenai teknologi kultur jaringan, dan enam kertas kerja berkaitan dengan pengelolaan SDG. Sedangkan dari 11 kertas kerja non penelitian terdiri atas kertas kerja membahas peralatan penanganan benda cair (1), komersialisasi

GMO (1), karantina (2), manajemen penelitian (4), pengelolaan SDG (2), perpustakaan BB-Biogen (1), dan situs BB-Biogen (1). Seminar rutin tidak saja dihadiri oleh peneliti BB-Biogen, tetapi peserta dari institusi lain seperti Balai Penelitian dan Pusat Penelitian dan Pengembangan di Bogor, Perguruan Tinggi, dan Pemerintah Daerah. Seminar Hasil Penelitian TA 2005 Seminar Hasil Penelitian BB-Biogen Tahun 2005 merupakan seminar evaluasi atas penelitian yang sudah dilaksanakan. Seminar ini bersifat terbatas hanya dihadiri oleh peneliti, teknisi litkayasa, dan staf BBBiogen. Makalah yang diseminarkan pada kegiatan ini, merupakan makalah yang sebelumnya telah dibahas di masing-masing Kelompok Peneliti. Dalam seminar ini telah dibahas hasil-hasil penelitian para peneliti BB-Biogen yang dibiayai dana APBN Tahun Anggaran 2005, sebanyak 18 judul penelitian (Lampiran V.6). Seminar Internasional Seminar internasional tahun 2006 diselenggarakan di Auditorium Dr. Ir. M. Ismunadji, 23-24 Agustus 2006 dengan tema The Status and Prospect of Modern Agricultural Biotechnology: Research and Development, Regulation and Intellectual Property Right. Pada seminar dipresentasikan dan didiskusikan 13 kertas kerja berkaitan dengan perkembangan, status pemanfaatan, dan pengaturan pemanfaatan produk bioteknologi modern di bidang pertanian (Lampiran V.7). Seminar dibuka oleh Kepala Badan Litbang Pertanian yang menyampaikan

59


bahwa seminar merupakan momen penting untuk meng-update pengetahuan tentang kemajuan bioteknologi yang telah dicapai di dalam dan luar negeri sehingga mampu introspeksi diri seberapa jauh Indonesia telah melangkah jauh ke depan atau sebaliknya seberapa jauh ketinggalan dari kemajuan negara lain. Hal itu akan menjadi dasar pijakan kita untuk menyusun strategi dalam rangka mencapai tujuan pembangunan pertanian ke depan secara lebih realistik, efektif, dan efisien. Prof. Dr. Atsuhiko Shinmyo (Nara University, Jepang) menyampaikan bahwa sampai dengan abad ke-20 minyak bumi merupakan sumber utama energi aktivitas manusia. Persediaan minyak yang semakin menipis dan penurunan kualitas lingkungan (polusi CO dan zat racun lainnya), mendorong untuk mencari sumber alternatif energi. Tanaman merupakan suatu biodegradable factory yang memiliki keuntungan sebagai sumber yang dapat diperbaharui dan ramah lingkungan (memanfaatkan CO2 dalam proses fotosintesis). Teknik rekayasa genetik menawarkan berbagai cara untuk meningkatkan kapasitas tanaman sebagai pabrik antara lain mengarahkan produk metabolit, memperpendek siklus produksi, dan meningkatkan kapasitas produksi. Dr. Hei Leung (IRRI) menyampaikan bahwa perkembangan mutakhir di bidang bioteknologi modern membuka peluang untuk lebih memahami peran gen dalam aktivitas biologi. Penerapan potensi bioteknologi molekuler pada padi melahirkan bidang rice functional genomic. Bidang ini memberikan implikasi luas tidak saja da-

60

lam pemahaman fungsi-fungsi gen tetapi secara praktis mempercepat terobosan-terobosan dalam perbaikan sifat tanaman. Potensi besar tersebut memerlukan tim peneliti yang kuat, ketersediaan dana, dan prioritas serta arah penelitian yang jelas. Dr. Arif Witarto (LIPI) menawarkan teknologi memanfaatkan tanaman tembakau sebagai pabrik untuk memproduksi senyawa-senyawa farmasi. Dari berbagai produk yang dapat diproduksi pada tembakau, LIPI memfokuskan pada upaya memproduksi human soluble albumin, interferon α2, dan M12 antigen. Di samping LIPI, diinformasikan pula bahwa ITB mencoba memanfaatkan tanaman sayuran dan tebu untuk memproduksi senyawa farmasi. Dr. Sutrisno (BB-Biogen) menyampaikan bahwa dalam memecahkan kendala ketahanan pangan, peningkatan nilai tambah produk pertanian, dan kesejahteraan petani, salah satu kebijakan Badan Litbang Pertanian adalah memanfaatkan bioteknologi modern (termasuk rekayasa genetik). Badan Litbang Pertanian memiliki kapasitas sumber daya manusia dan fasilitas penelitian yang mendukung kegiatan-kegiatan pemanfaatan bioteknologi modern untuk tujuan di atas. Tiga unit kerja di lingkup Badan Litbang Pertanian bekerja pada bidang rekayasa genetik, yaitu BB-Biogen, Balai Penelitian Tanaman Sayuran, dan Balai Penelitian Bioteknologi Perkebunan Indonesia. Enam penelitian perakitan tanaman transgenik di BB-Biogen, yaitu pada padi, pepaya, tomat, dan kentang masih berlangsung pada tahap pengujian di fasilitas uji terbatas dan di screenhouse.

LAPORAN TAHUN 2006

Dr. Abdelbagi Ismail (IRRI) menyampaikan bahwa IRRI memfokuskan perbaikan varietas untuk lahan marjinal pada tiga hal (1) salinitas, (2) kahat unsur P, dan (3) genangan (submergence). Strategi yang ditempuh adalah memanfaatkan teknologi marka molekuler untuk mempelajari dasar-dasar toleransi, mengidentifikasi sumber-sumber gen yang berkaitan dengan sifat yang diinginkan pada plasma nutfah padi, dan memanfaatkan marka molekuler dalam program perbaikan varietas. Tiga wilayah yang berbeda pada kromosom padi diidentifikasi menentukan toleransi padi terhadap salinitas, kahat unsur P, dan penggenangan, yaitu: a. Saltol, satu wilayah pada kromosom 1 yang diperoleh dari persilangan IR29 dengan Pokkali diidentifikasi menentukan toleransi padi terhadap salinitas. b. Pup1, satu wilayah pada kromosom 12 yang diperoleh dari persilangan Nipponbare dengan Kasalath diidentifikasi menentukan toleransi padi terhadap kahat unsur P. c. Sub1, satu wilayah pada kromosom 9 diidentifikasi menentukan sifat toleransi padi terhadap genangan (submergence). Wilayah ini memiliki subwilayah, salah satu di antaranya adalah subwilayah Sub1-A-1, yang spesifik pada padi indica. Salah satu program yang sedang dikembangkan berkaitan dengan pemanfaatan wilayah pup1 untuk Indonesia, adalah penggabungan sifat toleransi kahat unsur P dengan sifat tahan penyakit blas. Dr. Debby S. Retnoningrum (ITB) menyampaikan bahwa vaksinasi merupakan strategi yang sudah terbukti efektif dalam

mengendalikan penyakit infektif pada manusia. Produksi vaksin dengan metode klasik memiliki beberapa kelemahan. Untuk itu, pendekatan modern melalui teknologi rekayasa genetik memberikan jawaban yang memuaskan. Melalui pendekatan rekayasa genetik, vaksin dapat dibuat di tanaman tembakau, kentang, tomat, kacangkacangan/sereal, atau alfalfa. Dr. Randy Hautea (ISAAA) menginformasikan bahwa penanaman tanaman transgenik pada tahun 2004-2005 mengalami peningkatan luas areal sebesar 11% yang dibudidayakan di 21 negara. Tanaman transgenik yang paling banyak dibudidayakan adalah kedelai (54,4 juta ha), jagung (21,2 juta ha), kapas (9,8 juta ha), dan canola (4,6 juta ha). Tanaman transgenik yang dibudidayakan memiliki sifat toleran terhadap herbisida (63,7 juta ha), tahan serangga hama (16,2 juta ha), atau keduanya (10,1 juta ha). Pengalaman budi daya kapas Bt di India menunjukkan bahwa kapas transgenik ini kompatibel dengan teknologi pengendalian hama terpadu (PHT), bahkan dapat meningkatkan hasil kapas pada sistem PHT dan mengurangi pemakaian insektisida sebesar 80 kg bahan aktif per ha, sehingga pendapatan petanipun nyata meningkat. Mr. Kevin Elke (CropLife, Singapura) menyampaikan bahwa keuntungan finansial bagi petani karena adanya kenaikan hasil dan pengurangan biaya usahatani dan keuntungan terhadap lingkungan dari pengurangan pemakaian insektisida diperoleh petani kapas transgenik di USA, Cina, Argentina, Afrika Selatan, India, Meksiko, dan Australia. Kebijakan yang mendorong

61


tumbuhnya investasi adalah kebijakan yang (1) mendorong adanya kolaborasi antara institusi publik dan swasta dan transfer teknologi lokal, (2) kebijakan yang dapat diprediksi, teratur waktunya, berdasarkan kajian ilmiah, dan dengan biaya efektif berdasarkan standar internasional, dan (3) model bisnis yang efisien yang memungkinkan terjadi pengembalian investasi yang reasonable. Rekayasa genetik menawarkan berbagai kemungkinan dalam meningkatkan hasil pertanian, namun langkah selanjutnya dalam mengimplementasikan manfaatnya membutuhkan keterlibatan berbagai pemangku kepentingan. Pihak swasta dapat berperan aktif dalam kondisi adanya suatu kebijakan yang menguntungkan semua pihak.

pemanfaatan produk kayasa genetik (PRG) baik berupa undang-undang, peraturan pemerintah, keputusan bersama antar menteri, ataupun keputusan menteri. Indonesia memiliki Peraturan Pemerintah (PP) Nomor 21 Tahun 2005 yang mengatur mengenai pengkajian keamanan hayati PRG. PP ini merupakan evolusi dari peraturanperaturan sebelumnya, yaitu Surat Keputusan Bersama 4 Menteri (SKB) tentang keamanan hayati dan keamanan pangan PRG. Pada saat ini, SKB masih digunakan menunggu PP dapat jalan semestinya. Dijelaskan pula mengenai Komisi dan Tim Teknis, mekanisme, metode pengkajian, fasilitas, dan pengalaman dalam pengkajian serta monitoring atas penelitian tanaman transgenik.

Dr. Cholani Weebade (MSU, USA) menjelaskan berbagai fasilitas dan program dari MSU dalam kaitannya dengan pengembangan kapasitas SDM dan litbang bioteknologi modern. MSU melakukan penelitian dasar dalam perakitan tanaman transgenik yang selanjutnya ditransfer ke pihak swasta untuk didistribusikan ke petani. Hal ini ditempuh mengingat investasi untuk komersialisasi tanaman transgenik mahal. MSU menyiapkan program alih teknologi kepada pihak swasta, pendidikan dan pelayanan bagi petani. Di samping itu, MSU memberikan perhatian yang cukup besar pada komoditas minor di mana pihak swasta kurang berminat. MSU juga senantiasa membangun kerja sama baik pada tataran regional maupun internasional.

Dr. Sugiono Moeljopawiro (BB-Biogen) menyampaikan tatanan regulasi yang berkaitan dengan hak kekayaan intelektual (HKI) di tingkat global dan di Indonesia. Tantangan-tantangan baru yang muncul sebagai konsekuensi dari teknologi membutuhkan pemikiran-pemikiran baru dalam pengaturan perlindungan kekayaan intelektual. Di masa datang perlu adanya suatu upaya untuk memelihara keseimbangan antara hak swasta dan keuntungan masyarakat. Indonesia perlu meningkatkan penerapan (enforcement) peraturan HKI, lingkungan legal yang terprediksi, menetapkan peraturan perundangan yang dibutuhkan, dan menumbuhkan laboratorium penguji yang independen.

Dr. M. Herman (BB-Biogen) menyampaikan bahwa Indonesia memiliki peraturan perundangan yang berkaitan dengan

62

Dr. Jose Falk-Zeppeda (IFPRI) menyampaikan bahwa biaya akibat regulasi menjadi konsekuensi yang harus diperhitungkan dalam pemanfaatan PRG. Regulasi

LAPORAN TAHUN 2006

pemanfaatan PRG merupakan alat dalam menjamin publik atas keamanan pemanfaatan PRG. Analisis kajian biaya regulasi dapat menjadi alat bantu dalam menentukan regulasi dengan mempertimbangkan antara aspek keuntungan teknologi, sosial, dan ekonomi serta jaminan keamanan secara bijaksana. Dr. Bahagiawati (BB-Biogen) menyampaikan bahwa dari 31 kegiatan penelitian transgenik yang dilaksanakan sejak tahun 1996, hanya 16 kegiatan penelitian yang masih jalan dan baru dua penelitian yang memasuki taraf regulasi. Berhentinya kegiatan penelitian tersebut diakibatkan oleh (1) tidak ada kemajuan, (2) penghentian anggaran, dan (3) perubahan kebijakan prioritas penelitian. Kegagalan litbang tanaman transgenik mendorong menurunnya aktivitas penelitian transgenik akibat turunnya kepercayaan negara donor atas kapasitas Indonesia. Hal ini mengkhawatirkan karena akan menempatkan Indonesia bergantung pada tanaman transgenik yang menjadi milik perusahaan multi nasional. Pada tataran regulasi komersialisasi tanaman transgenik, Indonesia pernah merilis kapas Bt di tujuh kabupaten. Namun, hal ini terhenti karena pasokan benih yang terputus sehingga menyebabkan petani kehilangan kesempatan untuk memanfaatkan teknologi ini. Beranjak dari pengalamanpengalaman tersebut, disarankan untuk melakukan focusing dan pemantapan prioritas penelitian tanaman transgenik dan meningkatkan keefektifan regulasi dengan mengadopsi standar-standar internasional. Pada akhir dari simposium ini dibentuk Rice Genomic Functional Network. Jeja-

ring kerja (network) ini bertujuan untuk melakukan sharing informasi dan pengalaman serta melakukan suatu pemusatan (focusing) aktivitas penelitian atas suatu masalah yang dihadapi bersama. Jejaring kerja ini beranggotakan International Rice Research Institut (IRRI), Institut Pertanian Bogor, Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia dan Badan Litbang Pertanian. Pada pertemuan pembentukan jejaring kerja ini disepakati Dr. Sugiono Moeljopawiro (BBBiogen) sebagai ketua jejaring kerja. Lokakarya Nasional Lokakarya diselenggarakan pada tanggal 24 Agustus 2006 bertempat di Aula Balai Penelitian Tanaman Obat dan Atsiri dengan mengambil tema Prospek dan Regulasi Bioteknologi Pertanian. Lokakarya dihadiri oleh 32 peserta undangan dari Perguruan Tinggi (Unjem, Unsoed, IPB, dan ITB), KLH, LIPI, BIOTROP, Badan POM, Balai Penelitian Bioteknologi Perkebunan Indonesia, ISAAA, KP KIAT, dan Badan Litbang Pertanian (PSE, BB Pascapanen, Puslitbangbun, BB Padi, dan Balitsa). Pada pembukaan lokakarya, Kepala BB-Biogen menyampaikan harapannya bahwa melalui lokakarya ini dapat dihasilkan saran-saran berkaitan dengan tindakan apa yang perlu dilakukan oleh Departemen Pertanian untuk mempromosikan produk bioteknologi modern dalam bidang pertainan secara bertanggung jawab. Dari lokakarya, dirumuskan antara lain: a. Kemajuan ilmu di bidang bioteknologi untuk optimalisasi sumber daya lahan dan sumber daya genetik telah tersedia

63


sehingga Indonesia tidak bisa dipungkiri harus memanfaatkan teknologi rekayasa genetik secara bijaksana sesuai dengan kebutuhan dan kearifan budaya setempat, tanpa keraguan serta butuh dukungan semua pihak. Tidak dapat dipungkiri bahwa penciptaan varietas unggul baru masih merupakan tujuan utama dalam rekayasa genetik karena pemuliaan konvensional perlu waktu lebih lama, bahkan untuk tanaman tahunan butuh waktu 50 tahun. b. Kemajuan penelitian dan pengembangan rekayasa genetik di beberapa institusi penelitian di Indonesia, bervariasi sesuai dengan kondisi terutama ketersediaan sumber daya manusia, dana, dan infrastruktur. Umumnya penelitian meliputi komoditas tanaman pangan, perkebunan, hortikultura, dan mikroba (Lampiran V.8). c. Tingkat capaian yang lebih advance, yaitu diperolehnya tanaman transgenik yang teruji di laboratorium maupun di lapang, sebagian input riset atau produk tanaman transgenik masih didominasi oleh hasil penelitian yang berasal dari luar negeri. Untuk meningkatkan hasil riset rekayasa genetik yang optimum perlu koordinasi yang lebih terstruktur lintas departemen dan institusi. Secara terpisah kegiatan litbang tersebut meliputi: identifikasi dan kloning gen yang terkait dengan sifat unggul komoditas tertentu, pengembangan sistem transformasi genetik dan regenerasi tanaman transgeniknya, pengujian tanaman transgenik di laboratorium, FUT, LUT, dan studi kemanan hayati.

64

d. Diperlukan adanya suatu regulasi berupa kebijakan yang sangat jelas crystal clear serta operasional dari pemerintah tentang pemanfaatan PRG secara luas untuk penelitian dan komersialisasi. e. Revisi Pedoman Pengkajian Keamanan Pangan Produk Rekayasa Genetik sesuai dengan PP Nomor 21 Tahun 2005 oleh Komisi Keamanan Hayati perlu dilakukan serta terus disosialisasikan agar diketahui oleh semua lapisan dan segera operasional termasuk untuk membahas kembali pengkajian keamanan pangan PRG yang sudah diusulkan dan belum diputuskan hasilnya oleh KKH (KKHKP) sesuai dengan prosedur yang telah ditetapkan dalam PP Nomor 21 Tahun 2005. f. Pedoman pengkajian keamanan hayati dan keamanan pangan adalah spesifik untuk setiap komoditas, oleh karena itu sangat bervariasi sehingga semua pihak yang terkait perlu bersama-sama merumuskan peraturan yang secara teknis tidak menghambat penelitian tetapi tetap berpedoman kepada prinsip kehati-hatian. g. Pemanfaatan Plasma Nutfah untuk pengembangan varietas unggul dengan cara rekayasa genetik masih terbatas dibandingkan dengan pemuliaan konvensional. h. Penyadartahuan publik (public awareness) mengenai pemanfaatan produk bioteknologi telah dilakukan antara lain melalui media-scientists dialogue dan workshop para multipihak namun upaya lain yang lebih efektif perlu terus diintensifkan agar dapat memberikan

LAPORAN TAHUN 2006

informasi berimbang serta membangun pemahaman tentang PRG yang lebih benar.

Virus dan Bakteri Patogen Tanaman, dan NPS sebagai Biopestisida Unggulan PAMERAN KOORDINATIF

PAMERAN PARTISIPATIF BB-Biogen juga turut berpartisipasi dalam pameran yang dikoordinir/diselenggarakan oleh Badan Litbang Pertanian maupun yang diselenggarakan oleh institusi lain baik taraf nasional maupun internasional (Lampiran V.9.). Teknologi dan informasi yang didiseminasikan melalui pameran tersebut meliputi: 1. Plasma nutfah berupa poster: Food crops germplasm. 2. Kultur jaringan berupa poster: Kultur In Vitro untuk Perbanyakan Tanaman, Perbanyakan Tanaman Manggis (Garcenia mangosteen) secara In Vitro, Perbanyakan Tanaman Cendana (Santalum album) melalui Kultur jaringan, Produksi Bibit Gaharu melalui Kultur In Vitro, Perbanyakan Bibit Tanaman Hias melalui Kultur Jaringan, Perbanyakan Bibit Tanaman Buah melalui Kultur Jaringan, dan Perbaikan Tetua Padi Hibrida melalui Bioteknologi 3. Marka Molekuler dan Transgenik berupa poster: Analisis Sidik Jari DNA untuk Identifikasi Varietas Tanaman. 4. Biokimia berupa poster: Insect pheromone for insect pest management, Feromon Serangga sebagai Biopestisida Ramah Lingkungan, Nematoda Patogen Serangga sebagai Biopestisida Unggulan, Biopestisida Jamur Patogen Serangga, Kit ELISA untuk Deteksi Patogen Tanaman, Perangkat ELISA untuk Deteksi

BB-Biogen menyelenggarakan pameran koordinatif dalam bentuk Ekspose Biogen 2006 di Kampus Penelitian Pertanian Cimanggu pada tanggal 2005. Kegiatan yang diselengarakan selama ekspose berlangsung adalah: Kunjungan Laboratorium (Openhouse) Openhouse bertujuan untuk memperkenalkan laboratorium dan kegiatan penelitian di BB-Biogen kepada masyarakat umum. Openhouse diselenggarakan selama tiga hari, yaitu dari tanggal 23-25 Agustus 2006. Jumlah pengunjung openhouse tahun 2006 sebanyak 1200 orang yang berasal dari siswa sekolah dasar, sekolah menengah pertama, sekolah menengah atas, dan perguruan tinggi, dan wartawan. Jumlah peserta tersebut mengalami kenaikan sebanyak 200 orang dibandingkan dengan peserta pada tahun 2005. Perlombaan Lomba mewarnai gambar untuk siswa TK/TPA Lomba ini bertujuan meningkatkan minat dan kemampuan siswa/i mengenal plasma nutfah Indonesia sejak dini. Lomba mewarnai tingkat TK diselenggarakan pada tanggal 24 Agustus 2006 di Koridor Laboratorium Kelti Biologi Molekuler. Lomba ini diikuti oleh 65 peserta dari 14 TK di Kota Bogor.

65


Lomba mengenal tanaman dan buah untuk tingkat SD Lomba ini bertujuan meningkatkan minat dan kemampu-an siswa/i mengenal plasma nutfah Indonesia sejak dini. Lomba diselenggarakan pada tanggal 24 Agustus 2006 dan diikuti oleh 22 kelompok. Lomba pidato Bahasa Inggris untuk siswa tingkat SMP Lomba dise-lenggarakan pada tanggal 23 Agustus 2006 di arena lomba BB-Biogen. Lomba ini diikuti oleh 27 peserta dari 9 SMP di Kota Bogor. Lima topik pidato yang dilombakan adalah (1) If I were an agriculturist, (2) The benefit of food crops diversity, (3) How should we conserve our natural resources, (4) Why do we have to be proud of our local fruit?, dan (5) What is the best way to handle household waste?. Dewan juri terdiri atas staf pengajar Lembaga Indonesia Amerika (LIA), staf pengajar CLC dan peneliti BB-Biogen. Lomba karya ilmiah tingkat SMA Lomba diselenggarakan pada tang-gal 25 Agustus 2006 di Auditorium Dr. M. Ismunadji. Tujuan diselenggarakannya lomba ini untuk meningkatkan kreativitas dan inovasi siswa SMA, khususnya di kota Bogor. Ruang lingkup karya ilmiah adalah karya ilmiah primer yang berhubungan dengan biologi dan kimia secara umum. Peserta lomba terdiri dari enam tim. Setelah masing-masing tim mempresentasikan dan memperagakan karya ilmiahnya, terpilih sebagai Juara I adalah tim dari SMA Negeri 6 dengan judul “Pengaruh Jawer Kotok terhadap Penyembuhan Luka”, Juara II tim

66

dari SMA Negeri 6 dengan judul ”Penyedap Rasa Alami dari Karapaks Udang”, Juara III tim dari SMA Negeri 6 dengan judul ”Pemanfaatan Tembakau dalam Puntung Rokok untuk Pembasmi Hama Belalang”, Juara Harapan I tim dari SMA Negeri 3 dengan judul “Minuman dengan Nilai Tambah Isotonik”, Juara Harapan II tim dari SMA Negeri 4 dengan judul “Pemanfaatan Tumbuhan Mindi sebagai Bahan Pembuatan Biosintesa”, dan Juara Harapan III dari SMA Negeri 5 dengan judul “Pengaruh Pemberian Dosis Pupuk NPK sebagai Pupuk Dasar terhadap Pertumbuhan Vegetatif Tanaman Kacang Hijau”. DEMPLOT Teknologi hasil penelitian BB-Biogen dapat berbentuk produk seperti galur/varietas tanaman atau formulasi pupuk dan pestisida hayati. Produk yang berupa input pertanian akan lebih dikenal dan dipahami oleh pengguna apabila ditampilkan dalam bentuk aplikasi dalam bentuk demonstrasi plot (demplot). Pada tahun 2006, BBBiogen melaksanakan empat demplot, yaitu demplot plasma nutfah, aplikasi pupuk hayati dan bioinsektisida NPS pada kedelai, dan aplikasi feromon seks pada bawang merah. Demplot Plasma Nutfah Demplot plasma nutfah sorgum, kedelai, kacang hijau, dan kacang tanah dilakukan di Inlitbio Cikeumeuh. Demplot ini dilaksanakan untuk ikut serta memamerkan potensi plasma nutfah BB-Biogen kepada peserta IAEA/RCA Project Progress Review Meeting on Mutant Multilocation

LAPORAN TAHUN 2006

Trials (RMMT) and Mutational Enhancement of Genetic Diversity (MEGD). Acara tersebut diselenggarakan oleh BATAN pada tanggal 13-17 Maret 2006 dan kunjungan ke BB-Biogen pada tanggal 16 Maret 2006. Demplot Pupuk Hayati dan Bioinsektisida NPS pada Kedelai Pada tahun 2005, Dr. Rasti Saraswati atas nama BB-Biogen mendapatkan sertifikat Hak Kekayaan Intelektual berupa pupuk pelarut fosfat. Dalam rangka memperkenalkan pupuk hayati dan bioinsektisida NPS khususnya kepada petani kedelai di lahan kering masam, BB-Biogen bekerja sama dengan Balai Pengkajian Teknologi Pertanian (BPTP) Lampung dan Balai Penelitian Tanah membuat demplot pupuk hayati dan bioinsektisida NPS pada kebun kedelai milik petani di Desa Buminabung Ilir, Kecamatan Buminabung, Lampung Tengah, pada lahan seluas 6,5 h pada bulan Februari s/d Juni 2006. Varietas kedelai yang ditanam adalah Anjasmoro, Sinabung, dan Kaba. Melalui demplot tersebut, petani kedelai di Buminabung dikenalkan dengan pupuk hayati yang terdiri dari mikroba atau mikrofauna hidup yang bermanfaat untuk meningkatkan produktivitas lahan seperti Rhizobium, Azospirilium, mikroba pelarut fosfat, mikoriza, dan cacing. Selain itu, petani juga dikenalkan dengan nematoda patogen serangga (NPS) yang mempunyai keunggulan sebagai agensia pengendalian biologi serangga hama penggerek polong kedelai (Etiela zinckenella). Sebagai rangkaian dari kegiatan demplot, diselenggarakan Gelar Teknologi Pupuk Hayati dan Bioinsektisida NPS pada Kedelai di Desa Bumi Nabung Ilir, Kecamatan Bumi Na-

bung, Kabupaten Lampung Tengah pada tanggal 31 Mei 2006. Demplot Aplikasi Feromon Seks pada Bawang Merah Senyawa feromon seks memiliki potensi untuk mengendalikan serangga hama secara efektif, efisien, dan aman terhadap lingkungan, BB-Biogen melakukan penelitian feromon seks sejak tahun 2003. Salah satu feromon seks yang ditemukan adalah feromon seks ulat daun bawang merah, Spodoptera exigua (Feromon-Exi). Pada bulan Juni 2006, BB-Biogen bekerjasama dengan Dinas Pertanian Dati II Kabupaten Brebes mencoba menguji feromon seks pada lahan petani bawang merah di Desa Limbangan Kulon, Kecamatan Brebes, Kabupaten Brebes (Gambar V.1). Feromon tersebut digunakan bersama perangkap serangga. Hasil tangkapan dalam satu hari mencapai sekitar 3.000 serangga jantan dari 22 alat perangkap yang dipasang. Penggunaan feromon seks ini telah mengurangi frekuensi penyemprotan insektisida dari 15 kali penyemprotan per musim menjadi hanya 3 kali penyemprotan. Selain itu, jenis insektisida yang digunakan berkurang karena penyemprotan yang dilakukan pada kebun yang dipasang penangkap berferomon dilakukan untuk mengendalikan Lyriomyza sp. yang bukan hama target feromon seks. Pengurangan frekuensi penyemprotan insektisida tersebut tidak mengurangi hasil panen. Hasil panen petani yang tidak menggunakan feromon sekitar 49,6 t berat basah pada luasan panen 5000 m2 dan hasil panen petani yang menggunakan feromon sekitar 49,5 t pada luasan yang sama.

67


Gambar V.1. Demplot Feromon-Exi di areal pertanaman bawang merah Brebes, Jawa Tengah.

Sebagai rangkaian kegiatan demplot aplikasi feromon seks pada bawang merah, BB-Biogen bekerjasama dengan Dinas Pertanian, Kehutanan dan Konservasi Tanah Kabupaten Brebes menyelenggarakan Temu Wicara untuk mengenalkan metode Pemanfaatan Feromon Seks untuk mengendalikan Ulat Bawang (Spodoptera exigua) pada tanggal 20 Juli di Desa Limbangan Kulon, Kecamatan Brebes, Kabupaten Brebes. Acara ini dibuka oleh Kepala

68

BB-Biogen yang diwakili oleh Kabid KSPHP dan dihadiri oleh Kepala Dinas Pertanian, Kehutanan dan Konservasi Tanah Kabupaten Brebes, Asisten 2 Setda Kabupaten Brebes, anggota Komisi B DPRD Kabupaten Brebes, wakil dari lembaga penelitian lingkup Badan Litbang Pertanian, Camat, Lurah, Kepala Desa, PPL, PHP, Mantri Tani, Kelompok Tani, dan petani, khususnya petani Desa Limbangan.

LAPORAN TAHUN 2006

Lampiran V.1. Daftar institusi penerima publikasi BB-Biogen. No. Instansi 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17.

Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian Pusat Litbang di lingkup Badan Litbang Pertanian Pusat Analisis Penelitian Sosial Ekonomi dan Kebijakan Pertanian Pusat Perpustakaan dan Penyebaran Teknologi Pertanian LRPI dan Pusat Penelitian di lingkup LRPI Balai Besar di lingkup Badan Litbang Pertanian Balai dan Loka Penelitian di Lingkup Badan Litbang Pertanian Balai Pengkajian Teknologi Pertanian Pusat dan Balai Penelitian di lingkup LIPI Balai Pengkajian Bioteknologi BPPT Direktorat Jenderal dan Pusat di lingkup Departemen Pertanian Perpustakaan Nasional PDII LIPI Biotrop IndoBIC Dinas Pertanian di tingkat Dati I dan Dati II Perguruan tinggi negeri dan swasta

Jumlah unit kerja 1 5 1 1 6 6 14 29 3 1 3 1 1 1 1 39 94

69


Lampiran V.2. Artikel ilmiah para peneliti yang dipublikasikan tahun 2006. No. Judul artikel

Nama penulis

Judul publikasi

1. Struktur populasi Tricogrammatoidae armigera, parasitoid telur Helicoverpa armigera berdasarkan analisis RAPD-PCR 2. Karakterisasi populasi hama padi wereng coklat (Nilaparvata lugens) yang menyerang varietas padi IR64 3. Isolasi protoplas anggrek Phalaenopsis sp.

Bahagiawati, D. Buchari, Nurindah, H. Rizjaani, D.W. Utami, B. Sahari, dan A. Sari Bahagiawati dan H. Rijzaani

Jurnal Agrobiogen Vol. 2 No. 2. 2006

4. Perbaikan ketahanan tanaman panili terhadap penyakit layu melalui kultur in vitro 5. Pewarisan ketahanan penyakit blas (Pyricularia grisea Sacc) pada persilangan padi IR64 dan Oryza rufipogon Griff 6. Identifikasi somaklon padi Gajahmungkur, Towuti, dan IR64 yang tahan kekeringan menggunakan PEG 7. Hubungan antara kerapatan stomata dengan ketahanan kekeringan pada somaklon padi Gajahmungkur, Towuti, dan IR64 8. Produksi bibit kencur (Kaemferia galanga L.) melalui kultur jaringan 9. Uji toleransi pada galur somaklon IR64 dan Towuti hasil seleksi in vitro

D. Sukmadjaja

10. Uji toleransi kekeringan padi varietas Gajahmungkur, Towuti, dan IR64 menggunakan uji daya tembus akar 11. Induksi mutasi dan seleksi in vitro menggunakan asam fusarat untuk ketahanan penyakit layu pada pisang ambon hijau 12. In vitro selection and somaclonal variation for biotic and abiotic stress, tolerance 13. Perbaikan ketahanan tanaman vanili terhadap penyakit layu melalui kultur in vitro 14. Mekanisme toleransi terhadap cekaman kekeringan dan metode untuk seleksi tumbuhan yang tahan kekeringan 15. Pengaruh ekstrak mimba terhadap penggerek batang jagung Ostrinia furnacalis (Lep., Pyralidae)

70

D. Sukmadjaja

D.W. Utami, H. Aswidinnoor, S. Moeljopawiro, dan I.H. Somantri E.G. Lestari dkk.

Prosiding Seminar Nasional Entomologi dalam Perubahan Lingkungan dan Sosial. 2006 Prosiding seminar Nasional Bioteknologi dan Pemuliaan Tanaman, Dept. Agronomi dan Hortikultura, Fak. Pertanian IPB. 2006 Jurnal Penelitian dan Pengembangan Pertanian Vol. 25. No. 4. 2006 Hayati Vol. 13 No. 2. 2006

Buletin Agronomi Vol. XXXIV. No. 2. 2006

E.G. Lestari

Jurnal Biodiversitas Vol. 7. No. 1. 2006

E.G. Lestari dkk.

Berita Biologi Vol. 25. No. 2. 2006 Penelitian Pertanian Tanaman Pangan Vol. 25. No. 2. Tahun 2006 Prosiding BB Padi. 2006

E.G. Lestari dan D. Sukmadjaja E.G. Lestari dkk.

E.G. Lestari dkk.

Berita Biologi Vol. 8. No. 1. 2006

E.G. Lestari

Jurnal Biodiversitas Vol. 7. No. 3. 2006 Jurnal Litbang Pertanian Vol. 25. No. 4. 2006

E.G. Lestari dkk.

E.G. Lestari


Harnoto, D. Koswanudin, dan IM. Samudra

Prosiding Seminar Nasional Pestisida Nabati III

LAPORAN TAHUN 2006

Lampiran V.2. Lanjutan. No. Judul artikel

Nama penulis

Judul publikasi

16. Isolasi protoplas anggrek Phalaenopsis

I. Roostika, D. Sukmadjaja, dan Y. Suryadi

17. Regeneration of pruatjan (Pimpinella pruatjan Molk): Axillary bud proliferation and encapsulation 18. Status Penelitian Purwoceng (Pimpinella alpina Molk.) di Indonesia 19. Regenerasi tanaman pada kultur antera beberapa aksesi padi indica toleran aluminium 20. Karakterisasi kemiripan genetik koleksi inbrida jagung berdasarkan marka mikrosatelit 21. Genetic diversity analysis of traditional and improved Indonesian rice (Oryza sativa L.) germplasm using microsatelite markers

I. Roostika, I. Darwati, and I. Mariska

Prosiding Seminar Nasional Bioteknologi dan Pemuliaan Tanaman Tahun 2006 Jurnal Agrobiogen Vol. 2. No. 2. 2006

22. Deteksi dan identifikasi strain Ralstonia solanacearum dengan teknik ELISA tidak langsung 23. Deteksi Pseudomonas syringae pv glycinea (PSG) menggunakan antibodi poliklonal 24. Deteksi Xanthomonas oryzae pv oryzae penyebab hawar daun bakteri pada tanaman padi 25. Nodulation and growth of a supernodulating soybean mutant SS2-2 symbiotically associated with Bradyrhizobium japonicum 26. Induksi kalus dan optimasi regenerasi empat varietas padi melalui kultur in vitro 27. Studi transformasi genetik tanaman melinjo menggunakan Agrobacterium tumefaciens EHA 105 28. Evaluasi pertumbuhan dan produksi padi gogo haploid ganda toleran naungan dalam sistem tumpangsari. 29. Prospect of iron biofortification on rice 30. Optimasi dan transformasi gen pinII pada tanaman kedelai (Glycine max L. Merr) melalui Agrobacterium tumefaciens 31. Respons plasma nutfah jagung terhadap pemupukan rendah dan keracunan aluminium

I. Darwati dan I. Roostika I.S Dewi, B. S. Purwoko, H. Aswidinnor. I.H. Somantri, dan M.A. Chozin Marcia B. Pabendon, M. Dahlan, Sutrisno, dan M.L.C. George M.J. Thompson, E.M. Septiningsih, Fátimah, T.J. Santoso, T.S. Silitonga, and S.R. Mc Couch M. Machmud dan Y. Suryadi

Buletin Plasma Nutfah Vol. 12. No. 1. 2006 Jurnal Agrobiogen Vol. 2. No. 1. 2006 Jurnal Agrobiogen Vol. 2. No. 2. 2006 Theor. Appl. Genet. 2006

Penelitian Pertanian Tanaman Pangan Vol. 25. No. 2. 2006

M. Machmud dan Y. Suryadi


M. Machmud dan Y. Suryadi

Penelitian Pertanian Tanaman Pangan Vol. 25. No. 2. 2006

P. Lestari, K. Van, M.Y. Kim, dan Suk-Ha Lee

Jurnal Agrobiogen Vol. 2. No. 1. 2006

R. Purnamaningsih

Jurnal Agrobiogen Vol. 2. No. 2. 2006 Jurnal Dinamika Pertanian Vol. XXI. No. 2. 2006

R. Yunita

Sasmita, P. B.S. Purwoko, S. Sujiprihati, I. Hanarida, I.S. Dewi, dan M.A. Chozin S.D. Indrasari, A.A. Daradjat, and I. Hanarida Slamet dan S.J. Pardal

Buletin Agronomi Vol. XXXV. No. 1. 2006 Rice Industry, Culture, and Environment. 2006 Widyariset Vol. 9. No. 1. 2006

S.G. Budiarti., Sutoro, dan Ukup S.

Jurnal Wacana Pertanian Vol. 5. No. 1. 2006

71


Lampiran V.2. Lanjutan. No. Judul artikel

Nama penulis

Judul publikasi

32. Pertunasan tanaman panggal buaya (Xanthoxyllum rhetsa (Roxburgh) DC) pada berbagai formulasi media melalui kultur in vitro 33. Penggunaan arang aktif (Activated Charocoal) dalam kultur in vitro 34. Peningkatan keragaman genetik tanaman melalui keragaman somaklonal 35. Improvement of nitrate and nitrite dependent growth of rice by the introduction of a constitutively expressing chloroplasttic nitrite transporter 36. Pendugaan ragam genetik data terkoreksi dengan perlakuan pembanding 37. Parameter genetik jagung populasi Bisma pada pemupukan berbeda I. Ragam aditifdominan bobot biji jagung 38. Genebank management for an integrated system in sustainable conservation and utilization of plant genetic resources in Indonesia 39. Activation on Arabidopsis MAPK kinase (AtMEKK1) and induction of AtMEKK1 pathway by wounding 40. Analisis sidik jari DNA plasma nutfah kedelai menggunakan markah SSR 41. Pengaruh cekaman aluminium terhadap kandungan asam organik dalam kalus dan pinak tomat (Lycopersicon esculentum Mill.) 42. Produkdi dan evaluasi antibodi poliklonal untuk deteksi toksin Photorhabdus spp. 43. Multiplikasi tunas belimbing dewi (Averchoa carambola) melalui kultur in vitro 44. Development of new plant type rice lines through anther culture

S. Hutami, I. Mariska, dan E.G. Lestari

Prosiding Seminar Dept Agronomi dan Hortikultura Fak. Pertanian IPB. 2006

72

Berita Biologi Vol. 2 No. 2. 2006 S. Hutami, I. Mariska, dan Y. Jurnal Agrobiogen Vol. 2. Supriati No. 2. 2006 Sustiprijatno, M. Sugiwa, K. Plant Biotechnology 23. 2006 Ogawa, and M. Takahashi S. Hutami

Sutoro

Jurnal MatStat Vol. 6. 2006

Sutoro, A. Bari, Subandi, dan Jurnal Agrobiogen Vol. 2. S. Yahya No. 2. 2006 T.S. Silitonga and N. Bermawie

T. Hadiarto, T. Namori, D. Matsuoka, and T. Iwasaki

Proceeding of the APEC Workshop on Effective Genebank Management in APEC Member Planta 223. 2006

T.J. Santoso, D. W. Utami, Jurnal Agrobiogen. Vol. 2. dan E.M. Septiningsih No. 1. 2006. W. Enggarini dan E. Marwani Jurnal Agrobiogen Vol. 2. No. 1. 2006

Y. Suryadi, I. Manzila, A. Akhdiya, dan E. Pratiwi Y. Supriati, I. Mariska, dan Mujiman

Jurnal Agrobiogen Vol. 2. No. 1. 2006 Buletin Plasma Nutfah Vol. 12. No. 2. 2006

B. Abdullah, I.S. Dewi, A. Apriana, A. Sisharmini, and H. Safitri

Proceedingd of the 7th ASEAN Science and Technology Week. 2006

LAPORAN TAHUN 2006

Lampiran V.3. Daftar naskah Jurnal Agrobiogen Volume 2 Nomor 1 dan Nomor 2. No. Judul Biologi Molekuler 1. Analisis molekuler dan bioasai progeni kedelai transgenik putatif pinII 2. Status perkembangan perbaikan sifat genetik padi menggunakan transformasi Agrobacterium 3. Analisis sidik jari DNA plasma nutfah kedelai menggunakan marka SSR 4. Nodulation and growth of a supernodulating soybean mutant, SS@-2 symbiotically associated with Bradyrhizobium japonicum 5. Karakterisasi kemiripan genetik koleksi inbrida jagung berdasarkan marka mikrosatelit 6. Struktur populasi Trichogrammatoidea armigera, parasitoid telur Helicoverpa armigera, berdasarkan analisis RAPD-PCR Biologi Sel dan Jaringan 7. Kultur Protoplas Tanaman Terung dan Tekokak 8. Pengaruh cekaman aluminium terhadap kandungan asam organik dalam kalus dan pinak tomat (Lycopersicon esculentum Mill.) 9. Regenerasi tanaman pada kultur antera padi indica sumber toleran aluminium 10. Peningkatan keragaman genetik tanaman melalui keragaman somaklonal 11. Induksi kalus dan optimasi regenerasi empat varietas padi melalui kultur in vitro 12. Keragaman somaklonal pada tanaman panili untuk mendapatkan tanaman yang tahan penyakit layu Fusarium oxysporum 13. Regeneration of pruatjan (Pimpinella alpina KDS): Axillary bud proliferation and encapsulation 14. Enkapsulasi tunas apikal ubi jalar (Ipomoea batatas L. (Lam.))

Klasifikasi

Situs

Primer Tinjauan

Tidak terbit Terbit

Primer Primer

Terbit Terbit

Primer

Terbit

Primer

Terbit

Primer Primer

Tidak terbit Terbit

Primer Tinjauan Primer Tinjauan

Terbit Terbit Terbit Tidak terbit

Primer

Terbit

Primer

Tidak terbit

Biokimia/Serologi 15. Produksi dan evaluasi antibodi poliklonal untuk deteksi toksin Photorabdus Primer spp. 16. Parameter genetik jagung populasi Bisma pada pemupukan berbeda. I. Ragam Primer aditif-dominan bobot biji jagung Pengelolaan Sumber Daya Genetika 17. Kajian produksi selulosa bakterial dari Acetobacter xylinum

Primer

Terbit Terbit

Tidak terbit

73


Lampiran V.4. Daftar naskah Buletin Plasma Nutfah Volume 12 Nomor 1 dan Nomor 2. No. Judul

Klasifikasi

Situs

1. Karakterisasi deskripsi plasma nutfah kangkung 2. Eksplorasi dan karakterisasi sumber daya genetik tanaman obat-obatan spesifik Kalimantan Tengah 3. Ekologi dan potensi ramin (Gonystilus bancanus Kurz.) di kelompok hutan Sungai Tuan-Sungai Suruk, Kalimantan Barat 4. Status penelitian purwoceng di Indonesia 5. Ciri morfologi dan mutu buah mengkudu (Morinda citrifolia L.) di beberapa daerah di Pulau Jawa 6. Asupan harian dan kandungan nutrien pakan orangutan (Pongo pygmaeus) di Pusat Reintroduksi Orangutan, Wanariset SambojaKalimantan Timur 7. Pengaruh proses freeze-drying dan penyimpanan pada suhu kamar terhadap viabilitas dan patogenisitas plasma nutfah mikroba Pasteurella multocida 8. Multiplikasi tunas belimbing Dewi (Averrhoe carambola) melalui kultur in vitro 9. Pengaruh pengelolaan hutan produksi terhadap keragaman jenis plasma nutfah perairan 10. Kajian ekologi dan potensi pasak bumi (Eurycoma longifolia Jack.) di Kelompok Hutan Sungai Manna-Sungai Nassal, Bengkulu 11. Multiplikasi tunas belimbing dewi (Averrhoe carambola) melalui kultur in vitro 12. Diversity of pangasiid catfishes from Sumatra 13. Penampilan kesemek Junggo (Diospyros kaki L.) dan potensi keunggulannya 14. Isolasi protoplas tanaman kacang panjang (Vigna sinensis L.) secara Enzimatis 15. Karakterisasi empat nomor nilam 16. Komposisi jenis dan struktur tegakan hutan rawa gambut di kelompok hutan Sungai Belayan-Sungai kedang Kepala, Kabupaten Kutai, Kalimantan Timur 17. Klasifikasi potensi tegakan berdasarkan warna pada citra satelit di kelompok Hutan Sungai Bomberai-Sungai Besiri di Kabupaten Fakfak, Papua 18. Karakter morfologi dan beberapa keungulan mangga Podang Urang (Mangifera indica L.) 19. Analisis keanekaragaman fenotipik pisang introduksi (Musa spp.) 20. Penyakit akar gada (Plasmodiophora brassicae WOR) pada kubiskubisan: permasalahan dan prospek pengendaliannya

Primer Primer

Terbit Terbit

Primer

Terbit

Tinjauan Primer

Terbit Terbit

Primer

Terbit

Primer

Terbit

Primer

Terbit

Primer

Terbit

Primer

Terbit

Primer

Terbit

Primer Tinjauan

Terbit Terbit

Primer

Terbit

Primer Primer

Terbit Kembali ke penulis

Primer

Kembali ke penulis

Tinjauan

Kembali ke penulis

Primer Tinjauan

Kembali ke penulis Ditolak

74

LAPORAN TAHUN 2006

Lampiran V.5. Seminar rutin BB-Biogen periode tahun 2006. Tanggal Topik

Pembicara

18/01/06 Karakterisasi plasma nutfah kacang tunggak di BB-Biogen

Dr. Sutoro, Kelti PSDG-BBBiogen Roostika, MSi, Kelti BSJ-BBBiogen

Establishment of micropropagation technique and secondary metabolite production of commercial and endangered medicinal plant of pruatjan through in vitro culture Peran mikroba antagonis dan ekstrak akar tanaman non-inang terhadap pertumbuhan dan populasi Ralstonia solanacearum Sistem Manajemen Penelitian 03/02/06 Visi dan misi Departemen Pertanian ke Depan 08/02/06 Pengaruh cekaman aluminium terhadap kandungan asam organik dalam kalus dan pinak tomat (Lycopersicon esculentum Mill.) kultivar ‘Intan’ Regenerasi tanaman pada kultur antera padi: pengaruh persilangan dan aplikasi putresin Perlakuan karantina pasca masuk untuk mengintersepsi organisme pengganggu tumbuhan karantina 12/04/06 Uji virulensi penyakit hawar daun bakteri terhadap padi (Oryza sativa L.) galur IRBB Mengatasi masalah penyakit layu Fusarium oxysporum pada pisang ambon dengan keragaman somaklonal dan seleksi in vitro Pembentukan pisang ambon kuning toleran terhadap penyakit layu fusarium melalui variasi somaklonal Pemanfaatan bakteri endofitik tanaman padi untuk mengendalikan penyakit hawar daun padi (HDP) karena Rhizoctonia solani 10/05/06 Transformasi gen antisence ACC oksidase untuk menunda pemasakan buah pepaya melalui penembakan partikel Efektifitas metode seleksi dalam pemuliaan tanaman 14/06/06 Rekayasa metabolit tanaman padi untuk meningkatkan efisiensi penggunaan N dengan transformasi gen Cs Nitr1-L Pemetaan QTL ketahanan terhadap penyakit becak kering (Alternaria solani) pada tomat 28/06/06 Sosialisasi fungsional peneliti Sosialisasi fungsional litkayasa 04/07/06 Gilson liquid handling 09/08/06 Agronomical, anatomical, and molecular characterization of a supernodulating soybean mutant SS2-2 Pengelolaan website biogen online (www. indobiogen.or.id)

Strain virus-virus tungro Training report on Commercialization of Biotechnology Crop in Asia

Drs. M. Ace Suhendar, MSi, Kelti Biokimia-BB-Biogen Dr. Saptowo .J. Pardal, Kelti BM-BB-Biogen Dr. Sutrisno, Kepala BBBiogen Wening Enggarini, MSi, Kelti BM-BB-Biogen Dr. Iswari S. Dewi Kelti BSJBB-Biogen Dr. M. Machmud, Kelti Biokimia-BB- Biogen Siti Yuriah, SSi, Kelti BMBB-Biogen Dr. Endang G. Lestari, Kelti BSJ-BB- Biogen Mia Kosmiatin, MSi. Kelti BSJ-BB- Biogen Ir. Haeni Purwanti, MSc, Kelti PSDG-BB- Biogen Dra. Diani Damanyantii, MSi, Kelti BM-BB-Biogen Dr. Asadi, Kelti PSDG-BBBiogen Dr. Sustiprijatno, Kelti BMBB-Biogen Dr. Chaerani, Kelti PSDGBB-Biogen Dr. Novianti Sunarlim, Tim P2JP Drs. Deden Sukmadjaja, MSi, Tim Mr. Remi Bouthat (Gibson, France) Dr. Puji Lestari, Kelti BMBB-Biogen Hakim Kurniawan, MP Tim Pengembangan Situs BBBiogen Dr. M. Muhsin, Kelti Biokimia-BB-Biogen Dr. Saptowo J. Pardal, Kelti BM-BB-Biogen

75


Lampiran V.5. Lanjutan. Tanggal Topik

Pembicara

29/08/06 Benarkah ”Indonesia sangat kaya keanekaragaman hayati (tanaman)”?

Prof. (riset) Sumarno, Puslitbangtan Drs. Achmad Warsun, MP, Kelti BM-BB-Biogen

19/09/06 Keterpautan marka molekuler mikrosatelit dengan ketahanan terhadap penyakit blas pada tanaman padi

6/12/06

76

Status dan pengelolaan perpustakaan BB-Biogen

Elya Nurwullan, SP Koordinator Perpustakaan BB-Biogen

Metode determinasi bakteri: Kelompok actinomycetes

Dr. M. Machmud, Kelti Biokimia-BB-Biogen

Isolasi dan karakterisasi potensi aktinomisetes sebagai sumber senyawa antibakteri

D.N. Susilowati, MSi, Kelti Biokimia-BB-Biogen

Laporan mengikuti Training Course on Diagnostics of Stored Product Pests and Wood Boring Insects, 11-15 September 2006 di Perth, Australia

Trisnaningsih, SSi Kelti Biokimia-BB-Biogen

LAPORAN TAHUN 2006

Lampiran V.6. Daftar penelitian yang diseminarkan pada Seminar Hasil Penelitian TA 2005. No. Judul 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18.

Konstruksi kaset gen cryIA untuk pembentukan tanaman padi transgenik tahan hama penggerek batang Teknik biologi molekuler untuk perbaikan padi hibrida Marka molekuler untuk gen pemulih kesuburan Rf2 pada padi Konfirmasi varietas padi toleran kekeringan Studi isolasi protoplas dari suspensi sel tanaman padi liar dan budidaya Isolasi protoplas padi budi daya dan padi liar untuk hibridisasi asimetrik Konstruksi pustaka DNA genom Photorhabdus luminescens Produksi McAb rice tungro virus (RTV) Produksi McAb Ralstonia solanacearum (RS) Bioprospeksi senyawa bioaktif untuk pengendalian serangga hama: uji daya tarik feromon seks ulat bawang, Spodoptera exigua (Hbn) di lapang Pembentukan tanaman dihaploid jagung melalui kultur antera Pencarian alel-alel baru untuk sifat-sifat penting cekaman biotik dan abiotik pada padi Produksi dan evaluasi antibodi poliklonal untuk deteksi toksin Photorhabdus sp. Pemurnian dan karakterisasi toksin insektisidal Photorhabdus sp. Evaluasi plasma nutfah terhadap cekaman biotik dan abiotik Rejuvenasi dan karakterisasi plasma nutfah tanaman pangan Manajemen benih dan pengembangan database plasma nutfah tanaman pangan Konservasi dan karakterisasi mikroba pertanian

77


Lampiran V.7. Kertas kerja yang dipresentasikan pada International Seminar on the Status and Prospect of Modern Agricultural Biotechnology: Research, Regulation and Intelectual Property Rights. No.

Topik dan pembicara

1. Enhancement and control of transgene expression in higher plants (Prof. Atsuhiko Shinmyo, Dr. Eng.; Nara University Japan) 2. Rice genomic (Dr. Hei Leung; International Rice Research Institute, Phillipine) 3. The use of plants for molecular farming (Dr. Arief Witarto; Indonesian Institute of Science) 4. Genetic engineering for abiotic and biotic stresses at IAARD (Dr. Sutrisno; Indonesian Center for Agricultural Biotechnonology and Genetic Resources Research and Development) 5. Biotechnological approaches for developing improved rice varieties for marginal lands (Dr. Abdelbagi Ismail; International Rice Research Institute, Phillipine) 6. The role of genetic engineering for vaccine production (Dr. Debby Sofie Retnoningrum; Bandung Technology University) 7. Global status of GM crops and networking (Dr. Randy Hautea; International Service for Acquisitional Agrobiotech Application, USA) 8. Biotechnology development and regulations in ASEAN (Mr. Kevin Eke; CropLife Regional Asia-Pacific, Singapore) 9. Agricultural biotechnology training and capacity building programs at Michigan State University-USA (Prof. Dr. Karim Maredia and Dr. Cholani Weebadde; Michigan State University, USA) 10. Biosafety regulation in Indonesia (Dr. M. Herman; Indonesian Center for Agricultural Biotechnonology and Genetic Resources Research and Development) 11. Intellectual property right in agricultural biotechnology (Dr. Sugiono Moeljopawiro; Indonesian Center for Agricultural Biotechnonology and Genetic Resources Research and Development) 12. Assessing the cost of biosafety regulations in different countries (Dr. Jose F. Zepeda; International Food Policy Research Institute, USA) 13. The cost of research and development for producing transgenic crop and its biosafety regulation compliance in Indonesia (Dr. Bahagiawati A. H.; Indonesian Center for Agricultural Biotechnonology and Genetic Resources Research and Development)

78

LAPORAN TAHUN 2006

Lampiran V.8. Penelitian bioteknologi modern bidang pertanian di beberapa institusi. Institusi

Komoditas

Puslitbang Tembakau Bioteknologi-LIPI Ubi kayu Padi

Balai Penelitian Bioteknologi Perkebunan Indonesia

Kakao

Kopi Sawit Karet Tebu Institut Teknologi Jati Bandung BB-Biogen Padi

Pepaya

Kentang Tomat

Target yang diperbaiki

Partner

Produksi Huma EPO, interferon α2α dan human serum albumin pada tembakau Tepung bebas amilosa/amilopektin Transgenik Perakitan padi Bt Perakitan padi toleran kekeringan Perakitan padi tahan blas Pencarian gen Invensi gen pada padi Transgenik Perakitan kakao Bt (tahan PBK) Perakitan kakao produksi tinggi

PT Kalbe Farma Fraunhoffer-Jerman

Transgenik Tahan karat daun Transgenik Perakitan sawit rendemen tinggi Transegnik Perakitan karet tahan gugur daun Transgenik Perakitan tebu toleran kekeringan Transgenik Perbaikan kualitas kayu jati Transgenik Perakitan padi Bt Perakitan padi efisien pupuk N Pencarian gen Tahan blas Tahan BLB Toleran kekeringan Kahat P Keracunan Al Transgenik Penundaan kematangan buah (delay ripening) Transgenik Tahan daun lodoh Transgenik Tahan virus daun (CMV/TolYV) Sedikit biji

Institute of Biology-Leiden PRI-Wageningen-Netherlands CSIRO-Australia BB-Biogen BB Padi

Oregon State University, USA Osaka Pref. University, Jepang CIRAD Cornell University (USA), IRRI IRRI ISAAA Phylippines Malaysia Thailand Michigan State University, USA AVRDC Michigan State University, USA ISPO, Itali

79


Lampiran V.9. Keikutsertaan BB-Biogen dalam pameran yang dikoordinir/diselenggarakan Badan Litbang Pertanian. No. Kegiatan th

1. The 28 FAO Regional Conference for Asia and The Pacific

2.

3.

4.

5.

80

Waktu

Tempat

15-19 Mei 2006

Shangrila Hotel Jakarta

Materi yang dipamerkan

● Poster Insect pheromone for Insect Pest Management, Entomophatogenic Nematode for Biocontrol, dan Food crops germplasm ● Leaflet profil BB-Biogen Agro & Food Expo 2006 18-21 Mei 2006 Gedung Semanggi ● Poster Analisis Sidik Jari DNA Expo Jakarta untuk Identifikasi Varietas Tanaman dan Kultur In Vitro untuk Perbanyakan Tanaman ● Contoh bibit hasil kultur jaringan dalam botol dan bibit dalam polybag ● Leaflet Teknologi Produksi Bibit Abaka melalui Kultur Jaringan 8-12 Juli 2006 Soropadan Gelar Promosi ● Poster Feromon Serangga sebagai Agrobisnis II Biopestisida Ramah Lingkungan, Nematoda Patogen Serangga sebagai Biopestisida Unggulan, dan Biofosfat ● Leaflet BB-Biogen, NPS ● Hasil tangkapan kupu jantan Spodoptera exigua di Brebes 16-19 Juli 2006 Puslitbangbun ● Poster Perbanyakan Tanaman Pameran Varietas Bogor Manggis (Garcenia mangosteen) Unggul Tanaman secara In Vitro, Perbanyakan Perkebunan Tanaman Cendana (Santalum album) melalui Kultur Jaringan, dan Produksi Bibit Gaharu melalui Kultur In Vitro ● Bibit hasil kultur jaringan dalam botol dan dalam polybag ● Leaflet Profil BB-Biogen dan Teknologi Produksi Bibit Abaka melalui Kultur Jaringan ● Poster Feromon Serangga sebagai Gelar Teknologi Tepat 2-6 September 2006 Pontianak Biopestisida Ramah Lingkungan Guna dan Nematoda Patogen Serangga sebagai Biopestisida Unggulan Produk Feromon-Exi ● Leaflet Profil BB-Biogen dan NPS

LAPORAN TAHUN 2006

Lampiran V.9. Lanjutan. No. Kegiatan

Waktu

6. Pameran dalam rangka 7-9 November 2006 Pertemuan Masyarakat Perlindungan Tumbuhan dan Hewan Indonesia

7. Gelar Teknologi 2006

8. Ekspose Inovasi Teknologi Hortikultura 2006

9. Hari Pangan sedunia

Tempat


Wisma Dapenpos Bandung

● Poster Nematoda Patogen Serangga sebagai Biopestisida Unggulan, Feromon Serangga sebagai Biopestisida Ramah Lingkungan, Biopestisida Jamur Patogen Serangga, Kit ELISA untuk Deteksi Patogen Tanaman, dan Perangkat ELISA untuk Deteksi Virus dan Bakteri Patogen Tanaman ● Produk Feromon-Exi ● Leaflet Profil BB-Biogen, NPS, Feromon-Exi, dan Kit ELISA 22-23 November 2006 Sabuga ITB, ● Poster Nematoda Patogen Bandung Serangga sebagai Biopestisida Unggulan dan Improvement of Hybrid Rice Parental Lines through Anther Culture ● Produk Feromon-Exi ● Leaflet Profil BB-Biogen dan Feromon-Exi 22-25 November 2006 TMII, Jakarta ● Poster Perbanyakan Tanaman Manggis (Garcenia mangosteen) secara In Vitro, Perbanyakan Bibit Tanaman Hias melalui Kultur Jaringan, Perbanyakan Bibit Tanaman Buah melalui Kultur Jaringan, dan Feromon Serangga sebagai Biopestisida Ramah Lingkungan ● Contoh bibit dalam botol kultur dan dalam polybag ● Produk Feromon-Exi ● Leaflet Profil BB-Biogen,Teknologi Produksi Bibit Abaka melalui Kultur Jaringan, dan Feromon-Exi 25-27 November 2006 Lapangan ● Poster Perbaikan Tetua Padi Karebosi Makassar Hibrida melalui Bioteknologi ● Leaflet Profil BB-Biogen, NPS, Feromon-Exi, Kit ELISA, dan FUT

81


Lampiran V.9. Lanjutan. No. Kegiatan

Waktu

10. Inovasi Teknologi Pertanian

29-30 November 2006 Kampus Penelitian ● Poster Feromon Serangga sebagai Biopestisida Ramah Pertanian Lingkungan, Perbaikan Tetua Cimanggu, Bogor Padi Hibrida melalui Bioteknologi, Perbanyakan Tanaman Manggis (Garcenia mangosteen) secara In Vitro, NPS sebagai Biopestisida Unggulan, Perbanyakan Bibit Tanaman Buah melalui Kultur Jaringan, Perbanyakan Bibit Tanaman Hias melalui Kultur Jaringan, dan Analisis Sidik Jari DNA untuk Identifikasi Varietas Tanaman ● Bibit hasil kultur jaringan dalam botol dan dalam polybag ● Produk Feromon-Exi ● Leaflet Profil BB-Biogen, NPS, Feromon-Exi, FUT, Kit ELISA, dan Teknologi Produksi Bibit Abaka melalui Kultur Jaringan

82

Tempat


Laporan Tahun Penanggung Jawab Sutrisno. Redaksi Harnoto Asadi Budihardjo Soegiarto Karden Mulya ISSN Alamat

Recommend Documents